Date: 2019-12-25 22:42:47 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 17519 500
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| SD:hclust | 2 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | ** | |
| SD:kmeans | 2 | 1.000 | 0.997 | 0.999 | ** | |
| CV:hclust | 2 | 1.000 | 0.991 | 0.997 | ** | |
| CV:kmeans | 2 | 1.000 | 0.998 | 0.999 | ** | |
| CV:skmeans | 2 | 1.000 | 0.996 | 0.999 | ** | |
| CV:pam | 2 | 1.000 | 0.998 | 0.999 | ** | |
| CV:mclust | 2 | 1.000 | 0.993 | 0.997 | ** | |
| CV:NMF | 2 | 1.000 | 0.992 | 0.997 | ** | |
| MAD:hclust | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| MAD:kmeans | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| MAD:mclust | 3 | 1.000 | 0.973 | 0.989 | ** | 2 |
| ATC:kmeans | 2 | 1.000 | 0.998 | 0.999 | ** | |
| ATC:pam | 2 | 1.000 | 0.997 | 0.999 | ** | |
| ATC:mclust | 2 | 1.000 | 0.991 | 0.996 | ** | |
| MAD:pam | 3 | 1.000 | 0.968 | 0.987 | ** | 2 |
| ATC:skmeans | 4 | 0.986 | 0.952 | 0.975 | ** | 2 |
| SD:pam | 3 | 0.971 | 0.953 | 0.980 | ** | 2 |
| SD:skmeans | 5 | 0.969 | 0.925 | 0.959 | ** | 2,3 |
| SD:mclust | 3 | 0.966 | 0.936 | 0.972 | ** | 2 |
| SD:NMF | 3 | 0.954 | 0.933 | 0.971 | ** | 2 |
| ATC:NMF | 3 | 0.950 | 0.928 | 0.967 | * | 2 |
| MAD:NMF | 4 | 0.947 | 0.916 | 0.965 | * | 2,3 |
| MAD:skmeans | 5 | 0.932 | 0.909 | 0.949 | * | 2,3 |
| ATC:hclust | 5 | 0.917 | 0.903 | 0.959 | * | 2 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 1 0.997 0.999 0.492 0.508 0.508
#> CV:NMF 2 1 0.992 0.997 0.493 0.508 0.508
#> MAD:NMF 2 1 1.000 1.000 0.491 0.509 0.509
#> ATC:NMF 2 1 0.998 0.999 0.492 0.509 0.509
#> SD:skmeans 2 1 1.000 1.000 0.492 0.508 0.508
#> CV:skmeans 2 1 0.996 0.999 0.493 0.508 0.508
#> MAD:skmeans 2 1 0.998 0.999 0.492 0.509 0.509
#> ATC:skmeans 2 1 1.000 1.000 0.492 0.508 0.508
#> SD:mclust 2 1 0.996 0.998 0.495 0.505 0.505
#> CV:mclust 2 1 0.993 0.997 0.496 0.505 0.505
#> MAD:mclust 2 1 0.997 0.999 0.494 0.507 0.507
#> ATC:mclust 2 1 0.991 0.996 0.495 0.506 0.506
#> SD:kmeans 2 1 0.997 0.999 0.491 0.509 0.509
#> CV:kmeans 2 1 0.998 0.999 0.492 0.508 0.508
#> MAD:kmeans 2 1 1.000 1.000 0.491 0.509 0.509
#> ATC:kmeans 2 1 0.998 0.999 0.492 0.509 0.509
#> SD:pam 2 1 0.997 0.999 0.492 0.508 0.508
#> CV:pam 2 1 0.998 0.999 0.492 0.508 0.508
#> MAD:pam 2 1 0.999 0.999 0.491 0.509 0.509
#> ATC:pam 2 1 0.997 0.999 0.491 0.509 0.509
#> SD:hclust 2 1 0.999 1.000 0.492 0.509 0.509
#> CV:hclust 2 1 0.991 0.997 0.492 0.509 0.509
#> MAD:hclust 2 1 1.000 1.000 0.492 0.509 0.509
#> ATC:hclust 2 1 0.997 0.999 0.492 0.509 0.509
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.954 0.933 0.971 0.2096 0.891 0.786
#> CV:NMF 3 0.795 0.904 0.910 0.2217 0.876 0.756
#> MAD:NMF 3 0.979 0.941 0.976 0.2332 0.876 0.759
#> ATC:NMF 3 0.950 0.928 0.967 0.1523 0.908 0.821
#> SD:skmeans 3 0.990 0.953 0.977 0.2873 0.857 0.718
#> CV:skmeans 3 0.779 0.930 0.931 0.2755 0.855 0.715
#> MAD:skmeans 3 0.993 0.960 0.982 0.2896 0.858 0.721
#> ATC:skmeans 3 0.806 0.949 0.941 0.2464 0.864 0.733
#> SD:mclust 3 0.966 0.936 0.972 0.1660 0.911 0.824
#> CV:mclust 3 0.839 0.870 0.937 0.1495 0.954 0.909
#> MAD:mclust 3 1.000 0.973 0.989 0.2125 0.887 0.778
#> ATC:mclust 3 0.894 0.885 0.953 0.1739 0.921 0.844
#> SD:kmeans 3 0.786 0.853 0.846 0.2294 0.845 0.695
#> CV:kmeans 3 0.736 0.699 0.848 0.2155 0.993 0.985
#> MAD:kmeans 3 0.764 0.891 0.869 0.2365 0.861 0.728
#> ATC:kmeans 3 0.768 0.612 0.816 0.1985 0.956 0.913
#> SD:pam 3 0.971 0.953 0.980 0.2796 0.862 0.728
#> CV:pam 3 0.732 0.881 0.901 0.2998 0.842 0.690
#> MAD:pam 3 1.000 0.968 0.987 0.2793 0.863 0.731
#> ATC:pam 3 0.767 0.844 0.893 0.1903 0.934 0.870
#> SD:hclust 3 0.967 0.964 0.978 0.0350 0.997 0.993
#> CV:hclust 3 1.000 0.981 0.989 0.0312 0.977 0.955
#> MAD:hclust 3 0.893 0.943 0.964 0.0573 0.997 0.993
#> ATC:hclust 3 1.000 0.986 0.992 0.0157 0.997 0.993
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.829 0.859 0.911 0.0987 0.934 0.839
#> CV:NMF 4 0.748 0.829 0.892 0.0820 0.962 0.902
#> MAD:NMF 4 0.947 0.916 0.965 0.0837 0.934 0.835
#> ATC:NMF 4 0.869 0.860 0.938 0.0624 0.974 0.938
#> SD:skmeans 4 0.855 0.828 0.892 0.0940 0.936 0.828
#> CV:skmeans 4 0.739 0.837 0.897 0.1327 0.919 0.780
#> MAD:skmeans 4 0.857 0.846 0.903 0.0905 0.934 0.822
#> ATC:skmeans 4 0.986 0.952 0.975 0.1191 0.936 0.829
#> SD:mclust 4 0.781 0.805 0.884 0.1641 0.830 0.625
#> CV:mclust 4 0.725 0.851 0.894 0.2150 0.816 0.611
#> MAD:mclust 4 0.677 0.748 0.848 0.1413 0.836 0.632
#> ATC:mclust 4 0.717 0.806 0.881 0.1602 0.841 0.649
#> SD:kmeans 4 0.667 0.726 0.806 0.1227 0.880 0.685
#> CV:kmeans 4 0.615 0.705 0.796 0.1409 0.798 0.598
#> MAD:kmeans 4 0.662 0.775 0.841 0.1324 0.921 0.789
#> ATC:kmeans 4 0.658 0.727 0.829 0.1272 0.836 0.656
#> SD:pam 4 0.829 0.839 0.918 0.1358 0.910 0.759
#> CV:pam 4 0.692 0.738 0.846 0.1401 0.895 0.708
#> MAD:pam 4 0.874 0.815 0.915 0.1216 0.925 0.799
#> ATC:pam 4 0.841 0.835 0.932 0.1815 0.868 0.705
#> SD:hclust 4 0.878 0.923 0.957 0.0615 0.984 0.969
#> CV:hclust 4 0.958 0.954 0.969 0.0395 0.998 0.996
#> MAD:hclust 4 0.802 0.869 0.930 0.0849 0.980 0.961
#> ATC:hclust 4 0.910 0.894 0.942 0.0710 0.991 0.982
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.750 0.776 0.838 0.0958 0.894 0.706
#> CV:NMF 5 0.661 0.766 0.849 0.1256 0.874 0.655
#> MAD:NMF 5 0.743 0.726 0.862 0.0653 0.963 0.897
#> ATC:NMF 5 0.706 0.733 0.867 0.1172 0.910 0.781
#> SD:skmeans 5 0.969 0.925 0.959 0.0810 0.935 0.793
#> CV:skmeans 5 0.819 0.796 0.868 0.0774 0.918 0.725
#> MAD:skmeans 5 0.932 0.909 0.949 0.0832 0.933 0.788
#> ATC:skmeans 5 0.860 0.862 0.917 0.0607 0.941 0.814
#> SD:mclust 5 0.705 0.610 0.714 0.1035 0.851 0.558
#> CV:mclust 5 0.628 0.738 0.793 0.0680 0.909 0.717
#> MAD:mclust 5 0.674 0.634 0.713 0.0995 0.841 0.544
#> ATC:mclust 5 0.674 0.705 0.817 0.0965 0.889 0.669
#> SD:kmeans 5 0.596 0.779 0.787 0.0832 0.895 0.672
#> CV:kmeans 5 0.602 0.534 0.707 0.0774 0.906 0.713
#> MAD:kmeans 5 0.710 0.711 0.788 0.0800 0.888 0.649
#> ATC:kmeans 5 0.643 0.696 0.794 0.0951 0.939 0.816
#> SD:pam 5 0.744 0.769 0.855 0.0897 0.918 0.720
#> CV:pam 5 0.670 0.541 0.768 0.0579 0.951 0.819
#> MAD:pam 5 0.790 0.749 0.870 0.0898 0.921 0.741
#> ATC:pam 5 0.759 0.753 0.855 0.0864 0.908 0.722
#> SD:hclust 5 0.853 0.905 0.940 0.0750 0.942 0.882
#> CV:hclust 5 0.859 0.827 0.918 0.0933 0.943 0.884
#> MAD:hclust 5 0.738 0.835 0.904 0.0846 0.942 0.881
#> ATC:hclust 5 0.917 0.903 0.959 0.0773 0.924 0.846
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.662 0.636 0.810 0.0636 0.954 0.839
#> CV:NMF 6 0.691 0.574 0.765 0.0643 0.920 0.711
#> MAD:NMF 6 0.695 0.533 0.737 0.0535 0.886 0.682
#> ATC:NMF 6 0.635 0.681 0.824 0.0637 0.959 0.879
#> SD:skmeans 6 0.861 0.846 0.898 0.0466 0.952 0.814
#> CV:skmeans 6 0.829 0.804 0.873 0.0476 0.944 0.764
#> MAD:skmeans 6 0.842 0.803 0.892 0.0453 0.959 0.841
#> ATC:skmeans 6 0.837 0.796 0.877 0.0441 0.934 0.764
#> SD:mclust 6 0.734 0.724 0.816 0.0670 0.932 0.710
#> CV:mclust 6 0.613 0.567 0.689 0.0506 0.962 0.857
#> MAD:mclust 6 0.722 0.680 0.766 0.0581 0.961 0.824
#> ATC:mclust 6 0.686 0.571 0.755 0.0597 0.925 0.715
#> SD:kmeans 6 0.731 0.700 0.788 0.0632 0.992 0.967
#> CV:kmeans 6 0.627 0.613 0.739 0.0560 0.890 0.618
#> MAD:kmeans 6 0.686 0.667 0.783 0.0589 0.955 0.819
#> ATC:kmeans 6 0.662 0.389 0.719 0.0544 0.943 0.804
#> SD:pam 6 0.729 0.662 0.793 0.0443 0.964 0.842
#> CV:pam 6 0.690 0.632 0.758 0.0517 0.910 0.638
#> MAD:pam 6 0.826 0.719 0.863 0.0439 0.904 0.633
#> ATC:pam 6 0.741 0.626 0.791 0.0534 0.947 0.795
#> SD:hclust 6 0.752 0.723 0.876 0.1299 0.907 0.785
#> CV:hclust 6 0.851 0.683 0.827 0.0338 0.923 0.828
#> MAD:hclust 6 0.682 0.729 0.850 0.1441 0.877 0.714
#> ATC:hclust 6 0.898 0.888 0.945 0.0208 0.992 0.981
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 4000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 5000)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.4917 0.509 0.509
#> 3 3 0.967 0.964 0.978 0.0350 0.997 0.993
#> 4 4 0.878 0.923 0.957 0.0615 0.984 0.969
#> 5 5 0.853 0.905 0.940 0.0750 0.942 0.882
#> 6 6 0.752 0.723 0.876 0.1299 0.907 0.785
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR1326059 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1080648 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1391811 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.1414 0.980 0.020 0.980
#> SRR1431735 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1446308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1400799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1310334 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1415591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1309333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1413137 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1469973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1071011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1454073 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 2 0.3431 0.932 0.064 0.936
#> SRR1309314 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1355769 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1069895 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1069231 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.1184 0.984 0.016 0.984
#> SRR807679 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1488491 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1388997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.2948 0.946 0.948 0.052
#> SRR814657 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.0592 0.947 0.012 0.000 0.988
#> SRR1326059 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1098426 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1090310 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4702 0.803 0.788 0.000 0.212
#> SRR1329947 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.2066 0.922 0.940 0.000 0.060
#> SRR1464880 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3116 0.891 0.892 0.000 0.108
#> SRR1354203 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4605 0.811 0.796 0.000 0.204
#> SRR1486821 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.2066 0.922 0.940 0.000 0.060
#> SRR1408788 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1080648 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3192 0.888 0.888 0.000 0.112
#> SRR1321829 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR1453769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1391811 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1086490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.4121 0.844 0.832 0.000 0.168
#> SRR1384431 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0747 0.945 0.984 0.000 0.016
#> SRR1359738 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085900 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.4605 0.811 0.796 0.000 0.204
#> SRR1347870 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.1031 0.941 0.976 0.000 0.024
#> SRR1443350 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1076705 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 2 0.1289 0.966 0.000 0.968 0.032
#> SRR1431735 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417387 1 0.1031 0.941 0.976 0.000 0.024
#> SRR1445984 1 0.2625 0.907 0.916 0.000 0.084
#> SRR1370447 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1446308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.4605 0.811 0.796 0.000 0.204
#> SRR1319584 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.4750 0.799 0.784 0.000 0.216
#> SRR1317939 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399178 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0237 0.996 0.000 0.996 0.004
#> SRR1079543 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1400799 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.1529 0.932 0.960 0.000 0.040
#> SRR1312226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069328 1 0.4178 0.841 0.828 0.000 0.172
#> SRR1445023 1 0.4654 0.807 0.792 0.000 0.208
#> SRR1077599 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 2 0.0592 0.988 0.000 0.988 0.012
#> SRR1436949 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1310334 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385434 1 0.4842 0.790 0.776 0.000 0.224
#> SRR1415591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.3619 0.870 0.864 0.000 0.136
#> SRR1308734 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR814341 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR809919 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1370818 1 0.4002 0.851 0.840 0.000 0.160
#> SRR1323651 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1415708 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.1753 0.929 0.952 0.000 0.048
#> SRR1080044 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1964 0.925 0.944 0.000 0.056
#> SRR1069871 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1309333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.4796 0.794 0.780 0.000 0.220
#> SRR1413137 1 0.4796 0.794 0.780 0.000 0.220
#> SRR1469973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.3116 0.891 0.892 0.000 0.108
#> SRR1416266 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1071011 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.4504 0.819 0.804 0.000 0.196
#> SRR1435394 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419962 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0237 0.996 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312147 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1473891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.1643 0.930 0.956 0.000 0.044
#> SRR1474930 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.4750 0.799 0.784 0.000 0.216
#> SRR811915 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1529 0.932 0.960 0.000 0.040
#> SRR1310997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1348885 2 0.0592 0.988 0.000 0.988 0.012
#> SRR1325826 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.4121 0.844 0.832 0.000 0.168
#> SRR1345692 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1454073 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.1753 0.929 0.952 0.000 0.048
#> SRR1361436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 2 0.2448 0.913 0.000 0.924 0.076
#> SRR1309314 2 0.0424 0.992 0.000 0.992 0.008
#> SRR1420085 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1096760 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.4702 0.803 0.788 0.000 0.212
#> SRR1394321 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081160 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0892 0.943 0.980 0.000 0.020
#> SRR1486139 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.4291 0.834 0.820 0.000 0.180
#> SRR1447893 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.3816 0.861 0.852 0.000 0.148
#> SRR1445701 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.4121 0.846 0.832 0.000 0.168
#> SRR1355769 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.4291 0.834 0.820 0.000 0.180
#> SRR1089998 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.1860 0.927 0.948 0.000 0.052
#> SRR1325578 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1102656 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.4750 0.799 0.784 0.000 0.216
#> SRR1454695 1 0.0892 0.943 0.980 0.000 0.020
#> SRR1090241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0592 0.946 0.988 0.000 0.012
#> SRR1379581 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.2066 0.922 0.940 0.000 0.060
#> SRR1084742 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.2878 0.899 0.904 0.000 0.096
#> SRR1070332 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1069895 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.3192 0.888 0.888 0.000 0.112
#> SRR1385150 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4654 0.807 0.792 0.000 0.208
#> SRR1102583 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2625 0.907 0.916 0.000 0.084
#> SRR1340574 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408553 1 0.4796 0.794 0.780 0.000 0.220
#> SRR1069231 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.4702 0.803 0.788 0.000 0.212
#> SRR1080143 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.4750 0.799 0.784 0.000 0.216
#> SRR1357042 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.1163 0.971 0.000 0.972 0.028
#> SRR807679 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.2625 0.907 0.916 0.000 0.084
#> SRR1418041 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1085211 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1350958 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071131 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.2878 0.899 0.904 0.000 0.096
#> SRR1409171 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.4702 0.803 0.788 0.000 0.212
#> SRR1431887 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1488491 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.4504 0.819 0.804 0.000 0.196
#> SRR1453299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.4654 0.807 0.792 0.000 0.208
#> SRR1083530 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1378818 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413182 1 0.4702 0.803 0.788 0.000 0.212
#> SRR1464559 1 0.3941 0.854 0.844 0.000 0.156
#> SRR1413075 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.4887 0.785 0.772 0.000 0.228
#> SRR1388997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1456423 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1346710 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.0237 0.996 0.000 0.996 0.004
#> SRR1479175 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0424 0.947 0.992 0.000 0.008
#> SRR1366729 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.0237 0.996 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319100 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.4452 0.823 0.808 0.000 0.192
#> SRR1444598 2 0.0424 0.992 0.000 0.992 0.008
#> SRR1091743 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0237 0.948 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375531 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.2116 0.947 0.012 0.040 0.948
#> SRR814657 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1402132 3 0.1557 0.9391 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.2081 0.9171 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR819559 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.3400 0.8157 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1070036 1 0.0336 0.9475 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1098426 1 0.0592 0.9446 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1090310 2 0.1557 0.9332 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.3764 0.8038 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.2011 0.9158 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.2704 0.8802 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1402944 2 0.2530 0.8896 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.1637 0.9232 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.3400 0.8156 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.2469 0.8933 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0592 0.9550 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.2149 0.9116 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.3688 0.8119 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1486821 2 0.3219 0.8355 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1418540 1 0.1637 0.9232 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1408788 2 0.0707 0.9528 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1359487 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.2530 0.8902 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.2469 0.8946 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0188 0.9601 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1022 0.9380 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0592 0.9446 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1086490 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3311 0.8443 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0592 0.9451 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1359738 2 0.1637 0.9308 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1332141 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085900 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0188 0.9601 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1344034 2 0.2081 0.9129 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1080391 1 0.3688 0.8119 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417851 1 0.0817 0.9417 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0592 0.9446 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.1118 0.9458 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375394 4 0.1767 0.6227 0.000 0.044 0.012 0.944
#> SRR1431735 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1417387 1 0.0817 0.9415 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1445984 1 0.2081 0.9083 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1370447 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.2469 0.8946 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.3688 0.8114 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1319584 2 0.2216 0.9066 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.3945 0.8001 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0336 0.9474 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1399178 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.1474 0.9238 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1335314 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1400799 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1074578 1 0.1211 0.9330 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069328 1 0.3356 0.8407 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1445023 1 0.3726 0.8079 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 4 0.3074 0.7344 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.3356 0.8207 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1385434 1 0.4123 0.7912 0.772 0.000 0.220 0.008
#> SRR1415591 2 0.1940 0.9207 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.2868 0.8727 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1308734 2 0.2011 0.9158 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0592 0.9446 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.2281 0.9031 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR809919 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1370818 1 0.3172 0.8543 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.3123 0.8441 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.2345 0.9015 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1317731 2 0.3266 0.8316 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.1211 0.9441 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1101513 1 0.0336 0.9476 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1415708 2 0.0921 0.9500 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1316033 2 0.3219 0.8355 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1390371 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.3266 0.8307 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1076801 1 0.1389 0.9298 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1557 0.9259 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0188 0.9601 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.3982 0.7955 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1413137 1 0.3982 0.7955 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1469973 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.2469 0.8933 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1416266 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.3610 0.8196 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0188 0.9488 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1419962 2 0.3219 0.8355 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.3444 0.8104 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.1474 0.9238 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1312147 1 0.0921 0.9396 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.1302 0.9312 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1474930 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470988 1 0.3945 0.8001 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.3356 0.8213 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1211 0.9330 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1310997 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1464494 2 0.0188 0.9603 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357083 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.1792 0.9268 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1467704 1 0.0336 0.9475 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1348885 4 0.1716 0.6884 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.3311 0.8443 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1345692 2 0.0336 0.9588 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1401040 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.3172 0.8402 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.1389 0.9295 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1361436 2 0.2149 0.9116 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR817142 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 4 0.1557 0.3717 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1309314 4 0.3123 0.7295 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1420085 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1361308 2 0.2281 0.9052 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.2530 0.8896 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0188 0.9601 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0336 0.9477 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1096760 2 0.1557 0.9332 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR812294 1 0.3764 0.8038 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1394321 1 0.0188 0.9488 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099570 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0707 0.9432 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.3400 0.8375 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1447893 2 0.1792 0.9255 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1466025 2 0.0188 0.9603 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1477429 1 0.3074 0.8608 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1445701 2 0.2345 0.9015 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR820689 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.3577 0.8491 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.3400 0.8382 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.1557 0.9332 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1095188 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.2081 0.9145 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1105417 1 0.1474 0.9281 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1325578 2 0.2345 0.8997 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1358161 2 0.2281 0.9031 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1447828 2 0.3219 0.8355 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.2530 0.8911 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0336 0.9475 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1370682 2 0.3444 0.8101 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1475448 2 0.1637 0.9308 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.1474 0.9372 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.2408 0.8991 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.1302 0.9411 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1457527 2 0.3266 0.8309 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.2081 0.9145 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1488858 1 0.3945 0.7999 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR1454695 1 0.0707 0.9435 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0469 0.9461 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1379581 2 0.3726 0.7695 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1637 0.9232 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1084742 2 0.0188 0.9601 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.2281 0.9007 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1069895 2 0.0188 0.9603 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099144 1 0.2530 0.8902 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1385150 2 0.1792 0.9255 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3726 0.8079 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2081 0.9083 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.2281 0.9031 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1408553 1 0.3982 0.7955 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0188 0.9603 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077874 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808299 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0188 0.9601 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.1302 0.9411 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1380249 1 0.3764 0.8038 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.3945 0.7999 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR813283 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.2861 0.7336 0.000 0.096 0.016 0.888
#> SRR807679 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.2011 0.9158 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.2081 0.9083 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1418041 1 0.0336 0.9475 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1085211 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0592 0.9450 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1488881 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1102973 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071131 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.2281 0.9007 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0336 0.9591 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1384091 1 0.3764 0.8038 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.3610 0.8196 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1453299 2 0.2530 0.8911 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.2814 0.8713 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1091767 2 0.0817 0.9514 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1354467 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0336 0.9588 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1437430 2 0.3219 0.8363 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.2647 0.8833 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1077619 1 0.3726 0.8079 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.2081 0.9129 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0336 0.9475 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1378818 2 0.3074 0.8464 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1413182 1 0.3764 0.8038 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1464559 1 0.3123 0.8574 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1413075 2 0.0188 0.9603 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487928 1 0.4248 0.7868 0.768 0.000 0.220 0.012
#> SRR1388997 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0592 0.9447 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1376874 2 0.3400 0.8156 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1339903 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.4999 -0.0626 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0188 0.9604 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.2469 0.8943 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.4277 0.6492 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1455989 2 0.1022 0.9481 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1453680 2 0.3356 0.8210 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0336 0.9475 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1366729 2 0.3356 0.8210 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR821282 2 0.3400 0.8156 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.4916 0.2219 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.2345 0.9015 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.3569 0.8234 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1444598 4 0.3123 0.7295 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9614 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0592 0.9550 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1459785 2 0.2469 0.8943 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1083700 1 0.0188 0.9487 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.2542 0.9363 0.000 0.012 0.904 0.084
#> SRR814657 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402132 3 0.0000 0.9592 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0404 0.9424 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465313 2 0.1851 0.9202 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR819559 1 0.0794 0.9333 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.1043 0.9222 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1469926 2 0.2929 0.8313 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1070036 1 0.0290 0.9440 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1098426 1 0.0609 0.9374 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1090310 2 0.1341 0.9371 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1429748 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2929 0.8303 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.1732 0.9213 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.2424 0.8824 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1402944 2 0.2230 0.8947 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.3586 0.5564 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.3109 0.8078 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3336 0.6393 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0404 0.9423 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1092014 2 0.0510 0.9572 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1097857 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.1851 0.9174 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.4256 0.5725 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1486821 2 0.2773 0.8486 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1418540 1 0.3534 0.5770 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1408788 2 0.0703 0.9536 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1359487 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.4161 0.6652 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.2127 0.9020 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0290 0.9602 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.3242 0.6738 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1410 0.9037 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1086490 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.3612 0.7990 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1384431 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1072055 1 0.0609 0.9381 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1359738 2 0.1410 0.9349 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1332141 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085900 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0290 0.9602 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1344034 2 0.1792 0.9186 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1080391 4 0.3508 0.8108 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0162 0.9613 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070060 1 0.0290 0.9443 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1487969 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417851 1 0.2230 0.8392 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0880 0.9297 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1076705 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079380 2 0.1043 0.9475 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375394 5 0.2561 0.7524 0.000 0.000 0.000 0.144 0.856
#> SRR1431735 1 0.1043 0.9240 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1417387 1 0.2074 0.8518 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1445984 1 0.3661 0.5188 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1370447 4 0.2377 0.7950 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.2127 0.9020 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.3366 0.8212 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000
#> SRR1319584 2 0.1965 0.9105 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.3039 0.8300 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.1121 0.9194 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1399178 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.1544 0.9168 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335314 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1400799 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1074578 1 0.1341 0.9052 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069328 1 0.3876 0.3924 0.684 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1445023 4 0.3210 0.8287 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 5 0.1341 0.7725 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1458158 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432408 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.3039 0.8168 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1385434 4 0.2377 0.7955 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1415591 2 0.1671 0.9258 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1402009 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316055 4 0.3730 0.7719 0.288 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR1308734 2 0.1732 0.9213 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.1410 0.9037 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.2020 0.9072 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR809919 1 0.0880 0.9301 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1370818 4 0.4114 0.6912 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR818170 2 0.2891 0.8346 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.2020 0.9082 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1317731 2 0.2852 0.8413 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1490785 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0609 0.9374 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.1121 0.9456 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1101513 1 0.2074 0.8554 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1415708 2 0.0794 0.9525 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1316033 2 0.2773 0.8486 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1390371 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.2852 0.8402 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1076801 1 0.3305 0.6474 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.2773 0.7644 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0290 0.9602 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0510 0.9406 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1417023 4 0.2377 0.7948 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1352996 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1093172 4 0.2929 0.8290 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1413137 4 0.2929 0.8290 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1469973 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.3305 0.6476 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1416266 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3661 0.7903 0.276 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.1671 0.8852 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1419962 2 0.2813 0.8445 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1094357 1 0.0510 0.9403 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1081639 2 0.3003 0.8222 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.1544 0.9168 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1312147 1 0.2813 0.7586 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3143 0.6883 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1474930 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470988 4 0.3109 0.8308 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.2929 0.8319 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1732 0.8810 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1310997 2 0.0290 0.9610 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1464494 2 0.0290 0.9608 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357083 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0404 0.9421 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1378220 2 0.1544 0.9313 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1467704 1 0.0290 0.9440 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1348885 5 0.2329 0.7534 0.000 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.3586 0.8015 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1345692 2 0.0290 0.9605 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401040 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1097954 1 0.1043 0.9241 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1374396 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.2179 0.8377 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1429368 2 0.2732 0.8529 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.1270 0.9086 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1361436 2 0.1851 0.9174 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR817142 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 5 0.3039 0.7053 0.000 0.000 0.000 0.192 0.808
#> SRR1309314 5 0.1410 0.7657 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1420085 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361308 2 0.2020 0.9092 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1472126 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380482 2 0.2230 0.8947 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0290 0.9602 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.1341 0.9080 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1096760 2 0.1341 0.9371 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812294 4 0.2891 0.8294 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000
#> SRR1394321 1 0.0510 0.9408 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0794 0.9333 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1390413 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099570 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1312169 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096687 1 0.2230 0.8377 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.3210 0.8244 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1447893 2 0.1544 0.9301 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1466025 2 0.0290 0.9608 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477429 1 0.4201 0.0226 0.592 0.000 0.000 0.408 0.000
#> SRR1445701 2 0.2020 0.9082 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR820689 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1043 0.9247 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1489328 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.3816 0.7539 0.304 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR1355769 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.4242 -0.0881 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1089998 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.1341 0.9371 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1095188 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.1792 0.9201 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1105417 1 0.3210 0.6811 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1325578 2 0.2074 0.9041 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1358161 2 0.2020 0.9072 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0609 0.9385 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1090837 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1447828 2 0.2813 0.8445 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.2179 0.8988 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0880 0.9290 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1370682 2 0.3143 0.8025 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1475448 2 0.1410 0.9349 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082592 2 0.1341 0.9392 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.2074 0.9061 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.1121 0.9444 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1457527 2 0.2891 0.8360 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.1792 0.9201 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1488858 4 0.2516 0.8068 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1454695 1 0.2020 0.8575 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0510 0.9400 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1379581 2 0.3366 0.7638 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3561 0.5669 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1084742 2 0.0290 0.9602 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1433538 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085063 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454247 2 0.0162 0.9613 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.3612 0.5379 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0162 0.9613 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1076195 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1069895 2 0.0162 0.9618 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099144 4 0.4161 0.6652 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1385150 2 0.1544 0.9301 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3857 0.7554 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1102583 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1456971 1 0.3684 0.5075 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.1965 0.9097 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1408553 4 0.2929 0.8290 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1069231 1 0.0290 0.9439 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1325642 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0162 0.9618 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077874 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR808299 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0290 0.9602 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.1121 0.9444 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1380249 4 0.2773 0.8236 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1080143 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383148 4 0.2516 0.8068 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813283 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.0510 0.7485 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR807679 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.1732 0.9213 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432542 1 0.3707 0.4957 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1418041 1 0.0794 0.9323 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1085211 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1851 0.8715 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1488881 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1102973 1 0.0703 0.9355 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1071131 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.3612 0.5379 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0290 0.9609 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1384091 4 0.3210 0.8279 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0162 0.9613 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369514 4 0.4249 0.5782 0.432 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1453299 2 0.2179 0.8988 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.2648 0.8610 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1091767 2 0.0703 0.9539 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1354467 2 0.1671 0.9250 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0290 0.9605 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1437430 2 0.2813 0.8455 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1419736 2 0.0162 0.9613 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313343 2 0.2280 0.8917 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1077619 4 0.4161 0.6676 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.1792 0.9186 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0794 0.9318 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1378818 2 0.2813 0.8415 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1413182 4 0.2891 0.8294 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000
#> SRR1464559 4 0.3913 0.7454 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1413075 2 0.0290 0.9608 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487928 4 0.2329 0.7905 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1388997 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.2424 0.8176 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376874 2 0.3109 0.8078 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1339903 1 0.0290 0.9442 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.6032 0.0961 0.000 0.508 0.000 0.124 0.368
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0162 0.9619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.2127 0.9017 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0404 0.9424 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.3857 0.6301 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1455989 2 0.0880 0.9509 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1453680 2 0.3074 0.8131 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0794 0.9318 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1366729 2 0.3039 0.8181 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR821282 2 0.3109 0.8078 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.4283 0.2300 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.2020 0.9082 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.4114 0.6832 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1444598 5 0.1410 0.7657 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9628 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9463 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0510 0.9572 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1459785 2 0.2127 0.9017 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1083700 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375531 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1323470 3 0.1043 0.9583 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR814657 1 0.0162 0.9456 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0405 0.80904 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0363 0.81087 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 6 0.0000 0.95192 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326059 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.3409 0.23677 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0458 0.94442 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.3742 0.11187 0.000 0.648 0.348 0.000 0.004 0.000
#> SRR819559 1 0.0790 0.93736 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.3409 0.24720 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0508 0.94271 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.3330 0.30215 0.000 0.716 0.284 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.1082 0.92856 0.956 0.000 0.004 0.040 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.3927 0.81164 0.000 0.344 0.644 0.000 0.012 0.000
#> SRR1070036 1 0.0260 0.94584 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0547 0.94110 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.3866 -0.64450 0.000 0.516 0.484 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.3390 0.25500 0.000 0.704 0.296 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1643 0.77071 0.068 0.000 0.008 0.924 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.3979 -0.51368 0.000 0.540 0.456 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.3944 -0.25568 0.000 0.568 0.428 0.000 0.004 0.000
#> SRR1402944 2 0.3862 -0.12624 0.000 0.608 0.388 0.000 0.004 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.3895 0.54967 0.696 0.000 0.016 0.284 0.004 0.000
#> SRR1464880 2 0.0914 0.79969 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0790 0.80220 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.1500 0.79394 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012 0.000
#> SRR1331879 2 0.1225 0.80226 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012 0.000
#> SRR1320034 3 0.3426 0.75603 0.000 0.276 0.720 0.000 0.004 0.000
#> SRR1068687 2 0.3126 0.43904 0.000 0.752 0.248 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3512 0.60433 0.720 0.000 0.008 0.272 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0914 0.79969 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000
#> SRR1455214 1 0.0458 0.94453 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.3482 0.17096 0.000 0.684 0.316 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0363 0.94597 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.3851 0.77333 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.4063 0.40632 0.420 0.000 0.004 0.572 0.004 0.000
#> SRR1486821 3 0.3634 0.81754 0.000 0.356 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.3721 0.62008 0.728 0.000 0.016 0.252 0.004 0.000
#> SRR1408788 2 0.3668 0.12292 0.000 0.668 0.328 0.000 0.004 0.000
#> SRR1359487 4 0.0632 0.71254 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0146 0.94676 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0914 0.79725 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000
#> SRR1365722 2 0.0458 0.81100 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.4384 0.55666 0.296 0.000 0.028 0.664 0.012 0.000
#> SRR1321829 2 0.3330 0.30215 0.000 0.716 0.284 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.3828 0.79435 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.1151 0.79378 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1349300 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.3627 0.67365 0.752 0.000 0.020 0.224 0.004 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0363 0.94585 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.1151 0.80109 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1366124 4 0.1116 0.71696 0.004 0.000 0.028 0.960 0.008 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1524 0.90686 0.932 0.000 0.008 0.060 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.3867 0.72581 0.000 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.2768 0.73382 0.156 0.000 0.012 0.832 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0458 0.94418 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0547 0.94178 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.3866 -0.64635 0.000 0.516 0.484 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0146 0.94672 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.1501 0.76702 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.1265 0.79865 0.000 0.948 0.044 0.000 0.008 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.1151 0.79378 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1344034 2 0.3950 -0.40713 0.000 0.564 0.432 0.000 0.004 0.000
#> SRR1080391 4 0.2553 0.74651 0.144 0.000 0.008 0.848 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0146 0.81070 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0622 0.80398 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.1003 0.79420 0.000 0.964 0.020 0.000 0.016 0.000
#> SRR1070060 1 0.0632 0.94108 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.1563 0.79265 0.000 0.932 0.056 0.000 0.012 0.000
#> SRR1417851 1 0.2558 0.80945 0.840 0.000 0.004 0.156 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0865 0.93253 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0146 0.94668 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.2994 0.58084 0.000 0.788 0.208 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.1151 0.80109 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1366605 2 0.0777 0.80853 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.1588 0.78423 0.000 0.924 0.072 0.000 0.004 0.000
#> SRR1436840 2 0.0146 0.81070 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0508 0.81062 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375394 5 0.1152 0.72713 0.000 0.000 0.044 0.004 0.952 0.000
#> SRR1431735 1 0.1007 0.92928 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.2213 0.86282 0.888 0.000 0.008 0.100 0.004 0.000
#> SRR1445984 1 0.3812 0.59107 0.712 0.000 0.016 0.268 0.004 0.000
#> SRR1370447 4 0.1168 0.73161 0.016 0.000 0.028 0.956 0.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.3672 -0.14089 0.000 0.632 0.368 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 3 0.3804 0.80887 0.000 0.424 0.576 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0146 0.81091 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0146 0.80913 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2355 0.76498 0.112 0.000 0.008 0.876 0.004 0.000
#> SRR1319584 2 0.3852 -0.14984 0.000 0.612 0.384 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486584 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.2070 0.76821 0.092 0.000 0.012 0.896 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0291 0.81070 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.1075 0.92537 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0405 0.80904 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0790 0.80220 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0260 0.81113 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.2538 0.64964 0.000 0.860 0.124 0.000 0.016 0.000
#> SRR1079543 2 0.0260 0.81162 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0790 0.80619 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.2416 0.65498 0.000 0.844 0.156 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335314 4 0.0547 0.71330 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.3866 0.73662 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.1556 0.89529 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.1151 0.80420 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0146 0.94672 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.3619 0.50349 0.680 0.000 0.004 0.316 0.000 0.000
#> SRR1445023 4 0.2170 0.76944 0.100 0.000 0.012 0.888 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.3409 0.23677 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0508 0.94271 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.1075 0.79343 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 5 0.3464 0.76723 0.000 0.000 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1436949 2 0.0914 0.79969 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000
#> SRR1070429 3 0.3867 0.72581 0.000 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.1297 0.70575 0.000 0.000 0.040 0.948 0.012 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.3584 0.78511 0.000 0.308 0.688 0.000 0.004 0.000
#> SRR1385434 4 0.0984 0.72907 0.008 0.000 0.012 0.968 0.012 0.000
#> SRR1415591 3 0.3864 0.74168 0.000 0.480 0.520 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0363 0.94597 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.3191 0.70649 0.164 0.000 0.012 0.812 0.012 0.000
#> SRR1308734 2 0.3979 -0.51368 0.000 0.540 0.456 0.000 0.004 0.000
#> SRR1498973 2 0.0914 0.79969 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000
#> SRR1397115 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.1524 0.90686 0.932 0.000 0.008 0.060 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.3309 0.31165 0.000 0.720 0.280 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.3944 -0.36268 0.000 0.568 0.428 0.000 0.004 0.000
#> SRR809919 1 0.0790 0.93535 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1370818 4 0.3628 0.60950 0.268 0.000 0.008 0.720 0.004 0.000
#> SRR1323651 2 0.3351 0.29353 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0458 0.94475 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.3986 -0.32598 0.000 0.532 0.464 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091230 2 0.3330 0.30215 0.000 0.716 0.284 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.3828 0.79816 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317731 3 0.3967 0.81631 0.000 0.356 0.632 0.000 0.012 0.000
#> SRR1490785 1 0.0363 0.94597 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0632 0.94039 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0603 0.81075 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397312 2 0.1124 0.80292 0.000 0.956 0.036 0.000 0.008 0.000
#> SRR812128 2 0.2902 0.61023 0.000 0.800 0.196 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101513 1 0.1957 0.86749 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.3464 0.19990 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.3634 0.81754 0.000 0.356 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.1398 0.79612 0.000 0.940 0.052 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480263 2 0.0260 0.81125 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3699 0.80880 0.000 0.336 0.660 0.000 0.004 0.000
#> SRR1076801 1 0.3488 0.69384 0.764 0.000 0.016 0.216 0.004 0.000
#> SRR1080044 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.2632 0.79668 0.832 0.000 0.004 0.164 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.1151 0.79378 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1068929 2 0.0146 0.81108 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.1500 0.79394 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012 0.000
#> SRR1075054 2 0.0622 0.80911 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0458 0.94386 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1417023 4 0.1426 0.73146 0.016 0.000 0.028 0.948 0.008 0.000
#> SRR1309333 2 0.1075 0.79343 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.1926 0.76737 0.068 0.000 0.020 0.912 0.000 0.000
#> SRR1413137 4 0.1926 0.76737 0.068 0.000 0.020 0.912 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.1333 0.79682 0.000 0.944 0.048 0.000 0.008 0.000
#> SRR1420026 2 0.0790 0.80619 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.3490 0.61243 0.724 0.000 0.008 0.268 0.000 0.000
#> SRR1416266 4 0.0713 0.71240 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2597 0.71417 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.3409 0.23677 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.2234 0.84277 0.872 0.000 0.004 0.124 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.3578 0.81118 0.000 0.340 0.660 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0632 0.94106 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.3912 0.80902 0.000 0.340 0.648 0.000 0.012 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0260 0.81113 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.2538 0.64964 0.000 0.860 0.124 0.000 0.016 0.000
#> SRR1312147 1 0.3037 0.76167 0.808 0.000 0.016 0.176 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.2912 0.72365 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.1714 0.75003 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470988 4 0.2019 0.77119 0.088 0.000 0.012 0.900 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0146 0.81091 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.1908 0.75072 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313770 3 0.3940 0.81362 0.000 0.348 0.640 0.000 0.012 0.000
#> SRR1315780 2 0.0713 0.80643 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1765 0.88145 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.1913 0.77373 0.000 0.908 0.080 0.000 0.012 0.000
#> SRR1464494 2 0.1151 0.80135 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1357083 3 0.3867 0.72581 0.000 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0146 0.81070 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0363 0.94485 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.3868 -0.67943 0.000 0.504 0.496 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0260 0.94584 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1348885 5 0.0713 0.73296 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.2730 0.73682 0.152 0.000 0.012 0.836 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.2118 0.74739 0.000 0.888 0.104 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401040 3 0.3851 0.77507 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.1007 0.92944 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.0547 0.71330 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.1075 0.79343 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.2581 0.82635 0.860 0.000 0.020 0.120 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.3647 0.81817 0.000 0.360 0.640 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.1075 0.79343 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.1141 0.91700 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.3851 0.77333 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.3390 0.25386 0.000 0.704 0.296 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 5 0.2136 0.67997 0.000 0.000 0.048 0.048 0.904 0.000
#> SRR1309314 5 0.3795 0.73848 0.000 0.004 0.364 0.000 0.632 0.000
#> SRR1420085 2 0.1500 0.79272 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012 0.000
#> SRR1361308 3 0.3797 0.81027 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.3862 -0.12624 0.000 0.608 0.388 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.1151 0.79378 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.1204 0.91646 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.3860 -0.60431 0.000 0.528 0.472 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.3464 0.18303 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.3409 0.23677 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0603 0.81017 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004 0.000
#> SRR812294 4 0.1584 0.76992 0.064 0.000 0.008 0.928 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0547 0.94359 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0146 0.81111 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0405 0.80776 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR1390143 1 0.0790 0.93736 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0777 0.80838 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099570 3 0.3862 0.75128 0.000 0.476 0.524 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0632 0.94077 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.2092 0.85256 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.2326 0.76238 0.092 0.000 0.008 0.888 0.012 0.000
#> SRR1447893 2 0.3860 -0.60612 0.000 0.528 0.472 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.1967 0.76846 0.000 0.904 0.084 0.000 0.012 0.000
#> SRR1477429 1 0.3789 0.22170 0.584 0.000 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.3828 0.79816 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.1701 0.78298 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1007 0.93000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.1610 0.76014 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.4305 0.62708 0.232 0.000 0.044 0.712 0.012 0.000
#> SRR1355769 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.1225 0.80015 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012 0.000
#> SRR1474485 1 0.4178 0.12834 0.560 0.000 0.008 0.428 0.004 0.000
#> SRR1089998 1 0.0547 0.94268 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.3860 -0.60431 0.000 0.528 0.472 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.1501 0.76702 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3854 0.77287 0.000 0.464 0.536 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.2941 0.72186 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.3862 -0.16547 0.000 0.608 0.388 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358161 2 0.3944 -0.36268 0.000 0.568 0.428 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0914 0.79725 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000
#> SRR1452010 1 0.0937 0.93089 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.3126 0.43338 0.000 0.752 0.248 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.3867 0.72581 0.000 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.3592 0.81339 0.000 0.344 0.656 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3797 0.81167 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0865 0.93346 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0405 0.80776 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR1441443 2 0.1500 0.79277 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012 0.000
#> SRR1370682 3 0.3405 0.75126 0.000 0.272 0.724 0.000 0.004 0.000
#> SRR1475448 2 0.3857 -0.59081 0.000 0.532 0.468 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0260 0.94647 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0260 0.94661 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.3290 0.46749 0.000 0.744 0.252 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325794 2 0.1753 0.77004 0.000 0.912 0.084 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095961 3 0.3817 0.80317 0.000 0.432 0.568 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.3795 -0.08718 0.000 0.632 0.364 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457527 3 0.3668 0.80286 0.000 0.328 0.668 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3854 0.77287 0.000 0.464 0.536 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.1518 0.74269 0.024 0.000 0.024 0.944 0.008 0.000
#> SRR1454695 1 0.2163 0.86776 0.892 0.000 0.008 0.096 0.004 0.000
#> SRR1090241 2 0.1714 0.73866 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0291 0.81093 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0458 0.94313 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.3743 0.71950 0.000 0.252 0.724 0.000 0.024 0.000
#> SRR1309182 1 0.0260 0.94647 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3790 0.59466 0.716 0.000 0.016 0.264 0.004 0.000
#> SRR1084742 2 0.1151 0.79378 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1433538 1 0.0260 0.94625 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.1225 0.80172 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012 0.000
#> SRR1454247 2 0.1003 0.79420 0.000 0.964 0.020 0.000 0.016 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3409 0.23677 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.3833 0.58018 0.708 0.000 0.016 0.272 0.004 0.000
#> SRR1070332 2 0.0820 0.79954 0.000 0.972 0.016 0.000 0.012 0.000
#> SRR1320761 2 0.2482 0.68089 0.000 0.848 0.148 0.000 0.004 0.000
#> SRR1076195 4 0.1116 0.71696 0.004 0.000 0.028 0.960 0.008 0.000
#> SRR1069895 2 0.3428 0.21913 0.000 0.696 0.304 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 4 0.4384 0.55666 0.296 0.000 0.028 0.664 0.012 0.000
#> SRR1385150 3 0.3869 0.68879 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3213 0.68042 0.204 0.000 0.008 0.784 0.004 0.000
#> SRR1102583 1 0.0146 0.94668 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.3855 0.57333 0.704 0.000 0.016 0.276 0.004 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0790 0.80220 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.3930 -0.33336 0.000 0.576 0.420 0.000 0.004 0.000
#> SRR1408553 4 0.1926 0.76737 0.068 0.000 0.020 0.912 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0363 0.94540 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0363 0.81087 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0458 0.94418 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0260 0.81044 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.3076 0.46111 0.000 0.760 0.240 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.1434 0.79733 0.000 0.940 0.048 0.000 0.012 0.000
#> SRR808299 2 0.1219 0.79925 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098050 2 0.1151 0.79378 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1481238 2 0.1151 0.80109 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1443568 2 0.3221 0.39372 0.000 0.736 0.264 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380249 4 0.1624 0.76016 0.044 0.000 0.008 0.936 0.012 0.000
#> SRR1080143 1 0.0458 0.94440 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.1518 0.74269 0.024 0.000 0.024 0.944 0.008 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0146 0.81070 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.1500 0.79356 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012 0.000
#> SRR813283 1 0.0547 0.94268 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0547 0.94268 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.3558 0.77050 0.000 0.000 0.248 0.000 0.736 0.016
#> SRR807679 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.3979 -0.51835 0.000 0.540 0.456 0.000 0.004 0.000
#> SRR1078660 2 0.1204 0.79301 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0260 0.81113 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0508 0.94271 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.3915 0.54503 0.692 0.000 0.016 0.288 0.004 0.000
#> SRR1418041 1 0.0865 0.93371 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0146 0.94672 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.2062 0.87593 0.900 0.000 0.008 0.088 0.004 0.000
#> SRR1350958 2 0.0993 0.80689 0.000 0.964 0.024 0.000 0.012 0.000
#> SRR1396822 2 0.3464 0.18303 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0146 0.81070 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.3866 0.73473 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.3867 0.72581 0.000 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0713 0.93913 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.2416 0.65498 0.000 0.844 0.156 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.3833 0.58018 0.708 0.000 0.016 0.272 0.004 0.000
#> SRR1409171 2 0.0146 0.81091 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.1970 0.76261 0.000 0.900 0.092 0.000 0.008 0.000
#> SRR1430045 2 0.0363 0.81108 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1411 0.79552 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1384091 4 0.2446 0.75669 0.124 0.000 0.012 0.864 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0713 0.71240 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.1168 0.79320 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016 0.000
#> SRR1369514 4 0.3774 0.43062 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.3797 0.81167 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.3955 -0.02750 0.000 0.608 0.384 0.000 0.008 0.000
#> SRR1091767 2 0.2593 0.68275 0.000 0.844 0.148 0.000 0.008 0.000
#> SRR1354467 3 0.3857 0.76294 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.3221 0.37645 0.000 0.736 0.264 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0865 0.80405 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.3769 0.81753 0.000 0.356 0.640 0.000 0.004 0.000
#> SRR1419736 2 0.1003 0.79420 0.000 0.964 0.020 0.000 0.016 0.000
#> SRR1313343 3 0.3782 0.81433 0.000 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.4100 0.45515 0.388 0.000 0.008 0.600 0.004 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.3950 -0.40713 0.000 0.564 0.432 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354999 2 0.3390 0.26233 0.000 0.704 0.296 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0790 0.93584 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.3989 -0.35008 0.000 0.528 0.468 0.000 0.004 0.000
#> SRR1413182 4 0.1524 0.76886 0.060 0.000 0.008 0.932 0.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.3716 0.62836 0.248 0.000 0.008 0.732 0.012 0.000
#> SRR1413075 2 0.1074 0.80296 0.000 0.960 0.028 0.000 0.012 0.000
#> SRR1487928 4 0.1230 0.72277 0.008 0.000 0.028 0.956 0.008 0.000
#> SRR1388997 2 0.1333 0.79680 0.000 0.944 0.048 0.000 0.008 0.000
#> SRR1092865 2 0.1327 0.77793 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.2260 0.83545 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.2020 0.75698 0.000 0.896 0.096 0.000 0.008 0.000
#> SRR1376874 3 0.3426 0.75603 0.000 0.276 0.720 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339903 1 0.0363 0.94572 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0777 0.80838 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095358 2 0.1563 0.78933 0.000 0.932 0.056 0.000 0.012 0.000
#> SRR1480941 3 0.5782 0.00542 0.000 0.176 0.424 0.000 0.400 0.000
#> SRR1479175 2 0.0146 0.80913 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0891 0.80912 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR1491354 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.1075 0.79343 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0146 0.81070 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.3198 0.39469 0.000 0.740 0.260 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0146 0.94653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0363 0.81099 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0146 0.81070 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.3797 0.81153 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0458 0.94442 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.3098 0.48955 0.000 0.164 0.812 0.000 0.024 0.000
#> SRR1455989 2 0.3684 -0.15048 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.3448 0.75992 0.000 0.280 0.716 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470356 2 0.1124 0.80528 0.000 0.956 0.036 0.000 0.008 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0790 0.80220 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0790 0.93584 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.3508 0.77153 0.000 0.292 0.704 0.000 0.004 0.000
#> SRR821282 3 0.3426 0.75603 0.000 0.276 0.720 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074602 2 0.3409 0.23677 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.81029 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4795 0.02840 0.000 0.176 0.672 0.000 0.152 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.3828 0.79816 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.3702 0.60152 0.264 0.000 0.012 0.720 0.004 0.000
#> SRR1444598 5 0.3795 0.73848 0.000 0.004 0.364 0.000 0.632 0.000
#> SRR1091743 2 0.3409 0.23868 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.94698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.3499 0.15084 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 3 0.3789 0.81157 0.000 0.416 0.584 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0146 0.94672 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0363 0.94597 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1323470 6 0.0937 0.95082 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR814657 1 0.0363 0.94585 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.997 0.999 0.4915 0.509 0.509
#> 3 3 0.786 0.853 0.846 0.2294 0.845 0.695
#> 4 4 0.667 0.726 0.806 0.1227 0.880 0.685
#> 5 5 0.596 0.779 0.787 0.0832 0.895 0.672
#> 6 6 0.731 0.700 0.788 0.0632 0.992 0.967
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.722 0.750 0.200 0.800
#> SRR1431735 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1315291 2 0.978 0.301 0.412 0.588
#> SRR1309314 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1467726 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR815446 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1402132 1 0.6095 0.7210 0.608 0.392 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR809406 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0747 0.9147 0.984 0.016 0.000
#> SRR1387899 3 0.3116 0.6844 0.000 0.108 0.892
#> SRR1442292 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1378308 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1366919 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1380122 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.2066 0.8988 0.940 0.060 0.000
#> SRR1464880 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1078368 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1349608 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1466951 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1331879 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1320034 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 3 0.6252 -0.6994 0.000 0.444 0.556
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1374005 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3879 0.8554 0.848 0.152 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1077992 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.3038 0.6942 0.000 0.104 0.896
#> SRR1097857 1 0.0237 0.9183 0.996 0.004 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1071207 1 0.4346 0.8383 0.816 0.184 0.000
#> SRR1486821 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0237 0.9183 0.996 0.004 0.000
#> SRR1408788 3 0.0747 0.8331 0.000 0.016 0.984
#> SRR1359487 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1365722 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1448118 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1444808 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1321829 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1475993 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.4605 0.8282 0.796 0.204 0.000
#> SRR1453769 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 3 0.6299 -0.7978 0.000 0.476 0.524
#> SRR1366124 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1289 0.9090 0.968 0.032 0.000
#> SRR1086490 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1404577 1 0.6140 0.7128 0.596 0.404 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.6235 0.9831 0.000 0.564 0.436
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR814515 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1357999 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1344034 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1347870 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR814028 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR814219 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1418346 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1070060 1 0.0592 0.9159 0.988 0.012 0.000
#> SRR1487969 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1417851 1 0.2796 0.8849 0.908 0.092 0.000
#> SRR1443350 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 3 0.3038 0.6947 0.000 0.104 0.896
#> SRR1102923 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1369560 2 0.6309 0.8583 0.000 0.500 0.500
#> SRR1366605 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1396035 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1390223 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1436840 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1445573 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1375394 3 0.8515 0.1992 0.092 0.432 0.476
#> SRR1431735 1 0.0592 0.9159 0.988 0.012 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1446308 3 0.3038 0.6982 0.000 0.104 0.896
#> SRR1437346 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1319584 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1317939 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.4654 0.8259 0.792 0.208 0.000
#> SRR1399178 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1453259 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1340828 2 0.6295 0.9112 0.000 0.528 0.472
#> SRR1079543 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR816427 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1076681 3 0.6111 -0.5030 0.000 0.396 0.604
#> SRR1335314 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1400799 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.1163 0.9105 0.972 0.028 0.000
#> SRR1312226 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.5138 0.8023 0.748 0.252 0.000
#> SRR1445023 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1077599 3 0.6305 -0.8097 0.000 0.484 0.516
#> SRR1453480 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1101834 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1321744 1 0.0892 0.9133 0.980 0.020 0.000
#> SRR1074839 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1458727 3 0.0424 0.8432 0.000 0.008 0.992
#> SRR1436949 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1070429 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1415591 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1308734 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.6267 0.9577 0.000 0.548 0.452
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.1529 0.9061 0.960 0.040 0.000
#> SRR814341 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1313601 3 0.6215 -0.6365 0.000 0.428 0.572
#> SRR1459609 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1499325 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1323651 3 0.3116 0.6844 0.000 0.108 0.892
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0237 0.8479 0.000 0.004 0.996
#> SRR1091230 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1470556 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR812318 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1397312 3 0.6252 -0.6996 0.000 0.444 0.556
#> SRR812128 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1316033 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1480263 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1464473 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.1529 0.9061 0.960 0.040 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1068929 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1490097 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1075054 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1309333 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1333676 1 0.0592 0.9160 0.988 0.012 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1413137 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1469973 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1420026 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR817306 1 0.1411 0.9074 0.964 0.036 0.000
#> SRR1416266 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1071011 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1090290 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1435394 3 0.5497 0.0190 0.000 0.292 0.708
#> SRR1383192 1 0.1289 0.9095 0.968 0.032 0.000
#> SRR1419962 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1351082 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1397348 2 0.6309 0.8566 0.000 0.504 0.496
#> SRR1312147 1 0.1643 0.9048 0.956 0.044 0.000
#> SRR1473891 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1335470 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1474930 2 0.6274 0.9484 0.000 0.544 0.456
#> SRR1470988 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR811915 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1444436 2 0.6267 0.9578 0.000 0.548 0.452
#> SRR1313770 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0747 0.9147 0.984 0.016 0.000
#> SRR1310997 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1464494 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1357083 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.0424 0.8432 0.000 0.008 0.992
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1345692 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1401040 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.6215 0.6970 0.572 0.428 0.000
#> SRR1454073 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1355747 1 0.1289 0.9090 0.968 0.032 0.000
#> SRR1429368 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR817142 3 0.6295 -0.7768 0.000 0.472 0.528
#> SRR1315291 3 0.8515 0.1992 0.092 0.432 0.476
#> SRR1309314 3 0.0424 0.8432 0.000 0.008 0.992
#> SRR1420085 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1361308 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0424 0.9172 0.992 0.008 0.000
#> SRR1096760 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 3 0.5465 0.0473 0.000 0.288 0.712
#> SRR1330813 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1458931 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR812294 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1469704 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1086752 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1084698 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1390143 1 0.0747 0.9147 0.984 0.016 0.000
#> SRR1390413 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1099570 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.4654 0.8265 0.792 0.208 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1447893 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1477429 1 0.6008 0.7327 0.628 0.372 0.000
#> SRR1445701 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1452537 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1391985 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 3 0.4178 0.5233 0.000 0.172 0.828
#> SRR1474485 1 0.5760 0.7586 0.672 0.328 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.5859 0.7496 0.656 0.344 0.000
#> SRR1325578 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1333971 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1452010 1 0.0424 0.9171 0.992 0.008 0.000
#> SRR1418183 3 0.5859 -0.2737 0.000 0.344 0.656
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1333038 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1441443 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1370682 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 3 0.6295 -0.7855 0.000 0.472 0.528
#> SRR1325794 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1095961 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1320806 3 0.6291 -0.7703 0.000 0.468 0.532
#> SRR1457527 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1474374 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1454695 1 0.2625 0.8877 0.916 0.084 0.000
#> SRR1090241 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1329863 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1289 0.9090 0.968 0.032 0.000
#> SRR1084742 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1454247 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1097100 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR818622 2 0.6286 0.9332 0.000 0.536 0.464
#> SRR1072388 1 0.0592 0.9161 0.988 0.012 0.000
#> SRR1070332 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1320761 3 0.5785 -0.2314 0.000 0.332 0.668
#> SRR1076195 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1069895 3 0.0592 0.8382 0.000 0.012 0.988
#> SRR1099144 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1385150 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1332625 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.1529 0.9061 0.960 0.040 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1099330 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1077874 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR808299 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1098050 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1481238 3 0.5678 -0.1428 0.000 0.316 0.684
#> SRR1443568 3 0.5254 0.1758 0.000 0.264 0.736
#> SRR1380249 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1431015 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1078709 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR813283 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1347707 3 0.2165 0.7621 0.000 0.064 0.936
#> SRR807679 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1331730 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.1529 0.9061 0.960 0.040 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1396822 3 0.5621 -0.0695 0.000 0.308 0.692
#> SRR1441934 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1472552 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 3 0.6126 -0.5193 0.000 0.400 0.600
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.5138 0.8021 0.748 0.252 0.000
#> SRR1409171 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR809113 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1430045 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1441245 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1384091 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1431887 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1096525 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1488491 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1356351 2 0.6307 0.8883 0.000 0.512 0.488
#> SRR1369514 1 0.5431 0.7849 0.716 0.284 0.000
#> SRR1453299 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.6295 0.9226 0.000 0.528 0.472
#> SRR1091767 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1354467 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1452399 2 0.6280 0.9444 0.000 0.540 0.460
#> SRR1437430 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1313343 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.6309 0.8606 0.000 0.504 0.496
#> SRR1443592 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0237 0.8479 0.000 0.004 0.996
#> SRR1413182 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1464559 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1413075 2 0.6286 0.9373 0.000 0.536 0.464
#> SRR1487928 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1388997 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1092865 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1102729 1 0.1860 0.9021 0.948 0.052 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1376874 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1095358 2 0.6307 0.8875 0.000 0.512 0.488
#> SRR1480941 3 0.0424 0.8432 0.000 0.008 0.992
#> SRR1479175 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1313891 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1471074 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1353052 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1355554 3 0.5397 0.0892 0.000 0.280 0.720
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1318331 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1321333 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0237 0.8479 0.000 0.004 0.996
#> SRR1455989 3 0.3116 0.6872 0.000 0.108 0.892
#> SRR1453680 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1342977 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1444222 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR821282 3 0.0237 0.8479 0.000 0.004 0.996
#> SRR1074602 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR814633 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR1072480 3 0.0424 0.8432 0.000 0.008 0.992
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.6204 0.7003 0.576 0.424 0.000
#> SRR1444598 3 0.0237 0.8479 0.000 0.004 0.996
#> SRR1091743 2 0.6225 0.9892 0.000 0.568 0.432
#> SRR819637 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.1289 0.8123 0.000 0.032 0.968
#> SRR1459785 3 0.0000 0.8520 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.2448 0.8898 0.924 0.076 0.000
#> SRR1323470 3 0.0424 0.8432 0.000 0.008 0.992
#> SRR814657 1 0.0000 0.9194 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.2751 0.6824 0.056 0.000 0.040 0.904
#> SRR1326059 1 0.5708 0.8415 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1409062 2 0.1388 0.8423 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR809406 1 0.5592 0.8514 0.572 0.000 0.024 0.404
#> SRR1465313 3 0.7684 0.6657 0.360 0.220 0.420 0.000
#> SRR819559 1 0.6134 0.8012 0.508 0.000 0.048 0.444
#> SRR1387899 3 0.4957 0.8079 0.016 0.300 0.684 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.4804 0.8600 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1395635 1 0.7179 0.7085 0.480 0.000 0.140 0.380
#> SRR1343629 1 0.4790 0.8596 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1326868 2 0.1388 0.8417 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR1102320 1 0.5716 0.8405 0.552 0.000 0.028 0.420
#> SRR1469926 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1070036 1 0.7075 0.7195 0.488 0.000 0.128 0.384
#> SRR1098426 1 0.7186 0.7057 0.476 0.000 0.140 0.384
#> SRR1090310 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1429748 1 0.5808 0.8333 0.544 0.000 0.032 0.424
#> SRR1363654 1 0.5628 0.8437 0.556 0.000 0.024 0.420
#> SRR1326317 2 0.1388 0.8423 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1211 0.7270 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1329947 1 0.5352 0.8591 0.596 0.000 0.016 0.388
#> SRR1469769 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.7702 0.6608 0.360 0.224 0.416 0.000
#> SRR1402944 3 0.7702 0.6608 0.360 0.224 0.416 0.000
#> SRR1092818 1 0.7179 0.7085 0.480 0.000 0.140 0.380
#> SRR1093552 4 0.7259 -0.3913 0.352 0.000 0.156 0.492
#> SRR1464880 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1068687 2 0.6917 0.3167 0.288 0.568 0.144 0.000
#> SRR1437491 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1310777 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.4978 0.8600 0.612 0.000 0.004 0.384
#> SRR1329994 4 0.5538 -0.1870 0.320 0.000 0.036 0.644
#> SRR1354203 1 0.4964 0.8598 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1077850 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.5660 0.8578 0.576 0.000 0.028 0.396
#> SRR1092014 3 0.7896 0.5361 0.352 0.292 0.356 0.000
#> SRR1097857 1 0.5957 0.8368 0.540 0.000 0.040 0.420
#> SRR1473318 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1345974 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.6501 -0.1084 0.268 0.000 0.116 0.616
#> SRR1486821 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1418540 1 0.7206 0.6872 0.460 0.000 0.140 0.400
#> SRR1408788 3 0.5713 0.7534 0.040 0.340 0.620 0.000
#> SRR1359487 4 0.1302 0.7266 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1080648 1 0.7143 0.7129 0.484 0.000 0.136 0.380
#> SRR1414708 1 0.7197 0.7021 0.468 0.000 0.140 0.392
#> SRR1469080 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1321829 2 0.1488 0.8389 0.012 0.956 0.032 0.000
#> SRR1475993 3 0.4248 0.8924 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1445387 1 0.5487 0.8547 0.580 0.000 0.020 0.400
#> SRR1077575 2 0.5167 0.5204 0.340 0.644 0.016 0.000
#> SRR1349300 1 0.5708 0.8415 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1374165 4 0.6555 0.2574 0.212 0.000 0.156 0.632
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.5792 0.8386 0.552 0.000 0.032 0.416
#> SRR1401146 2 0.6835 0.3240 0.316 0.560 0.124 0.000
#> SRR1366124 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1391811 1 0.5099 0.8578 0.612 0.000 0.008 0.380
#> SRR1456674 4 0.7340 -0.5574 0.408 0.000 0.156 0.436
#> SRR1086490 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.2399 0.6595 0.048 0.000 0.032 0.920
#> SRR1384431 1 0.5865 0.8478 0.552 0.000 0.036 0.412
#> SRR1072055 1 0.7254 0.6949 0.468 0.000 0.148 0.384
#> SRR1359738 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1332141 1 0.5099 0.8578 0.612 0.000 0.008 0.380
#> SRR1085900 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1431625 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.5167 0.5204 0.340 0.644 0.016 0.000
#> SRR1344034 3 0.6908 0.7990 0.188 0.220 0.592 0.000
#> SRR1080391 4 0.1022 0.7256 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1347870 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.1022 0.8531 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1102128 1 0.5724 0.8372 0.548 0.000 0.028 0.424
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.5057 0.5270 0.340 0.648 0.012 0.000
#> SRR1070060 1 0.5833 0.8149 0.528 0.000 0.032 0.440
#> SRR1487969 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1417851 4 0.7203 -0.3163 0.312 0.000 0.164 0.524
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.7192 0.7066 0.472 0.000 0.140 0.388
#> SRR1076705 1 0.7254 0.6949 0.468 0.000 0.148 0.384
#> SRR1079380 1 0.7909 -0.7159 0.364 0.324 0.312 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.6054 0.4263 0.352 0.592 0.056 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.5839 0.3448 0.292 0.000 0.060 0.648
#> SRR1431735 1 0.7282 0.6349 0.436 0.000 0.148 0.416
#> SRR1417387 1 0.7231 0.6872 0.464 0.000 0.144 0.392
#> SRR1445984 1 0.7260 0.6882 0.464 0.000 0.148 0.388
#> SRR1370447 4 0.1118 0.7233 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1446308 3 0.4744 0.8319 0.012 0.284 0.704 0.000
#> SRR1437346 3 0.3982 0.8909 0.004 0.220 0.776 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.7179 0.7085 0.480 0.000 0.140 0.380
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.4978 0.8595 0.612 0.000 0.004 0.384
#> SRR1468914 4 0.1211 0.7270 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1319584 3 0.7702 0.6608 0.360 0.224 0.416 0.000
#> SRR1486584 1 0.5620 0.8441 0.560 0.000 0.024 0.416
#> SRR813536 4 0.0469 0.7114 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1317939 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.5112 0.8602 0.608 0.000 0.008 0.384
#> SRR1341921 4 0.5279 0.1815 0.252 0.000 0.044 0.704
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.4804 0.8600 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1328551 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.5386 0.5008 0.344 0.632 0.024 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.4214 0.5900 0.016 0.780 0.204 0.000
#> SRR1335314 4 0.1211 0.7270 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1400799 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1074578 1 0.5861 0.7448 0.492 0.000 0.032 0.476
#> SRR1312226 2 0.4564 0.5601 0.328 0.672 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1447371 1 0.5326 0.8546 0.604 0.000 0.016 0.380
#> SRR1069328 4 0.4692 0.3375 0.212 0.000 0.032 0.756
#> SRR1445023 4 0.1211 0.7270 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1077599 2 0.3978 0.6276 0.012 0.796 0.192 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.7249 0.6414 0.444 0.000 0.144 0.412
#> SRR1074839 2 0.0657 0.8609 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1458727 3 0.7650 0.6622 0.364 0.212 0.424 0.000
#> SRR1436949 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1458158 1 0.5620 0.8441 0.560 0.000 0.024 0.416
#> SRR1432408 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1310334 1 0.5548 0.8570 0.588 0.000 0.024 0.388
#> SRR1418201 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1385434 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1415591 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1402009 1 0.5376 0.8617 0.588 0.000 0.016 0.396
#> SRR1316055 4 0.1716 0.7216 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1308734 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1498973 2 0.5057 0.5270 0.340 0.648 0.012 0.000
#> SRR1397115 1 0.5628 0.8437 0.556 0.000 0.024 0.420
#> SRR1392141 4 0.7332 -0.5191 0.396 0.000 0.156 0.448
#> SRR814341 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.4770 0.4053 0.012 0.700 0.288 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.4853 0.8880 0.036 0.220 0.744 0.000
#> SRR809919 1 0.5352 0.8558 0.596 0.000 0.016 0.388
#> SRR1370818 4 0.1389 0.7264 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1323651 3 0.5110 0.7709 0.016 0.328 0.656 0.000
#> SRR1357297 1 0.5800 0.8373 0.548 0.000 0.032 0.420
#> SRR818170 3 0.7688 0.6633 0.364 0.220 0.416 0.000
#> SRR1091230 2 0.1677 0.8329 0.012 0.948 0.040 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1095285 3 0.4364 0.8924 0.016 0.220 0.764 0.000
#> SRR1317731 3 0.7093 0.7803 0.212 0.220 0.568 0.000
#> SRR1490785 1 0.5560 0.8607 0.584 0.000 0.024 0.392
#> SRR1432032 1 0.7036 0.7293 0.492 0.000 0.124 0.384
#> SRR1447808 1 0.5708 0.8415 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR809534 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.6949 0.2399 0.348 0.528 0.124 0.000
#> SRR812128 2 0.2216 0.8072 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.5700 0.8449 0.560 0.000 0.028 0.412
#> SRR1415708 2 0.1388 0.8416 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR1316033 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1076801 4 0.7332 -0.5191 0.396 0.000 0.156 0.448
#> SRR1080044 1 0.4978 0.8600 0.612 0.000 0.004 0.384
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.5971 0.8295 0.532 0.000 0.040 0.428
#> SRR1069871 1 0.5536 0.8581 0.592 0.000 0.024 0.384
#> SRR1095744 2 0.5167 0.5204 0.340 0.644 0.016 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.5099 0.8578 0.612 0.000 0.008 0.380
#> SRR1075458 1 0.7186 0.7057 0.476 0.000 0.140 0.384
#> SRR1417023 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1309333 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.5827 0.8198 0.532 0.000 0.032 0.436
#> SRR1352996 1 0.5708 0.8415 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1093172 4 0.0817 0.7197 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1413137 4 0.0469 0.7147 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1469973 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.5937 -0.7144 0.472 0.000 0.036 0.492
#> SRR1416266 4 0.1118 0.7233 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.1211 0.7270 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1435394 2 0.5407 -0.3680 0.012 0.504 0.484 0.000
#> SRR1383192 1 0.5838 0.8089 0.524 0.000 0.032 0.444
#> SRR1419962 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1094357 1 0.5638 0.8598 0.584 0.000 0.028 0.388
#> SRR1081639 3 0.4574 0.8915 0.024 0.220 0.756 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.5511 0.4801 0.352 0.620 0.028 0.000
#> SRR1312147 4 0.7323 -0.5085 0.388 0.000 0.156 0.456
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.1452 0.6933 0.008 0.000 0.036 0.956
#> SRR1474930 2 0.1975 0.8205 0.016 0.936 0.048 0.000
#> SRR1470988 4 0.1118 0.7233 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR811915 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.5220 0.5090 0.352 0.632 0.016 0.000
#> SRR1313770 3 0.5397 0.8747 0.064 0.220 0.716 0.000
#> SRR1315780 2 0.0817 0.8563 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.5112 0.8602 0.608 0.000 0.008 0.384
#> SRR819124 1 0.5833 0.8135 0.528 0.000 0.032 0.440
#> SRR1310997 2 0.5186 0.5180 0.344 0.640 0.016 0.000
#> SRR1464494 2 0.5186 0.5180 0.344 0.640 0.016 0.000
#> SRR1357083 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1475842 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.5256 0.8625 0.596 0.000 0.012 0.392
#> SRR1378220 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1467704 1 0.7186 0.7057 0.476 0.000 0.140 0.384
#> SRR1348885 3 0.7670 0.6631 0.364 0.216 0.420 0.000
#> SRR1325826 1 0.5571 0.8544 0.580 0.000 0.024 0.396
#> SRR1466812 4 0.0921 0.7219 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1345692 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1097954 1 0.5339 0.8542 0.600 0.000 0.016 0.384
#> SRR1374396 4 0.1211 0.7270 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1454073 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.7252 0.6202 0.436 0.000 0.144 0.420
#> SRR1429368 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1398138 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.7197 0.7021 0.468 0.000 0.140 0.392
#> SRR1361436 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR817142 2 0.4770 0.4123 0.012 0.700 0.288 0.000
#> SRR1315291 4 0.5906 0.3449 0.292 0.000 0.064 0.644
#> SRR1309314 3 0.4635 0.8889 0.028 0.216 0.756 0.000
#> SRR1420085 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1472126 1 0.5620 0.8441 0.560 0.000 0.024 0.416
#> SRR1380482 3 0.7702 0.6608 0.360 0.224 0.416 0.000
#> SRR1099789 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1079480 2 0.5167 0.5204 0.340 0.644 0.016 0.000
#> SRR1339276 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1418368 1 0.5592 0.8512 0.572 0.000 0.024 0.404
#> SRR1399353 1 0.7282 0.6241 0.436 0.000 0.148 0.416
#> SRR1096760 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1440290 3 0.5508 0.4392 0.016 0.476 0.508 0.000
#> SRR1330813 2 0.1284 0.8447 0.012 0.964 0.024 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1302 0.7266 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1394321 1 0.6954 0.7438 0.500 0.000 0.116 0.384
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.5992 0.8052 0.516 0.000 0.040 0.444
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1312169 1 0.5815 0.8296 0.540 0.000 0.032 0.428
#> SRR1096687 4 0.5090 0.2666 0.228 0.000 0.044 0.728
#> SRR1486139 1 0.5326 0.8546 0.604 0.000 0.016 0.380
#> SRR1470313 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1447893 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1466025 2 0.4800 0.5397 0.340 0.656 0.004 0.000
#> SRR1477429 4 0.2596 0.6491 0.068 0.000 0.024 0.908
#> SRR1445701 3 0.4364 0.8883 0.016 0.220 0.764 0.000
#> SRR820689 1 0.4804 0.8600 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1451876 2 0.0336 0.8651 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.5766 0.8552 0.564 0.000 0.032 0.404
#> SRR1489328 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.5560 0.8554 0.584 0.000 0.024 0.392
#> SRR1082709 1 0.5611 0.8466 0.564 0.000 0.024 0.412
#> SRR1447784 4 0.2408 0.7048 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1355769 1 0.5808 0.8342 0.544 0.000 0.032 0.424
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1480917 1 0.7912 -0.7105 0.356 0.336 0.308 0.000
#> SRR1474485 4 0.4424 0.5956 0.088 0.000 0.100 0.812
#> SRR1089998 1 0.5775 0.8491 0.560 0.000 0.032 0.408
#> SRR1318140 1 0.5560 0.8563 0.584 0.000 0.024 0.392
#> SRR1319262 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1095188 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1440374 1 0.4991 0.8607 0.608 0.000 0.004 0.388
#> SRR1359565 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1105417 4 0.2635 0.6363 0.076 0.000 0.020 0.904
#> SRR1325578 3 0.7684 0.6657 0.360 0.220 0.420 0.000
#> SRR1358161 3 0.4853 0.8880 0.036 0.220 0.744 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.5833 0.8149 0.528 0.000 0.032 0.440
#> SRR1418183 2 0.5130 0.2172 0.016 0.652 0.332 0.000
#> SRR1366345 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1387449 1 0.5560 0.8554 0.584 0.000 0.024 0.392
#> SRR1473461 1 0.6061 0.8530 0.552 0.000 0.048 0.400
#> SRR1090837 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1447828 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4364 0.8924 0.016 0.220 0.764 0.000
#> SRR1350280 1 0.5800 0.8373 0.548 0.000 0.032 0.420
#> SRR1088557 1 0.5708 0.8435 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1102656 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1475448 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1407291 1 0.5708 0.8415 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1405266 1 0.5571 0.8574 0.580 0.000 0.024 0.396
#> SRR1363766 1 0.5792 0.8386 0.552 0.000 0.032 0.416
#> SRR1082592 2 0.6083 0.4112 0.360 0.584 0.056 0.000
#> SRR1325794 2 0.5403 0.4997 0.348 0.628 0.024 0.000
#> SRR1095961 3 0.4248 0.8924 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.4163 0.6211 0.020 0.792 0.188 0.000
#> SRR1457527 3 0.4248 0.8924 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3982 0.8918 0.004 0.220 0.776 0.000
#> SRR1488858 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1454695 4 0.7300 -0.4424 0.372 0.000 0.156 0.472
#> SRR1090241 2 0.0657 0.8597 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.5217 0.8561 0.608 0.000 0.012 0.380
#> SRR1362135 1 0.7192 0.7066 0.472 0.000 0.140 0.388
#> SRR1379581 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1309182 1 0.5708 0.8415 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1437668 4 0.7340 -0.5574 0.408 0.000 0.156 0.436
#> SRR1084742 2 0.5186 0.5180 0.344 0.640 0.016 0.000
#> SRR1433538 1 0.5620 0.8441 0.560 0.000 0.024 0.416
#> SRR1085063 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.5167 0.5204 0.340 0.644 0.016 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.2867 0.7596 0.012 0.884 0.104 0.000
#> SRR1072388 4 0.7343 -0.5948 0.420 0.000 0.156 0.424
#> SRR1070332 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.7654 -0.1188 0.352 0.432 0.216 0.000
#> SRR1076195 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1069895 3 0.4284 0.8875 0.012 0.224 0.764 0.000
#> SRR1099144 4 0.3311 0.6555 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1385150 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1102583 1 0.5620 0.8441 0.560 0.000 0.024 0.416
#> SRR1456971 4 0.7323 -0.5085 0.388 0.000 0.156 0.456
#> SRR1340574 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1444830 2 0.1297 0.8466 0.016 0.964 0.020 0.000
#> SRR1096267 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1087127 3 0.7684 0.6657 0.360 0.220 0.420 0.000
#> SRR1408553 4 0.1022 0.7222 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1069231 1 0.6580 0.8205 0.504 0.000 0.080 0.416
#> SRR1325642 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.6766 0.7687 0.520 0.000 0.100 0.380
#> SRR1321942 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1094380 1 0.5326 0.8546 0.604 0.000 0.016 0.380
#> SRR1447499 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1284 0.8447 0.012 0.964 0.024 0.000
#> SRR1077874 2 0.4624 0.5458 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.5167 0.5204 0.340 0.644 0.016 0.000
#> SRR1481238 2 0.7853 -0.3335 0.292 0.400 0.308 0.000
#> SRR1443568 2 0.5387 -0.0773 0.016 0.584 0.400 0.000
#> SRR1380249 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1080143 1 0.5800 0.8373 0.548 0.000 0.032 0.420
#> SRR1383148 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1357042 1 0.5959 0.8399 0.568 0.000 0.044 0.388
#> SRR1416025 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.5428 0.8572 0.600 0.000 0.020 0.380
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.5326 0.8546 0.604 0.000 0.016 0.380
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.8248 0.6330 0.364 0.152 0.444 0.040
#> SRR807679 1 0.7179 0.7085 0.480 0.000 0.140 0.380
#> SRR1333811 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1078660 2 0.3688 0.6984 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.7179 0.7085 0.480 0.000 0.140 0.380
#> SRR1432542 4 0.7323 -0.5085 0.388 0.000 0.156 0.456
#> SRR1418041 1 0.5964 0.8359 0.536 0.000 0.040 0.424
#> SRR1085211 1 0.6090 0.8247 0.564 0.000 0.052 0.384
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.7264 0.6820 0.460 0.000 0.148 0.392
#> SRR1350958 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.5409 0.3966 0.012 0.492 0.496 0.000
#> SRR1441934 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1488881 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1102973 1 0.6520 0.7921 0.536 0.000 0.080 0.384
#> SRR1071131 2 0.4136 0.6034 0.016 0.788 0.196 0.000
#> SRR1074502 1 0.5548 0.8570 0.588 0.000 0.024 0.388
#> SRR1325271 4 0.6531 0.2654 0.204 0.000 0.160 0.636
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.1302 0.7259 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1431887 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.1022 0.7222 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.5882 0.4562 0.344 0.608 0.048 0.000
#> SRR1369514 4 0.4286 0.5004 0.136 0.000 0.052 0.812
#> SRR1453299 3 0.4248 0.8924 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1436300 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1348490 2 0.5368 0.5062 0.340 0.636 0.024 0.000
#> SRR1091767 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1069074 2 0.1174 0.8478 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR1452399 2 0.0524 0.8638 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1437430 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1419736 2 0.5167 0.5204 0.340 0.644 0.016 0.000
#> SRR1313343 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1077619 4 0.2799 0.6820 0.008 0.000 0.108 0.884
#> SRR1083530 1 0.7036 0.7293 0.492 0.000 0.124 0.384
#> SRR1333633 3 0.7490 0.7263 0.284 0.220 0.496 0.000
#> SRR1354999 2 0.4012 0.6380 0.016 0.800 0.184 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.5508 0.8517 0.572 0.000 0.020 0.408
#> SRR1378818 3 0.7688 0.6633 0.364 0.220 0.416 0.000
#> SRR1413182 4 0.1302 0.7266 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1464559 4 0.2469 0.6991 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1413075 2 0.5075 0.5249 0.344 0.644 0.012 0.000
#> SRR1487928 4 0.1302 0.7271 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1388997 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.1182 0.8496 0.016 0.968 0.016 0.000
#> SRR1102729 4 0.6003 -0.6777 0.456 0.000 0.040 0.504
#> SRR1456423 1 0.5138 0.8606 0.600 0.000 0.008 0.392
#> SRR1321591 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1339903 1 0.5628 0.8437 0.556 0.000 0.024 0.420
#> SRR1346710 1 0.7068 0.7216 0.492 0.000 0.128 0.380
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.6121 0.4230 0.352 0.588 0.060 0.000
#> SRR1480941 3 0.7670 0.6631 0.364 0.216 0.420 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.5611 0.8467 0.564 0.000 0.024 0.412
#> SRR1433884 2 0.0657 0.8609 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.5500 -0.3092 0.016 0.520 0.464 0.000
#> SRR1487173 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1474253 1 0.5465 0.8581 0.588 0.000 0.020 0.392
#> SRR1322918 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0188 0.8681 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.3801 0.8914 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1474231 1 0.5781 0.8384 0.584 0.000 0.036 0.380
#> SRR1350545 1 0.5602 0.8516 0.568 0.000 0.024 0.408
#> SRR1091328 1 0.7192 0.7066 0.472 0.000 0.140 0.388
#> SRR814447 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1455989 3 0.5244 0.6720 0.012 0.388 0.600 0.000
#> SRR1453680 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.5716 0.8405 0.552 0.000 0.028 0.420
#> SRR1366729 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR821282 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1074602 2 0.1388 0.8423 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.8694 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.7670 0.6631 0.364 0.216 0.420 0.000
#> SRR1319100 1 0.4978 0.8595 0.612 0.000 0.004 0.384
#> SRR1324004 3 0.4248 0.8898 0.012 0.220 0.768 0.000
#> SRR1457459 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1421031 4 0.1118 0.7252 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1444598 3 0.7688 0.6633 0.364 0.220 0.416 0.000
#> SRR1091743 2 0.1388 0.8423 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR819637 1 0.5099 0.8577 0.612 0.000 0.008 0.380
#> SRR1083848 1 0.4964 0.8588 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1088934 3 0.4387 0.8786 0.012 0.236 0.752 0.000
#> SRR1459785 3 0.4472 0.8923 0.020 0.220 0.760 0.000
#> SRR1083700 1 0.6212 0.8174 0.560 0.000 0.060 0.380
#> SRR1375531 4 0.6077 -0.6947 0.460 0.000 0.044 0.496
#> SRR1323470 3 0.7710 0.6477 0.368 0.224 0.408 0.000
#> SRR814657 1 0.5800 0.8373 0.548 0.000 0.032 0.420
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0162 0.88582 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1402132 4 0.5863 0.77019 0.292 0.000 0.004 0.588 0.116
#> SRR1326059 1 0.3086 0.80063 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1409062 2 0.3322 0.79254 0.000 0.848 0.044 0.104 0.004
#> SRR809406 1 0.2852 0.80539 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1465313 5 0.6176 0.48049 0.000 0.108 0.292 0.020 0.580
#> SRR819559 1 0.3831 0.79464 0.784 0.000 0.004 0.024 0.188
#> SRR1387899 3 0.5853 0.67357 0.000 0.172 0.644 0.172 0.012
#> SRR1442292 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0609 0.82005 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1395635 1 0.4216 0.73036 0.780 0.000 0.100 0.000 0.120
#> SRR1343629 1 0.0290 0.81890 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1326868 2 0.3248 0.79650 0.000 0.852 0.040 0.104 0.004
#> SRR1102320 1 0.3210 0.79025 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1469926 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1070036 1 0.3906 0.74391 0.804 0.000 0.084 0.000 0.112
#> SRR1098426 1 0.4351 0.72970 0.768 0.000 0.100 0.000 0.132
#> SRR1090310 3 0.3059 0.89933 0.000 0.108 0.860 0.028 0.004
#> SRR1429748 1 0.3551 0.78230 0.772 0.000 0.000 0.008 0.220
#> SRR1363654 1 0.3143 0.79372 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1326317 2 0.3395 0.78769 0.000 0.844 0.048 0.104 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.3461 0.91549 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1329947 1 0.1478 0.82036 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1469769 3 0.2805 0.90282 0.000 0.108 0.872 0.012 0.008
#> SRR1490761 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.5790 0.51097 0.000 0.120 0.268 0.004 0.608
#> SRR1402944 5 0.6036 0.48231 0.000 0.108 0.280 0.016 0.596
#> SRR1092818 1 0.4216 0.73036 0.780 0.000 0.100 0.000 0.120
#> SRR1093552 1 0.6369 0.57171 0.652 0.000 0.096 0.116 0.136
#> SRR1464880 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1078368 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.2707 0.82120 0.000 0.860 0.000 0.132 0.008
#> SRR1466951 2 0.3283 0.80090 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1331879 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1320034 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1068687 2 0.7883 -0.50394 0.000 0.364 0.088 0.196 0.352
#> SRR1437491 1 0.0162 0.81826 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310777 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0880 0.82061 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1329994 1 0.6224 0.38882 0.548 0.000 0.000 0.232 0.220
#> SRR1354203 1 0.0955 0.82136 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1077850 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369241 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1455214 1 0.2719 0.81704 0.852 0.000 0.004 0.000 0.144
#> SRR1092014 5 0.7508 0.48163 0.000 0.148 0.264 0.096 0.492
#> SRR1097857 1 0.3594 0.80167 0.804 0.000 0.004 0.020 0.172
#> SRR1473318 1 0.0324 0.81647 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1345974 3 0.2570 0.90322 0.000 0.108 0.880 0.004 0.008
#> SRR1338687 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.6793 0.34889 0.504 0.000 0.016 0.212 0.268
#> SRR1486821 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1418540 1 0.4735 0.72116 0.756 0.000 0.100 0.012 0.132
#> SRR1408788 3 0.6075 0.66250 0.000 0.224 0.640 0.092 0.044
#> SRR1359487 4 0.3461 0.91549 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1080648 1 0.3427 0.75504 0.836 0.000 0.056 0.000 0.108
#> SRR1414708 1 0.4627 0.72588 0.760 0.000 0.100 0.008 0.132
#> SRR1469080 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1365722 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.4209 0.90699 0.224 0.000 0.028 0.744 0.004
#> SRR1321829 2 0.3322 0.79221 0.000 0.848 0.044 0.104 0.004
#> SRR1475993 3 0.2445 0.90425 0.000 0.108 0.884 0.004 0.004
#> SRR1445387 1 0.2488 0.81395 0.872 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR1077575 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1349300 1 0.3003 0.79816 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1374165 1 0.7334 0.15242 0.524 0.000 0.100 0.244 0.132
#> SRR1453769 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.3210 0.78930 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1401146 5 0.6822 0.72454 0.000 0.332 0.104 0.052 0.512
#> SRR1366124 4 0.3305 0.91543 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1391811 1 0.0566 0.81742 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1456674 1 0.5260 0.69864 0.732 0.000 0.104 0.036 0.128
#> SRR1086490 3 0.3446 0.89042 0.000 0.108 0.840 0.048 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.6586 0.62076 0.300 0.000 0.004 0.488 0.208
#> SRR1384431 1 0.3160 0.80332 0.808 0.000 0.004 0.000 0.188
#> SRR1072055 1 0.4524 0.72705 0.768 0.000 0.092 0.008 0.132
#> SRR1359738 3 0.3059 0.89933 0.000 0.108 0.860 0.028 0.004
#> SRR1332141 1 0.0671 0.81696 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1085900 2 0.3495 0.78562 0.000 0.812 0.000 0.160 0.028
#> SRR1442173 1 0.0000 0.81768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1344034 3 0.6055 0.60612 0.000 0.108 0.648 0.040 0.204
#> SRR1080391 4 0.4054 0.91203 0.224 0.000 0.000 0.748 0.028
#> SRR1347870 2 0.2798 0.81560 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR814028 2 0.4036 0.75051 0.000 0.788 0.000 0.144 0.068
#> SRR814219 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0324 0.81647 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1102128 1 0.3509 0.79158 0.792 0.000 0.004 0.008 0.196
#> SRR1460211 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1070060 1 0.3993 0.76682 0.756 0.000 0.000 0.028 0.216
#> SRR1487969 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1417851 1 0.6912 0.53127 0.592 0.000 0.096 0.136 0.176
#> SRR1443350 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.4394 0.73162 0.764 0.000 0.100 0.000 0.136
#> SRR1076705 1 0.4576 0.72457 0.764 0.000 0.096 0.008 0.132
#> SRR1079380 5 0.5725 0.65318 0.000 0.204 0.172 0.000 0.624
#> SRR1102923 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.5501 0.76406 0.000 0.356 0.044 0.016 0.584
#> SRR1366605 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.3283 0.80090 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1436840 2 0.2798 0.81560 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1445573 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.4254 0.58776 0.024 0.000 0.020 0.768 0.188
#> SRR1431735 1 0.5057 0.71080 0.740 0.000 0.100 0.024 0.136
#> SRR1417387 1 0.4583 0.72478 0.764 0.000 0.100 0.008 0.128
#> SRR1445984 1 0.4834 0.71788 0.752 0.000 0.100 0.016 0.132
#> SRR1370447 4 0.4424 0.90425 0.224 0.000 0.000 0.728 0.048
#> SRR1446308 3 0.4548 0.80699 0.000 0.168 0.752 0.076 0.004
#> SRR1437346 3 0.2972 0.90233 0.000 0.108 0.864 0.024 0.004
#> SRR1103143 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.3731 0.74597 0.816 0.000 0.072 0.000 0.112
#> SRR1073191 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0609 0.81913 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1468914 4 0.3305 0.91543 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1319584 5 0.5997 0.49149 0.000 0.108 0.272 0.016 0.604
#> SRR1486584 1 0.3109 0.79550 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR813536 4 0.5382 0.85363 0.224 0.000 0.000 0.656 0.120
#> SRR1317939 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.1043 0.82076 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1341921 1 0.6412 0.30983 0.536 0.000 0.004 0.240 0.220
#> SRR1399178 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0510 0.81976 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1328551 2 0.0579 0.88152 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1453259 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.4551 0.76643 0.000 0.368 0.016 0.000 0.616
#> SRR1079543 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.3106 0.80958 0.000 0.844 0.000 0.132 0.024
#> SRR1076681 2 0.6195 0.43764 0.000 0.608 0.192 0.184 0.016
#> SRR1335314 4 0.3305 0.91543 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1400799 3 0.3141 0.89749 0.000 0.108 0.852 0.040 0.000
#> SRR1074578 1 0.4766 0.71619 0.708 0.000 0.000 0.072 0.220
#> SRR1312226 5 0.4359 0.73780 0.000 0.412 0.000 0.004 0.584
#> SRR1416207 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447371 1 0.0865 0.81715 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1069328 1 0.6555 -0.01595 0.460 0.000 0.000 0.320 0.220
#> SRR1445023 4 0.3690 0.91507 0.224 0.000 0.000 0.764 0.012
#> SRR1077599 2 0.5020 0.55940 0.000 0.712 0.180 0.104 0.004
#> SRR1453480 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4750 0.71810 0.760 0.000 0.104 0.016 0.120
#> SRR1074839 2 0.3039 0.80593 0.000 0.836 0.000 0.152 0.012
#> SRR1458727 5 0.6121 0.46462 0.000 0.092 0.268 0.032 0.608
#> SRR1436949 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1070429 3 0.3142 0.89818 0.000 0.108 0.856 0.032 0.004
#> SRR1458158 1 0.2929 0.80027 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1432408 4 0.3461 0.91493 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1310334 1 0.2020 0.81436 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1418201 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1385434 4 0.3305 0.91543 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1415591 3 0.3064 0.89899 0.000 0.108 0.856 0.036 0.000
#> SRR1402009 1 0.2124 0.82521 0.900 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR1316055 4 0.4626 0.89867 0.224 0.000 0.028 0.728 0.020
#> SRR1308734 3 0.3309 0.89706 0.000 0.108 0.852 0.016 0.024
#> SRR1498973 5 0.4480 0.75488 0.000 0.400 0.004 0.004 0.592
#> SRR1397115 1 0.3039 0.79687 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1392141 1 0.5424 0.68363 0.724 0.000 0.100 0.048 0.128
#> SRR814341 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.5772 0.28400 0.000 0.592 0.300 0.104 0.004
#> SRR1459609 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.3495 0.89342 0.000 0.108 0.844 0.024 0.024
#> SRR809919 1 0.1638 0.82531 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1370818 4 0.4125 0.90864 0.224 0.000 0.024 0.748 0.004
#> SRR1323651 3 0.6040 0.63354 0.000 0.192 0.620 0.176 0.012
#> SRR1357297 1 0.3242 0.78822 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR818170 5 0.5763 0.47690 0.000 0.108 0.288 0.004 0.600
#> SRR1091230 2 0.3599 0.77272 0.000 0.832 0.060 0.104 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095285 3 0.2880 0.90338 0.000 0.108 0.868 0.020 0.004
#> SRR1317731 3 0.6211 0.33911 0.000 0.108 0.552 0.016 0.324
#> SRR1490785 1 0.2233 0.82488 0.892 0.000 0.004 0.000 0.104
#> SRR1432032 1 0.4010 0.74246 0.796 0.000 0.088 0.000 0.116
#> SRR1447808 1 0.3123 0.79976 0.812 0.000 0.004 0.000 0.184
#> SRR809534 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.6018 0.75877 0.000 0.332 0.068 0.028 0.572
#> SRR812128 2 0.5053 0.47481 0.000 0.688 0.000 0.096 0.216
#> SRR1101513 1 0.3086 0.80209 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1415708 2 0.3294 0.80693 0.000 0.844 0.024 0.124 0.008
#> SRR1316033 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1390371 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1076801 1 0.5424 0.68363 0.724 0.000 0.100 0.048 0.128
#> SRR1080044 1 0.1043 0.82083 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1420850 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3737 0.78284 0.764 0.000 0.004 0.008 0.224
#> SRR1069871 1 0.1965 0.81507 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1095744 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1068929 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.3283 0.80090 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1075054 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1083480 1 0.0566 0.81700 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1075458 1 0.4307 0.72998 0.772 0.000 0.100 0.000 0.128
#> SRR1417023 4 0.3305 0.91543 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1309333 2 0.3197 0.80416 0.000 0.836 0.000 0.140 0.024
#> SRR1333676 1 0.3852 0.77280 0.760 0.000 0.000 0.020 0.220
#> SRR1352996 1 0.3143 0.79281 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1093172 4 0.4617 0.89870 0.224 0.000 0.000 0.716 0.060
#> SRR1413137 4 0.4795 0.89226 0.224 0.000 0.000 0.704 0.072
#> SRR1469973 2 0.3326 0.79621 0.000 0.824 0.000 0.152 0.024
#> SRR1420026 2 0.3238 0.80398 0.000 0.836 0.000 0.136 0.028
#> SRR817306 1 0.5060 0.69118 0.684 0.000 0.000 0.092 0.224
#> SRR1416266 4 0.3970 0.91141 0.224 0.000 0.000 0.752 0.024
#> SRR1071011 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3882 0.91473 0.224 0.000 0.000 0.756 0.020
#> SRR1435394 3 0.6028 0.31660 0.000 0.388 0.504 0.104 0.004
#> SRR1383192 1 0.4224 0.75505 0.744 0.000 0.000 0.040 0.216
#> SRR1419962 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1094357 1 0.2583 0.82150 0.864 0.000 0.004 0.000 0.132
#> SRR1081639 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1356016 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.4613 0.76681 0.000 0.360 0.020 0.000 0.620
#> SRR1312147 1 0.5712 0.66451 0.704 0.000 0.096 0.064 0.136
#> SRR1473891 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.6318 0.74010 0.240 0.000 0.004 0.552 0.204
#> SRR1474930 2 0.4514 0.72187 0.000 0.756 0.044 0.184 0.016
#> SRR1470988 4 0.4355 0.90592 0.224 0.000 0.000 0.732 0.044
#> SRR811915 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1100005 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.5714 0.73898 0.000 0.380 0.020 0.048 0.552
#> SRR1313770 3 0.4345 0.84131 0.000 0.108 0.792 0.016 0.084
#> SRR1315780 2 0.0865 0.86948 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1073631 1 0.1043 0.82076 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR819124 1 0.4001 0.77244 0.764 0.000 0.004 0.024 0.208
#> SRR1310997 5 0.4564 0.75513 0.000 0.388 0.004 0.008 0.600
#> SRR1464494 5 0.4564 0.75513 0.000 0.388 0.004 0.008 0.600
#> SRR1357083 3 0.3446 0.89042 0.000 0.108 0.840 0.048 0.004
#> SRR1475842 2 0.2563 0.82610 0.000 0.872 0.000 0.120 0.008
#> SRR1378085 1 0.2377 0.82398 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1378220 3 0.3374 0.89292 0.000 0.108 0.844 0.044 0.004
#> SRR1467704 1 0.4064 0.73609 0.792 0.000 0.092 0.000 0.116
#> SRR1348885 5 0.5868 0.50331 0.000 0.108 0.248 0.016 0.628
#> SRR1325826 1 0.2020 0.81410 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1466812 4 0.5158 0.86984 0.224 0.000 0.000 0.676 0.100
#> SRR1345692 2 0.3197 0.80416 0.000 0.836 0.000 0.140 0.024
#> SRR1401040 3 0.2813 0.90157 0.000 0.108 0.868 0.024 0.000
#> SRR1097954 1 0.1502 0.82519 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1374396 4 0.3461 0.91493 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1454073 2 0.3197 0.80416 0.000 0.836 0.000 0.140 0.024
#> SRR1355747 1 0.5021 0.70864 0.744 0.000 0.104 0.024 0.128
#> SRR1429368 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1398138 2 0.3412 0.79238 0.000 0.820 0.000 0.152 0.028
#> SRR1379260 1 0.4627 0.72588 0.760 0.000 0.100 0.008 0.132
#> SRR1361436 3 0.2900 0.90099 0.000 0.108 0.864 0.028 0.000
#> SRR817142 2 0.5879 0.21405 0.000 0.564 0.328 0.104 0.004
#> SRR1315291 4 0.4504 0.60029 0.024 0.000 0.048 0.772 0.156
#> SRR1309314 3 0.3851 0.87893 0.000 0.108 0.824 0.016 0.052
#> SRR1420085 2 0.3366 0.79739 0.000 0.828 0.000 0.140 0.032
#> SRR1361308 3 0.2722 0.90225 0.000 0.108 0.872 0.020 0.000
#> SRR1472126 1 0.2891 0.80240 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1380482 5 0.5997 0.49149 0.000 0.108 0.272 0.016 0.604
#> SRR1099789 1 0.0162 0.81826 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1079480 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1339276 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418368 1 0.2929 0.80305 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1399353 1 0.4964 0.71038 0.748 0.000 0.096 0.024 0.132
#> SRR1096760 3 0.3222 0.89620 0.000 0.108 0.852 0.036 0.004
#> SRR1440290 3 0.6452 0.46962 0.000 0.268 0.548 0.172 0.012
#> SRR1330813 2 0.3248 0.79650 0.000 0.852 0.040 0.104 0.004
#> SRR1458931 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.3461 0.91549 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1394321 1 0.3767 0.76315 0.812 0.000 0.068 0.000 0.120
#> SRR1081160 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0324 0.81647 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1477173 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0510 0.87756 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1390143 1 0.3968 0.78053 0.768 0.000 0.004 0.024 0.204
#> SRR1390413 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.2813 0.90157 0.000 0.108 0.868 0.024 0.000
#> SRR1312169 1 0.3519 0.78302 0.776 0.000 0.000 0.008 0.216
#> SRR1096687 1 0.6568 0.18036 0.500 0.000 0.004 0.276 0.220
#> SRR1486139 1 0.0609 0.81606 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1470313 4 0.3845 0.91336 0.224 0.000 0.012 0.760 0.004
#> SRR1447893 3 0.3446 0.89042 0.000 0.108 0.840 0.048 0.004
#> SRR1466025 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1477429 4 0.6366 0.66609 0.308 0.000 0.004 0.520 0.168
#> SRR1445701 3 0.5258 0.77014 0.000 0.108 0.704 0.176 0.012
#> SRR820689 1 0.0703 0.82013 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1451876 2 0.2284 0.83962 0.000 0.896 0.004 0.096 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.2970 0.81090 0.828 0.000 0.004 0.000 0.168
#> SRR1489328 2 0.3283 0.80090 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1344462 1 0.2020 0.81410 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1082709 1 0.3003 0.79848 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1447784 4 0.5957 0.84758 0.224 0.000 0.064 0.652 0.060
#> SRR1355769 1 0.3242 0.78822 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1488237 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0324 0.81735 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1480917 5 0.6265 0.65160 0.000 0.212 0.188 0.012 0.588
#> SRR1474485 4 0.7047 0.62122 0.328 0.000 0.088 0.500 0.084
#> SRR1089998 1 0.3123 0.80471 0.812 0.000 0.004 0.000 0.184
#> SRR1318140 1 0.2230 0.81406 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1319262 3 0.3142 0.89797 0.000 0.108 0.856 0.032 0.004
#> SRR1095188 2 0.3495 0.78562 0.000 0.812 0.000 0.160 0.028
#> SRR1454350 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440374 1 0.0865 0.82041 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1359565 3 0.2813 0.90157 0.000 0.108 0.868 0.024 0.000
#> SRR1105417 4 0.6369 0.63534 0.328 0.000 0.004 0.508 0.160
#> SRR1325578 5 0.6090 0.46801 0.000 0.108 0.292 0.016 0.584
#> SRR1358161 3 0.3495 0.89342 0.000 0.108 0.844 0.024 0.024
#> SRR1358665 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.4455 0.74973 0.000 0.404 0.000 0.008 0.588
#> SRR1452010 1 0.3909 0.77015 0.760 0.000 0.000 0.024 0.216
#> SRR1418183 2 0.6714 0.18007 0.000 0.496 0.296 0.196 0.012
#> SRR1366345 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387449 1 0.1952 0.81470 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1473461 1 0.3450 0.81132 0.808 0.000 0.008 0.008 0.176
#> SRR1090837 3 0.3446 0.89042 0.000 0.108 0.840 0.048 0.004
#> SRR1447828 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1338747 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.2570 0.90322 0.000 0.108 0.880 0.004 0.008
#> SRR1350280 1 0.3242 0.78822 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1088557 1 0.3086 0.80063 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1102656 5 0.4350 0.74559 0.000 0.408 0.000 0.004 0.588
#> SRR1441443 2 0.3197 0.80416 0.000 0.836 0.000 0.140 0.024
#> SRR1370682 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1475448 3 0.3446 0.89042 0.000 0.108 0.840 0.048 0.004
#> SRR1407291 1 0.3109 0.79425 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1405266 1 0.2629 0.81723 0.860 0.000 0.004 0.000 0.136
#> SRR1363766 1 0.3143 0.79349 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1082592 5 0.4871 0.76523 0.000 0.368 0.024 0.004 0.604
#> SRR1325794 5 0.5220 0.75118 0.000 0.388 0.012 0.028 0.572
#> SRR1095961 3 0.2681 0.90425 0.000 0.108 0.876 0.012 0.004
#> SRR1086702 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.6270 0.45522 0.000 0.612 0.168 0.196 0.024
#> SRR1457527 3 0.2570 0.90344 0.000 0.108 0.880 0.008 0.004
#> SRR1098831 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.2286 0.90379 0.000 0.108 0.888 0.000 0.004
#> SRR1488858 4 0.3305 0.91543 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1454695 1 0.5957 0.62879 0.688 0.000 0.100 0.084 0.128
#> SRR1090241 2 0.1560 0.85472 0.000 0.948 0.020 0.028 0.004
#> SRR1329863 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0771 0.81410 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1362135 1 0.4343 0.72942 0.768 0.000 0.096 0.000 0.136
#> SRR1379581 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1309182 1 0.3177 0.79131 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1437668 1 0.5246 0.69697 0.732 0.000 0.096 0.036 0.136
#> SRR1084742 5 0.4449 0.75661 0.000 0.388 0.004 0.004 0.604
#> SRR1433538 1 0.3039 0.79740 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1085063 2 0.1430 0.85107 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1454247 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1097100 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3906 0.74455 0.000 0.812 0.080 0.104 0.004
#> SRR1072388 1 0.5178 0.70381 0.736 0.000 0.100 0.032 0.132
#> SRR1070332 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1320761 5 0.6278 0.70322 0.000 0.252 0.148 0.016 0.584
#> SRR1076195 4 0.3461 0.91493 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1069895 3 0.4327 0.84332 0.000 0.112 0.780 0.104 0.004
#> SRR1099144 4 0.7083 0.75891 0.224 0.000 0.100 0.560 0.116
#> SRR1385150 3 0.3142 0.89797 0.000 0.108 0.856 0.032 0.004
#> SRR1420191 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3461 0.91515 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1102583 1 0.3039 0.79687 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1456971 1 0.5659 0.66880 0.708 0.000 0.100 0.060 0.132
#> SRR1340574 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444830 2 0.4037 0.75627 0.000 0.784 0.028 0.176 0.012
#> SRR1096267 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087127 5 0.6054 0.47728 0.000 0.108 0.284 0.016 0.592
#> SRR1408553 4 0.4555 0.90077 0.224 0.000 0.000 0.720 0.056
#> SRR1069231 1 0.3715 0.78722 0.736 0.000 0.004 0.000 0.260
#> SRR1325642 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.2248 0.78304 0.900 0.000 0.012 0.000 0.088
#> SRR1321942 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094380 1 0.0865 0.81715 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1447499 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.3222 0.79982 0.000 0.852 0.036 0.108 0.004
#> SRR1077874 5 0.4341 0.75013 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR808299 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1481238 5 0.7931 0.55490 0.000 0.232 0.216 0.112 0.440
#> SRR1443568 2 0.7016 -0.02185 0.000 0.436 0.344 0.200 0.020
#> SRR1380249 4 0.3461 0.91515 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1080143 1 0.3242 0.78822 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1383148 4 0.3305 0.91543 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1357042 1 0.3037 0.81806 0.860 0.000 0.040 0.000 0.100
#> SRR1416025 2 0.2798 0.81560 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1431015 2 0.3106 0.80761 0.000 0.840 0.000 0.140 0.020
#> SRR1078709 2 0.3283 0.80090 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR813283 1 0.1282 0.82361 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1430226 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.1124 0.82048 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1466927 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.6199 0.38607 0.000 0.024 0.240 0.128 0.608
#> SRR807679 1 0.4216 0.73036 0.780 0.000 0.100 0.000 0.120
#> SRR1333811 3 0.2805 0.90282 0.000 0.108 0.872 0.012 0.008
#> SRR1078660 2 0.6102 -0.16474 0.000 0.520 0.000 0.140 0.340
#> SRR1331730 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.4216 0.73036 0.780 0.000 0.100 0.000 0.120
#> SRR1432542 1 0.5659 0.66880 0.708 0.000 0.100 0.060 0.132
#> SRR1418041 1 0.3675 0.78593 0.772 0.000 0.004 0.008 0.216
#> SRR1085211 1 0.1697 0.80753 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR1339812 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4827 0.71800 0.752 0.000 0.096 0.016 0.136
#> SRR1350958 2 0.0510 0.88253 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1396822 3 0.5951 0.40983 0.000 0.352 0.540 0.104 0.004
#> SRR1441934 2 0.2843 0.81390 0.000 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR1472552 3 0.2900 0.90099 0.000 0.108 0.864 0.028 0.000
#> SRR1488881 3 0.2813 0.90157 0.000 0.108 0.868 0.024 0.000
#> SRR1102973 1 0.3291 0.78360 0.848 0.000 0.064 0.000 0.088
#> SRR1071131 2 0.5980 0.48403 0.000 0.636 0.176 0.172 0.016
#> SRR1074502 1 0.1965 0.81507 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1325271 1 0.7495 0.00592 0.484 0.000 0.100 0.284 0.132
#> SRR1409171 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0609 0.88065 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1981 0.85609 0.000 0.920 0.000 0.064 0.016
#> SRR1384091 4 0.3970 0.91427 0.224 0.000 0.000 0.752 0.024
#> SRR1431887 2 0.0324 0.88412 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1096525 4 0.4134 0.90898 0.224 0.000 0.000 0.744 0.032
#> SRR1488491 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.5588 0.76325 0.000 0.356 0.044 0.020 0.580
#> SRR1369514 1 0.6602 -0.28986 0.404 0.000 0.000 0.384 0.212
#> SRR1453299 3 0.2286 0.90379 0.000 0.108 0.888 0.000 0.004
#> SRR1436300 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1348490 5 0.4564 0.76635 0.000 0.372 0.016 0.000 0.612
#> SRR1091767 2 0.3283 0.80090 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1354467 3 0.2813 0.90157 0.000 0.108 0.868 0.024 0.000
#> SRR1069074 2 0.2408 0.83248 0.000 0.892 0.008 0.096 0.004
#> SRR1452399 2 0.3651 0.78161 0.000 0.808 0.004 0.160 0.028
#> SRR1437430 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1419736 5 0.4331 0.75624 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR1313343 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1077619 4 0.6689 0.79829 0.224 0.000 0.096 0.596 0.084
#> SRR1083530 1 0.3791 0.75501 0.812 0.000 0.076 0.000 0.112
#> SRR1333633 5 0.6368 0.24753 0.000 0.108 0.392 0.016 0.484
#> SRR1354999 2 0.6071 0.46424 0.000 0.616 0.180 0.192 0.012
#> SRR1443592 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.2930 0.80542 0.832 0.000 0.004 0.000 0.164
#> SRR1378818 5 0.5942 0.48283 0.000 0.108 0.280 0.012 0.600
#> SRR1413182 4 0.3461 0.91549 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1464559 4 0.6216 0.83044 0.224 0.000 0.088 0.632 0.056
#> SRR1413075 5 0.4564 0.75513 0.000 0.388 0.004 0.008 0.600
#> SRR1487928 4 0.3461 0.91493 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1388997 2 0.3197 0.80416 0.000 0.836 0.000 0.140 0.024
#> SRR1092865 2 0.3548 0.77240 0.000 0.796 0.004 0.188 0.012
#> SRR1102729 1 0.4324 0.76903 0.760 0.000 0.004 0.052 0.184
#> SRR1456423 1 0.1478 0.82082 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1321591 2 0.0162 0.88582 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376874 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1339903 1 0.3177 0.79189 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1346710 1 0.3477 0.75518 0.832 0.000 0.056 0.000 0.112
#> SRR1418771 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5956 0.75212 0.000 0.356 0.044 0.040 0.560
#> SRR1480941 5 0.6333 0.34699 0.000 0.108 0.336 0.020 0.536
#> SRR1479175 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.2890 0.80756 0.836 0.000 0.004 0.000 0.160
#> SRR1433884 2 0.3454 0.78920 0.000 0.816 0.000 0.156 0.028
#> SRR1471074 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2798 0.81560 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1355554 3 0.6778 0.29904 0.000 0.328 0.468 0.192 0.012
#> SRR1487173 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1474253 1 0.1952 0.81729 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1322918 2 0.2753 0.81791 0.000 0.856 0.000 0.136 0.008
#> SRR1318331 2 0.2707 0.82029 0.000 0.860 0.000 0.132 0.008
#> SRR1321333 3 0.2286 0.90379 0.000 0.108 0.888 0.000 0.004
#> SRR1474231 1 0.1282 0.81233 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1350545 1 0.3039 0.80092 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1091328 1 0.4351 0.72970 0.768 0.000 0.100 0.000 0.132
#> SRR814447 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1455989 3 0.5234 0.63661 0.000 0.260 0.660 0.076 0.004
#> SRR1453680 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1470356 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0703 0.87907 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1097197 1 0.3231 0.79689 0.800 0.000 0.004 0.000 0.196
#> SRR1366729 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR821282 3 0.3096 0.89972 0.000 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR1074602 2 0.3170 0.80096 0.000 0.856 0.036 0.104 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.88741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.6225 0.41938 0.000 0.108 0.304 0.020 0.568
#> SRR1319100 1 0.0771 0.81898 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1324004 3 0.5008 0.79344 0.000 0.108 0.724 0.160 0.008
#> SRR1457459 1 0.0162 0.81692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1421031 4 0.4905 0.88894 0.224 0.000 0.000 0.696 0.080
#> SRR1444598 5 0.5923 0.47796 0.000 0.108 0.276 0.012 0.604
#> SRR1091743 2 0.3322 0.79254 0.000 0.848 0.044 0.104 0.004
#> SRR819637 1 0.0451 0.81606 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1083848 1 0.0162 0.81826 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088934 3 0.4375 0.83949 0.000 0.116 0.776 0.104 0.004
#> SRR1459785 3 0.3206 0.89848 0.000 0.108 0.856 0.012 0.024
#> SRR1083700 1 0.1628 0.80795 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR1375531 1 0.5319 0.66367 0.676 0.000 0.004 0.108 0.212
#> SRR1323470 5 0.7456 0.42804 0.000 0.116 0.244 0.128 0.512
#> SRR814657 1 0.3242 0.78822 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0405 0.825492 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1402132 4 0.5542 0.741509 0.152 0.000 0.012 0.652 0.020 0.164
#> SRR1326059 1 0.3690 0.724522 0.700 0.000 0.012 0.000 0.000 0.288
#> SRR1409062 2 0.5144 0.482128 0.000 0.676 0.048 0.044 0.008 0.224
#> SRR809406 1 0.3323 0.739057 0.752 0.000 0.008 0.000 0.000 0.240
#> SRR1465313 5 0.5106 0.620751 0.000 0.036 0.224 0.028 0.684 0.028
#> SRR819559 1 0.4482 0.708623 0.644 0.000 0.016 0.024 0.000 0.316
#> SRR1387899 3 0.5866 0.526773 0.000 0.064 0.568 0.044 0.012 0.312
#> SRR1442292 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0632 0.757125 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1395635 1 0.5088 0.609251 0.628 0.000 0.000 0.000 0.220 0.152
#> SRR1343629 1 0.0363 0.756138 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1326868 2 0.4917 0.517702 0.000 0.700 0.040 0.044 0.008 0.208
#> SRR1102320 1 0.3652 0.710829 0.672 0.000 0.004 0.000 0.000 0.324
#> SRR1469926 3 0.2219 0.845522 0.000 0.036 0.916 0.020 0.012 0.016
#> SRR1070036 1 0.4723 0.634423 0.680 0.000 0.000 0.000 0.180 0.140
#> SRR1098426 1 0.5156 0.608047 0.620 0.000 0.000 0.000 0.216 0.164
#> SRR1090310 3 0.2763 0.835455 0.000 0.036 0.868 0.008 0.000 0.088
#> SRR1429748 1 0.3789 0.704923 0.660 0.000 0.000 0.008 0.000 0.332
#> SRR1363654 1 0.3428 0.720763 0.696 0.000 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1326317 2 0.5313 0.456928 0.000 0.664 0.060 0.044 0.008 0.224
#> SRR1378308 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1714 0.869575 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.1556 0.756115 0.920 0.000 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1469769 3 0.2201 0.846532 0.000 0.036 0.916 0.024 0.008 0.016
#> SRR1490761 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.4736 0.631328 0.000 0.040 0.216 0.020 0.708 0.016
#> SRR1402944 5 0.4723 0.622516 0.000 0.036 0.224 0.020 0.704 0.016
#> SRR1092818 1 0.5088 0.609251 0.628 0.000 0.000 0.000 0.220 0.152
#> SRR1093552 1 0.7030 0.433859 0.492 0.000 0.004 0.128 0.212 0.164
#> SRR1464880 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1078368 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.3190 0.686887 0.000 0.772 0.000 0.000 0.008 0.220
#> SRR1466951 2 0.3888 0.635503 0.000 0.716 0.000 0.000 0.032 0.252
#> SRR1331879 5 0.3521 0.763831 0.000 0.268 0.000 0.004 0.724 0.004
#> SRR1320034 3 0.1936 0.848563 0.000 0.036 0.928 0.016 0.012 0.008
#> SRR1068687 6 0.6760 -0.233083 0.000 0.208 0.052 0.000 0.328 0.412
#> SRR1437491 1 0.0146 0.755101 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310777 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0790 0.758112 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1329994 1 0.6240 0.086826 0.364 0.000 0.004 0.316 0.000 0.316
#> SRR1354203 1 0.1245 0.759342 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1077850 1 0.0000 0.754725 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1455214 1 0.3348 0.750483 0.768 0.000 0.016 0.000 0.000 0.216
#> SRR1092014 5 0.7180 0.470198 0.000 0.072 0.172 0.044 0.520 0.192
#> SRR1097857 1 0.4143 0.727262 0.692 0.000 0.016 0.016 0.000 0.276
#> SRR1473318 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345974 3 0.1526 0.852095 0.000 0.036 0.944 0.008 0.008 0.004
#> SRR1338687 2 0.0146 0.827155 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071207 6 0.6921 -0.499045 0.296 0.000 0.004 0.248 0.048 0.404
#> SRR1486821 3 0.2024 0.847638 0.000 0.036 0.924 0.020 0.008 0.012
#> SRR1418540 1 0.5682 0.594894 0.604 0.000 0.004 0.016 0.212 0.164
#> SRR1408788 3 0.6686 0.534649 0.000 0.144 0.564 0.056 0.032 0.204
#> SRR1359487 4 0.2225 0.868958 0.092 0.000 0.008 0.892 0.000 0.008
#> SRR1080648 1 0.4390 0.652165 0.720 0.000 0.000 0.000 0.132 0.148
#> SRR1414708 1 0.5511 0.603600 0.612 0.000 0.004 0.008 0.208 0.168
#> SRR1469080 5 0.3521 0.763831 0.000 0.268 0.000 0.004 0.724 0.004
#> SRR1365722 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.2554 0.862914 0.092 0.000 0.004 0.876 0.028 0.000
#> SRR1321829 2 0.5258 0.464362 0.000 0.668 0.056 0.044 0.008 0.224
#> SRR1475993 3 0.1749 0.853178 0.000 0.036 0.932 0.000 0.008 0.024
#> SRR1445387 1 0.2896 0.751621 0.824 0.000 0.016 0.000 0.000 0.160
#> SRR1077575 5 0.3337 0.772184 0.000 0.260 0.004 0.000 0.736 0.000
#> SRR1349300 1 0.3309 0.725554 0.720 0.000 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1374165 1 0.7449 0.124439 0.384 0.000 0.000 0.236 0.220 0.160
#> SRR1453769 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.3601 0.712964 0.684 0.000 0.004 0.000 0.000 0.312
#> SRR1401146 5 0.6724 0.602311 0.000 0.208 0.068 0.036 0.568 0.120
#> SRR1366124 4 0.2001 0.869119 0.092 0.000 0.004 0.900 0.000 0.004
#> SRR1391811 1 0.0717 0.754709 0.976 0.000 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456674 1 0.6392 0.529178 0.548 0.000 0.000 0.072 0.220 0.160
#> SRR1086490 3 0.3785 0.802587 0.000 0.036 0.804 0.040 0.000 0.120
#> SRR1088511 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.5835 0.574636 0.152 0.000 0.012 0.516 0.000 0.320
#> SRR1384431 1 0.3797 0.727046 0.692 0.000 0.016 0.000 0.000 0.292
#> SRR1072055 1 0.5524 0.603517 0.612 0.000 0.000 0.016 0.208 0.164
#> SRR1359738 3 0.2651 0.836743 0.000 0.036 0.872 0.004 0.000 0.088
#> SRR1332141 1 0.1168 0.754770 0.956 0.000 0.016 0.000 0.000 0.028
#> SRR1085900 2 0.4201 0.572599 0.000 0.664 0.000 0.000 0.036 0.300
#> SRR1442173 1 0.0000 0.754725 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.3337 0.772184 0.000 0.260 0.004 0.000 0.736 0.000
#> SRR1344034 3 0.5738 0.485459 0.000 0.036 0.616 0.036 0.268 0.044
#> SRR1080391 4 0.3079 0.863790 0.092 0.000 0.008 0.848 0.000 0.052
#> SRR1347870 2 0.3494 0.654111 0.000 0.736 0.000 0.000 0.012 0.252
#> SRR814028 2 0.4663 0.555453 0.000 0.660 0.000 0.000 0.088 0.252
#> SRR814219 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102128 1 0.4113 0.709044 0.668 0.000 0.016 0.008 0.000 0.308
#> SRR1460211 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.3476 0.771270 0.000 0.260 0.004 0.000 0.732 0.004
#> SRR1070060 1 0.4138 0.697182 0.656 0.000 0.004 0.020 0.000 0.320
#> SRR1487969 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1417851 1 0.7384 0.388159 0.432 0.000 0.004 0.156 0.200 0.208
#> SRR1443350 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.5273 0.608650 0.620 0.000 0.004 0.000 0.208 0.168
#> SRR1076705 1 0.5571 0.597930 0.604 0.000 0.000 0.016 0.216 0.164
#> SRR1079380 5 0.4303 0.697583 0.000 0.100 0.128 0.000 0.756 0.016
#> SRR1102923 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.4458 0.759101 0.000 0.216 0.024 0.004 0.720 0.036
#> SRR1366605 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.4003 0.637652 0.000 0.716 0.000 0.004 0.032 0.248
#> SRR1436840 2 0.3512 0.659165 0.000 0.740 0.000 0.004 0.008 0.248
#> SRR1445573 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.3236 0.712232 0.008 0.000 0.012 0.852 0.068 0.060
#> SRR1431735 1 0.6043 0.565523 0.576 0.000 0.000 0.044 0.216 0.164
#> SRR1417387 1 0.5480 0.598617 0.608 0.000 0.000 0.012 0.220 0.160
#> SRR1445984 1 0.5793 0.587060 0.592 0.000 0.000 0.028 0.216 0.164
#> SRR1370447 4 0.3613 0.853411 0.092 0.000 0.016 0.816 0.000 0.076
#> SRR1446308 3 0.5173 0.694876 0.000 0.068 0.688 0.040 0.008 0.196
#> SRR1437346 3 0.1937 0.851981 0.000 0.036 0.924 0.004 0.004 0.032
#> SRR1103143 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.4734 0.632333 0.680 0.000 0.000 0.000 0.168 0.152
#> SRR1073191 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0363 0.755865 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1468914 4 0.2001 0.869779 0.092 0.000 0.004 0.900 0.000 0.004
#> SRR1319584 5 0.4723 0.622516 0.000 0.036 0.224 0.020 0.704 0.016
#> SRR1486584 1 0.3409 0.721174 0.700 0.000 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR813536 4 0.4602 0.776275 0.092 0.000 0.008 0.704 0.000 0.196
#> SRR1317939 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.1204 0.758161 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1341921 1 0.6455 0.160407 0.376 0.000 0.016 0.284 0.000 0.324
#> SRR1399178 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0547 0.756789 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1328551 2 0.0405 0.824787 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1453259 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3380 0.771924 0.000 0.244 0.004 0.000 0.748 0.004
#> SRR1079543 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.3582 0.650686 0.000 0.732 0.000 0.000 0.016 0.252
#> SRR1076681 2 0.5768 0.157270 0.000 0.504 0.112 0.004 0.012 0.368
#> SRR1335314 4 0.2326 0.868372 0.092 0.000 0.008 0.888 0.000 0.012
#> SRR1400799 3 0.2963 0.831894 0.000 0.036 0.856 0.012 0.000 0.096
#> SRR1074578 1 0.4908 0.645605 0.596 0.000 0.004 0.068 0.000 0.332
#> SRR1312226 5 0.3565 0.753490 0.000 0.276 0.000 0.004 0.716 0.004
#> SRR1416207 1 0.0000 0.754725 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.1461 0.754246 0.940 0.000 0.016 0.000 0.000 0.044
#> SRR1069328 4 0.6341 0.039967 0.332 0.000 0.008 0.340 0.000 0.320
#> SRR1445023 4 0.2605 0.869303 0.092 0.000 0.012 0.876 0.000 0.020
#> SRR1077599 2 0.6540 0.022593 0.000 0.524 0.200 0.044 0.008 0.224
#> SRR1453480 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.5786 0.580573 0.592 0.000 0.000 0.028 0.220 0.160
#> SRR1074839 2 0.3935 0.603355 0.000 0.688 0.004 0.000 0.016 0.292
#> SRR1458727 5 0.5911 0.532790 0.000 0.024 0.256 0.040 0.608 0.072
#> SRR1436949 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1070429 3 0.3005 0.831281 0.000 0.036 0.856 0.016 0.000 0.092
#> SRR1458158 1 0.3175 0.733116 0.744 0.000 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1432408 4 0.2113 0.868391 0.092 0.000 0.004 0.896 0.000 0.008
#> SRR1310334 1 0.2048 0.753135 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1418201 3 0.2219 0.845522 0.000 0.036 0.916 0.020 0.012 0.016
#> SRR1385434 4 0.2001 0.869119 0.092 0.000 0.004 0.900 0.000 0.004
#> SRR1415591 3 0.2493 0.841516 0.000 0.036 0.884 0.004 0.000 0.076
#> SRR1402009 1 0.2704 0.762598 0.844 0.000 0.016 0.000 0.000 0.140
#> SRR1316055 4 0.2951 0.854113 0.092 0.000 0.000 0.856 0.044 0.008
#> SRR1308734 3 0.2289 0.844830 0.000 0.036 0.912 0.024 0.008 0.020
#> SRR1498973 5 0.3476 0.771270 0.000 0.260 0.004 0.000 0.732 0.004
#> SRR1397115 1 0.3405 0.726991 0.724 0.000 0.004 0.000 0.000 0.272
#> SRR1392141 1 0.6480 0.516139 0.540 0.000 0.000 0.080 0.220 0.160
#> SRR814341 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.6849 -0.199372 0.000 0.444 0.284 0.044 0.008 0.220
#> SRR1459609 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.2701 0.836662 0.000 0.036 0.892 0.036 0.012 0.024
#> SRR809919 1 0.2494 0.764353 0.864 0.000 0.016 0.000 0.000 0.120
#> SRR1370818 4 0.2487 0.862438 0.092 0.000 0.000 0.876 0.032 0.000
#> SRR1323651 3 0.6019 0.494633 0.000 0.076 0.552 0.044 0.012 0.316
#> SRR1357297 1 0.3636 0.710979 0.676 0.000 0.004 0.000 0.000 0.320
#> SRR818170 5 0.5211 0.587080 0.000 0.036 0.244 0.020 0.664 0.036
#> SRR1091230 2 0.5515 0.418386 0.000 0.648 0.076 0.044 0.008 0.224
#> SRR1470556 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095285 3 0.2337 0.852792 0.000 0.036 0.908 0.012 0.008 0.036
#> SRR1317731 3 0.5336 0.464261 0.000 0.036 0.640 0.036 0.268 0.020
#> SRR1490785 1 0.2783 0.761923 0.836 0.000 0.016 0.000 0.000 0.148
#> SRR1432032 1 0.4986 0.625971 0.660 0.000 0.004 0.000 0.188 0.148
#> SRR1447808 1 0.3670 0.726085 0.704 0.000 0.012 0.000 0.000 0.284
#> SRR809534 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.4790 0.747805 0.000 0.196 0.044 0.004 0.712 0.044
#> SRR812128 2 0.5297 0.462201 0.000 0.616 0.000 0.004 0.168 0.212
#> SRR1101513 1 0.3738 0.726839 0.704 0.000 0.016 0.000 0.000 0.280
#> SRR1415708 2 0.5017 0.539758 0.000 0.684 0.036 0.048 0.008 0.224
#> SRR1316033 3 0.2024 0.847638 0.000 0.036 0.924 0.020 0.008 0.012
#> SRR1390371 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.2037 0.847516 0.000 0.036 0.924 0.016 0.012 0.012
#> SRR1076801 1 0.6480 0.516139 0.540 0.000 0.000 0.080 0.220 0.160
#> SRR1080044 1 0.1075 0.758026 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1420850 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.4345 0.693784 0.624 0.000 0.008 0.020 0.000 0.348
#> SRR1069871 1 0.1814 0.754124 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1095744 5 0.3337 0.772184 0.000 0.260 0.004 0.000 0.736 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.3888 0.635503 0.000 0.716 0.000 0.000 0.032 0.252
#> SRR1075054 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1083480 1 0.0622 0.754770 0.980 0.000 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR1075458 1 0.5156 0.608047 0.620 0.000 0.000 0.000 0.216 0.164
#> SRR1417023 4 0.2001 0.869119 0.092 0.000 0.004 0.900 0.000 0.004
#> SRR1309333 2 0.3665 0.647327 0.000 0.728 0.000 0.000 0.020 0.252
#> SRR1333676 1 0.3898 0.700858 0.652 0.000 0.000 0.012 0.000 0.336
#> SRR1352996 1 0.3547 0.717362 0.696 0.000 0.004 0.000 0.000 0.300
#> SRR1093172 4 0.4001 0.838799 0.092 0.000 0.016 0.784 0.000 0.108
#> SRR1413137 4 0.4001 0.838799 0.092 0.000 0.016 0.784 0.000 0.108
#> SRR1469973 2 0.4009 0.599736 0.000 0.684 0.000 0.000 0.028 0.288
#> SRR1420026 2 0.3932 0.641001 0.000 0.720 0.000 0.004 0.028 0.248
#> SRR817306 1 0.5377 0.592950 0.556 0.000 0.004 0.116 0.000 0.324
#> SRR1416266 4 0.2913 0.864236 0.092 0.000 0.012 0.860 0.000 0.036
#> SRR1071011 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2333 0.868933 0.092 0.000 0.000 0.884 0.000 0.024
#> SRR1435394 3 0.6783 0.192903 0.000 0.256 0.468 0.044 0.008 0.224
#> SRR1383192 1 0.4648 0.672304 0.628 0.000 0.008 0.044 0.000 0.320
#> SRR1419962 3 0.2219 0.845522 0.000 0.036 0.916 0.020 0.012 0.016
#> SRR1094357 1 0.3261 0.756847 0.780 0.000 0.016 0.000 0.000 0.204
#> SRR1081639 3 0.2732 0.835041 0.000 0.036 0.892 0.020 0.024 0.028
#> SRR1356016 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.3380 0.771924 0.000 0.244 0.004 0.000 0.748 0.004
#> SRR1312147 1 0.6759 0.492495 0.524 0.000 0.004 0.096 0.212 0.164
#> SRR1473891 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.5472 0.640877 0.108 0.000 0.012 0.564 0.000 0.316
#> SRR1474930 2 0.4570 0.451813 0.000 0.600 0.020 0.000 0.016 0.364
#> SRR1470988 4 0.3391 0.858399 0.092 0.000 0.016 0.832 0.000 0.060
#> SRR811915 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.754725 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.5487 0.687280 0.000 0.228 0.008 0.032 0.644 0.088
#> SRR1313770 3 0.3967 0.785062 0.000 0.036 0.820 0.040 0.072 0.032
#> SRR1315780 2 0.0858 0.807800 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1073631 1 0.1204 0.758161 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR819124 1 0.4412 0.694718 0.644 0.000 0.012 0.024 0.000 0.320
#> SRR1310997 5 0.3608 0.767029 0.000 0.248 0.004 0.000 0.736 0.012
#> SRR1464494 5 0.4026 0.754937 0.000 0.252 0.004 0.000 0.712 0.032
#> SRR1357083 3 0.4089 0.787526 0.000 0.036 0.784 0.040 0.004 0.136
#> SRR1475842 2 0.3302 0.674679 0.000 0.760 0.000 0.004 0.004 0.232
#> SRR1378085 1 0.3136 0.762715 0.796 0.000 0.000 0.000 0.016 0.188
#> SRR1378220 3 0.3838 0.800842 0.000 0.036 0.800 0.028 0.004 0.132
#> SRR1467704 1 0.4969 0.618410 0.648 0.000 0.000 0.000 0.196 0.156
#> SRR1348885 5 0.5671 0.609818 0.000 0.036 0.184 0.036 0.668 0.076
#> SRR1325826 1 0.2092 0.750920 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1466812 4 0.4451 0.797808 0.092 0.000 0.012 0.732 0.000 0.164
#> SRR1345692 2 0.3766 0.639903 0.000 0.720 0.000 0.000 0.024 0.256
#> SRR1401040 3 0.2314 0.847059 0.000 0.036 0.900 0.008 0.000 0.056
#> SRR1097954 1 0.2263 0.764653 0.884 0.000 0.016 0.000 0.000 0.100
#> SRR1374396 4 0.2326 0.868372 0.092 0.000 0.008 0.888 0.000 0.012
#> SRR1454073 2 0.3907 0.623374 0.000 0.704 0.000 0.000 0.028 0.268
#> SRR1355747 1 0.6034 0.570939 0.584 0.000 0.004 0.036 0.212 0.164
#> SRR1429368 3 0.2024 0.847638 0.000 0.036 0.924 0.020 0.008 0.012
#> SRR1398138 2 0.4127 0.594741 0.000 0.680 0.000 0.000 0.036 0.284
#> SRR1379260 1 0.5401 0.603306 0.612 0.000 0.000 0.008 0.212 0.168
#> SRR1361436 3 0.2863 0.834876 0.000 0.036 0.864 0.012 0.000 0.088
#> SRR817142 2 0.6907 -0.247577 0.000 0.420 0.304 0.044 0.008 0.224
#> SRR1315291 4 0.2840 0.731607 0.012 0.000 0.012 0.880 0.040 0.056
#> SRR1309314 3 0.4128 0.787617 0.000 0.036 0.812 0.044 0.044 0.064
#> SRR1420085 2 0.3979 0.627678 0.000 0.708 0.000 0.000 0.036 0.256
#> SRR1361308 3 0.1666 0.852657 0.000 0.036 0.936 0.008 0.000 0.020
#> SRR1472126 1 0.3076 0.737399 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1380482 5 0.4723 0.622516 0.000 0.036 0.224 0.020 0.704 0.016
#> SRR1099789 1 0.0260 0.755726 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079480 5 0.3337 0.772184 0.000 0.260 0.004 0.000 0.736 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.754725 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.3198 0.736347 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1399353 1 0.6092 0.561736 0.572 0.000 0.000 0.048 0.220 0.160
#> SRR1096760 3 0.3603 0.808835 0.000 0.036 0.816 0.032 0.000 0.116
#> SRR1440290 3 0.6639 0.279144 0.000 0.148 0.480 0.044 0.012 0.316
#> SRR1330813 2 0.5084 0.490552 0.000 0.680 0.044 0.044 0.008 0.224
#> SRR1458931 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1714 0.869575 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.5004 0.648989 0.676 0.000 0.012 0.000 0.144 0.168
#> SRR1081160 2 0.0146 0.827155 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477173 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.1226 0.800615 0.000 0.952 0.000 0.004 0.040 0.004
#> SRR1390143 1 0.4482 0.699116 0.644 0.000 0.016 0.024 0.000 0.316
#> SRR1390413 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.2201 0.846227 0.000 0.036 0.904 0.004 0.000 0.056
#> SRR1312169 1 0.4058 0.700473 0.660 0.000 0.004 0.016 0.000 0.320
#> SRR1096687 1 0.6478 0.093386 0.348 0.000 0.016 0.296 0.000 0.340
#> SRR1486139 1 0.1245 0.753558 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1470313 4 0.1970 0.869527 0.092 0.000 0.000 0.900 0.008 0.000
#> SRR1447893 3 0.4310 0.768809 0.000 0.036 0.760 0.040 0.004 0.160
#> SRR1466025 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1477429 4 0.5937 0.597031 0.172 0.000 0.020 0.544 0.000 0.264
#> SRR1445701 3 0.5583 0.534701 0.000 0.036 0.564 0.044 0.012 0.344
#> SRR820689 1 0.0458 0.756382 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1451876 2 0.3637 0.666315 0.000 0.788 0.000 0.040 0.008 0.164
#> SRR1452537 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.3790 0.739530 0.716 0.000 0.016 0.004 0.000 0.264
#> SRR1489328 2 0.3978 0.618805 0.000 0.700 0.000 0.000 0.032 0.268
#> SRR1344462 1 0.2048 0.750882 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1082709 1 0.3309 0.726929 0.720 0.000 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1447784 4 0.4868 0.783160 0.092 0.000 0.004 0.740 0.096 0.068
#> SRR1355769 1 0.3619 0.712120 0.680 0.000 0.004 0.000 0.000 0.316
#> SRR1488237 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480917 5 0.4847 0.683156 0.000 0.092 0.144 0.008 0.728 0.028
#> SRR1474485 4 0.6467 0.590703 0.192 0.000 0.000 0.560 0.132 0.116
#> SRR1089998 1 0.3738 0.729632 0.704 0.000 0.016 0.000 0.000 0.280
#> SRR1318140 1 0.2219 0.751393 0.864 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1319262 3 0.3363 0.818302 0.000 0.036 0.832 0.024 0.000 0.108
#> SRR1095188 2 0.4201 0.572599 0.000 0.664 0.000 0.000 0.036 0.300
#> SRR1454350 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440374 1 0.0865 0.757408 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1359565 3 0.2201 0.846227 0.000 0.036 0.904 0.004 0.000 0.056
#> SRR1105417 4 0.5997 0.591529 0.196 0.000 0.020 0.540 0.000 0.244
#> SRR1325578 5 0.5050 0.580839 0.000 0.036 0.268 0.024 0.656 0.016
#> SRR1358161 3 0.2701 0.836662 0.000 0.036 0.892 0.036 0.012 0.024
#> SRR1358665 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1452010 1 0.4138 0.697182 0.656 0.000 0.004 0.020 0.000 0.320
#> SRR1418183 6 0.7057 0.211727 0.000 0.344 0.232 0.044 0.012 0.368
#> SRR1366345 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387449 1 0.2165 0.752303 0.884 0.000 0.008 0.000 0.000 0.108
#> SRR1473461 1 0.4041 0.736528 0.684 0.000 0.016 0.008 0.000 0.292
#> SRR1090837 3 0.3949 0.790934 0.000 0.036 0.788 0.040 0.000 0.136
#> SRR1447828 3 0.1835 0.848945 0.000 0.036 0.932 0.016 0.008 0.008
#> SRR1338747 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.1514 0.852598 0.000 0.036 0.944 0.004 0.004 0.012
#> SRR1350280 1 0.3636 0.710979 0.676 0.000 0.004 0.000 0.000 0.320
#> SRR1088557 1 0.3758 0.724855 0.700 0.000 0.016 0.000 0.000 0.284
#> SRR1102656 5 0.3646 0.733841 0.000 0.292 0.000 0.004 0.700 0.004
#> SRR1441443 2 0.3743 0.643608 0.000 0.724 0.000 0.000 0.024 0.252
#> SRR1370682 3 0.2037 0.847516 0.000 0.036 0.924 0.016 0.012 0.012
#> SRR1475448 3 0.3949 0.790934 0.000 0.036 0.788 0.040 0.000 0.136
#> SRR1407291 1 0.3428 0.717158 0.696 0.000 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1405266 1 0.3136 0.752264 0.796 0.000 0.016 0.000 0.000 0.188
#> SRR1363766 1 0.3601 0.714176 0.684 0.000 0.004 0.000 0.000 0.312
#> SRR1082592 5 0.3858 0.768089 0.000 0.228 0.020 0.000 0.740 0.012
#> SRR1325794 5 0.4347 0.755734 0.000 0.232 0.008 0.004 0.712 0.044
#> SRR1095961 3 0.2010 0.853021 0.000 0.036 0.920 0.004 0.004 0.036
#> SRR1086702 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.6961 -0.213220 0.000 0.412 0.140 0.040 0.032 0.376
#> SRR1457527 3 0.1628 0.851714 0.000 0.036 0.940 0.012 0.008 0.004
#> SRR1098831 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.1608 0.852574 0.000 0.036 0.940 0.004 0.004 0.016
#> SRR1488858 4 0.1858 0.869279 0.092 0.000 0.000 0.904 0.000 0.004
#> SRR1454695 1 0.6952 0.417488 0.488 0.000 0.000 0.136 0.216 0.160
#> SRR1090241 2 0.3262 0.694589 0.000 0.836 0.004 0.040 0.008 0.112
#> SRR1329863 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0858 0.749323 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1362135 1 0.5162 0.608284 0.620 0.000 0.000 0.000 0.212 0.168
#> SRR1379581 3 0.2219 0.845522 0.000 0.036 0.916 0.020 0.012 0.016
#> SRR1309182 1 0.3584 0.714114 0.688 0.000 0.004 0.000 0.000 0.308
#> SRR1437668 1 0.6464 0.535135 0.552 0.000 0.004 0.068 0.212 0.164
#> SRR1084742 5 0.3536 0.769890 0.000 0.252 0.004 0.000 0.736 0.008
#> SRR1433538 1 0.3244 0.730263 0.732 0.000 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1085063 2 0.1674 0.782848 0.000 0.924 0.000 0.004 0.068 0.004
#> SRR1454247 5 0.3476 0.771270 0.000 0.260 0.004 0.000 0.732 0.004
#> SRR1097100 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.5781 0.350001 0.000 0.624 0.100 0.044 0.008 0.224
#> SRR1072388 1 0.6306 0.541777 0.556 0.000 0.000 0.064 0.216 0.164
#> SRR1070332 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1320761 5 0.4702 0.729940 0.000 0.156 0.080 0.004 0.732 0.028
#> SRR1076195 4 0.2113 0.868391 0.092 0.000 0.004 0.896 0.000 0.008
#> SRR1069895 3 0.5021 0.691848 0.000 0.040 0.684 0.044 0.008 0.224
#> SRR1099144 4 0.6365 0.635393 0.092 0.000 0.004 0.576 0.208 0.120
#> SRR1385150 3 0.3317 0.820618 0.000 0.036 0.836 0.024 0.000 0.104
#> SRR1420191 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1970 0.869146 0.092 0.000 0.000 0.900 0.008 0.000
#> SRR1102583 1 0.3244 0.730005 0.732 0.000 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1456971 1 0.6609 0.500155 0.528 0.000 0.000 0.092 0.216 0.164
#> SRR1340574 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444830 2 0.5262 0.394835 0.000 0.596 0.020 0.044 0.012 0.328
#> SRR1096267 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087127 5 0.4826 0.617756 0.000 0.036 0.228 0.024 0.696 0.016
#> SRR1408553 4 0.3816 0.846471 0.092 0.000 0.016 0.800 0.000 0.092
#> SRR1069231 1 0.4290 0.707273 0.612 0.000 0.004 0.000 0.020 0.364
#> SRR1325642 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.3235 0.695262 0.820 0.000 0.000 0.000 0.052 0.128
#> SRR1321942 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094380 1 0.1461 0.754246 0.940 0.000 0.016 0.000 0.000 0.044
#> SRR1447499 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.5021 0.498116 0.000 0.684 0.040 0.044 0.008 0.224
#> SRR1077874 5 0.3383 0.766084 0.000 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR808299 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3337 0.772184 0.000 0.260 0.004 0.000 0.736 0.000
#> SRR1481238 5 0.7534 0.397869 0.000 0.108 0.176 0.036 0.468 0.212
#> SRR1443568 6 0.6460 0.228932 0.000 0.332 0.228 0.000 0.024 0.416
#> SRR1380249 4 0.1714 0.869575 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.3636 0.710979 0.676 0.000 0.004 0.000 0.000 0.320
#> SRR1383148 4 0.1714 0.869575 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.4193 0.734603 0.736 0.000 0.004 0.000 0.072 0.188
#> SRR1416025 2 0.3494 0.654111 0.000 0.736 0.000 0.000 0.012 0.252
#> SRR1431015 2 0.3606 0.647458 0.000 0.728 0.000 0.000 0.016 0.256
#> SRR1078709 2 0.4045 0.614140 0.000 0.696 0.000 0.000 0.036 0.268
#> SRR813283 1 0.1779 0.760144 0.920 0.000 0.016 0.000 0.000 0.064
#> SRR1430226 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.1895 0.761243 0.912 0.000 0.016 0.000 0.000 0.072
#> SRR1466927 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.5971 0.518987 0.000 0.000 0.180 0.136 0.612 0.072
#> SRR807679 1 0.5088 0.609251 0.628 0.000 0.000 0.000 0.220 0.152
#> SRR1333811 3 0.2372 0.845345 0.000 0.036 0.908 0.024 0.008 0.024
#> SRR1078660 2 0.6027 -0.014716 0.000 0.424 0.000 0.000 0.304 0.272
#> SRR1331730 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.5088 0.609251 0.628 0.000 0.000 0.000 0.220 0.152
#> SRR1432542 1 0.6609 0.500155 0.528 0.000 0.000 0.092 0.216 0.164
#> SRR1418041 1 0.4179 0.707366 0.652 0.000 0.016 0.008 0.000 0.324
#> SRR1085211 1 0.2698 0.735679 0.872 0.000 0.016 0.000 0.020 0.092
#> SRR1339812 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.5717 0.589785 0.596 0.000 0.000 0.024 0.220 0.160
#> SRR1350958 2 0.0603 0.823098 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1396822 3 0.6692 0.276618 0.000 0.232 0.492 0.044 0.008 0.224
#> SRR1441934 2 0.3608 0.636004 0.000 0.716 0.000 0.000 0.012 0.272
#> SRR1472552 3 0.2863 0.834876 0.000 0.036 0.864 0.012 0.000 0.088
#> SRR1488881 3 0.2201 0.846227 0.000 0.036 0.904 0.004 0.000 0.056
#> SRR1102973 1 0.4596 0.688921 0.728 0.000 0.016 0.000 0.132 0.124
#> SRR1071131 2 0.5401 0.310429 0.000 0.552 0.092 0.000 0.012 0.344
#> SRR1074502 1 0.1957 0.752626 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1325271 1 0.7555 -0.114692 0.312 0.000 0.000 0.308 0.216 0.164
#> SRR1409171 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0713 0.816940 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1430045 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.2196 0.772027 0.000 0.884 0.000 0.004 0.004 0.108
#> SRR1384091 4 0.3016 0.863793 0.092 0.000 0.008 0.852 0.000 0.048
#> SRR1431887 2 0.0405 0.825492 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1096525 4 0.3142 0.861541 0.092 0.000 0.016 0.848 0.000 0.044
#> SRR1488491 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.4220 0.764046 0.000 0.228 0.012 0.004 0.724 0.032
#> SRR1369514 4 0.6331 0.344845 0.244 0.000 0.008 0.420 0.004 0.324
#> SRR1453299 3 0.1464 0.852493 0.000 0.036 0.944 0.000 0.004 0.016
#> SRR1436300 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1348490 5 0.3571 0.772152 0.000 0.240 0.008 0.000 0.744 0.008
#> SRR1091767 2 0.4003 0.637652 0.000 0.716 0.000 0.004 0.032 0.248
#> SRR1354467 3 0.2201 0.846227 0.000 0.036 0.904 0.004 0.000 0.056
#> SRR1069074 2 0.4101 0.598741 0.000 0.748 0.004 0.044 0.008 0.196
#> SRR1452399 2 0.4302 0.578039 0.000 0.668 0.004 0.000 0.036 0.292
#> SRR1437430 3 0.2312 0.844044 0.000 0.036 0.912 0.020 0.016 0.016
#> SRR1419736 5 0.3337 0.772184 0.000 0.260 0.004 0.000 0.736 0.000
#> SRR1313343 3 0.2125 0.847188 0.000 0.036 0.920 0.020 0.012 0.012
#> SRR1077619 4 0.6133 0.657476 0.096 0.000 0.000 0.600 0.180 0.124
#> SRR1083530 1 0.4838 0.645608 0.680 0.000 0.004 0.000 0.168 0.148
#> SRR1333633 5 0.5602 0.434292 0.000 0.036 0.332 0.028 0.576 0.028
#> SRR1354999 2 0.6764 -0.177151 0.000 0.424 0.156 0.044 0.012 0.364
#> SRR1443592 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.3420 0.741820 0.748 0.000 0.012 0.000 0.000 0.240
#> SRR1378818 5 0.4726 0.627177 0.000 0.036 0.212 0.020 0.712 0.020
#> SRR1413182 4 0.1858 0.869467 0.092 0.000 0.004 0.904 0.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.4870 0.766066 0.092 0.000 0.000 0.720 0.144 0.044
#> SRR1413075 5 0.3633 0.768342 0.000 0.252 0.004 0.000 0.732 0.012
#> SRR1487928 4 0.2113 0.868391 0.092 0.000 0.004 0.896 0.000 0.008
#> SRR1388997 2 0.3743 0.643608 0.000 0.724 0.000 0.000 0.024 0.252
#> SRR1092865 2 0.4262 0.484836 0.000 0.616 0.004 0.004 0.012 0.364
#> SRR1102729 1 0.5151 0.665061 0.612 0.000 0.016 0.076 0.000 0.296
#> SRR1456423 1 0.1501 0.756526 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1321591 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.1936 0.848563 0.000 0.036 0.928 0.016 0.012 0.008
#> SRR1339903 1 0.3601 0.714176 0.684 0.000 0.004 0.000 0.000 0.312
#> SRR1346710 1 0.4429 0.653055 0.716 0.000 0.000 0.000 0.140 0.144
#> SRR1418771 2 0.0146 0.828055 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5638 0.690259 0.000 0.212 0.024 0.020 0.644 0.100
#> SRR1480941 5 0.6243 0.413919 0.000 0.036 0.324 0.032 0.536 0.072
#> SRR1479175 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.3394 0.739432 0.752 0.000 0.012 0.000 0.000 0.236
#> SRR1433884 2 0.4372 0.554378 0.000 0.652 0.004 0.000 0.036 0.308
#> SRR1471074 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.3586 0.639737 0.000 0.720 0.000 0.000 0.012 0.268
#> SRR1355554 3 0.6919 -0.000293 0.000 0.188 0.392 0.044 0.012 0.364
#> SRR1487173 1 0.0146 0.754126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1474253 1 0.2118 0.753211 0.888 0.000 0.008 0.000 0.000 0.104
#> SRR1322918 2 0.3398 0.657284 0.000 0.740 0.000 0.000 0.008 0.252
#> SRR1318331 2 0.3354 0.668706 0.000 0.752 0.000 0.004 0.004 0.240
#> SRR1321333 3 0.1320 0.852589 0.000 0.036 0.948 0.000 0.000 0.016
#> SRR1474231 1 0.1225 0.748956 0.952 0.000 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1350545 1 0.3490 0.735336 0.724 0.000 0.008 0.000 0.000 0.268
#> SRR1091328 1 0.5273 0.608650 0.620 0.000 0.004 0.000 0.208 0.168
#> SRR814447 3 0.2400 0.842635 0.000 0.036 0.908 0.020 0.016 0.020
#> SRR1455989 3 0.6022 0.468708 0.000 0.196 0.588 0.028 0.008 0.180
#> SRR1453680 3 0.1936 0.848563 0.000 0.036 0.928 0.016 0.012 0.008
#> SRR1470356 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0405 0.825492 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1444222 2 0.0891 0.814955 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1097197 1 0.3690 0.724386 0.700 0.000 0.012 0.000 0.000 0.288
#> SRR1366729 3 0.1835 0.849285 0.000 0.036 0.932 0.016 0.008 0.008
#> SRR821282 3 0.2131 0.846224 0.000 0.036 0.920 0.016 0.012 0.016
#> SRR1074602 2 0.5084 0.491429 0.000 0.680 0.044 0.044 0.008 0.224
#> SRR814633 2 0.0000 0.828596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.6073 0.475580 0.000 0.036 0.300 0.032 0.568 0.064
#> SRR1319100 1 0.0363 0.755865 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1324004 3 0.5076 0.627290 0.000 0.036 0.636 0.024 0.012 0.292
#> SRR1457459 1 0.0146 0.755101 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1421031 4 0.3768 0.843888 0.092 0.000 0.008 0.796 0.000 0.104
#> SRR1444598 5 0.5680 0.554215 0.000 0.036 0.256 0.036 0.628 0.044
#> SRR1091743 2 0.5258 0.466283 0.000 0.668 0.056 0.044 0.008 0.224
#> SRR819637 1 0.0717 0.751203 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1083848 1 0.0000 0.754725 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.5021 0.692179 0.000 0.040 0.684 0.044 0.008 0.224
#> SRR1459785 3 0.2024 0.847638 0.000 0.036 0.924 0.020 0.008 0.012
#> SRR1083700 1 0.2508 0.740804 0.884 0.000 0.016 0.000 0.016 0.084
#> SRR1375531 1 0.5530 0.610493 0.560 0.000 0.016 0.104 0.000 0.320
#> SRR1323470 5 0.7119 0.346734 0.000 0.036 0.184 0.036 0.436 0.308
#> SRR814657 1 0.3619 0.712317 0.680 0.000 0.004 0.000 0.000 0.316
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4922 0.508 0.508
#> 3 3 0.990 0.953 0.977 0.2873 0.857 0.718
#> 4 4 0.855 0.828 0.892 0.0940 0.936 0.828
#> 5 5 0.969 0.925 0.959 0.0810 0.935 0.793
#> 6 6 0.861 0.846 0.898 0.0466 0.952 0.814
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309314 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR807679 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0424 0.97160 0.000 0.992 0.008
#> SRR809406 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.1411 0.93533 0.000 0.036 0.964
#> SRR819559 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.4452 0.77953 0.000 0.192 0.808
#> SRR1442292 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0424 0.97160 0.000 0.992 0.008
#> SRR1102320 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1070036 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1429748 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0424 0.97160 0.000 0.992 0.008
#> SRR1378308 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1329947 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1490761 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.4452 0.77549 0.000 0.192 0.808
#> SRR1402944 3 0.1529 0.93246 0.000 0.040 0.960
#> SRR1092818 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078368 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320034 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1068687 2 0.2711 0.88708 0.000 0.912 0.088
#> SRR1437491 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1354203 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1455214 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.5497 0.63254 0.000 0.292 0.708
#> SRR1097857 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1338687 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0592 0.98863 0.988 0.000 0.012
#> SRR1486821 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1418540 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 3 0.2878 0.88568 0.000 0.096 0.904
#> SRR1359487 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1080648 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365722 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1321829 2 0.0424 0.97160 0.000 0.992 0.008
#> SRR1475993 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1445387 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349300 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.2625 0.89303 0.000 0.916 0.084
#> SRR1366124 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1391811 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1088511 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0424 0.99055 0.992 0.000 0.008
#> SRR1384431 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1332141 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344034 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1080391 1 0.0424 0.99047 0.992 0.000 0.008
#> SRR1347870 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR814219 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070060 1 0.0237 0.99238 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487969 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417851 1 0.0424 0.99055 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443350 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 3 0.6111 0.40167 0.000 0.396 0.604
#> SRR1102923 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1366605 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396035 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.5363 0.63693 0.724 0.000 0.276
#> SRR1431735 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1446308 3 0.4002 0.81865 0.000 0.160 0.840
#> SRR1437346 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1103143 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1319584 3 0.1529 0.93246 0.000 0.040 0.960
#> SRR1486584 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1317939 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1079543 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.5058 0.64979 0.000 0.756 0.244
#> SRR1335314 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1400799 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1074578 1 0.0237 0.99238 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312226 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1416207 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1445023 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077599 2 0.4504 0.73934 0.000 0.804 0.196
#> SRR1453480 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.1031 0.94257 0.000 0.024 0.976
#> SRR1436949 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070429 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1458158 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1310334 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1385434 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1415591 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1402009 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1308734 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1498973 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397115 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.5497 0.55956 0.000 0.708 0.292
#> SRR1459609 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0747 0.94517 0.000 0.016 0.984
#> SRR809919 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1323651 3 0.4399 0.78443 0.000 0.188 0.812
#> SRR1357297 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.1643 0.92935 0.000 0.044 0.956
#> SRR1091230 2 0.1860 0.92837 0.000 0.948 0.052
#> SRR1470556 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1317731 3 0.0892 0.94447 0.000 0.020 0.980
#> SRR1490785 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.3038 0.87278 0.000 0.896 0.104
#> SRR812128 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101513 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1390371 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1076801 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068929 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075054 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083480 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1309333 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1413137 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1469973 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR817306 1 0.0424 0.99055 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416266 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1071011 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1435394 3 0.6295 0.17949 0.000 0.472 0.528
#> SRR1383192 1 0.0237 0.99238 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419962 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1094357 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0747 0.94517 0.000 0.016 0.984
#> SRR1356016 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312147 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0237 0.99238 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474930 2 0.1753 0.93181 0.000 0.952 0.048
#> SRR1470988 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR811915 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313770 3 0.0747 0.94517 0.000 0.016 0.984
#> SRR1315780 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464494 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357083 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1475842 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1467704 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.6140 0.38025 0.000 0.404 0.596
#> SRR1325826 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0592 0.98863 0.988 0.000 0.012
#> SRR1345692 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1097954 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454073 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1398138 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR817142 2 0.5650 0.51687 0.000 0.688 0.312
#> SRR1315291 1 0.6154 0.34271 0.592 0.000 0.408
#> SRR1309314 3 0.0747 0.94517 0.000 0.016 0.984
#> SRR1420085 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1361308 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1472126 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.1529 0.93246 0.000 0.040 0.960
#> SRR1099789 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339276 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1440290 3 0.6244 0.28195 0.000 0.440 0.560
#> SRR1330813 2 0.0237 0.97493 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458931 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1394321 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1390143 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1312169 1 0.0237 0.99238 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096687 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1447893 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1466025 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477429 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR820689 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0592 0.98854 0.988 0.000 0.012
#> SRR1355769 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 3 0.5835 0.52670 0.000 0.340 0.660
#> SRR1474485 1 0.0424 0.99047 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089998 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1095188 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1105417 1 0.0424 0.99047 0.992 0.000 0.008
#> SRR1325578 3 0.1411 0.93530 0.000 0.036 0.964
#> SRR1358161 3 0.0747 0.94517 0.000 0.016 0.984
#> SRR1358665 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452010 1 0.0237 0.99238 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418183 2 0.5948 0.40355 0.000 0.640 0.360
#> SRR1366345 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1447828 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1338747 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1350280 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1441443 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1475448 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1407291 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.2959 0.87586 0.000 0.900 0.100
#> SRR1325794 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095961 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1086702 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.2959 0.87318 0.000 0.900 0.100
#> SRR1457527 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1098831 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1488858 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454695 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1309182 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433538 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454247 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1097100 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.1411 0.94584 0.000 0.964 0.036
#> SRR1072388 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320761 2 0.4605 0.73129 0.000 0.796 0.204
#> SRR1076195 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1069895 3 0.1289 0.94048 0.000 0.032 0.968
#> SRR1099144 1 0.0592 0.98863 0.988 0.000 0.012
#> SRR1385150 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1420191 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1102583 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0747 0.94517 0.000 0.016 0.984
#> SRR1408553 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1069231 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR808299 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1481238 2 0.6302 -0.00992 0.000 0.520 0.480
#> SRR1443568 2 0.6235 0.14952 0.000 0.564 0.436
#> SRR1380249 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1080143 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1357042 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.5325 0.68681 0.004 0.248 0.748
#> SRR807679 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1078660 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331730 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.6295 0.17935 0.000 0.472 0.528
#> SRR1441934 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1488881 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1102973 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.5058 0.64979 0.000 0.756 0.244
#> SRR1074502 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0237 0.99235 0.996 0.000 0.004
#> SRR1409171 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1431887 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096525 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488491 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1369514 1 0.0592 0.98863 0.988 0.000 0.012
#> SRR1453299 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1436300 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1091767 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1069074 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1419736 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313343 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1077619 1 0.0592 0.98863 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083530 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1354999 2 0.5058 0.65778 0.000 0.756 0.244
#> SRR1443592 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0892 0.94447 0.000 0.020 0.980
#> SRR1413182 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1464559 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1413075 2 0.0237 0.97595 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487928 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1388997 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1339903 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0237 0.97502 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480941 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1479175 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 3 0.6286 0.20684 0.000 0.464 0.536
#> SRR1487173 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1474231 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1455989 3 0.5291 0.67805 0.000 0.268 0.732
#> SRR1453680 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1470356 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR821282 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1074602 2 0.0237 0.97493 0.000 0.996 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.97782 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0747 0.94517 0.000 0.016 0.984
#> SRR1319100 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1457459 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0747 0.98652 0.984 0.000 0.016
#> SRR1444598 3 0.1031 0.94257 0.000 0.024 0.976
#> SRR1091743 2 0.0424 0.97160 0.000 0.992 0.008
#> SRR819637 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.1411 0.93791 0.000 0.036 0.964
#> SRR1459785 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR1083700 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0892 0.94768 0.000 0.020 0.980
#> SRR814657 1 0.0000 0.99410 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1326059 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1409062 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809406 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1465313 4 0.4989 0.0749 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR819559 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1387899 3 0.1661 0.8737 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1395635 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1343629 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1326868 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102320 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1469926 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1098426 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1090310 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429748 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1363654 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1326317 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1469769 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 4 0.5586 0.1316 0.000 0.020 0.452 0.528
#> SRR1402944 4 0.5155 0.0875 0.000 0.004 0.468 0.528
#> SRR1092818 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1093552 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1464880 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1320034 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.5558 -0.2220 0.000 0.608 0.028 0.364
#> SRR1437491 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1329994 1 0.1637 0.6257 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1354203 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1077850 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1455214 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1092014 4 0.6050 0.1777 0.000 0.044 0.432 0.524
#> SRR1097857 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1473318 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1345974 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.1792 0.6314 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1486821 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1408788 3 0.2053 0.8538 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1359487 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1414708 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1469080 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1475993 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1077575 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1349300 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1374165 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1401146 2 0.5859 -0.5984 0.000 0.496 0.032 0.472
#> SRR1366124 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1456674 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1086490 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.4955 0.8977 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1384431 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1072055 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1359738 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332141 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1344034 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.1022 0.6000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.2216 0.8126 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR814219 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1102128 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1070060 1 0.4967 0.9016 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1487969 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1417851 1 0.4948 0.8951 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1076705 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1079380 4 0.6443 0.2561 0.000 0.072 0.400 0.528
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.0469 0.5592 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1431735 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1417387 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1445984 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1370447 1 0.0188 0.5775 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1446308 3 0.1109 0.9092 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1437346 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1468914 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 4 0.4989 0.0749 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1486584 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR813536 1 0.0188 0.5775 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1341921 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.4781 0.2528 0.000 0.660 0.336 0.004
#> SRR1335314 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074578 1 0.4955 0.8973 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1312226 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1416207 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1447371 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1069328 1 0.0188 0.5775 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445023 1 0.0188 0.5775 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077599 2 0.3105 0.7213 0.000 0.856 0.140 0.004
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1074839 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458727 4 0.4989 0.0749 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1436949 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1070429 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458158 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1432408 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1418201 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402009 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1316055 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308734 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498973 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1397115 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1392141 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR814341 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.4677 0.3096 0.000 0.680 0.316 0.004
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809919 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1370818 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 3 0.1661 0.8737 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR1357297 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR818170 4 0.5155 0.0875 0.000 0.004 0.468 0.528
#> SRR1091230 2 0.0524 0.9443 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1095285 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 3 0.4697 0.3895 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1490785 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1432032 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1447808 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR809534 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 4 0.5586 0.6647 0.000 0.452 0.020 0.528
#> SRR812128 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1415708 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1316033 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1080044 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1069871 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1095744 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1083480 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1075458 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1417023 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.4981 0.9078 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1352996 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1093172 1 0.0188 0.5775 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413137 1 0.0188 0.5775 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.4948 0.8951 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1416266 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 3 0.4991 0.0827 0.000 0.388 0.608 0.004
#> SRR1383192 1 0.4967 0.9016 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1419962 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1081639 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1312147 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.4955 0.8973 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1474930 2 0.2999 0.7141 0.000 0.864 0.132 0.004
#> SRR1470988 1 0.0188 0.5775 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 4 0.4985 0.6670 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1313770 3 0.1557 0.8875 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR819124 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1310997 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1464494 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1357083 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1378220 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467704 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1348885 4 0.6340 0.2381 0.000 0.064 0.408 0.528
#> SRR1325826 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1466812 1 0.4790 0.8598 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1097954 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1374396 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1429368 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1361436 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR817142 2 0.5080 0.0484 0.000 0.576 0.420 0.004
#> SRR1315291 1 0.0592 0.5541 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1309314 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420085 2 0.0592 0.9387 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361308 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472126 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1380482 4 0.5155 0.0875 0.000 0.004 0.468 0.528
#> SRR1099789 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1079480 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1339276 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1418368 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1399353 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1096760 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1440290 3 0.4283 0.4641 0.000 0.256 0.740 0.004
#> SRR1330813 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0188 0.9548 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1390143 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312169 1 0.4977 0.9057 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1096687 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1486139 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1470313 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1466025 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1477429 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1445701 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR820689 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1451876 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1082709 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1447784 1 0.0817 0.5931 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1355769 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1480917 4 0.7205 0.6357 0.000 0.304 0.168 0.528
#> SRR1474485 1 0.2081 0.6430 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1089998 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1318140 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1319262 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1440374 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1359565 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105417 1 0.4454 0.8117 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1325578 4 0.4989 0.0749 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1358161 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1452010 1 0.4961 0.8995 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1418183 2 0.4905 0.2032 0.000 0.632 0.364 0.004
#> SRR1366345 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1387449 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1473461 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1090837 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1447828 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1088557 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1102656 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1407291 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1405266 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1363766 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1082592 4 0.6820 0.6471 0.000 0.364 0.108 0.528
#> SRR1325794 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1095961 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.3626 0.6262 0.000 0.812 0.184 0.004
#> SRR1457527 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1090241 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1362135 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1379581 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1437668 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1084742 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1433538 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1085063 2 0.0188 0.9548 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454247 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.1109 0.9167 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1072388 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1070332 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1320761 4 0.7322 0.5637 0.000 0.244 0.224 0.532
#> SRR1076195 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069895 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099144 1 0.2868 0.6864 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1385150 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1456971 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1340574 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1444830 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096267 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1087127 4 0.4989 0.0749 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1408553 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1321942 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1094380 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077874 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR808299 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1481238 4 0.7323 0.6061 0.000 0.388 0.156 0.456
#> SRR1443568 3 0.5165 0.0175 0.000 0.484 0.512 0.004
#> SRR1380249 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1383148 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.6182 0.1446 0.020 0.020 0.436 0.524
#> SRR807679 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1333811 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.3764 0.5124 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1432542 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1418041 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1085211 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.4313 0.4566 0.000 0.260 0.736 0.004
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488881 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102973 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1071131 2 0.4761 0.2619 0.000 0.664 0.332 0.004
#> SRR1074502 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1325271 1 0.4277 0.7919 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1369514 1 0.1637 0.6246 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1453299 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1348490 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069074 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419736 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1313343 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.1211 0.6080 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1083530 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1333633 3 0.4790 0.3278 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1354999 2 0.2888 0.7535 0.000 0.872 0.124 0.004
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1378818 4 0.4989 0.0749 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1413182 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 4 0.4989 0.6689 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1487928 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102729 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1456423 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1346710 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 4 0.4992 0.6546 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1480941 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1433884 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 3 0.4872 0.1851 0.000 0.356 0.640 0.004
#> SRR1487173 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1474253 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1350545 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1091328 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR814447 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455989 3 0.3791 0.6392 0.000 0.200 0.796 0.004
#> SRR1453680 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1366729 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.9596 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 4 0.4998 0.0293 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1319100 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1324004 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457459 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1421031 1 0.0000 0.5737 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 4 0.4989 0.0749 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1091743 2 0.0188 0.9555 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819637 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1083848 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1088934 3 0.0524 0.9344 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1459785 3 0.0000 0.9424 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1375531 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1323470 3 0.0188 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR814657 1 0.4985 0.9098 0.532 0.000 0.000 0.468
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326059 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409062 2 0.1695 0.9287 0.000 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR809406 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465313 5 0.1571 0.8864 0.000 0.004 0.060 0.000 0.936
#> SRR819559 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387899 3 0.1095 0.9265 0.000 0.008 0.968 0.012 0.012
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.1695 0.9287 0.000 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR1102320 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469926 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1070036 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098426 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1090310 3 0.0162 0.9401 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1429748 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363654 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326317 2 0.1695 0.9287 0.000 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1329947 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469769 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.0992 0.9093 0.000 0.008 0.024 0.000 0.968
#> SRR1402944 5 0.0955 0.9064 0.000 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1092818 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1093552 1 0.1117 0.9563 0.964 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1464880 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1466951 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1331879 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1320034 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1068687 5 0.6400 0.1502 0.000 0.424 0.092 0.024 0.460
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.4114 0.4547 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1455214 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092014 5 0.4318 0.6007 0.000 0.008 0.296 0.008 0.688
#> SRR1097857 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.1041 0.9436 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.4559 0.1417 0.480 0.000 0.000 0.512 0.008
#> SRR1486821 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1418540 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1408788 3 0.2295 0.8493 0.000 0.088 0.900 0.008 0.004
#> SRR1359487 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1080648 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1414708 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1469080 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1300 0.9231 0.028 0.000 0.000 0.956 0.016
#> SRR1321829 2 0.1695 0.9287 0.000 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR1475993 3 0.0794 0.9442 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1445387 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077575 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1349300 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374165 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401146 5 0.3142 0.8731 0.000 0.068 0.056 0.008 0.868
#> SRR1366124 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1086490 3 0.0451 0.9374 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3300 0.7307 0.792 0.000 0.000 0.204 0.004
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1359738 3 0.0162 0.9401 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1344034 3 0.1121 0.9407 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1080391 4 0.3366 0.7222 0.212 0.000 0.000 0.784 0.004
#> SRR1347870 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR814028 2 0.2625 0.8629 0.000 0.876 0.000 0.016 0.108
#> SRR814219 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1070060 1 0.2286 0.8659 0.888 0.000 0.000 0.108 0.004
#> SRR1487969 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1417851 1 0.3527 0.7415 0.792 0.000 0.000 0.192 0.016
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1076705 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079380 5 0.0912 0.9142 0.000 0.012 0.016 0.000 0.972
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.1668 0.9184 0.000 0.028 0.032 0.000 0.940
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1436840 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1431735 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417387 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1445984 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1370447 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1446308 3 0.0867 0.9312 0.000 0.008 0.976 0.008 0.008
#> SRR1437346 3 0.0510 0.9436 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1319584 5 0.0955 0.9064 0.000 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1486584 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813536 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1341921 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1076681 2 0.4369 0.6586 0.000 0.720 0.252 0.016 0.012
#> SRR1335314 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1400799 3 0.0324 0.9389 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1074578 1 0.3048 0.7738 0.820 0.000 0.000 0.176 0.004
#> SRR1312226 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 4 0.1205 0.9195 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1445023 4 0.1041 0.9268 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1077599 2 0.3631 0.7585 0.000 0.788 0.196 0.008 0.008
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1074839 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1458727 5 0.0955 0.9064 0.000 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1436949 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1070429 3 0.0162 0.9401 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458158 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432408 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1310334 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418201 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1385434 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1415591 3 0.0000 0.9414 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1316055 4 0.1300 0.9231 0.028 0.000 0.000 0.956 0.016
#> SRR1308734 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1498973 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1397115 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392141 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR814341 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.4504 0.4939 0.000 0.648 0.336 0.008 0.008
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR809919 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 4 0.1300 0.9231 0.028 0.000 0.000 0.956 0.016
#> SRR1323651 3 0.1095 0.9265 0.000 0.008 0.968 0.012 0.012
#> SRR1357297 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR818170 5 0.0955 0.9064 0.000 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1091230 2 0.1770 0.9254 0.000 0.936 0.048 0.008 0.008
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0794 0.9442 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1317731 3 0.4210 0.3241 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1490785 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432032 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447808 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR809534 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.1661 0.9157 0.000 0.024 0.036 0.000 0.940
#> SRR812128 2 0.1626 0.9340 0.000 0.940 0.000 0.016 0.044
#> SRR1101513 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415708 2 0.1492 0.9345 0.000 0.948 0.040 0.004 0.008
#> SRR1316033 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1076801 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1075054 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417023 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1309333 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1333676 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352996 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1093172 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1413137 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1469973 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1420026 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR817306 1 0.3196 0.7506 0.804 0.000 0.000 0.192 0.004
#> SRR1416266 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1435394 3 0.4318 0.5427 0.000 0.296 0.688 0.008 0.008
#> SRR1383192 1 0.2629 0.8312 0.860 0.000 0.000 0.136 0.004
#> SRR1419962 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1312147 1 0.0671 0.9693 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.2970 0.7857 0.828 0.000 0.000 0.168 0.004
#> SRR1474930 2 0.2444 0.9063 0.000 0.904 0.068 0.016 0.012
#> SRR1470988 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.1828 0.9171 0.000 0.028 0.032 0.004 0.936
#> SRR1313770 3 0.1831 0.9139 0.000 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310997 5 0.1410 0.9296 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1464494 5 0.1410 0.9296 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1357083 3 0.0451 0.9374 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1475842 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1378085 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378220 3 0.0162 0.9401 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1467704 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1348885 5 0.1012 0.9131 0.000 0.012 0.020 0.000 0.968
#> SRR1325826 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466812 1 0.4415 0.1267 0.552 0.000 0.000 0.444 0.004
#> SRR1345692 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1401040 3 0.0162 0.9419 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1454073 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1355747 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1429368 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1398138 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1379260 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361436 3 0.0000 0.9414 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.4811 0.0931 0.000 0.512 0.472 0.008 0.008
#> SRR1315291 4 0.0865 0.9251 0.024 0.000 0.004 0.972 0.000
#> SRR1309314 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1420085 2 0.1386 0.9444 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032
#> SRR1361308 3 0.0162 0.9419 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1472126 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380482 5 0.0955 0.9064 0.000 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399353 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1096760 3 0.0324 0.9389 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1440290 3 0.2968 0.8068 0.000 0.112 0.864 0.012 0.012
#> SRR1330813 2 0.1618 0.9318 0.000 0.944 0.040 0.008 0.008
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1394321 1 0.0162 0.9769 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0703 0.9512 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1390143 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0000 0.9414 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0771 0.9628 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1096687 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1447893 3 0.0451 0.9374 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1466025 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1477429 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445701 3 0.0912 0.9301 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR820689 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.1153 0.9465 0.000 0.964 0.024 0.004 0.008
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489328 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1344462 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082709 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447784 4 0.3055 0.7994 0.144 0.000 0.000 0.840 0.016
#> SRR1355769 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 5 0.1444 0.9124 0.000 0.012 0.040 0.000 0.948
#> SRR1474485 1 0.4599 0.2716 0.600 0.000 0.000 0.384 0.016
#> SRR1089998 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318140 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319262 3 0.0162 0.9401 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095188 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0000 0.9414 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.3231 0.7349 0.800 0.000 0.000 0.196 0.004
#> SRR1325578 5 0.0955 0.9064 0.000 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1358161 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1452010 1 0.2536 0.8407 0.868 0.000 0.000 0.128 0.004
#> SRR1418183 2 0.5143 0.3461 0.000 0.576 0.388 0.024 0.012
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473461 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090837 3 0.0451 0.9374 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1447828 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0794 0.9442 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1350280 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088557 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102656 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1441443 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1370682 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1475448 3 0.0451 0.9374 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1407291 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405266 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363766 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082592 5 0.1364 0.9256 0.000 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1325794 5 0.1668 0.9184 0.000 0.028 0.032 0.000 0.940
#> SRR1095961 3 0.0794 0.9442 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.4692 0.6091 0.000 0.688 0.276 0.024 0.012
#> SRR1457527 3 0.0955 0.9441 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0955 0.9441 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1488858 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1454695 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1090241 2 0.1412 0.9361 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1379581 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1309182 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1437668 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1084742 5 0.1410 0.9296 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1433538 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085063 2 0.0880 0.9447 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1454247 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3167 0.8217 0.000 0.836 0.148 0.008 0.008
#> SRR1072388 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1070332 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1320761 5 0.1626 0.9124 0.000 0.016 0.044 0.000 0.940
#> SRR1076195 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1069895 3 0.0579 0.9352 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1099144 4 0.3264 0.7706 0.164 0.000 0.000 0.820 0.016
#> SRR1385150 3 0.0162 0.9401 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1102583 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456971 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.1869 0.9311 0.000 0.936 0.036 0.016 0.012
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 5 0.0880 0.9021 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1408553 4 0.0955 0.9293 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1069231 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0162 0.9769 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1770 0.9260 0.000 0.936 0.048 0.008 0.008
#> SRR1077874 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR808299 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1481238 5 0.3116 0.8437 0.000 0.012 0.124 0.012 0.852
#> SRR1443568 3 0.5257 -0.0214 0.000 0.476 0.488 0.024 0.012
#> SRR1380249 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1080143 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1383148 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1357042 1 0.0162 0.9769 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416025 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1431015 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1078709 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR813283 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.1828 0.8923 0.000 0.004 0.032 0.028 0.936
#> SRR807679 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333811 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1078660 2 0.3961 0.6484 0.000 0.736 0.000 0.016 0.248
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432542 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418041 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.2846 0.8035 0.000 0.120 0.864 0.008 0.008
#> SRR1441934 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1472552 3 0.0000 0.9414 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.0162 0.9419 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.4202 0.6923 0.000 0.744 0.228 0.016 0.012
#> SRR1074502 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325271 1 0.3527 0.7281 0.792 0.000 0.000 0.192 0.016
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0162 0.9652 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384091 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.1753 0.9197 0.000 0.032 0.032 0.000 0.936
#> SRR1369514 4 0.4410 0.2947 0.440 0.000 0.000 0.556 0.004
#> SRR1453299 3 0.0955 0.9441 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1091767 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1354467 3 0.0162 0.9419 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1069074 2 0.1455 0.9377 0.000 0.952 0.032 0.008 0.008
#> SRR1452399 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1437430 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1419736 5 0.1544 0.9316 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1313343 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1077619 4 0.3988 0.6690 0.252 0.000 0.000 0.732 0.016
#> SRR1083530 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333633 5 0.3274 0.6994 0.000 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1354999 2 0.3757 0.8037 0.000 0.808 0.156 0.024 0.012
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.0880 0.9021 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1413182 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1464559 4 0.1300 0.9231 0.028 0.000 0.000 0.956 0.016
#> SRR1413075 5 0.1410 0.9296 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1487928 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1388997 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1092865 2 0.1701 0.9396 0.000 0.944 0.028 0.016 0.012
#> SRR1102729 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456423 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1339903 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1346710 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.2204 0.9120 0.000 0.036 0.036 0.008 0.920
#> SRR1480941 3 0.0880 0.9439 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433884 2 0.0912 0.9577 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1355554 3 0.4820 0.5173 0.000 0.300 0.664 0.024 0.012
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1322918 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1318331 2 0.0798 0.9592 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1321333 3 0.0955 0.9441 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0510 0.9717 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR814447 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1455989 3 0.3246 0.7128 0.000 0.184 0.808 0.000 0.008
#> SRR1453680 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0162 0.9652 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1097197 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1366729 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR821282 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1074602 2 0.1618 0.9318 0.000 0.944 0.040 0.008 0.008
#> SRR814633 2 0.0000 0.9666 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.4219 0.2511 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0451 0.9371 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.0794 0.9306 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1444598 5 0.0955 0.9064 0.000 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1091743 2 0.1695 0.9287 0.000 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR819637 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.0867 0.9315 0.000 0.008 0.976 0.008 0.008
#> SRR1459785 3 0.1124 0.9431 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9781 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323470 3 0.1211 0.9241 0.000 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR814657 1 0.0162 0.9780 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1467726 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR815446 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1402132 1 0.1814 0.8997 0.900 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.1007 0.9313 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.3652 0.4913 0.000 0.672 0.000 0.004 0.000 0.324
#> SRR809406 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 5 0.2171 0.9188 0.000 0.032 0.040 0.000 0.912 0.016
#> SRR819559 1 0.0547 0.9394 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 6 0.6030 -0.0701 0.000 0.208 0.364 0.004 0.000 0.424
#> SRR1442292 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.3636 0.4984 0.000 0.676 0.000 0.004 0.000 0.320
#> SRR1102320 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.1958 0.8983 0.000 0.100 0.896 0.004 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0713 0.9365 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.3699 0.4684 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR1378308 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1366919 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0291 0.9153 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490761 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1380122 5 0.0000 0.9600 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402944 5 0.0146 0.9591 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1092818 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.2581 0.8687 0.856 0.128 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1464880 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078368 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1349608 6 0.0937 0.6906 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1466951 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1331879 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320034 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 6 0.5287 0.4903 0.000 0.208 0.008 0.000 0.156 0.628
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1374005 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.4493 0.4030 0.364 0.040 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1077992 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1455214 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 5 0.5418 0.6377 0.000 0.208 0.080 0.004 0.660 0.048
#> SRR1097857 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0146 0.9180 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1071207 4 0.5651 0.1445 0.400 0.152 0.000 0.448 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 3 0.4664 0.6423 0.000 0.316 0.632 0.004 0.004 0.044
#> SRR1359487 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.2048 0.8847 0.880 0.120 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.2278 0.8773 0.868 0.128 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1469080 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365722 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1448118 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1444808 4 0.2278 0.8429 0.004 0.128 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.3652 0.4913 0.000 0.672 0.000 0.004 0.000 0.324
#> SRR1475993 3 0.0547 0.9176 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349300 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1473870 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 5 0.3604 0.7974 0.000 0.160 0.008 0.004 0.796 0.032
#> SRR1366124 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.2668 0.8603 0.000 0.168 0.828 0.004 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1404577 1 0.3516 0.7701 0.788 0.048 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0260 0.9393 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.2053 0.8943 0.000 0.108 0.888 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 6 0.0865 0.7557 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR814515 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1357999 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344034 3 0.2272 0.8977 0.000 0.056 0.900 0.000 0.040 0.004
#> SRR1080391 4 0.3455 0.7279 0.180 0.036 0.000 0.784 0.000 0.000
#> SRR1347870 6 0.0260 0.7483 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR814028 6 0.1858 0.7008 0.000 0.004 0.000 0.000 0.092 0.904
#> SRR814219 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0790 0.9354 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1418346 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070060 1 0.2660 0.8651 0.868 0.048 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1487969 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417851 1 0.4526 0.6997 0.704 0.132 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1403199 1 0.2278 0.8773 0.868 0.128 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102923 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1369560 5 0.0632 0.9509 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1366605 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1396035 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1390223 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1436840 6 0.0458 0.7368 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1445573 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1375394 4 0.0603 0.8940 0.000 0.016 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.1152 0.8930 0.004 0.044 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1446308 3 0.4390 0.7037 0.000 0.272 0.676 0.004 0.000 0.048
#> SRR1437346 3 0.0865 0.9161 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1086466 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1319584 5 0.0146 0.9591 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1486584 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.1219 0.8908 0.004 0.048 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1079730 1 0.0260 0.9393 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.3862 0.8842 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1453259 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1340828 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1079543 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR816427 6 0.0260 0.7476 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1076681 6 0.2815 0.6983 0.000 0.120 0.032 0.000 0.000 0.848
#> SRR1335314 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.2362 0.8820 0.000 0.136 0.860 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074578 1 0.3293 0.7992 0.812 0.048 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR1312226 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 4 0.1434 0.8867 0.012 0.048 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1445023 4 0.1151 0.8952 0.012 0.032 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.4799 0.2979 0.000 0.656 0.088 0.004 0.000 0.252
#> SRR1453480 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1101834 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1321744 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 6 0.0713 0.7566 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1458727 5 0.1387 0.9180 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1436949 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070429 3 0.2320 0.8832 0.000 0.132 0.864 0.004 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.1010 0.8915 0.004 0.036 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0547 0.9385 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.1957 0.8957 0.000 0.112 0.888 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.2278 0.8429 0.004 0.128 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1308734 3 0.0291 0.9153 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1498973 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397115 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1313601 2 0.5226 0.1128 0.000 0.628 0.196 0.004 0.000 0.172
#> SRR1459609 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1499325 3 0.0291 0.9153 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 4 0.2278 0.8429 0.004 0.128 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1323651 6 0.6030 -0.0702 0.000 0.208 0.364 0.004 0.000 0.424
#> SRR1357297 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 5 0.1327 0.9209 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1091230 2 0.3699 0.4684 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR1470556 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR812318 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1498 0.9050 0.000 0.032 0.940 0.000 0.000 0.028
#> SRR1317731 3 0.3076 0.6449 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1490785 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0937 0.9328 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1397312 5 0.0972 0.9456 0.000 0.028 0.000 0.000 0.964 0.008
#> SRR812128 6 0.0993 0.7379 0.000 0.012 0.000 0.000 0.024 0.964
#> SRR1101513 1 0.0790 0.9355 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.3995 0.4067 0.000 0.516 0.000 0.004 0.000 0.480
#> SRR1316033 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1480263 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1464473 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0146 0.9395 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1474295 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0260 0.9393 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068929 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1490097 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1075054 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 4 0.1500 0.8828 0.012 0.052 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1309333 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1333676 1 0.1333 0.9264 0.944 0.048 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.1152 0.8930 0.004 0.044 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1413137 4 0.1152 0.8930 0.004 0.044 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1469973 6 0.0458 0.7583 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1420026 6 0.0260 0.7476 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR817306 1 0.3618 0.7599 0.776 0.048 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1416266 4 0.1010 0.8955 0.004 0.036 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1090290 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.5548 -0.1957 0.000 0.504 0.368 0.004 0.000 0.124
#> SRR1383192 1 0.3044 0.8332 0.836 0.048 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1351082 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1397348 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312147 1 0.2489 0.8716 0.860 0.128 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1335470 1 0.3172 0.8148 0.824 0.048 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1474930 6 0.1970 0.7262 0.000 0.092 0.008 0.000 0.000 0.900
#> SRR1470988 4 0.1152 0.8930 0.004 0.044 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1444436 5 0.2110 0.8973 0.000 0.084 0.000 0.004 0.900 0.012
#> SRR1313770 3 0.1152 0.8914 0.000 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1315780 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464494 5 0.0363 0.9576 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1357083 3 0.2772 0.8514 0.000 0.180 0.816 0.004 0.000 0.000
#> SRR1475842 6 0.0865 0.7000 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1378085 1 0.0363 0.9395 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.2362 0.8821 0.000 0.136 0.860 0.004 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 5 0.1738 0.9240 0.000 0.016 0.052 0.000 0.928 0.004
#> SRR1325826 1 0.0632 0.9373 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.4726 0.1624 0.528 0.048 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR1345692 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1401040 3 0.1610 0.9035 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1454073 6 0.0146 0.7566 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1355747 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 6 0.0363 0.7579 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1379260 1 0.2278 0.8773 0.868 0.128 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.2178 0.8855 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.5110 0.1084 0.000 0.644 0.192 0.004 0.000 0.160
#> SRR1315291 4 0.0603 0.8940 0.000 0.016 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1309314 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420085 6 0.0935 0.7448 0.000 0.004 0.000 0.000 0.032 0.964
#> SRR1361308 3 0.0547 0.9173 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.0146 0.9591 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0937 0.9329 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.2402 0.8795 0.000 0.140 0.856 0.004 0.000 0.000
#> SRR1440290 6 0.5988 0.0550 0.000 0.208 0.332 0.004 0.000 0.456
#> SRR1330813 2 0.3699 0.4684 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR1458931 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR812294 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.1007 0.9248 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1469704 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1086752 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1084698 2 0.4763 0.8290 0.000 0.536 0.000 0.000 0.052 0.412
#> SRR1390143 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1099570 3 0.1663 0.9029 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.1780 0.9136 0.924 0.048 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.0291 0.9012 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1447893 3 0.2979 0.8416 0.000 0.188 0.804 0.004 0.000 0.004
#> SRR1466025 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477429 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 6 0.5973 0.0446 0.000 0.208 0.324 0.004 0.000 0.464
#> SRR820689 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.3950 0.6735 0.000 0.564 0.000 0.004 0.000 0.432
#> SRR1452537 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1383301 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 6 0.0146 0.7566 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1344462 1 0.0632 0.9373 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.3914 0.7573 0.104 0.128 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1391985 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 5 0.0632 0.9508 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1474485 1 0.5399 0.2224 0.528 0.128 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0547 0.9380 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0547 0.9380 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.2006 0.8959 0.000 0.104 0.892 0.004 0.000 0.000
#> SRR1095188 6 0.0865 0.7557 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0146 0.9395 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.1610 0.9036 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.3585 0.7462 0.780 0.048 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1325578 5 0.1588 0.9139 0.000 0.004 0.072 0.000 0.924 0.000
#> SRR1358161 3 0.0291 0.9153 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358665 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1333971 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452010 1 0.2860 0.8480 0.852 0.048 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1418183 6 0.4121 0.6253 0.000 0.208 0.056 0.004 0.000 0.732
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0547 0.9380 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0937 0.9363 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.2738 0.8543 0.000 0.176 0.820 0.004 0.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1333038 3 0.0260 0.9179 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0790 0.9356 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 5 0.0508 0.9526 0.000 0.004 0.000 0.000 0.984 0.012
#> SRR1441443 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1370682 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.2738 0.8543 0.000 0.176 0.820 0.004 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 5 0.0291 0.9599 0.000 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1325794 5 0.0972 0.9456 0.000 0.028 0.000 0.000 0.964 0.008
#> SRR1095961 3 0.0790 0.9159 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1320806 6 0.4003 0.6293 0.000 0.208 0.048 0.004 0.000 0.740
#> SRR1457527 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1474374 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.3620 0.7385 0.000 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1329863 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433538 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.4901 0.8085 0.000 0.484 0.000 0.000 0.060 0.456
#> SRR1454247 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1097100 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR818622 2 0.4074 0.4368 0.000 0.656 0.016 0.004 0.000 0.324
#> SRR1072388 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320761 5 0.0146 0.9593 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1076195 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1069895 3 0.4492 0.7361 0.000 0.216 0.700 0.004 0.000 0.080
#> SRR1099144 4 0.4165 0.7246 0.128 0.128 0.000 0.744 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.2006 0.8959 0.000 0.104 0.892 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1332625 4 0.1588 0.8754 0.004 0.072 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2278 0.8773 0.868 0.128 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 6 0.3565 0.5642 0.000 0.304 0.000 0.004 0.000 0.692
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 5 0.0146 0.9591 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1408553 4 0.1152 0.8930 0.004 0.044 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.1007 0.9313 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1362103 1 0.0937 0.9265 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1099330 2 0.3820 0.4608 0.000 0.660 0.004 0.004 0.000 0.332
#> SRR1077874 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR808299 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1098050 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1481238 5 0.5526 0.6375 0.000 0.140 0.040 0.004 0.660 0.156
#> SRR1443568 6 0.4106 0.6294 0.000 0.188 0.076 0.000 0.000 0.736
#> SRR1380249 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.1075 0.9338 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 6 0.0260 0.7483 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1431015 6 0.0146 0.7520 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1078709 6 0.0146 0.7566 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR813283 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1347707 5 0.4276 0.7967 0.000 0.076 0.124 0.024 0.772 0.004
#> SRR807679 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.0862 0.9153 0.000 0.016 0.972 0.000 0.004 0.008
#> SRR1078660 6 0.2669 0.6475 0.000 0.008 0.000 0.000 0.156 0.836
#> SRR1331730 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1333913 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.2278 0.8773 0.868 0.128 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0865 0.9343 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1402437 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1396822 2 0.5398 -0.1266 0.000 0.540 0.344 0.004 0.000 0.112
#> SRR1441934 6 0.0458 0.7564 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1472552 3 0.2178 0.8855 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.1663 0.9025 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 6 0.2255 0.7245 0.000 0.080 0.028 0.000 0.000 0.892
#> SRR1074502 1 0.0713 0.9364 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.4583 0.6532 0.696 0.128 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR809113 2 0.3862 0.8846 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1430045 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1441245 6 0.3737 -0.6511 0.000 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1384091 4 0.0603 0.9001 0.004 0.016 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.3982 0.8949 0.000 0.536 0.000 0.000 0.004 0.460
#> SRR1096525 4 0.1010 0.8955 0.004 0.036 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1356351 5 0.0713 0.9486 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1369514 4 0.4756 0.2872 0.408 0.052 0.000 0.540 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.0146 0.9180 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.0000 0.9600 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1354467 3 0.1714 0.9014 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.3756 0.5499 0.000 0.644 0.000 0.004 0.000 0.352
#> SRR1452399 6 0.0790 0.7567 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1437430 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313343 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.4860 0.6236 0.216 0.128 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.1387 0.9134 0.932 0.068 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 5 0.3588 0.7369 0.000 0.044 0.180 0.000 0.776 0.000
#> SRR1354999 6 0.4121 0.6237 0.000 0.208 0.056 0.004 0.000 0.732
#> SRR1443592 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1077356 1 0.0260 0.9393 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.0146 0.9591 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1413182 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.2278 0.8429 0.004 0.128 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1413075 5 0.0146 0.9612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487928 4 0.0146 0.9019 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1388997 6 0.0146 0.7524 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1092865 6 0.1957 0.7195 0.000 0.112 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR1102729 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1376874 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.2048 0.8847 0.880 0.120 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1095358 5 0.2455 0.8712 0.000 0.112 0.000 0.004 0.872 0.012
#> SRR1480941 3 0.1152 0.9094 0.000 0.044 0.952 0.000 0.004 0.000
#> SRR1479175 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1313891 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1491354 1 0.0632 0.9373 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 6 0.1075 0.7509 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1471074 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1353052 6 0.0260 0.7541 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1355554 6 0.5555 0.3350 0.000 0.208 0.212 0.004 0.000 0.576
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0458 0.9386 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 6 0.0260 0.7483 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1318331 6 0.0632 0.7232 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1321333 3 0.0260 0.9179 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0547 0.9387 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.2135 0.8798 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 3 0.5059 0.5935 0.000 0.168 0.652 0.004 0.000 0.176
#> SRR1453680 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1342977 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1444222 2 0.3862 0.8851 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1097197 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.3699 0.4684 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR814633 2 0.3854 0.9005 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1072480 3 0.3989 0.0641 0.000 0.004 0.528 0.000 0.468 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.5336 0.5418 0.000 0.140 0.596 0.004 0.000 0.260
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.0508 0.9007 0.004 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1444598 5 0.1753 0.9067 0.000 0.000 0.084 0.000 0.912 0.004
#> SRR1091743 2 0.3699 0.4684 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR819637 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.4543 0.7280 0.000 0.224 0.692 0.004 0.000 0.080
#> SRR1459785 3 0.0000 0.9179 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9395 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0865 0.9342 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 6 0.5887 0.2671 0.000 0.264 0.200 0.004 0.004 0.528
#> SRR814657 1 0.1075 0.9298 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.997 0.999 0.4920 0.508 0.508
#> 3 3 0.971 0.953 0.980 0.2796 0.862 0.728
#> 4 4 0.829 0.839 0.918 0.1358 0.910 0.759
#> 5 5 0.744 0.769 0.855 0.0897 0.918 0.720
#> 6 6 0.729 0.662 0.793 0.0443 0.964 0.842
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.999 0.0624 0.516 0.484
#> SRR1431735 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.163 0.9733 0.976 0.024
#> SRR1309314 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 1.0000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 0.9976 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0892 0.95305 0.000 0.980 0.020
#> SRR809406 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.2537 0.88724 0.000 0.080 0.920
#> SRR819559 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.4399 0.76467 0.000 0.188 0.812
#> SRR1442292 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0237 0.96442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102320 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0592 0.95894 0.000 0.988 0.012
#> SRR1378308 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.6026 0.39986 0.000 0.624 0.376
#> SRR1402944 3 0.6192 0.25888 0.000 0.420 0.580
#> SRR1092818 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.5254 0.63588 0.000 0.736 0.264
#> SRR1437491 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.3340 0.86120 0.000 0.880 0.120
#> SRR1097857 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 3 0.6308 -0.00415 0.000 0.492 0.508
#> SRR1359487 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.2878 0.88581 0.000 0.904 0.096
#> SRR1475993 3 0.3038 0.86400 0.000 0.104 0.896
#> SRR1445387 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.3340 0.86079 0.000 0.880 0.120
#> SRR1366124 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.1289 0.94435 0.000 0.968 0.032
#> SRR1442173 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0424 0.96168 0.000 0.992 0.008
#> SRR1102923 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.1753 0.93066 0.000 0.952 0.048
#> SRR1366605 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.4555 0.72867 0.200 0.000 0.800
#> SRR1431735 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446308 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.5948 0.46514 0.000 0.640 0.360
#> SRR1486584 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.5621 0.54466 0.000 0.692 0.308
#> SRR1335314 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.3551 0.84721 0.000 0.868 0.132
#> SRR1453480 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.0237 0.94747 0.000 0.004 0.996
#> SRR1402009 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308734 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.3879 0.82361 0.000 0.848 0.152
#> SRR1459609 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 3 0.2537 0.88661 0.000 0.080 0.920
#> SRR1357297 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.5178 0.65736 0.000 0.256 0.744
#> SRR1091230 2 0.3752 0.83302 0.000 0.856 0.144
#> SRR1470556 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 3 0.0237 0.94741 0.000 0.004 0.996
#> SRR1490785 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.2537 0.90202 0.000 0.920 0.080
#> SRR812128 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0592 0.95896 0.000 0.988 0.012
#> SRR1316033 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.4399 0.77797 0.000 0.812 0.188
#> SRR1383192 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0892 0.95286 0.000 0.980 0.020
#> SRR1470988 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.1529 0.93772 0.000 0.960 0.040
#> SRR1313770 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0237 0.96435 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357083 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.1753 0.93133 0.000 0.952 0.048
#> SRR1325826 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.3816 0.82840 0.000 0.852 0.148
#> SRR1315291 3 0.4654 0.71685 0.208 0.000 0.792
#> SRR1309314 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.6286 0.16293 0.000 0.536 0.464
#> SRR1099789 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 3 0.4504 0.75467 0.000 0.196 0.804
#> SRR1330813 2 0.1643 0.93406 0.000 0.956 0.044
#> SRR1458931 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.4062 0.79560 0.000 0.164 0.836
#> SRR820689 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.6111 0.37578 0.000 0.604 0.396
#> SRR1474485 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.1411 0.94119 0.000 0.964 0.036
#> SRR1454350 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.6045 0.41680 0.000 0.620 0.380
#> SRR1358161 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 3 0.5016 0.69096 0.000 0.240 0.760
#> SRR1366345 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.0424 0.94471 0.000 0.008 0.992
#> SRR1086702 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.1860 0.92602 0.000 0.948 0.052
#> SRR1457527 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0237 0.96441 0.000 0.996 0.004
#> SRR1329863 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.2959 0.88199 0.000 0.900 0.100
#> SRR1072388 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.2878 0.88681 0.000 0.904 0.096
#> SRR1076195 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069895 3 0.4702 0.73147 0.000 0.212 0.788
#> SRR1099144 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0424 0.96168 0.000 0.992 0.008
#> SRR1077874 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 3 0.6308 0.00218 0.000 0.492 0.508
#> SRR1443568 3 0.5591 0.58825 0.000 0.304 0.696
#> SRR1380249 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.3482 0.84548 0.000 0.872 0.128
#> SRR807679 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.3412 0.85708 0.000 0.876 0.124
#> SRR1441934 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.4931 0.69184 0.000 0.768 0.232
#> SRR1074502 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.3192 0.86953 0.000 0.888 0.112
#> SRR1369514 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.1860 0.92801 0.000 0.948 0.052
#> SRR1437430 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.6126 0.34850 0.000 0.600 0.400
#> SRR1443592 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.2356 0.90961 0.000 0.928 0.072
#> SRR1480941 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 3 0.4504 0.75410 0.000 0.196 0.804
#> SRR1487173 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.3619 0.84268 0.000 0.864 0.136
#> SRR1453680 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0237 0.96441 0.000 0.996 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.96706 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0592 0.94189 0.000 0.012 0.988
#> SRR1457459 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 3 0.2356 0.89353 0.000 0.072 0.928
#> SRR1091743 2 0.3551 0.84726 0.000 0.868 0.132
#> SRR819637 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.5138 0.67974 0.000 0.748 0.252
#> SRR1459785 3 0.0000 0.95008 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.5810 0.52161 0.000 0.664 0.336
#> SRR814657 1 0.0000 1.00000 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0707 0.9481 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1402132 4 0.3219 0.7922 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1326059 1 0.0707 0.8788 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1409062 2 0.0817 0.9400 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.3392 0.8484 0.000 0.072 0.872 0.056
#> SRR819559 1 0.4356 0.5908 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1387899 3 0.3219 0.7755 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.1867 0.8479 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0188 0.9492 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102320 1 0.4916 -0.0547 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1469926 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.1716 0.8528 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1098426 4 0.4989 0.1722 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1090310 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.1211 0.8723 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1363654 1 0.0188 0.8823 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326317 2 0.0592 0.9444 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.6135 0.3560 0.000 0.568 0.376 0.056
#> SRR1402944 3 0.6179 0.2289 0.000 0.392 0.552 0.056
#> SRR1092818 1 0.1940 0.8455 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1093552 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1464880 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0336 0.9495 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466951 2 0.0817 0.9469 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1331879 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1320034 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.5298 0.6549 0.000 0.708 0.244 0.048
#> SRR1437491 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.2281 0.8256 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1354203 1 0.0921 0.8770 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1077850 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1455214 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1092014 2 0.4259 0.8309 0.000 0.816 0.128 0.056
#> SRR1097857 1 0.3266 0.7545 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.2081 0.8293 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1486821 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 4 0.4996 0.1290 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1408788 2 0.5000 0.0309 0.000 0.500 0.500 0.000
#> SRR1359487 4 0.2149 0.8330 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1080648 1 0.1637 0.8553 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1414708 1 0.4356 0.5799 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1469080 2 0.1474 0.9384 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1321829 2 0.2345 0.8776 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1475993 3 0.2281 0.8572 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1445387 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1077575 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1349300 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 4 0.3975 0.6933 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.1557 0.8522 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1401146 2 0.2888 0.8521 0.000 0.872 0.124 0.004
#> SRR1366124 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1391811 1 0.0707 0.8792 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1456674 4 0.4304 0.6312 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1086490 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4605 0.6145 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1384431 1 0.1867 0.8526 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1072055 1 0.3266 0.7674 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1359738 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0336 0.8821 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1085900 2 0.1820 0.9332 0.000 0.944 0.036 0.020
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0469 0.9489 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR814515 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1344034 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080391 4 0.2530 0.8276 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR1347870 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR814028 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR814219 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1474 0.8663 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1070060 4 0.4730 0.5781 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR1487969 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1417851 4 0.4040 0.6832 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.4977 0.2467 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1076705 1 0.4193 0.6164 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1079380 2 0.1890 0.9341 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.3009 0.9053 0.000 0.892 0.052 0.056
#> SRR1366605 2 0.0336 0.9496 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.1389 0.9402 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.5112 0.2726 0.008 0.000 0.384 0.608
#> SRR1431735 4 0.4941 0.2657 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1417387 1 0.4564 0.5184 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1445984 4 0.4994 0.1639 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1370447 4 0.2921 0.8162 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR1446308 3 0.0336 0.9421 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1437346 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.1867 0.8471 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.1716 0.8347 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1319584 2 0.5790 0.4798 0.000 0.616 0.340 0.044
#> SRR1486584 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.3688 0.7693 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1317939 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1079730 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.4406 0.6655 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1076681 2 0.5108 0.5406 0.000 0.672 0.308 0.020
#> SRR1335314 4 0.2149 0.8330 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1400799 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074578 4 0.4277 0.6935 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1312226 2 0.1474 0.9386 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1416207 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0336 0.8824 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1069328 4 0.3726 0.7703 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1445023 4 0.2216 0.8323 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1077599 2 0.3074 0.8266 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4382 0.5745 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1074839 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1458727 3 0.1557 0.9107 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1436949 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1070429 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1310334 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1415591 3 0.0188 0.9446 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1402009 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1316055 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1308734 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1397115 1 0.3219 0.7064 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1392141 4 0.4543 0.5683 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR814341 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.3172 0.8124 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809919 1 0.1557 0.8627 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1370818 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1323651 3 0.2011 0.8728 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1357297 4 0.4804 0.5560 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR818170 3 0.5288 0.6500 0.000 0.224 0.720 0.056
#> SRR1091230 2 0.3123 0.8186 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0188 0.8826 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095285 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 3 0.1452 0.9194 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1490785 1 0.3400 0.7441 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1432032 1 0.3024 0.7807 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1447808 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR809534 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.3601 0.8772 0.000 0.860 0.084 0.056
#> SRR812128 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1101513 1 0.0707 0.8788 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1415708 2 0.0469 0.9464 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1316033 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.4955 0.1984 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1080044 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.4103 0.7263 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1069871 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1075054 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1083480 1 0.0921 0.8770 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1075458 1 0.1716 0.8535 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1417023 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1309333 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1333676 1 0.3569 0.7223 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1352996 1 0.3486 0.6692 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1093172 4 0.2760 0.8214 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1413137 4 0.2973 0.8165 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1469973 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1420026 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR817306 4 0.3400 0.7944 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1416266 4 0.2760 0.8214 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.1637 0.8345 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1435394 2 0.3837 0.7376 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1383192 4 0.4713 0.5830 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1419962 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.4933 -0.0332 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1081639 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1312147 4 0.4134 0.6756 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2345 0.8305 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1474930 2 0.1724 0.9362 0.000 0.948 0.032 0.020
#> SRR1470988 4 0.2760 0.8214 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR811915 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.2751 0.9151 0.000 0.904 0.040 0.056
#> SRR1313770 3 0.0188 0.9450 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.4977 -0.1434 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1310997 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1464494 2 0.1743 0.9357 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1357083 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.3400 0.7277 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1378220 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.1867 0.8471 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1348885 2 0.2840 0.9116 0.000 0.900 0.044 0.056
#> SRR1325826 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.2760 0.8214 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1345692 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1401040 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.1022 0.8754 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1374396 4 0.2149 0.8330 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1454073 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1355747 1 0.4941 0.1245 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1429368 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1379260 1 0.4830 0.3480 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1361436 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817142 2 0.3219 0.8105 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1315291 4 0.4072 0.5769 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1309314 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420085 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1361308 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.6257 0.2028 0.000 0.508 0.436 0.056
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1339276 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 4 0.4907 0.4740 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1096760 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 3 0.3266 0.7711 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1330813 2 0.1302 0.9268 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1458931 2 0.0592 0.9483 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR812294 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1394321 1 0.3942 0.6855 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.1118 0.9421 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1390143 1 0.3942 0.6790 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312169 4 0.4804 0.5560 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1096687 4 0.2408 0.8301 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1486139 1 0.0469 0.8823 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470313 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1447893 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1477429 4 0.2149 0.8330 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1445701 3 0.2868 0.8091 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0188 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4304 0.5187 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1489328 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1344462 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1355769 4 0.4817 0.5489 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.6055 0.3986 0.000 0.576 0.372 0.052
#> SRR1474485 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1089998 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1318140 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.1820 0.9326 0.000 0.944 0.036 0.020
#> SRR1454350 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105417 4 0.3649 0.7727 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1325578 2 0.6069 0.4369 0.000 0.588 0.356 0.056
#> SRR1358161 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.1474 0.9384 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1452010 4 0.4761 0.5674 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1418183 3 0.4212 0.7030 0.000 0.216 0.772 0.012
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.4304 0.6064 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1090837 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.4164 0.5329 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1088557 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1102656 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1441443 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1370682 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.1211 0.8731 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1363766 1 0.3528 0.6604 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1082592 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1325794 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1095961 3 0.0336 0.9415 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.2751 0.9142 0.000 0.904 0.040 0.056
#> SRR1457527 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1454695 4 0.4304 0.6560 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1090241 2 0.0188 0.9491 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.1022 0.8706 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1362135 1 0.4454 0.5454 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1379581 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.5000 -0.0898 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1084742 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1433538 1 0.0336 0.8816 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1085063 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1454247 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.2530 0.8704 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1072388 4 0.4925 0.2925 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1070332 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1320761 2 0.3858 0.8614 0.000 0.844 0.100 0.056
#> SRR1076195 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1069895 3 0.3444 0.7504 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1099144 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1385150 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1102583 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 4 0.4040 0.6832 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1340574 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0469 0.9398 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1408553 4 0.2760 0.8214 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1069231 4 0.4855 0.5320 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.1637 0.8553 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1321942 1 0.0336 0.8815 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1094380 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0336 0.9477 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1077874 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR808299 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1481238 3 0.5407 -0.0420 0.000 0.484 0.504 0.012
#> SRR1443568 3 0.4936 0.6042 0.000 0.280 0.700 0.020
#> SRR1380249 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1080143 1 0.4040 0.5829 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1383148 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1357042 1 0.3400 0.6902 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1416025 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1431015 2 0.0188 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1078709 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR813283 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.1211 0.8734 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.3919 0.8516 0.000 0.840 0.104 0.056
#> SRR807679 1 0.1637 0.8553 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1333811 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.1940 0.8448 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1432542 4 0.4164 0.6723 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1418041 1 0.2345 0.8272 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1085211 1 0.3801 0.6923 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4776 0.3796 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1350958 2 0.0592 0.9487 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1396822 2 0.2973 0.8367 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1441934 2 0.0336 0.9495 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1472552 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.1389 0.8688 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1071131 2 0.4610 0.6824 0.000 0.744 0.236 0.020
#> SRR1074502 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 4 0.4040 0.6832 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0469 0.9490 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0188 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1384091 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1431887 2 0.0817 0.9460 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1096525 4 0.2760 0.8214 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.3674 0.8498 0.000 0.848 0.116 0.036
#> SRR1369514 4 0.1637 0.8346 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1453299 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1091767 2 0.1389 0.9402 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1354467 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.2174 0.9207 0.000 0.928 0.052 0.020
#> SRR1437430 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419736 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1313343 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1083530 1 0.1792 0.8504 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1333633 3 0.0469 0.9405 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1354999 2 0.4916 0.3177 0.000 0.576 0.424 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1378818 3 0.1743 0.9079 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1413182 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1464559 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1413075 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1487928 4 0.1557 0.8342 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1388997 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1092865 2 0.0707 0.9475 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1102729 1 0.4661 0.4448 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0469 0.9490 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1376874 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339903 4 0.4817 0.5503 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1346710 1 0.1637 0.8553 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.3383 0.8863 0.000 0.872 0.076 0.052
#> SRR1480941 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.1118 0.8737 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1433884 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0592 0.9483 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1355554 3 0.3311 0.7657 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0921 0.8773 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1322918 2 0.0469 0.9491 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.1118 0.8688 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1350545 1 0.0592 0.8785 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1091328 1 0.4730 0.4119 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR814447 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.3450 0.8211 0.000 0.836 0.156 0.008
#> SRR1453680 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.3764 0.6438 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1366729 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0188 0.9491 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9502 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.1118 0.9243 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0804 0.9355 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.1940 0.8348 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1444598 3 0.3533 0.8350 0.000 0.080 0.864 0.056
#> SRR1091743 2 0.2921 0.8371 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR819637 1 0.1022 0.8712 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1083848 1 0.0000 0.8830 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.4331 0.6322 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1459785 3 0.0000 0.9474 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.1022 0.8753 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1375531 1 0.4250 0.5934 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1323470 2 0.5213 0.5390 0.000 0.652 0.328 0.020
#> SRR814657 1 0.3528 0.6604 0.808 0.000 0.000 0.192
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.3395 0.5834 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1402132 4 0.2513 0.7907 0.116 0.000 0.000 0.876 0.008
#> SRR1326059 1 0.1310 0.8788 0.956 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR1409062 2 0.2286 0.7789 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR809406 1 0.0609 0.8831 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1465313 5 0.3123 0.6119 0.000 0.004 0.184 0.000 0.812
#> SRR819559 1 0.4152 0.5995 0.692 0.000 0.000 0.296 0.012
#> SRR1387899 3 0.2445 0.8909 0.000 0.004 0.884 0.004 0.108
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0162 0.8833 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1395635 1 0.3532 0.7769 0.832 0.000 0.000 0.076 0.092
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.2286 0.7789 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1102320 1 0.4644 -0.1508 0.528 0.000 0.000 0.460 0.012
#> SRR1469926 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.2504 0.8321 0.896 0.000 0.000 0.064 0.040
#> SRR1098426 4 0.5675 0.4136 0.352 0.000 0.000 0.556 0.092
#> SRR1090310 3 0.2179 0.8962 0.000 0.000 0.896 0.004 0.100
#> SRR1429748 1 0.1741 0.8724 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR1363654 1 0.0566 0.8841 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1326317 2 0.2445 0.7764 0.000 0.884 0.004 0.004 0.108
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0771 0.8190 0.004 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0162 0.9191 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.4262 0.7753 0.000 0.100 0.124 0.000 0.776
#> SRR1402944 5 0.4707 0.7037 0.000 0.072 0.212 0.000 0.716
#> SRR1092818 1 0.2144 0.8420 0.912 0.000 0.000 0.068 0.020
#> SRR1093552 4 0.2233 0.8122 0.004 0.000 0.000 0.892 0.104
#> SRR1464880 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.1270 0.8323 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1466951 2 0.4150 0.2266 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1331879 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1320034 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 5 0.4690 0.7423 0.000 0.160 0.092 0.004 0.744
#> SRR1437491 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0290 0.8833 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1329994 4 0.3090 0.8129 0.052 0.000 0.000 0.860 0.088
#> SRR1354203 1 0.1195 0.8781 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1077850 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1455214 1 0.1364 0.8748 0.952 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1092014 5 0.5408 0.6585 0.000 0.212 0.116 0.004 0.668
#> SRR1097857 1 0.3163 0.7728 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.2848 0.8077 0.028 0.000 0.000 0.868 0.104
#> SRR1486821 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 4 0.5751 0.3980 0.348 0.000 0.000 0.552 0.100
#> SRR1408788 2 0.6397 0.1663 0.000 0.488 0.352 0.004 0.156
#> SRR1359487 4 0.0963 0.8198 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1080648 1 0.2659 0.8258 0.888 0.000 0.000 0.060 0.052
#> SRR1414708 1 0.5452 0.4483 0.616 0.000 0.000 0.292 0.092
#> SRR1469080 5 0.4030 0.7237 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.2068 0.8117 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092
#> SRR1321829 2 0.2880 0.7631 0.000 0.868 0.020 0.004 0.108
#> SRR1475993 3 0.3248 0.8625 0.000 0.052 0.856 0.004 0.088
#> SRR1445387 1 0.1364 0.8748 0.952 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1077575 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1349300 1 0.0703 0.8827 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1374165 4 0.4073 0.7634 0.104 0.000 0.000 0.792 0.104
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.1877 0.8480 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1401146 2 0.4068 0.6963 0.000 0.792 0.060 0.004 0.144
#> SRR1366124 4 0.1502 0.8168 0.004 0.000 0.000 0.940 0.056
#> SRR1391811 1 0.1106 0.8789 0.964 0.000 0.000 0.024 0.012
#> SRR1456674 4 0.4487 0.7336 0.140 0.000 0.000 0.756 0.104
#> SRR1086490 3 0.2179 0.8962 0.000 0.000 0.896 0.004 0.100
#> SRR1088511 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4114 0.6247 0.272 0.000 0.000 0.712 0.016
#> SRR1384431 1 0.1942 0.8597 0.920 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1072055 1 0.4610 0.6695 0.740 0.000 0.000 0.168 0.092
#> SRR1359738 3 0.2124 0.8978 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1332141 1 0.0693 0.8829 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1085900 2 0.3988 0.6469 0.000 0.768 0.036 0.000 0.196
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.1544 0.8208 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR814515 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1344034 3 0.0290 0.9176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1080391 4 0.1571 0.8156 0.060 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1347870 2 0.2605 0.7428 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR814028 2 0.3636 0.5538 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR814219 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0290 0.8835 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102128 1 0.1965 0.8670 0.924 0.000 0.000 0.052 0.024
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1070060 4 0.4484 0.5765 0.308 0.000 0.000 0.668 0.024
#> SRR1487969 5 0.3424 0.8489 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1417851 4 0.4064 0.7609 0.116 0.000 0.000 0.792 0.092
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.5644 0.4863 0.328 0.000 0.000 0.576 0.096
#> SRR1076705 1 0.5331 0.4936 0.640 0.000 0.000 0.268 0.092
#> SRR1079380 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.2621 0.7992 0.000 0.112 0.008 0.004 0.876
#> SRR1366605 2 0.1478 0.8194 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 5 0.3966 0.7134 0.000 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1436840 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.6297 0.3151 0.008 0.000 0.160 0.556 0.276
#> SRR1431735 4 0.5623 0.4883 0.300 0.000 0.000 0.596 0.104
#> SRR1417387 1 0.5731 0.3721 0.568 0.000 0.000 0.328 0.104
#> SRR1445984 4 0.5686 0.4137 0.356 0.000 0.000 0.552 0.092
#> SRR1370447 4 0.2130 0.8053 0.080 0.000 0.000 0.908 0.012
#> SRR1446308 3 0.4471 0.7715 0.000 0.120 0.768 0.004 0.108
#> SRR1437346 3 0.2011 0.9007 0.000 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR1103143 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.2006 0.8437 0.916 0.000 0.000 0.072 0.012
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0404 0.8195 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1319584 5 0.5950 0.6824 0.000 0.220 0.188 0.000 0.592
#> SRR1486584 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR813536 4 0.2864 0.7737 0.136 0.000 0.000 0.852 0.012
#> SRR1317939 2 0.2605 0.7428 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1079730 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1341921 4 0.4058 0.6708 0.236 0.000 0.000 0.740 0.024
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0404 0.8573 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.4101 0.2815 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1076681 2 0.6169 0.2526 0.000 0.536 0.324 0.004 0.136
#> SRR1335314 4 0.0963 0.8198 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1400799 3 0.2179 0.8962 0.000 0.000 0.896 0.004 0.100
#> SRR1074578 4 0.3970 0.6855 0.224 0.000 0.000 0.752 0.024
#> SRR1312226 5 0.3857 0.7771 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1416207 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0324 0.8845 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1069328 4 0.2953 0.7723 0.144 0.000 0.000 0.844 0.012
#> SRR1445023 4 0.1043 0.8192 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1077599 2 0.4279 0.6801 0.000 0.784 0.104 0.004 0.108
#> SRR1453480 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.5623 0.4323 0.596 0.000 0.000 0.300 0.104
#> SRR1074839 2 0.2891 0.7074 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1458727 5 0.3305 0.6383 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1436949 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1070429 3 0.2179 0.8962 0.000 0.000 0.896 0.004 0.100
#> SRR1458158 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1432408 4 0.0771 0.8190 0.004 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1310334 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418201 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.0324 0.8178 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1415591 3 0.1792 0.9034 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1402009 1 0.1549 0.8742 0.944 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR1316055 4 0.2068 0.8117 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092
#> SRR1308734 3 0.0162 0.9191 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1498973 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1397115 1 0.3163 0.7437 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1392141 4 0.4918 0.6891 0.192 0.000 0.000 0.708 0.100
#> SRR814341 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.4517 0.6547 0.000 0.764 0.124 0.004 0.108
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0290 0.9176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809919 1 0.1740 0.8671 0.932 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1370818 4 0.2068 0.8117 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092
#> SRR1323651 3 0.2445 0.8917 0.000 0.004 0.884 0.004 0.108
#> SRR1357297 4 0.4356 0.5511 0.340 0.000 0.000 0.648 0.012
#> SRR818170 5 0.3596 0.6611 0.000 0.012 0.212 0.000 0.776
#> SRR1091230 2 0.4605 0.6450 0.000 0.756 0.132 0.004 0.108
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0162 0.8836 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095285 3 0.0880 0.9165 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1317731 5 0.4242 0.2534 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1490785 1 0.3163 0.7728 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1432032 1 0.3691 0.7503 0.804 0.000 0.000 0.156 0.040
#> SRR1447808 1 0.1661 0.8735 0.940 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR809534 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.4013 0.7514 0.000 0.108 0.084 0.004 0.804
#> SRR812128 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1101513 1 0.1310 0.8788 0.956 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR1415708 2 0.1991 0.8142 0.000 0.916 0.004 0.004 0.076
#> SRR1316033 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 4 0.5931 0.0697 0.436 0.000 0.000 0.460 0.104
#> SRR1080044 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.3639 0.7350 0.184 0.000 0.000 0.792 0.024
#> SRR1069871 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1095744 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.4297 -0.1265 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1075054 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1083480 1 0.1195 0.8781 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1075458 1 0.3410 0.7846 0.840 0.000 0.000 0.068 0.092
#> SRR1417023 4 0.1952 0.8132 0.004 0.000 0.000 0.912 0.084
#> SRR1309333 2 0.4201 0.1540 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1333676 1 0.3565 0.7538 0.800 0.000 0.000 0.176 0.024
#> SRR1352996 1 0.3355 0.7166 0.804 0.000 0.000 0.184 0.012
#> SRR1093172 4 0.2069 0.8068 0.076 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR1413137 4 0.2189 0.8059 0.084 0.000 0.000 0.904 0.012
#> SRR1469973 2 0.3876 0.4441 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1420026 5 0.3612 0.8194 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR817306 4 0.2969 0.7817 0.128 0.000 0.000 0.852 0.020
#> SRR1416266 4 0.2069 0.8068 0.076 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0693 0.8203 0.008 0.000 0.000 0.980 0.012
#> SRR1435394 2 0.5685 0.4400 0.000 0.616 0.272 0.004 0.108
#> SRR1383192 4 0.4380 0.5833 0.304 0.000 0.000 0.676 0.020
#> SRR1419962 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.4644 -0.1012 0.528 0.000 0.000 0.460 0.012
#> SRR1081639 3 0.1851 0.8520 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1312147 4 0.4216 0.7577 0.120 0.000 0.000 0.780 0.100
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.1597 0.8180 0.048 0.000 0.000 0.940 0.012
#> SRR1474930 2 0.5896 0.3463 0.000 0.600 0.216 0.000 0.184
#> SRR1470988 4 0.2069 0.8068 0.076 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR811915 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.3031 0.7967 0.000 0.120 0.020 0.004 0.856
#> SRR1313770 3 0.1544 0.8777 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1315780 2 0.2074 0.7853 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1073631 1 0.0290 0.8833 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR819124 4 0.4906 0.2177 0.480 0.000 0.000 0.496 0.024
#> SRR1310997 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1464494 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1357083 3 0.2286 0.8927 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1475842 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.3353 0.7137 0.796 0.000 0.000 0.196 0.008
#> SRR1378220 3 0.2286 0.8927 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1467704 1 0.3532 0.7770 0.832 0.000 0.000 0.076 0.092
#> SRR1348885 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1325826 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466812 4 0.2362 0.8056 0.076 0.000 0.000 0.900 0.024
#> SRR1345692 2 0.4235 0.0842 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1401040 3 0.0162 0.9202 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1097954 1 0.1281 0.8766 0.956 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1374396 4 0.0963 0.8198 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1454073 2 0.3684 0.5304 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1355747 4 0.5853 0.2255 0.432 0.000 0.000 0.472 0.096
#> SRR1429368 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.3143 0.6687 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1379260 1 0.5815 0.1473 0.508 0.000 0.000 0.396 0.096
#> SRR1361436 3 0.2286 0.8927 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR817142 2 0.4772 0.6236 0.000 0.740 0.148 0.004 0.108
#> SRR1315291 4 0.3003 0.6736 0.000 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1309314 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420085 2 0.4283 -0.0653 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1361308 3 0.0162 0.9202 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472126 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1380482 5 0.4918 0.7403 0.000 0.100 0.192 0.000 0.708
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1339276 1 0.0609 0.8834 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1418368 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1399353 4 0.5505 0.6100 0.304 0.000 0.000 0.604 0.092
#> SRR1096760 3 0.1571 0.9099 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1440290 3 0.2445 0.8909 0.000 0.004 0.884 0.004 0.108
#> SRR1330813 2 0.2681 0.7687 0.000 0.876 0.012 0.004 0.108
#> SRR1458931 2 0.1608 0.8177 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR812294 4 0.0162 0.8179 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1394321 1 0.3727 0.7189 0.768 0.000 0.000 0.216 0.016
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.2020 0.7930 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1349342 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 5 0.4268 0.5469 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1390143 1 0.3720 0.7035 0.760 0.000 0.000 0.228 0.012
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.1851 0.9026 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1312169 4 0.4508 0.5547 0.332 0.000 0.000 0.648 0.020
#> SRR1096687 4 0.2300 0.8193 0.052 0.000 0.000 0.908 0.040
#> SRR1486139 1 0.0807 0.8837 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1470313 4 0.2011 0.8123 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1447893 3 0.2286 0.8927 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1466025 5 0.3395 0.8521 0.000 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1477429 4 0.1124 0.8200 0.036 0.000 0.000 0.960 0.004
#> SRR1445701 3 0.2488 0.8869 0.000 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR820689 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.1357 0.8348 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4522 0.4459 0.660 0.000 0.000 0.316 0.024
#> SRR1489328 2 0.4235 0.0873 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1344462 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1082709 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1447784 4 0.2068 0.8117 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092
#> SRR1355769 4 0.4371 0.5443 0.344 0.000 0.000 0.644 0.012
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 5 0.5241 0.6484 0.000 0.152 0.148 0.004 0.696
#> SRR1474485 4 0.2179 0.8133 0.004 0.000 0.000 0.896 0.100
#> SRR1089998 1 0.1364 0.8748 0.952 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1318140 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1319262 3 0.0404 0.9191 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1095188 2 0.3562 0.6658 0.000 0.788 0.016 0.000 0.196
#> SRR1454350 1 0.0404 0.8831 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1440374 1 0.0510 0.8835 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1359565 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 4 0.2966 0.7727 0.136 0.000 0.000 0.848 0.016
#> SRR1325578 5 0.5493 0.6660 0.000 0.112 0.256 0.000 0.632
#> SRR1358161 3 0.0290 0.9176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.3684 0.8141 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1452010 4 0.4540 0.5605 0.320 0.000 0.000 0.656 0.024
#> SRR1418183 3 0.4002 0.8258 0.000 0.056 0.796 0.004 0.144
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473461 1 0.4161 0.6240 0.704 0.000 0.000 0.280 0.016
#> SRR1090837 3 0.2286 0.8927 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1447828 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.4404 0.4737 0.684 0.000 0.000 0.292 0.024
#> SRR1088557 1 0.1568 0.8742 0.944 0.000 0.000 0.036 0.020
#> SRR1102656 5 0.3424 0.8515 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1441443 2 0.3816 0.4754 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1370682 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.2286 0.8927 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1407291 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1405266 1 0.1444 0.8743 0.948 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1363766 1 0.3710 0.7023 0.784 0.000 0.000 0.192 0.024
#> SRR1082592 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1325794 5 0.2848 0.7982 0.000 0.156 0.000 0.004 0.840
#> SRR1095961 3 0.1732 0.9044 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1086702 2 0.0794 0.8464 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1320806 5 0.3047 0.7992 0.000 0.160 0.004 0.004 0.832
#> SRR1457527 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.0162 0.8179 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1454695 4 0.4487 0.7461 0.140 0.000 0.000 0.756 0.104
#> SRR1090241 2 0.2286 0.7789 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1329863 2 0.0880 0.8434 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1357733 1 0.0880 0.8724 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1362135 1 0.5475 0.4230 0.604 0.000 0.000 0.308 0.088
#> SRR1379581 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0703 0.8827 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1437668 4 0.5844 0.3485 0.368 0.000 0.000 0.528 0.104
#> SRR1084742 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1433538 1 0.0693 0.8822 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1085063 5 0.3480 0.8415 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1454247 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.4069 0.7030 0.000 0.800 0.088 0.004 0.108
#> SRR1072388 4 0.5606 0.4979 0.296 0.000 0.000 0.600 0.104
#> SRR1070332 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1320761 5 0.2983 0.7856 0.000 0.096 0.040 0.000 0.864
#> SRR1076195 4 0.1430 0.8174 0.004 0.000 0.000 0.944 0.052
#> SRR1069895 3 0.2570 0.8889 0.000 0.008 0.880 0.004 0.108
#> SRR1099144 4 0.2124 0.8120 0.004 0.000 0.000 0.900 0.096
#> SRR1385150 3 0.1041 0.9156 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1952 0.8132 0.004 0.000 0.000 0.912 0.084
#> SRR1102583 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1456971 4 0.4123 0.7603 0.108 0.000 0.000 0.788 0.104
#> SRR1340574 1 0.0404 0.8831 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1444830 2 0.2286 0.7829 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.2329 0.8216 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1408553 4 0.2069 0.8068 0.076 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR1069231 4 0.5719 0.5335 0.352 0.000 0.000 0.552 0.096
#> SRR1325642 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.1697 0.8534 0.932 0.000 0.000 0.060 0.008
#> SRR1321942 1 0.0290 0.8826 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1094380 1 0.1364 0.8748 0.952 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1447499 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.2286 0.7789 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1077874 5 0.3366 0.8552 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR808299 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1481238 3 0.6302 0.0548 0.000 0.132 0.444 0.004 0.420
#> SRR1443568 3 0.5030 0.6062 0.000 0.060 0.672 0.004 0.264
#> SRR1380249 4 0.2011 0.8123 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1080143 1 0.4315 0.5253 0.700 0.000 0.000 0.276 0.024
#> SRR1383148 4 0.0162 0.8179 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1357042 1 0.3563 0.6479 0.780 0.000 0.000 0.208 0.012
#> SRR1416025 2 0.3074 0.6797 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1431015 2 0.1341 0.8304 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1078709 2 0.4192 0.1685 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR813283 1 0.1364 0.8748 0.952 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.1444 0.8745 0.948 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.3851 0.8546 0.000 0.212 0.016 0.004 0.768
#> SRR807679 1 0.2438 0.8351 0.900 0.000 0.000 0.060 0.040
#> SRR1333811 3 0.0290 0.9176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1078660 5 0.3636 0.8145 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.3590 0.7728 0.828 0.000 0.000 0.080 0.092
#> SRR1432542 4 0.4307 0.7536 0.128 0.000 0.000 0.772 0.100
#> SRR1418041 1 0.2561 0.8368 0.884 0.000 0.000 0.096 0.020
#> SRR1085211 1 0.3496 0.7292 0.788 0.000 0.000 0.200 0.012
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.5876 0.1720 0.512 0.000 0.000 0.384 0.104
#> SRR1350958 2 0.2439 0.7820 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1396822 2 0.5260 0.5497 0.000 0.684 0.204 0.004 0.108
#> SRR1441934 2 0.1410 0.8313 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1472552 3 0.2124 0.8978 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1488881 3 0.0162 0.9202 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102973 1 0.1670 0.8697 0.936 0.000 0.000 0.052 0.012
#> SRR1071131 2 0.6411 0.1289 0.000 0.492 0.312 0.000 0.196
#> SRR1074502 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1325271 4 0.4123 0.7603 0.108 0.000 0.000 0.788 0.104
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.2890 0.6979 0.000 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1430045 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1197 0.8348 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1384091 4 0.0162 0.8179 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1431887 2 0.4161 0.0374 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1096525 4 0.2069 0.8068 0.076 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.4949 0.6047 0.000 0.296 0.044 0.004 0.656
#> SRR1369514 4 0.0992 0.8226 0.008 0.000 0.000 0.968 0.024
#> SRR1453299 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.2690 0.8299 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1091767 5 0.4235 0.5106 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1354467 3 0.0162 0.9202 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069074 2 0.2286 0.7789 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1452399 2 0.4599 0.4931 0.000 0.688 0.040 0.000 0.272
#> SRR1437430 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1313343 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.2068 0.8117 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092
#> SRR1083530 1 0.2046 0.8503 0.916 0.000 0.000 0.068 0.016
#> SRR1333633 3 0.3969 0.5935 0.000 0.000 0.692 0.004 0.304
#> SRR1354999 3 0.5392 0.5759 0.000 0.216 0.668 0.004 0.112
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1364 0.8748 0.952 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1378818 5 0.3816 0.5325 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1413182 4 0.0162 0.8179 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1464559 4 0.2068 0.8117 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092
#> SRR1413075 5 0.3305 0.8586 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1487928 4 0.0162 0.8179 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1388997 2 0.3074 0.6797 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1092865 2 0.3491 0.6682 0.000 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR1102729 1 0.4371 0.4765 0.644 0.000 0.000 0.344 0.012
#> SRR1456423 1 0.0404 0.8830 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1321591 2 0.2127 0.7723 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1376874 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 4 0.4371 0.5459 0.344 0.000 0.000 0.644 0.012
#> SRR1346710 1 0.2514 0.8320 0.896 0.000 0.000 0.060 0.044
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5261 0.4226 0.000 0.380 0.044 0.004 0.572
#> SRR1480941 3 0.0510 0.9181 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.1661 0.8735 0.940 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR1433884 2 0.4084 0.4129 0.000 0.668 0.000 0.004 0.328
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.1732 0.8120 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1355554 3 0.2784 0.8846 0.000 0.016 0.872 0.004 0.108
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.1195 0.8785 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1322918 2 0.1270 0.8334 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1318331 2 0.0162 0.8615 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321333 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0963 0.8706 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1350545 1 0.1117 0.8803 0.964 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR1091328 1 0.5778 0.2030 0.528 0.000 0.000 0.376 0.096
#> SRR814447 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.5026 0.6196 0.000 0.716 0.160 0.004 0.120
#> SRR1453680 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.3909 0.6864 0.760 0.000 0.000 0.216 0.024
#> SRR1366729 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.2286 0.7789 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR814633 2 0.0000 0.8634 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4138 0.3339 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1319100 1 0.0162 0.8833 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324004 3 0.3160 0.8369 0.000 0.000 0.808 0.004 0.188
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8832 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.0865 0.8220 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR1444598 5 0.3628 0.6554 0.000 0.012 0.216 0.000 0.772
#> SRR1091743 2 0.4176 0.6878 0.000 0.792 0.096 0.004 0.108
#> SRR819637 1 0.0880 0.8729 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1083848 1 0.0290 0.8835 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088934 3 0.6060 0.2183 0.000 0.384 0.504 0.004 0.108
#> SRR1459785 3 0.0000 0.9202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.1281 0.8764 0.956 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1375531 1 0.4040 0.6114 0.712 0.000 0.000 0.276 0.012
#> SRR1323470 2 0.6811 0.0826 0.000 0.432 0.256 0.004 0.308
#> SRR814657 1 0.3492 0.7086 0.796 0.000 0.000 0.188 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.3351 0.51427 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1402132 4 0.4153 0.43031 0.024 0.000 0.000 0.636 0.000 0.340
#> SRR1326059 1 0.5053 0.69001 0.636 0.000 0.000 0.204 0.000 0.160
#> SRR1409062 2 0.5105 0.56565 0.000 0.652 0.000 0.008 0.140 0.200
#> SRR809406 1 0.3134 0.75947 0.820 0.000 0.000 0.144 0.000 0.036
#> SRR1465313 5 0.1967 0.67712 0.000 0.000 0.084 0.000 0.904 0.012
#> SRR819559 1 0.5371 0.43525 0.520 0.000 0.000 0.120 0.000 0.360
#> SRR1387899 3 0.5241 0.72533 0.000 0.004 0.648 0.008 0.140 0.200
#> SRR1442292 2 0.0146 0.83076 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488151 1 0.0547 0.76370 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.4072 -0.12074 0.544 0.000 0.000 0.008 0.000 0.448
#> SRR1343629 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.5105 0.56565 0.000 0.652 0.000 0.008 0.140 0.200
#> SRR1102320 1 0.3371 0.61478 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.3428 0.37961 0.696 0.000 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1098426 6 0.4990 0.63209 0.232 0.000 0.000 0.132 0.000 0.636
#> SRR1090310 3 0.4483 0.77059 0.000 0.000 0.728 0.008 0.120 0.144
#> SRR1429748 1 0.5389 0.64512 0.572 0.000 0.000 0.268 0.000 0.160
#> SRR1363654 1 0.3487 0.74523 0.788 0.000 0.000 0.168 0.000 0.044
#> SRR1326317 2 0.5105 0.56565 0.000 0.652 0.000 0.008 0.140 0.200
#> SRR1378308 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.3244 0.46197 0.000 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1329947 1 0.0363 0.76311 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0146 0.84355 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.2801 0.78241 0.000 0.072 0.068 0.000 0.860 0.000
#> SRR1402944 5 0.3171 0.65903 0.000 0.012 0.204 0.000 0.784 0.000
#> SRR1092818 1 0.1765 0.71513 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1093552 6 0.3309 0.65898 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1464880 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0547 0.82153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1466951 2 0.3810 0.18455 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1331879 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 5 0.5270 0.47251 0.000 0.040 0.088 0.008 0.688 0.176
#> SRR1437491 1 0.0146 0.76185 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.2178 0.74837 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.5561 -0.36649 0.136 0.000 0.000 0.436 0.000 0.428
#> SRR1354203 1 0.3417 0.73260 0.796 0.000 0.000 0.044 0.000 0.160
#> SRR1077850 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0260 0.82909 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077992 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1455214 1 0.3825 0.71905 0.768 0.000 0.000 0.072 0.000 0.160
#> SRR1092014 5 0.6336 0.39129 0.000 0.120 0.084 0.008 0.588 0.200
#> SRR1097857 1 0.5406 0.59919 0.568 0.000 0.000 0.160 0.000 0.272
#> SRR1473318 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.1398 0.80569 0.000 0.940 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1071207 6 0.3215 0.67354 0.004 0.000 0.000 0.240 0.000 0.756
#> SRR1486821 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 6 0.4165 0.62875 0.100 0.000 0.000 0.160 0.000 0.740
#> SRR1408788 2 0.7734 -0.12928 0.000 0.336 0.288 0.008 0.172 0.196
#> SRR1359487 4 0.2912 0.53342 0.000 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1080648 1 0.1863 0.69672 0.896 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1414708 6 0.4621 0.54663 0.332 0.000 0.000 0.056 0.000 0.612
#> SRR1469080 5 0.3198 0.72023 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 6 0.3659 0.58689 0.000 0.000 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1321829 2 0.5439 0.55404 0.000 0.640 0.012 0.008 0.140 0.200
#> SRR1475993 3 0.4933 0.76622 0.000 0.036 0.720 0.008 0.076 0.160
#> SRR1445387 1 0.3717 0.72648 0.776 0.000 0.000 0.064 0.000 0.160
#> SRR1077575 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1349300 1 0.5040 0.68879 0.636 0.000 0.000 0.212 0.000 0.152
#> SRR1374165 6 0.3236 0.69367 0.024 0.000 0.000 0.180 0.000 0.796
#> SRR1453769 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.2823 0.71238 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.6353 0.47078 0.000 0.568 0.052 0.008 0.172 0.200
#> SRR1366124 4 0.3782 0.06466 0.000 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1391811 1 0.3417 0.73205 0.796 0.000 0.000 0.044 0.000 0.160
#> SRR1456674 6 0.3245 0.69332 0.028 0.000 0.000 0.172 0.000 0.800
#> SRR1086490 3 0.4554 0.76672 0.000 0.000 0.720 0.008 0.120 0.152
#> SRR1088511 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.2384 0.57362 0.064 0.000 0.000 0.888 0.000 0.048
#> SRR1384431 1 0.5336 0.54946 0.584 0.000 0.000 0.256 0.000 0.160
#> SRR1072055 1 0.4578 -0.20799 0.520 0.000 0.000 0.036 0.000 0.444
#> SRR1359738 3 0.3875 0.79353 0.000 0.000 0.780 0.008 0.068 0.144
#> SRR1332141 1 0.3213 0.73730 0.808 0.000 0.000 0.032 0.000 0.160
#> SRR1085900 2 0.5373 0.55311 0.000 0.664 0.028 0.008 0.200 0.100
#> SRR1442173 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0865 0.81271 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1344034 3 0.0260 0.84177 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1080391 4 0.2805 0.56093 0.004 0.000 0.000 0.812 0.000 0.184
#> SRR1347870 2 0.2260 0.72898 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR814028 2 0.3309 0.53947 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR814219 2 0.0146 0.83061 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070620 1 0.2402 0.75608 0.868 0.000 0.000 0.012 0.000 0.120
#> SRR1102128 1 0.5318 0.65877 0.588 0.000 0.000 0.252 0.000 0.160
#> SRR1460211 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1070060 4 0.4455 0.46344 0.128 0.000 0.000 0.712 0.000 0.160
#> SRR1487969 5 0.2378 0.81889 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1417851 6 0.4757 0.67884 0.144 0.000 0.000 0.180 0.000 0.676
#> SRR1443350 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 6 0.5377 0.56211 0.272 0.000 0.000 0.156 0.000 0.572
#> SRR1076705 6 0.4664 0.51445 0.364 0.000 0.000 0.052 0.000 0.584
#> SRR1079380 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.2595 0.61340 0.000 0.000 0.000 0.004 0.836 0.160
#> SRR1366605 2 0.2003 0.75290 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 5 0.3244 0.69174 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.5098 0.47813 0.000 0.000 0.040 0.684 0.084 0.192
#> SRR1431735 6 0.3695 0.66959 0.060 0.000 0.000 0.164 0.000 0.776
#> SRR1417387 6 0.3544 0.64401 0.120 0.000 0.000 0.080 0.000 0.800
#> SRR1445984 6 0.4701 0.67085 0.192 0.000 0.000 0.128 0.000 0.680
#> SRR1370447 4 0.0806 0.60802 0.008 0.000 0.000 0.972 0.000 0.020
#> SRR1446308 3 0.6459 0.64928 0.000 0.080 0.572 0.008 0.140 0.200
#> SRR1437346 3 0.3079 0.81176 0.000 0.000 0.836 0.008 0.028 0.128
#> SRR1103143 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.1714 0.71469 0.908 0.000 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1073191 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2969 0.52560 0.000 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1319584 5 0.4945 0.63220 0.000 0.140 0.192 0.000 0.664 0.004
#> SRR1486584 1 0.2762 0.71725 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.1297 0.60164 0.012 0.000 0.000 0.948 0.000 0.040
#> SRR1317939 2 0.2092 0.74413 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1079730 1 0.2416 0.73818 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.3927 0.49904 0.072 0.000 0.000 0.756 0.000 0.172
#> SRR1399178 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0146 0.83035 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1079543 2 0.0260 0.82909 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR816427 2 0.3756 0.26435 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1076681 2 0.6591 0.34294 0.000 0.508 0.244 0.004 0.192 0.052
#> SRR1335314 4 0.2941 0.53063 0.000 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1400799 3 0.4401 0.77478 0.000 0.000 0.736 0.008 0.112 0.144
#> SRR1074578 4 0.3481 0.51554 0.048 0.000 0.000 0.792 0.000 0.160
#> SRR1312226 5 0.3076 0.74230 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0508 0.76416 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1069328 4 0.1498 0.60160 0.028 0.000 0.000 0.940 0.000 0.032
#> SRR1445023 4 0.2854 0.53958 0.000 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1077599 2 0.6322 0.49201 0.000 0.584 0.068 0.008 0.140 0.200
#> SRR1453480 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 6 0.3912 0.58738 0.164 0.000 0.000 0.076 0.000 0.760
#> SRR1074839 2 0.3712 0.65980 0.000 0.768 0.000 0.000 0.180 0.052
#> SRR1458727 5 0.2340 0.70471 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1436949 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1070429 3 0.4483 0.77059 0.000 0.000 0.728 0.008 0.120 0.144
#> SRR1458158 1 0.2631 0.72628 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.3482 0.36292 0.000 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1310334 1 0.2597 0.72877 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.3101 0.50029 0.000 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1415591 3 0.2734 0.81943 0.000 0.000 0.864 0.008 0.024 0.104
#> SRR1402009 1 0.4949 0.68780 0.648 0.000 0.000 0.144 0.000 0.208
#> SRR1316055 6 0.3647 0.59169 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1308734 3 0.0146 0.84355 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1498973 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1397115 1 0.3620 0.50986 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR1392141 6 0.4313 0.64919 0.124 0.000 0.000 0.148 0.000 0.728
#> SRR814341 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.6702 0.44680 0.000 0.548 0.104 0.008 0.140 0.200
#> SRR1459609 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0260 0.84177 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR809919 1 0.3928 0.71979 0.760 0.000 0.000 0.080 0.000 0.160
#> SRR1370818 6 0.3647 0.59169 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1323651 3 0.5105 0.72826 0.000 0.000 0.652 0.008 0.140 0.200
#> SRR1357297 4 0.3672 0.31627 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR818170 5 0.2260 0.70997 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1091230 2 0.6702 0.44680 0.000 0.548 0.104 0.008 0.140 0.200
#> SRR1470556 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0405 0.76306 0.988 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1095285 3 0.1977 0.83409 0.000 0.000 0.920 0.008 0.040 0.032
#> SRR1317731 5 0.3695 0.39370 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1490785 1 0.4495 0.66451 0.672 0.000 0.000 0.072 0.000 0.256
#> SRR1432032 1 0.4629 -0.00688 0.524 0.000 0.000 0.040 0.000 0.436
#> SRR1447808 1 0.5217 0.67337 0.608 0.000 0.000 0.232 0.000 0.160
#> SRR809534 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.4848 0.47613 0.000 0.020 0.068 0.008 0.704 0.200
#> SRR812128 5 0.2378 0.81909 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1101513 1 0.5238 0.66955 0.604 0.000 0.000 0.236 0.000 0.160
#> SRR1415708 2 0.3602 0.69874 0.000 0.784 0.000 0.008 0.032 0.176
#> SRR1316033 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0146 0.83061 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 6 0.3522 0.68653 0.072 0.000 0.000 0.128 0.000 0.800
#> SRR1080044 1 0.2219 0.74892 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.3315 0.53324 0.040 0.000 0.000 0.804 0.000 0.156
#> SRR1069871 1 0.1610 0.75942 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1068929 2 0.0146 0.83061 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490097 5 0.3833 0.24974 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1075054 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1083480 1 0.3481 0.73117 0.792 0.000 0.000 0.048 0.000 0.160
#> SRR1075458 1 0.4224 -0.07662 0.552 0.000 0.000 0.016 0.000 0.432
#> SRR1417023 6 0.3854 0.39991 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1309333 2 0.3843 0.10102 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000
#> SRR1333676 1 0.5406 0.64073 0.568 0.000 0.000 0.272 0.000 0.160
#> SRR1352996 1 0.3833 0.29491 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.0993 0.60773 0.012 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024
#> SRR1413137 4 0.1176 0.60561 0.020 0.000 0.000 0.956 0.000 0.024
#> SRR1469973 2 0.3446 0.48504 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1420026 5 0.2883 0.76688 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR817306 4 0.3657 0.52612 0.100 0.000 0.000 0.792 0.000 0.108
#> SRR1416266 4 0.0891 0.60720 0.008 0.000 0.000 0.968 0.000 0.024
#> SRR1071011 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3390 0.41765 0.000 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1435394 2 0.7474 0.16317 0.000 0.420 0.232 0.008 0.140 0.200
#> SRR1383192 4 0.3163 0.53485 0.140 0.000 0.000 0.820 0.000 0.040
#> SRR1419962 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.4634 0.65939 0.692 0.000 0.000 0.144 0.000 0.164
#> SRR1081639 3 0.1814 0.76064 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1312147 6 0.3885 0.70146 0.044 0.000 0.000 0.220 0.000 0.736
#> SRR1473891 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.4277 0.41226 0.028 0.000 0.000 0.616 0.000 0.356
#> SRR1474930 2 0.5808 0.36494 0.000 0.576 0.220 0.000 0.184 0.020
#> SRR1470988 4 0.1049 0.60825 0.008 0.000 0.000 0.960 0.000 0.032
#> SRR811915 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.3736 0.55738 0.000 0.012 0.012 0.008 0.768 0.200
#> SRR1313770 3 0.1327 0.80174 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1315780 2 0.3746 0.67090 0.000 0.780 0.000 0.000 0.140 0.080
#> SRR1073631 1 0.2178 0.74898 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.5662 0.49328 0.476 0.000 0.000 0.364 0.000 0.160
#> SRR1310997 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1464494 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1357083 3 0.5105 0.72826 0.000 0.000 0.652 0.008 0.140 0.200
#> SRR1475842 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.3920 0.66450 0.736 0.000 0.000 0.216 0.000 0.048
#> SRR1378220 3 0.5105 0.72826 0.000 0.000 0.652 0.008 0.140 0.200
#> SRR1467704 1 0.4051 -0.06479 0.560 0.000 0.000 0.008 0.000 0.432
#> SRR1348885 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1325826 1 0.2454 0.73671 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.2593 0.55230 0.008 0.000 0.000 0.844 0.000 0.148
#> SRR1345692 2 0.3854 0.05840 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1401040 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.3602 0.72969 0.784 0.000 0.000 0.056 0.000 0.160
#> SRR1374396 4 0.2941 0.53063 0.000 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1454073 2 0.3309 0.53809 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1355747 6 0.4718 0.66353 0.200 0.000 0.000 0.124 0.000 0.676
#> SRR1429368 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.3980 0.61048 0.000 0.732 0.000 0.000 0.216 0.052
#> SRR1379260 6 0.4888 0.63250 0.240 0.000 0.000 0.116 0.000 0.644
#> SRR1361436 3 0.5105 0.72826 0.000 0.000 0.652 0.008 0.140 0.200
#> SRR817142 2 0.6774 0.43565 0.000 0.540 0.112 0.008 0.140 0.200
#> SRR1315291 4 0.3964 0.49808 0.000 0.000 0.044 0.724 0.000 0.232
#> SRR1309314 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420085 5 0.3868 0.10278 0.000 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1361308 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.2697 0.72193 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.3746 0.74041 0.000 0.080 0.140 0.000 0.780 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1339276 1 0.4165 0.74102 0.740 0.000 0.000 0.100 0.000 0.160
#> SRR1418368 1 0.2730 0.71966 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1399353 6 0.5873 0.46946 0.340 0.000 0.000 0.208 0.000 0.452
#> SRR1096760 3 0.4486 0.76896 0.000 0.000 0.728 0.008 0.124 0.140
#> SRR1440290 3 0.5241 0.72533 0.000 0.004 0.648 0.008 0.140 0.200
#> SRR1330813 2 0.5241 0.56192 0.000 0.648 0.004 0.008 0.140 0.200
#> SRR1458931 2 0.1075 0.80656 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR812294 4 0.2996 0.52229 0.000 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1394321 1 0.4381 0.67732 0.692 0.000 0.000 0.072 0.000 0.236
#> SRR1081160 2 0.1075 0.81124 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1469704 2 0.2092 0.74014 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 5 0.3659 0.56084 0.000 0.364 0.000 0.000 0.636 0.000
#> SRR1390143 1 0.4380 0.68509 0.700 0.000 0.000 0.080 0.000 0.220
#> SRR1390413 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.4252 0.78243 0.000 0.000 0.752 0.008 0.120 0.120
#> SRR1312169 4 0.4191 0.41202 0.284 0.000 0.000 0.676 0.000 0.040
#> SRR1096687 4 0.3103 0.52245 0.008 0.000 0.000 0.784 0.000 0.208
#> SRR1486139 1 0.3139 0.73838 0.812 0.000 0.000 0.028 0.000 0.160
#> SRR1470313 6 0.3747 0.54026 0.000 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1447893 3 0.5105 0.72826 0.000 0.000 0.652 0.008 0.140 0.200
#> SRR1466025 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1477429 4 0.3050 0.53465 0.000 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1445701 3 0.4779 0.75668 0.000 0.000 0.696 0.008 0.152 0.144
#> SRR820689 1 0.0260 0.76249 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.2350 0.77676 0.000 0.880 0.000 0.000 0.020 0.100
#> SRR1452537 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.5539 0.59292 0.548 0.000 0.000 0.272 0.000 0.180
#> SRR1489328 2 0.3864 -0.00617 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1344462 1 0.2491 0.73470 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.2762 0.71725 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1447784 6 0.3647 0.59169 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1355769 4 0.3531 0.38334 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 5 0.5944 0.32174 0.000 0.040 0.140 0.008 0.612 0.200
#> SRR1474485 6 0.3151 0.65001 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1089998 1 0.3877 0.71879 0.764 0.000 0.000 0.076 0.000 0.160
#> SRR1318140 1 0.2597 0.72885 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.1049 0.83714 0.000 0.000 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1095188 2 0.4139 0.62119 0.000 0.744 0.032 0.000 0.200 0.024
#> SRR1454350 1 0.3139 0.73838 0.812 0.000 0.000 0.028 0.000 0.160
#> SRR1440374 1 0.3660 0.74156 0.780 0.000 0.000 0.060 0.000 0.160
#> SRR1359565 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 4 0.1701 0.60327 0.008 0.000 0.000 0.920 0.000 0.072
#> SRR1325578 5 0.4475 0.35019 0.000 0.032 0.412 0.000 0.556 0.000
#> SRR1358161 3 0.0260 0.84177 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.2527 0.80912 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1452010 4 0.4336 0.46806 0.116 0.000 0.000 0.724 0.000 0.160
#> SRR1418183 3 0.6351 0.65813 0.000 0.056 0.572 0.008 0.164 0.200
#> SRR1366345 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.2340 0.74186 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.5300 0.39089 0.496 0.000 0.000 0.104 0.000 0.400
#> SRR1090837 3 0.5105 0.72826 0.000 0.000 0.652 0.008 0.140 0.200
#> SRR1447828 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.5649 0.48925 0.484 0.000 0.000 0.356 0.000 0.160
#> SRR1088557 1 0.4830 0.70626 0.668 0.000 0.000 0.172 0.000 0.160
#> SRR1102656 5 0.2378 0.81959 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1441443 2 0.3371 0.50839 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.5105 0.72826 0.000 0.000 0.652 0.008 0.140 0.200
#> SRR1407291 1 0.2730 0.71966 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.3825 0.71905 0.768 0.000 0.000 0.072 0.000 0.160
#> SRR1363766 4 0.5259 0.27058 0.240 0.000 0.000 0.600 0.000 0.160
#> SRR1082592 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1325794 5 0.3671 0.59233 0.000 0.040 0.000 0.008 0.784 0.168
#> SRR1095961 3 0.2826 0.81727 0.000 0.000 0.856 0.008 0.024 0.112
#> SRR1086702 2 0.3842 0.68862 0.000 0.784 0.000 0.004 0.112 0.100
#> SRR1320806 5 0.3499 0.60865 0.000 0.032 0.000 0.008 0.796 0.164
#> SRR1457527 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.3023 0.51472 0.000 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1454695 6 0.3319 0.70033 0.036 0.000 0.000 0.164 0.000 0.800
#> SRR1090241 2 0.5105 0.56565 0.000 0.652 0.000 0.008 0.140 0.200
#> SRR1329863 2 0.1267 0.79568 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1357733 1 0.0146 0.75969 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362135 6 0.4638 0.58486 0.296 0.000 0.000 0.068 0.000 0.636
#> SRR1379581 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.5150 0.67866 0.620 0.000 0.000 0.220 0.000 0.160
#> SRR1437668 6 0.3885 0.71064 0.064 0.000 0.000 0.180 0.000 0.756
#> SRR1084742 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1433538 1 0.2697 0.72193 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1085063 5 0.2631 0.79776 0.000 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1454247 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1097100 2 0.0146 0.83077 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR818622 2 0.6415 0.48269 0.000 0.576 0.076 0.008 0.140 0.200
#> SRR1072388 6 0.3493 0.69030 0.064 0.000 0.000 0.136 0.000 0.800
#> SRR1070332 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1320761 5 0.2491 0.64198 0.000 0.000 0.020 0.000 0.868 0.112
#> SRR1076195 4 0.3684 0.19366 0.000 0.000 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1069895 3 0.5346 0.72247 0.000 0.008 0.644 0.008 0.140 0.200
#> SRR1099144 6 0.3578 0.61054 0.000 0.000 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1385150 3 0.3693 0.79025 0.000 0.000 0.788 0.000 0.120 0.092
#> SRR1420191 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 6 0.3782 0.52084 0.000 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1102583 1 0.2697 0.72193 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1456971 6 0.3202 0.69189 0.024 0.000 0.000 0.176 0.000 0.800
#> SRR1340574 1 0.3102 0.74025 0.816 0.000 0.000 0.028 0.000 0.156
#> SRR1444830 2 0.4988 0.58170 0.000 0.668 0.000 0.008 0.136 0.188
#> SRR1096267 1 0.0363 0.76369 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1087127 3 0.1814 0.76904 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1408553 4 0.0405 0.60850 0.008 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1069231 6 0.6109 0.21571 0.316 0.000 0.000 0.308 0.000 0.376
#> SRR1325642 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.1007 0.74406 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1321942 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.3660 0.72546 0.780 0.000 0.000 0.060 0.000 0.160
#> SRR1447499 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.5105 0.56565 0.000 0.652 0.000 0.008 0.140 0.200
#> SRR1077874 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR808299 2 0.0146 0.83076 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098050 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1481238 3 0.6716 0.40419 0.000 0.032 0.412 0.008 0.348 0.200
#> SRR1443568 3 0.6153 0.51399 0.000 0.048 0.544 0.008 0.304 0.096
#> SRR1380249 6 0.3737 0.55051 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1080143 1 0.5580 0.56192 0.516 0.000 0.000 0.324 0.000 0.160
#> SRR1383148 4 0.3050 0.51059 0.000 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1357042 1 0.3888 0.64480 0.716 0.000 0.000 0.252 0.000 0.032
#> SRR1416025 2 0.2793 0.65742 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1431015 2 0.0632 0.81977 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1078709 2 0.3851 0.07675 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR813283 1 0.3717 0.72350 0.776 0.000 0.000 0.064 0.000 0.160
#> SRR1430226 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.3660 0.72546 0.780 0.000 0.000 0.060 0.000 0.160
#> SRR1466927 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.2340 0.82123 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR807679 1 0.3288 0.43044 0.724 0.000 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1333811 3 0.0260 0.84177 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1078660 5 0.2912 0.76243 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.4072 -0.12074 0.544 0.000 0.000 0.008 0.000 0.448
#> SRR1432542 6 0.3318 0.69870 0.032 0.000 0.000 0.172 0.000 0.796
#> SRR1418041 1 0.5662 0.46827 0.476 0.000 0.000 0.364 0.000 0.160
#> SRR1085211 1 0.4205 0.69693 0.728 0.000 0.000 0.084 0.000 0.188
#> SRR1339812 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 6 0.3558 0.68614 0.088 0.000 0.000 0.112 0.000 0.800
#> SRR1350958 2 0.4449 0.65754 0.000 0.732 0.000 0.008 0.136 0.124
#> SRR1396822 2 0.7107 0.35820 0.000 0.496 0.156 0.008 0.140 0.200
#> SRR1441934 2 0.3419 0.73643 0.000 0.820 0.000 0.008 0.056 0.116
#> SRR1472552 3 0.3930 0.79120 0.000 0.000 0.772 0.008 0.064 0.156
#> SRR1488881 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.4636 0.70339 0.692 0.000 0.000 0.148 0.000 0.160
#> SRR1071131 2 0.6108 0.27482 0.000 0.528 0.248 0.000 0.200 0.024
#> SRR1074502 1 0.2527 0.73306 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1325271 6 0.3301 0.69562 0.024 0.000 0.000 0.188 0.000 0.788
#> SRR1409171 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.4164 0.61909 0.000 0.744 0.000 0.008 0.184 0.064
#> SRR1430045 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0713 0.81847 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1384091 4 0.2823 0.54329 0.000 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1431887 2 0.3804 0.02957 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1096525 4 0.0520 0.60877 0.008 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008
#> SRR1488491 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.6053 0.41921 0.000 0.164 0.040 0.008 0.600 0.188
#> SRR1369514 4 0.3706 0.38348 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1453299 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.0260 0.73241 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1091767 5 0.3695 0.48371 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1354467 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.5105 0.56565 0.000 0.652 0.000 0.008 0.140 0.200
#> SRR1452399 2 0.4072 0.52896 0.000 0.704 0.032 0.000 0.260 0.004
#> SRR1437430 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1313343 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 6 0.3634 0.59584 0.000 0.000 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1083530 1 0.3469 0.71690 0.808 0.000 0.000 0.088 0.000 0.104
#> SRR1333633 3 0.4969 0.58911 0.000 0.000 0.644 0.008 0.256 0.092
#> SRR1354999 3 0.6842 0.58851 0.000 0.120 0.532 0.008 0.140 0.200
#> SRR1443592 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.4295 0.72123 0.728 0.000 0.000 0.112 0.000 0.160
#> SRR1378818 5 0.3198 0.58994 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1413182 4 0.2941 0.53063 0.000 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1464559 6 0.3647 0.59169 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1413075 5 0.2260 0.82356 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1487928 4 0.2996 0.52046 0.000 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1388997 2 0.2793 0.65742 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1092865 2 0.5369 0.47964 0.000 0.572 0.000 0.008 0.312 0.108
#> SRR1102729 4 0.6049 0.14416 0.332 0.000 0.000 0.404 0.000 0.264
#> SRR1456423 1 0.1957 0.75284 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.2527 0.69334 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 4 0.4037 0.27546 0.380 0.000 0.000 0.608 0.000 0.012
#> SRR1346710 1 0.1957 0.69541 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1418771 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.6546 0.29286 0.000 0.252 0.036 0.008 0.504 0.200
#> SRR1480941 3 0.1225 0.83812 0.000 0.000 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR1479175 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.4946 0.69786 0.652 0.000 0.000 0.188 0.000 0.160
#> SRR1433884 2 0.5257 0.39349 0.000 0.596 0.000 0.008 0.292 0.104
#> SRR1471074 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.1075 0.80645 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1355554 3 0.5346 0.72271 0.000 0.008 0.644 0.008 0.140 0.200
#> SRR1487173 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.3772 0.72226 0.772 0.000 0.000 0.068 0.000 0.160
#> SRR1322918 2 0.1007 0.80942 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1318331 2 0.0146 0.83053 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0260 0.75923 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350545 1 0.4964 0.69825 0.648 0.000 0.000 0.200 0.000 0.152
#> SRR1091328 6 0.4875 0.61961 0.260 0.000 0.000 0.104 0.000 0.636
#> SRR814447 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.6729 0.46024 0.000 0.552 0.116 0.008 0.152 0.172
#> SRR1453680 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 4 0.5642 -0.13306 0.352 0.000 0.000 0.488 0.000 0.160
#> SRR1366729 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.5105 0.56565 0.000 0.652 0.000 0.008 0.140 0.200
#> SRR814633 2 0.0000 0.83214 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.3531 0.38804 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1319100 1 0.1501 0.76197 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.5112 0.72487 0.000 0.000 0.652 0.008 0.196 0.144
#> SRR1457459 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.3136 0.52107 0.004 0.000 0.000 0.768 0.000 0.228
#> SRR1444598 5 0.2562 0.68635 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1091743 2 0.6322 0.49184 0.000 0.584 0.068 0.008 0.140 0.200
#> SRR819637 1 0.0000 0.76098 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.1265 0.76667 0.948 0.000 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR1088934 3 0.7644 0.17126 0.000 0.316 0.332 0.008 0.144 0.200
#> SRR1459785 3 0.0000 0.84502 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.3602 0.72731 0.784 0.000 0.000 0.056 0.000 0.160
#> SRR1375531 1 0.5738 0.44152 0.496 0.000 0.000 0.192 0.000 0.312
#> SRR1323470 5 0.7727 0.00775 0.000 0.292 0.188 0.008 0.336 0.176
#> SRR814657 4 0.3982 -0.00153 0.460 0.000 0.000 0.536 0.000 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.996 0.998 0.495 0.505 0.505
#> 3 3 0.966 0.936 0.972 0.166 0.911 0.824
#> 4 4 0.781 0.805 0.884 0.164 0.830 0.625
#> 5 5 0.705 0.610 0.714 0.103 0.851 0.558
#> 6 6 0.734 0.724 0.816 0.067 0.932 0.710
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1079543 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 1 0.7674 0.715 0.776 0.224
#> SRR1436949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1091230 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1397312 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1312147 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1073631 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1348885 1 0.7674 0.715 0.776 0.224
#> SRR1325826 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1355747 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1309314 1 0.7674 0.715 0.776 0.224
#> SRR1420085 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 1 0.0376 0.992 0.996 0.004
#> SRR807679 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1413182 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 1 0.7674 0.715 0.776 0.224
#> SRR1479175 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1455989 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR1097197 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1074602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1319100 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR1091743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.0672 0.988 0.992 0.008
#> SRR814657 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.6274 0.2776 0.544 0.000 0.456
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0237 0.9694 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.3879 0.7785 0.000 0.152 0.848
#> SRR1402944 3 0.6225 0.4851 0.000 0.432 0.568
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.2796 0.8610 0.000 0.908 0.092
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.1411 0.9633 0.964 0.000 0.036
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 3 0.6215 0.4930 0.000 0.428 0.572
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.4555 0.6900 0.000 0.800 0.200
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.1643 0.9559 0.956 0.000 0.044
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.6291 0.3881 0.000 0.468 0.532
#> SRR1344034 2 0.0747 0.9563 0.000 0.984 0.016
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.5835 0.3269 0.000 0.660 0.340
#> SRR814219 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 3 0.6225 0.4851 0.000 0.432 0.568
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 3 0.6235 0.4759 0.000 0.436 0.564
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0237 0.9694 0.000 0.996 0.004
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0747 0.9808 0.984 0.000 0.016
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.4555 0.6900 0.000 0.800 0.200
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 3 0.6235 0.4760 0.000 0.436 0.564
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 3 0.0237 0.8257 0.000 0.004 0.996
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.2537 0.9207 0.920 0.000 0.080
#> SRR1400799 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.2878 0.9040 0.904 0.000 0.096
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.3192 0.8004 0.000 0.112 0.888
#> SRR1385434 1 0.0747 0.9808 0.984 0.000 0.016
#> SRR1415591 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.1289 0.9669 0.968 0.000 0.032
#> SRR1308734 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.6215 0.4928 0.000 0.428 0.572
#> SRR809919 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.5465 0.5080 0.000 0.712 0.288
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.3267 0.8294 0.000 0.884 0.116
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 3 0.6235 0.4759 0.000 0.436 0.564
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.1529 0.9596 0.960 0.000 0.040
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0237 0.9908 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413137 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.2878 0.9040 0.904 0.000 0.096
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.4796 0.6626 0.000 0.780 0.220
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.2959 0.8052 0.000 0.100 0.900
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.0237 0.8257 0.000 0.004 0.996
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.0237 0.9908 0.996 0.000 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.0237 0.9694 0.000 0.996 0.004
#> SRR1315780 3 0.2066 0.8166 0.000 0.060 0.940
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.4178 0.7351 0.000 0.828 0.172
#> SRR1464494 2 0.5835 0.3270 0.000 0.660 0.340
#> SRR1357083 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.2878 0.9040 0.904 0.000 0.096
#> SRR1454073 3 0.3192 0.8007 0.000 0.112 0.888
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309314 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.6180 0.0755 0.000 0.584 0.416
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0237 0.9694 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 3 0.6225 0.4851 0.000 0.432 0.568
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.4291 0.7253 0.000 0.820 0.180
#> SRR1466025 3 0.6168 0.5157 0.000 0.412 0.588
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.4002 0.7560 0.000 0.840 0.160
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.4654 0.6676 0.000 0.792 0.208
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.6244 -0.0756 0.000 0.560 0.440
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 3 0.3686 0.7869 0.000 0.140 0.860
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.1643 0.9559 0.956 0.000 0.044
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 3 0.6225 0.4851 0.000 0.432 0.568
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 3 0.5859 0.6146 0.000 0.344 0.656
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.2878 0.9040 0.904 0.000 0.096
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.5948 0.5934 0.000 0.360 0.640
#> SRR1408553 1 0.0237 0.9908 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.6215 0.4930 0.000 0.428 0.572
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0237 0.9694 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.2625 0.8105 0.000 0.084 0.916
#> SRR1488881 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.2356 0.9288 0.928 0.000 0.072
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.5859 0.3132 0.000 0.656 0.344
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.2448 0.8138 0.000 0.076 0.924
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.0747 0.9561 0.000 0.984 0.016
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.6192 0.0155 0.000 0.580 0.420
#> SRR1437430 3 0.6302 0.2818 0.000 0.480 0.520
#> SRR1419736 3 0.4555 0.7420 0.000 0.200 0.800
#> SRR1313343 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0592 0.9842 0.988 0.000 0.012
#> SRR1464559 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.6274 -0.1426 0.000 0.544 0.456
#> SRR1487928 1 0.2878 0.9040 0.904 0.000 0.096
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0424 0.9651 0.000 0.992 0.008
#> SRR1453680 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.4555 0.6900 0.000 0.800 0.200
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.5591 0.4664 0.000 0.696 0.304
#> SRR821282 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.9735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0000 0.8257 0.000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.9940 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.0524 0.7087 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 3 0.4776 0.6996 0.000 0.376 0.624 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.4134 0.7685 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR819559 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387899 3 0.3975 0.7713 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 3 0.4543 0.7439 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1102320 1 0.0336 0.9708 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1469926 3 0.1557 0.7185 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1070036 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098426 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1090310 3 0.1716 0.7224 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 3 0.4564 0.7410 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.1389 0.9453 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.3266 0.7691 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.7005 0.6764 0.000 0.256 0.572 0.172
#> SRR1402944 3 0.4722 0.7494 0.000 0.300 0.692 0.008
#> SRR1092818 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1093552 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1464880 3 0.4925 0.6106 0.000 0.428 0.572 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.2760 0.7449 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1466951 2 0.0469 0.9105 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1331879 3 0.4925 0.6151 0.000 0.428 0.572 0.000
#> SRR1320034 3 0.4134 0.2683 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1068687 3 0.4679 0.7239 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0336 0.9708 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1329994 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 3 0.4994 0.5074 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.4406 0.7579 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.1557 0.7185 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1338687 3 0.4985 0.5540 0.000 0.468 0.532 0.000
#> SRR1071207 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1486821 3 0.1637 0.7202 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1418540 1 0.0707 0.9667 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1408788 3 0.4134 0.7700 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1359487 4 0.4999 0.1587 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1080648 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1414708 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1469080 3 0.4977 0.5540 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.1211 0.9525 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1321829 3 0.4543 0.7439 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1475993 3 0.1792 0.7250 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 3 0.5913 0.6755 0.000 0.352 0.600 0.048
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1453769 2 0.5705 0.6089 0.000 0.712 0.108 0.180
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 3 0.4855 0.6686 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1366124 4 0.4955 0.3109 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0707 0.9667 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1086490 3 0.0707 0.6823 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0707 0.9618 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1359738 3 0.1022 0.6953 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 3 0.4746 0.7084 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.4855 0.6498 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1344034 3 0.3311 0.7708 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1080391 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 3 0.4977 0.5478 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 3 0.6074 0.6818 0.000 0.340 0.600 0.060
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 3 0.4981 0.5455 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1417851 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1076705 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079380 3 0.5186 0.7089 0.000 0.344 0.640 0.016
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 3 0.4643 0.7233 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1366605 2 0.1211 0.8852 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0707 0.9028 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1436840 2 0.1940 0.8325 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1431735 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417387 1 0.0707 0.9667 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1445984 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1370447 1 0.4761 0.3362 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1446308 3 0.3801 0.7733 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1437346 3 0.1722 0.7109 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0336 0.9708 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1468914 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1319584 3 0.4844 0.7476 0.000 0.300 0.688 0.012
#> SRR1486584 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813536 1 0.0921 0.9601 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 4 0.4898 0.0983 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 3 0.4406 0.7577 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1335314 4 0.4713 0.4933 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1400799 3 0.1389 0.7106 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 3 0.5000 0.4652 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0469 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1445023 1 0.3942 0.6683 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1077599 3 0.4356 0.7599 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1453480 2 0.4790 -0.0283 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1074839 3 0.4855 0.6749 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1458727 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1436949 3 0.4925 0.6151 0.000 0.428 0.572 0.000
#> SRR1070429 3 0.1118 0.6979 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.3873 0.6614 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0779 0.6608 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1385434 1 0.4697 0.3863 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1415591 3 0.1716 0.7224 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.4830 0.4335 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1308734 3 0.1716 0.7231 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1498973 3 0.4888 0.6387 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0707 0.9667 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR814341 2 0.4898 -0.2004 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1313601 3 0.4382 0.7589 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.1767 0.7087 0.000 0.044 0.944 0.012
#> SRR809919 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1323651 3 0.4008 0.7707 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 4 0.3610 0.5582 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1091230 3 0.4454 0.7524 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1557 0.7185 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1317731 3 0.4164 0.7687 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 3 0.7478 0.5236 0.000 0.344 0.468 0.188
#> SRR1397312 3 0.4500 0.7444 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR812128 3 0.4866 0.6482 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 3 0.4522 0.7462 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1316033 3 0.1637 0.7202 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1390371 2 0.0592 0.9072 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1480263 2 0.4304 0.3490 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1464473 3 0.0592 0.6796 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1076801 1 0.0921 0.9617 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0469 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 3 0.5428 0.6627 0.000 0.380 0.600 0.020
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0817 0.9037 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1075054 3 0.4985 0.5365 0.000 0.468 0.532 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417023 1 0.4985 -0.0263 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1309333 2 0.0592 0.9069 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.4250 0.5865 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1413137 1 0.2469 0.8718 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1469973 3 0.4713 0.7159 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1420026 2 0.1716 0.8630 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR817306 1 0.0469 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416266 4 0.4955 0.3121 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1435394 3 0.4134 0.7673 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1383192 1 0.0921 0.9601 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1419962 3 0.0469 0.6755 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.2174 0.6719 0.000 0.020 0.928 0.052
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 4 0.4817 0.1848 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1312147 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 3 0.4356 0.7615 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1470988 1 0.4500 0.4930 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR811915 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0469 0.9090 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1444436 3 0.4961 0.5969 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1313770 3 0.2412 0.7387 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR1315780 4 0.6503 -0.1578 0.000 0.072 0.448 0.480
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 3 0.4866 0.6461 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1464494 3 0.4855 0.6498 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1357083 3 0.0817 0.6866 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1378220 3 0.3172 0.7681 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1467704 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1348885 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.2281 0.8799 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1345692 2 0.2345 0.8087 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1401040 3 0.2266 0.5904 0.000 0.004 0.912 0.084
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.4040 0.6443 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1454073 3 0.7415 0.5273 0.000 0.196 0.500 0.304
#> SRR1355747 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1429368 3 0.1637 0.7202 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1398138 2 0.4250 0.4356 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1379260 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361436 3 0.1716 0.7224 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR817142 3 0.4277 0.7623 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1315291 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1309314 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1420085 2 0.4972 -0.3407 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1361308 3 0.0592 0.6796 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.4477 0.7454 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 3 0.5138 0.6539 0.000 0.392 0.600 0.008
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399353 1 0.0817 0.9644 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1096760 3 0.3123 0.7683 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1440290 3 0.3975 0.7713 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1330813 3 0.4585 0.7387 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.1302 0.9491 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1394321 1 0.0469 0.9698 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0592 0.9066 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.4585 0.1853 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0817 0.6884 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.1211 0.9525 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1447893 3 0.1211 0.7031 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1466025 3 0.6370 0.6980 0.000 0.280 0.620 0.100
#> SRR1477429 1 0.1022 0.9579 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1445701 3 0.3123 0.7674 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 3 0.4804 0.6910 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 3 0.4941 0.6208 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.2081 0.9056 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 3 0.4477 0.7448 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1474485 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319262 3 0.2973 0.7649 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1095188 3 0.4713 0.7163 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0921 0.6907 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1105417 1 0.0921 0.9601 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1325578 3 0.4250 0.7667 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1358161 3 0.1635 0.7106 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 3 0.5339 0.6576 0.000 0.384 0.600 0.016
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 3 0.3942 0.7736 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0336 0.9708 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090837 3 0.0707 0.6823 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1447828 3 0.0592 0.6796 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.1716 0.7224 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.4998 -0.4286 0.000 0.512 0.488 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.1824 0.6161 0.000 0.004 0.936 0.060
#> SRR1475448 3 0.0707 0.6842 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 3 0.4564 0.7347 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1325794 3 0.4804 0.6819 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR1095961 3 0.1716 0.7224 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1086702 2 0.1940 0.8357 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1320806 3 0.4277 0.7663 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1457527 3 0.0657 0.6641 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0707 0.6823 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1488858 4 0.4941 0.3329 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1454695 1 0.0707 0.9667 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1090241 2 0.3569 0.6362 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1329863 2 0.4888 -0.1878 0.000 0.588 0.412 0.000
#> SRR1357733 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362135 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1379581 3 0.3942 0.3260 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1084742 3 0.5016 0.6520 0.000 0.396 0.600 0.004
#> SRR1433538 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085063 2 0.1474 0.8736 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1454247 3 0.6215 0.6700 0.000 0.328 0.600 0.072
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.4477 0.7504 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1072388 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1070332 3 0.4925 0.6151 0.000 0.428 0.572 0.000
#> SRR1320761 3 0.4500 0.7426 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1076195 4 0.4103 0.6362 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1069895 3 0.3764 0.7724 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1099144 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1385150 3 0.1474 0.7153 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0707 0.9667 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 3 0.4585 0.7385 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.5188 0.6271 0.000 0.044 0.716 0.240
#> SRR1408553 1 0.4605 0.4408 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1069231 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1321942 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 3 0.4855 0.6734 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1099330 3 0.4713 0.7166 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1077874 2 0.4999 -0.4453 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.5510 0.6650 0.000 0.376 0.600 0.024
#> SRR1481238 3 0.4624 0.7348 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1443568 3 0.4134 0.7701 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1380249 1 0.1792 0.9244 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.4008 0.6537 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1357042 1 0.0469 0.9698 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 3 0.4961 0.5831 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR807679 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333811 3 0.2216 0.7402 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1078660 3 0.4916 0.6224 0.000 0.424 0.576 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432542 1 0.0921 0.9618 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.0188 0.9157 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1402437 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1350958 2 0.0336 0.9128 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1396822 3 0.4164 0.7661 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0469 0.6755 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1488881 3 0.0707 0.6823 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1102973 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071131 3 0.4382 0.7593 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.4454 0.3290 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1430045 2 0.3024 0.7270 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1441245 3 0.4999 0.5069 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1384091 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1431887 2 0.2149 0.8235 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1096525 4 0.4989 0.2287 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 3 0.4477 0.7437 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1369514 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453299 3 0.1716 0.7224 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.6071 0.5165 0.000 0.064 0.612 0.324
#> SRR1091767 2 0.4996 -0.4486 0.000 0.516 0.484 0.000
#> SRR1354467 3 0.0592 0.6796 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1069074 3 0.4925 0.6278 0.000 0.428 0.572 0.000
#> SRR1452399 3 0.4382 0.7546 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1437430 3 0.3355 0.7701 0.000 0.160 0.836 0.004
#> SRR1419736 3 0.6374 0.4976 0.000 0.084 0.592 0.324
#> SRR1313343 3 0.1557 0.7185 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1077619 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1083530 1 0.0336 0.9709 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333633 3 0.3837 0.7732 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1354999 3 0.4277 0.7618 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 4 0.2814 0.6370 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1413182 1 0.4585 0.4523 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1464559 1 0.1118 0.9557 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1413075 3 0.5364 0.6495 0.000 0.392 0.592 0.016
#> SRR1487928 4 0.3975 0.6518 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1388997 2 0.1302 0.8746 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1092865 3 0.4746 0.7087 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.3801 0.3621 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1339903 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1346710 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.4624 0.7263 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1480941 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 3 0.4948 0.6137 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0707 0.9041 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1355554 3 0.4072 0.7687 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.3486 0.6501 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0707 0.6823 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1474231 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1350545 1 0.0188 0.9716 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091328 1 0.0592 0.9686 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR814447 4 0.4746 0.5334 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1455989 3 0.3486 0.7717 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1453680 3 0.3801 0.3625 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0336 0.9115 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1444222 3 0.7423 0.5601 0.000 0.344 0.476 0.180
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0592 0.6796 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR821282 4 0.4916 0.4549 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1074602 3 0.4624 0.7330 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9197 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 4 0.3172 0.6079 0.000 0.000 0.160 0.840
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.3123 0.7674 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.1302 0.9491 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1444598 4 0.0707 0.7024 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1091743 3 0.4605 0.7360 0.000 0.336 0.664 0.000
#> SRR819637 1 0.0469 0.9698 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.3801 0.7731 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1459785 3 0.1637 0.7202 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 4 0.0336 0.7082 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR814657 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0451 0.83013 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1402132 5 0.5346 0.22528 0.368 0.000 0.020 0.028 0.584
#> SRR1326059 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1409062 3 0.6695 -0.06097 0.000 0.284 0.432 0.000 0.284
#> SRR809406 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1465313 3 0.6388 0.15625 0.000 0.192 0.496 0.000 0.312
#> SRR819559 4 0.4302 -0.59946 0.480 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1387899 3 0.4901 0.47136 0.000 0.060 0.672 0.000 0.268
#> SRR1442292 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.4256 0.83158 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1395635 4 0.0771 0.86128 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004
#> SRR1343629 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1326868 3 0.6374 0.18953 0.000 0.208 0.512 0.000 0.280
#> SRR1102320 4 0.2966 0.62016 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1469926 3 0.1357 0.54435 0.000 0.004 0.948 0.000 0.048
#> SRR1070036 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1098426 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1090310 3 0.0703 0.57479 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1363654 4 0.4306 -0.64622 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1326317 3 0.5888 0.34057 0.000 0.140 0.580 0.000 0.280
#> SRR1378308 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0703 0.84721 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1329947 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1469769 3 0.3953 0.53509 0.000 0.060 0.792 0.000 0.148
#> SRR1490761 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.6684 0.26566 0.008 0.208 0.296 0.000 0.488
#> SRR1402944 5 0.6632 0.23167 0.000 0.228 0.344 0.000 0.428
#> SRR1092818 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1093552 4 0.0000 0.85975 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 5 0.6815 0.31631 0.000 0.308 0.336 0.000 0.356
#> SRR1078368 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.1106 0.81434 0.000 0.964 0.024 0.000 0.012
#> SRR1466951 2 0.3876 0.59434 0.000 0.776 0.032 0.000 0.192
#> SRR1331879 5 0.6818 0.31567 0.000 0.312 0.336 0.000 0.352
#> SRR1320034 3 0.3086 0.40934 0.004 0.000 0.816 0.000 0.180
#> SRR1068687 3 0.6662 -0.02050 0.000 0.276 0.444 0.000 0.280
#> SRR1437491 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 4 0.3561 0.40536 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1329994 4 0.0880 0.86216 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1354203 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1077850 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.6814 0.32633 0.000 0.344 0.304 0.000 0.352
#> SRR1455214 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1092014 3 0.6532 0.09444 0.000 0.240 0.480 0.000 0.280
#> SRR1097857 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1473318 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1345974 3 0.1106 0.57302 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1338687 2 0.6514 -0.20625 0.000 0.484 0.236 0.000 0.280
#> SRR1071207 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1486821 3 0.1106 0.57302 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1418540 4 0.0510 0.86221 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1408788 3 0.6333 0.22263 0.000 0.196 0.516 0.000 0.288
#> SRR1359487 4 0.0880 0.84077 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1080648 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1414708 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1469080 5 0.6818 0.32636 0.000 0.328 0.316 0.000 0.356
#> SRR1365722 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0510 0.85253 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1321829 3 0.6514 0.10780 0.000 0.236 0.484 0.000 0.280
#> SRR1475993 3 0.1830 0.57183 0.000 0.028 0.932 0.000 0.040
#> SRR1445387 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1077575 5 0.6487 0.26364 0.000 0.208 0.316 0.000 0.476
#> SRR1349300 1 0.4045 0.97848 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1374165 4 0.0162 0.86001 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453769 2 0.4305 0.61232 0.008 0.760 0.040 0.000 0.192
#> SRR1473870 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1401146 3 0.6778 -0.16397 0.000 0.312 0.392 0.000 0.296
#> SRR1366124 4 0.0963 0.83729 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1391811 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1456674 4 0.0451 0.86166 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1086490 3 0.0865 0.57383 0.004 0.024 0.972 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.3452 0.46962 0.244 0.000 0.000 0.756 0.000
#> SRR1384431 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1072055 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1359738 3 0.1106 0.57285 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1332141 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1085900 3 0.6674 -0.03306 0.000 0.280 0.440 0.000 0.280
#> SRR1442173 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1431625 2 0.0324 0.83166 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.6783 0.32483 0.000 0.296 0.316 0.000 0.388
#> SRR1344034 3 0.4066 0.52669 0.000 0.044 0.768 0.000 0.188
#> SRR1080391 4 0.0000 0.85975 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 5 0.6804 0.33287 0.000 0.340 0.296 0.000 0.364
#> SRR814219 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1102128 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1460211 2 0.0162 0.83297 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.6273 0.21735 0.000 0.172 0.316 0.000 0.512
#> SRR1070060 1 0.4297 0.74353 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1487969 5 0.6814 0.32586 0.000 0.344 0.304 0.000 0.352
#> SRR1417851 4 0.0510 0.86214 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1443350 2 0.0162 0.83166 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403199 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1076705 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1079380 5 0.6710 0.31301 0.000 0.264 0.316 0.000 0.420
#> SRR1102923 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 3 0.6785 -0.28125 0.000 0.280 0.364 0.000 0.356
#> SRR1366605 2 0.1725 0.79823 0.000 0.936 0.044 0.000 0.020
#> SRR1396035 2 0.0162 0.83166 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390223 2 0.2153 0.77925 0.000 0.916 0.044 0.000 0.040
#> SRR1436840 2 0.2522 0.75034 0.000 0.896 0.052 0.000 0.052
#> SRR1445573 2 0.0451 0.83045 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1375394 5 0.5365 0.22826 0.348 0.000 0.024 0.028 0.600
#> SRR1431735 4 0.0609 0.86147 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1417387 4 0.0671 0.86199 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1445984 4 0.0566 0.86206 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1370447 4 0.1549 0.83767 0.040 0.000 0.000 0.944 0.016
#> SRR1446308 3 0.4946 0.46554 0.000 0.060 0.664 0.000 0.276
#> SRR1437346 3 0.1653 0.57017 0.004 0.028 0.944 0.000 0.024
#> SRR1103143 2 0.0290 0.83107 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1086466 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 4 0.2813 0.65648 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1468914 4 0.0510 0.85253 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1319584 5 0.6641 0.18151 0.000 0.224 0.368 0.000 0.408
#> SRR1486584 4 0.4060 -0.09245 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR813536 4 0.1410 0.83759 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1341921 4 0.3895 0.16585 0.320 0.000 0.000 0.680 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3642 0.17800 0.048 0.000 0.124 0.004 0.824
#> SRR1079543 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0771 0.82344 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1076681 3 0.5957 0.32482 0.000 0.148 0.572 0.000 0.280
#> SRR1335314 4 0.1502 0.81561 0.056 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1400799 3 0.1106 0.57296 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1074578 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1312226 2 0.6784 -0.46447 0.000 0.368 0.280 0.000 0.352
#> SRR1416207 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1447371 4 0.4262 -0.45281 0.440 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1069328 4 0.1121 0.84621 0.044 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1445023 4 0.0794 0.84409 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1077599 3 0.4967 0.46195 0.000 0.060 0.660 0.000 0.280
#> SRR1453480 2 0.5050 0.47345 0.000 0.700 0.120 0.000 0.180
#> SRR1101834 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 4 0.0162 0.86001 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074839 3 0.6783 -0.18244 0.000 0.348 0.372 0.000 0.280
#> SRR1458727 5 0.5365 0.22826 0.348 0.000 0.024 0.028 0.600
#> SRR1436949 5 0.6816 0.31261 0.000 0.308 0.340 0.000 0.352
#> SRR1070429 3 0.0703 0.57479 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1432408 4 0.5009 0.49238 0.288 0.000 0.000 0.652 0.060
#> SRR1310334 1 0.4045 0.97850 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1418201 3 0.2233 0.48800 0.004 0.000 0.892 0.000 0.104
#> SRR1385434 4 0.0880 0.84077 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1415591 3 0.0865 0.57515 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1402009 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1316055 4 0.1341 0.81701 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1308734 3 0.1469 0.57484 0.000 0.036 0.948 0.000 0.016
#> SRR1498973 5 0.6816 0.31261 0.000 0.308 0.340 0.000 0.352
#> SRR1397115 1 0.4114 0.94901 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1392141 4 0.0671 0.86199 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR814341 2 0.4926 0.48960 0.000 0.712 0.112 0.000 0.176
#> SRR1313601 3 0.5957 0.31574 0.000 0.148 0.572 0.000 0.280
#> SRR1459609 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.1043 0.54657 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR809919 4 0.3983 0.05477 0.340 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1370818 4 0.0566 0.85514 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1323651 3 0.4924 0.46848 0.000 0.060 0.668 0.000 0.272
#> SRR1357297 4 0.4060 -0.06428 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR818170 5 0.5140 0.21628 0.284 0.000 0.060 0.004 0.652
#> SRR1091230 3 0.5296 0.43272 0.000 0.084 0.636 0.000 0.280
#> SRR1470556 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1095285 3 0.1399 0.56575 0.000 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1317731 3 0.5947 0.31523 0.000 0.132 0.556 0.000 0.312
#> SRR1490785 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1432032 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1447808 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR809534 5 0.6762 0.25820 0.008 0.392 0.192 0.000 0.408
#> SRR1397312 3 0.6736 -0.19562 0.000 0.260 0.396 0.000 0.344
#> SRR812128 5 0.6790 0.32299 0.000 0.300 0.316 0.000 0.384
#> SRR1101513 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1415708 3 0.6438 0.15202 0.000 0.220 0.500 0.000 0.280
#> SRR1316033 3 0.1493 0.56655 0.000 0.024 0.948 0.000 0.028
#> SRR1390371 2 0.4197 0.50214 0.000 0.728 0.028 0.000 0.244
#> SRR1480263 2 0.3033 0.72577 0.000 0.864 0.084 0.000 0.052
#> SRR1464473 3 0.1605 0.55255 0.004 0.012 0.944 0.000 0.040
#> SRR1076801 4 0.0324 0.86096 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1080044 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.0880 0.85524 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1069871 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1095744 5 0.6742 0.32439 0.000 0.276 0.316 0.000 0.408
#> SRR1068929 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.1836 0.79789 0.000 0.932 0.036 0.000 0.032
#> SRR1075054 5 0.6814 0.32659 0.000 0.344 0.304 0.000 0.352
#> SRR1083480 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1075458 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1417023 4 0.1043 0.83387 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1309333 2 0.4010 0.56251 0.000 0.760 0.032 0.000 0.208
#> SRR1333676 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1352996 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1093172 4 0.1444 0.83949 0.040 0.000 0.000 0.948 0.012
#> SRR1413137 4 0.1549 0.84441 0.040 0.000 0.000 0.944 0.016
#> SRR1469973 3 0.6742 -0.13786 0.000 0.296 0.412 0.000 0.292
#> SRR1420026 2 0.3442 0.69650 0.000 0.836 0.060 0.000 0.104
#> SRR817306 4 0.1341 0.83475 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1416266 4 0.2540 0.77903 0.088 0.000 0.000 0.888 0.024
#> SRR1071011 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0404 0.85464 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1435394 3 0.5062 0.45740 0.000 0.068 0.656 0.000 0.276
#> SRR1383192 4 0.2561 0.70997 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1419962 3 0.1644 0.54456 0.004 0.008 0.940 0.000 0.048
#> SRR1094357 4 0.3480 0.45250 0.248 0.000 0.000 0.752 0.000
#> SRR1081639 3 0.2719 0.45843 0.004 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR1356016 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.3616 0.18174 0.052 0.000 0.116 0.004 0.828
#> SRR1312147 4 0.0162 0.86001 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473891 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1474930 3 0.6396 0.17411 0.000 0.212 0.508 0.000 0.280
#> SRR1470988 4 0.1648 0.83580 0.040 0.000 0.000 0.940 0.020
#> SRR811915 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.6788 -0.46262 0.000 0.372 0.344 0.000 0.284
#> SRR1313770 3 0.1774 0.56086 0.000 0.016 0.932 0.000 0.052
#> SRR1315780 5 0.6452 0.21529 0.024 0.168 0.224 0.000 0.584
#> SRR1073631 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR819124 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1310997 5 0.6807 0.31431 0.000 0.300 0.336 0.000 0.364
#> SRR1464494 5 0.6796 0.31793 0.000 0.296 0.328 0.000 0.376
#> SRR1357083 3 0.0865 0.57524 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1475842 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1378220 3 0.3714 0.54261 0.000 0.056 0.812 0.000 0.132
#> SRR1467704 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1348885 5 0.5365 0.22826 0.348 0.000 0.024 0.028 0.600
#> SRR1325826 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1466812 1 0.4746 0.85916 0.600 0.000 0.000 0.376 0.024
#> SRR1345692 2 0.5864 0.07628 0.000 0.560 0.120 0.000 0.320
#> SRR1401040 3 0.2338 0.47990 0.004 0.000 0.884 0.000 0.112
#> SRR1097954 1 0.4060 0.97311 0.640 0.000 0.000 0.360 0.000
#> SRR1374396 4 0.4086 0.57781 0.240 0.000 0.000 0.736 0.024
#> SRR1454073 5 0.6484 0.25831 0.008 0.224 0.228 0.000 0.540
#> SRR1355747 4 0.0162 0.86001 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429368 3 0.1403 0.56842 0.000 0.024 0.952 0.000 0.024
#> SRR1398138 2 0.6396 -0.13885 0.000 0.508 0.212 0.000 0.280
#> SRR1379260 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1361436 3 0.0703 0.57479 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR817142 3 0.4946 0.46554 0.000 0.060 0.664 0.000 0.276
#> SRR1315291 5 0.5687 0.22447 0.348 0.000 0.020 0.052 0.580
#> SRR1309314 5 0.5365 0.22826 0.348 0.000 0.024 0.028 0.600
#> SRR1420085 2 0.6736 -0.40791 0.000 0.396 0.260 0.000 0.344
#> SRR1361308 3 0.1605 0.55255 0.004 0.012 0.944 0.000 0.040
#> SRR1472126 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1380482 3 0.6726 -0.18630 0.000 0.252 0.388 0.000 0.360
#> SRR1099789 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1079480 5 0.6742 0.32439 0.000 0.276 0.316 0.000 0.408
#> SRR1339276 1 0.4045 0.97849 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1418368 1 0.4268 0.81371 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1399353 4 0.0404 0.86214 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1096760 3 0.4830 0.47911 0.000 0.060 0.684 0.000 0.256
#> SRR1440290 3 0.4946 0.46554 0.000 0.060 0.664 0.000 0.276
#> SRR1330813 3 0.6596 0.05356 0.000 0.256 0.464 0.000 0.280
#> SRR1458931 2 0.0566 0.82663 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR812294 4 0.0510 0.85253 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1394321 4 0.1792 0.80267 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.1041 0.81565 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1349342 1 0.4150 0.92990 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1477173 2 0.0324 0.83162 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1086752 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.4069 0.63308 0.000 0.792 0.112 0.000 0.096
#> SRR1390143 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0865 0.57383 0.004 0.024 0.972 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.4256 0.83396 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1096687 4 0.0609 0.86147 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1486139 1 0.4074 0.96717 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1470313 4 0.0510 0.85253 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1447893 3 0.3386 0.55512 0.000 0.040 0.832 0.000 0.128
#> SRR1466025 5 0.6754 0.31542 0.000 0.272 0.332 0.000 0.396
#> SRR1477429 4 0.1410 0.82435 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1445701 3 0.4010 0.53267 0.000 0.056 0.784 0.000 0.160
#> SRR820689 1 0.4249 0.83919 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000
#> SRR1451876 3 0.6731 -0.09680 0.000 0.304 0.416 0.000 0.280
#> SRR1452537 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 4 0.4302 -0.59739 0.480 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1489328 3 0.6767 -0.16791 0.000 0.328 0.392 0.000 0.280
#> SRR1344462 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1082709 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1447784 4 0.0703 0.84707 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1355769 1 0.4171 0.91463 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1480917 3 0.6691 -0.16779 0.000 0.240 0.400 0.000 0.360
#> SRR1474485 4 0.0609 0.86147 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1089998 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1318140 1 0.4305 0.69991 0.512 0.000 0.000 0.488 0.000
#> SRR1319262 3 0.3752 0.54018 0.000 0.048 0.804 0.000 0.148
#> SRR1095188 3 0.6685 -0.04525 0.000 0.284 0.436 0.000 0.280
#> SRR1454350 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1440374 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1359565 3 0.0703 0.57479 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1105417 4 0.2773 0.65484 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1325578 3 0.6183 0.26090 0.000 0.180 0.544 0.000 0.276
#> SRR1358161 3 0.1282 0.54718 0.000 0.004 0.952 0.000 0.044
#> SRR1358665 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.6779 0.32430 0.000 0.284 0.332 0.000 0.384
#> SRR1452010 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1418183 3 0.5083 0.45328 0.000 0.068 0.652 0.000 0.280
#> SRR1366345 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1387449 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1473461 4 0.1478 0.82720 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1090837 3 0.0865 0.57383 0.004 0.024 0.972 0.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.1822 0.56132 0.004 0.024 0.936 0.000 0.036
#> SRR1338747 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0865 0.57515 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1350280 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1088557 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1102656 2 0.6706 -0.38665 0.000 0.404 0.248 0.000 0.348
#> SRR1441443 2 0.3012 0.70311 0.000 0.852 0.024 0.000 0.124
#> SRR1370682 3 0.2338 0.47973 0.004 0.000 0.884 0.000 0.112
#> SRR1475448 3 0.0865 0.57383 0.004 0.024 0.972 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1405266 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1363766 4 0.3857 0.20181 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1082592 5 0.6784 0.26897 0.000 0.280 0.352 0.000 0.368
#> SRR1325794 5 0.6817 0.29660 0.000 0.308 0.344 0.000 0.348
#> SRR1095961 3 0.1364 0.57388 0.000 0.036 0.952 0.000 0.012
#> SRR1086702 2 0.3033 0.72372 0.000 0.864 0.052 0.000 0.084
#> SRR1320806 3 0.5990 0.31956 0.000 0.152 0.568 0.000 0.280
#> SRR1457527 3 0.1502 0.53135 0.004 0.000 0.940 0.000 0.056
#> SRR1098831 2 0.0290 0.82867 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474374 3 0.1372 0.56992 0.004 0.024 0.956 0.000 0.016
#> SRR1488858 4 0.2753 0.71544 0.136 0.000 0.000 0.856 0.008
#> SRR1454695 4 0.0671 0.86199 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1090241 2 0.4559 0.54071 0.000 0.748 0.100 0.000 0.152
#> SRR1329863 2 0.4929 0.49308 0.000 0.716 0.148 0.000 0.136
#> SRR1357733 4 0.2471 0.72160 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1362135 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1379581 3 0.3086 0.40904 0.004 0.000 0.816 0.000 0.180
#> SRR1309182 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1437668 4 0.0162 0.86001 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1084742 5 0.6752 0.32478 0.000 0.280 0.316 0.000 0.404
#> SRR1433538 4 0.4219 -0.37311 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1085063 2 0.4204 0.58515 0.000 0.756 0.048 0.000 0.196
#> SRR1454247 5 0.6621 0.30172 0.000 0.240 0.312 0.000 0.448
#> SRR1097100 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.5441 0.41579 0.000 0.096 0.624 0.000 0.280
#> SRR1072388 4 0.0671 0.86199 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1070332 5 0.6813 0.31227 0.000 0.304 0.340 0.000 0.356
#> SRR1320761 3 0.6748 -0.23573 0.000 0.260 0.372 0.000 0.368
#> SRR1076195 4 0.3086 0.65954 0.180 0.000 0.000 0.816 0.004
#> SRR1069895 3 0.4946 0.46554 0.000 0.060 0.664 0.000 0.276
#> SRR1099144 4 0.0566 0.85514 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1385150 3 0.0703 0.57479 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0566 0.85514 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1102583 1 0.4074 0.96729 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1456971 4 0.0566 0.86206 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1340574 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1444830 3 0.6532 0.10930 0.000 0.240 0.480 0.000 0.280
#> SRR1096267 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1087127 3 0.6833 0.04576 0.244 0.004 0.404 0.000 0.348
#> SRR1408553 4 0.1648 0.83580 0.040 0.000 0.000 0.940 0.020
#> SRR1069231 4 0.0880 0.85510 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1321942 4 0.4161 -0.26328 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1094380 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1447499 2 0.6729 -0.39713 0.000 0.408 0.328 0.000 0.264
#> SRR1099330 3 0.6723 -0.08531 0.000 0.300 0.420 0.000 0.280
#> SRR1077874 2 0.6802 -0.48958 0.000 0.356 0.292 0.000 0.352
#> SRR808299 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.6686 0.31178 0.000 0.256 0.316 0.000 0.428
#> SRR1481238 3 0.6631 -0.00366 0.000 0.256 0.452 0.000 0.292
#> SRR1443568 3 0.5373 0.42628 0.000 0.092 0.632 0.000 0.276
#> SRR1380249 4 0.0794 0.84410 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1080143 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1383148 4 0.0880 0.84077 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1357042 4 0.1908 0.79218 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.2920 0.70655 0.000 0.852 0.016 0.000 0.132
#> SRR1078709 2 0.6775 -0.44953 0.000 0.376 0.276 0.000 0.348
#> SRR813283 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.5365 0.22826 0.348 0.000 0.024 0.028 0.600
#> SRR807679 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1333811 3 0.2983 0.56035 0.000 0.040 0.864 0.000 0.096
#> SRR1078660 5 0.6810 0.30597 0.000 0.300 0.344 0.000 0.356
#> SRR1331730 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 4 0.0771 0.86128 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004
#> SRR1432542 4 0.0324 0.86096 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1418041 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1085211 4 0.4114 -0.15326 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1339812 2 0.0451 0.82917 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1402437 4 0.0671 0.86199 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1350958 2 0.0290 0.83125 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.4946 0.46554 0.000 0.060 0.664 0.000 0.276
#> SRR1441934 2 0.0162 0.83243 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.1443 0.54424 0.004 0.004 0.948 0.000 0.044
#> SRR1488881 3 0.1153 0.57235 0.004 0.024 0.964 0.000 0.008
#> SRR1102973 4 0.2966 0.62585 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1071131 3 0.6200 0.25507 0.000 0.180 0.540 0.000 0.280
#> SRR1074502 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1325271 4 0.0566 0.86206 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1409171 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.6365 -0.10716 0.000 0.516 0.212 0.000 0.272
#> SRR1430045 2 0.4498 0.55284 0.000 0.756 0.112 0.000 0.132
#> SRR1441245 2 0.6674 -0.32749 0.000 0.440 0.280 0.000 0.280
#> SRR1384091 4 0.0404 0.85464 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1431887 2 0.2843 0.74067 0.000 0.876 0.076 0.000 0.048
#> SRR1096525 4 0.1648 0.83580 0.040 0.000 0.000 0.940 0.020
#> SRR1488491 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 3 0.6734 -0.21808 0.000 0.256 0.388 0.000 0.356
#> SRR1369514 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1453299 3 0.0703 0.57479 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1348490 5 0.6221 0.22733 0.000 0.172 0.300 0.000 0.528
#> SRR1091767 2 0.6775 -0.43458 0.000 0.388 0.328 0.000 0.284
#> SRR1354467 3 0.1822 0.56005 0.004 0.024 0.936 0.000 0.036
#> SRR1069074 2 0.6785 -0.44807 0.000 0.364 0.356 0.000 0.280
#> SRR1452399 3 0.6681 -0.10004 0.000 0.248 0.424 0.000 0.328
#> SRR1437430 3 0.4774 0.49819 0.004 0.044 0.688 0.000 0.264
#> SRR1419736 5 0.5159 0.08737 0.004 0.056 0.300 0.000 0.640
#> SRR1313343 3 0.1211 0.57159 0.000 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR1077619 4 0.0324 0.86096 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1083530 4 0.2329 0.74243 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1333633 3 0.5296 0.42677 0.000 0.084 0.636 0.000 0.280
#> SRR1354999 3 0.5062 0.45710 0.000 0.068 0.656 0.000 0.276
#> SRR1443592 2 0.0162 0.83297 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1378818 5 0.5059 0.21773 0.280 0.000 0.056 0.004 0.660
#> SRR1413182 4 0.0880 0.84077 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1464559 4 0.0566 0.85514 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1413075 5 0.6798 0.32005 0.000 0.292 0.340 0.000 0.368
#> SRR1487928 4 0.3934 0.54450 0.276 0.000 0.000 0.716 0.008
#> SRR1388997 2 0.4823 0.38562 0.000 0.672 0.052 0.000 0.276
#> SRR1092865 3 0.6767 -0.14705 0.000 0.328 0.392 0.000 0.280
#> SRR1102729 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1456423 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1321591 2 0.2130 0.76585 0.000 0.908 0.012 0.000 0.080
#> SRR1376874 3 0.3123 0.40483 0.004 0.000 0.812 0.000 0.184
#> SRR1339903 4 0.1908 0.79327 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR1346710 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.6707 -0.12141 0.000 0.268 0.424 0.000 0.308
#> SRR1480941 5 0.5365 0.22826 0.348 0.000 0.024 0.028 0.600
#> SRR1479175 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0162 0.83166 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1491354 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1433884 2 0.6781 -0.45080 0.000 0.376 0.344 0.000 0.280
#> SRR1471074 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0992 0.81643 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008
#> SRR1355554 3 0.4946 0.46554 0.000 0.060 0.664 0.000 0.276
#> SRR1487173 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1474253 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1322918 2 0.5787 0.20527 0.000 0.608 0.152 0.000 0.240
#> SRR1318331 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0865 0.57454 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1474231 4 0.0703 0.86035 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1350545 4 0.3424 0.47515 0.240 0.000 0.000 0.760 0.000
#> SRR1091328 4 0.0771 0.86128 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004
#> SRR814447 3 0.5123 0.19803 0.044 0.000 0.616 0.004 0.336
#> SRR1455989 3 0.4967 0.46569 0.000 0.060 0.660 0.000 0.280
#> SRR1453680 3 0.2970 0.42186 0.004 0.000 0.828 0.000 0.168
#> SRR1470356 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.1012 0.81878 0.000 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1444222 5 0.6780 0.24856 0.008 0.284 0.236 0.000 0.472
#> SRR1097197 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1366729 3 0.1710 0.55489 0.004 0.016 0.940 0.000 0.040
#> SRR821282 3 0.4442 0.26055 0.016 0.000 0.676 0.004 0.304
#> SRR1074602 3 0.6674 -0.01545 0.000 0.280 0.440 0.000 0.280
#> SRR814633 2 0.0000 0.83466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.5263 0.21625 0.324 0.000 0.056 0.004 0.616
#> SRR1319100 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1324004 3 0.3904 0.53597 0.000 0.052 0.792 0.000 0.156
#> SRR1457459 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1421031 4 0.0510 0.85253 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1444598 5 0.4532 0.22588 0.304 0.000 0.020 0.004 0.672
#> SRR1091743 3 0.6637 0.00936 0.000 0.268 0.452 0.000 0.280
#> SRR819637 4 0.1410 0.83062 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1083848 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1088934 3 0.4946 0.46554 0.000 0.060 0.664 0.000 0.276
#> SRR1459785 3 0.1106 0.57302 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1083700 1 0.4074 0.96749 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1375531 1 0.4030 0.98348 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1323470 5 0.5365 0.22826 0.348 0.000 0.024 0.028 0.600
#> SRR814657 1 0.4114 0.94864 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0547 9.16e-01 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1402132 6 0.0767 8.88e-01 0.004 0.000 0.008 0.000 0.012 0.976
#> SRR1326059 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1409062 5 0.6019 6.79e-01 0.000 0.152 0.376 0.016 0.456 0.000
#> SRR809406 1 0.0458 9.15e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1465313 5 0.4996 5.94e-01 0.000 0.072 0.408 0.000 0.520 0.000
#> SRR819559 1 0.3460 7.36e-01 0.796 0.000 0.000 0.164 0.036 0.004
#> SRR1387899 3 0.4693 2.92e-02 0.000 0.024 0.576 0.016 0.384 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.2070 8.57e-01 0.896 0.000 0.000 0.092 0.012 0.000
#> SRR1395635 4 0.2311 8.61e-01 0.016 0.000 0.000 0.880 0.104 0.000
#> SRR1343629 1 0.1753 9.01e-01 0.912 0.000 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1326868 5 0.5746 5.34e-01 0.000 0.108 0.432 0.016 0.444 0.000
#> SRR1102320 4 0.3151 7.09e-01 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.1572 6.52e-01 0.000 0.000 0.936 0.000 0.028 0.036
#> SRR1070036 4 0.2445 8.63e-01 0.020 0.000 0.000 0.872 0.108 0.000
#> SRR1098426 4 0.2311 8.61e-01 0.016 0.000 0.000 0.880 0.104 0.000
#> SRR1090310 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1429748 1 0.0260 9.14e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1363654 1 0.3377 7.20e-01 0.784 0.000 0.000 0.188 0.028 0.000
#> SRR1326317 3 0.5453 -3.50e-01 0.000 0.076 0.484 0.016 0.424 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2394 8.60e-01 0.020 0.000 0.000 0.900 0.048 0.032
#> SRR1329947 1 0.1588 9.04e-01 0.924 0.000 0.000 0.000 0.072 0.004
#> SRR1469769 3 0.3574 5.02e-01 0.000 0.016 0.780 0.016 0.188 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.6331 7.08e-01 0.000 0.100 0.232 0.000 0.560 0.108
#> SRR1402944 5 0.5861 7.39e-01 0.000 0.100 0.292 0.000 0.564 0.044
#> SRR1092818 4 0.2538 8.54e-01 0.016 0.000 0.000 0.860 0.124 0.000
#> SRR1093552 4 0.1232 8.72e-01 0.016 0.000 0.000 0.956 0.024 0.004
#> SRR1464880 5 0.5237 7.86e-01 0.000 0.172 0.220 0.000 0.608 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.1498 8.88e-01 0.000 0.940 0.028 0.000 0.032 0.000
#> SRR1466951 2 0.2092 8.27e-01 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1331879 5 0.5231 7.86e-01 0.000 0.168 0.224 0.000 0.608 0.000
#> SRR1320034 3 0.3221 4.02e-01 0.000 0.000 0.792 0.000 0.020 0.188
#> SRR1068687 5 0.5958 6.52e-01 0.000 0.140 0.392 0.016 0.452 0.000
#> SRR1437491 1 0.1806 9.01e-01 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1310777 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 4 0.4099 4.80e-01 0.372 0.000 0.000 0.612 0.016 0.000
#> SRR1329994 4 0.1773 8.70e-01 0.036 0.000 0.000 0.932 0.016 0.016
#> SRR1354203 1 0.0865 9.15e-01 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1077850 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.5345 7.83e-01 0.000 0.188 0.220 0.000 0.592 0.000
#> SRR1455214 1 0.0692 9.14e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1092014 5 0.5836 5.78e-01 0.000 0.120 0.428 0.016 0.436 0.000
#> SRR1097857 1 0.0603 9.13e-01 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1473318 1 0.1700 9.03e-01 0.916 0.000 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1345974 3 0.0622 6.71e-01 0.000 0.008 0.980 0.000 0.012 0.000
#> SRR1338687 5 0.6304 6.53e-01 0.000 0.292 0.244 0.016 0.448 0.000
#> SRR1071207 4 0.1480 8.73e-01 0.020 0.000 0.000 0.940 0.040 0.000
#> SRR1486821 3 0.0806 6.70e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1418540 4 0.1528 8.72e-01 0.016 0.000 0.000 0.936 0.048 0.000
#> SRR1408788 3 0.5487 -3.82e-01 0.000 0.080 0.488 0.016 0.416 0.000
#> SRR1359487 4 0.2602 8.56e-01 0.020 0.000 0.000 0.888 0.052 0.040
#> SRR1080648 4 0.2790 8.48e-01 0.020 0.000 0.000 0.840 0.140 0.000
#> SRR1414708 4 0.1657 8.70e-01 0.016 0.000 0.000 0.928 0.056 0.000
#> SRR1469080 5 0.5265 7.85e-01 0.000 0.176 0.220 0.000 0.604 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1980 8.64e-01 0.016 0.000 0.000 0.920 0.048 0.016
#> SRR1321829 5 0.5806 5.62e-01 0.000 0.116 0.424 0.016 0.444 0.000
#> SRR1475993 3 0.2805 5.52e-01 0.000 0.012 0.828 0.000 0.160 0.000
#> SRR1445387 1 0.0713 9.15e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1077575 5 0.5688 7.42e-01 0.000 0.108 0.236 0.000 0.612 0.044
#> SRR1349300 1 0.0603 9.15e-01 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1374165 4 0.2060 8.66e-01 0.016 0.000 0.000 0.900 0.084 0.000
#> SRR1453769 2 0.5305 5.92e-01 0.000 0.676 0.048 0.000 0.168 0.108
#> SRR1473870 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1401146 5 0.5823 7.31e-01 0.000 0.200 0.332 0.000 0.468 0.000
#> SRR1366124 4 0.2507 8.58e-01 0.016 0.000 0.000 0.892 0.056 0.036
#> SRR1391811 1 0.2362 8.80e-01 0.860 0.000 0.000 0.000 0.136 0.004
#> SRR1456674 4 0.2404 8.65e-01 0.016 0.000 0.000 0.872 0.112 0.000
#> SRR1086490 3 0.0622 6.70e-01 0.000 0.008 0.980 0.000 0.012 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4900 4.51e-01 0.372 0.000 0.000 0.572 0.044 0.012
#> SRR1384431 1 0.0692 9.12e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1072055 4 0.2494 8.55e-01 0.016 0.000 0.000 0.864 0.120 0.000
#> SRR1359738 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1332141 1 0.1285 9.09e-01 0.944 0.000 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1085900 5 0.6023 6.73e-01 0.000 0.152 0.380 0.016 0.452 0.000
#> SRR1442173 1 0.1152 9.12e-01 0.952 0.000 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1431625 2 0.0363 9.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.5352 7.77e-01 0.000 0.144 0.236 0.000 0.612 0.008
#> SRR1344034 3 0.3772 3.06e-01 0.000 0.004 0.672 0.004 0.320 0.000
#> SRR1080391 4 0.2390 8.60e-01 0.044 0.000 0.000 0.896 0.052 0.008
#> SRR1347870 2 0.0146 9.23e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR814028 5 0.5462 7.65e-01 0.000 0.204 0.200 0.000 0.592 0.004
#> SRR814219 2 0.0146 9.23e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070620 1 0.1588 9.05e-01 0.924 0.000 0.000 0.000 0.072 0.004
#> SRR1102128 1 0.0458 9.15e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.5755 7.13e-01 0.000 0.088 0.236 0.000 0.612 0.064
#> SRR1070060 1 0.3122 7.49e-01 0.804 0.000 0.000 0.176 0.020 0.000
#> SRR1487969 5 0.5325 7.78e-01 0.000 0.192 0.212 0.000 0.596 0.000
#> SRR1417851 4 0.1528 8.71e-01 0.016 0.000 0.000 0.936 0.048 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.1719 8.70e-01 0.016 0.000 0.000 0.924 0.060 0.000
#> SRR1076705 4 0.2263 8.62e-01 0.016 0.000 0.000 0.884 0.100 0.000
#> SRR1079380 5 0.5569 7.74e-01 0.000 0.132 0.248 0.000 0.600 0.020
#> SRR1102923 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.5351 7.77e-01 0.000 0.144 0.288 0.000 0.568 0.000
#> SRR1366605 2 0.1588 8.80e-01 0.000 0.924 0.004 0.000 0.072 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.1957 8.39e-01 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1436840 2 0.3066 7.40e-01 0.000 0.832 0.044 0.000 0.124 0.000
#> SRR1445573 2 0.0260 9.21e-01 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1375394 6 0.0405 8.90e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1431735 4 0.1616 8.72e-01 0.020 0.000 0.000 0.932 0.048 0.000
#> SRR1417387 4 0.2214 8.71e-01 0.016 0.000 0.000 0.888 0.096 0.000
#> SRR1445984 4 0.2450 8.56e-01 0.016 0.000 0.000 0.868 0.116 0.000
#> SRR1370447 4 0.3216 8.45e-01 0.032 0.000 0.000 0.852 0.052 0.064
#> SRR1446308 3 0.4561 2.68e-02 0.000 0.016 0.576 0.016 0.392 0.000
#> SRR1437346 3 0.0717 6.72e-01 0.000 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000
#> SRR1103143 2 0.0146 9.23e-01 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 4 0.1657 8.71e-01 0.016 0.000 0.000 0.928 0.056 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 4 0.4302 7.65e-01 0.156 0.000 0.000 0.728 0.116 0.000
#> SRR1468914 4 0.2459 8.58e-01 0.020 0.000 0.000 0.896 0.052 0.032
#> SRR1319584 5 0.5530 7.33e-01 0.000 0.104 0.320 0.000 0.560 0.016
#> SRR1486584 1 0.3595 5.73e-01 0.704 0.000 0.000 0.288 0.008 0.000
#> SRR813536 4 0.3473 8.05e-01 0.136 0.000 0.000 0.812 0.040 0.012
#> SRR1317939 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.1787 9.05e-01 0.920 0.000 0.000 0.008 0.068 0.004
#> SRR1341921 4 0.4456 2.40e-01 0.456 0.000 0.000 0.520 0.020 0.004
#> SRR1399178 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.1700 9.02e-01 0.916 0.000 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1328551 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0146 9.23e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1340828 5 0.5414 2.08e-02 0.000 0.000 0.116 0.000 0.468 0.416
#> SRR1079543 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0865 9.07e-01 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1076681 3 0.5360 -2.88e-01 0.000 0.068 0.500 0.016 0.416 0.000
#> SRR1335314 4 0.2556 8.53e-01 0.012 0.000 0.000 0.888 0.052 0.048
#> SRR1400799 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1074578 1 0.0717 9.13e-01 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1312226 5 0.5341 7.50e-01 0.000 0.224 0.184 0.000 0.592 0.000
#> SRR1416207 1 0.1531 9.05e-01 0.928 0.000 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1447371 1 0.5429 4.06e-01 0.584 0.000 0.000 0.260 0.152 0.004
#> SRR1069328 4 0.2009 8.63e-01 0.068 0.000 0.000 0.908 0.024 0.000
#> SRR1445023 4 0.2459 8.58e-01 0.020 0.000 0.000 0.896 0.052 0.032
#> SRR1077599 3 0.4880 -9.16e-02 0.000 0.032 0.540 0.016 0.412 0.000
#> SRR1453480 2 0.4831 3.15e-01 0.000 0.636 0.096 0.000 0.268 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 4 0.2358 8.62e-01 0.016 0.000 0.000 0.876 0.108 0.000
#> SRR1074839 5 0.6205 6.92e-01 0.000 0.192 0.352 0.016 0.440 0.000
#> SRR1458727 6 0.0717 8.89e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016 0.976
#> SRR1436949 5 0.5202 7.87e-01 0.000 0.164 0.224 0.000 0.612 0.000
#> SRR1070429 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1458158 1 0.0632 9.15e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1432408 4 0.3017 8.18e-01 0.000 0.000 0.000 0.840 0.052 0.108
#> SRR1310334 1 0.1333 9.14e-01 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1418201 3 0.2263 5.67e-01 0.000 0.000 0.884 0.000 0.016 0.100
#> SRR1385434 4 0.2434 8.58e-01 0.016 0.000 0.000 0.896 0.056 0.032
#> SRR1415591 3 0.0891 6.71e-01 0.000 0.008 0.968 0.000 0.024 0.000
#> SRR1402009 1 0.0713 9.15e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1316055 4 0.2340 8.52e-01 0.004 0.000 0.000 0.896 0.056 0.044
#> SRR1308734 3 0.1367 6.59e-01 0.000 0.012 0.944 0.000 0.044 0.000
#> SRR1498973 5 0.5343 7.86e-01 0.000 0.156 0.264 0.000 0.580 0.000
#> SRR1397115 1 0.2489 8.13e-01 0.860 0.000 0.000 0.128 0.012 0.000
#> SRR1392141 4 0.2263 8.64e-01 0.016 0.000 0.000 0.884 0.100 0.000
#> SRR814341 2 0.5132 -2.91e-01 0.000 0.500 0.084 0.000 0.416 0.000
#> SRR1313601 3 0.5502 -4.50e-01 0.000 0.080 0.464 0.016 0.440 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.1713 6.46e-01 0.000 0.000 0.928 0.000 0.028 0.044
#> SRR809919 4 0.4760 2.95e-01 0.436 0.000 0.000 0.520 0.040 0.004
#> SRR1370818 4 0.1738 8.74e-01 0.016 0.000 0.000 0.928 0.052 0.004
#> SRR1323651 3 0.4702 1.04e-02 0.000 0.024 0.572 0.016 0.388 0.000
#> SRR1357297 4 0.4095 1.96e-01 0.480 0.000 0.000 0.512 0.008 0.000
#> SRR818170 6 0.2563 8.47e-01 0.000 0.000 0.052 0.000 0.072 0.876
#> SRR1091230 3 0.5126 -2.19e-01 0.000 0.048 0.512 0.016 0.424 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.2053 8.93e-01 0.888 0.000 0.000 0.000 0.108 0.004
#> SRR1095285 3 0.0972 6.68e-01 0.000 0.008 0.964 0.000 0.028 0.000
#> SRR1317731 3 0.4534 -3.27e-01 0.000 0.032 0.496 0.000 0.472 0.000
#> SRR1490785 1 0.0713 9.15e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1432032 4 0.2199 8.68e-01 0.020 0.000 0.000 0.892 0.088 0.000
#> SRR1447808 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR809534 5 0.6865 5.55e-01 0.000 0.252 0.152 0.000 0.484 0.112
#> SRR1397312 5 0.5336 7.40e-01 0.000 0.124 0.332 0.000 0.544 0.000
#> SRR812128 5 0.5219 7.86e-01 0.000 0.152 0.244 0.000 0.604 0.000
#> SRR1101513 1 0.0260 9.15e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1415708 5 0.5836 5.56e-01 0.000 0.120 0.428 0.016 0.436 0.000
#> SRR1316033 3 0.0806 6.70e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1390371 2 0.3398 5.84e-01 0.000 0.740 0.008 0.000 0.252 0.000
#> SRR1480263 2 0.2633 8.21e-01 0.000 0.864 0.032 0.000 0.104 0.000
#> SRR1464473 3 0.0260 6.65e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1076801 4 0.2060 8.66e-01 0.016 0.000 0.000 0.900 0.084 0.000
#> SRR1080044 1 0.0547 9.15e-01 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.2030 8.63e-01 0.064 0.000 0.000 0.908 0.028 0.000
#> SRR1069871 1 0.1644 9.04e-01 0.920 0.000 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1095744 5 0.5463 7.71e-01 0.000 0.136 0.236 0.000 0.612 0.016
#> SRR1068929 2 0.0146 9.23e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490097 2 0.1700 8.74e-01 0.000 0.916 0.004 0.000 0.080 0.000
#> SRR1075054 5 0.5350 7.77e-01 0.000 0.196 0.212 0.000 0.592 0.000
#> SRR1083480 1 0.2100 8.92e-01 0.884 0.000 0.000 0.000 0.112 0.004
#> SRR1075458 4 0.1549 8.72e-01 0.020 0.000 0.000 0.936 0.044 0.000
#> SRR1417023 4 0.2407 8.51e-01 0.004 0.000 0.000 0.892 0.056 0.048
#> SRR1309333 2 0.3575 4.83e-01 0.000 0.708 0.008 0.000 0.284 0.000
#> SRR1333676 1 0.0146 9.15e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1352996 1 0.0458 9.15e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1093172 4 0.3245 8.46e-01 0.044 0.000 0.000 0.852 0.052 0.052
#> SRR1413137 4 0.3494 8.37e-01 0.060 0.000 0.000 0.836 0.052 0.052
#> SRR1469973 5 0.5809 7.53e-01 0.000 0.176 0.324 0.004 0.496 0.000
#> SRR1420026 2 0.2942 7.86e-01 0.000 0.836 0.032 0.000 0.132 0.000
#> SRR817306 4 0.3054 8.20e-01 0.136 0.000 0.000 0.828 0.036 0.000
#> SRR1416266 4 0.3404 8.29e-01 0.020 0.000 0.000 0.832 0.052 0.096
#> SRR1071011 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2259 8.62e-01 0.044 0.000 0.000 0.904 0.044 0.008
#> SRR1435394 3 0.5001 -1.52e-01 0.000 0.040 0.532 0.016 0.412 0.000
#> SRR1383192 4 0.4245 7.08e-01 0.228 0.000 0.000 0.716 0.048 0.008
#> SRR1419962 3 0.1088 6.53e-01 0.000 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR1094357 4 0.4527 5.51e-01 0.332 0.000 0.000 0.624 0.040 0.004
#> SRR1081639 3 0.3345 4.78e-01 0.000 0.000 0.788 0.000 0.028 0.184
#> SRR1356016 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 6 0.5326 5.16e-02 0.000 0.000 0.104 0.000 0.432 0.464
#> SRR1312147 4 0.2006 8.67e-01 0.016 0.000 0.000 0.904 0.080 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0777 9.12e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1474930 3 0.5642 -4.33e-01 0.000 0.096 0.468 0.016 0.420 0.000
#> SRR1470988 4 0.3387 8.35e-01 0.024 0.000 0.000 0.836 0.052 0.088
#> SRR811915 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.1349 9.10e-01 0.940 0.000 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1100005 2 0.0146 9.22e-01 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.5887 7.35e-01 0.000 0.252 0.272 0.000 0.476 0.000
#> SRR1313770 3 0.2507 6.35e-01 0.000 0.004 0.884 0.000 0.072 0.040
#> SRR1315780 5 0.6563 5.62e-01 0.000 0.092 0.164 0.004 0.556 0.184
#> SRR1073631 1 0.1732 9.04e-01 0.920 0.000 0.000 0.004 0.072 0.004
#> SRR819124 1 0.0692 9.12e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1310997 5 0.5258 7.85e-01 0.000 0.152 0.252 0.000 0.596 0.000
#> SRR1464494 5 0.5280 7.79e-01 0.000 0.148 0.236 0.000 0.612 0.004
#> SRR1357083 3 0.0891 6.71e-01 0.000 0.008 0.968 0.000 0.024 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 4 0.1682 8.71e-01 0.020 0.000 0.000 0.928 0.052 0.000
#> SRR1378220 3 0.3263 5.51e-01 0.000 0.016 0.816 0.016 0.152 0.000
#> SRR1467704 4 0.1719 8.72e-01 0.016 0.000 0.000 0.924 0.060 0.000
#> SRR1348885 6 0.0260 8.91e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1325826 1 0.1700 9.02e-01 0.916 0.000 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1466812 1 0.4193 7.40e-01 0.776 0.000 0.000 0.124 0.036 0.064
#> SRR1345692 5 0.4992 3.54e-01 0.000 0.464 0.068 0.000 0.468 0.000
#> SRR1401040 3 0.2301 5.61e-01 0.000 0.000 0.884 0.000 0.020 0.096
#> SRR1097954 1 0.0603 9.13e-01 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1374396 4 0.3112 8.22e-01 0.004 0.000 0.000 0.840 0.052 0.104
#> SRR1454073 5 0.6393 6.41e-01 0.000 0.108 0.176 0.004 0.584 0.128
#> SRR1355747 4 0.2163 8.65e-01 0.016 0.000 0.000 0.892 0.092 0.000
#> SRR1429368 3 0.0806 6.70e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1398138 5 0.5970 6.13e-01 0.000 0.356 0.196 0.004 0.444 0.000
#> SRR1379260 4 0.2404 8.58e-01 0.016 0.000 0.000 0.872 0.112 0.000
#> SRR1361436 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR817142 3 0.4942 -1.29e-01 0.000 0.036 0.536 0.016 0.412 0.000
#> SRR1315291 6 0.2207 8.35e-01 0.000 0.000 0.008 0.076 0.016 0.900
#> SRR1309314 6 0.0520 8.90e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008 0.984
#> SRR1420085 5 0.5434 7.06e-01 0.000 0.272 0.164 0.000 0.564 0.000
#> SRR1361308 3 0.0458 6.62e-01 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1472126 1 0.0713 9.16e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1380482 5 0.5310 7.21e-01 0.000 0.116 0.348 0.000 0.536 0.000
#> SRR1099789 1 0.1806 9.00e-01 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1079480 5 0.5411 7.74e-01 0.000 0.140 0.236 0.000 0.612 0.012
#> SRR1339276 1 0.0972 9.15e-01 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028 0.000
#> SRR1418368 1 0.1866 8.64e-01 0.908 0.000 0.000 0.084 0.008 0.000
#> SRR1399353 4 0.1176 8.73e-01 0.020 0.000 0.000 0.956 0.024 0.000
#> SRR1096760 3 0.4523 7.46e-02 0.000 0.016 0.592 0.016 0.376 0.000
#> SRR1440290 3 0.4702 1.57e-02 0.000 0.024 0.572 0.016 0.388 0.000
#> SRR1330813 5 0.5912 6.15e-01 0.000 0.132 0.404 0.016 0.448 0.000
#> SRR1458931 2 0.0547 9.14e-01 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR812294 4 0.2459 8.58e-01 0.020 0.000 0.000 0.896 0.052 0.032
#> SRR1394321 4 0.4580 7.61e-01 0.168 0.000 0.000 0.708 0.120 0.004
#> SRR1081160 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0632 9.13e-01 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1349342 1 0.3309 8.32e-01 0.824 0.000 0.000 0.056 0.116 0.004
#> SRR1477173 2 0.0363 9.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.4273 5.78e-01 0.000 0.716 0.080 0.000 0.204 0.000
#> SRR1390143 1 0.0692 9.13e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1390413 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0405 6.70e-01 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312169 1 0.1958 8.60e-01 0.896 0.000 0.000 0.100 0.004 0.000
#> SRR1096687 4 0.2070 8.64e-01 0.044 0.000 0.000 0.908 0.048 0.000
#> SRR1486139 1 0.2959 8.43e-01 0.844 0.000 0.000 0.024 0.124 0.008
#> SRR1470313 4 0.1710 8.72e-01 0.016 0.000 0.000 0.936 0.028 0.020
#> SRR1447893 3 0.2821 5.63e-01 0.000 0.016 0.832 0.000 0.152 0.000
#> SRR1466025 5 0.5508 7.80e-01 0.000 0.140 0.276 0.000 0.576 0.008
#> SRR1477429 4 0.3854 7.54e-01 0.188 0.000 0.000 0.760 0.048 0.004
#> SRR1445701 3 0.3725 4.66e-01 0.000 0.016 0.760 0.016 0.208 0.000
#> SRR820689 1 0.3969 6.93e-01 0.740 0.000 0.000 0.212 0.044 0.004
#> SRR1451876 5 0.6157 6.93e-01 0.000 0.180 0.360 0.016 0.444 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4399 3.47e-01 0.616 0.000 0.000 0.352 0.028 0.004
#> SRR1489328 5 0.6080 7.57e-01 0.000 0.188 0.300 0.016 0.496 0.000
#> SRR1344462 1 0.1296 9.13e-01 0.948 0.000 0.000 0.004 0.044 0.004
#> SRR1082709 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1447784 4 0.1577 8.70e-01 0.016 0.000 0.000 0.940 0.036 0.008
#> SRR1355769 1 0.3046 7.46e-01 0.800 0.000 0.000 0.188 0.012 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1753 9.01e-01 0.912 0.000 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1480917 5 0.5240 7.15e-01 0.000 0.108 0.348 0.000 0.544 0.000
#> SRR1474485 4 0.1616 8.69e-01 0.020 0.000 0.000 0.932 0.048 0.000
#> SRR1089998 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318140 1 0.3496 7.92e-01 0.804 0.000 0.000 0.140 0.052 0.004
#> SRR1319262 3 0.3300 5.48e-01 0.000 0.016 0.812 0.016 0.156 0.000
#> SRR1095188 5 0.6052 6.94e-01 0.000 0.160 0.364 0.016 0.460 0.000
#> SRR1454350 1 0.2234 8.87e-01 0.872 0.000 0.000 0.000 0.124 0.004
#> SRR1440374 1 0.1700 9.02e-01 0.916 0.000 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1359565 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1105417 4 0.3839 7.32e-01 0.212 0.000 0.000 0.748 0.036 0.004
#> SRR1325578 3 0.4979 -3.53e-01 0.000 0.056 0.492 0.004 0.448 0.000
#> SRR1358161 3 0.1498 6.53e-01 0.000 0.000 0.940 0.000 0.028 0.032
#> SRR1358665 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.5246 7.84e-01 0.000 0.152 0.224 0.000 0.620 0.004
#> SRR1452010 1 0.0891 9.11e-01 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR1418183 3 0.4815 -7.90e-02 0.000 0.028 0.544 0.016 0.412 0.000
#> SRR1366345 1 0.2053 8.94e-01 0.888 0.000 0.000 0.000 0.108 0.004
#> SRR1387449 1 0.1204 9.11e-01 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1473461 4 0.3843 8.25e-01 0.108 0.000 0.000 0.784 0.104 0.004
#> SRR1090837 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1447828 3 0.0260 6.69e-01 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0717 6.71e-01 0.000 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000
#> SRR1350280 1 0.0260 9.14e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1088557 1 0.0363 9.14e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1102656 5 0.5346 7.21e-01 0.000 0.252 0.164 0.000 0.584 0.000
#> SRR1441443 2 0.2300 7.87e-01 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1370682 3 0.2398 5.47e-01 0.000 0.000 0.876 0.000 0.020 0.104
#> SRR1475448 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1407291 1 0.0458 9.15e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1405266 1 0.0713 9.16e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1363766 4 0.4561 4.34e-01 0.392 0.000 0.000 0.568 0.040 0.000
#> SRR1082592 5 0.5484 7.81e-01 0.000 0.148 0.280 0.000 0.568 0.004
#> SRR1325794 5 0.5411 7.89e-01 0.000 0.168 0.260 0.000 0.572 0.000
#> SRR1095961 3 0.1578 6.57e-01 0.000 0.012 0.936 0.004 0.048 0.000
#> SRR1086702 2 0.2350 8.34e-01 0.000 0.888 0.036 0.000 0.076 0.000
#> SRR1320806 3 0.5498 -3.94e-01 0.000 0.080 0.472 0.016 0.432 0.000
#> SRR1457527 3 0.1528 6.35e-01 0.000 0.000 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR1098831 2 0.0146 9.21e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474374 3 0.0405 6.70e-01 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488858 4 0.2533 8.46e-01 0.004 0.000 0.000 0.884 0.056 0.056
#> SRR1454695 4 0.2263 8.62e-01 0.016 0.000 0.000 0.884 0.100 0.000
#> SRR1090241 2 0.4680 4.38e-01 0.000 0.684 0.132 0.000 0.184 0.000
#> SRR1329863 2 0.5300 -2.85e-01 0.000 0.496 0.104 0.000 0.400 0.000
#> SRR1357733 4 0.4799 7.23e-01 0.172 0.000 0.000 0.684 0.140 0.004
#> SRR1362135 4 0.2311 8.61e-01 0.016 0.000 0.000 0.880 0.104 0.000
#> SRR1379581 3 0.3514 3.23e-01 0.000 0.000 0.752 0.000 0.020 0.228
#> SRR1309182 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1437668 4 0.2112 8.65e-01 0.016 0.000 0.000 0.896 0.088 0.000
#> SRR1084742 5 0.5411 7.74e-01 0.000 0.140 0.236 0.000 0.612 0.012
#> SRR1433538 1 0.4537 2.24e-01 0.552 0.000 0.000 0.412 0.036 0.000
#> SRR1085063 2 0.3043 7.24e-01 0.000 0.792 0.008 0.000 0.200 0.000
#> SRR1454247 5 0.5463 7.71e-01 0.000 0.136 0.236 0.000 0.612 0.016
#> SRR1097100 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.5112 -1.73e-01 0.000 0.048 0.524 0.016 0.412 0.000
#> SRR1072388 4 0.2263 8.62e-01 0.016 0.000 0.000 0.884 0.100 0.000
#> SRR1070332 5 0.5224 7.87e-01 0.000 0.164 0.228 0.000 0.608 0.000
#> SRR1320761 5 0.5347 7.68e-01 0.000 0.136 0.304 0.000 0.560 0.000
#> SRR1076195 4 0.2407 8.51e-01 0.004 0.000 0.000 0.892 0.056 0.048
#> SRR1069895 3 0.4719 -1.42e-02 0.000 0.024 0.564 0.016 0.396 0.000
#> SRR1099144 4 0.1914 8.72e-01 0.016 0.000 0.000 0.920 0.056 0.008
#> SRR1385150 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1718 8.67e-01 0.016 0.000 0.000 0.932 0.044 0.008
#> SRR1102583 1 0.1616 8.94e-01 0.932 0.000 0.000 0.048 0.020 0.000
#> SRR1456971 4 0.2214 8.63e-01 0.016 0.000 0.000 0.888 0.096 0.000
#> SRR1340574 1 0.2191 8.89e-01 0.876 0.000 0.000 0.000 0.120 0.004
#> SRR1444830 5 0.5944 5.75e-01 0.000 0.136 0.416 0.016 0.432 0.000
#> SRR1096267 1 0.1152 9.11e-01 0.952 0.000 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1087127 6 0.5400 1.48e-01 0.000 0.000 0.376 0.000 0.120 0.504
#> SRR1408553 4 0.3436 8.37e-01 0.032 0.000 0.000 0.836 0.052 0.080
#> SRR1069231 4 0.1594 8.70e-01 0.052 0.000 0.000 0.932 0.016 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 4 0.2301 8.66e-01 0.020 0.000 0.000 0.884 0.096 0.000
#> SRR1321942 1 0.5140 5.15e-01 0.624 0.000 0.000 0.248 0.124 0.004
#> SRR1094380 1 0.0858 9.12e-01 0.968 0.000 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1447499 5 0.6084 7.08e-01 0.000 0.228 0.244 0.016 0.512 0.000
#> SRR1099330 5 0.6152 6.92e-01 0.000 0.180 0.356 0.016 0.448 0.000
#> SRR1077874 5 0.5421 7.76e-01 0.000 0.204 0.216 0.000 0.580 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.5463 7.71e-01 0.000 0.136 0.236 0.000 0.612 0.016
#> SRR1481238 5 0.5649 6.56e-01 0.000 0.152 0.396 0.000 0.452 0.000
#> SRR1443568 3 0.4771 -1.96e-02 0.000 0.028 0.568 0.016 0.388 0.000
#> SRR1380249 4 0.2371 8.59e-01 0.016 0.000 0.000 0.900 0.052 0.032
#> SRR1080143 1 0.0458 9.15e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1383148 4 0.2459 8.58e-01 0.020 0.000 0.000 0.896 0.052 0.032
#> SRR1357042 4 0.3027 8.10e-01 0.148 0.000 0.000 0.824 0.028 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.2302 8.06e-01 0.000 0.872 0.008 0.000 0.120 0.000
#> SRR1078709 5 0.5458 7.53e-01 0.000 0.232 0.196 0.000 0.572 0.000
#> SRR813283 1 0.0632 9.14e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0777 9.12e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1466927 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 6 0.0260 8.91e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR807679 4 0.2358 8.59e-01 0.016 0.000 0.000 0.876 0.108 0.000
#> SRR1333811 3 0.2850 5.98e-01 0.000 0.016 0.856 0.016 0.112 0.000
#> SRR1078660 5 0.5318 7.89e-01 0.000 0.160 0.252 0.000 0.588 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 4 0.1719 8.71e-01 0.016 0.000 0.000 0.924 0.060 0.000
#> SRR1432542 4 0.2214 8.63e-01 0.016 0.000 0.000 0.888 0.096 0.000
#> SRR1418041 1 0.0692 9.12e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1085211 1 0.5752 -2.76e-03 0.472 0.000 0.000 0.372 0.152 0.004
#> SRR1339812 2 0.0260 9.22e-01 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1402437 4 0.2311 8.61e-01 0.016 0.000 0.000 0.880 0.104 0.000
#> SRR1350958 2 0.0405 9.20e-01 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396822 3 0.4867 -6.52e-02 0.000 0.032 0.548 0.016 0.404 0.000
#> SRR1441934 2 0.0520 9.17e-01 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR1472552 3 0.1092 6.50e-01 0.000 0.000 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1488881 3 0.0520 6.69e-01 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102973 4 0.4502 4.91e-01 0.364 0.000 0.000 0.600 0.032 0.004
#> SRR1071131 3 0.5446 -3.26e-01 0.000 0.076 0.492 0.016 0.416 0.000
#> SRR1074502 1 0.0790 9.15e-01 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1325271 4 0.2060 8.66e-01 0.016 0.000 0.000 0.900 0.084 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 5 0.5839 5.40e-01 0.000 0.404 0.188 0.000 0.408 0.000
#> SRR1430045 2 0.4619 4.62e-01 0.000 0.668 0.088 0.000 0.244 0.000
#> SRR1441245 5 0.6284 6.86e-01 0.000 0.284 0.244 0.016 0.456 0.000
#> SRR1384091 4 0.2459 8.60e-01 0.032 0.000 0.000 0.896 0.052 0.020
#> SRR1431887 2 0.3293 7.18e-01 0.000 0.812 0.048 0.000 0.140 0.000
#> SRR1096525 4 0.3437 8.32e-01 0.024 0.000 0.000 0.832 0.052 0.092
#> SRR1488491 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.5347 7.67e-01 0.000 0.136 0.304 0.000 0.560 0.000
#> SRR1369514 4 0.1789 8.68e-01 0.044 0.000 0.000 0.924 0.032 0.000
#> SRR1453299 3 0.0806 6.72e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1436300 1 0.1956 9.00e-01 0.908 0.000 0.000 0.008 0.080 0.004
#> SRR1348490 5 0.5845 7.19e-01 0.000 0.088 0.244 0.000 0.600 0.068
#> SRR1091767 5 0.5832 7.38e-01 0.000 0.248 0.260 0.000 0.492 0.000
#> SRR1354467 3 0.0405 6.67e-01 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069074 5 0.6303 6.95e-01 0.000 0.236 0.304 0.016 0.444 0.000
#> SRR1452399 5 0.5517 7.22e-01 0.000 0.124 0.352 0.004 0.520 0.000
#> SRR1437430 3 0.4196 -3.12e-03 0.000 0.004 0.568 0.004 0.420 0.004
#> SRR1419736 5 0.5699 5.88e-01 0.000 0.032 0.220 0.000 0.608 0.140
#> SRR1313343 3 0.0806 6.70e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1077619 4 0.2060 8.71e-01 0.016 0.000 0.000 0.900 0.084 0.000
#> SRR1083530 4 0.3343 8.05e-01 0.144 0.000 0.000 0.812 0.040 0.004
#> SRR1333633 3 0.4776 -3.37e-01 0.000 0.040 0.496 0.004 0.460 0.000
#> SRR1354999 3 0.5011 -1.64e-01 0.000 0.040 0.524 0.016 0.420 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0458 9.13e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1378818 6 0.2629 8.49e-01 0.000 0.000 0.040 0.000 0.092 0.868
#> SRR1413182 4 0.2459 8.58e-01 0.020 0.000 0.000 0.896 0.052 0.032
#> SRR1464559 4 0.1801 8.71e-01 0.016 0.000 0.000 0.924 0.056 0.004
#> SRR1413075 5 0.5403 7.86e-01 0.000 0.156 0.248 0.000 0.592 0.004
#> SRR1487928 4 0.2653 8.42e-01 0.004 0.000 0.000 0.876 0.056 0.064
#> SRR1388997 2 0.4379 4.22e-02 0.000 0.576 0.028 0.000 0.396 0.000
#> SRR1092865 5 0.6200 6.94e-01 0.000 0.192 0.348 0.016 0.444 0.000
#> SRR1102729 1 0.0603 9.13e-01 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1456423 1 0.1644 9.03e-01 0.920 0.000 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1321591 2 0.0458 9.18e-01 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1376874 3 0.3053 4.33e-01 0.000 0.000 0.812 0.000 0.020 0.168
#> SRR1339903 4 0.3534 7.11e-01 0.244 0.000 0.000 0.740 0.016 0.000
#> SRR1346710 4 0.2624 8.56e-01 0.020 0.000 0.000 0.856 0.124 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5601 7.54e-01 0.000 0.144 0.324 0.004 0.528 0.000
#> SRR1480941 6 0.0260 8.91e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1479175 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0363 9.20e-01 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1491354 1 0.0790 9.15e-01 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1433884 5 0.6267 7.24e-01 0.000 0.224 0.308 0.016 0.452 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.1926 8.56e-01 0.000 0.912 0.020 0.000 0.068 0.000
#> SRR1355554 3 0.4780 -1.10e-02 0.000 0.028 0.564 0.016 0.392 0.000
#> SRR1487173 1 0.1958 8.96e-01 0.896 0.000 0.000 0.000 0.100 0.004
#> SRR1474253 1 0.1858 9.00e-01 0.904 0.000 0.000 0.000 0.092 0.004
#> SRR1322918 2 0.5408 -3.58e-01 0.000 0.476 0.116 0.000 0.408 0.000
#> SRR1318331 2 0.0146 9.22e-01 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0520 6.71e-01 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR1474231 4 0.2667 8.54e-01 0.020 0.000 0.000 0.852 0.128 0.000
#> SRR1350545 4 0.4330 5.55e-01 0.332 0.000 0.000 0.632 0.036 0.000
#> SRR1091328 4 0.2450 8.56e-01 0.016 0.000 0.000 0.868 0.116 0.000
#> SRR814447 3 0.4237 -1.20e-01 0.000 0.000 0.584 0.000 0.020 0.396
#> SRR1455989 3 0.4702 8.03e-05 0.000 0.024 0.572 0.016 0.388 0.000
#> SRR1453680 3 0.3053 4.33e-01 0.000 0.000 0.812 0.000 0.020 0.168
#> SRR1470356 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.1219 8.96e-01 0.000 0.948 0.004 0.000 0.048 0.000
#> SRR1444222 5 0.6927 6.33e-01 0.000 0.168 0.212 0.004 0.504 0.112
#> SRR1097197 1 0.0363 9.14e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1366729 3 0.0547 6.60e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR821282 3 0.4178 -4.92e-02 0.000 0.000 0.608 0.000 0.020 0.372
#> SRR1074602 5 0.6026 6.55e-01 0.000 0.152 0.384 0.016 0.448 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 9.25e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 6 0.2058 8.56e-01 0.000 0.000 0.056 0.000 0.036 0.908
#> SRR1319100 1 0.0363 9.15e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1324004 3 0.3476 5.24e-01 0.000 0.016 0.792 0.016 0.176 0.000
#> SRR1457459 1 0.1806 9.01e-01 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1421031 4 0.1871 8.66e-01 0.016 0.000 0.000 0.928 0.024 0.032
#> SRR1444598 6 0.1408 8.84e-01 0.000 0.000 0.020 0.000 0.036 0.944
#> SRR1091743 5 0.5960 6.34e-01 0.000 0.140 0.396 0.016 0.448 0.000
#> SRR819637 4 0.3316 8.39e-01 0.052 0.000 0.000 0.812 0.136 0.000
#> SRR1083848 1 0.1753 9.01e-01 0.912 0.000 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1088934 3 0.4662 -2.40e-02 0.000 0.020 0.560 0.016 0.404 0.000
#> SRR1459785 3 0.0806 6.70e-01 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1083700 1 0.3052 8.36e-01 0.848 0.000 0.000 0.068 0.080 0.004
#> SRR1375531 1 0.0603 9.13e-01 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1323470 6 0.0405 8.91e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR814657 1 0.1152 9.00e-01 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.997 0.999 0.4921 0.508 0.508
#> 3 3 0.954 0.933 0.971 0.2096 0.891 0.786
#> 4 4 0.829 0.859 0.911 0.0987 0.934 0.839
#> 5 5 0.750 0.776 0.838 0.0958 0.894 0.706
#> 6 6 0.662 0.636 0.810 0.0636 0.954 0.839
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.925 0.486 0.660 0.340
#> SRR1431735 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.574 0.842 0.864 0.136
#> SRR1309314 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.625 0.814 0.156 0.844
#> SRR807679 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.6305 0.2219 0.000 0.484 0.516
#> SRR819559 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.6225 0.3779 0.000 0.432 0.568
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.6180 0.1594 0.000 0.584 0.416
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.6008 0.5144 0.000 0.372 0.628
#> SRR1402944 3 0.4291 0.7852 0.000 0.180 0.820
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.1753 0.8631 0.000 0.048 0.952
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1486821 3 0.2356 0.8533 0.000 0.072 0.928
#> SRR1418540 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.6204 0.1292 0.000 0.576 0.424
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.5733 0.5108 0.676 0.000 0.324
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086490 2 0.6215 0.1144 0.000 0.572 0.428
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.4178 0.7544 0.000 0.828 0.172
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.4235 0.7887 0.000 0.176 0.824
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079380 2 0.3879 0.7885 0.000 0.848 0.152
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.1289 0.9670 0.968 0.000 0.032
#> SRR1431735 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1370447 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.5733 0.4448 0.000 0.676 0.324
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1319584 2 0.4842 0.6677 0.000 0.776 0.224
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1400799 2 0.6267 0.0144 0.000 0.548 0.452
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0000 0.8621 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.5905 0.3679 0.000 0.648 0.352
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 3 0.6307 0.0344 0.488 0.000 0.512
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1385434 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1415591 2 0.4555 0.7079 0.000 0.800 0.200
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.4452 0.7588 0.808 0.000 0.192
#> SRR1308734 3 0.3619 0.8180 0.000 0.136 0.864
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0747 0.8716 0.000 0.016 0.984
#> SRR809919 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1031 0.8702 0.000 0.024 0.976
#> SRR1317731 3 0.4399 0.7781 0.000 0.188 0.812
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.0747 0.8716 0.000 0.016 0.984
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0747 0.8716 0.000 0.016 0.984
#> SRR1076801 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413137 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416266 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.0747 0.8715 0.000 0.016 0.984
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.4178 0.7542 0.000 0.828 0.172
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.1163 0.9439 0.000 0.972 0.028
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.3742 0.8542 0.036 0.892 0.072
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.1529 0.8659 0.000 0.040 0.960
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1429368 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1361436 3 0.6215 0.3883 0.000 0.428 0.572
#> SRR817142 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.4399 0.7010 0.188 0.000 0.812
#> SRR1309314 3 0.0000 0.8621 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0747 0.8716 0.000 0.016 0.984
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.5216 0.6967 0.000 0.260 0.740
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3192 0.8327 0.000 0.112 0.888
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1447893 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0592 0.9605 0.000 0.988 0.012
#> SRR820689 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.5859 0.5667 0.000 0.344 0.656
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.6079 0.2565 0.000 0.612 0.388
#> SRR1358161 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.5098 0.6185 0.000 0.752 0.248
#> SRR1447828 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.6280 0.2995 0.000 0.460 0.540
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1475448 2 0.5327 0.5684 0.000 0.728 0.272
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.6280 0.2993 0.000 0.460 0.540
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 3 0.0747 0.8716 0.000 0.016 0.984
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.1411 0.8671 0.000 0.036 0.964
#> SRR1488858 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 3 0.6204 0.2457 0.424 0.000 0.576
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1385150 3 0.6267 0.3230 0.000 0.452 0.548
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1408553 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.7431 0.6977 0.188 0.116 0.696
#> SRR807679 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.6291 -0.0552 0.000 0.532 0.468
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1432542 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.4399 0.7779 0.000 0.188 0.812
#> SRR1488881 3 0.3879 0.8072 0.000 0.152 0.848
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.6095 0.4727 0.000 0.392 0.608
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.2261 0.8551 0.000 0.068 0.932
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.4842 0.7402 0.000 0.224 0.776
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.0747 0.8716 0.000 0.016 0.984
#> SRR1077619 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.2959 0.8607 0.000 0.900 0.100
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1413182 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1464559 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.6168 0.2843 0.588 0.000 0.412
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.0592 0.9612 0.000 0.988 0.012
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.1031 0.8702 0.000 0.024 0.976
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0424 0.9895 0.992 0.000 0.008
#> SRR814447 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR821282 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4555 0.7654 0.000 0.200 0.800
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.3192 0.8439 0.000 0.888 0.112
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0592 0.9872 0.988 0.000 0.012
#> SRR1444598 3 0.0592 0.8713 0.000 0.012 0.988
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9727 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 3 0.0747 0.8716 0.000 0.016 0.984
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.5848 0.5662 0.012 0.720 0.268
#> SRR814657 1 0.0000 0.9931 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1326059 1 0.1302 0.92219 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1409062 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR809406 1 0.0188 0.92838 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465313 2 0.5018 0.39607 0.000 0.656 0.332 0.012
#> SRR819559 1 0.2081 0.90891 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1387899 2 0.0336 0.95934 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1395635 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1343629 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1326868 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102320 1 0.3356 0.86712 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1469926 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098426 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.3610 0.62028 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1429748 1 0.3528 0.85734 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1363654 1 0.0592 0.92769 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1326317 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1329947 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.4941 0.28339 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 4 0.4574 0.78445 0.000 0.220 0.024 0.756
#> SRR1402944 4 0.5175 0.68238 0.000 0.120 0.120 0.760
#> SRR1092818 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1093552 1 0.0336 0.92820 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1464880 2 0.2281 0.85461 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1078368 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.2469 0.83572 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1320034 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1437491 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1310777 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1354203 1 0.0469 0.92587 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077850 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1369241 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0592 0.95053 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1455214 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1097857 1 0.1867 0.91321 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1473318 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1345974 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071207 1 0.3219 0.87366 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1486821 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1359487 1 0.4855 0.58899 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1080648 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414708 1 0.0707 0.92746 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1469080 2 0.0469 0.95451 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1365722 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.2408 0.90121 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1321829 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1475993 3 0.4817 0.35496 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1445387 1 0.0707 0.92731 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1077575 4 0.3837 0.79710 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1349300 1 0.2469 0.89998 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1374165 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453769 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1401146 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.6722 0.61835 0.616 0.000 0.184 0.200
#> SRR1391811 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456674 1 0.0188 0.92744 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086490 3 0.3311 0.64977 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1384431 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1072055 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359738 3 0.4941 0.28039 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1332141 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1085900 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1431625 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 4 0.3975 0.78816 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1344034 3 0.2704 0.69096 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1080391 1 0.1022 0.92523 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1347870 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0336 0.95793 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR814219 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1102128 1 0.3024 0.88212 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1460211 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 4 0.3873 0.79669 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1070060 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1487969 2 0.2281 0.85226 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1417851 1 0.2281 0.90429 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1443350 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0336 0.92824 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1076705 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 4 0.3837 0.79710 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1102923 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1431735 1 0.0469 0.92831 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417387 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1445984 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.4585 0.70365 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1446308 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1437346 2 0.4998 -0.13294 0.000 0.512 0.488 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1468914 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1319584 4 0.5186 0.63046 0.000 0.344 0.016 0.640
#> SRR1486584 1 0.1022 0.92523 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR813536 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1317939 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0188 0.92744 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1341921 1 0.2760 0.89234 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1399178 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1328551 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 4 0.3975 0.78816 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1079543 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1335314 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1400799 3 0.4250 0.51997 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1074578 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1312226 2 0.0469 0.95456 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1416207 1 0.0188 0.92744 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447371 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1069328 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1445023 1 0.3528 0.85759 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1077599 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1074839 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458727 4 0.3688 0.53943 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1436949 2 0.3528 0.69718 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1070429 3 0.4454 0.47738 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1458158 1 0.1211 0.92336 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1432408 3 0.7485 0.04077 0.380 0.000 0.440 0.180
#> SRR1310334 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385434 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1415591 3 0.4996 0.20510 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1402009 1 0.0469 0.92783 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1316055 1 0.6542 0.11049 0.496 0.000 0.428 0.076
#> SRR1308734 3 0.1637 0.73246 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1498973 4 0.4843 0.57283 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1397115 1 0.0817 0.92659 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1392141 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR814341 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809919 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1370818 1 0.2469 0.89961 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1323651 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357297 1 0.3266 0.87208 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR818170 3 0.4907 0.18735 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1091230 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1095285 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 3 0.5369 0.58487 0.000 0.164 0.740 0.096
#> SRR1490785 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0188 0.92826 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447808 1 0.1637 0.91796 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR809534 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.4925 -0.00587 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR812128 2 0.1022 0.93336 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1101513 1 0.1792 0.91526 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1415708 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1316033 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1080044 1 0.0336 0.92846 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1420850 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3528 0.85734 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1069871 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 4 0.3873 0.79669 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1068929 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1075458 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0927 0.92554 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1309333 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.3356 0.86711 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1352996 1 0.3024 0.88223 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1093172 1 0.3837 0.83319 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1413137 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1469973 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1416266 4 0.2469 0.50292 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1071011 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1435394 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1383192 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1419962 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0188 0.75808 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1356016 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 4 0.3837 0.79710 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1312147 1 0.0188 0.92811 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473891 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1474930 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470988 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR811915 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1100005 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.0188 0.75808 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1315780 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR819124 1 0.3400 0.86461 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1310997 4 0.3907 0.79438 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1464494 4 0.3975 0.78816 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1357083 2 0.4989 -0.07214 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0469 0.92783 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1378220 2 0.4830 0.24545 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1467704 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348885 4 0.0895 0.57253 0.020 0.004 0.000 0.976
#> SRR1325826 1 0.0469 0.92783 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466812 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1345692 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0188 0.76036 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.3907 0.37994 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1454073 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1429368 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0469 0.92783 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1361436 3 0.3764 0.60043 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR817142 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1315291 3 0.5811 0.47580 0.116 0.000 0.704 0.180
#> SRR1309314 3 0.0188 0.75808 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420085 2 0.0188 0.96173 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1361308 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0707 0.92727 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1380482 4 0.5477 0.72550 0.000 0.180 0.092 0.728
#> SRR1099789 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079480 4 0.3873 0.79669 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1339276 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418368 1 0.0921 0.92612 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1399353 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096760 2 0.1474 0.90974 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1440290 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1330813 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1394321 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1477173 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.1637 0.91753 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1390413 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0469 0.75791 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1312169 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1096687 1 0.2921 0.88646 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1486139 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1470313 1 0.3444 0.86244 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1447893 2 0.3610 0.68881 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1466025 2 0.4916 0.00931 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1477429 1 0.2469 0.90074 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1445701 2 0.4454 0.47800 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR820689 1 0.0188 0.92744 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1451876 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1118 0.92401 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1489328 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.2760 0.89216 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1447784 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1355769 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1488237 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480917 2 0.4356 0.47671 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1474485 1 0.0188 0.92811 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089998 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1319262 2 0.4103 0.58535 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1095188 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454350 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1440374 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359565 3 0.2760 0.68744 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1105417 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1325578 2 0.2125 0.87378 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1358161 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0336 0.95826 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452010 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1418183 2 0.0592 0.95119 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1366345 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1387449 1 0.0188 0.92813 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473461 1 0.0707 0.92721 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1090837 3 0.4804 0.36274 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR1447828 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4406 0.48710 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1350280 1 0.3569 0.85485 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1088557 1 0.0707 0.92725 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1102656 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.4746 0.38841 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1407291 1 0.3356 0.86694 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1405266 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1363766 1 0.3528 0.85756 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1082592 2 0.4643 0.32098 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1325794 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.4454 0.47876 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1457527 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.3356 0.86701 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1454695 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1090241 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1362135 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.3569 0.85485 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1437668 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084742 4 0.3837 0.79710 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1433538 1 0.0707 0.92721 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1085063 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 4 0.3873 0.79669 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1097100 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.4164 0.54077 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1320761 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 3 0.7621 0.02423 0.376 0.000 0.420 0.204
#> SRR1069895 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1099144 1 0.0592 0.92767 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1385150 3 0.3610 0.61951 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3356 0.86694 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1102583 1 0.1211 0.92342 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1456971 1 0.0336 0.92820 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1340574 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1444830 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096267 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1087127 4 0.4193 0.48912 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1408553 1 0.3873 0.82957 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1069231 1 0.3074 0.88020 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1325642 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1094380 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447499 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1077874 2 0.0592 0.95040 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR808299 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 4 0.3837 0.79710 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1481238 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380249 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1080143 1 0.3486 0.85983 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1383148 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1357042 1 0.0469 0.92783 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416025 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430226 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0469 0.92587 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466927 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.1211 0.55725 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR807679 1 0.0707 0.92314 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1333811 3 0.4585 0.44587 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1078660 2 0.1557 0.90340 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1331730 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432542 1 0.0188 0.92826 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418041 1 0.1557 0.91937 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1085211 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1339812 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0817 0.75301 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1488881 3 0.0817 0.75278 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1102973 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071131 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1074502 1 0.0469 0.92828 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1325271 1 0.0469 0.92783 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1409171 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1431887 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.4103 0.35522 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1488491 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.3356 0.86694 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1453299 3 0.3569 0.62424 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1436300 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348490 4 0.3942 0.79050 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1091767 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0336 0.75929 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1069074 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452399 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1437430 3 0.3074 0.66265 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1419736 4 0.3837 0.79710 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1313343 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.0592 0.92759 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1083530 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.1209 0.92804 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1354999 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0336 0.92845 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1378818 4 0.3837 0.53056 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1413182 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1464559 1 0.2469 0.89961 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1413075 4 0.4040 0.77818 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1487928 1 0.7481 0.32314 0.484 0.000 0.316 0.200
#> SRR1388997 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102729 1 0.2469 0.90041 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1456423 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.2408 0.90256 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1346710 1 0.0188 0.92744 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418771 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.1749 0.91662 0.012 0.952 0.024 0.012
#> SRR1479175 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.1867 0.91371 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1433884 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487173 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1474253 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1350545 1 0.0336 0.92845 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1091328 1 0.0000 0.92785 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453680 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.2814 0.88931 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1366729 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.96489 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4175 0.60305 0.000 0.212 0.776 0.012
#> SRR1319100 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1324004 2 0.3726 0.66803 0.000 0.788 0.212 0.000
#> SRR1457459 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1421031 1 0.3649 0.84948 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1444598 4 0.3837 0.53056 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1091743 2 0.0188 0.96278 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819637 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1083848 1 0.0336 0.92680 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088934 2 0.0921 0.93807 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1459785 3 0.0000 0.76114 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0592 0.92475 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375531 1 0.2760 0.89121 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1323470 3 0.8754 0.20415 0.056 0.316 0.424 0.204
#> SRR814657 1 0.3610 0.85209 0.800 0.000 0.000 0.200
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0324 0.909027 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1467726 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.2624 0.839642 0.000 0.872 0.000 0.116 0.012
#> SRR1402132 4 0.4084 0.883282 0.328 0.000 0.000 0.668 0.004
#> SRR1326059 1 0.1544 0.836177 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1409062 2 0.1809 0.885388 0.000 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR809406 1 0.0609 0.870741 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1465313 2 0.6813 0.039407 0.000 0.492 0.200 0.016 0.292
#> SRR819559 1 0.3461 0.543005 0.772 0.000 0.000 0.224 0.004
#> SRR1387899 2 0.2416 0.855280 0.000 0.888 0.100 0.012 0.000
#> SRR1442292 2 0.0451 0.909257 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1488151 1 0.0162 0.873218 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1395635 1 0.1121 0.851198 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1343629 1 0.0955 0.865753 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1326868 2 0.1877 0.883183 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1102320 4 0.4060 0.904363 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1469926 3 0.1310 0.747787 0.000 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR1070036 1 0.0771 0.869542 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1098426 1 0.0771 0.868871 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1090310 3 0.4016 0.569285 0.000 0.272 0.716 0.012 0.000
#> SRR1429748 4 0.4211 0.904317 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1363654 4 0.4307 0.665313 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000
#> SRR1326317 2 0.1877 0.883012 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1378308 2 0.0566 0.908180 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1366919 4 0.4225 0.901999 0.364 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1329947 1 0.0609 0.869601 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1469769 2 0.5342 -0.096655 0.000 0.496 0.464 0.016 0.024
#> SRR1490761 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.1673 0.771302 0.000 0.032 0.016 0.008 0.944
#> SRR1402944 5 0.1911 0.768541 0.000 0.036 0.028 0.004 0.932
#> SRR1092818 1 0.0963 0.857688 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1093552 1 0.0771 0.867878 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1464880 5 0.4302 0.264564 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1078368 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0290 0.909123 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.1597 0.891032 0.000 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR1331879 5 0.5648 0.313097 0.000 0.448 0.000 0.076 0.476
#> SRR1320034 3 0.0566 0.760641 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1068687 2 0.1364 0.897509 0.000 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1437491 1 0.1041 0.863130 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1310777 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.1121 0.854133 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1329994 4 0.4225 0.901999 0.364 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1354203 1 0.1357 0.853248 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1077850 1 0.1251 0.854089 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1369241 2 0.0162 0.909431 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077992 2 0.4302 -0.140630 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1455214 1 0.0510 0.871145 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1092014 2 0.1809 0.886422 0.000 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR1097857 1 0.3048 0.655573 0.820 0.000 0.000 0.176 0.004
#> SRR1473318 1 0.0404 0.870821 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1345974 3 0.0566 0.762271 0.000 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR1338687 2 0.1195 0.901007 0.000 0.960 0.028 0.012 0.000
#> SRR1071207 4 0.4211 0.903886 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1486821 3 0.0955 0.755050 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1418540 1 0.0404 0.871996 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1408788 2 0.1697 0.888214 0.000 0.932 0.060 0.008 0.000
#> SRR1359487 4 0.5459 0.770112 0.236 0.000 0.000 0.644 0.120
#> SRR1080648 1 0.0566 0.871785 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1414708 1 0.3906 0.282412 0.704 0.000 0.000 0.292 0.004
#> SRR1469080 2 0.3109 0.705251 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1365722 2 0.0290 0.908490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1448118 2 0.0290 0.908490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1444808 4 0.4367 0.838696 0.416 0.000 0.000 0.580 0.004
#> SRR1321829 2 0.1809 0.885388 0.000 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR1475993 3 0.4184 0.545259 0.000 0.284 0.700 0.016 0.000
#> SRR1445387 1 0.1043 0.860437 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1077575 5 0.1282 0.787238 0.000 0.044 0.000 0.004 0.952
#> SRR1349300 1 0.4161 -0.234833 0.608 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1374165 1 0.0404 0.870821 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 4 0.4196 0.904898 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1401146 2 0.1651 0.896287 0.000 0.944 0.036 0.012 0.008
#> SRR1366124 4 0.5609 0.775970 0.260 0.000 0.088 0.640 0.012
#> SRR1391811 1 0.1478 0.832273 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1456674 1 0.0290 0.872206 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1086490 3 0.4130 0.548049 0.000 0.292 0.696 0.012 0.000
#> SRR1088511 2 0.0162 0.909056 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404577 4 0.4196 0.903439 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1384431 1 0.0703 0.870636 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1072055 1 0.0404 0.872497 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1359738 2 0.4641 0.045721 0.000 0.532 0.456 0.012 0.000
#> SRR1332141 1 0.0404 0.870821 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1085900 2 0.0510 0.908196 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0510 0.869484 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1431625 2 0.0693 0.907116 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR814515 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.2020 0.790172 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1344034 3 0.5837 0.494908 0.000 0.276 0.616 0.016 0.092
#> SRR1080391 1 0.3561 0.422971 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1347870 2 0.1365 0.899742 0.000 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR814028 2 0.1282 0.896357 0.000 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR814219 2 0.0290 0.908490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070620 1 0.1043 0.854810 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1102128 4 0.4276 0.890279 0.380 0.000 0.000 0.616 0.004
#> SRR1460211 2 0.0798 0.905768 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1418346 5 0.1571 0.794460 0.000 0.060 0.000 0.004 0.936
#> SRR1070060 4 0.4182 0.903569 0.352 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1487969 2 0.3395 0.643709 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1417851 4 0.4440 0.729332 0.468 0.000 0.000 0.528 0.004
#> SRR1443350 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.1952 0.810767 0.912 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1076705 1 0.0451 0.872885 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1079380 5 0.2139 0.774960 0.000 0.032 0.000 0.052 0.916
#> SRR1102923 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.4000 0.747743 0.000 0.788 0.028 0.012 0.172
#> SRR1366605 2 0.2674 0.835842 0.000 0.868 0.000 0.120 0.012
#> SRR1396035 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2513 0.842814 0.000 0.876 0.000 0.116 0.008
#> SRR1436840 2 0.0771 0.908534 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1445573 2 0.1408 0.894796 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1375394 4 0.4754 0.863873 0.316 0.000 0.028 0.652 0.004
#> SRR1431735 1 0.1043 0.858575 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1417387 1 0.1341 0.840184 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1445984 1 0.0865 0.867451 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1370447 4 0.5104 0.830308 0.284 0.000 0.000 0.648 0.068
#> SRR1446308 2 0.2248 0.865591 0.000 0.900 0.088 0.012 0.000
#> SRR1437346 3 0.4659 0.084354 0.000 0.492 0.496 0.012 0.000
#> SRR1103143 2 0.0510 0.908550 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.872892 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0162 0.873368 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468914 4 0.4030 0.904371 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1319584 5 0.3300 0.685842 0.000 0.204 0.004 0.000 0.792
#> SRR1486584 1 0.4171 -0.284132 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR813536 4 0.4182 0.903569 0.352 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1317939 2 0.0898 0.904729 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1079730 1 0.0404 0.871487 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1341921 1 0.3424 0.492417 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1399178 2 0.0290 0.909535 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1415615 1 0.0510 0.871629 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1328551 2 0.0162 0.909539 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0693 0.906710 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1340828 5 0.2286 0.787151 0.000 0.108 0.000 0.004 0.888
#> SRR1079543 2 0.0324 0.909159 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR816427 2 0.3055 0.807659 0.000 0.840 0.000 0.144 0.016
#> SRR1076681 2 0.1121 0.899021 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1335314 4 0.4182 0.903569 0.352 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1400799 3 0.3783 0.586348 0.000 0.252 0.740 0.008 0.000
#> SRR1074578 4 0.4182 0.903569 0.352 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1312226 2 0.5409 0.317863 0.000 0.612 0.000 0.084 0.304
#> SRR1416207 1 0.0162 0.872582 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447371 1 0.0290 0.873225 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1069328 4 0.4045 0.905003 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1445023 4 0.4225 0.900720 0.364 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1077599 2 0.2189 0.868728 0.000 0.904 0.084 0.012 0.000
#> SRR1453480 2 0.1956 0.875441 0.000 0.916 0.000 0.076 0.008
#> SRR1101834 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1908 0.799910 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1074839 2 0.2848 0.854799 0.000 0.868 0.028 0.104 0.000
#> SRR1458727 5 0.1117 0.736078 0.000 0.000 0.020 0.016 0.964
#> SRR1436949 5 0.5500 0.510748 0.000 0.376 0.000 0.072 0.552
#> SRR1070429 3 0.4371 0.476974 0.000 0.344 0.644 0.012 0.000
#> SRR1458158 1 0.4300 -0.577800 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1432408 4 0.6380 0.381817 0.156 0.000 0.344 0.496 0.004
#> SRR1310334 1 0.2127 0.773065 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1418201 3 0.1082 0.752582 0.000 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1385434 4 0.4182 0.904068 0.352 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1415591 3 0.4446 0.377310 0.000 0.400 0.592 0.008 0.000
#> SRR1402009 1 0.1282 0.852386 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1316055 3 0.6432 0.139725 0.244 0.000 0.532 0.220 0.004
#> SRR1308734 3 0.3991 0.710049 0.000 0.088 0.824 0.028 0.060
#> SRR1498973 5 0.2648 0.760614 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1397115 1 0.4297 -0.571507 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1392141 1 0.0703 0.866728 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR814341 2 0.0451 0.908280 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1313601 2 0.1942 0.880370 0.000 0.920 0.068 0.012 0.000
#> SRR1459609 2 0.0579 0.907489 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1499325 3 0.2959 0.701522 0.000 0.008 0.864 0.016 0.112
#> SRR809919 1 0.1768 0.824168 0.924 0.000 0.000 0.072 0.004
#> SRR1370818 4 0.4276 0.888500 0.380 0.000 0.000 0.616 0.004
#> SRR1323651 2 0.2248 0.865549 0.000 0.900 0.088 0.012 0.000
#> SRR1357297 4 0.4196 0.904898 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR818170 5 0.4083 0.523986 0.000 0.000 0.228 0.028 0.744
#> SRR1091230 2 0.2006 0.877547 0.000 0.916 0.072 0.012 0.000
#> SRR1470556 2 0.1082 0.901782 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR812318 1 0.0963 0.857725 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1095285 3 0.0579 0.760993 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1317731 3 0.6043 0.126396 0.000 0.064 0.520 0.024 0.392
#> SRR1490785 1 0.0955 0.864062 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1432032 1 0.2629 0.735437 0.860 0.000 0.000 0.136 0.004
#> SRR1447808 1 0.3109 0.600466 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR809534 2 0.0451 0.908115 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1397312 5 0.4557 0.431426 0.000 0.404 0.012 0.000 0.584
#> SRR812128 2 0.6342 0.046602 0.000 0.520 0.000 0.208 0.272
#> SRR1101513 1 0.2020 0.804224 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1415708 2 0.0771 0.905888 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1316033 3 0.1377 0.753058 0.000 0.004 0.956 0.020 0.020
#> SRR1390371 2 0.1628 0.888071 0.000 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1480263 2 0.1701 0.888693 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR1464473 3 0.0955 0.758416 0.000 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR1076801 1 0.0671 0.871845 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1080044 1 0.0404 0.873383 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1420850 2 0.0451 0.908591 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1474295 4 0.4196 0.904178 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1069871 1 0.0609 0.870464 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1095744 5 0.1502 0.793409 0.000 0.056 0.000 0.004 0.940
#> SRR1068929 2 0.0693 0.907239 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1490097 2 0.2519 0.851187 0.000 0.884 0.000 0.100 0.016
#> SRR1075054 2 0.3123 0.761971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1083480 1 0.1831 0.816515 0.920 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1075458 1 0.0290 0.872206 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1417023 1 0.6339 -0.024047 0.528 0.000 0.300 0.168 0.004
#> SRR1309333 2 0.3013 0.798258 0.000 0.832 0.000 0.160 0.008
#> SRR1333676 4 0.4225 0.902213 0.364 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1352996 4 0.4088 0.902369 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR1093172 4 0.4268 0.898476 0.344 0.000 0.000 0.648 0.008
#> SRR1413137 4 0.4166 0.901324 0.348 0.000 0.000 0.648 0.004
#> SRR1469973 2 0.2813 0.856535 0.000 0.868 0.024 0.108 0.000
#> SRR1420026 2 0.3412 0.785457 0.000 0.820 0.000 0.152 0.028
#> SRR817306 4 0.4211 0.903886 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1416266 4 0.5182 0.571384 0.112 0.000 0.000 0.680 0.208
#> SRR1071011 2 0.0324 0.909616 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1090290 4 0.4211 0.903886 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1435394 2 0.2130 0.871977 0.000 0.908 0.080 0.012 0.000
#> SRR1383192 4 0.4182 0.903569 0.352 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1419962 3 0.1082 0.752582 0.000 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1094357 1 0.0510 0.871629 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1081639 3 0.1668 0.737462 0.000 0.000 0.940 0.028 0.032
#> SRR1356016 2 0.0451 0.908591 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1351082 2 0.1124 0.900162 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1397348 5 0.1544 0.794252 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1312147 1 0.1638 0.834005 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1473891 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.4211 0.903886 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1474930 2 0.1502 0.892628 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1470988 4 0.4182 0.903569 0.352 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR811915 2 0.0290 0.909535 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1104987 1 0.0510 0.869484 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.1483 0.902149 0.000 0.952 0.028 0.012 0.008
#> SRR1313770 3 0.2450 0.706369 0.000 0.000 0.896 0.028 0.076
#> SRR1315780 2 0.0613 0.909092 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004
#> SRR1073631 1 0.0000 0.872892 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 4 0.4196 0.904898 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1310997 5 0.3116 0.787710 0.000 0.076 0.000 0.064 0.860
#> SRR1464494 5 0.4680 0.732616 0.000 0.132 0.000 0.128 0.740
#> SRR1357083 2 0.4610 0.146771 0.000 0.556 0.432 0.012 0.000
#> SRR1475842 2 0.0865 0.905056 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1378085 1 0.4262 -0.470693 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1378220 2 0.4574 0.224171 0.000 0.576 0.412 0.012 0.000
#> SRR1467704 1 0.0671 0.870449 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1348885 5 0.5258 0.661850 0.040 0.028 0.000 0.260 0.672
#> SRR1325826 1 0.3561 0.407471 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1466812 4 0.4196 0.903796 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1345692 2 0.2825 0.829298 0.000 0.860 0.000 0.124 0.016
#> SRR1401040 3 0.0798 0.761203 0.000 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR1097954 1 0.0404 0.872749 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1374396 4 0.5482 0.730855 0.204 0.000 0.000 0.652 0.144
#> SRR1454073 2 0.2074 0.859107 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1355747 1 0.0609 0.867776 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1429368 3 0.0703 0.757831 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1398138 2 0.1493 0.905034 0.000 0.948 0.028 0.024 0.000
#> SRR1379260 1 0.2179 0.790076 0.896 0.000 0.000 0.100 0.004
#> SRR1361436 3 0.4109 0.548883 0.000 0.288 0.700 0.012 0.000
#> SRR817142 2 0.2069 0.874707 0.000 0.912 0.076 0.012 0.000
#> SRR1315291 3 0.6940 -0.000236 0.148 0.000 0.464 0.356 0.032
#> SRR1309314 3 0.1830 0.732084 0.000 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1420085 2 0.2769 0.845298 0.000 0.876 0.000 0.092 0.032
#> SRR1361308 3 0.0807 0.760211 0.000 0.012 0.976 0.012 0.000
#> SRR1472126 4 0.4201 0.858302 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1380482 5 0.1970 0.781936 0.000 0.060 0.012 0.004 0.924
#> SRR1099789 1 0.0404 0.870821 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1079480 5 0.1341 0.792949 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1339276 1 0.0955 0.862258 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1418368 1 0.0880 0.867568 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.872892 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.2470 0.851177 0.000 0.884 0.104 0.012 0.000
#> SRR1440290 2 0.2189 0.868728 0.000 0.904 0.084 0.012 0.000
#> SRR1330813 2 0.1809 0.885388 0.000 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR1458931 2 0.2249 0.861036 0.000 0.896 0.000 0.096 0.008
#> SRR812294 4 0.4211 0.903886 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1394321 1 0.0451 0.872198 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1081160 2 0.0162 0.909431 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469704 2 0.0807 0.905976 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1349342 1 0.0963 0.857688 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0162 0.909056 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084698 2 0.0404 0.908156 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1390143 1 0.3398 0.557416 0.780 0.000 0.000 0.216 0.004
#> SRR1390413 2 0.0162 0.909056 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099570 3 0.1195 0.758019 0.000 0.028 0.960 0.012 0.000
#> SRR1312169 4 0.4196 0.904898 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1096687 4 0.4227 0.830066 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1486139 1 0.1671 0.819184 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1470313 4 0.4585 0.864924 0.396 0.000 0.004 0.592 0.008
#> SRR1447893 2 0.3750 0.681309 0.000 0.756 0.232 0.012 0.000
#> SRR1466025 5 0.5664 0.542613 0.000 0.348 0.000 0.092 0.560
#> SRR1477429 4 0.4171 0.873604 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1445701 2 0.4505 0.337880 0.000 0.604 0.384 0.012 0.000
#> SRR820689 1 0.0162 0.872861 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1451876 2 0.1106 0.902902 0.000 0.964 0.024 0.012 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1768 0.825472 0.924 0.000 0.000 0.072 0.004
#> SRR1489328 2 0.3163 0.790362 0.000 0.824 0.000 0.164 0.012
#> SRR1344462 1 0.0703 0.869596 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1082709 1 0.4256 -0.427307 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1447784 1 0.0703 0.866875 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1355769 4 0.4196 0.904898 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1488237 2 0.1408 0.894872 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1391985 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1704 0.825811 0.928 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1480917 5 0.4998 0.469918 0.000 0.372 0.024 0.008 0.596
#> SRR1474485 1 0.0955 0.865099 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1089998 1 0.0510 0.871145 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1318140 1 0.2690 0.701452 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1319262 2 0.3750 0.680257 0.000 0.756 0.232 0.012 0.000
#> SRR1095188 2 0.0693 0.910471 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1454350 1 0.2304 0.782375 0.892 0.000 0.000 0.100 0.008
#> SRR1440374 1 0.0404 0.873039 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1359565 3 0.2660 0.698233 0.000 0.128 0.864 0.008 0.000
#> SRR1105417 4 0.4251 0.893611 0.372 0.000 0.000 0.624 0.004
#> SRR1325578 2 0.5735 0.186739 0.000 0.568 0.076 0.008 0.348
#> SRR1358161 3 0.2783 0.696531 0.000 0.004 0.868 0.012 0.116
#> SRR1358665 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.3607 0.631379 0.000 0.752 0.000 0.004 0.244
#> SRR1452010 4 0.4196 0.904898 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1418183 2 0.2361 0.858757 0.000 0.892 0.096 0.012 0.000
#> SRR1366345 1 0.2179 0.786656 0.896 0.000 0.000 0.100 0.004
#> SRR1387449 1 0.0703 0.869691 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1473461 4 0.4415 0.784135 0.444 0.000 0.000 0.552 0.004
#> SRR1090837 3 0.4659 0.121891 0.000 0.488 0.500 0.012 0.000
#> SRR1447828 3 0.0955 0.758416 0.000 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR1338747 2 0.0324 0.909027 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1333038 3 0.3877 0.629526 0.000 0.212 0.764 0.024 0.000
#> SRR1350280 4 0.4350 0.845606 0.408 0.000 0.000 0.588 0.004
#> SRR1088557 1 0.0703 0.871429 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1102656 2 0.0609 0.906596 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1441443 2 0.1484 0.892813 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1370682 3 0.0955 0.758416 0.000 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR1475448 3 0.4658 0.137792 0.000 0.484 0.504 0.012 0.000
#> SRR1407291 4 0.4210 0.844525 0.412 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1405266 1 0.1124 0.859676 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1363766 1 0.3957 0.331874 0.712 0.000 0.000 0.280 0.008
#> SRR1082592 5 0.5984 0.649874 0.000 0.204 0.000 0.208 0.588
#> SRR1325794 2 0.1701 0.901331 0.000 0.944 0.028 0.012 0.016
#> SRR1095961 3 0.3807 0.596185 0.000 0.240 0.748 0.012 0.000
#> SRR1086702 2 0.0290 0.909189 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1320806 2 0.1740 0.887697 0.000 0.932 0.056 0.012 0.000
#> SRR1457527 3 0.0566 0.760825 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0693 0.760919 0.000 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR1488858 4 0.4238 0.900230 0.368 0.000 0.000 0.628 0.004
#> SRR1454695 1 0.0000 0.872892 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.1522 0.893821 0.000 0.944 0.044 0.012 0.000
#> SRR1329863 2 0.0290 0.908490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357733 1 0.1341 0.839996 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1362135 1 0.0955 0.866041 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1379581 3 0.1300 0.747761 0.000 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1309182 4 0.4276 0.884901 0.380 0.000 0.000 0.616 0.004
#> SRR1437668 1 0.0324 0.873151 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1084742 5 0.3471 0.779691 0.000 0.092 0.000 0.072 0.836
#> SRR1433538 4 0.4126 0.894034 0.380 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1085063 2 0.0798 0.906107 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1454247 5 0.1608 0.795105 0.000 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1097100 2 0.0162 0.909056 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR818622 2 0.2069 0.874707 0.000 0.912 0.076 0.012 0.000
#> SRR1072388 1 0.0771 0.868871 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1070332 5 0.4201 0.475725 0.000 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR1320761 2 0.3491 0.816761 0.000 0.836 0.028 0.012 0.124
#> SRR1076195 4 0.5914 0.668855 0.176 0.000 0.164 0.644 0.016
#> SRR1069895 2 0.2416 0.855280 0.000 0.888 0.100 0.012 0.000
#> SRR1099144 1 0.2536 0.748025 0.868 0.000 0.000 0.128 0.004
#> SRR1385150 3 0.4251 0.515385 0.000 0.316 0.672 0.012 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.4211 0.903886 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1102583 4 0.4294 0.726205 0.468 0.000 0.000 0.532 0.000
#> SRR1456971 1 0.1571 0.838158 0.936 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR1340574 1 0.1952 0.806974 0.912 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1444830 2 0.1877 0.883012 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1096267 1 0.0510 0.869484 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1087127 5 0.2127 0.690312 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1408553 4 0.4268 0.898452 0.344 0.000 0.000 0.648 0.008
#> SRR1069231 1 0.3949 0.087572 0.668 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1325642 2 0.2068 0.866049 0.000 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1362103 1 0.0290 0.872206 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1321942 1 0.0404 0.870821 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1094380 1 0.1638 0.829750 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1447499 2 0.0404 0.909260 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1099330 2 0.1670 0.889769 0.000 0.936 0.052 0.012 0.000
#> SRR1077874 2 0.2377 0.812065 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR808299 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.1282 0.787238 0.000 0.044 0.000 0.004 0.952
#> SRR1481238 2 0.1651 0.896287 0.000 0.944 0.036 0.012 0.008
#> SRR1443568 2 0.1830 0.882976 0.000 0.924 0.068 0.008 0.000
#> SRR1380249 4 0.4327 0.902084 0.360 0.000 0.000 0.632 0.008
#> SRR1080143 4 0.4264 0.893028 0.376 0.000 0.000 0.620 0.004
#> SRR1383148 4 0.4313 0.903614 0.356 0.000 0.000 0.636 0.008
#> SRR1357042 4 0.4302 0.712034 0.480 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1416025 2 0.0955 0.904123 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1431015 2 0.1243 0.904023 0.000 0.960 0.004 0.028 0.008
#> SRR1078709 2 0.3461 0.780757 0.000 0.812 0.004 0.168 0.016
#> SRR813283 1 0.0865 0.867952 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1430226 2 0.0290 0.909535 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1070665 1 0.0671 0.869056 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1466927 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.5766 -0.100934 0.068 0.008 0.008 0.604 0.312
#> SRR807679 1 0.1608 0.823767 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1333811 3 0.4580 0.450429 0.000 0.356 0.628 0.008 0.008
#> SRR1078660 2 0.5776 0.425999 0.000 0.632 0.004 0.160 0.204
#> SRR1331730 2 0.1082 0.901752 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1333913 1 0.0963 0.857688 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1432542 1 0.2439 0.760226 0.876 0.000 0.000 0.120 0.004
#> SRR1418041 1 0.0794 0.868282 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1085211 1 0.0290 0.871866 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1339812 2 0.0162 0.909056 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402437 1 0.0794 0.865905 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1350958 2 0.0324 0.909616 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1396822 2 0.2189 0.868728 0.000 0.904 0.084 0.012 0.000
#> SRR1441934 2 0.0955 0.903940 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1472552 3 0.2248 0.727357 0.000 0.088 0.900 0.012 0.000
#> SRR1488881 3 0.1195 0.757918 0.000 0.028 0.960 0.012 0.000
#> SRR1102973 1 0.0566 0.870736 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1071131 2 0.2669 0.855680 0.000 0.876 0.104 0.020 0.000
#> SRR1074502 1 0.0794 0.867950 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1325271 1 0.2890 0.687910 0.836 0.000 0.000 0.160 0.004
#> SRR1409171 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0162 0.909491 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430045 2 0.1082 0.901752 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1441245 2 0.1408 0.894560 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1384091 4 0.4196 0.904797 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1431887 2 0.1168 0.900151 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR1096525 4 0.5510 0.705167 0.184 0.000 0.000 0.652 0.164
#> SRR1488491 2 0.0162 0.909431 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1356351 2 0.2786 0.858381 0.000 0.884 0.020 0.012 0.084
#> SRR1369514 4 0.4211 0.903886 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004
#> SRR1453299 3 0.2971 0.678434 0.000 0.156 0.836 0.008 0.000
#> SRR1436300 1 0.0162 0.872887 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1348490 5 0.1197 0.790379 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1091767 2 0.2997 0.807586 0.000 0.840 0.000 0.148 0.012
#> SRR1354467 3 0.1195 0.757817 0.000 0.028 0.960 0.012 0.000
#> SRR1069074 2 0.1597 0.892048 0.000 0.940 0.048 0.012 0.000
#> SRR1452399 2 0.1668 0.902852 0.000 0.940 0.032 0.028 0.000
#> SRR1437430 3 0.2492 0.748722 0.000 0.048 0.908 0.024 0.020
#> SRR1419736 5 0.1502 0.793690 0.000 0.056 0.000 0.004 0.940
#> SRR1313343 3 0.0703 0.757831 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1077619 4 0.4331 0.865697 0.400 0.000 0.000 0.596 0.004
#> SRR1083530 1 0.2848 0.692426 0.840 0.000 0.000 0.156 0.004
#> SRR1333633 2 0.4447 0.732475 0.000 0.772 0.080 0.008 0.140
#> SRR1354999 2 0.2069 0.874707 0.000 0.912 0.076 0.012 0.000
#> SRR1443592 2 0.0798 0.905768 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1077356 1 0.0510 0.871835 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1378818 5 0.1041 0.733348 0.000 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1413182 4 0.4196 0.904797 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1464559 4 0.4350 0.851771 0.408 0.000 0.000 0.588 0.004
#> SRR1413075 5 0.1965 0.789477 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1487928 4 0.5668 0.736826 0.224 0.000 0.112 0.652 0.012
#> SRR1388997 2 0.1956 0.875614 0.000 0.916 0.000 0.076 0.008
#> SRR1092865 2 0.1628 0.889780 0.000 0.936 0.056 0.008 0.000
#> SRR1102729 1 0.2516 0.738883 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1456423 1 0.0609 0.868942 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1321591 2 0.0807 0.905976 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1376874 3 0.0955 0.758416 0.000 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR1339903 1 0.3816 0.240235 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1346710 1 0.1205 0.857195 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1418771 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.1356 0.900082 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1480941 2 0.4813 0.717022 0.072 0.784 0.068 0.072 0.004
#> SRR1479175 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.1628 0.888112 0.000 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1491354 1 0.4015 -0.003053 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000
#> SRR1433884 2 0.1469 0.902367 0.000 0.948 0.036 0.016 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0404 0.908843 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.2189 0.868728 0.000 0.904 0.084 0.012 0.000
#> SRR1487173 1 0.1851 0.804897 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1474253 1 0.1041 0.862435 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1322918 2 0.2249 0.860290 0.000 0.896 0.000 0.096 0.008
#> SRR1318331 2 0.0865 0.905115 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1321333 3 0.0798 0.761203 0.000 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.872892 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.3366 0.541454 0.784 0.000 0.000 0.212 0.004
#> SRR1091328 1 0.0771 0.868871 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR814447 3 0.1399 0.745233 0.000 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1455989 2 0.1364 0.897705 0.000 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1453680 3 0.0865 0.759289 0.000 0.004 0.972 0.024 0.000
#> SRR1470356 2 0.0613 0.909621 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008
#> SRR1342977 2 0.0162 0.909056 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444222 2 0.0510 0.907609 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.3684 0.340477 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1366729 3 0.0566 0.760739 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR821282 3 0.0955 0.758416 0.000 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR1074602 2 0.1809 0.885388 0.000 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.909507 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.6482 0.501251 0.000 0.200 0.596 0.032 0.172
#> SRR1319100 1 0.0992 0.863653 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1324004 2 0.4130 0.568530 0.000 0.696 0.292 0.012 0.000
#> SRR1457459 1 0.2193 0.792924 0.900 0.000 0.000 0.092 0.008
#> SRR1421031 4 0.4196 0.904797 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1444598 5 0.2712 0.726953 0.000 0.000 0.032 0.088 0.880
#> SRR1091743 2 0.1809 0.885388 0.000 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR819637 1 0.0703 0.865653 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1083848 1 0.0510 0.869484 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1088934 2 0.2574 0.844096 0.000 0.876 0.112 0.012 0.000
#> SRR1459785 3 0.0324 0.760902 0.000 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1083700 1 0.0609 0.867828 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1375531 4 0.4276 0.888754 0.380 0.000 0.000 0.616 0.004
#> SRR1323470 4 0.6826 0.466166 0.096 0.120 0.152 0.624 0.008
#> SRR814657 4 0.4276 0.888812 0.380 0.000 0.000 0.616 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0458 0.73380 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1467726 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.3713 0.33640 0.000 0.704 0.000 0.008 0.004 0.284
#> SRR1402132 4 0.3213 0.77359 0.084 0.000 0.000 0.836 0.004 0.076
#> SRR1326059 1 0.2527 0.79297 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.4125 0.62791 0.000 0.748 0.128 0.000 0.000 0.124
#> SRR809406 1 0.1663 0.84542 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1465313 5 0.5904 0.17418 0.000 0.296 0.116 0.000 0.552 0.036
#> SRR819559 1 0.4673 0.43838 0.648 0.000 0.000 0.272 0.000 0.080
#> SRR1387899 2 0.5406 0.44380 0.000 0.576 0.284 0.004 0.000 0.136
#> SRR1442292 2 0.0547 0.73886 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1488151 1 0.1349 0.85524 0.940 0.000 0.000 0.056 0.000 0.004
#> SRR1395635 1 0.1408 0.85391 0.944 0.000 0.000 0.020 0.000 0.036
#> SRR1343629 1 0.1176 0.85680 0.956 0.000 0.000 0.024 0.000 0.020
#> SRR1326868 2 0.4196 0.61985 0.000 0.740 0.144 0.000 0.000 0.116
#> SRR1102320 4 0.3602 0.84052 0.160 0.000 0.000 0.784 0.000 0.056
#> SRR1469926 3 0.2069 0.69989 0.000 0.000 0.908 0.020 0.004 0.068
#> SRR1070036 1 0.2740 0.81192 0.852 0.000 0.000 0.028 0.000 0.120
#> SRR1098426 1 0.2572 0.80710 0.852 0.000 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR1090310 3 0.5457 0.33250 0.000 0.328 0.544 0.004 0.000 0.124
#> SRR1429748 4 0.2882 0.83682 0.180 0.000 0.000 0.812 0.000 0.008
#> SRR1363654 4 0.4199 0.47629 0.416 0.000 0.000 0.568 0.000 0.016
#> SRR1326317 2 0.4682 0.58370 0.000 0.696 0.176 0.004 0.000 0.124
#> SRR1378308 2 0.0632 0.73099 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1366919 4 0.4855 0.78176 0.204 0.000 0.000 0.660 0.000 0.136
#> SRR1329947 1 0.1141 0.85817 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.6238 0.41088 0.000 0.580 0.252 0.016 0.060 0.092
#> SRR1490761 2 0.0458 0.73872 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1380122 5 0.1684 0.63137 0.000 0.028 0.008 0.008 0.940 0.016
#> SRR1402944 5 0.1140 0.62876 0.000 0.008 0.012 0.008 0.964 0.008
#> SRR1092818 1 0.0858 0.85609 0.968 0.000 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1093552 1 0.2404 0.83617 0.884 0.000 0.000 0.036 0.000 0.080
#> SRR1464880 2 0.3868 -0.29865 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000
#> SRR1078368 2 0.0458 0.73872 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1349608 2 0.1285 0.73638 0.000 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1466951 2 0.2234 0.66846 0.000 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1331879 2 0.5346 -0.18520 0.000 0.584 0.000 0.000 0.164 0.252
#> SRR1320034 3 0.0806 0.70921 0.000 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR1068687 2 0.4519 0.62049 0.000 0.728 0.128 0.004 0.004 0.136
#> SRR1437491 1 0.1780 0.84968 0.924 0.000 0.000 0.028 0.000 0.048
#> SRR1310777 2 0.0458 0.73576 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1374005 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.2230 0.84468 0.892 0.000 0.000 0.084 0.000 0.024
#> SRR1329994 4 0.4434 0.81054 0.172 0.000 0.000 0.712 0.000 0.116
#> SRR1354203 1 0.1863 0.84668 0.920 0.000 0.000 0.036 0.000 0.044
#> SRR1077850 1 0.1700 0.83809 0.916 0.000 0.000 0.004 0.000 0.080
#> SRR1369241 2 0.0632 0.73833 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077992 5 0.3862 -0.12459 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524 0.000
#> SRR1455214 1 0.1219 0.85799 0.948 0.000 0.000 0.048 0.000 0.004
#> SRR1092014 2 0.4596 0.57554 0.000 0.692 0.188 0.000 0.000 0.120
#> SRR1097857 1 0.3511 0.67544 0.760 0.000 0.000 0.216 0.000 0.024
#> SRR1473318 1 0.0725 0.85926 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1345974 3 0.0363 0.70861 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1338687 2 0.1753 0.72167 0.000 0.912 0.004 0.000 0.000 0.084
#> SRR1071207 4 0.4587 0.79921 0.204 0.000 0.000 0.688 0.000 0.108
#> SRR1486821 3 0.2290 0.68349 0.000 0.000 0.892 0.020 0.004 0.084
#> SRR1418540 1 0.1644 0.85434 0.932 0.000 0.000 0.028 0.000 0.040
#> SRR1408788 2 0.3976 0.64224 0.000 0.776 0.128 0.000 0.008 0.088
#> SRR1359487 4 0.2925 0.82947 0.104 0.000 0.000 0.856 0.016 0.024
#> SRR1080648 1 0.2266 0.82630 0.880 0.000 0.000 0.012 0.000 0.108
#> SRR1414708 1 0.5092 0.43761 0.624 0.000 0.000 0.232 0.000 0.144
#> SRR1469080 2 0.2933 0.51392 0.000 0.796 0.000 0.000 0.200 0.004
#> SRR1365722 2 0.0508 0.73376 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1448118 2 0.0291 0.73612 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1444808 4 0.5366 0.67650 0.292 0.000 0.000 0.564 0.000 0.144
#> SRR1321829 2 0.4277 0.61517 0.000 0.732 0.144 0.000 0.000 0.124
#> SRR1475993 3 0.3354 0.60482 0.000 0.168 0.796 0.000 0.000 0.036
#> SRR1445387 1 0.1753 0.84923 0.912 0.000 0.000 0.084 0.000 0.004
#> SRR1077575 5 0.0870 0.63114 0.000 0.012 0.000 0.004 0.972 0.012
#> SRR1349300 4 0.4076 0.43930 0.396 0.000 0.000 0.592 0.000 0.012
#> SRR1374165 1 0.1814 0.83627 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1453769 2 0.0363 0.73875 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473870 4 0.2219 0.83912 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.3858 0.66058 0.000 0.796 0.084 0.000 0.016 0.104
#> SRR1366124 4 0.5776 0.73241 0.152 0.000 0.060 0.632 0.000 0.156
#> SRR1391811 1 0.1572 0.84821 0.936 0.000 0.000 0.036 0.000 0.028
#> SRR1456674 1 0.2531 0.81159 0.856 0.000 0.000 0.012 0.000 0.132
#> SRR1086490 3 0.5408 0.37309 0.000 0.312 0.560 0.004 0.000 0.124
#> SRR1088511 2 0.0260 0.73578 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1404577 4 0.2446 0.83355 0.124 0.000 0.000 0.864 0.000 0.012
#> SRR1384431 1 0.2001 0.84931 0.912 0.000 0.000 0.048 0.000 0.040
#> SRR1072055 1 0.2257 0.82262 0.876 0.000 0.000 0.008 0.000 0.116
#> SRR1359738 2 0.5362 0.28844 0.000 0.524 0.356 0.000 0.000 0.120
#> SRR1332141 1 0.1074 0.85701 0.960 0.000 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR1085900 2 0.2685 0.71129 0.000 0.872 0.044 0.004 0.000 0.080
#> SRR1442173 1 0.1341 0.85732 0.948 0.000 0.000 0.028 0.000 0.024
#> SRR1431625 2 0.1219 0.71741 0.000 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR814515 2 0.0458 0.73872 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1357999 5 0.2053 0.57794 0.000 0.108 0.000 0.000 0.888 0.004
#> SRR1344034 5 0.7101 0.12173 0.000 0.132 0.316 0.008 0.436 0.108
#> SRR1080391 1 0.4047 0.35134 0.604 0.000 0.000 0.384 0.000 0.012
#> SRR1347870 2 0.2020 0.70394 0.000 0.896 0.008 0.000 0.000 0.096
#> SRR814028 2 0.3482 0.64950 0.000 0.816 0.016 0.000 0.128 0.040
#> SRR814219 2 0.0508 0.73885 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1070620 1 0.1082 0.85308 0.956 0.000 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1102128 4 0.3376 0.82209 0.220 0.000 0.000 0.764 0.000 0.016
#> SRR1460211 2 0.0790 0.72791 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1418346 5 0.1237 0.63087 0.000 0.020 0.000 0.004 0.956 0.020
#> SRR1070060 4 0.2048 0.83338 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.3193 0.58947 0.000 0.824 0.000 0.000 0.124 0.052
#> SRR1417851 4 0.5604 0.40706 0.404 0.000 0.000 0.452 0.000 0.144
#> SRR1443350 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.3103 0.80825 0.836 0.000 0.000 0.100 0.000 0.064
#> SRR1076705 1 0.2572 0.80655 0.852 0.000 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR1079380 5 0.2153 0.60939 0.000 0.004 0.004 0.040 0.912 0.040
#> SRR1102923 2 0.0260 0.73861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1369560 5 0.5484 -0.00327 0.000 0.400 0.052 0.000 0.512 0.036
#> SRR1366605 2 0.3448 0.35396 0.000 0.716 0.000 0.000 0.004 0.280
#> SRR1396035 2 0.0363 0.73875 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1390223 2 0.3606 0.36407 0.000 0.708 0.000 0.004 0.004 0.284
#> SRR1436840 2 0.1267 0.72401 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1445573 2 0.1908 0.67822 0.000 0.900 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1375394 4 0.4736 0.60682 0.044 0.000 0.112 0.736 0.000 0.108
#> SRR1431735 1 0.3123 0.79039 0.824 0.000 0.000 0.040 0.000 0.136
#> SRR1417387 1 0.0806 0.85647 0.972 0.000 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1445984 1 0.2872 0.79910 0.836 0.000 0.000 0.024 0.000 0.140
#> SRR1370447 4 0.1745 0.79099 0.068 0.000 0.000 0.920 0.012 0.000
#> SRR1446308 2 0.4834 0.53673 0.000 0.656 0.224 0.000 0.000 0.120
#> SRR1437346 3 0.5278 0.18401 0.000 0.384 0.512 0.000 0.000 0.104
#> SRR1103143 2 0.0790 0.73023 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1086466 1 0.0806 0.85696 0.972 0.000 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1073191 2 0.0260 0.73578 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098974 1 0.1049 0.85961 0.960 0.000 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1468914 4 0.2531 0.84202 0.132 0.000 0.000 0.856 0.000 0.012
#> SRR1319584 5 0.2914 0.52751 0.000 0.152 0.004 0.004 0.832 0.008
#> SRR1486584 1 0.3890 0.32648 0.596 0.000 0.000 0.400 0.000 0.004
#> SRR813536 4 0.2092 0.83515 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.1531 0.70457 0.000 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1079730 1 0.1563 0.85547 0.932 0.000 0.000 0.056 0.000 0.012
#> SRR1341921 1 0.3869 -0.15856 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0632 0.73216 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1415615 1 0.1391 0.85724 0.944 0.000 0.000 0.040 0.000 0.016
#> SRR1328551 2 0.0790 0.73599 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1453259 2 0.1349 0.71169 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1340828 5 0.2934 0.56623 0.000 0.112 0.000 0.000 0.844 0.044
#> SRR1079543 2 0.1075 0.73443 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR816427 2 0.4006 -0.05310 0.000 0.600 0.000 0.004 0.004 0.392
#> SRR1076681 2 0.2697 0.70187 0.000 0.864 0.092 0.000 0.000 0.044
#> SRR1335314 4 0.3138 0.82867 0.108 0.000 0.000 0.832 0.000 0.060
#> SRR1400799 3 0.4528 0.56881 0.000 0.148 0.716 0.004 0.000 0.132
#> SRR1074578 4 0.2260 0.84069 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.4813 -0.06118 0.000 0.608 0.000 0.000 0.076 0.316
#> SRR1416207 1 0.1092 0.85976 0.960 0.000 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1447371 1 0.1498 0.85721 0.940 0.000 0.000 0.028 0.000 0.032
#> SRR1069328 4 0.3377 0.84223 0.136 0.000 0.000 0.808 0.000 0.056
#> SRR1445023 4 0.2901 0.82960 0.128 0.000 0.000 0.840 0.000 0.032
#> SRR1077599 2 0.4983 0.53742 0.000 0.652 0.220 0.004 0.000 0.124
#> SRR1453480 2 0.2838 0.55725 0.000 0.808 0.000 0.000 0.004 0.188
#> SRR1101834 2 0.0363 0.73875 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1321744 1 0.2494 0.82651 0.864 0.000 0.000 0.016 0.000 0.120
#> SRR1074839 2 0.4161 0.41646 0.000 0.696 0.036 0.004 0.000 0.264
#> SRR1458727 5 0.1841 0.60789 0.000 0.000 0.008 0.064 0.920 0.008
#> SRR1436949 2 0.5630 -0.35708 0.000 0.540 0.000 0.000 0.232 0.228
#> SRR1070429 3 0.5395 0.37393 0.000 0.308 0.564 0.004 0.000 0.124
#> SRR1458158 4 0.3330 0.71178 0.284 0.000 0.000 0.716 0.000 0.000
#> SRR1432408 3 0.7132 -0.15096 0.120 0.000 0.404 0.316 0.000 0.160
#> SRR1310334 1 0.2793 0.75786 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.1983 0.69370 0.000 0.000 0.908 0.020 0.000 0.072
#> SRR1385434 4 0.4668 0.80439 0.160 0.000 0.000 0.700 0.004 0.136
#> SRR1415591 3 0.5140 0.43615 0.000 0.248 0.624 0.004 0.000 0.124
#> SRR1402009 1 0.1802 0.84761 0.916 0.000 0.000 0.072 0.000 0.012
#> SRR1316055 3 0.7257 0.06288 0.156 0.000 0.436 0.204 0.000 0.204
#> SRR1308734 3 0.6390 0.46097 0.000 0.168 0.596 0.020 0.156 0.060
#> SRR1498973 5 0.3266 0.27226 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1397115 4 0.3371 0.68860 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.2234 0.83906 0.872 0.000 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR814341 2 0.0603 0.73286 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1313601 2 0.4377 0.60348 0.000 0.720 0.160 0.000 0.000 0.120
#> SRR1459609 2 0.0603 0.73240 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1499325 3 0.5009 0.00972 0.000 0.000 0.500 0.012 0.444 0.044
#> SRR809919 1 0.2201 0.82534 0.896 0.000 0.000 0.028 0.000 0.076
#> SRR1370818 4 0.5069 0.76159 0.228 0.000 0.000 0.628 0.000 0.144
#> SRR1323651 2 0.5372 0.46451 0.000 0.588 0.268 0.004 0.000 0.140
#> SRR1357297 4 0.2219 0.83912 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR818170 5 0.4608 0.48206 0.000 0.000 0.168 0.020 0.724 0.088
#> SRR1091230 2 0.4713 0.57961 0.000 0.692 0.180 0.004 0.000 0.124
#> SRR1470556 2 0.1285 0.71390 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR812318 1 0.1168 0.85585 0.956 0.000 0.000 0.016 0.000 0.028
#> SRR1095285 3 0.2100 0.68792 0.000 0.000 0.884 0.004 0.000 0.112
#> SRR1317731 3 0.6025 0.39982 0.000 0.064 0.620 0.020 0.220 0.076
#> SRR1490785 1 0.1297 0.85772 0.948 0.000 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR1432032 1 0.3063 0.79785 0.840 0.000 0.000 0.092 0.000 0.068
#> SRR1447808 1 0.3828 0.12723 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0547 0.73231 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1397312 5 0.4687 0.23986 0.000 0.280 0.036 0.000 0.660 0.024
#> SRR812128 2 0.5340 -0.51925 0.000 0.480 0.000 0.012 0.072 0.436
#> SRR1101513 1 0.3512 0.65094 0.720 0.000 0.000 0.272 0.000 0.008
#> SRR1415708 2 0.0935 0.73704 0.000 0.964 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1316033 3 0.2183 0.69167 0.000 0.000 0.912 0.020 0.040 0.028
#> SRR1390371 2 0.2595 0.60439 0.000 0.836 0.000 0.000 0.004 0.160
#> SRR1480263 2 0.2346 0.64333 0.000 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1464473 3 0.2094 0.68933 0.000 0.000 0.900 0.020 0.000 0.080
#> SRR1076801 1 0.2191 0.81934 0.876 0.000 0.000 0.004 0.000 0.120
#> SRR1080044 1 0.1913 0.84481 0.908 0.000 0.000 0.080 0.000 0.012
#> SRR1420850 2 0.0547 0.73269 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1474295 4 0.2653 0.84315 0.144 0.000 0.000 0.844 0.000 0.012
#> SRR1069871 1 0.1327 0.85518 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.1401 0.62819 0.000 0.028 0.000 0.004 0.948 0.020
#> SRR1068929 2 0.1349 0.71157 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1490097 2 0.3693 0.37423 0.000 0.708 0.000 0.004 0.008 0.280
#> SRR1075054 2 0.3202 0.52786 0.000 0.800 0.000 0.000 0.176 0.024
#> SRR1083480 1 0.1644 0.84479 0.932 0.000 0.000 0.028 0.000 0.040
#> SRR1075458 1 0.2494 0.81713 0.864 0.000 0.000 0.016 0.000 0.120
#> SRR1417023 1 0.7249 -0.08014 0.344 0.000 0.344 0.108 0.000 0.204
#> SRR1309333 2 0.4215 -0.22372 0.000 0.556 0.004 0.004 0.004 0.432
#> SRR1333676 4 0.3253 0.83270 0.192 0.000 0.000 0.788 0.000 0.020
#> SRR1352996 4 0.2473 0.84203 0.136 0.000 0.000 0.856 0.000 0.008
#> SRR1093172 4 0.1728 0.78882 0.064 0.000 0.000 0.924 0.008 0.004
#> SRR1413137 4 0.1588 0.79744 0.072 0.000 0.000 0.924 0.004 0.000
#> SRR1469973 2 0.4855 0.32601 0.000 0.620 0.072 0.004 0.000 0.304
#> SRR1420026 2 0.4625 -0.30339 0.000 0.540 0.000 0.004 0.032 0.424
#> SRR817306 4 0.3168 0.84169 0.172 0.000 0.000 0.804 0.000 0.024
#> SRR1416266 4 0.1788 0.74058 0.028 0.000 0.000 0.928 0.040 0.004
#> SRR1071011 2 0.0547 0.73862 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1090290 4 0.4890 0.78284 0.204 0.000 0.000 0.656 0.000 0.140
#> SRR1435394 2 0.5054 0.52365 0.000 0.640 0.232 0.004 0.000 0.124
#> SRR1383192 4 0.2003 0.83132 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.2182 0.68891 0.000 0.000 0.900 0.020 0.004 0.076
#> SRR1094357 1 0.1151 0.85804 0.956 0.000 0.000 0.032 0.000 0.012
#> SRR1081639 3 0.2362 0.68352 0.000 0.000 0.892 0.016 0.012 0.080
#> SRR1356016 2 0.0632 0.73099 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1351082 2 0.1501 0.70170 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1397348 5 0.1334 0.63432 0.000 0.020 0.000 0.000 0.948 0.032
#> SRR1312147 1 0.3332 0.77774 0.808 0.000 0.000 0.048 0.000 0.144
#> SRR1473891 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.3200 0.83442 0.196 0.000 0.000 0.788 0.000 0.016
#> SRR1474930 2 0.4720 0.58558 0.000 0.692 0.176 0.004 0.000 0.128
#> SRR1470988 4 0.2053 0.82809 0.108 0.000 0.000 0.888 0.000 0.004
#> SRR811915 2 0.0632 0.73099 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1104987 1 0.1092 0.85862 0.960 0.000 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1100005 2 0.0260 0.73853 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1444436 2 0.3832 0.64697 0.000 0.776 0.104 0.000 0.000 0.120
#> SRR1313770 3 0.3747 0.60548 0.000 0.000 0.808 0.020 0.076 0.096
#> SRR1315780 2 0.2178 0.70518 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1073631 1 0.1471 0.85343 0.932 0.000 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR819124 4 0.2738 0.83719 0.176 0.000 0.000 0.820 0.000 0.004
#> SRR1310997 5 0.3292 0.56883 0.000 0.024 0.000 0.032 0.836 0.108
#> SRR1464494 5 0.5657 -0.26212 0.000 0.152 0.000 0.004 0.520 0.324
#> SRR1357083 2 0.5548 0.24713 0.000 0.504 0.368 0.004 0.000 0.124
#> SRR1475842 2 0.1387 0.71918 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1378085 1 0.5162 -0.09621 0.504 0.000 0.000 0.408 0.000 0.088
#> SRR1378220 2 0.5499 0.31488 0.000 0.528 0.344 0.004 0.000 0.124
#> SRR1467704 1 0.2572 0.80882 0.852 0.000 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR1348885 6 0.7532 0.25004 0.024 0.120 0.000 0.148 0.288 0.420
#> SRR1325826 1 0.3634 0.39298 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.2260 0.83947 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.4273 0.10038 0.000 0.616 0.008 0.004 0.008 0.364
#> SRR1401040 3 0.2443 0.69085 0.000 0.020 0.880 0.004 0.000 0.096
#> SRR1097954 1 0.1398 0.85709 0.940 0.000 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR1374396 4 0.2880 0.77561 0.056 0.000 0.000 0.872 0.048 0.024
#> SRR1454073 2 0.3833 0.43011 0.000 0.708 0.016 0.004 0.000 0.272
#> SRR1355747 1 0.2118 0.83747 0.888 0.000 0.000 0.008 0.000 0.104
#> SRR1429368 3 0.1616 0.70370 0.000 0.000 0.932 0.020 0.000 0.048
#> SRR1398138 2 0.3672 0.67963 0.000 0.792 0.064 0.004 0.000 0.140
#> SRR1379260 1 0.3680 0.74837 0.784 0.000 0.000 0.072 0.000 0.144
#> SRR1361436 3 0.5184 0.37060 0.000 0.316 0.572 0.000 0.000 0.112
#> SRR817142 2 0.4772 0.55326 0.000 0.668 0.208 0.000 0.000 0.124
#> SRR1315291 4 0.7557 0.34081 0.128 0.000 0.280 0.392 0.012 0.188
#> SRR1309314 3 0.2969 0.65749 0.000 0.000 0.860 0.020 0.032 0.088
#> SRR1420085 2 0.4496 0.15835 0.000 0.644 0.000 0.004 0.044 0.308
#> SRR1361308 3 0.2001 0.69270 0.000 0.004 0.900 0.004 0.000 0.092
#> SRR1472126 4 0.2823 0.82254 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.1268 0.63610 0.000 0.036 0.004 0.000 0.952 0.008
#> SRR1099789 1 0.1151 0.85781 0.956 0.000 0.000 0.032 0.000 0.012
#> SRR1079480 5 0.0458 0.63463 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1339276 1 0.1492 0.85453 0.940 0.000 0.000 0.024 0.000 0.036
#> SRR1418368 1 0.2191 0.82830 0.876 0.000 0.000 0.120 0.000 0.004
#> SRR1399353 1 0.1967 0.85403 0.904 0.000 0.000 0.012 0.000 0.084
#> SRR1096760 2 0.4871 0.51519 0.000 0.644 0.244 0.000 0.000 0.112
#> SRR1440290 2 0.5245 0.49486 0.000 0.612 0.248 0.004 0.000 0.136
#> SRR1330813 2 0.4415 0.61406 0.000 0.728 0.144 0.004 0.000 0.124
#> SRR1458931 2 0.2964 0.53162 0.000 0.792 0.000 0.000 0.004 0.204
#> SRR812294 4 0.3996 0.82899 0.168 0.000 0.000 0.752 0.000 0.080
#> SRR1394321 1 0.0820 0.85787 0.972 0.000 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1081160 2 0.1610 0.72281 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1469704 2 0.0858 0.72765 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1349342 1 0.0937 0.85669 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1477173 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0508 0.73376 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1390143 1 0.3816 0.51795 0.688 0.000 0.000 0.296 0.000 0.016
#> SRR1390413 2 0.0260 0.73801 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1099570 3 0.3224 0.66309 0.000 0.040 0.824 0.004 0.000 0.132
#> SRR1312169 4 0.2135 0.83702 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR1096687 4 0.2664 0.81902 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.1950 0.83289 0.912 0.000 0.000 0.024 0.000 0.064
#> SRR1470313 4 0.5304 0.76393 0.216 0.000 0.008 0.624 0.000 0.152
#> SRR1447893 2 0.5228 0.40900 0.000 0.572 0.308 0.000 0.000 0.120
#> SRR1466025 2 0.6515 -0.45051 0.000 0.464 0.000 0.040 0.200 0.296
#> SRR1477429 4 0.2854 0.81156 0.208 0.000 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.5583 0.26403 0.000 0.340 0.520 0.004 0.000 0.136
#> SRR820689 1 0.1074 0.85913 0.960 0.000 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1451876 2 0.2814 0.70483 0.000 0.864 0.052 0.004 0.000 0.080
#> SRR1452537 2 0.0632 0.73834 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1383301 1 0.3215 0.79552 0.828 0.000 0.000 0.072 0.000 0.100
#> SRR1489328 2 0.4750 -0.22526 0.000 0.544 0.020 0.008 0.008 0.420
#> SRR1344462 1 0.1958 0.83995 0.896 0.000 0.000 0.100 0.000 0.004
#> SRR1082709 4 0.3862 0.17479 0.476 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.1364 0.85183 0.944 0.000 0.004 0.004 0.000 0.048
#> SRR1355769 4 0.2320 0.83961 0.132 0.000 0.000 0.864 0.000 0.004
#> SRR1488237 2 0.2320 0.63954 0.000 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1391985 2 0.0146 0.73806 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478501 1 0.1779 0.83980 0.920 0.000 0.000 0.016 0.000 0.064
#> SRR1480917 5 0.3927 0.43187 0.000 0.196 0.036 0.000 0.756 0.012
#> SRR1474485 1 0.3626 0.75480 0.788 0.000 0.000 0.068 0.000 0.144
#> SRR1089998 1 0.1802 0.85257 0.916 0.000 0.000 0.072 0.000 0.012
#> SRR1318140 1 0.3023 0.70711 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.5011 0.47772 0.000 0.616 0.272 0.000 0.000 0.112
#> SRR1095188 2 0.1989 0.72911 0.000 0.916 0.028 0.004 0.000 0.052
#> SRR1454350 1 0.2060 0.82119 0.900 0.000 0.000 0.016 0.000 0.084
#> SRR1440374 1 0.1807 0.84947 0.920 0.000 0.000 0.060 0.000 0.020
#> SRR1359565 3 0.4053 0.61823 0.000 0.104 0.764 0.004 0.000 0.128
#> SRR1105417 4 0.3587 0.83246 0.188 0.000 0.000 0.772 0.000 0.040
#> SRR1325578 5 0.5566 0.12191 0.000 0.340 0.060 0.008 0.564 0.028
#> SRR1358161 5 0.4797 0.08751 0.000 0.000 0.460 0.016 0.500 0.024
#> SRR1358665 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.3860 -0.10912 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR1452010 4 0.2389 0.83885 0.128 0.000 0.000 0.864 0.000 0.008
#> SRR1418183 2 0.5258 0.49719 0.000 0.612 0.244 0.004 0.000 0.140
#> SRR1366345 1 0.2088 0.82979 0.904 0.000 0.000 0.028 0.000 0.068
#> SRR1387449 1 0.2053 0.83686 0.888 0.000 0.000 0.108 0.000 0.004
#> SRR1473461 4 0.5478 0.57518 0.352 0.000 0.000 0.512 0.000 0.136
#> SRR1090837 2 0.5598 0.11694 0.000 0.464 0.408 0.004 0.000 0.124
#> SRR1447828 3 0.1826 0.70029 0.000 0.000 0.924 0.020 0.004 0.052
#> SRR1338747 2 0.0260 0.73578 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333038 3 0.4081 0.61225 0.000 0.152 0.768 0.016 0.000 0.064
#> SRR1350280 4 0.2491 0.83305 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.1908 0.84355 0.900 0.000 0.000 0.096 0.000 0.004
#> SRR1102656 2 0.0806 0.73227 0.000 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1441443 2 0.2989 0.63164 0.000 0.824 0.008 0.004 0.004 0.160
#> SRR1370682 3 0.1594 0.70377 0.000 0.000 0.932 0.016 0.000 0.052
#> SRR1475448 2 0.5562 0.22291 0.000 0.496 0.376 0.004 0.000 0.124
#> SRR1407291 4 0.2597 0.82984 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.1531 0.85375 0.928 0.000 0.000 0.068 0.000 0.004
#> SRR1363766 4 0.4456 0.22683 0.448 0.000 0.000 0.524 0.000 0.028
#> SRR1082592 6 0.6367 0.53285 0.000 0.288 0.000 0.016 0.268 0.428
#> SRR1325794 2 0.4557 0.63208 0.000 0.756 0.060 0.000 0.108 0.076
#> SRR1095961 3 0.4408 0.47842 0.000 0.244 0.692 0.004 0.000 0.060
#> SRR1086702 2 0.1327 0.72960 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1320806 2 0.4794 0.57986 0.000 0.684 0.176 0.004 0.000 0.136
#> SRR1457527 3 0.0458 0.70852 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098831 2 0.0260 0.73853 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474374 3 0.2051 0.69258 0.000 0.004 0.896 0.004 0.000 0.096
#> SRR1488858 4 0.5069 0.76159 0.228 0.000 0.000 0.628 0.000 0.144
#> SRR1454695 1 0.0717 0.85935 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1090241 2 0.3261 0.67683 0.000 0.824 0.072 0.000 0.000 0.104
#> SRR1329863 2 0.0508 0.73392 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1357733 1 0.1225 0.84958 0.952 0.000 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1362135 1 0.3293 0.77938 0.812 0.000 0.000 0.048 0.000 0.140
#> SRR1379581 3 0.2006 0.69077 0.000 0.000 0.904 0.016 0.000 0.080
#> SRR1309182 4 0.2340 0.83719 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.2346 0.81676 0.868 0.000 0.000 0.008 0.000 0.124
#> SRR1084742 5 0.4697 0.28253 0.000 0.108 0.000 0.004 0.688 0.200
#> SRR1433538 4 0.2946 0.84073 0.176 0.000 0.000 0.812 0.000 0.012
#> SRR1085063 2 0.1265 0.71742 0.000 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1454247 5 0.1007 0.63057 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1097100 2 0.0458 0.73872 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR818622 2 0.4908 0.55158 0.000 0.664 0.208 0.004 0.000 0.124
#> SRR1072388 1 0.2750 0.80188 0.844 0.000 0.000 0.020 0.000 0.136
#> SRR1070332 2 0.5365 -0.28056 0.000 0.552 0.000 0.004 0.332 0.112
#> SRR1320761 5 0.6107 0.03904 0.000 0.360 0.076 0.000 0.496 0.068
#> SRR1076195 4 0.6043 0.68061 0.128 0.000 0.092 0.612 0.000 0.168
#> SRR1069895 2 0.5219 0.48234 0.000 0.608 0.264 0.004 0.000 0.124
#> SRR1099144 1 0.3930 0.72288 0.764 0.000 0.000 0.092 0.000 0.144
#> SRR1385150 3 0.5591 0.10319 0.000 0.400 0.472 0.004 0.000 0.124
#> SRR1420191 2 0.0458 0.73872 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1332625 4 0.4955 0.77256 0.220 0.000 0.000 0.644 0.000 0.136
#> SRR1102583 4 0.2883 0.79615 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.3416 0.77272 0.804 0.000 0.000 0.056 0.000 0.140
#> SRR1340574 1 0.1682 0.83969 0.928 0.000 0.000 0.020 0.000 0.052
#> SRR1444830 2 0.4531 0.61033 0.000 0.716 0.140 0.004 0.000 0.140
#> SRR1096267 1 0.0777 0.85858 0.972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1087127 5 0.1657 0.61678 0.000 0.000 0.056 0.000 0.928 0.016
#> SRR1408553 4 0.1788 0.80134 0.076 0.000 0.000 0.916 0.004 0.004
#> SRR1069231 1 0.4570 0.46471 0.644 0.000 0.000 0.292 0.000 0.064
#> SRR1325642 2 0.3043 0.54509 0.000 0.792 0.000 0.008 0.000 0.200
#> SRR1362103 1 0.1151 0.85463 0.956 0.000 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR1321942 1 0.1088 0.85988 0.960 0.000 0.000 0.016 0.000 0.024
#> SRR1094380 1 0.1391 0.84411 0.944 0.000 0.000 0.016 0.000 0.040
#> SRR1447499 2 0.0865 0.72789 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1099330 2 0.3790 0.64876 0.000 0.780 0.104 0.000 0.000 0.116
#> SRR1077874 2 0.2100 0.64755 0.000 0.884 0.000 0.000 0.112 0.004
#> SRR808299 2 0.0458 0.73872 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098050 5 0.0767 0.62993 0.000 0.008 0.000 0.012 0.976 0.004
#> SRR1481238 2 0.5138 0.60510 0.000 0.708 0.112 0.004 0.048 0.128
#> SRR1443568 2 0.5000 0.54856 0.000 0.656 0.200 0.004 0.000 0.140
#> SRR1380249 4 0.4915 0.77647 0.208 0.000 0.000 0.652 0.000 0.140
#> SRR1080143 4 0.2378 0.83995 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.4989 0.76886 0.220 0.000 0.000 0.640 0.000 0.140
#> SRR1357042 1 0.4755 -0.20561 0.492 0.000 0.000 0.460 0.000 0.048
#> SRR1416025 2 0.1411 0.72749 0.000 0.936 0.004 0.000 0.000 0.060
#> SRR1431015 2 0.3053 0.65384 0.000 0.828 0.024 0.004 0.000 0.144
#> SRR1078709 2 0.4660 -0.19886 0.000 0.540 0.020 0.004 0.008 0.428
#> SRR813283 1 0.1003 0.85914 0.964 0.000 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1430226 2 0.0632 0.73099 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1070665 1 0.1257 0.85747 0.952 0.000 0.000 0.028 0.000 0.020
#> SRR1466927 2 0.0363 0.73875 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1347707 4 0.7315 -0.00284 0.036 0.008 0.072 0.416 0.100 0.368
#> SRR807679 1 0.1391 0.84746 0.944 0.000 0.000 0.016 0.000 0.040
#> SRR1333811 2 0.6672 0.18426 0.000 0.472 0.340 0.016 0.052 0.120
#> SRR1078660 6 0.5885 0.46586 0.000 0.420 0.012 0.004 0.120 0.444
#> SRR1331730 2 0.1471 0.70708 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1333913 1 0.2020 0.83459 0.896 0.000 0.000 0.008 0.000 0.096
#> SRR1432542 1 0.3570 0.76135 0.792 0.000 0.000 0.064 0.000 0.144
#> SRR1418041 1 0.1610 0.84930 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.1151 0.85886 0.956 0.000 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR1339812 2 0.0363 0.73875 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1402437 1 0.2983 0.79693 0.832 0.000 0.000 0.032 0.000 0.136
#> SRR1350958 2 0.0632 0.73853 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1396822 2 0.5007 0.53275 0.000 0.648 0.224 0.004 0.000 0.124
#> SRR1441934 2 0.3457 0.67775 0.000 0.808 0.052 0.004 0.000 0.136
#> SRR1472552 3 0.4003 0.60807 0.000 0.124 0.760 0.000 0.000 0.116
#> SRR1488881 3 0.2868 0.67745 0.000 0.032 0.852 0.004 0.000 0.112
#> SRR1102973 1 0.1408 0.85664 0.944 0.000 0.000 0.020 0.000 0.036
#> SRR1071131 2 0.4469 0.42631 0.000 0.668 0.276 0.004 0.000 0.052
#> SRR1074502 1 0.1970 0.84114 0.900 0.000 0.000 0.092 0.000 0.008
#> SRR1325271 1 0.4316 0.67068 0.728 0.000 0.000 0.128 0.000 0.144
#> SRR1409171 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0363 0.73899 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1430045 2 0.1411 0.70852 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1441245 2 0.1765 0.68567 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1384091 4 0.4774 0.78941 0.192 0.000 0.000 0.672 0.000 0.136
#> SRR1431887 2 0.1349 0.71196 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1096525 4 0.1793 0.75344 0.036 0.000 0.000 0.928 0.032 0.004
#> SRR1488491 2 0.0547 0.73872 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1356351 2 0.4864 0.19089 0.000 0.584 0.024 0.000 0.364 0.028
#> SRR1369514 4 0.2896 0.84338 0.160 0.000 0.000 0.824 0.000 0.016
#> SRR1453299 3 0.2436 0.68757 0.000 0.088 0.880 0.000 0.000 0.032
#> SRR1436300 1 0.0725 0.85937 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1348490 5 0.0547 0.63629 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1091767 2 0.4292 -0.17767 0.000 0.568 0.004 0.008 0.004 0.416
#> SRR1354467 3 0.3000 0.67060 0.000 0.032 0.840 0.004 0.000 0.124
#> SRR1069074 2 0.2510 0.70396 0.000 0.872 0.028 0.000 0.000 0.100
#> SRR1452399 2 0.4264 0.61256 0.000 0.744 0.124 0.004 0.000 0.128
#> SRR1437430 3 0.3036 0.68537 0.000 0.028 0.860 0.020 0.004 0.088
#> SRR1419736 5 0.0603 0.63456 0.000 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1313343 3 0.1528 0.70483 0.000 0.000 0.936 0.016 0.000 0.048
#> SRR1077619 4 0.5252 0.72374 0.264 0.000 0.000 0.592 0.000 0.144
#> SRR1083530 1 0.3997 0.71678 0.760 0.000 0.000 0.108 0.000 0.132
#> SRR1333633 5 0.6484 0.21349 0.000 0.252 0.152 0.000 0.524 0.072
#> SRR1354999 2 0.5148 0.52257 0.000 0.632 0.224 0.004 0.000 0.140
#> SRR1443592 2 0.1082 0.72138 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1077356 1 0.1387 0.85304 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.0767 0.62324 0.000 0.000 0.012 0.004 0.976 0.008
#> SRR1413182 4 0.4095 0.81955 0.152 0.000 0.000 0.748 0.000 0.100
#> SRR1464559 4 0.5760 0.74057 0.228 0.000 0.024 0.588 0.000 0.160
#> SRR1413075 5 0.1838 0.61080 0.000 0.068 0.000 0.000 0.916 0.016
#> SRR1487928 4 0.5544 0.73019 0.112 0.000 0.060 0.656 0.000 0.172
#> SRR1388997 2 0.3274 0.53839 0.000 0.780 0.004 0.004 0.004 0.208
#> SRR1092865 2 0.4079 0.64529 0.000 0.760 0.096 0.004 0.000 0.140
#> SRR1102729 1 0.4059 0.63094 0.720 0.000 0.000 0.228 0.000 0.052
#> SRR1456423 1 0.1204 0.85695 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.1700 0.69428 0.000 0.916 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR1376874 3 0.1657 0.70263 0.000 0.000 0.928 0.016 0.000 0.056
#> SRR1339903 1 0.3265 0.67682 0.748 0.000 0.000 0.248 0.000 0.004
#> SRR1346710 1 0.2383 0.82835 0.880 0.000 0.000 0.024 0.000 0.096
#> SRR1418771 2 0.0458 0.73380 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1095358 2 0.3762 0.66265 0.000 0.800 0.080 0.000 0.012 0.108
#> SRR1480941 2 0.7079 0.30854 0.088 0.552 0.124 0.040 0.004 0.192
#> SRR1479175 2 0.0146 0.73834 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313891 2 0.2703 0.58406 0.000 0.824 0.000 0.000 0.004 0.172
#> SRR1491354 4 0.3993 0.25620 0.476 0.000 0.000 0.520 0.000 0.004
#> SRR1433884 2 0.3886 0.67097 0.000 0.776 0.080 0.004 0.000 0.140
#> SRR1471074 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2425 0.72046 0.000 0.884 0.024 0.004 0.000 0.088
#> SRR1355554 2 0.5336 0.47586 0.000 0.596 0.260 0.004 0.000 0.140
#> SRR1487173 1 0.1682 0.83969 0.928 0.000 0.000 0.020 0.000 0.052
#> SRR1474253 1 0.1531 0.85350 0.928 0.000 0.000 0.068 0.000 0.004
#> SRR1322918 2 0.3221 0.51563 0.000 0.772 0.000 0.004 0.004 0.220
#> SRR1318331 2 0.1204 0.72584 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1321333 3 0.2243 0.68535 0.000 0.004 0.880 0.004 0.000 0.112
#> SRR1474231 1 0.0820 0.85716 0.972 0.000 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1350545 1 0.3601 0.54646 0.684 0.000 0.000 0.312 0.000 0.004
#> SRR1091328 1 0.2909 0.79894 0.836 0.000 0.000 0.028 0.000 0.136
#> SRR814447 3 0.2454 0.67754 0.000 0.000 0.884 0.020 0.008 0.088
#> SRR1455989 2 0.3469 0.66765 0.000 0.808 0.088 0.000 0.000 0.104
#> SRR1453680 3 0.1719 0.70096 0.000 0.000 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR1470356 2 0.1531 0.72939 0.000 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1342977 2 0.0000 0.73743 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.1663 0.72624 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1097197 1 0.4097 -0.06786 0.500 0.000 0.000 0.492 0.000 0.008
#> SRR1366729 3 0.1265 0.70872 0.000 0.000 0.948 0.008 0.000 0.044
#> SRR821282 3 0.1719 0.70114 0.000 0.000 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR1074602 2 0.4451 0.61124 0.000 0.724 0.148 0.004 0.000 0.124
#> SRR814633 2 0.0790 0.73718 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1072480 5 0.7535 0.28749 0.000 0.140 0.248 0.044 0.464 0.104
#> SRR1319100 1 0.1700 0.85490 0.928 0.000 0.000 0.024 0.000 0.048
#> SRR1324004 2 0.5571 0.34992 0.000 0.532 0.324 0.004 0.000 0.140
#> SRR1457459 1 0.2221 0.82610 0.896 0.000 0.000 0.032 0.000 0.072
#> SRR1421031 4 0.4716 0.79403 0.184 0.000 0.000 0.680 0.000 0.136
#> SRR1444598 5 0.3469 0.55116 0.000 0.000 0.032 0.020 0.816 0.132
#> SRR1091743 2 0.4277 0.61533 0.000 0.732 0.144 0.000 0.000 0.124
#> SRR819637 1 0.1010 0.85618 0.960 0.000 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1083848 1 0.1074 0.85809 0.960 0.000 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1088934 2 0.5200 0.48776 0.000 0.612 0.260 0.004 0.000 0.124
#> SRR1459785 3 0.1806 0.70070 0.000 0.000 0.908 0.004 0.000 0.088
#> SRR1083700 1 0.0790 0.85684 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1375531 4 0.3566 0.81896 0.224 0.000 0.000 0.752 0.000 0.024
#> SRR1323470 4 0.6509 0.31887 0.040 0.016 0.208 0.564 0.004 0.168
#> SRR814657 4 0.2300 0.83825 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.991 0.997 0.4916 0.509 0.509
#> 3 3 1.000 0.981 0.989 0.0312 0.977 0.955
#> 4 4 0.958 0.954 0.969 0.0395 0.998 0.996
#> 5 5 0.859 0.827 0.918 0.0933 0.943 0.884
#> 6 6 0.851 0.683 0.827 0.0338 0.923 0.828
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.9850 0.2526 0.572 0.428
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.5519 0.8518 0.128 0.872
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0376 0.9936 0.004 0.996
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.2043 0.9632 0.968 0.032
#> SRR1308734 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.2778 0.9479 0.048 0.952
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1315291 2 0.9988 0.0714 0.480 0.520
#> SRR1309314 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.2043 0.9650 0.032 0.968
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.9850 0.2526 0.572 0.428
#> SRR814657 1 0.0000 0.9958 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.6621 0.384 0.284 0.032 0.684
#> SRR1326059 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1469926 2 0.2796 0.849 0.000 0.908 0.092
#> SRR1070036 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1329947 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402944 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1464880 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1354203 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486821 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1080648 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1469080 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1321829 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349300 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1401146 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1391811 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1384431 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344034 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.0237 0.992 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347870 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1487969 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443350 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1102923 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396035 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.8534 0.722 0.116 0.320 0.564
#> SRR1431735 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1446308 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1319584 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0237 0.992 0.996 0.000 0.004
#> SRR813536 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1317939 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1400799 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1312226 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1445023 1 0.0237 0.992 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077599 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.6095 0.709 0.000 0.392 0.608
#> SRR1436949 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1432408 1 0.1031 0.977 0.976 0.000 0.024
#> SRR1310334 1 0.0237 0.992 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418201 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385434 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1415591 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.1860 0.948 0.948 0.000 0.052
#> SRR1308734 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0237 0.992 0.996 0.000 0.004
#> SRR1392141 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323651 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR818170 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1091230 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317731 2 0.0747 0.974 0.000 0.984 0.016
#> SRR1490785 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1447808 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101513 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480263 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068929 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0237 0.992 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309333 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1093172 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1413137 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1469973 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416266 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1071011 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435394 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1419962 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.5058 0.472 0.000 0.756 0.244
#> SRR1356016 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473891 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474930 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR811915 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.4750 0.559 0.000 0.784 0.216
#> SRR1315780 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.6818 0.748 0.024 0.348 0.628
#> SRR1325826 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1345692 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0747 0.986 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454073 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1361436 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 1 0.9601 -0.261 0.456 0.216 0.328
#> SRR1309314 3 0.6309 0.536 0.000 0.496 0.504
#> SRR1420085 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339276 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1394321 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081160 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1096687 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1447893 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR820689 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0237 0.992 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082709 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1447784 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355769 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488237 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1418183 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1088557 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1405266 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1082592 2 0.1289 0.950 0.000 0.968 0.032
#> SRR1325794 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1454695 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379581 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1437668 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1084742 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433538 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1085063 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1070332 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069895 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385150 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102583 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1340574 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408553 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1069231 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1481238 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1080143 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1383148 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357042 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416025 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.5810 0.748 0.000 0.336 0.664
#> SRR807679 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418041 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1409171 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1430045 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1431887 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488491 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1453299 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0237 0.990 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354467 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.0747 0.974 0.000 0.984 0.016
#> SRR1419736 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.0237 0.993 0.996 0.000 0.004
#> SRR1083530 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333633 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413182 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1464559 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1413075 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.0592 0.989 0.988 0.000 0.012
#> SRR1388997 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.4861 0.623 0.012 0.808 0.180
#> SRR1479175 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR814447 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.5810 0.748 0.000 0.336 0.664
#> SRR1319100 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0424 0.991 0.992 0.000 0.008
#> SRR1444598 3 0.6309 0.525 0.000 0.500 0.500
#> SRR1091743 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.6621 0.384 0.284 0.032 0.684
#> SRR814657 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.3942 1.00000 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1326059 1 0.1389 0.95108 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1409062 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1465313 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819559 1 0.0921 0.95431 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1387899 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.1118 0.95305 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1395635 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1343629 1 0.0469 0.95314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1326868 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.1867 0.94504 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1469926 2 0.2408 0.87536 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1070036 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098426 1 0.0469 0.95322 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1090310 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.1022 0.95524 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1363654 1 0.1022 0.95703 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1326317 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.2760 0.91501 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1329947 1 0.0707 0.95494 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1469769 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1093552 1 0.0921 0.95330 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1464880 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1310777 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.1389 0.95126 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1329994 1 0.2760 0.91501 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1354203 1 0.0817 0.95221 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077850 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1369241 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.1118 0.95326 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1092014 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.1302 0.95256 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1473318 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1345974 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.1211 0.95476 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1486821 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1408788 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.3266 0.88413 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1080648 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1414708 1 0.1302 0.95271 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1469080 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.2408 0.93174 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1321829 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0817 0.95354 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077575 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349300 1 0.1557 0.94816 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1374165 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453769 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.2408 0.92936 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1401146 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.2589 0.92420 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1391811 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456674 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1086490 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.2704 0.91978 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1384431 1 0.1389 0.95349 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1072055 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1359738 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1085900 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0707 0.95494 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1431625 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.1792 0.94542 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1347870 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1102128 1 0.0921 0.95431 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1460211 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.2469 0.92782 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1487969 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.1389 0.95164 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1443350 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.1118 0.95438 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1076705 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079380 2 0.0336 0.98708 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.3307 -0.00243 0.104 0.000 0.868 0.028
#> SRR1431735 1 0.1557 0.95057 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1417387 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1445984 1 0.0469 0.95321 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1370447 1 0.3266 0.88413 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1446308 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1468914 1 0.3123 0.89690 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1319584 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.1637 0.94707 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR813536 1 0.3024 0.90282 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1317939 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.1022 0.95539 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1341921 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1399178 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0707 0.95494 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1328551 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.3219 0.88971 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1400799 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.2281 0.93479 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1312226 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0921 0.95025 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1447371 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1069328 1 0.3123 0.89690 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1445023 1 0.2647 0.91995 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1077599 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1074839 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.2053 0.18258 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1436949 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.2216 0.93582 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1432408 1 0.2589 0.91789 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1310334 1 0.1557 0.94880 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1418201 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 1 0.3123 0.89690 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1415591 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0921 0.95431 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1316055 1 0.3082 0.92301 0.884 0.000 0.032 0.084
#> SRR1308734 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.1716 0.94582 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1392141 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR814341 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1370818 1 0.2345 0.93403 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1323651 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.2281 0.93353 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR818170 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1095285 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1317731 2 0.0707 0.97443 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1490785 1 0.0921 0.95431 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1432032 1 0.0817 0.95551 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1447808 1 0.1118 0.95305 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR809534 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1101513 1 0.1716 0.94902 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1415708 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.0469 0.95321 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1080044 1 0.0817 0.95548 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1420850 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1940 0.94336 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1069871 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1095744 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1075458 1 0.0469 0.95322 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417023 1 0.1637 0.95064 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1309333 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.1022 0.95524 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1352996 1 0.2216 0.93582 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1093172 1 0.3123 0.89496 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1413137 1 0.3123 0.89496 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1469973 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.2704 0.91795 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1416266 1 0.3266 0.88413 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1071011 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.2530 0.92604 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1435394 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.3123 0.89496 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1419962 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1081639 2 0.4994 -0.00624 0.000 0.520 0.480 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.1302 0.95271 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1473891 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.2011 0.94107 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1474930 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.3024 0.90282 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR811915 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1100005 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.4916 0.20229 0.000 0.576 0.424 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.1118 0.95372 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR819124 1 0.1474 0.95350 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1310997 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.1557 0.94816 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1378220 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1348885 3 0.2742 0.14072 0.008 0.040 0.912 0.040
#> SRR1325826 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1466812 1 0.2469 0.92782 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1345692 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.1557 0.95057 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1374396 1 0.2814 0.91251 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1454073 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1429368 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0817 0.95551 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1361436 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.6299 0.01752 0.420 0.000 0.520 0.060
#> SRR1309314 3 0.3528 0.23373 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.1637 0.94836 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1380482 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079480 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1339276 1 0.0707 0.95472 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1418368 1 0.1118 0.95461 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1399353 1 0.0921 0.95025 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1096760 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.2760 0.91501 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1394321 1 0.0817 0.95551 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1081160 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1477173 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0921 0.95431 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1390413 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.2281 0.93353 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1096687 1 0.1302 0.95283 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1486139 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1470313 1 0.2868 0.91381 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1447893 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.1557 0.95402 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1445701 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR820689 1 0.1211 0.95353 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1451876 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1118 0.95513 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1489328 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.1716 0.94644 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1082709 1 0.1716 0.94591 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1447784 1 0.0921 0.95330 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1355769 1 0.3024 0.90282 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1488237 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1480917 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.0707 0.95564 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1089998 1 0.0817 0.95381 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1318140 1 0.1474 0.95150 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1319262 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1440374 1 0.1118 0.95299 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1359565 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.1716 0.94902 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1325578 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.2530 0.92753 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1418183 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1387449 1 0.1118 0.95299 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1473461 1 0.0921 0.95431 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1090837 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.2011 0.94073 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1088557 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1102656 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.2281 0.93347 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1405266 1 0.1022 0.95391 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1363766 1 0.1716 0.94681 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1082592 2 0.2149 0.89586 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.1792 0.94749 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1454695 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1090241 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1362135 1 0.0817 0.95551 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1379581 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.2011 0.94073 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1437668 1 0.0921 0.95330 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1084742 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1433538 1 0.2281 0.93353 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1085063 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0921 0.95595 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1070332 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.2589 0.92420 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1069895 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0817 0.95564 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1385150 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.2530 0.92613 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1102583 1 0.1637 0.94844 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1456971 1 0.0817 0.95551 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1340574 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1444830 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1087127 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408553 1 0.2973 0.90506 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1069231 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1325642 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1321942 1 0.0707 0.95472 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1094380 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447499 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0188 0.99086 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.2589 0.92420 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1080143 1 0.2081 0.94094 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1383148 1 0.2530 0.92613 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1357042 1 0.1474 0.95360 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1416025 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1430226 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1466927 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.0188 0.00823 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR807679 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333811 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432542 1 0.0921 0.95595 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1418041 1 0.0469 0.95548 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085211 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1339812 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0817 0.95221 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1350958 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0921 0.95025 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1071131 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.1022 0.95372 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1325271 1 0.0921 0.95595 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1409171 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.2589 0.92381 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1431887 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.3266 0.88413 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1488491 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.2345 0.93243 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1453299 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1348490 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0188 0.99087 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.0707 0.97443 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.1022 0.95566 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1083530 1 0.1211 0.95598 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1333633 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1118 0.95305 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1378818 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413182 1 0.2760 0.91501 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1464559 1 0.1389 0.95164 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1413075 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.2760 0.91501 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1388997 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.1557 0.95057 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1456423 1 0.1118 0.95326 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1321591 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.1302 0.95380 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1346710 1 0.0469 0.95322 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418771 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.4459 0.69873 0.000 0.780 0.188 0.032
#> SRR1479175 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1433884 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1474253 1 0.1022 0.95391 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1322918 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0592 0.95437 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1350545 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1091328 1 0.0817 0.95564 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR814447 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.1211 0.95210 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1366729 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821282 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0188 0.00823 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319100 1 0.0707 0.95344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1324004 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1421031 1 0.3123 0.89690 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1444598 3 0.3569 0.23100 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1083848 1 0.0592 0.95226 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1088934 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.99451 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.1022 0.95001 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1375531 1 0.0921 0.95641 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1323470 4 0.3942 1.00000 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR814657 1 0.1474 0.95004 0.948 0.000 0.000 0.052
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.1608 1.00000 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1326059 1 0.3636 0.58915 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.3109 0.70070 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819559 1 0.2177 0.79004 0.908 0.000 0.008 0.080 0.004
#> SRR1387899 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.2929 0.71766 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1395635 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1343629 1 0.0290 0.79994 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.3607 0.65345 0.752 0.000 0.004 0.244 0.000
#> SRR1469926 2 0.2074 0.87430 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1070036 1 0.0671 0.80291 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1098426 1 0.0579 0.79812 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.3544 0.69932 0.788 0.000 0.008 0.200 0.004
#> SRR1363654 1 0.2848 0.75689 0.840 0.000 0.004 0.156 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.4359 0.68248 0.304 0.000 0.008 0.680 0.008
#> SRR1329947 1 0.0963 0.80412 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402944 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0162 0.79545 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1093552 1 0.1430 0.79607 0.944 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1464880 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.2329 0.77029 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1329994 4 0.4470 0.66170 0.328 0.000 0.008 0.656 0.008
#> SRR1354203 1 0.1399 0.80137 0.952 0.000 0.020 0.028 0.000
#> SRR1077850 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.1331 0.79396 0.952 0.000 0.008 0.040 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.2793 0.78172 0.876 0.000 0.036 0.088 0.000
#> SRR1473318 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4553 0.21668 0.604 0.000 0.008 0.384 0.004
#> SRR1486821 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.1121 0.79807 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359487 4 0.3209 0.60422 0.180 0.000 0.008 0.812 0.000
#> SRR1080648 1 0.0404 0.79681 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1414708 1 0.2302 0.78339 0.904 0.000 0.008 0.080 0.008
#> SRR1469080 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.4591 0.34088 0.648 0.000 0.008 0.332 0.012
#> SRR1321829 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.1412 0.80540 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1077575 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349300 1 0.3684 0.57393 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1374165 1 0.2179 0.76603 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.4249 0.12649 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.4639 0.63398 0.344 0.000 0.008 0.636 0.012
#> SRR1391811 1 0.0324 0.79663 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1456674 1 0.1741 0.79790 0.936 0.000 0.024 0.040 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.4821 -0.15024 0.516 0.000 0.020 0.464 0.000
#> SRR1384431 1 0.3003 0.72229 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1072055 1 0.2389 0.77115 0.880 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.1661 0.79778 0.940 0.000 0.024 0.036 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0963 0.80412 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1431625 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1344034 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.3857 0.52295 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0162 0.79628 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102128 1 0.3328 0.72852 0.812 0.000 0.008 0.176 0.004
#> SRR1460211 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070060 4 0.4425 0.36710 0.452 0.000 0.004 0.544 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3764 0.66544 0.772 0.000 0.008 0.212 0.008
#> SRR1443350 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.2020 0.78945 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1076705 1 0.0324 0.79600 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1079380 2 0.0290 0.98699 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102923 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396035 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 5 0.5077 0.16376 0.040 0.000 0.128 0.084 0.748
#> SRR1431735 1 0.2676 0.78103 0.884 0.000 0.036 0.080 0.000
#> SRR1417387 1 0.0510 0.80124 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1445984 1 0.0955 0.80376 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1370447 4 0.1485 0.32655 0.020 0.000 0.032 0.948 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0162 0.79545 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0290 0.80002 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1468914 4 0.4555 0.67374 0.224 0.000 0.056 0.720 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.3274 0.67371 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR813536 4 0.4134 0.67133 0.224 0.000 0.032 0.744 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.2127 0.78007 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1341921 1 0.3612 0.60088 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0963 0.80412 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335314 4 0.3995 0.58480 0.152 0.000 0.060 0.788 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.4242 0.14892 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.1216 0.79909 0.960 0.000 0.020 0.020 0.000
#> SRR1447371 1 0.1661 0.79778 0.940 0.000 0.024 0.036 0.000
#> SRR1069328 4 0.4496 0.67094 0.216 0.000 0.056 0.728 0.000
#> SRR1445023 4 0.4712 0.67738 0.268 0.000 0.048 0.684 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 5 0.3301 0.36151 0.000 0.072 0.080 0.000 0.848
#> SRR1436949 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 4 0.4430 0.36223 0.456 0.000 0.004 0.540 0.000
#> SRR1432408 1 0.5734 0.17869 0.620 0.000 0.044 0.296 0.040
#> SRR1310334 1 0.3242 0.68073 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.4666 0.68015 0.240 0.000 0.056 0.704 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.1717 0.79280 0.936 0.000 0.008 0.052 0.004
#> SRR1316055 1 0.4661 0.57090 0.744 0.000 0.008 0.180 0.068
#> SRR1308734 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.4256 0.06838 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1392141 1 0.1741 0.79790 0.936 0.000 0.024 0.040 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.2482 0.78801 0.892 0.000 0.024 0.084 0.000
#> SRR1370818 1 0.4358 0.47482 0.696 0.000 0.008 0.284 0.012
#> SRR1323651 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 4 0.4425 0.37466 0.452 0.000 0.004 0.544 0.000
#> SRR818170 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091230 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0162 0.79628 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095285 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317731 2 0.0609 0.97425 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1490785 1 0.1717 0.79280 0.936 0.000 0.008 0.052 0.004
#> SRR1432032 1 0.1924 0.79360 0.924 0.000 0.008 0.064 0.004
#> SRR1447808 1 0.3561 0.61058 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1101513 1 0.3141 0.75567 0.852 0.000 0.040 0.108 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480263 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.0609 0.80253 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1080044 1 0.2771 0.76973 0.860 0.000 0.012 0.128 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.5157 0.46549 0.440 0.000 0.040 0.520 0.000
#> SRR1069871 1 0.3561 0.61011 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1095744 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1068929 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075458 1 0.0693 0.79726 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1417023 1 0.5108 -0.10832 0.548 0.000 0.024 0.420 0.008
#> SRR1309333 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.3509 0.70445 0.792 0.000 0.008 0.196 0.004
#> SRR1352996 4 0.4430 0.36223 0.456 0.000 0.004 0.540 0.000
#> SRR1093172 4 0.1124 0.39873 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1413137 4 0.1124 0.39873 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.4487 0.65734 0.332 0.000 0.008 0.652 0.008
#> SRR1416266 4 0.0898 0.34728 0.020 0.000 0.008 0.972 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.4564 0.56949 0.388 0.000 0.008 0.600 0.004
#> SRR1435394 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 4 0.2930 0.58053 0.164 0.000 0.004 0.832 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.2074 0.77733 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1081639 2 0.4302 -0.02907 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1356016 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.3252 0.69246 0.828 0.000 0.008 0.156 0.008
#> SRR1473891 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.4541 0.29780 0.608 0.000 0.008 0.380 0.004
#> SRR1474930 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470988 4 0.3977 0.66991 0.204 0.000 0.032 0.764 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0290 0.80002 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.4235 0.18674 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1315780 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.3210 0.68517 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR819124 1 0.3884 0.56492 0.708 0.000 0.004 0.288 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.2424 0.76565 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0865 0.80298 0.972 0.000 0.004 0.024 0.000
#> SRR1348885 5 0.1605 0.33187 0.000 0.040 0.004 0.012 0.944
#> SRR1325826 1 0.3074 0.70062 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1466812 1 0.4321 0.26017 0.600 0.000 0.004 0.396 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.2676 0.78103 0.884 0.000 0.036 0.080 0.000
#> SRR1374396 4 0.3966 0.67762 0.224 0.000 0.012 0.756 0.008
#> SRR1454073 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.1990 0.79332 0.920 0.000 0.008 0.068 0.004
#> SRR1361436 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 5 0.6421 -0.00601 0.244 0.000 0.012 0.184 0.560
#> SRR1309314 5 0.3039 0.33303 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1420085 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.4451 -0.22348 0.504 0.000 0.004 0.492 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0162 0.79859 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079480 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339276 1 0.0609 0.80285 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1418368 1 0.3579 0.64463 0.756 0.000 0.004 0.240 0.000
#> SRR1399353 1 0.1568 0.80114 0.944 0.000 0.020 0.036 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.4378 0.67877 0.308 0.000 0.008 0.676 0.008
#> SRR1394321 1 0.1924 0.79283 0.924 0.000 0.008 0.064 0.004
#> SRR1081160 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.79633 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.3675 0.69059 0.772 0.000 0.008 0.216 0.004
#> SRR1390413 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 4 0.4420 0.38559 0.448 0.000 0.004 0.548 0.000
#> SRR1096687 1 0.3966 0.43092 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1486139 1 0.0963 0.80152 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1470313 1 0.5281 -0.12749 0.548 0.000 0.052 0.400 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.4774 0.24714 0.612 0.000 0.028 0.360 0.000
#> SRR1445701 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR820689 1 0.2890 0.73872 0.836 0.000 0.004 0.160 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1502 0.80279 0.940 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.3305 0.67078 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1082709 1 0.3684 0.57781 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1447784 1 0.2848 0.65183 0.840 0.000 0.000 0.156 0.004
#> SRR1355769 4 0.4221 0.67665 0.236 0.000 0.032 0.732 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1661 0.79778 0.940 0.000 0.024 0.036 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.3671 0.59243 0.756 0.000 0.008 0.236 0.000
#> SRR1089998 1 0.0703 0.80406 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1318140 1 0.2230 0.77619 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1440374 1 0.2773 0.73481 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.5178 -0.37675 0.480 0.000 0.040 0.480 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.4538 0.01009 0.540 0.000 0.000 0.452 0.008
#> SRR1418183 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1387449 1 0.2891 0.72404 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1473461 1 0.2116 0.79216 0.912 0.000 0.008 0.076 0.004
#> SRR1090837 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.4074 0.37957 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1088557 1 0.3534 0.62077 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 4 0.4306 0.23874 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1405266 1 0.1484 0.79355 0.944 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1363766 1 0.3730 0.56519 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1082592 2 0.1851 0.89501 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1325794 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.4777 -0.09585 0.548 0.000 0.008 0.436 0.008
#> SRR1454695 1 0.2930 0.73817 0.832 0.000 0.004 0.164 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0162 0.79628 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1362135 1 0.2116 0.79263 0.912 0.000 0.008 0.076 0.004
#> SRR1379581 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.4088 0.36760 0.632 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1437668 1 0.1430 0.79607 0.944 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1084742 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433538 4 0.4425 0.37466 0.452 0.000 0.004 0.544 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.2753 0.71209 0.856 0.000 0.008 0.136 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 4 0.4639 0.63398 0.344 0.000 0.008 0.636 0.012
#> SRR1069895 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.2694 0.70965 0.864 0.000 0.004 0.128 0.004
#> SRR1385150 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.4816 0.28537 0.484 0.000 0.008 0.500 0.008
#> SRR1102583 1 0.3274 0.67918 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1456971 1 0.3365 0.67506 0.808 0.000 0.008 0.180 0.004
#> SRR1340574 1 0.0162 0.79628 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0162 0.79628 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408553 4 0.2932 0.54905 0.104 0.000 0.032 0.864 0.000
#> SRR1069231 1 0.3366 0.66069 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0162 0.79694 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0510 0.80185 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1094380 1 0.1851 0.78444 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0162 0.99080 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1481238 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380249 4 0.4844 0.51068 0.416 0.000 0.008 0.564 0.012
#> SRR1080143 1 0.4101 0.45820 0.664 0.000 0.004 0.332 0.000
#> SRR1383148 4 0.4435 0.66681 0.320 0.000 0.008 0.664 0.008
#> SRR1357042 1 0.1965 0.79369 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0510 0.80254 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.2516 0.23094 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR807679 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1432542 1 0.2753 0.71209 0.856 0.000 0.008 0.136 0.000
#> SRR1418041 1 0.2929 0.72116 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1085211 1 0.1661 0.79778 0.940 0.000 0.024 0.036 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1800 0.80183 0.932 0.000 0.020 0.048 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.1485 0.80245 0.948 0.000 0.020 0.032 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.2891 0.72196 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1325271 1 0.2753 0.71209 0.856 0.000 0.008 0.136 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430045 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.4633 0.61132 0.372 0.000 0.008 0.612 0.008
#> SRR1431887 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0898 0.34728 0.020 0.000 0.008 0.972 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 4 0.4430 0.42259 0.456 0.000 0.004 0.540 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0162 0.99081 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354467 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.0609 0.97425 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1419736 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.4260 0.46740 0.680 0.000 0.008 0.308 0.004
#> SRR1083530 1 0.2116 0.79338 0.912 0.000 0.004 0.076 0.008
#> SRR1333633 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.4150 0.26012 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413182 4 0.4275 0.68893 0.288 0.000 0.008 0.696 0.008
#> SRR1464559 1 0.3918 0.58231 0.752 0.000 0.008 0.232 0.008
#> SRR1413075 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487928 4 0.4416 0.66602 0.316 0.000 0.008 0.668 0.008
#> SRR1388997 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.2905 0.76803 0.868 0.000 0.036 0.096 0.000
#> SRR1456423 1 0.1408 0.79569 0.948 0.000 0.008 0.044 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.3730 0.55955 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1346710 1 0.0579 0.79812 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.3274 0.69726 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1479175 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.3074 0.70062 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1474253 1 0.1484 0.79355 0.944 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.1341 0.80173 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1350545 1 0.3983 0.42470 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1091328 1 0.1116 0.80173 0.964 0.000 0.004 0.028 0.004
#> SRR814447 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.4192 0.20069 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.2516 0.23094 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1319100 1 0.0510 0.79806 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1421031 4 0.4496 0.67094 0.216 0.000 0.056 0.728 0.000
#> SRR1444598 5 0.3074 0.32845 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1091743 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0290 0.79479 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1083848 1 0.0162 0.79859 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.99448 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.1661 0.79778 0.940 0.000 0.024 0.036 0.000
#> SRR1375531 1 0.2670 0.79019 0.888 0.000 0.028 0.080 0.004
#> SRR1323470 3 0.1608 1.00000 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR814657 4 0.4306 0.25383 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 6 0.2664 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR1326059 4 0.3309 0.0886 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809406 4 0.3620 -0.1889 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819559 1 0.4453 0.7043 0.528 0.000 0.028 0.444 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 4 0.3706 -0.2804 0.380 0.000 0.000 0.620 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.3797 0.7999 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 4 0.3861 -0.0508 0.316 0.000 0.008 0.672 0.000 0.004
#> SRR1469926 2 0.2775 0.8436 0.040 0.856 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1070036 1 0.4147 0.7921 0.552 0.000 0.012 0.436 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.3993 0.8088 0.592 0.000 0.008 0.400 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 4 0.4524 -0.3073 0.404 0.000 0.036 0.560 0.000 0.000
#> SRR1363654 4 0.4057 -0.4373 0.436 0.000 0.008 0.556 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.5106 -0.6132 0.084 0.000 0.396 0.520 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.3847 0.7738 0.544 0.000 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0291 0.9821 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.3737 0.8035 0.608 0.000 0.000 0.392 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.4610 0.7360 0.568 0.000 0.044 0.388 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.3727 0.8042 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 4 0.3833 -0.5466 0.444 0.000 0.000 0.556 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.5378 -0.4116 0.132 0.000 0.324 0.544 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.4318 0.7594 0.532 0.000 0.020 0.448 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.3717 0.8015 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.4018 0.7775 0.580 0.000 0.008 0.412 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0458 0.9782 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.4879 0.6322 0.500 0.000 0.048 0.448 0.000 0.004
#> SRR1473318 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.5583 0.2505 0.208 0.000 0.244 0.548 0.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0937 0.9620 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.4482 0.7510 0.580 0.000 0.036 0.384 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359487 3 0.4598 0.5975 0.028 0.000 0.576 0.388 0.000 0.008
#> SRR1080648 1 0.3706 0.8034 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.4863 0.6804 0.528 0.000 0.060 0.412 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.6091 0.0467 0.280 0.000 0.344 0.376 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.4141 0.7796 0.556 0.000 0.012 0.432 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0146 0.9836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349300 4 0.3266 0.1113 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.5292 0.5251 0.520 0.000 0.108 0.372 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 4 0.2631 0.3543 0.128 0.000 0.012 0.856 0.000 0.004
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 3 0.5359 0.6708 0.108 0.000 0.460 0.432 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.3765 0.8044 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.4439 0.7403 0.540 0.000 0.028 0.432 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4595 0.3851 0.168 0.000 0.136 0.696 0.000 0.000
#> SRR1384431 4 0.3830 -0.2924 0.376 0.000 0.004 0.620 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.5034 0.5257 0.464 0.000 0.072 0.464 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.4372 0.7507 0.544 0.000 0.024 0.432 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.3847 0.7738 0.544 0.000 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0146 0.9828 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0146 0.9836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 4 0.4585 0.1591 0.284 0.000 0.068 0.648 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.3717 0.8020 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR1102128 4 0.4366 -0.4074 0.428 0.000 0.024 0.548 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070060 4 0.1148 0.3375 0.016 0.000 0.020 0.960 0.000 0.004
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 4 0.5810 -0.1071 0.380 0.000 0.184 0.436 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.4181 -0.6415 0.476 0.000 0.012 0.512 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.3862 0.8067 0.608 0.000 0.004 0.388 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0622 0.9754 0.012 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0146 0.9828 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 5 0.3104 0.2683 0.024 0.000 0.112 0.000 0.844 0.020
#> SRR1431735 1 0.4960 0.6747 0.516 0.000 0.056 0.424 0.000 0.004
#> SRR1417387 1 0.4168 0.8057 0.584 0.000 0.016 0.400 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.4218 0.7880 0.556 0.000 0.016 0.428 0.000 0.000
#> SRR1370447 3 0.4821 0.4340 0.036 0.000 0.484 0.472 0.000 0.008
#> SRR1446308 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.3872 0.8055 0.604 0.000 0.004 0.392 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.3797 0.8015 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1468914 3 0.5139 0.7131 0.056 0.000 0.516 0.416 0.000 0.012
#> SRR1319584 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486584 4 0.3592 -0.1516 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.4136 -0.4900 0.032 0.000 0.272 0.692 0.000 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 4 0.3854 -0.5992 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.3468 0.0646 0.284 0.000 0.004 0.712 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.3847 0.7738 0.544 0.000 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335314 3 0.4825 0.6575 0.036 0.000 0.560 0.392 0.000 0.012
#> SRR1400799 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074578 4 0.2846 0.3507 0.140 0.000 0.016 0.840 0.000 0.004
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.4305 0.7663 0.544 0.000 0.020 0.436 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.4377 0.7452 0.540 0.000 0.024 0.436 0.000 0.000
#> SRR1069328 3 0.5148 0.7125 0.056 0.000 0.508 0.424 0.000 0.012
#> SRR1445023 3 0.5348 0.6673 0.092 0.000 0.476 0.428 0.000 0.004
#> SRR1077599 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 5 0.1701 0.4397 0.000 0.072 0.008 0.000 0.920 0.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 4 0.0717 0.3362 0.008 0.000 0.016 0.976 0.000 0.000
#> SRR1432408 3 0.4991 -0.2168 0.424 0.000 0.520 0.012 0.000 0.044
#> SRR1310334 4 0.3578 -0.1386 0.340 0.000 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 3 0.5299 0.7091 0.072 0.000 0.520 0.396 0.000 0.012
#> SRR1415591 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.4192 0.7678 0.572 0.000 0.016 0.412 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.7052 -0.0744 0.348 0.000 0.280 0.316 0.004 0.052
#> SRR1308734 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 4 0.2257 0.3626 0.116 0.000 0.008 0.876 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.4439 0.7403 0.540 0.000 0.028 0.432 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.4797 0.6556 0.504 0.000 0.052 0.444 0.000 0.000
#> SRR1370818 4 0.6109 0.1576 0.316 0.000 0.308 0.376 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 4 0.0806 0.3280 0.008 0.000 0.020 0.972 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0405 0.9801 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091230 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.3727 0.8035 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.1219 0.9531 0.048 0.948 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317731 2 0.1176 0.9577 0.024 0.956 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1490785 1 0.4192 0.7678 0.572 0.000 0.016 0.412 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.4629 0.7315 0.524 0.000 0.040 0.436 0.000 0.000
#> SRR1447808 4 0.3547 0.0312 0.300 0.000 0.004 0.696 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0291 0.9814 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101513 1 0.5214 0.5773 0.480 0.000 0.068 0.444 0.000 0.008
#> SRR1415708 2 0.0363 0.9793 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0291 0.9816 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.4176 0.8051 0.580 0.000 0.016 0.404 0.000 0.000
#> SRR1080044 4 0.4136 -0.5045 0.428 0.000 0.012 0.560 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.5977 -0.3951 0.172 0.000 0.384 0.436 0.000 0.008
#> SRR1069871 4 0.3371 0.0484 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0146 0.9836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.3717 0.8022 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.3852 0.8044 0.612 0.000 0.004 0.384 0.000 0.000
#> SRR1417023 4 0.6097 -0.2540 0.232 0.000 0.344 0.420 0.000 0.004
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 4 0.4461 -0.3178 0.404 0.000 0.032 0.564 0.000 0.000
#> SRR1352996 4 0.0717 0.3362 0.008 0.000 0.016 0.976 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.4687 -0.6429 0.028 0.000 0.448 0.516 0.000 0.008
#> SRR1413137 4 0.4687 -0.6429 0.028 0.000 0.448 0.516 0.000 0.008
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.5398 -0.3997 0.136 0.000 0.320 0.544 0.000 0.000
#> SRR1416266 4 0.4787 -0.6431 0.028 0.000 0.476 0.484 0.000 0.012
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.5303 -0.3929 0.120 0.000 0.332 0.548 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 4 0.4045 -0.5540 0.008 0.000 0.336 0.648 0.000 0.008
#> SRR1419962 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 4 0.3991 -0.6086 0.472 0.000 0.004 0.524 0.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.4878 -0.1360 0.040 0.480 0.008 0.000 0.472 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.5771 0.2783 0.476 0.000 0.188 0.336 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.4750 0.2837 0.252 0.000 0.096 0.652 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470988 4 0.4984 -0.7198 0.056 0.000 0.460 0.480 0.000 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.3797 0.8015 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.4836 0.0900 0.040 0.536 0.008 0.000 0.416 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 4 0.3607 -0.1697 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR819124 4 0.3819 0.1243 0.280 0.000 0.020 0.700 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 4 0.3817 -0.5254 0.432 0.000 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0458 0.9781 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.4212 0.7918 0.560 0.000 0.016 0.424 0.000 0.000
#> SRR1348885 5 0.3653 0.4211 0.012 0.040 0.004 0.000 0.804 0.140
#> SRR1325826 4 0.3634 -0.2032 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.3203 0.3272 0.160 0.000 0.024 0.812 0.000 0.004
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.4960 0.6747 0.516 0.000 0.056 0.424 0.000 0.004
#> SRR1374396 3 0.4841 0.6982 0.056 0.000 0.508 0.436 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.4666 0.7318 0.536 0.000 0.044 0.420 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 5 0.7197 -0.0287 0.084 0.000 0.344 0.020 0.416 0.136
#> SRR1309314 5 0.2980 0.3723 0.000 0.192 0.008 0.000 0.800 0.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 4 0.1779 0.3941 0.064 0.000 0.016 0.920 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.3789 0.8006 0.584 0.000 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0146 0.9836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339276 1 0.3797 0.8016 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1418368 4 0.3619 -0.0521 0.316 0.000 0.004 0.680 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.4520 0.7404 0.520 0.000 0.032 0.448 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.5152 -0.6141 0.088 0.000 0.400 0.512 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.4561 0.7387 0.536 0.000 0.036 0.428 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.3756 0.8038 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 4 0.4263 -0.1983 0.376 0.000 0.024 0.600 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 4 0.0891 0.3179 0.008 0.000 0.024 0.968 0.000 0.000
#> SRR1096687 4 0.3023 0.2463 0.212 0.000 0.004 0.784 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.3797 0.7899 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1470313 3 0.6293 0.2626 0.252 0.000 0.424 0.312 0.000 0.012
#> SRR1447893 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477429 4 0.5639 0.2470 0.308 0.000 0.156 0.532 0.000 0.004
#> SRR1445701 2 0.1219 0.9531 0.048 0.948 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR820689 4 0.3881 -0.3665 0.396 0.000 0.004 0.600 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4205 0.7740 0.564 0.000 0.016 0.420 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 4 0.3563 -0.1332 0.336 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR1082709 4 0.3266 0.1004 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.6006 0.0435 0.428 0.000 0.316 0.256 0.000 0.000
#> SRR1355769 4 0.4072 -0.4616 0.032 0.000 0.260 0.704 0.000 0.004
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.4372 0.7507 0.544 0.000 0.024 0.432 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 4 0.5997 0.0588 0.344 0.000 0.240 0.416 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.3937 0.7952 0.572 0.000 0.004 0.424 0.000 0.000
#> SRR1318140 4 0.3857 -0.6181 0.468 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1440374 4 0.3747 -0.3565 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 4 0.5949 -0.2486 0.176 0.000 0.344 0.472 0.000 0.008
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 4 0.3313 0.3693 0.148 0.000 0.036 0.812 0.000 0.004
#> SRR1418183 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1387449 4 0.3706 -0.2956 0.380 0.000 0.000 0.620 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.4393 0.7073 0.524 0.000 0.024 0.452 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 4 0.2697 0.2765 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR1088557 4 0.3528 0.0252 0.296 0.000 0.004 0.700 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 4 0.1367 0.4016 0.044 0.000 0.012 0.944 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.4116 0.7693 0.572 0.000 0.012 0.416 0.000 0.000
#> SRR1363766 4 0.3383 0.1201 0.268 0.000 0.004 0.728 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.2373 0.8793 0.024 0.888 0.004 0.000 0.084 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0790 0.9668 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.6005 -0.2222 0.236 0.000 0.380 0.384 0.000 0.000
#> SRR1454695 4 0.4991 -0.3279 0.404 0.000 0.072 0.524 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.3727 0.8035 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.4695 0.7065 0.508 0.000 0.044 0.448 0.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 4 0.2664 0.2826 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.4602 0.7321 0.572 0.000 0.044 0.384 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0146 0.9836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1433538 4 0.0806 0.3280 0.008 0.000 0.020 0.972 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0458 0.9781 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.5982 0.1792 0.428 0.000 0.240 0.332 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 3 0.5359 0.6708 0.108 0.000 0.460 0.432 0.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0458 0.9781 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.5994 0.1912 0.424 0.000 0.244 0.332 0.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.5482 -0.1115 0.156 0.000 0.300 0.544 0.000 0.000
#> SRR1102583 4 0.3563 -0.1378 0.336 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.6074 0.0406 0.376 0.000 0.268 0.356 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.3727 0.8035 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.3737 0.8047 0.608 0.000 0.000 0.392 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408553 4 0.4607 -0.6536 0.036 0.000 0.380 0.580 0.000 0.004
#> SRR1069231 4 0.3652 -0.0676 0.324 0.000 0.004 0.672 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.3774 0.8016 0.592 0.000 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.3797 0.8013 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1094380 4 0.3999 -0.6653 0.496 0.000 0.004 0.500 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0146 0.9836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380249 3 0.5608 0.5547 0.144 0.000 0.444 0.412 0.000 0.000
#> SRR1080143 4 0.3541 0.2294 0.232 0.000 0.020 0.748 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.5257 -0.6614 0.096 0.000 0.432 0.472 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.3993 0.7145 0.520 0.000 0.004 0.476 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.3817 0.7953 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.0891 0.3338 0.000 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR807679 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.5982 0.1792 0.428 0.000 0.240 0.332 0.000 0.000
#> SRR1418041 4 0.3695 -0.2637 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.4377 0.7452 0.540 0.000 0.024 0.436 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4523 0.7271 0.516 0.000 0.032 0.452 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.4322 0.7551 0.528 0.000 0.020 0.452 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074502 4 0.3717 -0.2974 0.384 0.000 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.5982 0.1792 0.428 0.000 0.240 0.332 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0405 0.9799 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.5334 -0.4583 0.120 0.000 0.344 0.536 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.4787 -0.6431 0.028 0.000 0.476 0.484 0.000 0.012
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 4 0.4307 -0.0405 0.072 0.000 0.224 0.704 0.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0146 0.9834 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0291 0.9814 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354467 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0363 0.9804 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.1176 0.9577 0.024 0.956 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.5680 0.1623 0.292 0.000 0.192 0.516 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.4524 0.7470 0.560 0.000 0.036 0.404 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 4 0.2632 0.3148 0.164 0.000 0.004 0.832 0.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413182 4 0.5011 -0.6652 0.072 0.000 0.420 0.508 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.6117 -0.0911 0.356 0.000 0.300 0.344 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487928 3 0.5187 0.6892 0.088 0.000 0.472 0.440 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.5066 0.6186 0.496 0.000 0.064 0.436 0.000 0.004
#> SRR1456423 1 0.4025 0.7756 0.576 0.000 0.008 0.416 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 4 0.3629 0.1016 0.276 0.000 0.012 0.712 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.3862 0.8069 0.608 0.000 0.004 0.388 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.4344 0.6763 0.024 0.756 0.000 0.000 0.080 0.140
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 4 0.3634 -0.2032 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.3717 0.8022 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.4116 0.7693 0.572 0.000 0.012 0.416 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.3864 0.7360 0.520 0.000 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1350545 4 0.2994 0.2511 0.208 0.000 0.004 0.788 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.4531 0.7863 0.556 0.000 0.036 0.408 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0458 0.9783 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0146 0.9835 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 4 0.2482 0.3328 0.148 0.000 0.004 0.848 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0458 0.9781 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.0891 0.3338 0.000 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1319100 1 0.3727 0.8002 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0937 0.9620 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1421031 3 0.5139 0.7143 0.056 0.000 0.516 0.416 0.000 0.012
#> SRR1444598 5 0.3012 0.3668 0.000 0.196 0.008 0.000 0.796 0.000
#> SRR1091743 2 0.0260 0.9821 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.3706 0.8001 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.3782 0.8026 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0458 0.9782 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.1075 0.9562 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.4372 0.7507 0.544 0.000 0.024 0.432 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.4721 0.6745 0.496 0.000 0.036 0.464 0.000 0.004
#> SRR1323470 6 0.2664 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR814657 4 0.2088 0.3978 0.068 0.000 0.028 0.904 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4920 0.508 0.508
#> 3 3 0.736 0.699 0.848 0.2155 0.993 0.985
#> 4 4 0.615 0.705 0.796 0.1409 0.798 0.598
#> 5 5 0.602 0.534 0.707 0.0774 0.906 0.713
#> 6 6 0.627 0.613 0.739 0.0560 0.890 0.618
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.6712 0.787 0.824 0.176
#> SRR1326059 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.7219 0.751 0.800 0.200
#> SRR1431735 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.0376 0.994 0.996 0.004
#> SRR1309314 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1467726 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR815446 2 0.6180 0.837 0.000 0.584 0.416
#> SRR1402132 3 0.7671 0.275 0.380 0.052 0.568
#> SRR1326059 1 0.1411 0.778 0.964 0.000 0.036
#> SRR1409062 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR809406 1 0.0747 0.785 0.984 0.000 0.016
#> SRR1465313 2 0.2261 0.588 0.000 0.932 0.068
#> SRR819559 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.2165 0.589 0.000 0.936 0.064
#> SRR1442292 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1488151 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1343629 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1102320 1 0.4235 0.687 0.824 0.000 0.176
#> SRR1469926 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR1070036 1 0.0237 0.787 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098426 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1090310 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.4555 0.659 0.800 0.000 0.200
#> SRR1363654 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1378308 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1366919 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1329947 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.1643 0.589 0.000 0.956 0.044
#> SRR1490761 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1380122 2 0.1529 0.633 0.000 0.960 0.040
#> SRR1402944 2 0.3116 0.642 0.000 0.892 0.108
#> SRR1092818 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1093552 1 0.0892 0.785 0.980 0.000 0.020
#> SRR1464880 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1078368 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1349608 2 0.6267 0.827 0.000 0.548 0.452
#> SRR1466951 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1331879 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1320034 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1068687 2 0.6267 0.826 0.000 0.548 0.452
#> SRR1437491 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.6267 0.827 0.000 0.548 0.452
#> SRR1374005 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1319182 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.6286 0.244 0.536 0.000 0.464
#> SRR1354203 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1077850 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1077992 2 0.6192 0.836 0.000 0.580 0.420
#> SRR1455214 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.5591 0.809 0.000 0.696 0.304
#> SRR1097857 1 0.2448 0.758 0.924 0.000 0.076
#> SRR1473318 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.1163 0.597 0.000 0.972 0.028
#> SRR1338687 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1071207 1 0.6267 0.268 0.548 0.000 0.452
#> SRR1486821 2 0.1289 0.595 0.000 0.968 0.032
#> SRR1418540 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1408788 2 0.6008 0.833 0.000 0.628 0.372
#> SRR1359487 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1080648 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR1414708 1 0.2537 0.758 0.920 0.000 0.080
#> SRR1469080 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1365722 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1448118 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1444808 1 0.5760 0.479 0.672 0.000 0.328
#> SRR1321829 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1475993 2 0.1289 0.630 0.000 0.968 0.032
#> SRR1445387 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.6140 0.838 0.000 0.596 0.404
#> SRR1349300 1 0.3192 0.732 0.888 0.000 0.112
#> SRR1374165 1 0.3192 0.727 0.888 0.000 0.112
#> SRR1453769 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1473870 1 0.5016 0.613 0.760 0.000 0.240
#> SRR1401146 2 0.5926 0.830 0.000 0.644 0.356
#> SRR1366124 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1391811 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR1086490 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1404577 1 0.6280 0.232 0.540 0.000 0.460
#> SRR1384431 1 0.0592 0.786 0.988 0.000 0.012
#> SRR1072055 1 0.0592 0.786 0.988 0.000 0.012
#> SRR1359738 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1085900 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1442173 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR814515 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1357999 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1344034 2 0.2066 0.580 0.000 0.940 0.060
#> SRR1080391 1 0.6225 0.299 0.568 0.000 0.432
#> SRR1347870 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR814028 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR814219 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1070620 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.2878 0.746 0.904 0.000 0.096
#> SRR1460211 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1418346 2 0.6215 0.824 0.000 0.572 0.428
#> SRR1070060 1 0.6260 0.253 0.552 0.000 0.448
#> SRR1487969 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1417851 1 0.5810 0.475 0.664 0.000 0.336
#> SRR1443350 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1403199 1 0.0592 0.786 0.988 0.000 0.012
#> SRR1076705 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1079380 2 0.6225 0.833 0.000 0.568 0.432
#> SRR1102923 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1369560 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1366605 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1396035 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1390223 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1436840 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1445573 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1375394 3 0.9042 0.504 0.280 0.176 0.544
#> SRR1431735 1 0.1411 0.780 0.964 0.000 0.036
#> SRR1417387 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1445984 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1370447 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR1446308 2 0.0424 0.614 0.000 0.992 0.008
#> SRR1437346 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1086466 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1098974 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1319584 2 0.6168 0.825 0.000 0.588 0.412
#> SRR1486584 1 0.1163 0.782 0.972 0.000 0.028
#> SRR813536 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR1317939 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1079730 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.5678 0.500 0.684 0.000 0.316
#> SRR1399178 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1415615 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.6260 0.828 0.000 0.552 0.448
#> SRR1453259 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1340828 2 0.6192 0.827 0.000 0.580 0.420
#> SRR1079543 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR816427 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1076681 2 0.6252 0.830 0.000 0.556 0.444
#> SRR1335314 1 0.6308 0.164 0.508 0.000 0.492
#> SRR1400799 2 0.2625 0.606 0.000 0.916 0.084
#> SRR1074578 1 0.6235 0.282 0.564 0.000 0.436
#> SRR1312226 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1416207 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1447371 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1069328 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR1445023 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1077599 2 0.5678 0.814 0.000 0.684 0.316
#> SRR1453480 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1101834 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1321744 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074839 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1458727 2 0.5178 0.200 0.000 0.744 0.256
#> SRR1436949 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1070429 2 0.0592 0.615 0.000 0.988 0.012
#> SRR1458158 1 0.4504 0.661 0.804 0.000 0.196
#> SRR1432408 1 0.6308 0.164 0.508 0.000 0.492
#> SRR1310334 1 0.1411 0.778 0.964 0.000 0.036
#> SRR1418201 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR1385434 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1415591 2 0.2356 0.607 0.000 0.928 0.072
#> SRR1402009 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.5291 0.562 0.732 0.000 0.268
#> SRR1308734 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1498973 2 0.6126 0.831 0.000 0.600 0.400
#> SRR1397115 1 0.5968 0.421 0.636 0.000 0.364
#> SRR1392141 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR814341 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1313601 2 0.6026 0.836 0.000 0.624 0.376
#> SRR1459609 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1499325 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR809919 1 0.2959 0.735 0.900 0.000 0.100
#> SRR1370818 1 0.6168 0.347 0.588 0.000 0.412
#> SRR1323651 2 0.2066 0.585 0.000 0.940 0.060
#> SRR1357297 1 0.6180 0.327 0.584 0.000 0.416
#> SRR818170 2 0.4121 0.682 0.000 0.832 0.168
#> SRR1091230 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1470556 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR812318 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.2165 0.584 0.000 0.936 0.064
#> SRR1317731 2 0.2878 0.640 0.000 0.904 0.096
#> SRR1490785 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1447808 1 0.0424 0.787 0.992 0.000 0.008
#> SRR809534 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1397312 2 0.6008 0.833 0.000 0.628 0.372
#> SRR812128 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1101513 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1415708 2 0.6026 0.837 0.000 0.624 0.376
#> SRR1316033 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1480263 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1464473 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1076801 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1080044 1 0.0424 0.786 0.992 0.000 0.008
#> SRR1420850 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1474295 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR1069871 1 0.0892 0.784 0.980 0.000 0.020
#> SRR1095744 2 0.6111 0.838 0.000 0.604 0.396
#> SRR1068929 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1490097 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1075054 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1083480 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1417023 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1309333 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1333676 1 0.4002 0.698 0.840 0.000 0.160
#> SRR1352996 1 0.5397 0.560 0.720 0.000 0.280
#> SRR1093172 1 0.6274 0.233 0.544 0.000 0.456
#> SRR1413137 1 0.6274 0.233 0.544 0.000 0.456
#> SRR1469973 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1420026 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR817306 1 0.6079 0.398 0.612 0.000 0.388
#> SRR1416266 1 0.6274 0.233 0.544 0.000 0.456
#> SRR1071011 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1090290 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1435394 2 0.2878 0.680 0.000 0.904 0.096
#> SRR1383192 1 0.6274 0.233 0.544 0.000 0.456
#> SRR1419962 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1094357 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.2165 0.577 0.000 0.936 0.064
#> SRR1356016 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1351082 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1397348 2 0.6204 0.826 0.000 0.576 0.424
#> SRR1312147 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1473891 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1335470 1 0.6235 0.282 0.564 0.000 0.436
#> SRR1474930 2 0.6244 0.824 0.000 0.560 0.440
#> SRR1470988 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR811915 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1104987 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1444436 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1313770 2 0.2165 0.577 0.000 0.936 0.064
#> SRR1315780 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1073631 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.4452 0.667 0.808 0.000 0.192
#> SRR1310997 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1464494 2 0.6260 0.823 0.000 0.552 0.448
#> SRR1357083 2 0.0592 0.616 0.000 0.988 0.012
#> SRR1475842 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1378085 1 0.0424 0.787 0.992 0.000 0.008
#> SRR1378220 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1348885 2 0.5810 0.579 0.000 0.664 0.336
#> SRR1325826 1 0.0424 0.787 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466812 1 0.6235 0.282 0.564 0.000 0.436
#> SRR1345692 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1401040 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR1097954 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1374396 1 0.6308 0.164 0.508 0.000 0.492
#> SRR1454073 2 0.6215 0.820 0.000 0.572 0.428
#> SRR1355747 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1429368 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1398138 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1379260 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361436 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR817142 2 0.5859 0.826 0.000 0.656 0.344
#> SRR1315291 3 0.9133 0.485 0.304 0.172 0.524
#> SRR1309314 2 0.3340 0.497 0.000 0.880 0.120
#> SRR1420085 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1361308 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.3619 0.715 0.864 0.000 0.136
#> SRR1380482 2 0.3038 0.657 0.000 0.896 0.104
#> SRR1099789 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.6079 0.836 0.000 0.612 0.388
#> SRR1339276 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0892 0.784 0.980 0.000 0.020
#> SRR1399353 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR1096760 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.5291 0.746 0.000 0.732 0.268
#> SRR1330813 2 0.5882 0.827 0.000 0.652 0.348
#> SRR1458931 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR812294 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1394321 1 0.0592 0.786 0.988 0.000 0.012
#> SRR1081160 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1469704 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1349342 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1086752 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1084698 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1390143 1 0.0892 0.784 0.980 0.000 0.020
#> SRR1390413 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1099570 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR1312169 1 0.6260 0.253 0.552 0.000 0.448
#> SRR1096687 1 0.6204 0.301 0.576 0.000 0.424
#> SRR1486139 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1447893 2 0.0592 0.616 0.000 0.988 0.012
#> SRR1466025 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1477429 1 0.6168 0.321 0.588 0.000 0.412
#> SRR1445701 2 0.2711 0.605 0.000 0.912 0.088
#> SRR820689 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1452537 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1383301 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1344462 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.3686 0.712 0.860 0.000 0.140
#> SRR1447784 1 0.2878 0.740 0.904 0.000 0.096
#> SRR1355769 1 0.6280 0.232 0.540 0.000 0.460
#> SRR1488237 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1391985 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1478501 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1480917 2 0.5560 0.805 0.000 0.700 0.300
#> SRR1474485 1 0.2959 0.737 0.900 0.000 0.100
#> SRR1089998 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1454350 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0237 0.787 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359565 2 0.2066 0.585 0.000 0.940 0.060
#> SRR1105417 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR1325578 2 0.0237 0.610 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358161 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1358665 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1333971 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1452010 1 0.5785 0.480 0.668 0.000 0.332
#> SRR1418183 2 0.6180 0.818 0.000 0.584 0.416
#> SRR1366345 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0237 0.787 0.996 0.000 0.004
#> SRR1473461 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0892 0.621 0.000 0.980 0.020
#> SRR1447828 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1338747 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1333038 2 0.1163 0.628 0.000 0.972 0.028
#> SRR1350280 1 0.5178 0.593 0.744 0.000 0.256
#> SRR1088557 1 0.0892 0.784 0.980 0.000 0.020
#> SRR1102656 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1441443 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1370682 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1475448 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.4654 0.648 0.792 0.000 0.208
#> SRR1405266 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.4504 0.660 0.804 0.000 0.196
#> SRR1082592 2 0.4887 0.714 0.000 0.772 0.228
#> SRR1325794 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1095961 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1320806 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1457527 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1474374 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR1488858 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1454695 1 0.4178 0.675 0.828 0.000 0.172
#> SRR1090241 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1329863 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1357733 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1379581 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1309182 1 0.4291 0.677 0.820 0.000 0.180
#> SRR1437668 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1084742 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1433538 1 0.5098 0.601 0.752 0.000 0.248
#> SRR1085063 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1454247 2 0.6204 0.826 0.000 0.576 0.424
#> SRR1097100 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR818622 2 0.5216 0.786 0.000 0.740 0.260
#> SRR1072388 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1070332 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR1320761 2 0.6111 0.838 0.000 0.604 0.396
#> SRR1076195 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1069895 2 0.1289 0.630 0.000 0.968 0.032
#> SRR1099144 1 0.1411 0.781 0.964 0.000 0.036
#> SRR1385150 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1332625 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1102583 1 0.3879 0.700 0.848 0.000 0.152
#> SRR1456971 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1340574 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.6267 0.827 0.000 0.548 0.452
#> SRR1096267 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.2165 0.577 0.000 0.936 0.064
#> SRR1408553 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR1069231 1 0.3686 0.710 0.860 0.000 0.140
#> SRR1325642 2 0.6244 0.831 0.000 0.560 0.440
#> SRR1362103 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1099330 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1077874 2 0.6140 0.837 0.000 0.596 0.404
#> SRR808299 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1098050 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1481238 2 0.6045 0.804 0.000 0.620 0.380
#> SRR1443568 2 0.5254 0.733 0.000 0.736 0.264
#> SRR1380249 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1080143 1 0.4555 0.656 0.800 0.000 0.200
#> SRR1383148 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1357042 1 0.4291 0.683 0.820 0.000 0.180
#> SRR1416025 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1431015 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1078709 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR813283 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1070665 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1347707 3 0.6267 -0.141 0.000 0.452 0.548
#> SRR807679 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1333811 2 0.2066 0.580 0.000 0.940 0.060
#> SRR1078660 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1331730 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1333913 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1432542 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1418041 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR1085211 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR1339812 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1402437 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR1350958 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1396822 2 0.1753 0.643 0.000 0.952 0.048
#> SRR1441934 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1472552 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.1163 0.781 0.972 0.000 0.028
#> SRR1071131 2 0.6111 0.809 0.000 0.604 0.396
#> SRR1074502 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1409171 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR809113 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1430045 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1441245 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1384091 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1431887 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1096525 1 0.6291 0.210 0.532 0.000 0.468
#> SRR1488491 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1356351 2 0.6079 0.837 0.000 0.612 0.388
#> SRR1369514 1 0.6274 0.233 0.544 0.000 0.456
#> SRR1453299 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1091767 2 0.6280 0.825 0.000 0.540 0.460
#> SRR1354467 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1452399 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1437430 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1419736 2 0.6045 0.835 0.000 0.620 0.380
#> SRR1313343 2 0.0892 0.600 0.000 0.980 0.020
#> SRR1077619 1 0.5835 0.466 0.660 0.000 0.340
#> SRR1083530 1 0.1529 0.779 0.960 0.000 0.040
#> SRR1333633 2 0.1163 0.597 0.000 0.972 0.028
#> SRR1354999 2 0.6026 0.804 0.000 0.624 0.376
#> SRR1443592 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1077356 1 0.0892 0.784 0.980 0.000 0.020
#> SRR1378818 2 0.2066 0.588 0.000 0.940 0.060
#> SRR1413182 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1464559 1 0.5497 0.532 0.708 0.000 0.292
#> SRR1413075 2 0.6260 0.823 0.000 0.552 0.448
#> SRR1487928 1 0.6295 0.216 0.528 0.000 0.472
#> SRR1388997 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1092865 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1102729 1 0.1964 0.769 0.944 0.000 0.056
#> SRR1456423 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1376874 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1339903 1 0.4555 0.654 0.800 0.000 0.200
#> SRR1346710 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR1418771 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1095358 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1480941 2 0.2448 0.549 0.000 0.924 0.076
#> SRR1479175 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1313891 2 0.6126 0.838 0.000 0.600 0.400
#> SRR1491354 1 0.1411 0.778 0.964 0.000 0.036
#> SRR1433884 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1471074 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1353052 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1355554 2 0.4555 0.697 0.000 0.800 0.200
#> SRR1487173 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1318331 2 0.6274 0.826 0.000 0.544 0.456
#> SRR1321333 2 0.0000 0.606 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.5591 0.517 0.696 0.000 0.304
#> SRR1091328 1 0.0747 0.784 0.984 0.000 0.016
#> SRR814447 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1455989 2 0.2711 0.674 0.000 0.912 0.088
#> SRR1453680 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR1470356 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1342977 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1444222 2 0.6267 0.827 0.000 0.548 0.452
#> SRR1097197 1 0.5785 0.476 0.668 0.000 0.332
#> SRR1366729 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR821282 2 0.1529 0.591 0.000 0.960 0.040
#> SRR1074602 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR814633 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR1072480 2 0.3340 0.497 0.000 0.880 0.120
#> SRR1319100 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.2165 0.584 0.000 0.936 0.064
#> SRR1457459 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.6305 0.191 0.516 0.000 0.484
#> SRR1444598 2 0.4504 0.639 0.000 0.804 0.196
#> SRR1091743 2 0.6111 0.839 0.000 0.604 0.396
#> SRR819637 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.787 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.1289 0.630 0.000 0.968 0.032
#> SRR1459785 2 0.1964 0.581 0.000 0.944 0.056
#> SRR1083700 1 0.0592 0.784 0.988 0.000 0.012
#> SRR1375531 1 0.3267 0.734 0.884 0.000 0.116
#> SRR1323470 2 0.4796 0.609 0.000 0.780 0.220
#> SRR814657 1 0.6026 0.401 0.624 0.000 0.376
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0707 0.8165 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1402132 4 0.7651 0.5947 0.288 0.000 0.248 0.464
#> SRR1326059 1 0.2760 0.7264 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1409062 2 0.1059 0.8060 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR809406 1 0.2469 0.7501 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1465313 3 0.7180 0.6656 0.000 0.188 0.548 0.264
#> SRR819559 1 0.0376 0.8200 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1387899 3 0.6346 0.7484 0.000 0.192 0.656 0.152
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0817 0.8137 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1395635 1 0.1520 0.8064 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.1174 0.8063 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1102320 1 0.4420 0.4729 0.748 0.000 0.012 0.240
#> SRR1469926 3 0.4175 0.8261 0.000 0.200 0.784 0.016
#> SRR1070036 1 0.1151 0.8162 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1098426 1 0.1724 0.8028 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1090310 3 0.4877 0.8348 0.000 0.328 0.664 0.008
#> SRR1429748 1 0.4697 0.3050 0.696 0.000 0.008 0.296
#> SRR1363654 1 0.1211 0.8067 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1326317 2 0.1182 0.8035 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.6764 0.8115 0.404 0.000 0.096 0.500
#> SRR1329947 1 0.0921 0.8119 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1469769 3 0.4502 0.8442 0.000 0.236 0.748 0.016
#> SRR1490761 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380122 2 0.7610 -0.5846 0.000 0.400 0.400 0.200
#> SRR1402944 3 0.7544 0.5950 0.000 0.352 0.452 0.196
#> SRR1092818 1 0.1520 0.8064 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1093552 1 0.2032 0.7973 0.936 0.000 0.036 0.028
#> SRR1464880 2 0.2271 0.7796 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.5309 0.6657 0.000 0.744 0.092 0.164
#> SRR1466951 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1331879 2 0.3047 0.7631 0.000 0.872 0.012 0.116
#> SRR1320034 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1068687 2 0.6289 0.5957 0.000 0.648 0.116 0.236
#> SRR1437491 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.4300 0.7215 0.000 0.820 0.092 0.088
#> SRR1374005 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1319182 1 0.2149 0.7707 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1329994 4 0.5708 0.8062 0.416 0.000 0.028 0.556
#> SRR1354203 1 0.1118 0.8111 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.4010 0.7222 0.000 0.816 0.028 0.156
#> SRR1455214 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.5066 0.5688 0.000 0.764 0.148 0.088
#> SRR1097857 1 0.3071 0.7442 0.888 0.000 0.044 0.068
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.4720 0.8507 0.000 0.264 0.720 0.016
#> SRR1338687 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.5865 0.7858 0.412 0.000 0.036 0.552
#> SRR1486821 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1418540 1 0.1833 0.8008 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1408788 2 0.3497 0.7459 0.000 0.860 0.104 0.036
#> SRR1359487 4 0.6764 0.8128 0.404 0.000 0.096 0.500
#> SRR1080648 1 0.2002 0.8017 0.936 0.000 0.044 0.020
#> SRR1414708 1 0.3266 0.7433 0.876 0.000 0.040 0.084
#> SRR1469080 2 0.1661 0.7959 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR1365722 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1448118 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1444808 1 0.6698 -0.4152 0.556 0.000 0.104 0.340
#> SRR1321829 2 0.1174 0.8063 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1475993 3 0.4889 0.8078 0.000 0.360 0.636 0.004
#> SRR1445387 1 0.1557 0.7968 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1077575 2 0.4238 0.7050 0.000 0.796 0.028 0.176
#> SRR1349300 1 0.3688 0.5788 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1374165 1 0.4586 0.5701 0.796 0.000 0.068 0.136
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.4643 0.1191 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1401146 2 0.2489 0.7548 0.000 0.912 0.068 0.020
#> SRR1366124 4 0.6944 0.8032 0.404 0.000 0.112 0.484
#> SRR1391811 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.2670 0.7820 0.904 0.000 0.072 0.024
#> SRR1086490 3 0.5018 0.8314 0.000 0.332 0.656 0.012
#> SRR1088511 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1404577 4 0.5372 0.7708 0.444 0.000 0.012 0.544
#> SRR1384431 1 0.2662 0.7671 0.900 0.000 0.016 0.084
#> SRR1072055 1 0.1284 0.8116 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1359738 3 0.4999 0.8341 0.000 0.328 0.660 0.012
#> SRR1332141 1 0.1118 0.8111 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1085900 2 0.5964 0.6245 0.000 0.676 0.096 0.228
#> SRR1442173 1 0.0188 0.8192 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431625 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.3925 0.7130 0.000 0.808 0.016 0.176
#> SRR1344034 3 0.6903 0.7080 0.000 0.184 0.592 0.224
#> SRR1080391 4 0.6134 0.7887 0.444 0.000 0.048 0.508
#> SRR1347870 2 0.5727 0.6419 0.000 0.704 0.096 0.200
#> SRR814028 2 0.5727 0.6419 0.000 0.704 0.096 0.200
#> SRR814219 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.3933 0.5967 0.792 0.000 0.008 0.200
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.5633 0.6385 0.000 0.716 0.100 0.184
#> SRR1070060 4 0.4955 0.7731 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1487969 2 0.2466 0.7731 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1417851 1 0.6347 -0.4285 0.548 0.000 0.068 0.384
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.2036 0.8127 0.936 0.000 0.032 0.032
#> SRR1076705 1 0.1724 0.8028 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1079380 2 0.6028 0.5935 0.000 0.644 0.076 0.280
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.3161 0.7502 0.000 0.864 0.012 0.124
#> SRR1366605 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1436840 2 0.5454 0.6597 0.000 0.732 0.096 0.172
#> SRR1445573 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1375394 4 0.6646 0.5488 0.204 0.000 0.172 0.624
#> SRR1431735 1 0.2773 0.7787 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1417387 1 0.1833 0.8002 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1445984 1 0.1929 0.7980 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1370447 4 0.6176 0.8128 0.424 0.000 0.052 0.524
#> SRR1446308 3 0.5057 0.8256 0.000 0.340 0.648 0.012
#> SRR1437346 3 0.4699 0.8391 0.000 0.320 0.676 0.004
#> SRR1103143 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.1411 0.8079 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1073191 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.7065 0.8021 0.404 0.000 0.124 0.472
#> SRR1319584 2 0.5889 0.5967 0.000 0.696 0.116 0.188
#> SRR1486584 1 0.2216 0.7707 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR813536 4 0.6038 0.8098 0.424 0.000 0.044 0.532
#> SRR1317939 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1079730 1 0.0921 0.8119 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1341921 1 0.4933 -0.4485 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0921 0.8119 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1328551 2 0.4982 0.6860 0.000 0.772 0.092 0.136
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.5314 0.6591 0.000 0.740 0.084 0.176
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1076681 2 0.5417 0.6639 0.000 0.732 0.088 0.180
#> SRR1335314 4 0.7130 0.7961 0.396 0.000 0.132 0.472
#> SRR1400799 3 0.5609 0.7876 0.000 0.200 0.712 0.088
#> SRR1074578 4 0.4955 0.7731 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1312226 2 0.3764 0.7215 0.000 0.816 0.012 0.172
#> SRR1416207 1 0.0817 0.8153 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1447371 1 0.1118 0.8111 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1069328 4 0.5543 0.7950 0.424 0.000 0.020 0.556
#> SRR1445023 4 0.6949 0.8089 0.408 0.000 0.112 0.480
#> SRR1077599 2 0.3280 0.6760 0.000 0.860 0.124 0.016
#> SRR1453480 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1724 0.8032 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1074839 2 0.5964 0.6245 0.000 0.676 0.096 0.228
#> SRR1458727 3 0.6140 0.5699 0.000 0.064 0.596 0.340
#> SRR1436949 2 0.3808 0.7195 0.000 0.812 0.012 0.176
#> SRR1070429 3 0.4917 0.8281 0.000 0.336 0.656 0.008
#> SRR1458158 1 0.4382 0.3265 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1432408 4 0.7175 0.7855 0.404 0.000 0.136 0.460
#> SRR1310334 1 0.2814 0.7217 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1418201 3 0.4095 0.8210 0.000 0.192 0.792 0.016
#> SRR1385434 4 0.7243 0.7909 0.404 0.000 0.144 0.452
#> SRR1415591 3 0.5292 0.8058 0.000 0.208 0.728 0.064
#> SRR1402009 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.6508 -0.2220 0.600 0.000 0.104 0.296
#> SRR1308734 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1498973 2 0.5495 0.6429 0.000 0.728 0.096 0.176
#> SRR1397115 4 0.4992 0.7179 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1392141 1 0.2596 0.7849 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR814341 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.1610 0.7920 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR1459609 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499325 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR809919 1 0.3999 0.6459 0.824 0.000 0.036 0.140
#> SRR1370818 1 0.6878 -0.6884 0.472 0.000 0.104 0.424
#> SRR1323651 3 0.6429 0.7419 0.000 0.192 0.648 0.160
#> SRR1357297 4 0.4972 0.7578 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR818170 2 0.7566 -0.4390 0.000 0.416 0.392 0.192
#> SRR1091230 2 0.1297 0.8040 0.000 0.964 0.020 0.016
#> SRR1470556 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.6397 0.7399 0.000 0.184 0.652 0.164
#> SRR1317731 3 0.7481 0.6671 0.000 0.316 0.484 0.200
#> SRR1490785 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.1624 0.8053 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1447808 1 0.2647 0.7369 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR809534 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.4789 0.6781 0.000 0.772 0.056 0.172
#> SRR812128 2 0.6726 0.5290 0.000 0.584 0.124 0.292
#> SRR1101513 1 0.3037 0.7653 0.888 0.000 0.036 0.076
#> SRR1415708 2 0.1798 0.8032 0.000 0.944 0.040 0.016
#> SRR1316033 3 0.4933 0.8446 0.000 0.296 0.688 0.016
#> SRR1390371 2 0.0707 0.8153 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1076801 1 0.1929 0.7980 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1080044 1 0.1209 0.8108 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1420850 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1474295 4 0.5901 0.7854 0.432 0.000 0.036 0.532
#> SRR1069871 1 0.2647 0.7358 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1095744 2 0.4035 0.7100 0.000 0.804 0.020 0.176
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1075054 2 0.1576 0.7980 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1083480 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.1411 0.8079 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1417023 4 0.7210 0.7901 0.404 0.000 0.140 0.456
#> SRR1309333 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1333676 1 0.4539 0.3985 0.720 0.000 0.008 0.272
#> SRR1352996 1 0.4804 -0.1234 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1093172 4 0.5808 0.8112 0.424 0.000 0.032 0.544
#> SRR1413137 4 0.5808 0.8112 0.424 0.000 0.032 0.544
#> SRR1469973 2 0.6157 0.6096 0.000 0.660 0.108 0.232
#> SRR1420026 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR817306 4 0.5383 0.7477 0.452 0.000 0.012 0.536
#> SRR1416266 4 0.5964 0.8138 0.424 0.000 0.040 0.536
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.6332 0.8156 0.404 0.000 0.064 0.532
#> SRR1435394 3 0.5466 0.6801 0.000 0.436 0.548 0.016
#> SRR1383192 4 0.5088 0.7944 0.424 0.000 0.004 0.572
#> SRR1419962 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1094357 1 0.1474 0.7996 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1081639 3 0.4990 0.8049 0.000 0.184 0.756 0.060
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.5457 0.6514 0.000 0.728 0.088 0.184
#> SRR1312147 1 0.2021 0.7967 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR1473891 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1335470 4 0.5257 0.7777 0.444 0.000 0.008 0.548
#> SRR1474930 2 0.6386 0.5845 0.000 0.640 0.124 0.236
#> SRR1470988 4 0.6176 0.8128 0.424 0.000 0.052 0.524
#> SRR811915 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.2222 0.7903 0.000 0.924 0.016 0.060
#> SRR1313770 3 0.7010 0.6876 0.000 0.184 0.576 0.240
#> SRR1315780 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1073631 1 0.1716 0.7918 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR819124 1 0.4356 0.3472 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1310997 2 0.6552 0.5222 0.000 0.576 0.096 0.328
#> SRR1464494 2 0.6603 0.5159 0.000 0.572 0.100 0.328
#> SRR1357083 3 0.5057 0.8251 0.000 0.340 0.648 0.012
#> SRR1475842 2 0.5495 0.6574 0.000 0.728 0.096 0.176
#> SRR1378085 1 0.1211 0.8113 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1378220 3 0.5090 0.8359 0.000 0.324 0.660 0.016
#> SRR1467704 1 0.1724 0.8028 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1348885 3 0.7254 0.4300 0.000 0.148 0.468 0.384
#> SRR1325826 1 0.2647 0.7369 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1466812 4 0.4948 0.7781 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1345692 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1401040 3 0.4387 0.8253 0.000 0.200 0.776 0.024
#> SRR1097954 1 0.1305 0.8100 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1374396 4 0.6895 0.8074 0.400 0.000 0.108 0.492
#> SRR1454073 2 0.6010 0.6222 0.000 0.676 0.104 0.220
#> SRR1355747 1 0.1929 0.7980 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1429368 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1398138 2 0.6050 0.6174 0.000 0.668 0.100 0.232
#> SRR1379260 1 0.1820 0.8027 0.944 0.000 0.036 0.020
#> SRR1361436 3 0.4877 0.8348 0.000 0.328 0.664 0.008
#> SRR817142 2 0.2796 0.7246 0.000 0.892 0.092 0.016
#> SRR1315291 4 0.6724 0.5785 0.224 0.000 0.164 0.612
#> SRR1309314 3 0.5690 0.7840 0.000 0.168 0.716 0.116
#> SRR1420085 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1361308 3 0.4877 0.8348 0.000 0.328 0.664 0.008
#> SRR1472126 1 0.4134 0.4453 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1380482 3 0.7589 0.4994 0.000 0.396 0.408 0.196
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.4035 0.7100 0.000 0.804 0.020 0.176
#> SRR1339276 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.3497 0.7322 0.860 0.000 0.036 0.104
#> SRR1399353 1 0.2670 0.7820 0.904 0.000 0.072 0.024
#> SRR1096760 3 0.4836 0.8386 0.000 0.320 0.672 0.008
#> SRR1440290 2 0.7218 -0.2140 0.000 0.444 0.416 0.140
#> SRR1330813 2 0.2730 0.7294 0.000 0.896 0.088 0.016
#> SRR1458931 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR812294 4 0.6716 0.8125 0.404 0.000 0.092 0.504
#> SRR1394321 1 0.1297 0.8101 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0336 0.8187 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1084698 2 0.1356 0.8066 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1390143 1 0.2345 0.7595 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.5172 0.7996 0.000 0.188 0.744 0.068
#> SRR1312169 4 0.4955 0.7731 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1096687 4 0.5155 0.7329 0.468 0.000 0.004 0.528
#> SRR1486139 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.7276 0.7876 0.404 0.000 0.148 0.448
#> SRR1447893 3 0.5167 0.8239 0.000 0.340 0.644 0.016
#> SRR1466025 2 0.2197 0.7835 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1477429 1 0.5935 -0.6537 0.496 0.000 0.036 0.468
#> SRR1445701 3 0.7001 0.6800 0.000 0.196 0.580 0.224
#> SRR820689 1 0.0921 0.8119 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1451876 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1344462 1 0.1716 0.7925 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1082709 1 0.4072 0.4696 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1447784 1 0.4401 0.6188 0.812 0.000 0.076 0.112
#> SRR1355769 4 0.5372 0.7708 0.444 0.000 0.012 0.544
#> SRR1488237 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1391985 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1478501 1 0.1118 0.8111 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1480917 2 0.6086 0.5077 0.000 0.680 0.132 0.188
#> SRR1474485 1 0.4245 0.6285 0.820 0.000 0.064 0.116
#> SRR1089998 1 0.0921 0.8119 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1318140 1 0.1022 0.8115 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1319262 3 0.4999 0.8341 0.000 0.328 0.660 0.012
#> SRR1095188 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1454350 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.5346 0.7960 0.000 0.192 0.732 0.076
#> SRR1105417 4 0.6537 0.8075 0.424 0.000 0.076 0.500
#> SRR1325578 3 0.7178 0.7508 0.000 0.324 0.520 0.156
#> SRR1358161 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.1489 0.8002 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR1452010 1 0.4977 -0.4991 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1418183 2 0.6565 0.5538 0.000 0.628 0.148 0.224
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.2469 0.7504 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1473461 1 0.1004 0.8173 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1090837 3 0.4917 0.8281 0.000 0.336 0.656 0.008
#> SRR1447828 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4889 0.8079 0.000 0.360 0.636 0.004
#> SRR1350280 1 0.4624 0.1198 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1088557 1 0.2704 0.7306 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1102656 2 0.1854 0.7970 0.000 0.940 0.012 0.048
#> SRR1441443 2 0.5763 0.6398 0.000 0.700 0.096 0.204
#> SRR1370682 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1475448 3 0.5038 0.8286 0.000 0.336 0.652 0.012
#> SRR1407291 1 0.4500 0.2396 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1405266 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.4584 0.2999 0.696 0.000 0.004 0.300
#> SRR1082592 2 0.7714 -0.2300 0.000 0.440 0.316 0.244
#> SRR1325794 2 0.2345 0.7713 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1095961 3 0.4699 0.8389 0.000 0.320 0.676 0.004
#> SRR1086702 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.6289 0.5963 0.000 0.648 0.116 0.236
#> SRR1457527 3 0.4877 0.8348 0.000 0.328 0.664 0.008
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.4956 0.8052 0.000 0.188 0.756 0.056
#> SRR1488858 4 0.7065 0.7981 0.404 0.000 0.124 0.472
#> SRR1454695 1 0.5106 0.3873 0.720 0.000 0.040 0.240
#> SRR1090241 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0188 0.8189 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357733 1 0.0336 0.8187 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1362135 1 0.1820 0.8009 0.944 0.000 0.036 0.020
#> SRR1379581 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1309182 1 0.4277 0.3813 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1437668 1 0.1929 0.7980 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1084742 2 0.6587 0.5218 0.000 0.576 0.100 0.324
#> SRR1433538 1 0.4643 0.0968 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1085063 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.5457 0.6491 0.000 0.728 0.088 0.184
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.4535 0.4141 0.000 0.744 0.240 0.016
#> SRR1072388 1 0.1929 0.7980 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1070332 2 0.3529 0.7334 0.000 0.836 0.012 0.152
#> SRR1320761 2 0.2973 0.7434 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1076195 4 0.6901 0.8059 0.404 0.000 0.108 0.488
#> SRR1069895 3 0.5269 0.7991 0.000 0.364 0.620 0.016
#> SRR1099144 1 0.3004 0.7655 0.892 0.000 0.048 0.060
#> SRR1385150 3 0.4857 0.8370 0.000 0.324 0.668 0.008
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.6901 0.8059 0.404 0.000 0.108 0.488
#> SRR1102583 1 0.3942 0.5125 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1456971 1 0.1929 0.7980 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1340574 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.5744 0.6411 0.000 0.708 0.108 0.184
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.7330 0.6500 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1408553 4 0.5808 0.8112 0.424 0.000 0.032 0.544
#> SRR1069231 1 0.3942 0.5140 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1325642 2 0.1256 0.8107 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1362103 1 0.0592 0.8167 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1321942 1 0.0188 0.8193 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1182 0.8035 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1077874 2 0.2334 0.7789 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR808299 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1098050 2 0.4035 0.7100 0.000 0.804 0.020 0.176
#> SRR1481238 2 0.7049 0.4666 0.000 0.572 0.192 0.236
#> SRR1443568 2 0.7621 0.1069 0.000 0.468 0.296 0.236
#> SRR1380249 4 0.7026 0.7996 0.404 0.000 0.120 0.476
#> SRR1080143 1 0.4431 0.2901 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1383148 4 0.6857 0.8082 0.404 0.000 0.104 0.492
#> SRR1357042 1 0.4567 0.4006 0.716 0.000 0.008 0.276
#> SRR1416025 2 0.5727 0.6419 0.000 0.704 0.096 0.200
#> SRR1431015 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1078709 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR813283 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.5872 -0.1274 0.000 0.040 0.384 0.576
#> SRR807679 1 0.1520 0.8064 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1333811 3 0.6397 0.7471 0.000 0.184 0.652 0.164
#> SRR1078660 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.1520 0.8064 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1432542 1 0.2021 0.7967 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR1418041 1 0.2647 0.7352 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1085211 1 0.1767 0.8077 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.2670 0.7820 0.904 0.000 0.072 0.024
#> SRR1350958 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1396822 3 0.5313 0.7835 0.000 0.376 0.608 0.016
#> SRR1441934 2 0.5615 0.6497 0.000 0.716 0.096 0.188
#> SRR1472552 3 0.4857 0.8359 0.000 0.324 0.668 0.008
#> SRR1488881 3 0.5038 0.8283 0.000 0.336 0.652 0.012
#> SRR1102973 1 0.1677 0.8090 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR1071131 2 0.6594 0.5452 0.000 0.624 0.148 0.228
#> SRR1074502 1 0.2469 0.7504 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1325271 1 0.2408 0.7880 0.920 0.000 0.044 0.036
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0921 0.8140 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1430045 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441245 2 0.0779 0.8164 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1384091 4 0.6764 0.8115 0.404 0.000 0.096 0.500
#> SRR1431887 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096525 4 0.6108 0.8154 0.424 0.000 0.048 0.528
#> SRR1488491 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1356351 2 0.3161 0.7383 0.000 0.864 0.012 0.124
#> SRR1369514 4 0.4916 0.7947 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1453299 3 0.4564 0.8355 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.3764 0.7184 0.000 0.816 0.012 0.172
#> SRR1091767 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1354467 3 0.4857 0.8370 0.000 0.324 0.668 0.008
#> SRR1069074 2 0.0469 0.8148 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452399 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1437430 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1419736 2 0.4423 0.6951 0.000 0.788 0.036 0.176
#> SRR1313343 3 0.4776 0.8489 0.000 0.272 0.712 0.016
#> SRR1077619 1 0.6398 -0.3531 0.576 0.000 0.080 0.344
#> SRR1083530 1 0.2443 0.7856 0.916 0.000 0.024 0.060
#> SRR1333633 3 0.5085 0.8511 0.000 0.260 0.708 0.032
#> SRR1354999 2 0.7252 0.3590 0.000 0.544 0.232 0.224
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.2469 0.7501 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1378818 3 0.7211 0.7361 0.000 0.264 0.544 0.192
#> SRR1413182 4 0.6764 0.8128 0.404 0.000 0.096 0.500
#> SRR1464559 1 0.6553 -0.2983 0.584 0.000 0.100 0.316
#> SRR1413075 2 0.6603 0.5159 0.000 0.572 0.100 0.328
#> SRR1487928 4 0.6857 0.8082 0.404 0.000 0.104 0.492
#> SRR1388997 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1092865 2 0.5436 0.6595 0.000 0.732 0.092 0.176
#> SRR1102729 1 0.2111 0.7937 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1339903 1 0.4250 0.3694 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1346710 1 0.1411 0.8079 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.2676 0.7744 0.000 0.896 0.012 0.092
#> SRR1480941 3 0.6420 0.8012 0.000 0.228 0.640 0.132
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.2760 0.7253 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1433884 2 0.5995 0.6210 0.000 0.672 0.096 0.232
#> SRR1471074 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1353052 2 0.5727 0.6419 0.000 0.704 0.096 0.200
#> SRR1355554 2 0.7716 -0.2425 0.000 0.396 0.380 0.224
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.5900 0.6303 0.000 0.684 0.096 0.220
#> SRR1318331 2 0.5454 0.6597 0.000 0.732 0.096 0.172
#> SRR1321333 3 0.4891 0.8405 0.000 0.308 0.680 0.012
#> SRR1474231 1 0.0592 0.8167 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1350545 1 0.4916 -0.4140 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1091328 1 0.1724 0.8032 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR814447 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1455989 3 0.5503 0.6284 0.000 0.468 0.516 0.016
#> SRR1453680 3 0.4054 0.8182 0.000 0.188 0.796 0.016
#> SRR1470356 2 0.0336 0.8168 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.5220 0.6714 0.000 0.752 0.092 0.156
#> SRR1097197 1 0.4994 -0.6091 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1366729 3 0.4267 0.8164 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR821282 3 0.4690 0.8514 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1074602 2 0.1182 0.8035 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR814633 2 0.0000 0.8192 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.6513 0.7636 0.000 0.184 0.640 0.176
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.6903 0.6911 0.000 0.184 0.592 0.224
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.6985 0.8064 0.404 0.000 0.116 0.480
#> SRR1444598 3 0.7607 0.5484 0.000 0.236 0.472 0.292
#> SRR1091743 2 0.1182 0.8035 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR819637 1 0.0336 0.8187 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.8196 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.5284 0.7943 0.000 0.368 0.616 0.016
#> SRR1459785 3 0.5307 0.7968 0.000 0.188 0.736 0.076
#> SRR1083700 1 0.0921 0.8141 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1375531 1 0.3335 0.6978 0.856 0.000 0.016 0.128
#> SRR1323470 4 0.7921 -0.5870 0.000 0.328 0.324 0.348
#> SRR814657 4 0.4985 0.7354 0.468 0.000 0.000 0.532
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0162 0.69694 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR815446 2 0.0566 0.69600 0.004 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR1402132 4 0.6092 0.42538 0.020 0.000 0.076 0.524 0.380
#> SRR1326059 4 0.4276 -0.12061 0.380 0.000 0.004 0.616 0.000
#> SRR1409062 2 0.2374 0.66527 0.016 0.912 0.052 0.000 0.020
#> SRR809406 4 0.4397 -0.34851 0.432 0.000 0.004 0.564 0.000
#> SRR1465313 5 0.7007 0.23021 0.052 0.116 0.368 0.000 0.464
#> SRR819559 1 0.4869 0.84418 0.624 0.000 0.004 0.344 0.028
#> SRR1387899 3 0.7566 0.21310 0.272 0.096 0.480 0.000 0.152
#> SRR1442292 2 0.0510 0.69566 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.4390 0.74587 0.568 0.000 0.004 0.428 0.000
#> SRR1395635 1 0.5199 0.83476 0.640 0.000 0.020 0.308 0.032
#> SRR1343629 1 0.4135 0.85486 0.656 0.000 0.004 0.340 0.000
#> SRR1326868 2 0.1904 0.67757 0.016 0.936 0.020 0.000 0.028
#> SRR1102320 4 0.4178 0.24145 0.292 0.000 0.004 0.696 0.008
#> SRR1469926 3 0.3559 0.73583 0.004 0.096 0.836 0.000 0.064
#> SRR1070036 1 0.5578 0.83942 0.592 0.000 0.032 0.344 0.032
#> SRR1098426 1 0.5435 0.82765 0.628 0.000 0.028 0.308 0.036
#> SRR1090310 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1429748 4 0.4451 0.38371 0.236 0.000 0.004 0.724 0.036
#> SRR1363654 1 0.4551 0.72871 0.556 0.000 0.004 0.436 0.004
#> SRR1326317 2 0.2708 0.65189 0.016 0.892 0.072 0.000 0.020
#> SRR1378308 2 0.0510 0.69566 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.3906 0.59695 0.016 0.000 0.000 0.744 0.240
#> SRR1329947 1 0.4251 0.82417 0.624 0.000 0.004 0.372 0.000
#> SRR1469769 3 0.3827 0.74992 0.004 0.112 0.816 0.000 0.068
#> SRR1490761 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380122 5 0.6740 0.25778 0.000 0.268 0.328 0.000 0.404
#> SRR1402944 5 0.6800 0.27970 0.004 0.240 0.332 0.000 0.424
#> SRR1092818 1 0.5199 0.83476 0.640 0.000 0.020 0.308 0.032
#> SRR1093552 1 0.5944 0.80464 0.592 0.000 0.028 0.312 0.068
#> SRR1464880 2 0.3086 0.55283 0.004 0.816 0.000 0.000 0.180
#> SRR1078368 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.7011 0.19243 0.288 0.516 0.048 0.000 0.148
#> SRR1466951 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1331879 2 0.3885 0.44028 0.008 0.724 0.000 0.000 0.268
#> SRR1320034 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1068687 2 0.7602 0.05704 0.304 0.424 0.060 0.000 0.212
#> SRR1437491 1 0.3983 0.85602 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1310777 2 0.4381 0.53898 0.104 0.800 0.044 0.000 0.052
#> SRR1374005 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1319182 4 0.4291 -0.46722 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1329994 4 0.2300 0.64023 0.024 0.000 0.000 0.904 0.072
#> SRR1354203 1 0.5386 0.82925 0.608 0.000 0.036 0.336 0.020
#> SRR1077850 1 0.3983 0.85602 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1369241 2 0.0404 0.69619 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.5267 0.20598 0.008 0.604 0.044 0.000 0.344
#> SRR1455214 1 0.4286 0.85536 0.652 0.000 0.004 0.340 0.004
#> SRR1092014 2 0.6517 0.15889 0.020 0.568 0.224 0.000 0.188
#> SRR1097857 1 0.5911 0.77332 0.556 0.000 0.036 0.364 0.044
#> SRR1473318 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1345974 3 0.3960 0.76536 0.004 0.140 0.800 0.000 0.056
#> SRR1338687 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.2452 0.63718 0.028 0.000 0.012 0.908 0.052
#> SRR1486821 3 0.4088 0.76337 0.004 0.140 0.792 0.000 0.064
#> SRR1418540 1 0.5636 0.81987 0.616 0.000 0.028 0.308 0.048
#> SRR1408788 2 0.4975 0.48099 0.016 0.740 0.108 0.000 0.136
#> SRR1359487 4 0.3944 0.60026 0.016 0.000 0.004 0.756 0.224
#> SRR1080648 1 0.5979 0.81207 0.596 0.000 0.044 0.308 0.052
#> SRR1414708 1 0.6230 0.74635 0.552 0.000 0.028 0.336 0.084
#> SRR1469080 2 0.3209 0.59866 0.004 0.848 0.028 0.000 0.120
#> SRR1365722 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1448118 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1444808 4 0.6727 0.29683 0.224 0.000 0.028 0.552 0.196
#> SRR1321829 2 0.1997 0.67497 0.016 0.932 0.024 0.000 0.028
#> SRR1475993 3 0.4114 0.66685 0.000 0.272 0.712 0.000 0.016
#> SRR1445387 1 0.4448 0.61416 0.516 0.000 0.004 0.480 0.000
#> SRR1077575 2 0.5603 0.15388 0.008 0.572 0.064 0.000 0.356
#> SRR1349300 4 0.3928 0.22581 0.296 0.000 0.004 0.700 0.000
#> SRR1374165 1 0.6647 0.55637 0.480 0.000 0.036 0.384 0.100
#> SRR1453769 2 0.0162 0.69694 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473870 4 0.2690 0.51728 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1401146 2 0.3395 0.60992 0.016 0.848 0.108 0.000 0.028
#> SRR1366124 4 0.4138 0.58541 0.016 0.000 0.000 0.708 0.276
#> SRR1391811 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1456674 1 0.6650 0.76354 0.548 0.000 0.064 0.308 0.080
#> SRR1086490 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1404577 4 0.0981 0.63434 0.008 0.000 0.012 0.972 0.008
#> SRR1384431 4 0.5084 -0.46784 0.452 0.000 0.016 0.520 0.012
#> SRR1072055 1 0.5576 0.83992 0.608 0.000 0.032 0.324 0.036
#> SRR1359738 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.5386 0.82925 0.608 0.000 0.036 0.336 0.020
#> SRR1085900 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1442173 1 0.4151 0.85279 0.652 0.000 0.004 0.344 0.000
#> SRR1431625 2 0.0794 0.69231 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.5536 0.17672 0.008 0.580 0.060 0.000 0.352
#> SRR1344034 3 0.7981 0.02987 0.300 0.096 0.388 0.000 0.216
#> SRR1080391 4 0.2653 0.63889 0.024 0.000 0.000 0.880 0.096
#> SRR1347870 2 0.7358 0.11334 0.292 0.460 0.048 0.000 0.200
#> SRR814028 2 0.7270 0.13653 0.292 0.476 0.048 0.000 0.184
#> SRR814219 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1070620 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1102128 4 0.4955 0.06911 0.328 0.000 0.004 0.632 0.036
#> SRR1460211 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418346 2 0.5973 0.00508 0.012 0.524 0.080 0.000 0.384
#> SRR1070060 4 0.0693 0.63442 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1487969 2 0.2970 0.57734 0.004 0.828 0.000 0.000 0.168
#> SRR1417851 4 0.6293 0.35928 0.208 0.000 0.040 0.624 0.128
#> SRR1443350 2 0.0162 0.69681 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.5629 0.78251 0.548 0.000 0.024 0.392 0.036
#> SRR1076705 1 0.5362 0.83090 0.632 0.000 0.028 0.308 0.032
#> SRR1079380 5 0.6705 0.25216 0.044 0.396 0.092 0.000 0.468
#> SRR1102923 2 0.0510 0.69566 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.5135 0.43912 0.024 0.696 0.048 0.000 0.232
#> SRR1366605 2 0.0771 0.69461 0.004 0.976 0.020 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.7379 0.09931 0.292 0.456 0.048 0.000 0.204
#> SRR1436840 2 0.7072 0.17432 0.288 0.508 0.048 0.000 0.156
#> SRR1445573 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1375394 5 0.5459 -0.29754 0.012 0.000 0.036 0.456 0.496
#> SRR1431735 1 0.6697 0.75831 0.544 0.000 0.064 0.308 0.084
#> SRR1417387 1 0.5636 0.81829 0.616 0.000 0.028 0.308 0.048
#> SRR1445984 1 0.5833 0.81271 0.604 0.000 0.032 0.308 0.056
#> SRR1370447 4 0.2727 0.63309 0.000 0.000 0.016 0.868 0.116
#> SRR1446308 3 0.3979 0.73915 0.016 0.188 0.780 0.000 0.016
#> SRR1437346 3 0.2848 0.76869 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1103143 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.5199 0.83476 0.640 0.000 0.020 0.308 0.032
#> SRR1073191 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098974 1 0.4166 0.85007 0.648 0.000 0.004 0.348 0.000
#> SRR1468914 4 0.4505 0.59851 0.016 0.000 0.028 0.736 0.220
#> SRR1319584 2 0.6168 -0.14618 0.008 0.476 0.104 0.000 0.412
#> SRR1486584 4 0.4403 -0.36839 0.436 0.000 0.004 0.560 0.000
#> SRR813536 4 0.2189 0.63726 0.000 0.000 0.012 0.904 0.084
#> SRR1317939 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1079730 1 0.4341 0.78043 0.592 0.000 0.004 0.404 0.000
#> SRR1341921 4 0.2136 0.59854 0.088 0.000 0.008 0.904 0.000
#> SRR1399178 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.4321 0.79028 0.600 0.000 0.004 0.396 0.000
#> SRR1328551 2 0.6456 0.30267 0.232 0.604 0.048 0.000 0.116
#> SRR1453259 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.5555 0.09350 0.008 0.556 0.056 0.000 0.380
#> SRR1079543 2 0.0000 0.69689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.7358 0.10583 0.292 0.460 0.048 0.000 0.200
#> SRR1076681 2 0.7316 0.12671 0.300 0.464 0.048 0.000 0.188
#> SRR1335314 4 0.4537 0.59371 0.016 0.000 0.024 0.724 0.236
#> SRR1400799 3 0.5525 0.58851 0.136 0.096 0.716 0.000 0.052
#> SRR1074578 4 0.0290 0.63291 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1312226 2 0.4327 0.27199 0.008 0.632 0.000 0.000 0.360
#> SRR1416207 1 0.5152 0.83744 0.620 0.000 0.028 0.336 0.016
#> SRR1447371 1 0.5469 0.82552 0.604 0.000 0.036 0.336 0.024
#> SRR1069328 4 0.2074 0.63883 0.000 0.000 0.036 0.920 0.044
#> SRR1445023 4 0.4449 0.60942 0.012 0.000 0.048 0.760 0.180
#> SRR1077599 2 0.3774 0.54329 0.016 0.816 0.140 0.000 0.028
#> SRR1453480 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1101834 2 0.0000 0.69689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.5409 0.82832 0.628 0.000 0.020 0.308 0.044
#> SRR1074839 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1458727 5 0.4318 0.32732 0.008 0.020 0.196 0.012 0.764
#> SRR1436949 2 0.4697 0.24494 0.008 0.620 0.012 0.000 0.360
#> SRR1070429 3 0.3210 0.74689 0.000 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1458158 4 0.3177 0.44315 0.208 0.000 0.000 0.792 0.000
#> SRR1432408 4 0.4571 0.56707 0.020 0.000 0.004 0.664 0.312
#> SRR1310334 4 0.4238 -0.07941 0.368 0.000 0.004 0.628 0.000
#> SRR1418201 3 0.3559 0.73583 0.004 0.096 0.836 0.000 0.064
#> SRR1385434 4 0.4695 0.58527 0.016 0.000 0.024 0.700 0.260
#> SRR1415591 3 0.4308 0.69061 0.068 0.096 0.804 0.000 0.032
#> SRR1402009 1 0.4387 0.85708 0.652 0.000 0.004 0.336 0.008
#> SRR1316055 4 0.7130 -0.01182 0.308 0.000 0.028 0.456 0.208
#> SRR1308734 3 0.4045 0.76390 0.004 0.136 0.796 0.000 0.064
#> SRR1498973 2 0.5765 0.05988 0.012 0.544 0.064 0.000 0.380
#> SRR1397115 4 0.1082 0.62959 0.028 0.000 0.008 0.964 0.000
#> SRR1392141 1 0.6650 0.76354 0.548 0.000 0.064 0.308 0.080
#> SRR814341 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.2830 0.64192 0.016 0.884 0.080 0.000 0.020
#> SRR1459609 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1499325 3 0.4017 0.76072 0.004 0.128 0.800 0.000 0.068
#> SRR809919 4 0.5832 -0.49020 0.436 0.000 0.040 0.496 0.028
#> SRR1370818 4 0.5835 0.51514 0.112 0.000 0.032 0.668 0.188
#> SRR1323651 3 0.7618 0.19136 0.288 0.096 0.464 0.000 0.152
#> SRR1357297 4 0.0865 0.62989 0.024 0.000 0.004 0.972 0.000
#> SRR818170 5 0.6822 0.38322 0.004 0.296 0.268 0.000 0.432
#> SRR1091230 2 0.2333 0.66531 0.016 0.916 0.040 0.000 0.028
#> SRR1470556 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR812318 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1095285 3 0.6822 0.40266 0.196 0.096 0.596 0.000 0.112
#> SRR1317731 5 0.6722 0.17679 0.004 0.212 0.356 0.000 0.428
#> SRR1490785 1 0.4235 0.85762 0.656 0.000 0.000 0.336 0.008
#> SRR1432032 1 0.5527 0.83372 0.620 0.000 0.032 0.312 0.036
#> SRR1447808 4 0.4367 -0.28424 0.416 0.000 0.004 0.580 0.000
#> SRR809534 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.6089 0.07277 0.012 0.536 0.096 0.000 0.356
#> SRR812128 5 0.6710 0.26825 0.068 0.396 0.064 0.000 0.472
#> SRR1101513 4 0.5708 -0.53154 0.460 0.000 0.036 0.480 0.024
#> SRR1415708 2 0.2938 0.64202 0.008 0.880 0.064 0.000 0.048
#> SRR1316033 3 0.3452 0.76638 0.000 0.148 0.820 0.000 0.032
#> SRR1390371 2 0.1560 0.68456 0.004 0.948 0.020 0.000 0.028
#> SRR1480263 2 0.0000 0.69689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1076801 1 0.5758 0.81137 0.608 0.000 0.028 0.308 0.056
#> SRR1080044 1 0.4865 0.73340 0.552 0.000 0.012 0.428 0.008
#> SRR1420850 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474295 4 0.2149 0.63698 0.000 0.000 0.048 0.916 0.036
#> SRR1069871 4 0.4331 -0.21318 0.400 0.000 0.004 0.596 0.000
#> SRR1095744 2 0.5548 0.16458 0.008 0.576 0.060 0.000 0.356
#> SRR1068929 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1075054 2 0.2775 0.62421 0.004 0.876 0.020 0.000 0.100
#> SRR1083480 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1075458 1 0.5199 0.83476 0.640 0.000 0.020 0.308 0.032
#> SRR1417023 4 0.4339 0.57753 0.020 0.000 0.000 0.684 0.296
#> SRR1309333 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1333676 4 0.4608 0.31819 0.260 0.000 0.004 0.700 0.036
#> SRR1352996 4 0.2127 0.57352 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000
#> SRR1093172 4 0.2519 0.63487 0.000 0.000 0.016 0.884 0.100
#> SRR1413137 4 0.2172 0.63707 0.000 0.000 0.016 0.908 0.076
#> SRR1469973 2 0.7507 0.07610 0.292 0.436 0.052 0.000 0.220
#> SRR1420026 2 0.7379 0.09931 0.292 0.456 0.048 0.000 0.204
#> SRR817306 4 0.1836 0.63950 0.032 0.000 0.000 0.932 0.036
#> SRR1416266 4 0.2777 0.63149 0.000 0.000 0.016 0.864 0.120
#> SRR1071011 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3011 0.62880 0.016 0.000 0.000 0.844 0.140
#> SRR1435394 3 0.4941 0.51725 0.016 0.324 0.640 0.000 0.020
#> SRR1383192 4 0.0807 0.63597 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1419962 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1094357 1 0.4425 0.69318 0.544 0.000 0.004 0.452 0.000
#> SRR1081639 3 0.5038 0.66098 0.024 0.092 0.740 0.000 0.144
#> SRR1356016 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0510 0.69566 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.5611 0.08277 0.008 0.552 0.060 0.000 0.380
#> SRR1312147 1 0.6147 0.78347 0.576 0.000 0.028 0.312 0.084
#> SRR1473891 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1335470 4 0.1412 0.63720 0.008 0.000 0.004 0.952 0.036
#> SRR1474930 2 0.7649 0.04562 0.304 0.420 0.064 0.000 0.212
#> SRR1470988 4 0.2727 0.63309 0.000 0.000 0.016 0.868 0.116
#> SRR811915 2 0.0510 0.69566 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.4135 0.85486 0.656 0.000 0.004 0.340 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.69689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.4507 0.49804 0.024 0.756 0.032 0.000 0.188
#> SRR1313770 3 0.6509 -0.00166 0.028 0.096 0.456 0.000 0.420
#> SRR1315780 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1073631 1 0.4449 0.61006 0.512 0.000 0.004 0.484 0.000
#> SRR819124 4 0.3762 0.36591 0.244 0.000 0.004 0.748 0.004
#> SRR1310997 5 0.7296 0.29469 0.172 0.332 0.048 0.000 0.448
#> SRR1464494 5 0.7649 0.20344 0.264 0.332 0.048 0.000 0.356
#> SRR1357083 3 0.3003 0.75310 0.000 0.188 0.812 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.7101 0.16824 0.288 0.504 0.048 0.000 0.160
#> SRR1378085 1 0.4420 0.71925 0.548 0.000 0.004 0.448 0.000
#> SRR1378220 3 0.3544 0.76055 0.016 0.164 0.812 0.000 0.008
#> SRR1467704 1 0.5510 0.82835 0.624 0.000 0.032 0.308 0.036
#> SRR1348885 5 0.3623 0.35871 0.008 0.020 0.136 0.008 0.828
#> SRR1325826 4 0.4359 -0.26352 0.412 0.000 0.004 0.584 0.000
#> SRR1466812 4 0.0290 0.63291 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1345692 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1401040 3 0.3617 0.73409 0.028 0.104 0.840 0.000 0.028
#> SRR1097954 1 0.5469 0.82552 0.604 0.000 0.036 0.336 0.024
#> SRR1374396 4 0.4089 0.59465 0.016 0.000 0.004 0.736 0.244
#> SRR1454073 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1355747 1 0.5698 0.81573 0.612 0.000 0.028 0.308 0.052
#> SRR1429368 3 0.3891 0.76428 0.004 0.128 0.808 0.000 0.060
#> SRR1398138 2 0.7507 0.07610 0.292 0.436 0.052 0.000 0.220
#> SRR1379260 1 0.5908 0.81079 0.596 0.000 0.032 0.312 0.060
#> SRR1361436 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.3509 0.58355 0.016 0.832 0.132 0.000 0.020
#> SRR1315291 4 0.4989 0.41471 0.016 0.000 0.008 0.520 0.456
#> SRR1309314 3 0.5026 0.54997 0.004 0.068 0.684 0.000 0.244
#> SRR1420085 2 0.7398 0.09612 0.292 0.452 0.048 0.000 0.208
#> SRR1361308 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1472126 4 0.3612 0.31422 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1380482 5 0.6875 0.30828 0.004 0.276 0.312 0.000 0.408
#> SRR1099789 1 0.4135 0.85486 0.656 0.000 0.004 0.340 0.000
#> SRR1079480 2 0.5697 0.14538 0.008 0.568 0.072 0.000 0.352
#> SRR1339276 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1418368 4 0.5462 -0.38666 0.420 0.000 0.024 0.532 0.024
#> SRR1399353 1 0.6602 0.76866 0.552 0.000 0.064 0.308 0.076
#> SRR1096760 3 0.2848 0.76851 0.004 0.156 0.840 0.000 0.000
#> SRR1440290 3 0.8349 -0.13941 0.252 0.260 0.344 0.000 0.144
#> SRR1330813 2 0.3416 0.59392 0.016 0.840 0.124 0.000 0.020
#> SRR1458931 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR812294 4 0.3789 0.60156 0.016 0.000 0.000 0.760 0.224
#> SRR1394321 1 0.4607 0.85508 0.656 0.000 0.004 0.320 0.020
#> SRR1081160 2 0.0000 0.69689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1349342 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1477173 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084698 2 0.1851 0.64559 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1390143 4 0.4651 -0.33649 0.428 0.000 0.004 0.560 0.008
#> SRR1390413 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1099570 3 0.4246 0.69433 0.064 0.096 0.808 0.000 0.032
#> SRR1312169 4 0.0693 0.63442 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1096687 4 0.0960 0.63505 0.016 0.000 0.004 0.972 0.008
#> SRR1486139 1 0.3983 0.85602 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1470313 4 0.5331 0.56646 0.020 0.000 0.056 0.668 0.256
#> SRR1447893 3 0.3851 0.72109 0.016 0.212 0.768 0.000 0.004
#> SRR1466025 2 0.3127 0.60076 0.004 0.848 0.020 0.000 0.128
#> SRR1477429 4 0.3673 0.62490 0.040 0.000 0.052 0.848 0.060
#> SRR1445701 3 0.7994 0.03253 0.296 0.100 0.392 0.000 0.212
#> SRR820689 1 0.4359 0.76761 0.584 0.000 0.004 0.412 0.000
#> SRR1451876 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1452537 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1383301 1 0.4403 0.85552 0.648 0.000 0.004 0.340 0.008
#> SRR1489328 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1344462 1 0.4449 0.60919 0.512 0.000 0.004 0.484 0.000
#> SRR1082709 4 0.3612 0.31422 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1447784 1 0.6711 0.55467 0.476 0.000 0.028 0.372 0.124
#> SRR1355769 4 0.0981 0.63434 0.008 0.000 0.012 0.972 0.008
#> SRR1488237 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1391985 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478501 1 0.5386 0.82925 0.608 0.000 0.036 0.336 0.020
#> SRR1480917 2 0.6812 -0.23848 0.012 0.440 0.188 0.000 0.360
#> SRR1474485 1 0.6607 0.58669 0.488 0.000 0.032 0.376 0.104
#> SRR1089998 1 0.4288 0.80824 0.612 0.000 0.004 0.384 0.000
#> SRR1318140 1 0.4397 0.73939 0.564 0.000 0.004 0.432 0.000
#> SRR1319262 3 0.3010 0.76432 0.004 0.172 0.824 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1454350 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1440374 1 0.4211 0.84302 0.636 0.000 0.004 0.360 0.000
#> SRR1359565 3 0.4832 0.65341 0.100 0.096 0.768 0.000 0.036
#> SRR1105417 4 0.3389 0.62992 0.000 0.000 0.048 0.836 0.116
#> SRR1325578 3 0.6291 0.17965 0.000 0.164 0.492 0.000 0.344
#> SRR1358161 3 0.4017 0.76072 0.004 0.128 0.800 0.000 0.068
#> SRR1358665 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.2179 0.62424 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1452010 4 0.2136 0.59346 0.088 0.000 0.000 0.904 0.008
#> SRR1418183 2 0.7915 -0.01156 0.300 0.400 0.092 0.000 0.208
#> SRR1366345 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1387449 4 0.4397 -0.35304 0.432 0.000 0.004 0.564 0.000
#> SRR1473461 1 0.5101 0.84739 0.628 0.000 0.012 0.328 0.032
#> SRR1090837 3 0.3274 0.73903 0.000 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1338747 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333038 3 0.3398 0.72715 0.000 0.216 0.780 0.000 0.004
#> SRR1350280 4 0.2424 0.55072 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1088557 4 0.4276 -0.13550 0.380 0.000 0.004 0.616 0.000
#> SRR1102656 2 0.2818 0.59872 0.000 0.856 0.012 0.000 0.132
#> SRR1441443 2 0.7398 0.10107 0.292 0.452 0.048 0.000 0.208
#> SRR1370682 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1475448 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1407291 4 0.2773 0.50933 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1405266 1 0.4302 0.85342 0.648 0.000 0.004 0.344 0.004
#> SRR1363766 4 0.3039 0.46685 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1082592 5 0.6726 0.45415 0.008 0.284 0.224 0.000 0.484
#> SRR1325794 2 0.4440 0.50465 0.020 0.752 0.028 0.000 0.200
#> SRR1095961 3 0.2848 0.76869 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1086702 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.7584 0.06664 0.304 0.428 0.060 0.000 0.208
#> SRR1457527 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3594 0.72304 0.032 0.096 0.844 0.000 0.028
#> SRR1488858 4 0.4138 0.58535 0.016 0.000 0.000 0.708 0.276
#> SRR1454695 4 0.6220 -0.21255 0.368 0.000 0.028 0.528 0.076
#> SRR1090241 2 0.0162 0.69726 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1357733 1 0.3932 0.85818 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1362135 1 0.5680 0.82502 0.608 0.000 0.032 0.316 0.044
#> SRR1379581 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1309182 4 0.3508 0.35794 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1437668 1 0.5698 0.81559 0.612 0.000 0.028 0.308 0.052
#> SRR1084742 5 0.7033 0.32499 0.124 0.344 0.052 0.000 0.480
#> SRR1433538 4 0.2329 0.55965 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1085063 2 0.0771 0.69461 0.004 0.976 0.020 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.5877 0.03178 0.012 0.532 0.072 0.000 0.384
#> SRR1097100 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.4505 0.40133 0.016 0.720 0.244 0.000 0.020
#> SRR1072388 1 0.5817 0.80967 0.604 0.000 0.028 0.308 0.060
#> SRR1070332 2 0.4608 0.29615 0.008 0.644 0.012 0.000 0.336
#> SRR1320761 2 0.5354 0.33772 0.020 0.640 0.044 0.000 0.296
#> SRR1076195 4 0.4138 0.58541 0.016 0.000 0.000 0.708 0.276
#> SRR1069895 3 0.4450 0.67823 0.016 0.236 0.728 0.000 0.020
#> SRR1099144 1 0.6452 0.73146 0.540 0.000 0.028 0.324 0.108
#> SRR1385150 3 0.2848 0.76851 0.004 0.156 0.840 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332625 4 0.4315 0.59401 0.016 0.000 0.012 0.728 0.244
#> SRR1102583 4 0.3395 0.38573 0.236 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1456971 1 0.5891 0.81019 0.600 0.000 0.032 0.308 0.060
#> SRR1340574 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1444830 2 0.7276 0.15558 0.300 0.484 0.060 0.000 0.156
#> SRR1096267 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1087127 5 0.6913 0.26186 0.064 0.096 0.336 0.000 0.504
#> SRR1408553 4 0.2519 0.63487 0.000 0.000 0.016 0.884 0.100
#> SRR1069231 4 0.3635 0.35151 0.248 0.000 0.004 0.748 0.000
#> SRR1325642 2 0.0693 0.69408 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1362103 1 0.4218 0.85821 0.668 0.000 0.004 0.324 0.004
#> SRR1321942 1 0.4084 0.85844 0.668 0.000 0.004 0.328 0.000
#> SRR1094380 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1447499 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.2513 0.66051 0.016 0.904 0.060 0.000 0.020
#> SRR1077874 2 0.3398 0.58777 0.004 0.828 0.024 0.000 0.144
#> SRR808299 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1098050 2 0.5548 0.16973 0.008 0.576 0.060 0.000 0.356
#> SRR1481238 2 0.8085 -0.07948 0.304 0.372 0.108 0.000 0.216
#> SRR1443568 2 0.8344 -0.16960 0.300 0.336 0.152 0.000 0.212
#> SRR1380249 4 0.4843 0.57493 0.020 0.000 0.028 0.696 0.256
#> SRR1080143 4 0.3231 0.46005 0.196 0.000 0.004 0.800 0.000
#> SRR1383148 4 0.4040 0.59108 0.016 0.000 0.000 0.724 0.260
#> SRR1357042 4 0.4338 0.23456 0.280 0.000 0.000 0.696 0.024
#> SRR1416025 2 0.7257 0.14092 0.288 0.480 0.048 0.000 0.184
#> SRR1431015 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1078709 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR813283 1 0.4135 0.85486 0.656 0.000 0.004 0.340 0.000
#> SRR1430226 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070665 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1466927 2 0.0162 0.69694 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347707 5 0.3567 0.33837 0.008 0.008 0.092 0.044 0.848
#> SRR807679 1 0.5199 0.83476 0.640 0.000 0.020 0.308 0.032
#> SRR1333811 3 0.7631 0.23550 0.260 0.096 0.476 0.000 0.168
#> SRR1078660 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1331730 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.5199 0.83476 0.640 0.000 0.020 0.308 0.032
#> SRR1432542 1 0.6049 0.79132 0.584 0.000 0.028 0.312 0.076
#> SRR1418041 4 0.4449 -0.16029 0.388 0.000 0.004 0.604 0.004
#> SRR1085211 1 0.5544 0.82988 0.616 0.000 0.036 0.316 0.032
#> SRR1339812 2 0.0000 0.69689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.6650 0.76354 0.548 0.000 0.064 0.308 0.080
#> SRR1350958 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396822 3 0.4584 0.64812 0.016 0.256 0.708 0.000 0.020
#> SRR1441934 2 0.7183 0.15757 0.288 0.492 0.048 0.000 0.172
#> SRR1472552 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.2966 0.75832 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.5555 0.82854 0.612 0.000 0.040 0.320 0.028
#> SRR1071131 2 0.7678 0.03749 0.296 0.424 0.068 0.000 0.212
#> SRR1074502 4 0.4403 -0.36961 0.436 0.000 0.004 0.560 0.000
#> SRR1325271 1 0.6162 0.77750 0.572 0.000 0.028 0.316 0.084
#> SRR1409171 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.2379 0.67120 0.012 0.912 0.028 0.000 0.048
#> SRR1430045 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1441245 2 0.1124 0.68778 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1384091 4 0.3759 0.60498 0.016 0.000 0.000 0.764 0.220
#> SRR1431887 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1096525 4 0.2920 0.62961 0.000 0.000 0.016 0.852 0.132
#> SRR1488491 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1356351 2 0.5257 0.39364 0.020 0.680 0.056 0.000 0.244
#> SRR1369514 4 0.0912 0.63638 0.000 0.000 0.012 0.972 0.016
#> SRR1453299 3 0.3010 0.76558 0.000 0.172 0.824 0.000 0.004
#> SRR1436300 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1348490 2 0.5502 0.17336 0.008 0.576 0.056 0.000 0.360
#> SRR1091767 2 0.7379 0.09931 0.292 0.456 0.048 0.000 0.204
#> SRR1354467 3 0.2852 0.76529 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.1179 0.68713 0.016 0.964 0.004 0.000 0.016
#> SRR1452399 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1437430 3 0.4210 0.76078 0.004 0.140 0.784 0.000 0.072
#> SRR1419736 2 0.5759 0.12092 0.008 0.560 0.076 0.000 0.356
#> SRR1313343 3 0.3846 0.76330 0.000 0.144 0.800 0.000 0.056
#> SRR1077619 4 0.6399 0.35665 0.212 0.000 0.032 0.604 0.152
#> SRR1083530 1 0.5715 0.79651 0.564 0.000 0.012 0.360 0.064
#> SRR1333633 3 0.5114 0.72624 0.020 0.136 0.732 0.000 0.112
#> SRR1354999 2 0.8332 -0.14847 0.300 0.340 0.152 0.000 0.208
#> SRR1443592 2 0.0404 0.69625 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077356 4 0.4375 -0.29065 0.420 0.000 0.004 0.576 0.000
#> SRR1378818 3 0.6331 0.02381 0.004 0.136 0.440 0.000 0.420
#> SRR1413182 4 0.4004 0.59806 0.016 0.000 0.004 0.748 0.232
#> SRR1464559 4 0.6920 0.13855 0.276 0.000 0.028 0.508 0.188
#> SRR1413075 5 0.7134 0.31075 0.144 0.344 0.048 0.000 0.464
#> SRR1487928 4 0.4014 0.59225 0.016 0.000 0.000 0.728 0.256
#> SRR1388997 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1092865 2 0.7039 0.18296 0.296 0.508 0.048 0.000 0.148
#> SRR1102729 1 0.5787 0.80411 0.580 0.000 0.036 0.344 0.040
#> SRR1456423 1 0.4302 0.85342 0.648 0.000 0.004 0.344 0.004
#> SRR1321591 2 0.0566 0.69600 0.004 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR1376874 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1339903 4 0.3196 0.49406 0.192 0.000 0.004 0.804 0.000
#> SRR1346710 1 0.5199 0.83476 0.640 0.000 0.020 0.308 0.032
#> SRR1418771 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1095358 2 0.4709 0.52082 0.020 0.748 0.052 0.000 0.180
#> SRR1480941 3 0.6106 0.34838 0.004 0.120 0.524 0.000 0.352
#> SRR1479175 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313891 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1491354 4 0.4299 -0.15185 0.388 0.000 0.004 0.608 0.000
#> SRR1433884 2 0.7453 0.08280 0.292 0.440 0.048 0.000 0.220
#> SRR1471074 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353052 2 0.7257 0.14092 0.288 0.480 0.048 0.000 0.184
#> SRR1355554 1 0.8548 -0.63744 0.300 0.268 0.224 0.000 0.208
#> SRR1487173 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1474253 1 0.4302 0.85342 0.648 0.000 0.004 0.344 0.004
#> SRR1322918 2 0.7436 0.08899 0.292 0.444 0.048 0.000 0.216
#> SRR1318331 2 0.7156 0.16365 0.288 0.496 0.048 0.000 0.168
#> SRR1321333 3 0.2561 0.76732 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.4066 0.85780 0.672 0.000 0.000 0.324 0.004
#> SRR1350545 4 0.2249 0.59273 0.096 0.000 0.008 0.896 0.000
#> SRR1091328 1 0.5571 0.82323 0.620 0.000 0.028 0.308 0.044
#> SRR814447 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1455989 3 0.4928 0.35465 0.016 0.412 0.564 0.000 0.008
#> SRR1453680 3 0.3559 0.73583 0.004 0.096 0.836 0.000 0.064
#> SRR1470356 2 0.1904 0.67946 0.016 0.936 0.028 0.000 0.020
#> SRR1342977 2 0.0609 0.69495 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.6560 0.28830 0.236 0.592 0.048 0.000 0.124
#> SRR1097197 4 0.1502 0.61878 0.056 0.000 0.004 0.940 0.000
#> SRR1366729 3 0.4034 0.72892 0.012 0.096 0.812 0.000 0.080
#> SRR821282 3 0.3955 0.76233 0.004 0.128 0.804 0.000 0.064
#> SRR1074602 2 0.2644 0.65491 0.016 0.896 0.068 0.000 0.020
#> SRR814633 2 0.0290 0.69673 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1072480 3 0.5818 0.17067 0.000 0.092 0.464 0.000 0.444
#> SRR1319100 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1324004 3 0.7959 0.04217 0.296 0.096 0.396 0.000 0.212
#> SRR1457459 1 0.3966 0.85726 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1421031 4 0.4583 0.60490 0.016 0.000 0.044 0.748 0.192
#> SRR1444598 5 0.6558 0.39249 0.024 0.140 0.292 0.000 0.544
#> SRR1091743 2 0.2580 0.65769 0.016 0.900 0.064 0.000 0.020
#> SRR819637 1 0.3932 0.85818 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1083848 1 0.4135 0.85486 0.656 0.000 0.004 0.340 0.000
#> SRR1088934 3 0.4414 0.67032 0.016 0.244 0.724 0.000 0.016
#> SRR1459785 3 0.4832 0.65341 0.100 0.096 0.768 0.000 0.036
#> SRR1083700 1 0.5386 0.82925 0.608 0.000 0.036 0.336 0.020
#> SRR1375531 4 0.5582 -0.47282 0.452 0.000 0.012 0.492 0.044
#> SRR1323470 5 0.6573 0.46746 0.084 0.152 0.136 0.000 0.628
#> SRR814657 4 0.0955 0.62861 0.028 0.000 0.004 0.968 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1467726 2 0.0291 0.80102 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR815446 2 0.1381 0.77884 0.000 0.952 0.004 0.004 0.020 0.020
#> SRR1402132 4 0.8334 0.17712 0.116 0.000 0.092 0.320 0.308 0.164
#> SRR1326059 1 0.4058 0.30463 0.616 0.000 0.004 0.372 0.000 0.008
#> SRR1409062 2 0.3182 0.71672 0.000 0.860 0.016 0.076 0.028 0.020
#> SRR809406 1 0.4034 0.39003 0.648 0.000 0.004 0.336 0.000 0.012
#> SRR1465313 6 0.7429 -0.08030 0.000 0.060 0.272 0.020 0.312 0.336
#> SRR819559 1 0.2225 0.75470 0.892 0.000 0.000 0.008 0.092 0.008
#> SRR1387899 6 0.6586 -0.00237 0.000 0.064 0.368 0.088 0.016 0.464
#> SRR1442292 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1488151 1 0.2909 0.68020 0.828 0.000 0.004 0.156 0.000 0.012
#> SRR1395635 1 0.2631 0.73470 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152 0.000
#> SRR1343629 1 0.0767 0.76807 0.976 0.000 0.004 0.012 0.000 0.008
#> SRR1326868 2 0.3296 0.71660 0.000 0.852 0.024 0.084 0.020 0.020
#> SRR1102320 4 0.4326 0.18076 0.484 0.000 0.000 0.500 0.008 0.008
#> SRR1469926 3 0.3186 0.83698 0.000 0.068 0.860 0.008 0.036 0.028
#> SRR1070036 1 0.4034 0.73240 0.764 0.000 0.004 0.052 0.172 0.008
#> SRR1098426 1 0.2948 0.72285 0.804 0.000 0.000 0.008 0.188 0.000
#> SRR1090310 3 0.2587 0.84225 0.000 0.120 0.864 0.008 0.004 0.004
#> SRR1429748 4 0.5213 0.40076 0.408 0.000 0.000 0.508 0.080 0.004
#> SRR1363654 1 0.3274 0.67773 0.804 0.000 0.000 0.168 0.024 0.004
#> SRR1326317 2 0.3774 0.68634 0.000 0.828 0.048 0.076 0.028 0.020
#> SRR1378308 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1366919 4 0.6845 0.43891 0.160 0.000 0.000 0.440 0.316 0.084
#> SRR1329947 1 0.1701 0.74287 0.920 0.000 0.000 0.072 0.000 0.008
#> SRR1469769 3 0.3689 0.83599 0.000 0.068 0.836 0.024 0.040 0.032
#> SRR1490761 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1380122 5 0.7903 -0.05523 0.000 0.216 0.248 0.020 0.356 0.160
#> SRR1402944 5 0.7874 -0.02313 0.000 0.192 0.256 0.016 0.352 0.184
#> SRR1092818 1 0.2593 0.73578 0.844 0.000 0.000 0.008 0.148 0.000
#> SRR1093552 1 0.3738 0.66737 0.704 0.000 0.000 0.016 0.280 0.000
#> SRR1464880 2 0.4703 0.54025 0.000 0.688 0.004 0.004 0.220 0.084
#> SRR1078368 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1349608 6 0.3899 0.73611 0.000 0.404 0.000 0.000 0.004 0.592
#> SRR1466951 6 0.3634 0.79976 0.000 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1331879 2 0.5336 0.47711 0.000 0.640 0.016 0.004 0.228 0.112
#> SRR1320034 3 0.3051 0.84243 0.000 0.076 0.864 0.008 0.036 0.016
#> SRR1068687 6 0.4513 0.79251 0.000 0.324 0.008 0.016 0.012 0.640
#> SRR1437491 1 0.0146 0.77106 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.3245 0.39355 0.000 0.764 0.000 0.008 0.000 0.228
#> SRR1374005 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1319182 1 0.3827 0.46785 0.680 0.000 0.004 0.308 0.000 0.008
#> SRR1329994 4 0.5616 0.61364 0.160 0.000 0.000 0.636 0.164 0.040
#> SRR1354203 1 0.2019 0.75497 0.924 0.000 0.020 0.004 0.020 0.032
#> SRR1077850 1 0.0146 0.77106 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1077992 2 0.6650 0.24565 0.000 0.488 0.068 0.004 0.300 0.140
#> SRR1455214 1 0.0551 0.77162 0.984 0.000 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1092014 2 0.7854 0.24273 0.000 0.464 0.176 0.080 0.172 0.108
#> SRR1097857 1 0.4293 0.68843 0.800 0.000 0.032 0.044 0.072 0.052
#> SRR1473318 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.2978 0.84309 0.000 0.076 0.868 0.008 0.032 0.016
#> SRR1338687 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1071207 4 0.5215 0.60624 0.160 0.000 0.000 0.640 0.192 0.008
#> SRR1486821 3 0.3137 0.84126 0.000 0.076 0.860 0.008 0.036 0.020
#> SRR1418540 1 0.3301 0.70846 0.772 0.000 0.004 0.008 0.216 0.000
#> SRR1408788 2 0.6275 0.45176 0.000 0.628 0.140 0.072 0.132 0.028
#> SRR1359487 4 0.7047 0.47896 0.160 0.000 0.008 0.484 0.244 0.104
#> SRR1080648 1 0.3665 0.72366 0.792 0.000 0.012 0.012 0.168 0.016
#> SRR1414708 1 0.4460 0.58848 0.644 0.000 0.000 0.052 0.304 0.000
#> SRR1469080 2 0.3847 0.64428 0.000 0.780 0.004 0.000 0.136 0.080
#> SRR1365722 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1448118 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1444808 5 0.5987 -0.17960 0.300 0.000 0.000 0.224 0.472 0.004
#> SRR1321829 2 0.3214 0.71973 0.000 0.856 0.020 0.084 0.020 0.020
#> SRR1475993 3 0.3910 0.75918 0.000 0.224 0.740 0.012 0.024 0.000
#> SRR1445387 1 0.2980 0.65093 0.808 0.000 0.000 0.180 0.000 0.012
#> SRR1077575 2 0.6765 0.13576 0.000 0.428 0.068 0.000 0.336 0.168
#> SRR1349300 1 0.4127 -0.10126 0.508 0.000 0.004 0.484 0.000 0.004
#> SRR1374165 1 0.4838 0.56295 0.644 0.000 0.004 0.068 0.280 0.004
#> SRR1453769 2 0.0291 0.80102 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1473870 4 0.3634 0.53129 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.4927 0.62930 0.000 0.756 0.076 0.080 0.052 0.036
#> SRR1366124 4 0.7013 0.34708 0.160 0.000 0.008 0.380 0.380 0.072
#> SRR1391811 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.4933 0.66755 0.696 0.000 0.032 0.012 0.216 0.044
#> SRR1086490 3 0.2884 0.83794 0.000 0.128 0.848 0.012 0.008 0.004
#> SRR1088511 2 0.0551 0.80009 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008 0.000
#> SRR1404577 4 0.3703 0.66906 0.176 0.000 0.004 0.780 0.004 0.036
#> SRR1384431 1 0.4758 0.50611 0.680 0.000 0.020 0.256 0.012 0.032
#> SRR1072055 1 0.2920 0.73994 0.820 0.000 0.000 0.004 0.168 0.008
#> SRR1359738 3 0.2841 0.83968 0.000 0.124 0.852 0.012 0.008 0.004
#> SRR1332141 1 0.2332 0.75047 0.908 0.000 0.032 0.004 0.020 0.036
#> SRR1085900 6 0.3847 0.80202 0.000 0.348 0.000 0.008 0.000 0.644
#> SRR1442173 1 0.0405 0.77041 0.988 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1431625 2 0.0405 0.79991 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR814515 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1357999 2 0.6664 0.15532 0.000 0.436 0.060 0.000 0.340 0.164
#> SRR1344034 6 0.5604 0.30362 0.000 0.060 0.280 0.028 0.020 0.612
#> SRR1080391 4 0.4796 0.65574 0.176 0.000 0.000 0.708 0.092 0.024
#> SRR1347870 6 0.3795 0.79493 0.000 0.364 0.000 0.004 0.000 0.632
#> SRR814028 6 0.3807 0.79156 0.000 0.368 0.000 0.004 0.000 0.628
#> SRR814219 2 0.0405 0.80122 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.5316 0.14311 0.548 0.000 0.000 0.360 0.080 0.012
#> SRR1460211 2 0.0260 0.80155 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1418346 2 0.7243 0.01775 0.000 0.376 0.096 0.004 0.332 0.192
#> SRR1070060 4 0.3473 0.67205 0.192 0.000 0.004 0.780 0.000 0.024
#> SRR1487969 2 0.4371 0.58593 0.000 0.728 0.000 0.004 0.168 0.100
#> SRR1417851 5 0.6886 -0.21138 0.328 0.000 0.012 0.252 0.380 0.028
#> SRR1443350 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1403199 1 0.4910 0.67984 0.680 0.000 0.004 0.100 0.208 0.008
#> SRR1076705 1 0.2948 0.72276 0.804 0.000 0.000 0.008 0.188 0.000
#> SRR1079380 5 0.7056 -0.29329 0.000 0.280 0.052 0.004 0.336 0.328
#> SRR1102923 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1369560 2 0.6661 0.42925 0.000 0.572 0.028 0.080 0.208 0.112
#> SRR1366605 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396035 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1390223 6 0.3634 0.79976 0.000 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1436840 6 0.3684 0.78735 0.000 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1445573 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1375394 5 0.7177 -0.01220 0.016 0.000 0.068 0.348 0.396 0.172
#> SRR1431735 1 0.4907 0.67063 0.700 0.000 0.032 0.012 0.212 0.044
#> SRR1417387 1 0.3012 0.71560 0.796 0.000 0.000 0.008 0.196 0.000
#> SRR1445984 1 0.3468 0.67814 0.728 0.000 0.000 0.008 0.264 0.000
#> SRR1370447 4 0.6064 0.61513 0.168 0.000 0.004 0.620 0.088 0.120
#> SRR1446308 3 0.4735 0.78446 0.000 0.144 0.740 0.080 0.016 0.020
#> SRR1437346 3 0.2615 0.84418 0.000 0.104 0.872 0.012 0.008 0.004
#> SRR1103143 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1086466 1 0.2593 0.73578 0.844 0.000 0.000 0.008 0.148 0.000
#> SRR1073191 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1098974 1 0.0806 0.76642 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1468914 4 0.7324 0.45309 0.156 0.000 0.012 0.452 0.252 0.128
#> SRR1319584 2 0.7631 -0.03170 0.000 0.344 0.124 0.016 0.336 0.180
#> SRR1486584 1 0.4089 0.31738 0.616 0.000 0.004 0.372 0.004 0.004
#> SRR813536 4 0.5639 0.63576 0.168 0.000 0.004 0.660 0.072 0.096
#> SRR1317939 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1079730 1 0.2573 0.70031 0.856 0.000 0.004 0.132 0.000 0.008
#> SRR1341921 4 0.4119 0.57866 0.336 0.000 0.004 0.644 0.000 0.016
#> SRR1399178 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1415615 1 0.2400 0.71132 0.872 0.000 0.004 0.116 0.000 0.008
#> SRR1328551 2 0.3955 -0.38695 0.000 0.560 0.000 0.004 0.000 0.436
#> SRR1453259 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1340828 2 0.7130 0.06955 0.000 0.396 0.088 0.004 0.332 0.180
#> SRR1079543 2 0.0146 0.80142 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR816427 6 0.3634 0.79976 0.000 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1076681 6 0.3967 0.79001 0.000 0.356 0.000 0.000 0.012 0.632
#> SRR1335314 4 0.7587 0.43092 0.156 0.000 0.016 0.420 0.248 0.160
#> SRR1400799 3 0.4782 0.63643 0.000 0.072 0.680 0.016 0.000 0.232
#> SRR1074578 4 0.2793 0.67061 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.5985 0.30157 0.000 0.524 0.016 0.004 0.308 0.148
#> SRR1416207 1 0.1854 0.75672 0.932 0.000 0.016 0.004 0.020 0.028
#> SRR1447371 1 0.2684 0.74340 0.888 0.000 0.032 0.004 0.024 0.052
#> SRR1069328 4 0.5887 0.64364 0.168 0.000 0.016 0.652 0.080 0.084
#> SRR1445023 4 0.7438 0.51329 0.156 0.000 0.028 0.488 0.156 0.172
#> SRR1077599 2 0.4745 0.58384 0.000 0.748 0.128 0.080 0.024 0.020
#> SRR1453480 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1101834 2 0.0146 0.80142 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.2669 0.73327 0.836 0.000 0.000 0.008 0.156 0.000
#> SRR1074839 6 0.3833 0.80189 0.000 0.344 0.000 0.008 0.000 0.648
#> SRR1458727 5 0.6764 0.21445 0.000 0.008 0.144 0.060 0.452 0.336
#> SRR1436949 2 0.6341 0.22239 0.000 0.480 0.028 0.004 0.324 0.164
#> SRR1070429 3 0.2734 0.82819 0.000 0.148 0.840 0.008 0.000 0.004
#> SRR1458158 4 0.3727 0.47426 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR1432408 5 0.7372 -0.32648 0.168 0.000 0.008 0.324 0.384 0.116
#> SRR1310334 1 0.4127 0.23002 0.588 0.000 0.004 0.400 0.000 0.008
#> SRR1418201 3 0.3256 0.83658 0.000 0.068 0.856 0.008 0.040 0.028
#> SRR1385434 4 0.7691 0.38325 0.156 0.000 0.028 0.388 0.304 0.124
#> SRR1415591 3 0.3905 0.76765 0.000 0.076 0.780 0.008 0.000 0.136
#> SRR1402009 1 0.0937 0.76853 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1316055 5 0.5576 -0.15032 0.376 0.000 0.000 0.144 0.480 0.000
#> SRR1308734 3 0.3343 0.84045 0.000 0.076 0.852 0.020 0.032 0.020
#> SRR1498973 2 0.7311 0.02215 0.000 0.372 0.112 0.004 0.332 0.180
#> SRR1397115 4 0.3384 0.66965 0.228 0.000 0.004 0.760 0.000 0.008
#> SRR1392141 1 0.4852 0.67569 0.708 0.000 0.032 0.012 0.204 0.044
#> SRR814341 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1313601 2 0.3574 0.69937 0.000 0.840 0.036 0.076 0.028 0.020
#> SRR1459609 2 0.0665 0.79923 0.000 0.980 0.004 0.008 0.008 0.000
#> SRR1499325 3 0.3787 0.83075 0.000 0.072 0.828 0.024 0.052 0.024
#> SRR809919 1 0.4983 0.59519 0.732 0.000 0.032 0.148 0.032 0.056
#> SRR1370818 5 0.5988 -0.24835 0.232 0.000 0.000 0.288 0.476 0.004
#> SRR1323651 6 0.5530 0.14716 0.000 0.064 0.356 0.016 0.012 0.552
#> SRR1357297 4 0.2902 0.67065 0.196 0.000 0.000 0.800 0.000 0.004
#> SRR818170 5 0.7817 0.00308 0.000 0.204 0.244 0.012 0.356 0.184
#> SRR1091230 2 0.3656 0.69728 0.000 0.832 0.044 0.084 0.020 0.020
#> SRR1470556 2 0.0810 0.79759 0.000 0.976 0.004 0.008 0.008 0.004
#> SRR812318 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.5389 0.27585 0.000 0.060 0.512 0.016 0.004 0.408
#> SRR1317731 5 0.7914 -0.09489 0.000 0.160 0.292 0.024 0.344 0.180
#> SRR1490785 1 0.0865 0.76910 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1432032 1 0.3411 0.70405 0.756 0.000 0.000 0.008 0.232 0.004
#> SRR1447808 1 0.4046 0.32134 0.620 0.000 0.004 0.368 0.000 0.008
#> SRR809534 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1397312 2 0.7214 0.11331 0.000 0.404 0.104 0.008 0.332 0.152
#> SRR812128 6 0.6672 0.40073 0.000 0.292 0.024 0.004 0.284 0.396
#> SRR1101513 1 0.5040 0.59289 0.716 0.000 0.032 0.172 0.024 0.056
#> SRR1415708 2 0.4647 0.62843 0.000 0.768 0.100 0.072 0.032 0.028
#> SRR1316033 3 0.2858 0.84416 0.000 0.096 0.864 0.008 0.028 0.004
#> SRR1390371 2 0.0820 0.79511 0.000 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1480263 2 0.0146 0.80184 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1464473 3 0.3051 0.84243 0.000 0.076 0.864 0.008 0.036 0.016
#> SRR1076801 1 0.3323 0.69324 0.752 0.000 0.000 0.008 0.240 0.000
#> SRR1080044 1 0.3649 0.68194 0.804 0.000 0.012 0.148 0.012 0.024
#> SRR1420850 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1474295 4 0.6023 0.64072 0.168 0.000 0.036 0.648 0.052 0.096
#> SRR1069871 1 0.4150 0.29807 0.612 0.000 0.004 0.372 0.000 0.012
#> SRR1095744 2 0.6658 0.16015 0.000 0.440 0.060 0.000 0.336 0.164
#> SRR1068929 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1490097 6 0.3769 0.79980 0.000 0.356 0.000 0.004 0.000 0.640
#> SRR1075054 2 0.3595 0.65577 0.000 0.796 0.000 0.000 0.120 0.084
#> SRR1083480 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.2593 0.73578 0.844 0.000 0.000 0.008 0.148 0.000
#> SRR1417023 5 0.7161 -0.33723 0.172 0.000 0.008 0.340 0.396 0.084
#> SRR1309333 6 0.3874 0.79981 0.000 0.356 0.000 0.008 0.000 0.636
#> SRR1333676 1 0.5316 -0.20813 0.468 0.000 0.000 0.440 0.088 0.004
#> SRR1352996 4 0.3409 0.61745 0.300 0.000 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.5802 0.62888 0.172 0.000 0.004 0.644 0.076 0.104
#> SRR1413137 4 0.5568 0.63843 0.172 0.000 0.004 0.664 0.064 0.096
#> SRR1469973 6 0.3898 0.80057 0.000 0.336 0.000 0.012 0.000 0.652
#> SRR1420026 6 0.3728 0.79948 0.000 0.344 0.000 0.000 0.004 0.652
#> SRR817306 4 0.5030 0.65190 0.184 0.000 0.000 0.676 0.124 0.016
#> SRR1416266 4 0.6140 0.61279 0.172 0.000 0.004 0.612 0.096 0.116
#> SRR1071011 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1090290 4 0.6108 0.52648 0.160 0.000 0.000 0.532 0.276 0.032
#> SRR1435394 3 0.5669 0.64458 0.000 0.252 0.624 0.076 0.028 0.020
#> SRR1383192 4 0.3911 0.66674 0.172 0.000 0.004 0.772 0.008 0.044
#> SRR1419962 3 0.3137 0.84126 0.000 0.076 0.860 0.008 0.036 0.020
#> SRR1094357 1 0.2768 0.68136 0.832 0.000 0.000 0.156 0.000 0.012
#> SRR1081639 3 0.4961 0.74794 0.000 0.048 0.740 0.016 0.088 0.108
#> SRR1356016 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1351082 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1397348 2 0.7113 0.06337 0.000 0.396 0.084 0.004 0.332 0.184
#> SRR1312147 1 0.3707 0.64158 0.680 0.000 0.000 0.008 0.312 0.000
#> SRR1473891 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1335470 4 0.4490 0.66582 0.200 0.000 0.000 0.712 0.080 0.008
#> SRR1474930 6 0.4670 0.78940 0.000 0.320 0.020 0.012 0.012 0.636
#> SRR1470988 4 0.5982 0.61799 0.168 0.000 0.004 0.628 0.084 0.116
#> SRR811915 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1104987 1 0.0291 0.77061 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1100005 2 0.0146 0.80142 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.6771 0.41231 0.000 0.564 0.048 0.064 0.220 0.104
#> SRR1313770 3 0.7195 0.35490 0.000 0.056 0.428 0.020 0.284 0.212
#> SRR1315780 2 0.0405 0.80087 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1073631 1 0.3650 0.52917 0.716 0.000 0.004 0.272 0.000 0.008
#> SRR819124 4 0.4914 0.36858 0.420 0.000 0.004 0.532 0.036 0.008
#> SRR1310997 6 0.5874 0.53075 0.000 0.232 0.004 0.004 0.224 0.536
#> SRR1464494 6 0.4687 0.68743 0.000 0.232 0.004 0.008 0.068 0.688
#> SRR1357083 3 0.3123 0.82110 0.000 0.152 0.824 0.012 0.008 0.004
#> SRR1475842 6 0.3684 0.78735 0.000 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1378085 1 0.3438 0.62257 0.764 0.000 0.000 0.220 0.008 0.008
#> SRR1378220 3 0.4450 0.80443 0.000 0.112 0.772 0.076 0.020 0.020
#> SRR1467704 1 0.2915 0.72392 0.808 0.000 0.000 0.008 0.184 0.000
#> SRR1348885 5 0.6529 0.24855 0.000 0.012 0.108 0.056 0.492 0.332
#> SRR1325826 1 0.4138 0.30725 0.616 0.000 0.004 0.368 0.000 0.012
#> SRR1466812 4 0.2793 0.67061 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1345692 6 0.3742 0.80133 0.000 0.348 0.000 0.000 0.004 0.648
#> SRR1401040 3 0.2942 0.83028 0.000 0.068 0.860 0.000 0.008 0.064
#> SRR1097954 1 0.2757 0.74275 0.884 0.000 0.036 0.004 0.024 0.052
#> SRR1374396 4 0.7314 0.43520 0.156 0.000 0.008 0.436 0.268 0.132
#> SRR1454073 6 0.3983 0.80235 0.000 0.348 0.004 0.008 0.000 0.640
#> SRR1355747 1 0.3190 0.70393 0.772 0.000 0.000 0.008 0.220 0.000
#> SRR1429368 3 0.2978 0.84309 0.000 0.076 0.868 0.008 0.032 0.016
#> SRR1398138 6 0.3927 0.80168 0.000 0.344 0.000 0.012 0.000 0.644
#> SRR1379260 1 0.3445 0.68737 0.732 0.000 0.000 0.008 0.260 0.000
#> SRR1361436 3 0.2687 0.84171 0.000 0.120 0.860 0.012 0.004 0.004
#> SRR817142 2 0.4561 0.61529 0.000 0.768 0.108 0.076 0.028 0.020
#> SRR1315291 5 0.6500 -0.09200 0.036 0.000 0.020 0.384 0.452 0.108
#> SRR1309314 3 0.5371 0.62452 0.000 0.012 0.692 0.040 0.136 0.120
#> SRR1420085 6 0.3742 0.80133 0.000 0.348 0.000 0.000 0.004 0.648
#> SRR1361308 3 0.2333 0.84322 0.000 0.120 0.872 0.000 0.004 0.004
#> SRR1472126 4 0.3843 0.30098 0.452 0.000 0.000 0.548 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.7851 -0.01324 0.000 0.208 0.256 0.012 0.340 0.184
#> SRR1099789 1 0.0291 0.77061 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1079480 2 0.6790 0.13556 0.000 0.424 0.072 0.000 0.340 0.164
#> SRR1339276 1 0.0146 0.77155 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.5306 0.37385 0.612 0.000 0.020 0.308 0.024 0.036
#> SRR1399353 1 0.4897 0.67422 0.700 0.000 0.028 0.012 0.212 0.048
#> SRR1096760 3 0.3637 0.83182 0.000 0.104 0.824 0.044 0.016 0.012
#> SRR1440290 6 0.7373 0.30828 0.000 0.196 0.300 0.084 0.016 0.404
#> SRR1330813 2 0.4280 0.64381 0.000 0.792 0.084 0.076 0.028 0.020
#> SRR1458931 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR812294 4 0.6774 0.45827 0.160 0.000 0.000 0.460 0.300 0.080
#> SRR1394321 1 0.2278 0.75184 0.868 0.000 0.000 0.004 0.128 0.000
#> SRR1081160 2 0.0146 0.80142 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1349342 1 0.0146 0.77162 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477173 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1086752 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1084698 2 0.3346 0.69345 0.000 0.832 0.004 0.004 0.092 0.068
#> SRR1390143 1 0.4704 0.47311 0.660 0.000 0.000 0.272 0.056 0.012
#> SRR1390413 2 0.0146 0.80123 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099570 3 0.3495 0.78121 0.000 0.060 0.808 0.004 0.000 0.128
#> SRR1312169 4 0.3517 0.67159 0.188 0.000 0.004 0.780 0.000 0.028
#> SRR1096687 4 0.3745 0.67165 0.192 0.000 0.004 0.772 0.016 0.016
#> SRR1486139 1 0.0146 0.77106 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1470313 5 0.7520 -0.35972 0.168 0.000 0.032 0.356 0.364 0.080
#> SRR1447893 3 0.4974 0.76192 0.000 0.168 0.716 0.076 0.020 0.020
#> SRR1466025 2 0.3828 0.63755 0.000 0.776 0.000 0.000 0.124 0.100
#> SRR1477429 4 0.6438 0.59817 0.276 0.000 0.028 0.556 0.064 0.076
#> SRR1445701 6 0.5152 0.35201 0.000 0.072 0.272 0.008 0.012 0.636
#> SRR820689 1 0.2361 0.71783 0.880 0.000 0.004 0.104 0.000 0.012
#> SRR1451876 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1452537 2 0.0405 0.80087 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1383301 1 0.1226 0.76800 0.952 0.000 0.000 0.004 0.040 0.004
#> SRR1489328 6 0.3756 0.80110 0.000 0.352 0.000 0.004 0.000 0.644
#> SRR1344462 1 0.3583 0.54005 0.728 0.000 0.004 0.260 0.000 0.008
#> SRR1082709 4 0.3847 0.28800 0.456 0.000 0.000 0.544 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.4616 0.54353 0.624 0.000 0.000 0.060 0.316 0.000
#> SRR1355769 4 0.4304 0.66606 0.172 0.000 0.004 0.752 0.020 0.052
#> SRR1488237 2 0.0551 0.80009 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008 0.000
#> SRR1391985 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1478501 1 0.2326 0.75046 0.908 0.000 0.028 0.004 0.020 0.040
#> SRR1480917 5 0.7682 -0.06308 0.000 0.324 0.192 0.012 0.332 0.140
#> SRR1474485 1 0.4822 0.53959 0.628 0.000 0.004 0.072 0.296 0.000
#> SRR1089998 1 0.1970 0.72982 0.900 0.000 0.000 0.092 0.000 0.008
#> SRR1318140 1 0.3061 0.66900 0.816 0.000 0.004 0.168 0.004 0.008
#> SRR1319262 3 0.3814 0.82607 0.000 0.120 0.808 0.044 0.016 0.012
#> SRR1095188 6 0.3607 0.80204 0.000 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1454350 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.1835 0.76092 0.932 0.000 0.008 0.036 0.008 0.016
#> SRR1359565 3 0.4164 0.72712 0.000 0.064 0.752 0.012 0.000 0.172
#> SRR1105417 4 0.7146 0.57629 0.168 0.000 0.036 0.536 0.108 0.152
#> SRR1325578 3 0.7087 0.36168 0.000 0.096 0.448 0.016 0.320 0.120
#> SRR1358161 3 0.3659 0.83230 0.000 0.072 0.836 0.024 0.044 0.024
#> SRR1358665 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333971 2 0.3726 0.65317 0.000 0.792 0.000 0.004 0.124 0.080
#> SRR1452010 4 0.3628 0.65499 0.268 0.000 0.000 0.720 0.004 0.008
#> SRR1418183 6 0.5068 0.77846 0.000 0.308 0.036 0.020 0.012 0.624
#> SRR1366345 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.4225 0.35193 0.628 0.000 0.004 0.352 0.004 0.012
#> SRR1473461 1 0.2504 0.75293 0.856 0.000 0.000 0.004 0.136 0.004
#> SRR1090837 3 0.3087 0.80469 0.000 0.176 0.808 0.012 0.000 0.004
#> SRR1447828 3 0.3051 0.84243 0.000 0.076 0.864 0.008 0.036 0.016
#> SRR1338747 2 0.0405 0.80087 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1333038 3 0.3154 0.79797 0.000 0.184 0.800 0.000 0.012 0.004
#> SRR1350280 4 0.3636 0.58768 0.320 0.000 0.004 0.676 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.4226 0.20459 0.580 0.000 0.004 0.404 0.000 0.012
#> SRR1102656 2 0.4209 0.63672 0.000 0.772 0.020 0.004 0.136 0.068
#> SRR1441443 6 0.3887 0.79785 0.000 0.360 0.000 0.008 0.000 0.632
#> SRR1370682 3 0.3051 0.84243 0.000 0.076 0.864 0.008 0.036 0.016
#> SRR1475448 3 0.2773 0.83889 0.000 0.128 0.852 0.012 0.004 0.004
#> SRR1407291 4 0.3607 0.54209 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.1232 0.76995 0.956 0.000 0.000 0.016 0.024 0.004
#> SRR1363766 4 0.3807 0.50528 0.368 0.000 0.004 0.628 0.000 0.000
#> SRR1082592 5 0.7989 -0.05461 0.000 0.228 0.188 0.020 0.340 0.224
#> SRR1325794 2 0.5942 0.48909 0.000 0.620 0.008 0.064 0.212 0.096
#> SRR1095961 3 0.2567 0.84518 0.000 0.100 0.876 0.012 0.008 0.004
#> SRR1086702 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1320806 6 0.5534 0.75054 0.000 0.324 0.012 0.072 0.016 0.576
#> SRR1457527 3 0.2445 0.84365 0.000 0.120 0.868 0.000 0.008 0.004
#> SRR1098831 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1474374 3 0.3025 0.82212 0.000 0.060 0.856 0.004 0.004 0.076
#> SRR1488858 4 0.7112 0.34511 0.156 0.000 0.012 0.380 0.376 0.076
#> SRR1454695 1 0.5966 0.39675 0.548 0.000 0.004 0.216 0.220 0.012
#> SRR1090241 2 0.0777 0.79258 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1329863 2 0.0653 0.79986 0.000 0.980 0.000 0.004 0.012 0.004
#> SRR1357733 1 0.0458 0.77183 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1362135 1 0.3705 0.70342 0.740 0.000 0.000 0.020 0.236 0.004
#> SRR1379581 3 0.3137 0.84126 0.000 0.076 0.860 0.008 0.036 0.020
#> SRR1309182 4 0.4063 0.38910 0.420 0.000 0.004 0.572 0.000 0.004
#> SRR1437668 1 0.3349 0.69106 0.748 0.000 0.000 0.008 0.244 0.000
#> SRR1084742 6 0.6196 0.40772 0.000 0.232 0.004 0.004 0.324 0.436
#> SRR1433538 4 0.3428 0.61213 0.304 0.000 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0405 0.80068 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1454247 2 0.7212 0.04182 0.000 0.384 0.096 0.004 0.332 0.184
#> SRR1097100 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR818622 2 0.5389 0.46726 0.000 0.672 0.204 0.076 0.028 0.020
#> SRR1072388 1 0.3398 0.68601 0.740 0.000 0.000 0.008 0.252 0.000
#> SRR1070332 2 0.5768 0.37704 0.000 0.564 0.020 0.004 0.296 0.116
#> SRR1320761 2 0.6657 0.39795 0.000 0.552 0.024 0.068 0.240 0.116
#> SRR1076195 5 0.7013 -0.38336 0.160 0.000 0.008 0.380 0.380 0.072
#> SRR1069895 3 0.5389 0.71493 0.000 0.204 0.672 0.076 0.028 0.020
#> SRR1099144 1 0.4300 0.54847 0.608 0.000 0.000 0.028 0.364 0.000
#> SRR1385150 3 0.3637 0.83182 0.000 0.104 0.824 0.044 0.016 0.012
#> SRR1420191 2 0.0146 0.80123 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1332625 4 0.6668 0.39700 0.160 0.000 0.000 0.416 0.364 0.060
#> SRR1102583 4 0.4070 0.37797 0.424 0.000 0.004 0.568 0.000 0.004
#> SRR1456971 1 0.3512 0.67334 0.720 0.000 0.000 0.008 0.272 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 6 0.4420 0.78029 0.000 0.348 0.008 0.008 0.012 0.624
#> SRR1096267 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 6 0.7370 0.00997 0.000 0.056 0.224 0.024 0.340 0.356
#> SRR1408553 4 0.5910 0.62219 0.168 0.000 0.004 0.636 0.088 0.104
#> SRR1069231 4 0.4178 0.34922 0.428 0.000 0.004 0.560 0.000 0.008
#> SRR1325642 2 0.1476 0.77307 0.000 0.948 0.004 0.008 0.012 0.028
#> SRR1362103 1 0.1010 0.77040 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1321942 1 0.0508 0.77286 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1099330 2 0.3710 0.69044 0.000 0.832 0.044 0.076 0.028 0.020
#> SRR1077874 2 0.4154 0.59685 0.000 0.740 0.000 0.000 0.164 0.096
#> SRR808299 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1098050 2 0.6664 0.15532 0.000 0.436 0.060 0.000 0.340 0.164
#> SRR1481238 6 0.6180 0.72519 0.000 0.268 0.040 0.068 0.040 0.584
#> SRR1443568 6 0.5439 0.72671 0.000 0.248 0.092 0.016 0.012 0.632
#> SRR1380249 5 0.6047 -0.34230 0.160 0.000 0.000 0.360 0.464 0.016
#> SRR1080143 4 0.3942 0.50410 0.368 0.000 0.004 0.624 0.000 0.004
#> SRR1383148 4 0.6942 0.39873 0.160 0.000 0.004 0.412 0.348 0.076
#> SRR1357042 4 0.4571 0.28511 0.432 0.000 0.000 0.536 0.028 0.004
#> SRR1416025 6 0.3807 0.79156 0.000 0.368 0.000 0.004 0.000 0.628
#> SRR1431015 6 0.3742 0.80228 0.000 0.348 0.000 0.004 0.000 0.648
#> SRR1078709 6 0.3878 0.80124 0.000 0.348 0.000 0.004 0.004 0.644
#> SRR813283 1 0.0291 0.77061 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1430226 2 0.0146 0.80123 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0146 0.80123 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347707 5 0.6066 0.27518 0.000 0.000 0.088 0.076 0.564 0.272
#> SRR807679 1 0.2631 0.73470 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152 0.000
#> SRR1333811 6 0.5834 0.18699 0.000 0.060 0.324 0.020 0.032 0.564
#> SRR1078660 6 0.3983 0.80123 0.000 0.348 0.000 0.008 0.004 0.640
#> SRR1331730 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333913 1 0.2631 0.73470 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152 0.000
#> SRR1432542 1 0.3595 0.66117 0.704 0.000 0.000 0.008 0.288 0.000
#> SRR1418041 1 0.4518 0.37172 0.632 0.000 0.004 0.332 0.020 0.012
#> SRR1085211 1 0.3289 0.74742 0.856 0.000 0.032 0.012 0.068 0.032
#> SRR1339812 2 0.0146 0.80142 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4758 0.66904 0.688 0.000 0.020 0.012 0.244 0.036
#> SRR1350958 2 0.0653 0.79938 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012 0.000
#> SRR1396822 3 0.5491 0.69462 0.000 0.220 0.656 0.076 0.028 0.020
#> SRR1441934 6 0.3942 0.79099 0.000 0.368 0.000 0.004 0.004 0.624
#> SRR1472552 3 0.2531 0.84048 0.000 0.128 0.860 0.008 0.000 0.004
#> SRR1488881 3 0.2948 0.82927 0.000 0.144 0.836 0.008 0.008 0.004
#> SRR1102973 1 0.3579 0.74406 0.836 0.000 0.036 0.008 0.076 0.044
#> SRR1071131 6 0.4230 0.79586 0.000 0.324 0.024 0.000 0.004 0.648
#> SRR1074502 1 0.4009 0.35432 0.632 0.000 0.004 0.356 0.000 0.008
#> SRR1325271 1 0.3748 0.64782 0.688 0.000 0.000 0.012 0.300 0.000
#> SRR1409171 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR809113 2 0.2545 0.74664 0.000 0.892 0.004 0.060 0.012 0.032
#> SRR1430045 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1441245 2 0.0912 0.79674 0.000 0.972 0.004 0.004 0.008 0.012
#> SRR1384091 4 0.6848 0.45070 0.156 0.000 0.004 0.460 0.304 0.076
#> SRR1431887 2 0.0665 0.79923 0.000 0.980 0.004 0.008 0.008 0.000
#> SRR1096525 4 0.6269 0.60068 0.168 0.000 0.004 0.600 0.112 0.116
#> SRR1488491 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1356351 2 0.6835 0.36853 0.000 0.536 0.044 0.060 0.256 0.104
#> SRR1369514 4 0.4204 0.66609 0.172 0.000 0.004 0.760 0.028 0.036
#> SRR1453299 3 0.2302 0.84392 0.000 0.120 0.872 0.000 0.008 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.6316 0.23958 0.000 0.476 0.032 0.004 0.344 0.144
#> SRR1091767 6 0.3742 0.80133 0.000 0.348 0.000 0.000 0.004 0.648
#> SRR1354467 3 0.2333 0.84322 0.000 0.120 0.872 0.000 0.004 0.004
#> SRR1069074 2 0.2076 0.75607 0.000 0.912 0.000 0.060 0.012 0.016
#> SRR1452399 6 0.3756 0.80110 0.000 0.352 0.000 0.004 0.000 0.644
#> SRR1437430 3 0.3496 0.83775 0.000 0.076 0.844 0.024 0.036 0.020
#> SRR1419736 2 0.6823 0.13322 0.000 0.424 0.076 0.000 0.336 0.164
#> SRR1313343 3 0.3065 0.84233 0.000 0.076 0.864 0.008 0.032 0.020
#> SRR1077619 5 0.6284 -0.19071 0.340 0.000 0.000 0.236 0.412 0.012
#> SRR1083530 1 0.4091 0.67956 0.720 0.000 0.000 0.056 0.224 0.000
#> SRR1333633 3 0.5948 0.74232 0.000 0.072 0.676 0.084 0.116 0.052
#> SRR1354999 6 0.5330 0.75147 0.000 0.272 0.072 0.016 0.012 0.628
#> SRR1443592 2 0.0260 0.80155 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1077356 1 0.3988 0.41019 0.660 0.000 0.004 0.324 0.000 0.012
#> SRR1378818 3 0.7254 0.22972 0.000 0.072 0.376 0.016 0.356 0.180
#> SRR1413182 4 0.6968 0.46274 0.160 0.000 0.000 0.460 0.268 0.112
#> SRR1464559 5 0.6025 -0.16970 0.320 0.000 0.000 0.200 0.472 0.008
#> SRR1413075 6 0.6230 0.43413 0.000 0.228 0.008 0.004 0.300 0.460
#> SRR1487928 4 0.7252 0.39274 0.160 0.000 0.008 0.400 0.328 0.104
#> SRR1388997 6 0.3769 0.80010 0.000 0.356 0.000 0.004 0.000 0.640
#> SRR1092865 6 0.3911 0.78357 0.000 0.368 0.000 0.000 0.008 0.624
#> SRR1102729 1 0.3192 0.73022 0.864 0.000 0.032 0.012 0.040 0.052
#> SRR1456423 1 0.1053 0.77082 0.964 0.000 0.000 0.012 0.020 0.004
#> SRR1321591 2 0.0653 0.80048 0.000 0.980 0.000 0.004 0.012 0.004
#> SRR1376874 3 0.3051 0.84243 0.000 0.076 0.864 0.008 0.036 0.016
#> SRR1339903 4 0.4157 0.37633 0.444 0.000 0.000 0.544 0.000 0.012
#> SRR1346710 1 0.2593 0.73578 0.844 0.000 0.000 0.008 0.148 0.000
#> SRR1418771 2 0.0291 0.80102 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1095358 2 0.6324 0.48926 0.000 0.616 0.024 0.080 0.172 0.108
#> SRR1480941 3 0.6409 0.51600 0.000 0.052 0.552 0.048 0.292 0.056
#> SRR1479175 2 0.0405 0.80087 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1313891 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1491354 1 0.4138 0.30452 0.616 0.000 0.004 0.368 0.000 0.012
#> SRR1433884 6 0.3819 0.80162 0.000 0.340 0.000 0.008 0.000 0.652
#> SRR1471074 2 0.0551 0.80011 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004 0.000
#> SRR1353052 6 0.3911 0.79166 0.000 0.368 0.000 0.008 0.000 0.624
#> SRR1355554 6 0.5729 0.63561 0.000 0.200 0.144 0.020 0.012 0.624
#> SRR1487173 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.1232 0.76995 0.956 0.000 0.000 0.016 0.024 0.004
#> SRR1322918 6 0.3769 0.80010 0.000 0.356 0.000 0.004 0.000 0.640
#> SRR1318331 6 0.3695 0.78259 0.000 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1321333 3 0.2512 0.84435 0.000 0.116 0.868 0.000 0.008 0.008
#> SRR1474231 1 0.1075 0.76696 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1350545 4 0.4105 0.58410 0.332 0.000 0.004 0.648 0.000 0.016
#> SRR1091328 1 0.3245 0.70521 0.764 0.000 0.000 0.008 0.228 0.000
#> SRR814447 3 0.3137 0.84126 0.000 0.076 0.860 0.008 0.036 0.020
#> SRR1455989 3 0.6117 0.42184 0.000 0.376 0.496 0.080 0.028 0.020
#> SRR1453680 3 0.3145 0.83179 0.000 0.060 0.864 0.008 0.036 0.032
#> SRR1470356 2 0.2543 0.74153 0.000 0.892 0.004 0.064 0.024 0.016
#> SRR1342977 2 0.0260 0.80117 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1444222 6 0.3999 0.54729 0.000 0.496 0.000 0.004 0.000 0.500
#> SRR1097197 4 0.3746 0.65652 0.272 0.000 0.004 0.712 0.000 0.012
#> SRR1366729 3 0.3662 0.82271 0.000 0.060 0.832 0.008 0.036 0.064
#> SRR821282 3 0.3051 0.84243 0.000 0.076 0.864 0.008 0.036 0.016
#> SRR1074602 2 0.3774 0.68634 0.000 0.828 0.048 0.076 0.028 0.020
#> SRR814633 2 0.0405 0.80087 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1072480 3 0.7071 0.30082 0.000 0.036 0.440 0.060 0.348 0.116
#> SRR1319100 1 0.0291 0.77233 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1324004 6 0.5056 0.32278 0.000 0.060 0.284 0.008 0.012 0.636
#> SRR1457459 1 0.0000 0.77131 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.7445 0.45527 0.156 0.000 0.020 0.448 0.252 0.124
#> SRR1444598 6 0.7463 -0.00156 0.000 0.084 0.212 0.016 0.340 0.348
#> SRR1091743 2 0.3643 0.69407 0.000 0.836 0.040 0.076 0.028 0.020
#> SRR819637 1 0.0363 0.77192 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1083848 1 0.0291 0.77061 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1088934 3 0.5466 0.70028 0.000 0.216 0.660 0.076 0.028 0.020
#> SRR1459785 3 0.4214 0.73515 0.000 0.060 0.756 0.012 0.004 0.168
#> SRR1083700 1 0.2102 0.75455 0.920 0.000 0.024 0.004 0.020 0.032
#> SRR1375531 1 0.5032 0.53981 0.700 0.000 0.008 0.168 0.104 0.020
#> SRR1323470 6 0.7038 0.16898 0.000 0.068 0.132 0.048 0.216 0.536
#> SRR814657 4 0.3134 0.67002 0.208 0.000 0.004 0.784 0.000 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.996 0.999 0.4928 0.508 0.508
#> 3 3 0.779 0.930 0.931 0.2755 0.855 0.715
#> 4 4 0.739 0.837 0.897 0.1327 0.919 0.780
#> 5 5 0.819 0.796 0.868 0.0774 0.918 0.725
#> 6 6 0.829 0.804 0.873 0.0476 0.944 0.764
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.971 0.331 0.400 0.600
#> SRR1325826 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309314 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 1 0.876 0.578 0.704 0.296
#> SRR807679 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR819559 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1469926 3 0.3879 0.9220 0.000 0.152 0.848
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1429748 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.1289 0.9298 0.000 0.968 0.032
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.4062 0.9273 0.000 0.164 0.836
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1402944 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1466951 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1068687 2 0.4555 0.7765 0.000 0.800 0.200
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.5058 0.8977 0.000 0.244 0.756
#> SRR1097857 1 0.1289 0.9554 0.968 0.000 0.032
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1486821 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.5621 0.4097 0.000 0.692 0.308
#> SRR1359487 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0747 0.9591 0.984 0.000 0.016
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1401146 2 0.2796 0.8591 0.000 0.908 0.092
#> SRR1366124 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1080391 1 0.2356 0.9449 0.928 0.000 0.072
#> SRR1347870 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR814028 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR814219 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1529 0.9535 0.960 0.000 0.040
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0237 0.9543 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070060 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.2261 0.9461 0.932 0.000 0.068
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.3267 0.8370 0.000 0.884 0.116
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1436840 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1446308 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1437346 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1319584 2 0.1289 0.9296 0.000 0.968 0.032
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1076681 2 0.4291 0.8062 0.000 0.820 0.180
#> SRR1335314 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1400799 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1074578 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1445023 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1077599 3 0.6225 0.5637 0.000 0.432 0.568
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.2537 0.9097 0.000 0.920 0.080
#> SRR1458727 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1458158 1 0.3340 0.9305 0.880 0.000 0.120
#> SRR1432408 1 0.3267 0.9319 0.884 0.000 0.116
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.3619 0.9144 0.000 0.136 0.864
#> SRR1385434 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1415591 3 0.3482 0.9102 0.000 0.128 0.872
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0424 0.9608 0.992 0.000 0.008
#> SRR1308734 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.3267 0.9318 0.884 0.000 0.116
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.1411 0.9256 0.000 0.964 0.036
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR809919 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1323651 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1357297 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR818170 3 0.5431 0.8478 0.000 0.284 0.716
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1317731 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.2356 0.9141 0.000 0.928 0.072
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.3879 0.7719 0.000 0.848 0.152
#> SRR1316033 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1309333 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1333676 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1352996 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1093172 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1413137 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1469973 2 0.2711 0.9051 0.000 0.912 0.088
#> SRR1420026 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR817306 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1416266 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1435394 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1383192 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1419962 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1474930 2 0.5397 0.6254 0.000 0.720 0.280
#> SRR1470988 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR811915 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1310997 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1464494 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1357083 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1475842 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.5363 0.4111 0.276 0.000 0.724
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1345692 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1401040 3 0.3686 0.9164 0.000 0.140 0.860
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1454073 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1398138 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR817142 2 0.4121 0.7437 0.000 0.832 0.168
#> SRR1315291 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1309314 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1420085 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1361308 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1472126 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1380482 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1440290 3 0.4062 0.8917 0.000 0.164 0.836
#> SRR1330813 2 0.4887 0.6235 0.000 0.772 0.228
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1312169 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1096687 1 0.3116 0.9344 0.892 0.000 0.108
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1447893 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0424 0.9609 0.992 0.000 0.008
#> SRR1445701 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR820689 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.3192 0.9330 0.888 0.000 0.112
#> SRR1447784 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.5810 0.3036 0.000 0.664 0.336
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1095188 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1105417 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1325578 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1358161 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1418183 2 0.5988 0.3913 0.000 0.632 0.368
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1447828 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1350280 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1370682 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1475448 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1407291 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.3038 0.9355 0.896 0.000 0.104
#> SRR1082592 3 0.6204 0.5902 0.000 0.424 0.576
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.4931 0.7215 0.000 0.768 0.232
#> SRR1457527 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1488858 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1309182 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1433538 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 3 0.5785 0.7744 0.000 0.332 0.668
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.3412 0.8138 0.000 0.876 0.124
#> SRR1076195 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1069895 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1102583 1 0.1031 0.9574 0.976 0.000 0.024
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1408553 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1069231 1 0.1753 0.9514 0.952 0.000 0.048
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1411 0.9259 0.000 0.964 0.036
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.4974 0.7166 0.000 0.764 0.236
#> SRR1443568 3 0.6008 0.5624 0.000 0.372 0.628
#> SRR1380249 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1080143 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1383148 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1357042 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1416025 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1431015 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1078709 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR813283 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.6225 -0.0779 0.432 0.000 0.568
#> SRR807679 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1078660 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1441934 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1472552 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1488881 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.5363 0.6342 0.000 0.724 0.276
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1453299 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1354467 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1437430 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1077619 1 0.1753 0.9515 0.952 0.000 0.048
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1354999 3 0.5760 0.6562 0.000 0.328 0.672
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.4504 0.9401 0.000 0.196 0.804
#> SRR1413182 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1464559 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1413075 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1487928 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1388997 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1092865 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1102729 1 0.1163 0.9563 0.972 0.000 0.028
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0424 0.9504 0.000 0.992 0.008
#> SRR1480941 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.2537 0.9097 0.000 0.920 0.080
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1355554 3 0.4291 0.8788 0.000 0.180 0.820
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1318331 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1321333 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1455989 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1453680 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.2448 0.9115 0.000 0.924 0.076
#> SRR1097197 1 0.2165 0.9470 0.936 0.000 0.064
#> SRR1366729 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR821282 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1074602 2 0.1031 0.9372 0.000 0.976 0.024
#> SRR814633 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
#> SRR1444598 3 0.3816 0.9005 0.000 0.148 0.852
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9565 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.4555 0.9415 0.000 0.200 0.800
#> SRR1459785 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.3267 0.9319 0.884 0.000 0.116
#> SRR1323470 3 0.3412 0.9079 0.000 0.124 0.876
#> SRR814657 1 0.3412 0.9293 0.876 0.000 0.124
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.4431 0.7251 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1326059 1 0.0188 0.9394 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409062 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.2198 0.7510 0.000 0.008 0.920 0.072
#> SRR819559 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.2589 0.7195 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.4304 0.5392 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1469926 3 0.1637 0.8188 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1429748 1 0.4454 0.4827 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.2081 0.8053 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.1940 0.8282 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.3764 0.8620 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1402944 3 0.3444 0.8788 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1466951 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1331879 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1068687 2 0.6898 0.4455 0.000 0.524 0.360 0.116
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.4996 0.7326 0.000 0.752 0.192 0.056
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.2814 0.9302 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1354203 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0188 0.8851 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.4040 0.8308 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1097857 1 0.1474 0.8962 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.3400 0.8789 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.2814 0.9302 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1486821 3 0.3400 0.8789 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.4543 0.3699 0.000 0.676 0.324 0.000
#> SRR1359487 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1080648 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3610 0.7022 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1321829 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.3610 0.8735 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.2760 0.8023 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1374165 1 0.0188 0.9393 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.4996 -0.1750 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1401146 2 0.1637 0.8319 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1366124 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086490 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.2760 0.9314 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1332141 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085900 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.2216 0.7353 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1080391 4 0.3649 0.8635 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1347870 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR814028 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR814219 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1389 0.8983 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0817 0.8746 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1070060 4 0.2814 0.9302 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1487969 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3569 0.7106 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.5272 0.7144 0.000 0.752 0.136 0.112
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0188 0.8842 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1436840 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1431735 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1446308 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1437346 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1319584 2 0.1474 0.8560 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1317939 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.4855 0.5562 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1076681 2 0.6824 0.4913 0.000 0.548 0.336 0.116
#> SRR1335314 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1400799 3 0.1792 0.7488 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1074578 4 0.2868 0.9278 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1312226 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447371 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069328 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1445023 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1077599 3 0.4877 0.5890 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.5963 0.6929 0.000 0.688 0.196 0.116
#> SRR1458727 3 0.4843 0.2042 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1436949 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1458158 1 0.4454 0.4813 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1432408 4 0.2814 0.9273 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1310334 1 0.0188 0.9394 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418201 3 0.0707 0.7926 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1385434 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1415591 3 0.0779 0.7887 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0469 0.9324 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1308734 3 0.3400 0.8789 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1498973 2 0.0336 0.8828 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1397115 4 0.3074 0.9172 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1392141 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814341 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.1302 0.8479 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR809919 1 0.0817 0.9219 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1370818 1 0.5000 -0.2251 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1323651 3 0.2589 0.7195 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1357297 4 0.2868 0.9278 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR818170 3 0.4103 0.8180 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.2216 0.7352 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1317731 3 0.3569 0.8753 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0336 0.8821 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR812128 2 0.5759 0.7077 0.000 0.708 0.180 0.112
#> SRR1101513 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415708 2 0.3801 0.6130 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR1316033 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.2647 0.9344 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1075054 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1309333 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1333676 1 0.3975 0.6290 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1352996 4 0.4843 0.5434 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1093172 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1413137 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1469973 2 0.6134 0.6732 0.000 0.668 0.216 0.116
#> SRR1420026 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR817306 4 0.4643 0.6565 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1416266 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1435394 3 0.3569 0.8753 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1383192 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1419962 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0188 0.7760 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0188 0.8851 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2868 0.9278 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1474930 2 0.6968 0.3700 0.000 0.492 0.392 0.116
#> SRR1470988 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR811915 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.1389 0.7584 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1315780 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.4454 0.4827 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1310997 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1464494 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1357083 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1475842 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 4 0.6056 0.6265 0.092 0.000 0.248 0.660
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.4543 0.6938 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1345692 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1401040 3 0.1211 0.8063 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1097954 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374396 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1454073 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.3400 0.8789 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1398138 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR817142 2 0.3688 0.6180 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1315291 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1309314 3 0.0000 0.7773 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420085 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1361308 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1472126 1 0.4331 0.5296 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1380482 3 0.3688 0.8664 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399353 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096760 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1440290 3 0.2909 0.7416 0.000 0.020 0.888 0.092
#> SRR1330813 2 0.4103 0.5139 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0188 0.7760 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312169 4 0.2760 0.9322 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1096687 4 0.3074 0.9171 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1447893 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477429 4 0.4431 0.7212 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1445701 3 0.2773 0.7187 0.000 0.004 0.880 0.116
#> SRR820689 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.4222 0.5633 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1447784 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 4 0.2647 0.9344 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480917 2 0.4585 0.3330 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1474485 1 0.0336 0.9358 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1095188 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0188 0.7760 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105417 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1325578 3 0.3486 0.8782 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1358161 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 4 0.4679 0.6412 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1418183 3 0.6909 0.0418 0.000 0.364 0.520 0.116
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1447828 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1350280 4 0.4994 0.2945 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1370682 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1475448 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1407291 1 0.4989 -0.1256 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.4697 0.3388 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1082592 3 0.5404 0.3684 0.000 0.476 0.512 0.012
#> SRR1325794 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.6909 0.4368 0.000 0.520 0.364 0.116
#> SRR1457527 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.7773 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1454695 1 0.4134 0.5552 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1090241 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1309182 1 0.4454 0.4827 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1433538 4 0.4898 0.4921 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1085063 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0592 0.8785 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.4697 0.6872 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.3074 0.7124 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1076195 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1069895 3 0.3569 0.8755 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1102583 1 0.3123 0.7642 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.1940 0.7447 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1408553 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1069231 1 0.3528 0.7101 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1325642 2 0.0707 0.8767 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.2149 0.8005 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.6634 0.5746 0.000 0.592 0.292 0.116
#> SRR1443568 3 0.5423 0.6079 0.000 0.144 0.740 0.116
#> SRR1380249 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1080143 1 0.4522 0.4514 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1383148 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1357042 1 0.4406 0.5023 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1416025 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1431015 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1078709 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR813283 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.3015 0.9053 0.092 0.000 0.024 0.884
#> SRR807679 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.2081 0.7400 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1078660 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350958 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.3569 0.8755 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1441934 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1472552 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1488881 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1102973 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071131 2 0.6937 0.4091 0.000 0.508 0.376 0.116
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1431887 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1453299 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1354467 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1437430 3 0.3444 0.8787 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.3444 0.8787 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1077619 1 0.4776 0.2485 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.3400 0.8789 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1354999 3 0.4718 0.6659 0.000 0.092 0.792 0.116
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.3311 0.8771 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1413182 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1464559 1 0.3649 0.6943 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1413075 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1487928 4 0.2647 0.9351 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1388997 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1092865 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1102729 1 0.1302 0.9043 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.3400 0.8789 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1339903 1 0.4431 0.4524 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0336 0.8810 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1480941 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0188 0.9394 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433884 2 0.5963 0.6929 0.000 0.688 0.196 0.116
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1355554 3 0.3581 0.7063 0.000 0.032 0.852 0.116
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1318331 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1321333 3 0.3400 0.8787 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 4 0.4804 0.5901 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.3356 0.8784 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1455989 3 0.3764 0.8621 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1453680 3 0.0000 0.7773 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.5926 0.6965 0.000 0.692 0.192 0.116
#> SRR1097197 4 0.3801 0.8506 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1366729 3 0.0000 0.7773 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 3 0.3400 0.8789 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1074602 2 0.1637 0.8322 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.3219 0.8738 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.2589 0.7195 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.2589 0.9343 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1444598 3 0.2909 0.7303 0.000 0.020 0.888 0.092
#> SRR1091743 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9423 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.3528 0.8775 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1459785 3 0.0188 0.7760 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083700 1 0.0188 0.9395 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375531 1 0.3400 0.7303 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1323470 3 0.2589 0.7195 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR814657 4 0.3074 0.9155 0.152 0.000 0.000 0.848
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1467726 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR815446 2 0.3534 0.8529 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1402132 4 0.5013 0.7138 0.240 0.000 0.080 0.680 0.000
#> SRR1326059 1 0.0703 0.9234 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1409062 2 0.3561 0.8503 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR809406 1 0.0404 0.9295 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465313 3 0.5180 0.4598 0.000 0.032 0.628 0.016 0.324
#> SRR819559 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387899 5 0.3983 0.4252 0.000 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1442292 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.3561 0.8503 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1102320 1 0.4182 0.4388 0.644 0.000 0.004 0.352 0.000
#> SRR1469926 3 0.2054 0.8495 0.000 0.028 0.920 0.000 0.052
#> SRR1070036 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098426 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090310 3 0.1732 0.8869 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.4150 0.3488 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1363654 1 0.0290 0.9317 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326317 2 0.4666 0.7824 0.000 0.732 0.088 0.000 0.180
#> SRR1378308 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1366919 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.2067 0.8534 0.000 0.032 0.920 0.000 0.048
#> SRR1490761 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1380122 2 0.6204 -0.4037 0.000 0.476 0.432 0.052 0.040
#> SRR1402944 3 0.6132 0.5498 0.000 0.332 0.568 0.052 0.048
#> SRR1092818 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1093552 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1464880 2 0.1430 0.6683 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1078368 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1349608 5 0.1410 0.8033 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1466951 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1331879 2 0.2506 0.6377 0.000 0.904 0.008 0.052 0.036
#> SRR1320034 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1068687 5 0.2074 0.7684 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 5 0.4291 -0.3109 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1374005 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1319182 1 0.0162 0.9325 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1329994 4 0.1410 0.8939 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1354203 1 0.1410 0.9033 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1077992 2 0.2661 0.6308 0.000 0.896 0.008 0.052 0.044
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.5313 0.3090 0.000 0.444 0.516 0.028 0.012
#> SRR1097857 1 0.2344 0.8767 0.904 0.000 0.064 0.032 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1338687 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1071207 4 0.1430 0.8946 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1486821 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1418540 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408788 2 0.6671 0.1542 0.000 0.432 0.408 0.016 0.144
#> SRR1359487 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1080648 1 0.1571 0.9026 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR1414708 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1469080 2 0.1430 0.6683 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1365722 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1448118 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1444808 1 0.3300 0.7280 0.792 0.000 0.000 0.204 0.004
#> SRR1321829 2 0.3561 0.8503 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1475993 3 0.3074 0.7859 0.000 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0162 0.9325 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077575 2 0.2943 0.6153 0.000 0.880 0.008 0.052 0.060
#> SRR1349300 1 0.3424 0.6663 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1374165 1 0.0671 0.9252 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1453769 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1473870 4 0.4268 0.2703 0.444 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1401146 2 0.2628 0.7492 0.000 0.884 0.028 0.000 0.088
#> SRR1366124 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1638 0.9008 0.932 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR1086490 3 0.1851 0.8849 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1404577 4 0.1638 0.8938 0.064 0.000 0.004 0.932 0.000
#> SRR1384431 1 0.0771 0.9256 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1072055 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1359738 3 0.1908 0.8829 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.1410 0.9033 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1085900 5 0.0404 0.8402 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR814515 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1357999 2 0.2943 0.6153 0.000 0.880 0.008 0.052 0.060
#> SRR1344034 5 0.4297 0.0590 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1080391 4 0.2329 0.8567 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1347870 5 0.0609 0.8387 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR814028 5 0.0794 0.8344 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR814219 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1478 0.8925 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1460211 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1418346 2 0.4146 0.5460 0.000 0.820 0.056 0.052 0.072
#> SRR1070060 4 0.1341 0.8944 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1487969 2 0.1300 0.6779 0.000 0.956 0.000 0.028 0.016
#> SRR1417851 1 0.3944 0.6916 0.764 0.000 0.020 0.212 0.004
#> SRR1443350 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1403199 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1076705 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1079380 5 0.5560 0.4778 0.000 0.412 0.008 0.052 0.528
#> SRR1102923 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1369560 2 0.1818 0.6634 0.000 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR1366605 2 0.3508 0.8554 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1396035 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1390223 5 0.0609 0.8383 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1436840 5 0.0963 0.8293 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1445573 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1375394 4 0.3133 0.8705 0.052 0.000 0.080 0.864 0.004
#> SRR1431735 1 0.1638 0.9008 0.932 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR1417387 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445984 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1370447 4 0.1591 0.8942 0.052 0.000 0.004 0.940 0.004
#> SRR1446308 3 0.2077 0.8852 0.000 0.084 0.908 0.000 0.008
#> SRR1437346 3 0.1732 0.8869 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1086466 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073191 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2885 0.8776 0.052 0.000 0.064 0.880 0.004
#> SRR1319584 2 0.4949 0.4509 0.000 0.752 0.148 0.052 0.048
#> SRR1486584 1 0.0703 0.9245 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR813536 4 0.1557 0.8946 0.052 0.000 0.008 0.940 0.000
#> SRR1317939 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.3774 0.6688 0.296 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR1399178 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 5 0.1851 0.7710 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1453259 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1340828 2 0.2875 0.6193 0.000 0.884 0.008 0.052 0.056
#> SRR1079543 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR816427 5 0.0609 0.8383 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1076681 5 0.1918 0.8165 0.000 0.036 0.036 0.000 0.928
#> SRR1335314 4 0.2885 0.8776 0.052 0.000 0.064 0.880 0.004
#> SRR1400799 3 0.3752 0.5714 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1074578 4 0.1544 0.8917 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1312226 2 0.2875 0.6193 0.000 0.884 0.008 0.052 0.056
#> SRR1416207 1 0.1410 0.9033 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.1410 0.9033 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1069328 4 0.2592 0.8816 0.052 0.000 0.056 0.892 0.000
#> SRR1445023 4 0.2885 0.8776 0.052 0.000 0.064 0.880 0.004
#> SRR1077599 2 0.4706 0.5885 0.000 0.692 0.256 0.000 0.052
#> SRR1453480 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1101834 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1321744 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074839 5 0.0290 0.8395 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1458727 4 0.8399 -0.1451 0.000 0.236 0.304 0.308 0.152
#> SRR1436949 2 0.2943 0.6153 0.000 0.880 0.008 0.052 0.060
#> SRR1070429 3 0.1908 0.8829 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.4262 0.1775 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1432408 4 0.3021 0.8751 0.060 0.000 0.064 0.872 0.004
#> SRR1310334 1 0.0510 0.9280 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1418201 3 0.1894 0.8280 0.000 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR1385434 4 0.2885 0.8776 0.052 0.000 0.064 0.880 0.004
#> SRR1415591 3 0.3013 0.7590 0.000 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0671 0.9274 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1308734 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1498973 2 0.3958 0.5620 0.000 0.832 0.056 0.052 0.060
#> SRR1397115 4 0.1792 0.8856 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000
#> SRR1392141 1 0.1571 0.9026 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR814341 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1313601 2 0.3783 0.8469 0.000 0.740 0.008 0.000 0.252
#> SRR1459609 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1499325 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR809919 1 0.2588 0.8643 0.892 0.000 0.060 0.048 0.000
#> SRR1370818 4 0.4331 0.3899 0.400 0.000 0.000 0.596 0.004
#> SRR1323651 5 0.3932 0.4476 0.000 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1357297 4 0.1544 0.8917 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR818170 3 0.6259 0.4422 0.000 0.424 0.480 0.052 0.044
#> SRR1091230 2 0.3561 0.8503 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1470556 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR812318 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.4291 0.1273 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1317731 3 0.5042 0.7446 0.000 0.188 0.728 0.044 0.040
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1447808 1 0.0609 0.9259 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR809534 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1397312 2 0.4146 0.5502 0.000 0.820 0.072 0.052 0.056
#> SRR812128 5 0.4140 0.7152 0.000 0.200 0.008 0.028 0.764
#> SRR1101513 1 0.1638 0.9000 0.932 0.000 0.064 0.004 0.000
#> SRR1415708 2 0.6746 0.3132 0.000 0.380 0.360 0.000 0.260
#> SRR1316033 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1390371 2 0.3561 0.8508 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1480263 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1464473 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1076801 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1080044 1 0.0771 0.9256 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1420850 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1474295 4 0.2795 0.8788 0.056 0.000 0.064 0.880 0.000
#> SRR1069871 1 0.0609 0.9251 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1095744 2 0.2943 0.6153 0.000 0.880 0.008 0.052 0.060
#> SRR1068929 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1490097 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1075054 2 0.0955 0.6847 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417023 4 0.2885 0.8776 0.052 0.000 0.064 0.880 0.004
#> SRR1309333 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1333676 1 0.3796 0.5641 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1352996 4 0.3707 0.6642 0.284 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1093172 4 0.1270 0.8947 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1413137 4 0.1270 0.8947 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1469973 5 0.0579 0.8380 0.000 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1420026 5 0.0609 0.8383 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR817306 4 0.3452 0.7269 0.244 0.000 0.000 0.756 0.000
#> SRR1416266 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1071011 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1090290 4 0.1270 0.8947 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1435394 3 0.3563 0.7637 0.000 0.208 0.780 0.000 0.012
#> SRR1383192 4 0.1270 0.8947 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1419962 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1094357 1 0.0162 0.9325 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1081639 3 0.2516 0.7739 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1356016 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1351082 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1397348 2 0.2943 0.6153 0.000 0.880 0.008 0.052 0.060
#> SRR1312147 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1473891 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1335470 4 0.1544 0.8917 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1474930 5 0.1908 0.7822 0.000 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1470988 4 0.1591 0.8942 0.052 0.000 0.004 0.940 0.004
#> SRR811915 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1444436 2 0.2277 0.6502 0.000 0.916 0.016 0.052 0.016
#> SRR1313770 3 0.4825 0.6181 0.000 0.028 0.708 0.024 0.240
#> SRR1315780 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.4114 0.3832 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1310997 5 0.4243 0.6199 0.000 0.264 0.000 0.024 0.712
#> SRR1464494 5 0.3586 0.6358 0.000 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1357083 3 0.2068 0.8822 0.000 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR1475842 5 0.0963 0.8293 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1378085 1 0.0451 0.9312 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1378220 3 0.2017 0.8861 0.000 0.080 0.912 0.000 0.008
#> SRR1467704 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1348885 4 0.6750 0.4046 0.000 0.220 0.156 0.576 0.048
#> SRR1325826 1 0.0703 0.9240 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1466812 4 0.3366 0.7438 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000
#> SRR1345692 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1401040 3 0.2017 0.8241 0.000 0.008 0.912 0.000 0.080
#> SRR1097954 1 0.1478 0.9014 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.1591 0.8942 0.052 0.000 0.004 0.940 0.004
#> SRR1454073 5 0.0404 0.8402 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1355747 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429368 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1398138 5 0.0290 0.8395 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1379260 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1361436 3 0.1792 0.8865 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.4781 0.7156 0.000 0.728 0.160 0.000 0.112
#> SRR1315291 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1309314 3 0.1732 0.8183 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1420085 5 0.0609 0.8383 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1361308 3 0.1792 0.8865 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.4074 0.4146 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1380482 3 0.6258 0.4932 0.000 0.380 0.520 0.052 0.048
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.3054 0.6115 0.000 0.876 0.012 0.052 0.060
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.1697 0.9001 0.932 0.000 0.060 0.008 0.000
#> SRR1399353 1 0.1571 0.9026 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR1096760 3 0.1952 0.8862 0.000 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR1440290 5 0.4367 0.2509 0.000 0.004 0.416 0.000 0.580
#> SRR1330813 2 0.4890 0.7338 0.000 0.720 0.140 0.000 0.140
#> SRR1458931 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR812294 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1394321 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1081160 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1469704 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1086752 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1084698 2 0.1741 0.6970 0.000 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR1390143 1 0.0609 0.9259 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1390413 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1099570 3 0.2561 0.7706 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1312169 4 0.1341 0.8944 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1096687 4 0.2130 0.8866 0.080 0.000 0.012 0.908 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.2885 0.8776 0.052 0.000 0.064 0.880 0.004
#> SRR1447893 3 0.2707 0.8477 0.000 0.132 0.860 0.000 0.008
#> SRR1466025 2 0.1106 0.6945 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1477429 4 0.4395 0.7700 0.188 0.000 0.064 0.748 0.000
#> SRR1445701 5 0.3661 0.5291 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR820689 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1452537 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.3999 0.4616 0.656 0.000 0.000 0.344 0.000
#> SRR1447784 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355769 4 0.1628 0.8950 0.056 0.000 0.008 0.936 0.000
#> SRR1488237 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1391985 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1478501 1 0.1410 0.9033 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.5757 0.2311 0.000 0.656 0.240 0.052 0.052
#> SRR1474485 1 0.0451 0.9300 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319262 3 0.1952 0.8862 0.000 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR1095188 5 0.0404 0.8402 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3074 0.7147 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1105417 4 0.2726 0.8784 0.052 0.000 0.064 0.884 0.000
#> SRR1325578 3 0.4796 0.6613 0.000 0.300 0.664 0.028 0.008
#> SRR1358161 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1358665 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1333971 2 0.0963 0.6821 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1452010 4 0.3508 0.7152 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1418183 5 0.2377 0.7491 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0404 0.9294 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1473461 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1090837 3 0.2233 0.8736 0.000 0.104 0.892 0.000 0.004
#> SRR1447828 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1338747 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1333038 3 0.2732 0.8239 0.000 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1350280 4 0.4138 0.4479 0.384 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1088557 1 0.0609 0.9251 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1102656 2 0.1717 0.6690 0.000 0.936 0.008 0.052 0.004
#> SRR1441443 5 0.0609 0.8387 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1370682 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1475448 3 0.1952 0.8862 0.000 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR1407291 4 0.4287 0.2147 0.460 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.4291 0.0731 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1082592 2 0.7016 -0.2536 0.000 0.488 0.336 0.052 0.124
#> SRR1325794 2 0.1399 0.6763 0.000 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1095961 3 0.1732 0.8869 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1320806 5 0.2179 0.7732 0.000 0.004 0.100 0.000 0.896
#> SRR1457527 3 0.1792 0.8865 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1474374 3 0.1908 0.8111 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1488858 4 0.2032 0.8918 0.052 0.000 0.020 0.924 0.004
#> SRR1454695 1 0.3949 0.5022 0.696 0.000 0.000 0.300 0.004
#> SRR1090241 2 0.3508 0.8553 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1329863 2 0.3424 0.8542 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1379581 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1309182 1 0.4171 0.3250 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR1437668 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084742 5 0.4777 0.6001 0.000 0.268 0.000 0.052 0.680
#> SRR1433538 4 0.3752 0.6501 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR1085063 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1454247 2 0.3724 0.5759 0.000 0.844 0.036 0.052 0.068
#> SRR1097100 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR818622 2 0.4815 0.0396 0.000 0.524 0.456 0.000 0.020
#> SRR1072388 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070332 2 0.2459 0.6378 0.000 0.904 0.004 0.052 0.040
#> SRR1320761 2 0.2657 0.6386 0.000 0.900 0.024 0.052 0.024
#> SRR1076195 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1069895 3 0.3427 0.7845 0.000 0.192 0.796 0.000 0.012
#> SRR1099144 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1385150 3 0.1892 0.8869 0.000 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR1420191 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1332625 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1102583 1 0.3857 0.5240 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1456971 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 5 0.1197 0.8119 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 5 0.7661 0.0282 0.000 0.248 0.328 0.052 0.372
#> SRR1408553 4 0.1430 0.8946 0.052 0.000 0.004 0.944 0.000
#> SRR1069231 1 0.3707 0.5854 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1325642 2 0.3534 0.8503 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1362103 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1099330 2 0.4647 0.7856 0.000 0.732 0.084 0.000 0.184
#> SRR1077874 2 0.1300 0.6779 0.000 0.956 0.000 0.028 0.016
#> SRR808299 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1098050 2 0.3009 0.6128 0.000 0.876 0.008 0.052 0.064
#> SRR1481238 5 0.3602 0.7069 0.000 0.180 0.024 0.000 0.796
#> SRR1443568 5 0.3242 0.6327 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1380249 4 0.1557 0.8947 0.052 0.000 0.000 0.940 0.008
#> SRR1080143 1 0.4262 0.1775 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1383148 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1357042 1 0.4114 0.3820 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1416025 5 0.0794 0.8344 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1431015 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1078709 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR813283 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1347707 4 0.2844 0.8462 0.028 0.000 0.092 0.876 0.004
#> SRR807679 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333811 3 0.4126 0.3834 0.000 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1078660 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1331730 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1333913 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432542 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1418041 1 0.0703 0.9234 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1085211 1 0.1571 0.9026 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1402437 1 0.1571 0.9026 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR1350958 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1396822 3 0.3391 0.7891 0.000 0.188 0.800 0.000 0.012
#> SRR1441934 5 0.0880 0.8316 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1472552 3 0.1851 0.8849 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.2020 0.8776 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.1410 0.9033 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1071131 5 0.1908 0.7822 0.000 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1074502 1 0.0162 0.9325 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325271 1 0.0324 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1409171 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR809113 2 0.3684 0.8389 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1430045 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1441245 2 0.3534 0.8531 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1384091 4 0.1430 0.8946 0.052 0.000 0.004 0.944 0.000
#> SRR1431887 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1096525 4 0.1591 0.8942 0.052 0.000 0.004 0.940 0.004
#> SRR1488491 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1356351 2 0.2069 0.6552 0.000 0.924 0.012 0.052 0.012
#> SRR1369514 4 0.1270 0.8947 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1453299 3 0.1792 0.8865 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.2806 0.6246 0.000 0.888 0.008 0.052 0.052
#> SRR1091767 5 0.0609 0.8383 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1354467 3 0.1792 0.8865 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.3561 0.8503 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1452399 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1437430 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1419736 2 0.3209 0.6080 0.000 0.872 0.024 0.052 0.052
#> SRR1313343 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1077619 1 0.4383 0.1666 0.572 0.000 0.000 0.424 0.004
#> SRR1083530 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333633 3 0.2069 0.8865 0.000 0.076 0.912 0.000 0.012
#> SRR1354999 5 0.3003 0.6746 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1443592 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1077356 1 0.0510 0.9274 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1378818 3 0.6074 0.5662 0.000 0.316 0.584 0.052 0.048
#> SRR1413182 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1464559 1 0.3522 0.7130 0.780 0.000 0.004 0.212 0.004
#> SRR1413075 5 0.4777 0.6001 0.000 0.268 0.000 0.052 0.680
#> SRR1487928 4 0.1430 0.8948 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1388997 5 0.0510 0.8401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1092865 5 0.0880 0.8275 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1102729 1 0.2171 0.8838 0.912 0.000 0.064 0.024 0.000
#> SRR1456423 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321591 2 0.3508 0.8554 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1376874 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1339903 1 0.4114 0.3072 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1346710 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418771 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1095358 2 0.1399 0.6775 0.000 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1480941 3 0.1732 0.8869 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1313891 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1491354 1 0.0703 0.9234 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1433884 5 0.0290 0.8395 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1471074 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1353052 5 0.0880 0.8316 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1355554 5 0.3424 0.5932 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 5 0.0609 0.8387 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1318331 5 0.0880 0.8316 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1321333 3 0.1892 0.8872 0.000 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR1474231 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350545 4 0.3796 0.6653 0.300 0.000 0.000 0.700 0.000
#> SRR1091328 1 0.0162 0.9328 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR814447 3 0.1894 0.8863 0.000 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR1455989 3 0.3612 0.7422 0.000 0.228 0.764 0.000 0.008
#> SRR1453680 3 0.1732 0.8183 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1470356 2 0.3534 0.8528 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1342977 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1444222 5 0.1671 0.7842 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1097197 4 0.2561 0.8444 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1366729 3 0.1851 0.8136 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR821282 3 0.1831 0.8873 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1074602 2 0.4627 0.7891 0.000 0.732 0.080 0.000 0.188
#> SRR814633 2 0.3480 0.8576 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1072480 3 0.1670 0.8737 0.000 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 5 0.3661 0.5291 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.2726 0.8784 0.052 0.000 0.064 0.884 0.000
#> SRR1444598 5 0.7549 0.2059 0.000 0.248 0.268 0.052 0.432
#> SRR1091743 2 0.3561 0.8503 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR819637 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9334 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.3355 0.7937 0.000 0.184 0.804 0.000 0.012
#> SRR1459785 3 0.3039 0.7194 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1083700 1 0.1410 0.9033 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.3527 0.7520 0.804 0.000 0.024 0.172 0.000
#> SRR1323470 5 0.3966 0.4613 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR814657 4 0.1608 0.8900 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.1167 0.92635 0.000 0.960 0.012 0.000 0.020 0.008
#> SRR1402132 4 0.5528 0.67922 0.172 0.000 0.004 0.596 0.224 0.004
#> SRR1326059 1 0.2697 0.78418 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.1053 0.93377 0.000 0.964 0.020 0.004 0.012 0.000
#> SRR809406 1 0.2340 0.81860 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.5214 0.42524 0.000 0.000 0.576 0.000 0.120 0.304
#> SRR819559 1 0.0862 0.88437 0.972 0.000 0.004 0.016 0.008 0.000
#> SRR1387899 6 0.2531 0.82484 0.000 0.000 0.128 0.004 0.008 0.860
#> SRR1442292 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488151 1 0.1663 0.85678 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1343629 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0622 0.95215 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012 0.000
#> SRR1102320 1 0.4333 0.16402 0.512 0.000 0.000 0.468 0.020 0.000
#> SRR1469926 3 0.1053 0.89600 0.000 0.012 0.964 0.000 0.020 0.004
#> SRR1070036 1 0.1483 0.88009 0.944 0.000 0.000 0.008 0.036 0.012
#> SRR1098426 1 0.1297 0.87749 0.948 0.000 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1090310 3 0.0777 0.89811 0.000 0.024 0.972 0.004 0.000 0.000
#> SRR1429748 4 0.4500 -0.04792 0.480 0.000 0.012 0.496 0.012 0.000
#> SRR1363654 1 0.2212 0.84350 0.880 0.000 0.000 0.112 0.008 0.000
#> SRR1326317 2 0.1586 0.90619 0.000 0.940 0.040 0.004 0.012 0.004
#> SRR1378308 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1366919 4 0.2908 0.78239 0.004 0.000 0.012 0.864 0.092 0.028
#> SRR1329947 1 0.1007 0.87568 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.1065 0.89360 0.000 0.008 0.964 0.000 0.020 0.008
#> SRR1490761 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380122 5 0.5085 0.67508 0.000 0.144 0.192 0.000 0.656 0.008
#> SRR1402944 5 0.4096 0.46396 0.000 0.016 0.304 0.000 0.672 0.008
#> SRR1092818 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1093552 1 0.2147 0.87943 0.912 0.000 0.000 0.032 0.044 0.012
#> SRR1464880 5 0.3850 0.75867 0.000 0.340 0.004 0.000 0.652 0.004
#> SRR1078368 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349608 6 0.1387 0.90722 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1466951 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1331879 5 0.4327 0.77940 0.000 0.316 0.016 0.000 0.652 0.016
#> SRR1320034 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1068687 6 0.1426 0.91425 0.000 0.028 0.016 0.000 0.008 0.948
#> SRR1437491 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.3101 0.55391 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1374005 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319182 1 0.2219 0.82871 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.2426 0.79302 0.044 0.000 0.012 0.896 0.048 0.000
#> SRR1354203 1 0.2146 0.83735 0.880 0.000 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1077850 1 0.0260 0.88427 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077992 5 0.4694 0.79746 0.000 0.288 0.044 0.000 0.652 0.016
#> SRR1455214 1 0.0405 0.88505 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1092014 3 0.6232 -0.23790 0.000 0.236 0.416 0.004 0.340 0.004
#> SRR1097857 1 0.3806 0.78752 0.776 0.000 0.000 0.088 0.136 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1338687 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071207 4 0.2332 0.77902 0.020 0.000 0.012 0.908 0.048 0.012
#> SRR1486821 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1418540 1 0.1370 0.87896 0.948 0.000 0.000 0.004 0.036 0.012
#> SRR1408788 3 0.5964 -0.11269 0.000 0.400 0.408 0.004 0.188 0.000
#> SRR1359487 4 0.2958 0.78158 0.004 0.000 0.012 0.860 0.096 0.028
#> SRR1080648 1 0.2653 0.82915 0.844 0.000 0.000 0.000 0.144 0.012
#> SRR1414708 1 0.1937 0.87488 0.924 0.000 0.012 0.004 0.048 0.012
#> SRR1469080 5 0.3878 0.75069 0.000 0.348 0.004 0.000 0.644 0.004
#> SRR1365722 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1448118 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444808 1 0.4401 0.71351 0.744 0.000 0.012 0.180 0.052 0.012
#> SRR1321829 2 0.1053 0.93559 0.000 0.964 0.020 0.004 0.012 0.000
#> SRR1475993 3 0.2946 0.72005 0.000 0.184 0.808 0.004 0.004 0.000
#> SRR1445387 1 0.2048 0.83863 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1077575 5 0.4823 0.79979 0.000 0.280 0.040 0.000 0.652 0.028
#> SRR1349300 1 0.3817 0.31849 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1750 0.87302 0.932 0.000 0.000 0.016 0.040 0.012
#> SRR1453769 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 4 0.3620 0.40435 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.3196 0.77504 0.000 0.844 0.072 0.004 0.076 0.004
#> SRR1366124 4 0.3054 0.78154 0.004 0.000 0.012 0.852 0.104 0.028
#> SRR1391811 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.2805 0.81970 0.828 0.000 0.000 0.000 0.160 0.012
#> SRR1086490 3 0.1080 0.89467 0.000 0.032 0.960 0.004 0.004 0.000
#> SRR1088511 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1404577 4 0.1657 0.78078 0.056 0.000 0.000 0.928 0.016 0.000
#> SRR1384431 1 0.3190 0.81236 0.820 0.000 0.000 0.136 0.044 0.000
#> SRR1072055 1 0.1225 0.87783 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1359738 3 0.1155 0.89235 0.000 0.036 0.956 0.004 0.004 0.000
#> SRR1332141 1 0.2048 0.83574 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1085900 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1442173 1 0.0547 0.88248 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR814515 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357999 5 0.4731 0.79748 0.000 0.288 0.032 0.000 0.652 0.028
#> SRR1344034 6 0.2814 0.76978 0.000 0.000 0.172 0.000 0.008 0.820
#> SRR1080391 4 0.1584 0.78628 0.064 0.000 0.000 0.928 0.000 0.008
#> SRR1347870 6 0.1075 0.92209 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR814028 6 0.1141 0.92048 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR814219 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.3487 0.75667 0.776 0.000 0.012 0.200 0.012 0.000
#> SRR1460211 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418346 5 0.5224 0.79459 0.000 0.232 0.084 0.000 0.652 0.032
#> SRR1070060 4 0.1349 0.77980 0.056 0.000 0.000 0.940 0.004 0.000
#> SRR1487969 5 0.4264 0.51926 0.000 0.484 0.000 0.000 0.500 0.016
#> SRR1417851 1 0.5464 0.56698 0.608 0.000 0.012 0.280 0.088 0.012
#> SRR1443350 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403199 1 0.2462 0.87463 0.892 0.000 0.000 0.064 0.032 0.012
#> SRR1076705 1 0.1225 0.87783 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1079380 5 0.5402 0.64659 0.000 0.116 0.036 0.000 0.652 0.196
#> SRR1102923 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369560 5 0.4780 0.74507 0.000 0.336 0.040 0.004 0.612 0.008
#> SRR1366605 2 0.0508 0.95358 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1396035 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1390223 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1436840 6 0.1327 0.91133 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1445573 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375394 4 0.4161 0.71958 0.004 0.000 0.004 0.700 0.264 0.028
#> SRR1431735 1 0.2841 0.81754 0.824 0.000 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1417387 1 0.1225 0.87783 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1445984 1 0.1511 0.87652 0.940 0.000 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR1370447 4 0.2701 0.78542 0.004 0.000 0.000 0.864 0.104 0.028
#> SRR1446308 3 0.1036 0.89704 0.000 0.024 0.964 0.004 0.008 0.000
#> SRR1437346 3 0.0922 0.89751 0.000 0.024 0.968 0.004 0.004 0.000
#> SRR1103143 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1086466 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1073191 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098974 1 0.0146 0.88446 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.3640 0.75566 0.004 0.000 0.000 0.764 0.204 0.028
#> SRR1319584 5 0.4979 0.71600 0.000 0.160 0.160 0.000 0.672 0.008
#> SRR1486584 1 0.2454 0.81373 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.2342 0.79080 0.004 0.000 0.000 0.888 0.088 0.020
#> SRR1317939 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079730 1 0.1714 0.85453 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.3101 0.65549 0.244 0.000 0.000 0.756 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415615 1 0.1863 0.84682 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1328551 6 0.3647 0.47352 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1453259 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1340828 5 0.4571 0.79105 0.000 0.300 0.024 0.000 0.652 0.024
#> SRR1079543 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1076681 6 0.1523 0.91891 0.000 0.044 0.008 0.000 0.008 0.940
#> SRR1335314 4 0.3753 0.74826 0.004 0.000 0.000 0.748 0.220 0.028
#> SRR1400799 3 0.3482 0.53539 0.000 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1074578 4 0.1411 0.77870 0.060 0.000 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1312226 5 0.4450 0.78498 0.000 0.308 0.016 0.000 0.652 0.024
#> SRR1416207 1 0.2003 0.83826 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1447371 1 0.2092 0.83335 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1069328 4 0.2734 0.78154 0.004 0.000 0.000 0.840 0.148 0.008
#> SRR1445023 4 0.3726 0.74894 0.004 0.000 0.000 0.752 0.216 0.028
#> SRR1077599 2 0.2145 0.85285 0.000 0.904 0.076 0.004 0.012 0.004
#> SRR1453480 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1074839 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1458727 5 0.4728 0.51509 0.000 0.000 0.076 0.076 0.744 0.104
#> SRR1436949 5 0.4626 0.79279 0.000 0.296 0.024 0.000 0.652 0.028
#> SRR1070429 3 0.1219 0.88725 0.000 0.048 0.948 0.004 0.000 0.000
#> SRR1458158 4 0.3765 0.26402 0.404 0.000 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.4182 0.74138 0.020 0.000 0.000 0.724 0.228 0.028
#> SRR1310334 1 0.2597 0.79522 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.1065 0.89361 0.000 0.008 0.964 0.000 0.020 0.008
#> SRR1385434 4 0.3753 0.74826 0.004 0.000 0.000 0.748 0.220 0.028
#> SRR1415591 3 0.2442 0.79881 0.000 0.000 0.852 0.004 0.000 0.144
#> SRR1402009 1 0.0405 0.88475 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1316055 1 0.2309 0.86984 0.908 0.000 0.012 0.016 0.052 0.012
#> SRR1308734 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1498973 5 0.5151 0.79450 0.000 0.236 0.088 0.000 0.652 0.024
#> SRR1397115 4 0.1327 0.77900 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.2768 0.82137 0.832 0.000 0.000 0.000 0.156 0.012
#> SRR814341 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313601 2 0.1053 0.93377 0.000 0.964 0.020 0.004 0.012 0.000
#> SRR1459609 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499325 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR809919 1 0.4045 0.75745 0.756 0.000 0.000 0.120 0.124 0.000
#> SRR1370818 4 0.5213 0.45828 0.328 0.000 0.012 0.596 0.052 0.012
#> SRR1323651 6 0.1812 0.86739 0.000 0.000 0.080 0.000 0.008 0.912
#> SRR1357297 4 0.1204 0.77897 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR818170 5 0.4813 0.61617 0.000 0.092 0.228 0.000 0.672 0.008
#> SRR1091230 2 0.1198 0.93194 0.000 0.960 0.020 0.004 0.012 0.004
#> SRR1470556 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 6 0.3860 0.08483 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1317731 3 0.4452 0.52785 0.000 0.040 0.664 0.000 0.288 0.008
#> SRR1490785 1 0.0405 0.88475 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1432032 1 0.1511 0.87652 0.940 0.000 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR1447808 1 0.2491 0.80659 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397312 5 0.5286 0.77080 0.000 0.204 0.120 0.000 0.652 0.024
#> SRR812128 6 0.4931 0.48855 0.000 0.072 0.012 0.000 0.276 0.640
#> SRR1101513 1 0.4045 0.76727 0.756 0.000 0.000 0.120 0.124 0.000
#> SRR1415708 2 0.4766 0.15991 0.000 0.564 0.392 0.004 0.036 0.004
#> SRR1316033 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1390371 2 0.0508 0.95358 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1480263 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1076801 1 0.1225 0.87783 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1080044 1 0.2912 0.82931 0.844 0.000 0.000 0.116 0.040 0.000
#> SRR1420850 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474295 4 0.3023 0.76719 0.032 0.000 0.000 0.828 0.140 0.000
#> SRR1069871 1 0.2562 0.79872 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.4731 0.79728 0.000 0.288 0.032 0.000 0.652 0.028
#> SRR1068929 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490097 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1075054 5 0.3989 0.56375 0.000 0.468 0.000 0.000 0.528 0.004
#> SRR1083480 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1417023 4 0.3753 0.75224 0.004 0.000 0.000 0.748 0.220 0.028
#> SRR1309333 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1333676 1 0.4563 0.21259 0.524 0.000 0.012 0.448 0.016 0.000
#> SRR1352996 4 0.2996 0.64574 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.2504 0.78557 0.004 0.000 0.000 0.880 0.088 0.028
#> SRR1413137 4 0.2504 0.78557 0.004 0.000 0.000 0.880 0.088 0.028
#> SRR1469973 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1420026 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR817306 4 0.3311 0.67964 0.204 0.000 0.012 0.780 0.004 0.000
#> SRR1416266 4 0.2554 0.78458 0.004 0.000 0.000 0.876 0.092 0.028
#> SRR1071011 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1090290 4 0.1836 0.79093 0.004 0.000 0.012 0.928 0.048 0.008
#> SRR1435394 3 0.3051 0.75626 0.000 0.156 0.824 0.004 0.012 0.004
#> SRR1383192 4 0.0508 0.78672 0.004 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000
#> SRR1419962 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1094357 1 0.1910 0.84469 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.2536 0.82093 0.000 0.000 0.864 0.000 0.020 0.116
#> SRR1356016 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351082 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397348 5 0.4626 0.79279 0.000 0.296 0.024 0.000 0.652 0.028
#> SRR1312147 1 0.1511 0.87652 0.940 0.000 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR1473891 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1335470 4 0.1983 0.78003 0.060 0.000 0.012 0.916 0.012 0.000
#> SRR1474930 6 0.1515 0.91297 0.000 0.028 0.020 0.000 0.008 0.944
#> SRR1470988 4 0.2701 0.78542 0.004 0.000 0.000 0.864 0.104 0.028
#> SRR811915 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.4665 0.79877 0.000 0.272 0.060 0.000 0.660 0.008
#> SRR1313770 3 0.4626 0.64329 0.000 0.000 0.692 0.000 0.172 0.136
#> SRR1315780 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.2135 0.83399 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR819124 4 0.3999 -0.11266 0.496 0.000 0.000 0.500 0.004 0.000
#> SRR1310997 6 0.3923 0.27253 0.000 0.004 0.000 0.000 0.416 0.580
#> SRR1464494 6 0.1285 0.88052 0.000 0.004 0.000 0.000 0.052 0.944
#> SRR1357083 3 0.1340 0.88880 0.000 0.040 0.948 0.004 0.008 0.000
#> SRR1475842 6 0.1204 0.91787 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1378085 1 0.1806 0.86056 0.908 0.000 0.000 0.088 0.004 0.000
#> SRR1378220 3 0.1138 0.89592 0.000 0.024 0.960 0.004 0.012 0.000
#> SRR1467704 1 0.1225 0.87783 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1348885 5 0.4930 -0.11856 0.000 0.000 0.012 0.420 0.528 0.040
#> SRR1325826 1 0.2527 0.80511 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.2793 0.68346 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1345692 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1401040 3 0.1152 0.87735 0.000 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1097954 1 0.2234 0.83227 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124 0.000
#> SRR1374396 4 0.3054 0.78148 0.004 0.000 0.012 0.852 0.104 0.028
#> SRR1454073 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1355747 1 0.1225 0.87783 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1429368 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1398138 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1379260 1 0.1511 0.87652 0.940 0.000 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR1361436 3 0.0922 0.89751 0.000 0.024 0.968 0.004 0.004 0.000
#> SRR817142 2 0.1851 0.88392 0.000 0.924 0.056 0.004 0.012 0.004
#> SRR1315291 4 0.3054 0.78154 0.004 0.000 0.012 0.852 0.104 0.028
#> SRR1309314 3 0.1088 0.88669 0.000 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR1420085 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1361308 3 0.0632 0.89855 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.3867 0.14833 0.512 0.000 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.4217 0.48285 0.000 0.024 0.296 0.000 0.672 0.008
#> SRR1099789 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.4865 0.80037 0.000 0.276 0.044 0.000 0.652 0.028
#> SRR1339276 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.4111 0.75648 0.748 0.000 0.000 0.144 0.108 0.000
#> SRR1399353 1 0.2872 0.82449 0.832 0.000 0.000 0.004 0.152 0.012
#> SRR1096760 3 0.1036 0.89683 0.000 0.024 0.964 0.004 0.008 0.000
#> SRR1440290 6 0.3056 0.76396 0.000 0.000 0.184 0.004 0.008 0.804
#> SRR1330813 2 0.1851 0.88290 0.000 0.924 0.056 0.004 0.012 0.004
#> SRR1458931 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812294 4 0.2908 0.78239 0.004 0.000 0.012 0.864 0.092 0.028
#> SRR1394321 1 0.1442 0.87770 0.944 0.000 0.000 0.004 0.040 0.012
#> SRR1081160 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1086752 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1084698 5 0.3995 0.52816 0.000 0.480 0.004 0.000 0.516 0.000
#> SRR1390143 1 0.2669 0.81008 0.836 0.000 0.000 0.156 0.008 0.000
#> SRR1390413 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099570 3 0.2146 0.82480 0.000 0.000 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1312169 4 0.1075 0.78079 0.048 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1096687 4 0.2190 0.78109 0.060 0.000 0.000 0.900 0.040 0.000
#> SRR1486139 1 0.0146 0.88446 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.3878 0.74725 0.004 0.000 0.000 0.736 0.228 0.032
#> SRR1447893 3 0.2110 0.84803 0.000 0.084 0.900 0.004 0.012 0.000
#> SRR1466025 2 0.4131 -0.13502 0.000 0.600 0.000 0.000 0.384 0.016
#> SRR1477429 4 0.3958 0.72327 0.108 0.000 0.000 0.764 0.128 0.000
#> SRR1445701 6 0.1477 0.89071 0.000 0.004 0.048 0.000 0.008 0.940
#> SRR820689 1 0.1663 0.85683 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1452537 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383301 1 0.0405 0.88475 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1489328 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1344462 1 0.2135 0.83399 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.3864 0.17393 0.520 0.000 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.1297 0.87799 0.948 0.000 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1355769 4 0.1921 0.79008 0.032 0.000 0.000 0.916 0.052 0.000
#> SRR1488237 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1391985 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478501 1 0.2003 0.83826 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1480917 5 0.5341 0.63382 0.000 0.100 0.236 0.004 0.640 0.020
#> SRR1474485 1 0.1692 0.87510 0.932 0.000 0.000 0.008 0.048 0.012
#> SRR1089998 1 0.1814 0.84934 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.1610 0.86149 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.1116 0.89563 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR1095188 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1454350 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.1082 0.87892 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1359565 3 0.2664 0.75063 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1105417 4 0.3393 0.76068 0.004 0.000 0.000 0.784 0.192 0.020
#> SRR1325578 3 0.4141 0.32923 0.000 0.016 0.596 0.000 0.388 0.000
#> SRR1358161 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1358665 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333971 5 0.3854 0.57287 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1452010 4 0.3052 0.66457 0.216 0.000 0.000 0.780 0.004 0.000
#> SRR1418183 6 0.1599 0.90821 0.000 0.024 0.028 0.000 0.008 0.940
#> SRR1366345 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.2454 0.80940 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.1586 0.87840 0.940 0.000 0.004 0.004 0.040 0.012
#> SRR1090837 3 0.1615 0.87322 0.000 0.064 0.928 0.004 0.004 0.000
#> SRR1447828 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1338747 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333038 3 0.2377 0.80437 0.000 0.124 0.868 0.004 0.004 0.000
#> SRR1350280 4 0.3409 0.52063 0.300 0.000 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.2527 0.80119 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1102656 5 0.4372 0.62566 0.000 0.432 0.024 0.000 0.544 0.000
#> SRR1441443 6 0.1075 0.92209 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1370682 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1475448 3 0.1116 0.89563 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR1407291 4 0.3634 0.39427 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0717 0.88429 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1363766 4 0.3765 0.27802 0.404 0.000 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1082592 5 0.5559 0.70489 0.000 0.128 0.148 0.000 0.660 0.064
#> SRR1325794 5 0.4214 0.56904 0.000 0.460 0.004 0.000 0.528 0.008
#> SRR1095961 3 0.0748 0.89769 0.000 0.016 0.976 0.004 0.004 0.000
#> SRR1086702 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1320806 6 0.1577 0.91396 0.000 0.036 0.016 0.000 0.008 0.940
#> SRR1457527 3 0.0632 0.89855 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474374 3 0.1528 0.87413 0.000 0.000 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR1488858 4 0.3319 0.77960 0.004 0.000 0.012 0.828 0.128 0.028
#> SRR1454695 1 0.4737 0.46919 0.612 0.000 0.000 0.336 0.040 0.012
#> SRR1090241 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0363 0.95688 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1357733 1 0.0717 0.88295 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1362135 1 0.1726 0.87832 0.932 0.000 0.000 0.012 0.044 0.012
#> SRR1379581 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1309182 4 0.3864 -0.03955 0.480 0.000 0.000 0.520 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1225 0.87783 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1084742 5 0.3742 0.34596 0.000 0.004 0.000 0.000 0.648 0.348
#> SRR1433538 4 0.3023 0.63981 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0291 0.95970 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1454247 5 0.5102 0.79801 0.000 0.248 0.072 0.000 0.652 0.028
#> SRR1097100 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR818622 2 0.4442 -0.03348 0.000 0.504 0.476 0.004 0.012 0.004
#> SRR1072388 1 0.1367 0.87682 0.944 0.000 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1070332 5 0.4327 0.77940 0.000 0.316 0.016 0.000 0.652 0.016
#> SRR1320761 5 0.4650 0.79167 0.000 0.288 0.044 0.004 0.656 0.008
#> SRR1076195 4 0.3054 0.78154 0.004 0.000 0.012 0.852 0.104 0.028
#> SRR1069895 3 0.3194 0.73167 0.000 0.172 0.808 0.004 0.012 0.004
#> SRR1099144 1 0.1870 0.87545 0.928 0.000 0.012 0.004 0.044 0.012
#> SRR1385150 3 0.0748 0.89756 0.000 0.016 0.976 0.004 0.004 0.000
#> SRR1420191 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1332625 4 0.2958 0.78431 0.004 0.000 0.012 0.860 0.096 0.028
#> SRR1102583 4 0.3868 -0.02543 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.1511 0.87652 0.940 0.000 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR1340574 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 6 0.1398 0.91821 0.000 0.052 0.000 0.000 0.008 0.940
#> SRR1096267 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 5 0.4904 0.49686 0.000 0.000 0.148 0.000 0.656 0.196
#> SRR1408553 4 0.2504 0.78557 0.004 0.000 0.000 0.880 0.088 0.028
#> SRR1069231 1 0.3851 0.22895 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0951 0.93626 0.000 0.968 0.004 0.000 0.020 0.008
#> SRR1362103 1 0.1074 0.87953 0.960 0.000 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1321942 1 0.0291 0.88451 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1094380 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099330 2 0.1514 0.91088 0.000 0.944 0.036 0.004 0.012 0.004
#> SRR1077874 5 0.4184 0.52102 0.000 0.484 0.000 0.000 0.504 0.012
#> SRR808299 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098050 5 0.4778 0.79866 0.000 0.284 0.036 0.000 0.652 0.028
#> SRR1481238 6 0.1616 0.88174 0.000 0.000 0.020 0.000 0.048 0.932
#> SRR1443568 6 0.1477 0.89071 0.000 0.004 0.048 0.000 0.008 0.940
#> SRR1380249 4 0.3491 0.77955 0.004 0.000 0.012 0.820 0.124 0.040
#> SRR1080143 4 0.3727 0.30603 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.3006 0.78208 0.004 0.000 0.012 0.856 0.100 0.028
#> SRR1357042 1 0.4183 0.13473 0.508 0.000 0.000 0.480 0.012 0.000
#> SRR1416025 6 0.1141 0.92048 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1431015 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1078709 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR813283 1 0.0146 0.88446 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347707 4 0.4338 0.71522 0.004 0.000 0.008 0.692 0.264 0.032
#> SRR807679 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1333811 6 0.4325 0.08212 0.000 0.000 0.456 0.000 0.020 0.524
#> SRR1078660 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1331730 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333913 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1432542 1 0.1511 0.87652 0.940 0.000 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR1418041 1 0.2703 0.79939 0.824 0.000 0.000 0.172 0.004 0.000
#> SRR1085211 1 0.2653 0.82823 0.844 0.000 0.000 0.000 0.144 0.012
#> SRR1339812 2 0.0000 0.96255 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.2872 0.82449 0.832 0.000 0.000 0.004 0.152 0.012
#> SRR1350958 2 0.0363 0.95670 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1396822 3 0.3051 0.75615 0.000 0.156 0.824 0.004 0.012 0.004
#> SRR1441934 6 0.1141 0.92048 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1472552 3 0.0935 0.89605 0.000 0.032 0.964 0.004 0.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.1296 0.88819 0.000 0.044 0.948 0.004 0.004 0.000
#> SRR1102973 1 0.2146 0.83735 0.880 0.000 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1071131 6 0.1485 0.91228 0.000 0.028 0.024 0.000 0.004 0.944
#> SRR1074502 1 0.2219 0.82854 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.1655 0.87634 0.936 0.000 0.004 0.004 0.044 0.012
#> SRR1409171 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR809113 2 0.0777 0.94154 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1430045 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1441245 2 0.0405 0.95753 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1384091 4 0.2086 0.79035 0.004 0.000 0.012 0.912 0.064 0.008
#> SRR1431887 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096525 4 0.2554 0.78458 0.004 0.000 0.000 0.876 0.092 0.028
#> SRR1488491 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1356351 5 0.4419 0.78961 0.000 0.304 0.040 0.000 0.652 0.004
#> SRR1369514 4 0.0665 0.78721 0.004 0.000 0.000 0.980 0.008 0.008
#> SRR1453299 3 0.0777 0.89817 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.4706 0.79866 0.000 0.284 0.036 0.000 0.656 0.024
#> SRR1091767 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1354467 3 0.0777 0.89817 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069074 2 0.0260 0.95872 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452399 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1437430 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1419736 5 0.4834 0.80025 0.000 0.276 0.052 0.000 0.652 0.020
#> SRR1313343 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1077619 1 0.5419 0.09279 0.496 0.000 0.012 0.428 0.052 0.012
#> SRR1083530 1 0.1633 0.88008 0.932 0.000 0.000 0.044 0.024 0.000
#> SRR1333633 3 0.1232 0.89771 0.000 0.016 0.956 0.004 0.024 0.000
#> SRR1354999 6 0.1555 0.89825 0.000 0.012 0.040 0.000 0.008 0.940
#> SRR1443592 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077356 1 0.2378 0.81387 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.4113 0.45953 0.000 0.016 0.308 0.000 0.668 0.008
#> SRR1413182 4 0.2958 0.78158 0.004 0.000 0.012 0.860 0.096 0.028
#> SRR1464559 1 0.4401 0.71381 0.744 0.000 0.012 0.180 0.052 0.012
#> SRR1413075 5 0.3852 0.27180 0.000 0.004 0.000 0.000 0.612 0.384
#> SRR1487928 4 0.2958 0.78158 0.004 0.000 0.012 0.860 0.096 0.028
#> SRR1388997 6 0.1075 0.92209 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1092865 6 0.1398 0.91821 0.000 0.052 0.000 0.000 0.008 0.940
#> SRR1102729 1 0.2389 0.82782 0.864 0.000 0.000 0.008 0.128 0.000
#> SRR1456423 1 0.0520 0.88492 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1321591 2 0.0405 0.95747 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1376874 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1339903 1 0.3868 0.00967 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1418771 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095358 5 0.4825 0.53600 0.000 0.460 0.028 0.004 0.500 0.008
#> SRR1480941 3 0.0922 0.89751 0.000 0.024 0.968 0.004 0.004 0.000
#> SRR1479175 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313891 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1491354 1 0.2838 0.78194 0.808 0.000 0.000 0.188 0.004 0.000
#> SRR1433884 6 0.1007 0.92333 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1471074 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353052 6 0.1141 0.92048 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1355554 6 0.1477 0.89071 0.000 0.004 0.048 0.000 0.008 0.940
#> SRR1487173 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0717 0.88429 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1322918 6 0.1075 0.92209 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1318331 6 0.1204 0.91787 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1321333 3 0.0922 0.89818 0.000 0.024 0.968 0.000 0.004 0.004
#> SRR1474231 1 0.1151 0.87851 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1350545 4 0.3175 0.64224 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.1511 0.87652 0.940 0.000 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR814447 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1455989 3 0.3398 0.66401 0.000 0.216 0.768 0.004 0.012 0.000
#> SRR1453680 3 0.1092 0.88557 0.000 0.000 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1470356 2 0.0405 0.95705 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1342977 2 0.0146 0.96210 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444222 6 0.3390 0.58544 0.000 0.296 0.000 0.000 0.000 0.704
#> SRR1097197 4 0.1910 0.76577 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.1682 0.87116 0.000 0.000 0.928 0.000 0.020 0.052
#> SRR821282 3 0.1003 0.89783 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR1074602 2 0.1514 0.91088 0.000 0.944 0.036 0.004 0.012 0.004
#> SRR814633 2 0.0146 0.96233 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1072480 3 0.1946 0.87738 0.000 0.012 0.912 0.000 0.072 0.004
#> SRR1319100 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 6 0.1398 0.88633 0.000 0.000 0.052 0.000 0.008 0.940
#> SRR1457459 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.3753 0.74826 0.004 0.000 0.000 0.748 0.220 0.028
#> SRR1444598 5 0.4783 0.51544 0.000 0.000 0.128 0.000 0.668 0.204
#> SRR1091743 2 0.1198 0.92995 0.000 0.960 0.020 0.004 0.012 0.004
#> SRR819637 1 0.0717 0.88295 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1083848 1 0.0000 0.88455 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.2982 0.74747 0.000 0.164 0.820 0.004 0.012 0.000
#> SRR1459785 3 0.2772 0.75548 0.000 0.000 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1083700 1 0.2003 0.83826 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1375531 1 0.4628 0.61814 0.668 0.000 0.012 0.268 0.052 0.000
#> SRR1323470 6 0.3118 0.82628 0.000 0.000 0.092 0.000 0.072 0.836
#> SRR814657 4 0.1327 0.77747 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4920 0.508 0.508
#> 3 3 0.732 0.881 0.901 0.2998 0.842 0.690
#> 4 4 0.692 0.738 0.846 0.1401 0.895 0.708
#> 5 5 0.670 0.541 0.768 0.0579 0.951 0.819
#> 6 6 0.690 0.632 0.758 0.0517 0.910 0.638
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.7219 0.751 0.800 0.200
#> SRR1326059 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.4815 0.884 0.896 0.104
#> SRR1431735 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.5059 0.874 0.888 0.112
#> SRR1309314 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR807679 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.3816 0.7392 0.000 0.852 0.148
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.1860 0.8840 0.000 0.948 0.052
#> SRR1402132 1 0.5791 0.7521 0.792 0.148 0.060
#> SRR1326059 1 0.0747 0.9633 0.984 0.000 0.016
#> SRR1409062 3 0.4931 0.9047 0.000 0.232 0.768
#> SRR809406 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.5968 0.5938 0.000 0.364 0.636
#> SRR819559 1 0.0892 0.9632 0.980 0.000 0.020
#> SRR1387899 3 0.3686 0.8935 0.000 0.140 0.860
#> SRR1442292 2 0.0237 0.9018 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 3 0.5178 0.8847 0.000 0.256 0.744
#> SRR1102320 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1469926 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR1070036 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1098426 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1090310 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1429748 1 0.3192 0.9429 0.888 0.000 0.112
#> SRR1363654 1 0.0747 0.9635 0.984 0.000 0.016
#> SRR1326317 3 0.4974 0.9026 0.000 0.236 0.764
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.4974 0.8754 0.000 0.236 0.764
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.4974 0.9032 0.000 0.236 0.764
#> SRR1402944 2 0.4121 0.7311 0.000 0.832 0.168
#> SRR1092818 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1093552 1 0.2066 0.9576 0.940 0.000 0.060
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.5178 0.5293 0.000 0.744 0.256
#> SRR1349608 2 0.2537 0.8759 0.000 0.920 0.080
#> SRR1466951 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.4121 0.9142 0.000 0.168 0.832
#> SRR1068687 3 0.5810 0.6679 0.000 0.336 0.664
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.1753 0.8861 0.000 0.952 0.048
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.2959 0.9448 0.900 0.000 0.100
#> SRR1329994 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.2625 0.8338 0.000 0.916 0.084
#> SRR1077992 2 0.1753 0.8912 0.000 0.952 0.048
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.4750 0.9115 0.000 0.216 0.784
#> SRR1097857 1 0.1289 0.9623 0.968 0.000 0.032
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.4121 0.9143 0.000 0.168 0.832
#> SRR1338687 3 0.6008 0.7134 0.000 0.372 0.628
#> SRR1071207 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1486821 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1418540 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408788 2 0.4654 0.6477 0.000 0.792 0.208
#> SRR1359487 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1080648 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414708 1 0.1031 0.9630 0.976 0.000 0.024
#> SRR1469080 2 0.1163 0.8895 0.000 0.972 0.028
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1321829 3 0.4887 0.9078 0.000 0.228 0.772
#> SRR1475993 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1445387 1 0.0592 0.9632 0.988 0.000 0.012
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.1163 0.9621 0.972 0.000 0.028
#> SRR1374165 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.3116 0.9435 0.892 0.000 0.108
#> SRR1401146 3 0.4842 0.9087 0.000 0.224 0.776
#> SRR1366124 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086490 3 0.4399 0.9161 0.000 0.188 0.812
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359738 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.2165 0.8795 0.000 0.936 0.064
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.4452 0.6605 0.000 0.808 0.192
#> SRR814515 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.6299 -0.3295 0.000 0.524 0.476
#> SRR1344034 3 0.3551 0.8925 0.000 0.132 0.868
#> SRR1080391 1 0.3192 0.9415 0.888 0.000 0.112
#> SRR1347870 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR814028 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR814219 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1163 0.9628 0.972 0.000 0.028
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.2165 0.8796 0.000 0.936 0.064
#> SRR1070060 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3192 0.9437 0.888 0.000 0.112
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.3192 0.9433 0.888 0.000 0.112
#> SRR1076705 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1079380 3 0.4974 0.8967 0.000 0.236 0.764
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 3 0.4842 0.9087 0.000 0.224 0.776
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.2165 0.8552 0.000 0.936 0.064
#> SRR1390223 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1436840 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.5070 0.8359 0.772 0.004 0.224
#> SRR1431735 1 0.0747 0.9629 0.984 0.000 0.016
#> SRR1417387 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1445984 1 0.0747 0.9635 0.984 0.000 0.016
#> SRR1370447 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1446308 3 0.4702 0.9131 0.000 0.212 0.788
#> SRR1437346 3 0.4399 0.9161 0.000 0.188 0.812
#> SRR1103143 2 0.0237 0.9018 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086466 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1319584 2 0.0892 0.8994 0.000 0.980 0.020
#> SRR1486584 1 0.1163 0.9621 0.972 0.000 0.028
#> SRR813536 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.1031 0.9630 0.976 0.000 0.024
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.1031 0.8965 0.000 0.976 0.024
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1076681 2 0.5835 0.3230 0.000 0.660 0.340
#> SRR1335314 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1400799 3 0.3619 0.8926 0.000 0.136 0.864
#> SRR1074578 1 0.3116 0.9435 0.892 0.000 0.108
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0424 0.9621 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069328 1 0.3412 0.9389 0.876 0.000 0.124
#> SRR1445023 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1077599 3 0.4796 0.9110 0.000 0.220 0.780
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074839 2 0.6244 0.0659 0.000 0.560 0.440
#> SRR1458727 2 0.6252 0.0925 0.000 0.556 0.444
#> SRR1436949 2 0.0237 0.9022 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070429 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1458158 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1432408 1 0.3038 0.9459 0.896 0.000 0.104
#> SRR1310334 1 0.0892 0.9631 0.980 0.000 0.020
#> SRR1418201 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR1385434 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1415591 3 0.3879 0.8950 0.000 0.152 0.848
#> SRR1402009 1 0.0747 0.9629 0.984 0.000 0.016
#> SRR1316055 1 0.2959 0.9467 0.900 0.000 0.100
#> SRR1308734 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1498973 2 0.1753 0.8883 0.000 0.952 0.048
#> SRR1397115 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1392141 1 0.0424 0.9627 0.992 0.000 0.008
#> SRR814341 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 3 0.4931 0.9047 0.000 0.232 0.768
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR809919 1 0.0592 0.9615 0.988 0.000 0.012
#> SRR1370818 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1323651 3 0.3551 0.8925 0.000 0.132 0.868
#> SRR1357297 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR818170 2 0.6280 -0.2587 0.000 0.540 0.460
#> SRR1091230 3 0.4887 0.9078 0.000 0.228 0.772
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.3551 0.8915 0.000 0.132 0.868
#> SRR1317731 2 0.3816 0.7754 0.000 0.852 0.148
#> SRR1490785 1 0.0592 0.9632 0.988 0.000 0.012
#> SRR1432032 1 0.1031 0.9630 0.976 0.000 0.024
#> SRR1447808 1 0.0237 0.9631 0.996 0.000 0.004
#> SRR809534 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 3 0.4842 0.9081 0.000 0.224 0.776
#> SRR812128 2 0.1964 0.8824 0.000 0.944 0.056
#> SRR1101513 1 0.0747 0.9619 0.984 0.000 0.016
#> SRR1415708 2 0.5397 0.5003 0.000 0.720 0.280
#> SRR1316033 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1390371 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.4178 0.9156 0.000 0.172 0.828
#> SRR1076801 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3412 0.9389 0.876 0.000 0.124
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0237 0.9016 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417023 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1309333 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1333676 1 0.3192 0.9429 0.888 0.000 0.112
#> SRR1352996 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1093172 1 0.3412 0.9389 0.876 0.000 0.124
#> SRR1413137 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1469973 3 0.5785 0.6805 0.000 0.332 0.668
#> SRR1420026 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR817306 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1416266 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1071011 2 0.4062 0.7248 0.000 0.836 0.164
#> SRR1090290 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1435394 3 0.4654 0.9140 0.000 0.208 0.792
#> SRR1383192 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1419962 3 0.4178 0.9156 0.000 0.172 0.828
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.3752 0.8910 0.000 0.144 0.856
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.1289 0.8924 0.000 0.968 0.032
#> SRR1312147 1 0.0892 0.9635 0.980 0.000 0.020
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1474930 3 0.6008 0.5870 0.000 0.372 0.628
#> SRR1470988 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR811915 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 3 0.4842 0.9079 0.000 0.224 0.776
#> SRR1313770 3 0.6309 0.1703 0.000 0.496 0.504
#> SRR1315780 2 0.2796 0.8263 0.000 0.908 0.092
#> SRR1073631 1 0.0237 0.9631 0.996 0.000 0.004
#> SRR819124 1 0.3116 0.9435 0.892 0.000 0.108
#> SRR1310997 2 0.6008 0.3248 0.000 0.628 0.372
#> SRR1464494 2 0.4235 0.7827 0.000 0.824 0.176
#> SRR1357083 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1475842 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1378085 1 0.3116 0.9442 0.892 0.000 0.108
#> SRR1378220 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1467704 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1348885 2 0.4121 0.7913 0.000 0.832 0.168
#> SRR1325826 1 0.0892 0.9630 0.980 0.000 0.020
#> SRR1466812 1 0.3192 0.9425 0.888 0.000 0.112
#> SRR1345692 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1401040 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1097954 1 0.0424 0.9621 0.992 0.000 0.008
#> SRR1374396 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1454073 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1355747 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1429368 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1398138 3 0.6215 0.4452 0.000 0.428 0.572
#> SRR1379260 1 0.1860 0.9591 0.948 0.000 0.052
#> SRR1361436 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR817142 3 0.4750 0.9115 0.000 0.216 0.784
#> SRR1315291 1 0.6398 0.8205 0.748 0.060 0.192
#> SRR1309314 3 0.6154 0.4635 0.000 0.408 0.592
#> SRR1420085 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1361308 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1472126 1 0.3116 0.9435 0.892 0.000 0.108
#> SRR1380482 3 0.5016 0.8992 0.000 0.240 0.760
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.4346 0.6897 0.000 0.816 0.184
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0747 0.9622 0.984 0.000 0.016
#> SRR1399353 1 0.0747 0.9617 0.984 0.000 0.016
#> SRR1096760 3 0.4452 0.9163 0.000 0.192 0.808
#> SRR1440290 3 0.3816 0.8954 0.000 0.148 0.852
#> SRR1330813 3 0.4931 0.9047 0.000 0.232 0.768
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1394321 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1081160 2 0.5926 0.2347 0.000 0.644 0.356
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0424 0.9000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0747 0.9629 0.984 0.000 0.016
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR1312169 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1096687 1 0.1411 0.9616 0.964 0.000 0.036
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1447893 3 0.4399 0.9161 0.000 0.188 0.812
#> SRR1466025 2 0.4555 0.6483 0.000 0.800 0.200
#> SRR1477429 1 0.1411 0.9616 0.964 0.000 0.036
#> SRR1445701 3 0.3752 0.8923 0.000 0.144 0.856
#> SRR820689 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.6308 -0.3825 0.000 0.508 0.492
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0237 0.9633 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489328 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.1643 0.9601 0.956 0.000 0.044
#> SRR1447784 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355769 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 3 0.4887 0.9066 0.000 0.228 0.772
#> SRR1474485 1 0.0592 0.9630 0.988 0.000 0.012
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0592 0.9633 0.988 0.000 0.012
#> SRR1319262 3 0.4346 0.9182 0.000 0.184 0.816
#> SRR1095188 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR1105417 1 0.3340 0.9406 0.880 0.000 0.120
#> SRR1325578 3 0.6309 0.3791 0.000 0.500 0.500
#> SRR1358161 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1358665 2 0.0892 0.8930 0.000 0.980 0.020
#> SRR1333971 2 0.0592 0.8976 0.000 0.988 0.012
#> SRR1452010 1 0.3192 0.9429 0.888 0.000 0.112
#> SRR1418183 3 0.5859 0.6350 0.000 0.344 0.656
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0592 0.9615 0.988 0.000 0.012
#> SRR1473461 1 0.0747 0.9629 0.984 0.000 0.016
#> SRR1090837 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1447828 3 0.4178 0.9156 0.000 0.172 0.828
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4504 0.9168 0.000 0.196 0.804
#> SRR1350280 1 0.3192 0.9425 0.888 0.000 0.112
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0592 0.8981 0.000 0.988 0.012
#> SRR1441443 2 0.4346 0.7646 0.000 0.816 0.184
#> SRR1370682 3 0.4062 0.9126 0.000 0.164 0.836
#> SRR1475448 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1407291 1 0.3340 0.9398 0.880 0.000 0.120
#> SRR1405266 1 0.0592 0.9632 0.988 0.000 0.012
#> SRR1363766 1 0.1529 0.9605 0.960 0.000 0.040
#> SRR1082592 2 0.6180 0.1168 0.000 0.584 0.416
#> SRR1325794 3 0.4974 0.9024 0.000 0.236 0.764
#> SRR1095961 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1086702 2 0.5431 0.4578 0.000 0.716 0.284
#> SRR1320806 3 0.4062 0.8905 0.000 0.164 0.836
#> SRR1457527 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1098831 2 0.0237 0.9018 0.000 0.996 0.004
#> SRR1474374 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR1488858 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1454695 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1090241 3 0.6307 0.4014 0.000 0.488 0.512
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.1289 0.9623 0.968 0.000 0.032
#> SRR1379581 3 0.4235 0.9166 0.000 0.176 0.824
#> SRR1309182 1 0.1163 0.9621 0.972 0.000 0.028
#> SRR1437668 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1084742 2 0.2165 0.8796 0.000 0.936 0.064
#> SRR1433538 1 0.3192 0.9425 0.888 0.000 0.112
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.2066 0.8824 0.000 0.940 0.060
#> SRR1097100 2 0.5621 0.3923 0.000 0.692 0.308
#> SRR818622 3 0.4887 0.9077 0.000 0.228 0.772
#> SRR1072388 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 3 0.4974 0.9024 0.000 0.236 0.764
#> SRR1076195 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1069895 3 0.4399 0.9161 0.000 0.188 0.812
#> SRR1099144 1 0.1289 0.9622 0.968 0.000 0.032
#> SRR1385150 3 0.4399 0.9161 0.000 0.188 0.812
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1102583 1 0.3116 0.9430 0.892 0.000 0.108
#> SRR1456971 1 0.0747 0.9629 0.984 0.000 0.016
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.6305 -0.1470 0.000 0.516 0.484
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.3551 0.8925 0.000 0.132 0.868
#> SRR1408553 1 0.3412 0.9389 0.876 0.000 0.124
#> SRR1069231 1 0.1163 0.9621 0.972 0.000 0.028
#> SRR1325642 2 0.1860 0.8840 0.000 0.948 0.052
#> SRR1362103 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321942 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 3 0.4974 0.9024 0.000 0.236 0.764
#> SRR1077874 2 0.3412 0.7841 0.000 0.876 0.124
#> SRR808299 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.5397 0.8604 0.000 0.280 0.720
#> SRR1481238 3 0.5178 0.8045 0.000 0.256 0.744
#> SRR1443568 3 0.5882 0.6289 0.000 0.348 0.652
#> SRR1380249 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1080143 1 0.3116 0.9435 0.892 0.000 0.108
#> SRR1383148 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1357042 1 0.3412 0.9395 0.876 0.000 0.124
#> SRR1416025 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1431015 2 0.2878 0.8656 0.000 0.904 0.096
#> SRR1078709 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR813283 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.2400 0.8764 0.004 0.932 0.064
#> SRR807679 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1333811 3 0.5926 0.6054 0.000 0.356 0.644
#> SRR1078660 2 0.2959 0.8612 0.000 0.900 0.100
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1432542 1 0.0747 0.9634 0.984 0.000 0.016
#> SRR1418041 1 0.1031 0.9629 0.976 0.000 0.024
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0892 0.9631 0.980 0.000 0.020
#> SRR1350958 2 0.5254 0.5210 0.000 0.736 0.264
#> SRR1396822 3 0.4702 0.9131 0.000 0.212 0.788
#> SRR1441934 2 0.3941 0.8081 0.000 0.844 0.156
#> SRR1472552 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1488881 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.4062 0.7958 0.000 0.836 0.164
#> SRR1074502 1 0.2625 0.9489 0.916 0.000 0.084
#> SRR1325271 1 0.2796 0.9483 0.908 0.000 0.092
#> SRR1409171 2 0.2878 0.8189 0.000 0.904 0.096
#> SRR809113 3 0.4931 0.9045 0.000 0.232 0.768
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1031 0.8908 0.000 0.976 0.024
#> SRR1384091 1 0.3412 0.9389 0.876 0.000 0.124
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1488491 2 0.0237 0.9018 0.000 0.996 0.004
#> SRR1356351 3 0.5138 0.8887 0.000 0.252 0.748
#> SRR1369514 1 0.3412 0.9389 0.876 0.000 0.124
#> SRR1453299 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.5016 0.8998 0.000 0.240 0.760
#> SRR1091767 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1354467 3 0.4346 0.9173 0.000 0.184 0.816
#> SRR1069074 3 0.6307 0.4140 0.000 0.488 0.512
#> SRR1452399 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1437430 2 0.4121 0.7309 0.000 0.832 0.168
#> SRR1419736 2 0.0237 0.9016 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313343 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1077619 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1083530 1 0.1753 0.9601 0.952 0.000 0.048
#> SRR1333633 3 0.4654 0.9143 0.000 0.208 0.792
#> SRR1354999 3 0.4178 0.8887 0.000 0.172 0.828
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.5178 0.6167 0.000 0.744 0.256
#> SRR1413182 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1464559 1 0.3267 0.9425 0.884 0.000 0.116
#> SRR1413075 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1487928 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1388997 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1092865 2 0.4931 0.7042 0.000 0.768 0.232
#> SRR1102729 1 0.0892 0.9631 0.980 0.000 0.020
#> SRR1456423 1 0.0424 0.9632 0.992 0.000 0.008
#> SRR1321591 2 0.3412 0.7838 0.000 0.876 0.124
#> SRR1376874 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1339903 1 0.0892 0.9637 0.980 0.000 0.020
#> SRR1346710 1 0.0424 0.9633 0.992 0.000 0.008
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.4887 0.9069 0.000 0.228 0.772
#> SRR1480941 3 0.4346 0.9182 0.000 0.184 0.816
#> SRR1479175 2 0.1031 0.8892 0.000 0.976 0.024
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0892 0.9633 0.980 0.000 0.020
#> SRR1433884 2 0.6267 0.0390 0.000 0.548 0.452
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1355554 3 0.3941 0.8915 0.000 0.156 0.844
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0424 0.9632 0.992 0.000 0.008
#> SRR1322918 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1318331 2 0.2066 0.8801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1321333 3 0.4291 0.9172 0.000 0.180 0.820
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.1163 0.9621 0.972 0.000 0.028
#> SRR1091328 1 0.0424 0.9623 0.992 0.000 0.008
#> SRR814447 3 0.3752 0.9018 0.000 0.144 0.856
#> SRR1455989 3 0.4750 0.9115 0.000 0.216 0.784
#> SRR1453680 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR1470356 3 0.5138 0.8902 0.000 0.252 0.748
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.1964 0.8818 0.000 0.944 0.056
#> SRR1097197 1 0.1031 0.9630 0.976 0.000 0.024
#> SRR1366729 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR821282 3 0.4235 0.9166 0.000 0.176 0.824
#> SRR1074602 3 0.5016 0.8997 0.000 0.240 0.760
#> SRR814633 2 0.0000 0.9033 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4002 0.9074 0.000 0.160 0.840
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.3619 0.8919 0.000 0.136 0.864
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.3482 0.9384 0.872 0.000 0.128
#> SRR1444598 2 0.2711 0.8645 0.000 0.912 0.088
#> SRR1091743 3 0.5016 0.8997 0.000 0.240 0.760
#> SRR819637 1 0.0237 0.9625 0.996 0.000 0.004
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.4452 0.9163 0.000 0.192 0.808
#> SRR1459785 3 0.3482 0.8908 0.000 0.128 0.872
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9626 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.3192 0.9429 0.888 0.000 0.112
#> SRR1323470 3 0.5968 0.6370 0.000 0.364 0.636
#> SRR814657 1 0.1163 0.9621 0.972 0.000 0.028
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.3266 0.7228 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.2149 0.8696 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1402132 4 0.7288 0.5843 0.144 0.076 0.124 0.656
#> SRR1326059 1 0.4817 0.2344 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1409062 3 0.3444 0.8544 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR809406 1 0.3688 0.6374 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1465313 3 0.4431 0.5573 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR819559 1 0.4830 0.2600 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1387899 3 0.0707 0.8360 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0592 0.8357 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 3 0.3975 0.8139 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1102320 4 0.4961 0.3364 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1469926 3 0.0336 0.8271 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1070036 1 0.4134 0.5643 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1098426 1 0.0707 0.8344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1090310 3 0.2216 0.8701 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1429748 4 0.4989 0.2703 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1363654 1 0.4817 0.2593 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1326317 3 0.3726 0.8374 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1022 0.7423 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.3088 0.8559 0.000 0.128 0.864 0.008
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.3172 0.8642 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1402944 2 0.4222 0.5930 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1092818 1 0.0592 0.8357 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1093552 1 0.4996 -0.0810 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.3975 0.5918 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1349608 2 0.2814 0.8548 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1466951 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.2342 0.8682 0.000 0.080 0.912 0.008
#> SRR1068687 3 0.4277 0.6132 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.2281 0.8692 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.5000 -0.1113 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1329994 4 0.4746 0.4643 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1354203 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077850 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.1474 0.8733 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1077992 2 0.2011 0.8806 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1455214 1 0.0188 0.8385 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092014 3 0.3311 0.8602 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1097857 1 0.4898 0.2162 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.2271 0.8678 0.000 0.076 0.916 0.008
#> SRR1338687 3 0.4679 0.6636 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1071207 4 0.4916 0.3699 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1486821 3 0.2546 0.8695 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1418540 1 0.0707 0.8371 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1408788 2 0.4406 0.4974 0.000 0.700 0.300 0.000
#> SRR1359487 4 0.0707 0.7409 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1080648 1 0.0707 0.8350 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1414708 1 0.3266 0.7167 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1469080 2 0.1211 0.8842 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0188 0.9028 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1444808 4 0.4977 0.2751 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1321829 3 0.3801 0.8342 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1475993 3 0.2704 0.8717 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1445387 1 0.4222 0.5280 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1077575 2 0.0188 0.9031 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349300 1 0.4898 0.1385 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1374165 1 0.0921 0.8344 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 4 0.4961 0.3408 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1401146 3 0.3311 0.8594 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1366124 4 0.1792 0.7397 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1391811 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1389 0.8271 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1086490 3 0.2530 0.8668 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.0921 0.7394 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1384431 1 0.0921 0.8321 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1072055 1 0.0469 0.8365 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1359738 3 0.2345 0.8700 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1332141 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1085900 2 0.2589 0.8588 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.3528 0.6758 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.4933 0.5102 0.000 0.432 0.568 0.000
#> SRR1344034 3 0.0336 0.8322 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1080391 4 0.4877 0.2830 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR1347870 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR814028 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.4907 0.1436 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.2408 0.8650 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1070060 4 0.1118 0.7416 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 4 0.4972 0.2875 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.4933 0.3480 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1076705 1 0.0707 0.8344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1079380 3 0.3649 0.8352 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 3 0.3266 0.8601 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.1389 0.8766 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1390223 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1436840 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.1557 0.7384 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1431735 1 0.1474 0.8246 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1417387 1 0.0592 0.8357 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1445984 1 0.1557 0.8210 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1370447 4 0.0921 0.7394 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1446308 3 0.2589 0.8722 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1437346 3 0.2654 0.8678 0.000 0.108 0.888 0.004
#> SRR1103143 2 0.0336 0.9029 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1086466 1 0.0592 0.8357 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0469 0.7385 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1319584 2 0.1867 0.8707 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1486584 1 0.4898 0.1493 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR813536 4 0.0921 0.7394 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1317939 2 0.0188 0.9032 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1079730 1 0.0188 0.8378 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1341921 4 0.4830 0.4487 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.1474 0.8896 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1453259 2 0.0469 0.8987 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1340828 2 0.0817 0.8955 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1076681 2 0.4817 0.2089 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1335314 4 0.0469 0.7385 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1400799 3 0.1389 0.8368 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1074578 4 0.4866 0.4280 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1447371 1 0.0707 0.8289 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1069328 4 0.0817 0.7393 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1445023 4 0.3311 0.6385 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1077599 3 0.3569 0.8501 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0592 0.8357 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1074839 3 0.4977 0.1582 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR1458727 4 0.7788 -0.2095 0.000 0.376 0.244 0.380
#> SRR1436949 2 0.0336 0.9023 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1070429 3 0.2675 0.8721 0.000 0.100 0.892 0.008
#> SRR1458158 4 0.4776 0.4680 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1432408 4 0.2216 0.7331 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1310334 1 0.4843 0.2039 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1418201 3 0.0524 0.8279 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1385434 4 0.0336 0.7371 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1415591 3 0.2480 0.8289 0.000 0.088 0.904 0.008
#> SRR1402009 1 0.1211 0.8269 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1316055 1 0.3356 0.6923 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1308734 3 0.2412 0.8692 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR1498973 2 0.2530 0.8679 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1397115 4 0.1118 0.7416 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1392141 1 0.0817 0.8326 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR814341 2 0.0469 0.8987 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1313601 3 0.3266 0.8602 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.2412 0.8692 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR809919 1 0.4866 0.1432 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1370818 4 0.4967 0.2981 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1323651 3 0.0336 0.8322 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1357297 4 0.1940 0.7395 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR818170 3 0.4916 0.4970 0.000 0.424 0.576 0.000
#> SRR1091230 3 0.3726 0.8380 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1470556 2 0.0336 0.9023 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1022 0.8364 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1317731 2 0.4262 0.6637 0.000 0.756 0.236 0.008
#> SRR1490785 1 0.1118 0.8275 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1432032 1 0.4804 0.2827 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1447808 1 0.0336 0.8376 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR809534 2 0.0188 0.9024 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1397312 3 0.3172 0.8642 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR812128 2 0.2345 0.8653 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1101513 1 0.1940 0.7989 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1415708 2 0.4624 0.3832 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1316033 3 0.2546 0.8700 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1390371 2 0.0817 0.8927 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.2198 0.8667 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1076801 1 0.0707 0.8344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1080044 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.0817 0.7393 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1069871 1 0.4661 0.3334 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1095744 2 0.0817 0.8931 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1068929 2 0.0707 0.8941 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1490097 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0469 0.8365 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417023 4 0.2760 0.7192 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1309333 2 0.2469 0.8613 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1333676 4 0.4989 0.2703 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1352996 4 0.1211 0.7422 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1093172 4 0.0921 0.7418 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1413137 4 0.1118 0.7416 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1469973 3 0.3764 0.7167 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1420026 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR817306 4 0.4948 0.3346 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1416266 4 0.0707 0.7409 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1071011 2 0.2760 0.7904 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1090290 4 0.4866 0.4034 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1435394 3 0.2760 0.8681 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1383192 4 0.1118 0.7416 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1419962 3 0.2271 0.8678 0.000 0.076 0.916 0.008
#> SRR1094357 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.1545 0.8312 0.000 0.040 0.952 0.008
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0592 0.8965 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1397348 2 0.1792 0.8826 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1312147 1 0.2868 0.7529 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1473891 2 0.0188 0.9032 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1335470 4 0.4961 0.3197 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1474930 3 0.4477 0.5490 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1470988 4 0.0921 0.7394 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR811915 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 3 0.3356 0.8558 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1313770 3 0.4877 0.4605 0.000 0.328 0.664 0.008
#> SRR1315780 2 0.1940 0.8475 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1073631 1 0.0592 0.8350 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR819124 4 0.4985 0.2882 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1310997 2 0.4977 0.1810 0.000 0.540 0.460 0.000
#> SRR1464494 2 0.3975 0.7451 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1357083 3 0.2408 0.8715 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1475842 2 0.2469 0.8618 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1378085 1 0.4761 0.3072 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1378220 3 0.2216 0.8706 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1467704 1 0.0707 0.8344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1348885 2 0.7063 0.4096 0.000 0.508 0.132 0.360
#> SRR1325826 1 0.4817 0.2200 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1466812 4 0.4697 0.5116 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR1345692 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1401040 3 0.3196 0.8713 0.000 0.136 0.856 0.008
#> SRR1097954 1 0.1211 0.8257 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1374396 4 0.0469 0.7385 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1454073 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1355747 1 0.0592 0.8357 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1429368 3 0.2412 0.8692 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR1398138 3 0.4697 0.4533 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1379260 1 0.3311 0.7152 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1361436 3 0.2216 0.8701 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR817142 3 0.3123 0.8633 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1315291 4 0.2408 0.7276 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1309314 3 0.4228 0.6331 0.000 0.232 0.760 0.008
#> SRR1420085 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1361308 3 0.2611 0.8693 0.000 0.096 0.896 0.008
#> SRR1472126 4 0.4967 0.3309 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1380482 3 0.3074 0.8671 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.4164 0.5685 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.4008 0.6041 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1399353 1 0.1474 0.8234 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1096760 3 0.2530 0.8683 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1440290 3 0.1716 0.8373 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1330813 3 0.3610 0.8456 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1022 0.7423 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1394321 1 0.0817 0.8350 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1081160 2 0.4522 0.3962 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0188 0.9027 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.4776 0.3047 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0188 0.8278 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312169 4 0.1118 0.7416 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1096687 4 0.3311 0.6808 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1486139 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.1474 0.7420 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1447893 3 0.2469 0.8678 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1466025 2 0.3726 0.6462 0.000 0.788 0.212 0.000
#> SRR1477429 4 0.3172 0.6827 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1445701 3 0.2216 0.8224 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 3 0.4992 0.3942 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0469 0.8379 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1489328 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.4981 -0.0371 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1447784 1 0.1118 0.8306 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1355769 4 0.0921 0.7394 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480917 3 0.3024 0.8661 0.000 0.148 0.852 0.000
#> SRR1474485 1 0.1474 0.8239 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1089998 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.4776 0.2695 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1319262 3 0.2216 0.8714 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1095188 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359565 3 0.0672 0.8301 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1105417 4 0.1302 0.7421 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1325578 3 0.5004 0.5256 0.000 0.392 0.604 0.004
#> SRR1358161 3 0.2412 0.8692 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR1358665 2 0.0469 0.8994 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1333971 2 0.0188 0.9027 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452010 4 0.4933 0.3674 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1418183 3 0.4356 0.5795 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0707 0.8291 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1473461 1 0.4804 0.2810 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1090837 3 0.2647 0.8731 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1447828 3 0.2342 0.8687 0.000 0.080 0.912 0.008
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3123 0.8667 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1350280 4 0.4933 0.3757 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1088557 1 0.1557 0.8069 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1102656 2 0.0469 0.8995 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1441443 2 0.3975 0.7362 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1370682 3 0.2124 0.8657 0.000 0.068 0.924 0.008
#> SRR1475448 3 0.2216 0.8701 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1407291 4 0.2973 0.7151 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1405266 1 0.3837 0.6176 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1363766 4 0.4477 0.5672 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1082592 3 0.4985 0.1774 0.000 0.468 0.532 0.000
#> SRR1325794 3 0.3486 0.8521 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1095961 3 0.2149 0.8703 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR1086702 2 0.4134 0.5536 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1320806 3 0.2530 0.8179 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1457527 3 0.2546 0.8695 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1098831 2 0.0592 0.8974 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1474374 3 0.0336 0.8271 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1488858 4 0.1389 0.7407 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1454695 1 0.3907 0.6296 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1090241 3 0.4996 0.3270 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.4925 0.1505 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1379581 3 0.2412 0.8692 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR1309182 1 0.4907 0.1244 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1437668 1 0.0707 0.8344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1084742 2 0.2408 0.8640 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1433538 4 0.3873 0.6689 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.2589 0.8636 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1097100 2 0.4134 0.5512 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR818622 3 0.3569 0.8483 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1072388 1 0.0707 0.8344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 3 0.3444 0.8540 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1076195 4 0.4585 0.5246 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1069895 3 0.2760 0.8692 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1099144 1 0.4907 0.1781 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1385150 3 0.2469 0.8679 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3942 0.6422 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1102583 1 0.4790 0.2686 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1456971 1 0.1302 0.8271 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1340574 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 3 0.4967 0.1661 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0336 0.8328 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1408553 4 0.0707 0.7394 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1069231 1 0.4916 0.1205 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1325642 2 0.2345 0.8662 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1362103 1 0.0469 0.8365 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1321942 1 0.0336 0.8377 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1094380 1 0.0188 0.8381 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 3 0.3569 0.8477 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1077874 2 0.3074 0.7472 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.3873 0.8251 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1481238 3 0.3074 0.7790 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1443568 3 0.4331 0.5880 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1380249 4 0.4961 0.3105 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1080143 4 0.4967 0.3264 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1383148 4 0.1302 0.7426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1357042 4 0.4925 0.3720 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1416025 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1431015 2 0.2973 0.8458 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1078709 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.6994 0.3100 0.000 0.472 0.116 0.412
#> SRR807679 1 0.0469 0.8365 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1333811 3 0.4391 0.6176 0.000 0.252 0.740 0.008
#> SRR1078660 2 0.3172 0.8344 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0592 0.8357 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432542 1 0.1474 0.8225 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1418041 1 0.4866 0.1979 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1085211 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4250 0.5630 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1350958 2 0.4040 0.5712 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1396822 3 0.2921 0.8694 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR1441934 2 0.3123 0.8399 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1472552 3 0.2281 0.8697 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1488881 3 0.2737 0.8703 0.000 0.104 0.888 0.008
#> SRR1102973 1 0.0707 0.8353 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1071131 2 0.4008 0.7412 0.000 0.756 0.244 0.000
#> SRR1074502 1 0.4431 0.4616 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1325271 1 0.3219 0.7044 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1409171 2 0.1302 0.8779 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR809113 3 0.3400 0.8565 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1022 0.8875 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1384091 4 0.1474 0.7433 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0592 0.7400 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 3 0.3610 0.8449 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1369514 4 0.0921 0.7416 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1453299 3 0.2611 0.8693 0.000 0.096 0.896 0.008
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.3764 0.8345 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1091767 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1354467 3 0.2611 0.8693 0.000 0.096 0.896 0.008
#> SRR1069074 3 0.4994 0.3598 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1452399 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1437430 2 0.4391 0.6114 0.000 0.740 0.252 0.008
#> SRR1419736 2 0.1389 0.8773 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1313343 3 0.2412 0.8692 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR1077619 4 0.4967 0.2984 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1083530 1 0.3873 0.6399 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1333633 3 0.2647 0.8714 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1354999 3 0.2647 0.8115 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.3975 0.5768 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1378818 2 0.5112 0.3614 0.000 0.608 0.384 0.008
#> SRR1413182 4 0.0592 0.7396 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1464559 4 0.4972 0.2871 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1413075 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1487928 4 0.1211 0.7416 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1388997 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1092865 2 0.4072 0.7370 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1102729 1 0.1557 0.8205 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1456423 1 0.4697 0.3264 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1321591 2 0.3074 0.7489 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1376874 3 0.2480 0.8693 0.000 0.088 0.904 0.008
#> SRR1339903 4 0.3801 0.6631 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1346710 1 0.0707 0.8355 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.3444 0.8545 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1480941 3 0.2345 0.8714 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1479175 2 0.0817 0.8917 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1313891 2 0.0707 0.8941 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1491354 1 0.4843 0.2246 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1433884 3 0.4999 -0.0369 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1355554 3 0.2216 0.8250 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.3688 0.6352 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1322918 2 0.2469 0.8613 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1318331 2 0.2530 0.8598 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1321333 3 0.2480 0.8708 0.000 0.088 0.904 0.008
#> SRR1474231 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 4 0.3837 0.6587 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1091328 1 0.0707 0.8344 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR814447 3 0.1452 0.8496 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1455989 3 0.3123 0.8633 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1453680 3 0.0804 0.8284 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1470356 3 0.3801 0.8304 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.2469 0.8619 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1097197 4 0.3975 0.6456 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1366729 3 0.1042 0.8284 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR821282 3 0.2412 0.8692 0.000 0.084 0.908 0.008
#> SRR1074602 3 0.3726 0.8373 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9039 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.1970 0.8580 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.1792 0.8301 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.0336 0.7371 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1444598 2 0.3768 0.8071 0.000 0.808 0.184 0.008
#> SRR1091743 3 0.3837 0.8303 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR819637 1 0.0336 0.8377 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1083848 1 0.0000 0.8388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.3074 0.8662 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1459785 3 0.0336 0.8271 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1083700 1 0.0336 0.8357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375531 4 0.4992 0.2578 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1323470 3 0.4454 0.6272 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR814657 4 0.3444 0.6814 0.184 0.000 0.000 0.816
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.1851 0.71924 0.000 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.4114 0.51447 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1402132 4 0.6400 0.60328 0.156 0.016 0.032 0.648 0.148
#> SRR1326059 1 0.4531 0.12033 0.568 0.000 0.004 0.424 0.004
#> SRR1409062 3 0.3242 0.62420 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.3461 0.60051 0.772 0.000 0.000 0.224 0.004
#> SRR1465313 5 0.6129 0.16629 0.000 0.128 0.420 0.000 0.452
#> SRR819559 1 0.6031 0.14882 0.544 0.000 0.056 0.368 0.032
#> SRR1387899 3 0.3318 0.46322 0.000 0.012 0.808 0.000 0.180
#> SRR1442292 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0162 0.80676 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1395635 1 0.0740 0.80714 0.980 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR1343629 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 3 0.4030 0.47750 0.000 0.352 0.648 0.000 0.000
#> SRR1102320 4 0.4751 0.31487 0.420 0.000 0.008 0.564 0.008
#> SRR1469926 5 0.4287 0.04391 0.000 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1070036 1 0.5694 0.46135 0.652 0.000 0.056 0.252 0.040
#> SRR1098426 1 0.2584 0.78467 0.900 0.000 0.052 0.008 0.040
#> SRR1090310 3 0.4558 0.51049 0.000 0.088 0.744 0.000 0.168
#> SRR1429748 4 0.6069 0.18004 0.452 0.000 0.056 0.464 0.028
#> SRR1363654 1 0.5978 0.13517 0.540 0.000 0.056 0.376 0.028
#> SRR1326317 3 0.3521 0.60918 0.000 0.232 0.764 0.000 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1772 0.72869 0.008 0.000 0.032 0.940 0.020
#> SRR1329947 1 0.0740 0.80887 0.980 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR1469769 5 0.6217 -0.07845 0.000 0.140 0.416 0.000 0.444
#> SRR1490761 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.3236 0.64218 0.000 0.152 0.828 0.000 0.020
#> SRR1402944 2 0.6265 0.34409 0.000 0.540 0.220 0.000 0.240
#> SRR1092818 1 0.0579 0.80644 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1093552 1 0.6249 -0.03748 0.484 0.000 0.056 0.420 0.040
#> SRR1464880 2 0.0451 0.78082 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1078368 2 0.2280 0.68960 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.4446 0.37154 0.000 0.520 0.004 0.000 0.476
#> SRR1466951 2 0.4305 0.36393 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1331879 2 0.1041 0.77652 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1320034 5 0.5734 -0.08379 0.000 0.084 0.444 0.000 0.472
#> SRR1068687 5 0.5966 0.14526 0.000 0.108 0.432 0.000 0.460
#> SRR1437491 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.3949 0.54589 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1374005 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.4562 -0.05555 0.500 0.000 0.008 0.492 0.000
#> SRR1329994 4 0.4910 0.46492 0.340 0.000 0.012 0.628 0.020
#> SRR1354203 1 0.1661 0.78643 0.940 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR1077850 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0880 0.76795 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.2439 0.72626 0.000 0.876 0.004 0.000 0.120
#> SRR1455214 1 0.0898 0.80744 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1092014 3 0.2930 0.64233 0.000 0.164 0.832 0.000 0.004
#> SRR1097857 1 0.6580 0.00874 0.488 0.000 0.076 0.388 0.048
#> SRR1473318 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 5 0.5557 -0.10455 0.000 0.068 0.464 0.000 0.468
#> SRR1338687 3 0.4262 0.35019 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.6199 0.33450 0.384 0.000 0.056 0.520 0.040
#> SRR1486821 3 0.5818 0.11888 0.000 0.092 0.460 0.000 0.448
#> SRR1418540 1 0.1948 0.79869 0.932 0.000 0.036 0.008 0.024
#> SRR1408788 2 0.3837 0.43153 0.000 0.692 0.308 0.000 0.000
#> SRR1359487 4 0.0833 0.72608 0.004 0.000 0.016 0.976 0.004
#> SRR1080648 1 0.1978 0.79204 0.928 0.000 0.044 0.004 0.024
#> SRR1414708 1 0.4705 0.67585 0.772 0.000 0.056 0.132 0.040
#> SRR1469080 2 0.2248 0.72906 0.000 0.900 0.088 0.000 0.012
#> SRR1365722 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.1041 0.77499 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1444808 4 0.6261 0.17563 0.440 0.000 0.056 0.464 0.040
#> SRR1321829 3 0.3857 0.52993 0.000 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.2583 0.64186 0.000 0.132 0.864 0.000 0.004
#> SRR1445387 1 0.4288 0.51299 0.720 0.000 0.008 0.256 0.016
#> SRR1077575 2 0.3779 0.64423 0.000 0.752 0.012 0.000 0.236
#> SRR1349300 1 0.4287 0.02369 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1374165 1 0.1612 0.80480 0.948 0.000 0.012 0.024 0.016
#> SRR1453769 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 4 0.4331 0.36727 0.400 0.000 0.004 0.596 0.000
#> SRR1401146 3 0.3109 0.63157 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.3606 0.71880 0.052 0.000 0.056 0.852 0.040
#> SRR1391811 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.3575 0.76514 0.848 0.000 0.076 0.020 0.056
#> SRR1086490 3 0.4548 0.52239 0.000 0.096 0.748 0.000 0.156
#> SRR1088511 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.0324 0.72134 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1384431 1 0.0960 0.80665 0.972 0.000 0.008 0.016 0.004
#> SRR1072055 1 0.1588 0.80299 0.948 0.000 0.016 0.008 0.028
#> SRR1359738 3 0.4521 0.51487 0.000 0.088 0.748 0.000 0.164
#> SRR1332141 1 0.1661 0.78643 0.940 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR1085900 2 0.4449 0.36151 0.000 0.512 0.004 0.000 0.484
#> SRR1442173 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.1732 0.72782 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0404 0.77998 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.4990 0.45292 0.000 0.324 0.628 0.000 0.048
#> SRR1344034 3 0.4436 0.24346 0.000 0.008 0.596 0.000 0.396
#> SRR1080391 4 0.4114 0.28232 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1347870 2 0.4302 0.37043 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR814028 2 0.4302 0.37043 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR814219 2 0.0451 0.78118 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1070620 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.6058 0.09609 0.532 0.000 0.056 0.380 0.032
#> SRR1460211 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.4276 0.50653 0.000 0.616 0.004 0.000 0.380
#> SRR1070060 4 0.0290 0.72200 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1487969 2 0.1043 0.77286 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1417851 4 0.6201 0.21968 0.428 0.000 0.052 0.480 0.040
#> SRR1443350 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.6034 0.31126 0.392 0.000 0.048 0.524 0.036
#> SRR1076705 1 0.2116 0.79609 0.924 0.000 0.040 0.008 0.028
#> SRR1079380 3 0.5067 0.53858 0.000 0.172 0.700 0.000 0.128
#> SRR1102923 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 3 0.3366 0.62428 0.000 0.212 0.784 0.000 0.004
#> SRR1366605 2 0.0404 0.78044 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396035 2 0.0963 0.76625 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.4210 0.47257 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1436840 2 0.4219 0.45455 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1445573 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.4993 0.66598 0.044 0.000 0.076 0.756 0.124
#> SRR1431735 1 0.3775 0.75812 0.832 0.000 0.092 0.016 0.060
#> SRR1417387 1 0.0854 0.80662 0.976 0.000 0.004 0.008 0.012
#> SRR1445984 1 0.3310 0.77044 0.868 0.000 0.056 0.036 0.040
#> SRR1370447 4 0.0324 0.72134 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1446308 3 0.2338 0.63717 0.000 0.112 0.884 0.000 0.004
#> SRR1437346 3 0.4683 0.50394 0.000 0.092 0.732 0.000 0.176
#> SRR1103143 2 0.0451 0.78135 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1086466 1 0.1498 0.80355 0.952 0.000 0.024 0.008 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2387 0.71798 0.004 0.000 0.048 0.908 0.040
#> SRR1319584 2 0.2171 0.73905 0.000 0.912 0.064 0.000 0.024
#> SRR1486584 1 0.5196 0.06676 0.536 0.000 0.028 0.428 0.008
#> SRR813536 4 0.0613 0.72169 0.004 0.000 0.008 0.984 0.004
#> SRR1317939 2 0.2605 0.70957 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1079730 1 0.0794 0.80072 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1341921 4 0.4837 0.49560 0.344 0.000 0.016 0.628 0.012
#> SRR1399178 2 0.0290 0.78095 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.3966 0.54375 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1453259 2 0.0404 0.77998 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.3690 0.66784 0.000 0.780 0.020 0.000 0.200
#> SRR1079543 2 0.0162 0.78199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR816427 2 0.4300 0.37927 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1076681 2 0.6615 -0.03862 0.000 0.424 0.356 0.000 0.220
#> SRR1335314 4 0.2529 0.71550 0.004 0.000 0.056 0.900 0.040
#> SRR1400799 3 0.4909 0.22643 0.000 0.028 0.560 0.000 0.412
#> SRR1074578 4 0.4402 0.45848 0.352 0.000 0.012 0.636 0.000
#> SRR1312226 2 0.3741 0.62438 0.000 0.732 0.004 0.000 0.264
#> SRR1416207 1 0.1661 0.78643 0.940 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR1447371 1 0.1822 0.78384 0.936 0.000 0.036 0.004 0.024
#> SRR1069328 4 0.0854 0.72313 0.004 0.000 0.012 0.976 0.008
#> SRR1445023 4 0.4486 0.61214 0.152 0.000 0.040 0.776 0.032
#> SRR1077599 3 0.3160 0.63525 0.000 0.188 0.808 0.000 0.004
#> SRR1453480 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1588 0.79553 0.948 0.000 0.028 0.008 0.016
#> SRR1074839 5 0.6247 0.22009 0.000 0.152 0.364 0.000 0.484
#> SRR1458727 5 0.5287 0.33392 0.000 0.036 0.032 0.264 0.668
#> SRR1436949 2 0.2389 0.73765 0.000 0.880 0.004 0.000 0.116
#> SRR1070429 3 0.6002 0.14911 0.000 0.112 0.452 0.000 0.436
#> SRR1458158 4 0.4015 0.46658 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1432408 4 0.4579 0.70504 0.068 0.000 0.084 0.792 0.056
#> SRR1310334 1 0.4989 -0.01800 0.520 0.000 0.016 0.456 0.008
#> SRR1418201 5 0.4397 0.08685 0.000 0.004 0.432 0.000 0.564
#> SRR1385434 4 0.3073 0.71587 0.008 0.000 0.068 0.872 0.052
#> SRR1415591 3 0.5302 0.17878 0.000 0.052 0.536 0.000 0.412
#> SRR1402009 1 0.2326 0.79324 0.916 0.000 0.044 0.020 0.020
#> SRR1316055 1 0.4522 0.70092 0.788 0.000 0.056 0.116 0.040
#> SRR1308734 3 0.5694 0.10592 0.000 0.080 0.464 0.000 0.456
#> SRR1498973 2 0.4935 0.51120 0.000 0.616 0.040 0.000 0.344
#> SRR1397115 4 0.0290 0.72200 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1392141 1 0.2036 0.78290 0.928 0.000 0.036 0.008 0.028
#> SRR814341 2 0.0290 0.78083 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1313601 3 0.3143 0.63051 0.000 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.5725 0.14397 0.000 0.084 0.488 0.000 0.428
#> SRR809919 1 0.5592 0.11624 0.564 0.000 0.036 0.376 0.024
#> SRR1370818 4 0.6258 0.20122 0.432 0.000 0.056 0.472 0.040
#> SRR1323651 3 0.3783 0.38515 0.000 0.008 0.740 0.000 0.252
#> SRR1357297 4 0.1197 0.73001 0.048 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR818170 3 0.6668 0.05252 0.000 0.264 0.440 0.000 0.296
#> SRR1091230 3 0.3715 0.58415 0.000 0.260 0.736 0.000 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.4557 0.22519 0.000 0.012 0.584 0.000 0.404
#> SRR1317731 5 0.5518 0.12628 0.000 0.384 0.072 0.000 0.544
#> SRR1490785 1 0.1306 0.80590 0.960 0.000 0.016 0.016 0.008
#> SRR1432032 1 0.6146 0.16517 0.544 0.000 0.056 0.360 0.040
#> SRR1447808 1 0.1282 0.80069 0.952 0.000 0.004 0.044 0.000
#> SRR809534 2 0.0162 0.78202 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1397312 3 0.2818 0.64242 0.000 0.132 0.856 0.000 0.012
#> SRR812128 2 0.4219 0.46744 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1101513 1 0.3178 0.75792 0.872 0.000 0.036 0.068 0.024
#> SRR1415708 2 0.3957 0.45765 0.000 0.712 0.280 0.000 0.008
#> SRR1316033 3 0.5737 0.11424 0.000 0.084 0.464 0.000 0.452
#> SRR1390371 2 0.0865 0.77277 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1480263 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 5 0.5557 -0.10447 0.000 0.068 0.464 0.000 0.468
#> SRR1076801 1 0.2283 0.79230 0.916 0.000 0.036 0.008 0.040
#> SRR1080044 1 0.0451 0.80533 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1420850 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.2142 0.71402 0.004 0.000 0.048 0.920 0.028
#> SRR1069871 1 0.4088 0.26294 0.632 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1095744 2 0.2423 0.74890 0.000 0.896 0.024 0.000 0.080
#> SRR1068929 2 0.0703 0.77259 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.4305 0.36393 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1075054 2 0.0290 0.78127 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1083480 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0579 0.80726 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1417023 4 0.5017 0.68423 0.120 0.000 0.076 0.756 0.048
#> SRR1309333 2 0.4304 0.36760 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1333676 4 0.5628 0.21650 0.452 0.000 0.036 0.492 0.020
#> SRR1352996 4 0.0404 0.72392 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1093172 4 0.0290 0.72200 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1413137 4 0.0290 0.72200 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1469973 5 0.5807 0.15231 0.000 0.092 0.424 0.000 0.484
#> SRR1420026 2 0.4304 0.37286 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR817306 4 0.4915 0.30336 0.420 0.000 0.020 0.556 0.004
#> SRR1416266 4 0.0162 0.72212 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1071011 2 0.1608 0.73919 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.5703 0.39142 0.368 0.000 0.044 0.564 0.024
#> SRR1435394 3 0.2124 0.63083 0.000 0.096 0.900 0.000 0.004
#> SRR1383192 4 0.0290 0.72200 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1419962 5 0.5557 -0.10422 0.000 0.068 0.464 0.000 0.468
#> SRR1094357 1 0.0290 0.80829 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1081639 5 0.3012 0.34944 0.000 0.024 0.124 0.000 0.852
#> SRR1356016 2 0.0162 0.78202 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0566 0.77841 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1397348 2 0.4323 0.55345 0.000 0.656 0.012 0.000 0.332
#> SRR1312147 1 0.4375 0.71001 0.800 0.000 0.056 0.104 0.040
#> SRR1473891 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.5730 0.27648 0.424 0.000 0.044 0.512 0.020
#> SRR1474930 5 0.5414 0.32459 0.000 0.140 0.200 0.000 0.660
#> SRR1470988 4 0.0486 0.72154 0.004 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 3 0.3757 0.62140 0.000 0.208 0.772 0.000 0.020
#> SRR1313770 5 0.1981 0.36939 0.000 0.028 0.048 0.000 0.924
#> SRR1315780 2 0.1270 0.75638 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.1270 0.79688 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR819124 4 0.4874 0.24030 0.452 0.000 0.016 0.528 0.004
#> SRR1310997 5 0.6494 0.23764 0.000 0.252 0.256 0.000 0.492
#> SRR1464494 5 0.5836 -0.17938 0.000 0.412 0.096 0.000 0.492
#> SRR1357083 3 0.1965 0.63035 0.000 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.4283 0.40388 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1378085 1 0.5057 0.29428 0.584 0.000 0.016 0.384 0.016
#> SRR1378220 3 0.2077 0.62314 0.000 0.084 0.908 0.000 0.008
#> SRR1467704 1 0.2506 0.78693 0.904 0.000 0.052 0.008 0.036
#> SRR1348885 5 0.6741 0.26224 0.000 0.176 0.016 0.316 0.492
#> SRR1325826 1 0.4651 0.09876 0.560 0.000 0.008 0.428 0.004
#> SRR1466812 4 0.4084 0.50810 0.328 0.000 0.004 0.668 0.000
#> SRR1345692 2 0.4304 0.37286 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1401040 5 0.6264 -0.12118 0.000 0.148 0.400 0.000 0.452
#> SRR1097954 1 0.2689 0.77610 0.900 0.000 0.036 0.040 0.024
#> SRR1374396 4 0.1547 0.72686 0.004 0.000 0.016 0.948 0.032
#> SRR1454073 2 0.4302 0.37043 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1355747 1 0.1948 0.79786 0.932 0.000 0.036 0.008 0.024
#> SRR1429368 3 0.5694 0.10592 0.000 0.080 0.464 0.000 0.456
#> SRR1398138 5 0.6275 0.22151 0.000 0.156 0.364 0.000 0.480
#> SRR1379260 1 0.4615 0.69617 0.780 0.000 0.056 0.124 0.040
#> SRR1361436 3 0.2011 0.62577 0.000 0.088 0.908 0.000 0.004
#> SRR817142 3 0.2848 0.64309 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1315291 4 0.4468 0.70034 0.100 0.000 0.056 0.796 0.048
#> SRR1309314 5 0.3013 0.33399 0.000 0.008 0.160 0.000 0.832
#> SRR1420085 2 0.4306 0.36075 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1361308 3 0.5818 0.12848 0.000 0.092 0.464 0.000 0.444
#> SRR1472126 4 0.4341 0.35834 0.404 0.000 0.004 0.592 0.000
#> SRR1380482 3 0.3283 0.63902 0.000 0.140 0.832 0.000 0.028
#> SRR1099789 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.5277 0.49096 0.000 0.664 0.228 0.000 0.108
#> SRR1339276 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.4057 0.56693 0.732 0.000 0.008 0.252 0.008
#> SRR1399353 1 0.3146 0.77638 0.876 0.000 0.056 0.028 0.040
#> SRR1096760 3 0.1908 0.62774 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1440290 3 0.3694 0.48394 0.000 0.032 0.796 0.000 0.172
#> SRR1330813 3 0.3336 0.61527 0.000 0.228 0.772 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0510 0.78034 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR812294 4 0.1560 0.72802 0.004 0.000 0.028 0.948 0.020
#> SRR1394321 1 0.2606 0.78478 0.900 0.000 0.056 0.012 0.032
#> SRR1081160 2 0.3424 0.54614 0.000 0.760 0.240 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.2280 0.72853 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1349342 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0290 0.78095 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0404 0.78044 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1390143 1 0.5942 0.19282 0.560 0.000 0.052 0.356 0.032
#> SRR1390413 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 5 0.4305 -0.02431 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1312169 4 0.0290 0.72200 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1096687 4 0.3310 0.69980 0.136 0.000 0.024 0.836 0.004
#> SRR1486139 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.4339 0.71154 0.056 0.000 0.076 0.808 0.060
#> SRR1447893 3 0.1908 0.62774 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.2966 0.67317 0.000 0.848 0.136 0.000 0.016
#> SRR1477429 4 0.4753 0.70017 0.076 0.000 0.088 0.780 0.056
#> SRR1445701 5 0.4949 0.25324 0.000 0.056 0.288 0.000 0.656
#> SRR820689 1 0.0579 0.80525 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1451876 2 0.4552 -0.19639 0.000 0.524 0.468 0.000 0.008
#> SRR1452537 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1990 0.79698 0.928 0.000 0.040 0.004 0.028
#> SRR1489328 2 0.4306 0.36075 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1344462 1 0.1043 0.80157 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1082709 4 0.4304 0.14336 0.484 0.000 0.000 0.516 0.000
#> SRR1447784 1 0.2188 0.79746 0.924 0.000 0.028 0.024 0.024
#> SRR1355769 4 0.0486 0.72154 0.004 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR1488237 2 0.0290 0.78230 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1391985 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1661 0.78643 0.940 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR1480917 3 0.2951 0.63739 0.000 0.112 0.860 0.000 0.028
#> SRR1474485 1 0.3319 0.77072 0.868 0.000 0.052 0.040 0.040
#> SRR1089998 1 0.0981 0.80784 0.972 0.000 0.012 0.008 0.008
#> SRR1318140 1 0.5714 0.14725 0.552 0.000 0.048 0.380 0.020
#> SRR1319262 3 0.2077 0.62314 0.000 0.084 0.908 0.000 0.008
#> SRR1095188 2 0.4304 0.36760 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1454350 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0324 0.80634 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1359565 5 0.4415 0.10620 0.000 0.008 0.388 0.000 0.604
#> SRR1105417 4 0.3584 0.71844 0.040 0.000 0.068 0.852 0.040
#> SRR1325578 3 0.5304 0.27845 0.000 0.384 0.560 0.000 0.056
#> SRR1358161 5 0.5694 -0.12136 0.000 0.080 0.456 0.000 0.464
#> SRR1358665 2 0.0290 0.78095 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.1168 0.77016 0.000 0.960 0.032 0.000 0.008
#> SRR1452010 4 0.4527 0.38116 0.392 0.000 0.012 0.596 0.000
#> SRR1418183 3 0.5953 -0.04612 0.000 0.112 0.504 0.000 0.384
#> SRR1366345 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.1059 0.80325 0.968 0.000 0.008 0.020 0.004
#> SRR1473461 1 0.6090 0.15239 0.544 0.000 0.056 0.364 0.036
#> SRR1090837 3 0.5074 0.53354 0.000 0.132 0.700 0.000 0.168
#> SRR1447828 5 0.5605 -0.11223 0.000 0.072 0.464 0.000 0.464
#> SRR1338747 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.5190 0.53258 0.000 0.140 0.688 0.000 0.172
#> SRR1350280 4 0.4150 0.39529 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1088557 1 0.1478 0.78550 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1102656 2 0.2130 0.75349 0.000 0.908 0.012 0.000 0.080
#> SRR1441443 2 0.5348 0.29978 0.000 0.492 0.052 0.000 0.456
#> SRR1370682 5 0.5509 -0.09352 0.000 0.064 0.464 0.000 0.472
#> SRR1475448 3 0.2011 0.62577 0.000 0.088 0.908 0.000 0.004
#> SRR1407291 4 0.2230 0.71227 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1405266 1 0.4285 0.58971 0.752 0.000 0.032 0.208 0.008
#> SRR1363766 4 0.3586 0.60675 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1082592 3 0.6718 -0.14930 0.000 0.248 0.384 0.000 0.368
#> SRR1325794 3 0.3421 0.62781 0.000 0.204 0.788 0.000 0.008
#> SRR1095961 3 0.4612 0.50617 0.000 0.084 0.736 0.000 0.180
#> SRR1086702 2 0.2230 0.69156 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1320806 3 0.4619 0.40888 0.000 0.064 0.720 0.000 0.216
#> SRR1457527 3 0.5778 0.12110 0.000 0.088 0.464 0.000 0.448
#> SRR1098831 2 0.0510 0.77677 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1474374 5 0.4262 0.07403 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1488858 4 0.3389 0.71925 0.052 0.000 0.048 0.864 0.036
#> SRR1454695 1 0.5355 0.53492 0.680 0.000 0.044 0.240 0.036
#> SRR1090241 2 0.4273 -0.04171 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0566 0.78025 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1357733 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.6183 0.11854 0.528 0.000 0.056 0.376 0.040
#> SRR1379581 3 0.5694 0.10373 0.000 0.080 0.464 0.000 0.456
#> SRR1309182 1 0.4552 -0.01478 0.524 0.000 0.008 0.468 0.000
#> SRR1437668 1 0.2576 0.78487 0.900 0.000 0.056 0.008 0.036
#> SRR1084742 2 0.4306 0.36075 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1433538 4 0.3548 0.67300 0.188 0.000 0.012 0.796 0.004
#> SRR1085063 2 0.0162 0.78199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454247 2 0.4067 0.58694 0.000 0.692 0.008 0.000 0.300
#> SRR1097100 2 0.2852 0.63502 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.3048 0.63961 0.000 0.176 0.820 0.000 0.004
#> SRR1072388 1 0.1948 0.79786 0.932 0.000 0.036 0.008 0.024
#> SRR1070332 2 0.2439 0.73456 0.000 0.876 0.004 0.000 0.120
#> SRR1320761 3 0.3282 0.63525 0.000 0.188 0.804 0.000 0.008
#> SRR1076195 4 0.6005 0.46878 0.316 0.000 0.056 0.588 0.040
#> SRR1069895 3 0.2280 0.63967 0.000 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.6183 0.11854 0.528 0.000 0.056 0.376 0.040
#> SRR1385150 3 0.1908 0.62774 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.5399 0.62208 0.208 0.000 0.056 0.696 0.040
#> SRR1102583 1 0.4242 0.21186 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1456971 1 0.3058 0.77483 0.880 0.000 0.056 0.024 0.040
#> SRR1340574 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 5 0.6706 0.22692 0.000 0.256 0.328 0.000 0.416
#> SRR1096267 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.3424 0.39705 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1408553 4 0.0324 0.72134 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1069231 1 0.5665 0.07071 0.528 0.000 0.036 0.412 0.024
#> SRR1325642 2 0.3774 0.59363 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1362103 1 0.0451 0.80693 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1321942 1 0.0324 0.80798 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1094380 1 0.0162 0.80697 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 3 0.3430 0.61896 0.000 0.220 0.776 0.000 0.004
#> SRR1077874 2 0.3339 0.66526 0.000 0.836 0.124 0.000 0.040
#> SRR808299 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.4645 0.58400 0.000 0.204 0.724 0.000 0.072
#> SRR1481238 3 0.5086 0.23372 0.000 0.060 0.636 0.000 0.304
#> SRR1443568 3 0.6001 -0.13612 0.000 0.112 0.456 0.000 0.432
#> SRR1380249 4 0.6255 0.21321 0.428 0.000 0.056 0.476 0.040
#> SRR1080143 4 0.4798 0.34789 0.404 0.000 0.016 0.576 0.004
#> SRR1383148 4 0.3011 0.72419 0.032 0.000 0.048 0.884 0.036
#> SRR1357042 4 0.4321 0.36868 0.396 0.000 0.000 0.600 0.004
#> SRR1416025 2 0.4300 0.37485 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1431015 2 0.4561 0.35044 0.000 0.504 0.008 0.000 0.488
#> SRR1078709 2 0.4306 0.36075 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR813283 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.7163 0.25324 0.000 0.152 0.044 0.364 0.440
#> SRR807679 1 0.0290 0.80677 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333811 5 0.4322 0.36186 0.000 0.088 0.144 0.000 0.768
#> SRR1078660 5 0.5401 -0.27274 0.000 0.452 0.056 0.000 0.492
#> SRR1331730 2 0.0162 0.78202 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.1087 0.80605 0.968 0.000 0.008 0.008 0.016
#> SRR1432542 1 0.3229 0.77251 0.872 0.000 0.056 0.032 0.040
#> SRR1418041 1 0.4620 0.22807 0.612 0.000 0.012 0.372 0.004
#> SRR1085211 1 0.1661 0.78643 0.940 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR1339812 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.6349 0.46652 0.620 0.000 0.092 0.228 0.060
#> SRR1350958 2 0.3988 0.50812 0.000 0.732 0.252 0.000 0.016
#> SRR1396822 3 0.2798 0.64357 0.000 0.140 0.852 0.000 0.008
#> SRR1441934 2 0.4702 0.41172 0.000 0.552 0.016 0.000 0.432
#> SRR1472552 3 0.5554 0.32756 0.000 0.092 0.592 0.000 0.316
#> SRR1488881 3 0.5741 0.25822 0.000 0.096 0.544 0.000 0.360
#> SRR1102973 1 0.2060 0.78650 0.928 0.000 0.036 0.012 0.024
#> SRR1071131 5 0.5111 -0.15143 0.000 0.408 0.040 0.000 0.552
#> SRR1074502 1 0.3796 0.49886 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1325271 1 0.4474 0.70500 0.792 0.000 0.056 0.112 0.040
#> SRR1409171 2 0.0880 0.77074 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR809113 3 0.3487 0.62295 0.000 0.212 0.780 0.000 0.008
#> SRR1430045 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1582 0.76721 0.000 0.944 0.028 0.000 0.028
#> SRR1384091 4 0.2026 0.73308 0.044 0.000 0.012 0.928 0.016
#> SRR1431887 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0162 0.72212 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1488491 2 0.0162 0.78199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1356351 3 0.3177 0.62688 0.000 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR1369514 4 0.0854 0.72552 0.004 0.000 0.012 0.976 0.008
#> SRR1453299 3 0.5818 0.12848 0.000 0.092 0.464 0.000 0.444
#> SRR1436300 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.3671 0.60351 0.000 0.236 0.756 0.000 0.008
#> SRR1091767 2 0.4201 0.47738 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1354467 3 0.5818 0.12848 0.000 0.092 0.464 0.000 0.444
#> SRR1069074 2 0.4273 -0.08361 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.4302 0.37043 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1437430 5 0.6066 0.19287 0.000 0.388 0.124 0.000 0.488
#> SRR1419736 2 0.2504 0.74227 0.000 0.896 0.064 0.000 0.040
#> SRR1313343 3 0.5694 0.10592 0.000 0.080 0.464 0.000 0.456
#> SRR1077619 4 0.6255 0.21378 0.428 0.000 0.056 0.476 0.040
#> SRR1083530 1 0.5029 0.63060 0.736 0.000 0.056 0.172 0.036
#> SRR1333633 3 0.2286 0.63547 0.000 0.108 0.888 0.000 0.004
#> SRR1354999 3 0.4830 0.33924 0.000 0.060 0.684 0.000 0.256
#> SRR1443592 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.3452 0.55341 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1378818 2 0.6431 -0.08338 0.000 0.436 0.176 0.000 0.388
#> SRR1413182 4 0.1018 0.72454 0.000 0.000 0.016 0.968 0.016
#> SRR1464559 4 0.6260 0.18853 0.436 0.000 0.056 0.468 0.040
#> SRR1413075 2 0.4306 0.36075 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1487928 4 0.2436 0.73049 0.036 0.000 0.020 0.912 0.032
#> SRR1388997 2 0.4302 0.37043 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1092865 5 0.5922 -0.18901 0.000 0.420 0.104 0.000 0.476
#> SRR1102729 1 0.3530 0.76378 0.856 0.000 0.060 0.040 0.044
#> SRR1456423 1 0.5283 0.24853 0.600 0.000 0.032 0.352 0.016
#> SRR1321591 2 0.3012 0.67143 0.000 0.852 0.124 0.000 0.024
#> SRR1376874 3 0.5737 0.11344 0.000 0.084 0.464 0.000 0.452
#> SRR1339903 4 0.3398 0.66440 0.216 0.000 0.004 0.780 0.000
#> SRR1346710 1 0.1869 0.80031 0.936 0.000 0.036 0.012 0.016
#> SRR1418771 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.3398 0.62322 0.000 0.216 0.780 0.000 0.004
#> SRR1480941 3 0.2464 0.63095 0.000 0.096 0.888 0.000 0.016
#> SRR1479175 2 0.0510 0.77567 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0771 0.77417 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1491354 1 0.5330 0.14394 0.564 0.000 0.024 0.392 0.020
#> SRR1433884 5 0.6504 0.26690 0.000 0.228 0.288 0.000 0.484
#> SRR1471074 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.4294 0.38330 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1355554 3 0.4706 0.34553 0.000 0.052 0.692 0.000 0.256
#> SRR1487173 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.4638 0.59331 0.744 0.000 0.040 0.196 0.020
#> SRR1322918 2 0.4302 0.37043 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1318331 2 0.4192 0.46016 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1321333 3 0.5652 0.18902 0.000 0.080 0.516 0.000 0.404
#> SRR1474231 1 0.0324 0.80587 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1350545 4 0.4300 0.68264 0.164 0.000 0.048 0.776 0.012
#> SRR1091328 1 0.2576 0.78487 0.900 0.000 0.056 0.008 0.036
#> SRR814447 5 0.5165 -0.00330 0.000 0.040 0.448 0.000 0.512
#> SRR1455989 3 0.2719 0.64351 0.000 0.144 0.852 0.000 0.004
#> SRR1453680 5 0.4510 0.08512 0.000 0.008 0.432 0.000 0.560
#> SRR1470356 3 0.3906 0.59745 0.000 0.240 0.744 0.000 0.016
#> SRR1342977 2 0.0162 0.78202 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.3612 0.59500 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1097197 4 0.2966 0.67976 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1366729 5 0.4482 0.14256 0.000 0.012 0.376 0.000 0.612
#> SRR821282 3 0.5694 0.10373 0.000 0.080 0.464 0.000 0.456
#> SRR1074602 3 0.3521 0.60906 0.000 0.232 0.764 0.000 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.78267 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.5773 0.21679 0.000 0.100 0.544 0.000 0.356
#> SRR1319100 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 5 0.5014 0.19360 0.000 0.040 0.368 0.000 0.592
#> SRR1457459 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.2370 0.71417 0.000 0.000 0.056 0.904 0.040
#> SRR1444598 5 0.2278 0.37790 0.000 0.060 0.032 0.000 0.908
#> SRR1091743 3 0.3452 0.60054 0.000 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0162 0.80724 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.80734 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.2561 0.64297 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1459785 5 0.4182 0.11523 0.000 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1083700 1 0.1661 0.78643 0.940 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR1375531 1 0.6262 -0.16002 0.460 0.000 0.056 0.444 0.040
#> SRR1323470 3 0.5233 0.43364 0.000 0.148 0.684 0.000 0.168
#> SRR814657 4 0.2674 0.70601 0.120 0.000 0.012 0.868 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.4664 0.84003 0.000 0.644 0.000 0.000 0.280 0.076
#> SRR1467726 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR815446 5 0.2902 0.48166 0.000 0.196 0.000 0.000 0.800 0.004
#> SRR1402132 4 0.6867 0.44519 0.252 0.008 0.052 0.528 0.140 0.020
#> SRR1326059 1 0.4136 0.01939 0.560 0.000 0.012 0.428 0.000 0.000
#> SRR1409062 6 0.2491 0.78177 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR809406 1 0.3534 0.44302 0.716 0.000 0.008 0.276 0.000 0.000
#> SRR1465313 5 0.3940 0.31944 0.000 0.012 0.000 0.000 0.640 0.348
#> SRR819559 1 0.5395 0.14672 0.564 0.004 0.124 0.308 0.000 0.000
#> SRR1387899 6 0.2979 0.67317 0.000 0.004 0.004 0.000 0.188 0.804
#> SRR1442292 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1488151 1 0.0508 0.73317 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.2507 0.70283 0.884 0.072 0.040 0.004 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 6 0.3595 0.67055 0.000 0.288 0.000 0.000 0.008 0.704
#> SRR1102320 4 0.4052 0.55053 0.284 0.008 0.012 0.692 0.000 0.004
#> SRR1469926 3 0.3606 0.89798 0.000 0.000 0.728 0.000 0.016 0.256
#> SRR1070036 1 0.7670 -0.10916 0.292 0.284 0.204 0.220 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.4794 0.58647 0.684 0.176 0.136 0.004 0.000 0.000
#> SRR1090310 6 0.3088 0.53079 0.000 0.020 0.172 0.000 0.000 0.808
#> SRR1429748 4 0.5255 0.47967 0.320 0.004 0.104 0.572 0.000 0.000
#> SRR1363654 4 0.5823 0.30584 0.400 0.016 0.120 0.464 0.000 0.000
#> SRR1326317 6 0.2632 0.78025 0.000 0.164 0.000 0.000 0.004 0.832
#> SRR1378308 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1366919 4 0.2728 0.71072 0.008 0.040 0.080 0.872 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0806 0.73368 0.972 0.000 0.020 0.008 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.5719 0.72613 0.000 0.048 0.548 0.000 0.068 0.336
#> SRR1490761 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1380122 6 0.2954 0.78462 0.000 0.108 0.000 0.000 0.048 0.844
#> SRR1402944 5 0.5852 0.34974 0.000 0.252 0.012 0.000 0.544 0.192
#> SRR1092818 1 0.2747 0.68898 0.860 0.108 0.028 0.004 0.000 0.000
#> SRR1093552 4 0.7530 0.38443 0.172 0.284 0.200 0.344 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.3725 0.87622 0.000 0.676 0.000 0.000 0.316 0.008
#> SRR1078368 2 0.4812 0.81646 0.000 0.640 0.000 0.000 0.264 0.096
#> SRR1349608 5 0.0713 0.69580 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1466951 5 0.0146 0.69985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1331879 2 0.3861 0.84631 0.000 0.640 0.000 0.000 0.352 0.008
#> SRR1320034 3 0.4186 0.88406 0.000 0.036 0.728 0.000 0.016 0.220
#> SRR1068687 5 0.3852 0.21161 0.000 0.004 0.000 0.000 0.612 0.384
#> SRR1437491 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 5 0.3198 0.38530 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1374005 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1319182 1 0.3975 0.29312 0.600 0.000 0.008 0.392 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.5106 0.66173 0.088 0.156 0.056 0.700 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.2213 0.70390 0.904 0.004 0.068 0.004 0.000 0.020
#> SRR1077850 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.4066 0.87567 0.000 0.692 0.000 0.000 0.272 0.036
#> SRR1077992 2 0.4263 0.59445 0.000 0.504 0.000 0.000 0.480 0.016
#> SRR1455214 1 0.1155 0.73067 0.956 0.004 0.036 0.004 0.000 0.000
#> SRR1092014 6 0.2234 0.79043 0.000 0.124 0.000 0.000 0.004 0.872
#> SRR1097857 1 0.6125 0.04721 0.500 0.008 0.132 0.340 0.000 0.020
#> SRR1473318 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.3541 0.89841 0.000 0.000 0.728 0.000 0.012 0.260
#> SRR1338687 6 0.4330 0.55813 0.000 0.332 0.000 0.000 0.036 0.632
#> SRR1071207 4 0.6597 0.58108 0.104 0.188 0.168 0.540 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.3665 0.89552 0.000 0.020 0.728 0.000 0.000 0.252
#> SRR1418540 1 0.5613 0.45897 0.548 0.284 0.164 0.004 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.5854 0.45269 0.000 0.508 0.008 0.000 0.172 0.312
#> SRR1359487 4 0.1370 0.70947 0.004 0.012 0.036 0.948 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.2565 0.70939 0.872 0.016 0.104 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414708 1 0.7138 0.25184 0.424 0.268 0.200 0.108 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.5133 0.78942 0.000 0.580 0.000 0.000 0.312 0.108
#> SRR1365722 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1448118 2 0.3756 0.83170 0.000 0.644 0.000 0.000 0.352 0.004
#> SRR1444808 4 0.7355 0.43433 0.132 0.288 0.204 0.376 0.000 0.000
#> SRR1321829 6 0.3555 0.67643 0.000 0.280 0.000 0.000 0.008 0.712
#> SRR1475993 6 0.2402 0.78940 0.000 0.140 0.000 0.000 0.004 0.856
#> SRR1445387 1 0.3686 0.47701 0.748 0.000 0.032 0.220 0.000 0.000
#> SRR1077575 5 0.3879 0.15053 0.000 0.292 0.000 0.000 0.688 0.020
#> SRR1349300 4 0.3971 0.28880 0.448 0.000 0.004 0.548 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.5306 0.49117 0.588 0.284 0.124 0.004 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1473870 4 0.3767 0.56144 0.276 0.004 0.012 0.708 0.000 0.000
#> SRR1401146 6 0.2092 0.79070 0.000 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1366124 4 0.6182 0.54049 0.020 0.288 0.200 0.492 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.6608 0.38494 0.456 0.284 0.228 0.012 0.000 0.020
#> SRR1086490 6 0.3210 0.54442 0.000 0.028 0.168 0.000 0.000 0.804
#> SRR1088511 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1404577 4 0.0291 0.70233 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.1180 0.73174 0.960 0.000 0.012 0.016 0.000 0.012
#> SRR1072055 1 0.4800 0.55378 0.660 0.244 0.092 0.004 0.000 0.000
#> SRR1359738 6 0.3194 0.54309 0.000 0.020 0.168 0.000 0.004 0.808
#> SRR1332141 1 0.2213 0.70390 0.904 0.004 0.068 0.004 0.000 0.020
#> SRR1085900 5 0.0692 0.69997 0.000 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004
#> SRR1442173 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.4313 0.86871 0.000 0.668 0.000 0.000 0.284 0.048
#> SRR814515 2 0.4029 0.88147 0.000 0.680 0.000 0.000 0.292 0.028
#> SRR1357999 6 0.5177 0.57488 0.000 0.236 0.000 0.000 0.152 0.612
#> SRR1344034 6 0.5300 0.34914 0.000 0.000 0.188 0.000 0.212 0.600
#> SRR1080391 4 0.3955 0.28936 0.340 0.008 0.004 0.648 0.000 0.000
#> SRR1347870 5 0.0713 0.69580 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR814028 5 0.0713 0.69580 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR814219 2 0.3565 0.88881 0.000 0.692 0.000 0.000 0.304 0.004
#> SRR1070620 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.5465 -0.03236 0.508 0.004 0.112 0.376 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1418346 5 0.2773 0.55120 0.000 0.152 0.004 0.000 0.836 0.008
#> SRR1070060 4 0.0405 0.70220 0.008 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.3810 0.73411 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1417851 4 0.7320 0.44457 0.132 0.284 0.196 0.388 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1403199 4 0.7042 0.48668 0.100 0.284 0.184 0.432 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.5527 0.47879 0.564 0.276 0.156 0.004 0.000 0.000
#> SRR1079380 6 0.4545 0.69938 0.000 0.124 0.000 0.000 0.176 0.700
#> SRR1102923 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1369560 6 0.2595 0.78300 0.000 0.160 0.000 0.000 0.004 0.836
#> SRR1366605 2 0.3852 0.87559 0.000 0.664 0.000 0.000 0.324 0.012
#> SRR1396035 2 0.4402 0.85505 0.000 0.672 0.000 0.000 0.268 0.060
#> SRR1390223 5 0.1957 0.60800 0.000 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000
#> SRR1436840 5 0.2454 0.57110 0.000 0.160 0.000 0.000 0.840 0.000
#> SRR1445573 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1375394 4 0.6992 0.51306 0.016 0.048 0.236 0.544 0.124 0.032
#> SRR1431735 1 0.6687 0.36183 0.432 0.288 0.248 0.012 0.000 0.020
#> SRR1417387 1 0.5181 0.50114 0.604 0.280 0.112 0.004 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.6259 0.39911 0.488 0.284 0.204 0.024 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.0291 0.70214 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1446308 6 0.1367 0.75430 0.000 0.044 0.012 0.000 0.000 0.944
#> SRR1437346 6 0.3453 0.56952 0.000 0.044 0.164 0.000 0.000 0.792
#> SRR1103143 2 0.3653 0.88915 0.000 0.692 0.000 0.000 0.300 0.008
#> SRR1086466 1 0.3590 0.66545 0.804 0.116 0.076 0.004 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1098974 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2631 0.69905 0.004 0.016 0.076 0.884 0.000 0.020
#> SRR1319584 2 0.5124 0.77097 0.000 0.592 0.012 0.000 0.324 0.072
#> SRR1486584 1 0.5324 -0.06772 0.500 0.012 0.072 0.416 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.0767 0.70232 0.004 0.000 0.008 0.976 0.000 0.012
#> SRR1317939 5 0.3847 -0.38903 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1079730 1 0.0692 0.73003 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.3663 0.66794 0.180 0.004 0.040 0.776 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.3710 0.89046 0.000 0.696 0.000 0.000 0.292 0.012
#> SRR1415615 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 5 0.2883 0.48326 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1453259 2 0.3797 0.88898 0.000 0.692 0.000 0.000 0.292 0.016
#> SRR1340828 5 0.4238 -0.00957 0.000 0.340 0.008 0.000 0.636 0.016
#> SRR1079543 2 0.3390 0.89233 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR816427 5 0.0547 0.69721 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1076681 5 0.6021 0.25908 0.000 0.296 0.000 0.000 0.428 0.276
#> SRR1335314 4 0.2746 0.69186 0.004 0.008 0.100 0.868 0.000 0.020
#> SRR1400799 6 0.5576 0.38487 0.000 0.004 0.184 0.000 0.244 0.568
#> SRR1074578 4 0.2809 0.69242 0.128 0.004 0.020 0.848 0.000 0.000
#> SRR1312226 5 0.3489 0.19142 0.000 0.288 0.000 0.000 0.708 0.004
#> SRR1416207 1 0.2213 0.70390 0.904 0.004 0.068 0.004 0.000 0.020
#> SRR1447371 1 0.2213 0.70390 0.904 0.004 0.068 0.004 0.000 0.020
#> SRR1069328 4 0.1053 0.70360 0.004 0.000 0.020 0.964 0.000 0.012
#> SRR1445023 4 0.5184 0.57954 0.136 0.024 0.112 0.708 0.000 0.020
#> SRR1077599 6 0.2669 0.78543 0.000 0.156 0.000 0.000 0.008 0.836
#> SRR1453480 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1101834 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1321744 1 0.3025 0.69701 0.860 0.060 0.068 0.004 0.000 0.008
#> SRR1074839 5 0.3244 0.43423 0.000 0.000 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1458727 5 0.5553 0.32872 0.000 0.004 0.184 0.160 0.632 0.020
#> SRR1436949 5 0.4183 -0.55609 0.000 0.480 0.000 0.000 0.508 0.012
#> SRR1070429 3 0.4595 0.78583 0.000 0.084 0.668 0.000 0.000 0.248
#> SRR1458158 4 0.3742 0.44130 0.348 0.000 0.004 0.648 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.6459 0.57693 0.044 0.168 0.248 0.532 0.000 0.008
#> SRR1310334 4 0.4861 0.42249 0.368 0.004 0.056 0.572 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.4149 0.87622 0.000 0.004 0.728 0.000 0.056 0.212
#> SRR1385434 4 0.5482 0.62644 0.008 0.132 0.192 0.648 0.000 0.020
#> SRR1415591 6 0.5818 0.33629 0.000 0.016 0.248 0.000 0.176 0.560
#> SRR1402009 1 0.2001 0.71274 0.900 0.004 0.092 0.004 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.6927 0.31921 0.432 0.288 0.204 0.076 0.000 0.000
#> SRR1308734 3 0.3583 0.89903 0.000 0.004 0.728 0.000 0.008 0.260
#> SRR1498973 5 0.3848 0.44335 0.000 0.204 0.004 0.000 0.752 0.040
#> SRR1397115 4 0.0405 0.70267 0.008 0.000 0.004 0.988 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.5945 0.48323 0.560 0.280 0.132 0.008 0.000 0.020
#> SRR814341 2 0.3859 0.88743 0.000 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1313601 6 0.2300 0.78988 0.000 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1459609 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1499325 3 0.3982 0.88286 0.000 0.016 0.696 0.000 0.008 0.280
#> SRR809919 1 0.5104 0.42191 0.648 0.004 0.068 0.260 0.000 0.020
#> SRR1370818 4 0.7341 0.43792 0.132 0.288 0.200 0.380 0.000 0.000
#> SRR1323651 6 0.3541 0.59697 0.000 0.000 0.012 0.000 0.260 0.728
#> SRR1357297 4 0.0858 0.70603 0.028 0.000 0.004 0.968 0.000 0.000
#> SRR818170 5 0.6759 0.26228 0.000 0.156 0.080 0.000 0.460 0.304
#> SRR1091230 6 0.3110 0.75654 0.000 0.196 0.000 0.000 0.012 0.792
#> SRR1470556 2 0.3508 0.89185 0.000 0.704 0.000 0.000 0.292 0.004
#> SRR812318 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 6 0.5593 0.36556 0.000 0.000 0.184 0.000 0.280 0.536
#> SRR1317731 5 0.6554 0.42887 0.000 0.200 0.204 0.000 0.524 0.072
#> SRR1490785 1 0.1340 0.72876 0.948 0.004 0.040 0.008 0.000 0.000
#> SRR1432032 4 0.7630 0.33615 0.200 0.284 0.204 0.312 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.2165 0.68659 0.884 0.000 0.008 0.108 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.3797 0.88881 0.000 0.692 0.000 0.000 0.292 0.016
#> SRR1397312 6 0.2030 0.77871 0.000 0.064 0.000 0.000 0.028 0.908
#> SRR812128 5 0.2118 0.61565 0.000 0.104 0.000 0.000 0.888 0.008
#> SRR1101513 1 0.3473 0.67617 0.836 0.004 0.068 0.072 0.000 0.020
#> SRR1415708 2 0.5556 0.53111 0.000 0.548 0.000 0.000 0.188 0.264
#> SRR1316033 3 0.3606 0.89798 0.000 0.004 0.724 0.000 0.008 0.264
#> SRR1390371 2 0.4291 0.86770 0.000 0.664 0.000 0.000 0.292 0.044
#> SRR1480263 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1464473 3 0.3805 0.89814 0.000 0.016 0.728 0.000 0.008 0.248
#> SRR1076801 1 0.5665 0.45098 0.540 0.284 0.172 0.004 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0984 0.73248 0.968 0.000 0.012 0.008 0.000 0.012
#> SRR1420850 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1474295 4 0.2325 0.68967 0.004 0.004 0.076 0.896 0.000 0.020
#> SRR1069871 1 0.3807 0.19306 0.628 0.000 0.004 0.368 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.4406 0.61857 0.000 0.500 0.000 0.000 0.476 0.024
#> SRR1068929 2 0.4191 0.87302 0.000 0.676 0.000 0.000 0.284 0.040
#> SRR1490097 5 0.0146 0.69985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1075054 2 0.3619 0.88053 0.000 0.680 0.000 0.000 0.316 0.004
#> SRR1083480 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0603 0.73531 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR1417023 4 0.7289 0.46258 0.080 0.284 0.236 0.392 0.000 0.008
#> SRR1309333 5 0.0547 0.69806 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1333676 4 0.4894 0.40466 0.376 0.000 0.068 0.556 0.000 0.000
#> SRR1352996 4 0.0260 0.70242 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.0405 0.70220 0.008 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1413137 4 0.0405 0.70220 0.008 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1469973 5 0.3489 0.38973 0.000 0.004 0.000 0.000 0.708 0.288
#> SRR1420026 5 0.0363 0.69636 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR817306 4 0.5197 0.62618 0.184 0.104 0.036 0.676 0.000 0.000
#> SRR1416266 4 0.0436 0.70283 0.004 0.004 0.004 0.988 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.4812 0.81695 0.000 0.640 0.000 0.000 0.264 0.096
#> SRR1090290 4 0.5950 0.62632 0.120 0.144 0.108 0.628 0.000 0.000
#> SRR1435394 6 0.1471 0.77061 0.000 0.064 0.000 0.000 0.004 0.932
#> SRR1383192 4 0.0405 0.70220 0.008 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.3541 0.89841 0.000 0.000 0.728 0.000 0.012 0.260
#> SRR1094357 1 0.0363 0.73497 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.4025 0.68807 0.000 0.000 0.720 0.000 0.232 0.048
#> SRR1356016 2 0.3797 0.88881 0.000 0.692 0.000 0.000 0.292 0.016
#> SRR1351082 2 0.3615 0.89221 0.000 0.700 0.000 0.000 0.292 0.008
#> SRR1397348 5 0.3510 0.44534 0.000 0.204 0.008 0.000 0.772 0.016
#> SRR1312147 1 0.6918 0.30292 0.436 0.284 0.204 0.076 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.3508 0.89211 0.000 0.704 0.000 0.000 0.292 0.004
#> SRR1335470 4 0.4358 0.64399 0.196 0.000 0.092 0.712 0.000 0.000
#> SRR1474930 5 0.4672 0.47667 0.000 0.016 0.136 0.000 0.720 0.128
#> SRR1470988 4 0.0696 0.70263 0.004 0.004 0.004 0.980 0.000 0.008
#> SRR811915 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1104987 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.3615 0.89199 0.000 0.700 0.000 0.000 0.292 0.008
#> SRR1444436 6 0.2730 0.78806 0.000 0.152 0.000 0.000 0.012 0.836
#> SRR1313770 5 0.4409 0.08882 0.000 0.000 0.380 0.000 0.588 0.032
#> SRR1315780 2 0.4620 0.84008 0.000 0.640 0.000 0.000 0.292 0.068
#> SRR1073631 1 0.1524 0.71730 0.932 0.000 0.008 0.060 0.000 0.000
#> SRR819124 4 0.4453 0.36956 0.400 0.000 0.032 0.568 0.000 0.000
#> SRR1310997 5 0.2527 0.58069 0.000 0.000 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1464494 5 0.1204 0.69478 0.000 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1357083 6 0.1075 0.75875 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1475842 5 0.2048 0.62494 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1378085 4 0.6335 0.27175 0.356 0.104 0.040 0.488 0.000 0.012
#> SRR1378220 6 0.0862 0.73147 0.000 0.016 0.008 0.000 0.004 0.972
#> SRR1467704 1 0.5785 0.43108 0.520 0.284 0.192 0.004 0.000 0.000
#> SRR1348885 5 0.4823 0.55070 0.000 0.032 0.048 0.160 0.736 0.024
#> SRR1325826 1 0.4318 -0.04620 0.532 0.000 0.020 0.448 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.2006 0.70397 0.104 0.000 0.004 0.892 0.000 0.000
#> SRR1345692 5 0.0260 0.69781 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1401040 3 0.4434 0.83242 0.000 0.096 0.728 0.000 0.008 0.168
#> SRR1097954 1 0.3052 0.69069 0.864 0.004 0.068 0.044 0.000 0.020
#> SRR1374396 4 0.1787 0.71001 0.004 0.008 0.068 0.920 0.000 0.000
#> SRR1454073 5 0.0777 0.69845 0.000 0.024 0.004 0.000 0.972 0.000
#> SRR1355747 1 0.5613 0.46206 0.548 0.284 0.164 0.004 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.3668 0.89984 0.000 0.008 0.728 0.000 0.008 0.256
#> SRR1398138 5 0.3448 0.41188 0.000 0.004 0.000 0.000 0.716 0.280
#> SRR1379260 1 0.7129 0.27181 0.412 0.284 0.204 0.100 0.000 0.000
#> SRR1361436 6 0.0862 0.73258 0.000 0.016 0.008 0.000 0.004 0.972
#> SRR817142 6 0.2320 0.79099 0.000 0.132 0.000 0.000 0.004 0.864
#> SRR1315291 4 0.6646 0.52023 0.052 0.280 0.204 0.464 0.000 0.000
#> SRR1309314 3 0.4313 0.79420 0.000 0.000 0.728 0.000 0.148 0.124
#> SRR1420085 5 0.0146 0.69906 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1361308 3 0.3629 0.89268 0.000 0.016 0.724 0.000 0.000 0.260
#> SRR1472126 4 0.3555 0.55528 0.280 0.000 0.008 0.712 0.000 0.000
#> SRR1380482 6 0.2796 0.77268 0.000 0.080 0.008 0.000 0.044 0.868
#> SRR1099789 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.5887 0.23233 0.000 0.408 0.000 0.000 0.392 0.200
#> SRR1339276 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.4288 0.34739 0.644 0.000 0.016 0.328 0.000 0.012
#> SRR1399353 1 0.6614 0.42079 0.488 0.288 0.180 0.024 0.000 0.020
#> SRR1096760 6 0.1003 0.73091 0.000 0.020 0.016 0.000 0.000 0.964
#> SRR1440290 6 0.2513 0.71529 0.000 0.008 0.000 0.000 0.140 0.852
#> SRR1330813 6 0.2454 0.78370 0.000 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR1458931 2 0.3563 0.85985 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR812294 4 0.1674 0.70991 0.004 0.004 0.068 0.924 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.2234 0.70111 0.872 0.004 0.124 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.5481 0.65611 0.000 0.568 0.000 0.000 0.232 0.200
#> SRR1469704 2 0.3854 0.60198 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1349342 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.3615 0.89214 0.000 0.700 0.000 0.000 0.292 0.008
#> SRR1086752 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1084698 2 0.3499 0.87726 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1390143 1 0.5208 0.20828 0.592 0.004 0.108 0.296 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1099570 3 0.4752 0.78133 0.000 0.000 0.676 0.000 0.140 0.184
#> SRR1312169 4 0.0405 0.70220 0.008 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1096687 4 0.2983 0.69830 0.092 0.004 0.032 0.860 0.000 0.012
#> SRR1486139 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.6978 0.51273 0.036 0.292 0.216 0.436 0.000 0.020
#> SRR1447893 6 0.1007 0.75568 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1466025 2 0.5750 0.61686 0.000 0.480 0.000 0.000 0.336 0.184
#> SRR1477429 4 0.4241 0.68693 0.028 0.012 0.188 0.752 0.000 0.020
#> SRR1445701 5 0.5066 0.33561 0.000 0.000 0.176 0.000 0.636 0.188
#> SRR820689 1 0.0520 0.73270 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR1451876 6 0.5590 0.25128 0.000 0.352 0.000 0.000 0.152 0.496
#> SRR1452537 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1383301 1 0.1588 0.72078 0.924 0.000 0.072 0.004 0.000 0.000
#> SRR1489328 5 0.0000 0.69970 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.1285 0.72171 0.944 0.000 0.004 0.052 0.000 0.000
#> SRR1082709 4 0.3699 0.49027 0.336 0.000 0.004 0.660 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.5687 0.45957 0.548 0.284 0.160 0.008 0.000 0.000
#> SRR1355769 4 0.0767 0.70232 0.004 0.000 0.008 0.976 0.000 0.012
#> SRR1488237 2 0.3428 0.88914 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1391985 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1478501 1 0.2213 0.70390 0.904 0.004 0.068 0.004 0.000 0.020
#> SRR1480917 6 0.1802 0.77912 0.000 0.072 0.000 0.000 0.012 0.916
#> SRR1474485 1 0.5994 0.41852 0.508 0.284 0.196 0.012 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0972 0.73188 0.964 0.000 0.028 0.008 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.5467 0.10142 0.548 0.008 0.112 0.332 0.000 0.000
#> SRR1319262 6 0.0922 0.73979 0.000 0.024 0.004 0.000 0.004 0.968
#> SRR1095188 5 0.0632 0.69686 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0881 0.73295 0.972 0.000 0.008 0.008 0.000 0.012
#> SRR1359565 3 0.5330 0.71941 0.000 0.000 0.592 0.000 0.176 0.232
#> SRR1105417 4 0.3352 0.69288 0.032 0.004 0.108 0.836 0.000 0.020
#> SRR1325578 6 0.5687 0.43783 0.000 0.220 0.024 0.000 0.156 0.600
#> SRR1358161 3 0.3656 0.89960 0.000 0.004 0.728 0.000 0.012 0.256
#> SRR1358665 2 0.3879 0.88666 0.000 0.688 0.000 0.000 0.292 0.020
#> SRR1333971 2 0.4134 0.86711 0.000 0.656 0.000 0.000 0.316 0.028
#> SRR1452010 4 0.3144 0.66775 0.172 0.004 0.016 0.808 0.000 0.000
#> SRR1418183 5 0.3868 -0.10904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1366345 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.1434 0.72789 0.948 0.000 0.012 0.028 0.000 0.012
#> SRR1473461 1 0.7198 -0.14478 0.400 0.132 0.160 0.308 0.000 0.000
#> SRR1090837 6 0.4683 0.52556 0.000 0.104 0.204 0.000 0.004 0.688
#> SRR1447828 3 0.3583 0.89927 0.000 0.004 0.728 0.000 0.008 0.260
#> SRR1338747 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1333038 6 0.4434 0.62360 0.000 0.096 0.168 0.000 0.008 0.728
#> SRR1350280 4 0.2772 0.65782 0.180 0.000 0.004 0.816 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.2053 0.68155 0.888 0.000 0.004 0.108 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.4150 0.77436 0.000 0.592 0.000 0.000 0.392 0.016
#> SRR1441443 5 0.2436 0.66932 0.000 0.088 0.000 0.000 0.880 0.032
#> SRR1370682 3 0.3740 0.89934 0.000 0.012 0.728 0.000 0.008 0.252
#> SRR1475448 6 0.0937 0.75230 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1407291 4 0.2278 0.68258 0.128 0.000 0.004 0.868 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.3683 0.53351 0.768 0.000 0.048 0.184 0.000 0.000
#> SRR1363766 4 0.2668 0.67214 0.168 0.000 0.004 0.828 0.000 0.000
#> SRR1082592 5 0.5815 0.40507 0.000 0.168 0.012 0.000 0.540 0.280
#> SRR1325794 6 0.2783 0.78789 0.000 0.148 0.000 0.000 0.016 0.836
#> SRR1095961 6 0.3163 0.52136 0.000 0.008 0.172 0.000 0.012 0.808
#> SRR1086702 2 0.4639 0.82739 0.000 0.660 0.000 0.000 0.256 0.084
#> SRR1320806 6 0.3592 0.64971 0.000 0.020 0.000 0.000 0.240 0.740
#> SRR1457527 3 0.3744 0.89312 0.000 0.016 0.724 0.000 0.004 0.256
#> SRR1098831 2 0.4191 0.87268 0.000 0.676 0.000 0.000 0.284 0.040
#> SRR1474374 3 0.4195 0.86638 0.000 0.000 0.724 0.000 0.076 0.200
#> SRR1488858 4 0.5403 0.62967 0.036 0.128 0.180 0.656 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.7517 0.06975 0.352 0.280 0.184 0.184 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.5339 0.21461 0.000 0.488 0.000 0.000 0.108 0.404
#> SRR1329863 2 0.3636 0.87714 0.000 0.676 0.000 0.000 0.320 0.004
#> SRR1357733 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 4 0.7619 0.34255 0.196 0.284 0.204 0.316 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.3583 0.89807 0.000 0.008 0.728 0.000 0.004 0.260
#> SRR1309182 4 0.4032 0.34675 0.420 0.000 0.008 0.572 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.5828 0.42443 0.512 0.284 0.200 0.004 0.000 0.000
#> SRR1084742 5 0.0146 0.69914 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1433538 4 0.3065 0.67683 0.152 0.000 0.028 0.820 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.3528 0.89265 0.000 0.700 0.000 0.000 0.296 0.004
#> SRR1454247 5 0.3507 0.38933 0.000 0.232 0.004 0.000 0.752 0.012
#> SRR1097100 2 0.5150 0.76409 0.000 0.608 0.000 0.000 0.256 0.136
#> SRR818622 6 0.2402 0.78933 0.000 0.140 0.000 0.000 0.004 0.856
#> SRR1072388 1 0.5613 0.45995 0.548 0.284 0.164 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070332 5 0.3995 -0.54624 0.000 0.480 0.000 0.000 0.516 0.004
#> SRR1320761 6 0.2513 0.79002 0.000 0.140 0.000 0.000 0.008 0.852
#> SRR1076195 4 0.7152 0.46929 0.104 0.288 0.200 0.408 0.000 0.000
#> SRR1069895 6 0.1556 0.77834 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1099144 4 0.7619 0.34255 0.196 0.284 0.204 0.316 0.000 0.000
#> SRR1385150 6 0.0725 0.72416 0.000 0.012 0.012 0.000 0.000 0.976
#> SRR1420191 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1332625 4 0.6871 0.50505 0.072 0.288 0.200 0.440 0.000 0.000
#> SRR1102583 4 0.3944 0.25475 0.428 0.000 0.004 0.568 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.6036 0.41231 0.500 0.284 0.204 0.012 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 5 0.4897 0.41668 0.000 0.092 0.000 0.000 0.616 0.292
#> SRR1096267 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 6 0.3728 0.51080 0.000 0.004 0.000 0.000 0.344 0.652
#> SRR1408553 4 0.0291 0.70214 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1069231 4 0.7353 0.39281 0.244 0.232 0.132 0.392 0.000 0.000
#> SRR1325642 5 0.3742 0.00787 0.000 0.348 0.000 0.000 0.648 0.004
#> SRR1362103 1 0.0508 0.73511 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0692 0.73548 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0146 0.73502 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1099330 6 0.2668 0.77739 0.000 0.168 0.000 0.000 0.004 0.828
#> SRR1077874 2 0.5133 0.61647 0.000 0.564 0.000 0.000 0.336 0.100
#> SRR808299 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1098050 6 0.4530 0.69863 0.000 0.136 0.000 0.000 0.160 0.704
#> SRR1481238 6 0.4265 0.40369 0.000 0.016 0.004 0.000 0.384 0.596
#> SRR1443568 5 0.3684 0.23074 0.000 0.000 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1380249 4 0.7317 0.44280 0.128 0.288 0.200 0.384 0.000 0.000
#> SRR1080143 4 0.4029 0.54340 0.292 0.000 0.028 0.680 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.4946 0.64704 0.016 0.128 0.168 0.688 0.000 0.000
#> SRR1357042 4 0.5429 0.63407 0.152 0.128 0.052 0.668 0.000 0.000
#> SRR1416025 5 0.1141 0.68159 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1431015 5 0.0405 0.70130 0.000 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1078709 5 0.0000 0.69970 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0146 0.73452 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1070665 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1347707 5 0.5881 0.47061 0.000 0.028 0.092 0.208 0.636 0.036
#> SRR807679 1 0.0767 0.73421 0.976 0.012 0.008 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333811 5 0.4914 0.26047 0.000 0.000 0.268 0.000 0.628 0.104
#> SRR1078660 5 0.0937 0.69804 0.000 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1331730 2 0.3615 0.89237 0.000 0.700 0.000 0.000 0.292 0.008
#> SRR1333913 1 0.5004 0.51746 0.624 0.276 0.096 0.004 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.6115 0.40745 0.496 0.284 0.204 0.016 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.4466 0.17852 0.612 0.004 0.032 0.352 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.2125 0.70497 0.908 0.004 0.068 0.004 0.000 0.016
#> SRR1339812 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1402437 2 0.8092 -0.59577 0.236 0.288 0.248 0.208 0.000 0.020
#> SRR1350958 2 0.5592 0.51197 0.000 0.544 0.000 0.000 0.200 0.256
#> SRR1396822 6 0.2053 0.78817 0.000 0.108 0.000 0.000 0.004 0.888
#> SRR1441934 5 0.2945 0.58964 0.000 0.156 0.000 0.000 0.824 0.020
#> SRR1472552 3 0.4453 0.67712 0.000 0.032 0.568 0.000 0.000 0.400
#> SRR1488881 6 0.4432 -0.07972 0.000 0.036 0.364 0.000 0.000 0.600
#> SRR1102973 1 0.2325 0.70331 0.900 0.004 0.068 0.008 0.000 0.020
#> SRR1071131 5 0.2570 0.68652 0.000 0.024 0.064 0.000 0.888 0.024
#> SRR1074502 1 0.3830 0.27340 0.620 0.000 0.004 0.376 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.6878 0.33155 0.440 0.284 0.204 0.072 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.4312 0.86267 0.000 0.676 0.000 0.000 0.272 0.052
#> SRR809113 6 0.2553 0.78948 0.000 0.144 0.000 0.000 0.008 0.848
#> SRR1430045 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1441245 2 0.4064 0.83301 0.000 0.644 0.000 0.000 0.336 0.020
#> SRR1384091 4 0.3833 0.68803 0.028 0.104 0.064 0.804 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1096525 4 0.0436 0.70283 0.004 0.004 0.004 0.988 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.3390 0.89233 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1356351 6 0.2378 0.78157 0.000 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848
#> SRR1369514 4 0.1080 0.70823 0.004 0.004 0.032 0.960 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.3652 0.89062 0.000 0.016 0.720 0.000 0.000 0.264
#> SRR1436300 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 6 0.2768 0.78266 0.000 0.156 0.000 0.000 0.012 0.832
#> SRR1091767 5 0.1910 0.61273 0.000 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000
#> SRR1354467 3 0.3688 0.88976 0.000 0.020 0.724 0.000 0.000 0.256
#> SRR1069074 2 0.4778 0.08507 0.000 0.524 0.000 0.000 0.052 0.424
#> SRR1452399 5 0.0713 0.69580 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1437430 3 0.6081 0.61491 0.000 0.152 0.612 0.000 0.104 0.132
#> SRR1419736 2 0.5252 0.62270 0.000 0.480 0.000 0.000 0.424 0.096
#> SRR1313343 3 0.3583 0.89903 0.000 0.004 0.728 0.000 0.008 0.260
#> SRR1077619 4 0.7349 0.43417 0.132 0.284 0.204 0.380 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.7314 0.19675 0.416 0.240 0.192 0.152 0.000 0.000
#> SRR1333633 6 0.1313 0.73757 0.000 0.028 0.016 0.000 0.004 0.952
#> SRR1354999 6 0.3584 0.56678 0.000 0.004 0.000 0.000 0.308 0.688
#> SRR1443592 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1077356 1 0.3052 0.51206 0.780 0.000 0.004 0.216 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.7499 0.13372 0.000 0.320 0.188 0.000 0.324 0.168
#> SRR1413182 4 0.1152 0.70784 0.000 0.004 0.044 0.952 0.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.7317 0.44316 0.128 0.288 0.200 0.384 0.000 0.000
#> SRR1413075 5 0.0000 0.69970 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 4 0.4716 0.66042 0.024 0.132 0.120 0.724 0.000 0.000
#> SRR1388997 5 0.0713 0.69580 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1092865 5 0.2361 0.68836 0.000 0.028 0.000 0.000 0.884 0.088
#> SRR1102729 1 0.3604 0.67841 0.820 0.004 0.112 0.044 0.000 0.020
#> SRR1456423 1 0.4886 0.22224 0.612 0.004 0.072 0.312 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.4880 0.71906 0.000 0.620 0.000 0.000 0.288 0.092
#> SRR1376874 3 0.3583 0.89807 0.000 0.008 0.728 0.000 0.004 0.260
#> SRR1339903 4 0.3377 0.66153 0.188 0.000 0.028 0.784 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.2510 0.71288 0.884 0.028 0.080 0.008 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1095358 6 0.2632 0.78174 0.000 0.164 0.000 0.000 0.004 0.832
#> SRR1480941 6 0.1078 0.71975 0.000 0.008 0.016 0.000 0.012 0.964
#> SRR1479175 2 0.3508 0.89324 0.000 0.704 0.000 0.000 0.292 0.004
#> SRR1313891 2 0.4079 0.87875 0.000 0.680 0.000 0.000 0.288 0.032
#> SRR1491354 1 0.4964 0.02280 0.540 0.000 0.072 0.388 0.000 0.000
#> SRR1433884 5 0.3023 0.50384 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1471074 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1353052 5 0.1663 0.65296 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1355554 6 0.3448 0.59644 0.000 0.004 0.000 0.000 0.280 0.716
#> SRR1487173 1 0.0000 0.73472 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.4087 0.51554 0.744 0.004 0.064 0.188 0.000 0.000
#> SRR1322918 5 0.0713 0.69580 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1318331 5 0.2730 0.52149 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1321333 3 0.4279 0.66426 0.000 0.004 0.548 0.000 0.012 0.436
#> SRR1474231 1 0.0260 0.73383 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 4 0.3649 0.69369 0.112 0.004 0.084 0.800 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.5828 0.42443 0.512 0.284 0.200 0.004 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.4252 0.88330 0.000 0.032 0.728 0.000 0.024 0.216
#> SRR1455989 6 0.2234 0.79124 0.000 0.124 0.000 0.000 0.004 0.872
#> SRR1453680 3 0.4095 0.87177 0.000 0.000 0.728 0.000 0.064 0.208
#> SRR1470356 6 0.2814 0.77742 0.000 0.172 0.000 0.000 0.008 0.820
#> SRR1342977 2 0.3729 0.89015 0.000 0.692 0.000 0.000 0.296 0.012
#> SRR1444222 5 0.3592 0.07868 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1097197 4 0.2431 0.68613 0.132 0.000 0.008 0.860 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.4313 0.82016 0.000 0.000 0.728 0.000 0.124 0.148
#> SRR821282 3 0.3721 0.89822 0.000 0.016 0.728 0.000 0.004 0.252
#> SRR1074602 6 0.2595 0.78280 0.000 0.160 0.000 0.000 0.004 0.836
#> SRR814633 2 0.3371 0.89394 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1072480 3 0.4964 0.73566 0.000 0.048 0.592 0.000 0.016 0.344
#> SRR1319100 1 0.0260 0.73496 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 5 0.4565 0.39426 0.000 0.000 0.096 0.000 0.684 0.220
#> SRR1457459 1 0.0146 0.73429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.4958 0.64554 0.000 0.124 0.164 0.692 0.000 0.020
#> SRR1444598 5 0.3724 0.36363 0.000 0.004 0.268 0.000 0.716 0.012
#> SRR1091743 6 0.2632 0.78109 0.000 0.164 0.000 0.000 0.004 0.832
#> SRR819637 1 0.0260 0.73479 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0146 0.73452 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 6 0.2006 0.78742 0.000 0.104 0.000 0.000 0.004 0.892
#> SRR1459785 3 0.4780 0.83880 0.000 0.000 0.660 0.000 0.112 0.228
#> SRR1083700 1 0.1913 0.70851 0.920 0.004 0.060 0.004 0.000 0.012
#> SRR1375531 1 0.5846 -0.05981 0.484 0.012 0.140 0.364 0.000 0.000
#> SRR1323470 6 0.4199 0.68275 0.000 0.060 0.008 0.000 0.196 0.736
#> SRR814657 4 0.2019 0.69804 0.088 0.000 0.012 0.900 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.993 0.997 0.4955 0.505 0.505
#> 3 3 0.839 0.870 0.937 0.1495 0.954 0.909
#> 4 4 0.725 0.851 0.894 0.2150 0.816 0.611
#> 5 5 0.628 0.738 0.793 0.0680 0.909 0.717
#> 6 6 0.613 0.567 0.689 0.0506 0.962 0.857
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.5178 0.872 0.116 0.884
#> SRR1079543 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1458727 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.5059 0.876 0.112 0.888
#> SRR1397312 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.5178 0.872 0.116 0.884
#> SRR1312147 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.5178 0.872 0.116 0.884
#> SRR1073631 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348885 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.5178 0.872 0.116 0.884
#> SRR1355747 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309314 1 0.0376 0.994 0.996 0.004
#> SRR1420085 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1347707 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1480941 1 0.9460 0.420 0.636 0.364
#> SRR1479175 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.6048 0.830 0.148 0.852
#> SRR1318331 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.5178 0.872 0.116 0.884
#> SRR1097197 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.5178 0.872 0.116 0.884
#> SRR1074602 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.7883 0.697 0.236 0.764
#> SRR1319100 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0938 0.984 0.012 0.988
#> SRR1091743 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.4654 0.623 0.208 0.000 0.792
#> SRR1326059 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR809406 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.2625 0.901 0.000 0.916 0.084
#> SRR819559 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1442292 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102320 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1469926 2 0.5650 0.633 0.000 0.688 0.312
#> SRR1070036 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.1031 0.932 0.976 0.000 0.024
#> SRR1090310 2 0.2959 0.882 0.000 0.900 0.100
#> SRR1429748 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0592 0.935 0.000 0.988 0.012
#> SRR1378308 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1329947 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.2537 0.898 0.000 0.920 0.080
#> SRR1490761 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.4974 0.750 0.000 0.764 0.236
#> SRR1402944 2 0.4452 0.811 0.000 0.808 0.192
#> SRR1092818 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.1860 0.913 0.000 0.948 0.052
#> SRR1331879 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.3192 0.727 0.000 0.112 0.888
#> SRR1068687 2 0.0892 0.932 0.000 0.980 0.020
#> SRR1437491 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.2261 0.902 0.000 0.932 0.068
#> SRR1374005 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1329994 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1354203 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1077850 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1455214 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1097857 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1473318 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.3686 0.855 0.000 0.860 0.140
#> SRR1338687 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.2878 0.888 0.000 0.904 0.096
#> SRR1418540 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.1529 0.924 0.000 0.960 0.040
#> SRR1359487 1 0.6302 0.214 0.520 0.000 0.480
#> SRR1080648 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1414708 1 0.1031 0.932 0.976 0.000 0.024
#> SRR1469080 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475993 2 0.2356 0.903 0.000 0.928 0.072
#> SRR1445387 1 0.0237 0.940 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077575 2 0.3619 0.838 0.000 0.864 0.136
#> SRR1349300 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.4062 0.805 0.000 0.836 0.164
#> SRR1473870 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0592 0.934 0.000 0.988 0.012
#> SRR1366124 1 0.6235 0.292 0.564 0.000 0.436
#> SRR1391811 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1086490 2 0.3551 0.854 0.000 0.868 0.132
#> SRR1088511 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1384431 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1072055 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.4974 0.755 0.000 0.764 0.236
#> SRR1332141 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1085900 2 0.0747 0.932 0.000 0.984 0.016
#> SRR1442173 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.2066 0.907 0.000 0.940 0.060
#> SRR1344034 2 0.3116 0.880 0.000 0.892 0.108
#> SRR1080391 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR814028 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR814219 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.4062 0.805 0.000 0.836 0.164
#> SRR1070060 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.4062 0.805 0.000 0.836 0.164
#> SRR1417851 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1443350 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.3752 0.829 0.000 0.856 0.144
#> SRR1102923 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1366605 2 0.0892 0.930 0.000 0.980 0.020
#> SRR1396035 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2625 0.889 0.000 0.916 0.084
#> SRR1436840 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1445573 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.4121 0.686 0.168 0.000 0.832
#> SRR1431735 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1417387 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.6295 0.241 0.528 0.000 0.472
#> SRR1446308 2 0.1753 0.918 0.000 0.952 0.048
#> SRR1437346 2 0.5254 0.714 0.000 0.736 0.264
#> SRR1103143 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1319584 2 0.4931 0.760 0.000 0.768 0.232
#> SRR1486584 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1317939 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453259 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1340828 3 0.5859 0.458 0.000 0.344 0.656
#> SRR1079543 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.6305 0.208 0.516 0.000 0.484
#> SRR1400799 2 0.2959 0.882 0.000 0.900 0.100
#> SRR1074578 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.1163 0.926 0.000 0.972 0.028
#> SRR1416207 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1447371 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1069328 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1445023 1 0.6235 0.332 0.564 0.000 0.436
#> SRR1077599 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1453480 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1074839 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458727 3 0.4121 0.686 0.168 0.000 0.832
#> SRR1436949 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1070429 2 0.3267 0.869 0.000 0.884 0.116
#> SRR1458158 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.6305 0.208 0.516 0.000 0.484
#> SRR1310334 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.5650 0.504 0.000 0.312 0.688
#> SRR1385434 1 0.6305 0.208 0.516 0.000 0.484
#> SRR1415591 2 0.2625 0.895 0.000 0.916 0.084
#> SRR1402009 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.6305 0.208 0.516 0.000 0.484
#> SRR1308734 2 0.2959 0.882 0.000 0.900 0.100
#> SRR1498973 2 0.0592 0.933 0.000 0.988 0.012
#> SRR1397115 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR814341 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.1031 0.929 0.000 0.976 0.024
#> SRR1459609 2 0.1289 0.925 0.000 0.968 0.032
#> SRR1499325 2 0.4062 0.824 0.000 0.836 0.164
#> SRR809919 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1370818 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1357297 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.5785 0.466 0.000 0.332 0.668
#> SRR1091230 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.5327 0.704 0.000 0.728 0.272
#> SRR1317731 2 0.4702 0.783 0.000 0.788 0.212
#> SRR1490785 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.4555 0.758 0.000 0.800 0.200
#> SRR1397312 2 0.4062 0.805 0.000 0.836 0.164
#> SRR812128 2 0.2711 0.885 0.000 0.912 0.088
#> SRR1101513 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1415708 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1316033 2 0.3619 0.852 0.000 0.864 0.136
#> SRR1390371 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.3752 0.846 0.000 0.856 0.144
#> SRR1076801 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1420850 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1069871 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.3752 0.829 0.000 0.856 0.144
#> SRR1068929 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075054 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.5760 0.555 0.672 0.000 0.328
#> SRR1309333 2 0.3192 0.864 0.000 0.888 0.112
#> SRR1333676 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.6286 0.241 0.536 0.000 0.464
#> SRR1413137 1 0.6204 0.321 0.576 0.000 0.424
#> SRR1469973 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1420026 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR817306 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.6305 0.202 0.516 0.000 0.484
#> SRR1071011 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1383192 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.4842 0.739 0.000 0.776 0.224
#> SRR1094357 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.1643 0.758 0.000 0.044 0.956
#> SRR1356016 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.5859 0.458 0.000 0.344 0.656
#> SRR1312147 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.2796 0.897 0.000 0.908 0.092
#> SRR1470988 1 0.6286 0.262 0.536 0.000 0.464
#> SRR811915 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313770 2 0.5363 0.695 0.000 0.724 0.276
#> SRR1315780 2 0.6286 0.107 0.000 0.536 0.464
#> SRR1073631 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.2959 0.874 0.000 0.900 0.100
#> SRR1464494 2 0.3941 0.815 0.000 0.844 0.156
#> SRR1357083 2 0.2959 0.882 0.000 0.900 0.100
#> SRR1475842 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1378220 2 0.2625 0.897 0.000 0.916 0.084
#> SRR1467704 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.4121 0.686 0.168 0.000 0.832
#> SRR1325826 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1401040 2 0.4121 0.819 0.000 0.832 0.168
#> SRR1097954 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1374396 1 0.6307 0.196 0.512 0.000 0.488
#> SRR1454073 3 0.6295 0.081 0.000 0.472 0.528
#> SRR1355747 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.3686 0.850 0.000 0.860 0.140
#> SRR1398138 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1379260 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.2959 0.882 0.000 0.900 0.100
#> SRR817142 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1315291 3 0.4504 0.643 0.196 0.000 0.804
#> SRR1309314 3 0.0237 0.743 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420085 2 0.2711 0.885 0.000 0.912 0.088
#> SRR1361308 2 0.3816 0.838 0.000 0.852 0.148
#> SRR1472126 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0892 0.934 0.000 0.980 0.020
#> SRR1099789 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.3551 0.842 0.000 0.868 0.132
#> SRR1339276 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1399353 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1096760 2 0.4931 0.756 0.000 0.768 0.232
#> SRR1440290 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1330813 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1458931 2 0.1031 0.928 0.000 0.976 0.024
#> SRR812294 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.3412 0.862 0.000 0.876 0.124
#> SRR1312169 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1486139 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1447893 2 0.2796 0.889 0.000 0.908 0.092
#> SRR1466025 2 0.3686 0.834 0.000 0.860 0.140
#> SRR1477429 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1445701 2 0.1529 0.924 0.000 0.960 0.040
#> SRR820689 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1451876 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.5859 0.492 0.656 0.000 0.344
#> SRR1355769 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1488237 2 0.2165 0.905 0.000 0.936 0.064
#> SRR1391985 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1480917 2 0.0892 0.934 0.000 0.980 0.020
#> SRR1474485 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.1163 0.930 0.972 0.000 0.028
#> SRR1319262 2 0.2448 0.900 0.000 0.924 0.076
#> SRR1095188 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1454350 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1359565 2 0.3619 0.850 0.000 0.864 0.136
#> SRR1105417 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1325578 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1358161 2 0.4235 0.823 0.000 0.824 0.176
#> SRR1358665 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.1529 0.924 0.000 0.960 0.040
#> SRR1366345 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1473461 1 0.0747 0.935 0.984 0.000 0.016
#> SRR1090837 2 0.2959 0.882 0.000 0.900 0.100
#> SRR1447828 2 0.4121 0.823 0.000 0.832 0.168
#> SRR1338747 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.2796 0.889 0.000 0.908 0.092
#> SRR1350280 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.5497 0.608 0.000 0.708 0.292
#> SRR1475448 2 0.3116 0.876 0.000 0.892 0.108
#> SRR1407291 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1082592 2 0.3412 0.851 0.000 0.876 0.124
#> SRR1325794 2 0.1643 0.918 0.000 0.956 0.044
#> SRR1095961 2 0.2625 0.901 0.000 0.916 0.084
#> SRR1086702 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1457527 2 0.3816 0.838 0.000 0.852 0.148
#> SRR1098831 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.3752 0.846 0.000 0.856 0.144
#> SRR1488858 1 0.5926 0.504 0.644 0.000 0.356
#> SRR1454695 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.6244 0.250 0.000 0.560 0.440
#> SRR1309182 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.3816 0.824 0.000 0.852 0.148
#> SRR1433538 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.3482 0.846 0.000 0.872 0.128
#> SRR1097100 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1072388 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.3752 0.829 0.000 0.856 0.144
#> SRR1320761 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1076195 1 0.6305 0.208 0.516 0.000 0.484
#> SRR1069895 2 0.2356 0.903 0.000 0.928 0.072
#> SRR1099144 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.2796 0.889 0.000 0.908 0.092
#> SRR1420191 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096267 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.5178 0.727 0.000 0.744 0.256
#> SRR1408553 1 0.6299 0.230 0.524 0.000 0.476
#> SRR1069231 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099330 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077874 2 0.1643 0.918 0.000 0.956 0.044
#> SRR808299 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.4062 0.805 0.000 0.836 0.164
#> SRR1481238 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1443568 2 0.1163 0.929 0.000 0.972 0.028
#> SRR1380249 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1080143 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.5497 0.587 0.708 0.000 0.292
#> SRR1357042 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1416025 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431015 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078709 2 0.1529 0.920 0.000 0.960 0.040
#> SRR813283 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.4121 0.686 0.168 0.000 0.832
#> SRR807679 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.2537 0.900 0.000 0.920 0.080
#> SRR1078660 2 0.2711 0.885 0.000 0.912 0.088
#> SRR1331730 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1339812 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1350958 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1441934 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472552 2 0.3879 0.833 0.000 0.848 0.152
#> SRR1488881 2 0.3686 0.846 0.000 0.860 0.140
#> SRR1102973 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1071131 2 0.0424 0.935 0.000 0.992 0.008
#> SRR1074502 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1430045 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1431887 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.6305 0.208 0.516 0.000 0.484
#> SRR1488491 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1369514 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.3619 0.850 0.000 0.864 0.136
#> SRR1436300 1 0.0237 0.940 0.996 0.000 0.004
#> SRR1348490 2 0.0747 0.934 0.000 0.984 0.016
#> SRR1091767 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354467 2 0.3879 0.837 0.000 0.848 0.152
#> SRR1069074 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437430 2 0.5291 0.708 0.000 0.732 0.268
#> SRR1419736 2 0.4605 0.775 0.000 0.796 0.204
#> SRR1313343 2 0.5465 0.677 0.000 0.712 0.288
#> SRR1077619 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0892 0.934 0.980 0.000 0.020
#> SRR1333633 2 0.1964 0.914 0.000 0.944 0.056
#> SRR1354999 2 0.3412 0.871 0.000 0.876 0.124
#> SRR1443592 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.1860 0.758 0.000 0.052 0.948
#> SRR1413182 1 0.6302 0.219 0.520 0.000 0.480
#> SRR1464559 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1413075 2 0.0592 0.934 0.000 0.988 0.012
#> SRR1487928 1 0.6305 0.208 0.516 0.000 0.484
#> SRR1388997 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1092865 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1456423 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.6225 0.187 0.000 0.432 0.568
#> SRR1339903 1 0.0237 0.940 0.996 0.000 0.004
#> SRR1346710 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480941 3 0.4062 0.690 0.164 0.000 0.836
#> SRR1479175 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471074 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1355554 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1487173 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.4555 0.758 0.000 0.800 0.200
#> SRR1318331 2 0.0237 0.935 0.000 0.996 0.004
#> SRR1321333 2 0.3816 0.838 0.000 0.852 0.148
#> SRR1474231 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1350545 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.1529 0.757 0.000 0.040 0.960
#> SRR1455989 2 0.1163 0.928 0.000 0.972 0.028
#> SRR1453680 3 0.6244 0.159 0.000 0.440 0.560
#> SRR1470356 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.4974 0.719 0.000 0.764 0.236
#> SRR1097197 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.4291 0.808 0.000 0.820 0.180
#> SRR821282 3 0.0237 0.746 0.000 0.004 0.996
#> SRR1074602 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4062 0.690 0.164 0.000 0.836
#> SRR1319100 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.1529 0.926 0.000 0.960 0.040
#> SRR1457459 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1444598 3 0.1031 0.753 0.000 0.024 0.976
#> SRR1091743 2 0.0237 0.936 0.000 0.996 0.004
#> SRR819637 1 0.0592 0.937 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083848 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.1411 0.924 0.000 0.964 0.036
#> SRR1459785 2 0.3551 0.854 0.000 0.868 0.132
#> SRR1083700 1 0.1411 0.927 0.964 0.000 0.036
#> SRR1375531 1 0.1289 0.929 0.968 0.000 0.032
#> SRR1323470 3 0.4062 0.690 0.164 0.000 0.836
#> SRR814657 1 0.0000 0.942 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.4907 -0.1032 0.000 0.580 0.420 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.3610 0.8992 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR819559 1 0.0469 0.9221 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1387899 3 0.3726 0.9005 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0336 0.9224 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1395635 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 3 0.3873 0.8961 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1102320 1 0.4011 0.7966 0.784 0.000 0.008 0.208
#> SRR1469926 3 0.1118 0.7745 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1070036 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1098426 1 0.2988 0.8695 0.876 0.000 0.012 0.112
#> SRR1090310 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0469 0.9221 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1326317 3 0.3801 0.8981 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4522 0.6352 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1490761 2 0.0188 0.9152 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380122 3 0.1211 0.7726 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1402944 3 0.1474 0.7850 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1092818 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1093552 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1464880 2 0.0707 0.9085 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.2814 0.7776 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1466951 2 0.1474 0.8947 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1331879 2 0.0188 0.9152 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1320034 3 0.0657 0.7461 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1068687 3 0.3726 0.8979 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.1792 0.8804 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.3539 0.8255 0.820 0.000 0.004 0.176
#> SRR1329994 1 0.3726 0.7976 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1354203 1 0.3751 0.7995 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0469 0.9121 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.3837 0.8983 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1097857 1 0.3791 0.7991 0.796 0.000 0.004 0.200
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.3311 0.8867 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1338687 2 0.0188 0.9149 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071207 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1486821 3 0.3688 0.9002 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1418540 1 0.0927 0.9205 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1408788 3 0.3764 0.8980 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1359487 4 0.0469 0.8859 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1080648 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1414708 1 0.3494 0.8302 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR1469080 2 0.0188 0.9152 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.1356 0.9128 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1321829 3 0.4776 0.6987 0.000 0.376 0.624 0.000
#> SRR1475993 3 0.3688 0.9002 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1445387 1 0.0895 0.9165 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1077575 2 0.4222 0.7230 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1356 0.9156 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1453769 2 0.3710 0.7514 0.000 0.804 0.192 0.004
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.4994 -0.3279 0.000 0.520 0.480 0.000
#> SRR1366124 4 0.3539 0.7969 0.176 0.000 0.004 0.820
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1086490 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3870 0.7996 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1384431 1 0.3751 0.8033 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1072055 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1359738 3 0.2704 0.8546 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1332141 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1085900 3 0.4790 0.6395 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.1389 0.8804 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.3688 0.7835 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1344034 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1080391 1 0.0469 0.9221 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1347870 2 0.0592 0.9107 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR814028 2 0.2647 0.8320 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.4406 0.6925 0.000 0.700 0.300 0.000
#> SRR1070060 1 0.0188 0.9226 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487969 2 0.4134 0.7317 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1417851 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1076705 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1079380 3 0.5294 -0.1526 0.000 0.484 0.508 0.008
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.4996 -0.3289 0.000 0.516 0.484 0.000
#> SRR1366605 2 0.1716 0.8823 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.1867 0.8772 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1436840 2 0.0592 0.9122 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1431735 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1417387 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1445984 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1370447 4 0.3196 0.8345 0.136 0.000 0.008 0.856
#> SRR1446308 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1437346 3 0.1022 0.7702 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1468914 1 0.3945 0.7921 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1319584 3 0.1940 0.7939 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.4011 0.7938 0.784 0.000 0.008 0.208
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0336 0.9224 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0592 0.9107 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1453259 2 0.0921 0.9060 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1340828 3 0.4614 0.5928 0.000 0.064 0.792 0.144
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0336 0.9138 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1076681 3 0.3873 0.8961 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1335314 4 0.2281 0.8603 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1400799 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.3024 0.8366 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1416207 1 0.3751 0.7995 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1447371 1 0.4011 0.7966 0.784 0.000 0.008 0.208
#> SRR1069328 1 0.3801 0.7907 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1445023 4 0.3908 0.7454 0.212 0.000 0.004 0.784
#> SRR1077599 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1453480 2 0.2011 0.8541 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1074839 3 0.3837 0.8908 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1458727 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1436949 2 0.0921 0.9059 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1070429 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.0524 0.8856 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1310334 1 0.0188 0.9226 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418201 3 0.0817 0.7611 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1385434 4 0.1042 0.8840 0.020 0.000 0.008 0.972
#> SRR1415591 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.0524 0.8856 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1308734 3 0.3764 0.9004 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1498973 2 0.2011 0.8834 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR814341 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 3 0.4713 0.7281 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1459609 2 0.1867 0.8771 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1499325 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR809919 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1370818 1 0.0927 0.9204 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1323651 3 0.3764 0.9003 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1357297 1 0.0336 0.9224 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR818170 3 0.3219 0.6538 0.000 0.020 0.868 0.112
#> SRR1091230 3 0.3907 0.8934 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1792 0.8065 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1317731 3 0.1302 0.7769 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.4697 0.6809 0.000 0.696 0.296 0.008
#> SRR1397312 2 0.4222 0.7235 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR812128 2 0.4331 0.7056 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1101513 1 0.3751 0.7995 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1415708 3 0.3764 0.8980 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1316033 3 0.3649 0.9001 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1390371 2 0.2408 0.8254 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3688 0.9002 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1076801 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1080044 1 0.3668 0.8072 0.808 0.000 0.004 0.188
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.4193 0.7271 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0592 0.9107 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1417023 4 0.3893 0.7663 0.196 0.000 0.008 0.796
#> SRR1309333 2 0.2760 0.8545 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.3791 0.7754 0.200 0.000 0.004 0.796
#> SRR1413137 4 0.4964 0.4769 0.380 0.000 0.004 0.616
#> SRR1469973 3 0.4072 0.8641 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1420026 2 0.0592 0.9107 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR817306 1 0.0592 0.9221 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1416266 4 0.0524 0.8849 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0469 0.9221 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1435394 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1383192 1 0.2589 0.8672 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1419962 3 0.3610 0.8994 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1094357 1 0.0469 0.9221 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1081639 3 0.5112 0.0837 0.000 0.008 0.608 0.384
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.4614 0.5928 0.000 0.064 0.792 0.144
#> SRR1312147 1 0.0927 0.9204 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 3 0.2530 0.8446 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1470988 4 0.3196 0.8345 0.136 0.000 0.008 0.856
#> SRR811915 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.1867 0.8677 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1313770 3 0.1022 0.7702 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1315780 3 0.6320 0.4551 0.000 0.204 0.656 0.140
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.4008 0.7514 0.000 0.756 0.244 0.000
#> SRR1464494 2 0.4250 0.7197 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1357083 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1475842 2 0.0188 0.9152 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1378085 1 0.3933 0.8046 0.792 0.000 0.008 0.200
#> SRR1378220 3 0.3649 0.9001 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1467704 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1348885 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.3610 0.7080 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1345692 2 0.0817 0.9082 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1401040 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1097954 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1374396 4 0.0376 0.8839 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1454073 3 0.3763 0.6141 0.000 0.024 0.832 0.144
#> SRR1355747 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1429368 3 0.3688 0.9002 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1398138 3 0.4730 0.6991 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1379260 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1361436 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR817142 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1315291 4 0.0592 0.8800 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1309314 4 0.1118 0.8705 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1420085 2 0.2921 0.8142 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1361308 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.3528 0.8930 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.4222 0.7230 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.3791 0.7991 0.796 0.000 0.004 0.200
#> SRR1399353 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1096760 3 0.1022 0.7702 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1440290 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1330813 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1458931 2 0.1389 0.8936 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR812294 1 0.1637 0.9050 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1394321 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0524 0.9221 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0188 0.9225 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1312169 1 0.0188 0.9226 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096687 1 0.3831 0.8018 0.792 0.000 0.004 0.204
#> SRR1486139 1 0.0188 0.9226 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470313 1 0.4212 0.7868 0.772 0.000 0.012 0.216
#> SRR1447893 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1466025 2 0.4250 0.7193 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1477429 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1445701 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR820689 1 0.3768 0.8183 0.808 0.000 0.008 0.184
#> SRR1451876 2 0.1637 0.8817 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0376 0.9227 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1489328 2 0.3123 0.7896 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.5024 0.5692 0.360 0.000 0.008 0.632
#> SRR1355769 1 0.3791 0.7991 0.796 0.000 0.004 0.200
#> SRR1488237 2 0.2345 0.8518 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.3751 0.7995 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1480917 3 0.4972 0.4155 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1474485 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.2888 0.8566 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1319262 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1095188 3 0.4500 0.7811 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.3583 0.8143 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1359565 3 0.3688 0.9006 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1105417 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1325578 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1358161 3 0.3444 0.8926 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.1557 0.8778 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.3583 0.8143 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1473461 1 0.2805 0.8770 0.888 0.000 0.012 0.100
#> SRR1090837 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1447828 3 0.3528 0.8962 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0592 0.9115 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1441443 2 0.0188 0.9146 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1370682 3 0.3610 0.8994 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1475448 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.3172 0.8380 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1082592 3 0.2011 0.7800 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1325794 2 0.2469 0.8491 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1095961 3 0.3400 0.8904 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 3 0.3726 0.8996 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1457527 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1488858 4 0.2760 0.8397 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1454695 1 0.4262 0.6318 0.756 0.000 0.008 0.236
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0336 0.9138 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1357733 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1362135 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1379581 3 0.1792 0.8070 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1084742 2 0.4250 0.7192 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1433538 1 0.0469 0.9221 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.4277 0.7144 0.000 0.720 0.280 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1072388 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1070332 2 0.3975 0.7490 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1320761 3 0.3907 0.8869 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1076195 4 0.0657 0.8856 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1069895 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1099144 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1385150 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 3 0.3873 0.8961 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.1118 0.7715 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1408553 4 0.3626 0.7881 0.184 0.000 0.004 0.812
#> SRR1069231 1 0.0469 0.9221 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1321942 1 0.0657 0.9216 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1094380 1 0.0188 0.9225 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447499 2 0.0592 0.9108 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1099330 3 0.3873 0.8961 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1077874 2 0.2011 0.8691 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.4356 0.7016 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1481238 3 0.4790 0.6916 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1443568 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1380249 1 0.4761 0.6057 0.664 0.000 0.004 0.332
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.4454 0.6550 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR1357042 1 0.3751 0.8064 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1416025 2 0.1302 0.8995 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1431015 2 0.1022 0.9051 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1078709 2 0.2345 0.8686 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR807679 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1333811 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1078660 2 0.3610 0.7924 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1432542 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4137 0.7952 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1441934 2 0.0469 0.9121 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1472552 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1488881 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1102973 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1071131 3 0.3726 0.8979 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 3 0.4304 0.8337 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1430045 2 0.0188 0.9152 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441245 2 0.2647 0.8174 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1384091 1 0.3726 0.7976 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.1576 0.8800 0.048 0.000 0.004 0.948
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.4830 0.1213 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1369514 1 0.0592 0.9219 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453299 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1436300 1 0.1305 0.9091 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1348490 3 0.4981 0.4656 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1091767 2 0.1474 0.8887 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1354467 3 0.3688 0.9002 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1069074 2 0.4961 -0.1920 0.000 0.552 0.448 0.000
#> SRR1452399 3 0.4193 0.8458 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1437430 3 0.1022 0.7702 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1419736 2 0.4955 0.4150 0.000 0.556 0.444 0.000
#> SRR1313343 3 0.1022 0.7702 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1077619 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1083530 1 0.2921 0.8539 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1333633 3 0.3726 0.9005 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1354999 3 0.2868 0.8637 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.2635 0.6895 0.000 0.020 0.904 0.076
#> SRR1413182 4 0.3400 0.7905 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1464559 1 0.4049 0.7948 0.780 0.000 0.008 0.212
#> SRR1413075 2 0.2868 0.8141 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1487928 4 0.0524 0.8856 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1388997 2 0.2469 0.8379 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1092865 2 0.2149 0.8465 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1102729 1 0.3870 0.7978 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0921 0.7658 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1339903 1 0.1557 0.9042 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1346710 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.4916 0.5938 0.000 0.424 0.576 0.000
#> SRR1480941 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 3 0.4431 0.7993 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.1716 0.8793 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1355554 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.5266 0.6987 0.000 0.752 0.108 0.140
#> SRR1318331 2 0.0592 0.9107 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1321333 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1474231 1 0.3978 0.8105 0.796 0.000 0.012 0.192
#> SRR1350545 1 0.0592 0.9223 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1091328 1 0.0804 0.9209 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR814447 3 0.0937 0.7435 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1455989 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1453680 3 0.0817 0.7611 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1470356 2 0.0707 0.9047 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.5512 0.2483 0.000 0.496 0.488 0.016
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.3311 0.8868 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR821282 3 0.3024 0.5934 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1074602 3 0.3873 0.8961 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.4053 0.7784 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR1444598 4 0.3569 0.7365 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1091743 3 0.4331 0.8360 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR819637 1 0.2255 0.8960 0.920 0.000 0.012 0.068
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9224 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.3801 0.8999 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1459785 3 0.3649 0.8998 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1083700 1 0.3831 0.7988 0.792 0.000 0.004 0.204
#> SRR1375531 1 0.3710 0.8069 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR1323470 4 0.0707 0.8795 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR814657 1 0.0188 0.9226 0.996 0.000 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.1341 0.8137 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.3530 0.6481 0.000 0.784 0.012 0.000 0.204
#> SRR1402132 4 0.3143 0.8082 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1326059 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409062 5 0.6109 0.6567 0.000 0.272 0.172 0.000 0.556
#> SRR809406 1 0.0000 0.8791 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.4569 0.6974 0.000 0.104 0.748 0.000 0.148
#> SRR819559 1 0.1831 0.8843 0.920 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1387899 3 0.4010 0.7868 0.000 0.160 0.784 0.000 0.056
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0880 0.8860 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1395635 1 0.2694 0.8807 0.884 0.000 0.000 0.076 0.040
#> SRR1343629 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1326868 5 0.6180 0.6357 0.000 0.220 0.224 0.000 0.556
#> SRR1102320 1 0.4181 0.7973 0.712 0.000 0.000 0.268 0.020
#> SRR1469926 3 0.2130 0.7065 0.000 0.012 0.908 0.000 0.080
#> SRR1070036 1 0.2540 0.8776 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1098426 1 0.3922 0.8467 0.780 0.000 0.000 0.180 0.040
#> SRR1090310 3 0.3863 0.7713 0.000 0.200 0.772 0.000 0.028
#> SRR1429748 1 0.0794 0.8796 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1363654 1 0.1124 0.8863 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1326317 5 0.6166 0.6384 0.000 0.180 0.272 0.000 0.548
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.5315 0.6088 0.600 0.000 0.000 0.332 0.068
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8791 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.4021 0.7868 0.000 0.168 0.780 0.000 0.052
#> SRR1490761 2 0.0290 0.8379 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.2891 0.6141 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1402944 3 0.3715 0.4386 0.000 0.004 0.736 0.000 0.260
#> SRR1092818 1 0.2712 0.8774 0.880 0.000 0.000 0.088 0.032
#> SRR1093552 1 0.2905 0.8787 0.868 0.000 0.000 0.096 0.036
#> SRR1464880 5 0.5770 0.5916 0.000 0.372 0.096 0.000 0.532
#> SRR1078368 2 0.0404 0.8393 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1349608 2 0.5658 -0.2522 0.000 0.512 0.080 0.000 0.408
#> SRR1466951 5 0.6178 0.5579 0.000 0.376 0.140 0.000 0.484
#> SRR1331879 5 0.5779 0.5072 0.000 0.400 0.092 0.000 0.508
#> SRR1320034 3 0.1579 0.6863 0.000 0.000 0.944 0.024 0.032
#> SRR1068687 5 0.5927 0.5994 0.000 0.120 0.340 0.000 0.540
#> SRR1437491 1 0.0404 0.8789 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1310777 2 0.2127 0.7443 0.000 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.4086 0.8155 0.736 0.000 0.000 0.240 0.024
#> SRR1329994 1 0.4575 0.8047 0.712 0.000 0.000 0.236 0.052
#> SRR1354203 1 0.3109 0.8040 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1077850 1 0.1018 0.8828 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.5901 0.6050 0.000 0.344 0.116 0.000 0.540
#> SRR1455214 1 0.0404 0.8789 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1092014 5 0.6221 0.5982 0.000 0.172 0.300 0.000 0.528
#> SRR1097857 1 0.3177 0.8050 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1473318 1 0.0566 0.8813 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1345974 3 0.2959 0.7979 0.000 0.100 0.864 0.000 0.036
#> SRR1338687 2 0.5458 -0.4155 0.000 0.476 0.060 0.000 0.464
#> SRR1071207 1 0.3354 0.8716 0.844 0.000 0.000 0.088 0.068
#> SRR1486821 3 0.3165 0.7987 0.000 0.116 0.848 0.000 0.036
#> SRR1418540 1 0.2628 0.8772 0.884 0.000 0.000 0.088 0.028
#> SRR1408788 5 0.5822 0.6032 0.000 0.108 0.344 0.000 0.548
#> SRR1359487 4 0.3119 0.8253 0.068 0.000 0.000 0.860 0.072
#> SRR1080648 1 0.4297 0.7823 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1414708 1 0.4066 0.8429 0.768 0.000 0.000 0.188 0.044
#> SRR1469080 2 0.5409 0.2689 0.000 0.612 0.084 0.000 0.304
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.4010 0.8559 0.796 0.000 0.000 0.116 0.088
#> SRR1321829 5 0.6155 0.6521 0.000 0.252 0.192 0.000 0.556
#> SRR1475993 3 0.3752 0.7928 0.000 0.124 0.812 0.000 0.064
#> SRR1445387 1 0.2448 0.8630 0.892 0.000 0.000 0.088 0.020
#> SRR1077575 5 0.5867 0.6849 0.000 0.144 0.268 0.000 0.588
#> SRR1349300 1 0.0609 0.8801 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1374165 1 0.2900 0.8767 0.864 0.000 0.000 0.108 0.028
#> SRR1453769 2 0.5384 0.5201 0.000 0.664 0.196 0.000 0.140
#> SRR1473870 1 0.1197 0.8764 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1401146 5 0.6193 0.6524 0.000 0.272 0.184 0.000 0.544
#> SRR1366124 4 0.3962 0.8007 0.112 0.000 0.000 0.800 0.088
#> SRR1391811 1 0.0510 0.8801 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456674 1 0.4297 0.7823 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1086490 3 0.3231 0.7722 0.000 0.196 0.800 0.000 0.004
#> SRR1088511 2 0.0703 0.8279 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.4374 0.7860 0.700 0.000 0.000 0.272 0.028
#> SRR1384431 1 0.3602 0.8159 0.796 0.000 0.000 0.180 0.024
#> SRR1072055 1 0.2793 0.8770 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1359738 3 0.1831 0.7859 0.000 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1332141 1 0.3636 0.7984 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1085900 5 0.6056 0.6642 0.000 0.152 0.296 0.000 0.552
#> SRR1442173 1 0.0290 0.8792 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1431625 5 0.5059 0.5027 0.000 0.416 0.036 0.000 0.548
#> SRR814515 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.5984 0.7113 0.000 0.208 0.204 0.000 0.588
#> SRR1344034 3 0.3165 0.7982 0.000 0.116 0.848 0.000 0.036
#> SRR1080391 1 0.2921 0.8784 0.856 0.000 0.000 0.124 0.020
#> SRR1347870 2 0.4343 0.6131 0.000 0.768 0.096 0.000 0.136
#> SRR814028 5 0.5824 0.7313 0.000 0.224 0.168 0.000 0.608
#> SRR814219 2 0.0290 0.8415 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070620 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1102128 1 0.0000 0.8791 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.5776 0.6752 0.000 0.124 0.288 0.000 0.588
#> SRR1070060 1 0.2592 0.8836 0.892 0.000 0.000 0.052 0.056
#> SRR1487969 5 0.5993 0.6625 0.000 0.164 0.260 0.000 0.576
#> SRR1417851 1 0.4622 0.7899 0.692 0.000 0.000 0.264 0.044
#> SRR1443350 2 0.0798 0.8350 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1403199 1 0.2448 0.8774 0.892 0.000 0.000 0.088 0.020
#> SRR1076705 1 0.2793 0.8770 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1079380 5 0.5927 0.6879 0.000 0.128 0.280 0.004 0.588
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.6179 0.6456 0.000 0.228 0.216 0.000 0.556
#> SRR1366605 5 0.6047 0.5854 0.000 0.332 0.136 0.000 0.532
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 5 0.5932 0.5575 0.000 0.356 0.116 0.000 0.528
#> SRR1436840 5 0.5831 0.5335 0.000 0.408 0.096 0.000 0.496
#> SRR1445573 2 0.0693 0.8364 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1375394 4 0.3143 0.8082 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1431735 1 0.4297 0.7823 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1417387 1 0.2793 0.8770 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1445984 1 0.2540 0.8776 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1370447 4 0.1942 0.8254 0.068 0.000 0.000 0.920 0.012
#> SRR1446308 3 0.6261 0.3294 0.000 0.200 0.536 0.000 0.264
#> SRR1437346 3 0.0963 0.7258 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1103143 2 0.0290 0.8407 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1086466 1 0.2793 0.8770 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.2628 0.8776 0.884 0.000 0.000 0.088 0.028
#> SRR1468914 1 0.3932 0.7547 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1319584 5 0.4565 0.5310 0.000 0.012 0.408 0.000 0.580
#> SRR1486584 1 0.0290 0.8799 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813536 1 0.4173 0.7660 0.688 0.000 0.000 0.300 0.012
#> SRR1317939 2 0.0579 0.8381 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1079730 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1341921 1 0.1282 0.8872 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1328551 2 0.2236 0.7727 0.000 0.908 0.068 0.000 0.024
#> SRR1453259 2 0.3226 0.7394 0.000 0.852 0.060 0.000 0.088
#> SRR1340828 5 0.4907 0.4479 0.000 0.000 0.280 0.056 0.664
#> SRR1079543 2 0.0162 0.8427 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR816427 2 0.4847 0.4940 0.000 0.692 0.068 0.000 0.240
#> SRR1076681 5 0.6146 0.6371 0.000 0.200 0.240 0.000 0.560
#> SRR1335314 4 0.1251 0.8362 0.036 0.000 0.000 0.956 0.008
#> SRR1400799 3 0.3612 0.7917 0.000 0.172 0.800 0.000 0.028
#> SRR1074578 1 0.1270 0.8757 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1312226 5 0.6072 0.6914 0.000 0.252 0.180 0.000 0.568
#> SRR1416207 1 0.3109 0.8040 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1447371 1 0.4206 0.7844 0.696 0.000 0.000 0.288 0.016
#> SRR1069328 1 0.4047 0.7600 0.676 0.000 0.000 0.320 0.004
#> SRR1445023 4 0.3039 0.6588 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1077599 5 0.6326 0.5961 0.000 0.208 0.268 0.000 0.524
#> SRR1453480 2 0.5638 -0.3126 0.000 0.492 0.076 0.000 0.432
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4229 0.7900 0.704 0.000 0.000 0.276 0.020
#> SRR1074839 5 0.5987 0.6448 0.000 0.140 0.304 0.000 0.556
#> SRR1458727 4 0.3143 0.8082 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1436949 5 0.5940 0.6717 0.000 0.292 0.140 0.000 0.568
#> SRR1070429 3 0.3196 0.7758 0.000 0.192 0.804 0.000 0.004
#> SRR1458158 1 0.0771 0.8810 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1432408 4 0.1478 0.8415 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1310334 1 0.0324 0.8814 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1418201 3 0.1197 0.6890 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1385434 4 0.0865 0.8358 0.004 0.000 0.000 0.972 0.024
#> SRR1415591 3 0.3994 0.7782 0.000 0.188 0.772 0.000 0.040
#> SRR1402009 1 0.0162 0.8801 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1316055 4 0.2179 0.8364 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1308734 3 0.3276 0.8030 0.000 0.132 0.836 0.000 0.032
#> SRR1498973 5 0.5920 0.7016 0.000 0.252 0.160 0.000 0.588
#> SRR1397115 1 0.1124 0.8792 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1392141 1 0.4297 0.7823 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR814341 2 0.4126 0.1282 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1313601 5 0.6255 0.6448 0.000 0.252 0.208 0.000 0.540
#> SRR1459609 2 0.2424 0.7215 0.000 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.2915 0.8016 0.000 0.116 0.860 0.000 0.024
#> SRR809919 1 0.3730 0.7911 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1370818 1 0.4057 0.8547 0.792 0.000 0.000 0.120 0.088
#> SRR1323651 3 0.4098 0.7842 0.000 0.156 0.780 0.000 0.064
#> SRR1357297 1 0.2726 0.8835 0.884 0.000 0.000 0.064 0.052
#> SRR818170 3 0.4010 0.5677 0.000 0.000 0.760 0.032 0.208
#> SRR1091230 5 0.6224 0.6392 0.000 0.232 0.220 0.000 0.548
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1095285 3 0.2124 0.7458 0.000 0.028 0.916 0.000 0.056
#> SRR1317731 3 0.3010 0.6236 0.000 0.004 0.824 0.000 0.172
#> SRR1490785 1 0.0290 0.8803 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432032 1 0.2597 0.8783 0.884 0.000 0.000 0.092 0.024
#> SRR1447808 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR809534 5 0.5589 0.4377 0.000 0.244 0.128 0.000 0.628
#> SRR1397312 5 0.5815 0.6777 0.000 0.136 0.272 0.000 0.592
#> SRR812128 5 0.5861 0.6925 0.000 0.148 0.260 0.000 0.592
#> SRR1101513 1 0.3109 0.8040 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1415708 5 0.6000 0.6183 0.000 0.132 0.328 0.000 0.540
#> SRR1316033 3 0.3165 0.8017 0.000 0.116 0.848 0.000 0.036
#> SRR1390371 5 0.5616 0.6111 0.000 0.364 0.084 0.000 0.552
#> SRR1480263 2 0.3671 0.5929 0.000 0.756 0.008 0.000 0.236
#> SRR1464473 3 0.2230 0.8022 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.2628 0.8774 0.884 0.000 0.000 0.088 0.028
#> SRR1080044 1 0.3527 0.8145 0.804 0.000 0.000 0.172 0.024
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3730 0.7911 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1069871 1 0.0566 0.8812 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1095744 5 0.5882 0.6886 0.000 0.148 0.264 0.000 0.588
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.5440 0.2572 0.000 0.612 0.088 0.000 0.300
#> SRR1075054 2 0.3885 0.5325 0.000 0.724 0.008 0.000 0.268
#> SRR1083480 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1075458 1 0.2793 0.8773 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1417023 4 0.3710 0.6430 0.192 0.000 0.000 0.784 0.024
#> SRR1309333 5 0.6031 0.7233 0.000 0.244 0.180 0.000 0.576
#> SRR1333676 1 0.1121 0.8773 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1352996 1 0.1774 0.8762 0.932 0.000 0.000 0.016 0.052
#> SRR1093172 4 0.3301 0.8264 0.072 0.000 0.000 0.848 0.080
#> SRR1413137 4 0.4294 0.7645 0.152 0.000 0.000 0.768 0.080
#> SRR1469973 5 0.5839 0.6201 0.000 0.116 0.324 0.000 0.560
#> SRR1420026 5 0.5850 0.6424 0.000 0.316 0.120 0.000 0.564
#> SRR817306 1 0.3906 0.8567 0.800 0.000 0.000 0.132 0.068
#> SRR1416266 4 0.2331 0.8400 0.020 0.000 0.000 0.900 0.080
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.3269 0.8745 0.848 0.000 0.000 0.096 0.056
#> SRR1435394 3 0.5847 0.5602 0.000 0.204 0.608 0.000 0.188
#> SRR1383192 1 0.4933 0.7682 0.692 0.000 0.000 0.228 0.080
#> SRR1419962 3 0.2230 0.8022 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.1851 0.8822 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1081639 3 0.6030 0.0754 0.000 0.000 0.544 0.316 0.140
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.1121 0.8193 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1397348 5 0.4885 0.4514 0.000 0.000 0.276 0.056 0.668
#> SRR1312147 1 0.3012 0.8756 0.860 0.000 0.000 0.104 0.036
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.1357 0.8782 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1474930 5 0.5844 0.4719 0.000 0.096 0.420 0.000 0.484
#> SRR1470988 4 0.1942 0.8254 0.068 0.000 0.000 0.920 0.012
#> SRR811915 2 0.1544 0.7999 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1104987 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.6000 0.6462 0.000 0.340 0.128 0.000 0.532
#> SRR1313770 3 0.2305 0.6954 0.000 0.000 0.896 0.012 0.092
#> SRR1315780 5 0.5331 0.4749 0.000 0.020 0.256 0.056 0.668
#> SRR1073631 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR819124 1 0.0703 0.8798 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1310997 5 0.5998 0.6939 0.000 0.188 0.228 0.000 0.584
#> SRR1464494 5 0.5929 0.6955 0.000 0.156 0.260 0.000 0.584
#> SRR1357083 3 0.3496 0.7703 0.000 0.200 0.788 0.000 0.012
#> SRR1475842 2 0.1121 0.8089 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.4527 0.7949 0.700 0.000 0.000 0.260 0.040
#> SRR1378220 3 0.3409 0.7948 0.000 0.112 0.836 0.000 0.052
#> SRR1467704 1 0.2793 0.8770 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1348885 4 0.3210 0.8065 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1325826 1 0.0162 0.8797 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466812 1 0.4588 0.7277 0.720 0.000 0.000 0.220 0.060
#> SRR1345692 5 0.5917 0.6619 0.000 0.304 0.132 0.000 0.564
#> SRR1401040 3 0.2230 0.8022 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.3661 0.7970 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1374396 4 0.0609 0.8373 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1454073 5 0.5107 0.4444 0.000 0.000 0.296 0.064 0.640
#> SRR1355747 1 0.2540 0.8772 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1429368 3 0.2179 0.8015 0.000 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR1398138 5 0.6054 0.6462 0.000 0.148 0.304 0.000 0.548
#> SRR1379260 1 0.2540 0.8776 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1361436 3 0.3944 0.7706 0.000 0.200 0.768 0.000 0.032
#> SRR817142 5 0.6374 0.5836 0.000 0.208 0.280 0.000 0.512
#> SRR1315291 4 0.3210 0.8065 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1309314 4 0.3421 0.8043 0.000 0.000 0.008 0.788 0.204
#> SRR1420085 5 0.6148 0.6121 0.000 0.268 0.180 0.000 0.552
#> SRR1361308 3 0.2930 0.7942 0.000 0.164 0.832 0.000 0.004
#> SRR1472126 1 0.0703 0.8798 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1380482 5 0.5922 0.5598 0.000 0.112 0.368 0.000 0.520
#> SRR1099789 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079480 5 0.5908 0.6952 0.000 0.156 0.256 0.000 0.588
#> SRR1339276 1 0.0404 0.8789 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418368 1 0.3177 0.8050 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1399353 1 0.4297 0.7823 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1096760 3 0.1270 0.7244 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1440290 5 0.6492 0.4582 0.000 0.196 0.348 0.000 0.456
#> SRR1330813 5 0.6286 0.6017 0.000 0.204 0.264 0.000 0.532
#> SRR1458931 2 0.6012 -0.1785 0.000 0.484 0.116 0.000 0.400
#> SRR812294 1 0.4276 0.8356 0.764 0.000 0.000 0.168 0.068
#> SRR1394321 1 0.2570 0.8789 0.888 0.000 0.000 0.084 0.028
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0290 0.8397 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.2260 0.8841 0.908 0.000 0.000 0.064 0.028
#> SRR1477173 2 0.0671 0.8368 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.4736 0.0525 0.000 0.576 0.020 0.000 0.404
#> SRR1390143 1 0.0324 0.8817 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.2970 0.7922 0.000 0.168 0.828 0.000 0.004
#> SRR1312169 1 0.2376 0.8844 0.904 0.000 0.000 0.044 0.052
#> SRR1096687 1 0.4268 0.7971 0.708 0.000 0.000 0.268 0.024
#> SRR1486139 1 0.0807 0.8834 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1470313 1 0.4318 0.7787 0.688 0.000 0.000 0.292 0.020
#> SRR1447893 3 0.3795 0.7748 0.000 0.192 0.780 0.000 0.028
#> SRR1466025 5 0.6073 0.6807 0.000 0.172 0.264 0.000 0.564
#> SRR1477429 1 0.3730 0.7911 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1445701 3 0.3840 0.7817 0.000 0.116 0.808 0.000 0.076
#> SRR820689 1 0.4141 0.8096 0.728 0.000 0.000 0.248 0.024
#> SRR1451876 5 0.5852 0.6628 0.000 0.328 0.116 0.000 0.556
#> SRR1452537 2 0.0162 0.8427 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1383301 1 0.1082 0.8877 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1489328 5 0.6109 0.7286 0.000 0.220 0.212 0.000 0.568
#> SRR1344462 1 0.0290 0.8800 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082709 1 0.0963 0.8788 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1447784 4 0.4613 0.4834 0.360 0.000 0.000 0.620 0.020
#> SRR1355769 1 0.3395 0.8046 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1488237 2 0.5155 0.5450 0.000 0.692 0.140 0.000 0.168
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.3109 0.8040 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1480917 5 0.5732 0.6577 0.000 0.116 0.296 0.000 0.588
#> SRR1474485 1 0.2540 0.8772 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1089998 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318140 1 0.2915 0.8486 0.860 0.000 0.000 0.116 0.024
#> SRR1319262 3 0.4305 0.7634 0.000 0.200 0.748 0.000 0.052
#> SRR1095188 5 0.6016 0.6379 0.000 0.140 0.312 0.000 0.548
#> SRR1454350 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1440374 1 0.3527 0.8145 0.804 0.000 0.000 0.172 0.024
#> SRR1359565 3 0.2629 0.8028 0.000 0.136 0.860 0.000 0.004
#> SRR1105417 1 0.3980 0.7865 0.708 0.000 0.000 0.284 0.008
#> SRR1325578 3 0.6200 0.3404 0.000 0.180 0.540 0.000 0.280
#> SRR1358161 3 0.2864 0.8023 0.000 0.112 0.864 0.000 0.024
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.5557 0.4175 0.000 0.460 0.068 0.000 0.472
#> SRR1452010 1 0.2036 0.8723 0.920 0.000 0.000 0.024 0.056
#> SRR1418183 3 0.6028 -0.2926 0.000 0.116 0.468 0.000 0.416
#> SRR1366345 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1387449 1 0.3409 0.8216 0.816 0.000 0.000 0.160 0.024
#> SRR1473461 1 0.3921 0.8504 0.784 0.000 0.000 0.172 0.044
#> SRR1090837 3 0.3231 0.7722 0.000 0.196 0.800 0.000 0.004
#> SRR1447828 3 0.2179 0.8018 0.000 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3805 0.7834 0.000 0.184 0.784 0.000 0.032
#> SRR1350280 1 0.1197 0.8764 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1088557 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102656 5 0.6090 0.6188 0.000 0.348 0.136 0.000 0.516
#> SRR1441443 2 0.4352 0.4979 0.000 0.720 0.036 0.000 0.244
#> SRR1370682 3 0.2230 0.8022 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.3266 0.7678 0.000 0.200 0.796 0.000 0.004
#> SRR1407291 1 0.1043 0.8779 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1405266 1 0.0000 0.8791 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.4087 0.8210 0.756 0.000 0.000 0.208 0.036
#> SRR1082592 3 0.5059 -0.2363 0.000 0.036 0.548 0.000 0.416
#> SRR1325794 5 0.6043 0.6676 0.000 0.264 0.168 0.000 0.568
#> SRR1095961 3 0.3493 0.7917 0.000 0.108 0.832 0.000 0.060
#> SRR1086702 2 0.0963 0.8263 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1320806 5 0.5952 0.6186 0.000 0.128 0.324 0.000 0.548
#> SRR1457527 3 0.3074 0.7715 0.000 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.2389 0.8019 0.000 0.116 0.880 0.000 0.004
#> SRR1488858 4 0.2193 0.8038 0.092 0.000 0.000 0.900 0.008
#> SRR1454695 1 0.2773 0.8704 0.868 0.000 0.000 0.112 0.020
#> SRR1090241 2 0.1341 0.8155 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1329863 5 0.5986 0.6126 0.000 0.348 0.124 0.000 0.528
#> SRR1357733 1 0.2616 0.8804 0.888 0.000 0.000 0.076 0.036
#> SRR1362135 1 0.2540 0.8776 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1379581 3 0.1211 0.7362 0.000 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR1309182 1 0.1043 0.8779 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1437668 1 0.2628 0.8775 0.884 0.000 0.000 0.088 0.028
#> SRR1084742 5 0.5851 0.6808 0.000 0.140 0.272 0.000 0.588
#> SRR1433538 1 0.2830 0.8813 0.876 0.000 0.000 0.080 0.044
#> SRR1085063 2 0.4537 0.1265 0.000 0.592 0.012 0.000 0.396
#> SRR1454247 5 0.5870 0.6952 0.000 0.140 0.276 0.000 0.584
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.6372 -0.1310 0.000 0.168 0.456 0.000 0.376
#> SRR1072388 1 0.2540 0.8772 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1070332 5 0.5973 0.6688 0.000 0.164 0.256 0.000 0.580
#> SRR1320761 5 0.5902 0.6238 0.000 0.124 0.320 0.000 0.556
#> SRR1076195 4 0.3239 0.8211 0.080 0.000 0.000 0.852 0.068
#> SRR1069895 3 0.4495 0.7577 0.000 0.200 0.736 0.000 0.064
#> SRR1099144 1 0.2793 0.8773 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1385150 3 0.4021 0.7700 0.000 0.200 0.764 0.000 0.036
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3962 0.8576 0.800 0.000 0.000 0.112 0.088
#> SRR1102583 1 0.0671 0.8811 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1456971 1 0.2540 0.8776 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1340574 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1444830 5 0.6195 0.6369 0.000 0.208 0.240 0.000 0.552
#> SRR1096267 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1087127 3 0.2488 0.6814 0.000 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR1408553 4 0.1877 0.8272 0.064 0.000 0.000 0.924 0.012
#> SRR1069231 1 0.2351 0.8829 0.896 0.000 0.000 0.088 0.016
#> SRR1325642 2 0.2597 0.7704 0.000 0.884 0.024 0.000 0.092
#> SRR1362103 1 0.2793 0.8770 0.876 0.000 0.000 0.088 0.036
#> SRR1321942 1 0.2535 0.8816 0.892 0.000 0.000 0.076 0.032
#> SRR1094380 1 0.0798 0.8817 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1447499 5 0.5737 0.4588 0.000 0.452 0.084 0.000 0.464
#> SRR1099330 5 0.6247 0.6314 0.000 0.228 0.228 0.000 0.544
#> SRR1077874 5 0.6036 0.6063 0.000 0.308 0.144 0.000 0.548
#> SRR808299 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.5834 0.6765 0.000 0.136 0.276 0.000 0.588
#> SRR1481238 5 0.6323 0.6393 0.000 0.252 0.220 0.000 0.528
#> SRR1443568 3 0.4872 0.6700 0.000 0.120 0.720 0.000 0.160
#> SRR1380249 1 0.5074 0.7204 0.660 0.000 0.000 0.268 0.072
#> SRR1080143 1 0.1121 0.8772 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1383148 4 0.4555 0.7210 0.200 0.000 0.000 0.732 0.068
#> SRR1357042 1 0.4054 0.8120 0.748 0.000 0.000 0.224 0.028
#> SRR1416025 2 0.5766 -0.1548 0.000 0.516 0.092 0.000 0.392
#> SRR1431015 5 0.5795 0.6992 0.000 0.268 0.136 0.000 0.596
#> SRR1078709 5 0.5957 0.7121 0.000 0.236 0.176 0.000 0.588
#> SRR813283 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.3143 0.8082 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR807679 1 0.2694 0.8807 0.884 0.000 0.000 0.076 0.040
#> SRR1333811 3 0.3459 0.7908 0.000 0.116 0.832 0.000 0.052
#> SRR1078660 5 0.6021 0.7187 0.000 0.188 0.232 0.000 0.580
#> SRR1331730 2 0.0290 0.8415 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333913 1 0.2362 0.8809 0.900 0.000 0.000 0.076 0.024
#> SRR1432542 1 0.2685 0.8774 0.880 0.000 0.000 0.092 0.028
#> SRR1418041 1 0.0000 0.8791 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.4297 0.7823 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4297 0.7823 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1350958 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.5590 0.6348 0.000 0.204 0.640 0.000 0.156
#> SRR1441934 2 0.5538 0.1468 0.000 0.588 0.088 0.000 0.324
#> SRR1472552 3 0.3196 0.7758 0.000 0.192 0.804 0.000 0.004
#> SRR1488881 3 0.3160 0.7788 0.000 0.188 0.808 0.000 0.004
#> SRR1102973 1 0.3636 0.7983 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1071131 5 0.6081 0.4640 0.000 0.124 0.400 0.000 0.476
#> SRR1074502 1 0.0000 0.8791 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.2540 0.8772 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1409171 2 0.4709 0.0641 0.000 0.612 0.024 0.000 0.364
#> SRR809113 5 0.6118 0.6363 0.000 0.164 0.288 0.000 0.548
#> SRR1430045 2 0.4588 0.5025 0.000 0.720 0.060 0.000 0.220
#> SRR1441245 5 0.6392 0.7203 0.000 0.268 0.220 0.000 0.512
#> SRR1384091 1 0.3861 0.7921 0.712 0.000 0.000 0.284 0.004
#> SRR1431887 2 0.0290 0.8415 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096525 4 0.0671 0.8375 0.004 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.6008 0.6583 0.000 0.148 0.292 0.000 0.560
#> SRR1369514 1 0.3307 0.8723 0.844 0.000 0.000 0.104 0.052
#> SRR1453299 3 0.3562 0.7746 0.000 0.196 0.788 0.000 0.016
#> SRR1436300 1 0.1764 0.8730 0.928 0.000 0.000 0.064 0.008
#> SRR1348490 5 0.5834 0.6756 0.000 0.136 0.276 0.000 0.588
#> SRR1091767 5 0.6008 0.6751 0.000 0.292 0.148 0.000 0.560
#> SRR1354467 3 0.2389 0.8019 0.000 0.116 0.880 0.000 0.004
#> SRR1069074 5 0.6133 0.6734 0.000 0.292 0.164 0.000 0.544
#> SRR1452399 5 0.5839 0.6174 0.000 0.116 0.324 0.000 0.560
#> SRR1437430 3 0.2179 0.6878 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1419736 5 0.5732 0.6729 0.000 0.116 0.296 0.000 0.588
#> SRR1313343 3 0.1197 0.7241 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1077619 1 0.2712 0.8778 0.880 0.000 0.000 0.088 0.032
#> SRR1083530 1 0.2654 0.8800 0.884 0.000 0.000 0.084 0.032
#> SRR1333633 3 0.3950 0.7892 0.000 0.136 0.796 0.000 0.068
#> SRR1354999 3 0.5718 -0.3340 0.000 0.084 0.496 0.000 0.420
#> SRR1443592 2 0.0404 0.8403 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077356 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378818 3 0.4162 0.6107 0.000 0.000 0.768 0.056 0.176
#> SRR1413182 4 0.2859 0.8280 0.056 0.000 0.000 0.876 0.068
#> SRR1464559 1 0.4665 0.7907 0.692 0.000 0.000 0.260 0.048
#> SRR1413075 5 0.5949 0.7177 0.000 0.240 0.172 0.000 0.588
#> SRR1487928 4 0.2470 0.8425 0.012 0.000 0.000 0.884 0.104
#> SRR1388997 5 0.6262 0.6975 0.000 0.304 0.176 0.000 0.520
#> SRR1092865 5 0.5804 0.6385 0.000 0.352 0.104 0.000 0.544
#> SRR1102729 1 0.3424 0.8054 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1456423 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321591 2 0.4617 -0.0577 0.000 0.552 0.012 0.000 0.436
#> SRR1376874 3 0.0000 0.7187 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.3106 0.8634 0.844 0.000 0.000 0.132 0.024
#> SRR1346710 1 0.2628 0.8774 0.884 0.000 0.000 0.088 0.028
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.6203 0.6381 0.000 0.224 0.224 0.000 0.552
#> SRR1480941 4 0.3210 0.8065 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1479175 2 0.1908 0.7753 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1313891 2 0.4760 -0.0198 0.000 0.564 0.020 0.000 0.416
#> SRR1491354 1 0.0404 0.8809 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1433884 5 0.5864 0.6239 0.000 0.120 0.320 0.000 0.560
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 5 0.6037 0.5337 0.000 0.392 0.120 0.000 0.488
#> SRR1355554 3 0.4203 0.7621 0.000 0.128 0.780 0.000 0.092
#> SRR1487173 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1474253 1 0.0162 0.8793 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1322918 5 0.5461 0.6125 0.000 0.116 0.080 0.076 0.728
#> SRR1318331 2 0.4901 0.4599 0.000 0.700 0.084 0.000 0.216
#> SRR1321333 3 0.3231 0.7722 0.000 0.196 0.800 0.000 0.004
#> SRR1474231 1 0.4597 0.7934 0.696 0.000 0.000 0.260 0.044
#> SRR1350545 1 0.2408 0.8832 0.892 0.000 0.000 0.092 0.016
#> SRR1091328 1 0.2270 0.8808 0.904 0.000 0.000 0.076 0.020
#> SRR814447 3 0.2694 0.6393 0.000 0.000 0.884 0.040 0.076
#> SRR1455989 5 0.6466 0.4953 0.000 0.204 0.316 0.000 0.480
#> SRR1453680 3 0.0000 0.7187 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.4557 -0.0155 0.000 0.584 0.012 0.000 0.404
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 5 0.4975 0.5537 0.000 0.076 0.220 0.004 0.700
#> SRR1097197 1 0.1195 0.8823 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1366729 3 0.2020 0.7983 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.5043 0.4091 0.000 0.000 0.704 0.136 0.160
#> SRR1074602 5 0.6222 0.6264 0.000 0.216 0.236 0.000 0.548
#> SRR814633 2 0.0000 0.8438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 4 0.3977 0.7912 0.000 0.000 0.032 0.764 0.204
#> SRR1319100 1 0.0404 0.8789 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1324004 3 0.4002 0.7730 0.000 0.120 0.796 0.000 0.084
#> SRR1457459 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1421031 1 0.4029 0.7645 0.680 0.000 0.000 0.316 0.004
#> SRR1444598 4 0.4909 0.7374 0.000 0.000 0.120 0.716 0.164
#> SRR1091743 5 0.6187 0.6489 0.000 0.248 0.200 0.000 0.552
#> SRR819637 1 0.3655 0.8588 0.804 0.000 0.000 0.160 0.036
#> SRR1083848 1 0.0510 0.8786 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1088934 3 0.4400 0.7618 0.000 0.196 0.744 0.000 0.060
#> SRR1459785 3 0.2513 0.8024 0.000 0.116 0.876 0.000 0.008
#> SRR1083700 1 0.3586 0.8010 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1375531 1 0.3602 0.8153 0.796 0.000 0.000 0.180 0.024
#> SRR1323470 4 0.3143 0.8082 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR814657 1 0.1444 0.8824 0.948 0.000 0.000 0.012 0.040
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.2452 0.77641 0.000 0.892 0.008 0.000 0.044 0.056
#> SRR1467726 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.4527 0.55130 0.000 0.660 0.000 0.000 0.068 0.272
#> SRR1402132 4 0.0260 0.65695 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1326059 1 0.0405 0.70859 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1409062 5 0.4468 0.49874 0.000 0.212 0.092 0.000 0.696 0.000
#> SRR809406 1 0.0692 0.71245 0.976 0.000 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1465313 3 0.5193 0.58004 0.000 0.084 0.576 0.000 0.332 0.008
#> SRR819559 1 0.3320 0.69006 0.772 0.000 0.016 0.000 0.000 0.212
#> SRR1387899 3 0.5519 0.43852 0.000 0.144 0.512 0.000 0.344 0.000
#> SRR1442292 2 0.0291 0.80922 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1488151 1 0.1918 0.72283 0.904 0.000 0.008 0.000 0.000 0.088
#> SRR1395635 1 0.4684 0.65817 0.656 0.000 0.088 0.000 0.000 0.256
#> SRR1343629 1 0.1908 0.69494 0.900 0.000 0.096 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326868 5 0.4772 0.47488 0.000 0.208 0.124 0.000 0.668 0.000
#> SRR1102320 1 0.4774 0.56667 0.600 0.000 0.000 0.068 0.000 0.332
#> SRR1469926 3 0.4377 0.68689 0.000 0.000 0.688 0.068 0.244 0.000
#> SRR1070036 1 0.3489 0.64843 0.708 0.000 0.004 0.000 0.000 0.288
#> SRR1098426 1 0.3954 0.59285 0.620 0.000 0.004 0.004 0.000 0.372
#> SRR1090310 3 0.3543 0.73483 0.000 0.200 0.768 0.000 0.032 0.000
#> SRR1429748 1 0.1151 0.71050 0.956 0.000 0.012 0.000 0.000 0.032
#> SRR1363654 1 0.2586 0.72260 0.868 0.000 0.032 0.000 0.000 0.100
#> SRR1326317 5 0.4493 0.48456 0.000 0.160 0.132 0.000 0.708 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 6 0.6419 0.22674 0.340 0.000 0.040 0.164 0.000 0.456
#> SRR1329947 1 0.0622 0.70828 0.980 0.000 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469769 3 0.4526 0.72837 0.000 0.164 0.704 0.000 0.132 0.000
#> SRR1490761 2 0.0692 0.80434 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1380122 3 0.4306 0.46799 0.000 0.004 0.520 0.000 0.464 0.012
#> SRR1402944 5 0.4491 -0.32524 0.000 0.012 0.460 0.000 0.516 0.012
#> SRR1092818 1 0.5207 0.61617 0.592 0.000 0.132 0.000 0.000 0.276
#> SRR1093552 1 0.3859 0.63345 0.692 0.000 0.020 0.000 0.000 0.288
#> SRR1464880 2 0.5650 0.25929 0.000 0.500 0.000 0.000 0.168 0.332
#> SRR1078368 2 0.1204 0.78534 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1349608 2 0.5270 0.20441 0.000 0.560 0.088 0.000 0.344 0.008
#> SRR1466951 5 0.6549 0.39342 0.000 0.276 0.040 0.000 0.464 0.220
#> SRR1331879 2 0.5779 0.21394 0.000 0.472 0.000 0.000 0.188 0.340
#> SRR1320034 3 0.4413 0.66528 0.000 0.004 0.724 0.076 0.192 0.004
#> SRR1068687 5 0.4120 0.45486 0.000 0.096 0.160 0.000 0.744 0.000
#> SRR1437491 1 0.1219 0.70655 0.948 0.000 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310777 2 0.2219 0.70119 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1374005 2 0.0146 0.80878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319182 1 0.4330 0.59956 0.632 0.000 0.000 0.036 0.000 0.332
#> SRR1329994 1 0.4419 0.55918 0.584 0.000 0.000 0.032 0.000 0.384
#> SRR1354203 1 0.3616 0.63983 0.792 0.000 0.000 0.076 0.000 0.132
#> SRR1077850 1 0.2121 0.70284 0.892 0.000 0.096 0.000 0.000 0.012
#> SRR1369241 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.5956 0.42212 0.000 0.224 0.000 0.000 0.420 0.356
#> SRR1455214 1 0.1151 0.70641 0.956 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1092014 5 0.5091 0.40310 0.000 0.172 0.196 0.000 0.632 0.000
#> SRR1097857 1 0.3946 0.64247 0.756 0.000 0.000 0.076 0.000 0.168
#> SRR1473318 1 0.2263 0.70282 0.884 0.000 0.100 0.000 0.000 0.016
#> SRR1345974 3 0.4032 0.76080 0.000 0.068 0.740 0.000 0.192 0.000
#> SRR1338687 5 0.4863 0.24026 0.000 0.412 0.060 0.000 0.528 0.000
#> SRR1071207 1 0.3972 0.63136 0.680 0.000 0.004 0.016 0.000 0.300
#> SRR1486821 3 0.4187 0.76051 0.000 0.096 0.736 0.000 0.168 0.000
#> SRR1418540 1 0.3916 0.63166 0.680 0.000 0.020 0.000 0.000 0.300
#> SRR1408788 5 0.4070 0.47326 0.000 0.092 0.144 0.000 0.760 0.004
#> SRR1359487 4 0.5552 0.50673 0.052 0.000 0.040 0.500 0.000 0.408
#> SRR1080648 1 0.5022 0.50144 0.528 0.000 0.000 0.076 0.000 0.396
#> SRR1414708 1 0.4900 0.60409 0.624 0.000 0.032 0.032 0.000 0.312
#> SRR1469080 2 0.5509 0.37178 0.000 0.544 0.000 0.000 0.164 0.292
#> SRR1365722 2 0.0603 0.80954 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1448118 2 0.0508 0.80937 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1444808 1 0.4875 0.27211 0.492 0.000 0.040 0.008 0.000 0.460
#> SRR1321829 5 0.4668 0.48208 0.000 0.204 0.116 0.000 0.680 0.000
#> SRR1475993 3 0.4904 0.68902 0.000 0.120 0.644 0.000 0.236 0.000
#> SRR1445387 1 0.1398 0.70711 0.940 0.000 0.008 0.000 0.000 0.052
#> SRR1077575 5 0.5086 0.48028 0.000 0.088 0.000 0.000 0.548 0.364
#> SRR1349300 1 0.0405 0.70886 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374165 1 0.4186 0.62534 0.656 0.000 0.032 0.000 0.000 0.312
#> SRR1453769 2 0.5195 0.39475 0.000 0.536 0.008 0.004 0.392 0.060
#> SRR1473870 1 0.1367 0.70339 0.944 0.000 0.012 0.000 0.000 0.044
#> SRR1401146 5 0.4772 0.47744 0.000 0.208 0.124 0.000 0.668 0.000
#> SRR1366124 6 0.5624 -0.47605 0.056 0.000 0.040 0.440 0.000 0.464
#> SRR1391811 1 0.2431 0.68454 0.860 0.000 0.132 0.000 0.000 0.008
#> SRR1456674 1 0.5040 0.48259 0.516 0.000 0.000 0.076 0.000 0.408
#> SRR1086490 3 0.3250 0.73897 0.000 0.196 0.788 0.000 0.012 0.004
#> SRR1088511 2 0.0790 0.79935 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1404577 1 0.5261 0.15370 0.460 0.000 0.000 0.096 0.000 0.444
#> SRR1384431 1 0.3370 0.64625 0.812 0.000 0.000 0.064 0.000 0.124
#> SRR1072055 1 0.4863 0.63008 0.624 0.000 0.092 0.000 0.000 0.284
#> SRR1359738 3 0.3647 0.75534 0.000 0.052 0.788 0.000 0.156 0.004
#> SRR1332141 1 0.4544 0.62426 0.668 0.000 0.000 0.076 0.000 0.256
#> SRR1085900 5 0.3815 0.48339 0.000 0.092 0.132 0.000 0.776 0.000
#> SRR1442173 1 0.1863 0.69620 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 5 0.6907 0.39911 0.000 0.320 0.060 0.000 0.392 0.228
#> SRR814515 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.5442 0.48349 0.000 0.128 0.000 0.000 0.508 0.364
#> SRR1344034 3 0.4014 0.76780 0.000 0.096 0.756 0.000 0.148 0.000
#> SRR1080391 1 0.4761 0.44383 0.600 0.000 0.024 0.024 0.000 0.352
#> SRR1347870 2 0.3934 0.59985 0.000 0.728 0.012 0.000 0.240 0.020
#> SRR814028 5 0.5093 0.56936 0.000 0.148 0.016 0.000 0.672 0.164
#> SRR814219 2 0.0725 0.80911 0.000 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1070620 1 0.2631 0.67340 0.840 0.000 0.152 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102128 1 0.0508 0.70971 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1460211 2 0.0146 0.80878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418346 5 0.5002 0.47686 0.000 0.080 0.000 0.000 0.556 0.364
#> SRR1070060 1 0.3253 0.69860 0.788 0.000 0.020 0.000 0.000 0.192
#> SRR1487969 5 0.5086 0.47187 0.000 0.088 0.000 0.000 0.548 0.364
#> SRR1417851 1 0.4905 0.49139 0.528 0.000 0.000 0.064 0.000 0.408
#> SRR1443350 2 0.3141 0.73683 0.000 0.836 0.004 0.000 0.048 0.112
#> SRR1403199 1 0.3489 0.64352 0.708 0.000 0.004 0.000 0.000 0.288
#> SRR1076705 1 0.4272 0.64460 0.668 0.000 0.044 0.000 0.000 0.288
#> SRR1079380 5 0.5332 0.49568 0.000 0.088 0.004 0.004 0.548 0.356
#> SRR1102923 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.6164 0.52811 0.000 0.208 0.104 0.000 0.588 0.100
#> SRR1366605 6 0.6105 -0.54935 0.000 0.288 0.000 0.000 0.352 0.360
#> SRR1396035 2 0.0291 0.80983 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1390223 5 0.5922 0.41102 0.000 0.216 0.000 0.000 0.432 0.352
#> SRR1436840 5 0.5791 0.36311 0.000 0.336 0.012 0.000 0.512 0.140
#> SRR1445573 2 0.1745 0.79491 0.000 0.924 0.000 0.000 0.056 0.020
#> SRR1375394 4 0.0000 0.65621 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.5040 0.48259 0.516 0.000 0.000 0.076 0.000 0.408
#> SRR1417387 1 0.5396 0.59393 0.564 0.000 0.152 0.000 0.000 0.284
#> SRR1445984 1 0.4117 0.64093 0.672 0.000 0.032 0.000 0.000 0.296
#> SRR1370447 4 0.4080 0.51722 0.008 0.000 0.000 0.536 0.000 0.456
#> SRR1446308 3 0.5684 0.32806 0.000 0.200 0.520 0.000 0.280 0.000
#> SRR1437346 3 0.3198 0.71745 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1103143 2 0.0632 0.80582 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1086466 1 0.5364 0.60300 0.572 0.000 0.152 0.000 0.000 0.276
#> SRR1073191 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.4284 0.66762 0.688 0.000 0.056 0.000 0.000 0.256
#> SRR1468914 6 0.5555 -0.02281 0.380 0.000 0.000 0.140 0.000 0.480
#> SRR1319584 5 0.5175 0.42741 0.000 0.016 0.136 0.016 0.696 0.136
#> SRR1486584 1 0.1152 0.71954 0.952 0.000 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR813536 6 0.5653 0.02008 0.376 0.000 0.000 0.156 0.000 0.468
#> SRR1317939 2 0.0914 0.80823 0.000 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1079730 1 0.0909 0.70763 0.968 0.000 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR1341921 1 0.2520 0.68368 0.844 0.000 0.004 0.000 0.000 0.152
#> SRR1399178 2 0.0291 0.80922 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1415615 1 0.1588 0.70266 0.924 0.000 0.072 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328551 2 0.2597 0.70404 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1453259 2 0.4356 0.63269 0.000 0.724 0.000 0.000 0.136 0.140
#> SRR1340828 5 0.6605 0.36749 0.000 0.000 0.116 0.168 0.544 0.172
#> SRR1079543 2 0.1391 0.80164 0.000 0.944 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR816427 2 0.5255 0.44792 0.000 0.588 0.000 0.000 0.140 0.272
#> SRR1076681 5 0.4904 0.45334 0.000 0.196 0.148 0.000 0.656 0.000
#> SRR1335314 4 0.3854 0.51512 0.000 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1400799 3 0.3894 0.75586 0.000 0.168 0.760 0.000 0.072 0.000
#> SRR1074578 1 0.1625 0.70273 0.928 0.000 0.012 0.000 0.000 0.060
#> SRR1312226 5 0.5530 0.48069 0.000 0.140 0.000 0.000 0.496 0.364
#> SRR1416207 1 0.3616 0.63937 0.792 0.000 0.000 0.076 0.000 0.132
#> SRR1447371 1 0.5034 0.48916 0.520 0.000 0.000 0.076 0.000 0.404
#> SRR1069328 1 0.5528 0.42672 0.508 0.000 0.000 0.144 0.000 0.348
#> SRR1445023 6 0.5151 -0.26586 0.084 0.000 0.000 0.444 0.000 0.472
#> SRR1077599 5 0.5253 0.39955 0.000 0.200 0.192 0.000 0.608 0.000
#> SRR1453480 2 0.5795 0.29208 0.000 0.548 0.012 0.000 0.268 0.172
#> SRR1101834 2 0.0146 0.80878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321744 1 0.5299 0.52029 0.540 0.000 0.012 0.076 0.000 0.372
#> SRR1074839 5 0.4053 0.48593 0.000 0.104 0.128 0.000 0.764 0.004
#> SRR1458727 4 0.0000 0.65621 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436949 5 0.5753 0.46999 0.000 0.176 0.000 0.000 0.460 0.364
#> SRR1070429 3 0.3250 0.73897 0.000 0.196 0.788 0.000 0.012 0.004
#> SRR1458158 1 0.0622 0.70883 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432408 4 0.3852 0.58786 0.000 0.000 0.004 0.612 0.000 0.384
#> SRR1310334 1 0.0935 0.71808 0.964 0.000 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1418201 3 0.3916 0.68421 0.000 0.000 0.752 0.048 0.196 0.004
#> SRR1385434 4 0.3867 0.50042 0.000 0.000 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1415591 3 0.3916 0.74198 0.000 0.184 0.752 0.000 0.064 0.000
#> SRR1402009 1 0.0993 0.70885 0.964 0.000 0.024 0.000 0.000 0.012
#> SRR1316055 4 0.4654 0.57914 0.016 0.000 0.028 0.612 0.000 0.344
#> SRR1308734 3 0.4043 0.77177 0.000 0.128 0.756 0.000 0.116 0.000
#> SRR1498973 5 0.5611 0.47974 0.000 0.152 0.000 0.000 0.484 0.364
#> SRR1397115 1 0.1951 0.71792 0.908 0.000 0.016 0.000 0.000 0.076
#> SRR1392141 1 0.5040 0.48259 0.516 0.000 0.000 0.076 0.000 0.408
#> SRR814341 2 0.4594 0.36248 0.000 0.608 0.000 0.000 0.340 0.052
#> SRR1313601 5 0.4668 0.48241 0.000 0.204 0.116 0.000 0.680 0.000
#> SRR1459609 2 0.2877 0.68194 0.000 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR1499325 3 0.3854 0.77295 0.000 0.092 0.772 0.000 0.136 0.000
#> SRR809919 1 0.4938 0.53272 0.568 0.000 0.000 0.076 0.000 0.356
#> SRR1370818 1 0.4435 0.58260 0.604 0.000 0.028 0.004 0.000 0.364
#> SRR1323651 3 0.5582 0.34294 0.000 0.144 0.476 0.000 0.380 0.000
#> SRR1357297 1 0.3614 0.68268 0.752 0.000 0.028 0.000 0.000 0.220
#> SRR818170 3 0.5659 0.49518 0.000 0.000 0.496 0.072 0.400 0.032
#> SRR1091230 5 0.4783 0.47136 0.000 0.204 0.128 0.000 0.668 0.000
#> SRR1470556 2 0.0363 0.80875 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR812318 1 0.2631 0.67340 0.840 0.000 0.152 0.000 0.000 0.008
#> SRR1095285 3 0.3770 0.73215 0.000 0.028 0.728 0.000 0.244 0.000
#> SRR1317731 3 0.4169 0.49872 0.000 0.000 0.532 0.000 0.456 0.012
#> SRR1490785 1 0.1151 0.70641 0.956 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1432032 1 0.3489 0.64819 0.708 0.000 0.004 0.000 0.000 0.288
#> SRR1447808 1 0.0622 0.70847 0.980 0.000 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR809534 5 0.6232 0.32834 0.000 0.224 0.020 0.088 0.600 0.068
#> SRR1397312 5 0.5060 0.50820 0.000 0.056 0.016 0.000 0.588 0.340
#> SRR812128 5 0.4993 0.49448 0.000 0.080 0.000 0.000 0.560 0.360
#> SRR1101513 1 0.3534 0.63776 0.800 0.000 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1415708 5 0.4050 0.46405 0.000 0.096 0.152 0.000 0.752 0.000
#> SRR1316033 3 0.4259 0.76988 0.000 0.096 0.740 0.004 0.160 0.000
#> SRR1390371 6 0.6217 -0.59466 0.000 0.280 0.004 0.000 0.356 0.360
#> SRR1480263 2 0.4527 0.55005 0.000 0.660 0.000 0.000 0.068 0.272
#> SRR1464473 3 0.3751 0.77419 0.000 0.096 0.792 0.000 0.108 0.004
#> SRR1076801 1 0.4552 0.63331 0.648 0.000 0.064 0.000 0.000 0.288
#> SRR1080044 1 0.3328 0.64515 0.816 0.000 0.000 0.064 0.000 0.120
#> SRR1420850 2 0.0146 0.80680 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474295 1 0.4938 0.53272 0.568 0.000 0.000 0.076 0.000 0.356
#> SRR1069871 1 0.0508 0.70953 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095744 5 0.5086 0.48028 0.000 0.088 0.000 0.000 0.548 0.364
#> SRR1068929 2 0.0405 0.80940 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1490097 2 0.5546 0.37978 0.000 0.552 0.000 0.000 0.192 0.256
#> SRR1075054 2 0.4414 0.57092 0.000 0.676 0.000 0.000 0.064 0.260
#> SRR1083480 1 0.2631 0.67340 0.840 0.000 0.152 0.000 0.000 0.008
#> SRR1075458 1 0.4253 0.64867 0.672 0.000 0.044 0.000 0.000 0.284
#> SRR1417023 6 0.5308 -0.23488 0.088 0.000 0.004 0.424 0.000 0.484
#> SRR1309333 5 0.4970 0.56943 0.000 0.104 0.016 0.000 0.676 0.204
#> SRR1333676 1 0.0972 0.70645 0.964 0.000 0.008 0.000 0.000 0.028
#> SRR1352996 1 0.1908 0.70217 0.916 0.000 0.028 0.000 0.000 0.056
#> SRR1093172 4 0.5295 0.53146 0.032 0.000 0.040 0.500 0.000 0.428
#> SRR1413137 6 0.5943 -0.39975 0.100 0.000 0.032 0.432 0.000 0.436
#> SRR1469973 5 0.5793 0.51258 0.000 0.096 0.140 0.000 0.644 0.120
#> SRR1420026 5 0.6023 0.37643 0.000 0.244 0.000 0.000 0.392 0.364
#> SRR817306 1 0.4045 0.63471 0.664 0.000 0.024 0.000 0.000 0.312
#> SRR1416266 4 0.5391 0.53194 0.040 0.000 0.040 0.512 0.000 0.408
#> SRR1071011 2 0.0291 0.80922 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1090290 1 0.4441 0.62786 0.668 0.000 0.024 0.020 0.000 0.288
#> SRR1435394 5 0.5823 0.11483 0.000 0.200 0.332 0.000 0.468 0.000
#> SRR1383192 1 0.5727 0.27628 0.520 0.000 0.032 0.084 0.000 0.364
#> SRR1419962 3 0.3706 0.77424 0.000 0.096 0.796 0.000 0.104 0.004
#> SRR1094357 1 0.3109 0.68378 0.772 0.000 0.004 0.000 0.000 0.224
#> SRR1081639 3 0.6253 0.33394 0.000 0.000 0.400 0.336 0.256 0.008
#> SRR1356016 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.2328 0.77616 0.000 0.892 0.000 0.000 0.052 0.056
#> SRR1397348 5 0.6605 0.36749 0.000 0.000 0.116 0.168 0.544 0.172
#> SRR1312147 1 0.4220 0.61987 0.664 0.000 0.028 0.004 0.000 0.304
#> SRR1473891 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.1471 0.70660 0.932 0.000 0.004 0.000 0.000 0.064
#> SRR1474930 5 0.4114 0.38573 0.000 0.072 0.196 0.000 0.732 0.000
#> SRR1470988 4 0.4172 0.49923 0.012 0.000 0.000 0.528 0.000 0.460
#> SRR811915 2 0.2006 0.76468 0.000 0.892 0.000 0.000 0.104 0.004
#> SRR1104987 1 0.2489 0.68420 0.860 0.000 0.128 0.000 0.000 0.012
#> SRR1100005 2 0.0508 0.80774 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1444436 5 0.5559 0.56531 0.000 0.148 0.056 0.000 0.656 0.140
#> SRR1313770 3 0.4926 0.60006 0.000 0.000 0.580 0.048 0.360 0.012
#> SRR1315780 5 0.5901 0.43129 0.000 0.004 0.044 0.168 0.616 0.168
#> SRR1073631 1 0.0692 0.71238 0.976 0.000 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR819124 1 0.0632 0.70810 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1310997 5 0.5277 0.48361 0.000 0.108 0.000 0.000 0.528 0.364
#> SRR1464494 5 0.5166 0.48583 0.000 0.096 0.000 0.000 0.540 0.364
#> SRR1357083 3 0.3141 0.73585 0.000 0.200 0.788 0.000 0.012 0.000
#> SRR1475842 2 0.1349 0.78358 0.000 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1378085 1 0.4728 0.52713 0.556 0.000 0.000 0.052 0.000 0.392
#> SRR1378220 3 0.4549 0.72158 0.000 0.088 0.680 0.000 0.232 0.000
#> SRR1467704 1 0.5100 0.61801 0.600 0.000 0.116 0.000 0.000 0.284
#> SRR1348885 4 0.0146 0.65642 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1325826 1 0.0405 0.70847 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466812 1 0.5540 0.11620 0.496 0.000 0.012 0.096 0.000 0.396
#> SRR1345692 5 0.5833 0.45817 0.000 0.192 0.000 0.000 0.444 0.364
#> SRR1401040 3 0.3706 0.77424 0.000 0.096 0.796 0.000 0.104 0.004
#> SRR1097954 1 0.4828 0.57420 0.604 0.000 0.000 0.076 0.000 0.320
#> SRR1374396 4 0.3872 0.59304 0.000 0.000 0.004 0.604 0.000 0.392
#> SRR1454073 5 0.6627 0.33010 0.000 0.000 0.144 0.176 0.544 0.136
#> SRR1355747 1 0.4229 0.63933 0.668 0.000 0.040 0.000 0.000 0.292
#> SRR1429368 3 0.3748 0.77439 0.000 0.092 0.792 0.000 0.112 0.004
#> SRR1398138 5 0.3985 0.47603 0.000 0.100 0.140 0.000 0.760 0.000
#> SRR1379260 1 0.4098 0.64402 0.676 0.000 0.032 0.000 0.000 0.292
#> SRR1361436 3 0.3679 0.73295 0.000 0.200 0.760 0.000 0.040 0.000
#> SRR817142 5 0.5253 0.41868 0.000 0.200 0.192 0.000 0.608 0.000
#> SRR1315291 4 0.0820 0.65436 0.000 0.000 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR1309314 4 0.0000 0.65621 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420085 5 0.5814 0.41200 0.000 0.188 0.000 0.000 0.448 0.364
#> SRR1361308 3 0.3743 0.77165 0.000 0.136 0.788 0.000 0.072 0.004
#> SRR1472126 1 0.0622 0.70836 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380482 5 0.5907 0.03207 0.000 0.080 0.360 0.000 0.512 0.048
#> SRR1099789 1 0.2446 0.68570 0.864 0.000 0.124 0.000 0.000 0.012
#> SRR1079480 5 0.5086 0.48041 0.000 0.088 0.000 0.000 0.548 0.364
#> SRR1339276 1 0.1225 0.70835 0.952 0.000 0.036 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418368 1 0.4331 0.63377 0.704 0.000 0.000 0.076 0.000 0.220
#> SRR1399353 1 0.5040 0.48259 0.516 0.000 0.000 0.076 0.000 0.408
#> SRR1096760 3 0.3565 0.70515 0.000 0.004 0.692 0.000 0.304 0.000
#> SRR1440290 5 0.5625 0.27375 0.000 0.192 0.276 0.000 0.532 0.000
#> SRR1330813 5 0.5058 0.44258 0.000 0.200 0.164 0.000 0.636 0.000
#> SRR1458931 2 0.6114 -0.06705 0.000 0.368 0.000 0.000 0.304 0.328
#> SRR812294 6 0.5670 -0.13322 0.440 0.000 0.040 0.060 0.000 0.460
#> SRR1394321 1 0.4020 0.65766 0.692 0.000 0.032 0.000 0.000 0.276
#> SRR1081160 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.1152 0.80563 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1349342 1 0.4162 0.68411 0.744 0.000 0.136 0.000 0.000 0.120
#> SRR1477173 2 0.1867 0.78925 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1086752 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.4900 0.44239 0.000 0.592 0.000 0.000 0.080 0.328
#> SRR1390143 1 0.0993 0.70891 0.964 0.000 0.024 0.000 0.000 0.012
#> SRR1390413 2 0.0405 0.80940 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1099570 3 0.3562 0.75810 0.000 0.168 0.788 0.000 0.040 0.004
#> SRR1312169 1 0.3695 0.67626 0.732 0.000 0.024 0.000 0.000 0.244
#> SRR1096687 1 0.4928 0.52938 0.572 0.000 0.000 0.076 0.000 0.352
#> SRR1486139 1 0.2692 0.68400 0.840 0.000 0.148 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470313 6 0.5095 -0.25167 0.420 0.000 0.000 0.080 0.000 0.500
#> SRR1447893 3 0.3333 0.74300 0.000 0.192 0.784 0.000 0.024 0.000
#> SRR1466025 5 0.5312 0.47705 0.000 0.112 0.000 0.000 0.524 0.364
#> SRR1477429 1 0.5029 0.44456 0.524 0.000 0.000 0.076 0.000 0.400
#> SRR1445701 3 0.4831 0.66990 0.000 0.096 0.636 0.000 0.268 0.000
#> SRR820689 1 0.4683 0.60386 0.628 0.000 0.004 0.056 0.000 0.312
#> SRR1451876 5 0.5817 0.54251 0.000 0.228 0.024 0.000 0.580 0.168
#> SRR1452537 2 0.0993 0.80623 0.000 0.964 0.000 0.000 0.024 0.012
#> SRR1383301 1 0.1168 0.71709 0.956 0.000 0.016 0.000 0.000 0.028
#> SRR1489328 5 0.5364 0.56947 0.000 0.120 0.044 0.000 0.668 0.168
#> SRR1344462 1 0.0260 0.70875 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0891 0.70712 0.968 0.000 0.008 0.000 0.000 0.024
#> SRR1447784 6 0.6618 -0.10680 0.216 0.000 0.036 0.360 0.000 0.388
#> SRR1355769 1 0.4783 0.58102 0.616 0.000 0.000 0.076 0.000 0.308
#> SRR1488237 2 0.5691 0.34866 0.000 0.520 0.000 0.000 0.204 0.276
#> SRR1391985 2 0.0146 0.80843 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478501 1 0.3534 0.63776 0.800 0.000 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1480917 5 0.6197 0.48491 0.000 0.080 0.160 0.000 0.588 0.172
#> SRR1474485 1 0.4047 0.63644 0.676 0.000 0.028 0.000 0.000 0.296
#> SRR1089998 1 0.1151 0.70641 0.956 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318140 1 0.2174 0.70711 0.896 0.000 0.008 0.008 0.000 0.088
#> SRR1319262 3 0.4195 0.71201 0.000 0.200 0.724 0.000 0.076 0.000
#> SRR1095188 5 0.4426 0.50121 0.000 0.100 0.124 0.000 0.752 0.024
#> SRR1454350 1 0.2631 0.67340 0.840 0.000 0.152 0.000 0.000 0.008
#> SRR1440374 1 0.3285 0.64818 0.820 0.000 0.000 0.064 0.000 0.116
#> SRR1359565 3 0.3795 0.77553 0.000 0.112 0.788 0.000 0.096 0.004
#> SRR1105417 6 0.5071 -0.22949 0.444 0.000 0.000 0.076 0.000 0.480
#> SRR1325578 5 0.5578 0.22692 0.000 0.184 0.276 0.000 0.540 0.000
#> SRR1358161 3 0.3883 0.77236 0.000 0.088 0.768 0.000 0.144 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.5973 0.05111 0.000 0.472 0.004 0.000 0.308 0.216
#> SRR1452010 1 0.2480 0.69775 0.872 0.000 0.024 0.000 0.000 0.104
#> SRR1418183 5 0.4599 0.37259 0.000 0.104 0.212 0.000 0.684 0.000
#> SRR1366345 1 0.2473 0.68158 0.856 0.000 0.136 0.000 0.000 0.008
#> SRR1387449 1 0.3096 0.66397 0.840 0.000 0.004 0.048 0.000 0.108
#> SRR1473461 1 0.3874 0.61147 0.636 0.000 0.008 0.000 0.000 0.356
#> SRR1090837 3 0.3183 0.73447 0.000 0.200 0.788 0.000 0.008 0.004
#> SRR1447828 3 0.3748 0.77397 0.000 0.092 0.792 0.000 0.112 0.004
#> SRR1338747 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3865 0.73671 0.000 0.192 0.752 0.000 0.056 0.000
#> SRR1350280 1 0.1124 0.70557 0.956 0.000 0.008 0.000 0.000 0.036
#> SRR1088557 1 0.0820 0.70778 0.972 0.000 0.016 0.000 0.000 0.012
#> SRR1102656 2 0.6067 -0.00594 0.000 0.400 0.000 0.000 0.276 0.324
#> SRR1441443 2 0.4078 0.51783 0.000 0.700 0.024 0.000 0.268 0.008
#> SRR1370682 3 0.4051 0.77126 0.000 0.092 0.784 0.012 0.108 0.004
#> SRR1475448 3 0.3183 0.73447 0.000 0.200 0.788 0.000 0.008 0.004
#> SRR1407291 1 0.1074 0.70586 0.960 0.000 0.012 0.000 0.000 0.028
#> SRR1405266 1 0.1074 0.70710 0.960 0.000 0.028 0.000 0.000 0.012
#> SRR1363766 1 0.3422 0.68032 0.788 0.000 0.000 0.036 0.000 0.176
#> SRR1082592 5 0.5192 -0.17536 0.000 0.024 0.404 0.000 0.528 0.044
#> SRR1325794 5 0.5978 0.49420 0.000 0.152 0.016 0.000 0.484 0.348
#> SRR1095961 3 0.4592 0.70887 0.000 0.080 0.664 0.000 0.256 0.000
#> SRR1086702 2 0.1866 0.76428 0.000 0.908 0.008 0.000 0.084 0.000
#> SRR1320806 5 0.4261 0.45235 0.000 0.112 0.156 0.000 0.732 0.000
#> SRR1457527 3 0.3250 0.73897 0.000 0.196 0.788 0.000 0.012 0.004
#> SRR1098831 2 0.0632 0.80842 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1474374 3 0.3795 0.77347 0.000 0.096 0.788 0.000 0.112 0.004
#> SRR1488858 4 0.4459 0.46607 0.020 0.000 0.004 0.516 0.000 0.460
#> SRR1454695 1 0.4141 0.62726 0.676 0.000 0.008 0.020 0.000 0.296
#> SRR1090241 2 0.2053 0.76016 0.000 0.888 0.004 0.000 0.108 0.000
#> SRR1329863 2 0.6089 -0.12629 0.000 0.364 0.000 0.000 0.276 0.360
#> SRR1357733 1 0.5219 0.63279 0.604 0.000 0.152 0.000 0.000 0.244
#> SRR1362135 1 0.3615 0.64499 0.700 0.000 0.008 0.000 0.000 0.292
#> SRR1379581 3 0.3503 0.72291 0.000 0.020 0.788 0.012 0.180 0.000
#> SRR1309182 1 0.1074 0.70586 0.960 0.000 0.012 0.000 0.000 0.028
#> SRR1437668 1 0.4117 0.64093 0.672 0.000 0.032 0.000 0.000 0.296
#> SRR1084742 5 0.5086 0.48028 0.000 0.088 0.000 0.000 0.548 0.364
#> SRR1433538 1 0.3314 0.68551 0.764 0.000 0.012 0.000 0.000 0.224
#> SRR1085063 2 0.5461 0.27592 0.000 0.520 0.000 0.000 0.136 0.344
#> SRR1454247 5 0.5436 0.48112 0.000 0.100 0.008 0.000 0.528 0.364
#> SRR1097100 2 0.0520 0.80973 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR818622 5 0.5318 0.24345 0.000 0.148 0.272 0.000 0.580 0.000
#> SRR1072388 1 0.4098 0.63367 0.676 0.000 0.032 0.000 0.000 0.292
#> SRR1070332 5 0.5127 0.47853 0.000 0.092 0.000 0.000 0.544 0.364
#> SRR1320761 5 0.5460 0.53012 0.000 0.104 0.112 0.000 0.680 0.104
#> SRR1076195 4 0.5577 0.44058 0.052 0.000 0.040 0.464 0.000 0.444
#> SRR1069895 3 0.5844 0.24794 0.000 0.200 0.456 0.000 0.344 0.000
#> SRR1099144 1 0.3915 0.63590 0.692 0.000 0.016 0.004 0.000 0.288
#> SRR1385150 3 0.3744 0.73135 0.000 0.200 0.756 0.000 0.044 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4871 0.42680 0.532 0.000 0.036 0.012 0.000 0.420
#> SRR1102583 1 0.0692 0.70939 0.976 0.000 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456971 1 0.4117 0.64093 0.672 0.000 0.032 0.000 0.000 0.296
#> SRR1340574 1 0.2631 0.67340 0.840 0.000 0.152 0.000 0.000 0.008
#> SRR1444830 5 0.4643 0.48016 0.000 0.184 0.128 0.000 0.688 0.000
#> SRR1096267 1 0.2631 0.67340 0.840 0.000 0.152 0.000 0.000 0.008
#> SRR1087127 3 0.4754 0.59384 0.000 0.000 0.568 0.032 0.388 0.012
#> SRR1408553 4 0.3817 0.56485 0.000 0.000 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1069231 1 0.3163 0.67945 0.764 0.000 0.004 0.000 0.000 0.232
#> SRR1325642 2 0.3327 0.73166 0.000 0.820 0.000 0.000 0.092 0.088
#> SRR1362103 1 0.5066 0.62654 0.608 0.000 0.116 0.000 0.000 0.276
#> SRR1321942 1 0.4771 0.65757 0.652 0.000 0.100 0.000 0.000 0.248
#> SRR1094380 1 0.3172 0.69190 0.816 0.000 0.148 0.000 0.000 0.036
#> SRR1447499 5 0.4728 0.38571 0.000 0.340 0.004 0.000 0.604 0.052
#> SRR1099330 5 0.4871 0.46684 0.000 0.212 0.132 0.000 0.656 0.000
#> SRR1077874 5 0.6041 0.33771 0.000 0.252 0.000 0.000 0.388 0.360
#> SRR808299 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.5002 0.47686 0.000 0.080 0.000 0.000 0.556 0.364
#> SRR1481238 5 0.4877 0.46237 0.000 0.192 0.148 0.000 0.660 0.000
#> SRR1443568 5 0.4887 0.21527 0.000 0.096 0.280 0.000 0.624 0.000
#> SRR1380249 6 0.6332 0.16703 0.364 0.000 0.040 0.144 0.000 0.452
#> SRR1080143 1 0.0777 0.70746 0.972 0.000 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1383148 6 0.5836 -0.41060 0.076 0.000 0.040 0.424 0.000 0.460
#> SRR1357042 1 0.4570 0.60276 0.644 0.000 0.000 0.064 0.000 0.292
#> SRR1416025 5 0.5045 0.16566 0.000 0.412 0.008 0.000 0.524 0.056
#> SRR1431015 5 0.6030 0.54683 0.000 0.148 0.028 0.000 0.528 0.296
#> SRR1078709 5 0.5578 0.48135 0.000 0.148 0.000 0.000 0.492 0.360
#> SRR813283 1 0.2178 0.68308 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0146 0.80858 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070665 1 0.2300 0.67823 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.0000 0.65621 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR807679 1 0.4613 0.65794 0.660 0.000 0.080 0.000 0.000 0.260
#> SRR1333811 3 0.4314 0.75718 0.000 0.096 0.720 0.000 0.184 0.000
#> SRR1078660 5 0.5449 0.52813 0.000 0.120 0.008 0.000 0.568 0.304
#> SRR1331730 2 0.1421 0.80025 0.000 0.944 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR1333913 1 0.4826 0.64933 0.660 0.000 0.044 0.028 0.000 0.268
#> SRR1432542 1 0.4165 0.63152 0.672 0.000 0.036 0.000 0.000 0.292
#> SRR1418041 1 0.0820 0.70848 0.972 0.000 0.016 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085211 1 0.5040 0.48259 0.516 0.000 0.000 0.076 0.000 0.408
#> SRR1339812 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.5040 0.48259 0.516 0.000 0.000 0.076 0.000 0.408
#> SRR1350958 2 0.0508 0.80937 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1396822 5 0.5823 0.11483 0.000 0.200 0.332 0.000 0.468 0.000
#> SRR1441934 2 0.5089 0.20055 0.000 0.524 0.008 0.000 0.408 0.060
#> SRR1472552 3 0.3250 0.73897 0.000 0.196 0.788 0.000 0.012 0.004
#> SRR1488881 3 0.3361 0.74485 0.000 0.188 0.788 0.000 0.020 0.004
#> SRR1102973 1 0.4855 0.56507 0.596 0.000 0.000 0.076 0.000 0.328
#> SRR1071131 5 0.4297 0.42142 0.000 0.100 0.176 0.000 0.724 0.000
#> SRR1074502 1 0.0363 0.70812 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1325271 1 0.3974 0.63546 0.680 0.000 0.024 0.000 0.000 0.296
#> SRR1409171 2 0.4636 0.02803 0.000 0.532 0.032 0.000 0.432 0.004
#> SRR809113 5 0.4459 0.48915 0.000 0.156 0.132 0.000 0.712 0.000
#> SRR1430045 2 0.5240 0.25093 0.000 0.544 0.000 0.000 0.348 0.108
#> SRR1441245 5 0.5624 0.57445 0.000 0.192 0.036 0.000 0.628 0.144
#> SRR1384091 1 0.5196 0.42431 0.520 0.000 0.004 0.080 0.000 0.396
#> SRR1431887 2 0.2558 0.76015 0.000 0.868 0.000 0.000 0.104 0.028
#> SRR1096525 4 0.3944 0.56699 0.000 0.000 0.004 0.568 0.000 0.428
#> SRR1488491 2 0.0622 0.80920 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1356351 5 0.5292 0.55491 0.000 0.112 0.072 0.000 0.692 0.124
#> SRR1369514 1 0.4754 0.61482 0.664 0.000 0.024 0.044 0.000 0.268
#> SRR1453299 3 0.3315 0.73604 0.000 0.200 0.780 0.000 0.020 0.000
#> SRR1436300 1 0.2389 0.70659 0.888 0.000 0.060 0.000 0.000 0.052
#> SRR1348490 5 0.6041 0.52766 0.000 0.100 0.104 0.000 0.608 0.188
#> SRR1091767 5 0.5753 0.46613 0.000 0.176 0.000 0.000 0.460 0.364
#> SRR1354467 3 0.3795 0.77347 0.000 0.096 0.788 0.000 0.112 0.004
#> SRR1069074 5 0.4625 0.48955 0.000 0.216 0.104 0.000 0.680 0.000
#> SRR1452399 5 0.5367 0.53766 0.000 0.096 0.096 0.000 0.688 0.120
#> SRR1437430 3 0.4053 0.63709 0.000 0.004 0.628 0.004 0.360 0.004
#> SRR1419736 5 0.5002 0.47686 0.000 0.080 0.000 0.000 0.556 0.364
#> SRR1313343 3 0.3288 0.71491 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1077619 1 0.3595 0.63841 0.704 0.000 0.008 0.000 0.000 0.288
#> SRR1083530 1 0.4069 0.69555 0.768 0.000 0.036 0.032 0.000 0.164
#> SRR1333633 3 0.5367 0.49657 0.000 0.124 0.532 0.000 0.344 0.000
#> SRR1354999 5 0.4443 0.19234 0.000 0.052 0.300 0.000 0.648 0.000
#> SRR1443592 2 0.1708 0.79820 0.000 0.932 0.004 0.000 0.024 0.040
#> SRR1077356 1 0.1151 0.70641 0.956 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1378818 3 0.6051 0.49320 0.000 0.000 0.480 0.188 0.320 0.012
#> SRR1413182 6 0.4927 -0.54301 0.016 0.000 0.032 0.468 0.000 0.484
#> SRR1464559 1 0.5292 0.48485 0.524 0.000 0.012 0.072 0.000 0.392
#> SRR1413075 5 0.5662 0.47823 0.000 0.160 0.000 0.000 0.476 0.364
#> SRR1487928 4 0.5038 0.55489 0.028 0.000 0.032 0.560 0.000 0.380
#> SRR1388997 5 0.4341 0.53051 0.000 0.180 0.080 0.000 0.732 0.008
#> SRR1092865 5 0.4448 0.51916 0.000 0.252 0.052 0.000 0.688 0.008
#> SRR1102729 1 0.4431 0.62690 0.688 0.000 0.000 0.076 0.000 0.236
#> SRR1456423 1 0.1151 0.70641 0.956 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1321591 2 0.5742 0.13124 0.000 0.468 0.000 0.000 0.176 0.356
#> SRR1376874 3 0.3359 0.70246 0.000 0.004 0.788 0.012 0.192 0.004
#> SRR1339903 1 0.3373 0.68329 0.744 0.000 0.008 0.000 0.000 0.248
#> SRR1346710 1 0.3936 0.64485 0.688 0.000 0.024 0.000 0.000 0.288
#> SRR1418771 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5070 0.49042 0.000 0.208 0.120 0.000 0.660 0.012
#> SRR1480941 4 0.0713 0.64168 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.2333 0.76665 0.000 0.884 0.000 0.000 0.092 0.024
#> SRR1313891 2 0.5666 0.17511 0.000 0.484 0.000 0.000 0.164 0.352
#> SRR1491354 1 0.0260 0.70875 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 5 0.5616 0.52239 0.000 0.100 0.124 0.000 0.664 0.112
#> SRR1471074 2 0.0000 0.80830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 5 0.4888 0.35800 0.000 0.352 0.020 0.000 0.592 0.036
#> SRR1355554 5 0.5255 0.06896 0.000 0.112 0.340 0.000 0.548 0.000
#> SRR1487173 1 0.2631 0.67340 0.840 0.000 0.152 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474253 1 0.1151 0.70641 0.956 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1322918 5 0.6151 0.46420 0.000 0.020 0.004 0.200 0.532 0.244
#> SRR1318331 2 0.3575 0.56558 0.000 0.708 0.000 0.000 0.284 0.008
#> SRR1321333 3 0.3250 0.73897 0.000 0.196 0.788 0.000 0.012 0.004
#> SRR1474231 1 0.4886 0.50860 0.540 0.000 0.000 0.064 0.000 0.396
#> SRR1350545 1 0.3431 0.67291 0.756 0.000 0.016 0.000 0.000 0.228
#> SRR1091328 1 0.3956 0.66606 0.704 0.000 0.032 0.000 0.000 0.264
#> SRR814447 3 0.5276 0.59247 0.000 0.004 0.636 0.164 0.192 0.004
#> SRR1455989 5 0.5557 0.30193 0.000 0.200 0.248 0.000 0.552 0.000
#> SRR1453680 3 0.3250 0.70065 0.000 0.000 0.788 0.012 0.196 0.004
#> SRR1470356 2 0.4718 0.29207 0.000 0.616 0.068 0.000 0.316 0.000
#> SRR1342977 2 0.1124 0.80310 0.000 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1444222 5 0.5759 0.47764 0.000 0.044 0.040 0.108 0.680 0.128
#> SRR1097197 1 0.1594 0.71645 0.932 0.000 0.016 0.000 0.000 0.052
#> SRR1366729 3 0.3675 0.76827 0.000 0.076 0.796 0.000 0.124 0.004
#> SRR821282 3 0.5065 0.39291 0.000 0.000 0.588 0.324 0.084 0.004
#> SRR1074602 5 0.4871 0.46684 0.000 0.212 0.132 0.000 0.656 0.000
#> SRR814633 2 0.0405 0.80980 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1072480 4 0.1765 0.60546 0.000 0.000 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1319100 1 0.1349 0.70608 0.940 0.000 0.056 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324004 3 0.5238 0.42751 0.000 0.096 0.496 0.000 0.408 0.000
#> SRR1457459 1 0.2473 0.68189 0.856 0.000 0.136 0.000 0.000 0.008
#> SRR1421031 1 0.5516 0.41865 0.504 0.000 0.000 0.140 0.000 0.356
#> SRR1444598 4 0.3111 0.55912 0.000 0.000 0.032 0.836 0.124 0.008
#> SRR1091743 5 0.4760 0.47781 0.000 0.212 0.120 0.000 0.668 0.000
#> SRR819637 1 0.4817 0.62846 0.616 0.000 0.056 0.008 0.000 0.320
#> SRR1083848 1 0.1908 0.69511 0.900 0.000 0.096 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088934 3 0.5818 0.15424 0.000 0.184 0.424 0.000 0.392 0.000
#> SRR1459785 3 0.3962 0.77332 0.000 0.096 0.772 0.000 0.128 0.004
#> SRR1083700 1 0.4251 0.63917 0.716 0.000 0.000 0.076 0.000 0.208
#> SRR1375531 1 0.3782 0.64962 0.788 0.000 0.008 0.064 0.000 0.140
#> SRR1323470 4 0.0000 0.65621 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814657 1 0.2768 0.71160 0.832 0.000 0.012 0.000 0.000 0.156
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.992 0.997 0.4931 0.508 0.508
#> 3 3 0.795 0.904 0.910 0.2217 0.876 0.756
#> 4 4 0.748 0.829 0.892 0.0820 0.962 0.902
#> 5 5 0.661 0.766 0.849 0.1256 0.874 0.655
#> 6 6 0.691 0.574 0.765 0.0643 0.920 0.711
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.855 0.613 0.280 0.720
#> SRR1436949 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.971 0.336 0.400 0.600
#> SRR1325826 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309314 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1347707 1 0.988 0.219 0.564 0.436
#> SRR807679 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.722 0.750 0.200 0.800
#> SRR1479175 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.722 0.750 0.200 0.800
#> SRR814657 1 0.000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1326059 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.5882 0.881 0.000 0.348 0.652
#> SRR819559 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.3192 0.804 0.000 0.888 0.112
#> SRR1442292 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.4504 0.855 0.804 0.000 0.196
#> SRR1469926 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1070036 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.5760 0.900 0.000 0.328 0.672
#> SRR1429748 1 0.3619 0.881 0.864 0.000 0.136
#> SRR1363654 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1329947 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.5760 0.900 0.000 0.328 0.672
#> SRR1490761 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.3482 0.764 0.000 0.872 0.128
#> SRR1402944 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1092818 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1068687 2 0.0747 0.959 0.000 0.984 0.016
#> SRR1437491 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1354203 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.4399 0.859 0.812 0.000 0.188
#> SRR1473318 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1338687 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.3116 0.891 0.892 0.000 0.108
#> SRR1486821 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1418540 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1080648 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.1031 0.918 0.976 0.000 0.024
#> SRR1469080 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.2448 0.902 0.924 0.000 0.076
#> SRR1321829 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.6180 0.786 0.000 0.416 0.584
#> SRR1445387 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0237 0.974 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349300 1 0.0237 0.923 0.996 0.000 0.004
#> SRR1374165 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.5058 0.831 0.756 0.000 0.244
#> SRR1401146 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.5138 0.826 0.748 0.000 0.252
#> SRR1391811 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0237 0.923 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086490 3 0.6062 0.836 0.000 0.384 0.616
#> SRR1088511 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.5560 0.797 0.700 0.000 0.300
#> SRR1384431 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.6225 0.755 0.000 0.432 0.568
#> SRR1332141 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.5678 0.908 0.000 0.316 0.684
#> SRR1080391 1 0.0237 0.923 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347870 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0592 0.922 0.988 0.000 0.012
#> SRR1460211 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0424 0.968 0.000 0.992 0.008
#> SRR1070060 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1487969 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3752 0.877 0.856 0.000 0.144
#> SRR1443350 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.1643 0.924 0.000 0.956 0.044
#> SRR1102923 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1431735 1 0.4346 0.861 0.816 0.000 0.184
#> SRR1417387 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1446308 2 0.0424 0.969 0.000 0.992 0.008
#> SRR1437346 2 0.5560 0.235 0.000 0.700 0.300
#> SRR1103143 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1319584 3 0.6244 0.735 0.000 0.440 0.560
#> SRR1486584 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1317939 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0237 0.923 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399178 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1400799 3 0.5926 0.872 0.000 0.356 0.644
#> SRR1074578 1 0.5397 0.809 0.720 0.000 0.280
#> SRR1312226 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1445023 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1077599 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0000 0.568 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.5859 0.886 0.000 0.344 0.656
#> SRR1458158 1 0.1031 0.919 0.976 0.000 0.024
#> SRR1432408 1 0.4931 0.837 0.768 0.000 0.232
#> SRR1310334 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1385434 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1415591 3 0.6302 0.649 0.000 0.480 0.520
#> SRR1402009 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0592 0.917 0.988 0.000 0.012
#> SRR1308734 3 0.5678 0.908 0.000 0.316 0.684
#> SRR1498973 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.4504 0.856 0.804 0.000 0.196
#> SRR1392141 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.5621 0.907 0.000 0.308 0.692
#> SRR809919 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.3619 0.880 0.864 0.000 0.136
#> SRR1323651 2 0.4235 0.662 0.000 0.824 0.176
#> SRR1357297 1 0.5327 0.814 0.728 0.000 0.272
#> SRR818170 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1091230 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1317731 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1490785 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.3116 0.892 0.892 0.000 0.108
#> SRR1415708 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1390371 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1076801 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1069871 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.4605 0.851 0.796 0.000 0.204
#> SRR1309333 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.2796 0.897 0.908 0.000 0.092
#> SRR1352996 1 0.5178 0.824 0.744 0.000 0.256
#> SRR1093172 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1413137 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1469973 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.5497 0.802 0.708 0.000 0.292
#> SRR1416266 1 0.5621 0.791 0.692 0.000 0.308
#> SRR1071011 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.5431 0.807 0.716 0.000 0.284
#> SRR1435394 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1419962 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1094357 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1356016 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.4702 0.848 0.788 0.000 0.212
#> SRR1474930 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR811915 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1315780 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1163 0.917 0.972 0.000 0.028
#> SRR1310997 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.6299 -0.535 0.000 0.524 0.476
#> SRR1475842 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0424 0.922 0.992 0.000 0.008
#> SRR1378220 2 0.4399 0.627 0.000 0.812 0.188
#> SRR1467704 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.8637 0.175 0.236 0.168 0.596
#> SRR1325826 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.4178 0.866 0.828 0.000 0.172
#> SRR1345692 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1097954 1 0.3941 0.873 0.844 0.000 0.156
#> SRR1374396 1 0.5650 0.788 0.688 0.000 0.312
#> SRR1454073 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1398138 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.5835 0.890 0.000 0.340 0.660
#> SRR817142 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.4178 0.364 0.172 0.000 0.828
#> SRR1309314 3 0.3941 0.746 0.000 0.156 0.844
#> SRR1420085 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1472126 1 0.0424 0.922 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380482 3 0.5810 0.894 0.000 0.336 0.664
#> SRR1099789 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0747 0.921 0.984 0.000 0.016
#> SRR1399353 1 0.0237 0.923 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096760 2 0.1643 0.919 0.000 0.956 0.044
#> SRR1440290 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1394321 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1312169 1 0.5497 0.802 0.708 0.000 0.292
#> SRR1096687 1 0.5291 0.817 0.732 0.000 0.268
#> SRR1486139 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1447893 2 0.2625 0.851 0.000 0.916 0.084
#> SRR1466025 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.4452 0.858 0.808 0.000 0.192
#> SRR1445701 2 0.6274 -0.462 0.000 0.544 0.456
#> SRR820689 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0424 0.922 0.992 0.000 0.008
#> SRR1447784 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.5560 0.797 0.700 0.000 0.300
#> SRR1488237 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.2165 0.889 0.000 0.936 0.064
#> SRR1474485 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.6295 -0.521 0.000 0.528 0.472
#> SRR1095188 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.5706 0.906 0.000 0.320 0.680
#> SRR1105417 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1325578 3 0.6307 0.624 0.000 0.488 0.512
#> SRR1358161 3 0.5621 0.907 0.000 0.308 0.692
#> SRR1358665 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1418183 2 0.0892 0.953 0.000 0.980 0.020
#> SRR1366345 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.6045 0.842 0.000 0.380 0.620
#> SRR1447828 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1338747 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.6168 0.793 0.000 0.412 0.588
#> SRR1350280 1 0.4796 0.844 0.780 0.000 0.220
#> SRR1088557 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1475448 3 0.6140 0.806 0.000 0.404 0.596
#> SRR1407291 1 0.4178 0.867 0.828 0.000 0.172
#> SRR1405266 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.4931 0.838 0.768 0.000 0.232
#> SRR1082592 2 0.3038 0.820 0.000 0.896 0.104
#> SRR1325794 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.5968 0.862 0.000 0.364 0.636
#> SRR1086702 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1098831 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1488858 1 0.5178 0.824 0.744 0.000 0.256
#> SRR1454695 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1309182 1 0.3879 0.875 0.848 0.000 0.152
#> SRR1437668 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.2796 0.897 0.908 0.000 0.092
#> SRR1085063 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.5733 0.775 0.676 0.000 0.324
#> SRR1069895 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.5810 0.894 0.000 0.336 0.664
#> SRR1420191 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.5363 0.812 0.724 0.000 0.276
#> SRR1102583 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1408553 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1069231 1 0.1529 0.914 0.960 0.000 0.040
#> SRR1325642 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.1289 0.937 0.000 0.968 0.032
#> SRR1443568 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1080143 1 0.1753 0.911 0.952 0.000 0.048
#> SRR1383148 1 0.5497 0.802 0.708 0.000 0.292
#> SRR1357042 1 0.4974 0.835 0.764 0.000 0.236
#> SRR1416025 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.5810 -0.141 0.336 0.000 0.664
#> SRR807679 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.5706 0.906 0.000 0.320 0.680
#> SRR1078660 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1031 0.919 0.976 0.000 0.024
#> SRR1350958 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.5733 0.903 0.000 0.324 0.676
#> SRR1488881 3 0.5785 0.897 0.000 0.332 0.668
#> SRR1102973 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.5529 0.799 0.704 0.000 0.296
#> SRR1431887 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1488491 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.5178 0.824 0.744 0.000 0.256
#> SRR1453299 3 0.5678 0.908 0.000 0.316 0.684
#> SRR1436300 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.5678 0.908 0.000 0.316 0.684
#> SRR1069074 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.5678 0.908 0.000 0.316 0.684
#> SRR1419736 2 0.0424 0.968 0.000 0.992 0.008
#> SRR1313343 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1077619 1 0.1031 0.918 0.976 0.000 0.024
#> SRR1083530 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.5706 0.906 0.000 0.320 0.680
#> SRR1354999 2 0.0237 0.974 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443592 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1413182 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1464559 1 0.4178 0.866 0.828 0.000 0.172
#> SRR1413075 2 0.0892 0.954 0.000 0.980 0.020
#> SRR1487928 1 0.5560 0.797 0.700 0.000 0.300
#> SRR1388997 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.4504 0.855 0.804 0.000 0.196
#> SRR1456423 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1339903 1 0.0424 0.922 0.992 0.000 0.008
#> SRR1346710 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.5536 0.559 0.200 0.776 0.024
#> SRR1479175 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0424 0.922 0.992 0.000 0.008
#> SRR1433884 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.1411 0.931 0.000 0.964 0.036
#> SRR1487173 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.5678 0.908 0.000 0.316 0.684
#> SRR1474231 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0592 0.922 0.988 0.000 0.012
#> SRR1091328 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.5591 0.905 0.000 0.304 0.696
#> SRR1455989 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.5621 0.907 0.000 0.308 0.692
#> SRR1470356 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.4062 0.870 0.836 0.000 0.164
#> SRR1366729 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR821282 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1074602 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.2448 0.672 0.000 0.076 0.924
#> SRR1319100 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.6140 0.804 0.000 0.404 0.596
#> SRR1457459 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.5591 0.794 0.696 0.000 0.304
#> SRR1444598 3 0.5529 0.897 0.000 0.296 0.704
#> SRR1091743 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 3 0.5650 0.909 0.000 0.312 0.688
#> SRR1083700 1 0.0000 0.924 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.3816 0.876 0.852 0.000 0.148
#> SRR1323470 3 0.8821 0.211 0.232 0.188 0.580
#> SRR814657 1 0.4842 0.843 0.776 0.000 0.224
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.4916 0.53473 0.056 0.000 0.184 0.760
#> SRR1326059 1 0.2647 0.83678 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1409062 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0817 0.86326 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1465313 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR819559 1 0.2149 0.84870 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1387899 2 0.4888 0.03753 0.000 0.588 0.412 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.3649 0.79725 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1469926 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1070036 1 0.0707 0.86413 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1098426 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090310 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1429748 1 0.3942 0.77713 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1363654 1 0.1022 0.86198 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1326317 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4888 0.59372 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1329947 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.2216 0.85446 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1402944 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.2589 0.83937 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1464880 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0336 0.95327 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1466951 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1068687 2 0.2589 0.83290 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.4855 0.61126 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1354203 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.1388 0.86053 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1473318 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.3649 0.79811 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1486821 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1418540 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408788 2 0.1389 0.91079 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1359487 4 0.4916 -0.26583 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1080648 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.2814 0.83263 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1469080 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3610 0.80034 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1321829 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.4103 0.85818 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1445387 1 0.0336 0.86469 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077575 4 0.5406 0.15332 0.000 0.480 0.012 0.508
#> SRR1349300 1 0.3649 0.79709 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1374165 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453769 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.4643 0.67835 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1401146 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.4343 0.75382 0.732 0.000 0.004 0.264
#> SRR1391811 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.4888 0.59080 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1384431 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.3688 0.92487 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1080391 1 0.3311 0.81352 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1347870 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR814028 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.3528 0.80342 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1460211 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 4 0.5600 0.17368 0.000 0.468 0.020 0.512
#> SRR1070060 1 0.5050 0.59223 0.588 0.000 0.004 0.408
#> SRR1487969 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3219 0.82003 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1443350 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.2589 0.83928 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1076705 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1079380 4 0.5503 0.18004 0.000 0.468 0.016 0.516
#> SRR1102923 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1436840 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.7495 0.07818 0.368 0.000 0.184 0.448
#> SRR1431735 1 0.1724 0.85533 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1417387 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0592 0.86439 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1370447 4 0.0188 0.57116 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1446308 2 0.3649 0.66186 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1437346 2 0.5000 -0.36998 0.000 0.500 0.500 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.4888 0.59372 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1319584 3 0.4955 0.50854 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1486584 1 0.3400 0.80909 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR813536 1 0.5151 0.49380 0.532 0.000 0.004 0.464
#> SRR1317939 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.3726 0.79336 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1399178 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0469 0.95085 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.7421 0.19602 0.456 0.000 0.172 0.372
#> SRR1400799 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1074578 1 0.4776 0.64322 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1312226 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.5060 0.58592 0.584 0.000 0.004 0.412
#> SRR1445023 1 0.7149 0.44846 0.552 0.000 0.184 0.264
#> SRR1077599 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1458727 4 0.3444 0.51592 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR1436949 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1458158 1 0.3726 0.79221 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1432408 1 0.5073 0.76515 0.744 0.000 0.056 0.200
#> SRR1310334 1 0.1867 0.85257 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1418201 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1385434 1 0.6862 0.54417 0.596 0.000 0.176 0.228
#> SRR1415591 3 0.3569 0.93303 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1402009 1 0.0336 0.86469 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1316055 1 0.6416 0.58207 0.648 0.000 0.200 0.152
#> SRR1308734 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1498973 2 0.0592 0.94830 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1397115 1 0.4776 0.64058 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1392141 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.3610 0.80034 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1323651 2 0.5000 -0.31935 0.000 0.504 0.496 0.000
#> SRR1357297 1 0.4713 0.66014 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR818170 3 0.3486 0.93770 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1317731 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.3172 0.82042 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1447808 1 0.2149 0.84817 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR809534 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1101513 1 0.0592 0.86295 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1415708 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1076801 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1080044 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.6785 0.56175 0.608 0.000 0.184 0.208
#> SRR1069871 1 0.1118 0.86195 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1095744 4 0.5168 0.12788 0.000 0.492 0.004 0.504
#> SRR1068929 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.3356 0.81481 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1309333 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1333676 1 0.3610 0.80034 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1352996 1 0.4697 0.66480 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1093172 4 0.2266 0.55242 0.084 0.000 0.004 0.912
#> SRR1413137 4 0.4905 -0.07142 0.364 0.000 0.004 0.632
#> SRR1469973 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1420026 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR817306 1 0.4776 0.64322 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1416266 4 0.0188 0.57116 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1071011 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.4761 0.64816 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1435394 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.5163 0.46116 0.516 0.000 0.004 0.480
#> SRR1419962 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1094357 1 0.0188 0.86476 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1081639 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.4946 0.46679 0.004 0.680 0.008 0.308
#> SRR1312147 1 0.0817 0.86363 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1473891 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.4679 0.67180 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1474930 2 0.0817 0.94296 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1470988 1 0.5168 0.43497 0.504 0.000 0.004 0.492
#> SRR811915 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0592 0.86430 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR819124 1 0.3649 0.79691 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1310997 2 0.4797 0.57133 0.000 0.720 0.020 0.260
#> SRR1464494 2 0.1042 0.94060 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1357083 3 0.3764 0.91609 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1475842 2 0.0592 0.94831 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1378085 1 0.0592 0.86472 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1378220 3 0.4972 0.49730 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1467704 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1348885 4 0.0188 0.57116 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1325826 1 0.3123 0.82124 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1466812 1 0.4222 0.74780 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1345692 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1401040 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1097954 1 0.1174 0.86046 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1374396 4 0.0000 0.57065 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454073 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1355747 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429368 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1398138 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1379260 1 0.1302 0.85999 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1361436 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.6595 0.21610 0.120 0.000 0.604 0.276
#> SRR1309314 3 0.0707 0.64769 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1420085 2 0.0469 0.95085 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1361308 3 0.3610 0.93100 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1472126 1 0.3444 0.80738 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1380482 3 0.4730 0.66198 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.5167 -0.12052 0.000 0.508 0.004 0.488
#> SRR1339276 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0188 0.86443 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399353 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.4866 0.02661 0.000 0.596 0.404 0.000
#> SRR1440290 2 0.2216 0.86430 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.4843 0.61691 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1394321 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.2530 0.84006 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1390413 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1312169 1 0.4978 0.62651 0.612 0.000 0.004 0.384
#> SRR1096687 1 0.4564 0.69528 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1486139 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.5913 0.68869 0.696 0.000 0.180 0.124
#> SRR1447893 2 0.4992 -0.28940 0.000 0.524 0.476 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.2408 0.83978 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1445701 3 0.3688 0.91570 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0336 0.86469 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489328 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1344462 1 0.0188 0.86476 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082709 1 0.3444 0.80736 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1447784 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355769 1 0.5080 0.57300 0.576 0.000 0.004 0.420
#> SRR1488237 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.1867 0.88447 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1474485 1 0.0469 0.86459 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1089998 1 0.0188 0.86476 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318140 1 0.0707 0.86378 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1319262 3 0.3688 0.92487 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1095188 2 0.0921 0.93971 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1105417 1 0.7105 0.46648 0.560 0.000 0.184 0.256
#> SRR1325578 3 0.4605 0.72617 0.000 0.336 0.664 0.000
#> SRR1358161 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.4817 0.62781 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1418183 2 0.4304 0.49758 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.1211 0.86086 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1090837 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1447828 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3837 0.90578 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1350280 1 0.4643 0.67828 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1088557 1 0.0469 0.86450 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1102656 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0469 0.95085 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1370682 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1475448 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1407291 1 0.4605 0.68707 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1405266 1 0.0336 0.86469 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1363766 1 0.4746 0.65109 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1082592 2 0.4700 0.72018 0.000 0.792 0.084 0.124
#> SRR1325794 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.3569 0.93296 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1457527 3 0.3569 0.93346 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1488858 1 0.4406 0.72449 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1454695 1 0.0469 0.86459 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1090241 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.2011 0.85094 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1379581 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1309182 1 0.4331 0.73360 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1437668 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084742 2 0.5203 0.35944 0.000 0.636 0.016 0.348
#> SRR1433538 1 0.3942 0.77585 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1085063 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.2796 0.85370 0.000 0.892 0.016 0.092
#> SRR1097100 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070332 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.7379 0.34860 0.468 0.000 0.168 0.364
#> SRR1069895 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.3356 0.81235 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1385150 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4661 0.67641 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1102583 1 0.2469 0.84208 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1456971 1 0.1022 0.86233 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1340574 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0592 0.94831 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1408553 4 0.3908 0.36301 0.212 0.000 0.004 0.784
#> SRR1069231 1 0.3975 0.77403 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1325642 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 4 0.5000 0.12067 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1481238 2 0.3311 0.74152 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1443568 2 0.0921 0.93974 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1380249 1 0.4761 0.64842 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1080143 1 0.4008 0.76979 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1383148 1 0.4804 0.63310 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1357042 1 0.4164 0.75463 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1416025 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1431015 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1078709 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.3444 0.51592 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR807679 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1078660 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418041 1 0.2973 0.82644 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1085211 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0592 0.86455 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1350958 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1472552 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1488881 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1074502 1 0.0336 0.86469 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325271 1 0.1211 0.86098 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1409171 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.4855 0.61126 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1431887 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0188 0.57116 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1488491 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.4713 0.66246 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1453299 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1354467 3 0.3649 0.92810 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1437430 3 0.3610 0.93100 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1419736 4 0.5402 0.17571 0.000 0.472 0.012 0.516
#> SRR1313343 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1077619 1 0.3569 0.80232 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1083530 1 0.2589 0.83954 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1333633 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1354999 2 0.2281 0.86101 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0592 0.86438 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1378818 3 0.4990 0.89420 0.000 0.184 0.756 0.060
#> SRR1413182 1 0.4999 0.44639 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1464559 1 0.3649 0.79831 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1413075 2 0.4079 0.72297 0.000 0.800 0.020 0.180
#> SRR1487928 1 0.4804 0.63302 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1388997 2 0.0469 0.95085 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1092865 2 0.0336 0.95327 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1102729 1 0.3219 0.82240 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1456423 1 0.0336 0.86469 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1321591 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1339903 1 0.1716 0.85666 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1346710 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.5087 0.68343 0.088 0.780 0.124 0.008
#> SRR1479175 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.3528 0.80358 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1433884 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1355554 2 0.4222 0.52713 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0336 0.86469 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1322918 2 0.3569 0.68253 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1318331 2 0.0707 0.94562 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1321333 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.3649 0.79854 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1091328 1 0.0188 0.86413 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814447 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0188 0.95558 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1097197 1 0.4804 0.63023 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1366729 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR821282 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0895 0.59590 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1319100 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.4888 0.59372 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1444598 4 0.6890 0.00577 0.000 0.152 0.268 0.580
#> SRR1091743 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.95795 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 3 0.3444 0.93966 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.86458 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.3444 0.80919 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1323470 3 0.8169 -0.18635 0.104 0.076 0.520 0.300
#> SRR814657 1 0.4776 0.64095 0.624 0.000 0.000 0.376
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467726 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.1965 0.83771 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1402132 4 0.5500 0.64804 0.008 0.000 0.144 0.676 0.172
#> SRR1326059 1 0.3999 0.53490 0.656 0.000 0.000 0.344 0.000
#> SRR1409062 2 0.0290 0.88249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.4851 0.47286 0.624 0.000 0.000 0.340 0.036
#> SRR1465313 3 0.4364 0.80826 0.000 0.148 0.764 0.000 0.088
#> SRR819559 1 0.1892 0.84590 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR1387899 2 0.5352 -0.23385 0.000 0.480 0.468 0.000 0.052
#> SRR1442292 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488151 1 0.2969 0.84061 0.852 0.000 0.000 0.020 0.128
#> SRR1395635 1 0.2583 0.83486 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1343629 1 0.1502 0.86477 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1326868 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.4300 -0.00787 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1469926 3 0.2886 0.87160 0.000 0.148 0.844 0.000 0.008
#> SRR1070036 1 0.1638 0.85406 0.932 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR1098426 1 0.0865 0.87009 0.972 0.000 0.004 0.024 0.000
#> SRR1090310 3 0.3039 0.86200 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1429748 4 0.3521 0.77724 0.232 0.000 0.004 0.764 0.000
#> SRR1363654 1 0.3160 0.73658 0.808 0.000 0.004 0.188 0.000
#> SRR1326317 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1366919 4 0.1768 0.85647 0.072 0.000 0.004 0.924 0.000
#> SRR1329947 1 0.1041 0.86944 0.964 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR1469769 3 0.2732 0.87424 0.000 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.5178 0.51362 0.000 0.480 0.040 0.000 0.480
#> SRR1402944 5 0.6223 0.41757 0.000 0.160 0.328 0.000 0.512
#> SRR1092818 1 0.0162 0.87086 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1093552 1 0.1282 0.86632 0.952 0.000 0.004 0.044 0.000
#> SRR1464880 2 0.2929 0.66737 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1078368 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.1430 0.85718 0.000 0.944 0.004 0.000 0.052
#> SRR1466951 2 0.3779 0.72893 0.000 0.804 0.052 0.000 0.144
#> SRR1331879 2 0.4171 -0.07807 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1320034 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.4270 0.68226 0.000 0.776 0.112 0.000 0.112
#> SRR1437491 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1310777 2 0.1270 0.86079 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1374005 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1319182 1 0.6162 -0.13379 0.440 0.000 0.000 0.428 0.132
#> SRR1329994 4 0.2011 0.85757 0.088 0.000 0.004 0.908 0.000
#> SRR1354203 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1077850 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1369241 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077992 2 0.4403 -0.28850 0.000 0.560 0.004 0.000 0.436
#> SRR1455214 1 0.0865 0.87051 0.972 0.000 0.004 0.024 0.000
#> SRR1092014 2 0.0510 0.87801 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.2407 0.83483 0.896 0.000 0.004 0.088 0.012
#> SRR1473318 1 0.1041 0.86933 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1345974 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0162 0.88419 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.3461 0.77708 0.224 0.000 0.004 0.772 0.000
#> SRR1486821 3 0.2763 0.87373 0.000 0.148 0.848 0.000 0.004
#> SRR1418540 1 0.2408 0.85804 0.892 0.000 0.000 0.016 0.092
#> SRR1408788 2 0.2074 0.78582 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1359487 4 0.1668 0.83775 0.028 0.000 0.000 0.940 0.032
#> SRR1080648 1 0.0404 0.87018 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1414708 1 0.1831 0.85054 0.920 0.000 0.004 0.076 0.000
#> SRR1469080 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1365722 2 0.0404 0.88493 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1448118 2 0.0609 0.88208 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1444808 1 0.3086 0.75444 0.816 0.000 0.004 0.180 0.000
#> SRR1321829 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.3242 0.83025 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.1205 0.86798 0.956 0.000 0.004 0.040 0.000
#> SRR1077575 5 0.5186 0.74723 0.000 0.260 0.028 0.036 0.676
#> SRR1349300 4 0.3430 0.75382 0.220 0.000 0.000 0.776 0.004
#> SRR1374165 1 0.2439 0.84161 0.876 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1453769 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 4 0.1732 0.85966 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1401146 2 0.0162 0.88419 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.6567 0.55714 0.240 0.000 0.228 0.524 0.008
#> SRR1391811 1 0.0162 0.87155 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1456674 1 0.1299 0.86888 0.960 0.000 0.020 0.012 0.008
#> SRR1086490 3 0.3395 0.81901 0.000 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1404577 4 0.1981 0.85665 0.064 0.000 0.000 0.920 0.016
#> SRR1384431 1 0.2707 0.83433 0.860 0.000 0.000 0.008 0.132
#> SRR1072055 1 0.1041 0.86783 0.964 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR1359738 3 0.3480 0.80340 0.000 0.248 0.752 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.2286 0.84576 0.888 0.000 0.004 0.000 0.108
#> SRR1085900 2 0.3543 0.74936 0.000 0.828 0.060 0.000 0.112
#> SRR1442173 1 0.0290 0.87240 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1431625 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.4415 0.59940 0.000 0.444 0.004 0.000 0.552
#> SRR1344034 3 0.4058 0.83037 0.000 0.152 0.784 0.000 0.064
#> SRR1080391 4 0.4656 0.07001 0.480 0.000 0.000 0.508 0.012
#> SRR1347870 2 0.3003 0.79110 0.000 0.864 0.044 0.000 0.092
#> SRR814028 2 0.3904 0.70994 0.000 0.792 0.052 0.000 0.156
#> SRR814219 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1070620 1 0.2233 0.84840 0.892 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1102128 4 0.4135 0.62552 0.340 0.000 0.004 0.656 0.000
#> SRR1460211 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418346 5 0.5479 0.73881 0.000 0.228 0.052 0.040 0.680
#> SRR1070060 4 0.1697 0.85633 0.060 0.000 0.000 0.932 0.008
#> SRR1487969 2 0.3366 0.54220 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1417851 4 0.4450 0.19410 0.488 0.000 0.004 0.508 0.000
#> SRR1443350 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403199 1 0.2329 0.81483 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1076705 1 0.0771 0.87040 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1079380 5 0.5221 0.73383 0.000 0.220 0.040 0.040 0.700
#> SRR1102923 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1366605 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1396035 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.3991 0.69087 0.000 0.780 0.048 0.000 0.172
#> SRR1436840 2 0.3090 0.78542 0.000 0.860 0.052 0.000 0.088
#> SRR1445573 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375394 4 0.5510 0.63784 0.000 0.000 0.144 0.648 0.208
#> SRR1431735 1 0.1908 0.86162 0.936 0.000 0.024 0.016 0.024
#> SRR1417387 1 0.0162 0.87086 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1445984 1 0.1430 0.86255 0.944 0.000 0.004 0.052 0.000
#> SRR1370447 4 0.1043 0.80282 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1446308 2 0.3561 0.49752 0.000 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1437346 3 0.4262 0.39841 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1086466 1 0.0324 0.87077 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1073191 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098974 1 0.0510 0.87175 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1468914 4 0.1197 0.85411 0.048 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1319584 5 0.6542 0.28987 0.000 0.200 0.372 0.000 0.428
#> SRR1486584 1 0.3932 0.57875 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR813536 4 0.1965 0.85022 0.052 0.000 0.000 0.924 0.024
#> SRR1317939 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079730 1 0.2920 0.83678 0.852 0.000 0.000 0.016 0.132
#> SRR1341921 4 0.2719 0.83148 0.144 0.000 0.000 0.852 0.004
#> SRR1399178 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415615 1 0.2612 0.83959 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1328551 2 0.1341 0.85814 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1453259 2 0.0609 0.88208 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1340828 5 0.3961 0.63733 0.016 0.248 0.000 0.000 0.736
#> SRR1079543 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR816427 2 0.3953 0.69707 0.000 0.784 0.048 0.000 0.168
#> SRR1076681 2 0.1725 0.85490 0.000 0.936 0.020 0.000 0.044
#> SRR1335314 4 0.4963 0.76849 0.036 0.000 0.140 0.752 0.072
#> SRR1400799 3 0.3772 0.84907 0.000 0.172 0.792 0.000 0.036
#> SRR1074578 4 0.1704 0.85910 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1312226 5 0.4235 0.63618 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1416207 1 0.0324 0.87171 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1447371 1 0.2193 0.84960 0.900 0.000 0.092 0.008 0.000
#> SRR1069328 4 0.1357 0.85353 0.048 0.000 0.000 0.948 0.004
#> SRR1445023 4 0.6449 0.71267 0.100 0.000 0.144 0.644 0.112
#> SRR1077599 2 0.0865 0.87124 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1453480 2 0.0703 0.88030 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1101834 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.2583 0.83486 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1074839 2 0.3477 0.75342 0.000 0.832 0.056 0.000 0.112
#> SRR1458727 5 0.4373 0.41958 0.000 0.000 0.160 0.080 0.760
#> SRR1436949 5 0.4436 0.67969 0.000 0.396 0.008 0.000 0.596
#> SRR1070429 3 0.3336 0.82790 0.000 0.228 0.772 0.000 0.000
#> SRR1458158 4 0.2249 0.85665 0.096 0.000 0.000 0.896 0.008
#> SRR1432408 3 0.6857 -0.15938 0.336 0.000 0.404 0.256 0.004
#> SRR1310334 4 0.3242 0.76694 0.216 0.000 0.000 0.784 0.000
#> SRR1418201 3 0.2763 0.87373 0.000 0.148 0.848 0.000 0.004
#> SRR1385434 4 0.5894 0.75282 0.060 0.000 0.156 0.684 0.100
#> SRR1415591 3 0.3203 0.86800 0.000 0.168 0.820 0.000 0.012
#> SRR1402009 1 0.0955 0.86976 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1316055 1 0.2795 0.82790 0.872 0.000 0.028 0.100 0.000
#> SRR1308734 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1498973 5 0.4921 0.72857 0.000 0.340 0.040 0.000 0.620
#> SRR1397115 4 0.2110 0.85849 0.072 0.000 0.000 0.912 0.016
#> SRR1392141 1 0.3101 0.83331 0.864 0.000 0.100 0.012 0.024
#> SRR814341 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313601 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1499325 3 0.2763 0.87373 0.000 0.148 0.848 0.000 0.004
#> SRR809919 1 0.3343 0.80812 0.812 0.000 0.000 0.016 0.172
#> SRR1370818 1 0.4166 0.42671 0.648 0.000 0.004 0.348 0.000
#> SRR1323651 3 0.5264 0.37572 0.000 0.392 0.556 0.000 0.052
#> SRR1357297 4 0.1830 0.85855 0.068 0.000 0.000 0.924 0.008
#> SRR818170 5 0.6185 0.36854 0.000 0.148 0.348 0.000 0.504
#> SRR1091230 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR812318 1 0.0324 0.87171 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1095285 3 0.4469 0.79416 0.000 0.148 0.756 0.000 0.096
#> SRR1317731 5 0.6144 0.41100 0.000 0.148 0.332 0.000 0.520
#> SRR1490785 1 0.0771 0.87092 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1432032 1 0.2389 0.81440 0.880 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1447808 1 0.3752 0.64158 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR809534 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1397312 5 0.4547 0.68219 0.000 0.400 0.012 0.000 0.588
#> SRR812128 5 0.4754 0.73609 0.000 0.264 0.052 0.000 0.684
#> SRR1101513 1 0.5864 0.42308 0.612 0.000 0.120 0.260 0.008
#> SRR1415708 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1316033 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0703 0.87933 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1480263 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1464473 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.0451 0.87097 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1080044 1 0.3276 0.82706 0.836 0.000 0.000 0.032 0.132
#> SRR1420850 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474295 4 0.5719 0.75868 0.056 0.000 0.144 0.700 0.100
#> SRR1069871 4 0.3579 0.74181 0.240 0.000 0.000 0.756 0.004
#> SRR1095744 5 0.4747 0.74084 0.000 0.284 0.004 0.036 0.676
#> SRR1068929 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1490097 2 0.4730 0.48942 0.000 0.688 0.052 0.000 0.260
#> SRR1075054 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1083480 1 0.1638 0.86209 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1075458 1 0.0451 0.87097 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1417023 1 0.5765 -0.08365 0.488 0.000 0.088 0.424 0.000
#> SRR1309333 2 0.4369 0.61992 0.000 0.740 0.052 0.000 0.208
#> SRR1333676 1 0.4367 0.17615 0.580 0.000 0.004 0.416 0.000
#> SRR1352996 4 0.1956 0.85945 0.076 0.000 0.000 0.916 0.008
#> SRR1093172 4 0.0609 0.81411 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1413137 4 0.1018 0.82797 0.016 0.000 0.000 0.968 0.016
#> SRR1469973 2 0.3459 0.75635 0.000 0.832 0.052 0.000 0.116
#> SRR1420026 5 0.5236 0.62745 0.000 0.380 0.052 0.000 0.568
#> SRR817306 4 0.1608 0.86014 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1416266 4 0.0963 0.80483 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1071011 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2890 0.82497 0.160 0.000 0.004 0.836 0.000
#> SRR1435394 2 0.1041 0.86450 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1383192 4 0.1597 0.85075 0.048 0.000 0.000 0.940 0.012
#> SRR1419962 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0794 0.87106 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1081639 3 0.3752 0.84442 0.000 0.148 0.804 0.000 0.048
#> SRR1356016 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0609 0.88208 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1397348 5 0.4010 0.55161 0.044 0.092 0.004 0.032 0.828
#> SRR1312147 1 0.1282 0.86558 0.952 0.000 0.004 0.044 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.3205 0.81759 0.176 0.000 0.004 0.816 0.004
#> SRR1474930 2 0.3536 0.75854 0.000 0.832 0.084 0.000 0.084
#> SRR1470988 4 0.1818 0.84645 0.044 0.000 0.000 0.932 0.024
#> SRR811915 2 0.0162 0.88593 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1104987 1 0.0162 0.87155 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100005 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444436 2 0.0404 0.88461 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1313770 5 0.5957 0.47437 0.000 0.148 0.280 0.000 0.572
#> SRR1315780 2 0.2516 0.68039 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1073631 1 0.3944 0.78765 0.788 0.000 0.000 0.160 0.052
#> SRR819124 4 0.3177 0.78490 0.208 0.000 0.000 0.792 0.000
#> SRR1310997 5 0.4673 0.73687 0.000 0.228 0.052 0.004 0.716
#> SRR1464494 5 0.4602 0.73697 0.000 0.240 0.052 0.000 0.708
#> SRR1357083 3 0.3730 0.73693 0.000 0.288 0.712 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.2946 0.79718 0.000 0.868 0.044 0.000 0.088
#> SRR1378085 1 0.2020 0.83141 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1378220 3 0.4299 0.51616 0.000 0.388 0.608 0.000 0.004
#> SRR1467704 1 0.0955 0.86953 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1348885 5 0.3932 0.27000 0.000 0.000 0.000 0.328 0.672
#> SRR1325826 1 0.4359 0.34747 0.584 0.000 0.000 0.412 0.004
#> SRR1466812 4 0.3857 0.59067 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1345692 5 0.5272 0.59923 0.000 0.396 0.052 0.000 0.552
#> SRR1401040 3 0.2806 0.87464 0.000 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1097954 1 0.3519 0.80409 0.828 0.000 0.136 0.008 0.028
#> SRR1374396 4 0.0290 0.81711 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1454073 2 0.3759 0.73159 0.000 0.808 0.056 0.000 0.136
#> SRR1355747 1 0.2583 0.83486 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1429368 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.3375 0.76274 0.000 0.840 0.056 0.000 0.104
#> SRR1379260 1 0.1430 0.86179 0.944 0.000 0.004 0.052 0.000
#> SRR1361436 3 0.3242 0.83814 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.6726 0.19246 0.120 0.000 0.544 0.292 0.044
#> SRR1309314 3 0.2795 0.59017 0.000 0.028 0.872 0.000 0.100
#> SRR1420085 2 0.4054 0.65313 0.000 0.760 0.036 0.000 0.204
#> SRR1361308 3 0.3003 0.86185 0.000 0.188 0.812 0.000 0.000
#> SRR1472126 4 0.2929 0.80976 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1380482 5 0.6327 0.45323 0.000 0.184 0.308 0.000 0.508
#> SRR1099789 1 0.0290 0.87172 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1079480 5 0.4645 0.73956 0.000 0.300 0.012 0.016 0.672
#> SRR1339276 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1418368 1 0.3798 0.80449 0.808 0.000 0.000 0.064 0.128
#> SRR1399353 1 0.1978 0.86577 0.932 0.000 0.024 0.012 0.032
#> SRR1096760 2 0.4138 0.13673 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.4163 0.56892 0.000 0.740 0.228 0.000 0.032
#> SRR1330813 2 0.0566 0.87969 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1458931 2 0.0703 0.88013 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR812294 4 0.1892 0.85746 0.080 0.000 0.004 0.916 0.000
#> SRR1394321 1 0.0865 0.86983 0.972 0.000 0.004 0.024 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1349342 1 0.2488 0.83942 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1477173 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.1043 0.86957 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1390143 1 0.3928 0.54253 0.700 0.000 0.004 0.296 0.000
#> SRR1390413 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1099570 3 0.2806 0.87464 0.000 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1312169 4 0.1628 0.85486 0.056 0.000 0.000 0.936 0.008
#> SRR1096687 4 0.2017 0.85979 0.080 0.000 0.000 0.912 0.008
#> SRR1486139 1 0.2660 0.83680 0.864 0.000 0.000 0.008 0.128
#> SRR1470313 1 0.7595 -0.20269 0.400 0.000 0.128 0.376 0.096
#> SRR1447893 2 0.3895 0.35440 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.3774 0.34205 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1477429 4 0.4047 0.66741 0.320 0.000 0.004 0.676 0.000
#> SRR1445701 3 0.4496 0.79777 0.000 0.156 0.752 0.000 0.092
#> SRR820689 1 0.2707 0.83433 0.860 0.000 0.000 0.008 0.132
#> SRR1451876 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0955 0.86976 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1489328 2 0.5155 0.16939 0.000 0.596 0.052 0.000 0.352
#> SRR1344462 1 0.3321 0.83192 0.832 0.000 0.000 0.032 0.136
#> SRR1082709 4 0.3123 0.82009 0.160 0.000 0.000 0.828 0.012
#> SRR1447784 1 0.0451 0.87097 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1355769 4 0.1943 0.85319 0.056 0.000 0.000 0.924 0.020
#> SRR1488237 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1391985 2 0.0162 0.88593 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478501 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1480917 2 0.5480 -0.23718 0.000 0.560 0.072 0.000 0.368
#> SRR1474485 1 0.1430 0.86255 0.944 0.000 0.004 0.052 0.000
#> SRR1089998 1 0.0609 0.87166 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1318140 1 0.1965 0.83663 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1319262 3 0.3586 0.77979 0.000 0.264 0.736 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.3719 0.73916 0.000 0.816 0.068 0.000 0.116
#> SRR1454350 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1440374 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1359565 3 0.3656 0.85491 0.000 0.168 0.800 0.000 0.032
#> SRR1105417 4 0.6125 0.72847 0.068 0.000 0.144 0.668 0.120
#> SRR1325578 3 0.4728 0.65854 0.000 0.296 0.664 0.000 0.040
#> SRR1358161 3 0.2763 0.87373 0.000 0.148 0.848 0.000 0.004
#> SRR1358665 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1452010 4 0.1704 0.85910 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1418183 2 0.5342 0.29932 0.000 0.612 0.312 0.000 0.076
#> SRR1366345 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1387449 1 0.5759 0.49372 0.596 0.000 0.000 0.276 0.128
#> SRR1473461 1 0.1768 0.85054 0.924 0.000 0.004 0.072 0.000
#> SRR1090837 3 0.3395 0.81920 0.000 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333038 3 0.3109 0.84421 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR1350280 4 0.2189 0.85933 0.084 0.000 0.000 0.904 0.012
#> SRR1088557 1 0.4098 0.78248 0.780 0.000 0.000 0.156 0.064
#> SRR1102656 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1441443 2 0.2850 0.80217 0.000 0.872 0.036 0.000 0.092
#> SRR1370682 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.3508 0.79752 0.000 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR1407291 4 0.1892 0.85959 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1405266 1 0.1282 0.86487 0.952 0.000 0.004 0.044 0.000
#> SRR1363766 4 0.2408 0.85876 0.092 0.000 0.000 0.892 0.016
#> SRR1082592 5 0.5030 0.73020 0.000 0.220 0.080 0.004 0.696
#> SRR1325794 2 0.0794 0.87677 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1095961 3 0.2773 0.87348 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.3110 0.78219 0.000 0.860 0.060 0.000 0.080
#> SRR1457527 3 0.2966 0.86292 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.2806 0.87464 0.000 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1488858 4 0.3969 0.67361 0.304 0.000 0.004 0.692 0.000
#> SRR1454695 1 0.2124 0.83560 0.900 0.000 0.004 0.096 0.000
#> SRR1090241 2 0.0162 0.88419 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1357733 1 0.0162 0.87141 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362135 1 0.2286 0.82441 0.888 0.000 0.004 0.108 0.000
#> SRR1379581 3 0.2886 0.87160 0.000 0.148 0.844 0.000 0.008
#> SRR1309182 4 0.2389 0.84781 0.116 0.000 0.000 0.880 0.004
#> SRR1437668 1 0.0771 0.87040 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1084742 5 0.4519 0.73726 0.000 0.228 0.052 0.000 0.720
#> SRR1433538 4 0.1732 0.85989 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1085063 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1454247 5 0.5511 0.74801 0.000 0.256 0.052 0.032 0.660
#> SRR1097100 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR818622 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0671 0.87020 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1070332 5 0.4262 0.60834 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1320761 2 0.0290 0.88559 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1076195 4 0.6604 0.56073 0.224 0.000 0.232 0.532 0.012
#> SRR1069895 2 0.1571 0.83666 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR1099144 1 0.2286 0.82849 0.888 0.000 0.004 0.108 0.000
#> SRR1385150 3 0.3274 0.83516 0.000 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3231 0.79469 0.196 0.000 0.004 0.800 0.000
#> SRR1102583 4 0.3203 0.81431 0.168 0.000 0.000 0.820 0.012
#> SRR1456971 1 0.1430 0.86255 0.944 0.000 0.004 0.052 0.000
#> SRR1340574 1 0.1041 0.86931 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1444830 2 0.2797 0.80332 0.000 0.880 0.060 0.000 0.060
#> SRR1096267 1 0.0162 0.87155 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087127 5 0.6133 0.38611 0.000 0.148 0.328 0.000 0.524
#> SRR1408553 4 0.0771 0.81469 0.004 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1069231 4 0.4101 0.44064 0.372 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1325642 2 0.1732 0.85112 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1362103 1 0.0671 0.87109 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1321942 1 0.0404 0.87172 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1094380 1 0.2439 0.84149 0.876 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1447499 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0290 0.88249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR808299 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098050 5 0.4715 0.73887 0.000 0.292 0.004 0.032 0.672
#> SRR1481238 2 0.4732 0.54732 0.000 0.716 0.208 0.000 0.076
#> SRR1443568 2 0.3806 0.73395 0.000 0.812 0.104 0.000 0.084
#> SRR1380249 4 0.4276 0.51065 0.380 0.000 0.004 0.616 0.000
#> SRR1080143 4 0.2179 0.85437 0.100 0.000 0.000 0.896 0.004
#> SRR1383148 4 0.3088 0.82016 0.164 0.000 0.004 0.828 0.004
#> SRR1357042 4 0.2624 0.84941 0.116 0.000 0.000 0.872 0.012
#> SRR1416025 2 0.3359 0.76010 0.000 0.840 0.052 0.000 0.108
#> SRR1431015 2 0.3647 0.74541 0.000 0.816 0.052 0.000 0.132
#> SRR1078709 5 0.5314 0.53128 0.000 0.420 0.052 0.000 0.528
#> SRR813283 1 0.0162 0.87155 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430226 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070665 1 0.0510 0.87146 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1466927 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347707 4 0.6210 0.37258 0.000 0.000 0.148 0.492 0.360
#> SRR807679 1 0.1768 0.86016 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1333811 3 0.4078 0.82675 0.000 0.148 0.784 0.000 0.068
#> SRR1078660 2 0.5264 -0.02965 0.000 0.556 0.052 0.000 0.392
#> SRR1331730 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333913 1 0.2488 0.83944 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1432542 1 0.0955 0.86922 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1418041 1 0.3143 0.73768 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1085211 1 0.0162 0.87153 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0955 0.87000 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1350958 2 0.0510 0.88372 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1396822 2 0.0609 0.87511 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.3033 0.78525 0.000 0.864 0.052 0.000 0.084
#> SRR1472552 3 0.3242 0.83814 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.3210 0.84045 0.000 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.2583 0.83486 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1071131 2 0.3532 0.75888 0.000 0.832 0.076 0.000 0.092
#> SRR1074502 1 0.5491 0.53853 0.624 0.000 0.000 0.272 0.104
#> SRR1325271 1 0.1638 0.85770 0.932 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0794 0.87792 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1430045 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1441245 2 0.0609 0.88208 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1384091 4 0.2629 0.83849 0.136 0.000 0.004 0.860 0.000
#> SRR1431887 2 0.0404 0.88493 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1096525 4 0.0703 0.81120 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1488491 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1356351 2 0.0703 0.87936 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1369514 4 0.1768 0.86006 0.072 0.000 0.000 0.924 0.004
#> SRR1453299 3 0.3039 0.85611 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0451 0.87173 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1348490 5 0.4449 0.51803 0.000 0.484 0.004 0.000 0.512
#> SRR1091767 2 0.5314 -0.19229 0.000 0.528 0.052 0.000 0.420
#> SRR1354467 3 0.3109 0.85338 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0290 0.88249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.3970 0.70764 0.000 0.788 0.056 0.000 0.156
#> SRR1437430 3 0.3132 0.86716 0.000 0.172 0.820 0.000 0.008
#> SRR1419736 5 0.5186 0.74580 0.000 0.260 0.028 0.036 0.676
#> SRR1313343 3 0.2763 0.87373 0.000 0.148 0.848 0.000 0.004
#> SRR1077619 1 0.4151 0.44044 0.652 0.000 0.004 0.344 0.000
#> SRR1083530 1 0.4448 -0.13012 0.516 0.000 0.004 0.480 0.000
#> SRR1333633 3 0.3048 0.87025 0.000 0.176 0.820 0.000 0.004
#> SRR1354999 2 0.4355 0.63805 0.000 0.760 0.164 0.000 0.076
#> SRR1443592 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077356 4 0.5777 0.10330 0.444 0.000 0.000 0.468 0.088
#> SRR1378818 5 0.5752 0.54637 0.000 0.148 0.240 0.000 0.612
#> SRR1413182 4 0.1043 0.85052 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1464559 1 0.2890 0.77898 0.836 0.000 0.004 0.160 0.000
#> SRR1413075 5 0.4771 0.73333 0.000 0.224 0.060 0.004 0.712
#> SRR1487928 4 0.2199 0.85482 0.060 0.000 0.016 0.916 0.008
#> SRR1388997 2 0.2850 0.80232 0.000 0.872 0.036 0.000 0.092
#> SRR1092865 2 0.2006 0.83926 0.000 0.916 0.012 0.000 0.072
#> SRR1102729 1 0.4007 0.79146 0.824 0.000 0.056 0.032 0.088
#> SRR1456423 1 0.1205 0.86625 0.956 0.000 0.004 0.040 0.000
#> SRR1321591 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1376874 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1339903 4 0.3752 0.70444 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR1346710 1 0.0451 0.87097 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1418771 2 0.0404 0.88585 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1095358 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.6282 0.19995 0.180 0.584 0.224 0.012 0.000
#> SRR1479175 2 0.0162 0.88584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313891 2 0.0880 0.87544 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1491354 4 0.3586 0.73982 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1433884 2 0.3527 0.75004 0.000 0.828 0.056 0.000 0.116
#> SRR1471074 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353052 2 0.3269 0.77140 0.000 0.848 0.056 0.000 0.096
#> SRR1355554 2 0.5359 0.28989 0.000 0.608 0.316 0.000 0.076
#> SRR1487173 1 0.0771 0.87101 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1474253 1 0.1502 0.86036 0.940 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1322918 2 0.5123 0.50127 0.000 0.696 0.144 0.000 0.160
#> SRR1318331 2 0.2889 0.79863 0.000 0.872 0.044 0.000 0.084
#> SRR1321333 3 0.2848 0.87429 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1474231 1 0.0290 0.87172 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350545 4 0.2068 0.85754 0.092 0.000 0.000 0.904 0.004
#> SRR1091328 1 0.0771 0.87040 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR814447 3 0.2886 0.87160 0.000 0.148 0.844 0.000 0.008
#> SRR1455989 2 0.0290 0.88249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0290 0.88574 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1444222 2 0.1270 0.86079 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1097197 4 0.2046 0.85828 0.068 0.000 0.000 0.916 0.016
#> SRR1366729 3 0.2605 0.87513 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.2648 0.87546 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0290 0.88249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.88550 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.3010 0.46882 0.000 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR1319100 1 0.2424 0.83518 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1324004 3 0.4404 0.80377 0.000 0.152 0.760 0.000 0.088
#> SRR1457459 1 0.2583 0.83503 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1421031 4 0.4181 0.81103 0.052 0.000 0.136 0.796 0.016
#> SRR1444598 5 0.5561 0.65039 0.000 0.148 0.100 0.044 0.708
#> SRR1091743 2 0.0404 0.88051 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.2074 0.84854 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1083848 1 0.0510 0.87175 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1088934 2 0.1704 0.82806 0.000 0.928 0.068 0.000 0.004
#> SRR1459785 3 0.3495 0.85884 0.000 0.152 0.816 0.000 0.032
#> SRR1083700 1 0.0510 0.87121 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375531 1 0.3689 0.62798 0.740 0.000 0.004 0.256 0.000
#> SRR1323470 4 0.5885 0.63889 0.000 0.012 0.176 0.640 0.172
#> SRR814657 4 0.1894 0.85916 0.072 0.000 0.000 0.920 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.3891 0.642932 0.000 0.780 0.140 0.000 0.072 0.008
#> SRR1402132 4 0.5386 0.037238 0.000 0.000 0.040 0.516 0.040 0.404
#> SRR1326059 1 0.4528 0.290820 0.564 0.000 0.000 0.404 0.004 0.028
#> SRR1409062 2 0.0717 0.889056 0.000 0.976 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR809406 1 0.4482 0.301570 0.580 0.000 0.000 0.384 0.036 0.000
#> SRR1465313 3 0.6242 0.261889 0.000 0.056 0.560 0.000 0.176 0.208
#> SRR819559 1 0.2997 0.712092 0.844 0.000 0.000 0.060 0.000 0.096
#> SRR1387899 3 0.3065 0.337318 0.000 0.096 0.848 0.000 0.008 0.048
#> SRR1442292 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488151 1 0.2980 0.712707 0.808 0.000 0.000 0.012 0.180 0.000
#> SRR1395635 1 0.2697 0.704712 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1343629 1 0.1327 0.748309 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1326868 2 0.0806 0.885884 0.000 0.972 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102320 1 0.5901 -0.146231 0.408 0.000 0.000 0.388 0.000 0.204
#> SRR1469926 3 0.4973 0.425685 0.000 0.044 0.572 0.000 0.016 0.368
#> SRR1070036 1 0.4039 0.644562 0.732 0.000 0.000 0.060 0.000 0.208
#> SRR1098426 1 0.3265 0.650084 0.748 0.000 0.000 0.004 0.000 0.248
#> SRR1090310 3 0.5673 0.406036 0.000 0.160 0.468 0.000 0.000 0.372
#> SRR1429748 4 0.4405 0.451498 0.240 0.000 0.000 0.688 0.000 0.072
#> SRR1363654 1 0.4650 0.508954 0.676 0.000 0.000 0.220 0.000 0.104
#> SRR1326317 2 0.0993 0.880231 0.000 0.964 0.024 0.000 0.000 0.012
#> SRR1378308 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.4414 0.433880 0.064 0.000 0.000 0.676 0.000 0.260
#> SRR1329947 1 0.1088 0.752454 0.960 0.000 0.000 0.016 0.000 0.024
#> SRR1469769 3 0.5105 0.432268 0.000 0.080 0.564 0.000 0.004 0.352
#> SRR1490761 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.4863 0.343311 0.000 0.460 0.028 0.000 0.496 0.016
#> SRR1402944 5 0.5274 0.540419 0.000 0.044 0.284 0.000 0.620 0.052
#> SRR1092818 1 0.1908 0.756746 0.916 0.000 0.000 0.000 0.028 0.056
#> SRR1093552 1 0.3650 0.669957 0.756 0.000 0.000 0.024 0.004 0.216
#> SRR1464880 2 0.0937 0.873035 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1078368 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349608 2 0.3934 0.287347 0.000 0.616 0.376 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466951 3 0.5420 0.143879 0.000 0.392 0.500 0.000 0.104 0.004
#> SRR1331879 2 0.4370 0.286445 0.000 0.640 0.032 0.000 0.324 0.004
#> SRR1320034 3 0.4563 0.431833 0.000 0.044 0.588 0.000 0.000 0.368
#> SRR1068687 3 0.4645 0.216767 0.000 0.276 0.648 0.000 0.076 0.000
#> SRR1437491 1 0.2562 0.709210 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1310777 2 0.3547 0.406207 0.000 0.668 0.332 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0260 0.897612 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.5820 -0.003345 0.416 0.000 0.000 0.400 0.184 0.000
#> SRR1329994 4 0.4360 0.448255 0.060 0.000 0.000 0.680 0.000 0.260
#> SRR1354203 1 0.2562 0.709210 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1077850 1 0.2562 0.708841 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1369241 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077992 2 0.3795 0.224705 0.000 0.632 0.004 0.000 0.364 0.000
#> SRR1455214 1 0.1333 0.749317 0.944 0.000 0.000 0.008 0.000 0.048
#> SRR1092014 2 0.1701 0.829255 0.000 0.920 0.072 0.000 0.000 0.008
#> SRR1097857 1 0.2762 0.708281 0.860 0.000 0.000 0.092 0.000 0.048
#> SRR1473318 1 0.1501 0.745639 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1345974 3 0.4856 0.431755 0.000 0.048 0.576 0.000 0.008 0.368
#> SRR1338687 2 0.0405 0.897023 0.000 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071207 4 0.5539 0.211257 0.200 0.000 0.000 0.556 0.000 0.244
#> SRR1486821 3 0.5029 0.428100 0.000 0.048 0.568 0.000 0.016 0.368
#> SRR1418540 1 0.4896 0.684924 0.676 0.000 0.000 0.008 0.120 0.196
#> SRR1408788 2 0.2948 0.665337 0.000 0.804 0.188 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359487 4 0.3470 0.582948 0.000 0.000 0.000 0.796 0.052 0.152
#> SRR1080648 1 0.2402 0.732772 0.868 0.000 0.000 0.000 0.012 0.120
#> SRR1414708 1 0.3934 0.614026 0.708 0.000 0.000 0.032 0.000 0.260
#> SRR1469080 2 0.0291 0.899996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1365722 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0146 0.899901 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.4954 0.503398 0.628 0.000 0.000 0.112 0.000 0.260
#> SRR1321829 2 0.0717 0.889056 0.000 0.976 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1475993 3 0.6101 0.362807 0.000 0.232 0.416 0.000 0.004 0.348
#> SRR1445387 1 0.1261 0.752073 0.952 0.000 0.000 0.024 0.000 0.024
#> SRR1077575 5 0.4061 0.690284 0.000 0.164 0.088 0.000 0.748 0.000
#> SRR1349300 4 0.2805 0.601498 0.184 0.000 0.000 0.812 0.000 0.004
#> SRR1374165 1 0.4488 0.697638 0.708 0.000 0.000 0.000 0.164 0.128
#> SRR1453769 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473870 4 0.1633 0.691459 0.044 0.000 0.000 0.932 0.000 0.024
#> SRR1401146 2 0.0405 0.897023 0.000 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1366124 6 0.6482 0.325138 0.212 0.000 0.012 0.324 0.012 0.440
#> SRR1391811 1 0.0000 0.753689 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.3623 0.682197 0.764 0.000 0.020 0.000 0.008 0.208
#> SRR1086490 3 0.5911 0.376400 0.000 0.212 0.432 0.000 0.000 0.356
#> SRR1088511 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.0665 0.677574 0.004 0.000 0.000 0.980 0.008 0.008
#> SRR1384431 1 0.2841 0.710681 0.824 0.000 0.000 0.012 0.164 0.000
#> SRR1072055 1 0.3460 0.696234 0.796 0.000 0.000 0.036 0.004 0.164
#> SRR1359738 3 0.6027 0.351592 0.000 0.252 0.408 0.000 0.000 0.340
#> SRR1332141 1 0.2744 0.719839 0.840 0.000 0.000 0.000 0.144 0.016
#> SRR1085900 3 0.5146 0.158378 0.000 0.396 0.516 0.000 0.088 0.000
#> SRR1442173 1 0.0146 0.753701 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1357999 5 0.3819 0.540000 0.000 0.372 0.000 0.000 0.624 0.004
#> SRR1344034 3 0.3368 0.313458 0.000 0.048 0.844 0.000 0.048 0.060
#> SRR1080391 4 0.4093 0.328153 0.324 0.000 0.000 0.656 0.012 0.008
#> SRR1347870 3 0.4945 0.147004 0.000 0.452 0.484 0.000 0.064 0.000
#> SRR814028 3 0.5313 0.142312 0.000 0.384 0.508 0.000 0.108 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.2260 0.724187 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1102128 4 0.4382 0.437161 0.264 0.000 0.000 0.676 0.000 0.060
#> SRR1460211 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.4183 0.673529 0.000 0.108 0.152 0.000 0.740 0.000
#> SRR1070060 4 0.0000 0.677392 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.1204 0.853928 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1417851 1 0.6016 -0.188775 0.404 0.000 0.000 0.352 0.000 0.244
#> SRR1443350 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.3963 0.662576 0.756 0.000 0.000 0.080 0.000 0.164
#> SRR1076705 1 0.3298 0.657272 0.756 0.000 0.000 0.008 0.000 0.236
#> SRR1079380 5 0.4582 0.685468 0.000 0.140 0.124 0.000 0.724 0.012
#> SRR1102923 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369560 2 0.0436 0.898650 0.000 0.988 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1366605 2 0.0291 0.898187 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396035 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390223 3 0.5576 0.135124 0.000 0.384 0.496 0.000 0.112 0.008
#> SRR1436840 3 0.4850 0.153639 0.000 0.448 0.496 0.000 0.056 0.000
#> SRR1445573 2 0.0146 0.899901 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.6032 -0.088062 0.000 0.000 0.112 0.448 0.032 0.408
#> SRR1431735 1 0.4242 0.642626 0.716 0.000 0.040 0.000 0.012 0.232
#> SRR1417387 1 0.1367 0.755390 0.944 0.000 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1445984 1 0.3979 0.616084 0.708 0.000 0.000 0.036 0.000 0.256
#> SRR1370447 4 0.0891 0.660130 0.000 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1446308 2 0.4601 0.277837 0.000 0.628 0.312 0.000 0.000 0.060
#> SRR1437346 2 0.5529 -0.044603 0.000 0.516 0.336 0.000 0.000 0.148
#> SRR1103143 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.1701 0.751006 0.920 0.000 0.000 0.000 0.008 0.072
#> SRR1073191 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.1269 0.756655 0.956 0.000 0.000 0.012 0.012 0.020
#> SRR1468914 4 0.3062 0.608949 0.008 0.000 0.008 0.824 0.004 0.156
#> SRR1319584 5 0.6450 0.433564 0.000 0.140 0.328 0.000 0.476 0.056
#> SRR1486584 1 0.4524 0.358267 0.584 0.000 0.000 0.376 0.000 0.040
#> SRR813536 4 0.0520 0.673497 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1317939 2 0.0363 0.895095 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.2558 0.714825 0.840 0.000 0.000 0.004 0.156 0.000
#> SRR1341921 4 0.2006 0.673217 0.104 0.000 0.000 0.892 0.000 0.004
#> SRR1399178 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.2340 0.718971 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1328551 2 0.3714 0.376315 0.000 0.656 0.340 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.2101 0.559673 0.000 0.100 0.000 0.004 0.892 0.004
#> SRR1079543 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR816427 3 0.5563 0.135361 0.000 0.400 0.484 0.000 0.108 0.008
#> SRR1076681 2 0.4464 0.329348 0.000 0.624 0.340 0.000 0.008 0.028
#> SRR1335314 4 0.4936 0.123425 0.000 0.000 0.036 0.540 0.016 0.408
#> SRR1400799 3 0.2997 0.366264 0.000 0.060 0.844 0.000 0.000 0.096
#> SRR1074578 4 0.1418 0.688753 0.024 0.000 0.000 0.944 0.000 0.032
#> SRR1312226 5 0.4540 0.578227 0.000 0.324 0.036 0.000 0.632 0.008
#> SRR1416207 1 0.0458 0.753732 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1447371 1 0.2833 0.701632 0.836 0.000 0.012 0.000 0.004 0.148
#> SRR1069328 4 0.1946 0.677610 0.012 0.000 0.004 0.912 0.000 0.072
#> SRR1445023 4 0.5390 0.123623 0.016 0.000 0.040 0.560 0.020 0.364
#> SRR1077599 2 0.2311 0.780807 0.000 0.880 0.104 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453480 2 0.0547 0.889309 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.3202 0.711831 0.800 0.000 0.000 0.000 0.176 0.024
#> SRR1074839 3 0.5258 0.164277 0.000 0.384 0.524 0.000 0.088 0.004
#> SRR1458727 5 0.4434 0.330064 0.000 0.000 0.040 0.008 0.668 0.284
#> SRR1436949 5 0.4322 0.616814 0.000 0.288 0.032 0.000 0.672 0.008
#> SRR1070429 3 0.5873 0.382075 0.000 0.200 0.432 0.000 0.000 0.368
#> SRR1458158 4 0.1901 0.685029 0.076 0.000 0.000 0.912 0.008 0.004
#> SRR1432408 6 0.7354 0.405290 0.248 0.000 0.096 0.240 0.008 0.408
#> SRR1310334 4 0.2809 0.623014 0.168 0.000 0.000 0.824 0.004 0.004
#> SRR1418201 3 0.4963 0.426309 0.000 0.044 0.576 0.000 0.016 0.364
#> SRR1385434 6 0.5011 0.096115 0.020 0.000 0.016 0.376 0.016 0.572
#> SRR1415591 3 0.4798 0.438112 0.000 0.076 0.612 0.000 0.000 0.312
#> SRR1402009 1 0.1584 0.746798 0.928 0.000 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR1316055 1 0.4130 0.601335 0.696 0.000 0.000 0.044 0.000 0.260
#> SRR1308734 3 0.5169 0.423122 0.000 0.048 0.564 0.000 0.024 0.364
#> SRR1498973 5 0.4552 0.674904 0.000 0.204 0.092 0.000 0.700 0.004
#> SRR1397115 4 0.0881 0.675083 0.012 0.000 0.000 0.972 0.008 0.008
#> SRR1392141 1 0.4570 0.651764 0.680 0.000 0.000 0.000 0.092 0.228
#> SRR814341 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313601 2 0.0891 0.882863 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000 0.008
#> SRR1459609 2 0.0146 0.899901 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.5463 0.405492 0.000 0.044 0.552 0.000 0.048 0.356
#> SRR809919 1 0.5244 0.551116 0.644 0.000 0.000 0.012 0.192 0.152
#> SRR1370818 1 0.5847 0.145003 0.488 0.000 0.000 0.252 0.000 0.260
#> SRR1323651 3 0.2787 0.337167 0.000 0.072 0.872 0.000 0.012 0.044
#> SRR1357297 4 0.0665 0.683270 0.008 0.000 0.000 0.980 0.004 0.008
#> SRR818170 5 0.5397 0.586517 0.000 0.064 0.232 0.000 0.644 0.060
#> SRR1091230 2 0.0993 0.880231 0.000 0.964 0.024 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470556 2 0.0260 0.897612 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0260 0.753648 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1095285 3 0.3610 0.302841 0.000 0.060 0.828 0.000 0.064 0.048
#> SRR1317731 5 0.5258 0.582028 0.000 0.052 0.236 0.000 0.652 0.060
#> SRR1490785 1 0.1285 0.749691 0.944 0.000 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1432032 1 0.3982 0.652940 0.740 0.000 0.000 0.060 0.000 0.200
#> SRR1447808 1 0.3864 0.443988 0.648 0.000 0.000 0.344 0.004 0.004
#> SRR809534 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.3883 0.585285 0.000 0.332 0.012 0.000 0.656 0.000
#> SRR812128 5 0.5807 0.398361 0.000 0.128 0.404 0.000 0.456 0.012
#> SRR1101513 1 0.5763 -0.000912 0.500 0.000 0.000 0.292 0.000 0.208
#> SRR1415708 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.4956 0.428661 0.000 0.048 0.568 0.000 0.012 0.372
#> SRR1390371 2 0.0291 0.898072 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480263 2 0.0146 0.899911 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1464473 3 0.4799 0.429353 0.000 0.044 0.580 0.000 0.008 0.368
#> SRR1076801 1 0.3384 0.666635 0.760 0.000 0.000 0.004 0.008 0.228
#> SRR1080044 1 0.3202 0.704891 0.800 0.000 0.000 0.024 0.176 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.5210 0.220334 0.036 0.000 0.016 0.584 0.016 0.348
#> SRR1069871 4 0.2473 0.648492 0.136 0.000 0.000 0.856 0.008 0.000
#> SRR1095744 5 0.3445 0.643315 0.000 0.260 0.008 0.000 0.732 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 3 0.5708 0.112137 0.000 0.352 0.504 0.000 0.136 0.008
#> SRR1075054 2 0.0291 0.899996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1083480 1 0.1957 0.734709 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1075458 1 0.2809 0.709601 0.824 0.000 0.000 0.004 0.004 0.168
#> SRR1417023 1 0.6326 -0.079488 0.432 0.000 0.016 0.236 0.000 0.316
#> SRR1309333 3 0.5656 0.122185 0.000 0.356 0.508 0.000 0.128 0.008
#> SRR1333676 4 0.5389 0.022834 0.428 0.000 0.000 0.460 0.000 0.112
#> SRR1352996 4 0.0551 0.682230 0.008 0.000 0.000 0.984 0.004 0.004
#> SRR1093172 4 0.0520 0.670466 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1413137 4 0.0291 0.674167 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1469973 3 0.5348 0.155927 0.000 0.404 0.504 0.000 0.084 0.008
#> SRR1420026 3 0.5996 -0.092219 0.000 0.232 0.500 0.000 0.260 0.008
#> SRR817306 4 0.4066 0.541947 0.064 0.000 0.000 0.732 0.000 0.204
#> SRR1416266 4 0.0622 0.668337 0.000 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1071011 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090290 4 0.5428 0.261345 0.176 0.000 0.000 0.572 0.000 0.252
#> SRR1435394 2 0.2730 0.712418 0.000 0.836 0.152 0.000 0.000 0.012
#> SRR1383192 4 0.0146 0.676241 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419962 3 0.4890 0.427293 0.000 0.044 0.576 0.000 0.012 0.368
#> SRR1094357 1 0.0622 0.753760 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1081639 3 0.6119 0.357438 0.000 0.044 0.500 0.000 0.112 0.344
#> SRR1356016 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.1440 0.522006 0.000 0.044 0.004 0.004 0.944 0.004
#> SRR1312147 1 0.4002 0.611626 0.704 0.000 0.000 0.036 0.000 0.260
#> SRR1473891 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.4114 0.509018 0.196 0.000 0.000 0.732 0.000 0.072
#> SRR1474930 3 0.4666 0.223601 0.000 0.296 0.644 0.000 0.052 0.008
#> SRR1470988 4 0.0717 0.669001 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR811915 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0260 0.753648 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313770 5 0.4731 0.554550 0.000 0.044 0.344 0.000 0.604 0.008
#> SRR1315780 2 0.2716 0.730820 0.000 0.852 0.004 0.008 0.132 0.004
#> SRR1073631 1 0.4247 0.660931 0.740 0.000 0.000 0.164 0.092 0.004
#> SRR819124 4 0.3506 0.611664 0.156 0.000 0.000 0.792 0.000 0.052
#> SRR1310997 5 0.5616 0.367233 0.000 0.112 0.436 0.000 0.444 0.008
#> SRR1464494 3 0.5564 -0.280444 0.000 0.112 0.504 0.000 0.376 0.008
#> SRR1357083 3 0.6061 0.308434 0.000 0.308 0.408 0.000 0.000 0.284
#> SRR1475842 3 0.4808 0.142681 0.000 0.468 0.480 0.000 0.052 0.000
#> SRR1378085 1 0.3470 0.692747 0.796 0.000 0.000 0.052 0.000 0.152
#> SRR1378220 3 0.5763 0.258076 0.000 0.372 0.452 0.000 0.000 0.176
#> SRR1467704 1 0.3705 0.656680 0.748 0.000 0.000 0.024 0.004 0.224
#> SRR1348885 5 0.4613 0.312386 0.000 0.000 0.032 0.264 0.676 0.028
#> SRR1325826 1 0.4468 0.037081 0.492 0.000 0.000 0.484 0.004 0.020
#> SRR1466812 4 0.3663 0.558918 0.180 0.000 0.000 0.776 0.004 0.040
#> SRR1345692 3 0.5932 -0.156036 0.000 0.196 0.504 0.000 0.292 0.008
#> SRR1401040 3 0.4575 0.435155 0.000 0.048 0.600 0.000 0.000 0.352
#> SRR1097954 1 0.4588 0.555963 0.652 0.000 0.008 0.024 0.012 0.304
#> SRR1374396 4 0.3078 0.564381 0.000 0.000 0.000 0.796 0.012 0.192
#> SRR1454073 3 0.5502 0.142726 0.000 0.380 0.508 0.000 0.104 0.008
#> SRR1355747 1 0.4174 0.707556 0.736 0.000 0.000 0.000 0.172 0.092
#> SRR1429368 3 0.4845 0.432580 0.000 0.048 0.580 0.000 0.008 0.364
#> SRR1398138 3 0.5237 0.159461 0.000 0.396 0.516 0.000 0.084 0.004
#> SRR1379260 1 0.3884 0.631161 0.724 0.000 0.000 0.036 0.000 0.240
#> SRR1361436 3 0.5859 0.382829 0.000 0.196 0.432 0.000 0.000 0.372
#> SRR817142 2 0.1367 0.859988 0.000 0.944 0.044 0.000 0.000 0.012
#> SRR1315291 6 0.6975 0.413959 0.140 0.000 0.052 0.192 0.064 0.552
#> SRR1309314 3 0.6068 0.238367 0.000 0.008 0.464 0.004 0.172 0.352
#> SRR1420085 3 0.5674 0.103169 0.000 0.424 0.448 0.000 0.120 0.008
#> SRR1361308 3 0.5285 0.426628 0.000 0.108 0.524 0.000 0.000 0.368
#> SRR1472126 4 0.2420 0.667663 0.128 0.000 0.000 0.864 0.004 0.004
#> SRR1380482 5 0.5390 0.548836 0.000 0.064 0.288 0.000 0.608 0.040
#> SRR1099789 1 0.0000 0.753689 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.3755 0.654999 0.000 0.244 0.020 0.000 0.732 0.004
#> SRR1339276 1 0.2664 0.705486 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1418368 1 0.3551 0.695437 0.784 0.000 0.000 0.048 0.168 0.000
#> SRR1399353 1 0.4461 0.685011 0.704 0.000 0.000 0.000 0.104 0.192
#> SRR1096760 2 0.4882 0.131713 0.000 0.576 0.352 0.000 0.000 0.072
#> SRR1440290 3 0.3907 0.291300 0.000 0.268 0.704 0.000 0.000 0.028
#> SRR1330813 2 0.1151 0.874430 0.000 0.956 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1458931 2 0.1268 0.864800 0.000 0.952 0.036 0.000 0.008 0.004
#> SRR812294 4 0.4301 0.463403 0.064 0.000 0.000 0.696 0.000 0.240
#> SRR1394321 1 0.2263 0.733934 0.884 0.000 0.000 0.016 0.000 0.100
#> SRR1081160 2 0.0291 0.899336 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469704 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.2562 0.712407 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1477173 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086752 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0146 0.899911 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1390143 1 0.4636 -0.038831 0.516 0.000 0.000 0.444 0.000 0.040
#> SRR1390413 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.4551 0.434850 0.000 0.048 0.608 0.000 0.000 0.344
#> SRR1312169 4 0.0436 0.677859 0.004 0.000 0.000 0.988 0.004 0.004
#> SRR1096687 4 0.1296 0.689368 0.044 0.000 0.000 0.948 0.004 0.004
#> SRR1486139 1 0.2562 0.709173 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1470313 6 0.5894 0.304004 0.288 0.000 0.000 0.176 0.012 0.524
#> SRR1447893 2 0.4481 0.328590 0.000 0.648 0.296 0.000 0.000 0.056
#> SRR1466025 2 0.3043 0.718214 0.000 0.832 0.020 0.000 0.140 0.008
#> SRR1477429 4 0.3841 0.466013 0.256 0.000 0.000 0.716 0.000 0.028
#> SRR1445701 3 0.2957 0.288213 0.000 0.064 0.864 0.000 0.056 0.016
#> SRR820689 1 0.2527 0.709834 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1451876 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0146 0.900406 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1643 0.745876 0.924 0.000 0.000 0.008 0.000 0.068
#> SRR1489328 3 0.5935 0.017568 0.000 0.280 0.508 0.000 0.204 0.008
#> SRR1344462 1 0.3268 0.708932 0.812 0.000 0.000 0.044 0.144 0.000
#> SRR1082709 4 0.2669 0.624984 0.156 0.000 0.000 0.836 0.008 0.000
#> SRR1447784 1 0.2146 0.737806 0.880 0.000 0.000 0.000 0.004 0.116
#> SRR1355769 4 0.0779 0.678077 0.008 0.000 0.000 0.976 0.008 0.008
#> SRR1488237 2 0.0777 0.883050 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.2597 0.707831 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1480917 2 0.5323 0.166743 0.000 0.600 0.120 0.000 0.272 0.008
#> SRR1474485 1 0.3989 0.623042 0.720 0.000 0.000 0.044 0.000 0.236
#> SRR1089998 1 0.0520 0.754004 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1318140 1 0.2201 0.731536 0.896 0.000 0.000 0.076 0.000 0.028
#> SRR1319262 3 0.6070 0.313274 0.000 0.304 0.404 0.000 0.000 0.292
#> SRR1095188 3 0.5322 0.156071 0.000 0.376 0.524 0.000 0.096 0.004
#> SRR1454350 1 0.2527 0.709834 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1440374 1 0.2562 0.709210 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1359565 3 0.3395 0.380097 0.000 0.060 0.808 0.000 0.000 0.132
#> SRR1105417 4 0.5454 0.090546 0.016 0.000 0.040 0.528 0.020 0.396
#> SRR1325578 2 0.6198 -0.229783 0.000 0.432 0.412 0.000 0.112 0.044
#> SRR1358161 3 0.5463 0.405492 0.000 0.044 0.552 0.000 0.048 0.356
#> SRR1358665 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333971 2 0.0291 0.899996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1452010 4 0.1074 0.686519 0.012 0.000 0.000 0.960 0.000 0.028
#> SRR1418183 3 0.3961 0.294582 0.000 0.160 0.776 0.000 0.036 0.028
#> SRR1366345 1 0.2527 0.709834 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1387449 1 0.5670 0.101171 0.452 0.000 0.000 0.392 0.156 0.000
#> SRR1473461 1 0.4121 0.622008 0.720 0.000 0.000 0.060 0.000 0.220
#> SRR1090837 3 0.5942 0.372194 0.000 0.220 0.424 0.000 0.000 0.356
#> SRR1447828 3 0.4799 0.429353 0.000 0.044 0.580 0.000 0.008 0.368
#> SRR1338747 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.5877 0.381414 0.000 0.200 0.428 0.000 0.000 0.372
#> SRR1350280 4 0.1434 0.691430 0.048 0.000 0.000 0.940 0.000 0.012
#> SRR1088557 1 0.3916 0.647697 0.752 0.000 0.000 0.184 0.064 0.000
#> SRR1102656 2 0.0291 0.899996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1441443 2 0.4947 -0.117479 0.000 0.480 0.456 0.000 0.064 0.000
#> SRR1370682 3 0.4799 0.429353 0.000 0.044 0.580 0.000 0.008 0.368
#> SRR1475448 3 0.5927 0.374512 0.000 0.216 0.428 0.000 0.000 0.356
#> SRR1407291 4 0.0632 0.688546 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.1682 0.746234 0.928 0.000 0.000 0.020 0.000 0.052
#> SRR1363766 4 0.2174 0.677187 0.088 0.000 0.000 0.896 0.008 0.008
#> SRR1082592 5 0.4524 0.645747 0.000 0.064 0.208 0.000 0.712 0.016
#> SRR1325794 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095961 3 0.5314 0.431753 0.000 0.096 0.528 0.000 0.004 0.372
#> SRR1086702 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320806 3 0.4829 0.190594 0.000 0.404 0.544 0.000 0.048 0.004
#> SRR1457527 3 0.5449 0.420982 0.000 0.128 0.504 0.000 0.000 0.368
#> SRR1098831 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1474374 3 0.4609 0.434337 0.000 0.048 0.588 0.000 0.000 0.364
#> SRR1488858 4 0.5889 0.042357 0.260 0.000 0.000 0.476 0.000 0.264
#> SRR1454695 1 0.3693 0.696331 0.796 0.000 0.000 0.084 0.004 0.116
#> SRR1090241 2 0.0291 0.899336 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1329863 2 0.0146 0.899911 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357733 1 0.0632 0.753619 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1362135 1 0.4176 0.633401 0.720 0.000 0.000 0.068 0.000 0.212
#> SRR1379581 3 0.4963 0.426309 0.000 0.044 0.576 0.000 0.016 0.364
#> SRR1309182 4 0.2432 0.669262 0.100 0.000 0.000 0.876 0.000 0.024
#> SRR1437668 1 0.3240 0.656196 0.752 0.000 0.000 0.004 0.000 0.244
#> SRR1084742 5 0.4679 0.663432 0.000 0.116 0.172 0.000 0.704 0.008
#> SRR1433538 4 0.1693 0.691609 0.044 0.000 0.000 0.932 0.004 0.020
#> SRR1085063 2 0.0291 0.899996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1454247 5 0.4381 0.680118 0.000 0.128 0.136 0.000 0.732 0.004
#> SRR1097100 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR818622 2 0.1151 0.872696 0.000 0.956 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1072388 1 0.3329 0.658977 0.756 0.000 0.000 0.004 0.004 0.236
#> SRR1070332 5 0.4368 0.515808 0.000 0.384 0.016 0.000 0.592 0.008
#> SRR1320761 2 0.0436 0.899241 0.000 0.988 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1076195 6 0.6760 0.333750 0.212 0.000 0.016 0.316 0.024 0.432
#> SRR1069895 2 0.3377 0.628894 0.000 0.784 0.188 0.000 0.000 0.028
#> SRR1099144 1 0.4190 0.599154 0.692 0.000 0.000 0.048 0.000 0.260
#> SRR1385150 3 0.5877 0.380896 0.000 0.200 0.428 0.000 0.000 0.372
#> SRR1420191 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332625 4 0.5446 0.212851 0.176 0.000 0.000 0.568 0.000 0.256
#> SRR1102583 4 0.2020 0.677160 0.096 0.000 0.000 0.896 0.008 0.000
#> SRR1456971 1 0.4022 0.616708 0.708 0.000 0.000 0.040 0.000 0.252
#> SRR1340574 1 0.1387 0.747743 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1444830 3 0.4413 0.099200 0.000 0.488 0.492 0.000 0.012 0.008
#> SRR1096267 1 0.0146 0.753701 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087127 5 0.4998 0.524320 0.000 0.048 0.356 0.000 0.580 0.016
#> SRR1408553 4 0.0260 0.674700 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069231 4 0.4887 0.257860 0.280 0.000 0.000 0.624 0.000 0.096
#> SRR1325642 2 0.4585 0.376595 0.000 0.644 0.304 0.000 0.044 0.008
#> SRR1362103 1 0.1802 0.743964 0.916 0.000 0.000 0.012 0.000 0.072
#> SRR1321942 1 0.2128 0.756562 0.908 0.000 0.000 0.004 0.032 0.056
#> SRR1094380 1 0.2562 0.712407 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0603 0.891350 0.000 0.980 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077874 2 0.0291 0.899996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR808299 2 0.0146 0.899901 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3608 0.649630 0.000 0.248 0.012 0.000 0.736 0.004
#> SRR1481238 3 0.4115 0.261291 0.000 0.268 0.696 0.000 0.032 0.004
#> SRR1443568 3 0.4618 0.238477 0.000 0.240 0.688 0.000 0.056 0.016
#> SRR1380249 4 0.6067 -0.109748 0.332 0.000 0.000 0.396 0.000 0.272
#> SRR1080143 4 0.2122 0.681733 0.076 0.000 0.000 0.900 0.000 0.024
#> SRR1383148 4 0.5288 0.285268 0.156 0.000 0.000 0.592 0.000 0.252
#> SRR1357042 4 0.2186 0.691076 0.056 0.000 0.000 0.908 0.012 0.024
#> SRR1416025 3 0.4971 0.157529 0.000 0.424 0.508 0.000 0.068 0.000
#> SRR1431015 3 0.5283 0.151485 0.000 0.420 0.496 0.000 0.076 0.008
#> SRR1078709 3 0.5968 -0.043623 0.000 0.248 0.508 0.000 0.236 0.008
#> SRR813283 1 0.0146 0.753701 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430226 2 0.0146 0.899901 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.1204 0.749939 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 6 0.6417 0.136857 0.000 0.000 0.064 0.356 0.116 0.464
#> SRR807679 1 0.2744 0.725955 0.840 0.000 0.000 0.000 0.144 0.016
#> SRR1333811 3 0.2620 0.322915 0.000 0.048 0.888 0.000 0.024 0.040
#> SRR1078660 3 0.5927 0.025358 0.000 0.284 0.508 0.000 0.200 0.008
#> SRR1331730 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.2946 0.711250 0.812 0.000 0.000 0.000 0.176 0.012
#> SRR1432542 1 0.3421 0.638239 0.736 0.000 0.000 0.008 0.000 0.256
#> SRR1418041 1 0.3122 0.659383 0.804 0.000 0.000 0.176 0.000 0.020
#> SRR1085211 1 0.0692 0.755864 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1339812 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402437 1 0.3719 0.636524 0.728 0.000 0.000 0.024 0.000 0.248
#> SRR1350958 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396822 2 0.2489 0.750441 0.000 0.860 0.128 0.000 0.000 0.012
#> SRR1441934 3 0.4844 0.158529 0.000 0.440 0.504 0.000 0.056 0.000
#> SRR1472552 3 0.5877 0.380896 0.000 0.200 0.428 0.000 0.000 0.372
#> SRR1488881 3 0.5870 0.383166 0.000 0.200 0.436 0.000 0.000 0.364
#> SRR1102973 1 0.2664 0.705486 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1071131 3 0.4921 0.206912 0.000 0.320 0.608 0.000 0.064 0.008
#> SRR1074502 1 0.5434 0.335855 0.544 0.000 0.000 0.312 0.144 0.000
#> SRR1325271 1 0.3911 0.617634 0.712 0.000 0.000 0.032 0.000 0.256
#> SRR1409171 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0146 0.899911 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0363 0.895095 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.4972 0.373392 0.116 0.000 0.000 0.628 0.000 0.256
#> SRR1431887 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0717 0.672494 0.000 0.000 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1488491 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1356351 2 0.1151 0.872866 0.000 0.956 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1369514 4 0.2001 0.683095 0.040 0.000 0.000 0.912 0.000 0.048
#> SRR1453299 3 0.5737 0.400725 0.000 0.172 0.460 0.000 0.000 0.368
#> SRR1436300 1 0.0547 0.753737 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1348490 5 0.4091 0.341158 0.000 0.472 0.000 0.000 0.520 0.008
#> SRR1091767 3 0.5911 0.049175 0.000 0.316 0.496 0.000 0.180 0.008
#> SRR1354467 3 0.5714 0.403104 0.000 0.168 0.464 0.000 0.000 0.368
#> SRR1069074 2 0.0717 0.889056 0.000 0.976 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1452399 3 0.5579 0.134456 0.000 0.336 0.532 0.000 0.124 0.008
#> SRR1437430 3 0.6137 0.394831 0.000 0.132 0.472 0.000 0.032 0.364
#> SRR1419736 5 0.4332 0.691108 0.000 0.156 0.096 0.000 0.740 0.008
#> SRR1313343 3 0.5186 0.432443 0.000 0.060 0.556 0.000 0.016 0.368
#> SRR1077619 1 0.5922 0.045189 0.464 0.000 0.000 0.284 0.000 0.252
#> SRR1083530 4 0.5725 -0.055118 0.416 0.000 0.000 0.420 0.000 0.164
#> SRR1333633 3 0.6055 0.387207 0.000 0.140 0.552 0.000 0.040 0.268
#> SRR1354999 3 0.4152 0.269124 0.000 0.264 0.700 0.000 0.024 0.012
#> SRR1443592 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 4 0.5238 0.288549 0.292 0.000 0.000 0.580 0.128 0.000
#> SRR1378818 5 0.4815 0.605258 0.000 0.044 0.220 0.000 0.692 0.044
#> SRR1413182 4 0.2260 0.638183 0.000 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1464559 1 0.4834 0.518837 0.640 0.000 0.000 0.100 0.000 0.260
#> SRR1413075 5 0.5142 0.541346 0.000 0.112 0.304 0.000 0.584 0.000
#> SRR1487928 4 0.3744 0.514000 0.016 0.000 0.000 0.724 0.004 0.256
#> SRR1388997 2 0.4903 -0.145227 0.000 0.472 0.468 0.000 0.060 0.000
#> SRR1092865 2 0.4319 0.178640 0.000 0.576 0.400 0.000 0.024 0.000
#> SRR1102729 1 0.5141 0.311752 0.548 0.000 0.008 0.036 0.016 0.392
#> SRR1456423 1 0.1616 0.747095 0.932 0.000 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR1321591 2 0.0820 0.883787 0.000 0.972 0.016 0.000 0.012 0.000
#> SRR1376874 3 0.4697 0.430935 0.000 0.044 0.584 0.000 0.004 0.368
#> SRR1339903 4 0.3786 0.559623 0.220 0.000 0.000 0.748 0.024 0.008
#> SRR1346710 1 0.2655 0.725129 0.848 0.000 0.000 0.004 0.008 0.140
#> SRR1418771 2 0.0547 0.889482 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0291 0.899336 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480941 2 0.6848 0.023866 0.164 0.480 0.272 0.004 0.000 0.080
#> SRR1479175 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0551 0.892547 0.000 0.984 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR1491354 4 0.3688 0.522750 0.256 0.000 0.000 0.724 0.000 0.020
#> SRR1433884 3 0.5452 0.154610 0.000 0.372 0.520 0.000 0.100 0.008
#> SRR1471074 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 3 0.4882 0.163007 0.000 0.428 0.512 0.000 0.060 0.000
#> SRR1355554 3 0.3779 0.301939 0.000 0.140 0.796 0.000 0.032 0.032
#> SRR1487173 1 0.1327 0.748117 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1474253 1 0.2058 0.740513 0.908 0.000 0.000 0.036 0.000 0.056
#> SRR1322918 3 0.6742 -0.006373 0.000 0.356 0.408 0.000 0.060 0.176
#> SRR1318331 2 0.4808 -0.139277 0.000 0.480 0.468 0.000 0.052 0.000
#> SRR1321333 3 0.4958 0.438622 0.000 0.076 0.560 0.000 0.000 0.364
#> SRR1474231 1 0.1285 0.754483 0.944 0.000 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1350545 4 0.1364 0.691364 0.048 0.000 0.000 0.944 0.004 0.004
#> SRR1091328 1 0.3163 0.666636 0.764 0.000 0.000 0.004 0.000 0.232
#> SRR814447 3 0.4963 0.426309 0.000 0.044 0.576 0.000 0.016 0.364
#> SRR1455989 2 0.0508 0.894407 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453680 3 0.4697 0.430935 0.000 0.044 0.584 0.000 0.004 0.368
#> SRR1470356 2 0.0146 0.900880 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1342977 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.3940 0.351627 0.000 0.640 0.348 0.000 0.012 0.000
#> SRR1097197 4 0.0653 0.681080 0.012 0.000 0.000 0.980 0.004 0.004
#> SRR1366729 3 0.4686 0.431686 0.000 0.044 0.588 0.000 0.004 0.364
#> SRR821282 3 0.4735 0.421718 0.000 0.044 0.568 0.000 0.004 0.384
#> SRR1074602 2 0.0909 0.883705 0.000 0.968 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR814633 2 0.0000 0.901390 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 6 0.4466 0.122910 0.000 0.000 0.180 0.004 0.100 0.716
#> SRR1319100 1 0.2664 0.705486 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1324004 3 0.3158 0.302749 0.000 0.060 0.856 0.000 0.052 0.032
#> SRR1457459 1 0.2527 0.709834 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1421031 4 0.4495 0.291146 0.028 0.000 0.004 0.580 0.000 0.388
#> SRR1444598 5 0.4058 0.638273 0.000 0.044 0.196 0.000 0.748 0.012
#> SRR1091743 2 0.0993 0.880231 0.000 0.964 0.024 0.000 0.000 0.012
#> SRR819637 1 0.2491 0.718278 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1083848 1 0.0520 0.754004 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1088934 2 0.3500 0.598311 0.000 0.768 0.204 0.000 0.000 0.028
#> SRR1459785 3 0.3336 0.378943 0.000 0.056 0.812 0.000 0.000 0.132
#> SRR1083700 1 0.1219 0.752481 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1375531 1 0.4191 0.575965 0.732 0.000 0.000 0.180 0.000 0.088
#> SRR1323470 6 0.6446 0.262500 0.000 0.000 0.304 0.220 0.028 0.448
#> SRR814657 4 0.0405 0.683276 0.008 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4917 0.509 0.509
#> 3 3 0.893 0.943 0.964 0.0573 0.997 0.993
#> 4 4 0.802 0.869 0.930 0.0849 0.980 0.961
#> 5 5 0.738 0.835 0.904 0.0846 0.942 0.881
#> 6 6 0.682 0.729 0.850 0.1441 0.877 0.714
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.1414 0.980 0.020 0.980
#> SRR1431735 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.1184 0.984 0.984 0.016
#> SRR1310334 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 2 0.1414 0.980 0.020 0.980
#> SRR1309314 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1355769 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814657 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.4504 1.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1326059 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR809406 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.2959 0.928 0.000 0.900 0.100
#> SRR819559 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1387899 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442292 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102320 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.3412 0.910 0.000 0.876 0.124
#> SRR1070036 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098426 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1090310 2 0.2711 0.935 0.000 0.912 0.088
#> SRR1429748 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1329947 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.2448 0.941 0.000 0.924 0.076
#> SRR1490761 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.2959 0.928 0.000 0.900 0.100
#> SRR1402944 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1092818 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.1163 0.940 0.972 0.000 0.028
#> SRR1464880 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331879 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.3482 0.907 0.000 0.872 0.128
#> SRR1068687 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437491 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.1411 0.936 0.964 0.000 0.036
#> SRR1354203 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0892 0.965 0.000 0.980 0.020
#> SRR1097857 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1338687 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.3816 0.842 0.852 0.000 0.148
#> SRR1486821 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1418540 1 0.1031 0.942 0.976 0.000 0.024
#> SRR1408788 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1359487 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1080648 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3551 0.858 0.868 0.000 0.132
#> SRR1321829 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.3192 0.919 0.000 0.888 0.112
#> SRR1445387 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1349300 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.2537 0.904 0.920 0.000 0.080
#> SRR1453769 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1391811 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.2537 0.904 0.920 0.000 0.080
#> SRR1086490 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1088511 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.2537 0.906 0.920 0.000 0.080
#> SRR1384431 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359738 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1332141 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1344034 2 0.2448 0.941 0.000 0.924 0.076
#> SRR1080391 1 0.3879 0.837 0.848 0.000 0.152
#> SRR1347870 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417851 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079380 2 0.1411 0.960 0.000 0.964 0.036
#> SRR1102923 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0424 0.969 0.000 0.992 0.008
#> SRR1436840 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 2 0.4605 0.829 0.000 0.796 0.204
#> SRR1431735 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1417387 1 0.2537 0.904 0.920 0.000 0.080
#> SRR1445984 1 0.2796 0.894 0.908 0.000 0.092
#> SRR1370447 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1446308 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437346 2 0.3192 0.919 0.000 0.888 0.112
#> SRR1103143 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1319584 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1486584 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.2625 0.902 0.916 0.000 0.084
#> SRR1317939 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.1753 0.928 0.952 0.000 0.048
#> SRR1399178 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1076681 2 0.0747 0.966 0.000 0.984 0.016
#> SRR1335314 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1400799 2 0.2356 0.943 0.000 0.928 0.072
#> SRR1074578 1 0.1163 0.940 0.972 0.000 0.028
#> SRR1312226 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.1411 0.935 0.964 0.000 0.036
#> SRR1445023 1 0.3879 0.837 0.848 0.000 0.152
#> SRR1077599 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453480 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 2 0.4346 0.852 0.000 0.816 0.184
#> SRR1436949 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.2796 0.932 0.000 0.908 0.092
#> SRR1458158 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.4178 0.812 0.828 0.000 0.172
#> SRR1310334 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.3192 0.919 0.000 0.888 0.112
#> SRR1385434 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1415591 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1402009 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.3482 0.861 0.872 0.000 0.128
#> SRR1308734 2 0.2448 0.941 0.000 0.924 0.076
#> SRR1498973 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.2537 0.904 0.920 0.000 0.080
#> SRR814341 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1459609 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR809919 1 0.1031 0.943 0.976 0.000 0.024
#> SRR1370818 1 0.3482 0.861 0.872 0.000 0.128
#> SRR1323651 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357297 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.3116 0.923 0.000 0.892 0.108
#> SRR1091230 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.2448 0.942 0.000 0.924 0.076
#> SRR1317731 2 0.3267 0.916 0.000 0.884 0.116
#> SRR1490785 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397312 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.1860 0.953 0.000 0.948 0.052
#> SRR1101513 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0424 0.969 0.000 0.992 0.008
#> SRR1316033 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1390371 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480263 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1076801 1 0.2537 0.904 0.920 0.000 0.080
#> SRR1080044 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0747 0.947 0.984 0.000 0.016
#> SRR1069871 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1068929 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075054 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1417023 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1309333 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1333676 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1413137 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1469973 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420026 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR817306 1 0.1411 0.936 0.964 0.000 0.036
#> SRR1416266 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1071011 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.3816 0.842 0.852 0.000 0.148
#> SRR1435394 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1383192 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1094357 1 0.0747 0.947 0.984 0.000 0.016
#> SRR1081639 2 0.3412 0.910 0.000 0.876 0.124
#> SRR1356016 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.2356 0.911 0.928 0.000 0.072
#> SRR1473891 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.1289 0.938 0.968 0.000 0.032
#> SRR1474930 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.3879 0.837 0.848 0.000 0.152
#> SRR811915 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313770 2 0.3267 0.916 0.000 0.884 0.116
#> SRR1315780 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1163 0.940 0.972 0.000 0.028
#> SRR1310997 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1464494 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1357083 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1475842 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.1753 0.954 0.000 0.952 0.048
#> SRR1467704 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1348885 2 0.4346 0.852 0.000 0.816 0.184
#> SRR1325826 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.2537 0.906 0.920 0.000 0.080
#> SRR1345692 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1401040 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1097954 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1454073 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1355747 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1398138 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1361436 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR817142 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1315291 2 0.4605 0.829 0.000 0.796 0.204
#> SRR1309314 2 0.4346 0.852 0.000 0.816 0.184
#> SRR1420085 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1361308 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1472126 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1099789 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1339276 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0592 0.949 0.988 0.000 0.012
#> SRR1096760 2 0.2625 0.937 0.000 0.916 0.084
#> SRR1440290 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330813 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458931 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR812294 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1394321 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081160 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390413 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099570 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1312169 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1486139 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.3482 0.861 0.872 0.000 0.128
#> SRR1447893 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1466025 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.1964 0.922 0.944 0.000 0.056
#> SRR1445701 2 0.2448 0.942 0.000 0.924 0.076
#> SRR820689 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.3879 0.838 0.848 0.000 0.152
#> SRR1355769 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1089998 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.2625 0.937 0.000 0.916 0.084
#> SRR1095188 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.2356 0.943 0.000 0.928 0.072
#> SRR1105417 1 0.1860 0.926 0.948 0.000 0.052
#> SRR1325578 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1358161 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1358665 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1366345 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1447828 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1338747 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.3192 0.919 0.000 0.888 0.112
#> SRR1350280 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1102656 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0424 0.969 0.000 0.992 0.008
#> SRR1370682 2 0.3482 0.907 0.000 0.872 0.128
#> SRR1475448 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1407291 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.1964 0.951 0.000 0.944 0.056
#> SRR1325794 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1086702 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.1411 0.959 0.000 0.964 0.036
#> SRR1457527 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1098831 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.2356 0.943 0.000 0.928 0.072
#> SRR1488858 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1454695 1 0.3267 0.873 0.884 0.000 0.116
#> SRR1090241 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379581 2 0.3686 0.896 0.000 0.860 0.140
#> SRR1309182 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1163 0.940 0.972 0.000 0.028
#> SRR1084742 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1433538 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454247 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1072388 1 0.2959 0.887 0.900 0.000 0.100
#> SRR1070332 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.1411 0.959 0.000 0.964 0.036
#> SRR1076195 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1069895 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1099144 1 0.3551 0.858 0.868 0.000 0.132
#> SRR1385150 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1420191 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1102583 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2796 0.894 0.908 0.000 0.092
#> SRR1340574 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1408553 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1069231 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321942 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1077874 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR808299 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1481238 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0747 0.966 0.000 0.984 0.016
#> SRR1380249 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1080143 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1357042 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR813283 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.4346 0.852 0.000 0.816 0.184
#> SRR807679 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.2448 0.941 0.000 0.924 0.076
#> SRR1078660 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331730 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.2796 0.894 0.908 0.000 0.092
#> SRR1418041 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1085211 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0592 0.949 0.988 0.000 0.012
#> SRR1350958 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1441934 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1488881 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1102973 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071131 2 0.0747 0.966 0.000 0.984 0.016
#> SRR1074502 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.2959 0.887 0.900 0.000 0.100
#> SRR1409171 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1430045 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1384091 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1431887 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1488491 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.3686 0.851 0.860 0.000 0.140
#> SRR1453299 2 0.3192 0.919 0.000 0.888 0.112
#> SRR1436300 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.2356 0.943 0.000 0.928 0.072
#> SRR1091767 2 0.1529 0.958 0.000 0.960 0.040
#> SRR1354467 2 0.2711 0.934 0.000 0.912 0.088
#> SRR1069074 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.3482 0.907 0.000 0.872 0.128
#> SRR1419736 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.3116 0.922 0.000 0.892 0.108
#> SRR1077619 1 0.3879 0.837 0.848 0.000 0.152
#> SRR1083530 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.2448 0.941 0.000 0.924 0.076
#> SRR1354999 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443592 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378818 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1413182 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1464559 1 0.3482 0.861 0.872 0.000 0.128
#> SRR1413075 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.3941 0.833 0.844 0.000 0.156
#> SRR1388997 2 0.0424 0.969 0.000 0.992 0.008
#> SRR1092865 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0424 0.950 0.992 0.000 0.008
#> SRR1456423 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0592 0.968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1376874 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1339903 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095358 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480941 2 0.2878 0.931 0.000 0.904 0.096
#> SRR1479175 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487173 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1318331 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1474231 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.3816 0.889 0.000 0.852 0.148
#> SRR1455989 2 0.0424 0.969 0.000 0.992 0.008
#> SRR1453680 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1470356 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR1342977 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1366729 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR821282 2 0.3482 0.907 0.000 0.872 0.128
#> SRR1074602 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.2959 0.928 0.000 0.900 0.100
#> SRR1319100 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.2448 0.942 0.000 0.924 0.076
#> SRR1457459 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.3619 0.855 0.864 0.000 0.136
#> SRR1444598 2 0.4346 0.852 0.000 0.816 0.184
#> SRR1091743 2 0.0237 0.970 0.000 0.996 0.004
#> SRR819637 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0892 0.965 0.000 0.980 0.020
#> SRR1459785 2 0.2878 0.930 0.000 0.904 0.096
#> SRR1083700 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0237 0.952 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323470 3 0.4504 1.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR814657 1 0.0000 0.953 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.0779 1.000 0.004 0.000 0.016 0.980
#> SRR1326059 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR809406 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465313 2 0.3569 0.800 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR819559 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1387899 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102320 1 0.0469 0.920 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469926 2 0.4713 0.529 0.000 0.640 0.360 0.000
#> SRR1070036 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098426 1 0.0921 0.913 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1090310 2 0.2921 0.848 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1429748 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363654 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1329947 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.2814 0.859 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.3649 0.792 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1402944 2 0.3528 0.805 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.1474 0.902 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1464880 2 0.0469 0.926 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0469 0.927 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1331879 2 0.0336 0.929 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1320034 2 0.4830 0.457 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1068687 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.2868 0.853 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1354203 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0817 0.921 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1455214 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1092014 2 0.0921 0.922 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1097857 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473318 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.3356 0.816 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4382 0.704 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1486821 2 0.4522 0.609 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1418540 1 0.1211 0.908 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1408788 2 0.0707 0.926 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1359487 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1080648 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0921 0.919 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.4040 0.756 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1321829 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.3837 0.761 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.1302 0.913 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.2760 0.857 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1453769 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0707 0.923 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1366124 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1391811 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.2760 0.857 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1086490 2 0.3074 0.837 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3024 0.845 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1384431 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1072055 1 0.0921 0.913 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1359738 2 0.2921 0.848 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1332141 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085900 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.1118 0.917 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1344034 2 0.2814 0.859 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1080391 1 0.4431 0.695 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1347870 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0188 0.928 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1460211 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0921 0.919 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0592 0.927 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1417851 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1443350 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1076705 1 0.0817 0.915 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1079380 2 0.2081 0.894 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0592 0.925 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0592 0.926 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.0707 0.633 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1431735 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417387 1 0.2760 0.857 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1445984 1 0.2868 0.851 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1370447 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1446308 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1437346 2 0.3837 0.761 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.4454 0.689 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1319584 2 0.3610 0.798 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.3074 0.842 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1317939 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.2469 0.872 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1399178 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.1211 0.912 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0336 0.928 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1076681 2 0.0921 0.921 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1335314 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1400799 2 0.2814 0.855 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1074578 1 0.2011 0.888 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1312226 2 0.0336 0.929 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069328 1 0.2814 0.856 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1445023 1 0.4431 0.695 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1077599 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0592 0.693 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1436949 2 0.0469 0.926 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1070429 2 0.3123 0.834 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.5069 0.650 0.664 0.000 0.016 0.320
#> SRR1310334 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.4817 0.467 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1385434 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1415591 2 0.3400 0.812 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1402009 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1316055 1 0.3975 0.763 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1308734 2 0.2814 0.859 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1498973 2 0.0592 0.924 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.2760 0.857 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR814341 2 0.0188 0.928 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1313601 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.3610 0.798 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR809919 1 0.1118 0.910 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1370818 1 0.4040 0.755 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1323651 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.4193 0.709 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.3266 0.827 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1317731 2 0.4713 0.529 0.000 0.640 0.360 0.000
#> SRR1490785 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432032 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1397312 2 0.0592 0.926 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR812128 2 0.2408 0.879 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1101513 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1415708 2 0.0707 0.925 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1316033 2 0.4431 0.639 0.000 0.696 0.304 0.000
#> SRR1390371 2 0.0336 0.928 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.4543 0.602 0.000 0.676 0.324 0.000
#> SRR1076801 1 0.2760 0.857 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1080044 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0817 0.915 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1069871 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.1302 0.913 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0469 0.927 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1075054 2 0.0469 0.926 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417023 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1309333 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1333676 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352996 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1413137 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1469973 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1420026 2 0.0336 0.928 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR817306 1 0.2868 0.853 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1416266 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1071011 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.4382 0.704 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1435394 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.4500 0.617 0.000 0.684 0.316 0.000
#> SRR1094357 1 0.0817 0.915 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1081639 2 0.4866 0.418 0.000 0.596 0.404 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.1211 0.912 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1312147 1 0.2814 0.855 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1473891 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.2216 0.881 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1474930 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470988 1 0.4477 0.685 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR811915 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0592 0.927 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1313770 2 0.4730 0.520 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.2011 0.888 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1310997 2 0.0817 0.923 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1464494 2 0.1211 0.919 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1357083 2 0.3074 0.837 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378220 2 0.2647 0.866 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1467704 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348885 3 0.0592 0.693 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.3024 0.845 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1345692 2 0.0817 0.923 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1401040 2 0.3219 0.828 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1097954 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374396 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1454073 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.4500 0.619 0.000 0.684 0.316 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0921 0.913 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1361436 2 0.3356 0.816 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR817142 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1315291 3 0.0707 0.633 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1309314 3 0.0592 0.693 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1420085 2 0.0336 0.928 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1361308 2 0.3486 0.803 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.3528 0.805 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.1302 0.913 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0469 0.919 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1096760 2 0.2868 0.851 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1440290 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1330813 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458931 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR812294 1 0.4454 0.689 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1394321 1 0.0469 0.919 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1081160 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0188 0.928 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1390143 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1390413 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1099570 2 0.3074 0.837 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.2530 0.869 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1486139 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.4040 0.755 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1447893 2 0.3024 0.841 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1466025 2 0.0707 0.926 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1477429 1 0.2589 0.866 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1445701 2 0.3219 0.830 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0707 0.917 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1489328 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.4456 0.719 0.716 0.000 0.004 0.280
#> SRR1355769 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0707 0.923 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1474485 1 0.4454 0.689 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1089998 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1318140 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.2868 0.851 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1095188 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.2921 0.850 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1105417 1 0.2530 0.870 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1325578 2 0.3569 0.799 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1358161 2 0.3610 0.798 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0921 0.919 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090837 2 0.3074 0.837 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1447828 2 0.4522 0.609 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.3837 0.761 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1102656 2 0.0188 0.928 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441443 2 0.0592 0.926 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1370682 2 0.4830 0.457 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1475448 2 0.2921 0.848 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.2469 0.877 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1325794 2 0.0469 0.927 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1095961 2 0.3649 0.786 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.1867 0.897 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1457527 2 0.4697 0.542 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.2921 0.850 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1488858 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1454695 1 0.4072 0.752 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1090241 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1379581 3 0.4933 0.103 0.000 0.432 0.568 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1474 0.902 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1084742 2 0.1302 0.913 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0592 0.927 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1454247 2 0.1118 0.914 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1072388 1 0.3444 0.815 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1070332 2 0.1022 0.919 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1320761 2 0.1474 0.909 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1076195 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1069895 2 0.1118 0.918 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1099144 1 0.4040 0.756 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1385150 2 0.3024 0.841 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4454 0.689 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1102583 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2868 0.851 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1340574 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.3688 0.790 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1408553 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1069231 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1321942 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447499 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1118 0.918 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1077874 2 0.0592 0.927 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.1302 0.913 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1481238 2 0.0707 0.923 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1443568 2 0.1474 0.909 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1380249 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1080143 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1357042 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0469 0.927 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR813283 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430226 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466927 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.0592 0.693 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.2868 0.856 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1078660 2 0.0469 0.928 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.2868 0.851 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1418041 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1085211 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1022 0.911 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1350958 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.3074 0.837 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1488881 2 0.3074 0.837 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1102973 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071131 2 0.0921 0.921 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.3444 0.815 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1409171 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0469 0.927 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1384091 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1431887 2 0.0188 0.928 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096525 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1488491 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0817 0.921 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1369514 1 0.4304 0.718 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1453299 2 0.3873 0.756 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.3356 0.824 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1091767 2 0.1557 0.908 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1354467 2 0.3074 0.837 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.4730 0.520 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1419736 2 0.1118 0.914 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1313343 2 0.4277 0.681 0.000 0.720 0.280 0.000
#> SRR1077619 1 0.4406 0.699 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1083530 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.2814 0.859 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1354999 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0469 0.919 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1378818 2 0.4008 0.744 0.000 0.756 0.244 0.000
#> SRR1413182 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1464559 1 0.4040 0.755 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1413075 2 0.0817 0.921 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1487928 1 0.4522 0.674 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1388997 2 0.0592 0.926 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0592 0.918 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456423 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0817 0.923 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1376874 2 0.4697 0.542 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1095358 2 0.0469 0.928 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1480941 2 0.3837 0.768 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0336 0.928 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.3486 0.803 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091328 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.3528 0.451 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1455989 2 0.0707 0.925 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1453680 2 0.4679 0.549 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1470356 2 0.0336 0.929 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0469 0.919 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1366729 2 0.4679 0.549 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR821282 2 0.4830 0.457 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1074602 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.929 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.3688 0.788 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.3219 0.831 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.4222 0.732 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1444598 3 0.0592 0.693 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1091743 2 0.0188 0.929 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0817 0.923 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1459785 2 0.3801 0.768 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR1083700 1 0.0188 0.921 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375531 1 0.0336 0.920 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1323470 4 0.0779 1.000 0.004 0.000 0.016 0.980
#> SRR814657 1 0.0000 0.921 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467726 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.2127 1.000 0.000 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR809406 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465313 2 0.4646 0.719 0.000 0.712 0.060 0.000 0.228
#> SRR819559 1 0.2074 0.839 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1387899 2 0.1043 0.888 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1442292 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1102320 1 0.0794 0.921 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1469926 2 0.4359 0.461 0.000 0.584 0.000 0.004 0.412
#> SRR1070036 1 0.0510 0.928 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1098426 1 0.1121 0.906 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1090310 2 0.3086 0.806 0.000 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1429748 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1378308 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.3274 0.869 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.3209 0.814 0.000 0.812 0.008 0.000 0.180
#> SRR1490761 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.5204 0.687 0.000 0.684 0.080 0.008 0.228
#> SRR1402944 2 0.4799 0.715 0.000 0.708 0.060 0.004 0.228
#> SRR1092818 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.2020 0.843 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1464880 2 0.2597 0.840 0.000 0.884 0.092 0.000 0.024
#> SRR1078368 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0807 0.894 0.000 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1331879 2 0.2597 0.847 0.000 0.884 0.092 0.000 0.024
#> SRR1320034 2 0.4397 0.406 0.000 0.564 0.000 0.004 0.432
#> SRR1068687 2 0.0510 0.894 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1437491 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.2773 0.744 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.2905 0.829 0.000 0.868 0.096 0.000 0.036
#> SRR1455214 1 0.0404 0.930 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1092014 2 0.1270 0.886 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1097857 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.3430 0.766 0.000 0.776 0.000 0.004 0.220
#> SRR1338687 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4306 -0.419 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1486821 2 0.4238 0.551 0.000 0.628 0.000 0.004 0.368
#> SRR1418540 1 0.1671 0.872 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1408788 2 0.2597 0.872 0.000 0.896 0.040 0.004 0.060
#> SRR1359487 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.2927 0.830 0.000 0.868 0.092 0.000 0.040
#> SRR1365722 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1448118 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.3983 0.796 0.340 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1321829 2 0.0880 0.890 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1475993 2 0.3684 0.707 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1445387 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.3427 0.808 0.000 0.836 0.108 0.000 0.056
#> SRR1349300 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.3684 0.469 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.1661 0.883 0.000 0.940 0.024 0.000 0.036
#> SRR1366124 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.3661 0.481 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1086490 2 0.3231 0.789 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1088511 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4256 0.612 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1384431 1 0.1608 0.878 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1072055 1 0.1121 0.905 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1359738 2 0.3160 0.798 0.000 0.808 0.000 0.004 0.188
#> SRR1332141 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085900 2 0.0404 0.895 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1442173 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0290 0.895 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR814515 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.3201 0.826 0.000 0.852 0.096 0.000 0.052
#> SRR1344034 2 0.3594 0.811 0.000 0.804 0.020 0.004 0.172
#> SRR1080391 4 0.3242 0.869 0.216 0.000 0.000 0.784 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.1764 0.867 0.000 0.928 0.064 0.000 0.008
#> SRR1070620 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0404 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.3141 0.816 0.000 0.852 0.108 0.000 0.040
#> SRR1070060 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.2712 0.847 0.000 0.880 0.088 0.000 0.032
#> SRR1417851 1 0.1341 0.897 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0510 0.928 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1076705 1 0.1043 0.909 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1079380 2 0.4072 0.796 0.000 0.792 0.108 0.000 0.100
#> SRR1102923 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.1668 0.883 0.000 0.940 0.028 0.000 0.032
#> SRR1366605 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.1661 0.885 0.000 0.940 0.036 0.000 0.024
#> SRR1436840 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 5 0.1732 0.663 0.000 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR1431735 1 0.0963 0.913 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1417387 1 0.3684 0.469 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1445984 1 0.3837 0.374 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1370447 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1446308 2 0.1357 0.885 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1437346 2 0.3661 0.711 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1103143 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098974 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.3395 0.866 0.236 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1319584 2 0.5282 0.672 0.000 0.676 0.100 0.004 0.220
#> SRR1486584 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.4278 0.574 0.452 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.3424 0.590 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1399178 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415615 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.3608 0.807 0.000 0.836 0.108 0.012 0.044
#> SRR1079543 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0451 0.895 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1076681 2 0.0880 0.892 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1335314 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1400799 2 0.2970 0.813 0.000 0.828 0.000 0.004 0.168
#> SRR1074578 1 0.2074 0.838 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1312226 2 0.2597 0.847 0.000 0.884 0.092 0.000 0.024
#> SRR1416207 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0404 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1069328 1 0.2891 0.723 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1445023 4 0.3210 0.868 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1077599 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1453480 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 5 0.1544 0.682 0.000 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1436949 2 0.2597 0.840 0.000 0.884 0.092 0.000 0.024
#> SRR1070429 2 0.3300 0.783 0.000 0.792 0.000 0.004 0.204
#> SRR1458158 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.3419 0.843 0.180 0.000 0.000 0.804 0.016
#> SRR1310334 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.4390 0.417 0.000 0.568 0.000 0.004 0.428
#> SRR1385434 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1415591 2 0.3366 0.763 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1402009 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316055 4 0.4074 0.770 0.364 0.000 0.000 0.636 0.000
#> SRR1308734 2 0.3209 0.814 0.000 0.812 0.008 0.000 0.180
#> SRR1498973 2 0.2685 0.838 0.000 0.880 0.092 0.000 0.028
#> SRR1397115 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.3684 0.469 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR814341 2 0.1628 0.871 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008
#> SRR1313601 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1459609 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.5342 0.661 0.000 0.664 0.096 0.004 0.236
#> SRR809919 1 0.1965 0.849 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1370818 4 0.4015 0.793 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1323651 2 0.0794 0.892 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1357297 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.5997 0.543 0.000 0.604 0.108 0.016 0.272
#> SRR1091230 2 0.0880 0.890 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1470556 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.3177 0.786 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1317731 2 0.4604 0.462 0.000 0.584 0.004 0.008 0.404
#> SRR1490785 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0290 0.932 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR809534 2 0.0290 0.895 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1397312 2 0.1836 0.882 0.000 0.932 0.032 0.000 0.036
#> SRR812128 2 0.3780 0.817 0.000 0.812 0.072 0.000 0.116
#> SRR1101513 1 0.0404 0.930 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1415708 2 0.0794 0.893 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1316033 2 0.4196 0.577 0.000 0.640 0.000 0.004 0.356
#> SRR1390371 2 0.0671 0.895 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1480263 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.4264 0.537 0.000 0.620 0.000 0.004 0.376
#> SRR1076801 1 0.3586 0.513 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1608 0.878 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.3427 0.808 0.000 0.836 0.108 0.000 0.056
#> SRR1068929 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0912 0.893 0.000 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1075054 2 0.2300 0.855 0.000 0.904 0.072 0.000 0.024
#> SRR1083480 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0880 0.917 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1417023 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1309333 2 0.0162 0.895 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333676 1 0.0404 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.3143 0.865 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR1413137 4 0.3143 0.865 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR1469973 2 0.0290 0.895 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1420026 2 0.0451 0.895 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR817306 1 0.2773 0.744 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1416266 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3684 0.845 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000
#> SRR1435394 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1383192 1 0.0290 0.933 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1419962 2 0.4238 0.553 0.000 0.628 0.000 0.004 0.368
#> SRR1094357 1 0.1792 0.863 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1081639 2 0.4533 0.352 0.000 0.544 0.000 0.008 0.448
#> SRR1356016 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.3608 0.807 0.000 0.836 0.108 0.012 0.044
#> SRR1312147 1 0.3074 0.681 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3143 0.674 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1474930 2 0.0404 0.895 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470988 4 0.3143 0.866 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.1753 0.883 0.000 0.936 0.032 0.000 0.032
#> SRR1313770 2 0.4464 0.459 0.000 0.584 0.000 0.008 0.408
#> SRR1315780 2 0.0162 0.895 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073631 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.2230 0.823 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1310997 2 0.2569 0.866 0.000 0.892 0.068 0.000 0.040
#> SRR1464494 2 0.3201 0.833 0.000 0.852 0.096 0.000 0.052
#> SRR1357083 2 0.3231 0.789 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1475842 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0404 0.930 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1378220 2 0.2732 0.825 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1467704 1 0.0510 0.928 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1348885 5 0.1410 0.686 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1325826 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.4256 0.612 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1345692 2 0.0955 0.893 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1401040 2 0.3333 0.779 0.000 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1097954 1 0.0404 0.930 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1374396 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1454073 2 0.0162 0.895 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355747 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.4238 0.556 0.000 0.628 0.000 0.004 0.368
#> SRR1398138 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0880 0.916 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1361436 2 0.3430 0.766 0.000 0.776 0.000 0.004 0.220
#> SRR817142 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1315291 5 0.1732 0.663 0.000 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR1309314 5 0.1410 0.686 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1420085 2 0.2300 0.863 0.000 0.904 0.072 0.000 0.024
#> SRR1361308 2 0.3521 0.753 0.000 0.764 0.000 0.004 0.232
#> SRR1472126 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.4799 0.715 0.000 0.708 0.060 0.004 0.228
#> SRR1099789 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.3427 0.808 0.000 0.836 0.108 0.000 0.056
#> SRR1339276 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0794 0.920 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1096760 2 0.2891 0.811 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1440290 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1330813 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1458931 2 0.0290 0.895 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR812294 4 0.3561 0.856 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1394321 1 0.1043 0.911 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.1894 0.862 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008
#> SRR1390143 1 0.1965 0.850 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1390413 2 0.0162 0.895 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099570 2 0.3074 0.792 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1312169 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.3636 0.503 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1486139 1 0.0290 0.932 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1470313 4 0.3932 0.809 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1447893 2 0.3196 0.792 0.000 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR1466025 2 0.2905 0.841 0.000 0.868 0.096 0.000 0.036
#> SRR1477429 1 0.3949 0.302 0.668 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1445701 2 0.3109 0.793 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR820689 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0290 0.895 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1452537 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0963 0.915 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1489328 2 0.0162 0.895 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.3491 0.859 0.228 0.000 0.000 0.768 0.004
#> SRR1355769 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.1907 0.879 0.000 0.928 0.028 0.000 0.044
#> SRR1474485 4 0.3876 0.814 0.316 0.000 0.000 0.684 0.000
#> SRR1089998 1 0.0609 0.926 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.2891 0.811 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1095188 2 0.0404 0.895 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1454350 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.3123 0.801 0.000 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1105417 1 0.3424 0.591 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1325578 2 0.4793 0.712 0.000 0.704 0.056 0.004 0.236
#> SRR1358161 2 0.5342 0.661 0.000 0.664 0.096 0.004 0.236
#> SRR1358665 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.2554 0.849 0.000 0.892 0.072 0.000 0.036
#> SRR1452010 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0703 0.892 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1366345 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0290 0.933 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1090837 2 0.3231 0.789 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1447828 2 0.4251 0.545 0.000 0.624 0.000 0.004 0.372
#> SRR1338747 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.3684 0.707 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1350280 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.1197 0.902 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1102656 2 0.1764 0.867 0.000 0.928 0.064 0.000 0.008
#> SRR1441443 2 0.1012 0.893 0.000 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1370682 2 0.4397 0.406 0.000 0.564 0.000 0.004 0.432
#> SRR1475448 2 0.3123 0.800 0.000 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1407291 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0290 0.933 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1082592 2 0.3946 0.807 0.000 0.800 0.080 0.000 0.120
#> SRR1325794 2 0.1668 0.883 0.000 0.940 0.032 0.000 0.028
#> SRR1095961 2 0.3480 0.743 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1086702 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.2685 0.864 0.000 0.880 0.028 0.000 0.092
#> SRR1457527 2 0.4321 0.496 0.000 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR1098831 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.3123 0.801 0.000 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1488858 4 0.3003 0.857 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1454695 1 0.4273 -0.248 0.552 0.000 0.000 0.448 0.000
#> SRR1090241 2 0.0609 0.893 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1329863 2 0.0290 0.894 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0703 0.922 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1379581 5 0.4264 0.217 0.000 0.376 0.000 0.004 0.620
#> SRR1309182 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1851 0.858 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1084742 2 0.3427 0.808 0.000 0.836 0.108 0.000 0.056
#> SRR1433538 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.2388 0.858 0.000 0.900 0.072 0.000 0.028
#> SRR1454247 2 0.3423 0.809 0.000 0.844 0.108 0.008 0.040
#> SRR1097100 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1072388 1 0.4242 -0.177 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1070332 2 0.3058 0.826 0.000 0.860 0.096 0.000 0.044
#> SRR1320761 2 0.2426 0.874 0.000 0.900 0.036 0.000 0.064
#> SRR1076195 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1069895 2 0.1544 0.878 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1099144 4 0.3983 0.796 0.340 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1385150 2 0.3160 0.798 0.000 0.808 0.000 0.004 0.188
#> SRR1420191 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3586 0.854 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.3837 0.374 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.5531 0.643 0.000 0.652 0.100 0.008 0.240
#> SRR1408553 4 0.3143 0.865 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR1069231 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0510 0.928 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1121 0.888 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1077874 2 0.2712 0.847 0.000 0.880 0.088 0.000 0.032
#> SRR808299 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.3427 0.808 0.000 0.836 0.108 0.000 0.056
#> SRR1481238 2 0.1648 0.884 0.000 0.940 0.020 0.000 0.040
#> SRR1443568 2 0.1341 0.883 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1380249 4 0.3274 0.869 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR1080143 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383148 4 0.3003 0.857 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0510 0.895 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR813283 1 0.0609 0.926 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0609 0.926 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.1410 0.686 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR807679 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.3246 0.810 0.000 0.808 0.008 0.000 0.184
#> SRR1078660 2 0.1211 0.889 0.000 0.960 0.024 0.000 0.016
#> SRR1331730 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.3837 0.374 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1418041 1 0.1197 0.902 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1085211 1 0.0404 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1478 0.885 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1350958 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396822 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1441934 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.3231 0.789 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1488881 2 0.3231 0.789 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1102973 1 0.0510 0.929 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1071131 2 0.0880 0.892 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1074502 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.4242 -0.177 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0703 0.894 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1430045 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441245 2 0.0404 0.895 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1384091 4 0.3274 0.869 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR1431887 2 0.0798 0.890 0.000 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1096525 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.2580 0.854 0.000 0.892 0.064 0.000 0.044
#> SRR1369514 4 0.4161 0.721 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1453299 2 0.3707 0.702 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1436300 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.5356 0.701 0.000 0.700 0.108 0.016 0.176
#> SRR1091767 2 0.2426 0.873 0.000 0.900 0.036 0.000 0.064
#> SRR1354467 2 0.3231 0.789 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1069074 2 0.0794 0.892 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1452399 2 0.0290 0.895 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1437430 2 0.4613 0.452 0.000 0.580 0.004 0.008 0.408
#> SRR1419736 2 0.3423 0.809 0.000 0.844 0.108 0.008 0.040
#> SRR1313343 2 0.4101 0.622 0.000 0.664 0.000 0.004 0.332
#> SRR1077619 4 0.3707 0.843 0.284 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.3594 0.811 0.000 0.804 0.020 0.004 0.172
#> SRR1354999 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1443592 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0609 0.926 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1378818 2 0.5865 0.607 0.000 0.636 0.104 0.020 0.240
#> SRR1413182 4 0.3274 0.869 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR1464559 4 0.3983 0.799 0.340 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1413075 2 0.3090 0.824 0.000 0.856 0.104 0.000 0.040
#> SRR1487928 4 0.2929 0.850 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1388997 2 0.1012 0.893 0.000 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1092865 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.1792 0.865 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0955 0.893 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1376874 2 0.4321 0.496 0.000 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR1339903 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0162 0.895 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095358 2 0.1211 0.892 0.000 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR1480941 2 0.4952 0.695 0.000 0.692 0.040 0.016 0.252
#> SRR1479175 2 0.0162 0.894 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313891 2 0.0404 0.895 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1491354 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0703 0.892 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1487173 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0451 0.895 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1318331 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.3521 0.753 0.000 0.764 0.000 0.004 0.232
#> SRR1474231 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0510 0.928 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 5 0.3536 0.436 0.000 0.156 0.000 0.032 0.812
#> SRR1455989 2 0.1341 0.885 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1453680 2 0.4310 0.503 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR1470356 2 0.0404 0.895 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1342977 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0609 0.926 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1366729 2 0.4310 0.503 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR821282 2 0.4397 0.406 0.000 0.564 0.000 0.004 0.432
#> SRR1074602 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR814633 2 0.0000 0.895 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.5060 0.690 0.000 0.688 0.064 0.008 0.240
#> SRR1319100 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.3143 0.790 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1457459 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.4227 0.664 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1444598 5 0.1410 0.686 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1091743 2 0.0963 0.889 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR819637 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.1270 0.885 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1459785 2 0.3766 0.719 0.000 0.728 0.004 0.000 0.268
#> SRR1083700 1 0.0162 0.934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375531 1 0.0609 0.926 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1323470 3 0.2127 1.000 0.000 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.1204 0.7879 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000 0
#> SRR1467726 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR815446 2 0.0632 0.7905 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1402132 6 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1326059 1 0.0146 0.9388 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR1409062 2 0.3547 0.3586 0.000 0.668 0.332 0.000 0.000 0
#> SRR809406 1 0.0363 0.9373 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0
#> SRR1465313 3 0.4822 0.5834 0.000 0.308 0.620 0.004 0.068 0
#> SRR819559 1 0.2219 0.8306 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0
#> SRR1387899 2 0.3620 0.3000 0.000 0.648 0.352 0.000 0.000 0
#> SRR1442292 2 0.0363 0.7904 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326868 2 0.3547 0.3610 0.000 0.668 0.332 0.000 0.000 0
#> SRR1102320 1 0.0713 0.9305 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0
#> SRR1469926 3 0.5530 0.6488 0.000 0.200 0.580 0.004 0.216 0
#> SRR1070036 1 0.0458 0.9347 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1098426 1 0.1007 0.9180 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0
#> SRR1090310 3 0.3782 0.6995 0.000 0.360 0.636 0.000 0.004 0
#> SRR1429748 1 0.0146 0.9389 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326317 2 0.3634 0.2888 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1378308 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1366919 4 0.1957 0.7710 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1469769 3 0.3967 0.6379 0.000 0.356 0.632 0.000 0.012 0
#> SRR1490761 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1380122 3 0.4518 0.5194 0.000 0.236 0.688 0.004 0.072 0
#> SRR1402944 3 0.4713 0.5655 0.000 0.272 0.652 0.004 0.072 0
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1093552 1 0.2003 0.8531 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000 0
#> SRR1464880 2 0.3052 0.6287 0.000 0.780 0.216 0.004 0.000 0
#> SRR1078368 2 0.0146 0.7895 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0
#> SRR1349608 2 0.1714 0.7599 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000 0
#> SRR1466951 2 0.2219 0.7568 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000 0
#> SRR1331879 2 0.3360 0.6322 0.000 0.732 0.264 0.004 0.000 0
#> SRR1320034 3 0.5641 0.5458 0.000 0.164 0.540 0.004 0.292 0
#> SRR1068687 2 0.3647 0.3449 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000 0
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1310777 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1374005 2 0.0146 0.7894 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1329994 1 0.2491 0.7892 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0
#> SRR1354203 1 0.0547 0.9339 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1369241 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077992 2 0.3314 0.5796 0.000 0.740 0.256 0.004 0.000 0
#> SRR1455214 1 0.0790 0.9277 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1092014 2 0.3797 0.0749 0.000 0.580 0.420 0.000 0.000 0
#> SRR1097857 1 0.0458 0.9356 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1345974 3 0.3974 0.7634 0.000 0.296 0.680 0.000 0.024 0
#> SRR1338687 2 0.0363 0.7902 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1071207 4 0.3868 0.1649 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000 0
#> SRR1486821 3 0.5231 0.6958 0.000 0.216 0.624 0.004 0.156 0
#> SRR1418540 1 0.1556 0.8871 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0
#> SRR1408788 2 0.3869 -0.1245 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000 0
#> SRR1359487 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1469080 2 0.3337 0.5735 0.000 0.736 0.260 0.004 0.000 0
#> SRR1365722 2 0.1444 0.7785 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000 0
#> SRR1448118 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1444808 4 0.2941 0.7079 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000 0
#> SRR1321829 2 0.3578 0.3397 0.000 0.660 0.340 0.000 0.000 0
#> SRR1475993 3 0.4664 0.7588 0.000 0.280 0.644 0.000 0.076 0
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077575 2 0.3848 0.5249 0.000 0.692 0.292 0.004 0.012 0
#> SRR1349300 1 0.0146 0.9388 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR1374165 1 0.3428 0.5234 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000 0
#> SRR1453769 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1401146 2 0.3050 0.6625 0.000 0.764 0.236 0.000 0.000 0
#> SRR1366124 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1456674 1 0.3499 0.4899 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000 0
#> SRR1086490 3 0.3390 0.7600 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000 0
#> SRR1088511 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1404577 4 0.3309 0.5919 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000 0
#> SRR1384431 1 0.2378 0.8097 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000 0
#> SRR1072055 1 0.1007 0.9177 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0
#> SRR1359738 3 0.3547 0.7295 0.000 0.332 0.668 0.000 0.000 0
#> SRR1332141 1 0.0146 0.9389 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR1085900 2 0.2597 0.6899 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000 0
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1431625 2 0.2219 0.7599 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000 0
#> SRR814515 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1357999 2 0.3672 0.5609 0.000 0.712 0.276 0.004 0.008 0
#> SRR1344034 3 0.3867 0.6202 0.000 0.328 0.660 0.000 0.012 0
#> SRR1080391 4 0.1075 0.7621 0.048 0.000 0.000 0.952 0.000 0
#> SRR1347870 2 0.1327 0.7822 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0
#> SRR814028 2 0.0363 0.7872 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR814219 2 0.2092 0.7180 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000 0
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1102128 1 0.0363 0.9372 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0
#> SRR1460211 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1418346 2 0.3468 0.5428 0.000 0.712 0.284 0.004 0.000 0
#> SRR1070060 1 0.0146 0.9388 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR1487969 2 0.3468 0.6226 0.000 0.712 0.284 0.004 0.000 0
#> SRR1417851 1 0.1610 0.8888 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0
#> SRR1443350 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1403199 1 0.0547 0.9338 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0
#> SRR1076705 1 0.0937 0.9205 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0
#> SRR1079380 3 0.4537 -0.1537 0.000 0.480 0.492 0.004 0.024 0
#> SRR1102923 2 0.0146 0.7894 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0
#> SRR1369560 2 0.3050 0.6654 0.000 0.764 0.236 0.000 0.000 0
#> SRR1366605 2 0.1075 0.7892 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0
#> SRR1396035 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1390223 2 0.2664 0.7377 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000 0
#> SRR1436840 2 0.1007 0.7868 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000 0
#> SRR1445573 2 0.0458 0.7883 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0
#> SRR1375394 5 0.0547 0.7042 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0
#> SRR1431735 1 0.1007 0.9195 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0
#> SRR1417387 1 0.3515 0.4794 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0
#> SRR1445984 1 0.3531 0.4645 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000 0
#> SRR1370447 4 0.0458 0.7412 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0
#> SRR1446308 2 0.3823 -0.0587 0.000 0.564 0.436 0.000 0.000 0
#> SRR1437346 3 0.4682 0.7596 0.000 0.284 0.640 0.000 0.076 0
#> SRR1103143 2 0.0363 0.7897 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1073191 2 0.0458 0.7908 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1468914 4 0.1957 0.7696 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0
#> SRR1319584 3 0.4720 0.3860 0.000 0.284 0.644 0.004 0.068 0
#> SRR1486584 1 0.0146 0.9389 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR813536 4 0.3482 0.5519 0.316 0.000 0.000 0.684 0.000 0
#> SRR1317939 2 0.0363 0.7901 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1341921 1 0.3198 0.6407 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000 0
#> SRR1399178 2 0.1204 0.7879 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000 0
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1328551 2 0.1714 0.7599 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000 0
#> SRR1453259 2 0.0363 0.7900 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1340828 2 0.3756 0.5062 0.000 0.676 0.316 0.004 0.004 0
#> SRR1079543 2 0.0937 0.7850 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000 0
#> SRR816427 2 0.1863 0.7675 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000 0
#> SRR1076681 2 0.3351 0.4836 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000 0
#> SRR1335314 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1400799 3 0.3563 0.7273 0.000 0.336 0.664 0.000 0.000 0
#> SRR1074578 1 0.1863 0.8642 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000 0
#> SRR1312226 2 0.3360 0.6322 0.000 0.732 0.264 0.004 0.000 0
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1447371 1 0.0865 0.9254 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1069328 1 0.2597 0.7726 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000 0
#> SRR1445023 4 0.1007 0.7602 0.044 0.000 0.000 0.956 0.000 0
#> SRR1077599 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1453480 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101834 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1074839 2 0.2092 0.7437 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000 0
#> SRR1458727 5 0.0260 0.7182 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0
#> SRR1436949 2 0.3052 0.6287 0.000 0.780 0.216 0.004 0.000 0
#> SRR1070429 3 0.3528 0.7617 0.000 0.296 0.700 0.000 0.004 0
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1432408 4 0.0820 0.7275 0.012 0.000 0.000 0.972 0.016 0
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1418201 3 0.5422 0.5925 0.000 0.164 0.592 0.004 0.240 0
#> SRR1385434 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1415591 3 0.4219 0.7638 0.000 0.304 0.660 0.000 0.036 0
#> SRR1402009 1 0.0458 0.9356 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1316055 4 0.3151 0.6745 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000 0
#> SRR1308734 3 0.3967 0.6379 0.000 0.356 0.632 0.000 0.012 0
#> SRR1498973 2 0.3189 0.6071 0.000 0.760 0.236 0.004 0.000 0
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1392141 1 0.3515 0.4794 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0
#> SRR814341 2 0.2003 0.7251 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000 0
#> SRR1313601 2 0.3547 0.3586 0.000 0.668 0.332 0.000 0.000 0
#> SRR1459609 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1499325 3 0.4367 0.4374 0.000 0.220 0.708 0.004 0.068 0
#> SRR809919 1 0.1863 0.8669 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000 0
#> SRR1370818 4 0.3198 0.6718 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000 0
#> SRR1323651 2 0.3634 0.2696 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1357297 1 0.0260 0.9381 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0
#> SRR818170 3 0.5484 0.2653 0.000 0.280 0.568 0.004 0.148 0
#> SRR1091230 2 0.3592 0.3275 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1470556 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR812318 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1095285 3 0.4640 0.7229 0.000 0.348 0.604 0.004 0.044 0
#> SRR1317731 3 0.5250 0.6282 0.000 0.184 0.608 0.000 0.208 0
#> SRR1490785 1 0.0458 0.9356 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1447808 1 0.0458 0.9357 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR809534 2 0.0363 0.7903 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1397312 2 0.3151 0.6660 0.000 0.748 0.252 0.000 0.000 0
#> SRR812128 2 0.4676 0.2529 0.000 0.544 0.416 0.004 0.036 0
#> SRR1101513 1 0.0632 0.9320 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0
#> SRR1415708 2 0.3482 0.4014 0.000 0.684 0.316 0.000 0.000 0
#> SRR1316033 3 0.5101 0.7035 0.000 0.216 0.640 0.004 0.140 0
#> SRR1390371 2 0.2092 0.7646 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000 0
#> SRR1480263 2 0.0260 0.7897 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0
#> SRR1464473 3 0.5213 0.6878 0.000 0.208 0.628 0.004 0.160 0
#> SRR1076801 1 0.3464 0.5086 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000 0
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1420850 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1474295 1 0.1444 0.8961 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1095744 2 0.3848 0.5249 0.000 0.692 0.292 0.004 0.012 0
#> SRR1068929 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1490097 2 0.2219 0.7591 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000 0
#> SRR1075054 2 0.2730 0.6600 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000 0
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1075458 1 0.0790 0.9268 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1417023 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1309333 2 0.2048 0.7475 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000 0
#> SRR1333676 1 0.0363 0.9372 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1093172 4 0.1327 0.7628 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0
#> SRR1413137 4 0.1327 0.7628 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0
#> SRR1469973 2 0.2178 0.7625 0.000 0.868 0.132 0.000 0.000 0
#> SRR1420026 2 0.1863 0.7675 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000 0
#> SRR817306 1 0.2491 0.7892 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0
#> SRR1416266 4 0.0458 0.7412 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0
#> SRR1071011 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1090290 4 0.2664 0.7387 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000 0
#> SRR1435394 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1383192 1 0.0363 0.9374 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0
#> SRR1419962 3 0.5175 0.6948 0.000 0.212 0.632 0.004 0.152 0
#> SRR1094357 1 0.1863 0.8676 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000 0
#> SRR1081639 3 0.5570 0.5778 0.000 0.172 0.564 0.004 0.260 0
#> SRR1356016 2 0.0146 0.7894 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0
#> SRR1351082 2 0.0363 0.7900 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1397348 2 0.3756 0.5062 0.000 0.676 0.316 0.004 0.004 0
#> SRR1312147 1 0.2854 0.7220 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000 0
#> SRR1473891 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1335470 1 0.3076 0.6790 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000 0
#> SRR1474930 2 0.2854 0.6303 0.000 0.792 0.208 0.000 0.000 0
#> SRR1470988 4 0.0865 0.7560 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0
#> SRR811915 2 0.0363 0.7897 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1100005 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1444436 2 0.3330 0.6336 0.000 0.716 0.284 0.000 0.000 0
#> SRR1313770 3 0.5273 0.6279 0.000 0.184 0.604 0.000 0.212 0
#> SRR1315780 2 0.0713 0.7906 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR819124 1 0.2048 0.8490 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000 0
#> SRR1310997 2 0.3584 0.5998 0.000 0.688 0.308 0.004 0.000 0
#> SRR1464494 2 0.3584 0.5684 0.000 0.688 0.308 0.004 0.000 0
#> SRR1357083 3 0.3390 0.7600 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000 0
#> SRR1475842 2 0.1327 0.7822 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0
#> SRR1378085 1 0.0363 0.9363 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0
#> SRR1378220 3 0.4237 0.6337 0.000 0.396 0.584 0.000 0.020 0
#> SRR1467704 1 0.0458 0.9347 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1348885 5 0.0000 0.7216 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1466812 4 0.3309 0.5919 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000 0
#> SRR1345692 2 0.2697 0.7211 0.000 0.812 0.188 0.000 0.000 0
#> SRR1401040 3 0.3468 0.7584 0.000 0.284 0.712 0.004 0.000 0
#> SRR1097954 1 0.0547 0.9339 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0
#> SRR1374396 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1454073 2 0.2048 0.7475 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000 0
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1429368 3 0.5125 0.6897 0.000 0.204 0.640 0.004 0.152 0
#> SRR1398138 2 0.1957 0.7521 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000 0
#> SRR1379260 1 0.0790 0.9262 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1361436 3 0.3974 0.7634 0.000 0.296 0.680 0.000 0.024 0
#> SRR817142 2 0.3634 0.2888 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1315291 5 0.0547 0.7042 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0
#> SRR1309314 5 0.0291 0.7200 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992 0
#> SRR1420085 2 0.3265 0.6686 0.000 0.748 0.248 0.004 0.000 0
#> SRR1361308 3 0.4229 0.7636 0.000 0.292 0.668 0.000 0.040 0
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1380482 3 0.4713 0.5655 0.000 0.272 0.652 0.004 0.072 0
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1079480 2 0.3848 0.5249 0.000 0.692 0.292 0.004 0.012 0
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1418368 1 0.0146 0.9389 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR1399353 1 0.0790 0.9282 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1096760 3 0.3672 0.6839 0.000 0.368 0.632 0.000 0.000 0
#> SRR1440290 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1330813 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1458931 2 0.1267 0.7862 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0
#> SRR812294 4 0.2491 0.7500 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000 0
#> SRR1394321 1 0.1204 0.9134 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0
#> SRR1081160 2 0.1007 0.7838 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000 0
#> SRR1469704 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477173 2 0.0363 0.7899 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1086752 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1084698 2 0.2703 0.6744 0.000 0.824 0.172 0.004 0.000 0
#> SRR1390143 1 0.2178 0.8362 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000 0
#> SRR1390413 2 0.0790 0.7878 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0
#> SRR1099570 3 0.3409 0.7579 0.000 0.300 0.700 0.000 0.000 0
#> SRR1312169 1 0.0260 0.9381 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0
#> SRR1096687 1 0.3390 0.5605 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000 0
#> SRR1486139 1 0.0790 0.9275 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1470313 4 0.2912 0.7149 0.216 0.000 0.000 0.784 0.000 0
#> SRR1447893 3 0.3446 0.7541 0.000 0.308 0.692 0.000 0.000 0
#> SRR1466025 2 0.3584 0.5819 0.000 0.688 0.308 0.004 0.000 0
#> SRR1477429 1 0.3647 0.3925 0.640 0.000 0.000 0.360 0.000 0
#> SRR1445701 3 0.4605 0.7124 0.000 0.356 0.600 0.004 0.040 0
#> SRR820689 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1451876 2 0.2562 0.7259 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000 0
#> SRR1452537 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1383301 1 0.0937 0.9243 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0
#> SRR1489328 2 0.2219 0.7392 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000 0
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1447784 4 0.1411 0.7537 0.060 0.000 0.000 0.936 0.004 0
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1488237 2 0.0146 0.7888 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0
#> SRR1391985 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1480917 2 0.3101 0.6524 0.000 0.756 0.244 0.000 0.000 0
#> SRR1474485 4 0.3221 0.6540 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000 0
#> SRR1089998 1 0.0937 0.9225 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1319262 3 0.3659 0.6904 0.000 0.364 0.636 0.000 0.000 0
#> SRR1095188 2 0.2597 0.6899 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000 0
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1359565 3 0.3690 0.7537 0.000 0.308 0.684 0.000 0.008 0
#> SRR1105417 1 0.3198 0.6417 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000 0
#> SRR1325578 3 0.4659 0.6158 0.000 0.252 0.668 0.004 0.076 0
#> SRR1358161 3 0.4367 0.4374 0.000 0.220 0.708 0.004 0.068 0
#> SRR1358665 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1333971 2 0.3189 0.6036 0.000 0.760 0.236 0.004 0.000 0
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1418183 2 0.3695 0.1920 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000 0
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473461 1 0.0363 0.9374 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0
#> SRR1090837 3 0.3390 0.7600 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000 0
#> SRR1447828 3 0.5207 0.6930 0.000 0.212 0.628 0.004 0.156 0
#> SRR1338747 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1333038 3 0.4664 0.7588 0.000 0.280 0.644 0.000 0.076 0
#> SRR1350280 1 0.0146 0.9388 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0
#> SRR1088557 1 0.1267 0.9067 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0
#> SRR1102656 2 0.2527 0.6810 0.000 0.832 0.168 0.000 0.000 0
#> SRR1441443 2 0.2378 0.7482 0.000 0.848 0.152 0.000 0.000 0
#> SRR1370682 3 0.5641 0.5458 0.000 0.164 0.540 0.004 0.292 0
#> SRR1475448 3 0.3620 0.7083 0.000 0.352 0.648 0.000 0.000 0
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1363766 1 0.0363 0.9374 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0
#> SRR1082592 2 0.4697 0.2132 0.000 0.528 0.432 0.004 0.036 0
#> SRR1325794 2 0.3221 0.6556 0.000 0.736 0.264 0.000 0.000 0
#> SRR1095961 3 0.4498 0.7645 0.000 0.300 0.644 0.000 0.056 0
#> SRR1086702 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1320806 3 0.3868 0.1711 0.000 0.496 0.504 0.000 0.000 0
#> SRR1457527 3 0.5167 0.6254 0.000 0.164 0.636 0.004 0.196 0
#> SRR1098831 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1474374 3 0.3690 0.7537 0.000 0.308 0.684 0.000 0.008 0
#> SRR1488858 4 0.0547 0.7451 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0
#> SRR1454695 1 0.3868 -0.1326 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000 0
#> SRR1090241 2 0.1863 0.7507 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000 0
#> SRR1329863 2 0.1075 0.7876 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1362135 1 0.0632 0.9306 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0
#> SRR1379581 5 0.5669 -0.1606 0.000 0.148 0.340 0.004 0.508 0
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1437668 1 0.1714 0.8755 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000 0
#> SRR1084742 2 0.3848 0.5249 0.000 0.692 0.292 0.004 0.012 0
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1085063 2 0.3076 0.6712 0.000 0.760 0.240 0.000 0.000 0
#> SRR1454247 2 0.3508 0.5323 0.000 0.704 0.292 0.004 0.000 0
#> SRR1097100 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR818622 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1072388 1 0.3833 0.0611 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000 0
#> SRR1070332 2 0.3426 0.5610 0.000 0.720 0.276 0.004 0.000 0
#> SRR1320761 2 0.3810 0.2455 0.000 0.572 0.428 0.000 0.000 0
#> SRR1076195 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1069895 2 0.3737 0.1507 0.000 0.608 0.392 0.000 0.000 0
#> SRR1099144 4 0.2941 0.7079 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000 0
#> SRR1385150 3 0.3515 0.7399 0.000 0.324 0.676 0.000 0.000 0
#> SRR1420191 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1332625 4 0.2597 0.7439 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000 0
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1456971 1 0.3515 0.4752 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1444830 2 0.1863 0.7507 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000 0
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1087127 3 0.4444 0.3943 0.000 0.224 0.700 0.004 0.072 0
#> SRR1408553 4 0.1327 0.7628 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0
#> SRR1069231 1 0.0260 0.9382 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0
#> SRR1325642 2 0.0632 0.7905 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1362103 1 0.0458 0.9347 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1094380 1 0.0458 0.9356 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1447499 2 0.1327 0.7762 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0
#> SRR1099330 2 0.3634 0.2783 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1077874 2 0.3468 0.6226 0.000 0.712 0.284 0.004 0.000 0
#> SRR808299 2 0.1714 0.7660 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000 0
#> SRR1098050 2 0.3848 0.5249 0.000 0.692 0.292 0.004 0.012 0
#> SRR1481238 2 0.3050 0.6614 0.000 0.764 0.236 0.000 0.000 0
#> SRR1443568 2 0.3684 0.2438 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000 0
#> SRR1380249 4 0.1910 0.7709 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000 0
#> SRR1080143 1 0.0260 0.9383 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0
#> SRR1383148 4 0.0547 0.7451 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1416025 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1431015 2 0.1327 0.7822 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0
#> SRR1078709 2 0.2178 0.7516 0.000 0.868 0.132 0.000 0.000 0
#> SRR813283 1 0.0937 0.9225 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0
#> SRR1430226 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1070665 1 0.0937 0.9225 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0
#> SRR1466927 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1347707 5 0.0000 0.7216 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR807679 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1333811 3 0.4206 0.6704 0.000 0.356 0.620 0.000 0.024 0
#> SRR1078660 2 0.2697 0.7364 0.000 0.812 0.188 0.000 0.000 0
#> SRR1331730 2 0.0363 0.7900 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1432542 1 0.3499 0.4855 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000 0
#> SRR1418041 1 0.1387 0.9006 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000 0
#> SRR1085211 1 0.0865 0.9254 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1339812 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1402437 1 0.1501 0.8905 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0
#> SRR1350958 2 0.1444 0.7835 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000 0
#> SRR1396822 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1441934 2 0.1327 0.7786 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0
#> SRR1472552 3 0.3390 0.7600 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000 0
#> SRR1488881 3 0.3390 0.7600 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000 0
#> SRR1102973 1 0.0632 0.9331 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0
#> SRR1071131 2 0.3351 0.4836 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000 0
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1325271 1 0.3833 0.0611 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000 0
#> SRR1409171 2 0.0363 0.7897 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR809113 2 0.2631 0.7325 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000 0
#> SRR1430045 2 0.1501 0.7798 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000 0
#> SRR1441245 2 0.2092 0.7618 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000 0
#> SRR1384091 4 0.1957 0.7710 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0
#> SRR1431887 2 0.1556 0.7556 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000 0
#> SRR1096525 4 0.0458 0.7412 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0
#> SRR1488491 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1356351 2 0.3189 0.6206 0.000 0.760 0.236 0.004 0.000 0
#> SRR1369514 4 0.3409 0.6105 0.300 0.000 0.000 0.700 0.000 0
#> SRR1453299 3 0.4664 0.7571 0.000 0.280 0.644 0.000 0.076 0
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1348490 3 0.4829 0.1303 0.000 0.404 0.544 0.004 0.048 0
#> SRR1091767 2 0.3608 0.5990 0.000 0.716 0.272 0.000 0.012 0
#> SRR1354467 3 0.3390 0.7600 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000 0
#> SRR1069074 2 0.3563 0.3514 0.000 0.664 0.336 0.000 0.000 0
#> SRR1452399 2 0.1714 0.7707 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000 0
#> SRR1437430 3 0.5563 0.5788 0.000 0.184 0.544 0.000 0.272 0
#> SRR1419736 2 0.3508 0.5323 0.000 0.704 0.292 0.004 0.000 0
#> SRR1313343 3 0.4956 0.7222 0.000 0.228 0.652 0.004 0.116 0
#> SRR1077619 4 0.2762 0.7304 0.196 0.000 0.000 0.804 0.000 0
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1333633 3 0.3867 0.6202 0.000 0.328 0.660 0.000 0.012 0
#> SRR1354999 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR1443592 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077356 1 0.0713 0.9301 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0
#> SRR1378818 3 0.5030 0.3056 0.000 0.264 0.628 0.004 0.104 0
#> SRR1413182 4 0.1957 0.7710 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0
#> SRR1464559 4 0.3050 0.6968 0.236 0.000 0.000 0.764 0.000 0
#> SRR1413075 2 0.3508 0.5631 0.000 0.704 0.292 0.004 0.000 0
#> SRR1487928 4 0.0363 0.7359 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0
#> SRR1388997 2 0.2454 0.7437 0.000 0.840 0.160 0.000 0.000 0
#> SRR1092865 2 0.2631 0.6680 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000 0
#> SRR1102729 1 0.2048 0.8506 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000 0
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1321591 2 0.2697 0.7211 0.000 0.812 0.188 0.000 0.000 0
#> SRR1376874 3 0.5167 0.6254 0.000 0.164 0.636 0.004 0.196 0
#> SRR1339903 1 0.0260 0.9385 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1418771 2 0.0790 0.7878 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0
#> SRR1095358 2 0.3620 0.4647 0.000 0.648 0.352 0.000 0.000 0
#> SRR1480941 3 0.4618 0.6158 0.000 0.236 0.672 0.000 0.092 0
#> SRR1479175 2 0.0458 0.7908 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0
#> SRR1313891 2 0.1501 0.7830 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000 0
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1433884 2 0.1957 0.7521 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000 0
#> SRR1471074 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1353052 2 0.1141 0.7803 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000 0
#> SRR1355554 2 0.3684 0.2095 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000 0
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1322918 2 0.1957 0.7639 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000 0
#> SRR1318331 2 0.1327 0.7822 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0
#> SRR1321333 3 0.4127 0.7617 0.000 0.284 0.680 0.000 0.036 0
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1350545 1 0.0632 0.9327 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR814447 5 0.3349 0.4289 0.000 0.000 0.244 0.008 0.748 0
#> SRR1455989 2 0.3634 0.2867 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1453680 3 0.5171 0.6330 0.000 0.168 0.636 0.004 0.192 0
#> SRR1470356 2 0.0790 0.7915 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0
#> SRR1342977 2 0.0146 0.7896 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0
#> SRR1444222 2 0.1765 0.7570 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000 0
#> SRR1097197 1 0.0713 0.9301 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0
#> SRR1366729 3 0.5171 0.6330 0.000 0.168 0.636 0.004 0.192 0
#> SRR821282 3 0.5641 0.5458 0.000 0.164 0.540 0.004 0.292 0
#> SRR1074602 2 0.3592 0.3261 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000 0
#> SRR814633 2 0.0000 0.7892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1072480 3 0.4570 0.5710 0.000 0.252 0.668 0.000 0.080 0
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1324004 3 0.4593 0.7183 0.000 0.352 0.604 0.004 0.040 0
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1421031 4 0.3737 0.4901 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000 0
#> SRR1444598 5 0.0146 0.7204 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0
#> SRR1091743 2 0.3634 0.2888 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR819637 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1088934 2 0.3756 0.0981 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000 0
#> SRR1459785 3 0.4191 0.7486 0.000 0.240 0.704 0.000 0.056 0
#> SRR1083700 1 0.0458 0.9356 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0
#> SRR1375531 1 0.0790 0.9292 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1323470 6 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR814657 1 0.0000 0.9397 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4911 0.509 0.509
#> 3 3 0.764 0.891 0.869 0.2365 0.861 0.728
#> 4 4 0.662 0.775 0.841 0.1324 0.921 0.789
#> 5 5 0.710 0.711 0.788 0.0800 0.888 0.649
#> 6 6 0.686 0.667 0.783 0.0589 0.955 0.819
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0 1 0 1
#> SRR1467726 2 0 1 0 1
#> SRR815446 2 0 1 0 1
#> SRR1402132 1 0 1 1 0
#> SRR1326059 1 0 1 1 0
#> SRR1409062 2 0 1 0 1
#> SRR809406 1 0 1 1 0
#> SRR1465313 2 0 1 0 1
#> SRR819559 1 0 1 1 0
#> SRR1387899 2 0 1 0 1
#> SRR1442292 2 0 1 0 1
#> SRR1488151 1 0 1 1 0
#> SRR1395635 1 0 1 1 0
#> SRR1343629 1 0 1 1 0
#> SRR1326868 2 0 1 0 1
#> SRR1102320 1 0 1 1 0
#> SRR1469926 2 0 1 0 1
#> SRR1070036 1 0 1 1 0
#> SRR1098426 1 0 1 1 0
#> SRR1090310 2 0 1 0 1
#> SRR1429748 1 0 1 1 0
#> SRR1363654 1 0 1 1 0
#> SRR1326317 2 0 1 0 1
#> SRR1378308 2 0 1 0 1
#> SRR1366919 1 0 1 1 0
#> SRR1329947 1 0 1 1 0
#> SRR1469769 2 0 1 0 1
#> SRR1490761 2 0 1 0 1
#> SRR1380122 2 0 1 0 1
#> SRR1402944 2 0 1 0 1
#> SRR1092818 1 0 1 1 0
#> SRR1093552 1 0 1 1 0
#> SRR1464880 2 0 1 0 1
#> SRR1078368 2 0 1 0 1
#> SRR1349608 2 0 1 0 1
#> SRR1466951 2 0 1 0 1
#> SRR1331879 2 0 1 0 1
#> SRR1320034 2 0 1 0 1
#> SRR1068687 2 0 1 0 1
#> SRR1437491 1 0 1 1 0
#> SRR1310777 2 0 1 0 1
#> SRR1374005 2 0 1 0 1
#> SRR1319182 1 0 1 1 0
#> SRR1329994 1 0 1 1 0
#> SRR1354203 1 0 1 1 0
#> SRR1077850 1 0 1 1 0
#> SRR1369241 2 0 1 0 1
#> SRR1077992 2 0 1 0 1
#> SRR1455214 1 0 1 1 0
#> SRR1092014 2 0 1 0 1
#> SRR1097857 1 0 1 1 0
#> SRR1473318 1 0 1 1 0
#> SRR1345974 2 0 1 0 1
#> SRR1338687 2 0 1 0 1
#> SRR1071207 1 0 1 1 0
#> SRR1486821 2 0 1 0 1
#> SRR1418540 1 0 1 1 0
#> SRR1408788 2 0 1 0 1
#> SRR1359487 1 0 1 1 0
#> SRR1080648 1 0 1 1 0
#> SRR1414708 1 0 1 1 0
#> SRR1469080 2 0 1 0 1
#> SRR1365722 2 0 1 0 1
#> SRR1448118 2 0 1 0 1
#> SRR1444808 1 0 1 1 0
#> SRR1321829 2 0 1 0 1
#> SRR1475993 2 0 1 0 1
#> SRR1445387 1 0 1 1 0
#> SRR1077575 2 0 1 0 1
#> SRR1349300 1 0 1 1 0
#> SRR1374165 1 0 1 1 0
#> SRR1453769 2 0 1 0 1
#> SRR1473870 1 0 1 1 0
#> SRR1401146 2 0 1 0 1
#> SRR1366124 1 0 1 1 0
#> SRR1391811 1 0 1 1 0
#> SRR1456674 1 0 1 1 0
#> SRR1086490 2 0 1 0 1
#> SRR1088511 2 0 1 0 1
#> SRR1404577 1 0 1 1 0
#> SRR1384431 1 0 1 1 0
#> SRR1072055 1 0 1 1 0
#> SRR1359738 2 0 1 0 1
#> SRR1332141 1 0 1 1 0
#> SRR1085900 2 0 1 0 1
#> SRR1442173 1 0 1 1 0
#> SRR1431625 2 0 1 0 1
#> SRR814515 2 0 1 0 1
#> SRR1357999 2 0 1 0 1
#> SRR1344034 2 0 1 0 1
#> SRR1080391 1 0 1 1 0
#> SRR1347870 2 0 1 0 1
#> SRR814028 2 0 1 0 1
#> SRR814219 2 0 1 0 1
#> SRR1070620 1 0 1 1 0
#> SRR1102128 1 0 1 1 0
#> SRR1460211 2 0 1 0 1
#> SRR1418346 2 0 1 0 1
#> SRR1070060 1 0 1 1 0
#> SRR1487969 2 0 1 0 1
#> SRR1417851 1 0 1 1 0
#> SRR1443350 2 0 1 0 1
#> SRR1403199 1 0 1 1 0
#> SRR1076705 1 0 1 1 0
#> SRR1079380 2 0 1 0 1
#> SRR1102923 2 0 1 0 1
#> SRR1369560 2 0 1 0 1
#> SRR1366605 2 0 1 0 1
#> SRR1396035 2 0 1 0 1
#> SRR1390223 2 0 1 0 1
#> SRR1436840 2 0 1 0 1
#> SRR1445573 2 0 1 0 1
#> SRR1375394 2 0 1 0 1
#> SRR1431735 1 0 1 1 0
#> SRR1417387 1 0 1 1 0
#> SRR1445984 1 0 1 1 0
#> SRR1370447 1 0 1 1 0
#> SRR1446308 2 0 1 0 1
#> SRR1437346 2 0 1 0 1
#> SRR1103143 2 0 1 0 1
#> SRR1086466 1 0 1 1 0
#> SRR1073191 2 0 1 0 1
#> SRR1098974 1 0 1 1 0
#> SRR1468914 1 0 1 1 0
#> SRR1319584 2 0 1 0 1
#> SRR1486584 1 0 1 1 0
#> SRR813536 1 0 1 1 0
#> SRR1317939 2 0 1 0 1
#> SRR1079730 1 0 1 1 0
#> SRR1341921 1 0 1 1 0
#> SRR1399178 2 0 1 0 1
#> SRR1415615 1 0 1 1 0
#> SRR1328551 2 0 1 0 1
#> SRR1453259 2 0 1 0 1
#> SRR1340828 2 0 1 0 1
#> SRR1079543 2 0 1 0 1
#> SRR816427 2 0 1 0 1
#> SRR1076681 2 0 1 0 1
#> SRR1335314 1 0 1 1 0
#> SRR1400799 2 0 1 0 1
#> SRR1074578 1 0 1 1 0
#> SRR1312226 2 0 1 0 1
#> SRR1416207 1 0 1 1 0
#> SRR1447371 1 0 1 1 0
#> SRR1069328 1 0 1 1 0
#> SRR1445023 1 0 1 1 0
#> SRR1077599 2 0 1 0 1
#> SRR1453480 2 0 1 0 1
#> SRR1101834 2 0 1 0 1
#> SRR1321744 1 0 1 1 0
#> SRR1074839 2 0 1 0 1
#> SRR1458727 2 0 1 0 1
#> SRR1436949 2 0 1 0 1
#> SRR1070429 2 0 1 0 1
#> SRR1458158 1 0 1 1 0
#> SRR1432408 1 0 1 1 0
#> SRR1310334 1 0 1 1 0
#> SRR1418201 2 0 1 0 1
#> SRR1385434 1 0 1 1 0
#> SRR1415591 2 0 1 0 1
#> SRR1402009 1 0 1 1 0
#> SRR1316055 1 0 1 1 0
#> SRR1308734 2 0 1 0 1
#> SRR1498973 2 0 1 0 1
#> SRR1397115 1 0 1 1 0
#> SRR1392141 1 0 1 1 0
#> SRR814341 2 0 1 0 1
#> SRR1313601 2 0 1 0 1
#> SRR1459609 2 0 1 0 1
#> SRR1499325 2 0 1 0 1
#> SRR809919 1 0 1 1 0
#> SRR1370818 1 0 1 1 0
#> SRR1323651 2 0 1 0 1
#> SRR1357297 1 0 1 1 0
#> SRR818170 2 0 1 0 1
#> SRR1091230 2 0 1 0 1
#> SRR1470556 2 0 1 0 1
#> SRR812318 1 0 1 1 0
#> SRR1095285 2 0 1 0 1
#> SRR1317731 2 0 1 0 1
#> SRR1490785 1 0 1 1 0
#> SRR1432032 1 0 1 1 0
#> SRR1447808 1 0 1 1 0
#> SRR809534 2 0 1 0 1
#> SRR1397312 2 0 1 0 1
#> SRR812128 2 0 1 0 1
#> SRR1101513 1 0 1 1 0
#> SRR1415708 2 0 1 0 1
#> SRR1316033 2 0 1 0 1
#> SRR1390371 2 0 1 0 1
#> SRR1480263 2 0 1 0 1
#> SRR1464473 2 0 1 0 1
#> SRR1076801 1 0 1 1 0
#> SRR1080044 1 0 1 1 0
#> SRR1420850 2 0 1 0 1
#> SRR1474295 1 0 1 1 0
#> SRR1069871 1 0 1 1 0
#> SRR1095744 2 0 1 0 1
#> SRR1068929 2 0 1 0 1
#> SRR1490097 2 0 1 0 1
#> SRR1075054 2 0 1 0 1
#> SRR1083480 1 0 1 1 0
#> SRR1075458 1 0 1 1 0
#> SRR1417023 1 0 1 1 0
#> SRR1309333 2 0 1 0 1
#> SRR1333676 1 0 1 1 0
#> SRR1352996 1 0 1 1 0
#> SRR1093172 1 0 1 1 0
#> SRR1413137 1 0 1 1 0
#> SRR1469973 2 0 1 0 1
#> SRR1420026 2 0 1 0 1
#> SRR817306 1 0 1 1 0
#> SRR1416266 1 0 1 1 0
#> SRR1071011 2 0 1 0 1
#> SRR1090290 1 0 1 1 0
#> SRR1435394 2 0 1 0 1
#> SRR1383192 1 0 1 1 0
#> SRR1419962 2 0 1 0 1
#> SRR1094357 1 0 1 1 0
#> SRR1081639 2 0 1 0 1
#> SRR1356016 2 0 1 0 1
#> SRR1351082 2 0 1 0 1
#> SRR1397348 2 0 1 0 1
#> SRR1312147 1 0 1 1 0
#> SRR1473891 2 0 1 0 1
#> SRR1335470 1 0 1 1 0
#> SRR1474930 2 0 1 0 1
#> SRR1470988 1 0 1 1 0
#> SRR811915 2 0 1 0 1
#> SRR1104987 1 0 1 1 0
#> SRR1100005 2 0 1 0 1
#> SRR1444436 2 0 1 0 1
#> SRR1313770 2 0 1 0 1
#> SRR1315780 2 0 1 0 1
#> SRR1073631 1 0 1 1 0
#> SRR819124 1 0 1 1 0
#> SRR1310997 2 0 1 0 1
#> SRR1464494 2 0 1 0 1
#> SRR1357083 2 0 1 0 1
#> SRR1475842 2 0 1 0 1
#> SRR1378085 1 0 1 1 0
#> SRR1378220 2 0 1 0 1
#> SRR1467704 1 0 1 1 0
#> SRR1348885 2 0 1 0 1
#> SRR1325826 1 0 1 1 0
#> SRR1466812 1 0 1 1 0
#> SRR1345692 2 0 1 0 1
#> SRR1401040 2 0 1 0 1
#> SRR1097954 1 0 1 1 0
#> SRR1374396 1 0 1 1 0
#> SRR1454073 2 0 1 0 1
#> SRR1355747 1 0 1 1 0
#> SRR1429368 2 0 1 0 1
#> SRR1398138 2 0 1 0 1
#> SRR1379260 1 0 1 1 0
#> SRR1361436 2 0 1 0 1
#> SRR817142 2 0 1 0 1
#> SRR1315291 2 0 1 0 1
#> SRR1309314 2 0 1 0 1
#> SRR1420085 2 0 1 0 1
#> SRR1361308 2 0 1 0 1
#> SRR1472126 1 0 1 1 0
#> SRR1380482 2 0 1 0 1
#> SRR1099789 1 0 1 1 0
#> SRR1079480 2 0 1 0 1
#> SRR1339276 1 0 1 1 0
#> SRR1418368 1 0 1 1 0
#> SRR1399353 1 0 1 1 0
#> SRR1096760 2 0 1 0 1
#> SRR1440290 2 0 1 0 1
#> SRR1330813 2 0 1 0 1
#> SRR1458931 2 0 1 0 1
#> SRR812294 1 0 1 1 0
#> SRR1394321 1 0 1 1 0
#> SRR1081160 2 0 1 0 1
#> SRR1469704 2 0 1 0 1
#> SRR1349342 1 0 1 1 0
#> SRR1477173 2 0 1 0 1
#> SRR1086752 2 0 1 0 1
#> SRR1084698 2 0 1 0 1
#> SRR1390143 1 0 1 1 0
#> SRR1390413 2 0 1 0 1
#> SRR1099570 2 0 1 0 1
#> SRR1312169 1 0 1 1 0
#> SRR1096687 1 0 1 1 0
#> SRR1486139 1 0 1 1 0
#> SRR1470313 1 0 1 1 0
#> SRR1447893 2 0 1 0 1
#> SRR1466025 2 0 1 0 1
#> SRR1477429 1 0 1 1 0
#> SRR1445701 2 0 1 0 1
#> SRR820689 1 0 1 1 0
#> SRR1451876 2 0 1 0 1
#> SRR1452537 2 0 1 0 1
#> SRR1383301 1 0 1 1 0
#> SRR1489328 2 0 1 0 1
#> SRR1344462 1 0 1 1 0
#> SRR1082709 1 0 1 1 0
#> SRR1447784 1 0 1 1 0
#> SRR1355769 1 0 1 1 0
#> SRR1488237 2 0 1 0 1
#> SRR1391985 2 0 1 0 1
#> SRR1478501 1 0 1 1 0
#> SRR1480917 2 0 1 0 1
#> SRR1474485 1 0 1 1 0
#> SRR1089998 1 0 1 1 0
#> SRR1318140 1 0 1 1 0
#> SRR1319262 2 0 1 0 1
#> SRR1095188 2 0 1 0 1
#> SRR1454350 1 0 1 1 0
#> SRR1440374 1 0 1 1 0
#> SRR1359565 2 0 1 0 1
#> SRR1105417 1 0 1 1 0
#> SRR1325578 2 0 1 0 1
#> SRR1358161 2 0 1 0 1
#> SRR1358665 2 0 1 0 1
#> SRR1333971 2 0 1 0 1
#> SRR1452010 1 0 1 1 0
#> SRR1418183 2 0 1 0 1
#> SRR1366345 1 0 1 1 0
#> SRR1387449 1 0 1 1 0
#> SRR1473461 1 0 1 1 0
#> SRR1090837 2 0 1 0 1
#> SRR1447828 2 0 1 0 1
#> SRR1338747 2 0 1 0 1
#> SRR1333038 2 0 1 0 1
#> SRR1350280 1 0 1 1 0
#> SRR1088557 1 0 1 1 0
#> SRR1102656 2 0 1 0 1
#> SRR1441443 2 0 1 0 1
#> SRR1370682 2 0 1 0 1
#> SRR1475448 2 0 1 0 1
#> SRR1407291 1 0 1 1 0
#> SRR1405266 1 0 1 1 0
#> SRR1363766 1 0 1 1 0
#> SRR1082592 2 0 1 0 1
#> SRR1325794 2 0 1 0 1
#> SRR1095961 2 0 1 0 1
#> SRR1086702 2 0 1 0 1
#> SRR1320806 2 0 1 0 1
#> SRR1457527 2 0 1 0 1
#> SRR1098831 2 0 1 0 1
#> SRR1474374 2 0 1 0 1
#> SRR1488858 1 0 1 1 0
#> SRR1454695 1 0 1 1 0
#> SRR1090241 2 0 1 0 1
#> SRR1329863 2 0 1 0 1
#> SRR1357733 1 0 1 1 0
#> SRR1362135 1 0 1 1 0
#> SRR1379581 2 0 1 0 1
#> SRR1309182 1 0 1 1 0
#> SRR1437668 1 0 1 1 0
#> SRR1084742 2 0 1 0 1
#> SRR1433538 1 0 1 1 0
#> SRR1085063 2 0 1 0 1
#> SRR1454247 2 0 1 0 1
#> SRR1097100 2 0 1 0 1
#> SRR818622 2 0 1 0 1
#> SRR1072388 1 0 1 1 0
#> SRR1070332 2 0 1 0 1
#> SRR1320761 2 0 1 0 1
#> SRR1076195 1 0 1 1 0
#> SRR1069895 2 0 1 0 1
#> SRR1099144 1 0 1 1 0
#> SRR1385150 2 0 1 0 1
#> SRR1420191 2 0 1 0 1
#> SRR1332625 1 0 1 1 0
#> SRR1102583 1 0 1 1 0
#> SRR1456971 1 0 1 1 0
#> SRR1340574 1 0 1 1 0
#> SRR1444830 2 0 1 0 1
#> SRR1096267 1 0 1 1 0
#> SRR1087127 2 0 1 0 1
#> SRR1408553 1 0 1 1 0
#> SRR1069231 1 0 1 1 0
#> SRR1325642 2 0 1 0 1
#> SRR1362103 1 0 1 1 0
#> SRR1321942 1 0 1 1 0
#> SRR1094380 1 0 1 1 0
#> SRR1447499 2 0 1 0 1
#> SRR1099330 2 0 1 0 1
#> SRR1077874 2 0 1 0 1
#> SRR808299 2 0 1 0 1
#> SRR1098050 2 0 1 0 1
#> SRR1481238 2 0 1 0 1
#> SRR1443568 2 0 1 0 1
#> SRR1380249 1 0 1 1 0
#> SRR1080143 1 0 1 1 0
#> SRR1383148 1 0 1 1 0
#> SRR1357042 1 0 1 1 0
#> SRR1416025 2 0 1 0 1
#> SRR1431015 2 0 1 0 1
#> SRR1078709 2 0 1 0 1
#> SRR813283 1 0 1 1 0
#> SRR1430226 2 0 1 0 1
#> SRR1070665 1 0 1 1 0
#> SRR1466927 2 0 1 0 1
#> SRR1347707 2 0 1 0 1
#> SRR807679 1 0 1 1 0
#> SRR1333811 2 0 1 0 1
#> SRR1078660 2 0 1 0 1
#> SRR1331730 2 0 1 0 1
#> SRR1333913 1 0 1 1 0
#> SRR1432542 1 0 1 1 0
#> SRR1418041 1 0 1 1 0
#> SRR1085211 1 0 1 1 0
#> SRR1339812 2 0 1 0 1
#> SRR1402437 1 0 1 1 0
#> SRR1350958 2 0 1 0 1
#> SRR1396822 2 0 1 0 1
#> SRR1441934 2 0 1 0 1
#> SRR1472552 2 0 1 0 1
#> SRR1488881 2 0 1 0 1
#> SRR1102973 1 0 1 1 0
#> SRR1071131 2 0 1 0 1
#> SRR1074502 1 0 1 1 0
#> SRR1325271 1 0 1 1 0
#> SRR1409171 2 0 1 0 1
#> SRR809113 2 0 1 0 1
#> SRR1430045 2 0 1 0 1
#> SRR1441245 2 0 1 0 1
#> SRR1384091 1 0 1 1 0
#> SRR1431887 2 0 1 0 1
#> SRR1096525 1 0 1 1 0
#> SRR1488491 2 0 1 0 1
#> SRR1356351 2 0 1 0 1
#> SRR1369514 1 0 1 1 0
#> SRR1453299 2 0 1 0 1
#> SRR1436300 1 0 1 1 0
#> SRR1348490 2 0 1 0 1
#> SRR1091767 2 0 1 0 1
#> SRR1354467 2 0 1 0 1
#> SRR1069074 2 0 1 0 1
#> SRR1452399 2 0 1 0 1
#> SRR1437430 2 0 1 0 1
#> SRR1419736 2 0 1 0 1
#> SRR1313343 2 0 1 0 1
#> SRR1077619 1 0 1 1 0
#> SRR1083530 1 0 1 1 0
#> SRR1333633 2 0 1 0 1
#> SRR1354999 2 0 1 0 1
#> SRR1443592 2 0 1 0 1
#> SRR1077356 1 0 1 1 0
#> SRR1378818 2 0 1 0 1
#> SRR1413182 1 0 1 1 0
#> SRR1464559 1 0 1 1 0
#> SRR1413075 2 0 1 0 1
#> SRR1487928 1 0 1 1 0
#> SRR1388997 2 0 1 0 1
#> SRR1092865 2 0 1 0 1
#> SRR1102729 1 0 1 1 0
#> SRR1456423 1 0 1 1 0
#> SRR1321591 2 0 1 0 1
#> SRR1376874 2 0 1 0 1
#> SRR1339903 1 0 1 1 0
#> SRR1346710 1 0 1 1 0
#> SRR1418771 2 0 1 0 1
#> SRR1095358 2 0 1 0 1
#> SRR1480941 2 0 1 0 1
#> SRR1479175 2 0 1 0 1
#> SRR1313891 2 0 1 0 1
#> SRR1491354 1 0 1 1 0
#> SRR1433884 2 0 1 0 1
#> SRR1471074 2 0 1 0 1
#> SRR1353052 2 0 1 0 1
#> SRR1355554 2 0 1 0 1
#> SRR1487173 1 0 1 1 0
#> SRR1474253 1 0 1 1 0
#> SRR1322918 2 0 1 0 1
#> SRR1318331 2 0 1 0 1
#> SRR1321333 2 0 1 0 1
#> SRR1474231 1 0 1 1 0
#> SRR1350545 1 0 1 1 0
#> SRR1091328 1 0 1 1 0
#> SRR814447 2 0 1 0 1
#> SRR1455989 2 0 1 0 1
#> SRR1453680 2 0 1 0 1
#> SRR1470356 2 0 1 0 1
#> SRR1342977 2 0 1 0 1
#> SRR1444222 2 0 1 0 1
#> SRR1097197 1 0 1 1 0
#> SRR1366729 2 0 1 0 1
#> SRR821282 2 0 1 0 1
#> SRR1074602 2 0 1 0 1
#> SRR814633 2 0 1 0 1
#> SRR1072480 2 0 1 0 1
#> SRR1319100 1 0 1 1 0
#> SRR1324004 2 0 1 0 1
#> SRR1457459 1 0 1 1 0
#> SRR1421031 1 0 1 1 0
#> SRR1444598 2 0 1 0 1
#> SRR1091743 2 0 1 0 1
#> SRR819637 1 0 1 1 0
#> SRR1083848 1 0 1 1 0
#> SRR1088934 2 0 1 0 1
#> SRR1459785 2 0 1 0 1
#> SRR1083700 1 0 1 1 0
#> SRR1375531 1 0 1 1 0
#> SRR1323470 2 0 1 0 1
#> SRR814657 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.1289 0.8995 0.968 0.000 0.032
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0237 0.9539 0.000 0.996 0.004
#> SRR809406 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR819559 1 0.1031 0.9012 0.976 0.000 0.024
#> SRR1387899 2 0.5465 0.1025 0.000 0.712 0.288
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0237 0.9539 0.000 0.996 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1402944 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.5138 0.8153 0.748 0.000 0.252
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1068687 2 0.1643 0.8977 0.000 0.956 0.044
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.2796 0.8793 0.908 0.000 0.092
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.6267 0.9172 0.000 0.452 0.548
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4654 0.8325 0.792 0.000 0.208
#> SRR1486821 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1418540 1 0.0747 0.9034 0.984 0.000 0.016
#> SRR1408788 3 0.6204 0.9673 0.000 0.424 0.576
#> SRR1359487 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1321829 2 0.0237 0.9539 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475993 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.1289 0.9167 0.000 0.968 0.032
#> SRR1366124 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.5138 0.8153 0.748 0.000 0.252
#> SRR1086490 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.5760 0.7763 0.672 0.000 0.328
#> SRR1384431 1 0.4291 0.8473 0.820 0.000 0.180
#> SRR1072055 1 0.1643 0.8956 0.956 0.000 0.044
#> SRR1359738 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1344034 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1080391 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0237 0.9539 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3879 0.8600 0.848 0.000 0.152
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.1411 0.8979 0.964 0.000 0.036
#> SRR1079380 3 0.6299 0.8697 0.000 0.476 0.524
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0592 0.9456 0.000 0.988 0.012
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.2711 0.5217 0.000 0.088 0.912
#> SRR1431735 1 0.3192 0.8744 0.888 0.000 0.112
#> SRR1417387 1 0.4555 0.8390 0.800 0.000 0.200
#> SRR1445984 1 0.0892 0.9023 0.980 0.000 0.020
#> SRR1370447 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1446308 2 0.6045 -0.4155 0.000 0.620 0.380
#> SRR1437346 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1319584 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.5859 0.7682 0.656 0.000 0.344
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.5098 0.2890 0.000 0.752 0.248
#> SRR1335314 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1400799 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.4654 0.8325 0.792 0.000 0.208
#> SRR1445023 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1077599 2 0.2356 0.8493 0.000 0.928 0.072
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.2796 0.8806 0.908 0.000 0.092
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.6095 0.9274 0.000 0.392 0.608
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1385434 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1415591 3 0.6204 0.9674 0.000 0.424 0.576
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1308734 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1498973 2 0.0237 0.9539 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.5859 0.7682 0.656 0.000 0.344
#> SRR814341 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.3116 0.7771 0.000 0.892 0.108
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR809919 1 0.2537 0.8851 0.920 0.000 0.080
#> SRR1370818 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1323651 2 0.5138 0.2989 0.000 0.748 0.252
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1091230 2 0.0237 0.9539 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1317731 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.1643 0.8969 0.000 0.956 0.044
#> SRR812128 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1076801 1 0.5016 0.8214 0.760 0.000 0.240
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.6180 0.7264 0.584 0.000 0.416
#> SRR1413137 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0237 0.9062 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416266 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1435394 2 0.3752 0.6893 0.000 0.856 0.144
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1094357 1 0.2066 0.8909 0.940 0.000 0.060
#> SRR1081639 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.1753 0.8926 0.000 0.952 0.048
#> SRR1312147 1 0.4605 0.8381 0.796 0.000 0.204
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1474930 2 0.2711 0.8127 0.000 0.912 0.088
#> SRR1470988 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR811915 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0592 0.9447 0.000 0.988 0.012
#> SRR1357083 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.6204 0.9674 0.000 0.424 0.576
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.3619 0.8651 0.864 0.000 0.136
#> SRR1429368 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR817142 2 0.2711 0.8183 0.000 0.912 0.088
#> SRR1315291 3 0.0000 0.3960 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309314 3 0.5760 0.8199 0.000 0.328 0.672
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.3551 0.8668 0.868 0.000 0.132
#> SRR1096760 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1440290 2 0.3340 0.7494 0.000 0.880 0.120
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.2796 0.8811 0.908 0.000 0.092
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.5760 0.7767 0.672 0.000 0.328
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1447893 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1466025 2 0.0592 0.9447 0.000 0.988 0.012
#> SRR1477429 1 0.5968 0.7575 0.636 0.000 0.364
#> SRR1445701 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR820689 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.5529 0.0672 0.000 0.704 0.296
#> SRR1474485 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1105417 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1325578 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1358161 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.4346 0.5730 0.000 0.816 0.184
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1447828 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1475448 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.4842 0.4084 0.000 0.776 0.224
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.2066 0.8710 0.000 0.940 0.060
#> SRR1457527 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1488858 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1454695 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.4178 0.8516 0.828 0.000 0.172
#> SRR1084742 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0424 0.9494 0.000 0.992 0.008
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.1643 0.8974 0.000 0.956 0.044
#> SRR1072388 1 0.3879 0.8591 0.848 0.000 0.152
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.5216 0.2692 0.000 0.740 0.260
#> SRR1076195 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1069895 3 0.6291 0.8878 0.000 0.468 0.532
#> SRR1099144 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1385150 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.4346 0.8467 0.816 0.000 0.184
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1408553 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1481238 2 0.3482 0.7346 0.000 0.872 0.128
#> SRR1443568 2 0.5905 -0.3013 0.000 0.648 0.352
#> SRR1380249 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.1031 0.9011 0.976 0.000 0.024
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.5988 0.8869 0.000 0.368 0.632
#> SRR807679 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.4002 0.8562 0.840 0.000 0.160
#> SRR1418041 1 0.2537 0.8846 0.920 0.000 0.080
#> SRR1085211 1 0.1529 0.8968 0.960 0.000 0.040
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1411 0.8987 0.964 0.000 0.036
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.3267 0.7587 0.000 0.884 0.116
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1488881 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1102973 1 0.2959 0.8779 0.900 0.000 0.100
#> SRR1071131 2 0.5058 0.3084 0.000 0.756 0.244
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.5835 0.7691 0.660 0.000 0.340
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.1031 0.9302 0.000 0.976 0.024
#> SRR1369514 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1453299 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.1529 0.9059 0.000 0.960 0.040
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1437430 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1419736 2 0.0747 0.9397 0.000 0.984 0.016
#> SRR1313343 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1077619 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1354999 2 0.2261 0.8566 0.000 0.932 0.068
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1413182 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1464559 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1413075 2 0.0424 0.9494 0.000 0.992 0.008
#> SRR1487928 1 0.6192 0.7239 0.580 0.000 0.420
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.4654 0.8353 0.792 0.000 0.208
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.3192 0.7678 0.000 0.888 0.112
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1455989 2 0.6295 -0.7494 0.000 0.528 0.472
#> SRR1453680 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR821282 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9581 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.6095 0.7414 0.608 0.000 0.392
#> SRR1444598 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1091743 2 0.0237 0.9539 0.000 0.996 0.004
#> SRR819637 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.6291 0.8879 0.000 0.468 0.532
#> SRR1459785 3 0.6192 0.9737 0.000 0.420 0.580
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.1289 0.8990 0.968 0.000 0.032
#> SRR1323470 3 0.6168 0.9342 0.000 0.412 0.588
#> SRR814657 1 0.0000 0.9072 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.2871 0.8237 0.896 0.000 0.072 0.032
#> SRR1326059 1 0.1743 0.8481 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1409062 2 0.1584 0.8535 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR809406 1 0.1118 0.8565 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1465313 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR819559 1 0.4030 0.7469 0.836 0.000 0.072 0.092
#> SRR1387899 3 0.5383 0.4475 0.000 0.452 0.536 0.012
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.2469 0.7942 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1343629 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326868 2 0.1174 0.8645 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1102320 1 0.0817 0.8581 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1469926 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1070036 1 0.2216 0.8054 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1098426 1 0.2799 0.7888 0.884 0.000 0.108 0.008
#> SRR1090310 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1429748 1 0.1474 0.8509 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1363654 1 0.0707 0.8587 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1326317 2 0.1767 0.8475 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.4814 0.9093 0.316 0.000 0.008 0.676
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1402944 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1092818 1 0.2469 0.7942 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1093552 1 0.6965 -0.5167 0.460 0.000 0.112 0.428
#> SRR1464880 2 0.4356 0.6440 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.4356 0.6440 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1320034 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1068687 2 0.5753 0.6062 0.000 0.680 0.072 0.248
#> SRR1437491 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.5050 0.6064 0.764 0.000 0.084 0.152
#> SRR1354203 1 0.1004 0.8580 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1077850 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.4356 0.6440 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1455214 1 0.1938 0.8482 0.936 0.000 0.052 0.012
#> SRR1092014 3 0.7312 0.7391 0.000 0.188 0.520 0.292
#> SRR1097857 1 0.1545 0.8542 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1338687 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.6701 -0.1262 0.564 0.000 0.108 0.328
#> SRR1486821 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1418540 1 0.4901 0.6441 0.780 0.000 0.108 0.112
#> SRR1408788 3 0.4387 0.8607 0.000 0.236 0.752 0.012
#> SRR1359487 4 0.5152 0.9080 0.316 0.000 0.020 0.664
#> SRR1080648 1 0.2011 0.8152 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1414708 1 0.2281 0.8028 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1469080 2 0.4356 0.6440 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.5152 0.9086 0.316 0.000 0.020 0.664
#> SRR1321829 2 0.1584 0.8535 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1475993 3 0.3626 0.9035 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1445387 1 0.1022 0.8571 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1077575 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1349300 1 0.1557 0.8494 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1374165 4 0.6700 0.8436 0.316 0.000 0.112 0.572
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.1474 0.8509 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1401146 2 0.6075 0.5371 0.000 0.636 0.076 0.288
#> SRR1366124 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1391811 1 0.0817 0.8583 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1456674 1 0.6965 -0.5167 0.460 0.000 0.112 0.428
#> SRR1086490 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1088511 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.6384 -0.4842 0.496 0.000 0.064 0.440
#> SRR1384431 1 0.5723 0.3841 0.684 0.000 0.072 0.244
#> SRR1072055 1 0.4727 0.6571 0.792 0.000 0.108 0.100
#> SRR1359738 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1332141 1 0.0817 0.8583 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1085900 2 0.0188 0.8817 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1344034 3 0.7128 0.7673 0.000 0.184 0.556 0.260
#> SRR1080391 4 0.4814 0.9100 0.316 0.000 0.008 0.676
#> SRR1347870 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1557 0.8494 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.5013 0.6176 0.000 0.688 0.020 0.292
#> SRR1070060 1 0.1824 0.8466 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1487969 2 0.4103 0.6803 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1417851 1 0.6945 -0.0798 0.552 0.000 0.136 0.312
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.2799 0.7907 0.884 0.000 0.108 0.008
#> SRR1076705 1 0.4411 0.6933 0.812 0.000 0.108 0.080
#> SRR1079380 3 0.7700 0.6457 0.000 0.248 0.448 0.304
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.5407 0.5931 0.000 0.668 0.036 0.296
#> SRR1366605 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.5738 -0.4550 0.000 0.028 0.432 0.540
#> SRR1431735 1 0.6801 -0.0302 0.568 0.000 0.124 0.308
#> SRR1417387 1 0.6748 -0.1212 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR1445984 1 0.4844 0.6593 0.784 0.000 0.108 0.108
#> SRR1370447 4 0.5599 0.9021 0.316 0.000 0.040 0.644
#> SRR1446308 3 0.4936 0.7518 0.000 0.316 0.672 0.012
#> SRR1437346 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1103143 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.2216 0.8054 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.4814 0.9100 0.316 0.000 0.008 0.676
#> SRR1319584 3 0.7359 0.7323 0.000 0.188 0.508 0.304
#> SRR1486584 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.5599 0.8975 0.316 0.000 0.040 0.644
#> SRR1317939 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.6458 0.7278 0.408 0.000 0.072 0.520
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.5110 0.2084 0.000 0.636 0.352 0.012
#> SRR1335314 4 0.5152 0.9080 0.316 0.000 0.020 0.664
#> SRR1400799 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1074578 1 0.2222 0.8412 0.924 0.000 0.060 0.016
#> SRR1312226 2 0.4331 0.6480 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1416207 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.1388 0.8562 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1069328 1 0.6265 -0.0547 0.588 0.000 0.072 0.340
#> SRR1445023 4 0.5152 0.9080 0.316 0.000 0.020 0.664
#> SRR1077599 2 0.4546 0.5421 0.000 0.732 0.256 0.012
#> SRR1453480 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.6178 0.3482 0.660 0.000 0.112 0.228
#> SRR1074839 2 0.0524 0.8770 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1458727 3 0.7006 0.7170 0.000 0.132 0.528 0.340
#> SRR1436949 2 0.4356 0.6440 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1070429 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1458158 1 0.0707 0.8590 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1432408 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1310334 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1385434 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1415591 3 0.3852 0.8975 0.000 0.192 0.800 0.008
#> SRR1402009 1 0.0817 0.8583 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1316055 4 0.5432 0.9052 0.316 0.000 0.032 0.652
#> SRR1308734 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1498973 2 0.5013 0.6176 0.000 0.688 0.020 0.292
#> SRR1397115 1 0.0707 0.8587 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1392141 4 0.6875 0.7624 0.368 0.000 0.112 0.520
#> SRR814341 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.4516 0.5497 0.000 0.736 0.252 0.012
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.4508 0.8961 0.000 0.184 0.780 0.036
#> SRR809919 1 0.4872 0.6415 0.776 0.000 0.076 0.148
#> SRR1370818 4 0.5754 0.8950 0.316 0.000 0.048 0.636
#> SRR1323651 3 0.5409 0.3190 0.000 0.492 0.496 0.012
#> SRR1357297 1 0.1302 0.8538 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR818170 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1091230 2 0.1584 0.8535 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095285 3 0.3626 0.9035 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1317731 3 0.6437 0.8254 0.000 0.184 0.648 0.168
#> SRR1490785 1 0.1151 0.8577 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1432032 1 0.2081 0.8123 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1447808 1 0.1743 0.8481 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR809534 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.5972 0.5435 0.000 0.640 0.068 0.292
#> SRR812128 2 0.2149 0.8278 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1101513 1 0.1743 0.8481 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1415708 2 0.0937 0.8690 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1316033 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1076801 1 0.6963 -0.5071 0.464 0.000 0.112 0.424
#> SRR1080044 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.2376 0.8387 0.916 0.000 0.068 0.016
#> SRR1069871 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.4331 0.6480 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1083480 1 0.0817 0.8583 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1075458 1 0.2799 0.7888 0.884 0.000 0.108 0.008
#> SRR1417023 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1309333 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.1557 0.8494 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1352996 1 0.0592 0.8591 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1093172 4 0.5658 0.8886 0.328 0.000 0.040 0.632
#> SRR1413137 4 0.5517 0.8999 0.316 0.000 0.036 0.648
#> SRR1469973 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.2411 0.8306 0.920 0.000 0.040 0.040
#> SRR1416266 4 0.5678 0.9007 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.4936 0.9095 0.316 0.000 0.012 0.672
#> SRR1435394 2 0.5093 0.2956 0.000 0.640 0.348 0.012
#> SRR1383192 1 0.1824 0.8466 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1419962 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1094357 1 0.5096 0.6127 0.760 0.000 0.084 0.156
#> SRR1081639 3 0.4225 0.9005 0.000 0.184 0.792 0.024
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.5512 0.5746 0.000 0.660 0.040 0.300
#> SRR1312147 1 0.6953 -0.4658 0.476 0.000 0.112 0.412
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.6280 0.8471 0.344 0.000 0.072 0.584
#> SRR1474930 2 0.3161 0.7438 0.000 0.864 0.124 0.012
#> SRR1470988 4 0.5599 0.9020 0.316 0.000 0.040 0.644
#> SRR811915 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.4697 0.6357 0.000 0.696 0.008 0.296
#> SRR1313770 3 0.4761 0.8914 0.000 0.184 0.768 0.048
#> SRR1315780 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.2300 0.8394 0.920 0.000 0.064 0.016
#> SRR1310997 2 0.4356 0.6440 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1464494 2 0.5013 0.6176 0.000 0.688 0.020 0.292
#> SRR1357083 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1475842 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.1389 0.8395 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1378220 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1467704 1 0.2408 0.7965 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1348885 3 0.7330 0.7322 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1325826 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.5678 0.8993 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR1345692 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1097954 1 0.1807 0.8500 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1374396 4 0.5152 0.9080 0.316 0.000 0.020 0.664
#> SRR1454073 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.6558 0.0510 0.596 0.000 0.108 0.296
#> SRR1429368 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1398138 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.2469 0.7942 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1361436 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR817142 2 0.4744 0.4821 0.000 0.704 0.284 0.012
#> SRR1315291 4 0.1211 0.4348 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1309314 3 0.4565 0.8633 0.000 0.140 0.796 0.064
#> SRR1420085 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1472126 1 0.0188 0.8597 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380482 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1339276 1 0.0336 0.8598 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.6759 -0.1954 0.548 0.000 0.108 0.344
#> SRR1096760 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1440290 2 0.5159 0.2339 0.000 0.624 0.364 0.012
#> SRR1330813 2 0.1388 0.8589 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1458931 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.4814 0.9100 0.316 0.000 0.008 0.676
#> SRR1394321 1 0.2542 0.8313 0.904 0.000 0.084 0.012
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.4804 0.6449 0.780 0.000 0.072 0.148
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1312169 1 0.1557 0.8494 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1096687 4 0.6688 0.6922 0.420 0.000 0.088 0.492
#> SRR1486139 1 0.1256 0.8573 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1470313 4 0.5250 0.9050 0.316 0.000 0.024 0.660
#> SRR1447893 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1466025 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1477429 4 0.6130 0.7666 0.400 0.000 0.052 0.548
#> SRR1445701 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR820689 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0376 0.8796 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.2376 0.8387 0.916 0.000 0.068 0.016
#> SRR1489328 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.5250 0.9084 0.316 0.000 0.024 0.660
#> SRR1355769 1 0.1022 0.8560 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480917 2 0.7802 -0.1886 0.000 0.420 0.276 0.304
#> SRR1474485 4 0.5678 0.8983 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR1089998 1 0.2101 0.8437 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR1318140 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1095188 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440374 1 0.0707 0.8588 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1359565 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1105417 4 0.6123 0.8630 0.336 0.000 0.064 0.600
#> SRR1325578 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1358161 3 0.4508 0.8961 0.000 0.184 0.780 0.036
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.4356 0.6440 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1452010 1 0.1389 0.8525 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1418183 2 0.5345 -0.0951 0.000 0.560 0.428 0.012
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.1022 0.8571 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1473461 1 0.0336 0.8600 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1090837 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1447828 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3768 0.9036 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1350280 1 0.1743 0.8481 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1088557 1 0.2521 0.8334 0.912 0.000 0.064 0.024
#> SRR1102656 2 0.4304 0.6524 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1441443 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1475448 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1407291 1 0.0707 0.8587 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1405266 1 0.1209 0.8567 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1363766 1 0.1743 0.8481 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1082592 2 0.7269 0.2266 0.000 0.524 0.180 0.296
#> SRR1325794 2 0.4560 0.6383 0.000 0.700 0.004 0.296
#> SRR1095961 3 0.3626 0.9035 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1086702 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.3852 0.6806 0.000 0.808 0.180 0.012
#> SRR1457527 3 0.3768 0.9036 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3444 0.9032 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1488858 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1454695 4 0.6700 0.8436 0.316 0.000 0.112 0.572
#> SRR1090241 2 0.0524 0.8771 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1329863 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0469 0.8564 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1362135 1 0.2654 0.7914 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1379581 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1309182 1 0.1474 0.8509 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1437668 1 0.6867 -0.3560 0.508 0.000 0.108 0.384
#> SRR1084742 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1433538 1 0.0469 0.8596 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.5013 0.6176 0.000 0.688 0.020 0.292
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3718 0.7037 0.000 0.820 0.168 0.012
#> SRR1072388 1 0.6616 -0.0307 0.584 0.000 0.108 0.308
#> SRR1070332 2 0.4331 0.6480 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1320761 2 0.7877 -0.2942 0.000 0.388 0.308 0.304
#> SRR1076195 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1069895 3 0.4175 0.8779 0.000 0.212 0.776 0.012
#> SRR1099144 4 0.6652 0.8452 0.316 0.000 0.108 0.576
#> SRR1385150 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.5343 0.9042 0.316 0.000 0.028 0.656
#> SRR1102583 1 0.0817 0.8585 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1456971 1 0.6953 -0.4658 0.476 0.000 0.112 0.412
#> SRR1340574 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444830 2 0.0937 0.8690 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1408553 4 0.5517 0.8999 0.316 0.000 0.036 0.648
#> SRR1069231 1 0.3577 0.7803 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1325642 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.1792 0.8248 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.1584 0.8542 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR1447499 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1388 0.8589 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1077874 2 0.4331 0.6480 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR808299 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1481238 2 0.7295 0.2399 0.000 0.524 0.188 0.288
#> SRR1443568 3 0.5404 0.4012 0.000 0.476 0.512 0.012
#> SRR1380249 4 0.4677 0.9097 0.316 0.000 0.004 0.680
#> SRR1080143 1 0.1557 0.8494 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1383148 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1357042 1 0.0707 0.8535 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.1938 0.8482 0.936 0.000 0.052 0.012
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.3885 0.7517 0.844 0.000 0.064 0.092
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.6887 0.7074 0.000 0.116 0.528 0.356
#> SRR807679 1 0.2469 0.7942 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1333811 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1078660 2 0.3172 0.7707 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.2469 0.7942 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1432542 1 0.6820 -0.2899 0.528 0.000 0.108 0.364
#> SRR1418041 1 0.4565 0.6690 0.796 0.000 0.064 0.140
#> SRR1085211 1 0.4094 0.7179 0.828 0.000 0.056 0.116
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.5820 0.4650 0.700 0.000 0.108 0.192
#> SRR1350958 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.5093 0.2917 0.000 0.640 0.348 0.012
#> SRR1441934 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1488881 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1102973 1 0.5751 0.5306 0.712 0.000 0.124 0.164
#> SRR1071131 2 0.4999 0.2985 0.000 0.660 0.328 0.012
#> SRR1074502 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 4 0.6773 0.8104 0.348 0.000 0.108 0.544
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.5678 0.9017 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR1431887 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.5599 0.9012 0.316 0.000 0.040 0.644
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.5383 0.5931 0.000 0.672 0.036 0.292
#> SRR1369514 4 0.6280 0.8873 0.316 0.000 0.080 0.604
#> SRR1453299 3 0.3626 0.9035 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.5489 0.5803 0.000 0.664 0.040 0.296
#> SRR1091767 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.3768 0.9022 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1069074 2 0.0937 0.8690 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1452399 2 0.1209 0.8602 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1437430 3 0.4012 0.9026 0.000 0.184 0.800 0.016
#> SRR1419736 2 0.5113 0.6118 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1313343 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1077619 4 0.6033 0.8847 0.316 0.000 0.064 0.620
#> SRR1083530 1 0.1867 0.8215 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1333633 3 0.7299 0.7417 0.000 0.184 0.520 0.296
#> SRR1354999 2 0.4019 0.6575 0.000 0.792 0.196 0.012
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1743 0.8481 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1378818 3 0.7330 0.7363 0.000 0.184 0.512 0.304
#> SRR1413182 4 0.5047 0.9091 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1464559 4 0.6098 0.8820 0.316 0.000 0.068 0.616
#> SRR1413075 2 0.5013 0.6176 0.000 0.688 0.020 0.292
#> SRR1487928 4 0.5047 0.9081 0.316 0.000 0.016 0.668
#> SRR1388997 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0937 0.8690 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1102729 1 0.6079 0.1528 0.628 0.000 0.072 0.300
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1339903 1 0.1022 0.8560 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1346710 1 0.2011 0.8152 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.5062 0.6138 0.000 0.680 0.020 0.300
#> SRR1480941 3 0.7265 0.7485 0.000 0.184 0.528 0.288
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.1022 0.8575 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1433884 2 0.0524 0.8770 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.4978 0.3642 0.000 0.664 0.324 0.012
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.3444 0.9032 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1474231 1 0.1637 0.8304 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1350545 1 0.2101 0.8440 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR1091328 1 0.2469 0.7942 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR814447 3 0.3969 0.9011 0.000 0.180 0.804 0.016
#> SRR1455989 3 0.4957 0.7453 0.000 0.320 0.668 0.012
#> SRR1453680 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1470356 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.1743 0.8481 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1366729 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR821282 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1074602 2 0.1388 0.8589 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR814633 2 0.0000 0.8843 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.7299 0.7425 0.000 0.184 0.520 0.296
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.3895 0.9012 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.6098 0.8920 0.316 0.000 0.068 0.616
#> SRR1444598 3 0.7270 0.7350 0.000 0.176 0.520 0.304
#> SRR1091743 2 0.1584 0.8535 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR819637 1 0.0336 0.8578 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1083848 1 0.0188 0.8596 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1088934 3 0.4212 0.8743 0.000 0.216 0.772 0.012
#> SRR1459785 3 0.3895 0.9036 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1083700 1 0.2741 0.8224 0.892 0.000 0.096 0.012
#> SRR1375531 1 0.4130 0.7286 0.828 0.000 0.064 0.108
#> SRR1323470 3 0.7421 0.6890 0.000 0.184 0.484 0.332
#> SRR814657 1 0.1389 0.8525 0.952 0.000 0.048 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0290 0.87532 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.6000 0.71222 0.508 0.000 0.012 0.400 0.080
#> SRR1326059 1 0.5756 0.82087 0.588 0.000 0.012 0.324 0.076
#> SRR1409062 2 0.5445 0.53971 0.224 0.680 0.072 0.000 0.024
#> SRR809406 1 0.5432 0.84290 0.620 0.000 0.012 0.312 0.056
#> SRR1465313 5 0.5129 0.40949 0.000 0.056 0.328 0.000 0.616
#> SRR819559 1 0.5975 0.68898 0.496 0.000 0.012 0.416 0.076
#> SRR1387899 3 0.7256 0.29097 0.240 0.304 0.428 0.000 0.028
#> SRR1442292 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1395635 1 0.6495 0.57391 0.480 0.000 0.000 0.304 0.216
#> SRR1343629 1 0.3814 0.86421 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1326868 2 0.4713 0.60645 0.224 0.724 0.028 0.000 0.024
#> SRR1102320 1 0.4977 0.85455 0.656 0.000 0.012 0.300 0.032
#> SRR1469926 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1070036 1 0.6155 0.67509 0.548 0.000 0.000 0.276 0.176
#> SRR1098426 1 0.6526 0.55694 0.468 0.000 0.000 0.316 0.216
#> SRR1090310 3 0.4715 0.81891 0.164 0.056 0.756 0.000 0.024
#> SRR1429748 1 0.5603 0.83459 0.608 0.000 0.012 0.312 0.068
#> SRR1363654 1 0.5031 0.85542 0.656 0.000 0.012 0.296 0.036
#> SRR1326317 2 0.5706 0.50498 0.224 0.660 0.092 0.000 0.024
#> SRR1378308 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1830 0.71851 0.000 0.000 0.028 0.932 0.040
#> SRR1329947 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1469769 3 0.2576 0.84679 0.036 0.056 0.900 0.000 0.008
#> SRR1490761 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.5279 0.40666 0.004 0.056 0.328 0.000 0.612
#> SRR1402944 5 0.5263 0.41044 0.004 0.056 0.324 0.000 0.616
#> SRR1092818 1 0.6495 0.57391 0.480 0.000 0.000 0.304 0.216
#> SRR1093552 4 0.5423 0.54731 0.124 0.000 0.000 0.652 0.224
#> SRR1464880 5 0.4299 0.70612 0.004 0.388 0.000 0.000 0.608
#> SRR1078368 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.1357 0.85863 0.048 0.948 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466951 2 0.2017 0.84075 0.080 0.912 0.000 0.000 0.008
#> SRR1331879 5 0.4415 0.70431 0.008 0.388 0.000 0.000 0.604
#> SRR1320034 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1068687 5 0.7707 0.44756 0.244 0.344 0.056 0.000 0.356
#> SRR1437491 1 0.3934 0.86438 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1310777 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1329994 4 0.6190 -0.38587 0.416 0.000 0.012 0.476 0.096
#> SRR1354203 1 0.4697 0.85465 0.660 0.000 0.000 0.304 0.036
#> SRR1077850 1 0.4063 0.86441 0.708 0.000 0.000 0.280 0.012
#> SRR1369241 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.4415 0.70431 0.008 0.388 0.000 0.000 0.604
#> SRR1455214 1 0.5667 0.81620 0.580 0.000 0.012 0.344 0.064
#> SRR1092014 5 0.7668 -0.03275 0.216 0.060 0.340 0.000 0.384
#> SRR1097857 1 0.5512 0.83287 0.600 0.000 0.012 0.332 0.056
#> SRR1473318 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1345974 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1338687 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.5802 0.40308 0.192 0.000 0.012 0.648 0.148
#> SRR1486821 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1418540 4 0.6618 -0.34096 0.388 0.000 0.000 0.396 0.216
#> SRR1408788 3 0.5794 0.73127 0.216 0.104 0.656 0.000 0.024
#> SRR1359487 4 0.2077 0.71373 0.000 0.000 0.040 0.920 0.040
#> SRR1080648 1 0.6155 0.67509 0.548 0.000 0.000 0.276 0.176
#> SRR1414708 1 0.6263 0.64957 0.532 0.000 0.000 0.276 0.192
#> SRR1469080 5 0.4415 0.70431 0.008 0.388 0.000 0.000 0.604
#> SRR1365722 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.2236 0.71739 0.000 0.000 0.024 0.908 0.068
#> SRR1321829 2 0.5445 0.53971 0.224 0.680 0.072 0.000 0.024
#> SRR1475993 3 0.3102 0.84733 0.084 0.056 0.860 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.5273 0.85047 0.636 0.000 0.012 0.304 0.048
#> SRR1077575 5 0.4774 0.73772 0.000 0.360 0.028 0.000 0.612
#> SRR1349300 1 0.5692 0.83211 0.604 0.000 0.012 0.308 0.076
#> SRR1374165 4 0.3461 0.65991 0.004 0.000 0.000 0.772 0.224
#> SRR1453769 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.5360 0.84603 0.636 0.000 0.012 0.296 0.056
#> SRR1401146 5 0.6869 0.68015 0.068 0.304 0.096 0.000 0.532
#> SRR1366124 4 0.2376 0.71393 0.000 0.000 0.044 0.904 0.052
#> SRR1391811 1 0.4382 0.86171 0.688 0.000 0.000 0.288 0.024
#> SRR1456674 4 0.5382 0.55237 0.120 0.000 0.000 0.656 0.224
#> SRR1086490 3 0.4826 0.81255 0.176 0.056 0.744 0.000 0.024
#> SRR1088511 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4939 0.43755 0.180 0.000 0.012 0.728 0.080
#> SRR1384431 4 0.5848 -0.21984 0.352 0.000 0.012 0.560 0.076
#> SRR1072055 4 0.6653 -0.22014 0.364 0.000 0.000 0.408 0.228
#> SRR1359738 3 0.4427 0.83007 0.144 0.056 0.780 0.000 0.020
#> SRR1332141 1 0.4382 0.86171 0.688 0.000 0.000 0.288 0.024
#> SRR1085900 2 0.2612 0.81052 0.124 0.868 0.000 0.000 0.008
#> SRR1442173 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.4709 0.73518 0.000 0.364 0.024 0.000 0.612
#> SRR1344034 5 0.6236 0.17960 0.040 0.056 0.408 0.000 0.496
#> SRR1080391 4 0.1997 0.71471 0.000 0.000 0.040 0.924 0.036
#> SRR1347870 2 0.1768 0.84674 0.072 0.924 0.000 0.000 0.004
#> SRR814028 2 0.2006 0.84327 0.072 0.916 0.000 0.000 0.012
#> SRR814219 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1102128 1 0.5725 0.82645 0.596 0.000 0.012 0.316 0.076
#> SRR1460211 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.4639 0.73191 0.000 0.368 0.020 0.000 0.612
#> SRR1070060 1 0.5811 0.80708 0.572 0.000 0.012 0.340 0.076
#> SRR1487969 5 0.4510 0.62569 0.008 0.432 0.000 0.000 0.560
#> SRR1417851 4 0.5875 0.47318 0.152 0.000 0.000 0.592 0.256
#> SRR1443350 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.6516 0.56519 0.472 0.000 0.000 0.312 0.216
#> SRR1076705 4 0.6659 -0.26217 0.376 0.000 0.000 0.396 0.228
#> SRR1079380 5 0.5441 0.49310 0.000 0.096 0.280 0.000 0.624
#> SRR1102923 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.5175 0.73958 0.008 0.320 0.044 0.000 0.628
#> SRR1366605 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2017 0.84075 0.080 0.912 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436840 2 0.1704 0.84854 0.068 0.928 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445573 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 5 0.6283 0.32149 0.008 0.000 0.280 0.156 0.556
#> SRR1431735 4 0.6009 0.42505 0.180 0.000 0.000 0.580 0.240
#> SRR1417387 4 0.6053 0.40654 0.196 0.000 0.000 0.576 0.228
#> SRR1445984 4 0.6642 -0.19661 0.352 0.000 0.000 0.420 0.228
#> SRR1370447 4 0.2569 0.71015 0.000 0.000 0.040 0.892 0.068
#> SRR1446308 3 0.6518 0.60112 0.220 0.180 0.576 0.000 0.024
#> SRR1437346 3 0.3807 0.84148 0.116 0.056 0.820 0.000 0.008
#> SRR1103143 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.6155 0.67509 0.548 0.000 0.000 0.276 0.176
#> SRR1073191 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1468914 4 0.1997 0.71471 0.000 0.000 0.040 0.924 0.036
#> SRR1319584 5 0.5263 0.41044 0.004 0.056 0.324 0.000 0.616
#> SRR1486584 1 0.3934 0.86398 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR813536 4 0.2130 0.68750 0.000 0.000 0.012 0.908 0.080
#> SRR1317939 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1341921 4 0.3922 0.60071 0.092 0.000 0.012 0.820 0.076
#> SRR1399178 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1328551 2 0.0162 0.87672 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453259 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.4774 0.73772 0.000 0.360 0.028 0.000 0.612
#> SRR1079543 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.1764 0.84851 0.064 0.928 0.000 0.000 0.008
#> SRR1076681 2 0.6959 0.17740 0.192 0.500 0.280 0.000 0.028
#> SRR1335314 4 0.2230 0.71296 0.000 0.000 0.044 0.912 0.044
#> SRR1400799 3 0.4375 0.83035 0.148 0.056 0.780 0.000 0.016
#> SRR1074578 1 0.5824 0.80322 0.568 0.000 0.012 0.344 0.076
#> SRR1312226 5 0.4436 0.69233 0.008 0.396 0.000 0.000 0.596
#> SRR1416207 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1447371 1 0.4820 0.84082 0.632 0.000 0.000 0.332 0.036
#> SRR1069328 4 0.5424 0.20021 0.264 0.000 0.012 0.652 0.072
#> SRR1445023 4 0.2077 0.71373 0.000 0.000 0.040 0.920 0.040
#> SRR1077599 2 0.6816 0.24132 0.224 0.528 0.224 0.000 0.024
#> SRR1453480 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 4 0.6417 0.18775 0.264 0.000 0.000 0.508 0.228
#> SRR1074839 2 0.2612 0.81051 0.124 0.868 0.000 0.000 0.008
#> SRR1458727 5 0.4882 0.25517 0.008 0.012 0.440 0.000 0.540
#> SRR1436949 5 0.4415 0.70431 0.008 0.388 0.000 0.000 0.604
#> SRR1070429 3 0.4469 0.82846 0.148 0.056 0.776 0.000 0.020
#> SRR1458158 1 0.4063 0.86504 0.708 0.000 0.000 0.280 0.012
#> SRR1432408 4 0.2446 0.71326 0.000 0.000 0.044 0.900 0.056
#> SRR1310334 1 0.3814 0.86430 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1418201 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1385434 4 0.2300 0.71430 0.000 0.000 0.040 0.908 0.052
#> SRR1415591 3 0.4333 0.83168 0.144 0.056 0.784 0.000 0.016
#> SRR1402009 1 0.4697 0.85465 0.660 0.000 0.000 0.304 0.036
#> SRR1316055 4 0.2338 0.71351 0.000 0.000 0.004 0.884 0.112
#> SRR1308734 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1498973 5 0.4789 0.73071 0.004 0.368 0.020 0.000 0.608
#> SRR1397115 1 0.4880 0.85686 0.664 0.000 0.012 0.296 0.028
#> SRR1392141 4 0.4384 0.63327 0.044 0.000 0.000 0.728 0.228
#> SRR814341 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.6628 0.30667 0.220 0.560 0.196 0.000 0.024
#> SRR1459609 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.2679 0.80761 0.004 0.056 0.892 0.000 0.048
#> SRR809919 4 0.6016 -0.45872 0.412 0.000 0.012 0.496 0.080
#> SRR1370818 4 0.1638 0.71542 0.000 0.000 0.004 0.932 0.064
#> SRR1323651 3 0.7320 0.17669 0.240 0.356 0.376 0.000 0.028
#> SRR1357297 1 0.5491 0.83784 0.616 0.000 0.012 0.312 0.060
#> SRR818170 5 0.5617 0.28339 0.008 0.056 0.412 0.000 0.524
#> SRR1091230 2 0.5606 0.51948 0.224 0.668 0.084 0.000 0.024
#> SRR1470556 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.3934 0.86438 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1095285 3 0.2729 0.84890 0.060 0.056 0.884 0.000 0.000
#> SRR1317731 3 0.4424 0.61336 0.004 0.056 0.752 0.000 0.188
#> SRR1490785 1 0.4770 0.84865 0.644 0.000 0.000 0.320 0.036
#> SRR1432032 1 0.6005 0.69138 0.568 0.000 0.000 0.276 0.156
#> SRR1447808 1 0.5741 0.82362 0.592 0.000 0.012 0.320 0.076
#> SRR809534 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.5646 0.73512 0.016 0.300 0.068 0.000 0.616
#> SRR812128 2 0.4466 0.58391 0.076 0.748 0.000 0.000 0.176
#> SRR1101513 1 0.5725 0.82625 0.596 0.000 0.012 0.316 0.076
#> SRR1415708 2 0.4229 0.66895 0.208 0.756 0.012 0.000 0.024
#> SRR1316033 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1390371 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1076801 4 0.5408 0.54891 0.120 0.000 0.000 0.652 0.228
#> SRR1080044 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.5900 0.77552 0.540 0.000 0.012 0.372 0.076
#> SRR1069871 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1095744 5 0.4709 0.73518 0.000 0.364 0.024 0.000 0.612
#> SRR1068929 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.1894 0.84484 0.072 0.920 0.000 0.000 0.008
#> SRR1075054 5 0.4425 0.69880 0.008 0.392 0.000 0.000 0.600
#> SRR1083480 1 0.4404 0.86121 0.684 0.000 0.000 0.292 0.024
#> SRR1075458 1 0.6536 0.55268 0.468 0.000 0.000 0.312 0.220
#> SRR1417023 4 0.2376 0.71393 0.000 0.000 0.044 0.904 0.052
#> SRR1309333 2 0.1952 0.84086 0.084 0.912 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333676 1 0.5741 0.82377 0.592 0.000 0.012 0.320 0.076
#> SRR1352996 1 0.4779 0.85936 0.672 0.000 0.012 0.292 0.024
#> SRR1093172 4 0.2006 0.70055 0.000 0.000 0.012 0.916 0.072
#> SRR1413137 4 0.2130 0.69861 0.000 0.000 0.012 0.908 0.080
#> SRR1469973 2 0.2358 0.82582 0.104 0.888 0.000 0.000 0.008
#> SRR1420026 2 0.1764 0.84856 0.064 0.928 0.000 0.000 0.008
#> SRR817306 1 0.5554 0.80853 0.588 0.000 0.012 0.344 0.056
#> SRR1416266 4 0.2569 0.71015 0.000 0.000 0.040 0.892 0.068
#> SRR1071011 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.1216 0.71807 0.000 0.000 0.020 0.960 0.020
#> SRR1435394 2 0.7132 0.03627 0.224 0.444 0.308 0.000 0.024
#> SRR1383192 1 0.5811 0.80708 0.572 0.000 0.012 0.340 0.076
#> SRR1419962 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1094357 4 0.6121 -0.54307 0.436 0.000 0.012 0.464 0.088
#> SRR1081639 3 0.2409 0.82280 0.008 0.056 0.908 0.000 0.028
#> SRR1356016 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.5016 0.74215 0.004 0.344 0.036 0.000 0.616
#> SRR1312147 4 0.5450 0.54334 0.124 0.000 0.000 0.648 0.228
#> SRR1473891 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2666 0.66773 0.020 0.000 0.012 0.892 0.076
#> SRR1474930 2 0.5343 0.61261 0.192 0.704 0.076 0.000 0.028
#> SRR1470988 4 0.2569 0.71015 0.000 0.000 0.040 0.892 0.068
#> SRR811915 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.3934 0.86438 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1100005 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.6243 0.64993 0.096 0.348 0.020 0.000 0.536
#> SRR1313770 3 0.3012 0.79260 0.008 0.056 0.876 0.000 0.060
#> SRR1315780 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR819124 1 0.5890 0.78011 0.544 0.000 0.012 0.368 0.076
#> SRR1310997 5 0.4403 0.70547 0.008 0.384 0.000 0.000 0.608
#> SRR1464494 5 0.4994 0.72978 0.012 0.364 0.020 0.000 0.604
#> SRR1357083 3 0.4826 0.81255 0.176 0.056 0.744 0.000 0.024
#> SRR1475842 2 0.1282 0.85686 0.044 0.952 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378085 1 0.5364 0.81471 0.636 0.000 0.004 0.284 0.076
#> SRR1378220 3 0.4896 0.80728 0.184 0.056 0.736 0.000 0.024
#> SRR1467704 1 0.6312 0.63742 0.524 0.000 0.000 0.276 0.200
#> SRR1348885 5 0.5590 0.44742 0.008 0.076 0.308 0.000 0.608
#> SRR1325826 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1466812 4 0.2824 0.69635 0.000 0.000 0.032 0.872 0.096
#> SRR1345692 2 0.2077 0.83844 0.084 0.908 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401040 3 0.3418 0.84636 0.072 0.056 0.856 0.000 0.016
#> SRR1097954 1 0.5626 0.82647 0.592 0.000 0.012 0.332 0.064
#> SRR1374396 4 0.2230 0.71296 0.000 0.000 0.044 0.912 0.044
#> SRR1454073 2 0.2068 0.83638 0.092 0.904 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355747 4 0.6247 0.31673 0.228 0.000 0.000 0.544 0.228
#> SRR1429368 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1398138 2 0.2304 0.82853 0.100 0.892 0.000 0.000 0.008
#> SRR1379260 1 0.6495 0.57391 0.480 0.000 0.000 0.304 0.216
#> SRR1361436 3 0.4247 0.83440 0.136 0.056 0.792 0.000 0.016
#> SRR817142 2 0.6933 0.19107 0.224 0.504 0.248 0.000 0.024
#> SRR1315291 4 0.6006 0.27855 0.008 0.000 0.216 0.612 0.164
#> SRR1309314 3 0.2819 0.76094 0.008 0.032 0.884 0.000 0.076
#> SRR1420085 2 0.2017 0.84075 0.080 0.912 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361308 3 0.2369 0.84845 0.032 0.056 0.908 0.000 0.004
#> SRR1472126 1 0.3934 0.86472 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1380482 5 0.5113 0.41297 0.000 0.056 0.324 0.000 0.620
#> SRR1099789 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1079480 5 0.4774 0.73772 0.000 0.360 0.028 0.000 0.612
#> SRR1339276 1 0.4339 0.86148 0.684 0.000 0.000 0.296 0.020
#> SRR1418368 1 0.3814 0.86430 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1399353 4 0.6071 0.41401 0.192 0.000 0.000 0.572 0.236
#> SRR1096760 3 0.4790 0.81462 0.172 0.056 0.748 0.000 0.024
#> SRR1440290 2 0.7256 0.02865 0.240 0.428 0.304 0.000 0.028
#> SRR1330813 2 0.5011 0.58468 0.224 0.708 0.044 0.000 0.024
#> SRR1458931 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1997 0.71471 0.000 0.000 0.040 0.924 0.036
#> SRR1394321 1 0.6124 0.72951 0.520 0.000 0.000 0.336 0.144
#> SRR1081160 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1477173 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0451 0.87349 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1390143 4 0.5989 -0.52255 0.432 0.000 0.012 0.480 0.076
#> SRR1390413 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.4203 0.83566 0.132 0.056 0.796 0.000 0.016
#> SRR1312169 1 0.5680 0.82012 0.588 0.000 0.012 0.332 0.068
#> SRR1096687 4 0.4435 0.55993 0.124 0.000 0.012 0.780 0.084
#> SRR1486139 1 0.4558 0.84918 0.652 0.000 0.000 0.324 0.024
#> SRR1470313 4 0.1943 0.71810 0.000 0.000 0.020 0.924 0.056
#> SRR1447893 3 0.4930 0.80430 0.188 0.056 0.732 0.000 0.024
#> SRR1466025 5 0.4829 0.72524 0.008 0.372 0.016 0.000 0.604
#> SRR1477429 4 0.3646 0.61090 0.100 0.000 0.012 0.836 0.052
#> SRR1445701 3 0.5398 0.76055 0.240 0.056 0.676 0.000 0.028
#> SRR820689 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1451876 2 0.3477 0.74512 0.140 0.828 0.008 0.000 0.024
#> SRR1452537 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.5908 0.79236 0.552 0.000 0.012 0.356 0.080
#> SRR1489328 2 0.2249 0.83111 0.096 0.896 0.000 0.000 0.008
#> SRR1344462 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1082709 1 0.3814 0.86430 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1447784 4 0.2388 0.71666 0.000 0.000 0.028 0.900 0.072
#> SRR1355769 1 0.5121 0.84997 0.648 0.000 0.012 0.300 0.040
#> SRR1488237 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.3934 0.86438 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1480917 5 0.5759 0.63338 0.004 0.188 0.172 0.000 0.636
#> SRR1474485 4 0.1845 0.71657 0.000 0.000 0.016 0.928 0.056
#> SRR1089998 1 0.5824 0.80602 0.568 0.000 0.012 0.344 0.076
#> SRR1318140 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1319262 3 0.4790 0.81462 0.172 0.056 0.748 0.000 0.024
#> SRR1095188 2 0.2612 0.81052 0.124 0.868 0.000 0.000 0.008
#> SRR1454350 1 0.3934 0.86438 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1440374 1 0.4338 0.86286 0.696 0.000 0.000 0.280 0.024
#> SRR1359565 3 0.4203 0.83566 0.132 0.056 0.796 0.000 0.016
#> SRR1105417 4 0.2069 0.67968 0.000 0.000 0.012 0.912 0.076
#> SRR1325578 5 0.5263 0.35670 0.000 0.056 0.368 0.000 0.576
#> SRR1358161 3 0.2679 0.80761 0.004 0.056 0.892 0.000 0.048
#> SRR1358665 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.4299 0.70612 0.004 0.388 0.000 0.000 0.608
#> SRR1452010 1 0.5415 0.84047 0.624 0.000 0.012 0.308 0.056
#> SRR1418183 2 0.7327 -0.05286 0.260 0.404 0.308 0.000 0.028
#> SRR1366345 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1387449 1 0.4822 0.85783 0.664 0.000 0.000 0.288 0.048
#> SRR1473461 1 0.4528 0.86319 0.680 0.000 0.012 0.296 0.012
#> SRR1090837 3 0.4826 0.81255 0.176 0.056 0.744 0.000 0.024
#> SRR1447828 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1338747 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.2576 0.84679 0.036 0.056 0.900 0.000 0.008
#> SRR1350280 1 0.5756 0.82087 0.588 0.000 0.012 0.324 0.076
#> SRR1088557 1 0.5917 0.76346 0.532 0.000 0.012 0.380 0.076
#> SRR1102656 5 0.4510 0.63761 0.008 0.432 0.000 0.000 0.560
#> SRR1441443 2 0.2017 0.84075 0.080 0.912 0.000 0.000 0.008
#> SRR1370682 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1475448 3 0.4826 0.81255 0.176 0.056 0.744 0.000 0.024
#> SRR1407291 1 0.4880 0.85686 0.664 0.000 0.012 0.296 0.028
#> SRR1405266 1 0.5188 0.84925 0.636 0.000 0.008 0.308 0.048
#> SRR1363766 1 0.5756 0.82087 0.588 0.000 0.012 0.324 0.076
#> SRR1082592 5 0.6006 0.70738 0.012 0.260 0.124 0.000 0.604
#> SRR1325794 5 0.4866 0.71750 0.016 0.352 0.012 0.000 0.620
#> SRR1095961 3 0.3102 0.84733 0.084 0.056 0.860 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.6773 0.32422 0.268 0.544 0.152 0.000 0.036
#> SRR1457527 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1098831 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.2859 0.84858 0.068 0.056 0.876 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.2300 0.71430 0.000 0.000 0.040 0.908 0.052
#> SRR1454695 4 0.3305 0.66177 0.000 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1090241 2 0.2585 0.80146 0.072 0.896 0.008 0.000 0.024
#> SRR1329863 2 0.0162 0.87687 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.4138 0.85678 0.708 0.000 0.000 0.276 0.016
#> SRR1362135 1 0.6526 0.55694 0.468 0.000 0.000 0.316 0.216
#> SRR1379581 3 0.1901 0.83681 0.004 0.056 0.928 0.000 0.012
#> SRR1309182 1 0.5692 0.83175 0.604 0.000 0.012 0.308 0.076
#> SRR1437668 4 0.5644 0.51051 0.144 0.000 0.000 0.628 0.228
#> SRR1084742 5 0.4761 0.73816 0.000 0.356 0.028 0.000 0.616
#> SRR1433538 1 0.4674 0.86134 0.676 0.000 0.008 0.292 0.024
#> SRR1085063 2 0.0451 0.87373 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454247 5 0.4639 0.73191 0.000 0.368 0.020 0.000 0.612
#> SRR1097100 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.6598 0.31647 0.224 0.564 0.188 0.000 0.024
#> SRR1072388 4 0.6080 0.40725 0.200 0.000 0.000 0.572 0.228
#> SRR1070332 5 0.4425 0.69880 0.008 0.392 0.000 0.000 0.600
#> SRR1320761 5 0.5638 0.64096 0.000 0.192 0.172 0.000 0.636
#> SRR1076195 4 0.2446 0.71326 0.000 0.000 0.044 0.900 0.056
#> SRR1069895 3 0.5657 0.73982 0.224 0.088 0.664 0.000 0.024
#> SRR1099144 4 0.3210 0.66762 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1385150 3 0.4790 0.81462 0.172 0.056 0.748 0.000 0.024
#> SRR1420191 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1872 0.71823 0.000 0.000 0.020 0.928 0.052
#> SRR1102583 1 0.4957 0.85524 0.660 0.000 0.012 0.296 0.032
#> SRR1456971 4 0.5490 0.53732 0.128 0.000 0.000 0.644 0.228
#> SRR1340574 1 0.3934 0.86438 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1444830 2 0.4358 0.64504 0.228 0.736 0.008 0.000 0.028
#> SRR1096267 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1087127 5 0.5279 0.40666 0.004 0.056 0.328 0.000 0.612
#> SRR1408553 4 0.2248 0.69787 0.000 0.000 0.012 0.900 0.088
#> SRR1069231 1 0.6918 0.61345 0.432 0.000 0.012 0.340 0.216
#> SRR1325642 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.5939 0.72007 0.576 0.000 0.000 0.276 0.148
#> SRR1321942 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1094380 1 0.5052 0.83236 0.612 0.000 0.000 0.340 0.048
#> SRR1447499 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.4868 0.59661 0.224 0.716 0.036 0.000 0.024
#> SRR1077874 5 0.4425 0.69880 0.008 0.392 0.000 0.000 0.600
#> SRR808299 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.4774 0.73772 0.000 0.360 0.028 0.000 0.612
#> SRR1481238 5 0.7296 0.64153 0.088 0.264 0.132 0.000 0.516
#> SRR1443568 3 0.7401 0.28265 0.272 0.296 0.400 0.000 0.032
#> SRR1380249 4 0.2193 0.71665 0.000 0.000 0.028 0.912 0.060
#> SRR1080143 1 0.5756 0.82087 0.588 0.000 0.012 0.324 0.076
#> SRR1383148 4 0.2300 0.71430 0.000 0.000 0.040 0.908 0.052
#> SRR1357042 1 0.4229 0.85447 0.704 0.000 0.000 0.276 0.020
#> SRR1416025 2 0.1768 0.84674 0.072 0.924 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431015 2 0.1892 0.84281 0.080 0.916 0.000 0.000 0.004
#> SRR1078709 2 0.2193 0.83371 0.092 0.900 0.000 0.000 0.008
#> SRR813283 1 0.5667 0.81620 0.580 0.000 0.012 0.344 0.064
#> SRR1430226 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.5758 0.72127 0.524 0.000 0.012 0.404 0.060
#> SRR1466927 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.5140 0.24122 0.008 0.012 0.440 0.008 0.532
#> SRR807679 1 0.6495 0.57391 0.480 0.000 0.000 0.304 0.216
#> SRR1333811 3 0.2576 0.84679 0.036 0.056 0.900 0.000 0.008
#> SRR1078660 2 0.5331 0.29157 0.092 0.640 0.000 0.000 0.268
#> SRR1331730 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.6495 0.57391 0.480 0.000 0.000 0.304 0.216
#> SRR1432542 4 0.6053 0.41730 0.196 0.000 0.000 0.576 0.228
#> SRR1418041 4 0.5996 -0.58175 0.452 0.000 0.012 0.460 0.076
#> SRR1085211 1 0.5901 0.65684 0.496 0.000 0.000 0.400 0.104
#> SRR1339812 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 4 0.6517 0.07024 0.292 0.000 0.000 0.480 0.228
#> SRR1350958 2 0.0510 0.87310 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.7068 0.11487 0.224 0.468 0.284 0.000 0.024
#> SRR1441934 2 0.2011 0.83877 0.088 0.908 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472552 3 0.4203 0.83585 0.132 0.056 0.796 0.000 0.016
#> SRR1488881 3 0.4112 0.83786 0.124 0.056 0.804 0.000 0.016
#> SRR1102973 4 0.6485 -0.25137 0.344 0.000 0.000 0.460 0.196
#> SRR1071131 2 0.6872 0.21870 0.188 0.520 0.264 0.000 0.028
#> SRR1074502 1 0.3814 0.86430 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1325271 4 0.4384 0.63827 0.044 0.000 0.000 0.728 0.228
#> SRR1409171 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0880 0.86595 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1952 0.84111 0.084 0.912 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384091 4 0.1549 0.71806 0.000 0.000 0.016 0.944 0.040
#> SRR1431887 2 0.0451 0.87373 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096525 4 0.2331 0.70400 0.000 0.000 0.020 0.900 0.080
#> SRR1488491 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.5037 0.74379 0.000 0.336 0.048 0.000 0.616
#> SRR1369514 4 0.2069 0.69903 0.000 0.000 0.012 0.912 0.076
#> SRR1453299 3 0.2795 0.84858 0.064 0.056 0.880 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1348490 5 0.4921 0.74342 0.000 0.340 0.040 0.000 0.620
#> SRR1091767 2 0.2077 0.83844 0.084 0.908 0.000 0.000 0.008
#> SRR1354467 3 0.4158 0.83682 0.128 0.056 0.800 0.000 0.016
#> SRR1069074 2 0.3844 0.70114 0.176 0.792 0.008 0.000 0.024
#> SRR1452399 2 0.3317 0.79116 0.112 0.848 0.032 0.000 0.008
#> SRR1437430 3 0.2131 0.83198 0.008 0.056 0.920 0.000 0.016
#> SRR1419736 5 0.4774 0.73772 0.000 0.360 0.028 0.000 0.612
#> SRR1313343 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1077619 4 0.2471 0.69820 0.000 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1083530 1 0.5556 0.76374 0.616 0.000 0.000 0.276 0.108
#> SRR1333633 5 0.6125 0.31548 0.040 0.056 0.352 0.000 0.552
#> SRR1354999 2 0.6880 0.27335 0.260 0.520 0.192 0.000 0.028
#> SRR1443592 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.5756 0.82087 0.588 0.000 0.012 0.324 0.076
#> SRR1378818 5 0.5279 0.40666 0.004 0.056 0.328 0.000 0.612
#> SRR1413182 4 0.2077 0.71373 0.000 0.000 0.040 0.920 0.040
#> SRR1464559 4 0.2516 0.69700 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1413075 5 0.4829 0.72524 0.008 0.372 0.016 0.000 0.604
#> SRR1487928 4 0.2520 0.71116 0.000 0.000 0.048 0.896 0.056
#> SRR1388997 2 0.1892 0.84281 0.080 0.916 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092865 2 0.4106 0.70245 0.196 0.768 0.008 0.000 0.028
#> SRR1102729 4 0.5741 -0.06887 0.320 0.000 0.012 0.592 0.076
#> SRR1456423 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1339903 1 0.5449 0.84066 0.616 0.000 0.012 0.316 0.056
#> SRR1346710 1 0.6155 0.67509 0.548 0.000 0.000 0.276 0.176
#> SRR1418771 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5661 0.72363 0.032 0.328 0.040 0.000 0.600
#> SRR1480941 3 0.5623 -0.01277 0.008 0.056 0.520 0.000 0.416
#> SRR1479175 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.4990 0.86155 0.664 0.000 0.012 0.288 0.036
#> SRR1433884 2 0.2771 0.80380 0.128 0.860 0.000 0.000 0.012
#> SRR1471074 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2011 0.83877 0.088 0.908 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355554 2 0.7176 0.14361 0.260 0.460 0.252 0.000 0.028
#> SRR1487173 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1474253 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1322918 2 0.1704 0.84854 0.068 0.928 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318331 2 0.1357 0.85577 0.048 0.948 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321333 3 0.2922 0.84830 0.072 0.056 0.872 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.5373 0.78288 0.632 0.000 0.000 0.276 0.092
#> SRR1350545 1 0.5848 0.79845 0.560 0.000 0.012 0.352 0.076
#> SRR1091328 1 0.6495 0.57391 0.480 0.000 0.000 0.304 0.216
#> SRR814447 3 0.2060 0.82966 0.008 0.052 0.924 0.000 0.016
#> SRR1455989 3 0.6227 0.66982 0.220 0.144 0.612 0.000 0.024
#> SRR1453680 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1470356 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.5770 0.81773 0.584 0.000 0.012 0.328 0.076
#> SRR1366729 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR821282 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1074602 2 0.5145 0.57276 0.224 0.700 0.052 0.000 0.024
#> SRR814633 2 0.0000 0.87846 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.5511 0.00152 0.004 0.056 0.524 0.000 0.416
#> SRR1319100 1 0.3814 0.86247 0.720 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR1324004 3 0.5291 0.76703 0.236 0.056 0.684 0.000 0.024
#> SRR1457459 1 0.3661 0.86362 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1421031 4 0.2006 0.71023 0.000 0.000 0.012 0.916 0.072
#> SRR1444598 5 0.5590 0.23965 0.008 0.052 0.436 0.000 0.504
#> SRR1091743 2 0.5445 0.53971 0.224 0.680 0.072 0.000 0.024
#> SRR819637 1 0.4138 0.85678 0.708 0.000 0.000 0.276 0.016
#> SRR1083848 1 0.3934 0.86438 0.716 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1088934 3 0.5657 0.73982 0.224 0.088 0.664 0.000 0.024
#> SRR1459785 3 0.1628 0.84151 0.000 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR1083700 1 0.6186 0.71943 0.512 0.000 0.000 0.336 0.152
#> SRR1375531 1 0.5975 0.68676 0.496 0.000 0.012 0.416 0.076
#> SRR1323470 5 0.6940 0.24628 0.104 0.056 0.360 0.000 0.480
#> SRR814657 1 0.5397 0.84247 0.628 0.000 0.012 0.304 0.056
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0146 0.8154 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.4406 0.6853 0.656 0.000 0.004 0.024 0.008 0.308
#> SRR1326059 1 0.3488 0.7401 0.744 0.000 0.008 0.000 0.004 0.244
#> SRR1409062 2 0.4597 -0.2105 0.000 0.548 0.040 0.000 0.000 0.412
#> SRR809406 1 0.3311 0.7582 0.780 0.000 0.004 0.000 0.012 0.204
#> SRR1465313 5 0.4158 0.6914 0.000 0.028 0.188 0.016 0.756 0.012
#> SRR819559 1 0.5052 0.6025 0.600 0.000 0.004 0.088 0.000 0.308
#> SRR1387899 6 0.5759 0.4439 0.000 0.172 0.392 0.000 0.000 0.436
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0260 0.7749 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1395635 1 0.5374 0.4765 0.588 0.000 0.000 0.000 0.200 0.212
#> SRR1343629 1 0.0363 0.7774 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1326868 2 0.4410 -0.1551 0.000 0.560 0.028 0.000 0.000 0.412
#> SRR1102320 1 0.2909 0.7662 0.828 0.000 0.012 0.000 0.004 0.156
#> SRR1469926 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1070036 1 0.4348 0.6084 0.724 0.000 0.000 0.000 0.124 0.152
#> SRR1098426 1 0.5398 0.4722 0.584 0.000 0.000 0.000 0.204 0.212
#> SRR1090310 3 0.3694 0.7260 0.000 0.028 0.740 0.000 0.000 0.232
#> SRR1429748 1 0.3359 0.7559 0.784 0.000 0.008 0.000 0.012 0.196
#> SRR1363654 1 0.2773 0.7674 0.836 0.000 0.008 0.000 0.004 0.152
#> SRR1326317 2 0.4863 -0.3052 0.000 0.528 0.060 0.000 0.000 0.412
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2969 0.8058 0.112 0.000 0.008 0.852 0.024 0.004
#> SRR1329947 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469769 3 0.2420 0.8143 0.000 0.028 0.900 0.008 0.008 0.056
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.4036 0.6928 0.000 0.028 0.188 0.020 0.760 0.004
#> SRR1402944 5 0.4158 0.6914 0.000 0.028 0.188 0.016 0.756 0.012
#> SRR1092818 1 0.5374 0.4765 0.588 0.000 0.000 0.000 0.200 0.212
#> SRR1093552 4 0.7546 0.5307 0.212 0.000 0.000 0.368 0.204 0.216
#> SRR1464880 5 0.2969 0.7921 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.3285 0.6936 0.000 0.820 0.000 0.064 0.000 0.116
#> SRR1466951 2 0.4185 0.6220 0.000 0.744 0.000 0.084 0.004 0.168
#> SRR1331879 5 0.3109 0.7919 0.000 0.224 0.000 0.004 0.772 0.000
#> SRR1320034 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1068687 6 0.7597 0.1394 0.000 0.204 0.028 0.084 0.300 0.384
#> SRR1437491 1 0.0713 0.7771 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1310777 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0551 0.7755 0.984 0.000 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR1329994 1 0.5835 0.5509 0.608 0.000 0.020 0.148 0.012 0.212
#> SRR1354203 1 0.2048 0.7717 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1077850 1 0.0790 0.7773 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.2969 0.7921 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1455214 1 0.3221 0.7353 0.736 0.000 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1092014 5 0.6467 0.0693 0.000 0.032 0.188 0.000 0.392 0.388
#> SRR1097857 1 0.2996 0.7516 0.772 0.000 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1473318 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345974 3 0.1476 0.8144 0.000 0.028 0.948 0.004 0.008 0.012
#> SRR1338687 2 0.0146 0.8142 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071207 1 0.7301 -0.0741 0.368 0.000 0.016 0.272 0.056 0.288
#> SRR1486821 3 0.1116 0.8123 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR1418540 1 0.7057 0.2116 0.460 0.000 0.000 0.116 0.204 0.220
#> SRR1408788 3 0.5140 0.2782 0.000 0.076 0.532 0.000 0.004 0.388
#> SRR1359487 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.4200 0.6262 0.740 0.000 0.000 0.000 0.120 0.140
#> SRR1414708 1 0.4701 0.5736 0.684 0.000 0.000 0.000 0.148 0.168
#> SRR1469080 5 0.2969 0.7921 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.2658 0.8058 0.112 0.000 0.008 0.864 0.016 0.000
#> SRR1321829 2 0.4654 -0.2302 0.000 0.544 0.044 0.000 0.000 0.412
#> SRR1475993 3 0.2510 0.8096 0.000 0.028 0.872 0.000 0.000 0.100
#> SRR1445387 1 0.2823 0.7587 0.796 0.000 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1077575 5 0.3301 0.7989 0.000 0.216 0.008 0.004 0.772 0.000
#> SRR1349300 1 0.3450 0.7536 0.772 0.000 0.008 0.000 0.012 0.208
#> SRR1374165 4 0.7023 0.6530 0.116 0.000 0.000 0.468 0.204 0.212
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.2920 0.7631 0.820 0.000 0.008 0.000 0.004 0.168
#> SRR1401146 5 0.6092 0.5871 0.000 0.196 0.048 0.000 0.576 0.180
#> SRR1366124 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.1501 0.7750 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1456674 4 0.7493 0.5504 0.200 0.000 0.000 0.384 0.204 0.212
#> SRR1086490 3 0.3841 0.7019 0.000 0.028 0.716 0.000 0.000 0.256
#> SRR1088511 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.6533 0.3094 0.304 0.000 0.012 0.412 0.008 0.264
#> SRR1384431 1 0.5903 0.2855 0.460 0.000 0.000 0.228 0.000 0.312
#> SRR1072055 1 0.6851 0.2881 0.500 0.000 0.004 0.084 0.200 0.212
#> SRR1359738 3 0.3409 0.7618 0.000 0.028 0.780 0.000 0.000 0.192
#> SRR1332141 1 0.1610 0.7752 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1085900 2 0.4566 0.5424 0.000 0.692 0.000 0.084 0.004 0.220
#> SRR1442173 1 0.0000 0.7758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.3301 0.7989 0.000 0.216 0.008 0.004 0.772 0.000
#> SRR1344034 5 0.5810 0.4606 0.000 0.028 0.316 0.016 0.568 0.072
#> SRR1080391 4 0.2243 0.8043 0.112 0.000 0.004 0.880 0.000 0.004
#> SRR1347870 2 0.3978 0.6353 0.000 0.756 0.000 0.084 0.000 0.160
#> SRR814028 2 0.4305 0.6344 0.000 0.752 0.000 0.084 0.016 0.148
#> SRR814219 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102128 1 0.3240 0.7433 0.752 0.000 0.004 0.000 0.000 0.244
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.3221 0.7960 0.000 0.220 0.004 0.004 0.772 0.000
#> SRR1070060 1 0.3763 0.7381 0.736 0.000 0.012 0.000 0.012 0.240
#> SRR1487969 5 0.3426 0.7236 0.000 0.276 0.000 0.004 0.720 0.000
#> SRR1417851 4 0.7780 0.4432 0.240 0.000 0.004 0.312 0.200 0.244
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.5397 0.4737 0.584 0.000 0.000 0.000 0.200 0.216
#> SRR1076705 1 0.6741 0.2883 0.500 0.000 0.000 0.084 0.204 0.212
#> SRR1079380 5 0.3742 0.7198 0.000 0.056 0.160 0.004 0.780 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.3780 0.7938 0.000 0.204 0.016 0.000 0.760 0.020
#> SRR1366605 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.4151 0.6266 0.000 0.748 0.000 0.084 0.004 0.164
#> SRR1436840 2 0.3718 0.6634 0.000 0.784 0.000 0.084 0.000 0.132
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 5 0.5612 0.4725 0.000 0.000 0.124 0.316 0.548 0.012
#> SRR1431735 4 0.7677 0.3992 0.268 0.000 0.000 0.300 0.204 0.228
#> SRR1417387 4 0.7655 0.3900 0.280 0.000 0.000 0.304 0.204 0.212
#> SRR1445984 1 0.6943 0.2276 0.476 0.000 0.000 0.104 0.204 0.216
#> SRR1370447 4 0.3157 0.7983 0.112 0.000 0.008 0.844 0.008 0.028
#> SRR1446308 3 0.5454 -0.0205 0.000 0.124 0.484 0.000 0.000 0.392
#> SRR1437346 3 0.2868 0.7976 0.000 0.028 0.840 0.000 0.000 0.132
#> SRR1103143 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.4348 0.6084 0.724 0.000 0.000 0.000 0.124 0.152
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0260 0.7749 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1468914 4 0.2243 0.8043 0.112 0.000 0.004 0.880 0.000 0.004
#> SRR1319584 5 0.4158 0.6914 0.000 0.028 0.188 0.016 0.756 0.012
#> SRR1486584 1 0.0748 0.7765 0.976 0.000 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR813536 4 0.5267 0.7231 0.112 0.000 0.016 0.664 0.008 0.200
#> SRR1317939 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0551 0.7755 0.984 0.000 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR1341921 4 0.5846 0.5605 0.192 0.000 0.000 0.500 0.004 0.304
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.7758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3301 0.7989 0.000 0.216 0.008 0.004 0.772 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.3649 0.6781 0.000 0.800 0.000 0.084 0.004 0.112
#> SRR1076681 2 0.6990 -0.5211 0.000 0.380 0.212 0.072 0.000 0.336
#> SRR1335314 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.3440 0.7583 0.000 0.028 0.776 0.000 0.000 0.196
#> SRR1074578 1 0.3620 0.7367 0.736 0.000 0.008 0.000 0.008 0.248
#> SRR1312226 5 0.3136 0.7890 0.000 0.228 0.000 0.004 0.768 0.000
#> SRR1416207 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447371 1 0.2562 0.7580 0.828 0.000 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1069328 1 0.6600 0.1354 0.416 0.000 0.016 0.280 0.008 0.280
#> SRR1445023 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1077599 6 0.5784 0.6680 0.000 0.412 0.176 0.000 0.000 0.412
#> SRR1453480 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.7590 -0.1944 0.352 0.000 0.000 0.228 0.204 0.216
#> SRR1074839 2 0.4573 0.4970 0.000 0.672 0.000 0.084 0.000 0.244
#> SRR1458727 5 0.4979 0.6096 0.000 0.008 0.256 0.072 0.656 0.008
#> SRR1436949 5 0.3109 0.7919 0.000 0.224 0.000 0.004 0.772 0.000
#> SRR1070429 3 0.3470 0.7556 0.000 0.028 0.772 0.000 0.000 0.200
#> SRR1458158 1 0.1080 0.7790 0.960 0.000 0.004 0.000 0.004 0.032
#> SRR1432408 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0748 0.7765 0.976 0.000 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR1418201 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1385434 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.3440 0.7599 0.000 0.028 0.776 0.000 0.000 0.196
#> SRR1402009 1 0.2092 0.7714 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1316055 4 0.4742 0.7878 0.112 0.000 0.004 0.744 0.096 0.044
#> SRR1308734 3 0.1691 0.8055 0.000 0.028 0.940 0.012 0.008 0.012
#> SRR1498973 5 0.3161 0.7988 0.000 0.216 0.008 0.000 0.776 0.000
#> SRR1397115 1 0.2714 0.7682 0.848 0.000 0.012 0.000 0.004 0.136
#> SRR1392141 4 0.7157 0.6355 0.132 0.000 0.000 0.448 0.204 0.216
#> SRR814341 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.5821 -0.6976 0.000 0.408 0.184 0.000 0.000 0.408
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.2489 0.7797 0.000 0.028 0.904 0.020 0.032 0.016
#> SRR809919 1 0.5498 0.4772 0.528 0.000 0.000 0.148 0.000 0.324
#> SRR1370818 4 0.5007 0.7873 0.112 0.000 0.008 0.732 0.080 0.068
#> SRR1323651 6 0.5870 0.5569 0.000 0.200 0.364 0.000 0.000 0.436
#> SRR1357297 1 0.3362 0.7572 0.792 0.000 0.012 0.000 0.012 0.184
#> SRR818170 5 0.4868 0.6180 0.000 0.028 0.276 0.024 0.660 0.012
#> SRR1091230 2 0.4654 -0.2302 0.000 0.544 0.044 0.000 0.000 0.412
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0713 0.7771 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1095285 3 0.2701 0.8111 0.000 0.028 0.864 0.000 0.004 0.104
#> SRR1317731 3 0.4432 0.4977 0.000 0.028 0.700 0.028 0.244 0.000
#> SRR1490785 1 0.2092 0.7714 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1432032 1 0.3593 0.6699 0.800 0.000 0.004 0.000 0.064 0.132
#> SRR1447808 1 0.3290 0.7391 0.744 0.000 0.004 0.000 0.000 0.252
#> SRR809534 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.4089 0.7796 0.000 0.204 0.020 0.000 0.744 0.032
#> SRR812128 2 0.6488 0.2279 0.000 0.544 0.000 0.088 0.216 0.152
#> SRR1101513 1 0.3126 0.7420 0.752 0.000 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1415708 2 0.4443 0.1854 0.000 0.620 0.016 0.016 0.000 0.348
#> SRR1316033 3 0.1116 0.8123 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1076801 4 0.7520 0.5396 0.204 0.000 0.000 0.376 0.204 0.216
#> SRR1080044 1 0.0551 0.7768 0.984 0.000 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3791 0.7123 0.688 0.000 0.004 0.000 0.008 0.300
#> SRR1069871 1 0.0363 0.7760 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1095744 5 0.3301 0.7989 0.000 0.216 0.008 0.004 0.772 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.4082 0.6360 0.000 0.756 0.000 0.084 0.004 0.156
#> SRR1075054 5 0.2996 0.7890 0.000 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000
#> SRR1083480 1 0.1501 0.7750 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1075458 1 0.5421 0.4713 0.580 0.000 0.000 0.000 0.204 0.216
#> SRR1417023 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.4185 0.6220 0.000 0.744 0.000 0.084 0.004 0.168
#> SRR1333676 1 0.3488 0.7421 0.744 0.000 0.008 0.000 0.004 0.244
#> SRR1352996 1 0.2500 0.7724 0.868 0.000 0.012 0.000 0.004 0.116
#> SRR1093172 4 0.4592 0.7675 0.112 0.000 0.012 0.740 0.008 0.128
#> SRR1413137 4 0.4471 0.7730 0.112 0.000 0.012 0.752 0.008 0.116
#> SRR1469973 2 0.4540 0.5495 0.000 0.696 0.000 0.084 0.004 0.216
#> SRR1420026 2 0.3649 0.6781 0.000 0.800 0.000 0.084 0.004 0.112
#> SRR817306 1 0.4103 0.7405 0.772 0.000 0.016 0.044 0.008 0.160
#> SRR1416266 4 0.3157 0.7983 0.112 0.000 0.008 0.844 0.008 0.028
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3179 0.8057 0.112 0.000 0.008 0.844 0.012 0.024
#> SRR1435394 6 0.6056 0.7403 0.000 0.300 0.288 0.000 0.000 0.412
#> SRR1383192 1 0.3826 0.7390 0.736 0.000 0.016 0.000 0.012 0.236
#> SRR1419962 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1094357 1 0.5573 0.4803 0.524 0.000 0.000 0.136 0.004 0.336
#> SRR1081639 3 0.1590 0.8046 0.000 0.028 0.944 0.008 0.012 0.008
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.3371 0.7975 0.000 0.200 0.016 0.004 0.780 0.000
#> SRR1312147 4 0.7569 0.5130 0.220 0.000 0.000 0.360 0.204 0.216
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.5381 0.6623 0.124 0.000 0.004 0.568 0.000 0.304
#> SRR1474930 2 0.6098 0.0130 0.000 0.528 0.068 0.084 0.000 0.320
#> SRR1470988 4 0.2826 0.8010 0.112 0.000 0.008 0.856 0.000 0.024
#> SRR811915 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0713 0.7771 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.5809 0.5043 0.000 0.204 0.012 0.000 0.556 0.228
#> SRR1313770 3 0.2623 0.7650 0.000 0.028 0.892 0.028 0.048 0.004
#> SRR1315780 2 0.0146 0.8150 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073631 1 0.0551 0.7755 0.984 0.000 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR819124 1 0.3508 0.7189 0.704 0.000 0.004 0.000 0.000 0.292
#> SRR1310997 5 0.3221 0.7960 0.000 0.220 0.004 0.004 0.772 0.000
#> SRR1464494 5 0.3507 0.7964 0.000 0.216 0.008 0.012 0.764 0.000
#> SRR1357083 3 0.3970 0.6707 0.000 0.028 0.692 0.000 0.000 0.280
#> SRR1475842 2 0.3176 0.7024 0.000 0.832 0.000 0.084 0.000 0.084
#> SRR1378085 1 0.3079 0.7512 0.844 0.000 0.004 0.000 0.056 0.096
#> SRR1378220 3 0.4065 0.6399 0.000 0.028 0.672 0.000 0.000 0.300
#> SRR1467704 1 0.4890 0.5499 0.660 0.000 0.000 0.000 0.160 0.180
#> SRR1348885 5 0.4495 0.7039 0.000 0.048 0.180 0.024 0.740 0.008
#> SRR1325826 1 0.0363 0.7760 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466812 4 0.4326 0.7660 0.112 0.000 0.008 0.744 0.000 0.136
#> SRR1345692 2 0.4185 0.6220 0.000 0.744 0.000 0.084 0.004 0.168
#> SRR1401040 3 0.2201 0.8129 0.000 0.028 0.896 0.000 0.000 0.076
#> SRR1097954 1 0.3288 0.7297 0.724 0.000 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1374396 4 0.1814 0.7974 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.4343 0.5950 0.000 0.724 0.000 0.084 0.004 0.188
#> SRR1355747 1 0.7658 -0.3231 0.308 0.000 0.000 0.272 0.204 0.216
#> SRR1429368 3 0.1116 0.8123 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR1398138 2 0.4540 0.5495 0.000 0.696 0.000 0.084 0.004 0.216
#> SRR1379260 1 0.5398 0.4722 0.584 0.000 0.000 0.000 0.204 0.212
#> SRR1361436 3 0.3312 0.7704 0.000 0.028 0.792 0.000 0.000 0.180
#> SRR817142 6 0.5983 0.7544 0.000 0.356 0.232 0.000 0.000 0.412
#> SRR1315291 4 0.3068 0.5964 0.000 0.000 0.120 0.840 0.032 0.008
#> SRR1309314 3 0.2922 0.7552 0.000 0.028 0.876 0.060 0.028 0.008
#> SRR1420085 2 0.4185 0.6220 0.000 0.744 0.000 0.084 0.004 0.168
#> SRR1361308 3 0.2201 0.8134 0.000 0.028 0.896 0.000 0.000 0.076
#> SRR1472126 1 0.0837 0.7771 0.972 0.000 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1380482 5 0.4158 0.6914 0.000 0.028 0.188 0.016 0.756 0.012
#> SRR1099789 1 0.0000 0.7758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.3301 0.7989 0.000 0.216 0.008 0.004 0.772 0.000
#> SRR1339276 1 0.1267 0.7769 0.940 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1418368 1 0.0870 0.7781 0.972 0.000 0.004 0.000 0.012 0.012
#> SRR1399353 4 0.7688 0.3985 0.272 0.000 0.000 0.292 0.212 0.224
#> SRR1096760 3 0.3886 0.6904 0.000 0.028 0.708 0.000 0.000 0.264
#> SRR1440290 6 0.5987 0.7018 0.000 0.252 0.312 0.000 0.000 0.436
#> SRR1330813 2 0.4475 -0.1745 0.000 0.556 0.032 0.000 0.000 0.412
#> SRR1458931 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.2212 0.8040 0.112 0.000 0.008 0.880 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.4792 0.6389 0.644 0.000 0.000 0.000 0.096 0.260
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0790 0.7912 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1390143 1 0.5523 0.5055 0.548 0.000 0.004 0.140 0.000 0.308
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3027 0.7897 0.000 0.028 0.824 0.000 0.000 0.148
#> SRR1312169 1 0.3632 0.7458 0.756 0.000 0.012 0.000 0.012 0.220
#> SRR1096687 4 0.6228 0.5525 0.212 0.000 0.008 0.484 0.008 0.288
#> SRR1486139 1 0.2048 0.7680 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1470313 4 0.3693 0.8028 0.112 0.000 0.008 0.816 0.048 0.016
#> SRR1447893 3 0.4101 0.6275 0.000 0.028 0.664 0.000 0.000 0.308
#> SRR1466025 5 0.3301 0.7989 0.000 0.216 0.008 0.004 0.772 0.000
#> SRR1477429 4 0.5655 0.5884 0.200 0.000 0.000 0.528 0.000 0.272
#> SRR1445701 3 0.4444 0.3336 0.000 0.028 0.536 0.000 0.000 0.436
#> SRR820689 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1451876 2 0.3601 0.3691 0.000 0.684 0.004 0.000 0.000 0.312
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.3584 0.7110 0.688 0.000 0.004 0.000 0.000 0.308
#> SRR1489328 2 0.4402 0.5827 0.000 0.716 0.000 0.084 0.004 0.196
#> SRR1344462 1 0.0405 0.7768 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1082709 1 0.0653 0.7771 0.980 0.000 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR1447784 4 0.2633 0.8057 0.112 0.000 0.000 0.864 0.020 0.004
#> SRR1355769 1 0.2833 0.7659 0.836 0.000 0.012 0.000 0.004 0.148
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0713 0.7771 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1480917 5 0.4170 0.7601 0.000 0.124 0.092 0.000 0.768 0.016
#> SRR1474485 4 0.4905 0.7894 0.112 0.000 0.008 0.740 0.068 0.072
#> SRR1089998 1 0.3288 0.7291 0.724 0.000 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1318140 1 0.0363 0.7760 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1319262 3 0.3841 0.6993 0.000 0.028 0.716 0.000 0.000 0.256
#> SRR1095188 2 0.4566 0.5424 0.000 0.692 0.000 0.084 0.004 0.220
#> SRR1454350 1 0.0713 0.7771 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1440374 1 0.1007 0.7779 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1359565 3 0.2988 0.7917 0.000 0.028 0.828 0.000 0.000 0.144
#> SRR1105417 4 0.5420 0.6856 0.116 0.000 0.004 0.600 0.008 0.272
#> SRR1325578 5 0.4361 0.6729 0.000 0.028 0.216 0.016 0.728 0.012
#> SRR1358161 3 0.2489 0.7797 0.000 0.028 0.904 0.020 0.032 0.016
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.2969 0.7921 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1452010 1 0.3261 0.7591 0.804 0.000 0.012 0.000 0.012 0.172
#> SRR1418183 6 0.5842 0.7470 0.000 0.272 0.240 0.000 0.000 0.488
#> SRR1366345 1 0.0000 0.7758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.2092 0.7723 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1473461 1 0.1863 0.7812 0.896 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1090837 3 0.3950 0.6758 0.000 0.028 0.696 0.000 0.000 0.276
#> SRR1447828 3 0.1116 0.8123 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.2101 0.8156 0.000 0.028 0.912 0.000 0.008 0.052
#> SRR1350280 1 0.3763 0.7381 0.736 0.000 0.012 0.000 0.012 0.240
#> SRR1088557 1 0.3729 0.7104 0.692 0.000 0.000 0.012 0.000 0.296
#> SRR1102656 5 0.3371 0.7080 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR1441443 2 0.4185 0.6220 0.000 0.744 0.000 0.084 0.004 0.168
#> SRR1370682 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1475448 3 0.3950 0.6758 0.000 0.028 0.696 0.000 0.000 0.276
#> SRR1407291 1 0.2488 0.7715 0.864 0.000 0.008 0.000 0.004 0.124
#> SRR1405266 1 0.2697 0.7624 0.812 0.000 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1363766 1 0.3763 0.7381 0.736 0.000 0.012 0.000 0.012 0.240
#> SRR1082592 5 0.3930 0.7810 0.000 0.156 0.064 0.008 0.772 0.000
#> SRR1325794 5 0.3650 0.7826 0.000 0.216 0.004 0.000 0.756 0.024
#> SRR1095961 3 0.2701 0.8098 0.000 0.028 0.864 0.000 0.004 0.104
#> SRR1086702 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 6 0.5744 0.6181 0.000 0.388 0.116 0.004 0.008 0.484
#> SRR1457527 3 0.1261 0.8133 0.000 0.028 0.956 0.004 0.008 0.004
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.2558 0.8077 0.000 0.028 0.868 0.000 0.000 0.104
#> SRR1488858 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1454695 4 0.7101 0.6578 0.112 0.000 0.004 0.472 0.200 0.212
#> SRR1090241 2 0.2980 0.5701 0.000 0.800 0.008 0.000 0.000 0.192
#> SRR1329863 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0260 0.7746 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1362135 1 0.5421 0.4692 0.580 0.000 0.000 0.000 0.204 0.216
#> SRR1379581 3 0.1488 0.8074 0.000 0.028 0.948 0.008 0.008 0.008
#> SRR1309182 1 0.3420 0.7543 0.776 0.000 0.008 0.000 0.012 0.204
#> SRR1437668 4 0.7608 0.4834 0.236 0.000 0.000 0.344 0.204 0.216
#> SRR1084742 5 0.3301 0.7989 0.000 0.216 0.008 0.004 0.772 0.000
#> SRR1433538 1 0.2213 0.7761 0.888 0.000 0.008 0.000 0.004 0.100
#> SRR1085063 2 0.0458 0.8071 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1454247 5 0.3161 0.7988 0.000 0.216 0.008 0.000 0.776 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.5529 -0.5805 0.000 0.456 0.132 0.000 0.000 0.412
#> SRR1072388 1 0.7616 -0.2410 0.340 0.000 0.000 0.240 0.204 0.216
#> SRR1070332 5 0.3136 0.7890 0.000 0.228 0.000 0.004 0.768 0.000
#> SRR1320761 5 0.4216 0.7511 0.000 0.108 0.084 0.000 0.776 0.032
#> SRR1076195 4 0.1814 0.7974 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1069895 3 0.4537 0.3667 0.000 0.036 0.552 0.000 0.000 0.412
#> SRR1099144 4 0.6954 0.6602 0.112 0.000 0.000 0.480 0.204 0.204
#> SRR1385150 3 0.3817 0.7040 0.000 0.028 0.720 0.000 0.000 0.252
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.4070 0.8010 0.112 0.000 0.008 0.796 0.052 0.032
#> SRR1102583 1 0.2655 0.7683 0.848 0.000 0.008 0.000 0.004 0.140
#> SRR1456971 4 0.7569 0.5130 0.220 0.000 0.000 0.360 0.204 0.216
#> SRR1340574 1 0.0713 0.7771 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1444830 2 0.4045 -0.0546 0.000 0.564 0.008 0.000 0.000 0.428
#> SRR1096267 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087127 5 0.4278 0.6880 0.000 0.028 0.192 0.016 0.748 0.016
#> SRR1408553 4 0.4471 0.7730 0.112 0.000 0.012 0.752 0.008 0.116
#> SRR1069231 1 0.5153 0.5720 0.536 0.000 0.012 0.000 0.060 0.392
#> SRR1325642 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.3693 0.6731 0.788 0.000 0.000 0.000 0.092 0.120
#> SRR1321942 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094380 1 0.3618 0.7429 0.768 0.000 0.000 0.000 0.040 0.192
#> SRR1447499 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.4192 -0.0971 0.000 0.572 0.016 0.000 0.000 0.412
#> SRR1077874 5 0.3136 0.7890 0.000 0.228 0.000 0.004 0.768 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3370 0.7993 0.000 0.212 0.012 0.004 0.772 0.000
#> SRR1481238 5 0.6533 0.5038 0.000 0.168 0.080 0.000 0.532 0.220
#> SRR1443568 6 0.7102 0.6004 0.000 0.228 0.296 0.084 0.000 0.392
#> SRR1380249 4 0.2904 0.8053 0.112 0.000 0.008 0.852 0.028 0.000
#> SRR1080143 1 0.3642 0.7415 0.744 0.000 0.008 0.000 0.012 0.236
#> SRR1383148 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0837 0.7750 0.972 0.000 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1416025 2 0.3907 0.6439 0.000 0.764 0.000 0.084 0.000 0.152
#> SRR1431015 2 0.4079 0.6213 0.000 0.744 0.000 0.084 0.000 0.172
#> SRR1078709 2 0.4402 0.5827 0.000 0.716 0.000 0.084 0.004 0.196
#> SRR813283 1 0.3266 0.7313 0.728 0.000 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.4757 0.6347 0.636 0.000 0.000 0.084 0.000 0.280
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.5243 0.6178 0.000 0.008 0.212 0.120 0.652 0.008
#> SRR807679 1 0.5374 0.4765 0.588 0.000 0.000 0.000 0.200 0.212
#> SRR1333811 3 0.2641 0.8130 0.000 0.028 0.888 0.012 0.008 0.064
#> SRR1078660 2 0.7000 -0.1067 0.000 0.416 0.000 0.084 0.304 0.196
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.5374 0.4765 0.588 0.000 0.000 0.000 0.200 0.212
#> SRR1432542 1 0.7664 -0.3712 0.296 0.000 0.000 0.284 0.204 0.216
#> SRR1418041 1 0.5378 0.5219 0.556 0.000 0.000 0.140 0.000 0.304
#> SRR1085211 1 0.6107 0.5273 0.580 0.000 0.000 0.104 0.080 0.236
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.7545 -0.1415 0.368 0.000 0.000 0.208 0.204 0.220
#> SRR1350958 2 0.0858 0.7987 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1396822 6 0.6056 0.7386 0.000 0.300 0.288 0.000 0.000 0.412
#> SRR1441934 2 0.4235 0.5944 0.000 0.724 0.000 0.084 0.000 0.192
#> SRR1472552 3 0.3245 0.7759 0.000 0.028 0.800 0.000 0.000 0.172
#> SRR1488881 3 0.2909 0.7954 0.000 0.028 0.836 0.000 0.000 0.136
#> SRR1102973 1 0.6832 0.2969 0.456 0.000 0.000 0.144 0.096 0.304
#> SRR1071131 2 0.6922 -0.3328 0.000 0.440 0.184 0.084 0.000 0.292
#> SRR1074502 1 0.0653 0.7771 0.980 0.000 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR1325271 4 0.7369 0.6281 0.148 0.000 0.004 0.432 0.200 0.216
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0865 0.7954 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1430045 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.4082 0.6359 0.000 0.756 0.000 0.084 0.004 0.156
#> SRR1384091 4 0.5002 0.7900 0.112 0.000 0.008 0.724 0.040 0.116
#> SRR1431887 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.4106 0.7822 0.112 0.000 0.012 0.784 0.008 0.084
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.3479 0.7982 0.000 0.212 0.012 0.000 0.768 0.008
#> SRR1369514 4 0.5641 0.7447 0.112 0.000 0.016 0.624 0.016 0.232
#> SRR1453299 3 0.2309 0.8123 0.000 0.028 0.888 0.000 0.000 0.084
#> SRR1436300 1 0.0146 0.7751 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1348490 5 0.3201 0.7991 0.000 0.208 0.012 0.000 0.780 0.000
#> SRR1091767 2 0.4151 0.6266 0.000 0.748 0.000 0.084 0.004 0.164
#> SRR1354467 3 0.2949 0.7938 0.000 0.028 0.832 0.000 0.000 0.140
#> SRR1069074 2 0.3874 0.1963 0.000 0.636 0.008 0.000 0.000 0.356
#> SRR1452399 2 0.4890 0.5319 0.000 0.684 0.008 0.084 0.008 0.216
#> SRR1437430 3 0.1476 0.8070 0.000 0.028 0.948 0.008 0.012 0.004
#> SRR1419736 5 0.3161 0.7988 0.000 0.216 0.008 0.000 0.776 0.000
#> SRR1313343 3 0.1116 0.8123 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR1077619 4 0.5942 0.7564 0.112 0.000 0.008 0.648 0.112 0.120
#> SRR1083530 1 0.3307 0.6860 0.820 0.000 0.000 0.000 0.072 0.108
#> SRR1333633 5 0.4982 0.6415 0.000 0.028 0.216 0.012 0.692 0.052
#> SRR1354999 6 0.5527 0.6589 0.000 0.380 0.136 0.000 0.000 0.484
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.3290 0.7391 0.744 0.000 0.004 0.000 0.000 0.252
#> SRR1378818 5 0.4278 0.6880 0.000 0.028 0.192 0.016 0.748 0.016
#> SRR1413182 4 0.1957 0.8038 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.6163 0.7461 0.112 0.000 0.008 0.624 0.132 0.124
#> SRR1413075 5 0.3161 0.7988 0.000 0.216 0.008 0.000 0.776 0.000
#> SRR1487928 4 0.1814 0.7974 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.4185 0.6220 0.000 0.744 0.000 0.084 0.004 0.168
#> SRR1092865 2 0.5138 0.1538 0.000 0.560 0.008 0.072 0.000 0.360
#> SRR1102729 1 0.6186 0.0802 0.404 0.000 0.004 0.284 0.000 0.308
#> SRR1456423 1 0.0260 0.7749 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1321591 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1339903 1 0.3295 0.7610 0.800 0.000 0.012 0.000 0.012 0.176
#> SRR1346710 1 0.4159 0.6289 0.744 0.000 0.000 0.000 0.116 0.140
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5114 0.6994 0.000 0.196 0.016 0.000 0.664 0.124
#> SRR1480941 5 0.5459 0.2841 0.000 0.028 0.444 0.016 0.484 0.028
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.2527 0.7712 0.832 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1433884 2 0.4687 0.5013 0.000 0.672 0.000 0.084 0.004 0.240
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.4205 0.5999 0.000 0.728 0.000 0.084 0.000 0.188
#> SRR1355554 6 0.5779 0.7674 0.000 0.312 0.200 0.000 0.000 0.488
#> SRR1487173 1 0.0000 0.7758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0146 0.7766 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1322918 2 0.3871 0.6478 0.000 0.768 0.000 0.084 0.000 0.148
#> SRR1318331 2 0.3325 0.6937 0.000 0.820 0.000 0.084 0.000 0.096
#> SRR1321333 3 0.2605 0.8062 0.000 0.028 0.864 0.000 0.000 0.108
#> SRR1474231 1 0.2350 0.7169 0.880 0.000 0.000 0.000 0.020 0.100
#> SRR1350545 1 0.3859 0.7159 0.692 0.000 0.008 0.000 0.008 0.292
#> SRR1091328 1 0.5374 0.4765 0.588 0.000 0.000 0.000 0.200 0.212
#> SRR814447 3 0.1590 0.8046 0.000 0.028 0.944 0.008 0.012 0.008
#> SRR1455989 3 0.5166 0.2532 0.000 0.096 0.540 0.000 0.000 0.364
#> SRR1453680 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0458 0.8083 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1097197 1 0.3596 0.7372 0.740 0.000 0.008 0.000 0.008 0.244
#> SRR1366729 3 0.1116 0.8123 0.000 0.028 0.960 0.004 0.008 0.000
#> SRR821282 3 0.1230 0.8117 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008 0.000
#> SRR1074602 2 0.4475 -0.1745 0.000 0.556 0.032 0.000 0.000 0.412
#> SRR814633 2 0.0000 0.8174 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.5230 0.4552 0.000 0.028 0.376 0.020 0.560 0.016
#> SRR1319100 1 0.0405 0.7754 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1324004 3 0.4417 0.3808 0.000 0.028 0.556 0.000 0.000 0.416
#> SRR1457459 1 0.0000 0.7758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.6123 0.7590 0.112 0.000 0.016 0.624 0.068 0.180
#> SRR1444598 5 0.4885 0.6075 0.000 0.028 0.284 0.028 0.652 0.008
#> SRR1091743 2 0.4597 -0.2105 0.000 0.548 0.040 0.000 0.000 0.412
#> SRR819637 1 0.0260 0.7746 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1083848 1 0.0713 0.7771 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1088934 3 0.4537 0.3667 0.000 0.036 0.552 0.000 0.000 0.412
#> SRR1459785 3 0.0972 0.8128 0.000 0.028 0.964 0.000 0.008 0.000
#> SRR1083700 1 0.4986 0.6109 0.612 0.000 0.000 0.000 0.104 0.284
#> SRR1375531 1 0.5105 0.5970 0.600 0.000 0.004 0.096 0.000 0.300
#> SRR1323470 5 0.7462 0.4198 0.000 0.036 0.200 0.084 0.464 0.216
#> SRR814657 1 0.3329 0.7575 0.796 0.000 0.012 0.000 0.012 0.180
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4919 0.509 0.509
#> 3 3 0.993 0.960 0.982 0.2896 0.858 0.721
#> 4 4 0.857 0.846 0.903 0.0905 0.934 0.822
#> 5 5 0.932 0.909 0.949 0.0832 0.933 0.788
#> 6 6 0.842 0.803 0.892 0.0453 0.959 0.841
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.6438 0.805 0.164 0.836
#> SRR1431735 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309314 2 0.6801 0.781 0.180 0.820
#> SRR1420085 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.0376 0.995 0.004 0.996
#> SRR814657 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0747 0.9579 0.000 0.984 0.016
#> SRR809406 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.0592 0.9629 0.000 0.012 0.988
#> SRR819559 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.6299 0.0629 0.000 0.476 0.524
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0424 0.9637 0.000 0.992 0.008
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0747 0.9579 0.000 0.984 0.016
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.3816 0.8298 0.000 0.148 0.852
#> SRR1402944 3 0.2878 0.8876 0.000 0.096 0.904
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1068687 2 0.0747 0.9575 0.000 0.984 0.016
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.4452 0.7721 0.000 0.192 0.808
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486821 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 3 0.2796 0.8894 0.000 0.092 0.908
#> SRR1359487 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321829 2 0.0892 0.9546 0.000 0.980 0.020
#> SRR1475993 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.2066 0.9168 0.000 0.940 0.060
#> SRR1366124 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1080391 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 3 0.5363 0.6381 0.000 0.276 0.724
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0424 0.9638 0.000 0.992 0.008
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446308 3 0.5835 0.4785 0.000 0.340 0.660
#> SRR1437346 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319584 3 0.3686 0.8417 0.000 0.140 0.860
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.6111 0.3244 0.000 0.604 0.396
#> SRR1335314 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400799 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1445023 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077599 2 0.4399 0.7685 0.000 0.812 0.188
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0592 0.9629 0.000 0.012 0.988
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1385434 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415591 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1308734 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.4750 0.7286 0.000 0.784 0.216
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR809919 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323651 2 0.6307 0.0661 0.000 0.512 0.488
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0592 0.9629 0.000 0.012 0.988
#> SRR1091230 2 0.0892 0.9546 0.000 0.980 0.020
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1317731 3 0.0592 0.9629 0.000 0.012 0.988
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.1031 0.9505 0.000 0.976 0.024
#> SRR812128 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413137 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435394 2 0.5560 0.5854 0.000 0.700 0.300
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.4555 0.7378 0.000 0.800 0.200
#> SRR1470988 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0424 0.9638 0.000 0.992 0.008
#> SRR1313770 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.4931 0.7145 0.000 0.232 0.768
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR817142 2 0.4842 0.7166 0.000 0.776 0.224
#> SRR1315291 3 0.4605 0.7319 0.204 0.000 0.796
#> SRR1309314 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.2878 0.8876 0.000 0.096 0.904
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1440290 2 0.5431 0.6162 0.000 0.716 0.284
#> SRR1330813 2 0.0747 0.9579 0.000 0.984 0.016
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1447893 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR820689 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.6267 0.1944 0.000 0.548 0.452
#> SRR1474485 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 3 0.0592 0.9629 0.000 0.012 0.988
#> SRR1358161 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.5968 0.4482 0.000 0.636 0.364
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1447828 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1475448 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.5497 0.5757 0.000 0.708 0.292
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.1289 0.9436 0.000 0.968 0.032
#> SRR1457527 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1488858 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.1529 0.9368 0.000 0.960 0.040
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.5138 0.6579 0.000 0.748 0.252
#> SRR1076195 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069895 3 0.0592 0.9626 0.000 0.012 0.988
#> SRR1099144 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1385150 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1408553 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0424 0.9638 0.000 0.992 0.008
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.4399 0.7685 0.000 0.812 0.188
#> SRR1443568 2 0.6252 0.1830 0.000 0.556 0.444
#> SRR1380249 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.4702 0.7449 0.000 0.212 0.788
#> SRR807679 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.5016 0.6919 0.000 0.760 0.240
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1488881 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.6111 0.3244 0.000 0.604 0.396
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453299 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1077619 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1354999 2 0.4121 0.7950 0.000 0.832 0.168
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0592 0.9629 0.000 0.012 0.988
#> SRR1413182 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1464559 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0424 0.9638 0.000 0.992 0.008
#> SRR1480941 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.4654 0.7411 0.000 0.792 0.208
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1455989 3 0.4121 0.8060 0.000 0.168 0.832
#> SRR1453680 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR821282 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1074602 2 0.0747 0.9579 0.000 0.984 0.016
#> SRR814633 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0237 0.9973 0.996 0.000 0.004
#> SRR1444598 3 0.0592 0.9629 0.000 0.012 0.988
#> SRR1091743 2 0.0747 0.9579 0.000 0.984 0.016
#> SRR819637 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.0424 0.9654 0.000 0.008 0.992
#> SRR1459785 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0237 0.9680 0.000 0.004 0.996
#> SRR814657 1 0.0000 0.9993 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR809406 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 4 0.4925 0.1919 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR819559 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.4560 0.3589 0.000 0.296 0.700 0.004
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090310 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 4 0.4898 0.2087 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1402944 4 0.4898 0.2087 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1464880 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1320034 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068687 2 0.2909 0.8023 0.000 0.888 0.020 0.092
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3801 0.7756 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.5512 -0.0318 0.000 0.016 0.492 0.492
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4761 0.6573 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1486821 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418540 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1408788 3 0.4283 0.5376 0.000 0.256 0.740 0.004
#> SRR1359487 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0188 0.9211 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469080 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1321829 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1475993 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0592 0.9155 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 4 0.5268 0.6492 0.000 0.452 0.008 0.540
#> SRR1366124 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1086490 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1344034 3 0.1474 0.9004 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1080391 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1417851 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1076705 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079380 4 0.5571 0.2606 0.000 0.024 0.396 0.580
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 4 0.5060 0.7201 0.000 0.412 0.004 0.584
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.4843 0.4791 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1431735 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417387 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445984 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1370447 1 0.4877 0.6250 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1446308 3 0.2773 0.7867 0.000 0.116 0.880 0.004
#> SRR1437346 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1319584 4 0.5060 0.2190 0.000 0.004 0.412 0.584
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.4866 0.6271 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.4978 0.2107 0.000 0.612 0.384 0.004
#> SRR1335314 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1400799 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.4761 0.6549 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1445023 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1077599 2 0.2944 0.7659 0.000 0.868 0.128 0.004
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 4 0.4916 0.1920 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1436949 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1070429 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385434 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1415591 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1308734 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498973 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR814341 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.3870 0.6124 0.000 0.788 0.208 0.004
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR809919 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1323651 3 0.4872 0.2269 0.000 0.356 0.640 0.004
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 4 0.4916 0.1920 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1091230 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0000 0.9485 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 3 0.3356 0.7432 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 4 0.5290 0.7182 0.000 0.404 0.012 0.584
#> SRR812128 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1316033 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1076801 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0188 0.9211 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417023 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.4866 0.6271 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1413137 1 0.4866 0.6271 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.4877 0.6250 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1435394 2 0.5050 0.1480 0.000 0.588 0.408 0.004
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1312147 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.4456 0.4271 0.000 0.716 0.280 0.004
#> SRR1470988 1 0.4877 0.6250 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR811915 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 4 0.5060 0.7201 0.000 0.412 0.004 0.584
#> SRR1313770 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1464494 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1357083 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 4 0.5398 0.2424 0.000 0.016 0.404 0.580
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429368 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361436 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR817142 2 0.4088 0.5627 0.000 0.764 0.232 0.004
#> SRR1315291 4 0.7586 -0.2320 0.196 0.000 0.388 0.416
#> SRR1309314 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 4 0.5060 0.2190 0.000 0.004 0.412 0.584
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096760 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1440290 2 0.5070 0.1435 0.000 0.580 0.416 0.004
#> SRR1330813 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0336 0.9478 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0188 0.9211 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1447893 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1466025 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1477429 1 0.0188 0.9211 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445701 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR820689 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0188 0.9529 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 4 0.5911 0.7083 0.000 0.372 0.044 0.584
#> SRR1474485 1 0.4843 0.6368 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 4 0.4916 0.1920 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1358161 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.4978 0.2238 0.000 0.612 0.384 0.004
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1447828 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.9485 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475448 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 4 0.6946 0.5229 0.000 0.168 0.252 0.580
#> SRR1325794 4 0.5060 0.7201 0.000 0.412 0.004 0.584
#> SRR1095961 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.2125 0.8486 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1457527 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.9485 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1454695 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090241 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084742 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.1398 0.9025 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1072388 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070332 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1320761 4 0.6794 0.4775 0.000 0.136 0.280 0.584
#> SRR1076195 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1069895 3 0.0376 0.9445 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1099144 1 0.3801 0.7783 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1385150 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 4 0.4898 0.2087 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1408553 1 0.4866 0.6271 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1077874 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR808299 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1481238 4 0.5881 0.6868 0.000 0.420 0.036 0.544
#> SRR1443568 2 0.5132 0.0915 0.000 0.548 0.448 0.004
#> SRR1380249 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.5244 0.1691 0.000 0.008 0.436 0.556
#> SRR807679 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333811 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078660 2 0.0336 0.9477 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432542 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.4819 0.3173 0.000 0.652 0.344 0.004
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488881 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.4790 0.2235 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.4790 0.6505 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.4877 0.6250 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 4 0.5060 0.7201 0.000 0.412 0.004 0.584
#> SRR1369514 1 0.4790 0.6505 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1453299 3 0.0000 0.9485 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069074 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419736 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1313343 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077619 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 4 0.4955 0.1440 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1354999 2 0.1743 0.8805 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 4 0.4898 0.2087 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1413182 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1464559 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1413075 4 0.4907 0.7217 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1487928 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0188 0.9529 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 4 0.5070 0.7171 0.000 0.416 0.004 0.580
#> SRR1480941 3 0.0000 0.9485 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.3355 0.7097 0.000 0.836 0.160 0.004
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.9485 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR814447 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1455989 3 0.3306 0.7221 0.000 0.156 0.840 0.004
#> SRR1453680 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR821282 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074602 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.9569 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4697 0.4033 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.4888 0.6225 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1444598 4 0.4898 0.2087 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1091743 2 0.0376 0.9488 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR819637 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.0376 0.9445 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1459785 3 0.0188 0.9482 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0188 0.9483 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR814657 1 0.0000 0.9226 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.2166 0.9037 0.000 0.912 0.072 0.004 0.012
#> SRR809406 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 5 0.1768 0.9073 0.000 0.000 0.072 0.004 0.924
#> SRR819559 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.2968 0.7886 0.000 0.112 0.864 0.012 0.012
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.2006 0.8993 0.916 0.000 0.000 0.072 0.012
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.2102 0.9068 0.000 0.916 0.068 0.004 0.012
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1070036 1 0.0404 0.9565 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1098426 1 0.1809 0.9098 0.928 0.000 0.000 0.060 0.012
#> SRR1090310 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.2289 0.8969 0.000 0.904 0.080 0.004 0.012
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.1399 0.9191 0.000 0.000 0.952 0.020 0.028
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.0703 0.9370 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1402944 5 0.0703 0.9370 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1092818 1 0.0566 0.9541 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1093552 1 0.3530 0.7455 0.784 0.000 0.000 0.204 0.012
#> SRR1464880 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1466951 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1331879 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1320034 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1068687 2 0.5274 0.6870 0.000 0.712 0.120 0.016 0.152
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3480 0.6174 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.4470 0.3048 0.000 0.004 0.596 0.004 0.396
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1338687 2 0.0162 0.9599 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071207 4 0.4307 0.1312 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000
#> SRR1486821 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1418540 1 0.2997 0.8204 0.840 0.000 0.000 0.148 0.012
#> SRR1408788 3 0.2646 0.7897 0.000 0.124 0.868 0.004 0.004
#> SRR1359487 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1080648 1 0.0404 0.9565 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1414708 1 0.1012 0.9429 0.968 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1469080 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1740 0.9045 0.056 0.000 0.000 0.932 0.012
#> SRR1321829 2 0.2166 0.9037 0.000 0.912 0.072 0.004 0.012
#> SRR1475993 3 0.1300 0.9191 0.000 0.000 0.956 0.016 0.028
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.4063 0.6073 0.708 0.000 0.000 0.280 0.012
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 5 0.2813 0.9020 0.000 0.048 0.064 0.004 0.884
#> SRR1366124 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.3203 0.7962 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR1086490 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0566 0.9541 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1359738 3 0.0162 0.9128 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1344034 3 0.1704 0.9000 0.000 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR1080391 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1347870 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR814028 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR814219 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1417851 1 0.3203 0.7972 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.2361 0.8765 0.892 0.000 0.000 0.096 0.012
#> SRR1076705 1 0.1809 0.9099 0.928 0.000 0.000 0.060 0.012
#> SRR1079380 5 0.0510 0.9394 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.1461 0.9434 0.000 0.016 0.028 0.004 0.952
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1436840 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.4106 0.4946 0.000 0.000 0.256 0.724 0.020
#> SRR1431735 1 0.3039 0.8161 0.836 0.000 0.000 0.152 0.012
#> SRR1417387 1 0.3163 0.8013 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1445984 1 0.3163 0.8013 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1370447 4 0.2020 0.8827 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1446308 3 0.1757 0.8690 0.000 0.048 0.936 0.004 0.012
#> SRR1437346 3 0.0771 0.9179 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0404 0.9565 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1319584 5 0.0703 0.9370 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.2852 0.8186 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0404 0.9554 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0162 0.9600 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1076681 2 0.4951 0.2638 0.000 0.556 0.420 0.012 0.012
#> SRR1335314 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1400799 3 0.0162 0.9128 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.4219 0.1224 0.584 0.000 0.000 0.416 0.000
#> SRR1445023 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1077599 2 0.4283 0.6042 0.000 0.692 0.292 0.004 0.012
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.3163 0.8013 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1074839 2 0.0854 0.9540 0.000 0.976 0.004 0.012 0.008
#> SRR1458727 5 0.1195 0.9299 0.000 0.000 0.028 0.012 0.960
#> SRR1436949 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1070429 3 0.0162 0.9128 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1385434 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1415591 3 0.0000 0.9139 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.1740 0.9045 0.056 0.000 0.000 0.932 0.012
#> SRR1308734 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1498973 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.3203 0.7962 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR814341 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.4283 0.6059 0.000 0.692 0.292 0.004 0.012
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR809919 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 4 0.1740 0.9045 0.056 0.000 0.000 0.932 0.012
#> SRR1323651 3 0.3669 0.7039 0.000 0.176 0.800 0.012 0.012
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 5 0.2069 0.8919 0.000 0.000 0.076 0.012 0.912
#> SRR1091230 2 0.2228 0.9003 0.000 0.908 0.076 0.004 0.012
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1300 0.9191 0.000 0.000 0.956 0.016 0.028
#> SRR1317731 3 0.4054 0.6822 0.000 0.000 0.732 0.020 0.248
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0404 0.9565 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.1728 0.9415 0.000 0.020 0.036 0.004 0.940
#> SRR812128 2 0.0807 0.9535 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.1757 0.9240 0.000 0.936 0.048 0.004 0.012
#> SRR1316033 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1076801 1 0.3203 0.7962 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1075054 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.1195 0.9367 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1417023 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1309333 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.2852 0.8173 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1413137 4 0.2773 0.8258 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1469973 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1420026 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR817306 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 4 0.2020 0.8827 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1435394 3 0.4769 0.1382 0.000 0.440 0.544 0.004 0.012
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1312147 1 0.3427 0.7633 0.796 0.000 0.000 0.192 0.012
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.3471 0.8080 0.000 0.820 0.156 0.012 0.012
#> SRR1470988 4 0.2074 0.8794 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.1605 0.9361 0.000 0.012 0.040 0.004 0.944
#> SRR1313770 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 5 0.1121 0.9563 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1464494 5 0.1197 0.9574 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1357083 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1475842 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0451 0.9095 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1467704 1 0.0693 0.9514 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1348885 5 0.0992 0.9338 0.000 0.000 0.024 0.008 0.968
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.1792 0.8921 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1345692 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1401040 3 0.0703 0.9165 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1454073 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1355747 1 0.3427 0.7633 0.796 0.000 0.000 0.192 0.012
#> SRR1429368 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1398138 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1379260 1 0.1877 0.9064 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1361436 3 0.0162 0.9128 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR817142 2 0.4783 0.1950 0.000 0.532 0.452 0.004 0.012
#> SRR1315291 4 0.0693 0.8400 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1309314 3 0.1907 0.9159 0.000 0.000 0.928 0.044 0.028
#> SRR1420085 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1361308 3 0.1469 0.9190 0.000 0.000 0.948 0.036 0.016
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.0703 0.9370 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.3123 0.8063 0.828 0.000 0.000 0.160 0.012
#> SRR1096760 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1440290 3 0.4441 0.5583 0.000 0.280 0.696 0.012 0.012
#> SRR1330813 2 0.2102 0.9068 0.000 0.916 0.068 0.004 0.012
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0162 0.9599 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0880 0.9385 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0162 0.9147 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.2074 0.8761 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1447893 3 0.0451 0.9095 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1466025 5 0.1341 0.9552 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1477429 1 0.2377 0.8512 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1445701 3 0.0807 0.9044 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR820689 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.1444 0.9305 0.000 0.948 0.040 0.000 0.012
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.1740 0.9045 0.056 0.000 0.000 0.932 0.012
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 5 0.1630 0.9404 0.000 0.016 0.036 0.004 0.944
#> SRR1474485 4 0.3534 0.7143 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1095188 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0000 0.9139 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.0703 0.9465 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1325578 5 0.2130 0.8880 0.000 0.000 0.080 0.012 0.908
#> SRR1358161 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.5099 0.0567 0.000 0.488 0.484 0.016 0.012
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1447828 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.1493 0.9190 0.000 0.000 0.948 0.024 0.028
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 5 0.1544 0.9424 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1441443 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1370682 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1475448 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 5 0.0671 0.9423 0.000 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1325794 5 0.1710 0.9384 0.000 0.016 0.040 0.004 0.940
#> SRR1095961 3 0.1195 0.9188 0.000 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.4703 0.5545 0.000 0.660 0.312 0.016 0.012
#> SRR1457527 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.1668 0.9186 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1488858 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1454695 1 0.3203 0.7962 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR1090241 2 0.1492 0.9292 0.000 0.948 0.040 0.004 0.008
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0693 0.9514 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1379581 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3391 0.7689 0.800 0.000 0.000 0.188 0.012
#> SRR1084742 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3783 0.7313 0.000 0.768 0.216 0.004 0.012
#> SRR1072388 1 0.2953 0.8255 0.844 0.000 0.000 0.144 0.012
#> SRR1070332 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1320761 5 0.1205 0.9358 0.000 0.000 0.040 0.004 0.956
#> SRR1076195 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1069895 3 0.0727 0.9056 0.000 0.004 0.980 0.004 0.012
#> SRR1099144 4 0.3835 0.7108 0.244 0.000 0.000 0.744 0.012
#> SRR1385150 3 0.0324 0.9114 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1544 0.9036 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.3203 0.7962 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.2139 0.9140 0.000 0.920 0.056 0.012 0.012
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 5 0.0703 0.9370 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1408553 4 0.2852 0.8173 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1069231 1 0.0290 0.9589 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.2102 0.9068 0.000 0.916 0.068 0.004 0.012
#> SRR1077874 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR808299 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1481238 5 0.2522 0.9067 0.000 0.024 0.076 0.004 0.896
#> SRR1443568 3 0.4919 0.3479 0.000 0.368 0.604 0.016 0.012
#> SRR1380249 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1431015 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1078709 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR813283 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.2540 0.8712 0.000 0.000 0.088 0.024 0.888
#> SRR807679 1 0.1942 0.9028 0.920 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1333811 3 0.1399 0.9191 0.000 0.000 0.952 0.020 0.028
#> SRR1078660 2 0.1012 0.9498 0.000 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.1877 0.9064 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1432542 1 0.3203 0.7962 0.820 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.3163 0.8013 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.4474 0.4596 0.000 0.332 0.652 0.004 0.012
#> SRR1441934 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1472552 3 0.0290 0.9139 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1488881 3 0.0162 0.9147 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.4920 0.3078 0.000 0.572 0.404 0.012 0.012
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 4 0.4597 0.3350 0.424 0.000 0.000 0.564 0.012
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0579 0.9571 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1384091 4 0.1478 0.9061 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.2179 0.8728 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.1728 0.9513 0.000 0.036 0.020 0.004 0.940
#> SRR1369514 4 0.4283 0.2675 0.456 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1453299 3 0.1668 0.9186 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.1197 0.9581 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1091767 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1354467 3 0.0404 0.9157 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1069074 2 0.1901 0.9161 0.000 0.928 0.056 0.004 0.012
#> SRR1452399 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1437430 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1419736 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1313343 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1077619 4 0.2305 0.8822 0.092 0.000 0.000 0.896 0.012
#> SRR1083530 1 0.0404 0.9565 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1333633 5 0.1831 0.9118 0.000 0.000 0.076 0.004 0.920
#> SRR1354999 2 0.3653 0.8000 0.000 0.808 0.164 0.016 0.012
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.0703 0.9370 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1413182 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1464559 4 0.1740 0.9045 0.056 0.000 0.000 0.932 0.012
#> SRR1413075 5 0.1270 0.9587 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1487928 4 0.1341 0.9084 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1388997 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1092865 2 0.1844 0.9271 0.000 0.936 0.040 0.012 0.012
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0404 0.9565 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.1960 0.9325 0.000 0.020 0.048 0.004 0.928
#> SRR1480941 3 0.1082 0.9187 0.000 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0854 0.9540 0.000 0.976 0.004 0.012 0.008
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0693 0.9558 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1355554 2 0.4721 0.5470 0.000 0.656 0.316 0.016 0.012
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1318331 2 0.0566 0.9569 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1321333 3 0.1668 0.9186 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.2305 0.8804 0.896 0.000 0.000 0.092 0.012
#> SRR814447 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1455989 3 0.2881 0.7824 0.000 0.124 0.860 0.004 0.012
#> SRR1453680 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0290 0.9588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR821282 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1074602 2 0.2102 0.9068 0.000 0.916 0.068 0.004 0.012
#> SRR814633 2 0.0000 0.9612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4817 0.3501 0.000 0.000 0.572 0.024 0.404
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0566 0.9074 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.1410 0.9074 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1444598 5 0.1403 0.9264 0.000 0.000 0.024 0.024 0.952
#> SRR1091743 2 0.2166 0.9037 0.000 0.912 0.072 0.004 0.012
#> SRR819637 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.0727 0.9056 0.000 0.004 0.980 0.004 0.012
#> SRR1459785 3 0.1830 0.9179 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0912 0.9028 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR814657 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1409062 6 0.3578 0.6206 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR809406 1 0.0260 0.9356 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465313 5 0.2046 0.8740 0.000 0.000 0.032 0.000 0.908 0.060
#> SRR819559 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 6 0.3394 0.5412 0.000 0.012 0.236 0.000 0.000 0.752
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.3375 0.8058 0.816 0.000 0.000 0.088 0.000 0.096
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 6 0.3578 0.6206 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1102320 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1469926 3 0.0260 0.8466 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070036 1 0.1765 0.8818 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1098426 1 0.3167 0.8216 0.832 0.000 0.000 0.072 0.000 0.096
#> SRR1090310 6 0.3868 0.0791 0.000 0.000 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1429748 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1363654 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1326317 6 0.3699 0.6261 0.000 0.336 0.004 0.000 0.000 0.660
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.1327 0.8226 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402944 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.2214 0.8700 0.888 0.000 0.000 0.016 0.000 0.096
#> SRR1093552 1 0.4539 0.6396 0.688 0.000 0.000 0.216 0.000 0.096
#> SRR1464880 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.3592 0.7193 0.000 0.740 0.000 0.020 0.000 0.240
#> SRR1466951 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1331879 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 6 0.3709 0.6099 0.000 0.128 0.004 0.020 0.040 0.808
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.4061 0.5927 0.708 0.000 0.000 0.248 0.000 0.044
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 6 0.5051 0.4596 0.000 0.008 0.128 0.000 0.208 0.656
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.5246 0.2159 0.416 0.000 0.000 0.488 0.000 0.096
#> SRR1486821 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.3977 0.7436 0.760 0.000 0.000 0.144 0.000 0.096
#> SRR1408788 6 0.4609 0.3963 0.000 0.048 0.364 0.000 0.000 0.588
#> SRR1359487 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.1610 0.8901 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1414708 1 0.2383 0.8639 0.880 0.000 0.000 0.024 0.000 0.096
#> SRR1469080 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.2301 0.8545 0.020 0.000 0.000 0.884 0.000 0.096
#> SRR1321829 6 0.3578 0.6206 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1475993 3 0.1957 0.7885 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1374165 1 0.4905 0.5027 0.620 0.000 0.000 0.284 0.000 0.096
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1401146 5 0.4045 0.5496 0.000 0.024 0.000 0.000 0.664 0.312
#> SRR1366124 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1086490 6 0.3857 0.1617 0.000 0.000 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1384431 1 0.0363 0.9347 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1072055 1 0.2214 0.8700 0.888 0.000 0.000 0.016 0.000 0.096
#> SRR1359738 3 0.3857 0.0455 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.4199 0.4949 0.000 0.600 0.000 0.020 0.000 0.380
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.5578 0.3562 0.000 0.000 0.540 0.000 0.276 0.184
#> SRR1080391 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.3514 0.7316 0.000 0.752 0.000 0.020 0.000 0.228
#> SRR814028 2 0.3487 0.7351 0.000 0.756 0.000 0.020 0.000 0.224
#> SRR814219 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1487969 5 0.0547 0.9097 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1417851 1 0.4220 0.7093 0.732 0.000 0.000 0.172 0.000 0.096
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.3611 0.7846 0.796 0.000 0.000 0.108 0.000 0.096
#> SRR1076705 1 0.3112 0.8253 0.836 0.000 0.000 0.068 0.000 0.096
#> SRR1079380 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.1007 0.9017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.3688 0.7051 0.000 0.724 0.000 0.020 0.000 0.256
#> SRR1436840 2 0.3156 0.7673 0.000 0.800 0.000 0.020 0.000 0.180
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.4766 0.4325 0.000 0.000 0.316 0.612 0.000 0.072
#> SRR1431735 1 0.4187 0.7128 0.736 0.000 0.000 0.168 0.000 0.096
#> SRR1417387 1 0.4220 0.7074 0.732 0.000 0.000 0.172 0.000 0.096
#> SRR1445984 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1370447 4 0.1895 0.8559 0.072 0.000 0.000 0.912 0.000 0.016
#> SRR1446308 6 0.4002 0.4692 0.000 0.020 0.320 0.000 0.000 0.660
#> SRR1437346 3 0.2697 0.7111 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.1765 0.8818 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1319584 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR813536 4 0.2744 0.7889 0.144 0.000 0.000 0.840 0.000 0.016
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0717 0.9308 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.3189 0.7647 0.000 0.796 0.000 0.020 0.000 0.184
#> SRR1076681 6 0.4810 0.4746 0.000 0.288 0.052 0.016 0.000 0.644
#> SRR1335314 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.3843 0.1065 0.000 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1074578 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1312226 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.4212 0.1169 0.560 0.000 0.000 0.424 0.000 0.016
#> SRR1445023 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1077599 6 0.4613 0.6387 0.000 0.260 0.080 0.000 0.000 0.660
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1074839 2 0.4199 0.4949 0.000 0.600 0.000 0.020 0.000 0.380
#> SRR1458727 5 0.4408 0.5909 0.000 0.000 0.280 0.000 0.664 0.056
#> SRR1436949 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.3862 0.0121 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1458158 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432408 4 0.0692 0.8888 0.020 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.3838 0.1233 0.000 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.2301 0.8545 0.020 0.000 0.000 0.884 0.000 0.096
#> SRR1308734 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1392141 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR814341 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 6 0.4613 0.6396 0.000 0.260 0.080 0.000 0.000 0.660
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 4 0.2301 0.8545 0.020 0.000 0.000 0.884 0.000 0.096
#> SRR1323651 6 0.3566 0.5570 0.000 0.024 0.224 0.000 0.000 0.752
#> SRR1357297 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR818170 5 0.3690 0.5849 0.000 0.000 0.308 0.000 0.684 0.008
#> SRR1091230 6 0.3699 0.6261 0.000 0.336 0.004 0.000 0.000 0.660
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.2178 0.7746 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1317731 3 0.2378 0.7176 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.1714 0.8846 0.908 0.000 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1447808 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR809534 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.1610 0.8706 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR812128 2 0.3813 0.7186 0.000 0.736 0.000 0.020 0.008 0.236
#> SRR1101513 1 0.0146 0.9364 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415708 6 0.3828 0.3381 0.000 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1316033 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.3514 0.7316 0.000 0.752 0.000 0.020 0.000 0.228
#> SRR1075054 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.2537 0.8576 0.872 0.000 0.000 0.032 0.000 0.096
#> SRR1417023 4 0.0692 0.8888 0.020 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1309333 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1333676 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1352996 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1093172 4 0.2664 0.7934 0.136 0.000 0.000 0.848 0.000 0.016
#> SRR1413137 4 0.2581 0.8022 0.128 0.000 0.000 0.856 0.000 0.016
#> SRR1469973 2 0.3969 0.6276 0.000 0.668 0.000 0.020 0.000 0.312
#> SRR1420026 2 0.3253 0.7594 0.000 0.788 0.000 0.020 0.000 0.192
#> SRR817306 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1416266 4 0.1895 0.8559 0.072 0.000 0.000 0.912 0.000 0.016
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1435394 6 0.4871 0.6011 0.000 0.144 0.196 0.000 0.000 0.660
#> SRR1383192 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1419962 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0260 0.8466 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.4459 0.6595 0.700 0.000 0.000 0.204 0.000 0.096
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1474930 6 0.4397 0.3647 0.000 0.336 0.012 0.020 0.000 0.632
#> SRR1470988 4 0.1951 0.8530 0.076 0.000 0.000 0.908 0.000 0.016
#> SRR811915 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.3607 0.5243 0.000 0.000 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1313770 3 0.0260 0.8466 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315780 2 0.0146 0.8969 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1310997 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 5 0.0405 0.9195 0.000 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1357083 6 0.3843 0.2038 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1475842 2 0.3122 0.7698 0.000 0.804 0.000 0.020 0.000 0.176
#> SRR1378085 1 0.0632 0.9271 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1378220 6 0.3817 0.2555 0.000 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1467704 1 0.2214 0.8700 0.888 0.000 0.000 0.016 0.000 0.096
#> SRR1348885 5 0.2733 0.8410 0.000 0.000 0.080 0.000 0.864 0.056
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.2581 0.8282 0.856 0.000 0.000 0.128 0.000 0.016
#> SRR1345692 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1401040 3 0.2631 0.6919 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1355747 1 0.4459 0.6595 0.700 0.000 0.000 0.204 0.000 0.096
#> SRR1429368 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.3952 0.6342 0.000 0.672 0.000 0.020 0.000 0.308
#> SRR1379260 1 0.3325 0.8098 0.820 0.000 0.000 0.084 0.000 0.096
#> SRR1361436 3 0.3647 0.3971 0.000 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR817142 6 0.4823 0.6302 0.000 0.216 0.124 0.000 0.000 0.660
#> SRR1315291 4 0.1745 0.8393 0.000 0.000 0.020 0.924 0.000 0.056
#> SRR1309314 3 0.1204 0.8089 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1420085 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1361308 3 0.0458 0.8467 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1472126 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1380482 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0363 0.9347 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1399353 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1096760 6 0.3860 0.1492 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1440290 6 0.3738 0.5744 0.000 0.040 0.208 0.000 0.000 0.752
#> SRR1330813 6 0.3578 0.6206 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.1610 0.8158 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1390143 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3547 0.4509 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1312169 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1096687 1 0.2491 0.8504 0.868 0.000 0.000 0.112 0.000 0.020
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.0692 0.8888 0.020 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1447893 6 0.3828 0.2308 0.000 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1466025 5 0.0146 0.9226 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1477429 1 0.2790 0.8232 0.840 0.000 0.000 0.140 0.000 0.020
#> SRR1445701 6 0.3101 0.5256 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR820689 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.3866 -0.1929 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.3799 0.6811 0.000 0.704 0.000 0.020 0.000 0.276
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447784 4 0.1745 0.8728 0.020 0.000 0.000 0.924 0.000 0.056
#> SRR1355769 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 5 0.1327 0.8873 0.000 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1474485 4 0.4030 0.7230 0.172 0.000 0.000 0.748 0.000 0.080
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 6 0.3862 0.1381 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1095188 2 0.4178 0.5126 0.000 0.608 0.000 0.020 0.000 0.372
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3607 0.4201 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1105417 1 0.1320 0.9135 0.948 0.000 0.000 0.036 0.000 0.016
#> SRR1325578 5 0.3221 0.6588 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1358161 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418183 6 0.3123 0.6258 0.000 0.112 0.056 0.000 0.000 0.832
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0146 0.9359 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090837 6 0.3847 0.1939 0.000 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1447828 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0865 0.8387 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1350280 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1088557 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1102656 5 0.1765 0.8298 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR1441443 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1370682 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 6 0.3851 0.1841 0.000 0.000 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1407291 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1082592 5 0.1007 0.9112 0.000 0.004 0.016 0.008 0.968 0.004
#> SRR1325794 5 0.1610 0.8706 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1095961 3 0.2219 0.7685 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 6 0.3041 0.6287 0.000 0.128 0.040 0.000 0.000 0.832
#> SRR1457527 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0547 0.8459 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1488858 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1090241 2 0.3390 0.4014 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.2214 0.8700 0.888 0.000 0.000 0.016 0.000 0.096
#> SRR1379581 3 0.0260 0.8466 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309182 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1437668 1 0.4431 0.6657 0.704 0.000 0.000 0.200 0.000 0.096
#> SRR1084742 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1085063 2 0.0146 0.8975 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1454247 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 6 0.4062 0.6396 0.000 0.316 0.024 0.000 0.000 0.660
#> SRR1072388 1 0.4120 0.7234 0.744 0.000 0.000 0.160 0.000 0.096
#> SRR1070332 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 5 0.0547 0.9170 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1076195 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1069895 6 0.3699 0.4417 0.000 0.004 0.336 0.000 0.000 0.660
#> SRR1099144 4 0.4565 0.6464 0.220 0.000 0.000 0.684 0.000 0.096
#> SRR1385150 6 0.3867 0.0982 0.000 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.2294 0.8616 0.036 0.000 0.000 0.892 0.000 0.072
#> SRR1102583 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456971 1 0.4283 0.6961 0.724 0.000 0.000 0.180 0.000 0.096
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 6 0.3288 0.6264 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408553 4 0.2664 0.7934 0.136 0.000 0.000 0.848 0.000 0.016
#> SRR1069231 1 0.1204 0.9176 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0363 0.9329 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 6 0.3699 0.6261 0.000 0.336 0.004 0.000 0.000 0.660
#> SRR1077874 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 5 0.3861 0.5111 0.000 0.000 0.008 0.000 0.640 0.352
#> SRR1443568 6 0.3747 0.6112 0.000 0.096 0.076 0.020 0.000 0.808
#> SRR1380249 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1383148 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0363 0.9330 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416025 2 0.3514 0.7316 0.000 0.752 0.000 0.020 0.000 0.228
#> SRR1431015 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1078709 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR813283 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.4870 0.4023 0.000 0.000 0.372 0.004 0.568 0.056
#> SRR807679 1 0.3221 0.8177 0.828 0.000 0.000 0.076 0.000 0.096
#> SRR1333811 3 0.1556 0.8119 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1078660 2 0.3977 0.6664 0.000 0.692 0.000 0.020 0.004 0.284
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.3274 0.8139 0.824 0.000 0.000 0.080 0.000 0.096
#> SRR1432542 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1418041 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4252 0.7018 0.728 0.000 0.000 0.176 0.000 0.096
#> SRR1350958 2 0.0260 0.8952 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396822 6 0.4892 0.6157 0.000 0.176 0.164 0.000 0.000 0.660
#> SRR1441934 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1472552 3 0.3547 0.4541 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1488881 3 0.3076 0.6247 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 6 0.5178 0.2327 0.000 0.376 0.052 0.020 0.000 0.552
#> SRR1074502 1 0.0146 0.9364 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325271 4 0.5016 0.4901 0.312 0.000 0.000 0.592 0.000 0.096
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0363 0.8925 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.3231 0.7565 0.000 0.784 0.000 0.016 0.000 0.200
#> SRR1384091 4 0.1168 0.8861 0.028 0.000 0.000 0.956 0.000 0.016
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.2006 0.8498 0.080 0.000 0.000 0.904 0.000 0.016
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.0865 0.9069 0.000 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1369514 4 0.5012 0.4470 0.336 0.000 0.000 0.576 0.000 0.088
#> SRR1453299 3 0.0713 0.8423 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.3688 0.7051 0.000 0.724 0.000 0.020 0.000 0.256
#> SRR1354467 3 0.3076 0.6207 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1069074 6 0.3747 0.5173 0.000 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1452399 2 0.4078 0.5776 0.000 0.640 0.000 0.020 0.000 0.340
#> SRR1437430 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.2679 0.8449 0.040 0.000 0.000 0.864 0.000 0.096
#> SRR1083530 1 0.0713 0.9251 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1333633 5 0.2790 0.7966 0.000 0.000 0.020 0.000 0.840 0.140
#> SRR1354999 6 0.2949 0.6287 0.000 0.140 0.028 0.000 0.000 0.832
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1378818 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413182 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.2301 0.8545 0.020 0.000 0.000 0.884 0.000 0.096
#> SRR1413075 5 0.0000 0.9252 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 4 0.0547 0.8894 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1092865 6 0.3984 0.3706 0.000 0.336 0.000 0.016 0.000 0.648
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1346710 1 0.1610 0.8901 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.3652 0.5593 0.000 0.004 0.000 0.000 0.672 0.324
#> SRR1480941 3 0.2378 0.7541 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0260 0.9356 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1433884 2 0.4254 0.4387 0.000 0.576 0.000 0.020 0.000 0.404
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.3734 0.6965 0.000 0.716 0.000 0.020 0.000 0.264
#> SRR1355554 6 0.3107 0.6275 0.000 0.116 0.052 0.000 0.000 0.832
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.3345 0.7507 0.000 0.776 0.000 0.020 0.000 0.204
#> SRR1318331 2 0.3122 0.7698 0.000 0.804 0.000 0.020 0.000 0.176
#> SRR1321333 3 0.0713 0.8428 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1474231 1 0.0547 0.9292 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1350545 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1091328 1 0.3473 0.7974 0.808 0.000 0.000 0.096 0.000 0.096
#> SRR814447 3 0.0547 0.8385 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1455989 6 0.4578 0.4874 0.000 0.056 0.320 0.000 0.000 0.624
#> SRR1453680 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1366729 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 6 0.3578 0.6206 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR814633 2 0.0000 0.9002 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.3409 0.4961 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 6 0.3428 0.4762 0.000 0.000 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.2199 0.8657 0.020 0.000 0.000 0.892 0.000 0.088
#> SRR1444598 5 0.4427 0.5891 0.000 0.000 0.284 0.000 0.660 0.056
#> SRR1091743 6 0.3578 0.6206 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR819637 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 6 0.3699 0.4417 0.000 0.004 0.336 0.000 0.000 0.660
#> SRR1459785 3 0.0000 0.8511 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9370 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0260 0.9356 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1323470 6 0.2871 0.5462 0.000 0.000 0.192 0.004 0.000 0.804
#> SRR814657 1 0.0458 0.9337 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 0.999 0.4913 0.509 0.509
#> 3 3 1.000 0.968 0.987 0.2793 0.863 0.731
#> 4 4 0.874 0.815 0.915 0.1216 0.925 0.799
#> 5 5 0.790 0.749 0.870 0.0898 0.921 0.741
#> 6 6 0.826 0.719 0.863 0.0439 0.904 0.633
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431735 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 2 0.821 0.656 0.256 0.744
#> SRR1309314 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.1411 0.9379 0 0.036 0.964
#> SRR819559 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1387899 3 0.2625 0.8977 0 0.084 0.916
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.6308 0.0685 0 0.492 0.508
#> SRR1402944 2 0.5926 0.4508 0 0.644 0.356
#> SRR1092818 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.3752 0.8206 0 0.856 0.144
#> SRR1437491 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.6307 0.0363 0 0.512 0.488
#> SRR1359487 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.0747 0.9536 0 0.016 0.984
#> SRR1445387 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1431735 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1446308 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1437346 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.4346 0.7716 0 0.816 0.184
#> SRR1486584 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1076681 3 0.6192 0.3153 0 0.420 0.580
#> SRR1335314 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0892 0.9632 0 0.980 0.020
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.2356 0.9085 0 0.072 0.928
#> SRR1402009 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1308734 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.1411 0.9475 0 0.964 0.036
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1323651 3 0.5591 0.5856 0 0.304 0.696
#> SRR1357297 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.5363 0.6276 0 0.276 0.724
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1317731 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.1163 0.9554 0 0.972 0.028
#> SRR1383192 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1357083 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0747 0.9669 0 0.984 0.016
#> SRR1315291 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1309314 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.3686 0.8308 0 0.860 0.140
#> SRR1099789 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1440290 3 0.3686 0.8387 0 0.140 0.860
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1447893 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.2625 0.8977 0 0.084 0.916
#> SRR820689 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.4605 0.7421 0 0.796 0.204
#> SRR1474485 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.3192 0.8645 0 0.888 0.112
#> SRR1358161 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1418183 3 0.2625 0.8977 0 0.084 0.916
#> SRR1366345 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1447828 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1475448 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.0424 0.9588 0 0.008 0.992
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.5560 0.5567 0 0.700 0.300
#> SRR1457527 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0424 0.9742 0 0.992 0.008
#> SRR1076195 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1069895 3 0.2625 0.8977 0 0.084 0.916
#> SRR1099144 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.5016 0.6798 0 0.760 0.240
#> SRR1443568 3 0.3412 0.8563 0 0.124 0.876
#> SRR1380249 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.2537 0.9002 0 0.920 0.080
#> SRR807679 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.1031 0.9594 0 0.976 0.024
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1488881 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.5733 0.4998 0 0.676 0.324
#> SRR1074502 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1333633 3 0.0892 0.9503 0 0.020 0.980
#> SRR1354999 2 0.6126 0.3136 0 0.600 0.400
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1355554 3 0.2625 0.8977 0 0.084 0.916
#> SRR1487173 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.1031 0.9476 0 0.024 0.976
#> SRR1457459 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1444598 3 0.4654 0.7376 0 0.208 0.792
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9814 0 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.6079 0.4018 0 0.388 0.612
#> SRR1459785 3 0.0000 0.9640 0 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.6299 0.0837 0 0.524 0.476
#> SRR814657 1 0.0000 1.0000 1 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.3266 0.6404 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1326059 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1409062 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR809406 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1465313 3 0.1929 0.8993 0.000 0.036 0.940 0.024
#> SRR819559 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1387899 3 0.2053 0.8745 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1102320 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1098426 1 0.4916 0.3666 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1090310 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429748 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1363654 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0188 0.9435 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.5693 0.0948 0.000 0.472 0.504 0.024
#> SRR1402944 2 0.5403 0.4488 0.000 0.628 0.348 0.024
#> SRR1092818 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1093552 1 0.5000 0.2209 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1464880 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1320034 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.3763 0.8116 0.000 0.832 0.144 0.024
#> SRR1437491 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.4955 0.2933 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1354203 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077850 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1455214 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1092014 2 0.0779 0.9704 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1097857 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.3569 0.5710 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1486821 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.4331 0.5625 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1408788 2 0.5163 0.0607 0.000 0.516 0.480 0.004
#> SRR1359487 4 0.3172 0.6960 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1080648 1 0.4855 0.4009 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1414708 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1469080 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0921 0.7000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1321829 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1475993 3 0.0895 0.9303 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1445387 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077575 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1349300 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1374165 4 0.2216 0.6737 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1366124 4 0.0921 0.7000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1391811 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1456674 4 0.4898 0.0592 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1086490 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4948 0.4998 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1384431 1 0.2921 0.6980 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1072055 1 0.4925 0.3579 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1359738 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332141 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085900 2 0.0188 0.9749 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1344034 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080391 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR814219 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1102128 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1070060 1 0.2281 0.7572 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1487969 2 0.0707 0.9694 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1417851 1 0.4948 0.3320 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.4907 0.3728 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1076705 1 0.4888 0.3815 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1079380 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.1109 0.9646 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1366605 2 0.0336 0.9740 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0592 0.9710 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.4981 0.0274 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1431735 1 0.4888 0.3818 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1417387 4 0.4972 -0.0838 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1445984 1 0.4933 0.3511 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1370447 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1446308 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437346 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.4761 0.5645 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1319584 2 0.4095 0.7791 0.000 0.804 0.172 0.024
#> SRR1486584 1 0.1022 0.8128 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR813536 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.4955 0.4929 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0188 0.8287 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1076681 3 0.4907 0.3262 0.000 0.420 0.580 0.000
#> SRR1335314 4 0.3688 0.6792 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1400799 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.2281 0.7572 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1312226 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1416207 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.1022 0.8186 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1069328 1 0.4888 -0.1340 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1445023 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1077599 2 0.1004 0.9594 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4916 0.3666 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.1109 0.9278 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1436949 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1070429 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458158 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.0921 0.7000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1310334 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.0921 0.7000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1415591 3 0.1902 0.8835 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1402009 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1316055 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1308734 3 0.0188 0.9435 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1498973 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1397115 1 0.0188 0.8279 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392141 4 0.4331 0.4202 0.288 0.000 0.000 0.712
#> SRR814341 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.1305 0.9485 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809919 1 0.1867 0.7784 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1370818 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1323651 3 0.4535 0.5653 0.000 0.292 0.704 0.004
#> SRR1357297 1 0.1389 0.8004 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR818170 3 0.4955 0.5765 0.000 0.268 0.708 0.024
#> SRR1091230 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1095285 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317731 3 0.1004 0.9296 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1490785 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1432032 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1447808 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR809534 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.1109 0.9646 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR812128 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1101513 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1415708 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1316033 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.4933 0.3511 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1080044 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.2216 0.7535 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1069871 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0336 0.9741 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075054 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1083480 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1075458 1 0.4843 0.4054 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1417023 4 0.0921 0.7000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1309333 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1333676 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1352996 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1413137 4 0.4941 0.5131 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1469973 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420026 2 0.0707 0.9694 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR817306 1 0.2081 0.7701 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1416266 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3486 0.6879 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1435394 2 0.1305 0.9495 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1383192 1 0.4072 0.4403 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1419962 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.1022 0.8186 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1081639 3 0.0188 0.9435 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1312147 4 0.4888 0.1047 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.4941 0.5074 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1474930 2 0.0188 0.9749 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470988 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR811915 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.1109 0.9646 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1313770 3 0.0188 0.9435 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1315780 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1073631 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0707 0.8255 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1310997 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1464494 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1357083 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.3266 0.6955 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1378220 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467704 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1348885 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1325826 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1345692 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1401040 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1374396 4 0.3649 0.6813 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 4 0.4989 -0.1025 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1429368 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.4877 0.3886 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1361436 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR817142 2 0.0779 0.9659 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1315291 4 0.4955 0.0949 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1309314 3 0.0469 0.9381 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420085 2 0.0592 0.9710 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361308 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.3606 0.8331 0.000 0.844 0.132 0.024
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1339276 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418368 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.4994 0.2591 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1096760 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1440290 3 0.2999 0.7980 0.000 0.132 0.864 0.004
#> SRR1330813 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1792 0.7050 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1394321 1 0.1389 0.8135 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.1716 0.7890 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1390143 1 0.0592 0.8272 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312169 1 0.2081 0.7620 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1096687 4 0.3356 0.6926 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1486139 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470313 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1447893 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1466025 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1477429 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1445701 3 0.2053 0.8745 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR820689 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0817 0.8235 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1489328 2 0.0336 0.9740 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1344462 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.0921 0.7000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1355769 1 0.1716 0.7783 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480917 2 0.4365 0.7509 0.000 0.784 0.188 0.028
#> SRR1474485 4 0.1557 0.7045 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1089998 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318140 1 0.0817 0.8175 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1319262 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1440374 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1359565 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105417 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1325578 2 0.3143 0.8701 0.000 0.876 0.100 0.024
#> SRR1358161 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1452010 1 0.1716 0.7783 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1418183 3 0.2053 0.8745 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1366345 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1387449 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473461 1 0.0921 0.8190 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1090837 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1447828 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1088557 1 0.1302 0.8089 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1102656 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1441443 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1370682 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1407291 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1363766 1 0.1940 0.7738 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1082592 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1325794 2 0.1109 0.9646 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1095961 3 0.0524 0.9399 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.5161 0.5386 0.000 0.676 0.300 0.024
#> SRR1457527 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.3649 0.6813 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1454695 4 0.2216 0.6694 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1090241 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1329863 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357733 1 0.2868 0.7262 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1362135 1 0.4877 0.3885 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1379581 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.4933 0.3511 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1084742 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1433538 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0707 0.9694 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1454247 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1072388 1 0.4933 0.3511 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1070332 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1320761 2 0.1388 0.9592 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR1076195 4 0.0921 0.7000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1069895 3 0.2053 0.8745 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1099144 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1385150 3 0.0188 0.9448 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1022 0.6993 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1102583 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.4955 0.3250 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1340574 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1444830 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0188 0.9441 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1408553 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1069231 1 0.4605 0.4684 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.4431 0.5317 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1321942 1 0.3074 0.7116 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1094380 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1077874 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR808299 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1481238 2 0.4220 0.6697 0.000 0.748 0.248 0.004
#> SRR1443568 3 0.2714 0.8239 0.000 0.112 0.884 0.004
#> SRR1380249 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1080143 1 0.0592 0.8272 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1383148 4 0.2216 0.7044 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1357042 1 0.3400 0.6822 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR813283 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0592 0.8272 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.6058 0.4834 0.000 0.624 0.068 0.308
#> SRR807679 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1333811 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0707 0.9694 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.4866 0.3952 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1432542 1 0.4933 0.3511 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1418041 1 0.2011 0.7709 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1085211 1 0.1118 0.8162 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4933 0.3511 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1350958 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396822 2 0.1109 0.9567 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488881 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.1118 0.8183 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1071131 2 0.4543 0.4970 0.000 0.676 0.324 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 4 0.1792 0.6881 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.4955 0.5102 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1431887 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1096525 4 0.4933 0.5141 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.1109 0.9646 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1369514 4 0.4925 0.5183 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1453299 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1091767 2 0.0592 0.9710 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1354467 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1452399 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1437430 3 0.0188 0.9435 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1419736 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1313343 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1083530 1 0.2647 0.7417 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1333633 3 0.1411 0.9211 0.000 0.020 0.960 0.020
#> SRR1354999 2 0.5050 0.2964 0.000 0.588 0.408 0.004
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1378818 3 0.0817 0.9315 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1413182 4 0.3311 0.6944 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1464559 4 0.1211 0.6973 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1413075 2 0.0817 0.9679 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1487928 4 0.3024 0.6984 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.4985 -0.3271 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.2081 0.7620 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1346710 1 0.4855 0.4013 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0895 0.9684 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1480941 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1433884 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 3 0.2053 0.8745 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1487173 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1474253 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.3400 0.6822 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1350545 1 0.1211 0.8134 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1091328 1 0.4898 0.3789 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR814447 3 0.0188 0.9435 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1455989 2 0.0188 0.9750 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453680 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.1716 0.7868 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1366729 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0592 0.9369 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.0895 0.9294 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8287 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.4454 0.6233 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR1444598 3 0.4501 0.6561 0.000 0.212 0.764 0.024
#> SRR1091743 2 0.0376 0.9728 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR819637 1 0.3024 0.7154 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1083848 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1088934 3 0.4950 0.4326 0.000 0.376 0.620 0.004
#> SRR1459785 3 0.0000 0.9456 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1375531 1 0.0469 0.8283 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1323470 4 0.7676 0.1692 0.000 0.276 0.264 0.460
#> SRR814657 1 0.1716 0.7783 0.936 0.000 0.000 0.064
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0404 0.92248 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1402132 1 0.3003 0.60698 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1326059 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1409062 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR809406 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465313 5 0.2852 0.67146 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR819559 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1387899 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1442292 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1102320 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1098426 1 0.4283 0.29116 0.544 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1090310 3 0.2813 0.84757 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1429748 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1363654 1 0.0290 0.82168 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326317 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1378308 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.4170 0.71410 0.000 0.048 0.192 0.000 0.760
#> SRR1402944 5 0.3961 0.69165 0.000 0.028 0.212 0.000 0.760
#> SRR1092818 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1093552 4 0.4283 -0.10575 0.456 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1464880 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1078368 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0404 0.92248 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1331879 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1320034 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 5 0.5096 0.42694 0.000 0.272 0.072 0.000 0.656
#> SRR1437491 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.4297 0.21746 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1354203 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1455214 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1092014 2 0.4161 0.49219 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1097857 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0162 0.92844 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071207 4 0.2852 0.56652 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1486821 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.3857 0.51840 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1408788 3 0.6705 0.23533 0.000 0.364 0.392 0.000 0.244
#> SRR1359487 4 0.2516 0.67964 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1080648 1 0.4227 0.34767 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1414708 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1469080 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1365722 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0000 0.66433 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1475993 3 0.1800 0.87097 0.000 0.020 0.932 0.000 0.048
#> SRR1445387 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1077575 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1349300 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1374165 4 0.1341 0.65747 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.3752 0.64872 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1366124 4 0.0000 0.66433 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1456674 4 0.4138 0.13872 0.384 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1086490 3 0.2813 0.84757 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1088511 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.4256 0.46398 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1384431 1 0.2852 0.65090 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1072055 1 0.4287 0.28163 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1359738 3 0.2732 0.85084 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1332141 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1085900 2 0.0771 0.91405 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1442173 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1344034 3 0.0162 0.88027 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080391 4 0.4235 0.48344 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.1043 0.89883 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR814219 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1102128 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1070060 1 0.2280 0.72706 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1487969 5 0.3684 0.82285 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1417851 1 0.4294 0.26207 0.532 0.000 0.000 0.468 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.4278 0.29812 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000
#> SRR1076705 1 0.4256 0.32063 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1079380 5 0.3642 0.85347 0.000 0.232 0.008 0.000 0.760
#> SRR1102923 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.0000 0.67604 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.1410 0.87397 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1396035 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 5 0.4126 0.67514 0.000 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1436840 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.6358 0.19506 0.000 0.000 0.276 0.516 0.208
#> SRR1431735 1 0.4262 0.31256 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1417387 4 0.4242 -0.00277 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1445984 1 0.4291 0.27412 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1370447 4 0.4235 0.48344 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1446308 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1437346 3 0.1197 0.87702 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1103143 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.4060 0.53927 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1319584 5 0.4404 0.75922 0.000 0.088 0.152 0.000 0.760
#> SRR1486584 1 0.0880 0.80739 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR813536 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 4 0.4262 0.45721 0.440 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0162 0.82357 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1079543 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0880 0.90524 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1076681 3 0.6064 0.19400 0.000 0.420 0.460 0.000 0.120
#> SRR1335314 4 0.3039 0.66082 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1400799 3 0.2377 0.86028 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1074578 1 0.2280 0.72706 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1312226 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1416207 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.1043 0.80823 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1069328 1 0.4210 -0.08496 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1445023 4 0.4235 0.48344 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1077599 2 0.3807 0.69103 0.000 0.748 0.012 0.000 0.240
#> SRR1453480 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.4283 0.29116 0.544 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 5 0.3424 0.65089 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1436949 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1070429 3 0.2813 0.84757 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1458158 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.0000 0.66433 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.0000 0.66433 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.1410 0.87656 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1402009 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1316055 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1308734 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1397115 1 0.0162 0.82279 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1392141 4 0.3508 0.45395 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR814341 2 0.0162 0.92824 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313601 2 0.4169 0.67257 0.000 0.732 0.028 0.000 0.240
#> SRR1459609 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0162 0.88027 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809919 1 0.1851 0.75721 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1370818 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1323651 3 0.4959 0.73036 0.000 0.076 0.684 0.000 0.240
#> SRR1357297 1 0.1544 0.77846 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR818170 5 0.3424 0.65089 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1091230 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1470556 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1095285 3 0.1341 0.87621 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1317731 5 0.3796 0.58312 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1490785 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1432032 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1447808 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 5 0.0000 0.67604 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR812128 5 0.3586 0.83871 0.000 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1101513 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1415708 2 0.0794 0.91019 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1316033 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.4291 0.27412 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.2179 0.72743 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1068929 2 0.0162 0.92824 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1490097 2 0.1410 0.87768 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1075054 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1083480 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1075458 1 0.4219 0.35136 0.584 0.000 0.000 0.416 0.000
#> SRR1417023 4 0.0000 0.66433 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0794 0.90882 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1333676 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1413137 4 0.4249 0.47770 0.432 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1469973 2 0.0992 0.90788 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1420026 5 0.3752 0.80952 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR817306 1 0.2020 0.74954 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1416266 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2852 0.66977 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1435394 2 0.4602 0.64523 0.000 0.708 0.052 0.000 0.240
#> SRR1383192 1 0.3508 0.45853 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1419962 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.1043 0.80823 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1312147 4 0.4114 0.18817 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.4249 0.47167 0.432 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1474930 2 0.0880 0.90583 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1470988 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.0000 0.67604 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315780 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1073631 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0794 0.81630 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1310997 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1464494 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1357083 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1475842 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.2929 0.67451 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1378220 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1467704 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1348885 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1325826 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1345692 2 0.0794 0.90882 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1401040 3 0.1851 0.87056 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1097954 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1374396 4 0.3003 0.66292 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 4 0.4268 -0.02188 0.444 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1429368 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.4249 0.32822 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000
#> SRR1361436 3 0.3039 0.83617 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR817142 2 0.3579 0.70003 0.000 0.756 0.004 0.000 0.240
#> SRR1315291 4 0.4446 0.00605 0.000 0.000 0.476 0.520 0.004
#> SRR1309314 3 0.0162 0.88023 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1420085 2 0.2690 0.72937 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1361308 3 0.1851 0.87056 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1472126 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.4357 0.77597 0.000 0.104 0.128 0.000 0.768
#> SRR1099789 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1339276 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 4 0.4300 -0.15857 0.476 0.000 0.000 0.524 0.000
#> SRR1096760 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1440290 3 0.4086 0.78807 0.000 0.024 0.736 0.000 0.240
#> SRR1330813 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1458931 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1043 0.67864 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1394321 1 0.1197 0.80819 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.1544 0.77995 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1390143 1 0.0510 0.82212 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.2813 0.84757 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1312169 1 0.2127 0.73192 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1096687 4 0.2690 0.67616 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1486139 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1470313 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1447893 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1466025 5 0.3561 0.84241 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1477429 4 0.4235 0.48344 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1445701 3 0.2813 0.84757 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR820689 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0703 0.81861 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1489328 2 0.1341 0.87929 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1344462 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.0000 0.66433 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.1732 0.75702 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1480917 5 0.0000 0.67604 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 4 0.0963 0.67730 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1089998 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318140 1 0.0703 0.81221 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1319262 3 0.2561 0.85327 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1095188 2 0.0290 0.92555 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1440374 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1359565 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1325578 5 0.4541 0.74594 0.000 0.084 0.172 0.000 0.744
#> SRR1358161 3 0.0162 0.88027 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358665 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1452010 1 0.1732 0.75702 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1418183 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1366345 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1387449 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1473461 1 0.0880 0.81198 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1090837 3 0.3274 0.82054 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1447828 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1088557 1 0.1341 0.79378 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1102656 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1441443 2 0.0880 0.90530 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1370682 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.3242 0.82292 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1407291 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1363766 1 0.1908 0.75243 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1082592 5 0.3636 0.83137 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1325794 5 0.0404 0.67637 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1095961 3 0.1197 0.87702 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1086702 2 0.3003 0.75819 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1320806 5 0.2020 0.66504 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1457527 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.3003 0.66292 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1454695 4 0.1608 0.64990 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1090241 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1329863 2 0.0703 0.91257 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1357733 1 0.2516 0.71473 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1362135 1 0.4249 0.32816 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.4291 0.27412 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1084742 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1433538 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 5 0.3612 0.83572 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1454247 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1097100 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1072388 1 0.4291 0.27412 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1070332 5 0.3452 0.85518 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1320761 5 0.0000 0.67604 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 4 0.0000 0.66433 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1099144 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1385150 3 0.3395 0.80987 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1420191 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0162 0.66376 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.4300 0.24516 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1340574 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1444830 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1096267 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.1197 0.85206 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1408553 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1069231 1 0.4101 0.38872 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.3895 0.49283 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1321942 1 0.2732 0.69530 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1094380 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1077874 5 0.3534 0.84633 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR808299 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1481238 5 0.5707 0.24103 0.000 0.160 0.216 0.000 0.624
#> SRR1443568 3 0.3932 0.81598 0.000 0.064 0.796 0.000 0.140
#> SRR1380249 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1080143 1 0.0703 0.81862 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1383148 4 0.1608 0.68431 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1357042 1 0.3039 0.65991 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0880 0.90524 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR813283 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0703 0.81861 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.4290 0.83514 0.000 0.196 0.044 0.004 0.756
#> SRR807679 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1333811 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 5 0.3949 0.75551 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1331730 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.4242 0.33544 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1432542 1 0.4291 0.27412 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1418041 1 0.1965 0.74934 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1085211 1 0.1121 0.80571 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4291 0.27412 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1350958 2 0.2280 0.83951 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1396822 2 0.4169 0.67311 0.000 0.732 0.028 0.000 0.240
#> SRR1441934 2 0.1121 0.89732 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1472552 3 0.2424 0.86017 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1488881 3 0.1851 0.87056 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1102973 1 0.1121 0.80776 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1071131 2 0.3274 0.66543 0.000 0.780 0.220 0.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 4 0.1043 0.66363 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0162 0.92822 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430045 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.4256 0.48049 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1431887 5 0.4201 0.61312 0.000 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR1096525 4 0.4242 0.47830 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.0000 0.67604 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 4 0.4227 0.48771 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1453299 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.1121 0.72239 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1091767 2 0.4182 -0.01678 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1354467 3 0.1851 0.87056 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1069074 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1452399 2 0.0955 0.90688 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1437430 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1313343 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1083530 1 0.2329 0.73090 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1333633 5 0.3177 0.58402 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1354999 3 0.6638 0.34994 0.000 0.320 0.440 0.000 0.240
#> SRR1443592 2 0.0703 0.91189 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077356 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1378818 5 0.3424 0.65089 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1413182 4 0.2690 0.67695 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1464559 4 0.0404 0.66216 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1413075 5 0.3424 0.85612 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1487928 4 0.2377 0.68223 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.3109 0.74584 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1102729 1 0.4287 -0.26826 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.2127 0.73192 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1346710 1 0.4227 0.34807 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.3913 0.37402 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1480941 3 0.0162 0.88027 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479175 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1433884 2 0.0609 0.91572 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1471074 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 3 0.3424 0.80750 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1487173 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1474253 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.3039 0.65991 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1350545 1 0.1341 0.79669 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1091328 1 0.4273 0.30497 0.552 0.000 0.000 0.448 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.3109 0.75223 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1453680 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.1608 0.77472 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR814633 2 0.0000 0.93093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.3913 0.41231 0.000 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1319100 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.2929 0.84234 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1457459 1 0.0000 0.82351 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.3774 0.60076 0.296 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR1444598 5 0.4367 0.72367 0.000 0.060 0.192 0.000 0.748
#> SRR1091743 2 0.3424 0.70419 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR819637 1 0.2648 0.70347 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1083848 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1088934 3 0.6602 0.38202 0.000 0.304 0.456 0.000 0.240
#> SRR1459785 3 0.0000 0.88198 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1375531 1 0.0404 0.82324 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1323470 4 0.8077 0.03529 0.000 0.136 0.252 0.420 0.192
#> SRR814657 1 0.1732 0.75702 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.2941 0.71362 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1402132 1 0.4641 0.57462 0.752 0.000 0.000 0.088 0.088 0.072
#> SRR1326059 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1409062 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR809406 1 0.0260 0.83508 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465313 5 0.2009 0.83790 0.000 0.000 0.068 0.000 0.908 0.024
#> SRR819559 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1387899 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1442292 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1395635 4 0.4123 0.35839 0.420 0.000 0.000 0.568 0.000 0.012
#> SRR1343629 1 0.0622 0.83381 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1326868 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1102320 1 0.0622 0.83357 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1469926 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.4262 -0.17429 0.508 0.000 0.000 0.476 0.000 0.016
#> SRR1098426 4 0.3945 0.42853 0.380 0.000 0.000 0.612 0.000 0.008
#> SRR1090310 6 0.3860 0.17003 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1429748 1 0.0146 0.83566 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363654 1 0.0458 0.83499 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1326317 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1378308 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2897 0.57408 0.000 0.000 0.000 0.852 0.088 0.060
#> SRR1329947 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1469769 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.1753 0.84096 0.000 0.004 0.084 0.000 0.912 0.000
#> SRR1402944 5 0.1753 0.84095 0.000 0.004 0.084 0.000 0.912 0.000
#> SRR1092818 1 0.4152 -0.07719 0.548 0.000 0.000 0.440 0.000 0.012
#> SRR1093552 4 0.3979 0.44832 0.360 0.000 0.000 0.628 0.000 0.012
#> SRR1464880 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.1663 0.87244 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1331879 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 6 0.1982 0.81982 0.000 0.068 0.004 0.000 0.016 0.912
#> SRR1437491 1 0.0547 0.83528 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1310777 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1329994 4 0.4175 0.26671 0.464 0.000 0.000 0.524 0.000 0.012
#> SRR1354203 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077850 1 0.0520 0.83555 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1369241 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1455214 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1092014 6 0.1858 0.81909 0.000 0.076 0.000 0.000 0.012 0.912
#> SRR1097857 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473318 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1345974 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0458 0.93380 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1071207 4 0.2706 0.59690 0.160 0.000 0.000 0.832 0.000 0.008
#> SRR1486821 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.4066 0.17068 0.596 0.000 0.000 0.392 0.000 0.012
#> SRR1408788 6 0.2058 0.81818 0.000 0.056 0.036 0.000 0.000 0.908
#> SRR1359487 4 0.5022 0.56850 0.140 0.000 0.000 0.712 0.088 0.060
#> SRR1080648 1 0.4250 -0.12235 0.528 0.000 0.000 0.456 0.000 0.016
#> SRR1414708 4 0.4212 0.34789 0.424 0.000 0.000 0.560 0.000 0.016
#> SRR1469080 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0260 0.58317 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1321829 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1475993 6 0.4141 0.28560 0.000 0.012 0.432 0.000 0.000 0.556
#> SRR1445387 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077575 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1349300 1 0.0260 0.83508 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374165 4 0.0000 0.58352 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0520 0.83425 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1401146 6 0.1895 0.81882 0.000 0.072 0.000 0.000 0.016 0.912
#> SRR1366124 4 0.2933 0.57584 0.008 0.000 0.000 0.860 0.076 0.056
#> SRR1391811 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1456674 4 0.3373 0.55623 0.248 0.000 0.000 0.744 0.000 0.008
#> SRR1086490 6 0.3838 0.24046 0.000 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1088511 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.6313 -0.16410 0.440 0.000 0.000 0.400 0.088 0.072
#> SRR1384431 1 0.4633 0.57955 0.752 0.000 0.000 0.096 0.084 0.068
#> SRR1072055 4 0.4047 0.42167 0.384 0.000 0.000 0.604 0.000 0.012
#> SRR1359738 6 0.3866 0.13037 0.000 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1332141 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085900 2 0.3171 0.72339 0.000 0.784 0.000 0.000 0.012 0.204
#> SRR1442173 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1431625 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1344034 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 4 0.6236 0.19747 0.416 0.000 0.000 0.432 0.088 0.064
#> SRR1347870 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0790 0.92105 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0458 0.83546 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1102128 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1460211 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1070060 1 0.3966 0.65820 0.800 0.000 0.000 0.040 0.088 0.072
#> SRR1487969 5 0.2883 0.79204 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1417851 4 0.3695 0.44128 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.4089 0.26867 0.468 0.000 0.000 0.524 0.000 0.008
#> SRR1076705 4 0.4109 0.37745 0.412 0.000 0.000 0.576 0.000 0.012
#> SRR1079380 5 0.1753 0.91502 0.000 0.084 0.004 0.000 0.912 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.3747 0.26589 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1366605 2 0.2969 0.71063 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 5 0.3309 0.68745 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 5 0.6346 0.03902 0.000 0.000 0.204 0.380 0.396 0.020
#> SRR1431735 4 0.3984 0.40950 0.396 0.000 0.000 0.596 0.000 0.008
#> SRR1417387 4 0.3670 0.52701 0.284 0.000 0.000 0.704 0.000 0.012
#> SRR1445984 4 0.3934 0.43436 0.376 0.000 0.000 0.616 0.000 0.008
#> SRR1370447 4 0.6236 0.19235 0.420 0.000 0.000 0.428 0.088 0.064
#> SRR1446308 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1437346 3 0.3817 0.13954 0.000 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1103143 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.4218 -0.04319 0.556 0.000 0.000 0.428 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1468914 4 0.6121 0.31125 0.352 0.000 0.000 0.500 0.088 0.060
#> SRR1319584 5 0.1984 0.87211 0.000 0.032 0.056 0.000 0.912 0.000
#> SRR1486584 1 0.1320 0.81303 0.948 0.000 0.000 0.036 0.000 0.016
#> SRR813536 1 0.6317 -0.18900 0.428 0.000 0.000 0.412 0.088 0.072
#> SRR1317939 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1341921 1 0.6317 -0.18900 0.428 0.000 0.000 0.412 0.088 0.072
#> SRR1399178 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0622 0.83357 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1328551 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2135 0.83134 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1076681 3 0.6130 -0.13433 0.000 0.324 0.340 0.000 0.000 0.336
#> SRR1335314 4 0.5460 0.53092 0.188 0.000 0.000 0.660 0.088 0.064
#> SRR1400799 3 0.3499 0.45481 0.000 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1074578 1 0.3966 0.65820 0.800 0.000 0.000 0.040 0.088 0.072
#> SRR1312226 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1416207 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1447371 1 0.1074 0.81927 0.960 0.000 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1069328 1 0.6021 0.15451 0.560 0.000 0.000 0.284 0.088 0.068
#> SRR1445023 4 0.6236 0.19747 0.416 0.000 0.000 0.432 0.088 0.064
#> SRR1077599 6 0.1753 0.81919 0.000 0.084 0.004 0.000 0.000 0.912
#> SRR1453480 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 4 0.4037 0.42307 0.380 0.000 0.000 0.608 0.000 0.012
#> SRR1074839 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 5 0.1663 0.83559 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1436949 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1070429 6 0.3860 0.17003 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1458158 1 0.0520 0.83425 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1432408 4 0.3150 0.57272 0.008 0.000 0.000 0.844 0.088 0.060
#> SRR1310334 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1418201 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.3150 0.57272 0.008 0.000 0.000 0.844 0.088 0.060
#> SRR1415591 3 0.3592 0.40140 0.000 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1402009 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1316055 4 0.0000 0.58352 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308734 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1397115 1 0.0862 0.83335 0.972 0.000 0.000 0.008 0.004 0.016
#> SRR1392141 4 0.2346 0.61604 0.124 0.000 0.000 0.868 0.000 0.008
#> SRR814341 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1459609 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.3270 0.70327 0.836 0.000 0.000 0.008 0.084 0.072
#> SRR1370818 4 0.0000 0.58352 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 6 0.1812 0.80211 0.000 0.008 0.080 0.000 0.000 0.912
#> SRR1357297 1 0.2171 0.79038 0.912 0.000 0.000 0.040 0.032 0.016
#> SRR818170 5 0.1765 0.83032 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1091230 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1470556 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0458 0.83552 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1095285 3 0.2697 0.69683 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1317731 5 0.3747 0.39292 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1490785 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1432032 1 0.4192 0.00395 0.572 0.000 0.000 0.412 0.000 0.016
#> SRR1447808 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR809534 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 6 0.1663 0.78622 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR812128 5 0.1863 0.90443 0.000 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR1101513 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1415708 2 0.3515 0.51475 0.000 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1316033 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 4 0.4015 0.43495 0.372 0.000 0.000 0.616 0.000 0.012
#> SRR1080044 1 0.0622 0.83357 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1420850 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.4221 0.65124 0.784 0.000 0.000 0.060 0.088 0.068
#> SRR1069871 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1095744 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.3288 0.62723 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1075054 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1083480 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1075458 4 0.4147 0.33428 0.436 0.000 0.000 0.552 0.000 0.012
#> SRR1417023 4 0.1832 0.58270 0.008 0.000 0.000 0.928 0.032 0.032
#> SRR1309333 2 0.2912 0.71889 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1333676 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1352996 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1093172 1 0.6277 -0.19368 0.428 0.000 0.000 0.416 0.088 0.068
#> SRR1413137 4 0.6234 0.19373 0.412 0.000 0.000 0.436 0.088 0.064
#> SRR1469973 2 0.1007 0.91282 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1420026 5 0.2491 0.84752 0.000 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR817306 1 0.3338 0.73441 0.844 0.000 0.000 0.036 0.072 0.048
#> SRR1416266 4 0.6236 0.19235 0.420 0.000 0.000 0.428 0.088 0.064
#> SRR1071011 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.5343 0.54475 0.172 0.000 0.000 0.676 0.088 0.064
#> SRR1435394 6 0.1753 0.81919 0.000 0.084 0.004 0.000 0.000 0.912
#> SRR1383192 1 0.5144 0.51011 0.704 0.000 0.000 0.136 0.088 0.072
#> SRR1419962 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.1225 0.81336 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000 0.012
#> SRR1081639 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1312147 4 0.3109 0.56485 0.224 0.000 0.000 0.772 0.000 0.004
#> SRR1473891 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.6314 -0.17335 0.436 0.000 0.000 0.404 0.088 0.072
#> SRR1474930 2 0.2775 0.82273 0.000 0.856 0.104 0.000 0.000 0.040
#> SRR1470988 4 0.6236 0.19235 0.420 0.000 0.000 0.428 0.088 0.064
#> SRR811915 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0458 0.83532 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1100005 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 6 0.1663 0.78622 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1313770 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315780 6 0.3446 0.58922 0.000 0.308 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR1073631 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR819124 1 0.0820 0.82847 0.972 0.000 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1310997 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1464494 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1357083 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1475842 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.2912 0.63718 0.816 0.000 0.000 0.172 0.000 0.012
#> SRR1378220 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1467704 4 0.4123 0.35839 0.420 0.000 0.000 0.568 0.000 0.012
#> SRR1348885 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1325826 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1466812 4 0.6318 0.18331 0.420 0.000 0.000 0.420 0.088 0.072
#> SRR1345692 2 0.2912 0.71889 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1401040 3 0.1007 0.86412 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1097954 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1374396 4 0.5431 0.53458 0.184 0.000 0.000 0.664 0.088 0.064
#> SRR1454073 2 0.0865 0.91911 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1355747 4 0.3615 0.51694 0.292 0.000 0.000 0.700 0.000 0.008
#> SRR1429368 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0622 0.93274 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1379260 4 0.4010 0.38627 0.408 0.000 0.000 0.584 0.000 0.008
#> SRR1361436 6 0.2762 0.70680 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR817142 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1315291 3 0.5744 0.23222 0.000 0.000 0.496 0.396 0.048 0.060
#> SRR1309314 3 0.0458 0.88602 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1420085 2 0.3446 0.55009 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1361308 3 0.1007 0.86412 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1472126 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1380482 5 0.2003 0.88354 0.000 0.044 0.044 0.000 0.912 0.000
#> SRR1099789 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1079480 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1339276 1 0.0405 0.83559 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1418368 1 0.0520 0.83531 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1399353 4 0.3923 0.44059 0.372 0.000 0.000 0.620 0.000 0.008
#> SRR1096760 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1440290 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1330813 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1458931 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.3985 0.57798 0.048 0.000 0.000 0.800 0.088 0.064
#> SRR1394321 1 0.1225 0.81635 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000 0.012
#> SRR1081160 2 0.1863 0.85715 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1469704 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.1838 0.77944 0.916 0.000 0.000 0.068 0.000 0.016
#> SRR1477173 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1390143 1 0.0508 0.83333 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1390413 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 6 0.3862 0.15742 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1312169 1 0.4041 0.66176 0.796 0.000 0.000 0.048 0.088 0.068
#> SRR1096687 4 0.5028 0.56445 0.164 0.000 0.000 0.704 0.076 0.056
#> SRR1486139 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470313 4 0.0000 0.58352 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1466025 5 0.1814 0.90801 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1477429 4 0.6236 0.19747 0.416 0.000 0.000 0.432 0.088 0.064
#> SRR1445701 6 0.3860 0.17003 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR820689 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1451876 2 0.2378 0.80307 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1452537 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0725 0.83002 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1489328 2 0.2996 0.70081 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1344462 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1082709 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1447784 4 0.0767 0.58423 0.008 0.000 0.000 0.976 0.004 0.012
#> SRR1355769 1 0.3510 0.70499 0.824 0.000 0.000 0.016 0.088 0.072
#> SRR1488237 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0146 0.83565 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480917 6 0.1663 0.78622 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1474485 4 0.1333 0.59924 0.048 0.000 0.000 0.944 0.000 0.008
#> SRR1089998 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318140 1 0.1245 0.81619 0.952 0.000 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1319262 3 0.3126 0.59922 0.000 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1095188 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1440374 1 0.0260 0.83497 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359565 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.6317 -0.18900 0.428 0.000 0.000 0.412 0.088 0.072
#> SRR1325578 5 0.4526 0.23967 0.000 0.032 0.456 0.000 0.512 0.000
#> SRR1358161 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1452010 1 0.3510 0.70499 0.824 0.000 0.000 0.016 0.088 0.072
#> SRR1418183 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1366345 1 0.0458 0.83436 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1387449 1 0.0260 0.83497 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473461 1 0.1074 0.82287 0.960 0.000 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1090837 6 0.2219 0.76642 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1447828 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1088557 1 0.2520 0.76097 0.888 0.000 0.000 0.012 0.032 0.068
#> SRR1102656 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1441443 2 0.0260 0.93949 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 6 0.2340 0.75632 0.000 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1407291 1 0.0520 0.83425 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1405266 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1363766 1 0.3265 0.69967 0.836 0.000 0.000 0.008 0.088 0.068
#> SRR1082592 5 0.2048 0.89173 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1325794 6 0.2941 0.67759 0.000 0.000 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1095961 3 0.3531 0.43790 0.000 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1086702 6 0.3854 0.17368 0.000 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1320806 6 0.1950 0.80211 0.000 0.024 0.000 0.000 0.064 0.912
#> SRR1457527 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.5431 0.53458 0.184 0.000 0.000 0.664 0.088 0.064
#> SRR1454695 4 0.0717 0.58764 0.016 0.000 0.000 0.976 0.000 0.008
#> SRR1090241 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1329863 2 0.1444 0.88406 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1357733 1 0.2704 0.68377 0.844 0.000 0.000 0.140 0.000 0.016
#> SRR1362135 1 0.4095 -0.17758 0.512 0.000 0.000 0.480 0.000 0.008
#> SRR1379581 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0405 0.83476 0.988 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1437668 4 0.4015 0.43507 0.372 0.000 0.000 0.616 0.000 0.012
#> SRR1084742 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1433538 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1085063 5 0.2562 0.83982 0.000 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1454247 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1072388 4 0.4015 0.43507 0.372 0.000 0.000 0.616 0.000 0.012
#> SRR1070332 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1320761 6 0.3782 0.29684 0.000 0.000 0.000 0.000 0.412 0.588
#> SRR1076195 4 0.3047 0.57447 0.008 0.000 0.000 0.852 0.080 0.060
#> SRR1069895 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1099144 4 0.0146 0.58349 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1385150 6 0.1814 0.79230 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1420191 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0405 0.58363 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1102583 1 0.0622 0.83357 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1456971 4 0.3992 0.44533 0.364 0.000 0.000 0.624 0.000 0.012
#> SRR1340574 1 0.0458 0.83552 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1444830 6 0.2003 0.79477 0.000 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR1096267 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1087127 3 0.1501 0.83745 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1408553 1 0.6278 -0.19919 0.424 0.000 0.000 0.420 0.088 0.068
#> SRR1069231 1 0.3843 -0.07081 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0260 0.93948 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1362103 1 0.3853 0.33702 0.680 0.000 0.000 0.304 0.000 0.016
#> SRR1321942 1 0.2821 0.66633 0.832 0.000 0.000 0.152 0.000 0.016
#> SRR1094380 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1447499 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1077874 5 0.2135 0.88439 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1481238 6 0.2137 0.80450 0.000 0.012 0.028 0.000 0.048 0.912
#> SRR1443568 3 0.5259 -0.07044 0.000 0.096 0.468 0.000 0.000 0.436
#> SRR1380249 4 0.2846 0.57495 0.000 0.000 0.000 0.856 0.084 0.060
#> SRR1080143 1 0.0725 0.82986 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1383148 4 0.4327 0.57859 0.076 0.000 0.000 0.776 0.088 0.060
#> SRR1357042 1 0.3104 0.61141 0.800 0.000 0.000 0.184 0.000 0.016
#> SRR1416025 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.2941 0.71317 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR813283 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1430226 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0820 0.82766 0.972 0.000 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1466927 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.2112 0.90992 0.000 0.088 0.000 0.016 0.896 0.000
#> SRR807679 1 0.4184 -0.19149 0.504 0.000 0.000 0.484 0.000 0.012
#> SRR1333811 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 5 0.2969 0.77513 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 4 0.4123 0.35839 0.420 0.000 0.000 0.568 0.000 0.012
#> SRR1432542 4 0.3934 0.43436 0.376 0.000 0.000 0.616 0.000 0.008
#> SRR1418041 1 0.3419 0.69371 0.828 0.000 0.000 0.012 0.088 0.072
#> SRR1085211 1 0.1367 0.80939 0.944 0.000 0.000 0.044 0.000 0.012
#> SRR1339812 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 4 0.3934 0.43436 0.376 0.000 0.000 0.616 0.000 0.008
#> SRR1350958 2 0.4913 0.29019 0.000 0.564 0.000 0.000 0.072 0.364
#> SRR1396822 6 0.1753 0.81919 0.000 0.084 0.004 0.000 0.000 0.912
#> SRR1441934 2 0.3221 0.63628 0.000 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1472552 3 0.3868 -0.09856 0.000 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1488881 3 0.1075 0.86122 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1102973 1 0.1225 0.81520 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000 0.012
#> SRR1071131 2 0.4541 0.35726 0.000 0.596 0.360 0.000 0.000 0.044
#> SRR1074502 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1325271 4 0.0937 0.59725 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.3700 0.73959 0.000 0.780 0.000 0.000 0.152 0.068
#> SRR1430045 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0363 0.93683 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1384091 4 0.6191 0.19857 0.412 0.000 0.000 0.440 0.088 0.060
#> SRR1431887 2 0.3843 0.04964 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000
#> SRR1096525 4 0.6236 0.19235 0.420 0.000 0.000 0.428 0.088 0.064
#> SRR1488491 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 6 0.3747 0.37682 0.000 0.000 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR1369514 1 0.6318 -0.20380 0.420 0.000 0.000 0.420 0.088 0.072
#> SRR1453299 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1348490 5 0.1663 0.81607 0.000 0.000 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1091767 2 0.3774 0.28124 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408 0.000
#> SRR1354467 3 0.1007 0.86412 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1069074 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1452399 2 0.0458 0.93431 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1437430 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1313343 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.0000 0.58352 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.2494 0.71357 0.864 0.000 0.000 0.120 0.000 0.016
#> SRR1333633 6 0.4871 0.55930 0.000 0.000 0.112 0.000 0.244 0.644
#> SRR1354999 6 0.1970 0.81882 0.000 0.060 0.028 0.000 0.000 0.912
#> SRR1443592 2 0.1327 0.89128 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1077356 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1378818 5 0.1663 0.83559 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1413182 4 0.5093 0.56222 0.148 0.000 0.000 0.704 0.088 0.060
#> SRR1464559 4 0.0000 0.58352 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 5 0.1663 0.91753 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1487928 4 0.4948 0.57339 0.132 0.000 0.000 0.720 0.088 0.060
#> SRR1388997 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 6 0.3515 0.53623 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR1102729 1 0.4507 0.13857 0.596 0.000 0.000 0.372 0.012 0.020
#> SRR1456423 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1321591 2 0.2823 0.73597 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.3805 0.68159 0.812 0.000 0.000 0.044 0.088 0.056
#> SRR1346710 1 0.4238 -0.08795 0.540 0.000 0.000 0.444 0.000 0.016
#> SRR1418771 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 6 0.2003 0.81280 0.000 0.044 0.000 0.000 0.044 0.912
#> SRR1480941 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0363 0.83554 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1433884 2 0.3133 0.71478 0.000 0.780 0.000 0.000 0.008 0.212
#> SRR1471074 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 6 0.1663 0.79741 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1487173 1 0.0458 0.83436 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1474253 1 0.0260 0.83535 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1322918 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.3104 0.61141 0.800 0.000 0.000 0.184 0.000 0.016
#> SRR1350545 1 0.2001 0.79158 0.920 0.000 0.000 0.044 0.016 0.020
#> SRR1091328 4 0.3984 0.40431 0.396 0.000 0.000 0.596 0.000 0.008
#> SRR814447 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 6 0.3288 0.61543 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1453680 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.2814 0.73582 0.864 0.000 0.000 0.004 0.080 0.052
#> SRR1366729 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR814633 2 0.0000 0.94449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.1204 0.85231 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1319100 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1324004 6 0.3828 0.25881 0.000 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1457459 1 0.0717 0.83280 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1421031 4 0.5924 0.41477 0.284 0.000 0.000 0.568 0.088 0.060
#> SRR1444598 5 0.2199 0.84960 0.000 0.020 0.088 0.000 0.892 0.000
#> SRR1091743 6 0.1663 0.81816 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR819637 1 0.2744 0.67854 0.840 0.000 0.000 0.144 0.000 0.016
#> SRR1083848 1 0.0458 0.83482 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1088934 6 0.1970 0.81066 0.000 0.028 0.060 0.000 0.000 0.912
#> SRR1459785 3 0.0000 0.89916 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1375531 1 0.0363 0.83442 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1323470 6 0.6202 0.48836 0.000 0.060 0.180 0.188 0.000 0.572
#> SRR814657 1 0.3364 0.71470 0.832 0.000 0.000 0.012 0.088 0.068
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.997 0.999 0.4938 0.507 0.507
#> 3 3 1.000 0.973 0.989 0.2125 0.887 0.778
#> 4 4 0.677 0.748 0.848 0.1413 0.836 0.632
#> 5 5 0.674 0.634 0.713 0.0995 0.841 0.544
#> 6 6 0.722 0.680 0.766 0.0581 0.961 0.824
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.939 0.446 0.356 0.644
#> SRR1436949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309314 1 0.788 0.691 0.764 0.236
#> SRR1420085 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 1 0.204 0.966 0.968 0.032
#> SRR807679 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814657 1 0.000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.1529 0.9507 0.000 0.960 0.040
#> SRR819559 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.6180 0.3647 0.000 0.416 0.584
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1402944 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.6235 0.1267 0.000 0.564 0.436
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.1860 0.9369 0.000 0.948 0.052
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0424 0.9851 0.000 0.992 0.008
#> SRR1359487 1 0.0237 0.9962 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.0237 0.9962 0.996 0.000 0.004
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1344034 3 0.6308 0.1390 0.000 0.492 0.508
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 3 0.6192 0.3590 0.000 0.420 0.580
#> SRR814219 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 3 0.0237 0.9326 0.000 0.004 0.996
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1400799 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1385434 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0237 0.9891 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0237 0.9891 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0237 0.9891 0.000 0.996 0.004
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.2537 0.9033 0.000 0.920 0.080
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.1163 0.9641 0.000 0.972 0.028
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.2066 0.8978 0.000 0.060 0.940
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.5178 0.6774 0.000 0.256 0.744
#> SRR1315780 2 0.6280 0.0339 0.000 0.540 0.460
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 3 0.6286 0.2334 0.000 0.464 0.536
#> SRR1464494 3 0.1031 0.9235 0.000 0.024 0.976
#> SRR1357083 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309314 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.5968 0.4887 0.000 0.364 0.636
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466025 3 0.0237 0.9322 0.000 0.004 0.996
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 3 0.6235 0.3166 0.000 0.436 0.564
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358161 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 3 0.3941 0.8067 0.000 0.156 0.844
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.6309 0.0943 0.000 0.500 0.500
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.1643 0.9460 0.000 0.956 0.044
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 3 0.0237 0.9327 0.000 0.004 0.996
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0424 0.9851 0.000 0.992 0.008
#> SRR1076195 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.4504 0.7308 0.000 0.804 0.196
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0424 0.9851 0.000 0.992 0.008
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0237 0.9327 0.000 0.004 0.996
#> SRR1488881 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 3 0.3816 0.8156 0.000 0.148 0.852
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.0424 0.9327 0.000 0.008 0.992
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.2261 0.9181 0.000 0.932 0.068
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 3 0.2066 0.8979 0.000 0.060 0.940
#> SRR1437430 3 0.0592 0.9306 0.000 0.012 0.988
#> SRR1419736 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 3 0.2165 0.8946 0.000 0.064 0.936
#> SRR1487928 1 0.0424 0.9928 0.992 0.000 0.008
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.1964 0.9008 0.000 0.056 0.944
#> SRR821282 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.9930 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0000 0.9322 0.000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.9996 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.2345 0.8152 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1402132 4 0.4977 0.1921 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1326059 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 3 0.4585 0.6616 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.4920 0.7542 0.000 0.164 0.768 0.068
#> SRR819559 1 0.0592 0.8920 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1387899 3 0.3726 0.7424 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 3 0.4040 0.7247 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.2334 0.6670 0.000 0.004 0.908 0.088
#> SRR1070036 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1098426 1 0.2868 0.8736 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1090310 3 0.1118 0.7199 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0592 0.8920 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1326317 3 0.4040 0.7247 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.3266 0.7543 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.5877 0.6405 0.000 0.068 0.656 0.276
#> SRR1402944 3 0.6138 0.6493 0.000 0.092 0.648 0.260
#> SRR1092818 1 0.2704 0.8777 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1093552 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1464880 3 0.6700 0.6089 0.000 0.316 0.572 0.112
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.4072 0.5087 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1466951 2 0.2408 0.8103 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1331879 3 0.5408 0.5355 0.000 0.408 0.576 0.016
#> SRR1320034 3 0.4164 0.4764 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1068687 3 0.4697 0.6355 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0188 0.8918 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1329994 1 0.1211 0.8916 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1354203 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 3 0.4941 0.4937 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.4008 0.7330 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1338687 3 0.4817 0.5918 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1071207 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1486821 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1418540 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1408788 3 0.3718 0.7575 0.000 0.168 0.820 0.012
#> SRR1359487 1 0.4981 0.2199 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1080648 1 0.2704 0.8777 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1414708 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1469080 3 0.5250 0.4802 0.000 0.440 0.552 0.008
#> SRR1365722 2 0.0336 0.8995 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3074 0.8656 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1321829 3 0.4040 0.7247 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1475993 3 0.1557 0.7286 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 3 0.6450 0.6171 0.000 0.108 0.616 0.276
#> SRR1349300 1 0.0188 0.8918 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374165 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 3 0.4967 0.4615 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1366124 1 0.4998 0.1249 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1391811 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1086490 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1384431 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1359738 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 3 0.4643 0.6512 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.6690 0.6547 0.000 0.188 0.620 0.192
#> SRR1344034 3 0.4174 0.7611 0.000 0.140 0.816 0.044
#> SRR1080391 1 0.3074 0.8656 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 3 0.6453 0.5648 0.000 0.360 0.560 0.080
#> SRR814219 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0188 0.9008 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1418346 3 0.6415 0.6083 0.000 0.100 0.612 0.288
#> SRR1070060 1 0.1557 0.8902 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1487969 3 0.4972 0.4532 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1417851 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1443350 2 0.0336 0.8974 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1403199 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1076705 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1079380 3 0.6238 0.6126 0.000 0.084 0.620 0.296
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 3 0.4746 0.6051 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1366605 2 0.2345 0.8152 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2408 0.8148 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1436840 2 0.3975 0.5609 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1445573 2 0.0188 0.9008 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1375394 4 0.0592 0.6264 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1431735 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1417387 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1445984 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1370447 1 0.4955 0.2921 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1446308 3 0.3486 0.7500 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1437346 3 0.1211 0.7220 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1103143 2 0.0336 0.8986 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1086466 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0817 0.8921 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1468914 1 0.3074 0.8656 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1319584 3 0.6301 0.6449 0.000 0.104 0.636 0.260
#> SRR1486584 1 0.0707 0.8920 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR813536 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.2589 0.8799 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 3 0.5620 0.4617 0.000 0.024 0.560 0.416
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2408 0.8148 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1076681 3 0.4277 0.7084 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1335314 1 0.5000 0.0895 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1400799 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 3 0.4955 0.4769 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.2760 0.8765 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1069328 1 0.2408 0.8828 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1445023 1 0.4981 0.2211 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1077599 3 0.3975 0.7291 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1453480 3 0.5406 0.3923 0.000 0.480 0.508 0.012
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1074839 3 0.4697 0.6341 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1458727 4 0.0592 0.6264 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1436949 3 0.5080 0.5207 0.000 0.420 0.576 0.004
#> SRR1070429 3 0.1118 0.7199 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.4866 0.2250 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1310334 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.3311 0.5996 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1385434 1 0.4999 0.1077 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1415591 3 0.1557 0.7286 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.4431 0.6586 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1308734 3 0.1557 0.7314 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1498973 3 0.5172 0.5439 0.000 0.404 0.588 0.008
#> SRR1397115 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR814341 2 0.4898 -0.0547 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1313601 3 0.3801 0.7425 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.3400 0.5946 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR809919 1 0.2149 0.8855 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1370818 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1323651 3 0.3837 0.7371 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1357297 1 0.0336 0.8919 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR818170 4 0.4454 0.2000 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1091230 3 0.4008 0.7264 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1151 0.7128 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1317731 3 0.5165 0.7548 0.000 0.168 0.752 0.080
#> SRR1490785 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.2647 0.8789 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1447808 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0469 0.8939 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1397312 3 0.4776 0.5992 0.000 0.376 0.624 0.000
#> SRR812128 3 0.4817 0.5635 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 3 0.4250 0.7083 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1316033 3 0.1510 0.7106 0.000 0.028 0.956 0.016
#> SRR1390371 2 0.3400 0.7032 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1480263 2 0.4941 -0.1963 0.000 0.564 0.436 0.000
#> SRR1464473 3 0.2345 0.6519 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1076801 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1080044 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.2469 0.8820 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1069871 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 3 0.6450 0.6171 0.000 0.108 0.616 0.276
#> SRR1068929 2 0.1474 0.8649 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1490097 2 0.2530 0.8122 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1075054 3 0.4955 0.4769 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1417023 4 0.4967 0.0806 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1309333 2 0.2704 0.7931 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.4817 0.4622 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1413137 1 0.3266 0.8522 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1469973 3 0.4907 0.5416 0.000 0.420 0.580 0.000
#> SRR1420026 2 0.2345 0.8152 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR817306 1 0.0707 0.8920 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1416266 1 0.4989 0.1890 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1435394 3 0.3907 0.7329 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1383192 1 0.2973 0.8703 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1419962 3 0.3123 0.6122 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1094357 1 0.2281 0.8842 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1081639 3 0.4008 0.5618 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.5126 0.4193 0.000 0.004 0.552 0.444
#> SRR1312147 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 3 0.4356 0.6973 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1470988 1 0.4916 0.3577 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR811915 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.4999 -0.3331 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1313770 3 0.3088 0.6765 0.000 0.008 0.864 0.128
#> SRR1315780 3 0.6064 0.4184 0.000 0.444 0.512 0.044
#> SRR1073631 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 3 0.6200 0.5762 0.000 0.356 0.580 0.064
#> SRR1464494 3 0.6560 0.6374 0.000 0.248 0.620 0.132
#> SRR1357083 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.2760 0.8765 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1378220 3 0.2469 0.7518 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1467704 1 0.2973 0.8703 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1348885 4 0.2921 0.5034 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1325826 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.4103 0.7411 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1345692 2 0.3528 0.6929 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1401040 3 0.4040 0.5005 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1097954 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.5000 -0.1068 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1454073 3 0.4866 0.5543 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1355747 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1429368 3 0.1209 0.7166 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1398138 2 0.4304 0.4944 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1379260 1 0.2921 0.8720 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1361436 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR817142 3 0.3942 0.7305 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1315291 4 0.0592 0.6264 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1309314 4 0.0592 0.6264 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1420085 2 0.4994 -0.2907 0.000 0.520 0.480 0.000
#> SRR1361308 3 0.2773 0.6336 0.000 0.004 0.880 0.116
#> SRR1472126 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.6147 0.7074 0.000 0.224 0.664 0.112
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 3 0.6473 0.6133 0.000 0.108 0.612 0.280
#> SRR1339276 1 0.0188 0.8918 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418368 1 0.0592 0.8922 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1399353 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1096760 3 0.3444 0.7508 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1440290 3 0.3873 0.7351 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1330813 3 0.4072 0.7228 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1458931 2 0.0336 0.9004 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR812294 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1394321 1 0.2530 0.8811 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.2921 0.7770 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1349342 1 0.0707 0.8922 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.4999 -0.3469 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1486139 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1470313 1 0.3074 0.8656 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1447893 3 0.1867 0.7389 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1466025 3 0.6525 0.6063 0.000 0.116 0.612 0.272
#> SRR1477429 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1445701 3 0.2814 0.7551 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 3 0.4830 0.5854 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 3 0.4933 0.5129 0.000 0.432 0.568 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.3356 0.8446 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1355769 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 3 0.5851 0.7029 0.000 0.236 0.680 0.084
#> SRR1474485 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1089998 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0592 0.8920 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1319262 3 0.2704 0.7545 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1095188 3 0.4661 0.6464 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1105417 1 0.2973 0.8705 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1325578 3 0.5184 0.7431 0.000 0.212 0.732 0.056
#> SRR1358161 3 0.2921 0.6325 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 3 0.6862 0.6467 0.000 0.228 0.596 0.176
#> SRR1452010 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 3 0.3311 0.7546 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.2647 0.8789 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1090837 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1447828 3 0.1890 0.6786 0.000 0.008 0.936 0.056
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.1389 0.7255 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 3 0.4961 0.4683 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1441443 2 0.2345 0.8152 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1370682 3 0.4164 0.4764 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1475448 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1082592 3 0.5090 0.6499 0.000 0.324 0.660 0.016
#> SRR1325794 3 0.4804 0.5871 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR1095961 3 0.1557 0.7304 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1086702 2 0.2345 0.8215 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1320806 3 0.3975 0.7354 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1457527 3 0.3123 0.6140 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1488858 4 0.4977 0.0480 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1454695 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1090241 2 0.4454 0.4187 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1329863 2 0.4746 0.1440 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1357733 1 0.2149 0.8857 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1362135 1 0.2760 0.8765 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1379581 3 0.4500 0.4297 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1309182 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1084742 3 0.6637 0.6406 0.000 0.144 0.616 0.240
#> SRR1433538 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.2868 0.7758 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1454247 3 0.6450 0.6170 0.000 0.108 0.616 0.276
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.4008 0.7264 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1072388 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1070332 3 0.5345 0.5014 0.000 0.428 0.560 0.012
#> SRR1320761 3 0.5038 0.6823 0.000 0.296 0.684 0.020
#> SRR1076195 4 0.4948 0.1241 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1069895 3 0.3649 0.7455 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1099144 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1385150 3 0.1209 0.7164 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1102583 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1340574 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 3 0.4193 0.7131 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.4989 0.3915 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1408553 1 0.4790 0.4834 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1069231 1 0.2973 0.8703 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.2281 0.8844 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1321942 1 0.1211 0.8912 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1094380 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.4948 -0.1988 0.000 0.560 0.440 0.000
#> SRR1099330 3 0.4431 0.6866 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR1077874 3 0.4955 0.4778 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.6476 0.6196 0.000 0.112 0.616 0.272
#> SRR1481238 3 0.4855 0.5711 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1443568 3 0.3726 0.7448 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1380249 1 0.3311 0.8485 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1080143 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.4454 0.6479 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1357042 1 0.1557 0.8897 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 3 0.4992 0.4111 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0469 0.8921 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.0592 0.6264 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR807679 1 0.2868 0.8736 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1333811 3 0.2216 0.7471 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1078660 3 0.4877 0.5446 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1432542 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1418041 1 0.0188 0.8918 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085211 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1339812 2 0.0336 0.8976 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1402437 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1350958 2 0.0921 0.8874 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1396822 3 0.3907 0.7329 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.2868 0.6241 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1488881 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1102973 1 0.2814 0.8751 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1071131 3 0.4222 0.7149 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1409171 2 0.0469 0.8956 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR809113 2 0.3726 0.6592 0.000 0.788 0.212 0.000
#> SRR1430045 2 0.2216 0.8278 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1441245 3 0.4955 0.4980 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1384091 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1431887 2 0.3486 0.7028 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1096525 1 0.4977 0.2349 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 3 0.6278 0.6927 0.000 0.228 0.652 0.120
#> SRR1369514 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1453299 3 0.1211 0.7220 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.5526 0.4643 0.000 0.020 0.564 0.416
#> SRR1091767 3 0.4992 0.4348 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR1354467 3 0.0921 0.7147 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1069074 3 0.4431 0.6862 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR1452399 3 0.5800 0.7284 0.000 0.164 0.708 0.128
#> SRR1437430 3 0.5050 0.7141 0.000 0.084 0.764 0.152
#> SRR1419736 3 0.4955 0.4215 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1313343 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1077619 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1083530 1 0.1557 0.8898 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1333633 3 0.3764 0.7579 0.000 0.172 0.816 0.012
#> SRR1354999 3 0.3942 0.7305 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 4 0.4134 0.3146 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1413182 1 0.4776 0.4937 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1464559 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1413075 3 0.6745 0.6485 0.000 0.176 0.612 0.212
#> SRR1487928 4 0.4933 0.1498 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1388997 2 0.3219 0.7263 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1092865 3 0.4500 0.6755 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1102729 1 0.0921 0.8921 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.2345 0.8152 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1376874 3 0.4164 0.4764 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1339903 1 0.1302 0.8908 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1346710 1 0.2760 0.8765 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.4730 0.6093 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1480941 4 0.3569 0.4318 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.1716 0.8521 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 3 0.4830 0.5864 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.1211 0.8770 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1355554 3 0.3873 0.7351 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0336 0.8995 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1474231 1 0.2589 0.8800 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1350545 1 0.0469 0.8920 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1091328 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR814447 4 0.4907 0.2058 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1455989 3 0.3569 0.7480 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1453680 3 0.4164 0.4764 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1470356 2 0.0188 0.9019 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1342977 2 0.1389 0.8752 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1444222 2 0.4454 0.3842 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.2773 0.6336 0.000 0.004 0.880 0.116
#> SRR821282 3 0.4304 0.4445 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1074602 3 0.4040 0.7247 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4804 0.5028 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 3 0.2868 0.7566 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.3024 0.8684 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1444598 4 0.2814 0.5104 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1091743 3 0.4040 0.7247 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR819637 1 0.2647 0.8789 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1083848 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.3569 0.7477 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1459785 3 0.1022 0.7177 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.8915 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 4 0.0592 0.6264 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR814657 1 0.2704 0.8783 0.876 0.000 0.000 0.124
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.2127 0.76792 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1402132 1 0.2889 0.62497 0.880 0.000 0.084 0.020 0.016
#> SRR1326059 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1409062 5 0.6362 0.41959 0.000 0.368 0.168 0.000 0.464
#> SRR809406 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1465313 5 0.5771 0.44175 0.000 0.316 0.112 0.000 0.572
#> SRR819559 1 0.4227 0.60056 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1387899 5 0.6368 -0.05452 0.000 0.164 0.400 0.000 0.436
#> SRR1442292 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.3210 0.95940 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1395635 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1326868 5 0.6362 0.05108 0.000 0.168 0.368 0.000 0.464
#> SRR1102320 4 0.3210 0.64281 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1469926 3 0.3999 0.66763 0.000 0.020 0.740 0.000 0.240
#> SRR1070036 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1098426 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1429748 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1363654 1 0.3932 0.80452 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1326317 5 0.6381 0.06474 0.000 0.172 0.364 0.000 0.464
#> SRR1378308 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1469769 5 0.6219 -0.18244 0.000 0.140 0.424 0.000 0.436
#> SRR1490761 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.3939 0.18593 0.048 0.072 0.048 0.000 0.832
#> SRR1402944 5 0.2424 0.21322 0.008 0.052 0.032 0.000 0.908
#> SRR1092818 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1093552 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 5 0.3612 0.43608 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1078368 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.3944 0.62412 0.000 0.788 0.052 0.000 0.160
#> SRR1466951 2 0.2605 0.72814 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1331879 5 0.4201 0.37833 0.000 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR1320034 3 0.2886 0.53169 0.008 0.000 0.844 0.000 0.148
#> SRR1068687 5 0.5854 0.39423 0.000 0.436 0.096 0.000 0.468
#> SRR1437491 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 4 0.4201 0.02766 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1329994 4 0.0609 0.88488 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1354203 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1077850 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.4219 0.36796 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1455214 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1092014 5 0.6327 0.41600 0.000 0.348 0.168 0.000 0.484
#> SRR1097857 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1473318 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1345974 3 0.4935 0.71170 0.000 0.040 0.616 0.000 0.344
#> SRR1338687 5 0.5737 0.35823 0.000 0.456 0.084 0.000 0.460
#> SRR1071207 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.4935 0.71170 0.000 0.040 0.616 0.000 0.344
#> SRR1418540 4 0.0510 0.88655 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1408788 5 0.6485 0.10594 0.000 0.196 0.344 0.000 0.460
#> SRR1359487 4 0.1285 0.86600 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1080648 4 0.0404 0.88896 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1414708 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1469080 5 0.4227 0.37154 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1365722 2 0.1121 0.83312 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1448118 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 5 0.6381 0.06489 0.000 0.172 0.364 0.000 0.464
#> SRR1475993 3 0.5341 0.64414 0.000 0.064 0.580 0.000 0.356
#> SRR1445387 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1077575 5 0.1948 0.18488 0.008 0.024 0.036 0.000 0.932
#> SRR1349300 1 0.3661 0.88808 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1374165 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1401146 2 0.4437 -0.14295 0.000 0.532 0.004 0.000 0.464
#> SRR1366124 4 0.1671 0.83134 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1391811 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1456674 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1088511 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.2813 0.73549 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1384431 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1072055 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1332141 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1085900 5 0.5880 0.42617 0.000 0.416 0.100 0.000 0.484
#> SRR1442173 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.3123 0.36867 0.004 0.184 0.000 0.000 0.812
#> SRR1344034 5 0.6072 -0.14556 0.000 0.124 0.392 0.000 0.484
#> SRR1080391 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 5 0.3999 0.42387 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR814219 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1102128 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1460211 2 0.0162 0.85560 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418346 5 0.0865 0.19985 0.004 0.024 0.000 0.000 0.972
#> SRR1070060 4 0.4305 -0.31991 0.488 0.000 0.000 0.512 0.000
#> SRR1487969 5 0.4262 0.34208 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1417851 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0290 0.85222 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1403199 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 5 0.1299 0.18814 0.008 0.020 0.012 0.000 0.960
#> SRR1102923 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.4227 0.36943 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1366605 2 0.2127 0.76792 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1396035 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2179 0.76788 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1436840 2 0.3534 0.51974 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1445573 2 0.0162 0.85560 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375394 5 0.6900 -0.05254 0.204 0.000 0.372 0.012 0.412
#> SRR1431735 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.2730 0.85014 0.056 0.000 0.044 0.892 0.008
#> SRR1446308 5 0.6247 -0.16293 0.000 0.144 0.420 0.000 0.436
#> SRR1437346 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1103143 2 0.0963 0.83730 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1086466 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 4 0.1671 0.84579 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1468914 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 5 0.2616 0.24183 0.000 0.076 0.036 0.000 0.888
#> SRR1486584 1 0.3752 0.86464 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR813536 4 0.1851 0.83296 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.3210 0.95944 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1341921 4 0.2966 0.71219 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3247 0.09909 0.008 0.016 0.136 0.000 0.840
#> SRR1079543 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2230 0.76716 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1076681 5 0.6684 0.28097 0.000 0.288 0.276 0.000 0.436
#> SRR1335314 4 0.4118 0.72022 0.160 0.000 0.040 0.788 0.012
#> SRR1400799 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1074578 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1312226 5 0.4227 0.36556 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1416207 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1447371 4 0.4341 0.04769 0.404 0.000 0.004 0.592 0.000
#> SRR1069328 4 0.1341 0.85775 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1445023 4 0.1205 0.86368 0.040 0.000 0.004 0.956 0.000
#> SRR1077599 5 0.6367 0.04008 0.000 0.168 0.372 0.000 0.460
#> SRR1453480 2 0.4307 -0.20799 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1101834 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 5 0.5929 0.40241 0.000 0.432 0.104 0.000 0.464
#> SRR1458727 5 0.6792 -0.04643 0.204 0.000 0.356 0.008 0.432
#> SRR1436949 5 0.4227 0.36556 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1070429 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1458158 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1432408 4 0.4673 0.68751 0.172 0.000 0.060 0.752 0.016
#> SRR1310334 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1418201 3 0.2516 0.58132 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1385434 4 0.1043 0.86448 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1415591 3 0.4950 0.70730 0.000 0.040 0.612 0.000 0.348
#> SRR1402009 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1316055 4 0.0880 0.87111 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1308734 3 0.5364 0.62885 0.000 0.064 0.572 0.000 0.364
#> SRR1498973 5 0.4210 0.37331 0.000 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1397115 1 0.3816 0.84538 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1392141 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.4291 -0.11670 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1313601 5 0.6335 0.06794 0.000 0.168 0.352 0.000 0.480
#> SRR1459609 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.2966 0.55896 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR809919 4 0.3913 0.38433 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1370818 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 5 0.6352 0.01174 0.000 0.164 0.380 0.000 0.456
#> SRR1357297 4 0.4307 -0.34811 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000
#> SRR818170 5 0.6191 -0.05670 0.164 0.000 0.308 0.000 0.528
#> SRR1091230 5 0.6362 0.05108 0.000 0.168 0.368 0.000 0.464
#> SRR1470556 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1095285 3 0.4718 0.70865 0.000 0.028 0.628 0.000 0.344
#> SRR1317731 5 0.5814 0.26719 0.000 0.208 0.180 0.000 0.612
#> SRR1490785 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1432032 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1447808 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR809534 2 0.0404 0.84864 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1397312 5 0.4262 0.35021 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR812128 5 0.4249 0.35625 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1101513 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1415708 5 0.6585 0.30061 0.000 0.268 0.264 0.000 0.468
#> SRR1316033 3 0.4498 0.68871 0.000 0.032 0.688 0.000 0.280
#> SRR1390371 2 0.3636 0.50590 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1480263 2 0.3796 0.42878 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1464473 3 0.3496 0.64167 0.000 0.012 0.788 0.000 0.200
#> SRR1076801 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.1792 0.83791 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000
#> SRR1069871 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1095744 5 0.1153 0.19533 0.004 0.024 0.008 0.000 0.964
#> SRR1068929 2 0.1410 0.81627 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1490097 2 0.2329 0.76408 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1075054 5 0.4256 0.35231 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1083480 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1075458 4 0.0162 0.89188 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1417023 4 0.2377 0.77856 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1309333 2 0.2929 0.68675 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1333676 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1352996 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1093172 4 0.2291 0.85927 0.056 0.000 0.036 0.908 0.000
#> SRR1413137 4 0.2208 0.84546 0.072 0.000 0.020 0.908 0.000
#> SRR1469973 5 0.5459 0.33175 0.000 0.468 0.060 0.000 0.472
#> SRR1420026 2 0.2280 0.76088 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR817306 4 0.3039 0.69725 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1416266 4 0.3850 0.78634 0.128 0.000 0.044 0.816 0.012
#> SRR1071011 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 5 0.6342 0.03560 0.000 0.164 0.372 0.000 0.464
#> SRR1383192 4 0.1908 0.82969 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR1419962 3 0.2377 0.59121 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1094357 4 0.3336 0.63305 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000
#> SRR1081639 3 0.3689 0.48359 0.004 0.000 0.740 0.000 0.256
#> SRR1356016 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.3504 0.07434 0.016 0.008 0.160 0.000 0.816
#> SRR1312147 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1474930 5 0.6638 0.34695 0.000 0.328 0.236 0.000 0.436
#> SRR1470988 4 0.2740 0.84874 0.064 0.000 0.044 0.888 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.4278 -0.10180 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1313770 5 0.5411 -0.45193 0.012 0.036 0.412 0.000 0.540
#> SRR1315780 2 0.5406 -0.28286 0.000 0.476 0.056 0.000 0.468
#> SRR1073631 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR819124 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1310997 5 0.4030 0.41798 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1464494 5 0.3586 0.43257 0.000 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1357083 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1475842 2 0.0162 0.85566 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378085 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1378220 3 0.6186 0.25548 0.000 0.136 0.452 0.000 0.412
#> SRR1467704 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 5 0.6349 -0.03863 0.168 0.000 0.360 0.000 0.472
#> SRR1325826 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1466812 1 0.4900 0.36805 0.512 0.000 0.024 0.464 0.000
#> SRR1345692 2 0.4015 0.32507 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1401040 3 0.2629 0.54272 0.004 0.000 0.860 0.000 0.136
#> SRR1097954 1 0.3661 0.88750 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1374396 4 0.4484 0.68199 0.192 0.000 0.044 0.752 0.012
#> SRR1454073 5 0.5283 0.36371 0.000 0.444 0.048 0.000 0.508
#> SRR1355747 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.4890 0.71240 0.000 0.040 0.628 0.000 0.332
#> SRR1398138 2 0.4045 0.27597 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1379260 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR817142 5 0.6342 0.03560 0.000 0.164 0.372 0.000 0.464
#> SRR1315291 5 0.7532 -0.04959 0.208 0.000 0.332 0.052 0.408
#> SRR1309314 5 0.6915 -0.05161 0.208 0.000 0.368 0.012 0.412
#> SRR1420085 2 0.4304 -0.18590 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1361308 3 0.3205 0.63146 0.004 0.004 0.816 0.000 0.176
#> SRR1472126 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1380482 5 0.4491 0.46705 0.004 0.336 0.012 0.000 0.648
#> SRR1099789 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1079480 5 0.1280 0.19272 0.008 0.024 0.008 0.000 0.960
#> SRR1339276 1 0.3274 0.95226 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1418368 1 0.3707 0.87633 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1399353 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 5 0.6247 -0.15808 0.000 0.144 0.420 0.000 0.436
#> SRR1440290 5 0.6360 -0.01411 0.000 0.164 0.388 0.000 0.448
#> SRR1330813 5 0.6416 0.08825 0.000 0.180 0.356 0.000 0.464
#> SRR1458931 2 0.1121 0.83131 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR812294 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 4 0.2605 0.76370 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.2424 0.75275 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1349342 1 0.4297 0.45057 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.4283 -0.08119 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1390143 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1390413 2 0.0162 0.85626 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099570 3 0.4935 0.71170 0.000 0.040 0.616 0.000 0.344
#> SRR1312169 1 0.3305 0.94902 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1096687 4 0.0609 0.88439 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1486139 4 0.4533 -0.17717 0.448 0.000 0.008 0.544 0.000
#> SRR1470313 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 3 0.5713 0.44373 0.000 0.084 0.500 0.000 0.416
#> SRR1466025 5 0.3467 0.30049 0.004 0.128 0.036 0.000 0.832
#> SRR1477429 4 0.2966 0.70868 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1445701 5 0.6219 -0.18221 0.000 0.140 0.424 0.000 0.436
#> SRR820689 1 0.3636 0.89168 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1451876 5 0.5650 0.35832 0.000 0.456 0.076 0.000 0.468
#> SRR1452537 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4235 0.59054 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1489328 5 0.5551 0.37094 0.000 0.444 0.068 0.000 0.488
#> SRR1344462 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1082709 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1447784 4 0.0162 0.89061 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1355769 1 0.3796 0.85099 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1480917 5 0.4348 0.46337 0.000 0.316 0.016 0.000 0.668
#> SRR1474485 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1318140 1 0.4114 0.70980 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1319262 3 0.6192 0.18618 0.000 0.136 0.432 0.000 0.432
#> SRR1095188 5 0.5847 0.41431 0.000 0.424 0.096 0.000 0.480
#> SRR1454350 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1440374 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1359565 3 0.4935 0.71170 0.000 0.040 0.616 0.000 0.344
#> SRR1105417 4 0.1908 0.82964 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR1325578 5 0.5675 0.46098 0.000 0.352 0.092 0.000 0.556
#> SRR1358161 3 0.3821 0.63539 0.000 0.020 0.764 0.000 0.216
#> SRR1358665 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.3143 0.38812 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1452010 1 0.3274 0.95212 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1418183 5 0.6296 -0.11954 0.000 0.152 0.408 0.000 0.440
#> SRR1366345 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1387449 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1473461 4 0.2230 0.80594 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1090837 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1447828 3 0.4465 0.70039 0.000 0.024 0.672 0.000 0.304
#> SRR1338747 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4935 0.71170 0.000 0.040 0.616 0.000 0.344
#> SRR1350280 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1088557 1 0.3210 0.95942 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1102656 5 0.4249 0.35594 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1441443 2 0.2377 0.74925 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1370682 3 0.2763 0.53528 0.004 0.000 0.848 0.000 0.148
#> SRR1475448 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1407291 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1405266 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1363766 4 0.2471 0.78078 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1082592 5 0.4590 0.38180 0.000 0.420 0.012 0.000 0.568
#> SRR1325794 5 0.4273 0.33947 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1095961 3 0.5091 0.65841 0.000 0.044 0.584 0.000 0.372
#> SRR1086702 2 0.2471 0.74104 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1320806 5 0.6483 0.20419 0.000 0.216 0.300 0.000 0.484
#> SRR1457527 3 0.2674 0.58406 0.004 0.000 0.856 0.000 0.140
#> SRR1098831 2 0.0162 0.85566 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1474374 3 0.4921 0.71333 0.000 0.040 0.620 0.000 0.340
#> SRR1488858 4 0.3276 0.76116 0.132 0.000 0.032 0.836 0.000
#> SRR1454695 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.3395 0.55836 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1329863 2 0.4262 -0.03591 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1357733 4 0.3305 0.63053 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1362135 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1379581 3 0.4197 0.41881 0.028 0.000 0.728 0.000 0.244
#> SRR1309182 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1437668 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 5 0.1455 0.20120 0.008 0.032 0.008 0.000 0.952
#> SRR1433538 1 0.3837 0.84221 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1085063 2 0.3210 0.65028 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1454247 5 0.1372 0.19372 0.004 0.024 0.016 0.000 0.956
#> SRR1097100 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 5 0.6396 0.03191 0.000 0.172 0.376 0.000 0.452
#> SRR1072388 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 5 0.4227 0.36856 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1320761 5 0.4649 0.40848 0.000 0.404 0.016 0.000 0.580
#> SRR1076195 4 0.2583 0.77233 0.132 0.000 0.004 0.864 0.000
#> SRR1069895 5 0.6349 -0.10344 0.000 0.160 0.412 0.000 0.428
#> SRR1099144 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1420191 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.3612 0.89698 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1456971 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1444830 5 0.6515 0.16443 0.000 0.208 0.328 0.000 0.464
#> SRR1096267 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1087127 5 0.5947 -0.05676 0.156 0.004 0.236 0.000 0.604
#> SRR1408553 4 0.2580 0.84991 0.064 0.000 0.044 0.892 0.000
#> SRR1069231 4 0.0162 0.89188 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 4 0.0510 0.88700 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1321942 4 0.4278 -0.17597 0.452 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1094380 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1447499 2 0.5357 0.00645 0.000 0.588 0.068 0.000 0.344
#> SRR1099330 5 0.6146 0.44342 0.000 0.400 0.132 0.000 0.468
#> SRR1077874 5 0.4278 0.31886 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR808299 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.1280 0.19272 0.008 0.024 0.008 0.000 0.960
#> SRR1481238 5 0.5604 0.33372 0.000 0.456 0.072 0.000 0.472
#> SRR1443568 5 0.6453 -0.01563 0.000 0.180 0.388 0.000 0.432
#> SRR1380249 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1383148 4 0.0794 0.87378 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1357042 4 0.3109 0.67845 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0290 0.85540 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1078709 5 0.4307 0.22005 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR813283 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.3752 0.86511 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.6915 -0.05161 0.208 0.000 0.368 0.012 0.412
#> SRR807679 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.6066 0.29198 0.000 0.120 0.456 0.000 0.424
#> SRR1078660 5 0.4504 0.36981 0.000 0.428 0.008 0.000 0.564
#> SRR1331730 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.3561 0.90925 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1085211 4 0.4327 0.23148 0.360 0.000 0.008 0.632 0.000
#> SRR1339812 2 0.0290 0.85239 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1402437 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.1965 0.78369 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1396822 5 0.6373 -0.09525 0.000 0.164 0.412 0.000 0.424
#> SRR1441934 2 0.0162 0.85626 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472552 3 0.2719 0.59966 0.004 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR1488881 3 0.4987 0.71126 0.000 0.044 0.616 0.000 0.340
#> SRR1102973 4 0.3837 0.42540 0.308 0.000 0.000 0.692 0.000
#> SRR1071131 5 0.6660 0.28836 0.000 0.288 0.268 0.000 0.444
#> SRR1074502 1 0.3452 0.92682 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1325271 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0162 0.85626 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR809113 2 0.3612 0.52183 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1430045 2 0.2719 0.72315 0.000 0.852 0.004 0.000 0.144
#> SRR1441245 2 0.5459 -0.33585 0.000 0.472 0.060 0.000 0.468
#> SRR1384091 4 0.0162 0.89188 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1431887 2 0.2852 0.69778 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1096525 4 0.2992 0.84150 0.072 0.000 0.044 0.876 0.008
#> SRR1488491 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.4251 0.45237 0.000 0.316 0.012 0.000 0.672
#> SRR1369514 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.4935 0.71170 0.000 0.040 0.616 0.000 0.344
#> SRR1436300 1 0.3210 0.95944 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1348490 5 0.3459 0.08805 0.016 0.016 0.136 0.000 0.832
#> SRR1091767 2 0.5177 -0.29541 0.000 0.488 0.040 0.000 0.472
#> SRR1354467 3 0.5071 0.71279 0.004 0.040 0.616 0.000 0.340
#> SRR1069074 5 0.6315 0.42524 0.000 0.372 0.160 0.000 0.468
#> SRR1452399 5 0.5470 0.40603 0.000 0.252 0.112 0.000 0.636
#> SRR1437430 3 0.5857 0.34325 0.000 0.096 0.460 0.000 0.444
#> SRR1419736 5 0.3733 0.06846 0.028 0.008 0.156 0.000 0.808
#> SRR1313343 3 0.4935 0.71170 0.000 0.040 0.616 0.000 0.344
#> SRR1077619 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 4 0.1851 0.83499 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1333633 5 0.6445 0.36637 0.000 0.288 0.216 0.000 0.496
#> SRR1354999 5 0.6362 0.05108 0.000 0.168 0.368 0.000 0.464
#> SRR1443592 2 0.0162 0.85706 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077356 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1378818 5 0.6235 -0.04028 0.156 0.000 0.344 0.000 0.500
#> SRR1413182 4 0.0794 0.87378 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1464559 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 5 0.2891 0.36442 0.000 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1487928 4 0.3928 0.70573 0.176 0.000 0.028 0.788 0.008
#> SRR1388997 2 0.3928 0.43889 0.000 0.700 0.004 0.000 0.296
#> SRR1092865 5 0.6118 0.44166 0.000 0.404 0.128 0.000 0.468
#> SRR1102729 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1456423 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1321591 2 0.2127 0.76912 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1376874 3 0.2763 0.53528 0.004 0.000 0.848 0.000 0.148
#> SRR1339903 4 0.2471 0.78020 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1346710 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5337 0.37018 0.000 0.440 0.052 0.000 0.508
#> SRR1480941 5 0.6561 -0.05903 0.204 0.000 0.372 0.000 0.424
#> SRR1479175 2 0.0162 0.85626 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313891 2 0.0794 0.84205 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1491354 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1433884 5 0.5650 0.35776 0.000 0.456 0.076 0.000 0.468
#> SRR1471074 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.1270 0.82257 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1355554 5 0.6372 0.02858 0.000 0.168 0.376 0.000 0.456
#> SRR1487173 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1474253 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1322918 2 0.0963 0.83627 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1318331 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.4921 0.71333 0.000 0.040 0.620 0.000 0.340
#> SRR1474231 4 0.0290 0.89051 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1350545 4 0.3177 0.67214 0.208 0.000 0.000 0.792 0.000
#> SRR1091328 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814447 3 0.4817 0.33861 0.056 0.000 0.680 0.000 0.264
#> SRR1455989 5 0.6324 -0.10740 0.000 0.156 0.412 0.000 0.432
#> SRR1453680 3 0.2763 0.53528 0.004 0.000 0.848 0.000 0.148
#> SRR1470356 2 0.0162 0.85705 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1342977 2 0.1121 0.83438 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1444222 2 0.4608 0.23349 0.000 0.640 0.024 0.000 0.336
#> SRR1097197 1 0.3210 0.95939 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1366729 3 0.2629 0.60717 0.000 0.004 0.860 0.000 0.136
#> SRR821282 3 0.2763 0.53528 0.004 0.000 0.848 0.000 0.148
#> SRR1074602 5 0.6399 0.07781 0.000 0.176 0.360 0.000 0.464
#> SRR814633 2 0.0000 0.85864 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.5948 -0.20874 0.108 0.000 0.408 0.000 0.484
#> SRR1319100 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1324004 5 0.6219 -0.16846 0.000 0.140 0.420 0.000 0.440
#> SRR1457459 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1421031 4 0.0000 0.89288 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 5 0.6349 -0.03863 0.168 0.000 0.360 0.000 0.472
#> SRR1091743 5 0.6477 0.13492 0.000 0.196 0.340 0.000 0.464
#> SRR819637 4 0.1732 0.84163 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1083848 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1088934 5 0.6298 -0.12179 0.000 0.152 0.412 0.000 0.436
#> SRR1459785 3 0.4921 0.71333 0.000 0.040 0.620 0.000 0.340
#> SRR1083700 1 0.3424 0.93099 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1375531 1 0.3177 0.96254 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1323470 5 0.6900 -0.05254 0.204 0.000 0.372 0.012 0.412
#> SRR814657 4 0.4262 -0.11915 0.440 0.000 0.000 0.560 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.1812 0.83766 0.000 0.912 0.008 0.000 0.080 0.000
#> SRR1402132 1 0.4755 0.56767 0.600 0.000 0.024 0.016 0.004 0.356
#> SRR1326059 1 0.1261 0.87449 0.952 0.000 0.000 0.024 0.000 0.024
#> SRR1409062 5 0.5680 0.57421 0.000 0.252 0.220 0.000 0.528 0.000
#> SRR809406 1 0.1477 0.87248 0.940 0.000 0.008 0.004 0.000 0.048
#> SRR1465313 5 0.4276 0.59494 0.000 0.168 0.104 0.000 0.728 0.000
#> SRR819559 1 0.4854 0.65391 0.664 0.000 0.000 0.184 0.000 0.152
#> SRR1387899 5 0.5224 0.27802 0.000 0.092 0.440 0.000 0.468 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.1075 0.87651 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1395635 4 0.2342 0.82494 0.004 0.000 0.020 0.888 0.000 0.088
#> SRR1343629 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1326868 5 0.5213 0.32363 0.000 0.092 0.420 0.000 0.488 0.000
#> SRR1102320 4 0.4145 0.64398 0.252 0.000 0.000 0.700 0.000 0.048
#> SRR1469926 3 0.4459 0.52223 0.000 0.000 0.712 0.000 0.132 0.156
#> SRR1070036 4 0.1956 0.83016 0.008 0.000 0.004 0.908 0.000 0.080
#> SRR1098426 4 0.1444 0.83498 0.000 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1090310 3 0.3245 0.69995 0.000 0.008 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR1429748 1 0.0146 0.87634 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.3368 0.81812 0.824 0.000 0.004 0.084 0.000 0.088
#> SRR1326317 5 0.5255 0.30941 0.000 0.096 0.428 0.000 0.476 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2300 0.83698 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1329947 1 0.1010 0.87436 0.960 0.000 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR1469769 5 0.5112 0.22922 0.000 0.080 0.444 0.000 0.476 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.3431 0.42136 0.000 0.052 0.060 0.000 0.840 0.048
#> SRR1402944 5 0.3181 0.40850 0.000 0.044 0.052 0.000 0.856 0.048
#> SRR1092818 4 0.2349 0.82205 0.008 0.000 0.020 0.892 0.000 0.080
#> SRR1093552 4 0.1663 0.84603 0.000 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1464880 5 0.2513 0.55590 0.000 0.140 0.000 0.000 0.852 0.008
#> SRR1078368 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.3815 0.63506 0.000 0.776 0.092 0.000 0.132 0.000
#> SRR1466951 2 0.1970 0.82648 0.000 0.900 0.008 0.000 0.092 0.000
#> SRR1331879 5 0.3266 0.60955 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1320034 3 0.4638 0.23431 0.000 0.000 0.672 0.000 0.096 0.232
#> SRR1068687 5 0.5506 0.58899 0.000 0.264 0.180 0.000 0.556 0.000
#> SRR1437491 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1310777 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 4 0.4978 0.25679 0.396 0.000 0.000 0.532 0.000 0.072
#> SRR1329994 4 0.2488 0.84640 0.044 0.000 0.000 0.880 0.000 0.076
#> SRR1354203 1 0.1003 0.87479 0.964 0.000 0.016 0.000 0.000 0.020
#> SRR1077850 1 0.1285 0.87018 0.944 0.000 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1369241 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.3288 0.60855 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1455214 1 0.1753 0.86441 0.912 0.000 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1092014 5 0.5522 0.54268 0.000 0.188 0.256 0.000 0.556 0.000
#> SRR1097857 1 0.1531 0.86988 0.928 0.000 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR1473318 1 0.1010 0.87436 0.960 0.000 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR1345974 3 0.3373 0.69276 0.000 0.008 0.744 0.000 0.248 0.000
#> SRR1338687 5 0.5737 0.57153 0.000 0.304 0.196 0.000 0.500 0.000
#> SRR1071207 4 0.0632 0.84898 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1486821 3 0.3560 0.69069 0.000 0.008 0.732 0.000 0.256 0.004
#> SRR1418540 4 0.1007 0.85158 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1408788 5 0.5418 0.41017 0.000 0.124 0.368 0.000 0.508 0.000
#> SRR1359487 4 0.2883 0.81501 0.000 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1080648 4 0.2170 0.82609 0.012 0.000 0.000 0.888 0.000 0.100
#> SRR1414708 4 0.1524 0.83849 0.008 0.000 0.000 0.932 0.000 0.060
#> SRR1469080 5 0.3468 0.60996 0.000 0.264 0.000 0.000 0.728 0.008
#> SRR1365722 2 0.0547 0.89754 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.2378 0.83446 0.000 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1321829 5 0.5233 0.35221 0.000 0.096 0.404 0.000 0.500 0.000
#> SRR1475993 3 0.4252 0.39895 0.000 0.024 0.604 0.000 0.372 0.000
#> SRR1445387 1 0.0862 0.87680 0.972 0.000 0.008 0.004 0.000 0.016
#> SRR1077575 5 0.2380 0.26333 0.000 0.004 0.036 0.000 0.892 0.068
#> SRR1349300 1 0.2250 0.83805 0.888 0.000 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR1374165 4 0.0713 0.84704 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1453769 2 0.0146 0.90616 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473870 1 0.0551 0.87709 0.984 0.000 0.004 0.004 0.000 0.008
#> SRR1401146 5 0.4453 0.41184 0.000 0.444 0.028 0.000 0.528 0.000
#> SRR1366124 4 0.2454 0.83202 0.000 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1391811 1 0.1934 0.86292 0.916 0.000 0.040 0.000 0.000 0.044
#> SRR1456674 4 0.1327 0.83946 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1086490 3 0.3133 0.70583 0.000 0.008 0.780 0.000 0.212 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 4 0.5648 0.54411 0.240 0.000 0.000 0.536 0.000 0.224
#> SRR1384431 1 0.3098 0.81793 0.812 0.000 0.000 0.024 0.000 0.164
#> SRR1072055 4 0.1444 0.83498 0.000 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1359738 3 0.3271 0.69649 0.000 0.008 0.760 0.000 0.232 0.000
#> SRR1332141 1 0.3166 0.82395 0.816 0.000 0.024 0.004 0.000 0.156
#> SRR1085900 5 0.5428 0.59416 0.000 0.264 0.168 0.000 0.568 0.000
#> SRR1442173 1 0.1007 0.87741 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1431625 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.2847 0.52266 0.000 0.120 0.016 0.000 0.852 0.012
#> SRR1344034 5 0.4957 0.30866 0.000 0.072 0.384 0.000 0.544 0.000
#> SRR1080391 4 0.2562 0.82948 0.000 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1347870 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 5 0.3198 0.57188 0.000 0.188 0.008 0.000 0.796 0.008
#> SRR814219 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.1010 0.87785 0.960 0.000 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR1102128 1 0.0405 0.87652 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1460211 2 0.0632 0.89728 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1418346 5 0.1138 0.39567 0.000 0.004 0.024 0.000 0.960 0.012
#> SRR1070060 1 0.4887 0.48141 0.612 0.000 0.000 0.300 0.000 0.088
#> SRR1487969 5 0.3804 0.56702 0.000 0.336 0.008 0.000 0.656 0.000
#> SRR1417851 4 0.0458 0.84863 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1443350 2 0.0146 0.90478 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403199 4 0.1349 0.84176 0.004 0.000 0.000 0.940 0.000 0.056
#> SRR1076705 4 0.1444 0.83498 0.000 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1079380 5 0.2027 0.37010 0.000 0.016 0.032 0.000 0.920 0.032
#> SRR1102923 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.3674 0.61434 0.000 0.268 0.016 0.000 0.716 0.000
#> SRR1366605 2 0.2006 0.81970 0.000 0.892 0.004 0.000 0.104 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2165 0.81454 0.000 0.884 0.008 0.000 0.108 0.000
#> SRR1436840 2 0.4357 0.21977 0.000 0.624 0.036 0.000 0.340 0.000
#> SRR1445573 2 0.0458 0.89958 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1375394 6 0.5331 0.91319 0.000 0.000 0.152 0.000 0.268 0.580
#> SRR1431735 4 0.1444 0.84852 0.000 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1417387 4 0.1588 0.83917 0.000 0.000 0.004 0.924 0.000 0.072
#> SRR1445984 4 0.1584 0.83518 0.000 0.000 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR1370447 4 0.3351 0.77730 0.000 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1446308 5 0.5151 0.25676 0.000 0.084 0.444 0.000 0.472 0.000
#> SRR1437346 3 0.3575 0.63151 0.000 0.008 0.708 0.000 0.284 0.000
#> SRR1103143 2 0.0260 0.90363 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 4 0.0891 0.84904 0.008 0.000 0.000 0.968 0.000 0.024
#> SRR1073191 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 4 0.4373 0.73514 0.096 0.000 0.016 0.748 0.000 0.140
#> SRR1468914 4 0.2454 0.83308 0.000 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1319584 5 0.2917 0.40681 0.000 0.048 0.040 0.000 0.872 0.040
#> SRR1486584 1 0.3054 0.82848 0.848 0.000 0.004 0.076 0.000 0.072
#> SRR813536 4 0.4228 0.77450 0.064 0.000 0.000 0.708 0.000 0.228
#> SRR1317939 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.1461 0.87167 0.940 0.000 0.016 0.000 0.000 0.044
#> SRR1341921 4 0.4669 0.72358 0.164 0.000 0.000 0.688 0.000 0.148
#> SRR1399178 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1328551 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3644 -0.07885 0.000 0.000 0.088 0.000 0.792 0.120
#> SRR1079543 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2165 0.81337 0.000 0.884 0.008 0.000 0.108 0.000
#> SRR1076681 5 0.5565 0.45803 0.000 0.152 0.340 0.000 0.508 0.000
#> SRR1335314 4 0.2883 0.81440 0.000 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1400799 3 0.3245 0.69995 0.000 0.008 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR1074578 1 0.2066 0.86362 0.904 0.000 0.000 0.024 0.000 0.072
#> SRR1312226 5 0.3351 0.60453 0.000 0.288 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR1416207 1 0.1010 0.87430 0.960 0.000 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR1447371 1 0.6293 0.20727 0.424 0.000 0.012 0.312 0.000 0.252
#> SRR1069328 4 0.3125 0.82705 0.084 0.000 0.000 0.836 0.000 0.080
#> SRR1445023 4 0.2527 0.83035 0.000 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1077599 5 0.5221 0.29888 0.000 0.092 0.432 0.000 0.476 0.000
#> SRR1453480 5 0.4211 0.31667 0.000 0.456 0.004 0.000 0.532 0.008
#> SRR1101834 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 4 0.1983 0.83022 0.000 0.000 0.020 0.908 0.000 0.072
#> SRR1074839 5 0.5764 0.56069 0.000 0.264 0.228 0.000 0.508 0.000
#> SRR1458727 6 0.5410 0.91503 0.000 0.000 0.156 0.000 0.280 0.564
#> SRR1436949 5 0.3288 0.60902 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1070429 3 0.3245 0.69995 0.000 0.008 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR1458158 1 0.0922 0.87630 0.968 0.000 0.004 0.004 0.000 0.024
#> SRR1432408 4 0.3109 0.80547 0.000 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR1310334 1 0.0914 0.87759 0.968 0.000 0.016 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418201 3 0.4032 0.39376 0.000 0.000 0.740 0.000 0.068 0.192
#> SRR1385434 4 0.2454 0.83202 0.000 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1415591 3 0.3555 0.63394 0.000 0.008 0.712 0.000 0.280 0.000
#> SRR1402009 1 0.1644 0.86806 0.920 0.000 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1316055 4 0.2219 0.84009 0.000 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1308734 3 0.3974 0.60309 0.000 0.024 0.680 0.000 0.296 0.000
#> SRR1498973 5 0.3288 0.60902 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1397115 1 0.4233 0.59211 0.684 0.000 0.000 0.268 0.000 0.048
#> SRR1392141 4 0.1075 0.84136 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR814341 5 0.4067 0.41616 0.000 0.444 0.008 0.000 0.548 0.000
#> SRR1313601 5 0.5212 0.40031 0.000 0.100 0.368 0.000 0.532 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.4884 0.26008 0.000 0.000 0.652 0.000 0.128 0.220
#> SRR809919 4 0.4915 0.60902 0.260 0.000 0.000 0.632 0.000 0.108
#> SRR1370818 4 0.0632 0.84788 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1323651 5 0.5223 0.28920 0.000 0.092 0.436 0.000 0.472 0.000
#> SRR1357297 1 0.4592 -0.02254 0.496 0.000 0.000 0.468 0.000 0.036
#> SRR818170 6 0.5637 0.84539 0.000 0.000 0.156 0.000 0.364 0.480
#> SRR1091230 5 0.5221 0.29888 0.000 0.092 0.432 0.000 0.476 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.1049 0.87367 0.960 0.000 0.008 0.000 0.000 0.032
#> SRR1095285 3 0.3337 0.68960 0.000 0.004 0.736 0.000 0.260 0.000
#> SRR1317731 5 0.4107 0.51696 0.000 0.092 0.148 0.000 0.756 0.004
#> SRR1490785 1 0.1674 0.87048 0.924 0.000 0.004 0.004 0.000 0.068
#> SRR1432032 4 0.1333 0.84414 0.008 0.000 0.000 0.944 0.000 0.048
#> SRR1447808 1 0.0692 0.87675 0.976 0.000 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR809534 2 0.0458 0.90067 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1397312 5 0.3855 0.61464 0.000 0.272 0.024 0.000 0.704 0.000
#> SRR812128 5 0.3266 0.61131 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1101513 1 0.1349 0.87079 0.940 0.000 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1415708 5 0.5658 0.49213 0.000 0.176 0.316 0.000 0.508 0.000
#> SRR1316033 3 0.3539 0.69302 0.000 0.008 0.768 0.000 0.208 0.016
#> SRR1390371 2 0.3012 0.67057 0.000 0.796 0.008 0.000 0.196 0.000
#> SRR1480263 2 0.3373 0.60224 0.000 0.744 0.008 0.000 0.248 0.000
#> SRR1464473 3 0.2795 0.64495 0.000 0.000 0.856 0.000 0.100 0.044
#> SRR1076801 4 0.1075 0.84136 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1080044 1 0.0767 0.87738 0.976 0.000 0.008 0.004 0.000 0.012
#> SRR1420850 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.3787 0.80129 0.100 0.000 0.000 0.780 0.000 0.120
#> SRR1069871 1 0.1320 0.87130 0.948 0.000 0.016 0.000 0.000 0.036
#> SRR1095744 5 0.1138 0.39567 0.000 0.004 0.024 0.000 0.960 0.012
#> SRR1068929 2 0.0713 0.89099 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1490097 2 0.2302 0.80426 0.000 0.872 0.008 0.000 0.120 0.000
#> SRR1075054 5 0.3351 0.60343 0.000 0.288 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR1083480 1 0.1320 0.87170 0.948 0.000 0.016 0.000 0.000 0.036
#> SRR1075458 4 0.1863 0.84726 0.000 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1417023 4 0.2491 0.83107 0.000 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1309333 2 0.3189 0.60670 0.000 0.760 0.004 0.000 0.236 0.000
#> SRR1333676 1 0.0858 0.87558 0.968 0.000 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1352996 1 0.1369 0.87616 0.952 0.000 0.016 0.016 0.000 0.016
#> SRR1093172 4 0.3555 0.77929 0.008 0.000 0.000 0.712 0.000 0.280
#> SRR1413137 4 0.3956 0.78042 0.036 0.000 0.000 0.712 0.000 0.252
#> SRR1469973 5 0.5286 0.59791 0.000 0.296 0.132 0.000 0.572 0.000
#> SRR1420026 2 0.2212 0.80840 0.000 0.880 0.008 0.000 0.112 0.000
#> SRR817306 4 0.4428 0.68473 0.220 0.000 0.000 0.696 0.000 0.084
#> SRR1416266 4 0.3584 0.76001 0.004 0.000 0.000 0.688 0.000 0.308
#> SRR1071011 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2300 0.83788 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1435394 5 0.5213 0.32257 0.000 0.092 0.420 0.000 0.488 0.000
#> SRR1383192 4 0.4871 0.72153 0.144 0.000 0.000 0.660 0.000 0.196
#> SRR1419962 3 0.3167 0.55876 0.000 0.000 0.832 0.000 0.072 0.096
#> SRR1094357 4 0.4675 0.67443 0.224 0.000 0.000 0.672 0.000 0.104
#> SRR1081639 3 0.5176 0.12497 0.000 0.000 0.608 0.000 0.144 0.248
#> SRR1356016 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.4383 -0.30798 0.000 0.000 0.108 0.000 0.716 0.176
#> SRR1312147 4 0.1075 0.84136 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1473891 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.2830 0.83147 0.836 0.000 0.000 0.020 0.000 0.144
#> SRR1474930 5 0.5669 0.48413 0.000 0.176 0.320 0.000 0.504 0.000
#> SRR1470988 4 0.3758 0.77139 0.016 0.000 0.000 0.700 0.000 0.284
#> SRR811915 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0713 0.87545 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1100005 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.4405 0.34311 0.000 0.472 0.024 0.000 0.504 0.000
#> SRR1313770 5 0.5628 -0.32679 0.000 0.008 0.400 0.000 0.476 0.116
#> SRR1315780 5 0.5138 0.60381 0.000 0.276 0.124 0.000 0.600 0.000
#> SRR1073631 1 0.1168 0.87387 0.956 0.000 0.016 0.000 0.000 0.028
#> SRR819124 1 0.2446 0.84507 0.864 0.000 0.000 0.012 0.000 0.124
#> SRR1310997 5 0.3213 0.58741 0.000 0.204 0.004 0.000 0.784 0.008
#> SRR1464494 5 0.3128 0.56076 0.000 0.168 0.008 0.000 0.812 0.012
#> SRR1357083 3 0.3271 0.69649 0.000 0.008 0.760 0.000 0.232 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 4 0.1049 0.84536 0.008 0.000 0.000 0.960 0.000 0.032
#> SRR1378220 3 0.5077 0.05015 0.000 0.080 0.516 0.000 0.404 0.000
#> SRR1467704 4 0.2126 0.82801 0.004 0.000 0.020 0.904 0.000 0.072
#> SRR1348885 6 0.5520 0.90955 0.000 0.000 0.156 0.000 0.312 0.532
#> SRR1325826 1 0.1297 0.87199 0.948 0.000 0.012 0.000 0.000 0.040
#> SRR1466812 1 0.5509 0.49086 0.540 0.000 0.000 0.160 0.000 0.300
#> SRR1345692 2 0.4109 0.03895 0.000 0.576 0.012 0.000 0.412 0.000
#> SRR1401040 3 0.4376 0.30425 0.000 0.000 0.704 0.000 0.084 0.212
#> SRR1097954 1 0.3092 0.83130 0.836 0.000 0.000 0.060 0.000 0.104
#> SRR1374396 4 0.3175 0.79077 0.000 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1454073 5 0.5085 0.60824 0.000 0.272 0.120 0.000 0.608 0.000
#> SRR1355747 4 0.0713 0.84795 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1429368 3 0.3438 0.70272 0.000 0.008 0.764 0.000 0.220 0.008
#> SRR1398138 2 0.4550 -0.10523 0.000 0.544 0.036 0.000 0.420 0.000
#> SRR1379260 4 0.2320 0.82113 0.004 0.000 0.024 0.892 0.000 0.080
#> SRR1361436 3 0.3245 0.69995 0.000 0.008 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR817142 5 0.5223 0.28920 0.000 0.092 0.436 0.000 0.472 0.000
#> SRR1315291 6 0.6561 0.78158 0.000 0.000 0.116 0.104 0.260 0.520
#> SRR1309314 6 0.5301 0.91188 0.000 0.000 0.148 0.000 0.268 0.584
#> SRR1420085 5 0.4089 0.34381 0.000 0.468 0.008 0.000 0.524 0.000
#> SRR1361308 3 0.2361 0.64994 0.000 0.000 0.884 0.000 0.088 0.028
#> SRR1472126 1 0.0777 0.87704 0.972 0.000 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1380482 5 0.3641 0.60906 0.000 0.224 0.028 0.000 0.748 0.000
#> SRR1099789 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1079480 5 0.1405 0.37613 0.000 0.004 0.024 0.000 0.948 0.024
#> SRR1339276 1 0.1812 0.86496 0.912 0.000 0.000 0.008 0.000 0.080
#> SRR1418368 1 0.2433 0.84475 0.884 0.000 0.000 0.072 0.000 0.044
#> SRR1399353 4 0.1814 0.84599 0.000 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1096760 5 0.5110 0.26853 0.000 0.080 0.440 0.000 0.480 0.000
#> SRR1440290 5 0.5223 0.28920 0.000 0.092 0.436 0.000 0.472 0.000
#> SRR1330813 5 0.5290 0.37623 0.000 0.104 0.392 0.000 0.504 0.000
#> SRR1458931 2 0.0713 0.89231 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR812294 4 0.2300 0.83718 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1394321 4 0.5101 0.72739 0.104 0.000 0.024 0.672 0.000 0.200
#> SRR1081160 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.2006 0.82841 0.000 0.892 0.004 0.000 0.104 0.000
#> SRR1349342 1 0.5364 0.58725 0.624 0.000 0.012 0.216 0.000 0.148
#> SRR1477173 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.3950 0.07717 0.000 0.564 0.004 0.000 0.432 0.000
#> SRR1390143 1 0.2790 0.83371 0.840 0.000 0.000 0.020 0.000 0.140
#> SRR1390413 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3103 0.70662 0.000 0.008 0.784 0.000 0.208 0.000
#> SRR1312169 1 0.2680 0.84705 0.868 0.000 0.000 0.076 0.000 0.056
#> SRR1096687 4 0.2442 0.84151 0.004 0.000 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR1486139 1 0.5867 0.36000 0.480 0.000 0.000 0.280 0.000 0.240
#> SRR1470313 4 0.2003 0.84234 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1447893 3 0.4660 0.30958 0.000 0.056 0.600 0.000 0.344 0.000
#> SRR1466025 5 0.3044 0.38748 0.000 0.052 0.048 0.000 0.864 0.036
#> SRR1477429 4 0.5260 0.61846 0.224 0.000 0.000 0.604 0.000 0.172
#> SRR1445701 3 0.5114 -0.16129 0.000 0.080 0.468 0.000 0.452 0.000
#> SRR820689 1 0.3468 0.78232 0.804 0.000 0.000 0.128 0.000 0.068
#> SRR1451876 5 0.5522 0.58691 0.000 0.288 0.168 0.000 0.544 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.5309 0.13899 0.488 0.000 0.000 0.408 0.000 0.104
#> SRR1489328 5 0.5138 0.60649 0.000 0.276 0.124 0.000 0.600 0.000
#> SRR1344462 1 0.0858 0.87488 0.968 0.000 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR1082709 1 0.0508 0.87619 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1447784 4 0.2454 0.83202 0.000 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1355769 1 0.3872 0.59955 0.712 0.000 0.004 0.264 0.000 0.020
#> SRR1488237 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1151 0.87278 0.956 0.000 0.012 0.000 0.000 0.032
#> SRR1480917 5 0.3440 0.59800 0.000 0.196 0.028 0.000 0.776 0.000
#> SRR1474485 4 0.2092 0.84484 0.000 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1089998 1 0.1732 0.86972 0.920 0.000 0.004 0.004 0.000 0.072
#> SRR1318140 1 0.4565 0.71588 0.716 0.000 0.008 0.168 0.000 0.108
#> SRR1319262 3 0.5102 -0.11328 0.000 0.080 0.492 0.000 0.428 0.000
#> SRR1095188 5 0.5515 0.58780 0.000 0.260 0.184 0.000 0.556 0.000
#> SRR1454350 1 0.1865 0.86436 0.920 0.000 0.040 0.000 0.000 0.040
#> SRR1440374 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1359565 3 0.3245 0.69995 0.000 0.008 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR1105417 4 0.4176 0.77944 0.068 0.000 0.000 0.720 0.000 0.212
#> SRR1325578 5 0.4396 0.61256 0.000 0.208 0.088 0.000 0.704 0.000
#> SRR1358161 3 0.4392 0.54200 0.000 0.000 0.720 0.000 0.144 0.136
#> SRR1358665 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.2402 0.49740 0.000 0.084 0.020 0.000 0.888 0.008
#> SRR1452010 1 0.1418 0.87415 0.944 0.000 0.000 0.024 0.000 0.032
#> SRR1418183 5 0.5145 0.28887 0.000 0.084 0.432 0.000 0.484 0.000
#> SRR1366345 1 0.1644 0.86822 0.932 0.000 0.028 0.000 0.000 0.040
#> SRR1387449 1 0.1088 0.87371 0.960 0.000 0.016 0.000 0.000 0.024
#> SRR1473461 4 0.5031 0.70995 0.088 0.000 0.024 0.672 0.000 0.216
#> SRR1090837 3 0.3217 0.70215 0.000 0.008 0.768 0.000 0.224 0.000
#> SRR1447828 3 0.2768 0.69672 0.000 0.000 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1338747 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3595 0.64398 0.000 0.008 0.704 0.000 0.288 0.000
#> SRR1350280 1 0.1320 0.87379 0.948 0.000 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1088557 1 0.2176 0.86015 0.896 0.000 0.000 0.024 0.000 0.080
#> SRR1102656 5 0.3468 0.60772 0.000 0.284 0.004 0.000 0.712 0.000
#> SRR1441443 2 0.2212 0.80648 0.000 0.880 0.008 0.000 0.112 0.000
#> SRR1370682 3 0.4539 0.27287 0.000 0.000 0.688 0.000 0.096 0.216
#> SRR1475448 3 0.3133 0.70583 0.000 0.008 0.780 0.000 0.212 0.000
#> SRR1407291 1 0.0964 0.87725 0.968 0.000 0.016 0.004 0.000 0.012
#> SRR1405266 1 0.1398 0.87395 0.940 0.000 0.008 0.000 0.000 0.052
#> SRR1363766 4 0.4918 0.71732 0.160 0.000 0.000 0.656 0.000 0.184
#> SRR1082592 5 0.3541 0.61443 0.000 0.260 0.012 0.000 0.728 0.000
#> SRR1325794 5 0.3917 0.61227 0.000 0.284 0.024 0.000 0.692 0.000
#> SRR1095961 3 0.3922 0.57090 0.000 0.016 0.664 0.000 0.320 0.000
#> SRR1086702 2 0.2896 0.72760 0.000 0.824 0.016 0.000 0.160 0.000
#> SRR1320806 5 0.5255 0.43218 0.000 0.112 0.340 0.000 0.548 0.000
#> SRR1457527 3 0.3717 0.47055 0.000 0.000 0.780 0.000 0.072 0.148
#> SRR1098831 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.3073 0.70688 0.000 0.008 0.788 0.000 0.204 0.000
#> SRR1488858 4 0.2854 0.81649 0.000 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1454695 4 0.1204 0.84371 0.000 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1090241 2 0.4445 0.34572 0.000 0.656 0.056 0.000 0.288 0.000
#> SRR1329863 5 0.4095 0.31330 0.000 0.480 0.008 0.000 0.512 0.000
#> SRR1357733 4 0.6040 0.45605 0.248 0.000 0.024 0.540 0.000 0.188
#> SRR1362135 4 0.1584 0.83681 0.008 0.000 0.000 0.928 0.000 0.064
#> SRR1379581 3 0.5246 0.00302 0.000 0.000 0.596 0.000 0.148 0.256
#> SRR1309182 1 0.0748 0.87679 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1437668 4 0.0547 0.84742 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1084742 5 0.1405 0.37613 0.000 0.004 0.024 0.000 0.948 0.024
#> SRR1433538 1 0.4113 0.62126 0.712 0.000 0.004 0.244 0.000 0.040
#> SRR1085063 2 0.2706 0.75170 0.000 0.832 0.008 0.000 0.160 0.000
#> SRR1454247 5 0.1218 0.38879 0.000 0.004 0.028 0.000 0.956 0.012
#> SRR1097100 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 5 0.5221 0.29888 0.000 0.092 0.432 0.000 0.476 0.000
#> SRR1072388 4 0.1267 0.83885 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1070332 5 0.3426 0.60936 0.000 0.276 0.000 0.000 0.720 0.004
#> SRR1320761 5 0.3998 0.61681 0.000 0.248 0.040 0.000 0.712 0.000
#> SRR1076195 4 0.2527 0.83079 0.000 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1069895 5 0.5147 0.28517 0.000 0.084 0.436 0.000 0.480 0.000
#> SRR1099144 4 0.1007 0.84920 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1385150 3 0.3271 0.69618 0.000 0.008 0.760 0.000 0.232 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1910 0.85085 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1102583 1 0.3412 0.79060 0.808 0.000 0.000 0.128 0.000 0.064
#> SRR1456971 4 0.1327 0.83728 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1340574 1 0.1794 0.86579 0.924 0.000 0.036 0.000 0.000 0.040
#> SRR1444830 5 0.5508 0.39068 0.000 0.132 0.388 0.000 0.480 0.000
#> SRR1096267 1 0.0632 0.87671 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1087127 5 0.5828 -0.74036 0.000 0.004 0.172 0.000 0.480 0.344
#> SRR1408553 4 0.3936 0.76352 0.024 0.000 0.000 0.688 0.000 0.288
#> SRR1069231 4 0.2300 0.84199 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1325642 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 4 0.1780 0.84351 0.028 0.000 0.000 0.924 0.000 0.048
#> SRR1321942 1 0.5866 0.41961 0.532 0.000 0.012 0.280 0.000 0.176
#> SRR1094380 1 0.2613 0.83762 0.848 0.000 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR1447499 2 0.5725 -0.49228 0.000 0.420 0.164 0.000 0.416 0.000
#> SRR1099330 5 0.5703 0.55529 0.000 0.232 0.244 0.000 0.524 0.000
#> SRR1077874 5 0.3867 0.57948 0.000 0.328 0.012 0.000 0.660 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.1405 0.37626 0.000 0.004 0.024 0.000 0.948 0.024
#> SRR1481238 5 0.4933 0.50470 0.000 0.396 0.068 0.000 0.536 0.000
#> SRR1443568 5 0.5223 0.35013 0.000 0.096 0.396 0.000 0.508 0.000
#> SRR1380249 4 0.2491 0.83248 0.000 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1080143 1 0.0767 0.87721 0.976 0.000 0.008 0.004 0.000 0.012
#> SRR1383148 4 0.2562 0.82933 0.000 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1357042 4 0.4127 0.60561 0.284 0.000 0.004 0.684 0.000 0.028
#> SRR1416025 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.1007 0.88099 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1078709 5 0.4084 0.50050 0.000 0.400 0.012 0.000 0.588 0.000
#> SRR813283 1 0.2006 0.86163 0.904 0.000 0.000 0.016 0.000 0.080
#> SRR1430226 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.3548 0.80449 0.796 0.000 0.000 0.068 0.000 0.136
#> SRR1466927 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 6 0.5361 0.91342 0.000 0.000 0.156 0.000 0.268 0.576
#> SRR807679 4 0.1950 0.83880 0.000 0.000 0.024 0.912 0.000 0.064
#> SRR1333811 3 0.5045 0.05379 0.000 0.076 0.512 0.000 0.412 0.000
#> SRR1078660 5 0.3405 0.61232 0.000 0.272 0.004 0.000 0.724 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 4 0.1152 0.84850 0.004 0.000 0.000 0.952 0.000 0.044
#> SRR1432542 4 0.1267 0.83907 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1418041 1 0.3241 0.82594 0.824 0.000 0.000 0.064 0.000 0.112
#> SRR1085211 1 0.6573 0.08293 0.376 0.000 0.024 0.324 0.000 0.276
#> SRR1339812 2 0.0458 0.90067 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1402437 4 0.1327 0.83728 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1350958 2 0.1584 0.85353 0.000 0.928 0.008 0.000 0.064 0.000
#> SRR1396822 5 0.5223 0.28920 0.000 0.092 0.436 0.000 0.472 0.000
#> SRR1441934 2 0.0260 0.90414 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1472552 3 0.3020 0.56138 0.000 0.000 0.844 0.000 0.076 0.080
#> SRR1488881 3 0.3133 0.70583 0.000 0.008 0.780 0.000 0.212 0.000
#> SRR1102973 4 0.5693 0.19227 0.392 0.000 0.000 0.448 0.000 0.160
#> SRR1071131 5 0.5529 0.46023 0.000 0.148 0.336 0.000 0.516 0.000
#> SRR1074502 1 0.1448 0.87455 0.948 0.000 0.016 0.012 0.000 0.024
#> SRR1325271 4 0.0937 0.84332 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1409171 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.4124 0.29459 0.000 0.644 0.024 0.000 0.332 0.000
#> SRR1430045 2 0.3202 0.69153 0.000 0.800 0.024 0.000 0.176 0.000
#> SRR1441245 5 0.5404 0.58727 0.000 0.312 0.140 0.000 0.548 0.000
#> SRR1384091 4 0.2300 0.83902 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1431887 2 0.2871 0.70875 0.000 0.804 0.004 0.000 0.192 0.000
#> SRR1096525 4 0.3584 0.76001 0.004 0.000 0.000 0.688 0.000 0.308
#> SRR1488491 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.3385 0.57414 0.000 0.180 0.032 0.000 0.788 0.000
#> SRR1369514 4 0.1610 0.84886 0.000 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1453299 3 0.3271 0.69898 0.000 0.008 0.760 0.000 0.232 0.000
#> SRR1436300 1 0.1010 0.87436 0.960 0.000 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR1348490 5 0.3815 -0.12935 0.000 0.000 0.092 0.000 0.776 0.132
#> SRR1091767 5 0.5320 0.57166 0.000 0.352 0.116 0.000 0.532 0.000
#> SRR1354467 3 0.3012 0.70642 0.000 0.008 0.796 0.000 0.196 0.000
#> SRR1069074 5 0.5738 0.50119 0.000 0.192 0.312 0.000 0.496 0.000
#> SRR1452399 5 0.4788 0.54694 0.000 0.132 0.180 0.000 0.684 0.004
#> SRR1437430 5 0.5909 -0.01608 0.000 0.052 0.428 0.000 0.452 0.068
#> SRR1419736 5 0.4383 -0.30900 0.000 0.000 0.108 0.000 0.716 0.176
#> SRR1313343 3 0.3560 0.69106 0.000 0.008 0.732 0.000 0.256 0.004
#> SRR1077619 4 0.1141 0.84184 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1083530 4 0.4437 0.74359 0.088 0.000 0.012 0.732 0.000 0.168
#> SRR1333633 5 0.5108 0.56612 0.000 0.164 0.208 0.000 0.628 0.000
#> SRR1354999 5 0.5213 0.32363 0.000 0.092 0.420 0.000 0.488 0.000
#> SRR1443592 2 0.0713 0.89252 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1077356 1 0.1643 0.86633 0.924 0.000 0.000 0.008 0.000 0.068
#> SRR1378818 6 0.5696 0.86372 0.000 0.000 0.164 0.000 0.372 0.464
#> SRR1413182 4 0.2664 0.82584 0.000 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1464559 4 0.0790 0.84595 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1413075 5 0.2224 0.46963 0.000 0.064 0.020 0.000 0.904 0.012
#> SRR1487928 4 0.2730 0.82218 0.000 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1388997 2 0.3938 0.33882 0.000 0.660 0.016 0.000 0.324 0.000
#> SRR1092865 5 0.5798 0.54359 0.000 0.236 0.264 0.000 0.500 0.000
#> SRR1102729 1 0.2945 0.82467 0.824 0.000 0.000 0.020 0.000 0.156
#> SRR1456423 1 0.1245 0.87196 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1321591 2 0.1757 0.84290 0.000 0.916 0.008 0.000 0.076 0.000
#> SRR1376874 3 0.4539 0.27287 0.000 0.000 0.688 0.000 0.096 0.216
#> SRR1339903 4 0.4613 0.64832 0.260 0.000 0.000 0.660 0.000 0.080
#> SRR1346710 4 0.2833 0.80715 0.012 0.000 0.024 0.860 0.000 0.104
#> SRR1418771 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.5138 0.60738 0.000 0.268 0.128 0.000 0.604 0.000
#> SRR1480941 6 0.5563 0.90507 0.000 0.000 0.184 0.000 0.272 0.544
#> SRR1479175 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0363 0.90282 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1491354 1 0.0806 0.87562 0.972 0.000 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1433884 5 0.5496 0.58694 0.000 0.296 0.160 0.000 0.544 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2593 0.74998 0.000 0.844 0.008 0.000 0.148 0.000
#> SRR1355554 5 0.5223 0.28920 0.000 0.092 0.436 0.000 0.472 0.000
#> SRR1487173 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1474253 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1322918 2 0.0458 0.90058 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.3161 0.70536 0.000 0.008 0.776 0.000 0.216 0.000
#> SRR1474231 4 0.2972 0.80351 0.016 0.000 0.024 0.852 0.000 0.108
#> SRR1350545 4 0.4544 0.62905 0.256 0.000 0.000 0.668 0.000 0.076
#> SRR1091328 4 0.2290 0.82322 0.004 0.000 0.020 0.892 0.000 0.084
#> SRR814447 3 0.5492 -0.16747 0.000 0.000 0.536 0.000 0.152 0.312
#> SRR1455989 5 0.5128 0.31646 0.000 0.084 0.412 0.000 0.504 0.000
#> SRR1453680 3 0.4539 0.27287 0.000 0.000 0.688 0.000 0.096 0.216
#> SRR1470356 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.1970 0.83105 0.000 0.900 0.008 0.000 0.092 0.000
#> SRR1444222 2 0.5449 -0.38814 0.000 0.456 0.120 0.000 0.424 0.000
#> SRR1097197 1 0.2145 0.86187 0.900 0.000 0.000 0.028 0.000 0.072
#> SRR1366729 3 0.2554 0.62466 0.000 0.000 0.876 0.000 0.076 0.048
#> SRR821282 3 0.4614 0.24097 0.000 0.000 0.676 0.000 0.096 0.228
#> SRR1074602 5 0.5246 0.33330 0.000 0.096 0.416 0.000 0.488 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.90811 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 6 0.6184 0.57610 0.000 0.004 0.264 0.000 0.344 0.388
#> SRR1319100 1 0.0458 0.87807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1324004 5 0.5102 0.25705 0.000 0.080 0.428 0.000 0.492 0.000
#> SRR1457459 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1421031 4 0.2003 0.84418 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1444598 6 0.5492 0.91003 0.000 0.000 0.152 0.000 0.312 0.536
#> SRR1091743 5 0.5406 0.40274 0.000 0.120 0.380 0.000 0.500 0.000
#> SRR819637 4 0.4055 0.77251 0.064 0.000 0.024 0.780 0.000 0.132
#> SRR1083848 1 0.1245 0.87183 0.952 0.000 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1088934 5 0.5108 0.27878 0.000 0.080 0.436 0.000 0.484 0.000
#> SRR1459785 3 0.3536 0.69341 0.000 0.008 0.736 0.000 0.252 0.004
#> SRR1083700 1 0.4988 0.70587 0.688 0.000 0.024 0.104 0.000 0.184
#> SRR1375531 1 0.2402 0.84091 0.856 0.000 0.000 0.004 0.000 0.140
#> SRR1323470 6 0.5331 0.91319 0.000 0.000 0.152 0.000 0.268 0.580
#> SRR814657 1 0.5133 0.39120 0.580 0.000 0.000 0.312 0.000 0.108
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4911 0.509 0.509
#> 3 3 0.979 0.941 0.976 0.2332 0.876 0.759
#> 4 4 0.947 0.916 0.965 0.0837 0.934 0.835
#> 5 5 0.743 0.726 0.862 0.0653 0.963 0.897
#> 6 6 0.695 0.533 0.737 0.0535 0.886 0.682
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431735 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 2 0.163 0.975 0.024 0.976
#> SRR1309314 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.4291 0.7528 0.000 0.820 0.180
#> SRR819559 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0237 0.9730 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.5591 0.6138 0.000 0.304 0.696
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.6204 0.3532 0.000 0.424 0.576
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.6302 -0.0514 0.000 0.520 0.480
#> SRR1402944 3 0.5760 0.5720 0.000 0.328 0.672
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.0424 0.8975 0.000 0.008 0.992
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1359487 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0237 0.9730 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475993 2 0.6299 -0.0302 0.000 0.524 0.476
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1366124 3 0.2261 0.8538 0.068 0.000 0.932
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.5497 0.6326 0.000 0.292 0.708
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.5882 0.4052 0.000 0.652 0.348
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.2625 0.8564 0.000 0.084 0.916
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.4033 0.8186 0.008 0.136 0.856
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1437346 2 0.6244 0.1150 0.000 0.560 0.440
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0747 0.9647 0.000 0.984 0.016
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1335314 1 0.0237 0.9937 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400799 3 0.6026 0.4728 0.000 0.376 0.624
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1458727 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.6286 0.2345 0.000 0.464 0.536
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 3 0.0592 0.8930 0.012 0.000 0.988
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 3 0.4121 0.7513 0.168 0.000 0.832
#> SRR1415591 2 0.5988 0.3505 0.000 0.632 0.368
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 3 0.1163 0.8841 0.028 0.000 0.972
#> SRR1308734 3 0.0592 0.8960 0.000 0.012 0.988
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0237 0.8989 0.000 0.004 0.996
#> SRR1091230 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0237 0.8989 0.000 0.004 0.996
#> SRR1317731 3 0.4842 0.7305 0.000 0.224 0.776
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316033 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.6192 0.2407 0.580 0.000 0.420
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1470988 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313770 3 0.0237 0.8989 0.000 0.004 0.996
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.5988 0.3507 0.000 0.632 0.368
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0747 0.9645 0.000 0.984 0.016
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.4452 0.7676 0.000 0.192 0.808
#> SRR817142 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1315291 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309314 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.3482 0.8317 0.000 0.872 0.128
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1440290 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1330813 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0892 0.9608 0.000 0.980 0.020
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR820689 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 3 0.6302 0.0169 0.480 0.000 0.520
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0747 0.9645 0.000 0.984 0.016
#> SRR1095188 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3116 0.8399 0.000 0.108 0.892
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.6204 0.1741 0.000 0.576 0.424
#> SRR1358161 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.6260 0.0851 0.000 0.552 0.448
#> SRR1447828 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.5948 0.5079 0.000 0.360 0.640
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.6307 -0.0778 0.000 0.512 0.488
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.6307 0.1529 0.000 0.488 0.512
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457527 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1076195 3 0.1163 0.8845 0.028 0.000 0.972
#> SRR1069895 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.4178 0.7881 0.000 0.172 0.828
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1443568 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1380249 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.5178 0.6903 0.000 0.256 0.744
#> SRR807679 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.6308 0.1390 0.000 0.492 0.508
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.1163 0.8884 0.000 0.028 0.972
#> SRR1488881 3 0.0592 0.8960 0.000 0.012 0.988
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.4121 0.7918 0.000 0.168 0.832
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452399 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1437430 3 0.4178 0.7882 0.000 0.172 0.828
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1354999 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 3 0.4887 0.6739 0.228 0.000 0.772
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480941 2 0.1031 0.9567 0.000 0.976 0.024
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0424 0.9709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1453680 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.9750 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4504 0.7634 0.000 0.196 0.804
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0892 0.9608 0.000 0.980 0.020
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0237 0.9732 0.000 0.996 0.004
#> SRR819637 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0592 0.9680 0.000 0.988 0.012
#> SRR1459785 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.5968 0.3626 0.000 0.636 0.364
#> SRR814657 1 0.0000 0.9978 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1402132 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.5993 0.3470 0.000 0.628 0.308 0.064
#> SRR819559 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.1302 0.9372 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0188 0.7931 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.3801 0.6847 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.4830 0.4878 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 4 0.0937 0.9043 0.000 0.012 0.012 0.976
#> SRR1402944 4 0.0657 0.9057 0.000 0.004 0.012 0.984
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.4961 0.2048 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1078368 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349608 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1466951 2 0.0188 0.9640 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1331879 2 0.4250 0.6211 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1320034 3 0.0188 0.7962 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1068687 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.2281 0.8828 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0707 0.9570 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0336 0.7967 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1338687 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0921 0.9511 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1359487 4 0.4356 0.5254 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.1867 0.9063 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1475993 3 0.4543 0.5802 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1366124 3 0.1938 0.7400 0.052 0.000 0.936 0.012
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.3975 0.6659 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.4955 0.3500 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357999 4 0.0817 0.9063 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1344034 3 0.3311 0.7218 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0592 0.9566 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR814219 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 4 0.0592 0.9108 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.1474 0.9262 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 4 0.0000 0.9073 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1369560 2 0.0188 0.9645 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1366605 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0188 0.9640 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.6073 0.6635 0.028 0.140 0.728 0.104
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.4981 0.1544 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1446308 2 0.1474 0.9293 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1437346 3 0.4746 0.5293 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1103143 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 4 0.2921 0.7242 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 4 0.0817 0.9063 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1079543 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816427 2 0.0469 0.9594 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1076681 2 0.1211 0.9407 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1335314 1 0.3123 0.8082 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1400799 3 0.4250 0.6305 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.2408 0.8728 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0817 0.9542 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1453480 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1101834 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0469 0.9621 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1458727 4 0.0817 0.8989 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1436949 2 0.4500 0.5463 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1070429 3 0.4454 0.5980 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 3 0.0937 0.7817 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0188 0.7931 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385434 3 0.2197 0.7085 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1415591 3 0.4948 0.3622 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 3 0.1489 0.7528 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR1308734 3 0.0707 0.7971 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1498973 4 0.4072 0.5684 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0188 0.7931 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR809919 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.1022 0.9478 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.4999 0.0182 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1091230 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0188 0.7962 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1317731 3 0.3320 0.7575 0.000 0.068 0.876 0.056
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.3801 0.7201 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR812128 2 0.1792 0.9105 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1316033 3 0.0188 0.7931 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1464473 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0469 0.9594 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1075054 2 0.1302 0.9332 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.4955 0.1759 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.2216 0.8925 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1413137 1 0.0707 0.9743 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1469973 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1420026 2 0.0592 0.9566 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR817306 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 4 0.0921 0.8881 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0707 0.9570 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0188 0.7931 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0469 0.7888 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1313770 3 0.0707 0.7841 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1315780 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 4 0.1022 0.8988 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1464494 4 0.1302 0.8851 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1357083 3 0.4877 0.4493 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.3837 0.6858 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 4 0.0188 0.9092 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1401040 3 0.0817 0.7963 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.1004 0.8922 0.024 0.000 0.004 0.972
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.3688 0.6949 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR817142 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1315291 3 0.0592 0.7864 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1309314 3 0.0469 0.7888 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420085 2 0.0469 0.9594 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1361308 3 0.0707 0.7968 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 4 0.0804 0.9065 0.000 0.012 0.008 0.980
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.1792 0.9124 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1440290 2 0.0817 0.9542 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1330813 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1469704 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.1118 0.7935 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.3266 0.7816 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1466025 2 0.4888 0.3181 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.3024 0.8109 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1452537 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 3 0.5300 0.1946 0.408 0.000 0.580 0.012
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.4941 0.2337 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.3024 0.8109 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1095188 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3172 0.7310 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.4595 0.6975 0.000 0.776 0.184 0.040
#> SRR1358161 3 0.0188 0.7931 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.2081 0.8952 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.1389 0.9331 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.4624 0.5624 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1447828 3 0.0188 0.7962 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3873 0.6773 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0592 0.9566 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475448 3 0.4585 0.5716 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.2973 0.8271 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.4406 0.6064 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1086702 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1320806 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1457527 3 0.0188 0.7962 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0592 0.7970 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1329863 2 0.0188 0.9640 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0188 0.7931 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1454247 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.3610 0.7480 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 3 0.1488 0.7712 0.012 0.000 0.956 0.032
#> SRR1069895 2 0.1022 0.9478 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.3311 0.7233 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1420191 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 4 0.2704 0.8169 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1408553 1 0.4431 0.5442 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1099330 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1077874 2 0.0707 0.9536 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR808299 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1481238 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1443568 2 0.0707 0.9570 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1380249 1 0.0469 0.9826 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0469 0.9826 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0336 0.9619 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR813283 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.0000 0.9073 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.4992 -0.0801 0.000 0.524 0.476 0.000
#> SRR1078660 2 0.1211 0.9366 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0817 0.9542 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1441934 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1472552 3 0.2408 0.7637 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1488881 3 0.1867 0.7797 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.1211 0.9407 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0188 0.9640 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096525 4 0.2647 0.7699 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0188 0.9645 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.3356 0.7202 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.1302 0.7910 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1069074 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1452399 2 0.0469 0.9621 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1437430 3 0.1902 0.7828 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1419736 4 0.0469 0.9125 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1313343 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1354999 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 4 0.1302 0.8874 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1413182 1 0.0469 0.9825 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1464559 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 4 0.0921 0.9030 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1487928 3 0.4485 0.4794 0.248 0.000 0.740 0.012
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1480941 2 0.1474 0.9293 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1355554 2 0.0817 0.9542 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0817 0.7963 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0469 0.7888 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1455989 2 0.0592 0.9596 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1453680 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9658 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0336 0.9638 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0188 0.7962 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1074602 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR814633 2 0.0188 0.9652 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1072480 3 0.3978 0.7064 0.000 0.192 0.796 0.012
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.2216 0.8850 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 4 0.0707 0.9011 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1091743 2 0.0469 0.9619 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.1637 0.9210 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1459785 3 0.0000 0.7948 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.4843 0.4792 0.000 0.396 0.604 0.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.9944 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0932 0.7566 0.000 0.972 0.004 0.020 0.004
#> SRR1467726 2 0.0566 0.7577 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR815446 2 0.4354 -0.0209 0.000 0.624 0.000 0.368 0.008
#> SRR1402132 1 0.3398 0.8561 0.780 0.000 0.000 0.216 0.004
#> SRR1326059 1 0.1341 0.9286 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1409062 2 0.3885 0.6784 0.000 0.784 0.040 0.176 0.000
#> SRR809406 1 0.0609 0.9324 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1465313 2 0.7510 0.1988 0.000 0.476 0.084 0.156 0.284
#> SRR819559 1 0.1792 0.9232 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1387899 2 0.5016 0.6099 0.000 0.704 0.120 0.176 0.000
#> SRR1442292 2 0.0671 0.7615 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.1121 0.9252 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1343629 1 0.0404 0.9321 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1326868 2 0.3732 0.6835 0.000 0.792 0.032 0.176 0.000
#> SRR1102320 1 0.2732 0.8993 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1469926 3 0.0963 0.7324 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1070036 1 0.1341 0.9244 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1098426 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1090310 2 0.6352 0.2297 0.000 0.488 0.336 0.176 0.000
#> SRR1429748 1 0.2690 0.8909 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1363654 1 0.2561 0.9006 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1326317 2 0.4522 0.6485 0.000 0.744 0.080 0.176 0.000
#> SRR1378308 2 0.1357 0.7425 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1366919 1 0.4737 0.8043 0.712 0.000 0.056 0.228 0.004
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.6529 0.3413 0.000 0.556 0.304 0.096 0.044
#> SRR1490761 2 0.0162 0.7610 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380122 5 0.2804 0.7106 0.000 0.012 0.092 0.016 0.880
#> SRR1402944 5 0.1787 0.7357 0.000 0.004 0.044 0.016 0.936
#> SRR1092818 1 0.1121 0.9255 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1093552 1 0.1121 0.9252 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1464880 5 0.4192 -0.0536 0.000 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1078368 2 0.0324 0.7613 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1349608 2 0.0324 0.7613 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1466951 2 0.1628 0.7347 0.000 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1331879 2 0.5725 0.0340 0.000 0.620 0.000 0.224 0.156
#> SRR1320034 3 0.2179 0.7235 0.000 0.004 0.896 0.100 0.000
#> SRR1068687 2 0.3807 0.6832 0.000 0.792 0.028 0.176 0.004
#> SRR1437491 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1310777 2 0.0609 0.7575 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1374005 2 0.0162 0.7599 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319182 1 0.1671 0.9279 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1329994 1 0.3109 0.8819 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1354203 1 0.0609 0.9322 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1077850 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369241 2 0.0566 0.7614 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1077992 2 0.4015 0.2671 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1455214 1 0.0609 0.9322 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1092014 2 0.4564 0.6505 0.000 0.748 0.072 0.176 0.004
#> SRR1097857 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.2471 0.7138 0.000 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1338687 2 0.2193 0.7386 0.000 0.900 0.008 0.092 0.000
#> SRR1071207 1 0.2891 0.8894 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1486821 3 0.0898 0.7166 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1418540 1 0.1197 0.9256 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1408788 2 0.3622 0.7088 0.000 0.832 0.068 0.096 0.004
#> SRR1359487 5 0.3777 0.6215 0.020 0.000 0.004 0.192 0.784
#> SRR1080648 1 0.1270 0.9243 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1414708 1 0.1341 0.9244 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1469080 2 0.1121 0.7464 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1365722 2 0.0566 0.7577 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1448118 2 0.0566 0.7577 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1444808 1 0.1410 0.9244 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1321829 2 0.4028 0.6730 0.000 0.776 0.048 0.176 0.000
#> SRR1475993 3 0.5120 0.5076 0.000 0.212 0.684 0.104 0.000
#> SRR1445387 1 0.1341 0.9285 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1077575 5 0.1012 0.7522 0.000 0.020 0.000 0.012 0.968
#> SRR1349300 1 0.2127 0.9132 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1374165 1 0.1484 0.9218 0.944 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1453769 2 0.0404 0.7619 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1473870 1 0.2690 0.8909 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1401146 2 0.3983 0.6914 0.000 0.796 0.016 0.160 0.028
#> SRR1366124 3 0.3400 0.6237 0.036 0.000 0.852 0.096 0.016
#> SRR1391811 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456674 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1086490 2 0.6385 0.1778 0.000 0.472 0.352 0.176 0.000
#> SRR1088511 2 0.0566 0.7577 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1404577 1 0.2561 0.8975 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1384431 1 0.0794 0.9322 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1072055 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1359738 2 0.6043 0.4290 0.000 0.572 0.252 0.176 0.000
#> SRR1332141 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085900 2 0.0451 0.7617 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431625 2 0.1357 0.7422 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR814515 2 0.0290 0.7614 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1357999 5 0.2522 0.6880 0.000 0.108 0.000 0.012 0.880
#> SRR1344034 2 0.7955 0.1619 0.000 0.452 0.232 0.148 0.168
#> SRR1080391 1 0.1197 0.9309 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1347870 2 0.1502 0.7403 0.000 0.940 0.004 0.056 0.000
#> SRR814028 2 0.1012 0.7601 0.000 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR814219 2 0.0324 0.7605 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1070620 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102128 1 0.2605 0.8949 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1460211 2 0.1430 0.7391 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1418346 5 0.1549 0.7506 0.000 0.040 0.000 0.016 0.944
#> SRR1070060 1 0.2813 0.8839 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1487969 2 0.0771 0.7588 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1417851 1 0.1341 0.9244 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1443350 2 0.0566 0.7577 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1403199 1 0.1043 0.9263 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1076705 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1079380 5 0.1478 0.7336 0.000 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1102923 2 0.0290 0.7597 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1369560 2 0.5647 0.5491 0.000 0.668 0.012 0.156 0.164
#> SRR1366605 2 0.4088 0.2540 0.000 0.688 0.000 0.304 0.008
#> SRR1396035 2 0.0162 0.7599 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390223 2 0.3635 0.4399 0.000 0.748 0.000 0.248 0.004
#> SRR1436840 2 0.1357 0.7456 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR1445573 2 0.2068 0.7046 0.000 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1375394 2 0.8808 -0.0140 0.052 0.352 0.156 0.332 0.108
#> SRR1431735 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1417387 1 0.1043 0.9263 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1445984 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1370447 5 0.5201 0.4782 0.128 0.000 0.000 0.188 0.684
#> SRR1446308 2 0.4879 0.6227 0.000 0.716 0.108 0.176 0.000
#> SRR1437346 3 0.6335 0.2250 0.000 0.352 0.480 0.168 0.000
#> SRR1103143 2 0.1205 0.7494 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1086466 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1073191 2 0.0727 0.7587 0.000 0.980 0.004 0.012 0.004
#> SRR1098974 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1468914 1 0.2891 0.8830 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1319584 5 0.2689 0.7097 0.000 0.084 0.012 0.016 0.888
#> SRR1486584 1 0.1341 0.9302 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR813536 1 0.2732 0.8885 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1317939 2 0.1357 0.7422 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1079730 1 0.0963 0.9344 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1341921 1 0.2020 0.9157 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1399178 2 0.1205 0.7498 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1415615 1 0.0404 0.9321 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1328551 2 0.0566 0.7596 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1453259 2 0.1282 0.7443 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1340828 5 0.3177 0.5074 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1079543 2 0.1121 0.7565 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR816427 2 0.4731 -0.4190 0.000 0.528 0.000 0.456 0.016
#> SRR1076681 2 0.1484 0.7552 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1335314 1 0.4910 0.7910 0.712 0.000 0.004 0.204 0.080
#> SRR1400799 3 0.6188 0.3629 0.000 0.284 0.540 0.176 0.000
#> SRR1074578 1 0.2732 0.8885 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1312226 2 0.4873 0.3022 0.000 0.688 0.000 0.244 0.068
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069328 1 0.2929 0.8848 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1445023 1 0.2732 0.8885 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1077599 2 0.4783 0.6306 0.000 0.724 0.100 0.176 0.000
#> SRR1453480 2 0.3861 0.3856 0.000 0.728 0.000 0.264 0.008
#> SRR1101834 2 0.0162 0.7610 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321744 1 0.1270 0.9232 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1074839 2 0.4735 0.3179 0.000 0.680 0.048 0.272 0.000
#> SRR1458727 5 0.1195 0.7410 0.000 0.000 0.012 0.028 0.960
#> SRR1436949 2 0.5382 0.2172 0.000 0.660 0.000 0.128 0.212
#> SRR1070429 2 0.6399 0.1528 0.000 0.464 0.360 0.176 0.000
#> SRR1458158 1 0.2179 0.9111 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1432408 3 0.2721 0.6600 0.028 0.000 0.892 0.068 0.012
#> SRR1310334 1 0.1121 0.9326 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1418201 3 0.0324 0.7240 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1385434 3 0.4918 0.4499 0.100 0.000 0.708 0.192 0.000
#> SRR1415591 3 0.6326 0.2792 0.000 0.336 0.492 0.172 0.000
#> SRR1402009 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316055 3 0.3277 0.6170 0.068 0.000 0.856 0.072 0.004
#> SRR1308734 3 0.5852 0.4380 0.000 0.240 0.648 0.040 0.072
#> SRR1498973 5 0.3969 0.2464 0.000 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1397115 1 0.2471 0.9002 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1392141 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR814341 2 0.0898 0.7552 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1313601 2 0.4226 0.6644 0.000 0.764 0.060 0.176 0.000
#> SRR1459609 2 0.0865 0.7543 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1499325 3 0.6589 0.4800 0.000 0.064 0.596 0.104 0.236
#> SRR809919 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1370818 1 0.3489 0.8890 0.820 0.000 0.036 0.144 0.000
#> SRR1323651 2 0.4926 0.6186 0.000 0.712 0.112 0.176 0.000
#> SRR1357297 1 0.2605 0.8936 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR818170 5 0.5103 0.2632 0.000 0.000 0.404 0.040 0.556
#> SRR1091230 2 0.4289 0.6616 0.000 0.760 0.064 0.176 0.000
#> SRR1470556 2 0.1864 0.7284 0.000 0.924 0.004 0.068 0.004
#> SRR812318 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095285 3 0.3476 0.6882 0.000 0.020 0.804 0.176 0.000
#> SRR1317731 3 0.3478 0.6442 0.000 0.024 0.848 0.028 0.100
#> SRR1490785 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432032 1 0.1270 0.9279 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1447808 1 0.1851 0.9199 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR809534 2 0.0865 0.7539 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1397312 5 0.6439 -0.1527 0.000 0.424 0.008 0.136 0.432
#> SRR812128 4 0.5052 0.5980 0.000 0.412 0.000 0.552 0.036
#> SRR1101513 1 0.1043 0.9311 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1415708 2 0.0771 0.7611 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1316033 3 0.1818 0.7224 0.000 0.000 0.932 0.044 0.024
#> SRR1390371 2 0.2741 0.6599 0.000 0.860 0.004 0.132 0.004
#> SRR1480263 2 0.2818 0.6492 0.000 0.856 0.000 0.132 0.012
#> SRR1464473 3 0.0162 0.7255 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1076801 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1080044 1 0.0162 0.9323 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420850 2 0.1124 0.7483 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1474295 1 0.2561 0.8974 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1069871 1 0.0609 0.9344 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1095744 5 0.1549 0.7513 0.000 0.040 0.000 0.016 0.944
#> SRR1068929 2 0.1408 0.7432 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1490097 2 0.3942 0.3937 0.000 0.728 0.000 0.260 0.012
#> SRR1075054 2 0.2370 0.7163 0.000 0.904 0.000 0.040 0.056
#> SRR1083480 1 0.0404 0.9320 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1075458 1 0.1270 0.9243 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1417023 3 0.5368 0.2770 0.332 0.000 0.596 0.072 0.000
#> SRR1309333 4 0.4595 0.4321 0.000 0.488 0.004 0.504 0.004
#> SRR1333676 1 0.2648 0.8925 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1352996 1 0.2648 0.8941 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1093172 1 0.5921 0.5732 0.596 0.000 0.000 0.184 0.220
#> SRR1413137 1 0.4819 0.7700 0.716 0.000 0.000 0.192 0.092
#> SRR1469973 2 0.3649 0.6629 0.000 0.808 0.040 0.152 0.000
#> SRR1420026 2 0.4713 -0.3546 0.000 0.544 0.000 0.440 0.016
#> SRR817306 1 0.2966 0.8864 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1416266 5 0.3266 0.6346 0.004 0.000 0.000 0.200 0.796
#> SRR1071011 2 0.0451 0.7611 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1090290 1 0.3109 0.8834 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1435394 2 0.4734 0.6344 0.000 0.728 0.096 0.176 0.000
#> SRR1383192 1 0.3010 0.8791 0.824 0.000 0.000 0.172 0.004
#> SRR1419962 3 0.0671 0.7203 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1094357 1 0.0404 0.9321 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1081639 3 0.0955 0.7143 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1356016 2 0.1518 0.7430 0.000 0.944 0.004 0.048 0.004
#> SRR1351082 2 0.2052 0.7188 0.000 0.912 0.004 0.080 0.004
#> SRR1397348 5 0.1478 0.7394 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1312147 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1473891 2 0.0566 0.7596 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1335470 1 0.2732 0.8885 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1474930 2 0.3912 0.6914 0.000 0.804 0.088 0.108 0.000
#> SRR1470988 1 0.3010 0.8791 0.824 0.000 0.000 0.172 0.004
#> SRR811915 2 0.1124 0.7513 0.000 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR1104987 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100005 2 0.0324 0.7593 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1444436 2 0.3844 0.6860 0.000 0.792 0.024 0.176 0.008
#> SRR1313770 3 0.1753 0.6920 0.000 0.000 0.936 0.032 0.032
#> SRR1315780 2 0.1410 0.7519 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1073631 1 0.0290 0.9328 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR819124 1 0.2605 0.8952 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1310997 5 0.2654 0.7275 0.000 0.048 0.000 0.064 0.888
#> SRR1464494 5 0.6651 -0.2184 0.000 0.248 0.000 0.312 0.440
#> SRR1357083 2 0.6138 0.3976 0.000 0.552 0.272 0.176 0.000
#> SRR1475842 2 0.1285 0.7496 0.000 0.956 0.004 0.036 0.004
#> SRR1378085 1 0.1410 0.9292 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1378220 2 0.5610 0.5298 0.000 0.640 0.184 0.176 0.000
#> SRR1467704 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1348885 4 0.5599 0.0882 0.000 0.092 0.000 0.580 0.328
#> SRR1325826 1 0.0963 0.9330 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1466812 1 0.2605 0.8966 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1345692 2 0.4474 0.1484 0.000 0.652 0.004 0.332 0.012
#> SRR1401040 3 0.2970 0.6995 0.000 0.004 0.828 0.168 0.000
#> SRR1097954 1 0.0404 0.9321 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1374396 5 0.3266 0.6325 0.004 0.000 0.000 0.200 0.796
#> SRR1454073 2 0.4063 0.3490 0.000 0.708 0.012 0.280 0.000
#> SRR1355747 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1429368 3 0.0404 0.7309 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1398138 2 0.2079 0.7512 0.000 0.916 0.020 0.064 0.000
#> SRR1379260 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1361436 3 0.6420 0.1406 0.000 0.376 0.448 0.176 0.000
#> SRR817142 2 0.4577 0.6449 0.000 0.740 0.084 0.176 0.000
#> SRR1315291 3 0.2708 0.6566 0.000 0.000 0.884 0.072 0.044
#> SRR1309314 3 0.1582 0.6972 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1420085 2 0.2248 0.7063 0.000 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1361308 3 0.3010 0.6974 0.000 0.004 0.824 0.172 0.000
#> SRR1472126 1 0.2377 0.9034 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1380482 5 0.1314 0.7479 0.000 0.012 0.016 0.012 0.960
#> SRR1099789 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079480 5 0.1205 0.7532 0.000 0.040 0.000 0.004 0.956
#> SRR1339276 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418368 1 0.0510 0.9341 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1399353 1 0.1270 0.9243 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1096760 2 0.5059 0.6053 0.000 0.700 0.124 0.176 0.000
#> SRR1440290 2 0.4926 0.6186 0.000 0.712 0.112 0.176 0.000
#> SRR1330813 2 0.4162 0.6674 0.000 0.768 0.056 0.176 0.000
#> SRR1458931 2 0.3422 0.5475 0.000 0.792 0.004 0.200 0.004
#> SRR812294 1 0.3039 0.8816 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1394321 1 0.0794 0.9299 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1081160 2 0.1544 0.7492 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1469704 2 0.1251 0.7474 0.000 0.956 0.000 0.036 0.008
#> SRR1349342 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477173 2 0.0451 0.7602 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1086752 2 0.0451 0.7586 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1084698 2 0.0798 0.7575 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1390143 1 0.2020 0.9157 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1390413 2 0.0324 0.7607 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1099570 3 0.5102 0.5848 0.000 0.128 0.696 0.176 0.000
#> SRR1312169 1 0.2732 0.8885 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1096687 1 0.2690 0.8911 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1486139 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470313 1 0.3477 0.8866 0.832 0.000 0.056 0.112 0.000
#> SRR1447893 2 0.5546 0.5403 0.000 0.648 0.176 0.176 0.000
#> SRR1466025 2 0.5923 0.0886 0.000 0.572 0.000 0.140 0.288
#> SRR1477429 1 0.2516 0.9003 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1445701 2 0.5862 0.4803 0.000 0.604 0.220 0.176 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.3197 0.7102 0.000 0.836 0.024 0.140 0.000
#> SRR1452537 2 0.0404 0.7617 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1383301 1 0.0880 0.9334 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1489328 2 0.5184 -0.2968 0.000 0.544 0.028 0.420 0.008
#> SRR1344462 1 0.0703 0.9322 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1082709 1 0.0880 0.9334 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1447784 3 0.5492 0.3058 0.304 0.000 0.624 0.056 0.016
#> SRR1355769 1 0.2648 0.8913 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1488237 2 0.1704 0.7300 0.000 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1391985 2 0.0451 0.7586 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1478501 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480917 5 0.5657 0.3540 0.000 0.180 0.020 0.124 0.676
#> SRR1474485 1 0.2179 0.9219 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1089998 1 0.0794 0.9322 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1318140 1 0.0162 0.9327 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319262 2 0.5224 0.5862 0.000 0.684 0.140 0.176 0.000
#> SRR1095188 2 0.0807 0.7617 0.000 0.976 0.012 0.012 0.000
#> SRR1454350 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1440374 1 0.0404 0.9321 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1359565 3 0.5514 0.5224 0.000 0.172 0.652 0.176 0.000
#> SRR1105417 1 0.2561 0.8996 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1325578 2 0.6489 0.1538 0.000 0.560 0.156 0.020 0.264
#> SRR1358161 3 0.5769 0.4570 0.000 0.012 0.620 0.096 0.272
#> SRR1358665 2 0.0162 0.7599 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333971 2 0.4225 0.2461 0.000 0.632 0.000 0.004 0.364
#> SRR1452010 1 0.2690 0.8892 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1418183 2 0.4971 0.6144 0.000 0.708 0.116 0.176 0.000
#> SRR1366345 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387449 1 0.1043 0.9311 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1473461 1 0.2074 0.9198 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1090837 2 0.6219 0.3517 0.000 0.532 0.292 0.176 0.000
#> SRR1447828 3 0.0451 0.7312 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1338747 2 0.0865 0.7543 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1333038 3 0.2824 0.6640 0.000 0.116 0.864 0.020 0.000
#> SRR1350280 1 0.2516 0.8991 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1088557 1 0.1478 0.9267 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1102656 2 0.0771 0.7573 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1441443 2 0.1492 0.7474 0.000 0.948 0.004 0.040 0.008
#> SRR1370682 3 0.0794 0.7332 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1475448 2 0.6219 0.3512 0.000 0.532 0.292 0.176 0.000
#> SRR1407291 1 0.2516 0.8989 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1405266 1 0.0703 0.9322 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1363766 1 0.1671 0.9259 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1082592 4 0.5636 0.5880 0.000 0.372 0.000 0.544 0.084
#> SRR1325794 2 0.3863 0.6892 0.000 0.792 0.012 0.176 0.020
#> SRR1095961 3 0.6234 0.3414 0.000 0.296 0.528 0.176 0.000
#> SRR1086702 2 0.1430 0.7541 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR1320806 2 0.4349 0.6593 0.000 0.756 0.068 0.176 0.000
#> SRR1457527 3 0.2233 0.7225 0.000 0.004 0.892 0.104 0.000
#> SRR1098831 2 0.0162 0.7603 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474374 3 0.2930 0.7012 0.000 0.004 0.832 0.164 0.000
#> SRR1488858 1 0.3224 0.8998 0.824 0.000 0.016 0.160 0.000
#> SRR1454695 1 0.0963 0.9270 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1090241 2 0.3381 0.6927 0.000 0.808 0.016 0.176 0.000
#> SRR1329863 2 0.0451 0.7586 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1357733 1 0.0510 0.9311 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1362135 1 0.1121 0.9255 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1379581 3 0.0451 0.7222 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1309182 1 0.2605 0.8949 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1437668 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1084742 5 0.4168 0.5074 0.000 0.184 0.000 0.052 0.764
#> SRR1433538 1 0.2605 0.8956 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1085063 2 0.1281 0.7485 0.000 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1454247 5 0.1478 0.7402 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1097100 2 0.0566 0.7614 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR818622 2 0.4630 0.6419 0.000 0.736 0.088 0.176 0.000
#> SRR1072388 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1070332 2 0.3280 0.5861 0.000 0.812 0.000 0.012 0.176
#> SRR1320761 2 0.4319 0.6776 0.000 0.772 0.024 0.176 0.028
#> SRR1076195 3 0.3651 0.5932 0.004 0.000 0.808 0.160 0.028
#> SRR1069895 2 0.4971 0.6143 0.000 0.708 0.116 0.176 0.000
#> SRR1099144 1 0.1270 0.9243 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1385150 2 0.6392 0.1665 0.000 0.468 0.356 0.176 0.000
#> SRR1420191 2 0.0324 0.7613 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1332625 1 0.3231 0.8811 0.800 0.000 0.004 0.196 0.000
#> SRR1102583 1 0.2516 0.8988 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1456971 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1340574 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1444830 2 0.3991 0.6766 0.000 0.780 0.048 0.172 0.000
#> SRR1096267 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087127 5 0.1372 0.7431 0.000 0.004 0.024 0.016 0.956
#> SRR1408553 1 0.5902 0.5769 0.600 0.000 0.000 0.192 0.208
#> SRR1069231 1 0.2074 0.9210 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1325642 2 0.3662 0.4301 0.000 0.744 0.004 0.252 0.000
#> SRR1362103 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0609 0.9314 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1447499 2 0.1282 0.7482 0.000 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1099330 2 0.3565 0.6863 0.000 0.800 0.024 0.176 0.000
#> SRR1077874 2 0.0510 0.7591 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR808299 2 0.0566 0.7615 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1098050 5 0.0671 0.7517 0.000 0.016 0.000 0.004 0.980
#> SRR1481238 2 0.4447 0.6743 0.000 0.768 0.028 0.172 0.032
#> SRR1443568 2 0.4496 0.6561 0.000 0.752 0.092 0.156 0.000
#> SRR1380249 1 0.4745 0.8279 0.740 0.000 0.020 0.192 0.048
#> SRR1080143 1 0.2516 0.8988 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1383148 1 0.5686 0.7394 0.664 0.000 0.084 0.224 0.028
#> SRR1357042 1 0.1608 0.9285 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1416025 2 0.0880 0.7527 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1431015 2 0.1329 0.7538 0.000 0.956 0.008 0.032 0.004
#> SRR1078709 2 0.4613 -0.1873 0.000 0.580 0.004 0.408 0.008
#> SRR813283 1 0.0510 0.9322 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1430226 2 0.1365 0.7476 0.000 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR1070665 1 0.0510 0.9322 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1466927 2 0.0162 0.7599 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347707 4 0.5905 0.0421 0.000 0.028 0.180 0.660 0.132
#> SRR807679 1 0.1121 0.9252 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1333811 2 0.6496 0.3157 0.000 0.536 0.328 0.104 0.032
#> SRR1078660 2 0.5225 -0.4315 0.000 0.508 0.008 0.456 0.028
#> SRR1331730 2 0.1768 0.7236 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1333913 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1432542 1 0.1270 0.9243 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1418041 1 0.0794 0.9319 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0324 0.7593 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1402437 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1350958 2 0.0955 0.7600 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR1396822 2 0.4926 0.6186 0.000 0.712 0.112 0.176 0.000
#> SRR1441934 2 0.2723 0.7230 0.000 0.864 0.012 0.124 0.000
#> SRR1472552 3 0.6138 0.3813 0.000 0.272 0.552 0.176 0.000
#> SRR1488881 3 0.3656 0.6851 0.000 0.032 0.800 0.168 0.000
#> SRR1102973 1 0.0703 0.9296 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1071131 2 0.3690 0.6146 0.000 0.780 0.200 0.020 0.000
#> SRR1074502 1 0.0880 0.9332 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1325271 1 0.1544 0.9221 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1409171 2 0.0566 0.7596 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR809113 2 0.0727 0.7621 0.000 0.980 0.004 0.012 0.004
#> SRR1430045 2 0.1638 0.7315 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1441245 2 0.2112 0.7144 0.000 0.908 0.004 0.084 0.004
#> SRR1384091 1 0.3177 0.8793 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1431887 2 0.1830 0.7261 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1096525 5 0.4204 0.5894 0.048 0.000 0.000 0.196 0.756
#> SRR1488491 2 0.0451 0.7611 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1356351 2 0.4995 0.6216 0.000 0.728 0.008 0.140 0.124
#> SRR1369514 1 0.2690 0.8908 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1453299 3 0.3608 0.6895 0.000 0.064 0.824 0.112 0.000
#> SRR1436300 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1348490 5 0.1041 0.7545 0.000 0.032 0.000 0.004 0.964
#> SRR1091767 2 0.4764 -0.3284 0.000 0.548 0.012 0.436 0.004
#> SRR1354467 3 0.5546 0.5257 0.000 0.176 0.648 0.176 0.000
#> SRR1069074 2 0.3278 0.7029 0.000 0.824 0.020 0.156 0.000
#> SRR1452399 2 0.2046 0.7436 0.000 0.916 0.068 0.016 0.000
#> SRR1437430 3 0.1369 0.7099 0.000 0.008 0.956 0.028 0.008
#> SRR1419736 5 0.0703 0.7541 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1313343 3 0.0510 0.7320 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1077619 1 0.2690 0.9050 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1083530 1 0.1341 0.9244 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1333633 2 0.6489 0.4525 0.000 0.616 0.052 0.140 0.192
#> SRR1354999 2 0.4734 0.6344 0.000 0.728 0.096 0.176 0.000
#> SRR1443592 2 0.1430 0.7391 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1077356 1 0.1341 0.9285 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1378818 5 0.1300 0.7396 0.000 0.000 0.028 0.016 0.956
#> SRR1413182 1 0.3944 0.8533 0.764 0.000 0.004 0.212 0.020
#> SRR1464559 1 0.3631 0.8741 0.824 0.000 0.072 0.104 0.000
#> SRR1413075 5 0.1478 0.7380 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1487928 3 0.6345 0.3057 0.196 0.000 0.576 0.216 0.012
#> SRR1388997 2 0.2964 0.6298 0.000 0.840 0.004 0.152 0.004
#> SRR1092865 2 0.3656 0.6896 0.000 0.800 0.032 0.168 0.000
#> SRR1102729 1 0.0703 0.9322 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9318 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.1484 0.7427 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1376874 3 0.0880 0.7327 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1339903 1 0.1851 0.9248 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1346710 1 0.1270 0.9262 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1418771 2 0.0324 0.7611 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1095358 2 0.3320 0.7061 0.000 0.828 0.012 0.152 0.008
#> SRR1480941 2 0.4677 0.6439 0.000 0.740 0.080 0.176 0.004
#> SRR1479175 2 0.0162 0.7610 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.2488 0.6704 0.000 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1491354 1 0.2127 0.9126 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1433884 2 0.2616 0.7365 0.000 0.888 0.036 0.076 0.000
#> SRR1471074 2 0.0671 0.7567 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1353052 2 0.0324 0.7613 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1355554 2 0.4879 0.6227 0.000 0.716 0.108 0.176 0.000
#> SRR1487173 1 0.0162 0.9317 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474253 1 0.0609 0.9324 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1322918 2 0.3461 0.4972 0.000 0.772 0.000 0.224 0.004
#> SRR1318331 2 0.1205 0.7494 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1321333 3 0.3280 0.6915 0.000 0.012 0.812 0.176 0.000
#> SRR1474231 1 0.1043 0.9277 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1350545 1 0.2424 0.9022 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1091328 1 0.1197 0.9242 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR814447 3 0.0992 0.7122 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1455989 2 0.3844 0.6936 0.000 0.804 0.064 0.132 0.000
#> SRR1453680 3 0.0703 0.7326 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1470356 2 0.1205 0.7579 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1342977 2 0.0451 0.7586 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1444222 2 0.0865 0.7603 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1097197 1 0.2230 0.9096 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1366729 3 0.1430 0.7316 0.000 0.004 0.944 0.052 0.000
#> SRR821282 3 0.0703 0.7326 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1074602 2 0.4226 0.6651 0.000 0.764 0.060 0.176 0.000
#> SRR814633 2 0.0404 0.7617 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1072480 3 0.7755 0.1993 0.000 0.312 0.428 0.096 0.164
#> SRR1319100 1 0.0510 0.9323 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1324004 2 0.5263 0.5827 0.000 0.680 0.144 0.176 0.000
#> SRR1457459 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1421031 1 0.2966 0.8914 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1444598 5 0.3702 0.6764 0.000 0.000 0.096 0.084 0.820
#> SRR1091743 2 0.4162 0.6674 0.000 0.768 0.056 0.176 0.000
#> SRR819637 1 0.0794 0.9290 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1083848 1 0.0290 0.9319 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1088934 2 0.5144 0.5963 0.000 0.692 0.132 0.176 0.000
#> SRR1459785 3 0.1768 0.7297 0.000 0.004 0.924 0.072 0.000
#> SRR1083700 1 0.0880 0.9291 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1375531 1 0.2020 0.9161 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1323470 2 0.6608 0.2084 0.000 0.456 0.244 0.300 0.000
#> SRR814657 1 0.2561 0.8967 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.3817 0.6100 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1467726 2 0.3817 0.6093 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR815446 2 0.2905 0.3829 0.000 0.852 0.000 0.084 0.000 0.064
#> SRR1402132 4 0.4181 0.2681 0.384 0.004 0.012 0.600 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.1387 0.8199 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1409062 6 0.1556 0.5486 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR809406 1 0.0547 0.8355 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1465313 5 0.5036 0.3971 0.000 0.076 0.008 0.000 0.604 0.312
#> SRR819559 1 0.1610 0.8116 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1387899 6 0.1464 0.5406 0.000 0.004 0.016 0.036 0.000 0.944
#> SRR1442292 6 0.3843 -0.3280 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8369 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.1387 0.8233 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0458 0.8351 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1326868 6 0.2454 0.4887 0.000 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR1102320 1 0.3126 0.6962 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.2412 0.7498 0.000 0.000 0.880 0.028 0.000 0.092
#> SRR1070036 1 0.1556 0.8207 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.1444 0.8224 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1090310 6 0.2325 0.5529 0.000 0.048 0.060 0.000 0.000 0.892
#> SRR1429748 1 0.3198 0.6427 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.2996 0.7064 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1326317 6 0.0858 0.5617 0.000 0.028 0.000 0.004 0.000 0.968
#> SRR1378308 2 0.3634 0.6320 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1366919 1 0.5275 0.2289 0.532 0.004 0.092 0.372 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0260 0.8381 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1469769 6 0.7529 0.2019 0.000 0.176 0.180 0.016 0.180 0.448
#> SRR1490761 6 0.3868 -0.4530 0.000 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR1380122 5 0.3653 0.6250 0.000 0.132 0.048 0.016 0.804 0.000
#> SRR1402944 5 0.1251 0.6406 0.000 0.008 0.024 0.012 0.956 0.000
#> SRR1092818 1 0.1327 0.8245 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.1204 0.8268 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1464880 5 0.5077 0.1528 0.000 0.404 0.000 0.000 0.516 0.080
#> SRR1078368 6 0.3868 -0.4522 0.000 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR1349608 6 0.3823 -0.3309 0.000 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1466951 2 0.4136 0.5713 0.000 0.560 0.000 0.012 0.000 0.428
#> SRR1331879 2 0.3138 0.4707 0.000 0.832 0.000 0.000 0.060 0.108
#> SRR1320034 3 0.3230 0.7068 0.000 0.000 0.776 0.012 0.000 0.212
#> SRR1068687 6 0.1225 0.5597 0.000 0.032 0.004 0.004 0.004 0.956
#> SRR1437491 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.3789 0.6224 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1374005 2 0.3862 0.5331 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1319182 1 0.1610 0.8317 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3714 0.5768 0.656 0.004 0.000 0.340 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0547 0.8347 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0363 0.8357 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1369241 6 0.3851 -0.3537 0.000 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1077992 5 0.5667 -0.0272 0.000 0.368 0.000 0.000 0.472 0.160
#> SRR1455214 1 0.0632 0.8343 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1092014 6 0.2053 0.5346 0.000 0.108 0.004 0.000 0.000 0.888
#> SRR1097857 1 0.0547 0.8360 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0547 0.8360 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.3778 0.6542 0.000 0.000 0.696 0.016 0.000 0.288
#> SRR1338687 6 0.3747 -0.1350 0.000 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1071207 1 0.3499 0.6086 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.2601 0.7425 0.000 0.004 0.888 0.016 0.024 0.068
#> SRR1418540 1 0.1327 0.8248 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1408788 6 0.4985 0.0857 0.000 0.328 0.020 0.008 0.032 0.612
#> SRR1359487 5 0.5103 -0.0423 0.072 0.004 0.000 0.392 0.532 0.000
#> SRR1080648 1 0.1501 0.8214 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.1610 0.8200 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.5519 0.5088 0.000 0.512 0.000 0.000 0.144 0.344
#> SRR1365722 2 0.3797 0.6194 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1448118 2 0.3823 0.6038 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR1444808 1 0.1858 0.8155 0.904 0.000 0.004 0.092 0.000 0.000
#> SRR1321829 6 0.1863 0.5375 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1475993 3 0.4934 0.5003 0.000 0.028 0.580 0.028 0.000 0.364
#> SRR1445387 1 0.1204 0.8255 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1077575 5 0.0622 0.6446 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1349300 1 0.2491 0.7520 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1531 0.8218 0.928 0.000 0.004 0.068 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.3864 0.5173 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1473870 1 0.3244 0.6369 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1401146 6 0.4247 0.4418 0.000 0.164 0.004 0.000 0.092 0.740
#> SRR1366124 3 0.2822 0.6529 0.040 0.000 0.852 0.108 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0363 0.8355 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1204 0.8268 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1086490 6 0.1779 0.5296 0.000 0.000 0.064 0.016 0.000 0.920
#> SRR1088511 2 0.3817 0.6083 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1404577 1 0.3337 0.6364 0.736 0.004 0.000 0.260 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0790 0.8329 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.1556 0.8221 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1359738 6 0.2462 0.5475 0.000 0.096 0.028 0.000 0.000 0.876
#> SRR1332141 1 0.0458 0.8354 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1085900 6 0.4169 -0.1272 0.000 0.364 0.008 0.004 0.004 0.620
#> SRR1442173 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.3717 0.6342 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR814515 6 0.3866 -0.4276 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1357999 5 0.4020 0.5678 0.000 0.260 0.004 0.012 0.712 0.012
#> SRR1344034 5 0.5850 0.3189 0.000 0.036 0.048 0.016 0.480 0.420
#> SRR1080391 1 0.1267 0.8270 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.4234 0.5144 0.000 0.544 0.000 0.016 0.000 0.440
#> SRR814028 6 0.5195 -0.2509 0.000 0.372 0.000 0.004 0.084 0.540
#> SRR814219 2 0.3866 0.5094 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1070620 1 0.0458 0.8354 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.3126 0.6605 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.3727 0.6348 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1418346 5 0.0725 0.6456 0.000 0.012 0.000 0.012 0.976 0.000
#> SRR1070060 1 0.3309 0.6142 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.4591 0.5377 0.000 0.516 0.000 0.004 0.028 0.452
#> SRR1417851 1 0.1610 0.8200 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.3851 0.5678 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1403199 1 0.1327 0.8248 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.1644 0.8201 0.920 0.000 0.004 0.076 0.000 0.000
#> SRR1079380 5 0.4288 0.5404 0.000 0.016 0.004 0.236 0.716 0.028
#> SRR1102923 2 0.3838 0.5863 0.000 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR1369560 5 0.3950 0.5298 0.000 0.028 0.000 0.000 0.696 0.276
#> SRR1366605 2 0.2536 0.4674 0.000 0.864 0.000 0.020 0.000 0.116
#> SRR1396035 2 0.3857 0.5471 0.000 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1390223 2 0.4983 0.3943 0.000 0.644 0.000 0.148 0.000 0.208
#> SRR1436840 2 0.4086 0.5528 0.000 0.528 0.000 0.008 0.000 0.464
#> SRR1445573 2 0.3244 0.5897 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1375394 6 0.5558 0.0100 0.028 0.004 0.036 0.284 0.028 0.620
#> SRR1431735 1 0.1588 0.8204 0.924 0.000 0.004 0.072 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.1075 0.8289 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.1644 0.8201 0.920 0.000 0.004 0.076 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.5442 -0.0135 0.120 0.000 0.000 0.468 0.412 0.000
#> SRR1446308 6 0.2234 0.5216 0.000 0.124 0.004 0.000 0.000 0.872
#> SRR1437346 6 0.4822 0.2776 0.000 0.072 0.296 0.004 0.000 0.628
#> SRR1103143 2 0.3727 0.6347 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1086466 1 0.1387 0.8233 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.3828 0.5989 0.000 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR1098974 1 0.0865 0.8340 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.3390 0.6124 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000 0.000
#> SRR1319584 5 0.4408 0.6031 0.000 0.164 0.044 0.016 0.756 0.020
#> SRR1486584 1 0.0363 0.8394 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.3309 0.6160 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.3756 0.6289 0.000 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1079730 1 0.0632 0.8365 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.2793 0.7164 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.3789 0.6234 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1415615 1 0.0363 0.8355 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.3823 0.6045 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR1453259 2 0.3789 0.6233 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1340828 5 0.2597 0.6220 0.000 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000
#> SRR1079543 6 0.3797 -0.2194 0.000 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR816427 2 0.2887 0.3043 0.000 0.844 0.000 0.120 0.000 0.036
#> SRR1076681 6 0.5029 -0.3888 0.000 0.448 0.052 0.008 0.000 0.492
#> SRR1335314 1 0.4844 -0.0131 0.500 0.000 0.012 0.456 0.032 0.000
#> SRR1400799 6 0.4160 0.0512 0.000 0.008 0.284 0.024 0.000 0.684
#> SRR1074578 1 0.3330 0.6164 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.3386 0.5171 0.000 0.796 0.000 0.012 0.016 0.176
#> SRR1416207 1 0.0458 0.8378 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.3482 0.6046 0.684 0.000 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.3405 0.6222 0.724 0.000 0.004 0.272 0.000 0.000
#> SRR1077599 6 0.0748 0.5607 0.000 0.016 0.004 0.004 0.000 0.976
#> SRR1453480 2 0.2632 0.5126 0.000 0.832 0.000 0.004 0.000 0.164
#> SRR1101834 2 0.3866 0.5085 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1321744 1 0.1531 0.8218 0.928 0.000 0.004 0.068 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.4212 0.3140 0.000 0.688 0.000 0.048 0.000 0.264
#> SRR1458727 5 0.1644 0.6208 0.000 0.000 0.004 0.076 0.920 0.000
#> SRR1436949 2 0.4421 0.4933 0.000 0.716 0.000 0.000 0.128 0.156
#> SRR1070429 6 0.2214 0.5278 0.000 0.016 0.096 0.000 0.000 0.888
#> SRR1458158 1 0.2454 0.7564 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1432408 3 0.2122 0.7185 0.008 0.000 0.900 0.084 0.000 0.008
#> SRR1310334 1 0.0146 0.8379 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.2006 0.7566 0.000 0.000 0.904 0.016 0.000 0.080
#> SRR1385434 3 0.5351 0.0861 0.148 0.000 0.572 0.280 0.000 0.000
#> SRR1415591 6 0.3992 0.1448 0.000 0.012 0.264 0.016 0.000 0.708
#> SRR1402009 1 0.0260 0.8360 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1316055 3 0.2647 0.6719 0.044 0.000 0.868 0.088 0.000 0.000
#> SRR1308734 3 0.7175 0.1777 0.000 0.088 0.476 0.016 0.236 0.184
#> SRR1498973 5 0.4717 0.1529 0.000 0.456 0.004 0.000 0.504 0.036
#> SRR1397115 1 0.2854 0.7082 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.1531 0.8218 0.928 0.000 0.004 0.068 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.3830 0.6350 0.000 0.620 0.000 0.000 0.004 0.376
#> SRR1313601 6 0.2048 0.5264 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1459609 2 0.3804 0.6177 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1499325 5 0.6578 0.1037 0.000 0.024 0.332 0.016 0.460 0.168
#> SRR809919 1 0.0363 0.8355 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.4613 0.6271 0.696 0.004 0.100 0.200 0.000 0.000
#> SRR1323651 6 0.0976 0.5544 0.000 0.008 0.008 0.016 0.000 0.968
#> SRR1357297 1 0.3244 0.6305 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.4882 0.1325 0.000 0.004 0.540 0.052 0.404 0.000
#> SRR1091230 6 0.0790 0.5609 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1470556 2 0.3531 0.6232 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR812318 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1095285 6 0.5165 -0.4505 0.000 0.004 0.404 0.076 0.000 0.516
#> SRR1317731 3 0.2441 0.7080 0.000 0.012 0.904 0.016 0.044 0.024
#> SRR1490785 1 0.0363 0.8361 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.1556 0.8228 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.2562 0.7455 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.3817 0.6086 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1397312 6 0.4653 -0.1866 0.000 0.020 0.000 0.012 0.484 0.484
#> SRR812128 2 0.3404 0.0988 0.000 0.792 0.012 0.184 0.004 0.008
#> SRR1101513 1 0.1007 0.8297 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1415708 6 0.3854 -0.3665 0.000 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1316033 3 0.3220 0.7307 0.000 0.000 0.844 0.016 0.052 0.088
#> SRR1390371 2 0.3271 0.5612 0.000 0.760 0.000 0.008 0.000 0.232
#> SRR1480263 2 0.2854 0.5492 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1464473 3 0.1584 0.7521 0.000 0.000 0.928 0.008 0.000 0.064
#> SRR1076801 1 0.1588 0.8204 0.924 0.000 0.004 0.072 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0260 0.8362 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.3747 0.6321 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1474295 1 0.3244 0.6444 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0790 0.8402 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.1074 0.6478 0.000 0.028 0.000 0.012 0.960 0.000
#> SRR1068929 2 0.3789 0.6234 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1490097 2 0.4143 0.3978 0.000 0.736 0.000 0.084 0.000 0.180
#> SRR1075054 2 0.5123 0.5357 0.000 0.616 0.000 0.000 0.140 0.244
#> SRR1083480 1 0.0363 0.8361 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.1556 0.8207 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1417023 3 0.4945 0.0126 0.304 0.000 0.604 0.092 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.3891 0.1243 0.000 0.768 0.000 0.164 0.004 0.064
#> SRR1333676 1 0.3126 0.6665 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.3266 0.6384 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.5034 -0.2474 0.472 0.000 0.000 0.456 0.072 0.000
#> SRR1413137 4 0.4937 0.0622 0.472 0.004 0.000 0.472 0.052 0.000
#> SRR1469973 6 0.4924 0.1529 0.000 0.336 0.008 0.060 0.000 0.596
#> SRR1420026 2 0.3190 0.2912 0.000 0.820 0.000 0.136 0.000 0.044
#> SRR817306 1 0.3515 0.6040 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR1416266 5 0.4117 0.1785 0.000 0.004 0.004 0.464 0.528 0.000
#> SRR1071011 6 0.3862 -0.4027 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1090290 1 0.3499 0.6242 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1435394 6 0.1218 0.5552 0.000 0.012 0.004 0.028 0.000 0.956
#> SRR1383192 1 0.3446 0.5592 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.2345 0.7481 0.000 0.000 0.896 0.016 0.016 0.072
#> SRR1094357 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.1313 0.7379 0.000 0.000 0.952 0.016 0.004 0.028
#> SRR1356016 2 0.3737 0.6335 0.000 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1351082 2 0.3547 0.6221 0.000 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1397348 5 0.0865 0.6508 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1312147 1 0.1700 0.8182 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.3828 0.5983 0.000 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR1335470 1 0.3288 0.6237 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000
#> SRR1474930 6 0.2699 0.5055 0.000 0.124 0.012 0.008 0.000 0.856
#> SRR1470988 1 0.3515 0.5279 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.3774 0.6267 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1104987 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.3857 0.5469 0.000 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1444436 6 0.1858 0.5442 0.000 0.092 0.000 0.004 0.000 0.904
#> SRR1313770 3 0.1458 0.7243 0.000 0.000 0.948 0.016 0.020 0.016
#> SRR1315780 6 0.3765 -0.1624 0.000 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1073631 1 0.0547 0.8370 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.3221 0.6444 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1310997 5 0.4573 0.5636 0.000 0.060 0.004 0.216 0.708 0.012
#> SRR1464494 2 0.4995 -0.0418 0.000 0.660 0.000 0.088 0.236 0.016
#> SRR1357083 6 0.1225 0.5467 0.000 0.000 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1475842 2 0.4161 0.5859 0.000 0.540 0.000 0.012 0.000 0.448
#> SRR1378085 1 0.1444 0.8262 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1378220 6 0.1485 0.5409 0.000 0.004 0.028 0.024 0.000 0.944
#> SRR1467704 1 0.1501 0.8214 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.5287 -0.3136 0.000 0.544 0.040 0.380 0.036 0.000
#> SRR1325826 1 0.1204 0.8343 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.3383 0.6291 0.728 0.004 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.4843 0.3061 0.000 0.664 0.000 0.144 0.000 0.192
#> SRR1401040 3 0.4803 0.5310 0.000 0.004 0.528 0.044 0.000 0.424
#> SRR1097954 1 0.0458 0.8351 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1374396 5 0.4141 0.1650 0.012 0.000 0.000 0.432 0.556 0.000
#> SRR1454073 2 0.4459 0.3467 0.000 0.708 0.000 0.084 0.004 0.204
#> SRR1355747 1 0.1531 0.8218 0.928 0.000 0.004 0.068 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.2163 0.7540 0.000 0.000 0.892 0.016 0.000 0.092
#> SRR1398138 6 0.3187 0.3944 0.000 0.188 0.004 0.012 0.000 0.796
#> SRR1379260 1 0.1501 0.8222 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1361436 6 0.4063 0.4115 0.000 0.052 0.208 0.004 0.000 0.736
#> SRR817142 6 0.1327 0.5565 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1315291 3 0.2872 0.6924 0.000 0.000 0.864 0.076 0.052 0.008
#> SRR1309314 3 0.0820 0.7280 0.000 0.000 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1420085 2 0.4838 0.5268 0.000 0.564 0.000 0.064 0.000 0.372
#> SRR1361308 3 0.4410 0.5455 0.000 0.000 0.560 0.028 0.000 0.412
#> SRR1472126 1 0.2912 0.6995 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.0870 0.6419 0.000 0.004 0.012 0.012 0.972 0.000
#> SRR1099789 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.0520 0.6452 0.000 0.008 0.000 0.008 0.984 0.000
#> SRR1339276 1 0.0363 0.8357 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0146 0.8380 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.1444 0.8224 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1096760 6 0.2945 0.5018 0.000 0.156 0.020 0.000 0.000 0.824
#> SRR1440290 6 0.0767 0.5560 0.000 0.008 0.004 0.012 0.000 0.976
#> SRR1330813 6 0.1556 0.5486 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1458931 2 0.3168 0.5279 0.000 0.792 0.000 0.016 0.000 0.192
#> SRR812294 1 0.3742 0.5422 0.648 0.004 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0713 0.8351 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1081160 6 0.3765 -0.1706 0.000 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1469704 2 0.3695 0.6360 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1349342 1 0.0865 0.8340 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.3810 0.6123 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1086752 2 0.3833 0.5931 0.000 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444
#> SRR1084698 2 0.4123 0.6135 0.000 0.568 0.000 0.000 0.012 0.420
#> SRR1390143 1 0.2135 0.7830 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.3869 0.4679 0.000 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR1099570 6 0.4638 -0.3088 0.000 0.004 0.368 0.040 0.000 0.588
#> SRR1312169 1 0.3266 0.6241 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.3151 0.6493 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0146 0.8360 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.4154 0.6801 0.744 0.000 0.112 0.144 0.000 0.000
#> SRR1447893 6 0.1745 0.5570 0.000 0.068 0.012 0.000 0.000 0.920
#> SRR1466025 2 0.7687 -0.1359 0.000 0.324 0.004 0.292 0.200 0.180
#> SRR1477429 1 0.2969 0.6870 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000 0.000
#> SRR1445701 6 0.2344 0.5132 0.000 0.004 0.048 0.052 0.000 0.896
#> SRR820689 1 0.0458 0.8375 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1451876 6 0.3380 0.3513 0.000 0.244 0.004 0.004 0.000 0.748
#> SRR1452537 6 0.3866 -0.4280 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1383301 1 0.1267 0.8403 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.4539 0.1443 0.000 0.728 0.008 0.164 0.004 0.096
#> SRR1344462 1 0.0547 0.8348 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0713 0.8339 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1447784 3 0.5158 -0.0758 0.436 0.000 0.496 0.056 0.012 0.000
#> SRR1355769 1 0.3351 0.6171 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.3881 0.6256 0.000 0.600 0.000 0.004 0.000 0.396
#> SRR1391985 2 0.3843 0.5794 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1478501 1 0.0363 0.8361 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1480917 5 0.2520 0.6311 0.000 0.012 0.008 0.000 0.872 0.108
#> SRR1474485 1 0.2798 0.7951 0.852 0.000 0.036 0.112 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0713 0.8336 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0363 0.8390 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1319262 6 0.3025 0.5040 0.000 0.156 0.024 0.000 0.000 0.820
#> SRR1095188 6 0.4255 -0.4482 0.000 0.476 0.004 0.004 0.004 0.512
#> SRR1454350 1 0.0363 0.8355 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0458 0.8351 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1359565 6 0.4317 -0.3429 0.000 0.004 0.408 0.016 0.000 0.572
#> SRR1105417 1 0.3221 0.6424 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1325578 5 0.6987 0.3906 0.000 0.284 0.128 0.016 0.484 0.088
#> SRR1358161 5 0.5839 0.1578 0.000 0.008 0.348 0.016 0.524 0.104
#> SRR1358665 2 0.3854 0.5594 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1333971 5 0.5366 0.2965 0.000 0.284 0.000 0.000 0.568 0.148
#> SRR1452010 1 0.3371 0.6076 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1418183 6 0.0820 0.5572 0.000 0.012 0.000 0.016 0.000 0.972
#> SRR1366345 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.1007 0.8296 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.2340 0.7913 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1090837 6 0.1116 0.5542 0.000 0.008 0.028 0.004 0.000 0.960
#> SRR1447828 3 0.2163 0.7540 0.000 0.000 0.892 0.016 0.000 0.092
#> SRR1338747 2 0.3797 0.6196 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1333038 3 0.2405 0.7071 0.000 0.016 0.880 0.004 0.000 0.100
#> SRR1350280 1 0.3023 0.6770 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.1814 0.8027 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.4555 0.5835 0.000 0.540 0.000 0.000 0.036 0.424
#> SRR1441443 6 0.4095 -0.4593 0.000 0.480 0.000 0.008 0.000 0.512
#> SRR1370682 3 0.1970 0.7559 0.000 0.000 0.900 0.008 0.000 0.092
#> SRR1475448 6 0.1921 0.5594 0.000 0.052 0.032 0.000 0.000 0.916
#> SRR1407291 1 0.3101 0.6684 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0632 0.8341 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.2092 0.7857 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.3701 0.1086 0.000 0.780 0.012 0.184 0.008 0.016
#> SRR1325794 6 0.3819 0.4418 0.000 0.172 0.000 0.000 0.064 0.764
#> SRR1095961 6 0.4487 0.0527 0.000 0.020 0.316 0.020 0.000 0.644
#> SRR1086702 6 0.3789 -0.2055 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1320806 6 0.2051 0.5497 0.000 0.036 0.008 0.040 0.000 0.916
#> SRR1457527 3 0.4060 0.6560 0.000 0.000 0.684 0.032 0.000 0.284
#> SRR1098831 2 0.3851 0.5643 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1474374 3 0.4374 0.5190 0.000 0.004 0.532 0.016 0.000 0.448
#> SRR1488858 1 0.4209 0.6826 0.736 0.000 0.104 0.160 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.1075 0.8294 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1090241 6 0.2941 0.4027 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1329863 2 0.3828 0.5993 0.000 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR1357733 1 0.0865 0.8329 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.1501 0.8222 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.1765 0.7472 0.000 0.000 0.924 0.024 0.000 0.052
#> SRR1309182 1 0.3151 0.6514 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1588 0.8204 0.924 0.000 0.004 0.072 0.000 0.000
#> SRR1084742 5 0.3883 0.5058 0.000 0.332 0.000 0.012 0.656 0.000
#> SRR1433538 1 0.3126 0.6713 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.3695 0.6358 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1454247 5 0.0520 0.6452 0.000 0.008 0.000 0.008 0.984 0.000
#> SRR1097100 6 0.3868 -0.4527 0.000 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR818622 6 0.1003 0.5616 0.000 0.028 0.004 0.004 0.000 0.964
#> SRR1072388 1 0.1700 0.8182 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.5729 0.5251 0.000 0.512 0.000 0.016 0.116 0.356
#> SRR1320761 6 0.4411 0.4475 0.000 0.076 0.000 0.008 0.196 0.720
#> SRR1076195 3 0.2668 0.6507 0.000 0.004 0.828 0.168 0.000 0.000
#> SRR1069895 6 0.1003 0.5529 0.000 0.004 0.004 0.028 0.000 0.964
#> SRR1099144 1 0.1700 0.8182 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1385150 6 0.2113 0.5461 0.000 0.028 0.060 0.004 0.000 0.908
#> SRR1420191 6 0.3868 -0.4652 0.000 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1332625 1 0.3892 0.5497 0.640 0.004 0.004 0.352 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.3101 0.6655 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.1644 0.8201 0.920 0.000 0.004 0.076 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1444830 6 0.1765 0.5422 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1096267 1 0.0363 0.8372 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1087127 5 0.0820 0.6390 0.000 0.000 0.016 0.012 0.972 0.000
#> SRR1408553 1 0.5371 -0.3240 0.460 0.004 0.004 0.452 0.080 0.000
#> SRR1069231 1 0.1765 0.8214 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.4745 0.4465 0.000 0.672 0.000 0.124 0.000 0.204
#> SRR1362103 1 0.1444 0.8224 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0363 0.8369 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0458 0.8354 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.3899 0.6331 0.000 0.628 0.000 0.008 0.000 0.364
#> SRR1099330 6 0.2378 0.4976 0.000 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848
#> SRR1077874 2 0.4242 0.5683 0.000 0.536 0.000 0.000 0.016 0.448
#> SRR808299 6 0.3851 -0.3522 0.000 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1098050 5 0.0692 0.6419 0.000 0.004 0.000 0.020 0.976 0.000
#> SRR1481238 6 0.3072 0.5314 0.000 0.084 0.000 0.000 0.076 0.840
#> SRR1443568 6 0.1845 0.5381 0.000 0.072 0.004 0.008 0.000 0.916
#> SRR1380249 1 0.4438 0.5578 0.640 0.000 0.020 0.324 0.016 0.000
#> SRR1080143 1 0.3101 0.6641 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.5066 0.4168 0.592 0.000 0.104 0.304 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.1501 0.8246 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1416025 6 0.4258 -0.4385 0.000 0.468 0.000 0.016 0.000 0.516
#> SRR1431015 6 0.3945 -0.1532 0.000 0.380 0.000 0.008 0.000 0.612
#> SRR1078709 2 0.4929 0.2164 0.000 0.664 0.000 0.132 0.004 0.200
#> SRR813283 1 0.0547 0.8347 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.3706 0.6353 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1070665 1 0.0632 0.8356 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.3864 0.5189 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1347707 4 0.6336 -0.3172 0.000 0.312 0.328 0.352 0.008 0.000
#> SRR807679 1 0.1327 0.8248 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1333811 6 0.7021 0.1810 0.000 0.084 0.236 0.016 0.164 0.500
#> SRR1078660 2 0.5415 0.0800 0.000 0.628 0.004 0.180 0.008 0.180
#> SRR1331730 2 0.3592 0.6290 0.000 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1333913 1 0.1531 0.8218 0.928 0.000 0.004 0.068 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.1753 0.8173 0.912 0.000 0.004 0.084 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0790 0.8328 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0363 0.8357 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.3851 0.5644 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1402437 1 0.1444 0.8224 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1350958 6 0.3789 -0.2109 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1396822 6 0.0458 0.5620 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1441934 6 0.2070 0.5164 0.000 0.100 0.000 0.008 0.000 0.892
#> SRR1472552 6 0.4337 0.0401 0.000 0.020 0.320 0.012 0.000 0.648
#> SRR1488881 3 0.4335 0.4912 0.000 0.000 0.508 0.020 0.000 0.472
#> SRR1102973 1 0.0547 0.8353 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1071131 6 0.6345 -0.0890 0.000 0.340 0.196 0.024 0.000 0.440
#> SRR1074502 1 0.0632 0.8396 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.2587 0.7952 0.868 0.004 0.020 0.108 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.3828 0.5983 0.000 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR809113 6 0.3851 -0.3545 0.000 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1430045 2 0.3531 0.6231 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1441245 2 0.3998 0.6220 0.000 0.644 0.000 0.016 0.000 0.340
#> SRR1384091 1 0.3805 0.5925 0.664 0.004 0.004 0.328 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.3528 0.6070 0.000 0.700 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR1096525 5 0.4535 0.0905 0.024 0.004 0.000 0.472 0.500 0.000
#> SRR1488491 6 0.3843 -0.3271 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1356351 5 0.5920 0.0619 0.000 0.192 0.004 0.000 0.468 0.336
#> SRR1369514 1 0.3330 0.6432 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000 0.000
#> SRR1453299 3 0.3265 0.6832 0.000 0.000 0.748 0.004 0.000 0.248
#> SRR1436300 1 0.0547 0.8369 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.0717 0.6448 0.000 0.008 0.000 0.016 0.976 0.000
#> SRR1091767 2 0.3725 0.2048 0.000 0.776 0.000 0.172 0.004 0.048
#> SRR1354467 6 0.4066 -0.2722 0.000 0.000 0.392 0.012 0.000 0.596
#> SRR1069074 6 0.3330 0.2609 0.000 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1452399 6 0.5036 -0.2341 0.000 0.416 0.048 0.012 0.000 0.524
#> SRR1437430 3 0.2166 0.7232 0.000 0.024 0.920 0.016 0.016 0.024
#> SRR1419736 5 0.0508 0.6425 0.000 0.004 0.000 0.012 0.984 0.000
#> SRR1313343 3 0.1753 0.7555 0.000 0.000 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR1077619 1 0.3240 0.7202 0.752 0.000 0.004 0.244 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.1501 0.8233 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1333633 5 0.5737 0.4393 0.000 0.128 0.012 0.008 0.576 0.276
#> SRR1354999 6 0.0964 0.5558 0.000 0.012 0.004 0.016 0.000 0.968
#> SRR1443592 2 0.3727 0.6348 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1077356 1 0.1387 0.8199 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.0820 0.6390 0.000 0.000 0.016 0.012 0.972 0.000
#> SRR1413182 1 0.4199 0.2534 0.544 0.004 0.008 0.444 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.4707 0.5160 0.672 0.000 0.216 0.112 0.000 0.000
#> SRR1413075 5 0.0767 0.6475 0.000 0.008 0.000 0.012 0.976 0.004
#> SRR1487928 3 0.5020 0.3117 0.128 0.004 0.648 0.220 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.4229 0.4841 0.000 0.712 0.000 0.068 0.000 0.220
#> SRR1092865 6 0.1806 0.5330 0.000 0.088 0.000 0.004 0.000 0.908
#> SRR1102729 1 0.0713 0.8335 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8369 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.3797 0.6189 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1376874 3 0.2250 0.7553 0.000 0.000 0.888 0.020 0.000 0.092
#> SRR1339903 1 0.1556 0.8282 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.1610 0.8200 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.3854 0.5602 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1095358 6 0.4051 0.3679 0.000 0.224 0.004 0.000 0.044 0.728
#> SRR1480941 6 0.2755 0.5131 0.000 0.140 0.012 0.000 0.004 0.844
#> SRR1479175 6 0.3866 -0.4289 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1313891 2 0.3615 0.5923 0.000 0.700 0.000 0.008 0.000 0.292
#> SRR1491354 1 0.2378 0.7630 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1433884 6 0.2920 0.4290 0.000 0.168 0.004 0.008 0.000 0.820
#> SRR1471074 2 0.3843 0.5820 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1353052 6 0.3717 -0.1770 0.000 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616
#> SRR1355554 6 0.1194 0.5492 0.000 0.008 0.004 0.032 0.000 0.956
#> SRR1487173 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0632 0.8341 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.3578 0.4784 0.000 0.784 0.000 0.052 0.000 0.164
#> SRR1318331 2 0.3923 0.6192 0.000 0.580 0.000 0.004 0.000 0.416
#> SRR1321333 3 0.4097 0.4725 0.000 0.000 0.500 0.008 0.000 0.492
#> SRR1474231 1 0.1327 0.8248 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.2454 0.7549 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.1501 0.8222 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.1168 0.7398 0.000 0.000 0.956 0.016 0.000 0.028
#> SRR1455989 6 0.3309 0.2701 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1453680 3 0.2350 0.7545 0.000 0.000 0.880 0.020 0.000 0.100
#> SRR1470356 6 0.3823 -0.2744 0.000 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1342977 2 0.3823 0.6038 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR1444222 6 0.3823 -0.2763 0.000 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1097197 1 0.2941 0.6919 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.3481 0.7144 0.000 0.000 0.776 0.032 0.000 0.192
#> SRR821282 3 0.2070 0.7553 0.000 0.000 0.892 0.008 0.000 0.100
#> SRR1074602 6 0.1155 0.5606 0.000 0.036 0.004 0.004 0.000 0.956
#> SRR814633 6 0.3862 -0.4034 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1072480 5 0.7556 0.3012 0.000 0.140 0.248 0.016 0.424 0.172
#> SRR1319100 1 0.0790 0.8347 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1324004 6 0.1138 0.5485 0.000 0.004 0.024 0.012 0.000 0.960
#> SRR1457459 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.3464 0.6320 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1444598 5 0.5920 0.2873 0.000 0.028 0.320 0.124 0.528 0.000
#> SRR1091743 6 0.1141 0.5582 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR819637 1 0.1075 0.8305 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0260 0.8358 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1088934 6 0.0692 0.5621 0.000 0.020 0.004 0.000 0.000 0.976
#> SRR1459785 3 0.4649 0.6211 0.000 0.004 0.632 0.016 0.024 0.324
#> SRR1083700 1 0.0865 0.8337 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.2219 0.7834 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1323470 6 0.4026 0.2245 0.000 0.004 0.032 0.252 0.000 0.712
#> SRR814657 1 0.3288 0.6382 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.997 0.999 0.4915 0.509 0.509
#> 3 3 1.000 0.986 0.992 0.0157 0.997 0.993
#> 4 4 0.910 0.894 0.942 0.0710 0.991 0.982
#> 5 5 0.917 0.903 0.959 0.0773 0.924 0.846
#> 6 6 0.898 0.888 0.945 0.0208 0.992 0.981
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.2778 0.950 0.048 0.952
#> SRR1431735 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR1436949 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.1633 0.975 0.024 0.976
#> SRR1325826 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 2 0.3274 0.937 0.060 0.940
#> SRR1309314 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.0938 0.988 0.012 0.988
#> SRR807679 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR1479175 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.9661 0.354 0.608 0.392
#> SRR814657 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.0237 0.530 0.004 0.000 0.996
#> SRR1326059 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465313 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR819559 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1387899 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1469926 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1090310 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1363654 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1326317 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1329947 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1464880 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.1163 0.973 0.972 0.000 0.028
#> SRR1354203 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.1163 0.973 0.972 0.000 0.028
#> SRR1486821 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.2625 0.932 0.916 0.000 0.084
#> SRR1080648 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1321829 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.3340 0.899 0.880 0.000 0.120
#> SRR1391811 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1072055 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359738 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085900 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.2261 0.946 0.932 0.000 0.068
#> SRR1347870 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1460211 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1443350 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079380 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 2 0.1860 0.931 0.000 0.948 0.052
#> SRR1431735 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1370447 1 0.2261 0.946 0.932 0.000 0.068
#> SRR1446308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.1860 0.958 0.948 0.000 0.052
#> SRR1319584 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.1964 0.955 0.944 0.000 0.056
#> SRR1317939 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.3340 0.899 0.880 0.000 0.120
#> SRR1400799 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.1163 0.973 0.972 0.000 0.028
#> SRR1312226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069328 1 0.1163 0.973 0.972 0.000 0.028
#> SRR1445023 1 0.2261 0.946 0.932 0.000 0.068
#> SRR1077599 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 2 0.0424 0.990 0.000 0.992 0.008
#> SRR1436949 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.3412 0.895 0.876 0.000 0.124
#> SRR1310334 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385434 1 0.3267 0.903 0.884 0.000 0.116
#> SRR1415591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.1964 0.955 0.944 0.000 0.056
#> SRR1308734 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR814341 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR809919 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1370818 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1323651 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415708 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069871 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.3340 0.899 0.880 0.000 0.120
#> SRR1309333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1352996 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1413137 1 0.2261 0.946 0.932 0.000 0.068
#> SRR1469973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.1163 0.973 0.972 0.000 0.028
#> SRR1416266 1 0.2625 0.932 0.916 0.000 0.084
#> SRR1071011 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1435394 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081639 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.1860 0.958 0.948 0.000 0.052
#> SRR1474930 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.2261 0.946 0.932 0.000 0.068
#> SRR811915 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1163 0.973 0.972 0.000 0.028
#> SRR1310997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378220 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.1163 0.964 0.000 0.972 0.028
#> SRR1325826 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.1964 0.955 0.944 0.000 0.056
#> SRR1345692 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1374396 1 0.3340 0.899 0.880 0.000 0.120
#> SRR1454073 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 2 0.2165 0.914 0.000 0.936 0.064
#> SRR1309314 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420085 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096760 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.2711 0.929 0.912 0.000 0.088
#> SRR1394321 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1081160 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390413 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1447893 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1445701 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1489328 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.1860 0.958 0.948 0.000 0.052
#> SRR1355769 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.2261 0.946 0.932 0.000 0.068
#> SRR1089998 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1318140 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1325578 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0592 0.981 0.988 0.000 0.012
#> SRR1090837 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102656 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475448 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.3192 0.907 0.888 0.000 0.112
#> SRR1454695 1 0.1289 0.971 0.968 0.000 0.032
#> SRR1090241 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1379581 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1309182 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1084742 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1070332 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.3340 0.899 0.880 0.000 0.120
#> SRR1069895 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0424 0.983 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385150 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.2711 0.929 0.912 0.000 0.088
#> SRR1102583 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1340574 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408553 1 0.2261 0.946 0.932 0.000 0.068
#> SRR1069231 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1080143 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.3192 0.907 0.888 0.000 0.112
#> SRR1357042 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1466927 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.0747 0.980 0.000 0.984 0.016
#> SRR807679 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418041 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085211 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1350958 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071131 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1409171 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.1411 0.968 0.964 0.000 0.036
#> SRR1431887 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.2625 0.932 0.916 0.000 0.084
#> SRR1488491 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.0892 0.977 0.980 0.000 0.020
#> SRR1453299 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1083530 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413182 1 0.2796 0.925 0.908 0.000 0.092
#> SRR1464559 1 0.1643 0.963 0.956 0.000 0.044
#> SRR1413075 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.3340 0.899 0.880 0.000 0.120
#> SRR1388997 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456423 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339903 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.0424 0.990 0.000 0.992 0.008
#> SRR1479175 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1455989 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR821282 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074602 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.1411 0.968 0.964 0.000 0.036
#> SRR1444598 2 0.0237 0.995 0.000 0.996 0.004
#> SRR1091743 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.0237 0.984 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375531 1 0.1163 0.973 0.972 0.000 0.028
#> SRR1323470 3 0.6079 0.364 0.000 0.388 0.612
#> SRR814657 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.4981 0.0000 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1326059 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0707 0.8875 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1465313 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819559 1 0.2760 0.8432 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.1211 0.8838 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1469926 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.0817 0.8872 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1098426 1 0.1022 0.8857 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1090310 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.1389 0.8813 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1363654 1 0.1716 0.8752 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4866 0.6070 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.3311 0.8121 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.2760 0.7425 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.4713 0.6555 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1354203 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0188 0.8889 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4746 0.6471 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1486821 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.4972 0.5357 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1080648 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.4866 0.6070 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1940 0.8677 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.5000 0.4689 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1391811 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.1716 0.8726 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1086490 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.1302 0.8827 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1384431 1 0.1211 0.8836 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1072055 1 0.1637 0.8768 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1359738 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.1022 0.8853 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.4907 0.5865 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1389 0.8813 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3400 0.8106 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.1637 0.8768 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1079380 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.6031 0.7806 0.000 0.420 0.536 0.044
#> SRR1431735 1 0.1022 0.8859 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1417387 1 0.1716 0.8726 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1445984 1 0.2216 0.8610 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1370447 1 0.4925 0.5761 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.4898 0.5921 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1319584 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.4855 0.6115 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0469 0.8886 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.5000 0.4689 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1400799 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.3172 0.8232 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.1302 0.8822 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1069328 1 0.4697 0.6598 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1445023 1 0.4907 0.5865 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 2 0.4950 -0.3384 0.000 0.620 0.376 0.004
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.5168 0.4613 0.500 0.000 0.004 0.496
#> SRR1310334 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 1 0.4999 0.4761 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1415591 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.4605 0.6792 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1308734 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.1940 0.8677 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR814341 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.1557 0.8792 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1370818 1 0.4866 0.6070 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0336 0.8886 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR809534 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0817 0.8871 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.1716 0.8726 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1080044 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1118 0.8847 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1069871 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.1022 0.8859 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1417023 1 0.5000 0.4689 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.1389 0.8813 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1352996 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.4776 0.6375 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1413137 1 0.4925 0.5761 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.4564 0.6868 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1416266 1 0.4972 0.5357 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.4877 0.6021 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0336 0.8889 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1419962 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.1118 0.8845 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1081639 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.3311 0.8121 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.4898 0.5921 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.4888 0.5966 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR811915 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.3172 0.8232 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0469 0.8886 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1378220 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0817 0.8872 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1348885 3 0.5576 0.7791 0.000 0.444 0.536 0.020
#> SRR1325826 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.4855 0.6115 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0921 0.8862 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1374396 1 0.5000 0.4689 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0188 0.8889 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361436 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.6214 0.7673 0.000 0.408 0.536 0.056
#> SRR1309314 2 0.4431 0.0744 0.000 0.696 0.304 0.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.2081 0.8643 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 1 0.4967 0.5419 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1394321 1 0.1716 0.8751 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.2530 0.8528 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0469 0.8886 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1486139 1 0.0817 0.8869 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1470313 1 0.4866 0.6070 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1447893 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.2149 0.8649 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1445701 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.3444 0.8076 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.4585 0.6830 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1355769 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.4955 0.5539 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1089998 1 0.0921 0.8862 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1318140 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.2281 0.8612 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0336 0.8889 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0188 0.8889 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473461 1 0.2530 0.8523 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1090837 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0707 0.8876 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.2760 0.7425 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.2530 0.7796 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 1 0.4998 0.4831 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1454695 1 0.4605 0.6797 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.1716 0.8751 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1379581 2 0.2760 0.7425 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3311 0.8121 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0188 0.8887 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.2589 0.8500 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.5000 0.4689 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.3311 0.8121 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1385150 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4967 0.5419 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1102583 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2216 0.8610 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1340574 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408553 1 0.4925 0.5761 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1069231 1 0.0336 0.8889 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0817 0.8872 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1321942 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.4866 0.6070 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1080143 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.4998 0.4831 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1357042 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0921 0.8862 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0921 0.8862 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.5125 -0.4062 0.000 0.604 0.388 0.008
#> SRR807679 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.2216 0.8610 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1418041 1 0.0817 0.8868 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1085211 1 0.1867 0.8717 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1557 0.8783 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0817 0.8874 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1071131 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.2589 0.8500 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.4804 0.6299 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.4972 0.5357 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.4008 0.7614 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1453299 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 1 0.4866 0.6070 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1083530 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0707 0.8875 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1378818 2 0.0336 0.9745 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1413182 1 0.4985 0.5167 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1464559 1 0.4866 0.6070 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.5000 0.4689 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.2281 0.8612 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.2760 0.7425 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.5161 0.7459 0.000 0.476 0.520 0.004
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0336 0.8886 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0336 0.8889 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1091328 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.2760 0.7425 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0707 0.8875 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1366729 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821282 2 0.2760 0.7425 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.1474 0.9016 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.4804 0.6299 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1444598 2 0.4431 0.0744 0.000 0.696 0.304 0.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.8891 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.9866 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.1022 0.8853 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1375531 1 0.3172 0.8232 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1323470 3 0.5724 -0.5072 0.000 0.140 0.716 0.144
#> SRR814657 1 0.0336 0.8889 0.992 0.000 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 5 0.0000 0.5968 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0609 0.9327 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1465313 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR819559 1 0.3003 0.7723 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.1341 0.9117 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1469926 2 0.0609 0.9675 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.0703 0.9312 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1098426 1 0.0963 0.9255 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.1908 0.8823 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1363654 1 0.1608 0.9011 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2329 0.8154 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.3336 0.7021 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.4307 0.4918 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.4291 0.0246 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0290 0.9367 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0162 0.9378 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.4291 0.0221 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1486821 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0162 0.9377 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359487 4 0.0880 0.7559 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.2377 0.8163 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.2516 0.8285 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.1012 0.7248 0.012 0.000 0.020 0.968 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.2230 0.8551 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.2561 0.8282 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1384431 1 0.2773 0.8012 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1072055 1 0.1851 0.8876 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.1043 0.9228 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 4 0.2690 0.8077 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.1965 0.8786 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3480 0.6758 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.1851 0.8876 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1079380 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.0510 -0.4521 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1431735 1 0.0880 0.9278 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1417387 1 0.2074 0.8676 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1445984 1 0.2280 0.8550 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1370447 4 0.2471 0.8149 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2561 0.8146 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.3366 0.7302 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0703 0.9308 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335314 4 0.1012 0.7248 0.012 0.000 0.020 0.968 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.3366 0.7025 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.1197 0.9178 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1069328 1 0.4268 0.1119 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1445023 4 0.2690 0.8077 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.3246 -0.0410 0.000 0.184 0.808 0.008 0.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.1195 0.7196 0.012 0.000 0.028 0.960 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0609 0.9675 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.0912 0.7260 0.012 0.000 0.016 0.972 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0162 0.9378 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316055 4 0.3642 0.7194 0.232 0.000 0.008 0.760 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.2377 0.8426 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.1608 0.9027 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1370818 4 0.2377 0.8163 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317731 2 0.0703 0.9619 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1490785 1 0.0162 0.9378 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0290 0.9366 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0703 0.9312 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.2230 0.8551 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1121 0.9211 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0963 0.9256 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1417023 4 0.1012 0.7248 0.012 0.000 0.020 0.968 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.1908 0.8823 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.3636 0.6698 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1413137 4 0.2516 0.8144 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.4235 0.1935 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1416266 4 0.0880 0.7559 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2929 0.7878 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0290 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1419962 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.1197 0.9191 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1081639 2 0.0609 0.9675 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.3612 0.6258 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.3143 0.7619 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470988 4 0.2773 0.8015 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.0609 0.9675 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.3636 0.6266 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0404 0.9356 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0703 0.9312 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1348885 3 0.0566 -0.4414 0.000 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.3305 0.7404 0.224 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0880 0.9275 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1374396 4 0.1012 0.7248 0.012 0.000 0.020 0.968 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0162 0.9377 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.0794 -0.4574 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1309314 3 0.3835 0.2444 0.000 0.260 0.732 0.008 0.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.2074 0.8695 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1956 0.7910 0.076 0.000 0.008 0.916 0.000
#> SRR1394321 1 0.1851 0.8874 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.3143 0.7517 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0703 0.9308 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1486139 1 0.0794 0.9288 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1470313 4 0.2471 0.8158 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0290 0.9832 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.3274 0.7239 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.3508 0.6680 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.4127 0.6191 0.312 0.000 0.008 0.680 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 4 0.2516 0.8103 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1089998 1 0.0880 0.9275 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.2471 0.8432 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0290 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0162 0.9377 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473461 1 0.2852 0.7942 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0703 0.9314 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.4307 0.4918 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457527 2 0.4283 -0.4294 0.000 0.544 0.456 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.0807 0.7273 0.012 0.000 0.012 0.976 0.000
#> SRR1454695 4 0.4256 0.3723 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.1851 0.8874 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1379581 3 0.4307 0.4925 0.000 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3336 0.7021 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0162 0.9376 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.2813 0.8019 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076195 4 0.1012 0.7248 0.012 0.000 0.020 0.968 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.3612 0.6258 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1385150 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1956 0.7910 0.076 0.000 0.008 0.916 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2280 0.8550 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408553 4 0.2516 0.8144 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1069231 1 0.0290 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0703 0.9312 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0162 0.9376 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380249 4 0.2329 0.8154 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.0807 0.7273 0.012 0.000 0.012 0.976 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0880 0.9275 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0880 0.9275 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.3013 -0.1421 0.000 0.160 0.832 0.008 0.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.2561 0.8281 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1418041 1 0.0794 0.9295 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1085211 1 0.2732 0.8135 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1732 0.8940 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0880 0.9276 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.2813 0.8019 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.4030 0.5664 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0880 0.7559 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0290 0.9832 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.4219 0.2198 0.584 0.000 0.000 0.416 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0162 0.9882 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0290 0.9832 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.0703 0.9619 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1419736 2 0.0290 0.9832 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.2852 0.7957 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0609 0.9327 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1378818 2 0.2020 0.8351 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1413182 4 0.1082 0.7498 0.028 0.000 0.008 0.964 0.000
#> SRR1464559 4 0.2471 0.8158 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1413075 2 0.0290 0.9832 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1487928 4 0.1106 0.7217 0.012 0.000 0.024 0.964 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.2471 0.8432 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.4297 -0.4817 0.000 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.4238 0.3036 0.000 0.368 0.628 0.004 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0290 0.9366 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0290 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.4307 0.4925 0.000 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0609 0.9327 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1366729 2 0.0404 0.9781 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.4307 0.4918 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.1478 0.8991 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.4030 0.5664 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1444598 3 0.3835 0.2444 0.000 0.260 0.732 0.008 0.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9387 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.9927 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.1043 0.9228 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1375531 1 0.3636 0.6266 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1323470 5 0.5922 0.4324 0.000 0.128 0.256 0.008 0.608
#> SRR814657 1 0.0290 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467726 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR815446 2 0.0363 0.9837 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1402132 6 0.0000 0.6881 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326059 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR809406 1 0.0713 0.9286 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0405 0.9813 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR819559 1 0.2996 0.7432 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1488151 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1395635 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1343629 1 0.0291 0.9337 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.1444 0.9072 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0632 0.9682 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.0790 0.9279 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.1204 0.9174 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.2092 0.8653 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.1765 0.8908 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1366919 4 0.1471 0.7006 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1329947 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469769 2 0.0146 0.9872 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0363 0.9839 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1380122 2 0.0405 0.9813 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092818 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1093552 1 0.3101 0.6989 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1078368 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0713 0.9697 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1320034 3 0.3727 0.5592 0.000 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310777 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1374005 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1319182 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1329994 4 0.3997 0.0346 0.488 0.000 0.000 0.508 0.004 0.000
#> SRR1354203 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077850 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369241 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1077992 2 0.0713 0.9697 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1455214 1 0.0547 0.9314 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0508 0.9328 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1473318 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1071207 4 0.3997 0.0368 0.488 0.000 0.000 0.508 0.004 0.000
#> SRR1486821 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.0405 0.9332 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359487 4 0.1501 0.6144 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1080648 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0713 0.9697 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1531 0.7030 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR1321829 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1349300 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.2595 0.8177 0.836 0.000 0.000 0.160 0.004 0.000
#> SRR1453769 2 0.0260 0.9862 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473870 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1366124 4 0.3351 0.4836 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1391811 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1456674 1 0.2219 0.8443 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.2562 0.8130 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.2631 0.7941 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.2135 0.8641 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.1219 0.9203 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR1085900 2 0.0363 0.9833 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1442173 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357999 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 4 0.2446 0.7028 0.124 0.000 0.000 0.864 0.012 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0713 0.9697 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102128 1 0.2135 0.8614 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0713 0.9697 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1070060 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.3489 0.6369 0.708 0.000 0.000 0.288 0.004 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.2135 0.8641 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0405 0.9842 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1390223 2 0.0363 0.9837 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1436840 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 5 0.3672 0.1631 0.000 0.000 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1431735 1 0.1075 0.9217 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.2092 0.8573 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.2260 0.8464 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.2214 0.7094 0.096 0.000 0.000 0.888 0.016 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1098974 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468914 4 0.1806 0.7077 0.088 0.000 0.000 0.908 0.004 0.000
#> SRR1319584 2 0.0458 0.9772 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.3141 0.6383 0.200 0.000 0.000 0.788 0.012 0.000
#> SRR1317939 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1079730 1 0.0291 0.9337 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1341921 1 0.1349 0.9153 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004 0.000
#> SRR1399178 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415615 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1340828 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1079543 2 0.0363 0.9839 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0146 0.9874 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1335314 4 0.3351 0.4836 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.3266 0.6709 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1416207 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447371 1 0.1411 0.9139 0.936 0.000 0.000 0.060 0.004 0.000
#> SRR1069328 1 0.3997 0.0276 0.508 0.000 0.000 0.488 0.004 0.000
#> SRR1445023 4 0.2446 0.7028 0.124 0.000 0.000 0.864 0.012 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.2623 -0.5230 0.000 0.016 0.852 0.000 0.132 0.000
#> SRR1436949 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.3371 0.4759 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1310334 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418201 2 0.0632 0.9682 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.3288 0.4911 0.000 0.000 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0508 0.9328 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1316055 4 0.3071 0.6445 0.180 0.000 0.000 0.804 0.016 0.000
#> SRR1308734 2 0.0146 0.9872 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0603 0.9317 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1392141 1 0.2482 0.8322 0.848 0.000 0.000 0.148 0.004 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.0458 0.9772 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR809919 1 0.1806 0.8974 0.908 0.000 0.000 0.088 0.004 0.000
#> SRR1370818 4 0.1531 0.7030 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0935 0.9530 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091230 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470556 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR812318 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317731 2 0.0713 0.9634 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490785 1 0.0508 0.9328 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1432032 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0363 0.9329 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR812128 2 0.0405 0.9813 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101513 1 0.0713 0.9288 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.2219 0.8443 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0291 0.9337 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1420850 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474295 1 0.1267 0.9147 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1068929 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1490097 2 0.0363 0.9836 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075458 1 0.1141 0.9196 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1417023 4 0.3330 0.4878 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.2092 0.8653 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.3287 0.6043 0.220 0.000 0.000 0.768 0.012 0.000
#> SRR1413137 4 0.2218 0.7087 0.104 0.000 0.000 0.884 0.012 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.3989 0.1138 0.528 0.000 0.000 0.468 0.004 0.000
#> SRR1416266 4 0.0937 0.6246 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.2389 0.6961 0.128 0.000 0.000 0.864 0.008 0.000
#> SRR1435394 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1383192 1 0.1082 0.9231 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1419962 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.1327 0.9124 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0632 0.9682 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1312147 1 0.3351 0.6169 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2558 0.6729 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470988 4 0.2531 0.6982 0.132 0.000 0.000 0.856 0.012 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1313770 2 0.0632 0.9682 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315780 2 0.0363 0.9839 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1073631 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR819124 1 0.3464 0.5910 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1464494 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0713 0.9299 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0790 0.9279 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1348885 5 0.3737 0.1529 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.3078 0.6471 0.192 0.000 0.000 0.796 0.012 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.0146 0.9872 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097954 1 0.0937 0.9238 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.3351 0.4836 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0146 0.9340 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 5 0.3899 0.1518 0.000 0.000 0.364 0.008 0.628 0.000
#> SRR1309314 3 0.1267 -0.3662 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472126 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0291 0.9337 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1079480 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1339276 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418368 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.2003 0.8656 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812294 4 0.1794 0.6726 0.036 0.000 0.000 0.924 0.040 0.000
#> SRR1394321 1 0.2135 0.8639 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.3050 0.7306 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1099570 2 0.0146 0.9875 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.1349 0.9153 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004 0.000
#> SRR1486139 1 0.1010 0.9256 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004 0.000
#> SRR1470313 4 0.1644 0.7057 0.076 0.000 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.2006 0.8529 0.000 0.892 0.004 0.000 0.104 0.000
#> SRR1477429 1 0.3126 0.7058 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1451876 2 0.0363 0.9839 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.3508 0.6289 0.704 0.000 0.000 0.292 0.004 0.000
#> SRR1489328 2 0.0363 0.9833 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1344462 1 0.0291 0.9337 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1082709 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.3695 0.5470 0.272 0.000 0.000 0.712 0.016 0.000
#> SRR1355769 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478501 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480917 2 0.0713 0.9697 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1474485 4 0.4681 0.6221 0.112 0.000 0.000 0.676 0.212 0.000
#> SRR1089998 1 0.0937 0.9238 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0363 0.9833 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1454350 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440374 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.2491 0.8291 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.0458 0.9772 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358665 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1333971 2 0.0713 0.9697 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1452010 1 0.1082 0.9231 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387449 1 0.0260 0.9337 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.2854 0.7699 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0790 0.9285 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1370682 3 0.3727 0.5592 0.000 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0405 0.9813 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325794 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1320806 2 0.0146 0.9874 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457527 3 0.3833 0.4963 0.000 0.444 0.556 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.3244 0.4981 0.000 0.000 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1454695 4 0.3737 0.3986 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0363 0.9839 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1329863 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357733 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1362135 1 0.2135 0.8639 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.3695 0.5505 0.000 0.376 0.624 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309182 1 0.0260 0.9334 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3101 0.6989 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1433538 1 0.0363 0.9327 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1097100 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.2730 0.7918 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0146 0.9874 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1076195 4 0.3351 0.4836 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.3351 0.6169 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0603 0.9753 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1794 0.6726 0.036 0.000 0.000 0.924 0.040 0.000
#> SRR1102583 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.2260 0.8464 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087127 2 0.0458 0.9772 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408553 4 0.2218 0.7087 0.104 0.000 0.000 0.884 0.012 0.000
#> SRR1069231 1 0.1082 0.9231 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1325642 2 0.0363 0.9837 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1362103 1 0.0790 0.9279 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1094380 1 0.0405 0.9334 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0260 0.9859 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1098050 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1481238 2 0.0260 0.9861 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380249 4 0.1471 0.7006 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1080143 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.3244 0.4981 0.000 0.000 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1357042 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0363 0.9836 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR813283 1 0.0937 0.9238 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0937 0.9238 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347707 3 0.2814 -0.5524 0.000 0.008 0.820 0.000 0.172 0.000
#> SRR807679 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0363 0.9836 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1331730 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333913 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432542 1 0.2491 0.8191 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0865 0.9263 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.2697 0.7978 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.2048 0.8710 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.1082 0.9248 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1071131 2 0.0146 0.9874 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074502 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325271 1 0.2730 0.7918 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0146 0.9878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.3547 0.5103 0.300 0.000 0.000 0.696 0.004 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0937 0.6246 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1488491 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1356351 2 0.1806 0.8794 0.000 0.908 0.004 0.000 0.088 0.000
#> SRR1369514 1 0.3982 0.1389 0.536 0.000 0.000 0.460 0.004 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1348490 2 0.0858 0.9584 0.000 0.968 0.028 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.1858 0.8679 0.000 0.904 0.004 0.000 0.092 0.000
#> SRR1437430 2 0.0865 0.9530 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419736 2 0.1806 0.8794 0.000 0.908 0.004 0.000 0.088 0.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077619 4 0.2191 0.7008 0.120 0.000 0.000 0.876 0.004 0.000
#> SRR1083530 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0713 0.9289 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.2278 0.7940 0.000 0.868 0.128 0.000 0.004 0.000
#> SRR1413182 4 0.2969 0.5322 0.000 0.000 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1464559 4 0.1644 0.7057 0.076 0.000 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1413075 2 0.1806 0.8794 0.000 0.908 0.004 0.000 0.088 0.000
#> SRR1487928 4 0.3371 0.4780 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.2491 0.8291 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.3789 0.5336 0.000 0.416 0.584 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1095358 2 0.0146 0.9879 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480941 5 0.5799 -0.3461 0.000 0.340 0.192 0.000 0.468 0.000
#> SRR1479175 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1313891 2 0.0458 0.9809 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1491354 1 0.0363 0.9329 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0363 0.9839 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474253 1 0.0146 0.9336 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1350545 1 0.1082 0.9231 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.3695 0.5505 0.000 0.376 0.624 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0713 0.9289 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0458 0.9771 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.3727 0.5592 0.000 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.1951 0.8648 0.000 0.908 0.076 0.000 0.016 0.000
#> SRR1319100 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1421031 4 0.3547 0.5103 0.300 0.000 0.000 0.696 0.004 0.000
#> SRR1444598 3 0.1267 -0.3662 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0146 0.9335 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1083848 1 0.0291 0.9337 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.9892 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.1219 0.9203 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR1375531 1 0.3464 0.5910 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1323470 6 0.3737 0.6700 0.000 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR814657 1 0.1082 0.9231 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4917 0.509 0.509
#> 3 3 0.768 0.612 0.816 0.1985 0.956 0.913
#> 4 4 0.658 0.727 0.829 0.1272 0.836 0.656
#> 5 5 0.643 0.696 0.794 0.0951 0.939 0.816
#> 6 6 0.662 0.389 0.719 0.0544 0.943 0.804
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.689 0.774 0.184 0.816
#> SRR1431735 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.714 0.756 0.804 0.196
#> SRR1309314 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.2711 0.67932 0.912 0.000 0.088
#> SRR1326059 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1409062 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1465313 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR819559 1 0.6308 0.90269 0.508 0.000 0.492
#> SRR1387899 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442292 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1395635 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1343629 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1326868 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102320 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1469926 2 0.6309 -0.98661 0.000 0.500 0.500
#> SRR1070036 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1098426 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1090310 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1429748 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1363654 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1326317 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1378308 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1469769 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1490761 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1402944 2 0.6308 -0.97557 0.000 0.508 0.492
#> SRR1092818 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1093552 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1464880 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1466951 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.6309 0.99230 0.000 0.496 0.504
#> SRR1068687 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437491 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1310777 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1329994 1 0.4796 0.76347 0.780 0.000 0.220
#> SRR1354203 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1077850 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1369241 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1092014 2 0.5291 0.00770 0.000 0.732 0.268
#> SRR1097857 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1473318 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1345974 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1338687 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1071207 1 0.4291 0.74084 0.820 0.000 0.180
#> SRR1486821 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1418540 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1408788 2 0.5760 -0.30434 0.000 0.672 0.328
#> SRR1359487 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1414708 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1469080 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475993 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1445387 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1077575 2 0.4452 0.36384 0.000 0.808 0.192
#> SRR1349300 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1374165 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1453769 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1401146 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1456674 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1086490 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1088511 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1384431 1 0.6244 0.88065 0.560 0.000 0.440
#> SRR1072055 1 0.6126 0.86139 0.600 0.000 0.400
#> SRR1359738 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1332141 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1085900 2 0.1753 0.69642 0.000 0.952 0.048
#> SRR1442173 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1431625 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.4452 0.36384 0.000 0.808 0.192
#> SRR1344034 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1080391 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1102128 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1460211 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.4002 0.45104 0.000 0.840 0.160
#> SRR1070060 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1487969 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.6045 0.85179 0.620 0.000 0.380
#> SRR1443350 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1076705 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1079380 2 0.5327 0.03414 0.000 0.728 0.272
#> SRR1102923 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.6309 -0.25845 0.500 0.000 0.500
#> SRR1431735 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1417387 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1445984 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1370447 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.4654 0.28979 0.000 0.792 0.208
#> SRR1437346 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1103143 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1073191 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1468914 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.6308 -0.97557 0.000 0.508 0.492
#> SRR1486584 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR813536 1 0.3686 0.71579 0.860 0.000 0.140
#> SRR1317939 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1341921 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1399178 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1328551 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.4452 0.36384 0.000 0.808 0.192
#> SRR1079543 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.5254 0.03067 0.000 0.736 0.264
#> SRR1335314 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.5835 -0.36179 0.000 0.660 0.340
#> SRR1074578 1 0.6307 0.90106 0.512 0.000 0.488
#> SRR1312226 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1447371 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1069328 1 0.4291 0.74084 0.820 0.000 0.180
#> SRR1445023 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453480 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1074839 2 0.5254 0.03067 0.000 0.736 0.264
#> SRR1458727 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1436949 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1458158 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1432408 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1418201 3 0.6309 0.98581 0.000 0.500 0.500
#> SRR1385434 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1402009 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1316055 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1498973 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1392141 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR814341 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.6309 -0.97622 0.000 0.504 0.496
#> SRR809919 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1370818 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357297 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR818170 2 0.6309 -0.99492 0.000 0.500 0.500
#> SRR1091230 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1095285 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1317731 2 0.6235 -0.79086 0.000 0.564 0.436
#> SRR1490785 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1432032 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1447808 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR809534 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1415708 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316033 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1390371 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.6309 -0.97622 0.000 0.504 0.496
#> SRR1076801 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1080044 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1420850 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1069871 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1095744 2 0.4346 0.38767 0.000 0.816 0.184
#> SRR1068929 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1075458 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1417023 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1352996 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1093172 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.5465 0.80213 0.712 0.000 0.288
#> SRR1416266 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1383192 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1419962 2 0.6309 -0.97622 0.000 0.504 0.496
#> SRR1094357 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1081639 3 0.6309 0.99230 0.000 0.496 0.504
#> SRR1356016 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.5529 -0.11132 0.000 0.704 0.296
#> SRR1312147 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1473891 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.5254 0.03067 0.000 0.736 0.264
#> SRR1470988 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1100005 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.6309 -0.97622 0.000 0.504 0.496
#> SRR1315780 2 0.1163 0.72107 0.000 0.972 0.028
#> SRR1073631 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR819124 1 0.6225 0.87742 0.568 0.000 0.432
#> SRR1310997 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0592 0.74561 0.000 0.988 0.012
#> SRR1357083 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1475842 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1378220 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1467704 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1348885 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1325826 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1466812 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1097954 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1374396 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0747 0.73894 0.000 0.984 0.016
#> SRR1355747 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1429368 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1398138 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379260 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1361436 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR817142 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1315291 1 0.6309 -0.25845 0.500 0.000 0.500
#> SRR1309314 2 0.6309 -0.99492 0.000 0.500 0.500
#> SRR1420085 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1472126 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1380482 2 0.6225 -0.78072 0.000 0.568 0.432
#> SRR1099789 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1079480 2 0.4452 0.36384 0.000 0.808 0.192
#> SRR1339276 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1418368 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1399353 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1096760 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1440290 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330813 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458931 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1081160 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1469704 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1477173 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.6215 0.87558 0.572 0.000 0.428
#> SRR1390413 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1312169 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1096687 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1486139 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1470313 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1466025 2 0.4346 0.38749 0.000 0.816 0.184
#> SRR1477429 1 0.6225 0.87712 0.568 0.000 0.432
#> SRR1445701 2 0.5254 0.03045 0.000 0.736 0.264
#> SRR820689 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1451876 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.6252 0.88240 0.556 0.000 0.444
#> SRR1489328 2 0.4178 0.41457 0.000 0.828 0.172
#> SRR1344462 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1082709 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1447784 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1488237 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1480917 2 0.0424 0.75090 0.000 0.992 0.008
#> SRR1474485 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1318140 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1319262 2 0.5465 -0.10517 0.000 0.712 0.288
#> SRR1095188 2 0.4605 0.30591 0.000 0.796 0.204
#> SRR1454350 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1440374 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1359565 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1105417 1 0.4002 0.72851 0.840 0.000 0.160
#> SRR1325578 2 0.6235 -0.79086 0.000 0.564 0.436
#> SRR1358161 2 0.6309 -0.97622 0.000 0.504 0.496
#> SRR1358665 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1418183 2 0.1643 0.70311 0.000 0.956 0.044
#> SRR1366345 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1387449 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1473461 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1090837 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1447828 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1338747 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1350280 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1088557 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1102656 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.6309 0.99230 0.000 0.496 0.504
#> SRR1475448 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1407291 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1405266 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1363766 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1082592 2 0.5291 0.00199 0.000 0.732 0.268
#> SRR1325794 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.5678 -0.24527 0.000 0.684 0.316
#> SRR1086702 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457527 2 0.6302 -0.92918 0.000 0.520 0.480
#> SRR1098831 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1488858 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.4121 0.73350 0.832 0.000 0.168
#> SRR1090241 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1329863 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1362135 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1379581 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1309182 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1437668 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1084742 2 0.4887 0.24562 0.000 0.772 0.228
#> SRR1433538 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1085063 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.4346 0.38767 0.000 0.816 0.184
#> SRR1097100 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1072388 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1070332 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1076195 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099144 1 0.5882 0.83516 0.652 0.000 0.348
#> SRR1385150 2 0.5835 -0.36179 0.000 0.660 0.340
#> SRR1420191 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1456971 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1340574 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1444830 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096267 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1087127 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1408553 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1325642 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1321942 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1094380 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1447499 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099330 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077874 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.4452 0.36384 0.000 0.808 0.192
#> SRR1481238 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.2165 0.67034 0.000 0.936 0.064
#> SRR1380249 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1383148 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1416025 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1430226 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1466927 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR807679 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1333811 2 0.5760 -0.30434 0.000 0.672 0.328
#> SRR1078660 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1432542 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1418041 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1085211 1 0.6192 0.87183 0.580 0.000 0.420
#> SRR1339812 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1350958 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1441934 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472552 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1488881 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1102973 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1071131 2 0.5650 -0.22487 0.000 0.688 0.312
#> SRR1074502 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1325271 1 0.4291 0.74084 0.820 0.000 0.180
#> SRR1409171 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.1031 0.72817 0.000 0.976 0.024
#> SRR1369514 1 0.3619 0.71320 0.864 0.000 0.136
#> SRR1453299 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1436300 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1348490 2 0.4452 0.36384 0.000 0.808 0.192
#> SRR1091767 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354467 2 0.5835 -0.36179 0.000 0.660 0.340
#> SRR1069074 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452399 2 0.6062 -0.62603 0.000 0.616 0.384
#> SRR1437430 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1419736 2 0.4452 0.36384 0.000 0.808 0.192
#> SRR1313343 2 0.6244 -0.79343 0.000 0.560 0.440
#> SRR1077619 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1333633 2 0.4702 0.26898 0.000 0.788 0.212
#> SRR1354999 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443592 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1378818 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1413182 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.3116 0.57363 0.000 0.892 0.108
#> SRR1487928 1 0.0000 0.62109 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102729 1 0.5968 0.84433 0.636 0.000 0.364
#> SRR1456423 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1321591 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.6309 0.99230 0.000 0.496 0.504
#> SRR1339903 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1346710 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1418771 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.6309 -0.99492 0.000 0.500 0.500
#> SRR1479175 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1433884 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471074 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1355554 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487173 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1474253 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1322918 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.5835 -0.36179 0.000 0.660 0.340
#> SRR1474231 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1350545 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1091328 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR814447 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1455989 2 0.5254 0.03067 0.000 0.736 0.264
#> SRR1453680 3 0.6309 0.99230 0.000 0.496 0.504
#> SRR1470356 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1366729 2 0.6302 -0.92918 0.000 0.520 0.480
#> SRR821282 3 0.6309 0.99230 0.000 0.496 0.504
#> SRR1074602 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR814633 2 0.0000 0.75957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.6309 0.99230 0.000 0.496 0.504
#> SRR1319100 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1324004 2 0.4654 0.28979 0.000 0.792 0.208
#> SRR1457459 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1421031 1 0.4062 0.73101 0.836 0.000 0.164
#> SRR1444598 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR1091743 2 0.0237 0.75676 0.000 0.996 0.004
#> SRR819637 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1083848 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1088934 2 0.4654 0.28979 0.000 0.792 0.208
#> SRR1459785 2 0.5859 -0.38058 0.000 0.656 0.344
#> SRR1083700 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
#> SRR1375531 1 0.6215 0.87550 0.572 0.000 0.428
#> SRR1323470 3 0.6309 0.99461 0.000 0.500 0.500
#> SRR814657 1 0.6309 0.90432 0.504 0.000 0.496
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.6123 0.7359 0.372 0.000 0.056 0.572
#> SRR1326059 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1409062 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809406 1 0.0188 0.8699 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465313 3 0.7253 0.6482 0.000 0.424 0.432 0.144
#> SRR819559 1 0.3208 0.8179 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1387899 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1395635 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1343629 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1326868 2 0.2742 0.7620 0.000 0.900 0.024 0.076
#> SRR1102320 1 0.2704 0.8373 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1469926 3 0.4472 0.7305 0.000 0.220 0.760 0.020
#> SRR1070036 1 0.1022 0.8701 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1098426 1 0.3569 0.8081 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1090310 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1429748 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1363654 1 0.2469 0.8457 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1326317 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.4663 0.9347 0.272 0.000 0.012 0.716
#> SRR1329947 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1469769 3 0.5088 0.6911 0.000 0.424 0.572 0.004
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.6973 0.6672 0.000 0.220 0.584 0.196
#> SRR1402944 3 0.6941 0.6695 0.000 0.220 0.588 0.192
#> SRR1092818 1 0.3123 0.8378 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1093552 1 0.3528 0.8157 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1464880 2 0.2469 0.7509 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0921 0.8302 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1466951 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1331879 2 0.4786 0.5766 0.000 0.788 0.108 0.104
#> SRR1320034 3 0.5397 0.7204 0.000 0.220 0.716 0.064
#> SRR1068687 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1437491 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.1118 0.8670 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1329994 1 0.7120 -0.0506 0.524 0.000 0.148 0.328
#> SRR1354203 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1077850 1 0.1302 0.8655 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.3616 0.6949 0.000 0.852 0.036 0.112
#> SRR1455214 1 0.2589 0.8410 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1092014 2 0.6557 -0.5865 0.000 0.476 0.448 0.076
#> SRR1097857 1 0.2973 0.8437 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1473318 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1345974 3 0.4713 0.7277 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.7227 -0.2327 0.484 0.000 0.148 0.368
#> SRR1486821 3 0.4889 0.7276 0.000 0.360 0.636 0.004
#> SRR1418540 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1408788 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1359487 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1080648 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1414708 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1469080 2 0.0921 0.8290 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.5256 0.9324 0.272 0.000 0.036 0.692
#> SRR1321829 2 0.2670 0.7643 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1475993 3 0.6425 0.6822 0.000 0.424 0.508 0.068
#> SRR1445387 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1077575 2 0.7114 0.0894 0.000 0.564 0.232 0.204
#> SRR1349300 1 0.0336 0.8698 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1374165 1 0.3668 0.8074 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1401146 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1366124 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1391811 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1456674 1 0.3710 0.8058 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR1086490 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1088511 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.2647 0.8391 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1384431 1 0.4804 0.7400 0.780 0.000 0.148 0.072
#> SRR1072055 1 0.5979 0.6084 0.692 0.000 0.172 0.136
#> SRR1359738 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1332141 1 0.3024 0.8448 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1085900 2 0.4919 0.4759 0.000 0.752 0.200 0.048
#> SRR1442173 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.7085 0.0994 0.000 0.568 0.232 0.200
#> SRR1344034 3 0.6963 0.6628 0.000 0.424 0.464 0.112
#> SRR1080391 4 0.5916 0.9155 0.272 0.000 0.072 0.656
#> SRR1347870 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR814219 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1102128 1 0.2814 0.8323 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.6702 0.2064 0.000 0.616 0.216 0.168
#> SRR1070060 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1487969 2 0.0469 0.8427 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1417851 1 0.6119 0.5522 0.680 0.000 0.152 0.168
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.1211 0.8716 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1076705 1 0.3569 0.8081 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1079380 2 0.7568 -0.2488 0.000 0.456 0.340 0.204
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.1474 0.8125 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1366605 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1436840 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.2216 0.5439 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1431735 1 0.3569 0.8081 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1417387 1 0.3528 0.8092 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1445984 1 0.3528 0.8092 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1370447 4 0.5078 0.9340 0.272 0.000 0.028 0.700
#> SRR1446308 2 0.6430 -0.5188 0.000 0.504 0.428 0.068
#> SRR1437346 3 0.6425 0.6822 0.000 0.424 0.508 0.068
#> SRR1103143 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086466 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1468914 4 0.4776 0.9348 0.272 0.000 0.016 0.712
#> SRR1319584 3 0.7028 0.6617 0.000 0.228 0.576 0.196
#> SRR1486584 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR813536 1 0.7281 -0.4143 0.440 0.000 0.148 0.412
#> SRR1317939 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1341921 1 0.3257 0.8161 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.7140 0.0810 0.000 0.560 0.236 0.204
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1076681 2 0.6557 -0.5865 0.000 0.476 0.448 0.076
#> SRR1335314 4 0.4401 0.9324 0.272 0.000 0.004 0.724
#> SRR1400799 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1074578 1 0.3708 0.8045 0.832 0.000 0.148 0.020
#> SRR1312226 2 0.1867 0.7904 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1416207 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1447371 1 0.2647 0.8445 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1069328 1 0.7227 -0.2327 0.484 0.000 0.148 0.368
#> SRR1445023 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1077599 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1453480 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.2149 0.8609 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1074839 2 0.6549 -0.5587 0.000 0.488 0.436 0.076
#> SRR1458727 3 0.6883 0.6642 0.000 0.212 0.596 0.192
#> SRR1436949 2 0.2011 0.7847 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1070429 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1458158 1 0.0336 0.8694 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1432408 4 0.4401 0.9324 0.272 0.000 0.004 0.724
#> SRR1310334 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1418201 3 0.4472 0.7305 0.000 0.220 0.760 0.020
#> SRR1385434 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1415591 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1402009 1 0.2868 0.8422 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1316055 4 0.5420 0.9287 0.272 0.000 0.044 0.684
#> SRR1308734 3 0.5355 0.7270 0.000 0.360 0.620 0.020
#> SRR1498973 2 0.2408 0.7520 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1397115 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1392141 1 0.3668 0.8074 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR814341 2 0.0188 0.8456 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313601 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.5533 0.7177 0.000 0.220 0.708 0.072
#> SRR809919 1 0.3486 0.8105 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1370818 4 0.5256 0.9324 0.272 0.000 0.036 0.692
#> SRR1323651 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1357297 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR818170 3 0.6879 0.6673 0.000 0.216 0.596 0.188
#> SRR1091230 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1095285 3 0.6482 0.6807 0.000 0.424 0.504 0.072
#> SRR1317731 3 0.6041 0.7279 0.000 0.332 0.608 0.060
#> SRR1490785 1 0.2281 0.8647 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1432032 1 0.0336 0.8698 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1447808 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0592 0.8406 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR812128 2 0.2174 0.7931 0.000 0.928 0.020 0.052
#> SRR1101513 1 0.0707 0.8716 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1415708 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1316033 3 0.4713 0.7277 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.4472 0.7305 0.000 0.220 0.760 0.020
#> SRR1076801 1 0.3710 0.8058 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR1080044 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3024 0.8204 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1069871 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1095744 2 0.7028 0.1198 0.000 0.576 0.228 0.196
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1075054 2 0.0469 0.8408 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083480 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1075458 1 0.3486 0.8129 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1417023 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1309333 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333676 1 0.3024 0.8204 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1352996 1 0.0469 0.8696 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1093172 4 0.5916 0.9155 0.272 0.000 0.072 0.656
#> SRR1413137 4 0.5916 0.9155 0.272 0.000 0.072 0.656
#> SRR1469973 2 0.0524 0.8432 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1420026 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.6781 0.2803 0.596 0.000 0.148 0.256
#> SRR1416266 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.5339 0.9308 0.272 0.000 0.040 0.688
#> SRR1435394 2 0.2670 0.7643 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1383192 1 0.1022 0.8697 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1419962 3 0.4472 0.7305 0.000 0.220 0.760 0.020
#> SRR1094357 1 0.3024 0.8204 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1081639 3 0.4764 0.7280 0.000 0.220 0.748 0.032
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.7621 -0.3418 0.000 0.420 0.376 0.204
#> SRR1312147 1 0.3528 0.8092 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.6773 0.8428 0.276 0.000 0.136 0.588
#> SRR1474930 2 0.6557 -0.5865 0.000 0.476 0.448 0.076
#> SRR1470988 4 0.5078 0.9340 0.272 0.000 0.028 0.700
#> SRR811915 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0817 0.8353 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1313770 3 0.4472 0.7305 0.000 0.220 0.760 0.020
#> SRR1315780 2 0.0707 0.8311 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1073631 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR819124 1 0.5003 0.7206 0.768 0.000 0.148 0.084
#> SRR1310997 2 0.3335 0.7150 0.000 0.860 0.020 0.120
#> SRR1464494 2 0.4586 0.6087 0.000 0.796 0.068 0.136
#> SRR1357083 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1475842 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1378220 3 0.6506 0.6319 0.000 0.456 0.472 0.072
#> SRR1467704 1 0.1716 0.8695 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1348885 3 0.6852 0.6621 0.000 0.208 0.600 0.192
#> SRR1325826 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1466812 4 0.5916 0.9155 0.272 0.000 0.072 0.656
#> SRR1345692 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1401040 3 0.6277 0.7201 0.000 0.360 0.572 0.068
#> SRR1097954 1 0.2469 0.8452 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1374396 4 0.4401 0.9324 0.272 0.000 0.004 0.724
#> SRR1454073 2 0.0804 0.8376 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1355747 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1429368 3 0.6376 0.7020 0.000 0.396 0.536 0.068
#> SRR1398138 2 0.1807 0.8042 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR1379260 1 0.3219 0.8320 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1361436 3 0.6425 0.6822 0.000 0.424 0.508 0.068
#> SRR817142 2 0.3764 0.7006 0.000 0.852 0.076 0.072
#> SRR1315291 4 0.2216 0.5458 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1309314 3 0.6248 0.6931 0.000 0.212 0.660 0.128
#> SRR1420085 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1361308 3 0.6277 0.7201 0.000 0.360 0.572 0.068
#> SRR1472126 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1380482 3 0.7521 0.6278 0.000 0.396 0.420 0.184
#> SRR1099789 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1079480 2 0.7085 0.0994 0.000 0.568 0.232 0.200
#> SRR1339276 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1418368 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1399353 1 0.3528 0.8092 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1096760 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1440290 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1330813 2 0.2670 0.7643 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1458931 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1394321 1 0.3074 0.8189 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0188 0.8456 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1390143 1 0.5066 0.7138 0.764 0.000 0.148 0.088
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.6430 0.6775 0.000 0.428 0.504 0.068
#> SRR1312169 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1096687 1 0.3208 0.8177 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1486139 1 0.2216 0.8636 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1470313 4 0.6040 0.9103 0.272 0.000 0.080 0.648
#> SRR1447893 2 0.6452 -0.6149 0.000 0.468 0.464 0.068
#> SRR1466025 2 0.7058 0.1048 0.000 0.572 0.228 0.200
#> SRR1477429 1 0.4804 0.7400 0.780 0.000 0.148 0.072
#> SRR1445701 2 0.6557 -0.5856 0.000 0.476 0.448 0.076
#> SRR820689 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1451876 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4735 0.7468 0.784 0.000 0.148 0.068
#> SRR1489328 2 0.4391 0.3587 0.000 0.740 0.252 0.008
#> SRR1344462 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1082709 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1447784 4 0.6269 0.9027 0.272 0.000 0.096 0.632
#> SRR1355769 1 0.0336 0.8698 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1480917 2 0.4139 0.6448 0.000 0.816 0.040 0.144
#> SRR1474485 4 0.5916 0.9155 0.272 0.000 0.072 0.656
#> SRR1089998 1 0.2647 0.8389 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1318140 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1319262 2 0.6452 -0.6149 0.000 0.468 0.464 0.068
#> SRR1095188 2 0.5943 -0.2463 0.000 0.592 0.360 0.048
#> SRR1454350 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1440374 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1359565 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1105417 1 0.7276 -0.3847 0.448 0.000 0.148 0.404
#> SRR1325578 3 0.6228 0.7198 0.000 0.364 0.572 0.064
#> SRR1358161 3 0.5533 0.7177 0.000 0.220 0.708 0.072
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.2469 0.7509 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1452010 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1418183 2 0.4872 0.5493 0.000 0.776 0.148 0.076
#> SRR1366345 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1387449 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1473461 1 0.3024 0.8204 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1090837 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1447828 3 0.4560 0.7374 0.000 0.296 0.700 0.004
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.6425 0.6822 0.000 0.424 0.508 0.068
#> SRR1350280 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1088557 1 0.2589 0.8410 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1102656 2 0.0336 0.8431 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1441443 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1370682 3 0.5397 0.7204 0.000 0.220 0.716 0.064
#> SRR1475448 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1407291 1 0.0336 0.8698 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1405266 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1363766 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1082592 2 0.6375 -0.0752 0.000 0.600 0.312 0.088
#> SRR1325794 2 0.0469 0.8437 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1095961 3 0.6451 0.6366 0.000 0.456 0.476 0.068
#> SRR1086702 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1457527 3 0.3982 0.7314 0.000 0.220 0.776 0.004
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.6430 0.6775 0.000 0.428 0.504 0.068
#> SRR1488858 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1454695 1 0.7281 -0.4036 0.440 0.000 0.148 0.412
#> SRR1090241 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1362135 1 0.3074 0.8189 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1379581 3 0.5809 0.7091 0.000 0.216 0.692 0.092
#> SRR1309182 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1437668 1 0.3486 0.8189 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1084742 2 0.7328 -0.0635 0.000 0.524 0.276 0.200
#> SRR1433538 1 0.0469 0.8702 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1085063 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454247 2 0.6964 0.1393 0.000 0.584 0.228 0.188
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1072388 1 0.3528 0.8092 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1070332 2 0.0592 0.8403 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1320761 2 0.4824 0.6223 0.000 0.780 0.076 0.144
#> SRR1076195 4 0.4401 0.9324 0.272 0.000 0.004 0.724
#> SRR1069895 2 0.4100 0.6707 0.000 0.832 0.092 0.076
#> SRR1099144 1 0.6303 0.5641 0.660 0.000 0.192 0.148
#> SRR1385150 3 0.6438 0.6665 0.000 0.436 0.496 0.068
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1102583 1 0.0336 0.8698 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456971 1 0.3569 0.8081 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1340574 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1444830 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1096267 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1087127 3 0.7004 0.6649 0.000 0.220 0.580 0.200
#> SRR1408553 4 0.5916 0.9155 0.272 0.000 0.072 0.656
#> SRR1069231 1 0.2921 0.8267 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.1022 0.8701 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1321942 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1094380 1 0.3266 0.8350 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1447499 2 0.1576 0.8106 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR1099330 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1077874 2 0.0707 0.8391 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR808299 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.7085 0.0994 0.000 0.568 0.232 0.200
#> SRR1481238 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443568 2 0.5056 0.5061 0.000 0.760 0.164 0.076
#> SRR1380249 4 0.5078 0.9340 0.272 0.000 0.028 0.700
#> SRR1080143 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1383148 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1357042 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1078709 2 0.0524 0.8432 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR813283 1 0.0921 0.8704 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.2921 0.8407 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.6756 0.5961 0.000 0.148 0.600 0.252
#> SRR807679 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1333811 3 0.6452 0.6178 0.000 0.464 0.468 0.068
#> SRR1078660 2 0.1004 0.8352 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1432542 1 0.3528 0.8092 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1418041 1 0.2760 0.8342 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1085211 1 0.5248 0.7097 0.748 0.000 0.164 0.088
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.3569 0.8081 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1441934 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472552 3 0.6419 0.6855 0.000 0.420 0.512 0.068
#> SRR1488881 3 0.6425 0.6822 0.000 0.424 0.508 0.068
#> SRR1102973 1 0.2973 0.8391 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1071131 3 0.6559 0.6284 0.000 0.456 0.468 0.076
#> SRR1074502 1 0.0592 0.8684 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1325271 1 0.7335 -0.1881 0.488 0.000 0.168 0.344
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430045 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1441245 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1384091 4 0.6214 0.8984 0.272 0.000 0.092 0.636
#> SRR1431887 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.5078 0.9340 0.272 0.000 0.028 0.700
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.4656 0.5971 0.000 0.792 0.072 0.136
#> SRR1369514 1 0.7253 -0.4409 0.432 0.000 0.144 0.424
#> SRR1453299 3 0.6425 0.6822 0.000 0.424 0.508 0.068
#> SRR1436300 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1348490 2 0.7188 0.0480 0.000 0.552 0.244 0.204
#> SRR1091767 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354467 3 0.6438 0.6665 0.000 0.436 0.496 0.068
#> SRR1069074 2 0.3398 0.7233 0.000 0.872 0.060 0.068
#> SRR1452399 3 0.7008 0.5881 0.000 0.436 0.448 0.116
#> SRR1437430 3 0.5598 0.7162 0.000 0.220 0.704 0.076
#> SRR1419736 2 0.7085 0.0943 0.000 0.568 0.232 0.200
#> SRR1313343 3 0.6263 0.7217 0.000 0.356 0.576 0.068
#> SRR1077619 4 0.6426 0.8824 0.272 0.000 0.108 0.620
#> SRR1083530 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1333633 2 0.5998 0.1610 0.000 0.668 0.240 0.092
#> SRR1354999 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1474 0.8663 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1378818 3 0.7004 0.6649 0.000 0.220 0.580 0.200
#> SRR1413182 4 0.4222 0.9339 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1464559 4 0.6269 0.8960 0.272 0.000 0.096 0.632
#> SRR1413075 2 0.6119 0.3638 0.000 0.680 0.152 0.168
#> SRR1487928 4 0.4401 0.9324 0.272 0.000 0.004 0.724
#> SRR1388997 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1092865 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1102729 1 0.6037 0.5694 0.688 0.000 0.156 0.156
#> SRR1456423 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.5254 0.7225 0.000 0.220 0.724 0.056
#> SRR1339903 1 0.0000 0.8702 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.1716 0.8611 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.1733 0.8121 0.000 0.948 0.024 0.028
#> SRR1480941 3 0.6852 0.6621 0.000 0.208 0.600 0.192
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0707 0.8704 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1433884 2 0.3903 0.6918 0.000 0.844 0.080 0.076
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0336 0.8448 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355554 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1487173 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1474253 1 0.0592 0.8681 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.6430 0.6775 0.000 0.428 0.504 0.068
#> SRR1474231 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1350545 1 0.3024 0.8204 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1091328 1 0.1637 0.8609 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR814447 3 0.5923 0.7063 0.000 0.216 0.684 0.100
#> SRR1455989 2 0.6452 -0.6149 0.000 0.468 0.464 0.068
#> SRR1453680 3 0.4472 0.7305 0.000 0.220 0.760 0.020
#> SRR1470356 2 0.0188 0.8462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.1637 0.8645 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1366729 3 0.4123 0.7317 0.000 0.220 0.772 0.008
#> SRR821282 3 0.5292 0.7198 0.000 0.216 0.724 0.060
#> SRR1074602 2 0.3834 0.6980 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR814633 2 0.0000 0.8476 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.6134 0.7001 0.000 0.216 0.668 0.116
#> SRR1319100 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1324004 2 0.6324 -0.2264 0.000 0.584 0.340 0.076
#> SRR1457459 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1421031 1 0.7269 -0.3488 0.456 0.000 0.148 0.396
#> SRR1444598 3 0.6850 0.6655 0.000 0.212 0.600 0.188
#> SRR1091743 2 0.3617 0.7140 0.000 0.860 0.064 0.076
#> SRR819637 1 0.1211 0.8663 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1083848 1 0.0469 0.8682 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1088934 2 0.6542 -0.5328 0.000 0.496 0.428 0.076
#> SRR1459785 3 0.6425 0.6822 0.000 0.424 0.508 0.068
#> SRR1083700 1 0.3486 0.8105 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1375531 1 0.5066 0.7138 0.764 0.000 0.148 0.088
#> SRR1323470 3 0.6840 0.6426 0.000 0.180 0.600 0.220
#> SRR814657 1 0.0336 0.8698 0.992 0.000 0.008 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.6300 0.69954 0.244 0.000 0.028 0.600 0.128
#> SRR1326059 1 0.2104 0.81194 0.916 0.000 0.024 0.000 0.060
#> SRR1409062 2 0.1043 0.82586 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR809406 1 0.0566 0.81308 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1465313 3 0.5944 0.63366 0.000 0.164 0.680 0.076 0.080
#> SRR819559 1 0.5386 0.69487 0.668 0.000 0.036 0.040 0.256
#> SRR1387899 2 0.5420 0.38824 0.000 0.592 0.332 0.076 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.1216 0.81001 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1395635 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1343629 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.5082 0.53292 0.000 0.664 0.260 0.076 0.000
#> SRR1102320 1 0.4242 0.75829 0.752 0.000 0.036 0.004 0.208
#> SRR1469926 3 0.5346 0.53322 0.000 0.080 0.736 0.068 0.116
#> SRR1070036 1 0.1914 0.81438 0.924 0.000 0.016 0.000 0.060
#> SRR1098426 1 0.4088 0.71552 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1090310 3 0.3353 0.74198 0.000 0.196 0.796 0.008 0.000
#> SRR1429748 1 0.2426 0.80973 0.900 0.000 0.036 0.000 0.064
#> SRR1363654 1 0.4087 0.75708 0.756 0.000 0.036 0.000 0.208
#> SRR1326317 2 0.5390 0.40816 0.000 0.600 0.324 0.076 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.2848 0.89452 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1329947 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.5877 0.66991 0.000 0.172 0.680 0.056 0.092
#> SRR1490761 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.5569 0.45415 0.000 0.080 0.364 0.000 0.556
#> SRR1402944 5 0.5691 0.28838 0.000 0.080 0.444 0.000 0.476
#> SRR1092818 1 0.4315 0.74779 0.700 0.000 0.024 0.000 0.276
#> SRR1093552 1 0.4252 0.72409 0.652 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1464880 2 0.4275 0.41193 0.000 0.696 0.020 0.000 0.284
#> SRR1078368 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.2331 0.79497 0.000 0.900 0.020 0.080 0.000
#> SRR1466951 2 0.1671 0.80881 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1331879 2 0.4989 0.25540 0.000 0.648 0.056 0.000 0.296
#> SRR1320034 3 0.6417 0.30257 0.000 0.080 0.612 0.072 0.236
#> SRR1068687 2 0.5475 0.40528 0.000 0.596 0.320 0.084 0.000
#> SRR1437491 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1310777 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1329994 1 0.7431 -0.00991 0.400 0.000 0.036 0.316 0.248
#> SRR1354203 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1077850 1 0.2236 0.80288 0.908 0.000 0.024 0.000 0.068
#> SRR1369241 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.4616 0.35118 0.000 0.676 0.036 0.000 0.288
#> SRR1455214 1 0.3779 0.76849 0.776 0.000 0.024 0.000 0.200
#> SRR1092014 3 0.4985 0.62506 0.000 0.244 0.680 0.076 0.000
#> SRR1097857 1 0.4114 0.77497 0.732 0.000 0.024 0.000 0.244
#> SRR1473318 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1345974 3 0.5586 0.62809 0.000 0.128 0.716 0.068 0.088
#> SRR1338687 2 0.0162 0.83535 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.7454 -0.10169 0.380 0.000 0.036 0.336 0.248
#> SRR1486821 3 0.5877 0.60372 0.000 0.128 0.692 0.068 0.112
#> SRR1418540 1 0.3106 0.79010 0.844 0.000 0.024 0.000 0.132
#> SRR1408788 3 0.3231 0.74316 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1359487 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1080648 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1414708 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1469080 2 0.3011 0.68088 0.000 0.844 0.016 0.000 0.140
#> SRR1365722 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.3536 0.89206 0.156 0.000 0.000 0.812 0.032
#> SRR1321829 2 0.4959 0.56161 0.000 0.684 0.240 0.076 0.000
#> SRR1475993 3 0.2929 0.74481 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.1914 0.81334 0.924 0.000 0.016 0.000 0.060
#> SRR1077575 5 0.6012 0.58200 0.000 0.400 0.116 0.000 0.484
#> SRR1349300 1 0.0798 0.81274 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1374165 1 0.4389 0.70970 0.624 0.000 0.004 0.004 0.368
#> SRR1453769 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.2054 0.81244 0.920 0.000 0.028 0.000 0.052
#> SRR1401146 2 0.1557 0.80491 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1366124 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1391811 1 0.1893 0.80604 0.928 0.000 0.024 0.000 0.048
#> SRR1456674 1 0.4251 0.70802 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR1086490 3 0.3353 0.74198 0.000 0.196 0.796 0.008 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.4021 0.76183 0.764 0.000 0.036 0.000 0.200
#> SRR1384431 1 0.5772 0.65125 0.636 0.000 0.028 0.072 0.264
#> SRR1072055 1 0.6940 0.40334 0.496 0.000 0.028 0.180 0.296
#> SRR1359738 3 0.3231 0.74316 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1332141 1 0.4065 0.76791 0.720 0.000 0.016 0.000 0.264
#> SRR1085900 2 0.5530 0.22414 0.000 0.556 0.368 0.076 0.000
#> SRR1442173 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1431625 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.6017 0.57594 0.000 0.404 0.116 0.000 0.480
#> SRR1344034 3 0.6772 0.49315 0.000 0.168 0.544 0.032 0.256
#> SRR1080391 4 0.4773 0.87303 0.156 0.000 0.012 0.748 0.084
#> SRR1347870 2 0.1121 0.82349 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR814028 2 0.0510 0.83276 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1102128 1 0.4273 0.75233 0.748 0.000 0.036 0.004 0.212
#> SRR1460211 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.5895 -0.32780 0.000 0.500 0.104 0.000 0.396
#> SRR1070060 1 0.2585 0.80859 0.896 0.000 0.036 0.004 0.064
#> SRR1487969 2 0.1671 0.78293 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1417851 1 0.7080 0.36437 0.492 0.000 0.032 0.212 0.264
#> SRR1443350 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.2519 0.82015 0.884 0.000 0.016 0.000 0.100
#> SRR1076705 1 0.4380 0.70276 0.616 0.000 0.000 0.008 0.376
#> SRR1079380 5 0.6334 0.61333 0.000 0.316 0.160 0.004 0.520
#> SRR1102923 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.3875 0.70811 0.000 0.804 0.000 0.072 0.124
#> SRR1366605 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.1671 0.80881 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1436840 2 0.1043 0.82504 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.4297 0.42836 0.000 0.000 0.020 0.692 0.288
#> SRR1431735 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1417387 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1445984 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1370447 4 0.3239 0.89394 0.156 0.000 0.012 0.828 0.004
#> SRR1446308 3 0.3612 0.70549 0.000 0.228 0.764 0.008 0.000
#> SRR1437346 3 0.2929 0.74481 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.1671 0.80881 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1086466 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1073191 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.2848 0.89452 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1319584 5 0.6175 0.49513 0.000 0.148 0.344 0.000 0.508
#> SRR1486584 1 0.0162 0.81117 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.7264 0.43004 0.284 0.000 0.028 0.432 0.256
#> SRR1317939 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0912 0.81067 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1341921 1 0.4503 0.72828 0.700 0.000 0.028 0.004 0.268
#> SRR1399178 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0404 0.81086 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0963 0.82639 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.5968 0.61038 0.000 0.372 0.116 0.000 0.512
#> SRR1079543 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.1410 0.81687 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1076681 3 0.4793 0.66750 0.000 0.216 0.708 0.076 0.000
#> SRR1335314 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1400799 3 0.3353 0.74199 0.000 0.196 0.796 0.008 0.000
#> SRR1074578 1 0.6031 0.62477 0.640 0.000 0.036 0.100 0.224
#> SRR1312226 2 0.3282 0.63611 0.000 0.804 0.008 0.000 0.188
#> SRR1416207 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1447371 1 0.3967 0.76793 0.724 0.000 0.012 0.000 0.264
#> SRR1069328 1 0.7459 -0.12526 0.372 0.000 0.036 0.344 0.248
#> SRR1445023 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1077599 2 0.5390 0.40736 0.000 0.600 0.324 0.076 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.3527 0.78591 0.804 0.000 0.024 0.000 0.172
#> SRR1074839 3 0.5088 0.61339 0.000 0.252 0.668 0.080 0.000
#> SRR1458727 5 0.6024 0.48004 0.000 0.060 0.324 0.036 0.580
#> SRR1436949 2 0.3659 0.57560 0.000 0.768 0.012 0.000 0.220
#> SRR1070429 3 0.3231 0.74316 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1310334 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.5391 0.52798 0.000 0.080 0.732 0.068 0.120
#> SRR1385434 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1415591 3 0.3910 0.72736 0.000 0.196 0.772 0.032 0.000
#> SRR1402009 1 0.4106 0.77150 0.724 0.000 0.020 0.000 0.256
#> SRR1316055 4 0.4599 0.86629 0.156 0.000 0.000 0.744 0.100
#> SRR1308734 3 0.6009 0.59044 0.000 0.128 0.680 0.068 0.124
#> SRR1498973 2 0.4132 0.47073 0.000 0.720 0.020 0.000 0.260
#> SRR1397115 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.4251 0.70802 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR814341 2 0.0162 0.83412 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313601 2 0.0290 0.83475 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.5902 0.43983 0.000 0.080 0.680 0.068 0.172
#> SRR809919 1 0.4341 0.71437 0.628 0.000 0.008 0.000 0.364
#> SRR1370818 4 0.3536 0.89206 0.156 0.000 0.000 0.812 0.032
#> SRR1323651 2 0.5405 0.39856 0.000 0.596 0.328 0.076 0.000
#> SRR1357297 1 0.2036 0.81230 0.920 0.000 0.024 0.000 0.056
#> SRR818170 5 0.6378 0.46950 0.000 0.080 0.332 0.040 0.548
#> SRR1091230 2 0.5405 0.39856 0.000 0.596 0.328 0.076 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1095285 3 0.4502 0.70258 0.000 0.180 0.744 0.076 0.000
#> SRR1317731 3 0.6340 0.51861 0.000 0.120 0.644 0.068 0.168
#> SRR1490785 1 0.3488 0.80446 0.808 0.000 0.024 0.000 0.168
#> SRR1432032 1 0.0451 0.81307 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1447808 1 0.1522 0.81496 0.944 0.000 0.012 0.000 0.044
#> SRR809534 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.2563 0.74260 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR812128 2 0.5421 0.52637 0.000 0.700 0.032 0.076 0.192
#> SRR1101513 1 0.1956 0.81661 0.916 0.000 0.008 0.000 0.076
#> SRR1415708 2 0.5410 0.36266 0.000 0.584 0.344 0.072 0.000
#> SRR1316033 3 0.5586 0.62809 0.000 0.128 0.716 0.068 0.088
#> SRR1390371 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.5391 0.52798 0.000 0.080 0.732 0.068 0.120
#> SRR1076801 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1080044 1 0.0912 0.81067 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1420850 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.4583 0.73058 0.704 0.000 0.036 0.004 0.256
#> SRR1069871 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.5998 0.52831 0.000 0.424 0.112 0.000 0.464
#> SRR1068929 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0609 0.83167 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1075054 2 0.1851 0.77123 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1083480 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1075458 1 0.4088 0.71552 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1417023 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1309333 2 0.1608 0.81100 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1333676 1 0.4365 0.74315 0.736 0.000 0.036 0.004 0.224
#> SRR1352996 1 0.0162 0.81082 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1093172 4 0.4661 0.87651 0.156 0.000 0.012 0.756 0.076
#> SRR1413137 4 0.4544 0.87945 0.156 0.000 0.012 0.764 0.068
#> SRR1469973 2 0.1892 0.80493 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR1420026 2 0.0404 0.83372 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR817306 1 0.7182 0.27997 0.484 0.000 0.036 0.244 0.236
#> SRR1416266 4 0.2690 0.89383 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3081 0.89453 0.156 0.000 0.000 0.832 0.012
#> SRR1435394 2 0.5035 0.54560 0.000 0.672 0.252 0.076 0.000
#> SRR1383192 1 0.2585 0.80859 0.896 0.000 0.036 0.004 0.064
#> SRR1419962 3 0.5391 0.52798 0.000 0.080 0.732 0.068 0.120
#> SRR1094357 1 0.4350 0.73106 0.704 0.000 0.028 0.000 0.268
#> SRR1081639 3 0.6153 0.38275 0.000 0.080 0.648 0.068 0.204
#> SRR1356016 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.6124 0.59505 0.000 0.236 0.200 0.000 0.564
#> SRR1312147 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1473891 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.6478 0.74022 0.156 0.000 0.036 0.600 0.208
#> SRR1474930 3 0.4958 0.65193 0.000 0.224 0.692 0.084 0.000
#> SRR1470988 4 0.3239 0.89394 0.156 0.000 0.012 0.828 0.004
#> SRR811915 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0290 0.81102 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.3611 0.75390 0.000 0.844 0.064 0.076 0.016
#> SRR1313770 3 0.5391 0.52798 0.000 0.080 0.732 0.068 0.120
#> SRR1315780 2 0.0898 0.82060 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR1073631 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.6617 0.52551 0.568 0.000 0.036 0.140 0.256
#> SRR1310997 2 0.5060 0.40296 0.000 0.668 0.020 0.032 0.280
#> SRR1464494 2 0.5452 0.14455 0.000 0.604 0.052 0.012 0.332
#> SRR1357083 3 0.3353 0.74198 0.000 0.196 0.796 0.008 0.000
#> SRR1475842 2 0.0963 0.82647 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1378085 1 0.1597 0.81494 0.940 0.000 0.012 0.000 0.048
#> SRR1378220 3 0.3863 0.72766 0.000 0.200 0.772 0.028 0.000
#> SRR1467704 1 0.3123 0.80275 0.812 0.000 0.004 0.000 0.184
#> SRR1348885 5 0.6024 0.48004 0.000 0.060 0.324 0.036 0.580
#> SRR1325826 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.4825 0.87465 0.156 0.000 0.024 0.752 0.068
#> SRR1345692 2 0.1341 0.81878 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1401040 3 0.3309 0.70178 0.000 0.128 0.836 0.036 0.000
#> SRR1097954 1 0.3845 0.76428 0.768 0.000 0.024 0.000 0.208
#> SRR1374396 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1454073 2 0.1671 0.80881 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1355747 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1429368 3 0.3409 0.73046 0.000 0.160 0.816 0.024 0.000
#> SRR1398138 2 0.4390 0.65880 0.000 0.760 0.156 0.084 0.000
#> SRR1379260 1 0.4309 0.74604 0.676 0.000 0.016 0.000 0.308
#> SRR1361436 3 0.3565 0.73939 0.000 0.176 0.800 0.024 0.000
#> SRR817142 2 0.5405 0.39856 0.000 0.596 0.328 0.076 0.000
#> SRR1315291 4 0.3319 0.59479 0.000 0.000 0.020 0.820 0.160
#> SRR1309314 5 0.6682 0.21347 0.000 0.060 0.432 0.068 0.440
#> SRR1420085 2 0.1671 0.80881 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1361308 3 0.3309 0.70178 0.000 0.128 0.836 0.036 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 5 0.6713 0.34896 0.000 0.196 0.332 0.008 0.464
#> SRR1099789 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 5 0.6017 0.57594 0.000 0.404 0.116 0.000 0.480
#> SRR1339276 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1418368 1 0.0912 0.81067 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1399353 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1096760 3 0.3231 0.74316 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1440290 2 0.5405 0.39856 0.000 0.596 0.328 0.076 0.000
#> SRR1330813 2 0.5010 0.55051 0.000 0.676 0.248 0.076 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.2848 0.89452 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1394321 1 0.4557 0.72815 0.700 0.000 0.032 0.004 0.264
#> SRR1081160 2 0.1544 0.81285 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1477173 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0794 0.82306 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1390143 1 0.6567 0.52386 0.568 0.000 0.032 0.140 0.260
#> SRR1390413 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.2966 0.74526 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.2359 0.81046 0.904 0.000 0.036 0.000 0.060
#> SRR1096687 1 0.4192 0.74482 0.736 0.000 0.032 0.000 0.232
#> SRR1486139 1 0.3284 0.80096 0.828 0.000 0.024 0.000 0.148
#> SRR1470313 4 0.4496 0.87340 0.156 0.000 0.000 0.752 0.092
#> SRR1447893 3 0.3455 0.73117 0.000 0.208 0.784 0.008 0.000
#> SRR1466025 5 0.6017 0.57297 0.000 0.404 0.116 0.000 0.480
#> SRR1477429 1 0.5825 0.64499 0.632 0.000 0.028 0.076 0.264
#> SRR1445701 3 0.4822 0.66097 0.000 0.220 0.704 0.076 0.000
#> SRR820689 1 0.0290 0.81102 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.1270 0.82147 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.6586 0.51961 0.564 0.000 0.032 0.140 0.264
#> SRR1489328 2 0.5364 0.37065 0.000 0.636 0.284 0.076 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.5163 0.84249 0.156 0.000 0.000 0.692 0.152
#> SRR1355769 1 0.0671 0.81269 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1488237 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1480917 2 0.4583 0.34759 0.000 0.672 0.032 0.000 0.296
#> SRR1474485 4 0.4098 0.88329 0.156 0.000 0.000 0.780 0.064
#> SRR1089998 1 0.3877 0.76362 0.764 0.000 0.024 0.000 0.212
#> SRR1318140 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.3366 0.72849 0.000 0.212 0.784 0.004 0.000
#> SRR1095188 3 0.5644 0.28656 0.000 0.440 0.484 0.076 0.000
#> SRR1454350 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1440374 1 0.0290 0.81102 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.3231 0.74316 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1105417 4 0.7292 0.38983 0.296 0.000 0.028 0.420 0.256
#> SRR1325578 3 0.6301 0.44612 0.000 0.144 0.600 0.024 0.232
#> SRR1358161 3 0.5867 0.44732 0.000 0.080 0.684 0.068 0.168
#> SRR1358665 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.4252 0.42277 0.000 0.700 0.020 0.000 0.280
#> SRR1452010 1 0.2209 0.81158 0.912 0.000 0.032 0.000 0.056
#> SRR1418183 2 0.5639 0.16893 0.000 0.524 0.396 0.080 0.000
#> SRR1366345 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1387449 1 0.1774 0.81349 0.932 0.000 0.016 0.000 0.052
#> SRR1473461 1 0.4558 0.73235 0.708 0.000 0.036 0.004 0.252
#> SRR1090837 3 0.3353 0.74198 0.000 0.196 0.796 0.008 0.000
#> SRR1447828 3 0.5561 0.57938 0.000 0.104 0.720 0.068 0.108
#> SRR1338747 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.2929 0.74481 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.2036 0.81230 0.920 0.000 0.024 0.000 0.056
#> SRR1088557 1 0.4054 0.75939 0.760 0.000 0.036 0.000 0.204
#> SRR1102656 2 0.1908 0.76683 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1441443 2 0.1671 0.80881 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1370682 3 0.6343 0.32812 0.000 0.080 0.624 0.072 0.224
#> SRR1475448 3 0.3231 0.74316 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1407291 1 0.0798 0.81274 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1405266 1 0.2104 0.81194 0.916 0.000 0.024 0.000 0.060
#> SRR1363766 1 0.0162 0.81117 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.7621 -0.27947 0.000 0.460 0.200 0.076 0.264
#> SRR1325794 2 0.3181 0.76590 0.000 0.856 0.000 0.072 0.072
#> SRR1095961 3 0.3231 0.74316 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.5456 0.39205 0.000 0.592 0.328 0.080 0.000
#> SRR1457527 3 0.5252 0.54332 0.000 0.080 0.744 0.068 0.108
#> SRR1098831 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.2966 0.74526 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1454695 4 0.7292 0.38914 0.296 0.000 0.028 0.420 0.256
#> SRR1090241 2 0.0290 0.83475 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1362135 1 0.4557 0.72815 0.700 0.000 0.032 0.004 0.264
#> SRR1379581 3 0.6817 0.04929 0.000 0.080 0.520 0.072 0.328
#> SRR1309182 1 0.1965 0.81257 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1437668 1 0.4235 0.72477 0.656 0.000 0.008 0.000 0.336
#> SRR1084742 5 0.6315 0.61756 0.000 0.372 0.140 0.004 0.484
#> SRR1433538 1 0.1399 0.81308 0.952 0.000 0.020 0.000 0.028
#> SRR1085063 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 5 0.6000 0.51892 0.000 0.428 0.112 0.000 0.460
#> SRR1097100 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.5390 0.40816 0.000 0.600 0.324 0.076 0.000
#> SRR1072388 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1070332 2 0.1792 0.77544 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1320761 2 0.6960 0.19033 0.000 0.492 0.348 0.076 0.084
#> SRR1076195 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1069895 2 0.5498 0.31720 0.000 0.568 0.356 0.076 0.000
#> SRR1099144 1 0.6171 0.48008 0.488 0.000 0.000 0.140 0.372
#> SRR1385150 3 0.3039 0.74478 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.2848 0.89452 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1102583 1 0.0671 0.81269 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1456971 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1340574 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1444830 2 0.5441 0.40207 0.000 0.596 0.324 0.080 0.000
#> SRR1096267 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1087127 5 0.5751 0.48594 0.000 0.100 0.348 0.000 0.552
#> SRR1408553 4 0.4483 0.88065 0.156 0.000 0.012 0.768 0.064
#> SRR1069231 1 0.4273 0.75235 0.748 0.000 0.036 0.004 0.212
#> SRR1325642 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.2390 0.81093 0.896 0.000 0.020 0.000 0.084
#> SRR1321942 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.4309 0.74215 0.676 0.000 0.016 0.000 0.308
#> SRR1447499 2 0.3476 0.73960 0.000 0.836 0.088 0.076 0.000
#> SRR1099330 2 0.5405 0.39856 0.000 0.596 0.328 0.076 0.000
#> SRR1077874 2 0.2685 0.76315 0.000 0.880 0.000 0.028 0.092
#> SRR808299 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.6017 0.57594 0.000 0.404 0.116 0.000 0.480
#> SRR1481238 2 0.2974 0.77861 0.000 0.868 0.000 0.080 0.052
#> SRR1443568 2 0.5639 0.16791 0.000 0.524 0.396 0.080 0.000
#> SRR1380249 4 0.2848 0.89452 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1080143 1 0.1845 0.81340 0.928 0.000 0.016 0.000 0.056
#> SRR1383148 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1357042 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1416025 2 0.0609 0.83167 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1431015 2 0.1732 0.80699 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1078709 2 0.1956 0.80487 0.000 0.916 0.008 0.076 0.000
#> SRR813283 1 0.2304 0.81232 0.892 0.000 0.008 0.000 0.100
#> SRR1430226 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.4138 0.76544 0.708 0.000 0.016 0.000 0.276
#> SRR1466927 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.6062 0.48298 0.000 0.060 0.316 0.040 0.584
#> SRR807679 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1333811 3 0.4323 0.73880 0.000 0.196 0.760 0.020 0.024
#> SRR1078660 2 0.3197 0.77420 0.000 0.864 0.008 0.076 0.052
#> SRR1331730 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1432542 1 0.4101 0.71174 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1418041 1 0.4042 0.75814 0.756 0.000 0.032 0.000 0.212
#> SRR1085211 1 0.6588 0.53518 0.536 0.000 0.028 0.128 0.308
#> SRR1339812 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.4101 0.71151 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1350958 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.5405 0.39856 0.000 0.596 0.328 0.076 0.000
#> SRR1441934 2 0.1732 0.80699 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1472552 3 0.3565 0.73939 0.000 0.176 0.800 0.024 0.000
#> SRR1488881 3 0.2891 0.74355 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.4249 0.75705 0.688 0.000 0.016 0.000 0.296
#> SRR1071131 3 0.4637 0.69113 0.000 0.196 0.728 0.076 0.000
#> SRR1074502 1 0.1117 0.81026 0.964 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1325271 1 0.6818 -0.09921 0.356 0.000 0.000 0.316 0.328
#> SRR1409171 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0290 0.83507 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.1831 0.80707 0.000 0.920 0.004 0.076 0.000
#> SRR1384091 4 0.4753 0.86727 0.156 0.000 0.004 0.740 0.100
#> SRR1431887 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.3362 0.89328 0.156 0.000 0.012 0.824 0.008
#> SRR1488491 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.5063 0.19953 0.000 0.632 0.056 0.000 0.312
#> SRR1369514 4 0.7242 0.44845 0.276 0.000 0.028 0.440 0.256
#> SRR1453299 3 0.2929 0.74481 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1348490 5 0.6066 0.60015 0.000 0.388 0.124 0.000 0.488
#> SRR1091767 2 0.1956 0.80491 0.000 0.916 0.008 0.076 0.000
#> SRR1354467 3 0.3039 0.74478 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.4879 0.57955 0.000 0.696 0.228 0.076 0.000
#> SRR1452399 3 0.7547 -0.09684 0.000 0.320 0.412 0.052 0.216
#> SRR1437430 3 0.6485 0.27388 0.000 0.080 0.600 0.072 0.248
#> SRR1419736 5 0.6007 0.58670 0.000 0.396 0.116 0.000 0.488
#> SRR1313343 3 0.4107 0.68439 0.000 0.124 0.808 0.036 0.032
#> SRR1077619 4 0.4835 0.85425 0.156 0.000 0.000 0.724 0.120
#> SRR1083530 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1333633 2 0.6425 -0.03114 0.000 0.532 0.212 0.004 0.252
#> SRR1354999 2 0.5425 0.41069 0.000 0.600 0.320 0.080 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.3284 0.79179 0.828 0.000 0.024 0.000 0.148
#> SRR1378818 5 0.5505 0.49712 0.000 0.084 0.328 0.000 0.588
#> SRR1413182 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1464559 4 0.4648 0.86647 0.156 0.000 0.000 0.740 0.104
#> SRR1413075 2 0.5520 -0.08287 0.000 0.560 0.076 0.000 0.364
#> SRR1487928 4 0.2848 0.89340 0.156 0.000 0.000 0.840 0.004
#> SRR1388997 2 0.1671 0.80881 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1092865 2 0.5459 0.41452 0.000 0.600 0.316 0.084 0.000
#> SRR1102729 1 0.6991 0.36680 0.496 0.000 0.028 0.200 0.276
#> SRR1456423 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.6317 0.34082 0.000 0.080 0.628 0.072 0.220
#> SRR1339903 1 0.0451 0.81263 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1346710 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR1418771 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.4826 0.68757 0.000 0.772 0.104 0.076 0.048
#> SRR1480941 5 0.6091 0.45660 0.000 0.060 0.344 0.036 0.560
#> SRR1479175 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.2036 0.81230 0.920 0.000 0.024 0.000 0.056
#> SRR1433884 2 0.5475 0.40497 0.000 0.596 0.320 0.084 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.1892 0.80493 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR1355554 2 0.5441 0.40207 0.000 0.596 0.324 0.080 0.000
#> SRR1487173 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1474253 1 0.0162 0.81117 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.1043 0.82504 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1318331 2 0.0880 0.82768 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1321333 3 0.3039 0.74478 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.2036 0.80431 0.920 0.000 0.024 0.000 0.056
#> SRR1350545 1 0.4365 0.74315 0.736 0.000 0.036 0.004 0.224
#> SRR1091328 1 0.2964 0.78905 0.856 0.000 0.024 0.000 0.120
#> SRR814447 3 0.6877 -0.01999 0.000 0.080 0.496 0.072 0.352
#> SRR1455989 3 0.3333 0.73283 0.000 0.208 0.788 0.004 0.000
#> SRR1453680 3 0.5436 0.52215 0.000 0.080 0.728 0.068 0.124
#> SRR1470356 2 0.1043 0.82590 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0290 0.83519 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1097197 1 0.3106 0.79807 0.844 0.000 0.024 0.000 0.132
#> SRR1366729 3 0.4712 0.58635 0.000 0.080 0.784 0.068 0.068
#> SRR821282 3 0.6588 0.23378 0.000 0.080 0.580 0.072 0.268
#> SRR1074602 2 0.5390 0.40736 0.000 0.600 0.324 0.076 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.83657 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.6640 -0.15123 0.000 0.080 0.472 0.048 0.400
#> SRR1319100 1 0.2036 0.80431 0.920 0.000 0.024 0.000 0.056
#> SRR1324004 3 0.5523 0.42814 0.000 0.348 0.572 0.080 0.000
#> SRR1457459 1 0.1965 0.80518 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1421031 4 0.7334 0.31239 0.320 0.000 0.028 0.396 0.256
#> SRR1444598 5 0.6078 0.48171 0.000 0.060 0.340 0.036 0.564
#> SRR1091743 2 0.5290 0.45817 0.000 0.624 0.300 0.076 0.000
#> SRR819637 1 0.2036 0.80431 0.920 0.000 0.024 0.000 0.056
#> SRR1083848 1 0.0000 0.81093 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.5035 0.61163 0.000 0.252 0.672 0.076 0.000
#> SRR1459785 3 0.2929 0.74481 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.4341 0.71437 0.628 0.000 0.008 0.000 0.364
#> SRR1375531 1 0.6532 0.53283 0.572 0.000 0.032 0.136 0.260
#> SRR1323470 5 0.6118 0.47941 0.000 0.056 0.312 0.048 0.584
#> SRR814657 1 0.0798 0.81274 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0405 0.83593 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1402132 4 0.7037 0.60359 0.132 0.000 0.044 0.552 0.092 0.180
#> SRR1326059 1 0.3168 0.11709 0.804 0.000 0.024 0.000 0.000 0.172
#> SRR1409062 2 0.1942 0.81301 0.000 0.916 0.008 0.012 0.000 0.064
#> SRR809406 1 0.3993 -0.06232 0.676 0.000 0.024 0.000 0.000 0.300
#> SRR1465313 3 0.5808 0.49820 0.000 0.124 0.648 0.004 0.148 0.076
#> SRR819559 1 0.2925 0.24453 0.876 0.000 0.020 0.052 0.044 0.008
#> SRR1387899 3 0.5352 0.22682 0.000 0.436 0.468 0.000 0.004 0.092
#> SRR1442292 2 0.0508 0.83541 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1488151 1 0.3823 -0.30669 0.564 0.000 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR1395635 6 0.5258 0.96939 0.448 0.000 0.012 0.000 0.064 0.476
#> SRR1343629 1 0.3979 -0.13665 0.628 0.000 0.012 0.000 0.000 0.360
#> SRR1326868 2 0.5275 0.10277 0.000 0.532 0.372 0.000 0.004 0.092
#> SRR1102320 1 0.2160 0.24890 0.920 0.000 0.012 0.024 0.020 0.024
#> SRR1469926 3 0.6507 0.22178 0.000 0.056 0.512 0.000 0.208 0.224
#> SRR1070036 1 0.3694 0.02493 0.740 0.000 0.028 0.000 0.000 0.232
#> SRR1098426 1 0.4695 0.08913 0.736 0.000 0.052 0.000 0.068 0.144
#> SRR1090310 3 0.2703 0.65004 0.000 0.172 0.824 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429748 1 0.3516 0.12165 0.792 0.000 0.024 0.000 0.012 0.172
#> SRR1363654 1 0.0725 0.24826 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012 0.000
#> SRR1326317 2 0.5389 -0.17290 0.000 0.456 0.444 0.000 0.004 0.096
#> SRR1378308 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1010 0.87817 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.3807 -0.14682 0.628 0.000 0.004 0.000 0.000 0.368
#> SRR1469769 3 0.6606 0.41200 0.000 0.148 0.548 0.004 0.096 0.204
#> SRR1490761 2 0.0260 0.83656 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.3985 0.54737 0.000 0.056 0.172 0.004 0.764 0.004
#> SRR1402944 5 0.4523 0.52054 0.000 0.056 0.204 0.004 0.720 0.016
#> SRR1092818 1 0.5596 -0.18935 0.624 0.000 0.052 0.000 0.088 0.236
#> SRR1093552 1 0.5586 -0.01374 0.652 0.000 0.064 0.000 0.108 0.176
#> SRR1464880 2 0.4317 -0.12714 0.000 0.520 0.000 0.008 0.464 0.008
#> SRR1078368 2 0.0291 0.83670 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1349608 2 0.3568 0.73614 0.000 0.828 0.060 0.020 0.004 0.088
#> SRR1466951 2 0.2425 0.78768 0.000 0.884 0.000 0.024 0.004 0.088
#> SRR1331879 5 0.4448 0.31950 0.000 0.464 0.004 0.008 0.516 0.008
#> SRR1320034 3 0.6867 -0.00528 0.000 0.056 0.404 0.000 0.304 0.236
#> SRR1068687 2 0.5776 -0.19490 0.000 0.444 0.440 0.016 0.004 0.096
#> SRR1437491 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1310777 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0260 0.83656 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1329994 1 0.5515 -0.26520 0.504 0.000 0.036 0.416 0.036 0.008
#> SRR1354203 1 0.3851 -0.39107 0.540 0.000 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1077850 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1369241 2 0.0405 0.83615 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1077992 5 0.4456 0.24894 0.000 0.484 0.004 0.008 0.496 0.008
#> SRR1455214 1 0.1149 0.24162 0.960 0.000 0.024 0.000 0.008 0.008
#> SRR1092014 3 0.4586 0.58564 0.000 0.216 0.692 0.000 0.004 0.088
#> SRR1097857 1 0.3235 0.12078 0.832 0.000 0.024 0.000 0.020 0.124
#> SRR1473318 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1345974 3 0.6408 0.33974 0.000 0.088 0.556 0.000 0.144 0.212
#> SRR1338687 2 0.0520 0.83570 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1071207 1 0.5534 -0.33879 0.480 0.000 0.036 0.440 0.036 0.008
#> SRR1486821 3 0.6599 0.32480 0.000 0.088 0.544 0.004 0.152 0.212
#> SRR1418540 1 0.5647 -0.79078 0.488 0.000 0.028 0.000 0.076 0.408
#> SRR1408788 3 0.2809 0.64934 0.000 0.168 0.824 0.004 0.000 0.004
#> SRR1359487 4 0.2107 0.87490 0.036 0.000 0.012 0.920 0.024 0.008
#> SRR1080648 6 0.5380 0.96378 0.448 0.000 0.016 0.000 0.068 0.468
#> SRR1414708 6 0.5337 0.96793 0.448 0.000 0.016 0.000 0.064 0.472
#> SRR1469080 2 0.4061 0.33891 0.000 0.664 0.000 0.012 0.316 0.008
#> SRR1365722 2 0.0405 0.83593 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1448118 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1639 0.87819 0.036 0.000 0.008 0.940 0.008 0.008
#> SRR1321829 2 0.5260 0.18484 0.000 0.552 0.348 0.004 0.000 0.096
#> SRR1475993 3 0.2340 0.64174 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445387 1 0.2948 0.10663 0.804 0.000 0.008 0.000 0.000 0.188
#> SRR1077575 5 0.3897 0.64849 0.000 0.280 0.024 0.000 0.696 0.000
#> SRR1349300 1 0.3789 -0.00677 0.716 0.000 0.024 0.000 0.000 0.260
#> SRR1374165 1 0.5801 0.04129 0.660 0.000 0.060 0.016 0.108 0.156
#> SRR1453769 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.3504 0.09107 0.776 0.000 0.024 0.000 0.004 0.196
#> SRR1401146 2 0.2806 0.71251 0.000 0.844 0.000 0.004 0.136 0.016
#> SRR1366124 4 0.1973 0.87330 0.036 0.000 0.008 0.924 0.028 0.004
#> SRR1391811 1 0.3847 -0.38977 0.544 0.000 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1456674 1 0.5649 0.05294 0.672 0.000 0.060 0.012 0.108 0.148
#> SRR1086490 3 0.2562 0.65030 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.1434 0.24096 0.948 0.000 0.028 0.000 0.012 0.012
#> SRR1384431 1 0.3928 0.22704 0.808 0.000 0.040 0.104 0.040 0.008
#> SRR1072055 1 0.6113 0.14443 0.628 0.000 0.056 0.208 0.056 0.052
#> SRR1359738 3 0.2562 0.65030 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.3850 0.05820 0.792 0.000 0.032 0.000 0.036 0.140
#> SRR1085900 2 0.5867 -0.11805 0.000 0.472 0.408 0.024 0.004 0.092
#> SRR1442173 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1431625 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0405 0.83593 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1357999 5 0.3897 0.64849 0.000 0.280 0.024 0.000 0.696 0.000
#> SRR1344034 5 0.6536 -0.01527 0.000 0.148 0.404 0.020 0.408 0.020
#> SRR1080391 4 0.3552 0.84709 0.096 0.000 0.036 0.832 0.028 0.008
#> SRR1347870 2 0.1867 0.80602 0.000 0.916 0.000 0.020 0.000 0.064
#> SRR814028 2 0.1575 0.82379 0.000 0.936 0.000 0.032 0.000 0.032
#> SRR814219 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1102128 1 0.1817 0.25026 0.936 0.000 0.012 0.016 0.016 0.020
#> SRR1460211 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.4138 0.54828 0.000 0.368 0.012 0.000 0.616 0.004
#> SRR1070060 1 0.3699 0.12772 0.788 0.000 0.028 0.004 0.012 0.168
#> SRR1487969 2 0.3426 0.57743 0.000 0.764 0.000 0.012 0.220 0.004
#> SRR1417851 1 0.5182 0.15548 0.648 0.000 0.036 0.264 0.044 0.008
#> SRR1443350 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.4154 -0.19701 0.676 0.000 0.012 0.000 0.016 0.296
#> SRR1076705 1 0.5602 0.06716 0.680 0.000 0.064 0.012 0.112 0.132
#> SRR1079380 5 0.4015 0.64019 0.000 0.208 0.036 0.000 0.744 0.012
#> SRR1102923 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.4488 0.45849 0.000 0.664 0.000 0.004 0.280 0.052
#> SRR1366605 2 0.0291 0.83524 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1396035 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2554 0.78609 0.000 0.876 0.000 0.028 0.004 0.092
#> SRR1436840 2 0.2030 0.80654 0.000 0.908 0.000 0.028 0.000 0.064
#> SRR1445573 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.5385 0.58095 0.000 0.000 0.024 0.636 0.220 0.120
#> SRR1431735 1 0.5246 0.06110 0.692 0.000 0.064 0.000 0.100 0.144
#> SRR1417387 1 0.5461 0.05389 0.680 0.000 0.064 0.004 0.104 0.148
#> SRR1445984 1 0.5365 0.04361 0.680 0.000 0.064 0.000 0.108 0.148
#> SRR1370447 4 0.1768 0.87682 0.040 0.000 0.004 0.932 0.020 0.004
#> SRR1446308 3 0.2730 0.64237 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 3 0.2340 0.64174 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.2182 0.79664 0.000 0.900 0.000 0.020 0.004 0.076
#> SRR1086466 6 0.5212 0.96496 0.448 0.000 0.012 0.000 0.060 0.480
#> SRR1073191 2 0.0405 0.83615 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1098974 1 0.3684 -0.15152 0.628 0.000 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1468914 4 0.1155 0.87790 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004 0.000
#> SRR1319584 5 0.4621 0.57467 0.000 0.096 0.152 0.004 0.732 0.016
#> SRR1486584 1 0.4109 -0.10542 0.648 0.000 0.024 0.000 0.000 0.328
#> SRR813536 4 0.5702 0.40735 0.448 0.000 0.044 0.460 0.040 0.008
#> SRR1317939 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.3774 -0.23881 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1341921 1 0.2956 0.24233 0.876 0.000 0.044 0.028 0.044 0.008
#> SRR1399178 2 0.0260 0.83672 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.3774 -0.23019 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1328551 2 0.1480 0.81786 0.000 0.940 0.000 0.020 0.000 0.040
#> SRR1453259 2 0.0260 0.83656 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.3950 0.64856 0.000 0.264 0.024 0.000 0.708 0.004
#> SRR1079543 2 0.0622 0.83510 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR816427 2 0.2094 0.80303 0.000 0.908 0.000 0.024 0.004 0.064
#> SRR1076681 3 0.4570 0.60360 0.000 0.192 0.716 0.008 0.004 0.080
#> SRR1335314 4 0.2288 0.87010 0.036 0.000 0.012 0.912 0.028 0.012
#> SRR1400799 3 0.2932 0.64888 0.000 0.164 0.820 0.000 0.000 0.016
#> SRR1074578 1 0.3083 0.23794 0.856 0.000 0.024 0.096 0.016 0.008
#> SRR1312226 2 0.4321 0.12360 0.000 0.580 0.000 0.012 0.400 0.008
#> SRR1416207 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1447371 1 0.2756 0.18680 0.876 0.000 0.032 0.000 0.020 0.072
#> SRR1069328 1 0.5476 -0.34686 0.480 0.000 0.032 0.444 0.036 0.008
#> SRR1445023 4 0.1636 0.87546 0.036 0.000 0.000 0.936 0.024 0.004
#> SRR1077599 3 0.5355 0.17852 0.000 0.452 0.452 0.000 0.004 0.092
#> SRR1453480 2 0.0653 0.83330 0.000 0.980 0.000 0.012 0.004 0.004
#> SRR1101834 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.5742 -0.63682 0.512 0.000 0.032 0.000 0.084 0.372
#> SRR1074839 3 0.5234 0.56121 0.000 0.240 0.648 0.020 0.004 0.088
#> SRR1458727 5 0.5517 0.47810 0.000 0.028 0.144 0.000 0.632 0.196
#> SRR1436949 2 0.3955 0.02395 0.000 0.560 0.000 0.004 0.436 0.000
#> SRR1070429 3 0.2562 0.65030 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.4153 -0.11807 0.636 0.000 0.024 0.000 0.000 0.340
#> SRR1432408 4 0.2288 0.87010 0.036 0.000 0.012 0.912 0.028 0.012
#> SRR1310334 1 0.4118 -0.13199 0.628 0.000 0.020 0.000 0.000 0.352
#> SRR1418201 3 0.6507 0.22178 0.000 0.056 0.512 0.000 0.208 0.224
#> SRR1385434 4 0.1973 0.87330 0.036 0.000 0.008 0.924 0.028 0.004
#> SRR1415591 3 0.2912 0.64841 0.000 0.172 0.816 0.000 0.000 0.012
#> SRR1402009 1 0.2834 0.16177 0.864 0.000 0.020 0.000 0.020 0.096
#> SRR1316055 4 0.4204 0.80918 0.040 0.000 0.012 0.796 0.064 0.088
#> SRR1308734 3 0.6888 0.25088 0.000 0.088 0.496 0.004 0.196 0.216
#> SRR1498973 2 0.3975 -0.05506 0.000 0.544 0.000 0.004 0.452 0.000
#> SRR1397115 1 0.4193 -0.14077 0.624 0.000 0.024 0.000 0.000 0.352
#> SRR1392141 1 0.5682 0.04724 0.668 0.000 0.060 0.012 0.108 0.152
#> SRR814341 2 0.0363 0.83229 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1313601 2 0.1074 0.83060 0.000 0.960 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR1459609 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.6898 0.06692 0.000 0.056 0.436 0.004 0.284 0.220
#> SRR809919 1 0.5001 0.06746 0.708 0.000 0.052 0.000 0.084 0.156
#> SRR1370818 4 0.1639 0.87819 0.036 0.000 0.008 0.940 0.008 0.008
#> SRR1323651 3 0.5354 0.20376 0.000 0.444 0.460 0.000 0.004 0.092
#> SRR1357297 1 0.3202 0.11300 0.800 0.000 0.024 0.000 0.000 0.176
#> SRR818170 5 0.5816 0.47542 0.000 0.056 0.160 0.000 0.624 0.160
#> SRR1091230 3 0.5390 0.18436 0.000 0.448 0.452 0.000 0.004 0.096
#> SRR1470556 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1095285 3 0.4059 0.61814 0.000 0.148 0.760 0.000 0.004 0.088
#> SRR1317731 3 0.7048 0.09635 0.000 0.076 0.436 0.004 0.272 0.212
#> SRR1490785 1 0.3261 0.03806 0.804 0.000 0.012 0.000 0.012 0.172
#> SRR1432032 1 0.3974 -0.06241 0.680 0.000 0.024 0.000 0.000 0.296
#> SRR1447808 1 0.3333 0.09540 0.784 0.000 0.024 0.000 0.000 0.192
#> SRR809534 2 0.0405 0.83681 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1397312 2 0.4011 0.56127 0.000 0.732 0.000 0.012 0.228 0.028
#> SRR812128 2 0.5937 0.01192 0.000 0.504 0.012 0.024 0.376 0.084
#> SRR1101513 1 0.2772 0.09554 0.816 0.000 0.004 0.000 0.000 0.180
#> SRR1415708 2 0.5371 -0.18777 0.000 0.456 0.456 0.004 0.004 0.080
#> SRR1316033 3 0.6540 0.33578 0.000 0.088 0.552 0.004 0.144 0.212
#> SRR1390371 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.6507 0.22178 0.000 0.056 0.512 0.000 0.208 0.224
#> SRR1076801 1 0.5608 0.04785 0.672 0.000 0.064 0.008 0.108 0.148
#> SRR1080044 1 0.3984 -0.22093 0.596 0.000 0.008 0.000 0.000 0.396
#> SRR1420850 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.2428 0.24767 0.904 0.000 0.020 0.024 0.044 0.008
#> SRR1069871 1 0.3979 -0.13665 0.628 0.000 0.012 0.000 0.000 0.360
#> SRR1095744 5 0.3897 0.64849 0.000 0.280 0.024 0.000 0.696 0.000
#> SRR1068929 2 0.0622 0.83434 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1490097 2 0.1644 0.81730 0.000 0.932 0.000 0.028 0.000 0.040
#> SRR1075054 2 0.3314 0.51712 0.000 0.740 0.000 0.004 0.256 0.000
#> SRR1083480 1 0.3851 -0.39107 0.540 0.000 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1075458 1 0.5365 0.04361 0.680 0.000 0.064 0.000 0.108 0.148
#> SRR1417023 4 0.2074 0.87287 0.036 0.000 0.012 0.920 0.028 0.004
#> SRR1309333 2 0.2237 0.79395 0.000 0.896 0.000 0.020 0.004 0.080
#> SRR1333676 1 0.1705 0.25274 0.940 0.000 0.012 0.024 0.016 0.008
#> SRR1352996 1 0.4028 -0.07127 0.668 0.000 0.024 0.000 0.000 0.308
#> SRR1093172 4 0.3428 0.85286 0.096 0.000 0.028 0.840 0.024 0.012
#> SRR1413137 4 0.3076 0.85596 0.096 0.000 0.028 0.852 0.024 0.000
#> SRR1469973 2 0.2958 0.77336 0.000 0.864 0.020 0.024 0.004 0.088
#> SRR1420026 2 0.1092 0.82564 0.000 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR817306 1 0.4847 0.06227 0.620 0.000 0.020 0.328 0.024 0.008
#> SRR1416266 4 0.1628 0.87814 0.036 0.000 0.012 0.940 0.008 0.004
#> SRR1071011 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.1585 0.87817 0.036 0.000 0.012 0.940 0.012 0.000
#> SRR1435394 2 0.5314 0.10148 0.000 0.528 0.372 0.004 0.000 0.096
#> SRR1383192 1 0.3871 0.12857 0.784 0.000 0.028 0.012 0.012 0.164
#> SRR1419962 3 0.6507 0.22178 0.000 0.056 0.512 0.000 0.208 0.224
#> SRR1094357 1 0.2325 0.24107 0.900 0.000 0.044 0.000 0.048 0.008
#> SRR1081639 3 0.6738 0.11820 0.000 0.056 0.456 0.000 0.256 0.232
#> SRR1356016 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.3909 0.62407 0.000 0.160 0.060 0.000 0.772 0.008
#> SRR1312147 1 0.5608 0.04785 0.672 0.000 0.064 0.008 0.108 0.148
#> SRR1473891 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.5089 0.67519 0.300 0.000 0.036 0.628 0.028 0.008
#> SRR1474930 3 0.4958 0.59523 0.000 0.196 0.692 0.020 0.004 0.088
#> SRR1470988 4 0.1552 0.87741 0.036 0.000 0.004 0.940 0.020 0.000
#> SRR811915 2 0.0363 0.83535 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1104987 1 0.3695 -0.16017 0.624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1100005 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.5703 0.52940 0.000 0.656 0.176 0.008 0.064 0.096
#> SRR1313770 3 0.6600 0.23239 0.000 0.056 0.516 0.004 0.208 0.216
#> SRR1315780 2 0.1483 0.81312 0.000 0.944 0.000 0.012 0.036 0.008
#> SRR1073631 1 0.3979 -0.13665 0.628 0.000 0.012 0.000 0.000 0.360
#> SRR819124 1 0.4451 0.21002 0.756 0.000 0.040 0.156 0.040 0.008
#> SRR1310997 2 0.4866 -0.18706 0.000 0.480 0.000 0.016 0.476 0.028
#> SRR1464494 5 0.4854 0.37943 0.000 0.432 0.012 0.020 0.528 0.008
#> SRR1357083 3 0.2562 0.65030 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.1528 0.81638 0.000 0.936 0.000 0.016 0.000 0.048
#> SRR1378085 1 0.3670 0.02998 0.736 0.000 0.024 0.000 0.000 0.240
#> SRR1378220 3 0.3456 0.64012 0.000 0.172 0.788 0.000 0.000 0.040
#> SRR1467704 1 0.5070 -0.31111 0.620 0.000 0.024 0.000 0.056 0.300
#> SRR1348885 5 0.5448 0.49485 0.000 0.032 0.144 0.000 0.648 0.176
#> SRR1325826 1 0.4052 -0.13426 0.628 0.000 0.016 0.000 0.000 0.356
#> SRR1466812 4 0.3292 0.84936 0.108 0.000 0.032 0.836 0.024 0.000
#> SRR1345692 2 0.2145 0.80192 0.000 0.900 0.000 0.028 0.000 0.072
#> SRR1401040 3 0.5279 0.47233 0.000 0.092 0.680 0.000 0.056 0.172
#> SRR1097954 1 0.0767 0.24459 0.976 0.000 0.012 0.000 0.008 0.004
#> SRR1374396 4 0.2288 0.87010 0.036 0.000 0.012 0.912 0.028 0.012
#> SRR1454073 2 0.2597 0.78579 0.000 0.880 0.004 0.020 0.008 0.088
#> SRR1355747 1 0.5680 -0.90182 0.452 0.000 0.024 0.000 0.084 0.440
#> SRR1429368 3 0.3850 0.59559 0.000 0.128 0.792 0.000 0.016 0.064
#> SRR1398138 2 0.5309 0.45612 0.000 0.648 0.232 0.024 0.004 0.092
#> SRR1379260 1 0.5294 -0.03467 0.676 0.000 0.048 0.000 0.104 0.172
#> SRR1361436 3 0.3268 0.62217 0.000 0.144 0.812 0.000 0.000 0.044
#> SRR817142 2 0.5262 -0.19229 0.000 0.452 0.452 0.000 0.000 0.096
#> SRR1315291 4 0.4122 0.75177 0.000 0.000 0.024 0.780 0.096 0.100
#> SRR1309314 5 0.6678 0.23844 0.000 0.036 0.264 0.000 0.408 0.292
#> SRR1420085 2 0.2554 0.78609 0.000 0.876 0.000 0.028 0.004 0.092
#> SRR1361308 3 0.5022 0.49297 0.000 0.088 0.712 0.000 0.060 0.140
#> SRR1472126 1 0.4118 -0.13199 0.628 0.000 0.020 0.000 0.000 0.352
#> SRR1380482 5 0.4864 0.55730 0.000 0.132 0.172 0.004 0.688 0.004
#> SRR1099789 1 0.3684 -0.15152 0.628 0.000 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1079480 5 0.3897 0.64849 0.000 0.280 0.024 0.000 0.696 0.000
#> SRR1339276 1 0.3847 -0.38977 0.544 0.000 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1418368 1 0.3984 -0.22093 0.596 0.000 0.008 0.000 0.000 0.396
#> SRR1399353 1 0.5365 0.04361 0.680 0.000 0.064 0.000 0.108 0.148
#> SRR1096760 3 0.2562 0.65030 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 3 0.5354 0.20376 0.000 0.444 0.460 0.000 0.004 0.092
#> SRR1330813 2 0.5127 0.14042 0.000 0.544 0.364 0.000 0.000 0.092
#> SRR1458931 2 0.0146 0.83698 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1010 0.87817 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.2476 0.24399 0.900 0.000 0.036 0.012 0.044 0.008
#> SRR1081160 2 0.1501 0.81093 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1469704 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1477173 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.1588 0.78682 0.000 0.924 0.000 0.004 0.072 0.000
#> SRR1390143 1 0.4483 0.20779 0.752 0.000 0.036 0.160 0.044 0.008
#> SRR1390413 2 0.0622 0.83434 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1099570 3 0.2378 0.64393 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.3516 0.12165 0.792 0.000 0.024 0.000 0.012 0.172
#> SRR1096687 1 0.2170 0.24932 0.912 0.000 0.056 0.008 0.016 0.008
#> SRR1486139 1 0.4288 -0.40541 0.644 0.000 0.016 0.000 0.012 0.328
#> SRR1470313 4 0.3010 0.86024 0.084 0.000 0.028 0.864 0.016 0.008
#> SRR1447893 3 0.2912 0.64886 0.000 0.172 0.816 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466025 5 0.4422 0.64203 0.000 0.288 0.024 0.008 0.672 0.008
#> SRR1477429 1 0.4127 0.22263 0.792 0.000 0.040 0.116 0.044 0.008
#> SRR1445701 3 0.4329 0.61005 0.000 0.180 0.728 0.000 0.004 0.088
#> SRR820689 1 0.3684 -0.15152 0.628 0.000 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1451876 2 0.1858 0.81110 0.000 0.912 0.000 0.012 0.000 0.076
#> SRR1452537 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4413 0.20709 0.760 0.000 0.036 0.152 0.044 0.008
#> SRR1489328 2 0.5187 0.48947 0.000 0.668 0.212 0.024 0.004 0.092
#> SRR1344462 1 0.3807 -0.14682 0.628 0.000 0.004 0.000 0.000 0.368
#> SRR1082709 1 0.3899 -0.14312 0.628 0.000 0.008 0.000 0.000 0.364
#> SRR1447784 4 0.5012 0.79405 0.076 0.000 0.028 0.748 0.068 0.080
#> SRR1355769 1 0.4011 -0.06450 0.672 0.000 0.024 0.000 0.000 0.304
#> SRR1488237 2 0.0260 0.83656 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1480917 5 0.4456 0.25716 0.000 0.484 0.004 0.008 0.496 0.008
#> SRR1474485 4 0.2290 0.86600 0.084 0.000 0.020 0.892 0.004 0.000
#> SRR1089998 1 0.0993 0.24549 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318140 1 0.4105 -0.12702 0.632 0.000 0.020 0.000 0.000 0.348
#> SRR1319262 3 0.2562 0.65030 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 3 0.5870 0.31324 0.000 0.412 0.468 0.024 0.004 0.092
#> SRR1454350 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1440374 1 0.3684 -0.15788 0.628 0.000 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1359565 3 0.2703 0.65005 0.000 0.172 0.824 0.000 0.000 0.004
#> SRR1105417 1 0.5702 -0.39626 0.460 0.000 0.040 0.448 0.044 0.008
#> SRR1325578 5 0.6548 0.13322 0.000 0.084 0.388 0.004 0.436 0.088
#> SRR1358161 3 0.6898 0.06692 0.000 0.056 0.436 0.004 0.284 0.220
#> SRR1358665 2 0.0260 0.83656 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.4317 -0.12714 0.000 0.520 0.000 0.008 0.464 0.008
#> SRR1452010 1 0.3616 0.10893 0.780 0.000 0.024 0.000 0.012 0.184
#> SRR1418183 3 0.5265 0.36005 0.000 0.388 0.520 0.000 0.004 0.088
#> SRR1366345 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1387449 1 0.3259 0.07041 0.772 0.000 0.012 0.000 0.000 0.216
#> SRR1473461 1 0.2341 0.24789 0.908 0.000 0.016 0.024 0.044 0.008
#> SRR1090837 3 0.2703 0.65005 0.000 0.172 0.824 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447828 3 0.6406 0.29624 0.000 0.068 0.544 0.000 0.172 0.216
#> SRR1338747 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.2340 0.64174 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350280 1 0.3202 0.11300 0.800 0.000 0.024 0.000 0.000 0.176
#> SRR1088557 1 0.0909 0.24684 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012 0.000
#> SRR1102656 2 0.3151 0.52859 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1441443 2 0.2630 0.78700 0.000 0.872 0.000 0.032 0.004 0.092
#> SRR1370682 3 0.6841 0.00910 0.000 0.056 0.412 0.000 0.304 0.228
#> SRR1475448 3 0.2527 0.64981 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.3897 -0.03470 0.696 0.000 0.024 0.000 0.000 0.280
#> SRR1405266 1 0.2848 0.11945 0.816 0.000 0.008 0.000 0.000 0.176
#> SRR1363766 1 0.4109 -0.10542 0.648 0.000 0.024 0.000 0.000 0.328
#> SRR1082592 5 0.6738 0.50374 0.000 0.328 0.108 0.016 0.480 0.068
#> SRR1325794 2 0.4436 0.61644 0.000 0.728 0.000 0.012 0.180 0.080
#> SRR1095961 3 0.2527 0.64981 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0622 0.83510 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1320806 3 0.5354 0.20376 0.000 0.444 0.460 0.000 0.004 0.092
#> SRR1457527 3 0.6331 0.27256 0.000 0.056 0.544 0.000 0.180 0.220
#> SRR1098831 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.2340 0.64174 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488858 4 0.1973 0.87330 0.036 0.000 0.008 0.924 0.028 0.004
#> SRR1454695 4 0.5845 0.45996 0.416 0.000 0.048 0.480 0.048 0.008
#> SRR1090241 2 0.1124 0.82986 0.000 0.956 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR1329863 2 0.0551 0.83472 0.000 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1357733 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1362135 1 0.2888 0.24122 0.880 0.000 0.040 0.028 0.044 0.008
#> SRR1379581 5 0.6901 0.12045 0.000 0.056 0.336 0.000 0.372 0.236
#> SRR1309182 1 0.3364 0.08873 0.780 0.000 0.024 0.000 0.000 0.196
#> SRR1437668 1 0.5586 -0.01374 0.652 0.000 0.064 0.000 0.108 0.176
#> SRR1084742 5 0.4099 0.64799 0.000 0.272 0.024 0.000 0.696 0.008
#> SRR1433538 1 0.3834 -0.01599 0.708 0.000 0.024 0.000 0.000 0.268
#> SRR1085063 2 0.0291 0.83651 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1454247 5 0.3898 0.63888 0.000 0.296 0.020 0.000 0.684 0.000
#> SRR1097100 2 0.0405 0.83615 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR818622 2 0.5390 -0.18613 0.000 0.452 0.448 0.000 0.004 0.096
#> SRR1072388 1 0.5365 0.04361 0.680 0.000 0.064 0.000 0.108 0.148
#> SRR1070332 2 0.3314 0.51922 0.000 0.740 0.000 0.004 0.256 0.000
#> SRR1320761 3 0.6916 0.28235 0.000 0.308 0.432 0.000 0.176 0.084
#> SRR1076195 4 0.2288 0.87010 0.036 0.000 0.012 0.912 0.028 0.012
#> SRR1069895 3 0.5335 0.29528 0.000 0.412 0.492 0.000 0.004 0.092
#> SRR1099144 1 0.7119 0.03686 0.560 0.000 0.060 0.124 0.108 0.148
#> SRR1385150 3 0.2884 0.64841 0.000 0.164 0.824 0.004 0.000 0.008
#> SRR1420191 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1010 0.87817 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.3936 -0.04362 0.688 0.000 0.024 0.000 0.000 0.288
#> SRR1456971 1 0.5331 0.04954 0.684 0.000 0.064 0.000 0.108 0.144
#> SRR1340574 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1444830 3 0.5319 0.18229 0.000 0.452 0.456 0.000 0.004 0.088
#> SRR1096267 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1087127 5 0.4235 0.55329 0.000 0.060 0.160 0.004 0.760 0.016
#> SRR1408553 4 0.2829 0.85995 0.096 0.000 0.016 0.864 0.024 0.000
#> SRR1069231 1 0.1862 0.24426 0.932 0.000 0.032 0.008 0.012 0.016
#> SRR1325642 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.3141 0.07375 0.788 0.000 0.012 0.000 0.000 0.200
#> SRR1321942 1 0.3847 -0.12158 0.644 0.000 0.008 0.000 0.000 0.348
#> SRR1094380 1 0.5394 -0.02689 0.668 0.000 0.060 0.000 0.092 0.180
#> SRR1447499 2 0.3980 0.69678 0.000 0.796 0.104 0.020 0.004 0.076
#> SRR1099330 3 0.5354 0.20376 0.000 0.444 0.460 0.000 0.004 0.092
#> SRR1077874 2 0.3831 0.49843 0.000 0.712 0.000 0.008 0.268 0.012
#> SRR808299 2 0.0260 0.83656 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3897 0.64849 0.000 0.280 0.024 0.000 0.696 0.000
#> SRR1481238 2 0.4493 0.65414 0.000 0.740 0.000 0.020 0.144 0.096
#> SRR1443568 3 0.5502 0.34489 0.000 0.392 0.508 0.008 0.004 0.088
#> SRR1380249 4 0.0865 0.87801 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.3301 0.10123 0.788 0.000 0.024 0.000 0.000 0.188
#> SRR1383148 4 0.1697 0.87513 0.036 0.000 0.004 0.936 0.020 0.004
#> SRR1357042 1 0.4114 -0.40006 0.532 0.000 0.004 0.000 0.004 0.460
#> SRR1416025 2 0.1480 0.81786 0.000 0.940 0.000 0.020 0.000 0.040
#> SRR1431015 2 0.2342 0.78879 0.000 0.888 0.000 0.020 0.004 0.088
#> SRR1078709 2 0.3168 0.76807 0.000 0.852 0.024 0.028 0.004 0.092
#> SRR813283 1 0.2482 0.13068 0.848 0.000 0.004 0.000 0.000 0.148
#> SRR1430226 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.3604 0.11069 0.820 0.000 0.032 0.000 0.044 0.104
#> SRR1466927 2 0.0146 0.83697 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.5492 0.47443 0.000 0.028 0.132 0.000 0.632 0.208
#> SRR807679 6 0.5464 0.95257 0.448 0.000 0.016 0.000 0.076 0.460
#> SRR1333811 3 0.4097 0.63609 0.000 0.168 0.772 0.020 0.020 0.020
#> SRR1078660 2 0.4760 0.66423 0.000 0.748 0.016 0.028 0.116 0.092
#> SRR1331730 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333913 6 0.5541 0.93226 0.448 0.000 0.016 0.000 0.084 0.452
#> SRR1432542 1 0.5365 0.04361 0.680 0.000 0.064 0.000 0.108 0.148
#> SRR1418041 1 0.1320 0.24877 0.948 0.000 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1085211 1 0.4844 0.20364 0.744 0.000 0.044 0.140 0.048 0.024
#> SRR1339812 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.5260 0.05932 0.692 0.000 0.064 0.000 0.108 0.136
#> SRR1350958 2 0.0520 0.83570 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1396822 3 0.5354 0.20376 0.000 0.444 0.460 0.000 0.004 0.092
#> SRR1441934 2 0.2864 0.77671 0.000 0.860 0.012 0.028 0.000 0.100
#> SRR1472552 3 0.3268 0.62217 0.000 0.144 0.812 0.000 0.000 0.044
#> SRR1488881 3 0.2300 0.63890 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.3931 0.08795 0.800 0.000 0.036 0.000 0.064 0.100
#> SRR1071131 3 0.4448 0.61309 0.000 0.176 0.732 0.008 0.004 0.080
#> SRR1074502 1 0.3810 -0.28844 0.572 0.000 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1325271 1 0.7700 -0.28292 0.376 0.000 0.060 0.352 0.112 0.100
#> SRR1409171 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0806 0.83481 0.000 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1430045 2 0.0146 0.83682 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1441245 2 0.2779 0.78210 0.000 0.872 0.012 0.024 0.004 0.088
#> SRR1384091 4 0.3402 0.84563 0.104 0.000 0.036 0.836 0.016 0.008
#> SRR1431887 2 0.0146 0.83564 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096525 4 0.1837 0.87608 0.044 0.000 0.004 0.928 0.020 0.004
#> SRR1488491 2 0.0508 0.83541 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1356351 5 0.4517 0.39200 0.000 0.440 0.012 0.004 0.536 0.008
#> SRR1369514 4 0.5619 0.47348 0.408 0.000 0.044 0.504 0.036 0.008
#> SRR1453299 3 0.2340 0.64174 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436300 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1348490 5 0.3971 0.64870 0.000 0.268 0.024 0.000 0.704 0.004
#> SRR1091767 2 0.2789 0.77898 0.000 0.872 0.016 0.020 0.004 0.088
#> SRR1354467 3 0.2454 0.64754 0.000 0.160 0.840 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.5290 0.07445 0.000 0.524 0.380 0.000 0.004 0.092
#> SRR1452399 5 0.8040 0.29473 0.000 0.252 0.236 0.028 0.332 0.152
#> SRR1437430 3 0.6883 -0.03269 0.000 0.056 0.392 0.000 0.316 0.236
#> SRR1419736 5 0.4034 0.64835 0.000 0.280 0.024 0.000 0.692 0.004
#> SRR1313343 3 0.5529 0.44984 0.000 0.084 0.668 0.000 0.100 0.148
#> SRR1077619 4 0.3706 0.82153 0.132 0.000 0.036 0.808 0.016 0.008
#> SRR1083530 6 0.5212 0.96131 0.448 0.000 0.012 0.000 0.060 0.480
#> SRR1333633 2 0.5861 -0.29488 0.000 0.440 0.144 0.004 0.408 0.004
#> SRR1354999 3 0.5355 0.19136 0.000 0.448 0.456 0.000 0.004 0.092
#> SRR1443592 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1858 0.19149 0.912 0.000 0.012 0.000 0.000 0.076
#> SRR1378818 5 0.3736 0.55885 0.000 0.056 0.144 0.004 0.792 0.004
#> SRR1413182 4 0.1810 0.87469 0.036 0.000 0.008 0.932 0.020 0.004
#> SRR1464559 4 0.3403 0.84731 0.096 0.000 0.032 0.840 0.024 0.008
#> SRR1413075 5 0.4418 0.51160 0.000 0.384 0.012 0.004 0.592 0.008
#> SRR1487928 4 0.2288 0.87010 0.036 0.000 0.012 0.912 0.028 0.012
#> SRR1388997 2 0.2342 0.78879 0.000 0.888 0.000 0.020 0.004 0.088
#> SRR1092865 2 0.5516 -0.15338 0.000 0.460 0.436 0.004 0.004 0.096
#> SRR1102729 1 0.5059 0.17465 0.684 0.000 0.044 0.220 0.044 0.008
#> SRR1456423 1 0.3899 -0.14312 0.628 0.000 0.008 0.000 0.000 0.364
#> SRR1321591 2 0.0508 0.83541 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1376874 3 0.6845 0.02611 0.000 0.056 0.416 0.000 0.292 0.236
#> SRR1339903 1 0.4011 -0.07026 0.672 0.000 0.024 0.000 0.000 0.304
#> SRR1346710 6 0.5291 0.96782 0.448 0.000 0.016 0.000 0.060 0.476
#> SRR1418771 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.6246 0.41590 0.000 0.584 0.192 0.000 0.128 0.096
#> SRR1480941 5 0.5854 0.46248 0.000 0.036 0.164 0.000 0.596 0.204
#> SRR1479175 2 0.0405 0.83615 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1313891 2 0.0508 0.83541 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1491354 1 0.3301 0.10123 0.788 0.000 0.024 0.000 0.000 0.188
#> SRR1433884 2 0.5807 -0.13348 0.000 0.464 0.420 0.020 0.004 0.092
#> SRR1471074 2 0.0146 0.83676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.3111 0.76451 0.000 0.856 0.032 0.020 0.004 0.088
#> SRR1355554 3 0.5317 0.20686 0.000 0.444 0.464 0.000 0.004 0.088
#> SRR1487173 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1474253 1 0.3940 -0.12215 0.640 0.000 0.012 0.000 0.000 0.348
#> SRR1322918 2 0.1950 0.80528 0.000 0.912 0.000 0.024 0.000 0.064
#> SRR1318331 2 0.1391 0.81981 0.000 0.944 0.000 0.016 0.000 0.040
#> SRR1321333 3 0.2491 0.64889 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1350545 1 0.1509 0.25058 0.948 0.000 0.024 0.008 0.012 0.008
#> SRR1091328 1 0.5798 -0.84195 0.464 0.000 0.032 0.000 0.084 0.420
#> SRR814447 5 0.6892 0.14054 0.000 0.056 0.324 0.000 0.384 0.236
#> SRR1455989 3 0.2562 0.65030 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.6507 0.22178 0.000 0.056 0.512 0.000 0.208 0.224
#> SRR1470356 2 0.0858 0.83232 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1342977 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0713 0.83183 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1097197 1 0.2432 0.16550 0.876 0.000 0.024 0.000 0.000 0.100
#> SRR1366729 3 0.6156 0.30835 0.000 0.056 0.572 0.000 0.160 0.212
#> SRR821282 3 0.6888 -0.03091 0.000 0.056 0.388 0.000 0.320 0.236
#> SRR1074602 2 0.5355 -0.17922 0.000 0.456 0.448 0.000 0.004 0.092
#> SRR814633 2 0.0000 0.83683 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 5 0.6817 0.15256 0.000 0.056 0.348 0.004 0.416 0.176
#> SRR1319100 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1324004 3 0.4955 0.52033 0.000 0.284 0.624 0.000 0.004 0.088
#> SRR1457459 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1421031 4 0.5592 0.40441 0.444 0.000 0.040 0.472 0.036 0.008
#> SRR1444598 5 0.5258 0.49706 0.000 0.036 0.136 0.000 0.676 0.152
#> SRR1091743 2 0.5384 -0.11592 0.000 0.472 0.428 0.000 0.004 0.096
#> SRR819637 1 0.3857 -0.39529 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1083848 1 0.3807 -0.14682 0.628 0.000 0.004 0.000 0.000 0.368
#> SRR1088934 3 0.4506 0.59423 0.000 0.204 0.704 0.000 0.004 0.088
#> SRR1459785 3 0.2340 0.64174 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083700 1 0.5127 0.06462 0.700 0.000 0.060 0.000 0.088 0.152
#> SRR1375531 1 0.4376 0.21304 0.764 0.000 0.036 0.148 0.044 0.008
#> SRR1323470 5 0.5584 0.47172 0.000 0.028 0.140 0.000 0.620 0.212
#> SRR814657 1 0.3812 -0.01262 0.712 0.000 0.024 0.000 0.000 0.264
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4922 0.508 0.508
#> 3 3 0.806 0.949 0.941 0.2464 0.864 0.733
#> 4 4 0.986 0.952 0.975 0.1191 0.936 0.829
#> 5 5 0.860 0.862 0.917 0.0607 0.941 0.814
#> 6 6 0.837 0.796 0.877 0.0441 0.934 0.764
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0 1 0 1
#> SRR1467726 2 0 1 0 1
#> SRR815446 2 0 1 0 1
#> SRR1402132 1 0 1 1 0
#> SRR1326059 1 0 1 1 0
#> SRR1409062 2 0 1 0 1
#> SRR809406 1 0 1 1 0
#> SRR1465313 2 0 1 0 1
#> SRR819559 1 0 1 1 0
#> SRR1387899 2 0 1 0 1
#> SRR1442292 2 0 1 0 1
#> SRR1488151 1 0 1 1 0
#> SRR1395635 1 0 1 1 0
#> SRR1343629 1 0 1 1 0
#> SRR1326868 2 0 1 0 1
#> SRR1102320 1 0 1 1 0
#> SRR1469926 2 0 1 0 1
#> SRR1070036 1 0 1 1 0
#> SRR1098426 1 0 1 1 0
#> SRR1090310 2 0 1 0 1
#> SRR1429748 1 0 1 1 0
#> SRR1363654 1 0 1 1 0
#> SRR1326317 2 0 1 0 1
#> SRR1378308 2 0 1 0 1
#> SRR1366919 1 0 1 1 0
#> SRR1329947 1 0 1 1 0
#> SRR1469769 2 0 1 0 1
#> SRR1490761 2 0 1 0 1
#> SRR1380122 2 0 1 0 1
#> SRR1402944 2 0 1 0 1
#> SRR1092818 1 0 1 1 0
#> SRR1093552 1 0 1 1 0
#> SRR1464880 2 0 1 0 1
#> SRR1078368 2 0 1 0 1
#> SRR1349608 2 0 1 0 1
#> SRR1466951 2 0 1 0 1
#> SRR1331879 2 0 1 0 1
#> SRR1320034 2 0 1 0 1
#> SRR1068687 2 0 1 0 1
#> SRR1437491 1 0 1 1 0
#> SRR1310777 2 0 1 0 1
#> SRR1374005 2 0 1 0 1
#> SRR1319182 1 0 1 1 0
#> SRR1329994 1 0 1 1 0
#> SRR1354203 1 0 1 1 0
#> SRR1077850 1 0 1 1 0
#> SRR1369241 2 0 1 0 1
#> SRR1077992 2 0 1 0 1
#> SRR1455214 1 0 1 1 0
#> SRR1092014 2 0 1 0 1
#> SRR1097857 1 0 1 1 0
#> SRR1473318 1 0 1 1 0
#> SRR1345974 2 0 1 0 1
#> SRR1338687 2 0 1 0 1
#> SRR1071207 1 0 1 1 0
#> SRR1486821 2 0 1 0 1
#> SRR1418540 1 0 1 1 0
#> SRR1408788 2 0 1 0 1
#> SRR1359487 1 0 1 1 0
#> SRR1080648 1 0 1 1 0
#> SRR1414708 1 0 1 1 0
#> SRR1469080 2 0 1 0 1
#> SRR1365722 2 0 1 0 1
#> SRR1448118 2 0 1 0 1
#> SRR1444808 1 0 1 1 0
#> SRR1321829 2 0 1 0 1
#> SRR1475993 2 0 1 0 1
#> SRR1445387 1 0 1 1 0
#> SRR1077575 2 0 1 0 1
#> SRR1349300 1 0 1 1 0
#> SRR1374165 1 0 1 1 0
#> SRR1453769 2 0 1 0 1
#> SRR1473870 1 0 1 1 0
#> SRR1401146 2 0 1 0 1
#> SRR1366124 1 0 1 1 0
#> SRR1391811 1 0 1 1 0
#> SRR1456674 1 0 1 1 0
#> SRR1086490 2 0 1 0 1
#> SRR1088511 2 0 1 0 1
#> SRR1404577 1 0 1 1 0
#> SRR1384431 1 0 1 1 0
#> SRR1072055 1 0 1 1 0
#> SRR1359738 2 0 1 0 1
#> SRR1332141 1 0 1 1 0
#> SRR1085900 2 0 1 0 1
#> SRR1442173 1 0 1 1 0
#> SRR1431625 2 0 1 0 1
#> SRR814515 2 0 1 0 1
#> SRR1357999 2 0 1 0 1
#> SRR1344034 2 0 1 0 1
#> SRR1080391 1 0 1 1 0
#> SRR1347870 2 0 1 0 1
#> SRR814028 2 0 1 0 1
#> SRR814219 2 0 1 0 1
#> SRR1070620 1 0 1 1 0
#> SRR1102128 1 0 1 1 0
#> SRR1460211 2 0 1 0 1
#> SRR1418346 2 0 1 0 1
#> SRR1070060 1 0 1 1 0
#> SRR1487969 2 0 1 0 1
#> SRR1417851 1 0 1 1 0
#> SRR1443350 2 0 1 0 1
#> SRR1403199 1 0 1 1 0
#> SRR1076705 1 0 1 1 0
#> SRR1079380 2 0 1 0 1
#> SRR1102923 2 0 1 0 1
#> SRR1369560 2 0 1 0 1
#> SRR1366605 2 0 1 0 1
#> SRR1396035 2 0 1 0 1
#> SRR1390223 2 0 1 0 1
#> SRR1436840 2 0 1 0 1
#> SRR1445573 2 0 1 0 1
#> SRR1375394 1 0 1 1 0
#> SRR1431735 1 0 1 1 0
#> SRR1417387 1 0 1 1 0
#> SRR1445984 1 0 1 1 0
#> SRR1370447 1 0 1 1 0
#> SRR1446308 2 0 1 0 1
#> SRR1437346 2 0 1 0 1
#> SRR1103143 2 0 1 0 1
#> SRR1086466 1 0 1 1 0
#> SRR1073191 2 0 1 0 1
#> SRR1098974 1 0 1 1 0
#> SRR1468914 1 0 1 1 0
#> SRR1319584 2 0 1 0 1
#> SRR1486584 1 0 1 1 0
#> SRR813536 1 0 1 1 0
#> SRR1317939 2 0 1 0 1
#> SRR1079730 1 0 1 1 0
#> SRR1341921 1 0 1 1 0
#> SRR1399178 2 0 1 0 1
#> SRR1415615 1 0 1 1 0
#> SRR1328551 2 0 1 0 1
#> SRR1453259 2 0 1 0 1
#> SRR1340828 2 0 1 0 1
#> SRR1079543 2 0 1 0 1
#> SRR816427 2 0 1 0 1
#> SRR1076681 2 0 1 0 1
#> SRR1335314 1 0 1 1 0
#> SRR1400799 2 0 1 0 1
#> SRR1074578 1 0 1 1 0
#> SRR1312226 2 0 1 0 1
#> SRR1416207 1 0 1 1 0
#> SRR1447371 1 0 1 1 0
#> SRR1069328 1 0 1 1 0
#> SRR1445023 1 0 1 1 0
#> SRR1077599 2 0 1 0 1
#> SRR1453480 2 0 1 0 1
#> SRR1101834 2 0 1 0 1
#> SRR1321744 1 0 1 1 0
#> SRR1074839 2 0 1 0 1
#> SRR1458727 2 0 1 0 1
#> SRR1436949 2 0 1 0 1
#> SRR1070429 2 0 1 0 1
#> SRR1458158 1 0 1 1 0
#> SRR1432408 1 0 1 1 0
#> SRR1310334 1 0 1 1 0
#> SRR1418201 2 0 1 0 1
#> SRR1385434 1 0 1 1 0
#> SRR1415591 2 0 1 0 1
#> SRR1402009 1 0 1 1 0
#> SRR1316055 1 0 1 1 0
#> SRR1308734 2 0 1 0 1
#> SRR1498973 2 0 1 0 1
#> SRR1397115 1 0 1 1 0
#> SRR1392141 1 0 1 1 0
#> SRR814341 2 0 1 0 1
#> SRR1313601 2 0 1 0 1
#> SRR1459609 2 0 1 0 1
#> SRR1499325 2 0 1 0 1
#> SRR809919 1 0 1 1 0
#> SRR1370818 1 0 1 1 0
#> SRR1323651 2 0 1 0 1
#> SRR1357297 1 0 1 1 0
#> SRR818170 2 0 1 0 1
#> SRR1091230 2 0 1 0 1
#> SRR1470556 2 0 1 0 1
#> SRR812318 1 0 1 1 0
#> SRR1095285 2 0 1 0 1
#> SRR1317731 2 0 1 0 1
#> SRR1490785 1 0 1 1 0
#> SRR1432032 1 0 1 1 0
#> SRR1447808 1 0 1 1 0
#> SRR809534 2 0 1 0 1
#> SRR1397312 2 0 1 0 1
#> SRR812128 2 0 1 0 1
#> SRR1101513 1 0 1 1 0
#> SRR1415708 2 0 1 0 1
#> SRR1316033 2 0 1 0 1
#> SRR1390371 2 0 1 0 1
#> SRR1480263 2 0 1 0 1
#> SRR1464473 2 0 1 0 1
#> SRR1076801 1 0 1 1 0
#> SRR1080044 1 0 1 1 0
#> SRR1420850 2 0 1 0 1
#> SRR1474295 1 0 1 1 0
#> SRR1069871 1 0 1 1 0
#> SRR1095744 2 0 1 0 1
#> SRR1068929 2 0 1 0 1
#> SRR1490097 2 0 1 0 1
#> SRR1075054 2 0 1 0 1
#> SRR1083480 1 0 1 1 0
#> SRR1075458 1 0 1 1 0
#> SRR1417023 1 0 1 1 0
#> SRR1309333 2 0 1 0 1
#> SRR1333676 1 0 1 1 0
#> SRR1352996 1 0 1 1 0
#> SRR1093172 1 0 1 1 0
#> SRR1413137 1 0 1 1 0
#> SRR1469973 2 0 1 0 1
#> SRR1420026 2 0 1 0 1
#> SRR817306 1 0 1 1 0
#> SRR1416266 1 0 1 1 0
#> SRR1071011 2 0 1 0 1
#> SRR1090290 1 0 1 1 0
#> SRR1435394 2 0 1 0 1
#> SRR1383192 1 0 1 1 0
#> SRR1419962 2 0 1 0 1
#> SRR1094357 1 0 1 1 0
#> SRR1081639 2 0 1 0 1
#> SRR1356016 2 0 1 0 1
#> SRR1351082 2 0 1 0 1
#> SRR1397348 2 0 1 0 1
#> SRR1312147 1 0 1 1 0
#> SRR1473891 2 0 1 0 1
#> SRR1335470 1 0 1 1 0
#> SRR1474930 2 0 1 0 1
#> SRR1470988 1 0 1 1 0
#> SRR811915 2 0 1 0 1
#> SRR1104987 1 0 1 1 0
#> SRR1100005 2 0 1 0 1
#> SRR1444436 2 0 1 0 1
#> SRR1313770 2 0 1 0 1
#> SRR1315780 2 0 1 0 1
#> SRR1073631 1 0 1 1 0
#> SRR819124 1 0 1 1 0
#> SRR1310997 2 0 1 0 1
#> SRR1464494 2 0 1 0 1
#> SRR1357083 2 0 1 0 1
#> SRR1475842 2 0 1 0 1
#> SRR1378085 1 0 1 1 0
#> SRR1378220 2 0 1 0 1
#> SRR1467704 1 0 1 1 0
#> SRR1348885 2 0 1 0 1
#> SRR1325826 1 0 1 1 0
#> SRR1466812 1 0 1 1 0
#> SRR1345692 2 0 1 0 1
#> SRR1401040 2 0 1 0 1
#> SRR1097954 1 0 1 1 0
#> SRR1374396 1 0 1 1 0
#> SRR1454073 2 0 1 0 1
#> SRR1355747 1 0 1 1 0
#> SRR1429368 2 0 1 0 1
#> SRR1398138 2 0 1 0 1
#> SRR1379260 1 0 1 1 0
#> SRR1361436 2 0 1 0 1
#> SRR817142 2 0 1 0 1
#> SRR1315291 1 0 1 1 0
#> SRR1309314 2 0 1 0 1
#> SRR1420085 2 0 1 0 1
#> SRR1361308 2 0 1 0 1
#> SRR1472126 1 0 1 1 0
#> SRR1380482 2 0 1 0 1
#> SRR1099789 1 0 1 1 0
#> SRR1079480 2 0 1 0 1
#> SRR1339276 1 0 1 1 0
#> SRR1418368 1 0 1 1 0
#> SRR1399353 1 0 1 1 0
#> SRR1096760 2 0 1 0 1
#> SRR1440290 2 0 1 0 1
#> SRR1330813 2 0 1 0 1
#> SRR1458931 2 0 1 0 1
#> SRR812294 1 0 1 1 0
#> SRR1394321 1 0 1 1 0
#> SRR1081160 2 0 1 0 1
#> SRR1469704 2 0 1 0 1
#> SRR1349342 1 0 1 1 0
#> SRR1477173 2 0 1 0 1
#> SRR1086752 2 0 1 0 1
#> SRR1084698 2 0 1 0 1
#> SRR1390143 1 0 1 1 0
#> SRR1390413 2 0 1 0 1
#> SRR1099570 2 0 1 0 1
#> SRR1312169 1 0 1 1 0
#> SRR1096687 1 0 1 1 0
#> SRR1486139 1 0 1 1 0
#> SRR1470313 1 0 1 1 0
#> SRR1447893 2 0 1 0 1
#> SRR1466025 2 0 1 0 1
#> SRR1477429 1 0 1 1 0
#> SRR1445701 2 0 1 0 1
#> SRR820689 1 0 1 1 0
#> SRR1451876 2 0 1 0 1
#> SRR1452537 2 0 1 0 1
#> SRR1383301 1 0 1 1 0
#> SRR1489328 2 0 1 0 1
#> SRR1344462 1 0 1 1 0
#> SRR1082709 1 0 1 1 0
#> SRR1447784 1 0 1 1 0
#> SRR1355769 1 0 1 1 0
#> SRR1488237 2 0 1 0 1
#> SRR1391985 2 0 1 0 1
#> SRR1478501 1 0 1 1 0
#> SRR1480917 2 0 1 0 1
#> SRR1474485 1 0 1 1 0
#> SRR1089998 1 0 1 1 0
#> SRR1318140 1 0 1 1 0
#> SRR1319262 2 0 1 0 1
#> SRR1095188 2 0 1 0 1
#> SRR1454350 1 0 1 1 0
#> SRR1440374 1 0 1 1 0
#> SRR1359565 2 0 1 0 1
#> SRR1105417 1 0 1 1 0
#> SRR1325578 2 0 1 0 1
#> SRR1358161 2 0 1 0 1
#> SRR1358665 2 0 1 0 1
#> SRR1333971 2 0 1 0 1
#> SRR1452010 1 0 1 1 0
#> SRR1418183 2 0 1 0 1
#> SRR1366345 1 0 1 1 0
#> SRR1387449 1 0 1 1 0
#> SRR1473461 1 0 1 1 0
#> SRR1090837 2 0 1 0 1
#> SRR1447828 2 0 1 0 1
#> SRR1338747 2 0 1 0 1
#> SRR1333038 2 0 1 0 1
#> SRR1350280 1 0 1 1 0
#> SRR1088557 1 0 1 1 0
#> SRR1102656 2 0 1 0 1
#> SRR1441443 2 0 1 0 1
#> SRR1370682 2 0 1 0 1
#> SRR1475448 2 0 1 0 1
#> SRR1407291 1 0 1 1 0
#> SRR1405266 1 0 1 1 0
#> SRR1363766 1 0 1 1 0
#> SRR1082592 2 0 1 0 1
#> SRR1325794 2 0 1 0 1
#> SRR1095961 2 0 1 0 1
#> SRR1086702 2 0 1 0 1
#> SRR1320806 2 0 1 0 1
#> SRR1457527 2 0 1 0 1
#> SRR1098831 2 0 1 0 1
#> SRR1474374 2 0 1 0 1
#> SRR1488858 1 0 1 1 0
#> SRR1454695 1 0 1 1 0
#> SRR1090241 2 0 1 0 1
#> SRR1329863 2 0 1 0 1
#> SRR1357733 1 0 1 1 0
#> SRR1362135 1 0 1 1 0
#> SRR1379581 2 0 1 0 1
#> SRR1309182 1 0 1 1 0
#> SRR1437668 1 0 1 1 0
#> SRR1084742 2 0 1 0 1
#> SRR1433538 1 0 1 1 0
#> SRR1085063 2 0 1 0 1
#> SRR1454247 2 0 1 0 1
#> SRR1097100 2 0 1 0 1
#> SRR818622 2 0 1 0 1
#> SRR1072388 1 0 1 1 0
#> SRR1070332 2 0 1 0 1
#> SRR1320761 2 0 1 0 1
#> SRR1076195 1 0 1 1 0
#> SRR1069895 2 0 1 0 1
#> SRR1099144 1 0 1 1 0
#> SRR1385150 2 0 1 0 1
#> SRR1420191 2 0 1 0 1
#> SRR1332625 1 0 1 1 0
#> SRR1102583 1 0 1 1 0
#> SRR1456971 1 0 1 1 0
#> SRR1340574 1 0 1 1 0
#> SRR1444830 2 0 1 0 1
#> SRR1096267 1 0 1 1 0
#> SRR1087127 2 0 1 0 1
#> SRR1408553 1 0 1 1 0
#> SRR1069231 1 0 1 1 0
#> SRR1325642 2 0 1 0 1
#> SRR1362103 1 0 1 1 0
#> SRR1321942 1 0 1 1 0
#> SRR1094380 1 0 1 1 0
#> SRR1447499 2 0 1 0 1
#> SRR1099330 2 0 1 0 1
#> SRR1077874 2 0 1 0 1
#> SRR808299 2 0 1 0 1
#> SRR1098050 2 0 1 0 1
#> SRR1481238 2 0 1 0 1
#> SRR1443568 2 0 1 0 1
#> SRR1380249 1 0 1 1 0
#> SRR1080143 1 0 1 1 0
#> SRR1383148 1 0 1 1 0
#> SRR1357042 1 0 1 1 0
#> SRR1416025 2 0 1 0 1
#> SRR1431015 2 0 1 0 1
#> SRR1078709 2 0 1 0 1
#> SRR813283 1 0 1 1 0
#> SRR1430226 2 0 1 0 1
#> SRR1070665 1 0 1 1 0
#> SRR1466927 2 0 1 0 1
#> SRR1347707 2 0 1 0 1
#> SRR807679 1 0 1 1 0
#> SRR1333811 2 0 1 0 1
#> SRR1078660 2 0 1 0 1
#> SRR1331730 2 0 1 0 1
#> SRR1333913 1 0 1 1 0
#> SRR1432542 1 0 1 1 0
#> SRR1418041 1 0 1 1 0
#> SRR1085211 1 0 1 1 0
#> SRR1339812 2 0 1 0 1
#> SRR1402437 1 0 1 1 0
#> SRR1350958 2 0 1 0 1
#> SRR1396822 2 0 1 0 1
#> SRR1441934 2 0 1 0 1
#> SRR1472552 2 0 1 0 1
#> SRR1488881 2 0 1 0 1
#> SRR1102973 1 0 1 1 0
#> SRR1071131 2 0 1 0 1
#> SRR1074502 1 0 1 1 0
#> SRR1325271 1 0 1 1 0
#> SRR1409171 2 0 1 0 1
#> SRR809113 2 0 1 0 1
#> SRR1430045 2 0 1 0 1
#> SRR1441245 2 0 1 0 1
#> SRR1384091 1 0 1 1 0
#> SRR1431887 2 0 1 0 1
#> SRR1096525 1 0 1 1 0
#> SRR1488491 2 0 1 0 1
#> SRR1356351 2 0 1 0 1
#> SRR1369514 1 0 1 1 0
#> SRR1453299 2 0 1 0 1
#> SRR1436300 1 0 1 1 0
#> SRR1348490 2 0 1 0 1
#> SRR1091767 2 0 1 0 1
#> SRR1354467 2 0 1 0 1
#> SRR1069074 2 0 1 0 1
#> SRR1452399 2 0 1 0 1
#> SRR1437430 2 0 1 0 1
#> SRR1419736 2 0 1 0 1
#> SRR1313343 2 0 1 0 1
#> SRR1077619 1 0 1 1 0
#> SRR1083530 1 0 1 1 0
#> SRR1333633 2 0 1 0 1
#> SRR1354999 2 0 1 0 1
#> SRR1443592 2 0 1 0 1
#> SRR1077356 1 0 1 1 0
#> SRR1378818 2 0 1 0 1
#> SRR1413182 1 0 1 1 0
#> SRR1464559 1 0 1 1 0
#> SRR1413075 2 0 1 0 1
#> SRR1487928 1 0 1 1 0
#> SRR1388997 2 0 1 0 1
#> SRR1092865 2 0 1 0 1
#> SRR1102729 1 0 1 1 0
#> SRR1456423 1 0 1 1 0
#> SRR1321591 2 0 1 0 1
#> SRR1376874 2 0 1 0 1
#> SRR1339903 1 0 1 1 0
#> SRR1346710 1 0 1 1 0
#> SRR1418771 2 0 1 0 1
#> SRR1095358 2 0 1 0 1
#> SRR1480941 2 0 1 0 1
#> SRR1479175 2 0 1 0 1
#> SRR1313891 2 0 1 0 1
#> SRR1491354 1 0 1 1 0
#> SRR1433884 2 0 1 0 1
#> SRR1471074 2 0 1 0 1
#> SRR1353052 2 0 1 0 1
#> SRR1355554 2 0 1 0 1
#> SRR1487173 1 0 1 1 0
#> SRR1474253 1 0 1 1 0
#> SRR1322918 2 0 1 0 1
#> SRR1318331 2 0 1 0 1
#> SRR1321333 2 0 1 0 1
#> SRR1474231 1 0 1 1 0
#> SRR1350545 1 0 1 1 0
#> SRR1091328 1 0 1 1 0
#> SRR814447 2 0 1 0 1
#> SRR1455989 2 0 1 0 1
#> SRR1453680 2 0 1 0 1
#> SRR1470356 2 0 1 0 1
#> SRR1342977 2 0 1 0 1
#> SRR1444222 2 0 1 0 1
#> SRR1097197 1 0 1 1 0
#> SRR1366729 2 0 1 0 1
#> SRR821282 2 0 1 0 1
#> SRR1074602 2 0 1 0 1
#> SRR814633 2 0 1 0 1
#> SRR1072480 2 0 1 0 1
#> SRR1319100 1 0 1 1 0
#> SRR1324004 2 0 1 0 1
#> SRR1457459 1 0 1 1 0
#> SRR1421031 1 0 1 1 0
#> SRR1444598 2 0 1 0 1
#> SRR1091743 2 0 1 0 1
#> SRR819637 1 0 1 1 0
#> SRR1083848 1 0 1 1 0
#> SRR1088934 2 0 1 0 1
#> SRR1459785 2 0 1 0 1
#> SRR1083700 1 0 1 1 0
#> SRR1375531 1 0 1 1 0
#> SRR1323470 2 0 1 0 1
#> SRR814657 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.4974 0.9512 0.000 0.236 0.764
#> SRR819559 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1402944 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.3619 0.8928 0.864 0.000 0.136
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.5948 0.7612 0.000 0.360 0.640
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.3619 0.8928 0.864 0.000 0.136
#> SRR1486821 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1359487 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.2625 0.8669 0.000 0.916 0.084
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 3 0.4750 0.9743 0.000 0.216 0.784
#> SRR1080391 1 0.3340 0.9024 0.880 0.000 0.120
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.3340 0.9024 0.880 0.000 0.120
#> SRR1446308 3 0.4654 0.9829 0.000 0.208 0.792
#> SRR1437346 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1319584 3 0.5621 0.8528 0.000 0.308 0.692
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 3 0.5058 0.9413 0.000 0.244 0.756
#> SRR1335314 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1400799 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.3619 0.8928 0.864 0.000 0.136
#> SRR1445023 1 0.4504 0.8529 0.804 0.000 0.196
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 3 0.5650 0.8459 0.000 0.312 0.688
#> SRR1458727 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1385434 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1415591 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.4452 0.8557 0.808 0.000 0.192
#> SRR1308734 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR809919 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1317731 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.3551 0.8952 0.868 0.000 0.132
#> SRR1413137 1 0.3551 0.8952 0.868 0.000 0.132
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0237 0.9669 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416266 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3879 0.8826 0.848 0.000 0.152
#> SRR1474930 3 0.5733 0.8264 0.000 0.324 0.676
#> SRR1470988 1 0.3551 0.8952 0.868 0.000 0.132
#> SRR811915 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.6295 -0.3155 0.000 0.528 0.472
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.3038 0.9118 0.896 0.000 0.104
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR817142 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1309314 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.6215 -0.1397 0.000 0.572 0.428
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1447893 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.5733 0.8262 0.000 0.324 0.676
#> SRR820689 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.3116 0.8310 0.000 0.892 0.108
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0237 0.9669 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1095188 2 0.5926 0.1892 0.000 0.644 0.356
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1358161 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.4346 0.6916 0.000 0.816 0.184
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1447828 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1475448 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.5098 0.5428 0.000 0.752 0.248
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1488858 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1454695 1 0.0424 0.9648 0.992 0.000 0.008
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1069895 2 0.2066 0.9014 0.000 0.940 0.060
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1408553 1 0.3619 0.8928 0.864 0.000 0.136
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.4452 0.6748 0.000 0.808 0.192
#> SRR1380249 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR807679 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1488881 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.4555 0.8501 0.800 0.000 0.200
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.3551 0.8952 0.868 0.000 0.132
#> SRR1453299 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.6274 -0.2470 0.000 0.544 0.456
#> SRR1437430 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1077619 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.6045 0.0872 0.000 0.620 0.380
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1413182 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1464559 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 1 0.4605 0.8472 0.796 0.000 0.204
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1455989 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1453680 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR821282 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.6154 -0.0473 0.000 0.592 0.408
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.3619 0.8928 0.864 0.000 0.136
#> SRR1444598 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9780 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.5859 0.7914 0.000 0.344 0.656
#> SRR1459785 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.4605 0.9871 0.000 0.204 0.796
#> SRR814657 1 0.0000 0.9689 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.0188 0.9943 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.3333 0.8446 0.000 0.088 0.872 0.040
#> SRR819559 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.1545 0.9258 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1402944 3 0.1913 0.9198 0.000 0.020 0.940 0.040
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1320034 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.2704 0.8953 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 3 0.4730 0.4701 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.2704 0.8953 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1486821 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 3 0.0921 0.9351 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1359487 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.1389 0.9429 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1359738 3 0.0592 0.9445 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.2011 0.9000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1344034 3 0.3931 0.7915 0.000 0.128 0.832 0.040
#> SRR1080391 4 0.4981 0.2906 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.1398 0.9343 0.040 0.000 0.004 0.956
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.3074 0.8686 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1446308 3 0.1557 0.9044 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1437346 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1319584 3 0.5417 0.5666 0.000 0.284 0.676 0.040
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0188 0.9939 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 3 0.2973 0.7951 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1335314 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1400799 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 4 0.2760 0.8928 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1445023 4 0.1557 0.9292 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 3 0.4500 0.5526 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1458727 3 0.1545 0.9258 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1436949 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1070429 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1385434 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1415591 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.3907 0.6704 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1308734 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1498973 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR809919 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.1545 0.9258 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1317731 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812128 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.2760 0.8928 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1413137 4 0.2760 0.8928 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.4431 0.6763 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1416266 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2149 0.9141 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1474930 3 0.4382 0.5804 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1470988 4 0.2760 0.8928 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR811915 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1464494 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1357083 3 0.0592 0.9445 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.0707 0.9418 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.6003 0.1425 0.000 0.456 0.504 0.040
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.4103 0.7534 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315291 4 0.1398 0.9343 0.040 0.000 0.004 0.956
#> SRR1309314 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.5957 0.1573 0.000 0.540 0.420 0.040
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 3 0.0707 0.9418 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1447893 3 0.0817 0.9386 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 3 0.3219 0.7652 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.2216 0.8867 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0336 0.9895 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0188 0.9753 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474485 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.0707 0.9418 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1095188 2 0.4746 0.3865 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 3 0.1297 0.9357 0.000 0.020 0.964 0.016
#> SRR1358161 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.3486 0.7542 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 3 0.0592 0.9445 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1447828 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.1118 0.9555 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1475448 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.5168 0.6107 0.000 0.712 0.248 0.040
#> SRR1325794 2 0.0188 0.9754 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095961 3 0.0592 0.9445 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457527 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1488858 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1454695 4 0.4564 0.6321 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0592 0.9682 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1320761 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1076195 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1069895 2 0.1792 0.9136 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.0469 0.9464 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.1913 0.9185 0.000 0.020 0.940 0.040
#> SRR1408553 4 0.2760 0.8928 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0336 0.9730 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR808299 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.3528 0.7487 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1380249 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.1211 0.9202 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR807679 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.0707 0.9418 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1488881 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 3 0.0817 0.9386 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0188 0.9939 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1369514 4 0.2760 0.8928 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1453299 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.5000 -0.0418 0.000 0.504 0.496 0.000
#> SRR1437430 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1419736 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1313343 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1077619 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.5807 0.3352 0.000 0.596 0.364 0.040
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.1798 0.9215 0.000 0.016 0.944 0.040
#> SRR1413182 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1464559 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1413075 2 0.1211 0.9530 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1487928 4 0.1211 0.9356 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.0592 0.9427 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1455989 3 0.0921 0.9350 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1453680 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR821282 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.4981 0.0809 0.000 0.536 0.464 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.2760 0.8928 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1444598 3 0.1545 0.9258 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.4477 0.5573 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1459785 3 0.0336 0.9474 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0188 0.9427 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.9981 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.2179 0.8839 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1326059 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1409062 2 0.1341 0.8657 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465313 5 0.4822 0.3723 0.000 0.032 0.352 0.000 0.616
#> SRR819559 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1387899 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1442292 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1343629 1 0.0404 0.9825 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1326868 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1102320 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1469926 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1070036 1 0.0510 0.9827 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098426 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090310 3 0.0290 0.8507 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1363654 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1326317 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.2798 0.8383 0.000 0.008 0.852 0.000 0.140
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.4009 0.3353 0.000 0.004 0.312 0.000 0.684
#> SRR1402944 5 0.4114 0.3829 0.000 0.024 0.244 0.000 0.732
#> SRR1092818 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1093552 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1464880 5 0.4182 0.7798 0.000 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.2824 0.8059 0.000 0.864 0.116 0.000 0.020
#> SRR1466951 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1331879 5 0.4182 0.7798 0.000 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1320034 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1068687 2 0.4786 0.6459 0.000 0.720 0.188 0.000 0.092
#> SRR1437491 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310777 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1329994 4 0.2351 0.8703 0.088 0.000 0.000 0.896 0.016
#> SRR1354203 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077850 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369241 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.4182 0.7798 0.000 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1455214 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1092014 3 0.4585 0.2123 0.000 0.352 0.628 0.000 0.020
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345974 3 0.2970 0.8320 0.000 0.004 0.828 0.000 0.168
#> SRR1338687 2 0.0290 0.8953 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.2351 0.8703 0.088 0.000 0.000 0.896 0.016
#> SRR1486821 3 0.3048 0.8294 0.000 0.004 0.820 0.000 0.176
#> SRR1418540 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1408788 3 0.0671 0.8432 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1359487 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414708 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1469080 2 0.2127 0.7682 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.3391 0.7378 0.000 0.800 0.188 0.000 0.012
#> SRR1475993 3 0.0451 0.8531 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1445387 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077575 5 0.4150 0.7868 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1349300 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1374165 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401146 2 0.2813 0.6525 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1366124 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1086490 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1384431 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1072055 1 0.2124 0.9266 0.916 0.000 0.000 0.056 0.028
#> SRR1359738 3 0.0290 0.8507 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085900 2 0.3586 0.7309 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1442173 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431625 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.4138 0.7871 0.000 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1344034 5 0.5086 0.4238 0.000 0.060 0.304 0.000 0.636
#> SRR1080391 1 0.4897 0.0239 0.516 0.000 0.000 0.460 0.024
#> SRR1347870 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR814028 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102128 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.4171 0.7823 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1070060 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1487969 2 0.0880 0.8694 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1417851 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1076705 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079380 5 0.4905 0.7702 0.000 0.336 0.040 0.000 0.624
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.4304 0.5827 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1366605 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1436840 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.0955 0.9107 0.000 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1431735 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417387 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445984 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1370447 4 0.2964 0.8300 0.120 0.000 0.000 0.856 0.024
#> SRR1446308 3 0.0703 0.8390 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1437346 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.0898 0.8872 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR1086466 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 5 0.4757 0.6732 0.000 0.204 0.080 0.000 0.716
#> SRR1486584 1 0.0609 0.9808 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR813536 1 0.0865 0.9774 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1317939 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.4150 0.7868 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1079543 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1076681 3 0.4157 0.4254 0.000 0.264 0.716 0.000 0.020
#> SRR1335314 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.0290 0.8507 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1074578 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1312226 2 0.1851 0.7989 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1416207 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 4 0.2408 0.8671 0.092 0.000 0.000 0.892 0.016
#> SRR1445023 4 0.0898 0.9138 0.020 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1077599 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1453480 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074839 2 0.4807 0.2223 0.000 0.532 0.448 0.000 0.020
#> SRR1458727 5 0.3086 0.3538 0.000 0.004 0.180 0.000 0.816
#> SRR1436949 5 0.4161 0.7841 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1070429 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432408 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418201 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1385434 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.3642 0.6847 0.760 0.000 0.000 0.232 0.008
#> SRR1308734 3 0.3048 0.8294 0.000 0.004 0.820 0.000 0.176
#> SRR1498973 5 0.4182 0.7798 0.000 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR814341 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.3048 0.8294 0.000 0.004 0.820 0.000 0.176
#> SRR809919 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1370818 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1357297 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR818170 5 0.4225 -0.0826 0.000 0.004 0.364 0.000 0.632
#> SRR1091230 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095285 3 0.0771 0.8408 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1317731 3 0.3093 0.8309 0.000 0.008 0.824 0.000 0.168
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447808 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR809534 2 0.0963 0.8781 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.2813 0.6525 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR812128 5 0.4192 0.7561 0.000 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1101513 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1415708 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1316033 3 0.3048 0.8294 0.000 0.004 0.820 0.000 0.176
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1076801 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 5 0.4150 0.7868 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1068929 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0162 0.8971 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075054 5 0.4192 0.7751 0.000 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1083480 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075458 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417023 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1333676 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1352996 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1093172 4 0.2761 0.8500 0.104 0.000 0.000 0.872 0.024
#> SRR1413137 4 0.2813 0.8452 0.108 0.000 0.000 0.868 0.024
#> SRR1469973 2 0.2969 0.7933 0.000 0.852 0.128 0.000 0.020
#> SRR1420026 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.4243 0.6364 0.264 0.000 0.000 0.712 0.024
#> SRR1416266 4 0.0510 0.9188 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.3391 0.7378 0.000 0.800 0.188 0.000 0.012
#> SRR1383192 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1419962 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1094357 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1081639 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.4138 0.7871 0.000 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1312147 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2423 0.8724 0.080 0.000 0.000 0.896 0.024
#> SRR1474930 3 0.4626 0.1976 0.000 0.364 0.616 0.000 0.020
#> SRR1470988 4 0.2653 0.8607 0.096 0.000 0.000 0.880 0.024
#> SRR811915 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.2761 0.8148 0.000 0.872 0.104 0.000 0.024
#> SRR1313770 3 0.2970 0.8322 0.000 0.004 0.828 0.000 0.168
#> SRR1315780 2 0.1121 0.8728 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR819124 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1310997 5 0.4138 0.7803 0.000 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1464494 5 0.4138 0.7842 0.000 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1357083 3 0.0290 0.8507 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1378085 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1378220 3 0.0671 0.8431 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1467704 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348885 5 0.4457 0.5685 0.000 0.116 0.124 0.000 0.760
#> SRR1325826 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1466812 4 0.4292 0.6272 0.272 0.000 0.000 0.704 0.024
#> SRR1345692 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401040 3 0.2806 0.8363 0.000 0.004 0.844 0.000 0.152
#> SRR1097954 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374396 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.2824 0.8059 0.000 0.864 0.116 0.000 0.020
#> SRR1355747 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429368 3 0.1571 0.8492 0.000 0.004 0.936 0.000 0.060
#> SRR1398138 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1379260 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361436 3 0.0566 0.8532 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR817142 2 0.3391 0.7378 0.000 0.800 0.188 0.000 0.012
#> SRR1315291 4 0.0955 0.9107 0.000 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1309314 3 0.3366 0.8118 0.000 0.004 0.784 0.000 0.212
#> SRR1420085 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1361308 3 0.2848 0.8355 0.000 0.004 0.840 0.000 0.156
#> SRR1472126 1 0.0609 0.9808 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1380482 5 0.4907 0.7671 0.000 0.292 0.052 0.000 0.656
#> SRR1099789 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079480 5 0.4150 0.7868 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1339276 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096760 3 0.0510 0.8455 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1330813 2 0.3391 0.7378 0.000 0.800 0.188 0.000 0.012
#> SRR1458931 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1081160 2 0.0404 0.8942 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469704 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.2127 0.7667 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1390143 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1096687 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1486139 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470313 4 0.0162 0.9224 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1447893 3 0.0609 0.8419 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.1341 0.8407 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1477429 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1445701 3 0.3690 0.5508 0.000 0.200 0.780 0.000 0.020
#> SRR820689 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.1106 0.8829 0.000 0.964 0.024 0.000 0.012
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1489328 2 0.3061 0.7881 0.000 0.844 0.136 0.000 0.020
#> SRR1344462 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0693 0.9750 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1355769 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480917 2 0.3109 0.5795 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1474485 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1318140 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1319262 3 0.0510 0.8455 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.4297 0.5637 0.000 0.692 0.288 0.000 0.020
#> SRR1454350 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1325578 3 0.4920 0.6249 0.000 0.048 0.644 0.000 0.308
#> SRR1358161 3 0.3048 0.8294 0.000 0.004 0.820 0.000 0.176
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.4182 0.7798 0.000 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1452010 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1418183 2 0.3882 0.6817 0.000 0.756 0.224 0.000 0.020
#> SRR1366345 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387449 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1473461 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1090837 3 0.0290 0.8507 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1447828 3 0.3123 0.8260 0.000 0.004 0.812 0.000 0.184
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0451 0.8531 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1350280 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1088557 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1102656 5 0.4302 0.6282 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1441443 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1370682 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1475448 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1405266 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1363766 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1082592 5 0.5522 0.7371 0.000 0.308 0.092 0.000 0.600
#> SRR1325794 2 0.3039 0.6369 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1095961 3 0.0290 0.8507 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1457527 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0324 0.8528 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1488858 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 4 0.4227 0.6033 0.292 0.000 0.000 0.692 0.016
#> SRR1090241 2 0.0290 0.8953 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362135 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1379581 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1309182 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1437668 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084742 5 0.4114 0.7855 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1433538 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1085063 2 0.0290 0.8951 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1454247 5 0.4150 0.7868 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1072388 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070332 2 0.3983 0.0571 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1320761 5 0.6253 0.5974 0.000 0.280 0.188 0.000 0.532
#> SRR1076195 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.3757 0.7064 0.000 0.772 0.208 0.000 0.020
#> SRR1099144 1 0.0451 0.9802 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1385150 3 0.0290 0.8507 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1456971 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1340574 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444830 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1096267 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087127 5 0.4028 0.4104 0.000 0.040 0.192 0.000 0.768
#> SRR1408553 4 0.2597 0.8626 0.092 0.000 0.000 0.884 0.024
#> SRR1069231 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1325642 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0404 0.9825 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447499 2 0.3151 0.7788 0.000 0.836 0.144 0.000 0.020
#> SRR1099330 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1077874 2 0.3661 0.3724 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR808299 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.4114 0.7855 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1481238 2 0.3003 0.6456 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1443568 2 0.3882 0.6827 0.000 0.756 0.224 0.000 0.020
#> SRR1380249 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1383148 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416025 2 0.0162 0.8971 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431015 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1078709 2 0.2079 0.8496 0.000 0.916 0.064 0.000 0.020
#> SRR813283 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.2891 0.2423 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR807679 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333811 3 0.1469 0.8493 0.000 0.016 0.948 0.000 0.036
#> SRR1078660 2 0.1800 0.8615 0.000 0.932 0.048 0.000 0.020
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432542 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418041 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1085211 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350958 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1441934 2 0.0693 0.8919 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1472552 3 0.0451 0.8533 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1488881 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1102973 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071131 3 0.1399 0.8185 0.000 0.028 0.952 0.000 0.020
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0898 0.9685 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0404 0.8940 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1441245 2 0.2561 0.8232 0.000 0.884 0.096 0.000 0.020
#> SRR1384091 4 0.0290 0.9215 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1431887 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0703 0.9158 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1488491 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.4249 0.7307 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1369514 4 0.2573 0.8552 0.104 0.000 0.000 0.880 0.016
#> SRR1453299 3 0.0324 0.8528 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1436300 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1348490 5 0.4114 0.7855 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1091767 2 0.2331 0.8374 0.000 0.900 0.080 0.000 0.020
#> SRR1354467 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1069074 2 0.3492 0.7353 0.000 0.796 0.188 0.000 0.016
#> SRR1452399 3 0.4807 0.0623 0.000 0.448 0.532 0.000 0.020
#> SRR1437430 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1419736 5 0.4171 0.7823 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1313343 3 0.2763 0.8367 0.000 0.004 0.848 0.000 0.148
#> SRR1077619 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333633 5 0.4805 0.7717 0.000 0.312 0.040 0.000 0.648
#> SRR1354999 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1378818 5 0.3562 0.3626 0.000 0.016 0.196 0.000 0.788
#> SRR1413182 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.0162 0.9224 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1413075 5 0.4182 0.7798 0.000 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1487928 4 0.0000 0.9237 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0609 0.8905 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1092865 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1102729 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1456423 1 0.0290 0.9830 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1321591 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1339903 1 0.0404 0.9825 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1346710 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.5460 0.4859 0.000 0.656 0.148 0.000 0.196
#> SRR1480941 3 0.0955 0.8400 0.000 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1433884 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2144 0.8471 0.000 0.912 0.068 0.000 0.020
#> SRR1355554 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR1487173 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1474253 1 0.0510 0.9818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1322918 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1318331 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1321333 3 0.0162 0.8520 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350545 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1091328 1 0.0290 0.9820 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR814447 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1455989 3 0.0510 0.8455 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1470356 2 0.0404 0.8937 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.1894 0.8496 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008
#> SRR1097197 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1366729 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR821282 3 0.3160 0.8242 0.000 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1074602 2 0.3586 0.7327 0.000 0.792 0.188 0.000 0.020
#> SRR814633 2 0.0000 0.8982 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.2674 0.8381 0.000 0.004 0.856 0.000 0.140
#> SRR1319100 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324004 3 0.4774 0.0835 0.000 0.424 0.556 0.000 0.020
#> SRR1457459 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1421031 4 0.2408 0.8671 0.092 0.000 0.000 0.892 0.016
#> SRR1444598 5 0.3123 0.3478 0.000 0.004 0.184 0.000 0.812
#> SRR1091743 2 0.3492 0.7353 0.000 0.796 0.188 0.000 0.016
#> SRR819637 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.4456 0.2933 0.000 0.320 0.660 0.000 0.020
#> SRR1459785 3 0.0324 0.8528 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1083700 1 0.0162 0.9830 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375531 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1323470 3 0.3730 0.7544 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR814657 1 0.0703 0.9797 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.4025 0.6963 0.720 0.000 0.000 0.000 0.048 0.232
#> SRR1326059 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1409062 2 0.2473 0.7706 0.000 0.856 0.136 0.000 0.000 0.008
#> SRR809406 1 0.0858 0.9545 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1465313 3 0.5257 0.3536 0.000 0.036 0.612 0.000 0.296 0.056
#> SRR819559 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1387899 3 0.5218 0.5299 0.000 0.364 0.544 0.000 0.004 0.088
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1395635 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1343629 1 0.0858 0.9545 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1326868 3 0.5251 0.5031 0.000 0.380 0.528 0.000 0.004 0.088
#> SRR1102320 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1469926 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1070036 1 0.1297 0.9544 0.948 0.000 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1098426 1 0.1391 0.9384 0.944 0.000 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR1090310 3 0.0260 0.4228 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429748 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1363654 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1326317 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0363 0.9557 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469769 3 0.3899 -0.6864 0.000 0.004 0.592 0.000 0.000 0.404
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 5 0.2830 0.6624 0.000 0.000 0.144 0.000 0.836 0.020
#> SRR1402944 5 0.3265 0.6881 0.000 0.016 0.108 0.000 0.836 0.040
#> SRR1092818 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1093552 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1464880 5 0.2416 0.8708 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.3368 0.7638 0.000 0.824 0.084 0.000 0.004 0.088
#> SRR1466951 2 0.1918 0.8603 0.000 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1331879 5 0.2631 0.8600 0.000 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1320034 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1068687 3 0.5472 0.5323 0.000 0.356 0.540 0.000 0.016 0.088
#> SRR1437491 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1329994 4 0.1716 0.8913 0.036 0.000 0.000 0.932 0.004 0.028
#> SRR1354203 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1077850 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 5 0.2730 0.8524 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1455214 1 0.0858 0.9546 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1092014 3 0.4925 0.5934 0.000 0.256 0.648 0.000 0.008 0.088
#> SRR1097857 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473318 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1345974 6 0.3991 0.9133 0.000 0.000 0.472 0.000 0.004 0.524
#> SRR1338687 2 0.0363 0.9115 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 4 0.1716 0.8913 0.036 0.000 0.000 0.932 0.004 0.028
#> SRR1486821 6 0.3986 0.9216 0.000 0.000 0.464 0.000 0.004 0.532
#> SRR1418540 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1408788 3 0.0725 0.4265 0.000 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012
#> SRR1359487 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1414708 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1469080 2 0.3737 0.1116 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 3 0.5265 0.4865 0.000 0.388 0.520 0.000 0.004 0.088
#> SRR1475993 3 0.0405 0.4045 0.000 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445387 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1077575 5 0.2378 0.8714 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1349300 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1374165 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1401146 2 0.3634 0.2786 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1366124 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456674 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1086490 3 0.0146 0.4158 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1384431 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1072055 1 0.2903 0.9126 0.864 0.000 0.000 0.036 0.016 0.084
#> SRR1359738 3 0.0260 0.4228 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1085900 3 0.5392 0.4364 0.000 0.408 0.496 0.000 0.008 0.088
#> SRR1442173 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.2340 0.8706 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1344034 5 0.4152 0.7084 0.000 0.060 0.140 0.000 0.772 0.028
#> SRR1080391 1 0.5000 0.1564 0.524 0.000 0.000 0.416 0.008 0.052
#> SRR1347870 2 0.1700 0.8694 0.000 0.916 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR814028 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1102128 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.2416 0.8708 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1070060 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1487969 2 0.0865 0.8851 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1417851 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1076705 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1079380 5 0.2623 0.8585 0.000 0.132 0.016 0.000 0.852 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.3570 0.7920 0.000 0.228 0.004 0.000 0.752 0.016
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.1918 0.8603 0.000 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1436840 2 0.1753 0.8662 0.000 0.912 0.000 0.000 0.004 0.084
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.2968 0.8366 0.000 0.000 0.004 0.852 0.092 0.052
#> SRR1431735 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1417387 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1445984 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1370447 4 0.3128 0.8059 0.096 0.000 0.000 0.844 0.008 0.052
#> SRR1446308 3 0.0632 0.4380 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437346 3 0.0146 0.4158 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103143 2 0.2274 0.8489 0.000 0.892 0.012 0.000 0.008 0.088
#> SRR1086466 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 5 0.3445 0.7873 0.000 0.080 0.048 0.000 0.836 0.036
#> SRR1486584 1 0.1219 0.9512 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR813536 1 0.1757 0.9422 0.928 0.000 0.000 0.012 0.008 0.052
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0146 0.9549 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1328551 2 0.1327 0.8831 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.2378 0.8714 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.1757 0.8700 0.000 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1076681 3 0.4585 0.5727 0.000 0.200 0.704 0.000 0.008 0.088
#> SRR1335314 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.0520 0.4288 0.000 0.008 0.984 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074578 1 0.1542 0.9471 0.936 0.000 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR1312226 2 0.2762 0.6445 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1416207 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1447371 1 0.0146 0.9549 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069328 4 0.1788 0.8883 0.040 0.000 0.000 0.928 0.004 0.028
#> SRR1445023 4 0.0862 0.9102 0.008 0.000 0.000 0.972 0.004 0.016
#> SRR1077599 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1074839 3 0.5155 0.5812 0.000 0.308 0.596 0.000 0.008 0.088
#> SRR1458727 5 0.5110 -0.0525 0.000 0.000 0.080 0.000 0.480 0.440
#> SRR1436949 5 0.2416 0.8709 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1070429 3 0.0260 0.4228 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458158 1 0.1265 0.9511 0.948 0.000 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1432408 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.1010 0.9534 0.960 0.000 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1418201 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1385434 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.0508 0.4260 0.000 0.004 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR1402009 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1316055 1 0.4511 0.5950 0.688 0.000 0.000 0.252 0.016 0.044
#> SRR1308734 6 0.3975 0.9196 0.000 0.000 0.452 0.000 0.004 0.544
#> SRR1498973 5 0.2378 0.8714 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1397115 1 0.0291 0.9555 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1392141 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR814341 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 6 0.4157 0.9183 0.000 0.000 0.444 0.000 0.012 0.544
#> SRR809919 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1370818 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1357297 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR818170 6 0.5509 0.5064 0.000 0.000 0.160 0.000 0.300 0.540
#> SRR1091230 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1095285 3 0.2062 0.4591 0.000 0.004 0.900 0.000 0.008 0.088
#> SRR1317731 3 0.4080 -0.7975 0.000 0.000 0.536 0.000 0.008 0.456
#> SRR1490785 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1432032 1 0.0935 0.9539 0.964 0.000 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1447808 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR809534 2 0.0713 0.8987 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.3634 0.2786 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR812128 5 0.4847 0.5151 0.000 0.376 0.000 0.000 0.560 0.064
#> SRR1101513 1 0.0777 0.9548 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1415708 3 0.5328 0.5212 0.000 0.368 0.536 0.000 0.008 0.088
#> SRR1316033 6 0.3986 0.9216 0.000 0.000 0.464 0.000 0.004 0.532
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1076801 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1080044 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1069871 1 0.0363 0.9556 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1095744 5 0.2378 0.8714 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0713 0.9052 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1075054 5 0.2491 0.8686 0.000 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1083480 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1075458 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1417023 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.1918 0.8603 0.000 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1333676 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1352996 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1093172 4 0.2520 0.8609 0.052 0.000 0.000 0.888 0.008 0.052
#> SRR1413137 4 0.2644 0.8520 0.060 0.000 0.000 0.880 0.008 0.052
#> SRR1469973 2 0.4468 0.5774 0.000 0.720 0.184 0.000 0.008 0.088
#> SRR1420026 2 0.0260 0.9152 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR817306 4 0.4354 0.6011 0.236 0.000 0.000 0.704 0.008 0.052
#> SRR1416266 4 0.0777 0.9091 0.000 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 3 0.5283 0.4607 0.000 0.400 0.508 0.000 0.004 0.088
#> SRR1383192 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1419962 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1094357 1 0.1196 0.9520 0.952 0.000 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1081639 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 5 0.2340 0.8706 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1312147 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2321 0.8724 0.040 0.000 0.000 0.900 0.008 0.052
#> SRR1474930 3 0.4925 0.5935 0.000 0.256 0.648 0.000 0.008 0.088
#> SRR1470988 4 0.3079 0.8170 0.092 0.000 0.000 0.848 0.008 0.052
#> SRR811915 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.5715 -0.2982 0.000 0.456 0.432 0.000 0.024 0.088
#> SRR1313770 3 0.3966 -0.7771 0.000 0.000 0.552 0.000 0.004 0.444
#> SRR1315780 2 0.0937 0.8887 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0777 0.9548 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR819124 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1310997 5 0.2772 0.8521 0.000 0.180 0.000 0.000 0.816 0.004
#> SRR1464494 5 0.2378 0.8702 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1357083 3 0.0260 0.4228 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475842 2 0.1588 0.8752 0.000 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1378085 1 0.1333 0.9501 0.944 0.000 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR1378220 3 0.0964 0.4396 0.000 0.012 0.968 0.000 0.004 0.016
#> SRR1467704 1 0.1367 0.9380 0.944 0.000 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1348885 5 0.4179 0.6725 0.000 0.060 0.052 0.000 0.784 0.104
#> SRR1325826 1 0.0935 0.9539 0.964 0.000 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1466812 4 0.4938 0.3670 0.380 0.000 0.000 0.560 0.008 0.052
#> SRR1345692 2 0.1644 0.8723 0.000 0.920 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR1401040 6 0.3993 0.9084 0.000 0.000 0.476 0.000 0.004 0.520
#> SRR1097954 1 0.0858 0.9545 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1374396 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.3673 0.7367 0.000 0.804 0.100 0.000 0.008 0.088
#> SRR1355747 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1429368 3 0.2871 -0.1344 0.000 0.004 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1398138 2 0.5403 -0.2234 0.000 0.484 0.420 0.000 0.008 0.088
#> SRR1379260 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1361436 3 0.0692 0.3832 0.000 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020
#> SRR817142 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1315291 4 0.2425 0.8575 0.000 0.000 0.004 0.884 0.088 0.024
#> SRR1309314 6 0.4051 0.9117 0.000 0.000 0.432 0.000 0.008 0.560
#> SRR1420085 2 0.1918 0.8603 0.000 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1361308 6 0.3993 0.9084 0.000 0.000 0.476 0.000 0.004 0.520
#> SRR1472126 1 0.1152 0.9520 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1380482 5 0.3036 0.8502 0.000 0.124 0.008 0.000 0.840 0.028
#> SRR1099789 1 0.0777 0.9548 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1079480 5 0.2378 0.8714 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1339276 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1096760 3 0.0363 0.4279 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440290 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1330813 3 0.5277 0.4697 0.000 0.396 0.512 0.000 0.004 0.088
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.1265 0.9511 0.948 0.000 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1081160 2 0.1644 0.8725 0.000 0.920 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1477173 2 0.0260 0.9139 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.3659 0.2441 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1390143 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0146 0.4158 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312169 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1096687 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1486139 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1470313 4 0.0508 0.9100 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1447893 3 0.0458 0.4316 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.2491 0.7017 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1477429 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1445701 3 0.4131 0.5470 0.000 0.144 0.760 0.000 0.008 0.088
#> SRR820689 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.1340 0.8923 0.000 0.948 0.008 0.000 0.004 0.040
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1489328 2 0.4556 0.5514 0.000 0.708 0.196 0.000 0.008 0.088
#> SRR1344462 1 0.0603 0.9554 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1082709 1 0.0291 0.9556 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1447784 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1355769 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1480917 5 0.3993 0.3596 0.000 0.476 0.000 0.000 0.520 0.004
#> SRR1474485 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1318140 1 0.1010 0.9534 0.960 0.000 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1319262 3 0.0363 0.4279 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095188 3 0.5377 0.4623 0.000 0.396 0.508 0.000 0.008 0.088
#> SRR1454350 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0146 0.4158 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105417 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1325578 5 0.5121 0.3398 0.000 0.036 0.304 0.000 0.616 0.044
#> SRR1358161 6 0.4157 0.9183 0.000 0.000 0.444 0.000 0.012 0.544
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.2730 0.8524 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1452010 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1418183 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1366345 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1387449 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1473461 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1090837 3 0.0260 0.4228 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447828 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0405 0.4045 0.000 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350280 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1088557 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1102656 5 0.2996 0.8230 0.000 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000
#> SRR1441443 2 0.1918 0.8603 0.000 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1370682 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1475448 3 0.0146 0.4158 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407291 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1405266 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1363766 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1082592 5 0.5243 0.6872 0.000 0.224 0.084 0.000 0.656 0.036
#> SRR1325794 2 0.5315 0.0843 0.000 0.532 0.012 0.000 0.380 0.076
#> SRR1095961 3 0.0260 0.4228 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1457527 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0405 0.4045 0.000 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1488858 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 4 0.4555 0.4661 0.340 0.000 0.000 0.616 0.004 0.040
#> SRR1090241 2 0.0458 0.9082 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1362135 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1379581 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1309182 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1437668 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1084742 5 0.2340 0.8706 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1433538 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1085063 2 0.0146 0.9163 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1454247 5 0.2378 0.8714 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1072388 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1070332 5 0.3647 0.6491 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1320761 3 0.6528 0.4336 0.000 0.164 0.540 0.000 0.208 0.088
#> SRR1076195 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069895 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1099144 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1385150 3 0.0260 0.4228 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1456971 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1340574 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1444830 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1096267 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1087127 5 0.3445 0.7136 0.000 0.036 0.080 0.000 0.836 0.048
#> SRR1408553 4 0.2456 0.8650 0.048 0.000 0.000 0.892 0.008 0.052
#> SRR1069231 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0935 0.9539 0.964 0.000 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1321942 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1094380 1 0.1151 0.9435 0.956 0.000 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1447499 2 0.4498 0.5665 0.000 0.716 0.188 0.000 0.008 0.088
#> SRR1099330 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1077874 5 0.3989 0.3472 0.000 0.468 0.000 0.000 0.528 0.004
#> SRR808299 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.2340 0.8706 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1481238 2 0.5100 0.1502 0.000 0.552 0.004 0.000 0.368 0.076
#> SRR1443568 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1380249 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1383148 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1416025 2 0.0713 0.9052 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1431015 2 0.1806 0.8628 0.000 0.908 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR1078709 2 0.3719 0.7293 0.000 0.800 0.104 0.000 0.008 0.088
#> SRR813283 1 0.0777 0.9548 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 6 0.3745 0.3471 0.000 0.000 0.028 0.000 0.240 0.732
#> SRR807679 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1333811 3 0.1245 0.4041 0.000 0.016 0.952 0.000 0.000 0.032
#> SRR1078660 2 0.3719 0.7295 0.000 0.800 0.104 0.000 0.008 0.088
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1432542 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1418041 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1085211 1 0.0891 0.9548 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1367 0.9380 0.944 0.000 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1441934 2 0.2342 0.8451 0.000 0.888 0.020 0.000 0.004 0.088
#> SRR1472552 3 0.0692 0.3832 0.000 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020
#> SRR1488881 3 0.0405 0.4045 0.000 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102973 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1071131 3 0.2833 0.4875 0.000 0.040 0.864 0.000 0.008 0.088
#> SRR1074502 1 0.0260 0.9544 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1325271 1 0.2519 0.8996 0.892 0.000 0.000 0.048 0.016 0.044
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0146 0.9169 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430045 2 0.0806 0.9057 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1441245 2 0.4016 0.6829 0.000 0.772 0.132 0.000 0.008 0.088
#> SRR1384091 4 0.0603 0.9117 0.000 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.1757 0.8893 0.012 0.000 0.000 0.928 0.008 0.052
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.2793 0.8465 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1369514 4 0.2144 0.8750 0.048 0.000 0.000 0.908 0.004 0.040
#> SRR1453299 3 0.0405 0.4045 0.000 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436300 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1348490 5 0.2340 0.8706 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1091767 2 0.4055 0.6772 0.000 0.768 0.136 0.000 0.008 0.088
#> SRR1354467 3 0.0146 0.4158 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069074 3 0.5251 0.5023 0.000 0.380 0.528 0.000 0.004 0.088
#> SRR1452399 2 0.5602 0.1704 0.000 0.536 0.336 0.000 0.012 0.116
#> SRR1437430 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1419736 5 0.2416 0.8708 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1313343 3 0.3907 -0.7226 0.000 0.000 0.588 0.000 0.004 0.408
#> SRR1077619 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1333633 5 0.3260 0.8536 0.000 0.136 0.012 0.000 0.824 0.028
#> SRR1354999 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1378818 5 0.3213 0.6572 0.000 0.004 0.084 0.000 0.836 0.076
#> SRR1413182 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.0405 0.9119 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1413075 5 0.2416 0.8708 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1487928 4 0.0000 0.9167 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.2062 0.8568 0.000 0.900 0.004 0.000 0.008 0.088
#> SRR1092865 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1102729 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1456423 1 0.0692 0.9551 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1339903 1 0.1010 0.9534 0.960 0.000 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1346710 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 3 0.7094 0.2906 0.000 0.352 0.360 0.000 0.200 0.088
#> SRR1480941 3 0.2504 0.3865 0.000 0.004 0.880 0.000 0.088 0.028
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1433884 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.3090 0.7988 0.000 0.848 0.056 0.000 0.008 0.088
#> SRR1355554 3 0.5319 0.5278 0.000 0.364 0.540 0.000 0.008 0.088
#> SRR1487173 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1474253 1 0.1152 0.9520 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1322918 2 0.1788 0.8698 0.000 0.916 0.004 0.000 0.004 0.076
#> SRR1318331 2 0.1531 0.8780 0.000 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1321333 3 0.0146 0.4158 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474231 1 0.1391 0.9384 0.944 0.000 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR1350545 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1091328 1 0.1461 0.9365 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR814447 6 0.4072 0.9233 0.000 0.000 0.448 0.000 0.008 0.544
#> SRR1455989 3 0.0363 0.4279 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453680 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1470356 2 0.0508 0.9115 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.2001 0.8603 0.000 0.912 0.048 0.000 0.000 0.040
#> SRR1097197 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1366729 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR821282 6 0.3979 0.9278 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1074602 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR814633 2 0.0000 0.9187 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.3862 -0.6534 0.000 0.004 0.608 0.000 0.000 0.388
#> SRR1319100 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1324004 3 0.4838 0.5881 0.000 0.240 0.664 0.000 0.008 0.088
#> SRR1457459 1 0.0405 0.9539 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1421031 4 0.2146 0.8769 0.044 0.000 0.000 0.908 0.004 0.044
#> SRR1444598 6 0.5047 0.3602 0.000 0.000 0.088 0.000 0.348 0.564
#> SRR1091743 3 0.5227 0.5246 0.000 0.368 0.540 0.000 0.004 0.088
#> SRR819637 1 0.1074 0.9451 0.960 0.000 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 3 0.4904 0.5925 0.000 0.252 0.652 0.000 0.008 0.088
#> SRR1459785 3 0.0405 0.4045 0.000 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1083700 1 0.1074 0.9451 0.960 0.000 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1375531 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1323470 6 0.3860 0.6952 0.000 0.000 0.236 0.000 0.036 0.728
#> SRR814657 1 0.1398 0.9491 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.997 0.999 0.4915 0.509 0.509
#> 3 3 0.767 0.844 0.893 0.1903 0.934 0.870
#> 4 4 0.841 0.835 0.932 0.1815 0.868 0.705
#> 5 5 0.759 0.753 0.855 0.0864 0.908 0.722
#> 6 6 0.741 0.626 0.791 0.0534 0.947 0.795
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.242 0.958 0.040 0.960
#> SRR1431735 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.994 0.161 0.544 0.456
#> SRR1309314 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 3 0.6168 0.8795 0.412 0.000 0.588
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.4452 0.8240 0.000 0.808 0.192
#> SRR819559 1 0.0237 0.9120 0.996 0.000 0.004
#> SRR1387899 2 0.1031 0.9053 0.000 0.976 0.024
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.2711 0.8763 0.000 0.912 0.088
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.4504 0.8218 0.000 0.804 0.196
#> SRR1402944 2 0.4291 0.8309 0.000 0.820 0.180
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.6225 -0.4350 0.568 0.000 0.432
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.1163 0.9033 0.000 0.972 0.028
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 3 0.6168 0.8802 0.412 0.000 0.588
#> SRR1486821 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.4346 0.8290 0.000 0.816 0.184
#> SRR1359487 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1643 0.8679 0.956 0.000 0.044
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.6192 -0.3916 0.580 0.000 0.420
#> SRR1086490 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1384431 1 0.5363 0.3306 0.724 0.000 0.276
#> SRR1072055 1 0.5431 0.2463 0.716 0.000 0.284
#> SRR1359738 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 2 0.4121 0.8354 0.000 0.832 0.168
#> SRR1080391 3 0.6026 0.9365 0.376 0.000 0.624
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.6225 -0.4350 0.568 0.000 0.432
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.5431 0.2463 0.716 0.000 0.284
#> SRR1079380 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.5948 0.3380 0.000 0.360 0.640
#> SRR1431735 1 0.0424 0.9080 0.992 0.000 0.008
#> SRR1417387 1 0.0592 0.9034 0.988 0.000 0.012
#> SRR1445984 1 0.2356 0.8237 0.928 0.000 0.072
#> SRR1370447 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1446308 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1437346 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1319584 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 3 0.6154 0.8875 0.408 0.000 0.592
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.4002 0.6746 0.840 0.000 0.160
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.4504 0.8218 0.000 0.804 0.196
#> SRR1335314 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1400799 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1074578 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.6235 -0.4510 0.564 0.000 0.436
#> SRR1445023 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1077599 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.3619 0.8543 0.000 0.864 0.136
#> SRR1458727 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1385434 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1415591 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1308734 2 0.5968 0.7112 0.000 0.636 0.364
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0592 0.9034 0.988 0.000 0.012
#> SRR814341 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR809919 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1370818 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1091230 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1317731 2 0.4399 0.8260 0.000 0.812 0.188
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1076801 1 0.4504 0.5603 0.804 0.000 0.196
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1413137 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.5363 0.3287 0.724 0.000 0.276
#> SRR1416266 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1419962 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.5905 -0.0766 0.648 0.000 0.352
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1474930 2 0.4121 0.8354 0.000 0.832 0.168
#> SRR1470988 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR811915 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.4178 0.6492 0.828 0.000 0.172
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.4555 0.8102 0.000 0.800 0.200
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR817142 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1315291 3 0.0000 0.4793 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309314 2 0.5948 0.7128 0.000 0.640 0.360
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.3192 0.7634 0.888 0.000 0.112
#> SRR1096760 2 0.5968 0.7112 0.000 0.636 0.364
#> SRR1440290 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.4346 0.6223 0.816 0.000 0.184
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1312169 1 0.0592 0.9038 0.988 0.000 0.012
#> SRR1096687 1 0.4399 0.6125 0.812 0.000 0.188
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1447893 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 3 0.6305 0.7155 0.484 0.000 0.516
#> SRR1445701 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR820689 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.5465 0.2783 0.712 0.000 0.288
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.4452 0.8240 0.000 0.808 0.192
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1105417 3 0.6140 0.8945 0.404 0.000 0.596
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358161 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0592 0.9038 0.988 0.000 0.012
#> SRR1418183 2 0.4504 0.8218 0.000 0.804 0.196
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1447828 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1475448 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.1860 0.8549 0.948 0.000 0.052
#> SRR1082592 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.4452 0.8240 0.000 0.808 0.192
#> SRR1457527 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1488858 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1454695 3 0.6126 0.9011 0.400 0.000 0.600
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.5363 0.2792 0.724 0.000 0.276
#> SRR1379581 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1163 0.8851 0.972 0.000 0.028
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.1163 0.9033 0.000 0.972 0.028
#> SRR1072388 1 0.3038 0.7703 0.896 0.000 0.104
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.1163 0.9033 0.000 0.972 0.028
#> SRR1076195 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1069895 2 0.4750 0.8102 0.000 0.784 0.216
#> SRR1099144 3 0.6062 0.9260 0.384 0.000 0.616
#> SRR1385150 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.4654 0.5263 0.792 0.000 0.208
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.4452 0.8240 0.000 0.808 0.192
#> SRR1408553 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1069231 1 0.3551 0.7276 0.868 0.000 0.132
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.4504 0.8218 0.000 0.804 0.196
#> SRR1380249 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.4178 0.8336 0.000 0.828 0.172
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.1163 0.8854 0.972 0.000 0.028
#> SRR1418041 1 0.3816 0.6974 0.852 0.000 0.148
#> SRR1085211 1 0.5138 0.3964 0.748 0.000 0.252
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0237 0.9119 0.996 0.000 0.004
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1488881 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.4504 0.8218 0.000 0.804 0.196
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.6225 -0.4350 0.568 0.000 0.432
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 3 0.6291 0.7539 0.468 0.000 0.532
#> SRR1453299 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1069074 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 2 0.5926 0.7150 0.000 0.644 0.356
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1077619 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.2878 0.8721 0.000 0.904 0.096
#> SRR1413182 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1464559 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 3 0.5988 0.9466 0.368 0.000 0.632
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0892 0.9062 0.000 0.980 0.020
#> SRR1102729 1 0.6307 -0.6408 0.512 0.000 0.488
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.4504 0.8218 0.000 0.804 0.196
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.4121 0.8354 0.000 0.832 0.168
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0424 0.9079 0.992 0.000 0.008
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1455989 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR1453680 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR821282 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.4002 0.8398 0.000 0.840 0.160
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.6309 -0.6580 0.504 0.000 0.496
#> SRR1444598 2 0.0000 0.9132 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091743 2 0.1031 0.9048 0.000 0.976 0.024
#> SRR819637 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.3752 0.8505 0.000 0.856 0.144
#> SRR1459785 2 0.5988 0.7082 0.000 0.632 0.368
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.5706 0.1270 0.680 0.000 0.320
#> SRR1323470 2 0.4235 0.8210 0.000 0.824 0.176
#> SRR814657 1 0.0000 0.9158 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.3610 0.73453 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1326059 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0336 0.92437 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR809406 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465313 2 0.5000 -0.01728 0.000 0.504 0.496 0.000
#> SRR819559 1 0.1059 0.91942 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1387899 2 0.4222 0.62054 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1442292 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.3311 0.76855 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1102320 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1469926 3 0.0707 0.86552 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1070036 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1098426 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1090310 3 0.2345 0.81973 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0336 0.92960 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326317 2 0.3219 0.77665 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.4843 0.31507 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.4925 0.28765 0.000 0.428 0.572 0.000
#> SRR1402944 2 0.4999 -0.00814 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1092818 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1093552 1 0.5143 0.42344 0.628 0.000 0.012 0.360
#> SRR1464880 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0921 0.90991 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.3123 0.77568 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1068687 2 0.3486 0.73804 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.3937 0.75513 0.188 0.000 0.012 0.800
#> SRR1354203 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1092014 2 0.3400 0.75827 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1097857 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0592 0.86588 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1338687 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071207 4 0.1677 0.88842 0.040 0.000 0.012 0.948
#> SRR1486821 3 0.0817 0.86470 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1418540 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1408788 2 0.4999 0.00474 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1359487 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321829 2 0.2704 0.82170 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1475993 3 0.2081 0.83218 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.1767 0.89732 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1453769 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 4 0.5383 0.17781 0.452 0.000 0.012 0.536
#> SRR1086490 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1088511 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1404577 1 0.4889 0.42806 0.636 0.000 0.004 0.360
#> SRR1384431 1 0.5406 0.06575 0.508 0.000 0.012 0.480
#> SRR1072055 1 0.5366 0.15210 0.548 0.000 0.012 0.440
#> SRR1359738 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1332141 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1085900 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344034 2 0.4989 0.04439 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1080391 4 0.0524 0.91023 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1347870 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.4713 0.43051 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1487969 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417851 4 0.3937 0.75513 0.188 0.000 0.012 0.800
#> SRR1443350 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1076705 1 0.5366 0.15210 0.548 0.000 0.012 0.440
#> SRR1079380 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431735 1 0.0804 0.92469 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1417387 1 0.0937 0.92174 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1445984 1 0.2329 0.86821 0.916 0.000 0.012 0.072
#> SRR1370447 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446308 3 0.3907 0.70580 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1437346 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319584 2 0.3024 0.78081 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.1584 0.89096 0.036 0.000 0.012 0.952
#> SRR1317939 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.5189 0.39658 0.616 0.000 0.012 0.372
#> SRR1399178 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.4999 0.00375 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1335314 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400799 3 0.2921 0.78688 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR1074578 1 0.5143 0.42344 0.628 0.000 0.012 0.360
#> SRR1312226 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1069328 4 0.3895 0.76037 0.184 0.000 0.012 0.804
#> SRR1445023 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077599 2 0.3356 0.76319 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1074839 2 0.4866 0.29765 0.000 0.596 0.404 0.000
#> SRR1458727 3 0.4382 0.63129 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070429 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0707 0.86552 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1385434 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415591 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1402009 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1316055 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308734 3 0.3311 0.76262 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0937 0.92174 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR814341 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0817 0.86551 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR809919 1 0.5110 0.44199 0.636 0.000 0.012 0.352
#> SRR1370818 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323651 2 0.3311 0.75664 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.3688 0.72954 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1091230 2 0.3356 0.76308 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1022 0.86189 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1317731 2 0.4643 0.43823 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1490785 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1415708 2 0.1118 0.90383 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1316033 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.1118 0.85988 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1076801 1 0.4019 0.71452 0.792 0.000 0.012 0.196
#> SRR1080044 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.5143 0.42344 0.628 0.000 0.012 0.360
#> SRR1069871 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1417023 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.0188 0.91350 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1413137 4 0.0188 0.91350 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1469973 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.5075 0.47658 0.344 0.000 0.012 0.644
#> SRR1416266 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435394 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1383192 1 0.5143 0.42344 0.628 0.000 0.012 0.360
#> SRR1419962 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1094357 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1081639 3 0.0921 0.86369 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.5143 0.41564 0.628 0.000 0.012 0.360
#> SRR1473891 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.0336 0.91201 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1474930 2 0.4643 0.43162 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1470988 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR811915 2 0.0336 0.92440 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.2345 0.84484 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1313770 3 0.1211 0.85812 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1315780 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.5217 0.37692 0.608 0.000 0.012 0.380
#> SRR1310997 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357083 3 0.2589 0.80693 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 3 0.4972 0.22638 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.2081 0.85457 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1097954 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1374396 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0336 0.92960 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1429368 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1361436 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR817142 2 0.3219 0.77665 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1315291 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309314 3 0.3311 0.75449 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.2973 0.78593 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.3105 0.81828 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR1096760 3 0.3907 0.70744 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1440290 2 0.3528 0.74325 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1330813 2 0.0921 0.90988 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394321 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.5268 0.33565 0.592 0.000 0.012 0.396
#> SRR1390413 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1312169 1 0.3801 0.69041 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1096687 1 0.5279 0.32499 0.588 0.000 0.012 0.400
#> SRR1486139 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1470313 4 0.0188 0.91350 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1447893 3 0.4382 0.63067 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1466025 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1477429 4 0.4635 0.61925 0.268 0.000 0.012 0.720
#> SRR1445701 3 0.3311 0.75810 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 4 0.5018 0.50474 0.332 0.000 0.012 0.656
#> SRR1489328 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0336 0.92501 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1474485 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089998 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 3 0.4730 0.42646 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1105417 4 0.1488 0.89348 0.032 0.000 0.012 0.956
#> SRR1325578 2 0.3024 0.78081 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1358161 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.3837 0.68419 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1418183 2 0.4999 0.00375 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1090837 3 0.2011 0.83377 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1447828 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0707 0.86567 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1350280 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1088557 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.3219 0.77005 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1475448 3 0.0921 0.86308 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.3726 0.70499 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1082592 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325794 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1095961 3 0.1211 0.85884 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1086702 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1320806 2 0.4989 0.08116 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1457527 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1488858 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454695 4 0.1388 0.89587 0.028 0.000 0.012 0.960
#> SRR1090241 2 0.0469 0.92168 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.5353 0.17690 0.556 0.000 0.012 0.432
#> SRR1379581 3 0.2011 0.83730 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.1388 0.90944 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1084742 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.3400 0.75827 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1072388 1 0.2867 0.83399 0.884 0.000 0.012 0.104
#> SRR1070332 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.3266 0.77212 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1076195 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069895 3 0.4999 0.04768 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1099144 4 0.2329 0.86317 0.072 0.000 0.012 0.916
#> SRR1385150 3 0.4103 0.69222 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.4576 0.61037 0.728 0.000 0.012 0.260
#> SRR1340574 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.4522 0.52071 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.4898 0.25322 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1408553 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069231 1 0.5075 0.45886 0.644 0.000 0.012 0.344
#> SRR1325642 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0188 0.93050 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1447499 2 0.0188 0.92663 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1099330 2 0.3356 0.76319 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443568 2 0.4999 0.00375 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1380249 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080143 1 0.0336 0.92960 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1383148 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.3444 0.73437 0.000 0.816 0.184 0.000
#> SRR807679 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.4994 0.11415 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.1388 0.90983 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1418041 1 0.5143 0.42344 0.628 0.000 0.012 0.360
#> SRR1085211 1 0.4485 0.64307 0.740 0.000 0.012 0.248
#> SRR1339812 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.1174 0.91696 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1350958 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1396822 2 0.3688 0.72219 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1441934 2 0.0469 0.92170 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1472552 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1488881 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1102973 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1071131 2 0.4999 0.00375 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 4 0.3937 0.75513 0.188 0.000 0.012 0.800
#> SRR1409171 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096525 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488491 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1356351 2 0.1211 0.89956 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1369514 4 0.2676 0.84844 0.092 0.000 0.012 0.896
#> SRR1453299 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0707 0.91442 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1069074 2 0.3172 0.78105 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.4500 0.59652 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1419736 2 0.0336 0.92348 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1313343 3 0.0592 0.86548 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1077619 4 0.0336 0.91201 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1083530 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.3024 0.79091 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1354999 2 0.2973 0.80297 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1378818 2 0.4072 0.62861 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1413182 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464559 4 0.0336 0.91201 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1413075 2 0.0336 0.92348 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1487928 4 0.0000 0.91465 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.3172 0.78150 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1102729 4 0.4820 0.56317 0.296 0.000 0.012 0.692
#> SRR1456423 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0188 0.92669 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1376874 3 0.0817 0.86470 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0336 0.92422 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1480941 3 0.4776 0.41986 0.000 0.376 0.624 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0592 0.91873 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.4661 0.42498 0.000 0.652 0.348 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1474231 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.4175 0.69755 0.776 0.000 0.012 0.212
#> SRR1091328 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR814447 3 0.2081 0.83520 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1455989 2 0.3649 0.73232 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1453680 3 0.0592 0.86548 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1366729 3 0.0592 0.86548 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR821282 3 0.1022 0.86228 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1074602 2 0.1211 0.90142 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.92874 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0592 0.86548 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.4331 0.57392 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.3271 0.81388 0.132 0.000 0.012 0.856
#> SRR1444598 2 0.3837 0.67207 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1091743 2 0.3266 0.77230 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.4948 0.20003 0.000 0.560 0.440 0.000
#> SRR1459785 3 0.0469 0.86556 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1083700 1 0.0469 0.92857 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1375531 4 0.5388 0.12779 0.456 0.000 0.012 0.532
#> SRR1323470 2 0.4999 -0.09930 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR814657 1 0.0000 0.93137 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0404 0.8626 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1402132 4 0.3910 0.6873 0.196 0.000 0.000 0.772 0.032
#> SRR1326059 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1409062 5 0.4510 0.7739 0.000 0.432 0.008 0.000 0.560
#> SRR809406 1 0.1121 0.8748 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1465313 2 0.4522 0.3105 0.000 0.660 0.316 0.000 0.024
#> SRR819559 1 0.3527 0.7932 0.792 0.000 0.000 0.016 0.192
#> SRR1387899 5 0.5888 0.7996 0.000 0.288 0.136 0.000 0.576
#> SRR1442292 2 0.0162 0.8649 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 5 0.5603 0.7173 0.000 0.452 0.072 0.000 0.476
#> SRR1102320 1 0.1270 0.8724 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1469926 3 0.0290 0.8271 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.0880 0.8779 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1098426 1 0.3039 0.8022 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1090310 5 0.5730 0.4769 0.000 0.108 0.316 0.000 0.576
#> SRR1429748 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.1121 0.8750 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1326317 5 0.5435 0.8368 0.000 0.352 0.072 0.000 0.576
#> SRR1378308 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.3636 0.5048 0.000 0.272 0.728 0.000 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.5104 0.6452 0.000 0.116 0.692 0.000 0.192
#> SRR1402944 3 0.4934 0.6580 0.000 0.104 0.708 0.000 0.188
#> SRR1092818 1 0.3242 0.7884 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1093552 1 0.6582 0.1550 0.440 0.000 0.000 0.344 0.216
#> SRR1464880 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1078368 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0609 0.8499 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1320034 3 0.1670 0.8056 0.000 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR1068687 2 0.1478 0.8029 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 4 0.3841 0.7888 0.032 0.000 0.000 0.780 0.188
#> SRR1354203 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1077850 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1369241 2 0.0162 0.8649 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1455214 1 0.2280 0.8444 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1092014 5 0.5474 0.8363 0.000 0.348 0.076 0.000 0.576
#> SRR1097857 1 0.3039 0.8022 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1473318 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0162 0.8267 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1338687 2 0.4299 -0.3079 0.000 0.608 0.004 0.000 0.388
#> SRR1071207 4 0.3280 0.8057 0.012 0.000 0.000 0.812 0.176
#> SRR1486821 3 0.0510 0.8262 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1418540 1 0.2891 0.8127 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1408788 2 0.5305 0.2113 0.000 0.672 0.132 0.000 0.196
#> SRR1359487 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0510 0.8782 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1469080 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1365722 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 5 0.5284 0.8240 0.000 0.376 0.056 0.000 0.568
#> SRR1475993 3 0.1211 0.8211 0.000 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR1445387 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1077575 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1349300 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.4073 0.7630 0.752 0.000 0.000 0.032 0.216
#> SRR1453769 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 5 0.4268 0.7564 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1366124 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456674 4 0.6365 0.4411 0.272 0.000 0.000 0.516 0.212
#> SRR1086490 5 0.4278 0.0565 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1088511 2 0.0162 0.8649 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.4774 0.3753 0.612 0.000 0.000 0.360 0.028
#> SRR1384431 1 0.6542 0.0988 0.428 0.000 0.000 0.372 0.200
#> SRR1072055 4 0.6593 0.1712 0.368 0.000 0.000 0.420 0.212
#> SRR1359738 3 0.4088 0.3965 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1332141 1 0.1270 0.8724 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1085900 2 0.0162 0.8649 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0162 0.8668 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814515 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1344034 3 0.4415 0.1682 0.000 0.444 0.552 0.000 0.004
#> SRR1080391 4 0.1732 0.8462 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1347870 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.1410 0.8316 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR814219 2 0.2179 0.7921 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1070620 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.2424 0.8384 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1460211 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1070060 1 0.4613 0.3810 0.620 0.000 0.000 0.360 0.020
#> SRR1487969 2 0.2966 0.7347 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1417851 4 0.3779 0.7870 0.024 0.000 0.000 0.776 0.200
#> SRR1443350 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.1341 0.8714 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1076705 4 0.6593 0.1712 0.368 0.000 0.000 0.420 0.212
#> SRR1079380 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1102923 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.4161 -0.2805 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1366605 2 0.0290 0.8648 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396035 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 5 0.4403 0.7683 0.000 0.436 0.004 0.000 0.560
#> SRR1445573 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.1270 0.8253 0.000 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1431735 1 0.3519 0.7831 0.776 0.000 0.000 0.008 0.216
#> SRR1417387 1 0.3242 0.7884 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1445984 1 0.4431 0.7418 0.732 0.000 0.000 0.052 0.216
#> SRR1370447 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 5 0.6004 0.7575 0.000 0.256 0.168 0.000 0.576
#> SRR1437346 3 0.0510 0.8232 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1103143 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0510 0.8782 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1073191 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.6442 0.2110 0.000 0.492 0.300 0.000 0.208
#> SRR1486584 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.3266 0.7972 0.004 0.000 0.000 0.796 0.200
#> SRR1317939 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.6530 0.1393 0.440 0.000 0.000 0.360 0.200
#> SRR1399178 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1079543 2 0.4350 -0.3887 0.000 0.588 0.004 0.000 0.408
#> SRR816427 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.5444 0.1604 0.000 0.656 0.140 0.000 0.204
#> SRR1335314 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.5201 0.0858 0.000 0.424 0.532 0.000 0.044
#> SRR1074578 1 0.6489 0.1566 0.448 0.000 0.000 0.360 0.192
#> SRR1312226 2 0.3333 0.7122 0.000 0.788 0.004 0.000 0.208
#> SRR1416207 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.2074 0.8525 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1069328 4 0.3805 0.7913 0.032 0.000 0.000 0.784 0.184
#> SRR1445023 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 5 0.5435 0.8368 0.000 0.352 0.072 0.000 0.576
#> SRR1453480 2 0.3143 0.7185 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1101834 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.3177 0.7951 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1074839 2 0.2351 0.7568 0.000 0.896 0.088 0.000 0.016
#> SRR1458727 3 0.4841 0.6533 0.000 0.084 0.708 0.000 0.208
#> SRR1436949 2 0.3039 0.7283 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1070429 3 0.4219 0.2911 0.000 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1458158 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0290 0.8271 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1385434 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.0510 0.8232 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1402009 1 0.1270 0.8724 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1316055 4 0.0609 0.8558 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1308734 3 0.1478 0.8013 0.000 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1397115 1 0.0162 0.8817 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392141 1 0.3242 0.7884 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR814341 2 0.0162 0.8670 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313601 5 0.4397 0.7708 0.000 0.432 0.004 0.000 0.564
#> SRR1459609 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.1364 0.8183 0.000 0.012 0.952 0.000 0.036
#> SRR809919 1 0.6519 0.1655 0.448 0.000 0.000 0.352 0.200
#> SRR1370818 4 0.0703 0.8557 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1323651 5 0.5405 0.8093 0.000 0.380 0.064 0.000 0.556
#> SRR1357297 1 0.0609 0.8801 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR818170 3 0.4428 0.6912 0.000 0.084 0.756 0.000 0.160
#> SRR1091230 5 0.5474 0.8359 0.000 0.348 0.076 0.000 0.576
#> SRR1470556 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1211 0.8163 0.000 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR1317731 3 0.4297 0.4706 0.000 0.288 0.692 0.000 0.020
#> SRR1490785 1 0.1608 0.8656 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1432032 1 0.0404 0.8794 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1447808 1 0.1121 0.8749 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR809534 2 0.0290 0.8648 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1397312 5 0.4321 0.7729 0.000 0.396 0.004 0.000 0.600
#> SRR812128 2 0.1851 0.8138 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1101513 1 0.1121 0.8748 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1415708 2 0.0703 0.8446 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.0000 0.8252 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0162 0.8668 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1464473 3 0.0703 0.8236 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1076801 1 0.5810 0.5598 0.612 0.000 0.000 0.176 0.212
#> SRR1080044 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.6489 0.1566 0.448 0.000 0.000 0.360 0.192
#> SRR1069871 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1068929 2 0.1121 0.8428 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1490097 2 0.2813 0.7467 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1075054 2 0.3003 0.7316 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1083480 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1075458 1 0.3109 0.7997 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1417023 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.2561 0.8319 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1352996 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.0609 0.8598 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1413137 4 0.0703 0.8590 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1469973 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.5192 0.5613 0.280 0.000 0.000 0.644 0.076
#> SRR1416266 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 5 0.4403 0.7683 0.000 0.436 0.004 0.000 0.560
#> SRR1383192 1 0.5406 0.3336 0.572 0.000 0.000 0.360 0.068
#> SRR1419962 3 0.0000 0.8252 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.3109 0.7975 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1081639 3 0.0609 0.8253 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1312147 1 0.6569 0.1467 0.448 0.000 0.000 0.336 0.216
#> SRR1473891 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2179 0.8341 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1474930 2 0.1792 0.7854 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1470988 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0290 0.8616 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 5 0.5028 0.8059 0.000 0.400 0.036 0.000 0.564
#> SRR1313770 3 0.1041 0.8207 0.000 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR1315780 2 0.4192 -0.3546 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1073631 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.6489 0.1566 0.448 0.000 0.000 0.360 0.192
#> SRR1310997 2 0.3003 0.7315 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1464494 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1357083 5 0.5702 0.4698 0.000 0.104 0.320 0.000 0.576
#> SRR1475842 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1378220 5 0.6031 0.6289 0.000 0.180 0.244 0.000 0.576
#> SRR1467704 1 0.0510 0.8782 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1348885 2 0.4434 0.6416 0.000 0.736 0.056 0.000 0.208
#> SRR1325826 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.0404 0.8241 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1097954 1 0.3039 0.8022 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1374396 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0290 0.8648 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355747 1 0.2561 0.8338 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1429368 3 0.0510 0.8232 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1398138 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.3177 0.7940 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1361436 3 0.4088 0.3965 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR817142 5 0.5435 0.8368 0.000 0.352 0.072 0.000 0.576
#> SRR1315291 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309314 3 0.2291 0.7943 0.000 0.056 0.908 0.000 0.036
#> SRR1420085 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.0404 0.8241 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1472126 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.5915 0.3691 0.000 0.584 0.264 0.000 0.152
#> SRR1099789 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1339276 1 0.0609 0.8801 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1418368 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.5327 0.6565 0.664 0.000 0.000 0.120 0.216
#> SRR1096760 5 0.5906 0.7954 0.000 0.284 0.140 0.000 0.576
#> SRR1440290 5 0.5674 0.8265 0.000 0.324 0.100 0.000 0.576
#> SRR1330813 5 0.4974 0.8001 0.000 0.408 0.032 0.000 0.560
#> SRR1458931 2 0.0162 0.8669 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812294 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.3039 0.8022 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1081160 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.1965 0.8048 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1390143 1 0.6510 0.0870 0.428 0.000 0.000 0.380 0.192
#> SRR1390413 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.4171 0.3412 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1312169 1 0.3852 0.6616 0.760 0.000 0.000 0.220 0.020
#> SRR1096687 1 0.6563 0.1339 0.436 0.000 0.000 0.356 0.208
#> SRR1486139 1 0.1270 0.8724 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1470313 4 0.1270 0.8539 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1447893 5 0.5781 0.8159 0.000 0.308 0.116 0.000 0.576
#> SRR1466025 5 0.3550 0.6364 0.000 0.236 0.004 0.000 0.760
#> SRR1477429 4 0.6146 0.4908 0.240 0.000 0.000 0.560 0.200
#> SRR1445701 5 0.5939 0.7850 0.000 0.276 0.148 0.000 0.576
#> SRR820689 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 5 0.4287 0.7295 0.000 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1452537 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 4 0.5502 0.6656 0.156 0.000 0.000 0.652 0.192
#> SRR1489328 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.0290 0.8606 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1355769 1 0.0290 0.8815 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1488237 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480917 5 0.3642 0.6447 0.000 0.232 0.008 0.000 0.760
#> SRR1474485 4 0.1197 0.8541 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1089998 1 0.1478 0.8685 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1318140 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 5 0.6043 0.5840 0.000 0.168 0.264 0.000 0.568
#> SRR1095188 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.0609 0.8224 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1105417 4 0.3266 0.7972 0.004 0.000 0.000 0.796 0.200
#> SRR1325578 2 0.5047 -0.0647 0.000 0.496 0.472 0.000 0.032
#> SRR1358161 3 0.0404 0.8252 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1358665 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1452010 1 0.4490 0.6275 0.724 0.000 0.000 0.224 0.052
#> SRR1418183 5 0.5906 0.7943 0.000 0.284 0.140 0.000 0.576
#> SRR1366345 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.3039 0.8022 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1090837 5 0.5395 0.3631 0.000 0.068 0.356 0.000 0.576
#> SRR1447828 3 0.0000 0.8252 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0798 0.8234 0.000 0.008 0.976 0.000 0.016
#> SRR1350280 1 0.1121 0.8748 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1088557 1 0.3003 0.8050 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1102656 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1441443 2 0.0290 0.8648 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1370682 3 0.2359 0.7903 0.000 0.060 0.904 0.000 0.036
#> SRR1475448 5 0.4940 0.2410 0.000 0.032 0.392 0.000 0.576
#> SRR1407291 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0609 0.8801 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1363766 1 0.3696 0.6782 0.772 0.000 0.000 0.212 0.016
#> SRR1082592 2 0.0290 0.8648 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325794 5 0.4440 0.7021 0.000 0.468 0.004 0.000 0.528
#> SRR1095961 2 0.4713 0.1830 0.000 0.544 0.440 0.000 0.016
#> SRR1086702 5 0.4403 0.7683 0.000 0.436 0.004 0.000 0.560
#> SRR1320806 5 0.5851 0.8011 0.000 0.288 0.132 0.000 0.580
#> SRR1457527 3 0.0000 0.8252 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.0510 0.8232 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488858 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 4 0.3039 0.8020 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1090241 5 0.4604 0.7791 0.000 0.428 0.012 0.000 0.560
#> SRR1329863 2 0.3109 0.7213 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1357733 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 4 0.6593 0.1712 0.368 0.000 0.000 0.420 0.212
#> SRR1379581 3 0.2291 0.7943 0.000 0.056 0.908 0.000 0.036
#> SRR1309182 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3993 0.7665 0.756 0.000 0.000 0.028 0.216
#> SRR1084742 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1433538 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1097100 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 5 0.5474 0.8363 0.000 0.348 0.076 0.000 0.576
#> SRR1072388 1 0.4847 0.7084 0.704 0.000 0.000 0.080 0.216
#> SRR1070332 2 0.2966 0.7347 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1320761 5 0.5382 0.8342 0.000 0.336 0.072 0.000 0.592
#> SRR1076195 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 5 0.5868 0.8023 0.000 0.292 0.132 0.000 0.576
#> SRR1099144 4 0.4589 0.7541 0.064 0.000 0.000 0.724 0.212
#> SRR1385150 5 0.6053 0.6565 0.000 0.196 0.228 0.000 0.576
#> SRR1420191 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456971 1 0.6219 0.4215 0.548 0.000 0.000 0.240 0.212
#> SRR1340574 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.2669 0.7221 0.000 0.876 0.104 0.000 0.020
#> SRR1096267 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.5177 0.6189 0.000 0.132 0.688 0.000 0.180
#> SRR1408553 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.6463 0.2061 0.464 0.000 0.000 0.344 0.192
#> SRR1325642 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0510 0.8812 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1321942 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.3109 0.7975 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1447499 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099330 5 0.5435 0.8368 0.000 0.352 0.072 0.000 0.576
#> SRR1077874 2 0.0290 0.8648 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR808299 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.3177 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1481238 2 0.4211 -0.1922 0.000 0.636 0.004 0.000 0.360
#> SRR1443568 5 0.5888 0.7982 0.000 0.288 0.136 0.000 0.576
#> SRR1380249 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0880 0.8778 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1383148 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0510 0.8602 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR813283 1 0.1270 0.8724 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1430226 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.2471 0.8362 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1466927 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 2 0.6442 0.2070 0.000 0.492 0.300 0.000 0.208
#> SRR807679 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 3 0.4219 0.2155 0.000 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.2329 0.7843 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1331730 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0510 0.8782 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432542 1 0.3727 0.7768 0.768 0.000 0.000 0.016 0.216
#> SRR1418041 1 0.6489 0.1566 0.448 0.000 0.000 0.360 0.192
#> SRR1085211 1 0.5819 0.5586 0.612 0.000 0.000 0.188 0.200
#> SRR1339812 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.3821 0.7748 0.764 0.000 0.000 0.020 0.216
#> SRR1350958 5 0.4390 0.7739 0.000 0.428 0.004 0.000 0.568
#> SRR1396822 5 0.5644 0.8272 0.000 0.328 0.096 0.000 0.576
#> SRR1441934 2 0.4659 -0.6498 0.000 0.500 0.012 0.000 0.488
#> SRR1472552 3 0.4088 0.3965 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1488881 3 0.4088 0.3965 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1102973 1 0.3074 0.7999 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1071131 2 0.4226 0.5504 0.000 0.776 0.140 0.000 0.084
#> SRR1074502 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 4 0.3877 0.7838 0.024 0.000 0.000 0.764 0.212
#> SRR1409171 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.3109 0.7213 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1096525 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 5 0.4403 0.7683 0.000 0.436 0.004 0.000 0.560
#> SRR1356351 5 0.4087 0.6191 0.000 0.208 0.036 0.000 0.756
#> SRR1369514 4 0.3231 0.7988 0.004 0.000 0.000 0.800 0.196
#> SRR1453299 3 0.0510 0.8232 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436300 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 5 0.4565 0.3274 0.000 0.408 0.012 0.000 0.580
#> SRR1091767 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.4088 0.3965 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1069074 5 0.5395 0.8359 0.000 0.356 0.068 0.000 0.576
#> SRR1452399 2 0.3039 0.7284 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1437430 3 0.2871 0.7627 0.000 0.088 0.872 0.000 0.040
#> SRR1419736 2 0.3455 0.7057 0.000 0.784 0.008 0.000 0.208
#> SRR1313343 3 0.0566 0.8256 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1077619 4 0.2377 0.8290 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1083530 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.4436 0.2040 0.000 0.596 0.396 0.000 0.008
#> SRR1354999 5 0.5498 0.8344 0.000 0.356 0.076 0.000 0.568
#> SRR1443592 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.1270 0.8724 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1378818 3 0.5434 0.5882 0.000 0.136 0.656 0.000 0.208
#> SRR1413182 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 4 0.2852 0.8146 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1413075 2 0.3455 0.7057 0.000 0.784 0.008 0.000 0.208
#> SRR1487928 4 0.0000 0.8616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 5 0.5395 0.8357 0.000 0.356 0.068 0.000 0.576
#> SRR1102729 4 0.6279 0.4237 0.268 0.000 0.000 0.532 0.200
#> SRR1456423 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0162 0.8649 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.0510 0.8262 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1339903 1 0.0510 0.8807 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1346710 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 5 0.4262 0.7625 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1480941 3 0.4333 0.6257 0.000 0.048 0.740 0.000 0.212
#> SRR1479175 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0404 0.8572 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.1792 0.7832 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.1410 0.8019 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1474231 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.5928 0.5317 0.596 0.000 0.000 0.212 0.192
#> SRR1091328 1 0.3143 0.7974 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR814447 3 0.2359 0.7914 0.000 0.060 0.904 0.000 0.036
#> SRR1455989 5 0.5580 0.8311 0.000 0.336 0.088 0.000 0.576
#> SRR1453680 3 0.0162 0.8263 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.3039 0.8022 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1366729 3 0.0162 0.8263 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0404 0.8269 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1074602 5 0.4909 0.7955 0.000 0.412 0.028 0.000 0.560
#> SRR814633 2 0.0000 0.8685 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0566 0.8270 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1319100 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 5 0.6257 0.7417 0.000 0.320 0.168 0.000 0.512
#> SRR1457459 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.3745 0.7892 0.024 0.000 0.000 0.780 0.196
#> SRR1444598 3 0.5394 0.5944 0.000 0.132 0.660 0.000 0.208
#> SRR1091743 5 0.5435 0.8368 0.000 0.352 0.072 0.000 0.576
#> SRR819637 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 5 0.5827 0.8072 0.000 0.300 0.124 0.000 0.576
#> SRR1459785 3 0.0404 0.8241 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083700 1 0.3109 0.7975 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1375531 4 0.6361 0.3560 0.296 0.000 0.000 0.508 0.196
#> SRR1323470 5 0.4971 0.3715 0.000 0.116 0.176 0.000 0.708
#> SRR814657 1 0.0000 0.8819 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.1563 0.76033 0.000 0.932 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1402132 5 0.4983 0.30619 0.080 0.000 0.000 0.356 0.564 0.000
#> SRR1326059 1 0.2912 0.67560 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1409062 6 0.3830 0.74107 0.000 0.376 0.004 0.000 0.000 0.620
#> SRR809406 1 0.3288 0.61847 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1465313 2 0.5046 0.30757 0.000 0.620 0.276 0.000 0.004 0.100
#> SRR819559 1 0.4381 0.20124 0.536 0.000 0.000 0.024 0.440 0.000
#> SRR1387899 6 0.4809 0.73108 0.000 0.208 0.128 0.000 0.000 0.664
#> SRR1442292 2 0.0632 0.77497 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1488151 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 6 0.4537 0.67806 0.000 0.412 0.036 0.000 0.000 0.552
#> SRR1102320 1 0.3330 0.60803 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070036 1 0.3390 0.41700 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1098426 1 0.3860 0.17517 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1090310 6 0.4537 0.49414 0.000 0.072 0.264 0.000 0.000 0.664
#> SRR1429748 1 0.0458 0.77463 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1363654 1 0.3288 0.61875 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1326317 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR1378308 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 3 0.4039 0.17253 0.000 0.424 0.568 0.000 0.000 0.008
#> SRR1490761 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.6521 0.46649 0.000 0.060 0.484 0.000 0.152 0.304
#> SRR1402944 3 0.6390 0.48695 0.000 0.052 0.504 0.000 0.152 0.292
#> SRR1092818 5 0.3175 0.61967 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1093552 5 0.3627 0.64432 0.128 0.000 0.000 0.080 0.792 0.000
#> SRR1464880 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1078368 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0653 0.78428 0.000 0.980 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR1466951 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331879 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1320034 3 0.1049 0.79963 0.000 0.008 0.960 0.000 0.000 0.032
#> SRR1068687 2 0.1080 0.76664 0.000 0.960 0.004 0.000 0.004 0.032
#> SRR1437491 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1329994 4 0.3927 0.40863 0.012 0.000 0.000 0.644 0.344 0.000
#> SRR1354203 1 0.2697 0.69434 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1077850 1 0.2969 0.66998 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1369241 2 0.0632 0.77497 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077992 2 0.5852 0.36519 0.000 0.464 0.000 0.000 0.208 0.328
#> SRR1455214 1 0.3659 0.46818 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1092014 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR1097857 1 0.3828 0.27215 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.0713 0.80797 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1338687 2 0.3817 -0.30868 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1071207 4 0.3373 0.59665 0.008 0.000 0.000 0.744 0.248 0.000
#> SRR1486821 3 0.0820 0.80816 0.000 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016
#> SRR1418540 1 0.3717 0.39312 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1408788 2 0.4348 0.20397 0.000 0.676 0.056 0.000 0.000 0.268
#> SRR1359487 4 0.1007 0.77721 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.3175 0.45538 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1469080 2 0.5817 0.37222 0.000 0.476 0.000 0.000 0.204 0.320
#> SRR1365722 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.0790 0.76345 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1321829 6 0.4170 0.79022 0.000 0.308 0.032 0.000 0.000 0.660
#> SRR1475993 3 0.1152 0.80485 0.000 0.004 0.952 0.000 0.000 0.044
#> SRR1445387 1 0.3050 0.66017 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1077575 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1349300 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1374165 5 0.3151 0.62061 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401146 6 0.3774 0.70034 0.000 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1366124 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.2664 0.69603 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1456674 5 0.3956 0.37017 0.032 0.000 0.000 0.264 0.704 0.000
#> SRR1086490 6 0.3860 -0.02523 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1088511 2 0.0458 0.78255 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1404577 4 0.6116 -0.34967 0.332 0.000 0.000 0.364 0.304 0.000
#> SRR1384431 5 0.5509 0.45762 0.136 0.000 0.000 0.368 0.496 0.000
#> SRR1072055 5 0.5155 0.43302 0.124 0.000 0.000 0.280 0.596 0.000
#> SRR1359738 3 0.3695 0.40854 0.000 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1332141 1 0.3330 0.60803 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1085900 2 0.0603 0.78281 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1442173 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0363 0.79069 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR814515 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1344034 2 0.4445 0.24745 0.000 0.572 0.396 0.000 0.000 0.032
#> SRR1080391 4 0.3221 0.57006 0.000 0.000 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1347870 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR814028 2 0.3953 0.60350 0.000 0.744 0.000 0.000 0.196 0.060
#> SRR814219 2 0.2048 0.71786 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1070620 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.3659 0.46836 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1070060 4 0.6111 -0.34278 0.340 0.000 0.000 0.364 0.296 0.000
#> SRR1487969 2 0.3426 0.59169 0.000 0.720 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR1417851 4 0.3706 0.36520 0.000 0.000 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.3126 0.64767 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1076705 5 0.5103 0.44275 0.124 0.000 0.000 0.268 0.608 0.000
#> SRR1079380 2 0.5879 0.34748 0.000 0.448 0.000 0.000 0.208 0.344
#> SRR1102923 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.3857 -0.31609 0.000 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1366605 2 0.1141 0.76744 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1396035 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.2738 0.66543 0.000 0.820 0.000 0.000 0.176 0.004
#> SRR1436840 6 0.3934 0.73544 0.000 0.376 0.000 0.000 0.008 0.616
#> SRR1445573 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375394 4 0.1616 0.73450 0.000 0.000 0.020 0.932 0.048 0.000
#> SRR1431735 5 0.3265 0.62552 0.248 0.000 0.000 0.004 0.748 0.000
#> SRR1417387 5 0.3151 0.62061 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1445984 5 0.3665 0.62675 0.252 0.000 0.000 0.020 0.728 0.000
#> SRR1370447 4 0.1204 0.77504 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1446308 6 0.4740 0.75159 0.000 0.228 0.108 0.000 0.000 0.664
#> SRR1437346 3 0.1075 0.80302 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1103143 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.3151 0.45518 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468914 4 0.1007 0.77721 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1319584 6 0.7479 -0.15718 0.000 0.312 0.152 0.000 0.204 0.332
#> SRR1486584 1 0.0458 0.77569 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR813536 4 0.3868 0.00566 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1341921 5 0.5530 0.46425 0.140 0.000 0.000 0.364 0.496 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1079543 2 0.3838 -0.35155 0.000 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR816427 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1076681 2 0.5125 0.04493 0.000 0.612 0.108 0.000 0.004 0.276
#> SRR1335314 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400799 3 0.4800 0.39843 0.000 0.280 0.640 0.000 0.004 0.076
#> SRR1074578 5 0.5592 0.46278 0.148 0.000 0.000 0.368 0.484 0.000
#> SRR1312226 2 0.5873 0.34539 0.000 0.452 0.000 0.000 0.208 0.340
#> SRR1416207 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.3578 0.51824 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1069328 4 0.3898 0.42644 0.012 0.000 0.000 0.652 0.336 0.000
#> SRR1445023 4 0.0937 0.77771 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1077599 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR1453480 2 0.5817 0.37371 0.000 0.476 0.000 0.000 0.204 0.320
#> SRR1101834 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 5 0.3221 0.60945 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1074839 2 0.1565 0.75118 0.000 0.940 0.028 0.000 0.004 0.028
#> SRR1458727 3 0.5867 0.43751 0.000 0.000 0.456 0.000 0.208 0.336
#> SRR1436949 2 0.5080 0.49273 0.000 0.600 0.000 0.000 0.112 0.288
#> SRR1070429 3 0.3578 0.47080 0.000 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1458158 1 0.0363 0.77610 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1432408 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0146 0.80940 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1385434 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415591 3 0.1075 0.80302 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1402009 1 0.3330 0.60803 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1316055 4 0.3428 0.45319 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304 0.000
#> SRR1308734 3 0.1444 0.76501 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498973 2 0.5852 0.36519 0.000 0.464 0.000 0.000 0.208 0.328
#> SRR1397115 1 0.2135 0.73149 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1392141 5 0.3151 0.62061 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR814341 2 0.0146 0.79400 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313601 6 0.3706 0.73424 0.000 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1459609 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.1814 0.77211 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR809919 5 0.5498 0.50590 0.148 0.000 0.000 0.324 0.528 0.000
#> SRR1370818 4 0.3371 0.46755 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1323651 6 0.4763 0.75541 0.000 0.344 0.064 0.000 0.000 0.592
#> SRR1357297 1 0.3151 0.64464 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR818170 3 0.4002 0.64128 0.000 0.000 0.704 0.000 0.036 0.260
#> SRR1091230 6 0.4291 0.78952 0.000 0.292 0.044 0.000 0.000 0.664
#> SRR1470556 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.1285 0.80119 0.000 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1317731 3 0.5920 0.27017 0.000 0.296 0.532 0.000 0.152 0.020
#> SRR1490785 1 0.3446 0.57263 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1432032 1 0.2527 0.60541 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1447808 1 0.3151 0.64516 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR809534 2 0.1141 0.76744 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1397312 6 0.3409 0.73504 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR812128 2 0.4983 0.52057 0.000 0.644 0.000 0.000 0.208 0.148
#> SRR1101513 1 0.3288 0.61847 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1415708 2 0.1049 0.76350 0.000 0.960 0.008 0.000 0.000 0.032
#> SRR1316033 3 0.0713 0.80797 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1390371 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0790 0.77996 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1464473 3 0.0458 0.80321 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076801 5 0.4727 0.63208 0.240 0.000 0.000 0.100 0.660 0.000
#> SRR1080044 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 5 0.5618 0.46176 0.152 0.000 0.000 0.368 0.480 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1068929 2 0.3163 0.67179 0.000 0.820 0.000 0.000 0.140 0.040
#> SRR1490097 2 0.5195 0.49218 0.000 0.616 0.000 0.000 0.208 0.176
#> SRR1075054 2 0.3448 0.58839 0.000 0.716 0.000 0.000 0.004 0.280
#> SRR1083480 1 0.2697 0.69337 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1075458 5 0.3390 0.56067 0.296 0.000 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR1417023 4 0.0790 0.76345 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1309333 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333676 1 0.3706 0.43289 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1352996 1 0.0458 0.77496 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1093172 4 0.1910 0.74973 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1413137 4 0.1610 0.76287 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1469973 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420026 2 0.2212 0.71998 0.000 0.880 0.000 0.000 0.112 0.008
#> SRR817306 4 0.5395 0.14294 0.144 0.000 0.000 0.556 0.300 0.000
#> SRR1416266 4 0.1007 0.77721 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.1007 0.77721 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1435394 6 0.3717 0.73102 0.000 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616
#> SRR1383192 4 0.6108 -0.38403 0.292 0.000 0.000 0.364 0.344 0.000
#> SRR1419962 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094357 1 0.3857 0.18911 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.6253 0.33788 0.000 0.440 0.016 0.000 0.208 0.336
#> SRR1312147 5 0.4352 0.62544 0.148 0.000 0.000 0.128 0.724 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.2527 0.69743 0.000 0.000 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1474930 2 0.2126 0.71960 0.000 0.904 0.072 0.000 0.004 0.020
#> SRR1470988 4 0.1075 0.77696 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR811915 2 0.0790 0.76847 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1104987 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 6 0.4153 0.77370 0.000 0.340 0.024 0.000 0.000 0.636
#> SRR1313770 3 0.1124 0.79584 0.000 0.036 0.956 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315780 2 0.3804 -0.29724 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1073631 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 5 0.5592 0.46278 0.148 0.000 0.000 0.368 0.484 0.000
#> SRR1310997 2 0.4107 0.56402 0.000 0.684 0.000 0.000 0.036 0.280
#> SRR1464494 2 0.5859 0.36161 0.000 0.460 0.000 0.000 0.208 0.332
#> SRR1357083 6 0.4371 0.44557 0.000 0.052 0.284 0.000 0.000 0.664
#> SRR1475842 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.2969 0.66998 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1378220 6 0.4685 0.54319 0.000 0.096 0.240 0.000 0.000 0.664
#> SRR1467704 1 0.3330 0.40157 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1348885 2 0.6454 0.32267 0.000 0.428 0.028 0.000 0.208 0.336
#> SRR1325826 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 4 0.1501 0.76588 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1345692 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401040 3 0.0937 0.80583 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1097954 1 0.3828 0.27215 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1374396 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.1285 0.76673 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1355747 5 0.3695 0.39344 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1429368 3 0.0937 0.80582 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1398138 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1379260 5 0.3351 0.58396 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR1361436 3 0.3547 0.48639 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR817142 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR1315291 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309314 3 0.1910 0.76813 0.000 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1420085 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1361308 3 0.0363 0.80951 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1472126 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380482 2 0.5133 0.47832 0.000 0.624 0.164 0.000 0.000 0.212
#> SRR1099789 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079480 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1339276 1 0.2883 0.67786 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1418368 1 0.0632 0.77329 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1399353 5 0.3488 0.66802 0.184 0.000 0.000 0.036 0.780 0.000
#> SRR1096760 6 0.4723 0.75632 0.000 0.232 0.104 0.000 0.000 0.664
#> SRR1440290 6 0.4685 0.76217 0.000 0.240 0.096 0.000 0.000 0.664
#> SRR1330813 6 0.3954 0.76474 0.000 0.352 0.012 0.000 0.000 0.636
#> SRR1458931 2 0.0291 0.79340 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR812294 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.3828 0.27215 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.3123 0.68860 0.000 0.832 0.000 0.000 0.056 0.112
#> SRR1390143 5 0.5592 0.46278 0.148 0.000 0.000 0.368 0.484 0.000
#> SRR1390413 2 0.0458 0.78264 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1099570 3 0.3866 0.15771 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1312169 1 0.5922 -0.09156 0.464 0.000 0.000 0.284 0.252 0.000
#> SRR1096687 5 0.5257 0.54910 0.136 0.000 0.000 0.280 0.584 0.000
#> SRR1486139 1 0.3288 0.61552 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1470313 4 0.3684 0.43869 0.000 0.000 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR1447893 6 0.4685 0.76280 0.000 0.240 0.096 0.000 0.000 0.664
#> SRR1466025 6 0.4111 0.22550 0.000 0.048 0.008 0.000 0.208 0.736
#> SRR1477429 5 0.5386 0.40943 0.116 0.000 0.000 0.388 0.496 0.000
#> SRR1445701 6 0.4771 0.74403 0.000 0.220 0.116 0.000 0.000 0.664
#> SRR820689 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1451876 6 0.3774 0.69820 0.000 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1452537 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 4 0.4179 0.03045 0.012 0.000 0.000 0.516 0.472 0.000
#> SRR1489328 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 4 0.1910 0.75690 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1355769 1 0.2562 0.70721 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1488237 2 0.0363 0.79059 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1391985 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.2941 0.67166 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1480917 6 0.4747 0.30577 0.000 0.100 0.008 0.000 0.204 0.688
#> SRR1474485 4 0.1556 0.75268 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1089998 1 0.3390 0.59093 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 6 0.4923 0.68499 0.000 0.176 0.168 0.000 0.000 0.656
#> SRR1095188 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.1141 0.80126 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1105417 4 0.3868 0.00566 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496 0.000
#> SRR1325578 2 0.4538 0.34758 0.000 0.624 0.324 0.000 0.000 0.052
#> SRR1358161 3 0.1141 0.80914 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1358665 2 0.0713 0.78234 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1333971 2 0.5841 0.36273 0.000 0.464 0.000 0.000 0.204 0.332
#> SRR1452010 1 0.4871 0.13770 0.616 0.000 0.000 0.296 0.088 0.000
#> SRR1418183 6 0.4740 0.75159 0.000 0.228 0.108 0.000 0.000 0.664
#> SRR1366345 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473461 1 0.3828 0.27215 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1090837 6 0.4291 0.42629 0.000 0.044 0.292 0.000 0.000 0.664
#> SRR1447828 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.0937 0.80582 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1350280 1 0.3288 0.61847 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1088557 1 0.3823 0.28398 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1102656 2 0.5755 0.38777 0.000 0.500 0.000 0.000 0.204 0.296
#> SRR1441443 2 0.1285 0.76673 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1370682 3 0.1958 0.77082 0.000 0.004 0.896 0.000 0.000 0.100
#> SRR1475448 6 0.4152 0.39666 0.000 0.032 0.304 0.000 0.000 0.664
#> SRR1407291 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1405266 1 0.3151 0.64464 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1363766 1 0.5649 0.13463 0.536 0.000 0.000 0.236 0.228 0.000
#> SRR1082592 2 0.1285 0.76673 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1325794 6 0.3684 0.69328 0.000 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1095961 3 0.4697 0.21874 0.000 0.404 0.548 0.000 0.000 0.048
#> SRR1086702 6 0.3717 0.73102 0.000 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616
#> SRR1320806 6 0.4641 0.72578 0.000 0.192 0.108 0.000 0.004 0.696
#> SRR1457527 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.1075 0.80302 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1488858 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 4 0.3499 0.52511 0.000 0.000 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1090241 6 0.3923 0.74563 0.000 0.372 0.008 0.000 0.000 0.620
#> SRR1329863 2 0.5711 0.39945 0.000 0.516 0.000 0.000 0.208 0.276
#> SRR1357733 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 5 0.5190 0.43609 0.128 0.000 0.000 0.280 0.592 0.000
#> SRR1379581 3 0.1863 0.77037 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1309182 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1437668 5 0.3151 0.62061 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1084742 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1433538 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085063 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1454247 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1097100 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR1072388 5 0.3151 0.62061 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1070332 2 0.3489 0.58165 0.000 0.708 0.000 0.000 0.004 0.288
#> SRR1320761 6 0.4023 0.76347 0.000 0.240 0.036 0.000 0.004 0.720
#> SRR1076195 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069895 6 0.4740 0.75232 0.000 0.228 0.108 0.000 0.000 0.664
#> SRR1099144 5 0.3446 0.25612 0.000 0.000 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1385150 6 0.4854 0.63390 0.000 0.152 0.184 0.000 0.000 0.664
#> SRR1420191 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.2969 0.66998 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1456971 5 0.4990 0.61332 0.204 0.000 0.000 0.152 0.644 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.2407 0.69582 0.000 0.892 0.048 0.000 0.004 0.056
#> SRR1096267 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.6404 0.47850 0.000 0.052 0.504 0.000 0.156 0.288
#> SRR1408553 4 0.1141 0.77621 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1069231 5 0.5382 0.54607 0.148 0.000 0.000 0.288 0.564 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.2730 0.69601 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.3866 0.13440 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1447499 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099330 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR1077874 2 0.1285 0.76673 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR808299 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1481238 2 0.3765 -0.19603 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1443568 6 0.4800 0.76594 0.000 0.244 0.092 0.000 0.004 0.660
#> SRR1380249 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.3221 0.63213 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1383148 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431015 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1078709 2 0.0692 0.78695 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR813283 1 0.3330 0.60803 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.3717 0.42305 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 6 0.7621 -0.19322 0.000 0.208 0.248 0.000 0.208 0.336
#> SRR807679 1 0.1327 0.73015 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1333811 2 0.4468 0.18173 0.000 0.560 0.408 0.000 0.000 0.032
#> SRR1078660 2 0.5058 0.51805 0.000 0.636 0.000 0.000 0.200 0.164
#> SRR1331730 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.3390 0.36835 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1432542 5 0.3265 0.62497 0.248 0.000 0.000 0.004 0.748 0.000
#> SRR1418041 5 0.5611 0.46704 0.152 0.000 0.000 0.364 0.484 0.000
#> SRR1085211 1 0.3996 0.12027 0.512 0.000 0.000 0.004 0.484 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 5 0.3151 0.62061 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1350958 6 0.3647 0.74839 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1396822 6 0.4443 0.78426 0.000 0.276 0.060 0.000 0.000 0.664
#> SRR1441934 6 0.3843 0.60982 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1472552 3 0.3464 0.51721 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1488881 3 0.3464 0.51721 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1102973 1 0.3833 0.26108 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1071131 2 0.4137 0.49857 0.000 0.756 0.108 0.000 0.004 0.132
#> SRR1074502 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 5 0.3607 0.15322 0.000 0.000 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0146 0.79221 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430045 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1441245 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1384091 4 0.1007 0.77721 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1431887 2 0.5691 0.40062 0.000 0.520 0.000 0.000 0.204 0.276
#> SRR1096525 4 0.1075 0.77666 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1488491 6 0.3727 0.72791 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1356351 6 0.2882 0.42457 0.000 0.076 0.004 0.000 0.060 0.860
#> SRR1369514 4 0.3634 0.41498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1453299 3 0.0937 0.80582 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1436300 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 6 0.5560 0.15034 0.000 0.132 0.032 0.000 0.208 0.628
#> SRR1091767 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354467 3 0.3464 0.51721 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1069074 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR1452399 2 0.5671 0.43133 0.000 0.548 0.004 0.000 0.188 0.260
#> SRR1437430 3 0.2006 0.76856 0.000 0.004 0.892 0.000 0.000 0.104
#> SRR1419736 2 0.5867 0.35796 0.000 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1313343 3 0.0790 0.80744 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1077619 4 0.2854 0.65351 0.000 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1083530 1 0.0146 0.77582 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333633 2 0.4061 0.48375 0.000 0.708 0.248 0.000 0.000 0.044
#> SRR1354999 6 0.4427 0.78769 0.000 0.284 0.056 0.000 0.000 0.660
#> SRR1443592 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.3330 0.60803 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1378818 3 0.6708 0.39560 0.000 0.048 0.412 0.000 0.204 0.336
#> SRR1413182 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 5 0.3868 -0.26434 0.000 0.000 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1413075 2 0.5859 0.36161 0.000 0.460 0.000 0.000 0.208 0.332
#> SRR1487928 4 0.0000 0.77842 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1092865 6 0.4338 0.79114 0.000 0.300 0.036 0.000 0.004 0.660
#> SRR1102729 5 0.5487 0.47153 0.136 0.000 0.000 0.356 0.508 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0146 0.79229 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376874 3 0.0458 0.80563 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1339903 1 0.2969 0.66998 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1346710 1 0.0632 0.77292 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 6 0.3727 0.72733 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1480941 3 0.4769 0.35457 0.000 0.060 0.576 0.000 0.000 0.364
#> SRR1479175 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0458 0.77463 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1433884 2 0.0603 0.78292 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1471074 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1355554 2 0.2277 0.70410 0.000 0.892 0.076 0.000 0.000 0.032
#> SRR1487173 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.1444 0.79074 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1474231 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 5 0.5994 0.54206 0.276 0.000 0.000 0.284 0.440 0.000
#> SRR1091328 5 0.3244 0.59829 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR814447 3 0.1910 0.76813 0.000 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1455989 6 0.4291 0.78991 0.000 0.292 0.044 0.000 0.000 0.664
#> SRR1453680 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.3828 0.27215 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1366729 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821282 3 0.0000 0.80913 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074602 6 0.3742 0.76627 0.000 0.348 0.004 0.000 0.000 0.648
#> SRR814633 2 0.0000 0.79472 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.1444 0.80106 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1319100 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 6 0.5484 0.71707 0.000 0.280 0.148 0.000 0.004 0.568
#> SRR1457459 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 4 0.3634 0.41498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1444598 3 0.6308 0.42015 0.000 0.020 0.440 0.000 0.204 0.336
#> SRR1091743 6 0.4201 0.79129 0.000 0.300 0.036 0.000 0.000 0.664
#> SRR819637 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.77758 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 6 0.4443 0.78358 0.000 0.276 0.060 0.000 0.000 0.664
#> SRR1459785 3 0.0865 0.80663 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1083700 1 0.3866 0.13440 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1375531 5 0.5565 0.46172 0.144 0.000 0.000 0.368 0.488 0.000
#> SRR1323470 6 0.5017 0.06269 0.000 0.004 0.136 0.000 0.208 0.652
#> SRR814657 1 0.0146 0.77765 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.991 0.996 0.4951 0.506 0.506
#> 3 3 0.894 0.885 0.953 0.1739 0.921 0.844
#> 4 4 0.717 0.806 0.881 0.1602 0.841 0.649
#> 5 5 0.674 0.705 0.817 0.0965 0.889 0.669
#> 6 6 0.686 0.571 0.755 0.0597 0.925 0.715
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1375394 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.7139 0.762 0.196 0.804
#> SRR1079543 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1458727 1 0.0672 0.992 0.992 0.008
#> SRR1436949 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.7139 0.762 0.196 0.804
#> SRR1397312 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.7139 0.762 0.196 0.804
#> SRR1312147 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.7139 0.762 0.196 0.804
#> SRR1073631 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1325826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.7139 0.762 0.196 0.804
#> SRR1355747 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309314 2 0.7139 0.762 0.196 0.804
#> SRR1420085 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1347707 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR807679 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.9710 0.348 0.400 0.600
#> SRR1479175 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.1414 0.974 0.020 0.980
#> SRR1097197 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.6247 0.818 0.156 0.844
#> SRR1074602 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.7139 0.762 0.196 0.804
#> SRR1319100 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 1 0.0672 0.992 0.992 0.008
#> SRR814657 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.5905 0.5549 0.648 0.000 0.352
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.4654 0.6814 0.000 0.792 0.208
#> SRR819559 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.5988 0.3043 0.000 0.632 0.368
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4504 0.7883 0.804 0.000 0.196
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.4974 0.6304 0.000 0.764 0.236
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.5733 0.6179 0.000 0.324 0.676
#> SRR1402944 2 0.5465 0.5209 0.000 0.712 0.288
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0424 0.9293 0.000 0.992 0.008
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320034 3 0.4555 0.7460 0.000 0.200 0.800
#> SRR1068687 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.4654 0.6810 0.000 0.792 0.208
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.5905 0.3547 0.000 0.648 0.352
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1359487 1 0.4399 0.7978 0.812 0.000 0.188
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 3 0.6204 0.4479 0.000 0.424 0.576
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.1163 0.9067 0.000 0.972 0.028
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.3551 0.8604 0.868 0.000 0.132
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.6267 -0.0197 0.000 0.548 0.452
#> SRR1344034 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.6308 -0.1968 0.000 0.508 0.492
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 3 0.5948 0.5805 0.000 0.360 0.640
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.1643 0.8951 0.000 0.956 0.044
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 3 0.0237 0.7990 0.004 0.000 0.996
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446308 2 0.5431 0.5309 0.000 0.716 0.284
#> SRR1437346 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.5905 0.3537 0.000 0.648 0.352
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1335314 1 0.4702 0.7686 0.788 0.000 0.212
#> SRR1400799 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0592 0.9273 0.000 0.988 0.012
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458727 3 0.0237 0.7990 0.004 0.000 0.996
#> SRR1436949 2 0.1860 0.8889 0.000 0.948 0.052
#> SRR1070429 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.5882 0.5622 0.652 0.000 0.348
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.6154 0.1634 0.000 0.592 0.408
#> SRR1385434 1 0.3879 0.8388 0.848 0.000 0.152
#> SRR1415591 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.4842 0.7532 0.776 0.000 0.224
#> SRR1308734 2 0.5138 0.5991 0.000 0.748 0.252
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.2066 0.8814 0.000 0.940 0.060
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.2066 0.7919 0.000 0.060 0.940
#> SRR809919 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.4555 0.6955 0.000 0.800 0.200
#> SRR1317731 2 0.2356 0.8676 0.000 0.928 0.072
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.6062 0.2232 0.000 0.616 0.384
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.3482 0.7999 0.000 0.872 0.128
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 2 0.3816 0.7732 0.000 0.852 0.148
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 2 0.6095 0.2232 0.000 0.608 0.392
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 3 0.6168 0.4770 0.000 0.412 0.588
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.4605 0.7791 0.796 0.000 0.204
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413137 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.4555 0.7834 0.800 0.000 0.200
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.6295 -0.1121 0.000 0.528 0.472
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.4504 0.7494 0.000 0.196 0.804
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470988 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 2 0.5760 0.4213 0.000 0.672 0.328
#> SRR1315780 3 0.6309 0.1621 0.000 0.500 0.500
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.6192 0.1143 0.000 0.580 0.420
#> SRR1464494 2 0.4750 0.6672 0.000 0.784 0.216
#> SRR1357083 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 3 0.0237 0.7990 0.004 0.000 0.996
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 2 0.6225 0.0657 0.000 0.568 0.432
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.5905 0.5549 0.648 0.000 0.352
#> SRR1454073 3 0.6111 0.4624 0.000 0.396 0.604
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.0424 0.9306 0.000 0.992 0.008
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.4605 0.6879 0.000 0.796 0.204
#> SRR817142 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.0424 0.7967 0.008 0.000 0.992
#> SRR1309314 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 2 0.5254 0.5745 0.000 0.736 0.264
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.2625 0.8540 0.000 0.916 0.084
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.6295 -0.1165 0.000 0.528 0.472
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.4235 0.7329 0.000 0.824 0.176
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1466025 3 0.4504 0.7483 0.000 0.196 0.804
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR820689 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.5988 0.3069 0.000 0.632 0.368
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095188 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358161 2 0.6302 -0.1461 0.000 0.520 0.480
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.5098 0.6070 0.000 0.752 0.248
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1447828 3 0.6299 0.2896 0.000 0.476 0.524
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.6026 0.2789 0.000 0.624 0.376
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.5905 0.3537 0.000 0.648 0.352
#> SRR1325794 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095961 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457527 3 0.5706 0.6395 0.000 0.320 0.680
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488858 1 0.4121 0.8214 0.832 0.000 0.168
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.6308 -0.1976 0.000 0.508 0.492
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 3 0.6215 0.4372 0.000 0.428 0.572
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.2625 0.8549 0.000 0.916 0.084
#> SRR1320761 2 0.3686 0.7845 0.000 0.860 0.140
#> SRR1076195 1 0.4842 0.7532 0.776 0.000 0.224
#> SRR1069895 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 3 0.5706 0.6393 0.000 0.320 0.680
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.6062 0.5362 0.000 0.384 0.616
#> SRR1408553 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099330 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.5706 0.6411 0.000 0.320 0.680
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380249 1 0.3482 0.8643 0.872 0.000 0.128
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR813283 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.0237 0.7990 0.004 0.000 0.996
#> SRR807679 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078660 2 0.1163 0.9128 0.000 0.972 0.028
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 2 0.5968 0.3182 0.000 0.636 0.364
#> SRR1488881 2 0.4346 0.7205 0.000 0.816 0.184
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1384091 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.3686 0.8517 0.860 0.000 0.140
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.4346 0.7212 0.000 0.816 0.184
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 3 0.6280 0.3447 0.000 0.460 0.540
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 3 0.5363 0.6868 0.000 0.276 0.724
#> SRR1437430 3 0.4555 0.7460 0.000 0.200 0.800
#> SRR1419736 3 0.0592 0.8002 0.000 0.012 0.988
#> SRR1313343 2 0.1163 0.9129 0.000 0.972 0.028
#> SRR1077619 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0892 0.7993 0.000 0.020 0.980
#> SRR1413182 1 0.4452 0.7931 0.808 0.000 0.192
#> SRR1464559 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.5926 0.3434 0.000 0.644 0.356
#> SRR1487928 1 0.5948 0.5401 0.640 0.000 0.360
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.4346 0.7538 0.000 0.184 0.816
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 3 0.0237 0.7990 0.004 0.000 0.996
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453680 3 0.5948 0.5801 0.000 0.360 0.640
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.4504 0.6592 0.000 0.804 0.196
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.3816 0.7733 0.000 0.852 0.148
#> SRR821282 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 3 0.0000 0.8003 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9346 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1459785 2 0.0237 0.9334 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.0237 0.7990 0.004 0.000 0.996
#> SRR814657 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 4 0.2867 0.8201 0.012 0.000 0.104 0.884
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.1557 0.8533 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.4468 0.8286 0.000 0.232 0.752 0.016
#> SRR819559 1 0.1792 0.9130 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1387899 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1395635 1 0.3355 0.8795 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1343629 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326868 2 0.3172 0.7259 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1102320 1 0.1637 0.9149 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1469926 3 0.3311 0.8282 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1070036 1 0.3172 0.8794 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1098426 1 0.3024 0.8853 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1090310 3 0.4888 0.6134 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.4761 0.5897 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1329947 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469769 3 0.3444 0.8305 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1490761 2 0.1557 0.8530 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1380122 3 0.4057 0.8130 0.000 0.160 0.812 0.028
#> SRR1402944 3 0.4574 0.8312 0.000 0.220 0.756 0.024
#> SRR1092818 1 0.3024 0.8853 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1093552 1 0.3074 0.8836 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1464880 3 0.4746 0.7877 0.000 0.304 0.688 0.008
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0336 0.8981 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331879 3 0.4382 0.7935 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1320034 3 0.1624 0.6503 0.000 0.028 0.952 0.020
#> SRR1068687 2 0.4661 0.1625 0.000 0.652 0.348 0.000
#> SRR1437491 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0376 0.9183 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1329994 1 0.3610 0.8513 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0188 0.9185 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 3 0.4382 0.7935 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.4941 -0.1928 0.000 0.564 0.436 0.000
#> SRR1097857 1 0.0921 0.9182 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1473318 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345974 3 0.3356 0.8293 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1338687 2 0.0188 0.8996 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071207 1 0.3569 0.8544 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1486821 3 0.3266 0.8252 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1418540 1 0.1637 0.9145 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1408788 3 0.5000 0.4482 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1359487 4 0.3975 0.6105 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1080648 1 0.3355 0.8795 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1414708 1 0.3539 0.8704 0.820 0.000 0.004 0.176
#> SRR1469080 3 0.4898 0.6307 0.000 0.416 0.584 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.3688 0.8433 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.4250 0.7995 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 3 0.4348 0.8301 0.000 0.196 0.780 0.024
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.3400 0.8669 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1453769 2 0.3266 0.7199 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.1716 0.8309 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.3311 0.8722 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1086490 3 0.4679 0.7147 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.1389 0.9163 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1384431 1 0.2081 0.9101 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1072055 1 0.3266 0.8747 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1359738 3 0.4697 0.7127 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1332141 1 0.1792 0.9130 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1085900 2 0.4985 -0.3005 0.000 0.532 0.468 0.000
#> SRR1442173 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431625 2 0.3024 0.7357 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.4307 0.8293 0.000 0.192 0.784 0.024
#> SRR1344034 2 0.4967 -0.2807 0.000 0.548 0.452 0.000
#> SRR1080391 1 0.3172 0.8809 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.4857 0.2257 0.000 0.668 0.324 0.008
#> SRR814219 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 3 0.4574 0.8307 0.000 0.220 0.756 0.024
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 3 0.4382 0.7935 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1417851 1 0.2973 0.8879 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.1867 0.9125 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1076705 1 0.3311 0.8724 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1079380 3 0.4267 0.8282 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.5295 -0.4477 0.000 0.504 0.488 0.008
#> SRR1366605 3 0.4746 0.7243 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.3074 0.7332 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375394 4 0.3266 0.7872 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1431735 1 0.3123 0.8816 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1417387 1 0.3074 0.8836 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1445984 1 0.3219 0.8770 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1370447 1 0.3123 0.8779 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1446308 3 0.4454 0.7816 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1437346 3 0.4040 0.8149 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.3257 0.8838 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468914 1 0.3649 0.8473 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1319584 3 0.4744 0.8264 0.000 0.240 0.736 0.024
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.1940 0.9115 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1341921 1 0.1940 0.9114 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 3 0.4426 0.4437 0.000 0.024 0.772 0.204
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.4967 -0.2795 0.000 0.548 0.452 0.000
#> SRR1335314 4 0.1022 0.8401 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1400799 3 0.4331 0.7897 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1074578 1 0.0469 0.9186 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1312226 3 0.4905 0.7176 0.000 0.364 0.632 0.004
#> SRR1416207 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447371 1 0.1389 0.9163 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1069328 1 0.3569 0.8544 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1445023 4 0.3975 0.6129 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1077599 2 0.0336 0.8981 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1453480 2 0.4776 0.1046 0.000 0.624 0.376 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.3539 0.8704 0.820 0.000 0.004 0.176
#> SRR1074839 2 0.4477 0.3129 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1458727 4 0.3837 0.7648 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1436949 3 0.4647 0.7993 0.000 0.288 0.704 0.008
#> SRR1070429 3 0.4877 0.6217 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1458158 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432408 4 0.0921 0.8398 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1310334 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418201 3 0.3172 0.8206 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1385434 4 0.1716 0.8309 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1415591 3 0.4967 0.5327 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.1557 0.8336 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1308734 3 0.3400 0.8302 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1498973 3 0.4817 0.6803 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1397115 1 0.0657 0.9181 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1392141 1 0.3400 0.8669 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR814341 2 0.2973 0.7414 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1313601 2 0.4866 -0.1167 0.000 0.596 0.404 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.0779 0.6437 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR809919 1 0.3123 0.8832 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1370818 1 0.3837 0.8272 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1323651 2 0.0336 0.8981 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.1978 0.5925 0.000 0.004 0.928 0.068
#> SRR1091230 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095285 3 0.4194 0.8302 0.000 0.228 0.764 0.008
#> SRR1317731 3 0.4103 0.8197 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0524 0.9185 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 3 0.6449 0.7109 0.000 0.204 0.644 0.152
#> SRR1397312 2 0.4972 -0.3211 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR812128 3 0.4511 0.8139 0.000 0.268 0.724 0.008
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1316033 3 0.3400 0.8302 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1390371 2 0.3024 0.7357 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.3074 0.8147 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1076801 1 0.3444 0.8641 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1080044 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.1867 0.9122 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1069871 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095744 3 0.4387 0.8308 0.000 0.200 0.776 0.024
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.1716 0.8463 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.3172 0.8792 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1417023 4 0.1118 0.8396 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1093172 1 0.3726 0.8404 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1413137 1 0.2814 0.8925 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1469973 2 0.4961 -0.2215 0.000 0.552 0.448 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817306 1 0.2345 0.9059 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1416266 4 0.4877 0.2715 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.3688 0.8433 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.3074 0.8145 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1094357 1 0.1867 0.9122 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1081639 3 0.1151 0.6529 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.3945 0.4052 0.000 0.004 0.780 0.216
#> SRR1312147 1 0.3219 0.8770 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.2530 0.9007 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1474930 3 0.4985 0.4932 0.000 0.468 0.532 0.000
#> SRR1470988 1 0.3873 0.7868 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR811915 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.4323 0.8340 0.000 0.204 0.776 0.020
#> SRR1315780 3 0.6745 0.7169 0.000 0.244 0.604 0.152
#> SRR1073631 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR819124 1 0.1867 0.9122 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1310997 3 0.4464 0.8314 0.000 0.208 0.768 0.024
#> SRR1464494 3 0.4546 0.8202 0.000 0.256 0.732 0.012
#> SRR1357083 3 0.4624 0.7335 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.1389 0.9166 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1378220 3 0.4994 0.4781 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1467704 1 0.3219 0.8770 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1348885 4 0.3688 0.7706 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1325826 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1466812 1 0.2647 0.8973 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.3024 0.8115 0.000 0.148 0.852 0.000
#> SRR1097954 1 0.0188 0.9185 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374396 4 0.0921 0.8398 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1454073 3 0.6393 0.7065 0.000 0.188 0.652 0.160
#> SRR1355747 1 0.3402 0.8775 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1429368 3 0.3528 0.8309 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.3172 0.8792 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1361436 3 0.3356 0.8293 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR817142 2 0.0707 0.8906 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1315291 4 0.2704 0.8035 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1309314 4 0.3837 0.7648 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1420085 2 0.4661 0.1855 0.000 0.652 0.348 0.000
#> SRR1361308 3 0.3311 0.8274 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1472126 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380482 3 0.4647 0.8001 0.000 0.288 0.704 0.008
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 3 0.4464 0.8314 0.000 0.208 0.768 0.024
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399353 1 0.3219 0.8770 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1096760 3 0.4941 0.5783 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1440290 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.1389 0.8618 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR812294 1 0.3873 0.8229 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1394321 1 0.1792 0.9130 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477173 2 0.0817 0.8844 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.1940 0.9115 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.3356 0.8293 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.2345 0.9066 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1486139 1 0.1637 0.9146 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1470313 1 0.3837 0.8272 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1447893 3 0.4972 0.5317 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1466025 3 0.2521 0.6357 0.000 0.024 0.912 0.064
#> SRR1477429 1 0.1940 0.9115 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1445701 2 0.4855 -0.0671 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0188 0.8999 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.1940 0.9114 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1489328 3 0.4713 0.7177 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1344462 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082709 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447784 1 0.3726 0.8394 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1355769 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480917 3 0.4964 0.8248 0.000 0.244 0.724 0.032
#> SRR1474485 1 0.3688 0.8433 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319262 2 0.4761 0.0568 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR1095188 3 0.4866 0.6523 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1454350 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.4697 0.7086 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1105417 1 0.2216 0.9082 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1325578 3 0.4585 0.7554 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1358161 3 0.3074 0.8144 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 3 0.4898 0.8174 0.000 0.260 0.716 0.024
#> SRR1452010 1 0.0895 0.9157 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1418183 2 0.4989 -0.3528 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1366345 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.1792 0.9130 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1090837 3 0.4866 0.6279 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1447828 3 0.2868 0.8004 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.4454 0.7749 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.2814 0.7590 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.1004 0.6093 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1475448 3 0.3266 0.8252 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1407291 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 3 0.4364 0.8312 0.000 0.220 0.764 0.016
#> SRR1325794 3 0.4661 0.7400 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1095961 3 0.4907 0.6151 0.000 0.420 0.580 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 3 0.4961 0.5722 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1457527 3 0.2593 0.7659 0.000 0.104 0.892 0.004
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.4134 0.8087 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1488858 4 0.1474 0.8359 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1454695 1 0.3356 0.8709 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.3764 0.6250 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1357733 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1362135 1 0.3074 0.8836 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1379581 3 0.0817 0.6021 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.3219 0.8770 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1084742 3 0.4538 0.8314 0.000 0.216 0.760 0.024
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454247 3 0.4426 0.8313 0.000 0.204 0.772 0.024
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1072388 1 0.3311 0.8722 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1070332 3 0.4511 0.8139 0.000 0.268 0.724 0.008
#> SRR1320761 3 0.4567 0.8246 0.000 0.244 0.740 0.016
#> SRR1076195 4 0.1022 0.8401 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1069895 3 0.4999 0.4200 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1099144 1 0.3400 0.8669 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1385150 3 0.2589 0.7803 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.4941 0.4229 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.3219 0.8770 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1340574 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444830 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1096267 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087127 3 0.4225 0.8311 0.000 0.184 0.792 0.024
#> SRR1408553 1 0.2868 0.8902 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1069231 1 0.2973 0.8875 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.3024 0.8853 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1321942 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1094380 1 0.1867 0.9122 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1447499 2 0.0592 0.8929 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1099330 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1077874 3 0.4967 0.5631 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.4267 0.8282 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.4761 0.0638 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR1380249 1 0.4643 0.6469 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.4746 0.2908 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1357042 1 0.0895 0.9157 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.4981 -0.3348 0.000 0.536 0.464 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.1792 0.9130 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.3726 0.7696 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR807679 1 0.3355 0.8795 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1333811 2 0.3486 0.6544 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1078660 3 0.4356 0.7971 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.3494 0.8729 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR1432542 1 0.3356 0.8697 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.2281 0.9071 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.3123 0.8816 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.3219 0.8227 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1488881 3 0.3356 0.8293 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1102973 1 0.1792 0.9130 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1071131 3 0.4925 0.6030 0.000 0.428 0.572 0.000
#> SRR1074502 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325271 1 0.3444 0.8642 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0188 0.8998 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1430045 2 0.0188 0.8999 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441245 2 0.2281 0.8122 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1384091 1 0.3801 0.8316 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1431887 2 0.2868 0.7532 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1096525 1 0.4222 0.7269 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 3 0.4983 0.8099 0.000 0.272 0.704 0.024
#> SRR1369514 1 0.3528 0.8577 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1453299 3 0.4477 0.7657 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1436300 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1348490 3 0.4426 0.8312 0.000 0.204 0.772 0.024
#> SRR1091767 2 0.1211 0.8696 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1354467 3 0.4072 0.8147 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1069074 2 0.0469 0.8954 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1452399 3 0.3840 0.7605 0.000 0.104 0.844 0.052
#> SRR1437430 3 0.1452 0.6726 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1419736 3 0.2048 0.6066 0.000 0.008 0.928 0.064
#> SRR1313343 3 0.3486 0.8311 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1077619 1 0.3688 0.8433 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1083530 1 0.3402 0.8793 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1333633 2 0.0336 0.8979 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1354999 2 0.0188 0.8996 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.3725 0.4524 0.000 0.008 0.812 0.180
#> SRR1413182 4 0.2345 0.8048 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1464559 1 0.3837 0.8272 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1413075 3 0.4711 0.8275 0.000 0.236 0.740 0.024
#> SRR1487928 4 0.0921 0.8398 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0592 0.8929 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1102729 1 0.2345 0.9058 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1456423 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.1297 0.6306 0.000 0.016 0.964 0.020
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.3355 0.8795 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.2704 0.7575 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1480941 4 0.3688 0.7706 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.2973 0.7415 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0592 0.8929 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0817 0.8885 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1487173 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474253 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1322918 2 0.3024 0.7357 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.4431 0.7729 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR1474231 1 0.3052 0.8916 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1350545 1 0.0817 0.9183 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1091328 1 0.3172 0.8792 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR814447 3 0.2149 0.5321 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1455989 2 0.4994 -0.3546 0.000 0.520 0.480 0.000
#> SRR1453680 3 0.2530 0.7612 0.000 0.100 0.896 0.004
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.1118 0.8733 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1444222 2 0.4525 0.7068 0.000 0.804 0.116 0.080
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.3356 0.8295 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR821282 3 0.3311 0.4121 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1074602 2 0.0188 0.8999 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9020 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4018 0.3910 0.000 0.004 0.772 0.224
#> SRR1319100 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1324004 2 0.0707 0.8899 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1457459 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1421031 1 0.3266 0.8747 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1444598 4 0.3837 0.7648 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1091743 2 0.0188 0.8996 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819637 1 0.1209 0.9185 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9181 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.4624 0.2012 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1459785 3 0.4356 0.7845 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1083700 1 0.2011 0.9107 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1375531 1 0.2011 0.9109 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1323470 4 0.3837 0.7648 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR814657 1 0.0188 0.9173 0.996 0.000 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0162 0.900124 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0162 0.900124 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1402132 5 0.3336 0.711295 0.000 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1326059 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0955 0.889790 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 3 0.3697 0.740361 0.000 0.072 0.832 0.008 0.088
#> SRR819559 1 0.4302 -0.439739 0.520 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1387899 2 0.2077 0.858271 0.000 0.908 0.084 0.008 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1395635 4 0.4047 0.762420 0.320 0.000 0.004 0.676 0.000
#> SRR1343629 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1326868 2 0.4318 0.397799 0.000 0.644 0.348 0.004 0.004
#> SRR1102320 1 0.4304 -0.453950 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1469926 3 0.3226 0.733764 0.000 0.060 0.868 0.056 0.016
#> SRR1070036 4 0.3999 0.762036 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1098426 4 0.4088 0.737421 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR1090310 3 0.4795 0.712371 0.000 0.224 0.704 0.072 0.000
#> SRR1429748 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.1952 0.859662 0.000 0.912 0.084 0.004 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.4357 0.663046 0.128 0.000 0.000 0.768 0.104
#> SRR1329947 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1469769 3 0.3535 0.745732 0.000 0.088 0.832 0.080 0.000
#> SRR1490761 2 0.0703 0.892247 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.3477 0.726789 0.000 0.056 0.832 0.000 0.112
#> SRR1402944 3 0.3517 0.735900 0.000 0.068 0.832 0.000 0.100
#> SRR1092818 4 0.4030 0.755139 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1093552 4 0.3966 0.769354 0.336 0.000 0.000 0.664 0.000
#> SRR1464880 3 0.4524 0.732121 0.000 0.208 0.736 0.004 0.052
#> SRR1078368 2 0.0162 0.900124 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349608 2 0.1270 0.884764 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0898 0.894532 0.000 0.972 0.020 0.008 0.000
#> SRR1331879 3 0.3550 0.730023 0.000 0.236 0.760 0.004 0.000
#> SRR1320034 3 0.4866 0.529283 0.000 0.004 0.732 0.116 0.148
#> SRR1068687 2 0.4415 0.214395 0.000 0.604 0.388 0.008 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.1732 0.774249 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1329994 4 0.3790 0.797656 0.272 0.000 0.000 0.724 0.004
#> SRR1354203 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.2813 0.639319 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077992 3 0.3635 0.723241 0.000 0.248 0.748 0.004 0.000
#> SRR1455214 1 0.0609 0.849666 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1092014 3 0.4481 0.421861 0.000 0.416 0.576 0.008 0.000
#> SRR1097857 1 0.2179 0.734916 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1473318 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1345974 3 0.3967 0.719416 0.000 0.060 0.808 0.124 0.008
#> SRR1338687 2 0.1282 0.885870 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1071207 4 0.3838 0.794756 0.280 0.000 0.000 0.716 0.004
#> SRR1486821 3 0.3798 0.721316 0.000 0.060 0.816 0.120 0.004
#> SRR1418540 1 0.4302 -0.438790 0.520 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1408788 3 0.4510 0.384117 0.000 0.432 0.560 0.008 0.000
#> SRR1359487 4 0.4671 0.605526 0.116 0.000 0.000 0.740 0.144
#> SRR1080648 4 0.3861 0.786402 0.284 0.000 0.004 0.712 0.000
#> SRR1414708 4 0.3579 0.793309 0.240 0.000 0.004 0.756 0.000
#> SRR1469080 3 0.4365 0.664400 0.000 0.308 0.676 0.004 0.012
#> SRR1365722 2 0.0865 0.895875 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444808 4 0.3488 0.745799 0.168 0.000 0.000 0.808 0.024
#> SRR1321829 2 0.0880 0.892537 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.3409 0.753674 0.000 0.112 0.836 0.052 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 3 0.3967 0.730886 0.000 0.088 0.808 0.004 0.100
#> SRR1349300 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 4 0.3534 0.795694 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1453769 2 0.3391 0.699102 0.000 0.800 0.188 0.000 0.012
#> SRR1473870 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 4 0.3967 0.308312 0.012 0.000 0.000 0.724 0.264
#> SRR1391811 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 4 0.3707 0.793947 0.284 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1086490 3 0.5050 0.723111 0.000 0.180 0.700 0.120 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3109 0.575665 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1384431 4 0.4510 0.621640 0.432 0.000 0.000 0.560 0.008
#> SRR1072055 4 0.3913 0.777001 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1359738 3 0.4221 0.740381 0.000 0.188 0.764 0.044 0.004
#> SRR1332141 1 0.4300 -0.428162 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1085900 3 0.4510 0.373568 0.000 0.432 0.560 0.008 0.000
#> SRR1442173 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1431625 2 0.3048 0.730690 0.000 0.820 0.176 0.004 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 3 0.4022 0.733218 0.000 0.092 0.804 0.004 0.100
#> SRR1344034 3 0.4522 0.380823 0.000 0.440 0.552 0.008 0.000
#> SRR1080391 4 0.4206 0.765670 0.272 0.000 0.000 0.708 0.020
#> SRR1347870 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.4371 0.325785 0.000 0.644 0.344 0.000 0.012
#> SRR814219 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 3 0.4069 0.722748 0.000 0.088 0.800 0.004 0.108
#> SRR1070060 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 3 0.3665 0.740494 0.000 0.200 0.784 0.008 0.008
#> SRR1417851 4 0.4299 0.715119 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1443350 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 4 0.4306 0.510589 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1076705 4 0.3774 0.790609 0.296 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR1079380 3 0.3616 0.711102 0.000 0.052 0.828 0.004 0.116
#> SRR1102923 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 3 0.4884 0.507473 0.000 0.392 0.584 0.008 0.016
#> SRR1366605 3 0.4555 0.333532 0.000 0.472 0.520 0.008 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0992 0.893181 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1436840 2 0.4009 0.491473 0.000 0.684 0.312 0.004 0.000
#> SRR1445573 2 0.0324 0.899389 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1375394 5 0.2171 0.873658 0.000 0.000 0.064 0.024 0.912
#> SRR1431735 4 0.4015 0.759336 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1417387 4 0.4030 0.755994 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1445984 4 0.3876 0.781871 0.316 0.000 0.000 0.684 0.000
#> SRR1370447 4 0.4520 0.720738 0.284 0.000 0.000 0.684 0.032
#> SRR1446308 3 0.4243 0.750687 0.000 0.168 0.772 0.056 0.004
#> SRR1437346 3 0.4172 0.741570 0.000 0.108 0.784 0.108 0.000
#> SRR1103143 2 0.1408 0.883989 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR1086466 4 0.4030 0.754766 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0162 0.862686 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468914 4 0.3940 0.764688 0.220 0.000 0.000 0.756 0.024
#> SRR1319584 3 0.3970 0.737431 0.000 0.104 0.800 0.000 0.096
#> SRR1486584 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.4437 0.571130 0.464 0.000 0.000 0.532 0.004
#> SRR1317939 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1341921 4 0.4287 0.582104 0.460 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1399178 2 0.0566 0.897789 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1415615 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 3 0.4504 0.408007 0.000 0.008 0.648 0.008 0.336
#> SRR1079543 2 0.0162 0.900124 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR816427 2 0.0798 0.895714 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1076681 3 0.4425 0.498696 0.000 0.392 0.600 0.008 0.000
#> SRR1335314 4 0.3661 0.268778 0.000 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1400799 3 0.3803 0.749925 0.000 0.140 0.804 0.056 0.000
#> SRR1074578 1 0.4074 -0.010301 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1312226 3 0.4111 0.699077 0.000 0.280 0.708 0.004 0.008
#> SRR1416207 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1447371 1 0.3561 0.412414 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1069328 4 0.3861 0.794554 0.284 0.000 0.000 0.712 0.004
#> SRR1445023 4 0.4747 0.505708 0.084 0.000 0.000 0.720 0.196
#> SRR1077599 2 0.1831 0.866401 0.000 0.920 0.076 0.004 0.000
#> SRR1453480 2 0.4580 -0.096733 0.000 0.532 0.460 0.004 0.004
#> SRR1101834 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 4 0.3550 0.792795 0.236 0.000 0.004 0.760 0.000
#> SRR1074839 2 0.4331 0.252664 0.000 0.596 0.400 0.004 0.000
#> SRR1458727 5 0.1981 0.875515 0.000 0.000 0.064 0.016 0.920
#> SRR1436949 3 0.3881 0.745672 0.000 0.180 0.788 0.008 0.024
#> SRR1070429 3 0.5010 0.708222 0.000 0.224 0.688 0.088 0.000
#> SRR1458158 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1432408 5 0.4291 0.423506 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1310334 1 0.0566 0.857195 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1418201 3 0.3829 0.728110 0.000 0.060 0.828 0.096 0.016
#> SRR1385434 4 0.3967 0.308312 0.012 0.000 0.000 0.724 0.264
#> SRR1415591 3 0.4602 0.705914 0.000 0.240 0.708 0.052 0.000
#> SRR1402009 1 0.0794 0.842396 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1316055 4 0.4305 0.459264 0.052 0.000 0.000 0.748 0.200
#> SRR1308734 3 0.3705 0.724059 0.000 0.064 0.816 0.120 0.000
#> SRR1498973 3 0.3990 0.662208 0.000 0.308 0.688 0.004 0.000
#> SRR1397115 1 0.4196 0.156599 0.640 0.000 0.004 0.356 0.000
#> SRR1392141 4 0.3561 0.795881 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR814341 2 0.3086 0.727161 0.000 0.816 0.180 0.004 0.000
#> SRR1313601 2 0.4383 0.000209 0.000 0.572 0.424 0.004 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.4273 0.592773 0.000 0.004 0.784 0.116 0.096
#> SRR809919 4 0.3857 0.786983 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1370818 4 0.4215 0.723183 0.168 0.000 0.000 0.768 0.064
#> SRR1323651 2 0.1638 0.873916 0.000 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.4268 0.170625 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1091230 2 0.2629 0.808669 0.000 0.860 0.136 0.004 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.3682 0.751636 0.000 0.096 0.832 0.008 0.064
#> SRR1317731 3 0.2930 0.753018 0.000 0.164 0.832 0.000 0.004
#> SRR1490785 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.3039 0.559749 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 3 0.5974 0.619451 0.000 0.168 0.604 0.004 0.224
#> SRR1397312 2 0.4390 0.054603 0.000 0.568 0.428 0.004 0.000
#> SRR812128 3 0.3750 0.749894 0.000 0.116 0.820 0.004 0.060
#> SRR1101513 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.2358 0.840956 0.000 0.888 0.104 0.008 0.000
#> SRR1316033 3 0.3862 0.723140 0.000 0.064 0.812 0.120 0.004
#> SRR1390371 2 0.3521 0.664522 0.000 0.764 0.232 0.004 0.000
#> SRR1480263 2 0.0324 0.899825 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1464473 3 0.3964 0.715650 0.000 0.056 0.812 0.120 0.012
#> SRR1076801 4 0.3534 0.795694 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1080044 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.4306 -0.473829 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1069871 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1095744 3 0.4022 0.733218 0.000 0.092 0.804 0.004 0.100
#> SRR1068929 2 0.0162 0.900124 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.2389 0.825628 0.000 0.880 0.116 0.004 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 4 0.3932 0.774135 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1417023 4 0.3730 0.238706 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1309333 2 0.1168 0.889574 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1333676 1 0.0963 0.833817 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 4 0.3242 0.757815 0.172 0.000 0.000 0.816 0.012
#> SRR1413137 4 0.4384 0.721582 0.324 0.000 0.000 0.660 0.016
#> SRR1469973 3 0.4436 0.490624 0.000 0.396 0.596 0.008 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817306 4 0.4268 0.615672 0.444 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1416266 4 0.4780 0.707210 0.248 0.000 0.000 0.692 0.060
#> SRR1071011 2 0.0162 0.899625 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1090290 4 0.3574 0.744299 0.168 0.000 0.000 0.804 0.028
#> SRR1435394 2 0.0404 0.899182 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.3860 0.685962 0.000 0.032 0.820 0.124 0.024
#> SRR1094357 1 0.4306 -0.473829 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1081639 3 0.4049 0.528897 0.000 0.000 0.780 0.056 0.164
#> SRR1356016 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.4516 0.251614 0.000 0.004 0.576 0.004 0.416
#> SRR1312147 4 0.3684 0.794733 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.4276 0.684578 0.380 0.000 0.000 0.616 0.004
#> SRR1474930 3 0.4135 0.588817 0.000 0.340 0.656 0.004 0.000
#> SRR1470988 4 0.4565 0.709800 0.308 0.000 0.000 0.664 0.028
#> SRR811915 2 0.0324 0.899697 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0404 0.899045 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.3635 0.739898 0.000 0.068 0.836 0.008 0.088
#> SRR1315780 3 0.6016 0.596932 0.000 0.184 0.580 0.000 0.236
#> SRR1073631 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR819124 4 0.4302 0.534343 0.480 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1310997 3 0.4075 0.735237 0.000 0.096 0.800 0.004 0.100
#> SRR1464494 3 0.4069 0.740126 0.000 0.108 0.800 0.004 0.088
#> SRR1357083 3 0.5222 0.714610 0.000 0.196 0.680 0.124 0.000
#> SRR1475842 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.4300 -0.438689 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1378220 3 0.4201 0.608835 0.000 0.328 0.664 0.008 0.000
#> SRR1467704 4 0.3999 0.762036 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1348885 5 0.1981 0.875515 0.000 0.000 0.064 0.016 0.920
#> SRR1325826 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1466812 4 0.4624 0.698928 0.340 0.000 0.000 0.636 0.024
#> SRR1345692 2 0.1082 0.893462 0.000 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR1401040 3 0.3803 0.704032 0.000 0.044 0.820 0.124 0.012
#> SRR1097954 1 0.2690 0.660940 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1374396 4 0.4307 -0.407668 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1454073 3 0.5790 0.598801 0.000 0.120 0.608 0.004 0.268
#> SRR1355747 4 0.3689 0.793671 0.256 0.000 0.004 0.740 0.000
#> SRR1429368 3 0.3946 0.732290 0.000 0.080 0.800 0.120 0.000
#> SRR1398138 2 0.1168 0.889644 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1379260 4 0.3913 0.776854 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1361436 3 0.3992 0.728857 0.000 0.080 0.796 0.124 0.000
#> SRR817142 2 0.3196 0.744198 0.000 0.804 0.192 0.004 0.000
#> SRR1315291 5 0.1830 0.841703 0.000 0.000 0.008 0.068 0.924
#> SRR1309314 5 0.1877 0.873588 0.000 0.000 0.064 0.012 0.924
#> SRR1420085 3 0.4517 0.406489 0.000 0.436 0.556 0.008 0.000
#> SRR1361308 3 0.3967 0.719416 0.000 0.060 0.808 0.124 0.008
#> SRR1472126 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 3 0.3252 0.751257 0.000 0.156 0.828 0.008 0.008
#> SRR1099789 1 0.0324 0.861144 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1079480 3 0.4022 0.733218 0.000 0.092 0.804 0.004 0.100
#> SRR1339276 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 4 0.3816 0.787472 0.304 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR1096760 3 0.3990 0.639339 0.000 0.308 0.688 0.004 0.000
#> SRR1440290 2 0.2011 0.857144 0.000 0.908 0.088 0.004 0.000
#> SRR1330813 2 0.0404 0.899045 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.2338 0.826133 0.000 0.884 0.112 0.004 0.000
#> SRR812294 4 0.4199 0.709954 0.160 0.000 0.000 0.772 0.068
#> SRR1394321 1 0.4306 -0.473829 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1477173 2 0.0798 0.896692 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390143 4 0.4307 0.495971 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.4305 0.730757 0.000 0.088 0.780 0.128 0.004
#> SRR1312169 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 4 0.4210 0.660574 0.412 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1486139 1 0.3534 0.430757 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1470313 4 0.3991 0.736490 0.172 0.000 0.000 0.780 0.048
#> SRR1447893 3 0.5309 0.532322 0.000 0.364 0.576 0.060 0.000
#> SRR1466025 3 0.3757 0.600019 0.000 0.020 0.772 0.000 0.208
#> SRR1477429 4 0.4297 0.551846 0.472 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR1445701 3 0.4415 0.505673 0.000 0.388 0.604 0.008 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.2193 0.855183 0.000 0.900 0.092 0.008 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4307 -0.497211 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1489328 3 0.3861 0.694537 0.000 0.264 0.728 0.008 0.000
#> SRR1344462 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1082709 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1447784 4 0.4449 0.707316 0.168 0.000 0.000 0.752 0.080
#> SRR1355769 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0451 0.859363 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1480917 3 0.4610 0.719728 0.000 0.128 0.756 0.004 0.112
#> SRR1474485 4 0.3991 0.737308 0.172 0.000 0.000 0.780 0.048
#> SRR1089998 1 0.0510 0.853006 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1318140 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1319262 2 0.4481 0.161332 0.000 0.576 0.416 0.008 0.000
#> SRR1095188 3 0.4252 0.591951 0.000 0.340 0.652 0.008 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 3 0.5072 0.720696 0.000 0.188 0.696 0.116 0.000
#> SRR1105417 4 0.4341 0.684286 0.404 0.000 0.000 0.592 0.004
#> SRR1325578 3 0.3741 0.696529 0.000 0.264 0.732 0.004 0.000
#> SRR1358161 3 0.3579 0.691906 0.000 0.032 0.836 0.116 0.016
#> SRR1358665 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 3 0.4592 0.728649 0.000 0.140 0.756 0.004 0.100
#> SRR1452010 1 0.1341 0.809338 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1418183 3 0.4392 0.526200 0.000 0.380 0.612 0.008 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.4302 -0.439739 0.520 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1090837 3 0.5263 0.692473 0.000 0.240 0.660 0.100 0.000
#> SRR1447828 3 0.3644 0.676233 0.000 0.024 0.832 0.120 0.024
#> SRR1338747 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333038 3 0.3531 0.753632 0.000 0.148 0.816 0.036 0.000
#> SRR1350280 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.2890 0.756275 0.000 0.836 0.160 0.004 0.000
#> SRR1441443 2 0.1331 0.886609 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1370682 3 0.5136 0.452662 0.000 0.000 0.688 0.116 0.196
#> SRR1475448 3 0.3980 0.727546 0.000 0.076 0.796 0.128 0.000
#> SRR1407291 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 3 0.3517 0.734763 0.000 0.068 0.832 0.000 0.100
#> SRR1325794 3 0.3607 0.724127 0.000 0.244 0.752 0.004 0.000
#> SRR1095961 3 0.4127 0.633918 0.000 0.312 0.680 0.008 0.000
#> SRR1086702 2 0.1043 0.888312 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1320806 3 0.4262 0.669651 0.000 0.288 0.696 0.012 0.004
#> SRR1457527 3 0.3924 0.619493 0.000 0.004 0.808 0.120 0.068
#> SRR1098831 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.4636 0.734701 0.000 0.132 0.744 0.124 0.000
#> SRR1488858 4 0.3790 0.282010 0.004 0.000 0.000 0.724 0.272
#> SRR1454695 4 0.3579 0.793321 0.240 0.000 0.000 0.756 0.004
#> SRR1090241 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.4430 -0.055974 0.000 0.540 0.456 0.004 0.000
#> SRR1357733 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1362135 4 0.4088 0.738523 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR1379581 3 0.5339 0.408456 0.000 0.000 0.660 0.116 0.224
#> SRR1309182 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 4 0.3752 0.792063 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR1084742 3 0.3911 0.735958 0.000 0.084 0.812 0.004 0.100
#> SRR1433538 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.1331 0.886436 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1454247 3 0.4022 0.733218 0.000 0.092 0.804 0.004 0.100
#> SRR1097100 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.2358 0.841486 0.000 0.888 0.104 0.008 0.000
#> SRR1072388 4 0.3661 0.795373 0.276 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1070332 3 0.4122 0.745660 0.000 0.132 0.796 0.008 0.064
#> SRR1320761 3 0.3421 0.743613 0.000 0.080 0.840 0.000 0.080
#> SRR1076195 4 0.4101 -0.026374 0.000 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1069895 3 0.4446 0.477805 0.000 0.400 0.592 0.008 0.000
#> SRR1099144 4 0.3561 0.795881 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1385150 3 0.3830 0.665670 0.000 0.020 0.824 0.116 0.040
#> SRR1420191 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.4444 0.687393 0.156 0.000 0.000 0.756 0.088
#> SRR1102583 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 4 0.3837 0.785567 0.308 0.000 0.000 0.692 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.2179 0.846369 0.000 0.896 0.100 0.004 0.000
#> SRR1096267 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1087127 3 0.3365 0.713985 0.000 0.044 0.836 0.000 0.120
#> SRR1408553 4 0.4465 0.720065 0.304 0.000 0.000 0.672 0.024
#> SRR1069231 4 0.4182 0.698151 0.400 0.000 0.000 0.600 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 4 0.4101 0.733737 0.372 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1321942 1 0.0451 0.859334 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1094380 4 0.4307 0.496846 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000
#> SRR1447499 2 0.3756 0.638352 0.000 0.744 0.248 0.008 0.000
#> SRR1099330 2 0.3421 0.708456 0.000 0.788 0.204 0.008 0.000
#> SRR1077874 3 0.4354 0.567427 0.000 0.368 0.624 0.008 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 3 0.3854 0.725526 0.000 0.080 0.816 0.004 0.100
#> SRR1481238 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.4562 -0.205962 0.000 0.496 0.496 0.008 0.000
#> SRR1380249 4 0.4096 0.703235 0.144 0.000 0.000 0.784 0.072
#> SRR1080143 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.4840 0.647152 0.152 0.000 0.000 0.724 0.124
#> SRR1357042 1 0.1831 0.799484 0.920 0.000 0.004 0.076 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.1331 0.886492 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1078709 3 0.4403 0.527031 0.000 0.384 0.608 0.008 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.4305 -0.462341 0.512 0.000 0.000 0.488 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 5 0.1981 0.875515 0.000 0.000 0.064 0.016 0.920
#> SRR807679 4 0.3814 0.789559 0.276 0.000 0.004 0.720 0.000
#> SRR1333811 2 0.4251 0.500228 0.000 0.672 0.316 0.012 0.000
#> SRR1078660 3 0.3559 0.748063 0.000 0.176 0.804 0.008 0.012
#> SRR1331730 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 4 0.3607 0.793718 0.244 0.000 0.004 0.752 0.000
#> SRR1432542 4 0.3586 0.795919 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1418041 1 0.0510 0.853006 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1085211 4 0.4350 0.659635 0.408 0.000 0.000 0.588 0.004
#> SRR1339812 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 4 0.4015 0.759120 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.2674 0.803782 0.000 0.856 0.140 0.004 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.3779 0.717409 0.000 0.056 0.816 0.124 0.004
#> SRR1488881 3 0.3909 0.722164 0.000 0.064 0.808 0.124 0.004
#> SRR1102973 1 0.4235 -0.255348 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1071131 3 0.4270 0.625142 0.000 0.320 0.668 0.012 0.000
#> SRR1074502 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1325271 4 0.3508 0.796016 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1409171 2 0.0290 0.899699 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0671 0.897341 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1430045 2 0.1894 0.866590 0.000 0.920 0.072 0.008 0.000
#> SRR1441245 2 0.4341 0.378856 0.000 0.628 0.364 0.008 0.000
#> SRR1384091 4 0.3438 0.751245 0.172 0.000 0.000 0.808 0.020
#> SRR1431887 2 0.2848 0.754867 0.000 0.840 0.156 0.004 0.000
#> SRR1096525 4 0.4730 0.712723 0.260 0.000 0.000 0.688 0.052
#> SRR1488491 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 3 0.4326 0.739201 0.000 0.140 0.776 0.004 0.080
#> SRR1369514 4 0.3550 0.792123 0.236 0.000 0.000 0.760 0.004
#> SRR1453299 3 0.4686 0.736154 0.000 0.160 0.736 0.104 0.000
#> SRR1436300 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1348490 3 0.3911 0.728227 0.000 0.084 0.812 0.004 0.100
#> SRR1091767 2 0.4046 0.532765 0.000 0.696 0.296 0.008 0.000
#> SRR1354467 3 0.4636 0.734701 0.000 0.132 0.744 0.124 0.000
#> SRR1069074 2 0.2017 0.861297 0.000 0.912 0.080 0.008 0.000
#> SRR1452399 3 0.3210 0.641487 0.000 0.008 0.832 0.008 0.152
#> SRR1437430 3 0.3750 0.628525 0.000 0.004 0.820 0.116 0.060
#> SRR1419736 3 0.3183 0.632013 0.000 0.016 0.828 0.000 0.156
#> SRR1313343 3 0.3900 0.732206 0.000 0.068 0.816 0.108 0.008
#> SRR1077619 4 0.3848 0.741775 0.172 0.000 0.000 0.788 0.040
#> SRR1083530 4 0.3662 0.794508 0.252 0.000 0.004 0.744 0.000
#> SRR1333633 2 0.2193 0.853089 0.000 0.900 0.092 0.008 0.000
#> SRR1354999 2 0.1768 0.868414 0.000 0.924 0.072 0.004 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.4227 0.225551 0.000 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1413182 4 0.4693 0.498752 0.080 0.000 0.000 0.724 0.196
#> SRR1464559 4 0.3921 0.738855 0.172 0.000 0.000 0.784 0.044
#> SRR1413075 3 0.4327 0.728560 0.000 0.112 0.780 0.004 0.104
#> SRR1487928 5 0.4306 0.372043 0.000 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1388997 2 0.1764 0.872253 0.000 0.928 0.064 0.008 0.000
#> SRR1092865 2 0.2612 0.823052 0.000 0.868 0.124 0.008 0.000
#> SRR1102729 4 0.4473 0.651758 0.412 0.000 0.000 0.580 0.008
#> SRR1456423 1 0.0771 0.852568 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1321591 2 0.0324 0.899389 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1376874 3 0.4866 0.530381 0.000 0.004 0.732 0.116 0.148
#> SRR1339903 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 4 0.3999 0.762036 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.3642 0.669213 0.000 0.760 0.232 0.008 0.000
#> SRR1480941 5 0.1981 0.875515 0.000 0.000 0.064 0.016 0.920
#> SRR1479175 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.2848 0.754781 0.000 0.840 0.156 0.004 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.3132 0.765646 0.000 0.820 0.172 0.008 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0404 0.898678 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.3333 0.708672 0.000 0.788 0.208 0.004 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0451 0.859334 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1322918 2 0.3550 0.655767 0.000 0.760 0.236 0.004 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.900830 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 3 0.5025 0.725251 0.000 0.172 0.704 0.124 0.000
#> SRR1474231 4 0.4235 0.674430 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1350545 1 0.4268 -0.332642 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1091328 4 0.3932 0.774135 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR814447 3 0.5865 0.167060 0.000 0.000 0.552 0.116 0.332
#> SRR1455989 3 0.4528 0.343507 0.000 0.444 0.548 0.008 0.000
#> SRR1453680 3 0.3664 0.627793 0.000 0.004 0.824 0.120 0.052
#> SRR1470356 2 0.0566 0.898306 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1342977 2 0.0290 0.899242 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.3906 0.735801 0.000 0.800 0.068 0.000 0.132
#> SRR1097197 1 0.0880 0.841480 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1366729 3 0.3872 0.721784 0.000 0.060 0.816 0.116 0.008
#> SRR821282 3 0.5927 0.166539 0.000 0.000 0.540 0.120 0.340
#> SRR1074602 2 0.1697 0.875178 0.000 0.932 0.060 0.008 0.000
#> SRR814633 2 0.0162 0.900314 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4562 0.028017 0.000 0.000 0.496 0.008 0.496
#> SRR1319100 1 0.0865 0.852530 0.972 0.000 0.004 0.024 0.000
#> SRR1324004 2 0.4025 0.550390 0.000 0.700 0.292 0.008 0.000
#> SRR1457459 1 0.0162 0.862694 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1421031 4 0.3928 0.792177 0.296 0.000 0.000 0.700 0.004
#> SRR1444598 5 0.1764 0.870861 0.000 0.000 0.064 0.008 0.928
#> SRR1091743 2 0.1571 0.876415 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR819637 1 0.4403 -0.315413 0.560 0.000 0.004 0.436 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.4390 0.142711 0.000 0.568 0.428 0.004 0.000
#> SRR1459785 3 0.4457 0.741007 0.000 0.152 0.756 0.092 0.000
#> SRR1083700 4 0.4278 0.604155 0.452 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1375531 4 0.4300 0.543258 0.476 0.000 0.000 0.524 0.000
#> SRR1323470 5 0.1981 0.875515 0.000 0.000 0.064 0.016 0.920
#> SRR814657 1 0.0000 0.864124 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0291 0.82024 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402132 6 0.5005 0.49946 0.000 0.000 0.164 0.192 0.000 0.644
#> SRR1326059 1 0.0692 0.92618 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1409062 2 0.1644 0.79360 0.000 0.920 0.004 0.000 0.076 0.000
#> SRR809406 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1465313 5 0.3062 0.18927 0.000 0.024 0.160 0.000 0.816 0.000
#> SRR819559 4 0.5242 0.52494 0.384 0.000 0.000 0.516 0.000 0.100
#> SRR1387899 2 0.3659 0.49965 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1442292 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0436 0.92337 0.988 0.000 0.004 0.004 0.000 0.004
#> SRR1395635 4 0.3165 0.69944 0.116 0.000 0.008 0.836 0.000 0.040
#> SRR1343629 1 0.0520 0.91954 0.984 0.000 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1326868 5 0.4463 0.05198 0.000 0.456 0.028 0.000 0.516 0.000
#> SRR1102320 4 0.4424 0.61239 0.324 0.000 0.000 0.632 0.000 0.044
#> SRR1469926 3 0.4083 0.52131 0.000 0.000 0.532 0.000 0.460 0.008
#> SRR1070036 4 0.2595 0.70984 0.160 0.000 0.000 0.836 0.000 0.004
#> SRR1098426 4 0.2562 0.70718 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1090310 5 0.5378 0.15879 0.000 0.132 0.324 0.000 0.544 0.000
#> SRR1429748 1 0.0692 0.92618 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1363654 1 0.0713 0.92355 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.3620 0.51380 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1378308 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366919 4 0.3695 0.30045 0.000 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1329947 1 0.1194 0.90511 0.956 0.000 0.008 0.004 0.000 0.032
#> SRR1469769 5 0.4603 -0.21342 0.000 0.040 0.416 0.000 0.544 0.000
#> SRR1490761 2 0.1141 0.80777 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1380122 5 0.3314 0.02472 0.000 0.000 0.256 0.000 0.740 0.004
#> SRR1402944 5 0.3349 0.04951 0.000 0.008 0.244 0.000 0.748 0.000
#> SRR1092818 4 0.2300 0.71537 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR1093552 4 0.2003 0.72121 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1464880 5 0.4669 0.27596 0.000 0.164 0.148 0.000 0.688 0.000
#> SRR1078368 2 0.0291 0.81971 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349608 2 0.3528 0.60356 0.000 0.700 0.004 0.000 0.296 0.000
#> SRR1466951 2 0.2883 0.69531 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1331879 5 0.5149 0.32802 0.000 0.184 0.192 0.000 0.624 0.000
#> SRR1320034 3 0.3071 0.67360 0.000 0.000 0.804 0.000 0.180 0.016
#> SRR1068687 2 0.4072 0.23039 0.000 0.544 0.008 0.000 0.448 0.000
#> SRR1437491 1 0.0748 0.92696 0.976 0.000 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1310777 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.3078 0.82648 0.844 0.000 0.012 0.112 0.000 0.032
#> SRR1329994 4 0.2263 0.71545 0.056 0.000 0.000 0.896 0.000 0.048
#> SRR1354203 1 0.0603 0.92694 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.3738 0.43385 0.680 0.000 0.004 0.312 0.000 0.004
#> SRR1369241 2 0.0260 0.82026 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1077992 5 0.5300 0.34244 0.000 0.212 0.188 0.000 0.600 0.000
#> SRR1455214 1 0.1204 0.90494 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1092014 5 0.3974 0.47768 0.000 0.296 0.024 0.000 0.680 0.000
#> SRR1097857 1 0.3309 0.54581 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.1268 0.90364 0.952 0.000 0.008 0.004 0.000 0.036
#> SRR1345974 3 0.4199 0.55329 0.000 0.016 0.568 0.000 0.416 0.000
#> SRR1338687 2 0.2378 0.74415 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1071207 4 0.3017 0.71609 0.072 0.000 0.000 0.844 0.000 0.084
#> SRR1486821 3 0.4219 0.59948 0.000 0.020 0.592 0.000 0.388 0.000
#> SRR1418540 4 0.3482 0.62218 0.316 0.000 0.000 0.684 0.000 0.000
#> SRR1408788 5 0.4203 0.44684 0.000 0.316 0.032 0.000 0.652 0.000
#> SRR1359487 4 0.3847 0.04921 0.000 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1080648 4 0.2492 0.69869 0.068 0.000 0.008 0.888 0.000 0.036
#> SRR1414708 4 0.2051 0.67991 0.036 0.000 0.008 0.916 0.000 0.040
#> SRR1469080 5 0.5265 0.34143 0.000 0.220 0.176 0.000 0.604 0.000
#> SRR1365722 2 0.3337 0.64316 0.000 0.736 0.004 0.000 0.260 0.000
#> SRR1448118 2 0.0603 0.81873 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR1444808 4 0.3175 0.51744 0.000 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1321829 2 0.2300 0.75625 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1475993 5 0.4675 0.26863 0.000 0.104 0.224 0.000 0.672 0.000
#> SRR1445387 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1077575 5 0.3376 0.12652 0.000 0.016 0.220 0.000 0.764 0.000
#> SRR1349300 1 0.0458 0.92694 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1374165 4 0.1492 0.69504 0.036 0.000 0.000 0.940 0.000 0.024
#> SRR1453769 2 0.3557 0.63760 0.000 0.800 0.044 0.000 0.148 0.008
#> SRR1473870 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366124 6 0.3854 0.20879 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1391811 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1456674 4 0.1471 0.71676 0.064 0.000 0.000 0.932 0.000 0.004
#> SRR1086490 5 0.5140 -0.03335 0.000 0.088 0.392 0.000 0.520 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.3874 0.30583 0.636 0.000 0.000 0.356 0.000 0.008
#> SRR1384431 4 0.5327 0.61250 0.248 0.000 0.000 0.588 0.000 0.164
#> SRR1072055 4 0.1556 0.72003 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1359738 5 0.4693 0.35772 0.000 0.140 0.176 0.000 0.684 0.000
#> SRR1332141 4 0.3789 0.48318 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1085900 5 0.4234 0.48514 0.000 0.280 0.044 0.000 0.676 0.000
#> SRR1442173 1 0.0405 0.92593 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.3023 0.63472 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 5 0.3376 0.12652 0.000 0.016 0.220 0.000 0.764 0.000
#> SRR1344034 5 0.4076 0.35745 0.000 0.364 0.016 0.000 0.620 0.000
#> SRR1080391 4 0.4254 0.60785 0.072 0.000 0.000 0.712 0.000 0.216
#> SRR1347870 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.4885 0.12610 0.000 0.560 0.068 0.000 0.372 0.000
#> SRR814219 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0767 0.92226 0.976 0.000 0.004 0.008 0.000 0.012
#> SRR1102128 1 0.0891 0.92328 0.968 0.000 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR1460211 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418346 5 0.3691 0.13136 0.000 0.020 0.204 0.000 0.764 0.012
#> SRR1070060 1 0.0806 0.92486 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1487969 5 0.4393 0.39663 0.000 0.172 0.112 0.000 0.716 0.000
#> SRR1417851 4 0.3516 0.72047 0.164 0.000 0.000 0.788 0.000 0.048
#> SRR1443350 2 0.0146 0.82053 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403199 4 0.3198 0.66354 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1076705 4 0.1267 0.71582 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1079380 5 0.3245 0.11151 0.000 0.008 0.228 0.000 0.764 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 5 0.3934 0.44422 0.000 0.304 0.020 0.000 0.676 0.000
#> SRR1366605 5 0.4338 -0.08231 0.000 0.484 0.020 0.000 0.496 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.3244 0.63455 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1436840 2 0.4319 0.30781 0.000 0.620 0.032 0.000 0.348 0.000
#> SRR1445573 2 0.0858 0.81113 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028 0.000
#> SRR1375394 6 0.5025 0.46674 0.000 0.000 0.284 0.000 0.108 0.608
#> SRR1431735 4 0.2003 0.72046 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1417387 4 0.2219 0.71790 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR1445984 4 0.1444 0.71897 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1370447 4 0.4597 0.51802 0.072 0.000 0.000 0.652 0.000 0.276
#> SRR1446308 5 0.4548 0.22634 0.000 0.080 0.248 0.000 0.672 0.000
#> SRR1437346 5 0.4747 -0.06637 0.000 0.056 0.376 0.000 0.568 0.000
#> SRR1103143 2 0.3409 0.59238 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1086466 4 0.3235 0.70014 0.136 0.000 0.008 0.824 0.000 0.032
#> SRR1073191 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.1528 0.91543 0.944 0.000 0.012 0.016 0.000 0.028
#> SRR1468914 4 0.3743 0.53470 0.024 0.000 0.000 0.724 0.000 0.252
#> SRR1319584 5 0.3511 0.13750 0.000 0.024 0.216 0.000 0.760 0.000
#> SRR1486584 1 0.0458 0.92694 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR813536 4 0.5373 0.63227 0.216 0.000 0.000 0.588 0.000 0.196
#> SRR1317939 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.1194 0.90511 0.956 0.000 0.008 0.004 0.000 0.032
#> SRR1341921 4 0.3450 0.70853 0.188 0.000 0.000 0.780 0.000 0.032
#> SRR1399178 2 0.1594 0.79087 0.000 0.932 0.016 0.000 0.052 0.000
#> SRR1415615 1 0.0291 0.92216 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328551 2 0.0146 0.82076 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453259 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340828 5 0.5121 -0.10618 0.000 0.000 0.332 0.000 0.568 0.100
#> SRR1079543 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.2969 0.68040 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1076681 5 0.4251 0.38224 0.000 0.348 0.028 0.000 0.624 0.000
#> SRR1335314 6 0.3843 0.23487 0.000 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1400799 5 0.4414 0.28569 0.000 0.092 0.204 0.000 0.704 0.000
#> SRR1074578 1 0.4841 -0.19469 0.508 0.000 0.000 0.436 0.000 0.056
#> SRR1312226 5 0.5208 0.36057 0.000 0.248 0.148 0.000 0.604 0.000
#> SRR1416207 1 0.1370 0.90076 0.948 0.000 0.012 0.004 0.000 0.036
#> SRR1447371 1 0.3782 0.09212 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1069328 4 0.3125 0.71959 0.080 0.000 0.000 0.836 0.000 0.084
#> SRR1445023 4 0.3857 -0.02641 0.000 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1077599 2 0.3592 0.53207 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344 0.000
#> SRR1453480 5 0.5693 0.34112 0.000 0.392 0.160 0.000 0.448 0.000
#> SRR1101834 2 0.0146 0.82053 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321744 4 0.2251 0.67447 0.036 0.000 0.008 0.904 0.000 0.052
#> SRR1074839 5 0.4084 0.25575 0.000 0.400 0.012 0.000 0.588 0.000
#> SRR1458727 6 0.5197 0.45527 0.000 0.000 0.320 0.000 0.112 0.568
#> SRR1436949 5 0.3862 0.38127 0.000 0.132 0.096 0.000 0.772 0.000
#> SRR1070429 5 0.5334 0.11275 0.000 0.120 0.344 0.000 0.536 0.000
#> SRR1458158 1 0.0405 0.92569 0.988 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1432408 6 0.3215 0.49704 0.000 0.000 0.004 0.240 0.000 0.756
#> SRR1310334 1 0.0964 0.91714 0.968 0.000 0.012 0.004 0.000 0.016
#> SRR1418201 3 0.3872 0.62640 0.000 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR1385434 6 0.3857 0.19996 0.000 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1415591 5 0.5088 0.34545 0.000 0.168 0.200 0.000 0.632 0.000
#> SRR1402009 1 0.1075 0.91019 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1316055 4 0.3756 0.23795 0.000 0.000 0.004 0.644 0.000 0.352
#> SRR1308734 3 0.4379 0.56117 0.000 0.028 0.576 0.000 0.396 0.000
#> SRR1498973 5 0.4494 0.40928 0.000 0.216 0.092 0.000 0.692 0.000
#> SRR1397115 1 0.4731 0.00949 0.532 0.000 0.008 0.428 0.000 0.032
#> SRR1392141 4 0.1367 0.70517 0.044 0.000 0.000 0.944 0.000 0.012
#> SRR814341 2 0.3290 0.62364 0.000 0.776 0.016 0.000 0.208 0.000
#> SRR1313601 2 0.5164 0.16885 0.000 0.584 0.116 0.000 0.300 0.000
#> SRR1459609 2 0.0363 0.81983 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1499325 3 0.3231 0.68434 0.000 0.000 0.784 0.000 0.200 0.016
#> SRR809919 4 0.2771 0.73123 0.116 0.000 0.000 0.852 0.000 0.032
#> SRR1370818 4 0.3515 0.39452 0.000 0.000 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1323651 2 0.3547 0.54758 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1357297 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.5631 0.28941 0.000 0.000 0.528 0.000 0.284 0.188
#> SRR1091230 2 0.3737 0.42819 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0603 0.92694 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000 0.000
#> SRR1095285 5 0.3978 0.05801 0.000 0.032 0.268 0.000 0.700 0.000
#> SRR1317731 5 0.5258 0.29162 0.000 0.152 0.252 0.000 0.596 0.000
#> SRR1490785 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.3219 0.71032 0.792 0.000 0.004 0.192 0.000 0.012
#> SRR1447808 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR809534 5 0.6869 0.21181 0.000 0.168 0.276 0.000 0.464 0.092
#> SRR1397312 5 0.4576 0.27123 0.000 0.400 0.040 0.000 0.560 0.000
#> SRR812128 5 0.4091 0.22620 0.000 0.068 0.200 0.000 0.732 0.000
#> SRR1101513 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.3706 0.46090 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1316033 5 0.4534 -0.32341 0.000 0.032 0.472 0.000 0.496 0.000
#> SRR1390371 2 0.3982 0.20132 0.000 0.536 0.004 0.000 0.460 0.000
#> SRR1480263 2 0.1471 0.80151 0.000 0.932 0.004 0.000 0.064 0.000
#> SRR1464473 3 0.3883 0.67348 0.000 0.012 0.656 0.000 0.332 0.000
#> SRR1076801 4 0.1074 0.69382 0.028 0.000 0.000 0.960 0.000 0.012
#> SRR1080044 1 0.1167 0.91233 0.960 0.000 0.012 0.008 0.000 0.020
#> SRR1420850 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474295 4 0.4131 0.65640 0.272 0.000 0.000 0.688 0.000 0.040
#> SRR1069871 1 0.1483 0.90170 0.944 0.000 0.012 0.008 0.000 0.036
#> SRR1095744 5 0.3376 0.12652 0.000 0.016 0.220 0.000 0.764 0.000
#> SRR1068929 2 0.0405 0.81901 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1490097 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.3653 0.56120 0.000 0.692 0.008 0.000 0.300 0.000
#> SRR1083480 1 0.0692 0.92702 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000 0.000
#> SRR1075458 4 0.1556 0.72003 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1417023 6 0.3847 0.22929 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1309333 2 0.3528 0.59334 0.000 0.700 0.004 0.000 0.296 0.000
#> SRR1333676 1 0.1049 0.91847 0.960 0.000 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1352996 1 0.1592 0.91302 0.940 0.000 0.008 0.020 0.000 0.032
#> SRR1093172 4 0.3151 0.52248 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1413137 4 0.4796 0.58847 0.116 0.000 0.000 0.660 0.000 0.224
#> SRR1469973 5 0.3799 0.48711 0.000 0.276 0.020 0.000 0.704 0.000
#> SRR1420026 2 0.0146 0.82027 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR817306 4 0.4242 0.70354 0.128 0.000 0.000 0.736 0.000 0.136
#> SRR1416266 4 0.4863 0.50209 0.092 0.000 0.000 0.624 0.000 0.284
#> SRR1071011 2 0.0603 0.81873 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR1090290 4 0.3076 0.53433 0.000 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1435394 2 0.1141 0.80571 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1383192 1 0.0891 0.92328 0.968 0.000 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR1419962 3 0.3619 0.69377 0.000 0.004 0.680 0.000 0.316 0.000
#> SRR1094357 4 0.3774 0.61277 0.328 0.000 0.000 0.664 0.000 0.008
#> SRR1081639 3 0.4452 0.59191 0.000 0.000 0.636 0.000 0.316 0.048
#> SRR1356016 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397348 3 0.6074 0.11813 0.000 0.000 0.388 0.000 0.340 0.272
#> SRR1312147 4 0.1204 0.71392 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.5195 0.62598 0.176 0.000 0.000 0.616 0.000 0.208
#> SRR1474930 5 0.3564 0.48308 0.000 0.264 0.012 0.000 0.724 0.000
#> SRR1470988 4 0.4947 0.55190 0.120 0.000 0.000 0.636 0.000 0.244
#> SRR811915 2 0.0865 0.81362 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1104987 1 0.0458 0.92694 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.2092 0.76357 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1313770 5 0.3330 -0.02415 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1315780 5 0.6923 0.17118 0.000 0.172 0.288 0.000 0.448 0.092
#> SRR1073631 1 0.1218 0.90523 0.956 0.000 0.012 0.004 0.000 0.028
#> SRR819124 4 0.5262 0.58972 0.308 0.000 0.000 0.568 0.000 0.124
#> SRR1310997 5 0.3320 0.13396 0.000 0.016 0.212 0.000 0.772 0.000
#> SRR1464494 5 0.3520 0.17370 0.000 0.036 0.188 0.000 0.776 0.000
#> SRR1357083 5 0.5201 -0.05021 0.000 0.092 0.408 0.000 0.500 0.000
#> SRR1475842 2 0.0603 0.81873 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR1378085 4 0.3592 0.58667 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1378220 5 0.3575 0.48451 0.000 0.284 0.008 0.000 0.708 0.000
#> SRR1467704 4 0.2631 0.71178 0.152 0.000 0.000 0.840 0.000 0.008
#> SRR1348885 6 0.5156 0.45874 0.000 0.000 0.308 0.000 0.112 0.580
#> SRR1325826 1 0.1483 0.90170 0.944 0.000 0.012 0.008 0.000 0.036
#> SRR1466812 4 0.5023 0.58451 0.144 0.000 0.000 0.636 0.000 0.220
#> SRR1345692 2 0.3330 0.61480 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1401040 3 0.3741 0.68835 0.000 0.008 0.672 0.000 0.320 0.000
#> SRR1097954 1 0.3221 0.57416 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1374396 6 0.3634 0.38222 0.000 0.000 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1454073 5 0.5980 0.06298 0.000 0.060 0.288 0.000 0.560 0.092
#> SRR1355747 4 0.2390 0.69042 0.052 0.000 0.008 0.896 0.000 0.044
#> SRR1429368 5 0.4787 -0.17322 0.000 0.052 0.432 0.000 0.516 0.000
#> SRR1398138 2 0.3330 0.61560 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1379260 4 0.1387 0.71792 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1361436 5 0.4648 -0.28177 0.000 0.040 0.464 0.000 0.496 0.000
#> SRR817142 2 0.3851 0.22657 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1315291 6 0.5076 0.49821 0.000 0.000 0.192 0.028 0.100 0.680
#> SRR1309314 6 0.5221 0.44976 0.000 0.000 0.328 0.000 0.112 0.560
#> SRR1420085 5 0.4094 0.44713 0.000 0.324 0.024 0.000 0.652 0.000
#> SRR1361308 3 0.4224 0.52131 0.000 0.016 0.552 0.000 0.432 0.000
#> SRR1472126 1 0.1605 0.91072 0.940 0.000 0.012 0.016 0.000 0.032
#> SRR1380482 5 0.3313 0.40961 0.000 0.124 0.060 0.000 0.816 0.000
#> SRR1099789 1 0.1180 0.92164 0.960 0.000 0.012 0.012 0.000 0.016
#> SRR1079480 5 0.3376 0.12652 0.000 0.016 0.220 0.000 0.764 0.000
#> SRR1339276 1 0.0632 0.92570 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0603 0.92694 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000 0.000
#> SRR1399353 4 0.1387 0.71792 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1096760 5 0.3512 0.48434 0.000 0.272 0.008 0.000 0.720 0.000
#> SRR1440290 2 0.3659 0.49368 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1330813 2 0.1204 0.80404 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1458931 2 0.3582 0.60205 0.000 0.732 0.016 0.000 0.252 0.000
#> SRR812294 4 0.3672 0.32032 0.000 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1394321 4 0.3595 0.64423 0.288 0.000 0.000 0.704 0.000 0.008
#> SRR1081160 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0146 0.82027 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349342 1 0.1116 0.90876 0.960 0.000 0.008 0.004 0.000 0.028
#> SRR1477173 2 0.2762 0.72018 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1086752 2 0.0692 0.81810 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR1084698 2 0.0291 0.82039 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1390143 4 0.5495 0.59738 0.288 0.000 0.000 0.548 0.000 0.164
#> SRR1390413 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099570 5 0.4850 -0.20717 0.000 0.056 0.448 0.000 0.496 0.000
#> SRR1312169 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1096687 4 0.3163 0.67957 0.232 0.000 0.000 0.764 0.000 0.004
#> SRR1486139 1 0.3828 -0.00578 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1470313 4 0.3151 0.47415 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1447893 5 0.5270 0.37321 0.000 0.216 0.180 0.000 0.604 0.000
#> SRR1466025 5 0.5888 -0.29124 0.000 0.004 0.304 0.000 0.492 0.200
#> SRR1477429 4 0.5268 0.59392 0.300 0.000 0.000 0.572 0.000 0.128
#> SRR1445701 5 0.3969 0.41564 0.000 0.332 0.016 0.000 0.652 0.000
#> SRR820689 1 0.1332 0.91795 0.952 0.000 0.008 0.012 0.000 0.028
#> SRR1451876 2 0.3907 0.39801 0.000 0.588 0.004 0.000 0.408 0.000
#> SRR1452537 2 0.0260 0.81582 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1383301 4 0.5119 0.64734 0.264 0.000 0.000 0.608 0.000 0.128
#> SRR1489328 5 0.3886 0.48430 0.000 0.264 0.028 0.000 0.708 0.000
#> SRR1344462 1 0.0725 0.91673 0.976 0.000 0.012 0.000 0.000 0.012
#> SRR1082709 1 0.0436 0.92088 0.988 0.000 0.004 0.004 0.000 0.004
#> SRR1447784 4 0.3198 0.45463 0.000 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1355769 1 0.1401 0.91731 0.948 0.000 0.004 0.020 0.000 0.028
#> SRR1488237 2 0.1267 0.80417 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1391985 2 0.0146 0.82027 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478501 1 0.0748 0.92696 0.976 0.000 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1480917 5 0.5000 0.09545 0.000 0.092 0.216 0.000 0.672 0.020
#> SRR1474485 4 0.3531 0.39922 0.000 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1089998 1 0.1075 0.91153 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0436 0.92337 0.988 0.000 0.004 0.004 0.000 0.004
#> SRR1319262 5 0.3804 0.16514 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1095188 5 0.4107 0.48535 0.000 0.280 0.036 0.000 0.684 0.000
#> SRR1454350 1 0.0748 0.92696 0.976 0.000 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1440374 1 0.0603 0.92694 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000 0.000
#> SRR1359565 5 0.5127 -0.01104 0.000 0.088 0.384 0.000 0.528 0.000
#> SRR1105417 4 0.4716 0.67791 0.136 0.000 0.000 0.680 0.000 0.184
#> SRR1325578 5 0.3933 0.47792 0.000 0.248 0.036 0.000 0.716 0.000
#> SRR1358161 3 0.3725 0.68902 0.000 0.008 0.676 0.000 0.316 0.000
#> SRR1358665 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333971 5 0.3867 0.14856 0.000 0.052 0.200 0.000 0.748 0.000
#> SRR1452010 1 0.2868 0.83758 0.852 0.000 0.004 0.112 0.000 0.032
#> SRR1418183 5 0.4470 0.37020 0.000 0.356 0.040 0.000 0.604 0.000
#> SRR1366345 1 0.0837 0.92725 0.972 0.000 0.004 0.020 0.000 0.004
#> SRR1387449 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1473461 4 0.4531 0.49581 0.408 0.000 0.000 0.556 0.000 0.036
#> SRR1090837 5 0.5510 0.13679 0.000 0.144 0.340 0.000 0.516 0.000
#> SRR1447828 3 0.3619 0.69405 0.000 0.004 0.680 0.000 0.316 0.000
#> SRR1338747 2 0.0146 0.82027 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333038 5 0.4624 0.31899 0.000 0.120 0.192 0.000 0.688 0.000
#> SRR1350280 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0692 0.92618 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1102656 2 0.3003 0.66865 0.000 0.812 0.016 0.000 0.172 0.000
#> SRR1441443 2 0.3464 0.57609 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1370682 3 0.3248 0.66277 0.000 0.000 0.804 0.000 0.164 0.032
#> SRR1475448 5 0.4331 -0.32157 0.000 0.020 0.464 0.000 0.516 0.000
#> SRR1407291 1 0.1003 0.92396 0.964 0.000 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1405266 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1082592 5 0.3023 0.11194 0.000 0.004 0.212 0.000 0.784 0.000
#> SRR1325794 5 0.3037 0.45504 0.000 0.176 0.016 0.000 0.808 0.000
#> SRR1095961 5 0.3978 0.47975 0.000 0.268 0.032 0.000 0.700 0.000
#> SRR1086702 2 0.1124 0.80970 0.000 0.956 0.008 0.000 0.036 0.000
#> SRR1320806 5 0.4067 0.47684 0.000 0.260 0.040 0.000 0.700 0.000
#> SRR1457527 3 0.3489 0.70233 0.000 0.000 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR1098831 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 5 0.4873 -0.12723 0.000 0.060 0.420 0.000 0.520 0.000
#> SRR1488858 6 0.3854 0.20888 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1454695 4 0.1984 0.71919 0.056 0.000 0.000 0.912 0.000 0.032
#> SRR1090241 2 0.0260 0.81988 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1329863 5 0.5586 0.36062 0.000 0.384 0.144 0.000 0.472 0.000
#> SRR1357733 1 0.0665 0.92334 0.980 0.000 0.004 0.008 0.000 0.008
#> SRR1362135 4 0.2631 0.71565 0.152 0.000 0.000 0.840 0.000 0.008
#> SRR1379581 3 0.2868 0.64105 0.000 0.000 0.840 0.000 0.132 0.028
#> SRR1309182 1 0.0692 0.92618 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1437668 4 0.1327 0.71704 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1084742 5 0.3368 0.11123 0.000 0.012 0.232 0.000 0.756 0.000
#> SRR1433538 1 0.1003 0.92369 0.964 0.000 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1085063 2 0.3499 0.56233 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1454247 5 0.3376 0.12652 0.000 0.016 0.220 0.000 0.764 0.000
#> SRR1097100 2 0.0146 0.82053 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR818622 2 0.3756 0.42272 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1072388 4 0.1349 0.71333 0.056 0.000 0.000 0.940 0.000 0.004
#> SRR1070332 5 0.4067 0.30325 0.000 0.104 0.144 0.000 0.752 0.000
#> SRR1320761 5 0.3094 0.23769 0.000 0.036 0.140 0.000 0.824 0.000
#> SRR1076195 6 0.3774 0.30396 0.000 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1069895 5 0.4333 0.31738 0.000 0.376 0.028 0.000 0.596 0.000
#> SRR1099144 4 0.1010 0.70097 0.036 0.000 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1385150 3 0.4105 0.65225 0.000 0.016 0.648 0.000 0.332 0.004
#> SRR1420191 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3854 0.00562 0.000 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1102583 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1456971 4 0.1327 0.71706 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0748 0.92696 0.976 0.000 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1444830 2 0.3672 0.48618 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1096267 1 0.1370 0.90076 0.948 0.000 0.012 0.004 0.000 0.036
#> SRR1087127 5 0.4729 -0.15412 0.000 0.000 0.284 0.000 0.636 0.080
#> SRR1408553 4 0.4827 0.55919 0.112 0.000 0.000 0.652 0.000 0.236
#> SRR1069231 4 0.2980 0.70333 0.192 0.000 0.000 0.800 0.000 0.008
#> SRR1325642 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 4 0.2738 0.70651 0.176 0.000 0.000 0.820 0.000 0.004
#> SRR1321942 1 0.1155 0.91726 0.956 0.000 0.004 0.036 0.000 0.004
#> SRR1094380 4 0.3351 0.64159 0.288 0.000 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.3797 0.36819 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1099330 2 0.3810 0.34934 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1077874 5 0.3707 0.45767 0.000 0.312 0.008 0.000 0.680 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3376 0.12652 0.000 0.016 0.220 0.000 0.764 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443568 5 0.4253 0.05977 0.000 0.460 0.016 0.000 0.524 0.000
#> SRR1380249 4 0.3515 0.41662 0.000 0.000 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1080143 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1383148 4 0.3857 -0.01179 0.000 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1357042 1 0.2774 0.84934 0.872 0.000 0.012 0.076 0.000 0.040
#> SRR1416025 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.3482 0.56877 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1078709 5 0.3784 0.46493 0.000 0.308 0.012 0.000 0.680 0.000
#> SRR813283 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 4 0.3789 0.48215 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 6 0.5156 0.45874 0.000 0.000 0.308 0.000 0.112 0.580
#> SRR807679 4 0.2445 0.69525 0.060 0.000 0.008 0.892 0.000 0.040
#> SRR1333811 5 0.4152 0.11831 0.000 0.440 0.012 0.000 0.548 0.000
#> SRR1078660 5 0.4488 0.39497 0.000 0.164 0.128 0.000 0.708 0.000
#> SRR1331730 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333913 4 0.2321 0.67810 0.040 0.000 0.008 0.900 0.000 0.052
#> SRR1432542 4 0.1082 0.70419 0.040 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004
#> SRR1418041 1 0.1285 0.90652 0.944 0.000 0.000 0.052 0.000 0.004
#> SRR1085211 4 0.4890 0.63504 0.160 0.000 0.000 0.660 0.000 0.180
#> SRR1339812 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402437 4 0.2378 0.71326 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0291 0.81944 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396822 2 0.3841 0.44611 0.000 0.616 0.004 0.000 0.380 0.000
#> SRR1441934 2 0.0260 0.82013 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1472552 3 0.4067 0.51437 0.000 0.008 0.548 0.000 0.444 0.000
#> SRR1488881 5 0.4336 -0.35196 0.000 0.020 0.476 0.000 0.504 0.000
#> SRR1102973 4 0.3851 0.37619 0.460 0.000 0.000 0.540 0.000 0.000
#> SRR1071131 5 0.4613 0.46173 0.000 0.260 0.080 0.000 0.660 0.000
#> SRR1074502 1 0.1442 0.89774 0.944 0.000 0.012 0.004 0.000 0.040
#> SRR1325271 4 0.1082 0.70506 0.040 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004
#> SRR1409171 2 0.0458 0.81818 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR809113 2 0.2219 0.76542 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1430045 2 0.3578 0.52787 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1441245 5 0.3965 0.29831 0.000 0.388 0.008 0.000 0.604 0.000
#> SRR1384091 4 0.2793 0.57162 0.000 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1431887 2 0.2783 0.68143 0.000 0.836 0.016 0.000 0.148 0.000
#> SRR1096525 4 0.4929 0.50148 0.100 0.000 0.000 0.620 0.000 0.280
#> SRR1488491 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 5 0.4008 0.19053 0.000 0.064 0.196 0.000 0.740 0.000
#> SRR1369514 4 0.3481 0.70188 0.072 0.000 0.000 0.804 0.000 0.124
#> SRR1453299 5 0.4864 -0.04543 0.000 0.064 0.384 0.000 0.552 0.000
#> SRR1436300 1 0.0935 0.91075 0.964 0.000 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1348490 5 0.3404 0.12234 0.000 0.016 0.224 0.000 0.760 0.000
#> SRR1091767 5 0.3867 -0.04860 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512 0.000
#> SRR1354467 5 0.4873 -0.12723 0.000 0.060 0.420 0.000 0.520 0.000
#> SRR1069074 2 0.3563 0.53843 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1452399 5 0.6034 -0.28357 0.000 0.016 0.308 0.000 0.500 0.176
#> SRR1437430 3 0.3534 0.69069 0.000 0.000 0.740 0.000 0.244 0.016
#> SRR1419736 5 0.4468 -0.09111 0.000 0.004 0.288 0.000 0.660 0.048
#> SRR1313343 3 0.4348 0.54070 0.000 0.024 0.560 0.000 0.416 0.000
#> SRR1077619 4 0.3012 0.58830 0.008 0.000 0.000 0.796 0.000 0.196
#> SRR1083530 4 0.2563 0.69675 0.068 0.000 0.008 0.884 0.000 0.040
#> SRR1333633 2 0.3737 0.42383 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1354999 2 0.3499 0.56868 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0713 0.92355 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1378818 5 0.5958 -0.35634 0.000 0.000 0.388 0.000 0.392 0.220
#> SRR1413182 6 0.3862 0.16968 0.000 0.000 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1464559 4 0.3050 0.48550 0.000 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1413075 5 0.3671 0.14050 0.000 0.036 0.208 0.000 0.756 0.000
#> SRR1487928 6 0.3076 0.50137 0.000 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1388997 2 0.3607 0.52130 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000
#> SRR1092865 2 0.3774 0.40115 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408 0.000
#> SRR1102729 4 0.5142 0.64726 0.204 0.000 0.000 0.624 0.000 0.172
#> SRR1456423 1 0.1370 0.89948 0.948 0.000 0.012 0.004 0.000 0.036
#> SRR1321591 2 0.0603 0.81786 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR1376874 3 0.3003 0.67198 0.000 0.000 0.812 0.000 0.172 0.016
#> SRR1339903 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1346710 4 0.2714 0.71314 0.136 0.000 0.004 0.848 0.000 0.012
#> SRR1418771 2 0.0146 0.82027 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095358 5 0.3860 0.02511 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR1480941 6 0.5156 0.45874 0.000 0.000 0.308 0.000 0.112 0.580
#> SRR1479175 2 0.0146 0.81945 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.3076 0.63563 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1491354 1 0.0547 0.92678 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.3833 0.30169 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.82027 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.2092 0.76856 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1355554 2 0.4218 0.29431 0.000 0.556 0.016 0.000 0.428 0.000
#> SRR1487173 1 0.0862 0.92571 0.972 0.000 0.004 0.016 0.000 0.008
#> SRR1474253 1 0.0260 0.92653 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1322918 5 0.3868 -0.09534 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000
#> SRR1318331 2 0.0363 0.81969 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1321333 5 0.4996 -0.07634 0.000 0.072 0.408 0.000 0.520 0.000
#> SRR1474231 4 0.3860 0.62992 0.236 0.000 0.000 0.728 0.000 0.036
#> SRR1350545 1 0.4337 -0.26300 0.500 0.000 0.000 0.480 0.000 0.020
#> SRR1091328 4 0.2149 0.71967 0.080 0.000 0.004 0.900 0.000 0.016
#> SRR814447 3 0.2389 0.50647 0.000 0.000 0.888 0.000 0.052 0.060
#> SRR1455989 5 0.4316 0.45186 0.000 0.312 0.040 0.000 0.648 0.000
#> SRR1453680 3 0.3288 0.70272 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1470356 2 0.2454 0.74181 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1342977 2 0.1003 0.80586 0.000 0.964 0.016 0.000 0.020 0.000
#> SRR1444222 2 0.3985 0.65508 0.000 0.800 0.088 0.000 0.048 0.064
#> SRR1097197 1 0.1610 0.88301 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.4121 0.61744 0.000 0.016 0.604 0.000 0.380 0.000
#> SRR821282 3 0.3023 0.44406 0.000 0.000 0.836 0.000 0.044 0.120
#> SRR1074602 2 0.3531 0.55736 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR814633 2 0.0790 0.81336 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1072480 3 0.5922 0.12692 0.000 0.000 0.464 0.000 0.284 0.252
#> SRR1319100 1 0.2002 0.90038 0.920 0.000 0.012 0.040 0.000 0.028
#> SRR1324004 5 0.3999 -0.11179 0.000 0.496 0.004 0.000 0.500 0.000
#> SRR1457459 1 0.1148 0.92165 0.960 0.000 0.004 0.016 0.000 0.020
#> SRR1421031 4 0.2442 0.72081 0.068 0.000 0.000 0.884 0.000 0.048
#> SRR1444598 6 0.5279 0.44788 0.000 0.000 0.324 0.000 0.120 0.556
#> SRR1091743 2 0.3309 0.62359 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR819637 4 0.4550 0.35738 0.448 0.000 0.008 0.524 0.000 0.020
#> SRR1083848 1 0.0603 0.92694 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000 0.000
#> SRR1088934 5 0.4116 0.20273 0.000 0.416 0.012 0.000 0.572 0.000
#> SRR1459785 5 0.4846 0.02926 0.000 0.068 0.356 0.000 0.576 0.000
#> SRR1083700 4 0.2883 0.69202 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1375531 4 0.5289 0.60606 0.280 0.000 0.000 0.580 0.000 0.140
#> SRR1323470 6 0.5184 0.45603 0.000 0.000 0.316 0.000 0.112 0.572
#> SRR814657 1 0.1176 0.92414 0.956 0.000 0.000 0.024 0.000 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17519 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4919 0.509 0.509
#> 3 3 0.950 0.928 0.967 0.1523 0.908 0.821
#> 4 4 0.869 0.860 0.938 0.0624 0.974 0.938
#> 5 5 0.706 0.733 0.867 0.1172 0.910 0.781
#> 6 6 0.635 0.681 0.824 0.0637 0.959 0.879
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1419807 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467726 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815446 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402132 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326059 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809406 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442292 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488151 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102320 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469926 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1429748 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380122 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349608 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466951 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331879 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437491 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1374005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077992 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455214 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345974 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338687 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486821 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418540 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1359487 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365722 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1448118 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475993 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473870 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1088511 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404577 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814515 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080391 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814028 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814219 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070620 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1418346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070060 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1417851 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403199 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366605 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396035 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390223 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436840 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445573 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375394 2 0.925 0.485 0.340 0.660
#> SRR1431735 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437346 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1103143 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086466 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098974 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1486584 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813536 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079730 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1415615 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453259 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1340828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079543 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816427 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076681 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335314 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074578 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101834 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321744 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458158 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310334 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418201 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402009 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397115 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814341 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313601 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459609 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499325 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357297 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818170 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470556 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812318 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095285 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317731 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809534 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397312 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812128 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101513 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1316033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390371 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464473 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076801 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474295 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068929 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490097 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083480 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333676 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420026 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817306 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1090290 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383192 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1419962 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1094357 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081639 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1351082 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397348 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312147 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1335470 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470988 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR811915 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1104987 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313770 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315780 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1073631 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR819124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1464494 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1378085 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467704 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325826 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1401040 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097954 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355747 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1429368 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398138 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1379260 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817142 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1315291 1 0.163 0.975 0.976 0.024
#> SRR1309314 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1361308 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472126 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099789 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339276 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440290 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330813 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1458931 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR812294 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1469704 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349342 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084698 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1390143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099570 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312169 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1466025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477429 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820689 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452537 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1383301 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1344462 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391985 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1478501 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474485 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095188 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454350 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105417 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358161 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1358665 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333971 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452010 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1366345 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1447828 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1338747 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333038 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350280 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441443 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1370682 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1475448 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1325794 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1086702 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320806 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457527 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474374 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488858 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329863 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357733 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379581 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1433538 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454247 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097100 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818622 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072388 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1320761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076195 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069895 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099144 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1420191 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332625 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096267 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087127 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1408553 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362103 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1099330 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098050 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1481238 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443568 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380249 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431015 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078709 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR813283 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1070665 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347707 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR807679 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078660 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331730 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1333913 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1402437 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1396822 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472552 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1488881 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102973 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074502 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR809113 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1430045 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1441245 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1384091 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096525 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1356351 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1369514 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436300 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091767 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354467 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452399 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1437430 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1419736 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313343 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077619 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1354999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443592 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077356 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1378818 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1413182 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487928 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092865 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102729 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1339903 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095358 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480941 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479175 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313891 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1491354 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471074 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353052 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1355554 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487173 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1318331 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1321333 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474231 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814447 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453680 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1470356 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1342977 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1444222 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097197 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366729 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR821282 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814633 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1072480 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1319100 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457459 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1444598 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819637 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1459785 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083700 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323470 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR814657 1 0.000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1419807 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR815446 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402132 1 0.1031 0.9765 0.976 0.000 0.024
#> SRR1326059 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR819559 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387899 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395635 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343629 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469926 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1070036 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098426 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090310 2 0.3412 0.7941 0.000 0.876 0.124
#> SRR1429748 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363654 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326317 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378308 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366919 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329947 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0592 0.9555 0.000 0.988 0.012
#> SRR1490761 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.6215 -0.1440 0.000 0.572 0.428
#> SRR1402944 2 0.5905 0.2005 0.000 0.648 0.352
#> SRR1092818 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093552 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464880 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078368 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331879 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320034 3 0.6111 0.6358 0.000 0.396 0.604
#> SRR1068687 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310777 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374005 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329994 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354203 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077850 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369241 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077992 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455214 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345974 3 0.5327 0.7309 0.000 0.272 0.728
#> SRR1338687 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486821 3 0.6204 0.5878 0.000 0.424 0.576
#> SRR1418540 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408788 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359487 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080648 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414708 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469080 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365722 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444808 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321829 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.6267 0.5254 0.000 0.452 0.548
#> SRR1445387 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349300 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453769 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401146 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366124 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391811 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456674 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086490 2 0.5835 0.2438 0.000 0.660 0.340
#> SRR1088511 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384431 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072055 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359738 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332141 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085900 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442173 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431625 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR814515 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344034 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR814219 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070620 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102128 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460211 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418346 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070060 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487969 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417851 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076705 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079380 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102923 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366605 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396035 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436840 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375394 1 0.0424 0.9886 0.992 0.008 0.000
#> SRR1431735 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417387 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445984 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370447 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446308 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437346 2 0.5905 0.1978 0.000 0.648 0.352
#> SRR1103143 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073191 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319584 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486584 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317939 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079730 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340828 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079543 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076681 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335314 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400799 2 0.5810 0.2586 0.000 0.664 0.336
#> SRR1074578 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312226 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416207 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447371 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069328 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445023 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453480 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101834 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074839 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458727 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436949 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070429 2 0.3340 0.8009 0.000 0.880 0.120
#> SRR1458158 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.3038 0.8908 0.896 0.000 0.104
#> SRR1310334 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385434 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415591 2 0.1289 0.9308 0.000 0.968 0.032
#> SRR1402009 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308734 2 0.6079 0.0413 0.000 0.612 0.388
#> SRR1498973 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397115 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR814341 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313601 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499325 3 0.6045 0.6549 0.000 0.380 0.620
#> SRR809919 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370818 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323651 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091230 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470556 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR812318 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095285 3 0.6252 0.4921 0.000 0.444 0.556
#> SRR1317731 2 0.2878 0.8401 0.000 0.904 0.096
#> SRR1490785 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447808 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397312 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR812128 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101513 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.6095 0.6411 0.000 0.392 0.608
#> SRR1390371 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480263 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464473 3 0.4796 0.7430 0.000 0.220 0.780
#> SRR1076801 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080044 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420850 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474295 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069871 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068929 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490097 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075054 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083480 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075458 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417023 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309333 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333676 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352996 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093172 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413137 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469973 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420026 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR817306 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416266 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071011 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090290 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435394 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419962 3 0.3752 0.7454 0.000 0.144 0.856
#> SRR1094357 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081639 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356016 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351082 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397348 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312147 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473891 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474930 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470988 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.1289 0.7373 0.000 0.032 0.968
#> SRR1315780 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073631 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310997 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464494 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357083 2 0.1163 0.9359 0.000 0.972 0.028
#> SRR1475842 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378220 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467704 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348885 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325826 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345692 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401040 3 0.5591 0.7129 0.000 0.304 0.696
#> SRR1097954 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454073 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429368 3 0.6079 0.6463 0.000 0.388 0.612
#> SRR1398138 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361436 2 0.6244 -0.1946 0.000 0.560 0.440
#> SRR817142 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315291 3 0.6291 0.0543 0.468 0.000 0.532
#> SRR1309314 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420085 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361308 3 0.6062 0.6508 0.000 0.384 0.616
#> SRR1472126 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099789 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339276 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418368 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399353 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096760 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440290 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR812294 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394321 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349342 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477173 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084698 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390143 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390413 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099570 3 0.6309 0.4046 0.000 0.496 0.504
#> SRR1312169 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096687 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486139 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470313 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447893 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466025 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477429 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489328 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355769 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488237 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391985 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478501 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480917 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089998 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095188 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454350 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440374 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359565 2 0.5948 0.1654 0.000 0.640 0.360
#> SRR1105417 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325578 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358161 3 0.5988 0.6658 0.000 0.368 0.632
#> SRR1358665 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333971 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452010 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418183 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366345 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387449 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090837 2 0.1643 0.9151 0.000 0.956 0.044
#> SRR1447828 3 0.6062 0.6508 0.000 0.384 0.616
#> SRR1338747 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333038 2 0.6008 0.1141 0.000 0.628 0.372
#> SRR1350280 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088557 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441443 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370682 3 0.5098 0.7391 0.000 0.248 0.752
#> SRR1475448 2 0.5327 0.4660 0.000 0.728 0.272
#> SRR1407291 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405266 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082592 2 0.0237 0.9648 0.000 0.996 0.004
#> SRR1325794 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095961 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457527 3 0.5178 0.7373 0.000 0.256 0.744
#> SRR1098831 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.6154 0.6177 0.000 0.408 0.592
#> SRR1488858 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454695 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090241 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362135 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379581 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309182 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437668 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084742 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433538 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085063 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454247 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097100 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR818622 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072388 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070332 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320761 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076195 3 0.6252 0.1155 0.444 0.000 0.556
#> SRR1069895 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099144 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385150 2 0.2959 0.8337 0.000 0.900 0.100
#> SRR1420191 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102583 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340574 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444830 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 3 0.5254 0.7339 0.000 0.264 0.736
#> SRR1408553 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069231 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325642 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321942 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447499 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR808299 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098050 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1481238 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443568 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380249 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080143 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357042 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431015 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078709 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR813283 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430226 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347707 3 0.0424 0.7334 0.000 0.008 0.992
#> SRR807679 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333811 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078660 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331730 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333913 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432542 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418041 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339812 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402437 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350958 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.6140 0.6240 0.000 0.404 0.596
#> SRR1488881 3 0.6154 0.6177 0.000 0.408 0.592
#> SRR1102973 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071131 2 0.1031 0.9409 0.000 0.976 0.024
#> SRR1074502 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409171 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430045 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441245 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431887 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096525 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488491 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369514 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453299 2 0.6299 -0.3293 0.000 0.524 0.476
#> SRR1436300 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091767 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354467 3 0.6252 0.5449 0.000 0.444 0.556
#> SRR1069074 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452399 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437430 3 0.6225 0.5715 0.000 0.432 0.568
#> SRR1419736 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313343 3 0.5216 0.7362 0.000 0.260 0.740
#> SRR1077619 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083530 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333633 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354999 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443592 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077356 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 3 0.0592 0.7334 0.000 0.012 0.988
#> SRR1413182 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464559 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413075 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487928 3 0.4702 0.5679 0.212 0.000 0.788
#> SRR1388997 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092865 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376874 3 0.4235 0.7456 0.000 0.176 0.824
#> SRR1339903 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418771 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095358 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480941 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479175 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1491354 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433884 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474253 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.5926 0.1817 0.000 0.644 0.356
#> SRR1474231 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350545 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091328 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR814447 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455989 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453680 3 0.0747 0.7355 0.000 0.016 0.984
#> SRR1470356 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342977 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097197 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366729 3 0.0237 0.7329 0.000 0.004 0.996
#> SRR821282 3 0.5216 0.7361 0.000 0.260 0.740
#> SRR1074602 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.6154 0.6178 0.000 0.408 0.592
#> SRR1319100 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324004 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457459 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421031 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444598 3 0.0000 0.7317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091743 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR819637 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083848 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088934 2 0.0000 0.9695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459785 2 0.6235 -0.1784 0.000 0.564 0.436
#> SRR1083700 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375531 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323470 3 0.6305 0.3906 0.000 0.484 0.516
#> SRR814657 1 0.0000 0.9994 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1419807 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1467726 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR815446 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1402132 1 0.4134 0.70633 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1326059 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409062 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809406 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465313 2 0.1042 0.94255 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR819559 1 0.0469 0.95938 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1387899 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442292 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1395635 1 0.1211 0.94231 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1343629 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326868 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102320 1 0.1389 0.93668 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1469926 3 0.0188 0.56044 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1070036 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098426 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090310 2 0.3074 0.76569 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1429748 1 0.1302 0.93960 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1363654 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326317 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1378308 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1366919 1 0.3569 0.79466 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1329947 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469769 2 0.0707 0.94118 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1490761 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 2 0.5112 -0.02743 0.000 0.560 0.436 0.004
#> SRR1402944 2 0.4507 0.62131 0.000 0.756 0.224 0.020
#> SRR1092818 1 0.0817 0.95379 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1093552 1 0.0336 0.96172 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1464880 2 0.1474 0.91879 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1078368 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349608 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466951 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1331879 2 0.0817 0.94529 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1320034 3 0.4220 0.64090 0.000 0.248 0.748 0.004
#> SRR1068687 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437491 1 0.0817 0.95211 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1310777 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1374005 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319182 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1329994 1 0.3356 0.81847 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1354203 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077850 1 0.0592 0.95854 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1369241 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077992 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1455214 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092014 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1097857 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473318 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345974 3 0.3024 0.64615 0.000 0.148 0.852 0.000
#> SRR1338687 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071207 1 0.3444 0.80578 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1486821 3 0.4679 0.52605 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1418540 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1408788 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1359487 4 0.4972 -0.00772 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1080648 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1414708 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469080 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1365722 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1444808 1 0.1557 0.93356 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1321829 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475993 3 0.4843 0.45596 0.000 0.396 0.604 0.000
#> SRR1445387 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077575 4 0.4855 0.27948 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1349300 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374165 1 0.0817 0.95379 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1453769 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473870 1 0.1557 0.93069 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1401146 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1366124 1 0.4237 0.80137 0.808 0.000 0.040 0.152
#> SRR1391811 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1456674 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086490 2 0.4661 0.29202 0.000 0.652 0.348 0.000
#> SRR1088511 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384431 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1072055 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359738 2 0.0592 0.94475 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1332141 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085900 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442173 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431625 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR814515 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357999 2 0.1211 0.93122 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1344034 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080391 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR814219 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1070620 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1102128 1 0.1557 0.93083 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1460211 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1418346 2 0.4222 0.56614 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1070060 1 0.1474 0.93393 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1487969 2 0.1389 0.92285 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1417851 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1443350 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403199 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1076705 1 0.0592 0.95893 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079380 4 0.4888 0.27212 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1102923 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.0817 0.94529 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1366605 2 0.0707 0.94797 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1396035 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1436840 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445573 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1375394 1 0.1637 0.89403 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1431735 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417387 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1445984 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1370447 1 0.3172 0.83550 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1446308 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1437346 2 0.4382 0.45280 0.000 0.704 0.296 0.000
#> SRR1103143 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073191 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468914 1 0.3569 0.79111 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1319584 2 0.0817 0.94529 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1486584 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813536 1 0.0592 0.95735 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1317939 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1079730 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341921 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399178 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1340828 2 0.3219 0.77584 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1079543 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816427 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1076681 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1335314 1 0.5273 0.22299 0.536 0.000 0.008 0.456
#> SRR1400799 2 0.4585 0.34492 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1074578 1 0.2589 0.87827 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1312226 2 0.1118 0.93494 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1416207 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447371 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069328 1 0.3400 0.81045 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1445023 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077599 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453480 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1101834 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.1302 0.93911 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1074839 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458727 4 0.4283 0.20821 0.000 0.004 0.256 0.740
#> SRR1436949 2 0.1474 0.91879 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1070429 2 0.2589 0.82234 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1458158 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432408 1 0.7113 0.22887 0.532 0.000 0.316 0.152
#> SRR1310334 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418201 3 0.0336 0.56339 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1385434 1 0.3486 0.80441 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1415591 2 0.0921 0.93336 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1402009 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316055 1 0.1938 0.92762 0.936 0.000 0.012 0.052
#> SRR1308734 2 0.4804 0.16004 0.000 0.616 0.384 0.000
#> SRR1498973 2 0.0817 0.94529 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1397115 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392141 1 0.0921 0.95319 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR814341 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1313601 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459609 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1499325 3 0.3907 0.64783 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR809919 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1370818 1 0.2408 0.89301 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1323651 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357297 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818170 3 0.0188 0.56044 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1091230 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470556 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR812318 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1095285 3 0.4222 0.53676 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1317731 2 0.2281 0.86059 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1490785 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432032 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447808 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809534 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1397312 2 0.0921 0.94177 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR812128 2 0.1022 0.93861 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1101513 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316033 3 0.4008 0.64342 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1390371 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1480263 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1464473 3 0.2011 0.61485 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1076801 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1080044 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420850 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1474295 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069871 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095744 4 0.4843 0.28021 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1068929 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1490097 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1075054 2 0.0817 0.94529 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1083480 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1075458 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417023 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309333 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333676 1 0.1716 0.92437 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1352996 1 0.0336 0.96085 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1093172 1 0.3610 0.78583 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1413137 1 0.3649 0.78129 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1469973 2 0.0188 0.95462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420026 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR817306 1 0.3528 0.79608 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1416266 4 0.3123 0.31510 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1071011 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1090290 1 0.2973 0.85036 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1435394 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383192 1 0.2704 0.87102 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1419962 3 0.1022 0.58323 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1094357 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1081639 3 0.0188 0.56044 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1356016 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1351082 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1397348 2 0.2081 0.88723 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1312147 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473891 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335470 1 0.3400 0.81056 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1474930 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470988 1 0.0707 0.95518 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR811915 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313770 3 0.0188 0.56044 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1315780 2 0.0469 0.94887 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1073631 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819124 1 0.1022 0.94775 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1310997 2 0.4804 0.25101 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1464494 2 0.1637 0.91116 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1357083 2 0.1389 0.91160 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1475842 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378085 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378220 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1467704 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348885 2 0.5378 -0.04442 0.012 0.540 0.000 0.448
#> SRR1325826 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466812 1 0.0592 0.95735 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1345692 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1401040 3 0.3610 0.65255 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1097954 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374396 4 0.4746 0.29711 0.304 0.000 0.008 0.688
#> SRR1454073 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.1022 0.94849 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1429368 3 0.3942 0.64777 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1398138 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379260 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361436 3 0.4981 0.36425 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR817142 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1315291 3 0.6806 0.07074 0.344 0.000 0.544 0.112
#> SRR1309314 3 0.0188 0.55328 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420085 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1361308 3 0.3873 0.65029 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1472126 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380482 2 0.0817 0.94529 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1099789 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079480 2 0.3907 0.65280 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1339276 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418368 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399353 1 0.0336 0.96172 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096760 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1440290 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1330813 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458931 2 0.0188 0.95462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR812294 1 0.3400 0.81383 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1394321 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081160 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469704 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1349342 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477173 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1084698 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1390143 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390413 2 0.0188 0.95462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099570 3 0.4941 0.40780 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1312169 1 0.0336 0.96085 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096687 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486139 1 0.0817 0.95211 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1470313 1 0.1474 0.93652 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1447893 2 0.0336 0.95100 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1466025 2 0.1716 0.90609 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1477429 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445701 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR820689 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451876 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452537 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489328 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082709 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447784 1 0.0592 0.95857 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1355769 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488237 2 0.0707 0.94797 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1391985 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1478501 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480917 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474485 1 0.2408 0.89303 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1089998 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319262 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1095188 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454350 1 0.1118 0.94331 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1440374 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1359565 2 0.4697 0.26489 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1105417 1 0.0336 0.96140 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325578 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358161 3 0.4040 0.63850 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1358665 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1333971 2 0.0921 0.94204 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1452010 1 0.2868 0.85810 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1418183 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1366345 1 0.0817 0.95211 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1387449 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473461 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090837 2 0.1716 0.89265 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1447828 3 0.3873 0.65046 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1338747 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333038 2 0.4907 0.00301 0.000 0.580 0.420 0.000
#> SRR1350280 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088557 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102656 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1441443 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1370682 3 0.2973 0.64518 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1475448 2 0.4250 0.50605 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1407291 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405266 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363766 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082592 2 0.1557 0.91477 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1325794 2 0.0817 0.94516 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1095961 2 0.0592 0.94476 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1086702 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320806 2 0.0188 0.95462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457527 3 0.2647 0.63644 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1098831 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.4250 0.61568 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1488858 1 0.1792 0.92423 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1454695 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090241 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329863 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0707 0.95631 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1362135 1 0.0336 0.96208 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1379581 3 0.0188 0.56044 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1309182 1 0.0817 0.95282 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1437668 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084742 2 0.4898 0.14095 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1433538 1 0.0592 0.95736 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1085063 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454247 4 0.5000 0.14713 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1097100 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR818622 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1072388 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070332 2 0.1792 0.90166 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1320761 2 0.0592 0.95100 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1076195 3 0.7423 0.04798 0.292 0.000 0.504 0.204
#> SRR1069895 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1099144 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1385150 2 0.3024 0.77221 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1420191 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332625 1 0.3649 0.78435 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1102583 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456971 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1340574 1 0.0707 0.95463 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1444830 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096267 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087127 4 0.7818 0.05381 0.000 0.324 0.268 0.408
#> SRR1408553 1 0.3764 0.76515 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1069231 1 0.0469 0.95981 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1325642 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1362103 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321942 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094380 1 0.0921 0.95120 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1447499 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1099330 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077874 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR808299 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098050 4 0.4477 0.27891 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1481238 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1443568 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380249 1 0.3688 0.77917 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1080143 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383148 1 0.3486 0.80144 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1357042 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416025 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1431015 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1078709 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR813283 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430226 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466927 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.4539 0.17677 0.000 0.008 0.272 0.720
#> SRR807679 1 0.1211 0.94231 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1333811 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1078660 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331730 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333913 1 0.1211 0.94231 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1432542 1 0.0336 0.96174 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418041 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085211 1 0.0188 0.96208 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1402437 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350958 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396822 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441934 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472552 3 0.4164 0.62841 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1488881 3 0.4134 0.63216 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1102973 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071131 2 0.0921 0.93344 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1074502 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325271 1 0.0817 0.95453 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1409171 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1430045 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1441245 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384091 1 0.3356 0.81847 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1431887 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096525 4 0.4072 0.30919 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1488491 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356351 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1369514 1 0.1022 0.94838 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1453299 3 0.4977 0.36870 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR1436300 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348490 2 0.1474 0.92097 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1091767 2 0.0188 0.95462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1354467 3 0.4790 0.49135 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1069074 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452399 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1437430 3 0.4936 0.49974 0.000 0.372 0.624 0.004
#> SRR1419736 4 0.4948 0.24753 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1313343 3 0.2647 0.63518 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1077619 1 0.2149 0.90735 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1083530 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333633 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1354999 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443592 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1077356 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378818 4 0.5292 0.23513 0.000 0.064 0.208 0.728
#> SRR1413182 4 0.5409 -0.14013 0.492 0.000 0.012 0.496
#> SRR1464559 1 0.2216 0.90391 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1413075 2 0.2149 0.87955 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1487928 3 0.6159 0.28016 0.172 0.000 0.676 0.152
#> SRR1388997 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1092865 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102729 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456423 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321591 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1376874 3 0.1474 0.59712 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1339903 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346710 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418771 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1095358 2 0.0188 0.95461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480941 2 0.0524 0.94910 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1479175 2 0.0188 0.95462 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313891 2 0.0592 0.95037 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1491354 1 0.0469 0.95918 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1433884 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471074 2 0.0336 0.95383 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353052 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487173 1 0.0707 0.95463 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1474253 1 0.0000 0.96261 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322918 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321333 2 0.4817 0.14253 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1474231 1 0.0336 0.96172 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350545 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091328 1 0.0188 0.96229 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814447 3 0.0188 0.56044 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1455989 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453680 3 0.0592 0.56948 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1470356 2 0.0469 0.95243 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1342977 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.0336 0.95169 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1097197 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1366729 3 0.0817 0.57561 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR821282 3 0.3893 0.65211 0.000 0.196 0.796 0.008
#> SRR1074602 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814633 2 0.0000 0.95477 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072480 3 0.4830 0.46489 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1319100 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1324004 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1457459 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1421031 1 0.2760 0.86979 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1444598 4 0.4741 0.13838 0.000 0.004 0.328 0.668
#> SRR1091743 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819637 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1083848 1 0.0336 0.96083 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088934 2 0.0188 0.95337 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1459785 2 0.4972 -0.15769 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1083700 1 0.0469 0.96029 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1375531 1 0.0188 0.96209 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323470 3 0.7905 0.35603 0.012 0.344 0.452 0.192
#> SRR814657 1 0.0592 0.95738 0.984 0.000 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1419807 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467726 2 0.0290 0.86735 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR815446 2 0.1043 0.85337 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1402132 4 0.3467 0.71768 0.128 0.000 0.004 0.832 0.036
#> SRR1326059 1 0.0703 0.87599 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1409062 2 0.2011 0.84979 0.000 0.908 0.088 0.000 0.004
#> SRR809406 1 0.0162 0.88237 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465313 2 0.3958 0.66537 0.000 0.780 0.044 0.000 0.176
#> SRR819559 1 0.4287 -0.35302 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1387899 2 0.2389 0.83364 0.000 0.880 0.116 0.000 0.004
#> SRR1442292 2 0.0162 0.86947 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1488151 1 0.0162 0.88232 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1395635 1 0.1907 0.83101 0.928 0.000 0.000 0.044 0.028
#> SRR1343629 1 0.0324 0.88265 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1326868 2 0.1768 0.85598 0.000 0.924 0.072 0.000 0.004
#> SRR1102320 4 0.4161 0.75129 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1469926 3 0.1484 0.54931 0.000 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR1070036 1 0.3452 0.53335 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1098426 1 0.0703 0.87883 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1090310 2 0.3123 0.76610 0.000 0.812 0.184 0.000 0.004
#> SRR1429748 4 0.4242 0.68820 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1363654 1 0.2230 0.76917 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1326317 2 0.2286 0.83905 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1378308 2 0.0404 0.86707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1366919 4 0.3398 0.83962 0.216 0.000 0.000 0.780 0.004
#> SRR1329947 1 0.0451 0.88250 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1469769 2 0.3455 0.72477 0.000 0.784 0.208 0.000 0.008
#> SRR1490761 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380122 3 0.6821 0.32976 0.000 0.296 0.524 0.036 0.144
#> SRR1402944 5 0.7328 0.27355 0.000 0.348 0.208 0.036 0.408
#> SRR1092818 1 0.1124 0.86739 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1093552 1 0.0451 0.88197 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1464880 2 0.4084 0.34428 0.000 0.668 0.000 0.004 0.328
#> SRR1078368 2 0.1430 0.86301 0.000 0.944 0.052 0.000 0.004
#> SRR1349608 2 0.1571 0.86031 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR1466951 2 0.1197 0.84798 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1331879 2 0.2561 0.75482 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1320034 3 0.3728 0.60378 0.000 0.244 0.748 0.000 0.008
#> SRR1068687 2 0.0671 0.86938 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1437491 1 0.1124 0.85798 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1310777 2 0.0162 0.86888 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374005 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319182 1 0.0703 0.87925 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1329994 4 0.3635 0.85613 0.248 0.000 0.000 0.748 0.004
#> SRR1354203 1 0.0671 0.87553 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1077850 1 0.0693 0.87870 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1369241 2 0.0290 0.86735 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077992 2 0.2612 0.78108 0.000 0.868 0.008 0.000 0.124
#> SRR1455214 1 0.0290 0.88170 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1092014 2 0.2338 0.83623 0.000 0.884 0.112 0.000 0.004
#> SRR1097857 1 0.0162 0.88269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473318 1 0.0324 0.88285 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1345974 3 0.2068 0.63008 0.000 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR1338687 2 0.2011 0.84979 0.000 0.908 0.088 0.000 0.004
#> SRR1071207 4 0.3534 0.85922 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1486821 3 0.4748 0.43358 0.000 0.384 0.596 0.004 0.016
#> SRR1418540 1 0.0162 0.88232 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408788 2 0.2280 0.83372 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1359487 4 0.3977 0.81674 0.204 0.000 0.000 0.764 0.032
#> SRR1080648 1 0.0404 0.88128 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1414708 1 0.0703 0.87883 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1469080 2 0.1908 0.81406 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1365722 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448118 2 0.0794 0.86061 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1444808 4 0.4225 0.78969 0.364 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1321829 2 0.2124 0.84606 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1475993 3 0.3635 0.57194 0.000 0.248 0.748 0.000 0.004
#> SRR1445387 1 0.0794 0.87337 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1077575 5 0.3128 0.69538 0.000 0.168 0.004 0.004 0.824
#> SRR1349300 1 0.1341 0.84785 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1374165 1 0.1117 0.87007 0.964 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1453769 2 0.0404 0.87034 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1473870 4 0.4249 0.67970 0.432 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1401146 2 0.0693 0.86943 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1366124 4 0.4467 0.85520 0.252 0.000 0.016 0.716 0.016
#> SRR1391811 1 0.0566 0.87797 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1456674 1 0.0609 0.87843 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1086490 2 0.3491 0.70250 0.000 0.768 0.228 0.000 0.004
#> SRR1088511 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404577 1 0.0794 0.87364 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1384431 1 0.0324 0.88265 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1072055 1 0.4434 -0.33241 0.536 0.000 0.000 0.460 0.004
#> SRR1359738 2 0.2848 0.79866 0.000 0.840 0.156 0.000 0.004
#> SRR1332141 1 0.0451 0.88145 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1085900 2 0.2068 0.84821 0.000 0.904 0.092 0.000 0.004
#> SRR1442173 1 0.0162 0.88259 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431625 2 0.0880 0.85858 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR814515 2 0.0451 0.87010 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1357999 2 0.4440 -0.24675 0.000 0.528 0.004 0.000 0.468
#> SRR1344034 2 0.3644 0.75615 0.000 0.824 0.096 0.000 0.080
#> SRR1080391 1 0.0000 0.88237 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347870 2 0.0290 0.87036 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR814028 2 0.2338 0.79408 0.000 0.884 0.004 0.000 0.112
#> SRR814219 2 0.0510 0.86573 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1070620 1 0.0451 0.88145 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1102128 4 0.4138 0.76857 0.384 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1460211 2 0.0162 0.86806 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418346 5 0.3934 0.68765 0.000 0.276 0.000 0.008 0.716
#> SRR1070060 4 0.4227 0.70522 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1487969 2 0.2516 0.76067 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1417851 1 0.4101 0.08684 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1443350 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403199 1 0.0404 0.88186 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1076705 1 0.4354 0.10691 0.624 0.000 0.000 0.368 0.008
#> SRR1079380 5 0.4037 0.67461 0.000 0.148 0.020 0.032 0.800
#> SRR1102923 2 0.0794 0.86873 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1369560 2 0.2970 0.71570 0.000 0.828 0.000 0.004 0.168
#> SRR1366605 2 0.2304 0.80005 0.000 0.892 0.000 0.008 0.100
#> SRR1396035 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390223 2 0.0671 0.86636 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1436840 2 0.1831 0.85487 0.000 0.920 0.076 0.000 0.004
#> SRR1445573 2 0.0794 0.86061 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1375394 1 0.7523 -0.27805 0.428 0.264 0.048 0.260 0.000
#> SRR1431735 1 0.0510 0.88095 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1417387 1 0.0693 0.87924 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1445984 1 0.1124 0.87202 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1370447 4 0.4327 0.79354 0.360 0.000 0.000 0.632 0.008
#> SRR1446308 2 0.2439 0.83168 0.000 0.876 0.120 0.000 0.004
#> SRR1437346 2 0.3550 0.68952 0.000 0.760 0.236 0.000 0.004
#> SRR1103143 2 0.0609 0.86984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1086466 1 0.0510 0.88095 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1073191 2 0.0162 0.86942 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098974 1 0.0579 0.88288 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1468914 4 0.3586 0.85722 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1319584 2 0.5363 -0.00545 0.000 0.572 0.052 0.004 0.372
#> SRR1486584 1 0.0404 0.88138 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR813536 1 0.4192 -0.09556 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR1317939 2 0.0880 0.85792 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1079730 1 0.0324 0.88292 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1341921 1 0.0404 0.88115 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1399178 2 0.0290 0.86984 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1415615 1 0.0000 0.88237 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328551 2 0.0510 0.86994 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1453259 2 0.0290 0.86745 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1340828 5 0.4674 0.51967 0.000 0.416 0.000 0.016 0.568
#> SRR1079543 2 0.1357 0.86509 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR816427 2 0.1965 0.80953 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1076681 2 0.2389 0.83468 0.000 0.880 0.116 0.000 0.004
#> SRR1335314 4 0.3562 0.82169 0.196 0.000 0.000 0.788 0.016
#> SRR1400799 2 0.3550 0.68922 0.000 0.760 0.236 0.000 0.004
#> SRR1074578 4 0.3857 0.84593 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1312226 2 0.3013 0.73293 0.000 0.832 0.008 0.000 0.160
#> SRR1416207 1 0.0566 0.88075 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1447371 1 0.0162 0.88202 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069328 4 0.3612 0.86066 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1445023 1 0.0451 0.88250 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1077599 2 0.2286 0.83837 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1453480 2 0.2127 0.79765 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1101834 2 0.0290 0.86983 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1321744 1 0.2104 0.81804 0.916 0.000 0.000 0.060 0.024
#> SRR1074839 2 0.2233 0.84096 0.000 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR1458727 5 0.3929 0.33863 0.000 0.000 0.208 0.028 0.764
#> SRR1436949 2 0.4118 0.31658 0.000 0.660 0.000 0.004 0.336
#> SRR1070429 2 0.3086 0.77022 0.000 0.816 0.180 0.000 0.004
#> SRR1458158 1 0.1544 0.83236 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1432408 4 0.5189 0.81297 0.204 0.000 0.084 0.700 0.012
#> SRR1310334 1 0.0162 0.88237 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418201 3 0.1469 0.55809 0.000 0.000 0.948 0.016 0.036
#> SRR1385434 4 0.3963 0.85715 0.256 0.000 0.004 0.732 0.008
#> SRR1415591 2 0.2930 0.78933 0.000 0.832 0.164 0.000 0.004
#> SRR1402009 1 0.0290 0.88170 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1316055 1 0.6159 0.10289 0.580 0.000 0.208 0.208 0.004
#> SRR1308734 2 0.5084 -0.20203 0.000 0.488 0.484 0.008 0.020
#> SRR1498973 2 0.2929 0.70398 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1397115 1 0.0451 0.88333 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1392141 1 0.1012 0.87310 0.968 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR814341 2 0.0703 0.86289 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1313601 2 0.2011 0.84979 0.000 0.908 0.088 0.000 0.004
#> SRR1459609 2 0.0703 0.86233 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1499325 3 0.4439 0.59724 0.000 0.236 0.728 0.012 0.024
#> SRR809919 1 0.0579 0.87979 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1370818 4 0.3980 0.85624 0.284 0.000 0.000 0.708 0.008
#> SRR1323651 2 0.2389 0.83349 0.000 0.880 0.116 0.000 0.004
#> SRR1357297 1 0.2690 0.71130 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR818170 3 0.3099 0.47375 0.000 0.000 0.848 0.028 0.124
#> SRR1091230 2 0.2233 0.84147 0.000 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR1470556 2 0.0404 0.86620 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR812318 1 0.0290 0.88105 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1095285 3 0.4422 0.45901 0.000 0.320 0.664 0.012 0.004
#> SRR1317731 2 0.5509 0.12613 0.000 0.564 0.360 0.000 0.076
#> SRR1490785 1 0.0162 0.88269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432032 1 0.3966 0.23815 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1447808 1 0.0703 0.87711 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR809534 2 0.0404 0.86620 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1397312 2 0.2286 0.80402 0.000 0.888 0.004 0.000 0.108
#> SRR812128 2 0.3109 0.66922 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1101513 1 0.0000 0.88237 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415708 2 0.1638 0.85884 0.000 0.932 0.064 0.000 0.004
#> SRR1316033 3 0.3874 0.63079 0.000 0.200 0.776 0.008 0.016
#> SRR1390371 2 0.0794 0.86066 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1480263 2 0.2338 0.79247 0.000 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1464473 3 0.1983 0.61434 0.000 0.060 0.924 0.008 0.008
#> SRR1076801 1 0.0794 0.87600 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1080044 1 0.0451 0.88000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1420850 2 0.0510 0.86573 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1474295 1 0.4150 -0.02137 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1069871 1 0.0404 0.88186 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1095744 5 0.3318 0.71019 0.000 0.192 0.000 0.008 0.800
#> SRR1068929 2 0.1282 0.85375 0.000 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR1490097 2 0.1270 0.84653 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1075054 2 0.2971 0.73008 0.000 0.836 0.000 0.008 0.156
#> SRR1083480 1 0.0671 0.87553 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1075458 1 0.0703 0.87883 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1417023 1 0.4318 0.60507 0.764 0.000 0.176 0.056 0.004
#> SRR1309333 2 0.0880 0.86046 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1333676 4 0.4060 0.80422 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1352996 1 0.4307 -0.47333 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000
#> SRR1093172 4 0.3612 0.85977 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1413137 4 0.3684 0.85808 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000
#> SRR1469973 2 0.1357 0.86502 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR1420026 2 0.1608 0.83055 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR817306 4 0.3636 0.86016 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1416266 4 0.4720 0.67860 0.124 0.000 0.000 0.736 0.140
#> SRR1071011 2 0.0510 0.86482 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1090290 4 0.3861 0.85822 0.284 0.000 0.000 0.712 0.004
#> SRR1435394 2 0.2233 0.84087 0.000 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR1383192 4 0.4235 0.69610 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1419962 3 0.1498 0.58120 0.000 0.016 0.952 0.008 0.024
#> SRR1094357 1 0.0451 0.88145 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1081639 3 0.2448 0.51207 0.000 0.000 0.892 0.020 0.088
#> SRR1356016 2 0.0510 0.86482 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1351082 2 0.0510 0.86586 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1397348 5 0.5005 0.39997 0.000 0.468 0.012 0.012 0.508
#> SRR1312147 1 0.0880 0.87595 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1473891 2 0.0162 0.86963 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1335470 4 0.3752 0.85658 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR1474930 2 0.2488 0.82791 0.000 0.872 0.124 0.000 0.004
#> SRR1470988 1 0.4297 -0.39338 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR811915 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1104987 1 0.0000 0.88237 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100005 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444436 2 0.1041 0.86902 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1313770 3 0.3248 0.48710 0.000 0.004 0.852 0.040 0.104
#> SRR1315780 2 0.2395 0.85262 0.000 0.904 0.072 0.008 0.016
#> SRR1073631 1 0.0324 0.88265 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR819124 4 0.4242 0.68615 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1310997 5 0.3618 0.71088 0.000 0.196 0.004 0.012 0.788
#> SRR1464494 2 0.4562 -0.35794 0.000 0.500 0.000 0.008 0.492
#> SRR1357083 2 0.2970 0.78610 0.000 0.828 0.168 0.000 0.004
#> SRR1475842 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378085 1 0.0880 0.87527 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1378220 2 0.2719 0.81095 0.000 0.852 0.144 0.000 0.004
#> SRR1467704 1 0.2020 0.80690 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1348885 5 0.5448 0.67218 0.020 0.272 0.004 0.048 0.656
#> SRR1325826 1 0.0771 0.87873 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1466812 1 0.4126 0.02211 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1345692 2 0.1357 0.85050 0.000 0.948 0.004 0.000 0.048
#> SRR1401040 3 0.3719 0.62336 0.000 0.208 0.776 0.012 0.004
#> SRR1097954 1 0.0162 0.88237 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1374396 4 0.4486 0.77124 0.172 0.000 0.000 0.748 0.080
#> SRR1454073 2 0.1121 0.86627 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1355747 1 0.1493 0.85357 0.948 0.000 0.000 0.028 0.024
#> SRR1429368 3 0.3790 0.60247 0.000 0.248 0.744 0.004 0.004
#> SRR1398138 2 0.2011 0.84974 0.000 0.908 0.088 0.000 0.004
#> SRR1379260 1 0.0794 0.87746 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1361436 2 0.4410 0.11720 0.000 0.556 0.440 0.000 0.004
#> SRR817142 2 0.2286 0.83905 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1315291 3 0.7062 0.12516 0.108 0.000 0.520 0.296 0.076
#> SRR1309314 3 0.2685 0.50906 0.000 0.000 0.880 0.028 0.092
#> SRR1420085 2 0.1124 0.85814 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1361308 3 0.3992 0.56759 0.000 0.280 0.712 0.004 0.004
#> SRR1472126 1 0.0865 0.87714 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1380482 2 0.5121 -0.31687 0.000 0.500 0.028 0.004 0.468
#> SRR1099789 1 0.0162 0.88269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079480 5 0.3766 0.69377 0.000 0.268 0.000 0.004 0.728
#> SRR1339276 1 0.0566 0.87797 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1418368 1 0.0451 0.88000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1399353 1 0.0451 0.88176 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1096760 2 0.2674 0.81420 0.000 0.856 0.140 0.000 0.004
#> SRR1440290 2 0.2286 0.83837 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1330813 2 0.2124 0.84558 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1458931 2 0.0162 0.86962 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR812294 4 0.3689 0.85901 0.256 0.000 0.000 0.740 0.004
#> SRR1394321 1 0.0671 0.88176 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1081160 2 0.1205 0.86612 0.000 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR1469704 2 0.1851 0.81718 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1349342 1 0.0451 0.88145 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1477173 2 0.0703 0.87015 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1086752 2 0.0955 0.86142 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1084698 2 0.1792 0.82135 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1390143 1 0.3109 0.62887 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1390413 2 0.0162 0.86947 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1099570 2 0.4446 -0.04805 0.000 0.520 0.476 0.000 0.004
#> SRR1312169 1 0.4291 -0.36292 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1096687 1 0.2516 0.73925 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1486139 1 0.1124 0.85798 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1470313 1 0.4549 -0.35039 0.528 0.000 0.000 0.464 0.008
#> SRR1447893 2 0.2629 0.81781 0.000 0.860 0.136 0.000 0.004
#> SRR1466025 2 0.4891 0.17875 0.000 0.608 0.020 0.008 0.364
#> SRR1477429 1 0.0510 0.87994 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1445701 2 0.2583 0.82186 0.000 0.864 0.132 0.000 0.004
#> SRR820689 1 0.0579 0.88288 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1451876 2 0.1502 0.86237 0.000 0.940 0.056 0.000 0.004
#> SRR1452537 2 0.0703 0.86985 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1383301 1 0.4114 0.06906 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1489328 2 0.0703 0.87074 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1344462 1 0.0324 0.88148 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1082709 1 0.0404 0.88175 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1447784 1 0.0566 0.88096 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1355769 1 0.4291 -0.36005 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1488237 2 0.1341 0.84277 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1391985 2 0.0510 0.86573 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1478501 1 0.0693 0.87766 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1480917 2 0.1597 0.85191 0.000 0.940 0.012 0.000 0.048
#> SRR1474485 4 0.3949 0.85001 0.300 0.000 0.000 0.696 0.004
#> SRR1089998 1 0.0000 0.88237 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318140 1 0.0404 0.88115 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1319262 2 0.2583 0.82053 0.000 0.864 0.132 0.000 0.004
#> SRR1095188 2 0.2286 0.83990 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1454350 1 0.1282 0.84949 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1440374 1 0.0324 0.88148 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1359565 2 0.3838 0.60214 0.000 0.716 0.280 0.000 0.004
#> SRR1105417 1 0.2605 0.72148 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1325578 2 0.3460 0.75769 0.000 0.828 0.128 0.000 0.044
#> SRR1358161 3 0.4745 0.60496 0.000 0.192 0.740 0.020 0.048
#> SRR1358665 2 0.0609 0.86330 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1333971 2 0.3177 0.65449 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1452010 4 0.4015 0.81587 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1418183 2 0.2389 0.83315 0.000 0.880 0.116 0.000 0.004
#> SRR1366345 1 0.0865 0.86940 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1387449 1 0.0794 0.87423 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1473461 4 0.4291 0.59080 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1090837 2 0.2890 0.79442 0.000 0.836 0.160 0.000 0.004
#> SRR1447828 3 0.3676 0.61739 0.000 0.232 0.760 0.004 0.004
#> SRR1338747 2 0.0510 0.86573 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333038 2 0.4448 -0.03986 0.000 0.516 0.480 0.000 0.004
#> SRR1350280 1 0.1671 0.82775 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1088557 1 0.0510 0.88007 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1102656 2 0.1671 0.82886 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1441443 2 0.2338 0.79349 0.000 0.884 0.004 0.000 0.112
#> SRR1370682 3 0.2020 0.63232 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1475448 2 0.3521 0.69600 0.000 0.764 0.232 0.000 0.004
#> SRR1407291 1 0.3508 0.50383 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1405266 1 0.0703 0.87601 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1363766 1 0.0609 0.87887 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1082592 2 0.5426 -0.34837 0.000 0.496 0.040 0.008 0.456
#> SRR1325794 2 0.2286 0.80402 0.000 0.888 0.004 0.000 0.108
#> SRR1095961 2 0.2763 0.80675 0.000 0.848 0.148 0.000 0.004
#> SRR1086702 2 0.1041 0.86842 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1320806 2 0.1661 0.86568 0.000 0.940 0.024 0.000 0.036
#> SRR1457527 3 0.2741 0.63716 0.000 0.132 0.860 0.004 0.004
#> SRR1098831 2 0.0609 0.86975 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1474374 3 0.4541 0.44088 0.000 0.380 0.608 0.008 0.004
#> SRR1488858 4 0.4135 0.81569 0.340 0.000 0.000 0.656 0.004
#> SRR1454695 1 0.2674 0.74256 0.856 0.000 0.000 0.140 0.004
#> SRR1090241 2 0.1768 0.85618 0.000 0.924 0.072 0.000 0.004
#> SRR1329863 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357733 1 0.0693 0.87766 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1362135 1 0.4268 -0.26469 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1379581 3 0.1670 0.54790 0.000 0.000 0.936 0.012 0.052
#> SRR1309182 1 0.3857 0.31856 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1437668 1 0.0609 0.87843 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1084742 5 0.4497 0.60904 0.000 0.352 0.000 0.016 0.632
#> SRR1433538 4 0.4210 0.72066 0.412 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1085063 2 0.1965 0.80922 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1454247 5 0.3551 0.71247 0.000 0.220 0.000 0.008 0.772
#> SRR1097100 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818622 2 0.2286 0.83837 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1072388 1 0.1124 0.86923 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1070332 2 0.3607 0.57007 0.000 0.752 0.000 0.004 0.244
#> SRR1320761 2 0.3002 0.79723 0.000 0.856 0.028 0.000 0.116
#> SRR1076195 4 0.4393 0.75575 0.152 0.000 0.044 0.780 0.024
#> SRR1069895 2 0.2286 0.83837 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1099144 1 0.0703 0.87976 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1385150 2 0.3366 0.73079 0.000 0.784 0.212 0.000 0.004
#> SRR1420191 2 0.0510 0.86991 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1332625 4 0.3461 0.84414 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1102583 1 0.0880 0.87152 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1456971 1 0.1282 0.86676 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1340574 1 0.0671 0.87553 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1444830 2 0.2233 0.84094 0.000 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR1096267 1 0.0162 0.88259 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087127 5 0.5013 0.51358 0.000 0.084 0.152 0.024 0.740
#> SRR1408553 4 0.3774 0.85474 0.296 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR1069231 1 0.4264 0.03391 0.620 0.000 0.000 0.376 0.004
#> SRR1325642 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362103 1 0.1121 0.86629 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1321942 1 0.0162 0.88237 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1094380 1 0.1310 0.86122 0.956 0.000 0.000 0.024 0.020
#> SRR1447499 2 0.1341 0.86371 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1099330 2 0.2068 0.84735 0.000 0.904 0.092 0.000 0.004
#> SRR1077874 2 0.2020 0.80389 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR808299 2 0.0162 0.86947 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098050 5 0.3525 0.68603 0.000 0.156 0.004 0.024 0.816
#> SRR1481238 2 0.1205 0.85658 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1443568 2 0.2286 0.83837 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1380249 4 0.3790 0.85990 0.272 0.000 0.000 0.724 0.004
#> SRR1080143 1 0.0703 0.87751 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1383148 4 0.3707 0.85797 0.284 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1357042 1 0.0566 0.88348 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1416025 2 0.0404 0.86707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1431015 2 0.0794 0.86006 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1078709 2 0.1205 0.85524 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR813283 1 0.0324 0.88148 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1430226 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070665 1 0.0000 0.88237 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466927 2 0.0290 0.86983 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1347707 4 0.7137 0.04710 0.028 0.000 0.216 0.460 0.296
#> SRR807679 1 0.1915 0.83107 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1333811 2 0.2864 0.81522 0.000 0.852 0.136 0.000 0.012
#> SRR1078660 2 0.2124 0.81592 0.000 0.900 0.004 0.000 0.096
#> SRR1331730 2 0.0510 0.86482 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333913 1 0.1661 0.84681 0.940 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR1432542 1 0.1282 0.86583 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1418041 1 0.0290 0.88223 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1085211 1 0.0162 0.88259 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339812 2 0.0703 0.86233 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1402437 1 0.0609 0.88017 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1350958 2 0.1704 0.85780 0.000 0.928 0.068 0.000 0.004
#> SRR1396822 2 0.2338 0.83588 0.000 0.884 0.112 0.000 0.004
#> SRR1441934 2 0.1357 0.86544 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR1472552 3 0.4738 0.37806 0.000 0.420 0.564 0.012 0.004
#> SRR1488881 3 0.4745 0.37245 0.000 0.424 0.560 0.012 0.004
#> SRR1102973 1 0.0671 0.87553 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1071131 2 0.2674 0.81472 0.000 0.856 0.140 0.000 0.004
#> SRR1074502 1 0.0162 0.88259 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325271 1 0.3766 0.48477 0.728 0.000 0.000 0.268 0.004
#> SRR1409171 2 0.1121 0.86593 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR809113 2 0.0510 0.86482 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1430045 2 0.0404 0.86620 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1441245 2 0.0671 0.87042 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1384091 4 0.3741 0.85983 0.264 0.000 0.000 0.732 0.004
#> SRR1431887 2 0.0510 0.86573 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1096525 4 0.4409 0.77772 0.176 0.000 0.000 0.752 0.072
#> SRR1488491 2 0.0566 0.87040 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1356351 2 0.2389 0.79003 0.000 0.880 0.004 0.000 0.116
#> SRR1369514 4 0.4150 0.75334 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1453299 2 0.4803 -0.15149 0.000 0.500 0.484 0.012 0.004
#> SRR1436300 1 0.0162 0.88286 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1348490 2 0.4657 0.09806 0.000 0.604 0.008 0.008 0.380
#> SRR1091767 2 0.0404 0.86633 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1354467 2 0.4688 0.00944 0.000 0.532 0.456 0.008 0.004
#> SRR1069074 2 0.2286 0.83837 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1452399 2 0.2124 0.84717 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1437430 3 0.4709 0.50958 0.000 0.324 0.648 0.004 0.024
#> SRR1419736 5 0.3300 0.71366 0.000 0.204 0.000 0.004 0.792
#> SRR1313343 3 0.3394 0.63897 0.000 0.152 0.824 0.020 0.004
#> SRR1077619 4 0.3980 0.85715 0.284 0.000 0.000 0.708 0.008
#> SRR1083530 1 0.0404 0.88128 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1333633 2 0.3339 0.76024 0.000 0.836 0.040 0.000 0.124
#> SRR1354999 2 0.2286 0.83837 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR1443592 2 0.0510 0.86482 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1077356 1 0.0404 0.88138 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1378818 5 0.2795 0.49204 0.000 0.008 0.080 0.028 0.884
#> SRR1413182 4 0.2930 0.78260 0.164 0.000 0.000 0.832 0.004
#> SRR1464559 4 0.4183 0.82948 0.324 0.000 0.000 0.668 0.008
#> SRR1413075 5 0.4219 0.53251 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1487928 4 0.5613 0.56168 0.088 0.000 0.120 0.716 0.076
#> SRR1388997 2 0.0794 0.86061 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1092865 2 0.2233 0.84147 0.000 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR1102729 1 0.0290 0.88170 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456423 1 0.0451 0.88250 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1321591 2 0.0566 0.86771 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1376874 3 0.1282 0.60818 0.000 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR1339903 1 0.0290 0.88170 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1346710 1 0.0963 0.87194 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1418771 2 0.0162 0.86806 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095358 2 0.0510 0.86861 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480941 2 0.2911 0.81371 0.000 0.852 0.136 0.004 0.008
#> SRR1479175 2 0.0162 0.86947 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313891 2 0.2011 0.81801 0.000 0.908 0.004 0.000 0.088
#> SRR1491354 1 0.4182 -0.08181 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1433884 2 0.2124 0.84566 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1471074 2 0.0000 0.86880 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353052 2 0.0880 0.86860 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1355554 2 0.2124 0.84520 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1487173 1 0.0693 0.87745 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1474253 1 0.0510 0.87994 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1322918 2 0.0162 0.86942 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1318331 2 0.0579 0.87097 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1321333 2 0.4449 0.30130 0.000 0.604 0.388 0.004 0.004
#> SRR1474231 1 0.0404 0.88128 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1350545 1 0.3003 0.64394 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1091328 1 0.0703 0.87826 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR814447 3 0.2189 0.51931 0.000 0.000 0.904 0.012 0.084
#> SRR1455989 2 0.2439 0.83114 0.000 0.876 0.120 0.000 0.004
#> SRR1453680 3 0.0981 0.58251 0.000 0.012 0.972 0.008 0.008
#> SRR1470356 2 0.0794 0.86012 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1342977 2 0.0404 0.87013 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1444222 2 0.2289 0.85167 0.000 0.904 0.080 0.004 0.012
#> SRR1097197 1 0.0794 0.87364 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1366729 3 0.0579 0.58078 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR821282 3 0.3340 0.63766 0.000 0.156 0.824 0.004 0.016
#> SRR1074602 2 0.2233 0.84094 0.000 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR814633 2 0.1124 0.86678 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1072480 3 0.5890 0.49317 0.000 0.312 0.596 0.028 0.064
#> SRR1319100 1 0.0579 0.87971 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1324004 2 0.2439 0.83199 0.000 0.876 0.120 0.000 0.004
#> SRR1457459 1 0.0693 0.87745 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1421031 4 0.3990 0.84566 0.308 0.000 0.000 0.688 0.004
#> SRR1444598 5 0.3053 0.41869 0.000 0.000 0.164 0.008 0.828
#> SRR1091743 2 0.2233 0.84155 0.000 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR819637 1 0.0693 0.87870 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1083848 1 0.0451 0.88000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1088934 2 0.2439 0.83038 0.000 0.876 0.120 0.000 0.004
#> SRR1459785 3 0.4596 0.14868 0.000 0.492 0.500 0.004 0.004
#> SRR1083700 1 0.0566 0.88075 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1375531 1 0.4227 -0.18343 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1323470 4 0.5071 0.40150 0.032 0.080 0.112 0.764 0.012
#> SRR814657 1 0.3003 0.65472 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1419807 2 0.0622 0.79152 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 NA
#> SRR1467726 2 0.0717 0.79101 0.000 0.976 0.000 0.000 0.016 NA
#> SRR815446 2 0.1686 0.77102 0.000 0.924 0.000 0.000 0.064 NA
#> SRR1402132 4 0.4920 0.49400 0.044 0.000 0.000 0.668 0.040 NA
#> SRR1326059 1 0.1866 0.83613 0.908 0.000 0.000 0.084 0.000 NA
#> SRR1409062 2 0.2932 0.73747 0.000 0.820 0.164 0.000 0.000 NA
#> SRR809406 1 0.0146 0.87884 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1465313 2 0.4998 0.47945 0.000 0.648 0.056 0.000 0.268 NA
#> SRR819559 4 0.4179 0.36856 0.472 0.000 0.000 0.516 0.000 NA
#> SRR1387899 2 0.3717 0.60565 0.000 0.708 0.276 0.000 0.000 NA
#> SRR1442292 2 0.1333 0.79346 0.000 0.944 0.048 0.000 0.000 NA
#> SRR1488151 1 0.0146 0.87905 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1395635 1 0.1779 0.85095 0.920 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1343629 1 0.0291 0.87886 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1326868 2 0.2313 0.78252 0.000 0.884 0.100 0.000 0.004 NA
#> SRR1102320 4 0.3383 0.74154 0.268 0.000 0.000 0.728 0.000 NA
#> SRR1469926 3 0.2651 0.51734 0.000 0.000 0.860 0.000 0.028 NA
#> SRR1070036 1 0.4382 0.55038 0.676 0.000 0.000 0.264 0.000 NA
#> SRR1098426 1 0.2328 0.84984 0.892 0.000 0.000 0.052 0.000 NA
#> SRR1090310 2 0.4066 0.36054 0.000 0.596 0.392 0.000 0.000 NA
#> SRR1429748 4 0.4330 0.67826 0.332 0.000 0.000 0.632 0.000 NA
#> SRR1363654 1 0.3136 0.71322 0.796 0.000 0.000 0.188 0.000 NA
#> SRR1326317 2 0.3261 0.69678 0.000 0.780 0.204 0.000 0.000 NA
#> SRR1378308 2 0.2420 0.75508 0.000 0.888 0.004 0.000 0.032 NA
#> SRR1366919 4 0.2170 0.78842 0.100 0.000 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1329947 1 0.0909 0.87874 0.968 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1469769 2 0.4880 0.17910 0.000 0.564 0.376 0.000 0.004 NA
#> SRR1490761 2 0.0508 0.79587 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004 NA
#> SRR1380122 3 0.7748 -0.22562 0.000 0.240 0.292 0.004 0.288 NA
#> SRR1402944 5 0.7468 0.41914 0.000 0.220 0.204 0.004 0.412 NA
#> SRR1092818 1 0.1643 0.85655 0.924 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1093552 1 0.1349 0.86439 0.940 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1464880 2 0.3774 0.32352 0.000 0.664 0.000 0.000 0.328 NA
#> SRR1078368 2 0.1333 0.79427 0.000 0.944 0.048 0.000 0.000 NA
#> SRR1349608 2 0.1265 0.79648 0.000 0.948 0.044 0.000 0.000 NA
#> SRR1466951 2 0.1584 0.77145 0.000 0.928 0.000 0.000 0.064 NA
#> SRR1331879 2 0.3094 0.68208 0.000 0.824 0.000 0.000 0.140 NA
#> SRR1320034 3 0.2783 0.63270 0.000 0.148 0.836 0.000 0.000 NA
#> SRR1068687 2 0.1624 0.80056 0.000 0.936 0.044 0.000 0.012 NA
#> SRR1437491 1 0.0520 0.87353 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1310777 2 0.2230 0.77542 0.000 0.904 0.016 0.000 0.016 NA
#> SRR1374005 2 0.0146 0.79297 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 NA
#> SRR1319182 1 0.1498 0.87335 0.940 0.000 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR1329994 4 0.2165 0.79410 0.108 0.000 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1354203 1 0.0146 0.87757 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1077850 1 0.0865 0.87437 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1369241 2 0.1226 0.78709 0.000 0.952 0.004 0.000 0.040 NA
#> SRR1077992 2 0.2445 0.74841 0.000 0.868 0.008 0.000 0.120 NA
#> SRR1455214 1 0.0508 0.87842 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR1092014 2 0.3445 0.65686 0.000 0.744 0.244 0.000 0.000 NA
#> SRR1097857 1 0.0603 0.87914 0.980 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1473318 1 0.0777 0.87619 0.972 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1345974 3 0.2609 0.63203 0.000 0.096 0.868 0.000 0.000 NA
#> SRR1338687 2 0.2814 0.73417 0.000 0.820 0.172 0.000 0.000 NA
#> SRR1071207 4 0.2100 0.79602 0.112 0.000 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1486821 3 0.4871 0.61396 0.000 0.204 0.676 0.000 0.008 NA
#> SRR1418540 1 0.0363 0.87866 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1408788 2 0.3668 0.62749 0.000 0.744 0.228 0.000 0.000 NA
#> SRR1359487 4 0.3338 0.73515 0.064 0.000 0.000 0.844 0.032 NA
#> SRR1080648 1 0.2451 0.83218 0.884 0.000 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR1414708 1 0.2568 0.84142 0.876 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1469080 2 0.1958 0.75144 0.000 0.896 0.000 0.000 0.100 NA
#> SRR1365722 2 0.0291 0.79478 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 NA
#> SRR1448118 2 0.2571 0.74153 0.000 0.876 0.000 0.000 0.060 NA
#> SRR1444808 4 0.3387 0.79616 0.164 0.000 0.000 0.796 0.000 NA
#> SRR1321829 2 0.2968 0.73257 0.000 0.816 0.168 0.000 0.000 NA
#> SRR1475993 3 0.4033 0.59122 0.000 0.224 0.724 0.000 0.000 NA
#> SRR1445387 1 0.1700 0.84180 0.916 0.000 0.000 0.080 0.000 NA
#> SRR1077575 5 0.2848 0.69111 0.000 0.160 0.000 0.004 0.828 NA
#> SRR1349300 1 0.3088 0.70973 0.808 0.000 0.000 0.172 0.000 NA
#> SRR1374165 1 0.1285 0.86526 0.944 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1453769 2 0.0632 0.79724 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 NA
#> SRR1473870 4 0.4357 0.66642 0.340 0.000 0.000 0.624 0.000 NA
#> SRR1401146 2 0.1909 0.79851 0.000 0.920 0.052 0.000 0.024 NA
#> SRR1366124 4 0.3004 0.79454 0.112 0.000 0.012 0.848 0.000 NA
#> SRR1391811 1 0.0146 0.87757 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1456674 1 0.1890 0.85570 0.916 0.000 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR1086490 2 0.4289 0.23105 0.000 0.556 0.424 0.000 0.000 NA
#> SRR1088511 2 0.0260 0.79291 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1404577 1 0.2170 0.81709 0.888 0.000 0.000 0.100 0.000 NA
#> SRR1384431 1 0.0692 0.87533 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1072055 1 0.4992 -0.19077 0.472 0.000 0.000 0.460 0.000 NA
#> SRR1359738 2 0.4015 0.41305 0.000 0.616 0.372 0.000 0.000 NA
#> SRR1332141 1 0.0632 0.87609 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1085900 2 0.2768 0.74795 0.000 0.832 0.156 0.000 0.000 NA
#> SRR1442173 1 0.0146 0.87884 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1431625 2 0.2471 0.75420 0.000 0.888 0.004 0.000 0.056 NA
#> SRR814515 2 0.1563 0.79064 0.000 0.932 0.056 0.000 0.000 NA
#> SRR1357999 2 0.4468 -0.35661 0.000 0.492 0.004 0.000 0.484 NA
#> SRR1344034 2 0.6795 0.00671 0.000 0.480 0.280 0.000 0.124 NA
#> SRR1080391 1 0.0260 0.87921 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1347870 2 0.1980 0.79305 0.000 0.920 0.036 0.000 0.008 NA
#> SRR814028 2 0.1958 0.74988 0.000 0.896 0.000 0.000 0.100 NA
#> SRR814219 2 0.2147 0.77646 0.000 0.912 0.012 0.000 0.044 NA
#> SRR1070620 1 0.0547 0.87720 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1102128 4 0.4285 0.69175 0.320 0.000 0.000 0.644 0.000 NA
#> SRR1460211 2 0.1074 0.78813 0.000 0.960 0.000 0.000 0.028 NA
#> SRR1418346 5 0.4631 0.70389 0.000 0.320 0.000 0.000 0.620 NA
#> SRR1070060 4 0.4315 0.68404 0.328 0.000 0.000 0.636 0.000 NA
#> SRR1487969 2 0.3109 0.67397 0.000 0.812 0.000 0.004 0.168 NA
#> SRR1417851 1 0.4399 -0.08126 0.516 0.000 0.000 0.460 0.000 NA
#> SRR1443350 2 0.1173 0.79317 0.000 0.960 0.008 0.000 0.016 NA
#> SRR1403199 1 0.0891 0.87705 0.968 0.000 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR1076705 1 0.5106 0.05451 0.520 0.000 0.000 0.396 0.000 NA
#> SRR1079380 5 0.4442 0.64675 0.000 0.128 0.004 0.028 0.760 NA
#> SRR1102923 2 0.0622 0.79595 0.000 0.980 0.008 0.000 0.000 NA
#> SRR1369560 2 0.3452 0.66681 0.000 0.788 0.012 0.000 0.184 NA
#> SRR1366605 2 0.4184 0.58504 0.000 0.752 0.004 0.000 0.120 NA
#> SRR1396035 2 0.0260 0.79489 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 NA
#> SRR1390223 2 0.1649 0.78983 0.000 0.936 0.016 0.000 0.040 NA
#> SRR1436840 2 0.1970 0.78411 0.000 0.900 0.092 0.000 0.000 NA
#> SRR1445573 2 0.2649 0.74736 0.000 0.876 0.004 0.000 0.052 NA
#> SRR1375394 4 0.7829 0.34589 0.296 0.140 0.200 0.344 0.000 NA
#> SRR1431735 1 0.1745 0.86046 0.924 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1417387 1 0.0858 0.87553 0.968 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1445984 1 0.3261 0.78932 0.824 0.000 0.000 0.104 0.000 NA
#> SRR1370447 4 0.4376 0.76107 0.248 0.000 0.000 0.692 0.004 NA
#> SRR1446308 2 0.3819 0.54191 0.000 0.672 0.316 0.000 0.000 NA
#> SRR1437346 3 0.4097 0.01324 0.000 0.492 0.500 0.000 0.000 NA
#> SRR1103143 2 0.0692 0.79380 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000 NA
#> SRR1086466 1 0.1594 0.86460 0.932 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1073191 2 0.0603 0.79627 0.000 0.980 0.016 0.000 0.000 NA
#> SRR1098974 1 0.0520 0.87996 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1468914 4 0.3522 0.78655 0.128 0.000 0.000 0.800 0.000 NA
#> SRR1319584 2 0.6924 -0.46586 0.000 0.416 0.092 0.000 0.336 NA
#> SRR1486584 1 0.0858 0.87294 0.968 0.000 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR813536 1 0.4172 -0.18220 0.528 0.000 0.000 0.460 0.000 NA
#> SRR1317939 2 0.1890 0.76767 0.000 0.916 0.000 0.000 0.060 NA
#> SRR1079730 1 0.0260 0.87871 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1341921 1 0.1152 0.86691 0.952 0.000 0.000 0.044 0.000 NA
#> SRR1399178 2 0.0146 0.79393 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 NA
#> SRR1415615 1 0.0291 0.87875 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1328551 2 0.0806 0.79554 0.000 0.972 0.008 0.000 0.000 NA
#> SRR1453259 2 0.0865 0.78755 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 NA
#> SRR1340828 5 0.5377 0.69642 0.000 0.324 0.004 0.000 0.556 NA
#> SRR1079543 2 0.2218 0.77563 0.000 0.884 0.104 0.000 0.000 NA
#> SRR816427 2 0.2923 0.71471 0.000 0.848 0.000 0.000 0.100 NA
#> SRR1076681 2 0.2821 0.74264 0.000 0.832 0.152 0.000 0.000 NA
#> SRR1335314 4 0.2588 0.77737 0.092 0.000 0.000 0.876 0.008 NA
#> SRR1400799 3 0.4097 -0.00149 0.000 0.492 0.500 0.000 0.000 NA
#> SRR1074578 4 0.3874 0.79289 0.172 0.000 0.000 0.760 0.000 NA
#> SRR1312226 2 0.3972 0.60611 0.000 0.740 0.016 0.000 0.220 NA
#> SRR1416207 1 0.0632 0.87646 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1447371 1 0.0146 0.87757 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1069328 4 0.2100 0.79561 0.112 0.000 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1445023 1 0.0717 0.87962 0.976 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1077599 2 0.3287 0.68090 0.000 0.768 0.220 0.000 0.000 NA
#> SRR1453480 2 0.3168 0.69341 0.000 0.828 0.000 0.000 0.116 NA
#> SRR1101834 2 0.0508 0.79500 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 NA
#> SRR1321744 1 0.2432 0.81971 0.876 0.000 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR1074839 2 0.3134 0.74762 0.000 0.820 0.144 0.000 0.000 NA
#> SRR1458727 5 0.4137 0.44322 0.000 0.000 0.080 0.028 0.780 NA
#> SRR1436949 2 0.4664 0.30073 0.000 0.644 0.000 0.000 0.280 NA
#> SRR1070429 2 0.4076 0.33882 0.000 0.592 0.396 0.000 0.000 NA
#> SRR1458158 1 0.2146 0.80409 0.880 0.000 0.000 0.116 0.000 NA
#> SRR1432408 4 0.3741 0.74241 0.080 0.000 0.080 0.816 0.004 NA
#> SRR1310334 1 0.0692 0.87593 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1418201 3 0.2865 0.53464 0.000 0.008 0.840 0.000 0.012 NA
#> SRR1385434 4 0.2053 0.79339 0.108 0.000 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1415591 2 0.4249 0.27687 0.000 0.568 0.416 0.000 0.004 NA
#> SRR1402009 1 0.0717 0.87962 0.976 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1316055 1 0.6986 -0.10569 0.436 0.000 0.104 0.300 0.000 NA
#> SRR1308734 3 0.5516 0.51618 0.000 0.284 0.588 0.000 0.020 NA
#> SRR1498973 2 0.4326 0.55178 0.000 0.732 0.004 0.000 0.168 NA
#> SRR1397115 1 0.0405 0.87910 0.988 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1392141 1 0.1686 0.85678 0.924 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR814341 2 0.2721 0.74071 0.000 0.868 0.004 0.000 0.040 NA
#> SRR1313601 2 0.3000 0.74356 0.000 0.824 0.156 0.000 0.004 NA
#> SRR1459609 2 0.2278 0.76394 0.000 0.900 0.004 0.000 0.044 NA
#> SRR1499325 3 0.4840 0.61151 0.000 0.148 0.696 0.000 0.012 NA
#> SRR809919 1 0.0547 0.87679 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1370818 4 0.2843 0.79543 0.116 0.000 0.000 0.848 0.000 NA
#> SRR1323651 2 0.3867 0.57134 0.000 0.688 0.296 0.000 0.004 NA
#> SRR1357297 1 0.3575 0.50584 0.708 0.000 0.000 0.284 0.000 NA
#> SRR818170 3 0.5160 0.23675 0.000 0.000 0.572 0.000 0.108 NA
#> SRR1091230 2 0.3290 0.69408 0.000 0.776 0.208 0.000 0.000 NA
#> SRR1470556 2 0.1421 0.78260 0.000 0.944 0.000 0.000 0.028 NA
#> SRR812318 1 0.0363 0.87797 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1095285 3 0.4363 0.47091 0.000 0.324 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1317731 3 0.5803 0.47629 0.000 0.256 0.588 0.000 0.040 NA
#> SRR1490785 1 0.0458 0.87872 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1432032 1 0.4159 0.14478 0.588 0.000 0.000 0.396 0.000 NA
#> SRR1447808 1 0.1757 0.84517 0.916 0.000 0.000 0.076 0.000 NA
#> SRR809534 2 0.1933 0.77470 0.000 0.920 0.004 0.000 0.044 NA
#> SRR1397312 2 0.4082 0.73412 0.000 0.776 0.092 0.004 0.120 NA
#> SRR812128 2 0.4475 0.46905 0.000 0.700 0.000 0.000 0.200 NA
#> SRR1101513 1 0.0146 0.87884 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1415708 2 0.1967 0.78566 0.000 0.904 0.084 0.000 0.000 NA
#> SRR1316033 3 0.3994 0.62182 0.000 0.116 0.776 0.000 0.008 NA
#> SRR1390371 2 0.2789 0.73780 0.000 0.864 0.004 0.000 0.044 NA
#> SRR1480263 2 0.3953 0.60422 0.000 0.764 0.000 0.000 0.132 NA
#> SRR1464473 3 0.3042 0.56598 0.000 0.032 0.836 0.000 0.004 NA
#> SRR1076801 1 0.2801 0.81661 0.860 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1080044 1 0.0363 0.87797 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1420850 2 0.2563 0.75574 0.000 0.884 0.008 0.000 0.040 NA
#> SRR1474295 1 0.3955 -0.04157 0.560 0.000 0.000 0.436 0.000 NA
#> SRR1069871 1 0.1010 0.87222 0.960 0.000 0.000 0.036 0.000 NA
#> SRR1095744 5 0.4864 0.71728 0.000 0.256 0.000 0.004 0.648 NA
#> SRR1068929 2 0.1845 0.77261 0.000 0.916 0.008 0.000 0.072 NA
#> SRR1490097 2 0.2277 0.75265 0.000 0.892 0.000 0.000 0.076 NA
#> SRR1075054 2 0.4199 0.57851 0.000 0.748 0.004 0.000 0.148 NA
#> SRR1083480 1 0.0260 0.87779 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1075458 1 0.2997 0.80138 0.844 0.000 0.000 0.096 0.000 NA
#> SRR1417023 1 0.5492 0.57272 0.668 0.000 0.064 0.136 0.000 NA
#> SRR1309333 2 0.3324 0.69684 0.000 0.824 0.004 0.000 0.060 NA
#> SRR1333676 4 0.3766 0.79015 0.212 0.000 0.000 0.748 0.000 NA
#> SRR1352996 4 0.4169 0.42276 0.456 0.000 0.000 0.532 0.000 NA
#> SRR1093172 4 0.2867 0.78996 0.112 0.000 0.000 0.848 0.000 NA
#> SRR1413137 4 0.3825 0.79031 0.160 0.000 0.000 0.768 0.000 NA
#> SRR1469973 2 0.2418 0.78964 0.000 0.884 0.096 0.004 0.008 NA
#> SRR1420026 2 0.3123 0.70245 0.000 0.836 0.000 0.000 0.088 NA
#> SRR817306 4 0.2538 0.79963 0.124 0.000 0.000 0.860 0.000 NA
#> SRR1416266 4 0.4048 0.68246 0.048 0.000 0.000 0.796 0.080 NA
#> SRR1071011 2 0.0713 0.78849 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 NA
#> SRR1090290 4 0.2357 0.79756 0.116 0.000 0.000 0.872 0.000 NA
#> SRR1435394 2 0.3348 0.68439 0.000 0.768 0.216 0.000 0.000 NA
#> SRR1383192 4 0.4377 0.70130 0.312 0.000 0.000 0.644 0.000 NA
#> SRR1419962 3 0.2890 0.53309 0.000 0.012 0.848 0.000 0.016 NA
#> SRR1094357 1 0.0146 0.87757 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1081639 3 0.3604 0.46421 0.000 0.000 0.788 0.008 0.036 NA
#> SRR1356016 2 0.1616 0.77764 0.000 0.932 0.000 0.000 0.048 NA
#> SRR1351082 2 0.2505 0.75826 0.000 0.888 0.008 0.000 0.040 NA
#> SRR1397348 5 0.5870 0.65120 0.000 0.324 0.016 0.000 0.516 NA
#> SRR1312147 1 0.2688 0.83033 0.868 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1473891 2 0.1485 0.79585 0.000 0.944 0.028 0.000 0.004 NA
#> SRR1335470 4 0.3587 0.79145 0.140 0.000 0.000 0.792 0.000 NA
#> SRR1474930 2 0.3853 0.56000 0.000 0.680 0.304 0.000 0.000 NA
#> SRR1470988 4 0.4294 0.49435 0.428 0.000 0.000 0.552 0.000 NA
#> SRR811915 2 0.0551 0.79558 0.000 0.984 0.004 0.000 0.004 NA
#> SRR1104987 1 0.0146 0.87884 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1100005 2 0.0717 0.79270 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 NA
#> SRR1444436 2 0.2636 0.76514 0.000 0.860 0.120 0.000 0.004 NA
#> SRR1313770 3 0.4579 0.41173 0.000 0.004 0.696 0.000 0.092 NA
#> SRR1315780 2 0.3985 0.70069 0.000 0.760 0.140 0.000 0.000 NA
#> SRR1073631 1 0.0508 0.87765 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR819124 4 0.3684 0.67879 0.332 0.000 0.000 0.664 0.000 NA
#> SRR1310997 5 0.4146 0.69335 0.000 0.180 0.000 0.016 0.752 NA
#> SRR1464494 2 0.5417 -0.42303 0.000 0.464 0.000 0.000 0.420 NA
#> SRR1357083 2 0.4076 0.42051 0.000 0.620 0.364 0.000 0.000 NA
#> SRR1475842 2 0.1649 0.78495 0.000 0.936 0.008 0.000 0.016 NA
#> SRR1378085 1 0.1856 0.86910 0.920 0.000 0.000 0.048 0.000 NA
#> SRR1378220 2 0.3998 0.48402 0.000 0.644 0.340 0.000 0.000 NA
#> SRR1467704 1 0.3588 0.74345 0.788 0.000 0.000 0.152 0.000 NA
#> SRR1348885 5 0.7513 0.64187 0.004 0.220 0.024 0.108 0.468 NA
#> SRR1325826 1 0.2053 0.81763 0.888 0.000 0.000 0.108 0.000 NA
#> SRR1466812 4 0.4338 0.32858 0.484 0.000 0.000 0.496 0.000 NA
#> SRR1345692 2 0.1829 0.77839 0.000 0.920 0.012 0.000 0.064 NA
#> SRR1401040 3 0.2968 0.62360 0.000 0.168 0.816 0.000 0.000 NA
#> SRR1097954 1 0.0291 0.87875 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1374396 4 0.2401 0.75893 0.072 0.000 0.000 0.892 0.028 NA
#> SRR1454073 2 0.2328 0.78660 0.000 0.892 0.056 0.000 0.000 NA
#> SRR1355747 1 0.1524 0.86056 0.932 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1429368 3 0.3618 0.63853 0.000 0.176 0.776 0.000 0.000 NA
#> SRR1398138 2 0.2706 0.74217 0.000 0.832 0.160 0.000 0.000 NA
#> SRR1379260 1 0.2629 0.83646 0.872 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1361436 3 0.4175 0.14068 0.000 0.464 0.524 0.000 0.000 NA
#> SRR817142 2 0.3431 0.67175 0.000 0.756 0.228 0.000 0.000 NA
#> SRR1315291 3 0.7245 -0.03457 0.056 0.000 0.400 0.360 0.036 NA
#> SRR1309314 3 0.4106 0.43081 0.000 0.000 0.736 0.000 0.076 NA
#> SRR1420085 2 0.1737 0.79066 0.000 0.932 0.020 0.000 0.040 NA
#> SRR1361308 3 0.2814 0.62498 0.000 0.172 0.820 0.000 0.000 NA
#> SRR1472126 1 0.1806 0.83700 0.908 0.000 0.000 0.088 0.000 NA
#> SRR1380482 5 0.6053 0.61474 0.000 0.348 0.052 0.000 0.508 NA
#> SRR1099789 1 0.0363 0.87928 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR1079480 5 0.4667 0.71459 0.000 0.308 0.000 0.004 0.632 NA
#> SRR1339276 1 0.0146 0.87757 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1418368 1 0.0000 0.87810 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1399353 1 0.1625 0.86090 0.928 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR1096760 2 0.3852 0.52484 0.000 0.664 0.324 0.000 0.000 NA
#> SRR1440290 2 0.3470 0.64792 0.000 0.740 0.248 0.000 0.000 NA
#> SRR1330813 2 0.3141 0.70070 0.000 0.788 0.200 0.000 0.000 NA
#> SRR1458931 2 0.1410 0.78980 0.000 0.944 0.008 0.000 0.004 NA
#> SRR812294 4 0.2053 0.79339 0.108 0.000 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1394321 1 0.1492 0.87448 0.940 0.000 0.000 0.036 0.000 NA
#> SRR1081160 2 0.1701 0.78861 0.000 0.920 0.072 0.000 0.000 NA
#> SRR1469704 2 0.2752 0.72052 0.000 0.856 0.000 0.000 0.108 NA
#> SRR1349342 1 0.0260 0.87871 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1477173 2 0.0806 0.79786 0.000 0.972 0.020 0.000 0.000 NA
#> SRR1086752 2 0.3030 0.72047 0.000 0.848 0.004 0.000 0.056 NA
#> SRR1084698 2 0.2660 0.73452 0.000 0.868 0.000 0.000 0.084 NA
#> SRR1390143 1 0.3468 0.51446 0.712 0.000 0.000 0.284 0.000 NA
#> SRR1390413 2 0.1850 0.79361 0.000 0.924 0.052 0.000 0.016 NA
#> SRR1099570 3 0.4709 0.29295 0.000 0.412 0.540 0.000 0.000 NA
#> SRR1312169 4 0.4322 0.43142 0.452 0.000 0.000 0.528 0.000 NA
#> SRR1096687 1 0.3376 0.63606 0.764 0.000 0.000 0.220 0.000 NA
#> SRR1486139 1 0.0622 0.87325 0.980 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1470313 4 0.5537 0.44050 0.368 0.000 0.000 0.492 0.000 NA
#> SRR1447893 2 0.3816 0.57134 0.000 0.688 0.296 0.000 0.000 NA
#> SRR1466025 2 0.6500 -0.16670 0.000 0.484 0.044 0.020 0.352 NA
#> SRR1477429 1 0.1588 0.84892 0.924 0.000 0.000 0.072 0.000 NA
#> SRR1445701 2 0.3916 0.55953 0.000 0.680 0.300 0.000 0.000 NA
#> SRR820689 1 0.0820 0.87982 0.972 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR1451876 2 0.2723 0.76006 0.000 0.852 0.128 0.000 0.004 NA
#> SRR1452537 2 0.1296 0.79768 0.000 0.952 0.032 0.000 0.004 NA
#> SRR1383301 1 0.4715 0.08109 0.536 0.000 0.000 0.416 0.000 NA
#> SRR1489328 2 0.1765 0.79893 0.000 0.924 0.052 0.000 0.000 NA
#> SRR1344462 1 0.0146 0.87837 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1082709 1 0.0146 0.87837 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1447784 1 0.0725 0.87637 0.976 0.000 0.012 0.000 0.000 NA
#> SRR1355769 4 0.4175 0.35631 0.464 0.000 0.000 0.524 0.000 NA
#> SRR1488237 2 0.2094 0.75953 0.000 0.900 0.000 0.000 0.080 NA
#> SRR1391985 2 0.2490 0.76435 0.000 0.892 0.012 0.000 0.044 NA
#> SRR1478501 1 0.0547 0.87679 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1480917 2 0.2944 0.78038 0.000 0.856 0.068 0.000 0.072 NA
#> SRR1474485 4 0.3522 0.79007 0.172 0.000 0.000 0.784 0.000 NA
#> SRR1089998 1 0.0291 0.87875 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1318140 1 0.1349 0.85992 0.940 0.000 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR1319262 2 0.3969 0.50158 0.000 0.652 0.332 0.000 0.000 NA
#> SRR1095188 2 0.2841 0.73385 0.000 0.824 0.164 0.000 0.000 NA
#> SRR1454350 1 0.0717 0.86892 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1440374 1 0.0146 0.87837 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1359565 3 0.4328 0.14887 0.000 0.460 0.520 0.000 0.000 NA
#> SRR1105417 1 0.2902 0.69975 0.800 0.000 0.000 0.196 0.000 NA
#> SRR1325578 2 0.6181 0.18026 0.000 0.532 0.304 0.000 0.076 NA
#> SRR1358161 3 0.4800 0.58683 0.000 0.104 0.712 0.000 0.024 NA
#> SRR1358665 2 0.1285 0.78007 0.000 0.944 0.000 0.000 0.052 NA
#> SRR1333971 2 0.3133 0.62848 0.000 0.780 0.000 0.000 0.212 NA
#> SRR1452010 4 0.4122 0.78428 0.212 0.000 0.000 0.724 0.000 NA
#> SRR1418183 2 0.3584 0.65159 0.000 0.740 0.244 0.000 0.004 NA
#> SRR1366345 1 0.0508 0.87557 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1387449 1 0.1806 0.83293 0.908 0.000 0.000 0.088 0.000 NA
#> SRR1473461 4 0.3725 0.68237 0.316 0.000 0.000 0.676 0.000 NA
#> SRR1090837 2 0.4037 0.38935 0.000 0.608 0.380 0.000 0.000 NA
#> SRR1447828 3 0.3680 0.63962 0.000 0.144 0.784 0.000 0.000 NA
#> SRR1338747 2 0.1938 0.77397 0.000 0.920 0.004 0.000 0.040 NA
#> SRR1333038 3 0.5152 0.46020 0.000 0.376 0.532 0.000 0.000 NA
#> SRR1350280 1 0.3231 0.67073 0.784 0.000 0.000 0.200 0.000 NA
#> SRR1088557 1 0.1745 0.84804 0.920 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1102656 2 0.2487 0.74236 0.000 0.876 0.000 0.000 0.092 NA
#> SRR1441443 2 0.3004 0.73954 0.000 0.848 0.028 0.000 0.112 NA
#> SRR1370682 3 0.2507 0.61739 0.000 0.072 0.884 0.000 0.004 NA
#> SRR1475448 2 0.4168 0.32575 0.000 0.584 0.400 0.000 0.000 NA
#> SRR1407291 1 0.3954 0.28839 0.636 0.000 0.000 0.352 0.000 NA
#> SRR1405266 1 0.2053 0.81597 0.888 0.000 0.000 0.108 0.000 NA
#> SRR1363766 1 0.0806 0.87546 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1082592 5 0.6426 0.62922 0.000 0.348 0.036 0.008 0.472 NA
#> SRR1325794 2 0.3808 0.73821 0.000 0.792 0.088 0.000 0.112 NA
#> SRR1095961 2 0.3993 0.34579 0.000 0.592 0.400 0.000 0.000 NA
#> SRR1086702 2 0.2405 0.77570 0.000 0.880 0.100 0.000 0.004 NA
#> SRR1320806 2 0.3881 0.74894 0.000 0.792 0.136 0.000 0.036 NA
#> SRR1457527 3 0.1918 0.62397 0.000 0.088 0.904 0.000 0.000 NA
#> SRR1098831 2 0.0806 0.79693 0.000 0.972 0.020 0.000 0.000 NA
#> SRR1474374 3 0.3081 0.60829 0.000 0.220 0.776 0.000 0.000 NA
#> SRR1488858 4 0.3172 0.79726 0.148 0.000 0.000 0.816 0.000 NA
#> SRR1454695 1 0.2933 0.69746 0.796 0.000 0.000 0.200 0.000 NA
#> SRR1090241 2 0.2581 0.76071 0.000 0.856 0.128 0.000 0.000 NA
#> SRR1329863 2 0.0458 0.79599 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 NA
#> SRR1357733 1 0.0632 0.87609 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1362135 4 0.4407 0.23211 0.480 0.000 0.000 0.496 0.000 NA
#> SRR1379581 3 0.2538 0.50982 0.000 0.000 0.860 0.000 0.016 NA
#> SRR1309182 1 0.4429 -0.07711 0.548 0.000 0.000 0.424 0.000 NA
#> SRR1437668 1 0.1584 0.86218 0.928 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1084742 5 0.5739 0.60985 0.000 0.392 0.000 0.008 0.468 NA
#> SRR1433538 4 0.4078 0.66555 0.340 0.000 0.000 0.640 0.000 NA
#> SRR1085063 2 0.2432 0.73824 0.000 0.876 0.000 0.000 0.100 NA
#> SRR1454247 5 0.4146 0.72437 0.000 0.288 0.000 0.004 0.680 NA
#> SRR1097100 2 0.0508 0.79229 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 NA
#> SRR818622 2 0.3261 0.69678 0.000 0.780 0.204 0.000 0.000 NA
#> SRR1072388 1 0.3167 0.78871 0.832 0.000 0.000 0.096 0.000 NA
#> SRR1070332 2 0.3794 0.54084 0.000 0.744 0.000 0.000 0.216 NA
#> SRR1320761 2 0.6095 0.46050 0.000 0.612 0.120 0.000 0.120 NA
#> SRR1076195 4 0.2060 0.77328 0.084 0.000 0.000 0.900 0.000 NA
#> SRR1069895 2 0.3514 0.66670 0.000 0.752 0.228 0.000 0.000 NA
#> SRR1099144 1 0.2003 0.86607 0.912 0.000 0.000 0.044 0.000 NA
#> SRR1385150 2 0.4332 0.43243 0.000 0.616 0.352 0.000 0.000 NA
#> SRR1420191 2 0.0547 0.79645 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 NA
#> SRR1332625 4 0.1908 0.78492 0.096 0.000 0.000 0.900 0.000 NA
#> SRR1102583 1 0.1753 0.83959 0.912 0.000 0.000 0.084 0.000 NA
#> SRR1456971 1 0.3396 0.77696 0.812 0.000 0.000 0.116 0.000 NA
#> SRR1340574 1 0.0291 0.87674 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1444830 2 0.2980 0.71629 0.000 0.800 0.192 0.000 0.000 NA
#> SRR1096267 1 0.0146 0.87847 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1087127 5 0.5587 0.53430 0.000 0.092 0.120 0.004 0.676 NA
#> SRR1408553 4 0.3645 0.79229 0.152 0.000 0.000 0.784 0.000 NA
#> SRR1069231 1 0.4756 0.01911 0.540 0.000 0.000 0.408 0.000 NA
#> SRR1325642 2 0.0820 0.79214 0.000 0.972 0.000 0.000 0.016 NA
#> SRR1362103 1 0.2506 0.84150 0.880 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1321942 1 0.0692 0.87704 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1094380 1 0.1049 0.87145 0.960 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1447499 2 0.1789 0.79782 0.000 0.924 0.044 0.000 0.000 NA
#> SRR1099330 2 0.2896 0.73879 0.000 0.824 0.160 0.000 0.000 NA
#> SRR1077874 2 0.1958 0.74797 0.000 0.896 0.000 0.000 0.100 NA
#> SRR808299 2 0.0806 0.79664 0.000 0.972 0.020 0.000 0.000 NA
#> SRR1098050 5 0.3674 0.66631 0.000 0.132 0.000 0.020 0.804 NA
#> SRR1481238 2 0.2594 0.79330 0.000 0.880 0.060 0.000 0.056 NA
#> SRR1443568 2 0.3403 0.68636 0.000 0.768 0.212 0.000 0.000 NA
#> SRR1380249 4 0.2266 0.79361 0.108 0.000 0.000 0.880 0.000 NA
#> SRR1080143 1 0.1349 0.86158 0.940 0.000 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR1383148 4 0.2234 0.80024 0.124 0.000 0.000 0.872 0.000 NA
#> SRR1357042 1 0.0622 0.88109 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR1416025 2 0.3097 0.74952 0.000 0.856 0.028 0.000 0.036 NA
#> SRR1431015 2 0.1970 0.78053 0.000 0.920 0.008 0.000 0.044 NA
#> SRR1078709 2 0.2216 0.78582 0.000 0.908 0.024 0.000 0.052 NA
#> SRR813283 1 0.0000 0.87810 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1430226 2 0.0922 0.79220 0.000 0.968 0.004 0.000 0.004 NA
#> SRR1070665 1 0.0260 0.87856 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1466927 2 0.0405 0.79557 0.000 0.988 0.008 0.000 0.000 NA
#> SRR1347707 4 0.7566 -0.01597 0.008 0.020 0.100 0.456 0.184 NA
#> SRR807679 1 0.1895 0.84835 0.912 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1333811 2 0.5463 0.31415 0.000 0.576 0.312 0.000 0.020 NA
#> SRR1078660 2 0.4242 0.72340 0.000 0.784 0.084 0.004 0.092 NA
#> SRR1331730 2 0.0972 0.78799 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028 NA
#> SRR1333913 1 0.2039 0.84387 0.904 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1432542 1 0.3261 0.78127 0.824 0.000 0.000 0.104 0.000 NA
#> SRR1418041 1 0.0777 0.87423 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR1085211 1 0.0363 0.87835 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1339812 2 0.2468 0.75546 0.000 0.888 0.004 0.000 0.048 NA
#> SRR1402437 1 0.1829 0.86226 0.920 0.000 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR1350958 2 0.2312 0.77243 0.000 0.876 0.112 0.000 0.000 NA
#> SRR1396822 2 0.3470 0.64648 0.000 0.740 0.248 0.000 0.000 NA
#> SRR1441934 2 0.2494 0.76531 0.000 0.864 0.120 0.000 0.000 NA
#> SRR1472552 3 0.3853 0.53006 0.000 0.304 0.680 0.000 0.000 NA
#> SRR1488881 3 0.3766 0.53325 0.000 0.304 0.684 0.000 0.000 NA
#> SRR1102973 1 0.0146 0.87847 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1071131 2 0.3766 0.62937 0.000 0.720 0.256 0.000 0.000 NA
#> SRR1074502 1 0.0291 0.87925 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1325271 1 0.4929 0.38860 0.608 0.000 0.000 0.300 0.000 NA
#> SRR1409171 2 0.0520 0.79593 0.000 0.984 0.008 0.000 0.000 NA
#> SRR809113 2 0.1642 0.79858 0.000 0.936 0.032 0.000 0.028 NA
#> SRR1430045 2 0.1636 0.78395 0.000 0.936 0.004 0.000 0.024 NA
#> SRR1441245 2 0.0891 0.79606 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000 NA
#> SRR1384091 4 0.2696 0.79641 0.116 0.000 0.000 0.856 0.000 NA
#> SRR1431887 2 0.3228 0.73204 0.000 0.844 0.020 0.000 0.044 NA
#> SRR1096525 4 0.3673 0.73666 0.076 0.000 0.000 0.820 0.032 NA
#> SRR1488491 2 0.2326 0.78011 0.000 0.888 0.092 0.000 0.008 NA
#> SRR1356351 2 0.3473 0.73919 0.000 0.804 0.048 0.000 0.144 NA
#> SRR1369514 4 0.3215 0.76475 0.240 0.000 0.000 0.756 0.000 NA
#> SRR1453299 3 0.4281 0.60985 0.000 0.228 0.704 0.000 0.000 NA
#> SRR1436300 1 0.0260 0.87871 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1348490 2 0.4923 -0.23202 0.000 0.496 0.016 0.000 0.456 NA
#> SRR1091767 2 0.0820 0.79243 0.000 0.972 0.000 0.000 0.012 NA
#> SRR1354467 3 0.4026 0.42412 0.000 0.376 0.612 0.000 0.000 NA
#> SRR1069074 2 0.2948 0.71735 0.000 0.804 0.188 0.000 0.000 NA
#> SRR1452399 2 0.3141 0.70753 0.000 0.788 0.200 0.000 0.000 NA
#> SRR1437430 3 0.4546 0.61486 0.000 0.132 0.728 0.000 0.012 NA
#> SRR1419736 5 0.3641 0.71921 0.000 0.224 0.000 0.000 0.748 NA
#> SRR1313343 3 0.3566 0.62438 0.000 0.104 0.800 0.000 0.000 NA
#> SRR1077619 4 0.2740 0.79740 0.120 0.000 0.000 0.852 0.000 NA
#> SRR1083530 1 0.1594 0.86460 0.932 0.000 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR1333633 2 0.6303 0.27581 0.000 0.584 0.132 0.000 0.172 NA
#> SRR1354999 2 0.3348 0.68391 0.000 0.768 0.216 0.000 0.000 NA
#> SRR1443592 2 0.1780 0.77271 0.000 0.924 0.000 0.000 0.048 NA
#> SRR1077356 1 0.0692 0.87702 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1378818 5 0.3843 0.48946 0.000 0.008 0.064 0.004 0.792 NA
#> SRR1413182 4 0.1982 0.75264 0.068 0.000 0.000 0.912 0.004 NA
#> SRR1464559 4 0.3893 0.78078 0.156 0.000 0.000 0.764 0.000 NA
#> SRR1413075 5 0.4218 0.63636 0.000 0.360 0.000 0.000 0.616 NA
#> SRR1487928 4 0.4802 0.59418 0.048 0.000 0.028 0.704 0.008 NA
#> SRR1388997 2 0.1930 0.76963 0.000 0.916 0.000 0.000 0.048 NA
#> SRR1092865 2 0.3221 0.70961 0.000 0.792 0.188 0.000 0.000 NA
#> SRR1102729 1 0.0692 0.87899 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1456423 1 0.0858 0.87411 0.968 0.000 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR1321591 2 0.0806 0.79367 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020 NA
#> SRR1376874 3 0.1982 0.56996 0.000 0.016 0.912 0.000 0.004 NA
#> SRR1339903 1 0.0547 0.87816 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR1346710 1 0.2846 0.81087 0.856 0.000 0.000 0.084 0.000 NA
#> SRR1418771 2 0.0632 0.79059 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 NA
#> SRR1095358 2 0.1477 0.79602 0.000 0.940 0.048 0.000 0.008 NA
#> SRR1480941 2 0.4917 0.45215 0.000 0.620 0.308 0.060 0.000 NA
#> SRR1479175 2 0.0458 0.79585 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 NA
#> SRR1313891 2 0.1970 0.75218 0.000 0.900 0.000 0.000 0.092 NA
#> SRR1491354 1 0.4250 -0.17994 0.528 0.000 0.000 0.456 0.000 NA
#> SRR1433884 2 0.2778 0.73549 0.000 0.824 0.168 0.000 0.000 NA
#> SRR1471074 2 0.1599 0.78693 0.000 0.940 0.008 0.000 0.028 NA
#> SRR1353052 2 0.2051 0.79284 0.000 0.916 0.040 0.000 0.008 NA
#> SRR1355554 2 0.3788 0.66628 0.000 0.740 0.232 0.000 0.008 NA
#> SRR1487173 1 0.0603 0.87502 0.980 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1474253 1 0.1531 0.85132 0.928 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1322918 2 0.0717 0.79602 0.000 0.976 0.008 0.000 0.000 NA
#> SRR1318331 2 0.3273 0.75296 0.000 0.844 0.048 0.000 0.024 NA
#> SRR1321333 3 0.3955 0.40199 0.000 0.384 0.608 0.000 0.000 NA
#> SRR1474231 1 0.1297 0.86962 0.948 0.000 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR1350545 1 0.3784 0.42709 0.680 0.000 0.000 0.308 0.000 NA
#> SRR1091328 1 0.1950 0.85896 0.912 0.000 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR814447 3 0.3134 0.47003 0.000 0.000 0.820 0.000 0.036 NA
#> SRR1455989 2 0.3595 0.59439 0.000 0.704 0.288 0.000 0.000 NA
#> SRR1453680 3 0.2051 0.54487 0.000 0.004 0.896 0.000 0.004 NA
#> SRR1470356 2 0.1285 0.78060 0.000 0.944 0.000 0.000 0.052 NA
#> SRR1342977 2 0.0622 0.79629 0.000 0.980 0.012 0.000 0.000 NA
#> SRR1444222 2 0.2843 0.76631 0.000 0.848 0.116 0.000 0.000 NA
#> SRR1097197 1 0.1643 0.84816 0.924 0.000 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR1366729 3 0.2214 0.55521 0.000 0.012 0.892 0.000 0.004 NA
#> SRR821282 3 0.3341 0.62814 0.000 0.116 0.816 0.000 0.000 NA
#> SRR1074602 2 0.3171 0.69770 0.000 0.784 0.204 0.000 0.000 NA
#> SRR814633 2 0.1124 0.79613 0.000 0.956 0.036 0.000 0.000 NA
#> SRR1072480 3 0.5703 0.58596 0.000 0.180 0.624 0.012 0.016 NA
#> SRR1319100 1 0.0713 0.87540 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1324004 2 0.3867 0.56583 0.000 0.688 0.296 0.000 0.004 NA
#> SRR1457459 1 0.0260 0.87779 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1421031 4 0.2872 0.80115 0.140 0.000 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1444598 5 0.4695 0.34806 0.000 0.000 0.208 0.000 0.676 NA
#> SRR1091743 2 0.3037 0.72480 0.000 0.808 0.176 0.000 0.000 NA
#> SRR819637 1 0.0935 0.87431 0.964 0.000 0.000 0.004 0.000 NA
#> SRR1083848 1 0.0146 0.87837 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1088934 2 0.3541 0.62906 0.000 0.728 0.260 0.000 0.000 NA
#> SRR1459785 3 0.3745 0.59143 0.000 0.240 0.732 0.000 0.000 NA
#> SRR1083700 1 0.1265 0.86871 0.948 0.000 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR1375531 1 0.3999 -0.29353 0.500 0.000 0.000 0.496 0.000 NA
#> SRR1323470 4 0.5394 0.34329 0.012 0.080 0.176 0.684 0.000 NA
#> SRR814657 1 0.3629 0.51981 0.712 0.000 0.000 0.276 0.000 NA
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0