Date: 2019-12-25 22:45:02 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 17262 475
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| CV:NMF | 2 | 1.000 | 0.971 | 0.988 | ** | |
| ATC:pam | 2 | 1.000 | 0.979 | 0.991 | ** | |
| ATC:mclust | 4 | 0.987 | 0.949 | 0.974 | ** | 3 |
| MAD:NMF | 2 | 0.987 | 0.961 | 0.984 | ** | |
| MAD:mclust | 2 | 0.982 | 0.956 | 0.981 | ** | |
| MAD:kmeans | 2 | 0.961 | 0.953 | 0.981 | ** | |
| SD:kmeans | 2 | 0.961 | 0.940 | 0.976 | ** | |
| SD:pam | 3 | 0.958 | 0.929 | 0.972 | ** | 2 |
| ATC:NMF | 2 | 0.952 | 0.945 | 0.977 | ** | |
| MAD:pam | 3 | 0.941 | 0.930 | 0.972 | * | 2 |
| ATC:kmeans | 4 | 0.935 | 0.903 | 0.960 | * | 2 |
| CV:kmeans | 3 | 0.932 | 0.909 | 0.956 | * | |
| SD:NMF | 3 | 0.930 | 0.935 | 0.973 | * | 2 |
| CV:skmeans | 3 | 0.927 | 0.924 | 0.968 | * | |
| SD:skmeans | 3 | 0.924 | 0.912 | 0.964 | * | |
| ATC:skmeans | 6 | 0.904 | 0.858 | 0.930 | * | 2,4 |
| MAD:skmeans | 3 | 0.904 | 0.889 | 0.957 | * | 2 |
| SD:mclust | 3 | 0.813 | 0.865 | 0.945 | ||
| CV:pam | 3 | 0.739 | 0.823 | 0.924 | ||
| CV:mclust | 3 | 0.672 | 0.810 | 0.922 | ||
| ATC:hclust | 2 | 0.546 | 0.820 | 0.910 | ||
| CV:hclust | 3 | 0.465 | 0.701 | 0.857 | ||
| MAD:hclust | 2 | 0.390 | 0.821 | 0.895 | ||
| SD:hclust | 3 | 0.348 | 0.662 | 0.822 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 1.000 0.965 0.986 0.446 0.557 0.557
#> CV:NMF 2 1.000 0.971 0.988 0.457 0.543 0.543
#> MAD:NMF 2 0.987 0.961 0.984 0.442 0.562 0.562
#> ATC:NMF 2 0.952 0.945 0.977 0.483 0.517 0.517
#> SD:skmeans 2 0.885 0.912 0.965 0.481 0.521 0.521
#> CV:skmeans 2 0.477 0.651 0.828 0.485 0.525 0.525
#> MAD:skmeans 2 0.901 0.911 0.966 0.481 0.521 0.521
#> ATC:skmeans 2 1.000 0.989 0.996 0.501 0.499 0.499
#> SD:mclust 2 0.530 0.782 0.886 0.386 0.632 0.632
#> CV:mclust 2 0.473 0.760 0.872 0.447 0.511 0.511
#> MAD:mclust 2 0.982 0.956 0.981 0.350 0.643 0.643
#> ATC:mclust 2 0.897 0.949 0.951 0.346 0.664 0.664
#> SD:kmeans 2 0.961 0.940 0.976 0.424 0.587 0.587
#> CV:kmeans 2 0.566 0.880 0.924 0.402 0.611 0.611
#> MAD:kmeans 2 0.961 0.953 0.981 0.424 0.580 0.580
#> ATC:kmeans 2 1.000 0.987 0.995 0.498 0.502 0.502
#> SD:pam 2 0.905 0.912 0.966 0.434 0.565 0.565
#> CV:pam 2 0.511 0.852 0.909 0.374 0.660 0.660
#> MAD:pam 2 0.914 0.924 0.970 0.430 0.577 0.577
#> ATC:pam 2 1.000 0.979 0.991 0.475 0.526 0.526
#> SD:hclust 2 0.177 0.630 0.791 0.424 0.526 0.526
#> CV:hclust 2 0.849 0.921 0.961 0.156 0.889 0.889
#> MAD:hclust 2 0.390 0.821 0.895 0.457 0.550 0.550
#> ATC:hclust 2 0.546 0.820 0.910 0.462 0.521 0.521
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.930 0.935 0.973 0.460 0.750 0.568
#> CV:NMF 3 0.787 0.885 0.942 0.443 0.729 0.531
#> MAD:NMF 3 0.896 0.919 0.966 0.469 0.739 0.556
#> ATC:NMF 3 0.693 0.792 0.894 0.320 0.792 0.616
#> SD:skmeans 3 0.924 0.912 0.964 0.377 0.723 0.512
#> CV:skmeans 3 0.927 0.924 0.968 0.354 0.719 0.511
#> MAD:skmeans 3 0.904 0.889 0.957 0.377 0.738 0.531
#> ATC:skmeans 3 0.816 0.875 0.940 0.272 0.824 0.661
#> SD:mclust 3 0.813 0.865 0.945 0.635 0.652 0.486
#> CV:mclust 3 0.672 0.810 0.922 0.361 0.732 0.542
#> MAD:mclust 3 0.814 0.878 0.948 0.801 0.654 0.493
#> ATC:mclust 3 0.925 0.916 0.966 0.840 0.684 0.529
#> SD:kmeans 3 0.874 0.893 0.955 0.513 0.765 0.604
#> CV:kmeans 3 0.932 0.909 0.956 0.503 0.704 0.545
#> MAD:kmeans 3 0.874 0.904 0.957 0.516 0.768 0.607
#> ATC:kmeans 3 0.899 0.897 0.958 0.307 0.668 0.437
#> SD:pam 3 0.958 0.929 0.972 0.525 0.723 0.530
#> CV:pam 3 0.739 0.823 0.924 0.674 0.645 0.489
#> MAD:pam 3 0.941 0.930 0.972 0.538 0.725 0.538
#> ATC:pam 3 0.882 0.912 0.961 0.375 0.728 0.523
#> SD:hclust 3 0.348 0.662 0.822 0.385 0.761 0.596
#> CV:hclust 3 0.465 0.701 0.857 1.430 0.726 0.692
#> MAD:hclust 3 0.329 0.635 0.820 0.272 0.874 0.772
#> ATC:hclust 3 0.411 0.539 0.691 0.316 0.754 0.559
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.702 0.680 0.818 0.1289 0.884 0.689
#> CV:NMF 4 0.744 0.745 0.855 0.1149 0.886 0.686
#> MAD:NMF 4 0.683 0.610 0.788 0.1301 0.836 0.574
#> ATC:NMF 4 0.729 0.802 0.884 0.1143 0.899 0.733
#> SD:skmeans 4 0.858 0.862 0.937 0.0987 0.899 0.717
#> CV:skmeans 4 0.825 0.823 0.921 0.1185 0.886 0.682
#> MAD:skmeans 4 0.833 0.825 0.915 0.1006 0.893 0.702
#> ATC:skmeans 4 0.961 0.942 0.974 0.1619 0.822 0.553
#> SD:mclust 4 0.681 0.781 0.885 0.1269 0.836 0.603
#> CV:mclust 4 0.622 0.678 0.844 0.2007 0.832 0.591
#> MAD:mclust 4 0.666 0.711 0.821 0.1091 0.819 0.570
#> ATC:mclust 4 0.987 0.949 0.974 0.0382 0.931 0.823
#> SD:kmeans 4 0.776 0.769 0.878 0.1295 0.910 0.759
#> CV:kmeans 4 0.769 0.806 0.909 0.1728 0.833 0.606
#> MAD:kmeans 4 0.742 0.729 0.844 0.1403 0.878 0.679
#> ATC:kmeans 4 0.935 0.903 0.960 0.1254 0.761 0.440
#> SD:pam 4 0.634 0.514 0.754 0.1144 0.881 0.672
#> CV:pam 4 0.643 0.664 0.812 0.1352 0.839 0.623
#> MAD:pam 4 0.676 0.568 0.776 0.1091 0.886 0.682
#> ATC:pam 4 0.774 0.823 0.907 0.0682 0.955 0.871
#> SD:hclust 4 0.383 0.580 0.788 0.0805 0.991 0.979
#> CV:hclust 4 0.429 0.578 0.802 0.1481 0.922 0.884
#> MAD:hclust 4 0.410 0.616 0.806 0.0824 0.958 0.905
#> ATC:hclust 4 0.446 0.555 0.713 0.1188 0.764 0.446
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.837 0.811 0.904 0.0622 0.848 0.533
#> CV:NMF 5 0.710 0.610 0.810 0.0516 0.946 0.814
#> MAD:NMF 5 0.779 0.772 0.877 0.0640 0.831 0.474
#> ATC:NMF 5 0.639 0.417 0.680 0.0883 0.898 0.685
#> SD:skmeans 5 0.822 0.759 0.857 0.0577 0.935 0.775
#> CV:skmeans 5 0.839 0.776 0.897 0.0552 0.907 0.685
#> MAD:skmeans 5 0.813 0.710 0.826 0.0566 0.918 0.729
#> ATC:skmeans 5 0.896 0.856 0.934 0.0461 0.947 0.801
#> SD:mclust 5 0.635 0.569 0.755 0.0701 0.890 0.650
#> CV:mclust 5 0.580 0.562 0.754 0.0547 0.837 0.489
#> MAD:mclust 5 0.612 0.515 0.740 0.0818 0.921 0.750
#> ATC:mclust 5 0.720 0.638 0.829 0.1169 0.919 0.768
#> SD:kmeans 5 0.760 0.767 0.860 0.0650 0.923 0.746
#> CV:kmeans 5 0.727 0.635 0.798 0.0625 0.927 0.763
#> MAD:kmeans 5 0.743 0.709 0.812 0.0618 0.930 0.755
#> ATC:kmeans 5 0.774 0.682 0.835 0.0647 0.941 0.788
#> SD:pam 5 0.654 0.529 0.772 0.0511 0.886 0.624
#> CV:pam 5 0.682 0.677 0.832 0.0905 0.866 0.600
#> MAD:pam 5 0.693 0.593 0.779 0.0603 0.892 0.633
#> ATC:pam 5 0.813 0.742 0.893 0.1123 0.833 0.523
#> SD:hclust 5 0.427 0.490 0.750 0.0725 0.955 0.892
#> CV:hclust 5 0.358 0.587 0.798 0.0857 0.945 0.916
#> MAD:hclust 5 0.472 0.524 0.764 0.0756 0.963 0.911
#> ATC:hclust 5 0.508 0.557 0.768 0.0627 0.927 0.761
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.784 0.654 0.820 0.0353 0.959 0.828
#> CV:NMF 6 0.777 0.689 0.842 0.0277 0.917 0.693
#> MAD:NMF 6 0.768 0.652 0.809 0.0342 0.959 0.823
#> ATC:NMF 6 0.702 0.649 0.791 0.0561 0.814 0.392
#> SD:skmeans 6 0.837 0.764 0.847 0.0486 0.923 0.698
#> CV:skmeans 6 0.781 0.644 0.816 0.0454 0.963 0.846
#> MAD:skmeans 6 0.846 0.814 0.870 0.0477 0.921 0.690
#> ATC:skmeans 6 0.904 0.858 0.930 0.0285 0.957 0.815
#> SD:mclust 6 0.641 0.548 0.703 0.0529 0.869 0.515
#> CV:mclust 6 0.586 0.533 0.707 0.0387 0.930 0.701
#> MAD:mclust 6 0.647 0.606 0.726 0.0616 0.851 0.497
#> ATC:mclust 6 0.752 0.658 0.815 0.0711 0.882 0.604
#> SD:kmeans 6 0.768 0.571 0.757 0.0436 0.952 0.808
#> CV:kmeans 6 0.725 0.661 0.791 0.0461 0.931 0.746
#> MAD:kmeans 6 0.735 0.547 0.746 0.0421 0.928 0.717
#> ATC:kmeans 6 0.741 0.625 0.760 0.0427 0.903 0.617
#> SD:pam 6 0.707 0.527 0.747 0.0454 0.912 0.650
#> CV:pam 6 0.731 0.725 0.832 0.0424 0.947 0.770
#> MAD:pam 6 0.709 0.507 0.706 0.0383 0.888 0.587
#> ATC:pam 6 0.757 0.433 0.721 0.0420 0.927 0.718
#> SD:hclust 6 0.450 0.557 0.740 0.0499 0.888 0.706
#> CV:hclust 6 0.328 0.541 0.761 0.1351 0.913 0.858
#> MAD:hclust 6 0.491 0.521 0.734 0.0535 0.908 0.762
#> ATC:hclust 6 0.555 0.588 0.761 0.0438 0.931 0.766
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 4000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 5000)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.177 0.630 0.791 0.4237 0.526 0.526
#> 3 3 0.348 0.662 0.822 0.3847 0.761 0.596
#> 4 4 0.383 0.580 0.788 0.0805 0.991 0.979
#> 5 5 0.427 0.490 0.750 0.0725 0.955 0.892
#> 6 6 0.450 0.557 0.740 0.0499 0.888 0.706
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.8713 0.7390 0.292 0.708
#> SRR1380716 2 0.9087 0.7253 0.324 0.676
#> SRR612803 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0938 0.8012 0.988 0.012
#> SRR1084417 1 0.7219 0.6383 0.800 0.200
#> SRR1074359 2 0.6247 0.7470 0.156 0.844
#> SRR1419258 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.7219 0.7074 0.200 0.800
#> SRR665262 2 0.8555 0.7411 0.280 0.720
#> SRR1499740 1 0.6247 0.7072 0.844 0.156
#> SRR1105057 2 0.9129 0.7161 0.328 0.672
#> SRR1439742 1 0.0376 0.8008 0.996 0.004
#> SRR614599 2 0.8207 0.7363 0.256 0.744
#> SRR612215 2 0.8499 0.7484 0.276 0.724
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.4690 0.7545 0.900 0.100
#> SRR1409263 2 0.5842 0.6144 0.140 0.860
#> SRR1431288 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 1.0000 0.3920 0.500 0.500
#> SRR614839 1 0.9998 -0.3709 0.508 0.492
#> SRR658433 2 0.8443 0.7456 0.272 0.728
#> SRR1088581 2 0.5408 0.7362 0.124 0.876
#> SRR1328797 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.9087 0.7230 0.324 0.676
#> SRR1471117 1 0.1414 0.7984 0.980 0.020
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.8713 0.7389 0.292 0.708
#> SRR1354955 2 0.4815 0.7186 0.104 0.896
#> SRR654802 2 0.1843 0.6564 0.028 0.972
#> SRR660066 2 0.8763 0.7367 0.296 0.704
#> SRR1447103 2 0.7815 0.7519 0.232 0.768
#> SRR1402153 2 0.5946 0.6717 0.144 0.856
#> SRR655887 2 0.9129 0.7220 0.328 0.672
#> SRR1408529 2 0.4431 0.7244 0.092 0.908
#> SRR658707 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.9427 0.6545 0.360 0.640
#> SRR1074670 2 0.5519 0.6679 0.128 0.872
#> SRR1375439 2 0.8763 0.6902 0.296 0.704
#> SRR1329003 2 0.8207 0.5727 0.256 0.744
#> SRR1404837 2 0.9427 0.6790 0.360 0.640
#> SRR1317920 1 0.2043 0.7922 0.968 0.032
#> SRR1455525 2 0.8386 0.5678 0.268 0.732
#> SRR613999 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0376 0.8031 0.996 0.004
#> SRR1499764 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.5408 0.7043 0.124 0.876
#> SRR1068855 1 0.1843 0.7942 0.972 0.028
#> SRR1375509 2 0.3584 0.6420 0.068 0.932
#> SRR612227 2 0.5519 0.6679 0.128 0.872
#> SRR1388809 2 0.9044 0.7238 0.320 0.680
#> SRR1413872 2 0.9896 0.5070 0.440 0.560
#> SRR1452864 1 0.2423 0.7889 0.960 0.040
#> SRR1473078 2 0.7674 0.6893 0.224 0.776
#> SRR615814 2 0.9460 0.6852 0.364 0.636
#> SRR1325225 1 0.7376 0.6156 0.792 0.208
#> SRR1313687 2 0.9775 0.6120 0.412 0.588
#> SRR1358220 2 0.9460 0.6814 0.364 0.636
#> SRR1096662 1 0.9998 -0.3699 0.508 0.492
#> SRR1487746 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.5946 0.6942 0.856 0.144
#> SRR660164 2 0.8386 0.7488 0.268 0.732
#> SRR815783 2 0.9286 0.7039 0.344 0.656
#> SRR809595 1 0.5946 0.6939 0.856 0.144
#> SRR1403133 2 0.8661 0.7416 0.288 0.712
#> SRR815470 2 0.6343 0.7480 0.160 0.840
#> SRR1344382 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.5946 0.7430 0.144 0.856
#> SRR1478362 2 0.6048 0.7437 0.148 0.852
#> SRR1392186 1 0.9909 -0.2061 0.556 0.444
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0376 0.8032 0.996 0.004
#> SRR1471594 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.7219 0.7208 0.200 0.800
#> SRR612683 2 0.8813 0.7388 0.300 0.700
#> SRR1392901 2 0.3114 0.7046 0.056 0.944
#> SRR1077805 2 0.1633 0.6804 0.024 0.976
#> SRR1360402 2 0.8713 0.7389 0.292 0.708
#> SRR1406112 2 0.4815 0.7186 0.104 0.896
#> SRR1355352 2 0.5408 0.6414 0.124 0.876
#> SRR656247 1 0.1184 0.8001 0.984 0.016
#> SRR813656 1 0.9491 0.1301 0.632 0.368
#> SRR808244 2 0.9087 0.4254 0.324 0.676
#> SRR1387240 2 0.8081 0.7515 0.248 0.752
#> SRR1408595 1 0.0938 0.8014 0.988 0.012
#> SRR1385277 1 0.9580 0.1775 0.620 0.380
#> SRR1435248 2 0.8608 0.7421 0.284 0.716
#> SRR1419110 2 0.8144 0.7325 0.252 0.748
#> SRR1408682 2 0.8144 0.7545 0.252 0.748
#> SRR1317134 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.9909 0.5469 0.444 0.556
#> SRR1453911 2 0.8499 0.7519 0.276 0.724
#> SRR603164 2 0.2778 0.6996 0.048 0.952
#> SRR1383259 1 0.9896 -0.1356 0.560 0.440
#> SRR1330854 1 0.6801 0.6772 0.820 0.180
#> SRR1452423 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.9998 0.4136 0.492 0.508
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.1843 0.6828 0.028 0.972
#> SRR1361546 1 0.7674 0.5906 0.776 0.224
#> SRR1486156 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.8144 0.7508 0.252 0.748
#> SRR615635 2 0.9460 0.6852 0.364 0.636
#> SRR1385411 2 0.9977 0.4696 0.472 0.528
#> SRR1342739 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.3274 0.6457 0.060 0.940
#> SRR662126 2 0.9944 0.5052 0.456 0.544
#> SRR1464601 2 0.8443 0.7456 0.272 0.728
#> SRR1071594 2 0.9815 0.5925 0.420 0.580
#> SRR612539 1 0.9970 -0.2881 0.532 0.468
#> SRR602010 1 0.6438 0.6618 0.836 0.164
#> SRR810249 2 0.8955 0.7271 0.312 0.688
#> SRR818773 1 0.6623 0.6501 0.828 0.172
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.8555 0.7494 0.280 0.720
#> SRR1442754 1 0.4431 0.7601 0.908 0.092
#> SRR1334247 2 0.4690 0.7210 0.100 0.900
#> SRR661639 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR613222 1 0.9754 -0.0470 0.592 0.408
#> SRR1459937 1 0.9909 -0.0968 0.556 0.444
#> SRR2185018 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.9044 0.7285 0.320 0.680
#> SRR809348 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.5519 0.6679 0.128 0.872
#> SRR661074 2 0.3584 0.6420 0.068 0.932
#> SRR1349851 1 0.2423 0.7881 0.960 0.040
#> SRR1405123 1 0.9896 -0.1356 0.560 0.440
#> SRR661096 1 0.9933 -0.2297 0.548 0.452
#> SRR1320225 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1454651 2 0.8207 0.5727 0.256 0.744
#> SRR1307677 2 0.9129 0.7220 0.328 0.672
#> SRR1466512 2 0.9833 0.5839 0.424 0.576
#> SRR658212 2 0.9129 0.7220 0.328 0.672
#> SRR1430525 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1344422 1 0.9850 -0.0871 0.572 0.428
#> SRR1353924 2 0.9248 0.7056 0.340 0.660
#> SRR1314832 1 0.9954 0.1128 0.540 0.460
#> SRR1487570 1 0.7376 0.6156 0.792 0.208
#> SRR627431 2 0.7299 0.7544 0.204 0.796
#> SRR1418561 2 0.9850 0.2692 0.428 0.572
#> SRR1448029 2 0.2778 0.6801 0.048 0.952
#> SRR813802 1 0.1184 0.7995 0.984 0.016
#> SRR815020 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.9427 0.6870 0.360 0.640
#> SRR1435311 2 0.9933 0.5255 0.452 0.548
#> SRR612395 2 0.7815 0.7519 0.232 0.768
#> SRR603116 2 0.9323 0.7049 0.348 0.652
#> SRR1323152 2 0.2603 0.6880 0.044 0.956
#> SRR1368264 1 0.6531 0.6585 0.832 0.168
#> SRR1326624 1 0.2778 0.7836 0.952 0.048
#> SRR1429265 2 0.4562 0.6398 0.096 0.904
#> SRR1327702 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR615611 1 0.9866 -0.1570 0.568 0.432
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.9209 0.2693 0.664 0.336
#> SRR815044 1 0.9993 -0.3420 0.516 0.484
#> SRR1338560 2 0.9954 0.5007 0.460 0.540
#> SRR615862 2 0.9580 0.6647 0.380 0.620
#> SRR1480038 2 0.9944 0.5174 0.456 0.544
#> SRR659436 2 0.6973 0.7487 0.188 0.812
#> SRR613699 2 0.8499 0.7450 0.276 0.724
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR615323 1 0.9963 -0.2715 0.536 0.464
#> SRR1330327 2 0.9661 0.5921 0.392 0.608
#> SRR1489950 2 0.8763 0.7372 0.296 0.704
#> SRR1431927 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.2236 0.6698 0.036 0.964
#> SRR1444002 1 0.1414 0.7984 0.980 0.020
#> SRR1318444 2 0.7376 0.7047 0.208 0.792
#> SRR600656 2 0.9866 0.5204 0.432 0.568
#> SRR658766 2 0.4815 0.7284 0.104 0.896
#> SRR655946 2 0.1184 0.6770 0.016 0.984
#> SRR817282 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.3879 0.6568 0.076 0.924
#> SRR1406418 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.6623 0.6501 0.828 0.172
#> SRR1471965 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.4939 0.7230 0.108 0.892
#> SRR662498 2 0.7219 0.7485 0.200 0.800
#> SRR1376764 2 0.5737 0.7294 0.136 0.864
#> SRR1377006 2 0.5294 0.7331 0.120 0.880
#> SRR656860 2 0.9909 0.5456 0.444 0.556
#> SRR1480547 1 0.9909 -0.1484 0.556 0.444
#> SRR1452515 2 0.4815 0.7215 0.104 0.896
#> SRR1324390 2 0.8713 0.7401 0.292 0.708
#> SRR615273 1 0.9795 0.1400 0.584 0.416
#> SRR601695 2 0.6531 0.7492 0.168 0.832
#> SRR820907 2 0.9933 0.5262 0.452 0.548
#> SRR812773 1 0.4939 0.7340 0.892 0.108
#> SRR1405984 2 0.9044 0.7224 0.320 0.680
#> SRR1472794 2 0.7815 0.7554 0.232 0.768
#> SRR1365448 1 0.1414 0.7984 0.980 0.020
#> SRR1095720 2 0.5178 0.6912 0.116 0.884
#> SRR1435626 2 0.6438 0.7088 0.164 0.836
#> SRR1080766 2 0.8443 0.7456 0.272 0.728
#> SRR1377862 1 0.2423 0.7881 0.960 0.040
#> SRR1332299 2 0.1414 0.6765 0.020 0.980
#> SRR1467966 2 0.4298 0.7142 0.088 0.912
#> SRR1320579 2 0.3274 0.7068 0.060 0.940
#> SRR1319710 1 1.0000 -0.3805 0.504 0.496
#> SRR1326604 2 0.9087 0.7223 0.324 0.676
#> SRR1098879 2 0.6973 0.6263 0.188 0.812
#> SRR662245 2 0.8499 0.7450 0.276 0.724
#> SRR1074719 2 0.9044 0.7224 0.320 0.680
#> SRR816226 1 0.7528 0.6034 0.784 0.216
#> SRR601387 2 0.8713 0.7395 0.292 0.708
#> SRR614575 2 0.9580 0.6647 0.380 0.620
#> SRR1353900 2 0.9286 0.7029 0.344 0.656
#> SRR662906 2 0.8144 0.7508 0.252 0.748
#> SRR1350832 2 0.8713 0.7389 0.292 0.708
#> SRR1403280 2 0.9909 0.5391 0.444 0.556
#> SRR1313969 2 0.9686 0.5896 0.396 0.604
#> SRR1388528 1 0.0376 0.8003 0.996 0.004
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4431 0.7483 0.908 0.092
#> SRR655399 2 0.1843 0.6564 0.028 0.972
#> SRR1319753 1 0.9608 0.0587 0.616 0.384
#> SRR818901 2 0.2236 0.6743 0.036 0.964
#> SRR607067 1 0.9922 -0.2089 0.552 0.448
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 1.0000 0.4031 0.496 0.504
#> SRR661961 2 0.9983 0.3238 0.476 0.524
#> SRR658259 2 0.9044 0.7273 0.320 0.680
#> SRR1310476 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.8499 0.7459 0.276 0.724
#> SRR1365034 1 0.9963 -0.2838 0.536 0.464
#> SRR1478053 2 0.9129 0.7161 0.328 0.672
#> SRR1475300 2 0.9954 0.5049 0.460 0.540
#> SRR1328101 2 0.8499 0.7484 0.276 0.724
#> SRR1322900 1 0.7745 0.6119 0.772 0.228
#> SRR1309942 2 0.8661 0.7407 0.288 0.712
#> SRR1345760 1 0.8661 0.4692 0.712 0.288
#> SRR1435418 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.8713 0.7360 0.292 0.708
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.8555 0.7436 0.280 0.720
#> SRR661469 2 0.8909 0.7055 0.308 0.692
#> SRR1500323 2 0.8267 0.7490 0.260 0.740
#> SRR1356705 1 0.9286 0.2174 0.656 0.344
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.7883 0.6763 0.236 0.764
#> SRR1350435 1 0.2778 0.7836 0.952 0.048
#> SRR1389177 2 0.0938 0.6744 0.012 0.988
#> SRR1368072 2 0.9044 0.7239 0.320 0.680
#> SRR601815 2 0.8763 0.7369 0.296 0.704
#> SRR613330 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.9286 0.6879 0.344 0.656
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.5059 0.7226 0.112 0.888
#> SRR1318839 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.9850 0.5301 0.428 0.572
#> SRR613126 2 0.7815 0.7554 0.232 0.768
#> SRR1089424 2 0.9775 0.6054 0.412 0.588
#> SRR1347214 2 0.9044 0.7274 0.320 0.680
#> SRR1309556 2 0.9427 0.6734 0.360 0.640
#> SRR1456027 1 0.7745 0.5989 0.772 0.228
#> SRR1400551 2 0.6973 0.6289 0.188 0.812
#> SRR1320469 1 0.1843 0.7953 0.972 0.028
#> SRR614251 2 0.8386 0.7504 0.268 0.732
#> SRR1454310 2 0.8661 0.7406 0.288 0.712
#> SRR615105 2 0.6623 0.7502 0.172 0.828
#> SRR1433290 2 0.1414 0.6765 0.020 0.980
#> SRR2166064 2 0.9998 0.3904 0.492 0.508
#> SRR601671 2 0.9970 0.4804 0.468 0.532
#> SRR663874 2 0.9087 0.7274 0.324 0.676
#> SRR1409130 2 0.8443 0.7470 0.272 0.728
#> SRR659696 2 0.9993 0.4055 0.484 0.516
#> SRR1408249 1 0.9933 -0.2297 0.548 0.452
#> SRR663284 1 0.9998 -0.3715 0.508 0.492
#> SRR1402794 2 0.5519 0.6679 0.128 0.872
#> SRR614852 2 0.9661 0.5921 0.392 0.608
#> SRR1348040 2 0.8555 0.6460 0.280 0.720
#> SRR1489610 1 1.0000 -0.3805 0.504 0.496
#> SRR1488091 2 0.8443 0.7456 0.272 0.728
#> SRR1499566 1 0.9944 -0.2451 0.544 0.456
#> SRR1361480 2 0.9286 0.7040 0.344 0.656
#> SRR1444501 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.8661 0.7394 0.288 0.712
#> SRR1388832 2 0.8499 0.6471 0.276 0.724
#> SRR1394637 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.7299 0.7544 0.204 0.796
#> SRR662918 2 0.9998 0.3909 0.492 0.508
#> SRR817421 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.9815 0.5912 0.420 0.580
#> SRR608264 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.4690 0.7545 0.900 0.100
#> SRR1454117 2 0.9909 0.5469 0.444 0.556
#> SRR1312684 1 0.2423 0.7889 0.960 0.040
#> SRR615044 1 0.9795 0.1400 0.584 0.416
#> SRR1432743 2 0.4690 0.7278 0.100 0.900
#> SRR1388873 2 0.9087 0.7223 0.324 0.676
#> SRR1353517 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.8016 0.7351 0.244 0.756
#> SRR1406008 2 0.9850 0.5827 0.428 0.572
#> SRR1396786 2 0.8763 0.7372 0.296 0.704
#> SRR1446564 1 0.2236 0.7899 0.964 0.036
#> SRR1318465 2 0.0938 0.6744 0.012 0.988
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR607117 1 0.9944 -0.2425 0.544 0.456
#> SRR655170 2 0.9933 0.5248 0.452 0.548
#> SRR1087825 2 0.9896 0.5070 0.440 0.560
#> SRR662019 2 0.8813 0.5201 0.300 0.700
#> SRR1349209 2 0.7376 0.7047 0.208 0.792
#> SRR1326161 2 0.8909 0.7343 0.308 0.692
#> SRR1345284 2 0.9954 0.5007 0.460 0.540
#> SRR1416672 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.9248 0.7056 0.340 0.660
#> SRR1454328 2 0.8555 0.7434 0.280 0.720
#> SRR1489286 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4431 0.7483 0.908 0.092
#> SRR1408183 2 0.0376 0.6633 0.004 0.996
#> SRR1084369 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.1843 0.6564 0.028 0.972
#> SRR660709 2 0.6531 0.7486 0.168 0.832
#> SRR809444 1 0.0376 0.8031 0.996 0.004
#> SRR1089901 2 0.8555 0.7436 0.280 0.720
#> SRR1375774 1 0.2236 0.7918 0.964 0.036
#> SRR1326292 2 0.8207 0.5727 0.256 0.744
#> SRR657139 1 0.7219 0.6383 0.800 0.200
#> SRR1440744 1 1.0000 -0.3923 0.500 0.500
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.8713 0.7360 0.292 0.708
#> SRR1381775 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.9896 0.5568 0.440 0.560
#> SRR658989 2 0.4939 0.7230 0.108 0.892
#> SRR1353663 1 0.1843 0.7942 0.972 0.028
#> SRR811771 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.9795 0.6043 0.416 0.584
#> SRR1367988 2 0.9988 0.3861 0.480 0.520
#> SRR1331922 1 0.2236 0.7918 0.964 0.036
#> SRR615479 1 0.6712 0.6477 0.824 0.176
#> SRR1375796 2 0.8386 0.7504 0.268 0.732
#> SRR1386991 2 0.7299 0.7480 0.204 0.796
#> SRR1355217 2 0.5842 0.7311 0.140 0.860
#> SRR1356290 2 0.6247 0.7478 0.156 0.844
#> SRR659507 2 0.8909 0.7136 0.308 0.692
#> SRR663296 1 0.0376 0.8030 0.996 0.004
#> SRR598044 2 0.9850 0.5812 0.428 0.572
#> SRR661155 2 0.9998 0.3904 0.492 0.508
#> SRR1414727 2 0.8499 0.6421 0.276 0.724
#> SRR663477 1 0.2778 0.7836 0.952 0.048
#> SRR1354489 2 0.0938 0.6744 0.012 0.988
#> SRR1377800 2 0.6531 0.6518 0.168 0.832
#> SRR614611 2 0.8267 0.7491 0.260 0.740
#> SRR655052 2 0.6887 0.7523 0.184 0.816
#> SRR1478968 1 0.7745 0.5989 0.772 0.228
#> SRR1351280 2 0.9993 0.4475 0.484 0.516
#> SRR613951 1 0.8443 0.4882 0.728 0.272
#> SRR1418022 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.7528 0.7025 0.216 0.784
#> SRR1408161 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.5519 0.6679 0.128 0.872
#> SRR655040 1 0.9358 0.2551 0.648 0.352
#> SRR810225 2 0.9608 0.6527 0.384 0.616
#> SRR1325377 2 0.9732 0.6211 0.404 0.596
#> SRR617829 2 0.2778 0.6993 0.048 0.952
#> SRR1402328 2 0.8763 0.7372 0.296 0.704
#> SRR1480455 2 0.8207 0.7503 0.256 0.744
#> SRR1442104 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.1414 0.7984 0.980 0.020
#> SRR1481396 2 0.3584 0.6420 0.068 0.932
#> SRR1414314 2 0.8713 0.7391 0.292 0.708
#> SRR663026 2 0.9000 0.7252 0.316 0.684
#> SRR1478386 1 1.0000 -0.3824 0.504 0.496
#> SRR1458683 2 0.7056 0.6545 0.192 0.808
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.7950 0.5922 0.760 0.240
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.9850 0.5301 0.428 0.572
#> SRR660260 2 0.7299 0.7494 0.204 0.796
#> SRR1071231 2 0.8955 0.7271 0.312 0.688
#> SRR1459125 2 0.9909 0.4984 0.444 0.556
#> SRR1337173 2 0.4690 0.7278 0.100 0.900
#> SRR1396250 2 0.1843 0.6564 0.028 0.972
#> SRR2166376 2 0.5178 0.6912 0.116 0.884
#> SRR659816 2 0.6531 0.7486 0.168 0.832
#> SRR1401379 1 1.0000 -0.3805 0.504 0.496
#> SRR600981 2 0.9970 0.4437 0.468 0.532
#> SRR1398335 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 1.0000 0.3537 0.496 0.504
#> SRR660115 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.8763 0.7369 0.296 0.704
#> SRR1359780 2 0.8608 0.7422 0.284 0.716
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.7299 0.6038 0.796 0.204
#> SRR1397156 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.8555 0.7436 0.280 0.720
#> SRR1319648 2 1.0000 0.3943 0.500 0.500
#> SRR1092985 2 0.9635 0.3494 0.388 0.612
#> SRR656409 1 0.9983 -0.3082 0.524 0.476
#> SRR1468658 2 0.4690 0.7272 0.100 0.900
#> SRR1390437 1 0.8443 0.4882 0.728 0.272
#> SRR658057 2 0.9881 0.5589 0.436 0.564
#> SRR612635 2 0.9866 0.5669 0.432 0.568
#> SRR1351480 2 0.9286 0.7029 0.344 0.656
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1184 0.8001 0.984 0.016
#> SRR659590 2 0.8955 0.7271 0.312 0.688
#> SRR614263 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.9833 0.5839 0.424 0.576
#> SRR659911 2 0.8608 0.7443 0.284 0.716
#> SRR1085519 2 0.2236 0.6698 0.036 0.964
#> SRR1345894 2 0.5178 0.7203 0.116 0.884
#> SRR1442928 2 0.7815 0.7519 0.232 0.768
#> SRR1464681 2 0.9896 0.5070 0.440 0.560
#> SRR1418880 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.4815 0.7292 0.104 0.896
#> SRR1365426 1 0.5946 0.6887 0.856 0.144
#> SRR1487947 1 0.1633 0.7970 0.976 0.024
#> SRR659708 1 0.1184 0.8001 0.984 0.016
#> SRR603236 2 0.6531 0.7492 0.168 0.832
#> SRR660673 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.8861 0.7328 0.304 0.696
#> SRR663807 2 0.9087 0.7217 0.324 0.676
#> SRR1087245 2 0.9881 0.5589 0.436 0.564
#> SRR1339108 2 0.9427 0.6790 0.360 0.640
#> SRR613426 1 0.8144 0.5384 0.748 0.252
#> SRR613879 2 0.8555 0.7494 0.280 0.720
#> SRR1385101 1 0.5737 0.7063 0.864 0.136
#> SRR1387966 2 0.9209 0.7125 0.336 0.664
#> SRR1458852 2 0.8267 0.7490 0.260 0.740
#> SRR1430489 1 0.7376 0.6156 0.792 0.208
#> SRR1349231 1 0.2043 0.7925 0.968 0.032
#> SRR1376249 2 0.3584 0.6420 0.068 0.932
#> SRR1321987 2 0.8499 0.7450 0.276 0.724
#> SRR662653 2 0.9000 0.7252 0.316 0.684
#> SRR1390027 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.9850 0.5828 0.428 0.572
#> SRR1383081 2 0.9850 0.5756 0.428 0.572
#> SRR2166960 2 0.9044 0.7282 0.320 0.680
#> SRR605101 1 0.9998 -0.3709 0.508 0.492
#> SRR818600 2 0.9248 0.7072 0.340 0.660
#> SRR1367715 2 0.9909 0.5425 0.444 0.556
#> SRR1351979 2 0.0000 0.6640 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.1184 0.6770 0.016 0.984
#> SRR1444306 2 0.3114 0.6932 0.056 0.944
#> SRR1322662 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.8608 0.7443 0.284 0.716
#> SRR612767 1 0.2043 0.7922 0.968 0.032
#> SRR1489030 2 0.9129 0.7161 0.328 0.672
#> SRR1430375 2 0.8443 0.7506 0.272 0.728
#> SRR615225 2 0.9970 0.4437 0.468 0.532
#> SRR1401839 2 0.7883 0.7237 0.236 0.764
#> SRR1379110 2 0.9954 0.5007 0.460 0.540
#> SRR1077288 2 0.3584 0.6420 0.068 0.932
#> SRR1331639 2 0.9896 0.5070 0.440 0.560
#> SRR1342782 1 0.8386 0.4732 0.732 0.268
#> SRR1443003 2 0.2603 0.6842 0.044 0.956
#> SRR612839 1 0.1414 0.7984 0.980 0.020
#> SRR1470093 2 0.2043 0.6888 0.032 0.968
#> SRR1395742 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.3114 0.7046 0.056 0.944
#> SRR664063 1 0.5946 0.6887 0.856 0.144
#> SRR1488214 1 0.2778 0.7834 0.952 0.048
#> SRR654766 2 0.9988 0.3861 0.480 0.520
#> SRR1320321 2 0.9933 0.5262 0.452 0.548
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.9850 0.5756 0.428 0.572
#> SRR1488470 1 0.9909 -0.1484 0.556 0.444
#> SRR1389497 2 0.0376 0.6633 0.004 0.996
#> SRR1367109 2 0.4562 0.7134 0.096 0.904
#> SRR615311 1 0.0000 0.8039 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0747 0.736822 0.016 0.984 0.000
#> SRR1380716 2 0.1860 0.750187 0.052 0.948 0.000
#> SRR612803 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR613282 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1355396 1 0.2066 0.853171 0.940 0.060 0.000
#> SRR1084417 1 0.5171 0.672296 0.784 0.012 0.204
#> SRR1074359 2 0.3686 0.647146 0.000 0.860 0.140
#> SRR1419258 3 0.3551 0.746351 0.000 0.132 0.868
#> SRR1403366 2 0.8731 -0.056964 0.116 0.516 0.368
#> SRR665262 2 0.5093 0.679095 0.088 0.836 0.076
#> SRR1499740 1 0.6083 0.694196 0.772 0.168 0.060
#> SRR1105057 2 0.1860 0.747677 0.052 0.948 0.000
#> SRR1439742 1 0.0661 0.883866 0.988 0.008 0.004
#> SRR614599 2 0.6046 0.614882 0.080 0.784 0.136
#> SRR612215 2 0.4745 0.696308 0.068 0.852 0.080
#> SRR1094051 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1324496 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1393449 1 0.3532 0.813940 0.884 0.008 0.108
#> SRR1409263 3 0.3784 0.680293 0.132 0.004 0.864
#> SRR1431288 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1334889 2 0.5247 0.685745 0.224 0.768 0.008
#> SRR614839 2 0.5058 0.673765 0.244 0.756 0.000
#> SRR658433 2 0.0237 0.727263 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088581 2 0.5285 0.512058 0.004 0.752 0.244
#> SRR1328797 3 0.3551 0.746351 0.000 0.132 0.868
#> SRR1334512 2 0.1964 0.751085 0.056 0.944 0.000
#> SRR1471117 1 0.1585 0.871721 0.964 0.008 0.028
#> SRR1311553 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1458220 2 0.1129 0.738463 0.020 0.976 0.004
#> SRR1354955 2 0.7192 -0.021118 0.028 0.560 0.412
#> SRR654802 3 0.3590 0.744505 0.028 0.076 0.896
#> SRR660066 2 0.0892 0.738504 0.020 0.980 0.000
#> SRR1447103 2 0.5136 0.648118 0.044 0.824 0.132
#> SRR1402153 3 0.7199 0.704932 0.108 0.180 0.712
#> SRR655887 2 0.1964 0.750623 0.056 0.944 0.000
#> SRR1408529 2 0.5529 0.418699 0.000 0.704 0.296
#> SRR658707 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1384371 2 0.7026 0.677833 0.152 0.728 0.120
#> SRR1074670 3 0.8533 0.558509 0.104 0.360 0.536
#> SRR1375439 2 0.8199 0.410743 0.160 0.640 0.200
#> SRR1329003 3 0.9084 0.582429 0.232 0.216 0.552
#> SRR1404837 2 0.4749 0.741179 0.116 0.844 0.040
#> SRR1317920 1 0.1751 0.871977 0.960 0.012 0.028
#> SRR1455525 3 0.9386 0.538033 0.244 0.244 0.512
#> SRR613999 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1310836 1 0.0661 0.884078 0.988 0.008 0.004
#> SRR1499764 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR658200 2 0.7736 -0.102462 0.052 0.548 0.400
#> SRR1068855 1 0.1585 0.873241 0.964 0.008 0.028
#> SRR1375509 3 0.3499 0.725129 0.072 0.028 0.900
#> SRR612227 3 0.8533 0.558509 0.104 0.360 0.536
#> SRR1388809 2 0.1989 0.747934 0.048 0.948 0.004
#> SRR1413872 2 0.7979 0.516414 0.272 0.628 0.100
#> SRR1452864 1 0.1999 0.867176 0.952 0.012 0.036
#> SRR1473078 2 0.9067 -0.199414 0.140 0.476 0.384
#> SRR615814 2 0.2711 0.750863 0.088 0.912 0.000
#> SRR1325225 1 0.6922 0.612969 0.720 0.200 0.080
#> SRR1313687 2 0.3619 0.739161 0.136 0.864 0.000
#> SRR1358220 2 0.2796 0.748800 0.092 0.908 0.000
#> SRR1096662 2 0.5285 0.669531 0.244 0.752 0.004
#> SRR1487746 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1354644 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1401752 1 0.5443 0.622332 0.736 0.260 0.004
#> SRR660164 2 0.1129 0.726382 0.004 0.976 0.020
#> SRR815783 2 0.2590 0.750660 0.072 0.924 0.004
#> SRR809595 1 0.5698 0.628246 0.736 0.252 0.012
#> SRR1403133 2 0.0592 0.736326 0.012 0.988 0.000
#> SRR815470 2 0.3619 0.651873 0.000 0.864 0.136
#> SRR1344382 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1432453 2 0.4755 0.600535 0.008 0.808 0.184
#> SRR1478362 2 0.4861 0.603873 0.012 0.808 0.180
#> SRR1392186 2 0.6047 0.604486 0.312 0.680 0.008
#> SRR1347937 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1431569 1 0.0661 0.884215 0.988 0.008 0.004
#> SRR1471594 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1354270 2 0.8286 0.170573 0.104 0.588 0.308
#> SRR612683 2 0.1399 0.743916 0.028 0.968 0.004
#> SRR1392901 2 0.5835 0.283868 0.000 0.660 0.340
#> SRR1077805 3 0.6033 0.641150 0.004 0.336 0.660
#> SRR1360402 2 0.1129 0.738463 0.020 0.976 0.004
#> SRR1406112 2 0.7192 -0.021118 0.028 0.560 0.412
#> SRR1355352 3 0.5889 0.735136 0.108 0.096 0.796
#> SRR656247 1 0.2356 0.843278 0.928 0.072 0.000
#> SRR813656 2 0.6859 0.413841 0.420 0.564 0.016
#> SRR808244 3 0.5988 0.461960 0.304 0.008 0.688
#> SRR1387240 2 0.1643 0.714546 0.000 0.956 0.044
#> SRR1408595 1 0.1399 0.874649 0.968 0.028 0.004
#> SRR1385277 1 0.8173 -0.000288 0.508 0.420 0.072
#> SRR1435248 2 0.0424 0.733173 0.008 0.992 0.000
#> SRR1419110 2 0.7107 0.496123 0.092 0.712 0.196
#> SRR1408682 2 0.4642 0.706371 0.060 0.856 0.084
#> SRR1317134 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1370780 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1489307 2 0.4351 0.724822 0.168 0.828 0.004
#> SRR1453911 2 0.4058 0.722708 0.044 0.880 0.076
#> SRR603164 3 0.6168 0.510356 0.000 0.412 0.588
#> SRR1383259 2 0.7251 0.526368 0.348 0.612 0.040
#> SRR1330854 1 0.4808 0.722721 0.804 0.008 0.188
#> SRR1452423 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1368574 2 0.4750 0.691894 0.216 0.784 0.000
#> SRR1468162 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1331220 3 0.6625 0.458053 0.008 0.440 0.552
#> SRR1361546 1 0.6800 0.483917 0.660 0.308 0.032
#> SRR1486156 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR660545 2 0.1163 0.721077 0.000 0.972 0.028
#> SRR615635 2 0.2711 0.750863 0.088 0.912 0.000
#> SRR1385411 2 0.5220 0.698141 0.208 0.780 0.012
#> SRR1342739 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1102830 3 0.5334 0.751667 0.060 0.120 0.820
#> SRR662126 2 0.6025 0.675362 0.232 0.740 0.028
#> SRR1464601 2 0.0237 0.727263 0.000 0.996 0.004
#> SRR1071594 2 0.3752 0.734366 0.144 0.856 0.000
#> SRR612539 2 0.5254 0.653039 0.264 0.736 0.000
#> SRR602010 1 0.5656 0.577207 0.712 0.284 0.004
#> SRR810249 2 0.1411 0.743805 0.036 0.964 0.000
#> SRR818773 1 0.5864 0.565691 0.704 0.288 0.008
#> SRR1336569 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1368117 2 0.1919 0.735277 0.024 0.956 0.020
#> SRR1442754 1 0.3375 0.820132 0.892 0.008 0.100
#> SRR1334247 2 0.6994 0.172165 0.028 0.612 0.360
#> SRR661639 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR613222 2 0.7032 0.507225 0.368 0.604 0.028
#> SRR1459937 2 0.8515 0.261114 0.432 0.476 0.092
#> SRR2185018 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR655732 2 0.2200 0.750062 0.056 0.940 0.004
#> SRR809348 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR819261 3 0.8533 0.558509 0.104 0.360 0.536
#> SRR661074 3 0.3370 0.723234 0.072 0.024 0.904
#> SRR1349851 1 0.2031 0.869016 0.952 0.016 0.032
#> SRR1405123 2 0.7251 0.526368 0.348 0.612 0.040
#> SRR661096 2 0.5690 0.627168 0.288 0.708 0.004
#> SRR1320225 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1454651 3 0.9084 0.582429 0.232 0.216 0.552
#> SRR1307677 2 0.1964 0.750623 0.056 0.944 0.000
#> SRR1466512 2 0.3941 0.730255 0.156 0.844 0.000
#> SRR658212 2 0.1964 0.750623 0.056 0.944 0.000
#> SRR1430525 3 0.5138 0.712397 0.000 0.252 0.748
#> SRR1344422 2 0.7607 0.486372 0.364 0.584 0.052
#> SRR1353924 2 0.2165 0.749041 0.064 0.936 0.000
#> SRR1314832 1 0.6659 0.049939 0.532 0.008 0.460
#> SRR1487570 1 0.6922 0.612969 0.720 0.200 0.080
#> SRR627431 2 0.3272 0.682777 0.004 0.892 0.104
#> SRR1418561 3 0.8659 0.292696 0.408 0.104 0.488
#> SRR1448029 3 0.6684 0.689971 0.032 0.292 0.676
#> SRR813802 1 0.1453 0.873956 0.968 0.008 0.024
#> SRR815020 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1309702 2 0.2796 0.750086 0.092 0.908 0.000
#> SRR1435311 2 0.4235 0.720263 0.176 0.824 0.000
#> SRR612395 2 0.4712 0.667551 0.044 0.848 0.108
#> SRR603116 2 0.2625 0.751384 0.084 0.916 0.000
#> SRR1323152 3 0.6798 0.532869 0.016 0.400 0.584
#> SRR1368264 1 0.5560 0.543927 0.700 0.300 0.000
#> SRR1326624 1 0.2229 0.862417 0.944 0.012 0.044
#> SRR1429265 3 0.3207 0.706265 0.084 0.012 0.904
#> SRR1327702 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR615611 2 0.6422 0.579128 0.324 0.660 0.016
#> SRR1486799 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1096174 2 0.7386 0.263934 0.460 0.508 0.032
#> SRR815044 2 0.5443 0.655583 0.260 0.736 0.004
#> SRR1338560 2 0.4399 0.711147 0.188 0.812 0.000
#> SRR615862 2 0.3116 0.748183 0.108 0.892 0.000
#> SRR1480038 2 0.4291 0.718395 0.180 0.820 0.000
#> SRR659436 2 0.6535 0.538095 0.052 0.728 0.220
#> SRR613699 2 0.0475 0.730539 0.004 0.992 0.004
#> SRR1436563 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR615323 2 0.5588 0.638539 0.276 0.720 0.004
#> SRR1330327 2 0.7781 0.571742 0.220 0.664 0.116
#> SRR1489950 2 0.0892 0.738652 0.020 0.980 0.000
#> SRR1431927 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1100588 3 0.6416 0.714238 0.032 0.260 0.708
#> SRR1444002 1 0.1585 0.871721 0.964 0.008 0.028
#> SRR1318444 2 0.8906 0.027045 0.136 0.520 0.344
#> SRR600656 2 0.8170 0.518164 0.256 0.624 0.120
#> SRR658766 2 0.5404 0.490178 0.004 0.740 0.256
#> SRR655946 3 0.5810 0.638849 0.000 0.336 0.664
#> SRR817282 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1475104 3 0.5875 0.751337 0.072 0.136 0.792
#> SRR1406418 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1090265 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1444120 1 0.5864 0.565691 0.704 0.288 0.008
#> SRR1471965 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR612695 2 0.6742 0.333497 0.028 0.656 0.316
#> SRR662498 2 0.6106 0.539449 0.044 0.756 0.200
#> SRR1376764 2 0.7285 0.296102 0.048 0.632 0.320
#> SRR1377006 2 0.6357 0.403182 0.020 0.684 0.296
#> SRR656860 2 0.4235 0.720997 0.176 0.824 0.000
#> SRR1480547 2 0.7023 0.540712 0.344 0.624 0.032
#> SRR1452515 2 0.7013 0.174991 0.028 0.608 0.364
#> SRR1324390 2 0.1129 0.739296 0.020 0.976 0.004
#> SRR615273 1 0.8675 0.007945 0.476 0.420 0.104
#> SRR601695 2 0.3619 0.648832 0.000 0.864 0.136
#> SRR820907 2 0.4235 0.719670 0.176 0.824 0.000
#> SRR812773 1 0.4883 0.697102 0.788 0.208 0.004
#> SRR1405984 2 0.1643 0.746347 0.044 0.956 0.000
#> SRR1472794 2 0.2939 0.709833 0.012 0.916 0.072
#> SRR1365448 1 0.1585 0.871721 0.964 0.008 0.028
#> SRR1095720 3 0.8087 0.579262 0.076 0.364 0.560
#> SRR1435626 2 0.8370 -0.193059 0.084 0.500 0.416
#> SRR1080766 2 0.0237 0.727263 0.000 0.996 0.004
#> SRR1377862 1 0.2031 0.869016 0.952 0.016 0.032
#> SRR1332299 3 0.5864 0.695771 0.008 0.288 0.704
#> SRR1467966 2 0.7043 -0.145473 0.020 0.532 0.448
#> SRR1320579 2 0.5621 0.373822 0.000 0.692 0.308
#> SRR1319710 2 0.5016 0.675209 0.240 0.760 0.000
#> SRR1326604 2 0.1753 0.748303 0.048 0.952 0.000
#> SRR1098879 3 0.6027 0.668427 0.164 0.060 0.776
#> SRR662245 2 0.0661 0.731008 0.004 0.988 0.008
#> SRR1074719 2 0.1643 0.746347 0.044 0.956 0.000
#> SRR816226 1 0.7058 0.596234 0.708 0.212 0.080
#> SRR601387 2 0.0747 0.737922 0.016 0.984 0.000
#> SRR614575 2 0.3116 0.748183 0.108 0.892 0.000
#> SRR1353900 2 0.2261 0.749240 0.068 0.932 0.000
#> SRR662906 2 0.1163 0.720688 0.000 0.972 0.028
#> SRR1350832 2 0.1129 0.738463 0.020 0.976 0.004
#> SRR1403280 2 0.4409 0.723221 0.172 0.824 0.004
#> SRR1313969 2 0.7906 0.557264 0.220 0.656 0.124
#> SRR1388528 1 0.0661 0.884289 0.988 0.008 0.004
#> SRR1452912 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1400180 1 0.4861 0.715601 0.800 0.192 0.008
#> SRR655399 3 0.2443 0.724855 0.028 0.032 0.940
#> SRR1319753 2 0.6140 0.455290 0.404 0.596 0.000
#> SRR818901 3 0.6482 0.689090 0.024 0.296 0.680
#> SRR607067 2 0.7553 0.540878 0.320 0.620 0.060
#> SRR1391420 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1384138 2 0.5202 0.688888 0.220 0.772 0.008
#> SRR661961 2 0.8512 0.266094 0.340 0.552 0.108
#> SRR658259 2 0.1989 0.749999 0.048 0.948 0.004
#> SRR1310476 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1452696 2 0.0848 0.732232 0.008 0.984 0.008
#> SRR1365034 2 0.6287 0.634722 0.272 0.704 0.024
#> SRR1478053 2 0.1860 0.747677 0.052 0.948 0.000
#> SRR1475300 2 0.4346 0.714717 0.184 0.816 0.000
#> SRR1328101 2 0.4745 0.696308 0.068 0.852 0.080
#> SRR1322900 1 0.7244 0.597570 0.700 0.208 0.092
#> SRR1309942 2 0.0983 0.736854 0.016 0.980 0.004
#> SRR1345760 1 0.7872 0.398898 0.620 0.296 0.084
#> SRR1435418 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1402172 2 0.5582 0.687805 0.100 0.812 0.088
#> SRR1443436 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR661675 2 0.0661 0.732450 0.008 0.988 0.004
#> SRR661469 2 0.8148 0.418932 0.156 0.644 0.200
#> SRR1500323 2 0.1163 0.721438 0.000 0.972 0.028
#> SRR1356705 2 0.6286 0.285269 0.464 0.536 0.000
#> SRR1464915 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1312406 2 0.9280 -0.233671 0.160 0.452 0.388
#> SRR1350435 1 0.2229 0.862417 0.944 0.012 0.044
#> SRR1389177 3 0.6513 0.371031 0.004 0.476 0.520
#> SRR1368072 2 0.1643 0.747225 0.044 0.956 0.000
#> SRR601815 2 0.1267 0.739997 0.024 0.972 0.004
#> SRR613330 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1434502 2 0.6128 0.712897 0.136 0.780 0.084
#> SRR1394190 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1481083 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR816382 2 0.7453 -0.111494 0.036 0.528 0.436
#> SRR1318839 3 0.2448 0.737078 0.000 0.076 0.924
#> SRR1432390 2 0.7884 0.541133 0.252 0.644 0.104
#> SRR613126 2 0.2939 0.709833 0.012 0.916 0.072
#> SRR1089424 2 0.3619 0.737194 0.136 0.864 0.000
#> SRR1347214 2 0.1643 0.748473 0.044 0.956 0.000
#> SRR1309556 2 0.6587 0.690072 0.156 0.752 0.092
#> SRR1456027 1 0.7276 0.594001 0.704 0.192 0.104
#> SRR1400551 3 0.8298 0.673117 0.152 0.220 0.628
#> SRR1320469 1 0.1832 0.866997 0.956 0.008 0.036
#> SRR614251 2 0.1170 0.730457 0.008 0.976 0.016
#> SRR1454310 2 0.0592 0.735483 0.012 0.988 0.000
#> SRR615105 2 0.5331 0.606178 0.024 0.792 0.184
#> SRR1433290 3 0.5864 0.695771 0.008 0.288 0.704
#> SRR2166064 2 0.7274 0.549157 0.304 0.644 0.052
#> SRR601671 2 0.4555 0.703825 0.200 0.800 0.000
#> SRR663874 2 0.2590 0.747192 0.072 0.924 0.004
#> SRR1409130 2 0.1015 0.729717 0.008 0.980 0.012
#> SRR659696 2 0.7924 0.490223 0.304 0.612 0.084
#> SRR1408249 2 0.5690 0.627168 0.288 0.708 0.004
#> SRR663284 2 0.4931 0.682425 0.232 0.768 0.000
#> SRR1402794 3 0.8533 0.558509 0.104 0.360 0.536
#> SRR614852 2 0.7781 0.571742 0.220 0.664 0.116
#> SRR1348040 2 0.9425 0.071405 0.200 0.488 0.312
#> SRR1489610 2 0.5016 0.675209 0.240 0.760 0.000
#> SRR1488091 2 0.0237 0.727263 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499566 2 0.5431 0.633963 0.284 0.716 0.000
#> SRR1361480 2 0.2496 0.750721 0.068 0.928 0.004
#> SRR1444501 3 0.5291 0.702702 0.000 0.268 0.732
#> SRR1415773 2 0.5662 0.704798 0.100 0.808 0.092
#> SRR1388832 2 0.9497 -0.029078 0.200 0.468 0.332
#> SRR1394637 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR606974 2 0.3272 0.682777 0.004 0.892 0.104
#> SRR662918 2 0.6927 0.573307 0.296 0.664 0.040
#> SRR817421 3 0.2448 0.737078 0.000 0.076 0.924
#> SRR1400823 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1381348 2 0.4172 0.730966 0.156 0.840 0.004
#> SRR608264 3 0.3619 0.746617 0.000 0.136 0.864
#> SRR1318560 1 0.3532 0.813940 0.884 0.008 0.108
#> SRR1454117 2 0.4351 0.724822 0.168 0.828 0.004
#> SRR1312684 1 0.1999 0.867176 0.952 0.012 0.036
#> SRR615044 1 0.8675 0.007945 0.476 0.420 0.104
#> SRR1432743 2 0.5363 0.455034 0.000 0.724 0.276
#> SRR1388873 2 0.1753 0.748303 0.048 0.952 0.000
#> SRR1353517 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1357148 2 0.7014 0.479921 0.080 0.712 0.208
#> SRR1406008 2 0.4293 0.732999 0.164 0.832 0.004
#> SRR1396786 2 0.0892 0.738652 0.020 0.980 0.000
#> SRR1446564 1 0.1877 0.869673 0.956 0.012 0.032
#> SRR1318465 3 0.6513 0.371031 0.004 0.476 0.520
#> SRR1431083 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR607117 2 0.7138 0.570447 0.312 0.644 0.044
#> SRR655170 2 0.4968 0.712721 0.188 0.800 0.012
#> SRR1087825 2 0.7979 0.516414 0.272 0.628 0.100
#> SRR662019 3 0.8489 0.587096 0.268 0.136 0.596
#> SRR1349209 2 0.8906 0.027045 0.136 0.520 0.344
#> SRR1326161 2 0.1525 0.745846 0.032 0.964 0.004
#> SRR1345284 2 0.4399 0.711147 0.188 0.812 0.000
#> SRR1416672 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR663356 2 0.2165 0.749041 0.064 0.936 0.000
#> SRR1454328 2 0.0237 0.730491 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489286 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1092349 1 0.4912 0.711067 0.796 0.196 0.008
#> SRR1408183 3 0.3425 0.746903 0.004 0.112 0.884
#> SRR1084369 3 0.5138 0.712397 0.000 0.252 0.748
#> SRR598452 3 0.3310 0.739817 0.028 0.064 0.908
#> SRR660709 2 0.5167 0.620904 0.024 0.804 0.172
#> SRR809444 1 0.0661 0.884078 0.988 0.008 0.004
#> SRR1089901 2 0.0661 0.732450 0.008 0.988 0.004
#> SRR1375774 1 0.2400 0.849905 0.932 0.064 0.004
#> SRR1326292 3 0.9084 0.582429 0.232 0.216 0.552
#> SRR657139 1 0.5171 0.672296 0.784 0.012 0.204
#> SRR1440744 2 0.4931 0.680003 0.232 0.768 0.000
#> SRR1353555 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1323087 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1452334 2 0.5662 0.684374 0.100 0.808 0.092
#> SRR1381775 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1363908 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1319626 2 0.4293 0.727787 0.164 0.832 0.004
#> SRR658989 2 0.6742 0.333497 0.028 0.656 0.316
#> SRR1353663 1 0.1585 0.873241 0.964 0.008 0.028
#> SRR811771 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR813983 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR815825 3 0.2448 0.737078 0.000 0.076 0.924
#> SRR819054 2 0.3686 0.737118 0.140 0.860 0.000
#> SRR1367988 2 0.8409 0.440127 0.308 0.580 0.112
#> SRR1331922 1 0.2400 0.849905 0.932 0.064 0.004
#> SRR615479 1 0.5928 0.540754 0.696 0.296 0.008
#> SRR1375796 2 0.1170 0.730457 0.008 0.976 0.016
#> SRR1386991 2 0.6151 0.589391 0.056 0.764 0.180
#> SRR1355217 2 0.7274 0.333109 0.052 0.644 0.304
#> SRR1356290 2 0.4629 0.600588 0.004 0.808 0.188
#> SRR659507 2 0.6597 0.579052 0.120 0.756 0.124
#> SRR663296 1 0.0747 0.882633 0.984 0.016 0.000
#> SRR598044 2 0.3879 0.732541 0.152 0.848 0.000
#> SRR661155 2 0.7274 0.549157 0.304 0.644 0.052
#> SRR1414727 2 0.9497 -0.084476 0.200 0.468 0.332
#> SRR663477 1 0.2229 0.862417 0.944 0.012 0.044
#> SRR1354489 3 0.6509 0.382747 0.004 0.472 0.524
#> SRR1377800 3 0.8175 0.674295 0.132 0.236 0.632
#> SRR614611 2 0.0747 0.723303 0.000 0.984 0.016
#> SRR655052 2 0.5060 0.638849 0.028 0.816 0.156
#> SRR1478968 1 0.7276 0.594001 0.704 0.192 0.104
#> SRR1351280 2 0.6141 0.667650 0.232 0.736 0.032
#> SRR613951 1 0.7644 0.399108 0.624 0.308 0.068
#> SRR1418022 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR661901 2 0.9074 -0.042257 0.148 0.500 0.352
#> SRR1408161 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR657054 3 0.8533 0.558509 0.104 0.360 0.536
#> SRR655040 1 0.8339 -0.146421 0.472 0.448 0.080
#> SRR810225 2 0.3425 0.745394 0.112 0.884 0.004
#> SRR1325377 2 0.3482 0.740139 0.128 0.872 0.000
#> SRR617829 2 0.5650 0.361201 0.000 0.688 0.312
#> SRR1402328 2 0.0892 0.738652 0.020 0.980 0.000
#> SRR1480455 2 0.0892 0.722644 0.000 0.980 0.020
#> SRR1442104 3 0.2448 0.736012 0.000 0.076 0.924
#> SRR1453416 1 0.1585 0.871721 0.964 0.008 0.028
#> SRR1481396 3 0.4087 0.735855 0.068 0.052 0.880
#> SRR1414314 2 0.0747 0.737617 0.016 0.984 0.000
#> SRR663026 2 0.1529 0.745401 0.040 0.960 0.000
#> SRR1478386 2 0.4931 0.679483 0.232 0.768 0.000
#> SRR1458683 3 0.8976 0.534572 0.152 0.316 0.532
#> SRR1370572 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1467567 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1468532 1 0.7384 0.512741 0.660 0.272 0.068
#> SRR1310735 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1440101 2 0.7884 0.541133 0.252 0.644 0.104
#> SRR660260 2 0.6154 0.537542 0.044 0.752 0.204
#> SRR1071231 2 0.1411 0.743805 0.036 0.964 0.000
#> SRR1459125 2 0.8109 0.518330 0.272 0.620 0.108
#> SRR1337173 2 0.5138 0.496280 0.000 0.748 0.252
#> SRR1396250 3 0.3213 0.738620 0.028 0.060 0.912
#> SRR2166376 3 0.8087 0.579262 0.076 0.364 0.560
#> SRR659816 2 0.5111 0.625222 0.024 0.808 0.168
#> SRR1401379 2 0.5016 0.675209 0.240 0.760 0.000
#> SRR600981 2 0.8142 0.524283 0.268 0.620 0.112
#> SRR1398335 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1397218 2 0.8122 0.530327 0.292 0.608 0.100
#> SRR660115 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1407950 2 0.1267 0.739997 0.024 0.972 0.004
#> SRR1359780 2 0.0829 0.735231 0.012 0.984 0.004
#> SRR1490037 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR627439 1 0.6339 0.372353 0.632 0.360 0.008
#> SRR1397156 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1410221 2 0.0661 0.732450 0.008 0.988 0.004
#> SRR1319648 2 0.5406 0.686423 0.224 0.764 0.012
#> SRR1092985 3 0.7607 0.346728 0.364 0.052 0.584
#> SRR656409 2 0.5953 0.633385 0.280 0.708 0.012
#> SRR1468658 2 0.6381 0.303115 0.012 0.648 0.340
#> SRR1390437 1 0.7644 0.399108 0.624 0.308 0.068
#> SRR658057 2 0.4409 0.722251 0.172 0.824 0.004
#> SRR612635 2 0.4062 0.726569 0.164 0.836 0.000
#> SRR1351480 2 0.2261 0.749240 0.068 0.932 0.000
#> SRR1436651 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1441590 1 0.2356 0.843278 0.928 0.072 0.000
#> SRR659590 2 0.1411 0.743805 0.036 0.964 0.000
#> SRR614263 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1409575 2 0.3941 0.730255 0.156 0.844 0.000
#> SRR659911 2 0.0829 0.735120 0.012 0.984 0.004
#> SRR1085519 3 0.6416 0.714238 0.032 0.260 0.708
#> SRR1345894 2 0.7498 -0.080339 0.040 0.548 0.412
#> SRR1442928 2 0.4712 0.667551 0.044 0.848 0.108
#> SRR1464681 2 0.7979 0.516414 0.272 0.628 0.100
#> SRR1418880 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1309070 2 0.5098 0.503088 0.000 0.752 0.248
#> SRR1365426 1 0.5363 0.594504 0.724 0.276 0.000
#> SRR1487947 1 0.1711 0.869492 0.960 0.008 0.032
#> SRR659708 1 0.2356 0.843278 0.928 0.072 0.000
#> SRR603236 2 0.3619 0.648832 0.000 0.864 0.136
#> SRR660673 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1430729 2 0.1163 0.741888 0.028 0.972 0.000
#> SRR663807 2 0.1753 0.748149 0.048 0.952 0.000
#> SRR1087245 2 0.4351 0.723138 0.168 0.828 0.004
#> SRR1339108 2 0.4749 0.741179 0.116 0.844 0.040
#> SRR613426 1 0.7592 0.565906 0.680 0.208 0.112
#> SRR613879 2 0.1919 0.735277 0.024 0.956 0.020
#> SRR1385101 1 0.5378 0.653583 0.756 0.236 0.008
#> SRR1387966 2 0.2066 0.750058 0.060 0.940 0.000
#> SRR1458852 2 0.1163 0.721438 0.000 0.972 0.028
#> SRR1430489 1 0.6922 0.612969 0.720 0.200 0.080
#> SRR1349231 1 0.2711 0.829300 0.912 0.088 0.000
#> SRR1376249 3 0.4087 0.735855 0.068 0.052 0.880
#> SRR1321987 2 0.0475 0.730206 0.004 0.992 0.004
#> SRR662653 2 0.1529 0.745401 0.040 0.960 0.000
#> SRR1390027 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1098474 2 0.3879 0.733057 0.152 0.848 0.000
#> SRR1383081 2 0.4002 0.727969 0.160 0.840 0.000
#> SRR2166960 2 0.1989 0.749832 0.048 0.948 0.004
#> SRR605101 2 0.5254 0.656973 0.264 0.736 0.000
#> SRR818600 2 0.2165 0.749553 0.064 0.936 0.000
#> SRR1367715 2 0.4178 0.721442 0.172 0.828 0.000
#> SRR1351979 3 0.2711 0.741272 0.000 0.088 0.912
#> SRR1387054 3 0.5810 0.638849 0.000 0.336 0.664
#> SRR1444306 3 0.7169 0.520291 0.028 0.404 0.568
#> SRR1322662 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR665478 2 0.0829 0.735120 0.012 0.984 0.004
#> SRR612767 1 0.1751 0.871977 0.960 0.012 0.028
#> SRR1489030 2 0.1860 0.747677 0.052 0.948 0.000
#> SRR1430375 2 0.2050 0.731598 0.020 0.952 0.028
#> SRR615225 2 0.8142 0.524283 0.268 0.620 0.112
#> SRR1401839 2 0.7717 0.506095 0.112 0.668 0.220
#> SRR1379110 2 0.4399 0.711147 0.188 0.812 0.000
#> SRR1077288 3 0.3370 0.723234 0.072 0.024 0.904
#> SRR1331639 2 0.7979 0.516414 0.272 0.628 0.100
#> SRR1342782 1 0.6513 0.247205 0.592 0.400 0.008
#> SRR1443003 3 0.6917 0.591873 0.024 0.368 0.608
#> SRR612839 1 0.1585 0.871721 0.964 0.008 0.028
#> SRR1470093 3 0.5621 0.674155 0.000 0.308 0.692
#> SRR1395742 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1469014 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1387222 2 0.5835 0.283638 0.000 0.660 0.340
#> SRR664063 1 0.5465 0.571674 0.712 0.288 0.000
#> SRR1488214 1 0.2443 0.863619 0.940 0.028 0.032
#> SRR654766 2 0.8409 0.440127 0.308 0.580 0.112
#> SRR1320321 2 0.4235 0.719670 0.176 0.824 0.000
#> SRR1071955 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1417483 1 0.0424 0.885813 0.992 0.008 0.000
#> SRR1394231 2 0.4002 0.727969 0.160 0.840 0.000
#> SRR1488470 2 0.7023 0.540712 0.344 0.624 0.032
#> SRR1389497 3 0.3425 0.746903 0.004 0.112 0.884
#> SRR1367109 2 0.7232 -0.087691 0.028 0.544 0.428
#> SRR615311 1 0.0592 0.884129 0.988 0.012 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0804 0.730012 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR1380716 2 0.1822 0.741874 0.044 0.944 0.008 0.004
#> SRR612803 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2399 0.809025 0.920 0.048 0.000 0.032
#> SRR1084417 1 0.5242 0.585840 0.748 0.004 0.064 0.184
#> SRR1074359 2 0.5304 0.600275 0.000 0.748 0.148 0.104
#> SRR1419258 3 0.1706 0.371768 0.000 0.036 0.948 0.016
#> SRR1403366 2 0.8755 -0.000952 0.072 0.464 0.280 0.184
#> SRR665262 2 0.5544 0.652807 0.076 0.780 0.072 0.072
#> SRR1499740 1 0.5758 0.609730 0.748 0.156 0.044 0.052
#> SRR1105057 2 0.1305 0.737410 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1439742 1 0.0336 0.853813 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR614599 2 0.6480 0.585302 0.060 0.716 0.116 0.108
#> SRR612215 2 0.5487 0.657501 0.052 0.780 0.068 0.100
#> SRR1094051 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.3581 0.754031 0.852 0.000 0.032 0.116
#> SRR1409263 3 0.6498 -0.089705 0.072 0.000 0.488 0.440
#> SRR1431288 1 0.0188 0.855665 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334889 2 0.4680 0.673096 0.192 0.772 0.004 0.032
#> SRR614839 2 0.4835 0.661979 0.208 0.756 0.004 0.032
#> SRR658433 2 0.0804 0.723155 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1088581 2 0.6027 0.479199 0.000 0.664 0.244 0.092
#> SRR1328797 3 0.1706 0.371768 0.000 0.036 0.948 0.016
#> SRR1334512 2 0.1863 0.742102 0.040 0.944 0.004 0.012
#> SRR1471117 1 0.1637 0.824770 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1311553 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.1114 0.731598 0.016 0.972 0.008 0.004
#> SRR1354955 2 0.7782 -0.027817 0.016 0.480 0.344 0.160
#> SRR654802 3 0.3823 0.306186 0.008 0.008 0.824 0.160
#> SRR660066 2 0.0927 0.731380 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR1447103 2 0.5915 0.608891 0.032 0.744 0.120 0.104
#> SRR1402153 4 0.6954 0.269154 0.000 0.152 0.280 0.568
#> SRR655887 2 0.2055 0.742457 0.048 0.936 0.008 0.008
#> SRR1408529 2 0.6238 0.391914 0.000 0.620 0.296 0.084
#> SRR658707 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.6124 0.678415 0.132 0.728 0.108 0.032
#> SRR1074670 3 0.8660 0.182386 0.036 0.300 0.396 0.268
#> SRR1375439 2 0.8170 0.415298 0.128 0.584 0.164 0.124
#> SRR1329003 4 0.8778 0.515593 0.096 0.144 0.288 0.472
#> SRR1404837 2 0.4605 0.731987 0.096 0.824 0.028 0.052
#> SRR1317920 1 0.1824 0.827827 0.936 0.004 0.000 0.060
#> SRR1455525 4 0.8890 0.489791 0.104 0.156 0.268 0.472
#> SRR613999 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0188 0.855303 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499764 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 2 0.7611 -0.069444 0.020 0.488 0.368 0.124
#> SRR1068855 1 0.1557 0.830558 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1375509 3 0.5896 0.101966 0.032 0.004 0.576 0.388
#> SRR612227 3 0.8660 0.182386 0.036 0.300 0.396 0.268
#> SRR1388809 2 0.1492 0.738892 0.036 0.956 0.004 0.004
#> SRR1413872 2 0.8060 0.293736 0.140 0.512 0.044 0.304
#> SRR1452864 1 0.1902 0.823431 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1473078 2 0.9106 -0.145619 0.092 0.416 0.300 0.192
#> SRR615814 2 0.2179 0.741557 0.064 0.924 0.000 0.012
#> SRR1325225 1 0.7293 0.336519 0.576 0.112 0.024 0.288
#> SRR1313687 2 0.3166 0.728188 0.116 0.868 0.000 0.016
#> SRR1358220 2 0.2271 0.740046 0.076 0.916 0.000 0.008
#> SRR1096662 2 0.4635 0.653815 0.216 0.756 0.000 0.028
#> SRR1487746 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.5404 0.519382 0.700 0.248 0.000 0.052
#> SRR660164 2 0.1639 0.722216 0.004 0.952 0.036 0.008
#> SRR815783 2 0.2174 0.740479 0.052 0.928 0.000 0.020
#> SRR809595 1 0.5386 0.529473 0.708 0.236 0.000 0.056
#> SRR1403133 2 0.0712 0.729852 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR815470 2 0.5257 0.605211 0.000 0.752 0.144 0.104
#> SRR1344382 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.5791 0.567919 0.008 0.716 0.192 0.084
#> SRR1478362 2 0.5876 0.570415 0.012 0.716 0.188 0.084
#> SRR1392186 2 0.5446 0.582822 0.276 0.680 0.000 0.044
#> SRR1347937 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0336 0.854795 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1471594 1 0.0188 0.855718 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354270 2 0.8371 0.206411 0.068 0.524 0.248 0.160
#> SRR612683 2 0.1617 0.737421 0.024 0.956 0.008 0.012
#> SRR1392901 2 0.6412 0.246264 0.000 0.572 0.348 0.080
#> SRR1077805 3 0.4877 0.359174 0.000 0.204 0.752 0.044
#> SRR1360402 2 0.1114 0.731598 0.016 0.972 0.008 0.004
#> SRR1406112 2 0.7782 -0.027817 0.016 0.480 0.344 0.160
#> SRR1355352 3 0.7784 0.015446 0.056 0.076 0.468 0.400
#> SRR656247 1 0.2830 0.791826 0.900 0.060 0.000 0.040
#> SRR813656 2 0.6432 0.399169 0.372 0.552 0.000 0.076
#> SRR808244 4 0.5969 0.400225 0.076 0.012 0.212 0.700
#> SRR1387240 2 0.2021 0.712198 0.000 0.932 0.056 0.012
#> SRR1408595 1 0.1624 0.838072 0.952 0.020 0.000 0.028
#> SRR1385277 1 0.8577 -0.159689 0.372 0.320 0.028 0.280
#> SRR1435248 2 0.0859 0.728357 0.008 0.980 0.008 0.004
#> SRR1419110 2 0.7255 0.486977 0.060 0.652 0.140 0.148
#> SRR1408682 2 0.4951 0.687953 0.056 0.812 0.080 0.052
#> SRR1317134 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4232 0.713094 0.144 0.816 0.004 0.036
#> SRR1453911 2 0.4587 0.701262 0.032 0.828 0.084 0.056
#> SRR603164 3 0.4978 0.278814 0.000 0.324 0.664 0.012
#> SRR1383259 2 0.7555 0.457898 0.272 0.560 0.024 0.144
#> SRR1330854 1 0.4969 0.643620 0.772 0.000 0.088 0.140
#> SRR1452423 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4204 0.677289 0.192 0.788 0.000 0.020
#> SRR1468162 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.6998 0.249699 0.008 0.372 0.524 0.096
#> SRR1361546 1 0.6260 0.399654 0.636 0.288 0.008 0.068
#> SRR1486156 1 0.0188 0.855665 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660545 2 0.1610 0.718101 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR615635 2 0.2179 0.741557 0.064 0.924 0.000 0.012
#> SRR1385411 2 0.4906 0.678823 0.188 0.768 0.012 0.032
#> SRR1342739 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.6894 0.198594 0.020 0.072 0.568 0.340
#> SRR662126 2 0.5787 0.654731 0.192 0.720 0.012 0.076
#> SRR1464601 2 0.0804 0.723155 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1071594 2 0.2999 0.722849 0.132 0.864 0.004 0.000
#> SRR612539 2 0.4642 0.635228 0.240 0.740 0.000 0.020
#> SRR602010 1 0.5471 0.483679 0.684 0.268 0.000 0.048
#> SRR810249 2 0.1004 0.734940 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR818773 1 0.5723 0.474192 0.676 0.268 0.004 0.052
#> SRR1336569 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.2497 0.725820 0.020 0.924 0.040 0.016
#> SRR1442754 1 0.3427 0.761749 0.860 0.000 0.028 0.112
#> SRR1334247 2 0.7445 0.163327 0.020 0.536 0.324 0.120
#> SRR661639 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6153 0.473738 0.328 0.604 0.000 0.068
#> SRR1459937 2 0.9105 -0.035416 0.308 0.368 0.068 0.256
#> SRR2185018 1 0.0188 0.855718 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR655732 2 0.1798 0.741127 0.040 0.944 0.000 0.016
#> SRR809348 1 0.0188 0.855718 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR819261 3 0.8660 0.182386 0.036 0.300 0.396 0.268
#> SRR661074 3 0.5896 0.102292 0.032 0.004 0.576 0.388
#> SRR1349851 1 0.1970 0.824832 0.932 0.008 0.000 0.060
#> SRR1405123 2 0.7555 0.457898 0.272 0.560 0.024 0.144
#> SRR661096 2 0.5143 0.605530 0.256 0.708 0.000 0.036
#> SRR1320225 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.8778 0.515593 0.096 0.144 0.288 0.472
#> SRR1307677 2 0.1909 0.742015 0.048 0.940 0.008 0.004
#> SRR1466512 2 0.3157 0.718411 0.144 0.852 0.000 0.004
#> SRR658212 2 0.1909 0.742015 0.048 0.940 0.008 0.004
#> SRR1430525 3 0.3674 0.390860 0.000 0.116 0.848 0.036
#> SRR1344422 2 0.7931 0.394307 0.284 0.524 0.032 0.160
#> SRR1353924 2 0.1576 0.738798 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR1314832 1 0.7542 -0.179079 0.488 0.000 0.232 0.280
#> SRR1487570 1 0.7293 0.336519 0.576 0.112 0.024 0.288
#> SRR627431 2 0.4457 0.660340 0.004 0.816 0.108 0.072
#> SRR1418561 4 0.9185 0.320440 0.308 0.080 0.236 0.376
#> SRR1448029 3 0.6220 0.376897 0.016 0.200 0.692 0.092
#> SRR813802 1 0.1211 0.836051 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR815020 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2665 0.740868 0.088 0.900 0.008 0.004
#> SRR1435311 2 0.3529 0.708796 0.152 0.836 0.000 0.012
#> SRR612395 2 0.5517 0.631692 0.032 0.772 0.092 0.104
#> SRR603116 2 0.3257 0.740958 0.068 0.888 0.012 0.032
#> SRR1323152 3 0.6939 0.293995 0.008 0.312 0.572 0.108
#> SRR1368264 1 0.5574 0.459032 0.668 0.284 0.000 0.048
#> SRR1326624 1 0.2053 0.817746 0.924 0.004 0.000 0.072
#> SRR1429265 3 0.6036 0.065793 0.036 0.004 0.548 0.412
#> SRR1327702 1 0.0188 0.855665 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615611 2 0.5546 0.555746 0.292 0.664 0.000 0.044
#> SRR1486799 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.7284 0.289350 0.388 0.492 0.012 0.108
#> SRR815044 2 0.4833 0.638710 0.228 0.740 0.000 0.032
#> SRR1338560 2 0.3494 0.697719 0.172 0.824 0.000 0.004
#> SRR615862 2 0.2847 0.739084 0.084 0.896 0.004 0.016
#> SRR1480038 2 0.3577 0.706809 0.156 0.832 0.000 0.012
#> SRR659436 2 0.6983 0.509162 0.036 0.656 0.180 0.128
#> SRR613699 2 0.0524 0.724839 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1436563 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.5025 0.614114 0.252 0.716 0.000 0.032
#> SRR1330327 2 0.8062 0.397062 0.116 0.552 0.072 0.260
#> SRR1489950 2 0.0657 0.730459 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.5779 0.394865 0.016 0.156 0.736 0.092
#> SRR1444002 1 0.1637 0.824770 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1318444 2 0.8791 0.060579 0.068 0.464 0.240 0.228
#> SRR600656 2 0.8224 0.315947 0.136 0.516 0.060 0.288
#> SRR658766 2 0.6066 0.462745 0.004 0.656 0.268 0.072
#> SRR655946 3 0.4707 0.365100 0.000 0.204 0.760 0.036
#> SRR817282 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.7114 0.207590 0.036 0.076 0.592 0.296
#> SRR1406418 1 0.0188 0.855665 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090265 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.5723 0.474192 0.676 0.268 0.004 0.052
#> SRR1471965 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.7295 0.322019 0.020 0.584 0.264 0.132
#> SRR662498 2 0.6415 0.525341 0.020 0.692 0.160 0.128
#> SRR1376764 2 0.7537 0.278040 0.016 0.560 0.240 0.184
#> SRR1377006 2 0.6668 0.372051 0.012 0.600 0.308 0.080
#> SRR656860 2 0.3757 0.707839 0.152 0.828 0.000 0.020
#> SRR1480547 2 0.7239 0.479798 0.272 0.580 0.016 0.132
#> SRR1452515 2 0.7368 0.132932 0.020 0.520 0.356 0.104
#> SRR1324390 2 0.1377 0.733551 0.020 0.964 0.008 0.008
#> SRR615273 1 0.8093 -0.060693 0.448 0.396 0.064 0.092
#> SRR601695 2 0.4920 0.620350 0.000 0.776 0.136 0.088
#> SRR820907 2 0.3355 0.706433 0.160 0.836 0.000 0.004
#> SRR812773 1 0.4881 0.608060 0.756 0.196 0.000 0.048
#> SRR1405984 2 0.1022 0.736561 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.3496 0.700686 0.004 0.872 0.072 0.052
#> SRR1365448 1 0.1637 0.824770 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1095720 3 0.8450 0.117601 0.028 0.324 0.412 0.236
#> SRR1435626 2 0.8418 -0.186284 0.052 0.432 0.368 0.148
#> SRR1080766 2 0.0804 0.723155 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1377862 1 0.1890 0.826805 0.936 0.008 0.000 0.056
#> SRR1332299 3 0.6044 0.385350 0.008 0.188 0.700 0.104
#> SRR1467966 2 0.7463 -0.142250 0.008 0.456 0.400 0.136
#> SRR1320579 2 0.6316 0.325284 0.000 0.596 0.324 0.080
#> SRR1319710 2 0.4644 0.664455 0.208 0.764 0.004 0.024
#> SRR1326604 2 0.1674 0.739003 0.032 0.952 0.004 0.012
#> SRR1098879 4 0.5250 0.252366 0.000 0.024 0.316 0.660
#> SRR662245 2 0.0672 0.725469 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1074719 2 0.1022 0.736561 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.7409 0.320189 0.568 0.124 0.024 0.284
#> SRR601387 2 0.0844 0.731186 0.012 0.980 0.004 0.004
#> SRR614575 2 0.2847 0.739084 0.084 0.896 0.004 0.016
#> SRR1353900 2 0.1743 0.740088 0.056 0.940 0.004 0.000
#> SRR662906 2 0.1820 0.719297 0.000 0.944 0.036 0.020
#> SRR1350832 2 0.1114 0.731598 0.016 0.972 0.008 0.004
#> SRR1403280 2 0.3632 0.708877 0.156 0.832 0.004 0.008
#> SRR1313969 2 0.8043 0.359763 0.104 0.540 0.072 0.284
#> SRR1388528 1 0.0592 0.851765 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1452912 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4874 0.628386 0.764 0.180 0.000 0.056
#> SRR655399 3 0.4540 0.221046 0.008 0.004 0.740 0.248
#> SRR1319753 2 0.5957 0.443456 0.364 0.588 0.000 0.048
#> SRR818901 3 0.6642 0.363984 0.008 0.200 0.648 0.144
#> SRR607067 2 0.7109 0.481814 0.224 0.584 0.004 0.188
#> SRR1391420 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4640 0.676629 0.188 0.776 0.004 0.032
#> SRR661961 2 0.8188 0.230263 0.316 0.508 0.080 0.096
#> SRR658259 2 0.2007 0.741510 0.036 0.940 0.004 0.020
#> SRR1310476 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0859 0.726830 0.004 0.980 0.008 0.008
#> SRR1365034 2 0.6194 0.601752 0.240 0.668 0.008 0.084
#> SRR1478053 2 0.1305 0.737410 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1475300 2 0.3448 0.701062 0.168 0.828 0.000 0.004
#> SRR1328101 2 0.5487 0.657501 0.052 0.780 0.068 0.100
#> SRR1322900 1 0.7087 0.485234 0.664 0.172 0.068 0.096
#> SRR1309942 2 0.0992 0.730310 0.012 0.976 0.008 0.004
#> SRR1345760 1 0.8367 0.127871 0.496 0.212 0.044 0.248
#> SRR1435418 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.5823 0.667978 0.060 0.760 0.072 0.108
#> SRR1443436 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0992 0.726153 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR661469 2 0.8177 0.411927 0.120 0.584 0.156 0.140
#> SRR1500323 2 0.1767 0.716311 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR1356705 2 0.6102 0.323471 0.420 0.532 0.000 0.048
#> SRR1464915 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.9314 -0.168285 0.104 0.400 0.272 0.224
#> SRR1350435 1 0.2053 0.817746 0.924 0.004 0.000 0.072
#> SRR1389177 3 0.6179 0.239948 0.000 0.392 0.552 0.056
#> SRR1368072 2 0.1786 0.739166 0.036 0.948 0.008 0.008
#> SRR601815 2 0.0967 0.731899 0.016 0.976 0.004 0.004
#> SRR613330 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6229 0.697491 0.108 0.736 0.072 0.084
#> SRR1394190 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.7667 -0.160041 0.020 0.444 0.412 0.124
#> SRR1318839 3 0.2125 0.317191 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1432390 2 0.7911 0.337099 0.128 0.532 0.044 0.296
#> SRR613126 2 0.3496 0.700686 0.004 0.872 0.072 0.052
#> SRR1089424 2 0.2888 0.725752 0.124 0.872 0.000 0.004
#> SRR1347214 2 0.1690 0.739295 0.032 0.952 0.008 0.008
#> SRR1309556 2 0.6414 0.682136 0.124 0.720 0.060 0.096
#> SRR1456027 1 0.7463 0.291537 0.556 0.104 0.032 0.308
#> SRR1400551 3 0.9258 -0.039576 0.112 0.176 0.388 0.324
#> SRR1320469 1 0.1902 0.819724 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR614251 2 0.1443 0.727590 0.008 0.960 0.028 0.004
#> SRR1454310 2 0.0859 0.729345 0.008 0.980 0.008 0.004
#> SRR615105 2 0.6019 0.542870 0.000 0.688 0.176 0.136
#> SRR1433290 3 0.5988 0.386751 0.008 0.188 0.704 0.100
#> SRR2166064 2 0.7786 0.444146 0.204 0.564 0.032 0.200
#> SRR601671 2 0.3486 0.688919 0.188 0.812 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.2142 0.740043 0.056 0.928 0.000 0.016
#> SRR1409130 2 0.0992 0.726225 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR659696 2 0.7994 0.321059 0.172 0.520 0.032 0.276
#> SRR1408249 2 0.5143 0.605530 0.256 0.708 0.000 0.036
#> SRR663284 2 0.4485 0.669043 0.200 0.772 0.000 0.028
#> SRR1402794 3 0.8660 0.182386 0.036 0.300 0.396 0.268
#> SRR614852 2 0.8083 0.387892 0.116 0.548 0.072 0.264
#> SRR1348040 2 0.9366 0.116191 0.156 0.436 0.224 0.184
#> SRR1489610 2 0.4644 0.664455 0.208 0.764 0.004 0.024
#> SRR1488091 2 0.0804 0.723155 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1499566 2 0.4797 0.615161 0.260 0.720 0.000 0.020
#> SRR1361480 2 0.2186 0.742352 0.048 0.932 0.008 0.012
#> SRR1444501 3 0.3931 0.395035 0.000 0.128 0.832 0.040
#> SRR1415773 2 0.5598 0.690368 0.096 0.772 0.088 0.044
#> SRR1388832 2 0.9459 0.026727 0.148 0.416 0.228 0.208
#> SRR1394637 1 0.0336 0.854718 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR606974 2 0.4457 0.660340 0.004 0.816 0.108 0.072
#> SRR662918 2 0.7495 0.486595 0.212 0.592 0.028 0.168
#> SRR817421 3 0.2125 0.317191 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1400823 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3662 0.717427 0.148 0.836 0.004 0.012
#> SRR608264 3 0.1820 0.365175 0.000 0.036 0.944 0.020
#> SRR1318560 1 0.3581 0.754031 0.852 0.000 0.032 0.116
#> SRR1454117 2 0.4232 0.713094 0.144 0.816 0.004 0.036
#> SRR1312684 1 0.1902 0.823431 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR615044 1 0.8093 -0.060693 0.448 0.396 0.064 0.092
#> SRR1432743 2 0.6052 0.427091 0.000 0.640 0.284 0.076
#> SRR1388873 2 0.1674 0.739003 0.032 0.952 0.004 0.012
#> SRR1353517 1 0.0188 0.855665 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1357148 2 0.7278 0.462817 0.052 0.644 0.164 0.140
#> SRR1406008 2 0.4130 0.723085 0.136 0.824 0.004 0.036
#> SRR1396786 2 0.0844 0.731090 0.012 0.980 0.004 0.004
#> SRR1446564 1 0.1824 0.825798 0.936 0.004 0.000 0.060
#> SRR1318465 3 0.6179 0.239948 0.000 0.392 0.552 0.056
#> SRR1431083 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.6576 0.540030 0.220 0.628 0.000 0.152
#> SRR655170 2 0.4599 0.695942 0.168 0.792 0.012 0.028
#> SRR1087825 2 0.8060 0.293736 0.140 0.512 0.044 0.304
#> SRR662019 4 0.9214 0.300179 0.192 0.100 0.312 0.396
#> SRR1349209 2 0.8791 0.060579 0.068 0.464 0.240 0.228
#> SRR1326161 2 0.1509 0.736996 0.020 0.960 0.012 0.008
#> SRR1345284 2 0.3494 0.697719 0.172 0.824 0.000 0.004
#> SRR1416672 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.1576 0.738798 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR1454328 2 0.0712 0.726106 0.004 0.984 0.008 0.004
#> SRR1489286 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4956 0.617863 0.756 0.188 0.000 0.056
#> SRR1408183 3 0.1471 0.354943 0.004 0.012 0.960 0.024
#> SRR1084369 3 0.3674 0.390860 0.000 0.116 0.848 0.036
#> SRR598452 3 0.4049 0.268445 0.008 0.000 0.780 0.212
#> SRR660709 2 0.6078 0.584009 0.020 0.712 0.180 0.088
#> SRR809444 1 0.0469 0.853933 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1089901 2 0.0992 0.726153 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR1375774 1 0.2670 0.805637 0.908 0.052 0.000 0.040
#> SRR1326292 4 0.8778 0.515593 0.096 0.144 0.288 0.472
#> SRR657139 1 0.5242 0.585840 0.748 0.004 0.064 0.184
#> SRR1440744 2 0.4318 0.667389 0.208 0.776 0.004 0.012
#> SRR1353555 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0336 0.854718 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1452334 2 0.5878 0.664663 0.060 0.756 0.072 0.112
#> SRR1381775 1 0.0188 0.855718 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363908 1 0.0188 0.855718 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.4141 0.715762 0.144 0.820 0.004 0.032
#> SRR658989 2 0.7295 0.322019 0.020 0.584 0.264 0.132
#> SRR1353663 1 0.1557 0.830558 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR811771 1 0.0188 0.855718 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813983 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.2125 0.317191 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR819054 2 0.3166 0.726937 0.116 0.868 0.000 0.016
#> SRR1367988 2 0.8277 0.186099 0.168 0.472 0.040 0.320
#> SRR1331922 1 0.2759 0.803198 0.904 0.052 0.000 0.044
#> SRR615479 1 0.5933 0.456902 0.668 0.272 0.012 0.048
#> SRR1375796 2 0.1443 0.727590 0.008 0.960 0.028 0.004
#> SRR1386991 2 0.6750 0.554401 0.048 0.688 0.148 0.116
#> SRR1355217 2 0.7534 0.314030 0.020 0.572 0.224 0.184
#> SRR1356290 2 0.5360 0.580852 0.004 0.736 0.196 0.064
#> SRR659507 2 0.6491 0.582865 0.100 0.720 0.096 0.084
#> SRR663296 1 0.0927 0.849365 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR598044 2 0.3324 0.719969 0.136 0.852 0.000 0.012
#> SRR661155 2 0.7786 0.444146 0.204 0.564 0.032 0.200
#> SRR1414727 2 0.9425 -0.023105 0.152 0.424 0.196 0.228
#> SRR663477 1 0.2053 0.817746 0.924 0.004 0.000 0.072
#> SRR1354489 3 0.6179 0.241166 0.000 0.392 0.552 0.056
#> SRR1377800 3 0.9059 0.024661 0.084 0.188 0.392 0.336
#> SRR614611 2 0.1520 0.721579 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR655052 2 0.5867 0.597859 0.016 0.728 0.164 0.092
#> SRR1478968 1 0.7463 0.291537 0.556 0.104 0.032 0.308
#> SRR1351280 2 0.6147 0.637916 0.192 0.700 0.016 0.092
#> SRR613951 1 0.7784 0.180009 0.512 0.236 0.012 0.240
#> SRR1418022 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.9018 -0.005772 0.084 0.444 0.236 0.236
#> SRR1408161 1 0.0188 0.855665 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657054 3 0.8660 0.182386 0.036 0.300 0.396 0.268
#> SRR655040 2 0.8249 0.155125 0.392 0.424 0.044 0.140
#> SRR810225 2 0.2737 0.733949 0.104 0.888 0.000 0.008
#> SRR1325377 2 0.2589 0.728797 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR617829 2 0.6391 0.307385 0.000 0.588 0.328 0.084
#> SRR1402328 2 0.0844 0.731090 0.012 0.980 0.004 0.004
#> SRR1480455 2 0.1520 0.721681 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR1442104 3 0.2647 0.282161 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1453416 1 0.1557 0.827292 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1481396 3 0.5411 0.176979 0.032 0.000 0.656 0.312
#> SRR1414314 2 0.0992 0.731284 0.012 0.976 0.008 0.004
#> SRR663026 2 0.1151 0.735775 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1478386 2 0.3945 0.662785 0.216 0.780 0.000 0.004
#> SRR1458683 4 0.8178 0.281240 0.020 0.236 0.284 0.460
#> SRR1370572 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.7031 0.391100 0.628 0.248 0.040 0.084
#> SRR1310735 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.7911 0.337099 0.128 0.532 0.044 0.296
#> SRR660260 2 0.6457 0.523516 0.020 0.688 0.164 0.128
#> SRR1071231 2 0.1004 0.734940 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1459125 2 0.8263 0.440418 0.196 0.552 0.072 0.180
#> SRR1337173 2 0.5864 0.468713 0.000 0.664 0.264 0.072
#> SRR1396250 3 0.3933 0.258251 0.008 0.000 0.792 0.200
#> SRR2166376 3 0.8450 0.117601 0.028 0.324 0.412 0.236
#> SRR659816 2 0.6038 0.588386 0.020 0.716 0.176 0.088
#> SRR1401379 2 0.4644 0.664455 0.208 0.764 0.004 0.024
#> SRR600981 2 0.8042 0.419173 0.168 0.556 0.052 0.224
#> SRR1398335 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.7829 0.509738 0.224 0.584 0.060 0.132
#> SRR660115 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0967 0.731899 0.016 0.976 0.004 0.004
#> SRR1359780 2 0.0859 0.728984 0.008 0.980 0.008 0.004
#> SRR1490037 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.7481 0.189591 0.516 0.292 0.004 0.188
#> SRR1397156 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0992 0.726153 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR1319648 2 0.4996 0.675260 0.188 0.764 0.012 0.036
#> SRR1092985 4 0.6556 0.413028 0.164 0.024 0.128 0.684
#> SRR656409 2 0.5664 0.610904 0.228 0.696 0.000 0.076
#> SRR1468658 2 0.6846 0.259382 0.012 0.556 0.352 0.080
#> SRR1390437 1 0.7784 0.180009 0.512 0.236 0.012 0.240
#> SRR658057 2 0.3862 0.708251 0.152 0.824 0.000 0.024
#> SRR612635 2 0.3428 0.714487 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR1351480 2 0.1743 0.740088 0.056 0.940 0.004 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.2830 0.791826 0.900 0.060 0.000 0.040
#> SRR659590 2 0.1004 0.734940 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR614263 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3157 0.718411 0.144 0.852 0.000 0.004
#> SRR659911 2 0.0859 0.729166 0.008 0.980 0.004 0.008
#> SRR1085519 3 0.5779 0.394865 0.016 0.156 0.736 0.092
#> SRR1345894 2 0.7724 -0.125722 0.020 0.456 0.392 0.132
#> SRR1442928 2 0.5458 0.635266 0.032 0.776 0.092 0.100
#> SRR1464681 2 0.8060 0.293736 0.140 0.512 0.044 0.304
#> SRR1418880 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.5900 0.470723 0.000 0.664 0.260 0.076
#> SRR1365426 1 0.5337 0.503376 0.696 0.260 0.000 0.044
#> SRR1487947 1 0.1743 0.825440 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR659708 1 0.2830 0.791826 0.900 0.060 0.000 0.040
#> SRR603236 2 0.4920 0.620350 0.000 0.776 0.136 0.088
#> SRR660673 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0592 0.732435 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.1398 0.738973 0.040 0.956 0.004 0.000
#> SRR1087245 2 0.3708 0.709289 0.148 0.832 0.000 0.020
#> SRR1339108 2 0.4605 0.731987 0.096 0.824 0.028 0.052
#> SRR613426 1 0.7707 0.355889 0.596 0.172 0.048 0.184
#> SRR613879 2 0.2497 0.725820 0.020 0.924 0.040 0.016
#> SRR1385101 1 0.5153 0.561037 0.732 0.224 0.004 0.040
#> SRR1387966 2 0.1576 0.741159 0.048 0.948 0.004 0.000
#> SRR1458852 2 0.1767 0.716311 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR1430489 1 0.7293 0.336519 0.576 0.112 0.024 0.288
#> SRR1349231 1 0.3128 0.774372 0.884 0.076 0.000 0.040
#> SRR1376249 3 0.5432 0.173172 0.032 0.000 0.652 0.316
#> SRR1321987 2 0.0672 0.724312 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR662653 2 0.1151 0.735775 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1390027 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3390 0.721151 0.132 0.852 0.000 0.016
#> SRR1383081 2 0.3428 0.714295 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR2166960 2 0.1833 0.740859 0.032 0.944 0.000 0.024
#> SRR605101 2 0.4360 0.637480 0.248 0.744 0.000 0.008
#> SRR818600 2 0.1661 0.740454 0.052 0.944 0.004 0.000
#> SRR1367715 2 0.3306 0.708169 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1351979 3 0.1902 0.325854 0.000 0.004 0.932 0.064
#> SRR1387054 3 0.4707 0.365100 0.000 0.204 0.760 0.036
#> SRR1444306 3 0.7175 0.302395 0.016 0.304 0.568 0.112
#> SRR1322662 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0859 0.729166 0.008 0.980 0.004 0.008
#> SRR612767 1 0.1970 0.826373 0.932 0.008 0.000 0.060
#> SRR1489030 2 0.1305 0.737410 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1430375 2 0.3081 0.716182 0.016 0.900 0.040 0.044
#> SRR615225 2 0.8042 0.419173 0.168 0.556 0.052 0.224
#> SRR1401839 2 0.7830 0.483872 0.084 0.608 0.168 0.140
#> SRR1379110 2 0.3494 0.697719 0.172 0.824 0.000 0.004
#> SRR1077288 3 0.5896 0.102292 0.032 0.004 0.576 0.388
#> SRR1331639 2 0.8060 0.293736 0.140 0.512 0.044 0.304
#> SRR1342782 1 0.6295 0.233694 0.568 0.372 0.004 0.056
#> SRR1443003 3 0.6698 0.334421 0.012 0.272 0.620 0.096
#> SRR612839 1 0.1637 0.824770 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1470093 3 0.5050 0.350874 0.000 0.176 0.756 0.068
#> SRR1395742 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0188 0.855665 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387222 2 0.6536 0.226823 0.000 0.560 0.352 0.088
#> SRR664063 1 0.5446 0.477313 0.680 0.276 0.000 0.044
#> SRR1488214 1 0.2443 0.817100 0.916 0.024 0.000 0.060
#> SRR654766 2 0.8277 0.186099 0.168 0.472 0.040 0.320
#> SRR1320321 2 0.3355 0.706433 0.160 0.836 0.000 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.856714 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3428 0.714295 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR1488470 2 0.7239 0.479798 0.272 0.580 0.016 0.132
#> SRR1389497 3 0.1471 0.354943 0.004 0.012 0.960 0.024
#> SRR1367109 2 0.7641 -0.090362 0.008 0.464 0.364 0.164
#> SRR615311 1 0.0779 0.851058 0.980 0.004 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0727 0.6449 0.000 0.980 0.004 0.012 0.004
#> SRR1380716 2 0.1989 0.6530 0.028 0.932 0.004 0.032 0.004
#> SRR612803 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2927 0.7956 0.888 0.048 0.000 0.036 0.028
#> SRR1084417 1 0.4676 0.6150 0.744 0.000 0.044 0.020 0.192
#> SRR1074359 2 0.6252 0.2078 0.000 0.544 0.100 0.336 0.020
#> SRR1419258 3 0.1804 0.3710 0.000 0.024 0.940 0.024 0.012
#> SRR1403366 2 0.8986 -0.1448 0.044 0.380 0.232 0.148 0.196
#> SRR665262 2 0.6106 0.4844 0.060 0.688 0.028 0.172 0.052
#> SRR1499740 1 0.6013 0.5882 0.708 0.136 0.028 0.064 0.064
#> SRR1105057 2 0.1059 0.6487 0.020 0.968 0.000 0.004 0.008
#> SRR1439742 1 0.0290 0.8593 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR614599 2 0.7156 0.3799 0.040 0.600 0.064 0.208 0.088
#> SRR612215 2 0.5747 0.4719 0.020 0.684 0.032 0.216 0.048
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.3265 0.7650 0.844 0.000 0.016 0.012 0.128
#> SRR1409263 5 0.5779 0.3602 0.044 0.000 0.368 0.028 0.560
#> SRR1431288 1 0.0162 0.8608 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1334889 2 0.4478 0.5579 0.168 0.768 0.000 0.040 0.024
#> SRR614839 2 0.4485 0.5444 0.184 0.756 0.000 0.048 0.012
#> SRR658433 2 0.1569 0.6409 0.000 0.944 0.004 0.044 0.008
#> SRR1088581 2 0.7091 0.1674 0.000 0.504 0.188 0.268 0.040
#> SRR1328797 3 0.1804 0.3710 0.000 0.024 0.940 0.024 0.012
#> SRR1334512 2 0.2029 0.6533 0.028 0.932 0.004 0.028 0.008
#> SRR1471117 1 0.1597 0.8334 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.1026 0.6446 0.000 0.968 0.004 0.024 0.004
#> SRR1354955 2 0.8466 -0.1886 0.008 0.372 0.280 0.192 0.148
#> SRR654802 3 0.4121 0.1924 0.000 0.008 0.760 0.024 0.208
#> SRR660066 2 0.0833 0.6444 0.000 0.976 0.004 0.016 0.004
#> SRR1447103 2 0.6471 0.4196 0.012 0.636 0.076 0.212 0.064
#> SRR1402153 5 0.6364 0.3060 0.000 0.096 0.140 0.112 0.652
#> SRR655887 2 0.2156 0.6538 0.032 0.924 0.004 0.036 0.004
#> SRR1408529 2 0.7367 0.1229 0.000 0.460 0.260 0.236 0.044
#> SRR658707 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.5788 0.5587 0.120 0.720 0.096 0.044 0.020
#> SRR1074670 3 0.8776 0.1078 0.020 0.204 0.324 0.148 0.304
#> SRR1375439 2 0.8692 0.1753 0.100 0.480 0.104 0.176 0.140
#> SRR1329003 4 0.7752 -0.2074 0.064 0.008 0.204 0.460 0.264
#> SRR1404837 2 0.4733 0.6148 0.076 0.788 0.012 0.096 0.028
#> SRR1317920 1 0.2284 0.8222 0.912 0.004 0.000 0.028 0.056
#> SRR1455525 4 0.7952 -0.1451 0.080 0.020 0.176 0.484 0.240
#> SRR613999 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0162 0.8607 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499764 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 2 0.8097 -0.1832 0.000 0.392 0.300 0.140 0.168
#> SRR1068855 1 0.1943 0.8269 0.924 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR1375509 5 0.5262 0.2695 0.004 0.004 0.460 0.028 0.504
#> SRR612227 3 0.8776 0.1078 0.020 0.204 0.324 0.148 0.304
#> SRR1388809 2 0.1173 0.6519 0.020 0.964 0.000 0.012 0.004
#> SRR1413872 4 0.5371 0.6577 0.044 0.304 0.008 0.636 0.008
#> SRR1452864 1 0.2264 0.8203 0.912 0.004 0.000 0.024 0.060
#> SRR1473078 2 0.9320 -0.2404 0.064 0.336 0.232 0.156 0.212
#> SRR615814 2 0.2217 0.6503 0.044 0.920 0.000 0.024 0.012
#> SRR1325225 1 0.7054 -0.0313 0.444 0.068 0.000 0.392 0.096
#> SRR1313687 2 0.3079 0.6268 0.092 0.868 0.000 0.028 0.012
#> SRR1358220 2 0.2074 0.6486 0.060 0.920 0.000 0.016 0.004
#> SRR1096662 2 0.4510 0.5246 0.184 0.752 0.000 0.056 0.008
#> SRR1487746 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.5838 0.4614 0.652 0.232 0.000 0.080 0.036
#> SRR660164 2 0.2945 0.6314 0.004 0.880 0.020 0.084 0.012
#> SRR815783 2 0.1996 0.6493 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR809595 1 0.5742 0.4812 0.664 0.228 0.000 0.052 0.056
#> SRR1403133 2 0.1187 0.6464 0.004 0.964 0.004 0.024 0.004
#> SRR815470 2 0.6221 0.2058 0.000 0.544 0.096 0.340 0.020
#> SRR1344382 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.6833 0.2642 0.004 0.548 0.152 0.264 0.032
#> SRR1478362 2 0.6914 0.2642 0.008 0.548 0.148 0.264 0.032
#> SRR1392186 2 0.5387 0.4487 0.220 0.684 0.000 0.076 0.020
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0404 0.8597 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1471594 1 0.0579 0.8572 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1354270 2 0.8964 -0.0888 0.044 0.384 0.188 0.236 0.148
#> SRR612683 2 0.2197 0.6476 0.012 0.916 0.004 0.064 0.004
#> SRR1392901 2 0.7214 -0.0879 0.000 0.400 0.312 0.268 0.020
#> SRR1077805 3 0.4865 0.3970 0.000 0.160 0.740 0.088 0.012
#> SRR1360402 2 0.0932 0.6446 0.000 0.972 0.004 0.020 0.004
#> SRR1406112 2 0.8466 -0.1886 0.008 0.372 0.280 0.192 0.148
#> SRR1355352 5 0.6969 0.2611 0.028 0.064 0.376 0.040 0.492
#> SRR656247 1 0.3389 0.7774 0.864 0.052 0.000 0.048 0.036
#> SRR813656 2 0.6647 0.2177 0.292 0.556 0.000 0.100 0.052
#> SRR808244 5 0.5662 0.3553 0.048 0.004 0.100 0.136 0.712
#> SRR1387240 2 0.3267 0.6206 0.000 0.864 0.044 0.076 0.016
#> SRR1408595 1 0.2002 0.8376 0.932 0.020 0.000 0.020 0.028
#> SRR1385277 4 0.7222 0.4480 0.248 0.204 0.000 0.500 0.048
#> SRR1435248 2 0.1116 0.6446 0.000 0.964 0.004 0.028 0.004
#> SRR1419110 2 0.7940 0.2731 0.040 0.540 0.104 0.176 0.140
#> SRR1408682 2 0.5205 0.5591 0.036 0.756 0.048 0.136 0.024
#> SRR1317134 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.3916 0.6085 0.116 0.816 0.000 0.056 0.012
#> SRR1453911 2 0.5288 0.5443 0.016 0.724 0.056 0.184 0.020
#> SRR603164 3 0.5644 0.2863 0.000 0.288 0.624 0.072 0.016
#> SRR1383259 2 0.7188 0.0553 0.208 0.496 0.004 0.260 0.032
#> SRR1330854 1 0.4468 0.6690 0.768 0.000 0.052 0.016 0.164
#> SRR1452423 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4082 0.5642 0.164 0.788 0.000 0.036 0.012
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.7609 0.2704 0.000 0.244 0.480 0.188 0.088
#> SRR1361546 1 0.6567 0.3417 0.596 0.264 0.008 0.072 0.060
#> SRR1486156 1 0.0162 0.8608 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR660545 2 0.2666 0.6296 0.000 0.892 0.020 0.076 0.012
#> SRR615635 2 0.2124 0.6509 0.044 0.924 0.000 0.020 0.012
#> SRR1385411 2 0.5036 0.5437 0.156 0.744 0.008 0.076 0.016
#> SRR1342739 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.6601 -0.1221 0.004 0.052 0.484 0.060 0.400
#> SRR662126 2 0.6125 0.4266 0.124 0.656 0.004 0.180 0.036
#> SRR1464601 2 0.1492 0.6416 0.000 0.948 0.004 0.040 0.008
#> SRR1071594 2 0.2982 0.6242 0.116 0.860 0.000 0.020 0.004
#> SRR612539 2 0.4362 0.5143 0.208 0.748 0.000 0.036 0.008
#> SRR602010 1 0.5949 0.4377 0.644 0.248 0.004 0.060 0.044
#> SRR810249 2 0.0960 0.6471 0.008 0.972 0.000 0.016 0.004
#> SRR818773 1 0.6073 0.4268 0.636 0.248 0.004 0.064 0.048
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3278 0.6273 0.008 0.864 0.032 0.088 0.008
#> SRR1442754 1 0.3067 0.7750 0.856 0.000 0.012 0.012 0.120
#> SRR1334247 2 0.8420 -0.0981 0.016 0.384 0.272 0.228 0.100
#> SRR661639 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6319 0.2915 0.276 0.592 0.000 0.088 0.044
#> SRR1459937 4 0.7834 0.5078 0.184 0.232 0.032 0.500 0.052
#> SRR2185018 1 0.0162 0.8610 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR655732 2 0.1822 0.6523 0.024 0.936 0.000 0.036 0.004
#> SRR809348 1 0.0451 0.8585 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR819261 3 0.8776 0.1078 0.020 0.204 0.324 0.148 0.304
#> SRR661074 5 0.5185 0.2755 0.004 0.004 0.456 0.024 0.512
#> SRR1349851 1 0.2409 0.8194 0.908 0.008 0.000 0.028 0.056
#> SRR1405123 2 0.7204 0.0463 0.208 0.492 0.004 0.264 0.032
#> SRR661096 2 0.4870 0.4742 0.224 0.712 0.000 0.052 0.012
#> SRR1320225 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.7752 -0.2074 0.064 0.008 0.204 0.460 0.264
#> SRR1307677 2 0.2074 0.6538 0.032 0.928 0.004 0.032 0.004
#> SRR1466512 2 0.3051 0.6179 0.120 0.852 0.000 0.028 0.000
#> SRR658212 2 0.2074 0.6538 0.032 0.928 0.004 0.032 0.004
#> SRR1430525 3 0.3697 0.4216 0.000 0.072 0.832 0.088 0.008
#> SRR1344422 2 0.7624 -0.0985 0.212 0.452 0.012 0.284 0.040
#> SRR1353924 2 0.1369 0.6488 0.028 0.956 0.000 0.008 0.008
#> SRR1314832 1 0.6987 -0.0891 0.480 0.000 0.180 0.028 0.312
#> SRR1487570 1 0.7054 -0.0313 0.444 0.068 0.000 0.392 0.096
#> SRR627431 2 0.5363 0.4733 0.004 0.696 0.088 0.200 0.012
#> SRR1418561 5 0.8977 0.2584 0.276 0.068 0.180 0.100 0.376
#> SRR1448029 3 0.6633 0.3729 0.000 0.136 0.628 0.124 0.112
#> SRR813802 1 0.1195 0.8434 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR815020 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2663 0.6491 0.064 0.896 0.004 0.032 0.004
#> SRR1435311 2 0.3304 0.6074 0.128 0.840 0.000 0.028 0.004
#> SRR612395 2 0.6117 0.4410 0.012 0.656 0.048 0.220 0.064
#> SRR603116 2 0.3303 0.6381 0.032 0.872 0.016 0.068 0.012
#> SRR1323152 3 0.7640 0.2896 0.000 0.216 0.500 0.160 0.124
#> SRR1368264 1 0.5832 0.3957 0.628 0.276 0.000 0.052 0.044
#> SRR1326624 1 0.2396 0.8153 0.904 0.004 0.000 0.024 0.068
#> SRR1429265 5 0.5182 0.2974 0.008 0.004 0.424 0.020 0.544
#> SRR1327702 1 0.0162 0.8608 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR615611 2 0.5677 0.4031 0.244 0.656 0.000 0.068 0.032
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.7169 0.0388 0.340 0.480 0.004 0.124 0.052
#> SRR815044 2 0.4841 0.5103 0.184 0.736 0.000 0.064 0.016
#> SRR1338560 2 0.3351 0.5954 0.148 0.828 0.000 0.020 0.004
#> SRR615862 2 0.2637 0.6457 0.060 0.900 0.004 0.028 0.008
#> SRR1480038 2 0.3387 0.6055 0.128 0.836 0.000 0.032 0.004
#> SRR659436 2 0.7774 0.2627 0.028 0.524 0.136 0.232 0.080
#> SRR613699 2 0.1365 0.6441 0.000 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4775 0.4834 0.220 0.720 0.000 0.048 0.012
#> SRR1330327 4 0.5740 0.5792 0.032 0.348 0.032 0.584 0.004
#> SRR1489950 2 0.0771 0.6457 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1431927 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.6077 0.3871 0.000 0.112 0.680 0.100 0.108
#> SRR1444002 1 0.1597 0.8334 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1318444 2 0.9402 -0.2900 0.064 0.312 0.196 0.248 0.180
#> SRR600656 4 0.5823 0.6451 0.048 0.308 0.024 0.612 0.008
#> SRR658766 2 0.7289 0.1815 0.004 0.488 0.228 0.244 0.036
#> SRR655946 3 0.4622 0.3974 0.000 0.164 0.748 0.084 0.004
#> SRR817282 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.6367 -0.1164 0.008 0.064 0.512 0.028 0.388
#> SRR1406418 1 0.0162 0.8608 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.6073 0.4268 0.636 0.248 0.004 0.064 0.048
#> SRR1471965 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.8298 0.0791 0.016 0.428 0.208 0.244 0.104
#> SRR662498 2 0.7043 0.3121 0.000 0.564 0.100 0.224 0.112
#> SRR1376764 2 0.8136 0.0515 0.000 0.424 0.172 0.228 0.176
#> SRR1377006 2 0.7446 0.0634 0.008 0.460 0.264 0.236 0.032
#> SRR656860 2 0.3573 0.6015 0.124 0.832 0.000 0.032 0.012
#> SRR1480547 2 0.6955 0.1288 0.208 0.524 0.004 0.240 0.024
#> SRR1452515 2 0.7979 -0.0641 0.004 0.400 0.296 0.220 0.080
#> SRR1324390 2 0.1404 0.6488 0.008 0.956 0.004 0.028 0.004
#> SRR615273 1 0.8185 -0.1484 0.412 0.344 0.036 0.128 0.080
#> SRR601695 2 0.6162 0.3386 0.000 0.592 0.104 0.280 0.024
#> SRR820907 2 0.3387 0.6064 0.132 0.836 0.000 0.024 0.008
#> SRR812773 1 0.5470 0.5471 0.696 0.188 0.000 0.088 0.028
#> SRR1405984 2 0.0854 0.6473 0.012 0.976 0.000 0.008 0.004
#> SRR1472794 2 0.4407 0.5538 0.000 0.764 0.040 0.180 0.016
#> SRR1365448 1 0.1597 0.8334 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1095720 5 0.8384 -0.0442 0.000 0.212 0.308 0.160 0.320
#> SRR1435626 2 0.8931 -0.2818 0.036 0.340 0.300 0.160 0.164
#> SRR1080766 2 0.1492 0.6416 0.000 0.948 0.004 0.040 0.008
#> SRR1377862 1 0.2321 0.8215 0.912 0.008 0.000 0.024 0.056
#> SRR1332299 3 0.6377 0.3742 0.000 0.132 0.652 0.116 0.100
#> SRR1467966 2 0.8250 -0.2993 0.000 0.340 0.324 0.192 0.144
#> SRR1320579 2 0.7189 -0.0427 0.000 0.416 0.284 0.280 0.020
#> SRR1319710 2 0.4150 0.5506 0.180 0.772 0.000 0.044 0.004
#> SRR1326604 2 0.1664 0.6516 0.020 0.948 0.004 0.020 0.008
#> SRR1098879 5 0.5236 0.3176 0.000 0.008 0.204 0.096 0.692
#> SRR662245 2 0.1412 0.6447 0.000 0.952 0.008 0.036 0.004
#> SRR1074719 2 0.0854 0.6473 0.012 0.976 0.000 0.008 0.004
#> SRR816226 1 0.7144 -0.0633 0.436 0.076 0.000 0.392 0.096
#> SRR601387 2 0.1187 0.6468 0.004 0.964 0.004 0.024 0.004
#> SRR614575 2 0.2637 0.6457 0.060 0.900 0.004 0.028 0.008
#> SRR1353900 2 0.1911 0.6509 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR662906 2 0.2707 0.6261 0.000 0.888 0.024 0.080 0.008
#> SRR1350832 2 0.1026 0.6452 0.000 0.968 0.004 0.024 0.004
#> SRR1403280 2 0.3631 0.6035 0.132 0.828 0.004 0.028 0.008
#> SRR1313969 4 0.5580 0.6100 0.020 0.336 0.032 0.604 0.008
#> SRR1388528 1 0.0579 0.8577 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.5229 0.5708 0.712 0.192 0.000 0.068 0.028
#> SRR655399 3 0.4680 0.0222 0.000 0.004 0.688 0.036 0.272
#> SRR1319753 2 0.5689 0.2833 0.324 0.596 0.000 0.064 0.016
#> SRR818901 3 0.6915 0.3401 0.000 0.148 0.596 0.104 0.152
#> SRR607067 2 0.6985 0.0729 0.156 0.528 0.004 0.276 0.036
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4403 0.5614 0.168 0.772 0.000 0.036 0.024
#> SRR661961 2 0.8462 -0.0101 0.288 0.428 0.048 0.152 0.084
#> SRR658259 2 0.2492 0.6474 0.020 0.900 0.000 0.072 0.008
#> SRR1310476 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1569 0.6440 0.000 0.944 0.004 0.044 0.008
#> SRR1365034 2 0.6285 0.4083 0.200 0.636 0.008 0.128 0.028
#> SRR1478053 2 0.1059 0.6487 0.020 0.968 0.000 0.004 0.008
#> SRR1475300 2 0.3477 0.5977 0.140 0.828 0.000 0.024 0.008
#> SRR1328101 2 0.5747 0.4719 0.020 0.684 0.032 0.216 0.048
#> SRR1322900 1 0.7112 0.4621 0.628 0.148 0.044 0.080 0.100
#> SRR1309942 2 0.1202 0.6446 0.000 0.960 0.004 0.032 0.004
#> SRR1345760 4 0.7952 0.2843 0.368 0.148 0.016 0.392 0.076
#> SRR1435418 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.6392 0.3691 0.036 0.632 0.044 0.244 0.044
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1357 0.6431 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR661469 2 0.8593 0.1557 0.084 0.484 0.116 0.196 0.120
#> SRR1500323 2 0.2846 0.6224 0.000 0.884 0.028 0.076 0.012
#> SRR1356705 2 0.5966 0.1690 0.380 0.536 0.000 0.060 0.024
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.9511 -0.2797 0.080 0.308 0.180 0.184 0.248
#> SRR1350435 1 0.2396 0.8153 0.904 0.004 0.000 0.024 0.068
#> SRR1389177 3 0.6812 0.2909 0.000 0.256 0.524 0.196 0.024
#> SRR1368072 2 0.1847 0.6528 0.020 0.940 0.004 0.028 0.008
#> SRR601815 2 0.0865 0.6447 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR613330 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6449 0.5110 0.084 0.668 0.052 0.164 0.032
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.8382 -0.2753 0.012 0.348 0.344 0.172 0.124
#> SRR1318839 3 0.2074 0.2762 0.000 0.000 0.920 0.036 0.044
#> SRR1432390 4 0.5406 0.6529 0.040 0.328 0.008 0.616 0.008
#> SRR613126 2 0.4407 0.5538 0.000 0.764 0.040 0.180 0.016
#> SRR1089424 2 0.2731 0.6275 0.104 0.876 0.000 0.016 0.004
#> SRR1347214 2 0.1554 0.6514 0.012 0.952 0.004 0.024 0.008
#> SRR1309556 2 0.6551 0.5122 0.092 0.668 0.040 0.148 0.052
#> SRR1456027 1 0.7213 -0.0702 0.428 0.064 0.000 0.388 0.120
#> SRR1400551 5 0.8997 0.1299 0.096 0.148 0.320 0.084 0.352
#> SRR1320469 1 0.1740 0.8290 0.932 0.000 0.000 0.012 0.056
#> SRR614251 2 0.2791 0.6380 0.008 0.892 0.016 0.072 0.012
#> SRR1454310 2 0.1285 0.6438 0.000 0.956 0.004 0.036 0.004
#> SRR615105 2 0.6558 0.0891 0.000 0.488 0.136 0.360 0.016
#> SRR1433290 3 0.6333 0.3764 0.000 0.132 0.656 0.112 0.100
#> SRR2166064 4 0.6834 0.3583 0.104 0.424 0.008 0.436 0.028
#> SRR601671 2 0.3319 0.5790 0.160 0.820 0.000 0.020 0.000
#> SRR663874 2 0.2313 0.6481 0.032 0.916 0.000 0.040 0.012
#> SRR1409130 2 0.1538 0.6427 0.000 0.948 0.008 0.036 0.008
#> SRR659696 4 0.6007 0.6000 0.068 0.352 0.012 0.560 0.008
#> SRR1408249 2 0.4870 0.4742 0.224 0.712 0.000 0.052 0.012
#> SRR663284 2 0.4370 0.5515 0.176 0.768 0.000 0.040 0.016
#> SRR1402794 3 0.8776 0.1078 0.020 0.204 0.324 0.148 0.304
#> SRR614852 4 0.5727 0.5931 0.032 0.344 0.032 0.588 0.004
#> SRR1348040 2 0.9693 -0.1483 0.132 0.324 0.164 0.192 0.188
#> SRR1489610 2 0.4150 0.5506 0.180 0.772 0.000 0.044 0.004
#> SRR1488091 2 0.1569 0.6409 0.000 0.944 0.004 0.044 0.008
#> SRR1499566 2 0.4514 0.4892 0.228 0.728 0.000 0.036 0.008
#> SRR1361480 2 0.2036 0.6493 0.028 0.928 0.000 0.036 0.008
#> SRR1444501 3 0.3928 0.4262 0.000 0.084 0.816 0.092 0.008
#> SRR1415773 2 0.5901 0.5446 0.072 0.712 0.052 0.140 0.024
#> SRR1388832 2 0.9738 -0.1797 0.132 0.308 0.168 0.180 0.212
#> SRR1394637 1 0.0324 0.8601 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR606974 2 0.5363 0.4733 0.004 0.696 0.088 0.200 0.012
#> SRR662918 2 0.6743 -0.2495 0.112 0.464 0.008 0.396 0.020
#> SRR817421 3 0.2074 0.2762 0.000 0.000 0.920 0.036 0.044
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3573 0.6175 0.120 0.836 0.004 0.032 0.008
#> SRR608264 3 0.2447 0.3671 0.000 0.032 0.912 0.024 0.032
#> SRR1318560 1 0.3265 0.7650 0.844 0.000 0.016 0.012 0.128
#> SRR1454117 2 0.3916 0.6085 0.116 0.816 0.000 0.056 0.012
#> SRR1312684 1 0.2264 0.8203 0.912 0.004 0.000 0.024 0.060
#> SRR615044 1 0.8185 -0.1484 0.412 0.344 0.036 0.128 0.080
#> SRR1432743 2 0.7166 0.1586 0.000 0.476 0.252 0.240 0.032
#> SRR1388873 2 0.1664 0.6516 0.020 0.948 0.004 0.020 0.008
#> SRR1353517 1 0.0162 0.8608 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357148 2 0.7813 0.2838 0.032 0.552 0.124 0.160 0.132
#> SRR1406008 2 0.3597 0.6175 0.116 0.832 0.000 0.044 0.008
#> SRR1396786 2 0.0865 0.6459 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1446564 1 0.2196 0.8225 0.916 0.004 0.000 0.024 0.056
#> SRR1318465 3 0.6812 0.2909 0.000 0.256 0.524 0.196 0.024
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.6525 0.2111 0.156 0.576 0.000 0.240 0.028
#> SRR655170 2 0.4638 0.5683 0.144 0.772 0.008 0.064 0.012
#> SRR1087825 4 0.5371 0.6577 0.044 0.304 0.008 0.636 0.008
#> SRR662019 5 0.8747 0.3042 0.168 0.076 0.228 0.088 0.440
#> SRR1349209 2 0.9402 -0.2900 0.064 0.312 0.196 0.248 0.180
#> SRR1326161 2 0.1587 0.6519 0.012 0.952 0.008 0.020 0.008
#> SRR1345284 2 0.3351 0.5954 0.148 0.828 0.000 0.020 0.004
#> SRR1416672 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.1369 0.6488 0.028 0.956 0.000 0.008 0.008
#> SRR1454328 2 0.1285 0.6440 0.000 0.956 0.004 0.036 0.004
#> SRR1489286 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5293 0.5578 0.704 0.200 0.000 0.068 0.028
#> SRR1408183 3 0.1710 0.3321 0.000 0.004 0.940 0.016 0.040
#> SRR1084369 3 0.3697 0.4216 0.000 0.072 0.832 0.088 0.008
#> SRR598452 3 0.4276 0.1159 0.000 0.000 0.724 0.032 0.244
#> SRR660709 2 0.7096 0.2304 0.012 0.524 0.148 0.284 0.032
#> SRR809444 1 0.0451 0.8595 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1089901 2 0.1282 0.6431 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1375774 1 0.2945 0.7983 0.884 0.056 0.000 0.044 0.016
#> SRR1326292 4 0.7752 -0.2074 0.064 0.008 0.204 0.460 0.264
#> SRR657139 1 0.4676 0.6150 0.744 0.000 0.044 0.020 0.192
#> SRR1440744 2 0.3805 0.5539 0.184 0.784 0.000 0.032 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0324 0.8601 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1452334 2 0.6457 0.3615 0.036 0.628 0.044 0.244 0.048
#> SRR1381775 1 0.0579 0.8572 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1363908 1 0.0451 0.8585 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1319626 2 0.3849 0.6124 0.116 0.820 0.000 0.052 0.012
#> SRR658989 2 0.8298 0.0791 0.016 0.428 0.208 0.244 0.104
#> SRR1353663 1 0.1943 0.8269 0.924 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR811771 1 0.0162 0.8610 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.2074 0.2762 0.000 0.000 0.920 0.036 0.044
#> SRR819054 2 0.2789 0.6273 0.092 0.880 0.000 0.020 0.008
#> SRR1367988 4 0.5823 0.6349 0.072 0.276 0.004 0.628 0.020
#> SRR1331922 1 0.3115 0.7940 0.876 0.056 0.000 0.048 0.020
#> SRR615479 1 0.6143 0.4002 0.628 0.256 0.008 0.072 0.036
#> SRR1375796 2 0.2791 0.6380 0.008 0.892 0.016 0.072 0.012
#> SRR1386991 2 0.7443 0.3371 0.032 0.568 0.088 0.220 0.092
#> SRR1355217 2 0.8203 0.0696 0.004 0.432 0.156 0.228 0.180
#> SRR1356290 2 0.6488 0.3493 0.004 0.588 0.164 0.224 0.020
#> SRR659507 2 0.6958 0.4124 0.076 0.644 0.048 0.140 0.092
#> SRR663296 1 0.2060 0.8290 0.924 0.008 0.000 0.052 0.016
#> SRR598044 2 0.3096 0.6182 0.108 0.860 0.000 0.024 0.008
#> SRR661155 4 0.6834 0.3583 0.104 0.424 0.008 0.436 0.028
#> SRR1414727 2 0.9474 -0.1377 0.120 0.356 0.148 0.148 0.228
#> SRR663477 1 0.2396 0.8153 0.904 0.004 0.000 0.024 0.068
#> SRR1354489 3 0.6862 0.2916 0.000 0.256 0.524 0.192 0.028
#> SRR1377800 5 0.8756 0.0962 0.064 0.152 0.324 0.088 0.372
#> SRR614611 2 0.2474 0.6286 0.000 0.896 0.012 0.084 0.008
#> SRR655052 2 0.6986 0.2624 0.016 0.548 0.128 0.276 0.032
#> SRR1478968 1 0.7213 -0.0702 0.428 0.064 0.000 0.388 0.120
#> SRR1351280 2 0.6364 0.4234 0.148 0.652 0.016 0.152 0.032
#> SRR613951 1 0.7854 -0.2991 0.384 0.188 0.008 0.356 0.064
#> SRR1418022 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.9520 -0.3192 0.076 0.304 0.196 0.236 0.188
#> SRR1408161 1 0.0162 0.8608 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR657054 3 0.8776 0.1078 0.020 0.204 0.324 0.148 0.304
#> SRR655040 2 0.8065 -0.1012 0.340 0.416 0.020 0.128 0.096
#> SRR810225 2 0.2595 0.6383 0.080 0.888 0.000 0.032 0.000
#> SRR1325377 2 0.2608 0.6330 0.088 0.888 0.000 0.020 0.004
#> SRR617829 2 0.7197 -0.0508 0.000 0.412 0.292 0.276 0.020
#> SRR1402328 2 0.0865 0.6459 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1480455 2 0.2457 0.6308 0.000 0.900 0.016 0.076 0.008
#> SRR1442104 3 0.3267 0.2169 0.000 0.000 0.844 0.044 0.112
#> SRR1453416 1 0.1522 0.8356 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1481396 3 0.4855 -0.1916 0.004 0.000 0.544 0.016 0.436
#> SRR1414314 2 0.1277 0.6461 0.004 0.960 0.004 0.028 0.004
#> SRR663026 2 0.0898 0.6484 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1478386 2 0.3828 0.5515 0.184 0.788 0.000 0.020 0.008
#> SRR1458683 4 0.7418 -0.1061 0.000 0.068 0.204 0.496 0.232
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.7026 0.3238 0.588 0.228 0.016 0.076 0.092
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5406 0.6529 0.040 0.328 0.008 0.616 0.008
#> SRR660260 2 0.7172 0.2847 0.000 0.544 0.104 0.240 0.112
#> SRR1071231 2 0.0960 0.6471 0.008 0.972 0.000 0.016 0.004
#> SRR1459125 2 0.7964 -0.1339 0.132 0.456 0.032 0.312 0.068
#> SRR1337173 2 0.7096 0.1890 0.000 0.492 0.228 0.248 0.032
#> SRR1396250 3 0.4210 0.1209 0.000 0.000 0.740 0.036 0.224
#> SRR2166376 5 0.8384 -0.0442 0.000 0.212 0.308 0.160 0.320
#> SRR659816 2 0.7080 0.2308 0.012 0.524 0.144 0.288 0.032
#> SRR1401379 2 0.4150 0.5506 0.180 0.772 0.000 0.044 0.004
#> SRR600981 2 0.7624 -0.3158 0.108 0.440 0.040 0.372 0.040
#> SRR1398335 1 0.0162 0.8609 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1397218 2 0.7679 0.2965 0.184 0.564 0.040 0.124 0.088
#> SRR660115 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0865 0.6447 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1359780 2 0.1202 0.6439 0.000 0.960 0.004 0.032 0.004
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.8482 0.2681 0.288 0.244 0.004 0.324 0.140
#> SRR1397156 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1357 0.6431 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1319648 2 0.4717 0.5596 0.168 0.760 0.004 0.040 0.028
#> SRR1092985 5 0.5832 0.3341 0.156 0.008 0.032 0.112 0.692
#> SRR656409 2 0.5657 0.4426 0.180 0.676 0.000 0.124 0.020
#> SRR1468658 2 0.7543 -0.0626 0.008 0.400 0.320 0.244 0.028
#> SRR1390437 1 0.7854 -0.2991 0.384 0.188 0.008 0.356 0.064
#> SRR658057 2 0.3543 0.5993 0.124 0.832 0.000 0.036 0.008
#> SRR612635 2 0.3155 0.6090 0.120 0.852 0.000 0.020 0.008
#> SRR1351480 2 0.1911 0.6509 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3389 0.7774 0.864 0.052 0.000 0.048 0.036
#> SRR659590 2 0.0960 0.6471 0.008 0.972 0.000 0.016 0.004
#> SRR614263 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3051 0.6179 0.120 0.852 0.000 0.028 0.000
#> SRR659911 2 0.1365 0.6452 0.000 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR1085519 3 0.6077 0.3871 0.000 0.112 0.680 0.100 0.108
#> SRR1345894 2 0.8162 -0.2667 0.000 0.348 0.328 0.200 0.124
#> SRR1442928 2 0.6089 0.4464 0.012 0.660 0.048 0.216 0.064
#> SRR1464681 4 0.5371 0.6577 0.044 0.304 0.008 0.636 0.008
#> SRR1418880 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.7093 0.1888 0.000 0.492 0.224 0.252 0.032
#> SRR1365426 1 0.5632 0.4523 0.656 0.252 0.000 0.052 0.040
#> SRR1487947 1 0.1597 0.8341 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR659708 1 0.3389 0.7774 0.864 0.052 0.000 0.048 0.036
#> SRR603236 2 0.6162 0.3386 0.000 0.592 0.104 0.280 0.024
#> SRR660673 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0727 0.6459 0.004 0.980 0.000 0.012 0.004
#> SRR663807 2 0.1334 0.6508 0.020 0.960 0.004 0.012 0.004
#> SRR1087245 2 0.3415 0.6016 0.120 0.840 0.000 0.032 0.008
#> SRR1339108 2 0.4733 0.6148 0.076 0.788 0.012 0.096 0.028
#> SRR613426 1 0.8024 0.1308 0.508 0.152 0.020 0.184 0.136
#> SRR613879 2 0.3278 0.6273 0.008 0.864 0.032 0.088 0.008
#> SRR1385101 1 0.5523 0.5250 0.692 0.212 0.004 0.048 0.044
#> SRR1387966 2 0.1525 0.6535 0.036 0.948 0.000 0.012 0.004
#> SRR1458852 2 0.2846 0.6224 0.000 0.884 0.028 0.076 0.012
#> SRR1430489 1 0.7054 -0.0313 0.444 0.068 0.000 0.392 0.096
#> SRR1349231 1 0.3525 0.7590 0.852 0.080 0.000 0.040 0.028
#> SRR1376249 3 0.5008 -0.1867 0.004 0.000 0.544 0.024 0.428
#> SRR1321987 2 0.1408 0.6419 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR662653 2 0.1059 0.6477 0.008 0.968 0.000 0.020 0.004
#> SRR1390027 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3154 0.6187 0.104 0.860 0.000 0.024 0.012
#> SRR1383081 2 0.3197 0.6084 0.116 0.852 0.000 0.024 0.008
#> SRR2166960 2 0.1854 0.6517 0.020 0.936 0.000 0.036 0.008
#> SRR605101 2 0.4323 0.5127 0.220 0.744 0.000 0.024 0.012
#> SRR818600 2 0.1996 0.6518 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1367715 2 0.3250 0.6030 0.128 0.844 0.000 0.020 0.008
#> SRR1351979 3 0.2153 0.2883 0.000 0.000 0.916 0.044 0.040
#> SRR1387054 3 0.4622 0.3974 0.000 0.164 0.748 0.084 0.004
#> SRR1444306 3 0.7486 0.3027 0.000 0.232 0.512 0.148 0.108
#> SRR1322662 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1365 0.6452 0.000 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR612767 1 0.2872 0.8053 0.884 0.008 0.000 0.048 0.060
#> SRR1489030 2 0.1186 0.6484 0.020 0.964 0.000 0.008 0.008
#> SRR1430375 2 0.3663 0.6087 0.004 0.836 0.024 0.116 0.020
#> SRR615225 2 0.7624 -0.3158 0.108 0.440 0.040 0.372 0.040
#> SRR1401839 2 0.8300 0.2362 0.060 0.504 0.116 0.208 0.112
#> SRR1379110 2 0.3351 0.5954 0.148 0.828 0.000 0.020 0.004
#> SRR1077288 5 0.5185 0.2755 0.004 0.004 0.456 0.024 0.512
#> SRR1331639 4 0.5371 0.6577 0.044 0.304 0.008 0.636 0.008
#> SRR1342782 1 0.6360 0.1425 0.532 0.356 0.000 0.068 0.044
#> SRR1443003 3 0.7058 0.3410 0.000 0.208 0.568 0.128 0.096
#> SRR612839 1 0.1597 0.8334 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1470093 3 0.5427 0.3816 0.000 0.108 0.704 0.164 0.024
#> SRR1395742 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0162 0.8608 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387222 2 0.7241 -0.0999 0.000 0.388 0.312 0.280 0.020
#> SRR664063 1 0.5723 0.4179 0.640 0.268 0.000 0.052 0.040
#> SRR1488214 1 0.2987 0.8057 0.884 0.028 0.000 0.032 0.056
#> SRR654766 4 0.5823 0.6349 0.072 0.276 0.004 0.628 0.020
#> SRR1320321 2 0.3387 0.6064 0.132 0.836 0.000 0.024 0.008
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3197 0.6084 0.116 0.852 0.000 0.024 0.008
#> SRR1488470 2 0.6955 0.1288 0.208 0.524 0.004 0.240 0.024
#> SRR1389497 3 0.1710 0.3321 0.000 0.004 0.940 0.016 0.040
#> SRR1367109 2 0.8323 -0.2370 0.000 0.356 0.288 0.192 0.164
#> SRR615311 1 0.1787 0.8357 0.936 0.004 0.000 0.044 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.0622 0.72027 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1380716 2 0.1710 0.73075 0.016 0.936 0.000 0.028 0.020 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.3076 0.79221 0.872 0.048 0.000 0.036 0.028 0.016
#> SRR1084417 1 0.4591 0.60636 0.740 0.000 0.028 0.008 0.056 0.168
#> SRR1074359 2 0.6671 -0.42137 0.000 0.396 0.036 0.172 0.388 0.008
#> SRR1419258 3 0.2234 0.53363 0.000 0.000 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1403366 5 0.7858 0.50059 0.044 0.276 0.144 0.016 0.436 0.084
#> SRR665262 2 0.5431 0.16500 0.052 0.608 0.000 0.016 0.300 0.024
#> SRR1499740 1 0.5711 0.57814 0.696 0.096 0.012 0.036 0.128 0.032
#> SRR1105057 2 0.0748 0.73128 0.016 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1439742 1 0.0260 0.87687 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR614599 2 0.6137 -0.27395 0.032 0.488 0.016 0.020 0.404 0.040
#> SRR612215 2 0.5181 0.02998 0.012 0.576 0.000 0.024 0.360 0.028
#> SRR1094051 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.3303 0.76979 0.840 0.000 0.016 0.008 0.028 0.108
#> SRR1409263 6 0.7135 0.26484 0.040 0.000 0.320 0.036 0.172 0.432
#> SRR1431288 1 0.0146 0.87848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334889 2 0.4848 0.66374 0.148 0.736 0.000 0.056 0.048 0.012
#> SRR614839 2 0.4647 0.65476 0.168 0.740 0.000 0.044 0.036 0.012
#> SRR658433 2 0.1605 0.70645 0.000 0.936 0.000 0.016 0.044 0.004
#> SRR1088581 5 0.6842 0.55547 0.000 0.316 0.092 0.128 0.460 0.004
#> SRR1328797 3 0.2234 0.53363 0.000 0.000 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1334512 2 0.1944 0.73315 0.016 0.924 0.000 0.036 0.024 0.000
#> SRR1471117 1 0.1542 0.84641 0.936 0.000 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR1311553 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0993 0.71786 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024 0.000
#> SRR1354955 5 0.6770 0.53212 0.008 0.240 0.164 0.024 0.532 0.032
#> SRR654802 3 0.4436 0.41167 0.000 0.000 0.744 0.016 0.116 0.124
#> SRR660066 2 0.0725 0.71996 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR1447103 2 0.5620 -0.21492 0.004 0.512 0.032 0.016 0.408 0.028
#> SRR1402153 6 0.6100 0.36373 0.000 0.060 0.112 0.028 0.160 0.640
#> SRR655887 2 0.1882 0.73190 0.020 0.928 0.000 0.028 0.024 0.000
#> SRR1408529 5 0.6330 0.58158 0.000 0.292 0.160 0.028 0.512 0.008
#> SRR658707 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.5894 0.56611 0.108 0.672 0.072 0.020 0.124 0.004
#> SRR1074670 5 0.8080 0.19351 0.012 0.136 0.204 0.044 0.436 0.168
#> SRR1375439 5 0.6982 0.49107 0.092 0.376 0.032 0.008 0.440 0.052
#> SRR1329003 4 0.8250 -0.16494 0.056 0.008 0.208 0.400 0.128 0.200
#> SRR1404837 2 0.4922 0.63732 0.068 0.728 0.004 0.044 0.152 0.004
#> SRR1317920 1 0.2422 0.82592 0.900 0.004 0.000 0.056 0.016 0.024
#> SRR1455525 4 0.8123 -0.11433 0.068 0.008 0.184 0.440 0.116 0.184
#> SRR613999 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0146 0.87799 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.7442 0.51564 0.000 0.312 0.208 0.028 0.388 0.064
#> SRR1068855 1 0.2196 0.82902 0.908 0.000 0.000 0.056 0.016 0.020
#> SRR1375509 3 0.6536 -0.14741 0.004 0.000 0.412 0.036 0.164 0.384
#> SRR612227 5 0.8080 0.19351 0.012 0.136 0.204 0.044 0.436 0.168
#> SRR1388809 2 0.1173 0.73087 0.016 0.960 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1413872 4 0.5533 0.52143 0.008 0.224 0.000 0.636 0.108 0.024
#> SRR1452864 1 0.2483 0.82018 0.896 0.004 0.000 0.060 0.016 0.024
#> SRR1473078 5 0.8220 0.46952 0.060 0.244 0.132 0.024 0.432 0.108
#> SRR615814 2 0.1893 0.73756 0.036 0.928 0.000 0.024 0.008 0.004
#> SRR1325225 4 0.5447 0.28582 0.348 0.032 0.000 0.572 0.024 0.024
#> SRR1313687 2 0.3118 0.72552 0.084 0.860 0.000 0.024 0.020 0.012
#> SRR1358220 2 0.2095 0.73832 0.052 0.916 0.000 0.016 0.012 0.004
#> SRR1096662 2 0.4426 0.64961 0.156 0.744 0.000 0.084 0.004 0.012
#> SRR1487746 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.5936 0.44997 0.636 0.200 0.000 0.040 0.096 0.028
#> SRR660164 2 0.3067 0.66181 0.000 0.840 0.004 0.028 0.124 0.004
#> SRR815783 2 0.2454 0.73690 0.032 0.904 0.000 0.024 0.032 0.008
#> SRR809595 1 0.5784 0.46300 0.648 0.204 0.000 0.040 0.080 0.028
#> SRR1403133 2 0.1148 0.72089 0.004 0.960 0.000 0.016 0.020 0.000
#> SRR815470 2 0.6689 -0.41785 0.000 0.396 0.036 0.176 0.384 0.008
#> SRR1344382 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.6019 0.49108 0.000 0.388 0.064 0.068 0.480 0.000
#> SRR1478362 5 0.6016 0.48915 0.000 0.388 0.060 0.072 0.480 0.000
#> SRR1392186 2 0.5540 0.57681 0.188 0.664 0.000 0.100 0.032 0.016
#> SRR1347937 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0520 0.87601 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1471594 1 0.0603 0.87215 0.980 0.000 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1354270 5 0.7529 0.58418 0.032 0.256 0.088 0.092 0.500 0.032
#> SRR612683 2 0.2533 0.71787 0.008 0.892 0.000 0.044 0.052 0.004
#> SRR1392901 5 0.7342 0.46555 0.000 0.248 0.236 0.096 0.412 0.008
#> SRR1077805 3 0.5435 0.45178 0.000 0.120 0.664 0.036 0.176 0.004
#> SRR1360402 2 0.0909 0.71830 0.000 0.968 0.000 0.012 0.020 0.000
#> SRR1406112 5 0.6770 0.53212 0.008 0.240 0.164 0.024 0.532 0.032
#> SRR1355352 6 0.7762 0.13793 0.028 0.036 0.312 0.024 0.264 0.336
#> SRR656247 1 0.3449 0.77512 0.852 0.048 0.000 0.040 0.040 0.020
#> SRR813656 2 0.6646 0.34597 0.224 0.536 0.000 0.176 0.044 0.020
#> SRR808244 6 0.5611 0.43867 0.036 0.000 0.100 0.128 0.044 0.692
#> SRR1387240 2 0.3415 0.62560 0.000 0.820 0.016 0.024 0.136 0.004
#> SRR1408595 1 0.1981 0.85047 0.928 0.016 0.000 0.028 0.016 0.012
#> SRR1385277 4 0.6064 0.46082 0.164 0.144 0.000 0.620 0.064 0.008
#> SRR1435248 2 0.1074 0.71673 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028 0.000
#> SRR1419110 5 0.6881 0.45163 0.036 0.420 0.044 0.032 0.424 0.044
#> SRR1408682 2 0.4893 0.44058 0.028 0.696 0.016 0.012 0.232 0.016
#> SRR1317134 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4058 0.70348 0.104 0.800 0.000 0.040 0.048 0.008
#> SRR1453911 2 0.5341 0.28459 0.012 0.616 0.012 0.028 0.308 0.024
#> SRR603164 3 0.6087 0.11375 0.000 0.252 0.560 0.032 0.152 0.004
#> SRR1383259 2 0.6684 0.15308 0.140 0.464 0.000 0.332 0.056 0.008
#> SRR1330854 1 0.4402 0.66395 0.764 0.000 0.048 0.008 0.036 0.144
#> SRR1452423 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4476 0.66980 0.148 0.760 0.000 0.040 0.040 0.012
#> SRR1468162 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.6104 0.22427 0.000 0.144 0.336 0.004 0.496 0.020
#> SRR1361546 1 0.6129 0.33029 0.584 0.240 0.000 0.028 0.128 0.020
#> SRR1486156 1 0.0146 0.87848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR660545 2 0.2765 0.66985 0.000 0.864 0.004 0.024 0.104 0.004
#> SRR615635 2 0.1810 0.73750 0.036 0.932 0.000 0.020 0.008 0.004
#> SRR1385411 2 0.5179 0.64728 0.124 0.716 0.004 0.108 0.040 0.008
#> SRR1342739 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.7251 0.05016 0.004 0.032 0.412 0.028 0.252 0.272
#> SRR662126 2 0.6232 0.49358 0.080 0.612 0.000 0.200 0.088 0.020
#> SRR1464601 2 0.1536 0.70836 0.000 0.940 0.000 0.016 0.040 0.004
#> SRR1071594 2 0.3265 0.71793 0.108 0.836 0.000 0.016 0.040 0.000
#> SRR612539 2 0.4300 0.63185 0.192 0.744 0.000 0.040 0.008 0.016
#> SRR602010 1 0.5818 0.42611 0.632 0.224 0.000 0.036 0.084 0.024
#> SRR810249 2 0.0862 0.72622 0.008 0.972 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR818773 1 0.5933 0.41428 0.624 0.224 0.000 0.036 0.088 0.028
#> SRR1336569 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3574 0.63015 0.000 0.804 0.000 0.036 0.144 0.016
#> SRR1442754 1 0.3117 0.78127 0.852 0.000 0.012 0.008 0.028 0.100
#> SRR1334247 5 0.6487 0.56241 0.016 0.236 0.152 0.016 0.560 0.020
#> SRR661639 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6442 0.40646 0.240 0.560 0.000 0.136 0.044 0.020
#> SRR1459937 4 0.6948 0.45302 0.120 0.152 0.020 0.560 0.144 0.004
#> SRR2185018 1 0.0146 0.87824 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.2460 0.72849 0.024 0.904 0.000 0.020 0.040 0.012
#> SRR809348 1 0.0508 0.87380 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR819261 5 0.8080 0.19351 0.012 0.136 0.204 0.044 0.436 0.168
#> SRR661074 3 0.6576 -0.15123 0.004 0.000 0.404 0.036 0.172 0.384
#> SRR1349851 1 0.2572 0.81862 0.892 0.008 0.000 0.064 0.016 0.020
#> SRR1405123 2 0.6738 0.13329 0.140 0.456 0.000 0.336 0.060 0.008
#> SRR661096 2 0.4634 0.60393 0.204 0.712 0.000 0.064 0.004 0.016
#> SRR1320225 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.8250 -0.16494 0.056 0.008 0.208 0.400 0.128 0.200
#> SRR1307677 2 0.1798 0.73260 0.020 0.932 0.000 0.028 0.020 0.000
#> SRR1466512 2 0.3100 0.71999 0.108 0.848 0.000 0.028 0.012 0.004
#> SRR658212 2 0.1798 0.73260 0.020 0.932 0.000 0.028 0.020 0.000
#> SRR1430525 3 0.3888 0.52391 0.000 0.020 0.752 0.012 0.212 0.004
#> SRR1344422 2 0.7119 -0.04644 0.140 0.408 0.008 0.364 0.072 0.008
#> SRR1353924 2 0.1036 0.73374 0.024 0.964 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1314832 1 0.6943 -0.16238 0.476 0.000 0.144 0.004 0.104 0.272
#> SRR1487570 4 0.5447 0.28582 0.348 0.032 0.000 0.572 0.024 0.024
#> SRR627431 2 0.5741 0.12592 0.000 0.604 0.032 0.084 0.268 0.012
#> SRR1418561 6 0.9470 0.31916 0.236 0.052 0.116 0.152 0.200 0.244
#> SRR1448029 3 0.5770 0.36760 0.000 0.092 0.500 0.000 0.380 0.028
#> SRR813802 1 0.1007 0.85732 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR815020 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2366 0.73743 0.056 0.900 0.000 0.024 0.020 0.000
#> SRR1435311 2 0.3666 0.70828 0.120 0.816 0.000 0.036 0.020 0.008
#> SRR612395 2 0.5067 -0.11803 0.004 0.544 0.004 0.016 0.404 0.028
#> SRR603116 2 0.3671 0.68093 0.028 0.828 0.000 0.032 0.096 0.016
#> SRR1323152 5 0.6559 0.08820 0.000 0.144 0.368 0.024 0.444 0.020
#> SRR1368264 1 0.5862 0.37686 0.612 0.256 0.000 0.040 0.068 0.024
#> SRR1326624 1 0.2638 0.81420 0.888 0.004 0.000 0.060 0.016 0.032
#> SRR1429265 6 0.6634 0.09990 0.008 0.000 0.388 0.032 0.176 0.396
#> SRR1327702 1 0.0146 0.87848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615611 2 0.5947 0.51753 0.212 0.624 0.000 0.104 0.040 0.020
#> SRR1486799 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.7103 0.12199 0.288 0.448 0.000 0.192 0.044 0.028
#> SRR815044 2 0.4808 0.63290 0.156 0.720 0.000 0.100 0.008 0.016
#> SRR1338560 2 0.3302 0.69936 0.136 0.824 0.000 0.028 0.004 0.008
#> SRR615862 2 0.2458 0.73662 0.052 0.900 0.000 0.028 0.008 0.012
#> SRR1480038 2 0.3735 0.70736 0.120 0.812 0.000 0.040 0.020 0.008
#> SRR659436 5 0.6333 0.55654 0.028 0.372 0.052 0.020 0.504 0.024
#> SRR613699 2 0.1829 0.71132 0.000 0.920 0.000 0.024 0.056 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4712 0.61169 0.196 0.716 0.000 0.060 0.008 0.020
#> SRR1330327 4 0.6390 0.39471 0.008 0.268 0.008 0.520 0.180 0.016
#> SRR1489950 2 0.0717 0.72143 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.5497 0.44412 0.000 0.072 0.552 0.000 0.348 0.028
#> SRR1444002 1 0.1542 0.84641 0.936 0.000 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR1318444 5 0.8714 0.42111 0.036 0.196 0.108 0.136 0.412 0.112
#> SRR600656 4 0.6511 0.47188 0.016 0.232 0.016 0.564 0.148 0.024
#> SRR658766 5 0.6222 0.58753 0.000 0.312 0.120 0.036 0.524 0.008
#> SRR655946 3 0.5329 0.45570 0.000 0.120 0.668 0.028 0.180 0.004
#> SRR817282 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.7194 0.08440 0.008 0.036 0.456 0.024 0.232 0.244
#> SRR1406418 1 0.0146 0.87848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090265 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.5933 0.41428 0.624 0.224 0.000 0.036 0.088 0.028
#> SRR1471965 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.6280 0.59991 0.016 0.272 0.092 0.020 0.576 0.024
#> SRR662498 5 0.5658 0.41766 0.000 0.452 0.032 0.032 0.464 0.020
#> SRR1376764 5 0.5550 0.57882 0.000 0.280 0.044 0.008 0.612 0.056
#> SRR1377006 5 0.6667 0.56667 0.000 0.316 0.164 0.064 0.456 0.000
#> SRR656860 2 0.3305 0.71107 0.108 0.832 0.000 0.048 0.000 0.012
#> SRR1480547 2 0.6575 0.23076 0.140 0.492 0.000 0.312 0.044 0.012
#> SRR1452515 5 0.6630 0.54335 0.000 0.304 0.188 0.020 0.468 0.020
#> SRR1324390 2 0.1332 0.72277 0.008 0.952 0.000 0.012 0.028 0.000
#> SRR615273 1 0.7141 -0.16074 0.408 0.268 0.004 0.016 0.268 0.036
#> SRR601695 2 0.6328 -0.38401 0.000 0.432 0.040 0.096 0.420 0.012
#> SRR820907 2 0.3345 0.70920 0.120 0.832 0.000 0.028 0.008 0.012
#> SRR812773 1 0.5738 0.51849 0.672 0.160 0.000 0.052 0.088 0.028
#> SRR1405984 2 0.0767 0.72891 0.012 0.976 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1472794 2 0.4825 0.46982 0.000 0.704 0.012 0.072 0.200 0.012
#> SRR1365448 1 0.1542 0.84641 0.936 0.000 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR1095720 5 0.7550 -0.04408 0.000 0.088 0.224 0.040 0.456 0.192
#> SRR1435626 5 0.7323 0.48496 0.032 0.236 0.180 0.016 0.492 0.044
#> SRR1080766 2 0.1536 0.70836 0.000 0.940 0.000 0.016 0.040 0.004
#> SRR1377862 1 0.2513 0.82141 0.896 0.008 0.000 0.060 0.016 0.020
#> SRR1332299 3 0.5912 0.39262 0.000 0.092 0.520 0.004 0.352 0.032
#> SRR1467966 5 0.6535 0.49211 0.000 0.220 0.204 0.016 0.528 0.032
#> SRR1320579 5 0.7230 0.48529 0.000 0.256 0.208 0.092 0.436 0.008
#> SRR1319710 2 0.4333 0.66012 0.164 0.760 0.000 0.040 0.024 0.012
#> SRR1326604 2 0.1616 0.73205 0.012 0.940 0.000 0.028 0.020 0.000
#> SRR1098879 6 0.4438 0.36046 0.000 0.000 0.212 0.036 0.032 0.720
#> SRR662245 2 0.2011 0.70703 0.000 0.912 0.004 0.020 0.064 0.000
#> SRR1074719 2 0.0767 0.72891 0.012 0.976 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR816226 4 0.5548 0.29537 0.340 0.040 0.000 0.572 0.024 0.024
#> SRR601387 2 0.1109 0.72311 0.004 0.964 0.000 0.016 0.012 0.004
#> SRR614575 2 0.2458 0.73662 0.052 0.900 0.000 0.028 0.008 0.012
#> SRR1353900 2 0.1882 0.73561 0.028 0.928 0.000 0.020 0.024 0.000
#> SRR662906 2 0.2563 0.68358 0.000 0.884 0.008 0.040 0.068 0.000
#> SRR1350832 2 0.0993 0.71827 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024 0.000
#> SRR1403280 2 0.3943 0.70516 0.116 0.808 0.004 0.036 0.024 0.012
#> SRR1313969 4 0.6367 0.41615 0.000 0.236 0.020 0.548 0.172 0.024
#> SRR1388528 1 0.0508 0.87445 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1452912 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.5468 0.53862 0.688 0.172 0.000 0.060 0.056 0.024
#> SRR655399 3 0.4929 0.24788 0.000 0.000 0.684 0.016 0.108 0.192
#> SRR1319753 2 0.5858 0.39869 0.304 0.580 0.000 0.056 0.032 0.028
#> SRR818901 3 0.6686 0.32276 0.000 0.104 0.460 0.028 0.364 0.044
#> SRR607067 2 0.6751 0.20508 0.132 0.504 0.000 0.292 0.044 0.028
#> SRR1391420 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4789 0.66635 0.148 0.740 0.000 0.052 0.048 0.012
#> SRR661961 2 0.7437 -0.33159 0.284 0.336 0.016 0.020 0.316 0.028
#> SRR658259 2 0.2840 0.72540 0.016 0.880 0.000 0.048 0.048 0.008
#> SRR1310476 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1594 0.71197 0.000 0.932 0.000 0.016 0.052 0.000
#> SRR1365034 2 0.5868 0.53950 0.160 0.620 0.000 0.180 0.028 0.012
#> SRR1478053 2 0.0748 0.73128 0.016 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1475300 2 0.3393 0.70176 0.132 0.824 0.000 0.024 0.008 0.012
#> SRR1328101 2 0.5181 0.02998 0.012 0.576 0.000 0.024 0.360 0.028
#> SRR1322900 1 0.6631 0.44327 0.616 0.104 0.016 0.060 0.168 0.036
#> SRR1309942 2 0.1168 0.71654 0.000 0.956 0.000 0.016 0.028 0.000
#> SRR1345760 4 0.6781 0.35052 0.272 0.072 0.016 0.544 0.076 0.020
#> SRR1435418 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.6432 0.09450 0.020 0.520 0.008 0.172 0.272 0.008
#> SRR1443436 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1442 0.71181 0.000 0.944 0.000 0.012 0.040 0.004
#> SRR661469 5 0.7180 0.53121 0.080 0.356 0.040 0.032 0.456 0.036
#> SRR1500323 2 0.3056 0.63682 0.000 0.848 0.012 0.016 0.116 0.008
#> SRR1356705 2 0.6011 0.26842 0.360 0.524 0.000 0.056 0.036 0.024
#> SRR1464915 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.8353 0.46922 0.064 0.216 0.092 0.068 0.460 0.100
#> SRR1350435 1 0.2638 0.81420 0.888 0.004 0.000 0.060 0.016 0.032
#> SRR1389177 5 0.5839 0.17879 0.000 0.128 0.392 0.004 0.468 0.008
#> SRR1368072 2 0.1862 0.73441 0.020 0.932 0.000 0.020 0.024 0.004
#> SRR601815 2 0.0891 0.71898 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6398 0.37960 0.064 0.592 0.024 0.072 0.240 0.008
#> SRR1394190 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.7003 0.49746 0.008 0.252 0.224 0.020 0.468 0.028
#> SRR1318839 3 0.0508 0.47865 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1432390 4 0.5752 0.50837 0.008 0.244 0.000 0.608 0.112 0.028
#> SRR613126 2 0.4825 0.46982 0.000 0.704 0.012 0.072 0.200 0.012
#> SRR1089424 2 0.2730 0.72547 0.092 0.872 0.000 0.024 0.004 0.008
#> SRR1347214 2 0.1223 0.73098 0.008 0.960 0.000 0.012 0.016 0.004
#> SRR1309556 2 0.6391 0.38633 0.076 0.596 0.020 0.060 0.236 0.012
#> SRR1456027 4 0.5739 0.27756 0.336 0.028 0.004 0.568 0.024 0.040
#> SRR1400551 5 0.8633 -0.24356 0.092 0.108 0.236 0.008 0.312 0.244
#> SRR1320469 1 0.1668 0.84168 0.928 0.000 0.000 0.004 0.008 0.060
#> SRR614251 2 0.2926 0.66872 0.004 0.844 0.000 0.028 0.124 0.000
#> SRR1454310 2 0.1245 0.71589 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032 0.000
#> SRR615105 5 0.7059 0.40096 0.000 0.352 0.068 0.180 0.392 0.008
#> SRR1433290 3 0.5848 0.39528 0.000 0.092 0.524 0.004 0.352 0.028
#> SRR2166064 4 0.6395 0.27414 0.036 0.368 0.000 0.468 0.116 0.012
#> SRR601671 2 0.3343 0.68731 0.148 0.816 0.000 0.024 0.004 0.008
#> SRR663874 2 0.2863 0.71658 0.032 0.884 0.000 0.020 0.044 0.020
#> SRR1409130 2 0.1434 0.71148 0.000 0.940 0.000 0.012 0.048 0.000
#> SRR659696 4 0.5975 0.42163 0.020 0.308 0.000 0.556 0.096 0.020
#> SRR1408249 2 0.4634 0.60393 0.204 0.712 0.000 0.064 0.004 0.016
#> SRR663284 2 0.4762 0.66001 0.156 0.740 0.000 0.048 0.040 0.016
#> SRR1402794 5 0.8080 0.19351 0.012 0.136 0.204 0.044 0.436 0.168
#> SRR614852 4 0.6326 0.41777 0.008 0.264 0.008 0.532 0.172 0.016
#> SRR1348040 5 0.8089 0.49236 0.116 0.232 0.060 0.056 0.472 0.064
#> SRR1489610 2 0.4333 0.66012 0.164 0.760 0.000 0.040 0.024 0.012
#> SRR1488091 2 0.1605 0.70645 0.000 0.936 0.000 0.016 0.044 0.004
#> SRR1499566 2 0.4444 0.60827 0.212 0.724 0.000 0.040 0.008 0.016
#> SRR1361480 2 0.1810 0.73555 0.020 0.932 0.000 0.036 0.008 0.004
#> SRR1444501 3 0.3991 0.51647 0.000 0.032 0.736 0.004 0.224 0.004
#> SRR1415773 2 0.5714 0.38856 0.064 0.632 0.016 0.020 0.252 0.016
#> SRR1388832 5 0.8195 0.46590 0.120 0.220 0.064 0.052 0.468 0.076
#> SRR1394637 1 0.0291 0.87723 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR606974 2 0.5741 0.12592 0.000 0.604 0.032 0.084 0.268 0.012
#> SRR662918 4 0.6293 0.18158 0.040 0.420 0.000 0.436 0.092 0.012
#> SRR817421 3 0.0508 0.47865 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1400823 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3283 0.71818 0.108 0.836 0.000 0.044 0.004 0.008
#> SRR608264 3 0.2393 0.54013 0.000 0.020 0.884 0.000 0.092 0.004
#> SRR1318560 1 0.3303 0.76979 0.840 0.000 0.016 0.008 0.028 0.108
#> SRR1454117 2 0.4058 0.70348 0.104 0.800 0.000 0.040 0.048 0.008
#> SRR1312684 1 0.2483 0.82018 0.896 0.004 0.000 0.060 0.016 0.024
#> SRR615044 1 0.7141 -0.16074 0.408 0.268 0.004 0.016 0.268 0.036
#> SRR1432743 5 0.6197 0.58262 0.000 0.308 0.148 0.028 0.512 0.004
#> SRR1388873 2 0.1616 0.73205 0.012 0.940 0.000 0.028 0.020 0.000
#> SRR1353517 1 0.0146 0.87848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1357148 2 0.6920 -0.44140 0.028 0.440 0.068 0.028 0.396 0.040
#> SRR1406008 2 0.3855 0.70643 0.112 0.812 0.000 0.032 0.028 0.016
#> SRR1396786 2 0.0806 0.72156 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR1446564 1 0.2401 0.82320 0.900 0.004 0.000 0.060 0.016 0.020
#> SRR1318465 5 0.5839 0.17879 0.000 0.128 0.392 0.004 0.468 0.008
#> SRR1431083 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.6506 0.37215 0.128 0.564 0.000 0.236 0.040 0.032
#> SRR655170 2 0.4793 0.66897 0.116 0.744 0.004 0.096 0.036 0.004
#> SRR1087825 4 0.5533 0.52143 0.008 0.224 0.000 0.636 0.108 0.024
#> SRR662019 6 0.9139 0.32519 0.152 0.048 0.176 0.072 0.264 0.288
#> SRR1349209 5 0.8714 0.42111 0.036 0.196 0.108 0.136 0.412 0.112
#> SRR1326161 2 0.1452 0.72815 0.008 0.948 0.004 0.008 0.032 0.000
#> SRR1345284 2 0.3302 0.69936 0.136 0.824 0.000 0.028 0.004 0.008
#> SRR1416672 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.1036 0.73374 0.024 0.964 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1454328 2 0.1313 0.71498 0.000 0.952 0.000 0.016 0.028 0.004
#> SRR1489286 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5474 0.52869 0.684 0.180 0.000 0.056 0.056 0.024
#> SRR1408183 3 0.2121 0.52764 0.000 0.000 0.892 0.000 0.096 0.012
#> SRR1084369 3 0.3888 0.52391 0.000 0.020 0.752 0.012 0.212 0.004
#> SRR598452 3 0.4765 0.34504 0.000 0.000 0.708 0.016 0.116 0.160
#> SRR660709 5 0.6326 0.49680 0.000 0.376 0.060 0.092 0.468 0.004
#> SRR809444 1 0.0405 0.87671 0.988 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1089901 2 0.1296 0.71326 0.000 0.952 0.000 0.012 0.032 0.004
#> SRR1375774 1 0.3003 0.80477 0.876 0.048 0.000 0.032 0.028 0.016
#> SRR1326292 4 0.8250 -0.16494 0.056 0.008 0.208 0.400 0.128 0.200
#> SRR657139 1 0.4591 0.60636 0.740 0.000 0.028 0.008 0.056 0.168
#> SRR1440744 2 0.3978 0.66434 0.168 0.776 0.000 0.032 0.012 0.012
#> SRR1353555 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0291 0.87723 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1452334 2 0.6470 0.07182 0.020 0.512 0.008 0.176 0.276 0.008
#> SRR1381775 1 0.0603 0.87215 0.980 0.000 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1363908 1 0.0508 0.87380 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.3990 0.70560 0.104 0.804 0.000 0.036 0.048 0.008
#> SRR658989 5 0.6280 0.59991 0.016 0.272 0.092 0.020 0.576 0.024
#> SRR1353663 1 0.2196 0.82902 0.908 0.000 0.000 0.056 0.016 0.020
#> SRR811771 1 0.0146 0.87824 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0508 0.47865 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR819054 2 0.2627 0.72622 0.084 0.880 0.000 0.024 0.008 0.004
#> SRR1367988 4 0.5800 0.52718 0.032 0.220 0.000 0.636 0.084 0.028
#> SRR1331922 1 0.3151 0.79950 0.868 0.048 0.000 0.036 0.032 0.016
#> SRR615479 1 0.6048 0.39369 0.612 0.216 0.000 0.040 0.112 0.020
#> SRR1375796 2 0.2926 0.66872 0.004 0.844 0.000 0.028 0.124 0.000
#> SRR1386991 5 0.5925 0.41782 0.024 0.436 0.024 0.016 0.472 0.028
#> SRR1355217 5 0.5422 0.58375 0.000 0.288 0.028 0.012 0.616 0.056
#> SRR1356290 2 0.5976 -0.40154 0.004 0.448 0.096 0.028 0.424 0.000
#> SRR659507 2 0.6114 -0.01259 0.068 0.568 0.012 0.016 0.304 0.032
#> SRR663296 1 0.2927 0.78992 0.864 0.004 0.000 0.092 0.020 0.020
#> SRR598044 2 0.3316 0.71808 0.100 0.844 0.000 0.024 0.020 0.012
#> SRR661155 4 0.6395 0.27414 0.036 0.368 0.000 0.468 0.116 0.012
#> SRR1414727 5 0.8401 0.41280 0.116 0.264 0.088 0.020 0.400 0.112
#> SRR663477 1 0.2638 0.81420 0.888 0.004 0.000 0.060 0.016 0.032
#> SRR1354489 5 0.5839 0.17467 0.000 0.128 0.392 0.004 0.468 0.008
#> SRR1377800 5 0.8553 -0.19927 0.060 0.112 0.240 0.016 0.328 0.244
#> SRR614611 2 0.2384 0.68738 0.000 0.888 0.000 0.048 0.064 0.000
#> SRR655052 5 0.6563 0.42370 0.004 0.400 0.048 0.108 0.432 0.008
#> SRR1478968 4 0.5739 0.27756 0.336 0.028 0.004 0.568 0.024 0.040
#> SRR1351280 2 0.6172 0.51564 0.108 0.620 0.004 0.196 0.056 0.016
#> SRR613951 4 0.6769 0.37409 0.296 0.156 0.004 0.488 0.044 0.012
#> SRR1418022 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 5 0.8861 0.37720 0.040 0.188 0.116 0.148 0.396 0.112
#> SRR1408161 1 0.0146 0.87848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR657054 5 0.8080 0.19351 0.012 0.136 0.204 0.044 0.436 0.168
#> SRR655040 2 0.8106 -0.10908 0.276 0.364 0.008 0.216 0.088 0.048
#> SRR810225 2 0.2770 0.73252 0.072 0.880 0.000 0.024 0.016 0.008
#> SRR1325377 2 0.2704 0.72843 0.080 0.880 0.000 0.020 0.012 0.008
#> SRR617829 5 0.7138 0.48995 0.000 0.264 0.212 0.088 0.432 0.004
#> SRR1402328 2 0.0806 0.72156 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR1480455 2 0.2393 0.68937 0.000 0.892 0.004 0.040 0.064 0.000
#> SRR1442104 3 0.2666 0.39682 0.000 0.000 0.864 0.012 0.012 0.112
#> SRR1453416 1 0.1477 0.84885 0.940 0.000 0.000 0.004 0.008 0.048
#> SRR1481396 3 0.6247 0.07101 0.004 0.000 0.512 0.036 0.136 0.312
#> SRR1414314 2 0.0993 0.71908 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024 0.000
#> SRR663026 2 0.1121 0.72872 0.008 0.964 0.000 0.008 0.016 0.004
#> SRR1478386 2 0.3916 0.66614 0.164 0.780 0.000 0.036 0.008 0.012
#> SRR1458683 4 0.7834 -0.10067 0.000 0.036 0.192 0.424 0.144 0.204
#> SRR1370572 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.6549 0.31416 0.572 0.188 0.000 0.024 0.164 0.052
#> SRR1310735 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5752 0.50837 0.008 0.244 0.000 0.608 0.112 0.028
#> SRR660260 5 0.5949 0.43362 0.000 0.440 0.036 0.044 0.456 0.024
#> SRR1071231 2 0.0862 0.72622 0.008 0.972 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1459125 2 0.7934 -0.27248 0.088 0.352 0.016 0.324 0.196 0.024
#> SRR1337173 5 0.6062 0.58440 0.000 0.324 0.124 0.028 0.520 0.004
#> SRR1396250 3 0.4231 0.35556 0.000 0.000 0.760 0.016 0.084 0.140
#> SRR2166376 5 0.7550 -0.04408 0.000 0.088 0.224 0.040 0.456 0.192
#> SRR659816 5 0.6280 0.49628 0.000 0.376 0.056 0.092 0.472 0.004
#> SRR1401379 2 0.4333 0.66012 0.164 0.760 0.000 0.040 0.024 0.012
#> SRR600981 2 0.7425 -0.29317 0.072 0.384 0.012 0.380 0.128 0.024
#> SRR1398335 1 0.0291 0.87694 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1397218 2 0.7682 0.28627 0.156 0.508 0.020 0.148 0.136 0.032
#> SRR660115 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0891 0.71898 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000
#> SRR1359780 2 0.1151 0.71571 0.000 0.956 0.000 0.012 0.032 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.8233 0.23963 0.084 0.212 0.000 0.400 0.140 0.164
#> SRR1397156 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1442 0.71181 0.000 0.944 0.000 0.012 0.040 0.004
#> SRR1319648 2 0.4988 0.66169 0.148 0.732 0.004 0.052 0.052 0.012
#> SRR1092985 6 0.4700 0.43242 0.148 0.000 0.020 0.052 0.032 0.748
#> SRR656409 2 0.5272 0.58354 0.152 0.672 0.000 0.152 0.016 0.008
#> SRR1468658 5 0.6688 0.53867 0.000 0.248 0.208 0.052 0.488 0.004
#> SRR1390437 4 0.6769 0.37409 0.296 0.156 0.004 0.488 0.044 0.012
#> SRR658057 2 0.3492 0.70771 0.112 0.824 0.000 0.048 0.004 0.012
#> SRR612635 2 0.2958 0.71443 0.108 0.852 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1351480 2 0.1882 0.73561 0.028 0.928 0.000 0.020 0.024 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3449 0.77512 0.852 0.048 0.000 0.040 0.040 0.020
#> SRR659590 2 0.0862 0.72622 0.008 0.972 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3100 0.71999 0.108 0.848 0.000 0.028 0.012 0.004
#> SRR659911 2 0.1644 0.71601 0.000 0.932 0.000 0.028 0.040 0.000
#> SRR1085519 3 0.5497 0.44412 0.000 0.072 0.552 0.000 0.348 0.028
#> SRR1345894 5 0.6704 0.48025 0.000 0.272 0.224 0.016 0.464 0.024
#> SRR1442928 2 0.5060 -0.10171 0.004 0.548 0.004 0.016 0.400 0.028
#> SRR1464681 4 0.5533 0.52143 0.008 0.224 0.000 0.636 0.108 0.024
#> SRR1418880 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.6094 0.58426 0.000 0.324 0.120 0.032 0.520 0.004
#> SRR1365426 1 0.5714 0.43714 0.640 0.228 0.000 0.040 0.068 0.024
#> SRR1487947 1 0.1542 0.84717 0.936 0.000 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR659708 1 0.3449 0.77512 0.852 0.048 0.000 0.040 0.040 0.020
#> SRR603236 2 0.6328 -0.38401 0.000 0.432 0.040 0.096 0.420 0.012
#> SRR660673 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0665 0.72308 0.004 0.980 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR663807 2 0.0964 0.73110 0.012 0.968 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1087245 2 0.3305 0.71010 0.108 0.832 0.000 0.048 0.000 0.012
#> SRR1339108 2 0.4922 0.63732 0.068 0.728 0.004 0.044 0.152 0.004
#> SRR613426 1 0.8077 -0.25099 0.408 0.128 0.020 0.300 0.072 0.072
#> SRR613879 2 0.3574 0.63015 0.000 0.804 0.000 0.036 0.144 0.016
#> SRR1385101 1 0.5491 0.51002 0.676 0.188 0.000 0.036 0.076 0.024
#> SRR1387966 2 0.1851 0.73358 0.024 0.928 0.000 0.012 0.036 0.000
#> SRR1458852 2 0.3056 0.63682 0.000 0.848 0.012 0.016 0.116 0.008
#> SRR1430489 4 0.5447 0.28582 0.348 0.032 0.000 0.572 0.024 0.024
#> SRR1349231 1 0.3679 0.75401 0.836 0.068 0.000 0.040 0.036 0.020
#> SRR1376249 3 0.6174 0.07505 0.004 0.000 0.524 0.036 0.128 0.308
#> SRR1321987 2 0.1442 0.71003 0.000 0.944 0.000 0.012 0.040 0.004
#> SRR662653 2 0.0976 0.72774 0.008 0.968 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3268 0.71967 0.096 0.848 0.000 0.024 0.020 0.012
#> SRR1383081 2 0.2986 0.71498 0.104 0.852 0.000 0.032 0.000 0.012
#> SRR2166960 2 0.2207 0.73331 0.016 0.916 0.000 0.028 0.032 0.008
#> SRR605101 2 0.4297 0.61283 0.216 0.732 0.000 0.020 0.016 0.016
#> SRR818600 2 0.2038 0.73520 0.028 0.920 0.000 0.020 0.032 0.000
#> SRR1367715 2 0.3186 0.70759 0.120 0.840 0.000 0.020 0.008 0.012
#> SRR1351979 3 0.0820 0.48951 0.000 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1387054 3 0.5329 0.45570 0.000 0.120 0.668 0.028 0.180 0.004
#> SRR1444306 5 0.6219 -0.00747 0.000 0.164 0.380 0.004 0.436 0.016
#> SRR1322662 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1644 0.71601 0.000 0.932 0.000 0.028 0.040 0.000
#> SRR612767 1 0.3328 0.78117 0.844 0.008 0.000 0.096 0.024 0.028
#> SRR1489030 2 0.0893 0.73170 0.016 0.972 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1430375 2 0.3626 0.57112 0.000 0.784 0.000 0.028 0.176 0.012
#> SRR615225 2 0.7425 -0.29317 0.072 0.384 0.012 0.380 0.128 0.024
#> SRR1401839 5 0.6829 0.53428 0.056 0.372 0.032 0.032 0.472 0.036
#> SRR1379110 2 0.3302 0.69936 0.136 0.824 0.000 0.028 0.004 0.008
#> SRR1077288 3 0.6576 -0.15123 0.004 0.000 0.404 0.036 0.172 0.384
#> SRR1331639 4 0.5533 0.52143 0.008 0.224 0.000 0.636 0.108 0.024
#> SRR1342782 1 0.6320 0.14816 0.520 0.332 0.000 0.040 0.084 0.024
#> SRR1443003 3 0.6159 0.13257 0.000 0.152 0.436 0.004 0.392 0.016
#> SRR612839 1 0.1542 0.84641 0.936 0.000 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR1470093 3 0.5546 0.45400 0.000 0.056 0.668 0.120 0.152 0.004
#> SRR1395742 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0146 0.87848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387222 5 0.7250 0.46425 0.000 0.240 0.236 0.088 0.428 0.008
#> SRR664063 1 0.5802 0.40292 0.624 0.244 0.000 0.040 0.068 0.024
#> SRR1488214 1 0.3103 0.80326 0.868 0.024 0.000 0.064 0.020 0.024
#> SRR654766 4 0.5800 0.52718 0.032 0.220 0.000 0.636 0.084 0.028
#> SRR1320321 2 0.3345 0.70920 0.120 0.832 0.000 0.028 0.008 0.012
#> SRR1071955 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.87938 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2986 0.71498 0.104 0.852 0.000 0.032 0.000 0.012
#> SRR1488470 2 0.6575 0.23076 0.140 0.492 0.000 0.312 0.044 0.012
#> SRR1389497 3 0.2121 0.52764 0.000 0.000 0.892 0.000 0.096 0.012
#> SRR1367109 5 0.6715 0.52075 0.000 0.232 0.168 0.028 0.532 0.040
#> SRR615311 1 0.2460 0.81982 0.896 0.004 0.000 0.064 0.016 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.961 0.940 0.976 0.4236 0.587 0.587
#> 3 3 0.874 0.893 0.955 0.5131 0.765 0.604
#> 4 4 0.776 0.769 0.878 0.1295 0.910 0.759
#> 5 5 0.760 0.767 0.860 0.0650 0.923 0.746
#> 6 6 0.768 0.571 0.757 0.0436 0.952 0.808
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.9087 0.5304 0.324 0.676
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.8713 0.5738 0.708 0.292
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1455525 2 0.9815 0.2947 0.420 0.580
#> SRR613999 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1375509 2 0.8955 0.5548 0.312 0.688
#> SRR612227 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.7815 0.6967 0.232 0.768
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.9833 0.2829 0.424 0.576
#> SRR656247 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.7219 0.7452 0.200 0.800
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.4161 0.8901 0.084 0.916
#> SRR810249 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.9170 0.5136 0.332 0.668
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR661074 1 0.9710 0.3182 0.600 0.400
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.7219 0.7397 0.200 0.800
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1418561 2 0.9970 0.1404 0.468 0.532
#> SRR1448029 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1429265 2 0.9732 0.3398 0.404 0.596
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.6801 0.7688 0.180 0.820
#> SRR815044 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.0672 0.9659 0.008 0.992
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.2778 0.9335 0.952 0.048
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR818901 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.5737 0.8303 0.136 0.864
#> SRR658259 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.9732 0.3067 0.596 0.404
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.9044 0.5386 0.320 0.680
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.4562 0.8785 0.904 0.096
#> SRR1400551 2 0.9209 0.5050 0.336 0.664
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.9815 0.2743 0.420 0.580
#> SRR663284 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.7674 0.7026 0.224 0.776
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.9710 0.3182 0.600 0.400
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1432743 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR662019 2 0.9686 0.3613 0.396 0.604
#> SRR1349209 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR615479 2 0.9775 0.3176 0.412 0.588
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.9000 0.5468 0.316 0.684
#> SRR663477 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.5629 0.8352 0.132 0.868
#> SRR614611 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.3584 0.9109 0.932 0.068
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1481396 2 0.9710 0.3506 0.400 0.600
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.9129 0.5221 0.328 0.672
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.9710 0.3310 0.400 0.600
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.7219 0.7452 0.200 0.800
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR613426 2 1.0000 0.0172 0.496 0.504
#> SRR613879 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.9552 0.4124 0.376 0.624
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.9710 0.3182 0.600 0.400
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.9710 0.3182 0.600 0.400
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.7056 0.7566 0.192 0.808
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.9731 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9807 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.6154 0.2984 0.000 0.408 0.592
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.1860 0.8953 0.000 0.948 0.052
#> SRR1499740 3 0.0592 0.9476 0.012 0.000 0.988
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.3551 0.8246 0.000 0.868 0.132
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.1964 0.9062 0.056 0.000 0.944
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 3 0.3267 0.8478 0.000 0.116 0.884
#> SRR655887 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.5138 0.6362 0.000 0.748 0.252
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.4931 0.6664 0.000 0.232 0.768
#> SRR1329003 1 0.5706 0.5119 0.680 0.000 0.320
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.1411 0.9075 0.000 0.964 0.036
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.1964 0.8918 0.000 0.944 0.056
#> SRR660164 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 2 0.7013 0.4522 0.028 0.608 0.364
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.1643 0.9015 0.000 0.956 0.044
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.3267 0.8481 0.000 0.116 0.884
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0424 0.9509 0.008 0.000 0.992
#> SRR656247 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 3 0.4702 0.7163 0.212 0.000 0.788
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.6126 0.4152 0.000 0.600 0.400
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.6192 0.1871 0.000 0.420 0.580
#> SRR1408682 2 0.4452 0.7597 0.000 0.808 0.192
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.4291 0.7736 0.000 0.820 0.180
#> SRR603164 3 0.3619 0.8239 0.000 0.136 0.864
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.6498 0.4111 0.008 0.596 0.396
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.5053 0.7722 0.024 0.812 0.164
#> SRR810249 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.8603 0.4933 0.168 0.600 0.232
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.1163 0.9126 0.000 0.972 0.028
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.1964 0.9062 0.056 0.000 0.944
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.5529 0.5595 0.704 0.000 0.296
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.1031 0.9160 0.000 0.976 0.024
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.5621 0.5969 0.000 0.692 0.308
#> SRR603116 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0237 0.9540 0.004 0.000 0.996
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.5760 0.5554 0.000 0.672 0.328
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.6111 0.4245 0.000 0.604 0.396
#> SRR658766 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.3941 0.7975 0.000 0.156 0.844
#> SRR817282 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.5465 0.6287 0.000 0.712 0.288
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.3816 0.7988 0.000 0.148 0.852
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.3686 0.8160 0.000 0.860 0.140
#> SRR820907 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.4452 0.7438 0.808 0.000 0.192
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.5948 0.4131 0.000 0.640 0.360
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.6235 0.3203 0.000 0.564 0.436
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4605 0.7093 0.796 0.204 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0237 0.9290 0.000 0.996 0.004
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0747 0.9215 0.000 0.984 0.016
#> SRR1322900 3 0.6026 0.3853 0.376 0.000 0.624
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 2 0.6126 0.4152 0.000 0.600 0.400
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 2 0.6126 0.4152 0.000 0.600 0.400
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.1163 0.9133 0.000 0.972 0.028
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.1031 0.9160 0.000 0.976 0.024
#> SRR613126 2 0.2261 0.8826 0.000 0.932 0.068
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.6126 0.4152 0.000 0.600 0.400
#> SRR1456027 1 0.5859 0.4568 0.656 0.000 0.344
#> SRR1400551 3 0.0237 0.9540 0.004 0.000 0.996
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.5926 0.5053 0.000 0.644 0.356
#> SRR1348040 3 0.5098 0.6363 0.000 0.248 0.752
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 3 0.1964 0.9062 0.056 0.000 0.944
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0747 0.9214 0.000 0.984 0.016
#> SRR662918 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.6126 0.4152 0.000 0.600 0.400
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.2537 0.8846 0.000 0.080 0.920
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.6244 0.3089 0.000 0.560 0.440
#> SRR662019 3 0.1163 0.9335 0.028 0.000 0.972
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.6111 0.4245 0.000 0.604 0.396
#> SRR809444 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.5706 0.5119 0.680 0.000 0.320
#> SRR657139 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.5905 0.5122 0.000 0.648 0.352
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.6126 0.4152 0.000 0.600 0.400
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.7337 0.2634 0.428 0.540 0.032
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.4974 0.6590 0.000 0.236 0.764
#> SRR1355217 2 0.5621 0.5965 0.000 0.692 0.308
#> SRR1356290 2 0.2356 0.8794 0.000 0.928 0.072
#> SRR659507 2 0.6126 0.4152 0.000 0.600 0.400
#> SRR663296 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414727 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 2 0.1529 0.9046 0.000 0.960 0.040
#> SRR1478968 1 0.6045 0.3654 0.620 0.000 0.380
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 2 0.5810 0.5415 0.000 0.664 0.336
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.2711 0.8767 0.000 0.088 0.912
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.6769 0.4071 0.016 0.592 0.392
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.6111 0.4245 0.000 0.604 0.396
#> SRR660260 3 0.6305 -0.0613 0.000 0.484 0.516
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.6079 0.4424 0.000 0.612 0.388
#> SRR1337173 3 0.0424 0.9507 0.000 0.008 0.992
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.5835 0.5347 0.000 0.660 0.340
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.6095 0.4336 0.000 0.608 0.392
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.1753 0.8988 0.000 0.952 0.048
#> SRR658057 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.5650 0.5901 0.000 0.688 0.312
#> SRR1464681 2 0.1163 0.9131 0.000 0.972 0.028
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.4555 0.7439 0.200 0.800 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 2 0.3752 0.8119 0.000 0.856 0.144
#> SRR660673 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.9507 0.0831 0.432 0.380 0.188
#> SRR613879 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 2 0.6126 0.3872 0.400 0.600 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0424 0.9509 0.008 0.000 0.992
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.3482 0.8338 0.000 0.128 0.872
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.4605 0.7452 0.000 0.796 0.204
#> SRR615225 2 0.6095 0.4336 0.000 0.608 0.392
#> SRR1401839 3 0.4796 0.6875 0.000 0.220 0.780
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.1964 0.9062 0.056 0.000 0.944
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.4733 0.7517 0.004 0.800 0.196
#> SRR1443003 3 0.0237 0.9540 0.000 0.004 0.996
#> SRR612839 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.5524 0.7567 0.164 0.796 0.040
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.6079 0.4424 0.000 0.612 0.388
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9315 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9571 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9784 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380716 2 0.0707 0.8493 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR612803 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0707 0.9737 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1074359 4 0.6863 0.2216 0.000 0.116 0.348 0.536
#> SRR1419258 3 0.3569 0.7265 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1403366 3 0.2081 0.7784 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR665262 2 0.7034 0.4113 0.000 0.576 0.204 0.220
#> SRR1499740 3 0.4103 0.6391 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1105057 2 0.0469 0.8503 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.3688 0.6808 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR612215 2 0.7034 0.4113 0.000 0.576 0.204 0.220
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0707 0.9737 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1409263 3 0.1151 0.7983 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.1940 0.8245 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR614839 2 0.2647 0.8071 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR658433 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1088581 4 0.3975 0.5417 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1328797 3 0.3219 0.7560 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1334512 2 0.1940 0.8245 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1471117 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354955 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.2704 0.7752 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR660066 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1447103 3 0.4692 0.6467 0.000 0.032 0.756 0.212
#> SRR1402153 3 0.5136 0.6783 0.000 0.048 0.728 0.224
#> SRR655887 2 0.0336 0.8519 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1408529 3 0.3123 0.7562 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR658707 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.3453 0.7819 0.000 0.868 0.080 0.052
#> SRR1074670 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1375439 3 0.7080 0.3198 0.000 0.196 0.568 0.236
#> SRR1329003 4 0.6273 0.5105 0.248 0.000 0.108 0.644
#> SRR1404837 2 0.4193 0.6696 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1317920 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1455525 4 0.4382 0.4776 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR613999 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0817 0.7995 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1068855 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1375509 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR612227 3 0.2281 0.7742 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1388809 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1413872 4 0.3760 0.7283 0.000 0.136 0.028 0.836
#> SRR1452864 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473078 3 0.2647 0.7633 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR615814 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1325225 1 0.2530 0.8726 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1313687 2 0.0188 0.8512 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358220 2 0.0707 0.8479 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1096662 2 0.4661 0.3940 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.7355 0.3631 0.000 0.520 0.204 0.276
#> SRR660164 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR815783 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809595 2 0.7959 0.1684 0.004 0.420 0.292 0.284
#> SRR1403133 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR815470 4 0.4220 0.6697 0.000 0.248 0.004 0.748
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4454 0.6575 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1478362 4 0.3447 0.7321 0.000 0.128 0.020 0.852
#> SRR1392186 2 0.2921 0.7946 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1354270 4 0.4730 0.2329 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR612683 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1392901 3 0.4250 0.6687 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1077805 3 0.4908 0.6144 0.000 0.016 0.692 0.292
#> SRR1360402 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1406112 3 0.0188 0.8043 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1355352 3 0.2281 0.7726 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR656247 1 0.0592 0.9709 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR813656 2 0.3975 0.6976 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR808244 4 0.5499 0.5362 0.072 0.000 0.216 0.712
#> SRR1387240 2 0.0469 0.8507 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1408595 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1385277 4 0.1406 0.6917 0.000 0.016 0.024 0.960
#> SRR1435248 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1419110 3 0.7684 0.0581 0.000 0.360 0.420 0.220
#> SRR1408682 2 0.6943 0.4000 0.000 0.576 0.160 0.264
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.2921 0.7947 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1453911 2 0.7247 0.3739 0.000 0.544 0.216 0.240
#> SRR603164 3 0.5775 0.6161 0.000 0.092 0.696 0.212
#> SRR1383259 2 0.4643 0.4042 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1330854 1 0.0707 0.9737 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.2647 0.8069 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2760 0.7705 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1361546 2 0.7722 0.1888 0.000 0.444 0.300 0.256
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2888 0.7587 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR615635 2 0.0188 0.8516 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1385411 2 0.3837 0.6529 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0469 0.8038 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR662126 2 0.4955 0.2948 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1464601 2 0.0672 0.8482 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1071594 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612539 2 0.1792 0.8300 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR602010 2 0.7164 0.3939 0.000 0.556 0.204 0.240
#> SRR810249 2 0.0188 0.8514 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818773 2 0.8021 0.1863 0.008 0.436 0.288 0.268
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.1474 0.8366 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1442754 1 0.0707 0.9737 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1334247 3 0.1792 0.7882 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR661639 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.7314 0.2674 0.000 0.488 0.164 0.348
#> SRR1459937 4 0.2760 0.6641 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0188 0.8512 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809348 1 0.0336 0.9806 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR819261 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR661074 3 0.1256 0.7978 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR1349851 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1405123 4 0.4981 0.2288 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR661096 2 0.1792 0.8300 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.6194 0.5062 0.260 0.000 0.096 0.644
#> SRR1307677 2 0.0336 0.8519 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466512 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR658212 2 0.0469 0.8518 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1430525 3 0.4072 0.6769 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1344422 4 0.4804 0.4341 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1353924 2 0.0592 0.8488 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1314832 1 0.0707 0.9737 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1487570 1 0.2281 0.8911 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR627431 2 0.4655 0.4737 0.000 0.684 0.004 0.312
#> SRR1418561 3 0.4040 0.5723 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1448029 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435311 2 0.0188 0.8512 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612395 2 0.7576 0.2193 0.000 0.472 0.308 0.220
#> SRR603116 2 0.2921 0.7711 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1323152 3 0.3074 0.7590 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1368264 2 0.6403 0.5305 0.000 0.640 0.128 0.232
#> SRR1326624 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1429265 3 0.0592 0.8020 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.2704 0.8041 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4955 0.2249 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR815044 2 0.4843 0.2998 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1338560 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.1637 0.8327 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1480038 2 0.1637 0.8327 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR659436 3 0.3726 0.6785 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR613699 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.1940 0.8245 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1330327 4 0.3550 0.7350 0.000 0.096 0.044 0.860
#> SRR1489950 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318444 4 0.3907 0.5295 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR600656 4 0.2675 0.7260 0.000 0.044 0.048 0.908
#> SRR658766 3 0.4679 0.6172 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR655946 3 0.4908 0.6144 0.000 0.016 0.692 0.292
#> SRR817282 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.7651 0.2293 0.000 0.464 0.288 0.248
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4843 0.6156 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR662498 3 0.4853 0.6340 0.000 0.036 0.744 0.220
#> SRR1376764 3 0.3400 0.7538 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1377006 3 0.4564 0.5992 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR656860 2 0.3219 0.7395 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1480547 2 0.1940 0.8245 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1452515 3 0.2760 0.7555 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1324390 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615273 1 0.1557 0.9385 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR601695 4 0.5615 0.4775 0.000 0.356 0.032 0.612
#> SRR820907 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 1 0.7866 0.1208 0.472 0.008 0.232 0.288
#> SRR1405984 2 0.0336 0.8509 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1472794 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365448 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095720 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1435626 3 0.2469 0.7672 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1080766 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0188 0.8046 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320579 3 0.4454 0.6170 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1319710 2 0.2704 0.8046 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1326604 2 0.1022 0.8453 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1098879 3 0.3219 0.7560 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR662245 2 0.0672 0.8482 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1074719 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 4 0.4877 0.2694 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR601387 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614575 2 0.1118 0.8425 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1353900 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR662906 2 0.4630 0.5406 0.000 0.732 0.252 0.016
#> SRR1350832 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1403280 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1313969 4 0.3107 0.7143 0.000 0.036 0.080 0.884
#> SRR1388528 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.6323 0.4956 0.648 0.012 0.072 0.268
#> SRR655399 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1319753 2 0.3569 0.7468 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR818901 3 0.0188 0.8046 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR607067 4 0.4248 0.6348 0.000 0.220 0.012 0.768
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR661961 3 0.3688 0.6808 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR658259 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365034 2 0.3873 0.6462 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1478053 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1475300 2 0.0336 0.8509 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1328101 2 0.6908 0.4371 0.000 0.592 0.188 0.220
#> SRR1322900 3 0.7946 0.1965 0.252 0.008 0.456 0.284
#> SRR1309942 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345760 4 0.2840 0.7217 0.000 0.044 0.056 0.900
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4972 0.2483 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0804 0.8474 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR661469 2 0.7711 0.1899 0.000 0.444 0.308 0.248
#> SRR1500323 2 0.1256 0.8421 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1356705 2 0.3528 0.7525 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1211 0.7991 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1350435 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1389177 3 0.3873 0.7198 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1368072 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR601815 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR613330 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.5408 -0.0910 0.000 0.488 0.012 0.500
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.2081 0.7823 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1318839 3 0.3219 0.7560 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1432390 4 0.3306 0.7231 0.000 0.156 0.004 0.840
#> SRR613126 2 0.4720 0.5692 0.000 0.720 0.016 0.264
#> SRR1089424 2 0.0336 0.8509 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1347214 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.7807 0.1684 0.000 0.420 0.292 0.288
#> SRR1456027 4 0.3873 0.6747 0.096 0.000 0.060 0.844
#> SRR1400551 3 0.2589 0.7607 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1320469 1 0.0707 0.9737 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR614251 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1454310 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615105 4 0.4053 0.5631 0.000 0.004 0.228 0.768
#> SRR1433290 3 0.3123 0.7562 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR2166064 4 0.3266 0.7176 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR601671 2 0.1637 0.8327 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR663874 2 0.1302 0.8364 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1409130 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR659696 4 0.4746 0.4602 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1408249 2 0.4292 0.7242 0.100 0.820 0.000 0.080
#> SRR663284 2 0.2011 0.8237 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1402794 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR614852 4 0.3486 0.7355 0.000 0.092 0.044 0.864
#> SRR1348040 4 0.4746 0.3484 0.000 0.008 0.304 0.688
#> SRR1489610 2 0.2704 0.8046 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1488091 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499566 2 0.2589 0.8092 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1361480 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1444501 3 0.3649 0.7253 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1415773 2 0.3444 0.7447 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1388832 3 0.3401 0.7313 0.008 0.000 0.840 0.152
#> SRR1394637 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR606974 2 0.4655 0.4737 0.000 0.684 0.004 0.312
#> SRR662918 4 0.4907 0.3342 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR817421 3 0.3356 0.7484 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1118 0.8442 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR608264 3 0.3123 0.7562 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1318560 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1454117 2 0.0707 0.8481 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1312684 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR615044 2 0.7807 0.1684 0.000 0.420 0.292 0.288
#> SRR1432743 3 0.3873 0.7198 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1388873 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.2469 0.7679 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1406008 2 0.2345 0.8147 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1396786 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1446564 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318465 3 0.4748 0.6644 0.000 0.016 0.716 0.268
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4898 0.3275 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR655170 2 0.0817 0.8513 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1087825 4 0.3820 0.7220 0.000 0.064 0.088 0.848
#> SRR662019 3 0.1109 0.8009 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1349209 4 0.2814 0.6552 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1326161 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345284 2 0.1022 0.8445 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.1474 0.8359 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1454328 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.3820 0.8230 0.848 0.000 0.064 0.088
#> SRR1408183 3 0.0336 0.8044 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1084369 3 0.3801 0.7167 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR598452 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR660709 4 0.1356 0.6976 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR809444 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1375774 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326292 4 0.6273 0.5105 0.248 0.000 0.108 0.644
#> SRR657139 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1440744 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.3907 0.7330 0.000 0.120 0.044 0.836
#> SRR1381775 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0469 0.8512 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR658989 3 0.3649 0.6868 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1353663 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR811771 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.3266 0.7536 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR819054 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.1629 0.6978 0.000 0.024 0.024 0.952
#> SRR1331922 1 0.5000 0.7158 0.772 0.000 0.100 0.128
#> SRR615479 2 0.9120 0.1173 0.076 0.396 0.244 0.284
#> SRR1375796 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1386991 3 0.7250 0.2857 0.000 0.236 0.544 0.220
#> SRR1355217 2 0.7636 0.2373 0.000 0.468 0.284 0.248
#> SRR1356290 2 0.4776 0.5786 0.000 0.732 0.024 0.244
#> SRR659507 2 0.7576 0.2193 0.000 0.472 0.308 0.220
#> SRR663296 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR598044 2 0.0336 0.8509 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661155 4 0.3402 0.7195 0.000 0.164 0.004 0.832
#> SRR1414727 3 0.3486 0.7044 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR663477 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1354489 3 0.3688 0.7355 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1377800 3 0.1792 0.7847 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR614611 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR655052 4 0.2867 0.7355 0.000 0.104 0.012 0.884
#> SRR1478968 4 0.3873 0.6747 0.096 0.000 0.060 0.844
#> SRR1351280 2 0.1940 0.8245 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR613951 4 0.2675 0.7245 0.000 0.048 0.044 0.908
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3726 0.5937 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.1302 0.7979 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR655040 2 0.4998 0.0984 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR810225 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.4769 0.6113 0.000 0.008 0.684 0.308
#> SRR1402328 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1480455 2 0.2342 0.7998 0.000 0.912 0.008 0.080
#> SRR1442104 3 0.4103 0.6741 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0592 0.8020 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1414314 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663026 2 0.0336 0.8509 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1478386 2 0.1940 0.8245 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1458683 4 0.4382 0.4638 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.8566 0.0895 0.028 0.384 0.296 0.292
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.3505 0.7350 0.000 0.088 0.048 0.864
#> SRR660260 4 0.5130 0.3534 0.000 0.020 0.312 0.668
#> SRR1071231 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.1174 0.6985 0.000 0.020 0.012 0.968
#> SRR1337173 3 0.4814 0.6412 0.000 0.008 0.676 0.316
#> SRR1396250 3 0.0336 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR2166376 3 0.1792 0.7890 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR659816 4 0.4800 0.6407 0.000 0.196 0.044 0.760
#> SRR1401379 2 0.2704 0.8046 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR600981 4 0.3894 0.7315 0.000 0.088 0.068 0.844
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4304 0.6380 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR660115 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1359780 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4981 0.2081 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1319648 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1092985 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR656409 2 0.3486 0.7070 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1468658 3 0.4454 0.6170 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1390437 4 0.2329 0.7000 0.000 0.072 0.012 0.916
#> SRR658057 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR612635 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1351480 2 0.0188 0.8512 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0336 0.9806 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659590 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0707 0.8479 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR659911 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1085519 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442928 2 0.7576 0.2193 0.000 0.472 0.308 0.220
#> SRR1464681 4 0.3257 0.7271 0.000 0.152 0.004 0.844
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.4585 0.6381 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1365426 2 0.7991 0.3905 0.044 0.548 0.164 0.244
#> SRR1487947 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659708 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR603236 2 0.5615 0.3275 0.000 0.612 0.032 0.356
#> SRR660673 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087245 2 0.1118 0.8424 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1339108 2 0.3569 0.7447 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR613426 4 0.2694 0.7188 0.024 0.044 0.016 0.916
#> SRR613879 2 0.1474 0.8366 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1385101 4 0.8255 0.4248 0.164 0.124 0.136 0.576
#> SRR1387966 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458852 2 0.0804 0.8474 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1430489 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1349231 1 0.1211 0.9489 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1376249 3 0.0779 0.8010 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1321987 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR662653 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0336 0.8509 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1383081 2 0.0188 0.8516 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2166960 2 0.0000 0.8515 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR605101 2 0.1637 0.8290 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR818600 2 0.0188 0.8516 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367715 2 0.1716 0.8308 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1351979 3 0.3219 0.7512 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1387054 3 0.4908 0.6144 0.000 0.016 0.692 0.292
#> SRR1444306 3 0.1022 0.7969 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612767 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1489030 2 0.0336 0.8515 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1430375 2 0.7148 0.3858 0.000 0.560 0.220 0.220
#> SRR615225 4 0.3828 0.7344 0.000 0.084 0.068 0.848
#> SRR1401839 3 0.6916 0.3627 0.000 0.176 0.588 0.236
#> SRR1379110 2 0.1637 0.8327 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1077288 3 0.1042 0.7987 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1331639 4 0.3486 0.7064 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1342782 2 0.7211 0.3868 0.000 0.548 0.204 0.248
#> SRR1443003 3 0.1302 0.8029 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR612839 1 0.0336 0.9804 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470093 3 0.4331 0.6233 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4500 0.6144 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR664063 2 0.7277 0.3764 0.000 0.536 0.204 0.260
#> SRR1488214 1 0.0469 0.9787 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR654766 4 0.1833 0.7045 0.000 0.032 0.024 0.944
#> SRR1320321 2 0.0188 0.8512 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9834 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0188 0.8514 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488470 2 0.1940 0.8245 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1389497 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.3649 0.7432 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR615311 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1380716 2 0.3058 0.8493 0.000 0.860 0.000 0.044 0.096
#> SRR612803 1 0.0162 0.9554 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.3184 0.8780 0.852 0.000 0.000 0.048 0.100
#> SRR1074359 4 0.6698 0.1597 0.000 0.148 0.412 0.424 0.016
#> SRR1419258 3 0.1671 0.7913 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1403366 5 0.4291 0.0380 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR665262 5 0.3737 0.6789 0.000 0.224 0.004 0.008 0.764
#> SRR1499740 5 0.1732 0.6921 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1105057 2 0.2873 0.8483 0.000 0.860 0.000 0.020 0.120
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.3519 0.5999 0.000 0.000 0.216 0.008 0.776
#> SRR612215 5 0.3750 0.6714 0.000 0.232 0.000 0.012 0.756
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0290 0.9543 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1393449 1 0.4202 0.8302 0.796 0.000 0.012 0.068 0.124
#> SRR1409263 3 0.4786 0.5488 0.000 0.000 0.652 0.040 0.308
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.3705 0.8327 0.000 0.816 0.000 0.064 0.120
#> SRR614839 2 0.5018 0.7044 0.000 0.664 0.000 0.068 0.268
#> SRR658433 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1088581 4 0.3835 0.6479 0.000 0.000 0.244 0.744 0.012
#> SRR1328797 3 0.0290 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1334512 2 0.3477 0.8392 0.000 0.832 0.000 0.056 0.112
#> SRR1471117 1 0.1750 0.9329 0.936 0.000 0.000 0.036 0.028
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1354955 3 0.2377 0.7680 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR654802 3 0.0290 0.8046 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660066 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1447103 5 0.4686 0.6826 0.000 0.112 0.124 0.008 0.756
#> SRR1402153 3 0.3049 0.7721 0.000 0.032 0.872 0.084 0.012
#> SRR655887 2 0.1331 0.8638 0.000 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1408529 3 0.0000 0.8045 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.3356 0.8242 0.000 0.860 0.068 0.016 0.056
#> SRR1074670 3 0.3456 0.7329 0.000 0.000 0.800 0.016 0.184
#> SRR1375439 5 0.3866 0.6909 0.000 0.076 0.096 0.008 0.820
#> SRR1329003 4 0.3817 0.6988 0.032 0.000 0.020 0.820 0.128
#> SRR1404837 5 0.4849 0.1862 0.000 0.360 0.000 0.032 0.608
#> SRR1317920 1 0.2795 0.9025 0.880 0.000 0.000 0.056 0.064
#> SRR1455525 4 0.3639 0.7068 0.000 0.000 0.076 0.824 0.100
#> SRR613999 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0162 0.9554 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.3913 0.5168 0.000 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1068855 1 0.2370 0.9173 0.904 0.000 0.000 0.056 0.040
#> SRR1375509 3 0.2953 0.7589 0.000 0.000 0.844 0.012 0.144
#> SRR612227 3 0.4562 0.0745 0.000 0.000 0.500 0.008 0.492
#> SRR1388809 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1413872 4 0.2263 0.7992 0.000 0.020 0.036 0.920 0.024
#> SRR1452864 1 0.3055 0.8919 0.864 0.000 0.000 0.064 0.072
#> SRR1473078 5 0.3949 0.4636 0.000 0.000 0.300 0.004 0.696
#> SRR615814 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1325225 1 0.5568 0.3646 0.540 0.000 0.000 0.384 0.076
#> SRR1313687 2 0.1697 0.8635 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1358220 2 0.2813 0.8511 0.000 0.868 0.000 0.024 0.108
#> SRR1096662 2 0.5382 0.6585 0.000 0.656 0.000 0.224 0.120
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.2628 0.6995 0.000 0.088 0.000 0.028 0.884
#> SRR660164 2 0.0955 0.8604 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR815783 2 0.0671 0.8567 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR809595 5 0.1612 0.7117 0.000 0.012 0.016 0.024 0.948
#> SRR1403133 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR815470 4 0.5403 0.3205 0.000 0.444 0.028 0.512 0.016
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4062 0.7326 0.000 0.004 0.796 0.132 0.068
#> SRR1478362 4 0.3824 0.7591 0.000 0.028 0.128 0.820 0.024
#> SRR1392186 2 0.5300 0.6135 0.000 0.604 0.000 0.068 0.328
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0162 0.9554 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471594 1 0.2153 0.9233 0.916 0.000 0.000 0.040 0.044
#> SRR1354270 4 0.3752 0.7048 0.000 0.000 0.048 0.804 0.148
#> SRR612683 2 0.1571 0.8625 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1392901 3 0.2930 0.7337 0.000 0.000 0.832 0.164 0.004
#> SRR1077805 3 0.2890 0.7370 0.000 0.004 0.836 0.160 0.000
#> SRR1360402 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1406112 3 0.2732 0.7512 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1355352 5 0.4524 0.3607 0.000 0.000 0.336 0.020 0.644
#> SRR656247 1 0.1121 0.9291 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR813656 2 0.5475 0.6048 0.000 0.596 0.000 0.084 0.320
#> SRR808244 4 0.4746 0.6509 0.004 0.000 0.132 0.744 0.120
#> SRR1387240 2 0.0671 0.8567 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1408595 1 0.2300 0.9188 0.908 0.000 0.000 0.040 0.052
#> SRR1385277 4 0.2208 0.7881 0.000 0.000 0.020 0.908 0.072
#> SRR1435248 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1419110 5 0.4593 0.6951 0.000 0.160 0.076 0.008 0.756
#> SRR1408682 5 0.4768 0.5777 0.000 0.304 0.000 0.040 0.656
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4603 0.6796 0.000 0.668 0.000 0.032 0.300
#> SRR1453911 5 0.3538 0.6957 0.000 0.176 0.004 0.016 0.804
#> SRR603164 3 0.3970 0.6980 0.000 0.096 0.800 0.104 0.000
#> SRR1383259 2 0.5681 0.5652 0.000 0.604 0.000 0.276 0.120
#> SRR1330854 1 0.3442 0.8663 0.836 0.000 0.000 0.060 0.104
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4967 0.6923 0.000 0.660 0.000 0.060 0.280
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0324 0.8048 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1361546 5 0.2878 0.7274 0.000 0.048 0.048 0.016 0.888
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3023 0.7713 0.000 0.872 0.028 0.088 0.012
#> SRR615635 2 0.0510 0.8621 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1385411 2 0.3946 0.8251 0.000 0.800 0.000 0.080 0.120
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.2773 0.7516 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR662126 2 0.6673 0.2908 0.000 0.424 0.000 0.244 0.332
#> SRR1464601 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1071594 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR612539 2 0.3622 0.8352 0.000 0.820 0.000 0.056 0.124
#> SRR602010 5 0.2802 0.7072 0.000 0.100 0.008 0.016 0.876
#> SRR810249 2 0.1502 0.8633 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR818773 5 0.1524 0.7188 0.000 0.016 0.016 0.016 0.952
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.2124 0.8370 0.000 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR1442754 1 0.3558 0.8602 0.828 0.000 0.000 0.064 0.108
#> SRR1334247 3 0.3707 0.6292 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR661639 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 5 0.3997 0.5955 0.000 0.116 0.004 0.076 0.804
#> SRR1459937 4 0.2149 0.7940 0.000 0.000 0.048 0.916 0.036
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.2536 0.8554 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR809348 1 0.1364 0.9399 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR819261 3 0.3456 0.7329 0.000 0.000 0.800 0.016 0.184
#> SRR661074 3 0.4836 0.4925 0.000 0.000 0.628 0.036 0.336
#> SRR1349851 1 0.2291 0.9185 0.908 0.000 0.000 0.036 0.056
#> SRR1405123 4 0.4774 0.1809 0.000 0.424 0.000 0.556 0.020
#> SRR661096 2 0.3752 0.8310 0.000 0.812 0.000 0.064 0.124
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.3817 0.6988 0.032 0.000 0.020 0.820 0.128
#> SRR1307677 2 0.2221 0.8600 0.000 0.912 0.000 0.036 0.052
#> SRR1466512 2 0.3641 0.8348 0.000 0.820 0.000 0.060 0.120
#> SRR658212 2 0.1281 0.8600 0.000 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1430525 3 0.2074 0.7799 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1344422 4 0.3970 0.5999 0.000 0.236 0.000 0.744 0.020
#> SRR1353924 2 0.2773 0.8513 0.000 0.868 0.000 0.020 0.112
#> SRR1314832 1 0.3620 0.8572 0.824 0.000 0.000 0.068 0.108
#> SRR1487570 1 0.5084 0.5144 0.616 0.000 0.000 0.332 0.052
#> SRR627431 2 0.5928 0.4798 0.000 0.672 0.116 0.168 0.044
#> SRR1418561 3 0.6671 0.2412 0.000 0.000 0.420 0.340 0.240
#> SRR1448029 3 0.2424 0.7653 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR813802 1 0.0290 0.9543 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.8595 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.2563 0.8566 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR612395 5 0.4480 0.6918 0.000 0.196 0.048 0.008 0.748
#> SRR603116 5 0.4656 -0.0116 0.000 0.480 0.000 0.012 0.508
#> SRR1323152 3 0.0162 0.8046 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1368264 5 0.2818 0.6744 0.000 0.132 0.000 0.012 0.856
#> SRR1326624 1 0.3055 0.8919 0.864 0.000 0.000 0.064 0.072
#> SRR1429265 3 0.3883 0.7192 0.000 0.000 0.780 0.036 0.184
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.5004 0.7080 0.000 0.672 0.000 0.072 0.256
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.6626 0.3086 0.000 0.456 0.000 0.272 0.272
#> SRR815044 2 0.6124 0.3888 0.000 0.520 0.000 0.336 0.144
#> SRR1338560 2 0.2286 0.8546 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR615862 2 0.3641 0.8344 0.000 0.820 0.000 0.060 0.120
#> SRR1480038 2 0.3575 0.8383 0.000 0.824 0.000 0.056 0.120
#> SRR659436 5 0.3756 0.5681 0.000 0.000 0.248 0.008 0.744
#> SRR613699 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.3752 0.8310 0.000 0.812 0.000 0.064 0.124
#> SRR1330327 4 0.2152 0.7984 0.000 0.004 0.044 0.920 0.032
#> SRR1489950 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.2471 0.7625 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1444002 1 0.0693 0.9506 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1318444 4 0.5490 0.6131 0.000 0.000 0.228 0.644 0.128
#> SRR600656 4 0.2077 0.7966 0.000 0.000 0.040 0.920 0.040
#> SRR658766 3 0.5971 0.4826 0.000 0.000 0.584 0.172 0.244
#> SRR655946 3 0.3171 0.7170 0.000 0.008 0.816 0.176 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.2773 0.7516 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0162 0.9554 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444120 5 0.3009 0.7195 0.000 0.080 0.028 0.016 0.876
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.5435 0.3398 0.000 0.000 0.352 0.072 0.576
#> SRR662498 5 0.4876 0.6855 0.000 0.136 0.108 0.012 0.744
#> SRR1376764 3 0.2139 0.7932 0.000 0.012 0.920 0.056 0.012
#> SRR1377006 3 0.4928 0.5493 0.000 0.000 0.660 0.284 0.056
#> SRR656860 2 0.3828 0.8293 0.000 0.808 0.000 0.072 0.120
#> SRR1480547 2 0.3641 0.8344 0.000 0.820 0.000 0.060 0.120
#> SRR1452515 5 0.4546 0.0468 0.000 0.000 0.460 0.008 0.532
#> SRR1324390 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR615273 5 0.5137 0.0543 0.424 0.000 0.000 0.040 0.536
#> SRR601695 4 0.7701 0.3538 0.000 0.316 0.160 0.432 0.092
#> SRR820907 2 0.1952 0.8594 0.000 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR812773 5 0.1503 0.7023 0.020 0.000 0.008 0.020 0.952
#> SRR1405984 2 0.2439 0.8515 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1472794 2 0.0807 0.8587 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1365448 1 0.1750 0.9329 0.936 0.000 0.000 0.036 0.028
#> SRR1095720 3 0.2605 0.7582 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1435626 5 0.4060 0.3331 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1080766 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1377862 1 0.1012 0.9466 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1332299 3 0.1270 0.7982 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1467966 3 0.0703 0.8025 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1320579 3 0.2929 0.7184 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1319710 2 0.4687 0.6928 0.000 0.672 0.000 0.040 0.288
#> SRR1326604 2 0.3323 0.8439 0.000 0.844 0.000 0.056 0.100
#> SRR1098879 3 0.0579 0.8046 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR662245 2 0.0968 0.8526 0.000 0.972 0.012 0.004 0.012
#> SRR1074719 2 0.0794 0.8631 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR816226 4 0.3359 0.6984 0.052 0.000 0.000 0.840 0.108
#> SRR601387 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR614575 2 0.3437 0.8395 0.000 0.832 0.000 0.048 0.120
#> SRR1353900 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR662906 2 0.4572 0.5448 0.000 0.708 0.256 0.024 0.012
#> SRR1350832 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1403280 2 0.3507 0.8383 0.000 0.828 0.000 0.052 0.120
#> SRR1313969 4 0.2278 0.7952 0.000 0.000 0.060 0.908 0.032
#> SRR1388528 1 0.1918 0.9294 0.928 0.000 0.000 0.036 0.036
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.2221 0.6771 0.036 0.000 0.000 0.052 0.912
#> SRR655399 3 0.2439 0.7771 0.000 0.000 0.876 0.004 0.120
#> SRR1319753 2 0.5507 0.3242 0.000 0.480 0.000 0.064 0.456
#> SRR818901 3 0.2771 0.7635 0.000 0.000 0.860 0.012 0.128
#> SRR607067 4 0.4597 0.5741 0.000 0.044 0.000 0.696 0.260
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.3705 0.8327 0.000 0.816 0.000 0.064 0.120
#> SRR661961 5 0.3430 0.5928 0.000 0.000 0.220 0.004 0.776
#> SRR658259 2 0.3688 0.8363 0.000 0.816 0.000 0.060 0.124
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1365034 2 0.3946 0.8251 0.000 0.800 0.000 0.080 0.120
#> SRR1478053 2 0.0609 0.8624 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1475300 2 0.2563 0.8506 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1328101 5 0.3849 0.6698 0.000 0.232 0.000 0.016 0.752
#> SRR1322900 5 0.1815 0.6950 0.016 0.000 0.024 0.020 0.940
#> SRR1309942 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1345760 4 0.1992 0.7977 0.000 0.000 0.044 0.924 0.032
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4872 0.1451 0.000 0.436 0.000 0.540 0.024
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0955 0.8524 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR661469 5 0.2899 0.7319 0.000 0.076 0.036 0.008 0.880
#> SRR1500323 2 0.1202 0.8488 0.000 0.960 0.004 0.004 0.032
#> SRR1356705 5 0.5168 -0.1845 0.000 0.452 0.000 0.040 0.508
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.5091 0.4061 0.000 0.000 0.584 0.044 0.372
#> SRR1350435 1 0.3055 0.8919 0.864 0.000 0.000 0.064 0.072
#> SRR1389177 3 0.2505 0.7818 0.000 0.000 0.888 0.092 0.020
#> SRR1368072 2 0.0671 0.8567 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR601815 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR613330 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.7757 -0.1763 0.000 0.416 0.084 0.316 0.184
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.4375 0.3080 0.000 0.000 0.576 0.004 0.420
#> SRR1318839 3 0.0579 0.8046 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1432390 4 0.2263 0.7992 0.000 0.020 0.036 0.920 0.024
#> SRR613126 2 0.5277 0.6073 0.000 0.728 0.036 0.144 0.092
#> SRR1089424 2 0.2513 0.8523 0.000 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1347214 2 0.1341 0.8633 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1309556 5 0.1243 0.7088 0.000 0.008 0.004 0.028 0.960
#> SRR1456027 4 0.1704 0.7602 0.000 0.000 0.004 0.928 0.068
#> SRR1400551 5 0.4184 0.4776 0.000 0.000 0.284 0.016 0.700
#> SRR1320469 1 0.3390 0.8692 0.840 0.000 0.000 0.060 0.100
#> SRR614251 2 0.0671 0.8567 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1454310 2 0.0000 0.8595 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615105 4 0.3690 0.6725 0.000 0.000 0.224 0.764 0.012
#> SRR1433290 3 0.0162 0.8046 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2166064 4 0.2060 0.7920 0.000 0.036 0.012 0.928 0.024
#> SRR601671 2 0.3641 0.8344 0.000 0.820 0.000 0.060 0.120
#> SRR663874 2 0.2513 0.8088 0.000 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1409130 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659696 4 0.2563 0.7241 0.000 0.120 0.000 0.872 0.008
#> SRR1408249 2 0.3909 0.8295 0.004 0.808 0.000 0.064 0.124
#> SRR663284 2 0.4199 0.8107 0.000 0.772 0.000 0.068 0.160
#> SRR1402794 3 0.3003 0.7393 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR614852 4 0.2152 0.7984 0.000 0.004 0.044 0.920 0.032
#> SRR1348040 5 0.2946 0.6713 0.000 0.000 0.044 0.088 0.868
#> SRR1489610 2 0.4687 0.6928 0.000 0.672 0.000 0.040 0.288
#> SRR1488091 2 0.0671 0.8567 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1499566 2 0.4890 0.7152 0.000 0.680 0.000 0.064 0.256
#> SRR1361480 2 0.3705 0.8327 0.000 0.816 0.000 0.064 0.120
#> SRR1444501 3 0.1952 0.7881 0.000 0.000 0.912 0.084 0.004
#> SRR1415773 2 0.4547 0.5248 0.000 0.588 0.000 0.012 0.400
#> SRR1388832 5 0.4555 0.5310 0.000 0.000 0.200 0.068 0.732
#> SRR1394637 1 0.2726 0.9050 0.884 0.000 0.000 0.064 0.052
#> SRR606974 2 0.5960 0.4730 0.000 0.672 0.116 0.164 0.048
#> SRR662918 4 0.4348 0.5020 0.000 0.316 0.000 0.668 0.016
#> SRR817421 3 0.0579 0.8046 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3323 0.8445 0.000 0.844 0.000 0.056 0.100
#> SRR608264 3 0.0290 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1318560 1 0.3900 0.8500 0.816 0.000 0.008 0.068 0.108
#> SRR1454117 2 0.1768 0.8586 0.000 0.924 0.000 0.004 0.072
#> SRR1312684 1 0.2992 0.8947 0.868 0.000 0.000 0.064 0.068
#> SRR615044 5 0.1186 0.7121 0.000 0.008 0.008 0.020 0.964
#> SRR1432743 3 0.2561 0.7800 0.000 0.000 0.884 0.096 0.020
#> SRR1388873 2 0.0000 0.8595 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.4201 0.2463 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1406008 2 0.4366 0.6748 0.000 0.664 0.000 0.016 0.320
#> SRR1396786 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1446564 1 0.2450 0.9149 0.900 0.000 0.000 0.052 0.048
#> SRR1318465 3 0.2899 0.7748 0.000 0.008 0.872 0.100 0.020
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.5195 0.5561 0.000 0.168 0.000 0.688 0.144
#> SRR655170 2 0.1493 0.8532 0.000 0.948 0.000 0.028 0.024
#> SRR1087825 4 0.1978 0.7989 0.000 0.004 0.044 0.928 0.024
#> SRR662019 3 0.6219 0.5404 0.004 0.000 0.568 0.192 0.236
#> SRR1349209 4 0.4406 0.7071 0.000 0.000 0.128 0.764 0.108
#> SRR1326161 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1345284 2 0.2964 0.8467 0.000 0.856 0.000 0.024 0.120
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.3527 0.8379 0.000 0.828 0.000 0.056 0.116
#> SRR1454328 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4930 0.2889 0.548 0.000 0.000 0.028 0.424
#> SRR1408183 3 0.0609 0.8027 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1084369 3 0.2074 0.7799 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR598452 3 0.2230 0.7775 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR660709 4 0.4961 0.6911 0.000 0.004 0.132 0.724 0.140
#> SRR809444 1 0.0579 0.9519 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1089901 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1375774 1 0.1670 0.9325 0.936 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR1326292 4 0.3817 0.6988 0.032 0.000 0.020 0.820 0.128
#> SRR657139 1 0.2889 0.8954 0.872 0.000 0.000 0.044 0.084
#> SRR1440744 2 0.3705 0.8327 0.000 0.816 0.000 0.064 0.120
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.1106 0.9452 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR1452334 4 0.2201 0.7994 0.000 0.008 0.032 0.920 0.040
#> SRR1381775 1 0.1408 0.9380 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1363908 1 0.0290 0.9543 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1319626 2 0.3055 0.8501 0.000 0.840 0.000 0.016 0.144
#> SRR658989 5 0.3582 0.5790 0.000 0.000 0.224 0.008 0.768
#> SRR1353663 1 0.2654 0.9075 0.888 0.000 0.000 0.064 0.048
#> SRR811771 1 0.0162 0.9554 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0579 0.8046 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR819054 2 0.0963 0.8632 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1367988 4 0.2054 0.7945 0.000 0.000 0.028 0.920 0.052
#> SRR1331922 5 0.5334 0.0133 0.436 0.000 0.000 0.052 0.512
#> SRR615479 5 0.1554 0.7118 0.004 0.008 0.012 0.024 0.952
#> SRR1375796 2 0.0671 0.8567 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1386991 5 0.4649 0.6910 0.000 0.160 0.080 0.008 0.752
#> SRR1355217 5 0.2981 0.7175 0.000 0.084 0.024 0.016 0.876
#> SRR1356290 2 0.5629 0.5573 0.000 0.708 0.148 0.076 0.068
#> SRR659507 5 0.4446 0.6926 0.000 0.192 0.048 0.008 0.752
#> SRR663296 1 0.0798 0.9493 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR598044 2 0.2723 0.8514 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR661155 4 0.2095 0.7960 0.000 0.028 0.020 0.928 0.024
#> SRR1414727 5 0.3455 0.5900 0.000 0.000 0.208 0.008 0.784
#> SRR663477 1 0.3055 0.8919 0.864 0.000 0.000 0.064 0.072
#> SRR1354489 3 0.2130 0.7886 0.000 0.000 0.908 0.080 0.012
#> SRR1377800 5 0.4268 0.0975 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR614611 2 0.0566 0.8570 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR655052 4 0.3849 0.7602 0.000 0.020 0.124 0.820 0.036
#> SRR1478968 4 0.1502 0.7660 0.000 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1351280 2 0.3543 0.8380 0.000 0.828 0.000 0.060 0.112
#> SRR613951 4 0.2221 0.7960 0.000 0.000 0.036 0.912 0.052
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4637 0.6776 0.000 0.000 0.196 0.728 0.076
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.4375 0.3435 0.000 0.000 0.576 0.004 0.420
#> SRR655040 4 0.6802 0.0885 0.000 0.336 0.000 0.368 0.296
#> SRR810225 2 0.0955 0.8603 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1325377 2 0.0609 0.8601 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR617829 3 0.3048 0.7198 0.000 0.004 0.820 0.176 0.000
#> SRR1402328 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480455 2 0.2606 0.7979 0.000 0.900 0.032 0.056 0.012
#> SRR1442104 3 0.1331 0.7999 0.000 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.3326 0.7490 0.000 0.000 0.824 0.024 0.152
#> SRR1414314 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR663026 2 0.2563 0.8508 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1478386 2 0.3752 0.8310 0.000 0.812 0.000 0.064 0.124
#> SRR1458683 4 0.2516 0.7310 0.000 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.1560 0.7133 0.004 0.000 0.028 0.020 0.948
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.2067 0.7987 0.000 0.004 0.044 0.924 0.028
#> SRR660260 5 0.5773 0.1590 0.000 0.016 0.052 0.432 0.500
#> SRR1071231 2 0.0794 0.8630 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1459125 4 0.2616 0.7886 0.000 0.000 0.036 0.888 0.076
#> SRR1337173 3 0.5174 0.6838 0.000 0.048 0.744 0.124 0.084
#> SRR1396250 3 0.1410 0.7977 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2166376 3 0.4561 0.0903 0.000 0.000 0.504 0.008 0.488
#> SRR659816 4 0.8020 0.3124 0.000 0.160 0.156 0.436 0.248
#> SRR1401379 2 0.4687 0.6928 0.000 0.672 0.000 0.040 0.288
#> SRR600981 4 0.2244 0.7994 0.000 0.016 0.040 0.920 0.024
#> SRR1398335 1 0.0162 0.9554 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397218 2 0.5937 0.5702 0.000 0.564 0.000 0.136 0.300
#> SRR660115 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1359780 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6728 0.2568 0.000 0.416 0.000 0.276 0.308
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1319648 2 0.3734 0.8354 0.000 0.812 0.000 0.060 0.128
#> SRR1092985 1 0.2580 0.9099 0.892 0.000 0.000 0.064 0.044
#> SRR656409 2 0.3946 0.8251 0.000 0.800 0.000 0.080 0.120
#> SRR1468658 3 0.3305 0.6639 0.000 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1390437 4 0.3796 0.6743 0.000 0.008 0.008 0.768 0.216
#> SRR658057 2 0.3641 0.8344 0.000 0.820 0.000 0.060 0.120
#> SRR612635 2 0.3575 0.8365 0.000 0.824 0.000 0.056 0.120
#> SRR1351480 2 0.2522 0.8542 0.000 0.880 0.000 0.012 0.108
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0771 0.9492 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR659590 2 0.1124 0.8626 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR614263 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3267 0.8441 0.000 0.844 0.000 0.044 0.112
#> SRR659911 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085519 3 0.2179 0.7763 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1345894 3 0.2329 0.7701 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1442928 5 0.4480 0.6918 0.000 0.196 0.048 0.008 0.748
#> SRR1464681 4 0.2095 0.7960 0.000 0.028 0.020 0.928 0.024
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.4357 0.7143 0.000 0.000 0.768 0.128 0.104
#> SRR1365426 5 0.2561 0.7022 0.000 0.096 0.000 0.020 0.884
#> SRR1487947 1 0.3215 0.8795 0.852 0.000 0.000 0.056 0.092
#> SRR659708 1 0.3291 0.8707 0.840 0.000 0.000 0.040 0.120
#> SRR603236 2 0.7184 0.2455 0.000 0.564 0.168 0.160 0.108
#> SRR660673 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0794 0.8612 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR663807 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1087245 2 0.3543 0.8384 0.000 0.828 0.000 0.060 0.112
#> SRR1339108 2 0.4599 0.7163 0.000 0.688 0.000 0.040 0.272
#> SRR613426 4 0.2068 0.7613 0.000 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR613879 2 0.2233 0.8316 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR1385101 5 0.2630 0.6651 0.016 0.012 0.000 0.080 0.892
#> SRR1387966 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1458852 2 0.0727 0.8563 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1430489 1 0.3692 0.8364 0.812 0.000 0.000 0.136 0.052
#> SRR1349231 1 0.3662 0.6893 0.744 0.000 0.000 0.004 0.252
#> SRR1376249 3 0.3921 0.7239 0.000 0.000 0.784 0.044 0.172
#> SRR1321987 2 0.0566 0.8574 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR662653 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.2674 0.8510 0.000 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR1383081 2 0.2011 0.8590 0.000 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR2166960 2 0.2233 0.8568 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR605101 2 0.4184 0.7260 0.000 0.700 0.000 0.016 0.284
#> SRR818600 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367715 2 0.3705 0.8327 0.000 0.816 0.000 0.064 0.120
#> SRR1351979 3 0.0290 0.8042 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1387054 3 0.3132 0.7214 0.000 0.008 0.820 0.172 0.000
#> SRR1444306 3 0.3143 0.7188 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR612767 1 0.2291 0.9185 0.908 0.000 0.000 0.036 0.056
#> SRR1489030 2 0.0000 0.8595 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 5 0.3905 0.6719 0.000 0.232 0.004 0.012 0.752
#> SRR615225 4 0.2116 0.7986 0.000 0.008 0.028 0.924 0.040
#> SRR1401839 5 0.4128 0.6828 0.000 0.080 0.112 0.008 0.800
#> SRR1379110 2 0.3437 0.8393 0.000 0.832 0.000 0.048 0.120
#> SRR1077288 3 0.3883 0.7192 0.000 0.000 0.780 0.036 0.184
#> SRR1331639 4 0.2011 0.7882 0.000 0.044 0.008 0.928 0.020
#> SRR1342782 5 0.2720 0.7052 0.000 0.096 0.004 0.020 0.880
#> SRR1443003 3 0.2284 0.7821 0.000 0.004 0.896 0.004 0.096
#> SRR612839 1 0.1830 0.9310 0.932 0.000 0.000 0.040 0.028
#> SRR1470093 3 0.2813 0.7309 0.000 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.2929 0.7184 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR664063 5 0.2623 0.7075 0.000 0.096 0.004 0.016 0.884
#> SRR1488214 1 0.2291 0.9185 0.908 0.000 0.000 0.036 0.056
#> SRR654766 4 0.2171 0.7912 0.000 0.000 0.024 0.912 0.064
#> SRR1320321 2 0.2462 0.8539 0.000 0.880 0.000 0.008 0.112
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9563 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2625 0.8534 0.000 0.876 0.000 0.016 0.108
#> SRR1488470 2 0.3641 0.8344 0.000 0.820 0.000 0.060 0.120
#> SRR1389497 3 0.1043 0.8005 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1367109 3 0.2570 0.7841 0.000 0.000 0.888 0.084 0.028
#> SRR615311 1 0.1251 0.9412 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.0146 0.7253 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380716 2 0.3575 0.7079 0.000 0.708 0.000 0.008 0.284 0.000
#> SRR612803 1 0.0508 0.9133 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR613282 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0146 0.9157 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084417 1 0.3464 0.6929 0.688 0.000 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1074359 3 0.8036 0.0193 0.000 0.268 0.276 0.208 0.016 0.232
#> SRR1419258 3 0.2956 0.5948 0.000 0.000 0.840 0.040 0.000 0.120
#> SRR1403366 6 0.6116 0.4019 0.000 0.000 0.340 0.000 0.300 0.360
#> SRR665262 5 0.4733 0.3033 0.000 0.072 0.000 0.004 0.648 0.276
#> SRR1499740 5 0.3847 0.2706 0.000 0.000 0.008 0.000 0.644 0.348
#> SRR1105057 2 0.3584 0.7014 0.000 0.688 0.000 0.004 0.308 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.4388 0.2568 0.000 0.000 0.036 0.004 0.648 0.312
#> SRR612215 5 0.4663 0.3082 0.000 0.068 0.000 0.004 0.656 0.272
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.1219 0.9025 0.948 0.000 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR1393449 1 0.4325 0.4419 0.504 0.000 0.008 0.000 0.008 0.480
#> SRR1409263 3 0.4343 0.2912 0.000 0.000 0.592 0.000 0.028 0.380
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.4834 0.6561 0.000 0.596 0.000 0.060 0.340 0.004
#> SRR614839 5 0.5193 -0.4977 0.000 0.468 0.000 0.036 0.468 0.028
#> SRR658433 2 0.0603 0.7158 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1088581 4 0.5055 0.4428 0.000 0.000 0.160 0.652 0.004 0.184
#> SRR1328797 3 0.0000 0.6300 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.4443 0.6840 0.000 0.648 0.000 0.052 0.300 0.000
#> SRR1471117 1 0.2320 0.8642 0.864 0.000 0.000 0.004 0.000 0.132
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.2445 0.5820 0.000 0.000 0.872 0.000 0.020 0.108
#> SRR654802 3 0.0937 0.6217 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR660066 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 5 0.4572 0.2912 0.000 0.028 0.012 0.004 0.648 0.308
#> SRR1402153 3 0.5049 0.5162 0.000 0.016 0.676 0.080 0.008 0.220
#> SRR655887 2 0.3078 0.7275 0.000 0.796 0.000 0.012 0.192 0.000
#> SRR1408529 3 0.2595 0.5937 0.000 0.000 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR658707 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.5858 0.4773 0.000 0.632 0.060 0.008 0.100 0.200
#> SRR1074670 3 0.4065 0.4065 0.000 0.000 0.672 0.000 0.028 0.300
#> SRR1375439 5 0.4516 0.2900 0.000 0.024 0.012 0.004 0.648 0.312
#> SRR1329003 4 0.4391 0.5425 0.016 0.000 0.020 0.652 0.000 0.312
#> SRR1404837 5 0.4533 0.3003 0.000 0.088 0.000 0.004 0.700 0.208
#> SRR1317920 1 0.3134 0.8123 0.784 0.000 0.000 0.004 0.004 0.208
#> SRR1455525 4 0.4107 0.5771 0.000 0.000 0.044 0.700 0.000 0.256
#> SRR613999 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0405 0.9142 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.4774 0.2703 0.000 0.000 0.672 0.000 0.136 0.192
#> SRR1068855 1 0.3189 0.7960 0.760 0.000 0.000 0.004 0.000 0.236
#> SRR1375509 3 0.3617 0.4778 0.000 0.000 0.736 0.000 0.020 0.244
#> SRR612227 6 0.6252 0.3988 0.000 0.000 0.332 0.004 0.328 0.336
#> SRR1388809 2 0.1074 0.7236 0.000 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1413872 4 0.0260 0.7327 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1452864 1 0.3380 0.7860 0.748 0.000 0.000 0.004 0.004 0.244
#> SRR1473078 6 0.5319 0.2143 0.000 0.000 0.104 0.000 0.420 0.476
#> SRR615814 2 0.1049 0.7277 0.000 0.960 0.000 0.000 0.032 0.008
#> SRR1325225 4 0.6137 0.0551 0.364 0.000 0.000 0.392 0.004 0.240
#> SRR1313687 2 0.2743 0.7338 0.000 0.828 0.000 0.000 0.164 0.008
#> SRR1358220 2 0.3595 0.7066 0.000 0.704 0.000 0.008 0.288 0.000
#> SRR1096662 2 0.5456 0.5991 0.000 0.536 0.000 0.120 0.340 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.3708 0.3682 0.000 0.020 0.000 0.008 0.752 0.220
#> SRR660164 2 0.2647 0.7202 0.000 0.868 0.000 0.000 0.088 0.044
#> SRR815783 2 0.1644 0.7169 0.000 0.932 0.000 0.000 0.040 0.028
#> SRR809595 5 0.3606 0.3547 0.000 0.000 0.004 0.008 0.724 0.264
#> SRR1403133 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.6509 -0.2915 0.000 0.380 0.008 0.368 0.012 0.232
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.6017 0.3882 0.000 0.008 0.556 0.120 0.028 0.288
#> SRR1478362 4 0.4387 0.5448 0.000 0.004 0.068 0.732 0.008 0.188
#> SRR1392186 5 0.5143 -0.3112 0.000 0.372 0.000 0.040 0.560 0.028
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0508 0.9136 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1471594 1 0.2632 0.8451 0.832 0.000 0.000 0.004 0.000 0.164
#> SRR1354270 4 0.4260 0.3792 0.000 0.000 0.016 0.512 0.000 0.472
#> SRR612683 2 0.3023 0.7227 0.000 0.784 0.000 0.000 0.212 0.004
#> SRR1392901 3 0.5101 0.4898 0.000 0.000 0.648 0.128 0.008 0.216
#> SRR1077805 3 0.4774 0.5343 0.000 0.012 0.700 0.116 0.000 0.172
#> SRR1360402 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.3307 0.5439 0.000 0.000 0.820 0.000 0.072 0.108
#> SRR1355352 6 0.5358 0.3212 0.000 0.000 0.128 0.000 0.328 0.544
#> SRR656247 1 0.1958 0.8374 0.896 0.000 0.000 0.000 0.100 0.004
#> SRR813656 5 0.5473 -0.3684 0.000 0.392 0.000 0.052 0.520 0.036
#> SRR808244 4 0.4857 0.4125 0.000 0.000 0.060 0.532 0.000 0.408
#> SRR1387240 2 0.2214 0.6655 0.000 0.892 0.000 0.004 0.012 0.092
#> SRR1408595 1 0.2845 0.8387 0.820 0.000 0.000 0.004 0.004 0.172
#> SRR1385277 4 0.1168 0.7244 0.000 0.000 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1435248 2 0.0146 0.7236 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1419110 5 0.4642 0.2976 0.000 0.040 0.008 0.004 0.648 0.300
#> SRR1408682 5 0.5630 0.0693 0.000 0.268 0.000 0.004 0.552 0.176
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 5 0.4924 -0.4237 0.000 0.440 0.000 0.020 0.512 0.028
#> SRR1453911 5 0.4390 0.3223 0.000 0.044 0.000 0.004 0.668 0.284
#> SRR603164 3 0.6692 0.3503 0.000 0.148 0.540 0.088 0.008 0.216
#> SRR1383259 2 0.5847 0.5488 0.000 0.492 0.000 0.160 0.340 0.008
#> SRR1330854 1 0.3607 0.6541 0.652 0.000 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 5 0.4700 -0.4764 0.000 0.472 0.000 0.028 0.492 0.008
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.1812 0.6180 0.000 0.000 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR1361546 5 0.3668 0.3531 0.000 0.000 0.008 0.008 0.728 0.256
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.5447 0.3165 0.000 0.632 0.008 0.108 0.016 0.236
#> SRR615635 2 0.2003 0.7365 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1385411 2 0.4738 0.6587 0.000 0.600 0.000 0.064 0.336 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.3950 0.4364 0.000 0.000 0.696 0.000 0.028 0.276
#> SRR662126 5 0.6201 -0.2359 0.000 0.296 0.000 0.164 0.508 0.032
#> SRR1464601 2 0.2981 0.5921 0.000 0.820 0.000 0.000 0.020 0.160
#> SRR1071594 2 0.1418 0.7211 0.000 0.944 0.000 0.000 0.032 0.024
#> SRR612539 2 0.4278 0.6757 0.000 0.632 0.000 0.032 0.336 0.000
#> SRR602010 5 0.3678 0.3690 0.000 0.016 0.000 0.008 0.748 0.228
#> SRR810249 2 0.2882 0.7306 0.000 0.812 0.000 0.008 0.180 0.000
#> SRR818773 5 0.3691 0.3532 0.000 0.000 0.008 0.008 0.724 0.260
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3522 0.6756 0.000 0.784 0.000 0.000 0.172 0.044
#> SRR1442754 1 0.3756 0.5842 0.600 0.000 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1334247 3 0.5042 0.1592 0.000 0.000 0.592 0.000 0.308 0.100
#> SRR661639 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 5 0.5084 0.1649 0.000 0.184 0.000 0.064 0.692 0.060
#> SRR1459937 4 0.1065 0.7259 0.000 0.000 0.008 0.964 0.008 0.020
#> SRR2185018 1 0.0508 0.9136 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR655732 2 0.4210 0.6879 0.000 0.636 0.000 0.000 0.336 0.028
#> SRR809348 1 0.1700 0.8910 0.916 0.000 0.000 0.004 0.000 0.080
#> SRR819261 3 0.4065 0.4065 0.000 0.000 0.672 0.000 0.028 0.300
#> SRR661074 3 0.4640 0.2302 0.000 0.000 0.576 0.000 0.048 0.376
#> SRR1349851 1 0.2773 0.8410 0.828 0.000 0.000 0.004 0.004 0.164
#> SRR1405123 2 0.5964 0.2780 0.000 0.408 0.000 0.400 0.188 0.004
#> SRR661096 2 0.4420 0.6696 0.000 0.620 0.000 0.040 0.340 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4391 0.5425 0.016 0.000 0.020 0.652 0.000 0.312
#> SRR1307677 2 0.3794 0.7154 0.000 0.724 0.000 0.028 0.248 0.000
#> SRR1466512 2 0.4466 0.6714 0.000 0.620 0.000 0.044 0.336 0.000
#> SRR658212 2 0.1845 0.7324 0.000 0.920 0.000 0.028 0.052 0.000
#> SRR1430525 3 0.4299 0.5413 0.000 0.000 0.720 0.092 0.000 0.188
#> SRR1344422 4 0.5178 0.4585 0.000 0.232 0.000 0.660 0.048 0.060
#> SRR1353924 2 0.3468 0.7076 0.000 0.712 0.000 0.004 0.284 0.000
#> SRR1314832 1 0.4136 0.5428 0.560 0.000 0.012 0.000 0.000 0.428
#> SRR1487570 1 0.5835 0.2436 0.484 0.000 0.000 0.336 0.004 0.176
#> SRR627431 2 0.6738 0.0905 0.000 0.528 0.056 0.184 0.016 0.216
#> SRR1418561 6 0.5483 0.0840 0.000 0.000 0.304 0.124 0.008 0.564
#> SRR1448029 3 0.2039 0.5969 0.000 0.000 0.904 0.000 0.020 0.076
#> SRR813802 1 0.1531 0.8954 0.928 0.000 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR815020 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0405 0.7250 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1435311 2 0.4118 0.6972 0.000 0.660 0.000 0.000 0.312 0.028
#> SRR612395 5 0.4787 0.3012 0.000 0.064 0.004 0.004 0.648 0.280
#> SRR603116 5 0.4785 0.3085 0.000 0.120 0.000 0.000 0.664 0.216
#> SRR1323152 3 0.0363 0.6305 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1368264 5 0.3504 0.3595 0.000 0.024 0.000 0.004 0.776 0.196
#> SRR1326624 1 0.3429 0.7796 0.740 0.000 0.000 0.004 0.004 0.252
#> SRR1429265 3 0.3819 0.4397 0.000 0.000 0.700 0.000 0.020 0.280
#> SRR1327702 1 0.0260 0.9151 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR615611 2 0.4857 0.5792 0.000 0.532 0.000 0.060 0.408 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 5 0.6232 -0.4065 0.000 0.392 0.000 0.192 0.400 0.016
#> SRR815044 2 0.6372 0.3928 0.000 0.376 0.000 0.272 0.340 0.012
#> SRR1338560 2 0.3351 0.7077 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR615862 2 0.4466 0.6709 0.000 0.620 0.000 0.044 0.336 0.000
#> SRR1480038 2 0.4464 0.6766 0.000 0.624 0.000 0.028 0.340 0.008
#> SRR659436 5 0.4667 0.2241 0.000 0.000 0.056 0.004 0.632 0.308
#> SRR613699 2 0.0972 0.7140 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4712 0.6551 0.000 0.596 0.000 0.060 0.344 0.000
#> SRR1330327 4 0.1493 0.7127 0.000 0.000 0.004 0.936 0.004 0.056
#> SRR1489950 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.2039 0.5969 0.000 0.000 0.904 0.000 0.020 0.076
#> SRR1444002 1 0.1814 0.8824 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1318444 4 0.6256 0.2356 0.000 0.000 0.140 0.456 0.036 0.368
#> SRR600656 4 0.0748 0.7298 0.000 0.000 0.004 0.976 0.004 0.016
#> SRR658766 6 0.6798 -0.0969 0.000 0.000 0.388 0.140 0.084 0.388
#> SRR655946 3 0.5178 0.4852 0.000 0.004 0.644 0.136 0.004 0.212
#> SRR817282 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.3794 0.4641 0.000 0.000 0.724 0.000 0.028 0.248
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0547 0.9124 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1444120 5 0.3519 0.3611 0.000 0.000 0.008 0.008 0.752 0.232
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 6 0.6482 0.3148 0.000 0.000 0.184 0.040 0.316 0.460
#> SRR662498 5 0.4945 0.2875 0.000 0.052 0.016 0.004 0.640 0.288
#> SRR1376764 3 0.4508 0.5412 0.000 0.012 0.716 0.048 0.008 0.216
#> SRR1377006 6 0.6099 -0.2477 0.000 0.000 0.372 0.200 0.008 0.420
#> SRR656860 2 0.4738 0.6587 0.000 0.600 0.000 0.064 0.336 0.000
#> SRR1480547 2 0.4648 0.6613 0.000 0.604 0.000 0.056 0.340 0.000
#> SRR1452515 6 0.6133 0.3461 0.000 0.000 0.252 0.004 0.324 0.420
#> SRR1324390 2 0.0622 0.7201 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR615273 5 0.6247 -0.1101 0.320 0.000 0.000 0.004 0.352 0.324
#> SRR601695 2 0.8087 -0.3214 0.000 0.324 0.148 0.260 0.032 0.236
#> SRR820907 2 0.3512 0.7116 0.000 0.720 0.000 0.000 0.272 0.008
#> SRR812773 5 0.3508 0.3419 0.000 0.000 0.000 0.004 0.704 0.292
#> SRR1405984 2 0.3528 0.7048 0.000 0.700 0.000 0.004 0.296 0.000
#> SRR1472794 2 0.1863 0.7120 0.000 0.920 0.000 0.000 0.036 0.044
#> SRR1365448 1 0.2320 0.8641 0.864 0.000 0.000 0.004 0.000 0.132
#> SRR1095720 3 0.2361 0.5902 0.000 0.000 0.884 0.000 0.028 0.088
#> SRR1435626 5 0.5277 -0.0449 0.000 0.000 0.108 0.000 0.528 0.364
#> SRR1080766 2 0.0458 0.7177 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1377862 1 0.1644 0.8924 0.920 0.000 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1332299 3 0.0820 0.6235 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1467966 3 0.0603 0.6277 0.000 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1320579 3 0.5076 0.4836 0.000 0.000 0.644 0.140 0.004 0.212
#> SRR1319710 5 0.5068 -0.4520 0.000 0.452 0.000 0.028 0.492 0.028
#> SRR1326604 2 0.3916 0.6990 0.000 0.680 0.000 0.020 0.300 0.000
#> SRR1098879 3 0.0146 0.6301 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR662245 2 0.3253 0.5574 0.000 0.788 0.000 0.000 0.020 0.192
#> SRR1074719 2 0.1910 0.7362 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR816226 4 0.4305 0.5717 0.056 0.000 0.000 0.704 0.004 0.236
#> SRR601387 2 0.0520 0.7213 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR614575 2 0.4210 0.6810 0.000 0.636 0.000 0.028 0.336 0.000
#> SRR1353900 2 0.0891 0.7244 0.000 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR662906 2 0.5557 0.2965 0.000 0.648 0.164 0.024 0.008 0.156
#> SRR1350832 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.4210 0.6806 0.000 0.636 0.000 0.028 0.336 0.000
#> SRR1313969 4 0.2036 0.6990 0.000 0.000 0.016 0.912 0.008 0.064
#> SRR1388528 1 0.2320 0.8641 0.864 0.000 0.000 0.004 0.000 0.132
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.3536 0.3504 0.008 0.000 0.000 0.004 0.736 0.252
#> SRR655399 3 0.3230 0.5132 0.000 0.000 0.776 0.000 0.012 0.212
#> SRR1319753 5 0.4195 0.1624 0.000 0.200 0.000 0.040 0.740 0.020
#> SRR818901 3 0.2309 0.5889 0.000 0.000 0.888 0.000 0.028 0.084
#> SRR607067 4 0.4010 0.3587 0.000 0.008 0.000 0.584 0.408 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4705 0.6714 0.000 0.612 0.000 0.044 0.336 0.008
#> SRR661961 5 0.4468 0.2434 0.000 0.000 0.040 0.004 0.640 0.316
#> SRR658259 2 0.5057 0.6671 0.000 0.592 0.000 0.040 0.340 0.028
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.4799 0.6527 0.000 0.592 0.000 0.068 0.340 0.000
#> SRR1478053 2 0.2146 0.7357 0.000 0.880 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1475300 2 0.3636 0.6968 0.000 0.676 0.000 0.004 0.320 0.000
#> SRR1328101 5 0.4799 0.3001 0.000 0.088 0.000 0.004 0.656 0.252
#> SRR1322900 5 0.3782 0.2677 0.000 0.000 0.004 0.000 0.636 0.360
#> SRR1309942 2 0.0146 0.7249 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345760 4 0.0922 0.7300 0.000 0.000 0.004 0.968 0.004 0.024
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.5869 -0.2340 0.000 0.388 0.000 0.416 0.196 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.3134 0.5820 0.000 0.808 0.000 0.000 0.024 0.168
#> SRR661469 5 0.4070 0.3093 0.000 0.008 0.008 0.004 0.672 0.308
#> SRR1500323 2 0.3998 0.4924 0.000 0.736 0.000 0.016 0.024 0.224
#> SRR1356705 5 0.3614 0.2605 0.000 0.164 0.000 0.016 0.792 0.028
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4948 -0.0280 0.000 0.000 0.472 0.000 0.064 0.464
#> SRR1350435 1 0.3429 0.7796 0.740 0.000 0.000 0.004 0.004 0.252
#> SRR1389177 3 0.4743 0.5168 0.000 0.000 0.680 0.088 0.008 0.224
#> SRR1368072 2 0.0972 0.7140 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR601815 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 6 0.8243 0.1195 0.000 0.236 0.052 0.212 0.152 0.348
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.6054 -0.3330 0.000 0.000 0.412 0.000 0.284 0.304
#> SRR1318839 3 0.0260 0.6294 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432390 4 0.0748 0.7298 0.000 0.000 0.004 0.976 0.004 0.016
#> SRR613126 2 0.6519 0.1111 0.000 0.520 0.000 0.172 0.068 0.240
#> SRR1089424 2 0.3653 0.7033 0.000 0.692 0.000 0.008 0.300 0.000
#> SRR1347214 2 0.3265 0.7199 0.000 0.748 0.000 0.004 0.248 0.000
#> SRR1309556 5 0.3738 0.3184 0.000 0.000 0.004 0.004 0.680 0.312
#> SRR1456027 4 0.2442 0.6750 0.000 0.000 0.000 0.852 0.004 0.144
#> SRR1400551 6 0.5400 0.2450 0.000 0.000 0.116 0.000 0.400 0.484
#> SRR1320469 1 0.3634 0.6492 0.644 0.000 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR614251 2 0.2697 0.6738 0.000 0.864 0.000 0.000 0.044 0.092
#> SRR1454310 2 0.0508 0.7262 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR615105 4 0.4882 0.4647 0.000 0.000 0.124 0.668 0.004 0.204
#> SRR1433290 3 0.0000 0.6300 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.0260 0.7327 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR601671 2 0.4406 0.6732 0.000 0.624 0.000 0.040 0.336 0.000
#> SRR663874 2 0.3368 0.6358 0.000 0.756 0.000 0.000 0.232 0.012
#> SRR1409130 2 0.0458 0.7177 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR659696 4 0.1480 0.7005 0.000 0.040 0.000 0.940 0.020 0.000
#> SRR1408249 2 0.5094 0.6431 0.004 0.580 0.000 0.060 0.348 0.008
#> SRR663284 2 0.5204 0.6215 0.000 0.548 0.000 0.060 0.376 0.016
#> SRR1402794 3 0.3898 0.4221 0.000 0.000 0.684 0.000 0.020 0.296
#> SRR614852 4 0.0748 0.7298 0.000 0.000 0.004 0.976 0.004 0.016
#> SRR1348040 5 0.4698 0.0977 0.000 0.000 0.000 0.044 0.504 0.452
#> SRR1489610 5 0.4937 -0.4612 0.000 0.460 0.000 0.020 0.492 0.028
#> SRR1488091 2 0.1500 0.6984 0.000 0.936 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR1499566 2 0.4717 0.5140 0.000 0.504 0.000 0.036 0.456 0.004
#> SRR1361480 2 0.4635 0.6641 0.000 0.608 0.000 0.056 0.336 0.000
#> SRR1444501 3 0.3978 0.5552 0.000 0.000 0.744 0.064 0.000 0.192
#> SRR1415773 5 0.5426 -0.0594 0.000 0.356 0.000 0.000 0.516 0.128
#> SRR1388832 6 0.4186 0.3413 0.000 0.000 0.080 0.000 0.192 0.728
#> SRR1394637 1 0.3136 0.8024 0.768 0.000 0.000 0.004 0.000 0.228
#> SRR606974 2 0.7023 0.0133 0.000 0.496 0.060 0.184 0.024 0.236
#> SRR662918 4 0.5390 0.1270 0.000 0.328 0.000 0.540 0.132 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.6300 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.4265 0.6918 0.000 0.660 0.000 0.040 0.300 0.000
#> SRR608264 3 0.0260 0.6300 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1318560 1 0.4285 0.5273 0.552 0.000 0.008 0.000 0.008 0.432
#> SRR1454117 2 0.3283 0.7004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.160 0.036
#> SRR1312684 1 0.3429 0.7796 0.740 0.000 0.000 0.004 0.004 0.252
#> SRR615044 5 0.3805 0.3047 0.000 0.000 0.004 0.004 0.664 0.328
#> SRR1432743 3 0.4886 0.5121 0.000 0.000 0.668 0.088 0.012 0.232
#> SRR1388873 2 0.0146 0.7249 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.5522 -0.0483 0.000 0.000 0.160 0.000 0.536 0.304
#> SRR1406008 5 0.4214 -0.4288 0.000 0.460 0.000 0.004 0.528 0.008
#> SRR1396786 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.3011 0.8232 0.800 0.000 0.000 0.004 0.004 0.192
#> SRR1318465 3 0.4880 0.5054 0.000 0.000 0.664 0.096 0.008 0.232
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4960 0.3690 0.000 0.092 0.000 0.600 0.308 0.000
#> SRR655170 2 0.3020 0.7180 0.000 0.864 0.000 0.040 0.064 0.032
#> SRR1087825 4 0.0291 0.7324 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR662019 6 0.6579 -0.1211 0.008 0.000 0.404 0.144 0.040 0.404
#> SRR1349209 4 0.5279 0.4989 0.000 0.000 0.096 0.544 0.004 0.356
#> SRR1326161 2 0.0146 0.7249 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345284 2 0.3766 0.6993 0.000 0.684 0.000 0.012 0.304 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4009 0.6992 0.000 0.684 0.000 0.028 0.288 0.000
#> SRR1454328 2 0.0520 0.7213 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5651 0.2239 0.484 0.000 0.000 0.004 0.376 0.136
#> SRR1408183 3 0.0405 0.6291 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1084369 3 0.4437 0.5389 0.000 0.000 0.716 0.092 0.004 0.188
#> SRR598452 3 0.3046 0.5339 0.000 0.000 0.800 0.000 0.012 0.188
#> SRR660709 4 0.6053 0.2297 0.000 0.000 0.080 0.520 0.064 0.336
#> SRR809444 1 0.1588 0.8938 0.924 0.000 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR1089901 2 0.0972 0.7140 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1375774 1 0.1471 0.8961 0.932 0.000 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1326292 4 0.4391 0.5425 0.016 0.000 0.020 0.652 0.000 0.312
#> SRR657139 1 0.2920 0.8375 0.820 0.000 0.000 0.004 0.008 0.168
#> SRR1440744 2 0.4392 0.6741 0.000 0.628 0.000 0.040 0.332 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.2100 0.8748 0.884 0.000 0.000 0.004 0.000 0.112
#> SRR1452334 4 0.1843 0.7223 0.000 0.016 0.004 0.932 0.016 0.032
#> SRR1381775 1 0.1555 0.8982 0.932 0.000 0.000 0.004 0.004 0.060
#> SRR1363908 1 0.1349 0.8994 0.940 0.000 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1319626 2 0.4264 0.6778 0.000 0.620 0.000 0.000 0.352 0.028
#> SRR658989 5 0.4538 0.2132 0.000 0.000 0.052 0.000 0.624 0.324
#> SRR1353663 1 0.3163 0.7992 0.764 0.000 0.000 0.004 0.000 0.232
#> SRR811771 1 0.0508 0.9133 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR813983 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0260 0.6294 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR819054 2 0.2260 0.7355 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1367988 4 0.0951 0.7276 0.000 0.000 0.004 0.968 0.020 0.008
#> SRR1331922 1 0.6170 0.0887 0.404 0.000 0.000 0.004 0.328 0.264
#> SRR615479 5 0.3628 0.3528 0.000 0.000 0.004 0.008 0.720 0.268
#> SRR1375796 2 0.2066 0.7063 0.000 0.908 0.000 0.000 0.040 0.052
#> SRR1386991 5 0.4686 0.2984 0.000 0.044 0.008 0.004 0.648 0.296
#> SRR1355217 5 0.3602 0.3615 0.000 0.004 0.004 0.008 0.744 0.240
#> SRR1356290 2 0.7203 0.0711 0.000 0.512 0.096 0.096 0.052 0.244
#> SRR659507 5 0.4839 0.2990 0.000 0.060 0.008 0.004 0.648 0.280
#> SRR663296 1 0.1411 0.8983 0.936 0.000 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR598044 2 0.3819 0.6927 0.000 0.652 0.000 0.000 0.340 0.008
#> SRR661155 4 0.0260 0.7327 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1414727 5 0.4468 0.1075 0.000 0.000 0.032 0.000 0.560 0.408
#> SRR663477 1 0.3429 0.7796 0.740 0.000 0.000 0.004 0.004 0.252
#> SRR1354489 3 0.4368 0.5406 0.000 0.000 0.716 0.064 0.008 0.212
#> SRR1377800 6 0.5798 0.3825 0.000 0.000 0.312 0.000 0.204 0.484
#> SRR614611 2 0.0862 0.7192 0.000 0.972 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR655052 4 0.4417 0.5394 0.000 0.004 0.068 0.728 0.008 0.192
#> SRR1478968 4 0.2320 0.6802 0.000 0.000 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1351280 2 0.4859 0.6625 0.000 0.600 0.000 0.064 0.332 0.004
#> SRR613951 4 0.0405 0.7323 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4999 0.5049 0.000 0.000 0.168 0.660 0.004 0.168
#> SRR1408161 1 0.0260 0.9151 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR657054 3 0.5205 -0.0201 0.000 0.000 0.496 0.000 0.092 0.412
#> SRR655040 5 0.6907 -0.2678 0.000 0.308 0.000 0.220 0.408 0.064
#> SRR810225 2 0.2462 0.7312 0.000 0.876 0.000 0.000 0.096 0.028
#> SRR1325377 2 0.0260 0.7231 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR617829 3 0.5237 0.4775 0.000 0.004 0.636 0.140 0.004 0.216
#> SRR1402328 2 0.0458 0.7177 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480455 2 0.4928 0.3743 0.000 0.676 0.004 0.084 0.012 0.224
#> SRR1442104 3 0.1856 0.6185 0.000 0.000 0.920 0.032 0.000 0.048
#> SRR1453416 1 0.0632 0.9106 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1481396 3 0.3711 0.4596 0.000 0.000 0.720 0.000 0.020 0.260
#> SRR1414314 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.3547 0.6940 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1478386 2 0.4660 0.6580 0.000 0.600 0.000 0.056 0.344 0.000
#> SRR1458683 4 0.1528 0.7054 0.000 0.000 0.048 0.936 0.000 0.016
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.3915 0.3257 0.000 0.000 0.008 0.008 0.680 0.304
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0748 0.7298 0.000 0.000 0.004 0.976 0.004 0.016
#> SRR660260 4 0.6485 -0.2480 0.000 0.000 0.020 0.388 0.332 0.260
#> SRR1071231 2 0.2048 0.7356 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1459125 4 0.3553 0.5937 0.000 0.000 0.004 0.804 0.064 0.128
#> SRR1337173 3 0.7786 0.1296 0.000 0.196 0.380 0.108 0.032 0.284
#> SRR1396250 3 0.2730 0.5610 0.000 0.000 0.836 0.000 0.012 0.152
#> SRR2166376 3 0.6121 -0.3324 0.000 0.000 0.420 0.004 0.244 0.332
#> SRR659816 6 0.8303 0.1154 0.000 0.136 0.096 0.280 0.132 0.356
#> SRR1401379 5 0.5068 -0.4520 0.000 0.452 0.000 0.028 0.492 0.028
#> SRR600981 4 0.0260 0.7327 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1398335 1 0.0405 0.9142 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1397218 5 0.5951 -0.4744 0.000 0.432 0.000 0.072 0.444 0.052
#> SRR660115 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.1075 0.6988 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 5 0.6388 -0.2407 0.000 0.300 0.000 0.184 0.480 0.036
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1265 0.7057 0.000 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1319648 2 0.4931 0.6713 0.000 0.600 0.000 0.032 0.340 0.028
#> SRR1092985 1 0.3052 0.8119 0.780 0.000 0.000 0.004 0.000 0.216
#> SRR656409 2 0.4987 0.6501 0.000 0.588 0.000 0.064 0.340 0.008
#> SRR1468658 3 0.5524 0.4420 0.000 0.000 0.592 0.144 0.012 0.252
#> SRR1390437 4 0.3468 0.5278 0.000 0.000 0.000 0.728 0.264 0.008
#> SRR658057 2 0.4567 0.6699 0.000 0.616 0.000 0.052 0.332 0.000
#> SRR612635 2 0.4580 0.6670 0.000 0.612 0.000 0.052 0.336 0.000
#> SRR1351480 2 0.4062 0.6982 0.000 0.660 0.000 0.000 0.316 0.024
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0777 0.9105 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR659590 2 0.1556 0.7353 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3653 0.7033 0.000 0.692 0.000 0.008 0.300 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.7240 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.1625 0.6080 0.000 0.000 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR1345894 3 0.2263 0.6111 0.000 0.000 0.884 0.000 0.016 0.100
#> SRR1442928 5 0.4787 0.3012 0.000 0.064 0.004 0.004 0.648 0.280
#> SRR1464681 4 0.0260 0.7327 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1418880 1 0.0260 0.9150 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309070 3 0.6188 0.1863 0.000 0.000 0.456 0.120 0.040 0.384
#> SRR1365426 5 0.3651 0.3693 0.000 0.016 0.000 0.008 0.752 0.224
#> SRR1487947 1 0.3499 0.6927 0.680 0.000 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR659708 1 0.3494 0.8174 0.792 0.000 0.000 0.004 0.036 0.168
#> SRR603236 2 0.8212 -0.3295 0.000 0.336 0.224 0.156 0.044 0.240
#> SRR660673 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1387 0.7344 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR663807 2 0.0146 0.7251 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087245 2 0.4393 0.6836 0.000 0.640 0.000 0.044 0.316 0.000
#> SRR1339108 2 0.5184 0.4967 0.000 0.472 0.000 0.024 0.464 0.040
#> SRR613426 4 0.3098 0.6593 0.000 0.000 0.000 0.812 0.024 0.164
#> SRR613879 2 0.3487 0.6760 0.000 0.788 0.000 0.000 0.168 0.044
#> SRR1385101 5 0.3854 0.3188 0.004 0.000 0.000 0.048 0.760 0.188
#> SRR1387966 2 0.0993 0.7177 0.000 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR1458852 2 0.3708 0.5107 0.000 0.752 0.000 0.008 0.020 0.220
#> SRR1430489 1 0.4742 0.6957 0.688 0.000 0.000 0.124 0.004 0.184
#> SRR1349231 1 0.4020 0.5749 0.692 0.000 0.000 0.000 0.276 0.032
#> SRR1376249 3 0.3799 0.4429 0.000 0.000 0.704 0.000 0.020 0.276
#> SRR1321987 2 0.1367 0.7031 0.000 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR662653 2 0.0260 0.7265 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3804 0.6933 0.000 0.656 0.000 0.000 0.336 0.008
#> SRR1383081 2 0.3351 0.7071 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR2166960 2 0.3684 0.6941 0.000 0.664 0.000 0.000 0.332 0.004
#> SRR605101 5 0.4407 -0.4764 0.000 0.480 0.000 0.000 0.496 0.024
#> SRR818600 2 0.2706 0.7357 0.000 0.832 0.000 0.000 0.160 0.008
#> SRR1367715 2 0.4715 0.6672 0.000 0.608 0.000 0.052 0.336 0.004
#> SRR1351979 3 0.0260 0.6300 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1387054 3 0.5007 0.5042 0.000 0.004 0.664 0.120 0.004 0.208
#> SRR1444306 3 0.3892 0.4330 0.000 0.000 0.752 0.000 0.188 0.060
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0547 0.7197 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR612767 1 0.2879 0.8327 0.816 0.000 0.000 0.004 0.004 0.176
#> SRR1489030 2 0.1204 0.7336 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1430375 5 0.5007 0.2743 0.000 0.112 0.000 0.004 0.640 0.244
#> SRR615225 4 0.0260 0.7327 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1401839 5 0.4516 0.2889 0.000 0.024 0.012 0.004 0.648 0.312
#> SRR1379110 2 0.4181 0.6822 0.000 0.644 0.000 0.028 0.328 0.000
#> SRR1077288 3 0.3993 0.4125 0.000 0.000 0.676 0.000 0.024 0.300
#> SRR1331639 4 0.0260 0.7327 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1342782 5 0.3543 0.3694 0.000 0.016 0.000 0.004 0.756 0.224
#> SRR1443003 3 0.4556 0.5179 0.000 0.004 0.696 0.004 0.068 0.228
#> SRR612839 1 0.2362 0.8619 0.860 0.000 0.000 0.004 0.000 0.136
#> SRR1470093 3 0.3953 0.5569 0.000 0.000 0.764 0.132 0.000 0.104
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.5229 0.4733 0.000 0.000 0.632 0.140 0.008 0.220
#> SRR664063 5 0.3678 0.3690 0.000 0.016 0.000 0.008 0.748 0.228
#> SRR1488214 1 0.2946 0.8284 0.808 0.000 0.000 0.004 0.004 0.184
#> SRR654766 4 0.0405 0.7324 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1320321 2 0.3758 0.6985 0.000 0.668 0.000 0.000 0.324 0.008
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9165 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4045 0.6962 0.000 0.664 0.000 0.024 0.312 0.000
#> SRR1488470 2 0.4580 0.6662 0.000 0.612 0.000 0.052 0.336 0.000
#> SRR1389497 3 0.1398 0.6138 0.000 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1367109 3 0.4998 0.4978 0.000 0.000 0.648 0.088 0.012 0.252
#> SRR615311 1 0.1152 0.9034 0.952 0.000 0.000 0.004 0.000 0.044
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.885 0.912 0.965 0.4811 0.521 0.521
#> 3 3 0.924 0.912 0.964 0.3769 0.723 0.512
#> 4 4 0.858 0.862 0.937 0.0987 0.899 0.717
#> 5 5 0.822 0.759 0.857 0.0577 0.935 0.775
#> 6 6 0.837 0.764 0.847 0.0486 0.923 0.698
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.8499 0.60865 0.276 0.724
#> SRR665262 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1499740 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.7602 0.70602 0.220 0.780
#> SRR612215 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.7528 0.71240 0.216 0.784
#> SRR654802 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.4298 0.88125 0.088 0.912
#> SRR1402153 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1074670 1 0.2236 0.92629 0.964 0.036
#> SRR1375439 1 0.9933 0.19556 0.548 0.452
#> SRR1329003 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 0.9580 0.39935 0.620 0.380
#> SRR612227 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1473078 1 0.7745 0.69405 0.772 0.228
#> SRR615814 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.4161 0.88540 0.084 0.916
#> SRR1487746 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR809595 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.9881 0.22695 0.436 0.564
#> SRR1347937 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.8016 0.66637 0.244 0.756
#> SRR1355352 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR813656 1 0.9795 0.28277 0.584 0.416
#> SRR808244 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.9710 0.33213 0.400 0.600
#> SRR1330854 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.9608 0.37416 0.384 0.616
#> SRR1468162 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1361546 1 0.9710 0.34957 0.600 0.400
#> SRR1486156 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1102830 1 0.9710 0.34957 0.600 0.400
#> SRR662126 2 0.5737 0.82541 0.136 0.864
#> SRR1464601 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.5842 0.82064 0.140 0.860
#> SRR602010 2 0.9944 0.13754 0.456 0.544
#> SRR810249 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR818773 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0376 0.96250 0.004 0.996
#> SRR661639 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR613222 1 0.1184 0.94418 0.984 0.016
#> SRR1459937 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR819261 1 0.8813 0.57085 0.700 0.300
#> SRR661074 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.9963 0.13441 0.464 0.536
#> SRR1320225 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.3431 0.90073 0.936 0.064
#> SRR1326624 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR615611 1 0.3584 0.89531 0.932 0.068
#> SRR1486799 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.8327 0.62858 0.736 0.264
#> SRR815044 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.9710 0.33213 0.400 0.600
#> SRR1330327 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.7815 0.68901 0.232 0.768
#> SRR600656 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1475104 1 0.9710 0.34957 0.600 0.400
#> SRR1406418 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.7219 0.73705 0.200 0.800
#> SRR1471965 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.2603 0.92599 0.044 0.956
#> SRR656860 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.5059 0.85401 0.112 0.888
#> SRR1435626 1 0.9710 0.34957 0.600 0.400
#> SRR1080766 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.4431 0.87687 0.092 0.908
#> SRR1320579 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.5946 0.81538 0.144 0.856
#> SRR1326604 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR655399 1 0.9710 0.34957 0.600 0.400
#> SRR1319753 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR818901 2 0.8813 0.56103 0.300 0.700
#> SRR607067 2 0.1633 0.94478 0.024 0.976
#> SRR1391420 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR661961 1 0.9710 0.34957 0.600 0.400
#> SRR658259 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.7745 0.69535 0.228 0.772
#> SRR1435418 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.7883 0.68018 0.236 0.764
#> SRR1500323 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1356705 1 0.9909 0.19538 0.556 0.444
#> SRR1464915 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1309556 1 0.2948 0.91156 0.948 0.052
#> SRR1456027 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1400551 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1408249 1 0.7745 0.68840 0.772 0.228
#> SRR663284 1 1.0000 0.00859 0.504 0.496
#> SRR1402794 2 0.8499 0.60869 0.276 0.724
#> SRR614852 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1348040 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1489610 2 0.0376 0.96250 0.004 0.996
#> SRR1488091 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1499566 1 0.4022 0.88188 0.920 0.080
#> SRR1361480 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR615044 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1432743 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.9710 0.33213 0.400 0.600
#> SRR655170 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR662019 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1349209 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.9710 0.31653 0.400 0.600
#> SRR660709 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.9358 0.44522 0.352 0.648
#> SRR1353663 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1414727 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1377800 1 0.9710 0.34957 0.600 0.400
#> SRR614611 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR657054 1 0.5519 0.82936 0.872 0.128
#> SRR655040 2 0.9983 0.09171 0.476 0.524
#> SRR810225 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.5294 0.83851 0.880 0.120
#> SRR1414314 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.9710 0.33213 0.400 0.600
#> SRR1458683 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.1843 0.94109 0.028 0.972
#> SRR1071231 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.4690 0.86799 0.100 0.900
#> SRR2166376 2 0.4690 0.86787 0.100 0.900
#> SRR659816 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.5946 0.81538 0.144 0.856
#> SRR600981 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.7745 0.69532 0.228 0.772
#> SRR660115 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.9775 0.29435 0.588 0.412
#> SRR1397156 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.9710 0.33213 0.400 0.600
#> SRR1468658 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.7219 0.73845 0.200 0.800
#> SRR658057 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1342782 1 0.9754 0.32812 0.592 0.408
#> SRR1443003 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.96591 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.95791 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.2448 0.8928 0.000 0.924 0.076
#> SRR1499740 3 0.6154 0.3177 0.408 0.000 0.592
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.5678 0.5075 0.000 0.684 0.316
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.6079 0.3704 0.388 0.000 0.612
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.5678 0.5446 0.000 0.316 0.684
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.1753 0.9211 0.000 0.952 0.048
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0424 0.9783 0.992 0.008 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.6154 0.2676 0.000 0.592 0.408
#> SRR1392186 2 0.1529 0.9286 0.040 0.960 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0892 0.9135 0.000 0.020 0.980
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.5760 0.5092 0.328 0.000 0.672
#> SRR656247 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.4887 0.6954 0.228 0.772 0.000
#> SRR808244 1 0.3038 0.8693 0.896 0.000 0.104
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.6111 0.3569 0.396 0.000 0.604
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408682 3 0.6260 0.2352 0.000 0.448 0.552
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 3 0.1411 0.9029 0.000 0.036 0.964
#> SRR603164 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 3 0.5591 0.5573 0.304 0.000 0.696
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.5926 0.4566 0.356 0.644 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.5098 0.6553 0.752 0.248 0.000
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.5363 0.6077 0.276 0.000 0.724
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0237 0.9635 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.4555 0.7256 0.000 0.800 0.200
#> SRR1418561 1 0.6299 0.0662 0.524 0.000 0.476
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 3 0.1964 0.8875 0.000 0.056 0.944
#> SRR603116 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.4702 0.7234 0.212 0.788 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.4504 0.7294 0.196 0.000 0.804
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.6111 0.3503 0.396 0.604 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 3 0.5810 0.5162 0.000 0.336 0.664
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.6079 0.4020 0.000 0.388 0.612
#> SRR658766 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.6520 0.0943 0.004 0.488 0.508
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 3 0.5178 0.6555 0.000 0.256 0.744
#> SRR820907 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.6235 0.1752 0.000 0.564 0.436
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.4346 0.7635 0.816 0.184 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0237 0.9240 0.004 0.000 0.996
#> SRR658259 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.1643 0.9253 0.000 0.956 0.044
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.3267 0.8265 0.116 0.000 0.884
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.2066 0.8844 0.000 0.060 0.940
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.1964 0.9128 0.000 0.944 0.056
#> SRR613126 3 0.6095 0.3934 0.000 0.392 0.608
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0237 0.9241 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.4605 0.7186 0.204 0.000 0.796
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.6111 0.3503 0.396 0.604 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.6026 0.4303 0.000 0.376 0.624
#> SRR1348040 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.6126 0.3396 0.400 0.600 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.6126 0.3121 0.600 0.000 0.400
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.4555 0.7256 0.000 0.800 0.200
#> SRR662918 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 1 0.5905 0.4368 0.648 0.000 0.352
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 3 0.3551 0.8144 0.000 0.132 0.868
#> SRR662019 3 0.4555 0.7241 0.200 0.000 0.800
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.1643 0.8968 0.000 0.044 0.956
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.6111 0.3826 0.000 0.396 0.604
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355217 3 0.5291 0.6379 0.000 0.268 0.732
#> SRR1356290 3 0.4842 0.7031 0.000 0.224 0.776
#> SRR659507 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0237 0.9635 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414727 3 0.5706 0.5257 0.320 0.000 0.680
#> SRR663477 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 2 0.6280 0.0925 0.000 0.540 0.460
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.5988 0.4207 0.368 0.632 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.1031 0.9089 0.024 0.000 0.976
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.5760 0.5319 0.000 0.328 0.672
#> SRR660260 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 3 0.6062 0.4116 0.000 0.384 0.616
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6095 0.3608 0.392 0.608 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.1163 0.9405 0.028 0.972 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.1031 0.9451 0.000 0.976 0.024
#> SRR658057 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 3 0.1529 0.8996 0.000 0.040 0.960
#> SRR1464681 2 0.0424 0.9600 0.000 0.992 0.008
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.4555 0.7241 0.200 0.000 0.800
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.5882 0.4912 0.000 0.348 0.652
#> SRR615225 3 0.5760 0.5319 0.000 0.328 0.672
#> SRR1401839 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.4974 0.6724 0.236 0.000 0.764
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.6140 0.3377 0.404 0.596 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 3 0.6111 0.3826 0.000 0.396 0.604
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9671 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9268 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0336 0.938 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612803 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 4 0.4761 0.145 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1419258 3 0.3400 0.799 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1403366 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665262 2 0.4277 0.614 0.000 0.720 0.280 0.000
#> SRR1499740 3 0.0707 0.854 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612215 2 0.4713 0.478 0.000 0.640 0.360 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.0188 0.863 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.3123 0.779 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR614839 2 0.0336 0.938 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR658433 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 4 0.2469 0.744 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1328797 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1334512 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1471117 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.1716 0.849 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR660066 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402153 3 0.4284 0.773 0.000 0.020 0.780 0.200
#> SRR655887 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR658707 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.6698 0.487 0.000 0.256 0.604 0.140
#> SRR1074670 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329003 4 0.3486 0.703 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1404837 2 0.1940 0.872 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1317920 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.1637 0.814 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR613999 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0921 0.957 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1313687 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 4 0.4830 0.407 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1487746 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.4150 0.803 0.824 0.056 0.120 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809595 1 0.3219 0.807 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 4 0.0336 0.849 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1344382 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3649 0.781 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1478362 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0804 0.930 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR1347937 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.4855 0.532 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR612683 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.3873 0.761 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1077805 3 0.4830 0.547 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1360402 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0188 0.863 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.5070 0.649 0.060 0.748 0.000 0.192
#> SRR808244 4 0.2334 0.791 0.088 0.000 0.004 0.908
#> SRR1387240 2 0.0921 0.920 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1408595 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.6650 0.438 0.000 0.624 0.176 0.200
#> SRR1317134 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 3 0.6094 0.191 0.000 0.416 0.536 0.048
#> SRR603164 3 0.4579 0.764 0.000 0.032 0.768 0.200
#> SRR1383259 4 0.4855 0.388 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1330854 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2589 0.832 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1361546 3 0.1388 0.845 0.028 0.012 0.960 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3569 0.718 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR615635 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.4992 0.169 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1342739 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 4 0.4564 0.541 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1464601 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602010 2 0.5758 0.612 0.160 0.712 0.128 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818773 1 0.2469 0.874 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.5856 0.566 0.692 0.240 0.056 0.012
#> SRR1459937 4 0.0469 0.844 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR2185018 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0188 0.863 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.3688 0.722 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR661096 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1320225 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.3486 0.703 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1307677 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1466512 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR658212 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1430525 3 0.3801 0.768 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1344422 4 0.3266 0.752 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1353924 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.1022 0.953 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR627431 2 0.4679 0.431 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1418561 3 0.4500 0.544 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612395 3 0.4164 0.538 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.2589 0.832 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1368264 2 0.3649 0.688 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.2973 0.795 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1486799 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.4830 0.407 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR815044 4 0.4134 0.655 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1338560 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1480038 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1330327 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.4855 0.532 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR600656 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658766 3 0.4454 0.671 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR655946 3 0.4830 0.547 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR817282 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.4989 0.177 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.3400 0.799 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR662498 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376764 3 0.2814 0.825 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1377006 3 0.4855 0.532 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR656860 2 0.4134 0.611 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1480547 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452515 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 4 0.4194 0.647 0.000 0.228 0.008 0.764
#> SRR820907 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 1 0.2589 0.864 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.4830 0.547 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1319710 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1098879 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR662245 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.2530 0.865 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR601387 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0188 0.940 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353900 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662906 2 0.4123 0.658 0.000 0.772 0.220 0.008
#> SRR1350832 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0188 0.940 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313969 4 0.0188 0.849 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1388528 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 1 0.2868 0.808 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR607067 4 0.0188 0.850 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1391420 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR661961 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658259 2 0.0336 0.938 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1310476 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.4961 0.103 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1478053 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.3123 0.781 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1322900 1 0.0336 0.976 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.2704 0.782 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1443436 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661469 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500323 2 0.0707 0.927 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1356705 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.3400 0.799 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1368072 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.3907 0.532 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1394190 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318839 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1432390 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.4980 0.510 0.000 0.680 0.016 0.304
#> SRR1089424 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.4188 0.801 0.064 0.000 0.824 0.112
#> SRR1456027 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400551 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615105 4 0.0469 0.844 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1433290 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR2166064 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR663874 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.2647 0.785 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1408249 2 0.5268 0.338 0.396 0.592 0.000 0.012
#> SRR663284 2 0.0657 0.934 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1402794 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348040 3 0.4406 0.681 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1489610 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.4925 0.260 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1444501 3 0.3400 0.799 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1415773 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388832 3 0.4679 0.493 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.4679 0.431 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR662918 4 0.3569 0.732 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR817421 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1400823 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR608264 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1318560 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.4888 0.302 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1432743 3 0.3400 0.799 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1388873 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3873 0.761 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1431083 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.3649 0.725 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR655170 2 0.0707 0.928 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1087825 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR662019 3 0.3610 0.698 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1349209 4 0.0592 0.841 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1326161 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1454328 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.3444 0.796 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR598452 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 4 0.0188 0.849 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR809444 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.3486 0.703 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR657139 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1353555 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR819054 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.2647 0.860 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355217 3 0.4164 0.538 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1356290 2 0.4095 0.703 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR659507 3 0.0469 0.857 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414727 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.3400 0.799 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1377800 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655052 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478968 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351280 2 0.3123 0.779 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR613951 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.0592 0.841 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1408161 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655040 4 0.3801 0.709 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR810225 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.4855 0.532 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1402328 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.2589 0.828 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1442104 3 0.3801 0.768 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1453416 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1458683 4 0.0469 0.844 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1370572 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4304 0.634 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660260 4 0.4817 0.386 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1071231 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.0188 0.849 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1337173 3 0.3688 0.778 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1396250 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659816 4 0.1940 0.784 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1401379 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600981 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4761 0.394 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR660115 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.4994 0.156 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1397156 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.4164 0.603 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1468658 3 0.4843 0.540 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1390437 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612635 2 0.0336 0.938 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351480 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0336 0.938 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR659911 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442928 3 0.4040 0.563 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1464681 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.3649 0.781 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1365426 1 0.4313 0.602 0.736 0.260 0.004 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.5352 0.535 0.000 0.016 0.596 0.388
#> SRR660673 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1339108 2 0.1389 0.901 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR613426 4 0.3610 0.690 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR613879 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.1637 0.925 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1387966 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0469 0.934 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1430489 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0188 0.863 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1351979 3 0.2647 0.831 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1387054 3 0.4830 0.547 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1444306 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.5016 0.388 0.000 0.600 0.396 0.004
#> SRR615225 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401839 3 0.0188 0.864 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379110 2 0.0336 0.938 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077288 3 0.0188 0.863 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1331639 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.6617 0.420 0.280 0.600 0.120 0.000
#> SRR1443003 3 0.0817 0.860 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR612839 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4830 0.547 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1395742 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4830 0.547 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR664063 1 0.2831 0.857 0.876 0.004 0.120 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0000 0.852 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0188 0.940 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488470 2 0.0469 0.936 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1389497 3 0.0000 0.865 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.3356 0.801 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR615311 1 0.0000 0.983 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1380716 2 0.0162 0.7346 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612803 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 4 0.6186 0.3242 0.000 0.000 0.152 0.512 0.336
#> SRR1419258 3 0.2130 0.8445 0.000 0.000 0.908 0.080 0.012
#> SRR1403366 3 0.3003 0.7369 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR665262 5 0.0404 0.5769 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1499740 5 0.4354 0.3305 0.008 0.000 0.368 0.000 0.624
#> SRR1105057 2 0.0290 0.7354 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.4114 0.3230 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR612215 5 0.0000 0.5733 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.2726 0.8188 0.052 0.000 0.884 0.000 0.064
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0510 0.7260 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR658433 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1088581 4 0.4356 0.4492 0.000 0.000 0.340 0.648 0.012
#> SRR1328797 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1354955 3 0.1121 0.8640 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR654802 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1447103 5 0.4101 0.3279 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1402153 3 0.2289 0.8432 0.000 0.004 0.904 0.080 0.012
#> SRR655887 2 0.1908 0.7446 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1408529 3 0.0290 0.8653 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR658707 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.4308 0.6948 0.000 0.128 0.788 0.072 0.012
#> SRR1074670 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1375439 5 0.4171 0.2941 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1329003 4 0.2230 0.7158 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1404837 5 0.6316 -0.3301 0.000 0.356 0.060 0.048 0.536
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.2127 0.7533 0.000 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.2074 0.8308 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR612227 3 0.1121 0.8640 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1388809 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1413872 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.1544 0.8567 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR615814 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1325225 1 0.2813 0.7929 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1313687 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1358220 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.3857 0.2498 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.4473 0.4321 0.324 0.020 0.000 0.000 0.656
#> SRR660164 2 0.4060 0.7424 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR815783 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR809595 5 0.4444 0.3710 0.364 0.000 0.012 0.000 0.624
#> SRR1403133 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR815470 4 0.6009 0.3480 0.000 0.056 0.036 0.572 0.336
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.2305 0.8382 0.000 0.000 0.896 0.092 0.012
#> SRR1478362 4 0.2130 0.7788 0.000 0.000 0.080 0.908 0.012
#> SRR1392186 2 0.1121 0.7078 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.3109 0.7882 0.000 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR612683 2 0.0963 0.7402 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1392901 3 0.2997 0.7974 0.000 0.000 0.840 0.148 0.012
#> SRR1077805 3 0.2193 0.8415 0.000 0.000 0.900 0.092 0.008
#> SRR1360402 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1406112 3 0.1671 0.8518 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1355352 3 0.4273 0.1343 0.000 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR656247 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.1205 0.7082 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR808244 4 0.4826 0.1105 0.020 0.000 0.472 0.508 0.000
#> SRR1387240 2 0.4564 0.7259 0.000 0.612 0.000 0.016 0.372
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1419110 5 0.2929 0.5623 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1408682 5 0.1478 0.5392 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.1341 0.7071 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1453911 5 0.1638 0.5402 0.000 0.004 0.064 0.000 0.932
#> SRR603164 3 0.2703 0.8376 0.000 0.020 0.896 0.060 0.024
#> SRR1383259 2 0.3480 0.4146 0.000 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0963 0.7133 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361546 5 0.3333 0.5375 0.004 0.000 0.208 0.000 0.788
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.6578 0.5607 0.000 0.476 0.016 0.136 0.372
#> SRR615635 2 0.3999 0.7484 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1385411 2 0.0880 0.7151 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.1608 0.8543 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR662126 2 0.5019 -0.0905 0.000 0.568 0.000 0.396 0.036
#> SRR1464601 2 0.4101 0.7380 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1071594 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR612539 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602010 5 0.1106 0.5770 0.012 0.024 0.000 0.000 0.964
#> SRR810249 2 0.3366 0.7494 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR818773 5 0.4114 0.3475 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4138 0.7261 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.2648 0.8072 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR661639 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6158 0.0849 0.324 0.576 0.064 0.004 0.032
#> SRR1459937 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.4015 0.7463 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR809348 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR661074 3 0.2580 0.8265 0.044 0.000 0.892 0.000 0.064
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.3895 0.4840 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.2230 0.7158 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1307677 2 0.0290 0.7355 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466512 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658212 2 0.2280 0.7460 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1430525 3 0.2189 0.8424 0.000 0.000 0.904 0.084 0.012
#> SRR1344422 4 0.3003 0.6493 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1353924 2 0.0162 0.7346 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.3242 0.7257 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR627431 5 0.7880 -0.3387 0.000 0.344 0.088 0.196 0.372
#> SRR1418561 3 0.2011 0.8016 0.088 0.000 0.908 0.004 0.000
#> SRR1448029 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR813802 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1435311 2 0.3336 0.7486 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR612395 5 0.0404 0.5769 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR603116 5 0.1732 0.5098 0.000 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1323152 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368264 5 0.3242 0.5385 0.072 0.076 0.000 0.000 0.852
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.2171 0.8444 0.024 0.000 0.912 0.000 0.064
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.3966 0.1807 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR815044 2 0.4287 -0.2184 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659436 5 0.4150 0.2973 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR613699 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330327 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.4517 0.3247 0.000 0.000 0.600 0.388 0.012
#> SRR600656 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658766 3 0.2305 0.8382 0.000 0.000 0.896 0.092 0.012
#> SRR655946 3 0.3039 0.7936 0.000 0.000 0.836 0.152 0.012
#> SRR817282 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.1364 0.5758 0.000 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.2293 0.8418 0.000 0.000 0.900 0.084 0.016
#> SRR662498 5 0.4256 0.1963 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1376764 3 0.1444 0.8583 0.000 0.000 0.948 0.040 0.012
#> SRR1377006 3 0.2416 0.8340 0.000 0.000 0.888 0.100 0.012
#> SRR656860 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.4192 0.3170 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1324390 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR615273 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 4 0.6038 0.3018 0.000 0.004 0.108 0.516 0.372
#> SRR820907 2 0.2020 0.7446 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR812773 5 0.4114 0.3473 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1405984 2 0.1341 0.7426 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1472794 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1435626 3 0.3305 0.7143 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1080766 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.1270 0.8622 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1467966 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.3203 0.7774 0.000 0.000 0.820 0.168 0.012
#> SRR1319710 2 0.1121 0.7078 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1326604 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662245 2 0.4238 0.7383 0.000 0.628 0.004 0.000 0.368
#> SRR1074719 2 0.4030 0.7473 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR816226 1 0.3366 0.7023 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR601387 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR614575 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR662906 2 0.4613 0.7321 0.000 0.620 0.020 0.000 0.360
#> SRR1350832 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1403280 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313969 4 0.1740 0.7919 0.000 0.000 0.056 0.932 0.012
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.2605 0.8123 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR655399 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1319753 1 0.5250 0.2371 0.536 0.416 0.000 0.000 0.048
#> SRR818901 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR607067 4 0.3707 0.5789 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661961 5 0.4114 0.3211 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR658259 2 0.0162 0.7348 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1365034 2 0.2280 0.6278 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1478053 2 0.3480 0.7497 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1475300 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 5 0.0000 0.5733 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.3003 0.7521 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1309942 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1345760 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.2471 0.7111 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.4114 0.7358 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR661469 5 0.3661 0.4669 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1500323 2 0.5209 0.6994 0.000 0.584 0.020 0.020 0.376
#> SRR1356705 5 0.4268 0.2972 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.2189 0.8424 0.000 0.000 0.904 0.084 0.012
#> SRR1368072 2 0.4074 0.7435 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR601815 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR613330 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.6242 0.3620 0.000 0.004 0.148 0.532 0.316
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0963 0.8654 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1318839 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.7439 0.4215 0.000 0.392 0.052 0.180 0.376
#> SRR1089424 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.1043 0.7401 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1309556 3 0.2929 0.8363 0.008 0.000 0.880 0.044 0.068
#> SRR1456027 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400551 5 0.4278 0.1516 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.4101 0.7380 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1454310 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR615105 4 0.2411 0.7625 0.000 0.000 0.108 0.884 0.008
#> SRR1433290 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.4192 0.7125 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1409130 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR659696 4 0.0609 0.8101 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1408249 2 0.1270 0.6891 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR614852 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348040 3 0.4451 0.6956 0.000 0.000 0.712 0.248 0.040
#> SRR1489610 2 0.1121 0.7078 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1488091 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1499566 2 0.1831 0.6594 0.076 0.920 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361480 2 0.0162 0.7346 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444501 3 0.2130 0.8445 0.000 0.000 0.908 0.080 0.012
#> SRR1415773 2 0.4235 0.6945 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1388832 3 0.4211 0.3627 0.360 0.000 0.636 0.000 0.004
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 5 0.7880 -0.3387 0.000 0.344 0.088 0.196 0.372
#> SRR662918 4 0.3039 0.6447 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0162 0.7346 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR608264 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.4101 0.7374 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.4808 0.3495 0.032 0.000 0.348 0.000 0.620
#> SRR1432743 3 0.2189 0.8424 0.000 0.000 0.904 0.084 0.012
#> SRR1388873 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.4283 0.1298 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1406008 2 0.4161 0.7174 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1396786 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.2248 0.8405 0.000 0.000 0.900 0.088 0.012
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4171 0.4588 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR655170 2 0.4849 0.7240 0.000 0.608 0.000 0.032 0.360
#> SRR1087825 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662019 3 0.3231 0.6616 0.196 0.000 0.800 0.000 0.004
#> SRR1349209 4 0.4561 0.0570 0.000 0.000 0.488 0.504 0.008
#> SRR1326161 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1345284 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0162 0.7346 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454328 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.2189 0.8424 0.000 0.000 0.904 0.084 0.012
#> SRR598452 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR660709 4 0.2522 0.7600 0.000 0.000 0.108 0.880 0.012
#> SRR809444 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.2230 0.7158 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.0162 0.8215 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.3983 0.7476 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR658989 3 0.0404 0.8663 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.4045 0.7465 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1367988 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 5 0.4101 0.3555 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1375796 2 0.4101 0.7380 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1386991 5 0.4088 0.3356 0.000 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1355217 5 0.0912 0.5797 0.000 0.012 0.016 0.000 0.972
#> SRR1356290 2 0.7652 0.3991 0.000 0.392 0.148 0.088 0.372
#> SRR659507 5 0.0404 0.5769 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR663296 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0290 0.7362 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR661155 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414727 5 0.4262 0.2070 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR663477 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.2069 0.8463 0.000 0.000 0.912 0.076 0.012
#> SRR1377800 3 0.2773 0.7683 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR614611 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR655052 4 0.2130 0.7788 0.000 0.000 0.080 0.908 0.012
#> SRR1478968 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0162 0.7348 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613951 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4307 0.0388 0.000 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR655040 4 0.4297 0.3594 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR810225 2 0.4045 0.7460 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1325377 2 0.4045 0.7460 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR617829 3 0.3242 0.7733 0.000 0.000 0.816 0.172 0.012
#> SRR1402328 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1480455 2 0.5789 0.6674 0.000 0.556 0.028 0.044 0.372
#> SRR1442104 3 0.1364 0.8593 0.000 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1414314 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR663026 2 0.0703 0.7389 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1478386 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.4525 0.3781 0.360 0.000 0.016 0.000 0.624
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660260 4 0.5039 0.5289 0.000 0.000 0.080 0.676 0.244
#> SRR1071231 2 0.4015 0.7479 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1459125 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337173 3 0.3590 0.7733 0.000 0.000 0.828 0.092 0.080
#> SRR1396250 3 0.1410 0.8601 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2166376 3 0.1671 0.8519 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR659816 4 0.5240 0.5709 0.000 0.000 0.244 0.660 0.096
#> SRR1401379 2 0.1121 0.7078 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR600981 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4938 0.3694 0.000 0.712 0.060 0.216 0.012
#> SRR660115 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1359780 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4394 0.4071 0.000 0.732 0.000 0.220 0.048
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1319648 2 0.0290 0.7310 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0162 0.7317 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468658 3 0.3039 0.7938 0.000 0.000 0.836 0.152 0.012
#> SRR1390437 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR614263 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659911 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1085519 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1345894 3 0.1478 0.8587 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1442928 5 0.0404 0.5769 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1464681 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.2305 0.8382 0.000 0.000 0.896 0.092 0.012
#> SRR1365426 5 0.2653 0.5438 0.096 0.024 0.000 0.000 0.880
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.6731 0.0154 0.000 0.008 0.432 0.188 0.372
#> SRR660673 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.4045 0.7465 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR663807 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1087245 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.5130 0.6751 0.000 0.732 0.060 0.040 0.168
#> SRR613426 4 0.1908 0.7427 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR613879 2 0.4150 0.7244 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1385101 1 0.3366 0.7086 0.784 0.004 0.000 0.000 0.212
#> SRR1387966 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1458852 2 0.4620 0.7253 0.000 0.612 0.012 0.004 0.372
#> SRR1430489 1 0.1965 0.8821 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.2260 0.8412 0.028 0.000 0.908 0.000 0.064
#> SRR1321987 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR662653 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0290 0.7362 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1383081 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.2605 0.7474 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR605101 2 0.4030 0.7151 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR818600 2 0.3816 0.7506 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1367715 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.8669 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.2522 0.8289 0.000 0.000 0.880 0.108 0.012
#> SRR1444306 3 0.3895 0.5393 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4060 0.7457 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR612767 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.3999 0.7484 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1430375 5 0.0000 0.5733 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615225 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401839 5 0.4446 0.2824 0.000 0.000 0.400 0.008 0.592
#> SRR1379110 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.2580 0.8265 0.044 0.000 0.892 0.000 0.064
#> SRR1331639 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 5 0.0566 0.5759 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1443003 3 0.1341 0.8589 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR612839 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.2561 0.8108 0.000 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.3203 0.7774 0.000 0.000 0.820 0.168 0.012
#> SRR664063 5 0.4654 0.3943 0.348 0.024 0.000 0.000 0.628
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0000 0.8229 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.7338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.1410 0.8601 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1367109 3 0.2130 0.8445 0.000 0.000 0.908 0.080 0.012
#> SRR615311 1 0.0000 0.9849 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.1349 0.75146 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1380716 2 0.3864 -0.48494 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR612803 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0909 0.95521 0.968 0.000 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1074359 2 0.4709 0.34424 0.000 0.516 0.036 0.444 0.004 0.000
#> SRR1419258 3 0.3151 0.77991 0.000 0.000 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.3672 0.42179 0.000 0.000 0.688 0.000 0.304 0.008
#> SRR665262 5 0.0865 0.84252 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1499740 5 0.1700 0.82826 0.000 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1105057 6 0.3728 0.83215 0.000 0.344 0.000 0.000 0.004 0.652
#> SRR1439742 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.1814 0.82920 0.000 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR612215 5 0.0713 0.84465 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.1767 0.91900 0.932 0.000 0.036 0.000 0.020 0.012
#> SRR1409263 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1431288 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR614839 6 0.5393 0.71313 0.000 0.292 0.000 0.016 0.100 0.592
#> SRR658433 2 0.1141 0.75383 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1088581 4 0.1327 0.57595 0.000 0.000 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR1328797 3 0.1411 0.82799 0.000 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR1334512 6 0.3547 0.84272 0.000 0.332 0.000 0.000 0.000 0.668
#> SRR1471117 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1354955 3 0.0603 0.82413 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR654802 3 0.0520 0.82396 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR660066 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1447103 5 0.1714 0.83429 0.000 0.000 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1402153 3 0.3819 0.74791 0.000 0.012 0.672 0.316 0.000 0.000
#> SRR655887 2 0.3244 0.39744 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1408529 3 0.2823 0.79691 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.5206 0.64914 0.000 0.116 0.572 0.312 0.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1375439 5 0.2300 0.79475 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1329003 4 0.3741 0.84082 0.008 0.000 0.000 0.672 0.000 0.320
#> SRR1404837 2 0.5304 0.49778 0.000 0.628 0.000 0.172 0.192 0.008
#> SRR1317920 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.3819 0.83940 0.000 0.000 0.012 0.672 0.000 0.316
#> SRR613999 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0260 0.82001 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR612227 3 0.0972 0.82633 0.000 0.000 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR1388809 2 0.0260 0.75436 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413872 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1452864 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR615814 2 0.0146 0.75403 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325225 1 0.4819 0.42930 0.628 0.000 0.000 0.088 0.000 0.284
#> SRR1313687 2 0.1471 0.74578 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1358220 6 0.3607 0.82961 0.000 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1096662 6 0.3541 0.77351 0.000 0.232 0.000 0.020 0.000 0.748
#> SRR1487746 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.0767 0.84505 0.012 0.004 0.000 0.000 0.976 0.008
#> SRR660164 2 0.2282 0.71374 0.000 0.888 0.000 0.088 0.000 0.024
#> SRR815783 2 0.0458 0.74994 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR809595 5 0.1844 0.84027 0.024 0.000 0.048 0.000 0.924 0.004
#> SRR1403133 2 0.1285 0.75304 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR815470 2 0.4103 0.38039 0.000 0.544 0.004 0.448 0.000 0.004
#> SRR1344382 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3636 0.74982 0.000 0.000 0.676 0.320 0.004 0.000
#> SRR1478362 4 0.0870 0.63284 0.000 0.012 0.004 0.972 0.000 0.012
#> SRR1392186 6 0.5156 0.70882 0.000 0.272 0.000 0.000 0.128 0.600
#> SRR1347937 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.4674 0.60717 0.000 0.000 0.676 0.048 0.020 0.256
#> SRR612683 2 0.3634 -0.14372 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1392901 3 0.3547 0.74473 0.000 0.000 0.668 0.332 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.3390 0.76318 0.000 0.000 0.704 0.296 0.000 0.000
#> SRR1360402 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1406112 3 0.0146 0.82073 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1355352 3 0.3819 0.44375 0.000 0.000 0.672 0.000 0.316 0.012
#> SRR656247 1 0.0405 0.97305 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR813656 6 0.5029 0.72578 0.000 0.260 0.000 0.000 0.120 0.620
#> SRR808244 4 0.6128 0.54019 0.000 0.000 0.288 0.492 0.016 0.204
#> SRR1387240 2 0.2793 0.64836 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1435248 2 0.1141 0.75375 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1419110 5 0.2118 0.82853 0.000 0.008 0.104 0.000 0.888 0.000
#> SRR1408682 5 0.4932 0.23866 0.000 0.372 0.000 0.072 0.556 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 6 0.6515 0.52106 0.000 0.292 0.000 0.084 0.120 0.504
#> SRR1453911 5 0.1820 0.82141 0.000 0.056 0.012 0.008 0.924 0.000
#> SRR603164 3 0.4766 0.69896 0.000 0.060 0.616 0.320 0.000 0.004
#> SRR1383259 6 0.3778 0.80985 0.000 0.272 0.000 0.020 0.000 0.708
#> SRR1330854 1 0.1053 0.95162 0.964 0.000 0.004 0.000 0.020 0.012
#> SRR1452423 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 6 0.5076 0.73131 0.000 0.248 0.000 0.000 0.132 0.620
#> SRR1468162 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.1863 0.82359 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1361546 5 0.1668 0.84410 0.000 0.008 0.060 0.000 0.928 0.004
#> SRR1486156 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3266 0.59388 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR615635 2 0.2772 0.59324 0.000 0.816 0.000 0.000 0.004 0.180
#> SRR1385411 6 0.3672 0.83233 0.000 0.304 0.000 0.008 0.000 0.688
#> SRR1342739 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR662126 6 0.5615 0.63585 0.000 0.160 0.000 0.076 0.108 0.656
#> SRR1464601 2 0.2219 0.69317 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0692 0.75271 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR612539 6 0.3652 0.84269 0.000 0.324 0.000 0.000 0.004 0.672
#> SRR602010 5 0.0717 0.84591 0.000 0.016 0.000 0.000 0.976 0.008
#> SRR810249 2 0.3290 0.43628 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004 0.252
#> SRR818773 5 0.1606 0.82217 0.056 0.000 0.008 0.000 0.932 0.004
#> SRR1336569 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4258 0.63594 0.000 0.768 0.000 0.104 0.104 0.024
#> SRR1442754 1 0.1053 0.95162 0.964 0.000 0.004 0.000 0.020 0.012
#> SRR1334247 3 0.3907 0.75940 0.000 0.000 0.764 0.084 0.152 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 6 0.5217 0.69217 0.032 0.152 0.124 0.000 0.004 0.688
#> SRR1459937 4 0.3446 0.84784 0.000 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR2185018 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.2201 0.70662 0.000 0.900 0.000 0.000 0.048 0.052
#> SRR809348 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR661074 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1349851 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 6 0.6007 0.27357 0.000 0.240 0.000 0.356 0.000 0.404
#> SRR661096 6 0.3515 0.84306 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR1320225 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.3741 0.84082 0.008 0.000 0.000 0.672 0.000 0.320
#> SRR1307677 6 0.3684 0.80261 0.000 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1466512 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR658212 2 0.2454 0.63230 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1430525 3 0.3515 0.74938 0.000 0.000 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.5287 0.53983 0.000 0.176 0.000 0.600 0.000 0.224
#> SRR1353924 6 0.3742 0.82871 0.000 0.348 0.000 0.000 0.004 0.648
#> SRR1314832 1 0.1167 0.94750 0.960 0.000 0.008 0.000 0.020 0.012
#> SRR1487570 1 0.4854 0.41077 0.620 0.000 0.000 0.088 0.000 0.292
#> SRR627431 2 0.3652 0.54580 0.000 0.672 0.004 0.324 0.000 0.000
#> SRR1418561 3 0.1269 0.81267 0.012 0.000 0.956 0.000 0.020 0.012
#> SRR1448029 3 0.0146 0.82073 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1435311 2 0.2112 0.67583 0.000 0.896 0.000 0.000 0.016 0.088
#> SRR612395 5 0.0692 0.84722 0.000 0.020 0.004 0.000 0.976 0.000
#> SRR603116 5 0.1398 0.82648 0.000 0.052 0.000 0.000 0.940 0.008
#> SRR1323152 3 0.1501 0.82709 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1368264 5 0.0806 0.84422 0.000 0.020 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1326624 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1327702 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.3499 0.84258 0.000 0.320 0.000 0.000 0.000 0.680
#> SRR1486799 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 6 0.3695 0.78243 0.000 0.244 0.000 0.024 0.000 0.732
#> SRR815044 6 0.3892 0.67444 0.000 0.188 0.000 0.060 0.000 0.752
#> SRR1338560 6 0.3899 0.75408 0.000 0.404 0.000 0.000 0.004 0.592
#> SRR615862 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1480038 6 0.3852 0.80976 0.000 0.384 0.000 0.000 0.004 0.612
#> SRR659436 5 0.1610 0.83432 0.000 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.75338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1330327 4 0.3446 0.84795 0.000 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1489950 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1431927 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0146 0.82073 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.4135 -0.28260 0.000 0.000 0.404 0.584 0.008 0.004
#> SRR600656 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR658766 3 0.4122 0.74026 0.000 0.020 0.660 0.316 0.004 0.000
#> SRR655946 3 0.3789 0.73983 0.000 0.008 0.660 0.332 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1406418 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.0717 0.84591 0.000 0.016 0.000 0.000 0.976 0.008
#> SRR1471965 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4042 0.74311 0.000 0.016 0.664 0.316 0.004 0.000
#> SRR662498 5 0.2697 0.76429 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1376764 3 0.3464 0.75580 0.000 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.4074 0.74982 0.000 0.000 0.656 0.324 0.016 0.004
#> SRR656860 6 0.3652 0.84283 0.000 0.324 0.000 0.004 0.000 0.672
#> SRR1480547 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1452515 5 0.5190 0.16281 0.000 0.000 0.376 0.096 0.528 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.75338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.4477 0.44162 0.000 0.588 0.028 0.380 0.004 0.000
#> SRR820907 2 0.3756 -0.11178 0.000 0.644 0.000 0.000 0.004 0.352
#> SRR812773 5 0.3023 0.63166 0.212 0.000 0.000 0.000 0.784 0.004
#> SRR1405984 2 0.3337 0.41161 0.000 0.736 0.000 0.000 0.004 0.260
#> SRR1472794 2 0.0363 0.75307 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0146 0.82073 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1435626 3 0.2135 0.75635 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1080766 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1377862 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.1082 0.82752 0.000 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1467966 3 0.1007 0.82722 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.3578 0.73902 0.000 0.000 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR1319710 6 0.5270 0.70021 0.000 0.268 0.000 0.000 0.144 0.588
#> SRR1326604 6 0.3547 0.84272 0.000 0.332 0.000 0.000 0.000 0.668
#> SRR1098879 3 0.1888 0.82823 0.000 0.000 0.916 0.068 0.012 0.004
#> SRR662245 2 0.2823 0.64707 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.1411 0.74911 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR816226 1 0.5694 0.08486 0.508 0.000 0.000 0.188 0.000 0.304
#> SRR601387 2 0.0777 0.75546 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR614575 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1353900 2 0.0363 0.75495 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR662906 2 0.3665 0.69299 0.000 0.800 0.012 0.136 0.000 0.052
#> SRR1350832 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1403280 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1313969 4 0.2340 0.74782 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1388528 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.2738 0.76956 0.820 0.000 0.000 0.000 0.176 0.004
#> SRR655399 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1319753 6 0.6178 0.46178 0.176 0.084 0.000 0.000 0.148 0.592
#> SRR818901 3 0.0146 0.82073 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR607067 6 0.3706 -0.47606 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1391420 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 6 0.3672 0.82363 0.000 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR661961 5 0.1814 0.82920 0.000 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR658259 6 0.3862 0.69122 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1310476 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1007 0.75503 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1365034 6 0.3608 0.81198 0.000 0.272 0.000 0.012 0.000 0.716
#> SRR1478053 2 0.3240 0.45714 0.000 0.752 0.000 0.000 0.004 0.244
#> SRR1475300 6 0.3684 0.84032 0.000 0.332 0.000 0.000 0.004 0.664
#> SRR1328101 5 0.0632 0.84486 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1322900 5 0.3997 0.07119 0.488 0.000 0.000 0.000 0.508 0.004
#> SRR1309942 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1345760 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1435418 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.5162 0.47944 0.000 0.212 0.000 0.620 0.000 0.168
#> SRR1443436 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.3773 0.62041 0.000 0.752 0.000 0.204 0.044 0.000
#> SRR661469 5 0.0692 0.84797 0.000 0.004 0.020 0.000 0.976 0.000
#> SRR1500323 2 0.4044 0.57978 0.000 0.704 0.000 0.256 0.040 0.000
#> SRR1356705 5 0.4032 0.20497 0.000 0.008 0.000 0.000 0.572 0.420
#> SRR1464915 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1350435 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.3972 0.74297 0.000 0.012 0.664 0.320 0.004 0.000
#> SRR1368072 2 0.1141 0.73414 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR601815 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR613330 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.4521 0.40968 0.000 0.568 0.028 0.400 0.004 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.1753 0.82770 0.000 0.000 0.912 0.084 0.004 0.000
#> SRR1318839 3 0.1434 0.82777 0.000 0.000 0.940 0.048 0.012 0.000
#> SRR1432390 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR613126 2 0.4464 0.55034 0.000 0.668 0.012 0.284 0.036 0.000
#> SRR1089424 6 0.3672 0.80622 0.000 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1347214 2 0.3221 0.40901 0.000 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1309556 3 0.4329 0.75144 0.000 0.012 0.664 0.300 0.024 0.000
#> SRR1456027 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1400551 3 0.4141 0.13852 0.000 0.000 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1320469 1 0.0820 0.95884 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR614251 2 0.2871 0.65416 0.000 0.804 0.000 0.192 0.000 0.004
#> SRR1454310 2 0.1387 0.74475 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR615105 4 0.0405 0.63290 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1433290 3 0.1327 0.82751 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR601671 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR663874 2 0.2664 0.67380 0.000 0.848 0.000 0.000 0.136 0.016
#> SRR1409130 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR659696 4 0.3482 0.84625 0.000 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1408249 6 0.3725 0.83995 0.008 0.316 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR663284 6 0.3647 0.82618 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1402794 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR614852 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1348040 3 0.7169 -0.00323 0.000 0.000 0.352 0.088 0.332 0.228
#> SRR1489610 6 0.5270 0.70021 0.000 0.268 0.000 0.000 0.144 0.588
#> SRR1488091 2 0.0547 0.74859 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1499566 6 0.4027 0.83772 0.008 0.308 0.000 0.000 0.012 0.672
#> SRR1361480 6 0.3547 0.84145 0.000 0.332 0.000 0.000 0.000 0.668
#> SRR1444501 3 0.3499 0.75133 0.000 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.4121 0.61388 0.000 0.748 0.000 0.116 0.136 0.000
#> SRR1388832 3 0.3568 0.63546 0.188 0.000 0.780 0.000 0.020 0.012
#> SRR1394637 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.3789 0.54127 0.000 0.668 0.004 0.324 0.004 0.000
#> SRR662918 4 0.5252 0.49520 0.000 0.204 0.000 0.608 0.000 0.188
#> SRR817421 3 0.1745 0.82817 0.000 0.000 0.920 0.068 0.012 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 6 0.3672 0.80762 0.000 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR608264 3 0.1863 0.82345 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.1151 0.94312 0.956 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012
#> SRR1454117 2 0.4024 0.64410 0.000 0.776 0.000 0.128 0.084 0.012
#> SRR1312684 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.1176 0.84417 0.024 0.000 0.020 0.000 0.956 0.000
#> SRR1432743 3 0.3619 0.75195 0.000 0.000 0.680 0.316 0.004 0.000
#> SRR1388873 2 0.1141 0.75369 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1353517 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.3854 0.17009 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1406008 2 0.3834 0.62127 0.000 0.772 0.000 0.000 0.144 0.084
#> SRR1396786 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1446564 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3986 0.74254 0.000 0.020 0.664 0.316 0.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 6 0.3101 -0.16357 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR655170 2 0.2301 0.72527 0.000 0.884 0.000 0.096 0.000 0.020
#> SRR1087825 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR662019 3 0.3312 0.71692 0.132 0.000 0.828 0.008 0.020 0.012
#> SRR1349209 4 0.4326 0.22738 0.000 0.000 0.300 0.656 0.000 0.044
#> SRR1326161 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1345284 6 0.3699 0.83825 0.000 0.336 0.000 0.000 0.004 0.660
#> SRR1416672 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 6 0.3578 0.83635 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1454328 2 0.0547 0.75501 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1489286 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.1075 0.82739 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.3515 0.74938 0.000 0.000 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0909 0.81535 0.000 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR660709 4 0.0810 0.62982 0.000 0.008 0.004 0.976 0.004 0.008
#> SRR809444 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0146 0.75323 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.3741 0.84082 0.008 0.000 0.000 0.672 0.000 0.320
#> SRR657139 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1353555 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.3565 0.84425 0.000 0.000 0.004 0.692 0.000 0.304
#> SRR1381775 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.1787 0.73293 0.000 0.932 0.000 0.016 0.020 0.032
#> SRR658989 3 0.1858 0.82755 0.000 0.000 0.912 0.076 0.012 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.1524 0.82811 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008 0.000
#> SRR819054 2 0.1644 0.73626 0.000 0.920 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR1367988 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1331922 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 5 0.0777 0.84097 0.024 0.000 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR1375796 2 0.2362 0.69179 0.000 0.860 0.000 0.136 0.000 0.004
#> SRR1386991 5 0.1644 0.83822 0.000 0.000 0.076 0.004 0.920 0.000
#> SRR1355217 5 0.0870 0.84780 0.000 0.012 0.012 0.000 0.972 0.004
#> SRR1356290 2 0.4025 0.53432 0.000 0.668 0.016 0.312 0.004 0.000
#> SRR659507 5 0.1723 0.84351 0.000 0.036 0.036 0.000 0.928 0.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 6 0.4086 0.69246 0.000 0.464 0.000 0.000 0.008 0.528
#> SRR661155 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1414727 5 0.3564 0.65499 0.000 0.000 0.264 0.000 0.724 0.012
#> SRR663477 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.3499 0.75133 0.000 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.1563 0.79671 0.000 0.000 0.932 0.000 0.056 0.012
#> SRR614611 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR655052 4 0.1198 0.62407 0.000 0.020 0.004 0.960 0.004 0.012
#> SRR1478968 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1351280 6 0.3774 0.78448 0.000 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR613951 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1418022 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4357 0.17288 0.000 0.000 0.340 0.624 0.000 0.036
#> SRR1408161 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR655040 6 0.1141 0.35853 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR810225 2 0.0820 0.74975 0.000 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1325377 2 0.1082 0.75459 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR617829 3 0.3912 0.73051 0.000 0.012 0.648 0.340 0.000 0.000
#> SRR1402328 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1480455 2 0.3969 0.58355 0.000 0.700 0.012 0.276 0.000 0.012
#> SRR1442104 3 0.2706 0.81185 0.000 0.000 0.832 0.160 0.008 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1414314 2 0.1141 0.75369 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR663026 2 0.3991 -0.44329 0.000 0.524 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR1478386 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1458683 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1370572 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.2265 0.83041 0.024 0.000 0.076 0.000 0.896 0.004
#> SRR1310735 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR660260 4 0.6618 0.26436 0.000 0.000 0.168 0.468 0.304 0.060
#> SRR1071231 2 0.1908 0.71704 0.000 0.900 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1459125 4 0.3565 0.84467 0.000 0.000 0.000 0.692 0.004 0.304
#> SRR1337173 3 0.5867 0.53878 0.000 0.192 0.492 0.312 0.004 0.000
#> SRR1396250 3 0.0909 0.81535 0.000 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR2166376 3 0.0935 0.80964 0.000 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR659816 4 0.4253 0.23071 0.000 0.296 0.032 0.668 0.004 0.000
#> SRR1401379 6 0.5270 0.70021 0.000 0.268 0.000 0.000 0.144 0.588
#> SRR600981 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1398335 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 6 0.5670 0.51110 0.000 0.184 0.004 0.236 0.004 0.572
#> SRR660115 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.1141 0.75369 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1359780 2 0.1682 0.75363 0.000 0.928 0.000 0.020 0.000 0.052
#> SRR1490037 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 6 0.5699 0.65432 0.000 0.180 0.000 0.056 0.128 0.636
#> SRR1397156 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.75338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 6 0.4938 0.70176 0.000 0.356 0.000 0.076 0.000 0.568
#> SRR1092985 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1468658 3 0.3578 0.73902 0.000 0.000 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR1390437 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR658057 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR612635 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1351480 2 0.3867 -0.62365 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1436651 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.1471 0.74622 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR614263 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR659911 2 0.1141 0.75369 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1085519 3 0.0146 0.82073 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345894 3 0.0405 0.82240 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1442928 5 0.1010 0.84349 0.000 0.036 0.004 0.000 0.960 0.000
#> SRR1464681 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1418880 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.4122 0.74026 0.000 0.020 0.660 0.316 0.004 0.000
#> SRR1365426 5 0.0862 0.84554 0.004 0.016 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1487947 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 2 0.4436 0.50378 0.000 0.636 0.036 0.324 0.004 0.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1644 0.73625 0.000 0.920 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR663807 2 0.1204 0.75257 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1087245 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1339108 2 0.5887 0.45811 0.000 0.580 0.000 0.232 0.032 0.156
#> SRR613426 4 0.3905 0.83418 0.016 0.000 0.000 0.668 0.000 0.316
#> SRR613879 2 0.4479 0.62332 0.000 0.744 0.000 0.144 0.088 0.024
#> SRR1385101 5 0.4114 0.17623 0.460 0.000 0.000 0.004 0.532 0.004
#> SRR1387966 2 0.0146 0.75430 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458852 2 0.3076 0.61720 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.2814 0.77863 0.820 0.000 0.000 0.008 0.000 0.172
#> SRR1349231 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1321987 2 0.0000 0.75338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.1267 0.75019 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1390027 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3930 -0.29411 0.000 0.576 0.000 0.000 0.004 0.420
#> SRR1383081 6 0.3659 0.81135 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR2166960 2 0.3966 -0.35083 0.000 0.552 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR605101 2 0.5992 -0.09966 0.000 0.420 0.000 0.000 0.340 0.240
#> SRR818600 2 0.0937 0.74199 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1367715 6 0.3647 0.82864 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1351979 3 0.1765 0.82476 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.3668 0.74498 0.000 0.004 0.668 0.328 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.3023 0.64098 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0363 0.75561 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR612767 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.2053 0.70229 0.000 0.888 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1430375 5 0.0937 0.84063 0.000 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR615225 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1401839 5 0.2618 0.80637 0.000 0.000 0.076 0.052 0.872 0.000
#> SRR1379110 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1077288 3 0.0993 0.81435 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1331639 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1342782 5 0.0692 0.84604 0.000 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004
#> SRR1443003 3 0.3952 0.74802 0.000 0.020 0.672 0.308 0.000 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.3829 0.77887 0.000 0.000 0.760 0.180 0.000 0.060
#> SRR1395742 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.3819 0.73356 0.000 0.008 0.652 0.340 0.000 0.000
#> SRR664063 5 0.0717 0.84351 0.016 0.000 0.000 0.000 0.976 0.008
#> SRR1488214 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.3464 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1320321 2 0.3999 -0.62444 0.000 0.500 0.000 0.000 0.004 0.496
#> SRR1071955 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 6 0.3672 0.80707 0.000 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1488470 6 0.3531 0.84326 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1389497 3 0.0146 0.82073 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367109 3 0.3584 0.75595 0.000 0.000 0.688 0.308 0.004 0.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.98386 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.905 0.912 0.966 0.4340 0.565 0.565
#> 3 3 0.958 0.929 0.972 0.5246 0.723 0.530
#> 4 4 0.634 0.514 0.754 0.1144 0.881 0.672
#> 5 5 0.654 0.529 0.772 0.0511 0.886 0.624
#> 6 6 0.707 0.527 0.747 0.0454 0.912 0.650
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.9954 0.10639 0.460 0.540
#> SRR1105057 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0376 0.96832 0.004 0.996
#> SRR612215 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0672 0.93941 0.992 0.008
#> SRR1431288 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.9996 -0.00355 0.488 0.512
#> SRR1375439 2 0.9815 0.24259 0.420 0.580
#> SRR1329003 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.1633 0.92622 0.976 0.024
#> SRR613999 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 0.9896 0.25447 0.560 0.440
#> SRR612227 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.9209 0.47199 0.336 0.664
#> SRR615814 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.8443 0.60712 0.272 0.728
#> SRR660164 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.7219 0.73529 0.200 0.800
#> SRR1403133 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.9209 0.51132 0.664 0.336
#> SRR612683 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1355352 1 0.6973 0.75248 0.812 0.188
#> SRR656247 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.0376 0.96830 0.004 0.996
#> SRR1435248 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.9710 0.30374 0.400 0.600
#> SRR1486156 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.9323 0.44289 0.348 0.652
#> SRR662126 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.7299 0.72493 0.204 0.796
#> SRR810249 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.9393 0.42285 0.356 0.644
#> SRR1336569 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.9993 0.01257 0.484 0.516
#> SRR661074 1 0.8608 0.60852 0.716 0.284
#> SRR1349851 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0938 0.96081 0.012 0.988
#> SRR1320225 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.9460 0.45068 0.636 0.364
#> SRR1448029 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.6048 0.80637 0.148 0.852
#> SRR1326624 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.9580 0.41677 0.620 0.380
#> SRR1327702 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1475104 1 0.9881 0.26633 0.564 0.436
#> SRR1406418 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.9044 0.50456 0.320 0.680
#> SRR656860 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.9977 0.14314 0.528 0.472
#> SRR1405984 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.9775 0.26787 0.412 0.588
#> SRR1080766 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.7453 0.71965 0.788 0.212
#> SRR601387 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.9977 0.14314 0.528 0.472
#> SRR655399 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.2236 0.93760 0.036 0.964
#> SRR818901 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.7139 0.73740 0.196 0.804
#> SRR658259 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.9209 0.51132 0.664 0.336
#> SRR1309942 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.6048 0.80634 0.148 0.852
#> SRR1500323 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.2236 0.93760 0.036 0.964
#> SRR1464915 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.9732 0.35212 0.596 0.404
#> SRR1350435 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.9988 0.02857 0.480 0.520
#> SRR1456027 1 0.7815 0.68243 0.768 0.232
#> SRR1400551 1 0.9922 0.22456 0.552 0.448
#> SRR1320469 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.2236 0.93786 0.036 0.964
#> SRR663284 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.2043 0.94161 0.032 0.968
#> SRR1489610 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.7056 0.74524 0.192 0.808
#> SRR1361480 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.8813 0.57968 0.700 0.300
#> SRR1394637 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.7299 0.72529 0.204 0.796
#> SRR1432743 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR662019 1 0.9970 0.16270 0.532 0.468
#> SRR1349209 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0672 0.93943 0.992 0.008
#> SRR1408183 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0376 0.96832 0.004 0.996
#> SRR660709 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.9608 0.40298 0.616 0.384
#> SRR615479 1 0.9993 0.09940 0.516 0.484
#> SRR1375796 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.9970 0.07861 0.468 0.532
#> SRR663477 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.6531 0.77941 0.168 0.832
#> SRR614611 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.6801 0.76159 0.180 0.820
#> SRR655040 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.9209 0.51282 0.664 0.336
#> SRR1414314 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.9977 0.14314 0.528 0.472
#> SRR1310735 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.2603 0.92975 0.044 0.956
#> SRR1397156 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.9944 0.12551 0.456 0.544
#> SRR1487947 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.3584 0.90503 0.068 0.932
#> SRR613879 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.9635 0.33831 0.388 0.612
#> SRR1387966 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.1414 0.92963 0.980 0.020
#> SRR1321987 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.6343 0.78744 0.840 0.160
#> SRR1331639 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.9552 0.37682 0.376 0.624
#> SRR1488214 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.97194 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.94577 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.3116 0.86017 0.000 0.108 0.892
#> SRR1419258 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499740 3 0.0424 0.94707 0.008 0.000 0.992
#> SRR1105057 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.6154 0.32071 0.408 0.000 0.592
#> SRR1431288 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.5327 0.64132 0.000 0.272 0.728
#> SRR1074670 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.6302 0.04454 0.000 0.520 0.480
#> SRR1317920 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.4555 0.72707 0.000 0.800 0.200
#> SRR1325225 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.5760 0.49742 0.000 0.672 0.328
#> SRR660164 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 3 0.6641 0.18251 0.008 0.448 0.544
#> SRR1403133 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0237 0.95005 0.000 0.004 0.996
#> SRR1360402 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.1753 0.91408 0.048 0.000 0.952
#> SRR656247 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 1 0.3038 0.87638 0.896 0.000 0.104
#> SRR1387240 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.2926 0.90248 0.040 0.036 0.924
#> SRR1435248 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0424 0.96638 0.000 0.992 0.008
#> SRR1317134 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0237 0.96979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453911 3 0.1289 0.92960 0.000 0.032 0.968
#> SRR603164 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.6079 0.36997 0.388 0.612 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.6305 0.00593 0.000 0.516 0.484
#> SRR612539 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.1525 0.94178 0.032 0.964 0.004
#> SRR810249 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.6215 0.25810 0.428 0.572 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.6215 0.25736 0.000 0.428 0.572
#> SRR1459937 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0237 0.94992 0.004 0.000 0.996
#> SRR1349851 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.0237 0.95005 0.000 0.004 0.996
#> SRR1353924 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418561 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0237 0.96979 0.000 0.996 0.004
#> SRR612395 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0892 0.95526 0.020 0.980 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 3 0.0424 0.94732 0.000 0.008 0.992
#> SRR1489950 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.4931 0.69314 0.000 0.232 0.768
#> SRR658766 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.2796 0.88231 0.000 0.908 0.092
#> SRR1471965 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.2261 0.90710 0.000 0.932 0.068
#> SRR1377006 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 3 0.0892 0.93770 0.020 0.000 0.980
#> SRR1405984 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.6168 0.32263 0.000 0.412 0.588
#> SRR1074719 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.4974 0.67255 0.000 0.764 0.236
#> SRR1350832 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.1964 0.91034 0.000 0.056 0.944
#> SRR1388528 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.3896 0.88206 0.888 0.052 0.060
#> SRR655399 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.6274 0.16010 0.456 0.544 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 3 0.3038 0.86787 0.000 0.104 0.896
#> SRR1322900 3 0.6286 0.12841 0.464 0.000 0.536
#> SRR1309942 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.1289 0.92961 0.000 0.032 0.968
#> SRR1435418 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.6079 0.39786 0.000 0.388 0.612
#> SRR661469 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.4075 0.87241 0.880 0.048 0.072
#> SRR1400551 3 0.0237 0.94994 0.004 0.000 0.996
#> SRR1320469 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.3116 0.86379 0.000 0.108 0.892
#> SRR601671 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.5397 0.62077 0.000 0.280 0.720
#> SRR1348040 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 3 0.1964 0.91034 0.000 0.056 0.944
#> SRR1388832 3 0.5650 0.53793 0.312 0.000 0.688
#> SRR1394637 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0424 0.94732 0.000 0.008 0.992
#> SRR1431083 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.5948 0.42333 0.000 0.640 0.360
#> SRR662019 3 0.3619 0.82283 0.136 0.000 0.864
#> SRR1349209 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.3192 0.86708 0.888 0.000 0.112
#> SRR1408183 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.0237 0.95005 0.000 0.004 0.996
#> SRR1381775 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.0237 0.96979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331922 1 0.3295 0.88063 0.896 0.008 0.096
#> SRR615479 1 0.6509 0.08616 0.524 0.004 0.472
#> SRR1375796 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356290 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR659507 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 3 0.2066 0.90725 0.000 0.060 0.940
#> SRR1414727 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 3 0.1411 0.92646 0.000 0.036 0.964
#> SRR1478968 1 0.1453 0.95728 0.968 0.008 0.024
#> SRR1351280 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.2066 0.90725 0.000 0.060 0.940
#> SRR1418022 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 3 0.2165 0.90405 0.000 0.064 0.936
#> SRR810225 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.5678 0.54061 0.000 0.316 0.684
#> SRR1310735 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR660260 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 3 0.1964 0.91034 0.000 0.056 0.944
#> SRR1337173 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.5988 0.41241 0.000 0.632 0.368
#> SRR1398335 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 3 0.5926 0.45309 0.000 0.356 0.644
#> SRR660115 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.2878 0.87448 0.000 0.904 0.096
#> SRR1418880 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.6299 0.07668 0.524 0.476 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 3 0.6008 0.43069 0.000 0.372 0.628
#> SRR613426 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.6140 0.30692 0.596 0.404 0.000
#> SRR1387966 2 0.5591 0.53743 0.000 0.696 0.304
#> SRR1458852 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.4555 0.74082 0.200 0.000 0.800
#> SRR1321987 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.5560 0.58149 0.000 0.300 0.700
#> SRR615225 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401839 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.2537 0.88402 0.080 0.000 0.920
#> SRR1331639 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.2400 0.90926 0.064 0.932 0.004
#> SRR1443003 3 0.5859 0.49077 0.000 0.344 0.656
#> SRR612839 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.6522 0.58373 0.272 0.696 0.032
#> SRR1488214 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.97334 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.95264 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.98478 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.5906 0.48493 0.644 0.000 0.064 0.292
#> SRR1074359 4 0.6448 0.16973 0.000 0.316 0.092 0.592
#> SRR1419258 4 0.4941 -0.00544 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR1403366 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR665262 3 0.4964 0.24388 0.000 0.028 0.716 0.256
#> SRR1499740 3 0.3791 0.26085 0.004 0.000 0.796 0.200
#> SRR1105057 2 0.4795 0.61317 0.000 0.696 0.292 0.012
#> SRR1439742 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4072 0.24832 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR612215 3 0.4797 0.24572 0.000 0.020 0.720 0.260
#> SRR1094051 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.6158 0.44999 0.628 0.000 0.080 0.292
#> SRR1409263 3 0.6783 0.21228 0.124 0.000 0.572 0.304
#> SRR1431288 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.1211 0.76603 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR614839 2 0.7587 0.46932 0.000 0.476 0.292 0.232
#> SRR658433 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 4 0.3688 0.15732 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1328797 3 0.4697 0.28275 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1334512 2 0.4697 0.59091 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1471117 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 4 0.4961 -0.13125 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR654802 3 0.4776 0.27430 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR660066 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.4348 0.25749 0.000 0.024 0.780 0.196
#> SRR1402153 2 0.6118 0.52365 0.000 0.672 0.208 0.120
#> SRR655887 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408529 4 0.4961 -0.13207 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR658707 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 4 0.6845 0.16469 0.000 0.128 0.308 0.564
#> SRR1074670 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1375439 3 0.3569 0.26242 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1329003 1 0.4220 0.70052 0.748 0.000 0.004 0.248
#> SRR1404837 4 0.7226 0.13761 0.000 0.144 0.388 0.468
#> SRR1317920 1 0.3356 0.78080 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1455525 4 0.3873 0.14947 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR613999 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1068855 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR612227 4 0.4933 -0.11752 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1388809 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.4967 0.45447 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1452864 1 0.3726 0.73853 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1473078 3 0.4998 0.17218 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR615814 2 0.5168 0.65122 0.000 0.712 0.248 0.040
#> SRR1325225 1 0.3726 0.73853 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1313687 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.4941 0.47594 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1487746 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.6127 0.07920 0.000 0.228 0.664 0.108
#> SRR660164 2 0.7309 0.53711 0.000 0.528 0.272 0.200
#> SRR815783 2 0.5482 0.53502 0.000 0.608 0.368 0.024
#> SRR809595 3 0.5253 0.21630 0.012 0.084 0.772 0.132
#> SRR1403133 2 0.3583 0.70709 0.000 0.816 0.180 0.004
#> SRR815470 2 0.4500 0.54542 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1344382 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 4 0.4961 -0.13207 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR1478362 4 0.6874 0.16661 0.000 0.296 0.136 0.568
#> SRR1392186 3 0.7891 -0.22364 0.000 0.288 0.356 0.356
#> SRR1347937 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.4406 0.11522 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR612683 2 0.2921 0.74727 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1392901 3 0.6274 0.10854 0.000 0.292 0.620 0.088
#> SRR1077805 4 0.6466 0.04652 0.000 0.092 0.320 0.588
#> SRR1360402 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.4998 0.17218 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1355352 3 0.5167 0.17255 0.004 0.000 0.508 0.488
#> SRR656247 1 0.1302 0.91229 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR813656 2 0.7412 0.50683 0.000 0.504 0.296 0.200
#> SRR808244 4 0.6354 -0.05213 0.416 0.000 0.064 0.520
#> SRR1387240 2 0.2408 0.74799 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1408595 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.4746 0.14658 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1435248 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.4277 0.23906 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1408682 2 0.4983 0.49262 0.000 0.704 0.272 0.024
#> SRR1317134 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.7828 -0.11423 0.000 0.296 0.292 0.412
#> SRR1453911 3 0.4406 0.19008 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR603164 4 0.7220 -0.04085 0.000 0.212 0.240 0.548
#> SRR1383259 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR1330854 1 0.0592 0.93228 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1452423 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.6436 0.57840 0.000 0.608 0.292 0.100
#> SRR1468162 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.4761 0.26726 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1361546 3 0.7321 0.05997 0.108 0.304 0.564 0.024
#> SRR1486156 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2760 0.73778 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR615635 2 0.0336 0.77595 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385411 2 0.2647 0.74229 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1342739 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR662126 4 0.7738 -0.03469 0.000 0.252 0.312 0.436
#> SRR1464601 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.7214 0.30360 0.000 0.476 0.380 0.144
#> SRR612539 2 0.6436 0.57840 0.000 0.608 0.292 0.100
#> SRR602010 3 0.6756 -0.08880 0.004 0.336 0.564 0.096
#> SRR810249 2 0.0188 0.77592 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818773 3 0.8375 0.05906 0.140 0.168 0.564 0.128
#> SRR1336569 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4284 0.73205 0.000 0.780 0.020 0.200
#> SRR1442754 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.4406 0.28172 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR661639 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 4 0.5971 0.13152 0.000 0.040 0.428 0.532
#> SRR1459937 4 0.3610 0.15732 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR2185018 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR809348 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR661074 4 0.7292 -0.09580 0.160 0.000 0.352 0.488
#> SRR1349851 1 0.3726 0.73853 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1405123 2 0.7046 0.35154 0.000 0.448 0.120 0.432
#> SRR661096 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR1320225 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.3801 0.73524 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1307677 2 0.2408 0.74799 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1466512 2 0.2345 0.76514 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR658212 2 0.4134 0.60478 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1430525 3 0.4776 0.27390 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1344422 4 0.3942 0.14849 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1353924 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1314832 1 0.5839 0.48082 0.648 0.000 0.060 0.292
#> SRR1487570 1 0.3726 0.73853 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR627431 2 0.7853 0.30450 0.000 0.400 0.292 0.308
#> SRR1418561 4 0.3975 0.14665 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1448029 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR813802 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0592 0.77210 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1435311 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR612395 3 0.4277 0.23906 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR603116 2 0.7341 0.51825 0.000 0.516 0.292 0.192
#> SRR1323152 4 0.4948 -0.12522 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1368264 3 0.6860 -0.13900 0.004 0.352 0.544 0.100
#> SRR1326624 1 0.3486 0.76739 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1429265 3 0.5406 0.17210 0.012 0.000 0.508 0.480
#> SRR1327702 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.7289 0.54224 0.000 0.532 0.268 0.200
#> SRR1486799 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.7828 -0.11299 0.000 0.296 0.292 0.412
#> SRR815044 4 0.7818 -0.10775 0.000 0.292 0.292 0.416
#> SRR1338560 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR615862 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1480038 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR659436 3 0.3801 0.25278 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR613699 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.7188 0.53393 0.000 0.536 0.292 0.172
#> SRR1330327 4 0.4673 0.17195 0.000 0.008 0.292 0.700
#> SRR1489950 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1444002 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.3975 0.14665 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR600656 4 0.5062 0.17121 0.000 0.020 0.300 0.680
#> SRR658766 4 0.4406 0.12205 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR655946 4 0.7546 0.07722 0.000 0.188 0.404 0.408
#> SRR817282 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.4356 0.28333 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1406418 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.7121 0.02141 0.000 0.220 0.564 0.216
#> SRR1471965 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 4 0.4994 0.06886 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR662498 3 0.4576 0.24543 0.000 0.012 0.728 0.260
#> SRR1376764 2 0.5039 0.26507 0.000 0.592 0.404 0.004
#> SRR1377006 4 0.3764 0.15495 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR656860 2 0.3837 0.72525 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1480547 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1452515 3 0.4103 0.24637 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1324390 2 0.0188 0.77509 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615273 1 0.1716 0.89596 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR601695 4 0.7050 0.14535 0.000 0.292 0.156 0.552
#> SRR820907 2 0.2216 0.76632 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR812773 3 0.5140 0.19686 0.020 0.004 0.692 0.284
#> SRR1405984 2 0.6340 0.58850 0.000 0.620 0.284 0.096
#> SRR1472794 2 0.2704 0.74015 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1365448 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.4843 0.23458 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1435626 3 0.4998 0.17218 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1080766 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1467966 4 0.4008 0.14230 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1320579 4 0.4925 -0.00205 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1319710 2 0.6488 0.57659 0.000 0.604 0.292 0.104
#> SRR1326604 2 0.3764 0.72839 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1098879 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR662245 2 0.5551 0.52924 0.000 0.728 0.112 0.160
#> SRR1074719 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.6977 0.40454 0.584 0.000 0.204 0.212
#> SRR601387 2 0.4356 0.61599 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR614575 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1353900 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662906 2 0.4348 0.58549 0.000 0.780 0.196 0.024
#> SRR1350832 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313969 4 0.4624 0.16052 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1388528 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 3 0.7914 -0.06582 0.332 0.000 0.356 0.312
#> SRR655399 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1319753 4 0.8796 0.10555 0.164 0.072 0.356 0.408
#> SRR818901 3 0.4564 0.27521 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR607067 4 0.7686 0.01576 0.000 0.228 0.336 0.436
#> SRR1391420 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.3610 0.73540 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR661961 3 0.3569 0.26242 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR658259 2 0.7293 0.55425 0.000 0.536 0.248 0.216
#> SRR1310476 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.2408 0.74799 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1365034 2 0.4843 0.54198 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1478053 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1328101 3 0.5530 0.23133 0.000 0.076 0.712 0.212
#> SRR1322900 3 0.7721 -0.05425 0.276 0.000 0.448 0.276
#> SRR1309942 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.4643 0.15638 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1435418 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4941 0.47594 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1443436 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.5672 0.45175 0.000 0.712 0.100 0.188
#> SRR661469 3 0.3764 0.25496 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1500323 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.7237 0.48958 0.000 0.528 0.296 0.176
#> SRR1464915 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 4 0.4431 0.11099 0.000 0.000 0.304 0.696
#> SRR1350435 1 0.3444 0.77121 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1389177 3 0.4746 0.27440 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1368072 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.4999 -0.06291 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1394190 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 4 0.4961 -0.13207 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR1318839 3 0.4697 0.28275 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1432390 2 0.3266 0.75210 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR613126 2 0.0817 0.76949 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1089424 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0592 0.77615 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1309556 3 0.4985 -0.05086 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1456027 1 0.5600 0.47984 0.596 0.000 0.028 0.376
#> SRR1400551 3 0.4998 0.17218 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1320469 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.2868 0.73401 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1454310 2 0.0188 0.77530 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615105 4 0.3569 0.15857 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1433290 3 0.4697 0.28275 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR2166064 4 0.4535 0.17123 0.000 0.004 0.292 0.704
#> SRR601671 2 0.3796 0.75263 0.000 0.848 0.056 0.096
#> SRR663874 2 0.4356 0.61599 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659696 2 0.4697 0.48678 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1408249 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR663284 2 0.7498 0.49838 0.000 0.492 0.292 0.216
#> SRR1402794 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR614852 4 0.6025 0.19423 0.000 0.172 0.140 0.688
#> SRR1348040 3 0.4933 -0.04586 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1489610 2 0.6538 0.57484 0.000 0.600 0.292 0.108
#> SRR1488091 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.6436 0.57685 0.000 0.608 0.292 0.100
#> SRR1361480 4 0.7873 -0.14494 0.000 0.320 0.292 0.388
#> SRR1444501 3 0.4697 0.28275 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1415773 4 0.5000 0.05039 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1388832 4 0.5990 0.09097 0.144 0.000 0.164 0.692
#> SRR1394637 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.7149 0.40779 0.000 0.528 0.156 0.316
#> SRR662918 2 0.4820 0.70509 0.000 0.772 0.060 0.168
#> SRR817421 3 0.4697 0.28275 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1400823 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1022 0.77217 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR608264 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1318560 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 4 0.7853 -0.14254 0.000 0.308 0.292 0.400
#> SRR1312684 1 0.1716 0.89292 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR615044 3 0.4925 -0.04138 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1432743 4 0.4916 -0.13590 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1388873 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.3801 0.26120 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1406008 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR1396786 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.3726 0.73853 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1318465 4 0.4454 0.08039 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1431083 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.7853 -0.16173 0.000 0.308 0.292 0.400
#> SRR655170 2 0.4800 0.50479 0.000 0.656 0.004 0.340
#> SRR1087825 2 0.5478 0.32836 0.000 0.540 0.016 0.444
#> SRR662019 4 0.7441 -0.07981 0.192 0.000 0.320 0.488
#> SRR1349209 4 0.3975 0.14665 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1326161 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR1416672 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4231 0.74155 0.000 0.824 0.080 0.096
#> SRR1454328 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5257 0.68575 0.728 0.000 0.060 0.212
#> SRR1408183 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1084369 3 0.4761 0.27731 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR598452 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR660709 3 0.4992 -0.05451 0.000 0.000 0.524 0.476
#> SRR809444 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0336 0.93920 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326292 1 0.3873 0.72417 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR657139 1 0.1716 0.89596 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1440744 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR1353555 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.5308 0.18030 0.000 0.280 0.036 0.684
#> SRR1381775 1 0.0336 0.93920 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.7796 0.30417 0.000 0.424 0.292 0.284
#> SRR658989 4 0.4250 0.10017 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1353663 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.4790 0.25784 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR819054 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.7250 0.01488 0.000 0.236 0.544 0.220
#> SRR1331922 1 0.7613 0.09358 0.440 0.000 0.352 0.208
#> SRR615479 3 0.6924 0.09500 0.280 0.004 0.584 0.132
#> SRR1375796 2 0.2868 0.73932 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1386991 3 0.4103 0.24637 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1355217 2 0.4164 0.52349 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1356290 4 0.7188 0.03270 0.000 0.136 0.432 0.432
#> SRR659507 3 0.3569 0.26242 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR663296 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.5949 0.59848 0.000 0.644 0.288 0.068
#> SRR661155 4 0.4746 0.17171 0.000 0.008 0.304 0.688
#> SRR1414727 3 0.4898 0.19413 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR663477 1 0.3726 0.73853 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1354489 3 0.5769 0.11861 0.000 0.292 0.652 0.056
#> SRR1377800 3 0.4998 0.17218 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR614611 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655052 4 0.4855 0.13114 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1478968 1 0.4053 0.72125 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR1351280 2 0.4072 0.70788 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR613951 4 0.4804 0.13953 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1418022 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3975 0.14665 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1408161 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 4 0.4967 -0.13497 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR655040 4 0.4585 0.15817 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR810225 2 0.2861 0.76372 0.000 0.888 0.016 0.096
#> SRR1325377 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 4 0.4713 0.05720 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1402328 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.2216 0.75340 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1442104 3 0.5856 0.23075 0.000 0.036 0.556 0.408
#> SRR1453416 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.4356 0.28333 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1414314 2 0.0336 0.77555 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663026 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1458683 4 0.4500 0.07461 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1370572 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.4418 0.25679 0.000 0.032 0.784 0.184
#> SRR1310735 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.6356 0.50179 0.000 0.604 0.088 0.308
#> SRR660260 3 0.7861 0.03336 0.000 0.284 0.392 0.324
#> SRR1071231 2 0.6340 0.58849 0.000 0.620 0.284 0.096
#> SRR1459125 3 0.4999 -0.06291 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1337173 4 0.7371 0.11730 0.000 0.168 0.360 0.472
#> SRR1396250 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR2166376 3 0.4817 0.20677 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR659816 3 0.4999 -0.06291 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1401379 2 0.6681 0.56876 0.000 0.588 0.292 0.120
#> SRR600981 4 0.7812 -0.04876 0.000 0.328 0.264 0.408
#> SRR1398335 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.6286 0.13710 0.000 0.064 0.384 0.552
#> SRR660115 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6681 0.56891 0.000 0.588 0.292 0.120
#> SRR1397156 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0188 0.77592 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319648 4 0.7853 -0.16197 0.000 0.308 0.292 0.400
#> SRR1092985 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR1468658 4 0.3764 0.15495 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1390437 4 0.7771 -0.08213 0.000 0.276 0.292 0.432
#> SRR658057 2 0.7397 0.51100 0.000 0.508 0.292 0.200
#> SRR612635 2 0.3444 0.74372 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1351480 2 0.2345 0.76609 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1436651 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1211 0.91547 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR659590 2 0.5371 0.65570 0.000 0.732 0.188 0.080
#> SRR614263 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.1716 0.77213 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR659911 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1345894 3 0.6626 0.18788 0.000 0.160 0.624 0.216
#> SRR1442928 3 0.4826 0.24332 0.000 0.020 0.716 0.264
#> SRR1464681 2 0.6393 0.38381 0.000 0.480 0.064 0.456
#> SRR1418880 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 4 0.3975 0.14665 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1365426 3 0.7865 0.07240 0.268 0.072 0.564 0.096
#> SRR1487947 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.1716 0.89596 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR603236 3 0.4941 0.06059 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR660673 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0817 0.77461 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.2973 0.73495 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1339108 4 0.6275 0.16235 0.000 0.076 0.328 0.596
#> SRR613426 4 0.5473 0.15355 0.032 0.000 0.324 0.644
#> SRR613879 2 0.3610 0.73540 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1385101 1 0.8718 -0.00434 0.412 0.064 0.356 0.168
#> SRR1387966 2 0.4522 0.53130 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1458852 2 0.0336 0.77424 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1430489 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.1716 0.89596 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1376249 3 0.7341 0.13789 0.192 0.000 0.516 0.292
#> SRR1321987 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.77578 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.5297 0.60773 0.000 0.676 0.292 0.032
#> SRR1383081 2 0.2081 0.77051 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2166960 2 0.4356 0.61599 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR605101 2 0.6383 0.57993 0.000 0.612 0.292 0.096
#> SRR818600 2 0.6722 0.63154 0.000 0.616 0.184 0.200
#> SRR1367715 2 0.3486 0.74174 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1351979 3 0.4697 0.28275 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1387054 4 0.6429 0.04610 0.000 0.088 0.324 0.588
#> SRR1444306 3 0.4356 0.28333 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1322662 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.2408 0.74799 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR612767 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.4673 0.61428 0.000 0.700 0.292 0.008
#> SRR1430375 3 0.5911 0.13534 0.000 0.112 0.692 0.196
#> SRR615225 4 0.6790 0.18550 0.000 0.192 0.200 0.608
#> SRR1401839 3 0.4898 0.02204 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1379110 2 0.4992 0.71192 0.000 0.772 0.132 0.096
#> SRR1077288 4 0.7410 -0.08276 0.184 0.000 0.328 0.488
#> SRR1331639 2 0.4730 0.48520 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1342782 3 0.6915 -0.01058 0.000 0.296 0.564 0.140
#> SRR1443003 2 0.5691 0.09047 0.000 0.508 0.468 0.024
#> SRR612839 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4746 0.27956 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1395742 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.7871 0.10154 0.000 0.284 0.332 0.384
#> SRR664063 3 0.8273 0.05330 0.112 0.204 0.564 0.120
#> SRR1488214 1 0.3123 0.80223 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR654766 4 0.7873 -0.15863 0.000 0.320 0.292 0.388
#> SRR1320321 2 0.2281 0.76524 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1071955 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2408 0.74799 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1488470 2 0.4093 0.74515 0.000 0.832 0.072 0.096
#> SRR1389497 3 0.4679 0.28493 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1367109 4 0.3975 0.14665 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR615311 1 0.0000 0.94452 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.2329 0.64073 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 5 0.5313 0.09801 0.388 0.000 0.056 0.000 0.556
#> SRR1074359 4 0.7937 -0.03873 0.000 0.080 0.324 0.356 0.240
#> SRR1419258 3 0.1195 0.63101 0.000 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR1403366 5 0.1732 0.42757 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR665262 5 0.6798 0.41476 0.000 0.104 0.080 0.236 0.580
#> SRR1499740 5 0.3395 0.48237 0.000 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1105057 2 0.2813 0.64448 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.4987 0.48963 0.000 0.000 0.080 0.236 0.684
#> SRR612215 5 0.4987 0.48963 0.000 0.000 0.080 0.236 0.684
#> SRR1094051 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 5 0.6058 0.07071 0.364 0.000 0.128 0.000 0.508
#> SRR1409263 5 0.4046 0.10654 0.008 0.000 0.296 0.000 0.696
#> SRR1431288 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.1121 0.70817 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR614839 4 0.3932 0.23343 0.000 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.6749 -0.12687 0.000 0.000 0.400 0.272 0.328
#> SRR1328797 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1334512 2 0.4306 0.13248 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0162 0.71718 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354955 5 0.3177 0.36892 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR654802 3 0.3884 0.58926 0.000 0.000 0.708 0.004 0.288
#> SRR660066 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 5 0.3395 0.48237 0.000 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1402153 3 0.5551 0.34497 0.000 0.288 0.624 0.080 0.008
#> SRR655887 2 0.0510 0.71552 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1408529 3 0.4242 0.12509 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR658707 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 4 0.6546 0.30537 0.000 0.172 0.052 0.612 0.164
#> SRR1074670 5 0.3684 0.28652 0.000 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1375439 5 0.3395 0.48237 0.000 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1329003 1 0.5912 0.49392 0.584 0.000 0.068 0.324 0.024
#> SRR1404837 4 0.6085 0.24787 0.000 0.100 0.016 0.572 0.312
#> SRR1317920 1 0.2905 0.83835 0.868 0.000 0.036 0.096 0.000
#> SRR1455525 3 0.6638 0.22757 0.000 0.000 0.412 0.224 0.364
#> SRR613999 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.2813 0.38324 0.000 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1068855 1 0.0794 0.92409 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR612227 5 0.4701 0.35148 0.000 0.000 0.204 0.076 0.720
#> SRR1388809 2 0.0290 0.71680 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1413872 4 0.3671 0.38379 0.000 0.236 0.008 0.756 0.000
#> SRR1452864 1 0.3216 0.81875 0.848 0.000 0.044 0.108 0.000
#> SRR1473078 5 0.1965 0.41392 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR615814 2 0.4879 0.54595 0.000 0.720 0.000 0.124 0.156
#> SRR1325225 1 0.3374 0.81605 0.844 0.000 0.044 0.108 0.004
#> SRR1313687 2 0.0162 0.71670 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 4 0.4287 0.00530 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.6378 0.01887 0.000 0.176 0.000 0.348 0.476
#> SRR660164 4 0.4138 0.10650 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR815783 2 0.5043 0.51531 0.000 0.704 0.000 0.160 0.136
#> SRR809595 5 0.5136 0.39603 0.008 0.064 0.000 0.252 0.676
#> SRR1403133 2 0.1608 0.69872 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR815470 2 0.6081 -0.04132 0.000 0.476 0.124 0.400 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.5783 0.26395 0.000 0.000 0.160 0.228 0.612
#> SRR1478362 4 0.7646 0.12711 0.000 0.172 0.092 0.468 0.268
#> SRR1392186 4 0.6576 0.30237 0.000 0.300 0.012 0.516 0.172
#> SRR1347937 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0290 0.93585 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1354270 5 0.4808 0.37097 0.000 0.000 0.168 0.108 0.724
#> SRR612683 2 0.3895 0.45921 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1392901 3 0.3531 0.59148 0.000 0.000 0.816 0.036 0.148
#> SRR1077805 3 0.4855 0.57096 0.000 0.004 0.700 0.060 0.236
#> SRR1360402 2 0.0510 0.71552 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1406112 5 0.3684 0.33926 0.000 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1355352 5 0.0000 0.44406 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.3684 0.62883 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR813656 4 0.4890 -0.07826 0.000 0.452 0.000 0.524 0.024
#> SRR808244 4 0.8409 -0.30474 0.152 0.000 0.260 0.324 0.264
#> SRR1387240 2 0.3424 0.51818 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1408595 1 0.0794 0.92409 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.4100 0.22863 0.000 0.000 0.044 0.764 0.192
#> SRR1435248 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 5 0.5039 0.48896 0.000 0.000 0.080 0.244 0.676
#> SRR1408682 2 0.6100 -0.07153 0.000 0.448 0.000 0.124 0.428
#> SRR1317134 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.3878 0.42314 0.000 0.236 0.016 0.748 0.000
#> SRR1453911 5 0.4297 0.18466 0.000 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR603164 5 0.6260 0.07522 0.000 0.172 0.312 0.000 0.516
#> SRR1383259 2 0.4227 0.37066 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1330854 1 0.0451 0.93185 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1452423 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.3913 0.52091 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.3048 0.58727 0.000 0.000 0.820 0.004 0.176
#> SRR1361546 5 0.6818 0.08472 0.012 0.272 0.000 0.232 0.484
#> SRR1486156 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3988 0.48642 0.000 0.732 0.016 0.252 0.000
#> SRR615635 2 0.0703 0.71694 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1385411 2 0.3242 0.56969 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 5 0.4045 0.14932 0.000 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR662126 4 0.3880 0.45012 0.000 0.204 0.004 0.772 0.020
#> SRR1464601 2 0.2280 0.63802 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.6158 0.13186 0.000 0.528 0.000 0.316 0.156
#> SRR612539 2 0.3913 0.53137 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR602010 5 0.6503 -0.08196 0.000 0.300 0.000 0.220 0.480
#> SRR810249 2 0.0609 0.71639 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR818773 5 0.6774 0.06666 0.028 0.136 0.000 0.352 0.484
#> SRR1336569 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4192 0.36063 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.4304 0.18189 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR661639 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 4 0.6155 0.14262 0.000 0.036 0.084 0.600 0.280
#> SRR1459937 4 0.6321 -0.20212 0.000 0.000 0.160 0.464 0.376
#> SRR2185018 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.4182 0.38413 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 5 0.3730 0.27411 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR661074 5 0.3289 0.40212 0.048 0.000 0.108 0.000 0.844
#> SRR1349851 1 0.3216 0.81875 0.848 0.000 0.044 0.108 0.000
#> SRR1405123 4 0.4517 0.06897 0.000 0.436 0.008 0.556 0.000
#> SRR661096 2 0.3661 0.56425 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.4990 0.56312 0.628 0.000 0.048 0.324 0.000
#> SRR1307677 2 0.3452 0.52248 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1466512 2 0.3003 0.65835 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR658212 2 0.3305 0.53824 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1430525 3 0.2179 0.62823 0.000 0.000 0.896 0.004 0.100
#> SRR1344422 5 0.6755 0.22855 0.000 0.016 0.228 0.240 0.516
#> SRR1353924 2 0.2773 0.66302 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1314832 1 0.5878 0.25752 0.548 0.000 0.116 0.000 0.336
#> SRR1487570 1 0.3216 0.81875 0.848 0.000 0.044 0.108 0.000
#> SRR627431 4 0.4582 0.10983 0.000 0.416 0.012 0.572 0.000
#> SRR1418561 5 0.5551 0.28924 0.000 0.000 0.284 0.104 0.612
#> SRR1448029 5 0.4171 -0.03631 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR813802 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0880 0.71186 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1435311 2 0.3661 0.56425 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR612395 5 0.4987 0.48963 0.000 0.000 0.080 0.236 0.684
#> SRR603116 4 0.5176 0.14658 0.000 0.380 0.000 0.572 0.048
#> SRR1323152 5 0.4249 -0.02452 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1368264 5 0.6470 -0.00772 0.000 0.192 0.000 0.348 0.460
#> SRR1326624 1 0.3012 0.83033 0.860 0.000 0.036 0.104 0.000
#> SRR1429265 5 0.2674 0.38906 0.004 0.000 0.140 0.000 0.856
#> SRR1327702 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.4305 0.22011 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.5043 0.27468 0.000 0.356 0.044 0.600 0.000
#> SRR815044 4 0.3816 0.33595 0.000 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR1338560 2 0.2773 0.66302 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR615862 2 0.3003 0.65893 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1480038 2 0.3661 0.56425 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR659436 5 0.3395 0.34636 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR613699 2 0.0162 0.71693 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4294 0.27380 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1330327 4 0.0798 0.45514 0.000 0.008 0.016 0.976 0.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 5 0.4138 -0.00327 0.000 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1444002 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 5 0.6309 0.23869 0.000 0.000 0.236 0.232 0.532
#> SRR600656 4 0.0794 0.45193 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR658766 3 0.6824 -0.15764 0.000 0.000 0.344 0.328 0.328
#> SRR655946 3 0.2677 0.59511 0.000 0.016 0.872 0.112 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 5 0.4227 -0.20536 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1406418 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.6289 0.03422 0.000 0.160 0.000 0.356 0.484
#> SRR1471965 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.6420 0.24798 0.000 0.000 0.324 0.192 0.484
#> SRR662498 5 0.7674 0.28031 0.000 0.188 0.096 0.240 0.476
#> SRR1376764 3 0.4911 0.52134 0.000 0.132 0.736 0.008 0.124
#> SRR1377006 5 0.5640 0.28461 0.000 0.000 0.276 0.116 0.608
#> SRR656860 2 0.4242 0.33101 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1480547 2 0.2929 0.66072 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1452515 5 0.4201 0.21875 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1324390 2 0.1121 0.70503 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR615273 1 0.3966 0.53312 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR601695 4 0.7046 -0.11548 0.000 0.008 0.328 0.360 0.304
#> SRR820907 2 0.2732 0.66586 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR812773 5 0.4588 0.31917 0.016 0.000 0.000 0.380 0.604
#> SRR1405984 2 0.3999 0.48156 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1472794 2 0.3452 0.51321 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.5112 0.48461 0.000 0.000 0.664 0.080 0.256
#> SRR1435626 5 0.0000 0.44406 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0794 0.92409 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.2852 0.59118 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1467966 5 0.4622 -0.00609 0.000 0.000 0.440 0.012 0.548
#> SRR1320579 3 0.1918 0.62847 0.000 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1319710 2 0.4305 0.23756 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1326604 2 0.4242 0.32455 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1098879 3 0.3774 0.58928 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR662245 2 0.7007 0.06424 0.000 0.488 0.236 0.024 0.252
#> SRR1074719 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.4925 0.49247 0.632 0.000 0.044 0.324 0.000
#> SRR601387 2 0.2179 0.66882 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR614575 2 0.2929 0.66072 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662906 2 0.4623 0.35727 0.000 0.664 0.304 0.032 0.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0609 0.71528 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1313969 4 0.1893 0.42100 0.000 0.000 0.024 0.928 0.048
#> SRR1388528 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.7401 -0.10105 0.196 0.000 0.044 0.400 0.360
#> SRR655399 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1319753 4 0.6211 0.41843 0.068 0.084 0.016 0.684 0.148
#> SRR818901 3 0.3586 0.52738 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR607067 4 0.4651 0.47766 0.000 0.184 0.016 0.748 0.052
#> SRR1391420 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4219 0.35213 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR661961 5 0.4386 0.46408 0.000 0.000 0.096 0.140 0.764
#> SRR658259 4 0.4262 -0.01838 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3508 0.51024 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1365034 4 0.4300 -0.05181 0.000 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR1478053 2 0.2377 0.65270 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1475300 2 0.2773 0.66302 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1328101 5 0.6563 0.42238 0.000 0.092 0.072 0.236 0.600
#> SRR1322900 5 0.6694 0.37401 0.136 0.000 0.048 0.240 0.576
#> SRR1309942 2 0.0609 0.71577 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1345760 4 0.3400 0.38160 0.000 0.000 0.036 0.828 0.136
#> SRR1435418 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4235 0.29779 0.000 0.336 0.008 0.656 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.5828 0.19945 0.000 0.608 0.004 0.128 0.260
#> SRR661469 5 0.3395 0.48237 0.000 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1500323 2 0.1965 0.66111 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.4437 0.23656 0.000 0.532 0.004 0.464 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.3093 0.40434 0.000 0.000 0.168 0.008 0.824
#> SRR1350435 1 0.3216 0.81875 0.848 0.000 0.044 0.108 0.000
#> SRR1389177 3 0.3577 0.58839 0.000 0.000 0.808 0.032 0.160
#> SRR1368072 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.5731 -0.00356 0.000 0.000 0.104 0.568 0.328
#> SRR1394190 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.4170 0.31289 0.000 0.000 0.192 0.048 0.760
#> SRR1318839 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1432390 4 0.4562 -0.15626 0.000 0.492 0.008 0.500 0.000
#> SRR613126 2 0.0510 0.71344 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0703 0.71855 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1309556 5 0.6418 0.38289 0.000 0.000 0.184 0.344 0.472
#> SRR1456027 4 0.5279 0.22060 0.292 0.000 0.052 0.644 0.012
#> SRR1400551 5 0.2377 0.39776 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1320469 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.5701 0.31432 0.000 0.604 0.124 0.272 0.000
#> SRR1454310 2 0.2561 0.63719 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR615105 3 0.6114 0.23535 0.000 0.000 0.492 0.376 0.132
#> SRR1433290 3 0.2020 0.62753 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR2166064 4 0.0992 0.47443 0.000 0.024 0.008 0.968 0.000
#> SRR601671 2 0.3039 0.65609 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR663874 2 0.3395 0.52782 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.4446 0.22196 0.000 0.400 0.008 0.592 0.000
#> SRR1408249 2 0.3752 0.55997 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR663284 4 0.4306 -0.19579 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1402794 5 0.4015 0.17201 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR614852 4 0.3241 0.49296 0.000 0.144 0.024 0.832 0.000
#> SRR1348040 5 0.5113 0.34135 0.000 0.000 0.044 0.380 0.576
#> SRR1489610 2 0.4305 0.22613 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.3661 0.56425 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1361480 4 0.3949 0.27360 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1444501 3 0.2020 0.62753 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1415773 4 0.5747 -0.16077 0.000 0.000 0.088 0.504 0.408
#> SRR1388832 5 0.2846 0.44047 0.048 0.000 0.052 0.012 0.888
#> SRR1394637 1 0.0794 0.92409 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR606974 4 0.4410 0.16714 0.000 0.440 0.004 0.556 0.000
#> SRR662918 2 0.4249 0.19898 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR817421 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1400823 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2329 0.66571 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR608264 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1318560 1 0.0290 0.93476 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1454117 4 0.4386 0.42489 0.000 0.240 0.016 0.728 0.016
#> SRR1312684 1 0.1836 0.89550 0.932 0.000 0.036 0.032 0.000
#> SRR615044 5 0.5016 0.38114 0.000 0.000 0.044 0.348 0.608
#> SRR1432743 5 0.6271 0.07429 0.000 0.000 0.412 0.148 0.440
#> SRR1388873 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.3508 0.34322 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1406008 2 0.4182 0.38413 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1396786 2 0.2329 0.64486 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1446564 1 0.3216 0.81875 0.848 0.000 0.044 0.108 0.000
#> SRR1318465 3 0.4014 0.43705 0.000 0.000 0.728 0.256 0.016
#> SRR1431083 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4341 0.21490 0.000 0.364 0.008 0.628 0.000
#> SRR655170 2 0.4262 0.10865 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1087825 4 0.6979 0.29106 0.000 0.228 0.132 0.564 0.076
#> SRR662019 5 0.3368 0.39678 0.024 0.000 0.156 0.000 0.820
#> SRR1349209 5 0.6236 0.25538 0.000 0.000 0.248 0.208 0.544
#> SRR1326161 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.3661 0.56425 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.3039 0.64829 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.6355 0.50084 0.608 0.000 0.044 0.108 0.240
#> SRR1408183 5 0.4249 -0.02452 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1084369 3 0.2597 0.62792 0.000 0.000 0.884 0.024 0.092
#> SRR598452 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR660709 4 0.6402 -0.13920 0.000 0.000 0.208 0.504 0.288
#> SRR809444 1 0.0794 0.92409 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.2280 0.65174 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1375774 1 0.2193 0.88272 0.912 0.000 0.028 0.000 0.060
#> SRR1326292 1 0.5172 0.54529 0.616 0.000 0.060 0.324 0.000
#> SRR657139 1 0.3966 0.53312 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1440744 2 0.3752 0.55997 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.7321 0.40932 0.000 0.220 0.092 0.532 0.156
#> SRR1381775 1 0.1195 0.91857 0.960 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1363908 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 4 0.4674 0.08305 0.000 0.416 0.016 0.568 0.000
#> SRR658989 5 0.3760 0.40200 0.000 0.000 0.188 0.028 0.784
#> SRR1353663 1 0.0703 0.92654 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0162 0.93804 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR819054 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.4122 0.30261 0.000 0.044 0.008 0.784 0.164
#> SRR1331922 1 0.7562 -0.11912 0.388 0.000 0.044 0.256 0.312
#> SRR615479 5 0.5659 0.32436 0.100 0.000 0.000 0.320 0.580
#> SRR1375796 2 0.3661 0.48750 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1386991 5 0.4987 0.48963 0.000 0.000 0.080 0.236 0.684
#> SRR1355217 2 0.4528 0.11685 0.000 0.548 0.000 0.008 0.444
#> SRR1356290 4 0.7057 -0.14473 0.000 0.008 0.320 0.348 0.324
#> SRR659507 5 0.3395 0.48237 0.000 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR663296 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.3353 0.63634 0.000 0.796 0.000 0.196 0.008
#> SRR661155 4 0.1822 0.43769 0.000 0.004 0.036 0.936 0.024
#> SRR1414727 5 0.1597 0.46877 0.000 0.000 0.012 0.048 0.940
#> SRR663477 1 0.3216 0.81875 0.848 0.000 0.044 0.108 0.000
#> SRR1354489 3 0.3039 0.57909 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1377800 5 0.0404 0.44252 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR614611 2 0.0510 0.71552 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR655052 4 0.5102 0.23404 0.000 0.000 0.100 0.684 0.216
#> SRR1478968 1 0.5341 0.30638 0.504 0.000 0.052 0.444 0.000
#> SRR1351280 2 0.4268 0.29290 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR613951 4 0.2813 0.34976 0.000 0.000 0.024 0.868 0.108
#> SRR1418022 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 5 0.6090 0.15406 0.000 0.000 0.348 0.136 0.516
#> SRR1408161 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 5 0.3177 0.36892 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR655040 4 0.5108 0.33045 0.000 0.008 0.120 0.716 0.156
#> SRR810225 2 0.2813 0.66190 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.2280 0.58375 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1402328 2 0.2329 0.64073 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1480455 2 0.3177 0.56208 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1442104 3 0.5405 0.56127 0.000 0.000 0.640 0.104 0.256
#> SRR1453416 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.4305 0.37249 0.000 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1414314 2 0.2230 0.68744 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR663026 2 0.0510 0.71552 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1478386 2 0.2773 0.66302 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1458683 3 0.6575 0.40597 0.000 0.000 0.464 0.300 0.236
#> SRR1370572 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.3671 0.47704 0.000 0.008 0.000 0.236 0.756
#> SRR1310735 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5112 0.02867 0.000 0.468 0.036 0.496 0.000
#> SRR660260 5 0.6510 0.31273 0.000 0.120 0.036 0.272 0.572
#> SRR1071231 2 0.3949 0.49848 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1459125 4 0.5903 -0.01930 0.000 0.000 0.120 0.548 0.332
#> SRR1337173 5 0.6826 0.13239 0.000 0.000 0.332 0.332 0.336
#> SRR1396250 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR2166376 5 0.6245 0.25509 0.000 0.000 0.236 0.220 0.544
#> SRR659816 4 0.5906 0.00774 0.000 0.008 0.096 0.568 0.328
#> SRR1401379 4 0.4305 -0.20102 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR600981 4 0.5191 0.38977 0.000 0.244 0.064 0.680 0.012
#> SRR1398335 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.5525 0.39418 0.000 0.048 0.116 0.716 0.120
#> SRR660115 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0162 0.71734 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4101 0.45331 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0162 0.71739 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319648 4 0.3480 0.39460 0.000 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR1092985 1 0.0162 0.93802 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.3752 0.55997 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1468658 5 0.6175 0.12138 0.000 0.000 0.332 0.152 0.516
#> SRR1390437 4 0.4441 0.43129 0.000 0.236 0.044 0.720 0.000
#> SRR658057 4 0.4273 -0.07231 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR612635 2 0.4192 0.37756 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1351480 2 0.3177 0.64231 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3395 0.69444 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR659590 2 0.3636 0.49915 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.2605 0.68148 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.71694 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.3661 0.60965 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1345894 3 0.3039 0.60132 0.000 0.000 0.836 0.012 0.152
#> SRR1442928 5 0.7468 0.18945 0.000 0.140 0.080 0.328 0.452
#> SRR1464681 4 0.4119 0.41513 0.000 0.212 0.036 0.752 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.6593 -0.17559 0.000 0.000 0.440 0.220 0.340
#> SRR1365426 5 0.7118 0.14144 0.092 0.084 0.000 0.340 0.484
#> SRR1487947 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.3966 0.53312 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR603236 5 0.6821 0.13603 0.000 0.000 0.324 0.324 0.352
#> SRR660673 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0290 0.71731 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR663807 2 0.0290 0.71665 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1087245 2 0.3636 0.48964 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1339108 4 0.5213 0.44136 0.000 0.072 0.080 0.748 0.100
#> SRR613426 4 0.5499 0.29934 0.016 0.000 0.124 0.688 0.172
#> SRR613879 2 0.5094 0.36423 0.000 0.600 0.000 0.352 0.048
#> SRR1385101 4 0.8074 0.02601 0.144 0.072 0.028 0.420 0.336
#> SRR1387966 2 0.4559 -0.01378 0.000 0.512 0.000 0.480 0.008
#> SRR1458852 2 0.2624 0.63489 0.000 0.872 0.116 0.012 0.000
#> SRR1430489 1 0.0794 0.92409 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.3966 0.53312 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1376249 3 0.5036 0.51614 0.052 0.000 0.628 0.000 0.320
#> SRR1321987 2 0.1121 0.70804 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR662653 2 0.1270 0.70397 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.2732 0.65715 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1383081 2 0.3210 0.64779 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR2166960 2 0.2648 0.65973 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR605101 2 0.3661 0.56425 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR818600 2 0.4305 0.21541 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1367715 2 0.4150 0.38968 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1351979 3 0.1341 0.63344 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1387054 3 0.4712 0.58924 0.000 0.004 0.724 0.064 0.208
#> SRR1444306 3 0.4201 0.31115 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1322662 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3480 0.51320 0.000 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR612767 1 0.0794 0.92409 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.3561 0.52258 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1430375 5 0.5773 0.04369 0.000 0.088 0.000 0.436 0.476
#> SRR615225 4 0.6466 0.38316 0.000 0.192 0.036 0.604 0.168
#> SRR1401839 5 0.5644 0.41742 0.000 0.000 0.096 0.328 0.576
#> SRR1379110 2 0.3109 0.64225 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1077288 5 0.3647 0.38683 0.052 0.000 0.132 0.000 0.816
#> SRR1331639 4 0.4283 0.28606 0.000 0.348 0.008 0.644 0.000
#> SRR1342782 5 0.6547 0.04861 0.000 0.232 0.000 0.296 0.472
#> SRR1443003 3 0.4718 0.55168 0.000 0.048 0.736 0.016 0.200
#> SRR612839 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4713 0.57689 0.000 0.000 0.676 0.044 0.280
#> SRR1395742 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.3792 0.57001 0.000 0.044 0.832 0.100 0.024
#> SRR664063 5 0.6522 0.02288 0.008 0.156 0.000 0.360 0.476
#> SRR1488214 1 0.2850 0.84222 0.872 0.000 0.036 0.092 0.000
#> SRR654766 4 0.3449 0.48124 0.000 0.164 0.024 0.812 0.000
#> SRR1320321 2 0.2773 0.66302 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.94005 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3395 0.52056 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1488470 2 0.3003 0.65056 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1389497 3 0.3730 0.58916 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1367109 5 0.5948 0.23713 0.000 0.000 0.408 0.108 0.484
#> SRR615311 1 0.0162 0.93804 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.1387 0.6549 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1380716 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 5 0.4953 0.4083 0.176 0.000 0.000 0.172 0.652 0.000
#> SRR1074359 6 0.6861 0.1310 0.000 0.044 0.308 0.060 0.088 0.500
#> SRR1419258 3 0.0000 0.6537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 5 0.5074 0.4651 0.000 0.000 0.032 0.156 0.692 0.120
#> SRR665262 5 0.5849 0.3797 0.000 0.184 0.020 0.000 0.568 0.228
#> SRR1499740 5 0.1910 0.5886 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1105057 2 0.4302 0.5447 0.000 0.728 0.000 0.000 0.156 0.116
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.3514 0.5567 0.000 0.000 0.020 0.000 0.752 0.228
#> SRR612215 5 0.3514 0.5567 0.000 0.000 0.020 0.000 0.752 0.228
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 5 0.5976 0.3646 0.168 0.000 0.032 0.208 0.588 0.004
#> SRR1409263 5 0.4310 0.4696 0.004 0.000 0.068 0.192 0.732 0.004
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.1333 0.6780 0.000 0.944 0.000 0.008 0.000 0.048
#> SRR614839 6 0.2178 0.5271 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR658433 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.7202 0.0153 0.000 0.000 0.416 0.184 0.124 0.276
#> SRR1328797 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR1334512 6 0.3221 0.4569 0.000 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0146 0.6866 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354955 5 0.5690 0.4213 0.000 0.000 0.052 0.192 0.632 0.124
#> SRR654802 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR660066 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 5 0.1910 0.5886 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1402153 3 0.4156 0.4352 0.000 0.256 0.704 0.000 0.008 0.032
#> SRR655887 2 0.1007 0.6774 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1408529 3 0.4377 0.4823 0.000 0.000 0.720 0.000 0.160 0.120
#> SRR658707 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 6 0.5378 0.3534 0.000 0.128 0.012 0.024 0.160 0.676
#> SRR1074670 5 0.6657 0.2736 0.000 0.000 0.148 0.192 0.536 0.124
#> SRR1375439 5 0.1910 0.5886 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1329003 4 0.2664 0.4517 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR1404837 5 0.5241 0.2063 0.000 0.016 0.000 0.060 0.528 0.396
#> SRR1317920 1 0.3595 0.6702 0.704 0.000 0.000 0.288 0.000 0.008
#> SRR1455525 4 0.1387 0.3912 0.000 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.5513 0.4220 0.000 0.000 0.040 0.192 0.644 0.124
#> SRR1068855 1 0.3101 0.7318 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR612227 5 0.6068 0.3775 0.000 0.000 0.056 0.236 0.576 0.132
#> SRR1388809 2 0.1075 0.6844 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1413872 4 0.3868 0.2332 0.000 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1452864 1 0.3672 0.6481 0.688 0.000 0.000 0.304 0.000 0.008
#> SRR1473078 5 0.3318 0.5111 0.000 0.000 0.032 0.172 0.796 0.000
#> SRR615814 2 0.4691 0.5106 0.000 0.680 0.000 0.000 0.196 0.124
#> SRR1325225 1 0.3672 0.6481 0.688 0.000 0.000 0.304 0.000 0.008
#> SRR1313687 2 0.0363 0.6860 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0146 0.6866 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096662 6 0.3050 0.4692 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.3740 0.5118 0.000 0.032 0.000 0.000 0.740 0.228
#> SRR660164 6 0.2454 0.5203 0.000 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR815783 2 0.5217 0.3954 0.000 0.608 0.000 0.000 0.232 0.160
#> SRR809595 5 0.2402 0.5813 0.004 0.000 0.000 0.000 0.856 0.140
#> SRR1403133 2 0.2629 0.6476 0.000 0.872 0.000 0.000 0.060 0.068
#> SRR815470 2 0.5258 -0.1343 0.000 0.472 0.072 0.008 0.000 0.448
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 6 0.6325 -0.0754 0.000 0.000 0.020 0.248 0.268 0.464
#> SRR1478362 6 0.6412 0.2551 0.000 0.248 0.016 0.060 0.112 0.564
#> SRR1392186 6 0.4131 0.5165 0.000 0.180 0.000 0.004 0.072 0.744
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1267 0.8830 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.2697 0.7841 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.4787 -0.1155 0.000 0.000 0.028 0.488 0.472 0.012
#> SRR612683 6 0.3828 0.2075 0.000 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1392901 3 0.1194 0.6485 0.000 0.000 0.956 0.008 0.032 0.004
#> SRR1077805 3 0.5351 0.6322 0.000 0.028 0.660 0.200 0.108 0.004
#> SRR1360402 2 0.1007 0.6774 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1406112 5 0.3288 0.4534 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1355352 5 0.2416 0.5327 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR656247 1 0.3838 0.2141 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448 0.000
#> SRR813656 6 0.3103 0.4934 0.000 0.208 0.000 0.000 0.008 0.784
#> SRR808244 4 0.2894 0.3339 0.000 0.000 0.036 0.852 0.108 0.004
#> SRR1387240 2 0.3765 0.0424 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1408595 1 0.3101 0.7318 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.4957 0.3134 0.000 0.000 0.000 0.648 0.204 0.148
#> SRR1435248 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 5 0.3514 0.5567 0.000 0.000 0.020 0.000 0.752 0.228
#> SRR1408682 5 0.4856 0.3340 0.000 0.360 0.000 0.000 0.572 0.068
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 6 0.5535 0.4833 0.000 0.124 0.000 0.060 0.156 0.660
#> SRR1453911 6 0.4262 0.0942 0.000 0.000 0.016 0.000 0.476 0.508
#> SRR603164 2 0.8836 -0.3802 0.000 0.252 0.196 0.192 0.236 0.124
#> SRR1383259 2 0.5515 0.3342 0.000 0.528 0.000 0.000 0.152 0.320
#> SRR1330854 1 0.0458 0.9067 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.3847 0.2991 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.1151 0.6485 0.000 0.000 0.956 0.012 0.032 0.000
#> SRR1361546 5 0.4125 0.5245 0.008 0.120 0.000 0.000 0.764 0.108
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.4076 0.0343 0.000 0.592 0.012 0.000 0.000 0.396
#> SRR615635 2 0.1556 0.6765 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1385411 2 0.3620 0.2285 0.000 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.7308 0.2499 0.000 0.000 0.348 0.192 0.336 0.124
#> SRR662126 6 0.4710 0.4729 0.000 0.088 0.000 0.016 0.192 0.704
#> SRR1464601 2 0.1267 0.6578 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.5921 0.1066 0.000 0.460 0.000 0.000 0.240 0.300
#> SRR612539 2 0.5488 0.3678 0.000 0.556 0.000 0.000 0.172 0.272
#> SRR602010 5 0.3930 0.4971 0.000 0.092 0.000 0.000 0.764 0.144
#> SRR810249 2 0.1501 0.6771 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR818773 5 0.3245 0.5331 0.008 0.000 0.000 0.000 0.764 0.228
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 6 0.3330 0.4391 0.000 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 5 0.3810 0.2680 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 6 0.4935 0.2998 0.000 0.020 0.016 0.028 0.288 0.648
#> SRR1459937 4 0.2110 0.4062 0.000 0.000 0.004 0.900 0.084 0.012
#> SRR2185018 1 0.2048 0.8392 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.5377 0.3608 0.000 0.572 0.000 0.000 0.156 0.272
#> SRR809348 1 0.2048 0.8392 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR819261 5 0.6816 0.2229 0.000 0.000 0.172 0.192 0.512 0.124
#> SRR661074 5 0.3691 0.4919 0.000 0.000 0.036 0.192 0.768 0.004
#> SRR1349851 1 0.3672 0.6481 0.688 0.000 0.000 0.304 0.000 0.008
#> SRR1405123 6 0.5383 0.3520 0.000 0.260 0.000 0.164 0.000 0.576
#> SRR661096 2 0.3647 0.4662 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.2762 0.4462 0.196 0.000 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.3804 0.0423 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1466512 2 0.3672 0.4733 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR658212 2 0.3109 0.4817 0.000 0.772 0.000 0.004 0.000 0.224
#> SRR1430525 3 0.0790 0.6519 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1344422 4 0.7360 0.1372 0.000 0.048 0.044 0.448 0.236 0.224
#> SRR1353924 2 0.3482 0.5054 0.000 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR1314832 4 0.6785 0.0034 0.324 0.000 0.028 0.344 0.300 0.004
#> SRR1487570 1 0.3707 0.6371 0.680 0.000 0.000 0.312 0.000 0.008
#> SRR627431 6 0.5163 0.3567 0.000 0.300 0.000 0.036 0.048 0.616
#> SRR1418561 4 0.6294 0.0144 0.000 0.000 0.048 0.492 0.328 0.132
#> SRR1448029 3 0.7112 0.4594 0.000 0.000 0.436 0.192 0.260 0.112
#> SRR813802 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1007 0.6774 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1435311 2 0.3647 0.4662 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR612395 5 0.3514 0.5567 0.000 0.000 0.020 0.000 0.752 0.228
#> SRR603116 6 0.5133 0.4563 0.000 0.212 0.000 0.000 0.164 0.624
#> SRR1323152 3 0.7123 0.4371 0.000 0.000 0.448 0.192 0.236 0.124
#> SRR1368264 5 0.3773 0.5214 0.000 0.044 0.000 0.000 0.752 0.204
#> SRR1326624 1 0.3634 0.6593 0.696 0.000 0.000 0.296 0.000 0.008
#> SRR1429265 5 0.3758 0.4900 0.000 0.000 0.040 0.192 0.764 0.004
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.3652 0.4361 0.000 0.264 0.000 0.000 0.016 0.720
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 6 0.5611 0.2941 0.000 0.180 0.000 0.292 0.000 0.528
#> SRR815044 6 0.2340 0.5253 0.000 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR1338560 2 0.3482 0.5054 0.000 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR615862 2 0.3659 0.4784 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1480038 2 0.3647 0.4662 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR659436 5 0.3309 0.4509 0.000 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR613699 2 0.0260 0.6856 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 6 0.3531 0.2758 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1330327 4 0.4274 0.2771 0.000 0.004 0.000 0.552 0.012 0.432
#> SRR1489950 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.7219 0.4334 0.000 0.000 0.416 0.192 0.268 0.124
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.6745 0.0755 0.000 0.000 0.052 0.440 0.280 0.228
#> SRR600656 4 0.4199 0.3001 0.000 0.000 0.000 0.568 0.016 0.416
#> SRR658766 6 0.6412 0.0948 0.000 0.000 0.328 0.060 0.128 0.484
#> SRR655946 3 0.1116 0.6401 0.000 0.028 0.960 0.004 0.000 0.008
#> SRR817282 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 5 0.5798 0.1048 0.000 0.000 0.288 0.192 0.516 0.004
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.3245 0.5329 0.000 0.008 0.000 0.000 0.764 0.228
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.6301 0.1024 0.000 0.000 0.296 0.008 0.388 0.308
#> SRR662498 5 0.6676 0.1495 0.000 0.308 0.020 0.012 0.428 0.232
#> SRR1376764 3 0.1575 0.6358 0.000 0.032 0.936 0.000 0.032 0.000
#> SRR1377006 4 0.6344 0.0123 0.000 0.000 0.052 0.488 0.328 0.132
#> SRR656860 6 0.3101 0.4595 0.000 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR1480547 2 0.3592 0.4934 0.000 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1452515 5 0.5445 0.1797 0.000 0.000 0.416 0.000 0.464 0.120
#> SRR1324390 2 0.0146 0.6869 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615273 5 0.3804 0.1889 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR601695 6 0.6111 0.1293 0.000 0.000 0.320 0.056 0.100 0.524
#> SRR820907 2 0.3409 0.5186 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR812773 5 0.3187 0.5581 0.012 0.000 0.000 0.004 0.796 0.188
#> SRR1405984 2 0.3774 0.4202 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1472794 2 0.3747 0.0758 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.3509 0.5359 0.000 0.000 0.804 0.000 0.084 0.112
#> SRR1435626 5 0.2562 0.5239 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.3101 0.7318 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0790 0.6519 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1467966 3 0.7176 0.4327 0.000 0.000 0.436 0.204 0.236 0.124
#> SRR1320579 3 0.1049 0.6438 0.000 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1319710 6 0.3774 -0.0527 0.000 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1326604 6 0.3076 0.4647 0.000 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1098879 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR662245 2 0.6484 0.1646 0.000 0.500 0.304 0.000 0.112 0.084
#> SRR1074719 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.6480 0.2698 0.496 0.000 0.000 0.312 0.096 0.096
#> SRR601387 2 0.3315 0.5769 0.000 0.804 0.000 0.000 0.156 0.040
#> SRR614575 2 0.3647 0.4819 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1353900 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662906 2 0.4107 0.4255 0.000 0.700 0.256 0.000 0.000 0.044
#> SRR1350832 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0937 0.6789 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1313969 4 0.5686 0.2658 0.000 0.000 0.012 0.564 0.156 0.268
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.4210 0.5236 0.052 0.000 0.000 0.012 0.736 0.200
#> SRR655399 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR1319753 6 0.4025 0.3588 0.000 0.004 0.000 0.016 0.312 0.668
#> SRR818901 3 0.1663 0.6339 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR607067 6 0.3565 0.5096 0.000 0.112 0.000 0.056 0.016 0.816
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 6 0.3175 0.4553 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR661961 5 0.4111 0.5617 0.000 0.000 0.144 0.000 0.748 0.108
#> SRR658259 6 0.2996 0.4929 0.000 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3789 0.0261 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1365034 6 0.3050 0.4692 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1478053 2 0.1765 0.6589 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1475300 2 0.3499 0.5024 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1328101 5 0.5372 0.4526 0.000 0.128 0.016 0.000 0.624 0.232
#> SRR1322900 5 0.3262 0.5787 0.040 0.000 0.004 0.008 0.836 0.112
#> SRR1309942 2 0.1007 0.6780 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1345760 6 0.4355 -0.1110 0.000 0.000 0.000 0.420 0.024 0.556
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 6 0.3456 0.5294 0.000 0.172 0.000 0.040 0.000 0.788
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.4674 0.4118 0.000 0.696 0.004 0.000 0.120 0.180
#> SRR661469 5 0.1910 0.5886 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1500323 2 0.1563 0.6638 0.000 0.932 0.056 0.000 0.000 0.012
#> SRR1356705 2 0.5968 0.3099 0.000 0.536 0.000 0.020 0.172 0.272
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.5102 0.4582 0.000 0.000 0.032 0.192 0.680 0.096
#> SRR1350435 1 0.3672 0.6481 0.688 0.000 0.000 0.304 0.000 0.008
#> SRR1389177 3 0.1511 0.6466 0.000 0.000 0.944 0.012 0.032 0.012
#> SRR1368072 2 0.0363 0.6873 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR601815 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 6 0.5398 0.2145 0.000 0.000 0.020 0.096 0.284 0.600
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.7006 0.1141 0.000 0.000 0.176 0.220 0.476 0.128
#> SRR1318839 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR1432390 4 0.5625 0.2236 0.000 0.164 0.000 0.504 0.000 0.332
#> SRR613126 2 0.0458 0.6866 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089424 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.1267 0.6820 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1309556 5 0.6752 0.1920 0.000 0.000 0.048 0.292 0.424 0.236
#> SRR1456027 4 0.2762 0.4673 0.000 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1400551 5 0.3621 0.4945 0.000 0.000 0.032 0.192 0.772 0.004
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.5034 -0.1243 0.000 0.472 0.072 0.000 0.000 0.456
#> SRR1454310 2 0.1957 0.6461 0.000 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR615105 4 0.6041 0.2007 0.000 0.000 0.360 0.488 0.032 0.120
#> SRR1433290 3 0.0790 0.6519 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2166064 4 0.3868 0.2332 0.000 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR601671 2 0.3672 0.4757 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR663874 2 0.4599 0.4799 0.000 0.696 0.000 0.000 0.164 0.140
#> SRR1409130 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.5743 0.1978 0.000 0.204 0.000 0.504 0.000 0.292
#> SRR1408249 2 0.4254 0.4172 0.000 0.576 0.000 0.020 0.000 0.404
#> SRR663284 6 0.5468 0.3087 0.000 0.296 0.000 0.000 0.156 0.548
#> SRR1402794 5 0.7163 0.0263 0.000 0.000 0.248 0.192 0.436 0.124
#> SRR614852 4 0.3828 0.2782 0.000 0.000 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1348040 5 0.3548 0.5571 0.000 0.000 0.000 0.068 0.796 0.136
#> SRR1489610 6 0.3804 -0.0609 0.000 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1488091 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.3706 0.4542 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1361480 6 0.5668 0.1824 0.000 0.328 0.000 0.004 0.152 0.516
#> SRR1444501 3 0.0790 0.6519 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1415773 5 0.4697 0.3493 0.000 0.000 0.000 0.048 0.548 0.404
#> SRR1388832 5 0.3134 0.5302 0.024 0.000 0.000 0.168 0.808 0.000
#> SRR1394637 1 0.3101 0.7318 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR606974 6 0.5116 0.2778 0.000 0.392 0.004 0.020 0.036 0.548
#> SRR662918 6 0.4837 0.2095 0.000 0.432 0.000 0.000 0.056 0.512
#> SRR817421 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2854 0.5220 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR608264 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 6 0.5307 0.4891 0.000 0.124 0.000 0.044 0.156 0.676
#> SRR1312684 1 0.3360 0.7053 0.732 0.000 0.000 0.264 0.000 0.004
#> SRR615044 5 0.3336 0.5665 0.000 0.000 0.000 0.056 0.812 0.132
#> SRR1432743 3 0.6412 0.2231 0.000 0.000 0.516 0.056 0.160 0.268
#> SRR1388873 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.4191 0.4379 0.000 0.000 0.284 0.000 0.676 0.040
#> SRR1406008 2 0.5377 0.3608 0.000 0.572 0.000 0.000 0.156 0.272
#> SRR1396786 2 0.1387 0.6580 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1446564 1 0.3672 0.6481 0.688 0.000 0.000 0.304 0.000 0.008
#> SRR1318465 3 0.4313 0.3573 0.000 0.000 0.720 0.060 0.008 0.212
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 6 0.3806 0.4901 0.000 0.200 0.000 0.048 0.000 0.752
#> SRR655170 2 0.4242 -0.0118 0.000 0.536 0.000 0.016 0.000 0.448
#> SRR1087825 4 0.3284 0.4766 0.000 0.032 0.000 0.800 0.000 0.168
#> SRR662019 5 0.3852 0.4822 0.000 0.000 0.032 0.224 0.740 0.004
#> SRR1349209 4 0.6495 0.0867 0.000 0.000 0.048 0.488 0.280 0.184
#> SRR1326161 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.3647 0.4662 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.3482 0.5054 0.000 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR1454328 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.6343 0.0846 0.416 0.000 0.000 0.232 0.336 0.016
#> SRR1408183 3 0.7123 0.4371 0.000 0.000 0.448 0.192 0.236 0.124
#> SRR1084369 3 0.1503 0.6431 0.000 0.000 0.944 0.008 0.032 0.016
#> SRR598452 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR660709 6 0.5791 0.1823 0.000 0.000 0.044 0.096 0.284 0.576
#> SRR809444 1 0.3101 0.7318 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1387 0.6590 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1375774 1 0.3534 0.7178 0.740 0.000 0.000 0.244 0.016 0.000
#> SRR1326292 4 0.2730 0.4485 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR657139 5 0.3823 0.1562 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1440744 2 0.3727 0.4513 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 6 0.3963 0.4033 0.000 0.092 0.016 0.076 0.012 0.804
#> SRR1381775 1 0.3349 0.7252 0.748 0.000 0.000 0.244 0.008 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.6646 0.0414 0.000 0.420 0.000 0.060 0.156 0.364
#> SRR658989 5 0.5491 0.4477 0.000 0.000 0.048 0.172 0.656 0.124
#> SRR1353663 1 0.2996 0.7476 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.2135 0.8331 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR819054 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.5948 0.3044 0.000 0.008 0.000 0.480 0.180 0.332
#> SRR1331922 5 0.6886 0.1778 0.156 0.000 0.000 0.260 0.476 0.108
#> SRR615479 5 0.3284 0.5509 0.020 0.000 0.000 0.000 0.784 0.196
#> SRR1375796 2 0.3857 -0.0365 0.000 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1386991 5 0.3514 0.5567 0.000 0.000 0.020 0.000 0.752 0.228
#> SRR1355217 5 0.4169 0.2107 0.000 0.456 0.000 0.000 0.532 0.012
#> SRR1356290 6 0.6201 0.1209 0.000 0.000 0.320 0.052 0.116 0.512
#> SRR659507 5 0.2730 0.5769 0.000 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR663296 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.4882 0.4756 0.000 0.660 0.000 0.000 0.152 0.188
#> SRR661155 4 0.3175 0.4544 0.000 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1414727 5 0.1970 0.5651 0.000 0.000 0.008 0.092 0.900 0.000
#> SRR663477 1 0.3672 0.6481 0.688 0.000 0.000 0.304 0.000 0.008
#> SRR1354489 3 0.1151 0.6485 0.000 0.000 0.956 0.012 0.032 0.000
#> SRR1377800 5 0.2814 0.5212 0.000 0.000 0.008 0.172 0.820 0.000
#> SRR614611 2 0.1007 0.6774 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR655052 6 0.3242 0.3399 0.000 0.000 0.024 0.060 0.068 0.848
#> SRR1478968 4 0.2980 0.4541 0.180 0.000 0.000 0.808 0.012 0.000
#> SRR1351280 6 0.3126 0.4579 0.000 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR613951 6 0.5933 0.0986 0.000 0.000 0.000 0.312 0.236 0.452
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.7629 -0.1483 0.000 0.000 0.220 0.336 0.236 0.208
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 5 0.5849 0.4091 0.000 0.000 0.064 0.192 0.620 0.124
#> SRR655040 6 0.3791 0.1084 0.000 0.004 0.000 0.300 0.008 0.688
#> SRR810225 2 0.3499 0.5024 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1325377 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.1707 0.6160 0.000 0.004 0.928 0.012 0.000 0.056
#> SRR1402328 2 0.1387 0.6549 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1480455 2 0.3578 0.1922 0.000 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1442104 3 0.4666 0.6332 0.000 0.000 0.676 0.216 0.108 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.5811 0.4561 0.000 0.000 0.512 0.192 0.292 0.004
#> SRR1414314 2 0.2378 0.5977 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR663026 2 0.1007 0.6774 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1478386 2 0.3499 0.5024 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1458683 4 0.4357 0.1758 0.000 0.000 0.224 0.700 0.000 0.076
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.2165 0.5878 0.000 0.008 0.000 0.000 0.884 0.108
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5173 0.3239 0.000 0.200 0.000 0.620 0.000 0.180
#> SRR660260 6 0.6514 -0.0109 0.000 0.212 0.012 0.012 0.348 0.416
#> SRR1071231 2 0.4795 0.4317 0.000 0.604 0.000 0.000 0.072 0.324
#> SRR1459125 6 0.6520 -0.0717 0.000 0.000 0.020 0.304 0.296 0.380
#> SRR1337173 6 0.6385 0.0997 0.000 0.000 0.324 0.056 0.132 0.488
#> SRR1396250 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR2166376 6 0.6071 0.1018 0.000 0.000 0.276 0.000 0.328 0.396
#> SRR659816 6 0.5601 0.2270 0.000 0.000 0.060 0.060 0.284 0.596
#> SRR1401379 6 0.3727 0.0115 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR600981 4 0.4660 0.4011 0.000 0.036 0.008 0.632 0.004 0.320
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 6 0.6647 0.0992 0.000 0.048 0.004 0.304 0.176 0.468
#> SRR660115 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0260 0.6860 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359780 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 6 0.3868 -0.1720 0.000 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0790 0.6849 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1319648 6 0.4525 0.5011 0.000 0.128 0.000 0.004 0.152 0.716
#> SRR1092985 1 0.0632 0.9063 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.3765 0.4395 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1468658 3 0.7430 0.3606 0.000 0.000 0.372 0.252 0.236 0.140
#> SRR1390437 6 0.7252 0.2571 0.000 0.148 0.000 0.296 0.156 0.400
#> SRR658057 6 0.2823 0.4911 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR612635 6 0.3309 0.4126 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1351480 2 0.3706 0.3987 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3782 0.3050 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR659590 2 0.3968 0.5747 0.000 0.756 0.000 0.004 0.060 0.180
#> SRR614263 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3446 0.5305 0.000 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR659911 2 0.0000 0.6869 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.3985 0.6610 0.000 0.000 0.768 0.088 0.140 0.004
#> SRR1345894 3 0.0790 0.6519 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1442928 6 0.6009 0.1395 0.000 0.140 0.020 0.000 0.372 0.468
#> SRR1464681 4 0.3076 0.4580 0.000 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.7014 -0.1113 0.000 0.000 0.348 0.060 0.300 0.292
#> SRR1365426 5 0.3376 0.5348 0.016 0.000 0.000 0.000 0.764 0.220
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 5 0.3804 0.1889 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR603236 6 0.6355 0.1039 0.000 0.000 0.320 0.052 0.136 0.492
#> SRR660673 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0291 0.6873 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR663807 2 0.0363 0.6859 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1087245 2 0.3860 -0.0478 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1339108 6 0.4570 0.4197 0.000 0.044 0.000 0.060 0.156 0.740
#> SRR613426 6 0.4357 0.0570 0.000 0.000 0.020 0.304 0.016 0.660
#> SRR613879 6 0.3330 0.4387 0.000 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1385101 5 0.3941 0.5221 0.028 0.000 0.000 0.008 0.732 0.232
#> SRR1387966 6 0.3867 0.1129 0.000 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR1458852 2 0.1625 0.6609 0.000 0.928 0.060 0.000 0.000 0.012
#> SRR1430489 1 0.3101 0.7318 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1349231 5 0.3804 0.1889 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1376249 3 0.4874 0.6320 0.000 0.000 0.672 0.192 0.132 0.004
#> SRR1321987 2 0.1556 0.6410 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR662653 2 0.1075 0.6847 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.4270 0.5452 0.000 0.740 0.000 0.004 0.156 0.100
#> SRR1383081 2 0.3782 0.3579 0.000 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR2166960 2 0.4261 0.5250 0.000 0.732 0.000 0.000 0.156 0.112
#> SRR605101 2 0.3647 0.4662 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR818600 6 0.2912 0.4834 0.000 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1367715 6 0.3499 0.3816 0.000 0.320 0.000 0.000 0.000 0.680
#> SRR1351979 3 0.0146 0.6540 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387054 3 0.5086 0.6443 0.000 0.028 0.696 0.164 0.108 0.004
#> SRR1444306 3 0.3659 0.2156 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3797 0.0235 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR612767 1 0.3101 0.7318 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.4942 0.4663 0.000 0.652 0.000 0.000 0.156 0.192
#> SRR1430375 5 0.3864 -0.0513 0.000 0.000 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR615225 6 0.4882 0.0819 0.000 0.000 0.016 0.280 0.060 0.644
#> SRR1401839 5 0.4618 0.5120 0.000 0.000 0.020 0.052 0.692 0.236
#> SRR1379110 2 0.3428 0.5124 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1077288 5 0.3823 0.4862 0.000 0.000 0.044 0.192 0.760 0.004
#> SRR1331639 4 0.5319 0.2429 0.000 0.108 0.000 0.504 0.000 0.388
#> SRR1342782 5 0.3852 0.5352 0.000 0.064 0.000 0.000 0.760 0.176
#> SRR1443003 3 0.1462 0.6395 0.000 0.008 0.936 0.000 0.056 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4669 0.6427 0.000 0.000 0.692 0.196 0.108 0.004
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.1364 0.6442 0.000 0.000 0.952 0.016 0.020 0.012
#> SRR664063 5 0.3276 0.5316 0.004 0.004 0.000 0.000 0.764 0.228
#> SRR1488214 1 0.3615 0.6648 0.700 0.000 0.000 0.292 0.000 0.008
#> SRR654766 4 0.5942 0.3103 0.000 0.040 0.000 0.564 0.124 0.272
#> SRR1320321 2 0.3499 0.5024 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3765 0.0420 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1488470 2 0.3464 0.5100 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1389497 3 0.4641 0.6444 0.000 0.000 0.696 0.192 0.108 0.004
#> SRR1367109 5 0.6513 0.2896 0.000 0.000 0.320 0.068 0.480 0.132
#> SRR615311 1 0.1075 0.8915 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.530 0.782 0.886 0.3865 0.632 0.632
#> 3 3 0.813 0.865 0.945 0.6352 0.652 0.486
#> 4 4 0.681 0.781 0.885 0.1269 0.836 0.603
#> 5 5 0.635 0.569 0.755 0.0701 0.890 0.650
#> 6 6 0.641 0.548 0.703 0.0529 0.869 0.515
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.9988 -0.1621 0.520 0.480
#> SRR1084417 2 0.9833 0.4726 0.424 0.576
#> SRR1074359 2 0.0938 0.8398 0.012 0.988
#> SRR1419258 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1403366 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR665262 2 0.6801 0.7842 0.180 0.820
#> SRR1499740 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1105057 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.8713 0.7237 0.292 0.708
#> SRR612215 2 0.7528 0.7673 0.216 0.784
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 1.0000 -0.2202 0.504 0.496
#> SRR1409263 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1328797 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1334512 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR654802 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR660066 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1402153 2 0.6623 0.7861 0.172 0.828
#> SRR655887 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR658707 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.1184 0.8386 0.016 0.984
#> SRR1074670 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1375439 2 0.8713 0.7237 0.292 0.708
#> SRR1329003 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1404837 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.9552 0.2529 0.624 0.376
#> SRR1455525 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR613999 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1068855 1 0.2236 0.8709 0.964 0.036
#> SRR1375509 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR612227 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1388809 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.9815 0.0906 0.580 0.420
#> SRR1473078 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR615814 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1325225 2 1.0000 0.2342 0.500 0.500
#> SRR1313687 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.8443 0.7382 0.272 0.728
#> SRR660164 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1403133 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1478362 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0376 0.8975 0.996 0.004
#> SRR1471594 1 0.0672 0.8946 0.992 0.008
#> SRR1354270 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR612683 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1077805 2 0.4562 0.8161 0.096 0.904
#> SRR1360402 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1355352 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR656247 1 0.7219 0.6757 0.800 0.200
#> SRR813656 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR808244 2 0.8813 0.7163 0.300 0.700
#> SRR1387240 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.8327 0.5576 0.736 0.264
#> SRR1385277 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1435248 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1408682 2 0.5408 0.8080 0.124 0.876
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.7453 0.7693 0.212 0.788
#> SRR603164 2 0.2043 0.8359 0.032 0.968
#> SRR1383259 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 1.0000 -0.2362 0.500 0.500
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1361546 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR662126 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.8386 0.7405 0.268 0.732
#> SRR810249 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.8763 0.7200 0.296 0.704
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.9983 -0.1453 0.524 0.476
#> SRR1334247 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR661639 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.8499 0.7358 0.276 0.724
#> SRR1459937 2 0.5059 0.8124 0.112 0.888
#> SRR2185018 1 0.0672 0.8946 0.992 0.008
#> SRR655732 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR661074 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1349851 1 0.4022 0.8286 0.920 0.080
#> SRR1405123 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1454651 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1307677 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1344422 2 0.0376 0.8411 0.004 0.996
#> SRR1353924 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1314832 2 0.9686 0.5497 0.396 0.604
#> SRR1487570 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR627431 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1418561 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1448029 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR813802 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.7528 0.7673 0.216 0.784
#> SRR603116 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1368264 2 0.7528 0.7673 0.216 0.784
#> SRR1326624 1 0.8386 0.5466 0.732 0.268
#> SRR1429265 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0672 0.8405 0.008 0.992
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR613699 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0376 0.8411 0.004 0.996
#> SRR1489950 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR600656 2 0.4431 0.8191 0.092 0.908
#> SRR658766 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR655946 2 0.3733 0.8232 0.072 0.928
#> SRR817282 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR662498 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1376764 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1377006 2 0.8763 0.7200 0.296 0.704
#> SRR656860 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1324390 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR615273 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR601695 2 0.1633 0.8375 0.024 0.976
#> SRR820907 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR812773 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1405984 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.1184 0.8882 0.984 0.016
#> SRR1095720 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1435626 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1080766 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1467966 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1320579 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1319710 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR662245 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR816226 2 0.8861 0.7125 0.304 0.696
#> SRR601387 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.4431 0.8191 0.092 0.908
#> SRR1388528 1 0.7950 0.6013 0.760 0.240
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR655399 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1319753 2 0.4161 0.8219 0.084 0.916
#> SRR818901 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR607067 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR658259 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.4939 0.8140 0.108 0.892
#> SRR1322900 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1309942 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.2236 0.8347 0.036 0.964
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1500323 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.1184 0.8392 0.016 0.984
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1350435 1 0.7219 0.6744 0.800 0.200
#> SRR1389177 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1368072 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1318839 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1432390 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.1414 0.8383 0.020 0.980
#> SRR1089424 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1456027 2 0.8207 0.7476 0.256 0.744
#> SRR1400551 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1320469 1 0.9686 0.1788 0.604 0.396
#> SRR614251 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.4431 0.8191 0.092 0.908
#> SRR1433290 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR2166064 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR614852 2 0.0672 0.8405 0.008 0.992
#> SRR1348040 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1489610 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1415773 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1394637 1 0.0376 0.8975 0.996 0.004
#> SRR606974 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1318560 1 0.9996 -0.1916 0.512 0.488
#> SRR1454117 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.8763 0.4824 0.704 0.296
#> SRR615044 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1432743 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1388873 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1406008 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.9552 0.2559 0.624 0.376
#> SRR1318465 2 0.8555 0.7336 0.280 0.720
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.4022 0.8228 0.080 0.920
#> SRR662019 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1349209 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1326161 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1408183 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1084369 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR598452 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR660709 2 0.2236 0.8348 0.036 0.964
#> SRR809444 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.7056 0.6882 0.808 0.192
#> SRR1326292 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR657139 1 0.9996 -0.1912 0.512 0.488
#> SRR1440744 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.1843 0.8367 0.028 0.972
#> SRR1381775 1 0.5629 0.7701 0.868 0.132
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR819054 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.5178 0.8108 0.116 0.884
#> SRR1331922 2 0.9323 0.6404 0.348 0.652
#> SRR615479 2 0.8813 0.7163 0.300 0.700
#> SRR1375796 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1355217 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1356290 2 0.4298 0.8204 0.088 0.912
#> SRR659507 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR663296 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR663477 1 0.9087 0.4102 0.676 0.324
#> SRR1354489 2 0.8813 0.7163 0.300 0.700
#> SRR1377800 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR614611 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1478968 2 0.7219 0.7761 0.200 0.800
#> SRR1351280 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0672 0.8405 0.008 0.992
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR655040 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.5946 0.8002 0.144 0.856
#> SRR1402328 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1481396 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1414314 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0938 0.8398 0.012 0.988
#> SRR660260 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1071231 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0938 0.8398 0.012 0.988
#> SRR1337173 2 0.8443 0.7383 0.272 0.728
#> SRR1396250 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR2166376 2 0.8661 0.7272 0.288 0.712
#> SRR659816 2 0.1414 0.8383 0.020 0.980
#> SRR1401379 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.3879 0.8240 0.076 0.924
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.1414 0.8849 0.980 0.020
#> SRR656409 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1390437 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.6887 0.6999 0.816 0.184
#> SRR659590 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1345894 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1442928 2 0.7745 0.7614 0.228 0.772
#> SRR1464681 2 0.0376 0.8411 0.004 0.996
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1365426 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1487947 1 0.9996 -0.1905 0.512 0.488
#> SRR659708 1 0.9998 -0.2066 0.508 0.492
#> SRR603236 2 0.4022 0.8228 0.080 0.920
#> SRR660673 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.5408 0.8078 0.124 0.876
#> SRR613879 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1387966 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.9963 -0.0974 0.536 0.464
#> SRR1349231 2 0.8909 0.7067 0.308 0.692
#> SRR1376249 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1321987 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1387054 2 0.4298 0.8193 0.088 0.912
#> SRR1444306 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.7815 0.6192 0.768 0.232
#> SRR1489030 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.7528 0.7673 0.216 0.784
#> SRR615225 2 0.4298 0.8204 0.088 0.912
#> SRR1401839 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR1379110 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1077288 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1331639 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1443003 2 0.8713 0.7237 0.292 0.708
#> SRR612839 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.8608 0.7306 0.284 0.716
#> SRR664063 2 0.8555 0.7334 0.280 0.720
#> SRR1488214 1 0.6887 0.7000 0.816 0.184
#> SRR654766 2 0.2948 0.8306 0.052 0.948
#> SRR1320321 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9002 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.8416 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR1367109 2 0.8861 0.7123 0.304 0.696
#> SRR615311 1 0.0672 0.8946 0.992 0.008
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0592 0.9725 0.988 0.000 0.012
#> SRR613282 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 3 0.1031 0.9011 0.024 0.000 0.976
#> SRR1084417 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074359 3 0.0237 0.9147 0.000 0.004 0.996
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.6215 0.2501 0.000 0.572 0.428
#> SRR1499740 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 3 0.6180 0.2997 0.000 0.416 0.584
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0237 0.9787 0.996 0.000 0.004
#> SRR1393449 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0424 0.9757 0.992 0.000 0.008
#> SRR1334889 3 0.0237 0.9146 0.000 0.004 0.996
#> SRR614839 2 0.1529 0.9081 0.000 0.960 0.040
#> SRR658433 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.2711 0.8624 0.000 0.912 0.088
#> SRR1471117 1 0.4235 0.7736 0.824 0.000 0.176
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.0892 0.9046 0.000 0.020 0.980
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404837 2 0.4654 0.7243 0.000 0.792 0.208
#> SRR1317920 3 0.4887 0.6825 0.228 0.000 0.772
#> SRR1455525 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.3192 0.8641 0.888 0.000 0.112
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452864 3 0.2711 0.8477 0.088 0.000 0.912
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 3 0.1031 0.9010 0.024 0.000 0.976
#> SRR1313687 2 0.4605 0.7295 0.000 0.796 0.204
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 3 0.5760 0.5160 0.000 0.328 0.672
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.4121 0.7692 0.000 0.168 0.832
#> SRR660164 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.6291 0.1124 0.000 0.532 0.468
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 3 0.5327 0.6153 0.000 0.272 0.728
#> SRR1392186 2 0.6291 0.1258 0.000 0.532 0.468
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0892 0.9656 0.980 0.000 0.020
#> SRR1471594 1 0.1163 0.9580 0.972 0.000 0.028
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 3 0.3941 0.7846 0.156 0.000 0.844
#> SRR813656 2 0.5254 0.6477 0.000 0.736 0.264
#> SRR808244 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 3 0.4452 0.7421 0.192 0.000 0.808
#> SRR1385277 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.4555 0.7312 0.000 0.200 0.800
#> SRR1408682 2 0.6140 0.3224 0.000 0.596 0.404
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0237 0.9359 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453911 3 0.6267 0.1865 0.000 0.452 0.548
#> SRR603164 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 3 0.5785 0.5078 0.000 0.332 0.668
#> SRR1330854 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.5591 0.5608 0.000 0.696 0.304
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3619 0.8175 0.000 0.864 0.136
#> SRR615635 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 3 0.1643 0.8879 0.000 0.044 0.956
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.3551 0.8165 0.000 0.868 0.132
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 3 0.5529 0.5790 0.000 0.296 0.704
#> SRR810249 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0592 0.9096 0.012 0.000 0.988
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0747 0.9692 0.984 0.000 0.016
#> SRR655732 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0424 0.9757 0.992 0.000 0.008
#> SRR819261 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.6274 0.1042 0.544 0.000 0.456
#> SRR1405123 3 0.3116 0.8343 0.000 0.108 0.892
#> SRR661096 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.1289 0.9151 0.000 0.968 0.032
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.3879 0.7810 0.152 0.000 0.848
#> SRR1487570 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR627431 2 0.3752 0.8088 0.000 0.856 0.144
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 3 0.6126 0.3445 0.000 0.400 0.600
#> SRR603116 2 0.4842 0.7018 0.000 0.776 0.224
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 3 0.5678 0.5400 0.000 0.316 0.684
#> SRR1326624 3 0.5431 0.5877 0.284 0.000 0.716
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0237 0.9787 0.996 0.000 0.004
#> SRR615611 3 0.6307 0.0488 0.000 0.488 0.512
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 3 0.5591 0.5634 0.000 0.304 0.696
#> SRR815044 2 0.1860 0.8968 0.000 0.948 0.052
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.1411 0.9109 0.000 0.964 0.036
#> SRR1330327 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR658766 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.4504 0.7362 0.000 0.196 0.804
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.2796 0.8493 0.000 0.092 0.908
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.1860 0.8968 0.000 0.948 0.052
#> SRR1480547 2 0.2448 0.8746 0.000 0.924 0.076
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR601695 2 0.6111 0.3703 0.000 0.604 0.396
#> SRR820907 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0892 0.9244 0.000 0.980 0.020
#> SRR1365448 1 0.5529 0.5535 0.704 0.000 0.296
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0892 0.9656 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.5733 0.5206 0.000 0.676 0.324
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 3 0.4178 0.7646 0.000 0.172 0.828
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388528 3 0.4974 0.6825 0.236 0.000 0.764
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 3 0.4842 0.6951 0.000 0.224 0.776
#> SRR818901 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.4796 0.7076 0.000 0.780 0.220
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.2796 0.8589 0.000 0.908 0.092
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 3 0.6180 0.2997 0.000 0.416 0.584
#> SRR1322900 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.6008 0.3888 0.000 0.628 0.372
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 3 0.3551 0.8097 0.000 0.132 0.868
#> SRR1500323 2 0.0592 0.9301 0.000 0.988 0.012
#> SRR1356705 2 0.6192 0.2752 0.000 0.580 0.420
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 3 0.6225 0.2641 0.432 0.000 0.568
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.5968 0.4275 0.000 0.364 0.636
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0424 0.9757 0.992 0.000 0.008
#> SRR816382 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 3 0.4555 0.7269 0.000 0.200 0.800
#> SRR613126 2 0.5733 0.5206 0.000 0.676 0.324
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456027 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 3 0.4178 0.7574 0.172 0.000 0.828
#> SRR614251 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.1163 0.8993 0.000 0.028 0.972
#> SRR601671 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 3 0.3941 0.7830 0.000 0.156 0.844
#> SRR1408249 3 0.5926 0.4545 0.000 0.356 0.644
#> SRR663284 3 0.1031 0.9033 0.000 0.024 0.976
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348040 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 3 0.5706 0.5441 0.000 0.320 0.680
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.4062 0.7842 0.000 0.836 0.164
#> SRR1388832 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394637 1 0.1643 0.9415 0.956 0.000 0.044
#> SRR606974 2 0.3267 0.8375 0.000 0.884 0.116
#> SRR662918 2 0.6140 0.3022 0.000 0.596 0.404
#> SRR817421 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 3 0.4887 0.6949 0.228 0.000 0.772
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 3 0.6299 0.1395 0.476 0.000 0.524
#> SRR615044 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 3 0.4346 0.7516 0.184 0.000 0.816
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 3 0.6215 0.2697 0.000 0.428 0.572
#> SRR655170 2 0.1289 0.9150 0.000 0.968 0.032
#> SRR1087825 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR662019 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.1643 0.8874 0.000 0.044 0.956
#> SRR809444 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 3 0.4605 0.7267 0.204 0.000 0.796
#> SRR1326292 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR657139 3 0.4555 0.7318 0.200 0.000 0.800
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381775 3 0.5706 0.5399 0.320 0.000 0.680
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.1529 0.9454 0.960 0.000 0.040
#> SRR811771 1 0.0592 0.9725 0.988 0.000 0.012
#> SRR813983 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.1643 0.8879 0.000 0.044 0.956
#> SRR1331922 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR615479 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.4235 0.7602 0.000 0.176 0.824
#> SRR1355217 3 0.5968 0.4347 0.000 0.364 0.636
#> SRR1356290 2 0.6111 0.3453 0.000 0.604 0.396
#> SRR659507 3 0.5529 0.5793 0.000 0.296 0.704
#> SRR663296 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 3 0.0237 0.9146 0.000 0.004 0.996
#> SRR1414727 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR663477 3 0.5431 0.5897 0.284 0.000 0.716
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 3 0.6244 0.1996 0.000 0.440 0.560
#> SRR1478968 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 3 0.5397 0.6066 0.000 0.280 0.720
#> SRR810225 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.2261 0.8837 0.000 0.932 0.068
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0592 0.9298 0.000 0.988 0.012
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR660260 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 3 0.0237 0.9147 0.000 0.004 0.996
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.6286 0.1068 0.000 0.464 0.536
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 3 0.6260 0.1880 0.000 0.448 0.552
#> SRR660115 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0237 0.9358 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6192 0.2553 0.000 0.580 0.420
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 3 0.6095 0.3702 0.000 0.392 0.608
#> SRR1092985 1 0.3752 0.8223 0.856 0.000 0.144
#> SRR656409 3 0.6168 0.3147 0.000 0.412 0.588
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 3 0.6192 0.3057 0.420 0.000 0.580
#> SRR659590 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 3 0.6079 0.3759 0.000 0.388 0.612
#> SRR1464681 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 3 0.2356 0.8667 0.000 0.072 0.928
#> SRR1487947 3 0.0592 0.9094 0.012 0.000 0.988
#> SRR659708 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR603236 2 0.5678 0.5371 0.000 0.684 0.316
#> SRR660673 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.1031 0.9215 0.000 0.976 0.024
#> SRR1385101 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0424 0.9329 0.000 0.992 0.008
#> SRR1430489 3 0.0747 0.9067 0.016 0.000 0.984
#> SRR1349231 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0237 0.9358 0.000 0.996 0.004
#> SRR818600 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 3 0.4931 0.6735 0.232 0.000 0.768
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.6305 0.0703 0.000 0.484 0.516
#> SRR615225 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401839 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 3 0.1031 0.9022 0.000 0.024 0.976
#> SRR1342782 3 0.5497 0.5864 0.000 0.292 0.708
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.1031 0.9616 0.976 0.000 0.024
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 3 0.3412 0.8180 0.000 0.124 0.876
#> SRR1488214 3 0.5926 0.4690 0.356 0.000 0.644
#> SRR654766 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9815 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9385 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.1529 0.9073 0.000 0.960 0.040
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9170 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0424 0.9757 0.992 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR612803 1 0.2760 0.8981 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR613282 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355396 3 0.6039 0.5489 0.188 0.000 0.684 0.128
#> SRR1084417 3 0.2408 0.7377 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1074359 3 0.6465 -0.0970 0.000 0.072 0.516 0.412
#> SRR1419258 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1403366 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665262 3 0.4454 0.5449 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1499740 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0469 0.9022 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1439742 1 0.2530 0.9069 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR614599 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612215 3 0.4193 0.6056 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1094051 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324496 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1393449 3 0.4259 0.6708 0.128 0.000 0.816 0.056
#> SRR1409263 3 0.0336 0.8128 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1431288 1 0.3161 0.8957 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1334889 4 0.7197 0.2609 0.000 0.392 0.140 0.468
#> SRR614839 2 0.2644 0.8501 0.000 0.908 0.060 0.032
#> SRR658433 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 4 0.5000 0.0952 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1328797 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1334512 2 0.1022 0.8950 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1471117 1 0.2530 0.9069 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1311553 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR654802 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR660066 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402153 3 0.2675 0.7636 0.000 0.008 0.892 0.100
#> SRR655887 2 0.0707 0.9001 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1408529 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR658707 1 0.0469 0.9147 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1384371 3 0.6883 0.4482 0.000 0.260 0.584 0.156
#> SRR1074670 3 0.1022 0.8149 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1375439 3 0.2868 0.7413 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1329003 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1404837 2 0.5173 0.4731 0.000 0.660 0.320 0.020
#> SRR1317920 1 0.5578 0.6467 0.648 0.000 0.040 0.312
#> SRR1455525 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR613999 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310836 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1499764 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658200 3 0.0336 0.8132 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1068855 1 0.4088 0.8092 0.764 0.000 0.004 0.232
#> SRR1375509 3 0.0921 0.8152 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR612227 3 0.0592 0.8147 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1452864 1 0.6477 0.4824 0.620 0.000 0.116 0.264
#> SRR1473078 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325225 4 0.3606 0.8829 0.024 0.000 0.132 0.844
#> SRR1313687 3 0.6214 0.3364 0.000 0.408 0.536 0.056
#> SRR1358220 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1096662 2 0.6141 0.4178 0.000 0.616 0.072 0.312
#> SRR1487746 1 0.0188 0.9145 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354644 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401752 3 0.3937 0.6944 0.000 0.188 0.800 0.012
#> SRR660164 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809595 3 0.3668 0.6989 0.000 0.188 0.808 0.004
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 4 0.5092 0.7775 0.000 0.140 0.096 0.764
#> SRR1344382 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432453 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1478362 4 0.5226 0.7822 0.000 0.128 0.116 0.756
#> SRR1392186 2 0.5950 0.1943 0.000 0.544 0.416 0.040
#> SRR1347937 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431569 1 0.2888 0.8982 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1471594 1 0.2999 0.8943 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1354270 3 0.3764 0.6247 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR612683 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1077805 3 0.4804 0.2123 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0707 0.8147 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1355352 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656247 3 0.5599 0.4957 0.288 0.000 0.664 0.048
#> SRR813656 2 0.3542 0.7911 0.000 0.852 0.120 0.028
#> SRR808244 4 0.3024 0.8853 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 3 0.6623 0.4714 0.232 0.000 0.620 0.148
#> SRR1385277 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.3444 0.7043 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1408682 3 0.4584 0.5602 0.000 0.300 0.696 0.004
#> SRR1317134 1 0.2216 0.9095 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1370780 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489307 2 0.0336 0.9038 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1453911 3 0.3837 0.6662 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR603164 3 0.4852 0.6403 0.000 0.072 0.776 0.152
#> SRR1383259 2 0.6003 0.0585 0.000 0.504 0.040 0.456
#> SRR1330854 3 0.3182 0.7313 0.028 0.000 0.876 0.096
#> SRR1452423 1 0.0817 0.9151 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1368574 2 0.4290 0.6786 0.000 0.772 0.212 0.016
#> SRR1468162 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1331220 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1361546 3 0.3444 0.7043 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1486156 1 0.1118 0.9146 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR660545 2 0.5977 0.5301 0.000 0.680 0.104 0.216
#> SRR615635 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.6711 0.4964 0.000 0.308 0.116 0.576
#> SRR1342739 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102830 3 0.0707 0.8147 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR662126 2 0.0817 0.8981 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1464601 2 0.0188 0.9034 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071594 2 0.0937 0.8952 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR612539 2 0.0707 0.8997 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR602010 3 0.3972 0.6821 0.000 0.204 0.788 0.008
#> SRR810249 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818773 3 0.3626 0.7025 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1336569 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368117 2 0.0188 0.9035 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442754 3 0.6301 0.4089 0.260 0.000 0.636 0.104
#> SRR1334247 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9141 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.6303 0.5628 0.000 0.192 0.660 0.148
#> SRR1459937 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR2185018 1 0.3105 0.8901 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR655732 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809348 1 0.2831 0.9002 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR819261 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR661074 3 0.0469 0.8135 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1349851 1 0.4844 0.7230 0.688 0.000 0.012 0.300
#> SRR1405123 4 0.2831 0.9000 0.000 0.004 0.120 0.876
#> SRR661096 2 0.0779 0.9000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1320225 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1454651 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1307677 2 0.0817 0.8986 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1466512 2 0.0707 0.9001 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR658212 2 0.6280 0.4075 0.000 0.604 0.080 0.316
#> SRR1430525 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1344422 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1353924 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1314832 3 0.5615 0.5487 0.188 0.000 0.716 0.096
#> SRR1487570 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR627431 2 0.4389 0.7523 0.000 0.812 0.072 0.116
#> SRR1418561 3 0.4790 0.2386 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1448029 3 0.0921 0.8153 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR813802 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR815020 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612395 3 0.3907 0.6556 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR603116 2 0.4817 0.3488 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1323152 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1368264 3 0.3972 0.6811 0.000 0.204 0.788 0.008
#> SRR1326624 1 0.5085 0.7066 0.676 0.000 0.020 0.304
#> SRR1429265 3 0.0707 0.8147 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1327702 1 0.2805 0.9051 0.888 0.000 0.012 0.100
#> SRR615611 2 0.5496 0.6547 0.000 0.732 0.108 0.160
#> SRR1486799 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096174 2 0.6613 0.2675 0.000 0.560 0.096 0.344
#> SRR815044 2 0.2647 0.8126 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1480038 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR659436 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615323 2 0.1743 0.8756 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1330327 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1100588 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1444002 1 0.2805 0.9048 0.888 0.000 0.012 0.100
#> SRR1318444 3 0.3837 0.6250 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR600656 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR658766 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR655946 3 0.4967 -0.0525 0.000 0.000 0.548 0.452
#> SRR817282 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475104 3 0.0707 0.8147 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1406418 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1090265 1 0.2530 0.9069 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1444120 3 0.3810 0.6963 0.000 0.188 0.804 0.008
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9141 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0707 0.8149 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR662498 3 0.4012 0.7059 0.000 0.184 0.800 0.016
#> SRR1376764 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1377006 4 0.4998 0.2458 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR656860 2 0.3486 0.7401 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1480547 2 0.1637 0.8766 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1452515 3 0.1022 0.8150 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 3 0.4153 0.6934 0.132 0.000 0.820 0.048
#> SRR601695 2 0.6373 0.4860 0.000 0.652 0.200 0.148
#> SRR820907 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 3 0.4225 0.6914 0.000 0.184 0.792 0.024
#> SRR1405984 2 0.0592 0.9014 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1472794 2 0.2081 0.8477 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1365448 1 0.6019 0.6597 0.672 0.000 0.228 0.100
#> SRR1095720 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1435626 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.2888 0.8982 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1332299 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1467966 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1320579 3 0.2973 0.7200 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1098879 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR662245 2 0.6116 0.3942 0.000 0.612 0.320 0.068
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR601387 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0336 0.9033 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662906 3 0.6300 0.2650 0.000 0.084 0.608 0.308
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0707 0.8997 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1313969 4 0.2814 0.8948 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1388528 1 0.6784 0.4280 0.528 0.000 0.368 0.104
#> SRR1452912 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400180 3 0.4267 0.6872 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR655399 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1319753 3 0.6568 0.3868 0.000 0.332 0.572 0.096
#> SRR818901 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR607067 2 0.4919 0.7054 0.000 0.772 0.076 0.152
#> SRR1391420 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384138 2 0.1118 0.8936 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR661961 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658259 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1310476 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.2593 0.8366 0.000 0.892 0.004 0.104
#> SRR1478053 2 0.0188 0.9042 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 3 0.4643 0.4851 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1322900 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1435418 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1402172 2 0.5070 0.3168 0.000 0.580 0.004 0.416
#> SRR1443436 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661675 2 0.0336 0.9014 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR661469 3 0.3444 0.7043 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1500323 2 0.0921 0.8863 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1356705 3 0.5402 0.1319 0.000 0.472 0.516 0.012
#> SRR1464915 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312406 3 0.0921 0.8151 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1350435 1 0.4844 0.7236 0.688 0.000 0.012 0.300
#> SRR1389177 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1434502 2 0.7480 0.1272 0.000 0.500 0.224 0.276
#> SRR1394190 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1481083 1 0.1722 0.9138 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR816382 3 0.0817 0.8155 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1318839 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1432390 4 0.2831 0.9000 0.000 0.004 0.120 0.876
#> SRR613126 2 0.5873 0.1471 0.000 0.548 0.416 0.036
#> SRR1089424 2 0.0188 0.9042 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.3895 0.7035 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1456027 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1400551 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320469 3 0.6918 -0.1040 0.420 0.000 0.472 0.108
#> SRR614251 2 0.1211 0.8834 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615105 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1433290 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR2166064 4 0.2976 0.8977 0.000 0.008 0.120 0.872
#> SRR601671 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR663874 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.3638 0.8776 0.000 0.032 0.120 0.848
#> SRR1408249 2 0.4236 0.7612 0.000 0.824 0.088 0.088
#> SRR663284 2 0.6855 0.4248 0.000 0.600 0.200 0.200
#> SRR1402794 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR614852 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1348040 3 0.4139 0.7308 0.000 0.144 0.816 0.040
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0469 0.8987 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1499566 2 0.4411 0.7451 0.000 0.812 0.108 0.080
#> SRR1361480 2 0.1302 0.8868 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1444501 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1415773 2 0.5253 0.3731 0.000 0.624 0.360 0.016
#> SRR1388832 3 0.0188 0.8121 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1394637 1 0.2593 0.9061 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR606974 2 0.4155 0.7552 0.000 0.828 0.072 0.100
#> SRR662918 4 0.5399 0.0589 0.000 0.468 0.012 0.520
#> SRR817421 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1400823 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1381348 2 0.0707 0.9001 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR608264 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1318560 1 0.6052 0.3148 0.556 0.000 0.396 0.048
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.5062 0.7081 0.680 0.000 0.020 0.300
#> SRR615044 3 0.3583 0.7065 0.000 0.180 0.816 0.004
#> SRR1432743 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0592 0.9148 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1357148 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406008 2 0.0188 0.9041 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.6402 0.4841 0.624 0.000 0.108 0.268
#> SRR1318465 3 0.1474 0.8050 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1431083 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR607117 2 0.5546 0.5197 0.000 0.680 0.052 0.268
#> SRR655170 2 0.4018 0.7030 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR1087825 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR662019 3 0.0707 0.8150 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1349209 4 0.3172 0.8671 0.000 0.000 0.160 0.840
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0469 0.9022 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1416672 1 0.0592 0.9148 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR663356 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1092349 3 0.4561 0.6606 0.176 0.008 0.788 0.028
#> SRR1408183 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1084369 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR598452 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR660709 4 0.7740 0.3484 0.000 0.248 0.320 0.432
#> SRR809444 1 0.2530 0.9069 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 3 0.6338 0.4946 0.236 0.000 0.644 0.120
#> SRR1326292 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR657139 3 0.6098 0.5380 0.200 0.000 0.676 0.124
#> SRR1440744 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353555 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323087 1 0.2675 0.9060 0.892 0.000 0.008 0.100
#> SRR1452334 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1381775 1 0.6903 0.5904 0.592 0.000 0.184 0.224
#> SRR1363908 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0188 0.8123 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353663 1 0.2714 0.9038 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR811771 1 0.2714 0.9041 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR813983 1 0.0592 0.9148 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR815825 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR819054 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.7584 0.0788 0.000 0.448 0.348 0.204
#> SRR1331922 3 0.5102 0.6213 0.188 0.000 0.748 0.064
#> SRR615479 3 0.3626 0.7025 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.3444 0.7043 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1355217 3 0.3649 0.6872 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1356290 3 0.5231 0.5704 0.000 0.296 0.676 0.028
#> SRR659507 3 0.3569 0.6958 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR663296 1 0.2593 0.9062 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR598044 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1414727 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.5085 0.7066 0.676 0.000 0.020 0.304
#> SRR1354489 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1377800 3 0.0000 0.8112 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0921 0.8951 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR655052 4 0.6698 0.4368 0.000 0.340 0.104 0.556
#> SRR1478968 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1351280 2 0.3074 0.7970 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR613951 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1418022 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661901 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1408161 1 0.2530 0.9069 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR657054 3 0.0817 0.8149 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR655040 2 0.5519 0.5778 0.000 0.684 0.052 0.264
#> SRR810225 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.4985 -0.1167 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.6138 0.4760 0.000 0.648 0.092 0.260
#> SRR1442104 3 0.2589 0.7513 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1453416 1 0.2805 0.9048 0.888 0.000 0.012 0.100
#> SRR1481396 3 0.0707 0.8147 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0817 0.8981 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1458683 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1370572 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467567 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468532 3 0.3626 0.7025 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1310735 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440101 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR660260 3 0.4636 0.6971 0.000 0.188 0.772 0.040
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.7596 -0.0218 0.000 0.456 0.212 0.332
#> SRR1337173 3 0.1305 0.8141 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1396250 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR2166376 3 0.0817 0.8149 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR659816 2 0.7191 0.1615 0.000 0.500 0.352 0.148
#> SRR1401379 2 0.0188 0.9042 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR600981 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1398335 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1397218 2 0.6259 0.4390 0.000 0.616 0.084 0.300
#> SRR660115 1 0.2589 0.9036 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0921 0.8913 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1490037 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR627439 2 0.4348 0.6709 0.000 0.780 0.024 0.196
#> SRR1397156 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.6224 0.5664 0.000 0.668 0.144 0.188
#> SRR1092985 1 0.3428 0.8825 0.844 0.000 0.012 0.144
#> SRR656409 2 0.3626 0.7431 0.000 0.812 0.004 0.184
#> SRR1468658 3 0.4356 0.4660 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1390437 2 0.7033 0.1990 0.000 0.528 0.136 0.336
#> SRR658057 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR612635 2 0.0817 0.8986 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441590 3 0.6765 0.3630 0.300 0.000 0.576 0.124
#> SRR659590 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409575 2 0.0469 0.9029 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR659911 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1345894 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1442928 3 0.3764 0.6753 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1464681 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1418880 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1309070 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1365426 3 0.3810 0.6963 0.000 0.188 0.804 0.008
#> SRR1487947 3 0.3996 0.6900 0.060 0.000 0.836 0.104
#> SRR659708 3 0.6265 0.5090 0.220 0.000 0.656 0.124
#> SRR603236 2 0.6448 0.4379 0.000 0.628 0.252 0.120
#> SRR660673 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0707 0.9001 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1339108 2 0.1867 0.8692 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR613426 4 0.2760 0.9018 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR613879 2 0.1109 0.8844 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1385101 3 0.4267 0.6872 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0188 0.9040 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430489 4 0.4245 0.7045 0.116 0.000 0.064 0.820
#> SRR1349231 3 0.4267 0.6530 0.188 0.000 0.788 0.024
#> SRR1376249 3 0.0921 0.8152 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0592 0.9148 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0188 0.9036 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351979 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1387054 3 0.4830 0.1824 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1444306 3 0.0469 0.8137 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1322662 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR665478 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.5492 0.6492 0.640 0.000 0.032 0.328
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.3837 0.6658 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR615225 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1401839 3 0.3925 0.7124 0.000 0.176 0.808 0.016
#> SRR1379110 2 0.0592 0.9010 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077288 3 0.0592 0.8143 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1331639 4 0.3991 0.8620 0.000 0.048 0.120 0.832
#> SRR1342782 3 0.3893 0.6885 0.000 0.196 0.796 0.008
#> SRR1443003 3 0.0469 0.8140 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR612839 1 0.2530 0.9069 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1470093 3 0.2011 0.7854 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1395742 1 0.1792 0.9124 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1469014 1 0.2345 0.9080 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1387222 3 0.3688 0.6287 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR664063 3 0.3810 0.6963 0.000 0.188 0.804 0.008
#> SRR1488214 1 0.5453 0.6689 0.660 0.000 0.036 0.304
#> SRR654766 4 0.2647 0.9013 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9050 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417483 1 0.0188 0.9139 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1394231 2 0.0188 0.9042 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488470 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1389497 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1367109 3 0.1118 0.8147 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR615311 1 0.3217 0.8926 0.860 0.000 0.012 0.128
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0880 0.61459 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1380716 5 0.4268 0.79279 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR612803 1 0.4971 0.79638 0.708 0.000 0.000 0.176 0.116
#> SRR613282 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 3 0.8440 -0.00632 0.224 0.000 0.316 0.168 0.292
#> SRR1084417 3 0.5848 0.50010 0.000 0.000 0.604 0.168 0.228
#> SRR1074359 3 0.5236 0.52319 0.000 0.088 0.712 0.180 0.020
#> SRR1419258 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0671 0.76800 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR665262 2 0.6477 -0.01348 0.000 0.464 0.340 0.000 0.196
#> SRR1499740 3 0.3861 0.65715 0.000 0.000 0.712 0.004 0.284
#> SRR1105057 5 0.4294 0.75250 0.000 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1439742 1 0.3794 0.82316 0.800 0.000 0.000 0.152 0.048
#> SRR614599 3 0.2806 0.72333 0.000 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR612215 2 0.6577 -0.15956 0.000 0.424 0.396 0.004 0.176
#> SRR1094051 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.4819 0.80094 0.724 0.000 0.000 0.164 0.112
#> SRR1393449 3 0.6118 0.50949 0.016 0.000 0.608 0.140 0.236
#> SRR1409263 3 0.2753 0.72724 0.000 0.000 0.856 0.008 0.136
#> SRR1431288 1 0.5541 0.76662 0.648 0.000 0.000 0.164 0.188
#> SRR1334889 5 0.7777 0.26284 0.000 0.152 0.116 0.280 0.452
#> SRR614839 2 0.5159 -0.31882 0.000 0.604 0.036 0.008 0.352
#> SRR658433 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.4074 0.30596 0.000 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1471117 1 0.5379 0.77134 0.668 0.000 0.000 0.164 0.168
#> SRR1311553 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.0880 0.60565 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1447103 3 0.3880 0.68943 0.000 0.028 0.784 0.004 0.184
#> SRR1402153 3 0.2236 0.72791 0.000 0.024 0.908 0.068 0.000
#> SRR655887 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1408529 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.1549 0.83481 0.944 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR1384371 3 0.6170 0.32000 0.000 0.324 0.560 0.096 0.020
#> SRR1074670 3 0.1357 0.76186 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1375439 3 0.4288 0.69212 0.000 0.052 0.764 0.004 0.180
#> SRR1329003 4 0.4035 0.76321 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR1404837 2 0.3207 0.52735 0.000 0.864 0.084 0.040 0.012
#> SRR1317920 4 0.6446 -0.20164 0.308 0.000 0.004 0.508 0.180
#> SRR1455525 4 0.3921 0.76102 0.000 0.000 0.172 0.784 0.044
#> SRR613999 1 0.0510 0.83172 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1310836 1 0.4386 0.81337 0.764 0.000 0.000 0.140 0.096
#> SRR1499764 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0162 0.76877 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1068855 1 0.6200 0.65824 0.540 0.000 0.000 0.280 0.180
#> SRR1375509 3 0.0404 0.76846 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612227 3 0.0324 0.76850 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1388809 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.3445 0.78260 0.000 0.000 0.140 0.824 0.036
#> SRR1452864 4 0.6251 0.47919 0.108 0.000 0.064 0.648 0.180
#> SRR1473078 3 0.1892 0.75419 0.000 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR615814 2 0.2852 0.38708 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1325225 4 0.4891 0.69229 0.000 0.000 0.112 0.716 0.172
#> SRR1313687 2 0.4877 0.41659 0.000 0.752 0.144 0.080 0.024
#> SRR1358220 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1096662 4 0.6953 -0.45640 0.000 0.320 0.004 0.356 0.320
#> SRR1487746 1 0.0510 0.83216 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1354644 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.6865 0.29864 0.000 0.344 0.396 0.004 0.256
#> SRR660164 2 0.3074 0.32760 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR815783 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809595 3 0.6697 0.43002 0.000 0.224 0.460 0.004 0.312
#> SRR1403133 2 0.0703 0.61781 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR815470 4 0.7926 -0.10663 0.000 0.292 0.084 0.388 0.236
#> SRR1344382 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0162 0.76832 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1478362 4 0.7876 0.35289 0.000 0.164 0.136 0.460 0.240
#> SRR1392186 2 0.7704 -0.33694 0.000 0.380 0.200 0.068 0.352
#> SRR1347937 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.5273 0.78548 0.680 0.000 0.000 0.164 0.156
#> SRR1471594 1 0.5344 0.77955 0.672 0.000 0.000 0.164 0.164
#> SRR1354270 3 0.4497 0.55855 0.000 0.000 0.732 0.208 0.060
#> SRR612683 2 0.3966 -0.22861 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1392901 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.4756 0.38054 0.000 0.000 0.668 0.288 0.044
#> SRR1360402 2 0.3143 0.36167 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1406112 3 0.0162 0.76895 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355352 3 0.2536 0.73444 0.000 0.000 0.868 0.004 0.128
#> SRR656247 1 0.7748 0.40691 0.416 0.000 0.204 0.076 0.304
#> SRR813656 2 0.6091 -0.60127 0.000 0.480 0.064 0.024 0.432
#> SRR808244 4 0.4035 0.76321 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR1387240 2 0.3074 0.32760 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1408595 1 0.7567 0.58369 0.476 0.000 0.088 0.164 0.272
#> SRR1385277 4 0.4495 0.73758 0.000 0.000 0.200 0.736 0.064
#> SRR1435248 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.5643 0.51709 0.000 0.256 0.628 0.004 0.112
#> SRR1408682 2 0.5032 0.00411 0.000 0.520 0.448 0.000 0.032
#> SRR1317134 1 0.3386 0.82809 0.832 0.000 0.000 0.128 0.040
#> SRR1370780 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.1205 0.61135 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1453911 2 0.6485 -0.14521 0.000 0.436 0.400 0.004 0.160
#> SRR603164 3 0.3401 0.67187 0.000 0.096 0.840 0.064 0.000
#> SRR1383259 4 0.6746 -0.37970 0.000 0.260 0.000 0.380 0.360
#> SRR1330854 3 0.6322 0.47942 0.016 0.000 0.584 0.164 0.236
#> SRR1452423 1 0.1211 0.83464 0.960 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR1368574 2 0.3689 0.47302 0.000 0.820 0.128 0.004 0.048
#> SRR1468162 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361546 3 0.6678 0.43866 0.000 0.232 0.472 0.004 0.292
#> SRR1486156 1 0.2708 0.83466 0.884 0.000 0.000 0.044 0.072
#> SRR660545 2 0.6588 0.16594 0.000 0.620 0.100 0.092 0.188
#> SRR615635 2 0.1270 0.60387 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1385411 5 0.7696 0.33428 0.000 0.172 0.092 0.284 0.452
#> SRR1342739 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0404 0.76867 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR662126 5 0.4305 0.71868 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1464601 2 0.0451 0.61750 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1071594 2 0.1300 0.59695 0.000 0.956 0.016 0.028 0.000
#> SRR612539 2 0.4450 -0.68179 0.000 0.508 0.004 0.000 0.488
#> SRR602010 3 0.6875 0.29780 0.000 0.344 0.392 0.004 0.260
#> SRR810249 2 0.3242 0.34781 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR818773 3 0.6697 0.43002 0.000 0.224 0.460 0.004 0.312
#> SRR1336569 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3958 0.35619 0.000 0.780 0.044 0.000 0.176
#> SRR1442754 3 0.6513 0.44598 0.020 0.000 0.560 0.164 0.256
#> SRR1334247 3 0.0510 0.76826 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR661639 1 0.1043 0.83414 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR613222 3 0.8069 -0.27394 0.000 0.188 0.352 0.116 0.344
#> SRR1459937 4 0.3355 0.76237 0.000 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR2185018 1 0.5482 0.76659 0.652 0.000 0.000 0.204 0.144
#> SRR655732 2 0.0794 0.61641 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR809348 1 0.5038 0.79563 0.704 0.000 0.000 0.164 0.132
#> SRR819261 3 0.0609 0.76799 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR661074 3 0.2068 0.74875 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1349851 1 0.6450 0.49346 0.436 0.000 0.000 0.384 0.180
#> SRR1405123 4 0.3521 0.78245 0.000 0.000 0.140 0.820 0.040
#> SRR661096 5 0.4567 0.78394 0.000 0.448 0.004 0.004 0.544
#> SRR1320225 1 0.4054 0.81986 0.788 0.000 0.000 0.140 0.072
#> SRR1454651 4 0.4035 0.76321 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR1307677 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1466512 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR658212 5 0.7179 0.56682 0.000 0.264 0.056 0.168 0.512
#> SRR1430525 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.3489 0.78247 0.000 0.000 0.144 0.820 0.036
#> SRR1353924 5 0.4287 0.76917 0.000 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1314832 3 0.7079 0.42765 0.064 0.000 0.548 0.172 0.216
#> SRR1487570 4 0.4657 0.74383 0.000 0.000 0.152 0.740 0.108
#> SRR627431 2 0.5935 -0.34183 0.000 0.572 0.060 0.028 0.340
#> SRR1418561 3 0.5218 0.28586 0.000 0.000 0.604 0.336 0.060
#> SRR1448029 3 0.0162 0.76832 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR813802 1 0.5125 0.78711 0.696 0.000 0.000 0.148 0.156
#> SRR815020 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 5 0.4273 0.79070 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1435311 2 0.0794 0.60898 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR612395 3 0.6210 0.30866 0.000 0.388 0.484 0.004 0.124
#> SRR603116 2 0.5681 0.27475 0.000 0.608 0.268 0.000 0.124
#> SRR1323152 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368264 2 0.6871 -0.19785 0.000 0.388 0.352 0.004 0.256
#> SRR1326624 4 0.6453 -0.41505 0.388 0.000 0.000 0.432 0.180
#> SRR1429265 3 0.1544 0.75627 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1327702 1 0.5126 0.79330 0.696 0.000 0.000 0.152 0.152
#> SRR615611 5 0.7264 0.59918 0.000 0.340 0.068 0.128 0.464
#> SRR1486799 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 5 0.6523 0.59840 0.000 0.372 0.000 0.196 0.432
#> SRR815044 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1338560 2 0.2966 0.36551 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR615862 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1480038 2 0.4150 -0.36046 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR659436 3 0.2068 0.74965 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR613699 2 0.3109 0.31771 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1436563 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 5 0.4403 0.79435 0.000 0.436 0.000 0.004 0.560
#> SRR1330327 4 0.3736 0.77965 0.000 0.000 0.140 0.808 0.052
#> SRR1489950 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.3521 0.82618 0.820 0.000 0.000 0.140 0.040
#> SRR1100588 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.6058 0.71166 0.588 0.000 0.004 0.164 0.244
#> SRR1318444 3 0.3421 0.61639 0.000 0.000 0.788 0.204 0.008
#> SRR600656 4 0.3319 0.77488 0.000 0.000 0.160 0.820 0.020
#> SRR658766 3 0.0703 0.76092 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR655946 3 0.4332 0.52117 0.000 0.008 0.732 0.236 0.024
#> SRR817282 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0162 0.76895 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1406418 1 0.3932 0.82200 0.796 0.000 0.000 0.140 0.064
#> SRR1090265 1 0.4583 0.80954 0.748 0.000 0.000 0.140 0.112
#> SRR1444120 3 0.6692 0.41608 0.000 0.280 0.472 0.004 0.244
#> SRR1471965 1 0.0794 0.83330 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR612695 3 0.0451 0.76831 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR662498 3 0.2214 0.74051 0.000 0.052 0.916 0.004 0.028
#> SRR1376764 3 0.0162 0.76832 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1377006 3 0.5048 0.14371 0.000 0.000 0.580 0.380 0.040
#> SRR656860 5 0.4604 0.78874 0.000 0.428 0.000 0.012 0.560
#> SRR1480547 5 0.4403 0.79435 0.000 0.436 0.000 0.004 0.560
#> SRR1452515 3 0.0162 0.76832 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615273 3 0.7121 0.46703 0.104 0.000 0.568 0.140 0.188
#> SRR601695 2 0.7839 0.03503 0.000 0.452 0.256 0.112 0.180
#> SRR820907 2 0.3177 0.29670 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR812773 3 0.7610 0.41441 0.120 0.096 0.456 0.004 0.324
#> SRR1405984 2 0.1043 0.61087 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1472794 2 0.4904 0.17865 0.000 0.704 0.024 0.032 0.240
#> SRR1365448 3 0.8383 -0.02831 0.240 0.000 0.356 0.164 0.240
#> SRR1095720 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0865 0.76729 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1080766 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.4981 0.79624 0.708 0.000 0.000 0.172 0.120
#> SRR1332299 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.1341 0.74344 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1319710 2 0.1331 0.61001 0.000 0.952 0.008 0.000 0.040
#> SRR1326604 5 0.4294 0.75595 0.000 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1098879 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662245 2 0.4849 0.26269 0.000 0.608 0.360 0.032 0.000
#> SRR1074719 2 0.0162 0.62118 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR816226 4 0.4035 0.76321 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR601387 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614575 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1353900 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662906 3 0.5851 0.23737 0.000 0.340 0.548 0.112 0.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1313969 4 0.4000 0.71336 0.000 0.000 0.228 0.748 0.024
#> SRR1388528 3 0.6940 0.41352 0.044 0.000 0.536 0.164 0.256
#> SRR1452912 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 3 0.6801 0.39337 0.000 0.244 0.428 0.004 0.324
#> SRR655399 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.7248 0.12357 0.000 0.488 0.248 0.044 0.220
#> SRR818901 3 0.0162 0.76895 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR607067 5 0.6868 0.64659 0.000 0.368 0.040 0.120 0.472
#> SRR1391420 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 5 0.4658 0.71377 0.000 0.484 0.000 0.012 0.504
#> SRR661961 3 0.2286 0.74229 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR658259 2 0.4138 -0.34597 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1310476 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1410 0.59289 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1365034 5 0.4767 0.78319 0.000 0.420 0.000 0.020 0.560
#> SRR1478053 5 0.4268 0.79196 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1475300 2 0.1792 0.57657 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1328101 2 0.6739 -0.12710 0.000 0.424 0.356 0.004 0.216
#> SRR1322900 3 0.3048 0.71280 0.000 0.000 0.820 0.004 0.176
#> SRR1309942 2 0.3039 0.33787 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1345760 4 0.3573 0.78081 0.000 0.000 0.152 0.812 0.036
#> SRR1435418 1 0.3521 0.82618 0.820 0.000 0.000 0.140 0.040
#> SRR1402172 5 0.7215 0.39595 0.000 0.300 0.016 0.336 0.348
#> SRR1443436 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1571 0.57796 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR661469 3 0.6626 0.42877 0.000 0.276 0.488 0.004 0.232
#> SRR1500323 2 0.1282 0.59565 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1356705 2 0.5949 0.28513 0.000 0.608 0.220 0.004 0.168
#> SRR1464915 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1831 0.75298 0.000 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1350435 1 0.6443 0.50875 0.444 0.000 0.000 0.376 0.180
#> SRR1389177 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.7544 0.49679 0.000 0.376 0.104 0.112 0.408
#> SRR1394190 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.2782 0.83261 0.880 0.000 0.000 0.072 0.048
#> SRR816382 3 0.0162 0.76832 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.4289 0.76564 0.000 0.020 0.120 0.796 0.064
#> SRR613126 2 0.4759 0.29362 0.000 0.636 0.336 0.024 0.004
#> SRR1089424 5 0.4300 0.73967 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1347214 2 0.4294 -0.61137 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1309556 3 0.5176 0.64276 0.000 0.120 0.716 0.012 0.152
#> SRR1456027 4 0.4035 0.76321 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR1400551 3 0.2806 0.72657 0.000 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR1320469 3 0.7230 0.39764 0.068 0.000 0.524 0.168 0.240
#> SRR614251 2 0.4187 0.30323 0.000 0.764 0.008 0.032 0.196
#> SRR1454310 2 0.4304 -0.64332 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR615105 4 0.4360 0.64046 0.000 0.000 0.300 0.680 0.020
#> SRR1433290 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.3445 0.78260 0.000 0.000 0.140 0.824 0.036
#> SRR601671 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR663874 2 0.1408 0.59577 0.000 0.948 0.044 0.000 0.008
#> SRR1409130 2 0.0880 0.61459 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR659696 4 0.3678 0.78198 0.000 0.004 0.140 0.816 0.040
#> SRR1408249 5 0.4621 0.77114 0.000 0.412 0.004 0.008 0.576
#> SRR663284 5 0.6942 0.62655 0.000 0.372 0.052 0.108 0.468
#> SRR1402794 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614852 4 0.3595 0.78184 0.000 0.000 0.140 0.816 0.044
#> SRR1348040 3 0.4040 0.69387 0.000 0.024 0.820 0.080 0.076
#> SRR1489610 2 0.1331 0.61001 0.000 0.952 0.008 0.000 0.040
#> SRR1488091 2 0.1831 0.56696 0.000 0.920 0.076 0.004 0.000
#> SRR1499566 2 0.5626 -0.60860 0.000 0.508 0.048 0.012 0.432
#> SRR1361480 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1444501 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.3130 0.53065 0.000 0.868 0.084 0.036 0.012
#> SRR1388832 3 0.3236 0.71181 0.000 0.000 0.828 0.020 0.152
#> SRR1394637 1 0.5446 0.76705 0.660 0.000 0.000 0.164 0.176
#> SRR606974 2 0.5125 0.25413 0.000 0.712 0.068 0.020 0.200
#> SRR662918 4 0.6648 -0.03471 0.000 0.272 0.004 0.484 0.240
#> SRR817421 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR608264 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.8192 0.37946 0.384 0.000 0.232 0.128 0.256
#> SRR1454117 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.6456 0.47861 0.428 0.000 0.000 0.392 0.180
#> SRR615044 3 0.5687 0.58791 0.000 0.112 0.620 0.004 0.264
#> SRR1432743 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.4150 -0.42749 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1353517 1 0.0693 0.83305 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1357148 3 0.1124 0.76561 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1406008 2 0.1205 0.61081 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1396786 2 0.0510 0.61984 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1446564 4 0.7625 0.16976 0.260 0.000 0.088 0.472 0.180
#> SRR1318465 3 0.0609 0.76200 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.6483 -0.20328 0.000 0.356 0.000 0.452 0.192
#> SRR655170 2 0.6497 -0.53488 0.000 0.472 0.028 0.096 0.404
#> SRR1087825 4 0.3011 0.78004 0.000 0.000 0.140 0.844 0.016
#> SRR662019 3 0.2740 0.73810 0.000 0.000 0.876 0.028 0.096
#> SRR1349209 4 0.4490 0.71321 0.000 0.000 0.224 0.724 0.052
#> SRR1326161 2 0.0162 0.62118 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345284 2 0.4114 -0.31533 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1416672 1 0.1830 0.83501 0.932 0.000 0.000 0.028 0.040
#> SRR663356 5 0.4291 0.76402 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1454328 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.3477 0.82685 0.824 0.000 0.000 0.136 0.040
#> SRR1092349 3 0.6689 0.32134 0.200 0.000 0.416 0.004 0.380
#> SRR1408183 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 4 0.8464 0.13181 0.000 0.216 0.288 0.316 0.180
#> SRR809444 1 0.4835 0.80165 0.724 0.000 0.000 0.156 0.120
#> SRR1089901 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.7985 0.51033 0.428 0.000 0.136 0.164 0.272
#> SRR1326292 4 0.4035 0.76321 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR657139 3 0.8395 -0.01489 0.228 0.000 0.348 0.164 0.260
#> SRR1440744 2 0.4302 -0.64889 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1353555 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.5233 0.78155 0.684 0.000 0.000 0.148 0.168
#> SRR1452334 4 0.3649 0.78071 0.000 0.000 0.152 0.808 0.040
#> SRR1381775 1 0.6410 0.68193 0.552 0.000 0.012 0.164 0.272
#> SRR1363908 1 0.4665 0.80710 0.740 0.000 0.000 0.148 0.112
#> SRR1319626 2 0.0451 0.62151 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR658989 3 0.1430 0.76241 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR1353663 1 0.5578 0.75801 0.644 0.000 0.000 0.180 0.176
#> SRR811771 1 0.5417 0.76037 0.648 0.000 0.000 0.236 0.116
#> SRR813983 1 0.1830 0.83501 0.932 0.000 0.000 0.028 0.040
#> SRR815825 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.1043 0.61087 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1367988 5 0.8237 0.24599 0.000 0.212 0.304 0.132 0.352
#> SRR1331922 3 0.7732 -0.04490 0.344 0.000 0.360 0.060 0.236
#> SRR615479 3 0.6688 0.43047 0.000 0.220 0.460 0.004 0.316
#> SRR1375796 2 0.2929 0.36697 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1386991 3 0.5503 0.50337 0.000 0.272 0.632 0.004 0.092
#> SRR1355217 3 0.6628 0.27375 0.000 0.376 0.432 0.004 0.188
#> SRR1356290 2 0.4637 0.03738 0.000 0.536 0.452 0.012 0.000
#> SRR659507 3 0.6362 0.44242 0.000 0.284 0.532 0.004 0.180
#> SRR663296 1 0.4840 0.80234 0.724 0.000 0.000 0.152 0.124
#> SRR598044 2 0.1043 0.61087 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR661155 4 0.3445 0.78260 0.000 0.000 0.140 0.824 0.036
#> SRR1414727 3 0.3196 0.70648 0.000 0.000 0.804 0.004 0.192
#> SRR663477 1 0.6453 0.48711 0.432 0.000 0.000 0.388 0.180
#> SRR1354489 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0955 0.76687 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR614611 5 0.5439 0.75973 0.000 0.416 0.016 0.032 0.536
#> SRR655052 4 0.7797 -0.29752 0.000 0.352 0.068 0.352 0.228
#> SRR1478968 4 0.4035 0.76321 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR1351280 5 0.5771 0.69272 0.000 0.420 0.004 0.076 0.500
#> SRR613951 4 0.3615 0.77935 0.000 0.000 0.156 0.808 0.036
#> SRR1418022 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3728 0.71642 0.000 0.000 0.244 0.748 0.008
#> SRR1408161 1 0.4535 0.81054 0.752 0.000 0.000 0.140 0.108
#> SRR657054 3 0.1430 0.76160 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR655040 5 0.5975 0.68725 0.000 0.344 0.000 0.124 0.532
#> SRR810225 2 0.0290 0.62133 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325377 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.3496 0.60529 0.000 0.000 0.788 0.200 0.012
#> SRR1402328 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.7089 0.14997 0.000 0.564 0.212 0.124 0.100
#> SRR1442104 3 0.0703 0.75798 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1453416 1 0.6262 0.72721 0.608 0.000 0.024 0.148 0.220
#> SRR1481396 3 0.1544 0.75627 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1414314 2 0.4302 -0.65525 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR663026 2 0.1121 0.60894 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1478386 5 0.4278 0.78388 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1458683 4 0.3756 0.71195 0.000 0.000 0.248 0.744 0.008
#> SRR1370572 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.6688 0.43047 0.000 0.220 0.460 0.004 0.316
#> SRR1310735 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.3521 0.78245 0.000 0.000 0.140 0.820 0.040
#> SRR660260 3 0.5304 0.51838 0.000 0.060 0.712 0.040 0.188
#> SRR1071231 2 0.1965 0.56575 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1459125 5 0.7938 0.44413 0.000 0.228 0.132 0.188 0.452
#> SRR1337173 3 0.1461 0.75360 0.000 0.028 0.952 0.016 0.004
#> SRR1396250 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0162 0.76832 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR659816 3 0.8147 -0.36963 0.000 0.268 0.320 0.100 0.312
#> SRR1401379 2 0.1522 0.60742 0.000 0.944 0.012 0.000 0.044
#> SRR600981 4 0.3521 0.78245 0.000 0.000 0.140 0.820 0.040
#> SRR1398335 1 0.4624 0.80828 0.744 0.000 0.000 0.144 0.112
#> SRR1397218 5 0.7554 0.55387 0.000 0.304 0.088 0.148 0.460
#> SRR660115 1 0.4827 0.80339 0.724 0.000 0.000 0.160 0.116
#> SRR1407950 2 0.0290 0.61997 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359780 2 0.4936 0.07087 0.000 0.684 0.048 0.008 0.260
#> SRR1490037 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6122 -0.16678 0.000 0.512 0.000 0.348 0.140
#> SRR1397156 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 5 0.6930 0.57722 0.000 0.408 0.060 0.092 0.440
#> SRR1092985 1 0.5640 0.75247 0.636 0.000 0.000 0.188 0.176
#> SRR656409 5 0.6117 0.64247 0.000 0.360 0.000 0.136 0.504
#> SRR1468658 3 0.2516 0.68479 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1390437 5 0.7685 0.51298 0.000 0.264 0.088 0.188 0.460
#> SRR658057 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR612635 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1351480 2 0.3210 0.28501 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1436651 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.8013 0.50395 0.424 0.000 0.140 0.164 0.272
#> SRR659590 2 0.1043 0.61087 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR614263 1 0.0404 0.83144 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1409575 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR659911 2 0.3837 -0.10854 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1085519 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442928 3 0.5828 0.48109 0.000 0.284 0.596 0.004 0.116
#> SRR1464681 4 0.3445 0.78260 0.000 0.000 0.140 0.824 0.036
#> SRR1418880 1 0.3521 0.82618 0.820 0.000 0.000 0.140 0.040
#> SRR1309070 3 0.0162 0.76832 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1365426 3 0.6769 0.41145 0.000 0.252 0.448 0.004 0.296
#> SRR1487947 3 0.6877 0.42080 0.040 0.000 0.540 0.164 0.256
#> SRR659708 1 0.8342 0.39763 0.364 0.000 0.208 0.164 0.264
#> SRR603236 2 0.6379 0.18057 0.000 0.508 0.384 0.056 0.052
#> SRR660673 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1043 0.61087 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR663807 2 0.0703 0.61780 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1087245 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1339108 2 0.4650 0.06630 0.000 0.684 0.004 0.032 0.280
#> SRR613426 4 0.4703 0.76639 0.000 0.016 0.156 0.756 0.072
#> SRR613879 2 0.4714 0.27781 0.000 0.724 0.084 0.000 0.192
#> SRR1385101 3 0.6413 0.34816 0.000 0.064 0.472 0.044 0.420
#> SRR1387966 2 0.4015 -0.26789 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1458852 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430489 4 0.3381 0.56599 0.000 0.000 0.016 0.808 0.176
#> SRR1349231 3 0.6689 0.32134 0.200 0.000 0.416 0.004 0.380
#> SRR1376249 3 0.2362 0.74467 0.000 0.000 0.900 0.024 0.076
#> SRR1321987 2 0.0000 0.62185 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0290 0.62129 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1390027 1 0.1830 0.83501 0.932 0.000 0.000 0.028 0.040
#> SRR1098474 2 0.1043 0.61087 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1383081 2 0.4306 -0.66605 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR2166960 2 0.1792 0.57738 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR605101 2 0.1430 0.59014 0.000 0.944 0.052 0.000 0.004
#> SRR818600 2 0.3177 0.29673 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1367715 5 0.4268 0.79139 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1351979 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.4086 0.52304 0.000 0.000 0.736 0.240 0.024
#> SRR1444306 3 0.0510 0.76826 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1322662 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3966 -0.23005 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR612767 4 0.5787 0.11136 0.204 0.000 0.000 0.616 0.180
#> SRR1489030 2 0.3752 0.10584 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1430375 3 0.6274 0.18185 0.000 0.432 0.436 0.004 0.128
#> SRR615225 4 0.5382 0.73093 0.000 0.068 0.160 0.720 0.052
#> SRR1401839 3 0.4604 0.62612 0.000 0.168 0.748 0.004 0.080
#> SRR1379110 5 0.4283 0.77772 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1077288 3 0.1671 0.75358 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1331639 4 0.3725 0.78129 0.000 0.008 0.140 0.816 0.036
#> SRR1342782 3 0.6876 0.23953 0.000 0.368 0.372 0.004 0.256
#> SRR1443003 3 0.0451 0.76831 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR612839 1 0.5379 0.77134 0.668 0.000 0.000 0.164 0.168
#> SRR1470093 3 0.0609 0.76110 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1395742 1 0.2561 0.83372 0.884 0.000 0.000 0.096 0.020
#> SRR1469014 1 0.3432 0.82752 0.828 0.000 0.000 0.132 0.040
#> SRR1387222 3 0.1544 0.73776 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR664063 3 0.6765 0.41274 0.000 0.248 0.448 0.004 0.300
#> SRR1488214 1 0.6704 0.44263 0.416 0.000 0.008 0.396 0.180
#> SRR654766 4 0.3823 0.78037 0.000 0.004 0.140 0.808 0.048
#> SRR1320321 2 0.1341 0.58537 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1071955 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.83028 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 5 0.4305 0.71915 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1488470 5 0.4262 0.79604 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1389497 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.76881 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615311 1 0.5233 0.78437 0.684 0.000 0.000 0.168 0.148
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 6 0.3175 0.652704 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1380716 2 0.0363 0.687121 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR612803 5 0.4780 0.235893 0.392 0.000 0.000 0.056 0.552 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 5 0.5521 0.431538 0.048 0.000 0.168 0.004 0.664 0.116
#> SRR1084417 3 0.5630 0.225207 0.000 0.000 0.468 0.012 0.416 0.104
#> SRR1074359 3 0.6578 0.303233 0.000 0.124 0.572 0.172 0.008 0.124
#> SRR1419258 3 0.0436 0.810954 0.000 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1403366 3 0.3181 0.777106 0.000 0.000 0.824 0.012 0.020 0.144
#> SRR665262 6 0.7625 0.199766 0.000 0.048 0.148 0.104 0.244 0.456
#> SRR1499740 3 0.6172 0.597101 0.000 0.000 0.600 0.120 0.112 0.168
#> SRR1105057 2 0.0713 0.686847 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1439742 1 0.3810 0.224468 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR614599 3 0.5934 0.598327 0.000 0.000 0.608 0.056 0.172 0.164
#> SRR612215 6 0.7007 0.098662 0.000 0.008 0.148 0.100 0.264 0.480
#> SRR1094051 1 0.0146 0.845978 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1324496 5 0.3851 0.108938 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1393449 5 0.5379 0.287837 0.000 0.000 0.300 0.012 0.584 0.104
#> SRR1409263 3 0.4184 0.742525 0.000 0.000 0.768 0.016 0.108 0.108
#> SRR1431288 5 0.3915 0.208971 0.412 0.000 0.000 0.004 0.584 0.000
#> SRR1334889 2 0.4569 0.407559 0.000 0.700 0.096 0.200 0.004 0.000
#> SRR614839 2 0.4044 0.442123 0.000 0.668 0.012 0.008 0.000 0.312
#> SRR658433 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1088581 3 0.3733 0.480326 0.000 0.008 0.700 0.288 0.000 0.004
#> SRR1328797 3 0.0405 0.810320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1334512 2 0.0146 0.684300 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1471117 5 0.3835 0.312976 0.336 0.000 0.000 0.004 0.656 0.004
#> SRR1311553 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1354955 3 0.0881 0.812554 0.000 0.000 0.972 0.012 0.008 0.008
#> SRR654802 3 0.0291 0.810780 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR660066 6 0.3201 0.683070 0.000 0.208 0.000 0.000 0.012 0.780
#> SRR1447103 3 0.6992 0.399837 0.000 0.000 0.448 0.100 0.272 0.180
#> SRR1402153 3 0.1862 0.795854 0.000 0.008 0.932 0.016 0.012 0.032
#> SRR655887 2 0.0291 0.685894 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1408529 3 0.0291 0.810925 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR658707 1 0.2941 0.657378 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1384371 3 0.5003 0.615701 0.000 0.084 0.740 0.032 0.032 0.112
#> SRR1074670 3 0.2786 0.790586 0.000 0.000 0.864 0.012 0.024 0.100
#> SRR1375439 3 0.6116 0.605601 0.000 0.024 0.612 0.032 0.156 0.176
#> SRR1329003 4 0.3667 0.791763 0.000 0.000 0.132 0.788 0.080 0.000
#> SRR1404837 2 0.5506 0.200207 0.000 0.508 0.064 0.004 0.020 0.404
#> SRR1317920 5 0.5074 0.390630 0.108 0.000 0.000 0.296 0.596 0.000
#> SRR1455525 4 0.4125 0.765558 0.000 0.000 0.184 0.736 0.080 0.000
#> SRR613999 1 0.1204 0.814699 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1310836 5 0.3868 0.002673 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.1760 0.811712 0.000 0.000 0.928 0.004 0.020 0.048
#> SRR1068855 5 0.5402 0.368627 0.252 0.000 0.000 0.172 0.576 0.000
#> SRR1375509 3 0.3080 0.786633 0.000 0.000 0.848 0.012 0.040 0.100
#> SRR612227 3 0.0858 0.810894 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1388809 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1413872 4 0.3423 0.845970 0.000 0.088 0.100 0.812 0.000 0.000
#> SRR1452864 5 0.5208 0.236090 0.040 0.000 0.032 0.372 0.556 0.000
#> SRR1473078 3 0.3476 0.767876 0.000 0.000 0.808 0.020 0.024 0.148
#> SRR615814 6 0.3230 0.679475 0.000 0.212 0.000 0.000 0.012 0.776
#> SRR1325225 4 0.5357 0.214778 0.000 0.000 0.108 0.464 0.428 0.000
#> SRR1313687 2 0.7064 -0.029659 0.000 0.388 0.112 0.004 0.128 0.368
#> SRR1358220 2 0.0363 0.686578 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1096662 2 0.3076 0.531893 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.1387 0.809423 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.8666 -0.005862 0.000 0.252 0.128 0.116 0.276 0.228
#> SRR660164 6 0.3287 0.674581 0.000 0.220 0.000 0.000 0.012 0.768
#> SRR815783 6 0.2933 0.685151 0.000 0.200 0.000 0.000 0.004 0.796
#> SRR809595 3 0.8868 -0.012741 0.000 0.212 0.224 0.124 0.224 0.216
#> SRR1403133 6 0.2969 0.664808 0.000 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR815470 4 0.7417 0.374268 0.000 0.220 0.156 0.392 0.000 0.232
#> SRR1344382 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0692 0.810673 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1478362 4 0.6038 0.605433 0.000 0.276 0.120 0.556 0.000 0.048
#> SRR1392186 2 0.6024 0.488028 0.000 0.632 0.084 0.092 0.012 0.180
#> SRR1347937 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 5 0.4093 0.224383 0.404 0.000 0.000 0.012 0.584 0.000
#> SRR1471594 5 0.4292 0.249559 0.388 0.000 0.000 0.024 0.588 0.000
#> SRR1354270 3 0.5184 0.325255 0.000 0.000 0.572 0.316 0.112 0.000
#> SRR612683 6 0.4096 0.202619 0.000 0.484 0.000 0.000 0.008 0.508
#> SRR1392901 3 0.0291 0.811351 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1077805 3 0.4680 0.375011 0.000 0.084 0.652 0.264 0.000 0.000
#> SRR1360402 6 0.3729 0.623751 0.000 0.296 0.000 0.000 0.012 0.692
#> SRR1406112 3 0.2520 0.794636 0.000 0.000 0.872 0.008 0.012 0.108
#> SRR1355352 3 0.3893 0.754234 0.000 0.000 0.784 0.020 0.048 0.148
#> SRR656247 5 0.7329 0.381375 0.232 0.000 0.116 0.044 0.500 0.108
#> SRR813656 2 0.4121 0.627566 0.000 0.784 0.032 0.080 0.000 0.104
#> SRR808244 4 0.4012 0.771240 0.000 0.000 0.176 0.748 0.076 0.000
#> SRR1387240 6 0.3470 0.656656 0.000 0.248 0.000 0.000 0.012 0.740
#> SRR1408595 5 0.6230 0.386720 0.260 0.000 0.064 0.008 0.568 0.100
#> SRR1385277 4 0.4792 0.822324 0.000 0.064 0.148 0.728 0.060 0.000
#> SRR1435248 6 0.2730 0.683533 0.000 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1419110 3 0.6297 0.238691 0.000 0.000 0.364 0.008 0.272 0.356
#> SRR1408682 6 0.6928 0.222871 0.000 0.088 0.332 0.000 0.164 0.416
#> SRR1317134 1 0.3499 0.485867 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.3993 0.122625 0.000 0.520 0.000 0.004 0.000 0.476
#> SRR1453911 6 0.7451 0.107870 0.000 0.032 0.168 0.088 0.264 0.448
#> SRR603164 3 0.3592 0.691650 0.000 0.012 0.824 0.036 0.016 0.112
#> SRR1383259 2 0.2941 0.569462 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1330854 5 0.5616 -0.016023 0.000 0.000 0.400 0.012 0.484 0.104
#> SRR1452423 1 0.2793 0.684087 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1368574 2 0.7024 0.251379 0.000 0.476 0.080 0.108 0.028 0.308
#> SRR1468162 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0146 0.811102 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361546 3 0.8635 0.160743 0.000 0.168 0.316 0.100 0.212 0.204
#> SRR1486156 1 0.3872 0.328455 0.604 0.000 0.000 0.000 0.392 0.004
#> SRR660545 6 0.6150 0.480291 0.000 0.168 0.156 0.048 0.016 0.612
#> SRR615635 6 0.3684 0.570349 0.000 0.332 0.000 0.000 0.004 0.664
#> SRR1385411 2 0.4864 0.249246 0.000 0.648 0.092 0.256 0.004 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.2850 0.789331 0.000 0.000 0.856 0.016 0.016 0.112
#> SRR662126 2 0.1398 0.685915 0.000 0.940 0.000 0.008 0.000 0.052
#> SRR1464601 6 0.2933 0.685871 0.000 0.200 0.004 0.000 0.000 0.796
#> SRR1071594 6 0.3340 0.682294 0.000 0.196 0.016 0.004 0.000 0.784
#> SRR612539 2 0.1863 0.663063 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR602010 5 0.8647 -0.001810 0.000 0.244 0.124 0.116 0.284 0.232
#> SRR810249 2 0.2668 0.621067 0.000 0.828 0.000 0.000 0.004 0.168
#> SRR818773 5 0.8850 -0.008252 0.000 0.204 0.216 0.124 0.252 0.204
#> SRR1336569 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 6 0.4289 0.663194 0.000 0.216 0.044 0.000 0.016 0.724
#> SRR1442754 5 0.5259 0.334116 0.000 0.000 0.280 0.012 0.608 0.100
#> SRR1334247 3 0.2886 0.779556 0.000 0.000 0.836 0.004 0.016 0.144
#> SRR661639 1 0.2793 0.681925 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR613222 2 0.5663 0.419420 0.000 0.632 0.232 0.092 0.016 0.028
#> SRR1459937 4 0.3743 0.844094 0.000 0.072 0.136 0.788 0.004 0.000
#> SRR2185018 5 0.5291 0.305743 0.328 0.000 0.000 0.120 0.552 0.000
#> SRR655732 6 0.3838 0.205079 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR809348 5 0.3823 0.164821 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR819261 3 0.2568 0.794512 0.000 0.000 0.876 0.012 0.016 0.096
#> SRR661074 3 0.3896 0.760612 0.000 0.000 0.792 0.016 0.080 0.112
#> SRR1349851 5 0.5383 0.380967 0.232 0.000 0.000 0.184 0.584 0.000
#> SRR1405123 4 0.3469 0.836460 0.000 0.104 0.088 0.808 0.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0547 0.688299 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1320225 1 0.3864 0.062366 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1454651 4 0.3667 0.791763 0.000 0.000 0.132 0.788 0.080 0.000
#> SRR1307677 2 0.0260 0.685961 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466512 2 0.0000 0.685179 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658212 2 0.6374 0.225121 0.000 0.560 0.084 0.208 0.000 0.148
#> SRR1430525 3 0.0291 0.810780 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1344422 4 0.3372 0.846290 0.000 0.084 0.100 0.816 0.000 0.000
#> SRR1353924 2 0.1327 0.676858 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1314832 3 0.6068 0.176065 0.016 0.000 0.452 0.020 0.420 0.092
#> SRR1487570 4 0.4263 0.753064 0.000 0.004 0.120 0.744 0.132 0.000
#> SRR627431 6 0.5228 0.452350 0.000 0.344 0.084 0.000 0.008 0.564
#> SRR1418561 4 0.5152 0.155986 0.000 0.000 0.448 0.468 0.084 0.000
#> SRR1448029 3 0.0665 0.812873 0.000 0.000 0.980 0.008 0.008 0.004
#> SRR813802 5 0.3961 0.160553 0.440 0.000 0.000 0.000 0.556 0.004
#> SRR815020 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3945 0.039448 0.000 0.612 0.000 0.000 0.008 0.380
#> SRR1435311 6 0.4010 0.300857 0.000 0.408 0.000 0.000 0.008 0.584
#> SRR612395 6 0.6476 0.036972 0.000 0.000 0.212 0.040 0.264 0.484
#> SRR603116 6 0.8485 -0.007474 0.000 0.236 0.132 0.092 0.208 0.332
#> SRR1323152 3 0.0405 0.810320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1368264 5 0.8664 0.000724 0.000 0.248 0.128 0.116 0.280 0.228
#> SRR1326624 5 0.5328 0.393803 0.200 0.000 0.000 0.204 0.596 0.000
#> SRR1429265 3 0.3747 0.766480 0.000 0.000 0.804 0.016 0.072 0.108
#> SRR1327702 5 0.3765 0.229444 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596 0.000
#> SRR615611 2 0.3199 0.654875 0.000 0.852 0.052 0.028 0.000 0.068
#> SRR1486799 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.1501 0.668182 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.685179 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.4096 0.023339 0.000 0.508 0.000 0.000 0.008 0.484
#> SRR615862 2 0.0363 0.686293 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480038 2 0.3547 0.388795 0.000 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR659436 3 0.4880 0.676402 0.000 0.000 0.684 0.008 0.160 0.148
#> SRR613699 6 0.3368 0.668061 0.000 0.232 0.000 0.000 0.012 0.756
#> SRR1436563 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.685179 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330327 4 0.3518 0.847193 0.000 0.092 0.104 0.804 0.000 0.000
#> SRR1489950 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1431927 1 0.3563 0.452770 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1100588 3 0.0508 0.812853 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1444002 5 0.4170 0.328833 0.336 0.000 0.012 0.004 0.644 0.004
#> SRR1318444 3 0.4923 0.305722 0.000 0.012 0.596 0.340 0.052 0.000
#> SRR600656 4 0.3563 0.847929 0.000 0.092 0.108 0.800 0.000 0.000
#> SRR658766 3 0.1096 0.809644 0.000 0.004 0.964 0.008 0.020 0.004
#> SRR655946 3 0.5011 0.427807 0.000 0.076 0.668 0.236 0.008 0.012
#> SRR817282 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.2666 0.792499 0.000 0.000 0.864 0.012 0.012 0.112
#> SRR1406418 1 0.3866 0.053040 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1090265 5 0.3971 0.134484 0.448 0.000 0.000 0.000 0.548 0.004
#> SRR1444120 5 0.8671 0.022476 0.000 0.232 0.136 0.116 0.296 0.220
#> SRR1471965 1 0.2697 0.695677 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR612695 3 0.1333 0.803780 0.000 0.000 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR662498 3 0.3930 0.645022 0.000 0.000 0.764 0.000 0.092 0.144
#> SRR1376764 3 0.0858 0.808644 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1377006 3 0.5491 -0.155640 0.000 0.080 0.484 0.420 0.016 0.000
#> SRR656860 2 0.0146 0.684300 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0146 0.684300 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.1075 0.804985 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1324390 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR615273 5 0.6067 0.204861 0.004 0.000 0.316 0.024 0.520 0.136
#> SRR601695 6 0.6864 0.325626 0.000 0.096 0.284 0.088 0.024 0.508
#> SRR820907 6 0.3819 0.560582 0.000 0.316 0.000 0.000 0.012 0.672
#> SRR812773 5 0.8950 0.010189 0.004 0.200 0.224 0.124 0.256 0.192
#> SRR1405984 2 0.4172 0.267725 0.000 0.564 0.000 0.004 0.008 0.424
#> SRR1472794 6 0.4225 0.534778 0.000 0.352 0.004 0.004 0.012 0.628
#> SRR1365448 5 0.5859 0.408427 0.204 0.000 0.108 0.004 0.624 0.060
#> SRR1095720 3 0.0881 0.813204 0.000 0.000 0.972 0.008 0.008 0.012
#> SRR1435626 3 0.3310 0.773482 0.000 0.000 0.816 0.016 0.020 0.148
#> SRR1080766 6 0.2823 0.685464 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1377862 5 0.4864 0.245342 0.384 0.000 0.000 0.064 0.552 0.000
#> SRR1332299 3 0.0508 0.813147 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1467966 3 0.0767 0.812118 0.000 0.000 0.976 0.012 0.008 0.004
#> SRR1320579 3 0.1003 0.802739 0.000 0.004 0.964 0.028 0.000 0.004
#> SRR1319710 2 0.4427 0.197942 0.000 0.548 0.000 0.020 0.004 0.428
#> SRR1326604 2 0.1556 0.671047 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1098879 3 0.0291 0.810780 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR662245 6 0.4962 0.396467 0.000 0.040 0.332 0.012 0.008 0.608
#> SRR1074719 6 0.3996 0.018931 0.000 0.484 0.000 0.000 0.004 0.512
#> SRR816226 4 0.3775 0.784554 0.000 0.000 0.128 0.780 0.092 0.000
#> SRR601387 6 0.2762 0.678365 0.000 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR614575 2 0.0547 0.687546 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1353900 6 0.3043 0.684327 0.000 0.200 0.000 0.000 0.008 0.792
#> SRR662906 3 0.5911 0.314987 0.000 0.060 0.580 0.076 0.004 0.280
#> SRR1350832 6 0.2933 0.685151 0.000 0.200 0.000 0.000 0.004 0.796
#> SRR1403280 2 0.1007 0.684584 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1313969 4 0.3945 0.803263 0.000 0.048 0.200 0.748 0.000 0.004
#> SRR1388528 5 0.5094 0.397671 0.016 0.000 0.264 0.004 0.644 0.072
#> SRR1452912 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.8864 0.031039 0.000 0.216 0.196 0.128 0.248 0.212
#> SRR655399 3 0.2001 0.805274 0.000 0.000 0.912 0.012 0.008 0.068
#> SRR1319753 2 0.6645 0.482992 0.000 0.608 0.084 0.096 0.060 0.152
#> SRR818901 3 0.1555 0.810989 0.000 0.000 0.940 0.012 0.008 0.040
#> SRR607067 2 0.2401 0.677068 0.000 0.900 0.024 0.028 0.000 0.048
#> SRR1391420 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.2020 0.668546 0.000 0.896 0.000 0.008 0.000 0.096
#> SRR661961 3 0.5157 0.685022 0.000 0.000 0.692 0.100 0.048 0.160
#> SRR658259 2 0.3547 0.386661 0.000 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1310476 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 6 0.3470 0.661464 0.000 0.248 0.000 0.000 0.012 0.740
#> SRR1365034 2 0.0260 0.682864 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0622 0.686406 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1475300 2 0.3950 0.183152 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR1328101 6 0.7516 0.078582 0.000 0.036 0.144 0.104 0.268 0.448
#> SRR1322900 3 0.5301 0.678186 0.000 0.000 0.676 0.044 0.120 0.160
#> SRR1309942 6 0.3394 0.669119 0.000 0.236 0.000 0.000 0.012 0.752
#> SRR1345760 4 0.3419 0.847925 0.000 0.084 0.104 0.812 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.3547 0.460937 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1402172 2 0.3887 0.172372 0.000 0.632 0.008 0.360 0.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 6 0.4148 0.648540 0.000 0.184 0.056 0.000 0.012 0.748
#> SRR661469 5 0.8747 0.041111 0.000 0.216 0.148 0.124 0.284 0.228
#> SRR1500323 6 0.3945 0.665597 0.000 0.200 0.048 0.000 0.004 0.748
#> SRR1356705 2 0.7889 0.225099 0.000 0.412 0.108 0.120 0.076 0.284
#> SRR1464915 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.3794 0.765762 0.000 0.000 0.804 0.020 0.076 0.100
#> SRR1350435 5 0.5325 0.391940 0.212 0.000 0.000 0.192 0.596 0.000
#> SRR1389177 3 0.0692 0.809795 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1368072 6 0.2823 0.683317 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR601815 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR613330 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.5493 0.515495 0.000 0.672 0.116 0.076 0.000 0.136
#> SRR1394190 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.2941 0.634251 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR816382 3 0.0972 0.812040 0.000 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1318839 3 0.0665 0.811253 0.000 0.000 0.980 0.008 0.008 0.004
#> SRR1432390 4 0.3611 0.839339 0.000 0.108 0.096 0.796 0.000 0.000
#> SRR613126 6 0.5183 0.392304 0.000 0.076 0.328 0.000 0.012 0.584
#> SRR1089424 2 0.2020 0.664773 0.000 0.896 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR1347214 2 0.2882 0.601446 0.000 0.812 0.000 0.000 0.008 0.180
#> SRR1309556 3 0.7324 0.373140 0.000 0.220 0.500 0.036 0.116 0.128
#> SRR1456027 4 0.3586 0.792625 0.000 0.000 0.124 0.796 0.080 0.000
#> SRR1400551 3 0.4200 0.743946 0.000 0.000 0.764 0.036 0.044 0.156
#> SRR1320469 5 0.6107 0.337121 0.044 0.000 0.292 0.012 0.560 0.092
#> SRR614251 6 0.3747 0.654217 0.000 0.248 0.004 0.004 0.012 0.732
#> SRR1454310 2 0.4147 -0.124545 0.000 0.552 0.000 0.000 0.012 0.436
#> SRR615105 4 0.4857 0.438679 0.000 0.060 0.408 0.532 0.000 0.000
#> SRR1433290 3 0.0291 0.810780 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR2166064 4 0.3473 0.843198 0.000 0.096 0.096 0.808 0.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0363 0.686293 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR663874 6 0.4845 0.249438 0.000 0.400 0.012 0.028 0.004 0.556
#> SRR1409130 6 0.3101 0.661316 0.000 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR659696 4 0.3464 0.832220 0.000 0.108 0.084 0.808 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0363 0.684200 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.3044 0.665359 0.000 0.860 0.036 0.028 0.000 0.076
#> SRR1402794 3 0.1942 0.806151 0.000 0.000 0.916 0.012 0.008 0.064
#> SRR614852 4 0.3518 0.847193 0.000 0.092 0.104 0.804 0.000 0.000
#> SRR1348040 3 0.6472 0.519760 0.000 0.164 0.620 0.084 0.068 0.064
#> SRR1489610 2 0.4546 0.161192 0.000 0.528 0.000 0.020 0.008 0.444
#> SRR1488091 6 0.4461 0.639796 0.000 0.196 0.080 0.000 0.008 0.716
#> SRR1499566 2 0.3598 0.654914 0.000 0.816 0.012 0.052 0.004 0.116
#> SRR1361480 2 0.0000 0.685179 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0291 0.810780 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1415773 2 0.5554 0.238911 0.000 0.520 0.060 0.016 0.012 0.392
#> SRR1388832 3 0.4673 0.715069 0.000 0.000 0.732 0.028 0.124 0.116
#> SRR1394637 5 0.3861 0.333313 0.316 0.000 0.000 0.008 0.672 0.004
#> SRR606974 6 0.4926 0.600935 0.000 0.240 0.080 0.000 0.016 0.664
#> SRR662918 4 0.3851 0.331550 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0665 0.811253 0.000 0.000 0.980 0.008 0.008 0.004
#> SRR1400823 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0146 0.685669 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR608264 3 0.0146 0.811102 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318560 5 0.6164 0.429970 0.116 0.000 0.164 0.004 0.612 0.104
#> SRR1454117 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1312684 5 0.5327 0.394429 0.196 0.000 0.000 0.208 0.596 0.000
#> SRR615044 3 0.8352 0.222080 0.000 0.200 0.368 0.072 0.184 0.176
#> SRR1432743 3 0.0603 0.810586 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1388873 6 0.4136 0.393638 0.000 0.428 0.000 0.000 0.012 0.560
#> SRR1353517 1 0.1075 0.825771 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1357148 3 0.4162 0.735524 0.000 0.000 0.752 0.004 0.100 0.144
#> SRR1406008 2 0.4226 0.110036 0.000 0.504 0.000 0.004 0.008 0.484
#> SRR1396786 6 0.2854 0.675124 0.000 0.208 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1446564 5 0.6233 0.254956 0.092 0.000 0.072 0.324 0.512 0.000
#> SRR1318465 3 0.0964 0.809216 0.000 0.000 0.968 0.004 0.016 0.012
#> SRR1431083 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.3409 0.405241 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.5299 -0.211343 0.000 0.468 0.044 0.020 0.004 0.464
#> SRR1087825 4 0.3586 0.847724 0.000 0.080 0.124 0.796 0.000 0.000
#> SRR662019 3 0.4095 0.746987 0.000 0.000 0.792 0.072 0.088 0.048
#> SRR1349209 4 0.4473 0.792840 0.000 0.028 0.184 0.732 0.056 0.000
#> SRR1326161 6 0.2964 0.685069 0.000 0.204 0.000 0.000 0.004 0.792
#> SRR1345284 2 0.3531 0.391540 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1416672 1 0.2941 0.657067 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR663356 2 0.1556 0.670268 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1454328 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1489286 1 0.3531 0.469139 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1092349 5 0.7650 0.278226 0.048 0.000 0.172 0.128 0.476 0.176
#> SRR1408183 3 0.0508 0.812853 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1084369 3 0.0146 0.811102 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR598452 3 0.0767 0.812118 0.000 0.000 0.976 0.012 0.008 0.004
#> SRR660709 4 0.7587 0.306000 0.000 0.308 0.240 0.328 0.008 0.116
#> SRR809444 5 0.3838 0.139953 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1089901 6 0.2664 0.679528 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1375774 5 0.6518 0.397324 0.236 0.000 0.100 0.004 0.548 0.112
#> SRR1326292 4 0.3667 0.791763 0.000 0.000 0.132 0.788 0.080 0.000
#> SRR657139 5 0.5487 0.348591 0.008 0.000 0.272 0.008 0.600 0.112
#> SRR1440744 2 0.2048 0.644833 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1353555 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 5 0.3756 0.289536 0.352 0.000 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1452334 4 0.3509 0.849011 0.000 0.084 0.112 0.804 0.000 0.000
#> SRR1381775 5 0.4457 0.292712 0.360 0.000 0.012 0.008 0.612 0.008
#> SRR1363908 5 0.3854 0.095895 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1319626 6 0.3986 0.080631 0.000 0.464 0.000 0.004 0.000 0.532
#> SRR658989 3 0.3012 0.788704 0.000 0.000 0.852 0.024 0.020 0.104
#> SRR1353663 5 0.4736 0.301985 0.352 0.000 0.000 0.060 0.588 0.000
#> SRR811771 5 0.5404 0.317016 0.312 0.000 0.000 0.140 0.548 0.000
#> SRR813983 1 0.2912 0.661950 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR815825 3 0.0665 0.811253 0.000 0.000 0.980 0.008 0.008 0.004
#> SRR819054 6 0.3872 0.319012 0.000 0.392 0.000 0.000 0.004 0.604
#> SRR1367988 2 0.6053 0.253896 0.000 0.528 0.324 0.108 0.004 0.036
#> SRR1331922 5 0.7741 0.314327 0.140 0.000 0.280 0.048 0.420 0.112
#> SRR615479 5 0.8756 0.058495 0.000 0.204 0.164 0.124 0.296 0.212
#> SRR1375796 6 0.3259 0.677278 0.000 0.216 0.000 0.000 0.012 0.772
#> SRR1386991 3 0.5791 0.478093 0.000 0.000 0.528 0.004 0.252 0.216
#> SRR1355217 6 0.8615 -0.042653 0.000 0.184 0.164 0.096 0.260 0.296
#> SRR1356290 6 0.5000 0.217166 0.000 0.008 0.416 0.000 0.052 0.524
#> SRR659507 6 0.7491 -0.087906 0.000 0.016 0.236 0.088 0.272 0.388
#> SRR663296 5 0.3838 0.138270 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR598044 2 0.3997 0.102150 0.000 0.508 0.000 0.000 0.004 0.488
#> SRR661155 4 0.3424 0.843935 0.000 0.092 0.096 0.812 0.000 0.000
#> SRR1414727 3 0.4793 0.712868 0.000 0.000 0.720 0.052 0.060 0.168
#> SRR663477 5 0.5325 0.391940 0.212 0.000 0.000 0.192 0.596 0.000
#> SRR1354489 3 0.0777 0.809399 0.000 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1377800 3 0.3310 0.773344 0.000 0.000 0.816 0.016 0.020 0.148
#> SRR614611 2 0.5715 0.174107 0.000 0.580 0.028 0.084 0.008 0.300
#> SRR655052 4 0.6669 0.460893 0.000 0.292 0.116 0.488 0.000 0.104
#> SRR1478968 4 0.3586 0.792625 0.000 0.000 0.124 0.796 0.080 0.000
#> SRR1351280 2 0.2512 0.657251 0.000 0.868 0.008 0.008 0.000 0.116
#> SRR613951 4 0.3952 0.848702 0.000 0.088 0.108 0.788 0.016 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4540 0.808748 0.000 0.064 0.188 0.724 0.024 0.000
#> SRR1408161 5 0.3838 0.138270 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR657054 3 0.2916 0.790537 0.000 0.000 0.860 0.024 0.020 0.096
#> SRR655040 2 0.1444 0.669757 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR810225 6 0.2996 0.672945 0.000 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1325377 6 0.2823 0.681374 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR617829 3 0.4466 0.472755 0.000 0.044 0.692 0.252 0.004 0.008
#> SRR1402328 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1480455 6 0.7082 0.307590 0.000 0.192 0.172 0.108 0.016 0.512
#> SRR1442104 3 0.1225 0.800372 0.000 0.004 0.956 0.032 0.004 0.004
#> SRR1453416 5 0.4230 0.294257 0.364 0.000 0.024 0.000 0.612 0.000
#> SRR1481396 3 0.3602 0.769973 0.000 0.000 0.812 0.012 0.068 0.108
#> SRR1414314 6 0.4185 0.276404 0.000 0.492 0.000 0.000 0.012 0.496
#> SRR663026 2 0.3995 0.098449 0.000 0.516 0.000 0.000 0.004 0.480
#> SRR1478386 2 0.0458 0.688319 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1458683 4 0.4399 0.735853 0.000 0.056 0.252 0.688 0.004 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.8861 -0.005343 0.000 0.204 0.220 0.124 0.240 0.212
#> SRR1310735 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.3423 0.846363 0.000 0.088 0.100 0.812 0.000 0.000
#> SRR660260 3 0.4730 0.653959 0.000 0.068 0.764 0.040 0.028 0.100
#> SRR1071231 6 0.3852 0.486568 0.000 0.384 0.000 0.000 0.004 0.612
#> SRR1459125 2 0.5290 0.415229 0.000 0.672 0.116 0.180 0.004 0.028
#> SRR1337173 3 0.1657 0.797573 0.000 0.000 0.928 0.000 0.056 0.016
#> SRR1396250 3 0.0405 0.811787 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR2166376 3 0.0964 0.814148 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004 0.012
#> SRR659816 6 0.6444 0.267139 0.000 0.184 0.320 0.028 0.004 0.464
#> SRR1401379 2 0.4421 0.187761 0.000 0.552 0.000 0.020 0.004 0.424
#> SRR600981 4 0.3644 0.848450 0.000 0.088 0.120 0.792 0.000 0.000
#> SRR1398335 5 0.3862 0.057698 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524 0.000
#> SRR1397218 2 0.3947 0.603456 0.000 0.800 0.092 0.072 0.000 0.036
#> SRR660115 5 0.4513 0.152104 0.440 0.000 0.000 0.032 0.528 0.000
#> SRR1407950 6 0.2964 0.685069 0.000 0.204 0.000 0.000 0.004 0.792
#> SRR1359780 6 0.5821 0.433313 0.000 0.332 0.060 0.040 0.012 0.556
#> SRR1490037 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.5698 0.425099 0.000 0.604 0.000 0.232 0.032 0.132
#> SRR1397156 1 0.1556 0.799615 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1410221 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1319648 2 0.3427 0.629687 0.000 0.804 0.032 0.008 0.000 0.156
#> SRR1092985 5 0.5019 0.356263 0.292 0.000 0.000 0.104 0.604 0.000
#> SRR656409 2 0.0713 0.680004 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.2402 0.734926 0.000 0.012 0.868 0.120 0.000 0.000
#> SRR1390437 2 0.3745 0.571255 0.000 0.784 0.100 0.116 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0146 0.685669 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612635 2 0.1267 0.680199 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1351480 2 0.4184 -0.010983 0.000 0.500 0.000 0.000 0.012 0.488
#> SRR1436651 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 5 0.6363 0.408814 0.220 0.000 0.108 0.004 0.572 0.096
#> SRR659590 6 0.3515 0.521806 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR614263 1 0.0713 0.830718 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1409575 2 0.0146 0.685669 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR659911 6 0.3852 0.572423 0.000 0.324 0.000 0.000 0.012 0.664
#> SRR1085519 3 0.0508 0.812853 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1345894 3 0.0146 0.811102 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442928 6 0.6393 -0.046995 0.000 0.000 0.248 0.024 0.268 0.460
#> SRR1464681 4 0.3372 0.846290 0.000 0.084 0.100 0.816 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.3695 0.366145 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1309070 3 0.1010 0.807203 0.000 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1365426 5 0.8700 0.040416 0.000 0.224 0.136 0.124 0.296 0.220
#> SRR1487947 5 0.5376 0.347726 0.004 0.000 0.276 0.012 0.608 0.100
#> SRR659708 5 0.6504 0.427033 0.120 0.000 0.188 0.008 0.576 0.108
#> SRR603236 6 0.5456 0.379536 0.000 0.028 0.328 0.032 0.024 0.588
#> SRR660673 1 0.0937 0.827997 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1430729 6 0.3984 0.309839 0.000 0.396 0.000 0.000 0.008 0.596
#> SRR663807 6 0.3342 0.674233 0.000 0.228 0.000 0.000 0.012 0.760
#> SRR1087245 2 0.0000 0.685179 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.3690 0.491927 0.000 0.684 0.000 0.008 0.000 0.308
#> SRR613426 4 0.4885 0.827453 0.000 0.088 0.120 0.728 0.064 0.000
#> SRR613879 6 0.4467 0.653780 0.000 0.216 0.056 0.000 0.016 0.712
#> SRR1385101 2 0.7708 0.113903 0.000 0.412 0.312 0.076 0.120 0.080
#> SRR1387966 6 0.3967 0.513851 0.000 0.356 0.000 0.000 0.012 0.632
#> SRR1458852 6 0.2980 0.685248 0.000 0.192 0.008 0.000 0.000 0.800
#> SRR1430489 5 0.4693 0.253630 0.040 0.000 0.004 0.392 0.564 0.000
#> SRR1349231 5 0.7419 0.323412 0.048 0.000 0.156 0.120 0.512 0.164
#> SRR1376249 3 0.3709 0.766780 0.000 0.000 0.808 0.016 0.076 0.100
#> SRR1321987 6 0.2793 0.685532 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR662653 6 0.2762 0.679403 0.000 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1390027 1 0.2883 0.668415 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1098474 2 0.4129 0.038046 0.000 0.496 0.000 0.004 0.004 0.496
#> SRR1383081 2 0.3133 0.546103 0.000 0.780 0.000 0.000 0.008 0.212
#> SRR2166960 2 0.4076 0.115086 0.000 0.540 0.000 0.000 0.008 0.452
#> SRR605101 2 0.5150 0.130178 0.000 0.492 0.016 0.032 0.008 0.452
#> SRR818600 6 0.3394 0.665807 0.000 0.236 0.000 0.000 0.012 0.752
#> SRR1367715 2 0.0458 0.687211 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1351979 3 0.0405 0.810320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1387054 3 0.4166 0.524462 0.000 0.076 0.728 0.196 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.2766 0.789898 0.000 0.000 0.852 0.004 0.020 0.124
#> SRR1322662 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 6 0.3979 0.514146 0.000 0.360 0.000 0.000 0.012 0.628
#> SRR612767 5 0.4587 0.325798 0.048 0.000 0.000 0.356 0.596 0.000
#> SRR1489030 2 0.4181 -0.206209 0.000 0.512 0.000 0.000 0.012 0.476
#> SRR1430375 6 0.6803 0.052357 0.000 0.000 0.272 0.052 0.252 0.424
#> SRR615225 4 0.3873 0.844204 0.000 0.104 0.124 0.772 0.000 0.000
#> SRR1401839 3 0.5139 0.679404 0.000 0.040 0.720 0.020 0.140 0.080
#> SRR1379110 2 0.1007 0.683175 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1077288 3 0.3844 0.762873 0.000 0.000 0.796 0.016 0.076 0.112
#> SRR1331639 4 0.3473 0.843198 0.000 0.096 0.096 0.808 0.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.8716 -0.002474 0.000 0.260 0.140 0.116 0.252 0.232
#> SRR1443003 3 0.3054 0.738446 0.000 0.000 0.828 0.000 0.136 0.036
#> SRR612839 5 0.3850 0.307930 0.340 0.000 0.000 0.004 0.652 0.004
#> SRR1470093 3 0.1067 0.803701 0.000 0.004 0.964 0.024 0.004 0.004
#> SRR1395742 1 0.2854 0.670418 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1469014 1 0.3684 0.381165 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1387222 3 0.1637 0.791770 0.000 0.004 0.932 0.056 0.004 0.004
#> SRR664063 5 0.8637 0.031858 0.000 0.228 0.124 0.120 0.304 0.224
#> SRR1488214 5 0.5350 0.392573 0.196 0.000 0.000 0.212 0.592 0.000
#> SRR654766 4 0.3698 0.847907 0.000 0.096 0.116 0.788 0.000 0.000
#> SRR1320321 6 0.4096 0.030440 0.000 0.484 0.000 0.000 0.008 0.508
#> SRR1071955 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.847896 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2558 0.619380 0.000 0.840 0.000 0.000 0.004 0.156
#> SRR1488470 2 0.0146 0.684300 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0508 0.812853 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1367109 3 0.0291 0.811303 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR615311 5 0.4468 0.217104 0.408 0.000 0.000 0.032 0.560 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.965 0.986 0.4460 0.557 0.557
#> 3 3 0.930 0.935 0.973 0.4604 0.750 0.568
#> 4 4 0.702 0.680 0.818 0.1289 0.884 0.689
#> 5 5 0.837 0.811 0.904 0.0622 0.848 0.533
#> 6 6 0.784 0.654 0.820 0.0353 0.959 0.828
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0376 0.9825 0.004 0.996
#> SRR665262 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1499740 1 0.8016 0.6772 0.756 0.244
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.9881 0.2310 0.436 0.564
#> SRR1375439 2 0.6247 0.8124 0.156 0.844
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 0.7815 0.6972 0.768 0.232
#> SRR612227 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.7299 0.7444 0.204 0.796
#> SRR615814 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR809595 1 0.8144 0.6634 0.748 0.252
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.4022 0.9042 0.920 0.080
#> SRR612683 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1355352 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.8661 0.6000 0.288 0.712
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.8499 0.6228 0.276 0.724
#> SRR662126 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.7219 0.7505 0.200 0.800
#> SRR810249 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR818773 1 0.9427 0.4378 0.640 0.360
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.7219 0.7505 0.200 0.800
#> SRR661074 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.5519 0.8486 0.128 0.872
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0376 0.9825 0.004 0.996
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1475104 1 0.9795 0.2861 0.584 0.416
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.6887 0.7738 0.184 0.816
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.2236 0.9520 0.036 0.964
#> SRR1319753 2 0.2948 0.9354 0.052 0.948
#> SRR818901 2 0.1633 0.9636 0.024 0.976
#> SRR607067 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.8327 0.6449 0.264 0.736
#> SRR658259 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0938 0.9751 0.012 0.988
#> SRR1456027 1 0.0672 0.9764 0.992 0.008
#> SRR1400551 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.2603 0.9434 0.044 0.956
#> SRR663284 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR615044 2 1.0000 0.0162 0.496 0.504
#> SRR1432743 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR662019 1 0.8207 0.6562 0.744 0.256
#> SRR1349209 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.3584 0.9163 0.932 0.068
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1414727 1 0.0672 0.9764 0.992 0.008
#> SRR663477 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.9129 0.5174 0.328 0.672
#> SRR614611 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0672 0.9764 0.992 0.008
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.3431 0.9227 0.064 0.936
#> SRR655040 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.0672 0.9764 0.992 0.008
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0672 0.9764 0.992 0.008
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.9286 0.4813 0.344 0.656
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR613426 1 0.5294 0.8587 0.880 0.120
#> SRR613879 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.9954 0.1435 0.540 0.460
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.7139 0.7564 0.196 0.804
#> SRR1443003 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.9358 0.4626 0.352 0.648
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.9861 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9833 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.3482 0.84811 0.872 0.000 0.128
#> SRR1074359 2 0.1643 0.93277 0.000 0.956 0.044
#> SRR1419258 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499740 1 0.6244 0.22468 0.560 0.000 0.440
#> SRR1105057 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.1289 0.94342 0.000 0.968 0.032
#> SRR1094051 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.6095 0.36364 0.608 0.000 0.392
#> SRR1409263 3 0.0424 0.95543 0.008 0.000 0.992
#> SRR1431288 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 2 0.6111 0.36849 0.000 0.604 0.396
#> SRR1402153 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.2066 0.90854 0.000 0.060 0.940
#> SRR1329003 3 0.3412 0.83708 0.124 0.000 0.876
#> SRR1404837 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 3 0.3686 0.82884 0.000 0.140 0.860
#> SRR1452864 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.1289 0.94231 0.032 0.968 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 1 0.1031 0.95621 0.976 0.024 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0237 0.96615 0.000 0.996 0.004
#> SRR1392186 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.4002 0.80638 0.000 0.160 0.840
#> SRR1360402 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.5397 0.62726 0.000 0.720 0.280
#> SRR1408682 2 0.3816 0.82433 0.000 0.852 0.148
#> SRR1317134 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.3116 0.87206 0.892 0.000 0.108
#> SRR1452423 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.9152 -0.00135 0.424 0.432 0.144
#> SRR1486156 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.4555 0.75245 0.200 0.800 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.3619 0.82218 0.864 0.136 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459937 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.3340 0.84865 0.000 0.880 0.120
#> SRR661096 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.3038 0.86080 0.104 0.000 0.896
#> SRR1307677 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.6062 0.35722 0.000 0.616 0.384
#> SRR1353924 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.6180 0.26817 0.416 0.000 0.584
#> SRR1487570 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.2537 0.89920 0.000 0.920 0.080
#> SRR1418561 3 0.4002 0.79025 0.160 0.000 0.840
#> SRR1448029 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.4555 0.75656 0.000 0.800 0.200
#> SRR603116 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.1289 0.94237 0.032 0.968 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 3 0.1163 0.93944 0.000 0.028 0.972
#> SRR1489950 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.3038 0.86354 0.000 0.104 0.896
#> SRR658766 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.3340 0.85023 0.000 0.120 0.880
#> SRR817282 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.3791 0.88186 0.048 0.892 0.060
#> SRR1471965 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0892 0.94574 0.000 0.020 0.980
#> SRR1376764 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.3752 0.82907 0.000 0.856 0.144
#> SRR820907 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0237 0.96605 0.004 0.996 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.4750 0.72500 0.784 0.000 0.216
#> SRR1309942 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.0237 0.95865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1435418 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 2 0.5696 0.77482 0.056 0.796 0.148
#> SRR1500323 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.2625 0.89543 0.000 0.916 0.084
#> SRR613126 2 0.4504 0.76241 0.000 0.804 0.196
#> SRR1089424 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.6553 0.31148 0.412 0.580 0.008
#> SRR1456027 3 0.1163 0.93886 0.028 0.000 0.972
#> SRR1400551 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.0237 0.95865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1348040 3 0.6154 0.30658 0.408 0.000 0.592
#> SRR1489610 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.3686 0.83291 0.860 0.000 0.140
#> SRR1394637 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0592 0.95235 0.000 0.012 0.988
#> SRR1406008 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0237 0.95865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1431083 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR662019 3 0.0747 0.94921 0.016 0.000 0.984
#> SRR1349209 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 3 0.2878 0.86973 0.096 0.000 0.904
#> SRR657139 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.2625 0.88704 0.000 0.084 0.916
#> SRR1381775 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.5098 0.66029 0.000 0.248 0.752
#> SRR1331922 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 2 0.6111 0.36867 0.000 0.604 0.396
#> SRR1355217 2 0.5431 0.62014 0.000 0.716 0.284
#> SRR1356290 2 0.1964 0.92205 0.000 0.944 0.056
#> SRR659507 3 0.6291 0.09182 0.000 0.468 0.532
#> SRR663296 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.5291 0.62279 0.000 0.732 0.268
#> SRR1414727 1 0.6079 0.35867 0.612 0.000 0.388
#> SRR663477 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 2 0.0424 0.96286 0.000 0.992 0.008
#> SRR1478968 3 0.0424 0.95575 0.008 0.000 0.992
#> SRR1351280 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.5178 0.66559 0.000 0.256 0.744
#> SRR1418022 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.3116 0.86778 0.892 0.000 0.108
#> SRR1310735 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR660260 3 0.3116 0.85923 0.000 0.108 0.892
#> SRR1071231 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.2356 0.90702 0.000 0.928 0.072
#> SRR1337173 3 0.0237 0.95855 0.000 0.004 0.996
#> SRR1396250 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.5327 0.63785 0.000 0.728 0.272
#> SRR1401379 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 3 0.1289 0.93516 0.000 0.032 0.968
#> SRR1398335 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0237 0.96620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397156 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.4452 0.76778 0.000 0.808 0.192
#> SRR1464681 2 0.0592 0.95996 0.000 0.988 0.012
#> SRR1418880 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.5016 0.69150 0.240 0.760 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 2 0.4399 0.77319 0.000 0.812 0.188
#> SRR660673 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.4974 0.67860 0.764 0.236 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0892 0.94628 0.000 0.020 0.980
#> SRR1444306 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.2959 0.87861 0.000 0.900 0.100
#> SRR615225 3 0.1031 0.94346 0.000 0.024 0.976
#> SRR1401839 3 0.6299 0.06141 0.000 0.476 0.524
#> SRR1379110 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.4555 0.75245 0.200 0.800 0.000
#> SRR1443003 3 0.5431 0.59897 0.000 0.284 0.716
#> SRR612839 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.5678 0.55334 0.316 0.684 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 3 0.5859 0.46264 0.000 0.344 0.656
#> SRR1320321 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.96924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.96140 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.98194 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.2530 0.67474 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1380716 2 0.4730 0.29831 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR612803 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.4624 0.45122 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1074359 4 0.5444 0.68843 0.000 0.264 0.048 0.688
#> SRR1419258 3 0.0592 0.78292 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1403366 3 0.6797 0.58203 0.000 0.160 0.600 0.240
#> SRR665262 2 0.4535 0.59865 0.000 0.744 0.016 0.240
#> SRR1499740 3 0.8196 0.51946 0.044 0.196 0.524 0.236
#> SRR1105057 2 0.3610 0.60870 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1439742 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.7516 0.43561 0.000 0.264 0.496 0.240
#> SRR612215 2 0.6110 0.52885 0.000 0.660 0.100 0.240
#> SRR1094051 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.4961 0.14944 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1409263 3 0.2081 0.75037 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 4 0.4761 0.56304 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR614839 2 0.2216 0.69460 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR658433 2 0.1474 0.69348 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1088581 3 0.4643 0.40025 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1328797 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334512 4 0.4697 0.59079 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1471117 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0817 0.69755 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1354955 3 0.0000 0.78792 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660066 2 0.2530 0.67460 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1447103 2 0.7324 0.30630 0.000 0.532 0.228 0.240
#> SRR1402153 3 0.0592 0.78296 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR655887 2 0.4761 0.27481 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1408529 3 0.1118 0.78643 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR658707 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.1302 0.69910 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1074670 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1375439 3 0.7567 0.40526 0.000 0.276 0.484 0.240
#> SRR1329003 4 0.5383 0.13700 0.012 0.000 0.452 0.536
#> SRR1404837 2 0.3975 0.60971 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1317920 1 0.0188 0.96820 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455525 3 0.4830 0.29461 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR613999 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.5136 0.68752 0.000 0.048 0.728 0.224
#> SRR1068855 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR612227 3 0.5111 0.69458 0.000 0.056 0.740 0.204
#> SRR1388809 2 0.0336 0.69800 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1413872 4 0.4949 0.71299 0.000 0.180 0.060 0.760
#> SRR1452864 1 0.0469 0.96111 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473078 3 0.5136 0.68730 0.000 0.048 0.728 0.224
#> SRR615814 2 0.3024 0.65257 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1325225 1 0.3528 0.75799 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1313687 2 0.1302 0.69662 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1358220 2 0.3873 0.57716 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1096662 4 0.4134 0.70186 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1487746 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.4420 0.60150 0.000 0.748 0.012 0.240
#> SRR660164 2 0.1557 0.69679 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR815783 2 0.2081 0.68659 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR809595 2 0.9031 0.29366 0.160 0.480 0.136 0.224
#> SRR1403133 2 0.2281 0.68202 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR815470 4 0.4040 0.70932 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1344382 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.1661 0.78243 0.000 0.004 0.944 0.052
#> SRR1478362 4 0.3975 0.71224 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1392186 2 0.2814 0.67391 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1347937 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.3444 0.64177 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR612683 2 0.3801 0.58695 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1392901 3 0.0817 0.78295 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1077805 3 0.6326 0.39959 0.000 0.108 0.636 0.256
#> SRR1360402 2 0.3400 0.62754 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1406112 3 0.3870 0.72127 0.000 0.004 0.788 0.208
#> SRR1355352 3 0.4332 0.73334 0.072 0.000 0.816 0.112
#> SRR656247 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.4933 0.14183 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR808244 3 0.3801 0.59990 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1387240 2 0.2704 0.66825 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1408595 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.4933 0.20883 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1435248 2 0.0707 0.69806 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1419110 2 0.7105 0.37635 0.000 0.564 0.196 0.240
#> SRR1408682 2 0.6216 0.52124 0.000 0.652 0.108 0.240
#> SRR1317134 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.3172 0.65434 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1453911 2 0.5267 0.57420 0.000 0.712 0.048 0.240
#> SRR603164 3 0.0592 0.78805 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1383259 4 0.4277 0.68448 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1330854 1 0.4776 0.36188 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.1867 0.69002 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1468162 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.1890 0.77986 0.000 0.008 0.936 0.056
#> SRR1361546 2 0.8129 0.27986 0.032 0.512 0.232 0.224
#> SRR1486156 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2647 0.67083 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR615635 2 0.2973 0.65588 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1385411 4 0.4585 0.62663 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1342739 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0336 0.78807 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR662126 4 0.4925 0.44381 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1464601 2 0.2216 0.68365 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1071594 2 0.2589 0.67271 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR612539 2 0.3356 0.63063 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR602010 2 0.6471 0.53394 0.080 0.660 0.020 0.240
#> SRR810249 2 0.2921 0.65892 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR818773 2 0.8551 0.36155 0.208 0.512 0.072 0.208
#> SRR1336569 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3837 0.61888 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1442754 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.6216 0.63127 0.000 0.108 0.652 0.240
#> SRR661639 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.7623 -0.23785 0.204 0.416 0.000 0.380
#> SRR1459937 4 0.4977 0.13147 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR2185018 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.2281 0.68503 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR809348 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR661074 3 0.2149 0.74712 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.4040 0.70932 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR661096 2 0.3444 0.62364 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1320225 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.5263 0.15557 0.008 0.000 0.448 0.544
#> SRR1307677 4 0.4948 0.41308 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1466512 2 0.4543 0.40109 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR658212 4 0.4605 0.62058 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1430525 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1344422 4 0.4008 0.71097 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1353924 2 0.3837 0.58203 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1314832 3 0.4877 0.30469 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1487570 4 0.4961 0.04644 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR627431 2 0.4054 0.64178 0.000 0.796 0.016 0.188
#> SRR1418561 3 0.4630 0.55543 0.016 0.000 0.732 0.252
#> SRR1448029 3 0.3652 0.75006 0.000 0.052 0.856 0.092
#> SRR813802 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.4730 0.29831 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1435311 2 0.3569 0.63640 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR612395 2 0.6907 0.42303 0.000 0.588 0.172 0.240
#> SRR603116 2 0.4295 0.60417 0.000 0.752 0.008 0.240
#> SRR1323152 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1368264 2 0.4155 0.60694 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1326624 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.78792 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.4585 0.38180 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1486799 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.4877 0.49075 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR815044 4 0.4164 0.69899 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1338560 2 0.2081 0.68564 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR615862 2 0.4843 0.19403 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1480038 2 0.2530 0.67436 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR659436 3 0.7478 0.45173 0.000 0.256 0.504 0.240
#> SRR613699 2 0.2704 0.66801 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1436563 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4564 0.39215 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1330327 4 0.5128 0.67687 0.000 0.092 0.148 0.760
#> SRR1489950 2 0.1940 0.68904 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1431927 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.1302 0.78442 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1444002 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.4431 0.47405 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR600656 4 0.5144 0.60879 0.000 0.052 0.216 0.732
#> SRR658766 3 0.1792 0.78298 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR655946 3 0.6212 0.20228 0.000 0.060 0.560 0.380
#> SRR817282 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0707 0.78752 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1406418 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.6871 0.43038 0.000 0.592 0.168 0.240
#> SRR1471965 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4728 0.70207 0.000 0.032 0.752 0.216
#> SRR662498 3 0.6797 0.58289 0.000 0.160 0.600 0.240
#> SRR1376764 3 0.0921 0.78708 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1377006 3 0.4008 0.56827 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR656860 4 0.4522 0.64109 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1480547 4 0.4955 0.40238 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1452515 3 0.6637 0.59767 0.000 0.144 0.616 0.240
#> SRR1324390 2 0.0592 0.69771 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615273 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.5308 0.55560 0.000 0.684 0.036 0.280
#> SRR820907 2 0.2149 0.68413 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR812773 1 0.9754 -0.09461 0.348 0.248 0.164 0.240
#> SRR1405984 2 0.1211 0.69775 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1472794 2 0.2647 0.67078 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1365448 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.78792 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.6461 0.61231 0.000 0.128 0.632 0.240
#> SRR1080766 2 0.1716 0.69125 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1377862 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.3074 0.74836 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1467966 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320579 3 0.2921 0.68957 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1319710 2 0.3311 0.64854 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1326604 2 0.4730 0.29805 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1098879 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR662245 2 0.1792 0.69271 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1074719 2 0.2081 0.68873 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR816226 1 0.4605 0.52216 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR601387 2 0.2081 0.68591 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR614575 2 0.3942 0.56564 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1353900 2 0.1637 0.69212 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR662906 2 0.3266 0.63896 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1350832 2 0.1940 0.68812 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1403280 2 0.4134 0.52880 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1313969 4 0.4977 0.13196 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1388528 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.2751 0.87533 0.904 0.056 0.000 0.040
#> SRR655399 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319753 2 0.4364 0.53686 0.220 0.764 0.000 0.016
#> SRR818901 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR607067 2 0.4977 0.00309 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1391420 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4605 0.37267 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR661961 3 0.7497 0.44420 0.000 0.260 0.500 0.240
#> SRR658259 2 0.3873 0.57643 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1310476 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1867 0.68934 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1365034 4 0.4543 0.63619 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1478053 2 0.3907 0.57221 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1475300 2 0.0817 0.69714 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1328101 2 0.4642 0.59568 0.000 0.740 0.020 0.240
#> SRR1322900 3 0.6684 0.13765 0.448 0.008 0.480 0.064
#> SRR1309942 2 0.3486 0.62026 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1345760 4 0.4535 0.57487 0.000 0.016 0.240 0.744
#> SRR1435418 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4072 0.70720 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1443436 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.3975 0.60971 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR661469 2 0.6907 0.42303 0.000 0.588 0.172 0.240
#> SRR1500323 2 0.3942 0.61229 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1356705 2 0.3975 0.60971 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1464915 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1350435 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.5788 0.65801 0.000 0.084 0.688 0.228
#> SRR1368072 2 0.3610 0.63394 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR601815 2 0.1211 0.69550 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR613330 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.4925 0.42034 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1394190 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.7110 0.54409 0.000 0.200 0.564 0.236
#> SRR1318839 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1432390 4 0.4916 0.71351 0.000 0.184 0.056 0.760
#> SRR613126 2 0.6478 0.49979 0.000 0.632 0.132 0.236
#> SRR1089424 2 0.3688 0.60019 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1347214 2 0.3649 0.60453 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1309556 2 0.8454 0.29226 0.308 0.484 0.068 0.140
#> SRR1456027 4 0.4605 0.42035 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1400551 3 0.5967 0.67984 0.028 0.052 0.708 0.212
#> SRR1320469 1 0.0707 0.95302 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR614251 2 0.2469 0.68066 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1454310 2 0.3942 0.56818 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR615105 4 0.4948 0.19006 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1433290 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2166064 4 0.3975 0.71224 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR601671 2 0.3942 0.56564 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR663874 2 0.3837 0.61934 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1409130 2 0.2011 0.68772 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR659696 4 0.4040 0.70932 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1408249 2 0.7228 -0.02256 0.156 0.504 0.000 0.340
#> SRR663284 2 0.5039 0.15367 0.004 0.592 0.000 0.404
#> SRR1402794 3 0.0000 0.78792 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 4 0.4920 0.63440 0.000 0.052 0.192 0.756
#> SRR1348040 1 0.4997 0.70245 0.744 0.004 0.036 0.216
#> SRR1489610 2 0.3356 0.64645 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1488091 2 0.3764 0.62465 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1499566 2 0.3144 0.66528 0.072 0.884 0.000 0.044
#> SRR1361480 2 0.4961 -0.01127 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1444501 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1415773 2 0.3942 0.61229 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1388832 1 0.4697 0.41233 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.2921 0.67103 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR662918 4 0.4072 0.70720 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR817421 3 0.0469 0.78476 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1400823 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.4981 0.33908 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR608264 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1318560 1 0.0592 0.95713 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1454117 2 0.3172 0.65469 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1312684 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 1 0.4642 0.76376 0.808 0.068 0.008 0.116
#> SRR1432743 3 0.5783 0.66147 0.000 0.088 0.692 0.220
#> SRR1388873 2 0.4040 0.54832 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1353517 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.7676 0.34317 0.000 0.308 0.452 0.240
#> SRR1406008 2 0.2647 0.67273 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1396786 2 0.2345 0.68644 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1446564 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.1576 0.78553 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1431083 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4103 0.70466 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR655170 2 0.4790 0.24875 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1087825 4 0.4222 0.52835 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR662019 3 0.3311 0.66768 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1349209 3 0.4790 0.32326 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1326161 2 0.2921 0.65851 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1345284 2 0.1637 0.69211 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1416672 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4564 0.39246 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1454328 2 0.2081 0.68590 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1489286 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0336 0.78837 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1084369 3 0.0707 0.78843 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR598452 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR660709 4 0.4804 0.22051 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR809444 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1637 0.69213 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1375774 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.5263 0.15557 0.008 0.000 0.448 0.544
#> SRR657139 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.3801 0.58658 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1353555 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.4707 0.71524 0.000 0.204 0.036 0.760
#> SRR1381775 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.1557 0.69297 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR658989 3 0.3583 0.73449 0.000 0.004 0.816 0.180
#> SRR1353663 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0469 0.78476 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR819054 2 0.2081 0.68597 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1367988 4 0.6038 0.04331 0.000 0.044 0.424 0.532
#> SRR1331922 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.8419 0.34191 0.216 0.496 0.048 0.240
#> SRR1375796 2 0.1302 0.69661 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1386991 2 0.7164 0.36003 0.000 0.556 0.204 0.240
#> SRR1355217 2 0.7220 0.34206 0.000 0.548 0.212 0.240
#> SRR1356290 2 0.5820 0.55041 0.000 0.684 0.084 0.232
#> SRR659507 2 0.7516 0.21519 0.000 0.496 0.264 0.240
#> SRR663296 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0817 0.69825 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR661155 4 0.4122 0.71315 0.000 0.236 0.004 0.760
#> SRR1414727 3 0.8563 0.54099 0.128 0.128 0.536 0.208
#> SRR663477 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.1867 0.77785 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1377800 3 0.5102 0.68981 0.000 0.048 0.732 0.220
#> SRR614611 4 0.4933 0.40837 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR655052 4 0.4008 0.71097 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1478968 4 0.4304 0.50949 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1351280 4 0.4967 0.37981 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR613951 4 0.4755 0.71468 0.000 0.200 0.040 0.760
#> SRR1418022 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.4996 0.02665 0.000 0.000 0.516 0.484
#> SRR1408161 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.78792 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655040 4 0.4164 0.69888 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR810225 2 0.2469 0.67760 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1325377 2 0.1792 0.69062 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR617829 3 0.4193 0.53354 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1402328 2 0.1637 0.69597 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1480455 2 0.3801 0.59306 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1442104 3 0.1211 0.76908 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1453416 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414314 2 0.4193 0.51540 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR663026 2 0.1118 0.69607 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1478386 2 0.3942 0.56597 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1458683 3 0.4999 0.00236 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1370572 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.9821 0.27155 0.176 0.256 0.332 0.236
#> SRR1310735 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.4792 0.46389 0.000 0.008 0.312 0.680
#> SRR660260 3 0.4632 0.47299 0.000 0.004 0.688 0.308
#> SRR1071231 2 0.2530 0.67522 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1459125 4 0.4979 0.71222 0.000 0.176 0.064 0.760
#> SRR1337173 3 0.5440 0.68641 0.000 0.104 0.736 0.160
#> SRR1396250 3 0.0188 0.78752 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2166376 3 0.0000 0.78792 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659816 4 0.7099 0.28661 0.000 0.168 0.280 0.552
#> SRR1401379 2 0.3311 0.64854 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR600981 4 0.5141 0.66620 0.000 0.084 0.160 0.756
#> SRR1398335 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4679 0.37441 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR660115 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.2814 0.66371 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1359780 2 0.3837 0.58337 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1490037 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.4585 0.47025 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1397156 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1637 0.69213 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1319648 2 0.3688 0.60027 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1092985 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.4730 0.57683 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1468658 3 0.3873 0.59098 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1390437 4 0.4008 0.71097 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR658057 2 0.4585 0.38227 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR612635 2 0.3873 0.57682 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1351480 2 0.2469 0.67613 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1436651 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.1389 0.69417 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR614263 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.4072 0.54206 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR659911 2 0.4134 0.52876 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1085519 3 0.1302 0.78451 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1345894 3 0.1406 0.78524 0.000 0.016 0.960 0.024
#> SRR1442928 2 0.6907 0.42303 0.000 0.588 0.172 0.240
#> SRR1464681 4 0.4122 0.71315 0.000 0.236 0.004 0.760
#> SRR1418880 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.4079 0.72746 0.000 0.020 0.800 0.180
#> SRR1365426 2 0.6367 0.52792 0.096 0.656 0.008 0.240
#> SRR1487947 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 2 0.5932 0.54810 0.000 0.680 0.096 0.224
#> SRR660673 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1867 0.68933 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR663807 2 0.3356 0.63086 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1087245 2 0.4679 0.33159 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1339108 2 0.1557 0.69517 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR613426 4 0.5217 0.64109 0.136 0.108 0.000 0.756
#> SRR613879 2 0.4053 0.61803 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR1385101 1 0.1022 0.93526 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.4103 0.53536 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1458852 2 0.1716 0.69135 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1430489 1 0.1867 0.90150 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1349231 1 0.0707 0.95440 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1376249 3 0.0376 0.78656 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1321987 2 0.1211 0.69544 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR662653 2 0.0921 0.69791 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1390027 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0817 0.69743 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1383081 2 0.3610 0.60861 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR2166960 2 0.3172 0.64381 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR605101 2 0.3975 0.60971 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR818600 2 0.3486 0.62007 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1367715 2 0.3801 0.58655 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1351979 3 0.0336 0.78634 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1387054 3 0.4741 0.56959 0.000 0.028 0.744 0.228
#> SRR1444306 3 0.5559 0.66533 0.000 0.064 0.696 0.240
#> SRR1322662 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4331 0.47790 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR612767 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.2868 0.66107 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1430375 2 0.6267 0.51741 0.000 0.648 0.112 0.240
#> SRR615225 4 0.4957 0.62158 0.000 0.048 0.204 0.748
#> SRR1401839 2 0.7372 0.29014 0.000 0.524 0.236 0.240
#> SRR1379110 2 0.3907 0.57126 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1077288 3 0.1389 0.77136 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1331639 4 0.3975 0.71224 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1342782 2 0.6569 0.53059 0.080 0.656 0.024 0.240
#> SRR1443003 3 0.7756 0.24435 0.000 0.348 0.412 0.240
#> SRR612839 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.2149 0.73414 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1395742 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.3400 0.64780 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR664063 2 0.6601 0.53105 0.076 0.656 0.028 0.240
#> SRR1488214 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.5072 0.61731 0.000 0.052 0.208 0.740
#> SRR1320321 2 0.0188 0.69804 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3837 0.58197 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1488470 4 0.4992 0.30326 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1389497 3 0.0188 0.78825 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367109 3 0.4540 0.71545 0.000 0.032 0.772 0.196
#> SRR615311 1 0.0000 0.97164 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0451 0.90551 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1380716 2 0.1205 0.90349 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR612803 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0290 0.97859 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084417 3 0.4307 0.08137 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR1074359 4 0.1410 0.85808 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1419258 3 0.1357 0.83069 0.000 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR1403366 5 0.4300 0.12732 0.000 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR665262 5 0.0510 0.80352 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1499740 5 0.1106 0.79472 0.012 0.000 0.024 0.000 0.964
#> SRR1105057 2 0.0290 0.90652 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1439742 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.0703 0.79918 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR612215 5 0.0290 0.80348 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1094051 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.1851 0.78612 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.0162 0.85262 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.2563 0.85611 0.000 0.872 0.000 0.120 0.008
#> SRR614839 2 0.4135 0.59282 0.000 0.656 0.000 0.004 0.340
#> SRR658433 2 0.1557 0.89521 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1088581 4 0.1270 0.86116 0.000 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1328797 3 0.0290 0.85309 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1334512 2 0.1768 0.89077 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1471117 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0880 0.90519 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1354955 3 0.4021 0.64891 0.000 0.000 0.764 0.036 0.200
#> SRR654802 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.1106 0.90759 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1447103 5 0.0671 0.80407 0.000 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1402153 3 0.0404 0.85213 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR655887 2 0.0865 0.90651 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1408529 3 0.0324 0.85318 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR658707 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.1306 0.90369 0.000 0.960 0.008 0.016 0.016
#> SRR1074670 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375439 5 0.3914 0.71334 0.004 0.024 0.156 0.012 0.804
#> SRR1329003 4 0.1168 0.87037 0.008 0.000 0.032 0.960 0.000
#> SRR1404837 5 0.1026 0.80288 0.000 0.024 0.004 0.004 0.968
#> SRR1317920 1 0.0162 0.98090 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1455525 4 0.1792 0.84571 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR613999 1 0.0162 0.98149 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310836 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.4307 0.09941 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1068855 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0162 0.85338 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR612227 5 0.4331 0.37688 0.000 0.000 0.400 0.004 0.596
#> SRR1388809 2 0.0963 0.90507 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1413872 4 0.0609 0.87782 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1452864 1 0.0324 0.97849 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1473078 3 0.4581 0.33487 0.000 0.004 0.624 0.012 0.360
#> SRR615814 2 0.2236 0.88915 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1325225 4 0.3534 0.62783 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1313687 2 0.0727 0.90358 0.000 0.980 0.004 0.012 0.004
#> SRR1358220 2 0.0671 0.90776 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1096662 2 0.3814 0.67750 0.000 0.720 0.000 0.276 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.0865 0.80286 0.000 0.024 0.000 0.004 0.972
#> SRR660164 5 0.4547 0.17267 0.000 0.400 0.000 0.012 0.588
#> SRR815783 2 0.2069 0.87724 0.000 0.912 0.000 0.012 0.076
#> SRR809595 5 0.1704 0.76896 0.068 0.000 0.004 0.000 0.928
#> SRR1403133 2 0.1901 0.88388 0.000 0.928 0.004 0.012 0.056
#> SRR815470 4 0.0609 0.87800 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.5236 0.54079 0.000 0.008 0.280 0.060 0.652
#> SRR1478362 4 0.0609 0.87800 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1392186 2 0.4291 0.28741 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1347937 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.3932 0.50115 0.000 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR612683 2 0.2291 0.89379 0.000 0.908 0.000 0.036 0.056
#> SRR1392901 5 0.6671 0.20099 0.000 0.000 0.240 0.340 0.420
#> SRR1077805 3 0.4722 0.34926 0.000 0.368 0.608 0.024 0.000
#> SRR1360402 2 0.0579 0.90786 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1406112 5 0.3876 0.53281 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1355352 3 0.0290 0.85089 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR656247 1 0.1544 0.92108 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR813656 2 0.5264 0.50781 0.004 0.604 0.000 0.052 0.340
#> SRR808244 3 0.0703 0.84718 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1387240 2 0.4449 0.76423 0.000 0.752 0.000 0.080 0.168
#> SRR1408595 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.1117 0.87203 0.000 0.000 0.020 0.964 0.016
#> SRR1435248 2 0.1106 0.90117 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1419110 5 0.0451 0.80329 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1408682 5 0.3511 0.70380 0.000 0.184 0.004 0.012 0.800
#> SRR1317134 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 5 0.1704 0.78090 0.000 0.068 0.000 0.004 0.928
#> SRR1453911 5 0.0451 0.80329 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR603164 3 0.1809 0.80177 0.000 0.060 0.928 0.012 0.000
#> SRR1383259 2 0.2629 0.84391 0.000 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR1330854 3 0.3395 0.62698 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.2732 0.83617 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1468162 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0290 0.85064 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1361546 5 0.0932 0.79885 0.020 0.004 0.004 0.000 0.972
#> SRR1486156 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.6223 0.38511 0.000 0.512 0.000 0.160 0.328
#> SRR615635 2 0.0807 0.90826 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1385411 2 0.3123 0.80110 0.000 0.812 0.000 0.184 0.004
#> SRR1342739 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662126 4 0.3241 0.78349 0.000 0.024 0.000 0.832 0.144
#> SRR1464601 2 0.2102 0.87716 0.000 0.916 0.004 0.012 0.068
#> SRR1071594 2 0.0451 0.90827 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR612539 2 0.1106 0.90707 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR602010 5 0.0290 0.80371 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR810249 2 0.0451 0.90516 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR818773 5 0.1704 0.76868 0.068 0.000 0.004 0.000 0.928
#> SRR1336569 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 5 0.0566 0.80341 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1442754 1 0.3895 0.51192 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1334247 5 0.3932 0.50789 0.000 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR661639 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6528 0.52326 0.176 0.596 0.000 0.036 0.192
#> SRR1459937 4 0.0880 0.87138 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.3689 0.72349 0.000 0.740 0.000 0.004 0.256
#> SRR809348 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0566 0.85035 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1349851 1 0.0324 0.97820 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405123 2 0.4196 0.53452 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR661096 2 0.0671 0.90758 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1320225 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.1168 0.87037 0.008 0.000 0.032 0.960 0.000
#> SRR1307677 2 0.1764 0.89402 0.000 0.928 0.000 0.064 0.008
#> SRR1466512 2 0.1331 0.90275 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR658212 2 0.2338 0.86360 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1430525 3 0.4552 0.39579 0.000 0.004 0.632 0.352 0.012
#> SRR1344422 2 0.4182 0.54210 0.000 0.644 0.000 0.352 0.004
#> SRR1353924 2 0.0324 0.90711 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1314832 3 0.3305 0.64031 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR1487570 4 0.2377 0.78226 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR627431 4 0.5164 0.55233 0.000 0.256 0.000 0.660 0.084
#> SRR1418561 3 0.0510 0.85044 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1448029 3 0.1442 0.82341 0.000 0.032 0.952 0.012 0.004
#> SRR813802 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1331 0.90396 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1435311 2 0.2520 0.85427 0.000 0.888 0.004 0.012 0.096
#> SRR612395 5 0.0290 0.80348 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR603116 5 0.0510 0.80366 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1323152 3 0.4184 0.53957 0.000 0.000 0.700 0.284 0.016
#> SRR1368264 5 0.1043 0.79760 0.000 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1326624 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.4591 0.77146 0.000 0.748 0.000 0.120 0.132
#> SRR1486799 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4252 0.56440 0.000 0.652 0.000 0.340 0.008
#> SRR815044 4 0.1195 0.87258 0.000 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR1338560 2 0.0566 0.90810 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR615862 2 0.2953 0.83642 0.000 0.844 0.000 0.144 0.012
#> SRR1480038 2 0.0898 0.90764 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR659436 5 0.0451 0.80180 0.000 0.004 0.008 0.000 0.988
#> SRR613699 2 0.3612 0.75099 0.000 0.764 0.000 0.008 0.228
#> SRR1436563 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.1331 0.90275 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1330327 4 0.0510 0.87870 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1489950 2 0.0693 0.90449 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1431927 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.2280 0.81694 0.000 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR600656 4 0.0404 0.87905 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR658766 5 0.5304 0.46087 0.000 0.000 0.080 0.292 0.628
#> SRR655946 4 0.4505 0.37082 0.000 0.012 0.384 0.604 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0162 0.85228 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.0162 0.80282 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1471965 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.2727 0.75315 0.000 0.000 0.116 0.016 0.868
#> SRR662498 5 0.0671 0.80164 0.000 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1376764 3 0.0771 0.84507 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1377006 3 0.4299 0.33278 0.000 0.004 0.608 0.388 0.000
#> SRR656860 2 0.3884 0.65989 0.000 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR1480547 2 0.1764 0.89402 0.000 0.928 0.000 0.064 0.008
#> SRR1452515 5 0.2112 0.77521 0.000 0.004 0.084 0.004 0.908
#> SRR1324390 2 0.1195 0.90076 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR615273 1 0.0609 0.96884 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR601695 5 0.4278 0.11660 0.000 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR820907 2 0.1469 0.90704 0.000 0.948 0.000 0.016 0.036
#> SRR812773 5 0.1243 0.79226 0.028 0.000 0.008 0.004 0.960
#> SRR1405984 2 0.0854 0.90335 0.000 0.976 0.004 0.012 0.008
#> SRR1472794 2 0.0992 0.90692 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1365448 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0324 0.85299 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1435626 5 0.3990 0.62798 0.000 0.004 0.244 0.012 0.740
#> SRR1080766 2 0.0992 0.90268 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1377862 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0162 0.85278 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1467966 3 0.0290 0.85309 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1320579 4 0.3231 0.71935 0.000 0.000 0.196 0.800 0.004
#> SRR1319710 2 0.4166 0.51131 0.000 0.648 0.000 0.004 0.348
#> SRR1326604 2 0.1894 0.89215 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1098879 3 0.0290 0.85293 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR662245 2 0.3969 0.64856 0.000 0.692 0.000 0.004 0.304
#> SRR1074719 2 0.0566 0.90426 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR816226 4 0.3274 0.67538 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR601387 2 0.1670 0.88830 0.000 0.936 0.000 0.012 0.052
#> SRR614575 2 0.1364 0.90467 0.000 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR1353900 2 0.1469 0.90710 0.000 0.948 0.000 0.016 0.036
#> SRR662906 2 0.0566 0.90760 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1350832 2 0.0404 0.90751 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1403280 2 0.1082 0.90730 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1313969 4 0.0880 0.87138 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1388528 1 0.0162 0.98076 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.4074 0.40196 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR655399 3 0.0162 0.85338 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1319753 1 0.4801 0.51486 0.668 0.048 0.000 0.000 0.284
#> SRR818901 3 0.0162 0.85338 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR607067 4 0.1251 0.86916 0.000 0.036 0.000 0.956 0.008
#> SRR1391420 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.2625 0.86530 0.000 0.876 0.000 0.108 0.016
#> SRR661961 5 0.0404 0.80037 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR658259 2 0.4325 0.71067 0.000 0.724 0.000 0.036 0.240
#> SRR1310476 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1357 0.90105 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1365034 2 0.3048 0.80662 0.000 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR1478053 2 0.0451 0.90709 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1475300 2 0.0579 0.90527 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1328101 5 0.0671 0.80346 0.000 0.016 0.000 0.004 0.980
#> SRR1322900 5 0.6493 0.22360 0.384 0.000 0.188 0.000 0.428
#> SRR1309942 2 0.0898 0.90764 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1345760 4 0.0451 0.87906 0.000 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.3366 0.65179 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.4217 0.61561 0.000 0.280 0.004 0.012 0.704
#> SRR661469 5 0.0324 0.80223 0.000 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1500323 5 0.3756 0.64997 0.000 0.248 0.000 0.008 0.744
#> SRR1356705 5 0.3835 0.65049 0.000 0.244 0.000 0.012 0.744
#> SRR1464915 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4323 0.63280 0.024 0.000 0.744 0.220 0.012
#> SRR1350435 1 0.0162 0.98124 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389177 5 0.2561 0.73758 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1368072 2 0.4270 0.51025 0.000 0.668 0.000 0.012 0.320
#> SRR601815 2 0.0510 0.90741 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR613330 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.2511 0.83508 0.000 0.028 0.000 0.892 0.080
#> SRR1394190 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.4796 0.55842 0.000 0.028 0.280 0.012 0.680
#> SRR1318839 3 0.0290 0.85309 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1432390 4 0.0510 0.87861 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR613126 5 0.2976 0.75157 0.000 0.132 0.004 0.012 0.852
#> SRR1089424 2 0.0898 0.90786 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1347214 2 0.0510 0.90747 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1309556 5 0.5038 0.69704 0.100 0.016 0.116 0.012 0.756
#> SRR1456027 4 0.0703 0.87417 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1400551 3 0.2881 0.74758 0.000 0.004 0.860 0.012 0.124
#> SRR1320469 1 0.2732 0.79556 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.3884 0.67110 0.000 0.708 0.000 0.004 0.288
#> SRR1454310 2 0.0324 0.90604 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR615105 4 0.0880 0.87138 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.0609 0.87800 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR601671 2 0.1568 0.90382 0.000 0.944 0.000 0.036 0.020
#> SRR663874 5 0.3661 0.53196 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1409130 2 0.0510 0.90675 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR659696 4 0.1410 0.85451 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1408249 2 0.1739 0.89699 0.024 0.940 0.000 0.032 0.004
#> SRR663284 2 0.4639 0.80255 0.040 0.784 0.000 0.096 0.080
#> SRR1402794 3 0.0162 0.85226 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR614852 4 0.0404 0.87905 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1348040 4 0.5222 0.16472 0.028 0.000 0.008 0.512 0.452
#> SRR1489610 2 0.4029 0.57398 0.000 0.680 0.000 0.004 0.316
#> SRR1488091 5 0.4270 0.54909 0.000 0.320 0.000 0.012 0.668
#> SRR1499566 2 0.0798 0.90257 0.016 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361480 2 0.1282 0.90227 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1444501 3 0.3165 0.74812 0.000 0.000 0.848 0.036 0.116
#> SRR1415773 5 0.4170 0.62048 0.000 0.272 0.004 0.012 0.712
#> SRR1388832 1 0.2505 0.86401 0.888 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR1394637 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 5 0.5341 0.32784 0.000 0.064 0.000 0.356 0.580
#> SRR662918 4 0.3086 0.71605 0.000 0.180 0.000 0.816 0.004
#> SRR817421 3 0.0290 0.85309 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1571 0.89706 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR608264 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 3 0.4307 0.00466 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR1454117 5 0.2179 0.76538 0.000 0.100 0.000 0.004 0.896
#> SRR1312684 1 0.0162 0.98124 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615044 5 0.2338 0.73326 0.112 0.000 0.004 0.000 0.884
#> SRR1432743 5 0.3724 0.67284 0.000 0.000 0.204 0.020 0.776
#> SRR1388873 2 0.0609 0.90734 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.3170 0.72146 0.000 0.004 0.160 0.008 0.828
#> SRR1406008 2 0.4504 0.24865 0.000 0.564 0.000 0.008 0.428
#> SRR1396786 2 0.0566 0.90426 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1446564 1 0.0771 0.96233 0.976 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318465 3 0.4668 0.36781 0.000 0.000 0.624 0.024 0.352
#> SRR1431083 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.1478 0.85046 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR655170 2 0.2189 0.88650 0.000 0.904 0.000 0.084 0.012
#> SRR1087825 4 0.0404 0.87905 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR662019 4 0.6632 0.03276 0.220 0.000 0.380 0.400 0.000
#> SRR1349209 4 0.1851 0.84237 0.000 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.90704 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0566 0.90426 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1416672 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0671 0.90705 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1454328 2 0.1364 0.89779 0.000 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1489286 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0510 0.84742 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1084369 3 0.6519 -0.04611 0.000 0.000 0.408 0.192 0.400
#> SRR598452 3 0.0290 0.85293 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR660709 4 0.2193 0.83556 0.000 0.000 0.008 0.900 0.092
#> SRR809444 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1830 0.88651 0.000 0.932 0.004 0.012 0.052
#> SRR1375774 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.1168 0.87037 0.008 0.000 0.032 0.960 0.000
#> SRR657139 1 0.0290 0.97781 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.1364 0.90467 0.000 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR1353555 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.2286 0.80574 0.000 0.108 0.004 0.888 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.2233 0.87514 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR658989 5 0.4309 0.53188 0.000 0.000 0.308 0.016 0.676
#> SRR1353663 1 0.0162 0.98124 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR811771 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0290 0.85309 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR819054 2 0.0451 0.90516 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1367988 4 0.1544 0.85304 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1331922 1 0.0162 0.98149 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615479 5 0.0162 0.80197 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1375796 2 0.2536 0.85998 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1386991 5 0.1883 0.79452 0.000 0.048 0.008 0.012 0.932
#> SRR1355217 5 0.0451 0.80373 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1356290 5 0.1518 0.79457 0.000 0.048 0.004 0.004 0.944
#> SRR659507 5 0.0693 0.80412 0.000 0.012 0.008 0.000 0.980
#> SRR663296 1 0.0510 0.97221 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR598044 2 0.0771 0.90661 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR661155 4 0.0609 0.87800 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1414727 5 0.4946 0.41081 0.036 0.000 0.368 0.000 0.596
#> SRR663477 1 0.0162 0.98124 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354489 3 0.3957 0.53295 0.000 0.000 0.712 0.008 0.280
#> SRR1377800 3 0.1608 0.80568 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR614611 2 0.0703 0.90778 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR655052 4 0.0798 0.87864 0.000 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR1478968 4 0.0579 0.87849 0.000 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1351280 2 0.4147 0.60882 0.000 0.676 0.000 0.316 0.008
#> SRR613951 4 0.0404 0.87905 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.2605 0.79574 0.000 0.000 0.148 0.852 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0451 0.85128 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR655040 4 0.2536 0.78769 0.000 0.128 0.000 0.868 0.004
#> SRR810225 2 0.2130 0.87682 0.000 0.908 0.000 0.012 0.080
#> SRR1325377 2 0.1484 0.89634 0.000 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR617829 4 0.3561 0.63314 0.000 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1402328 2 0.0807 0.90403 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1480455 2 0.0898 0.90622 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1442104 3 0.0404 0.85213 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0992 0.90814 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR663026 2 0.0609 0.90781 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1478386 2 0.0798 0.90756 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1458683 4 0.1410 0.85860 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.1444 0.78637 0.040 0.000 0.012 0.000 0.948
#> SRR1310735 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0566 0.87909 0.000 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR660260 5 0.5478 0.10579 0.000 0.000 0.064 0.420 0.516
#> SRR1071231 2 0.0566 0.90426 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1459125 4 0.2763 0.78089 0.000 0.004 0.000 0.848 0.148
#> SRR1337173 5 0.2674 0.75687 0.000 0.000 0.120 0.012 0.868
#> SRR1396250 3 0.0162 0.85338 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2166376 3 0.4620 0.25374 0.000 0.000 0.592 0.016 0.392
#> SRR659816 5 0.4350 0.25593 0.000 0.000 0.004 0.408 0.588
#> SRR1401379 2 0.4307 0.12569 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR600981 4 0.0609 0.87790 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.3671 0.71154 0.000 0.756 0.000 0.236 0.008
#> SRR660115 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0290 0.90685 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1359780 2 0.0807 0.90832 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1490037 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.4403 0.38937 0.000 0.008 0.000 0.608 0.384
#> SRR1397156 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1442 0.89814 0.000 0.952 0.004 0.012 0.032
#> SRR1319648 2 0.0693 0.90789 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1092985 3 0.4452 0.04483 0.496 0.000 0.500 0.000 0.004
#> SRR656409 2 0.1864 0.89145 0.004 0.924 0.000 0.068 0.004
#> SRR1468658 4 0.2561 0.78613 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1390437 4 0.0510 0.87861 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR658057 2 0.1628 0.89928 0.000 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR612635 2 0.1300 0.90731 0.000 0.956 0.000 0.028 0.016
#> SRR1351480 2 0.1648 0.90579 0.000 0.940 0.000 0.020 0.040
#> SRR1436651 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0609 0.96890 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR659590 2 0.1364 0.89685 0.000 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR614263 1 0.0162 0.98149 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409575 2 0.0865 0.90679 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR659911 2 0.1444 0.90470 0.000 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR1085519 3 0.0162 0.85228 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1345894 3 0.4517 0.07853 0.000 0.000 0.556 0.008 0.436
#> SRR1442928 5 0.0865 0.80385 0.000 0.024 0.004 0.000 0.972
#> SRR1464681 4 0.0510 0.87861 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.4360 0.56472 0.000 0.000 0.284 0.024 0.692
#> SRR1365426 5 0.0290 0.80162 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1487947 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.1195 0.95216 0.960 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR603236 5 0.2437 0.79004 0.000 0.032 0.004 0.060 0.904
#> SRR660673 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1442 0.89608 0.000 0.952 0.004 0.012 0.032
#> SRR663807 2 0.1310 0.90780 0.000 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1087245 2 0.1205 0.90349 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1339108 2 0.4096 0.65804 0.000 0.744 0.004 0.020 0.232
#> SRR613426 4 0.0912 0.87610 0.012 0.016 0.000 0.972 0.000
#> SRR613879 5 0.0451 0.80353 0.000 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1385101 1 0.4380 0.39191 0.616 0.000 0.000 0.008 0.376
#> SRR1387966 2 0.1331 0.90396 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1458852 2 0.3081 0.79330 0.000 0.832 0.000 0.012 0.156
#> SRR1430489 1 0.3003 0.75122 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1349231 1 0.0880 0.95838 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1376249 3 0.0290 0.85293 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1321987 2 0.1251 0.89950 0.000 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR662653 2 0.0798 0.90464 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1390027 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0807 0.90562 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1383081 2 0.1568 0.90607 0.000 0.944 0.000 0.036 0.020
#> SRR2166960 2 0.2270 0.88347 0.000 0.904 0.000 0.020 0.076
#> SRR605101 5 0.4029 0.55532 0.000 0.316 0.000 0.004 0.680
#> SRR818600 2 0.1568 0.90377 0.000 0.944 0.000 0.036 0.020
#> SRR1367715 2 0.1918 0.90539 0.000 0.928 0.000 0.036 0.036
#> SRR1351979 3 0.0290 0.85309 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1387054 3 0.5179 0.48856 0.000 0.072 0.640 0.288 0.000
#> SRR1444306 3 0.4899 0.05198 0.000 0.012 0.524 0.008 0.456
#> SRR1322662 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4064 0.81856 0.000 0.792 0.000 0.116 0.092
#> SRR612767 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0693 0.90805 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1430375 5 0.0290 0.80348 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR615225 4 0.0451 0.87839 0.000 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR1401839 5 0.1074 0.80324 0.000 0.012 0.004 0.016 0.968
#> SRR1379110 2 0.1012 0.90719 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1077288 3 0.0162 0.85338 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1331639 4 0.0609 0.87782 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1342782 5 0.0510 0.80352 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1443003 5 0.6108 0.18031 0.000 0.088 0.416 0.012 0.484
#> SRR612839 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 4 0.4171 0.34260 0.000 0.000 0.396 0.604 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.2773 0.80987 0.000 0.000 0.112 0.868 0.020
#> SRR664063 5 0.0162 0.80282 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1488214 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0404 0.87905 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1320321 2 0.1043 0.90388 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1071955 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.98400 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.1661 0.90563 0.000 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1488470 2 0.1331 0.90275 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1389497 3 0.0000 0.85336 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 5 0.4552 0.58755 0.000 0.000 0.264 0.040 0.696
#> SRR615311 1 0.0290 0.97859 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.2300 0.80265 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1380716 2 0.0405 0.82790 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR612803 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR613282 1 0.0363 0.94532 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1355396 1 0.1411 0.90722 0.936 0.000 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1084417 3 0.3867 0.09811 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 4 0.2488 0.78701 0.000 0.008 0.004 0.864 0.124 0.000
#> SRR1419258 3 0.2100 0.74462 0.000 0.000 0.884 0.004 0.112 0.000
#> SRR1403366 3 0.5867 -0.17377 0.000 0.000 0.420 0.000 0.384 0.196
#> SRR665262 5 0.3727 0.09927 0.000 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1499740 5 0.3807 0.16757 0.004 0.000 0.000 0.000 0.628 0.368
#> SRR1105057 2 0.1663 0.82257 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1439742 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR614599 5 0.3742 0.16281 0.000 0.000 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR612215 5 0.3076 0.32196 0.000 0.000 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1094051 1 0.0363 0.94524 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1324496 1 0.0146 0.94848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393449 3 0.1967 0.73744 0.084 0.000 0.904 0.000 0.000 0.012
#> SRR1409263 3 0.1700 0.76687 0.004 0.000 0.916 0.000 0.000 0.080
#> SRR1431288 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1334889 2 0.2218 0.79608 0.000 0.884 0.000 0.012 0.000 0.104
#> SRR614839 2 0.6004 -0.00965 0.000 0.408 0.000 0.000 0.352 0.240
#> SRR658433 2 0.2664 0.78785 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1088581 4 0.2755 0.76547 0.000 0.000 0.004 0.844 0.140 0.012
#> SRR1328797 3 0.1007 0.78203 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1334512 2 0.1753 0.80927 0.000 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1471117 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1458220 2 0.2135 0.81136 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1354955 5 0.4602 -0.18306 0.000 0.000 0.480 0.004 0.488 0.028
#> SRR654802 3 0.0363 0.78341 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR660066 2 0.2730 0.78265 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1447103 5 0.4083 -0.02139 0.000 0.000 0.008 0.000 0.532 0.460
#> SRR1402153 3 0.0653 0.78513 0.000 0.004 0.980 0.000 0.012 0.004
#> SRR655887 2 0.0508 0.82757 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1408529 3 0.3050 0.64884 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR658707 1 0.0146 0.94799 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384371 2 0.5203 0.56913 0.000 0.620 0.004 0.000 0.136 0.240
#> SRR1074670 3 0.2384 0.75716 0.000 0.000 0.884 0.000 0.084 0.032
#> SRR1375439 6 0.4631 0.14378 0.020 0.000 0.012 0.000 0.440 0.528
#> SRR1329003 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 5 0.1285 0.41721 0.000 0.004 0.000 0.000 0.944 0.052
#> SRR1317920 1 0.1204 0.91836 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1455525 4 0.0260 0.85030 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0603 0.94153 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1310836 1 0.0363 0.94652 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1499764 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.6016 -0.05335 0.000 0.000 0.340 0.000 0.412 0.248
#> SRR1068855 1 0.0865 0.93245 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1375509 3 0.0458 0.78374 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR612227 5 0.3490 0.34849 0.000 0.000 0.176 0.000 0.784 0.040
#> SRR1388809 2 0.1267 0.82806 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1413872 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.1765 0.88596 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1473078 5 0.5361 -0.11400 0.000 0.000 0.444 0.000 0.448 0.108
#> SRR615814 2 0.2531 0.77992 0.000 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR1325225 4 0.1913 0.78642 0.080 0.000 0.000 0.908 0.000 0.012
#> SRR1313687 2 0.2048 0.81430 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1358220 2 0.1387 0.82637 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1096662 2 0.3044 0.76677 0.000 0.836 0.000 0.048 0.000 0.116
#> SRR1487746 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1354644 1 0.0146 0.94791 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401752 5 0.3428 0.23163 0.000 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR660164 5 0.5078 0.22536 0.000 0.160 0.000 0.000 0.632 0.208
#> SRR815783 2 0.5037 0.58479 0.000 0.640 0.000 0.000 0.188 0.172
#> SRR809595 6 0.5501 0.12606 0.128 0.000 0.000 0.000 0.412 0.460
#> SRR1403133 2 0.4300 0.60900 0.000 0.640 0.000 0.000 0.036 0.324
#> SRR815470 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432453 5 0.5223 0.28910 0.000 0.004 0.044 0.096 0.692 0.164
#> SRR1478362 4 0.1116 0.84342 0.000 0.004 0.000 0.960 0.028 0.008
#> SRR1392186 5 0.6027 0.02501 0.000 0.352 0.000 0.000 0.400 0.248
#> SRR1347937 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0363 0.94656 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1471594 1 0.0146 0.94831 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354270 4 0.3698 0.75491 0.012 0.000 0.060 0.820 0.096 0.012
#> SRR612683 2 0.2278 0.78651 0.000 0.868 0.000 0.004 0.000 0.128
#> SRR1392901 4 0.3706 0.70991 0.000 0.000 0.032 0.800 0.140 0.028
#> SRR1077805 3 0.5136 0.22744 0.000 0.376 0.564 0.012 0.016 0.032
#> SRR1360402 2 0.1556 0.82453 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1406112 5 0.5186 0.21599 0.000 0.000 0.168 0.000 0.616 0.216
#> SRR1355352 3 0.3109 0.65109 0.004 0.000 0.772 0.000 0.000 0.224
#> SRR656247 1 0.5742 -0.05073 0.468 0.000 0.000 0.000 0.176 0.356
#> SRR813656 2 0.6043 0.18286 0.000 0.464 0.000 0.004 0.260 0.272
#> SRR808244 3 0.0363 0.78185 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1387240 2 0.5061 0.57716 0.000 0.668 0.000 0.028 0.224 0.080
#> SRR1408595 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1385277 4 0.0146 0.85206 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1435248 2 0.2912 0.76286 0.000 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1419110 5 0.2378 0.38689 0.000 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1408682 6 0.4983 0.11417 0.000 0.048 0.008 0.000 0.460 0.484
#> SRR1317134 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 5 0.2822 0.40357 0.000 0.040 0.000 0.000 0.852 0.108
#> SRR1453911 5 0.1814 0.40710 0.000 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR603164 3 0.6349 0.29872 0.000 0.072 0.528 0.000 0.120 0.280
#> SRR1383259 2 0.2218 0.80235 0.000 0.884 0.000 0.012 0.000 0.104
#> SRR1330854 3 0.3050 0.57662 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1368574 2 0.2527 0.79964 0.000 0.868 0.000 0.000 0.024 0.108
#> SRR1468162 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.3356 0.71486 0.000 0.000 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR1361546 6 0.5404 0.20760 0.060 0.020 0.000 0.004 0.372 0.544
#> SRR1486156 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.7306 -0.09962 0.000 0.384 0.000 0.304 0.160 0.152
#> SRR615635 2 0.0458 0.83005 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1385411 2 0.1745 0.81575 0.000 0.924 0.000 0.020 0.000 0.056
#> SRR1342739 1 0.0146 0.94791 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102830 3 0.1616 0.77824 0.000 0.000 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR662126 5 0.5943 0.26021 0.000 0.048 0.000 0.152 0.596 0.204
#> SRR1464601 2 0.4774 0.54327 0.000 0.600 0.000 0.000 0.068 0.332
#> SRR1071594 2 0.1075 0.82171 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR612539 2 0.0790 0.82480 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR602010 6 0.4403 0.08186 0.012 0.008 0.000 0.000 0.460 0.520
#> SRR810249 2 0.2883 0.76503 0.000 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR818773 5 0.5296 -0.12945 0.100 0.000 0.000 0.000 0.456 0.444
#> SRR1336569 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 5 0.3104 0.36716 0.000 0.016 0.000 0.000 0.800 0.184
#> SRR1442754 1 0.3953 0.48371 0.656 0.000 0.328 0.000 0.000 0.016
#> SRR1334247 5 0.4368 0.27266 0.000 0.000 0.296 0.000 0.656 0.048
#> SRR661639 1 0.0260 0.94686 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR613222 2 0.5198 0.47854 0.004 0.600 0.000 0.000 0.112 0.284
#> SRR1459937 4 0.0405 0.85146 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR2185018 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR655732 2 0.4496 0.62637 0.000 0.708 0.000 0.000 0.156 0.136
#> SRR809348 1 0.0458 0.94333 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR819261 3 0.2070 0.76152 0.000 0.000 0.896 0.000 0.092 0.012
#> SRR661074 3 0.1707 0.77398 0.004 0.000 0.928 0.000 0.012 0.056
#> SRR1349851 1 0.1141 0.92136 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1405123 2 0.4382 0.65493 0.000 0.716 0.000 0.080 0.004 0.200
#> SRR661096 2 0.0260 0.82790 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1320225 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1454651 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.1349 0.81866 0.000 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1466512 2 0.0458 0.82738 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR658212 2 0.1686 0.81390 0.000 0.924 0.000 0.012 0.000 0.064
#> SRR1430525 4 0.6937 0.25793 0.000 0.000 0.196 0.492 0.128 0.184
#> SRR1344422 2 0.4683 0.62442 0.000 0.688 0.004 0.104 0.000 0.204
#> SRR1353924 2 0.2260 0.80515 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1314832 3 0.3217 0.58444 0.224 0.000 0.768 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487570 4 0.1863 0.81765 0.036 0.000 0.000 0.920 0.000 0.044
#> SRR627431 4 0.4261 0.68762 0.000 0.056 0.004 0.760 0.160 0.020
#> SRR1418561 3 0.4051 0.68805 0.016 0.000 0.792 0.048 0.016 0.128
#> SRR1448029 6 0.6187 0.10480 0.000 0.048 0.344 0.016 0.072 0.520
#> SRR813802 1 0.0458 0.94722 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR815020 1 0.0547 0.94135 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1309702 2 0.0935 0.83049 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1435311 2 0.4695 0.64015 0.000 0.676 0.000 0.000 0.116 0.208
#> SRR612395 5 0.3727 0.13963 0.000 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR603116 5 0.3620 0.19840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1323152 3 0.6299 0.35924 0.000 0.000 0.496 0.096 0.336 0.072
#> SRR1368264 5 0.3851 0.02377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR1326624 1 0.2278 0.85168 0.868 0.000 0.000 0.000 0.004 0.128
#> SRR1429265 3 0.0146 0.78465 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1327702 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.3915 0.63358 0.000 0.692 0.000 0.004 0.016 0.288
#> SRR1486799 1 0.0146 0.94791 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096174 2 0.5128 0.60043 0.000 0.676 0.000 0.124 0.024 0.176
#> SRR815044 4 0.4044 0.71584 0.000 0.048 0.000 0.792 0.052 0.108
#> SRR1338560 2 0.1501 0.82763 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR615862 2 0.2266 0.79399 0.000 0.880 0.000 0.012 0.000 0.108
#> SRR1480038 2 0.1075 0.82273 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR659436 5 0.2300 0.39071 0.000 0.000 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR613699 2 0.3715 0.70673 0.000 0.764 0.000 0.000 0.048 0.188
#> SRR1436563 1 0.0363 0.94528 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR615323 2 0.1204 0.81966 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1330327 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.2219 0.80593 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1431927 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.3736 0.69620 0.000 0.000 0.776 0.000 0.068 0.156
#> SRR1444002 1 0.0458 0.94333 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1318444 5 0.7407 0.17781 0.000 0.004 0.184 0.192 0.432 0.188
#> SRR600656 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658766 5 0.5020 0.35554 0.000 0.004 0.056 0.060 0.708 0.172
#> SRR655946 4 0.4094 0.68521 0.000 0.044 0.160 0.768 0.028 0.000
#> SRR817282 1 0.0146 0.94847 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475104 3 0.0935 0.78377 0.000 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1406418 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0146 0.94799 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444120 5 0.3854 0.00777 0.000 0.000 0.000 0.000 0.536 0.464
#> SRR1471965 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.2451 0.42405 0.000 0.000 0.060 0.000 0.884 0.056
#> SRR662498 5 0.4229 0.03275 0.000 0.000 0.000 0.016 0.548 0.436
#> SRR1376764 3 0.3409 0.67476 0.000 0.000 0.780 0.028 0.000 0.192
#> SRR1377006 3 0.7245 0.45008 0.012 0.012 0.524 0.152 0.168 0.132
#> SRR656860 2 0.3211 0.75799 0.000 0.824 0.000 0.056 0.000 0.120
#> SRR1480547 2 0.2006 0.79927 0.000 0.892 0.000 0.004 0.000 0.104
#> SRR1452515 5 0.3445 0.26886 0.000 0.000 0.008 0.000 0.732 0.260
#> SRR1324390 2 0.2340 0.80135 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR615273 1 0.2956 0.80725 0.848 0.000 0.000 0.000 0.088 0.064
#> SRR601695 4 0.3868 0.13756 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR820907 2 0.1327 0.82987 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR812773 5 0.2214 0.39579 0.016 0.000 0.000 0.000 0.888 0.096
#> SRR1405984 2 0.3950 0.68104 0.000 0.696 0.000 0.000 0.028 0.276
#> SRR1472794 2 0.2941 0.76805 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1365448 1 0.0260 0.94689 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1095720 3 0.0858 0.77952 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1435626 5 0.4607 0.17271 0.000 0.000 0.056 0.000 0.616 0.328
#> SRR1080766 2 0.3351 0.69853 0.000 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1377862 1 0.0547 0.94257 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1332299 3 0.1643 0.77420 0.000 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1467966 3 0.2980 0.71025 0.000 0.000 0.808 0.000 0.180 0.012
#> SRR1320579 4 0.1480 0.83282 0.000 0.000 0.020 0.940 0.040 0.000
#> SRR1319710 2 0.4469 0.11853 0.000 0.504 0.000 0.000 0.468 0.028
#> SRR1326604 2 0.3020 0.75864 0.000 0.824 0.000 0.008 0.012 0.156
#> SRR1098879 3 0.0000 0.78437 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662245 2 0.4143 0.68108 0.000 0.736 0.000 0.000 0.084 0.180
#> SRR1074719 2 0.2793 0.77195 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR816226 4 0.2058 0.80312 0.056 0.000 0.000 0.908 0.000 0.036
#> SRR601387 2 0.3490 0.71038 0.000 0.724 0.000 0.000 0.008 0.268
#> SRR614575 2 0.1075 0.82255 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1353900 2 0.1007 0.82416 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR662906 2 0.2697 0.78738 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1350832 2 0.1444 0.82581 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1403280 2 0.1267 0.82878 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1313969 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.4192 0.02031 0.412 0.000 0.000 0.000 0.572 0.016
#> SRR655399 3 0.0260 0.78274 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1319753 1 0.4769 0.16816 0.536 0.020 0.000 0.000 0.424 0.020
#> SRR818901 3 0.2250 0.75619 0.020 0.000 0.888 0.000 0.000 0.092
#> SRR607067 4 0.0632 0.84602 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1391420 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.2402 0.78184 0.000 0.856 0.000 0.004 0.000 0.140
#> SRR661961 5 0.3747 0.12783 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR658259 2 0.4280 0.65589 0.000 0.716 0.000 0.012 0.044 0.228
#> SRR1310476 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3023 0.75883 0.000 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1365034 2 0.1984 0.81139 0.000 0.912 0.000 0.032 0.000 0.056
#> SRR1478053 2 0.2664 0.78246 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1475300 2 0.2793 0.77731 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1328101 5 0.3126 0.28857 0.000 0.000 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1322900 1 0.6451 -0.22972 0.416 0.000 0.056 0.000 0.400 0.128
#> SRR1309942 2 0.0632 0.82766 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1345760 4 0.0260 0.85161 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435418 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4697 0.37471 0.000 0.324 0.000 0.612 0.000 0.064
#> SRR1443436 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.4749 0.13456 0.000 0.092 0.000 0.000 0.648 0.260
#> SRR661469 5 0.2597 0.37083 0.000 0.000 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1500323 6 0.5551 0.20426 0.000 0.144 0.000 0.000 0.360 0.496
#> SRR1356705 6 0.5611 0.29251 0.004 0.152 0.000 0.000 0.308 0.536
#> SRR1464915 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.7126 0.43019 0.140 0.000 0.500 0.060 0.256 0.044
#> SRR1350435 1 0.1908 0.88261 0.900 0.000 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1389177 5 0.1921 0.42130 0.000 0.000 0.032 0.000 0.916 0.052
#> SRR1368072 2 0.4361 0.62021 0.000 0.648 0.000 0.000 0.044 0.308
#> SRR601815 2 0.2003 0.81713 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR613330 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.6293 0.23414 0.000 0.060 0.000 0.176 0.556 0.208
#> SRR1394190 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0260 0.94686 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR816382 6 0.5116 0.08176 0.000 0.004 0.068 0.000 0.444 0.484
#> SRR1318839 3 0.0146 0.78489 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432390 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613126 6 0.5272 0.22865 0.000 0.020 0.004 0.324 0.060 0.592
#> SRR1089424 2 0.1814 0.82385 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1347214 2 0.0937 0.82933 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1309556 5 0.4292 0.34871 0.028 0.000 0.044 0.000 0.744 0.184
#> SRR1456027 4 0.0146 0.85237 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400551 3 0.5380 0.30522 0.004 0.000 0.524 0.000 0.104 0.368
#> SRR1320469 1 0.4110 0.35896 0.608 0.000 0.376 0.000 0.000 0.016
#> SRR614251 2 0.4657 0.60514 0.000 0.672 0.000 0.000 0.100 0.228
#> SRR1454310 2 0.2527 0.79107 0.000 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR615105 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433290 3 0.0146 0.78465 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2166064 4 0.1075 0.83767 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR601671 2 0.0865 0.82544 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR663874 6 0.6017 0.21915 0.000 0.268 0.000 0.000 0.304 0.428
#> SRR1409130 2 0.2300 0.80866 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR659696 4 0.0547 0.84257 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.1845 0.81179 0.008 0.916 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR663284 2 0.3530 0.71993 0.004 0.776 0.000 0.008 0.012 0.200
#> SRR1402794 3 0.2234 0.74765 0.000 0.000 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR614852 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348040 5 0.3826 0.36767 0.000 0.000 0.004 0.124 0.784 0.088
#> SRR1489610 2 0.4892 0.14159 0.000 0.500 0.000 0.000 0.440 0.060
#> SRR1488091 5 0.5969 -0.12200 0.000 0.244 0.000 0.000 0.440 0.316
#> SRR1499566 2 0.2218 0.81607 0.012 0.884 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1361480 2 0.0790 0.82798 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1444501 3 0.4576 0.37167 0.000 0.000 0.560 0.000 0.400 0.040
#> SRR1415773 5 0.4521 0.19369 0.000 0.064 0.008 0.000 0.692 0.236
#> SRR1388832 1 0.4628 0.60977 0.712 0.000 0.200 0.000 0.064 0.024
#> SRR1394637 1 0.0363 0.94652 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR606974 4 0.3973 0.63337 0.000 0.004 0.000 0.728 0.232 0.036
#> SRR662918 4 0.5571 0.32486 0.000 0.324 0.000 0.532 0.004 0.140
#> SRR817421 3 0.0146 0.78489 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400823 1 0.0363 0.94528 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1381348 2 0.0820 0.82853 0.000 0.972 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR608264 3 0.1367 0.77928 0.000 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1318560 3 0.3601 0.46468 0.312 0.000 0.684 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454117 5 0.2837 0.37016 0.000 0.088 0.000 0.000 0.856 0.056
#> SRR1312684 1 0.1387 0.90922 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR615044 5 0.3295 0.32078 0.128 0.000 0.000 0.000 0.816 0.056
#> SRR1432743 5 0.1745 0.41586 0.000 0.000 0.056 0.000 0.924 0.020
#> SRR1388873 2 0.0865 0.82593 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1353517 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357148 5 0.4475 0.04626 0.000 0.000 0.032 0.000 0.556 0.412
#> SRR1406008 2 0.5771 0.12946 0.000 0.476 0.000 0.000 0.336 0.188
#> SRR1396786 2 0.3023 0.74819 0.000 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1446564 1 0.1838 0.89598 0.916 0.016 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1318465 5 0.5025 0.01852 0.000 0.000 0.400 0.004 0.532 0.064
#> SRR1431083 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.0692 0.84269 0.000 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR655170 2 0.1176 0.82610 0.000 0.956 0.000 0.024 0.000 0.020
#> SRR1087825 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662019 4 0.3458 0.73624 0.068 0.000 0.104 0.820 0.000 0.008
#> SRR1349209 5 0.7850 0.05941 0.004 0.004 0.256 0.216 0.328 0.192
#> SRR1326161 2 0.0865 0.82959 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1345284 2 0.2597 0.78868 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1416672 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0937 0.83168 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1454328 2 0.2941 0.76003 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1489286 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1092349 1 0.0363 0.94609 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1408183 3 0.4264 0.48629 0.000 0.000 0.620 0.000 0.352 0.028
#> SRR1084369 5 0.7085 0.08222 0.000 0.000 0.120 0.224 0.456 0.200
#> SRR598452 3 0.0363 0.78466 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR660709 5 0.4887 0.26068 0.000 0.000 0.000 0.280 0.624 0.096
#> SRR809444 1 0.0790 0.93554 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1089901 2 0.4045 0.67706 0.000 0.696 0.000 0.000 0.036 0.268
#> SRR1375774 1 0.0865 0.93352 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1326292 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.1471 0.90470 0.932 0.000 0.004 0.000 0.000 0.064
#> SRR1440744 2 0.1141 0.82103 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1353555 1 0.0146 0.94847 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323087 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1452334 4 0.6429 0.41247 0.000 0.208 0.016 0.548 0.032 0.196
#> SRR1381775 1 0.0146 0.94831 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363908 1 0.0146 0.94848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.3493 0.73262 0.000 0.796 0.000 0.000 0.148 0.056
#> SRR658989 5 0.4382 0.30494 0.000 0.000 0.228 0.000 0.696 0.076
#> SRR1353663 1 0.0632 0.94027 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR811771 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813983 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR815825 3 0.0146 0.78388 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR819054 2 0.1556 0.82361 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1367988 4 0.0363 0.84990 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1331922 1 0.2255 0.87873 0.892 0.000 0.000 0.000 0.028 0.080
#> SRR615479 5 0.4361 0.04587 0.024 0.000 0.000 0.000 0.552 0.424
#> SRR1375796 2 0.3395 0.75585 0.000 0.808 0.000 0.000 0.060 0.132
#> SRR1386991 5 0.4010 0.06821 0.000 0.000 0.008 0.000 0.584 0.408
#> SRR1355217 6 0.4217 0.07765 0.000 0.008 0.000 0.004 0.464 0.524
#> SRR1356290 5 0.3079 0.39811 0.000 0.056 0.004 0.000 0.844 0.096
#> SRR659507 5 0.3867 -0.03235 0.000 0.000 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR663296 1 0.0993 0.93116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR598044 2 0.1007 0.83201 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR661155 4 0.0547 0.84841 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1414727 5 0.6825 -0.10838 0.056 0.000 0.216 0.000 0.408 0.320
#> SRR663477 1 0.2053 0.87121 0.888 0.000 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1354489 3 0.4753 0.23553 0.000 0.000 0.496 0.000 0.456 0.048
#> SRR1377800 3 0.3952 0.61590 0.000 0.000 0.736 0.000 0.052 0.212
#> SRR614611 2 0.2730 0.77890 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR655052 4 0.5300 0.35452 0.000 0.000 0.000 0.540 0.344 0.116
#> SRR1478968 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.3602 0.72903 0.000 0.784 0.000 0.032 0.008 0.176
#> SRR613951 4 0.0260 0.85161 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1418022 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR661901 3 0.6571 0.37834 0.000 0.000 0.516 0.208 0.068 0.208
#> SRR1408161 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.2613 0.73947 0.000 0.000 0.848 0.000 0.140 0.012
#> SRR655040 2 0.7843 0.06115 0.032 0.392 0.000 0.240 0.120 0.216
#> SRR810225 2 0.2805 0.78786 0.000 0.812 0.000 0.000 0.004 0.184
#> SRR1325377 2 0.2631 0.79430 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR617829 4 0.4710 0.65381 0.000 0.000 0.132 0.716 0.136 0.016
#> SRR1402328 2 0.2996 0.75385 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1480455 2 0.3468 0.71409 0.000 0.728 0.000 0.000 0.008 0.264
#> SRR1442104 3 0.0146 0.78388 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453416 1 0.0632 0.93901 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1481396 3 0.0520 0.78502 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1414314 2 0.1075 0.83111 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR663026 2 0.1204 0.82912 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1478386 2 0.0790 0.82978 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1458683 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1467567 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 6 0.5102 0.12606 0.080 0.000 0.000 0.000 0.428 0.492
#> SRR1310735 1 0.0146 0.94847 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440101 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660260 4 0.5587 0.10652 0.004 0.000 0.000 0.508 0.132 0.356
#> SRR1071231 2 0.3175 0.72911 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1459125 4 0.4903 0.39942 0.000 0.000 0.000 0.568 0.360 0.072
#> SRR1337173 5 0.2688 0.41433 0.000 0.000 0.068 0.000 0.868 0.064
#> SRR1396250 3 0.0260 0.78429 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2166376 3 0.5933 -0.03754 0.000 0.000 0.452 0.000 0.312 0.236
#> SRR659816 5 0.4024 0.37280 0.000 0.008 0.000 0.092 0.772 0.128
#> SRR1401379 5 0.4409 0.00719 0.000 0.380 0.000 0.000 0.588 0.032
#> SRR600981 4 0.0146 0.85181 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0146 0.94848 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1397218 2 0.7122 -0.03234 0.032 0.392 0.000 0.028 0.328 0.220
#> SRR660115 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407950 2 0.1267 0.82727 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1359780 2 0.1814 0.81840 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1490037 1 0.0146 0.94847 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR627439 5 0.4717 0.34482 0.000 0.020 0.000 0.128 0.720 0.132
#> SRR1397156 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.3460 0.73915 0.000 0.760 0.000 0.000 0.020 0.220
#> SRR1319648 2 0.3611 0.72631 0.000 0.796 0.000 0.000 0.108 0.096
#> SRR1092985 3 0.3670 0.55325 0.240 0.000 0.736 0.000 0.000 0.024
#> SRR656409 2 0.1387 0.81673 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1468658 4 0.2070 0.80759 0.000 0.000 0.012 0.896 0.092 0.000
#> SRR1390437 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.1958 0.80129 0.000 0.896 0.000 0.004 0.000 0.100
#> SRR612635 2 0.0632 0.82991 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1351480 2 0.0937 0.82420 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1436651 1 0.0260 0.94686 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1441590 1 0.3922 0.51225 0.664 0.000 0.000 0.000 0.016 0.320
#> SRR659590 2 0.3373 0.73015 0.000 0.744 0.000 0.000 0.008 0.248
#> SRR614263 1 0.0508 0.94705 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1409575 2 0.0632 0.82975 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR659911 2 0.1010 0.83058 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1085519 3 0.4025 0.63459 0.000 0.000 0.720 0.000 0.048 0.232
#> SRR1345894 6 0.6769 0.22690 0.000 0.000 0.232 0.084 0.192 0.492
#> SRR1442928 5 0.3823 0.00909 0.000 0.000 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1464681 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0363 0.94524 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1309070 5 0.3822 0.36382 0.000 0.000 0.128 0.000 0.776 0.096
#> SRR1365426 5 0.4018 0.09109 0.008 0.000 0.000 0.000 0.580 0.412
#> SRR1487947 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR659708 1 0.5707 0.28380 0.560 0.000 0.044 0.000 0.076 0.320
#> SRR603236 5 0.2954 0.38000 0.000 0.004 0.008 0.028 0.856 0.104
#> SRR660673 1 0.0000 0.94861 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.3508 0.68964 0.000 0.704 0.000 0.000 0.004 0.292
#> SRR663807 2 0.0790 0.82991 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1087245 2 0.0603 0.82716 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1339108 5 0.5853 0.06257 0.000 0.144 0.012 0.000 0.492 0.352
#> SRR613426 4 0.8451 0.20509 0.168 0.140 0.000 0.368 0.108 0.216
#> SRR613879 5 0.3284 0.36886 0.000 0.020 0.000 0.000 0.784 0.196
#> SRR1385101 6 0.7383 0.11631 0.308 0.000 0.000 0.120 0.232 0.340
#> SRR1387966 2 0.1444 0.81470 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1458852 2 0.5234 0.51079 0.000 0.576 0.000 0.000 0.124 0.300
#> SRR1430489 1 0.3481 0.71517 0.776 0.000 0.000 0.192 0.000 0.032
#> SRR1349231 1 0.4122 0.58794 0.704 0.000 0.000 0.000 0.048 0.248
#> SRR1376249 3 0.0363 0.78185 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1321987 2 0.2664 0.78659 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR662653 2 0.2003 0.81518 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1390027 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098474 2 0.0632 0.83015 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1383081 2 0.0865 0.83037 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR2166960 2 0.2070 0.80035 0.000 0.892 0.000 0.000 0.008 0.100
#> SRR605101 6 0.4955 0.27439 0.000 0.296 0.000 0.000 0.096 0.608
#> SRR818600 2 0.2092 0.79266 0.000 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1367715 2 0.1610 0.82808 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1351979 3 0.0260 0.78555 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1387054 4 0.8500 -0.08044 0.000 0.148 0.224 0.316 0.080 0.232
#> SRR1444306 6 0.5418 0.21345 0.000 0.000 0.352 0.000 0.128 0.520
#> SRR1322662 1 0.0146 0.94791 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR665478 2 0.3171 0.77545 0.000 0.844 0.000 0.028 0.024 0.104
#> SRR612767 1 0.1204 0.91879 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1489030 2 0.1556 0.82385 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1430375 5 0.3727 0.14882 0.000 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR615225 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401839 5 0.1584 0.41058 0.000 0.000 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1379110 2 0.0632 0.82668 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077288 3 0.0547 0.78369 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1331639 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342782 5 0.4076 0.03280 0.008 0.000 0.000 0.000 0.540 0.452
#> SRR1443003 6 0.6474 0.27519 0.000 0.100 0.120 0.000 0.240 0.540
#> SRR612839 1 0.0260 0.94783 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470093 4 0.2532 0.78689 0.000 0.000 0.060 0.884 0.052 0.004
#> SRR1395742 1 0.0458 0.94333 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1469014 1 0.0260 0.94690 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1387222 4 0.2446 0.77883 0.000 0.000 0.012 0.864 0.124 0.000
#> SRR664063 5 0.3817 0.07167 0.000 0.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1488214 1 0.1075 0.92409 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR654766 4 0.0000 0.85305 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.1910 0.82037 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1071955 1 0.0146 0.94791 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417483 1 0.0146 0.94791 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1394231 2 0.1204 0.83066 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1488470 2 0.1806 0.80630 0.000 0.908 0.000 0.004 0.000 0.088
#> SRR1389497 3 0.2888 0.74211 0.000 0.000 0.852 0.000 0.092 0.056
#> SRR1367109 5 0.3464 0.37195 0.000 0.000 0.084 0.000 0.808 0.108
#> SRR615311 1 0.0692 0.93929 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.849 0.921 0.961 0.1562 0.889 0.889
#> 3 3 0.465 0.701 0.857 1.4300 0.726 0.692
#> 4 4 0.429 0.578 0.802 0.1481 0.922 0.884
#> 5 5 0.358 0.587 0.798 0.0857 0.945 0.916
#> 6 6 0.328 0.541 0.761 0.1351 0.913 0.858
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR612803 2 0.1184 0.9547 0.016 0.984
#> SRR613282 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1355396 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1084417 2 0.3431 0.9247 0.064 0.936
#> SRR1074359 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR1419258 1 0.1184 0.9055 0.984 0.016
#> SRR1403366 2 0.7883 0.7107 0.236 0.764
#> SRR665262 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1439742 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR614599 2 0.4022 0.9131 0.080 0.920
#> SRR612215 2 0.3431 0.9243 0.064 0.936
#> SRR1094051 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1324496 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1393449 2 0.5946 0.8425 0.144 0.856
#> SRR1409263 1 0.2236 0.9059 0.964 0.036
#> SRR1431288 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1334889 2 0.1414 0.9546 0.020 0.980
#> SRR614839 2 0.4161 0.9075 0.084 0.916
#> SRR658433 2 0.0938 0.9570 0.012 0.988
#> SRR1088581 2 0.7219 0.7689 0.200 0.800
#> SRR1328797 1 0.1184 0.9055 0.984 0.016
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1471117 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR1311553 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.2948 0.9345 0.052 0.948
#> SRR654802 1 0.1414 0.9058 0.980 0.020
#> SRR660066 2 0.0376 0.9602 0.004 0.996
#> SRR1447103 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.4815 0.8839 0.104 0.896
#> SRR655887 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.7219 0.7658 0.200 0.800
#> SRR658707 2 0.6343 0.8273 0.160 0.840
#> SRR1384371 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1074670 2 0.7056 0.7767 0.192 0.808
#> SRR1375439 2 0.0672 0.9591 0.008 0.992
#> SRR1329003 2 0.9000 0.5576 0.316 0.684
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1317920 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1455525 2 0.8661 0.6172 0.288 0.712
#> SRR613999 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1310836 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1499764 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR658200 2 0.8661 0.6197 0.288 0.712
#> SRR1068855 2 0.1843 0.9492 0.028 0.972
#> SRR1375509 1 0.2043 0.9070 0.968 0.032
#> SRR612227 2 0.5842 0.8519 0.140 0.860
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1452864 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1473078 2 0.1843 0.9496 0.028 0.972
#> SRR615814 2 0.1843 0.9505 0.028 0.972
#> SRR1325225 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1313687 2 0.0938 0.9574 0.012 0.988
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1487746 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1354644 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1344382 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1432453 2 0.1184 0.9555 0.016 0.984
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1347937 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1431569 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1471594 2 0.0672 0.9589 0.008 0.992
#> SRR1354270 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR612683 2 0.0376 0.9602 0.004 0.996
#> SRR1392901 2 0.1843 0.9499 0.028 0.972
#> SRR1077805 2 0.3114 0.9301 0.056 0.944
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.2948 0.9345 0.052 0.948
#> SRR1355352 2 0.5178 0.8749 0.116 0.884
#> SRR656247 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR813656 2 0.0938 0.9572 0.012 0.988
#> SRR808244 2 0.9000 0.5576 0.316 0.684
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1408595 2 0.0672 0.9589 0.008 0.992
#> SRR1385277 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.4431 0.8997 0.092 0.908
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1317134 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1370780 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.5519 0.8632 0.128 0.872
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1330854 2 0.8016 0.6967 0.244 0.756
#> SRR1452423 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1468162 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1331220 2 0.3431 0.9253 0.064 0.936
#> SRR1361546 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1486156 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR660545 2 0.3274 0.9305 0.060 0.940
#> SRR615635 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.1633 0.9526 0.024 0.976
#> SRR1342739 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1102830 1 0.2043 0.9070 0.968 0.032
#> SRR662126 2 0.0376 0.9602 0.004 0.996
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR612539 2 0.3431 0.9226 0.064 0.936
#> SRR602010 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.2423 0.9420 0.040 0.960
#> SRR1336569 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1442754 2 0.8016 0.6967 0.244 0.756
#> SRR1334247 2 0.4022 0.9093 0.080 0.920
#> SRR661639 2 0.6343 0.8273 0.160 0.840
#> SRR613222 2 0.0938 0.9572 0.012 0.988
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR2185018 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR809348 2 0.0672 0.9589 0.008 0.992
#> SRR819261 2 0.7056 0.7767 0.192 0.808
#> SRR661074 1 0.2043 0.9070 0.968 0.032
#> SRR1349851 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1405123 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR661096 2 0.0938 0.9570 0.012 0.988
#> SRR1320225 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1454651 2 0.9000 0.5576 0.316 0.684
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.1633 0.9522 0.024 0.976
#> SRR1430525 1 0.6801 0.8076 0.820 0.180
#> SRR1344422 2 0.0672 0.9593 0.008 0.992
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1314832 2 0.4022 0.9108 0.080 0.920
#> SRR1487570 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR627431 2 0.4298 0.9032 0.088 0.912
#> SRR1418561 2 0.7139 0.7705 0.196 0.804
#> SRR1448029 2 0.4298 0.9007 0.088 0.912
#> SRR813802 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR815020 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.3733 0.9185 0.072 0.928
#> SRR1368264 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1326624 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1429265 1 0.3733 0.8902 0.928 0.072
#> SRR1327702 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615611 2 0.4161 0.9083 0.084 0.916
#> SRR1486799 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.2236 0.9430 0.036 0.964
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.2236 0.9459 0.036 0.964
#> SRR613699 2 0.3584 0.9222 0.068 0.932
#> SRR1436563 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615323 2 0.1414 0.9529 0.020 0.980
#> SRR1330327 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1431927 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR1100588 2 0.9983 0.0208 0.476 0.524
#> SRR1444002 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR1318444 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.9686 0.3473 0.396 0.604
#> SRR655946 2 0.3733 0.9164 0.072 0.928
#> SRR817282 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1475104 1 0.9209 0.5576 0.664 0.336
#> SRR1406418 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1090265 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1471965 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR612695 2 0.2236 0.9459 0.036 0.964
#> SRR662498 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1376764 2 0.5519 0.8580 0.128 0.872
#> SRR1377006 2 0.0672 0.9589 0.008 0.992
#> SRR656860 2 0.2603 0.9384 0.044 0.956
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.2603 0.9398 0.044 0.956
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615273 2 0.4022 0.9131 0.080 0.920
#> SRR601695 2 0.4298 0.9032 0.088 0.912
#> SRR820907 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR812773 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1365448 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR1095720 1 0.2948 0.8999 0.948 0.052
#> SRR1435626 2 0.1633 0.9519 0.024 0.976
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1377862 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1332299 2 0.9087 0.5130 0.324 0.676
#> SRR1467966 2 0.6712 0.7975 0.176 0.824
#> SRR1320579 2 0.6623 0.8072 0.172 0.828
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1098879 1 0.7219 0.7879 0.800 0.200
#> SRR662245 2 0.3584 0.9222 0.068 0.932
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR816226 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR601387 2 0.4298 0.9032 0.088 0.912
#> SRR614575 2 0.2236 0.9430 0.036 0.964
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.9044 0.5453 0.320 0.680
#> SRR1350832 2 0.0672 0.9591 0.008 0.992
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1388528 2 0.2236 0.9445 0.036 0.964
#> SRR1452912 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1400180 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR655399 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR818901 2 0.8909 0.5506 0.308 0.692
#> SRR607067 2 0.4431 0.8992 0.092 0.908
#> SRR1391420 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1384138 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR661961 2 0.3114 0.9311 0.056 0.944
#> SRR658259 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1310476 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1322900 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1435418 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1443436 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1464915 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1312406 2 0.1414 0.9537 0.020 0.980
#> SRR1350435 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1389177 2 0.4161 0.9053 0.084 0.916
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.4431 0.8992 0.092 0.908
#> SRR613330 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1394190 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1481083 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR816382 2 0.2778 0.9376 0.048 0.952
#> SRR1318839 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.3114 0.9307 0.056 0.944
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1456027 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1400551 2 0.2778 0.9367 0.048 0.952
#> SRR1320469 2 0.4022 0.9117 0.080 0.920
#> SRR614251 2 0.4161 0.9075 0.084 0.916
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.3114 0.9307 0.056 0.944
#> SRR1433290 2 0.9754 0.2857 0.408 0.592
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.8267 0.6626 0.260 0.740
#> SRR659696 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR663284 2 0.1633 0.9527 0.024 0.976
#> SRR1402794 2 0.6048 0.8357 0.148 0.852
#> SRR614852 2 0.6048 0.8390 0.148 0.852
#> SRR1348040 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1444501 1 0.8861 0.6360 0.696 0.304
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.3584 0.9224 0.068 0.932
#> SRR1394637 2 0.1633 0.9517 0.024 0.976
#> SRR606974 2 0.4298 0.9032 0.088 0.912
#> SRR662918 2 0.0672 0.9588 0.008 0.992
#> SRR817421 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR1400823 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR608264 1 1.0000 0.0562 0.504 0.496
#> SRR1318560 2 0.6438 0.8171 0.164 0.836
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1312684 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615044 2 0.3733 0.9176 0.072 0.928
#> SRR1432743 2 0.6343 0.8179 0.160 0.840
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1353517 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1357148 2 0.3431 0.9253 0.064 0.936
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1446564 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1318465 2 0.4022 0.9091 0.080 0.920
#> SRR1431083 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR607117 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR655170 2 0.0672 0.9589 0.008 0.992
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR662019 2 0.3584 0.9215 0.068 0.932
#> SRR1349209 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1326161 2 0.1843 0.9503 0.028 0.972
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1416672 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR663356 2 0.4161 0.9067 0.084 0.916
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1489286 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR1092349 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1408183 2 0.6148 0.8302 0.152 0.848
#> SRR1084369 2 0.2948 0.9330 0.052 0.948
#> SRR598452 1 0.1184 0.9056 0.984 0.016
#> SRR660709 2 0.2423 0.9408 0.040 0.960
#> SRR809444 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1375774 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1326292 2 0.9000 0.5576 0.316 0.684
#> SRR657139 2 0.7139 0.7780 0.196 0.804
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1353555 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1323087 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1452334 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1381775 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1363908 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.2236 0.9459 0.036 0.964
#> SRR1353663 2 0.2236 0.9442 0.036 0.964
#> SRR811771 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR813983 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR815825 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1331922 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615479 2 0.3431 0.9243 0.064 0.936
#> SRR1375796 2 0.0672 0.9589 0.008 0.992
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1356290 2 0.1414 0.9540 0.020 0.980
#> SRR659507 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR663296 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR598044 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.3114 0.9312 0.056 0.944
#> SRR663477 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1354489 2 0.3733 0.9196 0.072 0.928
#> SRR1377800 2 0.6148 0.8314 0.152 0.848
#> SRR614611 2 0.5519 0.8624 0.128 0.872
#> SRR655052 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1478968 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0376 0.9602 0.004 0.996
#> SRR1418022 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR661901 2 0.9686 0.3473 0.396 0.604
#> SRR1408161 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR657054 2 0.8713 0.6122 0.292 0.708
#> SRR655040 2 0.3114 0.9282 0.056 0.944
#> SRR810225 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.4690 0.8948 0.100 0.900
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.2236 0.9457 0.036 0.964
#> SRR1442104 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR1453416 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR1481396 1 0.8763 0.6299 0.704 0.296
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.2603 0.9384 0.044 0.956
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.8763 0.6016 0.296 0.704
#> SRR1370572 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1467567 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1468532 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1310735 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0938 0.9569 0.012 0.988
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0672 0.9590 0.008 0.992
#> SRR1396250 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR2166376 1 0.2948 0.8999 0.948 0.052
#> SRR659816 2 0.2423 0.9408 0.040 0.960
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1398335 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR660115 2 0.1184 0.9547 0.016 0.984
#> SRR1407950 2 0.0672 0.9591 0.008 0.992
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1490037 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1397156 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR1092985 2 0.1414 0.9535 0.020 0.980
#> SRR656409 2 0.1843 0.9499 0.028 0.972
#> SRR1468658 2 0.0672 0.9589 0.008 0.992
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.4022 0.9105 0.080 0.920
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1436651 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1441590 2 0.0376 0.9605 0.004 0.996
#> SRR659590 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR614263 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.3114 0.9325 0.056 0.944
#> SRR1085519 1 0.5946 0.8412 0.856 0.144
#> SRR1345894 2 0.1414 0.9539 0.020 0.980
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1418880 2 0.1843 0.9492 0.028 0.972
#> SRR1309070 2 0.0938 0.9572 0.012 0.988
#> SRR1365426 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1487947 2 0.7674 0.7306 0.224 0.776
#> SRR659708 2 0.7139 0.7780 0.196 0.804
#> SRR603236 2 0.1414 0.9541 0.020 0.980
#> SRR660673 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0938 0.9570 0.012 0.988
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.3431 0.9241 0.064 0.936
#> SRR1385101 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1430489 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1349231 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1376249 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.2043 0.9469 0.032 0.968
#> SRR1390027 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1098474 2 0.4431 0.8999 0.092 0.908
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0376 0.9604 0.004 0.996
#> SRR818600 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1351979 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000
#> SRR1387054 2 0.3733 0.9164 0.072 0.928
#> SRR1444306 2 0.5519 0.8583 0.128 0.872
#> SRR1322662 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR665478 2 0.0376 0.9602 0.004 0.996
#> SRR612767 2 0.2423 0.9403 0.040 0.960
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0376 0.9602 0.004 0.996
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.2043 0.9070 0.968 0.032
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.5408 0.8630 0.124 0.876
#> SRR612839 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR1470093 2 0.6801 0.7967 0.180 0.820
#> SRR1395742 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1469014 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1387222 2 0.4022 0.9093 0.080 0.920
#> SRR664063 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1488214 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1071955 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1417483 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
#> SRR1389497 1 0.6887 0.7973 0.816 0.184
#> SRR1367109 2 0.1184 0.9557 0.016 0.984
#> SRR615311 2 0.0000 0.9618 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0237 0.87322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1380716 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR612803 2 0.1753 0.84990 0.048 0.952 0.000
#> SRR613282 2 0.0892 0.87123 0.020 0.980 0.000
#> SRR1355396 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1084417 1 0.6498 0.67878 0.596 0.396 0.008
#> SRR1074359 2 0.3192 0.79207 0.112 0.888 0.000
#> SRR1419258 3 0.2550 0.89372 0.056 0.012 0.932
#> SRR1403366 1 0.7211 0.50651 0.716 0.156 0.128
#> SRR665262 2 0.0592 0.87371 0.012 0.988 0.000
#> SRR1499740 2 0.0747 0.87418 0.016 0.984 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR614599 2 0.6204 -0.11050 0.424 0.576 0.000
#> SRR612215 2 0.5988 0.17360 0.368 0.632 0.000
#> SRR1094051 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR1324496 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR1393449 1 0.7279 0.69337 0.652 0.292 0.056
#> SRR1409263 3 0.3234 0.89289 0.072 0.020 0.908
#> SRR1431288 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1334889 2 0.4750 0.62469 0.216 0.784 0.000
#> SRR614839 1 0.5810 0.69819 0.664 0.336 0.000
#> SRR658433 2 0.1163 0.86746 0.028 0.972 0.000
#> SRR1088581 1 0.7107 0.58803 0.712 0.196 0.092
#> SRR1328797 3 0.2550 0.89372 0.056 0.012 0.932
#> SRR1334512 2 0.2537 0.81818 0.080 0.920 0.000
#> SRR1471117 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR1311553 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1458220 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1354955 1 0.7072 0.53598 0.504 0.476 0.020
#> SRR654802 3 0.4452 0.85592 0.192 0.000 0.808
#> SRR660066 2 0.1643 0.85717 0.044 0.956 0.000
#> SRR1447103 2 0.1031 0.87043 0.024 0.976 0.000
#> SRR1402153 1 0.8185 0.64905 0.500 0.428 0.072
#> SRR655887 2 0.1964 0.84374 0.056 0.944 0.000
#> SRR1408529 1 0.8067 0.66452 0.616 0.284 0.100
#> SRR658707 1 0.3784 0.51238 0.864 0.132 0.004
#> SRR1384371 2 0.4702 0.62721 0.212 0.788 0.000
#> SRR1074670 1 0.7222 0.62154 0.696 0.220 0.084
#> SRR1375439 2 0.3573 0.77290 0.120 0.876 0.004
#> SRR1329003 1 0.6054 0.21938 0.768 0.052 0.180
#> SRR1404837 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1317920 2 0.0747 0.87311 0.016 0.984 0.000
#> SRR1455525 1 0.7398 0.38695 0.700 0.120 0.180
#> SRR613999 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1310836 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1499764 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR658200 1 0.5892 0.38659 0.796 0.100 0.104
#> SRR1068855 2 0.6225 -0.20794 0.432 0.568 0.000
#> SRR1375509 3 0.3091 0.89497 0.072 0.016 0.912
#> SRR612227 1 0.6750 0.71492 0.640 0.336 0.024
#> SRR1388809 2 0.0424 0.87397 0.008 0.992 0.000
#> SRR1413872 2 0.0592 0.87418 0.012 0.988 0.000
#> SRR1452864 2 0.2448 0.83136 0.076 0.924 0.000
#> SRR1473078 2 0.6467 -0.04624 0.388 0.604 0.008
#> SRR615814 2 0.5098 0.56274 0.248 0.752 0.000
#> SRR1325225 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1313687 2 0.4002 0.71889 0.160 0.840 0.000
#> SRR1358220 2 0.0237 0.87322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1096662 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1487746 2 0.0592 0.87295 0.012 0.988 0.000
#> SRR1354644 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0592 0.87201 0.012 0.988 0.000
#> SRR815783 2 0.0892 0.87074 0.020 0.980 0.000
#> SRR809595 2 0.1163 0.87059 0.028 0.972 0.000
#> SRR1403133 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR815470 2 0.0424 0.87331 0.008 0.992 0.000
#> SRR1344382 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1432453 2 0.5785 0.24599 0.332 0.668 0.000
#> SRR1478362 2 0.0424 0.87331 0.008 0.992 0.000
#> SRR1392186 2 0.0747 0.87194 0.016 0.984 0.000
#> SRR1347937 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1431569 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1471594 2 0.1453 0.86582 0.024 0.968 0.008
#> SRR1354270 2 0.6111 -0.04808 0.396 0.604 0.000
#> SRR612683 2 0.1031 0.87117 0.024 0.976 0.000
#> SRR1392901 2 0.5285 0.53893 0.244 0.752 0.004
#> SRR1077805 2 0.7377 -0.43471 0.452 0.516 0.032
#> SRR1360402 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1406112 1 0.7069 0.54678 0.508 0.472 0.020
#> SRR1355352 1 0.7037 0.70831 0.636 0.328 0.036
#> SRR656247 2 0.0747 0.87389 0.016 0.984 0.000
#> SRR813656 2 0.2711 0.81855 0.088 0.912 0.000
#> SRR808244 1 0.6054 0.21938 0.768 0.052 0.180
#> SRR1387240 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 2 0.1453 0.86513 0.024 0.968 0.008
#> SRR1385277 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1435248 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1419110 2 0.6742 0.24673 0.316 0.656 0.028
#> SRR1408682 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1317134 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR1370780 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1489307 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1453911 2 0.0592 0.87282 0.012 0.988 0.000
#> SRR603164 1 0.7353 0.66228 0.568 0.396 0.036
#> SRR1383259 2 0.1031 0.86959 0.024 0.976 0.000
#> SRR1330854 1 0.7221 0.48817 0.716 0.148 0.136
#> SRR1452423 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1368574 2 0.1964 0.84322 0.056 0.944 0.000
#> SRR1468162 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1331220 2 0.6648 0.05561 0.364 0.620 0.016
#> SRR1361546 2 0.4931 0.56879 0.232 0.768 0.000
#> SRR1486156 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR660545 1 0.6664 0.54134 0.528 0.464 0.008
#> SRR615635 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1385411 2 0.5497 0.42059 0.292 0.708 0.000
#> SRR1342739 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1102830 3 0.3091 0.89497 0.072 0.016 0.912
#> SRR662126 2 0.2537 0.82644 0.080 0.920 0.000
#> SRR1464601 2 0.0747 0.87226 0.016 0.984 0.000
#> SRR1071594 2 0.4399 0.66947 0.188 0.812 0.000
#> SRR612539 2 0.5431 0.47202 0.284 0.716 0.000
#> SRR602010 2 0.0424 0.87289 0.008 0.992 0.000
#> SRR810249 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR818773 2 0.3682 0.77280 0.116 0.876 0.008
#> SRR1336569 2 0.4399 0.67401 0.188 0.812 0.000
#> SRR1368117 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1442754 1 0.7221 0.48817 0.716 0.148 0.136
#> SRR1334247 1 0.7585 0.54186 0.484 0.476 0.040
#> SRR661639 1 0.3784 0.51238 0.864 0.132 0.004
#> SRR613222 2 0.2796 0.81417 0.092 0.908 0.000
#> SRR1459937 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR2185018 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR655732 2 0.0892 0.87110 0.020 0.980 0.000
#> SRR809348 2 0.1315 0.86677 0.020 0.972 0.008
#> SRR819261 1 0.7222 0.62154 0.696 0.220 0.084
#> SRR661074 3 0.3091 0.89497 0.072 0.016 0.912
#> SRR1349851 2 0.1163 0.86982 0.028 0.972 0.000
#> SRR1405123 2 0.3267 0.77836 0.116 0.884 0.000
#> SRR661096 2 0.1163 0.86597 0.028 0.972 0.000
#> SRR1320225 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1454651 1 0.6054 0.21938 0.768 0.052 0.180
#> SRR1307677 2 0.1860 0.85042 0.052 0.948 0.000
#> SRR1466512 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR658212 2 0.6126 -0.05421 0.400 0.600 0.000
#> SRR1430525 3 0.6742 0.78283 0.240 0.052 0.708
#> SRR1344422 2 0.4605 0.63814 0.204 0.796 0.000
#> SRR1353924 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1314832 1 0.6881 0.69076 0.592 0.388 0.020
#> SRR1487570 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR627431 1 0.5650 0.68856 0.688 0.312 0.000
#> SRR1418561 1 0.7782 0.65128 0.652 0.248 0.100
#> SRR1448029 2 0.6894 0.36914 0.256 0.692 0.052
#> SRR813802 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR815020 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1309702 2 0.1031 0.87008 0.024 0.976 0.000
#> SRR1435311 2 0.0592 0.87350 0.012 0.988 0.000
#> SRR612395 2 0.1031 0.87043 0.024 0.976 0.000
#> SRR603116 2 0.0424 0.87289 0.008 0.992 0.000
#> SRR1323152 2 0.6794 0.21278 0.324 0.648 0.028
#> SRR1368264 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 2 0.3192 0.78888 0.112 0.888 0.000
#> SRR1429265 3 0.3456 0.87578 0.060 0.036 0.904
#> SRR1327702 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR615611 1 0.5760 0.70508 0.672 0.328 0.000
#> SRR1486799 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1096174 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR815044 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1338560 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR615862 2 0.3412 0.77412 0.124 0.876 0.000
#> SRR1480038 2 0.0592 0.87300 0.012 0.988 0.000
#> SRR659436 2 0.6154 -0.12059 0.408 0.592 0.000
#> SRR613699 2 0.5650 0.38889 0.312 0.688 0.000
#> SRR1436563 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR615323 2 0.1964 0.83956 0.056 0.944 0.000
#> SRR1330327 2 0.1411 0.86477 0.036 0.964 0.000
#> SRR1489950 2 0.0892 0.87121 0.020 0.980 0.000
#> SRR1431927 2 0.4346 0.68102 0.184 0.816 0.000
#> SRR1100588 1 0.8297 -0.07131 0.560 0.092 0.348
#> SRR1444002 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR1318444 2 0.3038 0.80548 0.104 0.896 0.000
#> SRR600656 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR658766 1 0.6049 0.08482 0.756 0.040 0.204
#> SRR655946 1 0.7585 0.54185 0.484 0.476 0.040
#> SRR817282 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1475104 3 0.7932 0.52928 0.384 0.064 0.552
#> SRR1406418 2 0.0592 0.87295 0.012 0.988 0.000
#> SRR1090265 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR1444120 2 0.0892 0.87051 0.020 0.980 0.000
#> SRR1471965 2 0.1529 0.86314 0.040 0.960 0.000
#> SRR612695 2 0.6154 -0.12059 0.408 0.592 0.000
#> SRR662498 2 0.2625 0.82025 0.084 0.916 0.000
#> SRR1376764 1 0.8288 0.67615 0.512 0.408 0.080
#> SRR1377006 2 0.6140 -0.10144 0.404 0.596 0.000
#> SRR656860 2 0.5810 0.29717 0.336 0.664 0.000
#> SRR1480547 2 0.2537 0.81886 0.080 0.920 0.000
#> SRR1452515 2 0.5692 0.47281 0.268 0.724 0.008
#> SRR1324390 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR615273 2 0.6204 -0.11559 0.424 0.576 0.000
#> SRR601695 1 0.5706 0.68939 0.680 0.320 0.000
#> SRR820907 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR812773 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1472794 2 0.1031 0.87031 0.024 0.976 0.000
#> SRR1365448 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR1095720 3 0.3610 0.89304 0.096 0.016 0.888
#> SRR1435626 2 0.6148 0.12379 0.356 0.640 0.004
#> SRR1080766 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 2 0.0592 0.87295 0.012 0.988 0.000
#> SRR1332299 1 0.9355 0.53554 0.516 0.252 0.232
#> SRR1467966 1 0.8308 0.70583 0.568 0.336 0.096
#> SRR1320579 1 0.7637 0.68520 0.640 0.284 0.076
#> SRR1319710 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1326604 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1098879 3 0.7252 0.70066 0.196 0.100 0.704
#> SRR662245 1 0.7337 0.63650 0.540 0.428 0.032
#> SRR1074719 2 0.0237 0.87322 0.004 0.996 0.000
#> SRR816226 2 0.0983 0.87337 0.016 0.980 0.004
#> SRR601387 1 0.6095 0.64448 0.608 0.392 0.000
#> SRR614575 2 0.3340 0.77977 0.120 0.880 0.000
#> SRR1353900 2 0.2066 0.84092 0.060 0.940 0.000
#> SRR662906 1 0.7059 0.31982 0.724 0.112 0.164
#> SRR1350832 2 0.6045 0.03873 0.380 0.620 0.000
#> SRR1403280 2 0.0892 0.87110 0.020 0.980 0.000
#> SRR1313969 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1388528 2 0.6308 -0.45602 0.492 0.508 0.000
#> SRR1452912 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1400180 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR655399 3 0.0892 0.89002 0.020 0.000 0.980
#> SRR1319753 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR818901 1 0.9333 0.56593 0.516 0.268 0.216
#> SRR607067 1 0.6111 0.63609 0.604 0.396 0.000
#> SRR1391420 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1384138 2 0.4346 0.67909 0.184 0.816 0.000
#> SRR661961 1 0.6664 0.55959 0.528 0.464 0.008
#> SRR658259 2 0.0747 0.87290 0.016 0.984 0.000
#> SRR1310476 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1452696 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1365034 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1478053 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1475300 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322900 2 0.0747 0.87418 0.016 0.984 0.000
#> SRR1309942 2 0.0892 0.87121 0.020 0.980 0.000
#> SRR1345760 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1435418 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1402172 2 0.1964 0.85085 0.056 0.944 0.000
#> SRR1443436 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR661675 2 0.1529 0.86134 0.040 0.960 0.000
#> SRR661469 2 0.0592 0.87371 0.012 0.988 0.000
#> SRR1500323 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1312406 2 0.6008 0.23523 0.332 0.664 0.004
#> SRR1350435 2 0.3192 0.78888 0.112 0.888 0.000
#> SRR1389177 2 0.7759 -0.54905 0.476 0.476 0.048
#> SRR1368072 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR601815 1 0.5926 0.68550 0.644 0.356 0.000
#> SRR613330 2 0.0892 0.87123 0.020 0.980 0.000
#> SRR1434502 2 0.2066 0.84811 0.060 0.940 0.000
#> SRR1394190 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1481083 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR816382 2 0.5728 0.46922 0.272 0.720 0.008
#> SRR1318839 3 0.0747 0.88979 0.016 0.000 0.984
#> SRR1432390 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR613126 2 0.6155 0.32206 0.328 0.664 0.008
#> SRR1089424 2 0.0592 0.87356 0.012 0.988 0.000
#> SRR1347214 2 0.0592 0.87312 0.012 0.988 0.000
#> SRR1309556 2 0.2711 0.82427 0.088 0.912 0.000
#> SRR1456027 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1400551 1 0.6299 0.53897 0.524 0.476 0.000
#> SRR1320469 1 0.6673 0.71808 0.636 0.344 0.020
#> SRR614251 1 0.5810 0.69819 0.664 0.336 0.000
#> SRR1454310 2 0.0592 0.87289 0.012 0.988 0.000
#> SRR615105 2 0.6229 0.27848 0.340 0.652 0.008
#> SRR1433290 1 0.8985 0.29521 0.544 0.164 0.292
#> SRR2166064 2 0.2959 0.80350 0.100 0.900 0.000
#> SRR601671 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR663874 2 0.0747 0.87288 0.016 0.984 0.000
#> SRR1409130 1 0.7653 0.49169 0.684 0.176 0.140
#> SRR659696 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1408249 2 0.0424 0.87307 0.008 0.992 0.000
#> SRR663284 2 0.4796 0.61828 0.220 0.780 0.000
#> SRR1402794 1 0.7828 0.70914 0.592 0.340 0.068
#> SRR614852 1 0.4931 0.62071 0.768 0.232 0.000
#> SRR1348040 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1489610 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1488091 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499566 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1361480 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1444501 3 0.8478 0.46492 0.240 0.152 0.608
#> SRR1415773 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1388832 1 0.6973 0.65503 0.564 0.416 0.020
#> SRR1394637 2 0.6095 -0.00919 0.392 0.608 0.000
#> SRR606974 1 0.5650 0.68856 0.688 0.312 0.000
#> SRR662918 2 0.2711 0.81815 0.088 0.912 0.000
#> SRR817421 3 0.0892 0.88913 0.020 0.000 0.980
#> SRR1400823 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1381348 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR608264 1 0.8230 -0.10228 0.564 0.088 0.348
#> SRR1318560 1 0.7416 0.67713 0.656 0.276 0.068
#> SRR1454117 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1312684 2 0.2625 0.82473 0.084 0.916 0.000
#> SRR615044 2 0.6235 -0.16571 0.436 0.564 0.000
#> SRR1432743 1 0.8175 0.69642 0.576 0.336 0.088
#> SRR1388873 2 0.0747 0.87197 0.016 0.984 0.000
#> SRR1353517 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1357148 2 0.6667 0.05706 0.368 0.616 0.016
#> SRR1406008 2 0.0424 0.87391 0.008 0.992 0.000
#> SRR1396786 2 0.1031 0.86914 0.024 0.976 0.000
#> SRR1446564 2 0.1289 0.86837 0.032 0.968 0.000
#> SRR1318465 2 0.7674 -0.53918 0.476 0.480 0.044
#> SRR1431083 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR607117 2 0.0424 0.87289 0.008 0.992 0.000
#> SRR655170 2 0.3267 0.78723 0.116 0.884 0.000
#> SRR1087825 2 0.0592 0.87418 0.012 0.988 0.000
#> SRR662019 1 0.6647 0.67921 0.592 0.396 0.012
#> SRR1349209 2 0.4121 0.70784 0.168 0.832 0.000
#> SRR1326161 2 0.5397 0.47859 0.280 0.720 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 2 0.1163 0.86842 0.028 0.972 0.000
#> SRR663356 1 0.6252 0.54211 0.556 0.444 0.000
#> SRR1454328 2 0.0592 0.87333 0.012 0.988 0.000
#> SRR1489286 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR1092349 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408183 1 0.8126 0.70548 0.564 0.356 0.080
#> SRR1084369 2 0.7286 -0.46184 0.464 0.508 0.028
#> SRR598452 3 0.1905 0.89470 0.028 0.016 0.956
#> SRR660709 2 0.5733 0.37103 0.324 0.676 0.000
#> SRR809444 2 0.1129 0.87061 0.020 0.976 0.004
#> SRR1089901 2 0.1163 0.86623 0.028 0.972 0.000
#> SRR1375774 2 0.0592 0.87318 0.012 0.988 0.000
#> SRR1326292 1 0.6054 0.21938 0.768 0.052 0.180
#> SRR657139 1 0.4063 0.46283 0.868 0.112 0.020
#> SRR1440744 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1353555 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1323087 2 0.0592 0.87295 0.012 0.988 0.000
#> SRR1452334 2 0.3752 0.75099 0.144 0.856 0.000
#> SRR1381775 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363908 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1319626 2 0.0747 0.87194 0.016 0.984 0.000
#> SRR658989 2 0.6168 -0.14174 0.412 0.588 0.000
#> SRR1353663 2 0.6235 -0.22432 0.436 0.564 0.000
#> SRR811771 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR813983 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR815825 3 0.0424 0.88824 0.008 0.000 0.992
#> SRR819054 2 0.1860 0.85211 0.052 0.948 0.000
#> SRR1367988 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1331922 2 0.0592 0.87318 0.012 0.988 0.000
#> SRR615479 2 0.5988 0.17360 0.368 0.632 0.000
#> SRR1375796 2 0.3192 0.79161 0.112 0.888 0.000
#> SRR1386991 2 0.1860 0.85144 0.052 0.948 0.000
#> SRR1355217 2 0.4842 0.57853 0.224 0.776 0.000
#> SRR1356290 2 0.6026 0.06823 0.376 0.624 0.000
#> SRR659507 2 0.0747 0.87271 0.016 0.984 0.000
#> SRR663296 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR598044 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR661155 2 0.2959 0.80350 0.100 0.900 0.000
#> SRR1414727 2 0.6318 0.14832 0.356 0.636 0.008
#> SRR663477 2 0.3192 0.78888 0.112 0.888 0.000
#> SRR1354489 1 0.7283 0.57925 0.512 0.460 0.028
#> SRR1377800 1 0.7749 0.70498 0.616 0.312 0.072
#> SRR614611 1 0.5216 0.64778 0.740 0.260 0.000
#> SRR655052 2 0.1411 0.86448 0.036 0.964 0.000
#> SRR1478968 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1351280 2 0.1411 0.85887 0.036 0.964 0.000
#> SRR613951 2 0.1031 0.87275 0.024 0.976 0.000
#> SRR1418022 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR661901 1 0.6049 0.08482 0.756 0.040 0.204
#> SRR1408161 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR657054 1 0.5815 0.37522 0.800 0.096 0.104
#> SRR655040 2 0.4346 0.68360 0.184 0.816 0.000
#> SRR810225 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1325377 2 0.0592 0.87356 0.012 0.988 0.000
#> SRR617829 1 0.7274 0.57340 0.520 0.452 0.028
#> SRR1402328 2 0.0424 0.87328 0.008 0.992 0.000
#> SRR1480455 2 0.6825 -0.48038 0.488 0.500 0.012
#> SRR1442104 3 0.2165 0.88026 0.064 0.000 0.936
#> SRR1453416 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR1481396 3 0.7032 0.62583 0.368 0.028 0.604
#> SRR1414314 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.5810 0.29717 0.336 0.664 0.000
#> SRR1478386 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1458683 1 0.6181 0.28755 0.772 0.072 0.156
#> SRR1370572 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1467567 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1468532 2 0.1289 0.86642 0.032 0.968 0.000
#> SRR1310735 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1440101 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR660260 2 0.1860 0.85571 0.052 0.948 0.000
#> SRR1071231 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1459125 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1337173 2 0.6062 0.00735 0.384 0.616 0.000
#> SRR1396250 3 0.0592 0.88855 0.012 0.000 0.988
#> SRR2166376 3 0.3610 0.89304 0.096 0.016 0.888
#> SRR659816 2 0.5760 0.35756 0.328 0.672 0.000
#> SRR1401379 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR600981 2 0.3551 0.76893 0.132 0.868 0.000
#> SRR1398335 2 0.4452 0.66699 0.192 0.808 0.000
#> SRR1397218 2 0.0592 0.87413 0.012 0.988 0.000
#> SRR660115 2 0.1753 0.84990 0.048 0.952 0.000
#> SRR1407950 2 0.6026 0.05701 0.376 0.624 0.000
#> SRR1359780 2 0.0892 0.87116 0.020 0.980 0.000
#> SRR1490037 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR627439 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1397156 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1410221 2 0.0592 0.87286 0.012 0.988 0.000
#> SRR1319648 2 0.4346 0.67909 0.184 0.816 0.000
#> SRR1092985 2 0.6244 -0.25555 0.440 0.560 0.000
#> SRR656409 2 0.6168 -0.09547 0.412 0.588 0.000
#> SRR1468658 2 0.6267 -0.31267 0.452 0.548 0.000
#> SRR1390437 2 0.0592 0.87392 0.012 0.988 0.000
#> SRR658057 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR612635 1 0.6140 0.63026 0.596 0.404 0.000
#> SRR1351480 2 0.2066 0.84092 0.060 0.940 0.000
#> SRR1436651 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1441590 2 0.1163 0.86845 0.028 0.972 0.000
#> SRR659590 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR614263 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1409575 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR659911 2 0.6111 0.02834 0.396 0.604 0.000
#> SRR1085519 3 0.6151 0.80730 0.180 0.056 0.764
#> SRR1345894 2 0.5497 0.40052 0.292 0.708 0.000
#> SRR1442928 2 0.1860 0.84894 0.052 0.948 0.000
#> SRR1464681 2 0.0237 0.87333 0.004 0.996 0.000
#> SRR1418880 2 0.6095 -0.01764 0.392 0.608 0.000
#> SRR1309070 2 0.6026 0.03147 0.376 0.624 0.000
#> SRR1365426 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.7126 0.52785 0.720 0.164 0.116
#> SRR659708 1 0.4063 0.46283 0.868 0.112 0.020
#> SRR603236 2 0.4750 0.61531 0.216 0.784 0.000
#> SRR660673 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1430729 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR663807 2 0.1289 0.86556 0.032 0.968 0.000
#> SRR1087245 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1339108 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR613426 2 0.2261 0.84640 0.068 0.932 0.000
#> SRR613879 2 0.6235 -0.15994 0.436 0.564 0.000
#> SRR1385101 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1387966 2 0.2066 0.84092 0.060 0.940 0.000
#> SRR1458852 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1430489 2 0.0592 0.87270 0.012 0.988 0.000
#> SRR1349231 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1376249 3 0.0592 0.88855 0.012 0.000 0.988
#> SRR1321987 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR662653 2 0.5397 0.46261 0.280 0.720 0.000
#> SRR1390027 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR1098474 1 0.7339 0.69480 0.572 0.392 0.036
#> SRR1383081 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR2166960 2 0.1860 0.85211 0.052 0.948 0.000
#> SRR605101 2 0.0747 0.87033 0.016 0.984 0.000
#> SRR818600 2 0.2537 0.82402 0.080 0.920 0.000
#> SRR1367715 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1351979 3 0.0747 0.88790 0.016 0.000 0.984
#> SRR1387054 1 0.7585 0.54185 0.484 0.476 0.040
#> SRR1444306 1 0.8370 0.66725 0.500 0.416 0.084
#> SRR1322662 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR665478 2 0.2959 0.80749 0.100 0.900 0.000
#> SRR612767 2 0.3752 0.74702 0.144 0.856 0.000
#> SRR1489030 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1430375 2 0.0747 0.87183 0.016 0.984 0.000
#> SRR615225 2 0.3619 0.76527 0.136 0.864 0.000
#> SRR1401839 2 0.1411 0.86549 0.036 0.964 0.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.3091 0.89497 0.072 0.016 0.912
#> SRR1331639 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.87303 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443003 1 0.8310 0.66179 0.500 0.420 0.080
#> SRR612839 1 0.6267 0.59064 0.548 0.452 0.000
#> SRR1470093 1 0.7022 0.63187 0.700 0.232 0.068
#> SRR1395742 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1469014 2 0.0892 0.87174 0.020 0.980 0.000
#> SRR1387222 1 0.7583 0.55857 0.492 0.468 0.040
#> SRR664063 2 0.0592 0.87329 0.012 0.988 0.000
#> SRR1488214 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR654766 2 0.0424 0.87325 0.008 0.992 0.000
#> SRR1320321 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1071955 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1417483 2 0.0747 0.87206 0.016 0.984 0.000
#> SRR1394231 2 0.0237 0.87307 0.004 0.996 0.000
#> SRR1488470 2 0.2537 0.82101 0.080 0.920 0.000
#> SRR1389497 3 0.6143 0.75538 0.256 0.024 0.720
#> SRR1367109 2 0.4842 0.58937 0.224 0.776 0.000
#> SRR615311 2 0.0892 0.87190 0.020 0.980 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0376 0.828067 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1380716 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR612803 2 0.3088 0.772995 0.128 0.864 0.000 0.008
#> SRR613282 2 0.2125 0.808323 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1355396 2 0.1474 0.820222 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.7398 0.193083 0.492 0.324 0.000 0.184
#> SRR1074359 2 0.3525 0.761655 0.100 0.860 0.000 0.040
#> SRR1419258 3 0.3257 0.827603 0.000 0.004 0.844 0.152
#> SRR1403366 1 0.8280 0.010313 0.548 0.108 0.104 0.240
#> SRR665262 2 0.0469 0.829463 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1499740 2 0.1302 0.826366 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0336 0.827882 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1439742 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR614599 2 0.7013 -0.044052 0.356 0.516 0.000 0.128
#> SRR612215 2 0.6228 0.165208 0.364 0.572 0.000 0.064
#> SRR1094051 2 0.2281 0.800014 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1324496 2 0.2081 0.806521 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.7974 0.157960 0.544 0.224 0.036 0.196
#> SRR1409263 3 0.4265 0.825189 0.024 0.012 0.816 0.148
#> SRR1431288 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.4638 0.658192 0.180 0.776 0.000 0.044
#> SRR614839 1 0.6474 0.182615 0.624 0.256 0.000 0.120
#> SRR658433 2 0.1109 0.828111 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1088581 1 0.8197 -0.063584 0.476 0.144 0.044 0.336
#> SRR1328797 3 0.3257 0.827603 0.000 0.004 0.844 0.152
#> SRR1334512 2 0.2473 0.793711 0.080 0.908 0.000 0.012
#> SRR1471117 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR1311553 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1354955 2 0.7928 -0.348747 0.332 0.440 0.008 0.220
#> SRR654802 3 0.5279 0.766898 0.072 0.000 0.736 0.192
#> SRR660066 2 0.1489 0.822617 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR1447103 2 0.1022 0.830581 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1402153 2 0.8107 -0.476960 0.272 0.400 0.008 0.320
#> SRR655887 2 0.1743 0.813378 0.056 0.940 0.000 0.004
#> SRR1408529 4 0.8715 0.294145 0.300 0.244 0.044 0.412
#> SRR658707 1 0.4214 0.009952 0.780 0.016 0.000 0.204
#> SRR1384371 2 0.4731 0.656551 0.160 0.780 0.000 0.060
#> SRR1074670 1 0.8586 -0.227448 0.412 0.184 0.048 0.356
#> SRR1375439 2 0.4023 0.742150 0.104 0.840 0.004 0.052
#> SRR1329003 1 0.6639 -0.017364 0.584 0.004 0.092 0.320
#> SRR1404837 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1317920 2 0.1302 0.824448 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.8528 -0.127677 0.480 0.076 0.136 0.308
#> SRR613999 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1310836 2 0.2011 0.807150 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1499764 2 0.2281 0.800014 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR658200 1 0.7828 -0.217116 0.480 0.064 0.072 0.384
#> SRR1068855 2 0.6332 -0.153212 0.452 0.488 0.000 0.060
#> SRR1375509 3 0.4093 0.829466 0.024 0.004 0.816 0.156
#> SRR612227 1 0.8439 -0.113420 0.372 0.296 0.020 0.312
#> SRR1388809 2 0.0672 0.828673 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1413872 2 0.0779 0.829959 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1452864 2 0.2704 0.787406 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.6962 0.147174 0.296 0.572 0.004 0.128
#> SRR615814 2 0.5170 0.583114 0.228 0.724 0.000 0.048
#> SRR1325225 2 0.1109 0.827747 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1313687 2 0.3708 0.723935 0.148 0.832 0.000 0.020
#> SRR1358220 2 0.0524 0.827858 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1096662 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1487746 2 0.1792 0.813323 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1354644 2 0.2281 0.800014 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0188 0.828107 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0469 0.828589 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.1174 0.826477 0.020 0.968 0.000 0.012
#> SRR809595 2 0.1388 0.829550 0.028 0.960 0.000 0.012
#> SRR1403133 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0469 0.827791 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1344382 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.6461 0.338234 0.240 0.632 0.000 0.128
#> SRR1478362 2 0.0592 0.828449 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.0927 0.827131 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1347937 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1431569 2 0.2011 0.807323 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1471594 2 0.2707 0.809920 0.068 0.908 0.008 0.016
#> SRR1354270 2 0.6726 0.197617 0.292 0.584 0.000 0.124
#> SRR612683 2 0.1004 0.829845 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1392901 2 0.5800 0.534345 0.164 0.708 0.000 0.128
#> SRR1077805 2 0.7530 -0.193519 0.272 0.492 0.000 0.236
#> SRR1360402 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1406112 2 0.7958 -0.357795 0.328 0.436 0.008 0.228
#> SRR1355352 1 0.7827 0.206950 0.536 0.272 0.028 0.164
#> SRR656247 2 0.1389 0.825107 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.2546 0.792942 0.092 0.900 0.000 0.008
#> SRR808244 1 0.6639 -0.017364 0.584 0.004 0.092 0.320
#> SRR1387240 2 0.0000 0.827320 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 2 0.2853 0.805891 0.076 0.900 0.008 0.016
#> SRR1385277 2 0.0707 0.828825 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1419110 2 0.7113 0.311680 0.228 0.620 0.024 0.128
#> SRR1408682 2 0.0336 0.828210 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1317134 2 0.2281 0.800014 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1370780 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0804 0.828189 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR603164 2 0.8510 -0.556451 0.348 0.352 0.024 0.276
#> SRR1383259 2 0.1209 0.827898 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR1330854 1 0.8249 0.004798 0.552 0.096 0.116 0.236
#> SRR1452423 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.2111 0.809450 0.044 0.932 0.000 0.024
#> SRR1468162 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.7303 0.186649 0.216 0.584 0.012 0.188
#> SRR1361546 2 0.5072 0.589742 0.208 0.740 0.000 0.052
#> SRR1486156 2 0.2149 0.803740 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.7621 -0.311279 0.344 0.444 0.000 0.212
#> SRR615635 2 0.0376 0.827570 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1385411 2 0.5716 0.516743 0.212 0.700 0.000 0.088
#> SRR1342739 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.4093 0.829466 0.024 0.004 0.816 0.156
#> SRR662126 2 0.2329 0.804077 0.072 0.916 0.000 0.012
#> SRR1464601 2 0.0779 0.829069 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1071594 2 0.4541 0.680784 0.144 0.796 0.000 0.060
#> SRR612539 2 0.5423 0.382911 0.332 0.640 0.000 0.028
#> SRR602010 2 0.0469 0.829221 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR810249 2 0.0524 0.827612 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR818773 2 0.4011 0.749784 0.084 0.844 0.004 0.068
#> SRR1336569 2 0.4453 0.633934 0.244 0.744 0.000 0.012
#> SRR1368117 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.8249 0.004798 0.552 0.096 0.116 0.236
#> SRR1334247 2 0.7732 -0.326583 0.268 0.444 0.000 0.288
#> SRR661639 1 0.4214 0.009952 0.780 0.016 0.000 0.204
#> SRR613222 2 0.2737 0.790152 0.104 0.888 0.000 0.008
#> SRR1459937 2 0.0895 0.829597 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR2185018 2 0.2011 0.807224 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0895 0.827610 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR809348 2 0.2781 0.807275 0.072 0.904 0.008 0.016
#> SRR819261 1 0.8586 -0.227448 0.412 0.184 0.048 0.356
#> SRR661074 3 0.4093 0.829466 0.024 0.004 0.816 0.156
#> SRR1349851 2 0.1389 0.830126 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.2928 0.770326 0.108 0.880 0.000 0.012
#> SRR661096 2 0.1151 0.827770 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1320225 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6639 -0.017364 0.584 0.004 0.092 0.320
#> SRR1307677 2 0.1576 0.819823 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR1466512 2 0.0524 0.828165 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR658212 2 0.6751 0.211993 0.272 0.592 0.000 0.136
#> SRR1430525 3 0.6442 0.657323 0.036 0.020 0.552 0.392
#> SRR1344422 2 0.4553 0.659573 0.180 0.780 0.000 0.040
#> SRR1353924 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.7816 0.195054 0.504 0.312 0.020 0.164
#> SRR1487570 2 0.1109 0.827860 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR627431 1 0.6296 0.164770 0.652 0.224 0.000 0.124
#> SRR1418561 1 0.8931 -0.105223 0.432 0.184 0.080 0.304
#> SRR1448029 2 0.7295 0.360887 0.152 0.636 0.044 0.168
#> SRR813802 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR815020 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0895 0.828710 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1435311 2 0.0804 0.828097 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR612395 2 0.1022 0.830581 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR603116 2 0.0469 0.829221 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1323152 2 0.7458 0.260719 0.212 0.596 0.028 0.164
#> SRR1368264 2 0.0188 0.828160 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1326624 2 0.3768 0.720139 0.184 0.808 0.000 0.008
#> SRR1429265 3 0.3166 0.826296 0.020 0.012 0.888 0.080
#> SRR1327702 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR615611 1 0.6296 0.184980 0.644 0.244 0.000 0.112
#> SRR1486799 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0524 0.827612 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR815044 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR615862 2 0.3636 0.707362 0.172 0.820 0.000 0.008
#> SRR1480038 2 0.0657 0.827929 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR659436 2 0.6933 0.082477 0.300 0.560 0.000 0.140
#> SRR613699 2 0.5836 0.390409 0.304 0.640 0.000 0.056
#> SRR1436563 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2401 0.784817 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR1330327 2 0.1584 0.827057 0.036 0.952 0.000 0.012
#> SRR1489950 2 0.1182 0.826881 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR1431927 2 0.4453 0.634351 0.244 0.744 0.000 0.012
#> SRR1100588 4 0.8323 -0.010117 0.220 0.040 0.244 0.496
#> SRR1444002 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR1318444 2 0.3219 0.786937 0.112 0.868 0.000 0.020
#> SRR600656 2 0.0895 0.829597 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR658766 1 0.7708 -0.188705 0.512 0.012 0.188 0.288
#> SRR655946 2 0.7771 -0.357644 0.276 0.432 0.000 0.292
#> SRR817282 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.8382 0.377419 0.196 0.036 0.452 0.316
#> SRR1406418 2 0.1792 0.813323 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1090265 2 0.2081 0.806521 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.1004 0.830773 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1471965 2 0.2530 0.792190 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.6933 0.082477 0.300 0.560 0.000 0.140
#> SRR662498 2 0.2845 0.795578 0.076 0.896 0.000 0.028
#> SRR1376764 2 0.8225 -0.569495 0.264 0.368 0.012 0.356
#> SRR1377006 2 0.6855 0.143009 0.292 0.572 0.000 0.136
#> SRR656860 2 0.5865 0.310758 0.340 0.612 0.000 0.048
#> SRR1480547 2 0.2402 0.795935 0.076 0.912 0.000 0.012
#> SRR1452515 2 0.6154 0.486957 0.192 0.684 0.004 0.120
#> SRR1324390 2 0.0376 0.827570 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR615273 2 0.7013 -0.049303 0.356 0.516 0.000 0.128
#> SRR601695 1 0.6357 0.169810 0.644 0.232 0.000 0.124
#> SRR820907 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR812773 2 0.0188 0.828107 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1472794 2 0.1109 0.828926 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1365448 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR1095720 3 0.4462 0.827061 0.024 0.008 0.792 0.176
#> SRR1435626 2 0.6648 0.270724 0.248 0.612 0.000 0.140
#> SRR1080766 2 0.0000 0.827320 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 2 0.1637 0.816734 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1332299 4 0.8657 0.416859 0.148 0.212 0.116 0.524
#> SRR1467966 4 0.8809 0.079974 0.332 0.296 0.040 0.332
#> SRR1320579 1 0.8377 -0.178162 0.368 0.252 0.020 0.360
#> SRR1319710 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.7039 0.564265 0.032 0.064 0.564 0.340
#> SRR662245 2 0.8143 -0.418254 0.324 0.416 0.012 0.248
#> SRR1074719 2 0.0376 0.828067 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR816226 2 0.1677 0.827015 0.040 0.948 0.000 0.012
#> SRR601387 1 0.6464 0.181100 0.596 0.308 0.000 0.096
#> SRR614575 2 0.3545 0.717643 0.164 0.828 0.000 0.008
#> SRR1353900 2 0.2300 0.805694 0.048 0.924 0.000 0.028
#> SRR662906 4 0.7209 0.288041 0.340 0.060 0.044 0.556
#> SRR1350832 2 0.6663 0.280295 0.244 0.612 0.000 0.144
#> SRR1403280 2 0.1042 0.827028 0.020 0.972 0.000 0.008
#> SRR1313969 2 0.0895 0.829597 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1388528 1 0.6799 0.197173 0.464 0.440 0.000 0.096
#> SRR1452912 2 0.2011 0.807150 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.0921 0.826702 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0817 0.833297 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1319753 2 0.0336 0.828437 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR818901 4 0.8712 0.402164 0.148 0.228 0.112 0.512
#> SRR607067 1 0.6464 0.176037 0.596 0.308 0.000 0.096
#> SRR1391420 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4199 0.694032 0.164 0.804 0.000 0.032
#> SRR661961 2 0.7371 -0.435433 0.416 0.424 0.000 0.160
#> SRR658259 2 0.0779 0.828511 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1310476 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1365034 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1328101 2 0.0188 0.828107 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1322900 2 0.1302 0.826366 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.1182 0.826881 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR1345760 2 0.0895 0.829597 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1435418 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.1902 0.817864 0.064 0.932 0.000 0.004
#> SRR1443436 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1452 0.824552 0.036 0.956 0.000 0.008
#> SRR661469 2 0.0469 0.829463 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1500323 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.827320 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.6449 0.344795 0.232 0.636 0.000 0.132
#> SRR1350435 2 0.3768 0.720139 0.184 0.808 0.000 0.008
#> SRR1389177 2 0.7897 -0.339867 0.268 0.440 0.004 0.288
#> SRR1368072 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR601815 1 0.6351 0.183492 0.628 0.268 0.000 0.104
#> SRR613330 2 0.2125 0.808323 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1434502 2 0.2053 0.814143 0.072 0.924 0.000 0.004
#> SRR1394190 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1481083 2 0.2011 0.807150 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.6297 0.504996 0.156 0.692 0.012 0.140
#> SRR1318839 3 0.0817 0.832285 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1432390 2 0.0657 0.829100 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR613126 2 0.6141 0.345778 0.312 0.616 0.000 0.072
#> SRR1089424 2 0.0469 0.829031 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0804 0.827836 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1309556 2 0.2611 0.797158 0.096 0.896 0.000 0.008
#> SRR1456027 2 0.0817 0.828515 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1400551 2 0.7251 -0.396596 0.416 0.440 0.000 0.144
#> SRR1320469 1 0.6808 0.245721 0.612 0.260 0.008 0.120
#> SRR614251 1 0.6474 0.182615 0.624 0.256 0.000 0.120
#> SRR1454310 2 0.0469 0.828441 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR615105 2 0.6299 0.304875 0.320 0.600 0.000 0.080
#> SRR1433290 4 0.8401 0.413134 0.148 0.120 0.172 0.560
#> SRR2166064 2 0.2654 0.785662 0.108 0.888 0.000 0.004
#> SRR601671 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0657 0.829420 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1409130 4 0.7610 0.337959 0.320 0.120 0.028 0.532
#> SRR659696 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0804 0.827399 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR663284 2 0.4679 0.652903 0.184 0.772 0.000 0.044
#> SRR1402794 1 0.9127 -0.166425 0.328 0.296 0.064 0.312
#> SRR614852 1 0.6110 0.091342 0.680 0.144 0.000 0.176
#> SRR1348040 2 0.0592 0.827751 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1489610 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1499566 2 0.0376 0.827570 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1361480 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.8211 0.235751 0.064 0.108 0.472 0.356
#> SRR1415773 2 0.0336 0.828210 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.7607 0.201800 0.464 0.352 0.004 0.180
#> SRR1394637 2 0.6384 0.028393 0.400 0.532 0.000 0.068
#> SRR606974 1 0.6296 0.164770 0.652 0.224 0.000 0.124
#> SRR662918 2 0.2401 0.798517 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR817421 3 0.1022 0.830755 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1400823 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR608264 4 0.8607 0.094592 0.216 0.056 0.252 0.476
#> SRR1318560 1 0.8155 0.142145 0.532 0.220 0.044 0.204
#> SRR1454117 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1312684 2 0.3157 0.767518 0.144 0.852 0.000 0.004
#> SRR615044 2 0.6938 -0.178662 0.400 0.488 0.000 0.112
#> SRR1432743 4 0.8631 0.200260 0.288 0.296 0.032 0.384
#> SRR1388873 2 0.0927 0.827331 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1353517 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.7303 0.199648 0.216 0.584 0.012 0.188
#> SRR1406008 2 0.0469 0.829353 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.1411 0.824317 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR1446564 2 0.1557 0.828993 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.7719 -0.317898 0.268 0.448 0.000 0.284
#> SRR1431083 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0469 0.829518 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.3219 0.771132 0.112 0.868 0.000 0.020
#> SRR1087825 2 0.0779 0.829959 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR662019 1 0.7552 0.182643 0.480 0.340 0.004 0.176
#> SRR1349209 2 0.4008 0.714830 0.148 0.820 0.000 0.032
#> SRR1326161 2 0.5448 0.531039 0.244 0.700 0.000 0.056
#> SRR1345284 2 0.0188 0.827736 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416672 2 0.2345 0.797128 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR663356 1 0.6350 0.159960 0.564 0.364 0.000 0.072
#> SRR1454328 2 0.0937 0.827652 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR1489286 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR1092349 2 0.0524 0.829339 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1408183 4 0.9131 0.071444 0.300 0.316 0.064 0.320
#> SRR1084369 2 0.7622 -0.254649 0.280 0.472 0.000 0.248
#> SRR598452 3 0.2310 0.839364 0.008 0.004 0.920 0.068
#> SRR660709 2 0.5807 0.401963 0.312 0.636 0.000 0.052
#> SRR809444 2 0.2586 0.801334 0.092 0.900 0.004 0.004
#> SRR1089901 2 0.1256 0.825348 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR1375774 2 0.1211 0.824231 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.6639 -0.017364 0.584 0.004 0.092 0.320
#> SRR657139 1 0.4844 -0.008785 0.748 0.016 0.012 0.224
#> SRR1440744 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1353555 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1323087 2 0.1792 0.813323 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.3597 0.744679 0.148 0.836 0.000 0.016
#> SRR1381775 2 0.0524 0.829339 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1363908 2 0.2216 0.801254 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0927 0.827131 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR658989 2 0.6973 0.065657 0.300 0.556 0.000 0.144
#> SRR1353663 2 0.6336 -0.182829 0.460 0.480 0.000 0.060
#> SRR811771 2 0.2011 0.807224 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR813983 2 0.2149 0.803740 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0469 0.830911 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR819054 2 0.1938 0.815497 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR1367988 2 0.0895 0.829597 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1331922 2 0.1211 0.824231 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.6228 0.165208 0.364 0.572 0.000 0.064
#> SRR1375796 2 0.3160 0.774737 0.108 0.872 0.000 0.020
#> SRR1386991 2 0.2500 0.804979 0.044 0.916 0.000 0.040
#> SRR1355217 2 0.4998 0.591482 0.200 0.748 0.000 0.052
#> SRR1356290 2 0.6673 0.273704 0.252 0.608 0.000 0.140
#> SRR659507 2 0.0592 0.829329 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR663296 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR598044 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR661155 2 0.2654 0.785662 0.108 0.888 0.000 0.004
#> SRR1414727 2 0.6872 0.242904 0.256 0.600 0.004 0.140
#> SRR663477 2 0.3768 0.720139 0.184 0.808 0.000 0.008
#> SRR1354489 2 0.8088 -0.425297 0.304 0.412 0.008 0.276
#> SRR1377800 1 0.8379 0.048116 0.448 0.256 0.028 0.268
#> SRR614611 1 0.6115 0.119208 0.680 0.172 0.000 0.148
#> SRR655052 2 0.1398 0.825405 0.040 0.956 0.000 0.004
#> SRR1478968 2 0.1109 0.827747 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1351280 2 0.1356 0.823365 0.032 0.960 0.000 0.008
#> SRR613951 2 0.1109 0.831182 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1418022 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR661901 1 0.7708 -0.188705 0.512 0.012 0.188 0.288
#> SRR1408161 2 0.2149 0.803740 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR657054 1 0.7775 -0.218538 0.480 0.060 0.072 0.388
#> SRR655040 2 0.4644 0.604047 0.228 0.748 0.000 0.024
#> SRR810225 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1325377 2 0.0469 0.829031 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR617829 2 0.7737 -0.416932 0.360 0.408 0.000 0.232
#> SRR1402328 2 0.0524 0.828369 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1480455 2 0.7527 -0.215598 0.300 0.484 0.000 0.216
#> SRR1442104 3 0.2888 0.811750 0.004 0.000 0.872 0.124
#> SRR1453416 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR1481396 3 0.7726 0.491013 0.184 0.012 0.504 0.300
#> SRR1414314 2 0.0000 0.827320 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.5865 0.310758 0.340 0.612 0.000 0.048
#> SRR1478386 2 0.0524 0.827612 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1458683 1 0.7180 -0.087657 0.516 0.020 0.084 0.380
#> SRR1370572 2 0.2011 0.807150 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1467567 2 0.2011 0.807150 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.1545 0.828783 0.040 0.952 0.000 0.008
#> SRR1310735 2 0.2011 0.807150 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0895 0.829597 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR660260 2 0.2179 0.818730 0.064 0.924 0.000 0.012
#> SRR1071231 2 0.0376 0.827570 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1459125 2 0.0707 0.828825 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1337173 2 0.6566 0.231076 0.288 0.600 0.000 0.112
#> SRR1396250 3 0.1109 0.832132 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR2166376 3 0.4462 0.827061 0.024 0.008 0.792 0.176
#> SRR659816 2 0.5878 0.391020 0.312 0.632 0.000 0.056
#> SRR1401379 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR600981 2 0.3217 0.763657 0.128 0.860 0.000 0.012
#> SRR1398335 2 0.4485 0.627262 0.248 0.740 0.000 0.012
#> SRR1397218 2 0.0779 0.829431 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR660115 2 0.3088 0.772995 0.128 0.864 0.000 0.008
#> SRR1407950 2 0.6637 0.293109 0.240 0.616 0.000 0.144
#> SRR1359780 2 0.0817 0.829477 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1490037 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1397156 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0657 0.827843 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1319648 2 0.4199 0.694032 0.164 0.804 0.000 0.032
#> SRR1092985 2 0.6276 -0.190319 0.464 0.480 0.000 0.056
#> SRR656409 2 0.6148 0.000158 0.408 0.540 0.000 0.052
#> SRR1468658 2 0.7258 -0.112549 0.328 0.508 0.000 0.164
#> SRR1390437 2 0.0895 0.830539 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR658057 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR612635 1 0.6429 0.181322 0.588 0.324 0.000 0.088
#> SRR1351480 2 0.2300 0.805694 0.048 0.924 0.000 0.028
#> SRR1436651 2 0.2011 0.807150 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1441590 2 0.1716 0.821619 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0376 0.827570 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR614263 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0524 0.828165 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR659911 2 0.6836 0.217768 0.280 0.580 0.000 0.140
#> SRR1085519 3 0.6181 0.708905 0.036 0.020 0.624 0.320
#> SRR1345894 2 0.6145 0.439525 0.236 0.668 0.004 0.092
#> SRR1442928 2 0.2816 0.786852 0.036 0.900 0.000 0.064
#> SRR1464681 2 0.0469 0.828576 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1418880 2 0.6235 0.007360 0.420 0.524 0.000 0.056
#> SRR1309070 2 0.6793 0.161738 0.288 0.580 0.000 0.132
#> SRR1365426 2 0.0336 0.828428 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.8182 0.029054 0.560 0.108 0.100 0.232
#> SRR659708 1 0.4844 -0.008785 0.748 0.016 0.012 0.224
#> SRR603236 2 0.5383 0.599550 0.160 0.740 0.000 0.100
#> SRR660673 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR663807 2 0.1388 0.826540 0.028 0.960 0.000 0.012
#> SRR1087245 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0376 0.827570 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR613426 2 0.2401 0.814338 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR613879 2 0.6442 -0.160466 0.440 0.492 0.000 0.068
#> SRR1385101 2 0.1118 0.824557 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.2300 0.805694 0.048 0.924 0.000 0.028
#> SRR1458852 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1430489 2 0.1302 0.824112 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1349231 2 0.0921 0.826702 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.1109 0.832132 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1321987 2 0.0524 0.827612 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR662653 2 0.5198 0.527872 0.252 0.708 0.000 0.040
#> SRR1390027 2 0.2281 0.800014 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.7902 -0.544562 0.328 0.368 0.000 0.304
#> SRR1383081 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.1938 0.815497 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR605101 2 0.0592 0.828843 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR818600 2 0.2699 0.794386 0.068 0.904 0.000 0.028
#> SRR1367715 2 0.0376 0.827642 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1351979 3 0.0817 0.830758 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1387054 2 0.7771 -0.357644 0.276 0.432 0.000 0.292
#> SRR1444306 2 0.8310 -0.578639 0.260 0.364 0.016 0.360
#> SRR1322662 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.2805 0.788385 0.100 0.888 0.000 0.012
#> SRR612767 2 0.4059 0.663846 0.200 0.788 0.000 0.012
#> SRR1489030 2 0.0376 0.827570 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1430375 2 0.1059 0.827017 0.012 0.972 0.000 0.016
#> SRR615225 2 0.3335 0.761705 0.128 0.856 0.000 0.016
#> SRR1401839 2 0.1767 0.826842 0.044 0.944 0.000 0.012
#> SRR1379110 2 0.0336 0.827882 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077288 3 0.4093 0.829466 0.024 0.004 0.816 0.156
#> SRR1331639 2 0.0657 0.829100 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1342782 2 0.0336 0.828428 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1443003 2 0.8215 -0.558684 0.260 0.372 0.012 0.356
#> SRR612839 1 0.6586 0.270989 0.544 0.368 0.000 0.088
#> SRR1470093 1 0.8570 -0.164774 0.444 0.180 0.052 0.324
#> SRR1395742 2 0.2216 0.801254 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1469014 2 0.2081 0.806521 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.7935 -0.368129 0.276 0.428 0.004 0.292
#> SRR664063 2 0.0592 0.830163 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1488214 2 0.1867 0.811154 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0895 0.829597 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1320321 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1071955 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1417483 2 0.2081 0.804765 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0188 0.827355 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.2271 0.798573 0.076 0.916 0.000 0.008
#> SRR1389497 3 0.5893 0.663063 0.028 0.008 0.592 0.372
#> SRR1367109 2 0.5077 0.625613 0.160 0.760 0.000 0.080
#> SRR615311 2 0.1940 0.811583 0.076 0.924 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0290 0.8143 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380716 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612803 2 0.3631 0.7331 0.104 0.824 0.000 0.072 0.000
#> SRR613282 2 0.2563 0.7669 0.120 0.872 0.000 0.008 0.000
#> SRR1355396 2 0.1908 0.7884 0.092 0.908 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.6917 0.2908 0.528 0.272 0.000 0.040 0.160
#> SRR1074359 2 0.4039 0.7178 0.044 0.820 0.000 0.036 0.100
#> SRR1419258 3 0.4099 0.8261 0.032 0.004 0.800 0.016 0.148
#> SRR1403366 1 0.7450 0.0669 0.572 0.072 0.100 0.040 0.216
#> SRR665262 2 0.0992 0.8153 0.008 0.968 0.000 0.024 0.000
#> SRR1499740 2 0.1502 0.8080 0.056 0.940 0.000 0.004 0.000
#> SRR1105057 2 0.0404 0.8138 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1439742 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR614599 2 0.7347 -0.1815 0.192 0.472 0.000 0.284 0.052
#> SRR612215 2 0.5445 0.0573 0.032 0.532 0.000 0.420 0.016
#> SRR1094051 2 0.2516 0.7569 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 2 0.2536 0.7637 0.128 0.868 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393449 1 0.7264 0.2575 0.584 0.184 0.036 0.044 0.152
#> SRR1409263 3 0.4283 0.8325 0.080 0.000 0.780 0.004 0.136
#> SRR1431288 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.5030 0.6147 0.044 0.748 0.000 0.144 0.064
#> SRR614839 4 0.4750 0.5297 0.052 0.208 0.000 0.728 0.012
#> SRR658433 2 0.1243 0.8135 0.008 0.960 0.000 0.028 0.004
#> SRR1088581 1 0.7809 -0.1000 0.508 0.112 0.016 0.124 0.240
#> SRR1328797 3 0.4099 0.8261 0.032 0.004 0.800 0.016 0.148
#> SRR1334512 2 0.2666 0.7709 0.012 0.892 0.000 0.076 0.020
#> SRR1471117 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR1311553 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354955 2 0.8183 -0.4998 0.172 0.392 0.004 0.128 0.304
#> SRR654802 3 0.5825 0.7642 0.032 0.000 0.672 0.120 0.176
#> SRR660066 2 0.1408 0.8098 0.008 0.948 0.000 0.044 0.000
#> SRR1447103 2 0.1299 0.8161 0.020 0.960 0.000 0.012 0.008
#> SRR1402153 5 0.7548 0.2401 0.128 0.360 0.000 0.092 0.420
#> SRR655887 2 0.2069 0.7934 0.012 0.924 0.000 0.052 0.012
#> SRR1408529 5 0.7666 0.4564 0.116 0.200 0.016 0.128 0.540
#> SRR658707 4 0.3495 0.3734 0.160 0.000 0.000 0.812 0.028
#> SRR1384371 2 0.4931 0.6197 0.036 0.760 0.000 0.108 0.096
#> SRR1074670 5 0.8655 0.3779 0.200 0.148 0.024 0.220 0.408
#> SRR1375439 2 0.4404 0.6963 0.056 0.804 0.004 0.036 0.100
#> SRR1329003 1 0.4858 -0.1082 0.772 0.000 0.064 0.064 0.100
#> SRR1404837 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317920 2 0.1704 0.8015 0.068 0.928 0.000 0.004 0.000
#> SRR1455525 1 0.8292 -0.1237 0.496 0.056 0.108 0.116 0.224
#> SRR613999 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 2 0.2329 0.7678 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 2 0.2516 0.7569 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.8032 0.1268 0.180 0.040 0.036 0.364 0.380
#> SRR1068855 1 0.5538 0.3117 0.500 0.440 0.000 0.056 0.004
#> SRR1375509 3 0.4250 0.8337 0.084 0.000 0.784 0.004 0.128
#> SRR612227 5 0.8665 0.3685 0.164 0.244 0.012 0.220 0.360
#> SRR1388809 2 0.0693 0.8141 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1413872 2 0.1200 0.8156 0.016 0.964 0.000 0.012 0.008
#> SRR1452864 2 0.2732 0.7480 0.160 0.840 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.7670 -0.0536 0.136 0.512 0.004 0.132 0.216
#> SRR615814 2 0.5360 0.5247 0.024 0.688 0.000 0.220 0.068
#> SRR1325225 2 0.1442 0.8127 0.032 0.952 0.000 0.012 0.004
#> SRR1313687 2 0.4167 0.6971 0.044 0.812 0.000 0.104 0.040
#> SRR1358220 2 0.0510 0.8137 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1096662 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487746 2 0.2127 0.7785 0.108 0.892 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 2 0.2516 0.7569 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0162 0.8138 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0404 0.8152 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR815783 2 0.1560 0.8085 0.004 0.948 0.000 0.028 0.020
#> SRR809595 2 0.1461 0.8150 0.016 0.952 0.000 0.004 0.028
#> SRR1403133 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR815470 2 0.0693 0.8147 0.012 0.980 0.000 0.008 0.000
#> SRR1344382 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.6866 0.1924 0.092 0.584 0.000 0.108 0.216
#> SRR1478362 2 0.0807 0.8157 0.012 0.976 0.000 0.012 0.000
#> SRR1392186 2 0.1267 0.8100 0.004 0.960 0.000 0.024 0.012
#> SRR1347937 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 2 0.2280 0.7706 0.120 0.880 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 2 0.2907 0.7722 0.116 0.864 0.008 0.000 0.012
#> SRR1354270 2 0.7277 0.0873 0.116 0.552 0.000 0.144 0.188
#> SRR612683 2 0.0992 0.8156 0.008 0.968 0.000 0.024 0.000
#> SRR1392901 2 0.6046 0.4220 0.068 0.656 0.000 0.072 0.204
#> SRR1077805 2 0.7600 -0.2987 0.112 0.468 0.000 0.128 0.292
#> SRR1360402 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1406112 2 0.8175 -0.5126 0.168 0.388 0.004 0.128 0.312
#> SRR1355352 1 0.6429 0.3131 0.628 0.216 0.028 0.016 0.112
#> SRR656247 2 0.1662 0.8068 0.056 0.936 0.000 0.004 0.004
#> SRR813656 2 0.2914 0.7651 0.016 0.872 0.000 0.100 0.012
#> SRR808244 1 0.4858 -0.1082 0.772 0.000 0.064 0.064 0.100
#> SRR1387240 2 0.0000 0.8130 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 2 0.3059 0.7673 0.120 0.856 0.008 0.000 0.016
#> SRR1385277 2 0.0865 0.8151 0.024 0.972 0.000 0.004 0.000
#> SRR1435248 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1419110 2 0.7263 0.1630 0.196 0.580 0.024 0.060 0.140
#> SRR1408682 2 0.0451 0.8151 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1317134 2 0.2516 0.7569 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453911 2 0.0609 0.8148 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR603164 5 0.8408 0.2865 0.092 0.308 0.016 0.228 0.356
#> SRR1383259 2 0.1393 0.8129 0.008 0.956 0.000 0.024 0.012
#> SRR1330854 1 0.7420 0.0614 0.576 0.064 0.112 0.040 0.208
#> SRR1452423 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.2217 0.7904 0.012 0.920 0.000 0.044 0.024
#> SRR1468162 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.7198 0.0179 0.088 0.536 0.004 0.104 0.268
#> SRR1361546 2 0.5791 0.5215 0.112 0.700 0.000 0.068 0.120
#> SRR1486156 2 0.2424 0.7625 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.7821 -0.3499 0.084 0.420 0.000 0.284 0.212
#> SRR615635 2 0.0324 0.8134 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1385411 2 0.6162 0.4464 0.060 0.660 0.000 0.156 0.124
#> SRR1342739 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.4295 0.8328 0.084 0.000 0.780 0.004 0.132
#> SRR662126 2 0.2237 0.7860 0.004 0.904 0.000 0.084 0.008
#> SRR1464601 2 0.0854 0.8151 0.004 0.976 0.000 0.008 0.012
#> SRR1071594 2 0.4666 0.6517 0.036 0.780 0.000 0.104 0.080
#> SRR612539 2 0.4852 0.2964 0.016 0.596 0.000 0.380 0.008
#> SRR602010 2 0.0510 0.8158 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR810249 2 0.0451 0.8136 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR818773 2 0.4094 0.7070 0.116 0.804 0.004 0.004 0.072
#> SRR1336569 2 0.3928 0.5452 0.296 0.700 0.000 0.004 0.000
#> SRR1368117 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1442754 1 0.7420 0.0614 0.576 0.064 0.112 0.040 0.208
#> SRR1334247 2 0.7665 -0.4799 0.112 0.404 0.000 0.120 0.364
#> SRR661639 4 0.3495 0.3734 0.160 0.000 0.000 0.812 0.028
#> SRR613222 2 0.3241 0.7615 0.028 0.856 0.000 0.104 0.012
#> SRR1459937 2 0.1267 0.8147 0.024 0.960 0.000 0.012 0.004
#> SRR2185018 2 0.2329 0.7679 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0932 0.8135 0.004 0.972 0.000 0.020 0.004
#> SRR809348 2 0.2957 0.7689 0.120 0.860 0.008 0.000 0.012
#> SRR819261 5 0.8655 0.3779 0.200 0.148 0.024 0.220 0.408
#> SRR661074 3 0.4295 0.8328 0.084 0.000 0.780 0.004 0.132
#> SRR1349851 2 0.1822 0.8152 0.036 0.936 0.000 0.024 0.004
#> SRR1405123 2 0.3388 0.7437 0.036 0.860 0.000 0.076 0.028
#> SRR661096 2 0.1041 0.8139 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1320225 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.4858 -0.1082 0.772 0.000 0.064 0.064 0.100
#> SRR1307677 2 0.1974 0.8074 0.016 0.932 0.000 0.036 0.016
#> SRR1466512 2 0.0613 0.8141 0.004 0.984 0.000 0.004 0.008
#> SRR658212 2 0.7050 0.1323 0.064 0.552 0.000 0.216 0.168
#> SRR1430525 3 0.6304 0.6405 0.048 0.012 0.472 0.028 0.440
#> SRR1344422 2 0.5160 0.6087 0.056 0.748 0.000 0.116 0.080
#> SRR1353924 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1314832 1 0.7340 0.3132 0.524 0.268 0.020 0.040 0.148
#> SRR1487570 2 0.1442 0.8129 0.032 0.952 0.000 0.012 0.004
#> SRR627431 4 0.4125 0.5496 0.040 0.172 0.000 0.780 0.008
#> SRR1418561 1 0.8982 -0.2003 0.348 0.140 0.080 0.104 0.328
#> SRR1448029 2 0.7065 0.2267 0.064 0.588 0.040 0.064 0.244
#> SRR813802 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR815020 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0865 0.8143 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1435311 2 0.0798 0.8136 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR612395 2 0.1299 0.8161 0.020 0.960 0.000 0.012 0.008
#> SRR603116 2 0.0510 0.8158 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1323152 2 0.7468 0.0758 0.116 0.544 0.016 0.088 0.236
#> SRR1368264 2 0.0162 0.8139 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326624 2 0.3642 0.6512 0.232 0.760 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429265 3 0.2824 0.8374 0.024 0.000 0.880 0.008 0.088
#> SRR1327702 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.4771 0.5169 0.060 0.208 0.000 0.724 0.008
#> SRR1486799 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0451 0.8136 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR815044 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1338560 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR615862 2 0.3770 0.6663 0.016 0.788 0.000 0.188 0.008
#> SRR1480038 2 0.0566 0.8141 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR659436 2 0.7511 -0.0648 0.128 0.520 0.000 0.144 0.208
#> SRR613699 2 0.5874 0.3293 0.032 0.604 0.000 0.304 0.060
#> SRR1436563 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2249 0.7769 0.008 0.896 0.000 0.096 0.000
#> SRR1330327 2 0.1787 0.8107 0.016 0.940 0.000 0.012 0.032
#> SRR1489950 2 0.1278 0.8113 0.004 0.960 0.000 0.020 0.016
#> SRR1431927 2 0.3928 0.5433 0.296 0.700 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100588 5 0.7385 -0.1860 0.176 0.020 0.192 0.056 0.556
#> SRR1444002 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR1318444 2 0.3923 0.7528 0.052 0.832 0.000 0.076 0.040
#> SRR600656 2 0.1267 0.8147 0.024 0.960 0.000 0.012 0.004
#> SRR658766 4 0.7391 0.0230 0.092 0.004 0.152 0.540 0.212
#> SRR655946 2 0.7754 -0.4954 0.124 0.396 0.000 0.120 0.360
#> SRR817282 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.7865 0.4930 0.228 0.016 0.416 0.044 0.296
#> SRR1406418 2 0.2127 0.7785 0.108 0.892 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 2 0.2536 0.7637 0.128 0.868 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444120 2 0.1243 0.8164 0.028 0.960 0.000 0.004 0.008
#> SRR1471965 2 0.2690 0.7453 0.156 0.844 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.7511 -0.0648 0.128 0.520 0.000 0.144 0.208
#> SRR662498 2 0.3146 0.7711 0.040 0.876 0.000 0.028 0.056
#> SRR1376764 5 0.7401 0.3314 0.128 0.320 0.000 0.084 0.468
#> SRR1377006 2 0.7325 0.0518 0.120 0.544 0.000 0.136 0.200
#> SRR656860 2 0.5441 0.2333 0.032 0.572 0.000 0.376 0.020
#> SRR1480547 2 0.2633 0.7733 0.012 0.896 0.000 0.068 0.024
#> SRR1452515 2 0.6289 0.3641 0.176 0.636 0.004 0.032 0.152
#> SRR1324390 2 0.0324 0.8134 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR615273 2 0.7316 -0.1819 0.204 0.476 0.000 0.272 0.048
#> SRR601695 4 0.4199 0.5516 0.040 0.180 0.000 0.772 0.008
#> SRR820907 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR812773 2 0.0162 0.8138 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1472794 2 0.1356 0.8144 0.012 0.956 0.000 0.028 0.004
#> SRR1365448 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR1095720 3 0.4592 0.8318 0.100 0.000 0.756 0.004 0.140
#> SRR1435626 2 0.7149 0.1120 0.124 0.560 0.000 0.108 0.208
#> SRR1080766 2 0.0000 0.8130 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 2 0.2020 0.7835 0.100 0.900 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 5 0.6987 0.4379 0.080 0.176 0.076 0.040 0.628
#> SRR1467966 5 0.8856 0.3158 0.220 0.248 0.036 0.124 0.372
#> SRR1320579 5 0.8391 0.3188 0.316 0.216 0.004 0.132 0.332
#> SRR1319710 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326604 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098879 3 0.6529 0.5769 0.036 0.044 0.488 0.020 0.412
#> SRR662245 2 0.8119 -0.4746 0.080 0.392 0.008 0.240 0.280
#> SRR1074719 2 0.0290 0.8143 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR816226 2 0.2086 0.8084 0.048 0.924 0.000 0.020 0.008
#> SRR601387 4 0.4508 0.4743 0.032 0.256 0.000 0.708 0.004
#> SRR614575 2 0.3697 0.6783 0.016 0.796 0.000 0.180 0.008
#> SRR1353900 2 0.2472 0.7855 0.012 0.908 0.000 0.044 0.036
#> SRR662906 5 0.6363 -0.0133 0.036 0.044 0.012 0.416 0.492
#> SRR1350832 2 0.6898 0.2048 0.064 0.576 0.000 0.192 0.168
#> SRR1403280 2 0.1059 0.8128 0.004 0.968 0.000 0.020 0.008
#> SRR1313969 2 0.1267 0.8147 0.024 0.960 0.000 0.012 0.004
#> SRR1388528 1 0.6142 0.3445 0.512 0.396 0.000 0.032 0.060
#> SRR1452912 2 0.2329 0.7678 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.1121 0.8090 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.1498 0.8388 0.008 0.000 0.952 0.016 0.024
#> SRR1319753 2 0.0566 0.8150 0.012 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR818901 5 0.7033 0.4446 0.076 0.196 0.072 0.040 0.616
#> SRR607067 4 0.4429 0.4780 0.028 0.256 0.000 0.712 0.004
#> SRR1391420 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4540 0.6608 0.036 0.784 0.000 0.124 0.056
#> SRR661961 1 0.7210 0.2157 0.424 0.384 0.000 0.052 0.140
#> SRR658259 2 0.0798 0.8142 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1310476 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1365034 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478053 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1475300 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1328101 2 0.0162 0.8138 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322900 2 0.1502 0.8080 0.056 0.940 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309942 2 0.1278 0.8113 0.004 0.960 0.000 0.020 0.016
#> SRR1345760 2 0.1267 0.8147 0.024 0.960 0.000 0.012 0.004
#> SRR1435418 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.2564 0.7933 0.024 0.904 0.000 0.052 0.020
#> SRR1443436 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1646 0.8107 0.004 0.944 0.000 0.032 0.020
#> SRR661469 2 0.0798 0.8164 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000
#> SRR1500323 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.8130 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.6903 0.2052 0.120 0.588 0.000 0.096 0.196
#> SRR1350435 2 0.3642 0.6512 0.232 0.760 0.000 0.000 0.008
#> SRR1389177 2 0.7667 -0.4931 0.112 0.400 0.000 0.120 0.368
#> SRR1368072 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR601815 4 0.4305 0.5332 0.036 0.216 0.000 0.744 0.004
#> SRR613330 2 0.2563 0.7669 0.120 0.872 0.000 0.008 0.000
#> SRR1434502 2 0.2436 0.7969 0.036 0.912 0.000 0.032 0.020
#> SRR1394190 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 2 0.2329 0.7678 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.6133 0.4122 0.056 0.652 0.004 0.076 0.212
#> SRR1318839 3 0.1267 0.8373 0.004 0.000 0.960 0.012 0.024
#> SRR1432390 2 0.1074 0.8151 0.016 0.968 0.000 0.012 0.004
#> SRR613126 2 0.6482 0.2609 0.048 0.572 0.000 0.288 0.092
#> SRR1089424 2 0.0404 0.8149 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1347214 2 0.0740 0.8139 0.004 0.980 0.000 0.008 0.008
#> SRR1309556 2 0.3091 0.7756 0.044 0.880 0.000 0.032 0.044
#> SRR1456027 2 0.1082 0.8139 0.028 0.964 0.000 0.008 0.000
#> SRR1400551 1 0.7162 0.2266 0.416 0.396 0.000 0.048 0.140
#> SRR1320469 1 0.3920 0.3685 0.768 0.212 0.004 0.008 0.008
#> SRR614251 4 0.4750 0.5297 0.052 0.208 0.000 0.728 0.012
#> SRR1454310 2 0.0404 0.8143 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR615105 2 0.6629 0.2203 0.048 0.556 0.000 0.292 0.104
#> SRR1433290 5 0.6597 0.2244 0.076 0.088 0.116 0.044 0.676
#> SRR2166064 2 0.3346 0.7534 0.036 0.856 0.000 0.092 0.016
#> SRR601671 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR663874 2 0.0609 0.8162 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1409130 5 0.6489 0.0672 0.024 0.104 0.000 0.392 0.480
#> SRR659696 2 0.0290 0.8139 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1408249 2 0.0833 0.8132 0.004 0.976 0.000 0.004 0.016
#> SRR663284 2 0.5071 0.6089 0.044 0.744 0.000 0.148 0.064
#> SRR1402794 5 0.8991 0.3633 0.172 0.244 0.052 0.144 0.388
#> SRR614852 4 0.3552 0.4941 0.044 0.096 0.000 0.844 0.016
#> SRR1348040 2 0.0771 0.8142 0.020 0.976 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489610 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488091 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1499566 2 0.0324 0.8134 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1361480 2 0.0324 0.8138 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444501 5 0.6813 -0.3885 0.024 0.076 0.412 0.024 0.464
#> SRR1415773 2 0.0451 0.8151 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1388832 1 0.7165 0.3107 0.500 0.312 0.004 0.052 0.132
#> SRR1394637 2 0.5193 -0.2651 0.480 0.484 0.000 0.004 0.032
#> SRR606974 4 0.4125 0.5496 0.040 0.172 0.000 0.780 0.008
#> SRR662918 2 0.2804 0.7706 0.012 0.880 0.000 0.092 0.016
#> SRR817421 3 0.1569 0.8358 0.008 0.000 0.948 0.012 0.032
#> SRR1400823 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR608264 5 0.7717 -0.0581 0.052 0.040 0.176 0.196 0.536
#> SRR1318560 1 0.7436 0.2172 0.572 0.172 0.044 0.044 0.168
#> SRR1454117 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312684 2 0.3003 0.7197 0.188 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.6780 -0.2744 0.112 0.444 0.000 0.408 0.036
#> SRR1432743 5 0.7493 0.4197 0.116 0.252 0.004 0.112 0.516
#> SRR1388873 2 0.1018 0.8126 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1353517 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.7198 0.0362 0.088 0.536 0.004 0.104 0.268
#> SRR1406008 2 0.0486 0.8152 0.004 0.988 0.000 0.004 0.004
#> SRR1396786 2 0.1471 0.8084 0.004 0.952 0.000 0.024 0.020
#> SRR1446564 2 0.2125 0.8109 0.052 0.920 0.000 0.024 0.004
#> SRR1318465 2 0.7659 -0.4594 0.112 0.412 0.000 0.120 0.356
#> SRR1431083 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0404 0.8154 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR655170 2 0.3314 0.7489 0.020 0.852 0.000 0.108 0.020
#> SRR1087825 2 0.1200 0.8156 0.016 0.964 0.000 0.012 0.008
#> SRR662019 1 0.7127 0.2678 0.512 0.288 0.004 0.044 0.152
#> SRR1349209 2 0.4647 0.6650 0.044 0.784 0.000 0.100 0.072
#> SRR1326161 2 0.5937 0.4719 0.052 0.664 0.000 0.200 0.084
#> SRR1345284 2 0.0290 0.8140 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416672 2 0.2561 0.7530 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.4754 0.3436 0.028 0.316 0.000 0.652 0.004
#> SRR1454328 2 0.1173 0.8129 0.004 0.964 0.000 0.012 0.020
#> SRR1489286 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR1092349 2 0.0451 0.8153 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408183 5 0.8901 0.3337 0.168 0.268 0.052 0.124 0.388
#> SRR1084369 2 0.7739 -0.4142 0.132 0.428 0.000 0.116 0.324
#> SRR598452 3 0.2859 0.8455 0.036 0.000 0.888 0.016 0.060
#> SRR660709 2 0.6028 0.2942 0.048 0.584 0.000 0.320 0.048
#> SRR809444 2 0.2787 0.7583 0.136 0.856 0.004 0.000 0.004
#> SRR1089901 2 0.1211 0.8119 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR1375774 2 0.1270 0.8070 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.4858 -0.1082 0.772 0.000 0.064 0.064 0.100
#> SRR657139 4 0.3634 0.3584 0.136 0.000 0.004 0.820 0.040
#> SRR1440744 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353555 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 2 0.2127 0.7785 0.108 0.892 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.4208 0.7113 0.044 0.812 0.000 0.096 0.048
#> SRR1381775 2 0.0451 0.8153 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363908 2 0.2516 0.7589 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.1267 0.8100 0.004 0.960 0.000 0.024 0.012
#> SRR658989 2 0.7533 -0.0833 0.128 0.516 0.000 0.144 0.212
#> SRR1353663 1 0.4397 0.3403 0.564 0.432 0.000 0.004 0.000
#> SRR811771 2 0.2329 0.7679 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 2 0.2424 0.7625 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.1186 0.8366 0.008 0.000 0.964 0.008 0.020
#> SRR819054 2 0.2095 0.7956 0.012 0.920 0.000 0.060 0.008
#> SRR1367988 2 0.1267 0.8147 0.024 0.960 0.000 0.012 0.004
#> SRR1331922 2 0.1270 0.8070 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.5445 0.0573 0.032 0.532 0.000 0.420 0.016
#> SRR1375796 2 0.3262 0.7513 0.020 0.856 0.000 0.104 0.020
#> SRR1386991 2 0.2700 0.7717 0.024 0.884 0.000 0.004 0.088
#> SRR1355217 2 0.5698 0.5245 0.104 0.708 0.000 0.068 0.120
#> SRR1356290 2 0.6876 0.2023 0.060 0.576 0.000 0.184 0.180
#> SRR659507 2 0.0693 0.8158 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR663296 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR598044 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR661155 2 0.3346 0.7534 0.036 0.856 0.000 0.092 0.016
#> SRR1414727 2 0.6808 0.0439 0.252 0.556 0.004 0.032 0.156
#> SRR663477 2 0.3642 0.6512 0.232 0.760 0.000 0.000 0.008
#> SRR1354489 5 0.7892 0.2373 0.132 0.360 0.000 0.132 0.376
#> SRR1377800 1 0.7993 0.0220 0.468 0.212 0.028 0.056 0.236
#> SRR614611 4 0.3339 0.5225 0.040 0.124 0.000 0.836 0.000
#> SRR655052 2 0.1787 0.8097 0.016 0.940 0.000 0.032 0.012
#> SRR1478968 2 0.1442 0.8127 0.032 0.952 0.000 0.012 0.004
#> SRR1351280 2 0.1413 0.8093 0.012 0.956 0.000 0.020 0.012
#> SRR613951 2 0.1597 0.8155 0.020 0.948 0.000 0.024 0.008
#> SRR1418022 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.7391 0.0230 0.092 0.004 0.152 0.540 0.212
#> SRR1408161 2 0.2424 0.7625 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 5 0.7974 0.1265 0.180 0.036 0.036 0.364 0.384
#> SRR655040 2 0.4347 0.5426 0.012 0.712 0.000 0.264 0.012
#> SRR810225 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1325377 2 0.0404 0.8149 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR617829 2 0.8201 -0.5158 0.120 0.368 0.000 0.252 0.260
#> SRR1402328 2 0.0451 0.8142 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1480455 2 0.7701 -0.2807 0.084 0.460 0.000 0.228 0.228
#> SRR1442104 3 0.4023 0.8055 0.076 0.000 0.816 0.016 0.092
#> SRR1453416 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR1481396 3 0.7476 0.5577 0.184 0.008 0.468 0.044 0.296
#> SRR1414314 2 0.0000 0.8130 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.5441 0.2333 0.032 0.572 0.000 0.376 0.020
#> SRR1478386 2 0.0451 0.8136 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1458683 1 0.6839 -0.0973 0.604 0.016 0.052 0.112 0.216
#> SRR1370572 2 0.2329 0.7678 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 2 0.2329 0.7678 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.1799 0.8135 0.028 0.940 0.000 0.012 0.020
#> SRR1310735 2 0.2329 0.7678 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.1267 0.8147 0.024 0.960 0.000 0.012 0.004
#> SRR660260 2 0.2839 0.7976 0.036 0.892 0.000 0.048 0.024
#> SRR1071231 2 0.0324 0.8134 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1459125 2 0.0865 0.8151 0.024 0.972 0.000 0.004 0.000
#> SRR1337173 2 0.7140 0.1264 0.100 0.564 0.000 0.144 0.192
#> SRR1396250 3 0.1498 0.8383 0.024 0.000 0.952 0.008 0.016
#> SRR2166376 3 0.4592 0.8318 0.100 0.000 0.756 0.004 0.140
#> SRR659816 2 0.6133 0.2837 0.048 0.580 0.000 0.316 0.056
#> SRR1401379 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR600981 2 0.3794 0.7300 0.036 0.828 0.000 0.112 0.024
#> SRR1398335 2 0.3949 0.5364 0.300 0.696 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397218 2 0.0854 0.8157 0.004 0.976 0.000 0.012 0.008
#> SRR660115 2 0.3631 0.7331 0.104 0.824 0.000 0.072 0.000
#> SRR1407950 2 0.6755 0.2342 0.060 0.592 0.000 0.184 0.164
#> SRR1359780 2 0.0898 0.8156 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1490037 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397156 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0566 0.8139 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1319648 2 0.4540 0.6608 0.036 0.784 0.000 0.124 0.056
#> SRR1092985 1 0.4658 0.3389 0.556 0.432 0.000 0.008 0.004
#> SRR656409 2 0.5390 -0.1156 0.032 0.504 0.000 0.452 0.012
#> SRR1468658 2 0.7891 -0.2921 0.164 0.452 0.000 0.132 0.252
#> SRR1390437 2 0.1095 0.8163 0.012 0.968 0.000 0.008 0.012
#> SRR658057 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612635 4 0.4703 0.4281 0.036 0.276 0.000 0.684 0.004
#> SRR1351480 2 0.2551 0.7851 0.012 0.904 0.000 0.044 0.040
#> SRR1436651 2 0.2329 0.7678 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 2 0.2112 0.7968 0.084 0.908 0.000 0.004 0.004
#> SRR659590 2 0.0324 0.8134 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR614263 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0613 0.8141 0.004 0.984 0.000 0.004 0.008
#> SRR659911 2 0.6751 0.1654 0.044 0.548 0.000 0.280 0.128
#> SRR1085519 3 0.5587 0.7006 0.032 0.008 0.544 0.012 0.404
#> SRR1345894 2 0.6742 0.2959 0.124 0.612 0.004 0.072 0.188
#> SRR1442928 2 0.2731 0.7592 0.016 0.876 0.000 0.004 0.104
#> SRR1464681 2 0.0854 0.8154 0.012 0.976 0.000 0.008 0.004
#> SRR1418880 1 0.4702 0.2602 0.512 0.476 0.000 0.004 0.008
#> SRR1309070 2 0.7312 0.0217 0.116 0.540 0.000 0.128 0.216
#> SRR1365426 2 0.0290 0.8142 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.7407 0.0815 0.580 0.076 0.096 0.040 0.208
#> SRR659708 4 0.3634 0.3584 0.136 0.000 0.004 0.820 0.040
#> SRR603236 2 0.5683 0.5011 0.052 0.688 0.000 0.072 0.188
#> SRR660673 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR663807 2 0.1365 0.8111 0.004 0.952 0.000 0.040 0.004
#> SRR1087245 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339108 2 0.0451 0.8139 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR613426 2 0.3002 0.7929 0.068 0.876 0.000 0.048 0.008
#> SRR613879 4 0.5317 0.1113 0.028 0.448 0.000 0.512 0.012
#> SRR1385101 2 0.1341 0.8050 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.2472 0.7855 0.012 0.908 0.000 0.044 0.036
#> SRR1458852 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430489 2 0.1731 0.8037 0.060 0.932 0.000 0.004 0.004
#> SRR1349231 2 0.1121 0.8090 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.1498 0.8383 0.024 0.000 0.952 0.008 0.016
#> SRR1321987 2 0.0579 0.8138 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR662653 2 0.4700 0.4681 0.016 0.676 0.000 0.292 0.016
#> SRR1390027 2 0.2516 0.7569 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.7899 -0.6038 0.072 0.352 0.000 0.260 0.316
#> SRR1383081 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2166960 2 0.2095 0.7956 0.012 0.920 0.000 0.060 0.008
#> SRR605101 2 0.0703 0.8158 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR818600 2 0.2846 0.7707 0.012 0.884 0.000 0.076 0.028
#> SRR1367715 2 0.0324 0.8136 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1351979 3 0.1569 0.8363 0.012 0.000 0.948 0.008 0.032
#> SRR1387054 2 0.7754 -0.4954 0.124 0.396 0.000 0.120 0.360
#> SRR1444306 5 0.7520 0.3255 0.120 0.320 0.004 0.088 0.468
#> SRR1322662 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.2899 0.7643 0.020 0.872 0.000 0.100 0.008
#> SRR612767 2 0.3904 0.6258 0.012 0.764 0.000 0.216 0.008
#> SRR1489030 2 0.0324 0.8134 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1430375 2 0.1041 0.8130 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR615225 2 0.3843 0.7277 0.036 0.824 0.000 0.116 0.024
#> SRR1401839 2 0.2095 0.8094 0.028 0.928 0.000 0.020 0.024
#> SRR1379110 2 0.0404 0.8138 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077288 3 0.4295 0.8328 0.084 0.000 0.780 0.004 0.132
#> SRR1331639 2 0.1074 0.8151 0.016 0.968 0.000 0.012 0.004
#> SRR1342782 2 0.0290 0.8142 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443003 5 0.7395 0.3146 0.120 0.328 0.000 0.088 0.464
#> SRR612839 1 0.4422 0.4531 0.664 0.320 0.000 0.012 0.004
#> SRR1470093 1 0.8605 -0.2667 0.388 0.136 0.036 0.128 0.312
#> SRR1395742 2 0.2471 0.7595 0.136 0.864 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 2 0.2536 0.7637 0.128 0.868 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387222 2 0.7728 -0.5041 0.116 0.392 0.000 0.124 0.368
#> SRR664063 2 0.0613 0.8161 0.004 0.984 0.000 0.008 0.004
#> SRR1488214 2 0.2127 0.7790 0.108 0.892 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.1267 0.8147 0.024 0.960 0.000 0.012 0.004
#> SRR1320321 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071955 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 2 0.2377 0.7647 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0162 0.8131 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488470 2 0.2403 0.7792 0.012 0.904 0.000 0.072 0.012
#> SRR1389497 3 0.5993 0.6582 0.024 0.004 0.516 0.048 0.408
#> SRR1367109 2 0.5445 0.5625 0.068 0.728 0.000 0.084 0.120
#> SRR615311 2 0.2286 0.7777 0.108 0.888 0.000 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.0547 0.786377 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 2 0.4114 0.670299 0.196 0.732 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR613282 2 0.3271 0.689056 0.232 0.760 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355396 2 0.3014 0.724612 0.184 0.804 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.6175 0.344632 0.520 0.172 0.284 0.000 0.012 0.012
#> SRR1074359 2 0.4045 0.627816 0.012 0.768 0.176 0.000 0.012 0.032
#> SRR1419258 4 0.3755 0.581374 0.004 0.000 0.020 0.732 0.244 0.000
#> SRR1403366 1 0.6746 0.171213 0.552 0.040 0.264 0.084 0.052 0.008
#> SRR665262 2 0.1434 0.789335 0.012 0.948 0.028 0.000 0.000 0.012
#> SRR1499740 2 0.2454 0.775981 0.088 0.884 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1105057 2 0.0777 0.785990 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR1439742 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR614599 2 0.7363 -0.385709 0.172 0.396 0.132 0.000 0.004 0.296
#> SRR612215 6 0.5114 -0.000835 0.004 0.468 0.056 0.000 0.004 0.468
#> SRR1094051 2 0.3151 0.676595 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 2 0.3189 0.687748 0.236 0.760 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.6272 0.429775 0.608 0.100 0.224 0.028 0.024 0.016
#> SRR1409263 4 0.4522 0.675896 0.056 0.000 0.064 0.764 0.112 0.004
#> SRR1431288 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.5445 0.426112 0.028 0.680 0.168 0.000 0.020 0.104
#> SRR614839 6 0.4102 0.494626 0.012 0.156 0.052 0.000 0.008 0.772
#> SRR658433 2 0.1320 0.781214 0.000 0.948 0.016 0.000 0.000 0.036
#> SRR1088581 1 0.7953 -0.072563 0.424 0.084 0.236 0.012 0.200 0.044
#> SRR1328797 4 0.3755 0.581374 0.004 0.000 0.020 0.732 0.244 0.000
#> SRR1334512 2 0.3306 0.691770 0.004 0.840 0.096 0.000 0.012 0.048
#> SRR1471117 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311553 2 0.3050 0.689604 0.236 0.764 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.6544 0.474800 0.092 0.280 0.544 0.000 0.036 0.048
#> SRR654802 4 0.5871 0.432796 0.012 0.000 0.044 0.604 0.256 0.084
#> SRR660066 2 0.1461 0.779164 0.000 0.940 0.016 0.000 0.000 0.044
#> SRR1447103 2 0.1679 0.789087 0.028 0.936 0.028 0.000 0.000 0.008
#> SRR1402153 3 0.7231 0.507688 0.048 0.300 0.420 0.000 0.204 0.028
#> SRR655887 2 0.2503 0.745749 0.008 0.896 0.060 0.000 0.012 0.024
#> SRR1408529 3 0.6801 0.217549 0.028 0.140 0.568 0.008 0.200 0.056
#> SRR658707 6 0.3789 0.071021 0.112 0.000 0.024 0.000 0.060 0.804
#> SRR1384371 2 0.4906 0.457235 0.004 0.704 0.192 0.000 0.032 0.068
#> SRR1074670 3 0.8248 -0.014953 0.124 0.096 0.484 0.032 0.116 0.148
#> SRR1375439 2 0.4175 0.572589 0.028 0.724 0.232 0.000 0.004 0.012
#> SRR1329003 1 0.5425 -0.071659 0.676 0.000 0.048 0.056 0.200 0.020
#> SRR1404837 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317920 2 0.2357 0.762907 0.116 0.872 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.8175 -0.211299 0.388 0.032 0.280 0.096 0.176 0.028
#> SRR613999 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 2 0.3163 0.690990 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 2 0.3151 0.676595 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.8172 -0.333654 0.104 0.024 0.408 0.048 0.136 0.280
#> SRR1068855 1 0.5452 0.324855 0.592 0.316 0.032 0.000 0.008 0.052
#> SRR1375509 4 0.4492 0.678496 0.060 0.000 0.064 0.768 0.104 0.004
#> SRR612227 3 0.7139 0.357778 0.068 0.164 0.576 0.016 0.056 0.120
#> SRR1388809 2 0.1152 0.786261 0.000 0.952 0.044 0.000 0.004 0.000
#> SRR1413872 2 0.2239 0.784614 0.028 0.912 0.040 0.000 0.004 0.016
#> SRR1452864 2 0.3541 0.661364 0.260 0.728 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.5977 0.409164 0.060 0.400 0.484 0.000 0.008 0.048
#> SRR615814 2 0.5510 0.274204 0.000 0.616 0.176 0.000 0.016 0.192
#> SRR1325225 2 0.2329 0.782600 0.048 0.904 0.036 0.000 0.004 0.008
#> SRR1313687 2 0.4169 0.601933 0.012 0.776 0.140 0.000 0.012 0.060
#> SRR1358220 2 0.0935 0.785239 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487746 2 0.3287 0.698797 0.220 0.768 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 2 0.3151 0.676595 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0622 0.788275 0.012 0.980 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0508 0.788478 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR815783 2 0.1906 0.773233 0.000 0.924 0.036 0.000 0.008 0.032
#> SRR809595 2 0.1914 0.782484 0.016 0.920 0.056 0.000 0.000 0.008
#> SRR1403133 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0665 0.789208 0.008 0.980 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1344382 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.5682 -0.323900 0.032 0.480 0.428 0.000 0.008 0.052
#> SRR1478362 2 0.0976 0.790099 0.008 0.968 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1392186 2 0.1261 0.781979 0.004 0.956 0.028 0.000 0.004 0.008
#> SRR1347937 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 2 0.3190 0.700096 0.220 0.772 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 2 0.3732 0.686411 0.228 0.744 0.024 0.004 0.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.6266 -0.421275 0.032 0.460 0.408 0.000 0.028 0.072
#> SRR612683 2 0.0909 0.787897 0.000 0.968 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR1392901 2 0.5789 0.075714 0.020 0.572 0.320 0.000 0.044 0.044
#> SRR1077805 3 0.6745 0.472282 0.032 0.408 0.416 0.000 0.100 0.044
#> SRR1360402 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.6548 0.481578 0.088 0.276 0.548 0.000 0.040 0.048
#> SRR1355352 1 0.6096 0.446618 0.636 0.136 0.164 0.020 0.036 0.008
#> SRR656247 2 0.2492 0.770981 0.100 0.876 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR813656 2 0.3455 0.698177 0.012 0.832 0.068 0.000 0.004 0.084
#> SRR808244 1 0.5425 -0.071659 0.676 0.000 0.048 0.056 0.200 0.020
#> SRR1387240 2 0.0260 0.785963 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 2 0.3833 0.679163 0.232 0.736 0.028 0.004 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.1737 0.787426 0.040 0.932 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1435248 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.7256 -0.126293 0.212 0.480 0.228 0.016 0.020 0.044
#> SRR1408682 2 0.0436 0.787784 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317134 2 0.3151 0.676595 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.1082 0.785579 0.004 0.956 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR603164 3 0.7283 0.418924 0.020 0.248 0.500 0.012 0.088 0.132
#> SRR1383259 2 0.1917 0.784851 0.016 0.928 0.036 0.000 0.004 0.016
#> SRR1330854 1 0.6658 0.152621 0.560 0.032 0.256 0.096 0.048 0.008
#> SRR1452423 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.2610 0.744335 0.004 0.880 0.088 0.000 0.012 0.016
#> SRR1468162 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.6116 0.390091 0.028 0.428 0.456 0.000 0.040 0.048
#> SRR1361546 2 0.5365 0.345233 0.056 0.632 0.272 0.000 0.024 0.016
#> SRR1486156 2 0.3101 0.684277 0.244 0.756 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.7807 -0.609928 0.020 0.348 0.300 0.000 0.140 0.192
#> SRR615635 2 0.0146 0.785428 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.6507 0.070389 0.028 0.564 0.240 0.000 0.048 0.120
#> SRR1342739 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 4 0.4537 0.676974 0.060 0.000 0.064 0.764 0.108 0.004
#> SRR662126 2 0.2383 0.739166 0.000 0.880 0.024 0.000 0.000 0.096
#> SRR1464601 2 0.1168 0.783304 0.000 0.956 0.028 0.000 0.000 0.016
#> SRR1071594 2 0.4699 0.501952 0.004 0.728 0.172 0.000 0.032 0.064
#> SRR612539 2 0.5040 0.120940 0.008 0.552 0.060 0.000 0.000 0.380
#> SRR602010 2 0.0508 0.788292 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR810249 2 0.0363 0.785395 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR818773 2 0.4423 0.656923 0.136 0.744 0.108 0.000 0.008 0.004
#> SRR1336569 2 0.4284 0.412721 0.392 0.588 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368117 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.6658 0.152621 0.560 0.032 0.256 0.096 0.048 0.008
#> SRR1334247 3 0.7019 0.523935 0.032 0.320 0.456 0.000 0.144 0.048
#> SRR661639 6 0.3789 0.071021 0.112 0.000 0.024 0.000 0.060 0.804
#> SRR613222 2 0.3780 0.687421 0.020 0.812 0.068 0.000 0.004 0.096
#> SRR1459937 2 0.2077 0.785268 0.032 0.920 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR2185018 2 0.3163 0.693000 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0964 0.784206 0.004 0.968 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR809348 2 0.3758 0.682034 0.232 0.740 0.024 0.004 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.8248 -0.014953 0.124 0.096 0.484 0.032 0.116 0.148
#> SRR661074 4 0.4537 0.676974 0.060 0.000 0.064 0.764 0.108 0.004
#> SRR1349851 2 0.2555 0.782279 0.064 0.888 0.032 0.000 0.000 0.016
#> SRR1405123 2 0.3848 0.660178 0.020 0.812 0.104 0.000 0.012 0.052
#> SRR661096 2 0.1245 0.782312 0.000 0.952 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1320225 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.5425 -0.071659 0.676 0.000 0.048 0.056 0.200 0.020
#> SRR1307677 2 0.2329 0.772523 0.004 0.904 0.056 0.000 0.012 0.024
#> SRR1466512 2 0.0508 0.786481 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004 0.000
#> SRR658212 2 0.7146 -0.371517 0.016 0.460 0.288 0.000 0.092 0.144
#> SRR1430525 5 0.5860 -0.058532 0.004 0.008 0.132 0.384 0.472 0.000
#> SRR1344422 2 0.5617 0.377653 0.040 0.644 0.220 0.000 0.012 0.084
#> SRR1353924 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.6253 0.371731 0.528 0.164 0.280 0.012 0.008 0.008
#> SRR1487570 2 0.2384 0.781622 0.056 0.900 0.032 0.000 0.004 0.008
#> SRR627431 6 0.3220 0.433282 0.004 0.108 0.056 0.000 0.000 0.832
#> SRR1418561 3 0.7651 -0.007750 0.272 0.084 0.484 0.076 0.056 0.028
#> SRR1448029 2 0.6313 -0.076064 0.032 0.528 0.348 0.024 0.044 0.024
#> SRR813802 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR815020 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0858 0.785161 0.000 0.968 0.028 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435311 2 0.1080 0.784100 0.000 0.960 0.032 0.000 0.004 0.004
#> SRR612395 2 0.1679 0.789087 0.028 0.936 0.028 0.000 0.000 0.008
#> SRR603116 2 0.0508 0.788292 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1323152 2 0.6632 -0.383458 0.072 0.452 0.400 0.012 0.032 0.032
#> SRR1368264 2 0.0508 0.788346 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326624 2 0.4002 0.562760 0.320 0.660 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 4 0.3072 0.676721 0.024 0.000 0.084 0.856 0.036 0.000
#> SRR1327702 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.4364 0.485018 0.024 0.164 0.048 0.000 0.008 0.756
#> SRR1486799 2 0.3215 0.686705 0.240 0.756 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0458 0.786914 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.3997 0.570291 0.004 0.736 0.044 0.000 0.000 0.216
#> SRR1480038 2 0.0436 0.786187 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR659436 3 0.5923 0.429971 0.028 0.412 0.476 0.000 0.012 0.072
#> SRR613699 2 0.6104 -0.037181 0.016 0.524 0.156 0.000 0.008 0.296
#> SRR1436563 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2264 0.757812 0.004 0.888 0.012 0.000 0.000 0.096
#> SRR1330327 2 0.1976 0.783678 0.016 0.916 0.060 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489950 2 0.1194 0.782239 0.000 0.956 0.032 0.000 0.004 0.008
#> SRR1431927 2 0.4293 0.403198 0.396 0.584 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1100588 3 0.7794 -0.456980 0.132 0.012 0.432 0.188 0.220 0.016
#> SRR1444002 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318444 2 0.4550 0.663917 0.060 0.760 0.120 0.000 0.004 0.056
#> SRR600656 2 0.2077 0.785268 0.032 0.920 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR658766 6 0.7878 -0.325185 0.060 0.004 0.176 0.128 0.164 0.468
#> SRR655946 3 0.7168 0.523735 0.048 0.300 0.460 0.000 0.148 0.044
#> SRR817282 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 4 0.7951 0.173766 0.176 0.008 0.232 0.400 0.164 0.020
#> SRR1406418 2 0.3287 0.698797 0.220 0.768 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 2 0.3189 0.687748 0.236 0.760 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.2009 0.786858 0.040 0.916 0.040 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471965 2 0.3360 0.660494 0.264 0.732 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.5923 0.429971 0.028 0.412 0.476 0.000 0.012 0.072
#> SRR662498 2 0.3795 0.697780 0.032 0.808 0.124 0.000 0.008 0.028
#> SRR1376764 3 0.7013 0.492712 0.048 0.244 0.468 0.000 0.220 0.020
#> SRR1377006 2 0.6302 -0.467274 0.040 0.440 0.428 0.000 0.028 0.064
#> SRR656860 2 0.5675 -0.085870 0.008 0.516 0.100 0.000 0.008 0.368
#> SRR1480547 2 0.3336 0.694652 0.004 0.836 0.104 0.000 0.012 0.044
#> SRR1452515 2 0.6010 0.189750 0.180 0.564 0.232 0.000 0.012 0.012
#> SRR1324390 2 0.0146 0.785428 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR615273 2 0.7363 -0.369423 0.184 0.404 0.128 0.000 0.004 0.280
#> SRR601695 6 0.3248 0.446772 0.004 0.116 0.052 0.000 0.000 0.828
#> SRR820907 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812773 2 0.0622 0.788275 0.012 0.980 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0458 0.787138 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.1495 0.784277 0.008 0.948 0.020 0.000 0.004 0.020
#> SRR1365448 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095720 4 0.4958 0.665965 0.072 0.000 0.060 0.732 0.128 0.008
#> SRR1435626 2 0.5954 -0.413291 0.056 0.448 0.440 0.000 0.008 0.048
#> SRR1080766 2 0.0260 0.785963 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 2 0.3141 0.712687 0.200 0.788 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.7578 -0.038588 0.044 0.140 0.416 0.064 0.328 0.008
#> SRR1467966 3 0.7520 0.349554 0.112 0.172 0.548 0.032 0.088 0.048
#> SRR1320579 3 0.8225 0.224806 0.220 0.164 0.376 0.004 0.192 0.044
#> SRR1319710 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098879 5 0.6340 -0.035509 0.004 0.028 0.148 0.404 0.416 0.000
#> SRR662245 3 0.7936 0.367745 0.024 0.324 0.336 0.004 0.168 0.144
#> SRR1074719 2 0.0547 0.786377 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR816226 2 0.2847 0.774910 0.076 0.872 0.036 0.000 0.004 0.012
#> SRR601387 6 0.3823 0.498387 0.004 0.192 0.044 0.000 0.000 0.760
#> SRR614575 2 0.3941 0.585379 0.004 0.744 0.044 0.000 0.000 0.208
#> SRR1353900 2 0.2803 0.738252 0.004 0.868 0.096 0.000 0.016 0.016
#> SRR662906 5 0.7171 0.439520 0.012 0.032 0.208 0.016 0.416 0.316
#> SRR1350832 2 0.6970 -0.285377 0.016 0.492 0.276 0.000 0.092 0.124
#> SRR1403280 2 0.1232 0.782892 0.004 0.956 0.024 0.000 0.000 0.016
#> SRR1313969 2 0.2077 0.785268 0.032 0.920 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR1388528 1 0.5839 0.358978 0.552 0.256 0.180 0.000 0.004 0.008
#> SRR1452912 2 0.3163 0.690990 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.1802 0.780866 0.072 0.916 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 4 0.1176 0.688191 0.000 0.000 0.020 0.956 0.024 0.000
#> SRR1319753 2 0.0806 0.789993 0.020 0.972 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.7682 0.070253 0.044 0.160 0.404 0.056 0.324 0.012
#> SRR607067 6 0.3683 0.500637 0.000 0.192 0.044 0.000 0.000 0.764
#> SRR1391420 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.5001 0.497103 0.028 0.716 0.156 0.000 0.012 0.088
#> SRR661961 1 0.6717 0.041484 0.412 0.300 0.256 0.000 0.008 0.024
#> SRR658259 2 0.0891 0.784022 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000 0.008
#> SRR1310476 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0146 0.786728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0622 0.788275 0.012 0.980 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322900 2 0.2454 0.775981 0.088 0.884 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309942 2 0.1194 0.782239 0.000 0.956 0.032 0.000 0.004 0.008
#> SRR1345760 2 0.2001 0.786256 0.032 0.924 0.028 0.000 0.004 0.012
#> SRR1435418 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.2639 0.742466 0.008 0.880 0.064 0.000 0.000 0.048
#> SRR1443436 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1780 0.775108 0.004 0.932 0.024 0.000 0.004 0.036
#> SRR661469 2 0.1036 0.789830 0.008 0.964 0.024 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500323 2 0.0405 0.787115 0.000 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1356705 2 0.0520 0.787583 0.008 0.984 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.5934 -0.289067 0.056 0.484 0.404 0.000 0.008 0.048
#> SRR1350435 2 0.4002 0.562760 0.320 0.660 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.7069 0.525953 0.032 0.320 0.448 0.000 0.152 0.048
#> SRR1368072 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR601815 6 0.3485 0.492403 0.004 0.152 0.044 0.000 0.000 0.800
#> SRR613330 2 0.3271 0.689056 0.232 0.760 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1434502 2 0.2785 0.755505 0.028 0.876 0.068 0.000 0.000 0.028
#> SRR1394190 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 2 0.3163 0.690990 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.5675 0.008757 0.032 0.548 0.360 0.000 0.024 0.036
#> SRR1318839 4 0.1297 0.683849 0.000 0.000 0.012 0.948 0.040 0.000
#> SRR1432390 2 0.2001 0.785547 0.028 0.924 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR613126 2 0.6748 -0.180623 0.012 0.488 0.192 0.000 0.044 0.264
#> SRR1089424 2 0.0508 0.786853 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347214 2 0.0632 0.786458 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.3171 0.727861 0.028 0.844 0.104 0.000 0.000 0.024
#> SRR1456027 2 0.2071 0.784879 0.044 0.916 0.028 0.000 0.000 0.012
#> SRR1400551 1 0.6615 0.021879 0.404 0.308 0.264 0.000 0.008 0.016
#> SRR1320469 1 0.3671 0.498730 0.820 0.104 0.044 0.004 0.028 0.000
#> SRR614251 6 0.4102 0.494626 0.012 0.156 0.052 0.000 0.008 0.772
#> SRR1454310 2 0.0508 0.786311 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR615105 2 0.6874 -0.273724 0.012 0.460 0.216 0.000 0.044 0.268
#> SRR1433290 3 0.7259 -0.430249 0.036 0.060 0.420 0.088 0.380 0.016
#> SRR2166064 2 0.4148 0.640749 0.020 0.772 0.128 0.000 0.000 0.080
#> SRR601671 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.1261 0.785554 0.000 0.952 0.024 0.000 0.000 0.024
#> SRR1409130 5 0.7330 0.430163 0.012 0.084 0.208 0.000 0.404 0.292
#> SRR659696 2 0.0748 0.788308 0.004 0.976 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408249 2 0.0858 0.784537 0.000 0.968 0.028 0.000 0.004 0.000
#> SRR663284 2 0.5487 0.416721 0.028 0.676 0.168 0.000 0.020 0.108
#> SRR1402794 3 0.6735 0.371846 0.076 0.156 0.628 0.044 0.048 0.048
#> SRR614852 6 0.2800 0.263597 0.016 0.036 0.052 0.000 0.012 0.884
#> SRR1348040 2 0.1844 0.785976 0.048 0.924 0.024 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489610 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0405 0.787561 0.004 0.988 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0717 0.788127 0.008 0.976 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444501 4 0.7291 -0.296756 0.008 0.052 0.236 0.352 0.344 0.008
#> SRR1415773 2 0.0436 0.787784 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1388832 1 0.6718 0.354124 0.524 0.196 0.224 0.004 0.032 0.020
#> SRR1394637 1 0.5204 0.260321 0.560 0.356 0.076 0.000 0.004 0.004
#> SRR606974 6 0.3220 0.433282 0.004 0.108 0.056 0.000 0.000 0.832
#> SRR662918 2 0.3265 0.695418 0.008 0.836 0.068 0.000 0.000 0.088
#> SRR817421 4 0.1858 0.670262 0.000 0.000 0.012 0.912 0.076 0.000
#> SRR1400823 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0146 0.785416 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR608264 3 0.7964 -0.533894 0.012 0.032 0.368 0.136 0.328 0.124
#> SRR1318560 1 0.6539 0.399138 0.580 0.096 0.244 0.032 0.032 0.016
#> SRR1454117 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 2 0.3729 0.617294 0.296 0.692 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 6 0.6658 -0.014708 0.080 0.364 0.108 0.000 0.004 0.444
#> SRR1432743 3 0.6868 0.386506 0.032 0.184 0.548 0.004 0.184 0.048
#> SRR1388873 2 0.1554 0.781205 0.004 0.940 0.044 0.000 0.004 0.008
#> SRR1353517 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.6122 0.382125 0.032 0.428 0.456 0.000 0.036 0.048
#> SRR1406008 2 0.0551 0.788761 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396786 2 0.1340 0.779499 0.000 0.948 0.040 0.000 0.004 0.008
#> SRR1446564 2 0.2955 0.771832 0.088 0.860 0.036 0.000 0.000 0.016
#> SRR1318465 3 0.7065 0.520985 0.032 0.332 0.440 0.000 0.148 0.048
#> SRR1431083 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0862 0.789794 0.004 0.972 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR655170 2 0.3517 0.667697 0.004 0.812 0.092 0.000 0.000 0.092
#> SRR1087825 2 0.2239 0.784614 0.028 0.912 0.040 0.000 0.004 0.016
#> SRR662019 1 0.6295 0.282782 0.496 0.192 0.288 0.000 0.008 0.016
#> SRR1349209 2 0.5237 0.479402 0.044 0.672 0.212 0.000 0.004 0.068
#> SRR1326161 2 0.5973 0.186401 0.016 0.596 0.216 0.000 0.020 0.152
#> SRR1345284 2 0.0858 0.787077 0.000 0.968 0.028 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416672 2 0.3175 0.671608 0.256 0.744 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 6 0.4283 0.380591 0.004 0.252 0.048 0.000 0.000 0.696
#> SRR1454328 2 0.1483 0.782791 0.000 0.944 0.036 0.000 0.008 0.012
#> SRR1489286 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092349 2 0.1176 0.790890 0.020 0.956 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.7166 0.410745 0.080 0.180 0.584 0.044 0.064 0.048
#> SRR1084369 3 0.6756 0.510567 0.052 0.336 0.484 0.000 0.092 0.036
#> SRR598452 4 0.2553 0.694116 0.012 0.000 0.044 0.888 0.056 0.000
#> SRR660709 2 0.6149 -0.133503 0.012 0.504 0.172 0.000 0.008 0.304
#> SRR809444 2 0.3373 0.676456 0.248 0.744 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1562 0.777095 0.004 0.940 0.032 0.000 0.000 0.024
#> SRR1375774 2 0.2333 0.774314 0.092 0.884 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.5425 -0.071659 0.676 0.000 0.048 0.056 0.200 0.020
#> SRR657139 6 0.3782 0.045773 0.088 0.000 0.024 0.000 0.080 0.808
#> SRR1440744 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 2 0.3050 0.689604 0.236 0.764 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 2 0.3201 0.706704 0.208 0.780 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.4799 0.565840 0.044 0.720 0.164 0.000 0.000 0.072
#> SRR1381775 2 0.1176 0.790890 0.020 0.956 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 2 0.3290 0.674836 0.252 0.744 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.1261 0.781979 0.004 0.956 0.028 0.000 0.004 0.008
#> SRR658989 3 0.5920 0.433993 0.028 0.408 0.480 0.000 0.012 0.072
#> SRR1353663 1 0.4289 0.364813 0.660 0.304 0.032 0.000 0.000 0.004
#> SRR811771 2 0.3163 0.693000 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 2 0.3101 0.684277 0.244 0.756 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 4 0.1340 0.682257 0.004 0.000 0.008 0.948 0.040 0.000
#> SRR819054 2 0.2213 0.753842 0.004 0.904 0.048 0.000 0.000 0.044
#> SRR1367988 2 0.2077 0.785268 0.032 0.920 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR1331922 2 0.2333 0.774314 0.092 0.884 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 6 0.5114 -0.000835 0.004 0.468 0.056 0.000 0.004 0.468
#> SRR1375796 2 0.3468 0.670764 0.004 0.816 0.092 0.000 0.000 0.088
#> SRR1386991 2 0.3098 0.723787 0.016 0.832 0.140 0.000 0.004 0.008
#> SRR1355217 2 0.5253 0.344286 0.048 0.640 0.272 0.000 0.024 0.016
#> SRR1356290 2 0.7082 -0.305021 0.028 0.484 0.288 0.000 0.088 0.112
#> SRR659507 2 0.0993 0.787119 0.000 0.964 0.024 0.000 0.000 0.012
#> SRR663296 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR598044 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661155 2 0.4148 0.640749 0.020 0.772 0.128 0.000 0.000 0.080
#> SRR1414727 2 0.6467 -0.140666 0.272 0.480 0.220 0.000 0.016 0.012
#> SRR663477 2 0.4002 0.562760 0.320 0.660 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.6362 0.517201 0.040 0.260 0.576 0.000 0.072 0.052
#> SRR1377800 1 0.7586 0.081911 0.396 0.160 0.344 0.028 0.052 0.020
#> SRR614611 6 0.2653 0.345189 0.004 0.064 0.056 0.000 0.000 0.876
#> SRR655052 2 0.1736 0.779824 0.008 0.936 0.032 0.000 0.004 0.020
#> SRR1478968 2 0.2329 0.782600 0.048 0.904 0.036 0.000 0.004 0.008
#> SRR1351280 2 0.1590 0.774050 0.000 0.936 0.048 0.000 0.008 0.008
#> SRR613951 2 0.1710 0.788197 0.016 0.936 0.028 0.000 0.000 0.020
#> SRR1418022 2 0.3050 0.689604 0.236 0.764 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 6 0.7878 -0.325185 0.060 0.004 0.176 0.128 0.164 0.468
#> SRR1408161 2 0.3076 0.687146 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.8106 -0.340154 0.104 0.020 0.412 0.048 0.136 0.280
#> SRR655040 2 0.4471 0.422272 0.008 0.660 0.040 0.000 0.000 0.292
#> SRR810225 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0508 0.786853 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR617829 3 0.7862 0.414243 0.032 0.296 0.364 0.000 0.124 0.184
#> SRR1402328 2 0.0458 0.785972 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.7508 -0.586344 0.016 0.384 0.324 0.000 0.144 0.132
#> SRR1442104 4 0.3817 0.556989 0.024 0.000 0.004 0.748 0.220 0.004
#> SRR1453416 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1481396 4 0.7538 0.234288 0.152 0.004 0.224 0.456 0.148 0.016
#> SRR1414314 2 0.0260 0.785963 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.5675 -0.085870 0.008 0.516 0.100 0.000 0.008 0.368
#> SRR1478386 2 0.0260 0.785577 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 1 0.7058 -0.200873 0.512 0.008 0.160 0.048 0.244 0.028
#> SRR1370572 2 0.3163 0.690990 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 2 0.3163 0.690990 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.2265 0.785392 0.040 0.908 0.040 0.000 0.004 0.008
#> SRR1310735 2 0.3163 0.690990 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.2077 0.785268 0.032 0.920 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR660260 2 0.3494 0.755472 0.052 0.836 0.052 0.000 0.000 0.060
#> SRR1071231 2 0.0146 0.785428 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.1737 0.787426 0.040 0.932 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1337173 2 0.6029 -0.379065 0.028 0.476 0.408 0.000 0.020 0.068
#> SRR1396250 4 0.1262 0.691835 0.016 0.000 0.020 0.956 0.008 0.000
#> SRR2166376 4 0.4958 0.665965 0.072 0.000 0.060 0.732 0.128 0.008
#> SRR659816 2 0.6185 -0.150290 0.012 0.500 0.180 0.000 0.008 0.300
#> SRR1401379 2 0.0146 0.785420 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR600981 2 0.4760 0.613461 0.028 0.748 0.116 0.000 0.016 0.092
#> SRR1398335 2 0.4293 0.402003 0.396 0.584 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1397218 2 0.1173 0.790699 0.016 0.960 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR660115 2 0.4114 0.670299 0.196 0.732 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1407950 2 0.6781 -0.266496 0.012 0.504 0.284 0.000 0.088 0.112
#> SRR1359780 2 0.0820 0.786969 0.000 0.972 0.016 0.000 0.000 0.012
#> SRR1490037 2 0.3050 0.689604 0.236 0.764 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0291 0.786470 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1397156 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0508 0.786410 0.004 0.984 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.5001 0.497103 0.028 0.716 0.156 0.000 0.012 0.088
#> SRR1092985 1 0.4323 0.355644 0.652 0.312 0.032 0.000 0.000 0.004
#> SRR656409 6 0.4852 -0.000626 0.000 0.452 0.056 0.000 0.000 0.492
#> SRR1468658 3 0.7027 0.462563 0.080 0.356 0.448 0.000 0.052 0.064
#> SRR1390437 2 0.0976 0.789725 0.008 0.968 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR658057 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612635 6 0.3969 0.463125 0.004 0.212 0.044 0.000 0.000 0.740
#> SRR1351480 2 0.2946 0.736183 0.004 0.856 0.108 0.000 0.016 0.016
#> SRR1436651 2 0.3163 0.690990 0.232 0.764 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 2 0.2971 0.749815 0.144 0.832 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR659590 2 0.0146 0.785428 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR614263 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0508 0.786481 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004 0.000
#> SRR659911 2 0.6985 -0.294517 0.008 0.472 0.240 0.000 0.072 0.208
#> SRR1085519 4 0.5823 0.048981 0.008 0.004 0.124 0.456 0.408 0.000
#> SRR1345894 2 0.6131 -0.004995 0.068 0.544 0.320 0.000 0.052 0.016
#> SRR1442928 2 0.3287 0.700130 0.008 0.820 0.148 0.000 0.016 0.008
#> SRR1464681 2 0.1767 0.786867 0.020 0.932 0.036 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418880 1 0.4665 0.284259 0.604 0.352 0.036 0.000 0.004 0.004
#> SRR1309070 3 0.5720 0.414678 0.024 0.428 0.480 0.000 0.016 0.052
#> SRR1365426 2 0.0717 0.788757 0.016 0.976 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.6658 0.192482 0.564 0.040 0.256 0.084 0.048 0.008
#> SRR659708 6 0.3782 0.045773 0.088 0.000 0.024 0.000 0.080 0.808
#> SRR603236 2 0.5610 0.216941 0.016 0.604 0.288 0.000 0.028 0.064
#> SRR660673 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.1492 0.777724 0.000 0.940 0.024 0.000 0.000 0.036
#> SRR1087245 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0405 0.787233 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR613426 2 0.3869 0.734917 0.088 0.808 0.056 0.000 0.000 0.048
#> SRR613879 6 0.4932 0.123098 0.004 0.388 0.048 0.000 0.004 0.556
#> SRR1385101 2 0.2019 0.775996 0.088 0.900 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.2803 0.738252 0.004 0.868 0.096 0.000 0.016 0.016
#> SRR1458852 2 0.0405 0.787115 0.000 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430489 2 0.2540 0.767306 0.104 0.872 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349231 2 0.1802 0.780866 0.072 0.916 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 4 0.1262 0.691835 0.016 0.000 0.020 0.956 0.008 0.000
#> SRR1321987 2 0.0520 0.786464 0.000 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR662653 2 0.5004 0.270263 0.000 0.632 0.088 0.000 0.008 0.272
#> SRR1390027 2 0.3151 0.676595 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.7665 0.433842 0.024 0.308 0.384 0.000 0.152 0.132
#> SRR1383081 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.2213 0.753842 0.004 0.904 0.048 0.000 0.000 0.044
#> SRR605101 2 0.0777 0.788333 0.000 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR818600 2 0.3232 0.707022 0.004 0.844 0.088 0.000 0.008 0.056
#> SRR1367715 2 0.0260 0.785594 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351979 4 0.1901 0.671685 0.004 0.000 0.008 0.912 0.076 0.000
#> SRR1387054 3 0.7168 0.523735 0.048 0.300 0.460 0.000 0.148 0.044
#> SRR1444306 3 0.6989 0.488513 0.048 0.244 0.460 0.000 0.232 0.016
#> SRR1322662 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3303 0.689980 0.004 0.836 0.076 0.000 0.004 0.080
#> SRR612767 2 0.4250 0.526748 0.012 0.708 0.036 0.000 0.000 0.244
#> SRR1489030 2 0.0146 0.785428 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.1524 0.778999 0.000 0.932 0.060 0.000 0.000 0.008
#> SRR615225 2 0.4764 0.611436 0.028 0.748 0.112 0.000 0.016 0.096
#> SRR1401839 2 0.2619 0.776835 0.048 0.884 0.056 0.000 0.000 0.012
#> SRR1379110 2 0.0935 0.786487 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077288 4 0.4537 0.676974 0.060 0.000 0.064 0.764 0.108 0.004
#> SRR1331639 2 0.2001 0.785547 0.028 0.924 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR1342782 2 0.0820 0.788844 0.016 0.972 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.7001 0.497295 0.048 0.252 0.456 0.000 0.228 0.016
#> SRR612839 1 0.3823 0.530398 0.764 0.184 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470093 3 0.7924 -0.064312 0.288 0.088 0.420 0.028 0.148 0.028
#> SRR1395742 2 0.3126 0.680129 0.248 0.752 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 2 0.3189 0.687748 0.236 0.760 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.7132 0.521445 0.048 0.296 0.468 0.000 0.144 0.044
#> SRR664063 2 0.0767 0.789524 0.008 0.976 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488214 2 0.2933 0.715217 0.200 0.796 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.2077 0.785268 0.032 0.920 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR1320321 2 0.0000 0.785195 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 2 0.3076 0.687319 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 2 0.3215 0.686705 0.240 0.756 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0146 0.786728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488470 2 0.2939 0.710085 0.004 0.864 0.080 0.000 0.008 0.044
#> SRR1389497 4 0.6597 0.199975 0.012 0.004 0.176 0.460 0.328 0.020
#> SRR1367109 2 0.5358 0.299861 0.040 0.636 0.268 0.000 0.012 0.044
#> SRR615311 2 0.3183 0.713119 0.200 0.788 0.008 0.000 0.000 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.566 0.880 0.924 0.4020 0.611 0.611
#> 3 3 0.932 0.909 0.956 0.5027 0.704 0.545
#> 4 4 0.769 0.806 0.909 0.1728 0.833 0.606
#> 5 5 0.727 0.635 0.798 0.0625 0.927 0.763
#> 6 6 0.725 0.661 0.791 0.0461 0.931 0.746
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR612803 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR613282 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1355396 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1084417 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1419258 1 0.4431 0.896 0.908 0.092
#> SRR1403366 1 0.2043 0.902 0.968 0.032
#> SRR665262 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.5737 0.864 0.136 0.864
#> SRR1105057 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1439742 2 0.7950 0.782 0.240 0.760
#> SRR614599 1 0.2778 0.904 0.952 0.048
#> SRR612215 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1094051 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1324496 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1393449 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR1431288 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1334889 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR614839 1 0.8081 0.800 0.752 0.248
#> SRR658433 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1088581 1 0.5629 0.881 0.868 0.132
#> SRR1328797 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1334512 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1471117 2 0.7950 0.782 0.240 0.760
#> SRR1311553 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1458220 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1354955 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR654802 1 0.3114 0.903 0.944 0.056
#> SRR660066 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1402153 1 0.8763 0.744 0.704 0.296
#> SRR655887 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1408529 1 0.5737 0.879 0.864 0.136
#> SRR658707 2 0.7883 0.789 0.236 0.764
#> SRR1384371 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1074670 1 0.2423 0.904 0.960 0.040
#> SRR1375439 2 0.7602 0.771 0.220 0.780
#> SRR1329003 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1317920 2 0.5294 0.875 0.120 0.880
#> SRR1455525 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR613999 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1310836 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1499764 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR658200 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1068855 2 0.8081 0.773 0.248 0.752
#> SRR1375509 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR612227 1 0.5737 0.879 0.864 0.136
#> SRR1388809 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1452864 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1473078 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR615814 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1325225 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1313687 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1487746 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1354644 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1401752 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1344382 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1432453 2 0.3733 0.869 0.072 0.928
#> SRR1478362 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1347937 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1431569 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1471594 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1354270 2 0.9286 0.565 0.344 0.656
#> SRR612683 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1392901 1 0.8499 0.769 0.724 0.276
#> SRR1077805 1 0.9754 0.545 0.592 0.408
#> SRR1360402 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1406112 1 0.2423 0.904 0.960 0.040
#> SRR1355352 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR656247 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR813656 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR1387240 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1408595 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1385277 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.5519 0.821 0.128 0.872
#> SRR1408682 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1317134 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1370780 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1489307 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR603164 1 0.7219 0.838 0.800 0.200
#> SRR1383259 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1452423 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1368574 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1468162 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1331220 1 0.7745 0.819 0.772 0.228
#> SRR1361546 2 0.5842 0.862 0.140 0.860
#> SRR1486156 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR660545 1 0.9732 0.554 0.596 0.404
#> SRR615635 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1342739 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1102830 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR662126 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.6623 0.848 0.172 0.828
#> SRR1336569 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1368117 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1334247 1 0.4939 0.891 0.892 0.108
#> SRR661639 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0672 0.922 0.008 0.992
#> SRR2185018 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR655732 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR809348 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR819261 1 0.2423 0.904 0.960 0.040
#> SRR661074 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR1349851 2 0.2043 0.914 0.032 0.968
#> SRR1405123 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1320225 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1454651 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR658212 1 0.9977 0.382 0.528 0.472
#> SRR1430525 1 0.5737 0.879 0.864 0.136
#> SRR1344422 2 0.0672 0.922 0.008 0.992
#> SRR1353924 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1487570 2 0.4690 0.885 0.100 0.900
#> SRR627431 1 0.8081 0.800 0.752 0.248
#> SRR1418561 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR1448029 1 0.5408 0.885 0.876 0.124
#> SRR813802 1 0.2236 0.877 0.964 0.036
#> SRR815020 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1309702 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1323152 1 0.4690 0.894 0.900 0.100
#> SRR1368264 2 0.0672 0.924 0.008 0.992
#> SRR1326624 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1429265 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR1327702 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR615611 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1486799 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1096174 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR659436 1 0.5178 0.888 0.884 0.116
#> SRR613699 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1436563 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR615323 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1431927 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1100588 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1444002 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR658766 1 0.5178 0.888 0.884 0.116
#> SRR655946 1 0.6801 0.849 0.820 0.180
#> SRR817282 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1475104 1 0.1633 0.899 0.976 0.024
#> SRR1406418 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1090265 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1444120 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1471965 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR612695 1 0.8763 0.744 0.704 0.296
#> SRR662498 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1376764 1 0.7453 0.830 0.788 0.212
#> SRR1377006 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1452515 1 0.9170 0.616 0.668 0.332
#> SRR1324390 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.3114 0.867 0.944 0.056
#> SRR601695 2 0.3584 0.871 0.068 0.932
#> SRR820907 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR812773 2 0.1184 0.921 0.016 0.984
#> SRR1405984 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1095720 1 0.2043 0.902 0.968 0.032
#> SRR1435626 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1080766 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1377862 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1332299 1 0.5178 0.888 0.884 0.116
#> SRR1467966 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1320579 1 0.6801 0.849 0.820 0.180
#> SRR1319710 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1098879 1 0.4815 0.893 0.896 0.104
#> SRR662245 1 0.7056 0.843 0.808 0.192
#> SRR1074719 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR816226 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR601387 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR662906 1 0.6712 0.852 0.824 0.176
#> SRR1350832 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0672 0.922 0.008 0.992
#> SRR1388528 1 1.0000 -0.196 0.504 0.496
#> SRR1452912 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1400180 2 0.1184 0.921 0.016 0.984
#> SRR655399 1 0.2043 0.902 0.968 0.032
#> SRR1319753 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR818901 1 0.2423 0.904 0.960 0.040
#> SRR607067 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1391420 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1384138 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR661961 1 0.2423 0.904 0.960 0.040
#> SRR658259 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1310476 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1452696 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1322900 2 0.6712 0.847 0.176 0.824
#> SRR1309942 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1435418 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1402172 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1443436 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR661675 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0672 0.924 0.008 0.992
#> SRR1464915 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1312406 2 0.9833 0.444 0.424 0.576
#> SRR1350435 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1389177 1 0.6148 0.869 0.848 0.152
#> SRR1368072 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR613330 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1434502 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1394190 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1481083 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR816382 2 0.7674 0.650 0.224 0.776
#> SRR1318839 1 0.2043 0.902 0.968 0.032
#> SRR1432390 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1456027 2 0.0672 0.924 0.008 0.992
#> SRR1400551 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR1320469 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR614251 1 0.8081 0.800 0.752 0.248
#> SRR1454310 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR615105 1 0.6801 0.849 0.820 0.180
#> SRR1433290 1 0.5178 0.888 0.884 0.116
#> SRR2166064 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1409130 1 0.8608 0.760 0.716 0.284
#> SRR659696 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.0376 0.926 0.004 0.996
#> SRR663284 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1402794 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR614852 1 0.6801 0.849 0.820 0.180
#> SRR1348040 2 0.0672 0.924 0.008 0.992
#> SRR1489610 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1444501 1 0.5294 0.887 0.880 0.120
#> SRR1415773 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1394637 2 0.9170 0.644 0.332 0.668
#> SRR606974 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR817421 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1400823 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1381348 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR608264 1 0.5737 0.879 0.864 0.136
#> SRR1318560 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1312684 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR615044 2 0.5294 0.873 0.120 0.880
#> SRR1432743 1 0.6712 0.852 0.824 0.176
#> SRR1388873 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1353517 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1357148 1 0.5178 0.888 0.884 0.116
#> SRR1406008 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1446564 2 0.3114 0.904 0.056 0.944
#> SRR1318465 1 0.7815 0.814 0.768 0.232
#> SRR1431083 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR607117 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0672 0.922 0.008 0.992
#> SRR662019 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR1349209 2 0.3274 0.901 0.060 0.940
#> SRR1326161 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1416672 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR663356 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1489286 2 0.6887 0.841 0.184 0.816
#> SRR1092349 2 0.1184 0.921 0.016 0.984
#> SRR1408183 1 0.4690 0.894 0.900 0.100
#> SRR1084369 1 0.5946 0.874 0.856 0.144
#> SRR598452 1 0.2043 0.902 0.968 0.032
#> SRR660709 2 0.0672 0.922 0.008 0.992
#> SRR809444 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1089901 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1375774 2 0.5294 0.875 0.120 0.880
#> SRR1326292 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR1440744 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1353555 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1323087 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1452334 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1381775 2 0.5059 0.879 0.112 0.888
#> SRR1363908 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1319626 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR658989 1 0.7299 0.832 0.796 0.204
#> SRR1353663 2 0.8016 0.778 0.244 0.756
#> SRR811771 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR813983 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR815825 1 0.2236 0.903 0.964 0.036
#> SRR819054 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1331922 2 0.6148 0.860 0.152 0.848
#> SRR615479 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.3431 0.873 0.064 0.936
#> SRR659507 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR663296 2 0.8016 0.778 0.244 0.756
#> SRR598044 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1414727 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR663477 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1354489 1 0.6148 0.869 0.848 0.152
#> SRR1377800 1 0.1184 0.896 0.984 0.016
#> SRR614611 1 0.8081 0.800 0.752 0.248
#> SRR655052 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1478968 2 0.6343 0.856 0.160 0.840
#> SRR1351280 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1418022 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR661901 1 0.3879 0.900 0.924 0.076
#> SRR1408161 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR657054 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR655040 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR617829 1 0.8016 0.804 0.756 0.244
#> SRR1402328 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 1.0000 -0.289 0.496 0.504
#> SRR1442104 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1453416 2 0.8144 0.768 0.252 0.748
#> SRR1481396 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR1414314 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1458683 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1370572 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1467567 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1468532 2 0.5629 0.870 0.132 0.868
#> SRR1310735 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1440101 2 0.0672 0.922 0.008 0.992
#> SRR660260 2 0.6973 0.740 0.188 0.812
#> SRR1071231 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1337173 1 0.9815 0.516 0.580 0.420
#> SRR1396250 1 0.2043 0.902 0.968 0.032
#> SRR2166376 1 0.2043 0.902 0.968 0.032
#> SRR659816 1 0.8081 0.800 0.752 0.248
#> SRR1401379 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1398335 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1397218 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR660115 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1407950 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1490037 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR627439 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1397156 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1410221 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1092985 2 0.7815 0.794 0.232 0.768
#> SRR656409 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1468658 1 0.6801 0.849 0.820 0.180
#> SRR1390437 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1436651 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1441590 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR659590 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR614263 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1409575 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1085519 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1345894 1 0.4298 0.897 0.912 0.088
#> SRR1442928 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1418880 2 0.8081 0.774 0.248 0.752
#> SRR1309070 1 0.9954 0.416 0.540 0.460
#> SRR1365426 2 0.0938 0.922 0.012 0.988
#> SRR1487947 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0938 0.895 0.988 0.012
#> SRR603236 2 0.0376 0.925 0.004 0.996
#> SRR660673 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1430729 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.5842 0.866 0.140 0.860
#> SRR613879 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.2948 0.907 0.052 0.948
#> SRR1387966 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1430489 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1349231 2 0.1843 0.916 0.028 0.972
#> SRR1376249 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR1321987 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1390027 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1098474 1 0.8608 0.760 0.716 0.284
#> SRR1383081 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1351979 1 0.2778 0.904 0.952 0.048
#> SRR1387054 1 0.6887 0.847 0.816 0.184
#> SRR1444306 1 0.4431 0.896 0.908 0.092
#> SRR1322662 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR665478 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR612767 2 0.3274 0.903 0.060 0.940
#> SRR1489030 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0376 0.925 0.004 0.996
#> SRR1401839 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.0672 0.893 0.992 0.008
#> SRR1331639 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1443003 1 0.8661 0.755 0.712 0.288
#> SRR612839 1 0.0000 0.887 1.000 0.000
#> SRR1470093 1 0.4562 0.895 0.904 0.096
#> SRR1395742 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1469014 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1387222 1 0.6801 0.849 0.820 0.180
#> SRR664063 2 0.0672 0.924 0.008 0.992
#> SRR1488214 2 0.6712 0.847 0.176 0.824
#> SRR654766 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1071955 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1417483 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
#> SRR1394231 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.927 0.000 1.000
#> SRR1389497 1 0.2603 0.904 0.956 0.044
#> SRR1367109 2 0.3274 0.901 0.060 0.940
#> SRR615311 2 0.6801 0.845 0.180 0.820
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR613282 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1355396 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1084417 3 0.4842 0.705 0.224 0.000 0.776
#> SRR1074359 2 0.0237 0.969 0.004 0.996 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499740 2 0.6280 0.164 0.460 0.540 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.2050 0.894 0.028 0.020 0.952
#> SRR612215 2 0.1031 0.957 0.024 0.976 0.000
#> SRR1094051 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1324496 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1393449 3 0.2878 0.856 0.096 0.000 0.904
#> SRR1409263 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1334889 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR614839 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1328797 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR654802 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402153 3 0.7274 0.226 0.028 0.452 0.520
#> SRR655887 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1074670 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1375439 2 0.4784 0.731 0.004 0.796 0.200
#> SRR1329003 1 0.6168 0.259 0.588 0.000 0.412
#> SRR1404837 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1455525 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR613999 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1310836 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1499764 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1388809 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1473078 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR615814 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1325225 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1313687 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1354644 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1432453 2 0.3310 0.895 0.028 0.908 0.064
#> SRR1478362 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1431569 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1471594 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1354270 2 0.7156 0.254 0.028 0.572 0.400
#> SRR612683 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 2 0.2443 0.928 0.028 0.940 0.032
#> SRR1077805 3 0.7293 0.144 0.028 0.476 0.496
#> SRR1360402 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR1355352 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR656247 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 3 0.0237 0.905 0.004 0.000 0.996
#> SRR1387240 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1385277 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.5660 0.709 0.028 0.772 0.200
#> SRR1408682 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1370780 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR603164 3 0.7256 0.261 0.028 0.440 0.532
#> SRR1383259 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 3 0.4002 0.786 0.160 0.000 0.840
#> SRR1452423 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1331220 2 0.7114 0.293 0.028 0.584 0.388
#> SRR1361546 2 0.1964 0.922 0.056 0.944 0.000
#> SRR1486156 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR660545 2 0.3765 0.868 0.028 0.888 0.084
#> SRR615635 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1342739 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR612539 2 0.0237 0.969 0.004 0.996 0.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.3412 0.808 0.876 0.124 0.000
#> SRR1336569 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334247 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR661639 1 0.2537 0.865 0.920 0.000 0.080
#> SRR613222 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1459937 2 0.0829 0.963 0.012 0.984 0.004
#> SRR2185018 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR819261 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR661074 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.4291 0.767 0.820 0.180 0.000
#> SRR1405123 2 0.0892 0.959 0.020 0.980 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1454651 1 0.6168 0.259 0.588 0.000 0.412
#> SRR1307677 2 0.0237 0.969 0.004 0.996 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.6215 0.316 0.428 0.000 0.572
#> SRR1487570 1 0.2356 0.916 0.928 0.072 0.000
#> SRR627431 2 0.1751 0.945 0.028 0.960 0.012
#> SRR1418561 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1448029 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR813802 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1368264 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0592 0.950 0.988 0.012 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR615611 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1486799 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR613699 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1436563 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.0237 0.969 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR658766 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR655946 3 0.4810 0.786 0.028 0.140 0.832
#> SRR817282 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1090265 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR612695 2 0.7169 0.198 0.028 0.568 0.404
#> SRR662498 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1376764 3 0.5708 0.720 0.028 0.204 0.768
#> SRR1377006 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR656860 2 0.0424 0.967 0.008 0.992 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.7223 0.260 0.028 0.424 0.548
#> SRR1324390 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 2 0.0747 0.958 0.016 0.984 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.3879 0.776 0.848 0.000 0.152
#> SRR1095720 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1080766 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR1320579 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1319710 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.5708 0.720 0.028 0.204 0.768
#> SRR1074719 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.1031 0.961 0.976 0.024 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0424 0.967 0.008 0.992 0.000
#> SRR662906 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.1031 0.957 0.024 0.976 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.0237 0.968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1388528 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1400180 2 0.0592 0.962 0.012 0.988 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1384138 2 0.0424 0.967 0.008 0.992 0.000
#> SRR661961 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR658259 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.2066 0.930 0.940 0.060 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 2 0.0475 0.967 0.004 0.992 0.004
#> SRR1435418 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1312406 1 0.5948 0.415 0.640 0.000 0.360
#> SRR1350435 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1389177 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1368072 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR613330 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1481083 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR816382 2 0.5939 0.669 0.028 0.748 0.224
#> SRR1318839 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456027 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1320469 3 0.6192 0.335 0.420 0.000 0.580
#> SRR614251 2 0.7232 0.111 0.028 0.544 0.428
#> SRR1454310 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 2 0.2903 0.913 0.028 0.924 0.048
#> SRR1433290 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0892 0.959 0.020 0.980 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 3 0.7156 0.376 0.028 0.400 0.572
#> SRR659696 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1402794 3 0.0892 0.906 0.020 0.000 0.980
#> SRR614852 3 0.5660 0.718 0.028 0.200 0.772
#> SRR1348040 2 0.0237 0.968 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.5678 0.492 0.684 0.000 0.316
#> SRR1394637 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR662918 2 0.0237 0.969 0.004 0.996 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1454117 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR615044 1 0.4931 0.637 0.768 0.232 0.000
#> SRR1432743 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1388873 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1357148 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1406008 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1318465 3 0.6407 0.639 0.028 0.272 0.700
#> SRR1431083 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1087825 2 0.1015 0.961 0.012 0.980 0.008
#> SRR662019 3 0.3038 0.849 0.104 0.000 0.896
#> SRR1349209 2 0.1399 0.951 0.028 0.968 0.004
#> SRR1326161 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR663356 2 0.0424 0.967 0.008 0.992 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.1031 0.961 0.976 0.024 0.000
#> SRR1092349 2 0.0592 0.962 0.012 0.988 0.000
#> SRR1408183 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR1084369 3 0.1399 0.904 0.028 0.004 0.968
#> SRR598452 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR809444 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1326292 1 0.6180 0.248 0.584 0.000 0.416
#> SRR657139 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR1440744 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1323087 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1452334 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1381775 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1363908 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.5894 0.705 0.028 0.220 0.752
#> SRR1353663 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR813983 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.0237 0.968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331922 1 0.2878 0.884 0.904 0.096 0.000
#> SRR615479 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356290 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR659507 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0892 0.959 0.020 0.980 0.000
#> SRR1414727 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR663477 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1354489 3 0.1399 0.904 0.028 0.004 0.968
#> SRR1377800 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR614611 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478968 2 0.5365 0.640 0.252 0.744 0.004
#> SRR1351280 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 2 0.0892 0.959 0.020 0.980 0.000
#> SRR1418022 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR661901 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1408161 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR657054 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR655040 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.7156 0.376 0.028 0.400 0.572
#> SRR1402328 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0747 0.962 0.016 0.984 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1370572 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1467567 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1468532 2 0.0747 0.958 0.016 0.984 0.000
#> SRR1310735 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1440101 2 0.0475 0.967 0.004 0.992 0.004
#> SRR660260 2 0.5708 0.703 0.028 0.768 0.204
#> SRR1071231 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337173 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.6954 0.359 0.028 0.620 0.352
#> SRR1401379 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1398335 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1407950 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1359780 2 0.0237 0.969 0.004 0.996 0.000
#> SRR1490037 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0592 0.964 0.012 0.988 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0424 0.967 0.008 0.992 0.000
#> SRR1468658 3 0.6570 0.599 0.028 0.292 0.680
#> SRR1390437 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1441590 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.1399 0.904 0.028 0.004 0.968
#> SRR1442928 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.6148 0.615 0.028 0.728 0.244
#> SRR1365426 2 0.0237 0.968 0.004 0.996 0.000
#> SRR1487947 3 0.5216 0.658 0.260 0.000 0.740
#> SRR659708 3 0.1031 0.906 0.024 0.000 0.976
#> SRR603236 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR660673 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 2 0.6140 0.291 0.404 0.596 0.000
#> SRR613879 2 0.0424 0.967 0.008 0.992 0.000
#> SRR1385101 2 0.6204 0.231 0.424 0.576 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1349231 1 0.4974 0.681 0.764 0.236 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0747 0.962 0.016 0.984 0.000
#> SRR1390027 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1098474 3 0.7129 0.396 0.028 0.392 0.580
#> SRR1383081 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.4874 0.782 0.028 0.144 0.828
#> SRR1444306 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.1643 0.949 0.956 0.044 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR615225 2 0.1163 0.954 0.028 0.972 0.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.7129 0.396 0.028 0.392 0.580
#> SRR612839 1 0.0000 0.938 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.1163 0.905 0.028 0.000 0.972
#> SRR1395742 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1469014 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1387222 3 0.3406 0.854 0.028 0.068 0.904
#> SRR664063 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1417483 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.971 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0237 0.969 0.004 0.996 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.905 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.1399 0.951 0.028 0.968 0.004
#> SRR615311 1 0.1163 0.965 0.972 0.028 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.7006 0.60542 0.204 0.000 0.580 0.216
#> SRR1074359 2 0.3837 0.68355 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1419258 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403366 3 0.0469 0.86883 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR665262 2 0.3074 0.79100 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1499740 4 0.2706 0.79009 0.020 0.080 0.000 0.900
#> SRR1105057 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR614599 4 0.0000 0.77646 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 4 0.3726 0.67383 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1094051 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.6110 0.69464 0.100 0.000 0.660 0.240
#> SRR1409263 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 4 0.3942 0.70304 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR614839 4 0.0707 0.78777 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR658433 2 0.0188 0.91201 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088581 4 0.3074 0.72036 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1328797 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334512 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1311553 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.3907 0.75656 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR654802 3 0.1211 0.85294 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR660066 2 0.1389 0.88508 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1447103 2 0.4761 0.40558 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1402153 4 0.2401 0.79332 0.000 0.092 0.004 0.904
#> SRR655887 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.3688 0.77660 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR658707 1 0.0592 0.95329 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1384371 4 0.4277 0.66710 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1074670 3 0.4605 0.59975 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1375439 4 0.5462 0.70747 0.000 0.152 0.112 0.736
#> SRR1329003 4 0.6403 0.43435 0.232 0.000 0.128 0.640
#> SRR1404837 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.4989 -0.08180 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR613999 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.3400 0.80792 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1068855 1 0.0592 0.95329 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375509 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 4 0.0469 0.77653 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1388809 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.4454 0.55190 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1452864 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 4 0.2973 0.72551 0.000 0.000 0.144 0.856
#> SRR615814 4 0.3907 0.67510 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1325225 1 0.1211 0.92364 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1313687 4 0.5000 0.18696 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1358220 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809595 2 0.4522 0.52002 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1403133 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 4 0.2999 0.77360 0.000 0.132 0.004 0.864
#> SRR1478362 2 0.0469 0.90812 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1392186 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.2048 0.77281 0.000 0.008 0.064 0.928
#> SRR612683 2 0.0336 0.91023 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1392901 4 0.1824 0.79604 0.000 0.060 0.004 0.936
#> SRR1077805 4 0.2704 0.77876 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1360402 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.3942 0.75126 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1355352 3 0.4122 0.75937 0.004 0.000 0.760 0.236
#> SRR656247 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0817 0.90140 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR808244 3 0.1211 0.86295 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1387240 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.2760 0.81272 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1435248 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 4 0.3542 0.75188 0.000 0.028 0.120 0.852
#> SRR1408682 2 0.1118 0.89187 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1317134 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR603164 4 0.1151 0.79077 0.000 0.024 0.008 0.968
#> SRR1383259 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330854 3 0.5628 0.73387 0.080 0.000 0.704 0.216
#> SRR1452423 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 4 0.3224 0.75000 0.000 0.016 0.120 0.864
#> SRR1361546 4 0.4524 0.70539 0.028 0.204 0.000 0.768
#> SRR1486156 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 4 0.1557 0.79266 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR615635 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.4331 0.65963 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1342739 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.1474 0.88273 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1464601 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.4967 0.00336 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR612539 2 0.4746 0.44777 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR602010 2 0.1474 0.88416 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR810249 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818773 4 0.3519 0.71032 0.128 0.016 0.004 0.852
#> SRR1336569 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0817 0.86445 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1334247 4 0.2011 0.76547 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR661639 1 0.4040 0.66204 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR613222 4 0.1867 0.79262 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1459937 4 0.3942 0.67633 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR2185018 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.3873 0.75952 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR661074 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.4624 0.46589 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.4072 0.59857 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR661096 2 0.0336 0.91023 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1320225 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.6403 0.43435 0.232 0.000 0.128 0.640
#> SRR1307677 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658212 4 0.2345 0.77977 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1430525 3 0.0817 0.86580 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1344422 4 0.3873 0.71088 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1353924 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.7678 -0.12559 0.440 0.000 0.332 0.228
#> SRR1487570 1 0.6407 0.13751 0.520 0.412 0.000 0.068
#> SRR627431 4 0.0707 0.78777 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1418561 3 0.4713 0.57179 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1448029 4 0.3074 0.72069 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR813802 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR815020 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612395 2 0.2704 0.82191 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR603116 2 0.1867 0.86802 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1323152 4 0.2973 0.72495 0.000 0.000 0.144 0.856
#> SRR1368264 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.0921 0.78953 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1486799 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0188 0.91206 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1338560 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.2647 0.82234 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1480038 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659436 4 0.0817 0.77615 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR613699 4 0.3219 0.73599 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1436563 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0188 0.91201 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1330327 2 0.4967 0.20233 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1489950 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1444002 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1318444 4 0.2647 0.78020 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR600656 2 0.4972 0.20338 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR658766 3 0.4605 0.68261 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR655946 4 0.1356 0.78194 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR817282 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.3172 0.76194 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1471965 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 4 0.0592 0.78611 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR662498 4 0.1792 0.79511 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1376764 4 0.2021 0.79356 0.000 0.040 0.024 0.936
#> SRR1377006 4 0.2760 0.77675 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR656860 2 0.4948 0.25291 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1480547 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452515 4 0.2408 0.74823 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1324390 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.4643 0.51689 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR601695 4 0.0707 0.78777 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR820907 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 2 0.1510 0.88917 0.016 0.956 0.000 0.028
#> SRR1405984 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.1406 0.93487 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1095720 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 4 0.2760 0.73054 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1080766 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.1022 0.86478 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1467966 3 0.3764 0.76991 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1320579 4 0.2149 0.76158 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1319710 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR662245 4 0.2593 0.78327 0.000 0.080 0.016 0.904
#> SRR1074719 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.3975 0.66581 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR601387 2 0.3400 0.76454 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR614575 2 0.1022 0.89675 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1353900 2 0.0469 0.90707 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR662906 3 0.3942 0.77257 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1350832 2 0.1716 0.86523 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1403280 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.4746 0.41470 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1388528 1 0.0592 0.95329 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1452912 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.0592 0.90151 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319753 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.2149 0.84452 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR607067 2 0.4985 0.20048 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1391420 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.1474 0.87574 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR661961 4 0.0336 0.77684 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR658259 2 0.0188 0.91206 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1310476 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.4008 0.64515 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1309942 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 2 0.4994 0.05185 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1435418 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661469 4 0.1118 0.79320 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1500323 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 4 0.2760 0.73054 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1350435 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 4 0.2868 0.73355 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1368072 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 4 0.4933 0.23046 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR613330 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0817 0.89978 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1394190 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 4 0.3278 0.75335 0.000 0.020 0.116 0.864
#> SRR1318839 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1432390 2 0.2081 0.85677 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR613126 4 0.2081 0.77770 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1089424 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.4072 0.64022 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1456027 2 0.3400 0.74652 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1400551 3 0.4898 0.47591 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1320469 3 0.7629 0.26279 0.392 0.000 0.404 0.204
#> SRR614251 4 0.0707 0.78777 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1454310 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615105 4 0.0592 0.78611 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1433290 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2166064 4 0.4761 0.47297 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR601671 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.1211 0.89121 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1409130 4 0.4011 0.72064 0.000 0.208 0.008 0.784
#> SRR659696 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663284 4 0.3688 0.69893 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1402794 3 0.3837 0.76311 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR614852 4 0.0672 0.78182 0.000 0.008 0.008 0.984
#> SRR1348040 2 0.4584 0.56011 0.004 0.696 0.000 0.300
#> SRR1489610 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0592 0.86779 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1415773 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388832 4 0.5408 0.02478 0.488 0.000 0.012 0.500
#> SRR1394637 1 0.0592 0.95329 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR606974 4 0.3907 0.65290 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR662918 2 0.4585 0.50280 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR817421 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400823 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR608264 3 0.3837 0.78893 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1318560 3 0.4679 0.58806 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1454117 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 4 0.0188 0.77923 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1432743 4 0.2868 0.73355 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1388873 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 4 0.2921 0.73046 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1406008 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0469 0.95023 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1318465 4 0.1406 0.79069 0.000 0.024 0.016 0.960
#> SRR1431083 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0707 0.90369 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR655170 4 0.3907 0.68696 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1087825 4 0.4250 0.62630 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR662019 4 0.2329 0.75138 0.072 0.000 0.012 0.916
#> SRR1349209 4 0.2530 0.78112 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1326161 4 0.4277 0.63590 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1345284 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4933 0.27756 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1454328 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0188 0.96082 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092349 2 0.0592 0.90151 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.3873 0.75952 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1084369 4 0.2999 0.73783 0.000 0.004 0.132 0.864
#> SRR598452 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660709 4 0.0707 0.78777 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR809444 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.6403 0.43435 0.232 0.000 0.128 0.640
#> SRR657139 3 0.4134 0.75789 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1440744 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.4040 0.69746 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1381775 1 0.0336 0.95542 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 4 0.1888 0.79490 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1353663 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR811771 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR819054 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.4477 0.54058 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1331922 1 0.2814 0.78773 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR615479 4 0.4948 0.13820 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1375796 2 0.3688 0.68975 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1386991 2 0.1867 0.86206 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1355217 2 0.1716 0.86981 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1356290 4 0.3942 0.70428 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR659507 4 0.2921 0.77148 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR663296 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR598044 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.4250 0.62193 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1414727 4 0.6797 0.33962 0.160 0.000 0.240 0.600
#> SRR663477 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 4 0.3105 0.73203 0.000 0.004 0.140 0.856
#> SRR1377800 4 0.4996 -0.16798 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR614611 4 0.0707 0.78777 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR655052 2 0.1557 0.87968 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1478968 2 0.7220 0.05589 0.144 0.472 0.000 0.384
#> SRR1351280 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613951 4 0.3837 0.68419 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1418022 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3942 0.53004 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1408161 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.4543 0.69468 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR655040 2 0.4992 0.17332 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR810225 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 4 0.0592 0.77621 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1402328 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 4 0.3907 0.70692 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1442104 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453416 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1481396 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414314 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.4948 0.25291 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1478386 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 4 0.4933 0.11003 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1370572 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.6058 0.45349 0.068 0.624 0.000 0.308
#> SRR1310735 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.4866 0.32675 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR660260 4 0.0592 0.78611 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1071231 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.2281 0.84545 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1337173 4 0.2149 0.79349 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1396250 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2166376 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659816 4 0.0707 0.78777 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1401379 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600981 4 0.3688 0.69508 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1398335 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.3649 0.68334 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1359780 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0469 0.90825 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1397156 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.1792 0.86116 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1092985 1 0.0779 0.95095 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR656409 2 0.4967 0.21271 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1468658 4 0.2256 0.78302 0.000 0.020 0.056 0.924
#> SRR1390437 2 0.2011 0.85925 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR658057 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612635 4 0.4382 0.58046 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1351480 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659911 2 0.4981 0.17092 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1085519 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1345894 4 0.3123 0.71676 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1442928 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464681 2 0.0707 0.90263 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1418880 1 0.0592 0.95329 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1309070 4 0.3356 0.74820 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1365426 2 0.0592 0.90151 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.7619 -0.14986 0.436 0.000 0.356 0.208
#> SRR659708 3 0.4730 0.65498 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR603236 4 0.1792 0.79511 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR660673 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.1557 0.87777 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1087245 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613426 4 0.7557 0.39095 0.252 0.260 0.000 0.488
#> SRR613879 2 0.4985 0.18188 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1385101 2 0.5746 0.43871 0.348 0.612 0.000 0.040
#> SRR1387966 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 2 0.4955 0.17703 0.444 0.556 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.3266 0.76178 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1390027 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 4 0.2542 0.78222 0.000 0.084 0.012 0.904
#> SRR1383081 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0817 0.90146 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR818600 2 0.2408 0.82515 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1367715 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1387054 4 0.2032 0.78983 0.000 0.028 0.036 0.936
#> SRR1444306 3 0.3837 0.74319 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1322662 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0469 0.90821 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612767 1 0.2868 0.82237 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1489030 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.0592 0.90455 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615225 4 0.2469 0.77915 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1401839 2 0.4866 0.32612 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1379110 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.86904 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0469 0.90822 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1342782 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443003 4 0.3925 0.74273 0.000 0.176 0.016 0.808
#> SRR612839 1 0.1398 0.92852 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1470093 4 0.3764 0.64783 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1395742 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.0921 0.77665 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR664063 2 0.2976 0.82284 0.008 0.872 0.000 0.120
#> SRR1488214 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.4477 0.54656 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1320321 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.91389 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0188 0.86981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367109 4 0.1637 0.79584 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR615311 1 0.0000 0.96321 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.1965 0.80118 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1380716 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0162 0.92563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR613282 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084417 4 0.8502 -0.18016 0.192 0.000 0.252 0.324 0.232
#> SRR1074359 2 0.6337 0.19931 0.000 0.512 0.000 0.296 0.192
#> SRR1419258 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1403366 3 0.2984 0.75893 0.000 0.000 0.860 0.108 0.032
#> SRR665262 2 0.5200 0.55010 0.000 0.688 0.000 0.152 0.160
#> SRR1499740 4 0.1764 0.54747 0.012 0.012 0.000 0.940 0.036
#> SRR1105057 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.2929 0.79331 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR614599 4 0.4088 0.07766 0.000 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR612215 5 0.5658 0.57985 0.000 0.096 0.000 0.332 0.572
#> SRR1094051 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 4 0.8277 -0.20510 0.132 0.000 0.288 0.348 0.232
#> SRR1409263 3 0.0703 0.81266 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1431288 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 5 0.6753 0.37922 0.000 0.268 0.000 0.340 0.392
#> SRR614839 5 0.4582 0.51571 0.000 0.012 0.000 0.416 0.572
#> SRR658433 2 0.3327 0.72218 0.000 0.828 0.000 0.028 0.144
#> SRR1088581 4 0.3171 0.50936 0.000 0.000 0.008 0.816 0.176
#> SRR1328797 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1334512 2 0.1851 0.80826 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1471117 1 0.2966 0.78967 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1311553 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 4 0.5202 0.06100 0.000 0.000 0.348 0.596 0.056
#> SRR654802 3 0.0324 0.81383 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR660066 2 0.0771 0.85609 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1447103 2 0.5049 0.03049 0.000 0.484 0.000 0.484 0.032
#> SRR1402153 4 0.3620 0.40444 0.000 0.108 0.000 0.824 0.068
#> SRR655887 2 0.1478 0.82689 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1408529 3 0.4249 0.37187 0.000 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR658707 1 0.3143 0.77027 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1384371 4 0.6492 -0.21562 0.000 0.348 0.000 0.456 0.196
#> SRR1074670 3 0.5895 0.27144 0.000 0.000 0.456 0.444 0.100
#> SRR1375439 4 0.4621 0.37603 0.000 0.176 0.004 0.744 0.076
#> SRR1329003 4 0.6526 0.30415 0.064 0.000 0.052 0.464 0.420
#> SRR1404837 2 0.0609 0.85850 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1317920 1 0.0703 0.91238 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1455525 4 0.6725 0.00955 0.000 0.000 0.288 0.420 0.292
#> SRR613999 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310836 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.6128 0.51885 0.000 0.000 0.560 0.252 0.188
#> SRR1068855 1 0.3074 0.77836 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1375509 3 0.0162 0.81419 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612227 4 0.3752 0.13259 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1388809 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.6482 0.16344 0.000 0.492 0.000 0.276 0.232
#> SRR1452864 1 0.0290 0.92537 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473078 4 0.1117 0.55093 0.000 0.000 0.016 0.964 0.020
#> SRR615814 5 0.5759 0.59088 0.000 0.108 0.000 0.324 0.568
#> SRR1325225 1 0.6376 0.16644 0.500 0.000 0.000 0.308 0.192
#> SRR1313687 2 0.6227 0.04666 0.000 0.536 0.000 0.280 0.184
#> SRR1358220 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.1195 0.85012 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR660164 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.2011 0.80504 0.000 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR809595 2 0.5591 0.13324 0.000 0.496 0.000 0.432 0.072
#> SRR1403133 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.1282 0.84625 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1344382 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 4 0.2416 0.49593 0.000 0.012 0.000 0.888 0.100
#> SRR1478362 2 0.2130 0.81606 0.000 0.908 0.000 0.012 0.080
#> SRR1392186 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471594 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354270 4 0.1792 0.54290 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR612683 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392901 4 0.1544 0.53634 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1077805 4 0.1943 0.53131 0.000 0.020 0.000 0.924 0.056
#> SRR1360402 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 4 0.5228 0.03411 0.000 0.000 0.356 0.588 0.056
#> SRR1355352 3 0.6664 0.30956 0.000 0.000 0.408 0.360 0.232
#> SRR656247 1 0.1082 0.90436 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR813656 2 0.2753 0.76094 0.000 0.856 0.000 0.008 0.136
#> SRR808244 3 0.4707 0.66576 0.000 0.000 0.708 0.064 0.228
#> SRR1387240 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1385277 2 0.6420 0.13462 0.000 0.484 0.000 0.324 0.192
#> SRR1435248 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 4 0.2569 0.51232 0.000 0.012 0.016 0.896 0.076
#> SRR1408682 2 0.1741 0.83417 0.000 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR1317134 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1453911 2 0.1106 0.85199 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR603164 4 0.3661 0.20804 0.000 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1383259 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330854 3 0.7916 0.28902 0.080 0.000 0.364 0.324 0.232
#> SRR1452423 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468162 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 4 0.1211 0.54781 0.000 0.000 0.016 0.960 0.024
#> SRR1361546 4 0.5423 0.21175 0.000 0.244 0.000 0.644 0.112
#> SRR1486156 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 5 0.5111 0.53469 0.000 0.040 0.000 0.408 0.552
#> SRR615635 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.6785 -0.32340 0.000 0.340 0.000 0.376 0.284
#> SRR1342739 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0794 0.81210 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR662126 2 0.1331 0.84895 0.000 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1464601 2 0.1018 0.85192 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1071594 2 0.6102 0.13211 0.000 0.560 0.000 0.264 0.176
#> SRR612539 5 0.5744 0.47382 0.000 0.332 0.000 0.104 0.564
#> SRR602010 2 0.1893 0.83508 0.000 0.928 0.000 0.024 0.048
#> SRR810249 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818773 4 0.4636 0.44287 0.032 0.004 0.004 0.708 0.252
#> SRR1336569 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.5164 0.64380 0.000 0.000 0.672 0.096 0.232
#> SRR1334247 4 0.1399 0.54834 0.000 0.000 0.020 0.952 0.028
#> SRR661639 5 0.6034 0.09898 0.256 0.000 0.000 0.172 0.572
#> SRR613222 5 0.5685 0.54357 0.000 0.084 0.000 0.396 0.520
#> SRR1459937 4 0.6388 0.20310 0.000 0.240 0.000 0.516 0.244
#> SRR2185018 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR655732 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.5728 0.31460 0.000 0.000 0.484 0.432 0.084
#> SRR661074 3 0.0794 0.81210 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1349851 1 0.4503 0.43182 0.664 0.312 0.000 0.000 0.024
#> SRR1405123 2 0.4981 0.52808 0.000 0.704 0.000 0.108 0.188
#> SRR661096 2 0.0771 0.85609 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1320225 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.6526 0.30415 0.064 0.000 0.052 0.464 0.420
#> SRR1307677 2 0.2773 0.73044 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1466512 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658212 5 0.5828 0.55262 0.000 0.100 0.000 0.380 0.520
#> SRR1430525 3 0.3053 0.69238 0.000 0.000 0.828 0.164 0.008
#> SRR1344422 4 0.6271 -0.18400 0.000 0.196 0.000 0.532 0.272
#> SRR1353924 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.7983 -0.11233 0.344 0.000 0.088 0.340 0.228
#> SRR1487570 4 0.8538 0.11111 0.276 0.240 0.000 0.292 0.192
#> SRR627431 5 0.4235 0.49837 0.000 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1418561 3 0.6635 0.31510 0.000 0.000 0.416 0.360 0.224
#> SRR1448029 4 0.1018 0.55050 0.000 0.000 0.016 0.968 0.016
#> SRR813802 1 0.3707 0.74066 0.768 0.000 0.004 0.008 0.220
#> SRR815020 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612395 2 0.3724 0.67963 0.000 0.788 0.000 0.184 0.028
#> SRR603116 2 0.1831 0.82600 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1323152 4 0.1300 0.55417 0.000 0.000 0.016 0.956 0.028
#> SRR1368264 2 0.0703 0.85722 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1326624 1 0.0162 0.92563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429265 3 0.0162 0.81419 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1327702 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615611 5 0.4658 0.52438 0.000 0.016 0.000 0.408 0.576
#> SRR1486799 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096174 2 0.0510 0.86021 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR815044 2 0.0510 0.86007 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1338560 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.4437 0.06881 0.000 0.532 0.000 0.004 0.464
#> SRR1480038 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659436 4 0.1270 0.53319 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR613699 5 0.5498 0.57692 0.000 0.076 0.000 0.356 0.568
#> SRR1436563 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615323 2 0.0162 0.86397 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1330327 4 0.6673 0.09367 0.000 0.380 0.000 0.388 0.232
#> SRR1489950 2 0.0510 0.85984 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1431927 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.1310 0.80880 0.000 0.000 0.956 0.020 0.024
#> SRR1444002 1 0.3875 0.72672 0.756 0.000 0.004 0.012 0.228
#> SRR1318444 4 0.3421 0.48818 0.000 0.008 0.000 0.788 0.204
#> SRR600656 4 0.6696 0.09442 0.000 0.372 0.000 0.388 0.240
#> SRR658766 5 0.6657 0.11636 0.000 0.000 0.232 0.352 0.416
#> SRR655946 4 0.1197 0.53558 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR817282 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0794 0.81204 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1406418 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090265 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.4959 0.57633 0.000 0.712 0.000 0.160 0.128
#> SRR1471965 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 4 0.2732 0.41714 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR662498 4 0.1914 0.52567 0.000 0.016 0.000 0.924 0.060
#> SRR1376764 4 0.1364 0.53725 0.000 0.012 0.000 0.952 0.036
#> SRR1377006 4 0.2248 0.53260 0.000 0.012 0.000 0.900 0.088
#> SRR656860 5 0.6063 0.54873 0.000 0.256 0.000 0.176 0.568
#> SRR1480547 2 0.2864 0.74853 0.000 0.852 0.000 0.012 0.136
#> SRR1452515 4 0.0324 0.55192 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1324390 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615273 5 0.6645 -0.07302 0.376 0.000 0.000 0.224 0.400
#> SRR601695 5 0.4210 0.50218 0.000 0.000 0.000 0.412 0.588
#> SRR820907 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812773 2 0.3152 0.78895 0.052 0.876 0.000 0.044 0.028
#> SRR1405984 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472794 2 0.0404 0.86084 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1365448 1 0.5535 0.59901 0.664 0.000 0.016 0.088 0.232
#> SRR1095720 3 0.0162 0.81419 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435626 4 0.1626 0.54817 0.000 0.000 0.016 0.940 0.044
#> SRR1080766 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332299 3 0.3741 0.62511 0.000 0.000 0.732 0.264 0.004
#> SRR1467966 4 0.6140 -0.14691 0.000 0.000 0.372 0.492 0.136
#> SRR1320579 4 0.1892 0.53743 0.000 0.000 0.004 0.916 0.080
#> SRR1319710 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1326604 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.2020 0.75305 0.000 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR662245 4 0.6102 -0.47334 0.000 0.124 0.000 0.440 0.436
#> SRR1074719 2 0.0404 0.86158 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR816226 1 0.6557 0.02299 0.448 0.000 0.000 0.340 0.212
#> SRR601387 5 0.5143 0.29008 0.000 0.428 0.000 0.040 0.532
#> SRR614575 2 0.0865 0.85424 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1353900 2 0.4021 0.65402 0.000 0.780 0.000 0.052 0.168
#> SRR662906 3 0.6292 0.08060 0.000 0.000 0.448 0.152 0.400
#> SRR1350832 2 0.4637 0.57007 0.000 0.728 0.000 0.076 0.196
#> SRR1403280 2 0.0162 0.86389 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313969 2 0.6646 -0.13531 0.000 0.396 0.000 0.380 0.224
#> SRR1388528 1 0.3246 0.78218 0.808 0.000 0.000 0.008 0.184
#> SRR1452912 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.2653 0.80667 0.052 0.900 0.000 0.020 0.028
#> SRR655399 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1319753 2 0.0703 0.85722 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR818901 3 0.4661 0.57085 0.000 0.000 0.656 0.312 0.032
#> SRR607067 5 0.5813 0.40428 0.000 0.328 0.000 0.112 0.560
#> SRR1391420 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4372 0.61781 0.000 0.756 0.000 0.072 0.172
#> SRR661961 4 0.2230 0.52668 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR658259 2 0.3452 0.70974 0.000 0.820 0.000 0.032 0.148
#> SRR1310476 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452696 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1478053 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.1195 0.85012 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1322900 1 0.5128 0.30245 0.580 0.004 0.000 0.380 0.036
#> SRR1309942 2 0.1544 0.82522 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1345760 4 0.6643 0.10971 0.000 0.372 0.000 0.404 0.224
#> SRR1435418 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.1792 0.82335 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1443436 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1571 0.82728 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR661469 4 0.3779 0.27547 0.000 0.012 0.000 0.752 0.236
#> SRR1500323 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0609 0.85901 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1464915 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312406 4 0.2848 0.52602 0.000 0.000 0.004 0.840 0.156
#> SRR1350435 1 0.0162 0.92563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389177 4 0.1216 0.54830 0.000 0.000 0.020 0.960 0.020
#> SRR1368072 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601815 5 0.6087 0.58167 0.000 0.188 0.000 0.244 0.568
#> SRR613330 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.1741 0.83708 0.000 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR1394190 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR816382 4 0.0671 0.55139 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1318839 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1432390 2 0.4660 0.62220 0.000 0.728 0.000 0.080 0.192
#> SRR613126 5 0.4779 0.53670 0.000 0.024 0.000 0.388 0.588
#> SRR1089424 2 0.0880 0.85107 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1347214 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309556 2 0.4808 0.40134 0.000 0.620 0.000 0.348 0.032
#> SRR1456027 2 0.6923 0.00577 0.016 0.440 0.000 0.348 0.196
#> SRR1400551 4 0.6179 0.14556 0.000 0.000 0.216 0.556 0.228
#> SRR1320469 1 0.8145 -0.01804 0.388 0.000 0.120 0.260 0.232
#> SRR614251 5 0.4582 0.51571 0.000 0.012 0.000 0.416 0.572
#> SRR1454310 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615105 5 0.4201 0.50322 0.000 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1433290 3 0.0290 0.81420 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2166064 5 0.6736 0.09968 0.000 0.260 0.000 0.344 0.396
#> SRR601671 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.2777 0.76998 0.000 0.864 0.000 0.016 0.120
#> SRR1409130 4 0.6444 -0.31709 0.000 0.200 0.000 0.484 0.316
#> SRR659696 2 0.2690 0.75703 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1408249 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663284 5 0.5731 0.58847 0.000 0.104 0.000 0.328 0.568
#> SRR1402794 3 0.5334 0.33117 0.000 0.000 0.512 0.436 0.052
#> SRR614852 5 0.3876 0.48116 0.000 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1348040 2 0.7199 -0.11849 0.032 0.396 0.000 0.384 0.188
#> SRR1489610 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1488091 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1444501 3 0.2732 0.70139 0.000 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1415773 2 0.0609 0.85850 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1388832 4 0.6393 0.25091 0.224 0.000 0.004 0.540 0.232
#> SRR1394637 1 0.3455 0.75773 0.784 0.000 0.000 0.008 0.208
#> SRR606974 5 0.5641 0.56929 0.000 0.088 0.000 0.356 0.556
#> SRR662918 2 0.5594 0.36594 0.000 0.632 0.000 0.136 0.232
#> SRR817421 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608264 3 0.6361 0.33891 0.000 0.000 0.484 0.340 0.176
#> SRR1318560 3 0.6998 0.30316 0.012 0.000 0.400 0.356 0.232
#> SRR1454117 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0162 0.92563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615044 5 0.4074 0.32050 0.000 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1432743 4 0.1216 0.54830 0.000 0.000 0.020 0.960 0.020
#> SRR1388873 2 0.0290 0.86307 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353517 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1357148 4 0.1018 0.55068 0.000 0.000 0.016 0.968 0.016
#> SRR1406008 2 0.0510 0.86007 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1396786 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1446564 1 0.1041 0.89575 0.964 0.032 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318465 4 0.2017 0.51511 0.000 0.008 0.000 0.912 0.080
#> SRR1431083 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.1205 0.85035 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR655170 5 0.6058 0.57785 0.000 0.136 0.000 0.336 0.528
#> SRR1087825 4 0.6608 0.14733 0.000 0.256 0.000 0.460 0.284
#> SRR662019 4 0.3521 0.46549 0.000 0.000 0.004 0.764 0.232
#> SRR1349209 4 0.3246 0.50583 0.000 0.008 0.000 0.808 0.184
#> SRR1326161 5 0.6422 0.54389 0.000 0.196 0.000 0.316 0.488
#> SRR1345284 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 5 0.6063 0.54873 0.000 0.256 0.000 0.176 0.568
#> SRR1454328 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489286 1 0.1043 0.90361 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1092349 2 0.2036 0.82887 0.036 0.928 0.000 0.008 0.028
#> SRR1408183 4 0.4798 -0.02035 0.000 0.000 0.396 0.580 0.024
#> SRR1084369 4 0.0771 0.55424 0.000 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR598452 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR660709 5 0.4242 0.48558 0.000 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR809444 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0992 0.90717 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1326292 4 0.6526 0.30415 0.064 0.000 0.052 0.464 0.420
#> SRR657139 5 0.6441 -0.28565 0.000 0.000 0.344 0.188 0.468
#> SRR1440744 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323087 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.6260 -0.06136 0.000 0.172 0.000 0.516 0.312
#> SRR1381775 1 0.0865 0.90982 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1363908 1 0.0162 0.92563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658989 4 0.0912 0.54951 0.000 0.012 0.000 0.972 0.016
#> SRR1353663 1 0.3160 0.78260 0.808 0.000 0.004 0.000 0.188
#> SRR811771 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813983 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819054 2 0.2806 0.73938 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1367988 2 0.6625 -0.08380 0.000 0.412 0.000 0.368 0.220
#> SRR1331922 1 0.4247 0.69621 0.792 0.144 0.000 0.036 0.028
#> SRR615479 5 0.6496 0.46636 0.004 0.280 0.000 0.204 0.512
#> SRR1375796 2 0.5555 0.38657 0.000 0.644 0.000 0.152 0.204
#> SRR1386991 2 0.4562 0.50420 0.000 0.676 0.000 0.292 0.032
#> SRR1355217 2 0.4442 0.52269 0.000 0.688 0.000 0.284 0.028
#> SRR1356290 4 0.6642 -0.27235 0.000 0.308 0.000 0.444 0.248
#> SRR659507 4 0.5567 0.05961 0.000 0.196 0.000 0.644 0.160
#> SRR663296 1 0.3123 0.78638 0.812 0.000 0.004 0.000 0.184
#> SRR598044 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661155 5 0.6443 0.08411 0.000 0.180 0.000 0.376 0.444
#> SRR1414727 4 0.5994 0.36579 0.052 0.000 0.068 0.640 0.240
#> SRR663477 1 0.0162 0.92563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354489 4 0.1774 0.54686 0.000 0.000 0.052 0.932 0.016
#> SRR1377800 4 0.6098 0.18384 0.000 0.000 0.196 0.568 0.236
#> SRR614611 5 0.4375 0.50588 0.000 0.004 0.000 0.420 0.576
#> SRR655052 2 0.2570 0.80150 0.000 0.888 0.000 0.028 0.084
#> SRR1478968 4 0.7485 0.11251 0.040 0.348 0.000 0.376 0.236
#> SRR1351280 2 0.0880 0.85098 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR613951 4 0.5966 0.04468 0.000 0.108 0.000 0.460 0.432
#> SRR1418022 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.5725 -0.16849 0.000 0.000 0.084 0.488 0.428
#> SRR1408161 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 4 0.6732 -0.09758 0.000 0.000 0.300 0.416 0.284
#> SRR655040 5 0.5756 0.44830 0.000 0.312 0.000 0.112 0.576
#> SRR810225 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR617829 4 0.4101 -0.05522 0.000 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1402328 2 0.2011 0.80504 0.000 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR1480455 4 0.6740 -0.37125 0.000 0.268 0.000 0.404 0.328
#> SRR1442104 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453416 1 0.2583 0.83254 0.864 0.000 0.004 0.000 0.132
#> SRR1481396 3 0.0865 0.81309 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1414314 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663026 5 0.6063 0.54873 0.000 0.256 0.000 0.176 0.568
#> SRR1478386 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 4 0.5478 0.44472 0.000 0.000 0.164 0.656 0.180
#> SRR1370572 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467567 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468532 2 0.7208 -0.08893 0.156 0.408 0.000 0.392 0.044
#> SRR1310735 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440101 4 0.6689 0.11448 0.000 0.344 0.000 0.412 0.244
#> SRR660260 4 0.4060 0.08141 0.000 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1071231 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.6294 0.24545 0.000 0.524 0.000 0.284 0.192
#> SRR1337173 4 0.3888 0.38282 0.000 0.056 0.000 0.796 0.148
#> SRR1396250 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2166376 3 0.0404 0.81414 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR659816 5 0.4256 0.48501 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR1401379 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR600981 4 0.5039 0.11372 0.000 0.032 0.000 0.512 0.456
#> SRR1398335 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR660115 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.5093 0.50569 0.000 0.696 0.000 0.124 0.180
#> SRR1359780 2 0.3123 0.72037 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1490037 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR627439 2 0.0609 0.85963 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1397156 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0609 0.85695 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1319648 2 0.4179 0.64958 0.000 0.776 0.000 0.072 0.152
#> SRR1092985 1 0.3643 0.74936 0.776 0.000 0.004 0.008 0.212
#> SRR656409 5 0.6080 0.55435 0.000 0.248 0.000 0.184 0.568
#> SRR1468658 4 0.1965 0.53241 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1390437 2 0.3215 0.76520 0.000 0.852 0.000 0.092 0.056
#> SRR658057 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612635 5 0.6031 0.58791 0.000 0.164 0.000 0.268 0.568
#> SRR1351480 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436651 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441590 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409575 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659911 5 0.6098 0.56103 0.000 0.236 0.000 0.196 0.568
#> SRR1085519 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1345894 4 0.1300 0.55254 0.000 0.000 0.016 0.956 0.028
#> SRR1442928 2 0.1386 0.84701 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016
#> SRR1464681 2 0.4333 0.65241 0.000 0.752 0.000 0.060 0.188
#> SRR1418880 1 0.3109 0.77434 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1309070 4 0.1117 0.54908 0.000 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR1365426 2 0.1596 0.84442 0.012 0.948 0.000 0.012 0.028
#> SRR1487947 4 0.8496 -0.11002 0.292 0.000 0.180 0.296 0.232
#> SRR659708 5 0.5871 -0.04810 0.000 0.000 0.212 0.184 0.604
#> SRR603236 4 0.3081 0.41606 0.000 0.012 0.000 0.832 0.156
#> SRR660673 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.3715 0.60040 0.000 0.736 0.000 0.004 0.260
#> SRR1087245 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0404 0.86153 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR613426 1 0.7960 -0.10802 0.376 0.104 0.000 0.184 0.336
#> SRR613879 5 0.6059 0.55311 0.000 0.244 0.000 0.184 0.572
#> SRR1385101 2 0.6320 0.19341 0.392 0.504 0.000 0.064 0.040
#> SRR1387966 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458852 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.1608 0.87780 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1349231 2 0.5399 0.17289 0.440 0.516 0.000 0.016 0.028
#> SRR1376249 3 0.0162 0.81419 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321987 2 0.0162 0.86389 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR662653 2 0.6180 -0.11229 0.000 0.496 0.000 0.144 0.360
#> SRR1390027 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 5 0.5929 0.48754 0.000 0.104 0.000 0.432 0.464
#> SRR1383081 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.3039 0.72999 0.000 0.836 0.000 0.012 0.152
#> SRR605101 2 0.0671 0.85813 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR818600 2 0.5164 0.45571 0.000 0.672 0.000 0.096 0.232
#> SRR1367715 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1387054 4 0.1197 0.53558 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1444306 4 0.4885 0.00364 0.000 0.000 0.400 0.572 0.028
#> SRR1322662 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.2377 0.76749 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR612767 1 0.3461 0.70593 0.772 0.000 0.000 0.004 0.224
#> SRR1489030 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.2863 0.79238 0.000 0.876 0.000 0.060 0.064
#> SRR615225 4 0.4861 0.17744 0.000 0.024 0.000 0.548 0.428
#> SRR1401839 2 0.6220 -0.06678 0.000 0.432 0.000 0.428 0.140
#> SRR1379110 2 0.0162 0.86413 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077288 3 0.0794 0.81210 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1331639 2 0.3994 0.67728 0.000 0.772 0.000 0.040 0.188
#> SRR1342782 2 0.1082 0.85215 0.000 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR1443003 4 0.2813 0.47330 0.000 0.084 0.000 0.876 0.040
#> SRR612839 1 0.5217 0.61712 0.676 0.000 0.004 0.088 0.232
#> SRR1470093 4 0.3413 0.52284 0.000 0.000 0.044 0.832 0.124
#> SRR1395742 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.92701 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.2074 0.52094 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR664063 2 0.3450 0.76697 0.012 0.848 0.000 0.096 0.044
#> SRR1488214 1 0.0703 0.91238 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR654766 2 0.6612 -0.08179 0.000 0.412 0.000 0.372 0.216
#> SRR1320321 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417483 1 0.0162 0.92617 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1394231 2 0.0000 0.86485 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.3264 0.71035 0.000 0.820 0.000 0.016 0.164
#> SRR1389497 3 0.0162 0.81510 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1367109 4 0.0290 0.55008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR615311 1 0.0703 0.91744 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.3812 0.68302 0.000 0.772 0.004 0.056 0.000 0.168
#> SRR1380716 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR612803 1 0.0363 0.89704 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 4 0.6610 -0.00796 0.184 0.000 0.324 0.452 0.032 0.008
#> SRR1074359 4 0.7076 0.47387 0.000 0.316 0.160 0.412 0.000 0.112
#> SRR1419258 5 0.0508 0.92206 0.000 0.000 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1403366 5 0.3906 0.63977 0.000 0.000 0.216 0.032 0.744 0.008
#> SRR665262 2 0.5368 0.52554 0.000 0.616 0.016 0.116 0.000 0.252
#> SRR1499740 3 0.3699 0.65513 0.016 0.016 0.816 0.120 0.000 0.032
#> SRR1105057 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1439742 1 0.3797 0.46134 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4972 0.25339 0.000 0.000 0.536 0.072 0.000 0.392
#> SRR612215 6 0.3017 0.71523 0.000 0.064 0.060 0.016 0.000 0.860
#> SRR1094051 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0363 0.89682 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1393449 4 0.6719 -0.06253 0.128 0.000 0.348 0.452 0.064 0.008
#> SRR1409263 5 0.0405 0.92621 0.000 0.000 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 6 0.6527 0.44116 0.000 0.296 0.056 0.164 0.000 0.484
#> SRR614839 6 0.2531 0.68836 0.000 0.000 0.132 0.012 0.000 0.856
#> SRR658433 2 0.3534 0.61548 0.000 0.740 0.000 0.016 0.000 0.244
#> SRR1088581 3 0.4492 0.34928 0.000 0.000 0.620 0.340 0.004 0.036
#> SRR1328797 5 0.0146 0.92759 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1334512 2 0.4092 0.64268 0.000 0.740 0.004 0.060 0.000 0.196
#> SRR1471117 1 0.3797 0.46134 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354955 3 0.2476 0.71564 0.000 0.000 0.880 0.024 0.092 0.004
#> SRR654802 5 0.0508 0.91970 0.000 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR660066 2 0.1010 0.82693 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1447103 2 0.5987 0.09370 0.000 0.516 0.336 0.112 0.000 0.036
#> SRR1402153 3 0.2965 0.69693 0.000 0.076 0.864 0.024 0.000 0.036
#> SRR655887 2 0.3417 0.73029 0.000 0.812 0.004 0.052 0.000 0.132
#> SRR1408529 3 0.3736 0.58638 0.000 0.000 0.716 0.008 0.268 0.008
#> SRR658707 1 0.4827 0.44121 0.568 0.000 0.004 0.376 0.000 0.052
#> SRR1384371 2 0.6809 -0.18239 0.000 0.412 0.232 0.052 0.000 0.304
#> SRR1074670 3 0.4093 0.62844 0.000 0.000 0.736 0.056 0.204 0.004
#> SRR1375439 3 0.6251 0.20932 0.000 0.136 0.592 0.160 0.000 0.112
#> SRR1329003 4 0.4468 0.26624 0.028 0.000 0.128 0.772 0.028 0.044
#> SRR1404837 2 0.2633 0.75823 0.000 0.864 0.000 0.104 0.000 0.032
#> SRR1317920 1 0.2263 0.79212 0.884 0.000 0.000 0.100 0.000 0.016
#> SRR1455525 4 0.7184 -0.02557 0.000 0.000 0.320 0.364 0.224 0.092
#> SRR613999 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.6386 0.28446 0.000 0.000 0.480 0.040 0.312 0.168
#> SRR1068855 1 0.3944 0.44328 0.568 0.000 0.000 0.428 0.000 0.004
#> SRR1375509 5 0.0146 0.92821 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR612227 3 0.3586 0.60252 0.000 0.000 0.756 0.028 0.000 0.216
#> SRR1388809 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1413872 4 0.6906 0.48662 0.000 0.288 0.120 0.460 0.000 0.132
#> SRR1452864 1 0.1124 0.87254 0.956 0.000 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR1473078 3 0.0951 0.74651 0.000 0.000 0.968 0.020 0.008 0.004
#> SRR615814 6 0.3659 0.71998 0.000 0.052 0.092 0.036 0.000 0.820
#> SRR1325225 4 0.6987 0.31511 0.304 0.000 0.148 0.436 0.000 0.112
#> SRR1313687 2 0.6331 0.15286 0.000 0.508 0.124 0.060 0.000 0.308
#> SRR1358220 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1096662 2 0.0520 0.83175 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1487746 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.2666 0.76510 0.000 0.872 0.008 0.092 0.000 0.028
#> SRR660164 2 0.0260 0.82996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR815783 2 0.3419 0.71770 0.000 0.804 0.004 0.040 0.000 0.152
#> SRR809595 2 0.6821 0.18241 0.000 0.488 0.260 0.120 0.000 0.132
#> SRR1403133 2 0.0520 0.82878 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR815470 2 0.3013 0.73813 0.000 0.844 0.000 0.068 0.000 0.088
#> SRR1344382 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.1984 0.72624 0.000 0.000 0.912 0.032 0.000 0.056
#> SRR1478362 2 0.4050 0.63824 0.000 0.752 0.000 0.152 0.000 0.096
#> SRR1392186 2 0.0922 0.83009 0.000 0.968 0.004 0.024 0.000 0.004
#> SRR1347937 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.3487 0.61721 0.000 0.000 0.788 0.168 0.000 0.044
#> SRR612683 2 0.0692 0.83015 0.000 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1392901 3 0.2039 0.72140 0.000 0.000 0.904 0.076 0.000 0.020
#> SRR1077805 3 0.1515 0.74484 0.000 0.008 0.944 0.020 0.000 0.028
#> SRR1360402 2 0.0405 0.83133 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1406112 3 0.2728 0.70826 0.000 0.000 0.864 0.032 0.100 0.004
#> SRR1355352 4 0.5940 -0.15095 0.000 0.000 0.368 0.456 0.168 0.008
#> SRR656247 1 0.2311 0.78686 0.880 0.000 0.000 0.104 0.000 0.016
#> SRR813656 2 0.4853 0.55798 0.000 0.644 0.000 0.108 0.000 0.248
#> SRR808244 5 0.4985 0.34234 0.000 0.000 0.036 0.460 0.488 0.016
#> SRR1387240 2 0.0692 0.83047 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1408595 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.6915 0.48286 0.000 0.284 0.144 0.460 0.000 0.112
#> SRR1435248 2 0.0837 0.83102 0.000 0.972 0.004 0.020 0.000 0.004
#> SRR1419110 3 0.3877 0.57741 0.000 0.004 0.768 0.036 0.008 0.184
#> SRR1408682 2 0.3317 0.73273 0.000 0.836 0.024 0.104 0.000 0.036
#> SRR1317134 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.1003 0.82378 0.000 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1453911 2 0.2612 0.78395 0.000 0.868 0.008 0.108 0.000 0.016
#> SRR603164 3 0.2630 0.72304 0.000 0.004 0.872 0.032 0.000 0.092
#> SRR1383259 2 0.1003 0.82919 0.000 0.964 0.004 0.028 0.000 0.004
#> SRR1330854 4 0.6931 -0.04955 0.088 0.000 0.316 0.456 0.132 0.008
#> SRR1452423 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.1194 0.82757 0.000 0.956 0.004 0.032 0.000 0.008
#> SRR1468162 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0806 0.74868 0.000 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1361546 3 0.7613 -0.25035 0.000 0.248 0.332 0.236 0.000 0.184
#> SRR1486156 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 6 0.3811 0.70484 0.000 0.032 0.136 0.036 0.000 0.796
#> SRR615635 2 0.0508 0.83127 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1385411 6 0.6492 0.32789 0.000 0.368 0.124 0.064 0.000 0.444
#> SRR1342739 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 5 0.0520 0.92459 0.000 0.000 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR662126 2 0.3268 0.73994 0.000 0.824 0.000 0.100 0.000 0.076
#> SRR1464601 2 0.1442 0.82485 0.000 0.944 0.004 0.040 0.000 0.012
#> SRR1071594 2 0.6308 0.17983 0.000 0.516 0.124 0.060 0.000 0.300
#> SRR612539 6 0.2624 0.69695 0.000 0.124 0.020 0.000 0.000 0.856
#> SRR602010 2 0.3223 0.73928 0.000 0.836 0.008 0.104 0.000 0.052
#> SRR810249 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR818773 4 0.5979 -0.08184 0.032 0.004 0.348 0.516 0.000 0.100
#> SRR1336569 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0806 0.82590 0.000 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1442754 4 0.5726 -0.27078 0.000 0.000 0.128 0.452 0.412 0.008
#> SRR1334247 3 0.1251 0.74821 0.000 0.000 0.956 0.024 0.008 0.012
#> SRR661639 6 0.6159 0.18344 0.064 0.000 0.080 0.408 0.000 0.448
#> SRR613222 6 0.5077 0.67732 0.000 0.092 0.124 0.072 0.000 0.712
#> SRR1459937 4 0.7159 0.45053 0.000 0.188 0.236 0.444 0.000 0.132
#> SRR2185018 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0820 0.83128 0.000 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR809348 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.4063 0.62518 0.000 0.000 0.736 0.052 0.208 0.004
#> SRR661074 5 0.0520 0.92459 0.000 0.000 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1349851 1 0.4542 0.53145 0.724 0.176 0.000 0.084 0.000 0.016
#> SRR1405123 2 0.5166 0.41374 0.000 0.608 0.020 0.068 0.000 0.304
#> SRR661096 2 0.0935 0.82802 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1320225 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4468 0.26624 0.028 0.000 0.128 0.772 0.028 0.044
#> SRR1307677 2 0.4815 0.48156 0.000 0.644 0.012 0.060 0.000 0.284
#> SRR1466512 2 0.0922 0.82893 0.000 0.968 0.004 0.024 0.000 0.004
#> SRR658212 6 0.4737 0.69716 0.000 0.080 0.132 0.052 0.000 0.736
#> SRR1430525 5 0.4433 0.40033 0.000 0.000 0.344 0.040 0.616 0.000
#> SRR1344422 6 0.7068 0.45286 0.000 0.240 0.184 0.120 0.000 0.456
#> SRR1353924 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1314832 4 0.6155 0.02419 0.240 0.000 0.304 0.448 0.000 0.008
#> SRR1487570 4 0.8061 0.44755 0.168 0.156 0.112 0.448 0.000 0.116
#> SRR627431 6 0.2613 0.68412 0.000 0.000 0.140 0.012 0.000 0.848
#> SRR1418561 3 0.5899 0.38087 0.000 0.000 0.520 0.264 0.208 0.008
#> SRR1448029 3 0.1065 0.74735 0.000 0.000 0.964 0.020 0.008 0.008
#> SRR813802 1 0.4550 0.36877 0.524 0.000 0.020 0.448 0.000 0.008
#> SRR815020 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1151 0.82965 0.000 0.956 0.000 0.032 0.000 0.012
#> SRR1435311 2 0.1116 0.82808 0.000 0.960 0.004 0.028 0.000 0.008
#> SRR612395 2 0.4982 0.55877 0.000 0.708 0.144 0.108 0.000 0.040
#> SRR603116 2 0.2744 0.77282 0.000 0.864 0.000 0.064 0.000 0.072
#> SRR1323152 3 0.0717 0.74710 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1368264 2 0.2255 0.78231 0.000 0.892 0.000 0.080 0.000 0.028
#> SRR1326624 1 0.0458 0.89467 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1429265 5 0.0146 0.92821 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.2355 0.69859 0.000 0.004 0.112 0.008 0.000 0.876
#> SRR1486799 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.1367 0.81378 0.000 0.944 0.000 0.044 0.000 0.012
#> SRR815044 2 0.2066 0.79303 0.000 0.904 0.000 0.072 0.000 0.024
#> SRR1338560 2 0.1003 0.82917 0.000 0.964 0.004 0.028 0.000 0.004
#> SRR615862 6 0.4170 0.50098 0.000 0.308 0.000 0.032 0.000 0.660
#> SRR1480038 2 0.0291 0.83118 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR659436 3 0.1793 0.74735 0.000 0.000 0.928 0.036 0.004 0.032
#> SRR613699 6 0.2776 0.71312 0.000 0.032 0.104 0.004 0.000 0.860
#> SRR1436563 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.1003 0.82544 0.000 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1330327 4 0.7191 0.48866 0.000 0.232 0.192 0.440 0.000 0.136
#> SRR1489950 2 0.1644 0.82042 0.000 0.932 0.004 0.052 0.000 0.012
#> SRR1431927 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 5 0.2404 0.82239 0.000 0.000 0.112 0.016 0.872 0.000
#> SRR1444002 1 0.4627 0.34634 0.512 0.000 0.024 0.456 0.000 0.008
#> SRR1318444 3 0.5387 0.16280 0.000 0.004 0.544 0.340 0.000 0.112
#> SRR600656 4 0.7178 0.49137 0.000 0.232 0.184 0.444 0.000 0.140
#> SRR658766 6 0.5062 0.20623 0.000 0.000 0.392 0.028 0.032 0.548
#> SRR655946 3 0.1341 0.74449 0.000 0.000 0.948 0.024 0.000 0.028
#> SRR817282 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 5 0.0622 0.92456 0.000 0.000 0.008 0.012 0.980 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.6143 0.42567 0.000 0.560 0.056 0.132 0.000 0.252
#> SRR1471965 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.2450 0.72179 0.000 0.000 0.868 0.016 0.000 0.116
#> SRR662498 3 0.3377 0.67208 0.000 0.016 0.828 0.112 0.000 0.044
#> SRR1376764 3 0.1230 0.74579 0.000 0.008 0.956 0.008 0.000 0.028
#> SRR1377006 3 0.4293 0.59743 0.000 0.016 0.748 0.164 0.000 0.072
#> SRR656860 6 0.2715 0.70721 0.000 0.112 0.024 0.004 0.000 0.860
#> SRR1480547 2 0.4778 0.49708 0.000 0.652 0.012 0.060 0.000 0.276
#> SRR1452515 3 0.1088 0.74824 0.000 0.000 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR1324390 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615273 4 0.7215 0.10745 0.260 0.000 0.132 0.424 0.000 0.184
#> SRR601695 6 0.2402 0.68536 0.000 0.000 0.140 0.004 0.000 0.856
#> SRR820907 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR812773 2 0.5476 0.56400 0.112 0.704 0.040 0.108 0.000 0.036
#> SRR1405984 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1472794 2 0.1168 0.82755 0.000 0.956 0.000 0.028 0.000 0.016
#> SRR1365448 1 0.5301 0.23705 0.460 0.000 0.076 0.456 0.000 0.008
#> SRR1095720 5 0.0291 0.92798 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1435626 3 0.1149 0.74457 0.000 0.000 0.960 0.024 0.008 0.008
#> SRR1080766 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1377862 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.3907 0.30331 0.000 0.000 0.588 0.004 0.408 0.000
#> SRR1467966 3 0.4292 0.62754 0.000 0.000 0.748 0.120 0.124 0.008
#> SRR1320579 3 0.2822 0.69946 0.000 0.000 0.856 0.108 0.004 0.032
#> SRR1319710 2 0.0993 0.82358 0.000 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR1326604 2 0.0146 0.83104 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098879 5 0.2402 0.79564 0.000 0.000 0.140 0.004 0.856 0.000
#> SRR662245 6 0.6106 0.41939 0.000 0.100 0.364 0.048 0.000 0.488
#> SRR1074719 2 0.1644 0.82042 0.000 0.932 0.004 0.052 0.000 0.012
#> SRR816226 4 0.7093 0.32032 0.260 0.000 0.176 0.444 0.000 0.120
#> SRR601387 6 0.2706 0.66615 0.000 0.160 0.008 0.000 0.000 0.832
#> SRR614575 2 0.1549 0.81584 0.000 0.936 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR1353900 2 0.4919 0.46682 0.000 0.636 0.016 0.060 0.000 0.288
#> SRR662906 6 0.5780 0.40450 0.000 0.000 0.176 0.016 0.240 0.568
#> SRR1350832 2 0.5110 0.39566 0.000 0.604 0.020 0.060 0.000 0.316
#> SRR1403280 2 0.1410 0.82452 0.000 0.944 0.004 0.044 0.000 0.008
#> SRR1313969 4 0.7154 0.49142 0.000 0.240 0.184 0.444 0.000 0.132
#> SRR1388528 1 0.3830 0.51038 0.620 0.000 0.000 0.376 0.000 0.004
#> SRR1452912 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.4586 0.64600 0.092 0.760 0.008 0.104 0.000 0.036
#> SRR655399 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.2432 0.76879 0.000 0.876 0.000 0.100 0.000 0.024
#> SRR818901 3 0.4078 0.43627 0.000 0.000 0.640 0.020 0.340 0.000
#> SRR607067 6 0.2963 0.59423 0.000 0.096 0.012 0.036 0.000 0.856
#> SRR1391420 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4970 0.44268 0.000 0.624 0.016 0.060 0.000 0.300
#> SRR661961 3 0.2350 0.73022 0.000 0.000 0.888 0.076 0.000 0.036
#> SRR658259 2 0.4299 0.48242 0.000 0.652 0.000 0.040 0.000 0.308
#> SRR1310476 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1365034 2 0.0717 0.82741 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1478053 2 0.0508 0.83142 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1475300 2 0.0748 0.83068 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1328101 2 0.2887 0.75262 0.000 0.856 0.008 0.104 0.000 0.032
#> SRR1322900 1 0.6121 0.25854 0.568 0.012 0.268 0.116 0.000 0.036
#> SRR1309942 2 0.3368 0.73739 0.000 0.820 0.004 0.060 0.000 0.116
#> SRR1345760 4 0.7168 0.48511 0.000 0.228 0.196 0.444 0.000 0.132
#> SRR1435418 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4321 0.64514 0.000 0.740 0.008 0.160 0.000 0.092
#> SRR1443436 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1719 0.81413 0.000 0.924 0.000 0.016 0.000 0.060
#> SRR661469 3 0.5730 0.31571 0.000 0.032 0.580 0.112 0.000 0.276
#> SRR1500323 2 0.0717 0.82718 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1356705 2 0.1616 0.80915 0.000 0.932 0.000 0.048 0.000 0.020
#> SRR1464915 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.2258 0.71266 0.000 0.000 0.896 0.060 0.000 0.044
#> SRR1350435 1 0.0458 0.89467 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0820 0.74971 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1368072 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR601815 6 0.2658 0.71216 0.000 0.100 0.036 0.000 0.000 0.864
#> SRR613330 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.3058 0.76751 0.000 0.848 0.020 0.108 0.000 0.024
#> SRR1394190 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.1167 0.74943 0.000 0.000 0.960 0.012 0.008 0.020
#> SRR1318839 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.6259 0.34118 0.000 0.396 0.052 0.444 0.000 0.108
#> SRR613126 6 0.3210 0.70225 0.000 0.012 0.124 0.032 0.000 0.832
#> SRR1089424 2 0.3186 0.75446 0.000 0.836 0.004 0.060 0.000 0.100
#> SRR1347214 2 0.1116 0.82808 0.000 0.960 0.004 0.028 0.000 0.008
#> SRR1309556 2 0.5713 0.44201 0.000 0.620 0.208 0.128 0.000 0.044
#> SRR1456027 4 0.7211 0.49362 0.004 0.252 0.168 0.448 0.000 0.128
#> SRR1400551 3 0.4804 0.31058 0.000 0.000 0.540 0.416 0.032 0.012
#> SRR1320469 4 0.6404 0.07220 0.324 0.000 0.196 0.456 0.008 0.016
#> SRR614251 6 0.2572 0.68750 0.000 0.000 0.136 0.012 0.000 0.852
#> SRR1454310 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR615105 6 0.3139 0.68392 0.000 0.000 0.152 0.032 0.000 0.816
#> SRR1433290 5 0.1556 0.86819 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR2166064 4 0.6611 0.27180 0.000 0.100 0.108 0.484 0.000 0.308
#> SRR601671 2 0.0405 0.82931 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR663874 2 0.3744 0.68629 0.000 0.756 0.000 0.044 0.000 0.200
#> SRR1409130 6 0.6656 0.41871 0.000 0.172 0.336 0.056 0.000 0.436
#> SRR659696 2 0.5206 0.23027 0.000 0.572 0.000 0.312 0.000 0.116
#> SRR1408249 2 0.0858 0.82991 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000 0.000
#> SRR663284 6 0.3779 0.71991 0.000 0.060 0.092 0.036 0.000 0.812
#> SRR1402794 3 0.4177 0.54817 0.000 0.000 0.684 0.032 0.280 0.004
#> SRR614852 6 0.3745 0.63334 0.000 0.000 0.116 0.100 0.000 0.784
#> SRR1348040 4 0.7523 0.45226 0.008 0.272 0.220 0.380 0.000 0.120
#> SRR1489610 2 0.0993 0.82358 0.000 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR1488091 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499566 2 0.1049 0.82215 0.000 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1361480 2 0.1745 0.80382 0.000 0.924 0.000 0.056 0.000 0.020
#> SRR1444501 5 0.3151 0.63748 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1415773 2 0.2147 0.78508 0.000 0.896 0.000 0.084 0.000 0.020
#> SRR1388832 4 0.5886 -0.09176 0.140 0.000 0.400 0.448 0.000 0.012
#> SRR1394637 1 0.4189 0.41640 0.552 0.000 0.004 0.436 0.000 0.008
#> SRR606974 6 0.3700 0.70388 0.000 0.024 0.140 0.036 0.000 0.800
#> SRR662918 2 0.5772 0.16986 0.000 0.500 0.024 0.100 0.000 0.376
#> SRR817421 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR608264 3 0.5451 0.54190 0.000 0.000 0.632 0.020 0.176 0.172
#> SRR1318560 4 0.6267 -0.12490 0.012 0.000 0.348 0.456 0.176 0.008
#> SRR1454117 2 0.0622 0.82797 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1312684 1 0.0260 0.89892 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR615044 6 0.4476 0.47088 0.000 0.000 0.064 0.272 0.000 0.664
#> SRR1432743 3 0.0964 0.74986 0.000 0.000 0.968 0.004 0.012 0.016
#> SRR1388873 2 0.1668 0.81879 0.000 0.928 0.004 0.060 0.000 0.008
#> SRR1353517 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.1065 0.74735 0.000 0.000 0.964 0.020 0.008 0.008
#> SRR1406008 2 0.1745 0.80436 0.000 0.924 0.000 0.056 0.000 0.020
#> SRR1396786 2 0.1410 0.82474 0.000 0.944 0.004 0.044 0.000 0.008
#> SRR1446564 1 0.1168 0.86739 0.956 0.016 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.1585 0.74607 0.000 0.012 0.940 0.012 0.000 0.036
#> SRR1431083 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.3657 0.68943 0.000 0.792 0.000 0.108 0.000 0.100
#> SRR655170 6 0.4403 0.70906 0.000 0.076 0.116 0.044 0.000 0.764
#> SRR1087825 4 0.7198 0.46022 0.000 0.168 0.192 0.452 0.000 0.188
#> SRR662019 3 0.3287 0.59742 0.000 0.000 0.768 0.220 0.000 0.012
#> SRR1349209 3 0.4949 0.19454 0.000 0.000 0.548 0.380 0.000 0.072
#> SRR1326161 6 0.5460 0.62604 0.000 0.192 0.112 0.044 0.000 0.652
#> SRR1345284 2 0.0922 0.82930 0.000 0.968 0.004 0.024 0.000 0.004
#> SRR1416672 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 6 0.2715 0.70644 0.000 0.112 0.024 0.004 0.000 0.860
#> SRR1454328 2 0.1268 0.82684 0.000 0.952 0.004 0.036 0.000 0.008
#> SRR1489286 1 0.2664 0.75135 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.4001 0.69987 0.064 0.800 0.004 0.100 0.000 0.032
#> SRR1408183 3 0.2633 0.71146 0.000 0.000 0.864 0.020 0.112 0.004
#> SRR1084369 3 0.0806 0.74737 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR598452 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 6 0.3534 0.52581 0.000 0.000 0.276 0.008 0.000 0.716
#> SRR809444 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1155 0.82849 0.000 0.956 0.004 0.036 0.000 0.004
#> SRR1375774 1 0.1699 0.84125 0.928 0.004 0.004 0.060 0.000 0.004
#> SRR1326292 4 0.4468 0.26624 0.028 0.000 0.128 0.772 0.028 0.044
#> SRR657139 6 0.6505 0.27593 0.000 0.000 0.112 0.312 0.084 0.492
#> SRR1440744 2 0.0717 0.82697 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1353555 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 6 0.7378 0.06188 0.000 0.168 0.160 0.300 0.000 0.372
#> SRR1381775 1 0.1901 0.82309 0.912 0.004 0.000 0.076 0.000 0.008
#> SRR1363908 1 0.0865 0.88139 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.1410 0.82456 0.000 0.944 0.004 0.044 0.000 0.008
#> SRR658989 3 0.1453 0.74567 0.000 0.008 0.944 0.040 0.000 0.008
#> SRR1353663 1 0.3944 0.44328 0.568 0.000 0.000 0.428 0.000 0.004
#> SRR811771 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819054 2 0.4579 0.51039 0.000 0.660 0.004 0.060 0.000 0.276
#> SRR1367988 4 0.7117 0.49229 0.000 0.256 0.172 0.444 0.000 0.128
#> SRR1331922 1 0.4637 0.63290 0.760 0.072 0.028 0.120 0.000 0.020
#> SRR615479 6 0.3873 0.61146 0.000 0.160 0.020 0.040 0.000 0.780
#> SRR1375796 2 0.5194 0.34093 0.000 0.596 0.044 0.036 0.000 0.324
#> SRR1386991 2 0.5463 0.44044 0.000 0.636 0.216 0.116 0.000 0.032
#> SRR1355217 2 0.5180 0.49984 0.000 0.680 0.176 0.108 0.000 0.036
#> SRR1356290 6 0.6863 0.34925 0.000 0.348 0.220 0.056 0.000 0.376
#> SRR659507 3 0.7052 -0.01417 0.000 0.164 0.448 0.120 0.000 0.268
#> SRR663296 1 0.3797 0.46134 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0260 0.82996 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR661155 4 0.6465 0.26034 0.000 0.068 0.120 0.472 0.000 0.340
#> SRR1414727 3 0.5383 0.22435 0.024 0.004 0.480 0.456 0.024 0.012
#> SRR663477 1 0.0363 0.89682 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.1138 0.74865 0.000 0.000 0.960 0.024 0.004 0.012
#> SRR1377800 3 0.4890 0.27815 0.000 0.000 0.516 0.436 0.036 0.012
#> SRR614611 6 0.2572 0.68750 0.000 0.000 0.136 0.012 0.000 0.852
#> SRR655052 2 0.4517 0.60981 0.000 0.732 0.016 0.156 0.000 0.096
#> SRR1478968 4 0.7362 0.49193 0.008 0.228 0.184 0.444 0.000 0.136
#> SRR1351280 2 0.2401 0.80012 0.000 0.892 0.004 0.060 0.000 0.044
#> SRR613951 4 0.6671 0.32232 0.000 0.076 0.144 0.464 0.000 0.316
#> SRR1418022 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 6 0.4788 0.22537 0.000 0.000 0.396 0.028 0.016 0.560
#> SRR1408161 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.5919 0.39865 0.000 0.000 0.556 0.072 0.068 0.304
#> SRR655040 6 0.2577 0.62555 0.000 0.072 0.012 0.032 0.000 0.884
#> SRR810225 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325377 2 0.0260 0.83086 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR617829 3 0.3922 0.43651 0.000 0.000 0.664 0.016 0.000 0.320
#> SRR1402328 2 0.3845 0.67913 0.000 0.768 0.004 0.056 0.000 0.172
#> SRR1480455 6 0.6498 0.44716 0.000 0.316 0.144 0.060 0.000 0.480
#> SRR1442104 5 0.0146 0.92759 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1453416 1 0.3695 0.52320 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1481396 5 0.0520 0.92459 0.000 0.000 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1414314 2 0.0922 0.82893 0.000 0.968 0.004 0.024 0.000 0.004
#> SRR663026 6 0.2573 0.70634 0.000 0.112 0.024 0.000 0.000 0.864
#> SRR1478386 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1458683 3 0.5434 0.33008 0.000 0.000 0.576 0.328 0.056 0.040
#> SRR1370572 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.8074 -0.25008 0.200 0.372 0.256 0.120 0.000 0.052
#> SRR1310735 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.7183 0.48903 0.000 0.228 0.188 0.444 0.000 0.140
#> SRR660260 6 0.5137 0.34108 0.000 0.000 0.284 0.120 0.000 0.596
#> SRR1071231 2 0.0363 0.83113 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.6905 0.42476 0.000 0.352 0.120 0.412 0.000 0.116
#> SRR1337173 3 0.2992 0.70560 0.000 0.032 0.864 0.032 0.000 0.072
#> SRR1396250 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 5 0.0291 0.92798 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR659816 6 0.3420 0.59400 0.000 0.000 0.240 0.012 0.000 0.748
#> SRR1401379 2 0.0993 0.82358 0.000 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR600981 4 0.5864 0.22633 0.000 0.004 0.176 0.468 0.000 0.352
#> SRR1398335 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.1672 0.82334 0.000 0.932 0.004 0.048 0.000 0.016
#> SRR660115 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.5194 0.41931 0.000 0.612 0.028 0.060 0.000 0.300
#> SRR1359780 2 0.4444 0.50354 0.000 0.672 0.012 0.036 0.000 0.280
#> SRR1490037 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.2088 0.79453 0.000 0.904 0.000 0.068 0.000 0.028
#> SRR1397156 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0820 0.83095 0.000 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1319648 2 0.4863 0.49193 0.000 0.648 0.016 0.060 0.000 0.276
#> SRR1092985 1 0.4296 0.40375 0.544 0.000 0.008 0.440 0.000 0.008
#> SRR656409 6 0.2573 0.70634 0.000 0.112 0.024 0.000 0.000 0.864
#> SRR1468658 3 0.3213 0.64183 0.000 0.000 0.808 0.160 0.000 0.032
#> SRR1390437 2 0.4665 0.61847 0.000 0.744 0.048 0.112 0.000 0.096
#> SRR658057 2 0.0405 0.82931 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR612635 6 0.2821 0.71373 0.000 0.096 0.040 0.004 0.000 0.860
#> SRR1351480 2 0.1410 0.82456 0.000 0.944 0.004 0.044 0.000 0.008
#> SRR1436651 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0806 0.82590 0.000 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR614263 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.1036 0.82861 0.000 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR659911 6 0.3586 0.70557 0.000 0.108 0.036 0.036 0.000 0.820
#> SRR1085519 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.1149 0.74836 0.000 0.000 0.960 0.008 0.008 0.024
#> SRR1442928 2 0.3033 0.75012 0.000 0.848 0.108 0.032 0.000 0.012
#> SRR1464681 4 0.6116 0.31724 0.000 0.400 0.036 0.448 0.000 0.116
#> SRR1418880 1 0.4039 0.44263 0.568 0.000 0.000 0.424 0.000 0.008
#> SRR1309070 3 0.1448 0.73954 0.000 0.016 0.948 0.024 0.000 0.012
#> SRR1365426 2 0.3147 0.74397 0.004 0.844 0.008 0.108 0.000 0.036
#> SRR1487947 4 0.7036 0.05064 0.204 0.000 0.260 0.456 0.072 0.008
#> SRR659708 6 0.5744 0.32016 0.000 0.000 0.100 0.332 0.028 0.540
#> SRR603236 3 0.2611 0.71164 0.000 0.012 0.880 0.028 0.000 0.080
#> SRR660673 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0146 0.83100 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.4651 0.00925 0.000 0.484 0.000 0.040 0.000 0.476
#> SRR1087245 2 0.0146 0.83067 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.1218 0.82861 0.000 0.956 0.004 0.028 0.000 0.012
#> SRR613426 4 0.7290 0.30015 0.316 0.028 0.044 0.384 0.000 0.228
#> SRR613879 6 0.2527 0.70668 0.000 0.108 0.024 0.000 0.000 0.868
#> SRR1385101 2 0.6825 -0.08103 0.372 0.436 0.024 0.116 0.000 0.052
#> SRR1387966 2 0.1668 0.81879 0.000 0.928 0.004 0.060 0.000 0.008
#> SRR1458852 2 0.0603 0.83161 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1430489 1 0.2309 0.80714 0.888 0.000 0.000 0.084 0.000 0.028
#> SRR1349231 1 0.6077 0.10316 0.524 0.332 0.008 0.104 0.000 0.032
#> SRR1376249 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.1049 0.83010 0.000 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR662653 6 0.5161 0.27104 0.000 0.416 0.028 0.036 0.000 0.520
#> SRR1390027 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 6 0.6172 0.50485 0.000 0.108 0.316 0.056 0.000 0.520
#> SRR1383081 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2166960 2 0.4635 0.49889 0.000 0.648 0.004 0.060 0.000 0.288
#> SRR605101 2 0.1176 0.82331 0.000 0.956 0.000 0.020 0.000 0.024
#> SRR818600 2 0.5288 0.22021 0.000 0.540 0.020 0.060 0.000 0.380
#> SRR1367715 2 0.0603 0.83069 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000 0.000
#> SRR1351979 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.1341 0.74449 0.000 0.000 0.948 0.024 0.000 0.028
#> SRR1444306 3 0.3514 0.62641 0.000 0.000 0.768 0.020 0.208 0.004
#> SRR1322662 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3782 0.62144 0.000 0.740 0.000 0.036 0.000 0.224
#> SRR612767 1 0.4722 0.50566 0.656 0.004 0.000 0.076 0.000 0.264
#> SRR1489030 2 0.0146 0.83044 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430375 2 0.3760 0.74779 0.000 0.796 0.012 0.064 0.000 0.128
#> SRR615225 4 0.6259 0.27038 0.000 0.024 0.184 0.468 0.000 0.324
#> SRR1401839 2 0.7348 -0.42178 0.000 0.332 0.320 0.236 0.000 0.112
#> SRR1379110 2 0.1268 0.82680 0.000 0.952 0.004 0.036 0.000 0.008
#> SRR1077288 5 0.0520 0.92459 0.000 0.000 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1331639 4 0.5848 0.26251 0.000 0.424 0.020 0.444 0.000 0.112
#> SRR1342782 2 0.2933 0.74780 0.000 0.852 0.008 0.108 0.000 0.032
#> SRR1443003 3 0.2201 0.72982 0.000 0.028 0.912 0.028 0.000 0.032
#> SRR612839 1 0.5218 0.25469 0.468 0.000 0.068 0.456 0.000 0.008
#> SRR1470093 3 0.3526 0.64582 0.000 0.000 0.792 0.172 0.016 0.020
#> SRR1395742 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.2930 0.68359 0.000 0.000 0.840 0.124 0.000 0.036
#> SRR664063 2 0.4636 0.65344 0.008 0.760 0.072 0.108 0.000 0.052
#> SRR1488214 1 0.0865 0.87256 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.7123 0.49372 0.000 0.256 0.168 0.444 0.000 0.132
#> SRR1320321 2 0.0000 0.83067 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.90314 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0405 0.82931 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1488470 2 0.4797 0.48947 0.000 0.648 0.012 0.060 0.000 0.280
#> SRR1389497 5 0.0000 0.92872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.1232 0.74565 0.000 0.004 0.956 0.024 0.000 0.016
#> SRR615311 1 0.1411 0.86430 0.936 0.000 0.000 0.060 0.000 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.477 0.651 0.828 0.4853 0.525 0.525
#> 3 3 0.927 0.924 0.968 0.3540 0.719 0.511
#> 4 4 0.825 0.823 0.921 0.1185 0.886 0.682
#> 5 5 0.839 0.776 0.897 0.0552 0.907 0.685
#> 6 6 0.781 0.644 0.816 0.0454 0.963 0.846
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1380716 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR613282 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1355396 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1084417 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1074359 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR665262 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1499740 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1105057 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1439742 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR612215 1 0.9286 0.02738 0.656 0.344
#> SRR1094051 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1324496 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1393449 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1409263 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1334889 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR614839 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR658433 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1088581 2 0.5294 0.69726 0.120 0.880
#> SRR1328797 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1334512 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1471117 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1311553 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1458220 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR660066 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1447103 1 0.9635 0.52812 0.612 0.388
#> SRR1402153 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR655887 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1408529 2 0.9323 0.58481 0.348 0.652
#> SRR658707 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1384371 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1074670 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.8608 0.24621 0.284 0.716
#> SRR1329003 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1404837 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1455525 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1310836 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1499764 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR658200 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1068855 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1375509 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR612227 2 0.7219 0.66011 0.200 0.800
#> SRR1388809 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1413872 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1473078 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1325225 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1313687 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1358220 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1096662 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1354644 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1401752 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR660164 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR815783 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR809595 1 0.9833 0.50795 0.576 0.424
#> SRR1403133 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR815470 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1432453 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1478362 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1392186 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1431569 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1471594 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1354270 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR612683 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1392901 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1077805 2 0.9909 0.52625 0.444 0.556
#> SRR1360402 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR813656 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR808244 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1387240 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1385277 1 0.0376 0.76129 0.996 0.004
#> SRR1435248 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.6247 0.68137 0.156 0.844
#> SRR1408682 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1370780 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1489307 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1453911 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR603164 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1383259 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1330854 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1452423 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1368574 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1331220 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1361546 2 0.7139 0.46230 0.196 0.804
#> SRR1486156 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR660545 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR615635 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1342739 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1102830 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR662126 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1464601 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR612539 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR602010 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR810249 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1336569 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1368117 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1442754 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR661639 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR613222 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1459937 1 0.1843 0.73502 0.972 0.028
#> SRR2185018 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR655732 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR819261 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR661074 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.7453 0.64470 0.788 0.212
#> SRR1405123 1 0.2603 0.71644 0.956 0.044
#> SRR661096 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1454651 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1307677 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1466512 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1430525 2 0.9286 0.58706 0.344 0.656
#> SRR1344422 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1353924 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1314832 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1487570 1 0.8608 0.59888 0.716 0.284
#> SRR627431 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1418561 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1448029 2 0.5059 0.70046 0.112 0.888
#> SRR813802 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR815020 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1309702 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1435311 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR612395 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR603116 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1326624 2 0.9393 0.00992 0.356 0.644
#> SRR1429265 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR615611 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1486799 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1096174 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR815044 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1338560 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR615862 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1480038 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR659436 2 0.3274 0.72058 0.060 0.940
#> SRR613699 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1436563 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR615323 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1330327 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1489950 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1100588 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1444002 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1318444 2 0.5059 0.69943 0.112 0.888
#> SRR600656 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR658766 2 0.3584 0.71801 0.068 0.932
#> SRR655946 2 0.9909 0.52625 0.444 0.556
#> SRR817282 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1475104 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1090265 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1444120 1 0.1633 0.73915 0.976 0.024
#> SRR1471965 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR612695 2 0.9881 0.53127 0.436 0.564
#> SRR662498 2 0.8713 0.61319 0.292 0.708
#> SRR1376764 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1377006 2 0.9909 0.52625 0.444 0.556
#> SRR656860 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1480547 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1324390 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR615273 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR601695 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR820907 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.7139 0.65474 0.804 0.196
#> SRR1405984 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1472794 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1365448 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1080766 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1332299 2 0.2948 0.72351 0.052 0.948
#> SRR1467966 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1319710 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1326604 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1074719 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR601387 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR614575 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1353900 1 0.2423 0.72124 0.960 0.040
#> SRR662906 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1350832 2 0.9983 0.47561 0.476 0.524
#> SRR1403280 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1313969 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1388528 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1452912 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1400180 1 0.1843 0.74973 0.972 0.028
#> SRR655399 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR818901 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1384138 1 0.1414 0.74336 0.980 0.020
#> SRR661961 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR658259 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1452696 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1365034 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1478053 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1475300 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1328101 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1309942 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1345760 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1402172 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR661675 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR661469 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1500323 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1356705 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1312406 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.9963 0.46733 0.536 0.464
#> SRR1389177 2 0.9323 0.58481 0.348 0.652
#> SRR1368072 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR613330 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1434502 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1481083 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR816382 2 0.9170 0.59361 0.332 0.668
#> SRR1318839 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1432390 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1089424 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1347214 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1309556 1 0.7453 0.64513 0.788 0.212
#> SRR1456027 1 0.7139 0.65428 0.804 0.196
#> SRR1400551 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1320469 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR614251 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1454310 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR615105 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1433290 2 0.7219 0.66011 0.200 0.800
#> SRR2166064 1 0.4022 0.67000 0.920 0.080
#> SRR601671 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR663874 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR659696 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1408249 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1402794 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1348040 1 0.9909 0.49681 0.556 0.444
#> SRR1489610 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1488091 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1499566 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1361480 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1444501 2 0.9000 0.60205 0.316 0.684
#> SRR1415773 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1388832 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1394637 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR606974 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR662918 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1381348 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR608264 2 0.9248 0.58925 0.340 0.660
#> SRR1318560 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1454117 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR615044 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1432743 2 0.9661 0.55809 0.392 0.608
#> SRR1388873 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1357148 2 0.2423 0.72739 0.040 0.960
#> SRR1406008 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1396786 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.9427 0.55025 0.640 0.360
#> SRR1318465 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1431083 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR607117 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1087825 1 0.6531 0.60575 0.832 0.168
#> SRR662019 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1349209 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1345284 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.9954 0.47436 0.540 0.460
#> SRR663356 1 0.0376 0.75935 0.996 0.004
#> SRR1454328 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1489286 2 0.6438 0.52322 0.164 0.836
#> SRR1092349 1 0.2603 0.74140 0.956 0.044
#> SRR1408183 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.8499 0.62251 0.276 0.724
#> SRR598452 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR809444 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1089901 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1326292 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR657139 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1440744 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1323087 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1452334 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1381775 1 0.9427 0.55024 0.640 0.360
#> SRR1363908 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1319626 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR658989 2 0.0672 0.73721 0.008 0.992
#> SRR1353663 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR811771 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR813983 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR815825 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR819054 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1367988 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR615479 1 0.7950 0.62496 0.760 0.240
#> SRR1375796 1 0.9686 -0.15949 0.604 0.396
#> SRR1386991 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1355217 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1356290 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR659507 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR663296 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR598044 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR661155 1 0.4022 0.67000 0.920 0.080
#> SRR1414727 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1354489 2 0.9323 0.58481 0.348 0.652
#> SRR1377800 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR655052 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.9909 0.49703 0.556 0.444
#> SRR1351280 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR613951 1 0.3584 0.68657 0.932 0.068
#> SRR1418022 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR661901 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR657054 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR655040 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR810225 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1325377 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR617829 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1402328 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1442104 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1453416 2 0.9580 -0.07596 0.380 0.620
#> SRR1481396 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1414314 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR663026 1 0.6247 0.54572 0.844 0.156
#> SRR1478386 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1467567 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1468532 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1310735 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1440101 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR660260 2 0.0938 0.73618 0.012 0.988
#> SRR1071231 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1459125 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1337173 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1396250 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1401379 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.9710 0.54969 0.400 0.600
#> SRR1398335 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1397218 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1407950 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1359780 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR627439 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1410221 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1319648 1 0.0938 0.75151 0.988 0.012
#> SRR1092985 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR656409 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1468658 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1390437 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR658057 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1351480 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1441590 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR659590 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1409575 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1085519 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1442928 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1464681 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1418880 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1309070 2 0.9896 0.52878 0.440 0.560
#> SRR1365426 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1487947 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR659708 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR603236 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR660673 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1430729 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR663807 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1087245 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1339108 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR613879 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.9491 0.54519 0.632 0.368
#> SRR1387966 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1458852 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1349231 1 0.8207 0.61713 0.744 0.256
#> SRR1376249 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1321987 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR662653 1 0.3431 0.69132 0.936 0.064
#> SRR1390027 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1098474 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1383081 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR2166960 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR605101 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR818600 1 0.9896 -0.28966 0.560 0.440
#> SRR1367715 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1444306 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR665478 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.9209 0.56537 0.664 0.336
#> SRR1489030 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1430375 1 0.0376 0.75934 0.996 0.004
#> SRR615225 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR1401839 1 0.9833 0.50801 0.576 0.424
#> SRR1379110 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1077288 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1331639 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1342782 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1443003 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR612839 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1469014 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1387222 2 0.9922 0.52355 0.448 0.552
#> SRR664063 1 0.7219 0.65120 0.800 0.200
#> SRR1488214 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR654766 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1320321 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1417483 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
#> SRR1394231 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1488470 1 0.0000 0.76308 1.000 0.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.73950 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.2778 0.72473 0.048 0.952
#> SRR615311 1 0.9922 0.49453 0.552 0.448
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.4555 0.7501 0.200 0.000 0.800
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499740 1 0.0747 0.9648 0.984 0.000 0.016
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.2448 0.8994 0.000 0.924 0.076
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.4504 0.7553 0.196 0.000 0.804
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 3 0.4605 0.7503 0.000 0.204 0.796
#> SRR614839 3 0.0747 0.9353 0.000 0.016 0.984
#> SRR658433 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 1 0.2356 0.9028 0.928 0.072 0.000
#> SRR1402153 3 0.4555 0.7556 0.000 0.200 0.800
#> SRR655887 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.6126 0.2958 0.000 0.600 0.400
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.4504 0.7347 0.196 0.000 0.804
#> SRR1329003 3 0.2165 0.8978 0.064 0.000 0.936
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.6126 0.2958 0.000 0.600 0.400
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 1 0.4349 0.8313 0.852 0.020 0.128
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0592 0.9382 0.000 0.012 0.988
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0237 0.9435 0.004 0.000 0.996
#> SRR656247 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.3267 0.8513 0.116 0.884 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 3 0.4555 0.7501 0.200 0.000 0.800
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 3 0.5948 0.4712 0.000 0.360 0.640
#> SRR615635 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.6244 0.1711 0.000 0.560 0.440
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.6244 0.1721 0.560 0.000 0.440
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.3192 0.8527 0.112 0.000 0.888
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 3 0.6140 0.3561 0.404 0.000 0.596
#> SRR613222 3 0.4702 0.7395 0.000 0.212 0.788
#> SRR1459937 2 0.6260 0.2151 0.000 0.552 0.448
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.2165 0.8978 0.064 0.000 0.936
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 3 0.4750 0.7339 0.000 0.216 0.784
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.6062 0.4079 0.384 0.000 0.616
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.1753 0.9322 0.952 0.000 0.048
#> SRR815020 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 3 0.4555 0.7556 0.000 0.200 0.800
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.4555 0.7472 0.000 0.800 0.200
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0747 0.9638 0.984 0.000 0.016
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.4555 0.7472 0.000 0.800 0.200
#> SRR658766 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.2537 0.8837 0.000 0.080 0.920
#> SRR656860 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.5948 0.4097 0.640 0.000 0.360
#> SRR601695 3 0.6126 0.3200 0.000 0.400 0.600
#> SRR820907 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.1031 0.9547 0.976 0.024 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.5968 0.3994 0.636 0.000 0.364
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.1964 0.9044 0.000 0.056 0.944
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.4555 0.7472 0.000 0.800 0.200
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0592 0.9667 0.988 0.012 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 2 0.4555 0.7472 0.000 0.800 0.200
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 3 0.3551 0.8351 0.000 0.132 0.868
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0592 0.9377 0.012 0.000 0.988
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.5733 0.4938 0.000 0.676 0.324
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 1 0.0747 0.9627 0.984 0.016 0.000
#> SRR1456027 1 0.0592 0.9668 0.988 0.012 0.000
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 3 0.5706 0.5512 0.320 0.000 0.680
#> SRR614251 3 0.1529 0.9171 0.000 0.040 0.960
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 3 0.4002 0.8054 0.000 0.160 0.840
#> SRR659696 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.4750 0.7038 0.000 0.784 0.216
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348040 1 0.4062 0.7987 0.836 0.000 0.164
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 3 0.4555 0.7501 0.200 0.000 0.800
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.2796 0.8728 0.092 0.000 0.908
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.6126 0.3559 0.000 0.600 0.400
#> SRR662019 3 0.0424 0.9408 0.008 0.000 0.992
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.1163 0.9512 0.972 0.028 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 3 0.2165 0.8978 0.064 0.000 0.936
#> SRR657139 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.6062 0.3777 0.000 0.616 0.384
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.4555 0.7472 0.000 0.800 0.200
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.2066 0.9163 0.940 0.060 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 2 0.0424 0.9648 0.000 0.992 0.008
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356290 3 0.6111 0.3838 0.000 0.396 0.604
#> SRR659507 3 0.6111 0.3837 0.000 0.396 0.604
#> SRR663296 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414727 3 0.4291 0.7757 0.180 0.000 0.820
#> SRR663477 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 3 0.0592 0.9381 0.000 0.012 0.988
#> SRR655052 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.2448 0.9046 0.924 0.000 0.076
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.6308 -0.0289 0.000 0.508 0.492
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0237 0.9745 0.996 0.000 0.004
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.5621 0.5668 0.000 0.692 0.308
#> SRR660260 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337173 3 0.0592 0.9381 0.000 0.012 0.988
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 3 0.6204 0.2368 0.000 0.424 0.576
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.4654 0.7301 0.792 0.208 0.000
#> SRR1487947 3 0.5178 0.6671 0.256 0.000 0.744
#> SRR659708 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR603236 3 0.4931 0.6981 0.000 0.232 0.768
#> SRR660673 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.2448 0.8871 0.000 0.076 0.924
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR615225 3 0.2165 0.8951 0.000 0.064 0.936
#> SRR1401839 1 0.4702 0.7305 0.788 0.000 0.212
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.2066 0.9147 0.060 0.940 0.000
#> SRR1443003 3 0.4452 0.7661 0.000 0.192 0.808
#> SRR612839 1 0.5968 0.3994 0.636 0.000 0.364
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.2261 0.9073 0.932 0.068 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.4178 0.7850 0.000 0.828 0.172
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9777 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.3528 0.6709 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.3610 0.7349 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1074359 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665262 2 0.4972 0.0989 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1499740 1 0.4382 0.5665 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4500 0.5979 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR612215 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.2081 0.8630 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 4 0.4755 0.7084 0.000 0.200 0.040 0.760
#> SRR614839 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR658433 4 0.4985 0.2670 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1088581 3 0.0707 0.9205 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.4304 0.4750 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660066 2 0.3688 0.6854 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1447103 1 0.5785 0.6287 0.720 0.208 0.040 0.032
#> SRR1402153 3 0.6187 0.5680 0.000 0.108 0.656 0.236
#> SRR655887 2 0.3444 0.6851 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 4 0.5766 0.4736 0.000 0.404 0.032 0.564
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375439 3 0.4238 0.6939 0.000 0.176 0.796 0.028
#> SRR1329003 3 0.1936 0.8992 0.032 0.000 0.940 0.028
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0921 0.9155 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR613999 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0188 0.9294 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 3 0.2647 0.8414 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.3837 0.6649 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615814 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1325225 1 0.0921 0.9261 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1313687 4 0.5478 0.4090 0.000 0.444 0.016 0.540
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.2973 0.7495 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR809595 1 0.7449 0.2279 0.480 0.332 0.188 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0817 0.8998 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0921 0.9155 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1478362 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0921 0.9155 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR612683 2 0.2281 0.8283 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1392901 3 0.1302 0.9093 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1077805 3 0.2546 0.8408 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 4 0.4103 0.6459 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR808244 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.1109 0.8945 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR603164 3 0.3649 0.7544 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330854 3 0.3569 0.7398 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361546 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR615635 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.4833 0.6900 0.000 0.228 0.032 0.740
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.4477 0.5009 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071594 4 0.4981 0.3782 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR612539 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR602010 2 0.3610 0.6971 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR810249 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818773 1 0.5000 -0.0321 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661639 3 0.6842 0.1006 0.436 0.000 0.464 0.100
#> SRR613222 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1459937 2 0.7289 0.2055 0.000 0.528 0.192 0.280
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.4898 0.4598 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR661096 2 0.3610 0.6971 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.1936 0.8992 0.032 0.000 0.940 0.028
#> SRR1307677 4 0.4977 0.3874 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658212 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.5297 0.5301 0.000 0.032 0.292 0.676
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.3649 0.7301 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1487570 1 0.4485 0.6834 0.772 0.200 0.000 0.028
#> SRR627431 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0592 0.9339 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612395 2 0.3172 0.7519 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR603116 2 0.3610 0.6971 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0336 0.9277 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR613699 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.3569 0.7029 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1330327 2 0.5586 0.1345 0.000 0.528 0.020 0.452
#> SRR1489950 2 0.0188 0.9135 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0707 0.9303 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1318444 3 0.0921 0.9155 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR600656 2 0.4989 0.1231 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR658766 3 0.3311 0.7951 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR655946 3 0.0469 0.9255 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR817282 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.3873 0.6046 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4730 0.5164 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR662498 3 0.1022 0.9137 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.4820 0.7033 0.000 0.168 0.772 0.060
#> SRR656860 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1480547 4 0.4989 0.3569 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.6727 0.1984 0.520 0.000 0.384 0.096
#> SRR601695 4 0.0000 0.7821 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 1 0.4877 0.3236 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0188 0.9135 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365448 1 0.4916 0.2287 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0336 0.9275 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662245 4 0.2760 0.7195 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1074719 2 0.0188 0.9135 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR816226 1 0.0921 0.9261 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR601387 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR614575 2 0.3610 0.6971 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1353900 4 0.4981 0.3782 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR662906 3 0.3172 0.8051 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1350832 4 0.4961 0.4131 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.5511 0.5884 0.000 0.720 0.196 0.084
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.4072 0.5888 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR607067 4 0.3801 0.6314 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.4981 0.3782 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR661961 3 0.1474 0.9005 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR658259 4 0.4817 0.5071 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.3942 0.5856 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1345760 2 0.5288 0.6037 0.000 0.732 0.200 0.068
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0336 0.9104 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661469 4 0.5396 -0.0879 0.000 0.012 0.464 0.524
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0707 0.9206 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR613330 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0592 0.9056 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR613126 4 0.0000 0.7821 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.1792 0.8514 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 1 0.4193 0.5818 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR1456027 2 0.5774 0.0784 0.464 0.508 0.000 0.028
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320469 3 0.4040 0.6739 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR614251 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615105 4 0.0000 0.7821 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.2469 0.7663 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR601671 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.4585 0.4739 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1409130 3 0.4267 0.6915 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR659696 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1408249 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663284 4 0.1059 0.7884 0.000 0.016 0.012 0.972
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 4 0.0000 0.7821 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348040 1 0.7779 0.4117 0.556 0.224 0.192 0.028
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388832 3 0.3356 0.7634 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 4 0.0592 0.7899 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR662918 4 0.0592 0.7899 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR817421 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0188 0.9294 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1318560 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.4948 0.3516 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.0336 0.9105 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3266 0.7936 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.3610 0.6971 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR655170 4 0.0469 0.7882 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1087825 4 0.7464 0.3531 0.000 0.328 0.192 0.480
#> SRR662019 3 0.0592 0.9219 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1349209 3 0.0921 0.9155 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1326161 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.2281 0.8162 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 4 0.1637 0.7480 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR809444 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 3 0.1936 0.8992 0.032 0.000 0.940 0.028
#> SRR657139 3 0.1302 0.9058 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.4163 0.7135 0.000 0.188 0.020 0.792
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819054 4 0.4981 0.3782 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1367988 2 0.4755 0.6385 0.000 0.760 0.200 0.040
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.4866 0.3696 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1375796 4 0.4277 0.6524 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356290 4 0.5074 0.6815 0.000 0.236 0.040 0.724
#> SRR659507 3 0.6106 0.3737 0.000 0.332 0.604 0.064
#> SRR663296 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.0000 0.7821 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414727 3 0.0592 0.9219 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614611 4 0.0921 0.7783 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR655052 2 0.1022 0.8952 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1478968 1 0.6669 0.5838 0.672 0.192 0.108 0.028
#> SRR1351280 2 0.0707 0.9003 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR613951 4 0.4222 0.5531 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.2647 0.8401 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.1557 0.8970 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR655040 4 0.3610 0.6515 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR810225 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 4 0.4643 0.3099 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1402328 2 0.3610 0.6563 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1480455 4 0.4599 0.7030 0.000 0.212 0.028 0.760
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.1302 0.9074 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.7265 0.2037 0.000 0.528 0.184 0.288
#> SRR660260 4 0.3764 0.6062 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1337173 3 0.5807 0.4909 0.000 0.052 0.636 0.312
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659816 4 0.2973 0.6758 0.000 0.000 0.144 0.856
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600981 4 0.2149 0.7398 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 4 0.4981 0.3782 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1359780 4 0.4981 0.3782 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.1716 0.8620 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0188 0.9135 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319648 2 0.4999 -0.2629 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1468658 3 0.1118 0.9130 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1390437 2 0.0707 0.9027 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR658057 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612635 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659911 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464681 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.1211 0.8996 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1365426 2 0.1118 0.8834 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1487947 3 0.3610 0.7349 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR659708 3 0.4624 0.5584 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR603236 4 0.4707 0.6160 0.000 0.036 0.204 0.760
#> SRR660673 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663807 4 0.2408 0.7676 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613426 1 0.1716 0.8976 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR613879 4 0.0921 0.7934 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1385101 1 0.3074 0.7742 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0188 0.9135 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0336 0.9410 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 4 0.2530 0.7718 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.4509 0.6395 0.000 0.004 0.708 0.288
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 4 0.4961 0.4131 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR605101 2 0.3610 0.6971 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR818600 4 0.4907 0.4658 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0336 0.9275 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 4 0.4790 0.5094 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR612767 1 0.3873 0.6921 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.1211 0.8813 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR615225 4 0.0188 0.7816 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1401839 2 0.7882 0.2784 0.164 0.524 0.284 0.028
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0921 0.8967 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.3528 0.7072 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR612839 1 0.4790 0.3568 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1470093 3 0.0188 0.9292 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.3123 0.8046 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR664063 1 0.6049 0.5745 0.680 0.120 0.000 0.200
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.5265 0.6534 0.000 0.748 0.092 0.160
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9161 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 4 0.4977 0.3874 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9310 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9483 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.3649 0.7366 0.000 0.808 0.000 0.040 0.152
#> SRR1380716 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.3093 0.7363 0.168 0.000 0.824 0.008 0.000
#> SRR1074359 4 0.1121 0.8106 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR665262 2 0.5044 0.1347 0.000 0.504 0.000 0.032 0.464
#> SRR1499740 3 0.5507 0.2805 0.400 0.008 0.552 0.028 0.012
#> SRR1105057 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1439742 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR614599 3 0.4135 0.5197 0.000 0.000 0.656 0.004 0.340
#> SRR612215 5 0.0000 0.7782 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.0451 0.8897 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR1409263 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 5 0.4536 0.6086 0.000 0.176 0.020 0.044 0.760
#> SRR614839 5 0.0404 0.7794 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR658433 2 0.4171 0.3850 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1088581 4 0.3774 0.5730 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.4990 0.4075 0.000 0.600 0.000 0.040 0.360
#> SRR1471117 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354955 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR654802 3 0.0703 0.8830 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR660066 2 0.3300 0.6794 0.000 0.792 0.000 0.004 0.204
#> SRR1447103 1 0.7789 0.0940 0.420 0.356 0.152 0.048 0.024
#> SRR1402153 3 0.5135 0.6151 0.000 0.100 0.696 0.004 0.200
#> SRR655887 2 0.3608 0.7419 0.000 0.812 0.000 0.040 0.148
#> SRR1408529 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR658707 1 0.0451 0.9604 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1384371 5 0.6318 0.0138 0.000 0.432 0.056 0.044 0.468
#> SRR1074670 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375439 3 0.4455 0.2019 0.000 0.000 0.588 0.404 0.008
#> SRR1329003 4 0.2304 0.8067 0.008 0.000 0.100 0.892 0.000
#> SRR1404837 2 0.1774 0.8378 0.000 0.932 0.000 0.052 0.016
#> SRR1317920 1 0.0162 0.9649 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1455525 4 0.3508 0.6792 0.000 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0404 0.8887 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1068855 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1375509 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR612227 3 0.1704 0.8566 0.000 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR1388809 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1413872 4 0.1485 0.8242 0.000 0.020 0.000 0.948 0.032
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR615814 5 0.0566 0.7834 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1325225 4 0.1671 0.7990 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1313687 2 0.5604 0.1652 0.000 0.500 0.016 0.040 0.444
#> SRR1358220 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1096662 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.1597 0.8408 0.000 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR660164 2 0.0324 0.8592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR815783 2 0.1364 0.8555 0.000 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR809595 2 0.7711 0.2026 0.240 0.460 0.240 0.048 0.012
#> SRR1403133 2 0.0451 0.8586 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR815470 2 0.3336 0.6648 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3999 0.3854 0.000 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1478362 4 0.4446 0.0838 0.000 0.476 0.000 0.520 0.004
#> SRR1392186 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.3109 0.7170 0.000 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR612683 2 0.2179 0.7954 0.000 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1392901 4 0.2971 0.7625 0.000 0.000 0.156 0.836 0.008
#> SRR1077805 3 0.3336 0.7171 0.000 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.8601 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0290 0.8910 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR656247 1 0.1195 0.9341 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR813656 2 0.4604 0.3017 0.000 0.560 0.000 0.012 0.428
#> SRR808244 3 0.1341 0.8666 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1387240 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.1270 0.8166 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1435248 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1419110 3 0.0324 0.8914 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1408682 2 0.1701 0.8393 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0798 0.8559 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1453911 2 0.1740 0.8461 0.000 0.932 0.000 0.056 0.012
#> SRR603164 3 0.2806 0.7840 0.000 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR1383259 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1330854 3 0.1894 0.8375 0.072 0.000 0.920 0.008 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1361546 1 0.4137 0.6528 0.732 0.000 0.008 0.248 0.012
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 5 0.0566 0.7796 0.000 0.000 0.012 0.004 0.984
#> SRR615635 2 0.0324 0.8592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1385411 5 0.4823 0.4868 0.000 0.276 0.000 0.052 0.672
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR662126 2 0.5381 0.1749 0.000 0.516 0.000 0.056 0.428
#> SRR1464601 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1071594 2 0.5211 0.2291 0.000 0.524 0.000 0.044 0.432
#> SRR612539 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR602010 2 0.4136 0.6751 0.000 0.764 0.000 0.048 0.188
#> SRR810249 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR818773 3 0.4860 0.2369 0.440 0.000 0.540 0.016 0.004
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0566 0.8580 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1442754 3 0.0290 0.8910 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1334247 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR661639 3 0.6987 0.0735 0.276 0.000 0.400 0.008 0.316
#> SRR613222 5 0.0566 0.7798 0.000 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR1459937 4 0.2104 0.8292 0.000 0.008 0.024 0.924 0.044
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0324 0.8592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR809348 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.5684 0.1477 0.000 0.488 0.000 0.080 0.432
#> SRR661096 2 0.3086 0.7105 0.000 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.2304 0.8067 0.008 0.000 0.100 0.892 0.000
#> SRR1307677 2 0.5143 0.2483 0.000 0.532 0.000 0.040 0.428
#> SRR1466512 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR658212 5 0.0613 0.7831 0.000 0.008 0.004 0.004 0.984
#> SRR1430525 3 0.1544 0.8565 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1344422 5 0.7270 0.3616 0.000 0.060 0.248 0.184 0.508
#> SRR1353924 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1314832 3 0.3455 0.6867 0.208 0.000 0.784 0.008 0.000
#> SRR1487570 4 0.1571 0.8102 0.060 0.004 0.000 0.936 0.000
#> SRR627431 5 0.0404 0.7794 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1418561 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1448029 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR813802 1 0.0898 0.9443 0.972 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1753 0.8464 0.000 0.936 0.000 0.032 0.032
#> SRR1435311 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR612395 2 0.3823 0.7314 0.000 0.808 0.004 0.048 0.140
#> SRR603116 2 0.4028 0.6764 0.000 0.768 0.000 0.040 0.192
#> SRR1323152 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1368264 2 0.1597 0.8408 0.000 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR1326624 1 0.0162 0.9653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 5 0.0404 0.7794 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0703 0.8592 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR815044 2 0.0671 0.8574 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1338560 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR615862 5 0.0566 0.7834 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1480038 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659436 3 0.0451 0.8902 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR613699 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2890 0.7319 0.000 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1330327 4 0.1872 0.8229 0.000 0.020 0.000 0.928 0.052
#> SRR1489950 2 0.1043 0.8578 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0898 0.9443 0.972 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR1318444 4 0.2074 0.8071 0.000 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR600656 4 0.1830 0.8178 0.000 0.008 0.000 0.924 0.068
#> SRR658766 3 0.3796 0.5912 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR655946 3 0.2886 0.7839 0.000 0.000 0.844 0.148 0.008
#> SRR817282 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.4425 0.6294 0.000 0.716 0.000 0.040 0.244
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4118 0.5286 0.000 0.000 0.660 0.004 0.336
#> SRR662498 3 0.1756 0.8606 0.000 0.016 0.940 0.036 0.008
#> SRR1376764 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1377006 4 0.3983 0.4169 0.000 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR656860 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1480547 2 0.5068 0.3475 0.000 0.572 0.000 0.040 0.388
#> SRR1452515 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1324390 2 0.0324 0.8592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR615273 1 0.6061 0.1796 0.524 0.000 0.368 0.008 0.100
#> SRR601695 5 0.0404 0.7774 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR820907 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR812773 2 0.5643 0.0639 0.456 0.484 0.000 0.048 0.012
#> SRR1405984 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1472794 2 0.0912 0.8598 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1365448 1 0.4380 0.3282 0.616 0.000 0.376 0.008 0.000
#> SRR1095720 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1435626 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1080766 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.3707 0.6105 0.000 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1319710 2 0.0898 0.8545 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1326604 2 0.0404 0.8606 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1098879 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR662245 5 0.3835 0.5536 0.000 0.000 0.260 0.008 0.732
#> SRR1074719 2 0.1043 0.8578 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR816226 4 0.1908 0.7847 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR601387 5 0.1965 0.7189 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR614575 2 0.2930 0.7270 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1353900 2 0.5148 0.2378 0.000 0.528 0.000 0.040 0.432
#> SRR662906 3 0.3661 0.6219 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1350832 2 0.5173 0.1559 0.000 0.500 0.000 0.040 0.460
#> SRR1403280 2 0.1043 0.8578 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1313969 4 0.1799 0.8334 0.000 0.020 0.028 0.940 0.012
#> SRR1388528 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.4870 0.5792 0.224 0.712 0.000 0.052 0.012
#> SRR655399 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.1549 0.8430 0.000 0.944 0.000 0.040 0.016
#> SRR818901 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR607067 5 0.4150 0.2248 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.5157 0.2164 0.000 0.520 0.000 0.040 0.440
#> SRR661961 3 0.0451 0.8902 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR658259 5 0.4390 0.1690 0.000 0.428 0.000 0.004 0.568
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1365034 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478053 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1475300 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1328101 2 0.1701 0.8393 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR1322900 1 0.1522 0.9192 0.944 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1309942 2 0.4599 0.5716 0.000 0.688 0.000 0.040 0.272
#> SRR1345760 4 0.1651 0.8323 0.000 0.012 0.036 0.944 0.008
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4045 0.3773 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0162 0.8600 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661469 5 0.5479 0.1638 0.000 0.020 0.392 0.032 0.556
#> SRR1500323 2 0.0451 0.8588 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1356705 2 0.1444 0.8444 0.000 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1478 0.8515 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1350435 1 0.0162 0.9653 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1389177 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1368072 2 0.0324 0.8594 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR601815 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR613330 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.2536 0.8105 0.000 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.1671 0.8123 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR613126 5 0.0451 0.7789 0.000 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1089424 2 0.3339 0.7670 0.000 0.836 0.000 0.040 0.124
#> SRR1347214 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1309556 1 0.4524 0.5707 0.720 0.236 0.000 0.040 0.004
#> SRR1456027 4 0.1282 0.8193 0.044 0.004 0.000 0.952 0.000
#> SRR1400551 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1320469 3 0.4283 0.4894 0.348 0.000 0.644 0.008 0.000
#> SRR614251 5 0.0404 0.7794 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1454310 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR615105 5 0.0566 0.7774 0.000 0.000 0.004 0.012 0.984
#> SRR1433290 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2166064 4 0.1478 0.8127 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR601671 2 0.0324 0.8592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR663874 2 0.4902 0.1138 0.000 0.508 0.000 0.024 0.468
#> SRR1409130 3 0.6619 0.3481 0.000 0.164 0.580 0.036 0.220
#> SRR659696 4 0.3452 0.6033 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1408249 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR663284 5 0.0566 0.7834 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1402794 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614852 5 0.4114 0.2475 0.000 0.000 0.000 0.376 0.624
#> SRR1348040 4 0.1729 0.8297 0.012 0.008 0.032 0.944 0.004
#> SRR1489610 2 0.0898 0.8545 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1488091 2 0.0451 0.8586 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1499566 2 0.0451 0.8586 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1361480 2 0.0566 0.8582 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1444501 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1415773 2 0.1018 0.8536 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1388832 3 0.2707 0.7773 0.132 0.000 0.860 0.008 0.000
#> SRR1394637 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR606974 5 0.0404 0.7774 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR662918 5 0.0671 0.7818 0.000 0.016 0.000 0.004 0.980
#> SRR817421 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR608264 3 0.0771 0.8846 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1318560 3 0.0290 0.8910 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1454117 2 0.0566 0.8580 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.4375 0.1218 0.000 0.000 0.420 0.004 0.576
#> SRR1432743 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1388873 2 0.1549 0.8517 0.000 0.944 0.000 0.040 0.016
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1406008 2 0.1211 0.8502 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR1396786 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3086 0.7529 0.000 0.000 0.816 0.004 0.180
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.4125 0.6867 0.000 0.772 0.000 0.056 0.172
#> SRR655170 5 0.0566 0.7834 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1087825 4 0.1965 0.8247 0.000 0.000 0.024 0.924 0.052
#> SRR662019 3 0.0290 0.8915 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1349209 4 0.2074 0.8067 0.000 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1326161 5 0.0566 0.7834 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1345284 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1454328 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.3189 0.7960 0.064 0.868 0.000 0.056 0.012
#> SRR1408183 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1084369 3 0.1732 0.8474 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 5 0.4150 0.2179 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR809444 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1375774 1 0.0324 0.9618 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1326292 4 0.2304 0.8067 0.008 0.000 0.100 0.892 0.000
#> SRR657139 3 0.1041 0.8792 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1440744 2 0.0324 0.8592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.3731 0.7073 0.000 0.072 0.000 0.816 0.112
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR658989 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1353663 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.5125 0.2782 0.000 0.544 0.000 0.040 0.416
#> SRR1367988 4 0.1469 0.8312 0.000 0.016 0.036 0.948 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 5 0.5019 0.1139 0.436 0.000 0.000 0.032 0.532
#> SRR1375796 5 0.4047 0.4679 0.000 0.320 0.000 0.004 0.676
#> SRR1386991 2 0.2130 0.8454 0.000 0.908 0.000 0.080 0.012
#> SRR1355217 2 0.1670 0.8395 0.000 0.936 0.000 0.052 0.012
#> SRR1356290 5 0.5638 0.5362 0.000 0.232 0.056 0.044 0.668
#> SRR659507 3 0.6524 0.3482 0.000 0.284 0.564 0.036 0.116
#> SRR663296 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR598044 2 0.0324 0.8592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR661155 4 0.1908 0.8045 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1414727 3 0.0290 0.8910 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1377800 3 0.0290 0.8910 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR614611 5 0.0404 0.7794 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR655052 4 0.4517 0.2149 0.000 0.436 0.000 0.556 0.008
#> SRR1478968 4 0.1893 0.8199 0.048 0.000 0.024 0.928 0.000
#> SRR1351280 2 0.1331 0.8553 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR613951 4 0.2179 0.8012 0.000 0.004 0.000 0.896 0.100
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.2966 0.7471 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.1121 0.8724 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR655040 5 0.4150 0.2254 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR810225 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325377 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR617829 5 0.4450 -0.1063 0.000 0.000 0.488 0.004 0.508
#> SRR1402328 2 0.3691 0.7321 0.000 0.804 0.000 0.040 0.156
#> SRR1480455 5 0.4372 0.5912 0.000 0.200 0.008 0.040 0.752
#> SRR1442104 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1481396 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1414314 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR663026 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1478386 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1458683 3 0.4171 0.3714 0.000 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4594 0.7442 0.788 0.020 0.124 0.056 0.012
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.2104 0.8292 0.000 0.008 0.024 0.924 0.044
#> SRR660260 4 0.6587 0.1237 0.000 0.000 0.208 0.404 0.388
#> SRR1071231 2 0.0609 0.8605 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1459125 4 0.1430 0.8153 0.000 0.052 0.000 0.944 0.004
#> SRR1337173 3 0.5211 0.5484 0.000 0.076 0.664 0.004 0.256
#> SRR1396250 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR659816 5 0.3774 0.4514 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1401379 2 0.1012 0.8534 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR600981 4 0.2286 0.7953 0.000 0.000 0.004 0.888 0.108
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.1197 0.8573 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.5165 0.1933 0.000 0.512 0.000 0.040 0.448
#> SRR1359780 2 0.4666 0.3019 0.000 0.572 0.000 0.016 0.412
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.2554 0.8090 0.000 0.892 0.000 0.036 0.072
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.8601 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.5131 0.2702 0.000 0.540 0.000 0.040 0.420
#> SRR1092985 1 0.0451 0.9595 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR656409 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1468658 4 0.3452 0.6655 0.000 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1390437 2 0.4644 0.1376 0.000 0.528 0.000 0.460 0.012
#> SRR658057 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612635 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1351480 2 0.1043 0.8578 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0579 0.8579 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR614263 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR659911 5 0.0566 0.7834 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1085519 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442928 2 0.1877 0.8516 0.000 0.924 0.000 0.064 0.012
#> SRR1464681 4 0.1043 0.8126 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1418880 1 0.0290 0.9627 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309070 3 0.2504 0.8133 0.000 0.064 0.896 0.040 0.000
#> SRR1365426 2 0.2649 0.8164 0.036 0.900 0.000 0.048 0.016
#> SRR1487947 3 0.2707 0.7778 0.132 0.000 0.860 0.008 0.000
#> SRR659708 3 0.4562 0.1288 0.000 0.000 0.500 0.008 0.492
#> SRR603236 5 0.7774 0.1693 0.000 0.072 0.284 0.232 0.412
#> SRR660673 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0693 0.8605 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR663807 5 0.1444 0.7636 0.000 0.040 0.000 0.012 0.948
#> SRR1087245 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339108 2 0.1331 0.8587 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR613426 4 0.4252 0.5493 0.280 0.000 0.000 0.700 0.020
#> SRR613879 5 0.0404 0.7838 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1385101 1 0.2674 0.8714 0.896 0.032 0.000 0.060 0.012
#> SRR1387966 2 0.1043 0.8578 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1458852 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430489 1 0.0963 0.9375 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1349231 1 0.2916 0.8535 0.884 0.056 0.000 0.048 0.012
#> SRR1376249 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1321987 2 0.0703 0.8603 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR662653 5 0.2069 0.7347 0.000 0.076 0.000 0.012 0.912
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.4403 0.5072 0.000 0.004 0.648 0.008 0.340
#> SRR1383081 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2166960 2 0.5173 0.1579 0.000 0.500 0.000 0.040 0.460
#> SRR605101 2 0.3639 0.6961 0.000 0.792 0.000 0.024 0.184
#> SRR818600 5 0.4990 0.2923 0.000 0.360 0.000 0.040 0.600
#> SRR1367715 2 0.1043 0.8595 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.2605 0.7872 0.000 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1444306 3 0.0162 0.8923 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4481 0.3224 0.000 0.576 0.000 0.008 0.416
#> SRR612767 1 0.3579 0.6627 0.756 0.000 0.000 0.004 0.240
#> SRR1489030 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430375 2 0.1872 0.8529 0.000 0.928 0.000 0.052 0.020
#> SRR615225 4 0.2020 0.7998 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1401839 4 0.1996 0.8275 0.012 0.012 0.028 0.936 0.012
#> SRR1379110 2 0.0963 0.8590 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1077288 3 0.0162 0.8922 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1331639 4 0.1410 0.8155 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1342782 2 0.1597 0.8408 0.000 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR1443003 3 0.3731 0.6879 0.000 0.160 0.800 0.040 0.000
#> SRR612839 1 0.4183 0.4648 0.668 0.000 0.324 0.008 0.000
#> SRR1470093 3 0.3816 0.5743 0.000 0.000 0.696 0.304 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4726 0.3402 0.000 0.000 0.580 0.400 0.020
#> SRR664063 2 0.7379 0.0831 0.360 0.412 0.000 0.048 0.180
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.1596 0.8286 0.000 0.028 0.012 0.948 0.012
#> SRR1320321 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0162 0.8597 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488470 2 0.5153 0.2270 0.000 0.524 0.000 0.040 0.436
#> SRR1389497 3 0.0000 0.8926 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.1043 0.8752 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9677 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.4037 0.43000 0.000 0.608 0.000 0.000 0.380 0.012
#> SRR1380716 2 0.3101 0.59814 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR612803 1 0.1204 0.90370 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.3974 0.69695 0.108 0.000 0.772 0.004 0.116 0.000
#> SRR1074359 4 0.0260 0.84229 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1419258 3 0.0260 0.83660 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1403366 3 0.0547 0.83264 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR665262 2 0.5774 -0.03045 0.000 0.440 0.000 0.000 0.384 0.176
#> SRR1499740 5 0.5890 -0.07327 0.212 0.000 0.340 0.000 0.448 0.000
#> SRR1105057 2 0.3198 0.58827 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1439742 1 0.2320 0.84218 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR614599 3 0.4379 0.39412 0.000 0.000 0.576 0.000 0.028 0.396
#> SRR612215 6 0.2703 0.59131 0.000 0.004 0.000 0.000 0.172 0.824
#> SRR1094051 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.2191 0.77733 0.000 0.000 0.876 0.004 0.120 0.000
#> SRR1409263 3 0.0632 0.83154 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 6 0.5069 0.18741 0.000 0.032 0.028 0.000 0.396 0.544
#> SRR614839 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.3627 0.53782 0.000 0.792 0.000 0.000 0.080 0.128
#> SRR1088581 4 0.4873 0.33082 0.000 0.000 0.320 0.600 0.080 0.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.5791 -0.01694 0.000 0.440 0.000 0.000 0.380 0.180
#> SRR1471117 1 0.2320 0.84218 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0146 0.66445 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354955 3 0.1387 0.83001 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR654802 3 0.1863 0.79844 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR660066 2 0.1141 0.64515 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1447103 5 0.5838 0.08642 0.188 0.400 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1402153 3 0.6183 0.59543 0.000 0.092 0.600 0.004 0.108 0.196
#> SRR655887 2 0.4252 0.42340 0.000 0.604 0.000 0.000 0.372 0.024
#> SRR1408529 3 0.2006 0.82070 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR658707 1 0.2851 0.82750 0.844 0.000 0.000 0.004 0.132 0.020
#> SRR1384371 5 0.6094 0.22785 0.000 0.188 0.008 0.004 0.480 0.320
#> SRR1074670 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375439 3 0.5628 0.31407 0.000 0.000 0.540 0.240 0.220 0.000
#> SRR1329003 4 0.3235 0.73481 0.000 0.000 0.052 0.820 0.128 0.000
#> SRR1404837 2 0.2491 0.54341 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.3240 0.64721 0.000 0.000 0.244 0.752 0.004 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0458 0.83579 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1068855 1 0.2320 0.84218 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR1375509 3 0.0547 0.83264 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR612227 3 0.4266 0.72576 0.000 0.000 0.736 0.004 0.088 0.172
#> SRR1388809 2 0.3198 0.58940 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1413872 4 0.0260 0.84229 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0547 0.83611 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR615814 6 0.1141 0.70489 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1325225 4 0.0260 0.84111 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1313687 5 0.6297 0.30670 0.000 0.236 0.012 0.000 0.396 0.356
#> SRR1358220 2 0.3175 0.59076 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1096662 2 0.0363 0.66679 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.3706 0.25506 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR660164 2 0.0260 0.66316 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR815783 2 0.3547 0.55156 0.000 0.696 0.000 0.000 0.300 0.004
#> SRR809595 5 0.7491 0.18540 0.168 0.280 0.164 0.004 0.384 0.000
#> SRR1403133 2 0.0547 0.65891 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR815470 2 0.3592 0.24892 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4614 0.62449 0.000 0.000 0.684 0.208 0.108 0.000
#> SRR1478362 4 0.4157 0.21721 0.000 0.444 0.000 0.544 0.012 0.000
#> SRR1392186 2 0.3151 0.59592 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.4570 0.52618 0.000 0.000 0.228 0.680 0.092 0.000
#> SRR612683 2 0.0146 0.66470 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392901 4 0.4723 0.51338 0.000 0.000 0.232 0.664 0.104 0.000
#> SRR1077805 3 0.4803 0.68229 0.000 0.004 0.684 0.168 0.144 0.000
#> SRR1360402 2 0.1267 0.66169 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1406112 3 0.0547 0.83604 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1355352 3 0.2320 0.76846 0.000 0.000 0.864 0.004 0.132 0.000
#> SRR656247 1 0.3706 0.45452 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR813656 2 0.4796 0.29528 0.000 0.660 0.000 0.000 0.116 0.224
#> SRR808244 3 0.3336 0.74360 0.000 0.000 0.812 0.056 0.132 0.000
#> SRR1387240 2 0.3050 0.60368 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0260 0.84196 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1435248 2 0.3244 0.58377 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1419110 3 0.3383 0.69948 0.000 0.000 0.728 0.004 0.268 0.000
#> SRR1408682 2 0.3409 0.37298 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.1267 0.63655 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1453911 2 0.3868 0.19958 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR603164 3 0.4787 0.66238 0.000 0.000 0.672 0.004 0.104 0.220
#> SRR1383259 2 0.2996 0.60589 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1330854 3 0.2765 0.75950 0.016 0.000 0.848 0.004 0.132 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.3464 0.53848 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2006 0.82070 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1361546 5 0.6447 -0.12951 0.192 0.012 0.024 0.264 0.508 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 6 0.1327 0.70047 0.000 0.000 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR615635 2 0.0146 0.66584 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1385411 6 0.5763 -0.09376 0.000 0.136 0.008 0.000 0.388 0.468
#> SRR1342739 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0547 0.83264 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR662126 2 0.5272 0.27082 0.000 0.628 0.000 0.008 0.148 0.216
#> SRR1464601 2 0.3409 0.55543 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1071594 5 0.6118 0.30691 0.000 0.236 0.000 0.004 0.408 0.352
#> SRR612539 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.3717 0.24874 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR810249 2 0.3151 0.59316 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR818773 5 0.6128 -0.00898 0.268 0.000 0.296 0.004 0.432 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0937 0.64821 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1442754 3 0.2320 0.76846 0.000 0.000 0.864 0.004 0.132 0.000
#> SRR1334247 3 0.1958 0.82166 0.000 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR661639 6 0.7040 0.27135 0.136 0.000 0.252 0.004 0.132 0.476
#> SRR613222 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459937 4 0.0291 0.84282 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR2185018 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.1141 0.65763 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0632 0.83154 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 5 0.6386 0.30811 0.000 0.240 0.000 0.016 0.380 0.364
#> SRR661096 2 0.1531 0.64223 0.000 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1320225 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.3235 0.73481 0.000 0.000 0.052 0.820 0.128 0.000
#> SRR1307677 5 0.6073 0.33966 0.000 0.268 0.000 0.000 0.380 0.352
#> SRR1466512 2 0.3050 0.60215 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR658212 6 0.2219 0.65357 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1430525 3 0.3419 0.78557 0.000 0.000 0.812 0.084 0.104 0.000
#> SRR1344422 6 0.6867 0.05887 0.000 0.040 0.072 0.068 0.384 0.436
#> SRR1353924 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.4624 0.59290 0.208 0.000 0.692 0.004 0.096 0.000
#> SRR1487570 4 0.0260 0.84111 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR627431 6 0.0458 0.71511 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1418561 3 0.0547 0.83264 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1448029 3 0.1858 0.82411 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092 0.000
#> SRR813802 1 0.3907 0.74828 0.776 0.000 0.088 0.004 0.132 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3650 0.54182 0.000 0.708 0.000 0.000 0.280 0.012
#> SRR1435311 2 0.3288 0.57656 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR612395 2 0.3727 0.24265 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR603116 2 0.3830 0.25542 0.000 0.620 0.000 0.000 0.376 0.004
#> SRR1323152 3 0.1753 0.82602 0.000 0.000 0.912 0.004 0.084 0.000
#> SRR1368264 2 0.3706 0.25506 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1326624 1 0.1444 0.89219 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0458 0.66773 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR815044 2 0.0865 0.65026 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1338560 2 0.3266 0.58031 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR615862 6 0.0858 0.71229 0.000 0.004 0.000 0.000 0.028 0.968
#> SRR1480038 2 0.0713 0.66595 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR659436 3 0.2006 0.82129 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR613699 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0806 0.65554 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1330327 4 0.0291 0.84282 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1489950 2 0.3841 0.44363 0.000 0.616 0.000 0.000 0.380 0.004
#> SRR1431927 1 0.0458 0.93038 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.4048 0.73340 0.764 0.000 0.100 0.004 0.132 0.000
#> SRR1318444 4 0.0717 0.83364 0.000 0.000 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR600656 4 0.0291 0.84282 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR658766 3 0.3971 0.28733 0.000 0.000 0.548 0.000 0.004 0.448
#> SRR655946 3 0.4509 0.69896 0.000 0.000 0.712 0.180 0.104 0.004
#> SRR817282 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0632 0.83154 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.5414 0.06989 0.000 0.416 0.000 0.000 0.468 0.116
#> SRR1471965 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.5351 0.47859 0.000 0.000 0.548 0.004 0.108 0.340
#> SRR662498 3 0.4392 0.37931 0.000 0.016 0.504 0.004 0.476 0.000
#> SRR1376764 3 0.2196 0.81982 0.000 0.000 0.884 0.004 0.108 0.004
#> SRR1377006 4 0.5081 0.31442 0.000 0.000 0.308 0.588 0.104 0.000
#> SRR656860 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480547 5 0.6099 0.35008 0.000 0.292 0.000 0.000 0.380 0.328
#> SRR1452515 3 0.2146 0.81924 0.000 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.7371 0.01750 0.380 0.000 0.316 0.004 0.132 0.168
#> SRR601695 6 0.0603 0.71413 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016 0.980
#> SRR820907 2 0.0260 0.66648 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR812773 2 0.5930 -0.12355 0.212 0.404 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1405984 2 0.3175 0.59120 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1472794 2 0.2402 0.61841 0.000 0.856 0.000 0.000 0.140 0.004
#> SRR1365448 1 0.5474 0.36581 0.552 0.000 0.312 0.004 0.132 0.000
#> SRR1095720 3 0.0547 0.83264 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1435626 3 0.1644 0.82771 0.000 0.000 0.920 0.004 0.076 0.000
#> SRR1080766 2 0.3221 0.58613 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.1958 0.82166 0.000 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.5160 0.46716 0.000 0.000 0.564 0.332 0.104 0.000
#> SRR1319710 2 0.1863 0.60262 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1326604 2 0.1267 0.66485 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1098879 3 0.1411 0.83241 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR662245 6 0.4776 0.51778 0.000 0.004 0.148 0.004 0.144 0.700
#> SRR1074719 2 0.3634 0.48562 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR816226 4 0.0260 0.84111 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR601387 6 0.2048 0.60116 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR614575 2 0.0858 0.65284 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1353900 5 0.6066 0.33567 0.000 0.264 0.000 0.000 0.380 0.356
#> SRR662906 3 0.4529 0.25843 0.000 0.000 0.512 0.004 0.024 0.460
#> SRR1350832 6 0.6016 -0.33790 0.000 0.240 0.000 0.000 0.380 0.380
#> SRR1403280 2 0.3819 0.45622 0.000 0.624 0.000 0.000 0.372 0.004
#> SRR1313969 4 0.0260 0.84229 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.2320 0.84218 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.5555 -0.00301 0.140 0.480 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.2883 0.48671 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607067 6 0.3499 0.40151 0.000 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1391420 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 5 0.6052 0.32532 0.000 0.256 0.000 0.000 0.380 0.364
#> SRR661961 3 0.0972 0.83241 0.000 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR658259 6 0.5862 -0.16670 0.000 0.376 0.000 0.000 0.196 0.428
#> SRR1310476 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3198 0.58940 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.3050 0.60323 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1475300 2 0.2664 0.62741 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1328101 2 0.3717 0.24874 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1322900 1 0.3695 0.46236 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1309942 2 0.4343 0.40027 0.000 0.592 0.000 0.000 0.380 0.028
#> SRR1345760 4 0.0146 0.84274 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.5325 0.23444 0.000 0.156 0.000 0.584 0.260 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1267 0.65538 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR661469 5 0.5701 -0.24342 0.000 0.012 0.112 0.000 0.440 0.436
#> SRR1500323 2 0.0547 0.65860 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1356705 2 0.2996 0.46771 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.2009 0.82940 0.000 0.000 0.908 0.024 0.068 0.000
#> SRR1350435 1 0.1387 0.89510 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1389177 3 0.2006 0.82070 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601815 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.4834 0.51122 0.000 0.660 0.000 0.128 0.212 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.2520 0.80456 0.000 0.000 0.844 0.004 0.152 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.0260 0.84229 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR613126 6 0.0363 0.71665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1089424 2 0.4400 0.39923 0.000 0.592 0.000 0.000 0.376 0.032
#> SRR1347214 2 0.3309 0.57293 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1309556 1 0.4327 0.48789 0.680 0.056 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1456027 4 0.0260 0.84111 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0632 0.83154 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1320469 3 0.5595 0.26836 0.360 0.000 0.504 0.004 0.132 0.000
#> SRR614251 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.3371 0.56279 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR615105 6 0.0363 0.71665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1433290 3 0.2006 0.82070 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR2166064 4 0.0260 0.84124 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR601671 2 0.0146 0.66445 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR663874 2 0.5726 0.01409 0.000 0.468 0.000 0.000 0.360 0.172
#> SRR1409130 3 0.6379 0.19055 0.000 0.032 0.472 0.004 0.336 0.156
#> SRR659696 4 0.3215 0.58524 0.000 0.240 0.000 0.756 0.004 0.000
#> SRR1408249 2 0.2912 0.61164 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR663284 6 0.1141 0.70495 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1402794 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614852 6 0.3508 0.44625 0.000 0.000 0.000 0.292 0.004 0.704
#> SRR1348040 4 0.0260 0.84196 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1489610 2 0.1863 0.60262 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.1327 0.63397 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1361480 2 0.0363 0.66170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1444501 3 0.2006 0.82070 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1415773 2 0.2135 0.58047 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1388832 3 0.3955 0.69803 0.092 0.000 0.772 0.004 0.132 0.000
#> SRR1394637 1 0.2462 0.83880 0.860 0.000 0.004 0.004 0.132 0.000
#> SRR606974 6 0.0458 0.71511 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR662918 6 0.1946 0.68822 0.000 0.012 0.000 0.004 0.072 0.912
#> SRR817421 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3151 0.59316 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR608264 3 0.3563 0.78928 0.000 0.000 0.808 0.004 0.100 0.088
#> SRR1318560 3 0.2320 0.76846 0.000 0.000 0.864 0.004 0.132 0.000
#> SRR1454117 2 0.0632 0.65659 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1312684 1 0.0260 0.93518 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR615044 6 0.5031 0.42838 0.000 0.000 0.228 0.004 0.124 0.644
#> SRR1432743 3 0.2006 0.82070 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1388873 2 0.4121 0.42283 0.000 0.604 0.000 0.000 0.380 0.016
#> SRR1353517 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.2006 0.82129 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1406008 2 0.2416 0.55188 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1396786 2 0.3578 0.50755 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.4970 0.62062 0.000 0.000 0.640 0.004 0.104 0.252
#> SRR1431083 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.3691 0.47568 0.000 0.780 0.000 0.168 0.048 0.004
#> SRR655170 6 0.0146 0.71943 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1087825 4 0.0291 0.84282 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR662019 3 0.0632 0.83154 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1349209 4 0.1890 0.80560 0.000 0.000 0.024 0.916 0.060 0.000
#> SRR1326161 6 0.2558 0.63057 0.000 0.004 0.000 0.000 0.156 0.840
#> SRR1345284 2 0.3023 0.60404 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.3390 0.55942 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1489286 1 0.2053 0.86183 0.888 0.000 0.000 0.004 0.108 0.000
#> SRR1092349 2 0.5573 0.16278 0.176 0.536 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1408183 3 0.1908 0.82290 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096 0.000
#> SRR1084369 3 0.3315 0.79040 0.000 0.000 0.820 0.076 0.104 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660709 6 0.4676 0.43764 0.000 0.000 0.012 0.256 0.060 0.672
#> SRR809444 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.3309 0.57532 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1375774 1 0.0146 0.93703 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326292 4 0.3235 0.73481 0.000 0.000 0.052 0.820 0.128 0.000
#> SRR657139 3 0.2748 0.77580 0.000 0.000 0.848 0.000 0.024 0.128
#> SRR1440744 2 0.0547 0.65855 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.5815 0.27631 0.000 0.020 0.000 0.544 0.300 0.136
#> SRR1381775 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.3563 0.51085 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR658989 3 0.1858 0.82506 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092 0.000
#> SRR1353663 1 0.2320 0.84218 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819054 5 0.6079 0.34308 0.000 0.272 0.000 0.000 0.380 0.348
#> SRR1367988 4 0.0260 0.84196 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1331922 1 0.0458 0.92610 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR615479 6 0.5771 0.20360 0.188 0.000 0.000 0.000 0.336 0.476
#> SRR1375796 6 0.5699 -0.01086 0.000 0.344 0.000 0.000 0.172 0.484
#> SRR1386991 5 0.3789 -0.15713 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1355217 2 0.3872 0.23052 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392 0.000
#> SRR1356290 6 0.5282 0.09647 0.000 0.064 0.008 0.004 0.420 0.504
#> SRR659507 5 0.6056 0.10904 0.000 0.264 0.272 0.000 0.460 0.004
#> SRR663296 1 0.2320 0.84218 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.0260 0.84124 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1414727 3 0.2278 0.77149 0.000 0.000 0.868 0.004 0.128 0.000
#> SRR663477 1 0.0260 0.93511 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1354489 3 0.2006 0.82070 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1377800 3 0.2146 0.78001 0.000 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR614611 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655052 4 0.4488 0.23761 0.000 0.420 0.000 0.548 0.032 0.000
#> SRR1478968 4 0.0260 0.84111 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.4037 0.43025 0.000 0.608 0.000 0.000 0.380 0.012
#> SRR613951 4 0.0858 0.82945 0.000 0.004 0.000 0.968 0.000 0.028
#> SRR1418022 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.3717 0.43007 0.000 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1408161 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.2416 0.75822 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR655040 6 0.3515 0.39391 0.000 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR810225 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0713 0.66644 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR617829 3 0.5455 0.26342 0.000 0.000 0.456 0.004 0.104 0.436
#> SRR1402328 2 0.4343 0.40095 0.000 0.592 0.000 0.000 0.380 0.028
#> SRR1480455 6 0.5031 0.11582 0.000 0.064 0.000 0.004 0.404 0.528
#> SRR1442104 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.2278 0.84550 0.868 0.000 0.000 0.004 0.128 0.000
#> SRR1481396 3 0.0363 0.83428 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1414314 2 0.3076 0.60079 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR663026 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.3221 0.58492 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1458683 3 0.4294 0.26054 0.000 0.000 0.552 0.428 0.020 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.6588 0.05271 0.428 0.060 0.124 0.004 0.384 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0291 0.84282 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR660260 6 0.6088 0.13913 0.000 0.000 0.192 0.328 0.012 0.468
#> SRR1071231 2 0.2219 0.64619 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1459125 4 0.0603 0.83785 0.000 0.004 0.000 0.980 0.016 0.000
#> SRR1337173 3 0.6150 0.49787 0.000 0.028 0.544 0.004 0.168 0.256
#> SRR1396250 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0547 0.83264 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR659816 6 0.3620 0.52639 0.000 0.000 0.184 0.000 0.044 0.772
#> SRR1401379 2 0.1863 0.60262 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR600981 4 0.0790 0.82796 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1398335 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.2823 0.61671 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 5 0.6051 0.32740 0.000 0.256 0.000 0.000 0.384 0.360
#> SRR1359780 2 0.5789 -0.13088 0.000 0.496 0.000 0.000 0.216 0.288
#> SRR1490037 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.1957 0.59571 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1663 0.65144 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1319648 5 0.6096 0.34960 0.000 0.288 0.000 0.000 0.380 0.332
#> SRR1092985 1 0.3808 0.75793 0.784 0.000 0.080 0.004 0.132 0.000
#> SRR656409 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468658 4 0.4914 0.42430 0.000 0.000 0.268 0.628 0.104 0.000
#> SRR1390437 2 0.5823 -0.02750 0.000 0.440 0.000 0.372 0.188 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612635 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.3706 0.45001 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.1267 0.63617 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3050 0.60215 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR659911 6 0.1267 0.70117 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1085519 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.1806 0.82640 0.000 0.000 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR1442928 5 0.3737 -0.14036 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1464681 4 0.0260 0.84229 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.2320 0.84218 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR1309070 3 0.4025 0.61769 0.000 0.016 0.668 0.004 0.312 0.000
#> SRR1365426 2 0.5347 0.04413 0.112 0.504 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1487947 3 0.4093 0.68543 0.104 0.000 0.760 0.004 0.132 0.000
#> SRR659708 6 0.5341 0.33037 0.000 0.000 0.276 0.004 0.132 0.588
#> SRR603236 3 0.8256 0.14577 0.000 0.064 0.352 0.164 0.152 0.268
#> SRR660673 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0937 0.66715 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR663807 6 0.2660 0.63804 0.000 0.048 0.000 0.000 0.084 0.868
#> SRR1087245 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.2969 0.60777 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR613426 4 0.3198 0.54629 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR613879 6 0.0000 0.72017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.5589 0.20272 0.504 0.104 0.000 0.012 0.380 0.000
#> SRR1387966 2 0.3945 0.43693 0.000 0.612 0.000 0.000 0.380 0.008
#> SRR1458852 2 0.1765 0.64906 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1430489 1 0.1267 0.89328 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1349231 5 0.6088 0.14483 0.280 0.340 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1376249 3 0.0547 0.83264 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1321987 2 0.3050 0.60636 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR662653 6 0.2750 0.62379 0.000 0.020 0.000 0.000 0.136 0.844
#> SRR1390027 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.4941 0.43355 0.000 0.004 0.572 0.004 0.052 0.368
#> SRR1383081 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 6 0.6026 -0.33721 0.000 0.244 0.000 0.000 0.376 0.380
#> SRR605101 2 0.3134 0.51950 0.000 0.808 0.000 0.000 0.168 0.024
#> SRR818600 6 0.5848 -0.23149 0.000 0.192 0.000 0.000 0.380 0.428
#> SRR1367715 2 0.2219 0.64376 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.4432 0.69241 0.000 0.000 0.708 0.188 0.104 0.000
#> SRR1444306 3 0.1644 0.83085 0.000 0.000 0.920 0.004 0.076 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4356 0.40317 0.000 0.724 0.000 0.000 0.136 0.140
#> SRR612767 1 0.3221 0.61676 0.736 0.000 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1489030 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 5 0.3547 -0.04046 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000
#> SRR615225 4 0.0260 0.84124 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1401839 4 0.3620 0.52215 0.000 0.000 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1379110 2 0.3515 0.52546 0.000 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1077288 3 0.0632 0.83154 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1331639 4 0.0260 0.84229 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.3955 0.23589 0.008 0.608 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1443003 3 0.4157 0.64913 0.000 0.032 0.688 0.004 0.276 0.000
#> SRR612839 1 0.5250 0.49719 0.608 0.000 0.256 0.004 0.132 0.000
#> SRR1470093 3 0.5109 0.47780 0.000 0.000 0.572 0.328 0.100 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.5319 0.24850 0.000 0.000 0.476 0.420 0.104 0.000
#> SRR664063 2 0.5794 -0.07913 0.180 0.436 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0260 0.84196 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.93972 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.66560 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 5 0.6079 0.34293 0.000 0.272 0.000 0.000 0.380 0.348
#> SRR1389497 3 0.0000 0.83596 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.2954 0.80552 0.000 0.000 0.844 0.048 0.108 0.000
#> SRR615311 1 0.0146 0.93711 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.511 0.852 0.909 0.3741 0.660 0.660
#> 3 3 0.739 0.823 0.924 0.6741 0.645 0.489
#> 4 4 0.643 0.664 0.812 0.1352 0.839 0.623
#> 5 5 0.682 0.677 0.832 0.0905 0.866 0.600
#> 6 6 0.731 0.725 0.832 0.0424 0.947 0.770
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR612803 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR613282 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1355396 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1084417 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1419258 1 0.5737 0.8650 0.864 0.136
#> SRR1403366 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR665262 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR1499740 2 0.4815 0.8728 0.104 0.896
#> SRR1105057 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1439742 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR614599 1 0.6343 0.8548 0.840 0.160
#> SRR612215 2 0.3584 0.8835 0.068 0.932
#> SRR1094051 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1324496 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1393449 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1431288 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1334889 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.4431 0.8374 0.092 0.908
#> SRR658433 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1088581 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1328797 1 0.0672 0.8940 0.992 0.008
#> SRR1334512 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1471117 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1311553 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1458220 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1354955 1 0.1414 0.8938 0.980 0.020
#> SRR654802 1 0.1633 0.8932 0.976 0.024
#> SRR660066 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.4022 0.8795 0.080 0.920
#> SRR1402153 2 0.4690 0.8289 0.100 0.900
#> SRR655887 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1408529 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR658707 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1384371 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1074670 1 0.0376 0.8935 0.996 0.004
#> SRR1375439 2 0.7883 0.7429 0.236 0.764
#> SRR1329003 1 0.8763 0.4871 0.704 0.296
#> SRR1404837 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1317920 2 0.5737 0.8451 0.136 0.864
#> SRR1455525 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR613999 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1310836 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1499764 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR658200 1 0.4022 0.8844 0.920 0.080
#> SRR1068855 2 0.7674 0.8097 0.224 0.776
#> SRR1375509 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR612227 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1388809 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1452864 2 0.5946 0.8491 0.144 0.856
#> SRR1473078 1 0.3584 0.8871 0.932 0.068
#> SRR615814 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1325225 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1313687 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR1358220 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1487746 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1354644 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1401752 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR1403133 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1344382 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1432453 2 0.4562 0.8713 0.096 0.904
#> SRR1478362 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1347937 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1431569 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1471594 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1354270 2 0.6438 0.8458 0.164 0.836
#> SRR612683 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.6531 0.8110 0.168 0.832
#> SRR1077805 1 0.8813 0.7162 0.700 0.300
#> SRR1360402 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1406112 1 0.0376 0.8935 0.996 0.004
#> SRR1355352 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR656247 2 0.7528 0.8158 0.216 0.784
#> SRR813656 2 0.0672 0.8985 0.008 0.992
#> SRR808244 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1408595 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1385277 2 0.3114 0.8876 0.056 0.944
#> SRR1435248 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR1408682 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1317134 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1370780 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1489307 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.1184 0.8971 0.016 0.984
#> SRR603164 1 0.6048 0.8584 0.852 0.148
#> SRR1383259 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1452423 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1368574 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1468162 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1331220 1 0.9922 0.2899 0.552 0.448
#> SRR1361546 2 0.5408 0.8651 0.124 0.876
#> SRR1486156 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR660545 2 0.4431 0.8286 0.092 0.908
#> SRR615635 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1342739 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1102830 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR1464601 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR810249 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.5737 0.8596 0.136 0.864
#> SRR1336569 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1368117 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1334247 1 0.8144 0.7560 0.748 0.252
#> SRR661639 1 0.2236 0.8770 0.964 0.036
#> SRR613222 2 0.3584 0.8835 0.068 0.932
#> SRR1459937 2 0.2948 0.8891 0.052 0.948
#> SRR2185018 2 0.7528 0.8154 0.216 0.784
#> SRR655732 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR809348 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR819261 1 0.0938 0.8942 0.988 0.012
#> SRR661074 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1349851 2 0.1414 0.8961 0.020 0.980
#> SRR1405123 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1320225 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1454651 2 0.9209 0.6705 0.336 0.664
#> SRR1307677 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1430525 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1344422 1 0.7950 0.7823 0.760 0.240
#> SRR1353924 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1487570 2 0.5629 0.8498 0.132 0.868
#> SRR627431 2 0.6438 0.8131 0.164 0.836
#> SRR1418561 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1448029 1 0.6148 0.8574 0.848 0.152
#> SRR813802 1 0.4161 0.8413 0.916 0.084
#> SRR815020 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1309702 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR603116 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1323152 1 0.5519 0.8687 0.872 0.128
#> SRR1368264 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1326624 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1429265 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1327702 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR615611 2 0.3274 0.8865 0.060 0.940
#> SRR1486799 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1096174 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.9000 0.5539 0.316 0.684
#> SRR613699 2 0.4431 0.8286 0.092 0.908
#> SRR1436563 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR615323 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1431927 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1100588 1 0.1184 0.8940 0.984 0.016
#> SRR1444002 1 0.4431 0.8338 0.908 0.092
#> SRR1318444 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR600656 2 0.2603 0.8910 0.044 0.956
#> SRR658766 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR655946 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR817282 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1475104 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1406418 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1090265 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1444120 2 0.3733 0.8819 0.072 0.928
#> SRR1471965 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR612695 2 0.6048 0.8329 0.148 0.852
#> SRR662498 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR1376764 2 0.9323 0.4722 0.348 0.652
#> SRR1377006 2 0.9944 -0.0624 0.456 0.544
#> SRR656860 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.6531 0.8110 0.168 0.832
#> SRR1324390 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR615273 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR601695 2 0.4815 0.8287 0.104 0.896
#> SRR820907 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR812773 2 0.2043 0.8941 0.032 0.968
#> SRR1405984 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1095720 1 0.0376 0.8935 0.996 0.004
#> SRR1435626 1 0.3733 0.8571 0.928 0.072
#> SRR1080766 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1377862 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1332299 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1467966 1 0.0672 0.8940 0.992 0.008
#> SRR1320579 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1319710 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1098879 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR662245 2 0.9209 0.4201 0.336 0.664
#> SRR1074719 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR816226 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR601387 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR662906 1 0.7056 0.8211 0.808 0.192
#> SRR1350832 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1388528 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1452912 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1400180 2 0.4022 0.8795 0.080 0.920
#> SRR655399 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR818901 1 0.0376 0.8936 0.996 0.004
#> SRR607067 2 0.3114 0.8877 0.056 0.944
#> SRR1391420 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1384138 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.9909 0.4236 0.444 0.556
#> SRR658259 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1310476 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1452696 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1322900 2 0.6247 0.8502 0.156 0.844
#> SRR1309942 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.3584 0.8836 0.068 0.932
#> SRR1435418 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1402172 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1443436 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR661675 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR1500323 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1464915 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1312406 1 0.9996 -0.2013 0.512 0.488
#> SRR1350435 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1389177 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1368072 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR613330 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1434502 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1394190 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1481083 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR816382 2 0.6343 0.8208 0.160 0.840
#> SRR1318839 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0938 0.8980 0.012 0.988
#> SRR1089424 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1456027 2 0.2236 0.8918 0.036 0.964
#> SRR1400551 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.4690 0.8288 0.100 0.900
#> SRR1454310 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR615105 1 0.7602 0.7929 0.780 0.220
#> SRR1433290 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR2166064 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.1843 0.8950 0.028 0.972
#> SRR1409130 2 0.9323 0.3212 0.348 0.652
#> SRR659696 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1402794 1 0.4022 0.8845 0.920 0.080
#> SRR614852 2 0.9491 0.4251 0.368 0.632
#> SRR1348040 2 0.4562 0.8754 0.096 0.904
#> SRR1489610 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1444501 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1415773 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.8955 0.7086 0.312 0.688
#> SRR1394637 2 0.9209 0.6585 0.336 0.664
#> SRR606974 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR817421 1 0.0376 0.8935 0.996 0.004
#> SRR1400823 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1381348 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR608264 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1318560 1 0.4431 0.8338 0.908 0.092
#> SRR1454117 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1312684 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR615044 2 0.4939 0.8715 0.108 0.892
#> SRR1432743 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1388873 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1353517 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1357148 2 0.9286 0.4881 0.344 0.656
#> SRR1406008 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1446564 2 0.1184 0.8970 0.016 0.984
#> SRR1318465 1 0.7745 0.7961 0.772 0.228
#> SRR1431083 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR607117 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0938 0.8986 0.012 0.988
#> SRR662019 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1349209 2 0.4939 0.8699 0.108 0.892
#> SRR1326161 2 0.1184 0.8918 0.016 0.984
#> SRR1345284 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1416672 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR663356 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1489286 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1092349 2 0.2778 0.8918 0.048 0.952
#> SRR1408183 1 0.4690 0.8791 0.900 0.100
#> SRR1084369 1 0.6887 0.8346 0.816 0.184
#> SRR598452 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR660709 1 0.8016 0.7710 0.756 0.244
#> SRR809444 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1089901 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1375774 2 0.4161 0.8790 0.084 0.916
#> SRR1326292 1 0.2043 0.8812 0.968 0.032
#> SRR657139 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1353555 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1323087 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1452334 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1381775 2 0.6247 0.8500 0.156 0.844
#> SRR1363908 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1319626 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR658989 1 0.9323 0.5854 0.652 0.348
#> SRR1353663 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR811771 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR813983 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR815825 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.3114 0.8876 0.056 0.944
#> SRR1331922 2 0.4815 0.8729 0.104 0.896
#> SRR615479 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR1375796 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.3733 0.8820 0.072 0.928
#> SRR1355217 2 0.3431 0.8850 0.064 0.936
#> SRR1356290 2 0.3431 0.8559 0.064 0.936
#> SRR659507 2 0.3114 0.8878 0.056 0.944
#> SRR663296 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR598044 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR663477 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1354489 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1377800 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR614611 2 0.9129 0.3868 0.328 0.672
#> SRR655052 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1478968 2 0.7453 0.8177 0.212 0.788
#> SRR1351280 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1418022 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR661901 1 0.5946 0.8611 0.856 0.144
#> SRR1408161 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR657054 1 0.5294 0.8717 0.880 0.120
#> SRR655040 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR810225 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR617829 1 0.9170 0.6757 0.668 0.332
#> SRR1402328 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.4298 0.8328 0.088 0.912
#> SRR1442104 1 0.0938 0.8942 0.988 0.012
#> SRR1453416 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1481396 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1458683 1 0.0938 0.8942 0.988 0.012
#> SRR1370572 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1467567 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1468532 2 0.4298 0.8779 0.088 0.912
#> SRR1310735 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1440101 2 0.2948 0.8888 0.052 0.948
#> SRR660260 2 0.4161 0.8786 0.084 0.916
#> SRR1071231 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR1337173 2 0.4431 0.8286 0.092 0.908
#> SRR1396250 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR2166376 1 0.0376 0.8936 0.996 0.004
#> SRR659816 1 0.6712 0.8361 0.824 0.176
#> SRR1401379 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1398335 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1397218 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR660115 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1407950 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1490037 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR627439 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1397156 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1410221 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1092985 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR656409 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1468658 1 0.7453 0.8069 0.788 0.212
#> SRR1390437 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1436651 2 0.7376 0.8187 0.208 0.792
#> SRR1441590 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR659590 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR614263 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1409575 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1085519 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1345894 2 0.6887 0.8064 0.184 0.816
#> SRR1442928 2 0.3879 0.8815 0.076 0.924
#> SRR1464681 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1418880 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1309070 1 0.6887 0.8361 0.816 0.184
#> SRR1365426 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR1487947 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.5519 0.8258 0.128 0.872
#> SRR660673 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1430729 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.7453 0.8182 0.212 0.788
#> SRR613879 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.4431 0.8766 0.092 0.908
#> SRR1387966 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1430489 2 0.7376 0.8184 0.208 0.792
#> SRR1349231 2 0.4431 0.8767 0.092 0.908
#> SRR1376249 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1390027 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1098474 1 0.9732 0.5207 0.596 0.404
#> SRR1383081 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1351979 1 0.5294 0.8722 0.880 0.120
#> SRR1387054 1 0.6343 0.8526 0.840 0.160
#> SRR1444306 1 0.7602 0.7154 0.780 0.220
#> SRR1322662 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR665478 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR612767 2 0.2236 0.8932 0.036 0.964
#> SRR1489030 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.3733 0.8819 0.072 0.928
#> SRR615225 2 0.0938 0.8979 0.012 0.988
#> SRR1401839 2 0.4022 0.8797 0.080 0.920
#> SRR1379110 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.0000 0.8926 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.3584 0.8836 0.068 0.932
#> SRR1443003 2 0.6531 0.8110 0.168 0.832
#> SRR612839 1 0.4431 0.8338 0.908 0.092
#> SRR1470093 1 0.4939 0.8765 0.892 0.108
#> SRR1395742 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1469014 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1387222 1 0.8016 0.7670 0.756 0.244
#> SRR664063 2 0.4022 0.8797 0.080 0.920
#> SRR1488214 2 0.7528 0.8154 0.216 0.784
#> SRR654766 2 0.2778 0.8900 0.048 0.952
#> SRR1320321 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1071955 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1417483 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
#> SRR1394231 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.8996 0.000 1.000
#> SRR1389497 1 0.0672 0.8940 0.992 0.008
#> SRR1367109 2 0.3879 0.8802 0.076 0.924
#> SRR615311 2 0.7602 0.8134 0.220 0.780
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.1031 0.89983 0.976 0.000 0.024
#> SRR1084417 1 0.6154 0.37838 0.592 0.000 0.408
#> SRR1074359 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.4235 0.76621 0.000 0.824 0.176
#> SRR1499740 1 0.9156 0.36916 0.540 0.256 0.204
#> SRR1105057 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.2955 0.80562 0.080 0.008 0.912
#> SRR612215 2 0.4575 0.75219 0.004 0.812 0.184
#> SRR1094051 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.6295 -0.04631 0.472 0.000 0.528
#> SRR1409263 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.2066 0.88312 0.060 0.940 0.000
#> SRR614839 2 0.5138 0.62897 0.000 0.748 0.252
#> SRR658433 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0237 0.86321 0.000 0.004 0.996
#> SRR1328797 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 1 0.9579 0.20144 0.444 0.352 0.204
#> SRR1402153 3 0.6291 0.23734 0.000 0.468 0.532
#> SRR655887 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.1289 0.89484 0.968 0.000 0.032
#> SRR1384371 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.6398 0.41309 0.008 0.620 0.372
#> SRR1329003 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.5760 0.52723 0.672 0.328 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.5067 0.77961 0.832 0.116 0.052
#> SRR1473078 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.4002 0.78338 0.840 0.000 0.160
#> SRR1313687 2 0.0424 0.92696 0.000 0.992 0.008
#> SRR1358220 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.1129 0.91619 0.020 0.976 0.004
#> SRR660164 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 2 0.8729 0.43165 0.204 0.592 0.204
#> SRR1403133 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.5650 0.55774 0.000 0.688 0.312
#> SRR1478362 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.4555 0.73749 0.800 0.000 0.200
#> SRR1354270 3 0.6045 0.27948 0.380 0.000 0.620
#> SRR612683 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.5291 0.63442 0.000 0.268 0.732
#> SRR1077805 3 0.5650 0.58002 0.000 0.312 0.688
#> SRR1360402 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.4062 0.72553 0.164 0.000 0.836
#> SRR656247 1 0.4605 0.73254 0.796 0.000 0.204
#> SRR813656 2 0.0592 0.92420 0.000 0.988 0.012
#> SRR808244 3 0.0747 0.85561 0.016 0.000 0.984
#> SRR1387240 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.4555 0.73749 0.800 0.000 0.200
#> SRR1385277 2 0.6652 0.68658 0.084 0.744 0.172
#> SRR1435248 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.6314 0.36694 0.004 0.604 0.392
#> SRR1408682 2 0.0237 0.92958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317134 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.1031 0.91608 0.000 0.976 0.024
#> SRR603164 3 0.2625 0.82170 0.000 0.084 0.916
#> SRR1383259 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.6045 0.45604 0.620 0.000 0.380
#> SRR1452423 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2625 0.81919 0.000 0.084 0.916
#> SRR1361546 1 0.6804 0.66119 0.724 0.072 0.204
#> SRR1486156 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.6286 -0.00954 0.000 0.536 0.464
#> SRR615635 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0661 0.92529 0.004 0.988 0.008
#> SRR1464601 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.4555 0.73271 0.000 0.800 0.200
#> SRR810249 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.6632 0.67087 0.732 0.064 0.204
#> SRR1336569 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.6305 -0.08727 0.484 0.000 0.516
#> SRR1334247 3 0.0237 0.86353 0.000 0.004 0.996
#> SRR661639 1 0.0892 0.90178 0.980 0.000 0.020
#> SRR613222 2 0.4235 0.76590 0.000 0.824 0.176
#> SRR1459937 2 0.5319 0.79033 0.072 0.824 0.104
#> SRR2185018 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.3267 0.82778 0.884 0.000 0.116
#> SRR819261 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0424 0.86053 0.008 0.000 0.992
#> SRR1349851 1 0.5529 0.56954 0.704 0.296 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.3851 0.80223 0.004 0.860 0.136
#> SRR1353924 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.6252 0.07258 0.444 0.000 0.556
#> SRR1487570 2 0.6345 0.33113 0.400 0.596 0.004
#> SRR627431 3 0.5497 0.60102 0.000 0.292 0.708
#> SRR1418561 3 0.6244 0.06813 0.440 0.000 0.560
#> SRR1448029 3 0.2066 0.83457 0.000 0.060 0.940
#> SRR813802 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.4834 0.72392 0.004 0.792 0.204
#> SRR603116 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0747 0.92051 0.016 0.984 0.000
#> SRR1326624 1 0.0592 0.90692 0.988 0.000 0.012
#> SRR1429265 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0237 0.91071 0.996 0.000 0.004
#> SRR615611 2 0.3695 0.83654 0.012 0.880 0.108
#> SRR1486799 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.1031 0.85569 0.000 0.024 0.976
#> SRR613699 2 0.1163 0.91163 0.000 0.972 0.028
#> SRR1436563 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.2066 0.87421 0.940 0.000 0.060
#> SRR1318444 2 0.4842 0.70198 0.000 0.776 0.224
#> SRR600656 2 0.2711 0.86048 0.000 0.912 0.088
#> SRR658766 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.1031 0.85569 0.000 0.024 0.976
#> SRR817282 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.5728 0.70756 0.032 0.772 0.196
#> SRR1471965 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4555 0.72450 0.000 0.200 0.800
#> SRR662498 2 0.6337 0.66189 0.044 0.736 0.220
#> SRR1376764 3 0.5254 0.64185 0.000 0.264 0.736
#> SRR1377006 2 0.6335 0.63151 0.036 0.724 0.240
#> SRR656860 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.5760 0.74014 0.064 0.140 0.796
#> SRR1324390 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.4504 0.74266 0.804 0.000 0.196
#> SRR601695 3 0.6274 0.27075 0.000 0.456 0.544
#> SRR820907 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 2 0.6119 0.71927 0.164 0.772 0.064
#> SRR1405984 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.1163 0.89442 0.972 0.000 0.028
#> SRR1095720 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.3918 0.80237 0.856 0.004 0.140
#> SRR1332299 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.6168 0.38143 0.000 0.412 0.588
#> SRR1074719 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.1031 0.89979 0.976 0.000 0.024
#> SRR601387 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 3 0.4002 0.74292 0.000 0.160 0.840
#> SRR1350832 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.0237 0.92958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1388528 1 0.1964 0.87794 0.944 0.000 0.056
#> SRR1452912 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.7613 0.59324 0.116 0.680 0.204
#> SRR655399 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.1289 0.90843 0.032 0.968 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.4002 0.78437 0.000 0.840 0.160
#> SRR1391420 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.5024 0.63905 0.220 0.004 0.776
#> SRR658259 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0237 0.92939 0.004 0.996 0.000
#> SRR1322900 1 0.8977 0.41245 0.564 0.232 0.204
#> SRR1309942 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 2 0.4953 0.75381 0.016 0.808 0.176
#> SRR1435418 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 2 0.6255 0.67984 0.048 0.748 0.204
#> SRR1500323 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.5926 0.50806 0.644 0.000 0.356
#> SRR1350435 1 0.4178 0.77047 0.828 0.000 0.172
#> SRR1389177 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.2625 0.81940 0.000 0.084 0.916
#> SRR1318839 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.0592 0.92451 0.000 0.988 0.012
#> SRR1089424 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.3918 0.81878 0.120 0.868 0.012
#> SRR1456027 2 0.2878 0.85058 0.096 0.904 0.000
#> SRR1400551 3 0.4399 0.67310 0.188 0.000 0.812
#> SRR1320469 1 0.2878 0.83919 0.904 0.000 0.096
#> SRR614251 3 0.6280 0.26027 0.000 0.460 0.540
#> SRR1454310 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.6286 0.24556 0.000 0.464 0.536
#> SRR1433290 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.2356 0.87713 0.000 0.928 0.072
#> SRR1409130 3 0.6295 0.22648 0.000 0.472 0.528
#> SRR659696 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.5058 0.67097 0.000 0.244 0.756
#> SRR1348040 1 0.8339 0.51836 0.628 0.168 0.204
#> SRR1489610 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.5968 0.46311 0.636 0.000 0.364
#> SRR1394637 1 0.4346 0.75672 0.816 0.000 0.184
#> SRR606974 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.6291 0.24444 0.532 0.000 0.468
#> SRR1454117 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 1 0.6354 0.68341 0.744 0.052 0.204
#> SRR1432743 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.1964 0.83700 0.000 0.056 0.944
#> SRR1406008 2 0.0424 0.92677 0.008 0.992 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.4452 0.71315 0.808 0.192 0.000
#> SRR1318465 3 0.5431 0.62204 0.000 0.284 0.716
#> SRR1431083 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.1015 0.92046 0.008 0.980 0.012
#> SRR662019 3 0.5733 0.41583 0.324 0.000 0.676
#> SRR1349209 2 0.8503 0.36086 0.120 0.576 0.304
#> SRR1326161 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.4399 0.82872 0.044 0.864 0.092
#> SRR1408183 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.6267 0.19345 0.000 0.548 0.452
#> SRR809444 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.1529 0.88108 0.960 0.040 0.000
#> SRR1326292 1 0.2261 0.87169 0.932 0.000 0.068
#> SRR657139 3 0.1411 0.84314 0.036 0.000 0.964
#> SRR1440744 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0592 0.90685 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452334 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381775 1 0.8824 0.29334 0.512 0.364 0.124
#> SRR1363908 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.1585 0.85272 0.008 0.028 0.964
#> SRR1353663 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.3816 0.79798 0.000 0.852 0.148
#> SRR1331922 1 0.5008 0.75188 0.804 0.016 0.180
#> SRR615479 2 0.9616 -0.01402 0.376 0.420 0.204
#> SRR1375796 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 2 0.4452 0.74376 0.000 0.808 0.192
#> SRR1355217 2 0.4228 0.79396 0.008 0.844 0.148
#> SRR1356290 2 0.5968 0.34177 0.000 0.636 0.364
#> SRR659507 2 0.4485 0.80033 0.020 0.844 0.136
#> SRR663296 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414727 1 0.4654 0.72859 0.792 0.000 0.208
#> SRR663477 1 0.2959 0.84179 0.900 0.000 0.100
#> SRR1354489 3 0.0592 0.86110 0.000 0.012 0.988
#> SRR1377800 3 0.4121 0.72019 0.168 0.000 0.832
#> SRR614611 2 0.2537 0.86389 0.000 0.920 0.080
#> SRR655052 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478968 2 0.9400 -0.04316 0.404 0.424 0.172
#> SRR1351280 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 2 0.2165 0.88117 0.064 0.936 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0424 0.92709 0.000 0.992 0.008
#> SRR810225 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.6062 0.44371 0.000 0.384 0.616
#> SRR1402328 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.4654 0.68944 0.000 0.792 0.208
#> SRR1442104 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.8608 0.46051 0.192 0.604 0.204
#> SRR1310735 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.3752 0.80285 0.000 0.856 0.144
#> SRR660260 2 0.5012 0.72038 0.008 0.788 0.204
#> SRR1071231 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.3120 0.85967 0.080 0.908 0.012
#> SRR1337173 3 0.6295 0.21395 0.000 0.472 0.528
#> SRR1396250 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.5254 0.65428 0.000 0.264 0.736
#> SRR1401379 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.1289 0.85223 0.000 0.032 0.968
#> SRR1390437 2 0.2261 0.87711 0.068 0.932 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.4748 0.78590 0.832 0.024 0.144
#> SRR659590 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.3618 0.80146 0.012 0.104 0.884
#> SRR1442928 2 0.4912 0.73110 0.008 0.796 0.196
#> SRR1464681 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.4121 0.75929 0.000 0.168 0.832
#> SRR1365426 2 0.5723 0.65729 0.240 0.744 0.016
#> SRR1487947 1 0.4121 0.76798 0.832 0.000 0.168
#> SRR659708 3 0.0424 0.86108 0.008 0.000 0.992
#> SRR603236 3 0.6192 0.36030 0.000 0.420 0.580
#> SRR660673 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 2 0.9372 0.25908 0.300 0.500 0.200
#> SRR613879 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 2 0.8290 0.51666 0.164 0.632 0.204
#> SRR1387966 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0237 0.90983 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349231 2 0.8650 0.46245 0.200 0.600 0.200
#> SRR1376249 3 0.0237 0.86259 0.004 0.000 0.996
#> SRR1321987 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.6180 0.37473 0.000 0.416 0.584
#> SRR1383081 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.1964 0.83945 0.000 0.056 0.944
#> SRR1444306 3 0.1182 0.85726 0.012 0.012 0.976
#> SRR1322662 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.6386 0.32157 0.584 0.412 0.004
#> SRR1489030 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.4291 0.75972 0.000 0.820 0.180
#> SRR615225 2 0.1163 0.91300 0.000 0.972 0.028
#> SRR1401839 2 0.9620 -0.02670 0.380 0.416 0.204
#> SRR1379110 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0747 0.85581 0.016 0.000 0.984
#> SRR1331639 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.6004 0.73356 0.064 0.780 0.156
#> SRR1443003 3 0.5363 0.62397 0.000 0.276 0.724
#> SRR612839 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0237 0.91082 0.996 0.000 0.004
#> SRR1387222 3 0.2959 0.81002 0.000 0.100 0.900
#> SRR664063 1 0.9612 0.16927 0.424 0.372 0.204
#> SRR1488214 1 0.0661 0.90758 0.988 0.004 0.008
#> SRR654766 2 0.3500 0.83061 0.004 0.880 0.116
#> SRR1320321 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.91269 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.93209 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.86467 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.4458 0.79257 0.080 0.056 0.864
#> SRR615311 1 0.0747 0.90450 0.984 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380716 2 0.0469 0.7788 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612803 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.4174 0.7445 0.816 0.000 0.140 0.044
#> SRR1084417 3 0.2530 0.4920 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1074359 2 0.4103 0.7938 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1419258 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1403366 3 0.2921 0.3209 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR665262 3 0.5810 0.5649 0.000 0.276 0.660 0.064
#> SRR1499740 3 0.6005 0.5380 0.084 0.008 0.692 0.216
#> SRR1105057 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.1109 0.5180 0.004 0.028 0.968 0.000
#> SRR612215 3 0.5592 0.5551 0.000 0.300 0.656 0.044
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.1356 0.5062 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR1409263 4 0.4500 0.9082 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.2837 0.7015 0.012 0.904 0.068 0.016
#> SRR614839 2 0.5237 0.1250 0.000 0.628 0.356 0.016
#> SRR658433 2 0.0336 0.7739 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1088581 3 0.5097 -0.4292 0.000 0.004 0.568 0.428
#> SRR1328797 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1334512 2 0.0336 0.7739 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4072 0.7922 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1354955 3 0.4643 -0.2167 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR654802 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR660066 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1447103 3 0.5656 0.5751 0.004 0.248 0.692 0.056
#> SRR1402153 2 0.7442 0.0280 0.000 0.504 0.212 0.284
#> SRR655887 2 0.0921 0.7831 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1408529 4 0.4661 0.8870 0.000 0.000 0.348 0.652
#> SRR658707 1 0.4877 0.2576 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1384371 2 0.4215 0.7257 0.000 0.824 0.072 0.104
#> SRR1074670 3 0.4730 -0.2979 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1375439 3 0.4690 0.5652 0.000 0.276 0.712 0.012
#> SRR1329003 1 0.0188 0.9282 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404837 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1317920 1 0.7084 -0.2008 0.440 0.436 0.000 0.124
#> SRR1455525 3 0.4730 -0.2979 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR613999 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 4 0.4941 0.7736 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR612227 3 0.0188 0.4933 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1388809 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1413872 2 0.3975 0.7937 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1452864 1 0.4584 0.7161 0.808 0.128 0.056 0.008
#> SRR1473078 3 0.0000 0.4960 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615814 2 0.0921 0.7773 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1325225 1 0.3583 0.7317 0.816 0.000 0.180 0.004
#> SRR1313687 2 0.4883 0.3221 0.000 0.696 0.288 0.016
#> SRR1358220 2 0.2589 0.7939 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1096662 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.4560 0.7810 0.000 0.700 0.004 0.296
#> SRR660164 2 0.4250 0.7883 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR815783 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809595 3 0.5656 0.5752 0.004 0.248 0.692 0.056
#> SRR1403133 2 0.4406 0.7833 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR815470 2 0.4382 0.7845 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.6655 0.4170 0.000 0.440 0.476 0.084
#> SRR1478362 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1392186 2 0.0817 0.7782 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0469 0.9219 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1471594 3 0.6101 0.2955 0.388 0.000 0.560 0.052
#> SRR1354270 3 0.2466 0.5428 0.028 0.000 0.916 0.056
#> SRR612683 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1392901 3 0.7203 0.4502 0.000 0.164 0.524 0.312
#> SRR1077805 3 0.4993 0.3806 0.000 0.260 0.712 0.028
#> SRR1360402 2 0.3942 0.7932 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1406112 3 0.3219 0.2842 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1355352 3 0.0817 0.5100 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR656247 3 0.5697 0.4767 0.292 0.000 0.656 0.052
#> SRR813656 2 0.5615 0.7347 0.000 0.716 0.096 0.188
#> SRR808244 4 0.4978 0.8469 0.004 0.000 0.384 0.612
#> SRR1387240 2 0.0000 0.7764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.5632 0.3916 0.624 0.000 0.340 0.036
#> SRR1385277 2 0.7655 0.5601 0.008 0.504 0.192 0.296
#> SRR1435248 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419110 3 0.5550 0.5741 0.000 0.248 0.692 0.060
#> SRR1408682 2 0.4535 0.7826 0.000 0.704 0.004 0.292
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1453911 2 0.7113 0.2792 0.000 0.532 0.316 0.152
#> SRR603164 3 0.5727 0.1973 0.000 0.076 0.688 0.236
#> SRR1383259 2 0.4008 0.7939 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1330854 3 0.2522 0.4993 0.076 0.000 0.908 0.016
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.4807 0.5613 0.000 0.248 0.728 0.024
#> SRR1361546 3 0.5938 0.5764 0.016 0.236 0.692 0.056
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.5142 0.4771 0.000 0.744 0.064 0.192
#> SRR615635 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1385411 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.4985 -0.5176 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR662126 2 0.6701 0.6844 0.000 0.584 0.120 0.296
#> SRR1464601 2 0.0927 0.7649 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1071594 2 0.0707 0.7721 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR612539 2 0.0921 0.7767 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR602010 3 0.7329 0.3199 0.000 0.188 0.516 0.296
#> SRR810249 2 0.3907 0.7934 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR818773 3 0.6433 0.5815 0.052 0.200 0.692 0.056
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1442754 3 0.5856 -0.3546 0.036 0.000 0.556 0.408
#> SRR1334247 3 0.3791 0.2815 0.000 0.004 0.796 0.200
#> SRR661639 1 0.5126 0.1413 0.552 0.000 0.444 0.004
#> SRR613222 3 0.5764 0.5469 0.000 0.304 0.644 0.052
#> SRR1459937 2 0.7848 0.4790 0.004 0.448 0.244 0.304
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.3074 0.7973 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR809348 3 0.5815 0.2211 0.428 0.000 0.540 0.032
#> SRR819261 3 0.4730 -0.2979 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR661074 3 0.4164 0.0395 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1349851 1 0.5759 0.5052 0.688 0.232 0.000 0.080
#> SRR1405123 2 0.2589 0.7944 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR661096 2 0.3975 0.7934 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0188 0.9284 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1307677 2 0.0336 0.7739 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466512 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR658212 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1430525 4 0.4624 0.8932 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1344422 2 0.4838 0.4684 0.000 0.724 0.024 0.252
#> SRR1353924 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1314832 3 0.1211 0.5101 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1487570 2 0.7468 0.6019 0.184 0.516 0.004 0.296
#> SRR627431 3 0.7497 0.3967 0.000 0.280 0.496 0.224
#> SRR1418561 3 0.5728 -0.2519 0.036 0.000 0.600 0.364
#> SRR1448029 3 0.4420 0.5659 0.000 0.240 0.748 0.012
#> SRR813802 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3942 0.7932 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1435311 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612395 3 0.5727 0.5792 0.000 0.228 0.692 0.080
#> SRR603116 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1323152 3 0.0000 0.4960 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368264 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1326624 1 0.3355 0.7609 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR1429265 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1327702 1 0.2840 0.8447 0.900 0.000 0.044 0.056
#> SRR615611 3 0.5427 0.4695 0.000 0.416 0.568 0.016
#> SRR1486799 1 0.0188 0.9282 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096174 2 0.4304 0.7863 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR815044 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1338560 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615862 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1480038 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR659436 3 0.1716 0.5366 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR613699 2 0.0707 0.7687 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1330327 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1489950 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 4 0.4500 0.9093 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1444002 1 0.6520 0.1788 0.536 0.000 0.384 0.080
#> SRR1318444 3 0.4795 0.5080 0.000 0.012 0.696 0.292
#> SRR600656 2 0.6269 0.7156 0.000 0.632 0.096 0.272
#> SRR658766 4 0.4898 0.7871 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR655946 3 0.4543 -0.0707 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR817282 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 4 0.4605 0.8987 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1406418 1 0.0188 0.9281 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.6324 0.5057 0.000 0.356 0.572 0.072
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4164 0.5313 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR662498 3 0.5550 0.5743 0.000 0.248 0.692 0.060
#> SRR1376764 3 0.7654 0.3538 0.000 0.252 0.464 0.284
#> SRR1377006 3 0.4964 0.4221 0.000 0.244 0.724 0.032
#> SRR656860 2 0.0469 0.7716 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1480547 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1452515 3 0.5318 0.5813 0.000 0.196 0.732 0.072
#> SRR1324390 2 0.3837 0.7969 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR615273 3 0.5159 0.3691 0.364 0.000 0.624 0.012
#> SRR601695 4 0.6878 -0.4702 0.000 0.424 0.104 0.472
#> SRR820907 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR812773 2 0.7677 0.4839 0.000 0.456 0.248 0.296
#> SRR1405984 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1472794 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1435626 3 0.0000 0.4960 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1377862 1 0.3895 0.7209 0.804 0.000 0.184 0.012
#> SRR1332299 3 0.4250 0.0598 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1467966 3 0.4817 -0.3580 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1320579 4 0.4746 0.8606 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1319710 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1326604 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1098879 4 0.5088 0.7563 0.000 0.004 0.424 0.572
#> SRR662245 2 0.7704 -0.2531 0.000 0.452 0.264 0.284
#> SRR1074719 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR816226 1 0.1510 0.8983 0.956 0.000 0.028 0.016
#> SRR601387 2 0.0188 0.7776 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614575 2 0.4103 0.7918 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1353900 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR662906 4 0.4454 0.9015 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1350832 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1403280 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313969 2 0.4584 0.7818 0.000 0.696 0.004 0.300
#> SRR1388528 1 0.4933 0.1896 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.8053 0.2530 0.004 0.368 0.332 0.296
#> SRR655399 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1319753 2 0.4560 0.7811 0.004 0.700 0.000 0.296
#> SRR818901 3 0.4103 0.1126 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR607067 2 0.7412 0.5564 0.000 0.504 0.200 0.296
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR661961 3 0.2855 0.5490 0.040 0.004 0.904 0.052
#> SRR658259 2 0.1716 0.7730 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1716 0.7889 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1365034 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1478053 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1475300 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1328101 2 0.4820 0.7770 0.000 0.692 0.012 0.296
#> SRR1322900 3 0.6166 0.5412 0.116 0.008 0.692 0.184
#> SRR1309942 2 0.1118 0.7856 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1345760 2 0.7846 0.3500 0.000 0.404 0.300 0.296
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4040 0.7934 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0707 0.7813 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR661469 3 0.5756 0.5792 0.000 0.224 0.692 0.084
#> SRR1500323 2 0.2408 0.7937 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1356705 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4222 0.4820 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1350435 3 0.5980 0.2906 0.396 0.000 0.560 0.044
#> SRR1389177 3 0.3764 0.2144 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1368072 2 0.0469 0.7784 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR601815 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR613330 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.5256 0.5809 0.000 0.204 0.732 0.064
#> SRR1318839 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1432390 2 0.4382 0.7845 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR613126 2 0.4908 0.3182 0.000 0.692 0.292 0.016
#> SRR1089424 2 0.0336 0.7739 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1347214 2 0.0000 0.7764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.7851 0.4742 0.008 0.480 0.248 0.264
#> SRR1456027 2 0.4722 0.7801 0.008 0.692 0.000 0.300
#> SRR1400551 3 0.0188 0.4985 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1320469 1 0.4963 0.5244 0.696 0.000 0.284 0.020
#> SRR614251 2 0.6834 0.1892 0.000 0.600 0.176 0.224
#> SRR1454310 2 0.4040 0.7926 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR615105 2 0.6991 0.1094 0.000 0.524 0.128 0.348
#> SRR1433290 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR2166064 2 0.4252 0.7936 0.000 0.744 0.004 0.252
#> SRR601671 2 0.4072 0.7922 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR663874 2 0.4963 0.3696 0.000 0.696 0.284 0.020
#> SRR1409130 2 0.6646 0.1856 0.000 0.620 0.156 0.224
#> SRR659696 2 0.4382 0.7848 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1408249 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR663284 2 0.2915 0.7145 0.000 0.892 0.080 0.028
#> SRR1402794 3 0.4730 -0.2979 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR614852 3 0.7366 0.4122 0.000 0.252 0.524 0.224
#> SRR1348040 3 0.5872 0.5158 0.224 0.004 0.692 0.080
#> SRR1489610 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1488091 2 0.4134 0.7925 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1499566 2 0.0469 0.7793 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1361480 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1444501 4 0.4790 0.8444 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1415773 2 0.5861 0.7451 0.000 0.644 0.060 0.296
#> SRR1388832 3 0.5546 0.4748 0.292 0.000 0.664 0.044
#> SRR1394637 1 0.4040 0.6323 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR606974 2 0.0707 0.7750 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR662918 2 0.2216 0.7742 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR817421 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3942 0.7932 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR608264 4 0.4746 0.8701 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1318560 3 0.5884 -0.2437 0.044 0.000 0.592 0.364
#> SRR1454117 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.6740 0.5766 0.104 0.148 0.692 0.056
#> SRR1432743 3 0.3764 0.2144 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1388873 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.4370 0.5827 0.000 0.156 0.800 0.044
#> SRR1406008 2 0.4250 0.7888 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1396786 2 0.0336 0.7774 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1446564 1 0.5147 0.5867 0.740 0.200 0.000 0.060
#> SRR1318465 3 0.7173 0.0673 0.000 0.216 0.556 0.228
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR655170 2 0.0707 0.7758 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1087825 2 0.4844 0.7814 0.000 0.688 0.012 0.300
#> SRR662019 3 0.2662 0.4215 0.016 0.000 0.900 0.084
#> SRR1349209 3 0.5253 0.5563 0.028 0.036 0.764 0.172
#> SRR1326161 2 0.0927 0.7655 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1345284 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0188 0.7774 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454328 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.6712 0.7006 0.008 0.600 0.096 0.296
#> SRR1408183 3 0.2345 0.4025 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1084369 3 0.3982 0.2225 0.000 0.004 0.776 0.220
#> SRR598452 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR660709 3 0.4737 0.5190 0.000 0.020 0.728 0.252
#> SRR809444 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0336 0.7768 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1375774 1 0.1811 0.8874 0.948 0.020 0.004 0.028
#> SRR1326292 1 0.1635 0.8915 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR657139 3 0.0524 0.5036 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1440744 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0336 0.9255 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452334 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1381775 2 0.9609 0.3132 0.216 0.368 0.144 0.272
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658989 3 0.0707 0.5118 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR819054 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1367988 2 0.6695 0.6506 0.000 0.616 0.164 0.220
#> SRR1331922 1 0.5321 0.5751 0.708 0.016 0.256 0.020
#> SRR615479 3 0.6678 0.5772 0.048 0.104 0.692 0.156
#> SRR1375796 2 0.1867 0.7811 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1386991 3 0.5636 0.5733 0.000 0.260 0.680 0.060
#> SRR1355217 3 0.6347 0.4471 0.000 0.412 0.524 0.064
#> SRR1356290 2 0.5500 0.4738 0.000 0.708 0.068 0.224
#> SRR659507 3 0.6274 0.5422 0.000 0.292 0.620 0.088
#> SRR663296 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR661155 2 0.4406 0.7840 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1414727 3 0.4608 0.4697 0.304 0.000 0.692 0.004
#> SRR663477 1 0.4916 0.6705 0.760 0.000 0.184 0.056
#> SRR1354489 3 0.4049 0.2142 0.000 0.008 0.780 0.212
#> SRR1377800 3 0.0921 0.5117 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR614611 2 0.1637 0.7394 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR655052 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1478968 1 0.9765 -0.1649 0.328 0.288 0.220 0.164
#> SRR1351280 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613951 2 0.5244 0.6672 0.004 0.764 0.124 0.108
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4898 0.7871 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.5000 -0.6567 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR655040 2 0.6120 0.7302 0.000 0.628 0.076 0.296
#> SRR810225 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1325377 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR617829 2 0.7890 -0.2076 0.000 0.372 0.336 0.292
#> SRR1402328 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480455 2 0.1716 0.7370 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1442104 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 4 0.4730 0.8737 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1414314 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR663026 2 0.0336 0.7738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1478386 2 0.3837 0.7940 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1458683 4 0.4730 0.8642 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.4820 0.5061 0.000 0.012 0.692 0.296
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.6823 0.6570 0.000 0.596 0.160 0.244
#> SRR660260 3 0.4908 0.5504 0.000 0.292 0.692 0.016
#> SRR1071231 2 0.4134 0.7912 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1459125 2 0.6294 0.7275 0.004 0.624 0.076 0.296
#> SRR1337173 2 0.7747 0.3114 0.000 0.388 0.232 0.380
#> SRR1396250 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR2166376 4 0.4746 0.8627 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR659816 3 0.6058 0.3230 0.000 0.180 0.684 0.136
#> SRR1401379 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR600981 2 0.0592 0.7732 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.3975 0.7950 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR660115 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1359780 2 0.0817 0.7744 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.2760 0.7875 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1319648 2 0.0336 0.7763 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.1118 0.7788 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1468658 3 0.4391 0.1872 0.000 0.008 0.740 0.252
#> SRR1390437 2 0.4697 0.7792 0.008 0.696 0.000 0.296
#> SRR658057 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR612635 2 0.1211 0.7806 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1351480 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436651 1 0.0188 0.9282 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441590 3 0.7713 0.4827 0.276 0.112 0.564 0.048
#> SRR659590 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR614263 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.4008 0.7927 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR659911 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1085519 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1345894 3 0.7297 0.4413 0.000 0.220 0.536 0.244
#> SRR1442928 3 0.5602 0.4837 0.000 0.408 0.568 0.024
#> SRR1464681 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.3342 0.4714 0.000 0.100 0.868 0.032
#> SRR1365426 2 0.7294 0.6541 0.012 0.556 0.136 0.296
#> SRR1487947 1 0.3004 0.8366 0.892 0.000 0.048 0.060
#> SRR659708 3 0.0336 0.5010 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR603236 2 0.7883 -0.2739 0.000 0.364 0.352 0.284
#> SRR660673 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.4356 0.7861 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR663807 2 0.0336 0.7756 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087245 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1339108 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR613426 3 0.7037 0.4396 0.012 0.116 0.584 0.288
#> SRR613879 2 0.0469 0.7765 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1385101 3 0.6788 0.4605 0.016 0.088 0.608 0.288
#> SRR1387966 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458852 2 0.3975 0.7927 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1430489 1 0.0188 0.9279 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349231 3 0.7570 0.3654 0.012 0.168 0.528 0.292
#> SRR1376249 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1321987 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662653 2 0.0000 0.7764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.7506 -0.2245 0.000 0.492 0.288 0.220
#> SRR1383081 2 0.4356 0.7838 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR2166960 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR605101 2 0.3764 0.7948 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR818600 2 0.0469 0.7716 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1367715 2 0.4008 0.7933 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1351979 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1387054 3 0.5812 -0.1043 0.000 0.048 0.624 0.328
#> SRR1444306 3 0.4882 0.1744 0.000 0.020 0.708 0.272
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0921 0.7821 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612767 2 0.7004 0.2487 0.428 0.468 0.004 0.100
#> SRR1489030 2 0.4382 0.7826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1430375 3 0.6264 0.4967 0.000 0.376 0.560 0.064
#> SRR615225 2 0.5833 0.5065 0.000 0.692 0.212 0.096
#> SRR1401839 3 0.5551 0.5230 0.032 0.012 0.692 0.264
#> SRR1379110 2 0.0188 0.7756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077288 3 0.4948 -0.4612 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1331639 2 0.4382 0.7845 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1342782 3 0.7476 0.1685 0.004 0.412 0.432 0.152
#> SRR1443003 3 0.7430 0.4087 0.000 0.260 0.512 0.228
#> SRR612839 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 4 0.4916 0.7906 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.7371 0.4057 0.000 0.244 0.524 0.232
#> SRR664063 3 0.5764 0.5314 0.056 0.008 0.692 0.244
#> SRR1488214 1 0.1042 0.9111 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR654766 2 0.6790 0.6665 0.000 0.576 0.128 0.296
#> SRR1320321 2 0.3942 0.7930 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9312 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4304 0.7862 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1488470 2 0.0592 0.7703 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1389497 4 0.4477 0.9106 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1367109 3 0.2287 0.5416 0.012 0.004 0.924 0.060
#> SRR615311 1 0.0592 0.9189 0.984 0.000 0.016 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.3561 0.6511 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1380716 2 0.4242 0.5541 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR612803 1 0.0162 0.9521 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.3409 0.7736 0.824 0.000 0.000 0.032 0.144
#> SRR1084417 5 0.2616 0.7338 0.076 0.000 0.036 0.000 0.888
#> SRR1074359 4 0.3752 0.5443 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1419258 3 0.1626 0.8130 0.000 0.016 0.940 0.000 0.044
#> SRR1403366 5 0.3274 0.6216 0.000 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR665262 5 0.1831 0.7545 0.000 0.004 0.000 0.076 0.920
#> SRR1499740 5 0.1205 0.7636 0.004 0.000 0.000 0.040 0.956
#> SRR1105057 2 0.4192 0.5840 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.1549 0.7594 0.000 0.016 0.040 0.000 0.944
#> SRR612215 5 0.2569 0.7506 0.000 0.040 0.000 0.068 0.892
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 5 0.1704 0.7528 0.004 0.000 0.068 0.000 0.928
#> SRR1409263 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.2127 0.6787 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR614839 2 0.4170 0.6278 0.000 0.760 0.000 0.192 0.048
#> SRR658433 2 0.4227 0.5824 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1088581 5 0.6722 -0.0903 0.000 0.268 0.316 0.000 0.416
#> SRR1328797 3 0.0912 0.8211 0.000 0.012 0.972 0.000 0.016
#> SRR1334512 2 0.3816 0.6426 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 4 0.2648 0.7397 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1354955 5 0.4161 0.5150 0.000 0.016 0.280 0.000 0.704
#> SRR654802 3 0.0703 0.8200 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR660066 4 0.1121 0.7881 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1447103 5 0.1205 0.7636 0.000 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR1402153 2 0.7913 0.1341 0.000 0.392 0.084 0.232 0.292
#> SRR655887 4 0.3534 0.4269 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR1408529 3 0.4138 0.6156 0.000 0.016 0.708 0.000 0.276
#> SRR658707 5 0.4430 0.4237 0.360 0.012 0.000 0.000 0.628
#> SRR1384371 4 0.4383 -0.0113 0.000 0.424 0.000 0.572 0.004
#> SRR1074670 5 0.4294 0.0607 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1375439 5 0.1483 0.7651 0.000 0.012 0.008 0.028 0.952
#> SRR1329003 1 0.0880 0.9292 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317920 4 0.4460 0.2795 0.392 0.004 0.000 0.600 0.004
#> SRR1455525 5 0.4294 0.0607 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR613999 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.4702 0.1880 0.000 0.016 0.552 0.000 0.432
#> SRR1068855 1 0.0162 0.9520 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612227 5 0.1197 0.7577 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1388809 4 0.2891 0.7235 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1413872 4 0.1410 0.7873 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1452864 1 0.3916 0.7508 0.804 0.004 0.000 0.136 0.056
#> SRR1473078 5 0.1121 0.7580 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR615814 2 0.4235 0.4765 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1325225 1 0.3160 0.7496 0.808 0.004 0.000 0.000 0.188
#> SRR1313687 2 0.3269 0.6821 0.000 0.848 0.000 0.096 0.056
#> SRR1358220 2 0.4060 0.5206 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1096662 4 0.1608 0.7871 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 4 0.0290 0.7877 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR660164 4 0.0880 0.7911 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR815783 2 0.3857 0.6366 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR809595 5 0.1205 0.7636 0.000 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR1403133 4 0.1124 0.7941 0.000 0.036 0.000 0.960 0.004
#> SRR815470 4 0.1671 0.7866 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.5788 0.5367 0.000 0.660 0.044 0.068 0.228
#> SRR1478362 4 0.2020 0.7715 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1392186 2 0.4030 0.6017 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0324 0.9483 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1471594 5 0.4818 0.5009 0.284 0.004 0.000 0.040 0.672
#> SRR1354270 5 0.1205 0.7636 0.004 0.000 0.000 0.040 0.956
#> SRR612683 4 0.1851 0.7793 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1392901 5 0.2293 0.7102 0.000 0.016 0.084 0.000 0.900
#> SRR1077805 2 0.7215 -0.0703 0.000 0.408 0.052 0.140 0.400
#> SRR1360402 4 0.2377 0.7539 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1406112 5 0.3300 0.6342 0.000 0.004 0.204 0.000 0.792
#> SRR1355352 5 0.1251 0.7600 0.008 0.000 0.036 0.000 0.956
#> SRR656247 5 0.2569 0.7431 0.068 0.000 0.000 0.040 0.892
#> SRR813656 4 0.5053 0.4636 0.000 0.096 0.000 0.688 0.216
#> SRR808244 3 0.5641 0.6332 0.004 0.228 0.640 0.000 0.128
#> SRR1387240 2 0.4126 0.5984 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1408595 1 0.4846 0.3949 0.612 0.004 0.000 0.024 0.360
#> SRR1385277 4 0.3474 0.6015 0.008 0.004 0.000 0.796 0.192
#> SRR1435248 2 0.3707 0.6498 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1419110 5 0.1997 0.7614 0.000 0.036 0.000 0.040 0.924
#> SRR1408682 4 0.1124 0.7945 0.000 0.036 0.000 0.960 0.004
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453911 4 0.6738 -0.1672 0.000 0.256 0.000 0.380 0.364
#> SRR603164 2 0.7114 -0.3754 0.000 0.368 0.284 0.012 0.336
#> SRR1383259 4 0.0955 0.7909 0.000 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR1330854 5 0.2554 0.7444 0.036 0.000 0.072 0.000 0.892
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.3586 0.6516 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.0693 0.7597 0.000 0.008 0.012 0.000 0.980
#> SRR1361546 5 0.1205 0.7636 0.000 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2020 0.6767 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR615635 4 0.1608 0.7866 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1385411 2 0.0963 0.6587 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.2127 0.7601 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR662126 4 0.1522 0.7555 0.000 0.012 0.000 0.944 0.044
#> SRR1464601 2 0.4333 0.6592 0.000 0.740 0.000 0.212 0.048
#> SRR1071594 2 0.4171 0.5705 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR612539 2 0.4126 0.4815 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR602010 5 0.4410 0.2080 0.000 0.004 0.000 0.440 0.556
#> SRR810249 4 0.2471 0.7452 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR818773 5 0.1442 0.7652 0.012 0.004 0.000 0.032 0.952
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 4 0.1478 0.7883 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1442754 3 0.3300 0.6701 0.004 0.000 0.792 0.000 0.204
#> SRR1334247 5 0.2351 0.7085 0.000 0.016 0.088 0.000 0.896
#> SRR661639 5 0.4290 0.4921 0.304 0.016 0.000 0.000 0.680
#> SRR613222 5 0.5632 0.3335 0.000 0.392 0.000 0.080 0.528
#> SRR1459937 4 0.5408 0.4384 0.000 0.180 0.000 0.664 0.156
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 4 0.3039 0.6727 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR809348 5 0.3916 0.6402 0.188 0.004 0.000 0.028 0.780
#> SRR819261 5 0.4294 0.0607 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR661074 3 0.3949 0.4597 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1349851 1 0.4717 0.5985 0.704 0.048 0.000 0.244 0.004
#> SRR1405123 4 0.3424 0.5530 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR661096 4 0.1205 0.7848 0.000 0.040 0.000 0.956 0.004
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0324 0.9499 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1307677 2 0.3876 0.6315 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1466512 4 0.1270 0.7885 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR658212 2 0.2020 0.6765 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1430525 3 0.5270 0.6717 0.000 0.208 0.672 0.000 0.120
#> SRR1344422 2 0.3375 0.5943 0.000 0.840 0.104 0.056 0.000
#> SRR1353924 4 0.1043 0.7887 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1314832 5 0.1522 0.7594 0.012 0.000 0.044 0.000 0.944
#> SRR1487570 4 0.2770 0.6806 0.124 0.004 0.000 0.864 0.008
#> SRR627431 2 0.6070 0.1524 0.000 0.580 0.084 0.024 0.312
#> SRR1418561 5 0.4437 0.0743 0.004 0.000 0.464 0.000 0.532
#> SRR1448029 5 0.2359 0.7493 0.000 0.060 0.036 0.000 0.904
#> SRR813802 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 4 0.1270 0.7867 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1435311 2 0.3796 0.6425 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR612395 5 0.1205 0.7636 0.000 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR603116 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1323152 5 0.0162 0.7586 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1368264 4 0.1704 0.7777 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR1326624 1 0.3797 0.6634 0.756 0.008 0.000 0.004 0.232
#> SRR1429265 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.2291 0.8754 0.908 0.000 0.000 0.036 0.056
#> SRR615611 2 0.4636 0.5742 0.000 0.744 0.000 0.124 0.132
#> SRR1486799 1 0.0162 0.9515 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096174 4 0.1270 0.7898 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR815044 4 0.1478 0.7880 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1338560 2 0.3983 0.6266 0.000 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR615862 4 0.1270 0.7867 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1480038 4 0.2280 0.7574 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR659436 5 0.0000 0.7596 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.3003 0.6511 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330327 4 0.0451 0.7860 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1489950 2 0.4161 0.5299 0.000 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0510 0.8205 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1444002 5 0.5900 0.2757 0.376 0.000 0.108 0.000 0.516
#> SRR1318444 5 0.1121 0.7630 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR600656 4 0.4865 0.4522 0.000 0.252 0.000 0.684 0.064
#> SRR658766 3 0.6494 0.4798 0.000 0.256 0.492 0.000 0.252
#> SRR655946 5 0.6166 0.2723 0.000 0.200 0.244 0.000 0.556
#> SRR817282 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.2110 0.8003 0.000 0.016 0.912 0.000 0.072
#> SRR1406418 1 0.0162 0.9520 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.5032 0.5376 0.000 0.220 0.000 0.092 0.688
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.0963 0.7640 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR662498 5 0.1205 0.7636 0.000 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR1376764 5 0.4407 0.6039 0.000 0.064 0.172 0.004 0.760
#> SRR1377006 5 0.5443 0.5900 0.000 0.116 0.036 0.132 0.716
#> SRR656860 2 0.3177 0.6486 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1480547 2 0.2852 0.6892 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1452515 5 0.0000 0.7596 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 4 0.2852 0.7066 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR615273 5 0.2488 0.7083 0.124 0.000 0.000 0.004 0.872
#> SRR601695 4 0.6655 0.2426 0.000 0.272 0.084 0.572 0.072
#> SRR820907 4 0.2424 0.7500 0.000 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR812773 4 0.3274 0.5786 0.000 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1405984 4 0.2280 0.7565 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1472794 2 0.4030 0.6147 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.1043 0.8158 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1435626 5 0.0794 0.7602 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1080766 2 0.3561 0.6511 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1377862 1 0.3317 0.7500 0.804 0.004 0.000 0.004 0.188
#> SRR1332299 5 0.3527 0.6199 0.000 0.016 0.192 0.000 0.792
#> SRR1467966 5 0.4525 0.3840 0.000 0.016 0.360 0.000 0.624
#> SRR1320579 3 0.5949 0.5953 0.000 0.240 0.588 0.000 0.172
#> SRR1319710 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326604 4 0.1478 0.7882 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1098879 3 0.3449 0.7366 0.000 0.024 0.812 0.000 0.164
#> SRR662245 2 0.5134 0.4271 0.000 0.736 0.160 0.052 0.052
#> SRR1074719 2 0.3561 0.6511 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR816226 1 0.1365 0.9184 0.952 0.004 0.000 0.004 0.040
#> SRR601387 2 0.4030 0.6238 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR614575 4 0.1043 0.7887 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1353900 2 0.1851 0.6831 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR662906 3 0.5142 0.5272 0.000 0.392 0.564 0.000 0.044
#> SRR1350832 2 0.1851 0.6831 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1403280 2 0.3876 0.6339 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1313969 4 0.1894 0.7790 0.000 0.072 0.000 0.920 0.008
#> SRR1388528 5 0.3983 0.4602 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.4101 0.4217 0.004 0.000 0.000 0.664 0.332
#> SRR655399 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 4 0.0324 0.7871 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR818901 5 0.3381 0.6365 0.000 0.016 0.176 0.000 0.808
#> SRR607067 4 0.6008 0.2624 0.000 0.292 0.000 0.560 0.148
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.2561 0.6889 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR661961 5 0.1041 0.7646 0.000 0.000 0.004 0.032 0.964
#> SRR658259 4 0.4276 -0.1349 0.000 0.380 0.000 0.616 0.004
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 4 0.4219 0.2178 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1365034 4 0.2127 0.7659 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1478053 4 0.1043 0.7887 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1475300 2 0.4060 0.6026 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1328101 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322900 5 0.1205 0.7636 0.004 0.000 0.000 0.040 0.956
#> SRR1309942 4 0.4249 0.0151 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1345760 4 0.4025 0.4735 0.000 0.008 0.000 0.700 0.292
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.1908 0.7763 0.000 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 4 0.3684 0.3623 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR661469 5 0.1205 0.7636 0.000 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR1500323 4 0.2732 0.6522 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1356705 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.1364 0.7587 0.036 0.000 0.012 0.000 0.952
#> SRR1350435 5 0.3888 0.6509 0.176 0.004 0.000 0.032 0.788
#> SRR1389177 5 0.2351 0.7085 0.000 0.016 0.088 0.000 0.896
#> SRR1368072 2 0.4171 0.5564 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR601815 2 0.1478 0.6697 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.0324 0.7872 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0510 0.9432 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.0324 0.7621 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1318839 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.0963 0.7932 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR613126 2 0.3496 0.6566 0.000 0.788 0.000 0.200 0.012
#> SRR1089424 2 0.3586 0.6513 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1347214 2 0.4256 0.5256 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1309556 4 0.4743 0.1441 0.008 0.008 0.000 0.568 0.416
#> SRR1456027 4 0.0727 0.7869 0.004 0.012 0.000 0.980 0.004
#> SRR1400551 5 0.1121 0.7580 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1320469 1 0.4479 0.6439 0.744 0.000 0.072 0.000 0.184
#> SRR614251 2 0.4927 0.5977 0.000 0.748 0.052 0.160 0.040
#> SRR1454310 4 0.3039 0.7037 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR615105 2 0.7101 0.2835 0.000 0.508 0.204 0.248 0.040
#> SRR1433290 3 0.1725 0.8127 0.000 0.020 0.936 0.000 0.044
#> SRR2166064 4 0.2966 0.6516 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR601671 4 0.0963 0.7901 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR663874 4 0.6708 -0.3570 0.000 0.376 0.000 0.380 0.244
#> SRR1409130 2 0.1493 0.6287 0.000 0.948 0.000 0.028 0.024
#> SRR659696 4 0.0865 0.7910 0.000 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR1408249 4 0.1043 0.7927 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR663284 2 0.4446 0.4509 0.000 0.592 0.000 0.400 0.008
#> SRR1402794 5 0.4294 0.0607 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR614852 5 0.5824 0.2738 0.000 0.392 0.084 0.004 0.520
#> SRR1348040 5 0.1205 0.7636 0.004 0.000 0.000 0.040 0.956
#> SRR1489610 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488091 4 0.2471 0.7484 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1499566 2 0.4446 0.5007 0.000 0.520 0.000 0.476 0.004
#> SRR1361480 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1444501 3 0.3051 0.7806 0.000 0.028 0.852 0.000 0.120
#> SRR1415773 4 0.0963 0.7699 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1388832 5 0.2409 0.7448 0.068 0.000 0.000 0.032 0.900
#> SRR1394637 1 0.3838 0.6030 0.716 0.004 0.000 0.000 0.280
#> SRR606974 2 0.3752 0.5993 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR662918 2 0.4437 0.3253 0.000 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR817421 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.1410 0.7873 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR608264 3 0.5475 0.5773 0.000 0.124 0.644 0.000 0.232
#> SRR1318560 5 0.4440 0.0613 0.004 0.000 0.468 0.000 0.528
#> SRR1454117 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312684 1 0.0162 0.9520 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.1787 0.7656 0.012 0.016 0.000 0.032 0.940
#> SRR1432743 5 0.2351 0.7085 0.000 0.016 0.088 0.000 0.896
#> SRR1388873 2 0.3561 0.6511 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.0162 0.7586 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1406008 4 0.0324 0.7892 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1396786 2 0.4242 0.5016 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1446564 1 0.4643 0.6481 0.736 0.068 0.000 0.192 0.004
#> SRR1318465 5 0.7714 0.1878 0.000 0.280 0.088 0.184 0.448
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.0794 0.7916 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR655170 2 0.3932 0.5362 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1087825 4 0.4430 0.4220 0.000 0.360 0.000 0.628 0.012
#> SRR662019 5 0.2605 0.6994 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1349209 5 0.2654 0.7375 0.000 0.064 0.000 0.048 0.888
#> SRR1326161 2 0.2929 0.6666 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1345284 2 0.4030 0.6222 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4305 0.3879 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1454328 2 0.3586 0.6513 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 4 0.3757 0.7062 0.008 0.088 0.000 0.828 0.076
#> SRR1408183 5 0.2462 0.7343 0.000 0.008 0.112 0.000 0.880
#> SRR1084369 5 0.3416 0.6882 0.000 0.072 0.088 0.000 0.840
#> SRR598452 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 5 0.1756 0.7632 0.000 0.008 0.036 0.016 0.940
#> SRR809444 1 0.0324 0.9500 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089901 2 0.3913 0.6319 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1375774 1 0.1893 0.9090 0.936 0.024 0.000 0.028 0.012
#> SRR1326292 1 0.1412 0.9187 0.952 0.004 0.008 0.000 0.036
#> SRR657139 5 0.1741 0.7597 0.000 0.024 0.040 0.000 0.936
#> SRR1440744 4 0.0794 0.7916 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0451 0.9474 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1452334 2 0.2329 0.6899 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1381775 4 0.5526 0.4811 0.172 0.012 0.000 0.680 0.136
#> SRR1363908 1 0.0162 0.9520 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.3857 0.6364 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR658989 5 0.1124 0.7607 0.000 0.000 0.036 0.004 0.960
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.1965 0.6850 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1367988 4 0.5759 0.0997 0.000 0.388 0.000 0.520 0.092
#> SRR1331922 1 0.4742 0.6496 0.716 0.060 0.000 0.004 0.220
#> SRR615479 5 0.1492 0.7647 0.004 0.008 0.000 0.040 0.948
#> SRR1375796 2 0.4114 0.4040 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1386991 5 0.2520 0.7532 0.000 0.056 0.000 0.048 0.896
#> SRR1355217 5 0.5002 0.5738 0.000 0.160 0.000 0.132 0.708
#> SRR1356290 2 0.2864 0.6711 0.000 0.864 0.024 0.112 0.000
#> SRR659507 5 0.2389 0.7289 0.000 0.004 0.000 0.116 0.880
#> SRR663296 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 4 0.2020 0.7711 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR661155 4 0.3561 0.5079 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1414727 5 0.1197 0.7550 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR663477 1 0.4512 0.6938 0.752 0.016 0.000 0.040 0.192
#> SRR1354489 5 0.3912 0.6665 0.000 0.108 0.088 0.000 0.804
#> SRR1377800 5 0.1251 0.7600 0.008 0.000 0.036 0.000 0.956
#> SRR614611 2 0.2648 0.6556 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR655052 4 0.0794 0.7916 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1478968 1 0.8395 -0.1366 0.332 0.172 0.000 0.296 0.200
#> SRR1351280 2 0.4262 0.4231 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR613951 2 0.5113 0.5353 0.000 0.576 0.000 0.380 0.044
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.6494 0.4798 0.000 0.256 0.492 0.000 0.252
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.4648 0.1055 0.000 0.012 0.524 0.000 0.464
#> SRR655040 4 0.1568 0.7597 0.000 0.036 0.000 0.944 0.020
#> SRR810225 4 0.1410 0.7889 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1325377 2 0.4030 0.6147 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR617829 2 0.8358 0.0587 0.000 0.352 0.184 0.284 0.180
#> SRR1402328 2 0.3983 0.6266 0.000 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1480455 2 0.1608 0.6733 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1442104 3 0.0963 0.8170 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.2516 0.7478 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1414314 4 0.2966 0.7092 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR663026 2 0.3274 0.6457 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1478386 4 0.3636 0.5552 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1458683 3 0.5523 0.6005 0.000 0.320 0.592 0.000 0.088
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.1121 0.7630 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.6022 0.3365 0.000 0.280 0.000 0.564 0.156
#> SRR660260 5 0.3929 0.6304 0.000 0.208 0.000 0.028 0.764
#> SRR1071231 4 0.1197 0.7903 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1459125 4 0.1202 0.7698 0.004 0.004 0.000 0.960 0.032
#> SRR1337173 5 0.5881 0.2243 0.000 0.032 0.040 0.416 0.512
#> SRR1396250 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.2519 0.7950 0.000 0.016 0.884 0.000 0.100
#> SRR659816 5 0.6947 0.3290 0.000 0.260 0.056 0.140 0.544
#> SRR1401379 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR600981 2 0.3366 0.6414 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.3534 0.5913 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.1671 0.6788 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1359780 2 0.3366 0.6496 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.0794 0.7916 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 4 0.2970 0.6078 0.000 0.168 0.000 0.828 0.004
#> SRR1319648 2 0.4171 0.5820 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1092985 1 0.0290 0.9499 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.4235 0.4054 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1468658 5 0.5423 0.4428 0.000 0.244 0.112 0.000 0.644
#> SRR1390437 4 0.0324 0.7871 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR658057 4 0.1041 0.7932 0.000 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR612635 2 0.4302 0.1912 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1351480 2 0.3561 0.6511 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 5 0.3771 0.6714 0.156 0.004 0.000 0.036 0.804
#> SRR659590 4 0.0162 0.7882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614263 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 4 0.2516 0.7434 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR659911 2 0.1792 0.6807 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1085519 3 0.0162 0.8223 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345894 5 0.4541 0.5744 0.000 0.172 0.084 0.000 0.744
#> SRR1442928 2 0.4679 0.5542 0.000 0.716 0.000 0.068 0.216
#> SRR1464681 4 0.2280 0.7596 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.3678 0.6524 0.000 0.168 0.008 0.020 0.804
#> SRR1365426 4 0.2189 0.7240 0.012 0.000 0.000 0.904 0.084
#> SRR1487947 1 0.2233 0.8669 0.904 0.000 0.080 0.000 0.016
#> SRR659708 5 0.3579 0.5722 0.000 0.240 0.004 0.000 0.756
#> SRR603236 5 0.6273 0.4901 0.000 0.128 0.060 0.164 0.648
#> SRR660673 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 4 0.2233 0.7519 0.000 0.104 0.000 0.892 0.004
#> SRR663807 2 0.4210 0.5760 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1087245 4 0.0451 0.7905 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1339108 4 0.0451 0.7888 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR613426 5 0.4846 0.3498 0.004 0.020 0.000 0.388 0.588
#> SRR613879 4 0.4307 -0.4656 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1385101 5 0.4088 0.5332 0.008 0.004 0.000 0.276 0.712
#> SRR1387966 2 0.3561 0.6511 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1458852 4 0.2329 0.7572 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1430489 1 0.0324 0.9497 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349231 5 0.4670 0.2150 0.008 0.004 0.000 0.440 0.548
#> SRR1376249 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.4171 0.5877 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR662653 2 0.4256 0.5468 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.2795 0.6347 0.000 0.880 0.000 0.064 0.056
#> SRR1383081 4 0.2020 0.7719 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR2166960 2 0.1908 0.6832 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR605101 4 0.3913 0.2800 0.000 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR818600 2 0.3452 0.6820 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1367715 4 0.2891 0.7197 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1351979 3 0.1444 0.8143 0.000 0.012 0.948 0.000 0.040
#> SRR1387054 5 0.6990 0.1797 0.000 0.236 0.248 0.024 0.492
#> SRR1444306 5 0.3224 0.6514 0.000 0.016 0.160 0.000 0.824
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 4 0.4268 -0.1318 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR612767 4 0.4697 0.2666 0.388 0.020 0.000 0.592 0.000
#> SRR1489030 4 0.0865 0.7921 0.000 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR1430375 2 0.5615 0.3655 0.000 0.584 0.000 0.096 0.320
#> SRR615225 2 0.6523 0.2355 0.000 0.460 0.000 0.332 0.208
#> SRR1401839 5 0.1365 0.7637 0.004 0.004 0.000 0.040 0.952
#> SRR1379110 2 0.3707 0.6480 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1077288 3 0.2424 0.7442 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1331639 4 0.2329 0.7565 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1342782 5 0.6521 0.1203 0.004 0.176 0.000 0.348 0.472
#> SRR1443003 5 0.4424 0.6348 0.000 0.144 0.084 0.004 0.768
#> SRR612839 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4743 0.1777 0.000 0.016 0.512 0.000 0.472
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 5 0.5854 0.2778 0.000 0.384 0.088 0.004 0.524
#> SRR664063 5 0.1430 0.7629 0.004 0.000 0.000 0.052 0.944
#> SRR1488214 1 0.1731 0.9132 0.940 0.040 0.000 0.008 0.012
#> SRR654766 4 0.3165 0.6855 0.000 0.036 0.000 0.848 0.116
#> SRR1320321 4 0.2471 0.7485 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9542 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 4 0.2329 0.7553 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1488470 2 0.2732 0.6919 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.8224 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 5 0.1121 0.7641 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR615311 1 0.0671 0.9405 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.2805 0.8072 0.000 0.812 0.004 0.184 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.1556 0.8920 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2212 0.8255 0.880 0.000 0.008 0.000 0.112 0.000
#> SRR1084417 5 0.1349 0.7417 0.056 0.000 0.004 0.000 0.940 0.000
#> SRR1074359 4 0.3563 0.6458 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR1419258 3 0.3817 0.3588 0.000 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1403366 5 0.3172 0.6535 0.000 0.000 0.048 0.000 0.824 0.128
#> SRR665262 5 0.1267 0.7436 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1499740 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1105057 2 0.2805 0.8024 0.000 0.812 0.004 0.184 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.1501 0.7319 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR612215 5 0.3014 0.7005 0.000 0.012 0.084 0.048 0.856 0.000
#> SRR1094051 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.1765 0.8827 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 5 0.0260 0.7570 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1409263 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.3469 0.8052 0.000 0.808 0.104 0.088 0.000 0.000
#> SRR614839 2 0.4432 0.7545 0.000 0.720 0.192 0.080 0.008 0.000
#> SRR658433 2 0.2668 0.8197 0.000 0.828 0.004 0.168 0.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.4312 0.5839 0.000 0.028 0.764 0.000 0.084 0.124
#> SRR1328797 6 0.2527 0.7216 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1334512 2 0.1387 0.8269 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0146 0.9203 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 4 0.2597 0.8005 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.5395 0.6013 0.000 0.000 0.556 0.000 0.300 0.144
#> SRR654802 6 0.0713 0.9027 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR660066 4 0.0508 0.8372 0.000 0.012 0.004 0.984 0.000 0.000
#> SRR1447103 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1402153 3 0.5649 0.4656 0.000 0.132 0.620 0.212 0.036 0.000
#> SRR655887 4 0.4107 -0.0636 0.000 0.452 0.004 0.540 0.004 0.000
#> SRR1408529 3 0.4658 0.4262 0.000 0.000 0.568 0.000 0.048 0.384
#> SRR658707 5 0.4371 0.4372 0.344 0.000 0.036 0.000 0.620 0.000
#> SRR1384371 4 0.4609 -0.0800 0.000 0.436 0.024 0.532 0.008 0.000
#> SRR1074670 5 0.3717 0.3810 0.000 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1375439 5 0.0260 0.7570 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1329003 1 0.2996 0.7923 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 4 0.0146 0.8358 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1317920 4 0.5795 0.1152 0.364 0.000 0.184 0.452 0.000 0.000
#> SRR1455525 5 0.4241 0.3818 0.000 0.000 0.024 0.000 0.608 0.368
#> SRR613999 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.4864 0.4252 0.000 0.000 0.552 0.000 0.064 0.384
#> SRR1068855 1 0.0790 0.9120 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 5 0.0508 0.7575 0.000 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1388809 4 0.2912 0.7798 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.2542 0.8286 0.000 0.044 0.080 0.876 0.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.5045 0.6962 0.688 0.000 0.184 0.096 0.032 0.000
#> SRR1473078 5 0.0260 0.7570 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR615814 2 0.4263 0.7146 0.000 0.684 0.032 0.276 0.008 0.000
#> SRR1325225 1 0.4546 0.7058 0.692 0.000 0.204 0.000 0.104 0.000
#> SRR1313687 2 0.1584 0.8316 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.2883 0.6199 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000 0.000
#> SRR1096662 4 0.2357 0.8228 0.000 0.116 0.012 0.872 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 4 0.0146 0.8358 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR660164 4 0.0937 0.8378 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.1327 0.8295 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR809595 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1403133 4 0.0458 0.8372 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR815470 4 0.2146 0.8245 0.000 0.116 0.004 0.880 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.3108 0.7648 0.000 0.852 0.004 0.008 0.088 0.048
#> SRR1478362 4 0.2260 0.8145 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.1765 0.8293 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.2118 0.8708 0.888 0.000 0.104 0.008 0.000 0.000
#> SRR1471594 5 0.5557 0.3737 0.240 0.000 0.184 0.004 0.572 0.000
#> SRR1354270 5 0.0405 0.7577 0.000 0.000 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR612683 4 0.2346 0.8202 0.000 0.124 0.008 0.868 0.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.3810 0.5423 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1077805 5 0.6795 0.2628 0.000 0.292 0.080 0.132 0.488 0.008
#> SRR1360402 4 0.2558 0.8052 0.000 0.156 0.004 0.840 0.000 0.000
#> SRR1406112 5 0.3645 0.6156 0.000 0.000 0.064 0.000 0.784 0.152
#> SRR1355352 5 0.0260 0.7571 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR656247 5 0.2128 0.7303 0.056 0.000 0.032 0.004 0.908 0.000
#> SRR813656 4 0.6264 0.5060 0.000 0.148 0.072 0.568 0.212 0.000
#> SRR808244 3 0.3942 0.4202 0.004 0.004 0.624 0.000 0.000 0.368
#> SRR1387240 2 0.2340 0.8213 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.5551 0.5442 0.588 0.000 0.180 0.008 0.224 0.000
#> SRR1385277 4 0.4701 0.6050 0.000 0.000 0.192 0.680 0.128 0.000
#> SRR1435248 2 0.0858 0.8238 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000 0.000
#> SRR1419110 5 0.1049 0.7523 0.000 0.032 0.000 0.008 0.960 0.000
#> SRR1408682 4 0.0458 0.8376 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.0000 0.8350 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 4 0.5947 0.0729 0.000 0.240 0.000 0.448 0.312 0.000
#> SRR603164 5 0.6746 0.3857 0.000 0.168 0.096 0.016 0.560 0.160
#> SRR1383259 4 0.0777 0.8370 0.000 0.024 0.004 0.972 0.000 0.000
#> SRR1330854 5 0.1946 0.7310 0.072 0.000 0.004 0.000 0.912 0.012
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.0779 0.7564 0.000 0.008 0.008 0.000 0.976 0.008
#> SRR1361546 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3509 0.8039 0.000 0.804 0.112 0.084 0.000 0.000
#> SRR615635 4 0.1908 0.8318 0.000 0.096 0.004 0.900 0.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.1814 0.7754 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 6 0.0790 0.8944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR662126 4 0.0146 0.8342 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1464601 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.2823 0.7858 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR612539 2 0.5609 0.6941 0.000 0.580 0.196 0.216 0.008 0.000
#> SRR602010 5 0.4158 0.2309 0.000 0.008 0.004 0.416 0.572 0.000
#> SRR810249 4 0.2454 0.7991 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000 0.000
#> SRR818773 5 0.0260 0.7571 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 4 0.1814 0.8307 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1442754 6 0.1858 0.8371 0.012 0.000 0.000 0.000 0.076 0.912
#> SRR1334247 3 0.3851 0.4896 0.000 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR661639 5 0.4444 0.5185 0.256 0.000 0.068 0.000 0.676 0.000
#> SRR613222 5 0.5898 0.3371 0.000 0.240 0.136 0.040 0.584 0.000
#> SRR1459937 4 0.4261 0.6614 0.000 0.000 0.252 0.692 0.056 0.000
#> SRR2185018 1 0.0547 0.9163 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 4 0.2738 0.7323 0.000 0.176 0.004 0.820 0.000 0.000
#> SRR809348 5 0.4328 0.5806 0.192 0.000 0.092 0.000 0.716 0.000
#> SRR819261 5 0.3717 0.3810 0.000 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR661074 6 0.3023 0.5447 0.000 0.000 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1349851 1 0.5530 0.6303 0.640 0.036 0.188 0.136 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.3812 0.6039 0.000 0.264 0.024 0.712 0.000 0.000
#> SRR661096 4 0.0777 0.8347 0.000 0.024 0.004 0.972 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0713 0.9152 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.2996 0.7923 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.1387 0.8284 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1466512 4 0.1765 0.8290 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR658212 2 0.3426 0.7912 0.000 0.816 0.116 0.064 0.004 0.000
#> SRR1430525 3 0.3890 0.4027 0.000 0.004 0.596 0.000 0.000 0.400
#> SRR1344422 2 0.4096 0.7435 0.000 0.788 0.112 0.024 0.004 0.072
#> SRR1353924 4 0.0260 0.8362 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1314832 5 0.0622 0.7580 0.012 0.000 0.000 0.000 0.980 0.008
#> SRR1487570 4 0.3953 0.6939 0.060 0.000 0.196 0.744 0.000 0.000
#> SRR627431 3 0.4063 0.5441 0.000 0.148 0.768 0.012 0.072 0.000
#> SRR1418561 5 0.3717 0.3810 0.000 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1448029 5 0.1434 0.7450 0.000 0.048 0.000 0.000 0.940 0.012
#> SRR813802 1 0.0146 0.9203 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 4 0.1958 0.8249 0.000 0.100 0.004 0.896 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.1219 0.8288 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000 0.000
#> SRR612395 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR603116 4 0.0000 0.8350 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323152 5 0.0363 0.7560 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1368264 4 0.1007 0.8374 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.5413 0.5216 0.580 0.000 0.192 0.000 0.228 0.000
#> SRR1429265 6 0.0146 0.9171 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1327702 1 0.1942 0.8903 0.916 0.000 0.064 0.008 0.012 0.000
#> SRR615611 2 0.4744 0.7435 0.000 0.708 0.196 0.064 0.032 0.000
#> SRR1486799 1 0.0632 0.9149 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.1918 0.8288 0.000 0.088 0.008 0.904 0.000 0.000
#> SRR815044 4 0.1075 0.8396 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.1753 0.8306 0.000 0.912 0.004 0.084 0.000 0.000
#> SRR615862 4 0.2443 0.8278 0.000 0.096 0.020 0.880 0.004 0.000
#> SRR1480038 4 0.2416 0.8058 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR659436 5 0.0260 0.7558 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR613699 2 0.4411 0.7545 0.000 0.720 0.196 0.076 0.008 0.000
#> SRR1436563 1 0.0547 0.9179 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.0146 0.8352 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1330327 4 0.1528 0.8374 0.000 0.016 0.048 0.936 0.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.2454 0.7899 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 6 0.0458 0.9094 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1444002 5 0.4672 0.3687 0.392 0.000 0.008 0.000 0.568 0.032
#> SRR1318444 5 0.2389 0.6976 0.000 0.000 0.128 0.008 0.864 0.000
#> SRR600656 4 0.5492 0.6475 0.000 0.120 0.204 0.640 0.036 0.000
#> SRR658766 3 0.3463 0.5075 0.000 0.004 0.748 0.000 0.008 0.240
#> SRR655946 3 0.4479 0.6247 0.000 0.004 0.624 0.000 0.336 0.036
#> SRR817282 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 6 0.4272 0.3972 0.000 0.000 0.288 0.000 0.044 0.668
#> SRR1406418 1 0.2597 0.8274 0.824 0.000 0.176 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.1610 0.8870 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.3927 0.3835 0.000 0.344 0.000 0.012 0.644 0.000
#> SRR1471965 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR662498 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1376764 3 0.4513 0.5717 0.000 0.028 0.572 0.004 0.396 0.000
#> SRR1377006 5 0.5910 0.5085 0.000 0.088 0.156 0.128 0.628 0.000
#> SRR656860 2 0.4483 0.7621 0.000 0.720 0.180 0.092 0.008 0.000
#> SRR1480547 2 0.0508 0.8173 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000 0.000
#> SRR1452515 5 0.0363 0.7547 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1324390 4 0.3290 0.6969 0.000 0.252 0.004 0.744 0.000 0.000
#> SRR615273 5 0.1700 0.7248 0.080 0.000 0.004 0.000 0.916 0.000
#> SRR601695 3 0.3507 0.4710 0.000 0.008 0.764 0.216 0.012 0.000
#> SRR820907 4 0.2595 0.8025 0.000 0.160 0.004 0.836 0.000 0.000
#> SRR812773 4 0.3567 0.7329 0.000 0.000 0.100 0.800 0.100 0.000
#> SRR1405984 4 0.1957 0.8088 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.2146 0.8250 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 6 0.0260 0.9141 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1435626 5 0.0260 0.7570 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1080766 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.4574 0.7268 0.716 0.000 0.164 0.008 0.112 0.000
#> SRR1332299 3 0.3817 0.5382 0.000 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1467966 3 0.5528 0.5811 0.000 0.000 0.556 0.000 0.252 0.192
#> SRR1320579 3 0.3848 0.4956 0.000 0.004 0.692 0.000 0.012 0.292
#> SRR1319710 4 0.0146 0.8358 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1326604 4 0.2100 0.8238 0.000 0.112 0.004 0.884 0.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.5449 0.5276 0.000 0.008 0.568 0.000 0.120 0.304
#> SRR662245 3 0.4484 0.4658 0.000 0.268 0.672 0.056 0.004 0.000
#> SRR1074719 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.3243 0.7982 0.780 0.000 0.208 0.008 0.004 0.000
#> SRR601387 2 0.4351 0.7627 0.000 0.740 0.104 0.148 0.008 0.000
#> SRR614575 4 0.1116 0.8393 0.000 0.028 0.008 0.960 0.004 0.000
#> SRR1353900 2 0.0405 0.8163 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR662906 3 0.4422 0.5017 0.000 0.068 0.680 0.000 0.000 0.252
#> SRR1350832 2 0.0632 0.8214 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.1471 0.8284 0.000 0.932 0.004 0.064 0.000 0.000
#> SRR1313969 4 0.4220 0.7473 0.000 0.096 0.172 0.732 0.000 0.000
#> SRR1388528 5 0.4078 0.4726 0.320 0.000 0.024 0.000 0.656 0.000
#> SRR1452912 1 0.0146 0.9203 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.4666 0.5642 0.000 0.000 0.108 0.676 0.216 0.000
#> SRR655399 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 4 0.1501 0.8137 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.3838 0.5123 0.000 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR607067 4 0.5153 0.6636 0.000 0.048 0.196 0.680 0.076 0.000
#> SRR1391420 1 0.0363 0.9197 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR661961 5 0.0291 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR658259 2 0.3584 0.6897 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0713 0.9122 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3817 0.0381 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000 0.000
#> SRR1365034 4 0.2442 0.8106 0.000 0.144 0.004 0.852 0.000 0.000
#> SRR1478053 4 0.0260 0.8362 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.2320 0.8230 0.000 0.864 0.004 0.132 0.000 0.000
#> SRR1328101 4 0.0000 0.8350 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322900 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1309942 2 0.3672 0.4420 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.5175 0.5630 0.000 0.004 0.176 0.636 0.184 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.2572 0.8202 0.000 0.136 0.012 0.852 0.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 4 0.3833 -0.1610 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000 0.000
#> SRR661469 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1500323 4 0.2969 0.6137 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR1356705 4 0.0000 0.8350 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0146 0.9204 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.0260 0.7570 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1350435 5 0.4447 0.5735 0.100 0.000 0.196 0.000 0.704 0.000
#> SRR1389177 3 0.3817 0.5382 0.000 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1368072 2 0.3151 0.7508 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.3449 0.7403 0.000 0.780 0.196 0.016 0.008 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.2454 0.7618 0.000 0.000 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0146 0.9203 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.1408 0.9058 0.944 0.020 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.0260 0.7558 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1318839 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 4 0.1918 0.8327 0.000 0.088 0.008 0.904 0.000 0.000
#> SRR613126 2 0.4670 0.7768 0.000 0.704 0.112 0.176 0.008 0.000
#> SRR1089424 2 0.0405 0.8152 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.2527 0.8144 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1309556 5 0.6046 0.1682 0.004 0.008 0.160 0.396 0.432 0.000
#> SRR1456027 4 0.3823 0.7457 0.004 0.044 0.192 0.760 0.000 0.000
#> SRR1400551 5 0.0260 0.7570 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1320469 1 0.3361 0.7039 0.788 0.000 0.020 0.000 0.188 0.004
#> SRR614251 3 0.4765 0.3693 0.000 0.252 0.664 0.076 0.008 0.000
#> SRR1454310 4 0.2912 0.7781 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000
#> SRR615105 3 0.4399 0.4806 0.000 0.012 0.748 0.164 0.008 0.068
#> SRR1433290 3 0.3810 0.3654 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR2166064 4 0.3586 0.7228 0.000 0.012 0.268 0.720 0.000 0.000
#> SRR601671 4 0.0508 0.8375 0.000 0.012 0.004 0.984 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.5070 0.6294 0.000 0.576 0.000 0.328 0.096 0.000
#> SRR1409130 2 0.0935 0.8086 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.2462 0.8306 0.000 0.096 0.028 0.876 0.000 0.000
#> SRR1408249 4 0.0777 0.8366 0.000 0.024 0.004 0.972 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.5333 0.6763 0.000 0.588 0.112 0.292 0.008 0.000
#> SRR1402794 5 0.3717 0.3810 0.000 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR614852 3 0.3441 0.6087 0.000 0.024 0.784 0.004 0.188 0.000
#> SRR1348040 5 0.2346 0.7005 0.000 0.000 0.124 0.008 0.868 0.000
#> SRR1489610 4 0.0146 0.8358 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488091 4 0.1814 0.8289 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.3547 0.7093 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000 0.000
#> SRR1361480 4 0.0146 0.8343 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.5161 0.4805 0.000 0.012 0.568 0.000 0.068 0.352
#> SRR1415773 4 0.0146 0.8358 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1388832 5 0.1616 0.7437 0.048 0.000 0.020 0.000 0.932 0.000
#> SRR1394637 1 0.4904 0.6350 0.656 0.000 0.148 0.000 0.196 0.000
#> SRR606974 2 0.4933 0.7137 0.000 0.624 0.104 0.272 0.000 0.000
#> SRR662918 2 0.5313 0.5128 0.000 0.508 0.108 0.384 0.000 0.000
#> SRR817421 6 0.0146 0.9173 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1400823 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.2003 0.8238 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR608264 3 0.4033 0.3995 0.000 0.004 0.588 0.000 0.004 0.404
#> SRR1318560 5 0.3717 0.3810 0.000 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1454117 4 0.0458 0.8387 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.2664 0.8214 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.1858 0.7240 0.004 0.000 0.092 0.000 0.904 0.000
#> SRR1432743 3 0.3810 0.5423 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1388873 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.1863 0.8753 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.0260 0.7558 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1406008 4 0.0000 0.8350 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.2793 0.7732 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.5690 0.6293 0.640 0.072 0.188 0.100 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.5343 0.5373 0.000 0.040 0.664 0.184 0.112 0.000
#> SRR1431083 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.0405 0.8365 0.000 0.008 0.004 0.988 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.4969 0.6841 0.000 0.616 0.104 0.280 0.000 0.000
#> SRR1087825 4 0.4808 0.6412 0.000 0.060 0.332 0.604 0.004 0.000
#> SRR662019 5 0.1714 0.7208 0.000 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1349209 5 0.4197 0.6282 0.000 0.052 0.176 0.020 0.752 0.000
#> SRR1326161 2 0.3914 0.7972 0.000 0.768 0.104 0.128 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.1700 0.8310 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0146 0.9203 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.5304 0.7319 0.000 0.628 0.172 0.192 0.008 0.000
#> SRR1454328 2 0.0405 0.8155 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 4 0.5116 0.6930 0.000 0.080 0.184 0.688 0.048 0.000
#> SRR1408183 5 0.4066 -0.1070 0.000 0.000 0.392 0.000 0.596 0.012
#> SRR1084369 3 0.4779 0.5865 0.000 0.060 0.572 0.000 0.368 0.000
#> SRR598452 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 5 0.1462 0.7420 0.000 0.000 0.056 0.008 0.936 0.000
#> SRR809444 1 0.2772 0.8286 0.816 0.000 0.180 0.000 0.004 0.000
#> SRR1089901 2 0.1765 0.8309 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.3816 0.8032 0.784 0.024 0.160 0.032 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.3337 0.7671 0.736 0.000 0.260 0.000 0.004 0.000
#> SRR657139 5 0.1753 0.7286 0.000 0.000 0.084 0.000 0.912 0.004
#> SRR1440744 4 0.0260 0.8362 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0146 0.9203 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.2070 0.8756 0.892 0.000 0.100 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452334 2 0.2001 0.8261 0.000 0.912 0.048 0.040 0.000 0.000
#> SRR1381775 4 0.6521 0.5642 0.076 0.028 0.192 0.592 0.112 0.000
#> SRR1363908 1 0.1327 0.8975 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.1267 0.8285 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR658989 5 0.0291 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1353663 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.1007 0.8252 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.6544 0.4294 0.000 0.324 0.164 0.460 0.052 0.000
#> SRR1331922 1 0.5702 0.6592 0.664 0.072 0.104 0.008 0.152 0.000
#> SRR615479 5 0.1007 0.7477 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1375796 2 0.4788 0.5035 0.000 0.568 0.060 0.372 0.000 0.000
#> SRR1386991 5 0.1926 0.7354 0.000 0.068 0.000 0.020 0.912 0.000
#> SRR1355217 5 0.4319 0.4900 0.000 0.248 0.004 0.052 0.696 0.000
#> SRR1356290 2 0.3372 0.7868 0.000 0.816 0.100 0.084 0.000 0.000
#> SRR659507 5 0.1663 0.7212 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR663296 1 0.0458 0.9176 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 4 0.1908 0.8318 0.000 0.096 0.004 0.900 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.3693 0.7106 0.000 0.004 0.280 0.708 0.008 0.000
#> SRR1414727 5 0.0405 0.7575 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000
#> SRR663477 1 0.5300 0.6224 0.612 0.000 0.252 0.008 0.128 0.000
#> SRR1354489 3 0.5065 0.5964 0.000 0.092 0.568 0.000 0.340 0.000
#> SRR1377800 5 0.0260 0.7571 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR614611 2 0.3533 0.7386 0.000 0.776 0.196 0.020 0.008 0.000
#> SRR655052 4 0.1075 0.8380 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1478968 2 0.8522 -0.0290 0.248 0.252 0.236 0.204 0.060 0.000
#> SRR1351280 2 0.2738 0.7745 0.000 0.820 0.004 0.176 0.000 0.000
#> SRR613951 2 0.6825 0.4809 0.004 0.452 0.288 0.200 0.056 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.3560 0.5036 0.000 0.004 0.732 0.000 0.008 0.256
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.5774 0.3284 0.000 0.000 0.440 0.000 0.176 0.384
#> SRR655040 4 0.2302 0.7982 0.000 0.000 0.120 0.872 0.008 0.000
#> SRR810225 4 0.1327 0.8397 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.2146 0.8250 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.4336 0.4603 0.000 0.060 0.704 0.232 0.004 0.000
#> SRR1402328 2 0.1327 0.8216 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.2511 0.8167 0.000 0.880 0.064 0.056 0.000 0.000
#> SRR1442104 6 0.0937 0.8964 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 6 0.1007 0.8810 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1414314 4 0.2883 0.7788 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.4432 0.7564 0.000 0.720 0.192 0.080 0.008 0.000
#> SRR1478386 4 0.3468 0.6912 0.000 0.284 0.004 0.712 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.3528 0.4807 0.000 0.004 0.700 0.000 0.000 0.296
#> SRR1370572 1 0.0146 0.9203 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.0260 0.7575 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1310735 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5528 0.5543 0.000 0.016 0.308 0.568 0.108 0.000
#> SRR660260 5 0.1843 0.7166 0.000 0.004 0.080 0.004 0.912 0.000
#> SRR1071231 4 0.1714 0.8289 0.000 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.2631 0.7473 0.000 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1337173 5 0.6938 -0.0877 0.000 0.056 0.252 0.344 0.348 0.000
#> SRR1396250 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.4828 0.4615 0.000 0.000 0.568 0.000 0.064 0.368
#> SRR659816 3 0.5843 0.2029 0.000 0.020 0.456 0.112 0.412 0.000
#> SRR1401379 4 0.0000 0.8350 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600981 2 0.5219 0.6487 0.000 0.580 0.296 0.124 0.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.3489 0.6985 0.000 0.288 0.004 0.708 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.1714 0.8837 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.2416 0.7959 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.0260 0.8362 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 4 0.3446 0.4662 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.2454 0.8165 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.2378 0.8496 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.5618 0.6741 0.000 0.568 0.164 0.260 0.008 0.000
#> SRR1468658 3 0.3656 0.6206 0.000 0.004 0.728 0.000 0.256 0.012
#> SRR1390437 4 0.0146 0.8354 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR658057 4 0.1349 0.8368 0.000 0.056 0.004 0.940 0.000 0.000
#> SRR612635 2 0.6084 0.3826 0.000 0.420 0.196 0.376 0.008 0.000
#> SRR1351480 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 5 0.3878 0.6415 0.112 0.000 0.116 0.000 0.772 0.000
#> SRR659590 4 0.0000 0.8350 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.1327 0.8975 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 4 0.2854 0.7845 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR659911 2 0.2069 0.8163 0.000 0.908 0.068 0.020 0.004 0.000
#> SRR1085519 6 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1345894 3 0.3862 0.4536 0.000 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1442928 2 0.0520 0.8117 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1464681 4 0.4924 0.7081 0.000 0.144 0.204 0.652 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.3827 0.6105 0.000 0.192 0.032 0.012 0.764 0.000
#> SRR1365426 4 0.1007 0.8245 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1487947 1 0.2036 0.8705 0.912 0.000 0.008 0.000 0.016 0.064
#> SRR659708 5 0.2946 0.6441 0.000 0.004 0.184 0.000 0.808 0.004
#> SRR603236 5 0.6910 0.1404 0.000 0.096 0.216 0.212 0.476 0.000
#> SRR660673 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 4 0.2092 0.8075 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.3558 0.8202 0.000 0.812 0.072 0.108 0.008 0.000
#> SRR1087245 4 0.1588 0.8348 0.000 0.072 0.004 0.924 0.000 0.000
#> SRR1339108 4 0.0363 0.8371 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR613426 5 0.6048 0.0854 0.004 0.000 0.212 0.368 0.416 0.000
#> SRR613879 2 0.4432 0.7896 0.000 0.720 0.080 0.192 0.008 0.000
#> SRR1385101 5 0.5096 0.4001 0.000 0.000 0.132 0.252 0.616 0.000
#> SRR1387966 2 0.0146 0.8129 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1458852 4 0.2482 0.8096 0.000 0.148 0.004 0.848 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.2805 0.8188 0.812 0.000 0.184 0.004 0.000 0.000
#> SRR1349231 5 0.5112 0.0754 0.000 0.000 0.080 0.444 0.476 0.000
#> SRR1376249 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.2558 0.8185 0.000 0.840 0.004 0.156 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.3183 0.8023 0.000 0.788 0.004 0.200 0.008 0.000
#> SRR1390027 1 0.0146 0.9202 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3978 0.7466 0.000 0.744 0.192 0.064 0.000 0.000
#> SRR1383081 4 0.2402 0.8137 0.000 0.140 0.004 0.856 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.2512 0.8215 0.000 0.880 0.060 0.060 0.000 0.000
#> SRR605101 4 0.3426 0.5594 0.000 0.276 0.004 0.720 0.000 0.000
#> SRR818600 2 0.1863 0.8245 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1367715 4 0.3081 0.7722 0.000 0.220 0.004 0.776 0.000 0.000
#> SRR1351979 6 0.3198 0.5422 0.000 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1387054 3 0.5663 0.6359 0.000 0.052 0.604 0.020 0.288 0.036
#> SRR1444306 3 0.3823 0.5322 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3601 0.6259 0.000 0.684 0.004 0.312 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.6282 0.0618 0.376 0.000 0.264 0.352 0.008 0.000
#> SRR1489030 4 0.0146 0.8358 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.3333 0.6642 0.000 0.784 0.000 0.024 0.192 0.000
#> SRR615225 5 0.7692 -0.0129 0.000 0.232 0.272 0.208 0.288 0.000
#> SRR1401839 5 0.1398 0.7471 0.000 0.000 0.052 0.008 0.940 0.000
#> SRR1379110 2 0.0935 0.8250 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000 0.000
#> SRR1077288 6 0.1075 0.8791 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1331639 4 0.3387 0.7976 0.000 0.164 0.040 0.796 0.000 0.000
#> SRR1342782 5 0.6491 0.1770 0.000 0.232 0.028 0.304 0.436 0.000
#> SRR1443003 3 0.5282 0.6098 0.000 0.128 0.568 0.000 0.304 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4707 0.4498 0.000 0.000 0.584 0.000 0.056 0.360
#> SRR1395742 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4974 0.6023 0.000 0.128 0.672 0.004 0.192 0.004
#> SRR664063 5 0.1444 0.7358 0.000 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1488214 1 0.4026 0.7941 0.768 0.056 0.164 0.008 0.004 0.000
#> SRR654766 4 0.5501 0.6716 0.000 0.080 0.208 0.648 0.064 0.000
#> SRR1320321 4 0.2595 0.8043 0.000 0.160 0.004 0.836 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0260 0.9199 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9205 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 4 0.2703 0.7959 0.000 0.172 0.004 0.824 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.1908 0.8302 0.000 0.900 0.004 0.096 0.000 0.000
#> SRR1389497 6 0.0000 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 5 0.0508 0.7580 0.000 0.000 0.004 0.012 0.984 0.000
#> SRR615311 1 0.2915 0.8166 0.808 0.000 0.184 0.000 0.008 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.473 0.760 0.872 0.4473 0.511 0.511
#> 3 3 0.672 0.810 0.922 0.3605 0.732 0.542
#> 4 4 0.622 0.678 0.844 0.2007 0.832 0.591
#> 5 5 0.580 0.562 0.754 0.0547 0.837 0.489
#> 6 6 0.586 0.533 0.707 0.0387 0.930 0.701
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR613282 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1084417 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1074359 2 0.4562 0.7900 0.096 0.904
#> SRR1419258 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1403366 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR665262 1 0.8763 0.6808 0.704 0.296
#> SRR1499740 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1105057 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR614599 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR612215 2 0.9977 0.0782 0.472 0.528
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.1633 0.8659 0.976 0.024
#> SRR1393449 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1409263 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1431288 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1334889 1 0.7376 0.8067 0.792 0.208
#> SRR614839 2 0.9983 0.0754 0.476 0.524
#> SRR658433 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1088581 1 0.7602 0.7934 0.780 0.220
#> SRR1328797 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1334512 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.2236 0.8712 0.964 0.036
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1354955 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR654802 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR660066 2 0.6712 0.7194 0.176 0.824
#> SRR1447103 1 0.6973 0.8236 0.812 0.188
#> SRR1402153 1 0.9044 0.6387 0.680 0.320
#> SRR655887 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1408529 1 0.6623 0.8351 0.828 0.172
#> SRR658707 1 0.2778 0.8760 0.952 0.048
#> SRR1384371 2 0.8661 0.5488 0.288 0.712
#> SRR1074670 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1375439 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1329003 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1404837 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1455525 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR613999 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR658200 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1068855 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1375509 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR612227 1 0.7674 0.7874 0.776 0.224
#> SRR1388809 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.7139 0.7002 0.196 0.804
#> SRR1452864 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1473078 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR615814 2 0.8763 0.5583 0.296 0.704
#> SRR1325225 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1313687 2 0.9635 0.2955 0.388 0.612
#> SRR1358220 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.9988 -0.0461 0.480 0.520
#> SRR660164 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR809595 1 0.6623 0.8351 0.828 0.172
#> SRR1403133 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.2236 0.8242 0.036 0.964
#> SRR1344382 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1432453 1 0.9815 0.3936 0.580 0.420
#> SRR1478362 2 0.2043 0.8262 0.032 0.968
#> SRR1392186 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0938 0.8600 0.988 0.012
#> SRR1471594 1 0.3431 0.8818 0.936 0.064
#> SRR1354270 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR612683 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1392901 1 0.9954 0.2292 0.540 0.460
#> SRR1077805 1 0.8861 0.6677 0.696 0.304
#> SRR1360402 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1406112 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1355352 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR656247 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR813656 1 0.9087 0.6201 0.676 0.324
#> SRR808244 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1387240 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1385277 1 0.9580 0.5052 0.620 0.380
#> SRR1435248 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1419110 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1408682 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.8555 0.5531 0.280 0.720
#> SRR603164 1 0.8386 0.7327 0.732 0.268
#> SRR1383259 2 0.2043 0.8261 0.032 0.968
#> SRR1330854 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1452423 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1331220 1 0.7453 0.8036 0.788 0.212
#> SRR1361546 1 0.6343 0.8427 0.840 0.160
#> SRR1486156 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.9983 0.0754 0.476 0.524
#> SRR615635 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1385411 1 0.9909 0.2603 0.556 0.444
#> SRR1342739 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1102830 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR662126 2 0.6531 0.7271 0.168 0.832
#> SRR1464601 2 0.0672 0.8374 0.008 0.992
#> SRR1071594 2 0.5519 0.7461 0.128 0.872
#> SRR612539 2 0.8861 0.5447 0.304 0.696
#> SRR602010 1 0.8955 0.6537 0.688 0.312
#> SRR810249 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR818773 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1334247 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR661639 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR613222 1 0.7950 0.7664 0.760 0.240
#> SRR1459937 2 1.0000 -0.0150 0.496 0.504
#> SRR2185018 1 0.0376 0.8560 0.996 0.004
#> SRR655732 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.1633 0.8659 0.976 0.024
#> SRR819261 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR661074 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1349851 1 0.4161 0.8832 0.916 0.084
#> SRR1405123 2 0.6712 0.7190 0.176 0.824
#> SRR661096 2 0.5408 0.7665 0.124 0.876
#> SRR1320225 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1307677 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.9970 0.1068 0.468 0.532
#> SRR1430525 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1344422 1 0.8443 0.7195 0.728 0.272
#> SRR1353924 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1487570 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR627431 2 0.9970 0.1068 0.468 0.532
#> SRR1418561 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1448029 1 0.7219 0.8143 0.800 0.200
#> SRR813802 1 0.2423 0.8728 0.960 0.040
#> SRR815020 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.9983 -0.0233 0.476 0.524
#> SRR603116 2 0.5519 0.7650 0.128 0.872
#> SRR1323152 1 0.5629 0.8600 0.868 0.132
#> SRR1368264 2 0.9427 0.3791 0.360 0.640
#> SRR1326624 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1429265 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1327702 1 0.1843 0.8678 0.972 0.028
#> SRR615611 2 0.9996 0.0214 0.488 0.512
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0672 0.8374 0.008 0.992
#> SRR815044 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.8081 0.6326 0.248 0.752
#> SRR1480038 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR659436 1 0.4161 0.8833 0.916 0.084
#> SRR613699 2 0.8861 0.5447 0.304 0.696
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.5946 0.7511 0.144 0.856
#> SRR1330327 2 0.9522 0.4046 0.372 0.628
#> SRR1489950 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1100588 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1444002 1 0.2043 0.8695 0.968 0.032
#> SRR1318444 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR600656 2 0.9983 0.0754 0.476 0.524
#> SRR658766 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR655946 1 0.8386 0.7245 0.732 0.268
#> SRR817282 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1475104 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1406418 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.8144 0.7491 0.748 0.252
#> SRR1471965 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR612695 1 0.8608 0.6975 0.716 0.284
#> SRR662498 1 0.7376 0.8063 0.792 0.208
#> SRR1376764 1 0.8499 0.7115 0.724 0.276
#> SRR1377006 1 0.8608 0.6987 0.716 0.284
#> SRR656860 2 0.9460 0.4210 0.364 0.636
#> SRR1480547 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1452515 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1324390 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR601695 2 0.9954 0.1381 0.460 0.540
#> SRR820907 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.5842 0.8554 0.860 0.140
#> SRR1405984 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.2236 0.8712 0.964 0.036
#> SRR1095720 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1435626 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1080766 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1332299 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1467966 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1320579 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1319710 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1098879 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR662245 1 0.8327 0.7313 0.736 0.264
#> SRR1074719 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR601387 2 0.8813 0.5515 0.300 0.700
#> SRR614575 2 0.2603 0.8203 0.044 0.956
#> SRR1353900 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR662906 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1350832 2 0.0672 0.8375 0.008 0.992
#> SRR1403280 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.8081 0.6362 0.248 0.752
#> SRR1388528 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR655399 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1319753 1 0.9833 0.3940 0.576 0.424
#> SRR818901 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR607067 2 0.9850 0.2469 0.428 0.572
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0376 0.8390 0.004 0.996
#> SRR661961 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR658259 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.5294 0.7695 0.120 0.880
#> SRR1322900 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1309942 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.9933 0.1628 0.452 0.548
#> SRR1435418 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.2043 0.8260 0.032 0.968
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR661469 1 0.8327 0.7311 0.736 0.264
#> SRR1500323 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.3274 0.8126 0.060 0.940
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1350435 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1389177 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1368072 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.8813 0.5515 0.300 0.700
#> SRR613330 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR816382 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1318839 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1432390 2 0.6048 0.7438 0.148 0.852
#> SRR613126 2 0.8909 0.5381 0.308 0.692
#> SRR1089424 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1309556 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1456027 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1400551 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1320469 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR614251 2 0.9983 0.0754 0.476 0.524
#> SRR1454310 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.9988 0.0586 0.480 0.520
#> SRR1433290 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR2166064 2 0.7815 0.6609 0.232 0.768
#> SRR601671 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.4815 0.7836 0.104 0.896
#> SRR1409130 1 0.8763 0.6857 0.704 0.296
#> SRR659696 2 0.4161 0.7953 0.084 0.916
#> SRR1408249 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR663284 2 0.9996 0.0214 0.488 0.512
#> SRR1402794 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR614852 2 0.9988 0.0586 0.480 0.520
#> SRR1348040 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1489610 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.8661 0.5778 0.288 0.712
#> SRR1361480 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1444501 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1415773 2 0.6887 0.7072 0.184 0.816
#> SRR1388832 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1394637 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR606974 2 0.8763 0.5583 0.296 0.704
#> SRR662918 2 0.6531 0.7277 0.168 0.832
#> SRR817421 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR608264 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1318560 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1454117 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR615044 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1432743 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1388873 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1357148 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1406008 2 0.0376 0.8390 0.004 0.996
#> SRR1396786 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.7219 0.8143 0.800 0.200
#> SRR1318465 1 0.8499 0.7114 0.724 0.276
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.9170 0.4977 0.332 0.668
#> SRR655170 2 0.9522 0.4022 0.372 0.628
#> SRR1087825 1 0.9922 0.2413 0.552 0.448
#> SRR662019 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1349209 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1326161 2 0.8763 0.5583 0.296 0.704
#> SRR1345284 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.8955 0.5301 0.312 0.688
#> SRR1454328 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1408183 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1084369 1 0.6973 0.8236 0.812 0.188
#> SRR598452 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR660709 2 0.9983 0.0754 0.476 0.524
#> SRR809444 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1326292 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR657139 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1440744 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1452334 1 0.9954 0.1982 0.540 0.460
#> SRR1381775 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1363908 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR658989 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1353663 1 0.2778 0.8759 0.952 0.048
#> SRR811771 1 0.1184 0.8620 0.984 0.016
#> SRR813983 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR815825 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR819054 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.8813 0.5563 0.300 0.700
#> SRR1331922 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR615479 1 0.5519 0.8607 0.872 0.128
#> SRR1375796 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1386991 1 0.8955 0.6576 0.688 0.312
#> SRR1355217 1 0.9881 0.3525 0.564 0.436
#> SRR1356290 2 0.9608 0.3416 0.384 0.616
#> SRR659507 1 0.8386 0.7246 0.732 0.268
#> SRR663296 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.9970 0.1073 0.468 0.532
#> SRR1414727 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR663477 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1354489 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1377800 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR614611 2 0.9983 0.0754 0.476 0.524
#> SRR655052 2 0.2236 0.8241 0.036 0.964
#> SRR1478968 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1351280 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.9993 0.0406 0.484 0.516
#> SRR1418022 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR661901 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1408161 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR657054 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR655040 2 0.9954 0.1385 0.460 0.540
#> SRR810225 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR617829 1 0.8861 0.6604 0.696 0.304
#> SRR1402328 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.9129 0.5023 0.328 0.672
#> SRR1442104 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1453416 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1414314 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.8813 0.5515 0.300 0.700
#> SRR1478386 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1458683 1 0.7528 0.7980 0.784 0.216
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.9996 0.0225 0.488 0.512
#> SRR660260 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1071231 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.8016 0.6371 0.244 0.756
#> SRR1337173 1 0.9896 0.3218 0.560 0.440
#> SRR1396250 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR2166376 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR659816 2 0.9996 0.0214 0.488 0.512
#> SRR1401379 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR600981 1 0.9881 0.2870 0.564 0.436
#> SRR1398335 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.3584 0.8830 0.932 0.068
#> SRR1407950 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.6531 0.7272 0.168 0.832
#> SRR1092985 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR656409 2 0.9170 0.4914 0.332 0.668
#> SRR1468658 1 0.8713 0.6839 0.708 0.292
#> SRR1390437 2 0.7056 0.7085 0.192 0.808
#> SRR658057 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.8909 0.5375 0.308 0.692
#> SRR1351480 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3733 0.8843 0.928 0.072
#> SRR659590 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.8813 0.5515 0.300 0.700
#> SRR1085519 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1345894 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1442928 1 0.9358 0.5747 0.648 0.352
#> SRR1464681 2 0.6973 0.7086 0.188 0.812
#> SRR1418880 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1309070 1 0.8661 0.7002 0.712 0.288
#> SRR1365426 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1487947 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR659708 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR603236 2 0.8499 0.5875 0.276 0.724
#> SRR660673 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.5408 0.7671 0.124 0.876
#> SRR1087245 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR613426 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR613879 2 0.8813 0.5515 0.300 0.700
#> SRR1385101 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1387966 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
#> SRR1349231 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1376249 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1321987 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.2043 0.8263 0.032 0.968
#> SRR1390027 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1098474 1 0.8386 0.7248 0.732 0.268
#> SRR1383081 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0376 0.8390 0.004 0.996
#> SRR818600 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1351979 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1387054 1 0.7745 0.7823 0.772 0.228
#> SRR1444306 1 0.4022 0.8846 0.920 0.080
#> SRR1322662 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1489030 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.9850 0.1653 0.428 0.572
#> SRR615225 2 0.9983 0.0754 0.476 0.524
#> SRR1401839 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1379110 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1331639 2 0.5946 0.7475 0.144 0.856
#> SRR1342782 1 0.7745 0.7882 0.772 0.228
#> SRR1443003 1 0.9635 0.4887 0.612 0.388
#> SRR612839 1 0.2948 0.8774 0.948 0.052
#> SRR1470093 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1395742 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1387222 1 0.9963 0.1812 0.536 0.464
#> SRR664063 1 0.7299 0.8106 0.796 0.204
#> SRR1488214 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR654766 2 0.9944 0.1481 0.456 0.544
#> SRR1320321 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8539 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.8405 0.000 1.000
#> SRR1389497 1 0.3879 0.8853 0.924 0.076
#> SRR1367109 1 0.4939 0.8727 0.892 0.108
#> SRR615311 1 0.7219 0.8139 0.800 0.200
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 3 0.0237 0.905311 0.004 0.000 0.996
#> SRR613282 1 0.0237 0.972025 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355396 3 0.6280 0.179541 0.460 0.000 0.540
#> SRR1084417 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074359 2 0.6008 0.436669 0.000 0.628 0.372
#> SRR1419258 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 3 0.5254 0.611731 0.000 0.264 0.736
#> SRR1499740 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.1964 0.927710 0.944 0.000 0.056
#> SRR614599 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.6299 0.146447 0.000 0.524 0.476
#> SRR1094051 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.3482 0.850172 0.872 0.000 0.128
#> SRR1393449 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0592 0.967336 0.988 0.000 0.012
#> SRR1334889 3 0.1031 0.896572 0.000 0.024 0.976
#> SRR614839 3 0.3340 0.824747 0.000 0.120 0.880
#> SRR658433 2 0.0424 0.866321 0.000 0.992 0.008
#> SRR1088581 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 3 0.6307 0.095251 0.488 0.000 0.512
#> SRR1311553 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.5621 0.557655 0.000 0.692 0.308
#> SRR1447103 3 0.1163 0.894065 0.000 0.028 0.972
#> SRR1402153 3 0.3619 0.812152 0.000 0.136 0.864
#> SRR655887 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 3 0.3340 0.820044 0.120 0.000 0.880
#> SRR1384371 2 0.3116 0.789253 0.000 0.892 0.108
#> SRR1074670 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 3 0.1529 0.886932 0.040 0.000 0.960
#> SRR1455525 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.1529 0.942337 0.960 0.000 0.040
#> SRR1499764 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 3 0.3752 0.795280 0.144 0.000 0.856
#> SRR1375509 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 3 0.6192 0.289705 0.000 0.420 0.580
#> SRR1452864 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.6192 0.309849 0.000 0.580 0.420
#> SRR1325225 3 0.0237 0.905462 0.004 0.000 0.996
#> SRR1313687 2 0.3686 0.768431 0.000 0.860 0.140
#> SRR1358220 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.5529 0.558896 0.000 0.704 0.296
#> SRR1487746 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.5926 0.416172 0.000 0.356 0.644
#> SRR660164 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 3 0.0424 0.903751 0.000 0.008 0.992
#> SRR1403133 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.2066 0.834679 0.000 0.940 0.060
#> SRR1344382 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.6244 0.116058 0.000 0.440 0.560
#> SRR1478362 2 0.4887 0.669840 0.000 0.772 0.228
#> SRR1392186 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0892 0.961537 0.980 0.000 0.020
#> SRR1471594 3 0.6204 0.279792 0.424 0.000 0.576
#> SRR1354270 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.1753 0.844284 0.000 0.952 0.048
#> SRR1392901 3 0.4931 0.657086 0.000 0.232 0.768
#> SRR1077805 3 0.2261 0.867167 0.000 0.068 0.932
#> SRR1360402 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 3 0.0237 0.905386 0.004 0.000 0.996
#> SRR813656 3 0.5291 0.618742 0.000 0.268 0.732
#> SRR808244 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 3 0.0237 0.905386 0.004 0.000 0.996
#> SRR1385277 3 0.5591 0.538774 0.000 0.304 0.696
#> SRR1435248 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.3192 0.787580 0.000 0.888 0.112
#> SRR603164 3 0.3192 0.821773 0.000 0.112 0.888
#> SRR1383259 2 0.5363 0.596366 0.000 0.724 0.276
#> SRR1330854 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.5465 0.544601 0.000 0.288 0.712
#> SRR1361546 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 3 0.3038 0.835893 0.000 0.104 0.896
#> SRR615635 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 3 0.4121 0.777859 0.000 0.168 0.832
#> SRR1342739 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.5810 0.505408 0.000 0.664 0.336
#> SRR1464601 2 0.5706 0.553942 0.000 0.680 0.320
#> SRR1071594 2 0.4235 0.746946 0.000 0.824 0.176
#> SRR612539 2 0.6309 0.058954 0.000 0.504 0.496
#> SRR602010 3 0.4974 0.674052 0.000 0.236 0.764
#> SRR810249 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 3 0.0237 0.905311 0.004 0.000 0.996
#> SRR613222 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459937 3 0.3116 0.832371 0.000 0.108 0.892
#> SRR2185018 1 0.3192 0.872434 0.888 0.000 0.112
#> SRR655732 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.4654 0.750561 0.792 0.000 0.208
#> SRR819261 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 3 0.0892 0.898127 0.000 0.020 0.980
#> SRR1405123 2 0.6295 0.092733 0.000 0.528 0.472
#> SRR661096 2 0.5178 0.640796 0.000 0.744 0.256
#> SRR1320225 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 3 0.4062 0.779562 0.000 0.164 0.836
#> SRR1430525 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.0592 0.901579 0.000 0.012 0.988
#> SRR1353924 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.3038 0.834548 0.104 0.000 0.896
#> SRR1487570 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR627431 3 0.3340 0.821782 0.000 0.120 0.880
#> SRR1418561 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 3 0.4291 0.759295 0.180 0.000 0.820
#> SRR815020 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.6260 0.232402 0.000 0.552 0.448
#> SRR603116 2 0.5254 0.632302 0.000 0.736 0.264
#> SRR1323152 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 3 0.6008 0.385973 0.000 0.372 0.628
#> SRR1326624 3 0.2261 0.867290 0.068 0.000 0.932
#> SRR1429265 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0892 0.961537 0.980 0.000 0.020
#> SRR615611 3 0.2796 0.845973 0.000 0.092 0.908
#> SRR1486799 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.5363 0.593578 0.000 0.724 0.276
#> SRR815044 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.6204 0.301483 0.000 0.576 0.424
#> SRR1480038 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 3 0.6225 0.209877 0.000 0.432 0.568
#> SRR1436563 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.5678 0.542639 0.000 0.684 0.316
#> SRR1330327 3 0.4796 0.710431 0.000 0.220 0.780
#> SRR1489950 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 3 0.3412 0.817859 0.124 0.000 0.876
#> SRR1318444 3 0.0237 0.905394 0.000 0.004 0.996
#> SRR600656 3 0.3267 0.825027 0.000 0.116 0.884
#> SRR658766 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0747 0.964886 0.984 0.000 0.016
#> SRR1444120 3 0.4291 0.758558 0.000 0.180 0.820
#> SRR1471965 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4399 0.724823 0.000 0.188 0.812
#> SRR662498 3 0.1289 0.891918 0.000 0.032 0.968
#> SRR1376764 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.4605 0.714299 0.000 0.204 0.796
#> SRR656860 3 0.5098 0.662403 0.000 0.248 0.752
#> SRR1480547 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR601695 3 0.3267 0.825774 0.000 0.116 0.884
#> SRR820907 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 3 0.1289 0.891699 0.000 0.032 0.968
#> SRR1405984 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 3 0.2625 0.852351 0.084 0.000 0.916
#> SRR1095720 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 3 0.4235 0.757997 0.176 0.000 0.824
#> SRR1332299 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR601387 2 0.6111 0.372024 0.000 0.604 0.396
#> SRR614575 2 0.3879 0.768065 0.000 0.848 0.152
#> SRR1353900 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.2878 0.812382 0.000 0.904 0.096
#> SRR1403280 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.5926 0.450443 0.000 0.356 0.644
#> SRR1388528 1 0.4605 0.756437 0.796 0.000 0.204
#> SRR1452912 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 3 0.1163 0.893861 0.000 0.028 0.972
#> SRR655399 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.6299 0.158368 0.000 0.524 0.476
#> SRR818901 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 3 0.3267 0.825027 0.000 0.116 0.884
#> SRR1391420 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.1289 0.854536 0.000 0.968 0.032
#> SRR661961 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.1753 0.842926 0.000 0.952 0.048
#> SRR1478053 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.5760 0.507672 0.000 0.672 0.328
#> SRR1322900 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.5948 0.442022 0.000 0.360 0.640
#> SRR1435418 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4796 0.681209 0.000 0.780 0.220
#> SRR1443436 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 3 0.3686 0.803075 0.000 0.140 0.860
#> SRR1500323 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.4796 0.694939 0.000 0.780 0.220
#> SRR1464915 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 3 0.2537 0.857801 0.080 0.000 0.920
#> SRR1389177 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.6309 0.058954 0.000 0.504 0.496
#> SRR613330 1 0.2448 0.903739 0.924 0.000 0.076
#> SRR1434502 2 0.0424 0.865698 0.000 0.992 0.008
#> SRR1394190 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0747 0.964898 0.984 0.000 0.016
#> SRR816382 3 0.5178 0.609811 0.000 0.256 0.744
#> SRR1318839 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.6295 0.094073 0.000 0.528 0.472
#> SRR613126 3 0.6309 -0.053216 0.000 0.500 0.500
#> SRR1089424 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.1860 0.879263 0.000 0.052 0.948
#> SRR1456027 3 0.1163 0.894475 0.000 0.028 0.972
#> SRR1400551 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 3 0.0424 0.903701 0.008 0.000 0.992
#> SRR614251 3 0.3192 0.828728 0.000 0.112 0.888
#> SRR1454310 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.3192 0.828728 0.000 0.112 0.888
#> SRR1433290 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.6274 0.169485 0.000 0.456 0.544
#> SRR601671 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.4346 0.737253 0.000 0.816 0.184
#> SRR1409130 3 0.0424 0.903829 0.000 0.008 0.992
#> SRR659696 2 0.6280 0.134282 0.000 0.540 0.460
#> SRR1408249 2 0.0592 0.864161 0.000 0.988 0.012
#> SRR663284 3 0.4399 0.749976 0.000 0.188 0.812
#> SRR1402794 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.2959 0.839334 0.000 0.100 0.900
#> SRR1348040 3 0.1031 0.896653 0.000 0.024 0.976
#> SRR1489610 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0892 0.860812 0.000 0.980 0.020
#> SRR1499566 2 0.3816 0.782726 0.000 0.852 0.148
#> SRR1361480 2 0.2261 0.833278 0.000 0.932 0.068
#> SRR1444501 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.1529 0.845915 0.000 0.960 0.040
#> SRR1388832 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394637 3 0.0424 0.903769 0.008 0.000 0.992
#> SRR606974 2 0.6307 0.090147 0.000 0.512 0.488
#> SRR662918 2 0.6267 0.207403 0.000 0.548 0.452
#> SRR817421 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 3 0.5497 0.577000 0.292 0.000 0.708
#> SRR615044 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0237 0.867762 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396786 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 3 0.0661 0.902856 0.004 0.008 0.988
#> SRR1318465 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 3 0.4605 0.733052 0.000 0.204 0.796
#> SRR655170 3 0.5216 0.639792 0.000 0.260 0.740
#> SRR1087825 3 0.3116 0.832371 0.000 0.108 0.892
#> SRR662019 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.6204 0.298775 0.000 0.576 0.424
#> SRR1345284 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 3 0.6062 0.360104 0.000 0.384 0.616
#> SRR1454328 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 3 0.1163 0.893861 0.000 0.028 0.972
#> SRR1408183 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.3267 0.825027 0.000 0.116 0.884
#> SRR809444 1 0.0424 0.969856 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089901 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 3 0.0424 0.903821 0.008 0.000 0.992
#> SRR1326292 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR657139 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0592 0.967336 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452334 3 0.4702 0.729727 0.000 0.212 0.788
#> SRR1381775 3 0.0424 0.903821 0.008 0.000 0.992
#> SRR1363908 1 0.0237 0.972142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 3 0.6244 0.224970 0.440 0.000 0.560
#> SRR811771 1 0.3412 0.859476 0.876 0.000 0.124
#> SRR813983 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.5988 0.422464 0.000 0.368 0.632
#> SRR1331922 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR615479 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.6305 -0.013269 0.000 0.484 0.516
#> SRR1355217 2 0.5560 0.589538 0.000 0.700 0.300
#> SRR1356290 2 0.6180 0.343033 0.000 0.584 0.416
#> SRR659507 3 0.4178 0.756995 0.000 0.172 0.828
#> SRR663296 1 0.3038 0.878263 0.896 0.000 0.104
#> SRR598044 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 3 0.3412 0.819613 0.000 0.124 0.876
#> SRR1414727 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR663477 3 0.0592 0.902042 0.012 0.000 0.988
#> SRR1354489 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 3 0.3267 0.825027 0.000 0.116 0.884
#> SRR655052 2 0.4121 0.744610 0.000 0.832 0.168
#> SRR1478968 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.2796 0.845973 0.000 0.092 0.908
#> SRR1418022 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.1031 0.958244 0.976 0.000 0.024
#> SRR657054 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 3 0.3267 0.825027 0.000 0.116 0.884
#> SRR810225 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 3 0.4750 0.721468 0.000 0.216 0.784
#> SRR1442104 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.1964 0.927031 0.944 0.000 0.056
#> SRR1481396 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.6244 0.252129 0.000 0.560 0.440
#> SRR1478386 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.3192 0.828728 0.000 0.112 0.888
#> SRR660260 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.6309 0.034182 0.000 0.504 0.496
#> SRR1337173 3 0.6079 0.291497 0.000 0.388 0.612
#> SRR1396250 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.2625 0.852745 0.000 0.084 0.916
#> SRR1401379 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 3 0.2796 0.845973 0.000 0.092 0.908
#> SRR1398335 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.3816 0.763937 0.000 0.852 0.148
#> SRR660115 3 0.0892 0.898168 0.020 0.000 0.980
#> SRR1407950 2 0.1411 0.852579 0.000 0.964 0.036
#> SRR1359780 2 0.0237 0.868083 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490037 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0592 0.863693 0.000 0.988 0.012
#> SRR1092985 3 0.3116 0.832330 0.108 0.000 0.892
#> SRR656409 3 0.6062 0.362726 0.000 0.384 0.616
#> SRR1468658 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.4504 0.728808 0.000 0.804 0.196
#> SRR658057 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 3 0.6286 0.094143 0.000 0.464 0.536
#> SRR1351480 2 0.3816 0.772590 0.000 0.852 0.148
#> SRR1436651 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 3 0.6260 0.210337 0.448 0.000 0.552
#> SRR659590 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 3 0.6305 0.012732 0.000 0.484 0.516
#> SRR1085519 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 3 0.1529 0.884578 0.000 0.040 0.960
#> SRR1464681 2 0.6309 0.000979 0.000 0.504 0.496
#> SRR1418880 1 0.5216 0.632077 0.740 0.000 0.260
#> SRR1309070 3 0.3038 0.830225 0.000 0.104 0.896
#> SRR1365426 3 0.1163 0.893861 0.000 0.028 0.972
#> SRR1487947 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR659708 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR603236 3 0.6192 0.195480 0.000 0.420 0.580
#> SRR660673 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.2625 0.819572 0.000 0.916 0.084
#> SRR663807 2 0.5291 0.622889 0.000 0.732 0.268
#> SRR1087245 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.6286 0.175869 0.000 0.536 0.464
#> SRR1385101 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 3 0.3941 0.783597 0.156 0.000 0.844
#> SRR1349231 3 0.1031 0.896131 0.000 0.024 0.976
#> SRR1376249 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.1753 0.844918 0.000 0.952 0.048
#> SRR1390027 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.2066 0.836284 0.000 0.940 0.060
#> SRR818600 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0424 0.866382 0.000 0.992 0.008
#> SRR612767 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.4235 0.744073 0.000 0.824 0.176
#> SRR615225 3 0.3267 0.825027 0.000 0.116 0.884
#> SRR1401839 3 0.0424 0.904008 0.000 0.008 0.992
#> SRR1379110 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.6307 0.032578 0.000 0.512 0.488
#> SRR1342782 3 0.2959 0.840010 0.000 0.100 0.900
#> SRR1443003 3 0.2878 0.842408 0.000 0.096 0.904
#> SRR612839 3 0.0237 0.905311 0.004 0.000 0.996
#> SRR1470093 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0237 0.972147 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469014 1 0.2066 0.925414 0.940 0.000 0.060
#> SRR1387222 3 0.2448 0.859691 0.000 0.076 0.924
#> SRR664063 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488214 3 0.0237 0.905386 0.004 0.000 0.996
#> SRR654766 3 0.4974 0.690049 0.000 0.236 0.764
#> SRR1320321 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.974388 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.869784 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.906727 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 3 0.0424 0.903794 0.008 0.000 0.992
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0336 0.89099 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380716 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612803 4 0.4070 0.63929 0.044 0.000 0.132 0.824
#> SRR613282 1 0.3399 0.83262 0.868 0.000 0.040 0.092
#> SRR1355396 3 0.6595 0.22963 0.428 0.000 0.492 0.080
#> SRR1084417 3 0.0657 0.74683 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1074359 4 0.5508 0.08662 0.000 0.476 0.016 0.508
#> SRR1419258 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1403366 3 0.0336 0.74744 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR665262 3 0.6750 0.22615 0.000 0.092 0.472 0.436
#> SRR1499740 3 0.3801 0.67204 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1105057 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.2908 0.88263 0.896 0.000 0.064 0.040
#> SRR614599 3 0.4713 0.50417 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR612215 4 0.5510 0.33664 0.000 0.376 0.024 0.600
#> SRR1094051 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.5884 0.43575 0.620 0.000 0.052 0.328
#> SRR1393449 3 0.0804 0.74471 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1409263 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1431288 1 0.0707 0.94998 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1334889 4 0.1624 0.68281 0.000 0.020 0.028 0.952
#> SRR614839 4 0.2578 0.67838 0.000 0.036 0.052 0.912
#> SRR658433 2 0.1022 0.87876 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1088581 4 0.5110 0.46832 0.000 0.012 0.352 0.636
#> SRR1328797 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1334512 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471117 1 0.7075 0.09025 0.488 0.000 0.128 0.384
#> SRR1311553 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0336 0.74751 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR654802 3 0.4103 0.58087 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR660066 2 0.4304 0.60260 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1447103 3 0.5130 0.53609 0.000 0.016 0.652 0.332
#> SRR1402153 3 0.5686 0.46891 0.000 0.032 0.592 0.376
#> SRR655887 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0592 0.74746 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR658707 4 0.6646 0.48324 0.156 0.000 0.224 0.620
#> SRR1384371 2 0.5077 0.69244 0.000 0.760 0.080 0.160
#> SRR1074670 3 0.0000 0.74699 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375439 3 0.4500 0.53213 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1329003 4 0.4331 0.53623 0.000 0.000 0.288 0.712
#> SRR1404837 2 0.1867 0.84793 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1317920 4 0.4444 0.64853 0.072 0.000 0.120 0.808
#> SRR1455525 4 0.4855 0.38297 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR613999 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0336 0.95631 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.3975 0.63121 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1068855 4 0.5800 0.56161 0.128 0.000 0.164 0.708
#> SRR1375509 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR612227 3 0.4543 0.56721 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1388809 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.4018 0.60340 0.000 0.224 0.004 0.772
#> SRR1452864 4 0.3224 0.65671 0.016 0.000 0.120 0.864
#> SRR1473078 3 0.1716 0.74077 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR615814 4 0.5000 -0.02327 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1325225 4 0.4656 0.62753 0.056 0.000 0.160 0.784
#> SRR1313687 2 0.6373 0.49077 0.000 0.636 0.248 0.116
#> SRR1358220 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.4500 0.50312 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1487746 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.7289 0.32791 0.000 0.252 0.536 0.212
#> SRR660164 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809595 3 0.5047 0.55573 0.000 0.016 0.668 0.316
#> SRR1403133 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.2647 0.80025 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1344382 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.7564 0.11656 0.000 0.388 0.420 0.192
#> SRR1478362 2 0.3907 0.64923 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1392186 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0921 0.94386 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1471594 4 0.7464 0.26140 0.192 0.000 0.328 0.480
#> SRR1354270 4 0.4277 0.54263 0.000 0.000 0.280 0.720
#> SRR612683 2 0.1211 0.87385 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1392901 4 0.6172 0.45906 0.000 0.084 0.284 0.632
#> SRR1077805 4 0.5543 0.12074 0.000 0.020 0.424 0.556
#> SRR1360402 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.74699 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR656247 4 0.5649 0.47973 0.052 0.000 0.284 0.664
#> SRR813656 4 0.3307 0.66184 0.000 0.028 0.104 0.868
#> SRR808244 4 0.4382 0.52746 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR1387240 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 3 0.5697 0.53564 0.052 0.000 0.656 0.292
#> SRR1385277 4 0.5427 0.59643 0.000 0.164 0.100 0.736
#> SRR1435248 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.3528 0.68890 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1408682 2 0.0336 0.89142 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1317134 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.4030 0.78629 0.000 0.836 0.072 0.092
#> SRR603164 3 0.4382 0.60826 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1383259 2 0.5155 0.10319 0.000 0.528 0.004 0.468
#> SRR1330854 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1452423 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.1118 0.87529 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1468162 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.5637 0.60858 0.000 0.112 0.720 0.168
#> SRR1361546 4 0.4746 0.35706 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1486156 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 4 0.4716 0.56713 0.000 0.040 0.196 0.764
#> SRR615635 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.3266 0.67576 0.000 0.040 0.084 0.876
#> SRR1342739 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR662126 2 0.4382 0.57819 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1464601 2 0.4121 0.70044 0.000 0.796 0.184 0.020
#> SRR1071594 2 0.6770 0.36463 0.000 0.580 0.292 0.128
#> SRR612539 4 0.4843 0.29005 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR602010 4 0.6785 -0.10778 0.000 0.096 0.420 0.484
#> SRR810249 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818773 3 0.4500 0.55457 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1336569 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1334247 3 0.3356 0.69845 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR661639 4 0.5638 0.30311 0.028 0.000 0.388 0.584
#> SRR613222 4 0.3157 0.62522 0.000 0.004 0.144 0.852
#> SRR1459937 4 0.1510 0.68221 0.000 0.028 0.016 0.956
#> SRR2185018 1 0.4121 0.74364 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR655732 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809348 1 0.5361 0.70180 0.744 0.000 0.108 0.148
#> SRR819261 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR661074 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1349851 4 0.4776 0.48094 0.000 0.016 0.272 0.712
#> SRR1405123 4 0.4781 0.42829 0.000 0.336 0.004 0.660
#> SRR661096 2 0.3569 0.72526 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1320225 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4382 0.52746 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR1307677 2 0.0592 0.88895 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1466512 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658212 4 0.3198 0.66784 0.000 0.040 0.080 0.880
#> SRR1430525 3 0.0000 0.74699 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.2742 0.68129 0.000 0.024 0.076 0.900
#> SRR1353924 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.2949 0.70518 0.088 0.000 0.888 0.024
#> SRR1487570 4 0.2795 0.66906 0.012 0.004 0.088 0.896
#> SRR627431 4 0.3216 0.66482 0.000 0.044 0.076 0.880
#> SRR1418561 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1448029 3 0.2469 0.72876 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR813802 3 0.7798 0.05771 0.320 0.000 0.416 0.264
#> SRR815020 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0469 0.89031 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1435311 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612395 2 0.7627 0.06176 0.000 0.468 0.240 0.292
#> SRR603116 2 0.3837 0.68953 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1323152 3 0.2408 0.73159 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1368264 3 0.6695 0.45686 0.000 0.220 0.616 0.164
#> SRR1326624 4 0.5384 0.58101 0.076 0.000 0.196 0.728
#> SRR1429265 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1327702 1 0.1256 0.94054 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR615611 4 0.1635 0.67819 0.000 0.008 0.044 0.948
#> SRR1486799 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4877 0.30533 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR815044 2 0.0469 0.89000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1338560 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.4877 0.31603 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1480038 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659436 3 0.3610 0.69103 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR613699 4 0.4222 0.55293 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1436563 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4401 0.61994 0.000 0.724 0.004 0.272
#> SRR1330327 4 0.3052 0.66003 0.000 0.136 0.004 0.860
#> SRR1489950 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1444002 3 0.7568 0.03040 0.404 0.000 0.404 0.192
#> SRR1318444 4 0.4477 0.44830 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR600656 4 0.1398 0.68170 0.000 0.040 0.004 0.956
#> SRR658766 4 0.4999 0.03230 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR655946 3 0.4661 0.53738 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR817282 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1406418 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0927 0.94983 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1444120 3 0.5213 0.53569 0.000 0.020 0.652 0.328
#> SRR1471965 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4877 0.46037 0.000 0.000 0.592 0.408
#> SRR662498 3 0.4072 0.64321 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1376764 3 0.3486 0.69226 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1377006 4 0.4054 0.60518 0.000 0.016 0.188 0.796
#> SRR656860 4 0.2281 0.66993 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1480547 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452515 3 0.3942 0.65329 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1324390 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 3 0.4933 0.27428 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR601695 4 0.1211 0.67950 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR820907 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 3 0.5352 0.44804 0.000 0.016 0.596 0.388
#> SRR1405984 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365448 3 0.4344 0.63988 0.108 0.000 0.816 0.076
#> SRR1095720 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1435626 3 0.1118 0.74577 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1080766 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 4 0.5175 0.62138 0.120 0.000 0.120 0.760
#> SRR1332299 3 0.0921 0.74728 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1467966 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1320579 4 0.4917 0.49178 0.000 0.008 0.336 0.656
#> SRR1319710 2 0.2053 0.83930 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1326604 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR662245 3 0.4222 0.63467 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR1074719 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 4 0.3266 0.63900 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR601387 2 0.4907 0.27339 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR614575 2 0.2589 0.81730 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1353900 2 0.1118 0.87501 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR662906 3 0.4746 0.44468 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1350832 2 0.6001 0.55042 0.000 0.688 0.128 0.184
#> SRR1403280 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313969 4 0.4855 0.56476 0.000 0.268 0.020 0.712
#> SRR1388528 1 0.3108 0.85329 0.872 0.000 0.112 0.016
#> SRR1452912 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 3 0.5417 0.40434 0.000 0.016 0.572 0.412
#> SRR655399 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1319753 3 0.7375 0.24842 0.000 0.172 0.480 0.348
#> SRR818901 3 0.0336 0.74744 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR607067 4 0.1474 0.67897 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1391420 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.3311 0.76799 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR661961 3 0.4382 0.59028 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR658259 2 0.0336 0.89149 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1310476 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.2216 0.82960 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1478053 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.6618 0.40576 0.000 0.604 0.272 0.124
#> SRR1322900 4 0.4907 0.22267 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1309942 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.4671 0.60209 0.000 0.220 0.028 0.752
#> SRR1435418 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4164 0.59557 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1443436 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0469 0.88866 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR661469 3 0.5158 0.31823 0.000 0.004 0.524 0.472
#> SRR1500323 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 3 0.7371 0.20690 0.000 0.360 0.472 0.168
#> SRR1464915 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4866 0.11181 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1350435 4 0.5032 0.61093 0.080 0.000 0.156 0.764
#> SRR1389177 3 0.2530 0.72747 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1368072 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 4 0.4543 0.46158 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR613330 1 0.4153 0.76673 0.820 0.000 0.048 0.132
#> SRR1434502 2 0.3597 0.78066 0.000 0.836 0.016 0.148
#> SRR1394190 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0779 0.95081 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR816382 3 0.5690 0.60352 0.000 0.096 0.708 0.196
#> SRR1318839 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1432390 2 0.4992 0.06455 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR613126 4 0.4697 0.39648 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1089424 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.5512 0.15357 0.000 0.016 0.496 0.488
#> SRR1456027 4 0.2593 0.67484 0.000 0.016 0.080 0.904
#> SRR1400551 3 0.1389 0.74550 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1320469 3 0.6077 -0.09269 0.044 0.000 0.496 0.460
#> SRR614251 4 0.4467 0.58351 0.000 0.040 0.172 0.788
#> SRR1454310 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615105 4 0.1398 0.68049 0.000 0.040 0.004 0.956
#> SRR1433290 3 0.0000 0.74699 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.3649 0.61931 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR601671 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.4313 0.64718 0.000 0.736 0.004 0.260
#> SRR1409130 3 0.3528 0.69173 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR659696 2 0.4916 0.23229 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1408249 2 0.4401 0.74713 0.000 0.812 0.112 0.076
#> SRR663284 4 0.2773 0.66785 0.000 0.028 0.072 0.900
#> SRR1402794 3 0.0000 0.74699 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 4 0.2271 0.67885 0.000 0.008 0.076 0.916
#> SRR1348040 4 0.3881 0.61629 0.000 0.016 0.172 0.812
#> SRR1489610 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488091 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.7762 -0.21653 0.000 0.384 0.236 0.380
#> SRR1361480 2 0.1004 0.88255 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1444501 3 0.0336 0.74783 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1415773 2 0.4332 0.76517 0.000 0.816 0.072 0.112
#> SRR1388832 3 0.5660 0.16041 0.028 0.000 0.576 0.396
#> SRR1394637 4 0.6301 0.49997 0.104 0.000 0.260 0.636
#> SRR606974 4 0.4776 0.35018 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR662918 4 0.4981 0.11547 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR817421 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1400823 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR608264 3 0.3688 0.64515 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1318560 3 0.1510 0.73487 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR1454117 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 4 0.5314 0.59837 0.144 0.000 0.108 0.748
#> SRR615044 4 0.4164 0.49406 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1432743 3 0.2216 0.73397 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1388873 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.2704 0.72156 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1406008 2 0.2469 0.82807 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1396786 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 4 0.3048 0.66523 0.016 0.000 0.108 0.876
#> SRR1318465 3 0.4817 0.48334 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1431083 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4163 0.63693 0.000 0.188 0.020 0.792
#> SRR655170 4 0.2921 0.65387 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1087825 4 0.2224 0.68533 0.000 0.032 0.040 0.928
#> SRR662019 4 0.4977 0.16720 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1349209 4 0.3569 0.62401 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1326161 4 0.5168 -0.00268 0.000 0.496 0.004 0.500
#> SRR1345284 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.4356 0.52044 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1454328 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 3 0.5387 0.42894 0.000 0.016 0.584 0.400
#> SRR1408183 3 0.0469 0.74774 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1084369 3 0.3266 0.70236 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR598452 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR660709 4 0.1302 0.67942 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR809444 1 0.0779 0.95125 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1089901 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 3 0.5769 0.43493 0.036 0.000 0.588 0.376
#> SRR1326292 4 0.4382 0.52746 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR657139 3 0.4585 0.46097 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1440744 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0779 0.95134 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1452334 4 0.2214 0.68453 0.000 0.044 0.028 0.928
#> SRR1381775 4 0.5987 0.04456 0.040 0.000 0.440 0.520
#> SRR1363908 1 0.0469 0.95383 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.3528 0.68920 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1353663 4 0.7276 0.11362 0.404 0.000 0.148 0.448
#> SRR811771 1 0.5137 0.53272 0.680 0.000 0.024 0.296
#> SRR813983 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR819054 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.4900 0.58485 0.000 0.236 0.032 0.732
#> SRR1331922 4 0.3810 0.62892 0.000 0.008 0.188 0.804
#> SRR615479 4 0.4697 0.24016 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1375796 2 0.2216 0.83813 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1386991 3 0.6932 0.24507 0.000 0.112 0.492 0.396
#> SRR1355217 2 0.7576 0.07579 0.000 0.452 0.344 0.204
#> SRR1356290 3 0.7896 -0.00316 0.000 0.352 0.356 0.292
#> SRR659507 3 0.4988 0.59963 0.000 0.020 0.692 0.288
#> SRR663296 1 0.3333 0.85914 0.872 0.000 0.088 0.040
#> SRR598044 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.1902 0.68047 0.000 0.064 0.004 0.932
#> SRR1414727 3 0.0000 0.74699 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663477 4 0.4444 0.63683 0.072 0.000 0.120 0.808
#> SRR1354489 3 0.3024 0.71068 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1377800 3 0.1022 0.74885 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR614611 4 0.1398 0.68079 0.000 0.040 0.004 0.956
#> SRR655052 2 0.3444 0.72115 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1478968 4 0.3311 0.63856 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1351280 2 0.1792 0.85159 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR613951 4 0.1004 0.67967 0.000 0.024 0.004 0.972
#> SRR1418022 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3751 0.61472 0.000 0.004 0.196 0.800
#> SRR1408161 1 0.0895 0.94887 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR657054 3 0.4543 0.49975 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR655040 4 0.1302 0.67942 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR810225 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 4 0.4453 0.51334 0.000 0.012 0.244 0.744
#> SRR1402328 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 4 0.5519 0.48483 0.000 0.052 0.264 0.684
#> SRR1442104 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1453416 1 0.1792 0.90974 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1481396 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1414314 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 4 0.5000 -0.02011 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1478386 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 4 0.4741 0.49771 0.000 0.004 0.328 0.668
#> SRR1370572 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 4 0.4999 -0.08231 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1310735 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.1706 0.68306 0.000 0.036 0.016 0.948
#> SRR660260 4 0.1305 0.67985 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1071231 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.5812 0.43227 0.000 0.328 0.048 0.624
#> SRR1337173 3 0.7726 0.06993 0.000 0.228 0.404 0.368
#> SRR1396250 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR2166376 3 0.1118 0.73565 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR659816 4 0.2032 0.68087 0.000 0.036 0.028 0.936
#> SRR1401379 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600981 4 0.1724 0.68277 0.000 0.020 0.032 0.948
#> SRR1398335 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4304 0.56262 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR660115 4 0.4070 0.63974 0.044 0.000 0.132 0.824
#> SRR1407950 2 0.5325 0.62437 0.000 0.728 0.204 0.068
#> SRR1359780 2 0.1792 0.85277 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1490037 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0469 0.89002 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1397156 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.3942 0.68383 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1092985 4 0.5609 0.57139 0.088 0.000 0.200 0.712
#> SRR656409 4 0.4250 0.54706 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1468658 4 0.4035 0.64031 0.000 0.020 0.176 0.804
#> SRR1390437 4 0.5229 0.20389 0.000 0.428 0.008 0.564
#> SRR658057 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612635 4 0.4761 0.35845 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1351480 2 0.3390 0.77233 0.000 0.852 0.016 0.132
#> SRR1436651 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 4 0.7036 0.43841 0.216 0.000 0.208 0.576
#> SRR659590 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659911 4 0.4164 0.56039 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1085519 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1345894 3 0.3219 0.68108 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1442928 4 0.6933 0.31777 0.000 0.140 0.300 0.560
#> SRR1464681 4 0.5404 0.45269 0.000 0.328 0.028 0.644
#> SRR1418880 1 0.3542 0.84738 0.864 0.000 0.060 0.076
#> SRR1309070 3 0.4516 0.64884 0.000 0.012 0.736 0.252
#> SRR1365426 3 0.5284 0.48162 0.000 0.016 0.616 0.368
#> SRR1487947 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR659708 4 0.4866 0.29494 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR603236 4 0.7919 0.06053 0.000 0.320 0.328 0.352
#> SRR660673 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663807 2 0.4164 0.63530 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1087245 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0336 0.89162 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR613426 4 0.2281 0.66342 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR613879 4 0.4996 0.01708 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1385101 4 0.3289 0.65769 0.012 0.004 0.120 0.864
#> SRR1387966 2 0.0469 0.88891 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1458852 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430489 4 0.5395 0.58352 0.172 0.000 0.092 0.736
#> SRR1349231 3 0.5167 0.54261 0.000 0.016 0.644 0.340
#> SRR1376249 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1321987 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.3486 0.73651 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1390027 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.4697 0.53153 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1383081 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR605101 2 0.1389 0.86756 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR818600 2 0.2281 0.83202 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1367715 2 0.0188 0.89267 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1351979 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1387054 3 0.3569 0.68844 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1444306 3 0.2647 0.72439 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1322662 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1118 0.87414 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR612767 4 0.2081 0.66722 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1489030 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.6282 0.54617 0.000 0.664 0.160 0.176
#> SRR615225 4 0.1489 0.68092 0.000 0.044 0.004 0.952
#> SRR1401839 4 0.4677 0.41209 0.000 0.004 0.316 0.680
#> SRR1379110 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1331639 2 0.5167 0.00667 0.000 0.508 0.004 0.488
#> SRR1342782 3 0.5573 0.45966 0.000 0.028 0.604 0.368
#> SRR1443003 3 0.4464 0.67263 0.000 0.024 0.768 0.208
#> SRR612839 4 0.5859 0.09640 0.032 0.000 0.472 0.496
#> SRR1470093 3 0.4907 0.04407 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1395742 1 0.0188 0.95860 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469014 1 0.1706 0.93007 0.948 0.000 0.036 0.016
#> SRR1387222 4 0.2227 0.68485 0.000 0.036 0.036 0.928
#> SRR664063 4 0.5212 0.02924 0.000 0.008 0.420 0.572
#> SRR1488214 4 0.5359 0.50264 0.036 0.000 0.288 0.676
#> SRR654766 4 0.3280 0.66460 0.000 0.124 0.016 0.860
#> SRR1320321 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.96075 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.89395 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0817 0.88397 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1389497 3 0.0469 0.74737 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1367109 3 0.4713 0.51458 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR615311 4 0.4599 0.62944 0.088 0.000 0.112 0.800
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.3016 0.7608 0.000 0.848 0.000 0.020 0.132
#> SRR1380716 2 0.1792 0.8088 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR612803 3 0.7420 0.3316 0.140 0.000 0.436 0.352 0.072
#> SRR613282 1 0.2331 0.8611 0.908 0.000 0.068 0.008 0.016
#> SRR1355396 1 0.7348 0.1573 0.480 0.000 0.312 0.084 0.124
#> SRR1084417 3 0.1117 0.7716 0.000 0.000 0.964 0.016 0.020
#> SRR1074359 5 0.6235 -0.0600 0.000 0.344 0.000 0.156 0.500
#> SRR1419258 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1403366 3 0.0510 0.7702 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR665262 5 0.4547 0.5763 0.000 0.052 0.196 0.008 0.744
#> SRR1499740 5 0.4775 0.5085 0.000 0.008 0.332 0.020 0.640
#> SRR1105057 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1439742 1 0.5456 0.6761 0.712 0.000 0.168 0.068 0.052
#> SRR614599 3 0.5935 0.3621 0.000 0.000 0.580 0.152 0.268
#> SRR612215 5 0.6992 -0.1722 0.000 0.104 0.056 0.412 0.428
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.5198 0.7269 0.748 0.000 0.104 0.084 0.064
#> SRR1393449 3 0.1668 0.7675 0.000 0.000 0.940 0.028 0.032
#> SRR1409263 3 0.0324 0.7723 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1431288 1 0.2188 0.8784 0.924 0.000 0.024 0.024 0.028
#> SRR1334889 5 0.5212 0.2155 0.000 0.020 0.060 0.228 0.692
#> SRR614839 4 0.5338 0.4269 0.000 0.016 0.028 0.556 0.400
#> SRR658433 2 0.4129 0.7052 0.000 0.756 0.000 0.040 0.204
#> SRR1088581 4 0.6631 0.2491 0.000 0.000 0.292 0.452 0.256
#> SRR1328797 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1334512 2 0.3531 0.7647 0.000 0.816 0.000 0.036 0.148
#> SRR1471117 1 0.7005 0.3641 0.536 0.000 0.272 0.128 0.064
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.8380 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.1197 0.7569 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR654802 3 0.2329 0.7274 0.000 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR660066 2 0.6254 0.3080 0.000 0.536 0.000 0.268 0.196
#> SRR1447103 5 0.4328 0.5724 0.000 0.020 0.248 0.008 0.724
#> SRR1402153 5 0.5000 0.5668 0.000 0.036 0.220 0.032 0.712
#> SRR655887 2 0.2616 0.8061 0.000 0.880 0.000 0.020 0.100
#> SRR1408529 3 0.2806 0.6509 0.000 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR658707 3 0.7069 0.3954 0.112 0.000 0.488 0.336 0.064
#> SRR1384371 5 0.5182 0.4306 0.000 0.228 0.064 0.016 0.692
#> SRR1074670 3 0.1670 0.7565 0.000 0.000 0.936 0.012 0.052
#> SRR1375439 5 0.4536 0.5484 0.000 0.016 0.324 0.004 0.656
#> SRR1329003 4 0.5125 -0.1432 0.000 0.000 0.416 0.544 0.040
#> SRR1404837 2 0.4817 0.5619 0.000 0.656 0.000 0.044 0.300
#> SRR1317920 5 0.8332 0.0107 0.180 0.000 0.188 0.260 0.372
#> SRR1455525 3 0.5114 0.2274 0.000 0.000 0.492 0.472 0.036
#> SRR613999 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0324 0.9089 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1499764 1 0.0451 0.9067 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR658200 3 0.1704 0.7553 0.000 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR1068855 3 0.7872 0.2218 0.244 0.000 0.356 0.328 0.072
#> SRR1375509 3 0.0566 0.7715 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR612227 5 0.5089 0.4192 0.000 0.012 0.400 0.020 0.568
#> SRR1388809 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413872 4 0.5553 0.2510 0.000 0.068 0.000 0.484 0.448
#> SRR1452864 5 0.6961 0.0862 0.012 0.000 0.252 0.292 0.444
#> SRR1473078 3 0.4650 -0.1714 0.000 0.012 0.520 0.000 0.468
#> SRR615814 4 0.6507 0.3373 0.000 0.212 0.000 0.472 0.316
#> SRR1325225 4 0.8035 0.1729 0.132 0.000 0.176 0.416 0.276
#> SRR1313687 5 0.5580 0.4212 0.000 0.256 0.096 0.008 0.640
#> SRR1358220 2 0.0609 0.8379 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1096662 2 0.6325 0.2105 0.000 0.504 0.000 0.180 0.316
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0162 0.9097 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401752 5 0.6461 0.4249 0.000 0.208 0.172 0.028 0.592
#> SRR660164 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR815783 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR809595 5 0.4328 0.5712 0.000 0.020 0.248 0.008 0.724
#> SRR1403133 2 0.1205 0.8343 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR815470 2 0.5144 0.6276 0.000 0.692 0.000 0.132 0.176
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.5191 0.4890 0.000 0.116 0.116 0.032 0.736
#> SRR1478362 2 0.5654 0.5168 0.000 0.628 0.000 0.148 0.224
#> SRR1392186 2 0.3919 0.7043 0.000 0.776 0.000 0.036 0.188
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.3284 0.8362 0.864 0.000 0.028 0.028 0.080
#> SRR1471594 1 0.6897 0.5441 0.588 0.000 0.092 0.124 0.196
#> SRR1354270 5 0.5805 0.4858 0.000 0.004 0.288 0.112 0.596
#> SRR612683 2 0.3814 0.7408 0.000 0.808 0.000 0.068 0.124
#> SRR1392901 5 0.4983 0.4016 0.000 0.084 0.060 0.092 0.764
#> SRR1077805 5 0.5311 0.5224 0.000 0.036 0.164 0.080 0.720
#> SRR1360402 2 0.0290 0.8382 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1406112 3 0.1121 0.7591 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1355352 3 0.1018 0.7722 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR656247 5 0.8226 0.0710 0.276 0.000 0.200 0.144 0.380
#> SRR813656 5 0.5181 0.4888 0.000 0.056 0.100 0.096 0.748
#> SRR808244 4 0.5103 -0.1891 0.000 0.000 0.452 0.512 0.036
#> SRR1387240 2 0.0771 0.8370 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1408595 5 0.5544 0.4737 0.040 0.000 0.248 0.048 0.664
#> SRR1385277 5 0.4769 0.1790 0.000 0.020 0.016 0.288 0.676
#> SRR1435248 2 0.0290 0.8382 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1419110 5 0.4371 0.5390 0.000 0.012 0.344 0.000 0.644
#> SRR1408682 2 0.3321 0.7732 0.000 0.832 0.000 0.032 0.136
#> SRR1317134 1 0.0162 0.9095 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.1502 0.8300 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1453911 5 0.6027 0.2619 0.000 0.352 0.064 0.028 0.556
#> SRR603164 5 0.5088 0.5627 0.000 0.028 0.256 0.032 0.684
#> SRR1383259 5 0.6311 -0.0782 0.000 0.320 0.000 0.176 0.504
#> SRR1330854 3 0.1211 0.7711 0.000 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4657 0.5751 0.000 0.668 0.000 0.036 0.296
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.5111 0.5562 0.000 0.064 0.248 0.008 0.680
#> SRR1361546 5 0.5299 0.5538 0.000 0.020 0.232 0.064 0.684
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 5 0.5999 -0.1251 0.000 0.016 0.076 0.376 0.532
#> SRR615635 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1385411 5 0.5005 0.1916 0.000 0.044 0.028 0.212 0.716
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0162 0.7717 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662126 5 0.6425 -0.1459 0.000 0.244 0.000 0.248 0.508
#> SRR1464601 2 0.4736 0.6354 0.000 0.704 0.024 0.020 0.252
#> SRR1071594 5 0.5330 0.1153 0.000 0.440 0.020 0.020 0.520
#> SRR612539 4 0.6300 0.3992 0.000 0.088 0.024 0.512 0.376
#> SRR602010 5 0.5140 0.5346 0.000 0.104 0.124 0.032 0.740
#> SRR810249 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR818773 5 0.5550 0.3798 0.000 0.000 0.376 0.076 0.548
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442754 3 0.1106 0.7717 0.000 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR1334247 3 0.4278 -0.1197 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR661639 3 0.5353 0.5160 0.004 0.000 0.604 0.332 0.060
#> SRR613222 5 0.5903 0.4609 0.000 0.020 0.164 0.164 0.652
#> SRR1459937 4 0.4771 0.2793 0.000 0.008 0.008 0.552 0.432
#> SRR2185018 1 0.4447 0.7754 0.788 0.000 0.020 0.100 0.092
#> SRR655732 2 0.0290 0.8382 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR809348 1 0.5654 0.7005 0.712 0.000 0.068 0.104 0.116
#> SRR819261 3 0.1522 0.7607 0.000 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR661074 3 0.0451 0.7725 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1349851 5 0.4867 0.4973 0.004 0.004 0.168 0.088 0.736
#> SRR1405123 5 0.5358 0.0404 0.000 0.104 0.000 0.248 0.648
#> SRR661096 2 0.5236 0.5876 0.000 0.684 0.000 0.152 0.164
#> SRR1320225 1 0.0290 0.9086 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454651 4 0.5131 -0.1498 0.000 0.000 0.420 0.540 0.040
#> SRR1307677 2 0.4879 0.6478 0.000 0.696 0.000 0.076 0.228
#> SRR1466512 2 0.1478 0.8259 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR658212 5 0.5358 -0.1595 0.000 0.048 0.008 0.352 0.592
#> SRR1430525 3 0.3438 0.6212 0.000 0.000 0.808 0.020 0.172
#> SRR1344422 5 0.4805 0.1239 0.000 0.012 0.032 0.268 0.688
#> SRR1353924 2 0.0000 0.8380 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.4288 0.6804 0.120 0.000 0.800 0.044 0.036
#> SRR1487570 4 0.6125 0.1370 0.008 0.000 0.104 0.508 0.380
#> SRR627431 4 0.5389 0.4317 0.000 0.036 0.012 0.552 0.400
#> SRR1418561 3 0.1469 0.7697 0.000 0.000 0.948 0.016 0.036
#> SRR1448029 5 0.4658 0.2605 0.000 0.012 0.484 0.000 0.504
#> SRR813802 3 0.7044 0.4222 0.248 0.000 0.540 0.152 0.060
#> SRR815020 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.4832 0.6727 0.000 0.720 0.000 0.104 0.176
#> SRR1435311 2 0.2130 0.8059 0.000 0.908 0.000 0.012 0.080
#> SRR612395 5 0.4449 0.5642 0.000 0.080 0.168 0.000 0.752
#> SRR603116 2 0.5303 0.5588 0.000 0.660 0.000 0.108 0.232
#> SRR1323152 3 0.4410 -0.0373 0.000 0.004 0.556 0.000 0.440
#> SRR1368264 5 0.6546 0.3865 0.000 0.236 0.144 0.036 0.584
#> SRR1326624 3 0.8236 0.1217 0.328 0.000 0.332 0.208 0.132
#> SRR1429265 3 0.0324 0.7720 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1327702 1 0.2897 0.8569 0.888 0.000 0.040 0.020 0.052
#> SRR615611 4 0.5512 0.4213 0.000 0.016 0.040 0.560 0.384
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.5807 0.1957 0.000 0.484 0.000 0.092 0.424
#> SRR815044 2 0.4629 0.6544 0.000 0.704 0.000 0.052 0.244
#> SRR1338560 2 0.0162 0.8383 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615862 4 0.6707 0.3059 0.000 0.308 0.000 0.424 0.268
#> SRR1480038 2 0.0000 0.8380 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659436 5 0.4268 0.3837 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR613699 4 0.6286 0.4227 0.000 0.204 0.000 0.532 0.264
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 5 0.5880 -0.0503 0.000 0.416 0.000 0.100 0.484
#> SRR1330327 4 0.5594 0.2748 0.000 0.072 0.000 0.492 0.436
#> SRR1489950 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1431927 1 0.1074 0.9001 0.968 0.000 0.004 0.012 0.016
#> SRR1100588 3 0.0290 0.7714 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1444002 3 0.6824 0.4154 0.264 0.000 0.556 0.124 0.056
#> SRR1318444 5 0.4400 0.4801 0.000 0.008 0.104 0.108 0.780
#> SRR600656 4 0.4769 0.3510 0.000 0.016 0.004 0.588 0.392
#> SRR658766 3 0.4701 0.5831 0.000 0.000 0.704 0.236 0.060
#> SRR655946 5 0.5600 0.5025 0.000 0.000 0.316 0.096 0.588
#> SRR817282 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0671 0.7709 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.2095 0.8810 0.928 0.000 0.024 0.020 0.028
#> SRR1444120 5 0.4153 0.5742 0.000 0.020 0.240 0.004 0.736
#> SRR1471965 1 0.0162 0.9097 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612695 5 0.5266 0.5635 0.000 0.056 0.200 0.036 0.708
#> SRR662498 5 0.4252 0.5670 0.000 0.020 0.280 0.000 0.700
#> SRR1376764 5 0.4810 0.5498 0.000 0.012 0.316 0.020 0.652
#> SRR1377006 5 0.4970 0.5108 0.000 0.032 0.132 0.084 0.752
#> SRR656860 4 0.5264 0.4450 0.000 0.052 0.000 0.556 0.392
#> SRR1480547 2 0.4575 0.6283 0.000 0.712 0.000 0.052 0.236
#> SRR1452515 5 0.4538 0.5349 0.000 0.012 0.348 0.004 0.636
#> SRR1324390 2 0.0290 0.8382 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR615273 3 0.4514 0.6484 0.008 0.000 0.728 0.228 0.036
#> SRR601695 4 0.5672 0.4214 0.000 0.032 0.028 0.528 0.412
#> SRR820907 2 0.0000 0.8380 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812773 5 0.4185 0.5723 0.000 0.024 0.216 0.008 0.752
#> SRR1405984 2 0.0510 0.8388 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1472794 2 0.2208 0.8170 0.000 0.908 0.000 0.020 0.072
#> SRR1365448 3 0.4103 0.6897 0.024 0.000 0.812 0.108 0.056
#> SRR1095720 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1435626 3 0.3949 0.3220 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1080766 2 0.0290 0.8382 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1377862 1 0.8361 0.0580 0.372 0.000 0.220 0.176 0.232
#> SRR1332299 3 0.1478 0.7466 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1467966 3 0.0880 0.7646 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1320579 3 0.6486 -0.1666 0.000 0.000 0.436 0.188 0.376
#> SRR1319710 2 0.3160 0.7866 0.000 0.852 0.028 0.004 0.116
#> SRR1326604 2 0.0703 0.8375 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1098879 3 0.1121 0.7591 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR662245 5 0.5500 0.4903 0.000 0.000 0.376 0.072 0.552
#> SRR1074719 2 0.1012 0.8373 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR816226 4 0.6504 0.1057 0.000 0.000 0.196 0.448 0.356
#> SRR601387 2 0.5900 0.2339 0.000 0.516 0.000 0.376 0.108
#> SRR614575 2 0.4509 0.6750 0.000 0.752 0.000 0.096 0.152
#> SRR1353900 2 0.4054 0.6409 0.000 0.732 0.000 0.020 0.248
#> SRR662906 3 0.5672 0.3887 0.000 0.000 0.632 0.180 0.188
#> SRR1350832 2 0.4798 0.2132 0.000 0.540 0.000 0.020 0.440
#> SRR1403280 2 0.0162 0.8383 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313969 4 0.5967 0.2441 0.000 0.108 0.000 0.456 0.436
#> SRR1388528 1 0.6089 0.5741 0.640 0.000 0.228 0.076 0.056
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.4183 0.5684 0.000 0.020 0.180 0.024 0.776
#> SRR655399 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1319753 5 0.4703 0.5115 0.000 0.144 0.096 0.008 0.752
#> SRR818901 3 0.1043 0.7613 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR607067 4 0.4920 0.4570 0.000 0.032 0.000 0.584 0.384
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 5 0.6492 -0.0964 0.000 0.324 0.004 0.180 0.492
#> SRR661961 3 0.4442 0.4014 0.000 0.000 0.688 0.028 0.284
#> SRR658259 2 0.3682 0.7744 0.000 0.820 0.000 0.072 0.108
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0162 0.8383 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365034 2 0.4490 0.6636 0.000 0.724 0.000 0.052 0.224
#> SRR1478053 2 0.0000 0.8380 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328101 5 0.6924 0.2052 0.000 0.392 0.140 0.032 0.436
#> SRR1322900 5 0.4663 0.5395 0.000 0.004 0.236 0.048 0.712
#> SRR1309942 2 0.1800 0.8297 0.000 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR1345760 5 0.5289 -0.1677 0.000 0.048 0.000 0.452 0.500
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.5858 0.3699 0.000 0.568 0.000 0.124 0.308
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.3061 0.7768 0.000 0.844 0.000 0.020 0.136
#> SRR661469 5 0.4425 0.5768 0.000 0.036 0.216 0.008 0.740
#> SRR1500323 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1356705 5 0.6242 0.2385 0.000 0.368 0.072 0.032 0.528
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4693 0.6327 0.000 0.000 0.724 0.080 0.196
#> SRR1350435 3 0.8285 0.1873 0.296 0.000 0.340 0.232 0.132
#> SRR1389177 3 0.4894 -0.1620 0.000 0.000 0.520 0.024 0.456
#> SRR1368072 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR601815 4 0.6332 0.3919 0.000 0.264 0.000 0.524 0.212
#> SRR613330 1 0.2466 0.8546 0.900 0.000 0.076 0.012 0.012
#> SRR1434502 5 0.4965 0.2633 0.000 0.292 0.020 0.024 0.664
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.1978 0.8817 0.928 0.000 0.004 0.024 0.044
#> SRR816382 5 0.4955 0.5608 0.000 0.072 0.248 0.000 0.680
#> SRR1318839 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1432390 2 0.6534 -0.0670 0.000 0.416 0.000 0.388 0.196
#> SRR613126 4 0.5807 0.3959 0.000 0.092 0.000 0.484 0.424
#> SRR1089424 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1347214 2 0.0566 0.8382 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1309556 5 0.4033 0.5732 0.000 0.020 0.208 0.008 0.764
#> SRR1456027 5 0.5156 -0.0284 0.000 0.008 0.024 0.464 0.504
#> SRR1400551 3 0.1469 0.7668 0.000 0.000 0.948 0.016 0.036
#> SRR1320469 3 0.4832 0.6080 0.004 0.000 0.708 0.224 0.064
#> SRR614251 4 0.5431 0.4191 0.000 0.020 0.028 0.548 0.404
#> SRR1454310 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR615105 4 0.4299 0.4489 0.000 0.004 0.008 0.672 0.316
#> SRR1433290 3 0.1121 0.7591 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR2166064 5 0.5556 -0.1657 0.000 0.072 0.000 0.404 0.524
#> SRR601671 2 0.0404 0.8389 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR663874 5 0.6342 0.2028 0.000 0.336 0.040 0.076 0.548
#> SRR1409130 5 0.4916 0.5581 0.000 0.012 0.288 0.032 0.668
#> SRR659696 2 0.6692 0.0133 0.000 0.432 0.000 0.296 0.272
#> SRR1408249 2 0.5348 0.5865 0.000 0.656 0.028 0.040 0.276
#> SRR663284 5 0.5759 -0.0492 0.000 0.016 0.064 0.344 0.576
#> SRR1402794 3 0.1043 0.7613 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR614852 4 0.6132 0.3644 0.000 0.004 0.252 0.576 0.168
#> SRR1348040 5 0.4917 0.5294 0.000 0.012 0.160 0.092 0.736
#> SRR1489610 2 0.2621 0.8045 0.000 0.876 0.008 0.004 0.112
#> SRR1488091 2 0.3135 0.8005 0.000 0.868 0.024 0.020 0.088
#> SRR1499566 5 0.4801 0.4457 0.000 0.204 0.064 0.008 0.724
#> SRR1361480 2 0.5316 0.5494 0.000 0.632 0.000 0.084 0.284
#> SRR1444501 3 0.1270 0.7544 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1415773 5 0.6188 0.0431 0.000 0.452 0.060 0.032 0.456
#> SRR1388832 3 0.3691 0.6857 0.000 0.000 0.804 0.156 0.040
#> SRR1394637 3 0.7769 0.2503 0.288 0.000 0.412 0.228 0.072
#> SRR606974 4 0.6433 0.4029 0.000 0.200 0.000 0.488 0.312
#> SRR662918 5 0.5865 -0.1931 0.000 0.116 0.000 0.332 0.552
#> SRR817421 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2286 0.8004 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR608264 3 0.2654 0.7448 0.000 0.000 0.888 0.064 0.048
#> SRR1318560 3 0.2299 0.7555 0.004 0.000 0.912 0.052 0.032
#> SRR1454117 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312684 1 0.8250 -0.0231 0.360 0.000 0.284 0.224 0.132
#> SRR615044 3 0.5699 0.4786 0.000 0.000 0.584 0.308 0.108
#> SRR1432743 3 0.5076 -0.1321 0.000 0.012 0.528 0.016 0.444
#> SRR1388873 2 0.0771 0.8372 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.4294 0.3410 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1406008 5 0.5832 0.0452 0.000 0.436 0.028 0.040 0.496
#> SRR1396786 2 0.1502 0.8238 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1446564 5 0.5960 0.3614 0.004 0.004 0.164 0.204 0.624
#> SRR1318465 5 0.5684 0.5206 0.000 0.012 0.248 0.100 0.640
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 5 0.5643 -0.3048 0.000 0.064 0.004 0.440 0.492
#> SRR655170 5 0.5507 -0.3579 0.000 0.064 0.000 0.456 0.480
#> SRR1087825 4 0.5046 0.2721 0.000 0.008 0.020 0.540 0.432
#> SRR662019 3 0.3521 0.7025 0.000 0.000 0.820 0.140 0.040
#> SRR1349209 5 0.6073 0.0635 0.000 0.004 0.108 0.392 0.496
#> SRR1326161 5 0.6286 0.0722 0.000 0.264 0.000 0.204 0.532
#> SRR1345284 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.6039 0.4474 0.000 0.148 0.000 0.552 0.300
#> SRR1454328 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1489286 1 0.2277 0.8690 0.916 0.000 0.052 0.016 0.016
#> SRR1092349 5 0.4373 0.5676 0.000 0.020 0.192 0.028 0.760
#> SRR1408183 3 0.1478 0.7474 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1084369 5 0.4171 0.4692 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR598452 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR660709 4 0.4974 0.4420 0.000 0.032 0.000 0.560 0.408
#> SRR809444 1 0.1356 0.8942 0.956 0.000 0.004 0.012 0.028
#> SRR1089901 2 0.0404 0.8379 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1375774 5 0.5823 0.4465 0.056 0.000 0.184 0.080 0.680
#> SRR1326292 4 0.5148 -0.1663 0.000 0.000 0.432 0.528 0.040
#> SRR657139 3 0.3246 0.6947 0.000 0.000 0.808 0.184 0.008
#> SRR1440744 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.1701 0.8892 0.944 0.000 0.012 0.016 0.028
#> SRR1452334 5 0.4584 0.0539 0.000 0.028 0.000 0.312 0.660
#> SRR1381775 5 0.5834 0.4530 0.048 0.004 0.176 0.084 0.688
#> SRR1363908 1 0.0451 0.9071 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1319626 2 0.0510 0.8374 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR658989 5 0.4375 0.4255 0.000 0.004 0.420 0.000 0.576
#> SRR1353663 1 0.7296 0.3107 0.504 0.000 0.268 0.160 0.068
#> SRR811771 1 0.5670 0.6950 0.708 0.000 0.060 0.124 0.108
#> SRR813983 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR819054 2 0.1216 0.8366 0.000 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1367988 5 0.5635 -0.1619 0.000 0.076 0.000 0.428 0.496
#> SRR1331922 5 0.5432 0.4595 0.004 0.004 0.184 0.124 0.684
#> SRR615479 5 0.6493 0.4395 0.000 0.012 0.224 0.212 0.552
#> SRR1375796 2 0.5232 0.5599 0.000 0.648 0.000 0.084 0.268
#> SRR1386991 5 0.4123 0.5396 0.000 0.104 0.108 0.000 0.788
#> SRR1355217 5 0.4591 0.5282 0.000 0.132 0.120 0.000 0.748
#> SRR1356290 5 0.5460 0.4200 0.000 0.176 0.048 0.068 0.708
#> SRR659507 5 0.4276 0.5725 0.000 0.028 0.256 0.000 0.716
#> SRR663296 1 0.5657 0.6700 0.700 0.000 0.160 0.088 0.052
#> SRR598044 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661155 4 0.4808 0.3520 0.000 0.024 0.000 0.576 0.400
#> SRR1414727 3 0.2006 0.7453 0.000 0.000 0.916 0.012 0.072
#> SRR663477 3 0.8366 0.2119 0.272 0.000 0.344 0.232 0.152
#> SRR1354489 5 0.4397 0.4199 0.000 0.000 0.432 0.004 0.564
#> SRR1377800 3 0.2727 0.7031 0.000 0.000 0.868 0.016 0.116
#> SRR614611 4 0.5355 0.4409 0.000 0.040 0.008 0.552 0.400
#> SRR655052 2 0.5707 0.5244 0.000 0.624 0.000 0.160 0.216
#> SRR1478968 4 0.5904 0.1409 0.000 0.000 0.112 0.528 0.360
#> SRR1351280 2 0.5016 0.5068 0.000 0.608 0.000 0.044 0.348
#> SRR613951 5 0.4859 -0.0596 0.000 0.008 0.024 0.332 0.636
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.5861 0.0213 0.000 0.000 0.376 0.520 0.104
#> SRR1408161 1 0.2354 0.8733 0.916 0.000 0.032 0.020 0.032
#> SRR657054 3 0.2813 0.7048 0.000 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR655040 4 0.5057 0.4420 0.000 0.028 0.004 0.556 0.412
#> SRR810225 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325377 2 0.0290 0.8382 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR617829 4 0.6401 0.1283 0.000 0.000 0.172 0.448 0.380
#> SRR1402328 2 0.1800 0.8295 0.000 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR1480455 5 0.6875 0.4189 0.000 0.060 0.176 0.188 0.576
#> SRR1442104 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1453416 1 0.1883 0.8807 0.932 0.000 0.048 0.008 0.012
#> SRR1481396 3 0.0162 0.7717 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414314 2 0.0162 0.8383 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR663026 4 0.6349 0.2311 0.000 0.360 0.000 0.472 0.168
#> SRR1478386 2 0.1197 0.8291 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1458683 3 0.5959 0.1192 0.000 0.000 0.472 0.420 0.108
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.4375 0.5478 0.000 0.004 0.236 0.032 0.728
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.4640 0.3334 0.000 0.016 0.000 0.584 0.400
#> SRR660260 5 0.5131 0.1552 0.000 0.012 0.060 0.244 0.684
#> SRR1071231 2 0.0162 0.8383 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1459125 5 0.3854 0.3929 0.000 0.076 0.016 0.080 0.828
#> SRR1337173 5 0.5317 0.4703 0.000 0.144 0.084 0.044 0.728
#> SRR1396250 3 0.0671 0.7709 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2166376 3 0.0703 0.7693 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR659816 4 0.5514 0.4057 0.000 0.016 0.036 0.528 0.420
#> SRR1401379 2 0.2011 0.8214 0.000 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR600981 5 0.4915 -0.1208 0.000 0.004 0.020 0.420 0.556
#> SRR1398335 1 0.0671 0.9040 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1397218 2 0.5552 0.4337 0.000 0.584 0.000 0.088 0.328
#> SRR660115 3 0.7391 0.3359 0.136 0.000 0.440 0.352 0.072
#> SRR1407950 2 0.4968 0.4401 0.000 0.612 0.012 0.020 0.356
#> SRR1359780 2 0.4329 0.6424 0.000 0.716 0.000 0.032 0.252
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.2230 0.8079 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1397156 1 0.0162 0.9097 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1410221 2 0.0771 0.8373 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1319648 5 0.5142 0.3277 0.000 0.160 0.032 0.076 0.732
#> SRR1092985 3 0.8042 0.2767 0.272 0.000 0.404 0.212 0.112
#> SRR656409 4 0.5281 0.4445 0.000 0.052 0.000 0.548 0.400
#> SRR1468658 5 0.4987 0.1390 0.000 0.004 0.044 0.304 0.648
#> SRR1390437 5 0.4514 0.3145 0.000 0.136 0.008 0.088 0.768
#> SRR658057 2 0.0162 0.8390 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612635 4 0.5654 0.4275 0.000 0.084 0.000 0.536 0.380
#> SRR1351480 2 0.4527 0.5479 0.000 0.692 0.000 0.036 0.272
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.7180 0.5025 0.568 0.000 0.132 0.168 0.132
#> SRR659590 2 0.1571 0.8270 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR614263 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659911 4 0.6425 0.3958 0.000 0.248 0.000 0.508 0.244
#> SRR1085519 3 0.0324 0.7720 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1345894 5 0.5186 0.3470 0.000 0.012 0.408 0.024 0.556
#> SRR1442928 5 0.4975 0.5430 0.000 0.012 0.272 0.040 0.676
#> SRR1464681 4 0.5929 0.2425 0.000 0.104 0.000 0.464 0.432
#> SRR1418880 1 0.6273 0.4996 0.612 0.000 0.252 0.084 0.052
#> SRR1309070 5 0.4288 0.5555 0.000 0.016 0.240 0.012 0.732
#> SRR1365426 5 0.4165 0.5755 0.000 0.032 0.208 0.004 0.756
#> SRR1487947 3 0.1579 0.7684 0.000 0.000 0.944 0.024 0.032
#> SRR659708 3 0.4360 0.5827 0.000 0.000 0.680 0.300 0.020
#> SRR603236 5 0.5752 0.0589 0.000 0.452 0.044 0.020 0.484
#> SRR660673 1 0.0671 0.9027 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1430729 2 0.3496 0.7710 0.000 0.832 0.040 0.004 0.124
#> SRR663807 2 0.6268 0.3073 0.000 0.536 0.000 0.260 0.204
#> SRR1087245 2 0.0290 0.8386 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1339108 2 0.3805 0.7318 0.000 0.784 0.000 0.032 0.184
#> SRR613426 4 0.5836 0.1558 0.000 0.000 0.100 0.516 0.384
#> SRR613879 4 0.6476 0.3855 0.000 0.260 0.000 0.496 0.244
#> SRR1385101 5 0.4752 0.5268 0.008 0.008 0.160 0.068 0.756
#> SRR1387966 2 0.3194 0.7575 0.000 0.832 0.000 0.020 0.148
#> SRR1458852 2 0.1648 0.8333 0.000 0.940 0.000 0.020 0.040
#> SRR1430489 4 0.8104 0.0311 0.228 0.000 0.224 0.416 0.132
#> SRR1349231 5 0.4609 0.5463 0.008 0.004 0.220 0.036 0.732
#> SRR1376249 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1321987 2 0.0609 0.8367 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR662653 2 0.5284 0.4408 0.000 0.608 0.000 0.068 0.324
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 5 0.4501 0.5659 0.000 0.020 0.276 0.008 0.696
#> SRR1383081 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2166960 2 0.1579 0.8345 0.000 0.944 0.000 0.024 0.032
#> SRR605101 2 0.3578 0.7392 0.000 0.820 0.000 0.048 0.132
#> SRR818600 2 0.5480 0.4854 0.000 0.616 0.000 0.096 0.288
#> SRR1367715 2 0.1671 0.8160 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1351979 3 0.0510 0.7706 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1387054 5 0.5066 0.5481 0.000 0.012 0.276 0.044 0.668
#> SRR1444306 3 0.3242 0.5287 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3193 0.7586 0.000 0.840 0.000 0.028 0.132
#> SRR612767 4 0.6749 0.1096 0.000 0.000 0.268 0.396 0.336
#> SRR1489030 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430375 5 0.5181 0.5165 0.000 0.148 0.124 0.012 0.716
#> SRR615225 5 0.4890 -0.0485 0.000 0.040 0.000 0.332 0.628
#> SRR1401839 5 0.4301 0.5702 0.000 0.020 0.204 0.020 0.756
#> SRR1379110 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077288 3 0.0324 0.7723 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1331639 4 0.6274 0.0376 0.000 0.420 0.000 0.432 0.148
#> SRR1342782 5 0.3760 0.5735 0.000 0.028 0.188 0.000 0.784
#> SRR1443003 5 0.4101 0.5142 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR612839 3 0.5368 0.5802 0.020 0.000 0.668 0.252 0.060
#> SRR1470093 3 0.5688 0.2422 0.000 0.000 0.572 0.100 0.328
#> SRR1395742 1 0.0162 0.9095 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.2002 0.8838 0.932 0.000 0.020 0.020 0.028
#> SRR1387222 4 0.5123 0.2690 0.000 0.004 0.028 0.492 0.476
#> SRR664063 5 0.3944 0.5742 0.000 0.020 0.212 0.004 0.764
#> SRR1488214 5 0.5841 0.4238 0.032 0.000 0.168 0.128 0.672
#> SRR654766 4 0.5100 0.2491 0.000 0.036 0.000 0.516 0.448
#> SRR1320321 2 0.0162 0.8379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9107 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.8380 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.5136 0.5770 0.000 0.660 0.000 0.080 0.260
#> SRR1389497 3 0.0671 0.7709 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1367109 5 0.4650 0.5593 0.000 0.020 0.304 0.008 0.668
#> SRR615311 4 0.7372 -0.0110 0.156 0.000 0.248 0.512 0.084
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.4467 0.7579 0.000 0.720 0.000 0.004 0.112 0.164
#> SRR1380716 2 0.5592 0.6847 0.000 0.656 0.000 0.152 0.064 0.128
#> SRR612803 6 0.5695 0.4276 0.076 0.000 0.320 0.028 0.008 0.568
#> SRR613282 1 0.2655 0.7981 0.884 0.000 0.020 0.000 0.036 0.060
#> SRR1355396 1 0.6495 -0.1033 0.488 0.000 0.184 0.000 0.048 0.280
#> SRR1084417 3 0.3287 0.5124 0.000 0.000 0.768 0.000 0.012 0.220
#> SRR1074359 4 0.6548 0.1676 0.000 0.312 0.000 0.352 0.316 0.020
#> SRR1419258 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0632 0.7085 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR665262 5 0.3101 0.5612 0.000 0.056 0.028 0.048 0.864 0.004
#> SRR1499740 5 0.3469 0.5687 0.000 0.004 0.184 0.004 0.788 0.020
#> SRR1105057 2 0.3907 0.7605 0.000 0.764 0.000 0.000 0.084 0.152
#> SRR1439742 1 0.5127 0.2964 0.572 0.000 0.024 0.004 0.036 0.364
#> SRR614599 3 0.5411 0.1282 0.000 0.000 0.516 0.028 0.400 0.056
#> SRR612215 4 0.5535 0.2391 0.000 0.076 0.004 0.520 0.384 0.016
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.5848 0.1961 0.560 0.000 0.120 0.000 0.032 0.288
#> SRR1393449 3 0.4127 0.3492 0.000 0.000 0.680 0.000 0.036 0.284
#> SRR1409263 3 0.0000 0.7104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.2149 0.8233 0.900 0.000 0.004 0.000 0.016 0.080
#> SRR1334889 4 0.4334 0.3394 0.000 0.004 0.004 0.588 0.392 0.012
#> SRR614839 4 0.4041 0.5731 0.000 0.016 0.008 0.792 0.112 0.072
#> SRR658433 2 0.4884 0.6133 0.000 0.648 0.000 0.044 0.280 0.028
#> SRR1088581 4 0.7348 0.1259 0.000 0.000 0.280 0.392 0.164 0.164
#> SRR1328797 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.6151 0.6483 0.000 0.592 0.000 0.172 0.076 0.160
#> SRR1471117 1 0.6436 -0.2726 0.416 0.000 0.136 0.004 0.040 0.404
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.1092 0.7586 0.000 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1354955 3 0.1010 0.7053 0.000 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR654802 3 0.2892 0.6191 0.000 0.000 0.840 0.020 0.004 0.136
#> SRR660066 2 0.5816 -0.0271 0.000 0.472 0.000 0.392 0.120 0.016
#> SRR1447103 5 0.3620 0.5899 0.000 0.028 0.120 0.012 0.820 0.020
#> SRR1402153 5 0.6301 0.4596 0.000 0.052 0.132 0.228 0.576 0.012
#> SRR655887 2 0.4580 0.6957 0.000 0.744 0.000 0.112 0.112 0.032
#> SRR1408529 3 0.4321 0.5110 0.000 0.000 0.732 0.064 0.192 0.012
#> SRR658707 6 0.5510 0.3403 0.044 0.000 0.360 0.024 0.016 0.556
#> SRR1384371 5 0.5433 0.3734 0.000 0.152 0.012 0.200 0.632 0.004
#> SRR1074670 3 0.1556 0.6827 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1375439 5 0.4342 0.5917 0.000 0.044 0.160 0.028 0.760 0.008
#> SRR1329003 6 0.6598 0.2961 0.000 0.000 0.268 0.160 0.072 0.500
#> SRR1404837 2 0.5953 0.4752 0.000 0.588 0.000 0.188 0.184 0.040
#> SRR1317920 6 0.7610 0.4953 0.132 0.000 0.136 0.028 0.292 0.412
#> SRR1455525 3 0.6599 -0.0222 0.000 0.000 0.456 0.156 0.060 0.328
#> SRR613999 1 0.0806 0.8659 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1310836 1 0.1010 0.8633 0.960 0.000 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR1499764 1 0.0405 0.8742 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR658200 3 0.1781 0.6832 0.000 0.000 0.924 0.008 0.008 0.060
#> SRR1068855 6 0.6441 0.5694 0.184 0.000 0.208 0.028 0.024 0.556
#> SRR1375509 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR612227 5 0.5242 0.4933 0.000 0.004 0.312 0.092 0.588 0.004
#> SRR1388809 2 0.3825 0.7578 0.000 0.768 0.000 0.000 0.072 0.160
#> SRR1413872 4 0.5756 0.4453 0.000 0.016 0.000 0.560 0.272 0.152
#> SRR1452864 6 0.6590 0.2660 0.008 0.000 0.132 0.048 0.372 0.440
#> SRR1473078 5 0.4172 0.3488 0.000 0.000 0.424 0.004 0.564 0.008
#> SRR615814 4 0.5433 0.4519 0.000 0.152 0.000 0.624 0.208 0.016
#> SRR1325225 6 0.7148 0.3695 0.084 0.000 0.024 0.124 0.320 0.448
#> SRR1313687 5 0.5466 0.4175 0.000 0.180 0.016 0.120 0.664 0.020
#> SRR1358220 2 0.2378 0.7501 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1096662 4 0.6234 0.2453 0.000 0.372 0.000 0.456 0.136 0.036
#> SRR1487746 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0146 0.8756 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.3547 0.5343 0.000 0.108 0.028 0.008 0.828 0.028
#> SRR660164 2 0.0777 0.7558 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR815783 2 0.4151 0.7614 0.000 0.748 0.000 0.004 0.084 0.164
#> SRR809595 5 0.3670 0.5923 0.000 0.044 0.092 0.020 0.828 0.016
#> SRR1403133 2 0.3155 0.7452 0.000 0.816 0.000 0.012 0.160 0.012
#> SRR815470 2 0.5759 0.5152 0.000 0.596 0.000 0.264 0.076 0.064
#> SRR1344382 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.6370 0.3382 0.000 0.100 0.064 0.272 0.552 0.012
#> SRR1478362 2 0.5576 0.3931 0.000 0.572 0.000 0.316 0.076 0.036
#> SRR1392186 2 0.6212 0.6846 0.000 0.592 0.004 0.068 0.184 0.152
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.3598 0.7248 0.804 0.000 0.004 0.000 0.080 0.112
#> SRR1471594 1 0.6245 -0.0952 0.436 0.000 0.024 0.000 0.168 0.372
#> SRR1354270 5 0.5656 0.5097 0.000 0.004 0.252 0.116 0.604 0.024
#> SRR612683 2 0.3504 0.7024 0.000 0.832 0.000 0.060 0.076 0.032
#> SRR1392901 5 0.5849 0.1805 0.000 0.060 0.036 0.368 0.524 0.012
#> SRR1077805 5 0.5805 0.2887 0.000 0.012 0.092 0.344 0.536 0.016
#> SRR1360402 2 0.0363 0.7551 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1406112 3 0.0790 0.7080 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1355352 3 0.3110 0.5438 0.000 0.000 0.792 0.000 0.012 0.196
#> SRR656247 6 0.7222 0.4450 0.272 0.000 0.088 0.000 0.288 0.352
#> SRR813656 5 0.4817 0.5572 0.000 0.056 0.064 0.112 0.752 0.016
#> SRR808244 3 0.6719 -0.1251 0.000 0.000 0.388 0.160 0.064 0.388
#> SRR1387240 2 0.4002 0.7578 0.000 0.776 0.000 0.076 0.012 0.136
#> SRR1408595 5 0.5516 0.2762 0.028 0.000 0.132 0.000 0.628 0.212
#> SRR1385277 5 0.5584 0.2137 0.000 0.016 0.000 0.276 0.580 0.128
#> SRR1435248 2 0.3602 0.7661 0.000 0.792 0.000 0.000 0.072 0.136
#> SRR1419110 5 0.4329 0.5650 0.000 0.024 0.160 0.048 0.760 0.008
#> SRR1408682 2 0.4409 0.7058 0.000 0.756 0.000 0.124 0.092 0.028
#> SRR1317134 1 0.0692 0.8707 0.976 0.000 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.2679 0.7681 0.000 0.868 0.000 0.032 0.096 0.004
#> SRR1453911 5 0.5391 0.3290 0.000 0.180 0.004 0.012 0.640 0.164
#> SRR603164 5 0.5766 0.4568 0.000 0.040 0.104 0.196 0.644 0.016
#> SRR1383259 4 0.6475 0.2803 0.000 0.244 0.000 0.424 0.308 0.024
#> SRR1330854 3 0.3342 0.4953 0.000 0.000 0.760 0.000 0.012 0.228
#> SRR1452423 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.6022 0.6207 0.000 0.560 0.000 0.048 0.272 0.120
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.6206 0.4793 0.000 0.068 0.124 0.176 0.616 0.016
#> SRR1361546 5 0.3397 0.5850 0.000 0.020 0.112 0.004 0.832 0.032
#> SRR1486156 1 0.0405 0.8744 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR660545 4 0.4353 0.5181 0.000 0.012 0.016 0.692 0.268 0.012
#> SRR615635 2 0.2277 0.7631 0.000 0.892 0.000 0.000 0.076 0.032
#> SRR1385411 4 0.4656 0.2857 0.000 0.028 0.000 0.544 0.420 0.008
#> SRR1342739 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.7104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662126 4 0.5892 0.3568 0.000 0.164 0.000 0.512 0.312 0.012
#> SRR1464601 2 0.7284 0.3412 0.000 0.412 0.048 0.044 0.340 0.156
#> SRR1071594 5 0.6035 0.2467 0.000 0.316 0.004 0.096 0.540 0.044
#> SRR612539 4 0.4210 0.5635 0.000 0.048 0.004 0.760 0.168 0.020
#> SRR602010 5 0.3317 0.5504 0.000 0.052 0.024 0.064 0.852 0.008
#> SRR810249 2 0.3395 0.7658 0.000 0.808 0.000 0.000 0.060 0.132
#> SRR818773 5 0.3848 0.5511 0.000 0.000 0.204 0.004 0.752 0.040
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0547 0.7525 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1442754 3 0.2933 0.5409 0.000 0.000 0.796 0.000 0.004 0.200
#> SRR1334247 3 0.4566 -0.2407 0.000 0.000 0.488 0.020 0.484 0.008
#> SRR661639 6 0.4921 0.1687 0.000 0.000 0.432 0.024 0.024 0.520
#> SRR613222 5 0.6045 0.3233 0.000 0.024 0.104 0.336 0.524 0.012
#> SRR1459937 4 0.5673 0.4254 0.000 0.008 0.000 0.544 0.296 0.152
#> SRR2185018 1 0.4960 0.4651 0.640 0.000 0.012 0.000 0.076 0.272
#> SRR655732 2 0.2221 0.7638 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR809348 1 0.5182 0.2142 0.532 0.000 0.000 0.000 0.096 0.372
#> SRR819261 3 0.0790 0.7080 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.7104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349851 5 0.4016 0.5394 0.000 0.004 0.108 0.000 0.768 0.120
#> SRR1405123 4 0.4819 0.3601 0.000 0.044 0.000 0.572 0.376 0.008
#> SRR661096 2 0.5324 0.4676 0.000 0.652 0.000 0.188 0.136 0.024
#> SRR1320225 1 0.0632 0.8680 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1454651 6 0.6611 0.2936 0.000 0.000 0.272 0.160 0.072 0.496
#> SRR1307677 2 0.6689 0.5473 0.000 0.516 0.000 0.228 0.100 0.156
#> SRR1466512 2 0.4706 0.7292 0.000 0.744 0.000 0.112 0.064 0.080
#> SRR658212 4 0.4138 0.4668 0.000 0.020 0.000 0.656 0.320 0.004
#> SRR1430525 3 0.3513 0.5903 0.000 0.000 0.812 0.084 0.100 0.004
#> SRR1344422 4 0.4731 0.3197 0.000 0.004 0.008 0.572 0.388 0.028
#> SRR1353924 2 0.0790 0.7509 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1314832 3 0.6144 -0.1444 0.132 0.000 0.516 0.000 0.040 0.312
#> SRR1487570 5 0.6402 -0.0614 0.000 0.000 0.020 0.224 0.404 0.352
#> SRR627431 4 0.3025 0.5839 0.000 0.016 0.000 0.844 0.120 0.020
#> SRR1418561 3 0.2805 0.5934 0.000 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1448029 5 0.4760 0.4350 0.000 0.004 0.372 0.032 0.584 0.008
#> SRR813802 6 0.6550 0.4726 0.192 0.000 0.332 0.000 0.040 0.436
#> SRR815020 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.5824 0.3462 0.000 0.548 0.000 0.312 0.108 0.032
#> SRR1435311 2 0.4085 0.7593 0.000 0.748 0.000 0.000 0.096 0.156
#> SRR612395 5 0.3441 0.5497 0.000 0.096 0.028 0.036 0.836 0.004
#> SRR603116 2 0.5836 0.5155 0.000 0.556 0.000 0.176 0.252 0.016
#> SRR1323152 5 0.4481 0.2565 0.000 0.000 0.456 0.016 0.520 0.008
#> SRR1368264 5 0.4746 0.4330 0.000 0.192 0.024 0.032 0.724 0.028
#> SRR1326624 6 0.7143 0.5336 0.272 0.000 0.172 0.004 0.108 0.444
#> SRR1429265 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.3124 0.7571 0.828 0.000 0.008 0.000 0.024 0.140
#> SRR615611 4 0.4428 0.5567 0.000 0.012 0.008 0.756 0.108 0.116
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.6598 -0.1445 0.000 0.356 0.000 0.292 0.328 0.024
#> SRR815044 2 0.5918 0.3154 0.000 0.532 0.000 0.320 0.116 0.032
#> SRR1338560 2 0.1297 0.7653 0.000 0.948 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR615862 4 0.4297 0.5400 0.000 0.152 0.000 0.744 0.096 0.008
#> SRR1480038 2 0.0146 0.7564 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR659436 5 0.4770 0.4482 0.000 0.000 0.380 0.040 0.572 0.008
#> SRR613699 4 0.4388 0.5560 0.000 0.104 0.000 0.756 0.116 0.024
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.6506 0.2109 0.000 0.276 0.000 0.384 0.320 0.020
#> SRR1330327 4 0.5508 0.4457 0.000 0.008 0.000 0.576 0.276 0.140
#> SRR1489950 2 0.3963 0.7591 0.000 0.756 0.000 0.000 0.080 0.164
#> SRR1431927 1 0.2848 0.7353 0.828 0.000 0.000 0.004 0.008 0.160
#> SRR1100588 3 0.0632 0.7085 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1444002 6 0.6543 0.4608 0.188 0.000 0.340 0.000 0.040 0.432
#> SRR1318444 5 0.4984 0.3149 0.000 0.012 0.024 0.320 0.620 0.024
#> SRR600656 4 0.5570 0.4459 0.000 0.008 0.000 0.568 0.276 0.148
#> SRR658766 3 0.5172 0.4492 0.000 0.000 0.672 0.132 0.024 0.172
#> SRR655946 5 0.6151 0.3973 0.000 0.000 0.252 0.236 0.496 0.016
#> SRR817282 1 0.0146 0.8756 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.7104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0146 0.8760 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090265 1 0.2122 0.8219 0.900 0.000 0.000 0.000 0.024 0.076
#> SRR1444120 5 0.2486 0.5659 0.000 0.048 0.028 0.016 0.900 0.008
#> SRR1471965 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.5761 0.4603 0.000 0.060 0.076 0.212 0.640 0.012
#> SRR662498 5 0.3802 0.5697 0.000 0.048 0.064 0.056 0.824 0.008
#> SRR1376764 5 0.5818 0.4698 0.000 0.000 0.260 0.168 0.556 0.016
#> SRR1377006 5 0.4795 0.2979 0.000 0.012 0.028 0.340 0.612 0.008
#> SRR656860 4 0.3046 0.5878 0.000 0.024 0.000 0.852 0.100 0.024
#> SRR1480547 2 0.6887 0.5916 0.000 0.516 0.004 0.124 0.200 0.156
#> SRR1452515 5 0.5222 0.5617 0.000 0.028 0.228 0.064 0.668 0.012
#> SRR1324390 2 0.0603 0.7548 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR615273 3 0.5486 -0.0730 0.040 0.000 0.492 0.012 0.024 0.432
#> SRR601695 4 0.3067 0.5849 0.000 0.020 0.000 0.844 0.116 0.020
#> SRR820907 2 0.0713 0.7608 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR812773 5 0.3604 0.5832 0.000 0.032 0.104 0.000 0.820 0.044
#> SRR1405984 2 0.4270 0.7618 0.000 0.740 0.000 0.004 0.100 0.156
#> SRR1472794 2 0.4572 0.6758 0.000 0.736 0.000 0.144 0.096 0.024
#> SRR1365448 3 0.4641 0.0767 0.004 0.000 0.564 0.000 0.036 0.396
#> SRR1095720 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.4114 -0.0332 0.000 0.000 0.532 0.004 0.460 0.004
#> SRR1080766 2 0.3997 0.7605 0.000 0.764 0.000 0.004 0.080 0.152
#> SRR1377862 6 0.7133 0.4628 0.300 0.000 0.124 0.000 0.160 0.416
#> SRR1332299 3 0.1700 0.6742 0.000 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1467966 3 0.0632 0.7092 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1320579 3 0.7008 -0.0543 0.000 0.000 0.404 0.284 0.240 0.072
#> SRR1319710 2 0.3826 0.6921 0.000 0.736 0.000 0.016 0.236 0.012
#> SRR1326604 2 0.2563 0.7707 0.000 0.884 0.000 0.040 0.008 0.068
#> SRR1098879 3 0.0858 0.7072 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR662245 5 0.6023 0.4318 0.000 0.000 0.296 0.180 0.508 0.016
#> SRR1074719 2 0.4369 0.7572 0.000 0.720 0.000 0.000 0.116 0.164
#> SRR816226 6 0.6516 0.1466 0.000 0.000 0.044 0.164 0.396 0.396
#> SRR601387 4 0.5827 -0.0463 0.000 0.388 0.000 0.492 0.084 0.036
#> SRR614575 2 0.4638 0.6150 0.000 0.728 0.000 0.120 0.132 0.020
#> SRR1353900 2 0.5985 0.6660 0.000 0.584 0.000 0.044 0.216 0.156
#> SRR662906 3 0.5982 0.3845 0.000 0.000 0.616 0.180 0.112 0.092
#> SRR1350832 5 0.5612 -0.0605 0.000 0.432 0.000 0.092 0.460 0.016
#> SRR1403280 2 0.3567 0.7723 0.000 0.804 0.000 0.004 0.068 0.124
#> SRR1313969 4 0.6386 0.4378 0.000 0.056 0.000 0.520 0.268 0.156
#> SRR1388528 1 0.5702 0.2066 0.536 0.000 0.060 0.004 0.040 0.360
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.3780 0.5816 0.000 0.044 0.096 0.000 0.812 0.048
#> SRR655399 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1319753 5 0.3384 0.5277 0.000 0.096 0.012 0.012 0.840 0.040
#> SRR818901 3 0.0713 0.7084 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR607067 4 0.2663 0.5849 0.000 0.012 0.000 0.876 0.084 0.028
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.6901 0.3884 0.000 0.136 0.000 0.496 0.216 0.152
#> SRR661961 3 0.4628 -0.0851 0.000 0.000 0.536 0.016 0.432 0.016
#> SRR658259 2 0.5477 0.5796 0.000 0.640 0.000 0.156 0.176 0.028
#> SRR1310476 1 0.0146 0.8760 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452696 2 0.3240 0.7601 0.000 0.812 0.000 0.000 0.040 0.148
#> SRR1365034 2 0.5803 0.4575 0.000 0.592 0.000 0.240 0.132 0.036
#> SRR1478053 2 0.0713 0.7518 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1475300 2 0.1444 0.7628 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1328101 5 0.5586 0.2667 0.000 0.328 0.024 0.032 0.580 0.036
#> SRR1322900 5 0.3633 0.5640 0.000 0.004 0.120 0.000 0.800 0.076
#> SRR1309942 2 0.4628 0.7561 0.000 0.712 0.000 0.008 0.124 0.156
#> SRR1345760 4 0.6051 0.3432 0.000 0.020 0.000 0.480 0.348 0.152
#> SRR1435418 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.7098 0.2235 0.000 0.380 0.000 0.348 0.108 0.164
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.4354 0.6631 0.000 0.684 0.000 0.016 0.272 0.028
#> SRR661469 5 0.3655 0.5470 0.000 0.052 0.028 0.092 0.824 0.004
#> SRR1500323 2 0.2308 0.7648 0.000 0.892 0.000 0.000 0.068 0.040
#> SRR1356705 5 0.4509 0.3853 0.000 0.236 0.004 0.036 0.704 0.020
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.5952 0.2086 0.000 0.000 0.500 0.012 0.316 0.172
#> SRR1350435 6 0.7255 0.5712 0.240 0.000 0.172 0.012 0.112 0.464
#> SRR1389177 3 0.6004 -0.1637 0.000 0.000 0.468 0.152 0.364 0.016
#> SRR1368072 2 0.2433 0.7716 0.000 0.884 0.000 0.000 0.072 0.044
#> SRR601815 4 0.5508 0.4627 0.000 0.176 0.000 0.636 0.160 0.028
#> SRR613330 1 0.3046 0.7684 0.860 0.000 0.036 0.004 0.016 0.084
#> SRR1434502 5 0.6135 0.1919 0.000 0.248 0.000 0.236 0.500 0.016
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.2436 0.8087 0.880 0.000 0.000 0.000 0.032 0.088
#> SRR816382 5 0.4736 0.5570 0.000 0.052 0.128 0.064 0.748 0.008
#> SRR1318839 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.6910 0.3554 0.000 0.312 0.000 0.436 0.092 0.160
#> SRR613126 4 0.3202 0.5769 0.000 0.040 0.000 0.816 0.144 0.000
#> SRR1089424 2 0.4082 0.7655 0.000 0.764 0.000 0.012 0.068 0.156
#> SRR1347214 2 0.4507 0.7606 0.000 0.736 0.000 0.020 0.088 0.156
#> SRR1309556 5 0.3880 0.5894 0.000 0.044 0.104 0.012 0.812 0.028
#> SRR1456027 5 0.6066 -0.0967 0.000 0.004 0.004 0.316 0.472 0.204
#> SRR1400551 3 0.1780 0.6874 0.000 0.000 0.924 0.000 0.028 0.048
#> SRR1320469 3 0.4780 -0.1455 0.000 0.000 0.480 0.004 0.040 0.476
#> SRR614251 4 0.3123 0.5835 0.000 0.016 0.004 0.844 0.116 0.020
#> SRR1454310 2 0.2520 0.7519 0.000 0.844 0.000 0.000 0.004 0.152
#> SRR615105 4 0.3971 0.4971 0.000 0.008 0.016 0.780 0.036 0.160
#> SRR1433290 3 0.0858 0.7074 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR2166064 4 0.5682 0.4461 0.000 0.016 0.000 0.564 0.284 0.136
#> SRR601671 2 0.1049 0.7507 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR663874 5 0.5897 0.1955 0.000 0.308 0.004 0.136 0.536 0.016
#> SRR1409130 5 0.6015 0.4643 0.000 0.012 0.188 0.208 0.576 0.016
#> SRR659696 4 0.5929 0.3281 0.000 0.340 0.000 0.524 0.092 0.044
#> SRR1408249 5 0.6423 -0.1502 0.000 0.396 0.000 0.124 0.424 0.056
#> SRR663284 4 0.4161 0.4199 0.000 0.016 0.004 0.632 0.348 0.000
#> SRR1402794 3 0.0937 0.7051 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614852 4 0.7205 -0.0721 0.000 0.008 0.228 0.376 0.068 0.320
#> SRR1348040 5 0.5301 0.5365 0.000 0.008 0.096 0.128 0.704 0.064
#> SRR1489610 2 0.3200 0.7270 0.000 0.788 0.000 0.016 0.196 0.000
#> SRR1488091 2 0.5364 0.6830 0.000 0.632 0.004 0.020 0.248 0.096
#> SRR1499566 5 0.4122 0.4704 0.000 0.160 0.008 0.040 0.772 0.020
#> SRR1361480 2 0.6405 -0.0296 0.000 0.424 0.000 0.368 0.176 0.032
#> SRR1444501 3 0.1219 0.6990 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR1415773 5 0.5054 0.1917 0.000 0.360 0.004 0.032 0.580 0.024
#> SRR1388832 3 0.4860 0.0893 0.012 0.000 0.568 0.000 0.040 0.380
#> SRR1394637 6 0.6568 0.5624 0.244 0.000 0.208 0.004 0.044 0.500
#> SRR606974 4 0.4143 0.5496 0.000 0.124 0.000 0.756 0.116 0.004
#> SRR662918 4 0.4476 0.5031 0.000 0.044 0.000 0.668 0.280 0.008
#> SRR817421 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.5810 0.6596 0.000 0.632 0.000 0.172 0.072 0.124
#> SRR608264 3 0.3780 0.6130 0.000 0.000 0.812 0.048 0.096 0.044
#> SRR1318560 3 0.3789 0.4131 0.000 0.000 0.716 0.000 0.024 0.260
#> SRR1454117 2 0.0260 0.7554 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312684 6 0.7016 0.5049 0.292 0.000 0.152 0.004 0.100 0.452
#> SRR615044 3 0.7102 -0.0628 0.000 0.000 0.396 0.108 0.168 0.328
#> SRR1432743 3 0.5904 -0.0715 0.000 0.000 0.492 0.140 0.352 0.016
#> SRR1388873 2 0.2821 0.7562 0.000 0.832 0.000 0.000 0.016 0.152
#> SRR1353517 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.4680 0.4136 0.000 0.000 0.396 0.032 0.564 0.008
#> SRR1406008 5 0.5549 -0.0913 0.000 0.424 0.004 0.060 0.488 0.024
#> SRR1396786 2 0.4293 0.7600 0.000 0.736 0.000 0.004 0.096 0.164
#> SRR1446564 5 0.5824 0.0831 0.004 0.000 0.140 0.008 0.516 0.332
#> SRR1318465 5 0.5963 0.3419 0.000 0.000 0.168 0.300 0.516 0.016
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.5102 0.4976 0.000 0.092 0.000 0.632 0.264 0.012
#> SRR655170 4 0.3280 0.5825 0.000 0.028 0.000 0.808 0.160 0.004
#> SRR1087825 4 0.5700 0.4184 0.000 0.008 0.000 0.536 0.304 0.152
#> SRR662019 3 0.5095 0.1617 0.000 0.000 0.576 0.008 0.072 0.344
#> SRR1349209 5 0.6668 0.0191 0.000 0.004 0.048 0.304 0.464 0.180
#> SRR1326161 5 0.5962 0.0524 0.000 0.172 0.000 0.320 0.496 0.012
#> SRR1345284 2 0.3667 0.7668 0.000 0.788 0.000 0.000 0.080 0.132
#> SRR1416672 1 0.1411 0.8449 0.936 0.000 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR663356 4 0.3545 0.5798 0.000 0.072 0.000 0.824 0.084 0.020
#> SRR1454328 2 0.4108 0.7600 0.000 0.744 0.000 0.000 0.092 0.164
#> SRR1489286 1 0.3302 0.6525 0.760 0.000 0.000 0.004 0.004 0.232
#> SRR1092349 5 0.3907 0.5796 0.000 0.036 0.108 0.000 0.800 0.056
#> SRR1408183 3 0.1845 0.6837 0.000 0.000 0.916 0.008 0.072 0.004
#> SRR1084369 5 0.5418 0.4777 0.000 0.000 0.336 0.096 0.556 0.012
#> SRR598452 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR660709 4 0.2904 0.5852 0.000 0.008 0.000 0.852 0.112 0.028
#> SRR809444 1 0.1890 0.8325 0.916 0.000 0.000 0.000 0.024 0.060
#> SRR1089901 2 0.3732 0.7645 0.000 0.780 0.000 0.000 0.076 0.144
#> SRR1375774 5 0.5552 0.2786 0.036 0.000 0.116 0.000 0.628 0.220
#> SRR1326292 6 0.6606 0.2762 0.000 0.000 0.284 0.160 0.068 0.488
#> SRR657139 3 0.3406 0.5757 0.000 0.000 0.792 0.020 0.008 0.180
#> SRR1440744 2 0.0790 0.7509 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.1983 0.8275 0.908 0.000 0.000 0.000 0.020 0.072
#> SRR1452334 4 0.5390 0.3666 0.000 0.012 0.000 0.544 0.356 0.088
#> SRR1381775 5 0.5730 0.2801 0.052 0.000 0.120 0.000 0.624 0.204
#> SRR1363908 1 0.1390 0.8563 0.948 0.000 0.000 0.004 0.016 0.032
#> SRR1319626 2 0.2378 0.7498 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR658989 5 0.4477 0.5253 0.000 0.000 0.308 0.036 0.648 0.008
#> SRR1353663 6 0.6483 0.2913 0.396 0.000 0.144 0.004 0.040 0.416
#> SRR811771 1 0.5563 0.2722 0.560 0.000 0.032 0.000 0.076 0.332
#> SRR813983 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.4382 0.7601 0.000 0.740 0.000 0.012 0.156 0.092
#> SRR1367988 4 0.6298 0.3718 0.000 0.040 0.000 0.484 0.328 0.148
#> SRR1331922 5 0.4657 0.4274 0.000 0.000 0.136 0.000 0.688 0.176
#> SRR615479 5 0.5909 0.4931 0.000 0.032 0.108 0.208 0.628 0.024
#> SRR1375796 2 0.6156 0.3189 0.000 0.504 0.000 0.208 0.268 0.020
#> SRR1386991 5 0.3513 0.5544 0.000 0.068 0.028 0.056 0.840 0.008
#> SRR1355217 5 0.3241 0.5364 0.000 0.096 0.012 0.044 0.844 0.004
#> SRR1356290 5 0.5950 0.3554 0.000 0.116 0.036 0.232 0.604 0.012
#> SRR659507 5 0.3029 0.5802 0.000 0.044 0.060 0.032 0.864 0.000
#> SRR663296 1 0.5047 0.2453 0.548 0.000 0.016 0.004 0.036 0.396
#> SRR598044 2 0.2122 0.7649 0.000 0.900 0.000 0.000 0.076 0.024
#> SRR661155 4 0.5328 0.4749 0.000 0.008 0.000 0.612 0.244 0.136
#> SRR1414727 3 0.3176 0.6401 0.000 0.000 0.832 0.000 0.084 0.084
#> SRR663477 6 0.7314 0.5885 0.192 0.000 0.160 0.024 0.128 0.496
#> SRR1354489 5 0.5816 0.3997 0.000 0.000 0.392 0.120 0.472 0.016
#> SRR1377800 3 0.3353 0.5793 0.000 0.000 0.804 0.004 0.160 0.032
#> SRR614611 4 0.3031 0.5842 0.000 0.012 0.004 0.848 0.116 0.020
#> SRR655052 2 0.5845 0.3785 0.000 0.556 0.000 0.304 0.100 0.040
#> SRR1478968 5 0.6425 -0.0412 0.000 0.000 0.024 0.212 0.412 0.352
#> SRR1351280 2 0.6790 0.5140 0.000 0.512 0.000 0.204 0.168 0.116
#> SRR613951 4 0.4105 0.4417 0.000 0.004 0.000 0.648 0.332 0.016
#> SRR1418022 1 0.0146 0.8760 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR661901 3 0.6984 -0.1071 0.000 0.000 0.348 0.256 0.060 0.336
#> SRR1408161 1 0.2651 0.8002 0.872 0.000 0.004 0.000 0.036 0.088
#> SRR657054 3 0.3043 0.6114 0.000 0.000 0.832 0.020 0.008 0.140
#> SRR655040 4 0.2699 0.5857 0.000 0.008 0.000 0.864 0.108 0.020
#> SRR810225 2 0.1807 0.7706 0.000 0.920 0.000 0.000 0.060 0.020
#> SRR1325377 2 0.2221 0.7701 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR617829 4 0.5163 0.3794 0.000 0.000 0.160 0.636 0.200 0.004
#> SRR1402328 2 0.4767 0.7374 0.000 0.676 0.000 0.000 0.168 0.156
#> SRR1480455 5 0.6635 0.3350 0.000 0.040 0.164 0.296 0.488 0.012
#> SRR1442104 3 0.0260 0.7102 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.2526 0.8085 0.876 0.000 0.000 0.004 0.024 0.096
#> SRR1481396 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.2300 0.7522 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR663026 4 0.5957 0.2857 0.000 0.268 0.000 0.552 0.152 0.028
#> SRR1478386 2 0.4621 0.7419 0.000 0.740 0.000 0.112 0.032 0.116
#> SRR1458683 3 0.6800 0.0278 0.000 0.000 0.448 0.240 0.060 0.252
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.3731 0.5646 0.000 0.004 0.116 0.004 0.800 0.076
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5615 0.4391 0.000 0.008 0.000 0.560 0.280 0.152
#> SRR660260 4 0.4379 0.3676 0.000 0.004 0.004 0.600 0.376 0.016
#> SRR1071231 2 0.2003 0.7578 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1459125 5 0.5782 0.2704 0.000 0.068 0.008 0.300 0.580 0.044
#> SRR1337173 5 0.6174 0.3207 0.000 0.092 0.044 0.288 0.560 0.016
#> SRR1396250 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.7104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659816 4 0.2990 0.5783 0.000 0.004 0.004 0.844 0.124 0.024
#> SRR1401379 2 0.3648 0.7263 0.000 0.776 0.000 0.012 0.188 0.024
#> SRR600981 4 0.5222 0.4197 0.000 0.000 0.000 0.584 0.288 0.128
#> SRR1398335 1 0.0865 0.8640 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1397218 2 0.6834 0.3577 0.000 0.472 0.000 0.276 0.156 0.096
#> SRR660115 6 0.5833 0.4367 0.088 0.000 0.316 0.024 0.012 0.560
#> SRR1407950 2 0.6734 0.4188 0.000 0.440 0.000 0.072 0.332 0.156
#> SRR1359780 2 0.5614 0.4580 0.000 0.556 0.000 0.116 0.312 0.016
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4225 0.6959 0.000 0.768 0.000 0.140 0.060 0.032
#> SRR1397156 1 0.0508 0.8728 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1410221 2 0.2605 0.7670 0.000 0.864 0.000 0.000 0.108 0.028
#> SRR1319648 5 0.6224 0.1177 0.000 0.152 0.000 0.336 0.480 0.032
#> SRR1092985 6 0.6855 0.5712 0.248 0.000 0.204 0.004 0.068 0.476
#> SRR656409 4 0.3058 0.5867 0.000 0.024 0.000 0.848 0.108 0.020
#> SRR1468658 4 0.5990 0.2133 0.000 0.004 0.016 0.440 0.416 0.124
#> SRR1390437 5 0.5940 0.1808 0.000 0.120 0.004 0.316 0.536 0.024
#> SRR658057 2 0.0790 0.7509 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR612635 4 0.3698 0.5810 0.000 0.048 0.000 0.804 0.128 0.020
#> SRR1351480 2 0.4224 0.5139 0.000 0.700 0.000 0.036 0.256 0.008
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.6175 -0.1087 0.436 0.000 0.040 0.000 0.116 0.408
#> SRR659590 2 0.2834 0.7644 0.000 0.864 0.000 0.020 0.096 0.020
#> SRR614263 1 0.0405 0.8722 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1409575 2 0.2300 0.7522 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR659911 4 0.5017 0.5187 0.000 0.140 0.000 0.696 0.136 0.028
#> SRR1085519 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1345894 5 0.6743 0.2628 0.000 0.016 0.308 0.252 0.408 0.016
#> SRR1442928 5 0.5090 0.5366 0.000 0.020 0.184 0.108 0.684 0.004
#> SRR1464681 4 0.6823 0.3701 0.000 0.080 0.000 0.444 0.312 0.164
#> SRR1418880 1 0.6366 -0.1798 0.448 0.000 0.136 0.004 0.036 0.376
#> SRR1309070 5 0.6280 0.4384 0.000 0.044 0.128 0.236 0.576 0.016
#> SRR1365426 5 0.3717 0.5842 0.000 0.036 0.120 0.000 0.808 0.036
#> SRR1487947 3 0.3743 0.4316 0.000 0.000 0.724 0.000 0.024 0.252
#> SRR659708 3 0.5240 0.3658 0.000 0.000 0.640 0.076 0.032 0.252
#> SRR603236 5 0.6319 0.2722 0.000 0.276 0.036 0.136 0.540 0.012
#> SRR660673 1 0.0291 0.8753 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1430729 2 0.5535 0.5695 0.000 0.592 0.020 0.020 0.312 0.056
#> SRR663807 2 0.6210 -0.0319 0.000 0.452 0.000 0.360 0.164 0.024
#> SRR1087245 2 0.0870 0.7610 0.000 0.972 0.000 0.012 0.004 0.012
#> SRR1339108 2 0.6492 0.6378 0.000 0.564 0.000 0.144 0.136 0.156
#> SRR613426 6 0.6814 0.0764 0.000 0.000 0.056 0.208 0.336 0.400
#> SRR613879 4 0.4608 0.5220 0.000 0.168 0.000 0.724 0.088 0.020
#> SRR1385101 5 0.4027 0.5454 0.004 0.004 0.104 0.000 0.776 0.112
#> SRR1387966 2 0.4688 0.7407 0.000 0.724 0.000 0.100 0.024 0.152
#> SRR1458852 2 0.4316 0.7602 0.000 0.728 0.000 0.000 0.128 0.144
#> SRR1430489 6 0.7774 0.5059 0.196 0.000 0.064 0.128 0.144 0.468
#> SRR1349231 5 0.3784 0.5618 0.000 0.008 0.124 0.000 0.792 0.076
#> SRR1376249 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.3680 0.7635 0.000 0.784 0.000 0.000 0.072 0.144
#> SRR662653 2 0.5622 0.2617 0.000 0.488 0.000 0.132 0.376 0.004
#> SRR1390027 1 0.0146 0.8756 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098474 5 0.5632 0.5086 0.000 0.008 0.192 0.160 0.624 0.016
#> SRR1383081 2 0.0260 0.7575 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2166960 2 0.3538 0.7569 0.000 0.816 0.000 0.024 0.124 0.036
#> SRR605101 2 0.4304 0.7104 0.000 0.752 0.000 0.044 0.168 0.036
#> SRR818600 5 0.6319 -0.0457 0.000 0.380 0.000 0.216 0.388 0.016
#> SRR1367715 2 0.4737 0.7024 0.000 0.736 0.000 0.136 0.064 0.064
#> SRR1351979 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1387054 5 0.5974 0.4358 0.000 0.000 0.232 0.216 0.536 0.016
#> SRR1444306 3 0.3437 0.4700 0.000 0.000 0.752 0.004 0.236 0.008
#> SRR1322662 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4171 0.7236 0.000 0.764 0.000 0.040 0.160 0.036
#> SRR612767 6 0.7252 0.3714 0.000 0.000 0.176 0.164 0.224 0.436
#> SRR1489030 2 0.2094 0.7647 0.000 0.900 0.000 0.000 0.080 0.020
#> SRR1430375 5 0.5625 0.4369 0.000 0.132 0.024 0.060 0.688 0.096
#> SRR615225 4 0.4783 0.4266 0.000 0.012 0.000 0.612 0.332 0.044
#> SRR1401839 5 0.3932 0.5916 0.000 0.044 0.100 0.020 0.812 0.024
#> SRR1379110 2 0.2482 0.7518 0.000 0.848 0.000 0.000 0.004 0.148
#> SRR1077288 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1331639 4 0.6707 0.2999 0.000 0.340 0.000 0.432 0.064 0.164
#> SRR1342782 5 0.2693 0.5634 0.000 0.052 0.036 0.000 0.884 0.028
#> SRR1443003 5 0.5679 0.4406 0.000 0.000 0.352 0.132 0.508 0.008
#> SRR612839 6 0.5059 0.1903 0.008 0.000 0.436 0.012 0.032 0.512
#> SRR1470093 3 0.6594 0.2244 0.000 0.000 0.504 0.196 0.236 0.064
#> SRR1395742 1 0.0508 0.8725 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1469014 1 0.2176 0.8201 0.896 0.000 0.000 0.000 0.024 0.080
#> SRR1387222 4 0.5667 0.4615 0.000 0.000 0.020 0.588 0.248 0.144
#> SRR664063 5 0.3749 0.5868 0.000 0.024 0.132 0.012 0.808 0.024
#> SRR1488214 5 0.5631 0.1919 0.024 0.000 0.124 0.000 0.592 0.260
#> SRR654766 4 0.5983 0.3956 0.000 0.020 0.000 0.504 0.328 0.148
#> SRR1320321 2 0.0632 0.7603 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8768 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0260 0.7554 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1488470 2 0.5672 0.4439 0.000 0.588 0.000 0.224 0.172 0.016
#> SRR1389497 3 0.0146 0.7111 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1367109 5 0.4206 0.5826 0.000 0.016 0.172 0.044 0.760 0.008
#> SRR615311 6 0.7246 0.5118 0.152 0.000 0.120 0.112 0.068 0.548
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.971 0.988 0.4572 0.543 0.543
#> 3 3 0.787 0.885 0.942 0.4427 0.729 0.531
#> 4 4 0.744 0.745 0.855 0.1149 0.886 0.686
#> 5 5 0.710 0.610 0.810 0.0516 0.946 0.814
#> 6 6 0.777 0.689 0.842 0.0277 0.917 0.693
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.8763 0.580 0.296 0.704
#> SRR665262 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1499740 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.7219 0.749 0.200 0.800
#> SRR612215 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1447103 1 0.9393 0.458 0.644 0.356
#> SRR1402153 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1074670 1 0.8081 0.675 0.752 0.248
#> SRR1375439 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0672 0.976 0.992 0.008
#> SRR613999 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR612227 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.0672 0.983 0.008 0.992
#> SRR615814 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.4022 0.909 0.080 0.920
#> SRR660164 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.4298 0.900 0.088 0.912
#> SRR1403133 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.6712 0.786 0.176 0.824
#> SRR612683 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.7950 0.684 0.240 0.760
#> SRR1355352 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.3733 0.918 0.072 0.928
#> SRR1435248 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1361546 1 0.3584 0.917 0.932 0.068
#> SRR1486156 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1102830 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR818773 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR819261 1 0.9944 0.176 0.544 0.456
#> SRR661074 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.4161 0.904 0.084 0.916
#> SRR1326624 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1475104 1 0.8327 0.647 0.736 0.264
#> SRR1406418 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0938 0.980 0.012 0.988
#> SRR1471965 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0672 0.983 0.008 0.992
#> SRR1435626 1 0.9970 0.133 0.532 0.468
#> SRR1080766 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.6623 0.790 0.172 0.828
#> SRR1320579 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.1184 0.976 0.016 0.984
#> SRR1319753 2 0.9358 0.454 0.352 0.648
#> SRR818901 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661961 1 0.1843 0.957 0.972 0.028
#> SRR658259 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR1432390 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1309556 1 0.9209 0.505 0.664 0.336
#> SRR1456027 1 0.4431 0.891 0.908 0.092
#> SRR1400551 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1348040 1 0.8267 0.655 0.740 0.260
#> SRR1489610 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR615044 1 0.6712 0.785 0.824 0.176
#> SRR1432743 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662019 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1349209 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR1326161 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0672 0.984 0.008 0.992
#> SRR660709 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR657139 2 0.9970 0.106 0.468 0.532
#> SRR1440744 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR1353663 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR615479 2 0.9170 0.498 0.332 0.668
#> SRR1375796 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1414727 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1377800 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.2423 0.952 0.040 0.960
#> SRR655040 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR659816 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0938 0.972 0.988 0.012
#> SRR603236 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.4939 0.876 0.108 0.892
#> SRR1379110 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1342782 1 0.2948 0.934 0.948 0.052
#> SRR1443003 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0938 0.972 0.988 0.012
#> SRR1488214 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.983 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380716 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0747 0.959 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074359 2 0.1163 0.920 0.000 0.972 0.028
#> SRR1419258 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1403366 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.4121 0.838 0.000 0.832 0.168
#> SRR1499740 3 0.1031 0.917 0.024 0.000 0.976
#> SRR1105057 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1439742 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR612215 2 0.5529 0.672 0.000 0.704 0.296
#> SRR1094051 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.4796 0.717 0.220 0.000 0.780
#> SRR1409263 3 0.4796 0.710 0.220 0.000 0.780
#> SRR1431288 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.6192 0.235 0.000 0.580 0.420
#> SRR614839 2 0.5621 0.652 0.000 0.692 0.308
#> SRR658433 2 0.0892 0.922 0.000 0.980 0.020
#> SRR1088581 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1328797 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0424 0.923 0.000 0.992 0.008
#> SRR1471117 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0424 0.925 0.000 0.992 0.008
#> SRR1354955 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR660066 2 0.2356 0.902 0.000 0.928 0.072
#> SRR1447103 1 0.6154 0.317 0.592 0.000 0.408
#> SRR1402153 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR655887 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.3752 0.820 0.000 0.856 0.144
#> SRR1074670 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 3 0.4504 0.748 0.196 0.000 0.804
#> SRR1404837 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1317920 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0237 0.926 0.004 0.000 0.996
#> SRR613999 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0424 0.964 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499764 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1068855 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.3551 0.818 0.132 0.000 0.868
#> SRR612227 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1388809 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1413872 2 0.5760 0.620 0.000 0.672 0.328
#> SRR1452864 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.4346 0.822 0.000 0.816 0.184
#> SRR1325225 1 0.0424 0.964 0.992 0.000 0.008
#> SRR1313687 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1096662 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.1482 0.912 0.020 0.968 0.012
#> SRR660164 2 0.2066 0.907 0.000 0.940 0.060
#> SRR815783 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR809595 1 0.7202 0.690 0.716 0.160 0.124
#> SRR1403133 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0892 0.922 0.000 0.980 0.020
#> SRR1344382 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3551 0.828 0.000 0.132 0.868
#> SRR1478362 2 0.2878 0.889 0.000 0.904 0.096
#> SRR1392186 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1347937 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0237 0.926 0.004 0.000 0.996
#> SRR612683 2 0.2625 0.896 0.000 0.916 0.084
#> SRR1392901 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1077805 3 0.1289 0.917 0.000 0.032 0.968
#> SRR1360402 2 0.0592 0.924 0.000 0.988 0.012
#> SRR1406112 3 0.0237 0.925 0.004 0.000 0.996
#> SRR1355352 3 0.4452 0.751 0.192 0.000 0.808
#> SRR656247 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.4887 0.774 0.000 0.772 0.228
#> SRR808244 3 0.4399 0.755 0.188 0.000 0.812
#> SRR1387240 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.0892 0.917 0.020 0.000 0.980
#> SRR1435248 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.4291 0.773 0.000 0.180 0.820
#> SRR1408682 2 0.4399 0.819 0.000 0.812 0.188
#> SRR1317134 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR603164 3 0.1753 0.901 0.000 0.048 0.952
#> SRR1383259 2 0.0424 0.923 0.000 0.992 0.008
#> SRR1330854 1 0.0424 0.964 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452423 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1468162 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 3 0.4062 0.796 0.164 0.000 0.836
#> SRR1486156 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.4121 0.837 0.000 0.832 0.168
#> SRR615635 2 0.0747 0.923 0.000 0.984 0.016
#> SRR1385411 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1342739 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.1289 0.908 0.032 0.000 0.968
#> SRR662126 2 0.3752 0.857 0.000 0.856 0.144
#> SRR1464601 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1071594 2 0.0237 0.925 0.000 0.996 0.004
#> SRR612539 2 0.4291 0.826 0.000 0.820 0.180
#> SRR602010 2 0.4346 0.822 0.000 0.816 0.184
#> SRR810249 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR818773 1 0.0592 0.961 0.988 0.000 0.012
#> SRR1336569 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3482 0.869 0.000 0.872 0.128
#> SRR1442754 1 0.5529 0.558 0.704 0.000 0.296
#> SRR1334247 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR661639 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.0747 0.924 0.000 0.016 0.984
#> SRR1459937 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR2185018 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0892 0.922 0.000 0.980 0.020
#> SRR809348 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.4002 0.792 0.160 0.000 0.840
#> SRR1349851 1 0.1031 0.951 0.976 0.024 0.000
#> SRR1405123 2 0.4399 0.752 0.000 0.812 0.188
#> SRR661096 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.4504 0.748 0.196 0.000 0.804
#> SRR1307677 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR658212 2 0.2878 0.890 0.000 0.904 0.096
#> SRR1430525 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1344422 2 0.5216 0.644 0.000 0.740 0.260
#> SRR1353924 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.4750 0.708 0.784 0.000 0.216
#> SRR1487570 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.5810 0.600 0.000 0.664 0.336
#> SRR1418561 3 0.4605 0.736 0.204 0.000 0.796
#> SRR1448029 3 0.3816 0.809 0.000 0.148 0.852
#> SRR813802 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR1435311 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR612395 3 0.3752 0.796 0.000 0.144 0.856
#> SRR603116 2 0.4346 0.822 0.000 0.816 0.184
#> SRR1323152 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.1753 0.896 0.048 0.000 0.952
#> SRR1327702 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.5254 0.723 0.000 0.736 0.264
#> SRR1486799 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.3879 0.851 0.000 0.848 0.152
#> SRR1338560 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.3686 0.861 0.000 0.860 0.140
#> SRR1480038 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR613699 2 0.4605 0.801 0.000 0.796 0.204
#> SRR1436563 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2165 0.906 0.000 0.936 0.064
#> SRR1330327 3 0.1643 0.905 0.000 0.044 0.956
#> SRR1489950 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR600656 2 0.6309 0.157 0.000 0.504 0.496
#> SRR658766 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR655946 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR817282 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.0661 0.926 0.004 0.008 0.988
#> SRR1471965 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR662498 3 0.0424 0.927 0.000 0.008 0.992
#> SRR1376764 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1377006 3 0.2537 0.877 0.000 0.080 0.920
#> SRR656860 2 0.4121 0.837 0.000 0.832 0.168
#> SRR1480547 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1452515 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0747 0.923 0.000 0.984 0.016
#> SRR615273 1 0.4605 0.730 0.796 0.000 0.204
#> SRR601695 2 0.4887 0.773 0.000 0.772 0.228
#> SRR820907 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0424 0.964 0.992 0.000 0.008
#> SRR1405984 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472794 2 0.1163 0.920 0.000 0.972 0.028
#> SRR1365448 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.2056 0.903 0.024 0.024 0.952
#> SRR1080766 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1377862 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1467966 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0424 0.927 0.000 0.008 0.992
#> SRR1319710 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.0892 0.923 0.000 0.020 0.980
#> SRR1074719 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0592 0.961 0.988 0.000 0.012
#> SRR601387 2 0.2165 0.906 0.000 0.936 0.064
#> SRR614575 2 0.4121 0.837 0.000 0.832 0.168
#> SRR1353900 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR662906 2 0.5835 0.599 0.000 0.660 0.340
#> SRR1350832 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1403280 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.3752 0.788 0.000 0.144 0.856
#> SRR1388528 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1319753 2 0.5733 0.557 0.324 0.676 0.000
#> SRR818901 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR607067 2 0.4750 0.787 0.000 0.784 0.216
#> SRR1391420 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR661961 3 0.0237 0.926 0.004 0.000 0.996
#> SRR658259 2 0.0747 0.923 0.000 0.984 0.016
#> SRR1310476 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365034 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1328101 2 0.4346 0.822 0.000 0.816 0.184
#> SRR1322900 3 0.6260 0.229 0.448 0.000 0.552
#> SRR1309942 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1435418 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1443436 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.2066 0.907 0.000 0.940 0.060
#> SRR661469 3 0.1860 0.898 0.000 0.052 0.948
#> SRR1500323 2 0.3551 0.866 0.000 0.868 0.132
#> SRR1356705 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1464915 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.3038 0.847 0.104 0.000 0.896
#> SRR1350435 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1368072 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.3686 0.861 0.000 0.860 0.140
#> SRR613330 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0592 0.924 0.000 0.988 0.012
#> SRR1394190 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0237 0.967 0.996 0.000 0.004
#> SRR816382 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1432390 2 0.4121 0.837 0.000 0.832 0.168
#> SRR613126 3 0.5926 0.368 0.000 0.356 0.644
#> SRR1089424 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1309556 1 0.4634 0.796 0.824 0.164 0.012
#> SRR1456027 1 0.3213 0.902 0.912 0.060 0.028
#> SRR1400551 3 0.1411 0.908 0.036 0.000 0.964
#> SRR1320469 1 0.3192 0.856 0.888 0.000 0.112
#> SRR614251 3 0.6274 0.012 0.000 0.456 0.544
#> SRR1454310 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1433290 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR2166064 2 0.4504 0.766 0.000 0.804 0.196
#> SRR601671 2 0.0892 0.922 0.000 0.980 0.020
#> SRR663874 2 0.3551 0.866 0.000 0.868 0.132
#> SRR1409130 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR659696 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR663284 2 0.3267 0.877 0.000 0.884 0.116
#> SRR1402794 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.4555 0.713 0.000 0.200 0.800
#> SRR1348040 1 0.4555 0.743 0.800 0.000 0.200
#> SRR1489610 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.1163 0.920 0.000 0.972 0.028
#> SRR1444501 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.3412 0.872 0.000 0.876 0.124
#> SRR1388832 3 0.4654 0.733 0.208 0.000 0.792
#> SRR1394637 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.5058 0.752 0.000 0.756 0.244
#> SRR662918 2 0.3686 0.861 0.000 0.860 0.140
#> SRR817421 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR608264 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1318560 3 0.6299 0.123 0.476 0.000 0.524
#> SRR1454117 2 0.0592 0.924 0.000 0.988 0.012
#> SRR1312684 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.6897 0.205 0.436 0.016 0.548
#> SRR1432743 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1388873 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1353517 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.3340 0.874 0.000 0.880 0.120
#> SRR1396786 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1446564 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1431083 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR655170 2 0.4452 0.815 0.000 0.808 0.192
#> SRR1087825 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR662019 3 0.2356 0.881 0.072 0.000 0.928
#> SRR1349209 3 0.2537 0.876 0.000 0.080 0.920
#> SRR1326161 2 0.3941 0.847 0.000 0.844 0.156
#> SRR1345284 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1416672 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4346 0.822 0.000 0.816 0.184
#> SRR1454328 2 0.0424 0.924 0.000 0.992 0.008
#> SRR1489286 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.3539 0.869 0.888 0.100 0.012
#> SRR1408183 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0592 0.923 0.000 0.012 0.988
#> SRR598452 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR660709 3 0.0892 0.922 0.000 0.020 0.980
#> SRR809444 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.1620 0.943 0.964 0.024 0.012
#> SRR1326292 3 0.4931 0.700 0.232 0.000 0.768
#> SRR657139 3 0.0475 0.927 0.004 0.004 0.992
#> SRR1440744 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR1353555 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.4555 0.750 0.000 0.200 0.800
#> SRR1381775 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1353663 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR819054 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.5016 0.632 0.000 0.240 0.760
#> SRR1331922 1 0.2446 0.918 0.936 0.052 0.012
#> SRR615479 1 0.7542 0.154 0.528 0.040 0.432
#> SRR1375796 2 0.2959 0.887 0.000 0.900 0.100
#> SRR1386991 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1355217 3 0.0424 0.925 0.000 0.008 0.992
#> SRR1356290 3 0.5138 0.670 0.000 0.252 0.748
#> SRR659507 3 0.0424 0.927 0.000 0.008 0.992
#> SRR663296 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0747 0.923 0.000 0.984 0.016
#> SRR661155 2 0.6026 0.522 0.000 0.624 0.376
#> SRR1414727 1 0.1129 0.954 0.976 0.004 0.020
#> SRR663477 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.2959 0.855 0.000 0.100 0.900
#> SRR1377800 3 0.3340 0.831 0.120 0.000 0.880
#> SRR614611 2 0.4654 0.796 0.000 0.792 0.208
#> SRR655052 2 0.4504 0.810 0.000 0.804 0.196
#> SRR1478968 1 0.6154 0.283 0.592 0.000 0.408
#> SRR1351280 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR613951 3 0.0892 0.922 0.000 0.020 0.980
#> SRR1418022 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1408161 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR655040 2 0.4887 0.773 0.000 0.772 0.228
#> SRR810225 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1402328 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0424 0.925 0.000 0.992 0.008
#> SRR1442104 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0237 0.926 0.004 0.000 0.996
#> SRR1414314 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.4178 0.833 0.000 0.828 0.172
#> SRR1478386 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.6260 0.183 0.448 0.000 0.552
#> SRR1310735 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR660260 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1071231 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 3 0.6215 0.145 0.000 0.428 0.572
#> SRR1337173 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1396250 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR659816 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1401379 2 0.0892 0.922 0.000 0.980 0.020
#> SRR600981 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1398335 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1359780 2 0.1860 0.911 0.000 0.948 0.052
#> SRR1490037 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4974 0.762 0.000 0.764 0.236
#> SRR1397156 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1163 0.920 0.000 0.972 0.028
#> SRR1319648 2 0.0747 0.922 0.000 0.984 0.016
#> SRR1092985 1 0.0237 0.967 0.996 0.000 0.004
#> SRR656409 2 0.3116 0.882 0.000 0.892 0.108
#> SRR1468658 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.3551 0.867 0.000 0.868 0.132
#> SRR658057 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.4346 0.822 0.000 0.816 0.184
#> SRR1351480 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1436651 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0424 0.923 0.000 0.992 0.008
#> SRR659911 2 0.2878 0.889 0.000 0.904 0.096
#> SRR1085519 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1464681 2 0.0424 0.924 0.000 0.992 0.008
#> SRR1418880 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.5706 0.520 0.000 0.680 0.320
#> SRR1365426 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 3 0.0661 0.925 0.008 0.004 0.988
#> SRR603236 2 0.5706 0.635 0.000 0.680 0.320
#> SRR660673 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR613426 1 0.4842 0.705 0.776 0.000 0.224
#> SRR613879 2 0.4931 0.767 0.000 0.768 0.232
#> SRR1385101 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR1458852 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR1430489 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0237 0.967 0.996 0.000 0.004
#> SRR1376249 3 0.2261 0.883 0.068 0.000 0.932
#> SRR1321987 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.2796 0.891 0.000 0.908 0.092
#> SRR1390027 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.1643 0.914 0.000 0.956 0.044
#> SRR1383081 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.1163 0.920 0.000 0.972 0.028
#> SRR818600 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351979 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1387054 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1444306 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3941 0.848 0.000 0.844 0.156
#> SRR612767 1 0.3686 0.815 0.860 0.000 0.140
#> SRR1489030 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.0592 0.922 0.000 0.988 0.012
#> SRR615225 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1401839 3 0.2096 0.896 0.052 0.004 0.944
#> SRR1379110 2 0.0237 0.924 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077288 3 0.4346 0.757 0.184 0.000 0.816
#> SRR1331639 2 0.0892 0.922 0.000 0.980 0.020
#> SRR1342782 1 0.3618 0.865 0.884 0.104 0.012
#> SRR1443003 3 0.6079 0.391 0.000 0.388 0.612
#> SRR612839 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0237 0.927 0.000 0.004 0.996
#> SRR1395742 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR664063 1 0.4178 0.772 0.828 0.000 0.172
#> SRR1488214 1 0.1482 0.947 0.968 0.020 0.012
#> SRR654766 3 0.5835 0.412 0.000 0.340 0.660
#> SRR1320321 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0747 0.923 0.000 0.984 0.016
#> SRR1488470 2 0.0000 0.925 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0592 0.926 0.000 0.012 0.988
#> SRR615311 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.4277 0.70563 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1380716 2 0.1474 0.78456 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR612803 1 0.0188 0.95972 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613282 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.4907 0.25383 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1074359 2 0.3969 0.61207 0.000 0.804 0.016 0.180
#> SRR1419258 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403366 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665262 2 0.1743 0.75934 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1499740 3 0.0779 0.88305 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1105057 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1439742 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.1022 0.87739 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR612215 2 0.5088 -0.16519 0.000 0.572 0.004 0.424
#> SRR1094051 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.3157 0.74524 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR1409263 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431288 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.6031 0.07483 0.000 0.564 0.388 0.048
#> SRR614839 4 0.4830 0.62039 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR658433 2 0.1398 0.76923 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1088581 3 0.4933 0.14834 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1328797 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334512 2 0.4477 0.68635 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1471117 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0469 0.77769 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1354955 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.1211 0.87285 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR660066 2 0.2647 0.69445 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1447103 3 0.4289 0.75177 0.052 0.096 0.836 0.016
#> SRR1402153 3 0.3626 0.65340 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR655887 2 0.0592 0.77644 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1408529 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR658707 1 0.0188 0.95972 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384371 2 0.2676 0.73478 0.000 0.896 0.092 0.012
#> SRR1074670 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1375439 3 0.2593 0.83035 0.000 0.016 0.904 0.080
#> SRR1329003 4 0.6709 0.49472 0.172 0.000 0.212 0.616
#> SRR1404837 2 0.1716 0.74844 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1317920 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.4999 -0.07720 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR613999 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.2345 0.87035 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1499764 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0592 0.88513 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1068855 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR612227 3 0.0592 0.88422 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1388809 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1413872 4 0.5668 0.67084 0.000 0.300 0.048 0.652
#> SRR1452864 1 0.0921 0.94005 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1473078 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR615814 2 0.2647 0.70050 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1325225 1 0.4643 0.46751 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1313687 2 0.0895 0.78432 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1358220 2 0.4605 0.66833 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1096662 2 0.3726 0.55317 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1487746 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.5487 0.65862 0.024 0.644 0.004 0.328
#> SRR660164 2 0.1022 0.76926 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR815783 2 0.4164 0.71425 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR809595 3 0.7839 0.37271 0.044 0.136 0.556 0.264
#> SRR1403133 2 0.0895 0.78030 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR815470 2 0.4907 -0.11282 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1344382 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.5159 0.63820 0.000 0.156 0.756 0.088
#> SRR1478362 4 0.4697 0.65014 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1392186 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1347937 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.2281 0.81917 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR612683 2 0.2011 0.73346 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1392901 3 0.1940 0.84237 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1077805 3 0.0336 0.88783 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1360402 2 0.0336 0.77885 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1406112 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0376 0.88798 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR656247 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.4489 0.60806 0.004 0.804 0.048 0.144
#> SRR808244 4 0.5203 0.31540 0.008 0.000 0.416 0.576
#> SRR1387240 2 0.2011 0.78192 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1408595 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.5298 0.39880 0.016 0.000 0.372 0.612
#> SRR1435248 2 0.0707 0.78399 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1419110 3 0.2596 0.81846 0.000 0.068 0.908 0.024
#> SRR1408682 2 0.2586 0.75799 0.000 0.912 0.040 0.048
#> SRR1317134 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0817 0.78396 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1453911 2 0.4781 0.67274 0.000 0.660 0.004 0.336
#> SRR603164 3 0.4675 0.54220 0.000 0.244 0.736 0.020
#> SRR1383259 2 0.3837 0.73467 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1330854 3 0.4989 0.11846 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1468162 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361546 3 0.4748 0.56903 0.268 0.000 0.716 0.016
#> SRR1486156 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2760 0.67675 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR615635 2 0.0592 0.77664 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1385411 2 0.4713 0.64886 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1342739 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 4 0.4877 0.60262 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1464601 2 0.4741 0.67789 0.000 0.668 0.004 0.328
#> SRR1071594 2 0.2111 0.78176 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR612539 2 0.4948 -0.21101 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR602010 2 0.3333 0.70791 0.032 0.876 0.004 0.088
#> SRR810249 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR818773 1 0.5361 0.65522 0.724 0.000 0.208 0.068
#> SRR1336569 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0921 0.77222 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1442754 3 0.4907 0.27796 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1334247 3 0.0336 0.88715 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR661639 1 0.0921 0.93913 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR613222 3 0.7228 -0.00948 0.000 0.340 0.504 0.156
#> SRR1459937 4 0.4855 0.44626 0.000 0.004 0.352 0.644
#> SRR2185018 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0707 0.77794 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR809348 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR661074 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349851 1 0.0921 0.93927 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1405123 2 0.4642 0.45384 0.000 0.740 0.020 0.240
#> SRR661096 2 0.2216 0.72675 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1320225 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.6742 0.48317 0.160 0.000 0.232 0.608
#> SRR1307677 2 0.2011 0.78174 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1466512 2 0.4222 0.70983 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR658212 2 0.2081 0.73502 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1430525 3 0.0592 0.88423 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1344422 4 0.6419 -0.35362 0.000 0.420 0.068 0.512
#> SRR1353924 2 0.0336 0.77885 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1314832 1 0.4776 0.37850 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1487570 4 0.4761 0.32857 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR627431 4 0.4830 0.62039 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1418561 3 0.0376 0.88801 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1448029 3 0.5564 0.54193 0.000 0.216 0.708 0.076
#> SRR813802 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1118 0.76719 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1435311 2 0.4522 0.68047 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR612395 3 0.2662 0.80259 0.000 0.084 0.900 0.016
#> SRR603116 2 0.2714 0.70717 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR1323152 3 0.0336 0.88703 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1368264 2 0.4818 0.73325 0.068 0.788 0.004 0.140
#> SRR1326624 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327702 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.4830 0.62039 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1486799 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4730 0.54018 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR815044 4 0.4855 0.62190 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1338560 2 0.0188 0.78158 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615862 2 0.4877 -0.11979 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1480038 2 0.0188 0.77990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659436 3 0.0592 0.88422 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR613699 2 0.4985 -0.30641 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1436563 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2973 0.65648 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1330327 4 0.6364 0.67733 0.000 0.204 0.144 0.652
#> SRR1489950 2 0.2868 0.76763 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1431927 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.2216 0.82656 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR600656 4 0.6316 0.66938 0.000 0.184 0.156 0.660
#> SRR658766 4 0.6280 0.66066 0.000 0.316 0.080 0.604
#> SRR655946 3 0.0921 0.87459 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR817282 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0336 0.88811 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1406418 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.0707 0.88411 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1471965 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0592 0.88422 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR662498 3 0.0469 0.88570 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1376764 3 0.0188 0.88828 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1377006 3 0.1637 0.85592 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR656860 4 0.4898 0.59838 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1480547 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1452515 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.0336 0.77885 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615273 1 0.0336 0.95627 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR601695 4 0.4855 0.61333 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR820907 2 0.0707 0.78354 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR812773 1 0.2704 0.82014 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1405984 2 0.3486 0.75071 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1472794 2 0.0707 0.77486 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1365448 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0469 0.88671 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1435626 3 0.0336 0.88715 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1080766 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1377862 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0188 0.88828 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467966 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320579 3 0.1474 0.86034 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1319710 2 0.1022 0.78469 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1326604 2 0.3837 0.73470 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1098879 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR662245 3 0.5088 0.42662 0.000 0.288 0.688 0.024
#> SRR1074719 2 0.3172 0.76081 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR816226 4 0.4624 0.30016 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR601387 2 0.2408 0.71633 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR614575 2 0.2345 0.71354 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1353900 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR662906 2 0.5140 0.52694 0.000 0.760 0.144 0.096
#> SRR1350832 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1403280 2 0.1389 0.78421 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1313969 4 0.5237 0.43930 0.000 0.016 0.356 0.628
#> SRR1388528 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319753 2 0.4695 0.56066 0.252 0.732 0.004 0.012
#> SRR818901 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR607067 4 0.4746 0.64218 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1391420 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4679 0.65664 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR661961 3 0.0592 0.88422 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR658259 2 0.0921 0.77165 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1310476 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4454 0.68851 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1365034 2 0.2216 0.73388 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1478053 2 0.0707 0.77486 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1475300 2 0.3688 0.74184 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1328101 2 0.1004 0.77653 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1322900 3 0.4431 0.52539 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR1309942 2 0.2973 0.76624 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1345760 4 0.4920 0.41559 0.000 0.004 0.368 0.628
#> SRR1435418 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4382 0.03497 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1443436 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1004 0.77653 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR661469 3 0.6000 0.21192 0.000 0.356 0.592 0.052
#> SRR1500323 2 0.1302 0.76755 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1356705 2 0.4522 0.68240 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1464915 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.3533 0.78711 0.080 0.000 0.864 0.056
#> SRR1350435 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1368072 2 0.2081 0.78068 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR601815 2 0.3610 0.57106 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR613330 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.4431 0.69006 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1394190 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.1389 0.92169 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR816382 3 0.0469 0.88570 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1318839 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1432390 4 0.4679 0.65243 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR613126 4 0.5217 0.63212 0.000 0.380 0.012 0.608
#> SRR1089424 2 0.2216 0.77897 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1347214 2 0.4382 0.69617 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1309556 1 0.6763 0.40454 0.564 0.116 0.000 0.320
#> SRR1456027 4 0.2297 0.50653 0.032 0.024 0.012 0.932
#> SRR1400551 3 0.0188 0.88828 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320469 1 0.4086 0.69337 0.776 0.000 0.216 0.008
#> SRR614251 4 0.5414 0.63259 0.000 0.376 0.020 0.604
#> SRR1454310 2 0.0817 0.78420 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR615105 4 0.6448 0.67798 0.000 0.252 0.120 0.628
#> SRR1433290 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.4837 0.65486 0.000 0.348 0.004 0.648
#> SRR601671 2 0.1211 0.76567 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR663874 2 0.2125 0.74334 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1409130 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR659696 4 0.4730 0.64560 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1408249 2 0.4605 0.66833 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR663284 2 0.3074 0.64898 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1402794 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 4 0.5038 0.66072 0.000 0.336 0.012 0.652
#> SRR1348040 4 0.8060 0.21844 0.340 0.008 0.248 0.404
#> SRR1489610 2 0.3486 0.75259 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1488091 2 0.1637 0.78436 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1499566 2 0.0895 0.77457 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1361480 2 0.3172 0.62660 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1444501 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415773 2 0.1489 0.76703 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR1388832 3 0.3626 0.69488 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1394637 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 4 0.4888 0.59708 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR662918 4 0.4916 0.58846 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR817421 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400823 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3569 0.74847 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR608264 3 0.0469 0.88696 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1318560 3 0.1022 0.87000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1454117 2 0.0188 0.77990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312684 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 4 0.7691 0.59439 0.188 0.244 0.020 0.548
#> SRR1432743 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1353517 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0469 0.88570 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1406008 2 0.1743 0.75940 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1396786 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1446564 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3335 0.73441 0.000 0.128 0.856 0.016
#> SRR1431083 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4817 0.63188 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR655170 4 0.4866 0.61452 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1087825 4 0.5167 0.46171 0.000 0.016 0.340 0.644
#> SRR662019 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349209 3 0.4977 0.10598 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR1326161 2 0.1557 0.75757 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1345284 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1416672 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.4888 0.59735 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1454328 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1489286 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5827 0.52215 0.632 0.052 0.000 0.316
#> SRR1408183 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660709 4 0.5368 0.66012 0.000 0.340 0.024 0.636
#> SRR809444 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1940 0.78122 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1375774 1 0.4406 0.62665 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1326292 4 0.6851 0.44886 0.148 0.000 0.268 0.584
#> SRR657139 3 0.6116 0.25803 0.024 0.020 0.588 0.368
#> SRR1440744 2 0.1118 0.76713 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1353555 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.5113 0.43302 0.000 0.024 0.292 0.684
#> SRR1381775 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0817 0.78420 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR658989 3 0.0469 0.88570 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1353663 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR819054 2 0.0336 0.78227 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1367988 4 0.5565 0.44920 0.000 0.032 0.344 0.624
#> SRR1331922 1 0.4477 0.60925 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR615479 2 0.8763 -0.33941 0.340 0.356 0.040 0.264
#> SRR1375796 2 0.1792 0.74576 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1386991 2 0.5284 0.63522 0.000 0.616 0.016 0.368
#> SRR1355217 3 0.0657 0.88479 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1356290 3 0.4364 0.60522 0.000 0.220 0.764 0.016
#> SRR659507 3 0.0469 0.88570 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR663296 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0592 0.77664 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR661155 4 0.4643 0.65577 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1414727 3 0.5849 0.53009 0.052 0.004 0.656 0.288
#> SRR663477 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0469 0.88671 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR614611 4 0.4830 0.62039 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR655052 4 0.4855 0.65417 0.000 0.352 0.004 0.644
#> SRR1478968 4 0.5496 0.44445 0.016 0.008 0.344 0.632
#> SRR1351280 2 0.4679 0.65492 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR613951 4 0.5754 0.66944 0.000 0.316 0.048 0.636
#> SRR1418022 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.5040 0.43732 0.000 0.008 0.364 0.628
#> SRR1408161 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0817 0.88155 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR655040 4 0.4746 0.64125 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR810225 2 0.0817 0.78434 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1325377 2 0.0336 0.78227 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR617829 3 0.6833 0.20504 0.000 0.272 0.584 0.144
#> SRR1402328 2 0.3172 0.76078 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1480455 2 0.1118 0.78529 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1442104 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453416 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414314 2 0.3356 0.75486 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR663026 2 0.2530 0.70893 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1478386 2 0.2011 0.78130 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1458683 4 0.4855 0.35200 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1370572 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.4950 0.41061 0.376 0.000 0.620 0.004
#> SRR1310735 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5453 0.49688 0.000 0.032 0.320 0.648
#> SRR660260 4 0.4925 0.31989 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1071231 2 0.4277 0.70572 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1459125 4 0.6373 0.59077 0.000 0.116 0.248 0.636
#> SRR1337173 3 0.0937 0.88006 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1396250 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2166376 3 0.0707 0.88302 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR659816 4 0.7153 0.62852 0.000 0.308 0.160 0.532
#> SRR1401379 2 0.1211 0.76965 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR600981 4 0.5596 0.49014 0.000 0.036 0.332 0.632
#> SRR1398335 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4134 0.70692 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR660115 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1359780 2 0.0817 0.77322 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1490037 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.4916 0.57683 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1397156 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0895 0.77770 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1319648 2 0.4718 0.70267 0.000 0.708 0.012 0.280
#> SRR1092985 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.4898 0.59646 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1468658 3 0.3764 0.66066 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1390437 4 0.4817 0.62492 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR658057 2 0.1022 0.76959 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR612635 4 0.4933 0.55630 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1351480 2 0.4661 0.65849 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1436651 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0895 0.78018 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR614263 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.4522 0.68047 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR659911 2 0.2011 0.73491 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1085519 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442928 2 0.4855 0.66014 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1464681 4 0.4370 0.59715 0.004 0.148 0.040 0.808
#> SRR1418880 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.7165 0.45613 0.000 0.488 0.140 0.372
#> SRR1365426 1 0.1262 0.93662 0.968 0.008 0.008 0.016
#> SRR1487947 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 4 0.7655 0.60427 0.212 0.108 0.072 0.608
#> SRR603236 2 0.3392 0.70227 0.000 0.872 0.072 0.056
#> SRR660673 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.4018 0.73855 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR663807 2 0.1474 0.75680 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1087245 2 0.2469 0.77619 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1339108 2 0.4697 0.65116 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR613426 4 0.4713 0.35861 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR613879 4 0.4916 0.57184 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1385101 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.4679 0.65492 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1458852 2 0.0000 0.78076 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.1792 0.89943 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1349231 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1321987 2 0.3356 0.75539 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR662653 2 0.1211 0.76920 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1390027 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0921 0.77601 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1383081 2 0.0188 0.78158 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2166960 2 0.0336 0.77885 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR605101 2 0.1637 0.75696 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR818600 2 0.0188 0.78226 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367715 2 0.3400 0.75401 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1351979 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1387054 3 0.0188 0.88843 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1444306 3 0.0469 0.88570 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1322662 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1474 0.75767 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR612767 4 0.5050 0.26547 0.408 0.004 0.000 0.588
#> SRR1489030 2 0.0336 0.77885 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1430375 2 0.4741 0.67789 0.000 0.668 0.004 0.328
#> SRR615225 4 0.4830 0.38911 0.000 0.000 0.392 0.608
#> SRR1401839 3 0.5366 0.52518 0.276 0.000 0.684 0.040
#> SRR1379110 2 0.4500 0.68317 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1077288 3 0.0188 0.88888 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331639 4 0.4697 0.65104 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1342782 2 0.7382 0.50623 0.144 0.520 0.008 0.328
#> SRR1443003 3 0.3806 0.70862 0.000 0.156 0.824 0.020
#> SRR612839 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.1118 0.87135 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1395742 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.4843 0.38183 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR664063 1 0.2153 0.90215 0.936 0.036 0.008 0.020
#> SRR1488214 1 0.3873 0.72262 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR654766 4 0.5657 0.50938 0.000 0.044 0.312 0.644
#> SRR1320321 2 0.0469 0.78291 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1071955 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.96298 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0188 0.77990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488470 2 0.0817 0.77585 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1389497 3 0.0000 0.88890 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0469 0.88713 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR615311 1 0.3975 0.65616 0.760 0.000 0.000 0.240
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.2424 0.66679 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1380716 2 0.2074 0.68324 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR612803 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.4297 0.03953 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1074359 4 0.4040 0.36556 0.000 0.260 0.016 0.724 0.000
#> SRR1419258 3 0.3326 0.76561 0.000 0.000 0.824 0.024 0.152
#> SRR1403366 3 0.2843 0.77506 0.000 0.000 0.848 0.008 0.144
#> SRR665262 2 0.7534 0.00559 0.000 0.496 0.172 0.092 0.240
#> SRR1499740 3 0.1251 0.79919 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1105057 2 0.3636 0.55743 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1439742 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.2853 0.76442 0.000 0.000 0.876 0.072 0.052
#> SRR612215 5 0.7783 0.22226 0.000 0.312 0.056 0.308 0.324
#> SRR1094051 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.4535 0.71701 0.072 0.000 0.760 0.008 0.160
#> SRR1409263 3 0.2929 0.77119 0.000 0.000 0.840 0.008 0.152
#> SRR1431288 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.7110 -0.11801 0.000 0.444 0.164 0.036 0.356
#> SRR614839 5 0.6718 0.15379 0.000 0.248 0.000 0.368 0.384
#> SRR658433 2 0.3218 0.64465 0.000 0.848 0.016 0.012 0.124
#> SRR1088581 4 0.4096 0.54404 0.000 0.000 0.176 0.772 0.052
#> SRR1328797 3 0.1638 0.80430 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR1334512 2 0.3707 0.55815 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1471117 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.1197 0.68805 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1354955 3 0.1012 0.80508 0.000 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR654802 3 0.4768 0.52497 0.000 0.000 0.592 0.024 0.384
#> SRR660066 2 0.4380 0.45754 0.000 0.708 0.000 0.032 0.260
#> SRR1447103 3 0.4561 0.69740 0.040 0.084 0.804 0.012 0.060
#> SRR1402153 3 0.3522 0.58894 0.000 0.212 0.780 0.004 0.004
#> SRR655887 2 0.1341 0.68809 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1408529 3 0.1410 0.80574 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR658707 1 0.2790 0.82643 0.880 0.000 0.000 0.052 0.068
#> SRR1384371 2 0.3943 0.55792 0.000 0.800 0.156 0.016 0.028
#> SRR1074670 3 0.1444 0.80720 0.000 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR1375439 3 0.5645 0.55359 0.000 0.124 0.700 0.040 0.136
#> SRR1329003 4 0.2696 0.59515 0.072 0.000 0.024 0.892 0.012
#> SRR1404837 2 0.4449 0.58485 0.000 0.792 0.032 0.112 0.064
#> SRR1317920 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.2719 0.59006 0.000 0.000 0.144 0.852 0.004
#> SRR613999 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0880 0.91886 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1499764 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.1386 0.80410 0.000 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR1068855 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.2674 0.78450 0.000 0.000 0.868 0.012 0.120
#> SRR612227 3 0.0912 0.80399 0.000 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1388809 2 0.3796 0.52893 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1413872 4 0.1608 0.59938 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1452864 1 0.0794 0.92466 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1473078 3 0.0510 0.80783 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615814 2 0.4235 0.37204 0.000 0.656 0.000 0.008 0.336
#> SRR1325225 4 0.3086 0.49732 0.180 0.000 0.004 0.816 0.000
#> SRR1313687 2 0.1012 0.69907 0.000 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1358220 2 0.4256 0.32076 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1096662 2 0.3970 0.60525 0.000 0.800 0.000 0.096 0.104
#> SRR1487746 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.5852 0.23025 0.000 0.524 0.104 0.000 0.372
#> SRR660164 2 0.1851 0.66998 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR815783 2 0.2732 0.65521 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR809595 3 0.5221 0.54608 0.004 0.128 0.696 0.000 0.172
#> SRR1403133 2 0.1697 0.69244 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR815470 4 0.3231 0.47203 0.000 0.196 0.004 0.800 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.7704 0.12055 0.000 0.212 0.484 0.108 0.196
#> SRR1478362 4 0.2358 0.57969 0.000 0.104 0.008 0.888 0.000
#> SRR1392186 2 0.3612 0.55913 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1347937 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.3999 0.37054 0.000 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR612683 2 0.3123 0.58653 0.000 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1392901 4 0.4627 0.13499 0.000 0.000 0.444 0.544 0.012
#> SRR1077805 3 0.4733 0.58523 0.000 0.012 0.700 0.256 0.032
#> SRR1360402 2 0.0963 0.69181 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1406112 3 0.0510 0.80585 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1355352 3 0.3242 0.75756 0.000 0.000 0.816 0.012 0.172
#> SRR656247 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.4882 0.13809 0.000 0.540 0.008 0.012 0.440
#> SRR808244 4 0.5164 0.48275 0.000 0.000 0.084 0.660 0.256
#> SRR1387240 2 0.2966 0.63011 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1408595 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.1732 0.62113 0.000 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1435248 2 0.0794 0.69765 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1419110 3 0.3859 0.73682 0.000 0.100 0.820 0.008 0.072
#> SRR1408682 2 0.6848 0.23443 0.000 0.592 0.172 0.160 0.076
#> SRR1317134 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.1341 0.69523 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1453911 5 0.6570 0.14185 0.000 0.348 0.212 0.000 0.440
#> SRR603164 3 0.4865 0.40965 0.000 0.268 0.680 0.004 0.048
#> SRR1383259 2 0.3814 0.59965 0.000 0.720 0.000 0.004 0.276
#> SRR1330854 3 0.4015 0.45623 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4242 0.33377 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1468162 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0566 0.80493 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1361546 3 0.6440 0.12899 0.436 0.012 0.468 0.040 0.044
#> SRR1486156 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.4040 0.47847 0.000 0.724 0.000 0.016 0.260
#> SRR615635 2 0.1197 0.68779 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1385411 2 0.4434 0.32554 0.000 0.536 0.000 0.004 0.460
#> SRR1342739 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0898 0.80814 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR662126 4 0.6767 -0.23224 0.000 0.348 0.000 0.380 0.272
#> SRR1464601 2 0.4114 0.56803 0.000 0.732 0.024 0.000 0.244
#> SRR1071594 2 0.2221 0.68148 0.000 0.912 0.052 0.000 0.036
#> SRR612539 2 0.6561 -0.12072 0.000 0.452 0.000 0.216 0.332
#> SRR602010 2 0.8143 0.04225 0.100 0.508 0.064 0.092 0.236
#> SRR810249 2 0.3774 0.53346 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR818773 1 0.4777 0.54702 0.680 0.000 0.268 0.000 0.052
#> SRR1336569 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.1430 0.68609 0.000 0.944 0.004 0.000 0.052
#> SRR1442754 3 0.5467 0.58728 0.204 0.000 0.672 0.008 0.116
#> SRR1334247 3 0.0703 0.80292 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR661639 1 0.5082 0.49471 0.664 0.000 0.000 0.076 0.260
#> SRR613222 5 0.6765 0.24699 0.000 0.344 0.072 0.072 0.512
#> SRR1459937 4 0.1608 0.62207 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0963 0.69286 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR809348 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.1124 0.80760 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR661074 3 0.2723 0.78283 0.000 0.000 0.864 0.012 0.124
#> SRR1349851 1 0.0510 0.93359 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1405123 2 0.4848 0.39258 0.000 0.656 0.004 0.036 0.304
#> SRR661096 2 0.5264 0.36658 0.000 0.652 0.000 0.092 0.256
#> SRR1320225 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.2721 0.59808 0.068 0.000 0.028 0.892 0.012
#> SRR1307677 2 0.2020 0.69307 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1466512 2 0.3210 0.61230 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR658212 2 0.4088 0.44471 0.000 0.688 0.000 0.008 0.304
#> SRR1430525 3 0.4464 0.27919 0.000 0.000 0.584 0.408 0.008
#> SRR1344422 5 0.5224 0.20243 0.000 0.276 0.000 0.080 0.644
#> SRR1353924 2 0.0703 0.69414 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1314832 1 0.3816 0.53526 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000
#> SRR1487570 4 0.1704 0.59255 0.068 0.000 0.004 0.928 0.000
#> SRR627431 4 0.6747 -0.21389 0.000 0.260 0.000 0.376 0.364
#> SRR1418561 3 0.2352 0.79602 0.004 0.000 0.896 0.008 0.092
#> SRR1448029 3 0.4933 0.46686 0.000 0.228 0.692 0.000 0.080
#> SRR813802 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2074 0.66617 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1435311 2 0.3876 0.51251 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR612395 3 0.3673 0.71731 0.000 0.092 0.836 0.012 0.060
#> SRR603116 2 0.6141 0.24056 0.000 0.600 0.012 0.156 0.232
#> SRR1323152 3 0.2727 0.75022 0.000 0.000 0.868 0.116 0.016
#> SRR1368264 2 0.4427 0.60227 0.076 0.796 0.032 0.000 0.096
#> SRR1326624 1 0.0162 0.94321 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429265 3 0.1331 0.80726 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1327702 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 5 0.6719 0.15001 0.000 0.248 0.000 0.372 0.380
#> SRR1486799 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4477 0.58142 0.000 0.708 0.000 0.040 0.252
#> SRR815044 2 0.6725 -0.24795 0.000 0.400 0.000 0.344 0.256
#> SRR1338560 2 0.0963 0.69559 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR615862 2 0.5820 0.20183 0.000 0.572 0.000 0.120 0.308
#> SRR1480038 2 0.1197 0.69294 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR659436 3 0.1251 0.79919 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR613699 2 0.6342 -0.04488 0.000 0.476 0.000 0.168 0.356
#> SRR1436563 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.5136 0.38355 0.000 0.660 0.000 0.080 0.260
#> SRR1330327 4 0.1764 0.62311 0.000 0.008 0.064 0.928 0.000
#> SRR1489950 2 0.1197 0.69647 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1431927 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.1331 0.80878 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1444002 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.5668 0.06002 0.000 0.000 0.416 0.504 0.080
#> SRR600656 4 0.1628 0.62221 0.000 0.008 0.056 0.936 0.000
#> SRR658766 4 0.7110 -0.17479 0.000 0.216 0.020 0.388 0.376
#> SRR655946 3 0.4169 0.59799 0.000 0.000 0.732 0.240 0.028
#> SRR817282 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.3391 0.74756 0.000 0.000 0.800 0.012 0.188
#> SRR1406418 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.3124 0.77329 0.000 0.008 0.840 0.008 0.144
#> SRR1471965 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.1808 0.79396 0.000 0.008 0.936 0.012 0.044
#> SRR662498 3 0.0880 0.80170 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1376764 3 0.1012 0.80324 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR1377006 4 0.5613 0.28582 0.000 0.020 0.344 0.588 0.048
#> SRR656860 2 0.6820 -0.33838 0.000 0.352 0.000 0.332 0.316
#> SRR1480547 2 0.3661 0.57961 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1452515 3 0.1668 0.79660 0.000 0.000 0.940 0.028 0.032
#> SRR1324390 2 0.0794 0.69331 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR615273 1 0.1525 0.90267 0.948 0.000 0.012 0.036 0.004
#> SRR601695 4 0.6554 -0.09337 0.000 0.252 0.000 0.476 0.272
#> SRR820907 2 0.0703 0.69932 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR812773 1 0.4839 0.52150 0.668 0.004 0.288 0.000 0.040
#> SRR1405984 2 0.2074 0.68363 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1472794 2 0.1341 0.68809 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1365448 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.3757 0.72855 0.000 0.000 0.772 0.020 0.208
#> SRR1435626 3 0.3880 0.73441 0.000 0.028 0.824 0.036 0.112
#> SRR1080766 2 0.3336 0.59083 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1377862 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0404 0.80478 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1467966 3 0.1956 0.80110 0.000 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1320579 4 0.4101 0.38304 0.000 0.000 0.332 0.664 0.004
#> SRR1319710 2 0.1282 0.69655 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1326604 2 0.2377 0.68187 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1098879 3 0.1205 0.80823 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR662245 3 0.6710 0.07263 0.000 0.316 0.420 0.000 0.264
#> SRR1074719 2 0.1732 0.69174 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR816226 4 0.2378 0.59279 0.048 0.000 0.000 0.904 0.048
#> SRR601387 2 0.5470 0.32209 0.000 0.628 0.000 0.104 0.268
#> SRR614575 2 0.4873 0.42703 0.000 0.688 0.000 0.068 0.244
#> SRR1353900 2 0.3210 0.61951 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR662906 2 0.5023 0.30692 0.000 0.616 0.024 0.012 0.348
#> SRR1350832 2 0.3579 0.59813 0.000 0.756 0.000 0.004 0.240
#> SRR1403280 2 0.1043 0.69906 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1313969 4 0.1608 0.62207 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0162 0.94314 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR655399 3 0.2997 0.77147 0.000 0.000 0.840 0.012 0.148
#> SRR1319753 2 0.4671 0.45584 0.200 0.740 0.020 0.000 0.040
#> SRR818901 3 0.0290 0.80735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR607067 4 0.6673 -0.14841 0.000 0.252 0.000 0.432 0.316
#> SRR1391420 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4201 0.43108 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR661961 3 0.3291 0.74308 0.000 0.000 0.848 0.088 0.064
#> SRR658259 2 0.1965 0.66681 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1310476 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3305 0.59310 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1365034 2 0.2291 0.68136 0.000 0.908 0.000 0.036 0.056
#> SRR1478053 2 0.0880 0.69713 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1475300 2 0.1544 0.69591 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1328101 2 0.5999 0.32346 0.000 0.648 0.204 0.032 0.116
#> SRR1322900 3 0.5884 0.29589 0.388 0.000 0.528 0.072 0.012
#> SRR1309942 2 0.1197 0.69897 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1345760 4 0.1732 0.62105 0.000 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.6226 0.15466 0.000 0.156 0.000 0.504 0.340
#> SRR1443436 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.2758 0.66978 0.000 0.888 0.024 0.012 0.076
#> SRR661469 3 0.7654 -0.10135 0.000 0.292 0.452 0.088 0.168
#> SRR1500323 2 0.3204 0.65478 0.000 0.860 0.024 0.016 0.100
#> SRR1356705 2 0.3586 0.56329 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1464915 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 4 0.5262 0.15099 0.032 0.000 0.424 0.536 0.008
#> SRR1350435 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.1168 0.80186 0.000 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1368072 2 0.1410 0.69526 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR601815 2 0.6016 0.14626 0.000 0.548 0.000 0.140 0.312
#> SRR613330 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6686 0.17879 0.000 0.536 0.032 0.296 0.136
#> SRR1394190 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0162 0.94311 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR816382 3 0.3948 0.70733 0.000 0.096 0.824 0.024 0.056
#> SRR1318839 3 0.2416 0.79249 0.000 0.000 0.888 0.012 0.100
#> SRR1432390 4 0.1956 0.59832 0.000 0.076 0.008 0.916 0.000
#> SRR613126 4 0.7183 -0.21441 0.000 0.300 0.016 0.384 0.300
#> SRR1089424 2 0.1341 0.69915 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1347214 2 0.2852 0.64144 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1309556 5 0.6603 0.07200 0.392 0.148 0.012 0.000 0.448
#> SRR1456027 4 0.2463 0.59255 0.004 0.000 0.008 0.888 0.100
#> SRR1400551 3 0.0162 0.80582 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1320469 1 0.5582 0.54763 0.660 0.000 0.124 0.008 0.208
#> SRR614251 5 0.6837 0.17337 0.000 0.248 0.004 0.340 0.408
#> SRR1454310 2 0.1043 0.69760 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR615105 4 0.6874 0.22923 0.000 0.132 0.052 0.544 0.272
#> SRR1433290 3 0.0290 0.80725 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2166064 4 0.1608 0.59938 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR601671 2 0.2424 0.64015 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR663874 2 0.4796 0.47351 0.000 0.720 0.028 0.028 0.224
#> SRR1409130 2 0.3730 0.54300 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR659696 4 0.2605 0.54118 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1408249 2 0.4227 0.34271 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR663284 2 0.4464 0.24268 0.000 0.584 0.000 0.008 0.408
#> SRR1402794 3 0.0609 0.80792 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR614852 4 0.2953 0.50416 0.000 0.012 0.000 0.844 0.144
#> SRR1348040 4 0.4086 0.58895 0.036 0.000 0.088 0.820 0.056
#> SRR1489610 2 0.1732 0.69153 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1488091 2 0.1430 0.69528 0.000 0.944 0.004 0.000 0.052
#> SRR1499566 2 0.2852 0.60783 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1361480 2 0.3239 0.63842 0.000 0.852 0.000 0.068 0.080
#> SRR1444501 3 0.1012 0.80342 0.000 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1415773 2 0.4135 0.58119 0.000 0.800 0.108 0.008 0.084
#> SRR1388832 3 0.6345 0.42352 0.304 0.000 0.536 0.008 0.152
#> SRR1394637 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.6764 -0.29435 0.000 0.372 0.000 0.360 0.268
#> SRR662918 2 0.6778 -0.29474 0.000 0.380 0.000 0.340 0.280
#> SRR817421 3 0.1484 0.80728 0.000 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR1400823 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2773 0.67319 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR608264 3 0.0510 0.80707 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1318560 3 0.4803 0.70044 0.068 0.000 0.736 0.012 0.184
#> SRR1454117 2 0.0794 0.69690 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1312684 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.7979 0.09650 0.076 0.168 0.012 0.364 0.380
#> SRR1432743 3 0.2260 0.78169 0.000 0.000 0.908 0.064 0.028
#> SRR1388873 2 0.3424 0.57963 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1353517 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.1331 0.79676 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR1406008 2 0.4071 0.58700 0.000 0.788 0.024 0.020 0.168
#> SRR1396786 2 0.3424 0.58108 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1446564 1 0.0404 0.93720 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318465 3 0.4159 0.63094 0.000 0.172 0.780 0.012 0.036
#> SRR1431083 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.6477 -0.04304 0.000 0.252 0.000 0.496 0.252
#> SRR655170 2 0.6788 -0.30610 0.000 0.372 0.000 0.284 0.344
#> SRR1087825 4 0.1809 0.62273 0.000 0.012 0.060 0.928 0.000
#> SRR662019 3 0.4010 0.72228 0.108 0.000 0.812 0.068 0.012
#> SRR1349209 4 0.5600 0.43943 0.000 0.000 0.116 0.616 0.268
#> SRR1326161 2 0.3452 0.52709 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1345284 2 0.3661 0.55348 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1416672 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.6804 -0.23120 0.000 0.300 0.000 0.368 0.332
#> SRR1454328 2 0.3143 0.61663 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1489286 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5375 0.33216 0.568 0.064 0.000 0.000 0.368
#> SRR1408183 3 0.0404 0.80478 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1084369 3 0.3590 0.72517 0.000 0.008 0.828 0.128 0.036
#> SRR598452 3 0.1502 0.80577 0.000 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR660709 4 0.5001 0.33650 0.000 0.080 0.004 0.700 0.216
#> SRR809444 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1410 0.69461 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1375774 1 0.3966 0.54016 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1326292 4 0.2741 0.60013 0.064 0.000 0.032 0.892 0.012
#> SRR657139 4 0.6928 0.02452 0.004 0.000 0.284 0.356 0.356
#> SRR1440744 2 0.1478 0.68213 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1353555 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 5 0.7081 -0.14273 0.000 0.044 0.160 0.300 0.496
#> SRR1381775 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0880 0.69940 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR658989 3 0.0703 0.80292 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1353663 1 0.0162 0.94333 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR811771 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.3152 0.77429 0.000 0.000 0.840 0.024 0.136
#> SRR819054 2 0.0609 0.69870 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1367988 4 0.1671 0.62179 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1331922 1 0.4171 0.43812 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR615479 5 0.9809 0.21151 0.124 0.224 0.180 0.200 0.272
#> SRR1375796 2 0.3196 0.57779 0.000 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR1386991 5 0.6669 0.19609 0.000 0.308 0.220 0.004 0.468
#> SRR1355217 3 0.3538 0.73361 0.000 0.080 0.848 0.016 0.056
#> SRR1356290 3 0.6504 0.08456 0.000 0.356 0.448 0.000 0.196
#> SRR659507 3 0.0992 0.80222 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR663296 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.1792 0.67274 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR661155 4 0.1952 0.59274 0.000 0.084 0.000 0.912 0.004
#> SRR1414727 3 0.5070 0.65113 0.124 0.000 0.712 0.004 0.160
#> SRR663477 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0992 0.80400 0.000 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR1377800 3 0.3242 0.75756 0.000 0.000 0.816 0.012 0.172
#> SRR614611 4 0.6785 -0.22009 0.000 0.284 0.000 0.376 0.340
#> SRR655052 4 0.1952 0.59447 0.000 0.084 0.004 0.912 0.000
#> SRR1478968 4 0.1764 0.62218 0.008 0.000 0.064 0.928 0.000
#> SRR1351280 2 0.3662 0.56932 0.000 0.744 0.000 0.004 0.252
#> SRR613951 4 0.3010 0.50338 0.000 0.172 0.000 0.824 0.004
#> SRR1418022 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.6215 0.27878 0.000 0.004 0.136 0.520 0.340
#> SRR1408161 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.3922 0.73962 0.000 0.000 0.780 0.040 0.180
#> SRR655040 4 0.6651 -0.13530 0.000 0.248 0.000 0.440 0.312
#> SRR810225 2 0.0880 0.69773 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1325377 2 0.0290 0.69852 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR617829 3 0.6980 0.25479 0.000 0.152 0.528 0.272 0.048
#> SRR1402328 2 0.1341 0.69538 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1480455 2 0.1914 0.69466 0.000 0.924 0.000 0.016 0.060
#> SRR1442104 3 0.4587 0.70784 0.000 0.000 0.728 0.068 0.204
#> SRR1453416 1 0.0162 0.94324 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1481396 3 0.1877 0.80283 0.000 0.000 0.924 0.012 0.064
#> SRR1414314 2 0.2424 0.66718 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR663026 2 0.5179 0.35022 0.000 0.640 0.000 0.072 0.288
#> SRR1478386 2 0.2280 0.68813 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1458683 4 0.1952 0.61920 0.000 0.000 0.084 0.912 0.004
#> SRR1370572 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.4193 0.48873 0.304 0.000 0.684 0.000 0.012
#> SRR1310735 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.1704 0.62280 0.000 0.004 0.068 0.928 0.000
#> SRR660260 3 0.6937 -0.22027 0.000 0.004 0.360 0.344 0.292
#> SRR1071231 2 0.2813 0.64387 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1459125 4 0.2919 0.60818 0.000 0.024 0.104 0.868 0.004
#> SRR1337173 3 0.1830 0.78042 0.000 0.068 0.924 0.000 0.008
#> SRR1396250 3 0.2249 0.79477 0.000 0.000 0.896 0.008 0.096
#> SRR2166376 3 0.3882 0.71635 0.000 0.000 0.756 0.020 0.224
#> SRR659816 4 0.7554 -0.17076 0.000 0.208 0.052 0.380 0.360
#> SRR1401379 2 0.2574 0.66143 0.000 0.876 0.000 0.012 0.112
#> SRR600981 4 0.7100 0.32375 0.000 0.036 0.184 0.484 0.296
#> SRR1398335 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.6206 0.28612 0.000 0.548 0.000 0.200 0.252
#> SRR660115 1 0.0290 0.93985 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407950 2 0.3366 0.58652 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1359780 2 0.1410 0.68406 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1490037 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6766 -0.22953 0.000 0.400 0.000 0.300 0.300
#> SRR1397156 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1121 0.69490 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1319648 2 0.4358 0.55310 0.000 0.696 0.012 0.008 0.284
#> SRR1092985 1 0.4372 0.68645 0.752 0.000 0.040 0.008 0.200
#> SRR656409 4 0.6796 -0.22298 0.000 0.296 0.000 0.376 0.328
#> SRR1468658 4 0.3635 0.51193 0.000 0.000 0.248 0.748 0.004
#> SRR1390437 4 0.2746 0.56968 0.000 0.112 0.008 0.872 0.008
#> SRR658057 2 0.1732 0.67792 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR612635 4 0.6817 -0.24293 0.000 0.312 0.000 0.356 0.332
#> SRR1351480 2 0.4420 0.29154 0.000 0.548 0.000 0.004 0.448
#> SRR1436651 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.2297 0.68104 0.000 0.912 0.020 0.008 0.060
#> SRR614263 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3561 0.56564 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR659911 2 0.3707 0.46349 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1085519 3 0.0162 0.80689 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345894 3 0.1357 0.80700 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1442928 5 0.6110 -0.07079 0.000 0.436 0.108 0.004 0.452
#> SRR1464681 4 0.1798 0.60161 0.000 0.064 0.004 0.928 0.004
#> SRR1418880 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.7381 0.23972 0.000 0.264 0.236 0.044 0.456
#> SRR1365426 1 0.6442 0.44118 0.628 0.080 0.224 0.008 0.060
#> SRR1487947 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 4 0.8080 -0.08687 0.108 0.104 0.024 0.384 0.380
#> SRR603236 2 0.6419 0.13293 0.000 0.580 0.288 0.064 0.068
#> SRR660673 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1851 0.68921 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR663807 2 0.4302 0.47269 0.000 0.720 0.000 0.032 0.248
#> SRR1087245 2 0.2732 0.64622 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1339108 2 0.4497 0.33023 0.000 0.568 0.000 0.008 0.424
#> SRR613426 4 0.4558 0.31204 0.324 0.000 0.000 0.652 0.024
#> SRR613879 5 0.6810 0.19223 0.000 0.300 0.000 0.344 0.356
#> SRR1385101 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.4171 0.38210 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1458852 2 0.1124 0.69692 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1430489 1 0.3039 0.73740 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.3391 0.74750 0.000 0.000 0.800 0.012 0.188
#> SRR1321987 2 0.1671 0.69142 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR662653 2 0.2777 0.64096 0.000 0.864 0.000 0.016 0.120
#> SRR1390027 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.1628 0.68467 0.000 0.936 0.008 0.000 0.056
#> SRR1383081 2 0.0510 0.69890 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR2166960 2 0.2377 0.64566 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR605101 2 0.5165 0.44845 0.000 0.696 0.008 0.088 0.208
#> SRR818600 2 0.2074 0.67382 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1367715 2 0.2966 0.63460 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1351979 3 0.1952 0.79984 0.000 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR1387054 3 0.4138 0.54739 0.000 0.000 0.708 0.276 0.016
#> SRR1444306 3 0.1041 0.80142 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1322662 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.2377 0.64478 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR612767 1 0.6771 -0.20296 0.372 0.000 0.000 0.356 0.272
#> SRR1489030 2 0.0963 0.69557 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1430375 2 0.4524 0.45355 0.000 0.644 0.020 0.000 0.336
#> SRR615225 4 0.2989 0.60445 0.000 0.008 0.132 0.852 0.008
#> SRR1401839 3 0.6413 0.01072 0.028 0.012 0.464 0.440 0.056
#> SRR1379110 2 0.3336 0.60652 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1077288 3 0.2077 0.79859 0.000 0.000 0.908 0.008 0.084
#> SRR1331639 4 0.1792 0.59304 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1342782 5 0.8374 0.21092 0.184 0.300 0.180 0.000 0.336
#> SRR1443003 3 0.4984 0.34168 0.000 0.308 0.640 0.000 0.052
#> SRR612839 1 0.0290 0.94042 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470093 4 0.4299 0.27825 0.000 0.000 0.388 0.608 0.004
#> SRR1395742 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.1671 0.62186 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR664063 1 0.9097 -0.12585 0.404 0.108 0.196 0.088 0.204
#> SRR1488214 1 0.3003 0.74901 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR654766 4 0.1764 0.62307 0.000 0.008 0.064 0.928 0.000
#> SRR1320321 2 0.0510 0.69923 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1071955 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.94615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0510 0.69594 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1488470 2 0.2471 0.65029 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1389497 3 0.0404 0.80478 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1367109 3 0.3867 0.70595 0.000 0.004 0.804 0.144 0.048
#> SRR615311 1 0.2377 0.80971 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.0405 0.83040 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1380716 2 0.0972 0.82794 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR612803 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.3674 0.52276 0.716 0.000 0.268 0.000 0.016 0.000
#> SRR1074359 4 0.0692 0.88562 0.000 0.020 0.004 0.976 0.000 0.000
#> SRR1419258 5 0.3966 0.28969 0.000 0.000 0.444 0.004 0.552 0.000
#> SRR1403366 3 0.3727 0.16669 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR665262 6 0.5811 0.54288 0.000 0.236 0.208 0.004 0.004 0.548
#> SRR1499740 3 0.0436 0.68248 0.004 0.004 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1105057 2 0.3841 0.70698 0.000 0.764 0.000 0.000 0.068 0.168
#> SRR1439742 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4423 0.43184 0.000 0.000 0.668 0.000 0.060 0.272
#> SRR612215 6 0.3820 0.78702 0.000 0.204 0.008 0.032 0.000 0.756
#> SRR1094051 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.5417 -0.20237 0.116 0.000 0.464 0.000 0.420 0.000
#> SRR1409263 5 0.3868 0.18321 0.000 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 5 0.5442 0.21211 0.000 0.276 0.016 0.000 0.596 0.112
#> SRR614839 6 0.3660 0.78378 0.000 0.188 0.000 0.036 0.004 0.772
#> SRR658433 2 0.2852 0.74630 0.000 0.856 0.064 0.000 0.000 0.080
#> SRR1088581 4 0.0806 0.88684 0.000 0.000 0.008 0.972 0.020 0.000
#> SRR1328797 3 0.3337 0.45848 0.000 0.000 0.736 0.004 0.260 0.000
#> SRR1334512 2 0.4352 0.67084 0.000 0.724 0.000 0.000 0.148 0.128
#> SRR1471117 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0458 0.82734 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1354955 3 0.0520 0.68343 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR654802 6 0.6075 -0.17840 0.000 0.000 0.312 0.000 0.288 0.400
#> SRR660066 2 0.3737 0.11511 0.000 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1447103 3 0.2581 0.65097 0.012 0.036 0.900 0.004 0.012 0.036
#> SRR1402153 3 0.3680 0.45722 0.000 0.216 0.756 0.000 0.020 0.008
#> SRR655887 2 0.0692 0.82763 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1408529 3 0.2793 0.54353 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR658707 6 0.3864 0.04835 0.480 0.000 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1384371 2 0.3011 0.67962 0.000 0.800 0.192 0.000 0.004 0.004
#> SRR1074670 3 0.2416 0.59260 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1375439 3 0.2428 0.65749 0.000 0.000 0.896 0.020 0.060 0.024
#> SRR1329003 4 0.0363 0.89024 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.4601 0.40803 0.000 0.644 0.020 0.308 0.000 0.028
#> SRR1317920 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.0260 0.89547 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.1151 0.67588 0.000 0.000 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1068855 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.3847 -0.06018 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR612227 3 0.0146 0.68168 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1388809 2 0.3796 0.71498 0.000 0.776 0.000 0.000 0.084 0.140
#> SRR1413872 4 0.0291 0.89548 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1452864 1 0.1552 0.91604 0.940 0.000 0.000 0.004 0.036 0.020
#> SRR1473078 3 0.1501 0.65559 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR615814 2 0.3862 0.18937 0.000 0.608 0.000 0.000 0.004 0.388
#> SRR1325225 4 0.0146 0.89499 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0405 0.82942 0.000 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1358220 2 0.5738 0.33679 0.000 0.496 0.000 0.000 0.312 0.192
#> SRR1096662 2 0.1599 0.82244 0.000 0.940 0.000 0.008 0.028 0.024
#> SRR1487746 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.7529 0.02731 0.008 0.264 0.384 0.004 0.244 0.096
#> SRR660164 2 0.1007 0.81623 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR815783 2 0.0603 0.83170 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR809595 3 0.2339 0.65749 0.000 0.020 0.904 0.004 0.056 0.016
#> SRR1403133 2 0.1148 0.82576 0.000 0.960 0.020 0.000 0.004 0.016
#> SRR815470 4 0.0632 0.88192 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4367 0.53446 0.000 0.008 0.736 0.196 0.048 0.012
#> SRR1478362 4 0.0363 0.89189 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.4012 0.69728 0.000 0.752 0.000 0.000 0.084 0.164
#> SRR1347937 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.1387 0.85027 0.000 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR612683 2 0.1610 0.78933 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1392901 4 0.3867 0.03779 0.000 0.000 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.5221 0.17215 0.000 0.000 0.476 0.432 0.092 0.000
#> SRR1360402 2 0.0363 0.82825 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1406112 3 0.0000 0.68195 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355352 5 0.3810 0.32055 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR656247 1 0.0260 0.96244 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813656 2 0.5755 -0.03384 0.000 0.500 0.000 0.000 0.204 0.296
#> SRR808244 5 0.4801 -0.15064 0.000 0.000 0.016 0.472 0.488 0.024
#> SRR1387240 2 0.0806 0.83108 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1408595 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0146 0.89648 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0146 0.82942 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1419110 3 0.4075 0.33172 0.000 0.240 0.712 0.000 0.048 0.000
#> SRR1408682 2 0.6791 -0.11139 0.000 0.356 0.272 0.340 0.008 0.024
#> SRR1317134 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.1003 0.82554 0.000 0.964 0.028 0.000 0.004 0.004
#> SRR1453911 3 0.5980 0.26513 0.000 0.108 0.536 0.004 0.320 0.032
#> SRR603164 3 0.2730 0.50727 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383259 2 0.2706 0.78453 0.000 0.860 0.000 0.000 0.104 0.036
#> SRR1330854 1 0.4242 0.04312 0.536 0.000 0.448 0.000 0.016 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 5 0.5837 -0.16432 0.000 0.396 0.000 0.000 0.416 0.188
#> SRR1468162 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0146 0.68244 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1361546 3 0.5964 0.10945 0.404 0.000 0.468 0.096 0.004 0.028
#> SRR1486156 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2482 0.73567 0.000 0.848 0.000 0.000 0.004 0.148
#> SRR615635 2 0.0547 0.82614 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1385411 2 0.4818 0.47306 0.000 0.588 0.000 0.004 0.352 0.056
#> SRR1342739 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.1327 0.66186 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR662126 6 0.4000 0.78098 0.000 0.228 0.000 0.048 0.000 0.724
#> SRR1464601 2 0.3855 0.62826 0.000 0.748 0.216 0.000 0.024 0.012
#> SRR1071594 2 0.1080 0.82555 0.000 0.960 0.032 0.000 0.004 0.004
#> SRR612539 6 0.3163 0.77929 0.000 0.232 0.000 0.004 0.000 0.764
#> SRR602010 6 0.4707 0.62567 0.012 0.368 0.032 0.000 0.000 0.588
#> SRR810249 2 0.3472 0.74759 0.000 0.808 0.000 0.000 0.100 0.092
#> SRR818773 1 0.4815 0.41893 0.656 0.000 0.272 0.000 0.052 0.020
#> SRR1336569 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0790 0.82199 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1442754 5 0.5838 0.22484 0.188 0.000 0.400 0.000 0.412 0.000
#> SRR1334247 3 0.0291 0.68243 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR661639 6 0.3244 0.46010 0.268 0.000 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR613222 6 0.6584 0.49898 0.000 0.144 0.156 0.000 0.148 0.552
#> SRR1459937 4 0.0291 0.89622 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2185018 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0547 0.82614 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR809348 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.2178 0.61386 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR661074 3 0.3659 0.23509 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1349851 1 0.0405 0.95962 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1405123 2 0.4506 0.47207 0.000 0.608 0.000 0.000 0.348 0.044
#> SRR661096 6 0.3446 0.72759 0.000 0.308 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR1320225 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.0363 0.89024 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.1349 0.82230 0.000 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1466512 2 0.1984 0.80886 0.000 0.912 0.000 0.000 0.032 0.056
#> SRR658212 2 0.3453 0.70566 0.000 0.804 0.000 0.000 0.064 0.132
#> SRR1430525 4 0.3782 0.25908 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1344422 5 0.4908 0.23320 0.000 0.280 0.000 0.020 0.644 0.056
#> SRR1353924 2 0.0547 0.82704 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1314832 1 0.2234 0.81115 0.872 0.000 0.124 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487570 4 0.0291 0.89482 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR627431 6 0.3715 0.78359 0.000 0.188 0.000 0.048 0.000 0.764
#> SRR1418561 3 0.3245 0.50325 0.008 0.000 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR1448029 3 0.1003 0.67742 0.000 0.016 0.964 0.000 0.020 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0891 0.82801 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1435311 2 0.5176 0.55135 0.000 0.620 0.000 0.000 0.188 0.192
#> SRR612395 3 0.1933 0.65723 0.000 0.044 0.920 0.000 0.004 0.032
#> SRR603116 6 0.3607 0.68497 0.000 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1323152 3 0.1753 0.65657 0.000 0.000 0.912 0.084 0.004 0.000
#> SRR1368264 2 0.4636 0.66287 0.088 0.760 0.104 0.000 0.036 0.012
#> SRR1326624 1 0.0291 0.96334 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1429265 3 0.2219 0.61036 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.3620 0.78217 0.000 0.184 0.000 0.044 0.000 0.772
#> SRR1486799 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.3784 0.72072 0.000 0.776 0.000 0.000 0.080 0.144
#> SRR815044 2 0.5510 0.15272 0.000 0.560 0.000 0.248 0.000 0.192
#> SRR1338560 2 0.0622 0.82940 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR615862 6 0.3578 0.67049 0.000 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1480038 2 0.0508 0.82915 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR659436 3 0.0291 0.68261 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR613699 6 0.3101 0.77385 0.000 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR1436563 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 6 0.3756 0.56647 0.000 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1330327 4 0.0291 0.89622 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1489950 2 0.0146 0.83012 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431927 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.1814 0.63904 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.3582 0.56782 0.000 0.000 0.252 0.732 0.016 0.000
#> SRR600656 4 0.0291 0.89622 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR658766 6 0.4461 0.71022 0.000 0.100 0.000 0.056 0.080 0.764
#> SRR655946 3 0.3738 0.42581 0.000 0.004 0.680 0.312 0.004 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 5 0.3810 0.32055 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.3828 -0.00456 0.000 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.1036 0.67947 0.000 0.008 0.964 0.004 0.000 0.024
#> SRR662498 3 0.0260 0.68185 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376764 3 0.1261 0.67859 0.000 0.028 0.956 0.008 0.004 0.004
#> SRR1377006 4 0.1923 0.84019 0.000 0.004 0.064 0.916 0.016 0.000
#> SRR656860 6 0.3699 0.78654 0.000 0.212 0.000 0.036 0.000 0.752
#> SRR1480547 2 0.3747 0.72727 0.000 0.784 0.000 0.000 0.104 0.112
#> SRR1452515 3 0.0547 0.68148 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.0363 0.82825 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR615273 1 0.2772 0.75254 0.816 0.000 0.004 0.000 0.000 0.180
#> SRR601695 6 0.3982 0.78397 0.000 0.200 0.000 0.060 0.000 0.740
#> SRR820907 2 0.0260 0.83066 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR812773 3 0.4020 0.34023 0.276 0.000 0.692 0.000 0.032 0.000
#> SRR1405984 2 0.1714 0.82102 0.000 0.936 0.016 0.000 0.024 0.024
#> SRR1472794 2 0.0458 0.82810 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1365448 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 5 0.4025 0.33346 0.000 0.000 0.416 0.000 0.576 0.008
#> SRR1435626 3 0.2563 0.64506 0.000 0.004 0.880 0.040 0.076 0.000
#> SRR1080766 2 0.1333 0.81980 0.000 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR1377862 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0146 0.68168 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467966 3 0.3464 0.36063 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1320579 4 0.1219 0.86549 0.000 0.000 0.048 0.948 0.004 0.000
#> SRR1319710 2 0.0862 0.82830 0.000 0.972 0.016 0.000 0.004 0.008
#> SRR1326604 2 0.1765 0.81671 0.000 0.924 0.000 0.000 0.052 0.024
#> SRR1098879 3 0.2848 0.57840 0.000 0.000 0.816 0.008 0.176 0.000
#> SRR662245 5 0.6176 0.31997 0.000 0.288 0.164 0.000 0.516 0.032
#> SRR1074719 2 0.1152 0.82556 0.000 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR816226 4 0.0146 0.89537 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR601387 6 0.3482 0.71806 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR614575 2 0.3515 0.35851 0.000 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1353900 2 0.1865 0.81397 0.000 0.920 0.000 0.000 0.040 0.040
#> SRR662906 2 0.5711 -0.09665 0.000 0.492 0.000 0.000 0.180 0.328
#> SRR1350832 2 0.2841 0.75849 0.000 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1403280 2 0.0622 0.83042 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1313969 4 0.0146 0.89648 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0508 0.95477 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004 0.000
#> SRR655399 5 0.3868 0.17303 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1319753 2 0.3920 0.65806 0.148 0.784 0.052 0.000 0.004 0.012
#> SRR818901 3 0.1141 0.66955 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR607067 6 0.3907 0.77494 0.000 0.176 0.000 0.068 0.000 0.756
#> SRR1391420 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.5008 0.57652 0.000 0.640 0.000 0.000 0.212 0.148
#> SRR661961 3 0.3493 0.50338 0.000 0.004 0.748 0.004 0.004 0.240
#> SRR658259 2 0.1219 0.81724 0.000 0.948 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR1310476 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.2112 0.79720 0.000 0.896 0.000 0.000 0.016 0.088
#> SRR1365034 2 0.0820 0.82916 0.000 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1478053 2 0.0363 0.82825 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1475300 2 0.0692 0.82954 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1328101 3 0.5059 0.22057 0.000 0.348 0.576 0.000 0.008 0.068
#> SRR1322900 3 0.4552 0.44549 0.180 0.000 0.708 0.108 0.004 0.000
#> SRR1309942 2 0.0508 0.83015 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1345760 4 0.0146 0.89648 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.1957 0.85426 0.000 0.024 0.000 0.920 0.008 0.048
#> SRR1443436 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.2455 0.76155 0.000 0.872 0.112 0.000 0.004 0.012
#> SRR661469 3 0.4685 0.41560 0.000 0.096 0.664 0.000 0.000 0.240
#> SRR1500323 2 0.2718 0.77196 0.000 0.876 0.044 0.004 0.004 0.072
#> SRR1356705 2 0.3557 0.73820 0.000 0.800 0.004 0.000 0.056 0.140
#> SRR1464915 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 4 0.3515 0.47728 0.000 0.000 0.324 0.676 0.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0935 0.67957 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1368072 2 0.0717 0.82888 0.000 0.976 0.016 0.000 0.008 0.000
#> SRR601815 6 0.3189 0.77848 0.000 0.236 0.000 0.004 0.000 0.760
#> SRR613330 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.5368 0.55699 0.000 0.188 0.056 0.688 0.028 0.040
#> SRR1394190 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.1536 0.67378 0.000 0.024 0.944 0.020 0.012 0.000
#> SRR1318839 3 0.3634 0.25516 0.000 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1432390 4 0.0291 0.89548 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR613126 6 0.4763 0.67061 0.000 0.344 0.000 0.064 0.000 0.592
#> SRR1089424 2 0.0508 0.83015 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1347214 2 0.1856 0.81498 0.000 0.920 0.000 0.000 0.032 0.048
#> SRR1309556 5 0.7394 0.15755 0.316 0.048 0.020 0.008 0.392 0.216
#> SRR1456027 4 0.0000 0.89557 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0547 0.67876 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1320469 5 0.4564 0.23891 0.396 0.000 0.020 0.000 0.572 0.012
#> SRR614251 6 0.3821 0.78093 0.000 0.188 0.000 0.024 0.020 0.768
#> SRR1454310 2 0.0291 0.83097 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR615105 4 0.5212 0.38746 0.000 0.016 0.000 0.596 0.076 0.312
#> SRR1433290 3 0.0865 0.67440 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR2166064 4 0.0291 0.89548 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR601671 2 0.1501 0.79459 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR663874 2 0.3907 0.01347 0.000 0.588 0.004 0.000 0.000 0.408
#> SRR1409130 2 0.4762 0.62370 0.000 0.676 0.000 0.000 0.176 0.148
#> SRR659696 4 0.1765 0.78441 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.5578 0.42279 0.000 0.540 0.000 0.000 0.276 0.184
#> SRR663284 2 0.5114 -0.28969 0.000 0.468 0.000 0.000 0.080 0.452
#> SRR1402794 3 0.1327 0.66181 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR614852 4 0.3860 0.07345 0.000 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1348040 4 0.0458 0.89186 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1489610 2 0.0964 0.82822 0.000 0.968 0.016 0.000 0.012 0.004
#> SRR1488091 2 0.1036 0.82666 0.000 0.964 0.024 0.000 0.004 0.008
#> SRR1499566 2 0.1398 0.81528 0.000 0.940 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1361480 2 0.1297 0.81800 0.000 0.948 0.000 0.012 0.000 0.040
#> SRR1444501 3 0.0909 0.68195 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020 0.000
#> SRR1415773 2 0.4191 0.32738 0.000 0.596 0.388 0.000 0.004 0.012
#> SRR1388832 5 0.5817 0.29121 0.320 0.000 0.204 0.000 0.476 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 6 0.5819 0.54233 0.000 0.368 0.000 0.188 0.000 0.444
#> SRR662918 2 0.5601 -0.16534 0.000 0.500 0.000 0.156 0.000 0.344
#> SRR817421 3 0.2778 0.58361 0.000 0.000 0.824 0.008 0.168 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1408 0.82379 0.000 0.944 0.000 0.000 0.036 0.020
#> SRR608264 3 0.0632 0.67809 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1318560 5 0.4151 0.33648 0.004 0.000 0.412 0.000 0.576 0.008
#> SRR1454117 2 0.0363 0.82825 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1312684 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 6 0.4114 0.63040 0.144 0.060 0.000 0.024 0.000 0.772
#> SRR1432743 3 0.2615 0.60765 0.000 0.008 0.852 0.136 0.004 0.000
#> SRR1388873 2 0.3328 0.75028 0.000 0.816 0.000 0.000 0.064 0.120
#> SRR1353517 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0405 0.68146 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1406008 2 0.4853 0.33048 0.000 0.644 0.108 0.000 0.000 0.248
#> SRR1396786 2 0.2869 0.75540 0.000 0.832 0.000 0.000 0.020 0.148
#> SRR1446564 1 0.0363 0.95920 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318465 3 0.4229 0.44557 0.000 0.208 0.728 0.000 0.056 0.008
#> SRR1431083 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 6 0.4569 0.73417 0.000 0.156 0.000 0.144 0.000 0.700
#> SRR655170 6 0.3995 0.30609 0.000 0.480 0.000 0.004 0.000 0.516
#> SRR1087825 4 0.0146 0.89648 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR662019 3 0.5073 0.47422 0.108 0.000 0.684 0.180 0.028 0.000
#> SRR1349209 4 0.3370 0.76548 0.000 0.000 0.000 0.812 0.124 0.064
#> SRR1326161 2 0.2020 0.78025 0.000 0.896 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR1345284 2 0.2740 0.77221 0.000 0.852 0.000 0.000 0.028 0.120
#> SRR1416672 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 6 0.3612 0.78706 0.000 0.200 0.000 0.036 0.000 0.764
#> SRR1454328 2 0.0891 0.82776 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1489286 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.6294 0.32130 0.548 0.040 0.000 0.004 0.188 0.220
#> SRR1408183 3 0.0000 0.68195 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.3213 0.54386 0.000 0.008 0.784 0.204 0.004 0.000
#> SRR598452 3 0.3109 0.51441 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224 0.000
#> SRR660709 6 0.3766 0.47424 0.000 0.012 0.000 0.304 0.000 0.684
#> SRR809444 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0363 0.83005 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.3955 0.65117 0.724 0.000 0.000 0.004 0.240 0.032
#> SRR1326292 4 0.0260 0.89262 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR657139 6 0.3954 0.58343 0.000 0.008 0.008 0.040 0.172 0.772
#> SRR1440744 2 0.0865 0.82029 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1353555 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 5 0.4434 0.40909 0.000 0.024 0.140 0.044 0.768 0.024
#> SRR1381775 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0458 0.83080 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.68195 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0146 0.96624 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 5 0.3868 0.17629 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR819054 2 0.0520 0.82986 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1367988 4 0.0146 0.89648 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.5787 0.18395 0.480 0.000 0.000 0.000 0.324 0.196
#> SRR615479 6 0.4775 0.74465 0.040 0.148 0.048 0.020 0.000 0.744
#> SRR1375796 2 0.1765 0.77834 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1386991 3 0.6238 0.13916 0.000 0.048 0.456 0.004 0.396 0.096
#> SRR1355217 3 0.1801 0.66794 0.000 0.040 0.932 0.012 0.004 0.012
#> SRR1356290 2 0.5317 0.11393 0.000 0.500 0.080 0.000 0.412 0.008
#> SRR659507 3 0.0508 0.68165 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR663296 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0865 0.82108 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR661155 4 0.0291 0.89548 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1414727 3 0.6312 0.05130 0.164 0.000 0.524 0.004 0.272 0.036
#> SRR663477 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0603 0.68347 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1377800 5 0.3810 0.32055 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR614611 6 0.3612 0.78706 0.000 0.200 0.000 0.036 0.000 0.764
#> SRR655052 4 0.0363 0.89189 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1478968 4 0.0146 0.89648 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.3901 0.71304 0.000 0.768 0.000 0.000 0.096 0.136
#> SRR613951 4 0.0820 0.88362 0.000 0.016 0.000 0.972 0.000 0.012
#> SRR1418022 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 6 0.5877 0.44378 0.000 0.000 0.048 0.184 0.160 0.608
#> SRR1408161 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.5778 -0.13030 0.000 0.000 0.464 0.000 0.352 0.184
#> SRR655040 6 0.3861 0.77999 0.000 0.184 0.000 0.060 0.000 0.756
#> SRR810225 2 0.0260 0.82877 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325377 2 0.0363 0.82916 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR617829 4 0.5872 0.32914 0.000 0.040 0.324 0.564 0.048 0.024
#> SRR1402328 2 0.0146 0.83012 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480455 2 0.0260 0.83003 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1442104 5 0.5378 0.34446 0.000 0.000 0.304 0.112 0.576 0.008
#> SRR1453416 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.2969 0.51295 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1414314 2 0.0603 0.83043 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR663026 6 0.3175 0.76961 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1478386 2 0.1434 0.82244 0.000 0.940 0.000 0.000 0.048 0.012
#> SRR1458683 4 0.0146 0.89648 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.2883 0.46268 0.212 0.000 0.788 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0291 0.89622 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR660260 6 0.6550 0.16075 0.000 0.000 0.296 0.160 0.060 0.484
#> SRR1071231 2 0.0914 0.82865 0.000 0.968 0.016 0.000 0.000 0.016
#> SRR1459125 4 0.0603 0.89280 0.000 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1337173 3 0.3213 0.57035 0.000 0.132 0.820 0.000 0.048 0.000
#> SRR1396250 3 0.3409 0.38009 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR2166376 5 0.4025 0.33346 0.000 0.000 0.416 0.000 0.576 0.008
#> SRR659816 6 0.4635 0.71171 0.000 0.104 0.008 0.048 0.080 0.760
#> SRR1401379 2 0.2346 0.74121 0.000 0.868 0.008 0.000 0.000 0.124
#> SRR600981 5 0.6793 0.36587 0.000 0.016 0.136 0.220 0.540 0.088
#> SRR1398335 1 0.0146 0.96624 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397218 2 0.4897 0.63929 0.000 0.692 0.000 0.020 0.100 0.188
#> SRR660115 1 0.0260 0.96259 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407950 2 0.2908 0.77247 0.000 0.848 0.000 0.000 0.048 0.104
#> SRR1359780 2 0.0632 0.82476 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1490037 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 6 0.5549 0.55464 0.000 0.376 0.000 0.140 0.000 0.484
#> SRR1397156 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0806 0.82756 0.000 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1319648 2 0.4260 0.54280 0.000 0.640 0.000 0.004 0.332 0.024
#> SRR1092985 5 0.4723 0.23548 0.396 0.000 0.020 0.000 0.564 0.020
#> SRR656409 6 0.3612 0.78712 0.000 0.200 0.000 0.036 0.000 0.764
#> SRR1468658 4 0.0777 0.88618 0.000 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1390437 4 0.0458 0.88885 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0713 0.82505 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR612635 6 0.3483 0.78611 0.000 0.212 0.000 0.024 0.000 0.764
#> SRR1351480 5 0.6056 -0.14401 0.000 0.388 0.000 0.004 0.396 0.212
#> SRR1436651 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.1668 0.80762 0.000 0.928 0.060 0.000 0.004 0.008
#> SRR614263 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.2999 0.76247 0.000 0.836 0.000 0.000 0.040 0.124
#> SRR659911 2 0.3221 0.53628 0.000 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1085519 3 0.0790 0.67555 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1345894 3 0.3023 0.50914 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1442928 5 0.7543 0.15733 0.000 0.236 0.168 0.004 0.392 0.200
#> SRR1464681 4 0.0146 0.89559 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.7650 0.09667 0.000 0.044 0.248 0.072 0.416 0.220
#> SRR1365426 3 0.4879 0.16491 0.412 0.024 0.544 0.000 0.004 0.016
#> SRR1487947 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 6 0.3931 0.56712 0.008 0.000 0.000 0.044 0.192 0.756
#> SRR603236 3 0.4774 0.24892 0.000 0.348 0.600 0.044 0.004 0.004
#> SRR660673 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0993 0.82562 0.000 0.964 0.024 0.000 0.012 0.000
#> SRR663807 2 0.3428 0.44310 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1087245 2 0.0692 0.83033 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1339108 2 0.6158 0.23927 0.000 0.444 0.004 0.004 0.328 0.220
#> SRR613426 4 0.3979 0.35673 0.360 0.000 0.000 0.628 0.000 0.012
#> SRR613879 6 0.3376 0.78416 0.000 0.220 0.000 0.016 0.000 0.764
#> SRR1385101 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.5898 0.32275 0.000 0.488 0.000 0.004 0.308 0.200
#> SRR1458852 2 0.0692 0.82911 0.000 0.976 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430489 1 0.2996 0.68306 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0777 0.94168 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376249 5 0.3810 0.32055 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1321987 2 0.0508 0.83195 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR662653 2 0.1444 0.80195 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1390027 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0692 0.82675 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1383081 2 0.0405 0.82932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2166960 2 0.0937 0.82026 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR605101 6 0.3907 0.57280 0.000 0.408 0.004 0.000 0.000 0.588
#> SRR818600 2 0.1152 0.82180 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1367715 2 0.1672 0.82344 0.000 0.932 0.000 0.004 0.048 0.016
#> SRR1351979 3 0.3409 0.38030 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1387054 3 0.3714 0.39308 0.000 0.004 0.656 0.340 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0665 0.68310 0.000 0.004 0.980 0.008 0.000 0.008
#> SRR1322662 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1075 0.81544 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR612767 6 0.4117 0.50053 0.228 0.000 0.000 0.056 0.000 0.716
#> SRR1489030 2 0.0547 0.82707 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1430375 2 0.6164 0.33009 0.000 0.540 0.196 0.004 0.236 0.024
#> SRR615225 4 0.0820 0.88689 0.000 0.000 0.012 0.972 0.016 0.000
#> SRR1401839 3 0.3841 0.31148 0.000 0.000 0.616 0.380 0.004 0.000
#> SRR1379110 2 0.2328 0.80023 0.000 0.892 0.000 0.000 0.052 0.056
#> SRR1077288 3 0.3330 0.41459 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1331639 4 0.0146 0.89559 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1342782 3 0.7748 0.10842 0.244 0.088 0.432 0.004 0.192 0.040
#> SRR1443003 3 0.3575 0.36221 0.000 0.284 0.708 0.000 0.008 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 4 0.1714 0.82672 0.000 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.0291 0.89622 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR664063 3 0.6430 0.09420 0.172 0.036 0.436 0.000 0.000 0.356
#> SRR1488214 1 0.0935 0.93863 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR654766 4 0.0291 0.89622 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1320321 2 0.0260 0.82877 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071955 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.96932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0363 0.82825 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1488470 2 0.1398 0.81840 0.000 0.940 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1389497 3 0.0363 0.68045 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1367109 3 0.3559 0.50073 0.000 0.012 0.744 0.240 0.004 0.000
#> SRR615311 1 0.0937 0.92898 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.390 0.821 0.895 0.4570 0.550 0.550
#> 3 3 0.329 0.635 0.820 0.2721 0.874 0.772
#> 4 4 0.410 0.616 0.806 0.0824 0.958 0.905
#> 5 5 0.472 0.524 0.764 0.0756 0.963 0.911
#> 6 6 0.491 0.521 0.734 0.0535 0.908 0.762
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.1184 0.8787 0.016 0.984
#> SRR1380716 2 0.5294 0.8671 0.120 0.880
#> SRR612803 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.1414 0.8964 0.980 0.020
#> SRR1084417 1 0.1414 0.8967 0.980 0.020
#> SRR1074359 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1419258 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.4815 0.8611 0.104 0.896
#> SRR665262 2 0.3733 0.8765 0.072 0.928
#> SRR1499740 1 0.7139 0.7565 0.804 0.196
#> SRR1105057 2 0.3733 0.8806 0.072 0.928
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.3114 0.8779 0.056 0.944
#> SRR612215 2 0.3274 0.8778 0.060 0.940
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.3114 0.8812 0.944 0.056
#> SRR1409263 2 0.7883 0.7317 0.236 0.764
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.8081 0.7570 0.248 0.752
#> SRR614839 2 0.7376 0.8028 0.208 0.792
#> SRR658433 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1088581 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1328797 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.5737 0.8631 0.136 0.864
#> SRR1471117 1 0.0938 0.8990 0.988 0.012
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.1184 0.8788 0.016 0.984
#> SRR1354955 2 0.2603 0.8763 0.044 0.956
#> SRR654802 2 0.2603 0.8788 0.044 0.956
#> SRR660066 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1447103 2 0.2948 0.8790 0.052 0.948
#> SRR1402153 1 0.9775 0.3071 0.588 0.412
#> SRR655887 2 0.4431 0.8759 0.092 0.908
#> SRR1408529 2 0.0376 0.8754 0.004 0.996
#> SRR658707 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.5519 0.8617 0.128 0.872
#> SRR1074670 2 0.6048 0.8446 0.148 0.852
#> SRR1375439 2 0.7674 0.7795 0.224 0.776
#> SRR1329003 1 0.6973 0.7618 0.812 0.188
#> SRR1404837 2 0.7299 0.8123 0.204 0.796
#> SRR1317920 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1455525 1 0.7376 0.7335 0.792 0.208
#> SRR613999 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.3584 0.8720 0.068 0.932
#> SRR1068855 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1375509 2 0.7056 0.7876 0.192 0.808
#> SRR612227 2 0.6048 0.8446 0.148 0.852
#> SRR1388809 2 0.3584 0.8807 0.068 0.932
#> SRR1413872 2 0.7219 0.7977 0.200 0.800
#> SRR1452864 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1473078 2 0.6623 0.8155 0.172 0.828
#> SRR615814 2 0.4022 0.8801 0.080 0.920
#> SRR1325225 1 0.5408 0.8256 0.876 0.124
#> SRR1313687 2 0.5629 0.8613 0.132 0.868
#> SRR1358220 2 0.6247 0.8466 0.156 0.844
#> SRR1096662 2 0.8327 0.7383 0.264 0.736
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.8909 0.5473 0.692 0.308
#> SRR660164 2 0.1414 0.8807 0.020 0.980
#> SRR815783 2 0.2948 0.8833 0.052 0.948
#> SRR809595 1 0.8763 0.5774 0.704 0.296
#> SRR1403133 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR815470 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0672 0.8775 0.008 0.992
#> SRR1478362 2 0.0672 0.8775 0.008 0.992
#> SRR1392186 2 0.8763 0.6935 0.296 0.704
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1633 0.8955 0.976 0.024
#> SRR1471594 1 0.0376 0.9004 0.996 0.004
#> SRR1354270 2 0.6801 0.8057 0.180 0.820
#> SRR612683 2 0.2043 0.8823 0.032 0.968
#> SRR1392901 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1077805 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.1184 0.8788 0.016 0.984
#> SRR1406112 2 0.2603 0.8763 0.044 0.956
#> SRR1355352 2 0.7674 0.7553 0.224 0.776
#> SRR656247 1 0.2948 0.8826 0.948 0.052
#> SRR813656 1 1.0000 -0.1358 0.500 0.500
#> SRR808244 1 0.8661 0.6018 0.712 0.288
#> SRR1387240 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1408595 1 0.2948 0.8844 0.948 0.052
#> SRR1385277 1 0.9850 0.2334 0.572 0.428
#> SRR1435248 2 0.1414 0.8797 0.020 0.980
#> SRR1419110 2 0.4690 0.8620 0.100 0.900
#> SRR1408682 2 0.1843 0.8809 0.028 0.972
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.6887 0.8252 0.184 0.816
#> SRR1453911 2 0.2778 0.8839 0.048 0.952
#> SRR603164 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.9881 0.3694 0.436 0.564
#> SRR1330854 1 0.4022 0.8644 0.920 0.080
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.7883 0.7705 0.236 0.764
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.1184 0.8768 0.016 0.984
#> SRR1361546 1 0.8327 0.6317 0.736 0.264
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR615635 2 0.4022 0.8801 0.080 0.920
#> SRR1385411 2 0.7056 0.8209 0.192 0.808
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.5294 0.8517 0.120 0.880
#> SRR662126 2 0.8499 0.7161 0.276 0.724
#> SRR1464601 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1071594 2 0.4939 0.8693 0.108 0.892
#> SRR612539 2 0.7376 0.8067 0.208 0.792
#> SRR602010 1 0.8555 0.6029 0.720 0.280
#> SRR810249 2 0.2778 0.8823 0.048 0.952
#> SRR818773 1 0.8386 0.6282 0.732 0.268
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.1843 0.8819 0.028 0.972
#> SRR1442754 1 0.3431 0.8765 0.936 0.064
#> SRR1334247 2 0.2948 0.8740 0.052 0.948
#> SRR661639 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.9833 0.4232 0.424 0.576
#> SRR1459937 2 0.9988 0.1344 0.480 0.520
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.5842 0.8568 0.140 0.860
#> SRR809348 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.6048 0.8446 0.148 0.852
#> SRR661074 2 0.7219 0.7787 0.200 0.800
#> SRR1349851 1 0.2778 0.8861 0.952 0.048
#> SRR1405123 2 0.9881 0.3694 0.436 0.564
#> SRR661096 2 0.9044 0.6477 0.320 0.680
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6973 0.7618 0.812 0.188
#> SRR1307677 2 0.4690 0.8733 0.100 0.900
#> SRR1466512 2 0.6438 0.8370 0.164 0.836
#> SRR658212 2 0.4690 0.8733 0.100 0.900
#> SRR1430525 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.9866 0.3802 0.432 0.568
#> SRR1353924 2 0.6343 0.8443 0.160 0.840
#> SRR1314832 1 0.8016 0.6855 0.756 0.244
#> SRR1487570 1 0.5408 0.8256 0.876 0.124
#> SRR627431 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1418561 1 0.8555 0.6280 0.720 0.280
#> SRR1448029 2 0.2423 0.8759 0.040 0.960
#> SRR813802 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.5178 0.8674 0.116 0.884
#> SRR1435311 2 0.7219 0.8101 0.200 0.800
#> SRR612395 2 0.2603 0.8799 0.044 0.956
#> SRR603116 2 0.3584 0.8831 0.068 0.932
#> SRR1323152 2 0.2043 0.8773 0.032 0.968
#> SRR1368264 1 0.8608 0.5967 0.716 0.284
#> SRR1326624 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1429265 2 0.6623 0.8084 0.172 0.828
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.9754 0.4631 0.408 0.592
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.9608 0.3389 0.616 0.384
#> SRR815044 2 0.8608 0.7095 0.284 0.716
#> SRR1338560 2 0.6973 0.8214 0.188 0.812
#> SRR615862 2 0.5178 0.8687 0.116 0.884
#> SRR1480038 2 0.7219 0.8101 0.200 0.800
#> SRR659436 2 0.4022 0.8754 0.080 0.920
#> SRR613699 2 0.1184 0.8787 0.016 0.984
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.9000 0.6554 0.316 0.684
#> SRR1330327 2 0.6623 0.8246 0.172 0.828
#> SRR1489950 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.2423 0.8759 0.040 0.960
#> SRR1444002 1 0.0672 0.8996 0.992 0.008
#> SRR1318444 2 0.8763 0.6581 0.296 0.704
#> SRR600656 2 0.7299 0.7974 0.204 0.796
#> SRR658766 2 0.3114 0.8844 0.056 0.944
#> SRR655946 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.5946 0.8317 0.144 0.856
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.8386 0.6282 0.732 0.268
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.4562 0.8728 0.096 0.904
#> SRR662498 2 0.3114 0.8792 0.056 0.944
#> SRR1376764 2 0.3431 0.8751 0.064 0.936
#> SRR1377006 2 0.1633 0.8817 0.024 0.976
#> SRR656860 2 0.7056 0.8159 0.192 0.808
#> SRR1480547 2 0.9881 0.3720 0.436 0.564
#> SRR1452515 2 0.2423 0.8780 0.040 0.960
#> SRR1324390 2 0.1633 0.8807 0.024 0.976
#> SRR615273 1 0.9044 0.5341 0.680 0.320
#> SRR601695 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR820907 2 0.6247 0.8454 0.156 0.844
#> SRR812773 1 0.5629 0.8193 0.868 0.132
#> SRR1405984 2 0.4562 0.8760 0.096 0.904
#> SRR1472794 2 0.0672 0.8770 0.008 0.992
#> SRR1365448 1 0.0938 0.8990 0.988 0.012
#> SRR1095720 2 0.3431 0.8764 0.064 0.936
#> SRR1435626 2 0.4690 0.8553 0.100 0.900
#> SRR1080766 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1377862 1 0.2603 0.8883 0.956 0.044
#> SRR1332299 2 0.1184 0.8768 0.016 0.984
#> SRR1467966 2 0.2236 0.8767 0.036 0.964
#> SRR1320579 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1319710 2 0.7376 0.8028 0.208 0.792
#> SRR1326604 2 0.5059 0.8728 0.112 0.888
#> SRR1098879 1 0.9775 0.3071 0.588 0.412
#> SRR662245 2 0.1184 0.8787 0.016 0.984
#> SRR1074719 2 0.4562 0.8760 0.096 0.904
#> SRR816226 1 0.6148 0.7995 0.848 0.152
#> SRR601387 2 0.1184 0.8790 0.016 0.984
#> SRR614575 2 0.5178 0.8687 0.116 0.884
#> SRR1353900 2 0.3431 0.8806 0.064 0.936
#> SRR662906 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1350832 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1403280 2 0.6801 0.8288 0.180 0.820
#> SRR1313969 2 0.6712 0.8228 0.176 0.824
#> SRR1388528 1 0.0672 0.8997 0.992 0.008
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4939 0.8411 0.892 0.108
#> SRR655399 2 0.3274 0.8771 0.060 0.940
#> SRR1319753 2 0.9522 0.5449 0.372 0.628
#> SRR818901 2 0.1843 0.8760 0.028 0.972
#> SRR607067 2 0.8955 0.6568 0.312 0.688
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.7950 0.7687 0.240 0.760
#> SRR661961 2 0.9552 0.4738 0.376 0.624
#> SRR658259 2 0.2948 0.8836 0.052 0.948
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1365034 2 0.8813 0.6871 0.300 0.700
#> SRR1478053 2 0.3733 0.8806 0.072 0.928
#> SRR1475300 2 0.6887 0.8237 0.184 0.816
#> SRR1328101 2 0.3274 0.8778 0.060 0.940
#> SRR1322900 1 0.7602 0.7236 0.780 0.220
#> SRR1309942 2 0.1414 0.8795 0.020 0.980
#> SRR1345760 1 0.8661 0.6030 0.712 0.288
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.5519 0.8638 0.128 0.872
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR661469 2 0.6148 0.8403 0.152 0.848
#> SRR1500323 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1356705 1 0.9896 0.0979 0.560 0.440
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.8016 0.7292 0.244 0.756
#> SRR1350435 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1389177 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.3431 0.8832 0.064 0.936
#> SRR601815 2 0.1414 0.8803 0.020 0.980
#> SRR613330 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.5629 0.8653 0.132 0.868
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.2603 0.8770 0.044 0.956
#> SRR1318839 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.7219 0.7977 0.200 0.800
#> SRR613126 2 0.0672 0.8770 0.008 0.992
#> SRR1089424 2 0.6623 0.8345 0.172 0.828
#> SRR1347214 2 0.3431 0.8824 0.064 0.936
#> SRR1309556 2 0.8144 0.7662 0.252 0.748
#> SRR1456027 1 0.5519 0.8218 0.872 0.128
#> SRR1400551 2 0.7299 0.7770 0.204 0.796
#> SRR1320469 1 0.0938 0.8990 0.988 0.012
#> SRR614251 2 0.1843 0.8817 0.028 0.972
#> SRR1454310 2 0.1184 0.8788 0.016 0.984
#> SRR615105 2 0.0938 0.8779 0.012 0.988
#> SRR1433290 2 0.1184 0.8768 0.016 0.984
#> SRR2166064 2 0.9427 0.5532 0.360 0.640
#> SRR601671 2 0.6887 0.8233 0.184 0.816
#> SRR663874 2 0.2423 0.8846 0.040 0.960
#> SRR1409130 2 0.1184 0.8789 0.016 0.984
#> SRR659696 2 0.7745 0.7747 0.228 0.772
#> SRR1408249 2 0.9044 0.6477 0.320 0.680
#> SRR663284 2 0.7883 0.7705 0.236 0.764
#> SRR1402794 2 0.6048 0.8446 0.148 0.852
#> SRR614852 2 0.6623 0.8246 0.172 0.828
#> SRR1348040 2 0.6623 0.8219 0.172 0.828
#> SRR1489610 2 0.7376 0.8028 0.208 0.792
#> SRR1488091 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1499566 2 0.9358 0.5981 0.352 0.648
#> SRR1361480 2 0.3879 0.8809 0.076 0.924
#> SRR1444501 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.6887 0.8337 0.184 0.816
#> SRR1388832 2 0.6623 0.8219 0.172 0.828
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR662918 2 0.9460 0.5432 0.364 0.636
#> SRR817421 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.6801 0.8282 0.180 0.820
#> SRR608264 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.3114 0.8812 0.944 0.056
#> SRR1454117 2 0.6887 0.8252 0.184 0.816
#> SRR1312684 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR615044 1 0.9044 0.5341 0.680 0.320
#> SRR1432743 2 0.0376 0.8754 0.004 0.996
#> SRR1388873 2 0.3114 0.8847 0.056 0.944
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.4562 0.8623 0.096 0.904
#> SRR1406008 2 0.6973 0.8269 0.188 0.812
#> SRR1396786 2 0.1414 0.8795 0.020 0.980
#> SRR1446564 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1318465 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.9000 0.6485 0.316 0.684
#> SRR655170 2 0.5946 0.8549 0.144 0.856
#> SRR1087825 2 0.7219 0.7977 0.200 0.800
#> SRR662019 2 0.9170 0.5690 0.332 0.668
#> SRR1349209 2 0.8763 0.6581 0.296 0.704
#> SRR1326161 2 0.3274 0.8830 0.060 0.940
#> SRR1345284 2 0.6973 0.8214 0.188 0.812
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.6343 0.8443 0.160 0.840
#> SRR1454328 2 0.1184 0.8790 0.016 0.984
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4939 0.8411 0.892 0.108
#> SRR1408183 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.2948 0.8787 0.052 0.948
#> SRR660709 2 0.2423 0.8840 0.040 0.960
#> SRR809444 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.1184 0.8789 0.016 0.984
#> SRR1375774 1 0.3431 0.8759 0.936 0.064
#> SRR1326292 1 0.6973 0.7618 0.812 0.188
#> SRR657139 1 0.1414 0.8967 0.980 0.020
#> SRR1440744 2 0.7815 0.7783 0.232 0.768
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.5519 0.8638 0.128 0.872
#> SRR1381775 1 0.0376 0.9004 0.996 0.004
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.6438 0.8398 0.164 0.836
#> SRR658989 2 0.4562 0.8728 0.096 0.904
#> SRR1353663 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR811771 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.5842 0.8597 0.140 0.860
#> SRR1367988 2 0.8813 0.6706 0.300 0.700
#> SRR1331922 1 0.3733 0.8707 0.928 0.072
#> SRR615479 1 0.8267 0.6467 0.740 0.260
#> SRR1375796 2 0.1843 0.8817 0.028 0.972
#> SRR1386991 2 0.3431 0.8786 0.064 0.936
#> SRR1355217 2 0.3431 0.8751 0.064 0.936
#> SRR1356290 2 0.1184 0.8793 0.016 0.984
#> SRR659507 2 0.3879 0.8749 0.076 0.924
#> SRR663296 1 0.0938 0.8989 0.988 0.012
#> SRR598044 2 0.5519 0.8623 0.128 0.872
#> SRR661155 2 0.9427 0.5532 0.360 0.640
#> SRR1414727 2 0.9460 0.5369 0.364 0.636
#> SRR663477 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1354489 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.6712 0.8061 0.176 0.824
#> SRR614611 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR655052 2 0.4690 0.8727 0.100 0.900
#> SRR1478968 1 0.5519 0.8218 0.872 0.128
#> SRR1351280 2 0.8861 0.6805 0.304 0.696
#> SRR613951 1 0.8608 0.6071 0.716 0.284
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.8608 0.6808 0.284 0.716
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.6048 0.8446 0.148 0.852
#> SRR655040 1 0.9686 0.3121 0.604 0.396
#> SRR810225 2 0.4431 0.8770 0.092 0.908
#> SRR1325377 2 0.6048 0.8515 0.148 0.852
#> SRR617829 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR1402328 2 0.1184 0.8787 0.016 0.984
#> SRR1480455 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1442104 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0938 0.8990 0.988 0.012
#> SRR1481396 2 0.6973 0.7907 0.188 0.812
#> SRR1414314 2 0.1414 0.8801 0.020 0.980
#> SRR663026 2 0.2603 0.8832 0.044 0.956
#> SRR1478386 2 0.8443 0.7237 0.272 0.728
#> SRR1458683 2 0.6531 0.8301 0.168 0.832
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.8763 0.5864 0.704 0.296
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.7219 0.7977 0.200 0.800
#> SRR660260 2 0.3274 0.8794 0.060 0.940
#> SRR1071231 2 0.2948 0.8827 0.052 0.948
#> SRR1459125 2 0.8016 0.7654 0.244 0.756
#> SRR1337173 2 0.0376 0.8754 0.004 0.996
#> SRR1396250 2 0.3114 0.8774 0.056 0.944
#> SRR2166376 2 0.3431 0.8764 0.064 0.936
#> SRR659816 2 0.2423 0.8840 0.040 0.960
#> SRR1401379 2 0.7376 0.8028 0.208 0.792
#> SRR600981 2 0.9087 0.6360 0.324 0.676
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.8763 0.6913 0.296 0.704
#> SRR660115 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.1184 0.8791 0.016 0.984
#> SRR1359780 2 0.1184 0.8788 0.016 0.984
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.7139 0.7477 0.804 0.196
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1319648 2 0.7883 0.7701 0.236 0.764
#> SRR1092985 1 0.8207 0.6562 0.744 0.256
#> SRR656409 2 0.9522 0.5369 0.372 0.628
#> SRR1468658 2 0.1414 0.8812 0.020 0.980
#> SRR1390437 1 0.8608 0.6071 0.716 0.284
#> SRR658057 2 0.7056 0.8182 0.192 0.808
#> SRR612635 2 0.6623 0.8326 0.172 0.828
#> SRR1351480 2 0.4690 0.8705 0.100 0.900
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.2948 0.8826 0.948 0.052
#> SRR659590 2 0.2778 0.8823 0.048 0.952
#> SRR614263 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.6712 0.8288 0.176 0.824
#> SRR659911 2 0.1184 0.8787 0.016 0.984
#> SRR1085519 2 0.2423 0.8759 0.040 0.960
#> SRR1345894 2 0.2778 0.8770 0.048 0.952
#> SRR1442928 2 0.2603 0.8799 0.044 0.956
#> SRR1464681 2 0.7219 0.7977 0.200 0.800
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0376 0.8754 0.004 0.996
#> SRR1365426 1 0.8443 0.6174 0.728 0.272
#> SRR1487947 1 0.1184 0.8982 0.984 0.016
#> SRR659708 1 0.2948 0.8826 0.948 0.052
#> SRR603236 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR660673 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1414 0.8795 0.020 0.980
#> SRR663807 2 0.3274 0.8817 0.060 0.940
#> SRR1087245 2 0.6973 0.8212 0.188 0.812
#> SRR1339108 2 0.7299 0.8123 0.204 0.796
#> SRR613426 1 0.7602 0.7122 0.780 0.220
#> SRR613879 2 0.1843 0.8819 0.028 0.972
#> SRR1385101 1 0.7745 0.6920 0.772 0.228
#> SRR1387966 2 0.2423 0.8832 0.040 0.960
#> SRR1458852 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR1430489 1 0.5408 0.8256 0.876 0.124
#> SRR1349231 1 0.3274 0.8753 0.940 0.060
#> SRR1376249 2 0.6973 0.7907 0.188 0.812
#> SRR1321987 2 0.0938 0.8776 0.012 0.988
#> SRR662653 2 0.2778 0.8823 0.048 0.952
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.5519 0.8623 0.128 0.872
#> SRR1383081 2 0.6973 0.8207 0.188 0.812
#> SRR2166960 2 0.3274 0.8848 0.060 0.940
#> SRR605101 2 0.7815 0.7801 0.232 0.768
#> SRR818600 2 0.3584 0.8808 0.068 0.932
#> SRR1367715 2 0.6712 0.8306 0.176 0.824
#> SRR1351979 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.2236 0.8760 0.036 0.964
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1184 0.8787 0.016 0.984
#> SRR612767 1 0.2603 0.8878 0.956 0.044
#> SRR1489030 2 0.2948 0.8829 0.052 0.948
#> SRR1430375 2 0.1184 0.8793 0.016 0.984
#> SRR615225 2 0.9087 0.6360 0.324 0.676
#> SRR1401839 2 0.5408 0.8608 0.124 0.876
#> SRR1379110 2 0.6973 0.8214 0.188 0.812
#> SRR1077288 2 0.7219 0.7787 0.200 0.800
#> SRR1331639 2 0.7219 0.7977 0.200 0.800
#> SRR1342782 1 0.9044 0.5175 0.680 0.320
#> SRR1443003 2 0.0672 0.8760 0.008 0.992
#> SRR612839 1 0.0938 0.8990 0.988 0.012
#> SRR1470093 2 0.0672 0.8775 0.008 0.992
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0672 0.8767 0.008 0.992
#> SRR664063 1 0.8813 0.5659 0.700 0.300
#> SRR1488214 1 0.2948 0.8841 0.948 0.052
#> SRR654766 2 0.8813 0.6706 0.300 0.700
#> SRR1320321 2 0.6247 0.8454 0.156 0.844
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.6973 0.8207 0.188 0.812
#> SRR1488470 2 0.9881 0.3720 0.436 0.564
#> SRR1389497 2 0.0000 0.8739 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.2236 0.8767 0.036 0.964
#> SRR615311 1 0.0000 0.9011 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0592 0.7063 0.000 0.988 0.012
#> SRR1380716 2 0.3610 0.7238 0.096 0.888 0.016
#> SRR612803 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.1129 0.8798 0.976 0.020 0.004
#> SRR1084417 1 0.1711 0.8761 0.960 0.008 0.032
#> SRR1074359 2 0.2796 0.6704 0.000 0.908 0.092
#> SRR1419258 3 0.5560 0.7124 0.000 0.300 0.700
#> SRR1403366 2 0.8093 -0.2770 0.068 0.516 0.416
#> SRR665262 2 0.5343 0.6082 0.052 0.816 0.132
#> SRR1499740 1 0.6171 0.7088 0.776 0.144 0.080
#> SRR1105057 2 0.2339 0.7239 0.048 0.940 0.012
#> SRR1439742 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 2 0.5635 0.5564 0.036 0.784 0.180
#> SRR612215 2 0.5285 0.5976 0.040 0.812 0.148
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.2590 0.8579 0.924 0.004 0.072
#> SRR1409263 3 0.6151 0.6264 0.160 0.068 0.772
#> SRR1431288 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.5816 0.6351 0.224 0.752 0.024
#> SRR614839 2 0.4629 0.6760 0.188 0.808 0.004
#> SRR658433 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1088581 2 0.3941 0.6100 0.000 0.844 0.156
#> SRR1328797 3 0.5560 0.7124 0.000 0.300 0.700
#> SRR1334512 2 0.4063 0.7213 0.112 0.868 0.020
#> SRR1471117 1 0.1129 0.8818 0.976 0.004 0.020
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0424 0.7063 0.000 0.992 0.008
#> SRR1354955 2 0.7389 -0.1030 0.036 0.556 0.408
#> SRR654802 3 0.5220 0.7318 0.012 0.208 0.780
#> SRR660066 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1447103 2 0.5178 0.5844 0.028 0.808 0.164
#> SRR1402153 3 0.8464 -0.1497 0.448 0.088 0.464
#> SRR655887 2 0.3091 0.7258 0.072 0.912 0.016
#> SRR1408529 2 0.4796 0.5235 0.000 0.780 0.220
#> SRR658707 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.4563 0.7186 0.112 0.852 0.036
#> SRR1074670 3 0.8618 0.5045 0.104 0.388 0.508
#> SRR1375439 2 0.9184 0.0525 0.188 0.528 0.284
#> SRR1329003 1 0.6254 0.7243 0.756 0.056 0.188
#> SRR1404837 2 0.6203 0.6604 0.184 0.760 0.056
#> SRR1317920 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1455525 1 0.6541 0.6956 0.732 0.056 0.212
#> SRR613999 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 2 0.7801 -0.3004 0.052 0.520 0.428
#> SRR1068855 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1375509 3 0.5263 0.6565 0.116 0.060 0.824
#> SRR612227 3 0.8618 0.5045 0.104 0.388 0.508
#> SRR1388809 2 0.2599 0.7239 0.052 0.932 0.016
#> SRR1413872 2 0.7211 0.5489 0.128 0.716 0.156
#> SRR1452864 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1473078 3 0.8238 0.6608 0.104 0.300 0.596
#> SRR615814 2 0.2902 0.7261 0.064 0.920 0.016
#> SRR1325225 1 0.5202 0.7843 0.820 0.044 0.136
#> SRR1313687 2 0.4068 0.7180 0.120 0.864 0.016
#> SRR1358220 2 0.3965 0.7115 0.132 0.860 0.008
#> SRR1096662 2 0.6211 0.6273 0.228 0.736 0.036
#> SRR1487746 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.7189 0.4841 0.656 0.292 0.052
#> SRR660164 2 0.1015 0.7104 0.008 0.980 0.012
#> SRR815783 2 0.1832 0.7230 0.036 0.956 0.008
#> SRR809595 1 0.7495 0.5289 0.668 0.248 0.084
#> SRR1403133 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR815470 2 0.2066 0.6882 0.000 0.940 0.060
#> SRR1344382 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.3500 0.6497 0.004 0.880 0.116
#> SRR1478362 2 0.3500 0.6497 0.004 0.880 0.116
#> SRR1392186 2 0.6287 0.5812 0.272 0.704 0.024
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1453 0.8800 0.968 0.008 0.024
#> SRR1471594 1 0.0237 0.8879 0.996 0.004 0.000
#> SRR1354270 2 0.9229 -0.1860 0.164 0.488 0.348
#> SRR612683 2 0.1751 0.7139 0.012 0.960 0.028
#> SRR1392901 2 0.3192 0.6548 0.000 0.888 0.112
#> SRR1077805 3 0.6225 0.5576 0.000 0.432 0.568
#> SRR1360402 2 0.0424 0.7063 0.000 0.992 0.008
#> SRR1406112 2 0.7389 -0.1030 0.036 0.556 0.408
#> SRR1355352 3 0.8271 0.6688 0.156 0.212 0.632
#> SRR656247 1 0.3009 0.8501 0.920 0.052 0.028
#> SRR813656 2 0.7392 0.2201 0.468 0.500 0.032
#> SRR808244 1 0.7181 0.4463 0.564 0.028 0.408
#> SRR1387240 2 0.0892 0.7027 0.000 0.980 0.020
#> SRR1408595 1 0.2443 0.8691 0.940 0.028 0.032
#> SRR1385277 1 0.9047 0.1965 0.508 0.344 0.148
#> SRR1435248 2 0.0661 0.7084 0.004 0.988 0.008
#> SRR1419110 2 0.7400 0.3160 0.072 0.664 0.264
#> SRR1408682 2 0.2313 0.7081 0.024 0.944 0.032
#> SRR1317134 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4634 0.6931 0.164 0.824 0.012
#> SRR1453911 2 0.4295 0.6780 0.032 0.864 0.104
#> SRR603164 2 0.6309 -0.4098 0.000 0.504 0.496
#> SRR1383259 2 0.8426 0.3377 0.384 0.524 0.092
#> SRR1330854 1 0.3272 0.8393 0.892 0.004 0.104
#> SRR1452423 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.5156 0.6503 0.216 0.776 0.008
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.6948 -0.3375 0.016 0.512 0.472
#> SRR1361546 1 0.6735 0.5538 0.696 0.260 0.044
#> SRR1486156 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.1031 0.7020 0.000 0.976 0.024
#> SRR615635 2 0.2902 0.7261 0.064 0.920 0.016
#> SRR1385411 2 0.5470 0.6839 0.168 0.796 0.036
#> SRR1342739 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.6678 0.7246 0.064 0.208 0.728
#> SRR662126 2 0.6646 0.5966 0.240 0.712 0.048
#> SRR1464601 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1071594 2 0.3752 0.7237 0.096 0.884 0.020
#> SRR612539 2 0.5455 0.6731 0.184 0.788 0.028
#> SRR602010 1 0.6937 0.5288 0.680 0.272 0.048
#> SRR810249 2 0.1620 0.7184 0.024 0.964 0.012
#> SRR818773 1 0.6834 0.5532 0.692 0.260 0.048
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.1182 0.7145 0.012 0.976 0.012
#> SRR1442754 1 0.2772 0.8543 0.916 0.004 0.080
#> SRR1334247 2 0.7591 -0.1682 0.044 0.544 0.412
#> SRR661639 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.7438 0.3906 0.392 0.568 0.040
#> SRR1459937 1 0.9464 -0.0783 0.412 0.408 0.180
#> SRR2185018 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.3573 0.7166 0.120 0.876 0.004
#> SRR809348 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.8618 0.5045 0.104 0.388 0.508
#> SRR661074 3 0.5497 0.6543 0.124 0.064 0.812
#> SRR1349851 1 0.2152 0.8727 0.948 0.016 0.036
#> SRR1405123 2 0.8362 0.3407 0.384 0.528 0.088
#> SRR661096 2 0.6601 0.5482 0.296 0.676 0.028
#> SRR1320225 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6254 0.7243 0.756 0.056 0.188
#> SRR1307677 2 0.3415 0.7257 0.080 0.900 0.020
#> SRR1466512 2 0.4164 0.7031 0.144 0.848 0.008
#> SRR658212 2 0.3415 0.7257 0.080 0.900 0.020
#> SRR1430525 3 0.5988 0.6534 0.000 0.368 0.632
#> SRR1344422 2 0.8699 0.3193 0.376 0.512 0.112
#> SRR1353924 2 0.4195 0.7097 0.136 0.852 0.012
#> SRR1314832 1 0.5831 0.5977 0.708 0.008 0.284
#> SRR1487570 1 0.5202 0.7843 0.820 0.044 0.136
#> SRR627431 2 0.1289 0.6993 0.000 0.968 0.032
#> SRR1418561 1 0.7673 0.5729 0.664 0.100 0.236
#> SRR1448029 3 0.7169 0.6036 0.028 0.404 0.568
#> SRR813802 1 0.0237 0.8882 0.996 0.000 0.004
#> SRR815020 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3610 0.7227 0.096 0.888 0.016
#> SRR1435311 2 0.4755 0.6803 0.184 0.808 0.008
#> SRR612395 2 0.4873 0.6015 0.024 0.824 0.152
#> SRR603116 2 0.2446 0.7264 0.052 0.936 0.012
#> SRR1323152 3 0.7188 0.3656 0.024 0.488 0.488
#> SRR1368264 1 0.6771 0.5296 0.684 0.276 0.040
#> SRR1326624 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1429265 3 0.6383 0.6935 0.104 0.128 0.768
#> SRR1327702 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.7192 0.4179 0.380 0.588 0.032
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.7841 0.2670 0.576 0.360 0.064
#> SRR815044 2 0.6379 0.5973 0.256 0.712 0.032
#> SRR1338560 2 0.4473 0.6935 0.164 0.828 0.008
#> SRR615862 2 0.3459 0.7238 0.096 0.892 0.012
#> SRR1480038 2 0.4755 0.6803 0.184 0.808 0.008
#> SRR659436 2 0.7146 0.3620 0.060 0.676 0.264
#> SRR613699 2 0.0424 0.7059 0.000 0.992 0.008
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.6570 0.5557 0.292 0.680 0.028
#> SRR1330327 2 0.6374 0.6078 0.100 0.768 0.132
#> SRR1489950 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1431927 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.7032 0.6537 0.028 0.368 0.604
#> SRR1444002 1 0.1031 0.8810 0.976 0.000 0.024
#> SRR1318444 2 0.9796 -0.1475 0.248 0.420 0.332
#> SRR600656 2 0.7333 0.5503 0.136 0.708 0.156
#> SRR658766 2 0.5688 0.5969 0.044 0.788 0.168
#> SRR655946 3 0.6215 0.5667 0.000 0.428 0.572
#> SRR817282 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.6728 0.7140 0.080 0.184 0.736
#> SRR1406418 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.6834 0.5532 0.692 0.260 0.048
#> SRR1471965 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.7918 0.1830 0.076 0.596 0.328
#> SRR662498 2 0.5295 0.5942 0.036 0.808 0.156
#> SRR1376764 2 0.7104 0.1203 0.032 0.608 0.360
#> SRR1377006 2 0.6910 0.0214 0.020 0.584 0.396
#> SRR656860 2 0.4749 0.6866 0.172 0.816 0.012
#> SRR1480547 2 0.8157 0.3545 0.384 0.540 0.076
#> SRR1452515 2 0.6750 0.2069 0.024 0.640 0.336
#> SRR1324390 2 0.0848 0.7108 0.008 0.984 0.008
#> SRR615273 1 0.8120 0.4791 0.640 0.224 0.136
#> SRR601695 2 0.2261 0.6838 0.000 0.932 0.068
#> SRR820907 2 0.3918 0.7082 0.140 0.856 0.004
#> SRR812773 1 0.4676 0.7826 0.848 0.112 0.040
#> SRR1405984 2 0.2939 0.7259 0.072 0.916 0.012
#> SRR1472794 2 0.1647 0.7013 0.004 0.960 0.036
#> SRR1365448 1 0.1267 0.8806 0.972 0.004 0.024
#> SRR1095720 2 0.7460 -0.2204 0.036 0.524 0.440
#> SRR1435626 2 0.8387 -0.3450 0.084 0.488 0.428
#> SRR1080766 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1377862 1 0.2031 0.8748 0.952 0.016 0.032
#> SRR1332299 3 0.6905 0.5354 0.016 0.440 0.544
#> SRR1467966 2 0.7240 -0.1891 0.028 0.540 0.432
#> SRR1320579 2 0.3752 0.6265 0.000 0.856 0.144
#> SRR1319710 2 0.4629 0.6760 0.188 0.808 0.004
#> SRR1326604 2 0.3587 0.7263 0.088 0.892 0.020
#> SRR1098879 3 0.7987 -0.1428 0.448 0.060 0.492
#> SRR662245 2 0.0592 0.7054 0.000 0.988 0.012
#> SRR1074719 2 0.2939 0.7259 0.072 0.916 0.012
#> SRR816226 1 0.5939 0.7532 0.788 0.072 0.140
#> SRR601387 2 0.0829 0.7078 0.004 0.984 0.012
#> SRR614575 2 0.3459 0.7238 0.096 0.892 0.012
#> SRR1353900 2 0.2446 0.7241 0.052 0.936 0.012
#> SRR662906 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1350832 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1403280 2 0.4723 0.6956 0.160 0.824 0.016
#> SRR1313969 2 0.6865 0.5761 0.104 0.736 0.160
#> SRR1388528 1 0.0829 0.8847 0.984 0.004 0.012
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4137 0.8055 0.872 0.096 0.032
#> SRR655399 3 0.4805 0.7202 0.012 0.176 0.812
#> SRR1319753 2 0.6696 0.4753 0.348 0.632 0.020
#> SRR818901 3 0.7013 0.5464 0.020 0.432 0.548
#> SRR607067 2 0.7782 0.5268 0.256 0.648 0.096
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.5315 0.6499 0.216 0.772 0.012
#> SRR661961 2 0.9174 0.0465 0.332 0.504 0.164
#> SRR658259 2 0.2313 0.7222 0.032 0.944 0.024
#> SRR1310476 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1365034 2 0.7318 0.5628 0.264 0.668 0.068
#> SRR1478053 2 0.2339 0.7239 0.048 0.940 0.012
#> SRR1475300 2 0.4351 0.6920 0.168 0.828 0.004
#> SRR1328101 2 0.5285 0.5976 0.040 0.812 0.148
#> SRR1322900 1 0.6567 0.6762 0.752 0.160 0.088
#> SRR1309942 2 0.0237 0.7069 0.000 0.996 0.004
#> SRR1345760 1 0.8076 0.5457 0.652 0.180 0.168
#> SRR1435418 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.5423 0.6932 0.096 0.820 0.084
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0747 0.7057 0.000 0.984 0.016
#> SRR661469 2 0.8380 0.1721 0.124 0.600 0.276
#> SRR1500323 2 0.1031 0.7025 0.000 0.976 0.024
#> SRR1356705 1 0.7248 0.0152 0.536 0.436 0.028
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.9706 -0.3433 0.220 0.412 0.368
#> SRR1350435 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1389177 2 0.6299 -0.2861 0.000 0.524 0.476
#> SRR1368072 2 0.2063 0.7240 0.044 0.948 0.008
#> SRR601815 2 0.1015 0.7099 0.008 0.980 0.012
#> SRR613330 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.5965 0.6740 0.108 0.792 0.100
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.7213 -0.1598 0.028 0.552 0.420
#> SRR1318839 3 0.5058 0.7306 0.000 0.244 0.756
#> SRR1432390 2 0.7211 0.5489 0.128 0.716 0.156
#> SRR613126 2 0.1647 0.7013 0.004 0.960 0.036
#> SRR1089424 2 0.4228 0.7011 0.148 0.844 0.008
#> SRR1347214 2 0.2446 0.7260 0.052 0.936 0.012
#> SRR1309556 2 0.7945 0.5223 0.224 0.652 0.124
#> SRR1456027 1 0.5267 0.7806 0.816 0.044 0.140
#> SRR1400551 3 0.8101 0.6820 0.132 0.228 0.640
#> SRR1320469 1 0.1267 0.8806 0.972 0.004 0.024
#> SRR614251 2 0.1482 0.7133 0.012 0.968 0.020
#> SRR1454310 2 0.0424 0.7063 0.000 0.992 0.008
#> SRR615105 2 0.2261 0.6888 0.000 0.932 0.068
#> SRR1433290 3 0.6905 0.5354 0.016 0.440 0.544
#> SRR2166064 2 0.8362 0.4090 0.300 0.588 0.112
#> SRR601671 2 0.4634 0.6924 0.164 0.824 0.012
#> SRR663874 2 0.1751 0.7180 0.028 0.960 0.012
#> SRR1409130 2 0.0829 0.7078 0.004 0.984 0.012
#> SRR659696 2 0.7558 0.5477 0.164 0.692 0.144
#> SRR1408249 2 0.6601 0.5482 0.296 0.676 0.028
#> SRR663284 2 0.5156 0.6503 0.216 0.776 0.008
#> SRR1402794 3 0.8618 0.5045 0.104 0.388 0.508
#> SRR614852 2 0.6374 0.6078 0.100 0.768 0.132
#> SRR1348040 2 0.9074 -0.0322 0.156 0.516 0.328
#> SRR1489610 2 0.4629 0.6760 0.188 0.808 0.004
#> SRR1488091 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR1499566 2 0.6819 0.5037 0.328 0.644 0.028
#> SRR1361480 2 0.3009 0.7260 0.052 0.920 0.028
#> SRR1444501 3 0.5988 0.6534 0.000 0.368 0.632
#> SRR1415773 2 0.6463 0.6526 0.164 0.756 0.080
#> SRR1388832 2 0.9074 -0.0322 0.156 0.516 0.328
#> SRR1394637 1 0.0424 0.8873 0.992 0.000 0.008
#> SRR606974 2 0.1289 0.6993 0.000 0.968 0.032
#> SRR662918 2 0.8286 0.4069 0.308 0.588 0.104
#> SRR817421 3 0.5058 0.7306 0.000 0.244 0.756
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.4514 0.6977 0.156 0.832 0.012
#> SRR608264 3 0.5098 0.7305 0.000 0.248 0.752
#> SRR1318560 1 0.2590 0.8579 0.924 0.004 0.072
#> SRR1454117 2 0.4634 0.6931 0.164 0.824 0.012
#> SRR1312684 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR615044 1 0.8120 0.4791 0.640 0.224 0.136
#> SRR1432743 2 0.4796 0.5235 0.000 0.780 0.220
#> SRR1388873 2 0.2434 0.7236 0.036 0.940 0.024
#> SRR1353517 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.7351 0.3095 0.068 0.664 0.268
#> SRR1406008 2 0.4531 0.6947 0.168 0.824 0.008
#> SRR1396786 2 0.0661 0.7083 0.004 0.988 0.008
#> SRR1446564 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1318465 2 0.6299 -0.2915 0.000 0.524 0.476
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.7951 0.5117 0.260 0.636 0.104
#> SRR655170 2 0.4731 0.7143 0.128 0.840 0.032
#> SRR1087825 2 0.7211 0.5489 0.128 0.716 0.156
#> SRR662019 3 0.9309 0.5464 0.264 0.216 0.520
#> SRR1349209 2 0.9796 -0.1475 0.248 0.420 0.332
#> SRR1326161 2 0.2229 0.7240 0.044 0.944 0.012
#> SRR1345284 2 0.4473 0.6935 0.164 0.828 0.008
#> SRR1416672 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4195 0.7097 0.136 0.852 0.012
#> SRR1454328 2 0.0829 0.7078 0.004 0.984 0.012
#> SRR1489286 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4137 0.8055 0.872 0.096 0.032
#> SRR1408183 3 0.5178 0.7290 0.000 0.256 0.744
#> SRR1084369 3 0.5988 0.6534 0.000 0.368 0.632
#> SRR598452 3 0.5167 0.7298 0.016 0.192 0.792
#> SRR660709 2 0.4324 0.6597 0.028 0.860 0.112
#> SRR809444 1 0.0424 0.8873 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089901 2 0.0829 0.7073 0.004 0.984 0.012
#> SRR1375774 1 0.2903 0.8538 0.924 0.048 0.028
#> SRR1326292 1 0.6254 0.7243 0.756 0.056 0.188
#> SRR657139 1 0.1711 0.8761 0.960 0.008 0.032
#> SRR1440744 2 0.5414 0.6538 0.212 0.772 0.016
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0424 0.8873 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452334 2 0.5423 0.6932 0.096 0.820 0.084
#> SRR1381775 1 0.0237 0.8879 0.996 0.004 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.4326 0.7049 0.144 0.844 0.012
#> SRR658989 2 0.7918 0.1830 0.076 0.596 0.328
#> SRR1353663 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR811771 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.5058 0.7306 0.000 0.244 0.756
#> SRR819054 2 0.4139 0.7174 0.124 0.860 0.016
#> SRR1367988 2 0.8472 0.4290 0.228 0.612 0.160
#> SRR1331922 1 0.3112 0.8476 0.916 0.056 0.028
#> SRR615479 1 0.7022 0.5815 0.700 0.232 0.068
#> SRR1375796 2 0.1482 0.7133 0.012 0.968 0.020
#> SRR1386991 2 0.7388 0.1070 0.044 0.600 0.356
#> SRR1355217 2 0.7085 0.1385 0.032 0.612 0.356
#> SRR1356290 2 0.4353 0.6157 0.008 0.836 0.156
#> SRR659507 2 0.5696 0.5846 0.056 0.796 0.148
#> SRR663296 1 0.0592 0.8850 0.988 0.012 0.000
#> SRR598044 2 0.3845 0.7184 0.116 0.872 0.012
#> SRR661155 2 0.8362 0.4090 0.300 0.588 0.112
#> SRR1414727 2 0.9987 -0.2958 0.312 0.356 0.332
#> SRR663477 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1354489 2 0.6299 -0.2915 0.000 0.524 0.476
#> SRR1377800 3 0.7778 0.6954 0.104 0.240 0.656
#> SRR614611 2 0.1163 0.7028 0.000 0.972 0.028
#> SRR655052 2 0.5331 0.6682 0.076 0.824 0.100
#> SRR1478968 1 0.5267 0.7806 0.816 0.044 0.140
#> SRR1351280 2 0.7246 0.5515 0.276 0.664 0.060
#> SRR613951 1 0.7926 0.5376 0.656 0.216 0.128
#> SRR1418022 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.9734 -0.1194 0.236 0.432 0.332
#> SRR1408161 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.8618 0.5045 0.104 0.388 0.508
#> SRR655040 1 0.8143 0.2388 0.560 0.360 0.080
#> SRR810225 2 0.2939 0.7259 0.072 0.916 0.012
#> SRR1325377 2 0.3896 0.7127 0.128 0.864 0.008
#> SRR617829 2 0.3941 0.6111 0.000 0.844 0.156
#> SRR1402328 2 0.0424 0.7059 0.000 0.992 0.008
#> SRR1480455 2 0.1163 0.7028 0.000 0.972 0.028
#> SRR1442104 3 0.5058 0.7265 0.000 0.244 0.756
#> SRR1453416 1 0.1267 0.8806 0.972 0.004 0.024
#> SRR1481396 3 0.5357 0.6605 0.116 0.064 0.820
#> SRR1414314 2 0.0661 0.7089 0.004 0.988 0.008
#> SRR663026 2 0.1453 0.7198 0.024 0.968 0.008
#> SRR1478386 2 0.5803 0.6106 0.248 0.736 0.016
#> SRR1458683 2 0.7272 0.5154 0.096 0.700 0.204
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.7954 0.5418 0.660 0.192 0.148
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.7211 0.5489 0.128 0.716 0.156
#> SRR660260 2 0.5407 0.5943 0.040 0.804 0.156
#> SRR1071231 2 0.1585 0.7196 0.028 0.964 0.008
#> SRR1459125 2 0.8681 0.4173 0.216 0.596 0.188
#> SRR1337173 2 0.4062 0.6001 0.000 0.836 0.164
#> SRR1396250 3 0.4861 0.7218 0.012 0.180 0.808
#> SRR2166376 2 0.7460 -0.2204 0.036 0.524 0.440
#> SRR659816 2 0.4324 0.6597 0.028 0.860 0.112
#> SRR1401379 2 0.4629 0.6760 0.188 0.808 0.004
#> SRR600981 2 0.8109 0.4830 0.272 0.620 0.108
#> SRR1398335 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.7433 0.5437 0.268 0.660 0.072
#> SRR660115 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0829 0.7078 0.004 0.984 0.012
#> SRR1359780 2 0.0424 0.7063 0.000 0.992 0.008
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.6728 0.6558 0.736 0.184 0.080
#> SRR1397156 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0747 0.7057 0.000 0.984 0.016
#> SRR1319648 2 0.5156 0.6496 0.216 0.776 0.008
#> SRR1092985 1 0.6865 0.5067 0.596 0.020 0.384
#> SRR656409 2 0.7023 0.4673 0.344 0.624 0.032
#> SRR1468658 2 0.6769 0.0392 0.016 0.592 0.392
#> SRR1390437 1 0.7926 0.5376 0.656 0.216 0.128
#> SRR658057 2 0.4897 0.6888 0.172 0.812 0.016
#> SRR612635 2 0.4453 0.6991 0.152 0.836 0.012
#> SRR1351480 2 0.3293 0.7225 0.088 0.900 0.012
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3009 0.8501 0.920 0.052 0.028
#> SRR659590 2 0.1620 0.7184 0.024 0.964 0.012
#> SRR614263 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.4353 0.6975 0.156 0.836 0.008
#> SRR659911 2 0.0424 0.7059 0.000 0.992 0.008
#> SRR1085519 3 0.7032 0.6537 0.028 0.368 0.604
#> SRR1345894 2 0.7023 0.1576 0.032 0.624 0.344
#> SRR1442928 2 0.4873 0.6015 0.024 0.824 0.152
#> SRR1464681 2 0.7211 0.5489 0.128 0.716 0.156
#> SRR1418880 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.4062 0.6001 0.000 0.836 0.164
#> SRR1365426 1 0.6869 0.5438 0.688 0.264 0.048
#> SRR1487947 1 0.1399 0.8798 0.968 0.004 0.028
#> SRR659708 1 0.3009 0.8501 0.920 0.052 0.028
#> SRR603236 2 0.2356 0.6821 0.000 0.928 0.072
#> SRR660673 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0237 0.7069 0.000 0.996 0.004
#> SRR663807 2 0.2229 0.7226 0.044 0.944 0.012
#> SRR1087245 2 0.4840 0.6903 0.168 0.816 0.016
#> SRR1339108 2 0.6203 0.6604 0.184 0.760 0.056
#> SRR613426 1 0.6968 0.6700 0.732 0.148 0.120
#> SRR613879 2 0.1182 0.7145 0.012 0.976 0.012
#> SRR1385101 1 0.6276 0.6203 0.736 0.224 0.040
#> SRR1387966 2 0.2176 0.7215 0.032 0.948 0.020
#> SRR1458852 2 0.1031 0.7025 0.000 0.976 0.024
#> SRR1430489 1 0.5202 0.7843 0.820 0.044 0.136
#> SRR1349231 1 0.2902 0.8428 0.920 0.064 0.016
#> SRR1376249 3 0.5357 0.6605 0.116 0.064 0.820
#> SRR1321987 2 0.0592 0.7050 0.000 0.988 0.012
#> SRR662653 2 0.1620 0.7184 0.024 0.964 0.012
#> SRR1390027 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3845 0.7184 0.116 0.872 0.012
#> SRR1383081 2 0.4692 0.6905 0.168 0.820 0.012
#> SRR2166960 2 0.2229 0.7236 0.044 0.944 0.012
#> SRR605101 2 0.5109 0.6511 0.212 0.780 0.008
#> SRR818600 2 0.2550 0.7253 0.056 0.932 0.012
#> SRR1367715 2 0.4514 0.6976 0.156 0.832 0.012
#> SRR1351979 3 0.5138 0.7308 0.000 0.252 0.748
#> SRR1387054 3 0.6215 0.5667 0.000 0.428 0.572
#> SRR1444306 3 0.7121 0.5527 0.024 0.428 0.548
#> SRR1322662 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0424 0.7059 0.000 0.992 0.008
#> SRR612767 1 0.1999 0.8737 0.952 0.012 0.036
#> SRR1489030 2 0.2031 0.7209 0.032 0.952 0.016
#> SRR1430375 2 0.2229 0.7019 0.012 0.944 0.044
#> SRR615225 2 0.8109 0.4830 0.272 0.620 0.108
#> SRR1401839 2 0.7949 0.3784 0.108 0.640 0.252
#> SRR1379110 2 0.4473 0.6935 0.164 0.828 0.008
#> SRR1077288 3 0.5497 0.6543 0.124 0.064 0.812
#> SRR1331639 2 0.7211 0.5489 0.128 0.716 0.156
#> SRR1342782 1 0.6962 0.4552 0.648 0.316 0.036
#> SRR1443003 3 0.6659 0.5016 0.008 0.460 0.532
#> SRR612839 1 0.1129 0.8818 0.976 0.004 0.020
#> SRR1470093 3 0.6062 0.6356 0.000 0.384 0.616
#> SRR1395742 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.3482 0.6406 0.000 0.872 0.128
#> SRR664063 1 0.7159 0.4966 0.660 0.288 0.052
#> SRR1488214 1 0.2297 0.8713 0.944 0.020 0.036
#> SRR654766 2 0.8472 0.4290 0.228 0.612 0.160
#> SRR1320321 2 0.3918 0.7082 0.140 0.856 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4692 0.6905 0.168 0.820 0.012
#> SRR1488470 2 0.8157 0.3545 0.384 0.540 0.076
#> SRR1389497 3 0.5178 0.7290 0.000 0.256 0.744
#> SRR1367109 2 0.7240 -0.1891 0.028 0.540 0.432
#> SRR615311 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0937 0.74078 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1380716 2 0.3103 0.75385 0.072 0.892 0.008 0.028
#> SRR612803 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.1182 0.84024 0.968 0.016 0.000 0.016
#> SRR1084417 1 0.1733 0.83224 0.948 0.000 0.024 0.028
#> SRR1074359 2 0.3335 0.69121 0.000 0.860 0.120 0.020
#> SRR1419258 3 0.2796 0.44973 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR1403366 2 0.7645 -0.31189 0.040 0.448 0.428 0.084
#> SRR665262 2 0.5694 0.59066 0.028 0.752 0.144 0.076
#> SRR1499740 1 0.6220 0.63308 0.736 0.112 0.072 0.080
#> SRR1105057 2 0.1816 0.75231 0.024 0.948 0.004 0.024
#> SRR1439742 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 2 0.5969 0.52894 0.020 0.716 0.188 0.076
#> SRR612215 2 0.5597 0.59034 0.024 0.756 0.144 0.076
#> SRR1094051 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.2578 0.81334 0.912 0.000 0.036 0.052
#> SRR1409263 3 0.6590 0.09549 0.120 0.008 0.644 0.228
#> SRR1431288 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.5409 0.68006 0.168 0.744 0.004 0.084
#> SRR614839 2 0.4405 0.71148 0.152 0.800 0.000 0.048
#> SRR658433 2 0.0804 0.73824 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1088581 2 0.4079 0.63114 0.000 0.800 0.180 0.020
#> SRR1328797 3 0.2796 0.44973 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR1334512 2 0.3767 0.75214 0.084 0.860 0.008 0.048
#> SRR1471117 1 0.1004 0.84375 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1311553 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0672 0.73970 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1354955 2 0.6909 -0.25531 0.012 0.460 0.456 0.072
#> SRR654802 3 0.3555 0.40052 0.004 0.048 0.868 0.080
#> SRR660066 2 0.0937 0.73935 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1447103 2 0.5420 0.56914 0.008 0.748 0.168 0.076
#> SRR1402153 4 0.4981 0.74793 0.012 0.052 0.156 0.780
#> SRR655887 2 0.2632 0.75496 0.048 0.916 0.008 0.028
#> SRR1408529 2 0.4737 0.53409 0.000 0.728 0.252 0.020
#> SRR658707 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.4369 0.74812 0.080 0.840 0.036 0.044
#> SRR1074670 3 0.8289 0.44999 0.056 0.312 0.492 0.140
#> SRR1375439 2 0.8825 -0.02878 0.148 0.464 0.292 0.096
#> SRR1329003 1 0.6553 0.46278 0.624 0.016 0.072 0.288
#> SRR1404837 2 0.5957 0.69686 0.128 0.744 0.040 0.088
#> SRR1317920 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1455525 1 0.6870 0.39512 0.592 0.016 0.088 0.304
#> SRR613999 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.7072 0.37581 0.024 0.432 0.480 0.064
#> SRR1068855 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1375509 3 0.5723 0.16451 0.084 0.000 0.696 0.220
#> SRR612227 3 0.8289 0.44999 0.056 0.312 0.492 0.140
#> SRR1388809 2 0.2335 0.75437 0.044 0.928 0.008 0.020
#> SRR1413872 2 0.5819 0.52553 0.016 0.664 0.032 0.288
#> SRR1452864 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1473078 3 0.8075 0.46609 0.076 0.212 0.572 0.140
#> SRR615814 2 0.2555 0.75558 0.040 0.920 0.008 0.032
#> SRR1325225 1 0.5751 0.56765 0.684 0.016 0.036 0.264
#> SRR1313687 2 0.3790 0.74917 0.088 0.860 0.012 0.040
#> SRR1358220 2 0.3307 0.74315 0.104 0.868 0.000 0.028
#> SRR1096662 2 0.5615 0.66947 0.176 0.728 0.004 0.092
#> SRR1487746 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.7195 0.40714 0.608 0.260 0.036 0.096
#> SRR660164 2 0.1362 0.74336 0.004 0.964 0.020 0.012
#> SRR815783 2 0.1593 0.75202 0.016 0.956 0.004 0.024
#> SRR809595 1 0.7294 0.43826 0.624 0.232 0.064 0.080
#> SRR1403133 2 0.0804 0.73824 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR815470 2 0.2706 0.71582 0.000 0.900 0.080 0.020
#> SRR1344382 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.3679 0.67244 0.004 0.840 0.140 0.016
#> SRR1478362 2 0.3679 0.67244 0.004 0.840 0.140 0.016
#> SRR1392186 2 0.5918 0.63240 0.208 0.696 0.004 0.092
#> SRR1347937 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1411 0.83988 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1471594 1 0.0376 0.85253 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1354270 2 0.8888 -0.21936 0.108 0.432 0.332 0.128
#> SRR612683 2 0.1510 0.74509 0.000 0.956 0.016 0.028
#> SRR1392901 2 0.3757 0.66533 0.000 0.828 0.152 0.020
#> SRR1077805 3 0.4642 0.51382 0.000 0.240 0.740 0.020
#> SRR1360402 2 0.0804 0.74068 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1406112 2 0.6909 -0.25531 0.012 0.460 0.456 0.072
#> SRR1355352 3 0.8191 0.34336 0.108 0.128 0.576 0.188
#> SRR656247 1 0.3398 0.79293 0.888 0.036 0.028 0.048
#> SRR813656 2 0.7163 0.32037 0.384 0.492 0.004 0.120
#> SRR808244 4 0.4828 0.81433 0.120 0.004 0.084 0.792
#> SRR1387240 2 0.1256 0.73806 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1408595 1 0.2719 0.82206 0.916 0.020 0.024 0.040
#> SRR1385277 1 0.8849 -0.12786 0.360 0.304 0.044 0.292
#> SRR1435248 2 0.0672 0.74118 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1419110 2 0.7243 0.28718 0.044 0.608 0.260 0.088
#> SRR1408682 2 0.2555 0.73592 0.008 0.920 0.040 0.032
#> SRR1317134 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4464 0.72699 0.124 0.812 0.004 0.060
#> SRR1453911 2 0.4247 0.69949 0.012 0.832 0.112 0.044
#> SRR603164 3 0.4855 0.47612 0.000 0.352 0.644 0.004
#> SRR1383259 2 0.7903 0.39321 0.280 0.508 0.020 0.192
#> SRR1330854 1 0.3398 0.78399 0.872 0.000 0.060 0.068
#> SRR1452423 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4920 0.69243 0.164 0.768 0.000 0.068
#> SRR1468162 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.5883 0.48871 0.000 0.388 0.572 0.040
#> SRR1361546 1 0.6690 0.47041 0.652 0.240 0.032 0.076
#> SRR1486156 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.1356 0.73517 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR615635 2 0.2555 0.75558 0.040 0.920 0.008 0.032
#> SRR1385411 2 0.4900 0.72105 0.116 0.788 0.004 0.092
#> SRR1342739 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.6445 0.44288 0.036 0.108 0.704 0.152
#> SRR662126 2 0.5961 0.64763 0.172 0.704 0.004 0.120
#> SRR1464601 2 0.0804 0.73824 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1071594 2 0.3424 0.75329 0.072 0.880 0.012 0.036
#> SRR612539 2 0.4888 0.71388 0.140 0.788 0.008 0.064
#> SRR602010 1 0.6924 0.44519 0.632 0.248 0.032 0.088
#> SRR810249 2 0.1124 0.74882 0.012 0.972 0.004 0.012
#> SRR818773 1 0.6840 0.46727 0.644 0.236 0.032 0.088
#> SRR1336569 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.1471 0.74662 0.004 0.960 0.012 0.024
#> SRR1442754 1 0.2908 0.80428 0.896 0.000 0.040 0.064
#> SRR1334247 3 0.7101 0.31261 0.020 0.444 0.464 0.072
#> SRR661639 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.7149 0.45421 0.312 0.560 0.012 0.116
#> SRR1459937 2 0.9068 -0.08111 0.296 0.372 0.064 0.268
#> SRR2185018 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.3182 0.74848 0.096 0.876 0.000 0.028
#> SRR809348 1 0.0188 0.85300 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR819261 3 0.8289 0.44999 0.056 0.312 0.492 0.140
#> SRR661074 3 0.6020 0.15513 0.092 0.004 0.684 0.220
#> SRR1349851 1 0.2521 0.81797 0.916 0.004 0.020 0.060
#> SRR1405123 2 0.7874 0.39774 0.280 0.512 0.020 0.188
#> SRR661096 2 0.5964 0.59946 0.244 0.676 0.004 0.076
#> SRR1320225 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6553 0.46278 0.624 0.016 0.072 0.288
#> SRR1307677 2 0.2928 0.75505 0.056 0.904 0.012 0.028
#> SRR1466512 2 0.3822 0.73294 0.120 0.844 0.004 0.032
#> SRR658212 2 0.2928 0.75505 0.056 0.904 0.012 0.028
#> SRR1430525 3 0.3672 0.50149 0.000 0.164 0.824 0.012
#> SRR1344422 2 0.8255 0.35591 0.272 0.484 0.032 0.212
#> SRR1353924 2 0.3509 0.74048 0.112 0.860 0.004 0.024
#> SRR1314832 1 0.6187 0.45514 0.672 0.000 0.184 0.144
#> SRR1487570 1 0.5751 0.56765 0.684 0.016 0.036 0.264
#> SRR627431 2 0.1767 0.73071 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR1418561 1 0.8058 0.25583 0.540 0.052 0.144 0.264
#> SRR1448029 3 0.5521 0.55151 0.004 0.240 0.704 0.052
#> SRR813802 1 0.0188 0.85297 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR815020 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3072 0.75223 0.076 0.892 0.008 0.024
#> SRR1435311 2 0.4370 0.71609 0.148 0.808 0.004 0.040
#> SRR612395 2 0.5219 0.59001 0.008 0.764 0.156 0.072
#> SRR603116 2 0.2797 0.75597 0.044 0.912 0.016 0.028
#> SRR1323152 3 0.6339 0.39407 0.004 0.420 0.524 0.052
#> SRR1368264 1 0.6800 0.44899 0.636 0.248 0.024 0.092
#> SRR1326624 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1429265 3 0.7004 0.31690 0.080 0.068 0.664 0.188
#> SRR1327702 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.7001 0.48271 0.300 0.580 0.012 0.108
#> SRR1486799 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.7650 0.14143 0.480 0.340 0.008 0.172
#> SRR815044 2 0.5948 0.64561 0.196 0.704 0.008 0.092
#> SRR1338560 2 0.3760 0.72605 0.136 0.836 0.000 0.028
#> SRR615862 2 0.3189 0.75313 0.060 0.888 0.004 0.048
#> SRR1480038 2 0.4370 0.71609 0.148 0.808 0.004 0.040
#> SRR659436 2 0.6946 0.30375 0.032 0.612 0.280 0.076
#> SRR613699 2 0.0657 0.74000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1436563 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.6193 0.60625 0.232 0.672 0.008 0.088
#> SRR1330327 2 0.5478 0.60004 0.016 0.720 0.036 0.228
#> SRR1489950 2 0.0937 0.73970 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1431927 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.5060 0.54348 0.004 0.188 0.756 0.052
#> SRR1444002 1 0.1004 0.84387 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1318444 2 0.9711 -0.21629 0.160 0.356 0.260 0.224
#> SRR600656 2 0.6090 0.52977 0.028 0.656 0.032 0.284
#> SRR658766 2 0.5349 0.60452 0.024 0.744 0.200 0.032
#> SRR655946 3 0.4610 0.51534 0.000 0.236 0.744 0.020
#> SRR817282 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.6575 0.40179 0.048 0.088 0.696 0.168
#> SRR1406418 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.6840 0.46727 0.644 0.236 0.032 0.088
#> SRR1471965 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.7451 0.09859 0.028 0.532 0.340 0.100
#> SRR662498 2 0.5446 0.56161 0.004 0.736 0.184 0.076
#> SRR1376764 2 0.6988 -0.00149 0.008 0.528 0.368 0.096
#> SRR1377006 3 0.6372 0.24117 0.008 0.460 0.488 0.044
#> SRR656860 2 0.4439 0.71806 0.140 0.808 0.004 0.048
#> SRR1480547 2 0.7429 0.42078 0.280 0.528 0.004 0.188
#> SRR1452515 2 0.6528 0.02521 0.004 0.540 0.388 0.068
#> SRR1324390 2 0.0859 0.74329 0.004 0.980 0.008 0.008
#> SRR615273 1 0.7827 0.39297 0.600 0.204 0.108 0.088
#> SRR601695 2 0.2593 0.71388 0.000 0.904 0.080 0.016
#> SRR820907 2 0.3943 0.73906 0.112 0.844 0.008 0.036
#> SRR812773 1 0.4868 0.70947 0.808 0.100 0.024 0.068
#> SRR1405984 2 0.2328 0.75526 0.056 0.924 0.004 0.016
#> SRR1472794 2 0.1888 0.73420 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1365448 1 0.1109 0.84214 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1095720 2 0.7218 -0.27622 0.008 0.448 0.436 0.108
#> SRR1435626 3 0.7745 0.39206 0.060 0.408 0.464 0.068
#> SRR1080766 2 0.0804 0.73824 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1377862 1 0.2275 0.82534 0.928 0.004 0.020 0.048
#> SRR1332299 3 0.5392 0.55750 0.000 0.280 0.680 0.040
#> SRR1467966 3 0.6721 0.30742 0.004 0.444 0.476 0.076
#> SRR1320579 2 0.4054 0.63189 0.000 0.796 0.188 0.016
#> SRR1319710 2 0.4405 0.71148 0.152 0.800 0.000 0.048
#> SRR1326604 2 0.3312 0.75659 0.068 0.884 0.008 0.040
#> SRR1098879 4 0.4355 0.76394 0.012 0.004 0.212 0.772
#> SRR662245 2 0.0779 0.73999 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1074719 2 0.2328 0.75526 0.056 0.924 0.004 0.016
#> SRR816226 1 0.6407 0.50883 0.644 0.040 0.036 0.280
#> SRR601387 2 0.0657 0.73982 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR614575 2 0.3189 0.75313 0.060 0.888 0.004 0.048
#> SRR1353900 2 0.2546 0.75482 0.044 0.920 0.008 0.028
#> SRR662906 2 0.0927 0.73885 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1350832 2 0.0804 0.73824 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1403280 2 0.4626 0.73018 0.120 0.808 0.008 0.064
#> SRR1313969 2 0.5666 0.55275 0.012 0.684 0.036 0.268
#> SRR1388528 1 0.0657 0.84776 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1452912 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4543 0.73389 0.828 0.084 0.024 0.064
#> SRR655399 3 0.3109 0.32826 0.004 0.016 0.880 0.100
#> SRR1319753 2 0.6525 0.52012 0.292 0.616 0.008 0.084
#> SRR818901 3 0.5646 0.55537 0.000 0.272 0.672 0.056
#> SRR607067 2 0.7214 0.56580 0.172 0.620 0.024 0.184
#> SRR1391420 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4820 0.69150 0.168 0.772 0.000 0.060
#> SRR661961 2 0.8958 0.00726 0.296 0.448 0.152 0.104
#> SRR658259 2 0.1863 0.74995 0.004 0.944 0.012 0.040
#> SRR1310476 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0927 0.73826 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1365034 2 0.6823 0.60697 0.180 0.648 0.016 0.156
#> SRR1478053 2 0.1816 0.75231 0.024 0.948 0.004 0.024
#> SRR1475300 2 0.4362 0.72446 0.136 0.816 0.008 0.040
#> SRR1328101 2 0.5597 0.59034 0.024 0.756 0.144 0.076
#> SRR1322900 1 0.6620 0.59264 0.708 0.128 0.084 0.080
#> SRR1309942 2 0.0524 0.74038 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1345760 1 0.8344 0.23212 0.512 0.148 0.064 0.276
#> SRR1435418 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4870 0.72155 0.048 0.816 0.056 0.080
#> SRR1443436 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0927 0.73928 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR661469 2 0.7895 0.15675 0.092 0.552 0.284 0.072
#> SRR1500323 2 0.1356 0.73490 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1356705 1 0.7272 -0.02663 0.484 0.412 0.024 0.080
#> SRR1464915 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.9401 -0.36062 0.156 0.364 0.336 0.144
#> SRR1350435 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1389177 3 0.5387 0.45840 0.000 0.400 0.584 0.016
#> SRR1368072 2 0.1822 0.75557 0.044 0.944 0.008 0.004
#> SRR601815 2 0.1124 0.74205 0.004 0.972 0.012 0.012
#> SRR613330 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.5983 0.69252 0.080 0.752 0.100 0.068
#> SRR1394190 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.6962 -0.28764 0.012 0.456 0.456 0.076
#> SRR1318839 3 0.2032 0.37372 0.000 0.036 0.936 0.028
#> SRR1432390 2 0.5819 0.52553 0.016 0.664 0.032 0.288
#> SRR613126 2 0.1888 0.73420 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1089424 2 0.3731 0.73304 0.120 0.844 0.000 0.036
#> SRR1347214 2 0.2261 0.75589 0.036 0.932 0.008 0.024
#> SRR1309556 2 0.7710 0.55130 0.156 0.624 0.100 0.120
#> SRR1456027 1 0.5834 0.56157 0.680 0.016 0.040 0.264
#> SRR1400551 3 0.7994 0.38806 0.088 0.140 0.592 0.180
#> SRR1320469 1 0.1109 0.84214 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR614251 2 0.1124 0.74525 0.004 0.972 0.012 0.012
#> SRR1454310 2 0.0804 0.74087 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR615105 2 0.2949 0.71483 0.000 0.888 0.088 0.024
#> SRR1433290 3 0.5392 0.55750 0.000 0.280 0.680 0.040
#> SRR2166064 2 0.7736 0.43451 0.188 0.552 0.024 0.236
#> SRR601671 2 0.4336 0.72394 0.132 0.816 0.004 0.048
#> SRR663874 2 0.1739 0.74892 0.016 0.952 0.008 0.024
#> SRR1409130 2 0.0804 0.73996 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR659696 2 0.6587 0.53531 0.052 0.640 0.036 0.272
#> SRR1408249 2 0.5964 0.59946 0.244 0.676 0.004 0.076
#> SRR663284 2 0.4920 0.69243 0.164 0.768 0.000 0.068
#> SRR1402794 3 0.8289 0.44999 0.056 0.312 0.492 0.140
#> SRR614852 2 0.5478 0.60004 0.016 0.720 0.036 0.228
#> SRR1348040 2 0.8770 -0.13089 0.112 0.448 0.328 0.112
#> SRR1489610 2 0.4405 0.71148 0.152 0.800 0.000 0.048
#> SRR1488091 2 0.0804 0.73824 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1499566 2 0.6333 0.54730 0.280 0.640 0.012 0.068
#> SRR1361480 2 0.2627 0.75487 0.024 0.920 0.020 0.036
#> SRR1444501 3 0.3672 0.50149 0.000 0.164 0.824 0.012
#> SRR1415773 2 0.6206 0.68262 0.116 0.736 0.068 0.080
#> SRR1388832 2 0.8770 -0.13089 0.112 0.448 0.328 0.112
#> SRR1394637 1 0.0469 0.85072 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR606974 2 0.1767 0.73071 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR662918 2 0.7667 0.45150 0.196 0.564 0.024 0.216
#> SRR817421 3 0.2032 0.37372 0.000 0.036 0.936 0.028
#> SRR1400823 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3890 0.72800 0.132 0.836 0.004 0.028
#> SRR608264 3 0.2124 0.38027 0.000 0.040 0.932 0.028
#> SRR1318560 1 0.2578 0.81334 0.912 0.000 0.036 0.052
#> SRR1454117 2 0.4464 0.72699 0.124 0.812 0.004 0.060
#> SRR1312684 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR615044 1 0.7827 0.39297 0.600 0.204 0.108 0.088
#> SRR1432743 2 0.4737 0.53409 0.000 0.728 0.252 0.020
#> SRR1388873 2 0.2297 0.75479 0.024 0.932 0.012 0.032
#> SRR1353517 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.7190 0.28060 0.040 0.608 0.264 0.088
#> SRR1406008 2 0.4259 0.72971 0.128 0.816 0.000 0.056
#> SRR1396786 2 0.0524 0.74152 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1446564 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1318465 3 0.5387 0.46150 0.000 0.400 0.584 0.016
#> SRR1431083 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.7259 0.54673 0.180 0.608 0.020 0.192
#> SRR655170 2 0.4504 0.74511 0.088 0.828 0.020 0.064
#> SRR1087825 2 0.5819 0.52553 0.016 0.664 0.032 0.288
#> SRR662019 3 0.9442 0.12319 0.192 0.160 0.424 0.224
#> SRR1349209 2 0.9711 -0.21629 0.160 0.356 0.260 0.224
#> SRR1326161 2 0.1697 0.75364 0.028 0.952 0.004 0.016
#> SRR1345284 2 0.3760 0.72605 0.136 0.836 0.000 0.028
#> SRR1416672 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.3509 0.74048 0.112 0.860 0.004 0.024
#> SRR1454328 2 0.0657 0.73982 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1489286 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4543 0.73389 0.828 0.084 0.024 0.064
#> SRR1408183 3 0.2197 0.39404 0.000 0.048 0.928 0.024
#> SRR1084369 3 0.3672 0.50149 0.000 0.164 0.824 0.012
#> SRR598452 3 0.3726 0.38648 0.008 0.040 0.860 0.092
#> SRR660709 2 0.4389 0.67683 0.020 0.820 0.132 0.028
#> SRR809444 1 0.0469 0.85072 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1089901 2 0.1059 0.74038 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1375774 1 0.3122 0.80414 0.900 0.040 0.024 0.036
#> SRR1326292 1 0.6553 0.46278 0.624 0.016 0.072 0.288
#> SRR657139 1 0.1733 0.83224 0.948 0.000 0.024 0.028
#> SRR1440744 2 0.4989 0.69387 0.164 0.764 0.000 0.072
#> SRR1353555 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0469 0.85072 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1452334 2 0.4870 0.72155 0.048 0.816 0.056 0.080
#> SRR1381775 1 0.0376 0.85253 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1363908 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.4102 0.73753 0.104 0.836 0.004 0.056
#> SRR658989 2 0.7451 0.09859 0.028 0.532 0.340 0.100
#> SRR1353663 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR811771 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.2032 0.37372 0.000 0.036 0.936 0.028
#> SRR819054 2 0.3571 0.75041 0.088 0.868 0.008 0.036
#> SRR1367988 2 0.7500 0.42553 0.100 0.568 0.040 0.292
#> SRR1331922 1 0.3389 0.79549 0.888 0.044 0.024 0.044
#> SRR615479 1 0.7043 0.49594 0.652 0.204 0.052 0.092
#> SRR1375796 2 0.1124 0.74525 0.004 0.972 0.012 0.012
#> SRR1386991 2 0.7371 0.01287 0.028 0.520 0.364 0.088
#> SRR1355217 2 0.6977 0.01872 0.008 0.532 0.364 0.096
#> SRR1356290 2 0.4321 0.64099 0.004 0.796 0.176 0.024
#> SRR659507 2 0.5601 0.58998 0.024 0.752 0.156 0.068
#> SRR663296 1 0.1174 0.84333 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR598044 2 0.3571 0.74909 0.088 0.868 0.008 0.036
#> SRR661155 2 0.7736 0.43451 0.188 0.552 0.024 0.236
#> SRR1414727 3 0.9718 0.17403 0.256 0.300 0.304 0.140
#> SRR663477 1 0.2335 0.81861 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1354489 3 0.5387 0.46150 0.000 0.400 0.584 0.016
#> SRR1377800 3 0.7646 0.42631 0.064 0.148 0.616 0.172
#> SRR614611 2 0.1356 0.73698 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR655052 2 0.5279 0.68049 0.044 0.788 0.112 0.056
#> SRR1478968 1 0.5834 0.56157 0.680 0.016 0.040 0.264
#> SRR1351280 2 0.6859 0.59978 0.184 0.644 0.016 0.156
#> SRR613951 1 0.7924 0.26883 0.532 0.192 0.028 0.248
#> SRR1418022 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.9637 -0.19268 0.148 0.368 0.260 0.224
#> SRR1408161 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.8289 0.44999 0.056 0.312 0.492 0.140
#> SRR655040 1 0.7872 0.10140 0.460 0.340 0.012 0.188
#> SRR810225 2 0.2360 0.75552 0.052 0.924 0.004 0.020
#> SRR1325377 2 0.3594 0.74333 0.108 0.860 0.008 0.024
#> SRR617829 2 0.4136 0.61983 0.000 0.788 0.196 0.016
#> SRR1402328 2 0.0804 0.74040 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1480455 2 0.1356 0.73698 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1442104 3 0.3427 0.27737 0.000 0.028 0.860 0.112
#> SRR1453416 1 0.1109 0.84214 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1481396 3 0.5681 0.17336 0.088 0.000 0.704 0.208
#> SRR1414314 2 0.0859 0.74209 0.004 0.980 0.008 0.008
#> SRR663026 2 0.1247 0.75047 0.012 0.968 0.004 0.016
#> SRR1478386 2 0.5643 0.65192 0.204 0.720 0.008 0.068
#> SRR1458683 2 0.6036 0.46843 0.000 0.636 0.072 0.292
#> SRR1370572 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.7803 0.43093 0.612 0.176 0.112 0.100
#> SRR1310735 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.5819 0.52553 0.016 0.664 0.032 0.288
#> SRR660260 2 0.5493 0.56577 0.004 0.736 0.176 0.084
#> SRR1071231 2 0.1059 0.75011 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR1459125 2 0.8316 0.44024 0.120 0.568 0.136 0.176
#> SRR1337173 2 0.4163 0.62108 0.000 0.792 0.188 0.020
#> SRR1396250 3 0.3046 0.33054 0.004 0.016 0.884 0.096
#> SRR2166376 2 0.7218 -0.27622 0.008 0.448 0.436 0.108
#> SRR659816 2 0.4389 0.67683 0.020 0.820 0.132 0.028
#> SRR1401379 2 0.4405 0.71148 0.152 0.800 0.000 0.048
#> SRR600981 2 0.7252 0.52004 0.152 0.592 0.016 0.240
#> SRR1398335 1 0.0188 0.85300 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1397218 2 0.7257 0.59042 0.192 0.640 0.052 0.116
#> SRR660115 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0992 0.74088 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR1359780 2 0.0672 0.73970 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1490037 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.7332 0.04023 0.468 0.160 0.000 0.372
#> SRR1397156 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0927 0.73928 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1319648 2 0.4820 0.69198 0.168 0.772 0.000 0.060
#> SRR1092985 4 0.4442 0.80788 0.128 0.004 0.056 0.812
#> SRR656409 2 0.6369 0.52398 0.288 0.624 0.004 0.084
#> SRR1468658 3 0.6155 0.21524 0.008 0.472 0.488 0.032
#> SRR1390437 1 0.7924 0.26883 0.532 0.192 0.028 0.248
#> SRR658057 2 0.4636 0.72214 0.132 0.804 0.008 0.056
#> SRR612635 2 0.4145 0.72947 0.124 0.828 0.004 0.044
#> SRR1351480 2 0.3245 0.75236 0.080 0.884 0.008 0.028
#> SRR1436651 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3312 0.79493 0.892 0.036 0.028 0.044
#> SRR659590 2 0.1124 0.74882 0.012 0.972 0.004 0.012
#> SRR614263 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3986 0.72744 0.132 0.832 0.004 0.032
#> SRR659911 2 0.0657 0.74000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1085519 3 0.5060 0.54348 0.004 0.188 0.756 0.052
#> SRR1345894 2 0.6510 -0.04482 0.004 0.524 0.408 0.064
#> SRR1442928 2 0.5219 0.59001 0.008 0.764 0.156 0.072
#> SRR1464681 2 0.5819 0.52553 0.016 0.664 0.032 0.288
#> SRR1418880 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.4163 0.62108 0.000 0.792 0.188 0.020
#> SRR1365426 1 0.6896 0.46013 0.640 0.236 0.032 0.092
#> SRR1487947 1 0.1209 0.84121 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR659708 1 0.3312 0.79493 0.892 0.036 0.028 0.044
#> SRR603236 2 0.2662 0.71197 0.000 0.900 0.084 0.016
#> SRR660673 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0524 0.74149 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR663807 2 0.2049 0.75319 0.036 0.940 0.012 0.012
#> SRR1087245 2 0.4494 0.72243 0.132 0.808 0.004 0.056
#> SRR1339108 2 0.5957 0.69686 0.128 0.744 0.040 0.088
#> SRR613426 1 0.7419 0.43947 0.604 0.120 0.040 0.236
#> SRR613879 2 0.1471 0.74662 0.004 0.960 0.012 0.024
#> SRR1385101 1 0.6338 0.53431 0.692 0.204 0.032 0.072
#> SRR1387966 2 0.2188 0.75346 0.020 0.936 0.012 0.032
#> SRR1458852 2 0.1356 0.73490 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1430489 1 0.5751 0.56765 0.684 0.016 0.036 0.264
#> SRR1349231 1 0.2907 0.78612 0.900 0.064 0.004 0.032
#> SRR1376249 3 0.5690 0.16846 0.084 0.000 0.700 0.216
#> SRR1321987 2 0.0804 0.73824 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR662653 2 0.1124 0.74882 0.012 0.972 0.004 0.012
#> SRR1390027 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3571 0.74909 0.088 0.868 0.008 0.036
#> SRR1383081 2 0.4442 0.72354 0.128 0.812 0.004 0.056
#> SRR2166960 2 0.1707 0.75318 0.020 0.952 0.004 0.024
#> SRR605101 2 0.4917 0.68669 0.184 0.768 0.008 0.040
#> SRR818600 2 0.2644 0.75555 0.044 0.916 0.008 0.032
#> SRR1367715 2 0.4173 0.73005 0.120 0.828 0.004 0.048
#> SRR1351979 3 0.2002 0.38619 0.000 0.044 0.936 0.020
#> SRR1387054 3 0.4610 0.51534 0.000 0.236 0.744 0.020
#> SRR1444306 3 0.5775 0.55100 0.004 0.276 0.668 0.052
#> SRR1322662 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0657 0.74000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR612767 1 0.2413 0.81736 0.916 0.000 0.020 0.064
#> SRR1489030 2 0.1509 0.74998 0.012 0.960 0.008 0.020
#> SRR1430375 2 0.2751 0.72651 0.000 0.904 0.056 0.040
#> SRR615225 2 0.7252 0.52004 0.152 0.592 0.016 0.240
#> SRR1401839 2 0.7713 0.34499 0.068 0.584 0.252 0.096
#> SRR1379110 2 0.3760 0.72605 0.136 0.836 0.000 0.028
#> SRR1077288 3 0.6020 0.15513 0.092 0.004 0.684 0.220
#> SRR1331639 2 0.5819 0.52553 0.016 0.664 0.032 0.288
#> SRR1342782 1 0.6818 0.38085 0.604 0.296 0.020 0.080
#> SRR1443003 3 0.5405 0.54919 0.004 0.312 0.660 0.024
#> SRR612839 1 0.1004 0.84375 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1470093 3 0.4579 0.48088 0.000 0.200 0.768 0.032
#> SRR1395742 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.4194 0.63646 0.000 0.800 0.172 0.028
#> SRR664063 1 0.7139 0.41513 0.612 0.256 0.032 0.100
#> SRR1488214 1 0.2667 0.81665 0.912 0.008 0.020 0.060
#> SRR654766 2 0.7500 0.42553 0.100 0.568 0.040 0.292
#> SRR1320321 2 0.3943 0.73906 0.112 0.844 0.008 0.036
#> SRR1071955 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.85429 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4442 0.72354 0.128 0.812 0.004 0.056
#> SRR1488470 2 0.7429 0.42078 0.280 0.528 0.004 0.188
#> SRR1389497 3 0.2197 0.39404 0.000 0.048 0.928 0.024
#> SRR1367109 3 0.6721 0.30742 0.004 0.444 0.476 0.076
#> SRR615311 1 0.0336 0.85205 0.992 0.000 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0794 0.6791 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1380716 2 0.3019 0.6715 0.048 0.864 0.000 0.088 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.1571 0.8082 0.936 0.004 0.000 0.060 0.000
#> SRR1084417 1 0.1612 0.8200 0.948 0.000 0.016 0.012 0.024
#> SRR1074359 2 0.5041 0.5532 0.000 0.752 0.088 0.120 0.040
#> SRR1419258 3 0.3816 0.3880 0.000 0.044 0.840 0.060 0.056
#> SRR1403366 3 0.7580 0.2784 0.032 0.388 0.424 0.116 0.040
#> SRR665262 2 0.6271 0.3959 0.020 0.644 0.132 0.188 0.016
#> SRR1499740 1 0.6223 0.4835 0.672 0.060 0.064 0.184 0.020
#> SRR1105057 2 0.1877 0.6806 0.012 0.924 0.000 0.064 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 2 0.6590 0.3195 0.012 0.600 0.180 0.188 0.020
#> SRR612215 2 0.6245 0.3860 0.012 0.640 0.136 0.192 0.020
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.2568 0.7957 0.904 0.000 0.032 0.016 0.048
#> SRR1409263 3 0.6730 0.1471 0.092 0.008 0.608 0.072 0.220
#> SRR1431288 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.4994 0.5448 0.096 0.696 0.000 0.208 0.000
#> SRR614839 2 0.4573 0.5970 0.092 0.744 0.000 0.164 0.000
#> SRR658433 2 0.1557 0.6689 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1088581 2 0.5643 0.4711 0.000 0.696 0.152 0.116 0.036
#> SRR1328797 3 0.3816 0.3880 0.000 0.044 0.840 0.060 0.056
#> SRR1334512 2 0.3543 0.6680 0.040 0.828 0.004 0.128 0.000
#> SRR1471117 1 0.0932 0.8310 0.972 0.000 0.004 0.004 0.020
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.1168 0.6730 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR1354955 3 0.6957 0.3346 0.008 0.368 0.444 0.168 0.012
#> SRR654802 3 0.3809 0.3775 0.000 0.032 0.832 0.036 0.100
#> SRR660066 2 0.1124 0.6763 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1447103 2 0.6087 0.3746 0.000 0.636 0.164 0.176 0.024
#> SRR1402153 5 0.4790 0.7811 0.000 0.040 0.108 0.080 0.772
#> SRR655887 2 0.2409 0.6789 0.032 0.900 0.000 0.068 0.000
#> SRR1408529 2 0.6207 0.3669 0.000 0.624 0.224 0.116 0.036
#> SRR658707 1 0.0290 0.8378 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1384371 2 0.4476 0.6621 0.056 0.796 0.032 0.112 0.004
#> SRR1074670 3 0.8044 0.3685 0.028 0.256 0.476 0.164 0.076
#> SRR1375439 2 0.8565 -0.2131 0.124 0.396 0.292 0.160 0.028
#> SRR1329003 1 0.6570 0.1898 0.528 0.000 0.040 0.336 0.096
#> SRR1404837 2 0.5712 0.5572 0.076 0.684 0.036 0.200 0.004
#> SRR1317920 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR1455525 1 0.6657 0.1083 0.500 0.000 0.044 0.364 0.092
#> SRR613999 1 0.0290 0.8378 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.7228 0.3584 0.016 0.364 0.468 0.112 0.040
#> SRR1068855 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR1375509 3 0.5955 0.2014 0.056 0.000 0.656 0.072 0.216
#> SRR612227 3 0.8044 0.3685 0.028 0.256 0.476 0.164 0.076
#> SRR1388809 2 0.2579 0.6843 0.028 0.900 0.004 0.064 0.004
#> SRR1413872 2 0.5303 0.2001 0.000 0.576 0.004 0.372 0.048
#> SRR1452864 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR1473078 3 0.7992 0.4686 0.064 0.160 0.552 0.124 0.100
#> SRR615814 2 0.2741 0.6847 0.024 0.888 0.004 0.080 0.004
#> SRR1325225 1 0.5636 0.2997 0.576 0.000 0.012 0.352 0.060
#> SRR1313687 2 0.3616 0.6615 0.052 0.828 0.004 0.116 0.000
#> SRR1358220 2 0.3410 0.6536 0.068 0.840 0.000 0.092 0.000
#> SRR1096662 2 0.5217 0.5221 0.088 0.676 0.000 0.232 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.7097 0.0145 0.532 0.192 0.032 0.236 0.008
#> SRR660164 2 0.2241 0.6765 0.000 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR815783 2 0.2213 0.6874 0.008 0.912 0.004 0.072 0.004
#> SRR809595 1 0.7160 0.1136 0.552 0.160 0.064 0.220 0.004
#> SRR1403133 2 0.1082 0.6751 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR815470 2 0.4398 0.5944 0.000 0.796 0.056 0.112 0.036
#> SRR1344382 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.5029 0.5337 0.000 0.740 0.112 0.128 0.020
#> SRR1478362 2 0.5029 0.5337 0.000 0.740 0.112 0.128 0.020
#> SRR1392186 2 0.5593 0.4583 0.116 0.640 0.004 0.240 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1377 0.8225 0.956 0.000 0.020 0.020 0.004
#> SRR1471594 1 0.0510 0.8367 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1354270 2 0.8765 -0.3601 0.076 0.360 0.316 0.188 0.060
#> SRR612683 2 0.2112 0.6839 0.000 0.908 0.004 0.084 0.004
#> SRR1392901 2 0.5386 0.5205 0.000 0.724 0.116 0.120 0.040
#> SRR1077805 3 0.5674 0.4797 0.000 0.188 0.684 0.092 0.036
#> SRR1360402 2 0.1124 0.6759 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1406112 3 0.6957 0.3346 0.008 0.368 0.444 0.168 0.012
#> SRR1355352 3 0.8032 0.3650 0.096 0.108 0.560 0.104 0.132
#> SRR656247 1 0.3721 0.7090 0.816 0.008 0.024 0.148 0.004
#> SRR813656 2 0.6841 -0.2083 0.176 0.440 0.000 0.368 0.016
#> SRR808244 5 0.4869 0.8361 0.084 0.000 0.044 0.104 0.768
#> SRR1387240 2 0.2037 0.6705 0.000 0.920 0.012 0.064 0.004
#> SRR1408595 1 0.2852 0.7912 0.892 0.012 0.024 0.064 0.008
#> SRR1385277 4 0.8054 0.4793 0.280 0.248 0.016 0.400 0.056
#> SRR1435248 2 0.1557 0.6772 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1419110 2 0.7479 0.0911 0.032 0.524 0.256 0.152 0.036
#> SRR1408682 2 0.3308 0.6542 0.004 0.860 0.024 0.096 0.016
#> SRR1317134 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4490 0.6189 0.072 0.756 0.004 0.168 0.000
#> SRR1453911 2 0.5034 0.5797 0.000 0.720 0.104 0.168 0.008
#> SRR603164 3 0.6043 0.4105 0.000 0.308 0.592 0.052 0.048
#> SRR1383259 2 0.6644 -0.1140 0.144 0.464 0.000 0.376 0.016
#> SRR1330854 1 0.3294 0.7667 0.868 0.000 0.048 0.028 0.056
#> SRR1452423 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4819 0.5647 0.092 0.716 0.000 0.192 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.5880 0.4778 0.000 0.296 0.584 0.116 0.004
#> SRR1361546 1 0.6798 0.1678 0.580 0.172 0.032 0.208 0.008
#> SRR1486156 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2074 0.6674 0.000 0.920 0.016 0.060 0.004
#> SRR615635 2 0.2741 0.6847 0.024 0.888 0.004 0.080 0.004
#> SRR1385411 2 0.4648 0.6066 0.072 0.748 0.000 0.172 0.008
#> SRR1342739 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.6225 0.4301 0.020 0.072 0.692 0.096 0.120
#> SRR662126 2 0.5158 0.4726 0.040 0.640 0.000 0.308 0.012
#> SRR1464601 2 0.1408 0.6682 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1071594 2 0.3570 0.6762 0.048 0.844 0.008 0.096 0.004
#> SRR612539 2 0.4831 0.5991 0.080 0.736 0.004 0.176 0.004
#> SRR602010 1 0.6929 0.1142 0.560 0.180 0.032 0.220 0.008
#> SRR810249 2 0.1408 0.6817 0.008 0.948 0.000 0.044 0.000
#> SRR818773 1 0.6865 0.1534 0.568 0.168 0.032 0.224 0.008
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.2517 0.6790 0.000 0.884 0.004 0.104 0.008
#> SRR1442754 1 0.2897 0.7853 0.888 0.000 0.040 0.020 0.052
#> SRR1334247 3 0.7226 0.3603 0.016 0.348 0.456 0.160 0.020
#> SRR661639 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6760 0.0996 0.200 0.524 0.008 0.260 0.008
#> SRR1459937 4 0.8543 0.5027 0.232 0.304 0.044 0.360 0.060
#> SRR2185018 1 0.0510 0.8356 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR655732 2 0.3758 0.6652 0.052 0.816 0.000 0.128 0.004
#> SRR809348 1 0.0290 0.8377 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR819261 3 0.8044 0.3685 0.028 0.256 0.476 0.164 0.076
#> SRR661074 3 0.6197 0.1973 0.064 0.004 0.648 0.072 0.212
#> SRR1349851 1 0.2769 0.7854 0.892 0.000 0.020 0.064 0.024
#> SRR1405123 2 0.6639 -0.1002 0.144 0.468 0.000 0.372 0.016
#> SRR661096 2 0.5769 0.4086 0.144 0.628 0.000 0.224 0.004
#> SRR1320225 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6570 0.1898 0.528 0.000 0.040 0.336 0.096
#> SRR1307677 2 0.2676 0.6765 0.036 0.884 0.000 0.080 0.000
#> SRR1466512 2 0.3861 0.6367 0.068 0.804 0.000 0.128 0.000
#> SRR658212 2 0.2676 0.6765 0.036 0.884 0.000 0.080 0.000
#> SRR1430525 3 0.4782 0.4417 0.000 0.096 0.776 0.080 0.048
#> SRR1344422 2 0.6955 -0.2048 0.136 0.432 0.012 0.404 0.016
#> SRR1353924 2 0.3517 0.6488 0.068 0.832 0.000 0.100 0.000
#> SRR1314832 1 0.6047 0.4675 0.660 0.000 0.172 0.044 0.124
#> SRR1487570 1 0.5636 0.2997 0.576 0.000 0.012 0.352 0.060
#> SRR627431 2 0.3038 0.6430 0.000 0.872 0.016 0.088 0.024
#> SRR1418561 1 0.8186 -0.0971 0.432 0.024 0.132 0.308 0.104
#> SRR1448029 3 0.5647 0.5438 0.000 0.184 0.676 0.120 0.020
#> SRR813802 1 0.0162 0.8390 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR815020 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2889 0.6703 0.044 0.872 0.000 0.084 0.000
#> SRR1435311 2 0.4602 0.6134 0.092 0.764 0.004 0.136 0.004
#> SRR612395 2 0.5925 0.3908 0.000 0.648 0.148 0.184 0.020
#> SRR603116 2 0.3683 0.6702 0.032 0.832 0.012 0.120 0.004
#> SRR1323152 3 0.6703 0.4232 0.000 0.336 0.512 0.116 0.036
#> SRR1368264 1 0.6766 0.1163 0.564 0.180 0.028 0.224 0.004
#> SRR1326624 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR1429265 3 0.6852 0.3362 0.060 0.056 0.644 0.072 0.168
#> SRR1327702 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.6573 0.1704 0.188 0.540 0.008 0.260 0.004
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.7405 0.5243 0.312 0.296 0.000 0.364 0.028
#> SRR815044 2 0.5416 0.4841 0.096 0.652 0.000 0.248 0.004
#> SRR1338560 2 0.3906 0.6274 0.084 0.804 0.000 0.112 0.000
#> SRR615862 2 0.3242 0.6699 0.040 0.844 0.000 0.116 0.000
#> SRR1480038 2 0.4602 0.6134 0.092 0.764 0.004 0.136 0.004
#> SRR659436 2 0.7190 0.0509 0.016 0.492 0.280 0.196 0.016
#> SRR613699 2 0.1717 0.6771 0.000 0.936 0.004 0.052 0.008
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.5782 0.4129 0.140 0.624 0.000 0.232 0.004
#> SRR1330327 2 0.5271 0.3425 0.000 0.632 0.016 0.312 0.040
#> SRR1489950 2 0.0992 0.6749 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1431927 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.5114 0.5250 0.000 0.136 0.732 0.112 0.020
#> SRR1444002 1 0.0865 0.8311 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1318444 4 0.9230 0.2467 0.096 0.292 0.228 0.304 0.080
#> SRR600656 2 0.5757 0.1864 0.012 0.568 0.008 0.364 0.048
#> SRR658766 2 0.6103 0.4260 0.004 0.648 0.168 0.156 0.024
#> SRR655946 3 0.5641 0.4798 0.000 0.184 0.688 0.092 0.036
#> SRR817282 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.6544 0.4116 0.036 0.072 0.676 0.096 0.120
#> SRR1406418 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.6865 0.1534 0.568 0.168 0.032 0.224 0.008
#> SRR1471965 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.7272 -0.1896 0.008 0.420 0.332 0.224 0.016
#> SRR662498 2 0.6101 0.3723 0.000 0.628 0.176 0.176 0.020
#> SRR1376764 2 0.7297 -0.2798 0.000 0.412 0.352 0.200 0.036
#> SRR1377006 3 0.7178 0.2628 0.000 0.376 0.432 0.144 0.048
#> SRR656860 2 0.4510 0.6092 0.076 0.756 0.000 0.164 0.004
#> SRR1480547 2 0.6596 -0.0209 0.144 0.492 0.000 0.348 0.016
#> SRR1452515 2 0.7065 -0.2453 0.000 0.432 0.372 0.164 0.032
#> SRR1324390 2 0.1408 0.6804 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR615273 1 0.7778 0.1123 0.540 0.148 0.104 0.184 0.024
#> SRR601695 2 0.4331 0.5988 0.000 0.800 0.052 0.112 0.036
#> SRR820907 2 0.4045 0.6445 0.072 0.808 0.004 0.112 0.004
#> SRR812773 1 0.5091 0.5902 0.740 0.060 0.024 0.168 0.008
#> SRR1405984 2 0.2473 0.6775 0.032 0.896 0.000 0.072 0.000
#> SRR1472794 2 0.3107 0.6524 0.000 0.868 0.032 0.088 0.012
#> SRR1365448 1 0.1026 0.8293 0.968 0.000 0.004 0.004 0.024
#> SRR1095720 3 0.7493 0.3270 0.000 0.344 0.420 0.176 0.060
#> SRR1435626 3 0.7781 0.3659 0.052 0.324 0.456 0.140 0.028
#> SRR1080766 2 0.1408 0.6682 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1377862 1 0.2542 0.7946 0.904 0.000 0.020 0.056 0.020
#> SRR1332299 3 0.5183 0.5500 0.000 0.200 0.692 0.104 0.004
#> SRR1467966 3 0.6806 0.3736 0.000 0.360 0.468 0.148 0.024
#> SRR1320579 2 0.5730 0.4857 0.000 0.696 0.144 0.112 0.048
#> SRR1319710 2 0.4573 0.5970 0.092 0.744 0.000 0.164 0.000
#> SRR1326604 2 0.3351 0.6786 0.032 0.848 0.004 0.112 0.004
#> SRR1098879 5 0.4155 0.7965 0.000 0.000 0.144 0.076 0.780
#> SRR662245 2 0.1843 0.6769 0.000 0.932 0.008 0.052 0.008
#> SRR1074719 2 0.2473 0.6775 0.032 0.896 0.000 0.072 0.000
#> SRR816226 1 0.6190 0.1691 0.532 0.020 0.012 0.380 0.056
#> SRR601387 2 0.1168 0.6767 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR614575 2 0.3242 0.6699 0.040 0.844 0.000 0.116 0.000
#> SRR1353900 2 0.2610 0.6835 0.028 0.892 0.004 0.076 0.000
#> SRR662906 2 0.1569 0.6683 0.000 0.944 0.004 0.044 0.008
#> SRR1350832 2 0.1082 0.6714 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1403280 2 0.4335 0.6245 0.072 0.772 0.000 0.152 0.004
#> SRR1313969 2 0.5406 0.2481 0.000 0.592 0.008 0.348 0.052
#> SRR1388528 1 0.0579 0.8356 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4654 0.6281 0.760 0.044 0.020 0.172 0.004
#> SRR655399 3 0.3506 0.3032 0.000 0.000 0.824 0.044 0.132
#> SRR1319753 2 0.6257 0.2193 0.220 0.564 0.004 0.212 0.000
#> SRR818901 3 0.5386 0.5470 0.000 0.192 0.676 0.128 0.004
#> SRR607067 2 0.6471 0.2578 0.108 0.544 0.008 0.324 0.016
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4768 0.5731 0.096 0.724 0.000 0.180 0.000
#> SRR661961 2 0.8808 -0.3654 0.280 0.360 0.144 0.188 0.028
#> SRR658259 2 0.2445 0.6868 0.000 0.884 0.004 0.108 0.004
#> SRR1310476 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1443 0.6740 0.000 0.948 0.004 0.044 0.004
#> SRR1365034 2 0.5824 0.3895 0.088 0.596 0.000 0.304 0.012
#> SRR1478053 2 0.1877 0.6806 0.012 0.924 0.000 0.064 0.000
#> SRR1475300 2 0.4239 0.6239 0.080 0.784 0.004 0.132 0.000
#> SRR1328101 2 0.6245 0.3860 0.012 0.640 0.136 0.192 0.020
#> SRR1322900 1 0.6611 0.4254 0.644 0.068 0.084 0.184 0.020
#> SRR1309942 2 0.0798 0.6762 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1345760 1 0.7875 -0.3129 0.416 0.104 0.048 0.380 0.052
#> SRR1435418 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4894 0.5954 0.012 0.732 0.048 0.200 0.008
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1569 0.6697 0.000 0.944 0.004 0.044 0.008
#> SRR661469 2 0.8075 -0.1006 0.076 0.444 0.280 0.180 0.020
#> SRR1500323 2 0.2266 0.6593 0.000 0.912 0.016 0.064 0.008
#> SRR1356705 1 0.7108 -0.4305 0.396 0.368 0.020 0.216 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.9231 0.1147 0.120 0.296 0.320 0.192 0.072
#> SRR1350435 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR1389177 3 0.6695 0.4563 0.000 0.288 0.552 0.112 0.048
#> SRR1368072 2 0.2788 0.6852 0.032 0.892 0.004 0.064 0.008
#> SRR601815 2 0.1285 0.6767 0.004 0.956 0.000 0.036 0.004
#> SRR613330 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.5700 0.5627 0.032 0.688 0.072 0.200 0.008
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.6988 0.3566 0.004 0.368 0.452 0.152 0.024
#> SRR1318839 3 0.2853 0.3181 0.000 0.004 0.880 0.040 0.076
#> SRR1432390 2 0.5417 0.1914 0.000 0.572 0.008 0.372 0.048
#> SRR613126 2 0.3107 0.6524 0.000 0.868 0.032 0.088 0.012
#> SRR1089424 2 0.3906 0.6357 0.068 0.800 0.000 0.132 0.000
#> SRR1347214 2 0.2208 0.6839 0.020 0.908 0.000 0.072 0.000
#> SRR1309556 2 0.7137 0.3221 0.100 0.568 0.092 0.232 0.008
#> SRR1456027 1 0.5649 0.2909 0.572 0.000 0.012 0.356 0.060
#> SRR1400551 3 0.7814 0.3981 0.080 0.108 0.580 0.108 0.124
#> SRR1320469 1 0.1026 0.8293 0.968 0.000 0.004 0.004 0.024
#> SRR614251 2 0.2116 0.6818 0.000 0.912 0.004 0.076 0.008
#> SRR1454310 2 0.0865 0.6769 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR615105 2 0.4527 0.5976 0.000 0.788 0.064 0.112 0.036
#> SRR1433290 3 0.5183 0.5500 0.000 0.200 0.692 0.104 0.004
#> SRR2166064 4 0.5561 -0.0410 0.028 0.476 0.004 0.476 0.016
#> SRR601671 2 0.4294 0.6155 0.080 0.768 0.000 0.152 0.000
#> SRR663874 2 0.2623 0.6827 0.012 0.888 0.004 0.092 0.004
#> SRR1409130 2 0.1662 0.6740 0.000 0.936 0.004 0.056 0.004
#> SRR659696 2 0.5705 0.2038 0.020 0.568 0.004 0.368 0.040
#> SRR1408249 2 0.5769 0.4086 0.144 0.628 0.000 0.224 0.004
#> SRR663284 2 0.4819 0.5647 0.092 0.716 0.000 0.192 0.000
#> SRR1402794 3 0.8044 0.3685 0.028 0.256 0.476 0.164 0.076
#> SRR614852 2 0.5288 0.3418 0.000 0.628 0.016 0.316 0.040
#> SRR1348040 2 0.8711 -0.3251 0.088 0.360 0.312 0.196 0.044
#> SRR1489610 2 0.4573 0.5970 0.092 0.744 0.000 0.164 0.000
#> SRR1488091 2 0.1484 0.6668 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1499566 2 0.6141 0.3166 0.196 0.596 0.008 0.200 0.000
#> SRR1361480 2 0.2416 0.6827 0.012 0.888 0.000 0.100 0.000
#> SRR1444501 3 0.4844 0.4413 0.000 0.100 0.772 0.076 0.052
#> SRR1415773 2 0.6158 0.5492 0.068 0.676 0.060 0.180 0.016
#> SRR1388832 2 0.8711 -0.3251 0.088 0.360 0.312 0.196 0.044
#> SRR1394637 1 0.0404 0.8369 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR606974 2 0.3038 0.6430 0.000 0.872 0.016 0.088 0.024
#> SRR662918 2 0.5640 -0.0237 0.028 0.488 0.004 0.460 0.020
#> SRR817421 3 0.2853 0.3181 0.000 0.004 0.880 0.040 0.076
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.4069 0.6265 0.076 0.788 0.000 0.136 0.000
#> SRR608264 3 0.2977 0.3250 0.000 0.008 0.876 0.040 0.076
#> SRR1318560 1 0.2568 0.7957 0.904 0.000 0.032 0.016 0.048
#> SRR1454117 2 0.4490 0.6189 0.072 0.756 0.004 0.168 0.000
#> SRR1312684 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR615044 1 0.7778 0.1123 0.540 0.148 0.104 0.184 0.024
#> SRR1432743 2 0.6248 0.3593 0.000 0.620 0.224 0.120 0.036
#> SRR1388873 2 0.2508 0.6856 0.012 0.896 0.004 0.084 0.004
#> SRR1353517 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.7465 0.0908 0.032 0.524 0.260 0.148 0.036
#> SRR1406008 2 0.4505 0.6235 0.084 0.760 0.000 0.152 0.004
#> SRR1396786 2 0.0510 0.6788 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1446564 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR1318465 3 0.6695 0.4572 0.000 0.288 0.552 0.112 0.048
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.6282 0.2013 0.108 0.528 0.000 0.348 0.016
#> SRR655170 2 0.4250 0.6521 0.064 0.800 0.012 0.120 0.004
#> SRR1087825 2 0.5303 0.2001 0.000 0.576 0.004 0.372 0.048
#> SRR662019 3 0.9381 0.1680 0.160 0.128 0.392 0.164 0.156
#> SRR1349209 4 0.9230 0.2467 0.096 0.292 0.228 0.304 0.080
#> SRR1326161 2 0.2141 0.6856 0.016 0.916 0.000 0.064 0.004
#> SRR1345284 2 0.3906 0.6274 0.084 0.804 0.000 0.112 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.3517 0.6488 0.068 0.832 0.000 0.100 0.000
#> SRR1454328 2 0.1331 0.6757 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1489286 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4617 0.6340 0.764 0.044 0.020 0.168 0.004
#> SRR1408183 3 0.2965 0.3353 0.000 0.012 0.880 0.040 0.068
#> SRR1084369 3 0.4782 0.4417 0.000 0.096 0.776 0.080 0.048
#> SRR598452 3 0.4095 0.3751 0.004 0.032 0.820 0.040 0.104
#> SRR660709 2 0.5263 0.5294 0.004 0.728 0.108 0.140 0.020
#> SRR809444 1 0.0404 0.8369 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1089901 2 0.1408 0.6744 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1375774 1 0.2989 0.7727 0.880 0.016 0.020 0.080 0.004
#> SRR1326292 1 0.6570 0.1898 0.528 0.000 0.040 0.336 0.096
#> SRR657139 1 0.1612 0.8200 0.948 0.000 0.016 0.012 0.024
#> SRR1440744 2 0.4902 0.5672 0.100 0.724 0.000 0.172 0.004
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0404 0.8369 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1452334 2 0.4894 0.5954 0.012 0.732 0.048 0.200 0.008
#> SRR1381775 1 0.0510 0.8367 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1363908 1 0.0162 0.8390 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319626 2 0.4192 0.6369 0.068 0.784 0.004 0.144 0.000
#> SRR658989 2 0.7272 -0.1896 0.008 0.420 0.332 0.224 0.016
#> SRR1353663 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR811771 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.2853 0.3181 0.000 0.004 0.880 0.040 0.076
#> SRR819054 2 0.3446 0.6680 0.048 0.840 0.004 0.108 0.000
#> SRR1367988 2 0.6509 -0.0784 0.052 0.476 0.008 0.420 0.044
#> SRR1331922 1 0.3313 0.7565 0.860 0.020 0.020 0.096 0.004
#> SRR615479 1 0.7000 0.2188 0.584 0.144 0.052 0.208 0.012
#> SRR1375796 2 0.2116 0.6818 0.000 0.912 0.004 0.076 0.008
#> SRR1386991 2 0.7277 -0.2379 0.008 0.424 0.360 0.184 0.024
#> SRR1355217 2 0.7293 -0.2646 0.000 0.416 0.348 0.200 0.036
#> SRR1356290 2 0.5529 0.5124 0.000 0.704 0.148 0.116 0.032
#> SRR659507 2 0.6174 0.4075 0.016 0.652 0.148 0.168 0.016
#> SRR663296 1 0.2798 0.7496 0.852 0.000 0.000 0.140 0.008
#> SRR598044 2 0.3516 0.6624 0.052 0.836 0.004 0.108 0.000
#> SRR661155 2 0.5561 -0.0654 0.028 0.476 0.004 0.476 0.016
#> SRR1414727 3 0.9266 -0.0829 0.232 0.244 0.308 0.168 0.048
#> SRR663477 1 0.2634 0.7878 0.900 0.000 0.020 0.056 0.024
#> SRR1354489 3 0.6695 0.4572 0.000 0.288 0.552 0.112 0.048
#> SRR1377800 3 0.7575 0.4321 0.056 0.120 0.596 0.108 0.120
#> SRR614611 2 0.1787 0.6685 0.000 0.936 0.016 0.044 0.004
#> SRR655052 2 0.5794 0.4939 0.012 0.680 0.092 0.196 0.020
#> SRR1478968 1 0.5649 0.2909 0.572 0.000 0.012 0.356 0.060
#> SRR1351280 2 0.5841 0.3757 0.088 0.592 0.000 0.308 0.012
#> SRR613951 1 0.7458 -0.3547 0.428 0.160 0.008 0.360 0.044
#> SRR1418022 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.9140 0.2289 0.084 0.296 0.228 0.312 0.080
#> SRR1408161 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.8044 0.3685 0.028 0.256 0.476 0.164 0.076
#> SRR655040 4 0.7456 0.5360 0.296 0.296 0.004 0.380 0.024
#> SRR810225 2 0.2809 0.6826 0.036 0.888 0.004 0.068 0.004
#> SRR1325377 2 0.3778 0.6538 0.068 0.820 0.004 0.108 0.000
#> SRR617829 2 0.5821 0.4671 0.000 0.684 0.156 0.116 0.044
#> SRR1402328 2 0.0703 0.6774 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1480455 2 0.1913 0.6669 0.000 0.932 0.016 0.044 0.008
#> SRR1442104 3 0.4125 0.1875 0.000 0.000 0.772 0.056 0.172
#> SRR1453416 1 0.1026 0.8293 0.968 0.000 0.004 0.004 0.024
#> SRR1481396 3 0.5900 0.2142 0.060 0.000 0.668 0.072 0.200
#> SRR1414314 2 0.1251 0.6755 0.000 0.956 0.000 0.036 0.008
#> SRR663026 2 0.1662 0.6839 0.004 0.936 0.000 0.056 0.004
#> SRR1478386 2 0.5222 0.5014 0.124 0.680 0.000 0.196 0.000
#> SRR1458683 2 0.6342 0.1159 0.000 0.548 0.040 0.336 0.076
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.7710 0.1599 0.552 0.128 0.120 0.176 0.024
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.5417 0.1914 0.000 0.572 0.008 0.372 0.048
#> SRR660260 2 0.6105 0.3697 0.000 0.620 0.176 0.188 0.016
#> SRR1071231 2 0.1522 0.6828 0.012 0.944 0.000 0.044 0.000
#> SRR1459125 2 0.7602 0.0209 0.072 0.476 0.116 0.320 0.016
#> SRR1337173 2 0.5717 0.4589 0.000 0.688 0.160 0.116 0.036
#> SRR1396250 3 0.3460 0.3056 0.000 0.000 0.828 0.044 0.128
#> SRR2166376 3 0.7493 0.3270 0.000 0.344 0.420 0.176 0.060
#> SRR659816 2 0.5263 0.5294 0.004 0.728 0.108 0.140 0.020
#> SRR1401379 2 0.4573 0.5970 0.092 0.744 0.000 0.164 0.000
#> SRR600981 2 0.6169 0.1444 0.084 0.524 0.000 0.372 0.020
#> SRR1398335 1 0.0290 0.8377 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1397218 2 0.6632 0.3459 0.132 0.584 0.036 0.244 0.004
#> SRR660115 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.1116 0.6749 0.004 0.964 0.000 0.028 0.004
#> SRR1359780 2 0.1168 0.6734 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.8054 -0.1293 0.176 0.132 0.000 0.408 0.284
#> SRR1397156 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1569 0.6697 0.000 0.944 0.004 0.044 0.008
#> SRR1319648 2 0.4768 0.5740 0.096 0.724 0.000 0.180 0.000
#> SRR1092985 5 0.4431 0.8321 0.092 0.000 0.024 0.092 0.792
#> SRR656409 2 0.6231 0.2669 0.156 0.584 0.000 0.248 0.012
#> SRR1468658 3 0.6983 0.2805 0.000 0.376 0.460 0.112 0.052
#> SRR1390437 1 0.7458 -0.3547 0.428 0.160 0.008 0.360 0.044
#> SRR658057 2 0.4430 0.6109 0.076 0.752 0.000 0.172 0.000
#> SRR612635 2 0.4252 0.6260 0.072 0.780 0.000 0.144 0.004
#> SRR1351480 2 0.3142 0.6728 0.056 0.864 0.004 0.076 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3678 0.7120 0.820 0.008 0.024 0.144 0.004
#> SRR659590 2 0.1331 0.6815 0.008 0.952 0.000 0.040 0.000
#> SRR614263 1 0.0290 0.8378 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1409575 2 0.4025 0.6287 0.076 0.792 0.000 0.132 0.000
#> SRR659911 2 0.1644 0.6782 0.000 0.940 0.004 0.048 0.008
#> SRR1085519 3 0.5114 0.5250 0.000 0.136 0.732 0.112 0.020
#> SRR1345894 2 0.6871 -0.2917 0.000 0.420 0.396 0.164 0.020
#> SRR1442928 2 0.5925 0.3908 0.000 0.648 0.148 0.184 0.020
#> SRR1464681 2 0.5303 0.2001 0.000 0.576 0.004 0.372 0.048
#> SRR1418880 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.5717 0.4589 0.000 0.688 0.160 0.116 0.036
#> SRR1365426 1 0.6781 0.1424 0.568 0.172 0.032 0.224 0.004
#> SRR1487947 1 0.1116 0.8283 0.964 0.000 0.004 0.004 0.028
#> SRR659708 1 0.3678 0.7120 0.820 0.008 0.024 0.144 0.004
#> SRR603236 2 0.4398 0.5951 0.000 0.796 0.056 0.112 0.036
#> SRR660673 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0703 0.6805 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR663807 2 0.2491 0.6857 0.024 0.904 0.004 0.064 0.004
#> SRR1087245 2 0.4393 0.6124 0.076 0.756 0.000 0.168 0.000
#> SRR1339108 2 0.5712 0.5572 0.076 0.684 0.036 0.200 0.004
#> SRR613426 4 0.7340 0.2101 0.408 0.080 0.024 0.432 0.056
#> SRR613879 2 0.2517 0.6790 0.000 0.884 0.004 0.104 0.008
#> SRR1385101 1 0.6388 0.2925 0.620 0.140 0.032 0.204 0.004
#> SRR1387966 2 0.2513 0.6880 0.012 0.900 0.004 0.076 0.008
#> SRR1458852 2 0.2266 0.6593 0.000 0.912 0.016 0.064 0.008
#> SRR1430489 1 0.5636 0.2997 0.576 0.000 0.012 0.352 0.060
#> SRR1349231 1 0.3264 0.7122 0.840 0.024 0.004 0.132 0.000
#> SRR1376249 3 0.5927 0.2052 0.056 0.000 0.660 0.072 0.212
#> SRR1321987 2 0.1557 0.6679 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR662653 2 0.1331 0.6815 0.008 0.952 0.000 0.040 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3516 0.6624 0.052 0.836 0.004 0.108 0.000
#> SRR1383081 2 0.4297 0.6159 0.072 0.764 0.000 0.164 0.000
#> SRR2166960 2 0.2358 0.6833 0.000 0.888 0.000 0.104 0.008
#> SRR605101 2 0.4920 0.5513 0.136 0.728 0.004 0.132 0.000
#> SRR818600 2 0.2670 0.6840 0.028 0.888 0.004 0.080 0.000
#> SRR1367715 2 0.4192 0.6281 0.068 0.784 0.004 0.144 0.000
#> SRR1351979 3 0.2878 0.3212 0.000 0.004 0.880 0.048 0.068
#> SRR1387054 3 0.5641 0.4798 0.000 0.184 0.688 0.092 0.036
#> SRR1444306 3 0.5597 0.5452 0.000 0.196 0.668 0.124 0.012
#> SRR1322662 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1644 0.6782 0.000 0.940 0.004 0.048 0.008
#> SRR612767 1 0.3278 0.7674 0.860 0.000 0.020 0.092 0.028
#> SRR1489030 2 0.1478 0.6815 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1430375 2 0.3776 0.6347 0.000 0.820 0.040 0.128 0.012
#> SRR615225 2 0.6169 0.1444 0.084 0.524 0.000 0.372 0.020
#> SRR1401839 2 0.7696 0.0801 0.040 0.496 0.240 0.196 0.028
#> SRR1379110 2 0.3906 0.6274 0.084 0.804 0.000 0.112 0.000
#> SRR1077288 3 0.6197 0.1973 0.064 0.004 0.648 0.072 0.212
#> SRR1331639 2 0.5303 0.2001 0.000 0.576 0.004 0.372 0.048
#> SRR1342782 1 0.6840 -0.0277 0.536 0.220 0.020 0.220 0.004
#> SRR1443003 3 0.5559 0.5484 0.000 0.228 0.664 0.092 0.016
#> SRR612839 1 0.0932 0.8310 0.972 0.000 0.004 0.004 0.020
#> SRR1470093 3 0.5771 0.4066 0.000 0.148 0.696 0.096 0.060
#> SRR1395742 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.5668 0.4844 0.000 0.700 0.140 0.116 0.044
#> SRR664063 1 0.7011 0.0402 0.540 0.192 0.036 0.228 0.004
#> SRR1488214 1 0.3236 0.7714 0.868 0.004 0.020 0.084 0.024
#> SRR654766 2 0.6509 -0.0784 0.052 0.476 0.008 0.420 0.044
#> SRR1320321 2 0.4045 0.6445 0.072 0.808 0.004 0.112 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4297 0.6159 0.072 0.764 0.000 0.164 0.000
#> SRR1488470 2 0.6596 -0.0209 0.144 0.492 0.000 0.348 0.016
#> SRR1389497 3 0.2965 0.3353 0.000 0.012 0.880 0.040 0.068
#> SRR1367109 3 0.6806 0.3736 0.000 0.360 0.468 0.148 0.024
#> SRR615311 1 0.1331 0.8217 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.1572 0.65117 0.000 0.936 0.000 0.036 0.028 0.000
#> SRR1380716 2 0.2554 0.65722 0.040 0.892 0.000 0.044 0.024 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2007 0.81472 0.924 0.012 0.000 0.016 0.040 0.008
#> SRR1084417 1 0.1334 0.82933 0.948 0.000 0.000 0.000 0.032 0.020
#> SRR1074359 2 0.6433 0.20823 0.000 0.568 0.080 0.104 0.236 0.012
#> SRR1419258 3 0.2163 0.53672 0.000 0.008 0.892 0.004 0.096 0.000
#> SRR1403366 5 0.7153 0.44696 0.028 0.252 0.208 0.012 0.472 0.028
#> SRR665262 2 0.5065 -0.18573 0.020 0.492 0.000 0.028 0.456 0.004
#> SRR1499740 1 0.5619 0.55210 0.644 0.048 0.000 0.072 0.224 0.012
#> SRR1105057 2 0.1666 0.65964 0.008 0.936 0.000 0.036 0.020 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.5017 0.37222 0.012 0.436 0.012 0.024 0.516 0.000
#> SRR612215 5 0.4787 0.23266 0.012 0.480 0.000 0.028 0.480 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.2407 0.80715 0.904 0.000 0.012 0.008 0.040 0.036
#> SRR1409263 3 0.7594 0.25505 0.088 0.004 0.380 0.020 0.320 0.188
#> SRR1431288 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.5023 0.53323 0.072 0.724 0.000 0.124 0.076 0.004
#> SRR614839 2 0.4596 0.58010 0.084 0.756 0.000 0.084 0.076 0.000
#> SRR658433 2 0.2595 0.61987 0.000 0.872 0.000 0.044 0.084 0.000
#> SRR1088581 2 0.6692 -0.01005 0.000 0.500 0.104 0.080 0.304 0.012
#> SRR1328797 3 0.2163 0.53672 0.000 0.008 0.892 0.004 0.096 0.000
#> SRR1334512 2 0.3509 0.64013 0.020 0.832 0.000 0.088 0.056 0.004
#> SRR1471117 1 0.0806 0.83968 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1311553 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.2129 0.63907 0.000 0.904 0.000 0.040 0.056 0.000
#> SRR1354955 5 0.6171 0.43861 0.004 0.220 0.188 0.024 0.560 0.004
#> SRR654802 3 0.4664 0.53200 0.000 0.020 0.684 0.008 0.256 0.032
#> SRR660066 2 0.1829 0.64623 0.000 0.920 0.000 0.024 0.056 0.000
#> SRR1447103 5 0.4849 0.29391 0.000 0.464 0.012 0.024 0.496 0.004
#> SRR1402153 6 0.3814 0.76628 0.000 0.028 0.052 0.008 0.096 0.816
#> SRR655887 2 0.2103 0.66161 0.024 0.916 0.000 0.040 0.020 0.000
#> SRR1408529 2 0.6803 -0.20629 0.000 0.452 0.136 0.060 0.340 0.012
#> SRR658707 1 0.0260 0.84630 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.4500 0.63710 0.056 0.784 0.024 0.060 0.076 0.000
#> SRR1074670 5 0.7765 0.29869 0.028 0.164 0.224 0.056 0.480 0.048
#> SRR1375439 5 0.7751 0.48021 0.104 0.284 0.092 0.040 0.456 0.024
#> SRR1329003 1 0.6245 0.24649 0.496 0.004 0.016 0.376 0.056 0.052
#> SRR1404837 2 0.5777 0.47905 0.068 0.656 0.008 0.120 0.148 0.000
#> SRR1317920 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR1455525 1 0.6425 0.18498 0.472 0.004 0.028 0.392 0.052 0.052
#> SRR613999 1 0.0260 0.84630 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.7066 0.38606 0.016 0.248 0.260 0.012 0.440 0.024
#> SRR1068855 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR1375509 3 0.7086 0.32743 0.052 0.000 0.424 0.020 0.324 0.180
#> SRR612227 5 0.7765 0.29869 0.028 0.164 0.224 0.056 0.480 0.048
#> SRR1388809 2 0.2415 0.66473 0.024 0.900 0.000 0.036 0.040 0.000
#> SRR1413872 4 0.5060 0.61277 0.000 0.428 0.000 0.504 0.064 0.004
#> SRR1452864 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR1473078 5 0.7555 0.00360 0.056 0.104 0.292 0.016 0.468 0.064
#> SRR615814 2 0.2537 0.66413 0.020 0.896 0.000 0.048 0.032 0.004
#> SRR1325225 1 0.5552 0.35658 0.544 0.008 0.000 0.368 0.044 0.036
#> SRR1313687 2 0.3448 0.64521 0.052 0.844 0.000 0.044 0.056 0.004
#> SRR1358220 2 0.3153 0.64398 0.048 0.856 0.000 0.064 0.032 0.000
#> SRR1096662 2 0.5088 0.50685 0.064 0.708 0.000 0.160 0.064 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.6903 0.26220 0.508 0.180 0.000 0.076 0.224 0.012
#> SRR660164 2 0.3344 0.60602 0.000 0.804 0.000 0.044 0.152 0.000
#> SRR815783 2 0.2716 0.66274 0.008 0.880 0.000 0.044 0.064 0.004
#> SRR809595 1 0.7028 0.31682 0.524 0.156 0.012 0.072 0.224 0.012
#> SRR1403133 2 0.2058 0.64291 0.000 0.908 0.000 0.036 0.056 0.000
#> SRR815470 2 0.5968 0.29051 0.000 0.612 0.044 0.112 0.220 0.012
#> SRR1344382 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.6152 0.20797 0.000 0.568 0.060 0.092 0.272 0.008
#> SRR1478362 2 0.6152 0.20797 0.000 0.568 0.060 0.092 0.272 0.008
#> SRR1392186 2 0.5702 0.44558 0.092 0.660 0.000 0.152 0.092 0.004
#> SRR1347937 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1082 0.83294 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040 0.000
#> SRR1471594 1 0.0551 0.84537 0.984 0.000 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1354270 5 0.7747 0.46640 0.072 0.240 0.088 0.064 0.500 0.036
#> SRR612683 2 0.2860 0.63779 0.000 0.852 0.000 0.048 0.100 0.000
#> SRR1392901 2 0.6692 0.15193 0.000 0.540 0.104 0.104 0.240 0.012
#> SRR1077805 3 0.5616 0.45640 0.000 0.132 0.672 0.092 0.100 0.004
#> SRR1360402 2 0.1845 0.64395 0.000 0.920 0.000 0.028 0.052 0.000
#> SRR1406112 5 0.6171 0.43861 0.004 0.220 0.188 0.024 0.560 0.004
#> SRR1355352 5 0.7744 -0.16345 0.092 0.052 0.304 0.016 0.440 0.096
#> SRR656247 1 0.3995 0.72583 0.800 0.024 0.000 0.060 0.108 0.008
#> SRR813656 2 0.6713 -0.13394 0.136 0.468 0.000 0.320 0.072 0.004
#> SRR808244 6 0.4088 0.82320 0.072 0.000 0.016 0.064 0.040 0.808
#> SRR1387240 2 0.3202 0.60090 0.000 0.816 0.000 0.040 0.144 0.000
#> SRR1408595 1 0.2694 0.80758 0.892 0.008 0.004 0.028 0.052 0.016
#> SRR1385277 4 0.7518 0.30516 0.256 0.208 0.004 0.428 0.084 0.020
#> SRR1435248 2 0.2365 0.63877 0.000 0.888 0.000 0.040 0.072 0.000
#> SRR1419110 5 0.6653 0.47224 0.028 0.376 0.080 0.020 0.472 0.024
#> SRR1408682 2 0.3885 0.55181 0.004 0.756 0.000 0.048 0.192 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4489 0.59873 0.068 0.764 0.000 0.080 0.088 0.000
#> SRR1453911 2 0.4811 0.38007 0.000 0.616 0.020 0.036 0.328 0.000
#> SRR603164 3 0.5461 0.18828 0.000 0.252 0.624 0.040 0.084 0.000
#> SRR1383259 2 0.6508 -0.23256 0.112 0.468 0.000 0.352 0.064 0.004
#> SRR1330854 1 0.2978 0.78003 0.868 0.000 0.016 0.004 0.060 0.052
#> SRR1452423 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4850 0.55337 0.072 0.740 0.000 0.112 0.072 0.004
#> SRR1468162 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.6074 0.15936 0.000 0.176 0.324 0.016 0.484 0.000
#> SRR1361546 1 0.6568 0.35460 0.552 0.164 0.000 0.072 0.204 0.008
#> SRR1486156 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3041 0.60496 0.000 0.832 0.000 0.040 0.128 0.000
#> SRR615635 2 0.2537 0.66413 0.020 0.896 0.000 0.048 0.032 0.004
#> SRR1385411 2 0.4225 0.58942 0.056 0.780 0.000 0.108 0.056 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 5 0.6788 -0.32456 0.020 0.040 0.416 0.016 0.420 0.088
#> SRR662126 2 0.5522 0.28417 0.020 0.600 0.000 0.260 0.120 0.000
#> SRR1464601 2 0.2595 0.61912 0.000 0.872 0.000 0.044 0.084 0.000
#> SRR1071594 2 0.3302 0.66250 0.044 0.852 0.004 0.036 0.064 0.000
#> SRR612539 2 0.4759 0.58072 0.064 0.748 0.000 0.104 0.080 0.004
#> SRR602010 1 0.6678 0.32025 0.532 0.168 0.000 0.072 0.220 0.008
#> SRR810249 2 0.1332 0.65931 0.008 0.952 0.000 0.028 0.012 0.000
#> SRR818773 1 0.6656 0.34121 0.540 0.164 0.000 0.076 0.212 0.008
#> SRR1336569 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3618 0.60401 0.000 0.776 0.000 0.048 0.176 0.000
#> SRR1442754 1 0.2708 0.79764 0.888 0.000 0.016 0.008 0.044 0.044
#> SRR1334247 5 0.6300 0.39308 0.012 0.200 0.204 0.016 0.560 0.008
#> SRR661639 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6582 0.11759 0.172 0.548 0.000 0.192 0.084 0.004
#> SRR1459937 4 0.8377 0.31135 0.208 0.220 0.040 0.392 0.112 0.028
#> SRR2185018 1 0.0458 0.84405 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.4162 0.64520 0.048 0.784 0.000 0.060 0.108 0.000
#> SRR809348 1 0.0291 0.84607 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR819261 5 0.7765 0.29869 0.028 0.164 0.224 0.056 0.480 0.048
#> SRR661074 3 0.7296 0.32253 0.060 0.004 0.416 0.020 0.320 0.180
#> SRR1349851 1 0.2693 0.79781 0.888 0.000 0.004 0.036 0.048 0.024
#> SRR1405123 2 0.6538 -0.21834 0.112 0.472 0.000 0.344 0.068 0.004
#> SRR661096 2 0.5731 0.40551 0.116 0.652 0.000 0.160 0.068 0.004
#> SRR1320225 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6245 0.24649 0.496 0.004 0.016 0.376 0.056 0.052
#> SRR1307677 2 0.2266 0.65998 0.028 0.908 0.000 0.040 0.024 0.000
#> SRR1466512 2 0.3474 0.62610 0.044 0.836 0.000 0.072 0.048 0.000
#> SRR658212 2 0.2266 0.65998 0.028 0.908 0.000 0.040 0.024 0.000
#> SRR1430525 3 0.3940 0.53729 0.000 0.040 0.796 0.048 0.116 0.000
#> SRR1344422 2 0.6881 -0.31591 0.108 0.436 0.004 0.364 0.080 0.008
#> SRR1353924 2 0.3057 0.64023 0.048 0.860 0.000 0.068 0.024 0.000
#> SRR1314832 1 0.5963 0.47725 0.656 0.000 0.104 0.016 0.116 0.108
#> SRR1487570 1 0.5552 0.35658 0.544 0.008 0.000 0.368 0.044 0.036
#> SRR627431 2 0.4616 0.48242 0.000 0.728 0.016 0.084 0.168 0.004
#> SRR1418561 1 0.8452 -0.01708 0.400 0.044 0.052 0.248 0.172 0.084
#> SRR1448029 3 0.5414 0.26251 0.000 0.100 0.476 0.004 0.420 0.000
#> SRR813802 1 0.0146 0.84729 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2490 0.65632 0.032 0.896 0.000 0.044 0.028 0.000
#> SRR1435311 2 0.4428 0.60521 0.076 0.776 0.000 0.068 0.076 0.004
#> SRR612395 5 0.4405 0.26001 0.000 0.472 0.000 0.024 0.504 0.000
#> SRR603116 2 0.3985 0.60750 0.024 0.764 0.000 0.032 0.180 0.000
#> SRR1323152 5 0.6423 0.30429 0.000 0.200 0.304 0.024 0.468 0.004
#> SRR1368264 1 0.6708 0.31958 0.536 0.172 0.000 0.080 0.204 0.008
#> SRR1326624 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR1429265 3 0.7421 0.34317 0.056 0.028 0.396 0.016 0.372 0.132
#> SRR1327702 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.6494 0.17949 0.160 0.564 0.000 0.184 0.088 0.004
#> SRR1486799 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.7054 0.34306 0.276 0.324 0.000 0.348 0.044 0.008
#> SRR815044 2 0.5327 0.46246 0.064 0.680 0.000 0.184 0.068 0.004
#> SRR1338560 2 0.3575 0.62233 0.060 0.828 0.000 0.076 0.036 0.000
#> SRR615862 2 0.2808 0.64962 0.024 0.876 0.000 0.060 0.040 0.000
#> SRR1480038 2 0.4428 0.60521 0.076 0.776 0.000 0.068 0.076 0.004
#> SRR659436 5 0.5547 0.52403 0.012 0.332 0.060 0.016 0.576 0.004
#> SRR613699 2 0.2309 0.63915 0.000 0.888 0.000 0.028 0.084 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.5692 0.40826 0.112 0.656 0.000 0.160 0.068 0.004
#> SRR1330327 2 0.5974 -0.49552 0.000 0.452 0.020 0.420 0.100 0.008
#> SRR1489950 2 0.1863 0.64188 0.000 0.920 0.000 0.036 0.044 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.5174 0.39401 0.000 0.072 0.544 0.008 0.376 0.000
#> SRR1444002 1 0.0806 0.83969 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1318444 5 0.8986 0.24679 0.084 0.208 0.088 0.220 0.344 0.056
#> SRR600656 4 0.5798 0.62070 0.012 0.408 0.008 0.484 0.084 0.004
#> SRR658766 2 0.6907 -0.03029 0.004 0.484 0.108 0.084 0.308 0.012
#> SRR655946 3 0.5580 0.47081 0.000 0.124 0.676 0.088 0.108 0.004
#> SRR817282 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 5 0.6955 -0.32100 0.032 0.036 0.408 0.016 0.416 0.092
#> SRR1406418 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.6656 0.34121 0.540 0.164 0.000 0.076 0.212 0.008
#> SRR1471965 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.5861 0.50603 0.004 0.264 0.080 0.048 0.600 0.004
#> SRR662498 5 0.4871 0.28886 0.000 0.460 0.020 0.024 0.496 0.000
#> SRR1376764 5 0.4715 0.48473 0.000 0.216 0.064 0.016 0.700 0.004
#> SRR1377006 5 0.7564 0.19015 0.000 0.256 0.312 0.108 0.316 0.008
#> SRR656860 2 0.4174 0.60028 0.048 0.784 0.000 0.104 0.064 0.000
#> SRR1480547 2 0.6443 -0.11927 0.112 0.500 0.000 0.320 0.064 0.004
#> SRR1452515 5 0.6210 0.45324 0.000 0.288 0.192 0.024 0.496 0.000
#> SRR1324390 2 0.2237 0.64662 0.000 0.896 0.000 0.036 0.068 0.000
#> SRR615273 1 0.7177 0.31471 0.520 0.124 0.028 0.056 0.252 0.020
#> SRR601695 2 0.5706 0.32390 0.000 0.620 0.028 0.100 0.240 0.012
#> SRR820907 2 0.3754 0.63666 0.052 0.824 0.000 0.056 0.064 0.004
#> SRR812773 1 0.5235 0.63412 0.712 0.064 0.000 0.076 0.136 0.012
#> SRR1405984 2 0.2172 0.65861 0.020 0.912 0.000 0.044 0.024 0.000
#> SRR1472794 2 0.4151 0.52554 0.000 0.744 0.012 0.052 0.192 0.000
#> SRR1365448 1 0.0909 0.83797 0.968 0.000 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1095720 5 0.5282 0.36431 0.000 0.148 0.112 0.016 0.696 0.028
#> SRR1435626 5 0.7055 0.42029 0.044 0.216 0.216 0.008 0.496 0.020
#> SRR1080766 2 0.2595 0.61912 0.000 0.872 0.000 0.044 0.084 0.000
#> SRR1377862 1 0.2461 0.80615 0.900 0.000 0.004 0.028 0.048 0.020
#> SRR1332299 3 0.5907 0.18501 0.000 0.132 0.456 0.016 0.396 0.000
#> SRR1467966 5 0.6175 0.40653 0.000 0.216 0.216 0.024 0.540 0.004
#> SRR1320579 2 0.6890 0.11439 0.000 0.524 0.132 0.108 0.224 0.012
#> SRR1319710 2 0.4596 0.58010 0.084 0.756 0.000 0.084 0.076 0.000
#> SRR1326604 2 0.3086 0.65502 0.020 0.856 0.000 0.076 0.048 0.000
#> SRR1098879 6 0.3235 0.77411 0.000 0.000 0.136 0.008 0.032 0.824
#> SRR662245 2 0.2384 0.63830 0.000 0.884 0.000 0.032 0.084 0.000
#> SRR1074719 2 0.2172 0.65861 0.020 0.912 0.000 0.044 0.024 0.000
#> SRR816226 1 0.6252 0.27827 0.500 0.032 0.000 0.368 0.064 0.036
#> SRR601387 2 0.1921 0.64666 0.000 0.916 0.000 0.032 0.052 0.000
#> SRR614575 2 0.2808 0.64962 0.024 0.876 0.000 0.060 0.040 0.000
#> SRR1353900 2 0.2415 0.66553 0.024 0.900 0.000 0.036 0.040 0.000
#> SRR662906 2 0.2854 0.61538 0.000 0.860 0.004 0.048 0.088 0.000
#> SRR1350832 2 0.2058 0.63759 0.000 0.908 0.000 0.036 0.056 0.000
#> SRR1403280 2 0.4058 0.61340 0.056 0.796 0.000 0.084 0.064 0.000
#> SRR1313969 4 0.5662 0.59226 0.000 0.424 0.016 0.472 0.084 0.004
#> SRR1388528 1 0.0520 0.84398 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1452912 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4905 0.66315 0.736 0.052 0.000 0.080 0.124 0.008
#> SRR655399 3 0.4443 0.48886 0.000 0.000 0.696 0.004 0.232 0.068
#> SRR1319753 2 0.6426 0.24318 0.200 0.580 0.000 0.116 0.096 0.008
#> SRR818901 3 0.5675 0.16740 0.000 0.120 0.444 0.008 0.428 0.000
#> SRR607067 2 0.6157 -0.03811 0.076 0.520 0.000 0.324 0.080 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4797 0.56551 0.072 0.744 0.000 0.112 0.068 0.004
#> SRR661961 5 0.7405 0.24604 0.272 0.268 0.024 0.032 0.392 0.012
#> SRR658259 2 0.3055 0.64870 0.000 0.840 0.000 0.064 0.096 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.2308 0.63940 0.000 0.892 0.000 0.040 0.068 0.000
#> SRR1365034 2 0.5906 0.30669 0.064 0.616 0.000 0.228 0.084 0.008
#> SRR1478053 2 0.1666 0.65964 0.008 0.936 0.000 0.036 0.020 0.000
#> SRR1475300 2 0.4101 0.61822 0.060 0.800 0.000 0.064 0.072 0.004
#> SRR1328101 5 0.4787 0.23266 0.012 0.480 0.000 0.028 0.480 0.000
#> SRR1322900 1 0.5959 0.51058 0.616 0.060 0.004 0.068 0.240 0.012
#> SRR1309942 2 0.1921 0.64439 0.000 0.916 0.000 0.032 0.052 0.000
#> SRR1345760 1 0.7806 -0.09210 0.384 0.092 0.036 0.368 0.088 0.032
#> SRR1435418 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.5345 0.37836 0.008 0.652 0.004 0.160 0.172 0.004
#> SRR1443436 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.2647 0.62266 0.000 0.868 0.000 0.044 0.088 0.000
#> SRR661469 5 0.6489 0.52697 0.068 0.312 0.064 0.008 0.532 0.016
#> SRR1500323 2 0.3235 0.59028 0.000 0.820 0.000 0.052 0.128 0.000
#> SRR1356705 1 0.7193 -0.27988 0.372 0.372 0.000 0.104 0.144 0.008
#> SRR1464915 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.7953 0.37769 0.116 0.180 0.080 0.064 0.512 0.048
#> SRR1350435 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR1389177 3 0.6489 0.09525 0.000 0.164 0.440 0.044 0.352 0.000
#> SRR1368072 2 0.3292 0.65705 0.024 0.836 0.000 0.032 0.108 0.000
#> SRR601815 2 0.1921 0.64490 0.000 0.916 0.000 0.032 0.052 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6063 0.41098 0.028 0.616 0.024 0.112 0.216 0.004
#> SRR1394190 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.6278 0.42737 0.000 0.244 0.220 0.016 0.512 0.008
#> SRR1318839 3 0.1333 0.51510 0.000 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1432390 4 0.5327 0.61760 0.000 0.420 0.008 0.500 0.068 0.004
#> SRR613126 2 0.4151 0.52554 0.000 0.744 0.012 0.052 0.192 0.000
#> SRR1089424 2 0.3528 0.62657 0.044 0.832 0.000 0.076 0.048 0.000
#> SRR1347214 2 0.1854 0.66169 0.016 0.932 0.000 0.028 0.020 0.004
#> SRR1309556 2 0.7071 0.17826 0.092 0.532 0.028 0.120 0.224 0.004
#> SRR1456027 1 0.5561 0.34877 0.540 0.008 0.000 0.372 0.044 0.036
#> SRR1400551 5 0.7661 -0.13855 0.076 0.064 0.304 0.016 0.452 0.088
#> SRR1320469 1 0.0909 0.83797 0.968 0.000 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR614251 2 0.3130 0.62822 0.000 0.828 0.000 0.048 0.124 0.000
#> SRR1454310 2 0.1863 0.64568 0.000 0.920 0.000 0.036 0.044 0.000
#> SRR615105 2 0.6154 0.27183 0.000 0.608 0.060 0.124 0.196 0.012
#> SRR1433290 3 0.5907 0.18501 0.000 0.132 0.456 0.016 0.396 0.000
#> SRR2166064 4 0.5624 0.48019 0.008 0.412 0.000 0.484 0.088 0.008
#> SRR601671 2 0.3990 0.60783 0.052 0.800 0.000 0.088 0.060 0.000
#> SRR663874 2 0.3277 0.63113 0.012 0.832 0.000 0.028 0.124 0.004
#> SRR1409130 2 0.2660 0.62522 0.000 0.868 0.000 0.048 0.084 0.000
#> SRR659696 4 0.5508 0.54228 0.016 0.444 0.000 0.468 0.068 0.004
#> SRR1408249 2 0.5731 0.40551 0.116 0.652 0.000 0.160 0.068 0.004
#> SRR663284 2 0.4850 0.55337 0.072 0.740 0.000 0.112 0.072 0.004
#> SRR1402794 5 0.7765 0.29869 0.028 0.164 0.224 0.056 0.480 0.048
#> SRR614852 2 0.5941 -0.50362 0.000 0.452 0.020 0.424 0.096 0.008
#> SRR1348040 5 0.6765 0.47676 0.084 0.212 0.060 0.052 0.584 0.008
#> SRR1489610 2 0.4596 0.58010 0.084 0.756 0.000 0.084 0.076 0.000
#> SRR1488091 2 0.2697 0.61454 0.000 0.864 0.000 0.044 0.092 0.000
#> SRR1499566 2 0.6085 0.32710 0.172 0.616 0.000 0.124 0.084 0.004
#> SRR1361480 2 0.2206 0.65676 0.008 0.904 0.000 0.064 0.024 0.000
#> SRR1444501 3 0.3897 0.53475 0.000 0.048 0.800 0.040 0.112 0.000
#> SRR1415773 2 0.6061 0.44404 0.060 0.632 0.016 0.092 0.196 0.004
#> SRR1388832 5 0.6765 0.47676 0.084 0.212 0.060 0.052 0.584 0.008
#> SRR1394637 1 0.0405 0.84508 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR606974 2 0.4616 0.48242 0.000 0.728 0.016 0.084 0.168 0.004
#> SRR662918 4 0.5460 0.44913 0.008 0.428 0.000 0.480 0.080 0.004
#> SRR817421 3 0.1333 0.51510 0.000 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1400823 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3759 0.61702 0.048 0.816 0.000 0.084 0.052 0.000
#> SRR608264 3 0.1398 0.51618 0.000 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1318560 1 0.2407 0.80715 0.904 0.000 0.012 0.008 0.040 0.036
#> SRR1454117 2 0.4489 0.59873 0.068 0.764 0.000 0.080 0.088 0.000
#> SRR1312684 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR615044 1 0.7177 0.31471 0.520 0.124 0.028 0.056 0.252 0.020
#> SRR1432743 2 0.6873 -0.22666 0.000 0.444 0.140 0.064 0.340 0.012
#> SRR1388873 2 0.2251 0.65668 0.008 0.904 0.000 0.052 0.036 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.6697 0.47394 0.028 0.380 0.084 0.020 0.464 0.024
#> SRR1406008 2 0.4683 0.60055 0.076 0.748 0.000 0.076 0.100 0.000
#> SRR1396786 2 0.1176 0.65271 0.000 0.956 0.000 0.024 0.020 0.000
#> SRR1446564 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR1318465 3 0.6489 0.10283 0.000 0.164 0.440 0.044 0.352 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.6227 -0.11150 0.076 0.504 0.000 0.336 0.084 0.000
#> SRR655170 2 0.4074 0.63688 0.056 0.808 0.012 0.072 0.052 0.000
#> SRR1087825 4 0.5060 0.61277 0.000 0.428 0.000 0.504 0.064 0.004
#> SRR662019 5 0.8993 -0.01041 0.156 0.076 0.200 0.076 0.384 0.108
#> SRR1349209 5 0.8986 0.24679 0.084 0.208 0.088 0.220 0.344 0.056
#> SRR1326161 2 0.1894 0.66285 0.012 0.928 0.000 0.040 0.016 0.004
#> SRR1345284 2 0.3575 0.62233 0.060 0.828 0.000 0.076 0.036 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.3057 0.64023 0.048 0.860 0.000 0.068 0.024 0.000
#> SRR1454328 2 0.2294 0.63719 0.000 0.892 0.000 0.036 0.072 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4855 0.66735 0.740 0.052 0.000 0.076 0.124 0.008
#> SRR1408183 3 0.1668 0.52384 0.000 0.004 0.928 0.000 0.060 0.008
#> SRR1084369 3 0.3940 0.53729 0.000 0.040 0.796 0.048 0.116 0.000
#> SRR598452 3 0.5097 0.51313 0.004 0.016 0.648 0.004 0.268 0.060
#> SRR660709 2 0.6409 0.17598 0.004 0.560 0.056 0.104 0.264 0.012
#> SRR809444 1 0.0405 0.84508 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1089901 2 0.2365 0.63419 0.000 0.888 0.000 0.040 0.072 0.000
#> SRR1375774 1 0.2921 0.78527 0.868 0.016 0.000 0.032 0.080 0.004
#> SRR1326292 1 0.6245 0.24649 0.496 0.004 0.016 0.376 0.056 0.052
#> SRR657139 1 0.1334 0.82933 0.948 0.000 0.000 0.000 0.032 0.020
#> SRR1440744 2 0.4604 0.55907 0.072 0.752 0.000 0.112 0.064 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0405 0.84508 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1452334 2 0.5345 0.37836 0.008 0.652 0.004 0.160 0.172 0.004
#> SRR1381775 1 0.0551 0.84537 0.984 0.000 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1363908 1 0.0146 0.84729 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.4228 0.61930 0.064 0.784 0.000 0.068 0.084 0.000
#> SRR658989 5 0.5861 0.50603 0.004 0.264 0.080 0.048 0.600 0.004
#> SRR1353663 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR811771 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.1333 0.51510 0.000 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR819054 2 0.3193 0.65242 0.048 0.860 0.000 0.048 0.040 0.004
#> SRR1367988 4 0.6240 0.61966 0.048 0.380 0.004 0.480 0.084 0.004
#> SRR1331922 1 0.3234 0.77299 0.848 0.016 0.000 0.044 0.088 0.004
#> SRR615479 1 0.6477 0.40041 0.556 0.124 0.000 0.076 0.236 0.008
#> SRR1375796 2 0.3130 0.62822 0.000 0.828 0.000 0.048 0.124 0.000
#> SRR1386991 5 0.6247 0.50574 0.004 0.288 0.132 0.028 0.540 0.008
#> SRR1355217 5 0.4661 0.48591 0.000 0.216 0.060 0.016 0.704 0.004
#> SRR1356290 2 0.5970 0.25010 0.000 0.580 0.096 0.052 0.268 0.004
#> SRR659507 2 0.5372 -0.12200 0.016 0.512 0.020 0.024 0.424 0.004
#> SRR663296 1 0.3293 0.74611 0.824 0.012 0.000 0.132 0.032 0.000
#> SRR598044 2 0.3320 0.64738 0.052 0.852 0.000 0.040 0.052 0.004
#> SRR661155 4 0.5624 0.48019 0.008 0.412 0.000 0.484 0.088 0.008
#> SRR1414727 5 0.8355 0.26695 0.216 0.168 0.120 0.032 0.420 0.044
#> SRR663477 1 0.2554 0.79961 0.896 0.000 0.004 0.032 0.044 0.024
#> SRR1354489 3 0.6489 0.10283 0.000 0.164 0.440 0.044 0.352 0.000
#> SRR1377800 5 0.7307 -0.14098 0.052 0.064 0.316 0.012 0.472 0.084
#> SRR614611 2 0.3059 0.61598 0.000 0.856 0.020 0.040 0.084 0.000
#> SRR655052 2 0.6637 0.11667 0.008 0.536 0.036 0.172 0.236 0.012
#> SRR1478968 1 0.5561 0.34877 0.540 0.008 0.000 0.372 0.044 0.036
#> SRR1351280 2 0.5984 0.27550 0.060 0.604 0.000 0.236 0.092 0.008
#> SRR613951 1 0.7021 -0.16734 0.400 0.168 0.000 0.364 0.048 0.020
#> SRR1418022 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 5 0.8936 0.24951 0.072 0.208 0.092 0.228 0.344 0.056
#> SRR1408161 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 5 0.7765 0.29869 0.028 0.164 0.224 0.056 0.480 0.048
#> SRR655040 4 0.6941 0.35454 0.268 0.312 0.000 0.372 0.044 0.004
#> SRR810225 2 0.2992 0.66559 0.036 0.872 0.000 0.044 0.044 0.004
#> SRR1325377 2 0.3662 0.64643 0.048 0.824 0.000 0.056 0.072 0.000
#> SRR617829 2 0.6947 0.08637 0.000 0.508 0.128 0.108 0.244 0.012
#> SRR1402328 2 0.1720 0.64745 0.000 0.928 0.000 0.032 0.040 0.000
#> SRR1480455 2 0.3127 0.61343 0.000 0.852 0.020 0.044 0.084 0.000
#> SRR1442104 3 0.2826 0.35315 0.000 0.000 0.856 0.024 0.008 0.112
#> SRR1453416 1 0.0909 0.83797 0.968 0.000 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1481396 3 0.7058 0.34059 0.056 0.000 0.440 0.020 0.316 0.168
#> SRR1414314 2 0.2134 0.63948 0.000 0.904 0.000 0.044 0.052 0.000
#> SRR663026 2 0.1457 0.66036 0.004 0.948 0.000 0.016 0.028 0.004
#> SRR1478386 2 0.5271 0.50084 0.096 0.704 0.000 0.120 0.076 0.004
#> SRR1458683 4 0.6507 0.59520 0.000 0.388 0.036 0.460 0.080 0.036
#> SRR1370572 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.7150 0.33824 0.524 0.120 0.016 0.064 0.248 0.028
#> SRR1310735 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5327 0.61760 0.000 0.420 0.008 0.500 0.068 0.004
#> SRR660260 5 0.4905 0.28298 0.000 0.460 0.012 0.036 0.492 0.000
#> SRR1071231 2 0.1251 0.66102 0.008 0.956 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1459125 2 0.8013 -0.27222 0.072 0.380 0.044 0.224 0.268 0.012
#> SRR1337173 2 0.6610 -0.00572 0.000 0.504 0.108 0.068 0.308 0.012
#> SRR1396250 3 0.4367 0.49288 0.000 0.000 0.708 0.004 0.220 0.068
#> SRR2166376 5 0.5282 0.36431 0.000 0.148 0.112 0.016 0.696 0.028
#> SRR659816 2 0.6409 0.17598 0.004 0.560 0.056 0.104 0.264 0.012
#> SRR1401379 2 0.4596 0.58010 0.084 0.756 0.000 0.084 0.076 0.000
#> SRR600981 2 0.6352 -0.28669 0.060 0.472 0.000 0.368 0.096 0.004
#> SRR1398335 1 0.0291 0.84607 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1397218 2 0.6631 0.24916 0.116 0.556 0.004 0.160 0.164 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.2065 0.64499 0.004 0.912 0.000 0.032 0.052 0.000
#> SRR1359780 2 0.2250 0.63635 0.000 0.896 0.000 0.040 0.064 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.7895 -0.34386 0.048 0.140 0.008 0.412 0.100 0.292
#> SRR1397156 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.2647 0.62266 0.000 0.868 0.000 0.044 0.088 0.000
#> SRR1319648 2 0.4951 0.56250 0.072 0.732 0.000 0.112 0.080 0.004
#> SRR1092985 6 0.3344 0.81505 0.088 0.000 0.000 0.032 0.040 0.840
#> SRR656409 2 0.6043 0.25270 0.120 0.600 0.000 0.216 0.060 0.004
#> SRR1468658 3 0.7344 -0.16632 0.000 0.240 0.344 0.080 0.328 0.008
#> SRR1390437 1 0.7021 -0.16734 0.400 0.168 0.000 0.364 0.048 0.020
#> SRR658057 2 0.4218 0.59874 0.048 0.780 0.000 0.108 0.064 0.000
#> SRR612635 2 0.3819 0.61619 0.048 0.812 0.000 0.084 0.056 0.000
#> SRR1351480 2 0.3049 0.66053 0.052 0.864 0.000 0.040 0.044 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3950 0.72827 0.804 0.024 0.000 0.060 0.104 0.008
#> SRR659590 2 0.1251 0.65911 0.008 0.956 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR614263 1 0.0260 0.84630 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3655 0.62076 0.052 0.824 0.000 0.076 0.048 0.000
#> SRR659911 2 0.2176 0.64269 0.000 0.896 0.000 0.024 0.080 0.000
#> SRR1085519 3 0.5174 0.39401 0.000 0.072 0.544 0.008 0.376 0.000
#> SRR1345894 5 0.5861 0.44957 0.000 0.272 0.180 0.012 0.536 0.000
#> SRR1442928 5 0.4405 0.26001 0.000 0.472 0.000 0.024 0.504 0.000
#> SRR1464681 4 0.5060 0.61277 0.000 0.428 0.000 0.504 0.064 0.004
#> SRR1418880 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.6610 -0.00572 0.000 0.504 0.108 0.068 0.308 0.012
#> SRR1365426 1 0.6661 0.33249 0.540 0.168 0.000 0.076 0.208 0.008
#> SRR1487947 1 0.0993 0.83708 0.964 0.000 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR659708 1 0.3950 0.72827 0.804 0.024 0.000 0.060 0.104 0.008
#> SRR603236 2 0.5773 0.31694 0.000 0.616 0.032 0.100 0.240 0.012
#> SRR660673 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1498 0.65606 0.000 0.940 0.000 0.028 0.032 0.000
#> SRR663807 2 0.2445 0.66514 0.020 0.896 0.000 0.028 0.056 0.000
#> SRR1087245 2 0.4162 0.60004 0.048 0.784 0.000 0.108 0.060 0.000
#> SRR1339108 2 0.5777 0.47905 0.068 0.656 0.008 0.120 0.148 0.000
#> SRR613426 4 0.7337 0.01926 0.368 0.100 0.016 0.416 0.076 0.024
#> SRR613879 2 0.3618 0.60401 0.000 0.776 0.000 0.048 0.176 0.000
#> SRR1385101 1 0.6301 0.43392 0.592 0.144 0.000 0.072 0.184 0.008
#> SRR1387966 2 0.2314 0.66300 0.008 0.900 0.000 0.036 0.056 0.000
#> SRR1458852 2 0.3235 0.59028 0.000 0.820 0.000 0.052 0.128 0.000
#> SRR1430489 1 0.5552 0.35658 0.544 0.008 0.000 0.368 0.044 0.036
#> SRR1349231 1 0.3922 0.72367 0.812 0.036 0.000 0.056 0.088 0.008
#> SRR1376249 3 0.7066 0.33539 0.052 0.000 0.436 0.020 0.312 0.180
#> SRR1321987 2 0.2762 0.61666 0.000 0.860 0.000 0.048 0.092 0.000
#> SRR662653 2 0.1251 0.65911 0.008 0.956 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3320 0.64738 0.052 0.852 0.000 0.040 0.052 0.004
#> SRR1383081 2 0.4120 0.60705 0.044 0.788 0.000 0.100 0.068 0.000
#> SRR2166960 2 0.2641 0.64907 0.000 0.876 0.000 0.048 0.072 0.004
#> SRR605101 2 0.5247 0.53526 0.112 0.704 0.000 0.064 0.116 0.004
#> SRR818600 2 0.2486 0.66555 0.024 0.896 0.000 0.040 0.040 0.000
#> SRR1367715 2 0.3884 0.62041 0.048 0.808 0.000 0.080 0.064 0.000
#> SRR1351979 3 0.1075 0.51814 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1387054 3 0.5580 0.47081 0.000 0.124 0.676 0.088 0.108 0.004
#> SRR1444306 5 0.5545 -0.16685 0.000 0.116 0.420 0.004 0.460 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.2176 0.64269 0.000 0.896 0.000 0.024 0.080 0.000
#> SRR612767 1 0.3405 0.77464 0.848 0.004 0.004 0.068 0.052 0.024
#> SRR1489030 2 0.1418 0.65890 0.000 0.944 0.000 0.032 0.024 0.000
#> SRR1430375 2 0.4089 0.48886 0.000 0.696 0.000 0.040 0.264 0.000
#> SRR615225 2 0.6352 -0.28669 0.060 0.472 0.000 0.368 0.096 0.004
#> SRR1401839 5 0.6882 0.46614 0.036 0.340 0.072 0.068 0.480 0.004
#> SRR1379110 2 0.3575 0.62233 0.060 0.828 0.000 0.076 0.036 0.000
#> SRR1077288 3 0.7296 0.32253 0.060 0.004 0.416 0.020 0.320 0.180
#> SRR1331639 4 0.5060 0.61277 0.000 0.428 0.000 0.504 0.064 0.004
#> SRR1342782 1 0.6883 0.21039 0.508 0.216 0.000 0.084 0.184 0.008
#> SRR1443003 3 0.5945 0.15981 0.000 0.152 0.456 0.012 0.380 0.000
#> SRR612839 1 0.0806 0.83968 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1470093 3 0.4488 0.47178 0.000 0.100 0.760 0.092 0.048 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.6893 0.08230 0.000 0.512 0.128 0.100 0.248 0.012
#> SRR664063 1 0.6815 0.27063 0.512 0.180 0.000 0.076 0.224 0.008
#> SRR1488214 1 0.3278 0.78455 0.860 0.008 0.004 0.052 0.052 0.024
#> SRR654766 4 0.6240 0.61966 0.048 0.380 0.004 0.480 0.084 0.004
#> SRR1320321 2 0.3754 0.63666 0.052 0.824 0.000 0.056 0.064 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.84839 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4120 0.60705 0.044 0.788 0.000 0.100 0.068 0.000
#> SRR1488470 2 0.6443 -0.11927 0.112 0.500 0.000 0.320 0.064 0.004
#> SRR1389497 3 0.1668 0.52384 0.000 0.004 0.928 0.000 0.060 0.008
#> SRR1367109 5 0.6175 0.40653 0.000 0.216 0.216 0.024 0.540 0.004
#> SRR615311 1 0.1410 0.82794 0.944 0.004 0.000 0.044 0.008 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.961 0.953 0.981 0.4239 0.580 0.580
#> 3 3 0.874 0.904 0.957 0.5162 0.768 0.607
#> 4 4 0.742 0.729 0.844 0.1403 0.878 0.679
#> 5 5 0.743 0.709 0.812 0.0618 0.930 0.755
#> 6 6 0.735 0.547 0.746 0.0421 0.928 0.717
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.730 0.743 0.204 0.796
#> SRR1105057 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.939 0.450 0.644 0.356
#> SRR1431288 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.343 0.911 0.936 0.064
#> SRR613999 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1375509 2 0.730 0.743 0.204 0.796
#> SRR612227 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.722 0.749 0.200 0.800
#> SRR1403133 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.242 0.944 0.040 0.960
#> SRR612683 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.978 0.301 0.412 0.588
#> SRR656247 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.706 0.761 0.192 0.808
#> SRR1486156 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR810249 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.722 0.749 0.200 0.800
#> SRR1336569 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR661074 1 0.971 0.339 0.600 0.400
#> SRR1349851 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.753 0.717 0.216 0.784
#> SRR1320225 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.936 0.459 0.648 0.352
#> SRR1448029 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1326624 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1429265 2 0.971 0.335 0.400 0.600
#> SRR1327702 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.795 0.677 0.240 0.760
#> SRR815044 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR818901 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.388 0.906 0.076 0.924
#> SRR658259 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.971 0.339 0.600 0.400
#> SRR1309942 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.745 0.731 0.212 0.788
#> SRR1350435 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1400551 2 0.795 0.685 0.240 0.760
#> SRR1320469 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1408249 1 0.971 0.343 0.600 0.400
#> SRR663284 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.722 0.742 0.200 0.800
#> SRR1361480 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.971 0.339 0.600 0.400
#> SRR1394637 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1432743 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662019 2 0.946 0.430 0.364 0.636
#> SRR1349209 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR615479 2 0.975 0.312 0.408 0.592
#> SRR1375796 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.730 0.743 0.204 0.796
#> SRR663477 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.343 0.919 0.064 0.936
#> SRR614611 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1481396 2 0.971 0.335 0.400 0.600
#> SRR1414314 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.730 0.743 0.204 0.796
#> SRR1310735 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.971 0.319 0.400 0.600
#> SRR1397156 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.714 0.755 0.196 0.804
#> SRR1487947 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613426 1 0.781 0.692 0.768 0.232
#> SRR613879 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.745 0.731 0.212 0.788
#> SRR1387966 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.971 0.339 0.600 0.400
#> SRR1321987 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.971 0.339 0.600 0.400
#> SRR1331639 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.706 0.761 0.192 0.808
#> SRR1488214 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.000 0.975 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.000 0.975 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.6305 0.0619 0.000 0.484 0.516
#> SRR1419258 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1403366 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR665262 2 0.4974 0.7109 0.000 0.764 0.236
#> SRR1499740 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR612215 2 0.5178 0.6856 0.000 0.744 0.256
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.1643 0.9282 0.044 0.000 0.956
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR614839 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1334512 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR654802 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR660066 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1402153 3 0.2878 0.8762 0.000 0.096 0.904
#> SRR655887 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR658707 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.5988 0.3974 0.000 0.632 0.368
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1329003 1 0.0237 0.9867 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR612227 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0424 0.9243 0.000 0.992 0.008
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR615814 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.4654 0.7435 0.000 0.792 0.208
#> SRR660164 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 2 0.6111 0.4433 0.000 0.604 0.396
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1478362 2 0.0592 0.9222 0.000 0.988 0.012
#> SRR1392186 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1077805 3 0.4555 0.7425 0.000 0.200 0.800
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1355352 3 0.0237 0.9633 0.004 0.000 0.996
#> SRR656247 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR808244 1 0.5363 0.6161 0.724 0.000 0.276
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.6126 0.4424 0.000 0.600 0.400
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.5529 0.5216 0.000 0.296 0.704
#> SRR1408682 2 0.5810 0.5646 0.000 0.664 0.336
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.5785 0.5720 0.000 0.668 0.332
#> SRR603164 3 0.4654 0.7308 0.000 0.208 0.792
#> SRR1383259 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1361546 2 0.6154 0.4150 0.000 0.592 0.408
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR662126 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.4931 0.7154 0.000 0.768 0.232
#> SRR810249 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.6600 0.4513 0.012 0.604 0.384
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR661639 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.4121 0.7900 0.000 0.832 0.168
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.1529 0.9321 0.040 0.000 0.960
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR661096 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0237 0.9867 0.996 0.000 0.004
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR658212 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1344422 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0237 0.9867 0.996 0.000 0.004
#> SRR627431 2 0.0237 0.9250 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418561 3 0.0747 0.9527 0.016 0.000 0.984
#> SRR1448029 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR813802 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.6095 0.4524 0.000 0.608 0.392
#> SRR603116 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1368264 2 0.4291 0.7737 0.000 0.820 0.180
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0237 0.9633 0.004 0.000 0.996
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR815044 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR613699 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330327 2 0.3192 0.8463 0.000 0.888 0.112
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.5810 0.5709 0.000 0.664 0.336
#> SRR658766 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR655946 3 0.4887 0.6995 0.000 0.228 0.772
#> SRR817282 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.6095 0.4525 0.000 0.608 0.392
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR662498 3 0.0424 0.9633 0.000 0.008 0.992
#> SRR1376764 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1377006 3 0.0747 0.9530 0.000 0.016 0.984
#> SRR656860 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480547 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452515 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.2959 0.8535 0.000 0.900 0.100
#> SRR820907 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.5178 0.6491 0.744 0.000 0.256
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1435626 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1467966 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1320579 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR662245 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0237 0.9867 0.996 0.000 0.004
#> SRR601387 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.4654 0.7074 0.000 0.792 0.208
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.6225 0.3639 0.000 0.568 0.432
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0475 0.9828 0.992 0.004 0.004
#> SRR655399 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1319753 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR818901 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR607067 2 0.2625 0.8690 0.000 0.916 0.084
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR658259 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.4555 0.7526 0.000 0.800 0.200
#> SRR1322900 3 0.1411 0.9373 0.036 0.000 0.964
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 2 0.5882 0.5489 0.000 0.652 0.348
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 2 0.6308 0.1702 0.000 0.508 0.492
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.1289 0.9086 0.000 0.968 0.032
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1318839 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1432390 2 0.0424 0.9243 0.000 0.992 0.008
#> SRR613126 2 0.1031 0.9125 0.000 0.976 0.024
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.6295 0.2367 0.000 0.528 0.472
#> SRR1456027 1 0.4178 0.7873 0.828 0.000 0.172
#> SRR1400551 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.4062 0.7899 0.000 0.164 0.836
#> SRR1433290 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR2166064 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR601671 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1408249 2 0.5201 0.6625 0.236 0.760 0.004
#> SRR663284 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402794 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR614852 2 0.3340 0.8396 0.000 0.880 0.120
#> SRR1348040 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1361480 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1444501 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 3 0.0892 0.9507 0.020 0.000 0.980
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0237 0.9250 0.000 0.996 0.004
#> SRR662918 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR817421 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.6307 -0.1093 0.000 0.488 0.512
#> SRR1432743 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.4178 0.7809 0.000 0.172 0.828
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR655170 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.5859 0.5560 0.000 0.656 0.344
#> SRR662019 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1084369 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR598452 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR660709 2 0.6045 0.4860 0.000 0.620 0.380
#> SRR809444 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0237 0.9867 0.996 0.000 0.004
#> SRR657139 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.3686 0.8193 0.000 0.860 0.140
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR819054 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.5948 0.5266 0.000 0.640 0.360
#> SRR1331922 1 0.3340 0.8548 0.880 0.000 0.120
#> SRR615479 2 0.9162 0.3964 0.196 0.536 0.268
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1355217 2 0.5785 0.5713 0.000 0.668 0.332
#> SRR1356290 2 0.1643 0.8985 0.000 0.956 0.044
#> SRR659507 2 0.6309 0.1419 0.000 0.500 0.500
#> SRR663296 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414727 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR663477 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1377800 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR614611 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 2 0.1529 0.9035 0.000 0.960 0.040
#> SRR1478968 1 0.4399 0.7641 0.812 0.000 0.188
#> SRR1351280 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR613951 2 0.5327 0.6700 0.000 0.728 0.272
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR810225 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.4654 0.7307 0.000 0.208 0.792
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0237 0.9633 0.004 0.000 0.996
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.8050 0.2149 0.064 0.500 0.436
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.5560 0.6291 0.000 0.700 0.300
#> SRR660260 2 0.6180 0.3953 0.000 0.584 0.416
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.5859 0.5564 0.000 0.656 0.344
#> SRR1337173 3 0.3941 0.8025 0.000 0.156 0.844
#> SRR1396250 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR2166376 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR659816 2 0.3752 0.8129 0.000 0.856 0.144
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.5431 0.6528 0.000 0.716 0.284
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0424 0.9243 0.000 0.992 0.008
#> SRR660115 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4978 0.6943 0.216 0.780 0.004
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.4062 0.7951 0.000 0.836 0.164
#> SRR658057 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR612635 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1345894 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1442928 2 0.6095 0.4524 0.000 0.608 0.392
#> SRR1464681 2 0.0424 0.9243 0.000 0.992 0.008
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1365426 2 0.5318 0.7354 0.016 0.780 0.204
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 2 0.3267 0.8403 0.000 0.884 0.116
#> SRR660673 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.5798 0.7310 0.776 0.040 0.184
#> SRR613879 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 2 0.7966 0.5971 0.128 0.652 0.220
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.1289 0.9398 0.032 0.000 0.968
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351979 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1387054 3 0.4702 0.7248 0.000 0.212 0.788
#> SRR1444306 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.5835 0.5574 0.000 0.660 0.340
#> SRR615225 2 0.5678 0.6038 0.000 0.684 0.316
#> SRR1401839 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.1529 0.9321 0.040 0.000 0.960
#> SRR1331639 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1342782 2 0.5216 0.6801 0.000 0.740 0.260
#> SRR1443003 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR612839 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9639 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0424 0.9634 0.000 0.008 0.992
#> SRR664063 2 0.5619 0.6903 0.012 0.744 0.244
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.5733 0.5913 0.000 0.676 0.324
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9270 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0237 0.9254 0.000 0.996 0.004
#> SRR1389497 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR1367109 3 0.0237 0.9663 0.000 0.004 0.996
#> SRR615311 1 0.0000 0.9900 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380716 2 0.1792 0.78119 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR612803 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.1118 0.96582 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1074359 2 0.7820 -0.23617 0.000 0.384 0.360 0.256
#> SRR1419258 3 0.3486 0.79454 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1403366 3 0.0707 0.83843 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR665262 2 0.6084 0.43063 0.000 0.656 0.252 0.092
#> SRR1499740 3 0.2868 0.77845 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1105057 2 0.2345 0.76553 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1439742 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.2149 0.80259 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR612215 2 0.6056 0.43036 0.000 0.660 0.248 0.092
#> SRR1094051 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.1302 0.95994 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1409263 3 0.1389 0.82996 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1431288 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.4843 0.36500 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR614839 2 0.4522 0.56471 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR658433 2 0.0336 0.79244 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1088581 3 0.5000 0.33915 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1328797 3 0.3486 0.79906 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1334512 2 0.4761 0.41400 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1471117 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.3024 0.81527 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR660066 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.2149 0.80259 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1402153 3 0.4831 0.76310 0.000 0.040 0.752 0.208
#> SRR655887 2 0.1211 0.79155 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1408529 3 0.3444 0.80097 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR658707 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.6464 0.21817 0.000 0.540 0.384 0.076
#> SRR1074670 3 0.0921 0.83613 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1375439 3 0.2976 0.78005 0.000 0.008 0.872 0.120
#> SRR1329003 4 0.5290 0.00389 0.476 0.000 0.008 0.516
#> SRR1404837 2 0.4564 0.56100 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1317920 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1455525 4 0.4193 0.42659 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR613999 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0336 0.98536 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375509 3 0.0921 0.83654 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR612227 3 0.0469 0.83962 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1388809 2 0.0188 0.79659 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413872 4 0.2814 0.66546 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1452864 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1473078 3 0.1474 0.82895 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR615814 2 0.0188 0.79659 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1325225 1 0.2281 0.90357 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1313687 2 0.0921 0.79448 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1358220 2 0.2345 0.76553 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1096662 4 0.4746 0.39779 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1487746 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.7740 0.08715 0.000 0.416 0.236 0.348
#> SRR660164 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809595 4 0.7740 0.29346 0.000 0.244 0.328 0.428
#> SRR1403133 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.4468 0.53011 0.000 0.752 0.016 0.232
#> SRR1344382 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3726 0.78733 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1478362 4 0.3249 0.66368 0.000 0.140 0.008 0.852
#> SRR1392186 2 0.4961 0.30734 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1347937 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0592 0.98110 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1354270 4 0.4877 0.11091 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR612683 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.4158 0.77460 0.000 0.008 0.768 0.224
#> SRR1077805 3 0.5025 0.71856 0.000 0.032 0.716 0.252
#> SRR1360402 2 0.0188 0.79658 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1406112 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.1867 0.81856 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR656247 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 4 0.4989 -0.01187 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR808244 4 0.6180 0.37659 0.296 0.000 0.080 0.624
#> SRR1387240 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1385277 4 0.2402 0.63582 0.000 0.012 0.076 0.912
#> SRR1435248 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.6462 0.27041 0.000 0.332 0.580 0.088
#> SRR1408682 2 0.6359 0.42222 0.000 0.648 0.220 0.132
#> SRR1317134 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4431 0.59094 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1453911 2 0.6708 0.34256 0.000 0.592 0.280 0.128
#> SRR603164 3 0.5421 0.72469 0.000 0.076 0.724 0.200
#> SRR1383259 4 0.4776 0.38030 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1330854 1 0.1211 0.96256 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1452423 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4477 0.57852 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1468162 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.3123 0.81352 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1361546 3 0.7896 -0.24010 0.000 0.296 0.368 0.336
#> SRR1486156 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2635 0.72884 0.000 0.904 0.020 0.076
#> SRR615635 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385411 4 0.4948 0.20329 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1342739 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0707 0.83799 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR662126 4 0.4522 0.44714 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1464601 2 0.0707 0.78534 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1071594 2 0.0188 0.79659 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612539 2 0.4164 0.61616 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR602010 2 0.7603 0.21863 0.000 0.476 0.244 0.280
#> SRR810249 2 0.1302 0.79097 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR818773 4 0.7876 0.20510 0.000 0.280 0.352 0.368
#> SRR1336569 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0707 0.79025 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1442754 1 0.1302 0.95994 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1334247 3 0.0921 0.83654 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR661639 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 4 0.5742 0.60505 0.000 0.120 0.168 0.712
#> SRR1459937 4 0.2589 0.58270 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR2185018 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0336 0.79679 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809348 1 0.0188 0.98714 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR819261 3 0.0921 0.83613 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR661074 3 0.1389 0.82996 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1349851 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1405123 4 0.4661 0.44183 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR661096 2 0.4522 0.52967 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1320225 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.5290 0.00389 0.476 0.000 0.008 0.516
#> SRR1307677 2 0.1118 0.79259 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1466512 2 0.4072 0.63140 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR658212 2 0.1118 0.79259 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1430525 3 0.3837 0.77873 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1344422 4 0.4304 0.53324 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1353924 2 0.2345 0.76553 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1314832 1 0.1302 0.95994 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1487570 1 0.2345 0.89610 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR627431 2 0.4134 0.57153 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1418561 4 0.5408 0.29401 0.016 0.000 0.408 0.576
#> SRR1448029 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435311 2 0.2081 0.77257 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR612395 2 0.6597 0.22540 0.000 0.540 0.372 0.088
#> SRR603116 2 0.2081 0.75288 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1323152 3 0.3266 0.80489 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1368264 2 0.7369 0.27167 0.000 0.496 0.180 0.324
#> SRR1326624 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1429265 3 0.1302 0.83087 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1327702 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.4955 0.29612 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1486799 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.4477 0.46901 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR815044 4 0.4761 0.39331 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1338560 2 0.1211 0.79110 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR615862 2 0.3975 0.64399 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1480038 2 0.4072 0.62980 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR659436 3 0.2081 0.80541 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR613699 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4843 0.36500 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1330327 4 0.2831 0.67221 0.000 0.120 0.004 0.876
#> SRR1489950 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.3356 0.51063 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR600656 4 0.1820 0.65863 0.000 0.036 0.020 0.944
#> SRR658766 3 0.4053 0.78275 0.000 0.004 0.768 0.228
#> SRR655946 3 0.5596 0.69903 0.000 0.068 0.696 0.236
#> SRR817282 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0707 0.83799 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1406418 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.7922 -0.09564 0.000 0.344 0.336 0.320
#> SRR1471965 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4103 0.78076 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR662498 3 0.3828 0.74844 0.000 0.068 0.848 0.084
#> SRR1376764 3 0.3893 0.79454 0.000 0.008 0.796 0.196
#> SRR1377006 3 0.4679 0.66223 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR656860 2 0.4907 0.29192 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1480547 2 0.4843 0.36500 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1452515 3 0.0707 0.83847 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1324390 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.1474 0.95147 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR601695 2 0.5219 0.47651 0.000 0.712 0.044 0.244
#> SRR820907 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 4 0.7782 0.29559 0.312 0.000 0.264 0.424
#> SRR1405984 2 0.2408 0.76406 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1472794 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0188 0.84016 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1435626 3 0.1302 0.83352 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1080766 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0188 0.98714 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332299 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0188 0.84016 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1320579 3 0.4422 0.74558 0.000 0.008 0.736 0.256
#> SRR1319710 2 0.4454 0.58258 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1326604 2 0.1474 0.78796 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1098879 3 0.3569 0.79674 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR662245 2 0.0707 0.78534 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1074719 2 0.0188 0.79658 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR816226 4 0.4888 0.23686 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR601387 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614575 2 0.2281 0.76977 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1353900 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662906 2 0.1724 0.76621 0.000 0.948 0.032 0.020
#> SRR1350832 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.3942 0.65033 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1313969 4 0.2799 0.60244 0.000 0.008 0.108 0.884
#> SRR1388528 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.7585 0.21425 0.400 0.004 0.168 0.428
#> SRR655399 3 0.0707 0.83799 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1319753 2 0.4877 0.41569 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR818901 3 0.0336 0.83974 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR607067 4 0.4466 0.61485 0.000 0.180 0.036 0.784
#> SRR1391420 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4193 0.61101 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR661961 3 0.2281 0.80054 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR658259 2 0.3873 0.65437 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1310476 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 4 0.4830 0.34184 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1478053 2 0.0469 0.79627 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1475300 2 0.2589 0.75660 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1328101 2 0.5907 0.46121 0.000 0.680 0.228 0.092
#> SRR1322900 3 0.5376 0.23765 0.016 0.000 0.588 0.396
#> SRR1309942 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.1297 0.64795 0.000 0.016 0.020 0.964
#> SRR1435418 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4643 0.44857 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1443436 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0895 0.78373 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR661469 3 0.7735 -0.09580 0.000 0.276 0.444 0.280
#> SRR1500323 2 0.1724 0.76905 0.000 0.948 0.020 0.032
#> SRR1356705 2 0.6171 0.44570 0.000 0.588 0.064 0.348
#> SRR1464915 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1302 0.83087 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1350435 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1389177 3 0.4011 0.78851 0.000 0.008 0.784 0.208
#> SRR1368072 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.5268 0.21100 0.000 0.396 0.012 0.592
#> SRR1394190 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0592 0.83898 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1318839 3 0.3528 0.79683 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1432390 4 0.2704 0.67053 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR613126 2 0.3862 0.64316 0.000 0.824 0.024 0.152
#> SRR1089424 2 0.1867 0.78078 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1347214 2 0.0921 0.79410 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1309556 4 0.7332 0.26506 0.000 0.156 0.396 0.448
#> SRR1456027 4 0.4839 0.57372 0.184 0.000 0.052 0.764
#> SRR1400551 3 0.1940 0.81601 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1320469 1 0.1211 0.96256 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR614251 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615105 4 0.5560 -0.05813 0.000 0.024 0.392 0.584
#> SRR1433290 3 0.3444 0.79691 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR2166064 4 0.2973 0.66031 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR601671 2 0.4008 0.64123 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR663874 2 0.1389 0.78308 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1409130 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.4356 0.52411 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1408249 2 0.6278 0.18325 0.060 0.532 0.000 0.408
#> SRR663284 2 0.4877 0.35784 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1402794 3 0.0707 0.83799 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR614852 4 0.2831 0.67221 0.000 0.120 0.004 0.876
#> SRR1348040 4 0.4477 0.44224 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1489610 2 0.4406 0.59397 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1488091 2 0.0469 0.79005 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1499566 2 0.4776 0.46253 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1361480 2 0.4585 0.50775 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1444501 3 0.3972 0.78925 0.000 0.008 0.788 0.204
#> SRR1415773 2 0.4500 0.58011 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1388832 3 0.2773 0.78893 0.004 0.000 0.880 0.116
#> SRR1394637 1 0.0592 0.98110 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR606974 2 0.4175 0.57040 0.000 0.776 0.012 0.212
#> SRR662918 4 0.4661 0.44161 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR817421 3 0.3528 0.79683 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1400823 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2345 0.76638 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR608264 3 0.3444 0.79691 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1318560 1 0.1118 0.96629 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1454117 2 0.0592 0.79202 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312684 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR615044 4 0.7397 0.23346 0.000 0.164 0.408 0.428
#> SRR1432743 3 0.3688 0.79169 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1388873 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.1302 0.83039 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1406008 2 0.4040 0.66222 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1396786 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1446564 1 0.0469 0.98337 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318465 3 0.4818 0.76003 0.000 0.036 0.748 0.216
#> SRR1431083 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4500 0.48944 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR655170 2 0.1389 0.79024 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1087825 4 0.2928 0.65557 0.000 0.052 0.052 0.896
#> SRR662019 3 0.1716 0.82481 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1349209 4 0.2408 0.58308 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1326161 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345284 2 0.3610 0.68536 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1416672 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.3837 0.66080 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1454328 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4261 0.78390 0.820 0.000 0.112 0.068
#> SRR1408183 3 0.1211 0.83799 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1084369 3 0.3649 0.79225 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR598452 3 0.0592 0.83877 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR660709 4 0.1888 0.64010 0.000 0.016 0.044 0.940
#> SRR809444 1 0.0188 0.98714 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089901 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0592 0.98112 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1326292 4 0.5290 0.00389 0.476 0.000 0.008 0.516
#> SRR657139 1 0.0469 0.98312 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1440744 2 0.4164 0.61518 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1353555 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.2714 0.67539 0.000 0.112 0.004 0.884
#> SRR1381775 1 0.0188 0.98714 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363908 1 0.0188 0.98714 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.1716 0.78500 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR658989 3 0.2345 0.80041 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1353663 1 0.0336 0.98536 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811771 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.3528 0.79683 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR819054 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1367988 4 0.2871 0.65141 0.000 0.032 0.072 0.896
#> SRR1331922 1 0.5722 0.62621 0.716 0.000 0.148 0.136
#> SRR615479 4 0.9142 0.36789 0.104 0.180 0.292 0.424
#> SRR1375796 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.3587 0.75896 0.000 0.052 0.860 0.088
#> SRR1355217 2 0.7883 0.00111 0.000 0.384 0.300 0.316
#> SRR1356290 2 0.4590 0.56955 0.000 0.772 0.036 0.192
#> SRR659507 2 0.6705 0.07224 0.000 0.472 0.440 0.088
#> SRR663296 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.1940 0.77916 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR661155 4 0.2814 0.66546 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1414727 3 0.2408 0.79624 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR663477 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1354489 3 0.3972 0.78925 0.000 0.008 0.788 0.204
#> SRR1377800 3 0.1118 0.83486 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR614611 2 0.0188 0.79658 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655052 4 0.2799 0.67531 0.000 0.108 0.008 0.884
#> SRR1478968 4 0.4874 0.57297 0.180 0.000 0.056 0.764
#> SRR1351280 2 0.4730 0.43801 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR613951 4 0.0817 0.65895 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1418022 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3219 0.53488 0.000 0.000 0.164 0.836
#> SRR1408161 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.1022 0.83587 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR655040 4 0.4250 0.52329 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR810225 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.5279 0.71675 0.000 0.044 0.704 0.252
#> SRR1402328 2 0.0336 0.79244 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1480455 2 0.3278 0.68504 0.000 0.864 0.020 0.116
#> SRR1442104 3 0.4018 0.77270 0.000 0.004 0.772 0.224
#> SRR1453416 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.1211 0.83266 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1414314 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.1867 0.78097 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1478386 2 0.4843 0.36500 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1458683 4 0.4830 -0.01745 0.000 0.000 0.392 0.608
#> SRR1370572 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 4 0.7588 0.27044 0.088 0.036 0.392 0.484
#> SRR1310735 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.2928 0.67639 0.000 0.108 0.012 0.880
#> SRR660260 4 0.6690 0.38264 0.000 0.100 0.352 0.548
#> SRR1071231 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1459125 4 0.1733 0.65376 0.000 0.028 0.024 0.948
#> SRR1337173 3 0.5923 0.70024 0.000 0.100 0.684 0.216
#> SRR1396250 3 0.0592 0.83877 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2166376 3 0.1211 0.83286 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR659816 2 0.5859 0.06245 0.000 0.496 0.032 0.472
#> SRR1401379 2 0.4454 0.58258 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR600981 4 0.2799 0.67540 0.000 0.108 0.008 0.884
#> SRR1398335 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.4804 0.24940 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR660115 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.4605 0.44079 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1397156 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.4222 0.60807 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1092985 1 0.0336 0.98536 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR656409 4 0.4955 0.19015 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1468658 3 0.4134 0.74644 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1390437 4 0.3557 0.66780 0.000 0.108 0.036 0.856
#> SRR658057 2 0.3074 0.72996 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR612635 2 0.4164 0.61616 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1351480 2 0.1557 0.78465 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1436651 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0336 0.98495 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659590 2 0.0469 0.79635 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR614263 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.2281 0.76785 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR659911 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0188 0.84038 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442928 2 0.6597 0.22540 0.000 0.540 0.372 0.088
#> SRR1464681 4 0.2760 0.66836 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1418880 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.3945 0.78506 0.000 0.004 0.780 0.216
#> SRR1365426 2 0.7698 0.14417 0.000 0.440 0.236 0.324
#> SRR1487947 1 0.1022 0.96879 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR659708 1 0.0921 0.97183 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR603236 2 0.5022 0.51560 0.000 0.736 0.044 0.220
#> SRR660673 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663807 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087245 2 0.2589 0.75668 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1339108 2 0.4585 0.54952 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR613426 4 0.3497 0.64085 0.060 0.008 0.056 0.876
#> SRR613879 2 0.0707 0.79025 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1385101 4 0.4879 0.54194 0.016 0.012 0.228 0.744
#> SRR1387966 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.1411 0.77455 0.000 0.960 0.020 0.020
#> SRR1430489 1 0.0592 0.98130 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1349231 1 0.0336 0.98495 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1376249 3 0.1302 0.83087 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1321987 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390027 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.2216 0.77098 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1383081 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2166960 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR605101 2 0.2589 0.76520 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR818600 2 0.0188 0.79659 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367715 2 0.4222 0.60563 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1351979 3 0.3444 0.79691 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1387054 3 0.5386 0.71386 0.000 0.056 0.708 0.236
#> SRR1444306 3 0.0188 0.84034 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322662 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.79641 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1489030 2 0.0336 0.79642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1430375 2 0.6329 0.36123 0.000 0.616 0.292 0.092
#> SRR615225 4 0.3463 0.68363 0.000 0.096 0.040 0.864
#> SRR1401839 3 0.2611 0.79450 0.000 0.008 0.896 0.096
#> SRR1379110 2 0.4008 0.63766 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1077288 3 0.1302 0.83087 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1331639 4 0.3528 0.62992 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1342782 2 0.7694 0.15851 0.000 0.448 0.244 0.308
#> SRR1443003 3 0.2737 0.82827 0.000 0.008 0.888 0.104
#> SRR612839 1 0.0188 0.98714 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470093 3 0.4008 0.74981 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1395742 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4576 0.74158 0.000 0.012 0.728 0.260
#> SRR664063 2 0.7799 0.05035 0.000 0.400 0.252 0.348
#> SRR1488214 1 0.0707 0.97887 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR654766 4 0.2816 0.65589 0.000 0.036 0.064 0.900
#> SRR1320321 2 0.1557 0.78533 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1071955 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.1792 0.78250 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1488470 2 0.4790 0.39854 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1389497 3 0.0000 0.84035 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.3356 0.80814 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR615311 1 0.0000 0.98876 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0579 0.7878 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1380716 2 0.4078 0.7493 0.000 0.784 0.000 0.068 0.148
#> SRR612803 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.2172 0.9197 0.908 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1074359 3 0.5771 0.3492 0.000 0.316 0.588 0.088 0.008
#> SRR1419258 3 0.0963 0.7907 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1403366 5 0.4331 0.3060 0.000 0.000 0.400 0.004 0.596
#> SRR665262 5 0.4305 0.5310 0.000 0.296 0.012 0.004 0.688
#> SRR1499740 5 0.3562 0.5619 0.000 0.000 0.196 0.016 0.788
#> SRR1105057 2 0.5149 0.6997 0.000 0.680 0.000 0.104 0.216
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.3816 0.4535 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR612215 5 0.4464 0.5266 0.000 0.304 0.012 0.008 0.676
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.3215 0.8842 0.852 0.000 0.000 0.056 0.092
#> SRR1409263 5 0.4865 0.0804 0.004 0.000 0.444 0.016 0.536
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.6309 0.5236 0.000 0.532 0.000 0.240 0.228
#> SRR614839 2 0.6035 0.5549 0.000 0.528 0.000 0.132 0.340
#> SRR658433 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 4 0.4444 0.4448 0.000 0.000 0.364 0.624 0.012
#> SRR1328797 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.6036 0.5875 0.000 0.580 0.000 0.208 0.212
#> SRR1471117 1 0.1168 0.9453 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.3143 0.7037 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR654802 3 0.0290 0.7934 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660066 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1447103 5 0.4360 0.4787 0.000 0.024 0.284 0.000 0.692
#> SRR1402153 3 0.2060 0.7788 0.000 0.016 0.924 0.052 0.008
#> SRR655887 2 0.4277 0.7469 0.000 0.768 0.000 0.076 0.156
#> SRR1408529 3 0.0579 0.7941 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR658707 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.6389 0.4346 0.000 0.568 0.308 0.068 0.056
#> SRR1074670 3 0.3863 0.6592 0.000 0.000 0.740 0.012 0.248
#> SRR1375439 5 0.3934 0.4862 0.000 0.000 0.276 0.008 0.716
#> SRR1329003 4 0.4249 0.6291 0.100 0.000 0.008 0.792 0.100
#> SRR1404837 5 0.5218 0.1543 0.000 0.296 0.000 0.072 0.632
#> SRR1317920 1 0.2992 0.8959 0.868 0.000 0.000 0.068 0.064
#> SRR1455525 4 0.3840 0.6600 0.000 0.000 0.076 0.808 0.116
#> SRR613999 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.4192 0.3231 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1068855 1 0.2522 0.9146 0.896 0.000 0.000 0.052 0.052
#> SRR1375509 3 0.3628 0.6858 0.000 0.000 0.772 0.012 0.216
#> SRR612227 3 0.4297 0.0830 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1388809 2 0.0324 0.7872 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1413872 4 0.1830 0.7557 0.000 0.012 0.052 0.932 0.004
#> SRR1452864 1 0.2992 0.8959 0.868 0.000 0.000 0.068 0.064
#> SRR1473078 5 0.4101 0.4150 0.000 0.000 0.332 0.004 0.664
#> SRR615814 2 0.0324 0.7872 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1325225 1 0.4937 0.6413 0.672 0.000 0.000 0.264 0.064
#> SRR1313687 2 0.3994 0.7468 0.000 0.772 0.000 0.040 0.188
#> SRR1358220 2 0.5024 0.7063 0.000 0.692 0.000 0.096 0.212
#> SRR1096662 4 0.5975 0.4597 0.000 0.188 0.000 0.588 0.224
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.2284 0.6096 0.000 0.028 0.004 0.056 0.912
#> SRR660164 2 0.0324 0.7845 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR815783 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR809595 5 0.2060 0.6235 0.000 0.008 0.016 0.052 0.924
#> SRR1403133 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.3870 0.6267 0.000 0.820 0.080 0.092 0.008
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.2026 0.7800 0.000 0.008 0.924 0.056 0.012
#> SRR1478362 4 0.4157 0.7063 0.000 0.040 0.164 0.784 0.012
#> SRR1392186 5 0.6526 -0.1553 0.000 0.324 0.000 0.212 0.464
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0162 0.9573 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471594 1 0.2149 0.9247 0.916 0.000 0.000 0.048 0.036
#> SRR1354270 4 0.4457 0.6178 0.000 0.000 0.092 0.756 0.152
#> SRR612683 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.2095 0.7764 0.000 0.012 0.920 0.060 0.008
#> SRR1077805 3 0.2233 0.7683 0.000 0.004 0.892 0.104 0.000
#> SRR1360402 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1406112 3 0.3452 0.6661 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1355352 5 0.3928 0.4566 0.000 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR656247 1 0.0162 0.9563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813656 5 0.6624 -0.0556 0.000 0.264 0.000 0.280 0.456
#> SRR808244 4 0.4500 0.6618 0.020 0.000 0.096 0.784 0.100
#> SRR1387240 2 0.0324 0.7845 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1408595 1 0.2659 0.9093 0.888 0.000 0.000 0.052 0.060
#> SRR1385277 4 0.2331 0.7253 0.000 0.000 0.020 0.900 0.080
#> SRR1435248 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 5 0.5224 0.5427 0.000 0.176 0.140 0.000 0.684
#> SRR1408682 2 0.5715 -0.1111 0.000 0.520 0.056 0.012 0.412
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.5904 0.5416 0.000 0.528 0.000 0.112 0.360
#> SRR1453911 5 0.4231 0.5782 0.000 0.232 0.012 0.016 0.740
#> SRR603164 3 0.2943 0.7463 0.000 0.052 0.880 0.060 0.008
#> SRR1383259 4 0.6156 0.4024 0.000 0.216 0.000 0.560 0.224
#> SRR1330854 1 0.2423 0.9125 0.896 0.000 0.000 0.024 0.080
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.6031 0.5414 0.000 0.520 0.000 0.128 0.352
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0404 0.7941 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1361546 5 0.2804 0.6411 0.000 0.016 0.044 0.048 0.892
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2104 0.7357 0.000 0.924 0.044 0.024 0.008
#> SRR615635 2 0.0771 0.7888 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1385411 4 0.6633 -0.1498 0.000 0.384 0.000 0.396 0.220
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.3579 0.6641 0.000 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR662126 4 0.6426 0.3226 0.000 0.184 0.000 0.468 0.348
#> SRR1464601 2 0.0486 0.7828 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1071594 2 0.0451 0.7879 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR612539 2 0.5477 0.6759 0.000 0.648 0.000 0.132 0.220
#> SRR602010 5 0.2661 0.6121 0.000 0.044 0.008 0.052 0.896
#> SRR810249 2 0.4263 0.7443 0.000 0.760 0.000 0.060 0.180
#> SRR818773 5 0.2142 0.6335 0.000 0.004 0.028 0.048 0.920
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0451 0.7833 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1442754 1 0.2793 0.9013 0.876 0.000 0.000 0.036 0.088
#> SRR1334247 3 0.3895 0.5710 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR661639 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 5 0.4132 0.3382 0.000 0.020 0.000 0.260 0.720
#> SRR1459937 4 0.3192 0.7224 0.000 0.000 0.112 0.848 0.040
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.3333 0.7503 0.000 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR809348 1 0.1281 0.9441 0.956 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR819261 3 0.3756 0.6629 0.000 0.000 0.744 0.008 0.248
#> SRR661074 5 0.4641 0.0634 0.000 0.000 0.456 0.012 0.532
#> SRR1349851 1 0.2450 0.9164 0.900 0.000 0.000 0.052 0.048
#> SRR1405123 4 0.4161 0.6159 0.000 0.208 0.000 0.752 0.040
#> SRR661096 2 0.5886 0.6252 0.000 0.600 0.000 0.176 0.224
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4249 0.6291 0.100 0.000 0.008 0.792 0.100
#> SRR1307677 2 0.2830 0.7733 0.000 0.876 0.000 0.080 0.044
#> SRR1466512 2 0.5437 0.6789 0.000 0.652 0.000 0.128 0.220
#> SRR658212 2 0.2325 0.7779 0.000 0.904 0.000 0.068 0.028
#> SRR1430525 3 0.1557 0.7846 0.000 0.000 0.940 0.052 0.008
#> SRR1344422 4 0.3060 0.6944 0.000 0.128 0.000 0.848 0.024
#> SRR1353924 2 0.5024 0.7063 0.000 0.692 0.000 0.096 0.212
#> SRR1314832 1 0.3159 0.8874 0.856 0.000 0.000 0.056 0.088
#> SRR1487570 1 0.4854 0.6501 0.680 0.000 0.000 0.260 0.060
#> SRR627431 2 0.4959 0.5629 0.000 0.736 0.144 0.108 0.012
#> SRR1418561 4 0.4723 0.6055 0.000 0.000 0.128 0.736 0.136
#> SRR1448029 3 0.3366 0.6907 0.000 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR813802 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0451 0.7873 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1435311 2 0.4337 0.7316 0.000 0.744 0.000 0.052 0.204
#> SRR612395 5 0.4644 0.5276 0.000 0.280 0.040 0.000 0.680
#> SRR603116 2 0.3980 0.4602 0.000 0.708 0.000 0.008 0.284
#> SRR1323152 3 0.0162 0.7944 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1368264 5 0.2661 0.5991 0.000 0.056 0.000 0.056 0.888
#> SRR1326624 1 0.2992 0.8959 0.868 0.000 0.000 0.068 0.064
#> SRR1429265 3 0.3835 0.6650 0.000 0.000 0.744 0.012 0.244
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.6645 0.3296 0.000 0.400 0.000 0.224 0.376
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.5740 0.4964 0.000 0.144 0.000 0.612 0.244
#> SRR815044 4 0.6085 0.4135 0.000 0.212 0.000 0.572 0.216
#> SRR1338560 2 0.4042 0.7346 0.000 0.756 0.000 0.032 0.212
#> SRR615862 2 0.5410 0.6816 0.000 0.656 0.000 0.128 0.216
#> SRR1480038 2 0.5223 0.6926 0.000 0.672 0.000 0.108 0.220
#> SRR659436 5 0.3876 0.4396 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR613699 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.6328 0.5163 0.000 0.528 0.000 0.244 0.228
#> SRR1330327 4 0.2811 0.7451 0.000 0.012 0.100 0.876 0.012
#> SRR1489950 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.3143 0.7004 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1444002 1 0.0404 0.9549 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318444 4 0.5035 0.6000 0.000 0.000 0.252 0.672 0.076
#> SRR600656 4 0.2332 0.7510 0.000 0.004 0.076 0.904 0.016
#> SRR658766 3 0.4453 0.5633 0.000 0.000 0.724 0.048 0.228
#> SRR655946 3 0.3002 0.7452 0.000 0.048 0.876 0.068 0.008
#> SRR817282 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.3491 0.6793 0.000 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0162 0.9573 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444120 5 0.2901 0.6388 0.000 0.020 0.044 0.048 0.888
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4735 -0.0336 0.000 0.000 0.524 0.016 0.460
#> SRR662498 5 0.5211 0.5227 0.000 0.112 0.212 0.000 0.676
#> SRR1376764 3 0.1731 0.7886 0.000 0.008 0.940 0.040 0.012
#> SRR1377006 3 0.4284 0.6243 0.000 0.000 0.736 0.224 0.040
#> SRR656860 2 0.6201 0.5516 0.000 0.552 0.000 0.232 0.216
#> SRR1480547 2 0.6225 0.5483 0.000 0.548 0.000 0.228 0.224
#> SRR1452515 3 0.4617 0.2762 0.000 0.000 0.552 0.012 0.436
#> SRR1324390 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615273 1 0.4559 0.2272 0.512 0.000 0.000 0.008 0.480
#> SRR601695 2 0.5361 0.4010 0.000 0.668 0.236 0.088 0.008
#> SRR820907 2 0.0865 0.7894 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR812773 5 0.1153 0.6253 0.004 0.000 0.008 0.024 0.964
#> SRR1405984 2 0.4930 0.7100 0.000 0.696 0.000 0.084 0.220
#> SRR1472794 2 0.0609 0.7872 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1365448 1 0.1041 0.9469 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1095720 3 0.3366 0.6907 0.000 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR1435626 5 0.4299 0.2725 0.000 0.000 0.388 0.004 0.608
#> SRR1080766 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1377862 1 0.1386 0.9415 0.952 0.000 0.000 0.032 0.016
#> SRR1332299 3 0.2020 0.7667 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1467966 3 0.1908 0.7701 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1320579 3 0.2352 0.7603 0.000 0.004 0.896 0.092 0.008
#> SRR1319710 2 0.6021 0.5478 0.000 0.524 0.000 0.128 0.348
#> SRR1326604 2 0.2793 0.7710 0.000 0.876 0.000 0.088 0.036
#> SRR1098879 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662245 2 0.0486 0.7828 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1074719 2 0.3123 0.7637 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR816226 4 0.4117 0.6205 0.116 0.000 0.000 0.788 0.096
#> SRR601387 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR614575 2 0.5195 0.6977 0.000 0.676 0.000 0.108 0.216
#> SRR1353900 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR662906 2 0.1442 0.7660 0.000 0.952 0.032 0.012 0.004
#> SRR1350832 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1403280 2 0.5396 0.6824 0.000 0.656 0.000 0.124 0.220
#> SRR1313969 4 0.3340 0.7211 0.000 0.004 0.156 0.824 0.016
#> SRR1388528 1 0.1364 0.9424 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.1764 0.6062 0.008 0.000 0.000 0.064 0.928
#> SRR655399 3 0.2763 0.7396 0.000 0.000 0.848 0.004 0.148
#> SRR1319753 5 0.6348 -0.1261 0.000 0.324 0.000 0.180 0.496
#> SRR818901 3 0.3398 0.6892 0.000 0.000 0.780 0.004 0.216
#> SRR607067 4 0.4533 0.5705 0.000 0.032 0.004 0.704 0.260
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.5437 0.6782 0.000 0.652 0.000 0.128 0.220
#> SRR661961 5 0.3837 0.4553 0.000 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR658259 2 0.5327 0.6876 0.000 0.664 0.000 0.120 0.216
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 4 0.6510 0.1716 0.000 0.296 0.000 0.480 0.224
#> SRR1478053 2 0.2153 0.7828 0.000 0.916 0.000 0.044 0.040
#> SRR1475300 2 0.4982 0.7040 0.000 0.692 0.000 0.088 0.220
#> SRR1328101 5 0.4464 0.5266 0.000 0.304 0.012 0.008 0.676
#> SRR1322900 5 0.1774 0.6257 0.000 0.000 0.052 0.016 0.932
#> SRR1309942 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1345760 4 0.1894 0.7517 0.000 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.3760 0.6422 0.000 0.188 0.000 0.784 0.028
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0613 0.7812 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008
#> SRR661469 5 0.3207 0.6354 0.000 0.040 0.084 0.012 0.864
#> SRR1500323 2 0.1883 0.7427 0.000 0.932 0.048 0.012 0.008
#> SRR1356705 5 0.5851 -0.0770 0.000 0.340 0.000 0.112 0.548
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4747 0.0635 0.000 0.000 0.496 0.016 0.488
#> SRR1350435 1 0.2992 0.8959 0.868 0.000 0.000 0.068 0.064
#> SRR1389177 3 0.1770 0.7840 0.000 0.008 0.936 0.048 0.008
#> SRR1368072 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.8092 -0.1892 0.000 0.388 0.144 0.308 0.160
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.3980 0.6330 0.000 0.000 0.708 0.008 0.284
#> SRR1318839 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.2474 0.7518 0.000 0.012 0.084 0.896 0.008
#> SRR613126 2 0.3145 0.6823 0.000 0.868 0.060 0.064 0.008
#> SRR1089424 2 0.5053 0.7059 0.000 0.688 0.000 0.096 0.216
#> SRR1347214 2 0.3944 0.7537 0.000 0.788 0.000 0.052 0.160
#> SRR1309556 5 0.1990 0.6381 0.000 0.004 0.028 0.040 0.928
#> SRR1456027 4 0.1798 0.7277 0.004 0.000 0.004 0.928 0.064
#> SRR1400551 5 0.3990 0.4491 0.000 0.000 0.308 0.004 0.688
#> SRR1320469 1 0.2423 0.9130 0.896 0.000 0.000 0.024 0.080
#> SRR614251 2 0.0324 0.7845 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1454310 2 0.0451 0.7873 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR615105 4 0.4370 0.5050 0.000 0.004 0.332 0.656 0.008
#> SRR1433290 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.1885 0.7546 0.000 0.020 0.044 0.932 0.004
#> SRR601671 2 0.5437 0.6789 0.000 0.652 0.000 0.128 0.220
#> SRR663874 2 0.1764 0.7745 0.000 0.928 0.000 0.008 0.064
#> SRR1409130 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR659696 4 0.2068 0.7225 0.000 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR1408249 2 0.7415 0.3634 0.044 0.444 0.000 0.280 0.232
#> SRR663284 2 0.6516 0.4480 0.000 0.472 0.000 0.216 0.312
#> SRR1402794 3 0.3579 0.6746 0.000 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR614852 4 0.2577 0.7503 0.000 0.008 0.084 0.892 0.016
#> SRR1348040 5 0.3932 0.5638 0.000 0.000 0.064 0.140 0.796
#> SRR1489610 2 0.5986 0.5522 0.000 0.528 0.000 0.124 0.348
#> SRR1488091 2 0.0324 0.7845 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1499566 2 0.6405 0.4554 0.000 0.460 0.000 0.176 0.364
#> SRR1361480 2 0.5516 0.6727 0.000 0.644 0.000 0.136 0.220
#> SRR1444501 3 0.1492 0.7882 0.000 0.004 0.948 0.040 0.008
#> SRR1415773 5 0.5622 -0.2641 0.000 0.416 0.000 0.076 0.508
#> SRR1388832 5 0.4730 0.4553 0.000 0.000 0.260 0.052 0.688
#> SRR1394637 1 0.2592 0.9124 0.892 0.000 0.000 0.052 0.056
#> SRR606974 2 0.4432 0.5674 0.000 0.772 0.144 0.076 0.008
#> SRR662918 4 0.3456 0.6526 0.000 0.184 0.000 0.800 0.016
#> SRR817421 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.4541 0.7368 0.000 0.752 0.000 0.112 0.136
#> SRR608264 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.3159 0.8874 0.856 0.000 0.000 0.056 0.088
#> SRR1454117 2 0.0451 0.7869 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1312684 1 0.2992 0.8959 0.868 0.000 0.000 0.068 0.064
#> SRR615044 5 0.1911 0.6372 0.000 0.004 0.028 0.036 0.932
#> SRR1432743 3 0.1597 0.7860 0.000 0.000 0.940 0.048 0.012
#> SRR1388873 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.4256 0.1424 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1406008 2 0.5636 0.5478 0.000 0.544 0.000 0.084 0.372
#> SRR1396786 2 0.0451 0.7873 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1446564 1 0.2797 0.9040 0.880 0.000 0.000 0.060 0.060
#> SRR1318465 3 0.2424 0.7685 0.000 0.032 0.908 0.052 0.008
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.3806 0.6765 0.000 0.104 0.000 0.812 0.084
#> SRR655170 2 0.1740 0.7831 0.000 0.932 0.000 0.056 0.012
#> SRR1087825 4 0.2291 0.7535 0.000 0.008 0.072 0.908 0.012
#> SRR662019 5 0.6292 0.0267 0.000 0.000 0.400 0.152 0.448
#> SRR1349209 4 0.4072 0.6834 0.000 0.000 0.108 0.792 0.100
#> SRR1326161 2 0.0579 0.7878 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1345284 2 0.5177 0.6925 0.000 0.676 0.000 0.104 0.220
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.5211 0.6954 0.000 0.676 0.000 0.112 0.212
#> SRR1454328 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5104 0.5669 0.632 0.000 0.000 0.060 0.308
#> SRR1408183 3 0.1197 0.7839 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1084369 3 0.1484 0.7859 0.000 0.000 0.944 0.048 0.008
#> SRR598452 3 0.2763 0.7396 0.000 0.000 0.848 0.004 0.148
#> SRR660709 4 0.5332 0.6378 0.000 0.012 0.164 0.700 0.124
#> SRR809444 1 0.1082 0.9468 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1089901 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375774 1 0.1997 0.9292 0.924 0.000 0.000 0.040 0.036
#> SRR1326292 4 0.4249 0.6291 0.100 0.000 0.008 0.792 0.100
#> SRR657139 1 0.2046 0.9258 0.916 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1440744 2 0.5477 0.6755 0.000 0.648 0.000 0.132 0.220
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.1082 0.9468 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1452334 4 0.1883 0.7562 0.000 0.012 0.048 0.932 0.008
#> SRR1381775 1 0.2074 0.9266 0.920 0.000 0.000 0.036 0.044
#> SRR1363908 1 0.0566 0.9537 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1319626 2 0.4134 0.7321 0.000 0.744 0.000 0.032 0.224
#> SRR658989 5 0.4127 0.4507 0.000 0.000 0.312 0.008 0.680
#> SRR1353663 1 0.2522 0.9146 0.896 0.000 0.000 0.052 0.052
#> SRR811771 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.2561 0.7787 0.000 0.884 0.000 0.020 0.096
#> SRR1367988 4 0.2927 0.7254 0.000 0.000 0.040 0.868 0.092
#> SRR1331922 1 0.5434 0.4931 0.588 0.000 0.000 0.076 0.336
#> SRR615479 5 0.1934 0.6241 0.004 0.000 0.016 0.052 0.928
#> SRR1375796 2 0.0324 0.7845 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1386991 5 0.5013 0.5161 0.000 0.084 0.232 0.000 0.684
#> SRR1355217 5 0.3082 0.6297 0.000 0.036 0.032 0.052 0.880
#> SRR1356290 2 0.4307 0.5536 0.000 0.764 0.184 0.044 0.008
#> SRR659507 5 0.4890 0.5340 0.000 0.256 0.064 0.000 0.680
#> SRR663296 1 0.0609 0.9527 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR598044 2 0.4588 0.7237 0.000 0.720 0.000 0.060 0.220
#> SRR661155 4 0.1830 0.7557 0.000 0.012 0.052 0.932 0.004
#> SRR1414727 5 0.3928 0.4613 0.000 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR663477 1 0.2992 0.8959 0.868 0.000 0.000 0.068 0.064
#> SRR1354489 3 0.1644 0.7854 0.000 0.004 0.940 0.048 0.008
#> SRR1377800 5 0.4415 0.1293 0.000 0.000 0.444 0.004 0.552
#> SRR614611 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR655052 4 0.3849 0.7126 0.000 0.020 0.164 0.800 0.016
#> SRR1478968 4 0.1798 0.7277 0.004 0.000 0.004 0.928 0.064
#> SRR1351280 2 0.5925 0.6165 0.000 0.596 0.000 0.188 0.216
#> SRR613951 4 0.1549 0.7522 0.000 0.000 0.040 0.944 0.016
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4269 0.6767 0.000 0.000 0.188 0.756 0.056
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 5 0.4425 0.1245 0.000 0.000 0.452 0.004 0.544
#> SRR655040 4 0.5164 0.5330 0.000 0.084 0.000 0.660 0.256
#> SRR810225 2 0.0566 0.7885 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1325377 2 0.0324 0.7872 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR617829 3 0.3038 0.7439 0.000 0.040 0.872 0.080 0.008
#> SRR1402328 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480455 2 0.2938 0.6883 0.000 0.876 0.084 0.032 0.008
#> SRR1442104 3 0.0880 0.7912 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.3835 0.6650 0.000 0.000 0.744 0.012 0.244
#> SRR1414314 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR663026 2 0.4766 0.7181 0.000 0.708 0.000 0.072 0.220
#> SRR1478386 2 0.6326 0.5152 0.000 0.528 0.000 0.248 0.224
#> SRR1458683 4 0.3231 0.6567 0.000 0.000 0.196 0.800 0.004
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.1836 0.6385 0.000 0.000 0.036 0.032 0.932
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.2518 0.7510 0.000 0.008 0.080 0.896 0.016
#> SRR660260 5 0.6222 0.4679 0.000 0.104 0.036 0.248 0.612
#> SRR1071231 2 0.2046 0.7841 0.000 0.916 0.000 0.016 0.068
#> SRR1459125 4 0.3719 0.6966 0.000 0.000 0.068 0.816 0.116
#> SRR1337173 3 0.5129 0.4531 0.000 0.264 0.672 0.052 0.012
#> SRR1396250 3 0.2583 0.7492 0.000 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR2166376 5 0.4350 0.2871 0.000 0.000 0.408 0.004 0.588
#> SRR659816 2 0.8330 -0.2490 0.000 0.360 0.212 0.156 0.272
#> SRR1401379 2 0.6021 0.5478 0.000 0.524 0.000 0.128 0.348
#> SRR600981 4 0.1956 0.7555 0.000 0.008 0.052 0.928 0.012
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.6599 0.2975 0.000 0.192 0.004 0.464 0.340
#> SRR660115 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1359780 2 0.0290 0.7865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.6434 0.4101 0.004 0.196 0.000 0.524 0.276
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319648 2 0.5477 0.6750 0.000 0.648 0.000 0.132 0.220
#> SRR1092985 1 0.2450 0.9170 0.900 0.000 0.000 0.052 0.048
#> SRR656409 4 0.6637 -0.0275 0.000 0.348 0.000 0.424 0.228
#> SRR1468658 3 0.2416 0.7564 0.000 0.000 0.888 0.100 0.012
#> SRR1390437 4 0.4133 0.6189 0.000 0.012 0.012 0.744 0.232
#> SRR658057 2 0.5284 0.6914 0.000 0.668 0.000 0.116 0.216
#> SRR612635 2 0.5437 0.6789 0.000 0.652 0.000 0.128 0.220
#> SRR1351480 2 0.4119 0.7347 0.000 0.752 0.000 0.036 0.212
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0510 0.9538 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR659590 2 0.1281 0.7880 0.000 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR614263 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.5073 0.7041 0.000 0.688 0.000 0.100 0.212
#> SRR659911 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.2732 0.7335 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1345894 3 0.3177 0.7059 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1442928 5 0.4594 0.5261 0.000 0.284 0.036 0.000 0.680
#> SRR1464681 4 0.1770 0.7554 0.000 0.008 0.048 0.936 0.008
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.2053 0.7837 0.000 0.004 0.924 0.048 0.024
#> SRR1365426 5 0.2227 0.6168 0.000 0.032 0.004 0.048 0.916
#> SRR1487947 1 0.2423 0.9125 0.896 0.000 0.000 0.024 0.080
#> SRR659708 1 0.2677 0.8970 0.872 0.000 0.000 0.016 0.112
#> SRR603236 2 0.5249 0.4187 0.000 0.676 0.244 0.068 0.012
#> SRR660673 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1012 0.7881 0.000 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR663807 2 0.0162 0.7876 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087245 2 0.5240 0.6946 0.000 0.672 0.000 0.112 0.216
#> SRR1339108 2 0.6175 0.5447 0.000 0.516 0.000 0.152 0.332
#> SRR613426 4 0.1768 0.7259 0.000 0.000 0.004 0.924 0.072
#> SRR613879 2 0.0451 0.7833 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1385101 5 0.2605 0.5209 0.000 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1387966 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458852 2 0.1808 0.7463 0.000 0.936 0.044 0.012 0.008
#> SRR1430489 1 0.2719 0.9070 0.884 0.000 0.000 0.068 0.048
#> SRR1349231 1 0.1908 0.9095 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1376249 3 0.3988 0.6588 0.000 0.000 0.732 0.016 0.252
#> SRR1321987 2 0.0162 0.7859 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR662653 2 0.0693 0.7878 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.4588 0.7215 0.000 0.720 0.000 0.060 0.220
#> SRR1383081 2 0.0807 0.7884 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR2166960 2 0.3055 0.7673 0.000 0.840 0.000 0.016 0.144
#> SRR605101 2 0.4956 0.6553 0.000 0.636 0.000 0.048 0.316
#> SRR818600 2 0.0451 0.7879 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1367715 2 0.5437 0.6782 0.000 0.652 0.000 0.128 0.220
#> SRR1351979 3 0.0000 0.7943 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.2992 0.7464 0.000 0.044 0.876 0.072 0.008
#> SRR1444306 3 0.3480 0.6672 0.000 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.7865 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.2514 0.9131 0.896 0.000 0.000 0.060 0.044
#> SRR1489030 2 0.0579 0.7878 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1430375 5 0.4598 0.5183 0.000 0.312 0.016 0.008 0.664
#> SRR615225 4 0.1862 0.7544 0.000 0.004 0.048 0.932 0.016
#> SRR1401839 5 0.4629 0.4892 0.000 0.020 0.280 0.012 0.688
#> SRR1379110 2 0.5355 0.6851 0.000 0.660 0.000 0.120 0.220
#> SRR1077288 3 0.4213 0.5750 0.000 0.000 0.680 0.012 0.308
#> SRR1331639 4 0.1788 0.7418 0.000 0.056 0.008 0.932 0.004
#> SRR1342782 5 0.2434 0.6173 0.000 0.036 0.008 0.048 0.908
#> SRR1443003 3 0.2243 0.7831 0.000 0.016 0.916 0.012 0.056
#> SRR612839 1 0.1168 0.9453 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1470093 3 0.2233 0.7551 0.000 0.000 0.892 0.104 0.004
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.2854 0.7514 0.000 0.028 0.880 0.084 0.008
#> SRR664063 5 0.2251 0.6169 0.000 0.024 0.008 0.052 0.916
#> SRR1488214 1 0.2863 0.9012 0.876 0.000 0.000 0.064 0.060
#> SRR654766 4 0.2077 0.7486 0.000 0.000 0.040 0.920 0.040
#> SRR1320321 2 0.4119 0.7347 0.000 0.752 0.000 0.036 0.212
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9584 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.5073 0.7057 0.000 0.688 0.000 0.100 0.212
#> SRR1488470 2 0.6110 0.5771 0.000 0.568 0.000 0.216 0.216
#> SRR1389497 3 0.1965 0.7684 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1367109 3 0.1626 0.7878 0.000 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR615311 1 0.0671 0.9528 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.3847 -0.16370 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1380716 2 0.1556 0.49222 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR612803 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0603 0.91281 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1084417 1 0.4549 0.77151 0.736 0.000 0.000 0.032 0.068 0.164
#> SRR1074359 6 0.5824 -0.10151 0.000 0.000 0.388 0.104 0.024 0.484
#> SRR1419258 3 0.2728 0.75035 0.000 0.000 0.860 0.040 0.000 0.100
#> SRR1403366 5 0.4597 0.52148 0.000 0.000 0.276 0.000 0.652 0.072
#> SRR665262 5 0.2191 0.72133 0.000 0.004 0.000 0.000 0.876 0.120
#> SRR1499740 5 0.1802 0.74219 0.000 0.024 0.024 0.000 0.932 0.020
#> SRR1105057 2 0.0858 0.51382 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1439742 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.2145 0.72498 0.000 0.000 0.072 0.000 0.900 0.028
#> SRR612215 5 0.2402 0.71110 0.000 0.000 0.004 0.000 0.856 0.140
#> SRR1094051 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0547 0.91298 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1393449 1 0.6030 0.57261 0.556 0.000 0.004 0.060 0.080 0.300
#> SRR1409263 5 0.6386 0.17251 0.000 0.000 0.336 0.020 0.420 0.224
#> SRR1431288 1 0.0291 0.91540 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1334889 2 0.2356 0.49737 0.000 0.884 0.000 0.096 0.016 0.004
#> SRR614839 2 0.4559 0.39206 0.000 0.708 0.000 0.036 0.220 0.036
#> SRR658433 2 0.3862 -0.20453 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1088581 4 0.5894 0.11200 0.000 0.000 0.352 0.476 0.008 0.164
#> SRR1328797 3 0.0363 0.76336 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1334512 2 0.2230 0.50872 0.000 0.892 0.000 0.084 0.000 0.024
#> SRR1471117 1 0.2893 0.87079 0.868 0.000 0.000 0.024 0.032 0.076
#> SRR1311553 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.3862 -0.20453 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1354955 3 0.3078 0.70145 0.000 0.000 0.836 0.000 0.108 0.056
#> SRR654802 3 0.1219 0.75198 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR660066 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1447103 5 0.2030 0.73050 0.000 0.000 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1402153 3 0.3867 0.72085 0.000 0.000 0.768 0.048 0.008 0.176
#> SRR655887 2 0.2019 0.48875 0.000 0.900 0.000 0.012 0.000 0.088
#> SRR1408529 3 0.2655 0.75220 0.000 0.000 0.848 0.004 0.008 0.140
#> SRR658707 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.7384 -0.18819 0.000 0.328 0.336 0.036 0.036 0.264
#> SRR1074670 3 0.5139 0.58238 0.000 0.000 0.664 0.016 0.136 0.184
#> SRR1375439 5 0.1700 0.73304 0.000 0.000 0.048 0.000 0.928 0.024
#> SRR1329003 4 0.4378 0.63876 0.016 0.000 0.000 0.704 0.040 0.240
#> SRR1404837 5 0.4259 0.59231 0.000 0.220 0.000 0.004 0.716 0.060
#> SRR1317920 1 0.4753 0.77415 0.724 0.000 0.000 0.076 0.040 0.160
#> SRR1455525 4 0.3884 0.65825 0.000 0.000 0.012 0.736 0.020 0.232
#> SRR613999 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0146 0.91614 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499764 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.4992 0.13400 0.000 0.000 0.464 0.000 0.468 0.068
#> SRR1068855 1 0.4424 0.79863 0.752 0.000 0.000 0.064 0.036 0.148
#> SRR1375509 3 0.4606 0.61909 0.000 0.000 0.712 0.008 0.112 0.168
#> SRR612227 5 0.4864 0.32261 0.000 0.000 0.384 0.000 0.552 0.064
#> SRR1388809 2 0.3864 -0.20563 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1413872 4 0.1757 0.77918 0.000 0.076 0.008 0.916 0.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.4786 0.77089 0.720 0.000 0.000 0.076 0.040 0.164
#> SRR1473078 5 0.5275 0.52696 0.000 0.000 0.192 0.008 0.632 0.168
#> SRR615814 2 0.3862 -0.19647 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1325225 1 0.6350 0.44630 0.516 0.000 0.000 0.272 0.048 0.164
#> SRR1313687 2 0.2762 0.37626 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1358220 2 0.1349 0.50506 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1096662 2 0.3601 0.22722 0.000 0.684 0.000 0.312 0.000 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.2191 0.72276 0.000 0.120 0.000 0.000 0.876 0.004
#> SRR660164 6 0.4172 0.41119 0.000 0.460 0.000 0.000 0.012 0.528
#> SRR815783 2 0.3867 -0.23151 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR809595 5 0.2213 0.73440 0.000 0.100 0.004 0.000 0.888 0.008
#> SRR1403133 2 0.3860 -0.19123 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR815470 6 0.6106 0.50163 0.000 0.160 0.028 0.204 0.016 0.592
#> SRR1344382 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4893 0.69634 0.000 0.000 0.712 0.072 0.048 0.168
#> SRR1478362 4 0.4995 0.64246 0.000 0.036 0.096 0.712 0.004 0.152
#> SRR1392186 2 0.5435 0.21241 0.000 0.584 0.000 0.064 0.316 0.036
#> SRR1347937 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1176 0.90637 0.956 0.000 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR1471594 1 0.3935 0.82716 0.792 0.000 0.000 0.056 0.028 0.124
#> SRR1354270 4 0.5947 0.51045 0.000 0.000 0.032 0.548 0.132 0.288
#> SRR612683 2 0.3634 0.06874 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1392901 3 0.4605 0.69506 0.000 0.000 0.728 0.084 0.024 0.164
#> SRR1077805 3 0.4299 0.72077 0.000 0.052 0.776 0.072 0.000 0.100
#> SRR1360402 2 0.3857 -0.19185 0.000 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1406112 3 0.3730 0.65661 0.000 0.000 0.772 0.000 0.168 0.060
#> SRR1355352 5 0.5192 0.52788 0.000 0.000 0.180 0.008 0.644 0.168
#> SRR656247 1 0.0865 0.89836 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR813656 2 0.5637 0.24918 0.000 0.592 0.000 0.104 0.272 0.032
#> SRR808244 4 0.4865 0.59125 0.000 0.000 0.016 0.640 0.056 0.288
#> SRR1387240 6 0.3937 0.47981 0.000 0.424 0.000 0.000 0.004 0.572
#> SRR1408595 1 0.4256 0.81069 0.768 0.000 0.000 0.060 0.036 0.136
#> SRR1385277 4 0.2209 0.75811 0.000 0.024 0.004 0.900 0.072 0.000
#> SRR1435248 2 0.3864 -0.21162 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1419110 5 0.2039 0.73619 0.000 0.000 0.020 0.000 0.904 0.076
#> SRR1408682 5 0.4825 0.10201 0.000 0.044 0.004 0.000 0.504 0.448
#> SRR1317134 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4406 0.36938 0.000 0.692 0.000 0.016 0.256 0.036
#> SRR1453911 5 0.2266 0.72749 0.000 0.012 0.000 0.000 0.880 0.108
#> SRR603164 3 0.4462 0.69795 0.000 0.000 0.728 0.064 0.020 0.188
#> SRR1383259 2 0.3903 0.23090 0.000 0.680 0.000 0.304 0.004 0.012
#> SRR1330854 1 0.4706 0.74654 0.708 0.000 0.000 0.040 0.048 0.204
#> SRR1452423 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4475 0.38926 0.000 0.708 0.000 0.032 0.228 0.032
#> SRR1468162 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2408 0.75805 0.000 0.000 0.876 0.012 0.004 0.108
#> SRR1361546 5 0.2313 0.73658 0.000 0.100 0.004 0.000 0.884 0.012
#> SRR1486156 1 0.0291 0.91540 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR660545 6 0.4816 0.58725 0.000 0.332 0.004 0.032 0.016 0.616
#> SRR615635 2 0.3756 -0.05576 0.000 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1385411 2 0.2668 0.45798 0.000 0.828 0.000 0.168 0.000 0.004
#> SRR1342739 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.4765 0.58382 0.000 0.000 0.676 0.000 0.152 0.172
#> SRR662126 2 0.5857 0.13600 0.000 0.568 0.000 0.220 0.192 0.020
#> SRR1464601 6 0.4069 0.55249 0.000 0.376 0.008 0.000 0.004 0.612
#> SRR1071594 2 0.3854 -0.18069 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR612539 2 0.1921 0.51311 0.000 0.916 0.000 0.052 0.032 0.000
#> SRR602010 5 0.2257 0.72513 0.000 0.116 0.000 0.000 0.876 0.008
#> SRR810249 2 0.2692 0.43504 0.000 0.840 0.000 0.012 0.000 0.148
#> SRR818773 5 0.2101 0.73349 0.000 0.100 0.004 0.000 0.892 0.004
#> SRR1336569 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 6 0.4574 0.45179 0.000 0.440 0.000 0.000 0.036 0.524
#> SRR1442754 1 0.5370 0.67124 0.636 0.000 0.000 0.048 0.068 0.248
#> SRR1334247 3 0.4356 0.42530 0.000 0.000 0.608 0.000 0.360 0.032
#> SRR661639 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6495 -0.00229 0.000 0.504 0.000 0.128 0.292 0.076
#> SRR1459937 4 0.2364 0.76113 0.000 0.020 0.052 0.904 0.004 0.020
#> SRR2185018 1 0.0291 0.91566 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR655732 2 0.2613 0.45212 0.000 0.848 0.000 0.000 0.012 0.140
#> SRR809348 1 0.2818 0.87504 0.872 0.000 0.000 0.024 0.028 0.076
#> SRR819261 3 0.5139 0.58238 0.000 0.000 0.664 0.016 0.136 0.184
#> SRR661074 5 0.6330 0.20313 0.000 0.000 0.340 0.020 0.432 0.208
#> SRR1349851 1 0.4301 0.80332 0.760 0.000 0.000 0.068 0.028 0.144
#> SRR1405123 4 0.4393 0.20900 0.000 0.480 0.000 0.500 0.004 0.016
#> SRR661096 2 0.2145 0.50697 0.000 0.900 0.000 0.072 0.028 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4378 0.63876 0.016 0.000 0.000 0.704 0.040 0.240
#> SRR1307677 2 0.2170 0.48024 0.000 0.888 0.000 0.012 0.000 0.100
#> SRR1466512 2 0.1219 0.51790 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR658212 2 0.3046 0.38380 0.000 0.800 0.000 0.012 0.000 0.188
#> SRR1430525 3 0.3332 0.73495 0.000 0.000 0.808 0.048 0.000 0.144
#> SRR1344422 4 0.4245 0.67098 0.000 0.228 0.000 0.716 0.008 0.048
#> SRR1353924 2 0.1411 0.50409 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1314832 1 0.5726 0.62994 0.596 0.000 0.000 0.060 0.076 0.268
#> SRR1487570 1 0.5975 0.46662 0.544 0.000 0.000 0.280 0.028 0.148
#> SRR627431 6 0.6709 0.54175 0.000 0.244 0.088 0.096 0.024 0.548
#> SRR1418561 4 0.7091 0.37038 0.000 0.004 0.136 0.428 0.116 0.316
#> SRR1448029 3 0.2888 0.70265 0.000 0.000 0.852 0.000 0.092 0.056
#> SRR813802 1 0.0632 0.91205 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR815020 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3833 -0.16952 0.000 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444
#> SRR1435311 2 0.2398 0.48593 0.000 0.876 0.000 0.000 0.020 0.104
#> SRR612395 5 0.2346 0.72155 0.000 0.000 0.008 0.000 0.868 0.124
#> SRR603116 5 0.4972 0.24639 0.000 0.080 0.000 0.000 0.568 0.352
#> SRR1323152 3 0.0632 0.76462 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1368264 5 0.2624 0.71353 0.000 0.124 0.000 0.000 0.856 0.020
#> SRR1326624 1 0.4786 0.77089 0.720 0.000 0.000 0.076 0.040 0.164
#> SRR1429265 3 0.5141 0.57334 0.000 0.000 0.660 0.016 0.124 0.200
#> SRR1327702 1 0.0717 0.91197 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR615611 2 0.3940 0.42816 0.000 0.764 0.000 0.096 0.140 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.5215 0.05112 0.000 0.600 0.000 0.316 0.032 0.052
#> SRR815044 2 0.4004 0.17166 0.000 0.656 0.000 0.328 0.012 0.004
#> SRR1338560 2 0.2146 0.47236 0.000 0.880 0.000 0.000 0.004 0.116
#> SRR615862 2 0.1204 0.51636 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.2183 0.51598 0.000 0.912 0.000 0.040 0.020 0.028
#> SRR659436 5 0.2201 0.72429 0.000 0.000 0.076 0.000 0.896 0.028
#> SRR613699 2 0.3866 -0.22571 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1436563 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2510 0.49399 0.000 0.872 0.000 0.100 0.028 0.000
#> SRR1330327 4 0.2699 0.76198 0.000 0.040 0.048 0.884 0.000 0.028
#> SRR1489950 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1431927 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.2733 0.71042 0.000 0.000 0.864 0.000 0.080 0.056
#> SRR1444002 1 0.1649 0.89896 0.932 0.000 0.000 0.000 0.032 0.036
#> SRR1318444 4 0.6694 0.48175 0.000 0.004 0.176 0.532 0.088 0.200
#> SRR600656 4 0.2051 0.77345 0.000 0.040 0.036 0.916 0.000 0.008
#> SRR658766 3 0.6948 0.31027 0.000 0.004 0.436 0.072 0.308 0.180
#> SRR655946 3 0.4656 0.68650 0.000 0.000 0.716 0.084 0.020 0.180
#> SRR817282 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.4764 0.60305 0.000 0.000 0.696 0.008 0.128 0.168
#> SRR1406418 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.1176 0.90637 0.956 0.000 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR1444120 5 0.2196 0.73066 0.000 0.108 0.004 0.000 0.884 0.004
#> SRR1471965 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.5622 0.39322 0.000 0.000 0.260 0.032 0.600 0.108
#> SRR662498 5 0.2928 0.72756 0.000 0.000 0.056 0.004 0.856 0.084
#> SRR1376764 3 0.3635 0.72976 0.000 0.000 0.780 0.032 0.008 0.180
#> SRR1377006 3 0.6428 0.51528 0.000 0.000 0.528 0.212 0.056 0.204
#> SRR656860 2 0.2003 0.49281 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.1714 0.50452 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1452515 5 0.5641 0.16667 0.000 0.000 0.340 0.004 0.512 0.144
#> SRR1324390 2 0.3867 -0.22732 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR615273 5 0.5190 0.15703 0.384 0.000 0.000 0.008 0.536 0.072
#> SRR601695 6 0.6569 0.38009 0.000 0.064 0.212 0.120 0.028 0.576
#> SRR820907 2 0.3563 0.13572 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR812773 5 0.1888 0.73456 0.000 0.068 0.000 0.004 0.916 0.012
#> SRR1405984 2 0.1265 0.51007 0.000 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1472794 2 0.3982 -0.19636 0.000 0.536 0.000 0.004 0.000 0.460
#> SRR1365448 1 0.2947 0.86935 0.864 0.000 0.000 0.024 0.032 0.080
#> SRR1095720 3 0.3183 0.68967 0.000 0.000 0.828 0.000 0.112 0.060
#> SRR1435626 5 0.3618 0.63446 0.000 0.000 0.192 0.000 0.768 0.040
#> SRR1080766 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1377862 1 0.2365 0.88380 0.896 0.000 0.000 0.024 0.012 0.068
#> SRR1332299 3 0.0993 0.75571 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1467966 3 0.1408 0.75102 0.000 0.000 0.944 0.000 0.020 0.036
#> SRR1320579 3 0.4472 0.70077 0.000 0.000 0.740 0.088 0.020 0.152
#> SRR1319710 2 0.4450 0.39254 0.000 0.712 0.000 0.032 0.224 0.032
#> SRR1326604 2 0.2053 0.47545 0.000 0.888 0.000 0.004 0.000 0.108
#> SRR1098879 3 0.1364 0.76177 0.000 0.000 0.944 0.004 0.004 0.048
#> SRR662245 6 0.4386 0.56325 0.000 0.372 0.004 0.000 0.024 0.600
#> SRR1074719 2 0.2442 0.44653 0.000 0.852 0.000 0.000 0.004 0.144
#> SRR816226 4 0.4809 0.63358 0.068 0.000 0.000 0.720 0.048 0.164
#> SRR601387 2 0.3864 -0.20637 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR614575 2 0.0603 0.51839 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1353900 2 0.3864 -0.20563 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR662906 6 0.4534 0.53880 0.000 0.380 0.040 0.000 0.000 0.580
#> SRR1350832 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1403280 2 0.1152 0.51840 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1313969 4 0.3585 0.72062 0.000 0.028 0.088 0.824 0.000 0.060
#> SRR1388528 1 0.2893 0.87097 0.868 0.000 0.000 0.024 0.032 0.076
#> SRR1452912 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.2617 0.72152 0.000 0.100 0.000 0.016 0.872 0.012
#> SRR655399 3 0.3806 0.66637 0.000 0.000 0.768 0.000 0.068 0.164
#> SRR1319753 2 0.5182 -0.04075 0.000 0.524 0.000 0.048 0.408 0.020
#> SRR818901 3 0.3252 0.68930 0.000 0.000 0.824 0.000 0.108 0.068
#> SRR607067 4 0.4855 0.44813 0.000 0.380 0.000 0.556 0.064 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.1914 0.51570 0.000 0.920 0.000 0.056 0.008 0.016
#> SRR661961 5 0.2066 0.72581 0.000 0.000 0.072 0.000 0.904 0.024
#> SRR658259 2 0.2190 0.51514 0.000 0.908 0.000 0.044 0.008 0.040
#> SRR1310476 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3860 -0.19347 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1365034 2 0.3373 0.37005 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008 0.000
#> SRR1478053 2 0.3221 0.25151 0.000 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1475300 2 0.1049 0.51433 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1328101 5 0.2260 0.70957 0.000 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1322900 5 0.1313 0.73829 0.000 0.028 0.000 0.004 0.952 0.016
#> SRR1309942 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1345760 4 0.2228 0.77782 0.000 0.044 0.024 0.912 0.004 0.016
#> SRR1435418 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4161 -0.08073 0.000 0.540 0.000 0.448 0.000 0.012
#> SRR1443436 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 6 0.4456 0.56616 0.000 0.372 0.004 0.000 0.028 0.596
#> SRR661469 5 0.1364 0.74647 0.000 0.048 0.004 0.000 0.944 0.004
#> SRR1500323 6 0.4707 0.58736 0.000 0.332 0.008 0.016 0.020 0.624
#> SRR1356705 5 0.4727 0.22058 0.000 0.460 0.000 0.016 0.504 0.020
#> SRR1464915 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.6396 0.12512 0.000 0.000 0.364 0.020 0.396 0.220
#> SRR1350435 1 0.4786 0.77089 0.720 0.000 0.000 0.076 0.040 0.164
#> SRR1389177 3 0.4116 0.71971 0.000 0.000 0.764 0.048 0.024 0.164
#> SRR1368072 2 0.3867 -0.22732 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR601815 2 0.3862 -0.20453 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR613330 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.8268 0.05905 0.000 0.092 0.088 0.200 0.312 0.308
#> SRR1394190 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.4773 0.52856 0.000 0.000 0.632 0.004 0.296 0.068
#> SRR1318839 3 0.0458 0.76068 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432390 4 0.2313 0.77156 0.000 0.044 0.036 0.904 0.000 0.016
#> SRR613126 6 0.5729 0.57075 0.000 0.248 0.016 0.084 0.032 0.620
#> SRR1089424 2 0.1578 0.50947 0.000 0.936 0.000 0.012 0.004 0.048
#> SRR1347214 2 0.1663 0.48420 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1309556 5 0.2182 0.74373 0.000 0.068 0.008 0.000 0.904 0.020
#> SRR1456027 4 0.2712 0.73098 0.000 0.012 0.000 0.864 0.016 0.108
#> SRR1400551 5 0.5070 0.55298 0.000 0.000 0.176 0.008 0.660 0.156
#> SRR1320469 1 0.4650 0.75532 0.716 0.000 0.000 0.040 0.048 0.196
#> SRR614251 6 0.4152 0.46939 0.000 0.440 0.000 0.000 0.012 0.548
#> SRR1454310 2 0.3843 -0.18512 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR615105 4 0.5372 0.44922 0.000 0.004 0.212 0.620 0.004 0.160
#> SRR1433290 3 0.0363 0.76377 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2166064 4 0.1663 0.77725 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR601671 2 0.1285 0.51728 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004 0.000
#> SRR663874 6 0.5560 0.27762 0.000 0.420 0.000 0.000 0.136 0.444
#> SRR1409130 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR659696 4 0.1910 0.76390 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.3394 0.47726 0.020 0.840 0.000 0.100 0.028 0.012
#> SRR663284 2 0.3608 0.47028 0.000 0.816 0.000 0.096 0.072 0.016
#> SRR1402794 3 0.4994 0.58510 0.000 0.000 0.668 0.008 0.140 0.184
#> SRR614852 4 0.2313 0.77156 0.000 0.044 0.036 0.904 0.000 0.016
#> SRR1348040 5 0.4190 0.61263 0.000 0.016 0.004 0.104 0.776 0.100
#> SRR1489610 2 0.4450 0.39254 0.000 0.712 0.000 0.032 0.224 0.032
#> SRR1488091 6 0.3961 0.44535 0.000 0.440 0.000 0.000 0.004 0.556
#> SRR1499566 2 0.4065 0.39198 0.000 0.724 0.000 0.056 0.220 0.000
#> SRR1361480 2 0.1958 0.50221 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004 0.000
#> SRR1444501 3 0.3667 0.72947 0.000 0.000 0.788 0.044 0.008 0.160
#> SRR1415773 5 0.4808 0.37319 0.000 0.368 0.000 0.004 0.576 0.052
#> SRR1388832 5 0.5751 0.47669 0.000 0.000 0.092 0.044 0.580 0.284
#> SRR1394637 1 0.4119 0.82047 0.780 0.000 0.000 0.056 0.036 0.128
#> SRR606974 6 0.6611 0.54445 0.000 0.216 0.092 0.096 0.024 0.572
#> SRR662918 4 0.4089 0.26316 0.000 0.468 0.000 0.524 0.000 0.008
#> SRR817421 3 0.0547 0.76412 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1400823 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1779 0.50382 0.000 0.920 0.000 0.016 0.000 0.064
#> SRR608264 3 0.0865 0.76497 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1318560 1 0.5417 0.67304 0.628 0.000 0.004 0.064 0.040 0.264
#> SRR1454117 6 0.4405 0.35712 0.000 0.472 0.000 0.000 0.024 0.504
#> SRR1312684 1 0.4786 0.77089 0.720 0.000 0.000 0.076 0.040 0.164
#> SRR615044 5 0.1674 0.74278 0.000 0.068 0.004 0.000 0.924 0.004
#> SRR1432743 3 0.4332 0.72012 0.000 0.000 0.752 0.048 0.036 0.164
#> SRR1388873 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1353517 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.3283 0.66511 0.000 0.000 0.160 0.000 0.804 0.036
#> SRR1406008 2 0.4146 0.34901 0.000 0.676 0.000 0.000 0.288 0.036
#> SRR1396786 2 0.3843 -0.16057 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1446564 1 0.4585 0.78309 0.736 0.000 0.000 0.076 0.032 0.156
#> SRR1318465 3 0.4256 0.70988 0.000 0.000 0.748 0.056 0.020 0.176
#> SRR1431083 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.3547 0.56405 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.4255 -0.05711 0.000 0.600 0.000 0.016 0.004 0.380
#> SRR1087825 4 0.1616 0.77863 0.000 0.048 0.020 0.932 0.000 0.000
#> SRR662019 3 0.7570 -0.01239 0.000 0.000 0.304 0.156 0.296 0.244
#> SRR1349209 4 0.5075 0.64843 0.000 0.004 0.056 0.672 0.036 0.232
#> SRR1326161 2 0.3847 -0.16372 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1345284 2 0.1693 0.51555 0.000 0.932 0.000 0.020 0.004 0.044
#> SRR1416672 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.2138 0.51600 0.000 0.908 0.000 0.036 0.004 0.052
#> SRR1454328 2 0.3866 -0.21793 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1489286 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.6494 0.38289 0.488 0.004 0.000 0.064 0.328 0.116
#> SRR1408183 3 0.0622 0.76035 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1084369 3 0.3658 0.72970 0.000 0.000 0.792 0.048 0.008 0.152
#> SRR598452 3 0.3588 0.67967 0.000 0.000 0.788 0.000 0.060 0.152
#> SRR660709 4 0.7025 0.31922 0.000 0.012 0.108 0.476 0.284 0.120
#> SRR809444 1 0.2401 0.88725 0.900 0.000 0.000 0.024 0.028 0.048
#> SRR1089901 2 0.3867 -0.22732 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1375774 1 0.2803 0.87680 0.876 0.000 0.000 0.028 0.032 0.064
#> SRR1326292 4 0.4378 0.63876 0.016 0.000 0.000 0.704 0.040 0.240
#> SRR657139 1 0.3344 0.85806 0.840 0.000 0.000 0.032 0.040 0.088
#> SRR1440744 2 0.1693 0.51729 0.000 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1353555 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.2459 0.88420 0.896 0.000 0.000 0.020 0.032 0.052
#> SRR1452334 4 0.2405 0.77363 0.000 0.100 0.004 0.880 0.000 0.016
#> SRR1381775 1 0.2684 0.87739 0.880 0.000 0.000 0.024 0.024 0.072
#> SRR1363908 1 0.1738 0.89772 0.928 0.000 0.000 0.016 0.004 0.052
#> SRR1319626 2 0.2250 0.49061 0.000 0.888 0.000 0.000 0.020 0.092
#> SRR658989 5 0.2480 0.71624 0.000 0.000 0.104 0.000 0.872 0.024
#> SRR1353663 1 0.4311 0.80494 0.760 0.000 0.000 0.056 0.036 0.148
#> SRR811771 1 0.0146 0.91614 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813983 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0363 0.76124 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR819054 2 0.3244 0.25497 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1367988 4 0.2637 0.74775 0.000 0.024 0.012 0.876 0.088 0.000
#> SRR1331922 1 0.6724 0.38661 0.468 0.000 0.000 0.076 0.296 0.160
#> SRR615479 5 0.1908 0.73360 0.000 0.096 0.000 0.000 0.900 0.004
#> SRR1375796 6 0.3862 0.32810 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1386991 5 0.2129 0.73546 0.000 0.000 0.040 0.000 0.904 0.056
#> SRR1355217 5 0.2357 0.72503 0.000 0.116 0.000 0.000 0.872 0.012
#> SRR1356290 6 0.6342 0.54071 0.000 0.200 0.140 0.040 0.028 0.592
#> SRR659507 5 0.2402 0.72449 0.000 0.000 0.012 0.000 0.868 0.120
#> SRR663296 1 0.1478 0.90349 0.944 0.000 0.000 0.004 0.020 0.032
#> SRR598044 2 0.1779 0.50378 0.000 0.920 0.000 0.000 0.016 0.064
#> SRR661155 4 0.1610 0.77752 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1414727 5 0.3511 0.67663 0.000 0.000 0.124 0.004 0.808 0.064
#> SRR663477 1 0.4786 0.77089 0.720 0.000 0.000 0.076 0.040 0.164
#> SRR1354489 3 0.3918 0.72404 0.000 0.000 0.776 0.048 0.016 0.160
#> SRR1377800 5 0.5406 0.43080 0.000 0.000 0.276 0.004 0.580 0.140
#> SRR614611 2 0.3843 -0.18512 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR655052 4 0.5220 0.64445 0.000 0.044 0.096 0.708 0.012 0.140
#> SRR1478968 4 0.2665 0.73286 0.000 0.012 0.000 0.868 0.016 0.104
#> SRR1351280 2 0.1970 0.50361 0.000 0.900 0.000 0.092 0.000 0.008
#> SRR613951 4 0.1872 0.78061 0.000 0.064 0.004 0.920 0.004 0.008
#> SRR1418022 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.5083 0.65857 0.000 0.020 0.168 0.704 0.016 0.092
#> SRR1408161 1 0.0717 0.91197 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR657054 5 0.6033 0.14055 0.000 0.000 0.380 0.008 0.428 0.184
#> SRR655040 2 0.5922 -0.19004 0.000 0.504 0.000 0.368 0.048 0.080
#> SRR810225 2 0.3862 -0.19633 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1325377 2 0.3864 -0.20637 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR617829 3 0.4656 0.68647 0.000 0.000 0.716 0.084 0.020 0.180
#> SRR1402328 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1480455 6 0.4982 0.58293 0.000 0.336 0.024 0.032 0.004 0.604
#> SRR1442104 3 0.1644 0.76272 0.000 0.000 0.932 0.028 0.000 0.040
#> SRR1453416 1 0.0717 0.91197 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1481396 3 0.4962 0.59515 0.000 0.000 0.684 0.016 0.120 0.180
#> SRR1414314 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR663026 2 0.0935 0.51111 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1478386 2 0.2462 0.49615 0.000 0.876 0.000 0.096 0.028 0.000
#> SRR1458683 4 0.2357 0.71296 0.000 0.000 0.116 0.872 0.000 0.012
#> SRR1370572 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.2209 0.74230 0.000 0.072 0.004 0.000 0.900 0.024
#> SRR1310735 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.2147 0.77371 0.000 0.044 0.032 0.912 0.000 0.012
#> SRR660260 5 0.5056 0.57202 0.000 0.004 0.036 0.220 0.680 0.060
#> SRR1071231 2 0.3198 0.27866 0.000 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1459125 4 0.4984 0.52352 0.000 0.020 0.028 0.672 0.252 0.028
#> SRR1337173 6 0.5723 -0.13854 0.000 0.000 0.404 0.072 0.036 0.488
#> SRR1396250 3 0.3470 0.68500 0.000 0.000 0.796 0.000 0.052 0.152
#> SRR2166376 5 0.4713 0.52302 0.000 0.004 0.272 0.000 0.652 0.072
#> SRR659816 6 0.7518 -0.18858 0.000 0.008 0.148 0.160 0.320 0.364
#> SRR1401379 2 0.4450 0.39254 0.000 0.712 0.000 0.032 0.224 0.032
#> SRR600981 4 0.1610 0.77752 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0547 0.91298 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1397218 2 0.5958 0.23505 0.000 0.616 0.004 0.196 0.124 0.060
#> SRR660115 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1359780 6 0.3867 0.32218 0.000 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR1490037 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6212 0.09372 0.000 0.536 0.000 0.264 0.156 0.044
#> SRR1397156 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.3867 -0.22732 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1319648 2 0.2629 0.51117 0.000 0.888 0.000 0.048 0.028 0.036
#> SRR1092985 1 0.4078 0.82266 0.784 0.000 0.000 0.056 0.036 0.124
#> SRR656409 2 0.3243 0.45630 0.000 0.812 0.000 0.156 0.028 0.004
#> SRR1468658 3 0.4931 0.69122 0.000 0.000 0.708 0.088 0.040 0.164
#> SRR1390437 4 0.4617 0.55207 0.000 0.312 0.000 0.636 0.044 0.008
#> SRR658057 2 0.1616 0.51757 0.000 0.932 0.000 0.048 0.000 0.020
#> SRR612635 2 0.1500 0.51652 0.000 0.936 0.000 0.052 0.012 0.000
#> SRR1351480 2 0.2100 0.47718 0.000 0.884 0.000 0.000 0.004 0.112
#> SRR1436651 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1716 0.90095 0.932 0.000 0.000 0.004 0.036 0.028
#> SRR659590 2 0.3782 -0.08813 0.000 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR614263 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.1226 0.51180 0.000 0.952 0.000 0.004 0.004 0.040
#> SRR659911 2 0.3860 -0.20009 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1085519 3 0.2451 0.72241 0.000 0.000 0.884 0.000 0.060 0.056
#> SRR1345894 3 0.3472 0.72267 0.000 0.000 0.808 0.000 0.092 0.100
#> SRR1442928 5 0.2346 0.72155 0.000 0.000 0.008 0.000 0.868 0.124
#> SRR1464681 4 0.1610 0.77752 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.5831 0.63478 0.000 0.000 0.628 0.072 0.120 0.180
#> SRR1365426 5 0.2257 0.72513 0.000 0.116 0.000 0.000 0.876 0.008
#> SRR1487947 1 0.4650 0.75435 0.716 0.000 0.000 0.040 0.048 0.196
#> SRR659708 1 0.4032 0.83180 0.792 0.000 0.000 0.032 0.084 0.092
#> SRR603236 6 0.6500 0.36134 0.000 0.072 0.248 0.084 0.028 0.568
#> SRR660673 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.3828 -0.13477 0.000 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR663807 2 0.3854 -0.17576 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1087245 2 0.1334 0.51789 0.000 0.948 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR1339108 2 0.4768 0.40212 0.000 0.720 0.000 0.040 0.168 0.072
#> SRR613426 4 0.3266 0.74152 0.000 0.028 0.004 0.844 0.024 0.100
#> SRR613879 6 0.4565 0.47007 0.000 0.432 0.000 0.000 0.036 0.532
#> SRR1385101 5 0.4063 0.58467 0.000 0.208 0.000 0.052 0.736 0.004
#> SRR1387966 2 0.3868 -0.23702 0.000 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR1458852 6 0.4374 0.58280 0.000 0.340 0.008 0.016 0.004 0.632
#> SRR1430489 1 0.4472 0.78190 0.740 0.000 0.000 0.088 0.020 0.152
#> SRR1349231 1 0.3158 0.80566 0.812 0.000 0.000 0.004 0.164 0.020
#> SRR1376249 3 0.5299 0.56034 0.000 0.000 0.648 0.024 0.116 0.212
#> SRR1321987 2 0.3867 -0.22732 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR662653 2 0.3843 -0.16057 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1390027 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.1500 0.50784 0.000 0.936 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR1383081 2 0.2883 0.35851 0.000 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR2166960 2 0.2048 0.46600 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR605101 2 0.4301 0.36984 0.000 0.696 0.000 0.000 0.240 0.064
#> SRR818600 2 0.3843 -0.15622 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1367715 2 0.1976 0.51424 0.000 0.916 0.000 0.060 0.016 0.008
#> SRR1351979 3 0.0790 0.76483 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1387054 3 0.4326 0.69942 0.000 0.000 0.736 0.084 0.008 0.172
#> SRR1444306 3 0.3744 0.62988 0.000 0.000 0.756 0.000 0.200 0.044
#> SRR1322662 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3862 -0.20453 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR612767 1 0.4203 0.80617 0.768 0.000 0.000 0.072 0.024 0.136
#> SRR1489030 2 0.3847 -0.16305 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1430375 5 0.3626 0.53841 0.000 0.004 0.004 0.000 0.704 0.288
#> SRR615225 4 0.1663 0.77725 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1401839 5 0.1890 0.73117 0.000 0.000 0.060 0.000 0.916 0.024
#> SRR1379110 2 0.1370 0.51979 0.000 0.948 0.000 0.036 0.004 0.012
#> SRR1077288 3 0.5536 0.52195 0.000 0.000 0.616 0.020 0.152 0.212
#> SRR1331639 4 0.1663 0.77592 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1342782 5 0.2257 0.72513 0.000 0.116 0.000 0.000 0.876 0.008
#> SRR1443003 3 0.3781 0.73132 0.000 0.000 0.772 0.016 0.028 0.184
#> SRR612839 1 0.2971 0.86879 0.864 0.000 0.000 0.028 0.032 0.076
#> SRR1470093 3 0.3044 0.72982 0.000 0.000 0.836 0.116 0.000 0.048
#> SRR1395742 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4671 0.68970 0.000 0.000 0.720 0.084 0.024 0.172
#> SRR664063 5 0.2257 0.72513 0.000 0.116 0.000 0.000 0.876 0.008
#> SRR1488214 1 0.4653 0.78056 0.732 0.000 0.000 0.076 0.036 0.156
#> SRR654766 4 0.1909 0.77632 0.000 0.052 0.004 0.920 0.024 0.000
#> SRR1320321 2 0.1958 0.48358 0.000 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1071955 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.91674 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.1500 0.50836 0.000 0.936 0.000 0.012 0.000 0.052
#> SRR1488470 2 0.1663 0.50597 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.1765 0.74204 0.000 0.000 0.924 0.000 0.024 0.052
#> SRR1367109 3 0.4365 0.72303 0.000 0.000 0.752 0.048 0.040 0.160
#> SRR615311 1 0.1232 0.90620 0.956 0.000 0.000 0.016 0.004 0.024
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.901 0.911 0.966 0.4812 0.521 0.521
#> 3 3 0.904 0.889 0.957 0.3767 0.738 0.531
#> 4 4 0.833 0.825 0.915 0.1006 0.893 0.702
#> 5 5 0.813 0.710 0.826 0.0566 0.918 0.729
#> 6 6 0.846 0.814 0.870 0.0477 0.921 0.690
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.7219 0.7358 0.200 0.800
#> SRR665262 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1499740 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.7219 0.7358 0.200 0.800
#> SRR612215 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR658433 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.7139 0.7417 0.196 0.804
#> SRR654802 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0938 0.9559 0.012 0.988
#> SRR1402153 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1074670 1 0.0376 0.9548 0.996 0.004
#> SRR1375439 2 0.9710 0.3267 0.400 0.600
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 0.9710 0.3323 0.600 0.400
#> SRR612227 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1473078 1 0.2236 0.9261 0.964 0.036
#> SRR615814 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.2603 0.9263 0.044 0.956
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR809595 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1392186 1 0.9710 0.3422 0.600 0.400
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.7219 0.7358 0.200 0.800
#> SRR1355352 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR813656 1 0.8861 0.5605 0.696 0.304
#> SRR808244 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.9922 0.1710 0.448 0.552
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.9732 0.3068 0.404 0.596
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.9732 0.3155 0.404 0.596
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1102830 1 0.9896 0.2161 0.560 0.440
#> SRR662126 2 0.2948 0.9186 0.052 0.948
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.1414 0.9489 0.020 0.980
#> SRR602010 2 0.9129 0.5036 0.328 0.672
#> SRR810249 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR818773 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR613222 1 0.0672 0.9514 0.992 0.008
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR819261 1 0.7453 0.7140 0.788 0.212
#> SRR661074 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.3431 0.9059 0.064 0.936
#> SRR661096 1 0.9710 0.3422 0.600 0.400
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.1633 0.9451 0.024 0.976
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.9933 0.1661 0.548 0.452
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR615611 1 0.8713 0.5825 0.708 0.292
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.7219 0.7326 0.800 0.200
#> SRR815044 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.9988 0.0562 0.480 0.520
#> SRR1330327 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1318444 1 0.9944 0.1749 0.544 0.456
#> SRR600656 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1475104 1 0.9850 0.2529 0.572 0.428
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.3274 0.9098 0.060 0.940
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.6623 0.7754 0.172 0.828
#> SRR656860 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0376 0.9628 0.004 0.996
#> SRR1452515 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0672 0.9594 0.008 0.992
#> SRR1435626 2 0.9922 0.1812 0.448 0.552
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.7139 0.7393 0.196 0.804
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR655399 1 0.9815 0.2765 0.580 0.420
#> SRR1319753 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR818901 2 0.7219 0.7358 0.200 0.800
#> SRR607067 2 0.3879 0.8932 0.076 0.924
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.9710 0.3267 0.400 0.600
#> SRR658259 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.9881 0.2106 0.436 0.564
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.7219 0.7358 0.200 0.800
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.8955 0.5444 0.312 0.688
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1309556 1 0.1843 0.9337 0.972 0.028
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1400551 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1408249 1 0.7219 0.7326 0.800 0.200
#> SRR663284 1 0.9286 0.4781 0.656 0.344
#> SRR1402794 2 0.8267 0.6387 0.260 0.740
#> SRR614852 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1348040 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1489610 2 0.2236 0.9341 0.036 0.964
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1499566 1 0.1414 0.9408 0.980 0.020
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR615044 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1432743 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.9850 0.2355 0.428 0.572
#> SRR655170 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR662019 1 0.1414 0.9410 0.980 0.020
#> SRR1349209 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.9393 0.4401 0.356 0.644
#> SRR660709 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR658989 1 0.9970 0.1229 0.532 0.468
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1414727 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1377800 1 0.9850 0.2529 0.572 0.428
#> SRR614611 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR657054 1 0.7299 0.7258 0.796 0.204
#> SRR655040 1 0.9686 0.3529 0.604 0.396
#> SRR810225 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.1414 0.9409 0.980 0.020
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.9815 0.2600 0.420 0.580
#> SRR1458683 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.4815 0.8615 0.104 0.896
#> SRR2166376 2 0.1184 0.9524 0.016 0.984
#> SRR659816 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.7139 0.7393 0.196 0.804
#> SRR600981 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.9686 0.3293 0.396 0.604
#> SRR660115 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.9491 0.4231 0.632 0.368
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR656409 1 0.9710 0.3422 0.600 0.400
#> SRR1468658 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.9661 0.3402 0.392 0.608
#> SRR658057 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.1184 0.9524 0.016 0.984
#> SRR1077288 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.9635 0.3591 0.388 0.612
#> SRR1443003 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.9662 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9582 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.0747 0.8985 0.000 0.016 0.984
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 3 0.4399 0.7391 0.000 0.188 0.812
#> SRR1499740 3 0.6252 0.2139 0.444 0.000 0.556
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 3 0.5621 0.5636 0.000 0.308 0.692
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.6225 0.2076 0.568 0.000 0.432
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.5363 0.6115 0.000 0.276 0.724
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0747 0.9560 0.000 0.984 0.016
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.6280 0.0910 0.540 0.000 0.460
#> SRR613999 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.6309 -0.0679 0.000 0.504 0.496
#> SRR1392186 2 0.6111 0.3250 0.396 0.604 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0237 0.9054 0.004 0.000 0.996
#> SRR612683 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.4452 0.7322 0.000 0.192 0.808
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.6126 0.3381 0.400 0.000 0.600
#> SRR656247 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.6252 0.1816 0.444 0.556 0.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.6192 0.2857 0.420 0.000 0.580
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408682 3 0.5859 0.4953 0.000 0.344 0.656
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.1289 0.9388 0.032 0.968 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 3 0.5928 0.5561 0.296 0.008 0.696
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.4931 0.6873 0.232 0.768 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.3816 0.8005 0.852 0.148 0.000
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.6126 0.3381 0.400 0.000 0.600
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 2 0.4002 0.7910 0.160 0.840 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.3879 0.7937 0.000 0.848 0.152
#> SRR1418561 1 0.1964 0.9126 0.944 0.000 0.056
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.4555 0.7373 0.200 0.800 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.4555 0.7082 0.200 0.000 0.800
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.6126 0.3333 0.600 0.400 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 3 0.6204 0.3129 0.000 0.424 0.576
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.6204 0.3129 0.000 0.424 0.576
#> SRR658766 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.2261 0.8608 0.000 0.068 0.932
#> SRR817282 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.6291 0.1812 0.000 0.468 0.532
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 3 0.5905 0.4783 0.000 0.352 0.648
#> SRR820907 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.1753 0.9222 0.000 0.952 0.048
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.0892 0.9501 0.980 0.020 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.5254 0.6079 0.000 0.736 0.264
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.6168 0.3067 0.412 0.000 0.588
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1411 0.9351 0.000 0.964 0.036
#> SRR661469 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.2448 0.8539 0.000 0.076 0.924
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.1289 0.9398 0.000 0.968 0.032
#> SRR613126 3 0.6225 0.2945 0.000 0.432 0.568
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0892 0.8936 0.020 0.000 0.980
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.5810 0.4832 0.336 0.000 0.664
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 1 0.6126 0.3333 0.600 0.400 0.000
#> SRR663284 2 0.0237 0.9672 0.004 0.996 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.6204 0.3129 0.000 0.424 0.576
#> SRR1348040 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 1 0.6126 0.3333 0.600 0.400 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.5810 0.4613 0.664 0.000 0.336
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.3879 0.7937 0.000 0.848 0.152
#> SRR662918 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 1 0.6244 0.1821 0.560 0.000 0.440
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 3 0.5760 0.5252 0.000 0.328 0.672
#> SRR662019 3 0.4605 0.7029 0.204 0.000 0.796
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.6274 0.2327 0.000 0.456 0.544
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.6204 0.3129 0.000 0.424 0.576
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355217 3 0.6307 0.1131 0.000 0.488 0.512
#> SRR1356290 3 0.5905 0.4804 0.000 0.352 0.648
#> SRR659507 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414727 3 0.6095 0.3580 0.392 0.000 0.608
#> SRR663477 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 3 0.6225 0.2910 0.000 0.432 0.568
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.1289 0.8877 0.000 0.032 0.968
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 1 0.6267 0.1803 0.548 0.452 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.4399 0.7237 0.188 0.000 0.812
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.6192 0.3233 0.000 0.420 0.580
#> SRR660260 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.6267 0.0931 0.000 0.548 0.452
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0747 0.9554 0.016 0.984 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.6126 0.3333 0.600 0.400 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.5785 0.4864 0.332 0.668 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.5938 0.6398 0.248 0.732 0.020
#> SRR658057 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.6126 0.3381 0.400 0.000 0.600
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0747 0.8981 0.000 0.016 0.984
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.4121 0.7598 0.000 0.168 0.832
#> SRR615225 2 0.6295 0.0105 0.000 0.528 0.472
#> SRR1401839 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.6126 0.3381 0.400 0.000 0.600
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.7533 0.3951 0.348 0.600 0.052
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 3 0.6215 0.3021 0.000 0.428 0.572
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9711 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9082 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612803 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.4948 0.5524 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1419258 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1403366 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665262 2 0.4843 0.4218 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1499740 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612215 2 0.4843 0.4218 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.2216 0.7563 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.3907 0.6495 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR614839 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR658433 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.4999 0.4480 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1328797 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1334512 2 0.3873 0.6563 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.3837 0.7839 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR660066 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402153 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR655887 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR658707 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.6771 0.5932 0.000 0.152 0.600 0.248
#> SRR1074670 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329003 4 0.4679 0.4549 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1404837 2 0.3024 0.7620 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.3710 0.6740 0.192 0.000 0.004 0.804
#> SRR613999 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 4 0.4406 0.6132 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.4995 0.6464 0.720 0.032 0.248 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809595 1 0.4040 0.6834 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 4 0.4933 0.2156 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4072 0.7731 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1478362 4 0.0921 0.7702 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1392186 2 0.5527 0.3529 0.356 0.616 0.000 0.028
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.5244 0.6179 0.012 0.000 0.600 0.388
#> SRR612683 2 0.0188 0.9146 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1392901 3 0.4072 0.7731 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1077805 3 0.4746 0.6595 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.6961 0.0272 0.120 0.512 0.000 0.368
#> SRR808244 1 0.3764 0.6978 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0336 0.7796 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.6818 0.3721 0.000 0.600 0.168 0.232
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 3 0.4655 0.4273 0.000 0.312 0.684 0.004
#> SRR603164 3 0.4072 0.7731 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1383259 4 0.4522 0.5804 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1361546 3 0.3123 0.6688 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3311 0.7300 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR615635 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.4855 0.4167 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 4 0.4193 0.6595 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602010 2 0.4697 0.4873 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818773 1 0.4454 0.5978 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.7374 0.3636 0.600 0.168 0.024 0.208
#> SRR1459937 4 0.1022 0.7569 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.4040 0.6839 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR661096 2 0.4418 0.6607 0.184 0.784 0.000 0.032
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4679 0.4549 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1307677 2 0.1022 0.8986 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1466512 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR658212 2 0.1022 0.8986 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1430525 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1344422 4 0.3610 0.7291 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0336 0.9589 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR627431 2 0.4164 0.5860 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1418561 1 0.4019 0.7077 0.792 0.000 0.196 0.012
#> SRR1448029 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612395 3 0.3873 0.5648 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1368264 2 0.3873 0.6683 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.3873 0.6563 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.4134 0.6695 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR815044 4 0.4040 0.6839 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.1118 0.8956 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1480038 2 0.0817 0.9037 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR659436 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.3907 0.6495 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1330327 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.4992 0.4823 0.000 0.000 0.524 0.476
#> SRR600656 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658766 3 0.4277 0.7505 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR655946 3 0.4761 0.6547 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR817282 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.4916 0.3556 0.000 0.576 0.424 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR662498 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376764 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1377006 3 0.4855 0.6157 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR656860 2 0.4898 0.1934 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1480547 2 0.3907 0.6495 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1452515 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.5435 0.2148 0.000 0.564 0.016 0.420
#> SRR820907 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 1 0.3610 0.7452 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.1302 0.8240 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1320579 3 0.4761 0.6547 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1098879 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR662245 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0336 0.9589 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR601387 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0707 0.9060 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662906 2 0.0336 0.9113 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1313969 4 0.0921 0.7607 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 1 0.0592 0.9483 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR607067 4 0.2530 0.7617 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR661961 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658259 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 4 0.4830 0.4361 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.4643 0.5056 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1322900 1 0.1474 0.9158 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.3907 0.7002 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661469 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500323 2 0.2216 0.8304 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.4955 0.5453 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0592 0.8278 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1318839 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1432390 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.3873 0.6451 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.4312 0.7873 0.056 0.000 0.812 0.132
#> SRR1456027 4 0.4250 0.5878 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1400551 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615105 4 0.1211 0.7481 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1433290 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR2166064 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR663874 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.3610 0.7291 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1408249 1 0.5837 0.2490 0.564 0.400 0.000 0.036
#> SRR663284 2 0.3907 0.6495 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1402794 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348040 3 0.4072 0.7704 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 1 0.4830 0.3290 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.1716 0.8730 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1444501 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.4866 0.2720 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.4164 0.5860 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR662918 4 0.4040 0.6839 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR817421 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1022 0.8986 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR608264 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.2704 0.7218 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1432743 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.4072 0.7731 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4040 0.6839 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR655170 2 0.0707 0.9023 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1087825 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR662019 3 0.3610 0.6748 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1349209 4 0.1022 0.7569 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0592 0.8278 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1084369 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR598452 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 4 0.0921 0.7607 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR809444 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.4679 0.4549 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR657139 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.1022 0.8987 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0188 0.8288 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR819054 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.4040 0.6834 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355217 2 0.4925 0.3453 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1356290 2 0.4360 0.5999 0.000 0.744 0.008 0.248
#> SRR659507 3 0.1118 0.8023 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414727 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1377800 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655052 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478968 4 0.4134 0.6107 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1351280 2 0.4008 0.6294 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR613951 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.1022 0.7569 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655040 4 0.4040 0.6839 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR810225 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.4817 0.6330 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.3528 0.7011 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1442104 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.3907 0.6495 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1458683 4 0.0921 0.7607 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4164 0.6617 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660260 3 0.5000 -0.0998 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.0921 0.7607 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1337173 3 0.4072 0.7731 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1396250 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659816 3 0.4916 0.5796 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600981 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.4761 0.4635 0.004 0.332 0.000 0.664
#> SRR660115 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.4855 0.5195 0.004 0.352 0.000 0.644
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.4855 0.4167 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1468658 3 0.4776 0.6496 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1390437 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.1022 0.8986 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR612635 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR659911 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442928 3 0.3837 0.5710 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1464681 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.4072 0.7731 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1365426 2 0.7798 0.0387 0.364 0.388 0.248 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.6356 0.6335 0.000 0.084 0.596 0.320
#> SRR660673 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.1022 0.8986 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1339108 2 0.2814 0.7827 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR613426 4 0.4040 0.6253 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR613879 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.2921 0.8102 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.2081 0.8393 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.2704 0.7514 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0188 0.9146 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.1022 0.8986 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1351979 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1387054 3 0.4761 0.6547 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1444306 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.4898 0.3752 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR615225 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401839 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379110 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1077288 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331639 4 0.2081 0.7691 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1342782 2 0.4830 0.4306 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1443003 3 0.3528 0.7930 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR612839 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4776 0.6496 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4761 0.6547 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR664063 1 0.4040 0.6834 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0000 0.7832 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9166 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0921 0.9013 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1488470 2 0.3873 0.6563 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1389497 3 0.0000 0.8291 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.4040 0.7758 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR615311 1 0.0000 0.9662 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1380716 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR612803 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.6579 -0.0454 0.000 0.004 0.416 0.176 0.404
#> SRR1419258 3 0.1270 0.8216 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1403366 5 0.4307 0.0141 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR665262 5 0.0162 0.5210 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1499740 5 0.4210 0.2086 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1105057 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.4219 0.2024 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR612215 5 0.0000 0.5197 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.5417 0.4230 0.236 0.000 0.648 0.000 0.116
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0404 0.6756 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR614839 2 0.0404 0.6768 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR658433 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1088581 3 0.4555 0.0234 0.000 0.000 0.520 0.472 0.008
#> SRR1328797 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1334512 2 0.0404 0.6756 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1354955 3 0.0794 0.8196 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR654802 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR660066 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1447103 5 0.4219 0.2024 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1402153 3 0.1788 0.8179 0.000 0.004 0.932 0.056 0.008
#> SRR655887 2 0.3246 0.6959 0.000 0.808 0.000 0.008 0.184
#> SRR1408529 3 0.0290 0.8259 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.2688 0.7897 0.000 0.012 0.896 0.056 0.036
#> SRR1074670 3 0.2127 0.7835 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1375439 5 0.4219 0.2024 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1329003 4 0.3074 0.6750 0.196 0.000 0.000 0.804 0.000
#> SRR1404837 5 0.6910 -0.4467 0.000 0.392 0.108 0.048 0.452
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.1697 0.8274 0.008 0.000 0.060 0.932 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.3774 0.5352 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.2690 0.7451 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR612227 3 0.0162 0.8246 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1388809 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1413872 4 0.0000 0.8610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.2690 0.7451 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR615814 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1325225 1 0.2471 0.8324 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1313687 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1358220 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1096662 2 0.4268 -0.1830 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.4575 0.2439 0.392 0.008 0.004 0.000 0.596
#> SRR660164 2 0.4201 0.6993 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR815783 2 0.4192 0.7022 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR809595 5 0.4341 0.2193 0.404 0.000 0.004 0.000 0.592
#> SRR1403133 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR815470 5 0.7384 -0.0989 0.000 0.180 0.048 0.368 0.404
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.1697 0.8175 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR1478362 4 0.3053 0.7491 0.000 0.000 0.164 0.828 0.008
#> SRR1392186 2 0.1582 0.6448 0.028 0.944 0.000 0.000 0.028
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.2561 0.7502 0.000 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR612683 2 0.3003 0.6979 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1392901 3 0.1697 0.8175 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR1077805 3 0.1638 0.8195 0.000 0.004 0.932 0.064 0.000
#> SRR1360402 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1406112 3 0.2773 0.7369 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1355352 5 0.4283 0.1217 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR656247 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.2769 0.5999 0.020 0.892 0.000 0.064 0.024
#> SRR808244 4 0.5059 0.2569 0.416 0.000 0.036 0.548 0.000
#> SRR1387240 2 0.4350 0.6965 0.000 0.588 0.000 0.004 0.408
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0451 0.8605 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1435248 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1419110 5 0.2732 0.4817 0.000 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1408682 5 0.2286 0.4682 0.000 0.004 0.108 0.000 0.888
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.2074 0.6815 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1453911 5 0.2127 0.4695 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR603164 3 0.1809 0.8156 0.000 0.000 0.928 0.060 0.012
#> SRR1383259 2 0.4219 -0.0945 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0794 0.6674 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0290 0.8259 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1361546 5 0.3003 0.4635 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.5554 0.6380 0.000 0.532 0.008 0.052 0.408
#> SRR615635 2 0.4138 0.7068 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1385411 2 0.2852 0.5103 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.2773 0.7369 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR662126 2 0.4455 -0.0821 0.000 0.588 0.000 0.404 0.008
#> SRR1464601 2 0.4201 0.6993 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1071594 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR612539 2 0.0162 0.6789 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR602010 5 0.0671 0.5213 0.000 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR810249 2 0.4003 0.7032 0.000 0.704 0.000 0.008 0.288
#> SRR818773 5 0.4585 0.2349 0.396 0.008 0.004 0.000 0.592
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4219 0.6941 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.2230 0.7871 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR661639 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.7432 -0.1208 0.368 0.456 0.036 0.108 0.032
#> SRR1459937 4 0.0404 0.8596 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.4192 0.7027 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR809348 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.2127 0.7835 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR661074 3 0.4064 0.6841 0.092 0.000 0.792 0.000 0.116
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.3752 0.5737 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR661096 2 0.0451 0.6755 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.3074 0.6750 0.196 0.000 0.000 0.804 0.000
#> SRR1307677 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1466512 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR658212 2 0.3582 0.6984 0.000 0.768 0.000 0.008 0.224
#> SRR1430525 3 0.1502 0.8203 0.000 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1344422 4 0.2377 0.7490 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1353924 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.2891 0.7788 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR627431 5 0.7383 -0.4152 0.000 0.384 0.144 0.064 0.408
#> SRR1418561 1 0.4712 0.5300 0.684 0.000 0.268 0.048 0.000
#> SRR1448029 3 0.2690 0.7451 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR813802 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.4436 0.7046 0.000 0.596 0.000 0.008 0.396
#> SRR1435311 2 0.2813 0.6951 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR612395 5 0.0290 0.5227 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR603116 5 0.2280 0.3104 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1323152 3 0.0290 0.8259 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1368264 5 0.3266 0.4360 0.004 0.200 0.000 0.000 0.796
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.3389 0.7409 0.048 0.000 0.836 0.000 0.116
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0566 0.6737 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4287 -0.2268 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR815044 2 0.4273 -0.1931 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.6797 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480038 2 0.0162 0.6795 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659436 5 0.4219 0.1928 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR613699 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0404 0.6756 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1330327 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1489950 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.2732 0.7410 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.4210 0.2350 0.000 0.000 0.588 0.412 0.000
#> SRR600656 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR658766 3 0.1697 0.8175 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR655946 3 0.1877 0.8134 0.000 0.000 0.924 0.064 0.012
#> SRR817282 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.2690 0.7451 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.3171 0.4523 0.000 0.176 0.008 0.000 0.816
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.1697 0.8175 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR662498 5 0.4227 0.1841 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1376764 3 0.1557 0.8204 0.000 0.000 0.940 0.052 0.008
#> SRR1377006 3 0.1544 0.8167 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR656860 2 0.1197 0.6545 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1480547 2 0.0404 0.6756 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1452515 5 0.4307 -0.0595 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1324390 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR615273 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 5 0.8149 0.0466 0.000 0.148 0.256 0.188 0.408
#> SRR820907 2 0.3074 0.6966 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR812773 1 0.4350 0.2980 0.588 0.000 0.004 0.000 0.408
#> SRR1405984 2 0.0162 0.6789 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1472794 2 0.4192 0.7022 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.2690 0.7451 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1435626 3 0.4101 0.4034 0.000 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1080766 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0510 0.8226 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1467966 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1320579 3 0.1764 0.8155 0.000 0.000 0.928 0.064 0.008
#> SRR1319710 2 0.0794 0.6674 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1326604 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1098879 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR662245 2 0.4210 0.6966 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1074719 2 0.4150 0.7070 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR816226 1 0.3109 0.7432 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR601387 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR614575 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1353900 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR662906 2 0.4192 0.7005 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1350832 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1403280 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1313969 4 0.2020 0.8057 0.000 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0609 0.9608 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR655399 3 0.2127 0.7835 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1319753 1 0.4893 0.3278 0.568 0.404 0.000 0.000 0.028
#> SRR818901 3 0.2127 0.7839 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR607067 4 0.3196 0.7086 0.000 0.192 0.000 0.804 0.004
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0162 0.6795 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661961 5 0.4219 0.2024 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR658259 2 0.0609 0.6837 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1365034 2 0.4256 -0.1612 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1478053 2 0.4025 0.7033 0.000 0.700 0.000 0.008 0.292
#> SRR1475300 2 0.0000 0.6797 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 5 0.0000 0.5197 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0880 0.9490 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1309942 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1345760 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.2773 0.7062 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.4219 0.6941 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR661469 5 0.4182 0.2183 0.000 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1500323 2 0.5873 0.6144 0.000 0.512 0.028 0.044 0.416
#> SRR1356705 2 0.4273 -0.0944 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.2074 0.7859 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.1628 0.8191 0.000 0.000 0.936 0.056 0.008
#> SRR1368072 2 0.4192 0.7027 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR601815 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR613330 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.5985 0.0443 0.000 0.000 0.480 0.112 0.408
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.1251 0.8232 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1318839 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1432390 4 0.0162 0.8612 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR613126 2 0.6306 0.5780 0.000 0.484 0.044 0.056 0.416
#> SRR1089424 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347214 2 0.3171 0.6954 0.000 0.816 0.000 0.008 0.176
#> SRR1309556 3 0.1646 0.8186 0.020 0.000 0.944 0.032 0.004
#> SRR1456027 4 0.1544 0.8138 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1400551 5 0.4273 0.1338 0.000 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.4201 0.6993 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1454310 2 0.4436 0.7046 0.000 0.596 0.000 0.008 0.396
#> SRR615105 4 0.2852 0.7476 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1433290 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2166064 4 0.0162 0.8600 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR601671 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR663874 2 0.4242 0.6858 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1409130 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR659696 4 0.1043 0.8330 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1408249 2 0.3455 0.4230 0.208 0.784 0.000 0.008 0.000
#> SRR663284 2 0.0451 0.6774 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1402794 3 0.2127 0.7835 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR614852 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1348040 3 0.2818 0.7797 0.000 0.000 0.856 0.132 0.012
#> SRR1489610 2 0.0794 0.6674 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1488091 2 0.4201 0.6993 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1499566 2 0.3487 0.4169 0.212 0.780 0.000 0.008 0.000
#> SRR1361480 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1444501 3 0.1557 0.8204 0.000 0.000 0.940 0.052 0.008
#> SRR1415773 2 0.4610 0.6714 0.000 0.556 0.012 0.000 0.432
#> SRR1388832 1 0.4446 0.2482 0.592 0.000 0.400 0.000 0.008
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 5 0.7383 -0.4152 0.000 0.384 0.144 0.064 0.408
#> SRR662918 4 0.3003 0.6756 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR817421 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR608264 3 0.0290 0.8259 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.4210 0.6971 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.4630 0.2220 0.016 0.000 0.396 0.000 0.588
#> SRR1432743 3 0.1628 0.8191 0.000 0.000 0.936 0.056 0.008
#> SRR1388873 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.4256 0.1584 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1406008 2 0.4235 0.6892 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1396786 2 0.4321 0.7052 0.000 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.1697 0.8175 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.3508 0.6506 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR655170 2 0.4640 0.6949 0.000 0.584 0.000 0.016 0.400
#> SRR1087825 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR662019 3 0.3718 0.6106 0.196 0.000 0.784 0.004 0.016
#> SRR1349209 4 0.4210 0.3504 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1326161 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1345284 2 0.0000 0.6797 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454328 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1084369 3 0.1628 0.8191 0.000 0.000 0.936 0.056 0.008
#> SRR598452 3 0.2127 0.7835 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR660709 4 0.3053 0.7491 0.000 0.000 0.164 0.828 0.008
#> SRR809444 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.3074 0.6750 0.196 0.000 0.000 0.804 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0162 0.6789 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.0324 0.8604 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.4161 0.7050 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR658989 3 0.0000 0.8252 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819054 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1367988 4 0.0566 0.8577 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 5 0.4341 0.2193 0.404 0.000 0.004 0.000 0.592
#> SRR1375796 2 0.4201 0.6993 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1386991 5 0.4201 0.2076 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1355217 5 0.1106 0.5227 0.000 0.024 0.012 0.000 0.964
#> SRR1356290 5 0.7529 -0.3173 0.000 0.332 0.196 0.056 0.416
#> SRR659507 5 0.0290 0.5227 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR663296 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0510 0.6829 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR661155 4 0.0162 0.8600 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1414727 5 0.4262 0.1553 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR663477 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.1557 0.8204 0.000 0.000 0.940 0.052 0.008
#> SRR1377800 3 0.4060 0.3915 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR614611 2 0.4436 0.7046 0.000 0.596 0.000 0.008 0.396
#> SRR655052 4 0.3053 0.7491 0.000 0.000 0.164 0.828 0.008
#> SRR1478968 4 0.1544 0.8138 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1351280 2 0.0771 0.6751 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR613951 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4210 0.3283 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.2127 0.7835 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR655040 4 0.4262 0.4351 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR810225 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1325377 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR617829 3 0.1877 0.8134 0.000 0.000 0.924 0.064 0.012
#> SRR1402328 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1480455 2 0.6176 0.5983 0.000 0.504 0.040 0.052 0.404
#> SRR1442104 3 0.1043 0.8241 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.3291 0.7458 0.040 0.000 0.840 0.000 0.120
#> SRR1414314 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR663026 2 0.0162 0.6789 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478386 2 0.0404 0.6756 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1458683 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.4359 0.2000 0.412 0.000 0.004 0.000 0.584
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR660260 5 0.4559 -0.1633 0.000 0.000 0.008 0.480 0.512
#> SRR1071231 2 0.4310 0.7062 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR1459125 4 0.0290 0.8610 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1337173 3 0.5331 0.1801 0.000 0.000 0.568 0.060 0.372
#> SRR1396250 3 0.2074 0.7859 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2166376 3 0.3366 0.6531 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR659816 3 0.5911 0.0551 0.000 0.000 0.488 0.104 0.408
#> SRR1401379 2 0.0794 0.6674 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR600981 4 0.0000 0.8610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.5513 0.2467 0.000 0.664 0.144 0.188 0.004
#> SRR660115 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1359780 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4403 -0.0384 0.000 0.608 0.000 0.384 0.008
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1319648 2 0.0162 0.6795 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.3039 0.4685 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1468658 3 0.1764 0.8155 0.000 0.000 0.928 0.064 0.008
#> SRR1390437 4 0.0000 0.8610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR612635 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1351480 2 0.0404 0.6818 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.4321 0.7052 0.000 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR614263 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0290 0.6776 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR659911 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1085519 3 0.2690 0.7451 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1345894 3 0.2813 0.7343 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1442928 5 0.0290 0.5227 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1464681 4 0.0162 0.8600 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.1697 0.8175 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR1365426 5 0.1569 0.5156 0.044 0.008 0.004 0.000 0.944
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.5770 0.0861 0.000 0.008 0.516 0.068 0.408
#> SRR660673 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR663807 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1087245 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1339108 2 0.5148 0.5580 0.000 0.748 0.104 0.048 0.100
#> SRR613426 4 0.1544 0.8138 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR613879 2 0.4219 0.6941 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1385101 1 0.2929 0.7980 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152
#> SRR1387966 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1458852 2 0.5787 0.6270 0.000 0.524 0.024 0.044 0.408
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.3442 0.7375 0.060 0.000 0.836 0.000 0.104
#> SRR1321987 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR662653 2 0.4321 0.7052 0.000 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0609 0.6834 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1383081 2 0.0451 0.6815 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR2166960 2 0.3913 0.7059 0.000 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR605101 2 0.3395 0.6887 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR818600 2 0.4182 0.7046 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1367715 2 0.0451 0.6778 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1351979 3 0.0162 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1387054 3 0.1877 0.8134 0.000 0.000 0.924 0.064 0.012
#> SRR1444306 3 0.4171 0.3442 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR612767 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.4171 0.7054 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1430375 5 0.0000 0.5197 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615225 4 0.0162 0.8600 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1401839 5 0.4235 0.1810 0.000 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1379110 2 0.0162 0.6789 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077288 3 0.3593 0.7275 0.060 0.000 0.824 0.000 0.116
#> SRR1331639 4 0.0290 0.8580 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1342782 5 0.0162 0.5210 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1443003 3 0.1934 0.8202 0.000 0.008 0.932 0.040 0.020
#> SRR612839 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.1544 0.8167 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.1764 0.8155 0.000 0.000 0.928 0.064 0.008
#> SRR664063 5 0.4585 0.2349 0.396 0.008 0.004 0.000 0.592
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0451 0.8593 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1320321 2 0.0290 0.6807 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0579 0.6806 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1488470 2 0.0404 0.6756 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1389497 3 0.2020 0.7882 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1367109 3 0.1430 0.8212 0.000 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR615311 1 0.0000 0.9804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 6 0.3244 0.8338 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1380716 2 0.3647 0.2258 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR612803 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0291 0.9737 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074359 6 0.2673 0.6258 0.000 0.000 0.064 0.044 0.012 0.880
#> SRR1419258 3 0.2907 0.8386 0.000 0.000 0.828 0.020 0.000 0.152
#> SRR1403366 5 0.3409 0.6407 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR665262 5 0.1007 0.8764 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1499740 5 0.1007 0.8830 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1105057 2 0.1196 0.8236 0.000 0.952 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.1204 0.8780 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR612215 5 0.1327 0.8585 0.000 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0291 0.9737 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409263 3 0.3658 0.6840 0.136 0.004 0.800 0.000 0.056 0.004
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0363 0.8264 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR614839 2 0.2979 0.7803 0.000 0.840 0.000 0.000 0.044 0.116
#> SRR658433 6 0.3126 0.8414 0.000 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR1088581 4 0.5144 0.6056 0.000 0.000 0.140 0.656 0.012 0.192
#> SRR1328797 3 0.1075 0.8560 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1334512 2 0.0790 0.8273 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 6 0.3175 0.8396 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1354955 3 0.0260 0.8482 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR654802 3 0.0260 0.8511 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR660066 6 0.3198 0.8378 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1447103 5 0.1204 0.8780 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1402153 3 0.3580 0.8197 0.000 0.000 0.772 0.028 0.004 0.196
#> SRR655887 2 0.3765 -0.0319 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1408529 3 0.3128 0.8356 0.000 0.000 0.812 0.012 0.008 0.168
#> SRR658707 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.4503 0.6517 0.000 0.000 0.612 0.028 0.008 0.352
#> SRR1074670 3 0.1364 0.8361 0.000 0.004 0.944 0.000 0.048 0.004
#> SRR1375439 5 0.1267 0.8766 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1329003 4 0.1219 0.8469 0.048 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004
#> SRR1404837 6 0.2207 0.6723 0.000 0.008 0.004 0.020 0.060 0.908
#> SRR1317920 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455525 4 0.1155 0.8605 0.000 0.004 0.036 0.956 0.000 0.004
#> SRR613999 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.2454 0.7551 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.1493 0.8317 0.000 0.004 0.936 0.000 0.056 0.004
#> SRR612227 3 0.1074 0.8555 0.000 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1388809 6 0.2823 0.8404 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1413872 4 0.0632 0.8740 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473078 3 0.1493 0.8317 0.000 0.004 0.936 0.000 0.056 0.004
#> SRR615814 6 0.2823 0.8419 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1325225 1 0.2738 0.7757 0.820 0.000 0.000 0.176 0.000 0.004
#> SRR1313687 6 0.3244 0.8336 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1358220 2 0.1010 0.8242 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1096662 2 0.2003 0.7366 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.0520 0.8826 0.008 0.008 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR660164 6 0.2402 0.8151 0.000 0.140 0.000 0.000 0.004 0.856
#> SRR815783 6 0.2697 0.8408 0.000 0.188 0.000 0.000 0.000 0.812
#> SRR809595 5 0.1078 0.8819 0.016 0.008 0.012 0.000 0.964 0.000
#> SRR1403133 6 0.3151 0.8406 0.000 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748
#> SRR815470 6 0.2908 0.6929 0.000 0.044 0.016 0.064 0.004 0.872
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3827 0.8153 0.000 0.000 0.764 0.032 0.012 0.192
#> SRR1478362 4 0.4114 0.7064 0.000 0.000 0.052 0.740 0.008 0.200
#> SRR1392186 2 0.2889 0.7889 0.004 0.856 0.000 0.000 0.044 0.096
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.3250 0.7749 0.000 0.004 0.808 0.168 0.004 0.016
#> SRR612683 6 0.3833 0.4749 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1392901 3 0.3823 0.8131 0.000 0.000 0.760 0.044 0.004 0.192
#> SRR1077805 3 0.3352 0.8384 0.000 0.032 0.812 0.008 0.000 0.148
#> SRR1360402 6 0.3221 0.8359 0.000 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1406112 3 0.1267 0.8329 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1355352 5 0.3850 0.5320 0.000 0.004 0.340 0.000 0.652 0.004
#> SRR656247 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.2586 0.7952 0.008 0.880 0.000 0.000 0.032 0.080
#> SRR808244 4 0.4259 0.5887 0.228 0.004 0.040 0.720 0.000 0.008
#> SRR1387240 6 0.1957 0.8085 0.000 0.112 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0260 0.8740 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1435248 6 0.3126 0.8417 0.000 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR1419110 5 0.0820 0.8870 0.000 0.000 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR1408682 6 0.3991 -0.0455 0.000 0.000 0.004 0.000 0.472 0.524
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4774 0.2441 0.000 0.528 0.000 0.000 0.052 0.420
#> SRR1453911 5 0.2191 0.8125 0.000 0.000 0.004 0.000 0.876 0.120
#> SRR603164 3 0.3593 0.8031 0.000 0.000 0.748 0.024 0.000 0.228
#> SRR1383259 2 0.1958 0.7596 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004 0.000
#> SRR1330854 1 0.0291 0.9737 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.2826 0.7884 0.000 0.856 0.000 0.000 0.052 0.092
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2312 0.8494 0.000 0.000 0.876 0.012 0.000 0.112
#> SRR1361546 5 0.0935 0.8863 0.000 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 6 0.1728 0.7662 0.000 0.064 0.000 0.008 0.004 0.924
#> SRR615635 6 0.3706 0.6658 0.000 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1385411 2 0.0777 0.8188 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.1493 0.8317 0.000 0.004 0.936 0.000 0.056 0.004
#> SRR662126 2 0.4114 0.7003 0.000 0.784 0.000 0.076 0.032 0.108
#> SRR1464601 6 0.2100 0.8066 0.000 0.112 0.000 0.000 0.004 0.884
#> SRR1071594 6 0.2793 0.8429 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR612539 2 0.0806 0.8274 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR602010 5 0.0622 0.8836 0.000 0.012 0.000 0.000 0.980 0.008
#> SRR810249 2 0.3979 -0.2365 0.000 0.540 0.000 0.000 0.004 0.456
#> SRR818773 5 0.0622 0.8829 0.012 0.008 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 6 0.2538 0.8062 0.000 0.124 0.000 0.000 0.016 0.860
#> SRR1442754 1 0.0291 0.9737 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334247 3 0.3224 0.8130 0.000 0.000 0.824 0.004 0.132 0.040
#> SRR661639 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.4072 0.6548 0.056 0.800 0.088 0.052 0.000 0.004
#> SRR1459937 4 0.0865 0.8612 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 6 0.3320 0.8296 0.000 0.212 0.000 0.000 0.016 0.772
#> SRR809348 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.1364 0.8361 0.000 0.004 0.944 0.000 0.048 0.004
#> SRR661074 3 0.1750 0.8286 0.008 0.004 0.928 0.000 0.056 0.004
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.3717 0.2928 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0717 0.8277 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.1219 0.8469 0.048 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004
#> SRR1307677 2 0.2003 0.7548 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1466512 2 0.0458 0.8269 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR658212 6 0.3868 0.4117 0.000 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1430525 3 0.3345 0.8262 0.000 0.000 0.788 0.028 0.000 0.184
#> SRR1344422 4 0.3468 0.5985 0.000 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1353924 2 0.1265 0.8222 0.000 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1314832 1 0.0291 0.9737 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487570 1 0.3189 0.6851 0.760 0.000 0.000 0.236 0.000 0.004
#> SRR627431 6 0.1680 0.6716 0.000 0.004 0.016 0.040 0.004 0.936
#> SRR1418561 1 0.4351 0.1182 0.516 0.004 0.468 0.000 0.004 0.008
#> SRR1448029 3 0.1204 0.8345 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 6 0.3288 0.8302 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1435311 6 0.4172 0.2910 0.000 0.460 0.000 0.000 0.012 0.528
#> SRR612395 5 0.0790 0.8816 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR603116 5 0.1757 0.8389 0.000 0.008 0.000 0.000 0.916 0.076
#> SRR1323152 3 0.1542 0.8565 0.000 0.000 0.936 0.008 0.004 0.052
#> SRR1368264 5 0.1367 0.8579 0.000 0.012 0.000 0.000 0.944 0.044
#> SRR1326624 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429265 3 0.1637 0.8303 0.004 0.004 0.932 0.000 0.056 0.004
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0291 0.8258 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.2288 0.7340 0.000 0.876 0.000 0.116 0.004 0.004
#> SRR815044 2 0.3575 0.5233 0.000 0.708 0.000 0.284 0.000 0.008
#> SRR1338560 2 0.2738 0.7070 0.000 0.820 0.000 0.000 0.004 0.176
#> SRR615862 2 0.0547 0.8270 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1480038 2 0.2070 0.7995 0.000 0.892 0.000 0.000 0.008 0.100
#> SRR659436 5 0.1049 0.8831 0.000 0.000 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR613699 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0291 0.8261 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1330327 4 0.1010 0.8608 0.000 0.000 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1489950 6 0.3198 0.8378 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.1204 0.8345 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.5903 0.2168 0.000 0.000 0.456 0.376 0.008 0.160
#> SRR600656 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658766 3 0.3858 0.8139 0.000 0.000 0.760 0.032 0.012 0.196
#> SRR655946 3 0.4041 0.7962 0.000 0.000 0.736 0.040 0.008 0.216
#> SRR817282 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.1493 0.8317 0.000 0.004 0.936 0.000 0.056 0.004
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.0603 0.8827 0.000 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.3827 0.8153 0.000 0.000 0.764 0.032 0.012 0.192
#> SRR662498 5 0.1745 0.8720 0.000 0.000 0.068 0.000 0.920 0.012
#> SRR1376764 3 0.3277 0.8287 0.000 0.000 0.792 0.016 0.004 0.188
#> SRR1377006 3 0.3353 0.8338 0.000 0.000 0.804 0.032 0.004 0.160
#> SRR656860 2 0.0508 0.8258 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1480547 2 0.0363 0.8264 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1452515 5 0.3176 0.7538 0.000 0.000 0.156 0.000 0.812 0.032
#> SRR1324390 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR615273 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 6 0.2553 0.6324 0.000 0.000 0.056 0.044 0.012 0.888
#> SRR820907 6 0.3907 0.4756 0.000 0.408 0.000 0.000 0.004 0.588
#> SRR812773 1 0.3847 0.1505 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1405984 2 0.2980 0.6669 0.000 0.800 0.000 0.000 0.008 0.192
#> SRR1472794 6 0.2631 0.8400 0.000 0.180 0.000 0.000 0.000 0.820
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.1204 0.8363 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1435626 3 0.3405 0.6423 0.000 0.000 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR1080766 6 0.3175 0.8396 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.1007 0.8560 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1467966 3 0.1010 0.8551 0.000 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1320579 3 0.3931 0.8106 0.000 0.000 0.756 0.044 0.008 0.192
#> SRR1319710 2 0.3062 0.7791 0.000 0.836 0.000 0.000 0.052 0.112
#> SRR1326604 2 0.0790 0.8273 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1098879 3 0.1075 0.8560 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR662245 6 0.2288 0.8096 0.000 0.116 0.004 0.000 0.004 0.876
#> SRR1074719 6 0.3405 0.8296 0.000 0.272 0.000 0.000 0.004 0.724
#> SRR816226 1 0.3528 0.5768 0.700 0.000 0.000 0.296 0.000 0.004
#> SRR601387 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR614575 2 0.0547 0.8270 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1353900 6 0.2823 0.8419 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR662906 6 0.3134 0.8316 0.000 0.208 0.004 0.000 0.004 0.784
#> SRR1350832 6 0.3198 0.8378 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1403280 2 0.0547 0.8270 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1313969 4 0.2482 0.7883 0.000 0.000 0.004 0.848 0.000 0.148
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0713 0.9547 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR655399 3 0.1364 0.8361 0.000 0.004 0.944 0.000 0.048 0.004
#> SRR1319753 2 0.5212 0.4911 0.228 0.660 0.000 0.000 0.052 0.060
#> SRR818901 3 0.1075 0.8375 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR607067 4 0.3189 0.6616 0.000 0.236 0.000 0.760 0.004 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.1444 0.8153 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR661961 5 0.1204 0.8780 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR658259 2 0.3592 0.4378 0.000 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 6 0.3151 0.8409 0.000 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748
#> SRR1365034 2 0.1814 0.7566 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.3857 -0.2677 0.000 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1475300 2 0.1265 0.8231 0.000 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1328101 5 0.1267 0.8594 0.000 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1322900 1 0.3074 0.7321 0.792 0.004 0.000 0.000 0.200 0.004
#> SRR1309942 6 0.3198 0.8378 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1345760 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.3349 0.6413 0.000 0.244 0.000 0.748 0.000 0.008
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 6 0.2020 0.7925 0.000 0.096 0.000 0.000 0.008 0.896
#> SRR661469 5 0.0260 0.8864 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1500323 6 0.1219 0.7537 0.000 0.048 0.000 0.000 0.004 0.948
#> SRR1356705 5 0.4703 0.1948 0.000 0.408 0.000 0.000 0.544 0.048
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1364 0.8361 0.000 0.004 0.944 0.000 0.048 0.004
#> SRR1350435 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389177 3 0.3827 0.8153 0.000 0.000 0.764 0.032 0.012 0.192
#> SRR1368072 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR601815 6 0.3175 0.8393 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR613330 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 6 0.2485 0.6353 0.000 0.000 0.056 0.040 0.012 0.892
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.2686 0.8525 0.000 0.000 0.876 0.012 0.032 0.080
#> SRR1318839 3 0.0632 0.8539 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1432390 4 0.0260 0.8761 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR613126 6 0.1788 0.7534 0.000 0.052 0.004 0.012 0.004 0.928
#> SRR1089424 2 0.1444 0.7989 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1347214 2 0.3804 -0.0907 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1309556 3 0.3716 0.8287 0.000 0.000 0.780 0.028 0.016 0.176
#> SRR1456027 4 0.1036 0.8647 0.024 0.008 0.000 0.964 0.000 0.004
#> SRR1400551 5 0.4076 0.2820 0.000 0.004 0.428 0.000 0.564 0.004
#> SRR1320469 1 0.0291 0.9737 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR614251 6 0.2234 0.8113 0.000 0.124 0.000 0.000 0.004 0.872
#> SRR1454310 6 0.3266 0.8320 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR615105 4 0.4199 0.7017 0.000 0.000 0.060 0.736 0.008 0.196
#> SRR1433290 3 0.1075 0.8560 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR2166064 4 0.0632 0.8740 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0363 0.8277 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR663874 6 0.3312 0.8319 0.000 0.180 0.000 0.000 0.028 0.792
#> SRR1409130 6 0.3175 0.8396 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR659696 4 0.0790 0.8698 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0777 0.8153 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR663284 2 0.1471 0.8151 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1402794 3 0.1364 0.8361 0.000 0.004 0.944 0.000 0.048 0.004
#> SRR614852 4 0.0260 0.8761 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1348040 3 0.5831 0.6210 0.000 0.000 0.624 0.128 0.184 0.064
#> SRR1489610 2 0.3062 0.7791 0.000 0.836 0.000 0.000 0.052 0.112
#> SRR1488091 6 0.2491 0.8345 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR1499566 2 0.1452 0.8201 0.020 0.948 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1361480 2 0.0692 0.8266 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1444501 3 0.3549 0.8210 0.000 0.000 0.776 0.028 0.004 0.192
#> SRR1415773 6 0.2001 0.7450 0.000 0.048 0.000 0.000 0.040 0.912
#> SRR1388832 1 0.4720 0.1835 0.544 0.004 0.420 0.000 0.024 0.008
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 6 0.1680 0.6716 0.000 0.004 0.016 0.040 0.004 0.936
#> SRR662918 4 0.3337 0.6261 0.000 0.260 0.000 0.736 0.000 0.004
#> SRR817421 3 0.1075 0.8560 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1714 0.7799 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR608264 3 0.1588 0.8554 0.000 0.000 0.924 0.004 0.000 0.072
#> SRR1318560 1 0.0146 0.9770 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 6 0.2573 0.8030 0.000 0.112 0.000 0.000 0.024 0.864
#> SRR1312684 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615044 5 0.0458 0.8867 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1432743 3 0.3827 0.8153 0.000 0.000 0.764 0.032 0.012 0.192
#> SRR1388873 6 0.3198 0.8378 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.2219 0.8149 0.000 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1406008 6 0.3835 0.8116 0.000 0.188 0.000 0.000 0.056 0.756
#> SRR1396786 6 0.3244 0.8338 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3791 0.8138 0.000 0.000 0.760 0.032 0.008 0.200
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.3578 0.4853 0.000 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR655170 6 0.3190 0.8273 0.000 0.220 0.000 0.008 0.000 0.772
#> SRR1087825 4 0.0260 0.8761 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR662019 3 0.3048 0.7437 0.132 0.004 0.840 0.016 0.004 0.004
#> SRR1349209 4 0.5137 0.5433 0.000 0.000 0.228 0.632 0.004 0.136
#> SRR1326161 6 0.3244 0.8338 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1345284 2 0.1049 0.8246 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.1124 0.8243 0.000 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR1454328 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.1010 0.8551 0.000 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1084369 3 0.3549 0.8210 0.000 0.000 0.776 0.028 0.004 0.192
#> SRR598452 3 0.1429 0.8340 0.000 0.004 0.940 0.000 0.052 0.004
#> SRR660709 4 0.4239 0.7023 0.000 0.000 0.056 0.736 0.012 0.196
#> SRR809444 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.1219 0.8469 0.048 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004
#> SRR657139 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0692 0.8277 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.1642 0.8666 0.000 0.028 0.032 0.936 0.000 0.004
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 6 0.3483 0.8263 0.000 0.212 0.000 0.000 0.024 0.764
#> SRR658989 3 0.1820 0.8572 0.000 0.000 0.924 0.008 0.012 0.056
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0632 0.8539 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR819054 6 0.3309 0.8236 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1367988 4 0.0865 0.8620 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1331922 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615479 5 0.0717 0.8805 0.016 0.008 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1375796 6 0.2092 0.8133 0.000 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1386991 5 0.1297 0.8808 0.000 0.000 0.040 0.000 0.948 0.012
#> SRR1355217 5 0.0551 0.8850 0.000 0.008 0.004 0.000 0.984 0.004
#> SRR1356290 6 0.1680 0.6712 0.000 0.004 0.020 0.024 0.012 0.940
#> SRR659507 5 0.1461 0.8763 0.000 0.000 0.016 0.000 0.940 0.044
#> SRR663296 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.3457 0.6616 0.000 0.752 0.000 0.000 0.016 0.232
#> SRR661155 4 0.0632 0.8740 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1414727 5 0.2809 0.7992 0.000 0.004 0.168 0.000 0.824 0.004
#> SRR663477 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354489 3 0.3473 0.8228 0.000 0.000 0.780 0.024 0.004 0.192
#> SRR1377800 3 0.3043 0.6929 0.000 0.004 0.796 0.000 0.196 0.004
#> SRR614611 6 0.3266 0.8320 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR655052 4 0.4114 0.7064 0.000 0.000 0.052 0.740 0.008 0.200
#> SRR1478968 4 0.1036 0.8647 0.024 0.008 0.000 0.964 0.000 0.004
#> SRR1351280 2 0.1765 0.7904 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR613951 4 0.0260 0.8761 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.5076 0.5398 0.000 0.000 0.236 0.636 0.004 0.124
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.1429 0.8340 0.000 0.004 0.940 0.000 0.052 0.004
#> SRR655040 2 0.3404 0.5223 0.000 0.744 0.000 0.248 0.004 0.004
#> SRR810225 6 0.2964 0.8396 0.000 0.204 0.000 0.000 0.004 0.792
#> SRR1325377 6 0.3023 0.8398 0.000 0.212 0.000 0.000 0.004 0.784
#> SRR617829 3 0.3991 0.8056 0.000 0.000 0.748 0.044 0.008 0.200
#> SRR1402328 6 0.3198 0.8378 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1480455 6 0.2102 0.7369 0.000 0.068 0.012 0.012 0.000 0.908
#> SRR1442104 3 0.2121 0.8526 0.000 0.000 0.892 0.012 0.000 0.096
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.1493 0.8317 0.000 0.004 0.936 0.000 0.056 0.004
#> SRR1414314 6 0.3198 0.8378 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR663026 2 0.3052 0.6232 0.000 0.780 0.000 0.000 0.004 0.216
#> SRR1478386 2 0.0520 0.8274 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1458683 4 0.0260 0.8745 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.1168 0.8748 0.028 0.000 0.016 0.000 0.956 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0260 0.8761 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR660260 5 0.4448 0.5899 0.000 0.000 0.052 0.252 0.688 0.008
#> SRR1071231 6 0.3405 0.8296 0.000 0.272 0.000 0.000 0.004 0.724
#> SRR1459125 4 0.1398 0.8497 0.000 0.000 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR1337173 6 0.3631 0.5104 0.000 0.000 0.168 0.032 0.012 0.788
#> SRR1396250 3 0.1364 0.8361 0.000 0.004 0.944 0.000 0.048 0.004
#> SRR2166376 3 0.3833 0.0670 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR659816 6 0.2806 0.6202 0.000 0.000 0.060 0.056 0.012 0.872
#> SRR1401379 2 0.3062 0.7791 0.000 0.836 0.000 0.000 0.052 0.112
#> SRR600981 4 0.0632 0.8740 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.5841 0.4842 0.000 0.568 0.052 0.040 0.020 0.320
#> SRR660115 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 6 0.3151 0.8405 0.000 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748
#> SRR1359780 6 0.3175 0.8391 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.3830 0.7524 0.000 0.808 0.000 0.076 0.032 0.084
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1319648 2 0.2473 0.7836 0.000 0.856 0.000 0.000 0.008 0.136
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0692 0.8209 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1468658 3 0.3867 0.8130 0.000 0.000 0.760 0.040 0.008 0.192
#> SRR1390437 4 0.0632 0.8740 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0363 0.8264 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR612635 2 0.0363 0.8272 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1351480 2 0.3911 0.3487 0.000 0.624 0.000 0.000 0.008 0.368
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 6 0.3244 0.8338 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR614263 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0458 0.8269 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR659911 6 0.3175 0.8396 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1085519 3 0.1141 0.8358 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1345894 3 0.1462 0.8376 0.000 0.000 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1442928 5 0.1152 0.8767 0.000 0.000 0.004 0.000 0.952 0.044
#> SRR1464681 4 0.0632 0.8740 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.3858 0.8139 0.000 0.000 0.760 0.032 0.012 0.196
#> SRR1365426 5 0.0665 0.8830 0.004 0.008 0.000 0.000 0.980 0.008
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 6 0.2546 0.6325 0.000 0.000 0.060 0.040 0.012 0.888
#> SRR660673 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 6 0.3383 0.8328 0.000 0.268 0.000 0.000 0.004 0.728
#> SRR663807 6 0.3175 0.8393 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1087245 2 0.0363 0.8264 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1339108 6 0.5123 0.0828 0.000 0.328 0.008 0.024 0.036 0.604
#> SRR613426 4 0.1370 0.8569 0.036 0.012 0.000 0.948 0.000 0.004
#> SRR613879 6 0.2536 0.7986 0.000 0.116 0.000 0.000 0.020 0.864
#> SRR1385101 5 0.4227 0.0285 0.488 0.008 0.000 0.004 0.500 0.000
#> SRR1387966 6 0.2854 0.8427 0.000 0.208 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1458852 6 0.1555 0.7618 0.000 0.060 0.000 0.004 0.004 0.932
#> SRR1430489 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.1816 0.8279 0.016 0.004 0.928 0.000 0.048 0.004
#> SRR1321987 6 0.2793 0.8411 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR662653 6 0.3244 0.8338 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3955 0.2910 0.000 0.608 0.000 0.000 0.008 0.384
#> SRR1383081 2 0.3101 0.5822 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR2166960 6 0.3684 0.6780 0.000 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR605101 2 0.5907 0.1535 0.000 0.436 0.000 0.000 0.212 0.352
#> SRR818600 6 0.2854 0.8413 0.000 0.208 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1367715 2 0.1387 0.8095 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1351979 3 0.1471 0.8559 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1387054 3 0.3722 0.8156 0.000 0.000 0.764 0.036 0.004 0.196
#> SRR1444306 3 0.3706 0.4562 0.000 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 6 0.3101 0.8421 0.000 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR612767 1 0.0146 0.9773 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489030 6 0.3244 0.8338 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1430375 5 0.1714 0.8443 0.000 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR615225 4 0.0547 0.8748 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1401839 5 0.1297 0.8780 0.000 0.000 0.040 0.000 0.948 0.012
#> SRR1379110 2 0.0692 0.8277 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1077288 3 0.1750 0.8286 0.008 0.004 0.928 0.000 0.056 0.004
#> SRR1331639 4 0.0713 0.8720 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1342782 5 0.0622 0.8834 0.000 0.008 0.000 0.000 0.980 0.012
#> SRR1443003 3 0.3250 0.8278 0.000 0.000 0.788 0.012 0.004 0.196
#> SRR612839 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.3252 0.8376 0.000 0.000 0.824 0.068 0.000 0.108
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.3962 0.8084 0.000 0.000 0.752 0.044 0.008 0.196
#> SRR664063 5 0.0520 0.8826 0.008 0.008 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0260 0.8761 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.3774 0.4647 0.000 0.664 0.000 0.000 0.008 0.328
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2219 0.7387 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1488470 2 0.0777 0.8271 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1389497 3 0.0937 0.8407 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1367109 3 0.3436 0.8322 0.000 0.000 0.796 0.020 0.012 0.172
#> SRR615311 1 0.0000 0.9800 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.914 0.924 0.970 0.4305 0.577 0.577
#> 3 3 0.941 0.930 0.972 0.5378 0.725 0.538
#> 4 4 0.676 0.568 0.776 0.1091 0.886 0.682
#> 5 5 0.693 0.593 0.779 0.0603 0.892 0.633
#> 6 6 0.709 0.507 0.706 0.0383 0.888 0.587
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.9635 0.3689 0.388 0.612
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.9754 0.3143 0.408 0.592
#> SRR1375439 2 0.8713 0.5865 0.292 0.708
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 1.0000 0.0119 0.504 0.496
#> SRR612227 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.7883 0.6866 0.236 0.764
#> SRR615814 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.4022 0.8934 0.080 0.920
#> SRR660164 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.7745 0.7011 0.228 0.772
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.8713 0.5880 0.708 0.292
#> SRR612683 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1355352 1 0.8443 0.6248 0.728 0.272
#> SRR656247 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.1633 0.9477 0.024 0.976
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.9552 0.4000 0.376 0.624
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.9209 0.4951 0.336 0.664
#> SRR662126 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.5519 0.8384 0.128 0.872
#> SRR810249 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.7453 0.7240 0.212 0.788
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.9754 0.3143 0.408 0.592
#> SRR661074 1 0.9491 0.4176 0.632 0.368
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.2423 0.9329 0.040 0.960
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.8763 0.5801 0.704 0.296
#> SRR1448029 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0376 0.9654 0.004 0.996
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.9866 0.2435 0.568 0.432
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.9754 0.3143 0.408 0.592
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.7219 0.7411 0.200 0.800
#> SRR656860 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.6801 0.7685 0.820 0.180
#> SRR601695 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR812773 2 0.9988 0.0869 0.480 0.520
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.8207 0.6525 0.256 0.744
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.7139 0.7463 0.804 0.196
#> SRR601387 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.9988 0.0869 0.480 0.520
#> SRR655399 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.3733 0.9013 0.072 0.928
#> SRR818901 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.7219 0.7418 0.200 0.800
#> SRR658259 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.8713 0.5880 0.708 0.292
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.4298 0.8844 0.088 0.912
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.2603 0.9292 0.044 0.956
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.9988 0.0636 0.520 0.480
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.6531 0.7880 0.168 0.832
#> SRR1456027 1 0.2236 0.9332 0.964 0.036
#> SRR1400551 2 0.9983 0.1001 0.476 0.524
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.3733 0.9013 0.072 0.928
#> SRR663284 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.3584 0.9054 0.068 0.932
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.4431 0.8808 0.092 0.908
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.8713 0.5880 0.708 0.292
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.4022 0.8931 0.080 0.920
#> SRR1432743 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR662019 2 0.9815 0.2793 0.420 0.580
#> SRR1349209 2 0.0672 0.9621 0.008 0.992
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.8713 0.5880 0.708 0.292
#> SRR615479 2 0.9977 0.1163 0.472 0.528
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.9933 0.1843 0.452 0.548
#> SRR663477 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.5178 0.8528 0.116 0.884
#> SRR614611 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.6148 0.8082 0.152 0.848
#> SRR655040 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.9129 0.5167 0.672 0.328
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.9988 0.0869 0.480 0.520
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.6712 0.7771 0.176 0.824
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.8955 0.5514 0.312 0.688
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.5408 0.8448 0.124 0.876
#> SRR613879 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.9608 0.3794 0.384 0.616
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.1414 0.9485 0.980 0.020
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.7883 0.6857 0.764 0.236
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.8813 0.5772 0.300 0.700
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9665 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 3 0.0747 0.9501 0.000 0.016 0.984
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499740 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.6244 0.2065 0.560 0.000 0.440
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0424 0.9640 0.000 0.992 0.008
#> SRR658433 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0892 0.9537 0.000 0.980 0.020
#> SRR655887 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.3879 0.8193 0.000 0.152 0.848
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 3 0.5497 0.5985 0.000 0.292 0.708
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.5785 0.4903 0.332 0.000 0.668
#> SRR613999 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.5431 0.5883 0.000 0.716 0.284
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.6204 0.2721 0.000 0.576 0.424
#> SRR660164 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.3482 0.8390 0.000 0.872 0.128
#> SRR809595 3 0.5733 0.5189 0.000 0.324 0.676
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 3 0.0424 0.9558 0.000 0.008 0.992
#> SRR1392186 2 0.0424 0.9641 0.000 0.992 0.008
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0892 0.9456 0.020 0.000 0.980
#> SRR612683 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.1031 0.9436 0.000 0.024 0.976
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0237 0.9580 0.004 0.000 0.996
#> SRR656247 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR808244 1 0.3038 0.8730 0.896 0.000 0.104
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.1031 0.9422 0.024 0.000 0.976
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.1860 0.9258 0.000 0.948 0.052
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.3116 0.8674 0.000 0.892 0.108
#> SRR1453911 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.4883 0.7316 0.208 0.788 0.004
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 3 0.6295 0.1341 0.000 0.472 0.528
#> SRR612539 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.1031 0.9508 0.000 0.976 0.024
#> SRR810249 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.6617 0.3612 0.388 0.600 0.012
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.6252 0.1941 0.000 0.444 0.556
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0892 0.9459 0.020 0.000 0.980
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.1031 0.9434 0.000 0.024 0.976
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.1031 0.9508 0.000 0.976 0.024
#> SRR612395 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR815044 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 3 0.0237 0.9582 0.000 0.004 0.996
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.5650 0.5446 0.000 0.312 0.688
#> SRR658766 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0892 0.9468 0.000 0.020 0.980
#> SRR817282 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.4002 0.8059 0.000 0.840 0.160
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.2448 0.9011 0.000 0.924 0.076
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 3 0.0237 0.9583 0.000 0.004 0.996
#> SRR820907 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 3 0.3267 0.8481 0.116 0.000 0.884
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.6305 0.0504 0.000 0.516 0.484
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.4291 0.7666 0.000 0.820 0.180
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.2165 0.9081 0.000 0.064 0.936
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.6007 0.7274 0.768 0.048 0.184
#> SRR655399 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.7905 0.0983 0.444 0.500 0.056
#> SRR818901 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.6309 0.0256 0.504 0.000 0.496
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.0424 0.9556 0.000 0.008 0.992
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0424 0.9638 0.000 0.992 0.008
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.4399 0.7707 0.000 0.188 0.812
#> SRR661469 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.1031 0.9508 0.000 0.976 0.024
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.0747 0.9576 0.000 0.984 0.016
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.3886 0.8653 0.880 0.024 0.096
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.4062 0.8042 0.000 0.164 0.836
#> SRR601671 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0424 0.9640 0.000 0.992 0.008
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.6045 0.3778 0.000 0.620 0.380
#> SRR1348040 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 3 0.2261 0.9044 0.000 0.068 0.932
#> SRR1388832 3 0.5363 0.6055 0.276 0.000 0.724
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.4002 0.7945 0.000 0.840 0.160
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0237 0.9583 0.000 0.004 0.996
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.4842 0.7054 0.000 0.776 0.224
#> SRR662019 3 0.2625 0.8842 0.084 0.000 0.916
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.3340 0.8540 0.880 0.000 0.120
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.1031 0.9436 0.000 0.024 0.976
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.1411 0.9407 0.000 0.964 0.036
#> SRR1331922 1 0.3192 0.8636 0.888 0.000 0.112
#> SRR615479 1 0.7386 0.0978 0.508 0.032 0.460
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0237 0.9668 0.000 0.996 0.004
#> SRR1356290 3 0.0237 0.9583 0.000 0.004 0.996
#> SRR659507 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 3 0.2796 0.8832 0.000 0.092 0.908
#> SRR1414727 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.1182 0.9608 0.976 0.012 0.012
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.2537 0.8941 0.000 0.080 0.920
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 3 0.3340 0.8562 0.000 0.120 0.880
#> SRR810225 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0237 0.9582 0.000 0.004 0.996
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.6008 0.4041 0.000 0.372 0.628
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR660260 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR600981 2 0.4291 0.7772 0.000 0.820 0.180
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 3 0.4452 0.7535 0.000 0.192 0.808
#> SRR660115 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0424 0.9638 0.000 0.992 0.008
#> SRR658057 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.2066 0.9160 0.000 0.940 0.060
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.6045 0.3964 0.380 0.620 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 3 0.5465 0.6053 0.000 0.288 0.712
#> SRR613426 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.0237 0.9669 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385101 1 0.6553 0.2664 0.580 0.412 0.008
#> SRR1387966 2 0.6244 0.1859 0.000 0.560 0.440
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.5905 0.4563 0.352 0.000 0.648
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0237 0.9582 0.000 0.004 0.996
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.0424 0.9557 0.000 0.008 0.992
#> SRR615225 3 0.1031 0.9436 0.000 0.024 0.976
#> SRR1401839 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.3752 0.8167 0.144 0.000 0.856
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.4178 0.7900 0.000 0.828 0.172
#> SRR1443003 3 0.5178 0.6546 0.000 0.256 0.744
#> SRR612839 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0424 0.9558 0.000 0.008 0.992
#> SRR664063 2 0.7323 0.6455 0.196 0.700 0.104
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9696 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9607 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9806 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380716 2 0.0336 0.7568 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612803 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0657 0.9538 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1074359 4 0.6083 -0.0817 0.000 0.056 0.360 0.584
#> SRR1419258 3 0.3219 0.4863 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1403366 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR665262 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1499740 3 0.4543 0.6553 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1105057 2 0.0921 0.7577 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR612215 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0524 0.9584 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1409263 3 0.7441 0.2852 0.352 0.000 0.468 0.180
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.4193 0.6906 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR614839 2 0.4981 0.5316 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR658433 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088581 4 0.4998 -0.3494 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1328797 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334512 4 0.4804 -0.1941 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.4500 0.6537 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR654802 3 0.0188 0.6211 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660066 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.4543 0.6553 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1402153 4 0.7920 -0.1371 0.000 0.340 0.316 0.344
#> SRR655887 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408529 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR658707 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 4 0.5354 0.1852 0.000 0.232 0.056 0.712
#> SRR1074670 3 0.4522 0.6505 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1375439 3 0.4522 0.6568 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1329003 1 0.3649 0.7743 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1404837 4 0.3907 0.2609 0.000 0.032 0.140 0.828
#> SRR1317920 1 0.2589 0.8694 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1455525 3 0.7866 0.1784 0.276 0.000 0.376 0.348
#> SRR613999 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1068855 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375509 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 3 0.4585 0.6394 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1388809 2 0.0592 0.7569 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1413872 4 0.4697 -0.1613 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1452864 1 0.3649 0.7727 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1473078 3 0.4585 0.6502 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR615814 2 0.5687 0.4180 0.000 0.684 0.248 0.068
#> SRR1325225 1 0.3266 0.8142 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1313687 2 0.0188 0.7551 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358220 2 0.0336 0.7572 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1096662 4 0.4624 -0.1199 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.7884 -0.2268 0.000 0.304 0.384 0.312
#> SRR660164 2 0.4967 0.5383 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR815783 2 0.4807 0.4996 0.000 0.728 0.248 0.024
#> SRR809595 3 0.6110 0.5446 0.000 0.100 0.660 0.240
#> SRR1403133 2 0.0592 0.7570 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR815470 2 0.3873 0.6283 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1478362 4 0.5271 -0.1205 0.000 0.024 0.320 0.656
#> SRR1392186 4 0.4999 -0.4701 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1354270 4 0.5600 -0.3485 0.020 0.000 0.468 0.512
#> SRR612683 2 0.3873 0.6661 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1392901 3 0.0657 0.6146 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1077805 3 0.7325 0.1097 0.000 0.264 0.528 0.208
#> SRR1360402 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.4522 0.6568 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1355352 3 0.4522 0.6568 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR656247 1 0.0469 0.9561 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR813656 2 0.4981 0.5316 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR808244 1 0.4472 0.7349 0.760 0.000 0.020 0.220
#> SRR1387240 2 0.3444 0.6677 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1408595 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1385277 4 0.1938 0.3109 0.012 0.000 0.052 0.936
#> SRR1435248 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1408682 2 0.4562 0.5252 0.000 0.764 0.208 0.028
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.4781 -0.1065 0.000 0.336 0.004 0.660
#> SRR1453911 4 0.5167 -0.4005 0.000 0.004 0.488 0.508
#> SRR603164 3 0.7456 0.3715 0.000 0.200 0.492 0.308
#> SRR1383259 2 0.4304 0.6825 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4382 0.6782 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2704 0.5310 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1361546 2 0.5422 0.5016 0.040 0.740 0.200 0.020
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3486 0.6652 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR615635 2 0.0707 0.7572 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1385411 2 0.3801 0.7032 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR662126 4 0.4585 -0.1067 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1464601 2 0.0188 0.7545 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071594 2 0.6498 0.0500 0.000 0.488 0.072 0.440
#> SRR612539 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR602010 2 0.7363 0.4143 0.000 0.516 0.200 0.284
#> SRR810249 2 0.0921 0.7576 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR818773 4 0.8521 -0.1252 0.040 0.316 0.208 0.436
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4972 0.5360 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0592 0.6170 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR661639 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 4 0.7285 0.1627 0.000 0.180 0.300 0.520
#> SRR1459937 4 0.4998 -0.3491 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR2185018 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR655732 2 0.4222 0.6880 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR809348 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR819261 3 0.4522 0.6506 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR661074 3 0.7357 0.4687 0.180 0.000 0.500 0.320
#> SRR1349851 1 0.3649 0.7727 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1405123 4 0.4564 -0.0991 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR661096 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.2973 0.8438 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1307677 2 0.3356 0.6780 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1466512 2 0.4250 0.6862 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR658212 2 0.2408 0.7226 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1430525 3 0.0188 0.6211 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344422 4 0.5163 -0.3434 0.000 0.004 0.480 0.516
#> SRR1353924 2 0.4250 0.6862 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1314832 1 0.0524 0.9584 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1487570 1 0.3311 0.8098 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR627431 2 0.4941 0.5611 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1418561 4 0.4996 -0.3460 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1448029 3 0.4103 0.6587 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR813802 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0336 0.7554 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435311 2 0.4428 0.6830 0.000 0.720 0.004 0.276
#> SRR612395 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR603116 2 0.4283 0.6628 0.000 0.740 0.004 0.256
#> SRR1323152 3 0.4564 0.6429 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1368264 2 0.7380 0.4102 0.000 0.512 0.200 0.288
#> SRR1326624 1 0.2408 0.8805 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1429265 3 0.4699 0.6559 0.004 0.000 0.676 0.320
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.4977 0.5337 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.4585 -0.1038 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR815044 4 0.4830 -0.2430 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1338560 2 0.4164 0.6901 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR615862 2 0.4250 0.6862 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1480038 2 0.4250 0.6844 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR659436 3 0.4543 0.6553 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR613699 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4925 0.5742 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1330327 4 0.1406 0.3329 0.000 0.016 0.024 0.960
#> SRR1489950 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.4999 -0.3519 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR600656 4 0.3176 0.3742 0.000 0.084 0.036 0.880
#> SRR658766 4 0.4998 -0.3484 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR655946 3 0.5910 0.3230 0.000 0.104 0.688 0.208
#> SRR817282 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0469 0.6188 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 4 0.7598 -0.1349 0.000 0.324 0.216 0.460
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 4 0.4830 -0.2432 0.000 0.000 0.392 0.608
#> SRR662498 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1376764 2 0.5000 0.0801 0.000 0.504 0.496 0.000
#> SRR1377006 4 0.4999 -0.3519 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR656860 2 0.4981 0.5318 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1480547 2 0.4222 0.6878 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1452515 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1324390 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0592 0.9535 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR601695 4 0.5510 -0.3824 0.000 0.016 0.480 0.504
#> SRR820907 2 0.1716 0.7548 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR812773 4 0.6637 -0.1064 0.092 0.000 0.368 0.540
#> SRR1405984 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1472794 2 0.3569 0.6668 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.3791 0.3949 0.000 0.004 0.796 0.200
#> SRR1435626 3 0.4522 0.6568 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1080766 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332299 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.4994 0.3978 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1320579 3 0.3219 0.4863 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1319710 2 0.4746 0.6307 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1326604 2 0.4977 0.5355 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1098879 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662245 2 0.6835 0.1721 0.000 0.592 0.252 0.156
#> SRR1074719 2 0.0336 0.7572 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR816226 1 0.3688 0.7685 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR601387 2 0.0188 0.7563 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614575 2 0.4250 0.6862 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1353900 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662906 2 0.4769 0.3872 0.000 0.684 0.308 0.008
#> SRR1350832 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403280 2 0.0469 0.7570 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1313969 4 0.3870 0.1011 0.000 0.004 0.208 0.788
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.5755 -0.1195 0.444 0.000 0.028 0.528
#> SRR655399 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 4 0.6086 0.1764 0.188 0.132 0.000 0.680
#> SRR818901 3 0.3583 0.4261 0.000 0.004 0.816 0.180
#> SRR607067 4 0.4564 -0.0921 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4967 0.5394 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR661961 3 0.4543 0.6553 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR658259 2 0.4981 0.5285 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.3444 0.6677 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1365034 4 0.4830 -0.2487 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1478053 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1475300 2 0.4222 0.6866 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1328101 3 0.4792 0.6545 0.000 0.008 0.680 0.312
#> SRR1322900 1 0.7894 -0.2702 0.372 0.000 0.332 0.296
#> SRR1309942 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.1022 0.3285 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4661 -0.1237 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.7740 0.2910 0.000 0.248 0.432 0.320
#> SRR661469 3 0.4543 0.6553 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1500323 2 0.0524 0.7525 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1356705 2 0.5827 0.4470 0.000 0.532 0.032 0.436
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 4 0.4994 -0.3543 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1350435 1 0.2647 0.8650 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1389177 3 0.0336 0.6204 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1368072 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.4998 -0.3484 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1318839 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.4477 0.6699 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR613126 2 0.0592 0.7570 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1089424 2 0.0336 0.7572 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1347214 2 0.0921 0.7576 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1309556 4 0.4998 -0.3484 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1456027 1 0.5408 0.2416 0.500 0.000 0.012 0.488
#> SRR1400551 3 0.4522 0.6568 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.3610 0.6669 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1454310 2 0.0592 0.7534 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615105 4 0.5165 -0.3477 0.000 0.004 0.484 0.512
#> SRR1433290 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.1624 0.3532 0.000 0.028 0.020 0.952
#> SRR601671 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR663874 2 0.0707 0.7569 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1409130 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659696 2 0.4843 0.3680 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1408249 2 0.4331 0.6806 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR663284 2 0.4855 0.6039 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1402794 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR614852 4 0.4468 0.1591 0.000 0.232 0.016 0.752
#> SRR1348040 4 0.4992 -0.3509 0.000 0.000 0.476 0.524
#> SRR1489610 2 0.4916 0.5782 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1488091 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.4431 0.6682 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1361480 4 0.4855 -0.2303 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1444501 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415773 4 0.4994 -0.3409 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1388832 4 0.7188 -0.2141 0.164 0.000 0.308 0.528
#> SRR1394637 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR606974 2 0.4608 0.5187 0.000 0.692 0.004 0.304
#> SRR662918 2 0.3649 0.6655 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR817421 3 0.0336 0.6208 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1637 0.7464 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR608264 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 4 0.4948 -0.3293 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1312684 1 0.1637 0.9199 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR615044 4 0.4996 -0.3577 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1432743 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1388873 2 0.0188 0.7562 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.4522 0.6564 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1406008 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1396786 2 0.0469 0.7524 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1446564 1 0.3356 0.8054 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1318465 3 0.5040 0.1959 0.000 0.008 0.628 0.364
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4730 -0.1855 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR655170 2 0.4679 0.4304 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1087825 4 0.4999 -0.0725 0.000 0.328 0.012 0.660
#> SRR662019 3 0.7395 0.4499 0.176 0.000 0.480 0.344
#> SRR1349209 4 0.4999 -0.3519 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1326161 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345284 2 0.4250 0.6844 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1454328 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.4364 0.7395 0.764 0.000 0.016 0.220
#> SRR1408183 3 0.4454 0.6579 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1084369 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 4 0.4998 -0.3484 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR809444 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1089901 2 0.0188 0.7551 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375774 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326292 1 0.3649 0.7743 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR657139 1 0.0469 0.9561 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1440744 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.1356 0.3301 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR1381775 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.4454 0.6699 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR658989 3 0.4985 0.4240 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1353663 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811771 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR813983 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.1716 0.5866 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR819054 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.7395 -0.1879 0.000 0.344 0.176 0.480
#> SRR1331922 1 0.4364 0.7400 0.764 0.000 0.016 0.220
#> SRR615479 4 0.7899 0.0695 0.360 0.004 0.232 0.404
#> SRR1375796 2 0.3610 0.6669 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1386991 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1355217 2 0.5747 0.5324 0.000 0.704 0.196 0.100
#> SRR1356290 3 0.5696 0.4011 0.000 0.024 0.496 0.480
#> SRR659507 3 0.4792 0.6545 0.000 0.008 0.680 0.312
#> SRR663296 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR598044 2 0.2345 0.7480 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR661155 4 0.2593 0.2690 0.000 0.004 0.104 0.892
#> SRR1414727 3 0.4543 0.6553 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR663477 1 0.2921 0.8448 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1354489 3 0.0336 0.6193 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1377800 3 0.4522 0.6568 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR614611 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655052 4 0.1792 0.3035 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1478968 1 0.3982 0.7507 0.776 0.000 0.004 0.220
#> SRR1351280 4 0.5000 -0.4694 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR613951 4 0.4193 -0.0277 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.4999 -0.3519 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.4543 0.6469 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR655040 4 0.0707 0.3364 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR810225 2 0.4164 0.6901 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1325377 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.4831 0.3262 0.000 0.016 0.704 0.280
#> SRR1402328 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480455 2 0.3311 0.6776 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1442104 3 0.2329 0.5515 0.000 0.072 0.916 0.012
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0469 0.6188 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1414314 2 0.2281 0.7257 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR663026 2 0.0469 0.7570 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1478386 2 0.4222 0.6866 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1458683 3 0.7566 -0.0771 0.000 0.192 0.416 0.392
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.6924 0.2699 0.000 0.124 0.536 0.340
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.4992 0.4025 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR660260 4 0.7506 -0.1417 0.000 0.208 0.308 0.484
#> SRR1071231 2 0.3975 0.7031 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1459125 4 0.4998 -0.3484 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1337173 3 0.4837 0.6195 0.000 0.004 0.648 0.348
#> SRR1396250 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 4 0.4999 -0.4048 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR659816 4 0.4998 -0.3484 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1401379 2 0.4925 0.5739 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR600981 4 0.5888 -0.2620 0.000 0.424 0.036 0.540
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.3870 0.1331 0.000 0.004 0.208 0.788
#> SRR660115 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4830 0.6065 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0469 0.7569 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1319648 4 0.4994 -0.4490 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.4277 0.6841 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1468658 4 0.4998 -0.3494 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1390437 4 0.4699 -0.0814 0.000 0.320 0.004 0.676
#> SRR658057 2 0.4981 0.5316 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR612635 2 0.4898 0.5866 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1351480 2 0.4134 0.6919 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0469 0.9561 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659590 2 0.3688 0.5761 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR614263 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3907 0.7061 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR659911 2 0.0000 0.7559 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0657 0.6145 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1442928 3 0.4477 0.6570 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1464681 4 0.4814 -0.0728 0.000 0.316 0.008 0.676
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 4 0.4999 -0.3519 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1365426 4 0.9158 -0.1034 0.092 0.304 0.200 0.404
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0469 0.9561 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR603236 3 0.4999 0.4251 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR660673 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663807 2 0.0188 0.7559 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1087245 2 0.3907 0.6412 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1339108 4 0.1833 0.3478 0.000 0.024 0.032 0.944
#> SRR613426 4 0.1557 0.3133 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR613879 2 0.4961 0.5419 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1385101 4 0.8640 0.1096 0.376 0.140 0.072 0.412
#> SRR1387966 2 0.5168 0.0978 0.000 0.500 0.004 0.496
#> SRR1458852 2 0.0469 0.7569 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1430489 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1349231 1 0.0469 0.9561 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1376249 3 0.5110 0.2519 0.352 0.000 0.636 0.012
#> SRR1321987 2 0.0188 0.7562 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662653 2 0.0336 0.7567 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.4103 0.6954 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1383081 2 0.3123 0.7003 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR2166960 2 0.0707 0.7561 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR605101 2 0.4250 0.6844 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR818600 2 0.4972 0.5378 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1367715 2 0.4967 0.5411 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1351979 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.7337 0.1059 0.000 0.272 0.524 0.204
#> SRR1444306 3 0.0469 0.6188 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3486 0.6674 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR612767 1 0.0336 0.9601 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489030 2 0.0817 0.7570 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1430375 4 0.5406 -0.3912 0.000 0.012 0.480 0.508
#> SRR615225 4 0.4560 -0.0688 0.000 0.004 0.296 0.700
#> SRR1401839 3 0.4790 0.5804 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1379110 2 0.4222 0.6875 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1077288 3 0.7468 0.4510 0.196 0.000 0.484 0.320
#> SRR1331639 4 0.4977 -0.2549 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1342782 2 0.7004 0.3460 0.000 0.580 0.220 0.200
#> SRR1443003 3 0.5193 0.1090 0.000 0.412 0.580 0.008
#> SRR612839 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0188 0.6214 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.5599 0.1787 0.000 0.032 0.616 0.352
#> SRR664063 4 0.8481 -0.1329 0.036 0.320 0.212 0.432
#> SRR1488214 1 0.2469 0.8773 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR654766 2 0.6197 0.4388 0.000 0.508 0.052 0.440
#> SRR1320321 2 0.4222 0.6866 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9634 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3528 0.6685 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1488470 2 0.4250 0.6860 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1389497 3 0.0000 0.6232 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 4 0.4999 -0.3519 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR615311 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.1270 0.67027 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1380716 2 0.1341 0.67150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.2953 0.81517 0.844 0.000 0.012 0.000 0.144
#> SRR1074359 3 0.7508 0.36791 0.000 0.144 0.500 0.252 0.104
#> SRR1419258 5 0.4288 0.60627 0.000 0.000 0.384 0.004 0.612
#> SRR1403366 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR665262 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1499740 3 0.4182 0.62532 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1105057 2 0.2280 0.65999 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR612215 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1094051 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.6707 0.57239 0.604 0.000 0.188 0.136 0.072
#> SRR1409263 3 0.5472 0.48209 0.140 0.000 0.652 0.000 0.208
#> SRR1431288 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.4088 0.42350 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR614839 4 0.3305 0.55623 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR658433 2 0.1197 0.67126 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1088581 3 0.3718 0.63755 0.000 0.004 0.784 0.196 0.016
#> SRR1328797 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1334512 4 0.3838 0.53735 0.000 0.280 0.004 0.716 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0794 0.68501 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR654802 5 0.4166 0.61649 0.000 0.000 0.348 0.004 0.648
#> SRR660066 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.4182 0.62532 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1402153 5 0.6411 0.19362 0.000 0.196 0.000 0.312 0.492
#> SRR655887 2 0.1608 0.66527 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1408529 3 0.3336 0.69338 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR658707 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 4 0.6619 0.28661 0.000 0.224 0.256 0.512 0.008
#> SRR1074670 3 0.0794 0.68501 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1375439 3 0.4171 0.62792 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1329003 1 0.4178 0.78601 0.748 0.000 0.028 0.220 0.004
#> SRR1404837 4 0.6414 0.22014 0.000 0.084 0.384 0.500 0.032
#> SRR1317920 1 0.3354 0.85437 0.832 0.000 0.024 0.140 0.004
#> SRR1455525 3 0.5795 0.25551 0.140 0.000 0.636 0.216 0.008
#> SRR613999 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.3177 0.69747 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1068855 1 0.3124 0.86210 0.844 0.000 0.016 0.136 0.004
#> SRR1375509 5 0.4088 0.61165 0.000 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR612227 3 0.0703 0.68509 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1388809 2 0.2179 0.66139 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1413872 4 0.2471 0.57970 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1452864 1 0.3441 0.85142 0.828 0.000 0.028 0.140 0.004
#> SRR1473078 3 0.3143 0.64204 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR615814 2 0.6056 0.29635 0.000 0.576 0.292 0.124 0.008
#> SRR1325225 1 0.3441 0.85142 0.828 0.000 0.028 0.140 0.004
#> SRR1313687 2 0.0609 0.67374 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1358220 2 0.0290 0.67138 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1096662 4 0.3266 0.57180 0.000 0.200 0.004 0.796 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.7538 -0.27618 0.000 0.304 0.044 0.252 0.400
#> SRR660164 4 0.3707 0.54489 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR815783 2 0.4990 0.38168 0.000 0.688 0.248 0.056 0.008
#> SRR809595 5 0.7391 -0.41548 0.000 0.080 0.400 0.120 0.400
#> SRR1403133 2 0.1121 0.66608 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR815470 2 0.4210 0.04120 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3333 0.69785 0.000 0.000 0.788 0.004 0.208
#> SRR1478362 3 0.5265 0.54062 0.000 0.096 0.656 0.248 0.000
#> SRR1392186 4 0.4599 0.55014 0.000 0.272 0.000 0.688 0.040
#> SRR1347937 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0794 0.92677 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1471594 1 0.3124 0.86210 0.844 0.000 0.016 0.136 0.004
#> SRR1354270 3 0.5156 0.50954 0.020 0.000 0.728 0.140 0.112
#> SRR612683 2 0.4283 -0.06373 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1392901 5 0.3264 0.60236 0.000 0.000 0.164 0.016 0.820
#> SRR1077805 5 0.6424 0.58631 0.000 0.056 0.260 0.088 0.596
#> SRR1360402 2 0.0794 0.67201 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1406112 3 0.4161 0.62771 0.000 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1355352 3 0.4182 0.62532 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR656247 1 0.2930 0.80030 0.832 0.000 0.004 0.000 0.164
#> SRR813656 4 0.3689 0.54063 0.000 0.256 0.000 0.740 0.004
#> SRR808244 1 0.7896 0.30152 0.444 0.000 0.232 0.216 0.108
#> SRR1387240 2 0.4161 0.06033 0.000 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1408595 1 0.3124 0.86210 0.844 0.000 0.016 0.136 0.004
#> SRR1385277 4 0.4537 0.36992 0.000 0.000 0.076 0.740 0.184
#> SRR1435248 2 0.0880 0.67359 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1419110 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1408682 2 0.4268 0.31197 0.000 0.648 0.008 0.000 0.344
#> SRR1317134 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.4979 0.57127 0.000 0.228 0.064 0.700 0.008
#> SRR1453911 3 0.6505 0.33943 0.000 0.004 0.440 0.392 0.164
#> SRR603164 3 0.1704 0.67168 0.000 0.068 0.928 0.000 0.004
#> SRR1383259 2 0.4297 0.28234 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4192 0.35623 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.3160 0.60114 0.000 0.000 0.188 0.004 0.808
#> SRR1361546 2 0.4480 0.26318 0.004 0.592 0.004 0.000 0.400
#> SRR1486156 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.4171 0.05350 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR615635 2 0.2280 0.65893 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1385411 2 0.4283 0.09520 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0794 0.68501 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR662126 4 0.3596 0.56746 0.000 0.212 0.012 0.776 0.000
#> SRR1464601 2 0.0162 0.66900 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071594 4 0.6622 0.22798 0.000 0.328 0.232 0.440 0.000
#> SRR612539 2 0.4210 0.36082 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR602010 5 0.6845 -0.29775 0.000 0.348 0.004 0.248 0.400
#> SRR810249 2 0.2424 0.65522 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR818773 5 0.6798 -0.36462 0.004 0.192 0.004 0.400 0.400
#> SRR1336569 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 4 0.3774 0.53649 0.000 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 5 0.0290 0.53278 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR661639 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.6467 -0.09775 0.000 0.140 0.428 0.424 0.008
#> SRR1459937 3 0.0290 0.68201 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2185018 1 0.2471 0.87331 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR655732 2 0.4060 0.42417 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR809348 1 0.2864 0.86679 0.852 0.000 0.012 0.136 0.000
#> SRR819261 3 0.0703 0.68509 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR661074 3 0.3650 0.63217 0.028 0.000 0.796 0.000 0.176
#> SRR1349851 1 0.3441 0.85142 0.828 0.000 0.028 0.140 0.004
#> SRR1405123 4 0.2358 0.56423 0.000 0.104 0.008 0.888 0.000
#> SRR661096 2 0.4088 0.41399 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.3883 0.80176 0.764 0.000 0.016 0.216 0.004
#> SRR1307677 2 0.4273 0.05710 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1466512 2 0.4138 0.40523 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR658212 2 0.3586 0.46418 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1430525 5 0.3123 0.60324 0.000 0.000 0.184 0.004 0.812
#> SRR1344422 3 0.3398 0.52022 0.000 0.000 0.780 0.216 0.004
#> SRR1353924 2 0.4074 0.41924 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1314832 1 0.3551 0.84695 0.820 0.000 0.044 0.136 0.000
#> SRR1487570 1 0.3441 0.85142 0.828 0.000 0.028 0.140 0.004
#> SRR627431 4 0.4278 0.24382 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1418561 3 0.2629 0.55216 0.000 0.000 0.860 0.136 0.004
#> SRR1448029 3 0.3796 0.62233 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR813802 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1671 0.66452 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1435311 2 0.3876 0.42553 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR612395 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR603116 2 0.4641 -0.07397 0.000 0.532 0.000 0.456 0.012
#> SRR1323152 3 0.0880 0.68304 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1368264 5 0.6853 -0.29988 0.000 0.344 0.004 0.252 0.400
#> SRR1326624 1 0.3310 0.85717 0.836 0.000 0.024 0.136 0.004
#> SRR1429265 3 0.3143 0.64204 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1327702 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.3305 0.55623 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.3396 0.54354 0.000 0.136 0.028 0.832 0.004
#> SRR815044 4 0.3661 0.54874 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1338560 2 0.3816 0.43967 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR615862 2 0.4171 0.38901 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1480038 2 0.3876 0.42553 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR659436 3 0.4182 0.62532 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR613699 2 0.0609 0.66761 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.4182 0.21942 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1330327 4 0.4402 0.48540 0.000 0.056 0.204 0.740 0.000
#> SRR1489950 2 0.0404 0.67277 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.3274 0.69378 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1444002 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0510 0.68261 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR600656 4 0.4505 0.54546 0.000 0.068 0.176 0.752 0.004
#> SRR658766 3 0.3427 0.64033 0.000 0.000 0.796 0.192 0.012
#> SRR655946 5 0.6411 0.48517 0.000 0.064 0.076 0.264 0.596
#> SRR817282 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 5 0.3143 0.55535 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1406418 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 4 0.6658 0.33693 0.000 0.192 0.004 0.404 0.400
#> SRR1471965 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4755 0.60634 0.000 0.000 0.696 0.244 0.060
#> SRR662498 3 0.3461 0.69399 0.000 0.004 0.772 0.000 0.224
#> SRR1376764 5 0.3039 0.55165 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1377006 3 0.0000 0.68149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656860 4 0.3274 0.55858 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1480547 2 0.4114 0.41319 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1452515 3 0.3336 0.69338 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1324390 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.3048 0.78652 0.820 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR601695 3 0.6209 0.32537 0.000 0.060 0.508 0.396 0.036
#> SRR820907 2 0.1671 0.65600 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR812773 4 0.8256 0.01003 0.196 0.000 0.164 0.392 0.248
#> SRR1405984 2 0.4060 0.42164 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1472794 2 0.4182 0.08497 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 5 0.3561 0.44067 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1435626 3 0.4182 0.62532 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1080766 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.3031 0.86725 0.852 0.000 0.016 0.128 0.004
#> SRR1332299 5 0.2929 0.59805 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1467966 3 0.0609 0.68222 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1320579 5 0.3578 0.60940 0.000 0.004 0.204 0.008 0.784
#> SRR1319710 4 0.4306 -0.07684 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1326604 4 0.3305 0.55623 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR1098879 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR662245 2 0.5192 0.16445 0.000 0.572 0.388 0.032 0.008
#> SRR1074719 2 0.0290 0.67138 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR816226 1 0.4211 0.82785 0.792 0.000 0.032 0.148 0.028
#> SRR601387 2 0.0290 0.67218 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR614575 2 0.4138 0.40523 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1353900 2 0.1410 0.66894 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR662906 2 0.5434 0.23227 0.000 0.588 0.000 0.076 0.336
#> SRR1350832 2 0.1270 0.67027 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1403280 2 0.1732 0.66502 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1313969 4 0.4595 0.01488 0.000 0.004 0.400 0.588 0.008
#> SRR1388528 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.7573 -0.04024 0.356 0.000 0.064 0.400 0.180
#> SRR655399 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1319753 4 0.3721 0.53858 0.036 0.020 0.012 0.848 0.084
#> SRR818901 5 0.0162 0.53570 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR607067 4 0.4679 0.56225 0.000 0.260 0.012 0.700 0.028
#> SRR1391420 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.3684 0.54728 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR661961 3 0.4182 0.62532 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR658259 4 0.3684 0.54688 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4150 0.06869 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1365034 4 0.3366 0.56429 0.000 0.212 0.004 0.784 0.000
#> SRR1478053 2 0.1608 0.66527 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1475300 2 0.3857 0.43082 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1328101 3 0.3582 0.69253 0.000 0.008 0.768 0.000 0.224
#> SRR1322900 3 0.7038 0.28152 0.324 0.000 0.444 0.020 0.212
#> SRR1309942 2 0.1121 0.67244 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1345760 4 0.2773 0.47048 0.000 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.3700 0.55572 0.000 0.240 0.008 0.752 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.5036 0.42689 0.000 0.320 0.628 0.052 0.000
#> SRR661469 3 0.4182 0.62532 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1500323 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.5307 0.30801 0.000 0.592 0.008 0.356 0.044
#> SRR1464915 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.2891 0.63705 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1350435 1 0.3310 0.85717 0.836 0.000 0.024 0.136 0.004
#> SRR1389177 5 0.3048 0.59977 0.000 0.000 0.176 0.004 0.820
#> SRR1368072 2 0.0290 0.67091 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.3455 0.63208 0.000 0.000 0.784 0.208 0.008
#> SRR1394190 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1318839 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1432390 2 0.4262 0.24718 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR613126 2 0.1430 0.66432 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1089424 2 0.0290 0.67138 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347214 2 0.2377 0.65677 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1309556 3 0.0162 0.68243 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1456027 4 0.5944 0.14270 0.312 0.000 0.116 0.568 0.004
#> SRR1400551 3 0.3143 0.64204 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1320469 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.4287 -0.03189 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1454310 2 0.1544 0.66698 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR615105 3 0.2690 0.65595 0.000 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1433290 5 0.3003 0.60181 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR2166064 4 0.2777 0.56784 0.000 0.016 0.120 0.864 0.000
#> SRR601671 2 0.4138 0.40523 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR663874 2 0.2020 0.66385 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.4262 0.12131 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1408249 4 0.4552 -0.18701 0.000 0.468 0.008 0.524 0.000
#> SRR663284 4 0.3949 0.38822 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1402794 3 0.0794 0.68501 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR614852 4 0.3779 0.56988 0.000 0.200 0.024 0.776 0.000
#> SRR1348040 3 0.5700 0.59733 0.000 0.000 0.628 0.176 0.196
#> SRR1489610 4 0.4201 0.23253 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.4088 0.41702 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1361480 4 0.4390 0.12101 0.000 0.428 0.004 0.568 0.000
#> SRR1444501 5 0.3003 0.60181 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1415773 3 0.3607 0.61254 0.000 0.000 0.752 0.244 0.004
#> SRR1388832 3 0.6441 0.50580 0.160 0.000 0.612 0.040 0.188
#> SRR1394637 1 0.2407 0.89208 0.896 0.000 0.012 0.088 0.004
#> SRR606974 2 0.4242 0.01363 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR662918 2 0.4300 -0.00575 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR817421 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1400823 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2929 0.59066 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR608264 5 0.4101 0.61164 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1318560 1 0.0162 0.93575 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454117 4 0.4280 0.52580 0.000 0.312 0.004 0.676 0.008
#> SRR1312684 1 0.3219 0.85963 0.840 0.000 0.020 0.136 0.004
#> SRR615044 3 0.3579 0.69989 0.000 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1432743 3 0.3461 0.69474 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR1388873 2 0.0794 0.67425 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.3999 0.65848 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1406008 2 0.4088 0.41399 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1396786 2 0.1830 0.66497 0.000 0.924 0.008 0.068 0.000
#> SRR1446564 1 0.3441 0.85142 0.828 0.000 0.028 0.140 0.004
#> SRR1318465 5 0.6385 0.46410 0.000 0.052 0.088 0.264 0.596
#> SRR1431083 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.3353 0.56966 0.000 0.196 0.008 0.796 0.000
#> SRR655170 2 0.4341 0.17856 0.000 0.592 0.004 0.404 0.000
#> SRR1087825 4 0.3951 0.37702 0.000 0.028 0.192 0.776 0.004
#> SRR662019 3 0.3318 0.63270 0.012 0.000 0.808 0.000 0.180
#> SRR1349209 3 0.0290 0.68201 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1326161 2 0.1270 0.67027 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1345284 2 0.3857 0.43082 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.4074 0.41924 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.6059 0.66963 0.648 0.000 0.032 0.140 0.180
#> SRR1408183 3 0.0880 0.68304 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1084369 5 0.3003 0.60181 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR598452 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR660709 3 0.0880 0.68429 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR809444 1 0.3124 0.86210 0.844 0.000 0.016 0.136 0.004
#> SRR1089901 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.3152 0.88050 0.872 0.000 0.016 0.048 0.064
#> SRR1326292 1 0.4178 0.78601 0.748 0.000 0.028 0.220 0.004
#> SRR657139 1 0.2890 0.80480 0.836 0.000 0.004 0.000 0.160
#> SRR1440744 2 0.4138 0.40275 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.3934 0.49512 0.000 0.016 0.244 0.740 0.000
#> SRR1381775 1 0.3459 0.85684 0.832 0.000 0.016 0.136 0.016
#> SRR1363908 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.4074 0.33193 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR658989 3 0.0609 0.68471 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1353663 1 0.3124 0.86210 0.844 0.000 0.016 0.136 0.004
#> SRR811771 1 0.1851 0.89961 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 5 0.4126 0.60896 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR819054 2 0.0703 0.67422 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1367988 4 0.6935 0.15118 0.000 0.340 0.004 0.364 0.292
#> SRR1331922 1 0.6367 0.64885 0.632 0.000 0.052 0.140 0.176
#> SRR615479 5 0.7962 -0.03042 0.120 0.000 0.164 0.316 0.400
#> SRR1375796 2 0.4273 -0.02047 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1386991 3 0.3305 0.69465 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1355217 2 0.5409 0.27428 0.000 0.600 0.004 0.064 0.332
#> SRR1356290 3 0.5733 0.45148 0.000 0.036 0.580 0.348 0.036
#> SRR659507 3 0.3582 0.69253 0.000 0.008 0.768 0.000 0.224
#> SRR663296 1 0.1121 0.92012 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR598044 2 0.3013 0.61699 0.000 0.832 0.000 0.160 0.008
#> SRR661155 4 0.3452 0.45492 0.000 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1414727 3 0.3612 0.65269 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR663477 1 0.3310 0.85717 0.836 0.000 0.024 0.136 0.004
#> SRR1354489 5 0.3521 0.60141 0.000 0.040 0.140 0.000 0.820
#> SRR1377800 3 0.4161 0.62900 0.000 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR614611 2 0.1608 0.66527 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR655052 4 0.4182 0.32670 0.000 0.004 0.352 0.644 0.000
#> SRR1478968 1 0.4775 0.68114 0.660 0.000 0.032 0.304 0.004
#> SRR1351280 4 0.3636 0.55124 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR613951 4 0.3774 0.13405 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0290 0.68201 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0794 0.68501 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR655040 4 0.2233 0.54994 0.000 0.000 0.104 0.892 0.004
#> SRR810225 2 0.3837 0.43459 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR617829 5 0.6479 0.50622 0.000 0.044 0.120 0.240 0.596
#> SRR1402328 2 0.1043 0.67276 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1480455 2 0.3561 0.34649 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1442104 5 0.5057 0.60716 0.000 0.004 0.356 0.036 0.604
#> SRR1453416 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 5 0.3143 0.55535 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1414314 2 0.2732 0.54493 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR663026 2 0.1732 0.66502 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1478386 2 0.3857 0.43082 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1458683 5 0.6399 0.54389 0.000 0.000 0.308 0.196 0.496
#> SRR1370572 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.7471 -0.27547 0.000 0.040 0.320 0.240 0.400
#> SRR1310735 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.4425 0.33084 0.000 0.600 0.008 0.392 0.000
#> SRR660260 3 0.8408 0.19048 0.000 0.204 0.348 0.268 0.180
#> SRR1071231 2 0.3661 0.47874 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1459125 3 0.3391 0.63965 0.000 0.000 0.800 0.188 0.012
#> SRR1337173 3 0.3985 0.64031 0.000 0.004 0.772 0.196 0.028
#> SRR1396250 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR2166376 3 0.6384 0.35177 0.000 0.000 0.444 0.388 0.168
#> SRR659816 3 0.3455 0.63208 0.000 0.000 0.784 0.208 0.008
#> SRR1401379 4 0.4192 0.24449 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR600981 4 0.5341 0.20844 0.000 0.356 0.064 0.580 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.4557 0.12341 0.000 0.012 0.404 0.584 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.4305 0.05907 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1197 0.66482 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1319648 4 0.3398 0.56180 0.000 0.216 0.004 0.780 0.000
#> SRR1092985 1 0.0324 0.93478 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR656409 4 0.4307 -0.23961 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1468658 3 0.0898 0.68256 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1390437 4 0.2919 0.56183 0.000 0.104 0.024 0.868 0.004
#> SRR658057 4 0.3305 0.55623 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR612635 4 0.4114 0.28598 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1351480 2 0.3636 0.46179 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.2930 0.80030 0.832 0.000 0.004 0.000 0.164
#> SRR659590 2 0.2439 0.65916 0.000 0.876 0.004 0.120 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3796 0.49684 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.66994 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 5 0.3003 0.60181 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1345894 5 0.3048 0.59977 0.000 0.000 0.176 0.004 0.820
#> SRR1442928 3 0.3461 0.69474 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR1464681 4 0.0960 0.54819 0.000 0.008 0.016 0.972 0.004
#> SRR1418880 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.1469 0.69551 0.000 0.000 0.948 0.016 0.036
#> SRR1365426 5 0.6994 -0.35306 0.012 0.192 0.004 0.392 0.400
#> SRR1487947 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.3048 0.78652 0.820 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR603236 3 0.4375 0.61024 0.000 0.004 0.728 0.236 0.032
#> SRR660673 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1197 0.67126 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR663807 2 0.1341 0.66967 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1087245 2 0.4304 -0.01731 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1339108 4 0.4206 0.48246 0.000 0.020 0.272 0.708 0.000
#> SRR613426 4 0.3579 0.40854 0.000 0.000 0.240 0.756 0.004
#> SRR613879 4 0.4088 0.53209 0.000 0.304 0.000 0.688 0.008
#> SRR1385101 4 0.7289 0.23483 0.188 0.020 0.044 0.556 0.192
#> SRR1387966 4 0.6146 0.18044 0.000 0.400 0.132 0.468 0.000
#> SRR1458852 2 0.0703 0.67098 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1430489 1 0.3124 0.86210 0.844 0.000 0.016 0.136 0.004
#> SRR1349231 1 0.3048 0.78652 0.820 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR1376249 5 0.4522 0.54984 0.068 0.000 0.196 0.000 0.736
#> SRR1321987 2 0.0794 0.66901 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR662653 2 0.1965 0.66505 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3752 0.45679 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1383081 2 0.4138 0.14877 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR2166960 2 0.2179 0.65248 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR605101 2 0.3876 0.42553 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR818600 4 0.3366 0.55356 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1367715 4 0.3966 0.49023 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1351979 5 0.3895 0.61690 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1387054 5 0.6002 0.60199 0.000 0.064 0.304 0.036 0.596
#> SRR1444306 5 0.0510 0.53695 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1322662 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4182 0.05260 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR612767 1 0.3124 0.86210 0.844 0.000 0.016 0.136 0.004
#> SRR1489030 2 0.2329 0.65751 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1430375 3 0.7495 0.46342 0.000 0.056 0.448 0.208 0.288
#> SRR615225 4 0.4305 -0.23689 0.000 0.000 0.488 0.512 0.000
#> SRR1401839 3 0.3430 0.69594 0.000 0.000 0.776 0.004 0.220
#> SRR1379110 2 0.3932 0.45208 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1077288 3 0.3650 0.63217 0.028 0.000 0.796 0.000 0.176
#> SRR1331639 4 0.3796 0.42270 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1342782 2 0.6486 0.01506 0.000 0.448 0.008 0.144 0.400
#> SRR1443003 5 0.2522 0.58656 0.000 0.024 0.076 0.004 0.896
#> SRR612839 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 5 0.4264 0.60984 0.000 0.000 0.376 0.004 0.620
#> SRR1395742 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 5 0.6335 0.44631 0.000 0.104 0.044 0.244 0.608
#> SRR664063 5 0.6845 -0.35602 0.000 0.212 0.008 0.380 0.400
#> SRR1488214 1 0.3310 0.85715 0.836 0.000 0.024 0.136 0.004
#> SRR654766 2 0.4980 0.05644 0.000 0.488 0.000 0.484 0.028
#> SRR1320321 2 0.3857 0.43082 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.93794 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4201 0.03972 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1488470 2 0.4101 0.41724 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1389497 5 0.4114 0.61042 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1367109 3 0.3266 0.69810 0.000 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR615311 1 0.1671 0.90557 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.3695 0.6088 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.3620 0.6114 0.000 0.648 0.352 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.3398 0.7633 0.824 0.000 0.040 0.000 0.016 0.120
#> SRR1074359 5 0.6090 0.1885 0.000 0.004 0.240 0.000 0.436 0.320
#> SRR1419258 3 0.5171 0.6506 0.000 0.000 0.560 0.000 0.104 0.336
#> SRR1403366 5 0.0260 0.6232 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR665262 5 0.0520 0.6218 0.000 0.008 0.000 0.008 0.984 0.000
#> SRR1499740 5 0.3382 0.5721 0.000 0.000 0.048 0.008 0.820 0.124
#> SRR1105057 2 0.3733 0.6079 0.000 0.700 0.288 0.008 0.000 0.004
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.0260 0.6232 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR612215 5 0.0260 0.6232 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.6792 0.3431 0.508 0.000 0.264 0.128 0.008 0.092
#> SRR1409263 5 0.6907 0.4455 0.100 0.000 0.312 0.000 0.440 0.148
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0858 0.5106 0.000 0.968 0.028 0.000 0.000 0.004
#> SRR614839 6 0.3999 0.4715 0.000 0.496 0.004 0.000 0.000 0.500
#> SRR658433 2 0.3695 0.6088 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088581 5 0.3757 0.5301 0.000 0.000 0.008 0.008 0.712 0.272
#> SRR1328797 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR1334512 6 0.4962 0.4750 0.000 0.416 0.068 0.000 0.000 0.516
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1354955 5 0.3789 0.5714 0.000 0.000 0.260 0.000 0.716 0.024
#> SRR654802 3 0.5606 0.6163 0.000 0.000 0.512 0.000 0.164 0.324
#> SRR660066 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1447103 5 0.3382 0.5721 0.000 0.000 0.048 0.008 0.820 0.124
#> SRR1402153 6 0.5638 -0.0836 0.000 0.152 0.384 0.000 0.000 0.464
#> SRR655887 2 0.3841 0.6071 0.000 0.616 0.380 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408529 5 0.0622 0.6207 0.000 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR658707 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 6 0.6781 0.3682 0.000 0.108 0.276 0.008 0.104 0.504
#> SRR1074670 5 0.3812 0.5693 0.000 0.000 0.264 0.000 0.712 0.024
#> SRR1375439 5 0.2258 0.6025 0.000 0.000 0.044 0.000 0.896 0.060
#> SRR1329003 4 0.0260 0.6668 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.6778 -0.3504 0.000 0.384 0.024 0.008 0.296 0.288
#> SRR1317920 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.2748 0.6151 0.000 0.000 0.120 0.856 0.008 0.016
#> SRR613999 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.0547 0.6264 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1068855 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.5197 0.6524 0.000 0.000 0.560 0.000 0.108 0.332
#> SRR612227 5 0.3789 0.5714 0.000 0.000 0.260 0.000 0.716 0.024
#> SRR1388809 2 0.3636 0.6085 0.000 0.676 0.320 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413872 4 0.5001 0.5768 0.000 0.116 0.004 0.644 0.000 0.236
#> SRR1452864 1 0.3742 0.6344 0.648 0.000 0.000 0.348 0.000 0.004
#> SRR1473078 5 0.5451 0.5383 0.000 0.000 0.308 0.000 0.544 0.148
#> SRR615814 2 0.4873 0.3598 0.000 0.648 0.040 0.008 0.288 0.016
#> SRR1325225 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.4343 0.6087 0.000 0.592 0.380 0.000 0.000 0.028
#> SRR1358220 2 0.4408 0.6099 0.000 0.608 0.356 0.000 0.000 0.036
#> SRR1096662 6 0.3998 0.4735 0.000 0.492 0.004 0.000 0.000 0.504
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.6462 -0.0715 0.000 0.492 0.048 0.008 0.328 0.124
#> SRR660164 6 0.4666 0.4795 0.000 0.420 0.044 0.000 0.000 0.536
#> SRR815783 2 0.5345 0.3816 0.000 0.632 0.044 0.008 0.272 0.044
#> SRR809595 5 0.4660 0.4255 0.000 0.000 0.048 0.008 0.636 0.308
#> SRR1403133 2 0.4450 0.6077 0.000 0.632 0.328 0.004 0.000 0.036
#> SRR815470 6 0.5059 0.3129 0.000 0.080 0.392 0.000 0.000 0.528
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.0622 0.6256 0.000 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1478362 5 0.4798 0.3871 0.000 0.000 0.076 0.000 0.612 0.312
#> SRR1392186 6 0.4260 0.4512 0.000 0.472 0.016 0.000 0.000 0.512
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.1141 0.8768 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.3578 0.6477 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000 0.000
#> SRR1354270 5 0.7488 0.4120 0.020 0.000 0.288 0.188 0.408 0.096
#> SRR612683 6 0.5458 0.3723 0.000 0.144 0.320 0.000 0.000 0.536
#> SRR1392901 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1077805 3 0.5577 0.5760 0.000 0.056 0.572 0.000 0.052 0.320
#> SRR1360402 2 0.4482 0.6080 0.000 0.580 0.384 0.000 0.000 0.036
#> SRR1406112 5 0.3213 0.5720 0.000 0.000 0.048 0.000 0.820 0.132
#> SRR1355352 5 0.3130 0.5738 0.000 0.000 0.048 0.000 0.828 0.124
#> SRR656247 1 0.2201 0.8378 0.904 0.000 0.036 0.000 0.004 0.056
#> SRR813656 2 0.3854 -0.4411 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR808244 4 0.2445 0.5881 0.004 0.000 0.120 0.868 0.008 0.000
#> SRR1387240 6 0.5052 0.3182 0.000 0.080 0.388 0.000 0.000 0.532
#> SRR1408595 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.3603 0.5891 0.000 0.100 0.004 0.812 0.004 0.080
#> SRR1435248 2 0.4121 0.6099 0.000 0.604 0.380 0.000 0.000 0.016
#> SRR1419110 5 0.0260 0.6232 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1408682 3 0.7298 -0.1661 0.000 0.224 0.372 0.000 0.292 0.112
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 6 0.4594 0.4868 0.000 0.436 0.004 0.008 0.016 0.536
#> SRR1453911 6 0.4358 0.0613 0.000 0.000 0.020 0.008 0.352 0.620
#> SRR603164 5 0.4878 0.5452 0.000 0.076 0.184 0.000 0.704 0.036
#> SRR1383259 2 0.2001 0.4308 0.000 0.900 0.004 0.092 0.000 0.004
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.1007 0.4627 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1361546 3 0.7582 -0.1396 0.000 0.220 0.352 0.008 0.296 0.124
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 6 0.5052 0.3182 0.000 0.080 0.388 0.000 0.000 0.532
#> SRR615635 2 0.3619 0.6083 0.000 0.680 0.316 0.000 0.000 0.004
#> SRR1385411 2 0.6061 -0.1443 0.000 0.372 0.260 0.000 0.000 0.368
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 5 0.3855 0.5654 0.000 0.000 0.272 0.000 0.704 0.024
#> SRR662126 6 0.4224 0.4789 0.000 0.476 0.004 0.008 0.000 0.512
#> SRR1464601 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1071594 6 0.7486 0.3179 0.000 0.216 0.232 0.008 0.132 0.412
#> SRR612539 2 0.1268 0.4736 0.000 0.952 0.004 0.008 0.000 0.036
#> SRR602010 2 0.6427 -0.0249 0.000 0.520 0.052 0.008 0.296 0.124
#> SRR810249 2 0.3508 0.6074 0.000 0.704 0.292 0.000 0.000 0.004
#> SRR818773 6 0.7109 0.1777 0.000 0.304 0.048 0.008 0.296 0.344
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 6 0.4169 0.4755 0.000 0.456 0.012 0.000 0.000 0.532
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 6 0.6001 -0.4132 0.000 0.000 0.268 0.000 0.296 0.436
#> SRR661639 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 6 0.5685 0.1310 0.000 0.076 0.000 0.032 0.388 0.504
#> SRR1459937 5 0.4901 0.5761 0.000 0.000 0.184 0.096 0.696 0.024
#> SRR2185018 1 0.2416 0.8059 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.1307 0.5126 0.000 0.952 0.032 0.008 0.000 0.008
#> SRR809348 1 0.3023 0.7478 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR819261 5 0.3812 0.5693 0.000 0.000 0.264 0.000 0.712 0.024
#> SRR661074 5 0.5463 0.5361 0.000 0.000 0.312 0.000 0.540 0.148
#> SRR1349851 1 0.3742 0.6344 0.648 0.000 0.000 0.348 0.000 0.004
#> SRR1405123 2 0.5692 -0.3414 0.000 0.524 0.004 0.164 0.000 0.308
#> SRR661096 2 0.0260 0.4961 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.0260 0.6668 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1307677 6 0.5637 0.2991 0.000 0.156 0.364 0.000 0.000 0.480
#> SRR1466512 2 0.0291 0.4988 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR658212 3 0.6073 -0.4612 0.000 0.352 0.380 0.000 0.000 0.268
#> SRR1430525 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1344422 5 0.6689 0.4761 0.000 0.048 0.200 0.172 0.552 0.028
#> SRR1353924 2 0.0000 0.5015 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.5307 0.6714 0.692 0.000 0.100 0.156 0.008 0.044
#> SRR1487570 1 0.3620 0.6346 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.4291 0.0319 0.000 0.664 0.044 0.000 0.000 0.292
#> SRR1418561 5 0.5508 0.3700 0.000 0.000 0.124 0.348 0.524 0.004
#> SRR1448029 5 0.1895 0.5746 0.000 0.000 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR813802 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3841 0.6071 0.000 0.616 0.380 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435311 2 0.1367 0.4956 0.000 0.944 0.012 0.000 0.000 0.044
#> SRR612395 5 0.0260 0.6232 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR603116 6 0.6269 0.3364 0.000 0.268 0.236 0.008 0.008 0.480
#> SRR1323152 5 0.3855 0.5654 0.000 0.000 0.272 0.000 0.704 0.024
#> SRR1368264 2 0.6375 -0.0273 0.000 0.524 0.048 0.008 0.296 0.124
#> SRR1326624 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1429265 5 0.5463 0.5361 0.000 0.000 0.312 0.000 0.540 0.148
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.4184 0.4737 0.000 0.488 0.012 0.000 0.000 0.500
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.5983 -0.2999 0.000 0.432 0.000 0.324 0.000 0.244
#> SRR815044 6 0.4238 0.4809 0.000 0.444 0.016 0.000 0.000 0.540
#> SRR1338560 2 0.1408 0.5057 0.000 0.944 0.020 0.000 0.000 0.036
#> SRR615862 2 0.1124 0.4739 0.000 0.956 0.008 0.000 0.000 0.036
#> SRR1480038 2 0.1367 0.4956 0.000 0.944 0.012 0.000 0.000 0.044
#> SRR659436 5 0.3213 0.5720 0.000 0.000 0.048 0.000 0.820 0.132
#> SRR613699 2 0.5052 0.5781 0.000 0.532 0.388 0.000 0.000 0.080
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.3290 0.0476 0.000 0.744 0.004 0.000 0.000 0.252
#> SRR1330327 4 0.5352 0.5697 0.000 0.012 0.056 0.620 0.024 0.288
#> SRR1489950 2 0.4409 0.6079 0.000 0.588 0.380 0.000 0.000 0.032
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 5 0.0260 0.6217 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 5 0.4108 0.5680 0.000 0.000 0.260 0.008 0.704 0.028
#> SRR600656 4 0.5374 0.6058 0.000 0.036 0.012 0.652 0.060 0.240
#> SRR658766 5 0.4001 0.5333 0.000 0.004 0.028 0.000 0.708 0.260
#> SRR655946 6 0.5590 -0.3329 0.000 0.052 0.364 0.000 0.048 0.536
#> SRR817282 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.4150 0.5753 0.000 0.000 0.592 0.000 0.016 0.392
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 6 0.7109 0.1777 0.000 0.304 0.048 0.008 0.296 0.344
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.3923 0.4479 0.000 0.008 0.000 0.000 0.620 0.372
#> SRR662498 5 0.0520 0.6218 0.000 0.008 0.000 0.008 0.984 0.000
#> SRR1376764 3 0.6990 0.3891 0.000 0.060 0.348 0.000 0.260 0.332
#> SRR1377006 5 0.4108 0.5680 0.000 0.000 0.260 0.008 0.704 0.028
#> SRR656860 6 0.3999 0.4715 0.000 0.496 0.004 0.000 0.000 0.500
#> SRR1480547 2 0.0820 0.5003 0.000 0.972 0.016 0.000 0.000 0.012
#> SRR1452515 5 0.0520 0.6199 0.000 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1324390 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR615273 1 0.3822 0.7450 0.804 0.000 0.048 0.016 0.008 0.124
#> SRR601695 6 0.4881 0.1045 0.000 0.008 0.044 0.000 0.408 0.540
#> SRR820907 2 0.4127 0.6073 0.000 0.680 0.284 0.000 0.000 0.036
#> SRR812773 2 0.9465 -0.2816 0.148 0.296 0.064 0.148 0.216 0.128
#> SRR1405984 2 0.0000 0.5015 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 6 0.5811 0.2297 0.000 0.196 0.336 0.000 0.000 0.468
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 6 0.3245 -0.0467 0.000 0.000 0.008 0.000 0.228 0.764
#> SRR1435626 5 0.3130 0.5738 0.000 0.000 0.048 0.000 0.828 0.124
#> SRR1080766 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1377862 1 0.3578 0.6479 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000 0.000
#> SRR1332299 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1467966 5 0.3855 0.5654 0.000 0.000 0.272 0.000 0.704 0.024
#> SRR1320579 6 0.7219 -0.5504 0.000 0.000 0.316 0.088 0.256 0.340
#> SRR1319710 2 0.2454 0.2753 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1326604 6 0.3999 0.4715 0.000 0.496 0.004 0.000 0.000 0.500
#> SRR1098879 3 0.5257 0.6518 0.000 0.000 0.556 0.000 0.116 0.328
#> SRR662245 2 0.6721 0.2363 0.000 0.456 0.112 0.000 0.328 0.104
#> SRR1074719 2 0.4408 0.6099 0.000 0.608 0.356 0.000 0.000 0.036
#> SRR816226 1 0.3874 0.6200 0.636 0.000 0.000 0.356 0.000 0.008
#> SRR601387 2 0.4636 0.6086 0.000 0.584 0.376 0.008 0.000 0.032
#> SRR614575 2 0.0291 0.4988 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353900 2 0.3841 0.6071 0.000 0.616 0.380 0.000 0.000 0.004
#> SRR662906 3 0.3684 -0.2716 0.000 0.332 0.664 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350832 2 0.3695 0.6088 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.3742 0.6085 0.000 0.648 0.348 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313969 4 0.5495 0.6027 0.000 0.044 0.004 0.652 0.092 0.208
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.8385 -0.2963 0.236 0.304 0.048 0.280 0.008 0.124
#> SRR655399 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR1319753 6 0.4906 0.4269 0.004 0.376 0.004 0.048 0.000 0.568
#> SRR818901 6 0.6103 -0.4513 0.000 0.000 0.344 0.000 0.288 0.368
#> SRR607067 6 0.4229 0.4847 0.000 0.436 0.016 0.000 0.000 0.548
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 6 0.4318 0.4798 0.000 0.448 0.020 0.000 0.000 0.532
#> SRR661961 5 0.3314 0.5721 0.000 0.000 0.048 0.004 0.820 0.128
#> SRR658259 6 0.4165 0.4773 0.000 0.452 0.012 0.000 0.000 0.536
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 6 0.5134 0.3084 0.000 0.088 0.388 0.000 0.000 0.524
#> SRR1365034 6 0.3999 0.4715 0.000 0.496 0.004 0.000 0.000 0.500
#> SRR1478053 2 0.3841 0.6071 0.000 0.616 0.380 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475300 2 0.1225 0.5014 0.000 0.952 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1328101 5 0.1307 0.6085 0.000 0.008 0.032 0.008 0.952 0.000
#> SRR1322900 5 0.8043 0.3192 0.236 0.000 0.152 0.056 0.404 0.152
#> SRR1309942 2 0.4209 0.6093 0.000 0.596 0.384 0.000 0.000 0.020
#> SRR1345760 6 0.7124 0.1663 0.000 0.312 0.000 0.284 0.072 0.332
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 6 0.4592 0.4728 0.000 0.468 0.036 0.000 0.000 0.496
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.5380 0.3259 0.000 0.312 0.056 0.000 0.592 0.040
#> SRR661469 5 0.3382 0.5721 0.000 0.000 0.048 0.008 0.820 0.124
#> SRR1500323 2 0.4625 0.6036 0.000 0.572 0.388 0.000 0.004 0.036
#> SRR1356705 2 0.3014 0.4207 0.000 0.864 0.008 0.008 0.068 0.052
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.4874 0.5634 0.000 0.000 0.308 0.000 0.608 0.084
#> SRR1350435 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1389177 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1368072 2 0.4473 0.6068 0.000 0.584 0.380 0.000 0.000 0.036
#> SRR601815 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR613330 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.4467 0.4840 0.000 0.060 0.000 0.008 0.696 0.236
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.0260 0.6217 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1318839 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR1432390 4 0.4742 0.5158 0.000 0.292 0.012 0.644 0.000 0.052
#> SRR613126 2 0.4555 0.6060 0.000 0.628 0.328 0.000 0.008 0.036
#> SRR1089424 2 0.4408 0.6099 0.000 0.608 0.356 0.000 0.000 0.036
#> SRR1347214 2 0.3468 0.6060 0.000 0.712 0.284 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309556 5 0.4108 0.5733 0.000 0.000 0.260 0.008 0.704 0.028
#> SRR1456027 4 0.0260 0.6697 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1400551 5 0.5451 0.5383 0.000 0.000 0.308 0.000 0.544 0.148
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 6 0.5400 0.3490 0.000 0.132 0.332 0.000 0.000 0.536
#> SRR1454310 2 0.3945 0.6064 0.000 0.612 0.380 0.000 0.000 0.008
#> SRR615105 5 0.6661 0.3210 0.000 0.028 0.072 0.316 0.508 0.076
#> SRR1433290 5 0.6094 -0.3552 0.000 0.000 0.300 0.000 0.388 0.312
#> SRR2166064 4 0.5099 0.5799 0.000 0.112 0.004 0.644 0.004 0.236
#> SRR601671 2 0.0291 0.4988 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR663874 2 0.3690 0.6097 0.000 0.684 0.308 0.008 0.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR659696 4 0.5366 0.5892 0.000 0.056 0.064 0.644 0.000 0.236
#> SRR1408249 2 0.2979 0.2957 0.000 0.804 0.004 0.188 0.000 0.004
#> SRR663284 2 0.4046 -0.2804 0.000 0.620 0.004 0.008 0.000 0.368
#> SRR1402794 5 0.3812 0.5693 0.000 0.000 0.264 0.000 0.712 0.024
#> SRR614852 4 0.5031 0.5818 0.000 0.032 0.052 0.644 0.000 0.272
#> SRR1348040 5 0.6298 0.4680 0.000 0.000 0.048 0.168 0.532 0.252
#> SRR1489610 2 0.3151 0.0438 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1488091 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1499566 2 0.0146 0.4997 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361480 2 0.3183 0.1843 0.000 0.788 0.004 0.008 0.000 0.200
#> SRR1444501 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1415773 5 0.4443 0.4857 0.000 0.060 0.000 0.008 0.700 0.232
#> SRR1388832 5 0.7415 0.3818 0.124 0.000 0.048 0.192 0.508 0.128
#> SRR1394637 1 0.3428 0.6838 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000 0.000
#> SRR606974 6 0.5120 0.3250 0.000 0.088 0.380 0.000 0.000 0.532
#> SRR662918 6 0.5795 0.3416 0.000 0.152 0.340 0.008 0.000 0.500
#> SRR817421 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.5344 0.5113 0.000 0.532 0.348 0.000 0.000 0.120
#> SRR608264 3 0.5257 0.6519 0.000 0.000 0.556 0.000 0.116 0.328
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 6 0.5071 0.4777 0.000 0.396 0.060 0.008 0.000 0.536
#> SRR1312684 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.4800 0.6005 0.000 0.000 0.104 0.060 0.736 0.100
#> SRR1432743 5 0.0458 0.6215 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1388873 2 0.4343 0.6089 0.000 0.592 0.380 0.000 0.000 0.028
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.1845 0.6110 0.000 0.000 0.028 0.000 0.920 0.052
#> SRR1406008 2 0.0520 0.4973 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1396786 2 0.3976 0.6062 0.000 0.612 0.380 0.000 0.004 0.004
#> SRR1446564 1 0.3742 0.6344 0.648 0.000 0.000 0.348 0.000 0.004
#> SRR1318465 6 0.4992 -0.2733 0.000 0.024 0.308 0.000 0.048 0.620
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.5077 -0.4174 0.000 0.524 0.004 0.068 0.000 0.404
#> SRR655170 6 0.6088 0.1452 0.000 0.224 0.364 0.004 0.000 0.408
#> SRR1087825 4 0.0260 0.6697 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR662019 5 0.5451 0.5383 0.000 0.000 0.308 0.000 0.544 0.148
#> SRR1349209 5 0.4304 0.5708 0.000 0.000 0.248 0.020 0.704 0.028
#> SRR1326161 2 0.3695 0.6088 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.1225 0.5014 0.000 0.952 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.5015 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.5706 0.5294 0.568 0.000 0.036 0.304 0.000 0.092
#> SRR1408183 5 0.3734 0.5727 0.000 0.000 0.264 0.000 0.716 0.020
#> SRR1084369 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR598452 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR660709 5 0.4329 0.5738 0.000 0.000 0.252 0.008 0.696 0.044
#> SRR809444 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1375774 1 0.3151 0.7308 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.0260 0.6668 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.2981 0.7898 0.852 0.000 0.040 0.000 0.008 0.100
#> SRR1440744 2 0.0508 0.4932 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 6 0.5908 0.4329 0.000 0.356 0.016 0.012 0.100 0.516
#> SRR1381775 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.2915 0.4188 0.000 0.848 0.024 0.008 0.000 0.120
#> SRR658989 5 0.3863 0.5702 0.000 0.000 0.260 0.000 0.712 0.028
#> SRR1353663 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.2527 0.8000 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR819054 2 0.4362 0.6078 0.000 0.584 0.388 0.000 0.000 0.028
#> SRR1367988 2 0.7214 -0.2072 0.000 0.436 0.024 0.228 0.260 0.052
#> SRR1331922 1 0.5607 0.4988 0.548 0.000 0.028 0.340 0.000 0.084
#> SRR615479 2 0.8176 -0.2964 0.084 0.304 0.048 0.008 0.296 0.260
#> SRR1375796 6 0.5421 0.3472 0.000 0.136 0.328 0.000 0.000 0.536
#> SRR1386991 5 0.0260 0.6232 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1355217 2 0.7173 0.1647 0.000 0.348 0.280 0.000 0.292 0.080
#> SRR1356290 6 0.4689 0.0356 0.000 0.000 0.044 0.000 0.440 0.516
#> SRR659507 5 0.0972 0.6136 0.000 0.000 0.028 0.008 0.964 0.000
#> SRR663296 1 0.1204 0.8723 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.3849 0.5840 0.000 0.752 0.208 0.008 0.000 0.032
#> SRR661155 4 0.4951 0.6654 0.000 0.112 0.004 0.732 0.072 0.080
#> SRR1414727 5 0.5381 0.5680 0.000 0.000 0.248 0.008 0.604 0.140
#> SRR663477 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1354489 5 0.6094 -0.3533 0.000 0.000 0.300 0.000 0.388 0.312
#> SRR1377800 5 0.3254 0.5761 0.000 0.000 0.056 0.000 0.820 0.124
#> SRR614611 2 0.3841 0.6071 0.000 0.616 0.380 0.000 0.000 0.004
#> SRR655052 6 0.5549 0.4065 0.000 0.304 0.000 0.000 0.164 0.532
#> SRR1478968 4 0.0260 0.6668 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1351280 6 0.4242 0.4786 0.000 0.448 0.016 0.000 0.000 0.536
#> SRR613951 6 0.4594 -0.2077 0.000 0.000 0.000 0.476 0.036 0.488
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 5 0.4072 0.5686 0.000 0.000 0.260 0.004 0.704 0.032
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 5 0.3812 0.5693 0.000 0.000 0.264 0.000 0.712 0.024
#> SRR655040 2 0.7016 -0.3577 0.000 0.372 0.000 0.296 0.064 0.268
#> SRR810225 2 0.2003 0.5095 0.000 0.912 0.044 0.000 0.000 0.044
#> SRR1325377 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR617829 6 0.4750 -0.3268 0.000 0.000 0.340 0.000 0.064 0.596
#> SRR1402328 2 0.3934 0.6097 0.000 0.616 0.376 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480455 3 0.6083 -0.4312 0.000 0.280 0.388 0.000 0.000 0.332
#> SRR1442104 3 0.5685 0.6401 0.000 0.000 0.552 0.040 0.076 0.332
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.4131 0.5820 0.000 0.000 0.600 0.000 0.016 0.384
#> SRR1414314 2 0.5818 0.4608 0.000 0.424 0.392 0.000 0.000 0.184
#> SRR663026 2 0.3742 0.6085 0.000 0.648 0.348 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478386 2 0.1225 0.5014 0.000 0.952 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1458683 4 0.5425 0.4691 0.000 0.000 0.228 0.644 0.060 0.068
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.6749 0.3609 0.000 0.136 0.048 0.096 0.596 0.124
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.5002 0.5020 0.000 0.276 0.040 0.644 0.000 0.040
#> SRR660260 5 0.5981 -0.1828 0.000 0.000 0.228 0.000 0.396 0.376
#> SRR1071231 2 0.2549 0.5310 0.000 0.884 0.072 0.008 0.000 0.036
#> SRR1459125 5 0.5053 0.4737 0.000 0.000 0.000 0.204 0.636 0.160
#> SRR1337173 5 0.3629 0.5013 0.000 0.012 0.000 0.000 0.712 0.276
#> SRR1396250 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR2166376 6 0.3819 0.0167 0.000 0.000 0.004 0.000 0.372 0.624
#> SRR659816 5 0.4329 0.4858 0.000 0.044 0.000 0.008 0.696 0.252
#> SRR1401379 2 0.3175 0.0316 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR600981 4 0.5505 0.5877 0.000 0.216 0.004 0.644 0.036 0.100
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.7478 -0.3072 0.000 0.304 0.000 0.292 0.276 0.128
#> SRR660115 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1359780 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.3109 0.1753 0.000 0.772 0.004 0.000 0.000 0.224
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.4315 0.6071 0.000 0.636 0.328 0.000 0.000 0.036
#> SRR1319648 6 0.4226 0.4751 0.000 0.484 0.004 0.008 0.000 0.504
#> SRR1092985 1 0.1501 0.8627 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.2001 0.4194 0.000 0.900 0.004 0.092 0.000 0.004
#> SRR1468658 5 0.3907 0.5666 0.000 0.000 0.268 0.000 0.704 0.028
#> SRR1390437 2 0.6034 -0.3241 0.000 0.420 0.000 0.308 0.000 0.272
#> SRR658057 6 0.3999 0.4715 0.000 0.496 0.004 0.000 0.000 0.500
#> SRR612635 2 0.3601 -0.1295 0.000 0.684 0.004 0.000 0.000 0.312
#> SRR1351480 2 0.2554 0.5145 0.000 0.876 0.076 0.000 0.000 0.048
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.2813 0.8025 0.864 0.000 0.036 0.000 0.008 0.092
#> SRR659590 2 0.4004 0.6091 0.000 0.656 0.328 0.004 0.000 0.012
#> SRR614263 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.2053 0.5412 0.000 0.888 0.108 0.000 0.000 0.004
#> SRR659911 2 0.4491 0.6047 0.000 0.576 0.388 0.000 0.000 0.036
#> SRR1085519 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1345894 5 0.6088 -0.3504 0.000 0.000 0.296 0.000 0.392 0.312
#> SRR1442928 5 0.0520 0.6227 0.000 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1464681 4 0.1555 0.6800 0.000 0.060 0.004 0.932 0.000 0.004
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.3542 0.6087 0.000 0.000 0.160 0.000 0.788 0.052
#> SRR1365426 6 0.7380 0.1729 0.000 0.272 0.080 0.008 0.296 0.344
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.3382 0.7569 0.820 0.000 0.048 0.000 0.008 0.124
#> SRR603236 5 0.3330 0.4964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR660673 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.3695 0.6088 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.3706 0.6081 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087245 6 0.5618 0.3402 0.000 0.160 0.340 0.000 0.000 0.500
#> SRR1339108 6 0.5352 0.4467 0.000 0.408 0.000 0.008 0.084 0.500
#> SRR613426 4 0.7105 -0.1181 0.000 0.312 0.000 0.348 0.072 0.268
#> SRR613879 6 0.4620 0.4760 0.000 0.428 0.040 0.000 0.000 0.532
#> SRR1385101 6 0.8226 0.0632 0.124 0.304 0.052 0.160 0.008 0.352
#> SRR1387966 6 0.5778 0.3312 0.000 0.100 0.380 0.000 0.024 0.496
#> SRR1458852 2 0.4396 0.6096 0.000 0.612 0.352 0.000 0.000 0.036
#> SRR1430489 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.3382 0.7569 0.820 0.000 0.048 0.000 0.008 0.124
#> SRR1376249 3 0.4468 0.5958 0.024 0.000 0.604 0.000 0.008 0.364
#> SRR1321987 2 0.4649 0.6034 0.000 0.572 0.380 0.000 0.000 0.048
#> SRR662653 2 0.3742 0.6114 0.000 0.648 0.348 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.2513 0.5197 0.000 0.888 0.060 0.008 0.000 0.044
#> SRR1383081 6 0.5862 0.1981 0.000 0.204 0.344 0.000 0.000 0.452
#> SRR2166960 2 0.5043 0.5770 0.000 0.568 0.360 0.008 0.000 0.064
#> SRR605101 2 0.1442 0.4966 0.000 0.944 0.012 0.000 0.004 0.040
#> SRR818600 6 0.4591 0.4739 0.000 0.464 0.036 0.000 0.000 0.500
#> SRR1367715 2 0.4157 -0.3628 0.000 0.544 0.012 0.000 0.000 0.444
#> SRR1351979 3 0.5962 0.5264 0.000 0.000 0.436 0.000 0.236 0.328
#> SRR1387054 3 0.5397 0.5551 0.000 0.020 0.524 0.000 0.068 0.388
#> SRR1444306 6 0.6103 -0.4513 0.000 0.000 0.344 0.000 0.288 0.368
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 6 0.5176 0.3215 0.000 0.080 0.384 0.004 0.000 0.532
#> SRR612767 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.3827 0.6075 0.000 0.680 0.308 0.008 0.000 0.004
#> SRR1430375 5 0.4497 0.3079 0.000 0.000 0.048 0.000 0.624 0.328
#> SRR615225 6 0.5966 0.1627 0.000 0.080 0.000 0.052 0.364 0.504
#> SRR1401839 5 0.0260 0.6232 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1379110 2 0.1075 0.5185 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 5 0.5463 0.5361 0.000 0.000 0.312 0.000 0.540 0.148
#> SRR1331639 4 0.5480 0.5948 0.000 0.072 0.064 0.644 0.000 0.220
#> SRR1342782 3 0.6327 -0.1449 0.000 0.000 0.352 0.008 0.296 0.344
#> SRR1443003 6 0.6128 -0.4670 0.000 0.000 0.332 0.000 0.320 0.348
#> SRR612839 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.5434 0.6508 0.000 0.000 0.560 0.012 0.100 0.328
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 6 0.4230 -0.2635 0.000 0.000 0.364 0.000 0.024 0.612
#> SRR664063 6 0.7116 0.1712 0.000 0.324 0.048 0.008 0.296 0.324
#> SRR1488214 1 0.3607 0.6394 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.5562 0.5849 0.000 0.188 0.012 0.660 0.036 0.104
#> SRR1320321 2 0.1225 0.5014 0.000 0.952 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9025 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 6 0.5259 0.3400 0.000 0.108 0.356 0.000 0.000 0.536
#> SRR1488470 2 0.1003 0.4999 0.000 0.964 0.020 0.000 0.000 0.016
#> SRR1389497 3 0.5221 0.6530 0.000 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR1367109 5 0.0363 0.6230 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR615311 1 0.1714 0.8512 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.982 0.956 0.981 0.3502 0.643 0.643
#> 3 3 0.814 0.878 0.948 0.8009 0.654 0.493
#> 4 4 0.666 0.711 0.821 0.1091 0.819 0.570
#> 5 5 0.612 0.515 0.740 0.0818 0.921 0.750
#> 6 6 0.647 0.606 0.726 0.0616 0.851 0.497
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1355396 2 0.9661 0.30337 0.392 0.608
#> SRR1084417 1 0.9988 0.15110 0.520 0.480
#> SRR1074359 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.8081 0.64536 0.248 0.752
#> SRR1409263 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0376 0.94235 0.996 0.004
#> SRR1334889 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1329003 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR1404837 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.9129 0.56864 0.672 0.328
#> SRR1455525 2 0.0376 0.98743 0.004 0.996
#> SRR613999 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1375509 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612227 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1452864 2 0.9963 0.04884 0.464 0.536
#> SRR1473078 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1325225 2 0.5737 0.83231 0.136 0.864
#> SRR1313687 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0376 0.94235 0.996 0.004
#> SRR1471594 1 0.0376 0.94235 0.996 0.004
#> SRR1354270 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.8443 0.67419 0.728 0.272
#> SRR813656 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR808244 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR1387240 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.8861 0.62042 0.696 0.304
#> SRR1385277 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1330854 2 0.9988 -0.00676 0.480 0.520
#> SRR1452423 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1442754 2 0.9933 0.11199 0.452 0.548
#> SRR1334247 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0376 0.94234 0.996 0.004
#> SRR655732 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR661074 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.8207 0.69523 0.744 0.256
#> SRR1405123 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1454651 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR1307677 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1314832 2 0.7139 0.74459 0.196 0.804
#> SRR1487570 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR627431 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1418561 2 0.1184 0.97536 0.016 0.984
#> SRR1448029 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1326624 1 0.7815 0.72774 0.768 0.232
#> SRR1429265 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR615273 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR812773 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0938 0.93683 0.988 0.012
#> SRR1095720 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR816226 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR601387 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.1414 0.93142 0.980 0.020
#> SRR1452912 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR655399 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR818901 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1322900 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.7528 0.74789 0.784 0.216
#> SRR1389177 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1456027 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR1400551 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1320469 1 0.9522 0.45479 0.628 0.372
#> SRR614251 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.8608 0.65375 0.716 0.284
#> SRR1454117 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.7745 0.73309 0.772 0.228
#> SRR615044 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1432743 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.9933 0.25783 0.548 0.452
#> SRR1318465 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR662019 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1349209 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.0376 0.98743 0.004 0.996
#> SRR1408183 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.8499 0.66804 0.724 0.276
#> SRR1326292 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR657139 1 0.8555 0.65129 0.720 0.280
#> SRR1440744 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.6887 0.78759 0.816 0.184
#> SRR1363908 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1331922 2 0.0376 0.98743 0.004 0.996
#> SRR615479 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.7745 0.73299 0.772 0.228
#> SRR1354489 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1478968 2 0.2948 0.93691 0.052 0.948
#> SRR1351280 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1481396 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.1633 0.92859 0.976 0.024
#> SRR656409 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.7056 0.77830 0.808 0.192
#> SRR659590 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1487947 1 0.9977 0.17574 0.528 0.472
#> SRR659708 2 0.5294 0.85219 0.120 0.880
#> SRR603236 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.8713 0.63703 0.708 0.292
#> SRR1349231 2 0.1843 0.96290 0.028 0.972
#> SRR1376249 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.8081 0.70605 0.752 0.248
#> SRR1489030 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1077288 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1488214 1 0.8499 0.66454 0.724 0.276
#> SRR654766 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.94470 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.99135 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0376 0.94234 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0237 0.9716 0.996 0.000 0.004
#> SRR613282 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084417 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074359 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.6267 0.1512 0.000 0.548 0.452
#> SRR1499740 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 3 0.6204 0.2973 0.000 0.424 0.576
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.1163 0.9518 0.972 0.000 0.028
#> SRR1334889 3 0.4291 0.7620 0.000 0.180 0.820
#> SRR614839 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.1289 0.9245 0.000 0.968 0.032
#> SRR1471117 1 0.4931 0.6781 0.768 0.000 0.232
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR655887 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329003 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR1404837 2 0.4291 0.7682 0.000 0.820 0.180
#> SRR1317920 3 0.5058 0.6807 0.244 0.000 0.756
#> SRR1455525 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.4002 0.8033 0.840 0.000 0.160
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1452864 3 0.2625 0.8585 0.084 0.000 0.916
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 3 0.1753 0.8886 0.048 0.000 0.952
#> SRR1313687 2 0.1031 0.9319 0.000 0.976 0.024
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 3 0.4887 0.6982 0.000 0.228 0.772
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 3 0.4291 0.7668 0.000 0.180 0.820
#> SRR660164 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.6295 0.1021 0.000 0.528 0.472
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 3 0.0892 0.9101 0.000 0.020 0.980
#> SRR1392186 3 0.5706 0.5471 0.000 0.320 0.680
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.3340 0.8561 0.880 0.000 0.120
#> SRR1471594 1 0.3340 0.8561 0.880 0.000 0.120
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 3 0.4291 0.7608 0.180 0.000 0.820
#> SRR813656 2 0.3412 0.8352 0.000 0.876 0.124
#> SRR808244 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 3 0.5254 0.6431 0.264 0.000 0.736
#> SRR1385277 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 3 0.4555 0.7432 0.000 0.200 0.800
#> SRR1408682 2 0.6126 0.3210 0.000 0.600 0.400
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0237 0.9470 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453911 3 0.6280 0.1813 0.000 0.460 0.540
#> SRR603164 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1383259 3 0.4796 0.7097 0.000 0.220 0.780
#> SRR1330854 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.2066 0.8999 0.000 0.940 0.060
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 3 0.2959 0.8488 0.000 0.100 0.900
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2711 0.8720 0.000 0.912 0.088
#> SRR615635 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 3 0.3941 0.7910 0.000 0.156 0.844
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.1753 0.9103 0.000 0.952 0.048
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 3 0.5706 0.5487 0.000 0.320 0.680
#> SRR810249 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0237 0.9195 0.004 0.000 0.996
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.1529 0.9414 0.960 0.000 0.040
#> SRR655732 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0747 0.9618 0.984 0.000 0.016
#> SRR819261 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 3 0.6309 0.0757 0.496 0.000 0.504
#> SRR1405123 3 0.2165 0.8779 0.000 0.064 0.936
#> SRR661096 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.1529 0.8947 0.040 0.000 0.960
#> SRR1487570 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR627431 2 0.3340 0.8370 0.000 0.880 0.120
#> SRR1418561 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 3 0.6126 0.3649 0.000 0.400 0.600
#> SRR603116 2 0.4654 0.7272 0.000 0.792 0.208
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 3 0.5733 0.5402 0.000 0.324 0.676
#> SRR1326624 3 0.3340 0.8251 0.120 0.000 0.880
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.5591 0.5558 0.000 0.696 0.304
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 3 0.4702 0.7205 0.000 0.212 0.788
#> SRR815044 2 0.0892 0.9343 0.000 0.980 0.020
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0237 0.9716 0.996 0.000 0.004
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR658766 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR817282 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.4702 0.7272 0.000 0.212 0.788
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.3686 0.8125 0.000 0.140 0.860
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR656860 2 0.0892 0.9343 0.000 0.980 0.020
#> SRR1480547 2 0.1964 0.9029 0.000 0.944 0.056
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR601695 2 0.5835 0.5111 0.000 0.660 0.340
#> SRR820907 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.6026 0.3547 0.624 0.000 0.376
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.2959 0.8797 0.900 0.000 0.100
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.2878 0.8642 0.000 0.904 0.096
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 3 0.1031 0.9066 0.024 0.000 0.976
#> SRR601387 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.5988 0.4333 0.000 0.632 0.368
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388528 3 0.3192 0.8352 0.112 0.000 0.888
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 3 0.4842 0.7098 0.000 0.224 0.776
#> SRR818901 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.4702 0.7211 0.000 0.788 0.212
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.2711 0.8704 0.000 0.912 0.088
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 3 0.6204 0.2973 0.000 0.424 0.576
#> SRR1322900 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.5678 0.5313 0.000 0.684 0.316
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 3 0.4062 0.7856 0.000 0.164 0.836
#> SRR1500323 2 0.1031 0.9316 0.000 0.976 0.024
#> SRR1356705 2 0.6079 0.3560 0.000 0.612 0.388
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 3 0.5810 0.5189 0.336 0.000 0.664
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.3116 0.8441 0.000 0.108 0.892
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.1964 0.9277 0.944 0.000 0.056
#> SRR816382 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 3 0.1411 0.8996 0.000 0.036 0.964
#> SRR613126 2 0.4842 0.7041 0.000 0.776 0.224
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456027 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 3 0.2625 0.8580 0.084 0.000 0.916
#> SRR614251 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR601671 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 3 0.3340 0.8295 0.000 0.120 0.880
#> SRR1408249 3 0.5465 0.5998 0.000 0.288 0.712
#> SRR663284 3 0.5948 0.4889 0.000 0.360 0.640
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1348040 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 3 0.6295 0.1747 0.000 0.472 0.528
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.4062 0.7881 0.000 0.836 0.164
#> SRR1388832 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394637 1 0.3752 0.8257 0.856 0.000 0.144
#> SRR606974 2 0.2878 0.8633 0.000 0.904 0.096
#> SRR662918 2 0.5859 0.4690 0.000 0.656 0.344
#> SRR817421 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 3 0.4796 0.7087 0.220 0.000 0.780
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 3 0.6095 0.3952 0.392 0.000 0.608
#> SRR615044 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 3 0.5178 0.6632 0.256 0.000 0.744
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 3 0.5810 0.5034 0.000 0.336 0.664
#> SRR655170 2 0.1031 0.9317 0.000 0.976 0.024
#> SRR1087825 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR662019 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 3 0.6126 0.3616 0.400 0.000 0.600
#> SRR1326292 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR657139 3 0.6045 0.4118 0.380 0.000 0.620
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1381775 3 0.6154 0.3407 0.408 0.000 0.592
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.3482 0.8463 0.872 0.000 0.128
#> SRR811771 1 0.1860 0.9297 0.948 0.000 0.052
#> SRR813983 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331922 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR615479 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 3 0.3879 0.7991 0.000 0.152 0.848
#> SRR1355217 3 0.6079 0.3959 0.000 0.388 0.612
#> SRR1356290 2 0.6026 0.3885 0.000 0.624 0.376
#> SRR659507 3 0.5431 0.6155 0.000 0.284 0.716
#> SRR663296 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1414727 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR663477 3 0.4002 0.7853 0.160 0.000 0.840
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 3 0.4702 0.7109 0.000 0.212 0.788
#> SRR1478968 3 0.0237 0.9198 0.004 0.000 0.996
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 3 0.4002 0.7873 0.000 0.160 0.840
#> SRR810225 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.2066 0.8995 0.000 0.940 0.060
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0424 0.9684 0.992 0.000 0.008
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.1529 0.9173 0.000 0.960 0.040
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR660260 3 0.0424 0.9174 0.000 0.008 0.992
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.6168 0.3037 0.000 0.412 0.588
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 3 0.4291 0.7687 0.000 0.180 0.820
#> SRR660115 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 3 0.6126 0.3455 0.000 0.400 0.600
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.6274 0.1109 0.000 0.544 0.456
#> SRR1092985 1 0.5948 0.4095 0.640 0.000 0.360
#> SRR656409 3 0.5706 0.5374 0.000 0.320 0.680
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR658057 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 3 0.6180 0.3182 0.416 0.000 0.584
#> SRR659590 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 3 0.6111 0.3755 0.000 0.396 0.604
#> SRR1464681 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 3 0.4178 0.7763 0.000 0.172 0.828
#> SRR1487947 3 0.0424 0.9171 0.008 0.000 0.992
#> SRR659708 3 0.0237 0.9196 0.004 0.000 0.996
#> SRR603236 2 0.4842 0.7040 0.000 0.776 0.224
#> SRR660673 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.1529 0.9197 0.000 0.960 0.040
#> SRR613426 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR613879 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0237 0.9470 0.000 0.996 0.004
#> SRR1430489 3 0.1964 0.8821 0.056 0.000 0.944
#> SRR1349231 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 3 0.2878 0.8463 0.096 0.000 0.904
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.6244 0.2478 0.000 0.440 0.560
#> SRR615225 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1401839 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 3 0.1964 0.8843 0.000 0.056 0.944
#> SRR1342782 3 0.5497 0.6013 0.000 0.292 0.708
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 3 0.4346 0.7625 0.000 0.184 0.816
#> SRR1488214 3 0.5497 0.6043 0.292 0.000 0.708
#> SRR654766 3 0.0237 0.9201 0.000 0.004 0.996
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9499 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.1031 0.9311 0.000 0.976 0.024
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9214 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9746 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380716 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR612803 1 0.0469 0.8031 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR613282 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1355396 1 0.5708 0.2318 0.556 0.000 0.416 0.028
#> SRR1084417 3 0.5018 0.2607 0.332 0.000 0.656 0.012
#> SRR1074359 3 0.4428 0.2295 0.000 0.004 0.720 0.276
#> SRR1419258 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1403366 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR665262 3 0.5244 0.3119 0.000 0.388 0.600 0.012
#> SRR1499740 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1105057 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1439742 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR612215 3 0.5268 0.2996 0.000 0.396 0.592 0.012
#> SRR1094051 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1324496 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.5119 0.2857 0.556 0.000 0.440 0.004
#> SRR1409263 3 0.0336 0.7255 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1431288 1 0.0376 0.8044 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1334889 2 0.7321 0.0656 0.000 0.500 0.328 0.172
#> SRR614839 2 0.0895 0.8795 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR658433 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088581 3 0.4866 -0.2556 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1328797 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1334512 2 0.0817 0.8782 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1471117 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1458220 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1354955 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR654802 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR660066 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1447103 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1402153 3 0.1474 0.7215 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR655887 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1408529 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR658707 1 0.4008 0.8077 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1384371 3 0.5696 0.4754 0.000 0.232 0.692 0.076
#> SRR1074670 3 0.1022 0.7324 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1375439 3 0.0804 0.7228 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1329003 4 0.4741 0.9396 0.004 0.000 0.328 0.668
#> SRR1404837 2 0.5038 0.5281 0.000 0.684 0.296 0.020
#> SRR1317920 1 0.3271 0.7208 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1455525 4 0.4605 0.9383 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR613999 1 0.4331 0.8029 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1310836 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR658200 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1068855 1 0.1584 0.7860 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1375509 3 0.0817 0.7326 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR612227 3 0.1022 0.7324 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1388809 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413872 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1452864 1 0.5674 0.5642 0.720 0.000 0.132 0.148
#> SRR1473078 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR615814 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1325225 4 0.7111 0.3185 0.364 0.000 0.136 0.500
#> SRR1313687 2 0.4905 0.3437 0.000 0.632 0.364 0.004
#> SRR1358220 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1096662 2 0.7854 -0.2380 0.000 0.400 0.296 0.304
#> SRR1487746 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1354644 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1401752 3 0.4661 0.5023 0.000 0.256 0.728 0.016
#> SRR660164 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815783 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809595 3 0.4661 0.5023 0.000 0.256 0.728 0.016
#> SRR1403133 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815470 4 0.6956 0.7150 0.000 0.148 0.288 0.564
#> SRR1344382 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1432453 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1478362 4 0.5233 0.9163 0.000 0.020 0.332 0.648
#> SRR1392186 2 0.5781 0.3081 0.000 0.584 0.380 0.036
#> SRR1347937 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1431569 1 0.0707 0.8000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1471594 1 0.0937 0.7982 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1354270 3 0.2011 0.6917 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR612683 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1392901 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1077805 3 0.3311 0.5326 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1360402 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1406112 3 0.0336 0.7255 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1355352 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR656247 1 0.6340 0.2123 0.528 0.000 0.408 0.064
#> SRR813656 2 0.4988 0.5265 0.000 0.692 0.288 0.020
#> SRR808244 4 0.4781 0.9346 0.004 0.000 0.336 0.660
#> SRR1387240 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408595 1 0.6091 0.3596 0.596 0.000 0.344 0.060
#> SRR1385277 4 0.4624 0.9317 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1435248 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419110 3 0.4485 0.5163 0.000 0.248 0.740 0.012
#> SRR1408682 3 0.4844 0.4498 0.000 0.300 0.688 0.012
#> SRR1317134 1 0.2760 0.8140 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1370780 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1489307 2 0.0779 0.8809 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1453911 3 0.4718 0.4799 0.000 0.280 0.708 0.012
#> SRR603164 3 0.2149 0.6787 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1383259 4 0.7844 0.4552 0.000 0.308 0.288 0.404
#> SRR1330854 3 0.5168 -0.1314 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR1452423 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1368574 2 0.4933 0.5153 0.000 0.688 0.296 0.016
#> SRR1468162 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1331220 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1361546 3 0.4420 0.5232 0.000 0.240 0.748 0.012
#> SRR1486156 1 0.2814 0.8140 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR660545 2 0.5663 0.4928 0.000 0.676 0.264 0.060
#> SRR615635 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.7771 -0.1980 0.000 0.420 0.328 0.252
#> SRR1342739 1 0.4382 0.8017 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1102830 3 0.0000 0.7282 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.1520 0.8687 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR1464601 2 0.3123 0.7376 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1071594 2 0.0469 0.8817 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612539 2 0.0927 0.8794 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR602010 3 0.4635 0.4935 0.000 0.268 0.720 0.012
#> SRR810249 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818773 3 0.4546 0.5058 0.000 0.256 0.732 0.012
#> SRR1336569 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1368117 2 0.1209 0.8662 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1442754 1 0.5236 0.2865 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1334247 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR661639 1 0.4356 0.8023 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR613222 3 0.6852 0.2430 0.000 0.320 0.556 0.124
#> SRR1459937 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR2185018 1 0.1557 0.7835 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR655732 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809348 1 0.0188 0.8051 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR819261 3 0.1118 0.7317 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR661074 3 0.0000 0.7282 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.3161 0.7272 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1405123 4 0.4741 0.9388 0.000 0.004 0.328 0.668
#> SRR661096 2 0.3881 0.7126 0.000 0.812 0.172 0.016
#> SRR1320225 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4741 0.9396 0.004 0.000 0.328 0.668
#> SRR1307677 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1466512 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR658212 2 0.4549 0.7357 0.000 0.804 0.096 0.100
#> SRR1430525 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1344422 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1353924 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1314832 1 0.5905 0.2780 0.564 0.000 0.396 0.040
#> SRR1487570 4 0.4741 0.9396 0.004 0.000 0.328 0.668
#> SRR627431 2 0.3761 0.7873 0.000 0.852 0.080 0.068
#> SRR1418561 3 0.5050 -0.3389 0.004 0.000 0.588 0.408
#> SRR1448029 3 0.1022 0.7324 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR813802 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.4382 0.8017 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1309702 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435311 2 0.0469 0.8822 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612395 3 0.5018 0.4003 0.000 0.332 0.656 0.012
#> SRR603116 2 0.5143 0.3906 0.000 0.628 0.360 0.012
#> SRR1323152 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1368264 3 0.4576 0.5024 0.000 0.260 0.728 0.012
#> SRR1326624 1 0.3105 0.7307 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR1429265 3 0.0000 0.7282 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0188 0.8053 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615611 2 0.5272 0.5067 0.000 0.680 0.288 0.032
#> SRR1486799 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1096174 2 0.7834 -0.2443 0.000 0.408 0.308 0.284
#> SRR815044 2 0.2345 0.8138 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1338560 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1480038 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR659436 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR613699 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436563 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR615323 2 0.4323 0.6676 0.000 0.776 0.204 0.020
#> SRR1330327 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1489950 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431927 1 0.0469 0.8079 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1100588 3 0.0817 0.7327 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1444002 1 0.0336 0.8043 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1318444 3 0.3444 0.5195 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR600656 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR658766 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR655946 3 0.3528 0.4865 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR817282 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1475104 3 0.0000 0.7282 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 3 0.4661 0.5028 0.000 0.256 0.728 0.016
#> SRR1471965 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR612695 3 0.0921 0.7329 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR662498 3 0.4123 0.5439 0.000 0.220 0.772 0.008
#> SRR1376764 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1377006 3 0.4222 0.2514 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR656860 2 0.2814 0.7801 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1480547 2 0.0779 0.8809 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1452515 3 0.0817 0.7327 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1324390 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615273 3 0.3335 0.5938 0.128 0.000 0.856 0.016
#> SRR601695 2 0.6508 0.2196 0.000 0.556 0.360 0.084
#> SRR820907 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR812773 3 0.4964 0.4898 0.000 0.256 0.716 0.028
#> SRR1405984 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1472794 2 0.0779 0.8790 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1365448 1 0.3837 0.6198 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1095720 3 0.0336 0.7302 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1435626 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1080766 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1377862 1 0.0188 0.8051 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332299 3 0.1022 0.7326 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1467966 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1320579 3 0.1716 0.7090 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1319710 2 0.0937 0.8786 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1326604 2 0.0188 0.8836 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098879 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR662245 2 0.5577 0.3988 0.000 0.636 0.328 0.036
#> SRR1074719 2 0.0469 0.8822 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR816226 4 0.4741 0.9396 0.004 0.000 0.328 0.668
#> SRR601387 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614575 2 0.0188 0.8836 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353900 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662906 3 0.6808 0.2170 0.000 0.320 0.560 0.120
#> SRR1350832 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403280 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1313969 4 0.4643 0.9240 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1388528 1 0.4643 0.4647 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1452912 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1400180 3 0.4964 0.4898 0.000 0.256 0.716 0.028
#> SRR655399 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1319753 3 0.6024 0.2297 0.000 0.416 0.540 0.044
#> SRR818901 3 0.1022 0.7324 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR607067 2 0.5056 0.6633 0.000 0.760 0.164 0.076
#> SRR1391420 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1384138 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR661961 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR658259 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1310476 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1452696 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365034 2 0.5072 0.6308 0.000 0.740 0.208 0.052
#> SRR1478053 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0469 0.8822 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1328101 3 0.5268 0.2996 0.000 0.396 0.592 0.012
#> SRR1322900 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1309942 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345760 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1435418 1 0.0188 0.8067 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402172 2 0.5508 0.5614 0.000 0.692 0.056 0.252
#> SRR1443436 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR661675 2 0.3569 0.6850 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR661469 3 0.4516 0.5104 0.000 0.252 0.736 0.012
#> SRR1500323 2 0.4222 0.5633 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1356705 2 0.5660 0.2841 0.000 0.576 0.396 0.028
#> SRR1464915 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1312406 3 0.1022 0.7324 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1350435 1 0.3105 0.7307 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR1389177 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1368072 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR601815 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613330 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1434502 3 0.7197 0.0932 0.000 0.392 0.468 0.140
#> SRR1394190 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1481083 1 0.2546 0.8143 0.900 0.000 0.008 0.092
#> SRR816382 3 0.1022 0.7324 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1318839 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1432390 4 0.4957 0.9259 0.000 0.012 0.320 0.668
#> SRR613126 3 0.6334 0.1569 0.000 0.456 0.484 0.060
#> SRR1089424 2 0.0188 0.8836 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347214 2 0.0336 0.8830 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309556 3 0.4934 0.5018 0.000 0.252 0.720 0.028
#> SRR1456027 4 0.4741 0.9396 0.004 0.000 0.328 0.668
#> SRR1400551 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1320469 1 0.4720 0.4675 0.672 0.000 0.324 0.004
#> SRR614251 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454310 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615105 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1433290 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR2166064 4 0.4741 0.9388 0.000 0.004 0.328 0.668
#> SRR601671 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR663874 2 0.1637 0.8440 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1409130 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659696 4 0.4857 0.9331 0.000 0.008 0.324 0.668
#> SRR1408249 2 0.5905 0.4294 0.000 0.636 0.304 0.060
#> SRR663284 2 0.5906 0.4484 0.000 0.644 0.292 0.064
#> SRR1402794 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR614852 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1348040 3 0.1489 0.7271 0.000 0.004 0.952 0.044
#> SRR1489610 2 0.0657 0.8821 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1488091 2 0.4304 0.5403 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1499566 2 0.5038 0.5070 0.000 0.684 0.296 0.020
#> SRR1361480 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1444501 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1415773 3 0.5409 0.0994 0.000 0.492 0.496 0.012
#> SRR1388832 3 0.0000 0.7282 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.3697 0.7709 0.000 0.852 0.100 0.048
#> SRR662918 2 0.6966 0.2037 0.000 0.532 0.128 0.340
#> SRR817421 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1400823 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1381348 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR608264 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1318560 1 0.2868 0.7250 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1454117 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312684 1 0.3161 0.7272 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR615044 3 0.4353 0.5313 0.000 0.232 0.756 0.012
#> SRR1432743 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1388873 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353517 1 0.4356 0.8024 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1357148 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1406008 2 0.0469 0.8822 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1396786 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446564 1 0.5630 0.5679 0.724 0.000 0.140 0.136
#> SRR1318465 3 0.1474 0.7215 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1431083 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR607117 2 0.7823 -0.2309 0.000 0.412 0.308 0.280
#> SRR655170 2 0.3215 0.8021 0.000 0.876 0.032 0.092
#> SRR1087825 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR662019 3 0.1022 0.7324 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1349209 4 0.4624 0.9310 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1326161 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345284 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416672 1 0.2814 0.8140 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR663356 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454328 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489286 1 0.2647 0.8141 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1092349 3 0.5387 0.3265 0.256 0.000 0.696 0.048
#> SRR1408183 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1084369 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR598452 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR660709 4 0.7587 0.4801 0.000 0.196 0.392 0.412
#> SRR809444 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375774 1 0.5929 0.4424 0.640 0.000 0.296 0.064
#> SRR1326292 4 0.4741 0.9396 0.004 0.000 0.328 0.668
#> SRR657139 1 0.5003 0.4758 0.676 0.000 0.308 0.016
#> SRR1440744 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353555 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1323087 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1381775 1 0.4036 0.7171 0.836 0.000 0.088 0.076
#> SRR1363908 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0336 0.7257 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1353663 1 0.0188 0.8051 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811771 1 0.0188 0.8051 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813983 1 0.3400 0.8127 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR815825 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR819054 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.7510 -0.1011 0.000 0.436 0.380 0.184
#> SRR1331922 3 0.5890 0.2464 0.268 0.000 0.660 0.072
#> SRR615479 3 0.4546 0.5058 0.000 0.256 0.732 0.012
#> SRR1375796 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1386991 3 0.3895 0.5772 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1355217 3 0.4927 0.4866 0.000 0.264 0.712 0.024
#> SRR1356290 3 0.5793 0.3423 0.000 0.360 0.600 0.040
#> SRR659507 3 0.4635 0.4950 0.000 0.268 0.720 0.012
#> SRR663296 1 0.0707 0.8002 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR598044 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1414727 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR663477 1 0.3105 0.7307 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR1354489 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1377800 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR614611 2 0.0376 0.8826 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR655052 4 0.6925 0.7357 0.000 0.128 0.328 0.544
#> SRR1478968 4 0.4741 0.9396 0.004 0.000 0.328 0.668
#> SRR1351280 2 0.1716 0.8561 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR613951 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1418022 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR661901 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1408161 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0707 0.7322 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR655040 2 0.7149 0.1603 0.000 0.528 0.316 0.156
#> SRR810225 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1325377 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR617829 3 0.3801 0.4141 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1402328 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480455 2 0.6300 0.4317 0.000 0.640 0.252 0.108
#> SRR1442104 3 0.1716 0.7092 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1453416 1 0.0817 0.7984 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1481396 3 0.0592 0.7316 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1414314 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663026 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1458683 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1370572 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1467567 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1468532 3 0.4420 0.5232 0.000 0.240 0.748 0.012
#> SRR1310735 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1440101 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR660260 3 0.5172 0.4884 0.000 0.260 0.704 0.036
#> SRR1071231 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1459125 3 0.7431 0.0324 0.000 0.380 0.448 0.172
#> SRR1337173 3 0.1302 0.7285 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1396250 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR2166376 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR659816 3 0.6707 0.1178 0.000 0.444 0.468 0.088
#> SRR1401379 2 0.1388 0.8681 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR600981 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1398335 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.6990 0.2435 0.000 0.552 0.304 0.144
#> SRR660115 1 0.0188 0.8051 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407950 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359780 2 0.0779 0.8765 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1490037 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR627439 2 0.7039 0.2969 0.000 0.568 0.176 0.256
#> SRR1397156 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1410221 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319648 2 0.3370 0.8102 0.000 0.872 0.048 0.080
#> SRR1092985 1 0.2473 0.7615 0.908 0.000 0.012 0.080
#> SRR656409 2 0.6303 0.5111 0.000 0.660 0.192 0.148
#> SRR1468658 3 0.2868 0.6033 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1390437 2 0.7393 0.0234 0.000 0.488 0.332 0.180
#> SRR658057 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR612635 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351480 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.4382 0.8017 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1441590 1 0.6023 0.3912 0.612 0.000 0.328 0.060
#> SRR659590 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1409575 2 0.0188 0.8836 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659911 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085519 3 0.1118 0.7319 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1345894 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1442928 3 0.4690 0.4854 0.000 0.276 0.712 0.012
#> SRR1464681 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1418880 1 0.0188 0.8067 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309070 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1365426 3 0.4546 0.5058 0.000 0.256 0.732 0.012
#> SRR1487947 3 0.4855 0.1792 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR659708 1 0.6147 0.2888 0.564 0.000 0.380 0.056
#> SRR603236 2 0.6386 0.1920 0.000 0.552 0.376 0.072
#> SRR660673 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1430729 2 0.0188 0.8834 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR663807 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1087245 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1339108 2 0.2224 0.8525 0.000 0.928 0.032 0.040
#> SRR613426 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR613879 2 0.2125 0.8282 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1385101 3 0.5705 0.4336 0.000 0.260 0.676 0.064
#> SRR1387966 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458852 2 0.2125 0.8281 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1430489 1 0.5602 0.2746 0.568 0.000 0.024 0.408
#> SRR1349231 3 0.5200 0.3379 0.264 0.000 0.700 0.036
#> SRR1376249 3 0.0817 0.7326 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1321987 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662653 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1390027 1 0.4277 0.8040 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1098474 2 0.0469 0.8822 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1383081 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR605101 2 0.2589 0.7885 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR818600 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367715 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351979 3 0.1302 0.7287 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1387054 3 0.3219 0.5495 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1444306 3 0.0469 0.7239 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1322662 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR665478 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612767 1 0.4010 0.6810 0.816 0.000 0.028 0.156
#> SRR1489030 2 0.0188 0.8841 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430375 3 0.5093 0.3746 0.000 0.348 0.640 0.012
#> SRR615225 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1401839 3 0.4307 0.5696 0.000 0.192 0.784 0.024
#> SRR1379110 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077288 3 0.0000 0.7282 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331639 4 0.4741 0.9388 0.000 0.004 0.328 0.668
#> SRR1342782 3 0.4767 0.4995 0.000 0.256 0.724 0.020
#> SRR1443003 3 0.0336 0.7285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR612839 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.1716 0.7093 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1395742 1 0.3311 0.8133 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1469014 1 0.3219 0.8140 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1387222 3 0.2704 0.6244 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR664063 3 0.4546 0.5058 0.000 0.256 0.732 0.012
#> SRR1488214 1 0.3217 0.7240 0.860 0.000 0.012 0.128
#> SRR654766 4 0.4585 0.9424 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1320321 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1417483 1 0.4406 0.8012 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1394231 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0592 0.8813 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1389497 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1367109 3 0.1211 0.7308 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR615311 1 0.1557 0.7835 0.944 0.000 0.000 0.056
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.4192 0.64753 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1380716 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612803 1 0.4604 0.62943 0.560 0.000 0.000 0.428 0.012
#> SRR613282 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 4 0.7850 -0.10377 0.256 0.000 0.176 0.452 0.116
#> SRR1084417 3 0.6588 0.08968 0.028 0.000 0.480 0.384 0.108
#> SRR1074359 3 0.4000 0.52768 0.000 0.004 0.800 0.132 0.064
#> SRR1419258 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403366 3 0.1478 0.65953 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR665262 5 0.5989 0.62843 0.000 0.112 0.412 0.000 0.476
#> SRR1499740 3 0.4333 0.46164 0.000 0.000 0.752 0.060 0.188
#> SRR1105057 2 0.0794 0.69408 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1439742 1 0.3661 0.74000 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR614599 3 0.3143 0.50445 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR612215 3 0.6055 -0.56496 0.000 0.120 0.472 0.000 0.408
#> SRR1094051 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.4323 0.69802 0.656 0.000 0.000 0.332 0.012
#> SRR1393449 3 0.7443 0.04603 0.096 0.000 0.416 0.380 0.108
#> SRR1409263 3 0.3921 0.54370 0.000 0.000 0.800 0.072 0.128
#> SRR1431288 1 0.5597 0.54883 0.488 0.000 0.000 0.440 0.072
#> SRR1334889 2 0.5432 0.40682 0.000 0.712 0.092 0.160 0.036
#> SRR614839 2 0.3281 0.69867 0.000 0.848 0.060 0.000 0.092
#> SRR658433 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1088581 3 0.5255 0.24610 0.000 0.000 0.624 0.304 0.072
#> SRR1328797 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.0290 0.68482 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1471117 1 0.4547 0.63501 0.588 0.000 0.000 0.400 0.012
#> SRR1311553 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1354955 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.4171 0.67050 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1447103 3 0.3521 0.45777 0.000 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1402153 3 0.3062 0.60790 0.000 0.004 0.868 0.080 0.048
#> SRR655887 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408529 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.1792 0.80467 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1384371 3 0.5580 0.08546 0.000 0.232 0.668 0.072 0.028
#> SRR1074670 3 0.0771 0.68713 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1375439 3 0.4509 0.37601 0.000 0.044 0.728 0.004 0.224
#> SRR1329003 4 0.5756 0.52664 0.000 0.000 0.204 0.620 0.176
#> SRR1404837 2 0.6710 0.40282 0.000 0.492 0.168 0.016 0.324
#> SRR1317920 4 0.3730 -0.15365 0.288 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR1455525 4 0.5756 0.52664 0.000 0.000 0.204 0.620 0.176
#> SRR613999 1 0.2624 0.78407 0.872 0.000 0.000 0.116 0.012
#> SRR1310836 1 0.4109 0.72665 0.700 0.000 0.000 0.288 0.012
#> SRR1499764 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0510 0.69058 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1068855 4 0.4656 -0.53925 0.480 0.000 0.000 0.508 0.012
#> SRR1375509 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612227 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388809 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1413872 4 0.7167 0.51907 0.000 0.044 0.208 0.504 0.244
#> SRR1452864 4 0.4325 0.09449 0.220 0.000 0.044 0.736 0.000
#> SRR1473078 3 0.2629 0.59958 0.000 0.000 0.860 0.004 0.136
#> SRR615814 2 0.3932 0.69526 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1325225 4 0.2069 0.42836 0.012 0.000 0.052 0.924 0.012
#> SRR1313687 2 0.7145 -0.14039 0.000 0.404 0.300 0.016 0.280
#> SRR1358220 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096662 2 0.5855 0.38592 0.000 0.632 0.048 0.268 0.052
#> SRR1487746 1 0.0404 0.80974 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.6141 0.71404 0.000 0.064 0.408 0.028 0.500
#> SRR660164 2 0.3586 0.70631 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR815783 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR809595 5 0.6150 0.66907 0.000 0.028 0.416 0.064 0.492
#> SRR1403133 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR815470 4 0.8382 0.17924 0.000 0.272 0.164 0.348 0.216
#> SRR1344382 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1478362 4 0.8227 0.29834 0.000 0.236 0.228 0.392 0.144
#> SRR1392186 2 0.4541 0.50093 0.000 0.752 0.192 0.024 0.032
#> SRR1347937 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.4978 0.55514 0.496 0.000 0.000 0.476 0.028
#> SRR1471594 1 0.4740 0.58001 0.516 0.000 0.000 0.468 0.016
#> SRR1354270 3 0.5375 0.37887 0.000 0.000 0.668 0.176 0.156
#> SRR612683 2 0.3074 0.71068 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1392901 3 0.0290 0.69313 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077805 3 0.4523 0.50510 0.000 0.036 0.776 0.148 0.040
#> SRR1360402 2 0.3895 0.69731 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1406112 3 0.0404 0.69165 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1355352 3 0.3848 0.51327 0.000 0.000 0.788 0.040 0.172
#> SRR656247 4 0.7632 -0.29377 0.368 0.000 0.104 0.404 0.124
#> SRR813656 2 0.2570 0.65546 0.000 0.888 0.084 0.000 0.028
#> SRR808244 4 0.5756 0.52664 0.000 0.000 0.204 0.620 0.176
#> SRR1387240 2 0.3661 0.70484 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1408595 4 0.6363 -0.40274 0.388 0.000 0.024 0.496 0.092
#> SRR1385277 4 0.6160 0.46576 0.000 0.000 0.284 0.544 0.172
#> SRR1435248 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1419110 3 0.5576 -0.42451 0.000 0.068 0.560 0.004 0.368
#> SRR1408682 3 0.5884 -0.45600 0.000 0.112 0.536 0.000 0.352
#> SRR1317134 1 0.2329 0.79660 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.5053 0.63848 0.000 0.624 0.052 0.000 0.324
#> SRR1453911 3 0.5959 -0.57758 0.000 0.108 0.472 0.000 0.420
#> SRR603164 3 0.2949 0.61130 0.000 0.012 0.880 0.072 0.036
#> SRR1383259 2 0.6393 0.25713 0.000 0.556 0.064 0.324 0.056
#> SRR1330854 3 0.7446 0.04103 0.096 0.000 0.408 0.388 0.108
#> SRR1452423 1 0.0404 0.80974 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1368574 2 0.5398 0.60675 0.000 0.648 0.112 0.000 0.240
#> SRR1468162 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361546 5 0.6091 0.68968 0.000 0.064 0.432 0.024 0.480
#> SRR1486156 1 0.2561 0.79219 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR660545 2 0.6609 0.53916 0.000 0.572 0.160 0.032 0.236
#> SRR615635 2 0.4126 0.65159 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1385411 2 0.6153 0.34839 0.000 0.656 0.092 0.184 0.068
#> SRR1342739 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0703 0.68437 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR662126 2 0.0703 0.68080 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1464601 2 0.4637 0.62668 0.000 0.536 0.012 0.000 0.452
#> SRR1071594 2 0.4538 0.62960 0.000 0.540 0.008 0.000 0.452
#> SRR612539 2 0.0794 0.69732 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR602010 5 0.6283 0.71025 0.000 0.084 0.392 0.024 0.500
#> SRR810249 2 0.3684 0.65814 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR818773 5 0.6195 0.69464 0.000 0.044 0.416 0.048 0.492
#> SRR1336569 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4302 0.70448 0.000 0.720 0.032 0.000 0.248
#> SRR1442754 3 0.7414 0.04069 0.096 0.000 0.408 0.392 0.104
#> SRR1334247 3 0.1043 0.67298 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR661639 1 0.1270 0.80806 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR613222 2 0.7186 -0.21264 0.000 0.448 0.360 0.140 0.052
#> SRR1459937 4 0.6361 0.47453 0.000 0.000 0.296 0.508 0.196
#> SRR2185018 1 0.4659 0.55711 0.500 0.000 0.000 0.488 0.012
#> SRR655732 2 0.4958 0.62924 0.000 0.568 0.032 0.000 0.400
#> SRR809348 1 0.4622 0.61803 0.548 0.000 0.000 0.440 0.012
#> SRR819261 3 0.0324 0.69429 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR661074 3 0.2726 0.63499 0.000 0.000 0.884 0.052 0.064
#> SRR1349851 4 0.4383 -0.43864 0.424 0.000 0.000 0.572 0.004
#> SRR1405123 4 0.7239 0.51967 0.000 0.052 0.200 0.504 0.244
#> SRR661096 2 0.1117 0.67128 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1320225 1 0.3910 0.73766 0.720 0.000 0.000 0.272 0.008
#> SRR1454651 4 0.5756 0.52664 0.000 0.000 0.204 0.620 0.176
#> SRR1307677 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466512 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658212 2 0.4453 0.55514 0.000 0.796 0.076 0.092 0.036
#> SRR1430525 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1344422 4 0.7239 0.51967 0.000 0.052 0.200 0.504 0.244
#> SRR1353924 2 0.0609 0.69236 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1314832 3 0.7502 0.04286 0.092 0.000 0.408 0.380 0.120
#> SRR1487570 4 0.4270 0.48323 0.000 0.000 0.204 0.748 0.048
#> SRR627431 2 0.4354 0.69099 0.000 0.768 0.068 0.004 0.160
#> SRR1418561 3 0.6378 -0.03821 0.000 0.000 0.476 0.348 0.176
#> SRR1448029 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813802 1 0.4288 0.70406 0.664 0.000 0.000 0.324 0.012
#> SRR815020 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2280 0.71066 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1435311 2 0.3774 0.70479 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR612395 3 0.5752 -0.49909 0.000 0.092 0.524 0.000 0.384
#> SRR603116 5 0.6822 0.22486 0.000 0.340 0.316 0.000 0.344
#> SRR1323152 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368264 5 0.6033 0.70817 0.000 0.084 0.392 0.012 0.512
#> SRR1326624 4 0.3816 -0.19213 0.304 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR1429265 3 0.1836 0.66756 0.000 0.000 0.932 0.036 0.032
#> SRR1327702 1 0.5125 0.61437 0.544 0.000 0.000 0.416 0.040
#> SRR615611 2 0.3812 0.54004 0.000 0.816 0.136 0.032 0.016
#> SRR1486799 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.6952 -0.02268 0.000 0.448 0.120 0.388 0.044
#> SRR815044 2 0.0510 0.68071 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1338560 2 0.3143 0.71394 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR615862 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480038 2 0.1851 0.70904 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR659436 3 0.2852 0.55511 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR613699 2 0.3586 0.70631 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1436563 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0865 0.67470 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1330327 4 0.6935 0.51359 0.000 0.024 0.228 0.504 0.244
#> SRR1489950 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1431927 1 0.3366 0.75946 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.5791 0.55157 0.516 0.000 0.004 0.400 0.080
#> SRR1318444 3 0.5610 0.33128 0.000 0.000 0.640 0.180 0.180
#> SRR600656 4 0.6586 0.49812 0.000 0.004 0.256 0.500 0.240
#> SRR658766 3 0.0912 0.68776 0.000 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR655946 3 0.4182 0.51015 0.000 0.016 0.784 0.164 0.036
#> SRR817282 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0609 0.68711 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1406418 1 0.3942 0.74207 0.728 0.000 0.000 0.260 0.012
#> SRR1090265 1 0.4251 0.70943 0.672 0.000 0.000 0.316 0.012
#> SRR1444120 3 0.5901 -0.66213 0.000 0.076 0.460 0.008 0.456
#> SRR1471965 1 0.0404 0.80974 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR612695 3 0.0960 0.68492 0.000 0.004 0.972 0.008 0.016
#> SRR662498 3 0.2670 0.53723 0.000 0.080 0.888 0.004 0.028
#> SRR1376764 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.5210 0.38322 0.000 0.000 0.680 0.200 0.120
#> SRR656860 2 0.1282 0.66316 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1480547 2 0.0609 0.67852 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1452515 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR615273 3 0.7258 0.10127 0.092 0.000 0.540 0.220 0.148
#> SRR601695 2 0.7421 -0.12161 0.000 0.392 0.380 0.052 0.176
#> SRR820907 2 0.3395 0.70942 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR812773 3 0.7846 -0.17883 0.196 0.000 0.420 0.092 0.292
#> SRR1405984 2 0.3816 0.66334 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1472794 2 0.4355 0.70463 0.000 0.732 0.044 0.000 0.224
#> SRR1365448 4 0.7721 0.02210 0.200 0.000 0.324 0.404 0.072
#> SRR1095720 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.1341 0.66511 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1080766 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1377862 1 0.4617 0.62241 0.552 0.000 0.000 0.436 0.012
#> SRR1332299 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.1168 0.67563 0.000 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1319710 2 0.4990 0.64230 0.000 0.628 0.048 0.000 0.324
#> SRR1326604 2 0.1270 0.69982 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1098879 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662245 5 0.7178 -0.19616 0.000 0.348 0.240 0.020 0.392
#> SRR1074719 2 0.4126 0.67054 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR816226 4 0.5725 0.52579 0.000 0.000 0.204 0.624 0.172
#> SRR601387 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR614575 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353900 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR662906 3 0.6887 -0.09065 0.000 0.172 0.564 0.052 0.212
#> SRR1350832 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1403280 2 0.0000 0.68801 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313969 4 0.6619 0.46166 0.000 0.004 0.304 0.480 0.212
#> SRR1388528 4 0.7379 -0.06302 0.104 0.000 0.400 0.404 0.092
#> SRR1452912 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.6154 0.66503 0.000 0.028 0.420 0.064 0.488
#> SRR655399 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.7301 -0.11698 0.000 0.460 0.312 0.048 0.180
#> SRR818901 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR607067 2 0.3658 0.57471 0.000 0.832 0.112 0.044 0.012
#> SRR1391420 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0404 0.69222 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR661961 3 0.2848 0.56260 0.000 0.000 0.840 0.004 0.156
#> SRR658259 2 0.2179 0.71187 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1310476 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4161 0.67236 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1365034 2 0.1818 0.64949 0.000 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR1478053 2 0.0404 0.68964 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1475300 2 0.2929 0.71651 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1328101 3 0.6127 -0.59393 0.000 0.128 0.456 0.000 0.416
#> SRR1322900 3 0.4252 0.48029 0.000 0.000 0.764 0.064 0.172
#> SRR1309942 2 0.3730 0.70348 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1345760 4 0.6550 0.50222 0.000 0.004 0.252 0.508 0.236
#> SRR1435418 1 0.3480 0.75251 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1402172 2 0.5329 0.37242 0.000 0.608 0.032 0.340 0.020
#> SRR1443436 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.6032 0.50134 0.000 0.508 0.124 0.000 0.368
#> SRR661469 3 0.5782 -0.60459 0.000 0.076 0.488 0.004 0.432
#> SRR1500323 2 0.6309 0.43009 0.000 0.472 0.160 0.000 0.368
#> SRR1356705 5 0.6530 0.04439 0.000 0.380 0.196 0.000 0.424
#> SRR1464915 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1399 0.67793 0.000 0.000 0.952 0.020 0.028
#> SRR1350435 4 0.4114 -0.34368 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR601815 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR613330 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6982 0.00979 0.000 0.528 0.296 0.100 0.076
#> SRR1394190 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.3912 0.75436 0.752 0.000 0.000 0.228 0.020
#> SRR816382 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.7330 0.51153 0.000 0.064 0.188 0.504 0.244
#> SRR613126 3 0.7039 -0.40209 0.000 0.232 0.460 0.020 0.288
#> SRR1089424 2 0.0703 0.69654 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1347214 2 0.1270 0.70383 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1309556 3 0.4733 0.44564 0.000 0.056 0.772 0.044 0.128
#> SRR1456027 4 0.5756 0.52664 0.000 0.000 0.204 0.620 0.176
#> SRR1400551 3 0.3810 0.51173 0.000 0.000 0.788 0.036 0.176
#> SRR1320469 3 0.7483 0.03493 0.104 0.000 0.400 0.392 0.104
#> SRR614251 2 0.3661 0.70484 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1454310 2 0.2020 0.71286 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR615105 4 0.6391 0.38827 0.000 0.004 0.364 0.480 0.152
#> SRR1433290 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2166064 4 0.7239 0.51967 0.000 0.052 0.200 0.504 0.244
#> SRR601671 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663874 2 0.5589 0.58102 0.000 0.548 0.080 0.000 0.372
#> SRR1409130 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR659696 4 0.7239 0.51967 0.000 0.052 0.200 0.504 0.244
#> SRR1408249 2 0.5206 0.44431 0.000 0.728 0.056 0.168 0.048
#> SRR663284 2 0.3479 0.60791 0.000 0.856 0.064 0.056 0.024
#> SRR1402794 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614852 4 0.6935 0.51359 0.000 0.024 0.228 0.504 0.244
#> SRR1348040 3 0.3942 0.56513 0.000 0.028 0.828 0.080 0.064
#> SRR1489610 2 0.5094 0.62907 0.000 0.600 0.048 0.000 0.352
#> SRR1488091 2 0.6188 0.46871 0.000 0.492 0.144 0.000 0.364
#> SRR1499566 2 0.4025 0.57167 0.000 0.812 0.124 0.028 0.036
#> SRR1361480 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444501 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415773 2 0.7155 0.06608 0.000 0.428 0.264 0.020 0.288
#> SRR1388832 3 0.4010 0.53809 0.000 0.000 0.796 0.088 0.116
#> SRR1394637 1 0.4547 0.63501 0.588 0.000 0.000 0.400 0.012
#> SRR606974 2 0.5003 0.68382 0.000 0.692 0.072 0.004 0.232
#> SRR662918 2 0.6153 0.24265 0.000 0.544 0.024 0.352 0.080
#> SRR817421 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR608264 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1318560 4 0.7611 -0.29305 0.368 0.000 0.136 0.404 0.092
#> SRR1454117 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1312684 4 0.4088 -0.32610 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR615044 3 0.5965 -0.13107 0.000 0.044 0.588 0.048 0.320
#> SRR1432743 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.2891 0.71084 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1353517 1 0.0771 0.81020 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1357148 3 0.1965 0.63454 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1406008 2 0.4696 0.64358 0.000 0.616 0.024 0.000 0.360
#> SRR1396786 2 0.4249 0.64105 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1446564 4 0.4788 0.08496 0.240 0.000 0.064 0.696 0.000
#> SRR1318465 3 0.0290 0.69313 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1431083 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.5841 0.25941 0.000 0.524 0.024 0.404 0.048
#> SRR655170 2 0.5299 0.61432 0.000 0.740 0.068 0.080 0.112
#> SRR1087825 4 0.6569 0.50154 0.000 0.004 0.252 0.504 0.240
#> SRR662019 3 0.3644 0.58102 0.000 0.000 0.824 0.096 0.080
#> SRR1349209 4 0.6148 0.48599 0.000 0.000 0.268 0.552 0.180
#> SRR1326161 2 0.4273 0.64102 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1345284 2 0.1732 0.70760 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1416672 1 0.2280 0.79743 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR663356 2 0.0609 0.69209 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1454328 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1489286 1 0.2471 0.79366 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1092349 3 0.8484 -0.17257 0.212 0.000 0.336 0.204 0.248
#> SRR1408183 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 4 0.8314 0.10182 0.000 0.260 0.304 0.308 0.128
#> SRR809444 1 0.4505 0.66425 0.604 0.000 0.000 0.384 0.012
#> SRR1089901 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1375774 4 0.6630 -0.38840 0.384 0.000 0.040 0.484 0.092
#> SRR1326292 4 0.5756 0.52664 0.000 0.000 0.204 0.620 0.176
#> SRR657139 4 0.7683 -0.21507 0.320 0.000 0.156 0.432 0.092
#> SRR1440744 2 0.0963 0.69677 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1353555 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.4457 0.66735 0.620 0.000 0.000 0.368 0.012
#> SRR1452334 4 0.7130 0.51746 0.000 0.040 0.216 0.504 0.240
#> SRR1381775 4 0.5790 -0.44192 0.408 0.000 0.000 0.500 0.092
#> SRR1363908 1 0.4402 0.69117 0.636 0.000 0.000 0.352 0.012
#> SRR1319626 2 0.4689 0.63488 0.000 0.560 0.016 0.000 0.424
#> SRR658989 3 0.2068 0.64107 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1353663 1 0.4650 0.57495 0.520 0.000 0.000 0.468 0.012
#> SRR811771 1 0.4622 0.61779 0.548 0.000 0.000 0.440 0.012
#> SRR813983 1 0.2179 0.79918 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR815825 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819054 2 0.4114 0.65253 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1367988 2 0.6505 -0.03726 0.000 0.528 0.344 0.088 0.040
#> SRR1331922 1 0.8183 -0.07719 0.320 0.000 0.288 0.288 0.104
#> SRR615479 5 0.6150 0.66907 0.000 0.028 0.416 0.064 0.492
#> SRR1375796 2 0.3684 0.70431 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1386991 3 0.5368 -0.28033 0.000 0.068 0.620 0.004 0.308
#> SRR1355217 3 0.6072 -0.62601 0.000 0.104 0.460 0.004 0.432
#> SRR1356290 3 0.6436 -0.39617 0.000 0.168 0.528 0.008 0.296
#> SRR659507 3 0.5677 -0.58969 0.000 0.080 0.496 0.000 0.424
#> SRR663296 1 0.4604 0.63098 0.560 0.000 0.000 0.428 0.012
#> SRR598044 2 0.4101 0.65320 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR661155 4 0.7239 0.51967 0.000 0.052 0.200 0.504 0.244
#> SRR1414727 3 0.3885 0.50665 0.000 0.000 0.784 0.040 0.176
#> SRR663477 4 0.3966 -0.25925 0.336 0.000 0.000 0.664 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.1965 0.61849 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR614611 2 0.1981 0.68388 0.000 0.924 0.048 0.000 0.028
#> SRR655052 4 0.8245 0.27241 0.000 0.248 0.216 0.388 0.148
#> SRR1478968 4 0.5756 0.52664 0.000 0.000 0.204 0.620 0.176
#> SRR1351280 2 0.1278 0.68173 0.000 0.960 0.004 0.020 0.016
#> SRR613951 4 0.7071 0.51477 0.000 0.044 0.220 0.524 0.212
#> SRR1418022 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.6301 0.46612 0.000 0.000 0.308 0.512 0.180
#> SRR1408161 1 0.4130 0.72434 0.696 0.000 0.000 0.292 0.012
#> SRR657054 3 0.1251 0.68084 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR655040 2 0.5890 0.33863 0.000 0.672 0.136 0.156 0.036
#> SRR810225 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1325377 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR617829 3 0.3400 0.55557 0.000 0.000 0.828 0.136 0.036
#> SRR1402328 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1480455 2 0.7962 -0.00688 0.000 0.340 0.288 0.076 0.296
#> SRR1442104 3 0.0290 0.69313 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1453416 1 0.6679 0.51048 0.504 0.000 0.052 0.360 0.084
#> SRR1481396 3 0.1018 0.68692 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1414314 2 0.3039 0.71161 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR663026 2 0.4045 0.65517 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1478386 2 0.0609 0.67852 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1458683 4 0.6325 0.45904 0.000 0.000 0.316 0.504 0.180
#> SRR1370572 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.6150 0.66907 0.000 0.028 0.416 0.064 0.492
#> SRR1310735 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.6935 0.51359 0.000 0.024 0.228 0.504 0.244
#> SRR660260 3 0.5846 -0.09247 0.000 0.324 0.592 0.048 0.036
#> SRR1071231 2 0.4074 0.66775 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1459125 2 0.7077 -0.00784 0.000 0.516 0.296 0.120 0.068
#> SRR1337173 3 0.1211 0.67047 0.000 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR1396250 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0671 0.68981 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR659816 2 0.6717 -0.13201 0.000 0.472 0.392 0.048 0.088
#> SRR1401379 2 0.4629 0.68473 0.000 0.704 0.052 0.000 0.244
#> SRR600981 4 0.6742 0.50711 0.000 0.012 0.244 0.504 0.240
#> SRR1398335 1 0.4457 0.68205 0.620 0.000 0.000 0.368 0.012
#> SRR1397218 2 0.5471 0.39260 0.000 0.704 0.176 0.084 0.036
#> SRR660115 1 0.4482 0.67618 0.612 0.000 0.000 0.376 0.012
#> SRR1407950 2 0.4273 0.64094 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1359780 2 0.4637 0.68691 0.000 0.728 0.076 0.000 0.196
#> SRR1490037 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.5882 0.36642 0.000 0.528 0.004 0.376 0.092
#> SRR1397156 1 0.0404 0.80974 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1410221 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1319648 2 0.3537 0.65545 0.000 0.856 0.052 0.052 0.040
#> SRR1092985 4 0.4656 -0.53913 0.480 0.000 0.000 0.508 0.012
#> SRR656409 2 0.4479 0.52745 0.000 0.760 0.016 0.180 0.044
#> SRR1468658 3 0.1981 0.65285 0.000 0.000 0.924 0.048 0.028
#> SRR1390437 2 0.6290 0.22931 0.000 0.620 0.196 0.152 0.032
#> SRR658057 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612635 2 0.0000 0.68801 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.3210 0.71188 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1436651 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 4 0.7109 -0.29663 0.336 0.000 0.084 0.488 0.092
#> SRR659590 2 0.4101 0.65326 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR614263 1 0.2305 0.78250 0.896 0.000 0.000 0.092 0.012
#> SRR1409575 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659911 2 0.3366 0.70958 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1085519 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442928 3 0.5616 -0.44699 0.000 0.084 0.552 0.000 0.364
#> SRR1464681 4 0.7239 0.51967 0.000 0.052 0.200 0.504 0.244
#> SRR1418880 1 0.3480 0.75251 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365426 5 0.6182 0.70635 0.000 0.056 0.416 0.036 0.492
#> SRR1487947 3 0.7377 0.04337 0.092 0.000 0.412 0.392 0.104
#> SRR659708 4 0.7475 -0.18994 0.288 0.000 0.128 0.484 0.100
#> SRR603236 3 0.6951 -0.27443 0.000 0.204 0.520 0.032 0.244
#> SRR660673 1 0.0404 0.80974 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1430729 2 0.4288 0.64939 0.000 0.612 0.004 0.000 0.384
#> SRR663807 2 0.4283 0.63526 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1087245 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339108 2 0.3631 0.70777 0.000 0.820 0.012 0.024 0.144
#> SRR613426 4 0.5933 0.52422 0.000 0.004 0.208 0.612 0.176
#> SRR613879 2 0.4555 0.69716 0.000 0.720 0.056 0.000 0.224
#> SRR1385101 3 0.8053 -0.27124 0.000 0.288 0.408 0.140 0.164
#> SRR1387966 2 0.3305 0.71053 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1458852 2 0.4437 0.62834 0.000 0.532 0.004 0.000 0.464
#> SRR1430489 4 0.0880 0.32295 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1349231 3 0.8590 -0.16830 0.224 0.000 0.284 0.252 0.240
#> SRR1376249 3 0.2511 0.63283 0.000 0.000 0.892 0.080 0.028
#> SRR1321987 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR662653 2 0.4287 0.63228 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1390027 1 0.1197 0.80862 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1098474 2 0.4238 0.65534 0.000 0.628 0.004 0.000 0.368
#> SRR1383081 2 0.2074 0.71140 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR2166960 2 0.3707 0.69930 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR605101 2 0.5726 0.58070 0.000 0.548 0.080 0.004 0.368
#> SRR818600 2 0.3561 0.70693 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1367715 2 0.0290 0.68816 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1351979 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.3510 0.56435 0.000 0.008 0.832 0.128 0.032
#> SRR1444306 3 0.0609 0.68824 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1322662 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3274 0.71046 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR612767 4 0.3336 -0.01815 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000
#> SRR1489030 2 0.3395 0.71804 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1430375 3 0.5794 -0.49692 0.000 0.096 0.520 0.000 0.384
#> SRR615225 4 0.7429 0.40802 0.000 0.072 0.284 0.480 0.164
#> SRR1401839 3 0.3916 0.45204 0.000 0.056 0.804 0.004 0.136
#> SRR1379110 2 0.0162 0.68655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077288 3 0.2221 0.65389 0.000 0.000 0.912 0.052 0.036
#> SRR1331639 4 0.7239 0.51967 0.000 0.052 0.200 0.504 0.244
#> SRR1342782 5 0.6217 0.70987 0.000 0.084 0.400 0.020 0.496
#> SRR1443003 3 0.0162 0.69525 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612839 1 0.4547 0.63501 0.588 0.000 0.000 0.400 0.012
#> SRR1470093 3 0.0162 0.69498 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1395742 1 0.1851 0.80405 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1469014 1 0.2377 0.79641 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1387222 3 0.2036 0.64356 0.000 0.000 0.920 0.056 0.024
#> SRR664063 5 0.6186 0.70792 0.000 0.052 0.412 0.040 0.496
#> SRR1488214 4 0.4045 -0.30018 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR654766 4 0.7202 0.47679 0.000 0.044 0.252 0.496 0.208
#> SRR1320321 2 0.3508 0.71223 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1071955 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.80939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.1270 0.70371 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1488470 2 0.0290 0.68482 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1389497 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.69611 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615311 1 0.4653 0.57915 0.516 0.000 0.000 0.472 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 6 0.3448 0.6019 0.000 0.280 0.000 0.000 0.004 0.716
#> SRR1380716 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 5 0.4428 0.3003 0.388 0.000 0.000 0.032 0.580 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 5 0.5347 0.4961 0.056 0.000 0.164 0.000 0.676 0.104
#> SRR1084417 5 0.5022 0.4211 0.000 0.000 0.280 0.004 0.620 0.096
#> SRR1074359 3 0.4836 0.5358 0.000 0.048 0.716 0.188 0.008 0.040
#> SRR1419258 3 0.0260 0.8197 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.4003 0.7424 0.000 0.000 0.784 0.104 0.016 0.096
#> SRR665262 6 0.7597 0.2175 0.000 0.016 0.148 0.184 0.228 0.424
#> SRR1499740 3 0.5922 0.5820 0.000 0.000 0.620 0.184 0.084 0.112
#> SRR1105057 2 0.0713 0.7424 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1439742 5 0.3867 0.0729 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512 0.000
#> SRR614599 3 0.5826 0.6015 0.000 0.000 0.640 0.148 0.100 0.112
#> SRR612215 6 0.7207 0.1707 0.000 0.004 0.168 0.140 0.228 0.460
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 5 0.3817 0.2265 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1393449 5 0.4943 0.4375 0.000 0.000 0.272 0.004 0.632 0.092
#> SRR1409263 3 0.4879 0.6983 0.000 0.000 0.732 0.076 0.096 0.096
#> SRR1431288 5 0.3717 0.3237 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1334889 2 0.2346 0.7002 0.000 0.868 0.008 0.124 0.000 0.000
#> SRR614839 2 0.2772 0.6792 0.000 0.816 0.004 0.000 0.000 0.180
#> SRR658433 6 0.2048 0.7568 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1088581 3 0.2996 0.5886 0.000 0.000 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR1328797 3 0.0291 0.8202 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1334512 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471117 5 0.3428 0.4197 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1354955 3 0.0508 0.8203 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR654802 3 0.0260 0.8197 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR660066 6 0.2709 0.7552 0.000 0.132 0.000 0.000 0.020 0.848
#> SRR1447103 3 0.6858 0.4161 0.000 0.000 0.500 0.176 0.208 0.116
#> SRR1402153 3 0.1265 0.8125 0.000 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR655887 2 0.0146 0.7391 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0405 0.8201 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR658707 1 0.3126 0.5998 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1384371 3 0.3559 0.7304 0.000 0.044 0.844 0.032 0.020 0.060
#> SRR1074670 3 0.2624 0.7995 0.000 0.000 0.884 0.028 0.020 0.068
#> SRR1375439 3 0.5127 0.6610 0.000 0.000 0.692 0.156 0.040 0.112
#> SRR1329003 4 0.4896 0.8194 0.000 0.000 0.216 0.652 0.132 0.000
#> SRR1404837 2 0.6651 0.4090 0.000 0.524 0.180 0.016 0.044 0.236
#> SRR1317920 5 0.4545 0.4745 0.092 0.000 0.000 0.224 0.684 0.000
#> SRR1455525 4 0.4908 0.8218 0.000 0.000 0.224 0.648 0.128 0.000
#> SRR613999 1 0.2597 0.7192 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1310836 5 0.3828 0.2042 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.1710 0.8154 0.000 0.000 0.936 0.028 0.020 0.016
#> SRR1068855 5 0.4646 0.3832 0.324 0.000 0.000 0.060 0.616 0.000
#> SRR1375509 3 0.2944 0.7859 0.000 0.000 0.860 0.020 0.028 0.092
#> SRR612227 3 0.0622 0.8203 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1388809 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1413872 4 0.3490 0.8560 0.000 0.040 0.176 0.784 0.000 0.000
#> SRR1452864 5 0.4400 0.4696 0.068 0.000 0.000 0.248 0.684 0.000
#> SRR1473078 3 0.3723 0.7500 0.000 0.000 0.800 0.096 0.008 0.096
#> SRR615814 6 0.2868 0.7520 0.000 0.132 0.000 0.000 0.028 0.840
#> SRR1325225 5 0.3835 0.3462 0.000 0.000 0.012 0.320 0.668 0.000
#> SRR1313687 2 0.6560 0.3806 0.000 0.520 0.088 0.012 0.084 0.296
#> SRR1358220 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.2664 0.6743 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0146 0.8718 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.8699 -0.0404 0.000 0.248 0.112 0.196 0.288 0.156
#> SRR660164 6 0.2950 0.7450 0.000 0.148 0.000 0.000 0.024 0.828
#> SRR815783 6 0.2357 0.7573 0.000 0.116 0.000 0.000 0.012 0.872
#> SRR809595 2 0.8930 -0.0239 0.000 0.236 0.192 0.196 0.220 0.156
#> SRR1403133 6 0.2191 0.7560 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR815470 4 0.7204 0.5436 0.000 0.112 0.284 0.404 0.000 0.200
#> SRR1344382 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0725 0.8202 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012 0.000
#> SRR1478362 4 0.5194 0.7811 0.000 0.140 0.232 0.624 0.000 0.004
#> SRR1392186 2 0.4792 0.6337 0.000 0.720 0.124 0.028 0.000 0.128
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 5 0.3830 0.3344 0.376 0.000 0.000 0.004 0.620 0.000
#> SRR1471594 5 0.3717 0.3161 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1354270 3 0.4902 0.4839 0.000 0.000 0.668 0.196 0.132 0.004
#> SRR612683 6 0.3620 0.5150 0.000 0.352 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR1392901 3 0.0520 0.8200 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1077805 3 0.3587 0.6107 0.000 0.040 0.772 0.188 0.000 0.000
#> SRR1360402 6 0.2909 0.7528 0.000 0.136 0.000 0.000 0.028 0.836
#> SRR1406112 3 0.2712 0.7856 0.000 0.000 0.864 0.048 0.000 0.088
#> SRR1355352 3 0.5548 0.6318 0.000 0.000 0.664 0.156 0.080 0.100
#> SRR656247 5 0.7061 0.4585 0.204 0.000 0.092 0.056 0.548 0.100
#> SRR813656 2 0.2331 0.7313 0.000 0.888 0.032 0.000 0.000 0.080
#> SRR808244 4 0.4847 0.8218 0.000 0.000 0.220 0.656 0.124 0.000
#> SRR1387240 6 0.2950 0.7459 0.000 0.148 0.000 0.000 0.024 0.828
#> SRR1408595 5 0.5588 0.4629 0.240 0.000 0.044 0.000 0.620 0.096
#> SRR1385277 4 0.5008 0.7978 0.000 0.004 0.268 0.628 0.100 0.000
#> SRR1435248 6 0.2048 0.7568 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1419110 3 0.7063 0.2616 0.000 0.000 0.424 0.088 0.232 0.256
#> SRR1408682 3 0.6604 -0.0719 0.000 0.008 0.384 0.020 0.216 0.372
#> SRR1317134 1 0.3330 0.5365 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.3733 0.5791 0.000 0.700 0.004 0.000 0.008 0.288
#> SRR1453911 6 0.7614 0.1565 0.000 0.012 0.212 0.144 0.228 0.404
#> SRR603164 3 0.2937 0.7398 0.000 0.000 0.852 0.100 0.004 0.044
#> SRR1383259 2 0.3409 0.5380 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1330854 5 0.5004 0.4275 0.000 0.000 0.276 0.004 0.624 0.096
#> SRR1452423 1 0.1141 0.8384 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1368574 2 0.6077 0.5548 0.000 0.620 0.044 0.088 0.032 0.216
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0520 0.8200 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1361546 5 0.8916 -0.0166 0.000 0.184 0.224 0.192 0.244 0.156
#> SRR1486156 1 0.3823 0.1873 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR660545 6 0.5545 0.6203 0.000 0.080 0.124 0.068 0.028 0.700
#> SRR615635 6 0.3782 0.4581 0.000 0.360 0.000 0.000 0.004 0.636
#> SRR1385411 2 0.3364 0.5948 0.000 0.780 0.024 0.196 0.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.2629 0.7870 0.000 0.000 0.868 0.040 0.000 0.092
#> SRR662126 2 0.0458 0.7422 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1464601 6 0.2723 0.7504 0.000 0.120 0.020 0.000 0.004 0.856
#> SRR1071594 6 0.2219 0.7532 0.000 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR612539 2 0.1814 0.7296 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR602010 5 0.8678 -0.0420 0.000 0.248 0.108 0.196 0.292 0.156
#> SRR810249 2 0.2703 0.6927 0.000 0.824 0.000 0.000 0.004 0.172
#> SRR818773 5 0.8822 -0.0124 0.000 0.236 0.144 0.192 0.272 0.156
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 6 0.3265 0.7486 0.000 0.140 0.008 0.004 0.024 0.824
#> SRR1442754 5 0.4881 0.4466 0.000 0.000 0.268 0.004 0.640 0.088
#> SRR1334247 3 0.3714 0.7519 0.000 0.000 0.808 0.080 0.016 0.096
#> SRR661639 1 0.3023 0.6239 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR613222 2 0.5086 0.3463 0.000 0.616 0.276 0.104 0.000 0.004
#> SRR1459937 4 0.4308 0.8401 0.000 0.024 0.248 0.704 0.024 0.000
#> SRR2185018 5 0.4843 0.3993 0.300 0.000 0.000 0.084 0.616 0.000
#> SRR655732 2 0.3991 0.1998 0.000 0.524 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR809348 5 0.3727 0.3161 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR819261 3 0.2137 0.8096 0.000 0.000 0.912 0.028 0.012 0.048
#> SRR661074 3 0.4258 0.7431 0.000 0.000 0.780 0.068 0.056 0.096
#> SRR1349851 5 0.4881 0.4481 0.232 0.000 0.000 0.120 0.648 0.000
#> SRR1405123 4 0.3646 0.8502 0.000 0.052 0.172 0.776 0.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0363 0.7386 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.3860 0.0479 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1454651 4 0.4896 0.8194 0.000 0.000 0.216 0.652 0.132 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658212 2 0.6584 0.1882 0.000 0.548 0.176 0.156 0.000 0.120
#> SRR1430525 3 0.0260 0.8197 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.3679 0.8604 0.000 0.040 0.200 0.760 0.000 0.000
#> SRR1353924 2 0.0363 0.7404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1314832 5 0.5548 0.2318 0.000 0.000 0.356 0.020 0.536 0.088
#> SRR1487570 4 0.5592 0.6828 0.000 0.000 0.200 0.544 0.256 0.000
#> SRR627431 6 0.5408 0.3422 0.000 0.364 0.108 0.004 0.000 0.524
#> SRR1418561 4 0.5184 0.7413 0.000 0.000 0.296 0.584 0.120 0.000
#> SRR1448029 3 0.0622 0.8211 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR813802 5 0.3756 0.2978 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 6 0.4401 0.3482 0.000 0.464 0.000 0.000 0.024 0.512
#> SRR1435311 6 0.3868 -0.1365 0.000 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR612395 6 0.7007 0.1158 0.000 0.004 0.228 0.080 0.228 0.460
#> SRR603116 6 0.8206 0.2073 0.000 0.096 0.192 0.108 0.200 0.404
#> SRR1323152 3 0.0291 0.8202 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1368264 5 0.8678 -0.0420 0.000 0.248 0.108 0.196 0.292 0.156
#> SRR1326624 5 0.4653 0.4779 0.120 0.000 0.000 0.196 0.684 0.000
#> SRR1429265 3 0.3637 0.7701 0.000 0.000 0.820 0.052 0.032 0.096
#> SRR1327702 5 0.3592 0.3813 0.344 0.000 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR615611 2 0.2056 0.7363 0.000 0.904 0.012 0.004 0.000 0.080
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4551 0.4895 0.000 0.672 0.000 0.260 0.064 0.004
#> SRR815044 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.3765 0.3734 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR615862 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.2562 0.6828 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR659436 3 0.5777 0.6175 0.000 0.000 0.648 0.124 0.116 0.112
#> SRR613699 6 0.2911 0.7471 0.000 0.144 0.000 0.000 0.024 0.832
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330327 4 0.3523 0.8558 0.000 0.040 0.180 0.780 0.000 0.000
#> SRR1489950 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1431927 1 0.3672 0.3421 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.8214 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 5 0.3835 0.4084 0.320 0.000 0.012 0.000 0.668 0.000
#> SRR1318444 3 0.4957 -0.0646 0.000 0.000 0.544 0.384 0.072 0.000
#> SRR600656 4 0.3520 0.8596 0.000 0.036 0.188 0.776 0.000 0.000
#> SRR658766 3 0.0909 0.8193 0.000 0.000 0.968 0.020 0.012 0.000
#> SRR655946 3 0.3727 0.5987 0.000 0.040 0.768 0.188 0.004 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.2762 0.7832 0.000 0.000 0.860 0.048 0.000 0.092
#> SRR1406418 5 0.3854 0.1359 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1090265 5 0.3747 0.3035 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1444120 5 0.8742 -0.0314 0.000 0.240 0.128 0.184 0.292 0.156
#> SRR1471965 1 0.0363 0.8670 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR612695 3 0.0717 0.8199 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR662498 3 0.3140 0.7034 0.000 0.000 0.840 0.016 0.028 0.116
#> SRR1376764 3 0.0820 0.8198 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012 0.000
#> SRR1377006 3 0.5098 0.2673 0.000 0.040 0.628 0.296 0.032 0.004
#> SRR656860 2 0.0547 0.7370 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0622 0.8197 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1324390 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR615273 5 0.6701 0.2356 0.004 0.000 0.308 0.092 0.484 0.112
#> SRR601695 6 0.6606 0.2997 0.000 0.044 0.288 0.108 0.032 0.528
#> SRR820907 6 0.2805 0.7272 0.000 0.184 0.000 0.000 0.004 0.812
#> SRR812773 5 0.8828 0.1478 0.032 0.080 0.224 0.192 0.356 0.116
#> SRR1405984 2 0.3658 0.6503 0.000 0.752 0.000 0.000 0.032 0.216
#> SRR1472794 6 0.4347 0.5980 0.000 0.288 0.012 0.000 0.028 0.672
#> SRR1365448 5 0.5252 0.4945 0.116 0.000 0.184 0.000 0.668 0.032
#> SRR1095720 3 0.0405 0.8226 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1435626 3 0.3424 0.7580 0.000 0.000 0.812 0.092 0.000 0.096
#> SRR1080766 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1377862 5 0.4419 0.3051 0.384 0.000 0.000 0.032 0.584 0.000
#> SRR1332299 3 0.0291 0.8213 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1467966 3 0.0363 0.8208 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0937 0.8131 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1319710 2 0.3756 0.5989 0.000 0.712 0.000 0.000 0.020 0.268
#> SRR1326604 2 0.0713 0.7381 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1098879 3 0.0291 0.8202 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR662245 6 0.4882 0.5607 0.000 0.032 0.248 0.020 0.020 0.680
#> SRR1074719 2 0.3823 0.3187 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR816226 4 0.5484 0.7105 0.000 0.000 0.204 0.568 0.228 0.000
#> SRR601387 6 0.2191 0.7560 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR614575 2 0.0458 0.7420 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1353900 6 0.2450 0.7568 0.000 0.116 0.000 0.000 0.016 0.868
#> SRR662906 3 0.5563 0.3502 0.000 0.012 0.620 0.104 0.016 0.248
#> SRR1350832 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1403280 2 0.1501 0.7341 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1313969 4 0.3244 0.8220 0.000 0.000 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR1388528 5 0.4880 0.4697 0.012 0.000 0.256 0.000 0.656 0.076
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.8904 0.0490 0.000 0.204 0.188 0.192 0.260 0.156
#> SRR655399 3 0.1225 0.8181 0.000 0.000 0.952 0.012 0.000 0.036
#> SRR1319753 2 0.6578 0.5459 0.000 0.608 0.120 0.088 0.040 0.144
#> SRR818901 3 0.0806 0.8205 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR607067 2 0.2563 0.7290 0.000 0.880 0.040 0.004 0.000 0.076
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.1556 0.7341 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR661961 3 0.4842 0.6744 0.000 0.000 0.708 0.160 0.024 0.108
#> SRR658259 2 0.2631 0.6790 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1310476 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 6 0.2748 0.7544 0.000 0.128 0.000 0.000 0.024 0.848
#> SRR1365034 2 0.0260 0.7385 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0291 0.7407 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1475300 2 0.3136 0.6388 0.000 0.768 0.000 0.000 0.004 0.228
#> SRR1328101 6 0.7379 0.1886 0.000 0.012 0.132 0.176 0.228 0.452
#> SRR1322900 3 0.6383 0.5370 0.000 0.000 0.576 0.160 0.148 0.116
#> SRR1309942 6 0.3065 0.7464 0.000 0.152 0.000 0.000 0.028 0.820
#> SRR1345760 4 0.4252 0.8574 0.000 0.040 0.220 0.724 0.016 0.000
#> SRR1435418 1 0.3782 0.2149 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1402172 2 0.3938 0.3648 0.000 0.660 0.016 0.324 0.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 6 0.3792 0.7265 0.000 0.116 0.048 0.004 0.024 0.808
#> SRR661469 5 0.8899 -0.0141 0.000 0.180 0.212 0.192 0.260 0.156
#> SRR1500323 6 0.3982 0.6967 0.000 0.112 0.100 0.004 0.004 0.780
#> SRR1356705 2 0.7673 0.3698 0.000 0.460 0.060 0.188 0.084 0.208
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.3557 0.7640 0.000 0.000 0.824 0.024 0.060 0.092
#> SRR1350435 5 0.4680 0.4783 0.132 0.000 0.000 0.184 0.684 0.000
#> SRR1389177 3 0.0622 0.8197 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1368072 6 0.2048 0.7568 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR601815 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR613330 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6880 0.0245 0.000 0.460 0.280 0.168 0.000 0.092
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.2941 0.6511 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR816382 3 0.0862 0.8217 0.000 0.000 0.972 0.008 0.016 0.004
#> SRR1318839 3 0.0405 0.8204 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1432390 4 0.3490 0.8560 0.000 0.040 0.176 0.784 0.000 0.000
#> SRR613126 6 0.5484 0.2776 0.000 0.016 0.408 0.024 0.036 0.516
#> SRR1089424 2 0.1714 0.7294 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1347214 2 0.2003 0.7221 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1309556 3 0.6502 0.3477 0.000 0.236 0.580 0.044 0.080 0.060
#> SRR1456027 4 0.4896 0.8194 0.000 0.000 0.216 0.652 0.132 0.000
#> SRR1400551 3 0.5327 0.6447 0.000 0.000 0.680 0.160 0.060 0.100
#> SRR1320469 5 0.5261 0.4576 0.020 0.000 0.272 0.000 0.620 0.088
#> SRR614251 6 0.3027 0.7439 0.000 0.148 0.000 0.000 0.028 0.824
#> SRR1454310 6 0.4401 0.3287 0.000 0.464 0.000 0.000 0.024 0.512
#> SRR615105 3 0.4444 -0.2182 0.000 0.028 0.536 0.436 0.000 0.000
#> SRR1433290 3 0.0146 0.8204 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.3490 0.8560 0.000 0.040 0.176 0.784 0.000 0.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663874 6 0.5480 0.2840 0.000 0.376 0.032 0.036 0.012 0.544
#> SRR1409130 6 0.2257 0.7573 0.000 0.116 0.000 0.000 0.008 0.876
#> SRR659696 4 0.3660 0.8420 0.000 0.060 0.160 0.780 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.2066 0.6997 0.000 0.904 0.000 0.024 0.072 0.000
#> SRR663284 2 0.1895 0.7378 0.000 0.912 0.000 0.016 0.000 0.072
#> SRR1402794 3 0.0909 0.8202 0.000 0.000 0.968 0.020 0.000 0.012
#> SRR614852 4 0.3490 0.8560 0.000 0.040 0.176 0.784 0.000 0.000
#> SRR1348040 3 0.5814 0.4624 0.000 0.172 0.660 0.056 0.088 0.024
#> SRR1489610 2 0.3819 0.5846 0.000 0.700 0.000 0.000 0.020 0.280
#> SRR1488091 6 0.4576 0.6629 0.000 0.120 0.120 0.016 0.004 0.740
#> SRR1499566 2 0.2222 0.7345 0.000 0.896 0.008 0.012 0.000 0.084
#> SRR1361480 2 0.0146 0.7391 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0260 0.8197 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.6418 0.5114 0.000 0.580 0.132 0.012 0.072 0.204
#> SRR1388832 3 0.5348 0.6420 0.000 0.000 0.684 0.068 0.140 0.108
#> SRR1394637 5 0.3428 0.4197 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR606974 6 0.4655 0.6969 0.000 0.140 0.088 0.004 0.028 0.740
#> SRR662918 4 0.4338 0.0683 0.000 0.488 0.020 0.492 0.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0405 0.8204 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0260 0.8197 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1318560 5 0.5764 0.4951 0.092 0.000 0.184 0.000 0.636 0.088
#> SRR1454117 6 0.2146 0.7568 0.000 0.116 0.000 0.000 0.004 0.880
#> SRR1312684 5 0.4693 0.4781 0.140 0.000 0.000 0.176 0.684 0.000
#> SRR615044 3 0.8628 0.1318 0.000 0.228 0.332 0.160 0.128 0.152
#> SRR1432743 3 0.0622 0.8197 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1388873 6 0.4011 0.6075 0.000 0.304 0.000 0.000 0.024 0.672
#> SRR1353517 1 0.0363 0.8673 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1357148 3 0.4648 0.7188 0.000 0.000 0.748 0.088 0.056 0.108
#> SRR1406008 2 0.3898 0.5669 0.000 0.684 0.000 0.000 0.020 0.296
#> SRR1396786 6 0.3050 0.6584 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1446564 5 0.4765 0.4696 0.072 0.000 0.012 0.244 0.672 0.000
#> SRR1318465 3 0.0622 0.8203 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.4576 0.2298 0.000 0.560 0.000 0.400 0.040 0.000
#> SRR655170 6 0.6468 0.3207 0.000 0.372 0.104 0.028 0.028 0.468
#> SRR1087825 4 0.3587 0.8593 0.000 0.040 0.188 0.772 0.000 0.000
#> SRR662019 3 0.3850 0.7636 0.000 0.000 0.812 0.060 0.064 0.064
#> SRR1349209 4 0.4874 0.8114 0.000 0.000 0.252 0.640 0.108 0.000
#> SRR1326161 6 0.2572 0.7548 0.000 0.136 0.000 0.000 0.012 0.852
#> SRR1345284 2 0.2378 0.6973 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1416672 1 0.3309 0.5427 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR663356 2 0.0363 0.7404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1454328 6 0.2048 0.7568 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1489286 1 0.3371 0.5206 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1092349 5 0.7713 0.3502 0.072 0.000 0.168 0.164 0.484 0.112
#> SRR1408183 3 0.0000 0.8214 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0260 0.8197 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0508 0.8203 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR660709 4 0.6369 0.5429 0.000 0.252 0.312 0.420 0.000 0.016
#> SRR809444 5 0.3737 0.3108 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1089901 6 0.2191 0.7560 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1375774 5 0.5804 0.4446 0.264 0.000 0.048 0.000 0.588 0.100
#> SRR1326292 4 0.4896 0.8194 0.000 0.000 0.216 0.652 0.132 0.000
#> SRR657139 5 0.5580 0.4911 0.056 0.000 0.216 0.000 0.636 0.092
#> SRR1440744 2 0.0790 0.7365 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 5 0.3428 0.4197 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR1452334 4 0.3794 0.8570 0.000 0.040 0.216 0.744 0.000 0.000
#> SRR1381775 5 0.3620 0.3613 0.352 0.000 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1363908 5 0.3797 0.2499 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1319626 2 0.3862 0.2202 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR658989 3 0.2825 0.7968 0.000 0.000 0.868 0.060 0.008 0.064
#> SRR1353663 5 0.4292 0.3753 0.340 0.000 0.000 0.032 0.628 0.000
#> SRR811771 5 0.4534 0.3102 0.380 0.000 0.000 0.040 0.580 0.000
#> SRR813983 1 0.3244 0.5651 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR815825 3 0.0405 0.8204 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR819054 2 0.3899 0.3612 0.000 0.592 0.000 0.000 0.004 0.404
#> SRR1367988 2 0.5646 0.1777 0.000 0.504 0.396 0.052 0.000 0.048
#> SRR1331922 5 0.7751 0.4240 0.172 0.000 0.212 0.060 0.456 0.100
#> SRR615479 5 0.8754 0.0522 0.000 0.192 0.144 0.196 0.312 0.156
#> SRR1375796 6 0.2909 0.7483 0.000 0.136 0.000 0.000 0.028 0.836
#> SRR1386991 3 0.5184 0.5466 0.000 0.000 0.668 0.032 0.204 0.096
#> SRR1355217 2 0.8842 0.0923 0.000 0.256 0.128 0.184 0.232 0.200
#> SRR1356290 6 0.5218 0.2601 0.000 0.012 0.416 0.020 0.028 0.524
#> SRR659507 6 0.7497 -0.0573 0.000 0.000 0.280 0.148 0.228 0.344
#> SRR663296 5 0.3706 0.3297 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR598044 2 0.3707 0.5552 0.000 0.680 0.000 0.000 0.008 0.312
#> SRR661155 4 0.3490 0.8560 0.000 0.040 0.176 0.784 0.000 0.000
#> SRR1414727 3 0.5606 0.6220 0.000 0.000 0.656 0.160 0.072 0.112
#> SRR663477 5 0.4663 0.4782 0.124 0.000 0.000 0.192 0.684 0.000
#> SRR1354489 3 0.0622 0.8197 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1377800 3 0.4189 0.7013 0.000 0.000 0.748 0.152 0.004 0.096
#> SRR614611 2 0.6176 -0.1404 0.000 0.500 0.088 0.020 0.028 0.364
#> SRR655052 4 0.5785 0.7494 0.000 0.140 0.236 0.592 0.000 0.032
#> SRR1478968 4 0.4884 0.8210 0.000 0.000 0.220 0.652 0.128 0.000
#> SRR1351280 2 0.1701 0.7384 0.000 0.920 0.000 0.008 0.000 0.072
#> SRR613951 4 0.5008 0.8490 0.000 0.040 0.224 0.676 0.060 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.5000 0.8100 0.000 0.024 0.272 0.644 0.060 0.000
#> SRR1408161 5 0.3774 0.2793 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR657054 3 0.2577 0.8033 0.000 0.000 0.888 0.056 0.016 0.040
#> SRR655040 2 0.1806 0.7220 0.000 0.908 0.000 0.088 0.000 0.004
#> SRR810225 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1325377 6 0.2146 0.7568 0.000 0.116 0.000 0.000 0.004 0.880
#> SRR617829 3 0.3674 0.5794 0.000 0.012 0.756 0.220 0.004 0.008
#> SRR1402328 6 0.2048 0.7568 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1480455 6 0.6845 0.3440 0.000 0.076 0.240 0.112 0.032 0.540
#> SRR1442104 3 0.0777 0.8122 0.000 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1453416 5 0.4617 0.4583 0.252 0.000 0.084 0.000 0.664 0.000
#> SRR1481396 3 0.3500 0.7744 0.000 0.000 0.828 0.048 0.028 0.096
#> SRR1414314 6 0.4214 0.5883 0.000 0.320 0.000 0.004 0.024 0.652
#> SRR663026 2 0.3565 0.5646 0.000 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1478386 2 0.0260 0.7409 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1458683 4 0.3927 0.7296 0.000 0.012 0.344 0.644 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.8925 0.0261 0.000 0.192 0.220 0.192 0.240 0.156
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.3490 0.8560 0.000 0.040 0.176 0.784 0.000 0.000
#> SRR660260 3 0.4569 0.5796 0.000 0.016 0.740 0.048 0.020 0.176
#> SRR1071231 2 0.3923 0.2849 0.000 0.580 0.000 0.000 0.004 0.416
#> SRR1459125 2 0.5723 0.0447 0.000 0.544 0.232 0.220 0.000 0.004
#> SRR1337173 3 0.1088 0.8176 0.000 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1396250 3 0.0508 0.8203 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR2166376 3 0.1668 0.8147 0.000 0.000 0.928 0.060 0.008 0.004
#> SRR659816 6 0.6883 0.2276 0.000 0.084 0.336 0.088 0.024 0.468
#> SRR1401379 2 0.3541 0.6110 0.000 0.728 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR600981 4 0.3821 0.8556 0.000 0.040 0.220 0.740 0.000 0.000
#> SRR1398335 5 0.3823 0.2142 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1397218 2 0.4315 0.5945 0.000 0.756 0.148 0.072 0.000 0.024
#> SRR660115 1 0.3851 0.0862 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1407950 6 0.2446 0.7562 0.000 0.124 0.000 0.000 0.012 0.864
#> SRR1359780 6 0.5755 0.5943 0.000 0.224 0.124 0.008 0.028 0.616
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.5580 0.3850 0.000 0.600 0.000 0.272 0.092 0.036
#> SRR1397156 1 0.0146 0.8718 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1410221 6 0.2048 0.7568 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1319648 2 0.1967 0.7353 0.000 0.904 0.000 0.012 0.000 0.084
#> SRR1092985 5 0.4619 0.4490 0.244 0.000 0.000 0.088 0.668 0.000
#> SRR656409 2 0.1501 0.7236 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.1204 0.8026 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1390437 2 0.4490 0.4937 0.000 0.716 0.172 0.108 0.000 0.004
#> SRR658057 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612635 2 0.1444 0.7349 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1351480 2 0.3851 0.2150 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 5 0.5919 0.4839 0.188 0.000 0.096 0.000 0.620 0.096
#> SRR659590 6 0.3971 0.1661 0.000 0.448 0.000 0.000 0.004 0.548
#> SRR614263 1 0.0937 0.8472 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659911 6 0.3364 0.7166 0.000 0.196 0.000 0.000 0.024 0.780
#> SRR1085519 3 0.0146 0.8210 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0405 0.8201 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1442928 6 0.6953 0.0462 0.000 0.004 0.276 0.060 0.228 0.432
#> SRR1464681 4 0.3523 0.8563 0.000 0.040 0.180 0.780 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.3789 0.2044 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416 0.000
#> SRR1309070 3 0.0717 0.8200 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1365426 5 0.8708 -0.0215 0.000 0.236 0.116 0.196 0.296 0.156
#> SRR1487947 5 0.4789 0.4481 0.000 0.000 0.268 0.000 0.640 0.092
#> SRR659708 5 0.6359 0.4923 0.116 0.000 0.164 0.012 0.604 0.104
#> SRR603236 6 0.5870 0.2981 0.000 0.008 0.336 0.076 0.036 0.544
#> SRR660673 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.5114 0.0658 0.000 0.484 0.012 0.016 0.024 0.464
#> SRR663807 6 0.2302 0.7575 0.000 0.120 0.000 0.000 0.008 0.872
#> SRR1087245 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.3229 0.6916 0.000 0.804 0.000 0.004 0.020 0.172
#> SRR613426 4 0.5419 0.8313 0.000 0.028 0.220 0.636 0.116 0.000
#> SRR613879 6 0.3454 0.7478 0.000 0.140 0.016 0.004 0.024 0.816
#> SRR1385101 2 0.8108 0.0469 0.000 0.368 0.288 0.164 0.108 0.072
#> SRR1387966 6 0.3511 0.6971 0.000 0.216 0.000 0.000 0.024 0.760
#> SRR1458852 6 0.2355 0.7575 0.000 0.112 0.004 0.000 0.008 0.876
#> SRR1430489 5 0.3802 0.3803 0.012 0.000 0.000 0.312 0.676 0.000
#> SRR1349231 5 0.7228 0.4239 0.072 0.000 0.120 0.148 0.552 0.108
#> SRR1376249 3 0.3461 0.7739 0.000 0.000 0.832 0.032 0.044 0.092
#> SRR1321987 6 0.2191 0.7573 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR662653 6 0.2300 0.7471 0.000 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1390027 1 0.1610 0.8104 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1098474 2 0.3528 0.5728 0.000 0.700 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR1383081 2 0.2631 0.6695 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR2166960 2 0.3528 0.5654 0.000 0.700 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR605101 2 0.6760 0.4401 0.000 0.532 0.088 0.060 0.044 0.276
#> SRR818600 6 0.2950 0.7459 0.000 0.148 0.000 0.000 0.024 0.828
#> SRR1367715 2 0.0865 0.7417 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1351979 3 0.0260 0.8197 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.3317 0.6586 0.000 0.032 0.808 0.156 0.004 0.000
#> SRR1444306 3 0.2933 0.7807 0.000 0.000 0.856 0.040 0.008 0.096
#> SRR1322662 1 0.0146 0.8718 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR665478 6 0.3364 0.7147 0.000 0.196 0.000 0.000 0.024 0.780
#> SRR612767 5 0.4400 0.4696 0.068 0.000 0.000 0.248 0.684 0.000
#> SRR1489030 6 0.3672 0.5270 0.000 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1430375 6 0.7068 0.0889 0.000 0.004 0.316 0.064 0.228 0.388
#> SRR615225 4 0.3938 0.8541 0.000 0.044 0.228 0.728 0.000 0.000
#> SRR1401839 3 0.2401 0.7986 0.000 0.000 0.900 0.024 0.028 0.048
#> SRR1379110 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.3902 0.7601 0.000 0.000 0.804 0.056 0.044 0.096
#> SRR1331639 4 0.3490 0.8560 0.000 0.040 0.176 0.784 0.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.8684 0.0897 0.000 0.284 0.108 0.196 0.256 0.156
#> SRR1443003 3 0.2518 0.7689 0.000 0.000 0.880 0.016 0.092 0.012
#> SRR612839 5 0.3499 0.4078 0.320 0.000 0.000 0.000 0.680 0.000
#> SRR1470093 3 0.0291 0.8202 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1395742 1 0.1957 0.7870 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1469014 1 0.3288 0.5722 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1387222 3 0.1958 0.7729 0.000 0.000 0.896 0.100 0.004 0.000
#> SRR664063 5 0.8708 -0.0215 0.000 0.236 0.116 0.196 0.296 0.156
#> SRR1488214 5 0.4701 0.4774 0.148 0.000 0.000 0.168 0.684 0.000
#> SRR654766 4 0.3848 0.8558 0.000 0.040 0.224 0.736 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.3860 0.2155 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8736 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2135 0.7120 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1488470 2 0.0000 0.7403 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.8214 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0405 0.8211 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR615311 5 0.3706 0.3297 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.987 0.961 0.984 0.4425 0.562 0.562
#> 3 3 0.896 0.919 0.966 0.4689 0.739 0.556
#> 4 4 0.683 0.610 0.788 0.1301 0.836 0.574
#> 5 5 0.779 0.772 0.877 0.0640 0.831 0.474
#> 6 6 0.768 0.652 0.809 0.0342 0.959 0.823
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1499740 1 0.9686 0.3357 0.604 0.396
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.9491 0.4312 0.368 0.632
#> SRR1375439 2 0.5946 0.8293 0.144 0.856
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 0.9710 0.3244 0.600 0.400
#> SRR612227 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.7139 0.7593 0.196 0.804
#> SRR615814 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.9996 0.0616 0.488 0.512
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1355352 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.7299 0.7475 0.204 0.796
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.8443 0.6348 0.272 0.728
#> SRR662126 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.6973 0.7707 0.188 0.812
#> SRR810249 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.9922 0.2037 0.448 0.552
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.7376 0.7419 0.208 0.792
#> SRR661074 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR661096 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.2603 0.9412 0.044 0.956
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0672 0.9752 0.008 0.992
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.9909 0.2169 0.444 0.556
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.7299 0.7475 0.204 0.796
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.4939 0.8733 0.108 0.892
#> SRR1319753 2 0.3879 0.9083 0.076 0.924
#> SRR818901 2 0.1184 0.9678 0.016 0.984
#> SRR607067 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.7219 0.7534 0.200 0.800
#> SRR658259 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0376 0.9788 0.004 0.996
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.2948 0.9345 0.948 0.052
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0376 0.9788 0.004 0.996
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1400551 1 0.6148 0.8142 0.848 0.152
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.6973 0.7648 0.188 0.812
#> SRR663284 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.2778 0.9372 0.048 0.952
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.9635 0.3801 0.388 0.612
#> SRR1432743 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR662019 1 0.9635 0.3579 0.612 0.388
#> SRR1349209 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0376 0.9788 0.004 0.996
#> SRR660709 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.8016 0.6723 0.756 0.244
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1414727 1 0.8608 0.5983 0.716 0.284
#> SRR663477 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.7219 0.7534 0.200 0.800
#> SRR614611 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.6712 0.7873 0.176 0.824
#> SRR655040 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.1414 0.9668 0.980 0.020
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.2778 0.9387 0.952 0.048
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.7528 0.7294 0.216 0.784
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR613426 1 0.5408 0.8516 0.876 0.124
#> SRR613879 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.9710 0.3478 0.400 0.600
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1376249 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.4431 0.8909 0.092 0.908
#> SRR1443003 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.7602 0.7231 0.220 0.780
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.2537 0.8976 0.920 0.000 0.080
#> SRR1074359 2 0.4235 0.7829 0.000 0.824 0.176
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0237 0.9471 0.000 0.004 0.996
#> SRR665262 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499740 3 0.6260 0.1863 0.448 0.000 0.552
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0237 0.9471 0.000 0.004 0.996
#> SRR612215 2 0.2165 0.9097 0.000 0.936 0.064
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.5926 0.4386 0.644 0.000 0.356
#> SRR1409263 3 0.0892 0.9349 0.020 0.000 0.980
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 2 0.6154 0.3488 0.000 0.592 0.408
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 3 0.1860 0.9088 0.000 0.052 0.948
#> SRR1329003 3 0.4605 0.7299 0.204 0.000 0.796
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 3 0.4931 0.7072 0.000 0.232 0.768
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.3192 0.8589 0.112 0.888 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 1 0.5254 0.6280 0.736 0.264 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.1411 0.9337 0.000 0.964 0.036
#> SRR1392186 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.4605 0.7481 0.000 0.204 0.796
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.5327 0.6480 0.000 0.728 0.272
#> SRR1408682 2 0.4452 0.7693 0.000 0.808 0.192
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.1529 0.9305 0.000 0.960 0.040
#> SRR603164 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.1289 0.9477 0.968 0.000 0.032
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.8631 0.5006 0.220 0.600 0.180
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.4555 0.7486 0.200 0.800 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.6126 0.3147 0.600 0.400 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0424 0.9557 0.008 0.992 0.000
#> SRR1459937 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0237 0.9470 0.004 0.000 0.996
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.4002 0.7970 0.000 0.840 0.160
#> SRR661096 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.4555 0.7358 0.200 0.000 0.800
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.5835 0.4708 0.000 0.660 0.340
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.6307 0.0336 0.512 0.000 0.488
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0747 0.9500 0.000 0.984 0.016
#> SRR1418561 3 0.5098 0.6615 0.248 0.000 0.752
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.5016 0.7005 0.000 0.760 0.240
#> SRR603116 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.1031 0.9423 0.024 0.976 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.1031 0.9323 0.000 0.024 0.976
#> SRR613699 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 3 0.1163 0.9296 0.000 0.028 0.972
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR600656 3 0.1753 0.9122 0.000 0.048 0.952
#> SRR658766 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.4605 0.7490 0.000 0.204 0.796
#> SRR817282 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.3879 0.8190 0.000 0.848 0.152
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.3482 0.8350 0.000 0.128 0.872
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0237 0.9471 0.000 0.004 0.996
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.3879 0.8198 0.000 0.848 0.152
#> SRR820907 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.1643 0.9333 0.956 0.000 0.044
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0237 0.9471 0.000 0.004 0.996
#> SRR658259 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0237 0.9591 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322900 1 0.5591 0.5610 0.696 0.000 0.304
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 3 0.0892 0.9357 0.000 0.020 0.980
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 2 0.5247 0.7172 0.008 0.768 0.224
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.4842 0.7163 0.000 0.776 0.224
#> SRR613126 2 0.4399 0.7763 0.000 0.812 0.188
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.7551 0.3556 0.372 0.580 0.048
#> SRR1456027 3 0.4062 0.7847 0.164 0.000 0.836
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 1 0.0237 0.9734 0.996 0.000 0.004
#> SRR614251 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0424 0.9559 0.000 0.992 0.008
#> SRR601671 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 3 0.0592 0.9416 0.000 0.012 0.988
#> SRR1348040 3 0.5859 0.4797 0.344 0.000 0.656
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 1 0.3412 0.8446 0.876 0.000 0.124
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0237 0.9591 0.000 0.996 0.004
#> SRR662918 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0237 0.9734 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 1 0.4452 0.7422 0.808 0.192 0.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.3267 0.8480 0.000 0.116 0.884
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR662019 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.2066 0.9017 0.000 0.060 0.940
#> SRR809444 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 3 0.4452 0.7471 0.192 0.000 0.808
#> SRR657139 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.4555 0.7535 0.000 0.200 0.800
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 3 0.5216 0.6360 0.000 0.260 0.740
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0424 0.9685 0.992 0.008 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 2 0.6154 0.3488 0.000 0.592 0.408
#> SRR1355217 2 0.4452 0.7692 0.000 0.808 0.192
#> SRR1356290 2 0.3412 0.8516 0.000 0.876 0.124
#> SRR659507 2 0.6299 0.1337 0.000 0.524 0.476
#> SRR663296 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.5905 0.4423 0.000 0.648 0.352
#> SRR1414727 3 0.6274 0.1819 0.456 0.000 0.544
#> SRR663477 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 2 0.2796 0.8819 0.000 0.908 0.092
#> SRR1478968 3 0.2959 0.8622 0.100 0.000 0.900
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.5178 0.6689 0.000 0.256 0.744
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0237 0.9471 0.000 0.004 0.996
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.2711 0.8842 0.912 0.000 0.088
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR660260 3 0.5529 0.5656 0.000 0.296 0.704
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.2537 0.8959 0.000 0.920 0.080
#> SRR1337173 3 0.0892 0.9354 0.000 0.020 0.980
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.4121 0.8019 0.000 0.832 0.168
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 3 0.3619 0.8340 0.000 0.136 0.864
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 2 0.0237 0.9591 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.4555 0.7583 0.000 0.800 0.200
#> SRR1464681 2 0.2796 0.8799 0.000 0.908 0.092
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.4555 0.7486 0.200 0.800 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 2 0.5098 0.6891 0.000 0.752 0.248
#> SRR660673 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.6111 0.3259 0.604 0.396 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.3192 0.8549 0.000 0.112 0.888
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.3879 0.8191 0.000 0.848 0.152
#> SRR615225 3 0.3941 0.8142 0.000 0.156 0.844
#> SRR1401839 2 0.6286 0.1776 0.000 0.536 0.464
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0237 0.9468 0.004 0.000 0.996
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.4733 0.7514 0.196 0.800 0.004
#> SRR1443003 3 0.6192 0.2413 0.000 0.420 0.580
#> SRR612839 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.4974 0.6943 0.236 0.764 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 3 0.5835 0.4674 0.000 0.340 0.660
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9496 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9768 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.4948 0.19843 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1380716 4 0.4277 0.51265 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR612803 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0188 0.96769 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.4008 0.65288 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1074359 4 0.5318 0.44016 0.000 0.072 0.196 0.732
#> SRR1419258 3 0.0188 0.80147 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403366 2 0.4992 -0.34988 0.000 0.524 0.476 0.000
#> SRR665262 2 0.0469 0.58704 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1499740 2 0.6546 -0.26750 0.080 0.524 0.396 0.000
#> SRR1105057 4 0.4977 0.19802 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1439742 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 2 0.4855 -0.16490 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR612215 2 0.1022 0.57855 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.4697 0.42025 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1409263 3 0.4175 0.67807 0.200 0.016 0.784 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 4 0.1389 0.60371 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR614839 2 0.4193 0.54021 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR658433 2 0.3975 0.57076 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1088581 3 0.3688 0.69097 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1328797 3 0.0000 0.80240 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334512 4 0.1557 0.60319 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1471117 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4406 0.50938 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1354955 3 0.0817 0.80390 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR654802 3 0.0592 0.80386 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR660066 2 0.4941 0.20831 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1447103 2 0.3311 0.45511 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1402153 3 0.0188 0.80147 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655887 4 0.4304 0.50949 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1408529 3 0.3356 0.75956 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.4535 0.52283 0.000 0.704 0.004 0.292
#> SRR1074670 3 0.0188 0.80299 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1375439 2 0.4925 -0.22799 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1329003 3 0.6323 0.37106 0.060 0.000 0.500 0.440
#> SRR1404837 2 0.1022 0.60019 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1317920 1 0.0336 0.96403 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1455525 3 0.4382 0.60808 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR613999 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.4941 0.50853 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0469 0.80359 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR612227 3 0.4761 0.59019 0.000 0.372 0.628 0.000
#> SRR1388809 2 0.4250 0.53663 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1413872 4 0.2760 0.50688 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1452864 1 0.0817 0.95027 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1473078 3 0.4790 0.58814 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR615814 2 0.4981 0.10018 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1325225 1 0.2489 0.88886 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1313687 2 0.4008 0.56783 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1358220 4 0.4866 0.34441 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1096662 4 0.0469 0.60040 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1487746 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0592 0.58563 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR660164 2 0.4643 0.43499 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR815783 2 0.3610 0.59539 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR809595 2 0.4337 0.46998 0.140 0.808 0.052 0.000
#> SRR1403133 2 0.3400 0.60204 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR815470 4 0.1022 0.60380 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1344382 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.3219 0.76170 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1478362 4 0.1389 0.57536 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1392186 2 0.3907 0.56297 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1347937 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.1716 0.77856 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR612683 4 0.4981 0.18936 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1392901 3 0.2216 0.79312 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1077805 3 0.4477 0.57266 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1360402 4 0.5000 0.03840 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1406112 3 0.4585 0.64376 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1355352 3 0.5787 0.67889 0.076 0.244 0.680 0.000
#> SRR656247 1 0.0336 0.96453 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR813656 4 0.4643 0.45010 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR808244 3 0.3356 0.71396 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1387240 2 0.4888 0.27385 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1408595 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 3 0.4830 0.49201 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1435248 2 0.4304 0.52753 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1419110 2 0.2589 0.52443 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1408682 2 0.1792 0.55851 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.3444 0.60011 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1453911 2 0.0817 0.58232 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR603164 3 0.1305 0.80406 0.000 0.036 0.960 0.004
#> SRR1383259 4 0.0469 0.60040 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1330854 1 0.4477 0.52154 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.3942 0.56994 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1468162 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.3610 0.73875 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1361546 2 0.3821 0.50337 0.040 0.840 0.120 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.4761 0.37850 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR615635 2 0.4989 0.07005 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1385411 4 0.1022 0.60401 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1342739 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.2345 0.79018 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR662126 4 0.2530 0.59478 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1464601 2 0.3172 0.60610 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1071594 2 0.4941 0.21271 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR612539 4 0.5000 0.06292 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR602010 2 0.0927 0.58313 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR810249 2 0.4989 0.08102 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR818773 2 0.4227 0.48241 0.120 0.820 0.060 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.1940 0.60371 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1442754 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.4992 0.44833 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 4 0.5800 0.50286 0.128 0.164 0.000 0.708
#> SRR1459937 3 0.4817 0.49837 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR2185018 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.3764 0.58580 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR809348 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0188 0.80299 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR661074 3 0.3554 0.74020 0.136 0.020 0.844 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.0188 0.59481 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR661096 4 0.4967 0.23218 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1320225 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 3 0.6387 0.35993 0.064 0.000 0.492 0.444
#> SRR1307677 4 0.2647 0.59280 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1466512 4 0.4643 0.44339 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR658212 4 0.1022 0.60395 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1430525 3 0.0000 0.80240 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.1022 0.58308 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1353924 4 0.4955 0.25099 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1314832 3 0.4977 0.13554 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1487570 1 0.5233 0.55043 0.648 0.000 0.020 0.332
#> SRR627431 2 0.3991 0.59903 0.000 0.808 0.020 0.172
#> SRR1418561 3 0.4748 0.63177 0.016 0.000 0.716 0.268
#> SRR1448029 3 0.4697 0.58799 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 4 0.4522 0.47437 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1435311 2 0.2345 0.60838 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR612395 2 0.2081 0.54767 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR603116 2 0.0188 0.59221 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323152 3 0.0000 0.80240 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368264 2 0.0188 0.58964 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.1545 0.80243 0.008 0.040 0.952 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.5355 0.40820 0.020 0.360 0.000 0.620
#> SRR1486799 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.1302 0.60386 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR815044 4 0.0921 0.60353 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1338560 2 0.4933 0.21145 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR615862 4 0.4331 0.50741 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1480038 2 0.4941 0.20163 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR659436 2 0.4790 -0.10883 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR613699 2 0.4941 0.19106 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1436563 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.4500 0.47746 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1330327 4 0.3801 0.34937 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1489950 2 0.4585 0.46713 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1431927 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.3907 0.72385 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 3 0.3569 0.69976 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR600656 4 0.4431 0.17328 0.000 0.000 0.304 0.696
#> SRR658766 3 0.1706 0.80498 0.000 0.036 0.948 0.016
#> SRR655946 3 0.4877 0.44704 0.000 0.000 0.592 0.408
#> SRR817282 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.3074 0.77141 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.1716 0.56083 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.4382 0.67841 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR662498 2 0.4941 -0.24413 0.000 0.564 0.436 0.000
#> SRR1376764 3 0.3074 0.77001 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1377006 3 0.3219 0.72184 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR656860 4 0.1022 0.60395 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1480547 4 0.2469 0.59551 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1452515 3 0.5000 0.39691 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1324390 2 0.4277 0.53221 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR615273 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.2408 0.59524 0.000 0.920 0.036 0.044
#> SRR820907 2 0.4898 0.26266 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR812773 2 0.7332 -0.08573 0.356 0.480 0.164 0.000
#> SRR1405984 2 0.4277 0.53356 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1472794 2 0.4643 0.44216 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1365448 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.1792 0.79946 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1435626 3 0.4994 0.43349 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1080766 2 0.4564 0.46943 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1377862 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.4304 0.68702 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1467966 3 0.1022 0.80374 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1320579 3 0.1389 0.78679 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1319710 2 0.3123 0.60586 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1326604 4 0.4222 0.51881 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1098879 3 0.0188 0.80147 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR662245 2 0.3873 0.57949 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1074719 2 0.4776 0.37721 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR816226 1 0.4452 0.67248 0.732 0.000 0.008 0.260
#> SRR601387 2 0.3486 0.59983 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR614575 4 0.4933 0.28551 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1353900 2 0.4761 0.37866 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR662906 2 0.4916 0.25644 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1350832 2 0.4713 0.41400 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1403280 4 0.4866 0.34819 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1313969 3 0.4790 0.50765 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1388528 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.1389 0.92481 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0657 0.80350 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1319753 2 0.6587 0.28536 0.324 0.576 0.000 0.100
#> SRR818901 3 0.0967 0.80424 0.004 0.016 0.976 0.004
#> SRR607067 4 0.4761 0.38562 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1391420 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.4522 0.47523 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR661961 2 0.5004 -0.14986 0.004 0.604 0.392 0.000
#> SRR658259 4 0.4948 0.26650 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1310476 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4643 0.44054 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1365034 4 0.0921 0.60353 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1478053 4 0.4898 0.31800 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1475300 2 0.4522 0.47961 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1328101 2 0.0592 0.58563 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1322900 1 0.7362 -0.10172 0.444 0.160 0.396 0.000
#> SRR1309942 4 0.4994 0.12456 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1345760 4 0.4382 0.18922 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR1435418 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.0469 0.60040 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1443436 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1545 0.60073 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR661469 2 0.2408 0.53362 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1500323 2 0.1211 0.60152 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1356705 2 0.0817 0.59799 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1464915 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.80240 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.4961 0.48792 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1368072 2 0.2760 0.60884 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR601815 2 0.4643 0.44170 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR613330 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.3528 0.56240 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1394190 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.4999 -0.37944 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1318839 3 0.0336 0.80043 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1432390 4 0.2814 0.50076 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR613126 2 0.1489 0.57510 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1089424 4 0.4961 0.24166 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1347214 4 0.4961 0.23902 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1309556 2 0.7153 0.19921 0.308 0.532 0.160 0.000
#> SRR1456027 4 0.5137 -0.22486 0.004 0.000 0.452 0.544
#> SRR1400551 3 0.5459 0.50248 0.016 0.432 0.552 0.000
#> SRR1320469 1 0.0188 0.96737 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR614251 2 0.4790 0.36024 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1454310 4 0.4941 0.25792 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR615105 3 0.4925 0.43900 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1433290 3 0.0000 0.80240 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.1211 0.57938 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR601671 4 0.4888 0.33311 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR663874 2 0.2149 0.60648 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1409130 2 0.4661 0.43559 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR659696 4 0.0524 0.59770 0.000 0.008 0.004 0.988
#> SRR1408249 4 0.5624 0.49491 0.172 0.108 0.000 0.720
#> SRR663284 4 0.4456 0.51281 0.004 0.280 0.000 0.716
#> SRR1402794 3 0.1022 0.80348 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR614852 4 0.4222 0.24130 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1348040 1 0.4897 0.72065 0.776 0.016 0.176 0.032
#> SRR1489610 2 0.3024 0.60694 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1488091 2 0.2345 0.60826 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1499566 2 0.6309 0.34721 0.076 0.588 0.000 0.336
#> SRR1361480 4 0.3837 0.54910 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1444501 3 0.0469 0.80431 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1415773 2 0.1452 0.59973 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1388832 1 0.4331 0.57138 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.3024 0.60665 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR662918 4 0.0469 0.60040 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR817421 3 0.0469 0.79924 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1400823 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.3123 0.58091 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR608264 3 0.0336 0.80383 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1318560 1 0.0921 0.94466 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1454117 2 0.3024 0.60762 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1312684 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 1 0.5167 0.12790 0.508 0.488 0.004 0.000
#> SRR1432743 3 0.4961 0.48289 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1388873 4 0.4888 0.33157 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1353517 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.4643 0.00726 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1406008 2 0.3400 0.60241 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1396786 2 0.4730 0.40344 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1446564 1 0.0817 0.94954 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1318465 3 0.1211 0.80462 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.0469 0.60040 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR655170 4 0.4500 0.47930 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1087825 4 0.4713 0.01873 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR662019 3 0.1677 0.79260 0.040 0.000 0.948 0.012
#> SRR1349209 3 0.4250 0.62829 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1326161 2 0.4992 0.05239 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1345284 2 0.4817 0.34260 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1416672 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.4713 0.42143 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1454328 2 0.3528 0.59845 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1489286 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0188 0.96769 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.1867 0.79802 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1084369 3 0.2216 0.79165 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR598452 3 0.0188 0.80147 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660709 3 0.5388 0.39383 0.000 0.012 0.532 0.456
#> SRR809444 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.3610 0.59522 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1375774 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 3 0.6200 0.37048 0.052 0.000 0.504 0.444
#> SRR657139 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 4 0.4955 0.25552 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1353555 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.2469 0.53625 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1381775 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.3837 0.58172 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR658989 3 0.3726 0.73947 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0707 0.79664 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR819054 2 0.4776 0.37723 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1367988 3 0.7877 0.43043 0.000 0.304 0.388 0.308
#> SRR1331922 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.4514 0.45483 0.148 0.796 0.056 0.000
#> SRR1375796 2 0.4624 0.44378 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1386991 2 0.3486 0.42892 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1355217 2 0.2345 0.53633 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1356290 2 0.2224 0.58919 0.000 0.928 0.040 0.032
#> SRR659507 2 0.3486 0.42945 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.4356 0.51768 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR661155 4 0.1716 0.56654 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1414727 2 0.6722 -0.29860 0.092 0.500 0.408 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.3975 0.71318 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1377800 3 0.4888 0.54601 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR614611 4 0.4008 0.53403 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR655052 4 0.1302 0.57794 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1478968 4 0.4790 -0.04094 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1351280 4 0.2281 0.59764 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR613951 4 0.3074 0.48034 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1418022 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.4804 0.50409 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1408161 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0895 0.80428 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR655040 4 0.0817 0.60289 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR810225 2 0.3649 0.59320 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1325377 2 0.3764 0.58718 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR617829 3 0.3266 0.71889 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1402328 2 0.4522 0.48451 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1480455 2 0.4933 0.23419 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1442104 3 0.0817 0.79526 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1453416 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0707 0.80407 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1414314 4 0.4888 0.33184 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR663026 2 0.4679 0.42597 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1478386 4 0.4855 0.35469 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1458683 3 0.4746 0.52469 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1370572 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.6883 0.07254 0.212 0.596 0.192 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.4933 -0.17707 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR660260 3 0.7677 0.51607 0.000 0.268 0.460 0.272
#> SRR1071231 2 0.4907 0.26627 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1459125 4 0.4055 0.52883 0.000 0.060 0.108 0.832
#> SRR1337173 3 0.4977 0.43264 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR1396250 3 0.0376 0.80245 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR2166376 3 0.2944 0.78220 0.000 0.128 0.868 0.004
#> SRR659816 4 0.7743 0.04400 0.000 0.368 0.232 0.400
#> SRR1401379 2 0.3172 0.60500 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR600981 4 0.3219 0.45077 0.000 0.000 0.164 0.836
#> SRR1398335 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.4605 0.43418 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR660115 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4933 0.22642 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1359780 4 0.4985 0.16162 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1490037 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.3837 0.51775 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1397156 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.3610 0.59515 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1319648 4 0.4994 0.12958 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1092985 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.1118 0.60402 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1468658 3 0.2647 0.74919 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1390437 4 0.0927 0.59945 0.000 0.016 0.008 0.976
#> SRR658057 4 0.4406 0.49490 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR612635 4 0.4955 0.25225 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1351480 2 0.4972 0.11776 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1436651 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0188 0.96769 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.3873 0.57965 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR614263 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 4 0.4776 0.39454 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR659911 4 0.4925 0.29698 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1085519 3 0.3610 0.74383 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1345894 3 0.4134 0.69368 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1442928 2 0.1867 0.55569 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1464681 4 0.1716 0.56653 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1418880 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.4072 0.71106 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1365426 2 0.1398 0.57201 0.040 0.956 0.004 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0188 0.96769 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR603236 2 0.2965 0.57974 0.000 0.892 0.072 0.036
#> SRR660673 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.3726 0.58948 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR663807 2 0.4989 0.06822 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1087245 4 0.4331 0.50598 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1339108 2 0.4155 0.57336 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR613426 4 0.3443 0.48358 0.136 0.000 0.016 0.848
#> SRR613879 2 0.1557 0.60004 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1385101 1 0.3351 0.77853 0.844 0.148 0.000 0.008
#> SRR1387966 4 0.4907 0.31383 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1458852 2 0.3649 0.59383 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1430489 1 0.0469 0.96075 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1349231 1 0.0592 0.95772 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0657 0.80150 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1321987 2 0.3975 0.57000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR662653 2 0.4277 0.53452 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1390027 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.4277 0.53333 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1383081 4 0.4977 0.20384 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR2166960 2 0.5000 -0.04945 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR605101 2 0.1022 0.59998 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR818600 4 0.5000 0.06576 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1367715 4 0.4948 0.26685 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1351979 3 0.0188 0.80147 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1387054 3 0.3688 0.69004 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1444306 3 0.4955 0.49928 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 4 0.4941 0.27547 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR612767 1 0.0188 0.96739 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489030 2 0.4994 0.03764 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1430375 2 0.1474 0.56802 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR615225 4 0.4222 0.24465 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1401839 2 0.3486 0.43806 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1379110 4 0.4907 0.31568 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1077288 3 0.3048 0.75978 0.108 0.016 0.876 0.000
#> SRR1331639 4 0.0817 0.58652 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1342782 2 0.1610 0.57225 0.016 0.952 0.032 0.000
#> SRR1443003 2 0.4304 0.18699 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.1022 0.79221 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1395742 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.1940 0.77500 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR664063 2 0.1520 0.57398 0.024 0.956 0.020 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.4304 0.22043 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1320321 2 0.4477 0.49055 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1071955 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 4 0.4925 0.29557 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1488470 4 0.2973 0.58554 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1389497 3 0.1716 0.79999 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1367109 3 0.4713 0.60167 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.97063 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0451 0.8680 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1380716 2 0.1671 0.8620 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084417 1 0.4297 0.0516 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1074359 4 0.2577 0.8260 0.000 0.084 0.016 0.892 0.008
#> SRR1419258 3 0.1831 0.8188 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1403366 5 0.3816 0.5012 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR665262 5 0.0671 0.7600 0.000 0.016 0.000 0.004 0.980
#> SRR1499740 5 0.1668 0.7457 0.028 0.000 0.032 0.000 0.940
#> SRR1105057 2 0.0290 0.8687 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.1282 0.7527 0.000 0.004 0.044 0.000 0.952
#> SRR612215 5 0.0579 0.7584 0.000 0.008 0.000 0.008 0.984
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.3491 0.6248 0.228 0.000 0.768 0.004 0.000
#> SRR1409263 3 0.1074 0.8350 0.012 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.3282 0.7875 0.000 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR614839 2 0.4658 0.4252 0.000 0.576 0.000 0.016 0.408
#> SRR658433 2 0.1830 0.8547 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1088581 4 0.2825 0.7822 0.000 0.000 0.124 0.860 0.016
#> SRR1328797 3 0.0671 0.8376 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1334512 2 0.2806 0.8234 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0880 0.8670 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1354955 3 0.4823 0.6178 0.000 0.000 0.700 0.072 0.228
#> SRR654802 3 0.0290 0.8345 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR660066 2 0.0671 0.8698 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1447103 5 0.1564 0.7583 0.000 0.024 0.024 0.004 0.948
#> SRR1402153 3 0.0880 0.8351 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR655887 2 0.1544 0.8642 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1408529 3 0.3099 0.7694 0.000 0.000 0.848 0.028 0.124
#> SRR658707 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.2095 0.8495 0.000 0.928 0.020 0.024 0.028
#> SRR1074670 3 0.0451 0.8375 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1375439 5 0.5397 0.5934 0.008 0.064 0.220 0.016 0.692
#> SRR1329003 4 0.2236 0.8263 0.024 0.000 0.068 0.908 0.000
#> SRR1404837 5 0.1981 0.7534 0.000 0.064 0.000 0.016 0.920
#> SRR1317920 1 0.0404 0.9618 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1455525 4 0.2732 0.7687 0.000 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR613999 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.4443 0.1398 0.000 0.000 0.472 0.004 0.524
#> SRR1068855 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375509 3 0.0771 0.8376 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR612227 3 0.4807 0.0619 0.000 0.000 0.532 0.020 0.448
#> SRR1388809 2 0.1197 0.8669 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1413872 4 0.1357 0.8479 0.000 0.048 0.004 0.948 0.000
#> SRR1452864 1 0.0510 0.9584 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1473078 3 0.4223 0.5779 0.000 0.000 0.724 0.028 0.248
#> SRR615814 2 0.3012 0.8375 0.000 0.860 0.000 0.036 0.104
#> SRR1325225 4 0.4182 0.3574 0.400 0.000 0.000 0.600 0.000
#> SRR1313687 2 0.1623 0.8575 0.000 0.948 0.016 0.016 0.020
#> SRR1358220 2 0.0794 0.8700 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1096662 2 0.4151 0.5732 0.000 0.652 0.000 0.344 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.2112 0.7478 0.000 0.084 0.004 0.004 0.908
#> SRR660164 5 0.4014 0.5363 0.000 0.256 0.000 0.016 0.728
#> SRR815783 2 0.3170 0.7833 0.000 0.848 0.004 0.024 0.124
#> SRR809595 5 0.2677 0.6900 0.112 0.000 0.016 0.000 0.872
#> SRR1403133 2 0.2733 0.8228 0.000 0.888 0.016 0.016 0.080
#> SRR815470 4 0.1341 0.8453 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.5685 0.3736 0.000 0.008 0.348 0.072 0.572
#> SRR1478362 4 0.1282 0.8486 0.000 0.044 0.004 0.952 0.000
#> SRR1392186 5 0.4640 0.1684 0.000 0.400 0.000 0.016 0.584
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 4 0.4359 0.2686 0.004 0.000 0.412 0.584 0.000
#> SRR612683 2 0.3780 0.8083 0.000 0.808 0.000 0.060 0.132
#> SRR1392901 5 0.6235 0.3582 0.000 0.004 0.296 0.156 0.544
#> SRR1077805 3 0.5103 0.2391 0.000 0.404 0.556 0.040 0.000
#> SRR1360402 2 0.0324 0.8692 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1406112 5 0.4482 0.4264 0.000 0.000 0.348 0.016 0.636
#> SRR1355352 3 0.1569 0.8318 0.008 0.000 0.948 0.012 0.032
#> SRR656247 1 0.2377 0.8423 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR813656 5 0.5615 -0.1699 0.016 0.472 0.000 0.040 0.472
#> SRR808244 3 0.1608 0.8176 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1387240 2 0.5289 0.4656 0.000 0.596 0.000 0.064 0.340
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.2446 0.8206 0.000 0.000 0.056 0.900 0.044
#> SRR1435248 2 0.1211 0.8618 0.000 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1419110 5 0.0451 0.7575 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1408682 5 0.4796 0.6255 0.000 0.248 0.024 0.024 0.704
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 5 0.2825 0.7069 0.000 0.124 0.000 0.016 0.860
#> SRR1453911 5 0.0404 0.7566 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR603164 3 0.3120 0.7338 0.000 0.116 0.856 0.016 0.012
#> SRR1383259 2 0.3274 0.7620 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1330854 3 0.3636 0.5737 0.272 0.000 0.728 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.3586 0.7059 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.1205 0.8261 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1361546 5 0.1612 0.7579 0.012 0.024 0.016 0.000 0.948
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 5 0.5080 0.2881 0.000 0.348 0.000 0.048 0.604
#> SRR615635 2 0.0566 0.8699 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1385411 2 0.3766 0.6955 0.000 0.728 0.000 0.268 0.004
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0451 0.8375 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR662126 4 0.4479 0.6245 0.000 0.036 0.000 0.700 0.264
#> SRR1464601 2 0.2889 0.8162 0.000 0.880 0.020 0.016 0.084
#> SRR1071594 2 0.0510 0.8706 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR612539 2 0.1568 0.8684 0.000 0.944 0.000 0.036 0.020
#> SRR602010 5 0.0794 0.7591 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR810249 2 0.0898 0.8649 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR818773 5 0.0771 0.7548 0.020 0.004 0.000 0.000 0.976
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 5 0.1012 0.7562 0.000 0.020 0.000 0.012 0.968
#> SRR1442754 1 0.3461 0.7036 0.772 0.000 0.224 0.004 0.000
#> SRR1334247 5 0.4348 0.4956 0.000 0.000 0.316 0.016 0.668
#> SRR661639 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.7473 0.3381 0.172 0.484 0.000 0.076 0.268
#> SRR1459937 4 0.1732 0.8218 0.000 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.4114 0.5359 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR809348 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0566 0.8377 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR661074 3 0.1493 0.8339 0.000 0.000 0.948 0.024 0.028
#> SRR1349851 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1405123 2 0.4440 0.2766 0.000 0.528 0.000 0.468 0.004
#> SRR661096 2 0.1522 0.8687 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.2171 0.8286 0.024 0.000 0.064 0.912 0.000
#> SRR1307677 2 0.2629 0.8307 0.000 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR1466512 2 0.1942 0.8619 0.000 0.920 0.000 0.068 0.012
#> SRR658212 2 0.3048 0.7996 0.000 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR1430525 3 0.4860 0.6192 0.000 0.004 0.704 0.228 0.064
#> SRR1344422 2 0.4572 0.3162 0.000 0.540 0.004 0.452 0.004
#> SRR1353924 2 0.0566 0.8677 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1314832 3 0.3582 0.6341 0.224 0.000 0.768 0.008 0.000
#> SRR1487570 4 0.3612 0.5969 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR627431 5 0.6888 0.2538 0.000 0.348 0.004 0.264 0.384
#> SRR1418561 3 0.4199 0.5373 0.008 0.004 0.692 0.296 0.000
#> SRR1448029 3 0.3624 0.7434 0.000 0.084 0.844 0.020 0.052
#> SRR813802 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2020 0.8533 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1435311 2 0.4481 0.6199 0.000 0.732 0.016 0.024 0.228
#> SRR612395 5 0.0290 0.7583 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR603116 5 0.0404 0.7587 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1323152 3 0.4080 0.6218 0.000 0.000 0.728 0.252 0.020
#> SRR1368264 5 0.1270 0.7557 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1326624 1 0.0290 0.9649 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1429265 3 0.0671 0.8376 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.4924 0.6372 0.000 0.668 0.000 0.060 0.272
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.4589 0.2452 0.004 0.520 0.000 0.472 0.004
#> SRR815044 4 0.2659 0.8302 0.000 0.060 0.000 0.888 0.052
#> SRR1338560 2 0.0671 0.8701 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR615862 2 0.3789 0.7561 0.000 0.768 0.000 0.212 0.020
#> SRR1480038 2 0.0693 0.8708 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR659436 5 0.0693 0.7562 0.000 0.000 0.008 0.012 0.980
#> SRR613699 2 0.4201 0.5995 0.000 0.664 0.000 0.008 0.328
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2069 0.8598 0.000 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR1330327 4 0.1281 0.8509 0.000 0.032 0.012 0.956 0.000
#> SRR1489950 2 0.1074 0.8631 0.000 0.968 0.004 0.016 0.012
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.1270 0.8224 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.3696 0.6891 0.000 0.000 0.212 0.772 0.016
#> SRR600656 4 0.0771 0.8506 0.000 0.020 0.004 0.976 0.000
#> SRR658766 5 0.5050 0.6009 0.000 0.000 0.120 0.180 0.700
#> SRR655946 3 0.6804 -0.0218 0.000 0.300 0.368 0.332 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0798 0.8296 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.0162 0.7573 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 5 0.2997 0.6956 0.000 0.000 0.148 0.012 0.840
#> SRR662498 5 0.1121 0.7507 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1376764 3 0.1809 0.8220 0.000 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR1377006 3 0.3835 0.6324 0.000 0.012 0.744 0.244 0.000
#> SRR656860 2 0.4151 0.5720 0.000 0.652 0.000 0.344 0.004
#> SRR1480547 2 0.2886 0.8217 0.000 0.844 0.000 0.148 0.008
#> SRR1452515 5 0.3320 0.6835 0.000 0.004 0.164 0.012 0.820
#> SRR1324390 2 0.1251 0.8616 0.000 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR615273 1 0.1043 0.9373 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR601695 5 0.3022 0.6982 0.000 0.012 0.004 0.136 0.848
#> SRR820907 2 0.1750 0.8709 0.000 0.936 0.000 0.028 0.036
#> SRR812773 5 0.2701 0.7153 0.092 0.000 0.012 0.012 0.884
#> SRR1405984 2 0.1623 0.8566 0.000 0.948 0.020 0.016 0.016
#> SRR1472794 2 0.1357 0.8588 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.2930 0.7177 0.000 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR1435626 5 0.5121 0.4878 0.008 0.008 0.312 0.028 0.644
#> SRR1080766 2 0.1372 0.8607 0.000 0.956 0.004 0.016 0.024
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.1041 0.8291 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1467966 3 0.1211 0.8376 0.000 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1320579 4 0.4400 0.4988 0.000 0.000 0.308 0.672 0.020
#> SRR1319710 2 0.4251 0.5655 0.000 0.672 0.000 0.012 0.316
#> SRR1326604 2 0.2966 0.8297 0.000 0.848 0.000 0.136 0.016
#> SRR1098879 3 0.0510 0.8374 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR662245 2 0.4201 0.4664 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1074719 2 0.1200 0.8621 0.000 0.964 0.008 0.016 0.012
#> SRR816226 4 0.3752 0.5663 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR601387 2 0.2547 0.8316 0.000 0.900 0.016 0.016 0.068
#> SRR614575 2 0.2344 0.8603 0.000 0.904 0.000 0.064 0.032
#> SRR1353900 2 0.2408 0.8541 0.000 0.892 0.000 0.016 0.092
#> SRR662906 2 0.0451 0.8680 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1350832 2 0.0404 0.8693 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1403280 2 0.1774 0.8670 0.000 0.932 0.000 0.052 0.016
#> SRR1313969 4 0.1831 0.8238 0.000 0.000 0.076 0.920 0.004
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4307 0.0203 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR655399 3 0.0609 0.8370 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1319753 1 0.5543 0.4585 0.636 0.076 0.000 0.012 0.276
#> SRR818901 3 0.1907 0.8236 0.000 0.000 0.928 0.028 0.044
#> SRR607067 4 0.2825 0.7960 0.000 0.124 0.000 0.860 0.016
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.3513 0.7898 0.000 0.800 0.000 0.180 0.020
#> SRR661961 5 0.0609 0.7552 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR658259 2 0.5045 0.5835 0.000 0.636 0.000 0.056 0.308
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1557 0.8644 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1365034 2 0.3689 0.7121 0.000 0.740 0.000 0.256 0.004
#> SRR1478053 2 0.0579 0.8680 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1475300 2 0.1211 0.8618 0.000 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1328101 5 0.0865 0.7599 0.000 0.024 0.000 0.004 0.972
#> SRR1322900 5 0.6548 0.1855 0.380 0.000 0.200 0.000 0.420
#> SRR1309942 2 0.1626 0.8676 0.000 0.940 0.000 0.044 0.016
#> SRR1345760 4 0.0703 0.8474 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.2813 0.7462 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.5292 0.5337 0.000 0.328 0.024 0.028 0.620
#> SRR661469 5 0.0566 0.7574 0.000 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1500323 5 0.4957 0.5358 0.000 0.328 0.016 0.020 0.636
#> SRR1356705 5 0.4643 0.5556 0.000 0.320 0.012 0.012 0.656
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4978 0.7151 0.076 0.000 0.752 0.136 0.036
#> SRR1350435 1 0.0290 0.9649 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1389177 5 0.3039 0.6906 0.000 0.000 0.152 0.012 0.836
#> SRR1368072 2 0.4236 0.6066 0.000 0.728 0.008 0.016 0.248
#> SRR601815 2 0.0510 0.8692 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR613330 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.3863 0.7631 0.000 0.052 0.000 0.796 0.152
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.5920 0.4442 0.000 0.072 0.312 0.024 0.592
#> SRR1318839 3 0.0609 0.8370 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1432390 4 0.1484 0.8481 0.000 0.048 0.008 0.944 0.000
#> SRR613126 5 0.4180 0.6771 0.000 0.192 0.028 0.012 0.768
#> SRR1089424 2 0.1444 0.8692 0.000 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR1347214 2 0.0290 0.8698 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309556 5 0.6602 0.5347 0.120 0.028 0.204 0.024 0.624
#> SRR1456027 4 0.1205 0.8453 0.000 0.004 0.040 0.956 0.000
#> SRR1400551 3 0.3547 0.7299 0.000 0.016 0.824 0.016 0.144
#> SRR1320469 1 0.2074 0.8675 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.4663 0.5113 0.000 0.604 0.000 0.020 0.376
#> SRR1454310 2 0.0693 0.8665 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR615105 4 0.1671 0.8305 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1433290 3 0.0451 0.8375 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR2166064 4 0.1341 0.8455 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR601671 2 0.2853 0.8513 0.000 0.876 0.000 0.072 0.052
#> SRR663874 5 0.4088 0.3114 0.000 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1409130 2 0.0404 0.8694 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659696 4 0.2230 0.8008 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1408249 2 0.3141 0.8366 0.040 0.860 0.000 0.096 0.004
#> SRR663284 2 0.5337 0.7139 0.020 0.704 0.000 0.096 0.180
#> SRR1402794 3 0.0579 0.8376 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR614852 4 0.1117 0.8507 0.000 0.020 0.016 0.964 0.000
#> SRR1348040 5 0.5232 -0.0657 0.028 0.000 0.008 0.472 0.492
#> SRR1489610 2 0.4309 0.5603 0.000 0.676 0.000 0.016 0.308
#> SRR1488091 5 0.5133 0.4232 0.000 0.384 0.012 0.024 0.580
#> SRR1499566 2 0.0867 0.8671 0.008 0.976 0.000 0.008 0.008
#> SRR1361480 2 0.1965 0.8554 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1444501 3 0.3214 0.7624 0.000 0.000 0.844 0.036 0.120
#> SRR1415773 5 0.5292 0.5346 0.000 0.328 0.024 0.028 0.620
#> SRR1388832 1 0.3934 0.7525 0.800 0.000 0.124 0.000 0.076
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 5 0.4167 0.7079 0.000 0.136 0.004 0.072 0.788
#> SRR662918 4 0.3421 0.6960 0.000 0.204 0.000 0.788 0.008
#> SRR817421 3 0.0880 0.8348 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2471 0.8332 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR608264 3 0.0451 0.8375 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1318560 1 0.3752 0.5883 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1454117 5 0.2771 0.7224 0.000 0.128 0.000 0.012 0.860
#> SRR1312684 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR615044 5 0.2563 0.6910 0.120 0.000 0.000 0.008 0.872
#> SRR1432743 5 0.3906 0.5995 0.000 0.000 0.240 0.016 0.744
#> SRR1388873 2 0.0963 0.8696 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.3988 0.6527 0.000 0.024 0.192 0.008 0.776
#> SRR1406008 2 0.4235 0.4724 0.000 0.656 0.000 0.008 0.336
#> SRR1396786 2 0.1200 0.8621 0.000 0.964 0.008 0.016 0.012
#> SRR1446564 1 0.0833 0.9507 0.976 0.016 0.004 0.004 0.000
#> SRR1318465 3 0.4714 0.4568 0.000 0.000 0.644 0.032 0.324
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.1792 0.8280 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR655170 2 0.2806 0.8246 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1087825 4 0.1195 0.8491 0.000 0.012 0.028 0.960 0.000
#> SRR662019 3 0.6699 0.1268 0.208 0.000 0.436 0.352 0.004
#> SRR1349209 4 0.3010 0.7474 0.000 0.000 0.172 0.824 0.004
#> SRR1326161 2 0.0162 0.8690 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345284 2 0.0912 0.8647 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0703 0.8706 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1454328 2 0.2131 0.8442 0.000 0.920 0.008 0.016 0.056
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0162 0.9667 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408183 3 0.1469 0.8298 0.000 0.000 0.948 0.016 0.036
#> SRR1084369 5 0.5893 0.0858 0.000 0.000 0.436 0.100 0.464
#> SRR598452 3 0.0671 0.8376 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR660709 4 0.3904 0.6982 0.000 0.008 0.012 0.764 0.216
#> SRR809444 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.2644 0.8288 0.000 0.896 0.016 0.020 0.068
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.2079 0.8306 0.020 0.000 0.064 0.916 0.000
#> SRR657139 1 0.0451 0.9617 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1440744 2 0.2172 0.8592 0.000 0.908 0.000 0.076 0.016
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.2304 0.8112 0.000 0.100 0.008 0.892 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.3242 0.7909 0.000 0.816 0.000 0.012 0.172
#> SRR658989 5 0.4602 0.4732 0.000 0.000 0.316 0.028 0.656
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0703 0.8361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR819054 2 0.0798 0.8652 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1367988 4 0.4428 0.5913 0.000 0.004 0.020 0.692 0.284
#> SRR1331922 1 0.0324 0.9655 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR615479 5 0.0510 0.7545 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1375796 2 0.3689 0.7183 0.000 0.740 0.000 0.004 0.256
#> SRR1386991 5 0.4338 0.7043 0.000 0.084 0.100 0.020 0.796
#> SRR1355217 5 0.0693 0.7596 0.000 0.012 0.008 0.000 0.980
#> SRR1356290 5 0.1547 0.7590 0.000 0.032 0.004 0.016 0.948
#> SRR659507 5 0.1106 0.7594 0.000 0.012 0.024 0.000 0.964
#> SRR663296 1 0.0404 0.9619 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR598044 2 0.0898 0.8686 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR661155 4 0.1430 0.8470 0.000 0.052 0.004 0.944 0.000
#> SRR1414727 5 0.5117 0.5014 0.072 0.000 0.276 0.000 0.652
#> SRR663477 1 0.0290 0.9649 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1354489 3 0.4384 0.4543 0.000 0.000 0.660 0.016 0.324
#> SRR1377800 3 0.3081 0.7344 0.000 0.000 0.832 0.012 0.156
#> SRR614611 2 0.0880 0.8711 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR655052 4 0.1854 0.8460 0.000 0.020 0.008 0.936 0.036
#> SRR1478968 4 0.0955 0.8478 0.000 0.004 0.028 0.968 0.000
#> SRR1351280 2 0.4734 0.4956 0.000 0.604 0.000 0.372 0.024
#> SRR613951 4 0.1012 0.8503 0.000 0.012 0.020 0.968 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3210 0.7187 0.000 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.2359 0.8144 0.000 0.000 0.904 0.036 0.060
#> SRR655040 4 0.2997 0.7637 0.000 0.148 0.000 0.840 0.012
#> SRR810225 2 0.2416 0.8293 0.000 0.888 0.000 0.012 0.100
#> SRR1325377 2 0.1740 0.8545 0.000 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR617829 4 0.3837 0.5223 0.000 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1402328 2 0.1179 0.8625 0.000 0.964 0.004 0.016 0.016
#> SRR1480455 2 0.1372 0.8607 0.000 0.956 0.004 0.016 0.024
#> SRR1442104 3 0.0880 0.8348 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1453416 1 0.0162 0.9674 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1481396 3 0.0162 0.8354 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1414314 2 0.1341 0.8666 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR663026 2 0.0671 0.8705 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1478386 2 0.0703 0.8703 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1458683 4 0.2230 0.8029 0.000 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.2795 0.7007 0.100 0.000 0.028 0.000 0.872
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.1281 0.8496 0.000 0.012 0.032 0.956 0.000
#> SRR660260 5 0.4431 0.6248 0.000 0.004 0.068 0.168 0.760
#> SRR1071231 2 0.1074 0.8631 0.000 0.968 0.004 0.016 0.012
#> SRR1459125 4 0.4039 0.6194 0.000 0.008 0.004 0.720 0.268
#> SRR1337173 5 0.2777 0.7138 0.000 0.000 0.120 0.016 0.864
#> SRR1396250 3 0.0510 0.8374 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2166376 5 0.4347 0.3797 0.000 0.004 0.356 0.004 0.636
#> SRR659816 5 0.3944 0.5839 0.000 0.016 0.004 0.224 0.756
#> SRR1401379 2 0.4590 0.3493 0.000 0.568 0.000 0.012 0.420
#> SRR600981 4 0.1502 0.8459 0.000 0.056 0.004 0.940 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4201 0.5788 0.000 0.664 0.000 0.328 0.008
#> SRR660115 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0162 0.8687 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1359780 2 0.0324 0.8692 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 5 0.4802 -0.0719 0.000 0.012 0.004 0.480 0.504
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.2580 0.8319 0.000 0.900 0.020 0.016 0.064
#> SRR1319648 2 0.1195 0.8720 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1092985 1 0.3741 0.6345 0.732 0.000 0.264 0.004 0.000
#> SRR656409 2 0.2741 0.8347 0.004 0.860 0.000 0.132 0.004
#> SRR1468658 4 0.3809 0.6051 0.000 0.000 0.256 0.736 0.008
#> SRR1390437 4 0.1341 0.8444 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR658057 2 0.2773 0.8416 0.000 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR612635 2 0.1965 0.8664 0.000 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1351480 2 0.2511 0.8559 0.000 0.892 0.000 0.028 0.080
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0609 0.9553 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR659590 2 0.2131 0.8441 0.000 0.920 0.008 0.016 0.056
#> SRR614263 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.1628 0.8659 0.000 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR659911 2 0.2388 0.8590 0.000 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1085519 3 0.1845 0.8123 0.000 0.000 0.928 0.016 0.056
#> SRR1345894 3 0.4870 0.0638 0.000 0.004 0.532 0.016 0.448
#> SRR1442928 5 0.1243 0.7600 0.000 0.028 0.008 0.004 0.960
#> SRR1464681 4 0.1270 0.8468 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.4655 0.4485 0.000 0.000 0.328 0.028 0.644
#> SRR1365426 5 0.0566 0.7593 0.004 0.012 0.000 0.000 0.984
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.1412 0.9326 0.952 0.000 0.008 0.004 0.036
#> SRR603236 5 0.3426 0.7452 0.000 0.068 0.040 0.032 0.860
#> SRR660673 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.2130 0.8465 0.000 0.924 0.016 0.016 0.044
#> SRR663807 2 0.1668 0.8697 0.000 0.940 0.000 0.032 0.028
#> SRR1087245 2 0.2416 0.8505 0.000 0.888 0.000 0.100 0.012
#> SRR1339108 2 0.5599 0.5187 0.000 0.664 0.020 0.088 0.228
#> SRR613426 4 0.1836 0.8482 0.016 0.040 0.000 0.936 0.008
#> SRR613879 5 0.1012 0.7562 0.000 0.020 0.000 0.012 0.968
#> SRR1385101 1 0.4653 0.1124 0.516 0.000 0.000 0.012 0.472
#> SRR1387966 2 0.2362 0.8584 0.000 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1458852 2 0.4491 0.5618 0.000 0.708 0.008 0.024 0.260
#> SRR1430489 1 0.2648 0.7987 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1349231 1 0.0703 0.9523 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1376249 3 0.0703 0.8365 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1321987 2 0.1774 0.8527 0.000 0.932 0.000 0.016 0.052
#> SRR662653 2 0.1018 0.8643 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.1117 0.8668 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1383081 2 0.2491 0.8604 0.000 0.896 0.000 0.068 0.036
#> SRR2166960 2 0.3326 0.8074 0.000 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR605101 5 0.4470 0.4496 0.000 0.372 0.000 0.012 0.616
#> SRR818600 2 0.2592 0.8566 0.000 0.892 0.000 0.052 0.056
#> SRR1367715 2 0.3043 0.8568 0.000 0.864 0.000 0.080 0.056
#> SRR1351979 3 0.0865 0.8367 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1387054 3 0.6040 0.3947 0.000 0.292 0.556 0.152 0.000
#> SRR1444306 3 0.4737 0.3174 0.000 0.004 0.600 0.016 0.380
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4587 0.7738 0.000 0.744 0.000 0.096 0.160
#> SRR612767 1 0.0162 0.9672 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489030 2 0.0162 0.8687 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430375 5 0.0290 0.7583 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR615225 4 0.1701 0.8461 0.000 0.048 0.016 0.936 0.000
#> SRR1401839 5 0.1186 0.7586 0.000 0.008 0.008 0.020 0.964
#> SRR1379110 2 0.1701 0.8665 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR1077288 3 0.0771 0.8376 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1331639 4 0.1410 0.8435 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1342782 5 0.0955 0.7600 0.000 0.028 0.000 0.004 0.968
#> SRR1443003 5 0.6664 0.1469 0.000 0.144 0.396 0.016 0.444
#> SRR612839 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4450 0.0523 0.000 0.000 0.508 0.488 0.004
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.4134 0.6753 0.000 0.000 0.196 0.760 0.044
#> SRR664063 5 0.0451 0.7570 0.008 0.004 0.000 0.000 0.988
#> SRR1488214 1 0.0404 0.9618 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR654766 4 0.1300 0.8511 0.000 0.028 0.016 0.956 0.000
#> SRR1320321 2 0.0794 0.8690 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9698 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2676 0.8563 0.000 0.884 0.000 0.080 0.036
#> SRR1488470 2 0.2338 0.8453 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1389497 3 0.0404 0.8350 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1367109 5 0.4714 0.4737 0.000 0.000 0.324 0.032 0.644
#> SRR615311 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.2442 0.79691 0.000 0.852 0.000 0.000 0.004 0.144
#> SRR1380716 2 0.0993 0.82276 0.000 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR612803 1 0.0260 0.95237 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR613282 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.1007 0.92374 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1084417 3 0.3867 0.09457 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 4 0.3370 0.66945 0.000 0.012 0.000 0.772 0.004 0.212
#> SRR1419258 3 0.2346 0.70714 0.000 0.000 0.868 0.008 0.000 0.124
#> SRR1403366 5 0.3834 0.34676 0.000 0.000 0.268 0.000 0.708 0.024
#> SRR665262 5 0.3271 0.42070 0.000 0.008 0.000 0.000 0.760 0.232
#> SRR1499740 5 0.2377 0.50489 0.024 0.000 0.008 0.000 0.892 0.076
#> SRR1105057 2 0.1970 0.81916 0.000 0.900 0.000 0.008 0.000 0.092
#> SRR1439742 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR614599 5 0.2859 0.47988 0.000 0.000 0.016 0.000 0.828 0.156
#> SRR612215 5 0.2491 0.47143 0.000 0.000 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1094051 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393449 3 0.2664 0.60469 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.1528 0.73874 0.016 0.000 0.936 0.000 0.048 0.000
#> SRR1431288 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334889 2 0.2605 0.79057 0.000 0.864 0.000 0.028 0.000 0.108
#> SRR614839 2 0.6027 -0.11027 0.000 0.400 0.000 0.000 0.248 0.352
#> SRR658433 2 0.3083 0.78889 0.000 0.828 0.000 0.000 0.040 0.132
#> SRR1088581 4 0.3970 0.59881 0.000 0.000 0.016 0.712 0.012 0.260
#> SRR1328797 3 0.1267 0.74208 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1334512 2 0.2726 0.78724 0.000 0.856 0.000 0.032 0.000 0.112
#> SRR1471117 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458220 2 0.2053 0.80955 0.000 0.888 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1354955 3 0.6015 -0.03260 0.000 0.000 0.432 0.016 0.148 0.404
#> SRR654802 3 0.0146 0.74604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR660066 2 0.3204 0.78740 0.000 0.820 0.000 0.004 0.032 0.144
#> SRR1447103 5 0.3121 0.46128 0.000 0.004 0.012 0.000 0.804 0.180
#> SRR1402153 3 0.1007 0.74329 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR655887 2 0.0725 0.82332 0.000 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1408529 3 0.4781 0.37953 0.000 0.000 0.624 0.000 0.080 0.296
#> SRR658707 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.3878 0.66975 0.000 0.688 0.008 0.000 0.008 0.296
#> SRR1074670 3 0.1910 0.72259 0.000 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1375439 5 0.5262 0.08546 0.008 0.012 0.048 0.000 0.520 0.412
#> SRR1329003 4 0.0603 0.83312 0.000 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1404837 6 0.4157 0.02276 0.000 0.012 0.000 0.000 0.444 0.544
#> SRR1317920 1 0.1007 0.92961 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1455525 4 0.0692 0.83172 0.000 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR613999 1 0.0146 0.95219 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310836 1 0.0260 0.95237 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1499764 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.5440 0.20689 0.000 0.000 0.288 0.000 0.556 0.156
#> SRR1068855 1 0.0713 0.94089 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1375509 3 0.0146 0.74604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612227 6 0.5768 0.22779 0.000 0.000 0.196 0.000 0.316 0.488
#> SRR1388809 2 0.0935 0.82528 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1413872 4 0.0146 0.83618 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.1814 0.88419 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1473078 3 0.5714 -0.00779 0.000 0.004 0.428 0.000 0.140 0.428
#> SRR615814 2 0.2921 0.76779 0.000 0.828 0.000 0.008 0.008 0.156
#> SRR1325225 4 0.3460 0.58454 0.220 0.000 0.000 0.760 0.000 0.020
#> SRR1313687 2 0.2006 0.81003 0.000 0.892 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1358220 2 0.1320 0.82666 0.000 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1096662 2 0.3878 0.72288 0.000 0.772 0.000 0.112 0.000 0.116
#> SRR1487746 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354644 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.4039 0.28161 0.000 0.016 0.000 0.000 0.632 0.352
#> SRR660164 5 0.5217 0.09510 0.000 0.096 0.000 0.000 0.512 0.392
#> SRR815783 2 0.5326 0.10969 0.000 0.464 0.000 0.000 0.104 0.432
#> SRR809595 5 0.2784 0.42930 0.132 0.000 0.012 0.000 0.848 0.008
#> SRR1403133 2 0.4514 0.53262 0.000 0.588 0.000 0.000 0.040 0.372
#> SRR815470 4 0.0291 0.83676 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1344382 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432453 6 0.5762 0.30218 0.000 0.004 0.092 0.044 0.256 0.604
#> SRR1478362 4 0.2019 0.80105 0.000 0.012 0.000 0.900 0.000 0.088
#> SRR1392186 5 0.6129 -0.06565 0.000 0.336 0.000 0.000 0.344 0.320
#> SRR1347937 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0363 0.95071 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1471594 1 0.0260 0.95282 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1354270 4 0.5678 0.53984 0.060 0.000 0.156 0.644 0.000 0.140
#> SRR612683 2 0.2825 0.77788 0.000 0.844 0.000 0.012 0.008 0.136
#> SRR1392901 4 0.5071 0.57895 0.000 0.000 0.052 0.704 0.096 0.148
#> SRR1077805 3 0.4772 -0.02889 0.000 0.452 0.504 0.004 0.000 0.040
#> SRR1360402 2 0.1493 0.82312 0.000 0.936 0.000 0.004 0.004 0.056
#> SRR1406112 5 0.5579 0.12265 0.000 0.000 0.176 0.004 0.564 0.256
#> SRR1355352 3 0.3245 0.63212 0.008 0.000 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR656247 5 0.4128 -0.07790 0.492 0.000 0.004 0.000 0.500 0.004
#> SRR813656 2 0.6163 0.03375 0.000 0.412 0.000 0.004 0.316 0.268
#> SRR808244 3 0.1088 0.74116 0.000 0.000 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR1387240 2 0.5812 0.24447 0.000 0.536 0.000 0.008 0.264 0.192
#> SRR1408595 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1385277 4 0.0725 0.83219 0.000 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1435248 2 0.3168 0.76445 0.000 0.792 0.000 0.000 0.016 0.192
#> SRR1419110 5 0.3428 0.33385 0.000 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR1408682 5 0.4948 0.01534 0.000 0.064 0.000 0.000 0.472 0.464
#> SRR1317134 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 5 0.4305 0.13541 0.000 0.020 0.000 0.000 0.544 0.436
#> SRR1453911 5 0.3547 0.29087 0.000 0.000 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR603164 3 0.5540 0.16478 0.000 0.116 0.468 0.000 0.004 0.412
#> SRR1383259 2 0.2740 0.79760 0.000 0.864 0.000 0.060 0.000 0.076
#> SRR1330854 3 0.3050 0.54152 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368574 2 0.3646 0.72832 0.000 0.776 0.000 0.000 0.172 0.052
#> SRR1468162 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.2669 0.69824 0.000 0.000 0.836 0.000 0.008 0.156
#> SRR1361546 5 0.3919 0.45058 0.032 0.036 0.016 0.008 0.824 0.084
#> SRR1486156 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 5 0.6378 0.04944 0.000 0.364 0.000 0.128 0.456 0.052
#> SRR615635 2 0.0653 0.82553 0.000 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1385411 2 0.2389 0.80459 0.000 0.888 0.000 0.052 0.000 0.060
#> SRR1342739 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.1049 0.74483 0.000 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR662126 6 0.6337 0.19050 0.000 0.052 0.000 0.148 0.284 0.516
#> SRR1464601 2 0.4463 0.52724 0.000 0.588 0.000 0.000 0.036 0.376
#> SRR1071594 2 0.1007 0.82356 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR612539 2 0.0405 0.82395 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR602010 5 0.1921 0.49237 0.000 0.032 0.000 0.000 0.916 0.052
#> SRR810249 2 0.2730 0.77204 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR818773 5 0.2529 0.47237 0.088 0.008 0.008 0.000 0.884 0.012
#> SRR1336569 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 5 0.3617 0.38272 0.000 0.020 0.000 0.000 0.736 0.244
#> SRR1442754 1 0.3518 0.63688 0.732 0.000 0.256 0.000 0.012 0.000
#> SRR1334247 5 0.6031 -0.09962 0.000 0.000 0.312 0.000 0.420 0.268
#> SRR661639 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.6274 0.33891 0.016 0.516 0.004 0.008 0.292 0.164
#> SRR1459937 4 0.0865 0.83197 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR2185018 1 0.0363 0.95071 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR655732 2 0.4729 0.53101 0.000 0.636 0.000 0.000 0.284 0.080
#> SRR809348 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.2048 0.71631 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR661074 3 0.1644 0.73797 0.000 0.000 0.932 0.004 0.052 0.012
#> SRR1349851 1 0.0790 0.93822 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1405123 2 0.4881 0.59147 0.000 0.656 0.000 0.136 0.000 0.208
#> SRR661096 2 0.0717 0.82342 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1320225 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.0603 0.83312 0.000 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1307677 2 0.1921 0.81161 0.000 0.916 0.000 0.032 0.000 0.052
#> SRR1466512 2 0.0820 0.82330 0.000 0.972 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR658212 2 0.1921 0.81186 0.000 0.916 0.000 0.032 0.000 0.052
#> SRR1430525 6 0.6686 0.04827 0.000 0.004 0.268 0.328 0.024 0.376
#> SRR1344422 2 0.5297 0.52991 0.000 0.616 0.004 0.168 0.000 0.212
#> SRR1353924 2 0.2778 0.78539 0.000 0.824 0.000 0.008 0.000 0.168
#> SRR1314832 3 0.2823 0.58204 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 4 0.2771 0.72481 0.116 0.000 0.000 0.852 0.000 0.032
#> SRR627431 4 0.5295 0.53822 0.000 0.096 0.000 0.668 0.044 0.192
#> SRR1418561 3 0.4436 0.60839 0.020 0.000 0.744 0.088 0.000 0.148
#> SRR1448029 6 0.7489 0.01471 0.000 0.080 0.308 0.020 0.216 0.376
#> SRR813802 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0146 0.95219 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309702 2 0.0717 0.82551 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1435311 2 0.5809 0.09507 0.000 0.452 0.000 0.000 0.188 0.360
#> SRR612395 5 0.1141 0.51485 0.000 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR603116 5 0.1757 0.50996 0.000 0.008 0.000 0.000 0.916 0.076
#> SRR1323152 3 0.5514 0.43033 0.000 0.000 0.572 0.108 0.016 0.304
#> SRR1368264 5 0.2277 0.50660 0.000 0.032 0.000 0.000 0.892 0.076
#> SRR1326624 1 0.1957 0.87245 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1429265 3 0.0146 0.74604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.4983 0.57856 0.004 0.644 0.000 0.008 0.268 0.076
#> SRR1486799 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.5341 0.55041 0.012 0.632 0.000 0.168 0.000 0.188
#> SRR815044 4 0.4557 0.64862 0.000 0.048 0.000 0.752 0.120 0.080
#> SRR1338560 2 0.1477 0.82434 0.000 0.940 0.000 0.004 0.008 0.048
#> SRR615862 2 0.2776 0.78858 0.000 0.860 0.000 0.032 0.004 0.104
#> SRR1480038 2 0.1141 0.82136 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR659436 5 0.3409 0.33248 0.000 0.000 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR613699 2 0.4554 0.66259 0.000 0.716 0.000 0.008 0.104 0.172
#> SRR1436563 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.1765 0.81359 0.000 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1330327 4 0.0146 0.83657 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489950 2 0.2632 0.78937 0.000 0.832 0.000 0.000 0.004 0.164
#> SRR1431927 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.4085 0.64769 0.000 0.000 0.752 0.000 0.120 0.128
#> SRR1444002 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 6 0.5953 0.32983 0.000 0.000 0.192 0.200 0.032 0.576
#> SRR600656 4 0.0146 0.83657 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658766 6 0.5828 0.19710 0.000 0.000 0.060 0.068 0.320 0.552
#> SRR655946 4 0.6506 0.17003 0.000 0.324 0.088 0.484 0.000 0.104
#> SRR817282 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475104 3 0.1391 0.74151 0.000 0.000 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR1406418 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090265 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.1464 0.50811 0.000 0.016 0.004 0.000 0.944 0.036
#> SRR1471965 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612695 5 0.5237 -0.01366 0.000 0.000 0.080 0.004 0.480 0.436
#> SRR662498 5 0.3123 0.48973 0.000 0.000 0.024 0.036 0.852 0.088
#> SRR1376764 3 0.4850 0.57559 0.000 0.008 0.700 0.020 0.208 0.064
#> SRR1377006 3 0.5519 0.36141 0.008 0.016 0.516 0.064 0.000 0.396
#> SRR656860 2 0.3607 0.74470 0.000 0.796 0.000 0.092 0.000 0.112
#> SRR1480547 2 0.2462 0.79489 0.000 0.876 0.000 0.028 0.000 0.096
#> SRR1452515 5 0.3972 0.32875 0.000 0.004 0.012 0.000 0.664 0.320
#> SRR1324390 2 0.2146 0.80567 0.000 0.880 0.000 0.000 0.004 0.116
#> SRR615273 1 0.2697 0.75557 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR601695 6 0.6128 0.18468 0.000 0.000 0.000 0.320 0.332 0.348
#> SRR820907 2 0.1780 0.82442 0.000 0.924 0.000 0.000 0.028 0.048
#> SRR812773 5 0.4861 0.17903 0.052 0.000 0.004 0.000 0.552 0.392
#> SRR1405984 2 0.3636 0.64873 0.000 0.676 0.004 0.000 0.000 0.320
#> SRR1472794 2 0.3490 0.76474 0.000 0.784 0.000 0.000 0.040 0.176
#> SRR1365448 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.2260 0.69418 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1435626 6 0.5508 0.10748 0.000 0.004 0.112 0.000 0.412 0.472
#> SRR1080766 2 0.3911 0.69807 0.000 0.712 0.000 0.000 0.032 0.256
#> SRR1377862 1 0.0363 0.95071 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1332299 3 0.1333 0.74081 0.000 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1467966 3 0.3534 0.58729 0.000 0.000 0.716 0.000 0.008 0.276
#> SRR1320579 4 0.2940 0.75964 0.000 0.000 0.036 0.848 0.004 0.112
#> SRR1319710 2 0.5434 0.30832 0.000 0.564 0.000 0.000 0.272 0.164
#> SRR1326604 2 0.3098 0.75537 0.000 0.812 0.000 0.024 0.000 0.164
#> SRR1098879 3 0.0363 0.74503 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR662245 2 0.5135 0.55277 0.000 0.636 0.000 0.004 0.216 0.144
#> SRR1074719 2 0.3052 0.75327 0.000 0.780 0.000 0.004 0.000 0.216
#> SRR816226 4 0.2537 0.74857 0.096 0.000 0.000 0.872 0.000 0.032
#> SRR601387 2 0.3841 0.69975 0.000 0.716 0.000 0.000 0.028 0.256
#> SRR614575 2 0.1461 0.81772 0.000 0.940 0.000 0.016 0.000 0.044
#> SRR1353900 2 0.1765 0.81781 0.000 0.924 0.000 0.000 0.024 0.052
#> SRR662906 2 0.2730 0.79013 0.000 0.836 0.000 0.000 0.012 0.152
#> SRR1350832 2 0.1285 0.82310 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1403280 2 0.1080 0.82749 0.000 0.960 0.000 0.004 0.004 0.032
#> SRR1313969 4 0.0632 0.83296 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1388528 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4871 0.26648 0.580 0.000 0.000 0.000 0.348 0.072
#> SRR655399 3 0.0291 0.74624 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1319753 1 0.5739 0.33774 0.592 0.028 0.000 0.000 0.240 0.140
#> SRR818901 3 0.2983 0.69123 0.032 0.000 0.832 0.000 0.136 0.000
#> SRR607067 4 0.1832 0.80970 0.000 0.032 0.000 0.928 0.032 0.008
#> SRR1391420 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.3016 0.77211 0.000 0.836 0.000 0.012 0.016 0.136
#> SRR661961 5 0.1471 0.51233 0.000 0.000 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR658259 2 0.5008 0.60673 0.000 0.668 0.000 0.008 0.152 0.172
#> SRR1310476 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452696 2 0.3506 0.77417 0.000 0.792 0.000 0.000 0.052 0.156
#> SRR1365034 2 0.2948 0.78380 0.000 0.848 0.000 0.092 0.000 0.060
#> SRR1478053 2 0.2778 0.78624 0.000 0.824 0.000 0.008 0.000 0.168
#> SRR1475300 2 0.2949 0.78919 0.000 0.832 0.000 0.000 0.028 0.140
#> SRR1328101 5 0.3398 0.41378 0.000 0.008 0.000 0.000 0.740 0.252
#> SRR1322900 1 0.5837 -0.14630 0.432 0.000 0.120 0.000 0.432 0.016
#> SRR1309942 2 0.0603 0.82431 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1345760 4 0.0692 0.83499 0.000 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1435418 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402172 4 0.4301 0.49518 0.000 0.240 0.000 0.696 0.000 0.064
#> SRR1443436 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 6 0.4849 0.25624 0.000 0.112 0.000 0.000 0.240 0.648
#> SRR661469 5 0.3330 0.35467 0.000 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1500323 6 0.5818 0.02959 0.000 0.184 0.000 0.000 0.392 0.424
#> SRR1356705 5 0.5565 0.03099 0.000 0.144 0.000 0.000 0.488 0.368
#> SRR1464915 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312406 3 0.6643 0.34698 0.120 0.000 0.508 0.036 0.032 0.304
#> SRR1350435 1 0.1610 0.89819 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1389177 5 0.4470 0.20315 0.000 0.000 0.040 0.000 0.604 0.356
#> SRR1368072 2 0.4843 0.57520 0.000 0.616 0.000 0.000 0.084 0.300
#> SRR601815 2 0.2312 0.80899 0.000 0.876 0.000 0.000 0.012 0.112
#> SRR613330 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1434502 6 0.6021 0.29781 0.000 0.068 0.000 0.180 0.148 0.604
#> SRR1394190 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 6 0.5465 0.05875 0.000 0.016 0.080 0.000 0.396 0.508
#> SRR1318839 3 0.0363 0.74584 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1432390 4 0.0146 0.83618 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR613126 5 0.6653 0.12366 0.000 0.048 0.008 0.228 0.508 0.208
#> SRR1089424 2 0.2145 0.82163 0.000 0.900 0.000 0.000 0.028 0.072
#> SRR1347214 2 0.0820 0.82548 0.000 0.972 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1309556 6 0.5330 0.30576 0.040 0.000 0.080 0.000 0.236 0.644
#> SRR1456027 4 0.0363 0.83568 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1400551 3 0.6234 0.33959 0.012 0.008 0.508 0.000 0.244 0.228
#> SRR1320469 1 0.3266 0.61593 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.5055 0.58116 0.000 0.652 0.000 0.004 0.184 0.160
#> SRR1454310 2 0.2841 0.78913 0.000 0.824 0.000 0.012 0.000 0.164
#> SRR615105 4 0.0508 0.83657 0.000 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1433290 3 0.0405 0.74660 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR2166064 4 0.1049 0.82938 0.000 0.008 0.000 0.960 0.000 0.032
#> SRR601671 2 0.1760 0.81661 0.000 0.928 0.000 0.004 0.020 0.048
#> SRR663874 5 0.4393 0.17797 0.000 0.316 0.000 0.000 0.640 0.044
#> SRR1409130 2 0.2930 0.79966 0.000 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR659696 4 0.1152 0.80874 0.000 0.044 0.000 0.952 0.000 0.004
#> SRR1408249 2 0.2505 0.79747 0.008 0.880 0.000 0.020 0.000 0.092
#> SRR663284 2 0.4184 0.70531 0.004 0.752 0.000 0.008 0.060 0.176
#> SRR1402794 3 0.2595 0.69299 0.000 0.000 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR614852 4 0.0146 0.83623 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1348040 6 0.5814 0.06164 0.004 0.000 0.004 0.136 0.420 0.436
#> SRR1489610 2 0.5446 0.31511 0.000 0.568 0.000 0.000 0.256 0.176
#> SRR1488091 6 0.5472 0.19441 0.000 0.256 0.000 0.000 0.180 0.564
#> SRR1499566 2 0.2346 0.80681 0.008 0.868 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1361480 2 0.1421 0.82341 0.000 0.944 0.000 0.028 0.000 0.028
#> SRR1444501 3 0.4616 0.44647 0.000 0.000 0.624 0.000 0.060 0.316
#> SRR1415773 6 0.4613 0.26575 0.000 0.080 0.000 0.000 0.260 0.660
#> SRR1388832 1 0.4762 0.57774 0.688 0.000 0.104 0.000 0.200 0.008
#> SRR1394637 1 0.0260 0.95237 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR606974 4 0.6171 0.32146 0.000 0.060 0.000 0.572 0.152 0.216
#> SRR662918 4 0.4970 0.47164 0.000 0.224 0.000 0.652 0.004 0.120
#> SRR817421 3 0.0603 0.74541 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1400823 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.1320 0.82120 0.000 0.948 0.000 0.036 0.000 0.016
#> SRR608264 3 0.1075 0.74428 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1318560 1 0.3797 0.24456 0.580 0.000 0.420 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 5 0.5190 0.11455 0.000 0.096 0.000 0.000 0.528 0.376
#> SRR1312684 1 0.1075 0.92659 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR615044 5 0.5378 0.23051 0.180 0.000 0.000 0.000 0.584 0.236
#> SRR1432743 5 0.5029 -0.01786 0.000 0.000 0.072 0.000 0.484 0.444
#> SRR1388873 2 0.1225 0.82546 0.000 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1353517 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1357148 5 0.3927 0.42547 0.000 0.008 0.040 0.000 0.752 0.200
#> SRR1406008 2 0.5569 0.36142 0.000 0.540 0.000 0.000 0.180 0.280
#> SRR1396786 2 0.3290 0.72443 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004 0.252
#> SRR1446564 1 0.1983 0.89072 0.908 0.020 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1318465 3 0.5447 0.02659 0.000 0.000 0.460 0.000 0.120 0.420
#> SRR1431083 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR607117 4 0.0458 0.83125 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.1701 0.81842 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008 0.000
#> SRR1087825 4 0.0146 0.83622 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662019 4 0.3750 0.71448 0.044 0.000 0.132 0.804 0.012 0.008
#> SRR1349209 6 0.5996 0.21646 0.000 0.000 0.232 0.260 0.008 0.500
#> SRR1326161 2 0.0692 0.82620 0.000 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1345284 2 0.2278 0.80130 0.000 0.868 0.000 0.000 0.004 0.128
#> SRR1416672 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.1802 0.82545 0.000 0.916 0.000 0.012 0.000 0.072
#> SRR1454328 2 0.3279 0.76873 0.000 0.796 0.000 0.000 0.028 0.176
#> SRR1489286 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0260 0.95257 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1408183 3 0.4039 0.45478 0.000 0.000 0.632 0.000 0.016 0.352
#> SRR1084369 6 0.6553 0.32764 0.000 0.004 0.168 0.096 0.172 0.560
#> SRR598452 3 0.0622 0.74726 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR660709 6 0.6235 0.23079 0.000 0.004 0.004 0.292 0.264 0.436
#> SRR809444 1 0.0458 0.94850 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089901 2 0.4039 0.59210 0.000 0.632 0.000 0.000 0.016 0.352
#> SRR1375774 1 0.0363 0.95071 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1326292 4 0.0603 0.83312 0.000 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR657139 1 0.1307 0.92202 0.952 0.000 0.008 0.000 0.032 0.008
#> SRR1440744 2 0.1719 0.81356 0.000 0.924 0.000 0.016 0.000 0.060
#> SRR1353555 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323087 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452334 4 0.5019 0.51854 0.000 0.152 0.004 0.656 0.000 0.188
#> SRR1381775 1 0.0260 0.95282 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1363908 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.3361 0.74901 0.000 0.816 0.000 0.000 0.076 0.108
#> SRR658989 6 0.5629 0.27762 0.000 0.000 0.224 0.000 0.236 0.540
#> SRR1353663 1 0.0547 0.94590 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR811771 1 0.0260 0.95237 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813983 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR815825 3 0.0405 0.74557 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR819054 2 0.1556 0.81762 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1367988 4 0.1429 0.81908 0.000 0.004 0.000 0.940 0.052 0.004
#> SRR1331922 1 0.1444 0.90818 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR615479 5 0.1464 0.51017 0.036 0.004 0.000 0.000 0.944 0.016
#> SRR1375796 2 0.3930 0.73501 0.000 0.776 0.000 0.004 0.104 0.116
#> SRR1386991 5 0.4397 0.09691 0.000 0.008 0.012 0.000 0.528 0.452
#> SRR1355217 5 0.2650 0.48079 0.000 0.036 0.016 0.004 0.888 0.056
#> SRR1356290 5 0.4850 0.10308 0.000 0.024 0.020 0.000 0.524 0.432
#> SRR659507 5 0.2834 0.49250 0.000 0.008 0.020 0.000 0.852 0.120
#> SRR663296 1 0.1088 0.92974 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR598044 2 0.1010 0.82766 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR661155 4 0.0692 0.83365 0.000 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1414727 5 0.4917 0.41025 0.092 0.000 0.124 0.000 0.724 0.060
#> SRR663477 1 0.1908 0.88440 0.900 0.000 0.004 0.000 0.000 0.096
#> SRR1354489 3 0.5487 0.22932 0.000 0.000 0.532 0.000 0.148 0.320
#> SRR1377800 3 0.3791 0.60158 0.000 0.000 0.732 0.000 0.236 0.032
#> SRR614611 2 0.3104 0.78085 0.000 0.800 0.000 0.016 0.000 0.184
#> SRR655052 4 0.4872 0.29528 0.000 0.000 0.000 0.548 0.064 0.388
#> SRR1478968 4 0.0000 0.83614 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.4975 0.67472 0.000 0.716 0.000 0.084 0.060 0.140
#> SRR613951 4 0.0713 0.83290 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1418022 1 0.0260 0.95237 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR661901 3 0.6034 0.20913 0.000 0.000 0.464 0.244 0.004 0.288
#> SRR1408161 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.5153 0.52119 0.000 0.000 0.664 0.032 0.084 0.220
#> SRR655040 6 0.6547 -0.03458 0.008 0.312 0.000 0.324 0.008 0.348
#> SRR810225 2 0.2983 0.79179 0.000 0.832 0.000 0.000 0.032 0.136
#> SRR1325377 2 0.3602 0.77827 0.000 0.792 0.000 0.000 0.072 0.136
#> SRR617829 4 0.5319 0.41227 0.000 0.000 0.184 0.596 0.000 0.220
#> SRR1402328 2 0.3163 0.74214 0.000 0.764 0.000 0.000 0.004 0.232
#> SRR1480455 2 0.3650 0.70391 0.000 0.716 0.000 0.004 0.008 0.272
#> SRR1442104 3 0.0520 0.74588 0.000 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1453416 1 0.0692 0.94028 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR1481396 3 0.0291 0.74662 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1414314 2 0.1442 0.82783 0.000 0.944 0.000 0.012 0.004 0.040
#> SRR663026 2 0.1462 0.82420 0.000 0.936 0.000 0.000 0.008 0.056
#> SRR1478386 2 0.0858 0.82715 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1458683 4 0.0692 0.83172 0.000 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1370572 1 0.0260 0.95237 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1467567 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468532 5 0.3399 0.44230 0.100 0.004 0.020 0.000 0.836 0.040
#> SRR1310735 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440101 4 0.0000 0.83614 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660260 5 0.4688 0.01741 0.000 0.000 0.012 0.428 0.536 0.024
#> SRR1071231 2 0.3189 0.73844 0.000 0.760 0.000 0.000 0.004 0.236
#> SRR1459125 4 0.5492 0.05671 0.000 0.000 0.000 0.472 0.128 0.400
#> SRR1337173 6 0.5058 0.07369 0.000 0.000 0.076 0.000 0.424 0.500
#> SRR1396250 3 0.0291 0.74617 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR2166376 5 0.4150 0.37244 0.000 0.000 0.204 0.004 0.732 0.060
#> SRR659816 6 0.5683 0.08849 0.000 0.012 0.004 0.096 0.408 0.480
#> SRR1401379 5 0.5722 -0.01126 0.000 0.404 0.000 0.000 0.432 0.164
#> SRR600981 4 0.0146 0.83618 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1397218 6 0.5260 0.25486 0.044 0.280 0.004 0.028 0.008 0.636
#> SRR660115 1 0.0260 0.95237 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407950 2 0.0935 0.82494 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1359780 2 0.2313 0.81459 0.000 0.884 0.000 0.012 0.004 0.100
#> SRR1490037 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR627439 5 0.5430 0.02695 0.000 0.004 0.000 0.104 0.492 0.400
#> SRR1397156 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.3528 0.67744 0.000 0.700 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR1319648 2 0.2794 0.78053 0.000 0.840 0.004 0.012 0.000 0.144
#> SRR1092985 3 0.3872 0.33880 0.392 0.000 0.604 0.000 0.000 0.004
#> SRR656409 2 0.2190 0.80946 0.000 0.900 0.000 0.040 0.000 0.060
#> SRR1468658 4 0.3473 0.68823 0.000 0.000 0.024 0.780 0.004 0.192
#> SRR1390437 4 0.0405 0.83607 0.000 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR658057 2 0.2605 0.78913 0.000 0.864 0.000 0.028 0.000 0.108
#> SRR612635 2 0.1088 0.82580 0.000 0.960 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1351480 2 0.2199 0.80349 0.000 0.892 0.000 0.000 0.020 0.088
#> SRR1436651 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3925 0.51139 0.656 0.000 0.004 0.000 0.332 0.008
#> SRR659590 2 0.3253 0.76211 0.000 0.788 0.000 0.000 0.020 0.192
#> SRR614263 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409575 2 0.0405 0.82410 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR659911 2 0.1232 0.82362 0.000 0.956 0.000 0.016 0.004 0.024
#> SRR1085519 3 0.4530 0.59447 0.000 0.000 0.704 0.000 0.136 0.160
#> SRR1345894 5 0.5426 0.34841 0.000 0.004 0.144 0.064 0.684 0.104
#> SRR1442928 5 0.3012 0.45325 0.000 0.008 0.000 0.000 0.796 0.196
#> SRR1464681 4 0.0146 0.83618 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 6 0.5477 0.28595 0.000 0.000 0.168 0.000 0.276 0.556
#> SRR1365426 5 0.1757 0.51748 0.012 0.008 0.000 0.000 0.928 0.052
#> SRR1487947 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.4550 0.18026 0.524 0.000 0.020 0.000 0.448 0.008
#> SRR603236 6 0.4262 0.16195 0.000 0.004 0.004 0.012 0.364 0.616
#> SRR660673 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430729 2 0.4044 0.68942 0.000 0.704 0.000 0.000 0.040 0.256
#> SRR663807 2 0.0837 0.82636 0.000 0.972 0.000 0.004 0.004 0.020
#> SRR1087245 2 0.1088 0.82222 0.000 0.960 0.000 0.024 0.000 0.016
#> SRR1339108 6 0.4054 0.31832 0.000 0.188 0.000 0.000 0.072 0.740
#> SRR613426 4 0.7402 0.17885 0.136 0.136 0.000 0.400 0.012 0.316
#> SRR613879 5 0.3421 0.37644 0.000 0.008 0.000 0.000 0.736 0.256
#> SRR1385101 5 0.5610 0.21002 0.300 0.016 0.004 0.092 0.584 0.004
#> SRR1387966 2 0.2263 0.80496 0.000 0.884 0.000 0.016 0.000 0.100
#> SRR1458852 2 0.5121 0.46211 0.000 0.568 0.000 0.000 0.100 0.332
#> SRR1430489 1 0.2658 0.84205 0.864 0.000 0.000 0.100 0.000 0.036
#> SRR1349231 1 0.3653 0.57696 0.692 0.000 0.000 0.000 0.300 0.008
#> SRR1376249 3 0.0146 0.74604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321987 2 0.2709 0.79564 0.000 0.848 0.000 0.000 0.020 0.132
#> SRR662653 2 0.2118 0.80913 0.000 0.888 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR1390027 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098474 2 0.0405 0.82544 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1383081 2 0.1262 0.82615 0.000 0.956 0.000 0.008 0.016 0.020
#> SRR2166960 2 0.2492 0.79725 0.000 0.876 0.000 0.004 0.020 0.100
#> SRR605101 5 0.5845 0.03637 0.000 0.316 0.000 0.000 0.472 0.212
#> SRR818600 2 0.2655 0.77845 0.000 0.848 0.000 0.008 0.004 0.140
#> SRR1367715 2 0.3380 0.79409 0.000 0.832 0.000 0.016 0.096 0.056
#> SRR1351979 3 0.1082 0.74417 0.000 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1387054 6 0.7401 0.13815 0.000 0.308 0.176 0.156 0.000 0.360
#> SRR1444306 3 0.5886 0.19858 0.000 0.004 0.464 0.000 0.352 0.180
#> SRR1322662 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3592 0.77570 0.000 0.824 0.000 0.028 0.064 0.084
#> SRR612767 1 0.0865 0.93557 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1489030 2 0.1524 0.82369 0.000 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR1430375 5 0.1531 0.51396 0.000 0.004 0.000 0.000 0.928 0.068
#> SRR615225 4 0.0405 0.83651 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1401839 5 0.3961 0.14617 0.000 0.000 0.004 0.000 0.556 0.440
#> SRR1379110 2 0.0858 0.82254 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1077288 3 0.0260 0.74615 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1331639 4 0.0146 0.83618 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1342782 5 0.2218 0.50736 0.000 0.012 0.000 0.000 0.884 0.104
#> SRR1443003 6 0.7203 0.13483 0.000 0.136 0.168 0.000 0.276 0.420
#> SRR612839 1 0.0146 0.95368 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470093 4 0.2740 0.74979 0.000 0.000 0.120 0.852 0.000 0.028
#> SRR1395742 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0146 0.95224 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387222 4 0.3526 0.68625 0.000 0.000 0.020 0.792 0.016 0.172
#> SRR664063 5 0.0458 0.51457 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1488214 1 0.1007 0.92945 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR654766 4 0.0405 0.83604 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1320321 2 0.1983 0.82127 0.000 0.908 0.000 0.000 0.020 0.072
#> SRR1071955 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.95378 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2422 0.81932 0.000 0.896 0.000 0.012 0.052 0.040
#> SRR1488470 2 0.2398 0.79493 0.000 0.876 0.000 0.020 0.000 0.104
#> SRR1389497 3 0.2664 0.70393 0.000 0.000 0.848 0.000 0.016 0.136
#> SRR1367109 6 0.5271 0.27631 0.000 0.000 0.120 0.004 0.284 0.592
#> SRR615311 1 0.0508 0.94602 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.546 0.820 0.910 0.4623 0.521 0.521
#> 3 3 0.411 0.539 0.691 0.3161 0.754 0.559
#> 4 4 0.446 0.555 0.713 0.1188 0.764 0.446
#> 5 5 0.508 0.557 0.768 0.0627 0.927 0.761
#> 6 6 0.555 0.588 0.761 0.0438 0.931 0.766
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.8909 0.60507 0.308 0.692
#> SRR1380716 1 0.2603 0.90083 0.956 0.044
#> SRR612803 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1084417 2 0.7139 0.76721 0.196 0.804
#> SRR1074359 2 0.1843 0.88720 0.028 0.972
#> SRR1419258 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR1499740 2 0.9754 0.35550 0.408 0.592
#> SRR1105057 1 0.5946 0.83763 0.856 0.144
#> SRR1439742 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.2948 0.88337 0.052 0.948
#> SRR612215 2 0.3431 0.87859 0.064 0.936
#> SRR1094051 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.5946 0.83212 0.856 0.144
#> SRR1409263 2 0.6531 0.79386 0.168 0.832
#> SRR1431288 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1334889 1 0.6247 0.82501 0.844 0.156
#> SRR614839 1 0.4161 0.88155 0.916 0.084
#> SRR658433 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR1088581 1 0.8763 0.63068 0.704 0.296
#> SRR1328797 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1334512 1 0.5059 0.86350 0.888 0.112
#> SRR1471117 1 0.1843 0.90326 0.972 0.028
#> SRR1311553 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.9460 0.48267 0.364 0.636
#> SRR1354955 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0376 0.88478 0.004 0.996
#> SRR660066 2 0.8661 0.64179 0.288 0.712
#> SRR1447103 2 0.3431 0.87859 0.064 0.936
#> SRR1402153 2 0.7139 0.76898 0.196 0.804
#> SRR655887 1 0.9815 0.31287 0.580 0.420
#> SRR1408529 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.9491 0.47314 0.368 0.632
#> SRR1074670 2 0.1184 0.88702 0.016 0.984
#> SRR1375439 2 0.9710 0.37883 0.400 0.600
#> SRR1329003 1 0.4298 0.87422 0.912 0.088
#> SRR1404837 1 0.2948 0.89828 0.948 0.052
#> SRR1317920 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0376 0.90653 0.996 0.004
#> SRR613999 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1375509 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR612227 2 0.1184 0.88702 0.016 0.984
#> SRR1388809 2 0.2948 0.88373 0.052 0.948
#> SRR1413872 1 0.2778 0.89946 0.952 0.048
#> SRR1452864 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.9710 0.37883 0.400 0.600
#> SRR615814 2 0.3114 0.88245 0.056 0.944
#> SRR1325225 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.9491 0.47593 0.368 0.632
#> SRR1358220 1 0.2603 0.90083 0.956 0.044
#> SRR1096662 1 0.0938 0.90652 0.988 0.012
#> SRR1487746 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.2236 0.90343 0.964 0.036
#> SRR660164 1 0.7453 0.76010 0.788 0.212
#> SRR815783 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR809595 1 0.3114 0.89721 0.944 0.056
#> SRR1403133 2 0.6247 0.81058 0.156 0.844
#> SRR815470 2 0.1843 0.88720 0.028 0.972
#> SRR1344382 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.2948 0.88374 0.052 0.948
#> SRR1478362 1 0.4939 0.86848 0.892 0.108
#> SRR1392186 1 0.0672 0.90655 0.992 0.008
#> SRR1347937 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.9775 0.34325 0.412 0.588
#> SRR612683 1 0.7376 0.76394 0.792 0.208
#> SRR1392901 2 0.1633 0.88721 0.024 0.976
#> SRR1077805 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.9460 0.48267 0.364 0.636
#> SRR1406112 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.6623 0.79036 0.172 0.828
#> SRR656247 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR813656 1 0.2948 0.89861 0.948 0.052
#> SRR808244 1 0.4298 0.87422 0.912 0.088
#> SRR1387240 2 0.2778 0.88469 0.048 0.952
#> SRR1408595 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0672 0.90677 0.992 0.008
#> SRR1435248 2 0.2948 0.88346 0.052 0.948
#> SRR1419110 2 0.9209 0.54143 0.336 0.664
#> SRR1408682 2 0.4022 0.86930 0.080 0.920
#> SRR1317134 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1489307 1 0.3584 0.89097 0.932 0.068
#> SRR1453911 1 0.9933 0.20083 0.548 0.452
#> SRR603164 2 0.1184 0.88702 0.016 0.984
#> SRR1383259 1 0.2423 0.90236 0.960 0.040
#> SRR1330854 1 0.7299 0.76619 0.796 0.204
#> SRR1452423 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.0672 0.90655 0.992 0.008
#> SRR1468162 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0376 0.88487 0.004 0.996
#> SRR1361546 1 0.5059 0.86317 0.888 0.112
#> SRR1486156 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0376 0.88474 0.004 0.996
#> SRR615635 2 0.5178 0.84521 0.116 0.884
#> SRR1385411 1 0.6712 0.80427 0.824 0.176
#> SRR1342739 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR662126 1 0.7219 0.77761 0.800 0.200
#> SRR1464601 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR1071594 2 0.9491 0.47314 0.368 0.632
#> SRR612539 1 0.7745 0.73890 0.772 0.228
#> SRR602010 1 0.4022 0.88473 0.920 0.080
#> SRR810249 1 0.7950 0.72273 0.760 0.240
#> SRR818773 1 0.3274 0.89557 0.940 0.060
#> SRR1336569 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1368117 1 0.7376 0.76394 0.792 0.208
#> SRR1442754 1 0.5946 0.83212 0.856 0.144
#> SRR1334247 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR613222 1 0.4022 0.88422 0.920 0.080
#> SRR1459937 1 0.2778 0.90050 0.952 0.048
#> SRR2185018 1 0.0938 0.90682 0.988 0.012
#> SRR655732 1 0.9933 0.19818 0.548 0.452
#> SRR809348 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.1184 0.88702 0.016 0.984
#> SRR661074 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1405123 1 0.5178 0.86048 0.884 0.116
#> SRR661096 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.4298 0.87422 0.912 0.088
#> SRR1307677 1 0.9427 0.48444 0.640 0.360
#> SRR1466512 1 0.1414 0.90591 0.980 0.020
#> SRR658212 1 0.9754 0.34658 0.592 0.408
#> SRR1430525 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.9909 0.24375 0.444 0.556
#> SRR1353924 1 0.4022 0.88527 0.920 0.080
#> SRR1314832 2 0.7139 0.76721 0.196 0.804
#> SRR1487570 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR627431 1 0.6531 0.81221 0.832 0.168
#> SRR1418561 2 0.4815 0.85160 0.104 0.896
#> SRR1448029 2 0.0376 0.88487 0.004 0.996
#> SRR813802 1 0.4431 0.87071 0.908 0.092
#> SRR815020 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1309702 1 0.6247 0.82548 0.844 0.156
#> SRR1435311 1 0.2043 0.90438 0.968 0.032
#> SRR612395 2 0.3431 0.87859 0.064 0.936
#> SRR603116 1 0.9209 0.53876 0.664 0.336
#> SRR1323152 2 0.1184 0.88702 0.016 0.984
#> SRR1368264 1 0.2236 0.90351 0.964 0.036
#> SRR1326624 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1429265 2 0.0376 0.88478 0.004 0.996
#> SRR1327702 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR615611 1 0.5629 0.84629 0.868 0.132
#> SRR1486799 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR815044 1 0.0376 0.90668 0.996 0.004
#> SRR1338560 1 0.3431 0.89351 0.936 0.064
#> SRR615862 1 0.7528 0.75289 0.784 0.216
#> SRR1480038 1 0.2043 0.90438 0.968 0.032
#> SRR659436 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.8713 0.63442 0.292 0.708
#> SRR1436563 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR615323 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1330327 1 0.0376 0.90653 0.996 0.004
#> SRR1489950 2 0.3114 0.88262 0.056 0.944
#> SRR1431927 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.1843 0.90326 0.972 0.028
#> SRR1318444 1 0.8207 0.69705 0.744 0.256
#> SRR600656 1 0.2778 0.89946 0.952 0.048
#> SRR658766 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.0376 0.88478 0.004 0.996
#> SRR1406418 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.3274 0.89557 0.940 0.060
#> SRR1471965 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.2236 0.88678 0.036 0.964
#> SRR662498 2 0.2423 0.88619 0.040 0.960
#> SRR1376764 2 0.7139 0.76898 0.196 0.804
#> SRR1377006 2 0.8081 0.70007 0.248 0.752
#> SRR656860 1 0.6438 0.81665 0.836 0.164
#> SRR1480547 1 0.5946 0.83683 0.856 0.144
#> SRR1452515 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR1324390 2 0.8555 0.65482 0.280 0.720
#> SRR615273 1 0.4298 0.87908 0.912 0.088
#> SRR601695 2 0.1843 0.88720 0.028 0.972
#> SRR820907 1 0.5737 0.84457 0.864 0.136
#> SRR812773 1 0.0938 0.90675 0.988 0.012
#> SRR1405984 1 0.5519 0.85219 0.872 0.128
#> SRR1472794 2 0.3584 0.87667 0.068 0.932
#> SRR1365448 1 0.5946 0.83127 0.856 0.144
#> SRR1095720 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.7056 0.77087 0.192 0.808
#> SRR1080766 2 0.3274 0.88043 0.060 0.940
#> SRR1377862 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1319710 1 0.0938 0.90652 0.988 0.012
#> SRR1326604 1 0.8016 0.71292 0.756 0.244
#> SRR1098879 2 0.2948 0.87789 0.052 0.948
#> SRR662245 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1074719 1 0.5519 0.85219 0.872 0.128
#> SRR816226 1 0.3114 0.89639 0.944 0.056
#> SRR601387 1 0.9635 0.40248 0.612 0.388
#> SRR614575 1 0.9044 0.57751 0.680 0.320
#> SRR1353900 1 0.9491 0.46519 0.632 0.368
#> SRR662906 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.8909 0.60583 0.308 0.692
#> SRR1403280 1 0.6623 0.80827 0.828 0.172
#> SRR1313969 1 0.4298 0.88078 0.912 0.088
#> SRR1388528 1 0.5408 0.84694 0.876 0.124
#> SRR1452912 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.1633 0.90560 0.976 0.024
#> SRR655399 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.1843 0.90490 0.972 0.028
#> SRR818901 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1384138 1 0.6247 0.82501 0.844 0.156
#> SRR661961 2 0.2423 0.88606 0.040 0.960
#> SRR658259 1 0.8661 0.63875 0.712 0.288
#> SRR1310476 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4939 0.85094 0.108 0.892
#> SRR1365034 1 0.0938 0.90652 0.988 0.012
#> SRR1478053 2 0.9248 0.53943 0.340 0.660
#> SRR1475300 1 0.2423 0.90208 0.960 0.040
#> SRR1328101 2 0.3431 0.87859 0.064 0.936
#> SRR1322900 1 0.3274 0.89559 0.940 0.060
#> SRR1309942 2 0.2778 0.88469 0.048 0.952
#> SRR1345760 1 0.0376 0.90674 0.996 0.004
#> SRR1435418 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1402172 1 0.7745 0.74102 0.772 0.228
#> SRR1443436 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR661469 1 0.9998 0.01802 0.508 0.492
#> SRR1500323 2 0.0376 0.88474 0.004 0.996
#> SRR1356705 1 0.2043 0.90407 0.968 0.032
#> SRR1464915 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.9732 0.36720 0.404 0.596
#> SRR1350435 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1368072 1 0.9754 0.34380 0.592 0.408
#> SRR601815 1 1.0000 -0.01516 0.500 0.500
#> SRR613330 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.8813 0.62218 0.300 0.700
#> SRR1394190 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.8555 0.64977 0.280 0.720
#> SRR1318839 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1432390 1 0.2778 0.89946 0.952 0.048
#> SRR613126 2 0.0376 0.88474 0.004 0.996
#> SRR1089424 1 0.5059 0.86317 0.888 0.112
#> SRR1347214 1 0.9954 0.16343 0.540 0.460
#> SRR1309556 2 0.9795 0.33379 0.416 0.584
#> SRR1456027 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1400551 2 0.6801 0.78321 0.180 0.820
#> SRR1320469 1 0.8555 0.63279 0.720 0.280
#> SRR614251 2 0.6531 0.80045 0.168 0.832
#> SRR1454310 2 0.9044 0.58089 0.320 0.680
#> SRR615105 2 0.1843 0.88720 0.028 0.972
#> SRR1433290 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR601671 1 0.1414 0.90591 0.980 0.020
#> SRR663874 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR1409130 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR659696 1 0.6247 0.82584 0.844 0.156
#> SRR1408249 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR663284 1 0.6048 0.83408 0.852 0.148
#> SRR1402794 2 0.1184 0.88702 0.016 0.984
#> SRR614852 1 0.0376 0.90653 0.996 0.004
#> SRR1348040 1 0.2778 0.89935 0.952 0.048
#> SRR1489610 1 0.0938 0.90652 0.988 0.012
#> SRR1488091 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR1499566 1 0.2043 0.90407 0.968 0.032
#> SRR1361480 1 0.7815 0.73301 0.768 0.232
#> SRR1444501 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.9896 0.25465 0.440 0.560
#> SRR1388832 2 0.9754 0.35550 0.408 0.592
#> SRR1394637 1 0.2043 0.90352 0.968 0.032
#> SRR606974 2 0.9608 0.43200 0.384 0.616
#> SRR662918 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR817421 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1381348 1 0.6343 0.82143 0.840 0.160
#> SRR608264 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.1843 0.90326 0.972 0.028
#> SRR1454117 1 0.3584 0.89097 0.932 0.068
#> SRR1312684 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR615044 1 0.9954 0.15087 0.540 0.460
#> SRR1432743 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.7950 0.71647 0.240 0.760
#> SRR1353517 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0672 0.88568 0.008 0.992
#> SRR1406008 1 0.8955 0.58978 0.688 0.312
#> SRR1396786 2 0.3114 0.88262 0.056 0.944
#> SRR1446564 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.9815 0.32406 0.420 0.580
#> SRR1087825 1 0.2778 0.89946 0.952 0.048
#> SRR662019 2 0.4690 0.85165 0.100 0.900
#> SRR1349209 1 0.8207 0.69705 0.744 0.256
#> SRR1326161 2 0.9944 0.19496 0.456 0.544
#> SRR1345284 1 0.1184 0.90643 0.984 0.016
#> SRR1416672 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR663356 1 0.4022 0.88527 0.920 0.080
#> SRR1454328 2 0.2603 0.88527 0.044 0.956
#> SRR1489286 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR809444 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.6531 0.79952 0.168 0.832
#> SRR1375774 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.4298 0.87422 0.912 0.088
#> SRR657139 1 0.2423 0.90200 0.960 0.040
#> SRR1440744 1 0.0938 0.90652 0.988 0.012
#> SRR1353555 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.2043 0.90352 0.968 0.032
#> SRR1452334 1 0.7745 0.74102 0.772 0.228
#> SRR1381775 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1319626 1 0.3584 0.89097 0.932 0.068
#> SRR658989 2 0.1414 0.88732 0.020 0.980
#> SRR1353663 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.9998 0.04549 0.492 0.508
#> SRR1367988 1 0.0376 0.90653 0.996 0.004
#> SRR1331922 1 0.0376 0.90653 0.996 0.004
#> SRR615479 1 0.3879 0.88652 0.924 0.076
#> SRR1375796 2 0.6531 0.80045 0.168 0.832
#> SRR1386991 2 0.8763 0.62165 0.296 0.704
#> SRR1355217 1 0.6048 0.83908 0.852 0.148
#> SRR1356290 2 0.9323 0.52382 0.348 0.652
#> SRR659507 2 0.0672 0.88567 0.008 0.992
#> SRR663296 1 0.2948 0.89861 0.948 0.052
#> SRR598044 1 0.5842 0.84227 0.860 0.140
#> SRR661155 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR1414727 2 0.9209 0.54143 0.336 0.664
#> SRR663477 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.6801 0.78321 0.180 0.820
#> SRR614611 2 0.3274 0.88050 0.060 0.940
#> SRR655052 1 0.7745 0.74102 0.772 0.228
#> SRR1478968 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1351280 1 0.8661 0.63875 0.712 0.288
#> SRR613951 1 0.4939 0.86708 0.892 0.108
#> SRR1418022 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR661901 1 0.8207 0.69705 0.744 0.256
#> SRR1408161 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR655040 1 0.0938 0.90675 0.988 0.012
#> SRR810225 1 0.9248 0.52926 0.660 0.340
#> SRR1325377 1 0.5842 0.84227 0.860 0.140
#> SRR617829 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR1480455 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0672 0.90609 0.992 0.008
#> SRR1481396 2 0.0376 0.88478 0.004 0.996
#> SRR1414314 2 0.7745 0.73249 0.228 0.772
#> SRR663026 1 0.9460 0.47255 0.636 0.364
#> SRR1478386 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1458683 2 0.1184 0.88682 0.016 0.984
#> SRR1370572 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1440101 1 0.2423 0.90203 0.960 0.040
#> SRR660260 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR1071231 1 0.5519 0.85219 0.872 0.128
#> SRR1459125 1 0.3431 0.89339 0.936 0.064
#> SRR1337173 2 0.1843 0.88761 0.028 0.972
#> SRR1396250 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR1401379 1 0.0938 0.90652 0.988 0.012
#> SRR600981 1 0.5629 0.84774 0.868 0.132
#> SRR1398335 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.2043 0.90407 0.968 0.032
#> SRR660115 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.9608 0.43273 0.384 0.616
#> SRR1359780 2 0.2778 0.88469 0.048 0.952
#> SRR1490037 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.4161 0.86742 0.084 0.916
#> SRR1319648 1 0.6343 0.82069 0.840 0.160
#> SRR1092985 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR656409 1 0.2423 0.90236 0.960 0.040
#> SRR1468658 2 0.1843 0.88764 0.028 0.972
#> SRR1390437 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR658057 1 0.8016 0.71292 0.756 0.244
#> SRR612635 1 0.5059 0.86317 0.888 0.112
#> SRR1351480 1 0.3431 0.89351 0.936 0.064
#> SRR1436651 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR659590 1 1.0000 0.00425 0.504 0.496
#> SRR614263 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1409575 1 0.1414 0.90591 0.980 0.020
#> SRR659911 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR1085519 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.1184 0.88682 0.016 0.984
#> SRR1442928 2 0.3431 0.87859 0.064 0.936
#> SRR1464681 1 0.2778 0.89946 0.952 0.048
#> SRR1418880 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.1843 0.88761 0.028 0.972
#> SRR1365426 1 0.2948 0.89839 0.948 0.052
#> SRR1487947 1 0.3879 0.88678 0.924 0.076
#> SRR659708 1 0.3431 0.89451 0.936 0.064
#> SRR603236 2 0.1633 0.88721 0.024 0.976
#> SRR660673 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1430729 1 0.9732 0.35436 0.596 0.404
#> SRR663807 2 0.8555 0.65482 0.280 0.720
#> SRR1087245 1 0.7883 0.72490 0.764 0.236
#> SRR1339108 1 0.3733 0.88948 0.928 0.072
#> SRR613426 1 0.0672 0.90685 0.992 0.008
#> SRR613879 1 0.7376 0.76394 0.792 0.208
#> SRR1385101 1 0.1414 0.90591 0.980 0.020
#> SRR1387966 2 0.7950 0.71647 0.240 0.760
#> SRR1458852 2 0.2778 0.88469 0.048 0.952
#> SRR1430489 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1376249 2 0.0376 0.88478 0.004 0.996
#> SRR1321987 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR662653 2 0.2236 0.88647 0.036 0.964
#> SRR1390027 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1098474 1 0.9833 0.29421 0.576 0.424
#> SRR1383081 1 0.6712 0.80394 0.824 0.176
#> SRR2166960 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR605101 1 0.4022 0.88473 0.920 0.080
#> SRR818600 2 0.6887 0.78503 0.184 0.816
#> SRR1367715 1 0.2043 0.90405 0.968 0.032
#> SRR1351979 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3274 0.88115 0.060 0.940
#> SRR612767 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.8909 0.60507 0.308 0.692
#> SRR1430375 2 0.0376 0.88474 0.004 0.996
#> SRR615225 1 0.5842 0.84064 0.860 0.140
#> SRR1401839 1 0.9963 0.15346 0.536 0.464
#> SRR1379110 1 0.0672 0.90655 0.992 0.008
#> SRR1077288 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1331639 1 0.2778 0.89946 0.952 0.048
#> SRR1342782 1 0.8144 0.70168 0.748 0.252
#> SRR1443003 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.1633 0.90465 0.976 0.024
#> SRR1470093 2 0.1184 0.88702 0.016 0.984
#> SRR1395742 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.1184 0.88682 0.016 0.984
#> SRR664063 1 0.5842 0.84334 0.860 0.140
#> SRR1488214 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR654766 1 0.0376 0.90653 0.996 0.004
#> SRR1320321 1 0.3431 0.89351 0.936 0.064
#> SRR1071955 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
#> SRR1394231 1 0.7883 0.72490 0.764 0.236
#> SRR1488470 1 0.5946 0.83683 0.856 0.144
#> SRR1389497 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.88362 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.90645 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.7995 0.11112 0.088 0.608 0.304
#> SRR1380716 1 0.6154 0.43955 0.592 0.408 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2796 0.74053 0.908 0.092 0.000
#> SRR1084417 3 0.7807 0.43558 0.052 0.432 0.516
#> SRR1074359 3 0.6008 0.73979 0.000 0.372 0.628
#> SRR1419258 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.3267 0.78207 0.000 0.116 0.884
#> SRR665262 3 0.6168 0.71268 0.000 0.412 0.588
#> SRR1499740 2 0.7485 0.37954 0.096 0.680 0.224
#> SRR1105057 2 0.6140 0.20103 0.404 0.596 0.000
#> SRR1439742 1 0.1289 0.74649 0.968 0.032 0.000
#> SRR614599 3 0.6280 0.66347 0.000 0.460 0.540
#> SRR612215 3 0.6302 0.64056 0.000 0.480 0.520
#> SRR1094051 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.6678 0.31083 0.512 0.480 0.008
#> SRR1409263 3 0.7309 0.50068 0.032 0.416 0.552
#> SRR1431288 1 0.3116 0.73813 0.892 0.108 0.000
#> SRR1334889 2 0.6373 0.20259 0.408 0.588 0.004
#> SRR614839 1 0.6291 0.27002 0.532 0.468 0.000
#> SRR658433 3 0.6140 0.71848 0.000 0.404 0.596
#> SRR1088581 2 0.6805 0.48879 0.268 0.688 0.044
#> SRR1328797 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.6307 -0.11336 0.488 0.512 0.000
#> SRR1471117 1 0.5529 0.63609 0.704 0.296 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.7533 0.27707 0.088 0.668 0.244
#> SRR1354955 3 0.2625 0.77134 0.000 0.084 0.916
#> SRR654802 3 0.1411 0.75533 0.000 0.036 0.964
#> SRR660066 2 0.7773 0.01831 0.072 0.612 0.316
#> SRR1447103 3 0.6302 0.64056 0.000 0.480 0.520
#> SRR1402153 2 0.6500 -0.38510 0.004 0.532 0.464
#> SRR655887 2 0.7079 0.57095 0.176 0.720 0.104
#> SRR1408529 3 0.2711 0.77223 0.000 0.088 0.912
#> SRR658707 1 0.2711 0.74288 0.912 0.088 0.000
#> SRR1384371 2 0.7101 0.29226 0.068 0.692 0.240
#> SRR1074670 3 0.4931 0.77787 0.000 0.232 0.768
#> SRR1375439 2 0.7180 0.36990 0.084 0.700 0.216
#> SRR1329003 1 0.6180 0.47339 0.584 0.416 0.000
#> SRR1404837 1 0.6260 0.35443 0.552 0.448 0.000
#> SRR1317920 1 0.0424 0.74349 0.992 0.008 0.000
#> SRR1455525 1 0.6111 0.47916 0.604 0.396 0.000
#> SRR613999 1 0.0592 0.74462 0.988 0.012 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.2959 0.77859 0.000 0.100 0.900
#> SRR1068855 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.4931 0.77787 0.000 0.232 0.768
#> SRR1388809 3 0.6280 0.66966 0.000 0.460 0.540
#> SRR1413872 1 0.6309 0.20039 0.504 0.496 0.000
#> SRR1452864 1 0.0424 0.74349 0.992 0.008 0.000
#> SRR1473078 2 0.7180 0.36990 0.084 0.700 0.216
#> SRR615814 3 0.6476 0.67095 0.004 0.448 0.548
#> SRR1325225 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.7145 0.28647 0.072 0.692 0.236
#> SRR1358220 1 0.6154 0.43955 0.592 0.408 0.000
#> SRR1096662 1 0.5363 0.63506 0.724 0.276 0.000
#> SRR1487746 1 0.0592 0.74462 0.988 0.012 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.5968 0.52608 0.636 0.364 0.000
#> SRR660164 2 0.5982 0.39107 0.328 0.668 0.004
#> SRR815783 3 0.6168 0.71268 0.000 0.412 0.588
#> SRR809595 1 0.6126 0.45634 0.600 0.400 0.000
#> SRR1403133 2 0.6724 -0.43425 0.012 0.568 0.420
#> SRR815470 3 0.6008 0.73979 0.000 0.372 0.628
#> SRR1344382 1 0.0592 0.74462 0.988 0.012 0.000
#> SRR1432453 3 0.6140 0.72043 0.000 0.404 0.596
#> SRR1478362 2 0.6625 0.05954 0.440 0.552 0.008
#> SRR1392186 1 0.5291 0.64405 0.732 0.268 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.3038 0.73927 0.896 0.104 0.000
#> SRR1471594 1 0.0592 0.74485 0.988 0.012 0.000
#> SRR1354270 2 0.7372 0.37747 0.092 0.688 0.220
#> SRR612683 2 0.5760 0.38645 0.328 0.672 0.000
#> SRR1392901 3 0.5560 0.77196 0.000 0.300 0.700
#> SRR1077805 3 0.3038 0.77451 0.000 0.104 0.896
#> SRR1360402 2 0.7533 0.27707 0.088 0.668 0.244
#> SRR1406112 3 0.2625 0.77134 0.000 0.084 0.916
#> SRR1355352 3 0.7329 0.49534 0.032 0.424 0.544
#> SRR656247 1 0.1860 0.74791 0.948 0.052 0.000
#> SRR813656 1 0.5621 0.60796 0.692 0.308 0.000
#> SRR808244 1 0.6180 0.47339 0.584 0.416 0.000
#> SRR1387240 3 0.6204 0.70290 0.000 0.424 0.576
#> SRR1408595 1 0.2537 0.74353 0.920 0.080 0.000
#> SRR1385277 1 0.5926 0.54893 0.644 0.356 0.000
#> SRR1435248 3 0.6267 0.67592 0.000 0.452 0.548
#> SRR1419110 2 0.6596 0.19545 0.040 0.704 0.256
#> SRR1408682 2 0.6308 -0.60055 0.000 0.508 0.492
#> SRR1317134 1 0.2165 0.74625 0.936 0.064 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 1 0.6291 0.29046 0.532 0.468 0.000
#> SRR1453911 2 0.6363 0.57390 0.136 0.768 0.096
#> SRR603164 3 0.4931 0.77763 0.000 0.232 0.768
#> SRR1383259 1 0.5859 0.55334 0.656 0.344 0.000
#> SRR1330854 2 0.7841 -0.18104 0.468 0.480 0.052
#> SRR1452423 1 0.0592 0.74462 0.988 0.012 0.000
#> SRR1368574 1 0.5216 0.64926 0.740 0.260 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.4346 0.78318 0.000 0.184 0.816
#> SRR1361546 2 0.6267 0.02070 0.452 0.548 0.000
#> SRR1486156 1 0.3340 0.73534 0.880 0.120 0.000
#> SRR660545 3 0.5810 0.76216 0.000 0.336 0.664
#> SRR615635 3 0.7824 0.56744 0.052 0.444 0.504
#> SRR1385411 2 0.6416 0.29151 0.376 0.616 0.008
#> SRR1342739 1 0.0237 0.74216 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102830 3 0.0237 0.75248 0.000 0.004 0.996
#> SRR662126 2 0.6247 0.31225 0.376 0.620 0.004
#> SRR1464601 3 0.6140 0.71848 0.000 0.404 0.596
#> SRR1071594 2 0.7139 0.28586 0.068 0.688 0.244
#> SRR612539 2 0.6543 0.37834 0.344 0.640 0.016
#> SRR602010 1 0.6305 0.23476 0.516 0.484 0.000
#> SRR810249 2 0.6200 0.42521 0.312 0.676 0.012
#> SRR818773 1 0.6274 0.34137 0.544 0.456 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.5760 0.38645 0.328 0.672 0.000
#> SRR1442754 1 0.6678 0.31083 0.512 0.480 0.008
#> SRR1334247 3 0.2066 0.76447 0.000 0.060 0.940
#> SRR661639 1 0.1964 0.74743 0.944 0.056 0.000
#> SRR613222 1 0.6280 0.29908 0.540 0.460 0.000
#> SRR1459937 1 0.6244 0.37902 0.560 0.440 0.000
#> SRR2185018 1 0.4605 0.69033 0.796 0.204 0.000
#> SRR655732 2 0.8419 0.54885 0.212 0.620 0.168
#> SRR809348 1 0.0747 0.74552 0.984 0.016 0.000
#> SRR819261 3 0.4931 0.77787 0.000 0.232 0.768
#> SRR661074 3 0.0237 0.75248 0.000 0.004 0.996
#> SRR1349851 1 0.1860 0.74757 0.948 0.052 0.000
#> SRR1405123 2 0.6295 -0.04573 0.472 0.528 0.000
#> SRR661096 1 0.3412 0.72788 0.876 0.124 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6180 0.47339 0.584 0.416 0.000
#> SRR1307677 2 0.6939 0.54355 0.216 0.712 0.072
#> SRR1466512 1 0.5905 0.55069 0.648 0.352 0.000
#> SRR658212 2 0.6835 0.56786 0.180 0.732 0.088
#> SRR1430525 3 0.1411 0.75590 0.000 0.036 0.964
#> SRR1344422 2 0.7569 0.44208 0.116 0.684 0.200
#> SRR1353924 2 0.6307 -0.14223 0.488 0.512 0.000
#> SRR1314832 3 0.7807 0.43558 0.052 0.432 0.516
#> SRR1487570 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.6045 0.27415 0.380 0.620 0.000
#> SRR1418561 3 0.6483 0.64385 0.008 0.392 0.600
#> SRR1448029 3 0.4346 0.78318 0.000 0.184 0.816
#> SRR813802 1 0.6154 0.48790 0.592 0.408 0.000
#> SRR815020 1 0.0237 0.74216 0.996 0.004 0.000
#> SRR1309702 2 0.6111 0.23180 0.396 0.604 0.000
#> SRR1435311 1 0.6126 0.46322 0.600 0.400 0.000
#> SRR612395 3 0.6302 0.64056 0.000 0.480 0.520
#> SRR603116 2 0.6361 0.52914 0.232 0.728 0.040
#> SRR1323152 3 0.4750 0.77947 0.000 0.216 0.784
#> SRR1368264 1 0.6180 0.43697 0.584 0.416 0.000
#> SRR1326624 1 0.1643 0.74737 0.956 0.044 0.000
#> SRR1429265 3 0.1753 0.75841 0.000 0.048 0.952
#> SRR1327702 1 0.3686 0.72866 0.860 0.140 0.000
#> SRR615611 2 0.6204 0.14358 0.424 0.576 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.3038 0.73136 0.896 0.104 0.000
#> SRR815044 1 0.5138 0.65950 0.748 0.252 0.000
#> SRR1338560 1 0.6235 0.37084 0.564 0.436 0.000
#> SRR615862 2 0.5706 0.40287 0.320 0.680 0.000
#> SRR1480038 1 0.6111 0.47060 0.604 0.396 0.000
#> SRR659436 3 0.2625 0.77641 0.000 0.084 0.916
#> SRR613699 2 0.8058 -0.05750 0.072 0.552 0.376
#> SRR1436563 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.4555 0.69446 0.800 0.200 0.000
#> SRR1330327 1 0.6008 0.52177 0.628 0.372 0.000
#> SRR1489950 3 0.6633 0.67391 0.008 0.444 0.548
#> SRR1431927 1 0.1411 0.74703 0.964 0.036 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.5529 0.63609 0.704 0.296 0.000
#> SRR1318444 2 0.6294 0.45894 0.288 0.692 0.020
#> SRR600656 1 0.6309 0.20039 0.504 0.496 0.000
#> SRR658766 3 0.3412 0.78296 0.000 0.124 0.876
#> SRR655946 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0747 0.74549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1475104 3 0.1411 0.75533 0.000 0.036 0.964
#> SRR1406418 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.2625 0.74308 0.916 0.084 0.000
#> SRR1444120 1 0.6267 0.35267 0.548 0.452 0.000
#> SRR1471965 1 0.1643 0.74737 0.956 0.044 0.000
#> SRR612695 3 0.5591 0.74230 0.000 0.304 0.696
#> SRR662498 3 0.5465 0.76392 0.000 0.288 0.712
#> SRR1376764 2 0.6500 -0.38510 0.004 0.532 0.464
#> SRR1377006 2 0.7023 -0.14591 0.032 0.624 0.344
#> SRR656860 2 0.6079 0.26063 0.388 0.612 0.000
#> SRR1480547 2 0.6442 0.12255 0.432 0.564 0.004
#> SRR1452515 3 0.6079 0.72959 0.000 0.388 0.612
#> SRR1324390 2 0.7797 0.00257 0.072 0.608 0.320
#> SRR615273 1 0.6291 0.26512 0.532 0.468 0.000
#> SRR601695 3 0.6008 0.73979 0.000 0.372 0.628
#> SRR820907 2 0.6168 0.17616 0.412 0.588 0.000
#> SRR812773 1 0.5678 0.59718 0.684 0.316 0.000
#> SRR1405984 2 0.6192 0.13919 0.420 0.580 0.000
#> SRR1472794 3 0.6299 0.64472 0.000 0.476 0.524
#> SRR1365448 1 0.6518 0.30867 0.512 0.484 0.004
#> SRR1095720 3 0.1964 0.77113 0.000 0.056 0.944
#> SRR1435626 2 0.7213 -0.35811 0.028 0.552 0.420
#> SRR1080766 3 0.6305 0.63727 0.000 0.484 0.516
#> SRR1377862 1 0.0592 0.74452 0.988 0.012 0.000
#> SRR1332299 3 0.1860 0.76210 0.000 0.052 0.948
#> SRR1467966 3 0.1964 0.76364 0.000 0.056 0.944
#> SRR1320579 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 1 0.5560 0.61153 0.700 0.300 0.000
#> SRR1326604 2 0.5722 0.44780 0.292 0.704 0.004
#> SRR1098879 3 0.5760 0.68703 0.000 0.328 0.672
#> SRR662245 3 0.2959 0.77859 0.000 0.100 0.900
#> SRR1074719 2 0.6192 0.13919 0.420 0.580 0.000
#> SRR816226 1 0.6045 0.49710 0.620 0.380 0.000
#> SRR601387 2 0.6254 0.55788 0.188 0.756 0.056
#> SRR614575 2 0.6546 0.52054 0.240 0.716 0.044
#> SRR1353900 2 0.7101 0.54611 0.216 0.704 0.080
#> SRR662906 3 0.5529 0.77227 0.000 0.296 0.704
#> SRR1350832 2 0.7644 0.09828 0.072 0.632 0.296
#> SRR1403280 2 0.6298 0.26109 0.388 0.608 0.004
#> SRR1313969 2 0.6280 -0.02892 0.460 0.540 0.000
#> SRR1388528 1 0.6919 0.37277 0.536 0.448 0.016
#> SRR1452912 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.5905 0.54786 0.648 0.352 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.5785 0.57319 0.668 0.332 0.000
#> SRR818901 3 0.1964 0.77113 0.000 0.056 0.944
#> SRR607067 1 0.4702 0.68738 0.788 0.212 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.6373 0.20259 0.408 0.588 0.004
#> SRR661961 3 0.6204 0.70199 0.000 0.424 0.576
#> SRR658259 2 0.6698 0.48469 0.280 0.684 0.036
#> SRR1310476 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 3 0.6825 0.60071 0.012 0.488 0.500
#> SRR1365034 1 0.5363 0.63506 0.724 0.276 0.000
#> SRR1478053 2 0.7841 0.22603 0.092 0.636 0.272
#> SRR1475300 1 0.6045 0.49278 0.620 0.380 0.000
#> SRR1328101 3 0.6302 0.64056 0.000 0.480 0.520
#> SRR1322900 1 0.6225 0.41466 0.568 0.432 0.000
#> SRR1309942 3 0.6204 0.70290 0.000 0.424 0.576
#> SRR1345760 1 0.5363 0.63976 0.724 0.276 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.6047 0.41794 0.312 0.680 0.008
#> SRR1443436 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.6154 0.71538 0.000 0.408 0.592
#> SRR661469 2 0.8950 0.50559 0.216 0.568 0.216
#> SRR1500323 3 0.5835 0.76029 0.000 0.340 0.660
#> SRR1356705 1 0.5926 0.53674 0.644 0.356 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.7339 0.37088 0.088 0.688 0.224
#> SRR1350435 1 0.1643 0.74737 0.956 0.044 0.000
#> SRR1389177 3 0.1753 0.76088 0.000 0.048 0.952
#> SRR1368072 2 0.6562 0.56512 0.184 0.744 0.072
#> SRR601815 2 0.6460 0.51790 0.112 0.764 0.124
#> SRR613330 1 0.0424 0.74350 0.992 0.008 0.000
#> SRR1434502 2 0.7396 0.06688 0.060 0.644 0.296
#> SRR1394190 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.6908 -0.00232 0.036 0.656 0.308
#> SRR1318839 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 1 0.6309 0.20039 0.504 0.496 0.000
#> SRR613126 3 0.5859 0.75867 0.000 0.344 0.656
#> SRR1089424 2 0.6267 0.02070 0.452 0.548 0.000
#> SRR1347214 2 0.6764 0.56746 0.148 0.744 0.108
#> SRR1309556 2 0.7213 0.38786 0.088 0.700 0.212
#> SRR1456027 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 2 0.7043 -0.41678 0.020 0.532 0.448
#> SRR1320469 2 0.8427 0.09798 0.412 0.500 0.088
#> SRR614251 2 0.7289 -0.49031 0.028 0.504 0.468
#> SRR1454310 2 0.7558 0.16185 0.072 0.644 0.284
#> SRR615105 3 0.5968 0.74360 0.000 0.364 0.636
#> SRR1433290 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR601671 1 0.5905 0.55069 0.648 0.352 0.000
#> SRR663874 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR1409130 3 0.5591 0.77014 0.000 0.304 0.696
#> SRR659696 2 0.6314 0.25210 0.392 0.604 0.004
#> SRR1408249 1 0.3267 0.72934 0.884 0.116 0.000
#> SRR663284 2 0.6432 0.13452 0.428 0.568 0.004
#> SRR1402794 3 0.4931 0.77787 0.000 0.232 0.768
#> SRR614852 1 0.6111 0.47979 0.604 0.396 0.000
#> SRR1348040 1 0.6244 0.37352 0.560 0.440 0.000
#> SRR1489610 1 0.5560 0.61153 0.700 0.300 0.000
#> SRR1488091 3 0.6154 0.71538 0.000 0.408 0.592
#> SRR1499566 1 0.5859 0.55537 0.656 0.344 0.000
#> SRR1361480 2 0.6497 0.39489 0.336 0.648 0.016
#> SRR1444501 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.7036 0.43914 0.096 0.720 0.184
#> SRR1388832 2 0.7485 0.37954 0.096 0.680 0.224
#> SRR1394637 1 0.5678 0.61679 0.684 0.316 0.000
#> SRR606974 2 0.7145 0.31766 0.072 0.692 0.236
#> SRR662918 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR817421 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.6079 0.25143 0.388 0.612 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.5529 0.63609 0.704 0.296 0.000
#> SRR1454117 1 0.6291 0.29046 0.532 0.468 0.000
#> SRR1312684 1 0.1529 0.74730 0.960 0.040 0.000
#> SRR615044 2 0.7963 0.55872 0.188 0.660 0.152
#> SRR1432743 3 0.2711 0.77223 0.000 0.088 0.912
#> SRR1388873 2 0.7824 -0.15115 0.064 0.580 0.356
#> SRR1353517 1 0.1163 0.74750 0.972 0.028 0.000
#> SRR1357148 3 0.4750 0.78063 0.000 0.216 0.784
#> SRR1406008 2 0.6526 0.50761 0.260 0.704 0.036
#> SRR1396786 3 0.6633 0.67391 0.008 0.444 0.548
#> SRR1446564 1 0.0892 0.74620 0.980 0.020 0.000
#> SRR1318465 3 0.2165 0.76579 0.000 0.064 0.936
#> SRR1431083 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.3038 0.73136 0.896 0.104 0.000
#> SRR655170 2 0.7372 0.38818 0.092 0.688 0.220
#> SRR1087825 1 0.6309 0.20039 0.504 0.496 0.000
#> SRR662019 3 0.6255 0.67814 0.016 0.300 0.684
#> SRR1349209 2 0.6294 0.45894 0.288 0.692 0.020
#> SRR1326161 2 0.6809 0.47116 0.104 0.740 0.156
#> SRR1345284 1 0.4504 0.69479 0.804 0.196 0.000
#> SRR1416672 1 0.1643 0.74737 0.956 0.044 0.000
#> SRR663356 2 0.6307 -0.14223 0.488 0.512 0.000
#> SRR1454328 3 0.6252 0.68428 0.000 0.444 0.556
#> SRR1489286 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.2261 0.74578 0.932 0.068 0.000
#> SRR1408183 3 0.1860 0.76250 0.000 0.052 0.948
#> SRR1084369 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR809444 1 0.1753 0.74730 0.952 0.048 0.000
#> SRR1089901 2 0.6962 -0.40404 0.020 0.568 0.412
#> SRR1375774 1 0.0892 0.74628 0.980 0.020 0.000
#> SRR1326292 1 0.6180 0.47339 0.584 0.416 0.000
#> SRR657139 1 0.6008 0.54331 0.628 0.372 0.000
#> SRR1440744 1 0.5560 0.61140 0.700 0.300 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.5678 0.61679 0.684 0.316 0.000
#> SRR1452334 2 0.6047 0.41794 0.312 0.680 0.008
#> SRR1381775 1 0.0747 0.74552 0.984 0.016 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 1 0.6291 0.29046 0.532 0.468 0.000
#> SRR658989 3 0.5098 0.76460 0.000 0.248 0.752
#> SRR1353663 1 0.1529 0.74730 0.960 0.040 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.1643 0.74737 0.956 0.044 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.6590 0.50927 0.112 0.756 0.132
#> SRR1367988 1 0.5948 0.53876 0.640 0.360 0.000
#> SRR1331922 1 0.3816 0.72128 0.852 0.148 0.000
#> SRR615479 1 0.6280 0.31054 0.540 0.460 0.000
#> SRR1375796 2 0.7289 -0.49031 0.028 0.504 0.468
#> SRR1386991 2 0.6793 0.06993 0.036 0.672 0.292
#> SRR1355217 2 0.6260 -0.01304 0.448 0.552 0.000
#> SRR1356290 2 0.7366 0.22639 0.072 0.668 0.260
#> SRR659507 3 0.5859 0.75659 0.000 0.344 0.656
#> SRR663296 1 0.5621 0.60796 0.692 0.308 0.000
#> SRR598044 2 0.6215 0.12626 0.428 0.572 0.000
#> SRR661155 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR1414727 2 0.6596 0.19545 0.040 0.704 0.256
#> SRR663477 1 0.1643 0.74737 0.956 0.044 0.000
#> SRR1354489 3 0.1860 0.76210 0.000 0.052 0.948
#> SRR1377800 2 0.7036 -0.41471 0.020 0.536 0.444
#> SRR614611 3 0.6299 0.64374 0.000 0.476 0.524
#> SRR655052 2 0.6047 0.41794 0.312 0.680 0.008
#> SRR1478968 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.6698 0.48469 0.280 0.684 0.036
#> SRR613951 2 0.6309 -0.15763 0.496 0.504 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.6294 0.45894 0.288 0.692 0.020
#> SRR1408161 1 0.2878 0.74151 0.904 0.096 0.000
#> SRR657054 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR655040 1 0.5760 0.58332 0.672 0.328 0.000
#> SRR810225 2 0.6319 0.53153 0.228 0.732 0.040
#> SRR1325377 2 0.6215 0.12626 0.428 0.572 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 3 0.6204 0.70233 0.000 0.424 0.576
#> SRR1480455 3 0.5591 0.77014 0.000 0.304 0.696
#> SRR1442104 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.3116 0.73811 0.892 0.108 0.000
#> SRR1481396 3 0.1411 0.75533 0.000 0.036 0.964
#> SRR1414314 2 0.7794 -0.20578 0.060 0.572 0.368
#> SRR663026 2 0.6633 0.54399 0.212 0.728 0.060
#> SRR1478386 1 0.3551 0.72431 0.868 0.132 0.000
#> SRR1458683 3 0.5397 0.77633 0.000 0.280 0.720
#> SRR1370572 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4702 0.68674 0.788 0.212 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 1 0.6260 0.34764 0.552 0.448 0.000
#> SRR660260 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR1071231 2 0.6192 0.13919 0.420 0.580 0.000
#> SRR1459125 1 0.6483 0.32608 0.544 0.452 0.004
#> SRR1337173 3 0.6062 0.74080 0.000 0.384 0.616
#> SRR1396250 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.3038 0.77926 0.000 0.104 0.896
#> SRR659816 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR1401379 1 0.5560 0.61153 0.700 0.300 0.000
#> SRR600981 2 0.6154 0.19092 0.408 0.592 0.000
#> SRR1398335 1 0.1411 0.74703 0.964 0.036 0.000
#> SRR1397218 1 0.5859 0.55537 0.656 0.344 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.6630 0.31560 0.056 0.724 0.220
#> SRR1359780 3 0.6204 0.70290 0.000 0.424 0.576
#> SRR1490037 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0747 0.74549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1410221 3 0.6816 0.62697 0.012 0.472 0.516
#> SRR1319648 2 0.6386 0.20135 0.412 0.584 0.004
#> SRR1092985 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.5859 0.55334 0.656 0.344 0.000
#> SRR1468658 3 0.5845 0.76918 0.004 0.308 0.688
#> SRR1390437 1 0.4702 0.68738 0.788 0.212 0.000
#> SRR658057 2 0.5722 0.44780 0.292 0.704 0.004
#> SRR612635 2 0.6267 0.02070 0.452 0.548 0.000
#> SRR1351480 1 0.6235 0.37084 0.564 0.436 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1163 0.74713 0.972 0.028 0.000
#> SRR659590 2 0.7221 0.52803 0.136 0.716 0.148
#> SRR614263 1 0.2165 0.74631 0.936 0.064 0.000
#> SRR1409575 1 0.5905 0.55069 0.648 0.352 0.000
#> SRR659911 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR1085519 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.5397 0.77702 0.000 0.280 0.720
#> SRR1442928 3 0.6302 0.64056 0.000 0.480 0.520
#> SRR1464681 1 0.6309 0.20039 0.504 0.496 0.000
#> SRR1418880 1 0.1643 0.74783 0.956 0.044 0.000
#> SRR1309070 3 0.6062 0.74080 0.000 0.384 0.616
#> SRR1365426 1 0.6267 0.34036 0.548 0.452 0.000
#> SRR1487947 1 0.6359 0.47627 0.592 0.404 0.004
#> SRR659708 1 0.6180 0.44555 0.584 0.416 0.000
#> SRR603236 3 0.5859 0.75621 0.000 0.344 0.656
#> SRR660673 1 0.1643 0.74737 0.956 0.044 0.000
#> SRR1430729 2 0.6476 0.56325 0.184 0.748 0.068
#> SRR663807 2 0.7797 0.00257 0.072 0.608 0.320
#> SRR1087245 2 0.5785 0.43728 0.300 0.696 0.004
#> SRR1339108 2 0.6308 -0.16724 0.492 0.508 0.000
#> SRR613426 1 0.4887 0.67573 0.772 0.228 0.000
#> SRR613879 2 0.5760 0.38645 0.328 0.672 0.000
#> SRR1385101 1 0.5905 0.55069 0.648 0.352 0.000
#> SRR1387966 2 0.7824 -0.15115 0.064 0.580 0.356
#> SRR1458852 3 0.6204 0.70290 0.000 0.424 0.576
#> SRR1430489 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.1411 0.74778 0.964 0.036 0.000
#> SRR1376249 3 0.0747 0.75433 0.000 0.016 0.984
#> SRR1321987 3 0.6215 0.69861 0.000 0.428 0.572
#> SRR662653 3 0.6215 0.69861 0.000 0.428 0.572
#> SRR1390027 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.6622 0.57179 0.164 0.748 0.088
#> SRR1383081 2 0.6008 0.29736 0.372 0.628 0.000
#> SRR2166960 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR605101 1 0.6305 0.23476 0.516 0.484 0.000
#> SRR818600 2 0.7542 -0.41130 0.040 0.528 0.432
#> SRR1367715 1 0.5926 0.53505 0.644 0.356 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.1643 0.75761 0.000 0.044 0.956
#> SRR1322662 1 0.0424 0.74349 0.992 0.008 0.000
#> SRR665478 3 0.5948 0.73343 0.000 0.360 0.640
#> SRR612767 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.7995 0.11112 0.088 0.608 0.304
#> SRR1430375 3 0.5835 0.76029 0.000 0.340 0.660
#> SRR615225 2 0.6126 0.21753 0.400 0.600 0.000
#> SRR1401839 2 0.6383 0.56253 0.128 0.768 0.104
#> SRR1379110 1 0.5216 0.64926 0.740 0.260 0.000
#> SRR1077288 3 0.0237 0.75248 0.000 0.004 0.996
#> SRR1331639 1 0.6309 0.20039 0.504 0.496 0.000
#> SRR1342782 2 0.6702 0.41911 0.328 0.648 0.024
#> SRR1443003 3 0.1411 0.75590 0.000 0.036 0.964
#> SRR612839 1 0.4887 0.68046 0.772 0.228 0.000
#> SRR1470093 3 0.4291 0.77836 0.000 0.180 0.820
#> SRR1395742 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.5397 0.77702 0.000 0.280 0.720
#> SRR664063 1 0.6309 0.14714 0.504 0.496 0.000
#> SRR1488214 1 0.3752 0.72328 0.856 0.144 0.000
#> SRR654766 1 0.5948 0.53876 0.640 0.360 0.000
#> SRR1320321 1 0.6235 0.37084 0.564 0.436 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.5785 0.43728 0.300 0.696 0.004
#> SRR1488470 2 0.6442 0.12255 0.432 0.564 0.004
#> SRR1389497 3 0.0000 0.75022 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.3267 0.77645 0.000 0.116 0.884
#> SRR615311 1 0.0000 0.74082 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 4 0.5698 0.52062 0.044 0.320 0.000 0.636
#> SRR1380716 2 0.5203 0.53035 0.416 0.576 0.000 0.008
#> SRR612803 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2760 0.74105 0.872 0.128 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.7927 0.21173 0.008 0.356 0.424 0.212
#> SRR1074359 4 0.3278 0.58484 0.000 0.020 0.116 0.864
#> SRR1419258 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1403366 3 0.5300 0.55761 0.000 0.012 0.580 0.408
#> SRR665262 4 0.2214 0.62623 0.000 0.028 0.044 0.928
#> SRR1499740 4 0.7583 0.25814 0.052 0.432 0.064 0.452
#> SRR1105057 2 0.5279 0.69550 0.232 0.716 0.000 0.052
#> SRR1439742 1 0.1716 0.79887 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR614599 4 0.2101 0.64236 0.000 0.060 0.012 0.928
#> SRR612215 4 0.2125 0.64481 0.000 0.076 0.004 0.920
#> SRR1094051 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.6743 0.26010 0.380 0.548 0.044 0.028
#> SRR1409263 3 0.7824 0.18745 0.000 0.328 0.404 0.268
#> SRR1431288 1 0.3306 0.72347 0.840 0.156 0.004 0.000
#> SRR1334889 2 0.5742 0.69517 0.232 0.696 0.004 0.068
#> SRR614839 2 0.5626 0.62440 0.360 0.612 0.004 0.024
#> SRR658433 4 0.2596 0.61499 0.000 0.024 0.068 0.908
#> SRR1088581 2 0.6425 0.59802 0.128 0.668 0.008 0.196
#> SRR1328797 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1334512 2 0.5693 0.66485 0.316 0.644 0.004 0.036
#> SRR1471117 1 0.5440 0.22572 0.596 0.384 0.020 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 4 0.5860 0.41562 0.040 0.380 0.000 0.580
#> SRR1354955 3 0.5473 0.69563 0.000 0.032 0.644 0.324
#> SRR654802 3 0.4379 0.80156 0.000 0.036 0.792 0.172
#> SRR660066 4 0.5618 0.57537 0.040 0.288 0.004 0.668
#> SRR1447103 4 0.2125 0.64481 0.000 0.076 0.004 0.920
#> SRR1402153 2 0.7762 -0.40143 0.000 0.384 0.380 0.236
#> SRR655887 2 0.6309 0.33515 0.068 0.604 0.004 0.324
#> SRR1408529 3 0.5404 0.70088 0.000 0.028 0.644 0.328
#> SRR658707 1 0.2973 0.73423 0.856 0.144 0.000 0.000
#> SRR1384371 4 0.6966 0.39231 0.036 0.408 0.044 0.512
#> SRR1074670 4 0.5848 0.03715 0.000 0.048 0.336 0.616
#> SRR1375439 4 0.6537 0.30086 0.032 0.440 0.024 0.504
#> SRR1329003 2 0.5851 0.12797 0.456 0.516 0.024 0.004
#> SRR1404837 2 0.4776 0.59403 0.376 0.624 0.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0336 0.81055 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1455525 2 0.4916 0.51883 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0817 0.80959 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.5189 0.60144 0.000 0.012 0.616 0.372
#> SRR1068855 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR612227 4 0.5865 0.03108 0.000 0.048 0.340 0.612
#> SRR1388809 4 0.2101 0.64264 0.000 0.060 0.012 0.928
#> SRR1413872 2 0.4814 0.65610 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR1452864 1 0.0336 0.81055 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1473078 4 0.6619 0.30810 0.032 0.436 0.028 0.504
#> SRR615814 4 0.2983 0.64307 0.000 0.068 0.040 0.892
#> SRR1325225 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 4 0.6561 0.41818 0.032 0.400 0.028 0.540
#> SRR1358220 2 0.5203 0.53035 0.416 0.576 0.000 0.008
#> SRR1096662 1 0.4933 -0.08289 0.568 0.432 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0469 0.81039 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.5285 0.42137 0.468 0.524 0.000 0.008
#> SRR660164 2 0.5496 0.68164 0.160 0.732 0.000 0.108
#> SRR815783 4 0.2214 0.62623 0.000 0.028 0.044 0.928
#> SRR809595 2 0.5345 0.51976 0.428 0.560 0.000 0.012
#> SRR1403133 4 0.3808 0.62839 0.004 0.184 0.004 0.808
#> SRR815470 4 0.3278 0.58484 0.000 0.020 0.116 0.864
#> SRR1344382 1 0.0469 0.81039 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1432453 4 0.3372 0.61387 0.000 0.036 0.096 0.868
#> SRR1478362 2 0.5227 0.68847 0.256 0.704 0.000 0.040
#> SRR1392186 1 0.4916 -0.04258 0.576 0.424 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.3257 0.72797 0.844 0.152 0.004 0.000
#> SRR1471594 1 0.0592 0.81022 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.7399 -0.27733 0.044 0.448 0.060 0.448
#> SRR612683 2 0.5496 0.68093 0.160 0.732 0.000 0.108
#> SRR1392901 4 0.4019 0.48410 0.000 0.012 0.196 0.792
#> SRR1077805 3 0.5865 0.56725 0.000 0.036 0.552 0.412
#> SRR1360402 4 0.5860 0.41562 0.040 0.380 0.000 0.580
#> SRR1406112 3 0.5473 0.69563 0.000 0.032 0.644 0.324
#> SRR1355352 3 0.7818 0.18254 0.000 0.332 0.404 0.264
#> SRR656247 1 0.2281 0.77432 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR813656 1 0.5837 0.00545 0.552 0.420 0.008 0.020
#> SRR808244 2 0.5851 0.12797 0.456 0.516 0.024 0.004
#> SRR1387240 4 0.2494 0.63141 0.000 0.036 0.048 0.916
#> SRR1408595 1 0.2469 0.75930 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.4989 0.40852 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR1435248 4 0.2142 0.64159 0.000 0.056 0.016 0.928
#> SRR1419110 4 0.6362 0.45914 0.016 0.400 0.036 0.548
#> SRR1408682 4 0.2469 0.64298 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1317134 1 0.2466 0.77778 0.900 0.096 0.004 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4990 0.62392 0.352 0.640 0.000 0.008
#> SRR1453911 2 0.6474 0.22497 0.068 0.560 0.004 0.368
#> SRR603164 4 0.5898 0.00487 0.000 0.048 0.348 0.604
#> SRR1383259 2 0.5296 0.35970 0.492 0.500 0.000 0.008
#> SRR1330854 2 0.7147 0.28222 0.336 0.560 0.072 0.032
#> SRR1452423 1 0.0469 0.81039 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.4888 0.01128 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 4 0.5856 -0.20153 0.000 0.036 0.408 0.556
#> SRR1361546 2 0.5078 0.68301 0.272 0.700 0.000 0.028
#> SRR1486156 1 0.3545 0.71123 0.828 0.164 0.008 0.000
#> SRR660545 4 0.4035 0.51830 0.000 0.020 0.176 0.804
#> SRR615635 4 0.3726 0.64361 0.032 0.088 0.016 0.864
#> SRR1385411 2 0.5701 0.69415 0.204 0.712 0.004 0.080
#> SRR1342739 1 0.0188 0.81040 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.3074 0.81095 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR662126 2 0.5859 0.68009 0.208 0.700 0.004 0.088
#> SRR1464601 4 0.2596 0.61499 0.000 0.024 0.068 0.908
#> SRR1071594 4 0.6959 0.39837 0.036 0.404 0.044 0.516
#> SRR612539 2 0.6110 0.67924 0.176 0.680 0.000 0.144
#> SRR602010 2 0.5057 0.63895 0.340 0.648 0.000 0.012
#> SRR810249 2 0.5812 0.67692 0.156 0.708 0.000 0.136
#> SRR818773 2 0.5099 0.58790 0.380 0.612 0.000 0.008
#> SRR1336569 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.5496 0.68093 0.160 0.732 0.000 0.108
#> SRR1442754 2 0.6743 0.26010 0.380 0.548 0.044 0.028
#> SRR1334247 3 0.5169 0.75262 0.000 0.032 0.696 0.272
#> SRR661639 1 0.2216 0.78342 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.5574 0.61070 0.372 0.604 0.004 0.020
#> SRR1459937 2 0.5231 0.59154 0.384 0.604 0.000 0.012
#> SRR2185018 1 0.4500 0.40205 0.684 0.316 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.7962 0.26271 0.108 0.536 0.060 0.296
#> SRR809348 1 0.0921 0.80832 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR819261 4 0.5848 0.03715 0.000 0.048 0.336 0.616
#> SRR661074 3 0.3074 0.81095 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1349851 1 0.1940 0.78695 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.5711 0.67377 0.304 0.652 0.004 0.040
#> SRR661096 1 0.3726 0.60633 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 2 0.5851 0.12797 0.456 0.516 0.024 0.004
#> SRR1307677 2 0.6484 0.46215 0.084 0.652 0.016 0.248
#> SRR1466512 2 0.5161 0.39358 0.476 0.520 0.000 0.004
#> SRR658212 2 0.6575 0.33550 0.068 0.612 0.016 0.304
#> SRR1430525 3 0.4540 0.79733 0.000 0.032 0.772 0.196
#> SRR1344422 4 0.7181 0.19085 0.060 0.440 0.032 0.468
#> SRR1353924 2 0.5184 0.66854 0.304 0.672 0.000 0.024
#> SRR1314832 3 0.7927 0.21173 0.008 0.356 0.424 0.212
#> SRR1487570 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.5142 0.69269 0.192 0.744 0.000 0.064
#> SRR1418561 3 0.7872 0.12585 0.008 0.196 0.404 0.392
#> SRR1448029 4 0.5856 -0.20153 0.000 0.036 0.408 0.556
#> SRR813802 2 0.6022 0.10749 0.460 0.504 0.032 0.004
#> SRR815020 1 0.0188 0.81040 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.5102 0.69581 0.220 0.732 0.000 0.048
#> SRR1435311 2 0.5097 0.51298 0.428 0.568 0.000 0.004
#> SRR612395 4 0.2125 0.64481 0.000 0.076 0.004 0.920
#> SRR603116 2 0.6245 0.51077 0.108 0.648 0.000 0.244
#> SRR1323152 4 0.6067 -0.10474 0.000 0.052 0.376 0.572
#> SRR1368264 2 0.5060 0.53478 0.412 0.584 0.000 0.004
#> SRR1326624 1 0.2011 0.79047 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.4553 0.80009 0.000 0.040 0.780 0.180
#> SRR1327702 1 0.3972 0.65381 0.788 0.204 0.008 0.000
#> SRR615611 2 0.5427 0.69384 0.248 0.704 0.004 0.044
#> SRR1486799 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.3400 0.65014 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR815044 1 0.4866 0.04797 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.5231 0.58400 0.384 0.604 0.000 0.012
#> SRR615862 2 0.5452 0.67923 0.156 0.736 0.000 0.108
#> SRR1480038 2 0.5105 0.50532 0.432 0.564 0.000 0.004
#> SRR659436 3 0.4990 0.63448 0.000 0.008 0.640 0.352
#> SRR613699 4 0.7762 0.46983 0.032 0.328 0.124 0.516
#> SRR1436563 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.4585 0.32549 0.668 0.332 0.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.4967 0.46139 0.452 0.548 0.000 0.000
#> SRR1489950 4 0.2328 0.64356 0.004 0.056 0.016 0.924
#> SRR1431927 1 0.1716 0.79875 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1444002 1 0.5440 0.22572 0.596 0.384 0.020 0.000
#> SRR1318444 2 0.5979 0.63088 0.128 0.704 0.004 0.164
#> SRR600656 2 0.4814 0.65610 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR658766 3 0.5337 0.53149 0.000 0.012 0.564 0.424
#> SRR655946 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR817282 1 0.1022 0.80769 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.4379 0.80156 0.000 0.036 0.792 0.172
#> SRR1406418 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.2944 0.74898 0.868 0.128 0.004 0.000
#> SRR1444120 2 0.5112 0.58168 0.384 0.608 0.000 0.008
#> SRR1471965 1 0.2011 0.79089 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR612695 4 0.7078 -0.20358 0.000 0.124 0.420 0.456
#> SRR662498 4 0.5453 0.28022 0.000 0.036 0.304 0.660
#> SRR1376764 2 0.7762 -0.40143 0.000 0.384 0.380 0.236
#> SRR1377006 4 0.6725 0.55044 0.012 0.308 0.084 0.596
#> SRR656860 2 0.5361 0.69509 0.208 0.724 0.000 0.068
#> SRR1480547 2 0.5854 0.69153 0.256 0.676 0.004 0.064
#> SRR1452515 4 0.2706 0.61184 0.000 0.020 0.080 0.900
#> SRR1324390 4 0.5417 0.57713 0.040 0.284 0.000 0.676
#> SRR615273 2 0.5641 0.61994 0.364 0.608 0.004 0.024
#> SRR601695 4 0.3278 0.58484 0.000 0.020 0.116 0.864
#> SRR820907 2 0.5021 0.69436 0.240 0.724 0.000 0.036
#> SRR812773 1 0.4994 -0.26495 0.520 0.480 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.5168 0.69286 0.248 0.712 0.000 0.040
#> SRR1472794 4 0.2775 0.64832 0.000 0.084 0.020 0.896
#> SRR1365448 2 0.6655 0.26388 0.380 0.552 0.044 0.024
#> SRR1095720 3 0.4677 0.71822 0.000 0.004 0.680 0.316
#> SRR1435626 4 0.6878 0.53968 0.016 0.236 0.120 0.628
#> SRR1080766 4 0.2011 0.64374 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1377862 1 0.0817 0.80892 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.4995 0.77247 0.000 0.032 0.720 0.248
#> SRR1467966 3 0.5195 0.75199 0.000 0.032 0.692 0.276
#> SRR1320579 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1319710 1 0.4977 -0.19824 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.5724 0.65055 0.140 0.716 0.000 0.144
#> SRR1098879 3 0.7121 0.42541 0.000 0.216 0.564 0.220
#> SRR662245 3 0.5189 0.60144 0.000 0.012 0.616 0.372
#> SRR1074719 2 0.5168 0.69286 0.248 0.712 0.000 0.040
#> SRR816226 2 0.5328 0.41326 0.472 0.520 0.004 0.004
#> SRR601387 2 0.6637 0.37781 0.096 0.592 0.004 0.308
#> SRR614575 2 0.6104 0.53225 0.104 0.664 0.000 0.232
#> SRR1353900 2 0.6539 0.45142 0.084 0.644 0.016 0.256
#> SRR662906 4 0.4464 0.47419 0.000 0.024 0.208 0.768
#> SRR1350832 4 0.5557 0.54363 0.040 0.308 0.000 0.652
#> SRR1403280 2 0.5771 0.69501 0.212 0.704 0.004 0.080
#> SRR1313969 2 0.5010 0.68048 0.276 0.700 0.000 0.024
#> SRR1388528 2 0.6703 0.26029 0.400 0.532 0.044 0.024
#> SRR1452912 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.4996 0.37444 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1319753 1 0.5000 -0.32508 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.4677 0.71822 0.000 0.004 0.680 0.316
#> SRR607067 1 0.4643 0.28582 0.656 0.344 0.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.5742 0.69517 0.232 0.696 0.004 0.068
#> SRR661961 4 0.2983 0.63244 0.000 0.040 0.068 0.892
#> SRR658259 2 0.6462 0.60973 0.140 0.676 0.012 0.172
#> SRR1310476 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 4 0.3884 0.64893 0.008 0.108 0.036 0.848
#> SRR1365034 1 0.4933 -0.08289 0.568 0.432 0.000 0.000
#> SRR1478053 4 0.5898 0.45984 0.048 0.348 0.000 0.604
#> SRR1475300 2 0.5132 0.46721 0.448 0.548 0.000 0.004
#> SRR1328101 4 0.2125 0.64481 0.000 0.076 0.004 0.920
#> SRR1322900 2 0.5375 0.52094 0.416 0.572 0.008 0.004
#> SRR1309942 4 0.2494 0.63141 0.000 0.036 0.048 0.916
#> SRR1345760 1 0.5080 -0.02639 0.576 0.420 0.000 0.004
#> SRR1435418 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.5859 0.67312 0.156 0.704 0.000 0.140
#> SRR1443436 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 4 0.2363 0.62085 0.000 0.024 0.056 0.920
#> SRR661469 2 0.8524 0.15471 0.120 0.456 0.080 0.344
#> SRR1500323 4 0.3946 0.53121 0.000 0.020 0.168 0.812
#> SRR1356705 2 0.4992 0.39421 0.476 0.524 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 4 0.7454 0.26843 0.044 0.436 0.064 0.456
#> SRR1350435 1 0.2011 0.79047 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.4993 0.76797 0.000 0.028 0.712 0.260
#> SRR1368072 2 0.6619 0.32920 0.088 0.580 0.004 0.328
#> SRR601815 2 0.6433 -0.03612 0.056 0.496 0.004 0.444
#> SRR613330 1 0.0336 0.81057 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.6161 0.54684 0.036 0.316 0.020 0.628
#> SRR1394190 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 4 0.5834 0.55776 0.012 0.328 0.028 0.632
#> SRR1318839 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1432390 2 0.4814 0.65610 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR613126 4 0.3900 0.53682 0.000 0.020 0.164 0.816
#> SRR1089424 2 0.5078 0.68301 0.272 0.700 0.000 0.028
#> SRR1347214 2 0.6755 0.19090 0.076 0.536 0.008 0.380
#> SRR1309556 4 0.7344 0.24819 0.048 0.444 0.052 0.456
#> SRR1456027 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 4 0.7106 0.48867 0.004 0.256 0.164 0.576
#> SRR1320469 2 0.8412 0.28213 0.320 0.484 0.076 0.120
#> SRR614251 4 0.5848 0.61627 0.016 0.180 0.080 0.724
#> SRR1454310 4 0.5686 0.51280 0.032 0.332 0.004 0.632
#> SRR615105 4 0.3443 0.56976 0.000 0.016 0.136 0.848
#> SRR1433290 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR2166064 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR601671 2 0.5161 0.39358 0.476 0.520 0.000 0.004
#> SRR663874 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR1409130 4 0.4387 0.48559 0.000 0.024 0.200 0.776
#> SRR659696 2 0.5564 0.69617 0.216 0.708 0.000 0.076
#> SRR1408249 1 0.3569 0.62959 0.804 0.196 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.5894 0.68900 0.252 0.680 0.008 0.060
#> SRR1402794 4 0.5865 0.03108 0.000 0.048 0.340 0.612
#> SRR614852 2 0.4916 0.51756 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR1348040 2 0.4790 0.59145 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR1489610 1 0.4977 -0.19824 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR1488091 4 0.2197 0.62357 0.000 0.024 0.048 0.928
#> SRR1499566 2 0.4998 0.35795 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.6115 0.67730 0.172 0.680 0.000 0.148
#> SRR1444501 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1415773 4 0.6335 0.23073 0.036 0.452 0.012 0.500
#> SRR1388832 4 0.7583 0.25814 0.052 0.432 0.064 0.452
#> SRR1394637 1 0.5802 0.15636 0.568 0.404 0.020 0.008
#> SRR606974 4 0.6354 0.36846 0.024 0.428 0.024 0.524
#> SRR662918 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR817421 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1400823 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.5144 0.69530 0.216 0.732 0.000 0.052
#> SRR608264 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1318560 1 0.5440 0.22572 0.596 0.384 0.020 0.000
#> SRR1454117 2 0.4990 0.62392 0.352 0.640 0.000 0.008
#> SRR1312684 1 0.1940 0.79297 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.8098 0.21764 0.128 0.472 0.044 0.356
#> SRR1432743 3 0.5404 0.70088 0.000 0.028 0.644 0.328
#> SRR1388873 4 0.5055 0.59649 0.032 0.256 0.000 0.712
#> SRR1353517 1 0.1302 0.80341 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1357148 4 0.6168 -0.11777 0.000 0.056 0.388 0.556
#> SRR1406008 2 0.6565 0.56657 0.132 0.640 0.004 0.224
#> SRR1396786 4 0.2328 0.64356 0.004 0.056 0.016 0.924
#> SRR1446564 1 0.1022 0.80685 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.5222 0.74392 0.000 0.032 0.688 0.280
#> SRR1431083 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.3400 0.65014 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR655170 4 0.6299 0.26794 0.024 0.468 0.020 0.488
#> SRR1087825 2 0.4814 0.65610 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR662019 3 0.7670 0.27479 0.000 0.216 0.420 0.364
#> SRR1349209 2 0.5979 0.63088 0.128 0.704 0.004 0.164
#> SRR1326161 2 0.6414 -0.16013 0.040 0.488 0.012 0.460
#> SRR1345284 1 0.4454 0.40334 0.692 0.308 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.2011 0.79089 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.5184 0.66854 0.304 0.672 0.000 0.024
#> SRR1454328 4 0.2089 0.63843 0.000 0.048 0.020 0.932
#> SRR1489286 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.2281 0.77042 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.5113 0.76180 0.000 0.032 0.704 0.264
#> SRR1084369 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR598452 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR660709 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR809444 1 0.2081 0.78775 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1089901 4 0.4175 0.62547 0.008 0.192 0.008 0.792
#> SRR1375774 1 0.1118 0.80616 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1326292 2 0.5851 0.12797 0.456 0.516 0.024 0.004
#> SRR657139 1 0.6090 -0.10854 0.512 0.452 0.024 0.012
#> SRR1440744 1 0.4981 -0.21353 0.536 0.464 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.5802 0.15636 0.568 0.404 0.020 0.008
#> SRR1452334 2 0.5859 0.67312 0.156 0.704 0.000 0.140
#> SRR1381775 1 0.0707 0.80952 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.4990 0.62392 0.352 0.640 0.000 0.008
#> SRR658989 3 0.6750 0.31703 0.000 0.092 0.472 0.436
#> SRR1353663 1 0.1940 0.79297 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.2011 0.79089 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR819054 2 0.6438 -0.06689 0.056 0.488 0.004 0.452
#> SRR1367988 2 0.4981 0.43548 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.3942 0.57626 0.764 0.236 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.5588 0.60240 0.376 0.600 0.004 0.020
#> SRR1375796 4 0.5848 0.61627 0.016 0.180 0.080 0.724
#> SRR1386991 4 0.5831 0.53513 0.012 0.348 0.024 0.616
#> SRR1355217 2 0.5471 0.66363 0.284 0.680 0.008 0.028
#> SRR1356290 4 0.6584 0.46358 0.032 0.376 0.032 0.560
#> SRR659507 4 0.3577 0.55057 0.000 0.012 0.156 0.832
#> SRR663296 1 0.5837 0.00545 0.552 0.420 0.008 0.020
#> SRR598044 2 0.5508 0.69397 0.252 0.692 0.000 0.056
#> SRR661155 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR1414727 4 0.6362 0.45914 0.016 0.400 0.036 0.548
#> SRR663477 1 0.2011 0.79047 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.5113 0.75905 0.000 0.032 0.704 0.264
#> SRR1377800 4 0.6993 0.50015 0.004 0.256 0.152 0.588
#> SRR614611 4 0.2542 0.64726 0.000 0.084 0.012 0.904
#> SRR655052 2 0.5859 0.67312 0.156 0.704 0.000 0.140
#> SRR1478968 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.6462 0.60973 0.140 0.676 0.012 0.172
#> SRR613951 2 0.5723 0.64279 0.340 0.624 0.004 0.032
#> SRR1418022 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.5979 0.63088 0.128 0.704 0.004 0.164
#> SRR1408161 1 0.3196 0.74286 0.856 0.136 0.008 0.000
#> SRR657054 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR655040 1 0.4999 -0.30609 0.508 0.492 0.000 0.000
#> SRR810225 2 0.6273 0.50482 0.108 0.644 0.000 0.248
#> SRR1325377 2 0.5508 0.69397 0.252 0.692 0.000 0.056
#> SRR617829 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1402328 4 0.2313 0.63058 0.000 0.032 0.044 0.924
#> SRR1480455 4 0.4387 0.48559 0.000 0.024 0.200 0.776
#> SRR1442104 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1453416 1 0.3157 0.74834 0.852 0.144 0.004 0.000
#> SRR1481396 3 0.4379 0.80156 0.000 0.036 0.792 0.172
#> SRR1414314 4 0.4900 0.60417 0.032 0.236 0.000 0.732
#> SRR663026 2 0.6444 0.46689 0.096 0.628 0.004 0.272
#> SRR1478386 1 0.3801 0.58951 0.780 0.220 0.000 0.000
#> SRR1458683 4 0.5137 0.40265 0.000 0.040 0.244 0.716
#> SRR1370572 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4661 0.26461 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.5070 0.60193 0.372 0.620 0.000 0.008
#> SRR660260 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR1071231 2 0.5168 0.69286 0.248 0.712 0.000 0.040
#> SRR1459125 2 0.5159 0.61483 0.364 0.624 0.000 0.012
#> SRR1337173 4 0.3907 0.55907 0.000 0.032 0.140 0.828
#> SRR1396250 3 0.3123 0.81265 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR2166376 3 0.5204 0.59626 0.000 0.012 0.612 0.376
#> SRR659816 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR1401379 1 0.4977 -0.19824 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR600981 2 0.5327 0.69578 0.220 0.720 0.000 0.060
#> SRR1398335 1 0.1716 0.79875 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4998 0.35795 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 4 0.6330 0.38860 0.028 0.416 0.020 0.536
#> SRR1359780 4 0.2494 0.63141 0.000 0.036 0.048 0.916
#> SRR1490037 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.1118 0.80695 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1410221 4 0.3036 0.64889 0.008 0.080 0.020 0.892
#> SRR1319648 2 0.5774 0.69453 0.236 0.692 0.004 0.068
#> SRR1092985 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.5296 0.35970 0.492 0.500 0.000 0.008
#> SRR1468658 4 0.5019 0.47959 0.004 0.044 0.200 0.752
#> SRR1390437 1 0.4643 0.28582 0.656 0.344 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.5724 0.65055 0.140 0.716 0.000 0.144
#> SRR612635 2 0.5078 0.68301 0.272 0.700 0.000 0.028
#> SRR1351480 2 0.5231 0.58400 0.384 0.604 0.000 0.012
#> SRR1436651 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1474 0.80048 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.6591 0.04858 0.060 0.516 0.008 0.416
#> SRR614263 1 0.2530 0.75941 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.5161 0.39358 0.476 0.520 0.000 0.004
#> SRR659911 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR1085519 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1345894 4 0.5106 0.40778 0.000 0.040 0.240 0.720
#> SRR1442928 4 0.2125 0.64481 0.000 0.076 0.004 0.920
#> SRR1464681 2 0.4814 0.65610 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR1418880 1 0.2011 0.79120 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1309070 4 0.3907 0.55907 0.000 0.032 0.140 0.828
#> SRR1365426 2 0.4936 0.59945 0.372 0.624 0.000 0.004
#> SRR1487947 1 0.6699 -0.13061 0.480 0.456 0.040 0.024
#> SRR659708 2 0.5687 0.38145 0.456 0.524 0.008 0.012
#> SRR603236 4 0.3351 0.54991 0.000 0.008 0.148 0.844
#> SRR660673 1 0.2011 0.79089 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.6708 0.34029 0.096 0.576 0.004 0.324
#> SRR663807 4 0.5417 0.57713 0.040 0.284 0.000 0.676
#> SRR1087245 2 0.5628 0.65975 0.144 0.724 0.000 0.132
#> SRR1339108 2 0.4792 0.66021 0.312 0.680 0.000 0.008
#> SRR613426 1 0.4713 0.25295 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.5496 0.68093 0.160 0.732 0.000 0.108
#> SRR1385101 2 0.5161 0.39358 0.476 0.520 0.000 0.004
#> SRR1387966 4 0.5055 0.59649 0.032 0.256 0.000 0.712
#> SRR1458852 4 0.2494 0.63141 0.000 0.036 0.048 0.916
#> SRR1430489 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.1557 0.79817 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.4004 0.80564 0.000 0.024 0.812 0.164
#> SRR1321987 4 0.2131 0.63346 0.000 0.036 0.032 0.932
#> SRR662653 4 0.2131 0.63346 0.000 0.036 0.032 0.932
#> SRR1390027 1 0.0336 0.81056 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.6591 0.26909 0.060 0.588 0.016 0.336
#> SRR1383081 2 0.5494 0.69442 0.208 0.716 0.000 0.076
#> SRR2166960 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR605101 2 0.5057 0.63895 0.340 0.648 0.000 0.012
#> SRR818600 4 0.5496 0.61610 0.020 0.208 0.040 0.732
#> SRR1367715 2 0.5158 0.41093 0.472 0.524 0.000 0.004
#> SRR1351979 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1387054 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1444306 3 0.4669 0.79467 0.000 0.036 0.764 0.200
#> SRR1322662 1 0.0336 0.81055 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR665478 4 0.5753 0.39793 0.000 0.072 0.248 0.680
#> SRR612767 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 4 0.5698 0.52062 0.044 0.320 0.000 0.636
#> SRR1430375 4 0.3946 0.53121 0.000 0.020 0.168 0.812
#> SRR615225 2 0.5363 0.69599 0.216 0.720 0.000 0.064
#> SRR1401839 2 0.6567 0.19263 0.064 0.552 0.008 0.376
#> SRR1379110 1 0.4888 0.01128 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.3074 0.81095 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1331639 2 0.4814 0.65610 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR1342782 2 0.6204 0.66372 0.160 0.672 0.000 0.168
#> SRR1443003 3 0.4540 0.79733 0.000 0.032 0.772 0.196
#> SRR612839 1 0.4841 0.54623 0.712 0.272 0.012 0.004
#> SRR1470093 4 0.6204 -0.32689 0.000 0.052 0.448 0.500
#> SRR1395742 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.5106 0.40778 0.000 0.040 0.240 0.720
#> SRR664063 2 0.6413 0.62769 0.332 0.596 0.008 0.064
#> SRR1488214 1 0.3837 0.59754 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.4981 0.43548 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.5231 0.58400 0.384 0.604 0.000 0.012
#> SRR1071955 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.5628 0.65975 0.144 0.724 0.000 0.132
#> SRR1488470 2 0.5854 0.69153 0.256 0.676 0.004 0.064
#> SRR1389497 3 0.3024 0.81317 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1367109 3 0.5827 0.51439 0.000 0.032 0.532 0.436
#> SRR615311 1 0.0000 0.81008 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 5 0.5002 0.38353 0.000 0.364 0.000 0.040 0.596
#> SRR1380716 2 0.3636 0.63457 0.272 0.728 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2773 0.75676 0.836 0.164 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 4 0.6764 0.72452 0.008 0.120 0.100 0.632 0.140
#> SRR1074359 5 0.2731 0.55265 0.000 0.004 0.104 0.016 0.876
#> SRR1419258 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.5272 0.32967 0.000 0.008 0.616 0.048 0.328
#> SRR665262 5 0.1626 0.58342 0.000 0.016 0.044 0.000 0.940
#> SRR1499740 2 0.6740 -0.17926 0.012 0.452 0.008 0.132 0.396
#> SRR1105057 2 0.3374 0.70655 0.100 0.852 0.000 0.016 0.032
#> SRR1439742 1 0.1831 0.82756 0.920 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR614599 5 0.2104 0.58324 0.000 0.060 0.000 0.024 0.916
#> SRR612215 5 0.2006 0.58489 0.000 0.072 0.000 0.012 0.916
#> SRR1094051 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.6895 0.13290 0.360 0.404 0.000 0.228 0.008
#> SRR1409263 4 0.7339 0.74059 0.004 0.120 0.124 0.556 0.196
#> SRR1431288 1 0.3304 0.74376 0.816 0.168 0.000 0.016 0.000
#> SRR1334889 2 0.3658 0.70566 0.104 0.836 0.000 0.016 0.044
#> SRR614839 2 0.3875 0.67960 0.228 0.756 0.000 0.004 0.012
#> SRR658433 5 0.1830 0.57791 0.000 0.008 0.068 0.000 0.924
#> SRR1088581 2 0.3721 0.58478 0.008 0.816 0.004 0.024 0.148
#> SRR1328797 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.3972 0.70397 0.188 0.780 0.000 0.012 0.020
#> SRR1471117 1 0.5606 0.32367 0.568 0.344 0.000 0.088 0.000
#> SRR1311553 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 5 0.5065 0.32614 0.000 0.420 0.000 0.036 0.544
#> SRR1354955 3 0.5680 0.45774 0.000 0.000 0.624 0.148 0.228
#> SRR654802 3 0.3535 0.67398 0.000 0.000 0.808 0.164 0.028
#> SRR660066 5 0.4820 0.41803 0.000 0.332 0.000 0.036 0.632
#> SRR1447103 5 0.2006 0.58489 0.000 0.072 0.000 0.012 0.916
#> SRR1402153 4 0.6023 0.70853 0.000 0.136 0.048 0.668 0.148
#> SRR655887 2 0.5006 0.36723 0.008 0.672 0.000 0.048 0.272
#> SRR1408529 3 0.5656 0.46740 0.000 0.000 0.624 0.140 0.236
#> SRR658707 1 0.3013 0.75620 0.832 0.160 0.000 0.008 0.000
#> SRR1384371 5 0.5987 0.26249 0.000 0.440 0.016 0.068 0.476
#> SRR1074670 5 0.6235 0.03834 0.000 0.004 0.244 0.188 0.564
#> SRR1375439 5 0.5779 0.22878 0.000 0.456 0.000 0.088 0.456
#> SRR1329003 1 0.6392 0.01280 0.432 0.400 0.000 0.168 0.000
#> SRR1404837 2 0.3452 0.66186 0.244 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0404 0.84657 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 2 0.3934 0.63909 0.276 0.716 0.000 0.008 0.000
#> SRR613999 1 0.1043 0.84329 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.6462 0.24457 0.000 0.012 0.536 0.160 0.292
#> SRR1068855 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612227 5 0.6256 0.03871 0.000 0.004 0.248 0.188 0.560
#> SRR1388809 5 0.1883 0.58707 0.000 0.048 0.008 0.012 0.932
#> SRR1413872 2 0.3053 0.70881 0.164 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452864 1 0.0404 0.84657 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 5 0.5819 0.23307 0.000 0.452 0.000 0.092 0.456
#> SRR615814 5 0.2869 0.58570 0.000 0.056 0.040 0.016 0.888
#> SRR1325225 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 5 0.5790 0.29000 0.000 0.424 0.008 0.068 0.500
#> SRR1358220 2 0.3636 0.63457 0.272 0.728 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.4291 0.28507 0.464 0.536 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0609 0.84599 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.3999 0.54901 0.344 0.656 0.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.2513 0.64507 0.016 0.904 0.000 0.020 0.060
#> SRR815783 5 0.1626 0.58342 0.000 0.016 0.044 0.000 0.940
#> SRR809595 2 0.3774 0.61909 0.296 0.704 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403133 5 0.3994 0.52025 0.000 0.188 0.000 0.040 0.772
#> SRR815470 5 0.2731 0.55265 0.000 0.004 0.104 0.016 0.876
#> SRR1344382 1 0.0609 0.84599 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.3361 0.57164 0.000 0.036 0.080 0.024 0.860
#> SRR1478362 2 0.3356 0.71188 0.120 0.844 0.000 0.012 0.024
#> SRR1392186 2 0.4300 0.24734 0.476 0.524 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.3264 0.74752 0.820 0.164 0.000 0.016 0.000
#> SRR1471594 1 0.0703 0.84572 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.6542 -0.19597 0.004 0.452 0.004 0.148 0.392
#> SRR612683 2 0.2416 0.64672 0.016 0.908 0.000 0.016 0.060
#> SRR1392901 5 0.4086 0.48277 0.000 0.004 0.152 0.056 0.788
#> SRR1077805 3 0.6235 0.18283 0.000 0.000 0.500 0.156 0.344
#> SRR1360402 5 0.5065 0.32614 0.000 0.420 0.000 0.036 0.544
#> SRR1406112 3 0.5680 0.45774 0.000 0.000 0.624 0.148 0.228
#> SRR1355352 4 0.7262 0.74233 0.004 0.120 0.116 0.564 0.196
#> SRR656247 1 0.2179 0.80774 0.888 0.112 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.5461 0.10782 0.460 0.492 0.000 0.036 0.012
#> SRR808244 1 0.6392 0.01280 0.432 0.400 0.000 0.168 0.000
#> SRR1387240 5 0.1893 0.58690 0.000 0.024 0.048 0.000 0.928
#> SRR1408595 1 0.2516 0.78019 0.860 0.140 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.4066 0.58028 0.324 0.672 0.000 0.004 0.000
#> SRR1435248 5 0.1695 0.58781 0.000 0.044 0.008 0.008 0.940
#> SRR1419110 5 0.5908 0.29822 0.000 0.404 0.008 0.080 0.508
#> SRR1408682 5 0.3064 0.56725 0.000 0.108 0.000 0.036 0.856
#> SRR1317134 1 0.2411 0.80471 0.884 0.108 0.000 0.008 0.000
#> SRR1370780 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.3274 0.67934 0.220 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.4731 0.27177 0.000 0.640 0.000 0.032 0.328
#> SRR603164 5 0.6295 0.02841 0.000 0.004 0.256 0.188 0.552
#> SRR1383259 2 0.4166 0.54277 0.348 0.648 0.000 0.004 0.000
#> SRR1330854 2 0.7004 0.17912 0.316 0.392 0.000 0.284 0.008
#> SRR1452423 1 0.0609 0.84599 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4305 0.20798 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.6154 -0.07951 0.000 0.000 0.348 0.144 0.508
#> SRR1361546 2 0.3078 0.71686 0.132 0.848 0.000 0.004 0.016
#> SRR1486156 1 0.3476 0.73191 0.804 0.176 0.000 0.020 0.000
#> SRR660545 5 0.3774 0.49999 0.000 0.008 0.160 0.028 0.804
#> SRR615635 5 0.2462 0.57706 0.000 0.112 0.008 0.000 0.880
#> SRR1385411 2 0.3839 0.69499 0.088 0.832 0.000 0.024 0.056
#> SRR1342739 1 0.0290 0.84659 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0865 0.74477 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR662126 2 0.3793 0.66131 0.072 0.840 0.000 0.048 0.040
#> SRR1464601 5 0.1830 0.57791 0.000 0.008 0.068 0.000 0.924
#> SRR1071594 5 0.6017 0.26440 0.000 0.436 0.020 0.064 0.480
#> SRR612539 2 0.4255 0.66251 0.068 0.800 0.000 0.020 0.112
#> SRR602010 2 0.3300 0.69214 0.204 0.792 0.000 0.000 0.004
#> SRR810249 2 0.3730 0.64327 0.040 0.832 0.000 0.020 0.108
#> SRR818773 2 0.4244 0.64228 0.268 0.712 0.000 0.016 0.004
#> SRR1336569 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.2347 0.64739 0.016 0.912 0.000 0.016 0.056
#> SRR1442754 2 0.6895 0.13290 0.360 0.404 0.000 0.228 0.008
#> SRR1334247 3 0.5163 0.57189 0.000 0.000 0.692 0.152 0.156
#> SRR661639 1 0.2411 0.80737 0.884 0.108 0.000 0.008 0.000
#> SRR613222 2 0.3826 0.67254 0.236 0.752 0.000 0.004 0.008
#> SRR1459937 2 0.3947 0.67683 0.236 0.748 0.000 0.008 0.008
#> SRR2185018 1 0.4171 0.31339 0.604 0.396 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.6320 0.32349 0.028 0.636 0.020 0.088 0.228
#> SRR809348 1 0.0963 0.84361 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 5 0.6235 0.03834 0.000 0.004 0.244 0.188 0.564
#> SRR661074 3 0.0992 0.74456 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1349851 1 0.2074 0.81215 0.896 0.104 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.3964 0.71051 0.176 0.788 0.000 0.016 0.020
#> SRR661096 1 0.3661 0.56156 0.724 0.276 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6392 0.01280 0.432 0.400 0.000 0.168 0.000
#> SRR1307677 2 0.4204 0.48297 0.000 0.756 0.000 0.048 0.196
#> SRR1466512 2 0.3966 0.55778 0.336 0.664 0.000 0.000 0.000
#> SRR658212 2 0.4665 0.37300 0.000 0.692 0.000 0.048 0.260
#> SRR1430525 3 0.3622 0.68871 0.000 0.000 0.820 0.124 0.056
#> SRR1344422 2 0.5810 -0.14828 0.000 0.480 0.000 0.092 0.428
#> SRR1353924 2 0.3443 0.71262 0.164 0.816 0.000 0.008 0.012
#> SRR1314832 4 0.6764 0.72452 0.008 0.120 0.100 0.632 0.140
#> SRR1487570 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.2597 0.68778 0.060 0.896 0.000 0.004 0.040
#> SRR1418561 4 0.7204 0.62850 0.004 0.064 0.112 0.488 0.332
#> SRR1448029 5 0.6154 -0.07951 0.000 0.000 0.348 0.144 0.508
#> SRR813802 1 0.6415 0.00943 0.428 0.400 0.000 0.172 0.000
#> SRR815020 1 0.0290 0.84659 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2707 0.69972 0.080 0.888 0.000 0.008 0.024
#> SRR1435311 2 0.3816 0.60476 0.304 0.696 0.000 0.000 0.000
#> SRR612395 5 0.2006 0.58489 0.000 0.072 0.000 0.012 0.916
#> SRR603116 2 0.4412 0.51198 0.016 0.748 0.000 0.028 0.208
#> SRR1323152 5 0.6520 -0.05270 0.000 0.008 0.264 0.200 0.528
#> SRR1368264 2 0.3661 0.63246 0.276 0.724 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.1952 0.82215 0.912 0.084 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429265 3 0.3772 0.66605 0.000 0.000 0.792 0.172 0.036
#> SRR1327702 1 0.3821 0.67512 0.764 0.216 0.000 0.020 0.000
#> SRR615611 2 0.3122 0.70977 0.108 0.860 0.000 0.016 0.016
#> SRR1486799 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.3452 0.61117 0.756 0.244 0.000 0.000 0.000
#> SRR815044 1 0.4306 -0.14280 0.508 0.492 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.3734 0.66708 0.240 0.752 0.000 0.004 0.004
#> SRR615862 2 0.2769 0.64915 0.024 0.892 0.000 0.020 0.064
#> SRR1480038 2 0.3837 0.60001 0.308 0.692 0.000 0.000 0.000
#> SRR659436 3 0.6316 0.29841 0.000 0.012 0.564 0.152 0.272
#> SRR613699 5 0.7452 0.17692 0.000 0.356 0.072 0.144 0.428
#> SRR1436563 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.4182 0.24206 0.600 0.400 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.4088 0.60877 0.304 0.688 0.000 0.008 0.000
#> SRR1489950 5 0.1770 0.58955 0.000 0.048 0.008 0.008 0.936
#> SRR1431927 1 0.1831 0.82754 0.920 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100588 3 0.0162 0.75461 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1444002 1 0.5606 0.32367 0.568 0.344 0.000 0.088 0.000
#> SRR1318444 2 0.3415 0.60859 0.008 0.840 0.000 0.032 0.120
#> SRR600656 2 0.3053 0.70881 0.164 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR658766 3 0.5468 0.30370 0.000 0.008 0.600 0.060 0.332
#> SRR655946 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.1121 0.84061 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.3574 0.67164 0.000 0.000 0.804 0.168 0.028
#> SRR1406418 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.2843 0.77187 0.848 0.144 0.000 0.008 0.000
#> SRR1444120 2 0.4268 0.63786 0.272 0.708 0.000 0.016 0.004
#> SRR1471965 1 0.2068 0.81802 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR612695 4 0.6939 0.49319 0.000 0.024 0.164 0.428 0.384
#> SRR662498 5 0.6501 0.19266 0.000 0.020 0.200 0.208 0.572
#> SRR1376764 4 0.6023 0.70853 0.000 0.136 0.048 0.668 0.148
#> SRR1377006 5 0.6470 0.32096 0.000 0.260 0.020 0.156 0.564
#> SRR656860 2 0.2908 0.69059 0.068 0.884 0.000 0.016 0.032
#> SRR1480547 2 0.3846 0.71327 0.132 0.816 0.000 0.016 0.036
#> SRR1452515 5 0.2630 0.57293 0.000 0.016 0.080 0.012 0.892
#> SRR1324390 5 0.4787 0.42467 0.000 0.324 0.000 0.036 0.640
#> SRR615273 2 0.3996 0.68134 0.228 0.752 0.000 0.008 0.012
#> SRR601695 5 0.2731 0.55265 0.000 0.004 0.104 0.016 0.876
#> SRR820907 2 0.3010 0.70845 0.100 0.868 0.000 0.012 0.020
#> SRR812773 2 0.4201 0.42211 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.3359 0.71197 0.112 0.848 0.000 0.016 0.024
#> SRR1472794 5 0.2532 0.58518 0.000 0.088 0.008 0.012 0.892
#> SRR1365448 2 0.6880 0.13663 0.360 0.408 0.000 0.224 0.008
#> SRR1095720 3 0.4729 0.52656 0.000 0.004 0.708 0.052 0.236
#> SRR1435626 5 0.6644 0.30624 0.000 0.216 0.032 0.180 0.572
#> SRR1080766 5 0.2325 0.58091 0.000 0.068 0.000 0.028 0.904
#> SRR1377862 1 0.0794 0.84496 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.4884 0.60961 0.000 0.000 0.720 0.152 0.128
#> SRR1467966 3 0.5002 0.58568 0.000 0.000 0.708 0.132 0.160
#> SRR1320579 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 2 0.4262 0.35699 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.3134 0.61651 0.012 0.864 0.000 0.028 0.096
#> SRR1098879 4 0.5481 0.58546 0.000 0.004 0.184 0.668 0.144
#> SRR662245 3 0.6462 0.24457 0.000 0.012 0.536 0.160 0.292
#> SRR1074719 2 0.3359 0.71197 0.112 0.848 0.000 0.016 0.024
#> SRR816226 2 0.4211 0.51775 0.360 0.636 0.000 0.004 0.000
#> SRR601387 2 0.5246 0.39535 0.024 0.664 0.000 0.040 0.272
#> SRR614575 2 0.3953 0.53124 0.008 0.780 0.000 0.024 0.188
#> SRR1353900 2 0.4270 0.47320 0.000 0.748 0.000 0.048 0.204
#> SRR662906 5 0.4270 0.46032 0.000 0.008 0.188 0.040 0.764
#> SRR1350832 5 0.4880 0.40139 0.000 0.348 0.000 0.036 0.616
#> SRR1403280 2 0.3585 0.69755 0.088 0.844 0.000 0.016 0.052
#> SRR1313969 2 0.3005 0.71235 0.124 0.856 0.000 0.012 0.008
#> SRR1388528 2 0.6804 0.16499 0.368 0.420 0.000 0.204 0.008
#> SRR1452912 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.4045 0.52500 0.356 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.4138 0.47839 0.384 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.4729 0.52656 0.000 0.004 0.708 0.052 0.236
#> SRR607067 1 0.4219 0.18303 0.584 0.416 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.3658 0.70566 0.104 0.836 0.000 0.016 0.044
#> SRR661961 5 0.3048 0.58405 0.000 0.036 0.060 0.024 0.880
#> SRR658259 2 0.3952 0.59183 0.020 0.816 0.000 0.044 0.120
#> SRR1310476 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 5 0.3945 0.57757 0.000 0.112 0.044 0.024 0.820
#> SRR1365034 2 0.4291 0.28507 0.464 0.536 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478053 5 0.5086 0.35345 0.000 0.396 0.000 0.040 0.564
#> SRR1475300 2 0.3876 0.58290 0.316 0.684 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 5 0.2006 0.58489 0.000 0.072 0.000 0.012 0.916
#> SRR1322900 2 0.4620 0.56464 0.320 0.652 0.000 0.028 0.000
#> SRR1309942 5 0.1893 0.58690 0.000 0.024 0.048 0.000 0.928
#> SRR1345760 2 0.4305 0.18423 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.3059 0.63754 0.020 0.868 0.000 0.016 0.096
#> SRR1443436 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.1740 0.58099 0.000 0.012 0.056 0.000 0.932
#> SRR661469 2 0.6143 0.19054 0.008 0.576 0.004 0.116 0.296
#> SRR1500323 5 0.3692 0.50831 0.000 0.008 0.152 0.028 0.812
#> SRR1356705 2 0.3999 0.54350 0.344 0.656 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.6571 -0.19402 0.004 0.452 0.008 0.136 0.400
#> SRR1350435 1 0.1952 0.82215 0.912 0.084 0.000 0.004 0.000
#> SRR1389177 3 0.4849 0.61611 0.000 0.000 0.724 0.140 0.136
#> SRR1368072 2 0.5196 0.35439 0.020 0.652 0.000 0.036 0.292
#> SRR601815 2 0.5540 0.02168 0.012 0.532 0.000 0.044 0.412
#> SRR613330 1 0.0404 0.84661 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.5146 0.40244 0.000 0.348 0.008 0.036 0.608
#> SRR1394190 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.5599 0.35995 0.000 0.328 0.000 0.092 0.580
#> SRR1318839 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.3053 0.70881 0.164 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR613126 5 0.3650 0.51282 0.000 0.008 0.148 0.028 0.816
#> SRR1089424 2 0.3078 0.71686 0.132 0.848 0.000 0.004 0.016
#> SRR1347214 2 0.5272 0.23267 0.008 0.616 0.000 0.048 0.328
#> SRR1309556 2 0.6289 -0.17370 0.004 0.464 0.000 0.132 0.400
#> SRR1456027 1 0.0290 0.84559 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 5 0.6976 0.19473 0.000 0.200 0.036 0.240 0.524
#> SRR1320469 2 0.8064 0.10938 0.304 0.328 0.000 0.280 0.088
#> SRR614251 5 0.5411 0.49488 0.000 0.208 0.072 0.028 0.692
#> SRR1454310 5 0.5068 0.37880 0.000 0.364 0.000 0.044 0.592
#> SRR615105 5 0.3031 0.54407 0.000 0.004 0.120 0.020 0.856
#> SRR1433290 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR601671 2 0.3983 0.55187 0.340 0.660 0.000 0.000 0.000
#> SRR663874 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR1409130 5 0.4199 0.46969 0.000 0.008 0.180 0.040 0.772
#> SRR659696 2 0.3385 0.69690 0.084 0.856 0.000 0.016 0.044
#> SRR1408249 1 0.3561 0.58783 0.740 0.260 0.000 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.3764 0.70699 0.116 0.828 0.000 0.024 0.032
#> SRR1402794 5 0.6256 0.03871 0.000 0.004 0.248 0.188 0.560
#> SRR614852 2 0.3934 0.63834 0.276 0.716 0.000 0.008 0.000
#> SRR1348040 2 0.3508 0.65964 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489610 2 0.4262 0.35699 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 5 0.1597 0.58166 0.000 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1499566 2 0.4045 0.52274 0.356 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.4303 0.65904 0.068 0.796 0.000 0.020 0.116
#> SRR1444501 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.5454 -0.16543 0.000 0.488 0.000 0.060 0.452
#> SRR1388832 2 0.6740 -0.17926 0.012 0.452 0.008 0.132 0.396
#> SRR1394637 1 0.5682 0.24017 0.540 0.372 0.000 0.088 0.000
#> SRR606974 5 0.5401 0.25446 0.004 0.468 0.004 0.036 0.488
#> SRR662918 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR817421 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.2758 0.69669 0.076 0.888 0.000 0.012 0.024
#> SRR608264 3 0.0162 0.75461 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1318560 1 0.5606 0.32367 0.568 0.344 0.000 0.088 0.000
#> SRR1454117 2 0.3274 0.67934 0.220 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.1892 0.82463 0.916 0.080 0.000 0.004 0.000
#> SRR615044 2 0.6193 0.24690 0.028 0.580 0.000 0.092 0.300
#> SRR1432743 3 0.5656 0.46740 0.000 0.000 0.624 0.140 0.236
#> SRR1388873 5 0.4520 0.46358 0.000 0.284 0.000 0.032 0.684
#> SRR1353517 1 0.1341 0.83714 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 5 0.6661 -0.05270 0.000 0.020 0.328 0.148 0.504
#> SRR1406008 2 0.4642 0.56628 0.032 0.756 0.000 0.036 0.176
#> SRR1396786 5 0.1770 0.58955 0.000 0.048 0.008 0.008 0.936
#> SRR1446564 1 0.1043 0.84208 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.5307 0.54972 0.000 0.000 0.676 0.156 0.168
#> SRR1431083 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.3452 0.61117 0.756 0.244 0.000 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.5259 -0.15049 0.004 0.508 0.004 0.028 0.456
#> SRR1087825 2 0.3053 0.70881 0.164 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR662019 4 0.7798 0.59418 0.000 0.076 0.220 0.408 0.296
#> SRR1349209 2 0.3415 0.60859 0.008 0.840 0.000 0.032 0.120
#> SRR1326161 2 0.5556 -0.07385 0.000 0.524 0.000 0.072 0.404
#> SRR1345284 1 0.4150 0.29897 0.612 0.388 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.2068 0.81802 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR663356 2 0.3443 0.71262 0.164 0.816 0.000 0.008 0.012
#> SRR1454328 5 0.1444 0.58652 0.000 0.040 0.012 0.000 0.948
#> SRR1489286 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.2329 0.79472 0.876 0.124 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.4887 0.60112 0.000 0.000 0.720 0.132 0.148
#> SRR1084369 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR809444 1 0.2124 0.81454 0.900 0.096 0.000 0.004 0.000
#> SRR1089901 5 0.4305 0.50810 0.000 0.200 0.000 0.052 0.748
#> SRR1375774 1 0.1197 0.84009 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.6392 0.01280 0.432 0.400 0.000 0.168 0.000
#> SRR657139 1 0.5995 -0.01646 0.468 0.420 0.000 0.112 0.000
#> SRR1440744 2 0.4256 0.36685 0.436 0.564 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.5682 0.24017 0.540 0.372 0.000 0.088 0.000
#> SRR1452334 2 0.3059 0.63754 0.020 0.868 0.000 0.016 0.096
#> SRR1381775 1 0.0794 0.84494 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.3274 0.67934 0.220 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR658989 4 0.6853 0.46241 0.000 0.004 0.248 0.388 0.360
#> SRR1353663 1 0.1892 0.82463 0.916 0.080 0.000 0.004 0.000
#> SRR811771 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.2068 0.81802 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.5552 -0.01067 0.012 0.524 0.000 0.044 0.420
#> SRR1367988 2 0.4147 0.59508 0.316 0.676 0.000 0.008 0.000
#> SRR1331922 1 0.3816 0.52025 0.696 0.304 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.4322 0.65218 0.260 0.716 0.000 0.012 0.012
#> SRR1375796 5 0.5411 0.49488 0.000 0.208 0.072 0.028 0.692
#> SRR1386991 5 0.5618 0.34683 0.000 0.348 0.000 0.088 0.564
#> SRR1355217 2 0.5138 0.67033 0.164 0.712 0.000 0.116 0.008
#> SRR1356290 5 0.5856 0.31034 0.000 0.400 0.012 0.068 0.520
#> SRR659507 5 0.3264 0.52808 0.000 0.004 0.140 0.020 0.836
#> SRR663296 2 0.5461 0.10782 0.460 0.492 0.000 0.036 0.012
#> SRR598044 2 0.3446 0.71475 0.116 0.840 0.000 0.008 0.036
#> SRR661155 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR1414727 5 0.5908 0.29822 0.000 0.404 0.008 0.080 0.508
#> SRR663477 1 0.1952 0.82215 0.912 0.084 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354489 3 0.5087 0.58329 0.000 0.000 0.700 0.152 0.148
#> SRR1377800 5 0.6981 0.21549 0.000 0.200 0.040 0.228 0.532
#> SRR614611 5 0.2390 0.58319 0.000 0.084 0.000 0.020 0.896
#> SRR655052 2 0.3059 0.63754 0.020 0.868 0.000 0.016 0.096
#> SRR1478968 1 0.0290 0.84559 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.3952 0.59183 0.020 0.816 0.000 0.044 0.120
#> SRR613951 2 0.3686 0.69483 0.204 0.780 0.000 0.004 0.012
#> SRR1418022 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.3415 0.60859 0.008 0.840 0.000 0.032 0.120
#> SRR1408161 1 0.3098 0.76418 0.836 0.148 0.000 0.016 0.000
#> SRR657054 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR655040 2 0.4171 0.44845 0.396 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR810225 2 0.4443 0.50653 0.016 0.744 0.000 0.028 0.212
#> SRR1325377 2 0.3446 0.71475 0.116 0.840 0.000 0.008 0.036
#> SRR617829 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 5 0.1725 0.58662 0.000 0.020 0.044 0.000 0.936
#> SRR1480455 5 0.4199 0.46969 0.000 0.008 0.180 0.040 0.772
#> SRR1442104 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.3370 0.76356 0.824 0.148 0.000 0.028 0.000
#> SRR1481396 3 0.3574 0.67164 0.000 0.000 0.804 0.168 0.028
#> SRR1414314 5 0.4404 0.47820 0.000 0.264 0.000 0.032 0.704
#> SRR663026 2 0.4970 0.47924 0.024 0.708 0.000 0.040 0.228
#> SRR1478386 1 0.3707 0.54180 0.716 0.284 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 5 0.5035 0.38269 0.000 0.008 0.212 0.076 0.704
#> SRR1370572 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4278 0.03298 0.548 0.452 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.3551 0.68201 0.220 0.772 0.000 0.008 0.000
#> SRR660260 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR1071231 2 0.3359 0.71197 0.112 0.848 0.000 0.016 0.024
#> SRR1459125 2 0.3734 0.67298 0.240 0.752 0.000 0.004 0.004
#> SRR1337173 5 0.4194 0.51809 0.000 0.016 0.120 0.064 0.800
#> SRR1396250 3 0.0510 0.75134 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2166376 3 0.6506 0.23231 0.000 0.012 0.528 0.164 0.296
#> SRR659816 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR1401379 2 0.4262 0.35699 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000
#> SRR600981 2 0.3107 0.70276 0.088 0.868 0.000 0.012 0.032
#> SRR1398335 1 0.1831 0.82754 0.920 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397218 2 0.4045 0.52274 0.356 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 5 0.5389 0.29508 0.000 0.436 0.000 0.056 0.508
#> SRR1359780 5 0.1893 0.58690 0.000 0.024 0.048 0.000 0.928
#> SRR1490037 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.1197 0.83966 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 5 0.2938 0.58117 0.000 0.084 0.008 0.032 0.876
#> SRR1319648 2 0.3709 0.70540 0.108 0.832 0.000 0.016 0.044
#> SRR1092985 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.4166 0.54277 0.348 0.648 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468658 5 0.4959 0.43607 0.000 0.020 0.180 0.068 0.732
#> SRR1390437 1 0.4219 0.18303 0.584 0.416 0.000 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.3134 0.61651 0.012 0.864 0.000 0.028 0.096
#> SRR612635 2 0.3078 0.71686 0.132 0.848 0.000 0.004 0.016
#> SRR1351480 2 0.3734 0.66708 0.240 0.752 0.000 0.004 0.004
#> SRR1436651 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1544 0.83267 0.932 0.068 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.5528 0.10800 0.012 0.564 0.000 0.048 0.376
#> SRR614263 1 0.2424 0.79084 0.868 0.132 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.3983 0.55187 0.340 0.660 0.000 0.000 0.000
#> SRR659911 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR1085519 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 5 0.5141 0.38842 0.000 0.012 0.212 0.076 0.700
#> SRR1442928 5 0.2006 0.58489 0.000 0.072 0.000 0.012 0.916
#> SRR1464681 2 0.3053 0.70881 0.164 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR1418880 1 0.2068 0.81823 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309070 5 0.4194 0.51809 0.000 0.016 0.120 0.064 0.800
#> SRR1365426 2 0.3424 0.66711 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.6538 0.01488 0.444 0.396 0.000 0.152 0.008
#> SRR659708 2 0.5623 0.36844 0.388 0.540 0.000 0.068 0.004
#> SRR603236 5 0.3340 0.53249 0.000 0.004 0.124 0.032 0.840
#> SRR660673 1 0.2068 0.81802 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430729 2 0.5331 0.35986 0.024 0.648 0.000 0.040 0.288
#> SRR663807 5 0.4787 0.42467 0.000 0.324 0.000 0.036 0.640
#> SRR1087245 2 0.2965 0.62349 0.012 0.876 0.000 0.028 0.084
#> SRR1339108 2 0.3053 0.70866 0.164 0.828 0.000 0.000 0.008
#> SRR613426 1 0.4273 0.11569 0.552 0.448 0.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.2347 0.64739 0.016 0.912 0.000 0.016 0.056
#> SRR1385101 2 0.3966 0.55778 0.336 0.664 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 5 0.4520 0.46358 0.000 0.284 0.000 0.032 0.684
#> SRR1458852 5 0.1893 0.58690 0.000 0.024 0.048 0.000 0.928
#> SRR1430489 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.1608 0.83033 0.928 0.072 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.2864 0.69511 0.000 0.000 0.852 0.136 0.012
#> SRR1321987 5 0.1582 0.58615 0.000 0.028 0.028 0.000 0.944
#> SRR662653 5 0.1582 0.58615 0.000 0.028 0.028 0.000 0.944
#> SRR1390027 1 0.0510 0.84650 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.5514 0.32917 0.012 0.628 0.000 0.068 0.292
#> SRR1383081 2 0.3152 0.68674 0.064 0.872 0.000 0.016 0.048
#> SRR2166960 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR605101 2 0.3300 0.69214 0.204 0.792 0.000 0.000 0.004
#> SRR818600 5 0.5203 0.48429 0.000 0.240 0.044 0.028 0.688
#> SRR1367715 2 0.3999 0.54327 0.344 0.656 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.3844 0.68084 0.000 0.000 0.804 0.132 0.064
#> SRR1322662 1 0.0510 0.84635 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 5 0.6220 0.26487 0.000 0.036 0.108 0.240 0.616
#> SRR612767 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 5 0.5002 0.38353 0.000 0.364 0.000 0.040 0.596
#> SRR1430375 5 0.3692 0.50831 0.000 0.008 0.152 0.028 0.812
#> SRR615225 2 0.3152 0.69982 0.084 0.868 0.000 0.016 0.032
#> SRR1401839 2 0.4836 0.24631 0.000 0.628 0.000 0.036 0.336
#> SRR1379110 2 0.4305 0.20798 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0992 0.74456 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1331639 2 0.3053 0.70881 0.164 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR1342782 2 0.4406 0.64403 0.060 0.784 0.000 0.020 0.136
#> SRR1443003 3 0.3622 0.68871 0.000 0.000 0.820 0.124 0.056
#> SRR612839 1 0.4890 0.56947 0.680 0.256 0.000 0.064 0.000
#> SRR1470093 5 0.6704 -0.22811 0.000 0.004 0.356 0.208 0.432
#> SRR1395742 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 5 0.5141 0.38842 0.000 0.012 0.212 0.076 0.700
#> SRR664063 2 0.4964 0.68324 0.196 0.728 0.000 0.040 0.036
#> SRR1488214 1 0.3774 0.54110 0.704 0.296 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.4147 0.59508 0.316 0.676 0.000 0.008 0.000
#> SRR1320321 2 0.3734 0.66708 0.240 0.752 0.000 0.004 0.004
#> SRR1071955 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.2965 0.62349 0.012 0.876 0.000 0.028 0.084
#> SRR1488470 2 0.3846 0.71327 0.132 0.816 0.000 0.016 0.036
#> SRR1389497 3 0.0000 0.75521 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.6132 0.18592 0.000 0.000 0.508 0.140 0.352
#> SRR615311 1 0.0162 0.84642 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 5 0.5095 0.4649 0.000 0.256 0.000 0.104 0.632 0.008
#> SRR1380716 2 0.2833 0.6979 0.148 0.836 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR612803 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.2948 0.7542 0.804 0.188 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084417 4 0.5096 0.6234 0.000 0.048 0.036 0.728 0.044 0.144
#> SRR1074359 5 0.3567 0.4552 0.000 0.000 0.100 0.000 0.800 0.100
#> SRR1419258 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.5852 0.3548 0.000 0.004 0.576 0.028 0.272 0.120
#> SRR665262 5 0.1549 0.5308 0.000 0.000 0.044 0.000 0.936 0.020
#> SRR1499740 5 0.6759 0.2603 0.008 0.324 0.000 0.260 0.384 0.024
#> SRR1105057 2 0.3166 0.6968 0.036 0.856 0.000 0.060 0.048 0.000
#> SRR1439742 1 0.2122 0.8500 0.900 0.084 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR614599 5 0.1149 0.5531 0.000 0.008 0.000 0.024 0.960 0.008
#> SRR612215 5 0.1173 0.5547 0.000 0.016 0.000 0.016 0.960 0.008
#> SRR1094051 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.7244 0.1458 0.272 0.380 0.000 0.248 0.000 0.100
#> SRR1409263 4 0.6167 0.6285 0.000 0.052 0.060 0.652 0.108 0.128
#> SRR1431288 1 0.3720 0.7282 0.768 0.196 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1334889 2 0.4295 0.6962 0.052 0.792 0.000 0.080 0.064 0.012
#> SRR614839 2 0.4227 0.7039 0.152 0.772 0.000 0.040 0.024 0.012
#> SRR658433 5 0.1926 0.5220 0.000 0.000 0.068 0.000 0.912 0.020
#> SRR1088581 2 0.5085 0.5529 0.000 0.688 0.000 0.132 0.152 0.028
#> SRR1328797 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.4165 0.7107 0.120 0.784 0.000 0.060 0.032 0.004
#> SRR1471117 1 0.6194 0.1830 0.484 0.356 0.000 0.112 0.000 0.048
#> SRR1311553 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 5 0.5228 0.4263 0.000 0.312 0.000 0.104 0.580 0.004
#> SRR1354955 3 0.5945 0.4929 0.000 0.000 0.580 0.164 0.220 0.036
#> SRR654802 3 0.4086 0.6771 0.000 0.000 0.756 0.184 0.024 0.036
#> SRR660066 5 0.4837 0.4862 0.000 0.232 0.000 0.092 0.668 0.008
#> SRR1447103 5 0.1173 0.5547 0.000 0.016 0.000 0.016 0.960 0.008
#> SRR1402153 4 0.4672 0.5903 0.000 0.060 0.000 0.728 0.044 0.168
#> SRR655887 2 0.5695 0.2684 0.004 0.548 0.000 0.132 0.308 0.008
#> SRR1408529 3 0.5951 0.5184 0.000 0.000 0.592 0.144 0.216 0.048
#> SRR658707 1 0.3419 0.7523 0.792 0.180 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1384371 5 0.6383 0.3721 0.000 0.312 0.012 0.180 0.480 0.016
#> SRR1074670 5 0.6564 0.1102 0.000 0.000 0.192 0.224 0.516 0.068
#> SRR1375439 5 0.6339 0.3268 0.000 0.332 0.000 0.184 0.456 0.028
#> SRR1329003 2 0.7080 0.0867 0.344 0.376 0.000 0.188 0.000 0.092
#> SRR1404837 2 0.2948 0.7083 0.144 0.836 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR1317920 1 0.0260 0.8739 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 2 0.3004 0.7024 0.144 0.832 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR613999 1 0.0937 0.8703 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 6 0.5184 0.2411 0.000 0.000 0.432 0.000 0.088 0.480
#> SRR1068855 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0146 0.7725 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612227 5 0.6508 0.1373 0.000 0.000 0.196 0.208 0.528 0.068
#> SRR1388809 5 0.1242 0.5461 0.000 0.008 0.008 0.012 0.960 0.012
#> SRR1413872 2 0.2314 0.7035 0.048 0.908 0.000 0.024 0.008 0.012
#> SRR1452864 1 0.0260 0.8739 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 5 0.6344 0.3377 0.000 0.324 0.000 0.188 0.460 0.028
#> SRR615814 5 0.2415 0.5149 0.000 0.016 0.012 0.000 0.888 0.084
#> SRR1325225 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 5 0.5987 0.3979 0.000 0.292 0.000 0.176 0.516 0.016
#> SRR1358220 2 0.2833 0.6979 0.148 0.836 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1096662 2 0.4076 0.4845 0.348 0.636 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1487746 1 0.0458 0.8736 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.3454 0.6592 0.224 0.760 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR660164 2 0.4070 0.6378 0.004 0.796 0.000 0.076 0.092 0.032
#> SRR815783 5 0.1549 0.5308 0.000 0.000 0.044 0.000 0.936 0.020
#> SRR809595 2 0.3782 0.6952 0.196 0.768 0.000 0.020 0.008 0.008
#> SRR1403133 5 0.3744 0.5379 0.000 0.072 0.000 0.116 0.800 0.012
#> SRR815470 5 0.3567 0.4552 0.000 0.000 0.100 0.000 0.800 0.100
#> SRR1344382 1 0.0458 0.8736 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.3638 0.5363 0.000 0.012 0.068 0.044 0.836 0.040
#> SRR1478362 2 0.3265 0.6962 0.036 0.860 0.000 0.052 0.040 0.012
#> SRR1392186 2 0.4127 0.4539 0.364 0.620 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1347937 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.3689 0.7325 0.772 0.192 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1471594 1 0.0632 0.8728 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 5 0.6626 0.2581 0.004 0.316 0.000 0.276 0.384 0.020
#> SRR612683 2 0.3847 0.6279 0.004 0.792 0.000 0.104 0.096 0.004
#> SRR1392901 5 0.4963 0.3922 0.000 0.000 0.136 0.052 0.716 0.096
#> SRR1077805 3 0.6343 0.2754 0.000 0.000 0.460 0.172 0.336 0.032
#> SRR1360402 5 0.5228 0.4263 0.000 0.312 0.000 0.104 0.580 0.004
#> SRR1406112 3 0.5945 0.4929 0.000 0.000 0.580 0.164 0.220 0.036
#> SRR1355352 4 0.6057 0.6301 0.000 0.052 0.052 0.660 0.108 0.128
#> SRR656247 1 0.2431 0.8155 0.860 0.132 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813656 2 0.5269 0.2914 0.380 0.532 0.000 0.008 0.000 0.080
#> SRR808244 2 0.7080 0.0867 0.344 0.376 0.000 0.188 0.000 0.092
#> SRR1387240 5 0.2017 0.5375 0.000 0.008 0.048 0.004 0.920 0.020
#> SRR1408595 1 0.2706 0.7852 0.832 0.160 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1385277 2 0.3292 0.6840 0.200 0.784 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1435248 5 0.1337 0.5462 0.000 0.008 0.008 0.012 0.956 0.016
#> SRR1419110 5 0.6218 0.3897 0.000 0.272 0.004 0.192 0.512 0.020
#> SRR1408682 5 0.2556 0.5532 0.000 0.028 0.000 0.076 0.884 0.012
#> SRR1317134 1 0.2784 0.8113 0.848 0.132 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1370780 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.2897 0.7128 0.120 0.852 0.000 0.012 0.012 0.004
#> SRR1453911 2 0.5716 0.1361 0.000 0.500 0.000 0.136 0.356 0.008
#> SRR603164 5 0.6525 0.1280 0.000 0.000 0.204 0.212 0.520 0.064
#> SRR1383259 2 0.3972 0.6569 0.232 0.732 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1330854 2 0.7384 0.0766 0.240 0.360 0.000 0.296 0.004 0.100
#> SRR1452423 1 0.0458 0.8736 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.4161 0.4278 0.376 0.608 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1468162 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.6259 0.0482 0.000 0.000 0.308 0.168 0.492 0.032
#> SRR1361546 2 0.2465 0.7074 0.048 0.900 0.000 0.024 0.024 0.004
#> SRR1486156 1 0.3859 0.7156 0.756 0.204 0.000 0.024 0.000 0.016
#> SRR660545 5 0.4347 0.4078 0.000 0.000 0.152 0.012 0.744 0.092
#> SRR615635 5 0.2207 0.5549 0.000 0.076 0.008 0.000 0.900 0.016
#> SRR1385411 2 0.4434 0.6832 0.044 0.776 0.000 0.092 0.080 0.008
#> SRR1342739 1 0.0146 0.8738 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.1010 0.7555 0.000 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR662126 2 0.5246 0.6527 0.056 0.736 0.000 0.072 0.056 0.080
#> SRR1464601 5 0.1926 0.5220 0.000 0.000 0.068 0.000 0.912 0.020
#> SRR1071594 5 0.6439 0.3747 0.000 0.312 0.016 0.176 0.480 0.016
#> SRR612539 2 0.4043 0.6400 0.016 0.788 0.000 0.060 0.128 0.008
#> SRR602010 2 0.2986 0.7157 0.112 0.852 0.000 0.012 0.020 0.004
#> SRR810249 2 0.4107 0.6168 0.008 0.772 0.000 0.084 0.132 0.004
#> SRR818773 2 0.4167 0.6993 0.180 0.760 0.000 0.032 0.016 0.012
#> SRR1336569 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3799 0.6299 0.004 0.796 0.000 0.104 0.092 0.004
#> SRR1442754 2 0.7244 0.1458 0.272 0.380 0.000 0.248 0.000 0.100
#> SRR1334247 3 0.5314 0.5996 0.000 0.000 0.656 0.168 0.152 0.024
#> SRR661639 1 0.2748 0.8221 0.856 0.120 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR613222 2 0.4184 0.7019 0.156 0.772 0.000 0.040 0.020 0.012
#> SRR1459937 2 0.2932 0.7123 0.116 0.852 0.000 0.020 0.004 0.008
#> SRR2185018 1 0.4374 0.1382 0.532 0.448 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR655732 2 0.6871 0.2827 0.020 0.528 0.000 0.076 0.228 0.148
#> SRR809348 1 0.1152 0.8688 0.952 0.044 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR819261 5 0.6564 0.1102 0.000 0.000 0.192 0.224 0.516 0.068
#> SRR661074 3 0.1155 0.7554 0.000 0.000 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1349851 1 0.2212 0.8318 0.880 0.112 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1405123 2 0.4468 0.7091 0.112 0.772 0.000 0.068 0.036 0.012
#> SRR661096 1 0.3867 0.4530 0.660 0.328 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1320225 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 2 0.7080 0.0867 0.344 0.376 0.000 0.188 0.000 0.092
#> SRR1307677 2 0.5721 0.4316 0.000 0.616 0.000 0.136 0.208 0.040
#> SRR1466512 2 0.3301 0.6693 0.216 0.772 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR658212 2 0.5948 0.3040 0.000 0.560 0.000 0.132 0.272 0.036
#> SRR1430525 3 0.3959 0.7008 0.000 0.000 0.784 0.140 0.052 0.024
#> SRR1344422 5 0.6485 0.2796 0.000 0.340 0.000 0.200 0.428 0.032
#> SRR1353924 2 0.2899 0.7150 0.072 0.872 0.000 0.032 0.020 0.004
#> SRR1314832 4 0.5096 0.6234 0.000 0.048 0.036 0.728 0.044 0.144
#> SRR1487570 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.3553 0.6831 0.024 0.836 0.000 0.064 0.068 0.008
#> SRR1418561 4 0.6323 0.5037 0.000 0.024 0.028 0.560 0.252 0.136
#> SRR1448029 5 0.6259 0.0482 0.000 0.000 0.308 0.168 0.492 0.032
#> SRR813802 2 0.7080 0.0930 0.344 0.376 0.000 0.188 0.000 0.092
#> SRR815020 1 0.0146 0.8738 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3430 0.6948 0.036 0.844 0.000 0.064 0.052 0.004
#> SRR1435311 2 0.3261 0.6917 0.192 0.792 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR612395 5 0.1173 0.5547 0.000 0.016 0.000 0.016 0.960 0.008
#> SRR603116 2 0.5137 0.4453 0.004 0.640 0.000 0.116 0.236 0.004
#> SRR1323152 5 0.6689 0.0713 0.000 0.000 0.204 0.228 0.496 0.072
#> SRR1368264 2 0.3198 0.6992 0.160 0.816 0.000 0.008 0.004 0.012
#> SRR1326624 1 0.2275 0.8411 0.888 0.096 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1429265 3 0.4244 0.6664 0.000 0.000 0.740 0.196 0.024 0.040
#> SRR1327702 1 0.4207 0.6448 0.712 0.244 0.000 0.024 0.000 0.020
#> SRR615611 2 0.3927 0.7035 0.056 0.820 0.000 0.064 0.044 0.016
#> SRR1486799 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.3710 0.5219 0.696 0.292 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR815044 2 0.4312 0.3772 0.396 0.584 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1338560 2 0.2976 0.7079 0.128 0.844 0.000 0.016 0.004 0.008
#> SRR615862 2 0.4274 0.6303 0.016 0.768 0.000 0.116 0.096 0.004
#> SRR1480038 2 0.3293 0.6899 0.196 0.788 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR659436 3 0.5535 -0.1939 0.000 0.000 0.460 0.012 0.092 0.436
#> SRR613699 6 0.6851 0.1357 0.000 0.256 0.000 0.048 0.324 0.372
#> SRR1436563 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.4313 -0.0344 0.504 0.480 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1330327 2 0.3295 0.6936 0.176 0.800 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1489950 5 0.1439 0.5479 0.000 0.012 0.008 0.012 0.952 0.016
#> SRR1431927 1 0.2122 0.8504 0.900 0.084 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1100588 3 0.0146 0.7738 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.6194 0.1830 0.484 0.356 0.000 0.112 0.000 0.048
#> SRR1318444 2 0.4869 0.5861 0.000 0.712 0.000 0.132 0.128 0.028
#> SRR600656 2 0.2314 0.7035 0.048 0.908 0.000 0.024 0.008 0.012
#> SRR658766 3 0.6039 0.3452 0.000 0.004 0.560 0.044 0.284 0.108
#> SRR655946 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.1296 0.8675 0.948 0.044 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1475104 3 0.4117 0.6747 0.000 0.000 0.752 0.188 0.024 0.036
#> SRR1406418 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.3197 0.7625 0.804 0.176 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1444120 2 0.4127 0.6969 0.184 0.760 0.000 0.028 0.016 0.012
#> SRR1471965 1 0.2420 0.8339 0.876 0.108 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR612695 4 0.6797 0.3906 0.000 0.008 0.080 0.472 0.316 0.124
#> SRR662498 6 0.4892 0.7221 0.000 0.000 0.100 0.000 0.272 0.628
#> SRR1376764 4 0.4672 0.5903 0.000 0.060 0.000 0.728 0.044 0.168
#> SRR1377006 5 0.6553 0.3696 0.000 0.160 0.020 0.252 0.532 0.036
#> SRR656860 2 0.3673 0.6847 0.028 0.832 0.000 0.064 0.064 0.012
#> SRR1480547 2 0.4263 0.7067 0.076 0.792 0.000 0.064 0.060 0.008
#> SRR1452515 5 0.2570 0.5190 0.000 0.000 0.076 0.016 0.884 0.024
#> SRR1324390 5 0.4682 0.4922 0.000 0.224 0.000 0.092 0.680 0.004
#> SRR615273 2 0.4292 0.7037 0.152 0.768 0.000 0.044 0.024 0.012
#> SRR601695 5 0.3567 0.4552 0.000 0.000 0.100 0.000 0.800 0.100
#> SRR820907 2 0.3470 0.7027 0.052 0.836 0.000 0.072 0.040 0.000
#> SRR812773 2 0.4034 0.5653 0.300 0.680 0.000 0.008 0.004 0.008
#> SRR1405984 2 0.3303 0.7009 0.044 0.848 0.000 0.060 0.048 0.000
#> SRR1472794 5 0.2574 0.5595 0.000 0.028 0.008 0.048 0.896 0.020
#> SRR1365448 2 0.7251 0.1497 0.276 0.376 0.000 0.248 0.000 0.100
#> SRR1095720 3 0.5291 0.5123 0.000 0.000 0.664 0.028 0.148 0.160
#> SRR1435626 5 0.6612 0.3196 0.000 0.128 0.016 0.276 0.524 0.056
#> SRR1080766 5 0.1477 0.5511 0.000 0.004 0.000 0.048 0.940 0.008
#> SRR1377862 1 0.0777 0.8721 0.972 0.024 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332299 3 0.5067 0.6303 0.000 0.000 0.684 0.168 0.124 0.024
#> SRR1467966 3 0.5292 0.6095 0.000 0.000 0.664 0.156 0.152 0.028
#> SRR1320579 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 2 0.3988 0.5286 0.324 0.660 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1326604 2 0.4472 0.5840 0.004 0.740 0.000 0.124 0.124 0.008
#> SRR1098879 4 0.4803 0.5602 0.000 0.000 0.080 0.720 0.040 0.160
#> SRR662245 6 0.5184 0.2411 0.000 0.000 0.432 0.000 0.088 0.480
#> SRR1074719 2 0.3303 0.7009 0.044 0.848 0.000 0.060 0.048 0.000
#> SRR816226 2 0.4213 0.6092 0.276 0.692 0.000 0.012 0.012 0.008
#> SRR601387 2 0.5466 0.3000 0.004 0.572 0.000 0.120 0.300 0.004
#> SRR614575 2 0.5124 0.4777 0.004 0.656 0.000 0.116 0.216 0.008
#> SRR1353900 2 0.5735 0.4241 0.000 0.612 0.000 0.132 0.216 0.040
#> SRR662906 5 0.4951 0.3461 0.000 0.000 0.168 0.020 0.692 0.120
#> SRR1350832 5 0.4886 0.4784 0.000 0.244 0.000 0.100 0.652 0.004
#> SRR1403280 2 0.4298 0.6914 0.048 0.788 0.000 0.076 0.080 0.008
#> SRR1313969 2 0.2905 0.6969 0.036 0.880 0.000 0.048 0.024 0.012
#> SRR1388528 2 0.7027 0.2277 0.272 0.424 0.000 0.220 0.000 0.084
#> SRR1452912 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.3734 0.6395 0.244 0.736 0.000 0.008 0.004 0.008
#> SRR655399 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.3757 0.6143 0.272 0.712 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR818901 3 0.5291 0.5123 0.000 0.000 0.664 0.028 0.148 0.160
#> SRR607067 2 0.4314 0.1031 0.484 0.500 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1391420 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.4295 0.6962 0.052 0.792 0.000 0.080 0.064 0.012
#> SRR661961 5 0.2589 0.5414 0.000 0.004 0.056 0.028 0.892 0.020
#> SRR658259 2 0.5346 0.5625 0.012 0.692 0.000 0.128 0.132 0.036
#> SRR1310476 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 5 0.3455 0.5630 0.000 0.076 0.044 0.024 0.844 0.012
#> SRR1365034 2 0.4076 0.4845 0.348 0.636 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1478053 5 0.5241 0.4437 0.000 0.288 0.000 0.104 0.600 0.008
#> SRR1475300 2 0.3219 0.6809 0.192 0.792 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1328101 5 0.1173 0.5547 0.000 0.016 0.000 0.016 0.960 0.008
#> SRR1322900 2 0.4845 0.6473 0.236 0.684 0.000 0.056 0.012 0.012
#> SRR1309942 5 0.2017 0.5375 0.000 0.008 0.048 0.004 0.920 0.020
#> SRR1345760 2 0.4255 0.4086 0.380 0.600 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1435418 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4557 0.6199 0.008 0.752 0.000 0.104 0.116 0.020
#> SRR1443436 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.1745 0.5264 0.000 0.000 0.056 0.000 0.924 0.020
#> SRR661469 2 0.6598 0.1239 0.000 0.500 0.004 0.068 0.292 0.136
#> SRR1500323 5 0.4228 0.4207 0.000 0.000 0.144 0.012 0.756 0.088
#> SRR1356705 2 0.3454 0.6552 0.224 0.760 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1464915 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.6606 0.2686 0.004 0.320 0.000 0.264 0.392 0.020
#> SRR1350435 1 0.2275 0.8411 0.888 0.096 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1389177 3 0.5113 0.6403 0.000 0.000 0.692 0.148 0.124 0.036
#> SRR1368072 2 0.5510 0.2523 0.004 0.552 0.000 0.116 0.324 0.004
#> SRR601815 5 0.5675 0.1163 0.000 0.432 0.000 0.120 0.440 0.008
#> SRR613330 1 0.0260 0.8739 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.5444 0.4775 0.000 0.244 0.008 0.112 0.624 0.012
#> SRR1394190 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.5841 0.4329 0.000 0.192 0.000 0.204 0.580 0.024
#> SRR1318839 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.2314 0.7035 0.048 0.908 0.000 0.024 0.008 0.012
#> SRR613126 5 0.4190 0.4261 0.000 0.000 0.140 0.012 0.760 0.088
#> SRR1089424 2 0.2465 0.7074 0.048 0.900 0.000 0.024 0.024 0.004
#> SRR1347214 2 0.5831 0.1086 0.004 0.492 0.000 0.132 0.364 0.008
#> SRR1309556 5 0.6531 0.2743 0.004 0.332 0.000 0.256 0.392 0.016
#> SRR1456027 1 0.0622 0.8676 0.980 0.012 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400551 5 0.6710 0.2004 0.000 0.108 0.016 0.336 0.476 0.064
#> SRR1320469 4 0.7862 0.1202 0.240 0.260 0.000 0.352 0.024 0.124
#> SRR614251 5 0.5555 0.5211 0.000 0.156 0.068 0.064 0.688 0.024
#> SRR1454310 5 0.5134 0.4634 0.000 0.256 0.000 0.108 0.628 0.008
#> SRR615105 5 0.3997 0.4500 0.000 0.000 0.108 0.008 0.776 0.108
#> SRR1433290 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR601671 2 0.3329 0.6658 0.220 0.768 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR663874 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR1409130 5 0.4887 0.3547 0.000 0.000 0.160 0.020 0.700 0.120
#> SRR659696 2 0.3935 0.6858 0.032 0.808 0.000 0.100 0.052 0.008
#> SRR1408249 1 0.3802 0.4875 0.676 0.312 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR663284 2 0.4373 0.7014 0.064 0.796 0.000 0.060 0.044 0.036
#> SRR1402794 5 0.6508 0.1373 0.000 0.000 0.196 0.208 0.528 0.068
#> SRR614852 2 0.3004 0.7020 0.144 0.832 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1348040 2 0.3337 0.7099 0.156 0.812 0.000 0.020 0.008 0.004
#> SRR1489610 2 0.3988 0.5286 0.324 0.660 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1488091 5 0.1616 0.5281 0.000 0.000 0.048 0.000 0.932 0.020
#> SRR1499566 2 0.3533 0.6443 0.236 0.748 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1361480 2 0.4155 0.6330 0.016 0.780 0.000 0.068 0.128 0.008
#> SRR1444501 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 5 0.5845 0.2757 0.000 0.368 0.000 0.152 0.472 0.008
#> SRR1388832 5 0.6759 0.2603 0.008 0.324 0.000 0.260 0.384 0.024
#> SRR1394637 1 0.6178 0.0874 0.452 0.396 0.000 0.104 0.000 0.048
#> SRR606974 5 0.6010 0.3440 0.004 0.340 0.000 0.140 0.500 0.016
#> SRR662918 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR817421 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3542 0.6922 0.036 0.836 0.000 0.072 0.052 0.004
#> SRR608264 3 0.0146 0.7738 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.6194 0.1830 0.484 0.356 0.000 0.112 0.000 0.048
#> SRR1454117 2 0.2897 0.7128 0.120 0.852 0.000 0.012 0.012 0.004
#> SRR1312684 1 0.2174 0.8465 0.896 0.088 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR615044 2 0.6520 0.1035 0.016 0.456 0.000 0.212 0.304 0.012
#> SRR1432743 3 0.5951 0.5184 0.000 0.000 0.592 0.144 0.216 0.048
#> SRR1388873 5 0.4376 0.5100 0.000 0.180 0.000 0.092 0.724 0.004
#> SRR1353517 1 0.1398 0.8644 0.940 0.052 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357148 5 0.6293 0.0918 0.000 0.004 0.288 0.172 0.508 0.028
#> SRR1406008 2 0.5060 0.5251 0.012 0.676 0.000 0.116 0.192 0.004
#> SRR1396786 5 0.1439 0.5479 0.000 0.012 0.008 0.012 0.952 0.016
#> SRR1446564 1 0.1082 0.8688 0.956 0.040 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318465 3 0.5479 0.5819 0.000 0.000 0.640 0.172 0.160 0.028
#> SRR1431083 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.3710 0.5219 0.696 0.292 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR655170 5 0.6024 0.2362 0.004 0.384 0.000 0.132 0.464 0.016
#> SRR1087825 2 0.2314 0.7035 0.048 0.908 0.000 0.024 0.008 0.012
#> SRR662019 4 0.7250 0.4578 0.000 0.032 0.156 0.484 0.248 0.080
#> SRR1349209 2 0.4869 0.5861 0.000 0.712 0.000 0.132 0.128 0.028
#> SRR1326161 5 0.6119 0.2037 0.000 0.384 0.000 0.184 0.420 0.012
#> SRR1345284 1 0.4308 0.0326 0.516 0.468 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1416672 1 0.2420 0.8339 0.876 0.108 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR663356 2 0.2899 0.7150 0.072 0.872 0.000 0.032 0.020 0.004
#> SRR1454328 5 0.0964 0.5408 0.000 0.004 0.012 0.000 0.968 0.016
#> SRR1489286 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.2389 0.8162 0.864 0.128 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1408183 3 0.5190 0.6219 0.000 0.000 0.676 0.156 0.140 0.028
#> SRR1084369 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660709 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR809444 1 0.2420 0.8321 0.876 0.108 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1089901 5 0.4073 0.5358 0.000 0.088 0.000 0.128 0.772 0.012
#> SRR1375774 1 0.1285 0.8656 0.944 0.052 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326292 2 0.7080 0.0867 0.344 0.376 0.000 0.188 0.000 0.092
#> SRR657139 2 0.6384 0.1882 0.364 0.452 0.000 0.136 0.000 0.048
#> SRR1440744 2 0.3972 0.5352 0.320 0.664 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1353555 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.6178 0.0874 0.452 0.396 0.000 0.104 0.000 0.048
#> SRR1452334 2 0.4557 0.6199 0.008 0.752 0.000 0.104 0.116 0.020
#> SRR1381775 1 0.0713 0.8721 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.2897 0.7128 0.120 0.852 0.000 0.012 0.012 0.004
#> SRR658989 4 0.7213 0.3562 0.000 0.000 0.176 0.400 0.300 0.124
#> SRR1353663 1 0.2174 0.8465 0.896 0.088 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR811771 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.2420 0.8339 0.876 0.108 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR815825 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819054 5 0.5674 0.1468 0.000 0.424 0.000 0.120 0.448 0.008
#> SRR1367988 2 0.3426 0.6869 0.192 0.784 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1331922 1 0.3847 0.4288 0.644 0.348 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR615479 2 0.4400 0.6944 0.184 0.744 0.000 0.040 0.024 0.008
#> SRR1375796 5 0.5555 0.5211 0.000 0.156 0.068 0.064 0.688 0.024
#> SRR1386991 5 0.5932 0.4247 0.000 0.216 0.000 0.196 0.564 0.024
#> SRR1355217 2 0.5367 0.6143 0.076 0.704 0.000 0.144 0.020 0.056
#> SRR1356290 5 0.6051 0.4126 0.000 0.280 0.004 0.160 0.536 0.020
#> SRR659507 5 0.3865 0.4470 0.000 0.000 0.132 0.008 0.784 0.076
#> SRR663296 2 0.5269 0.2914 0.380 0.532 0.000 0.008 0.000 0.080
#> SRR598044 2 0.2772 0.7038 0.036 0.884 0.000 0.028 0.048 0.004
#> SRR661155 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR1414727 5 0.6218 0.3897 0.000 0.272 0.004 0.192 0.512 0.020
#> SRR663477 1 0.2275 0.8411 0.888 0.096 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1354489 3 0.5247 0.6082 0.000 0.000 0.664 0.168 0.144 0.024
#> SRR1377800 5 0.6721 0.2200 0.000 0.108 0.020 0.328 0.484 0.060
#> SRR614611 5 0.1908 0.5598 0.000 0.020 0.000 0.044 0.924 0.012
#> SRR655052 2 0.4557 0.6199 0.008 0.752 0.000 0.104 0.116 0.020
#> SRR1478968 1 0.0622 0.8676 0.980 0.012 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1351280 2 0.5346 0.5625 0.012 0.692 0.000 0.128 0.132 0.036
#> SRR613951 2 0.4188 0.7075 0.140 0.776 0.000 0.056 0.020 0.008
#> SRR1418022 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.4869 0.5861 0.000 0.712 0.000 0.132 0.128 0.028
#> SRR1408161 1 0.3438 0.7477 0.788 0.184 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR657054 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR655040 2 0.3957 0.5867 0.284 0.696 0.000 0.008 0.004 0.008
#> SRR810225 2 0.5159 0.4382 0.004 0.636 0.000 0.116 0.240 0.004
#> SRR1325377 2 0.2772 0.7038 0.036 0.884 0.000 0.028 0.048 0.004
#> SRR617829 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 5 0.1461 0.5363 0.000 0.000 0.044 0.000 0.940 0.016
#> SRR1480455 5 0.4887 0.3547 0.000 0.000 0.160 0.020 0.700 0.120
#> SRR1442104 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.3816 0.7639 0.784 0.160 0.000 0.032 0.000 0.024
#> SRR1481396 3 0.4117 0.6747 0.000 0.000 0.752 0.188 0.024 0.036
#> SRR1414314 5 0.4200 0.5172 0.000 0.164 0.000 0.088 0.744 0.004
#> SRR663026 2 0.5410 0.4175 0.008 0.620 0.000 0.116 0.248 0.008
#> SRR1478386 1 0.4102 0.3870 0.628 0.356 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1458683 5 0.5929 0.2278 0.000 0.000 0.192 0.044 0.596 0.168
#> SRR1370572 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.4165 0.2258 0.452 0.536 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1310735 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.2467 0.7074 0.088 0.884 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR660260 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR1071231 2 0.3303 0.7009 0.044 0.848 0.000 0.060 0.048 0.000
#> SRR1459125 2 0.3641 0.7152 0.148 0.804 0.000 0.024 0.016 0.008
#> SRR1337173 5 0.4616 0.4922 0.000 0.008 0.108 0.080 0.760 0.044
#> SRR1396250 3 0.0713 0.7676 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR2166376 6 0.5175 0.2724 0.000 0.000 0.420 0.000 0.088 0.492
#> SRR659816 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR1401379 2 0.3988 0.5286 0.324 0.660 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR600981 2 0.3711 0.6942 0.032 0.828 0.000 0.084 0.044 0.012
#> SRR1398335 1 0.2122 0.8504 0.900 0.084 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1397218 2 0.3533 0.6443 0.236 0.748 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR660115 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 5 0.5751 0.4032 0.000 0.312 0.000 0.156 0.524 0.008
#> SRR1359780 5 0.2017 0.5375 0.000 0.008 0.048 0.004 0.920 0.020
#> SRR1490037 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.1429 0.8654 0.940 0.052 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1410221 5 0.2776 0.5633 0.000 0.032 0.008 0.056 0.884 0.020
#> SRR1319648 2 0.4370 0.6966 0.060 0.784 0.000 0.080 0.068 0.008
#> SRR1092985 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.3972 0.6569 0.232 0.732 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1468658 5 0.5758 0.3258 0.000 0.008 0.168 0.040 0.640 0.144
#> SRR1390437 2 0.4314 0.1031 0.484 0.500 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR658057 2 0.4472 0.5840 0.004 0.740 0.000 0.124 0.124 0.008
#> SRR612635 2 0.2465 0.7074 0.048 0.900 0.000 0.024 0.024 0.004
#> SRR1351480 2 0.2976 0.7079 0.128 0.844 0.000 0.016 0.004 0.008
#> SRR1436651 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1643 0.8591 0.924 0.068 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR659590 2 0.5823 -0.0382 0.004 0.456 0.000 0.124 0.408 0.008
#> SRR614263 1 0.2734 0.7981 0.840 0.148 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1409575 2 0.3329 0.6658 0.220 0.768 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR659911 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR1085519 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 5 0.5841 0.2423 0.000 0.000 0.192 0.040 0.604 0.164
#> SRR1442928 5 0.1173 0.5547 0.000 0.016 0.000 0.016 0.960 0.008
#> SRR1464681 2 0.2314 0.7035 0.048 0.908 0.000 0.024 0.008 0.012
#> SRR1418880 1 0.2420 0.8333 0.876 0.108 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1309070 5 0.4616 0.4922 0.000 0.008 0.108 0.080 0.760 0.044
#> SRR1365426 2 0.3007 0.7111 0.140 0.836 0.000 0.012 0.008 0.004
#> SRR1487947 2 0.6861 0.0975 0.360 0.388 0.000 0.184 0.000 0.068
#> SRR659708 2 0.5826 0.4948 0.288 0.584 0.000 0.084 0.012 0.032
#> SRR603236 5 0.4287 0.4457 0.000 0.000 0.108 0.028 0.768 0.096
#> SRR660673 1 0.2420 0.8339 0.876 0.108 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1430729 2 0.5520 0.2567 0.004 0.556 0.000 0.120 0.316 0.004
#> SRR663807 5 0.4682 0.4922 0.000 0.224 0.000 0.092 0.680 0.004
#> SRR1087245 2 0.4348 0.5936 0.004 0.752 0.000 0.124 0.112 0.008
#> SRR1339108 2 0.2658 0.7143 0.072 0.884 0.000 0.016 0.024 0.004
#> SRR613426 2 0.4488 0.1173 0.468 0.508 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR613879 2 0.3799 0.6299 0.004 0.796 0.000 0.104 0.092 0.004
#> SRR1385101 2 0.3301 0.6693 0.216 0.772 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1387966 5 0.4376 0.5100 0.000 0.180 0.000 0.092 0.724 0.004
#> SRR1458852 5 0.2017 0.5375 0.000 0.008 0.048 0.004 0.920 0.020
#> SRR1430489 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.1701 0.8562 0.920 0.072 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1376249 3 0.3352 0.7013 0.000 0.000 0.812 0.148 0.008 0.032
#> SRR1321987 5 0.1168 0.5375 0.000 0.000 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR662653 5 0.1168 0.5375 0.000 0.000 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR1390027 1 0.0405 0.8736 0.988 0.008 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098474 2 0.5718 0.2119 0.000 0.520 0.000 0.168 0.308 0.004
#> SRR1383081 2 0.3687 0.6719 0.020 0.820 0.000 0.084 0.072 0.004
#> SRR2166960 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR605101 2 0.2986 0.7157 0.112 0.852 0.000 0.012 0.020 0.004
#> SRR818600 5 0.5254 0.4832 0.000 0.172 0.012 0.044 0.696 0.076
#> SRR1367715 2 0.3426 0.6567 0.220 0.764 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1351979 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.4182 0.6944 0.000 0.000 0.768 0.148 0.052 0.032
#> SRR1322662 1 0.0363 0.8739 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 6 0.3489 0.8059 0.000 0.000 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR612767 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 5 0.5095 0.4649 0.000 0.256 0.000 0.104 0.632 0.008
#> SRR1430375 5 0.4228 0.4207 0.000 0.000 0.144 0.012 0.756 0.088
#> SRR615225 2 0.3713 0.6903 0.032 0.824 0.000 0.092 0.044 0.008
#> SRR1401839 2 0.5759 0.1035 0.000 0.488 0.000 0.140 0.364 0.008
#> SRR1379110 2 0.4161 0.4278 0.376 0.608 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1077288 3 0.1155 0.7554 0.000 0.000 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1331639 2 0.2314 0.7035 0.048 0.908 0.000 0.024 0.008 0.012
#> SRR1342782 2 0.4395 0.6126 0.016 0.752 0.000 0.080 0.148 0.004
#> SRR1443003 3 0.3959 0.7008 0.000 0.000 0.784 0.140 0.052 0.024
#> SRR612839 1 0.5370 0.5452 0.636 0.248 0.000 0.068 0.000 0.048
#> SRR1470093 5 0.6938 -0.1091 0.000 0.000 0.296 0.236 0.404 0.064
#> SRR1395742 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 5 0.5841 0.2423 0.000 0.000 0.192 0.040 0.604 0.164
#> SRR664063 2 0.5050 0.6729 0.124 0.736 0.000 0.044 0.028 0.068
#> SRR1488214 1 0.3940 0.4633 0.652 0.336 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR654766 2 0.3426 0.6869 0.192 0.784 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1320321 2 0.2976 0.7079 0.128 0.844 0.000 0.016 0.004 0.008
#> SRR1071955 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4348 0.5936 0.004 0.752 0.000 0.124 0.112 0.008
#> SRR1488470 2 0.4263 0.7067 0.076 0.792 0.000 0.064 0.060 0.008
#> SRR1389497 3 0.0000 0.7743 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.6125 0.2764 0.000 0.000 0.468 0.164 0.348 0.020
#> SRR615311 1 0.0000 0.8735 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.987 0.995 0.4984 0.502 0.502
#> 3 3 0.899 0.897 0.958 0.3073 0.668 0.437
#> 4 4 0.935 0.903 0.960 0.1254 0.761 0.440
#> 5 5 0.774 0.682 0.835 0.0647 0.941 0.788
#> 6 6 0.741 0.625 0.760 0.0427 0.903 0.617
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1380716 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1084417 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1105057 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1409263 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1334889 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614839 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1334512 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1404837 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1375509 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR612227 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1413872 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1358220 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1096662 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809595 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1478362 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1392186 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.0938 0.982 0.988 0.012
#> SRR612683 1 0.9881 0.232 0.564 0.436
#> SRR1392901 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR813656 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1489307 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1383259 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1361546 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR1486156 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1342739 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR662126 1 0.9635 0.371 0.612 0.388
#> SRR1464601 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR612539 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR602010 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR810249 2 0.9896 0.207 0.440 0.560
#> SRR818773 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1368117 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1334247 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613222 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1459937 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR661074 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1405123 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661096 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1466512 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1353924 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1314832 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR627431 1 0.2603 0.950 0.956 0.044
#> SRR1418561 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1309702 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR1435311 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.8207 0.653 0.256 0.744
#> SRR1323152 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1429265 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615611 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR815044 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1338560 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615862 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1480038 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615323 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1330327 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1318444 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR600656 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR656860 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1480547 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR820907 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1405984 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1319710 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1074719 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR601387 1 0.9170 0.507 0.668 0.332
#> SRR614575 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1403280 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1313969 1 0.2423 0.954 0.960 0.040
#> SRR1388528 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR818901 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1384138 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661961 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1365034 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1475300 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1345760 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1402172 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1356705 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1432390 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1089424 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1400551 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR601671 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1408249 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR663284 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR614852 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1348040 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1489610 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1499566 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1361480 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1381348 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1454117 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1432743 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1406008 1 0.7219 0.751 0.800 0.200
#> SRR1396786 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1087825 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR662019 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1349209 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1345284 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR663356 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1440744 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452334 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1319626 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1367988 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1355217 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR598044 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR655052 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR613951 1 0.0672 0.986 0.992 0.008
#> SRR1418022 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.6048 0.824 0.148 0.852
#> SRR1408161 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR655040 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1325377 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1481396 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR663026 1 0.1843 0.967 0.972 0.028
#> SRR1478386 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1440101 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1071231 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1459125 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1401379 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR600981 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1319648 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390437 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR612635 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1351480 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1409575 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1464681 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1339108 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1376249 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1383081 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR605101 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1367715 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1379110 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1077288 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1331639 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1342782 1 0.4562 0.892 0.904 0.096
#> SRR1443003 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR654766 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1320321 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1394231 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1488470 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.6192 0.2914 0.000 0.420 0.580
#> SRR1074359 3 0.5621 0.5996 0.000 0.308 0.692
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 3 0.3412 0.8350 0.000 0.124 0.876
#> SRR1499740 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4842 0.7243 0.000 0.224 0.776
#> SRR612215 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.3551 0.8187 0.132 0.868 0.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 2 0.2711 0.8704 0.000 0.912 0.088
#> SRR1402153 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.1529 0.9168 0.000 0.960 0.040
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329003 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.2261 0.9011 0.932 0.068 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.2625 0.8747 0.000 0.916 0.084
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR615814 3 0.5431 0.6394 0.000 0.284 0.716
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.1860 0.9059 0.000 0.948 0.052
#> SRR1358220 2 0.0592 0.9400 0.012 0.988 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.6008 0.4106 0.372 0.628 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 3 0.5591 0.6066 0.000 0.304 0.696
#> SRR809595 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.6307 -0.0356 0.000 0.512 0.488
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.2796 0.8645 0.000 0.092 0.908
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392186 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.6111 0.3253 0.000 0.604 0.396
#> SRR656247 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 1 0.0592 0.9598 0.988 0.012 0.000
#> SRR1387240 2 0.5138 0.6409 0.000 0.748 0.252
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR1435248 2 0.5016 0.6620 0.000 0.760 0.240
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.4605 0.7246 0.204 0.796 0.000
#> SRR1330854 1 0.6252 0.2150 0.556 0.444 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 3 0.4346 0.7723 0.000 0.184 0.816
#> SRR615635 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071594 3 0.5397 0.6456 0.000 0.280 0.720
#> SRR612539 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0237 0.9466 0.000 0.996 0.004
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.0237 0.9332 0.000 0.004 0.996
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418561 2 0.4605 0.7215 0.000 0.796 0.204
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.4702 0.7078 0.000 0.788 0.212
#> SRR603116 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.6062 0.3747 0.616 0.384 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR815044 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330327 1 0.6180 0.2814 0.584 0.416 0.000
#> SRR1489950 2 0.1163 0.9273 0.000 0.972 0.028
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR658766 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.6062 0.4096 0.000 0.384 0.616
#> SRR656860 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR601695 3 0.5591 0.6066 0.000 0.304 0.696
#> SRR820907 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.2165 0.8951 0.000 0.936 0.064
#> SRR1365448 2 0.6307 0.0235 0.488 0.512 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.5098 0.6480 0.000 0.752 0.248
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.5016 0.6810 0.760 0.240 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.5178 0.6451 0.256 0.744 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4931 0.6753 0.000 0.768 0.232
#> SRR1365034 2 0.6180 0.2780 0.416 0.584 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 1 0.5591 0.5600 0.696 0.304 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322900 2 0.2165 0.8898 0.064 0.936 0.000
#> SRR1309942 3 0.5621 0.5996 0.000 0.308 0.692
#> SRR1345760 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0237 0.9467 0.000 0.996 0.004
#> SRR1500323 3 0.5621 0.5996 0.000 0.308 0.692
#> SRR1356705 1 0.6309 0.0148 0.504 0.496 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.5810 0.4950 0.000 0.336 0.664
#> SRR1320469 2 0.4654 0.7228 0.208 0.792 0.000
#> SRR614251 3 0.5497 0.6266 0.000 0.292 0.708
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.2796 0.8660 0.000 0.908 0.092
#> SRR601671 2 0.6302 0.0791 0.480 0.520 0.000
#> SRR663874 2 0.2796 0.8660 0.000 0.908 0.092
#> SRR1409130 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348040 2 0.0237 0.9464 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489610 1 0.6026 0.3962 0.624 0.376 0.000
#> SRR1488091 3 0.5988 0.4731 0.000 0.368 0.632
#> SRR1499566 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 2 0.2711 0.8704 0.000 0.912 0.088
#> SRR817421 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.5016 0.6619 0.000 0.760 0.240
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR662019 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.6154 0.2618 0.000 0.592 0.408
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.3116 0.8486 0.000 0.892 0.108
#> SRR809444 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR657139 1 0.6267 0.1891 0.548 0.452 0.000
#> SRR1440744 2 0.4654 0.7185 0.208 0.792 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.3686 0.8076 0.140 0.860 0.000
#> SRR1375796 2 0.5216 0.6263 0.000 0.740 0.260
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356290 2 0.2537 0.8787 0.000 0.920 0.080
#> SRR659507 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0424 0.9636 0.992 0.008 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0237 0.9466 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414727 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.5327 0.6028 0.000 0.728 0.272
#> SRR655052 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.4974 0.6746 0.236 0.764 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480455 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR660260 3 0.6305 0.1318 0.000 0.484 0.516
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.4702 0.7395 0.000 0.212 0.788
#> SRR1401379 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 3 0.5621 0.5996 0.000 0.308 0.692
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 3 0.6252 0.2681 0.000 0.444 0.556
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.2711 0.8704 0.000 0.912 0.088
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.2537 0.8788 0.000 0.920 0.080
#> SRR1464681 2 0.2796 0.8643 0.092 0.908 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.5988 0.4270 0.632 0.368 0.000
#> SRR659708 1 0.6111 0.3561 0.604 0.396 0.000
#> SRR603236 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.4796 0.7000 0.220 0.780 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 2 0.6252 0.1958 0.444 0.556 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 3 0.5621 0.5996 0.000 0.308 0.692
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 3 0.5621 0.5996 0.000 0.308 0.692
#> SRR662653 3 0.5760 0.5607 0.000 0.328 0.672
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0424 0.9436 0.000 0.992 0.008
#> SRR1367715 1 0.0237 0.9673 0.996 0.004 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.5465 0.5707 0.000 0.712 0.288
#> SRR612767 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.2448 0.8783 0.000 0.076 0.924
#> SRR615225 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379110 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9497 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9361 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1380716 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612803 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 4 0.6795 0.0205 0.000 0.096 0.432 0.472
#> SRR1074359 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403366 4 0.4941 0.2248 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR665262 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1499740 4 0.4790 0.4037 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1105057 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 4 0.0376 0.9186 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR612215 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1409263 3 0.5151 0.1247 0.000 0.004 0.532 0.464
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614839 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658433 4 0.4040 0.6491 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1088581 4 0.4624 0.4945 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471117 1 0.3837 0.7074 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660066 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1447103 4 0.0000 0.9200 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.1022 0.9371 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR655887 2 0.4977 0.1367 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 4 0.0188 0.9181 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1074670 4 0.4720 0.5001 0.000 0.004 0.324 0.672
#> SRR1375439 4 0.0592 0.9130 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1329003 2 0.0469 0.9550 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 4 0.0376 0.9186 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1388809 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1413872 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.4992 0.0656 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR615814 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 4 0.0188 0.9181 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1358220 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096662 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR660164 4 0.4898 0.2998 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR815783 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR809595 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403133 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR815470 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1478362 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1392186 2 0.0817 0.9454 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612683 2 0.0336 0.9582 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1392901 3 0.4661 0.4608 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1077805 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360402 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 4 0.3402 0.7650 0.000 0.004 0.164 0.832
#> SRR656247 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808244 2 0.2266 0.8825 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR1387240 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1435248 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1419110 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1408682 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453911 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR603164 4 0.1867 0.8701 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR1383259 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1330854 2 0.1978 0.8996 0.068 0.928 0.000 0.004
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.1302 0.9281 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 4 0.1978 0.8707 0.000 0.004 0.068 0.928
#> SRR1361546 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR615635 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1385411 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1464601 4 0.4730 0.4251 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1071594 4 0.0376 0.9186 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR612539 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR602010 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR810249 2 0.1637 0.9112 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR818773 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1442754 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1459937 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR809348 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.4155 0.6726 0.000 0.004 0.756 0.240
#> SRR661074 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.0000 0.9592 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661096 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 2 0.1792 0.9061 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1307677 4 0.4040 0.6511 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1466512 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658212 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.0592 0.9130 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1353924 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1314832 3 0.5151 0.1247 0.000 0.004 0.532 0.464
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418561 4 0.2342 0.8542 0.000 0.008 0.080 0.912
#> SRR1448029 4 0.0592 0.9140 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR813802 1 0.3688 0.7300 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435311 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612395 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR603116 2 0.4961 0.1706 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1323152 4 0.5126 0.1895 0.000 0.004 0.444 0.552
#> SRR1368264 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.1792 0.9104 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0188 0.9842 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615862 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480038 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659436 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613699 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.2149 0.8840 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1489950 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.9592 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600656 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658766 4 0.3157 0.7915 0.000 0.004 0.144 0.852
#> SRR655946 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 4 0.4122 0.6593 0.000 0.004 0.236 0.760
#> SRR662498 4 0.3942 0.6679 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1376764 3 0.1661 0.9106 0.000 0.004 0.944 0.052
#> SRR1377006 4 0.0188 0.9181 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR656860 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480547 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452515 4 0.0336 0.9180 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1324390 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR615273 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR601695 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR820907 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR812773 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472794 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1365448 2 0.1398 0.9272 0.040 0.956 0.000 0.004
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 4 0.0188 0.9181 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1080766 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319710 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1326604 4 0.4356 0.5865 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1098879 3 0.0376 0.9515 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR662245 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR816226 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.1118 0.9348 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR614575 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353900 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR662906 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350832 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1403280 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313969 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1388528 2 0.4088 0.6912 0.232 0.764 0.000 0.004
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR607067 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR661961 4 0.1389 0.8904 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR658259 2 0.5000 -0.0247 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1365034 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1478053 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1475300 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1328101 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1322900 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309942 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1345760 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 4 0.3486 0.7383 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR661469 4 0.0000 0.9200 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500323 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1356705 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 4 0.0188 0.9181 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368072 4 0.0336 0.9188 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR601815 4 0.3837 0.6815 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR613330 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 4 0.0188 0.9181 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613126 4 0.0469 0.9162 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1089424 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347214 4 0.0592 0.9130 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1309556 2 0.3942 0.6805 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 4 0.0524 0.9148 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1320469 2 0.0376 0.9562 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR614251 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1454310 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR615105 4 0.1389 0.8895 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR601671 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663874 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1409130 4 0.1557 0.8828 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR659696 2 0.2081 0.8839 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1408249 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1402794 3 0.4193 0.6273 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR614852 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1348040 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489610 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488091 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1499566 2 0.3123 0.8049 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415773 4 0.0592 0.9130 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1388832 4 0.0469 0.9159 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1394637 1 0.3610 0.7409 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR606974 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR662918 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR817421 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR608264 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.3569 0.7465 0.804 0.196 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 4 0.3400 0.7390 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388873 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 4 0.4992 0.0903 0.000 0.000 0.476 0.524
#> SRR1406008 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396786 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0188 0.9842 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR655170 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1087825 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662019 4 0.5112 0.2079 0.000 0.004 0.436 0.560
#> SRR1349209 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1326161 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1345284 2 0.4543 0.5372 0.324 0.676 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454328 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR809444 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 2 0.0469 0.9550 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR657139 2 0.1576 0.9197 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR1440744 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.3528 0.7517 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658989 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819054 4 0.0469 0.9160 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1367988 2 0.4585 0.5223 0.332 0.668 0.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.0376 0.9580 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1375796 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1386991 4 0.1637 0.8728 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1355217 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1356290 4 0.0000 0.9200 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659507 4 0.0336 0.9180 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR663296 2 0.1557 0.9170 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR661155 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1414727 4 0.0188 0.9181 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR663477 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377800 4 0.2530 0.8363 0.000 0.004 0.100 0.896
#> SRR614611 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR655052 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.3444 0.7621 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR613951 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.3172 0.7924 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR655040 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR810225 4 0.4948 0.2202 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1325377 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR617829 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402328 4 0.0336 0.9180 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1480455 4 0.4998 0.0556 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414314 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR663026 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1478386 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.3528 0.7493 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR660260 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1071231 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1459125 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337173 4 0.4877 0.3081 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0469 0.9476 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR659816 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1401379 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR600981 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1359780 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1319648 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1468658 4 0.0376 0.9186 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1390437 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR658057 4 0.4304 0.6010 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR612635 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1351480 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR614263 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659911 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1442928 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1464681 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 4 0.0376 0.9186 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1365426 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487947 2 0.1824 0.9078 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR659708 2 0.0188 0.9574 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR603236 4 0.0336 0.9180 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR660673 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 4 0.3569 0.7176 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR663807 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1087245 4 0.2011 0.8530 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1339108 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR613426 2 0.4304 0.6174 0.284 0.716 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.4406 0.5622 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1385101 2 0.0188 0.9594 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1387966 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1458852 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321987 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR662653 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.1716 0.9051 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1383081 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2166960 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR605101 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818600 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1367715 2 0.0336 0.9574 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR612767 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 4 0.0188 0.9210 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1430375 4 0.0188 0.9203 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR615225 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1401839 4 0.0707 0.9098 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1379110 2 0.0817 0.9454 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1342782 2 0.1211 0.9311 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 4 0.4999 0.0287 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR664063 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 2 0.2408 0.8665 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488470 2 0.0188 0.9607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9572 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.4304 0.5954 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR615311 1 0.0000 0.9887 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.3707 0.610235 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1380716 4 0.0609 0.738590 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR612803 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.4337 0.712911 0.748 0.000 0.000 0.196 0.056
#> SRR1084417 5 0.4068 0.497910 0.000 0.108 0.036 0.040 0.816
#> SRR1074359 2 0.0510 0.772683 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1419258 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 2 0.5756 0.425214 0.000 0.620 0.204 0.000 0.176
#> SRR665262 2 0.0609 0.774842 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1499740 5 0.3471 0.524109 0.000 0.092 0.000 0.072 0.836
#> SRR1105057 4 0.3707 0.588478 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1439742 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.776479 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612215 2 0.1792 0.765460 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1094051 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 5 0.4114 0.309174 0.000 0.000 0.000 0.376 0.624
#> SRR1409263 5 0.6349 -0.023326 0.000 0.416 0.160 0.000 0.424
#> SRR1431288 1 0.4337 0.712911 0.748 0.000 0.000 0.196 0.056
#> SRR1334889 5 0.4235 0.101446 0.000 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR614839 4 0.2074 0.692096 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR658433 2 0.1582 0.760881 0.000 0.944 0.028 0.000 0.028
#> SRR1088581 5 0.2818 0.468436 0.000 0.132 0.000 0.012 0.856
#> SRR1328797 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 4 0.3395 0.630300 0.000 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1471117 5 0.6805 0.154596 0.344 0.000 0.000 0.296 0.360
#> SRR1311553 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4387 0.511532 0.000 0.640 0.000 0.012 0.348
#> SRR1354955 3 0.3284 0.838661 0.000 0.024 0.828 0.000 0.148
#> SRR654802 3 0.1818 0.888386 0.000 0.024 0.932 0.000 0.044
#> SRR660066 2 0.3752 0.602179 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1447103 2 0.1197 0.776299 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1402153 5 0.3391 0.481883 0.000 0.012 0.000 0.188 0.800
#> SRR655887 5 0.6771 0.121342 0.000 0.272 0.000 0.360 0.368
#> SRR1408529 3 0.1818 0.888386 0.000 0.024 0.932 0.000 0.044
#> SRR658707 1 0.4269 0.724318 0.756 0.000 0.000 0.188 0.056
#> SRR1384371 2 0.3612 0.602746 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1074670 5 0.4872 0.005408 0.000 0.436 0.024 0.000 0.540
#> SRR1375439 2 0.4416 0.498984 0.000 0.632 0.000 0.012 0.356
#> SRR1329003 4 0.4138 0.174188 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1404837 4 0.2230 0.704631 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1317920 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.3816 0.326512 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR613999 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612227 2 0.2813 0.669018 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1388809 2 0.1197 0.776188 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1413872 4 0.2127 0.717108 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1452864 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 5 0.3180 0.527586 0.000 0.076 0.000 0.068 0.856
#> SRR615814 2 0.0794 0.773730 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1325225 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.1341 0.776719 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1358220 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096662 4 0.0000 0.736104 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660164 4 0.6685 -0.095632 0.000 0.236 0.000 0.384 0.380
#> SRR815783 2 0.0510 0.775247 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR809595 4 0.1341 0.724254 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1403133 2 0.3452 0.651796 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR815470 2 0.0290 0.776064 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1344382 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0510 0.772683 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1478362 4 0.3837 0.572358 0.000 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1392186 4 0.1121 0.709027 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1347937 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.4337 0.712911 0.748 0.000 0.000 0.196 0.056
#> SRR1471594 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 5 0.3561 0.420607 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR612683 4 0.4511 0.463025 0.000 0.016 0.000 0.628 0.356
#> SRR1392901 2 0.4609 0.583455 0.000 0.744 0.104 0.000 0.152
#> SRR1077805 3 0.3531 0.830344 0.000 0.036 0.816 0.000 0.148
#> SRR1360402 2 0.4015 0.530555 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1406112 3 0.1741 0.889634 0.000 0.024 0.936 0.000 0.040
#> SRR1355352 5 0.3789 0.368551 0.000 0.224 0.016 0.000 0.760
#> SRR656247 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 4 0.3752 0.578509 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR808244 4 0.5556 -0.139769 0.068 0.000 0.000 0.476 0.456
#> SRR1387240 2 0.1197 0.776188 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1408595 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0794 0.725164 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1435248 2 0.1043 0.777219 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1419110 2 0.3796 0.590769 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1408682 2 0.3424 0.655557 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1317134 1 0.1043 0.931696 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1370780 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453911 2 0.4045 0.519474 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR603164 2 0.3183 0.667851 0.000 0.828 0.016 0.000 0.156
#> SRR1383259 4 0.0290 0.733882 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1330854 5 0.4473 0.258834 0.008 0.000 0.000 0.412 0.580
#> SRR1452423 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 4 0.0451 0.730967 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1468162 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.2891 0.661893 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1361546 4 0.3857 0.561681 0.000 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1486156 1 0.3427 0.826288 0.836 0.000 0.000 0.108 0.056
#> SRR660545 2 0.0510 0.774677 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR615635 2 0.1965 0.760169 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1385411 5 0.4138 0.139772 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1342739 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662126 4 0.4397 0.379315 0.000 0.004 0.000 0.564 0.432
#> SRR1464601 2 0.3779 0.630903 0.000 0.776 0.200 0.000 0.024
#> SRR1071594 2 0.2074 0.731401 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR612539 4 0.3816 0.571512 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR602010 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR810249 4 0.5341 0.371775 0.000 0.064 0.000 0.580 0.356
#> SRR818773 4 0.2605 0.663935 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1336569 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 4 0.3752 0.579728 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1442754 5 0.3983 0.353186 0.000 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1334247 3 0.3284 0.838661 0.000 0.024 0.828 0.000 0.148
#> SRR661639 1 0.2209 0.901016 0.912 0.000 0.000 0.032 0.056
#> SRR613222 4 0.3177 0.577167 0.000 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1459937 4 0.0703 0.727521 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR2185018 1 0.1845 0.912149 0.928 0.000 0.000 0.016 0.056
#> SRR655732 2 0.4517 0.478651 0.000 0.600 0.000 0.012 0.388
#> SRR809348 1 0.0880 0.936007 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR819261 3 0.6546 0.272820 0.000 0.376 0.424 0.000 0.200
#> SRR661074 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.4074 0.234334 0.000 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR661096 1 0.0290 0.947554 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4403 0.157075 0.008 0.000 0.000 0.608 0.384
#> SRR1307677 5 0.6804 0.203720 0.000 0.324 0.000 0.304 0.372
#> SRR1466512 4 0.0609 0.738590 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR658212 2 0.1908 0.772982 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1430525 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344422 5 0.3642 0.353309 0.000 0.232 0.000 0.008 0.760
#> SRR1353924 4 0.0609 0.738590 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1314832 5 0.5036 0.225699 0.000 0.320 0.052 0.000 0.628
#> SRR1487570 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 4 0.3730 0.584732 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1418561 5 0.4030 0.173107 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1448029 2 0.2690 0.678853 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR813802 5 0.6773 0.149288 0.344 0.000 0.000 0.276 0.380
#> SRR815020 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 4 0.3796 0.571487 0.000 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1435311 4 0.0510 0.738815 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR612395 2 0.1121 0.777878 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR603116 4 0.6661 -0.039257 0.000 0.232 0.000 0.412 0.356
#> SRR1323152 2 0.5848 0.400519 0.000 0.608 0.192 0.000 0.200
#> SRR1368264 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326624 1 0.2592 0.884320 0.892 0.000 0.000 0.052 0.056
#> SRR1429265 3 0.3284 0.838661 0.000 0.024 0.828 0.000 0.148
#> SRR1327702 1 0.4693 0.633757 0.700 0.000 0.000 0.244 0.056
#> SRR615611 4 0.3730 0.587323 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1486799 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.2660 0.836972 0.864 0.000 0.000 0.128 0.008
#> SRR815044 4 0.0404 0.731949 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1338560 4 0.0880 0.737439 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR615862 4 0.3707 0.588305 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1480038 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR659436 3 0.1915 0.887394 0.000 0.032 0.928 0.000 0.040
#> SRR613699 2 0.1671 0.773596 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1436563 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.0671 0.727527 0.016 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1330327 4 0.0703 0.727521 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1489950 2 0.1544 0.771103 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1431927 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.5817 0.510654 0.612 0.000 0.000 0.204 0.184
#> SRR1318444 4 0.3983 0.251755 0.000 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR600656 4 0.1043 0.732702 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR658766 2 0.3596 0.632438 0.000 0.776 0.012 0.000 0.212
#> SRR655946 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.3904 0.811262 0.000 0.052 0.792 0.000 0.156
#> SRR1406418 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.4269 0.724318 0.756 0.000 0.000 0.188 0.056
#> SRR1444120 4 0.1043 0.730566 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1471965 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 2 0.4740 0.164389 0.000 0.516 0.016 0.000 0.468
#> SRR662498 2 0.1943 0.756382 0.000 0.924 0.020 0.000 0.056
#> SRR1376764 3 0.6371 0.453387 0.000 0.292 0.508 0.000 0.200
#> SRR1377006 2 0.4305 0.157372 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR656860 4 0.3508 0.614009 0.000 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1480547 4 0.3561 0.607605 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1452515 2 0.0794 0.770453 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1324390 2 0.3336 0.666109 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR615273 5 0.4256 0.173746 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR601695 2 0.0510 0.772683 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR820907 4 0.3774 0.575021 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR812773 4 0.0880 0.718362 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1405984 4 0.1792 0.722659 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1472794 2 0.1270 0.775645 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1365448 5 0.4449 0.127793 0.004 0.000 0.000 0.484 0.512
#> SRR1095720 3 0.1818 0.888386 0.000 0.024 0.932 0.000 0.044
#> SRR1435626 2 0.3395 0.626423 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1080766 2 0.1121 0.776875 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1377862 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0794 0.900480 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1320579 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326604 5 0.6756 0.106525 0.000 0.264 0.000 0.368 0.368
#> SRR1098879 3 0.3779 0.797933 0.000 0.024 0.776 0.000 0.200
#> SRR662245 3 0.0404 0.900212 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1074719 4 0.3816 0.567826 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR816226 4 0.1908 0.671775 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR601387 4 0.4977 0.419899 0.000 0.040 0.000 0.604 0.356
#> SRR614575 2 0.4482 0.485232 0.000 0.612 0.000 0.012 0.376
#> SRR1353900 2 0.4030 0.528299 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR662906 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350832 2 0.3707 0.610235 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1403280 4 0.3774 0.579731 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1313969 4 0.3561 0.616119 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1388528 5 0.5959 0.202053 0.108 0.000 0.000 0.420 0.472
#> SRR1452912 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.0162 0.734572 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655399 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 4 0.0000 0.736104 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818901 3 0.1661 0.890741 0.000 0.024 0.940 0.000 0.036
#> SRR607067 4 0.0404 0.731949 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1391420 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.3816 0.569898 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR661961 2 0.2773 0.676687 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR658259 4 0.6439 0.000262 0.000 0.176 0.000 0.420 0.404
#> SRR1310476 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.1197 0.776188 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1365034 4 0.0000 0.736104 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.4387 0.511532 0.000 0.640 0.000 0.012 0.348
#> SRR1475300 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1328101 2 0.3966 0.547097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1322900 4 0.4227 0.078232 0.000 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1309942 2 0.0162 0.775848 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345760 4 0.1043 0.719194 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1435418 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.3774 0.585798 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1443436 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1216 0.767076 0.000 0.960 0.020 0.000 0.020
#> SRR661469 2 0.1908 0.772491 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1500323 2 0.0000 0.776479 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464915 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 5 0.3242 0.381069 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1350435 1 0.1484 0.923008 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR1389177 3 0.0290 0.904798 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1368072 2 0.4387 0.511532 0.000 0.640 0.000 0.012 0.348
#> SRR601815 2 0.6791 -0.184113 0.000 0.360 0.000 0.284 0.356
#> SRR613330 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.1478 0.776285 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1394190 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 5 0.4302 -0.360279 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1318839 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.1671 0.729434 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR613126 2 0.0955 0.769809 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1089424 4 0.3796 0.572472 0.000 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1347214 2 0.4761 0.470139 0.000 0.616 0.000 0.028 0.356
#> SRR1309556 5 0.4465 0.430457 0.000 0.056 0.000 0.212 0.732
#> SRR1456027 1 0.0162 0.949496 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400551 5 0.4283 -0.022397 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1320469 5 0.3895 0.377007 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR614251 2 0.1121 0.761316 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1454310 2 0.3999 0.536329 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR615105 2 0.1697 0.753399 0.000 0.932 0.008 0.000 0.060
#> SRR1433290 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 2 0.1608 0.773862 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR601671 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR663874 2 0.1671 0.773596 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1409130 2 0.0955 0.769809 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR659696 4 0.4367 0.476314 0.000 0.008 0.000 0.620 0.372
#> SRR1408249 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663284 5 0.4192 0.147758 0.000 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1402794 3 0.6360 0.285107 0.000 0.388 0.448 0.000 0.164
#> SRR614852 4 0.0703 0.727521 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1348040 4 0.0000 0.736104 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489610 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488091 2 0.0290 0.777835 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1499566 4 0.0771 0.724490 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004
#> SRR1361480 4 0.3774 0.575574 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1444501 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.4604 0.395969 0.000 0.560 0.000 0.012 0.428
#> SRR1388832 5 0.2997 0.457463 0.000 0.148 0.000 0.012 0.840
#> SRR1394637 1 0.6714 -0.008843 0.404 0.000 0.000 0.252 0.344
#> SRR606974 2 0.3895 0.567455 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR662918 2 0.1671 0.773596 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR817421 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.3752 0.579728 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR608264 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 5 0.6785 0.120732 0.356 0.000 0.000 0.280 0.364
#> SRR1454117 4 0.3752 0.579728 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1312684 1 0.2859 0.869338 0.876 0.000 0.000 0.068 0.056
#> SRR615044 5 0.4337 0.418344 0.000 0.204 0.000 0.052 0.744
#> SRR1432743 3 0.3752 0.821112 0.000 0.048 0.804 0.000 0.148
#> SRR1388873 2 0.4166 0.524577 0.000 0.648 0.000 0.004 0.348
#> SRR1353517 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.4922 0.548784 0.000 0.716 0.128 0.000 0.156
#> SRR1406008 4 0.4538 0.455654 0.000 0.016 0.000 0.620 0.364
#> SRR1396786 2 0.1197 0.776777 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1446564 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3284 0.838661 0.000 0.024 0.828 0.000 0.148
#> SRR1431083 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.2011 0.867614 0.908 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR655170 2 0.4088 0.511738 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1087825 4 0.1043 0.732702 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR662019 2 0.5346 0.114201 0.000 0.496 0.052 0.000 0.452
#> SRR1349209 5 0.4030 0.266725 0.000 0.000 0.000 0.352 0.648
#> SRR1326161 2 0.3003 0.699802 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1345284 4 0.1282 0.703454 0.044 0.000 0.000 0.952 0.004
#> SRR1416672 1 0.1197 0.927152 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR663356 4 0.0609 0.738590 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1454328 2 0.0880 0.777311 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1489286 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 2 0.1608 0.773862 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR809444 1 0.2446 0.891370 0.900 0.000 0.000 0.044 0.056
#> SRR1089901 2 0.2179 0.752076 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1375774 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.4138 0.174188 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR657139 4 0.5114 -0.130235 0.036 0.000 0.000 0.488 0.476
#> SRR1440744 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353555 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.5010 0.598530 0.676 0.000 0.000 0.248 0.076
#> SRR1452334 4 0.3949 0.558810 0.000 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1381775 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 4 0.3534 0.612071 0.000 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR658989 3 0.3649 0.824352 0.000 0.040 0.808 0.000 0.152
#> SRR1353663 1 0.2661 0.880673 0.888 0.000 0.000 0.056 0.056
#> SRR811771 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.2209 0.901016 0.912 0.000 0.000 0.032 0.056
#> SRR815825 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.4538 0.482779 0.000 0.620 0.000 0.016 0.364
#> SRR1367988 4 0.2193 0.674498 0.060 0.000 0.000 0.912 0.028
#> SRR1331922 1 0.4370 0.707043 0.744 0.000 0.000 0.200 0.056
#> SRR615479 4 0.3039 0.600923 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1375796 2 0.0290 0.777730 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1386991 2 0.4908 0.456284 0.000 0.608 0.000 0.036 0.356
#> SRR1355217 4 0.0609 0.737180 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1356290 2 0.1121 0.776907 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR659507 2 0.0794 0.770686 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR663296 4 0.5401 -0.097634 0.056 0.000 0.000 0.492 0.452
#> SRR598044 4 0.2424 0.699669 0.000 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR661155 2 0.1671 0.773193 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1414727 2 0.3999 0.586974 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR663477 1 0.2291 0.897920 0.908 0.000 0.000 0.036 0.056
#> SRR1354489 3 0.0794 0.900480 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1377800 2 0.3242 0.627093 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR614611 2 0.0880 0.777311 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR655052 4 0.3336 0.641031 0.000 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1478968 1 0.0162 0.949496 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1351280 4 0.5314 0.297242 0.000 0.052 0.000 0.528 0.420
#> SRR613951 5 0.4101 0.231635 0.000 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1418022 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 5 0.3837 0.346361 0.000 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1408161 1 0.2520 0.887902 0.896 0.000 0.000 0.048 0.056
#> SRR657054 3 0.6455 0.346325 0.000 0.352 0.460 0.000 0.188
#> SRR655040 4 0.0000 0.736104 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 4 0.6688 -0.058516 0.000 0.240 0.000 0.404 0.356
#> SRR1325377 4 0.2690 0.685857 0.000 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR617829 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 2 0.0510 0.772683 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480455 2 0.2905 0.707971 0.000 0.868 0.096 0.000 0.036
#> SRR1442104 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.1399 0.927662 0.952 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR1481396 3 0.3284 0.838661 0.000 0.024 0.828 0.000 0.148
#> SRR1414314 2 0.2516 0.733501 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR663026 4 0.4074 0.483158 0.000 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1478386 1 0.0162 0.949764 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458683 2 0.6409 -0.025044 0.000 0.468 0.352 0.000 0.180
#> SRR1370572 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 4 0.0566 0.729189 0.004 0.000 0.000 0.984 0.012
#> SRR1310735 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.1043 0.732702 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR660260 2 0.1478 0.774015 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1071231 4 0.3561 0.606452 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1459125 4 0.3684 0.590915 0.000 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1337173 2 0.3301 0.694227 0.000 0.848 0.080 0.000 0.072
#> SRR1396250 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.5199 0.564745 0.000 0.292 0.636 0.000 0.072
#> SRR659816 2 0.1544 0.773932 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1401379 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR600981 4 0.2127 0.717188 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1398335 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.0162 0.734572 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660115 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4030 0.524766 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1359780 2 0.0290 0.775019 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1490037 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.776479 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319648 5 0.4283 -0.014090 0.000 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1092985 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.1270 0.701563 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1468658 2 0.2891 0.661893 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1390437 4 0.0510 0.730655 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR658057 5 0.6790 0.168994 0.000 0.292 0.000 0.328 0.380
#> SRR612635 4 0.3210 0.648517 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1351480 4 0.0794 0.737683 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1436651 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.1626 0.916935 0.940 0.000 0.000 0.044 0.016
#> SRR659590 2 0.4599 0.485578 0.000 0.624 0.000 0.020 0.356
#> SRR614263 1 0.1043 0.931696 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1409575 4 0.0609 0.738590 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR659911 2 0.1671 0.773596 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1085519 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 2 0.0794 0.768733 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1442928 2 0.1043 0.777219 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1464681 4 0.1043 0.732702 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1418880 1 0.1197 0.927152 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1309070 2 0.2929 0.658373 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1365426 4 0.0794 0.735884 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1487947 4 0.5177 -0.127923 0.040 0.000 0.000 0.488 0.472
#> SRR659708 4 0.4262 0.048147 0.000 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR603236 2 0.0963 0.766418 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR660673 1 0.1197 0.927152 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1430729 2 0.6416 0.099377 0.000 0.464 0.000 0.180 0.356
#> SRR663807 2 0.3752 0.601438 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1087245 5 0.6784 0.166627 0.000 0.352 0.000 0.280 0.368
#> SRR1339108 4 0.0162 0.737257 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR613426 4 0.3242 0.610213 0.076 0.000 0.000 0.852 0.072
#> SRR613879 4 0.6289 0.143201 0.000 0.160 0.000 0.484 0.356
#> SRR1385101 4 0.0000 0.736104 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.3752 0.601438 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1458852 2 0.0510 0.772683 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1430489 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0955 0.933901 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1376249 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0162 0.775848 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR662653 2 0.0000 0.776479 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 5 0.4054 0.390843 0.000 0.020 0.000 0.248 0.732
#> SRR1383081 4 0.3752 0.579728 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR2166960 2 0.2605 0.749069 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR605101 4 0.0404 0.738556 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR818600 2 0.1608 0.776313 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1367715 4 0.0290 0.733882 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1351979 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.3370 0.835994 0.000 0.028 0.824 0.000 0.148
#> SRR1322662 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1671 0.773596 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR612767 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.4135 0.536249 0.000 0.656 0.000 0.004 0.340
#> SRR1430375 2 0.0510 0.774677 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR615225 4 0.4235 0.414811 0.000 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1401839 2 0.4416 0.498984 0.000 0.632 0.000 0.012 0.356
#> SRR1379110 4 0.0162 0.734572 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077288 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331639 4 0.3561 0.616119 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1342782 4 0.5240 0.383223 0.000 0.056 0.000 0.584 0.360
#> SRR1443003 3 0.3284 0.838661 0.000 0.024 0.828 0.000 0.148
#> SRR612839 1 0.3269 0.839886 0.848 0.000 0.000 0.096 0.056
#> SRR1470093 3 0.3284 0.838661 0.000 0.024 0.828 0.000 0.148
#> SRR1395742 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.6231 0.194527 0.000 0.532 0.288 0.000 0.180
#> SRR664063 4 0.1478 0.723497 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1488214 1 0.4465 0.688152 0.732 0.000 0.000 0.212 0.056
#> SRR654766 4 0.1082 0.721294 0.008 0.000 0.000 0.964 0.028
#> SRR1320321 4 0.0794 0.737683 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1071955 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 4 0.4015 0.503011 0.000 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1488470 4 0.3210 0.648748 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1389497 3 0.0000 0.906360 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 2 0.5339 0.496485 0.000 0.672 0.176 0.000 0.152
#> SRR615311 1 0.0000 0.951843 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.3997 0.216754 0.000 0.508 0.000 0.000 0.488 0.004
#> SRR1380716 4 0.0458 0.785233 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.5391 0.499315 0.580 0.000 0.000 0.176 0.000 0.244
#> SRR1084417 6 0.4108 0.495813 0.000 0.172 0.000 0.012 0.060 0.756
#> SRR1074359 5 0.1088 0.775550 0.000 0.016 0.000 0.000 0.960 0.024
#> SRR1419258 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 5 0.5463 0.540923 0.000 0.116 0.068 0.000 0.672 0.144
#> SRR665262 5 0.1492 0.780362 0.000 0.024 0.000 0.000 0.940 0.036
#> SRR1499740 6 0.4784 0.175739 0.000 0.464 0.000 0.028 0.012 0.496
#> SRR1105057 4 0.3782 0.062415 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0458 0.894555 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR614599 5 0.0622 0.781792 0.000 0.012 0.000 0.000 0.980 0.008
#> SRR612215 5 0.2902 0.645633 0.000 0.196 0.000 0.000 0.800 0.004
#> SRR1094051 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 6 0.4431 0.526601 0.000 0.096 0.000 0.200 0.000 0.704
#> SRR1409263 6 0.5836 0.078263 0.000 0.120 0.020 0.000 0.356 0.504
#> SRR1431288 1 0.5308 0.520863 0.592 0.000 0.000 0.164 0.000 0.244
#> SRR1334889 2 0.5936 0.179855 0.000 0.460 0.000 0.256 0.000 0.284
#> SRR614839 4 0.4382 0.576180 0.000 0.156 0.000 0.720 0.000 0.124
#> SRR658433 5 0.0972 0.780850 0.000 0.008 0.000 0.000 0.964 0.028
#> SRR1088581 2 0.3923 -0.122480 0.000 0.580 0.000 0.000 0.004 0.416
#> SRR1328797 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 4 0.4025 0.107865 0.000 0.416 0.000 0.576 0.000 0.008
#> SRR1471117 6 0.6101 0.384655 0.232 0.024 0.000 0.212 0.000 0.532
#> SRR1311553 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4364 0.495380 0.000 0.608 0.000 0.024 0.364 0.004
#> SRR1354955 3 0.5661 0.664480 0.000 0.092 0.632 0.000 0.064 0.212
#> SRR654802 3 0.3535 0.805073 0.000 0.040 0.828 0.000 0.040 0.092
#> SRR660066 2 0.3975 0.320907 0.000 0.544 0.000 0.000 0.452 0.004
#> SRR1447103 5 0.1806 0.760022 0.000 0.088 0.000 0.000 0.908 0.004
#> SRR1402153 6 0.4868 0.355334 0.000 0.352 0.000 0.052 0.008 0.588
#> SRR655887 2 0.5019 0.617796 0.000 0.656 0.000 0.188 0.152 0.004
#> SRR1408529 3 0.3920 0.792149 0.000 0.052 0.804 0.000 0.052 0.092
#> SRR658707 1 0.5150 0.549890 0.608 0.000 0.000 0.136 0.000 0.256
#> SRR1384371 6 0.5917 -0.074965 0.000 0.208 0.000 0.000 0.388 0.404
#> SRR1074670 6 0.5411 0.071133 0.000 0.124 0.000 0.000 0.364 0.512
#> SRR1375439 2 0.4046 0.481201 0.000 0.620 0.000 0.008 0.368 0.004
#> SRR1329003 6 0.5704 0.241965 0.000 0.192 0.000 0.300 0.000 0.508
#> SRR1404837 4 0.2135 0.687112 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.5371 0.382697 0.000 0.176 0.000 0.584 0.000 0.240
#> SRR613999 1 0.0146 0.899102 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310836 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0146 0.864998 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1068855 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612227 5 0.4657 0.544980 0.000 0.100 0.000 0.000 0.672 0.228
#> SRR1388809 5 0.2170 0.751356 0.000 0.100 0.000 0.000 0.888 0.012
#> SRR1413872 4 0.4422 0.628045 0.000 0.252 0.000 0.680 0.000 0.068
#> SRR1452864 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 6 0.4699 0.223692 0.000 0.428 0.000 0.020 0.016 0.536
#> SRR615814 5 0.1564 0.780271 0.000 0.040 0.000 0.000 0.936 0.024
#> SRR1325225 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 5 0.3297 0.738208 0.000 0.112 0.000 0.000 0.820 0.068
#> SRR1358220 4 0.0260 0.786251 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1096662 4 0.0865 0.780390 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR660164 2 0.4386 0.609027 0.000 0.708 0.000 0.200 0.092 0.000
#> SRR815783 5 0.1003 0.783744 0.000 0.020 0.000 0.000 0.964 0.016
#> SRR809595 4 0.3746 0.634698 0.000 0.140 0.000 0.780 0.000 0.080
#> SRR1403133 5 0.3979 -0.057358 0.000 0.456 0.000 0.000 0.540 0.004
#> SRR815470 5 0.0909 0.784051 0.000 0.020 0.000 0.000 0.968 0.012
#> SRR1344382 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 5 0.0909 0.775425 0.000 0.012 0.000 0.000 0.968 0.020
#> SRR1478362 2 0.4167 0.254067 0.000 0.612 0.000 0.368 0.000 0.020
#> SRR1392186 4 0.1556 0.742338 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1347937 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.5383 0.499713 0.580 0.000 0.000 0.172 0.000 0.248
#> SRR1471594 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 6 0.5285 0.278639 0.000 0.352 0.000 0.112 0.000 0.536
#> SRR612683 2 0.3769 0.492548 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004 0.000
#> SRR1392901 5 0.4894 0.548771 0.000 0.100 0.012 0.000 0.676 0.212
#> SRR1077805 3 0.5919 0.638918 0.000 0.092 0.612 0.000 0.088 0.208
#> SRR1360402 2 0.3862 0.456960 0.000 0.608 0.000 0.000 0.388 0.004
#> SRR1406112 3 0.4305 0.774521 0.000 0.064 0.772 0.000 0.048 0.116
#> SRR1355352 6 0.4827 0.393604 0.000 0.296 0.000 0.000 0.084 0.620
#> SRR656247 1 0.0363 0.896143 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR813656 2 0.5919 0.086543 0.000 0.424 0.000 0.364 0.000 0.212
#> SRR808244 6 0.4911 0.466685 0.020 0.104 0.000 0.184 0.000 0.692
#> SRR1387240 5 0.1910 0.748549 0.000 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000
#> SRR1408595 1 0.0363 0.895225 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1385277 4 0.3834 0.656900 0.000 0.144 0.000 0.772 0.000 0.084
#> SRR1435248 5 0.1814 0.753545 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1419110 2 0.4091 0.249762 0.000 0.520 0.000 0.000 0.472 0.008
#> SRR1408682 5 0.3997 -0.168399 0.000 0.488 0.000 0.000 0.508 0.004
#> SRR1317134 1 0.2883 0.764727 0.788 0.000 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1370780 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.0146 0.785850 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.3795 0.485768 0.000 0.632 0.000 0.000 0.364 0.004
#> SRR603164 5 0.4608 0.551493 0.000 0.100 0.000 0.000 0.680 0.220
#> SRR1383259 4 0.0632 0.782515 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1330854 6 0.4092 0.524225 0.004 0.060 0.000 0.196 0.000 0.740
#> SRR1452423 1 0.0363 0.896143 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1368574 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1468162 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.4750 0.521705 0.000 0.100 0.000 0.000 0.656 0.244
#> SRR1361546 2 0.4057 0.362990 0.000 0.556 0.000 0.436 0.000 0.008
#> SRR1486156 1 0.4834 0.606429 0.644 0.000 0.000 0.104 0.000 0.252
#> SRR660545 5 0.0909 0.783368 0.000 0.020 0.000 0.000 0.968 0.012
#> SRR615635 5 0.3023 0.622116 0.000 0.212 0.000 0.000 0.784 0.004
#> SRR1385411 2 0.5530 0.375310 0.000 0.560 0.000 0.224 0.000 0.216
#> SRR1342739 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0146 0.864998 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR662126 2 0.5190 0.427068 0.000 0.596 0.000 0.272 0.000 0.132
#> SRR1464601 5 0.2039 0.759683 0.000 0.012 0.052 0.000 0.916 0.020
#> SRR1071594 5 0.4328 0.596959 0.000 0.100 0.000 0.000 0.720 0.180
#> SRR612539 2 0.3989 0.311233 0.000 0.528 0.000 0.468 0.000 0.004
#> SRR602010 4 0.0363 0.785565 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR810249 2 0.4300 0.495599 0.000 0.608 0.000 0.364 0.028 0.000
#> SRR818773 4 0.5177 0.391836 0.000 0.236 0.000 0.612 0.000 0.152
#> SRR1336569 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.3864 0.280005 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1442754 6 0.4434 0.536611 0.000 0.116 0.000 0.172 0.000 0.712
#> SRR1334247 3 0.5328 0.691008 0.000 0.084 0.660 0.000 0.048 0.208
#> SRR661639 1 0.3888 0.699341 0.716 0.000 0.000 0.032 0.000 0.252
#> SRR613222 4 0.5650 0.197751 0.000 0.168 0.000 0.500 0.000 0.332
#> SRR1459937 4 0.3806 0.655695 0.000 0.164 0.000 0.768 0.000 0.068
#> SRR2185018 1 0.3265 0.729258 0.748 0.000 0.000 0.004 0.000 0.248
#> SRR655732 2 0.3954 0.508494 0.000 0.684 0.000 0.004 0.296 0.016
#> SRR809348 1 0.1957 0.839949 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR819261 5 0.7208 0.036046 0.000 0.104 0.200 0.000 0.360 0.336
#> SRR661074 3 0.0146 0.864998 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349851 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.5847 0.215249 0.000 0.232 0.000 0.484 0.000 0.284
#> SRR661096 1 0.1895 0.844189 0.912 0.000 0.000 0.072 0.000 0.016
#> SRR1320225 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 6 0.5660 0.238790 0.000 0.184 0.000 0.300 0.000 0.516
#> SRR1307677 2 0.4775 0.612432 0.000 0.688 0.000 0.152 0.156 0.004
#> SRR1466512 4 0.0458 0.785233 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR658212 5 0.3141 0.687985 0.000 0.200 0.000 0.000 0.788 0.012
#> SRR1430525 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344422 2 0.4977 0.228172 0.000 0.612 0.000 0.004 0.084 0.300
#> SRR1353924 4 0.0458 0.785233 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1314832 6 0.4164 0.472776 0.000 0.124 0.000 0.000 0.132 0.744
#> SRR1487570 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.3847 0.287296 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1418561 6 0.5032 0.412464 0.000 0.196 0.000 0.000 0.164 0.640
#> SRR1448029 5 0.4633 0.547278 0.000 0.100 0.000 0.000 0.676 0.224
#> SRR813802 6 0.6067 0.402061 0.220 0.028 0.000 0.204 0.000 0.548
#> SRR815020 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3857 0.309687 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1435311 4 0.0547 0.783280 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR612395 5 0.2009 0.764854 0.000 0.068 0.000 0.000 0.908 0.024
#> SRR603116 2 0.5068 0.606724 0.000 0.624 0.000 0.240 0.136 0.000
#> SRR1323152 5 0.5788 0.399352 0.000 0.100 0.040 0.000 0.572 0.288
#> SRR1368264 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1326624 1 0.4294 0.672709 0.692 0.000 0.000 0.060 0.000 0.248
#> SRR1429265 3 0.5181 0.697515 0.000 0.084 0.672 0.000 0.040 0.204
#> SRR1327702 1 0.5597 0.425903 0.544 0.000 0.000 0.204 0.000 0.252
#> SRR615611 4 0.5442 -0.025942 0.000 0.412 0.000 0.468 0.000 0.120
#> SRR1486799 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.4679 0.402932 0.604 0.028 0.000 0.352 0.000 0.016
#> SRR815044 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1338560 4 0.1610 0.744198 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.3867 0.213932 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1480038 4 0.0146 0.785850 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR659436 3 0.3775 0.800115 0.000 0.060 0.816 0.000 0.076 0.048
#> SRR613699 5 0.3278 0.735019 0.000 0.152 0.000 0.000 0.808 0.040
#> SRR1436563 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1330327 4 0.4012 0.645351 0.000 0.164 0.000 0.752 0.000 0.084
#> SRR1489950 5 0.2234 0.733283 0.000 0.124 0.000 0.000 0.872 0.004
#> SRR1431927 1 0.0458 0.894555 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1100588 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.6208 0.131299 0.424 0.020 0.000 0.172 0.000 0.384
#> SRR1318444 4 0.5778 0.200097 0.000 0.204 0.000 0.492 0.000 0.304
#> SRR600656 4 0.3907 0.654847 0.000 0.176 0.000 0.756 0.000 0.068
#> SRR658766 5 0.5076 0.495940 0.000 0.132 0.000 0.000 0.620 0.248
#> SRR655946 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0458 0.894555 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1475104 3 0.6167 0.603551 0.000 0.092 0.584 0.000 0.108 0.216
#> SRR1406418 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.5227 0.536467 0.600 0.000 0.000 0.148 0.000 0.252
#> SRR1444120 4 0.2837 0.713682 0.000 0.088 0.000 0.856 0.000 0.056
#> SRR1471965 1 0.0458 0.894555 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR612695 6 0.5475 -0.055652 0.000 0.124 0.000 0.000 0.416 0.460
#> SRR662498 5 0.2625 0.754859 0.000 0.072 0.000 0.000 0.872 0.056
#> SRR1376764 6 0.7315 -0.111854 0.000 0.100 0.284 0.000 0.280 0.336
#> SRR1377006 6 0.5517 -0.019495 0.000 0.132 0.000 0.000 0.396 0.472
#> SRR656860 4 0.3833 0.013608 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000 0.000
#> SRR1480547 4 0.5564 0.042298 0.000 0.388 0.000 0.472 0.000 0.140
#> SRR1452515 5 0.1616 0.757499 0.000 0.048 0.000 0.000 0.932 0.020
#> SRR1324390 5 0.3989 -0.100851 0.000 0.468 0.000 0.000 0.528 0.004
#> SRR615273 6 0.5163 0.444878 0.000 0.140 0.000 0.252 0.000 0.608
#> SRR601695 5 0.0458 0.780122 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR820907 2 0.3866 0.281538 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000 0.000
#> SRR812773 4 0.1075 0.763825 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1405984 4 0.1765 0.732545 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1472794 5 0.1957 0.745510 0.000 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000
#> SRR1365448 6 0.4370 0.480883 0.000 0.064 0.000 0.252 0.000 0.684
#> SRR1095720 3 0.3714 0.799900 0.000 0.040 0.816 0.000 0.048 0.096
#> SRR1435626 5 0.5176 0.353375 0.000 0.100 0.000 0.000 0.548 0.352
#> SRR1080766 5 0.1957 0.745510 0.000 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.2456 0.834788 0.000 0.048 0.892 0.000 0.008 0.052
#> SRR1320579 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1326604 2 0.4765 0.616817 0.000 0.672 0.000 0.196 0.132 0.000
#> SRR1098879 3 0.5929 0.513098 0.000 0.092 0.524 0.000 0.044 0.340
#> SRR662245 3 0.1262 0.845616 0.000 0.016 0.956 0.000 0.020 0.008
#> SRR1074719 2 0.3864 0.290634 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR816226 4 0.5027 0.304369 0.000 0.100 0.000 0.596 0.000 0.304
#> SRR601387 2 0.4290 0.493499 0.000 0.612 0.000 0.364 0.020 0.004
#> SRR614575 2 0.3805 0.506172 0.000 0.664 0.000 0.004 0.328 0.004
#> SRR1353900 2 0.3819 0.477700 0.000 0.624 0.000 0.000 0.372 0.004
#> SRR662906 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350832 2 0.3993 0.254236 0.000 0.520 0.000 0.000 0.476 0.004
#> SRR1403280 2 0.4062 0.344108 0.000 0.552 0.000 0.440 0.000 0.008
#> SRR1313969 4 0.4952 0.374763 0.000 0.408 0.000 0.524 0.000 0.068
#> SRR1388528 6 0.5092 0.471775 0.064 0.036 0.000 0.240 0.000 0.660
#> SRR1452912 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR655399 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR818901 3 0.3451 0.807720 0.000 0.028 0.832 0.000 0.048 0.092
#> SRR607067 4 0.1168 0.772682 0.000 0.028 0.000 0.956 0.000 0.016
#> SRR1391420 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.5509 -0.114366 0.000 0.436 0.000 0.436 0.000 0.128
#> SRR661961 5 0.4582 0.557151 0.000 0.100 0.000 0.000 0.684 0.216
#> SRR658259 2 0.4545 0.604909 0.000 0.704 0.000 0.208 0.080 0.008
#> SRR1310476 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 5 0.1957 0.745510 0.000 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000
#> SRR1365034 4 0.0000 0.785650 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.3862 0.456960 0.000 0.608 0.000 0.000 0.388 0.004
#> SRR1475300 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1328101 2 0.3890 0.433586 0.000 0.596 0.000 0.000 0.400 0.004
#> SRR1322900 6 0.4808 0.124408 0.000 0.052 0.000 0.468 0.000 0.480
#> SRR1309942 5 0.0508 0.783663 0.000 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1345760 4 0.4131 0.634250 0.000 0.156 0.000 0.744 0.000 0.100
#> SRR1435418 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.4136 0.177417 0.000 0.560 0.000 0.428 0.000 0.012
#> SRR1443436 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.0603 0.778923 0.000 0.004 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR661469 5 0.3149 0.747448 0.000 0.132 0.000 0.000 0.824 0.044
#> SRR1500323 5 0.0777 0.784314 0.000 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR1356705 4 0.0146 0.785850 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 6 0.4886 0.268827 0.000 0.396 0.000 0.000 0.064 0.540
#> SRR1350435 1 0.3445 0.726517 0.744 0.000 0.000 0.012 0.000 0.244
#> SRR1389177 3 0.1913 0.845626 0.000 0.044 0.924 0.000 0.016 0.016
#> SRR1368072 2 0.3852 0.462631 0.000 0.612 0.000 0.000 0.384 0.004
#> SRR601815 2 0.5283 0.612277 0.000 0.620 0.000 0.180 0.196 0.004
#> SRR613330 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.2704 0.732528 0.000 0.140 0.000 0.000 0.844 0.016
#> SRR1394190 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 2 0.5844 -0.000635 0.000 0.468 0.000 0.000 0.208 0.324
#> SRR1318839 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.4148 0.652697 0.000 0.208 0.000 0.724 0.000 0.068
#> SRR613126 5 0.0717 0.778993 0.000 0.008 0.000 0.000 0.976 0.016
#> SRR1089424 2 0.3857 0.311484 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.5004 0.588094 0.000 0.632 0.000 0.088 0.272 0.008
#> SRR1309556 2 0.5317 0.284061 0.000 0.580 0.000 0.104 0.008 0.308
#> SRR1456027 1 0.1152 0.867342 0.952 0.044 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1400551 6 0.5634 0.139627 0.000 0.172 0.000 0.000 0.316 0.512
#> SRR1320469 6 0.4302 0.544745 0.000 0.116 0.000 0.156 0.000 0.728
#> SRR614251 5 0.2609 0.726296 0.000 0.036 0.000 0.000 0.868 0.096
#> SRR1454310 2 0.3852 0.463413 0.000 0.612 0.000 0.000 0.384 0.004
#> SRR615105 5 0.2433 0.733062 0.000 0.072 0.000 0.000 0.884 0.044
#> SRR1433290 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 5 0.3202 0.740268 0.000 0.144 0.000 0.000 0.816 0.040
#> SRR601671 4 0.0260 0.786251 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR663874 5 0.3041 0.749951 0.000 0.128 0.000 0.000 0.832 0.040
#> SRR1409130 5 0.0914 0.777533 0.000 0.016 0.000 0.000 0.968 0.016
#> SRR659696 2 0.3445 0.455783 0.000 0.744 0.000 0.244 0.000 0.012
#> SRR1408249 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.5902 0.187743 0.000 0.472 0.000 0.260 0.000 0.268
#> SRR1402794 5 0.7075 0.200400 0.000 0.104 0.216 0.000 0.444 0.236
#> SRR614852 4 0.3841 0.653681 0.000 0.168 0.000 0.764 0.000 0.068
#> SRR1348040 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1489610 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1488091 5 0.1196 0.782157 0.000 0.040 0.000 0.000 0.952 0.008
#> SRR1499566 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361480 2 0.3847 0.336289 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.4729 0.533967 0.000 0.644 0.000 0.016 0.296 0.044
#> SRR1388832 6 0.4508 0.250241 0.000 0.436 0.000 0.004 0.024 0.536
#> SRR1394637 6 0.6206 0.223421 0.304 0.020 0.000 0.196 0.000 0.480
#> SRR606974 2 0.3852 0.463413 0.000 0.612 0.000 0.000 0.384 0.004
#> SRR662918 5 0.3163 0.744914 0.000 0.140 0.000 0.000 0.820 0.040
#> SRR817421 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3864 0.241141 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 6 0.6102 0.388880 0.228 0.024 0.000 0.216 0.000 0.532
#> SRR1454117 2 0.3868 0.247572 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.4325 0.672188 0.692 0.000 0.000 0.064 0.000 0.244
#> SRR615044 2 0.5456 0.325813 0.000 0.600 0.000 0.040 0.068 0.292
#> SRR1432743 3 0.6231 0.596614 0.000 0.092 0.580 0.000 0.120 0.208
#> SRR1388873 2 0.3841 0.467154 0.000 0.616 0.000 0.000 0.380 0.004
#> SRR1353517 1 0.0363 0.896143 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1357148 5 0.4875 0.538901 0.000 0.100 0.008 0.000 0.668 0.224
#> SRR1406008 2 0.3819 0.476315 0.000 0.624 0.000 0.372 0.004 0.000
#> SRR1396786 5 0.1663 0.760642 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.5475 0.678041 0.000 0.092 0.648 0.000 0.052 0.208
#> SRR1431083 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.4024 0.537043 0.700 0.036 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.4196 0.502360 0.000 0.640 0.000 0.000 0.332 0.028
#> SRR1087825 4 0.3907 0.654847 0.000 0.176 0.000 0.756 0.000 0.068
#> SRR662019 6 0.5475 -0.050957 0.000 0.124 0.000 0.000 0.416 0.460
#> SRR1349209 6 0.5585 0.155878 0.000 0.416 0.000 0.140 0.000 0.444
#> SRR1326161 5 0.4018 0.124725 0.000 0.412 0.000 0.000 0.580 0.008
#> SRR1345284 4 0.0603 0.781801 0.004 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1416672 1 0.3050 0.743912 0.764 0.000 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR663356 4 0.0458 0.785233 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1454328 5 0.1858 0.764047 0.000 0.076 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR1489286 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660709 5 0.2999 0.755929 0.000 0.124 0.000 0.000 0.836 0.040
#> SRR809444 1 0.4099 0.691154 0.708 0.000 0.000 0.048 0.000 0.244
#> SRR1089901 5 0.3109 0.600037 0.000 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004
#> SRR1375774 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 6 0.5704 0.241965 0.000 0.192 0.000 0.300 0.000 0.508
#> SRR657139 6 0.4844 0.457836 0.016 0.060 0.000 0.272 0.000 0.652
#> SRR1440744 4 0.0146 0.785850 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.5823 0.253339 0.468 0.000 0.000 0.200 0.000 0.332
#> SRR1452334 2 0.5564 -0.014236 0.000 0.516 0.000 0.328 0.000 0.156
#> SRR1381775 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 4 0.3620 0.262107 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.5842 0.642992 0.000 0.100 0.612 0.000 0.068 0.220
#> SRR1353663 1 0.4294 0.672709 0.692 0.000 0.000 0.060 0.000 0.248
#> SRR811771 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.3719 0.711241 0.728 0.000 0.000 0.024 0.000 0.248
#> SRR815825 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.4618 0.538535 0.000 0.632 0.000 0.036 0.320 0.012
#> SRR1367988 4 0.3858 0.660904 0.004 0.132 0.000 0.780 0.000 0.084
#> SRR1331922 1 0.5364 0.506012 0.584 0.000 0.000 0.172 0.000 0.244
#> SRR615479 4 0.5012 0.279767 0.000 0.088 0.000 0.576 0.000 0.336
#> SRR1375796 5 0.1082 0.782769 0.000 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1386991 2 0.4844 0.562994 0.000 0.628 0.000 0.064 0.300 0.008
#> SRR1355217 4 0.2122 0.745495 0.000 0.076 0.000 0.900 0.000 0.024
#> SRR1356290 5 0.1462 0.774447 0.000 0.056 0.000 0.000 0.936 0.008
#> SRR659507 5 0.0820 0.781856 0.000 0.012 0.000 0.000 0.972 0.016
#> SRR663296 6 0.6288 0.387386 0.080 0.100 0.000 0.288 0.000 0.532
#> SRR598044 4 0.3309 0.455300 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000 0.000
#> SRR661155 5 0.3422 0.725477 0.000 0.168 0.000 0.000 0.792 0.040
#> SRR1414727 5 0.6077 0.154425 0.000 0.296 0.000 0.000 0.400 0.304
#> SRR663477 1 0.4038 0.695666 0.712 0.000 0.000 0.044 0.000 0.244
#> SRR1354489 3 0.2278 0.838478 0.000 0.052 0.904 0.000 0.012 0.032
#> SRR1377800 5 0.5212 0.317550 0.000 0.100 0.000 0.000 0.532 0.368
#> SRR614611 5 0.1610 0.762276 0.000 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000
#> SRR655052 4 0.4687 0.559575 0.000 0.308 0.000 0.624 0.000 0.068
#> SRR1478968 1 0.0858 0.879293 0.968 0.028 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.4138 0.581478 0.000 0.720 0.000 0.228 0.048 0.004
#> SRR613951 2 0.5774 -0.125553 0.000 0.440 0.000 0.176 0.000 0.384
#> SRR1418022 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 6 0.5360 0.169336 0.000 0.436 0.000 0.108 0.000 0.456
#> SRR1408161 1 0.4158 0.686130 0.704 0.000 0.000 0.052 0.000 0.244
#> SRR657054 5 0.7520 0.059089 0.000 0.160 0.248 0.000 0.356 0.236
#> SRR655040 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR810225 2 0.5055 0.604411 0.000 0.624 0.000 0.244 0.132 0.000
#> SRR1325377 4 0.3390 0.418085 0.000 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 5 0.0363 0.780869 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1480455 5 0.1622 0.767648 0.000 0.028 0.016 0.000 0.940 0.016
#> SRR1442104 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.3221 0.770677 0.792 0.000 0.000 0.020 0.000 0.188
#> SRR1481396 3 0.5242 0.694638 0.000 0.084 0.668 0.000 0.044 0.204
#> SRR1414314 5 0.3409 0.444278 0.000 0.300 0.000 0.000 0.700 0.000
#> SRR663026 2 0.3747 0.445793 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1478386 1 0.1757 0.843520 0.916 0.000 0.000 0.076 0.000 0.008
#> SRR1458683 5 0.6500 0.373724 0.000 0.112 0.124 0.000 0.548 0.216
#> SRR1370572 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1310735 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.3907 0.654847 0.000 0.176 0.000 0.756 0.000 0.068
#> SRR660260 5 0.2457 0.764213 0.000 0.084 0.000 0.000 0.880 0.036
#> SRR1071231 4 0.3244 0.466025 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.3823 -0.065831 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1337173 5 0.3998 0.648657 0.000 0.092 0.012 0.000 0.780 0.116
#> SRR1396250 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.6207 0.238225 0.000 0.084 0.476 0.000 0.372 0.068
#> SRR659816 5 0.2775 0.759571 0.000 0.104 0.000 0.000 0.856 0.040
#> SRR1401379 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR600981 4 0.4487 0.624950 0.000 0.264 0.000 0.668 0.000 0.068
#> SRR1398335 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR660115 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4039 0.491660 0.000 0.632 0.000 0.000 0.352 0.016
#> SRR1359780 5 0.0891 0.784121 0.000 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008
#> SRR1490037 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0363 0.896143 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1410221 5 0.0858 0.783895 0.000 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1319648 2 0.5817 0.280376 0.000 0.480 0.000 0.312 0.000 0.208
#> SRR1092985 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.1908 0.723784 0.000 0.004 0.000 0.900 0.000 0.096
#> SRR1468658 5 0.4625 0.552189 0.000 0.104 0.000 0.000 0.680 0.216
#> SRR1390437 4 0.1657 0.756824 0.000 0.056 0.000 0.928 0.000 0.016
#> SRR658057 2 0.4535 0.608612 0.000 0.704 0.000 0.148 0.148 0.000
#> SRR612635 4 0.3426 0.452447 0.000 0.276 0.000 0.720 0.000 0.004
#> SRR1351480 4 0.1007 0.772785 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.2733 0.822146 0.864 0.000 0.000 0.056 0.000 0.080
#> SRR659590 2 0.4822 0.568140 0.000 0.628 0.000 0.072 0.296 0.004
#> SRR614263 1 0.2135 0.828893 0.872 0.000 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1409575 4 0.0458 0.785233 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR659911 5 0.2972 0.750705 0.000 0.128 0.000 0.000 0.836 0.036
#> SRR1085519 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 5 0.2088 0.739506 0.000 0.068 0.000 0.000 0.904 0.028
#> SRR1442928 5 0.1863 0.750985 0.000 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR1464681 4 0.3907 0.654847 0.000 0.176 0.000 0.756 0.000 0.068
#> SRR1418880 1 0.3076 0.740184 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1309070 5 0.4834 0.509966 0.000 0.104 0.000 0.000 0.644 0.252
#> SRR1365426 4 0.1444 0.751277 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1487947 6 0.4895 0.461391 0.032 0.044 0.000 0.268 0.000 0.656
#> SRR659708 6 0.4524 0.375412 0.000 0.048 0.000 0.336 0.000 0.616
#> SRR603236 5 0.1498 0.762453 0.000 0.032 0.000 0.000 0.940 0.028
#> SRR660673 1 0.3023 0.747533 0.768 0.000 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1430729 2 0.5285 0.611956 0.000 0.620 0.000 0.188 0.188 0.004
#> SRR663807 2 0.3989 0.278136 0.000 0.528 0.000 0.000 0.468 0.004
#> SRR1087245 2 0.4931 0.609703 0.000 0.648 0.000 0.136 0.216 0.000
#> SRR1339108 4 0.0146 0.785850 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR613426 4 0.5428 0.495655 0.016 0.172 0.000 0.628 0.000 0.184
#> SRR613879 2 0.4639 0.585587 0.000 0.660 0.000 0.256 0.084 0.000
#> SRR1385101 4 0.0000 0.785650 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.3979 0.309300 0.000 0.540 0.000 0.000 0.456 0.004
#> SRR1458852 5 0.0914 0.782466 0.000 0.016 0.000 0.000 0.968 0.016
#> SRR1430489 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.1492 0.871187 0.940 0.000 0.000 0.024 0.000 0.036
#> SRR1376249 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321987 5 0.0508 0.783663 0.000 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR662653 5 0.0858 0.783895 0.000 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1390027 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.5187 0.356242 0.000 0.600 0.000 0.136 0.000 0.264
#> SRR1383081 2 0.3869 0.222933 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR2166960 5 0.3858 0.659461 0.000 0.216 0.000 0.000 0.740 0.044
#> SRR605101 4 0.0865 0.776649 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR818600 5 0.2624 0.753708 0.000 0.124 0.000 0.000 0.856 0.020
#> SRR1367715 4 0.0458 0.783784 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351979 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.5416 0.685718 0.000 0.084 0.656 0.000 0.056 0.204
#> SRR1322662 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 5 0.2972 0.750705 0.000 0.128 0.000 0.000 0.836 0.036
#> SRR612767 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.3862 0.456960 0.000 0.608 0.000 0.000 0.388 0.004
#> SRR1430375 5 0.0725 0.783713 0.000 0.012 0.000 0.000 0.976 0.012
#> SRR615225 2 0.4444 0.398812 0.000 0.708 0.000 0.184 0.000 0.108
#> SRR1401839 2 0.3807 0.482551 0.000 0.628 0.000 0.000 0.368 0.004
#> SRR1379110 4 0.0603 0.784448 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1077288 3 0.0146 0.864998 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1331639 4 0.4787 0.516631 0.000 0.336 0.000 0.596 0.000 0.068
#> SRR1342782 2 0.4646 0.540491 0.000 0.616 0.000 0.324 0.060 0.000
#> SRR1443003 3 0.5360 0.689025 0.000 0.084 0.660 0.000 0.052 0.204
#> SRR612839 1 0.4869 0.586149 0.628 0.000 0.000 0.096 0.000 0.276
#> SRR1470093 3 0.5530 0.674629 0.000 0.092 0.644 0.000 0.056 0.208
#> SRR1395742 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 5 0.6107 0.406865 0.000 0.100 0.080 0.000 0.576 0.244
#> SRR664063 4 0.3736 0.623582 0.000 0.156 0.000 0.776 0.000 0.068
#> SRR1488214 1 0.5468 0.473880 0.568 0.000 0.000 0.188 0.000 0.244
#> SRR654766 4 0.3796 0.659388 0.000 0.140 0.000 0.776 0.000 0.084
#> SRR1320321 4 0.0790 0.777643 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3765 0.429264 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000 0.000
#> SRR1488470 4 0.5431 0.191373 0.000 0.344 0.000 0.524 0.000 0.132
#> SRR1389497 3 0.0000 0.865873 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 5 0.5131 0.543535 0.000 0.100 0.028 0.000 0.672 0.200
#> SRR615311 1 0.0000 0.900501 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.989 0.996 0.5011 0.499 0.499
#> 3 3 0.816 0.875 0.940 0.2716 0.824 0.661
#> 4 4 0.961 0.942 0.974 0.1619 0.822 0.553
#> 5 5 0.896 0.856 0.934 0.0461 0.947 0.801
#> 6 6 0.904 0.858 0.930 0.0285 0.957 0.815
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 4
There is also optional best \(k\) = 2 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1380716 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1084417 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1105057 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1409263 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1334889 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR614839 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1334512 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1404837 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1375509 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR612227 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1413872 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1358220 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1096662 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR809595 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.9358 0.4627 0.352 0.648
#> SRR1392186 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.5294 0.8611 0.120 0.880
#> SRR612683 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR813656 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1489307 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1383259 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.2778 0.9445 0.048 0.952
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR612539 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR602010 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR818773 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1368117 1 0.5737 0.8415 0.864 0.136
#> SRR1442754 1 0.0672 0.9909 0.992 0.008
#> SRR1334247 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR613222 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1459937 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR661074 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1405123 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR661096 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1466512 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1353924 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1314832 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.9491 0.4240 0.368 0.632
#> SRR1418561 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3274 0.9316 0.060 0.940
#> SRR1435311 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1429265 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR615611 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR815044 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1338560 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR615862 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1480038 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR615323 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1330327 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1318444 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR600656 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR658766 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR656860 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1480547 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR820907 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1405984 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1319710 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1074719 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1403280 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.2236 0.9569 0.036 0.964
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR818901 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1384138 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR661961 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1365034 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1475300 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1345760 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1402172 1 0.5178 0.8680 0.884 0.116
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1356705 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1432390 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1089424 1 0.1184 0.9828 0.984 0.016
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1400551 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR601671 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1408249 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR663284 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR614852 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1348040 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1489610 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1499566 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1361480 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1381348 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1454117 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1432743 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1087825 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR662019 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1349209 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1345284 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR663356 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1440744 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1452334 1 0.0376 0.9949 0.996 0.004
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1319626 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1367988 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1355217 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR598044 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR655052 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.9993 0.0709 0.484 0.516
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR655040 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1325377 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1481396 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1478386 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1440101 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1071231 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1459125 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1401379 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR600981 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1319648 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1390437 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR612635 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1351480 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1409575 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1464681 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1339108 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1376249 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1383081 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR605101 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1367715 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1379110 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1077288 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1331639 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR654766 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1320321 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.8955 0.5503 0.312 0.688
#> SRR1488470 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.9923 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9988 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1380716 1 0.3551 0.8853 0.868 0.132 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074359 3 0.4452 0.7040 0.000 0.192 0.808
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 3 0.6168 0.2243 0.000 0.412 0.588
#> SRR1499740 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.5948 0.3382 0.360 0.640 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.4750 0.7277 0.784 0.000 0.216
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 1 0.0592 0.9646 0.988 0.000 0.012
#> SRR614839 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR658433 3 0.6140 0.2500 0.000 0.404 0.596
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 1 0.3551 0.8853 0.868 0.132 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1447103 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.3412 0.8670 0.000 0.876 0.124
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 1 0.3686 0.8777 0.860 0.140 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.4452 0.8226 0.000 0.808 0.192
#> SRR1413872 1 0.3879 0.8655 0.848 0.152 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 3 0.4062 0.7422 0.000 0.164 0.836
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358220 1 0.3412 0.8926 0.876 0.124 0.000
#> SRR1096662 1 0.0237 0.9714 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR815783 3 0.6140 0.2500 0.000 0.404 0.596
#> SRR809595 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR815470 2 0.4605 0.8120 0.000 0.796 0.204
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392186 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.3192 0.7761 0.112 0.000 0.888
#> SRR612683 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 1 0.3752 0.8198 0.856 0.144 0.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1419110 2 0.6291 0.2362 0.000 0.532 0.468
#> SRR1408682 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 1 0.2356 0.9330 0.928 0.072 0.000
#> SRR1453911 2 0.4605 0.8120 0.000 0.796 0.204
#> SRR603164 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.1289 0.9482 0.968 0.000 0.032
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 3 0.4931 0.6417 0.000 0.232 0.768
#> SRR615635 2 0.4235 0.8352 0.000 0.824 0.176
#> SRR1385411 3 0.6168 0.2454 0.000 0.412 0.588
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.4555 0.8162 0.000 0.800 0.200
#> SRR1464601 3 0.4346 0.7155 0.000 0.184 0.816
#> SRR1071594 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.4399 0.6926 0.188 0.812 0.000
#> SRR602010 1 0.3340 0.8960 0.880 0.120 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 1 0.6308 0.0611 0.508 0.000 0.492
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459937 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.4504 0.8193 0.000 0.804 0.196
#> SRR809348 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR661096 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.2356 0.8727 0.000 0.928 0.072
#> SRR1466512 1 0.3482 0.8889 0.872 0.128 0.000
#> SRR658212 3 0.4504 0.6985 0.000 0.196 0.804
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353924 1 0.3551 0.8855 0.868 0.132 0.000
#> SRR1314832 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR612395 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR603116 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 1 0.2796 0.9176 0.908 0.092 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR815044 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338560 1 0.4178 0.8419 0.828 0.172 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.1964 0.9430 0.944 0.056 0.000
#> SRR1330327 1 0.1753 0.9477 0.952 0.048 0.000
#> SRR1489950 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR600656 1 0.3412 0.8925 0.876 0.124 0.000
#> SRR658766 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0237 0.8537 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480547 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR615273 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR601695 3 0.6168 0.2243 0.000 0.412 0.588
#> SRR820907 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 1 0.2959 0.9123 0.900 0.100 0.000
#> SRR1472794 2 0.4605 0.8120 0.000 0.796 0.204
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1326604 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.4555 0.6698 0.200 0.800 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1353900 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR662906 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1403280 2 0.0237 0.8537 0.004 0.996 0.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 1 0.5988 0.4984 0.632 0.368 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.3482 0.8653 0.000 0.872 0.128
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.4178 0.8379 0.000 0.828 0.172
#> SRR1365034 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1478053 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR1475300 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1328101 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309942 3 0.6274 0.0582 0.000 0.456 0.544
#> SRR1345760 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.6140 0.2500 0.000 0.404 0.596
#> SRR661469 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.5760 0.6131 0.000 0.672 0.328
#> SRR1356705 1 0.3192 0.9027 0.888 0.112 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR601815 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.6295 0.2213 0.000 0.528 0.472
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 1 0.4842 0.7785 0.776 0.224 0.000
#> SRR613126 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1309556 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 3 0.4931 0.6102 0.232 0.000 0.768
#> SRR614251 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR615105 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.4702 0.6743 0.000 0.212 0.788
#> SRR601671 1 0.3340 0.8960 0.880 0.120 0.000
#> SRR663874 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1409130 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR1408249 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR663284 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 1 0.2165 0.9381 0.936 0.064 0.000
#> SRR1348040 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489610 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1488091 2 0.4605 0.8120 0.000 0.796 0.204
#> SRR1499566 1 0.0747 0.9652 0.984 0.016 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.6307 0.1641 0.000 0.512 0.488
#> SRR1388832 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.3482 0.8653 0.000 0.872 0.128
#> SRR662918 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR817421 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.1163 0.8636 0.000 0.972 0.028
#> SRR1396786 2 0.6111 0.4557 0.000 0.604 0.396
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR655170 3 0.1163 0.8941 0.000 0.028 0.972
#> SRR1087825 1 0.3192 0.9027 0.888 0.112 0.000
#> SRR662019 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 3 0.5591 0.5050 0.304 0.000 0.696
#> SRR1326161 3 0.6252 0.1073 0.000 0.444 0.556
#> SRR1345284 1 0.1860 0.9454 0.948 0.052 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 1 0.3192 0.9027 0.888 0.112 0.000
#> SRR1454328 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.4605 0.8119 0.000 0.796 0.204
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.6813 -0.0752 0.468 0.520 0.012
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.5178 0.5908 0.256 0.744 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1367988 1 0.1860 0.9454 0.948 0.052 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 3 0.6154 0.2373 0.000 0.408 0.592
#> SRR1386991 2 0.3267 0.8707 0.000 0.884 0.116
#> SRR1355217 1 0.1163 0.9588 0.972 0.028 0.000
#> SRR1356290 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR659507 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.4605 0.6650 0.204 0.796 0.000
#> SRR661155 3 0.4702 0.6743 0.000 0.212 0.788
#> SRR1414727 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.4504 0.8192 0.000 0.804 0.196
#> SRR655052 2 0.0592 0.8489 0.012 0.988 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.3551 0.8632 0.000 0.868 0.132
#> SRR613951 3 0.1753 0.8607 0.048 0.000 0.952
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0237 0.8537 0.004 0.996 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 3 0.6140 0.2500 0.000 0.404 0.596
#> SRR1480455 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR663026 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 1 0.3340 0.8960 0.880 0.120 0.000
#> SRR660260 3 0.6126 0.2619 0.000 0.400 0.600
#> SRR1071231 2 0.1643 0.8267 0.044 0.956 0.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR600981 1 0.3619 0.8814 0.864 0.136 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 3 0.6204 0.1827 0.000 0.424 0.576
#> SRR1359780 3 0.6274 0.0582 0.000 0.456 0.544
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 3 0.6154 0.2373 0.000 0.408 0.592
#> SRR1319648 1 0.3619 0.8828 0.864 0.136 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390437 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR612635 1 0.3752 0.8742 0.856 0.144 0.000
#> SRR1351480 1 0.3551 0.8853 0.868 0.132 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR614263 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 1 0.3619 0.8814 0.864 0.136 0.000
#> SRR659911 2 0.4235 0.8350 0.000 0.824 0.176
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1464681 1 0.3340 0.8960 0.880 0.120 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 1 0.0424 0.9694 0.992 0.008 0.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1031 0.8625 0.000 0.976 0.024
#> SRR663807 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1087245 2 0.2261 0.8724 0.000 0.932 0.068
#> SRR1339108 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 1 0.1964 0.9430 0.944 0.056 0.000
#> SRR1387966 2 0.3192 0.8725 0.000 0.888 0.112
#> SRR1458852 3 0.6235 0.1384 0.000 0.436 0.564
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 3 0.6180 0.2107 0.000 0.416 0.584
#> SRR662653 3 0.6168 0.2243 0.000 0.412 0.588
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.0424 0.9117 0.000 0.008 0.992
#> SRR1383081 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR605101 1 0.3340 0.8960 0.880 0.120 0.000
#> SRR818600 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR1367715 1 0.2261 0.9356 0.932 0.068 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4654 0.8077 0.000 0.792 0.208
#> SRR612767 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.2356 0.8727 0.000 0.928 0.072
#> SRR1430375 3 0.6140 0.2500 0.000 0.404 0.596
#> SRR615225 3 0.5327 0.5785 0.000 0.272 0.728
#> SRR1401839 2 0.3340 0.8689 0.000 0.880 0.120
#> SRR1379110 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 1 0.0237 0.9709 0.996 0.004 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 1 0.1860 0.9454 0.948 0.052 0.000
#> SRR1320321 1 0.3551 0.8853 0.868 0.132 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.8554 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9190 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9733 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR612803 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.4790 0.4577 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665262 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499740 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105057 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.1211 0.9440 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 1 0.0707 0.9687 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR614839 1 0.3528 0.7557 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR658433 2 0.2081 0.9031 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1088581 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334512 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 2 0.4072 0.7055 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655887 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0592 0.9705 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR613999 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615814 2 0.2408 0.8866 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358220 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1096662 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 4 0.3172 0.8138 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR660164 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815783 2 0.1940 0.9086 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR809595 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0817 0.9366 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0469 0.9712 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1478362 4 0.0336 0.9601 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1392186 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0592 0.9640 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR612683 2 0.0188 0.9444 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1392901 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 1 0.3052 0.8331 0.860 0.136 0.000 0.004
#> SRR808244 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0469 0.9586 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1453911 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383259 4 0.0336 0.9617 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1330854 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 4 0.3024 0.8264 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361546 4 0.0336 0.9603 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2149 0.9000 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 3 0.6238 0.5326 0.000 0.236 0.652 0.112
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.1743 0.9194 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1464601 2 0.3764 0.7590 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1071594 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 4 0.1867 0.8925 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR602010 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR810249 2 0.0707 0.9341 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR818773 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.3311 0.7921 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1459937 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809348 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 1 0.0469 0.9744 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR661096 1 0.4522 0.5177 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1466512 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR658212 2 0.2868 0.8557 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344422 3 0.1824 0.9195 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1353924 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1314832 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435311 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR612395 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368264 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.0336 0.9597 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.3356 0.7792 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR815044 4 0.4761 0.4392 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1338560 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR615862 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480038 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR659436 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613699 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1330327 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600656 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR658766 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 4 0.4522 0.5551 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662498 3 0.2345 0.8736 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656860 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480547 1 0.4500 0.5318 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1452515 3 0.0592 0.9673 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601695 2 0.2011 0.9059 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR820907 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR812773 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319710 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1326604 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662245 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074719 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR816226 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0336 0.9419 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614575 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353900 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662906 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313969 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 4 0.3400 0.7888 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR818901 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR607067 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658259 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309942 2 0.2011 0.9059 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1345760 1 0.4477 0.5364 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.2281 0.8938 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR661469 3 0.2345 0.8732 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1500323 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1356705 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0188 0.9785 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR613126 2 0.4661 0.5291 0.000 0.652 0.348 0.000
#> SRR1089424 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.4103 0.6592 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR614251 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 2 0.2773 0.8741 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR601671 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR663874 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1409130 2 0.4941 0.3059 0.000 0.564 0.436 0.000
#> SRR659696 2 0.4950 0.3533 0.000 0.620 0.004 0.376
#> SRR1408249 1 0.0336 0.9782 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR663284 1 0.0188 0.9816 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1348040 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489610 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1361480 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.0817 0.9366 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1388832 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR817421 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.0469 0.9586 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR655170 3 0.0188 0.9785 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1087825 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR662019 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349209 3 0.4950 0.3882 0.376 0.000 0.620 0.004
#> SRR1326161 2 0.1940 0.9086 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1345284 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1454328 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 2 0.4999 0.0982 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR658989 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.3610 0.7807 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355217 4 0.1716 0.9110 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1356290 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659507 2 0.4761 0.4760 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598044 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR661155 2 0.3355 0.8268 0.000 0.836 0.160 0.004
#> SRR1414727 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655052 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613951 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0188 0.9785 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655040 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR617829 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402328 2 0.2011 0.9059 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1480455 3 0.4830 0.2944 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1478386 4 0.4804 0.4076 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR660260 2 0.1940 0.9084 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1071231 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1459125 4 0.0188 0.9623 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1337173 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659816 3 0.4500 0.5144 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1401379 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR600981 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR660115 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.3444 0.8007 0.000 0.816 0.184 0.000
#> SRR1359780 2 0.2011 0.9059 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.2589 0.8763 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1319648 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390437 4 0.1302 0.9299 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR658057 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612635 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1351480 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR659911 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464681 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365426 4 0.3172 0.8139 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1487947 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.0336 0.9748 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339108 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR613426 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1385101 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.2469 0.8836 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.2081 0.9031 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR662653 2 0.2081 0.9031 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR605101 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR818600 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1367715 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0188 0.9458 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.1867 0.9108 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR615225 3 0.3908 0.7125 0.000 0.212 0.784 0.004
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379110 4 0.3400 0.7888 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331639 4 0.0000 0.9626 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9465 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR664063 1 0.3400 0.7731 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1320321 4 0.0188 0.9645 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 4 0.4477 0.5564 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1488470 4 0.4746 0.4488 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9819 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.9854 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380716 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.3895 0.56201 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499740 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105057 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.3876 0.54070 0.000 0.316 0.684 0.000 0.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0290 0.97130 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 4 0.0000 0.68936 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 1 0.4897 0.03364 0.516 0.000 0.000 0.024 0.460
#> SRR658433 2 0.1965 0.84735 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1088581 3 0.3143 0.73181 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1328797 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 4 0.3661 0.59108 0.000 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1471117 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447103 2 0.2732 0.77479 0.000 0.840 0.160 0.000 0.000
#> SRR1402153 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655887 2 0.0794 0.89249 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329003 4 0.4161 0.42522 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1404837 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.4874 0.47553 0.368 0.000 0.000 0.600 0.032
#> SRR613999 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612227 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.1965 0.68825 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1452864 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615814 2 0.2813 0.77545 0.000 0.832 0.168 0.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358220 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096662 4 0.5476 0.41628 0.068 0.000 0.000 0.544 0.388
#> SRR1487746 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.0510 0.85723 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR660164 2 0.4101 0.54763 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR815783 2 0.1043 0.88581 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR809595 1 0.0963 0.94054 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1403133 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815470 2 0.1341 0.87787 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.2127 0.86161 0.000 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR1478362 4 0.4341 0.48897 0.000 0.008 0.000 0.628 0.364
#> SRR1392186 1 0.0510 0.96255 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1347937 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0609 0.95606 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR612683 2 0.5562 0.51657 0.000 0.644 0.000 0.200 0.156
#> SRR1392901 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 4 0.3224 0.65158 0.160 0.016 0.000 0.824 0.000
#> SRR808244 1 0.3837 0.50304 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 5 0.5725 -0.16638 0.084 0.000 0.000 0.428 0.488
#> SRR1435248 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0609 0.89459 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383259 5 0.4648 -0.18687 0.012 0.000 0.000 0.464 0.524
#> SRR1330854 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 5 0.1270 0.81895 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1468162 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361546 5 0.4226 0.65115 0.000 0.140 0.000 0.084 0.776
#> SRR1486156 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.2690 0.78947 0.000 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385411 4 0.0000 0.68936 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662126 4 0.2719 0.63077 0.000 0.144 0.004 0.852 0.000
#> SRR1464601 2 0.2966 0.75308 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1071594 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612539 5 0.0609 0.85758 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR602010 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR810249 2 0.2179 0.81370 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR818773 1 0.4304 0.00305 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1336569 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 5 0.3707 0.56242 0.000 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1442754 1 0.3246 0.70632 0.808 0.000 0.184 0.008 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.0290 0.97130 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1459937 4 0.4182 0.43558 0.000 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR2185018 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.2074 0.85452 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.2424 0.67431 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR661096 5 0.4088 0.32396 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1320225 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.4161 0.42522 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1307677 2 0.4074 0.56147 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1466512 5 0.0510 0.86136 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR658212 2 0.4761 0.70396 0.000 0.728 0.168 0.104 0.000
#> SRR1430525 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.4223 0.54259 0.000 0.028 0.248 0.724 0.000
#> SRR1353924 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314832 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 5 0.4278 0.16020 0.000 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1418561 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0290 0.97130 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 5 0.3612 0.58648 0.000 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1435311 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368264 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.2230 0.65810 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1486799 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.1410 0.91151 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR815044 5 0.4088 0.32315 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1338560 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615862 4 0.3424 0.54013 0.000 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1480038 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613699 2 0.2074 0.85452 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330327 4 0.4150 0.45730 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1489950 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.5322 0.52019 0.320 0.000 0.000 0.608 0.072
#> SRR600656 4 0.3966 0.52946 0.000 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR658766 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.2732 0.66640 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR1471965 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662498 3 0.0794 0.95257 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656860 4 0.2074 0.66728 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1480547 4 0.3810 0.66605 0.088 0.000 0.000 0.812 0.100
#> SRR1452515 3 0.1341 0.92343 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615273 1 0.0290 0.97130 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR601695 2 0.1270 0.87950 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR820907 5 0.1608 0.82159 0.000 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR812773 1 0.0290 0.97058 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1405984 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.3983 0.59565 0.000 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662245 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074719 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.4210 0.26846 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR614575 2 0.2516 0.82930 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1353900 2 0.1732 0.86902 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR662906 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403280 5 0.3949 0.49515 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1313969 4 0.3999 0.51898 0.000 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1388528 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.1792 0.88216 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR655399 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 5 0.2074 0.75301 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR818901 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR607067 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.2074 0.66491 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR661961 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658259 2 0.3966 0.60204 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365034 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475300 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322900 1 0.0290 0.97058 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309942 2 0.1478 0.87215 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.4874 0.46934 0.368 0.000 0.000 0.600 0.032
#> SRR1435418 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.1608 0.69211 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1443436 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1608 0.86615 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR661469 3 0.1270 0.92654 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356705 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0671 0.89657 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.1043 0.94230 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.4219 0.39176 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR613126 2 0.4015 0.52350 0.000 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR1089424 5 0.3661 0.57486 0.000 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1347214 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309556 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.4201 0.43684 0.664 0.000 0.328 0.008 0.000
#> SRR614251 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.4378 0.47682 0.000 0.248 0.036 0.716 0.000
#> SRR601671 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.1792 0.86681 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1409130 2 0.4294 0.20666 0.000 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.2966 0.64253 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1408249 1 0.1197 0.92600 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR663284 4 0.2280 0.66838 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614852 4 0.3774 0.57513 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1348040 1 0.3039 0.72652 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1489610 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499566 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361480 5 0.0566 0.86148 0.000 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1444501 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.0404 0.89683 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1388832 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662918 2 0.3816 0.64644 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.4138 0.33234 0.000 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR608264 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406008 2 0.0404 0.89711 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 5 0.1121 0.83047 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR655170 3 0.0609 0.96109 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1087825 4 0.3561 0.60528 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR662019 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349209 4 0.2983 0.68694 0.096 0.000 0.040 0.864 0.000
#> SRR1326161 2 0.0703 0.89249 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1345284 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0162 0.97435 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1408183 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 3 0.5030 0.59253 0.000 0.200 0.696 0.104 0.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.4161 0.42522 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440744 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.0000 0.68936 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367988 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 2 0.3452 0.68049 0.000 0.756 0.244 0.000 0.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355217 5 0.2928 0.77479 0.064 0.000 0.000 0.064 0.872
#> SRR1356290 3 0.0290 0.97337 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR659507 2 0.4074 0.49185 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR663296 1 0.0290 0.97130 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR598044 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR661155 4 0.3365 0.64196 0.000 0.120 0.044 0.836 0.000
#> SRR1414727 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655052 4 0.2179 0.68322 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1478968 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 4 0.3305 0.52551 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR613951 4 0.4060 0.40285 0.000 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3210 0.58898 0.000 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655040 1 0.3177 0.69991 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR810225 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325377 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 2 0.1270 0.87935 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1480455 3 0.4192 0.25740 0.000 0.404 0.596 0.000 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.4701 0.59835 0.000 0.704 0.000 0.060 0.236
#> SRR1478386 5 0.2020 0.76148 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1458683 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.1043 0.93611 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1310735 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.4060 0.49555 0.000 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR660260 2 0.3164 0.83666 0.000 0.852 0.044 0.104 0.000
#> SRR1071231 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459125 5 0.2074 0.76922 0.000 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1337173 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.1908 0.88657 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR659816 3 0.4609 0.67231 0.000 0.152 0.744 0.104 0.000
#> SRR1401379 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR600981 4 0.2773 0.66495 0.000 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1398335 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.2424 0.81039 0.000 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.1544 0.86926 0.000 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.1608 0.86615 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1319648 4 0.3366 0.60739 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1092985 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390437 5 0.0404 0.86143 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR658057 2 0.3966 0.60204 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR612635 5 0.2074 0.79157 0.000 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1351480 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.2074 0.85452 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464681 4 0.3684 0.59045 0.000 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1418880 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365426 5 0.1478 0.80539 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1487947 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0290 0.97130 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR603236 3 0.0609 0.96139 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.3932 0.61389 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1339108 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613426 4 0.4201 0.39035 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR613879 2 0.4114 0.54010 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1385101 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.1544 0.86891 0.000 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.1544 0.86926 0.000 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.1671 0.86348 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383081 5 0.3752 0.55124 0.000 0.000 0.000 0.292 0.708
#> SRR2166960 2 0.2074 0.85452 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR605101 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.1544 0.87532 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1367715 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.2074 0.85452 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.1341 0.87707 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR615225 4 0.0000 0.68936 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379110 5 0.2471 0.70551 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR1077288 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331639 4 0.1965 0.68825 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1342782 2 0.0000 0.90076 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR664063 5 0.4443 0.13129 0.472 0.000 0.000 0.004 0.524
#> SRR1488214 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 5 0.4305 -0.17848 0.000 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1320321 5 0.0000 0.87056 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 5 0.5889 0.21271 0.000 0.104 0.000 0.392 0.504
#> SRR1488470 4 0.5006 0.61862 0.156 0.000 0.000 0.708 0.136
#> SRR1389497 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.98099 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.97804 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1380716 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.0806 9.47e-01 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1074359 5 0.2946 7.52e-01 0.000 0.000 0.176 0.000 0.812 0.012
#> SRR1419258 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0146 9.65e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR665262 5 0.1075 8.91e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1499740 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105057 2 0.0260 8.85e-01 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 5 0.2706 7.69e-01 0.000 0.000 0.160 0.000 0.832 0.008
#> SRR612215 5 0.0547 9.02e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1094051 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.2136 8.93e-01 0.904 0.000 0.000 0.048 0.000 0.048
#> SRR1409263 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 6 0.2697 6.72e-01 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR614839 2 0.5099 4.68e-01 0.264 0.636 0.000 0.016 0.000 0.084
#> SRR658433 5 0.2491 8.28e-01 0.000 0.000 0.112 0.000 0.868 0.020
#> SRR1088581 4 0.3862 1.02e-01 0.000 0.000 0.476 0.524 0.000 0.000
#> SRR1328797 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.5116 5.16e-01 0.000 0.612 0.000 0.256 0.000 0.132
#> SRR1471117 1 0.0692 9.56e-01 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1311553 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 5 0.0717 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1354955 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660066 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1447103 5 0.2218 8.42e-01 0.000 0.000 0.104 0.000 0.884 0.012
#> SRR1402153 3 0.0806 9.47e-01 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR655887 5 0.2783 7.65e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.836 0.148
#> SRR1408529 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375439 5 0.0363 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1329003 4 0.3065 6.96e-01 0.152 0.000 0.000 0.820 0.000 0.028
#> SRR1404837 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.2882 6.82e-01 0.180 0.008 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068855 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612227 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388809 5 0.0547 9.02e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1413872 4 0.1411 7.84e-01 0.000 0.004 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR1452864 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615814 5 0.4239 5.94e-01 0.000 0.000 0.248 0.000 0.696 0.056
#> SRR1325225 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.3983 7.42e-01 0.088 0.796 0.000 0.084 0.000 0.032
#> SRR1487746 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660164 6 0.1320 7.59e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.036 0.948
#> SRR815783 5 0.2009 8.68e-01 0.000 0.000 0.068 0.000 0.908 0.024
#> SRR809595 1 0.0713 9.49e-01 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403133 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR815470 5 0.2618 8.52e-01 0.000 0.000 0.052 0.000 0.872 0.076
#> SRR1344382 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4184 -5.17e-02 0.000 0.000 0.504 0.000 0.484 0.012
#> SRR1478362 4 0.2879 7.61e-01 0.000 0.044 0.000 0.868 0.072 0.016
#> SRR1392186 1 0.1444 9.05e-01 0.928 0.072 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.1914 8.96e-01 0.016 0.000 0.920 0.056 0.000 0.008
#> SRR612683 6 0.4978 4.43e-01 0.000 0.032 0.000 0.024 0.384 0.560
#> SRR1392901 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360402 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1406112 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0146 9.65e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR656247 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 6 0.1863 7.20e-01 0.036 0.000 0.000 0.044 0.000 0.920
#> SRR808244 4 0.3938 5.89e-01 0.228 0.000 0.000 0.728 0.000 0.044
#> SRR1387240 5 0.0713 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1408595 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.3619 6.89e-01 0.024 0.232 0.000 0.744 0.000 0.000
#> SRR1435248 5 0.0260 9.05e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1419110 5 0.0547 9.02e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1408682 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1317134 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 5 0.1408 8.90e-01 0.000 0.000 0.036 0.000 0.944 0.020
#> SRR603164 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383259 2 0.3837 6.45e-01 0.052 0.752 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.1196 9.37e-01 0.952 0.000 0.000 0.040 0.000 0.008
#> SRR1452423 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0260 8.83e-01 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361546 2 0.5552 6.03e-01 0.000 0.664 0.000 0.144 0.072 0.120
#> SRR1486156 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 5 0.4793 4.89e-01 0.000 0.000 0.288 0.000 0.628 0.084
#> SRR615635 5 0.0405 9.07e-01 0.000 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1385411 6 0.2562 6.74e-01 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1342739 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662126 6 0.0972 7.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008 0.964
#> SRR1464601 5 0.2572 8.03e-01 0.000 0.000 0.136 0.000 0.852 0.012
#> SRR1071594 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612539 6 0.4406 1.49e-01 0.000 0.464 0.000 0.012 0.008 0.516
#> SRR602010 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810249 5 0.1503 8.80e-01 0.000 0.032 0.000 0.016 0.944 0.008
#> SRR818773 2 0.4453 2.15e-01 0.444 0.528 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1336569 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.5290 5.14e-01 0.000 0.612 0.000 0.152 0.004 0.232
#> SRR1442754 1 0.4716 6.13e-01 0.716 0.000 0.188 0.048 0.000 0.048
#> SRR1334247 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 1 0.3766 6.33e-01 0.720 0.000 0.000 0.024 0.000 0.256
#> SRR1459937 4 0.2854 7.13e-01 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 6 0.2527 7.41e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR809348 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.1327 7.78e-01 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR661096 2 0.2454 7.05e-01 0.160 0.840 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.3065 6.96e-01 0.152 0.000 0.000 0.820 0.000 0.028
#> SRR1307677 6 0.1398 7.62e-01 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052 0.940
#> SRR1466512 2 0.1663 8.34e-01 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR658212 6 0.3254 7.34e-01 0.000 0.000 0.056 0.000 0.124 0.820
#> SRR1430525 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344422 6 0.3435 6.63e-01 0.000 0.000 0.128 0.028 0.024 0.820
#> SRR1353924 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.0806 9.47e-01 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1487570 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.6059 7.12e-02 0.000 0.380 0.000 0.360 0.000 0.260
#> SRR1418561 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1448029 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813802 1 0.2136 8.93e-01 0.904 0.000 0.000 0.048 0.000 0.048
#> SRR815020 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.5337 5.15e-01 0.000 0.608 0.000 0.164 0.004 0.224
#> SRR1435311 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612395 5 0.0937 8.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR603116 5 0.0717 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1323152 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368264 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 6 0.2805 6.77e-01 0.000 0.012 0.000 0.160 0.000 0.828
#> SRR1486799 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.1863 8.68e-01 0.896 0.104 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.3175 5.52e-01 0.256 0.744 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615862 6 0.3283 6.74e-01 0.000 0.036 0.000 0.160 0.000 0.804
#> SRR1480038 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613699 6 0.2597 7.36e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1436563 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330327 4 0.2882 7.34e-01 0.000 0.180 0.000 0.812 0.000 0.008
#> SRR1489950 5 0.0146 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431927 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0146 9.69e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318444 4 0.3546 7.38e-01 0.096 0.056 0.000 0.824 0.000 0.024
#> SRR600656 4 0.1625 7.97e-01 0.000 0.060 0.000 0.928 0.000 0.012
#> SRR658766 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655946 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0632 8.72e-01 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662498 3 0.2448 8.61e-01 0.000 0.000 0.884 0.000 0.052 0.064
#> SRR1376764 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656860 6 0.3201 6.51e-01 0.000 0.012 0.000 0.208 0.000 0.780
#> SRR1480547 6 0.4673 5.76e-01 0.104 0.016 0.000 0.164 0.000 0.716
#> SRR1452515 3 0.3053 7.48e-01 0.000 0.000 0.812 0.000 0.168 0.020
#> SRR1324390 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR615273 1 0.2136 8.93e-01 0.904 0.000 0.000 0.048 0.000 0.048
#> SRR601695 5 0.2094 8.61e-01 0.000 0.000 0.080 0.000 0.900 0.020
#> SRR820907 2 0.3779 7.39e-01 0.000 0.784 0.000 0.152 0.008 0.056
#> SRR812773 1 0.0937 9.36e-01 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0146 8.86e-01 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1472794 5 0.0458 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1365448 1 0.1856 9.08e-01 0.920 0.000 0.000 0.048 0.000 0.032
#> SRR1095720 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080766 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1377862 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326604 6 0.1531 7.62e-01 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068 0.928
#> SRR1098879 3 0.0291 9.63e-01 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR662245 3 0.1176 9.32e-01 0.000 0.000 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1074719 2 0.0717 8.76e-01 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR816226 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR601387 5 0.1850 8.61e-01 0.000 0.052 0.000 0.016 0.924 0.008
#> SRR614575 6 0.2632 7.40e-01 0.000 0.000 0.000 0.004 0.164 0.832
#> SRR1353900 6 0.3023 7.03e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR662906 3 0.0603 9.53e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1350832 5 0.0458 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1403280 6 0.5124 4.88e-01 0.000 0.232 0.000 0.148 0.000 0.620
#> SRR1313969 4 0.1434 7.98e-01 0.000 0.048 0.000 0.940 0.000 0.012
#> SRR1388528 1 0.0806 9.53e-01 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1452912 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.2491 7.90e-01 0.836 0.164 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.0865 8.61e-01 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607067 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 6 0.2912 6.76e-01 0.000 0.012 0.000 0.172 0.000 0.816
#> SRR661961 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658259 6 0.1219 7.62e-01 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048 0.948
#> SRR1310476 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 5 0.0458 9.05e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1365034 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478053 5 0.0717 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1475300 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328101 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1322900 1 0.1349 9.19e-01 0.940 0.056 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309942 5 0.2147 8.58e-01 0.000 0.000 0.084 0.000 0.896 0.020
#> SRR1345760 4 0.3315 6.63e-01 0.200 0.020 0.000 0.780 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.1910 7.53e-01 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1443436 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 5 0.2147 8.58e-01 0.000 0.000 0.084 0.000 0.896 0.020
#> SRR661469 3 0.3293 7.72e-01 0.000 0.000 0.812 0.000 0.048 0.140
#> SRR1500323 5 0.0547 9.02e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1356705 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368072 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR601815 5 0.0717 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR613330 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 5 0.2300 8.12e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1394190 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.1327 9.06e-01 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.1524 7.97e-01 0.000 0.060 0.000 0.932 0.000 0.008
#> SRR613126 5 0.3717 5.93e-01 0.000 0.000 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR1089424 2 0.5191 5.40e-01 0.000 0.628 0.000 0.148 0.004 0.220
#> SRR1347214 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1309556 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456027 1 0.2219 8.30e-01 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.5441 3.26e-01 0.576 0.000 0.328 0.048 0.000 0.048
#> SRR614251 3 0.0405 9.59e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1454310 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR615105 3 0.0820 9.46e-01 0.000 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1433290 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 6 0.2758 7.54e-01 0.000 0.000 0.016 0.012 0.112 0.860
#> SRR601671 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663874 6 0.3833 2.51e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1409130 3 0.4338 -9.57e-02 0.000 0.000 0.492 0.000 0.488 0.020
#> SRR659696 4 0.2828 7.42e-01 0.000 0.004 0.000 0.864 0.072 0.060
#> SRR1408249 1 0.1910 8.64e-01 0.892 0.108 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663284 6 0.1141 7.31e-01 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1402794 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614852 4 0.1657 7.98e-01 0.000 0.056 0.000 0.928 0.000 0.016
#> SRR1348040 1 0.3390 5.78e-01 0.704 0.296 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489610 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 5 0.0363 9.05e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1499566 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.2546 8.18e-01 0.000 0.888 0.000 0.040 0.060 0.012
#> SRR1444501 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 5 0.0508 9.07e-01 0.000 0.000 0.004 0.012 0.984 0.000
#> SRR1388832 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0291 9.67e-01 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR606974 5 0.0547 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR662918 6 0.2178 7.53e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR817421 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.5949 2.65e-01 0.000 0.452 0.000 0.300 0.000 0.248
#> SRR608264 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.0692 9.56e-01 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1454117 2 0.0146 8.86e-01 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 3 0.0622 9.53e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1432743 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388873 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1353517 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406008 5 0.2450 8.32e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.868 0.116
#> SRR1396786 5 0.0146 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1446564 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.1556 8.13e-01 0.080 0.920 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655170 3 0.1700 8.84e-01 0.000 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1087825 4 0.1549 7.97e-01 0.000 0.044 0.000 0.936 0.000 0.020
#> SRR662019 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349209 4 0.1542 7.79e-01 0.008 0.000 0.004 0.936 0.000 0.052
#> SRR1326161 5 0.1245 8.94e-01 0.000 0.000 0.032 0.000 0.952 0.016
#> SRR1345284 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454328 5 0.0547 9.02e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1489286 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660709 6 0.4191 6.17e-01 0.000 0.000 0.180 0.000 0.088 0.732
#> SRR809444 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 5 0.0363 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.3065 6.96e-01 0.152 0.000 0.000 0.820 0.000 0.028
#> SRR657139 1 0.0806 9.53e-01 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1440744 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0146 9.69e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452334 4 0.1327 7.82e-01 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1381775 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819054 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1367988 2 0.0937 8.61e-01 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 5 0.3952 5.37e-01 0.000 0.000 0.308 0.000 0.672 0.020
#> SRR1386991 5 0.0508 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1355217 2 0.3565 7.70e-01 0.012 0.816 0.000 0.100 0.000 0.072
#> SRR1356290 3 0.1500 9.10e-01 0.000 0.000 0.936 0.000 0.052 0.012
#> SRR659507 5 0.4078 4.84e-01 0.000 0.000 0.340 0.000 0.640 0.020
#> SRR663296 1 0.3817 6.31e-01 0.720 0.000 0.000 0.028 0.000 0.252
#> SRR598044 2 0.0146 8.86e-01 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR661155 6 0.3794 7.00e-01 0.000 0.000 0.016 0.128 0.060 0.796
#> SRR1414727 3 0.0146 9.65e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663477 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614611 5 0.0363 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR655052 4 0.1462 7.87e-01 0.000 0.008 0.000 0.936 0.000 0.056
#> SRR1478968 1 0.2219 8.30e-01 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1351280 6 0.1408 7.57e-01 0.000 0.000 0.000 0.020 0.036 0.944
#> SRR613951 4 0.2320 6.93e-01 0.000 0.000 0.132 0.864 0.000 0.004
#> SRR1418022 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.3616 6.92e-01 0.000 0.000 0.076 0.792 0.000 0.132
#> SRR1408161 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0865 9.37e-01 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR655040 1 0.3482 5.42e-01 0.684 0.316 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810225 5 0.0717 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1325377 2 0.0146 8.86e-01 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 5 0.2039 8.64e-01 0.000 0.000 0.076 0.000 0.904 0.020
#> SRR1480455 3 0.4331 8.58e-05 0.000 0.000 0.516 0.000 0.464 0.020
#> SRR1442104 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414314 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR663026 6 0.5933 5.14e-01 0.000 0.192 0.000 0.016 0.252 0.540
#> SRR1478386 2 0.1007 8.53e-01 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.1765 8.78e-01 0.904 0.096 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.1686 7.96e-01 0.000 0.064 0.000 0.924 0.000 0.012
#> SRR660260 6 0.3509 6.80e-01 0.000 0.000 0.016 0.000 0.240 0.744
#> SRR1071231 2 0.0146 8.86e-01 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1459125 4 0.3807 4.77e-01 0.000 0.368 0.000 0.628 0.004 0.000
#> SRR1337173 3 0.0622 9.53e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1396250 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 3 0.4123 2.34e-01 0.000 0.000 0.568 0.000 0.012 0.420
#> SRR659816 6 0.4222 6.12e-01 0.000 0.000 0.184 0.000 0.088 0.728
#> SRR1401379 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600981 4 0.1549 7.91e-01 0.000 0.020 0.000 0.936 0.000 0.044
#> SRR1398335 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 5 0.2489 8.14e-01 0.000 0.000 0.128 0.000 0.860 0.012
#> SRR1359780 5 0.2094 8.61e-01 0.000 0.000 0.080 0.000 0.900 0.020
#> SRR1490037 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 5 0.2112 8.56e-01 0.000 0.000 0.088 0.000 0.896 0.016
#> SRR1319648 2 0.5509 4.72e-01 0.000 0.564 0.000 0.220 0.000 0.216
#> SRR1092985 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390437 2 0.0632 8.71e-01 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658057 6 0.1411 7.63e-01 0.000 0.000 0.000 0.004 0.060 0.936
#> SRR612635 2 0.3796 7.28e-01 0.000 0.776 0.000 0.140 0.000 0.084
#> SRR1351480 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR614263 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659911 6 0.3076 6.89e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1085519 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 3 0.0692 9.49e-01 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1442928 5 0.0458 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1464681 4 0.1549 7.97e-01 0.000 0.044 0.000 0.936 0.000 0.020
#> SRR1418880 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365426 2 0.0363 8.81e-01 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.0806 9.53e-01 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR659708 1 0.2070 8.97e-01 0.908 0.000 0.000 0.048 0.000 0.044
#> SRR603236 3 0.2572 8.04e-01 0.000 0.000 0.852 0.000 0.136 0.012
#> SRR660673 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 5 0.0717 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR663807 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1087245 6 0.1610 7.61e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1339108 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613426 4 0.3940 4.52e-01 0.348 0.000 0.000 0.640 0.000 0.012
#> SRR613879 6 0.3650 7.13e-01 0.000 0.000 0.000 0.116 0.092 0.792
#> SRR1385101 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387966 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1458852 5 0.2070 8.53e-01 0.000 0.000 0.092 0.000 0.896 0.012
#> SRR1430489 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321987 5 0.2094 8.61e-01 0.000 0.000 0.080 0.000 0.900 0.020
#> SRR662653 5 0.2094 8.61e-01 0.000 0.000 0.080 0.000 0.900 0.020
#> SRR1390027 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.5380 4.76e-01 0.000 0.592 0.000 0.148 0.004 0.256
#> SRR2166960 6 0.2762 7.24e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR605101 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818600 5 0.3838 1.34e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1367715 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 6 0.3244 6.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR612767 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 5 0.0622 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1430375 5 0.2094 8.61e-01 0.000 0.000 0.080 0.000 0.900 0.020
#> SRR615225 4 0.1501 7.80e-01 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1401839 5 0.0508 9.06e-01 0.000 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1379110 2 0.1141 8.46e-01 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331639 4 0.1411 7.84e-01 0.000 0.004 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR1342782 5 0.0717 9.04e-01 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1443003 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612839 1 0.0692 9.56e-01 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1470093 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664063 6 0.4652 3.67e-01 0.312 0.064 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1488214 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 4 0.2969 7.00e-01 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 8.88e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 6 0.4120 6.87e-01 0.000 0.044 0.000 0.140 0.040 0.776
#> SRR1488470 6 0.6906 1.08e-01 0.144 0.352 0.000 0.096 0.000 0.408
#> SRR1389497 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0000 9.68e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615311 1 0.0000 9.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.979 0.991 0.4754 0.526 0.526
#> 3 3 0.882 0.912 0.961 0.3752 0.728 0.523
#> 4 4 0.774 0.823 0.907 0.0682 0.955 0.871
#> 5 5 0.813 0.742 0.893 0.1123 0.833 0.523
#> 6 6 0.757 0.433 0.721 0.0420 0.927 0.718
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.6148 0.820 0.152 0.848
#> SRR612803 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1084417 2 0.0672 0.983 0.008 0.992
#> SRR1074359 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1419258 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1403366 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1499740 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.9775 0.299 0.412 0.588
#> SRR1409263 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614839 2 0.8861 0.568 0.304 0.696
#> SRR658433 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1328797 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR654802 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1402153 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1408529 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1074670 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR658200 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1375509 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612227 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0938 0.980 0.012 0.988
#> SRR1452864 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1358220 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1096662 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1401752 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.0672 0.983 0.008 0.992
#> SRR1403133 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1392186 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1077805 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1355352 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR808244 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1385277 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.2603 0.949 0.044 0.956
#> SRR1453911 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1383259 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.7056 0.764 0.808 0.192
#> SRR1452423 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1102830 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.9710 0.339 0.400 0.600
#> SRR810249 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1442754 2 0.3114 0.935 0.056 0.944
#> SRR1334247 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.7139 0.758 0.196 0.804
#> SRR1459937 2 0.2423 0.953 0.040 0.960
#> SRR2185018 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR819261 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR661074 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1405123 1 0.2043 0.962 0.968 0.032
#> SRR661096 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1466512 1 0.1633 0.969 0.976 0.024
#> SRR658212 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1430525 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1353924 1 0.2423 0.953 0.960 0.040
#> SRR1314832 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1418561 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1368264 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1429265 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR815044 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.1184 0.976 0.016 0.984
#> SRR615862 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1480038 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR659436 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR615323 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1330327 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR600656 1 0.8955 0.545 0.688 0.312
#> SRR658766 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR655946 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1475104 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.1184 0.976 0.016 0.984
#> SRR1471965 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR612695 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1376764 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.9248 0.486 0.340 0.660
#> SRR1452515 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615273 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR812773 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.7883 0.691 0.236 0.764
#> SRR1472794 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1095720 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1435626 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1332299 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1467966 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1319710 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1098879 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662245 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR655399 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1319753 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR818901 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1365034 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1475300 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1322900 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1309942 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1345760 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1356705 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1318839 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.9427 0.441 0.360 0.640
#> SRR613126 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1400551 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1320469 1 0.9710 0.336 0.600 0.400
#> SRR614251 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1433290 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR601671 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1408249 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1402794 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614852 1 0.0672 0.985 0.992 0.008
#> SRR1348040 2 0.2778 0.945 0.048 0.952
#> SRR1489610 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1499566 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1444501 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR817421 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR608264 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1432743 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1318465 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1087825 1 0.0938 0.981 0.988 0.012
#> SRR662019 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1349209 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1345284 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR663356 1 0.4815 0.882 0.896 0.104
#> SRR1454328 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1408183 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1084369 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR598452 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0672 0.985 0.992 0.008
#> SRR1440744 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR658989 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR815825 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1367988 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.5842 0.836 0.860 0.140
#> SRR1375796 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.1414 0.972 0.020 0.980
#> SRR1356290 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1414727 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1377800 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR657054 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR655040 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1442104 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1481396 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1478386 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1440101 1 0.0672 0.985 0.992 0.008
#> SRR660260 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1396250 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1401379 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR1398335 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1390437 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0672 0.983 0.008 0.992
#> SRR1351480 2 0.1184 0.976 0.016 0.984
#> SRR1436651 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1409575 1 0.7056 0.763 0.808 0.192
#> SRR659911 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1085519 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1464681 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.1184 0.976 0.016 0.984
#> SRR1487947 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1339108 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1385101 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1376249 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.1184 0.976 0.016 0.984
#> SRR818600 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1367715 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1351979 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1387054 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1444306 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1379110 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1077288 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.0938 0.980 0.012 0.988
#> SRR1488214 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR654766 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.1184 0.976 0.016 0.984
#> SRR1071955 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1389497 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.992 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.0592 0.929 0.000 0.012 0.988
#> SRR1074359 3 0.4062 0.832 0.000 0.164 0.836
#> SRR1419258 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0237 0.931 0.000 0.004 0.996
#> SRR665262 3 0.4702 0.778 0.000 0.212 0.788
#> SRR1499740 2 0.0747 0.948 0.000 0.984 0.016
#> SRR1105057 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4121 0.831 0.000 0.168 0.832
#> SRR612215 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR1094051 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.6111 0.313 0.396 0.604 0.000
#> SRR1409263 3 0.0592 0.929 0.000 0.012 0.988
#> SRR1431288 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 3 0.2165 0.902 0.000 0.064 0.936
#> SRR1088581 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR1328797 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.4235 0.822 0.000 0.176 0.824
#> SRR1402153 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR655887 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.6126 0.428 0.000 0.400 0.600
#> SRR1074670 3 0.0592 0.929 0.000 0.012 0.988
#> SRR1375439 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0237 0.968 0.996 0.004 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0592 0.929 0.000 0.012 0.988
#> SRR1388809 2 0.0237 0.958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1413872 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.4504 0.727 0.000 0.804 0.196
#> SRR615814 3 0.6111 0.439 0.000 0.396 0.604
#> SRR1325225 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.5650 0.508 0.000 0.688 0.312
#> SRR1358220 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR1096662 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 3 0.4555 0.794 0.000 0.200 0.800
#> SRR809595 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 3 0.6095 0.448 0.000 0.392 0.608
#> SRR1344382 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0747 0.927 0.000 0.016 0.984
#> SRR1478362 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392186 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.1753 0.912 0.000 0.048 0.952
#> SRR656247 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.6126 0.258 0.000 0.600 0.400
#> SRR1408595 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.6026 0.409 0.376 0.624 0.000
#> SRR1435248 2 0.6111 0.273 0.000 0.604 0.396
#> SRR1419110 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR1408682 2 0.5138 0.623 0.000 0.748 0.252
#> SRR1317134 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR1330854 1 0.6111 0.368 0.604 0.396 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR615635 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464601 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071594 3 0.4178 0.826 0.000 0.172 0.828
#> SRR612539 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 2 0.4555 0.728 0.200 0.800 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR1459937 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.5397 0.585 0.280 0.720 0.000
#> SRR661096 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR658212 2 0.0237 0.958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1430525 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353924 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR1314832 3 0.0592 0.929 0.000 0.012 0.988
#> SRR1487570 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418561 2 0.4654 0.726 0.000 0.792 0.208
#> SRR1448029 3 0.0424 0.930 0.000 0.008 0.992
#> SRR813802 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 3 0.5016 0.741 0.000 0.240 0.760
#> SRR603116 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.4291 0.771 0.180 0.820 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.0592 0.952 0.012 0.988 0.000
#> SRR1489950 2 0.0237 0.958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431927 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR600656 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR658766 3 0.0237 0.931 0.000 0.004 0.996
#> SRR655946 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.1411 0.918 0.000 0.036 0.964
#> SRR662498 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 2 0.5968 0.373 0.000 0.636 0.364
#> SRR656860 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 2 0.0747 0.948 0.016 0.984 0.000
#> SRR601695 3 0.4062 0.832 0.000 0.164 0.836
#> SRR820907 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 1 0.0592 0.962 0.988 0.012 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.5968 0.365 0.000 0.636 0.364
#> SRR1365448 1 0.6079 0.388 0.612 0.388 0.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0592 0.929 0.000 0.012 0.988
#> SRR1080766 3 0.6008 0.502 0.000 0.372 0.628
#> SRR1377862 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.6111 0.360 0.396 0.604 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.5397 0.612 0.720 0.280 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.5706 0.543 0.680 0.320 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.6045 0.369 0.620 0.380 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0237 0.931 0.000 0.004 0.996
#> SRR658259 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.5988 0.356 0.000 0.632 0.368
#> SRR1365034 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 1 0.6126 0.313 0.600 0.400 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322900 2 0.0592 0.952 0.012 0.988 0.000
#> SRR1309942 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR1345760 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR1500323 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR1356705 2 0.1163 0.938 0.028 0.972 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR1350435 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0424 0.955 0.000 0.992 0.008
#> SRR1394190 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.4235 0.822 0.000 0.176 0.824
#> SRR1318839 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 3 0.2448 0.894 0.000 0.076 0.924
#> SRR1089424 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.4235 0.822 0.000 0.176 0.824
#> SRR1320469 1 0.6126 0.359 0.600 0.400 0.000
#> SRR614251 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR1454310 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR601671 2 0.5835 0.495 0.340 0.660 0.000
#> SRR663874 2 0.0237 0.958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1409130 3 0.0237 0.931 0.000 0.004 0.996
#> SRR659696 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR1348040 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489610 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR1488091 3 0.4062 0.832 0.000 0.164 0.836
#> SRR1499566 1 0.0747 0.959 0.984 0.016 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR1394637 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.5785 0.453 0.000 0.668 0.332
#> SRR1446564 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.1411 0.928 0.036 0.964 0.000
#> SRR662019 3 0.0424 0.930 0.000 0.008 0.992
#> SRR1349209 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326161 2 0.0237 0.958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1345284 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 3 0.4931 0.753 0.000 0.232 0.768
#> SRR1489286 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR809444 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0237 0.958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1375774 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.4504 0.754 0.804 0.196 0.000
#> SRR1440744 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375796 3 0.6008 0.499 0.000 0.372 0.628
#> SRR1386991 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356290 3 0.4555 0.795 0.000 0.200 0.800
#> SRR659507 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR663296 1 0.5760 0.526 0.672 0.328 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414727 2 0.0892 0.945 0.000 0.980 0.020
#> SRR663477 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0592 0.929 0.000 0.012 0.988
#> SRR614611 3 0.4654 0.785 0.000 0.208 0.792
#> SRR655052 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0424 0.955 0.008 0.992 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 3 0.4062 0.832 0.000 0.164 0.836
#> SRR1480455 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR660260 3 0.6062 0.469 0.000 0.384 0.616
#> SRR1071231 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337173 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 2 0.1529 0.926 0.000 0.960 0.040
#> SRR1401379 2 0.5497 0.592 0.292 0.708 0.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR1490037 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 3 0.4235 0.822 0.000 0.176 0.824
#> SRR1319648 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1468658 3 0.0424 0.930 0.000 0.008 0.992
#> SRR1390437 1 0.1031 0.952 0.976 0.024 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085519 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR1442928 3 0.5785 0.584 0.000 0.332 0.668
#> SRR1464681 2 0.5291 0.635 0.268 0.732 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.4452 0.759 0.808 0.192 0.000
#> SRR659708 1 0.4452 0.759 0.808 0.192 0.000
#> SRR603236 3 0.3879 0.842 0.000 0.152 0.848
#> SRR660673 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0237 0.958 0.004 0.996 0.000
#> SRR613426 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 2 0.5785 0.511 0.332 0.668 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR1430489 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR662653 3 0.4291 0.818 0.000 0.180 0.820
#> SRR1390027 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0237 0.958 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367715 1 0.1964 0.919 0.944 0.056 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.4121 0.830 0.000 0.168 0.832
#> SRR615225 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379110 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR654766 1 0.0892 0.956 0.980 0.020 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.961 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.932 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.2412 0.8115 0.008 0.000 0.908 0.084
#> SRR1074359 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419258 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0817 0.8271 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR665262 3 0.0336 0.8200 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1499740 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1105057 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612215 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 2 0.5376 0.3857 0.396 0.588 0.016 0.000
#> SRR1409263 3 0.3801 0.6978 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1431288 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR614839 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658433 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1088581 2 0.3942 0.8069 0.000 0.764 0.236 0.000
#> SRR1328797 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.2281 0.8628 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1354955 3 0.3975 0.6781 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR654802 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR660066 2 0.2760 0.8545 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1447103 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402153 2 0.1867 0.8669 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR655887 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1408529 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR658707 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.3569 0.6055 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1074670 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1375439 2 0.4103 0.7963 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.0921 0.9150 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.1716 0.8202 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1388809 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 2 0.4585 0.6429 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR615814 3 0.3311 0.6392 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 3 0.4994 -0.2723 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1358220 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660164 2 0.3528 0.8299 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR815783 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR815470 3 0.3764 0.6436 0.000 0.172 0.816 0.012
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0336 0.8268 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1478362 2 0.0469 0.8625 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1392186 1 0.4040 0.6949 0.752 0.248 0.000 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 2 0.3569 0.8169 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR612683 2 0.1867 0.8671 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1392901 3 0.0921 0.8279 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1077805 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1360402 2 0.3649 0.8274 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1406112 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1355352 3 0.0921 0.8274 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR656247 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 2 0.0188 0.8617 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR808244 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387240 3 0.4713 0.2101 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 2 0.4679 0.3316 0.352 0.648 0.000 0.000
#> SRR1435248 3 0.4776 0.1532 0.000 0.376 0.624 0.000
#> SRR1419110 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1408682 2 0.5000 0.3159 0.000 0.500 0.500 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.4103 0.7959 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR603164 3 0.1637 0.8208 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1383259 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.5244 0.3167 0.600 0.388 0.012 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 1 0.4072 0.6905 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.1637 0.8208 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1361546 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1385411 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR662126 2 0.1716 0.8670 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1464601 3 0.1867 0.8183 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1071594 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR810249 2 0.1118 0.8639 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR818773 2 0.0336 0.8624 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.1557 0.8670 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1442754 2 0.5332 0.7703 0.124 0.748 0.128 0.000
#> SRR1334247 3 0.4072 0.6624 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR661639 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459937 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.3837 0.8143 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.3801 0.6978 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR661074 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 2 0.2149 0.7831 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR661096 1 0.1637 0.8899 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.2011 0.8666 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1466512 2 0.0336 0.8565 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR658212 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1430525 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.3764 0.7022 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1418561 2 0.6022 0.6508 0.000 0.656 0.260 0.084
#> SRR1448029 3 0.1637 0.8208 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR813802 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612395 3 0.0592 0.8141 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR603116 2 0.3649 0.8257 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1323152 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1368264 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.1637 0.8899 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR815044 2 0.3219 0.6896 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659436 3 0.2345 0.8070 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR613699 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.1940 0.8766 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.0188 0.8588 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 4 0.1792 0.9069 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.2647 0.8446 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR600656 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658766 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR655946 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.2281 0.8094 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR662498 3 0.1792 0.8200 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1376764 3 0.1118 0.8264 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1377006 3 0.6278 0.1115 0.000 0.408 0.532 0.060
#> SRR656860 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1324390 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR615273 2 0.4307 0.8185 0.024 0.784 0.192 0.000
#> SRR601695 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR820907 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812773 1 0.2345 0.8573 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472794 3 0.4830 0.0920 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1365448 1 0.4843 0.3305 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.4500 0.5864 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1435626 3 0.1637 0.8208 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1080766 3 0.2814 0.6896 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1320579 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.4761 0.2763 0.372 0.628 0.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.3837 0.8143 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1098879 3 0.4072 0.6647 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR662245 4 0.0817 0.9535 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1074719 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816226 1 0.4277 0.5696 0.720 0.280 0.000 0.000
#> SRR601387 2 0.2281 0.8628 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR614575 2 0.2281 0.8628 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1353900 2 0.3837 0.8143 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR662906 4 0.4746 0.3465 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1350832 2 0.4072 0.7992 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1403280 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.4431 0.5329 0.696 0.304 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 1 0.4877 0.4469 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR655399 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818901 3 0.4222 0.6381 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR607067 1 0.4134 0.6809 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR661961 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR658259 2 0.3837 0.8143 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 3 0.4855 0.0591 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1365034 1 0.4134 0.6809 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.2281 0.8628 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1475300 1 0.4916 0.4119 0.576 0.424 0.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.4103 0.7963 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1322900 2 0.3074 0.8306 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1309942 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1345760 1 0.2814 0.8251 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0188 0.8617 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.0592 0.8277 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR661469 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1500323 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0707 0.8485 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 2 0.5111 0.7771 0.000 0.740 0.204 0.056
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.4134 0.6503 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1368072 2 0.2281 0.8628 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR601815 2 0.2281 0.8628 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318839 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613126 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1089424 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1347214 2 0.2281 0.8628 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1309556 2 0.3837 0.8112 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.1716 0.8202 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1320469 1 0.5244 0.3167 0.600 0.388 0.012 0.000
#> SRR614251 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1454310 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR615105 3 0.0921 0.8274 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1433290 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR601671 2 0.4500 0.4296 0.316 0.684 0.000 0.000
#> SRR663874 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1409130 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR659696 2 0.0817 0.8652 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1408249 1 0.0336 0.9306 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR663284 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1402794 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR614852 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348040 2 0.3074 0.8306 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488091 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 1 0.3688 0.7404 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444501 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1388832 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR662918 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR817421 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR608264 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.4040 0.8018 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1432743 3 0.2281 0.8094 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1388873 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.2281 0.8094 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1406008 2 0.1867 0.8668 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1396786 3 0.4948 -0.1119 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.4072 0.6624 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.1637 0.8899 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1087825 2 0.0188 0.8588 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR662019 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1349209 2 0.3219 0.8275 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1326161 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1345284 1 0.4008 0.6991 0.756 0.244 0.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454328 3 0.0336 0.8200 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 4 0.3486 0.7414 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1084369 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.3610 0.7069 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658989 3 0.2345 0.8070 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.4072 0.7992 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1367988 1 0.4072 0.6905 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375796 3 0.2973 0.6749 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1386991 2 0.4040 0.8018 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1355217 2 0.1557 0.8670 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1356290 3 0.0817 0.8075 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR659507 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663296 1 0.4522 0.5114 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661155 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1414727 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.4134 0.6503 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1377800 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR614611 3 0.0469 0.8172 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.1867 0.8668 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR613951 2 0.2868 0.8389 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.3907 0.8095 0.000 0.768 0.232 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.3907 0.6876 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR655040 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR810225 2 0.1867 0.8668 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1325377 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR617829 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1480455 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1442104 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1414314 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR663026 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1478386 1 0.1637 0.8899 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.3311 0.7438 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 1 0.4134 0.6809 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660260 3 0.3219 0.6496 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.3219 0.8275 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1337173 3 0.2281 0.8094 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1396250 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.4624 0.5199 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR659816 2 0.4277 0.7718 0.000 0.720 0.280 0.000
#> SRR1401379 2 0.4193 0.5302 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR600981 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 1 0.4134 0.6809 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4103 0.7963 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1359780 3 0.0469 0.8272 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.1211 0.8662 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 1 0.3873 0.7198 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR1468658 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390437 1 0.4164 0.6755 0.736 0.264 0.000 0.000
#> SRR658057 2 0.1867 0.8668 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.3801 0.8194 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659911 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1085519 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442928 3 0.2408 0.7228 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1464681 2 0.4008 0.5690 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.2081 0.8148 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1365426 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487947 1 0.3610 0.7069 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR659708 1 0.3610 0.7069 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR603236 3 0.0188 0.8256 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660673 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.1118 0.8639 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR663807 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1087245 2 0.1867 0.8668 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613426 1 0.1867 0.8800 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR613879 2 0.3528 0.8306 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1385101 2 0.4477 0.4385 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1458852 3 0.0336 0.8265 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.3649 0.8258 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166960 2 0.4072 0.7992 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818600 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1367715 1 0.4134 0.6809 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1351979 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.4134 0.7932 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.4040 0.8018 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1430375 3 0.0000 0.8245 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615225 2 0.1940 0.8667 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1401839 2 0.4103 0.7964 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1379110 1 0.4134 0.6809 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1077288 4 0.1022 0.9431 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1331639 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.2081 0.8663 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1443003 3 0.4103 0.6565 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR612839 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.4040 0.6680 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.1118 0.8264 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR664063 2 0.1637 0.8670 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654766 1 0.4072 0.6903 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389497 4 0.0000 0.9740 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.2281 0.8094 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR615311 1 0.0000 0.9364 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1380716 4 0.0290 0.8866 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.1124 0.7653 0.000 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1074359 3 0.0290 0.7639 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1419258 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.1386 0.7657 0.000 0.032 0.952 0.000 0.016
#> SRR665262 3 0.2891 0.6791 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1499740 2 0.4182 0.1938 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1105057 4 0.1732 0.8519 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.1478 0.7469 0.000 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR612215 2 0.0794 0.7933 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 4 0.7452 0.1903 0.364 0.120 0.088 0.428 0.000
#> SRR1409263 3 0.3667 0.7003 0.000 0.140 0.812 0.000 0.048
#> SRR1431288 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1334889 4 0.4114 0.3950 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR614839 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 3 0.0510 0.7618 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1088581 2 0.1892 0.7558 0.000 0.916 0.080 0.004 0.000
#> SRR1328797 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0955 0.7974 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1354955 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR654802 5 0.4300 0.2170 0.000 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR660066 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1447103 3 0.3452 0.6242 0.000 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR1402153 2 0.4136 0.6633 0.000 0.764 0.048 0.188 0.000
#> SRR655887 2 0.3109 0.6685 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1408529 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR658707 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.4302 0.0604 0.000 0.520 0.480 0.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1375439 3 0.6074 0.2012 0.000 0.372 0.500 0.128 0.000
#> SRR1329003 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1404837 4 0.0510 0.8843 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.4305 0.0408 0.512 0.000 0.000 0.488 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1388809 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1413872 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.4551 0.3919 0.000 0.368 0.616 0.016 0.000
#> SRR615814 3 0.4287 0.1320 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.2230 0.7479 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1358220 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 4 0.0510 0.8843 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR660164 2 0.2127 0.7496 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR815783 3 0.3039 0.6662 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR809595 4 0.0609 0.8830 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1403133 2 0.5721 0.0687 0.000 0.492 0.424 0.084 0.000
#> SRR815470 2 0.1908 0.7583 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.0162 0.7646 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1478362 4 0.2280 0.8227 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1392186 4 0.3774 0.5455 0.296 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.6455 0.2857 0.000 0.264 0.500 0.236 0.000
#> SRR612683 2 0.1478 0.7755 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1392901 3 0.0324 0.7651 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1077805 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1360402 2 0.0794 0.7963 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1355352 3 0.4025 0.5619 0.000 0.292 0.700 0.000 0.008
#> SRR656247 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 4 0.0794 0.8809 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR808244 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387240 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.1121 0.7927 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.1732 0.7553 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 4 0.0609 0.8830 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1453911 2 0.0162 0.7970 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR603164 3 0.0162 0.7653 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1383259 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 1 0.3888 0.7277 0.788 0.032 0.004 0.176 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 4 0.1544 0.8363 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.1041 0.7664 0.000 0.004 0.964 0.000 0.032
#> SRR1361546 4 0.4268 0.2094 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.3039 0.6590 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR615635 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.3452 0.6203 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.4283 -0.0365 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR662126 2 0.3336 0.6470 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1464601 3 0.1282 0.7490 0.000 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR1071594 2 0.4287 0.1851 0.000 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR612539 4 0.1197 0.8719 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR602010 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810249 4 0.3690 0.7179 0.000 0.200 0.020 0.780 0.000
#> SRR818773 4 0.1043 0.8757 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 4 0.3999 0.4486 0.000 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1442754 4 0.7721 0.3456 0.208 0.120 0.184 0.488 0.000
#> SRR1334247 5 0.4305 0.1901 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR661639 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 4 0.0609 0.8830 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1459937 4 0.0510 0.8843 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.1608 0.7699 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR661074 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661096 1 0.3966 0.5059 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1307677 2 0.0290 0.7962 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466512 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.0162 0.7970 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1430525 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 2 0.4114 0.2707 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000
#> SRR1353924 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 4 0.4287 0.1582 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1418561 3 0.3779 0.6713 0.000 0.200 0.776 0.000 0.024
#> SRR1448029 3 0.0324 0.7651 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR813802 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.3508 0.6088 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1435311 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 3 0.4294 0.1221 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR603116 2 0.2230 0.7458 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1323152 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1368264 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.4201 0.1263 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1327702 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 4 0.4074 0.4210 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 1 0.3983 0.4978 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR815044 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR613699 2 0.0290 0.7972 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 1 0.4192 0.3551 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR1330327 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 4 0.0703 0.8822 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR600656 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658766 3 0.3848 0.6826 0.000 0.172 0.788 0.000 0.040
#> SRR655946 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.1270 0.7581 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR662498 3 0.0324 0.7651 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1376764 3 0.4793 0.1405 0.000 0.436 0.544 0.000 0.020
#> SRR1377006 3 0.3690 0.6431 0.000 0.224 0.764 0.000 0.012
#> SRR656860 4 0.1792 0.8401 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1480547 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452515 3 0.0162 0.7646 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR615273 2 0.5778 -0.0382 0.088 0.460 0.000 0.452 0.000
#> SRR601695 3 0.4249 0.1232 0.000 0.432 0.568 0.000 0.000
#> SRR820907 4 0.0510 0.8837 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR812773 4 0.3837 0.5069 0.308 0.000 0.000 0.692 0.000
#> SRR1405984 4 0.1121 0.8670 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1472794 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.4101 0.4867 0.664 0.004 0.000 0.332 0.000
#> SRR1095720 5 0.5234 0.1904 0.000 0.044 0.460 0.000 0.496
#> SRR1435626 3 0.0955 0.7675 0.000 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1080766 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1320579 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0162 0.7965 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098879 5 0.4307 0.1493 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR662245 5 0.2230 0.7751 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1074719 4 0.1671 0.8544 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR816226 1 0.1197 0.9103 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR601387 2 0.4658 0.2338 0.000 0.576 0.016 0.408 0.000
#> SRR614575 2 0.1502 0.7799 0.000 0.940 0.004 0.056 0.000
#> SRR1353900 2 0.0324 0.7973 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR662906 5 0.1671 0.8279 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1350832 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.4268 0.1725 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1313969 4 0.0880 0.8790 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1388528 1 0.1571 0.8948 0.936 0.004 0.000 0.060 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655399 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818901 5 0.4283 0.2667 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR607067 4 0.0162 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.4305 0.0276 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR661961 3 0.0963 0.7657 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR658259 2 0.0290 0.7966 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1365034 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.4318 0.5204 0.000 0.688 0.020 0.292 0.000
#> SRR1475300 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0609 0.7963 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1322900 4 0.2006 0.8498 0.012 0.072 0.000 0.916 0.000
#> SRR1309942 2 0.3074 0.6630 0.000 0.804 0.196 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.3586 0.5855 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.2424 0.7924 0.000 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.0290 0.7639 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR661469 2 0.4074 0.2996 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1500323 2 0.4307 0.0714 0.000 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR1356705 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.4547 0.3356 0.000 0.400 0.588 0.000 0.012
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 5 0.4294 0.2412 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1368072 2 0.4269 0.6151 0.000 0.732 0.036 0.232 0.000
#> SRR601815 2 0.2351 0.7595 0.000 0.896 0.016 0.088 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 3 0.4306 0.1006 0.000 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.3039 0.6783 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1318839 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 3 0.1043 0.7503 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1089424 4 0.4074 0.4034 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1347214 2 0.2660 0.7317 0.000 0.864 0.008 0.128 0.000
#> SRR1309556 2 0.6667 0.1056 0.000 0.432 0.320 0.248 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.1211 0.7650 0.000 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR1320469 1 0.5218 0.3770 0.604 0.336 0.000 0.060 0.000
#> SRR614251 2 0.3039 0.6564 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1454310 2 0.0609 0.7963 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR615105 3 0.0771 0.7656 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1433290 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 2 0.1792 0.7554 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR601671 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.0963 0.7948 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1409130 2 0.4302 0.0958 0.000 0.520 0.480 0.000 0.000
#> SRR659696 4 0.4300 0.1456 0.000 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR1408249 1 0.0963 0.9206 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR663284 2 0.3876 0.4983 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1402794 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR614852 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348040 4 0.2605 0.7789 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1489610 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 3 0.4304 -0.0191 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1499566 1 0.4256 0.2630 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1361480 4 0.1965 0.8408 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1444501 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.4627 0.0546 0.000 0.544 0.444 0.012 0.000
#> SRR1388832 2 0.4307 -0.0961 0.000 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.7964 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662918 2 0.0162 0.7970 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR817421 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 4 0.0609 0.8830 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0324 0.7964 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1432743 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1388873 2 0.0290 0.7972 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1406008 4 0.4304 0.0933 0.000 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1396786 3 0.4201 0.3253 0.000 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 1 0.3966 0.5047 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR655170 2 0.0162 0.7965 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087825 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662019 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1349209 4 0.5796 0.3985 0.000 0.284 0.128 0.588 0.000
#> SRR1326161 2 0.0794 0.7963 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1345284 4 0.2127 0.7969 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.1197 0.7915 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 5 0.0963 0.8625 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1084369 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.4304 0.1107 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.3661 0.5245 0.000 0.724 0.276 0.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR657139 1 0.3231 0.7324 0.800 0.004 0.000 0.196 0.000
#> SRR1440744 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1452334 4 0.2179 0.8109 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 4 0.0609 0.8830 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR658989 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0510 0.7970 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1367988 4 0.2648 0.7425 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 4 0.0609 0.8830 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1375796 2 0.0609 0.7960 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1386991 2 0.6177 0.3596 0.000 0.532 0.164 0.304 0.000
#> SRR1355217 4 0.3003 0.7246 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1356290 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR659507 3 0.0162 0.7646 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR663296 1 0.1831 0.8755 0.920 0.004 0.000 0.076 0.000
#> SRR598044 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 2 0.4287 0.0322 0.000 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR1414727 2 0.4306 -0.0897 0.000 0.508 0.492 0.000 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 5 0.4294 0.2412 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1377800 3 0.3141 0.7239 0.000 0.108 0.852 0.000 0.040
#> SRR614611 2 0.1121 0.7932 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR655052 4 0.1608 0.8504 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.1732 0.7669 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR613951 4 0.3003 0.7351 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 2 0.4767 0.1173 0.000 0.560 0.420 0.020 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR655040 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.3274 0.6401 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1325377 4 0.3707 0.5654 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR617829 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 3 0.3242 0.6034 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1480455 3 0.3508 0.5322 0.000 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR1442104 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.4283 -0.0377 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1414314 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR663026 2 0.4300 0.0330 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1478386 1 0.3796 0.5753 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1458683 3 0.1399 0.7650 0.000 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660260 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1071231 4 0.0162 0.8875 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1459125 4 0.3074 0.7206 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1337173 3 0.1205 0.7653 0.000 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR1396250 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 2 0.4224 0.6080 0.000 0.744 0.216 0.000 0.040
#> SRR659816 3 0.4307 0.0966 0.000 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR1401379 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 4 0.3534 0.6131 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0290 0.7972 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.3774 0.5197 0.000 0.704 0.296 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 3 0.4101 0.4192 0.000 0.372 0.628 0.000 0.000
#> SRR1319648 4 0.4045 0.4469 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.1671 0.8283 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1468658 3 0.3819 0.6207 0.000 0.228 0.756 0.000 0.016
#> SRR1390437 4 0.0510 0.8800 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR658057 2 0.0609 0.7943 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR612635 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0290 0.7972 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1085519 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.4256 0.2099 0.000 0.564 0.436 0.000 0.000
#> SRR1442928 2 0.2230 0.7506 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1464681 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1365426 4 0.0609 0.8830 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1487947 1 0.3231 0.7324 0.800 0.004 0.000 0.196 0.000
#> SRR659708 1 0.4287 0.1446 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR603236 3 0.0162 0.7646 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 4 0.4400 0.5491 0.000 0.308 0.020 0.672 0.000
#> SRR663807 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0566 0.7972 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1339108 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 1 0.4192 0.3552 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR613879 2 0.1732 0.7663 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1385101 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0609 0.7970 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.4304 0.0845 0.000 0.516 0.484 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 5 0.0162 0.8847 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1321987 2 0.4273 0.2059 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.4305 0.0859 0.000 0.512 0.488 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0290 0.7962 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1383081 4 0.0963 0.8731 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR2166960 2 0.0162 0.7970 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR605101 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0510 0.7975 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1367715 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.4307 -0.1698 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.1043 0.7937 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0794 0.7963 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1430375 3 0.4268 0.0936 0.000 0.444 0.556 0.000 0.000
#> SRR615225 2 0.1608 0.7699 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1401839 2 0.0290 0.7972 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1379110 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 5 0.0963 0.8635 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1331639 4 0.1270 0.8618 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1342782 2 0.3999 0.4015 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1443003 3 0.4307 -0.1692 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR612839 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.4686 0.2763 0.000 0.384 0.596 0.000 0.020
#> SRR664063 4 0.3999 0.4652 0.000 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1488214 1 0.0162 0.9518 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR654766 4 0.1341 0.8492 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1320321 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 4 0.3661 0.6240 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1488470 4 0.0000 0.8884 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 5 0.0000 0.8872 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.1043 0.7650 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR615311 1 0.0000 0.9549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.5995 0.45323 0.000 0.436 0.000 0.260 0.304 0.000
#> SRR1380716 5 0.3531 -0.19544 0.000 0.000 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR612803 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR613282 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1355396 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084417 3 0.1049 0.74844 0.000 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1074359 3 0.4360 0.60690 0.000 0.060 0.680 0.260 0.000 0.000
#> SRR1419258 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1403366 3 0.3198 0.54256 0.000 0.260 0.740 0.000 0.000 0.000
#> SRR665262 2 0.6058 -0.13003 0.000 0.384 0.356 0.260 0.000 0.000
#> SRR1499740 2 0.5254 0.45998 0.000 0.468 0.036 0.032 0.464 0.000
#> SRR1105057 5 0.0622 0.19103 0.000 0.012 0.000 0.008 0.980 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614599 3 0.4107 0.62379 0.000 0.044 0.700 0.256 0.000 0.000
#> SRR612215 2 0.4693 0.49037 0.000 0.508 0.008 0.028 0.456 0.000
#> SRR1094051 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1324496 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 5 0.6806 -0.05155 0.116 0.052 0.296 0.032 0.504 0.000
#> SRR1409263 3 0.2450 0.71815 0.000 0.068 0.892 0.032 0.004 0.004
#> SRR1431288 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1334889 5 0.4529 -0.24273 0.000 0.460 0.000 0.032 0.508 0.000
#> SRR614839 5 0.3851 -0.25008 0.000 0.000 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR658433 3 0.6003 0.27140 0.000 0.308 0.432 0.260 0.000 0.000
#> SRR1088581 2 0.4602 0.58498 0.000 0.668 0.024 0.032 0.276 0.000
#> SRR1328797 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1334512 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1471117 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1458220 2 0.0909 0.63214 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654802 3 0.3266 0.54979 0.000 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR660066 2 0.1075 0.64094 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1447103 3 0.6663 0.43862 0.000 0.120 0.508 0.260 0.112 0.000
#> SRR1402153 2 0.4734 0.54188 0.000 0.604 0.016 0.032 0.348 0.000
#> SRR655887 2 0.3934 0.50776 0.000 0.616 0.000 0.008 0.376 0.000
#> SRR1408529 3 0.0146 0.75599 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658707 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.6406 0.05729 0.000 0.316 0.440 0.024 0.220 0.000
#> SRR1074670 3 0.0858 0.75034 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1375439 5 0.6377 -0.30653 0.000 0.152 0.052 0.288 0.508 0.000
#> SRR1329003 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1404837 5 0.2730 -0.01651 0.000 0.000 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.5855 -0.26930 0.456 0.000 0.000 0.340 0.204 0.000
#> SRR613999 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.2805 0.81555 0.812 0.000 0.000 0.184 0.000 0.004
#> SRR658200 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1068855 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR612227 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388809 2 0.3198 0.50256 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000 0.000
#> SRR1413872 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.6061 0.17704 0.000 0.140 0.524 0.032 0.304 0.000
#> SRR615814 2 0.5277 0.35042 0.000 0.592 0.152 0.256 0.000 0.000
#> SRR1325225 1 0.0547 0.88134 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.3481 0.62722 0.000 0.836 0.044 0.052 0.068 0.000
#> SRR1358220 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1096662 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.3607 -0.22821 0.000 0.000 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR660164 2 0.4252 0.56868 0.000 0.652 0.000 0.036 0.312 0.000
#> SRR815783 2 0.6034 -0.06149 0.000 0.412 0.328 0.260 0.000 0.000
#> SRR809595 5 0.0363 0.18711 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1403133 2 0.6346 0.40083 0.000 0.504 0.036 0.260 0.200 0.000
#> SRR815470 2 0.0937 0.61010 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 3 0.4895 0.56393 0.000 0.108 0.636 0.256 0.000 0.000
#> SRR1478362 5 0.0935 0.19798 0.000 0.032 0.000 0.004 0.964 0.000
#> SRR1392186 5 0.6066 -0.56081 0.264 0.000 0.000 0.356 0.380 0.000
#> SRR1347937 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1431569 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 5 0.5697 -0.14071 0.000 0.096 0.308 0.032 0.564 0.000
#> SRR612683 5 0.3868 -0.45714 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000
#> SRR1392901 3 0.4044 0.62521 0.000 0.040 0.704 0.256 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360402 2 0.0909 0.63214 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012 0.000
#> SRR1406112 3 0.0146 0.75599 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355352 3 0.3024 0.67526 0.000 0.116 0.844 0.032 0.008 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813656 5 0.0405 0.19101 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR808244 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.62951 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385277 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1435248 2 0.3476 0.49943 0.000 0.732 0.004 0.260 0.004 0.000
#> SRR1419110 2 0.4341 0.58099 0.000 0.668 0.008 0.032 0.292 0.000
#> SRR1408682 2 0.3541 0.50191 0.000 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1489307 5 0.1075 0.16286 0.000 0.000 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1453911 2 0.4098 0.58129 0.000 0.676 0.000 0.032 0.292 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383259 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1330854 1 0.6193 0.39023 0.552 0.012 0.128 0.032 0.276 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 5 0.4531 -0.37315 0.032 0.000 0.000 0.464 0.504 0.000
#> SRR1468162 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1331220 3 0.1092 0.75339 0.000 0.020 0.960 0.020 0.000 0.000
#> SRR1361546 5 0.4185 -0.32324 0.000 0.492 0.000 0.012 0.496 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.1556 0.58221 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000 0.000
#> SRR615635 2 0.4466 0.48922 0.000 0.672 0.000 0.260 0.068 0.000
#> SRR1385411 2 0.4300 0.48892 0.000 0.608 0.000 0.028 0.364 0.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.2260 0.66866 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR662126 5 0.4517 -0.41911 0.000 0.444 0.000 0.032 0.524 0.000
#> SRR1464601 3 0.4305 0.61022 0.000 0.056 0.684 0.260 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.3833 0.05975 0.000 0.556 0.444 0.000 0.000 0.000
#> SRR612539 5 0.0806 0.19529 0.000 0.020 0.000 0.008 0.972 0.000
#> SRR602010 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR810249 5 0.4202 0.03594 0.000 0.064 0.000 0.224 0.712 0.000
#> SRR818773 5 0.1719 0.18748 0.000 0.016 0.000 0.060 0.924 0.000
#> SRR1336569 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1368117 2 0.5946 -0.09892 0.000 0.456 0.000 0.256 0.288 0.000
#> SRR1442754 5 0.5786 -0.02063 0.024 0.048 0.316 0.036 0.576 0.000
#> SRR1334247 3 0.2340 0.65962 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR661639 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613222 5 0.0547 0.18281 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1459937 5 0.2762 -0.02612 0.000 0.000 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655732 2 0.4534 0.46410 0.000 0.496 0.000 0.032 0.472 0.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661074 6 0.2048 0.85070 0.000 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1349851 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405123 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR661096 1 0.5951 -0.42388 0.456 0.000 0.000 0.268 0.276 0.000
#> SRR1320225 1 0.1075 0.87237 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.3464 0.57592 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1466512 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR658212 2 0.0260 0.63238 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1430525 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1344422 2 0.6201 0.50882 0.000 0.508 0.164 0.032 0.296 0.000
#> SRR1353924 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1314832 3 0.0935 0.74911 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1487570 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR627431 5 0.4095 -0.32797 0.000 0.480 0.000 0.008 0.512 0.000
#> SRR1418561 3 0.5327 0.37022 0.000 0.072 0.616 0.032 0.280 0.000
#> SRR1448029 3 0.1745 0.74429 0.000 0.020 0.924 0.056 0.000 0.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.4700 0.45969 0.000 0.600 0.000 0.060 0.340 0.000
#> SRR1435311 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR612395 2 0.5651 0.24357 0.000 0.532 0.208 0.260 0.000 0.000
#> SRR603116 2 0.3869 0.45086 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368264 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.2092 0.68192 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1327702 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615611 5 0.4529 -0.24238 0.000 0.460 0.000 0.032 0.508 0.000
#> SRR1486799 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1096174 1 0.6023 -0.49585 0.428 0.000 0.000 0.292 0.280 0.000
#> SRR815044 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1338560 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR615862 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1480038 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR659436 3 0.1074 0.75055 0.000 0.012 0.960 0.000 0.000 0.028
#> SRR613699 2 0.1411 0.64103 0.000 0.936 0.004 0.000 0.060 0.000
#> SRR1436563 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR615323 4 0.6003 0.55617 0.272 0.000 0.000 0.436 0.292 0.000
#> SRR1330327 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1489950 2 0.5325 0.45162 0.000 0.584 0.000 0.260 0.156 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 6 0.0260 0.95493 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1444002 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 5 0.2362 0.11262 0.000 0.000 0.004 0.136 0.860 0.000
#> SRR600656 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR658766 3 0.1444 0.72836 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR655946 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR817282 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0146 0.75587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406418 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.3851 -0.25016 0.000 0.000 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0935 0.74911 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR662498 3 0.4284 0.61296 0.000 0.056 0.688 0.256 0.000 0.000
#> SRR1376764 3 0.2300 0.68424 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.5049 0.52655 0.000 0.128 0.696 0.032 0.144 0.000
#> SRR656860 5 0.4698 -0.31621 0.000 0.044 0.000 0.452 0.504 0.000
#> SRR1480547 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1452515 3 0.4339 0.60977 0.000 0.060 0.684 0.256 0.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.3541 0.51046 0.000 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR615273 5 0.5087 -0.22947 0.044 0.312 0.000 0.032 0.612 0.000
#> SRR601695 2 0.5969 -0.05092 0.000 0.436 0.324 0.240 0.000 0.000
#> SRR820907 5 0.4165 -0.26185 0.000 0.012 0.000 0.452 0.536 0.000
#> SRR812773 4 0.5190 0.48471 0.088 0.000 0.000 0.460 0.452 0.000
#> SRR1405984 5 0.3966 -0.27262 0.000 0.004 0.000 0.444 0.552 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.62951 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365448 1 0.4493 0.41982 0.596 0.000 0.000 0.040 0.364 0.000
#> SRR1095720 3 0.4067 0.25877 0.000 0.008 0.548 0.000 0.000 0.444
#> SRR1435626 3 0.1194 0.74913 0.000 0.008 0.956 0.032 0.004 0.000
#> SRR1080766 2 0.3198 0.50256 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1467966 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1319710 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1326604 2 0.3288 0.59953 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1098879 3 0.2260 0.66710 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR662245 6 0.1563 0.90429 0.000 0.012 0.056 0.000 0.000 0.932
#> SRR1074719 5 0.0622 0.18950 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR816226 1 0.4691 0.50069 0.680 0.000 0.000 0.196 0.124 0.000
#> SRR601387 5 0.4933 -0.22633 0.000 0.272 0.000 0.104 0.624 0.000
#> SRR614575 2 0.3747 0.53970 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR1353900 2 0.1141 0.64011 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR662906 6 0.2454 0.77401 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1350832 2 0.0363 0.63358 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1403280 2 0.4381 0.38568 0.000 0.536 0.000 0.024 0.440 0.000
#> SRR1313969 5 0.0405 0.19309 0.000 0.008 0.000 0.004 0.988 0.000
#> SRR1388528 1 0.3602 0.66196 0.760 0.000 0.000 0.032 0.208 0.000
#> SRR1452912 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1400180 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR655399 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1319753 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR818901 3 0.3854 0.21785 0.000 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR607067 5 0.3986 -0.26081 0.004 0.000 0.000 0.464 0.532 0.000
#> SRR1391420 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1384138 2 0.5784 0.04320 0.000 0.504 0.000 0.260 0.236 0.000
#> SRR661961 3 0.0291 0.75705 0.000 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR658259 2 0.4079 0.58250 0.000 0.680 0.000 0.032 0.288 0.000
#> SRR1310476 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1452696 2 0.0363 0.62768 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1365034 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1478053 5 0.5563 -0.29444 0.000 0.192 0.000 0.260 0.548 0.000
#> SRR1475300 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1328101 5 0.5938 -0.41806 0.000 0.280 0.000 0.260 0.460 0.000
#> SRR1322900 5 0.3539 0.00112 0.000 0.024 0.000 0.220 0.756 0.000
#> SRR1309942 2 0.2147 0.57573 0.000 0.896 0.084 0.020 0.000 0.000
#> SRR1345760 4 0.5115 0.47003 0.080 0.000 0.000 0.464 0.456 0.000
#> SRR1435418 1 0.2003 0.84684 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1402172 5 0.5153 -0.37289 0.000 0.084 0.000 0.456 0.460 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 3 0.6010 0.26403 0.000 0.312 0.428 0.260 0.000 0.000
#> SRR661469 2 0.5310 0.46314 0.000 0.468 0.040 0.032 0.460 0.000
#> SRR1500323 2 0.5926 0.03961 0.000 0.464 0.276 0.260 0.000 0.000
#> SRR1356705 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1464915 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1312406 3 0.6265 0.08336 0.000 0.164 0.484 0.032 0.320 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.3851 0.22700 0.000 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1368072 5 0.5731 -0.31101 0.000 0.224 0.000 0.260 0.516 0.000
#> SRR601815 2 0.3748 0.57011 0.000 0.688 0.000 0.012 0.300 0.000
#> SRR613330 1 0.1267 0.86796 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.4081 0.55066 0.000 0.768 0.152 0.016 0.064 0.000
#> SRR1394190 1 0.1663 0.85769 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR816382 3 0.5393 0.55339 0.000 0.092 0.620 0.260 0.028 0.000
#> SRR1318839 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1432390 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR613126 3 0.5995 0.27871 0.000 0.304 0.436 0.260 0.000 0.000
#> SRR1089424 2 0.5894 -0.13682 0.000 0.472 0.000 0.284 0.244 0.000
#> SRR1347214 5 0.4175 -0.42736 0.000 0.464 0.000 0.012 0.524 0.000
#> SRR1309556 5 0.5239 -0.30784 0.000 0.344 0.028 0.052 0.576 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.1194 0.74774 0.000 0.004 0.956 0.032 0.008 0.000
#> SRR1320469 1 0.7670 0.11462 0.436 0.148 0.140 0.032 0.244 0.000
#> SRR614251 2 0.3578 0.30616 0.000 0.660 0.340 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454310 5 0.5761 -0.47035 0.000 0.396 0.000 0.172 0.432 0.000
#> SRR615105 3 0.0458 0.75670 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433290 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR2166064 2 0.1333 0.63750 0.000 0.944 0.008 0.000 0.048 0.000
#> SRR601671 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR663874 2 0.5410 0.46821 0.000 0.576 0.000 0.248 0.176 0.000
#> SRR1409130 2 0.5737 0.09382 0.000 0.512 0.272 0.216 0.000 0.000
#> SRR659696 5 0.3151 0.00802 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1408249 1 0.1225 0.85010 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036 0.000
#> SRR663284 2 0.4205 0.45050 0.000 0.564 0.000 0.016 0.420 0.000
#> SRR1402794 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614852 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1348040 5 0.1856 0.19566 0.000 0.048 0.000 0.032 0.920 0.000
#> SRR1489610 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1488091 2 0.5889 0.06736 0.000 0.476 0.264 0.260 0.000 0.000
#> SRR1499566 4 0.6003 0.55621 0.272 0.000 0.000 0.436 0.292 0.000
#> SRR1361480 5 0.0717 0.19015 0.000 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000
#> SRR1444501 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1415773 5 0.6555 -0.37095 0.000 0.204 0.044 0.284 0.468 0.000
#> SRR1388832 5 0.6494 -0.37146 0.000 0.292 0.224 0.032 0.452 0.000
#> SRR1394637 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.4040 0.58541 0.000 0.688 0.000 0.032 0.280 0.000
#> SRR662918 2 0.1075 0.63871 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR817421 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1400823 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1381348 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR608264 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1318560 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1454117 5 0.0363 0.18709 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.4531 0.47048 0.000 0.504 0.000 0.032 0.464 0.000
#> SRR1432743 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.3734 0.60816 0.000 0.716 0.000 0.020 0.264 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406008 5 0.3592 -0.20353 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1396786 2 0.6942 0.22158 0.000 0.460 0.184 0.260 0.096 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR607117 1 0.6039 -0.50893 0.420 0.000 0.000 0.300 0.280 0.000
#> SRR655170 2 0.4098 0.58129 0.000 0.676 0.000 0.032 0.292 0.000
#> SRR1087825 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR662019 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349209 5 0.5582 0.02461 0.000 0.132 0.024 0.236 0.608 0.000
#> SRR1326161 2 0.0820 0.63280 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012 0.000
#> SRR1345284 5 0.4986 -0.47898 0.068 0.000 0.000 0.444 0.488 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663356 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1454328 2 0.3337 0.49928 0.000 0.736 0.004 0.260 0.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408183 6 0.3390 0.61097 0.000 0.000 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1084369 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR598452 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR660709 3 0.6121 -0.10742 0.000 0.356 0.404 0.004 0.236 0.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.6110 0.41750 0.000 0.532 0.028 0.260 0.180 0.000
#> SRR1375774 1 0.2491 0.82601 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR657139 1 0.3940 0.68011 0.764 0.000 0.000 0.096 0.140 0.000
#> SRR1440744 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1353555 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1323087 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.4808 0.29394 0.000 0.052 0.000 0.480 0.468 0.000
#> SRR1381775 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 5 0.0632 0.18034 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815825 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR819054 5 0.5635 -0.47695 0.000 0.420 0.000 0.148 0.432 0.000
#> SRR1367988 4 0.5226 0.49191 0.092 0.000 0.000 0.464 0.444 0.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615479 5 0.1863 0.14062 0.000 0.000 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1375796 2 0.0405 0.63141 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1386991 5 0.5630 -0.23609 0.000 0.144 0.012 0.276 0.568 0.000
#> SRR1355217 5 0.5871 -0.16508 0.000 0.216 0.000 0.320 0.464 0.000
#> SRR1356290 2 0.0363 0.63358 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR659507 3 0.6010 0.26403 0.000 0.312 0.428 0.260 0.000 0.000
#> SRR663296 1 0.2854 0.70304 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR598044 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR661155 2 0.4030 0.56303 0.000 0.756 0.140 0.000 0.104 0.000
#> SRR1414727 2 0.6249 0.47554 0.000 0.452 0.148 0.032 0.368 0.000
#> SRR663477 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.3727 0.37468 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1377800 3 0.1010 0.74732 0.000 0.036 0.960 0.000 0.004 0.000
#> SRR614611 2 0.3337 0.49996 0.000 0.736 0.004 0.260 0.000 0.000
#> SRR655052 5 0.4644 -0.33548 0.000 0.040 0.000 0.456 0.504 0.000
#> SRR1478968 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1351280 2 0.3758 0.57025 0.000 0.668 0.000 0.008 0.324 0.000
#> SRR613951 5 0.2221 0.19923 0.000 0.072 0.000 0.032 0.896 0.000
#> SRR1418022 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR661901 2 0.6127 0.51985 0.000 0.512 0.136 0.036 0.316 0.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655040 5 0.3823 -0.27413 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR810225 2 0.4045 0.49092 0.000 0.564 0.000 0.008 0.428 0.000
#> SRR1325377 2 0.6075 -0.34126 0.000 0.396 0.000 0.324 0.280 0.000
#> SRR617829 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1402328 3 0.6058 0.18717 0.000 0.356 0.384 0.260 0.000 0.000
#> SRR1480455 3 0.6061 0.16285 0.000 0.368 0.372 0.260 0.000 0.000
#> SRR1442104 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1453416 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.2178 0.67470 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1414314 2 0.3541 0.50504 0.000 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR663026 5 0.3592 -0.20299 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1478386 1 0.4789 0.23985 0.640 0.000 0.000 0.092 0.268 0.000
#> SRR1458683 3 0.0146 0.75671 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1467567 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1468532 5 0.3982 -0.25815 0.004 0.000 0.000 0.460 0.536 0.000
#> SRR1310735 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1440101 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.62951 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071231 5 0.3101 -0.08479 0.000 0.000 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1459125 5 0.2221 0.19731 0.000 0.072 0.000 0.032 0.896 0.000
#> SRR1337173 3 0.3244 0.53597 0.000 0.268 0.732 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396250 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR2166376 2 0.4168 0.41607 0.000 0.696 0.256 0.000 0.000 0.048
#> SRR659816 2 0.3053 0.53950 0.000 0.812 0.168 0.000 0.020 0.000
#> SRR1401379 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR600981 4 0.6107 0.07553 0.000 0.332 0.000 0.372 0.296 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.4249 0.59888 0.000 0.688 0.000 0.052 0.260 0.000
#> SRR1359780 2 0.2581 0.54322 0.000 0.860 0.120 0.020 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR627439 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1397156 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.6003 -0.02502 0.000 0.432 0.308 0.260 0.000 0.000
#> SRR1319648 5 0.3799 -0.03644 0.000 0.276 0.000 0.020 0.704 0.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 5 0.4517 -0.35987 0.032 0.000 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1468658 3 0.1814 0.72109 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390437 5 0.4175 -0.29328 0.012 0.000 0.000 0.464 0.524 0.000
#> SRR658057 2 0.3868 0.45872 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR612635 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1351480 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1436651 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1441590 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.4797 0.48370 0.000 0.504 0.000 0.052 0.444 0.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409575 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.62951 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085519 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1345894 3 0.3862 0.19155 0.000 0.476 0.524 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442928 2 0.4002 0.46866 0.000 0.704 0.036 0.260 0.000 0.000
#> SRR1464681 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365426 5 0.0146 0.19039 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1487947 1 0.2823 0.71845 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR659708 1 0.5156 0.37215 0.620 0.000 0.000 0.164 0.216 0.000
#> SRR603236 3 0.4284 0.61323 0.000 0.056 0.688 0.256 0.000 0.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 5 0.4834 -0.10087 0.000 0.100 0.000 0.260 0.640 0.000
#> SRR663807 2 0.0363 0.63358 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1087245 2 0.1267 0.64110 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1339108 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR613426 4 0.6062 0.51743 0.304 0.000 0.000 0.408 0.288 0.000
#> SRR613879 2 0.3952 0.56373 0.000 0.672 0.000 0.020 0.308 0.000
#> SRR1385101 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1387966 2 0.0458 0.63449 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1458852 3 0.5656 0.42570 0.000 0.256 0.532 0.212 0.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1349231 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376249 6 0.2378 0.81667 0.000 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1321987 2 0.5563 0.22643 0.000 0.548 0.192 0.260 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.6061 -0.16484 0.000 0.372 0.368 0.260 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.4098 0.58129 0.000 0.676 0.000 0.032 0.292 0.000
#> SRR1383081 5 0.4509 -0.28778 0.000 0.032 0.000 0.436 0.532 0.000
#> SRR2166960 2 0.1075 0.63871 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR605101 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.62951 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367715 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1351979 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1387054 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1444306 3 0.2793 0.62359 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1322662 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 2 0.3151 0.50727 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR612767 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1489030 2 0.6047 0.45549 0.000 0.400 0.000 0.260 0.340 0.000
#> SRR1430375 2 0.5894 0.03330 0.000 0.472 0.284 0.244 0.000 0.000
#> SRR615225 2 0.4367 0.54576 0.000 0.604 0.000 0.032 0.364 0.000
#> SRR1401839 2 0.4807 0.47055 0.000 0.484 0.000 0.052 0.464 0.000
#> SRR1379110 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1077288 6 0.3592 0.51785 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1331639 5 0.4083 -0.26488 0.000 0.008 0.000 0.460 0.532 0.000
#> SRR1342782 5 0.3737 -0.28732 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1443003 3 0.3586 0.55251 0.000 0.012 0.720 0.000 0.000 0.268
#> SRR612839 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.2300 0.83481 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.88706 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.3634 0.40278 0.000 0.356 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR664063 5 0.3266 -0.05067 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1488214 1 0.0146 0.88493 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR654766 5 0.4331 -0.32435 0.020 0.000 0.000 0.464 0.516 0.000
#> SRR1320321 5 0.3854 -0.24493 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1071955 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1417483 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1394231 5 0.3307 0.16535 0.000 0.108 0.000 0.072 0.820 0.000
#> SRR1488470 5 0.3782 -0.26928 0.000 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1389497 6 0.0146 0.95829 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1367109 3 0.0000 0.75665 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615311 1 0.3240 0.78658 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.897 0.949 0.951 0.3464 0.664 0.664
#> 3 3 0.925 0.916 0.966 0.8396 0.684 0.529
#> 4 4 0.987 0.949 0.974 0.0382 0.931 0.823
#> 5 5 0.720 0.638 0.829 0.1169 0.919 0.768
#> 6 6 0.752 0.658 0.815 0.0711 0.882 0.604
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 3
There is also optional best \(k\) = 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR612803 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR613282 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1355396 2 0.6973 0.7725 0.188 0.812
#> SRR1084417 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR1074359 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1419258 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1403366 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR665262 2 0.1414 0.9618 0.020 0.980
#> SRR1499740 2 0.1843 0.9549 0.028 0.972
#> SRR1105057 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1439742 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR614599 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR612215 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1324496 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1393449 2 0.3879 0.9434 0.076 0.924
#> SRR1409263 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1431288 1 0.4022 0.9838 0.920 0.080
#> SRR1334889 2 0.1414 0.9593 0.020 0.980
#> SRR614839 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR658433 2 0.1184 0.9590 0.016 0.984
#> SRR1088581 2 0.0938 0.9614 0.012 0.988
#> SRR1328797 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1334512 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1471117 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1311553 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1354955 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR654802 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR660066 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1402153 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR655887 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1408529 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR658707 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1384371 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR1074670 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1375439 2 0.0376 0.9622 0.004 0.996
#> SRR1329003 2 0.9775 0.2496 0.412 0.588
#> SRR1404837 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1317920 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1455525 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR613999 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1310836 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1499764 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR658200 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR1068855 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1375509 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR612227 2 0.4161 0.9302 0.084 0.916
#> SRR1388809 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1413872 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1452864 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1473078 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR615814 2 0.1184 0.9591 0.016 0.984
#> SRR1325225 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1313687 2 0.1414 0.9601 0.020 0.980
#> SRR1358220 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1096662 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1487746 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1354644 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1401752 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR660164 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR815783 2 0.0376 0.9619 0.004 0.996
#> SRR809595 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1344382 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1432453 2 0.0672 0.9610 0.008 0.992
#> SRR1478362 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1392186 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1347937 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1431569 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1471594 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1354270 2 0.3274 0.9493 0.060 0.940
#> SRR612683 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1392901 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR1077805 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1406112 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1355352 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR656247 2 0.3733 0.9234 0.072 0.928
#> SRR813656 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR808244 2 0.6801 0.8578 0.180 0.820
#> SRR1387240 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1408595 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1385277 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1317134 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1370780 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1489307 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1453911 2 0.0376 0.9622 0.004 0.996
#> SRR603164 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR1383259 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1330854 2 0.4690 0.9315 0.100 0.900
#> SRR1452423 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1368574 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1468162 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1331220 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR1361546 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1486156 1 0.4022 0.9838 0.920 0.080
#> SRR660545 2 0.0376 0.9619 0.004 0.996
#> SRR615635 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR1342739 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1102830 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR662126 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1464601 2 0.0672 0.9613 0.008 0.992
#> SRR1071594 2 0.2603 0.9507 0.044 0.956
#> SRR612539 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR602010 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR810249 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1336569 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1368117 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1442754 2 0.4431 0.9353 0.092 0.908
#> SRR1334247 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR661639 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR613222 2 0.1633 0.9613 0.024 0.976
#> SRR1459937 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR2185018 2 0.2603 0.9541 0.044 0.956
#> SRR655732 2 0.1414 0.9618 0.020 0.980
#> SRR809348 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR819261 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR661074 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1349851 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1405123 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR661096 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1320225 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1454651 2 0.9970 0.0363 0.468 0.532
#> SRR1307677 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1466512 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR658212 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1430525 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1344422 2 0.2043 0.9601 0.032 0.968
#> SRR1353924 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1314832 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR1487570 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR627431 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1418561 2 0.4690 0.9315 0.100 0.900
#> SRR1448029 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR813802 2 0.2603 0.9541 0.044 0.956
#> SRR815020 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1309702 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1435311 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR612395 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR603116 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1323152 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1368264 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1326624 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1429265 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1327702 2 0.8499 0.6120 0.276 0.724
#> SRR615611 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1486799 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1096174 2 0.1633 0.9578 0.024 0.976
#> SRR815044 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1338560 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR615862 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1480038 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR659436 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR613699 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1436563 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR615323 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1330327 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1100588 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1444002 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1318444 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR600656 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR658766 2 0.4431 0.9286 0.092 0.908
#> SRR655946 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR817282 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1475104 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1406418 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1090265 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1444120 2 0.1843 0.9559 0.028 0.972
#> SRR1471965 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR612695 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR662498 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1376764 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1377006 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR656860 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1480547 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR1452515 2 0.0672 0.9610 0.008 0.992
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR615273 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR601695 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR812773 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1405984 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1365448 2 0.4161 0.9397 0.084 0.916
#> SRR1095720 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1435626 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1332299 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1467966 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1320579 2 0.4161 0.9303 0.084 0.916
#> SRR1319710 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1326604 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR1098879 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR662245 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR1074719 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR816226 2 0.6048 0.8321 0.148 0.852
#> SRR601387 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR1353900 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR662906 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR1350832 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1403280 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1313969 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1388528 2 0.4562 0.9331 0.096 0.904
#> SRR1452912 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1400180 2 0.0938 0.9615 0.012 0.988
#> SRR655399 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1319753 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR818901 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR607067 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1391420 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1384138 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR661961 2 0.4431 0.9286 0.092 0.908
#> SRR658259 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1310476 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1322900 2 0.2236 0.9544 0.036 0.964
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1435418 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1402172 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1443436 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR661675 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR661469 2 0.2043 0.9601 0.032 0.968
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1464915 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1312406 2 0.4298 0.9317 0.088 0.912
#> SRR1350435 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1389177 2 0.4431 0.9286 0.092 0.908
#> SRR1368072 2 0.0376 0.9623 0.004 0.996
#> SRR601815 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1434502 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR1394190 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1481083 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR816382 2 0.3584 0.9361 0.068 0.932
#> SRR1318839 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1432390 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR613126 2 0.0672 0.9610 0.008 0.992
#> SRR1089424 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1347214 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1309556 2 0.1414 0.9593 0.020 0.980
#> SRR1456027 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1400551 2 0.4431 0.9292 0.092 0.908
#> SRR1320469 2 0.4562 0.9331 0.096 0.904
#> SRR614251 2 0.1633 0.9577 0.024 0.976
#> SRR1454310 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR615105 2 0.1414 0.9576 0.020 0.980
#> SRR1433290 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR2166064 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR601671 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR663874 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1409130 2 0.1414 0.9576 0.020 0.980
#> SRR659696 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1408249 2 0.5946 0.8380 0.144 0.856
#> SRR663284 2 0.1843 0.9607 0.028 0.972
#> SRR1402794 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR614852 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1348040 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR1489610 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1488091 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1499566 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1361480 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1444501 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1388832 2 0.3733 0.9451 0.072 0.928
#> SRR1394637 1 0.6148 0.8985 0.848 0.152
#> SRR606974 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR817421 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1400823 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1381348 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR608264 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1318560 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1454117 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1312684 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR615044 2 0.1414 0.9593 0.020 0.980
#> SRR1432743 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1357148 2 0.4431 0.9286 0.092 0.908
#> SRR1406008 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1396786 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1446564 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1318465 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1431083 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR607117 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR655170 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1087825 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR662019 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1349209 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1416672 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR663356 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1092349 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1408183 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1084369 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR598452 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR660709 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR809444 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1089901 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1375774 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1326292 2 0.8327 0.6363 0.264 0.736
#> SRR657139 2 0.4562 0.9331 0.096 0.904
#> SRR1440744 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1353555 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1323087 2 0.2778 0.9443 0.048 0.952
#> SRR1452334 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1381775 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1363908 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1319626 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR658989 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1353663 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR811771 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR813983 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR815825 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR819054 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1367988 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1331922 1 0.4562 0.9663 0.904 0.096
#> SRR615479 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1375796 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.1633 0.9578 0.024 0.976
#> SRR1356290 2 0.0672 0.9610 0.008 0.992
#> SRR659507 2 0.1414 0.9576 0.020 0.980
#> SRR663296 2 0.1843 0.9607 0.028 0.972
#> SRR598044 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR661155 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1414727 2 0.1843 0.9579 0.028 0.972
#> SRR663477 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1354489 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1377800 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR614611 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1478968 1 0.3879 0.9879 0.924 0.076
#> SRR1351280 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR613951 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1418022 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR661901 2 0.2236 0.9544 0.036 0.964
#> SRR1408161 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR657054 2 0.4022 0.9349 0.080 0.920
#> SRR655040 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR810225 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR617829 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1402328 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1480455 2 0.1414 0.9576 0.020 0.980
#> SRR1442104 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1453416 2 0.9993 -0.0373 0.484 0.516
#> SRR1481396 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1414314 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR663026 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1478386 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR1458683 2 0.4161 0.9303 0.084 0.916
#> SRR1370572 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1467567 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1468532 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR1310735 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1440101 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR660260 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1337173 2 0.1184 0.9590 0.016 0.984
#> SRR1396250 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR2166376 2 0.2948 0.9530 0.052 0.948
#> SRR659816 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1401379 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR600981 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1398335 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1397218 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR660115 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1407950 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1359780 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1490037 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR627439 2 0.2778 0.9525 0.048 0.952
#> SRR1397156 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1410221 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1319648 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR1092985 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR656409 2 0.2043 0.9539 0.032 0.968
#> SRR1468658 2 0.2948 0.9464 0.052 0.948
#> SRR1390437 2 0.1184 0.9605 0.016 0.984
#> SRR658057 2 0.1184 0.9623 0.016 0.984
#> SRR612635 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1351480 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1436651 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1441590 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR659590 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR614263 2 0.2423 0.9527 0.040 0.960
#> SRR1409575 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR659911 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR1085519 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1345894 2 0.0672 0.9610 0.008 0.992
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1418880 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1309070 2 0.3584 0.9383 0.068 0.932
#> SRR1365426 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1487947 2 0.4562 0.9331 0.096 0.904
#> SRR659708 2 0.4690 0.8936 0.100 0.900
#> SRR603236 2 0.0938 0.9602 0.012 0.988
#> SRR660673 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1087245 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1339108 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR613426 2 0.1414 0.9617 0.020 0.980
#> SRR613879 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1385101 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1387966 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1458852 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1430489 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1349231 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1376249 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1321987 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR662653 2 0.0376 0.9618 0.004 0.996
#> SRR1390027 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1098474 2 0.0672 0.9618 0.008 0.992
#> SRR1383081 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR2166960 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR605101 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR818600 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR1367715 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1351979 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1387054 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1444306 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1322662 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR665478 2 0.1633 0.9610 0.024 0.976
#> SRR612767 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1489030 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1430375 2 0.0672 0.9610 0.008 0.992
#> SRR615225 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9622 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1077288 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1331639 2 0.0938 0.9622 0.012 0.988
#> SRR1342782 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1443003 2 0.4431 0.9286 0.092 0.908
#> SRR612839 2 0.8207 0.7128 0.256 0.744
#> SRR1470093 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1395742 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1469014 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1387222 2 0.4298 0.9295 0.088 0.912
#> SRR664063 2 0.1184 0.9623 0.016 0.984
#> SRR1488214 1 0.9988 0.1688 0.520 0.480
#> SRR654766 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1320321 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1071955 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1417483 1 0.3733 0.9919 0.928 0.072
#> SRR1394231 2 0.0672 0.9619 0.008 0.992
#> SRR1488470 2 0.0938 0.9615 0.012 0.988
#> SRR1389497 2 0.4562 0.9274 0.096 0.904
#> SRR1367109 2 0.4022 0.9307 0.080 0.920
#> SRR615311 1 0.8327 0.7270 0.736 0.264
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.9163 0.4031 0.540 0.208 0.252
#> SRR1084417 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403366 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR665262 2 0.3816 0.8148 0.000 0.852 0.148
#> SRR1499740 3 0.0592 0.9443 0.000 0.012 0.988
#> SRR1105057 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0424 0.9623 0.000 0.992 0.008
#> SRR612215 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431288 1 0.1411 0.9322 0.964 0.000 0.036
#> SRR1334889 3 0.5785 0.5121 0.000 0.332 0.668
#> SRR614839 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR658433 2 0.4605 0.7367 0.000 0.796 0.204
#> SRR1088581 2 0.6274 0.1490 0.000 0.544 0.456
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471117 1 0.1163 0.9401 0.972 0.000 0.028
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR658707 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384371 3 0.0424 0.9472 0.000 0.008 0.992
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329003 1 0.6295 0.1294 0.528 0.000 0.472
#> SRR1404837 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 3 0.8130 0.2084 0.400 0.072 0.528
#> SRR613999 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1068855 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR612227 3 0.0424 0.9472 0.000 0.008 0.992
#> SRR1388809 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452864 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473078 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR615814 2 0.5785 0.5051 0.000 0.668 0.332
#> SRR1325225 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 3 0.4654 0.7272 0.000 0.208 0.792
#> SRR1358220 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR809595 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.2796 0.8797 0.092 0.908 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392901 3 0.2625 0.8728 0.000 0.084 0.916
#> SRR1077805 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360402 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR656247 3 0.5882 0.4582 0.348 0.000 0.652
#> SRR813656 3 0.0592 0.9443 0.000 0.012 0.988
#> SRR808244 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408595 1 0.9122 0.4242 0.536 0.280 0.184
#> SRR1385277 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR603164 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330854 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0237 0.9497 0.000 0.004 0.996
#> SRR1361546 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.0424 0.9573 0.992 0.000 0.008
#> SRR660545 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385411 2 0.3941 0.8019 0.000 0.844 0.156
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR662126 3 0.1753 0.9108 0.000 0.048 0.952
#> SRR1464601 2 0.4931 0.6928 0.000 0.768 0.232
#> SRR1071594 3 0.5706 0.5344 0.000 0.320 0.680
#> SRR612539 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR818773 2 0.1289 0.9411 0.000 0.968 0.032
#> SRR1336569 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442754 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR613222 3 0.1289 0.9266 0.000 0.032 0.968
#> SRR1459937 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR2185018 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR655732 2 0.3038 0.8682 0.000 0.896 0.104
#> SRR809348 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR661074 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349851 1 0.0747 0.9483 0.984 0.016 0.000
#> SRR1405123 3 0.1163 0.9305 0.000 0.028 0.972
#> SRR661096 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.6140 0.3364 0.596 0.000 0.404
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR658212 2 0.5254 0.6403 0.000 0.736 0.264
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344422 3 0.0747 0.9410 0.000 0.016 0.984
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487570 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR813802 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368264 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327702 1 0.6180 0.2867 0.584 0.000 0.416
#> SRR615611 2 0.0424 0.9625 0.000 0.992 0.008
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR613699 3 0.4235 0.7673 0.000 0.176 0.824
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444002 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.6235 0.2153 0.000 0.564 0.436
#> SRR600656 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR658766 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR655946 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR817282 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR662498 3 0.0592 0.9443 0.000 0.012 0.988
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480547 2 0.1163 0.9454 0.000 0.972 0.028
#> SRR1452515 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR615273 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR812773 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365448 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR662245 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR816226 1 0.6587 0.2505 0.568 0.008 0.424
#> SRR601387 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR662906 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388528 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR655399 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR818901 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR661961 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR658259 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322900 3 0.0237 0.9498 0.000 0.004 0.996
#> SRR1309942 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345760 2 0.3454 0.8604 0.104 0.888 0.008
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR661469 3 0.4931 0.6969 0.000 0.232 0.768
#> SRR1500323 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368072 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309556 2 0.4974 0.6836 0.000 0.764 0.236
#> SRR1456027 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1320469 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR614251 3 0.6302 0.0822 0.000 0.480 0.520
#> SRR1454310 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR615105 2 0.6140 0.3147 0.000 0.596 0.404
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166064 3 0.0424 0.9472 0.000 0.008 0.992
#> SRR601671 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR663874 2 0.6302 0.0685 0.000 0.520 0.480
#> SRR1409130 2 0.5397 0.6053 0.000 0.720 0.280
#> SRR659696 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.1289 0.9410 0.032 0.968 0.000
#> SRR663284 3 0.0592 0.9443 0.000 0.012 0.988
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348040 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415773 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388832 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394637 3 0.6192 0.2444 0.420 0.000 0.580
#> SRR606974 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR662918 3 0.0592 0.9443 0.000 0.012 0.988
#> SRR817421 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318560 1 0.1643 0.9251 0.956 0.000 0.044
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR615044 2 0.6154 0.3022 0.000 0.592 0.408
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388873 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406008 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR662019 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349209 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326161 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.5953 0.5850 0.280 0.708 0.012
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR660709 3 0.0592 0.9443 0.000 0.012 0.988
#> SRR809444 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 3 0.5678 0.5126 0.316 0.000 0.684
#> SRR657139 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 3 0.0424 0.9465 0.008 0.000 0.992
#> SRR1452334 2 0.2878 0.8759 0.000 0.904 0.096
#> SRR1381775 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR658989 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331922 1 0.0237 0.9606 0.996 0.000 0.004
#> SRR615479 3 0.5327 0.6315 0.000 0.272 0.728
#> SRR1375796 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR659507 2 0.6045 0.3908 0.000 0.620 0.380
#> SRR663296 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 3 0.1289 0.9266 0.000 0.032 0.968
#> SRR1414727 3 0.0237 0.9498 0.000 0.004 0.996
#> SRR663477 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR614611 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478968 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR613951 3 0.1031 0.9341 0.000 0.024 0.976
#> SRR1418022 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408161 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR657054 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402328 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.5497 0.5908 0.000 0.708 0.292
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453416 1 0.4346 0.7598 0.816 0.000 0.184
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458683 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR660260 3 0.2356 0.8856 0.000 0.072 0.928
#> SRR1071231 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337173 2 0.3038 0.8702 0.000 0.896 0.104
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166376 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.0592 0.9443 0.000 0.012 0.988
#> SRR1401379 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR627439 3 0.1525 0.9254 0.004 0.032 0.964
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092985 1 0.4974 0.6820 0.764 0.000 0.236
#> SRR656409 2 0.1860 0.9216 0.052 0.948 0.000
#> SRR1468658 3 0.6291 0.1318 0.000 0.468 0.532
#> SRR1390437 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 3 0.3267 0.8430 0.116 0.000 0.884
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR659911 3 0.4796 0.7137 0.000 0.220 0.780
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345894 2 0.2066 0.9140 0.000 0.940 0.060
#> SRR1442928 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 3 0.6180 0.2994 0.000 0.416 0.584
#> SRR1365426 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487947 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR659708 3 0.4931 0.6747 0.232 0.000 0.768
#> SRR603236 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR613426 3 0.0747 0.9410 0.000 0.016 0.984
#> SRR613879 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385101 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.6104 0.4631 0.648 0.348 0.004
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.5948 0.4304 0.000 0.640 0.360
#> SRR1383081 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166960 3 0.4452 0.7491 0.000 0.192 0.808
#> SRR605101 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR665478 3 0.1753 0.9108 0.000 0.048 0.952
#> SRR612767 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489030 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR615225 2 0.0424 0.9622 0.000 0.992 0.008
#> SRR1401839 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR612839 3 0.2066 0.8988 0.060 0.000 0.940
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.5760 0.5112 0.000 0.672 0.328
#> SRR1488214 1 0.5408 0.7833 0.812 0.052 0.136
#> SRR654766 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.9690 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9523 0.000 0.000 1.000
#> SRR615311 1 0.0747 0.9510 0.984 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380716 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612803 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355396 1 0.0779 0.9559 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1084417 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0592 0.9644 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR665262 2 0.1867 0.9208 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1499740 3 0.5364 0.3462 0.000 0.320 0.652 0.028
#> SRR1105057 2 0.0336 0.9702 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1439742 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614599 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612215 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1094051 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324496 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393449 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409263 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334889 2 0.4387 0.7328 0.000 0.776 0.024 0.200
#> SRR614839 2 0.1118 0.9579 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR658433 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1088581 2 0.2021 0.9312 0.000 0.936 0.024 0.040
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1471117 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311553 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458220 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660066 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1447103 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1402153 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658707 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384371 3 0.0188 0.9730 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1074670 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375439 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329003 1 0.4920 0.7120 0.768 0.000 0.068 0.164
#> SRR1404837 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1317920 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455525 1 0.3408 0.7698 0.860 0.120 0.016 0.004
#> SRR613999 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310836 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658200 3 0.3610 0.7395 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1068855 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612227 3 0.2714 0.7963 0.000 0.112 0.884 0.004
#> SRR1388809 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1413872 2 0.1940 0.9243 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1452864 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473078 3 0.0188 0.9732 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR615814 2 0.1297 0.9540 0.000 0.964 0.020 0.016
#> SRR1325225 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313687 2 0.1211 0.9469 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1358220 2 0.0336 0.9702 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1096662 2 0.0707 0.9673 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1487746 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401752 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR660164 2 0.0804 0.9640 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR815783 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809595 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1403133 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR815470 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1344382 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432453 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1478362 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392186 2 0.3390 0.8204 0.132 0.852 0.000 0.016
#> SRR1347937 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431569 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471594 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354270 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612683 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1392901 2 0.3306 0.7928 0.000 0.840 0.156 0.004
#> SRR1077805 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360402 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.4608 0.5782 0.692 0.000 0.004 0.304
#> SRR813656 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR808244 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1408595 1 0.1833 0.9131 0.944 0.032 0.024 0.000
#> SRR1385277 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1435248 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1419110 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408682 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1317134 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1370780 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489307 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1453911 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR603164 3 0.0188 0.9733 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1383259 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1330854 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1468162 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1331220 3 0.0188 0.9732 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1361546 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1486156 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660545 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615635 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385411 2 0.2342 0.9126 0.000 0.912 0.008 0.080
#> SRR1342739 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662126 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1464601 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1071594 2 0.0469 0.9676 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR612539 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR602010 2 0.0188 0.9707 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR810249 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR818773 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1336569 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368117 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442754 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613222 4 0.1510 0.9680 0.000 0.016 0.028 0.956
#> SRR1459937 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2185018 4 0.0921 0.9760 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR655732 2 0.2522 0.8997 0.000 0.908 0.016 0.076
#> SRR809348 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR819261 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0336 0.9717 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1349851 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405123 2 0.8342 -0.0361 0.308 0.444 0.028 0.220
#> SRR661096 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1320225 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454651 1 0.3972 0.7359 0.788 0.000 0.008 0.204
#> SRR1307677 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466512 2 0.0336 0.9702 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR658212 2 0.2363 0.9165 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344422 4 0.2699 0.9026 0.000 0.068 0.028 0.904
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314832 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR627431 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1418561 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1448029 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813802 3 0.0817 0.9571 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR815020 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309702 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435311 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612395 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR603116 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323152 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368264 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1326624 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429265 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615611 2 0.4426 0.7267 0.000 0.772 0.024 0.204
#> SRR1486799 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096174 2 0.1302 0.9518 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR815044 2 0.1716 0.9355 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1338560 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615862 2 0.0707 0.9673 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1480038 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR659436 3 0.2814 0.8432 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR613699 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1436563 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615323 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1330327 2 0.1211 0.9554 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1489950 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1431927 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318444 2 0.2222 0.9243 0.000 0.924 0.016 0.060
#> SRR600656 2 0.0469 0.9697 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR658766 3 0.1474 0.9299 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR655946 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817282 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444120 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1471965 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612695 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662498 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656860 2 0.0707 0.9673 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1480547 2 0.2124 0.9212 0.000 0.924 0.008 0.068
#> SRR1452515 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1324390 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615273 3 0.2216 0.8885 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR601695 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR820907 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR812773 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1405984 2 0.0707 0.9631 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1472794 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365448 3 0.0188 0.9747 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095720 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1377862 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319710 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1326604 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1098879 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662245 4 0.1022 0.9762 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1074719 2 0.0336 0.9702 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR816226 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR601387 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614575 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353900 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR662906 3 0.2413 0.8700 0.000 0.064 0.916 0.020
#> SRR1350832 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1403280 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1313969 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388528 3 0.0188 0.9747 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452912 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400180 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR655399 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR818901 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR607067 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1391420 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384138 2 0.1637 0.9386 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR661961 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658259 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1310476 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452696 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365034 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1478053 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1475300 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1328101 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1322900 3 0.1042 0.9478 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR1309942 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345760 2 0.6162 0.4308 0.304 0.620 0.000 0.076
#> SRR1435418 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1402172 2 0.0469 0.9697 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1443436 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661469 2 0.4057 0.7909 0.000 0.816 0.032 0.152
#> SRR1500323 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1356705 2 0.0188 0.9707 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1464915 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312406 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389177 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR601815 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR613330 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1434502 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394190 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1481083 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR816382 3 0.0188 0.9730 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613126 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089424 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309556 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1456027 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400551 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1320469 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0469 0.9676 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1454310 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615105 2 0.1356 0.9490 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166064 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR601671 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR663874 4 0.2699 0.9023 0.000 0.068 0.028 0.904
#> SRR1409130 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR659696 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408249 2 0.1356 0.9558 0.008 0.960 0.000 0.032
#> SRR663284 4 0.1209 0.9780 0.000 0.004 0.032 0.964
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614852 2 0.1118 0.9579 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1348040 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1489610 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488091 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499566 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361480 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1388832 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394637 3 0.1398 0.9279 0.040 0.000 0.956 0.004
#> SRR606974 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR662918 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR817421 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1381348 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR608264 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454117 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312684 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615044 2 0.0804 0.9650 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1432743 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406008 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1396786 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0707 0.9673 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR655170 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087825 2 0.0817 0.9654 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR662019 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349209 3 0.4869 0.6708 0.000 0.132 0.780 0.088
#> SRR1326161 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345284 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416672 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663356 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454328 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1489286 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092349 2 0.3625 0.8239 0.120 0.852 0.024 0.004
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660709 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR809444 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089901 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1375774 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.7088 0.3194 0.568 0.000 0.204 0.228
#> SRR657139 3 0.0188 0.9747 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1440744 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353555 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323087 3 0.1109 0.9447 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR1452334 2 0.4284 0.7418 0.000 0.780 0.020 0.200
#> SRR1381775 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363908 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR658989 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811771 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813983 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR815825 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819054 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1367988 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331922 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615479 2 0.5809 0.2997 0.400 0.572 0.016 0.012
#> SRR1375796 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1386991 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355217 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1356290 2 0.0376 0.9703 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR659507 2 0.0524 0.9703 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR663296 4 0.1022 0.9762 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR598044 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR661155 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1414727 3 0.1545 0.9347 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR663477 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354489 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR655052 2 0.0469 0.9697 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1478968 1 0.0336 0.9725 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1351280 2 0.2376 0.9096 0.000 0.916 0.016 0.068
#> SRR613951 2 0.5742 0.4801 0.000 0.648 0.300 0.052
#> SRR1418022 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661901 3 0.5369 0.6339 0.000 0.096 0.740 0.164
#> SRR1408161 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657054 4 0.3649 0.7723 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR655040 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR810225 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1325377 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR617829 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402328 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1480455 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663026 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1478386 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1458683 3 0.2412 0.8885 0.000 0.008 0.908 0.084
#> SRR1370572 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467567 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468532 2 0.0707 0.9673 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1310735 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440101 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR660260 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1071231 2 0.0376 0.9703 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1459125 2 0.0336 0.9702 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1337173 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2166376 4 0.1022 0.9762 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR659816 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1401379 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR600981 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1398335 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR660115 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407950 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1359780 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1490037 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR627439 4 0.2023 0.9563 0.028 0.004 0.028 0.940
#> SRR1397156 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1319648 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1092985 1 0.0376 0.9720 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR656409 2 0.4274 0.7701 0.148 0.808 0.000 0.044
#> SRR1468658 2 0.1520 0.9479 0.000 0.956 0.020 0.024
#> SRR1390437 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR658057 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612635 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351480 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436651 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9750 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614263 1 0.5137 0.2096 0.544 0.000 0.004 0.452
#> SRR1409575 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659911 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345894 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442928 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1464681 2 0.0817 0.9654 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1418880 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309070 2 0.0336 0.9691 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1365426 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1487947 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.4707 0.6595 0.760 0.000 0.204 0.036
#> SRR603236 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660673 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430729 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663807 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087245 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1339108 2 0.0592 0.9650 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR613426 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR613879 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385101 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1387966 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458852 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1430489 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349231 1 0.0188 0.9719 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1376249 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR662653 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390027 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098474 2 0.0657 0.9686 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1383081 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2166960 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR605101 2 0.0188 0.9707 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818600 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1367715 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR665478 4 0.1109 0.9802 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR612767 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489030 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1430375 2 0.0336 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615225 2 0.1867 0.9278 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1401839 2 0.0188 0.9710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379110 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077288 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0188 0.9708 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1342782 2 0.0188 0.9707 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612839 3 0.0188 0.9747 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469014 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387222 3 0.0469 0.9680 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR664063 2 0.5127 0.4461 0.000 0.632 0.012 0.356
#> SRR1488214 1 0.0188 0.9747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR654766 2 0.0592 0.9687 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1320321 2 0.0469 0.9696 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1071955 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417483 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1394231 2 0.0000 0.9709 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488470 2 0.0817 0.9654 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0000 0.9776 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615311 1 0.3626 0.7718 0.812 0.004 0.000 0.184
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.0794 0.65724 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1380716 2 0.4262 -0.06743 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.4404 0.81443 0.776 0.008 0.000 0.136 0.080
#> SRR1084417 3 0.1671 0.88722 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1074359 2 0.0963 0.65282 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.1544 0.89316 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR665262 2 0.2260 0.63371 0.000 0.908 0.000 0.064 0.028
#> SRR1499740 3 0.5231 0.57862 0.000 0.184 0.704 0.012 0.100
#> SRR1105057 2 0.4101 0.17654 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1439742 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR614599 2 0.0404 0.66407 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR612215 2 0.0609 0.66331 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0794 0.90766 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1393449 3 0.4183 0.76899 0.000 0.000 0.780 0.136 0.084
#> SRR1409263 3 0.1671 0.88722 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1431288 1 0.4054 0.82642 0.788 0.000 0.000 0.140 0.072
#> SRR1334889 4 0.6821 0.41611 0.000 0.328 0.012 0.460 0.200
#> SRR614839 4 0.4387 0.57690 0.000 0.348 0.000 0.640 0.012
#> SRR658433 2 0.1197 0.65767 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1088581 2 0.7041 0.00723 0.000 0.576 0.144 0.184 0.096
#> SRR1328797 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.4304 -0.30724 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1471117 1 0.4170 0.81819 0.780 0.000 0.000 0.140 0.080
#> SRR1311553 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1458220 2 0.0963 0.65377 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.1121 0.64845 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1447103 2 0.0703 0.66393 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1402153 3 0.1671 0.88814 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR655887 2 0.3143 0.53708 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.2605 0.88049 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1384371 3 0.1282 0.87783 0.000 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR1074670 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375439 2 0.1410 0.65811 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1329003 1 0.7360 0.46389 0.528 0.000 0.128 0.232 0.112
#> SRR1404837 2 0.4219 0.03206 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 1 0.5685 0.70203 0.672 0.020 0.008 0.224 0.076
#> SRR613999 1 0.0162 0.90826 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310836 1 0.0162 0.90828 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.2280 0.85207 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1068855 1 0.1732 0.89926 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612227 3 0.2358 0.79829 0.000 0.104 0.888 0.000 0.008
#> SRR1388809 2 0.1121 0.65815 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1413872 2 0.5551 -0.37541 0.000 0.488 0.000 0.444 0.068
#> SRR1452864 1 0.0404 0.90862 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1473078 3 0.2189 0.87703 0.000 0.012 0.904 0.000 0.084
#> SRR615814 2 0.3532 0.55177 0.000 0.824 0.000 0.128 0.048
#> SRR1325225 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.5484 0.24239 0.000 0.664 0.240 0.080 0.016
#> SRR1358220 2 0.4227 0.03074 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1096662 4 0.4397 0.51317 0.000 0.432 0.000 0.564 0.004
#> SRR1487746 1 0.0609 0.90809 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.4302 -0.19617 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR660164 2 0.4901 0.36765 0.000 0.700 0.000 0.216 0.084
#> SRR815783 2 0.1043 0.65810 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR809595 4 0.4171 0.55902 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1403133 2 0.1043 0.65150 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR815470 2 0.1121 0.65663 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0794 0.66216 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1478362 2 0.3143 0.52759 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1392186 4 0.5565 0.45424 0.168 0.168 0.000 0.660 0.004
#> SRR1347937 1 0.0162 0.90838 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431569 1 0.2471 0.88502 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.4139 0.77281 0.000 0.000 0.784 0.132 0.084
#> SRR612683 2 0.2516 0.60315 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1392901 2 0.3913 0.22003 0.000 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360402 2 0.0880 0.65630 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.1792 0.88285 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR656247 1 0.5877 0.49378 0.544 0.004 0.000 0.356 0.096
#> SRR813656 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808244 3 0.3955 0.78939 0.000 0.000 0.800 0.116 0.084
#> SRR1387240 2 0.0880 0.65537 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1408595 1 0.4868 0.77724 0.736 0.012 0.000 0.172 0.080
#> SRR1385277 4 0.4126 0.57639 0.000 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1435248 2 0.1043 0.65001 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1419110 2 0.1908 0.64243 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1408682 2 0.1043 0.65150 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1317134 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.4300 -0.16068 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1453911 2 0.1671 0.65164 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR603164 3 0.0671 0.91166 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1383259 4 0.4171 0.56731 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1330854 3 0.1792 0.88285 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1452423 1 0.0609 0.90809 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1368574 4 0.4219 0.49280 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0671 0.90855 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1361546 2 0.3707 0.38046 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1486156 1 0.3994 0.83041 0.792 0.000 0.000 0.140 0.068
#> SRR660545 2 0.1952 0.63566 0.000 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR615635 2 0.0703 0.65814 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1385411 4 0.6069 0.42214 0.000 0.432 0.000 0.448 0.120
#> SRR1342739 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662126 5 0.0290 0.88661 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1464601 2 0.1043 0.65001 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1071594 2 0.3346 0.57597 0.000 0.844 0.092 0.064 0.000
#> SRR612539 2 0.4256 -0.12785 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR602010 2 0.3508 0.49370 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR810249 2 0.1908 0.65105 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR818773 4 0.4497 0.52504 0.000 0.424 0.000 0.568 0.008
#> SRR1336569 1 0.0703 0.90781 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1368117 2 0.1671 0.65040 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1442754 3 0.4139 0.77345 0.000 0.000 0.784 0.132 0.084
#> SRR1334247 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661639 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR613222 5 0.5458 0.56022 0.000 0.068 0.000 0.380 0.552
#> SRR1459937 2 0.4304 -0.25959 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR2185018 5 0.3427 0.80227 0.000 0.000 0.012 0.192 0.796
#> SRR655732 2 0.6054 -0.04457 0.000 0.560 0.000 0.280 0.160
#> SRR809348 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661074 3 0.1732 0.88475 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1349851 1 0.1197 0.90498 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1405123 4 0.7266 -0.20321 0.200 0.064 0.004 0.540 0.192
#> SRR661096 4 0.4201 0.50722 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.7025 0.53117 0.564 0.000 0.108 0.228 0.100
#> SRR1307677 2 0.3424 0.47876 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1466512 2 0.4262 -0.02140 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR658212 2 0.6021 -0.05799 0.000 0.580 0.000 0.232 0.188
#> SRR1430525 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344422 5 0.5717 0.53179 0.000 0.132 0.000 0.260 0.608
#> SRR1353924 2 0.3774 0.42678 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1314832 3 0.1732 0.88475 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1487570 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.4030 0.21865 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1418561 3 0.1792 0.88285 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1448029 3 0.0324 0.91695 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR813802 3 0.4720 0.73995 0.008 0.000 0.752 0.136 0.104
#> SRR815020 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.1478 0.66015 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1435311 2 0.4030 0.21172 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR612395 2 0.1270 0.65508 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR603116 2 0.0963 0.66231 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1323152 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368264 2 0.4283 -0.08806 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1326624 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1429265 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.4170 0.81819 0.780 0.000 0.000 0.140 0.080
#> SRR615611 4 0.6530 0.42343 0.000 0.380 0.000 0.424 0.196
#> SRR1486799 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.5724 0.54166 0.044 0.236 0.000 0.660 0.060
#> SRR815044 4 0.5139 0.55108 0.000 0.316 0.000 0.624 0.060
#> SRR1338560 2 0.4262 -0.08352 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR615862 2 0.4836 0.16473 0.000 0.628 0.000 0.336 0.036
#> SRR1480038 2 0.4302 -0.16952 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR659436 3 0.2074 0.87460 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR613699 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.4307 -0.23000 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR1330327 4 0.4425 0.57264 0.000 0.392 0.000 0.600 0.008
#> SRR1489950 2 0.0794 0.65714 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1431927 1 0.2020 0.89494 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1318444 4 0.5577 0.48051 0.000 0.256 0.000 0.624 0.120
#> SRR600656 2 0.4287 -0.13790 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR658766 3 0.1965 0.87608 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR655946 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1444120 4 0.4306 0.36701 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1471965 1 0.2074 0.89426 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR612695 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662498 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376764 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.1544 0.89237 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR656860 2 0.4675 0.04115 0.000 0.600 0.000 0.380 0.020
#> SRR1480547 4 0.5687 0.51043 0.000 0.316 0.000 0.580 0.104
#> SRR1452515 2 0.1197 0.65723 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1324390 2 0.1121 0.64845 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR615273 3 0.5580 0.57214 0.000 0.000 0.632 0.236 0.132
#> SRR601695 2 0.0963 0.65290 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR820907 2 0.1965 0.65001 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR812773 4 0.4639 0.59145 0.024 0.344 0.000 0.632 0.000
#> SRR1405984 2 0.3360 0.58510 0.000 0.816 0.004 0.168 0.012
#> SRR1472794 2 0.0703 0.65900 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1365448 3 0.4382 0.76066 0.004 0.000 0.772 0.140 0.084
#> SRR1095720 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435626 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080766 2 0.1197 0.64553 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 2 0.4300 -0.15407 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1326604 2 0.2605 0.60078 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1098879 3 0.0510 0.91505 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR662245 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074719 2 0.3177 0.53658 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR816226 1 0.4355 0.80383 0.760 0.000 0.000 0.164 0.076
#> SRR601387 2 0.1908 0.65105 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR614575 2 0.3305 0.49956 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1353900 2 0.1270 0.65477 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR662906 3 0.1830 0.85557 0.000 0.068 0.924 0.000 0.008
#> SRR1350832 2 0.0794 0.66233 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1403280 2 0.4210 -0.01334 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1313969 2 0.2813 0.57968 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1388528 3 0.4226 0.76502 0.000 0.000 0.776 0.140 0.084
#> SRR1452912 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 4 0.4150 0.56690 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR655399 3 0.0162 0.91856 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319753 4 0.4283 0.43404 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR818901 3 0.0794 0.91040 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR607067 2 0.4287 -0.09325 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 4 0.5765 0.46106 0.000 0.424 0.000 0.488 0.088
#> SRR661961 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658259 2 0.4366 0.25778 0.000 0.664 0.000 0.320 0.016
#> SRR1310476 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0880 0.65537 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1365034 4 0.4278 0.38442 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1478053 2 0.1197 0.65820 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1475300 2 0.4278 -0.05167 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1328101 2 0.0880 0.65510 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1322900 3 0.4786 0.76572 0.000 0.048 0.776 0.088 0.088
#> SRR1309942 2 0.0880 0.66053 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1345760 4 0.6631 0.22163 0.168 0.128 0.000 0.620 0.084
#> SRR1435418 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1402172 2 0.3966 0.27521 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.1197 0.64785 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR661469 2 0.6938 -0.13182 0.000 0.524 0.032 0.212 0.232
#> SRR1500323 2 0.1043 0.65001 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1356705 2 0.4219 0.10629 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1792 0.88285 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1350435 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1389177 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.1043 0.65814 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR601815 2 0.1270 0.65585 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.2773 0.57353 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.2046 0.86116 0.000 0.068 0.916 0.000 0.016
#> SRR1318839 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.3661 0.43311 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR613126 2 0.0963 0.66038 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1089424 2 0.3366 0.49308 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1347214 2 0.1792 0.64922 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1309556 2 0.4505 0.06186 0.000 0.604 0.000 0.384 0.012
#> SRR1456027 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1320469 3 0.1792 0.88285 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR614251 2 0.2608 0.62290 0.000 0.888 0.020 0.088 0.004
#> SRR1454310 2 0.1121 0.65332 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR615105 2 0.2740 0.61118 0.000 0.876 0.000 0.096 0.028
#> SRR1433290 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.4256 -0.05469 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR663874 5 0.2522 0.76665 0.000 0.108 0.000 0.012 0.880
#> SRR1409130 2 0.1341 0.65457 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR659696 2 0.2891 0.57019 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1408249 4 0.6982 0.49666 0.132 0.220 0.000 0.568 0.080
#> SRR663284 5 0.4142 0.76175 0.000 0.004 0.016 0.252 0.728
#> SRR1402794 3 0.0404 0.91637 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR614852 4 0.4354 0.58499 0.000 0.368 0.000 0.624 0.008
#> SRR1348040 2 0.4300 -0.25563 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1489610 2 0.4297 -0.14844 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1488091 2 0.1043 0.65001 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1499566 4 0.4307 0.22047 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR1361480 2 0.3395 0.48454 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.2966 0.56524 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1388832 3 0.3090 0.84514 0.000 0.000 0.860 0.052 0.088
#> SRR1394637 3 0.6837 0.47089 0.180 0.000 0.596 0.140 0.084
#> SRR606974 2 0.0290 0.66429 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR662918 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.3039 0.55194 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.3366 0.86291 0.828 0.000 0.000 0.140 0.032
#> SRR1454117 2 0.3274 0.53842 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1312684 1 0.2179 0.89197 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR615044 2 0.5447 -0.21145 0.000 0.536 0.000 0.400 0.064
#> SRR1432743 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.0703 0.66394 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1353517 1 0.1121 0.90558 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1357148 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1406008 2 0.3857 0.33389 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1396786 2 0.0963 0.65282 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 4 0.4341 0.51708 0.000 0.404 0.000 0.592 0.004
#> SRR655170 2 0.1608 0.65370 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1087825 4 0.4210 0.49814 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR662019 3 0.1792 0.88285 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1349209 3 0.6995 0.37082 0.000 0.056 0.524 0.288 0.132
#> SRR1326161 2 0.1197 0.65925 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1345284 2 0.4300 -0.15411 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1416672 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR663356 2 0.4297 -0.20241 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1454328 2 0.1043 0.65550 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1489286 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1092349 4 0.7993 0.29756 0.296 0.260 0.000 0.360 0.084
#> SRR1408183 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660709 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1089901 2 0.0963 0.65377 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1375774 1 0.2329 0.88864 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1326292 1 0.8218 0.17419 0.404 0.000 0.204 0.232 0.160
#> SRR657139 3 0.4183 0.76981 0.000 0.000 0.780 0.136 0.084
#> SRR1440744 4 0.4306 0.26647 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 3 0.6837 0.46881 0.180 0.000 0.596 0.140 0.084
#> SRR1452334 4 0.6396 0.42139 0.000 0.416 0.000 0.416 0.168
#> SRR1381775 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0404 0.90833 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1319626 2 0.4192 0.07265 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR658989 3 0.0609 0.91361 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1353663 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR811771 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR813983 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.1478 0.66118 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1367988 4 0.4297 0.31042 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1331922 1 0.2516 0.88420 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR615479 4 0.6827 0.03155 0.304 0.088 0.016 0.552 0.040
#> SRR1375796 2 0.1197 0.65690 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1386991 2 0.1732 0.65576 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1355217 4 0.4302 0.40936 0.000 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1356290 2 0.1908 0.63405 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR659507 2 0.2011 0.63313 0.000 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR663296 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR598044 2 0.3684 0.45075 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR661155 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414727 3 0.4697 0.68946 0.000 0.124 0.760 0.012 0.104
#> SRR663477 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1354489 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614611 2 0.0794 0.65714 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR655052 2 0.3999 0.25228 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1478968 1 0.2605 0.85174 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1351280 2 0.5891 -0.14401 0.000 0.552 0.000 0.328 0.120
#> SRR613951 3 0.7808 0.12485 0.000 0.164 0.448 0.276 0.112
#> SRR1418022 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 3 0.7070 0.34905 0.000 0.052 0.516 0.280 0.152
#> SRR1408161 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR657054 5 0.4278 0.01224 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR655040 4 0.4114 0.58079 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR810225 2 0.1270 0.65835 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1325377 2 0.2852 0.59063 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 2 0.0963 0.65291 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1480455 2 0.1043 0.65873 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.4170 0.81819 0.780 0.000 0.000 0.140 0.080
#> SRR1481396 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0609 0.66019 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR663026 2 0.3913 0.29897 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1478386 4 0.4307 0.26681 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1458683 3 0.2653 0.86146 0.000 0.024 0.880 0.000 0.096
#> SRR1370572 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 4 0.3969 0.58548 0.000 0.304 0.000 0.692 0.004
#> SRR1310735 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.4307 0.26060 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR660260 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.1965 0.65058 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1459125 2 0.3876 0.31126 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1337173 2 0.0963 0.66015 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.4300 -0.15407 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR600981 4 0.4306 0.36124 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.4302 -0.16952 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR660115 1 0.2424 0.88609 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1407950 2 0.1270 0.66055 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1359780 2 0.0880 0.65537 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 5 0.6025 0.61278 0.116 0.004 0.000 0.336 0.544
#> SRR1397156 1 0.0290 0.90833 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1410221 2 0.0963 0.65282 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1319648 2 0.4561 -0.35192 0.000 0.504 0.000 0.488 0.008
#> SRR1092985 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR656409 4 0.5166 0.25046 0.172 0.088 0.000 0.720 0.020
#> SRR1468658 2 0.4935 0.32437 0.000 0.720 0.200 0.068 0.012
#> SRR1390437 2 0.4304 -0.26959 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR658057 2 0.4113 0.44146 0.000 0.740 0.000 0.232 0.028
#> SRR612635 2 0.4101 0.15662 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1351480 2 0.4262 -0.08733 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0703 0.90781 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR659590 2 0.1341 0.65899 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR614263 1 0.5884 0.47793 0.536 0.000 0.000 0.352 0.112
#> SRR1409575 2 0.3932 0.31312 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR659911 5 0.0162 0.88575 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1085519 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 2 0.0880 0.66253 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1442928 2 0.0880 0.65537 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1464681 2 0.4924 -0.16212 0.000 0.552 0.000 0.420 0.028
#> SRR1418880 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1309070 2 0.4394 0.33203 0.000 0.732 0.228 0.036 0.004
#> SRR1365426 2 0.4278 -0.14724 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1487947 3 0.4049 0.78309 0.000 0.000 0.792 0.124 0.084
#> SRR659708 1 0.7615 0.34172 0.480 0.000 0.240 0.192 0.088
#> SRR603236 2 0.1121 0.65868 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR660673 1 0.2516 0.88392 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1430729 2 0.1792 0.65411 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR663807 2 0.0404 0.66341 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1087245 2 0.2127 0.63572 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1339108 2 0.4756 0.30286 0.000 0.668 0.000 0.288 0.044
#> SRR613426 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.2074 0.63793 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1385101 4 0.4249 0.46011 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1387966 2 0.0510 0.66344 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1458852 2 0.1043 0.65143 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.2424 0.88609 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1376249 3 0.0162 0.91856 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321987 2 0.1197 0.65323 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR662653 2 0.0703 0.65894 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1390027 1 0.0609 0.90829 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1098474 2 0.4404 0.40657 0.000 0.712 0.000 0.252 0.036
#> SRR1383081 2 0.2280 0.62283 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR2166960 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.3612 0.46550 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR818600 2 0.1851 0.63289 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1367715 2 0.4294 -0.12235 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 5 0.0000 0.88986 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612767 1 0.1043 0.90595 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1489030 2 0.0703 0.65887 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1430375 2 0.1043 0.65810 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR615225 2 0.5729 -0.26939 0.000 0.516 0.000 0.396 0.088
#> SRR1401839 2 0.1544 0.65686 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1379110 4 0.4210 0.54559 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1077288 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.3656 0.52791 0.000 0.784 0.000 0.196 0.020
#> SRR1342782 2 0.3636 0.40780 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612839 3 0.4226 0.76502 0.000 0.000 0.776 0.140 0.084
#> SRR1470093 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0451 0.91452 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR664063 5 0.6478 -0.01595 0.000 0.184 0.000 0.396 0.420
#> SRR1488214 1 0.2966 0.85871 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR654766 4 0.4268 0.40270 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1320321 2 0.4227 0.02260 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.90814 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.3305 0.50706 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1488470 4 0.4457 0.56788 0.000 0.368 0.000 0.620 0.012
#> SRR1389497 3 0.0000 0.91923 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0162 0.91849 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615311 1 0.5259 0.56609 0.588 0.016 0.000 0.368 0.028
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.0260 0.8461 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380716 5 0.3316 0.7266 0.000 0.136 0.000 0.052 0.812 0.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.5097 0.0295 0.476 0.000 0.000 0.464 0.044 0.016
#> SRR1084417 3 0.1682 0.8650 0.000 0.000 0.928 0.052 0.000 0.020
#> SRR1074359 2 0.0405 0.8457 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1419258 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 3 0.0508 0.9096 0.000 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR665262 2 0.2147 0.8225 0.000 0.912 0.000 0.044 0.032 0.012
#> SRR1499740 3 0.6752 0.1941 0.000 0.108 0.520 0.076 0.276 0.020
#> SRR1105057 5 0.4569 0.6864 0.000 0.156 0.000 0.144 0.700 0.000
#> SRR1439742 1 0.4064 0.4151 0.624 0.000 0.000 0.360 0.016 0.000
#> SRR614599 2 0.0508 0.8465 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR612215 2 0.0603 0.8452 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.4335 -0.1182 0.000 0.000 0.508 0.472 0.000 0.020
#> SRR1409263 3 0.0806 0.9025 0.000 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR1431288 1 0.4184 0.1183 0.500 0.000 0.000 0.488 0.000 0.012
#> SRR1334889 5 0.5696 0.6005 0.000 0.092 0.004 0.300 0.576 0.028
#> SRR614839 5 0.4662 0.6999 0.000 0.096 0.000 0.236 0.668 0.000
#> SRR658433 2 0.1549 0.8273 0.000 0.936 0.000 0.044 0.020 0.000
#> SRR1088581 2 0.6948 -0.1651 0.000 0.408 0.204 0.032 0.336 0.020
#> SRR1328797 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334512 5 0.4620 0.7261 0.000 0.176 0.000 0.132 0.692 0.000
#> SRR1471117 1 0.4184 0.1186 0.500 0.000 0.000 0.488 0.000 0.012
#> SRR1311553 1 0.3747 0.3857 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0725 0.8450 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR1354955 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654802 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.0622 0.8455 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1447103 2 0.0717 0.8461 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1402153 3 0.0806 0.9025 0.000 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR655887 2 0.3592 0.3305 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344 0.000
#> SRR1408529 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.4335 0.1454 0.508 0.000 0.000 0.472 0.020 0.000
#> SRR1384371 3 0.1010 0.8816 0.000 0.036 0.960 0.004 0.000 0.000
#> SRR1074670 3 0.0291 0.9133 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1375439 2 0.1588 0.8168 0.000 0.924 0.000 0.004 0.072 0.000
#> SRR1329003 4 0.6122 0.2940 0.356 0.000 0.084 0.512 0.028 0.020
#> SRR1404837 5 0.3962 0.7108 0.000 0.120 0.000 0.116 0.764 0.000
#> SRR1317920 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455525 4 0.5474 0.1175 0.416 0.000 0.008 0.504 0.052 0.020
#> SRR613999 1 0.0146 0.7597 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658200 3 0.0865 0.8968 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1068855 1 0.2854 0.6265 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612227 3 0.2146 0.7726 0.000 0.116 0.880 0.004 0.000 0.000
#> SRR1388809 2 0.1334 0.8368 0.000 0.948 0.000 0.032 0.020 0.000
#> SRR1413872 5 0.4763 0.7154 0.000 0.172 0.000 0.136 0.688 0.004
#> SRR1452864 1 0.0146 0.7593 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473078 3 0.1515 0.8819 0.000 0.028 0.944 0.008 0.000 0.020
#> SRR615814 2 0.2650 0.8156 0.000 0.888 0.004 0.036 0.056 0.016
#> SRR1325225 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313687 3 0.4413 -0.0212 0.000 0.488 0.492 0.008 0.012 0.000
#> SRR1358220 5 0.4104 0.6856 0.000 0.104 0.000 0.148 0.748 0.000
#> SRR1096662 5 0.4518 0.7188 0.000 0.104 0.000 0.200 0.696 0.000
#> SRR1487746 1 0.0146 0.7597 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401752 5 0.3627 0.7083 0.000 0.080 0.000 0.128 0.792 0.000
#> SRR660164 2 0.6363 0.3539 0.000 0.524 0.000 0.048 0.184 0.244
#> SRR815783 2 0.1549 0.8273 0.000 0.936 0.000 0.044 0.020 0.000
#> SRR809595 5 0.4691 0.7081 0.000 0.108 0.000 0.220 0.672 0.000
#> SRR1403133 2 0.0717 0.8454 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR815470 2 0.1793 0.8253 0.000 0.928 0.000 0.032 0.036 0.004
#> SRR1344382 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.1007 0.8364 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1478362 2 0.3991 -0.1355 0.000 0.524 0.000 0.004 0.472 0.000
#> SRR1392186 5 0.4568 0.5367 0.040 0.004 0.000 0.344 0.612 0.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.4253 0.1939 0.524 0.000 0.000 0.460 0.016 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354270 3 0.4105 0.3248 0.000 0.000 0.632 0.348 0.000 0.020
#> SRR612683 2 0.3555 0.5063 0.000 0.712 0.000 0.008 0.280 0.000
#> SRR1392901 2 0.3835 0.4674 0.000 0.668 0.320 0.012 0.000 0.000
#> SRR1077805 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1360402 2 0.0520 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1406112 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355352 3 0.1003 0.8974 0.000 0.000 0.964 0.016 0.000 0.020
#> SRR656247 4 0.5083 0.1383 0.404 0.000 0.000 0.528 0.060 0.008
#> SRR813656 6 0.0146 0.9175 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR808244 3 0.4335 -0.1182 0.000 0.000 0.508 0.472 0.000 0.020
#> SRR1387240 2 0.0260 0.8464 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1408595 4 0.5228 -0.0306 0.464 0.008 0.000 0.476 0.032 0.020
#> SRR1385277 5 0.3660 0.7246 0.000 0.060 0.000 0.160 0.780 0.000
#> SRR1435248 2 0.0291 0.8460 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1419110 2 0.1333 0.8347 0.000 0.944 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1408682 2 0.0622 0.8455 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1317134 1 0.3782 0.3551 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489307 5 0.3586 0.7042 0.000 0.080 0.000 0.124 0.796 0.000
#> SRR1453911 2 0.1411 0.8280 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060 0.000
#> SRR603164 3 0.1010 0.8842 0.000 0.036 0.960 0.004 0.000 0.000
#> SRR1383259 5 0.4120 0.7141 0.000 0.068 0.000 0.204 0.728 0.000
#> SRR1330854 3 0.3156 0.6967 0.000 0.000 0.800 0.180 0.000 0.020
#> SRR1452423 1 0.1204 0.7335 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1368574 5 0.2250 0.7369 0.000 0.064 0.000 0.040 0.896 0.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 3 0.0935 0.8881 0.000 0.032 0.964 0.004 0.000 0.000
#> SRR1361546 5 0.4338 0.2542 0.000 0.484 0.000 0.020 0.496 0.000
#> SRR1486156 1 0.4184 0.1186 0.500 0.000 0.000 0.488 0.000 0.012
#> SRR660545 2 0.1789 0.8195 0.000 0.924 0.000 0.044 0.032 0.000
#> SRR615635 2 0.0291 0.8460 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1385411 5 0.5624 0.6586 0.000 0.188 0.000 0.228 0.576 0.008
#> SRR1342739 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102830 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662126 6 0.0806 0.9060 0.000 0.000 0.000 0.020 0.008 0.972
#> SRR1464601 2 0.0260 0.8458 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071594 2 0.3219 0.6878 0.000 0.808 0.168 0.016 0.008 0.000
#> SRR612539 5 0.4972 0.6526 0.000 0.256 0.000 0.116 0.628 0.000
#> SRR602010 5 0.5319 0.5189 0.000 0.296 0.000 0.136 0.568 0.000
#> SRR810249 2 0.2658 0.7746 0.000 0.864 0.000 0.036 0.100 0.000
#> SRR818773 5 0.4929 0.6648 0.000 0.092 0.000 0.300 0.608 0.000
#> SRR1336569 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.2613 0.7505 0.000 0.848 0.000 0.012 0.140 0.000
#> SRR1442754 3 0.4335 -0.1182 0.000 0.000 0.508 0.472 0.000 0.020
#> SRR1334247 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661639 1 0.3843 0.2679 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR613222 4 0.5896 -0.1058 0.000 0.004 0.000 0.480 0.192 0.324
#> SRR1459937 5 0.2450 0.7501 0.000 0.116 0.000 0.016 0.868 0.000
#> SRR2185018 4 0.5067 -0.0718 0.000 0.000 0.024 0.488 0.032 0.456
#> SRR655732 5 0.6515 0.3907 0.000 0.344 0.000 0.072 0.464 0.120
#> SRR809348 1 0.4289 0.2812 0.556 0.000 0.000 0.424 0.020 0.000
#> SRR819261 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661074 3 0.0891 0.9012 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1349851 1 0.3547 0.4738 0.668 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.4893 0.3072 0.048 0.004 0.000 0.684 0.232 0.032
#> SRR661096 5 0.2250 0.7369 0.000 0.064 0.000 0.040 0.896 0.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454651 4 0.5723 0.1954 0.396 0.000 0.044 0.512 0.028 0.020
#> SRR1307677 2 0.4499 0.0491 0.000 0.540 0.000 0.032 0.428 0.000
#> SRR1466512 5 0.3453 0.7239 0.000 0.132 0.000 0.064 0.804 0.000
#> SRR658212 2 0.5967 0.2546 0.000 0.540 0.000 0.064 0.320 0.076
#> SRR1430525 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344422 6 0.5851 0.5795 0.000 0.120 0.000 0.128 0.112 0.640
#> SRR1353924 5 0.5283 0.5668 0.000 0.264 0.000 0.148 0.588 0.000
#> SRR1314832 3 0.1745 0.8608 0.000 0.000 0.924 0.056 0.000 0.020
#> SRR1487570 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627431 5 0.4219 0.4909 0.000 0.388 0.000 0.020 0.592 0.000
#> SRR1418561 3 0.3374 0.6494 0.000 0.000 0.772 0.208 0.000 0.020
#> SRR1448029 3 0.0692 0.9001 0.000 0.020 0.976 0.004 0.000 0.000
#> SRR813802 4 0.5228 0.1883 0.008 0.000 0.468 0.472 0.020 0.032
#> SRR815020 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.2263 0.7868 0.000 0.884 0.000 0.016 0.100 0.000
#> SRR1435311 5 0.4700 0.6247 0.000 0.288 0.000 0.076 0.636 0.000
#> SRR612395 2 0.1794 0.8275 0.000 0.924 0.000 0.040 0.036 0.000
#> SRR603116 2 0.1074 0.8414 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028 0.000
#> SRR1323152 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1368264 5 0.3967 0.6879 0.000 0.092 0.000 0.148 0.760 0.000
#> SRR1326624 1 0.4289 0.2804 0.556 0.000 0.000 0.424 0.020 0.000
#> SRR1429265 3 0.0146 0.9147 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1327702 4 0.4566 -0.0852 0.480 0.000 0.008 0.492 0.000 0.020
#> SRR615611 5 0.5672 0.6708 0.000 0.164 0.000 0.220 0.596 0.020
#> SRR1486799 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 5 0.4400 0.6074 0.032 0.008 0.000 0.276 0.680 0.004
#> SRR815044 5 0.4451 0.6900 0.000 0.072 0.000 0.248 0.680 0.000
#> SRR1338560 5 0.3136 0.7244 0.000 0.188 0.000 0.016 0.796 0.000
#> SRR615862 5 0.5078 0.5119 0.000 0.340 0.000 0.064 0.584 0.012
#> SRR1480038 5 0.3667 0.7003 0.000 0.080 0.000 0.132 0.788 0.000
#> SRR659436 3 0.0603 0.9087 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR613699 6 0.0260 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1436563 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615323 5 0.3616 0.7018 0.000 0.076 0.000 0.132 0.792 0.000
#> SRR1330327 5 0.3939 0.7214 0.000 0.068 0.000 0.180 0.752 0.000
#> SRR1489950 2 0.0291 0.8460 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1431927 1 0.1863 0.7031 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1100588 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444002 1 0.3866 0.1756 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000 0.000
#> SRR1318444 5 0.4531 0.5757 0.000 0.036 0.000 0.352 0.608 0.004
#> SRR600656 5 0.3202 0.7364 0.000 0.176 0.000 0.024 0.800 0.000
#> SRR658766 3 0.0692 0.9050 0.000 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR655946 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817282 1 0.3859 0.5134 0.692 0.000 0.000 0.288 0.020 0.000
#> SRR1475104 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.2003 0.6962 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.3851 0.2473 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR1444120 5 0.4663 0.7286 0.000 0.124 0.000 0.192 0.684 0.000
#> SRR1471965 1 0.2491 0.6619 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR612695 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662498 6 0.0260 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1376764 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377006 3 0.0692 0.9050 0.000 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR656860 5 0.4775 0.6060 0.000 0.284 0.000 0.084 0.632 0.000
#> SRR1480547 5 0.4764 0.6454 0.000 0.080 0.000 0.292 0.628 0.000
#> SRR1452515 2 0.1700 0.8236 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004 0.000
#> SRR1324390 2 0.0520 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR615273 4 0.5033 0.2889 0.000 0.000 0.416 0.528 0.032 0.024
#> SRR601695 2 0.0363 0.8448 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR820907 2 0.2740 0.7546 0.000 0.852 0.000 0.028 0.120 0.000
#> SRR812773 5 0.4428 0.6820 0.004 0.052 0.000 0.268 0.676 0.000
#> SRR1405984 2 0.4960 0.3567 0.000 0.620 0.012 0.052 0.312 0.004
#> SRR1472794 2 0.0520 0.8463 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1365448 3 0.4467 -0.1572 0.004 0.000 0.496 0.480 0.000 0.020
#> SRR1095720 3 0.0146 0.9146 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435626 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1080766 2 0.0622 0.8455 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332299 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320579 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319710 5 0.3757 0.6975 0.000 0.084 0.000 0.136 0.780 0.000
#> SRR1326604 2 0.3585 0.7103 0.000 0.780 0.000 0.048 0.172 0.000
#> SRR1098879 3 0.0717 0.9054 0.000 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR662245 6 0.0865 0.8915 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1074719 2 0.4753 -0.1276 0.000 0.496 0.000 0.048 0.456 0.000
#> SRR816226 4 0.4787 -0.0871 0.480 0.000 0.000 0.480 0.028 0.012
#> SRR601387 2 0.2558 0.7758 0.000 0.868 0.000 0.028 0.104 0.000
#> SRR614575 2 0.4630 0.2597 0.000 0.580 0.000 0.048 0.372 0.000
#> SRR1353900 2 0.1480 0.8399 0.000 0.940 0.000 0.020 0.040 0.000
#> SRR662906 3 0.1010 0.8832 0.000 0.036 0.960 0.004 0.000 0.000
#> SRR1350832 2 0.0914 0.8439 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016 0.000
#> SRR1403280 5 0.4932 0.6834 0.000 0.228 0.000 0.128 0.644 0.000
#> SRR1313969 2 0.3619 0.4457 0.000 0.680 0.000 0.004 0.316 0.000
#> SRR1388528 4 0.4338 0.1356 0.000 0.000 0.488 0.492 0.000 0.020
#> SRR1452912 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.4075 0.7232 0.000 0.076 0.000 0.184 0.740 0.000
#> SRR655399 3 0.0405 0.9116 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1319753 5 0.3563 0.7337 0.000 0.072 0.000 0.132 0.796 0.000
#> SRR818901 3 0.0363 0.9113 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR607067 5 0.4014 0.6908 0.000 0.096 0.000 0.148 0.756 0.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384138 5 0.5388 0.6823 0.000 0.160 0.000 0.220 0.612 0.008
#> SRR661961 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR658259 5 0.5064 0.4633 0.000 0.372 0.000 0.072 0.552 0.004
#> SRR1310476 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0291 0.8460 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1365034 5 0.2499 0.7275 0.000 0.072 0.000 0.048 0.880 0.000
#> SRR1478053 2 0.0725 0.8450 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR1475300 5 0.4095 0.6848 0.000 0.100 0.000 0.152 0.748 0.000
#> SRR1328101 2 0.0622 0.8456 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1322900 3 0.4275 0.4839 0.000 0.012 0.688 0.276 0.004 0.020
#> SRR1309942 2 0.1297 0.8345 0.000 0.948 0.000 0.040 0.012 0.000
#> SRR1345760 4 0.4698 -0.1835 0.044 0.000 0.000 0.504 0.452 0.000
#> SRR1435418 1 0.3464 0.5141 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1402172 5 0.4150 0.4763 0.000 0.392 0.000 0.016 0.592 0.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0865 0.8377 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR661469 5 0.7546 0.4949 0.000 0.288 0.052 0.096 0.444 0.120
#> SRR1500323 2 0.0146 0.8454 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1356705 5 0.4387 0.6752 0.000 0.128 0.000 0.152 0.720 0.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312406 3 0.1458 0.8884 0.000 0.016 0.948 0.016 0.000 0.020
#> SRR1350435 1 0.3756 0.3779 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1389177 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1368072 2 0.0806 0.8437 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR601815 2 0.1092 0.8417 0.000 0.960 0.000 0.020 0.020 0.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.3083 0.7716 0.000 0.828 0.000 0.040 0.132 0.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816382 3 0.1707 0.8546 0.000 0.056 0.928 0.004 0.000 0.012
#> SRR1318839 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 5 0.5336 0.5710 0.000 0.284 0.000 0.144 0.572 0.000
#> SRR613126 2 0.1501 0.8244 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1089424 5 0.4338 0.1948 0.000 0.488 0.000 0.020 0.492 0.000
#> SRR1347214 2 0.1814 0.7918 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1309556 5 0.5410 0.6486 0.000 0.248 0.000 0.176 0.576 0.000
#> SRR1456027 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400551 3 0.0146 0.9147 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1320469 3 0.4002 0.3999 0.000 0.000 0.660 0.320 0.000 0.020
#> SRR614251 2 0.2171 0.8216 0.000 0.912 0.040 0.032 0.016 0.000
#> SRR1454310 2 0.0622 0.8455 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR615105 2 0.2039 0.8180 0.000 0.908 0.004 0.072 0.016 0.000
#> SRR1433290 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 6 0.0000 0.9183 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR601671 5 0.2882 0.7285 0.000 0.180 0.000 0.008 0.812 0.000
#> SRR663874 6 0.2159 0.8350 0.000 0.072 0.000 0.012 0.012 0.904
#> SRR1409130 2 0.1913 0.8162 0.000 0.908 0.000 0.080 0.012 0.000
#> SRR659696 2 0.3742 0.3163 0.000 0.648 0.000 0.004 0.348 0.000
#> SRR1408249 5 0.6600 -0.1315 0.160 0.020 0.000 0.392 0.408 0.020
#> SRR663284 6 0.5497 0.4810 0.000 0.000 0.036 0.320 0.068 0.576
#> SRR1402794 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614852 5 0.3939 0.7226 0.000 0.068 0.000 0.180 0.752 0.000
#> SRR1348040 5 0.3862 0.7440 0.000 0.096 0.000 0.132 0.772 0.000
#> SRR1489610 5 0.3796 0.6955 0.000 0.084 0.000 0.140 0.776 0.000
#> SRR1488091 2 0.0405 0.8460 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1499566 5 0.3616 0.7018 0.000 0.076 0.000 0.132 0.792 0.000
#> SRR1361480 2 0.4097 -0.2124 0.000 0.500 0.000 0.008 0.492 0.000
#> SRR1444501 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 2 0.3898 0.4335 0.000 0.684 0.000 0.020 0.296 0.000
#> SRR1388832 3 0.4034 0.3843 0.000 0.000 0.652 0.328 0.000 0.020
#> SRR1394637 4 0.5778 0.4119 0.108 0.000 0.380 0.492 0.000 0.020
#> SRR606974 2 0.0405 0.8460 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR662918 6 0.0000 0.9183 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817421 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.4152 -0.0242 0.000 0.548 0.000 0.012 0.440 0.000
#> SRR608264 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.3866 0.1756 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.4449 0.0410 0.000 0.532 0.000 0.028 0.440 0.000
#> SRR1312684 1 0.3804 0.3188 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.5598 0.6553 0.000 0.208 0.000 0.220 0.568 0.004
#> SRR1432743 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1388873 2 0.0508 0.8460 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1353517 1 0.3023 0.5999 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1357148 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1406008 5 0.4689 0.3741 0.000 0.440 0.000 0.044 0.516 0.000
#> SRR1396786 2 0.0520 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1446564 1 0.0632 0.7511 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431083 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607117 5 0.2190 0.7358 0.000 0.060 0.000 0.040 0.900 0.000
#> SRR655170 2 0.1802 0.8194 0.000 0.916 0.000 0.012 0.072 0.000
#> SRR1087825 5 0.2956 0.7473 0.000 0.088 0.000 0.064 0.848 0.000
#> SRR662019 3 0.0692 0.9050 0.000 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1349209 4 0.5304 0.4113 0.000 0.008 0.264 0.636 0.068 0.024
#> SRR1326161 2 0.0692 0.8457 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1345284 5 0.3871 0.6903 0.000 0.084 0.000 0.148 0.768 0.000
#> SRR1416672 1 0.3838 0.2792 0.552 0.000 0.000 0.448 0.000 0.000
#> SRR663356 5 0.2573 0.7468 0.000 0.112 0.000 0.024 0.864 0.000
#> SRR1454328 2 0.0972 0.8399 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008 0.000
#> SRR1489286 1 0.3833 0.2890 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000 0.000
#> SRR1092349 4 0.6629 0.2014 0.360 0.056 0.000 0.468 0.096 0.020
#> SRR1408183 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084369 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR598452 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660709 6 0.0000 0.9183 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.3823 0.3074 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0520 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1375774 1 0.3390 0.5216 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000 0.000
#> SRR1326292 4 0.6390 0.3641 0.316 0.000 0.116 0.516 0.028 0.024
#> SRR657139 4 0.4338 0.1356 0.000 0.000 0.488 0.492 0.000 0.020
#> SRR1440744 5 0.2857 0.7221 0.000 0.072 0.000 0.072 0.856 0.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323087 4 0.5657 0.3853 0.092 0.000 0.396 0.492 0.000 0.020
#> SRR1452334 5 0.5833 0.6631 0.000 0.188 0.000 0.220 0.572 0.020
#> SRR1381775 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363908 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319626 5 0.3679 0.7135 0.000 0.176 0.000 0.052 0.772 0.000
#> SRR658989 3 0.0405 0.9116 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1353663 1 0.3804 0.3311 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.3765 0.3701 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.3828 0.2983 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR815825 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.1297 0.8371 0.000 0.948 0.000 0.012 0.040 0.000
#> SRR1367988 5 0.3439 0.7076 0.000 0.072 0.000 0.120 0.808 0.000
#> SRR1331922 1 0.4328 0.1799 0.520 0.000 0.000 0.460 0.020 0.000
#> SRR615479 5 0.5472 0.2523 0.132 0.000 0.000 0.364 0.504 0.000
#> SRR1375796 2 0.0858 0.8420 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004 0.000
#> SRR1386991 2 0.1524 0.8258 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060 0.000
#> SRR1355217 5 0.4918 0.7136 0.000 0.124 0.000 0.232 0.644 0.000
#> SRR1356290 2 0.1528 0.8368 0.000 0.936 0.000 0.016 0.048 0.000
#> SRR659507 2 0.1657 0.8275 0.000 0.928 0.000 0.056 0.016 0.000
#> SRR663296 6 0.1204 0.8829 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR598044 5 0.5481 0.4006 0.000 0.340 0.000 0.140 0.520 0.000
#> SRR661155 6 0.0260 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1414727 3 0.3410 0.7428 0.000 0.108 0.836 0.012 0.024 0.020
#> SRR663477 1 0.3797 0.3410 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1354489 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1377800 3 0.0146 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR614611 2 0.0508 0.8458 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR655052 5 0.4057 0.4837 0.000 0.388 0.000 0.012 0.600 0.000
#> SRR1478968 1 0.1908 0.7183 0.916 0.000 0.000 0.056 0.028 0.000
#> SRR1351280 5 0.5961 0.4926 0.000 0.312 0.000 0.124 0.532 0.032
#> SRR613951 5 0.6777 0.0780 0.000 0.012 0.316 0.264 0.388 0.020
#> SRR1418022 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661901 4 0.5820 0.3980 0.000 0.020 0.292 0.588 0.068 0.032
#> SRR1408161 1 0.3833 0.2890 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000 0.000
#> SRR657054 6 0.3819 0.4392 0.000 0.000 0.340 0.008 0.000 0.652
#> SRR655040 5 0.4305 0.7108 0.000 0.076 0.000 0.216 0.708 0.000
#> SRR810225 2 0.0993 0.8416 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024 0.000
#> SRR1325377 2 0.4313 0.4733 0.000 0.668 0.000 0.048 0.284 0.000
#> SRR617829 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402328 2 0.1204 0.8314 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1480455 2 0.1700 0.8211 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004 0.000
#> SRR1442104 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453416 4 0.4264 -0.1307 0.492 0.000 0.000 0.492 0.000 0.016
#> SRR1481396 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0405 0.8463 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR663026 5 0.4570 0.3844 0.000 0.436 0.000 0.036 0.528 0.000
#> SRR1478386 5 0.3332 0.7225 0.000 0.072 0.000 0.068 0.840 0.020
#> SRR1458683 3 0.1176 0.8910 0.000 0.024 0.956 0.000 0.000 0.020
#> SRR1370572 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 5 0.3645 0.6778 0.000 0.024 0.000 0.236 0.740 0.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 5 0.2432 0.7448 0.000 0.100 0.000 0.024 0.876 0.000
#> SRR660260 6 0.0260 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1071231 2 0.2842 0.7655 0.000 0.852 0.000 0.044 0.104 0.000
#> SRR1459125 5 0.4189 0.5079 0.000 0.376 0.000 0.020 0.604 0.000
#> SRR1337173 2 0.1644 0.8230 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004 0.000
#> SRR1396250 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 6 0.0146 0.9175 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR659816 6 0.0000 0.9183 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401379 5 0.3667 0.7003 0.000 0.080 0.000 0.132 0.788 0.000
#> SRR600981 5 0.4377 0.7348 0.000 0.160 0.000 0.120 0.720 0.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 5 0.3707 0.6982 0.000 0.080 0.000 0.136 0.784 0.000
#> SRR660115 1 0.2039 0.7116 0.904 0.000 0.000 0.076 0.020 0.000
#> SRR1407950 2 0.1367 0.8352 0.000 0.944 0.000 0.012 0.044 0.000
#> SRR1359780 2 0.0458 0.8439 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 4 0.6740 0.2442 0.144 0.000 0.000 0.472 0.088 0.296
#> SRR1397156 1 0.0260 0.7582 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0405 0.8457 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1319648 5 0.5142 0.7000 0.000 0.172 0.000 0.204 0.624 0.000
#> SRR1092985 1 0.3997 0.1490 0.508 0.000 0.004 0.488 0.000 0.000
#> SRR656409 5 0.4395 0.4570 0.028 0.000 0.000 0.404 0.568 0.000
#> SRR1468658 2 0.3977 0.5165 0.000 0.692 0.284 0.020 0.004 0.000
#> SRR1390437 5 0.2688 0.7326 0.000 0.068 0.000 0.064 0.868 0.000
#> SRR658057 2 0.5141 0.1915 0.000 0.548 0.000 0.048 0.384 0.020
#> SRR612635 5 0.3808 0.7009 0.000 0.228 0.000 0.036 0.736 0.000
#> SRR1351480 5 0.2778 0.7394 0.000 0.168 0.000 0.008 0.824 0.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.3266 0.5577 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0891 0.8424 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000
#> SRR614263 4 0.5019 0.1374 0.404 0.000 0.000 0.536 0.048 0.012
#> SRR1409575 5 0.4223 0.6613 0.000 0.236 0.000 0.060 0.704 0.000
#> SRR659911 6 0.0405 0.9152 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000 0.988
#> SRR1085519 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345894 2 0.1075 0.8355 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1442928 2 0.0291 0.8460 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1464681 5 0.4152 0.6813 0.000 0.240 0.000 0.044 0.712 0.004
#> SRR1418880 1 0.3843 0.2689 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.3702 0.5593 0.000 0.720 0.264 0.012 0.004 0.000
#> SRR1365426 5 0.4196 0.7512 0.000 0.116 0.000 0.144 0.740 0.000
#> SRR1487947 3 0.4335 -0.1182 0.000 0.000 0.508 0.472 0.000 0.020
#> SRR659708 4 0.6465 0.3718 0.312 0.000 0.136 0.504 0.028 0.020
#> SRR603236 2 0.1387 0.8293 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR660673 1 0.3636 0.4917 0.676 0.000 0.000 0.320 0.004 0.000
#> SRR1430729 2 0.1780 0.8246 0.000 0.924 0.000 0.028 0.048 0.000
#> SRR663807 2 0.0622 0.8464 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1087245 2 0.2728 0.7959 0.000 0.860 0.000 0.040 0.100 0.000
#> SRR1339108 5 0.5781 0.5513 0.000 0.328 0.028 0.060 0.564 0.020
#> SRR613426 6 0.1387 0.8780 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR613879 2 0.2868 0.7703 0.000 0.840 0.000 0.028 0.132 0.000
#> SRR1385101 5 0.2088 0.7361 0.000 0.068 0.000 0.028 0.904 0.000
#> SRR1387966 2 0.0820 0.8455 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR1458852 2 0.0520 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1430489 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.4165 0.2207 0.536 0.000 0.000 0.452 0.012 0.000
#> SRR1376249 3 0.0717 0.9054 0.000 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1321987 2 0.1267 0.8322 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR662653 2 0.0790 0.8406 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1390027 1 0.0146 0.7597 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.5564 -0.1064 0.000 0.508 0.040 0.036 0.408 0.008
#> SRR1383081 2 0.3539 0.6209 0.000 0.756 0.000 0.024 0.220 0.000
#> SRR2166960 6 0.0260 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR605101 5 0.5220 0.5725 0.000 0.264 0.000 0.140 0.596 0.000
#> SRR818600 2 0.2134 0.8197 0.000 0.904 0.000 0.044 0.052 0.000
#> SRR1367715 5 0.3667 0.7003 0.000 0.080 0.000 0.132 0.788 0.000
#> SRR1351979 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444306 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665478 6 0.0260 0.9185 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR612767 1 0.0405 0.7566 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1489030 2 0.0508 0.8461 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1430375 2 0.1528 0.8305 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016 0.000
#> SRR615225 5 0.5691 0.6160 0.000 0.256 0.000 0.164 0.568 0.012
#> SRR1401839 2 0.1524 0.8246 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060 0.000
#> SRR1379110 5 0.3960 0.7256 0.000 0.072 0.000 0.176 0.752 0.000
#> SRR1077288 3 0.0146 0.9147 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.4792 0.1141 0.000 0.548 0.000 0.032 0.408 0.012
#> SRR1342782 2 0.3989 -0.1381 0.000 0.528 0.000 0.004 0.468 0.000
#> SRR1443003 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612839 4 0.4338 0.1356 0.000 0.000 0.488 0.492 0.000 0.020
#> SRR1470093 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395742 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.0508 0.9063 0.000 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR664063 5 0.6438 0.4695 0.000 0.076 0.000 0.124 0.516 0.284
#> SRR1488214 1 0.4534 0.0922 0.492 0.000 0.000 0.476 0.032 0.000
#> SRR654766 5 0.2433 0.7284 0.000 0.072 0.000 0.044 0.884 0.000
#> SRR1320321 5 0.4190 0.6827 0.000 0.112 0.000 0.148 0.740 0.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.7610 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.4238 -0.0435 0.000 0.540 0.000 0.016 0.444 0.000
#> SRR1488470 5 0.4967 0.6938 0.000 0.132 0.000 0.228 0.640 0.000
#> SRR1389497 3 0.0000 0.9158 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367109 3 0.0260 0.9126 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR615311 1 0.4863 0.1769 0.528 0.000 0.000 0.412 0.060 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17262 rows and 475 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.952 0.945 0.977 0.4831 0.517 0.517
#> 3 3 0.693 0.792 0.894 0.3199 0.792 0.616
#> 4 4 0.729 0.802 0.884 0.1143 0.899 0.733
#> 5 5 0.639 0.417 0.680 0.0883 0.898 0.685
#> 6 6 0.702 0.649 0.791 0.0561 0.814 0.392
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR816015 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1380716 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR612803 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR613282 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1355396 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1084417 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1074359 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1419258 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1403366 2 0.9044 0.530 0.320 0.680
#> SRR665262 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1499740 1 0.6438 0.798 0.836 0.164
#> SRR1105057 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1439742 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR614599 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR612215 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1094051 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1324496 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1393449 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1409263 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1431288 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1334889 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR614839 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR658433 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1088581 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1328797 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1471117 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1354955 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR654802 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR660066 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1447103 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1402153 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR655887 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1408529 1 0.9850 0.266 0.572 0.428
#> SRR658707 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1384371 2 0.1414 0.964 0.020 0.980
#> SRR1074670 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1375439 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1329003 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1404837 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1317920 1 0.9608 0.403 0.616 0.384
#> SRR1455525 1 0.9754 0.339 0.592 0.408
#> SRR613999 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1310836 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR658200 1 0.9427 0.447 0.640 0.360
#> SRR1068855 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1375509 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR612227 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1388809 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1413872 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1452864 1 0.5842 0.831 0.860 0.140
#> SRR1473078 1 0.6623 0.791 0.828 0.172
#> SRR615814 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1325225 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1313687 2 0.2603 0.940 0.044 0.956
#> SRR1358220 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1096662 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1487746 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1354644 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1401752 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR660164 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR815783 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR809595 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1403133 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR815470 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1344382 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1432453 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1478362 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1392186 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1347937 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1431569 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1471594 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1354270 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR612683 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1392901 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1077805 1 0.8763 0.587 0.704 0.296
#> SRR1360402 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1406112 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1355352 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR656247 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR813656 2 0.1414 0.964 0.020 0.980
#> SRR808244 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1408595 1 0.9427 0.462 0.640 0.360
#> SRR1385277 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1435248 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1419110 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1408682 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1317134 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1370780 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1489307 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1453911 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR603164 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1383259 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1330854 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1368574 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1468162 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1361546 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR660545 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR615635 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1385411 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1342739 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1102830 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR662126 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1464601 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1071594 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR612539 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR602010 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR810249 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR818773 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR1336569 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1442754 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1334247 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR661639 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR613222 2 0.8713 0.589 0.292 0.708
#> SRR1459937 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR2185018 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR655732 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR809348 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR819261 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR661074 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1349851 1 0.8661 0.609 0.712 0.288
#> SRR1405123 2 0.9896 0.201 0.440 0.560
#> SRR661096 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1320225 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1454651 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1466512 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR658212 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1430525 1 0.0938 0.960 0.988 0.012
#> SRR1344422 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1353924 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1314832 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1487570 1 0.2778 0.928 0.952 0.048
#> SRR627431 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1418561 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1448029 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR813802 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR815020 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1309702 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1435311 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR612395 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR603116 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1323152 2 0.9732 0.317 0.404 0.596
#> SRR1368264 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1326624 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1429265 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR615611 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1486799 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1096174 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR815044 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1338560 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR615862 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1480038 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR659436 2 0.9866 0.238 0.432 0.568
#> SRR613699 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1436563 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1330327 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1489950 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1431927 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1100588 2 0.4815 0.876 0.104 0.896
#> SRR1444002 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1318444 2 0.1843 0.956 0.028 0.972
#> SRR600656 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR658766 2 0.9775 0.298 0.412 0.588
#> SRR655946 2 0.7139 0.754 0.196 0.804
#> SRR817282 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1475104 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1406418 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1090265 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1444120 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1471965 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR612695 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR662498 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1376764 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1377006 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR656860 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1480547 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1452515 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1324390 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR615273 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR601695 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR820907 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR812773 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1405984 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1472794 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1365448 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1095720 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1435626 1 0.9963 0.151 0.536 0.464
#> SRR1080766 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1377862 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1332299 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1467966 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1320579 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1319710 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1326604 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1098879 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR662245 2 0.0938 0.971 0.012 0.988
#> SRR1074719 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR816226 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR601387 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR614575 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1353900 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR662906 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1350832 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1403280 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1313969 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1388528 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1400180 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR655399 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1319753 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR818901 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR607067 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1391420 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1384138 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR661961 2 0.4939 0.871 0.108 0.892
#> SRR658259 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1310476 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1452696 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1365034 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1478053 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1328101 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1322900 1 0.3431 0.913 0.936 0.064
#> SRR1309942 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1345760 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1435418 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1402172 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1443436 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR661675 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR661469 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1500323 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1356705 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1464915 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1312406 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1350435 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1389177 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR1368072 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR601815 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR613330 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1434502 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1394190 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1481083 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR816382 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1318839 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1432390 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR613126 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1089424 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1347214 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1309556 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1456027 1 0.8267 0.660 0.740 0.260
#> SRR1400551 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1320469 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR614251 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1454310 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR615105 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1433290 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR2166064 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR601671 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR663874 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1409130 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR659696 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1408249 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR663284 1 0.9248 0.494 0.660 0.340
#> SRR1402794 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR614852 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1348040 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1489610 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1488091 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1499566 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1361480 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1444501 1 0.0938 0.960 0.988 0.012
#> SRR1415773 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1388832 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1394637 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR606974 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR662918 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR817421 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1381348 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR608264 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1318560 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1312684 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR615044 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR1432743 2 0.6973 0.765 0.188 0.812
#> SRR1388873 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1353517 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1406008 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1396786 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1318465 1 0.7815 0.699 0.768 0.232
#> SRR1431083 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR607117 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR655170 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1087825 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR662019 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1349209 1 0.3114 0.921 0.944 0.056
#> SRR1326161 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1345284 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1416672 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR663356 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1454328 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1489286 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1408183 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1084369 2 0.2423 0.944 0.040 0.960
#> SRR598452 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR660709 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR809444 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1375774 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1326292 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR657139 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1440744 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1353555 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1323087 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1452334 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1381775 1 0.1184 0.957 0.984 0.016
#> SRR1363908 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1319626 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR658989 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1353663 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR811771 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR813983 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR815825 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR819054 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1367988 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1331922 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR615479 1 0.9635 0.376 0.612 0.388
#> SRR1375796 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1386991 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1355217 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1356290 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR659507 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR663296 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR598044 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR661155 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1414727 1 0.9000 0.548 0.684 0.316
#> SRR663477 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1354489 2 0.5519 0.847 0.128 0.872
#> SRR1377800 1 0.1184 0.957 0.984 0.016
#> SRR614611 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR655052 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1478968 2 0.6623 0.783 0.172 0.828
#> SRR1351280 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR613951 2 0.8499 0.620 0.276 0.724
#> SRR1418022 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR661901 1 0.5178 0.858 0.884 0.116
#> SRR1408161 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR657054 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR655040 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR810225 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1325377 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR617829 2 0.3584 0.916 0.068 0.932
#> SRR1402328 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1480455 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1442104 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1481396 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1414314 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR663026 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1478386 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1458683 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1370572 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1467567 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1310735 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1440101 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR660260 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1071231 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1459125 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1337173 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1396250 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR2166376 1 0.4298 0.888 0.912 0.088
#> SRR659816 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1401379 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR600981 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1398335 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1397218 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR660115 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1407950 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1359780 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1490037 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR627439 2 0.4161 0.899 0.084 0.916
#> SRR1397156 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1410221 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1319648 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1092985 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR656409 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1468658 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1390437 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR658057 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR612635 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1351480 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1436651 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1441590 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR614263 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1409575 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR659911 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1085519 1 0.0672 0.963 0.992 0.008
#> SRR1345894 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1442928 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1464681 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1418880 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1309070 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1365426 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1487947 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR659708 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR603236 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR660673 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1430729 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR663807 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1087245 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1339108 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR613426 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR613879 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1385101 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1387966 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1458852 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1430489 1 0.7299 0.747 0.796 0.204
#> SRR1349231 2 0.7815 0.695 0.232 0.768
#> SRR1376249 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR662653 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1390027 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1098474 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1383081 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR2166960 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR605101 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR818600 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1367715 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1351979 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1387054 2 0.4298 0.894 0.088 0.912
#> SRR1444306 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR665478 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR612767 2 0.4690 0.878 0.100 0.900
#> SRR1489030 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1430375 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR615225 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1401839 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1379110 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1077288 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1331639 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1342782 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1443003 2 0.9732 0.321 0.404 0.596
#> SRR612839 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1470093 2 0.9686 0.342 0.396 0.604
#> SRR1395742 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1469014 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1387222 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR664063 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1488214 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR654766 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1320321 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1071955 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1394231 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1488470 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR1389497 1 0.0000 0.970 1.000 0.000
#> SRR1367109 2 0.0000 0.981 0.000 1.000
#> SRR615311 2 0.2948 0.932 0.052 0.948
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR816015 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380716 2 0.1860 0.8882 0.000 0.948 0.052
#> SRR612803 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR613282 1 0.5098 0.7165 0.752 0.000 0.248
#> SRR1355396 1 0.4178 0.7473 0.828 0.172 0.000
#> SRR1084417 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074359 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419258 1 0.2356 0.9055 0.928 0.000 0.072
#> SRR1403366 3 0.7581 0.1397 0.408 0.044 0.548
#> SRR665262 2 0.4750 0.7078 0.000 0.784 0.216
#> SRR1499740 1 0.1267 0.9175 0.972 0.024 0.004
#> SRR1105057 2 0.0237 0.9005 0.004 0.996 0.000
#> SRR1439742 1 0.3038 0.8748 0.896 0.000 0.104
#> SRR614599 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR612215 2 0.0747 0.9011 0.000 0.984 0.016
#> SRR1094051 1 0.1860 0.9113 0.948 0.000 0.052
#> SRR1324496 1 0.0592 0.9258 0.988 0.000 0.012
#> SRR1393449 1 0.1753 0.9218 0.952 0.000 0.048
#> SRR1409263 1 0.1411 0.9244 0.964 0.000 0.036
#> SRR1431288 1 0.0424 0.9239 0.992 0.008 0.000
#> SRR1334889 3 0.0237 0.7556 0.000 0.004 0.996
#> SRR614839 2 0.5882 0.3984 0.000 0.652 0.348
#> SRR658433 2 0.2625 0.8700 0.000 0.916 0.084
#> SRR1088581 3 0.6373 0.4410 0.004 0.408 0.588
#> SRR1328797 1 0.1031 0.9251 0.976 0.000 0.024
#> SRR1334512 2 0.4399 0.7422 0.000 0.812 0.188
#> SRR1471117 1 0.0237 0.9260 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311553 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354955 1 0.3879 0.8542 0.848 0.000 0.152
#> SRR654802 1 0.1337 0.9208 0.972 0.012 0.016
#> SRR660066 2 0.0424 0.9023 0.000 0.992 0.008
#> SRR1447103 2 0.0661 0.8994 0.008 0.988 0.004
#> SRR1402153 1 0.2651 0.8978 0.928 0.012 0.060
#> SRR655887 2 0.1411 0.8960 0.000 0.964 0.036
#> SRR1408529 1 0.2680 0.8936 0.924 0.008 0.068
#> SRR658707 1 0.4291 0.8027 0.820 0.000 0.180
#> SRR1384371 2 0.5723 0.5505 0.240 0.744 0.016
#> SRR1074670 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1375439 2 0.0424 0.9024 0.000 0.992 0.008
#> SRR1329003 3 0.4654 0.6175 0.208 0.000 0.792
#> SRR1404837 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317920 3 0.5663 0.7564 0.096 0.096 0.808
#> SRR1455525 3 0.7824 0.6747 0.124 0.212 0.664
#> SRR613999 1 0.5016 0.7282 0.760 0.000 0.240
#> SRR1310836 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499764 1 0.0747 0.9253 0.984 0.000 0.016
#> SRR658200 3 0.3434 0.7417 0.064 0.032 0.904
#> SRR1068855 1 0.0237 0.9258 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375509 1 0.1031 0.9251 0.976 0.000 0.024
#> SRR612227 2 0.1315 0.8876 0.020 0.972 0.008
#> SRR1388809 2 0.2356 0.8772 0.000 0.928 0.072
#> SRR1413872 3 0.4931 0.7071 0.000 0.232 0.768
#> SRR1452864 3 0.2066 0.7292 0.060 0.000 0.940
#> SRR1473078 1 0.5062 0.7302 0.800 0.184 0.016
#> SRR615814 3 0.6252 0.2583 0.000 0.444 0.556
#> SRR1325225 1 0.4399 0.7776 0.812 0.000 0.188
#> SRR1313687 2 0.3272 0.7950 0.104 0.892 0.004
#> SRR1358220 2 0.0424 0.9023 0.000 0.992 0.008
#> SRR1096662 3 0.4121 0.7463 0.000 0.168 0.832
#> SRR1487746 1 0.3267 0.8642 0.884 0.000 0.116
#> SRR1354644 1 0.1289 0.9210 0.968 0.000 0.032
#> SRR1401752 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR660164 3 0.4399 0.7324 0.000 0.188 0.812
#> SRR815783 2 0.2066 0.8843 0.000 0.940 0.060
#> SRR809595 2 0.2796 0.8505 0.000 0.908 0.092
#> SRR1403133 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR815470 2 0.6309 -0.1989 0.000 0.504 0.496
#> SRR1344382 1 0.4750 0.7594 0.784 0.000 0.216
#> SRR1432453 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1478362 2 0.3412 0.8223 0.000 0.876 0.124
#> SRR1392186 2 0.6062 0.3193 0.000 0.616 0.384
#> SRR1347937 1 0.5760 0.5858 0.672 0.000 0.328
#> SRR1431569 1 0.1289 0.9210 0.968 0.000 0.032
#> SRR1471594 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354270 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR612683 2 0.1964 0.8865 0.000 0.944 0.056
#> SRR1392901 2 0.1399 0.8983 0.004 0.968 0.028
#> SRR1077805 1 0.1636 0.9172 0.964 0.020 0.016
#> SRR1360402 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1406112 1 0.0892 0.9251 0.980 0.000 0.020
#> SRR1355352 1 0.1031 0.9251 0.976 0.000 0.024
#> SRR656247 3 0.3686 0.6810 0.140 0.000 0.860
#> SRR813656 3 0.1860 0.7668 0.000 0.052 0.948
#> SRR808244 1 0.3941 0.8294 0.844 0.000 0.156
#> SRR1387240 2 0.2165 0.8815 0.000 0.936 0.064
#> SRR1408595 2 0.6252 0.1904 0.444 0.556 0.000
#> SRR1385277 3 0.5560 0.6371 0.000 0.300 0.700
#> SRR1435248 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419110 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1408682 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1317134 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR1370780 1 0.4235 0.8067 0.824 0.000 0.176
#> SRR1489307 2 0.0424 0.9020 0.000 0.992 0.008
#> SRR1453911 2 0.1860 0.8879 0.000 0.948 0.052
#> SRR603164 2 0.1905 0.8709 0.028 0.956 0.016
#> SRR1383259 3 0.5650 0.6255 0.000 0.312 0.688
#> SRR1330854 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1452423 1 0.3941 0.8273 0.844 0.000 0.156
#> SRR1368574 2 0.2356 0.8771 0.000 0.928 0.072
#> SRR1468162 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 2 0.1905 0.8709 0.028 0.956 0.016
#> SRR1361546 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR660545 2 0.6235 0.0746 0.000 0.564 0.436
#> SRR615635 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1385411 3 0.4555 0.7274 0.000 0.200 0.800
#> SRR1342739 1 0.0424 0.9261 0.992 0.000 0.008
#> SRR1102830 1 0.1753 0.9219 0.952 0.000 0.048
#> SRR662126 3 0.1964 0.7670 0.000 0.056 0.944
#> SRR1464601 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1071594 2 0.0661 0.9003 0.008 0.988 0.004
#> SRR612539 2 0.5363 0.5985 0.000 0.724 0.276
#> SRR602010 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR810249 2 0.0237 0.9005 0.004 0.996 0.000
#> SRR818773 2 0.0829 0.8974 0.012 0.984 0.004
#> SRR1336569 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR1368117 2 0.2959 0.8525 0.000 0.900 0.100
#> SRR1442754 1 0.1289 0.9251 0.968 0.000 0.032
#> SRR1334247 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR661639 1 0.1163 0.9224 0.972 0.000 0.028
#> SRR613222 3 0.1399 0.7653 0.004 0.028 0.968
#> SRR1459937 2 0.6295 -0.0694 0.000 0.528 0.472
#> SRR2185018 3 0.4291 0.6328 0.180 0.000 0.820
#> SRR655732 3 0.5497 0.5970 0.000 0.292 0.708
#> SRR809348 3 0.6045 0.2568 0.380 0.000 0.620
#> SRR819261 1 0.1031 0.9251 0.976 0.000 0.024
#> SRR661074 1 0.6308 0.2098 0.508 0.000 0.492
#> SRR1349851 1 0.5621 0.5127 0.692 0.308 0.000
#> SRR1405123 3 0.4526 0.7336 0.104 0.040 0.856
#> SRR661096 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1320225 1 0.0424 0.9263 0.992 0.000 0.008
#> SRR1454651 3 0.3482 0.6861 0.128 0.000 0.872
#> SRR1307677 2 0.6295 -0.0884 0.000 0.528 0.472
#> SRR1466512 2 0.2066 0.8837 0.000 0.940 0.060
#> SRR658212 3 0.3619 0.7517 0.000 0.136 0.864
#> SRR1430525 1 0.3045 0.8803 0.916 0.064 0.020
#> SRR1344422 3 0.0747 0.7619 0.000 0.016 0.984
#> SRR1353924 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314832 1 0.1031 0.9251 0.976 0.000 0.024
#> SRR1487570 3 0.5785 0.4894 0.300 0.004 0.696
#> SRR627431 2 0.4121 0.7652 0.000 0.832 0.168
#> SRR1418561 1 0.2537 0.9081 0.920 0.000 0.080
#> SRR1448029 2 0.1647 0.8737 0.036 0.960 0.004
#> SRR813802 1 0.4702 0.7645 0.788 0.000 0.212
#> SRR815020 1 0.3941 0.8275 0.844 0.000 0.156
#> SRR1309702 2 0.1753 0.8888 0.000 0.952 0.048
#> SRR1435311 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR612395 2 0.4121 0.7831 0.000 0.832 0.168
#> SRR603116 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1323152 1 0.3589 0.8748 0.900 0.052 0.048
#> SRR1368264 2 0.0661 0.8994 0.008 0.988 0.004
#> SRR1326624 1 0.5948 0.5535 0.640 0.000 0.360
#> SRR1429265 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1327702 1 0.0424 0.9239 0.992 0.008 0.000
#> SRR615611 3 0.2356 0.7664 0.000 0.072 0.928
#> SRR1486799 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 3 0.5138 0.6904 0.000 0.252 0.748
#> SRR815044 3 0.1529 0.7662 0.000 0.040 0.960
#> SRR1338560 2 0.2165 0.8818 0.000 0.936 0.064
#> SRR615862 3 0.5859 0.5810 0.000 0.344 0.656
#> SRR1480038 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR659436 3 0.3415 0.7603 0.020 0.080 0.900
#> SRR613699 3 0.3816 0.7408 0.000 0.148 0.852
#> SRR1436563 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR615323 2 0.0424 0.9023 0.000 0.992 0.008
#> SRR1330327 3 0.4555 0.7295 0.000 0.200 0.800
#> SRR1489950 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431927 1 0.1289 0.9210 0.968 0.000 0.032
#> SRR1100588 1 0.5977 0.5791 0.728 0.252 0.020
#> SRR1444002 1 0.0892 0.9246 0.980 0.000 0.020
#> SRR1318444 3 0.5921 0.7162 0.032 0.212 0.756
#> SRR600656 3 0.6180 0.4330 0.000 0.416 0.584
#> SRR658766 3 0.0592 0.7500 0.012 0.000 0.988
#> SRR655946 3 0.1950 0.7671 0.008 0.040 0.952
#> SRR817282 1 0.4750 0.7602 0.784 0.000 0.216
#> SRR1475104 1 0.1337 0.9209 0.972 0.012 0.016
#> SRR1406418 1 0.0237 0.9250 0.996 0.004 0.000
#> SRR1090265 1 0.0892 0.9246 0.980 0.000 0.020
#> SRR1444120 2 0.0829 0.8974 0.012 0.984 0.004
#> SRR1471965 1 0.0892 0.9246 0.980 0.000 0.020
#> SRR612695 1 0.2200 0.9042 0.940 0.004 0.056
#> SRR662498 3 0.3619 0.7435 0.000 0.136 0.864
#> SRR1376764 1 0.3213 0.8735 0.900 0.008 0.092
#> SRR1377006 1 0.0892 0.9250 0.980 0.000 0.020
#> SRR656860 3 0.5058 0.6999 0.000 0.244 0.756
#> SRR1480547 3 0.2066 0.7670 0.000 0.060 0.940
#> SRR1452515 2 0.2448 0.8712 0.000 0.924 0.076
#> SRR1324390 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR615273 1 0.4235 0.8068 0.824 0.000 0.176
#> SRR601695 2 0.1860 0.8865 0.000 0.948 0.052
#> SRR820907 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR812773 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1405984 2 0.0747 0.8937 0.016 0.984 0.000
#> SRR1472794 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365448 1 0.0747 0.9254 0.984 0.000 0.016
#> SRR1095720 3 0.5529 0.4483 0.296 0.000 0.704
#> SRR1435626 1 0.6540 0.3200 0.584 0.408 0.008
#> SRR1080766 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377862 1 0.0592 0.9258 0.988 0.000 0.012
#> SRR1332299 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1467966 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1320579 3 0.6045 0.5054 0.000 0.380 0.620
#> SRR1319710 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326604 2 0.4605 0.7197 0.000 0.796 0.204
#> SRR1098879 1 0.0892 0.9238 0.980 0.000 0.020
#> SRR662245 3 0.2796 0.7601 0.000 0.092 0.908
#> SRR1074719 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR816226 3 0.6008 0.2583 0.372 0.000 0.628
#> SRR601387 2 0.0237 0.9005 0.004 0.996 0.000
#> SRR614575 2 0.5591 0.5350 0.000 0.696 0.304
#> SRR1353900 2 0.3482 0.8245 0.000 0.872 0.128
#> SRR662906 2 0.2261 0.8765 0.000 0.932 0.068
#> SRR1350832 2 0.2448 0.8738 0.000 0.924 0.076
#> SRR1403280 2 0.2878 0.8577 0.000 0.904 0.096
#> SRR1313969 2 0.6260 0.0326 0.000 0.552 0.448
#> SRR1388528 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452912 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR1400180 2 0.2066 0.8844 0.000 0.940 0.060
#> SRR655399 1 0.2537 0.9059 0.920 0.000 0.080
#> SRR1319753 2 0.1411 0.8957 0.000 0.964 0.036
#> SRR818901 3 0.6062 0.1900 0.384 0.000 0.616
#> SRR607067 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR1391420 1 0.1031 0.9236 0.976 0.000 0.024
#> SRR1384138 3 0.2356 0.7683 0.000 0.072 0.928
#> SRR661961 2 0.9022 0.0703 0.384 0.480 0.136
#> SRR658259 3 0.6154 0.4517 0.000 0.408 0.592
#> SRR1310476 1 0.5810 0.5699 0.664 0.000 0.336
#> SRR1452696 2 0.0747 0.9014 0.000 0.984 0.016
#> SRR1365034 2 0.2165 0.8791 0.000 0.936 0.064
#> SRR1478053 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475300 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328101 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322900 1 0.5115 0.7241 0.796 0.188 0.016
#> SRR1309942 2 0.2625 0.8673 0.000 0.916 0.084
#> SRR1345760 3 0.4702 0.7186 0.000 0.212 0.788
#> SRR1435418 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402172 3 0.5926 0.5515 0.000 0.356 0.644
#> SRR1443436 1 0.0237 0.9260 0.996 0.000 0.004
#> SRR661675 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR661469 3 0.6305 0.1206 0.000 0.484 0.516
#> SRR1500323 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1356705 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464915 1 0.0747 0.9255 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312406 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1350435 1 0.0892 0.9250 0.980 0.000 0.020
#> SRR1389177 2 0.4351 0.7738 0.004 0.828 0.168
#> SRR1368072 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR601815 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR613330 1 0.2959 0.8775 0.900 0.000 0.100
#> SRR1434502 2 0.6302 -0.0894 0.000 0.520 0.480
#> SRR1394190 1 0.1031 0.9236 0.976 0.000 0.024
#> SRR1481083 1 0.1529 0.9180 0.960 0.000 0.040
#> SRR816382 2 0.1529 0.8732 0.040 0.960 0.000
#> SRR1318839 1 0.1643 0.9215 0.956 0.000 0.044
#> SRR1432390 2 0.4002 0.7777 0.000 0.840 0.160
#> SRR613126 2 0.0592 0.9016 0.000 0.988 0.012
#> SRR1089424 2 0.1163 0.8974 0.000 0.972 0.028
#> SRR1347214 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1309556 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1456027 3 0.6144 0.7396 0.088 0.132 0.780
#> SRR1400551 1 0.1491 0.9190 0.968 0.016 0.016
#> SRR1320469 1 0.1411 0.9244 0.964 0.000 0.036
#> SRR614251 2 0.2959 0.8503 0.000 0.900 0.100
#> SRR1454310 2 0.0237 0.9005 0.004 0.996 0.000
#> SRR615105 3 0.6154 0.4504 0.000 0.408 0.592
#> SRR1433290 1 0.1031 0.9245 0.976 0.000 0.024
#> SRR2166064 3 0.1031 0.7634 0.000 0.024 0.976
#> SRR601671 2 0.3412 0.8281 0.000 0.876 0.124
#> SRR663874 3 0.5835 0.5162 0.000 0.340 0.660
#> SRR1409130 2 0.2261 0.8791 0.000 0.932 0.068
#> SRR659696 2 0.5016 0.6467 0.000 0.760 0.240
#> SRR1408249 2 0.4062 0.7747 0.000 0.836 0.164
#> SRR663284 3 0.0983 0.7626 0.004 0.016 0.980
#> SRR1402794 1 0.4178 0.8246 0.828 0.000 0.172
#> SRR614852 3 0.5178 0.6845 0.000 0.256 0.744
#> SRR1348040 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1489610 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488091 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499566 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1361480 2 0.1411 0.8957 0.000 0.964 0.036
#> SRR1444501 1 0.2165 0.9070 0.936 0.000 0.064
#> SRR1415773 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1388832 1 0.4062 0.8286 0.836 0.000 0.164
#> SRR1394637 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR606974 2 0.1411 0.8945 0.000 0.964 0.036
#> SRR662918 3 0.2066 0.7670 0.000 0.060 0.940
#> SRR817421 1 0.1643 0.9215 0.956 0.000 0.044
#> SRR1400823 1 0.1411 0.9193 0.964 0.000 0.036
#> SRR1381348 2 0.3879 0.7931 0.000 0.848 0.152
#> SRR608264 1 0.1620 0.9188 0.964 0.012 0.024
#> SRR1318560 1 0.1163 0.9259 0.972 0.000 0.028
#> SRR1454117 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312684 1 0.0424 0.9265 0.992 0.000 0.008
#> SRR615044 2 0.3623 0.8571 0.032 0.896 0.072
#> SRR1432743 1 0.6944 0.1224 0.516 0.468 0.016
#> SRR1388873 2 0.0424 0.9021 0.000 0.992 0.008
#> SRR1353517 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357148 2 0.1964 0.8562 0.056 0.944 0.000
#> SRR1406008 2 0.1964 0.8867 0.000 0.944 0.056
#> SRR1396786 2 0.0237 0.9005 0.004 0.996 0.000
#> SRR1446564 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318465 1 0.4779 0.8185 0.840 0.036 0.124
#> SRR1431083 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR607117 3 0.6111 0.4744 0.000 0.396 0.604
#> SRR655170 2 0.1529 0.8930 0.000 0.960 0.040
#> SRR1087825 3 0.5733 0.6059 0.000 0.324 0.676
#> SRR662019 1 0.3619 0.8504 0.864 0.000 0.136
#> SRR1349209 3 0.5158 0.5946 0.232 0.004 0.764
#> SRR1326161 2 0.0592 0.9016 0.000 0.988 0.012
#> SRR1345284 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1416672 1 0.1031 0.9236 0.976 0.000 0.024
#> SRR663356 2 0.1529 0.8944 0.000 0.960 0.040
#> SRR1454328 2 0.1411 0.8962 0.000 0.964 0.036
#> SRR1489286 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR1092349 2 0.2537 0.8307 0.080 0.920 0.000
#> SRR1408183 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1084369 2 0.4295 0.7888 0.104 0.864 0.032
#> SRR598452 1 0.1529 0.9238 0.960 0.000 0.040
#> SRR660709 3 0.1031 0.7634 0.000 0.024 0.976
#> SRR809444 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1375774 1 0.2878 0.8486 0.904 0.096 0.000
#> SRR1326292 3 0.3267 0.6947 0.116 0.000 0.884
#> SRR657139 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1440744 2 0.1753 0.8898 0.000 0.952 0.048
#> SRR1353555 1 0.0747 0.9253 0.984 0.000 0.016
#> SRR1323087 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452334 3 0.3482 0.7581 0.000 0.128 0.872
#> SRR1381775 1 0.1031 0.9249 0.976 0.000 0.024
#> SRR1363908 1 0.1031 0.9236 0.976 0.000 0.024
#> SRR1319626 2 0.0424 0.9023 0.000 0.992 0.008
#> SRR658989 1 0.2959 0.8925 0.900 0.000 0.100
#> SRR1353663 1 0.1031 0.9236 0.976 0.000 0.024
#> SRR811771 1 0.0237 0.9261 0.996 0.000 0.004
#> SRR813983 1 0.0592 0.9259 0.988 0.000 0.012
#> SRR815825 1 0.4002 0.8243 0.840 0.000 0.160
#> SRR819054 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1367988 2 0.6008 0.3181 0.000 0.628 0.372
#> SRR1331922 1 0.6309 0.1625 0.504 0.000 0.496
#> SRR615479 1 0.5365 0.6085 0.744 0.252 0.004
#> SRR1375796 2 0.1753 0.8902 0.000 0.952 0.048
#> SRR1386991 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355217 2 0.4887 0.6749 0.000 0.772 0.228
#> SRR1356290 2 0.2448 0.8729 0.000 0.924 0.076
#> SRR659507 2 0.1643 0.8915 0.000 0.956 0.044
#> SRR663296 3 0.3482 0.6857 0.128 0.000 0.872
#> SRR598044 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR661155 3 0.1289 0.7649 0.000 0.032 0.968
#> SRR1414727 1 0.6661 0.4197 0.588 0.012 0.400
#> SRR663477 1 0.0892 0.9250 0.980 0.000 0.020
#> SRR1354489 2 0.6952 0.0105 0.480 0.504 0.016
#> SRR1377800 1 0.2269 0.9026 0.944 0.040 0.016
#> SRR614611 2 0.0592 0.9016 0.000 0.988 0.012
#> SRR655052 3 0.5835 0.5789 0.000 0.340 0.660
#> SRR1478968 3 0.4233 0.7473 0.004 0.160 0.836
#> SRR1351280 3 0.2711 0.7665 0.000 0.088 0.912
#> SRR613951 3 0.7130 0.1832 0.432 0.024 0.544
#> SRR1418022 1 0.0592 0.9258 0.988 0.000 0.012
#> SRR661901 3 0.1411 0.7411 0.036 0.000 0.964
#> SRR1408161 1 0.0237 0.9260 0.996 0.000 0.004
#> SRR657054 3 0.2165 0.7160 0.064 0.000 0.936
#> SRR655040 3 0.6126 0.4815 0.000 0.400 0.600
#> SRR810225 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1325377 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR617829 2 0.9049 0.2551 0.212 0.556 0.232
#> SRR1402328 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480455 2 0.1860 0.8889 0.000 0.948 0.052
#> SRR1442104 1 0.3267 0.8703 0.884 0.000 0.116
#> SRR1453416 1 0.1411 0.9077 0.964 0.036 0.000
#> SRR1481396 1 0.0983 0.9235 0.980 0.004 0.016
#> SRR1414314 2 0.2356 0.8767 0.000 0.928 0.072
#> SRR663026 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1478386 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1458683 3 0.4883 0.7206 0.004 0.208 0.788
#> SRR1370572 1 0.1411 0.9193 0.964 0.000 0.036
#> SRR1467567 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468532 2 0.6095 0.2466 0.000 0.608 0.392
#> SRR1310735 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 3 0.6095 0.4874 0.000 0.392 0.608
#> SRR660260 3 0.2261 0.7672 0.000 0.068 0.932
#> SRR1071231 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1459125 2 0.1411 0.8941 0.000 0.964 0.036
#> SRR1337173 2 0.1860 0.8865 0.000 0.948 0.052
#> SRR1396250 1 0.1163 0.9251 0.972 0.000 0.028
#> SRR2166376 3 0.0000 0.7531 0.000 0.000 1.000
#> SRR659816 3 0.1643 0.7668 0.000 0.044 0.956
#> SRR1401379 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR600981 3 0.6026 0.5166 0.000 0.376 0.624
#> SRR1398335 1 0.0892 0.9246 0.980 0.000 0.020
#> SRR1397218 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR660115 3 0.6307 -0.1200 0.488 0.000 0.512
#> SRR1407950 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR1359780 2 0.0892 0.9000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1490037 1 0.0237 0.9260 0.996 0.000 0.004
#> SRR627439 3 0.0747 0.7621 0.000 0.016 0.984
#> SRR1397156 1 0.0747 0.9253 0.984 0.000 0.016
#> SRR1410221 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1319648 2 0.1411 0.8961 0.000 0.964 0.036
#> SRR1092985 1 0.0892 0.9250 0.980 0.000 0.020
#> SRR656409 3 0.5138 0.6981 0.000 0.252 0.748
#> SRR1468658 3 0.6244 0.3562 0.000 0.440 0.560
#> SRR1390437 2 0.1765 0.8870 0.004 0.956 0.040
#> SRR658057 3 0.5926 0.5293 0.000 0.356 0.644
#> SRR612635 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351480 2 0.3267 0.8368 0.000 0.884 0.116
#> SRR1436651 1 0.0237 0.9259 0.996 0.000 0.004
#> SRR1441590 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR614263 3 0.5678 0.4115 0.316 0.000 0.684
#> SRR1409575 2 0.1643 0.8918 0.000 0.956 0.044
#> SRR659911 3 0.4605 0.7057 0.000 0.204 0.796
#> SRR1085519 1 0.1337 0.9209 0.972 0.012 0.016
#> SRR1345894 2 0.1964 0.8844 0.000 0.944 0.056
#> SRR1442928 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1464681 3 0.5291 0.6737 0.000 0.268 0.732
#> SRR1418880 1 0.0424 0.9260 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309070 2 0.4409 0.7438 0.004 0.824 0.172
#> SRR1365426 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487947 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR659708 1 0.1964 0.9188 0.944 0.000 0.056
#> SRR603236 2 0.0424 0.9021 0.000 0.992 0.008
#> SRR660673 1 0.1529 0.9178 0.960 0.000 0.040
#> SRR1430729 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR663807 2 0.1529 0.8948 0.000 0.960 0.040
#> SRR1087245 2 0.3340 0.8346 0.000 0.880 0.120
#> SRR1339108 2 0.0892 0.8908 0.020 0.980 0.000
#> SRR613426 3 0.0747 0.7621 0.000 0.016 0.984
#> SRR613879 2 0.4750 0.6955 0.000 0.784 0.216
#> SRR1385101 2 0.2796 0.8581 0.000 0.908 0.092
#> SRR1387966 2 0.2165 0.8818 0.000 0.936 0.064
#> SRR1458852 2 0.0237 0.9005 0.004 0.996 0.000
#> SRR1430489 3 0.7388 0.6596 0.208 0.100 0.692
#> SRR1349231 2 0.6264 0.3257 0.380 0.616 0.004
#> SRR1376249 1 0.1031 0.9251 0.976 0.000 0.024
#> SRR1321987 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR662653 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1390027 1 0.1411 0.9193 0.964 0.000 0.036
#> SRR1098474 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR1383081 2 0.3038 0.8493 0.000 0.896 0.104
#> SRR2166960 3 0.4399 0.7103 0.000 0.188 0.812
#> SRR605101 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR818600 2 0.5178 0.6424 0.000 0.744 0.256
#> SRR1367715 2 0.1753 0.8891 0.000 0.952 0.048
#> SRR1351979 1 0.3619 0.8503 0.864 0.000 0.136
#> SRR1387054 2 0.6473 0.3879 0.332 0.652 0.016
#> SRR1444306 1 0.2152 0.9062 0.948 0.036 0.016
#> SRR1322662 1 0.0829 0.9258 0.984 0.004 0.012
#> SRR665478 3 0.4605 0.7022 0.000 0.204 0.796
#> SRR612767 3 0.4723 0.7473 0.016 0.160 0.824
#> SRR1489030 2 0.0592 0.9019 0.000 0.988 0.012
#> SRR1430375 2 0.2066 0.8847 0.000 0.940 0.060
#> SRR615225 3 0.4842 0.7130 0.000 0.224 0.776
#> SRR1401839 2 0.0237 0.9021 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379110 3 0.6215 0.3682 0.000 0.428 0.572
#> SRR1077288 1 0.1163 0.9251 0.972 0.000 0.028
#> SRR1331639 3 0.5706 0.6114 0.000 0.320 0.680
#> SRR1342782 2 0.0237 0.9020 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443003 2 0.6721 0.2963 0.380 0.604 0.016
#> SRR612839 1 0.0747 0.9244 0.984 0.000 0.016
#> SRR1470093 1 0.5988 0.7392 0.776 0.056 0.168
#> SRR1395742 1 0.0892 0.9246 0.980 0.000 0.020
#> SRR1469014 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387222 3 0.6062 0.4971 0.000 0.384 0.616
#> SRR664063 3 0.5254 0.6320 0.000 0.264 0.736
#> SRR1488214 1 0.6204 0.3767 0.576 0.000 0.424
#> SRR654766 3 0.6168 0.4453 0.000 0.412 0.588
#> SRR1320321 2 0.0000 0.9015 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071955 1 0.0237 0.9250 0.996 0.004 0.000
#> SRR1417483 1 0.2050 0.9127 0.952 0.020 0.028
#> SRR1394231 2 0.2711 0.8638 0.000 0.912 0.088
#> SRR1488470 3 0.6126 0.4718 0.000 0.400 0.600
#> SRR1389497 1 0.0892 0.9251 0.980 0.000 0.020
#> SRR1367109 2 0.0424 0.8988 0.008 0.992 0.000
#> SRR615311 3 0.1170 0.7575 0.016 0.008 0.976
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR816015 2 0.0469 0.92141 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1380716 2 0.2522 0.89597 0.000 0.908 0.076 0.016
#> SRR612803 1 0.1059 0.86665 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR613282 1 0.4981 0.13073 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1355396 1 0.5434 0.55905 0.696 0.252 0.052 0.000
#> SRR1084417 1 0.2918 0.85793 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1074359 2 0.2530 0.85886 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1419258 1 0.3074 0.84607 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1403366 3 0.2864 0.76095 0.024 0.016 0.908 0.052
#> SRR665262 3 0.4040 0.62898 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1499740 1 0.4233 0.79103 0.820 0.140 0.008 0.032
#> SRR1105057 2 0.0336 0.91889 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1439742 1 0.2530 0.81894 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR614599 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR612215 2 0.1489 0.91669 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1094051 1 0.2011 0.84194 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1324496 1 0.0804 0.86585 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1393449 1 0.3015 0.86505 0.884 0.000 0.024 0.092
#> SRR1409263 1 0.2714 0.86070 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1431288 1 0.1059 0.86378 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1334889 3 0.2520 0.75697 0.004 0.004 0.904 0.088
#> SRR614839 3 0.5383 0.10556 0.000 0.452 0.536 0.012
#> SRR658433 2 0.2149 0.89533 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1088581 4 0.0376 0.84024 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1328797 1 0.2888 0.85655 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1334512 2 0.5042 0.76539 0.000 0.768 0.136 0.096
#> SRR1471117 1 0.0336 0.86686 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311553 1 0.0672 0.86628 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1458220 2 0.1004 0.92103 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1354955 1 0.3428 0.84992 0.844 0.000 0.012 0.144
#> SRR654802 1 0.2944 0.85525 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR660066 2 0.1004 0.92103 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1447103 2 0.0469 0.91761 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1402153 1 0.4268 0.77415 0.760 0.004 0.004 0.232
#> SRR655887 2 0.1970 0.90949 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR1408529 1 0.3591 0.83411 0.824 0.008 0.000 0.168
#> SRR658707 1 0.4382 0.56996 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1384371 2 0.6300 0.14556 0.404 0.544 0.008 0.044
#> SRR1074670 1 0.2888 0.85655 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1375439 2 0.0188 0.92006 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329003 4 0.1297 0.84387 0.016 0.000 0.020 0.964
#> SRR1404837 2 0.0672 0.92214 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1317920 4 0.3278 0.79623 0.116 0.000 0.020 0.864
#> SRR1455525 4 0.0657 0.83500 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR613999 3 0.4543 0.50671 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1310836 1 0.0657 0.86537 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1499764 1 0.1302 0.85839 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR658200 3 0.1406 0.77669 0.016 0.000 0.960 0.024
#> SRR1068855 1 0.2408 0.86278 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1375509 1 0.2704 0.85741 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR612227 2 0.3861 0.79215 0.080 0.856 0.008 0.056
#> SRR1388809 2 0.2053 0.90550 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1413872 4 0.2589 0.86612 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1452864 4 0.4482 0.75740 0.128 0.000 0.068 0.804
#> SRR1473078 1 0.5050 0.79787 0.784 0.108 0.008 0.100
#> SRR615814 3 0.2197 0.76815 0.000 0.080 0.916 0.004
#> SRR1325225 4 0.1867 0.77621 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1313687 2 0.1284 0.90343 0.024 0.964 0.012 0.000
#> SRR1358220 2 0.1004 0.92103 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1096662 3 0.4405 0.67548 0.000 0.048 0.800 0.152
#> SRR1487746 1 0.3356 0.75291 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1354644 1 0.2011 0.84232 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1401752 2 0.0336 0.91889 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR660164 3 0.3176 0.74990 0.000 0.036 0.880 0.084
#> SRR815783 2 0.1824 0.91127 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR809595 2 0.5204 0.39040 0.012 0.612 0.376 0.000
#> SRR1403133 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR815470 4 0.5116 0.75801 0.000 0.108 0.128 0.764
#> SRR1344382 1 0.4925 0.24941 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1432453 2 0.0657 0.92003 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1478362 2 0.6665 0.28995 0.000 0.544 0.096 0.360
#> SRR1392186 3 0.3791 0.66435 0.000 0.200 0.796 0.004
#> SRR1347937 3 0.4790 0.38217 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1431569 1 0.2530 0.82707 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1471594 1 0.1209 0.86157 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1354270 1 0.2888 0.85655 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR612683 2 0.2676 0.88729 0.000 0.896 0.092 0.012
#> SRR1392901 4 0.4235 0.66585 0.016 0.188 0.004 0.792
#> SRR1077805 1 0.3272 0.85484 0.860 0.004 0.008 0.128
#> SRR1360402 2 0.1004 0.92103 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1406112 1 0.3102 0.85802 0.872 0.004 0.008 0.116
#> SRR1355352 1 0.2831 0.85757 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR656247 3 0.2704 0.71984 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR813656 3 0.0844 0.78460 0.004 0.004 0.980 0.012
#> SRR808244 4 0.4250 0.47675 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1387240 2 0.2943 0.88738 0.000 0.892 0.076 0.032
#> SRR1408595 2 0.4049 0.66471 0.212 0.780 0.008 0.000
#> SRR1385277 4 0.3581 0.85510 0.000 0.032 0.116 0.852
#> SRR1435248 2 0.0336 0.92084 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1419110 2 0.0707 0.92200 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1408682 2 0.0376 0.91893 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1317134 1 0.1118 0.86084 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1370780 1 0.4855 0.33264 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1489307 2 0.0817 0.92148 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1453911 2 0.2222 0.90570 0.000 0.924 0.060 0.016
#> SRR603164 2 0.1843 0.88824 0.028 0.948 0.008 0.016
#> SRR1383259 4 0.3931 0.84147 0.000 0.040 0.128 0.832
#> SRR1330854 1 0.2918 0.85793 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1452423 1 0.4697 0.44451 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1368574 2 0.2799 0.87807 0.000 0.884 0.108 0.008
#> SRR1468162 1 0.1209 0.86157 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1331220 2 0.2917 0.84849 0.040 0.904 0.008 0.048
#> SRR1361546 2 0.0804 0.92224 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1486156 1 0.0895 0.86376 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR660545 3 0.6071 0.05486 0.000 0.452 0.504 0.044
#> SRR615635 2 0.1211 0.91853 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1385411 4 0.2888 0.86276 0.000 0.004 0.124 0.872
#> SRR1342739 1 0.1489 0.85805 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1102830 1 0.3384 0.85929 0.860 0.000 0.024 0.116
#> SRR662126 3 0.1151 0.78441 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1464601 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1071594 2 0.0376 0.91761 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR612539 3 0.2760 0.73886 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR602010 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR810249 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR818773 2 0.2021 0.90162 0.040 0.936 0.024 0.000
#> SRR1336569 1 0.1022 0.86170 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1368117 2 0.3435 0.86499 0.000 0.864 0.100 0.036
#> SRR1442754 1 0.1520 0.86763 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1334247 1 0.3072 0.85684 0.868 0.004 0.004 0.124
#> SRR661639 1 0.1637 0.85314 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR613222 3 0.0804 0.78309 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1459937 4 0.1389 0.86222 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR2185018 3 0.2868 0.71134 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR655732 3 0.1661 0.78004 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR809348 3 0.4761 0.40283 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR819261 1 0.2760 0.85621 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR661074 3 0.4286 0.68204 0.136 0.000 0.812 0.052
#> SRR1349851 1 0.5833 0.16339 0.528 0.440 0.032 0.000
#> SRR1405123 4 0.2053 0.86402 0.004 0.000 0.072 0.924
#> SRR661096 2 0.1824 0.91068 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR1320225 1 0.1489 0.85805 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1454651 4 0.1798 0.85322 0.016 0.000 0.040 0.944
#> SRR1307677 3 0.6123 0.32236 0.000 0.372 0.572 0.056
#> SRR1466512 2 0.3966 0.84397 0.000 0.840 0.088 0.072
#> SRR658212 3 0.1798 0.77959 0.000 0.016 0.944 0.040
#> SRR1430525 1 0.4655 0.80475 0.784 0.032 0.008 0.176
#> SRR1344422 3 0.2125 0.76285 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1353924 2 0.0188 0.92006 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1314832 1 0.2704 0.85741 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1487570 4 0.2214 0.85006 0.044 0.000 0.028 0.928
#> SRR627431 2 0.5880 0.62206 0.000 0.680 0.088 0.232
#> SRR1418561 1 0.3377 0.85376 0.848 0.000 0.012 0.140
#> SRR1448029 2 0.1917 0.88409 0.036 0.944 0.008 0.012
#> SRR813802 1 0.4697 0.44660 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR815020 1 0.4999 0.02235 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1309702 2 0.3691 0.85715 0.000 0.856 0.068 0.076
#> SRR1435311 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR612395 3 0.4955 0.19551 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR603116 2 0.1489 0.91669 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1323152 1 0.4442 0.76895 0.752 0.008 0.004 0.236
#> SRR1368264 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326624 1 0.2644 0.84368 0.908 0.000 0.060 0.032
#> SRR1429265 1 0.2888 0.85655 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1327702 1 0.1059 0.86456 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR615611 3 0.1151 0.78441 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1486799 1 0.1489 0.85805 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1096174 4 0.2918 0.86484 0.000 0.008 0.116 0.876
#> SRR815044 3 0.2412 0.75849 0.000 0.008 0.908 0.084
#> SRR1338560 2 0.2402 0.89808 0.000 0.912 0.076 0.012
#> SRR615862 3 0.5143 0.62728 0.000 0.172 0.752 0.076
#> SRR1480038 2 0.0376 0.92102 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR659436 3 0.1229 0.78527 0.004 0.008 0.968 0.020
#> SRR613699 3 0.1356 0.78217 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1436563 1 0.1209 0.86157 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR615323 2 0.1356 0.91950 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1330327 4 0.2773 0.86564 0.000 0.004 0.116 0.880
#> SRR1489950 2 0.0336 0.92084 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1431927 1 0.1792 0.84909 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1100588 1 0.3445 0.85657 0.864 0.012 0.012 0.112
#> SRR1444002 1 0.1211 0.85972 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1318444 4 0.0779 0.84754 0.004 0.000 0.016 0.980
#> SRR600656 4 0.3581 0.85508 0.000 0.032 0.116 0.852
#> SRR658766 3 0.5008 0.61984 0.040 0.000 0.732 0.228
#> SRR655946 3 0.2999 0.73608 0.000 0.004 0.864 0.132
#> SRR817282 1 0.4866 0.32096 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1475104 1 0.3573 0.85549 0.864 0.028 0.008 0.100
#> SRR1406418 1 0.1356 0.86141 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR1090265 1 0.1474 0.85613 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1444120 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1471965 1 0.1302 0.85839 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR612695 1 0.3726 0.79843 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR662498 3 0.0804 0.78534 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1376764 1 0.4072 0.75728 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1377006 1 0.2888 0.85655 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR656860 4 0.4781 0.75486 0.000 0.036 0.212 0.752
#> SRR1480547 3 0.1722 0.77733 0.000 0.008 0.944 0.048
#> SRR1452515 2 0.2021 0.91346 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR1324390 2 0.0895 0.92148 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR615273 3 0.4967 0.17837 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR601695 2 0.3333 0.86893 0.000 0.872 0.040 0.088
#> SRR820907 2 0.1388 0.91961 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR812773 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1405984 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1472794 2 0.1151 0.92080 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1365448 1 0.0817 0.86327 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1095720 1 0.4882 0.73206 0.708 0.000 0.020 0.272
#> SRR1435626 1 0.5701 0.16939 0.504 0.476 0.008 0.012
#> SRR1080766 2 0.0188 0.92006 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1377862 1 0.1118 0.86084 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1332299 1 0.2944 0.85525 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1467966 1 0.2831 0.85757 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1320579 4 0.0336 0.83517 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1319710 2 0.0469 0.92141 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1326604 2 0.5658 0.51514 0.000 0.632 0.328 0.040
#> SRR1098879 1 0.2868 0.85348 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR662245 3 0.1151 0.78441 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1074719 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR816226 4 0.3398 0.83638 0.060 0.000 0.068 0.872
#> SRR601387 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR614575 3 0.3768 0.67130 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1353900 2 0.3479 0.83797 0.000 0.840 0.148 0.012
#> SRR662906 2 0.3108 0.86849 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1350832 2 0.2197 0.90058 0.000 0.916 0.080 0.004
#> SRR1403280 2 0.2988 0.87193 0.000 0.876 0.112 0.012
#> SRR1313969 4 0.3404 0.86056 0.000 0.032 0.104 0.864
#> SRR1388528 1 0.1661 0.86725 0.944 0.004 0.000 0.052
#> SRR1452912 1 0.1118 0.86084 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1400180 2 0.1489 0.91718 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR655399 1 0.3552 0.85376 0.848 0.000 0.024 0.128
#> SRR1319753 2 0.1637 0.91182 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR818901 3 0.7049 0.00524 0.392 0.000 0.484 0.124
#> SRR607067 2 0.1297 0.92034 0.000 0.964 0.016 0.020
#> SRR1391420 1 0.1302 0.85839 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1384138 3 0.3088 0.72043 0.000 0.008 0.864 0.128
#> SRR661961 3 0.6594 0.56647 0.148 0.228 0.624 0.000
#> SRR658259 3 0.3900 0.68359 0.000 0.164 0.816 0.020
#> SRR1310476 3 0.4830 0.35305 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1452696 2 0.1209 0.91999 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1365034 2 0.3840 0.84706 0.000 0.844 0.104 0.052
#> SRR1478053 2 0.0657 0.92165 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1475300 2 0.0376 0.91893 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1328101 2 0.0524 0.92139 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1322900 1 0.5236 0.73277 0.752 0.184 0.008 0.056
#> SRR1309942 2 0.2706 0.89240 0.000 0.900 0.080 0.020
#> SRR1345760 4 0.2216 0.86751 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1435418 1 0.0657 0.86537 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1402172 4 0.3542 0.85560 0.000 0.028 0.120 0.852
#> SRR1443436 1 0.1489 0.85805 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR661675 2 0.0336 0.92084 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR661469 3 0.3032 0.74065 0.008 0.124 0.868 0.000
#> SRR1500323 2 0.0657 0.92165 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1356705 2 0.0188 0.92006 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1464915 1 0.1902 0.84973 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR1312406 1 0.3188 0.85830 0.872 0.008 0.008 0.112
#> SRR1350435 1 0.2921 0.85312 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1389177 2 0.7359 0.24012 0.184 0.504 0.000 0.312
#> SRR1368072 2 0.0707 0.92175 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR601815 2 0.0524 0.92148 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR613330 1 0.3942 0.67216 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1434502 3 0.3161 0.72914 0.000 0.124 0.864 0.012
#> SRR1394190 1 0.1557 0.85419 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1481083 1 0.2216 0.83376 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR816382 2 0.1452 0.89220 0.036 0.956 0.008 0.000
#> SRR1318839 1 0.2921 0.85203 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1432390 4 0.4104 0.82067 0.000 0.080 0.088 0.832
#> SRR613126 2 0.0779 0.92171 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1089424 2 0.2759 0.89454 0.000 0.904 0.044 0.052
#> SRR1347214 2 0.0921 0.92117 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1309556 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1456027 4 0.1545 0.85588 0.008 0.000 0.040 0.952
#> SRR1400551 1 0.3798 0.84762 0.860 0.060 0.008 0.072
#> SRR1320469 1 0.2589 0.85935 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR614251 2 0.3834 0.85809 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1454310 2 0.0376 0.91893 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR615105 4 0.3047 0.86566 0.000 0.012 0.116 0.872
#> SRR1433290 1 0.2814 0.85480 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR2166064 3 0.2198 0.76458 0.000 0.008 0.920 0.072
#> SRR601671 2 0.4804 0.78025 0.000 0.780 0.148 0.072
#> SRR663874 3 0.1489 0.78352 0.004 0.044 0.952 0.000
#> SRR1409130 2 0.1661 0.91400 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR659696 4 0.3758 0.84833 0.000 0.048 0.104 0.848
#> SRR1408249 4 0.6350 0.54174 0.000 0.252 0.112 0.636
#> SRR663284 3 0.0927 0.78337 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1402794 1 0.3787 0.85221 0.840 0.000 0.036 0.124
#> SRR614852 4 0.2281 0.86762 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1348040 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1489610 2 0.0469 0.92141 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1488091 2 0.0657 0.92165 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1499566 2 0.0188 0.92002 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1361480 2 0.1824 0.91068 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR1444501 1 0.3444 0.82278 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1415773 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1388832 1 0.5050 0.62664 0.704 0.000 0.268 0.028
#> SRR1394637 1 0.2345 0.86251 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR606974 2 0.2500 0.90184 0.000 0.916 0.044 0.040
#> SRR662918 3 0.1256 0.78343 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR817421 1 0.2921 0.85203 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1400823 1 0.1867 0.84689 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1381348 2 0.6432 0.55504 0.000 0.636 0.128 0.236
#> SRR608264 1 0.3391 0.84419 0.844 0.004 0.004 0.148
#> SRR1318560 1 0.1940 0.86566 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1454117 2 0.1004 0.92103 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1312684 1 0.0707 0.86398 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR615044 2 0.5660 0.29495 0.028 0.576 0.396 0.000
#> SRR1432743 1 0.5760 0.72818 0.724 0.140 0.004 0.132
#> SRR1388873 2 0.1388 0.91961 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1353517 1 0.1356 0.86141 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR1357148 2 0.3196 0.80746 0.104 0.876 0.008 0.012
#> SRR1406008 2 0.1557 0.91341 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1396786 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1446564 1 0.0657 0.86537 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1318465 1 0.5212 0.49659 0.588 0.004 0.004 0.404
#> SRR1431083 1 0.1118 0.86084 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR607117 4 0.3384 0.85978 0.000 0.024 0.116 0.860
#> SRR655170 2 0.5489 0.56792 0.000 0.664 0.040 0.296
#> SRR1087825 4 0.2714 0.86770 0.000 0.004 0.112 0.884
#> SRR662019 1 0.4406 0.70187 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1349209 4 0.0895 0.82969 0.020 0.000 0.004 0.976
#> SRR1326161 2 0.1109 0.92061 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1345284 2 0.0376 0.91893 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1416672 1 0.1389 0.85742 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR663356 2 0.1489 0.91718 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1454328 2 0.1489 0.91669 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1489286 1 0.0336 0.86686 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1092349 2 0.1256 0.89882 0.028 0.964 0.008 0.000
#> SRR1408183 1 0.3128 0.85568 0.864 0.004 0.004 0.128
#> SRR1084369 2 0.6261 0.41734 0.300 0.628 0.008 0.064
#> SRR598452 1 0.2944 0.85696 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR660709 3 0.1722 0.77616 0.000 0.008 0.944 0.048
#> SRR809444 1 0.1022 0.86752 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1089901 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1375774 1 0.4245 0.70350 0.784 0.196 0.020 0.000
#> SRR1326292 4 0.1798 0.85322 0.016 0.000 0.040 0.944
#> SRR657139 1 0.2773 0.85867 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1440744 2 0.3037 0.88437 0.000 0.888 0.076 0.036
#> SRR1353555 1 0.1743 0.85353 0.940 0.004 0.056 0.000
#> SRR1323087 1 0.1443 0.86765 0.960 0.004 0.008 0.028
#> SRR1452334 4 0.2530 0.86657 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1381775 1 0.1854 0.85495 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR1363908 1 0.1302 0.85902 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1319626 2 0.1151 0.92080 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR658989 1 0.3731 0.85384 0.844 0.000 0.036 0.120
#> SRR1353663 1 0.1211 0.85972 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR811771 1 0.0524 0.86660 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR813983 1 0.1118 0.86084 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR815825 1 0.3801 0.79275 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR819054 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1367988 4 0.3674 0.85199 0.000 0.044 0.104 0.852
#> SRR1331922 3 0.3311 0.68384 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR615479 1 0.4594 0.61679 0.712 0.280 0.008 0.000
#> SRR1375796 2 0.1767 0.91474 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR1386991 2 0.0524 0.91758 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1355217 4 0.2385 0.86201 0.000 0.028 0.052 0.920
#> SRR1356290 2 0.1938 0.91203 0.000 0.936 0.052 0.012
#> SRR659507 2 0.4222 0.63014 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR663296 3 0.2647 0.72173 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR598044 2 0.0376 0.92102 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR661155 4 0.3052 0.85636 0.000 0.004 0.136 0.860
#> SRR1414727 3 0.3300 0.70947 0.144 0.008 0.848 0.000
#> SRR663477 1 0.2973 0.85181 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1354489 1 0.5803 0.73123 0.720 0.128 0.004 0.148
#> SRR1377800 1 0.5193 0.76781 0.768 0.148 0.008 0.076
#> SRR614611 2 0.1151 0.92080 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR655052 4 0.3108 0.86515 0.000 0.016 0.112 0.872
#> SRR1478968 4 0.2345 0.86681 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1351280 3 0.2741 0.74836 0.000 0.012 0.892 0.096
#> SRR613951 4 0.0707 0.82631 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1418022 1 0.1489 0.85805 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR661901 4 0.1724 0.84820 0.020 0.000 0.032 0.948
#> SRR1408161 1 0.1209 0.86157 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR657054 3 0.2319 0.75771 0.040 0.000 0.924 0.036
#> SRR655040 4 0.6592 0.52997 0.000 0.116 0.284 0.600
#> SRR810225 2 0.0779 0.92171 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1325377 2 0.0524 0.92181 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR617829 1 0.6371 0.32744 0.508 0.064 0.000 0.428
#> SRR1402328 2 0.0336 0.92084 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1480455 2 0.1004 0.92143 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1442104 1 0.3444 0.82358 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1453416 1 0.1985 0.85562 0.940 0.040 0.016 0.004
#> SRR1481396 1 0.3188 0.85750 0.872 0.008 0.008 0.112
#> SRR1414314 2 0.2255 0.90309 0.000 0.920 0.068 0.012
#> SRR663026 2 0.1305 0.91904 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1478386 2 0.0804 0.91824 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1458683 4 0.1389 0.86157 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1370572 1 0.1940 0.84472 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1467567 1 0.1305 0.86055 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR1468532 2 0.5812 0.49806 0.000 0.624 0.328 0.048
#> SRR1310735 1 0.1022 0.86170 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1440101 4 0.2988 0.86667 0.000 0.012 0.112 0.876
#> SRR660260 3 0.1722 0.77616 0.000 0.008 0.944 0.048
#> SRR1071231 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1459125 2 0.1820 0.91451 0.000 0.944 0.036 0.020
#> SRR1337173 2 0.2845 0.88696 0.000 0.896 0.028 0.076
#> SRR1396250 1 0.2814 0.85516 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR2166376 3 0.0895 0.78326 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR659816 3 0.1356 0.78217 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1401379 2 0.1109 0.92061 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR600981 4 0.2773 0.86564 0.000 0.004 0.116 0.880
#> SRR1398335 1 0.1211 0.85972 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1397218 2 0.0672 0.92214 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR660115 3 0.3528 0.66621 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1407950 2 0.0188 0.92006 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359780 2 0.1837 0.91559 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1490037 1 0.1118 0.86084 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR627439 3 0.1305 0.78106 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1397156 1 0.1489 0.85805 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1410221 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1319648 2 0.1388 0.91961 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1092985 1 0.2647 0.85849 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR656409 3 0.4083 0.71849 0.000 0.068 0.832 0.100
#> SRR1468658 4 0.0469 0.83182 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1390437 4 0.4335 0.72202 0.000 0.168 0.036 0.796
#> SRR658057 3 0.2949 0.75111 0.000 0.088 0.888 0.024
#> SRR612635 2 0.2300 0.90458 0.000 0.924 0.028 0.048
#> SRR1351480 2 0.3099 0.87304 0.000 0.876 0.104 0.020
#> SRR1436651 1 0.1722 0.85578 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR1441590 1 0.1305 0.86055 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR659590 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR614263 3 0.2814 0.71440 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1409575 2 0.2996 0.88674 0.000 0.892 0.064 0.044
#> SRR659911 3 0.1820 0.78156 0.000 0.036 0.944 0.020
#> SRR1085519 1 0.3494 0.85521 0.860 0.016 0.008 0.116
#> SRR1345894 2 0.3597 0.82912 0.000 0.836 0.016 0.148
#> SRR1442928 2 0.0657 0.92165 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1464681 4 0.3105 0.86228 0.000 0.012 0.120 0.868
#> SRR1418880 1 0.0707 0.86398 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1309070 4 0.2319 0.80403 0.036 0.040 0.000 0.924
#> SRR1365426 2 0.0469 0.92141 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1487947 1 0.3472 0.85672 0.868 0.024 0.008 0.100
#> SRR659708 1 0.3525 0.86308 0.860 0.000 0.040 0.100
#> SRR603236 2 0.0524 0.92139 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR660673 1 0.2345 0.82833 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1430729 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR663807 2 0.1902 0.90889 0.000 0.932 0.064 0.004
#> SRR1087245 2 0.3636 0.81422 0.000 0.820 0.172 0.008
#> SRR1339108 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR613426 3 0.4950 0.25747 0.000 0.004 0.620 0.376
#> SRR613879 2 0.4957 0.73249 0.000 0.748 0.204 0.048
#> SRR1385101 2 0.4513 0.80724 0.000 0.804 0.120 0.076
#> SRR1387966 2 0.2473 0.89568 0.000 0.908 0.080 0.012
#> SRR1458852 2 0.0376 0.91893 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1430489 4 0.3280 0.78760 0.124 0.000 0.016 0.860
#> SRR1349231 2 0.5189 0.40243 0.372 0.616 0.012 0.000
#> SRR1376249 1 0.2704 0.85741 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1321987 2 0.0921 0.92136 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR662653 2 0.0188 0.92002 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1390027 1 0.1792 0.84909 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1098474 2 0.0524 0.91492 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1383081 2 0.3587 0.85938 0.000 0.856 0.104 0.040
#> SRR2166960 3 0.0967 0.78685 0.004 0.016 0.976 0.004
#> SRR605101 2 0.0188 0.91775 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR818600 3 0.4018 0.63731 0.000 0.224 0.772 0.004
#> SRR1367715 2 0.3323 0.87468 0.000 0.876 0.060 0.064
#> SRR1351979 1 0.3610 0.80993 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1387054 1 0.6527 0.59780 0.644 0.240 0.008 0.108
#> SRR1444306 1 0.3884 0.84946 0.848 0.036 0.008 0.108
#> SRR1322662 1 0.1970 0.85115 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR665478 3 0.1624 0.78346 0.000 0.028 0.952 0.020
#> SRR612767 4 0.7781 0.29218 0.108 0.040 0.340 0.512
#> SRR1489030 2 0.1489 0.91669 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1430375 2 0.1716 0.90997 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR615225 4 0.2773 0.86564 0.000 0.004 0.116 0.880
#> SRR1401839 2 0.0657 0.92165 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1379110 3 0.2473 0.76066 0.000 0.080 0.908 0.012
#> SRR1077288 1 0.2647 0.85859 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1331639 4 0.3485 0.85770 0.000 0.028 0.116 0.856
#> SRR1342782 2 0.0817 0.92171 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1443003 2 0.6232 -0.09506 0.472 0.484 0.008 0.036
#> SRR612839 1 0.2647 0.85849 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1470093 4 0.3024 0.68594 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1395742 1 0.1389 0.85742 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1469014 1 0.1209 0.86157 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1387222 4 0.0336 0.83465 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR664063 3 0.1488 0.77794 0.032 0.012 0.956 0.000
#> SRR1488214 3 0.3219 0.69072 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR654766 4 0.3108 0.86515 0.000 0.016 0.112 0.872
#> SRR1320321 2 0.1004 0.92103 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1071955 1 0.1042 0.86381 0.972 0.008 0.020 0.000
#> SRR1417483 1 0.4511 0.71703 0.784 0.040 0.176 0.000
#> SRR1394231 2 0.2867 0.87829 0.000 0.884 0.104 0.012
#> SRR1488470 3 0.3711 0.70666 0.000 0.140 0.836 0.024
#> SRR1389497 1 0.3102 0.85802 0.872 0.004 0.008 0.116
#> SRR1367109 2 0.0336 0.91609 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR615311 3 0.5428 0.23764 0.020 0.000 0.600 0.380
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR816015 2 0.2286 0.688739 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1380716 2 0.4547 0.619996 0.000 0.588 0.000 0.400 0.012
#> SRR612803 3 0.4171 0.132638 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.6651 0.350467 0.428 0.000 0.236 0.000 0.336
#> SRR1355396 1 0.5435 0.203363 0.524 0.428 0.040 0.004 0.004
#> SRR1084417 3 0.1831 0.504777 0.076 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1074359 2 0.6699 0.018213 0.256 0.472 0.004 0.268 0.000
#> SRR1419258 3 0.0912 0.508469 0.012 0.000 0.972 0.016 0.000
#> SRR1403366 5 0.0579 0.745868 0.008 0.000 0.008 0.000 0.984
#> SRR665262 5 0.5149 0.388764 0.036 0.388 0.000 0.004 0.572
#> SRR1499740 3 0.6018 0.286937 0.208 0.172 0.612 0.008 0.000
#> SRR1105057 2 0.1671 0.683455 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1439742 3 0.5708 -0.055695 0.412 0.000 0.504 0.000 0.084
#> SRR614599 2 0.3666 0.560315 0.132 0.824 0.032 0.012 0.000
#> SRR612215 2 0.3972 0.690119 0.008 0.764 0.000 0.212 0.016
#> SRR1094051 3 0.4894 0.028361 0.456 0.000 0.520 0.000 0.024
#> SRR1324496 3 0.4273 0.084292 0.448 0.000 0.552 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.2740 0.495568 0.096 0.000 0.876 0.000 0.028
#> SRR1409263 3 0.1267 0.507094 0.024 0.000 0.960 0.004 0.012
#> SRR1431288 3 0.4561 0.003659 0.488 0.008 0.504 0.000 0.000
#> SRR1334889 5 0.6436 0.572423 0.036 0.036 0.096 0.168 0.664
#> SRR614839 5 0.7333 -0.058754 0.004 0.244 0.020 0.360 0.372
#> SRR658433 2 0.5770 0.347117 0.004 0.528 0.000 0.080 0.388
#> SRR1088581 4 0.5364 0.620598 0.352 0.000 0.056 0.588 0.004
#> SRR1328797 3 0.0451 0.513044 0.008 0.004 0.988 0.000 0.000
#> SRR1334512 2 0.6081 0.389122 0.052 0.472 0.000 0.444 0.032
#> SRR1471117 3 0.4242 0.109962 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1311553 3 0.4242 0.107616 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.4108 0.668292 0.000 0.684 0.000 0.308 0.008
#> SRR1354955 3 0.6034 0.243095 0.280 0.000 0.608 0.080 0.032
#> SRR654802 3 0.0613 0.511986 0.008 0.004 0.984 0.004 0.000
#> SRR660066 2 0.4564 0.629210 0.004 0.600 0.000 0.388 0.008
#> SRR1447103 2 0.3542 0.582766 0.112 0.840 0.028 0.020 0.000
#> SRR1402153 3 0.1774 0.496078 0.016 0.000 0.932 0.052 0.000
#> SRR655887 2 0.4686 0.620859 0.004 0.588 0.000 0.396 0.012
#> SRR1408529 3 0.0854 0.510140 0.012 0.008 0.976 0.004 0.000
#> SRR658707 1 0.6686 0.338740 0.428 0.000 0.256 0.000 0.316
#> SRR1384371 3 0.6234 0.145095 0.008 0.276 0.564 0.152 0.000
#> SRR1074670 3 0.4356 0.398751 0.204 0.044 0.748 0.004 0.000
#> SRR1375439 2 0.4480 0.512047 0.152 0.772 0.016 0.060 0.000
#> SRR1329003 4 0.5742 0.612533 0.356 0.000 0.084 0.556 0.004
#> SRR1404837 2 0.4138 0.559965 0.148 0.780 0.000 0.072 0.000
#> SRR1317920 4 0.4560 0.552408 0.484 0.000 0.000 0.508 0.008
#> SRR1455525 4 0.5304 0.622429 0.352 0.000 0.052 0.592 0.004
#> SRR613999 5 0.5389 -0.099660 0.436 0.000 0.056 0.000 0.508
#> SRR1310836 3 0.4249 0.094205 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1499764 3 0.4440 0.058750 0.468 0.000 0.528 0.000 0.004
#> SRR658200 5 0.0451 0.746010 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988
#> SRR1068855 3 0.4249 0.105297 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.0865 0.512703 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR612227 2 0.6882 0.034066 0.220 0.456 0.312 0.012 0.000
#> SRR1388809 2 0.4010 0.654518 0.000 0.792 0.000 0.072 0.136
#> SRR1413872 4 0.4623 0.639231 0.340 0.008 0.000 0.640 0.012
#> SRR1452864 1 0.4854 -0.321746 0.628 0.000 0.004 0.340 0.028
#> SRR1473078 2 0.6828 -0.060230 0.212 0.424 0.356 0.008 0.000
#> SRR615814 5 0.0451 0.748610 0.008 0.000 0.000 0.004 0.988
#> SRR1325225 4 0.5559 0.598918 0.380 0.000 0.076 0.544 0.000
#> SRR1313687 2 0.2981 0.621427 0.036 0.884 0.064 0.012 0.004
#> SRR1358220 2 0.4225 0.647595 0.000 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1096662 4 0.5954 0.181024 0.008 0.136 0.000 0.608 0.248
#> SRR1487746 1 0.6445 0.237029 0.456 0.000 0.360 0.000 0.184
#> SRR1354644 3 0.4718 0.057546 0.444 0.000 0.540 0.000 0.016
#> SRR1401752 2 0.1041 0.652293 0.032 0.964 0.000 0.004 0.000
#> SRR660164 5 0.6312 0.220415 0.004 0.136 0.000 0.392 0.468
#> SRR815783 2 0.4011 0.570297 0.112 0.808 0.000 0.008 0.072
#> SRR809595 5 0.5099 0.054053 0.004 0.440 0.000 0.028 0.528
#> SRR1403133 2 0.2249 0.610965 0.096 0.896 0.000 0.008 0.000
#> SRR815470 4 0.3916 0.502715 0.096 0.072 0.000 0.820 0.012
#> SRR1344382 1 0.6341 0.362003 0.444 0.000 0.160 0.000 0.396
#> SRR1432453 2 0.5056 0.475788 0.148 0.740 0.028 0.084 0.000
#> SRR1478362 4 0.6517 0.521412 0.216 0.224 0.000 0.548 0.012
#> SRR1392186 5 0.5082 0.512618 0.000 0.220 0.000 0.096 0.684
#> SRR1347937 5 0.6032 -0.242199 0.424 0.000 0.116 0.000 0.460
#> SRR1431569 1 0.5406 0.035195 0.476 0.000 0.468 0.000 0.056
#> SRR1471594 1 0.4855 0.074022 0.544 0.016 0.436 0.000 0.004
#> SRR1354270 3 0.5638 0.294594 0.280 0.068 0.632 0.020 0.000
#> SRR612683 2 0.5167 0.610331 0.004 0.564 0.000 0.396 0.036
#> SRR1392901 4 0.8360 0.276214 0.200 0.232 0.192 0.376 0.000
#> SRR1077805 3 0.2005 0.504528 0.056 0.016 0.924 0.004 0.000
#> SRR1360402 2 0.4252 0.656079 0.000 0.652 0.000 0.340 0.008
#> SRR1406112 3 0.3842 0.454632 0.156 0.028 0.804 0.012 0.000
#> SRR1355352 3 0.0566 0.512116 0.012 0.004 0.984 0.000 0.000
#> SRR656247 5 0.0609 0.742155 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR813656 5 0.0290 0.746804 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR808244 3 0.5659 0.149378 0.280 0.000 0.604 0.116 0.000
#> SRR1387240 2 0.4922 0.591871 0.004 0.552 0.000 0.424 0.020
#> SRR1408595 2 0.4507 0.124322 0.412 0.580 0.004 0.004 0.000
#> SRR1385277 4 0.4968 0.638618 0.356 0.020 0.000 0.612 0.012
#> SRR1435248 2 0.0324 0.665742 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1419110 2 0.2686 0.620538 0.080 0.892 0.004 0.012 0.012
#> SRR1408682 2 0.0912 0.663732 0.012 0.972 0.000 0.016 0.000
#> SRR1317134 3 0.4449 0.032992 0.484 0.000 0.512 0.000 0.004
#> SRR1370780 1 0.6465 0.363202 0.440 0.000 0.184 0.000 0.376
#> SRR1489307 2 0.2353 0.644180 0.060 0.908 0.000 0.028 0.004
#> SRR1453911 2 0.5051 0.633150 0.012 0.584 0.000 0.384 0.020
#> SRR603164 2 0.6157 0.316096 0.200 0.604 0.184 0.012 0.000
#> SRR1383259 4 0.5011 0.624688 0.292 0.036 0.000 0.660 0.012
#> SRR1330854 3 0.0963 0.511420 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.6405 0.364550 0.444 0.000 0.172 0.000 0.384
#> SRR1368574 2 0.5176 0.603112 0.004 0.560 0.000 0.400 0.036
#> SRR1468162 3 0.4440 0.058750 0.468 0.000 0.528 0.000 0.004
#> SRR1331220 2 0.6853 0.225618 0.180 0.520 0.272 0.028 0.000
#> SRR1361546 2 0.4585 0.621869 0.004 0.592 0.000 0.396 0.008
#> SRR1486156 3 0.4450 0.019637 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004
#> SRR660545 4 0.6904 -0.263761 0.004 0.308 0.000 0.396 0.292
#> SRR615635 2 0.2660 0.689602 0.000 0.864 0.000 0.128 0.008
#> SRR1385411 4 0.4728 0.294410 0.016 0.124 0.064 0.780 0.016
#> SRR1342739 1 0.4705 0.001017 0.504 0.008 0.484 0.000 0.004
#> SRR1102830 3 0.4248 0.451496 0.092 0.004 0.800 0.008 0.096
#> SRR662126 5 0.0162 0.748761 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1464601 2 0.2206 0.675691 0.016 0.912 0.004 0.068 0.000
#> SRR1071594 2 0.5708 0.613646 0.008 0.568 0.060 0.360 0.004
#> SRR612539 5 0.2077 0.721594 0.008 0.084 0.000 0.000 0.908
#> SRR602010 2 0.4101 0.642646 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR810249 2 0.0671 0.666463 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000
#> SRR818773 2 0.5569 0.624121 0.012 0.588 0.012 0.356 0.032
#> SRR1336569 3 0.4256 0.090087 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.4798 0.580366 0.000 0.540 0.000 0.440 0.020
#> SRR1442754 3 0.2069 0.492610 0.076 0.000 0.912 0.000 0.012
#> SRR1334247 3 0.0932 0.513451 0.020 0.004 0.972 0.004 0.000
#> SRR661639 3 0.4538 0.067474 0.452 0.000 0.540 0.000 0.008
#> SRR613222 5 0.0290 0.747545 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1459937 4 0.4817 0.633270 0.368 0.000 0.016 0.608 0.008
#> SRR2185018 5 0.1270 0.720790 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR655732 5 0.0566 0.748306 0.000 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR809348 5 0.4950 0.208912 0.348 0.000 0.040 0.000 0.612
#> SRR819261 3 0.3840 0.427596 0.196 0.016 0.780 0.008 0.000
#> SRR661074 5 0.1549 0.724951 0.016 0.000 0.040 0.000 0.944
#> SRR1349851 1 0.4812 0.222302 0.600 0.372 0.028 0.000 0.000
#> SRR1405123 4 0.5419 0.622102 0.352 0.000 0.052 0.588 0.008
#> SRR661096 2 0.4856 0.619829 0.004 0.584 0.000 0.392 0.020
#> SRR1320225 3 0.5362 -0.023302 0.456 0.036 0.500 0.000 0.008
#> SRR1454651 4 0.5742 0.610918 0.356 0.000 0.084 0.556 0.004
#> SRR1307677 4 0.6846 -0.284053 0.004 0.320 0.000 0.416 0.260
#> SRR1466512 4 0.4403 -0.301790 0.000 0.384 0.000 0.608 0.008
#> SRR658212 5 0.5151 0.468752 0.008 0.048 0.000 0.300 0.644
#> SRR1430525 3 0.3684 0.418271 0.056 0.116 0.824 0.004 0.000
#> SRR1344422 5 0.4210 0.552881 0.204 0.004 0.000 0.036 0.756
#> SRR1353924 2 0.1493 0.659311 0.024 0.948 0.000 0.028 0.000
#> SRR1314832 3 0.1831 0.504456 0.076 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1487570 4 0.5138 0.623323 0.368 0.000 0.032 0.592 0.008
#> SRR627431 4 0.4659 -0.517655 0.000 0.488 0.000 0.500 0.012
#> SRR1418561 3 0.5944 0.319131 0.232 0.000 0.648 0.052 0.068
#> SRR1448029 2 0.4991 0.464872 0.092 0.720 0.180 0.008 0.000
#> SRR813802 1 0.6825 0.281292 0.340 0.000 0.332 0.000 0.328
#> SRR815020 1 0.5967 0.260042 0.456 0.000 0.108 0.000 0.436
#> SRR1309702 4 0.4522 -0.421195 0.000 0.440 0.000 0.552 0.008
#> SRR1435311 2 0.3307 0.579980 0.116 0.848 0.024 0.012 0.000
#> SRR612395 5 0.2624 0.688631 0.000 0.116 0.000 0.012 0.872
#> SRR603116 2 0.4462 0.666385 0.004 0.672 0.000 0.308 0.016
#> SRR1323152 3 0.7239 0.113449 0.344 0.124 0.464 0.068 0.000
#> SRR1368264 2 0.4264 0.638416 0.004 0.620 0.000 0.376 0.000
#> SRR1326624 3 0.6188 0.081829 0.392 0.000 0.512 0.032 0.064
#> SRR1429265 3 0.0290 0.513350 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1327702 3 0.4300 0.036180 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR615611 5 0.4755 0.501203 0.008 0.028 0.000 0.292 0.672
#> SRR1486799 3 0.4448 0.042271 0.480 0.000 0.516 0.000 0.004
#> SRR1096174 4 0.4812 0.637134 0.364 0.012 0.000 0.612 0.012
#> SRR815044 5 0.5114 0.297445 0.004 0.028 0.000 0.456 0.512
#> SRR1338560 2 0.4866 0.616777 0.004 0.580 0.000 0.396 0.020
#> SRR615862 4 0.6781 -0.134961 0.008 0.196 0.000 0.404 0.392
#> SRR1480038 2 0.1251 0.671357 0.008 0.956 0.000 0.036 0.000
#> SRR659436 5 0.0451 0.746686 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988
#> SRR613699 5 0.0290 0.748718 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1436563 3 0.4450 0.027666 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004
#> SRR615323 2 0.3715 0.681683 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1330327 4 0.4538 0.637549 0.348 0.004 0.000 0.636 0.012
#> SRR1489950 2 0.1041 0.648185 0.032 0.964 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431927 3 0.4617 0.068484 0.436 0.000 0.552 0.000 0.012
#> SRR1100588 3 0.6317 0.253441 0.180 0.204 0.600 0.008 0.008
#> SRR1444002 3 0.4350 0.113255 0.408 0.000 0.588 0.000 0.004
#> SRR1318444 4 0.6197 0.591284 0.392 0.008 0.076 0.512 0.012
#> SRR600656 4 0.4999 0.639107 0.348 0.028 0.000 0.616 0.008
#> SRR658766 5 0.5922 0.434116 0.076 0.000 0.268 0.032 0.624
#> SRR655946 5 0.1571 0.719139 0.004 0.000 0.060 0.000 0.936
#> SRR817282 1 0.6346 0.352995 0.436 0.000 0.160 0.000 0.404
#> SRR1475104 3 0.1990 0.504390 0.028 0.040 0.928 0.004 0.000
#> SRR1406418 3 0.4595 0.018535 0.488 0.004 0.504 0.000 0.004
#> SRR1090265 1 0.4738 0.027957 0.520 0.000 0.464 0.000 0.016
#> SRR1444120 2 0.4897 0.630980 0.008 0.600 0.012 0.376 0.004
#> SRR1471965 3 0.4437 0.062747 0.464 0.000 0.532 0.000 0.004
#> SRR612695 3 0.2769 0.485739 0.092 0.000 0.876 0.032 0.000
#> SRR662498 5 0.0290 0.746804 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1376764 3 0.2416 0.457979 0.012 0.000 0.888 0.100 0.000
#> SRR1377006 3 0.6897 0.119915 0.216 0.292 0.476 0.016 0.000
#> SRR656860 4 0.3806 0.257864 0.004 0.152 0.000 0.804 0.040
#> SRR1480547 5 0.5943 0.375349 0.008 0.084 0.004 0.336 0.568
#> SRR1452515 2 0.4345 0.571132 0.096 0.808 0.016 0.068 0.012
#> SRR1324390 2 0.3835 0.680786 0.000 0.732 0.000 0.260 0.008
#> SRR615273 5 0.4890 0.184171 0.040 0.000 0.332 0.000 0.628
#> SRR601695 2 0.4779 0.571754 0.012 0.536 0.000 0.448 0.004
#> SRR820907 2 0.4436 0.626694 0.000 0.596 0.000 0.396 0.008
#> SRR812773 2 0.4750 0.449339 0.236 0.712 0.040 0.012 0.000
#> SRR1405984 2 0.3605 0.565770 0.120 0.832 0.036 0.012 0.000
#> SRR1472794 2 0.2753 0.688050 0.000 0.856 0.000 0.136 0.008
#> SRR1365448 3 0.4088 0.175672 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1095720 3 0.3361 0.421924 0.020 0.000 0.840 0.128 0.012
#> SRR1435626 2 0.6394 0.214483 0.216 0.556 0.220 0.008 0.000
#> SRR1080766 2 0.1410 0.679053 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1377862 1 0.4437 0.022374 0.532 0.000 0.464 0.000 0.004
#> SRR1332299 3 0.0671 0.512551 0.016 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1467966 3 0.4876 0.378362 0.200 0.064 0.724 0.012 0.000
#> SRR1320579 1 0.7039 -0.354816 0.352 0.000 0.348 0.292 0.008
#> SRR1319710 2 0.3398 0.687809 0.000 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR1326604 2 0.7255 0.350629 0.024 0.376 0.000 0.360 0.240
#> SRR1098879 3 0.0912 0.509335 0.016 0.000 0.972 0.012 0.000
#> SRR662245 5 0.0162 0.748761 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1074719 2 0.2362 0.613874 0.084 0.900 0.008 0.008 0.000
#> SRR816226 4 0.5535 0.069971 0.088 0.000 0.288 0.620 0.004
#> SRR601387 2 0.1831 0.684071 0.004 0.920 0.000 0.076 0.000
#> SRR614575 5 0.2198 0.727159 0.012 0.048 0.000 0.020 0.920
#> SRR1353900 2 0.5689 0.574569 0.004 0.528 0.000 0.396 0.072
#> SRR662906 2 0.7124 0.398522 0.008 0.420 0.232 0.332 0.008
#> SRR1350832 2 0.4971 0.648794 0.004 0.628 0.000 0.332 0.036
#> SRR1403280 2 0.5306 0.597174 0.004 0.552 0.000 0.400 0.044
#> SRR1313969 4 0.4837 0.639841 0.348 0.020 0.000 0.624 0.008
#> SRR1388528 3 0.3790 0.353929 0.272 0.000 0.724 0.004 0.000
#> SRR1452912 3 0.4425 0.069640 0.452 0.000 0.544 0.000 0.004
#> SRR1400180 2 0.4724 0.500078 0.216 0.728 0.004 0.044 0.008
#> SRR655399 3 0.1116 0.506828 0.004 0.000 0.964 0.004 0.028
#> SRR1319753 2 0.4789 0.615778 0.004 0.580 0.000 0.400 0.016
#> SRR818901 3 0.4017 0.309814 0.012 0.000 0.736 0.004 0.248
#> SRR607067 4 0.4242 -0.387447 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1391420 3 0.4440 0.058750 0.468 0.000 0.528 0.000 0.004
#> SRR1384138 5 0.6521 0.162049 0.008 0.148 0.000 0.416 0.428
#> SRR661961 5 0.4407 0.663810 0.052 0.080 0.048 0.008 0.812
#> SRR658259 5 0.6593 0.142359 0.004 0.184 0.000 0.364 0.448
#> SRR1310476 5 0.4807 -0.005854 0.448 0.000 0.020 0.000 0.532
#> SRR1452696 2 0.4644 0.631740 0.004 0.604 0.000 0.380 0.012
#> SRR1365034 4 0.4268 -0.202717 0.000 0.344 0.000 0.648 0.008
#> SRR1478053 2 0.2966 0.690872 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1475300 2 0.1124 0.672086 0.004 0.960 0.000 0.036 0.000
#> SRR1328101 2 0.1059 0.657308 0.020 0.968 0.000 0.008 0.004
#> SRR1322900 3 0.6035 0.300181 0.128 0.192 0.648 0.032 0.000
#> SRR1309942 2 0.5051 0.620482 0.008 0.576 0.000 0.392 0.024
#> SRR1345760 4 0.5013 0.630426 0.352 0.000 0.028 0.612 0.008
#> SRR1435418 3 0.4302 0.048011 0.480 0.000 0.520 0.000 0.000
#> SRR1402172 4 0.4900 0.628388 0.300 0.028 0.000 0.660 0.012
#> SRR1443436 3 0.4450 0.027666 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004
#> SRR661675 2 0.2352 0.611261 0.092 0.896 0.004 0.008 0.000
#> SRR661469 5 0.0451 0.747232 0.008 0.004 0.000 0.000 0.988
#> SRR1500323 2 0.3870 0.681199 0.004 0.732 0.000 0.260 0.004
#> SRR1356705 2 0.2074 0.685145 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1464915 1 0.4865 0.064205 0.536 0.004 0.444 0.000 0.016
#> SRR1312406 3 0.7109 0.052450 0.240 0.364 0.380 0.016 0.000
#> SRR1350435 3 0.3093 0.475947 0.168 0.000 0.824 0.008 0.000
#> SRR1389177 3 0.5924 0.299512 0.120 0.068 0.688 0.124 0.000
#> SRR1368072 2 0.1041 0.673706 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR601815 2 0.4414 0.637254 0.004 0.616 0.000 0.376 0.004
#> SRR613330 1 0.6396 0.364649 0.488 0.000 0.188 0.000 0.324
#> SRR1434502 5 0.5736 0.488264 0.080 0.268 0.000 0.020 0.632
#> SRR1394190 1 0.4562 -0.025786 0.500 0.000 0.492 0.000 0.008
#> SRR1481083 3 0.5548 -0.062893 0.440 0.000 0.492 0.000 0.068
#> SRR816382 2 0.4412 0.519319 0.132 0.780 0.076 0.012 0.000
#> SRR1318839 3 0.0579 0.510290 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR1432390 4 0.5048 0.608453 0.268 0.052 0.000 0.672 0.008
#> SRR613126 2 0.0932 0.671764 0.004 0.972 0.000 0.020 0.004
#> SRR1089424 2 0.4769 0.580416 0.004 0.544 0.000 0.440 0.012
#> SRR1347214 2 0.3209 0.690216 0.000 0.812 0.000 0.180 0.008
#> SRR1309556 2 0.4926 0.440834 0.232 0.704 0.052 0.012 0.000
#> SRR1456027 4 0.5358 0.622670 0.352 0.000 0.048 0.592 0.008
#> SRR1400551 3 0.5063 0.397449 0.156 0.116 0.720 0.008 0.000
#> SRR1320469 3 0.1478 0.498484 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR614251 4 0.7262 -0.379342 0.004 0.372 0.220 0.384 0.020
#> SRR1454310 2 0.3534 0.684669 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR615105 4 0.5016 0.635141 0.352 0.004 0.012 0.616 0.016
#> SRR1433290 3 0.0451 0.511278 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR2166064 5 0.1809 0.715700 0.060 0.000 0.000 0.012 0.928
#> SRR601671 2 0.5122 0.521547 0.004 0.496 0.000 0.472 0.028
#> SRR663874 5 0.0451 0.748911 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1409130 2 0.4973 0.626655 0.004 0.592 0.000 0.376 0.028
#> SRR659696 4 0.3956 0.505973 0.108 0.080 0.000 0.808 0.004
#> SRR1408249 4 0.3582 0.116212 0.000 0.224 0.000 0.768 0.008
#> SRR663284 5 0.0290 0.747545 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1402794 3 0.8368 0.040824 0.252 0.284 0.368 0.020 0.076
#> SRR614852 4 0.4984 0.632861 0.344 0.000 0.028 0.620 0.008
#> SRR1348040 2 0.4985 0.437811 0.236 0.700 0.048 0.016 0.000
#> SRR1489610 2 0.3430 0.687539 0.000 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1488091 2 0.0932 0.667962 0.004 0.972 0.000 0.020 0.004
#> SRR1499566 2 0.1386 0.667789 0.016 0.952 0.000 0.032 0.000
#> SRR1361480 2 0.2470 0.684234 0.000 0.884 0.000 0.104 0.012
#> SRR1444501 3 0.0566 0.510557 0.012 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR1415773 2 0.3266 0.582012 0.108 0.852 0.032 0.008 0.000
#> SRR1388832 5 0.5723 0.141398 0.088 0.000 0.392 0.000 0.520
#> SRR1394637 3 0.2773 0.472655 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR606974 2 0.4722 0.609158 0.004 0.572 0.000 0.412 0.012
#> SRR662918 5 0.0162 0.747639 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR817421 3 0.0693 0.509703 0.008 0.000 0.980 0.012 0.000
#> SRR1400823 3 0.5046 -0.003007 0.468 0.000 0.500 0.000 0.032
#> SRR1381348 4 0.4332 0.107254 0.024 0.236 0.000 0.732 0.008
#> SRR608264 3 0.2866 0.475882 0.100 0.024 0.872 0.004 0.000
#> SRR1318560 3 0.2233 0.495649 0.104 0.000 0.892 0.000 0.004
#> SRR1454117 2 0.2921 0.690662 0.004 0.844 0.000 0.148 0.004
#> SRR1312684 1 0.4884 0.279543 0.720 0.152 0.128 0.000 0.000
#> SRR615044 5 0.5402 0.535174 0.020 0.248 0.064 0.000 0.668
#> SRR1432743 3 0.2663 0.487730 0.048 0.048 0.896 0.008 0.000
#> SRR1388873 2 0.1282 0.674061 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1353517 1 0.4524 0.070373 0.572 0.004 0.420 0.000 0.004
#> SRR1357148 2 0.6275 -0.040531 0.104 0.452 0.432 0.012 0.000
#> SRR1406008 2 0.4312 0.662893 0.000 0.772 0.000 0.104 0.124
#> SRR1396786 2 0.2407 0.611970 0.088 0.896 0.004 0.012 0.000
#> SRR1446564 3 0.4305 0.025366 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR1318465 3 0.3758 0.424293 0.088 0.000 0.816 0.096 0.000
#> SRR1431083 3 0.4448 0.040385 0.480 0.000 0.516 0.000 0.004
#> SRR607117 4 0.3294 0.526059 0.104 0.036 0.000 0.852 0.008
#> SRR655170 4 0.4455 -0.366306 0.000 0.404 0.000 0.588 0.008
#> SRR1087825 4 0.4585 0.638647 0.348 0.004 0.004 0.636 0.008
#> SRR662019 3 0.3141 0.431476 0.016 0.000 0.832 0.152 0.000
#> SRR1349209 4 0.6812 0.511579 0.388 0.000 0.168 0.428 0.016
#> SRR1326161 2 0.1243 0.670382 0.004 0.960 0.000 0.028 0.008
#> SRR1345284 2 0.3707 0.676558 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1416672 3 0.4397 0.083442 0.432 0.000 0.564 0.000 0.004
#> SRR663356 2 0.1728 0.663384 0.020 0.940 0.000 0.036 0.004
#> SRR1454328 2 0.1173 0.670373 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1489286 3 0.4192 0.126393 0.404 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1092349 2 0.4676 0.467126 0.216 0.728 0.044 0.012 0.000
#> SRR1408183 3 0.5541 0.324265 0.212 0.108 0.668 0.012 0.000
#> SRR1084369 3 0.5521 0.241650 0.072 0.304 0.616 0.008 0.000
#> SRR598452 3 0.1095 0.508329 0.008 0.000 0.968 0.012 0.012
#> SRR660709 5 0.1195 0.737389 0.028 0.000 0.000 0.012 0.960
#> SRR809444 1 0.4283 -0.003724 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1089901 2 0.2352 0.611261 0.092 0.896 0.004 0.008 0.000
#> SRR1375774 1 0.6168 0.200105 0.548 0.304 0.144 0.004 0.000
#> SRR1326292 4 0.5808 0.612367 0.356 0.000 0.080 0.556 0.008
#> SRR657139 3 0.1798 0.507629 0.064 0.004 0.928 0.004 0.000
#> SRR1440744 2 0.4769 0.584840 0.004 0.544 0.000 0.440 0.012
#> SRR1353555 3 0.4747 -0.000178 0.488 0.000 0.496 0.000 0.016
#> SRR1323087 3 0.4533 0.096981 0.448 0.008 0.544 0.000 0.000
#> SRR1452334 4 0.4866 0.633644 0.352 0.000 0.016 0.620 0.012
#> SRR1381775 1 0.5226 0.287761 0.704 0.088 0.196 0.008 0.004
#> SRR1363908 3 0.4446 0.044274 0.476 0.000 0.520 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.3728 0.684652 0.000 0.748 0.000 0.244 0.008
#> SRR658989 3 0.6468 0.189363 0.192 0.004 0.544 0.004 0.256
#> SRR1353663 3 0.4410 0.078691 0.440 0.000 0.556 0.000 0.004
#> SRR811771 3 0.4227 0.112054 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR813983 3 0.4443 0.054507 0.472 0.000 0.524 0.000 0.004
#> SRR815825 3 0.1997 0.485343 0.036 0.000 0.924 0.040 0.000
#> SRR819054 2 0.3003 0.691258 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1367988 4 0.4789 0.636159 0.324 0.028 0.000 0.644 0.004
#> SRR1331922 5 0.2732 0.657550 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR615479 3 0.6197 -0.021781 0.008 0.436 0.472 0.072 0.012
#> SRR1375796 2 0.4759 0.624919 0.004 0.592 0.000 0.388 0.016
#> SRR1386991 2 0.3402 0.566809 0.140 0.832 0.012 0.016 0.000
#> SRR1355217 4 0.5652 0.181001 0.012 0.144 0.160 0.680 0.004
#> SRR1356290 2 0.4329 0.664797 0.000 0.672 0.000 0.312 0.016
#> SRR659507 5 0.4504 0.252893 0.000 0.428 0.000 0.008 0.564
#> SRR663296 5 0.0671 0.742115 0.016 0.000 0.004 0.000 0.980
#> SRR598044 2 0.4045 0.651676 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR661155 4 0.5240 0.613203 0.360 0.000 0.000 0.584 0.056
#> SRR1414727 5 0.0510 0.743589 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR663477 3 0.3011 0.483705 0.140 0.000 0.844 0.016 0.000
#> SRR1354489 3 0.3086 0.475831 0.092 0.040 0.864 0.004 0.000
#> SRR1377800 2 0.6665 -0.035943 0.176 0.444 0.372 0.008 0.000
#> SRR614611 2 0.3676 0.686033 0.004 0.760 0.000 0.232 0.004
#> SRR655052 4 0.4825 0.636274 0.368 0.012 0.000 0.608 0.012
#> SRR1478968 4 0.5088 0.628729 0.352 0.000 0.032 0.608 0.008
#> SRR1351280 5 0.5230 0.419935 0.004 0.048 0.000 0.348 0.600
#> SRR613951 4 0.5950 0.445833 0.188 0.000 0.220 0.592 0.000
#> SRR1418022 3 0.4449 0.033031 0.484 0.000 0.512 0.000 0.004
#> SRR661901 1 0.7264 -0.389160 0.376 0.000 0.296 0.308 0.020
#> SRR1408161 1 0.4448 0.002099 0.516 0.000 0.480 0.000 0.004
#> SRR657054 5 0.1211 0.735234 0.016 0.000 0.024 0.000 0.960
#> SRR655040 4 0.6520 0.552129 0.408 0.060 0.000 0.476 0.056
#> SRR810225 2 0.3160 0.689219 0.000 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR1325377 2 0.4460 0.627223 0.004 0.600 0.000 0.392 0.004
#> SRR617829 3 0.4877 0.360390 0.136 0.028 0.756 0.080 0.000
#> SRR1402328 2 0.1717 0.678044 0.008 0.936 0.000 0.052 0.004
#> SRR1480455 2 0.2881 0.692235 0.004 0.860 0.000 0.124 0.012
#> SRR1442104 3 0.1059 0.507476 0.008 0.000 0.968 0.020 0.004
#> SRR1453416 3 0.4713 0.067303 0.440 0.016 0.544 0.000 0.000
#> SRR1481396 3 0.2729 0.495163 0.084 0.028 0.884 0.004 0.000
#> SRR1414314 2 0.3644 0.681987 0.016 0.824 0.000 0.136 0.024
#> SRR663026 2 0.4737 0.629682 0.004 0.600 0.000 0.380 0.016
#> SRR1478386 2 0.4030 0.654165 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1458683 4 0.5358 0.622670 0.352 0.000 0.048 0.592 0.008
#> SRR1370572 3 0.4744 0.022019 0.476 0.000 0.508 0.000 0.016
#> SRR1467567 1 0.4451 -0.022186 0.504 0.000 0.492 0.000 0.004
#> SRR1468532 2 0.6988 -0.080822 0.088 0.428 0.000 0.068 0.416
#> SRR1310735 3 0.4437 0.061310 0.464 0.000 0.532 0.000 0.004
#> SRR1440101 4 0.4565 0.638621 0.352 0.008 0.000 0.632 0.008
#> SRR660260 5 0.0162 0.747639 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1071231 2 0.2915 0.683969 0.024 0.860 0.000 0.116 0.000
#> SRR1459125 2 0.5519 0.396912 0.148 0.648 0.000 0.204 0.000
#> SRR1337173 2 0.5964 0.422670 0.200 0.656 0.024 0.116 0.004
#> SRR1396250 3 0.0451 0.511037 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR2166376 5 0.0324 0.747276 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR659816 5 0.0404 0.746826 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1401379 2 0.4046 0.672344 0.000 0.696 0.000 0.296 0.008
#> SRR600981 4 0.4938 0.630666 0.308 0.028 0.000 0.652 0.012
#> SRR1398335 3 0.4415 0.076126 0.444 0.000 0.552 0.000 0.004
#> SRR1397218 2 0.3767 0.593743 0.120 0.812 0.000 0.068 0.000
#> SRR660115 5 0.4464 0.140952 0.408 0.000 0.008 0.000 0.584
#> SRR1407950 2 0.4196 0.648605 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR1359780 2 0.4575 0.627879 0.004 0.596 0.000 0.392 0.008
#> SRR1490037 3 0.4448 0.043334 0.480 0.000 0.516 0.000 0.004
#> SRR627439 5 0.0162 0.747639 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1397156 3 0.4448 0.043334 0.480 0.000 0.516 0.000 0.004
#> SRR1410221 2 0.2518 0.611933 0.080 0.896 0.016 0.008 0.000
#> SRR1319648 2 0.5148 0.634059 0.004 0.600 0.032 0.360 0.004
#> SRR1092985 3 0.1965 0.484064 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR656409 4 0.7298 -0.108278 0.020 0.156 0.020 0.444 0.360
#> SRR1468658 4 0.5855 0.598134 0.348 0.000 0.096 0.552 0.004
#> SRR1390437 4 0.2629 0.306890 0.004 0.136 0.000 0.860 0.000
#> SRR658057 5 0.3401 0.682131 0.008 0.072 0.000 0.068 0.852
#> SRR612635 2 0.4664 0.608100 0.004 0.572 0.004 0.416 0.004
#> SRR1351480 2 0.5155 0.577134 0.004 0.536 0.000 0.428 0.032
#> SRR1436651 3 0.4595 0.018535 0.488 0.004 0.504 0.000 0.004
#> SRR1441590 3 0.6505 -0.070737 0.396 0.008 0.464 0.128 0.004
#> SRR659590 2 0.3741 0.681889 0.004 0.732 0.000 0.264 0.000
#> SRR614263 5 0.3480 0.485777 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR1409575 2 0.4764 0.584305 0.004 0.548 0.000 0.436 0.012
#> SRR659911 5 0.0798 0.745930 0.000 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1085519 3 0.2157 0.502058 0.036 0.040 0.920 0.004 0.000
#> SRR1345894 2 0.4811 0.593522 0.008 0.548 0.004 0.436 0.004
#> SRR1442928 2 0.1990 0.629196 0.068 0.920 0.000 0.008 0.004
#> SRR1464681 4 0.4940 0.639050 0.348 0.020 0.000 0.620 0.012
#> SRR1418880 3 0.4171 0.141627 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1309070 1 0.7761 -0.231253 0.384 0.084 0.356 0.176 0.000
#> SRR1365426 2 0.4491 0.638412 0.004 0.624 0.000 0.364 0.008
#> SRR1487947 3 0.2238 0.504350 0.064 0.020 0.912 0.004 0.000
#> SRR659708 3 0.1845 0.497996 0.056 0.000 0.928 0.000 0.016
#> SRR603236 2 0.3587 0.582636 0.100 0.844 0.040 0.012 0.004
#> SRR660673 3 0.5507 -0.056942 0.456 0.000 0.480 0.000 0.064
#> SRR1430729 2 0.1117 0.659539 0.020 0.964 0.000 0.016 0.000
#> SRR663807 2 0.4914 0.649142 0.004 0.628 0.000 0.336 0.032
#> SRR1087245 2 0.5708 0.561023 0.004 0.516 0.000 0.408 0.072
#> SRR1339108 2 0.3409 0.581169 0.116 0.844 0.024 0.016 0.000
#> SRR613426 4 0.6804 0.293258 0.300 0.000 0.000 0.368 0.332
#> SRR613879 2 0.5893 0.497572 0.000 0.464 0.000 0.436 0.100
#> SRR1385101 4 0.4419 -0.214692 0.004 0.344 0.000 0.644 0.008
#> SRR1387966 2 0.2642 0.677452 0.004 0.888 0.000 0.084 0.024
#> SRR1458852 2 0.4126 0.638051 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1430489 4 0.4651 0.588069 0.428 0.000 0.004 0.560 0.008
#> SRR1349231 1 0.7495 0.192369 0.520 0.160 0.228 0.088 0.004
#> SRR1376249 3 0.0798 0.509661 0.016 0.000 0.976 0.008 0.000
#> SRR1321987 2 0.4054 0.684692 0.008 0.744 0.000 0.236 0.012
#> SRR662653 2 0.4199 0.670649 0.008 0.692 0.000 0.296 0.004
#> SRR1390027 3 0.4546 0.059230 0.460 0.000 0.532 0.000 0.008
#> SRR1098474 2 0.5799 0.583678 0.004 0.548 0.088 0.360 0.000
#> SRR1383081 2 0.5089 0.576448 0.004 0.536 0.000 0.432 0.028
#> SRR2166960 5 0.0162 0.748038 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR605101 2 0.4151 0.650433 0.004 0.652 0.000 0.344 0.000
#> SRR818600 5 0.3452 0.647852 0.000 0.148 0.000 0.032 0.820
#> SRR1367715 4 0.4559 -0.492178 0.000 0.480 0.000 0.512 0.008
#> SRR1351979 3 0.1012 0.506154 0.012 0.000 0.968 0.020 0.000
#> SRR1387054 3 0.3849 0.432046 0.052 0.136 0.808 0.004 0.000
#> SRR1444306 3 0.1179 0.511701 0.016 0.016 0.964 0.004 0.000
#> SRR1322662 1 0.4892 -0.018180 0.492 0.004 0.488 0.000 0.016
#> SRR665478 5 0.0324 0.748431 0.004 0.004 0.000 0.000 0.992
#> SRR612767 1 0.6331 -0.236039 0.452 0.032 0.000 0.444 0.072
#> SRR1489030 2 0.4220 0.669793 0.004 0.688 0.000 0.300 0.008
#> SRR1430375 2 0.5969 0.600530 0.004 0.608 0.000 0.200 0.188
#> SRR615225 4 0.4647 0.636613 0.352 0.000 0.004 0.628 0.016
#> SRR1401839 2 0.3182 0.596438 0.124 0.844 0.000 0.032 0.000
#> SRR1379110 4 0.6772 -0.128648 0.004 0.220 0.000 0.388 0.388
#> SRR1077288 3 0.1764 0.505974 0.064 0.000 0.928 0.000 0.008
#> SRR1331639 4 0.4999 0.639107 0.348 0.028 0.000 0.616 0.008
#> SRR1342782 2 0.0771 0.670550 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1443003 3 0.4217 0.322009 0.012 0.244 0.732 0.012 0.000
#> SRR612839 3 0.1671 0.495016 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1470093 3 0.6525 -0.094224 0.308 0.000 0.472 0.220 0.000
#> SRR1395742 3 0.4452 0.009974 0.496 0.000 0.500 0.000 0.004
#> SRR1469014 1 0.4706 -0.012507 0.500 0.008 0.488 0.000 0.004
#> SRR1387222 4 0.5748 0.575897 0.252 0.000 0.140 0.608 0.000
#> SRR664063 5 0.0290 0.747545 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1488214 5 0.4192 0.174215 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR654766 4 0.4920 0.639514 0.348 0.024 0.000 0.620 0.008
#> SRR1320321 2 0.4299 0.632537 0.000 0.608 0.000 0.388 0.004
#> SRR1071955 3 0.4304 0.037120 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000
#> SRR1417483 1 0.7379 0.304530 0.496 0.084 0.280 0.000 0.140
#> SRR1394231 2 0.5199 0.591586 0.004 0.548 0.000 0.412 0.036
#> SRR1488470 5 0.5732 0.434090 0.000 0.192 0.000 0.184 0.624
#> SRR1389497 3 0.4280 0.429178 0.120 0.084 0.788 0.008 0.000
#> SRR1367109 2 0.5463 0.399718 0.228 0.668 0.092 0.012 0.000
#> SRR615311 4 0.6491 0.261771 0.200 0.000 0.000 0.464 0.336
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR816015 2 0.3866 0.0951 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1380716 2 0.2191 0.7723 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120 0.000
#> SRR612803 1 0.3782 0.6640 0.588 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000
#> SRR613282 1 0.4705 0.6265 0.652 0.000 0.088 0.000 0.000 0.260
#> SRR1355396 1 0.3847 0.4245 0.644 0.000 0.008 0.000 0.348 0.000
#> SRR1084417 3 0.3175 0.7361 0.164 0.000 0.808 0.000 0.028 0.000
#> SRR1074359 4 0.3204 0.7815 0.032 0.004 0.000 0.820 0.144 0.000
#> SRR1419258 3 0.0632 0.7836 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403366 6 0.0551 0.8317 0.008 0.004 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR665262 5 0.4243 0.2266 0.008 0.004 0.000 0.004 0.592 0.392
#> SRR1499740 1 0.6461 -0.3672 0.344 0.000 0.320 0.004 0.324 0.008
#> SRR1105057 5 0.3864 0.0298 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1439742 1 0.4601 0.7057 0.628 0.000 0.312 0.000 0.000 0.060
#> SRR614599 5 0.1232 0.6584 0.024 0.004 0.016 0.000 0.956 0.000
#> SRR612215 2 0.2692 0.7465 0.012 0.840 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1094051 1 0.4079 0.7425 0.680 0.000 0.288 0.000 0.000 0.032
#> SRR1324496 1 0.2941 0.7477 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393449 3 0.2249 0.7633 0.064 0.000 0.900 0.000 0.004 0.032
#> SRR1409263 3 0.1563 0.7606 0.056 0.000 0.932 0.000 0.000 0.012
#> SRR1431288 1 0.3104 0.7136 0.800 0.000 0.184 0.000 0.016 0.000
#> SRR1334889 6 0.6666 0.2106 0.044 0.172 0.360 0.004 0.000 0.420
#> SRR614839 2 0.1465 0.7954 0.004 0.948 0.024 0.000 0.004 0.020
#> SRR658433 6 0.4479 0.3644 0.004 0.336 0.000 0.000 0.036 0.624
#> SRR1088581 4 0.0603 0.9023 0.004 0.000 0.016 0.980 0.000 0.000
#> SRR1328797 3 0.1010 0.7873 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000
#> SRR1334512 2 0.5082 0.5818 0.004 0.652 0.000 0.100 0.236 0.008
#> SRR1471117 1 0.3706 0.6870 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311553 1 0.3464 0.7286 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458220 2 0.3446 0.5571 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1354955 3 0.6876 0.4576 0.348 0.000 0.416 0.020 0.184 0.032
#> SRR654802 3 0.0937 0.7715 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR660066 2 0.1075 0.8022 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1447103 5 0.4219 0.6220 0.152 0.052 0.032 0.000 0.764 0.000
#> SRR1402153 3 0.2030 0.7669 0.028 0.064 0.908 0.000 0.000 0.000
#> SRR655887 2 0.2908 0.7527 0.004 0.840 0.000 0.008 0.140 0.008
#> SRR1408529 3 0.0632 0.7798 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR658707 1 0.4044 0.6302 0.704 0.000 0.040 0.000 0.000 0.256
#> SRR1384371 3 0.4819 0.4182 0.032 0.380 0.572 0.000 0.016 0.000
#> SRR1074670 3 0.5933 0.5315 0.176 0.000 0.532 0.016 0.276 0.000
#> SRR1375439 5 0.0982 0.6616 0.004 0.004 0.000 0.020 0.968 0.004
#> SRR1329003 4 0.1075 0.8922 0.000 0.000 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR1404837 5 0.3544 0.6168 0.132 0.012 0.008 0.032 0.816 0.000
#> SRR1317920 4 0.1155 0.8954 0.036 0.000 0.004 0.956 0.000 0.004
#> SRR1455525 4 0.0551 0.9035 0.004 0.004 0.008 0.984 0.000 0.000
#> SRR613999 1 0.3464 0.5410 0.688 0.000 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1310836 1 0.3531 0.7244 0.672 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499764 1 0.3349 0.7539 0.748 0.000 0.244 0.000 0.000 0.008
#> SRR658200 6 0.0508 0.8308 0.012 0.000 0.000 0.000 0.004 0.984
#> SRR1068855 1 0.3647 0.6988 0.640 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375509 3 0.1714 0.7732 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000
#> SRR612227 5 0.4103 0.5416 0.192 0.000 0.040 0.004 0.752 0.012
#> SRR1388809 5 0.5456 0.0109 0.000 0.440 0.000 0.004 0.452 0.104
#> SRR1413872 4 0.0458 0.9033 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1452864 4 0.2149 0.8575 0.080 0.000 0.004 0.900 0.000 0.016
#> SRR1473078 5 0.3652 0.5780 0.124 0.004 0.064 0.004 0.804 0.000
#> SRR615814 6 0.0551 0.8320 0.008 0.004 0.000 0.000 0.004 0.984
#> SRR1325225 4 0.1625 0.8852 0.060 0.000 0.012 0.928 0.000 0.000
#> SRR1313687 5 0.3525 0.6343 0.004 0.180 0.032 0.000 0.784 0.000
#> SRR1358220 2 0.2883 0.6935 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1096662 2 0.5511 0.3533 0.004 0.548 0.000 0.100 0.008 0.340
#> SRR1487746 1 0.4252 0.6982 0.724 0.000 0.088 0.000 0.000 0.188
#> SRR1354644 1 0.4135 0.7326 0.668 0.000 0.300 0.000 0.000 0.032
#> SRR1401752 5 0.3314 0.6046 0.012 0.224 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR660164 2 0.2196 0.7459 0.004 0.884 0.000 0.004 0.000 0.108
#> SRR815783 5 0.2051 0.6572 0.012 0.020 0.000 0.004 0.920 0.044
#> SRR809595 6 0.5516 0.0257 0.004 0.388 0.000 0.000 0.116 0.492
#> SRR1403133 5 0.1753 0.6745 0.004 0.084 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR815470 4 0.3050 0.7047 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR1344382 1 0.3575 0.5837 0.708 0.000 0.008 0.000 0.000 0.284
#> SRR1432453 5 0.0858 0.6612 0.000 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1478362 4 0.3668 0.4897 0.004 0.000 0.000 0.668 0.328 0.000
#> SRR1392186 2 0.6621 0.2289 0.020 0.464 0.044 0.008 0.084 0.380
#> SRR1347937 1 0.3782 0.4753 0.636 0.000 0.004 0.000 0.000 0.360
#> SRR1431569 1 0.3313 0.7402 0.816 0.000 0.124 0.000 0.000 0.060
#> SRR1471594 1 0.2728 0.7065 0.864 0.000 0.100 0.004 0.032 0.000
#> SRR1354270 5 0.6763 0.1719 0.196 0.000 0.188 0.104 0.512 0.000
#> SRR612683 2 0.0798 0.8080 0.004 0.976 0.000 0.004 0.012 0.004
#> SRR1392901 4 0.6766 0.1831 0.004 0.240 0.308 0.412 0.036 0.000
#> SRR1077805 3 0.3054 0.7485 0.136 0.000 0.828 0.000 0.036 0.000
#> SRR1360402 2 0.2823 0.7012 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1406112 3 0.5739 0.5266 0.336 0.000 0.500 0.000 0.160 0.004
#> SRR1355352 3 0.0937 0.7711 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR656247 6 0.0692 0.8308 0.020 0.004 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR813656 6 0.0291 0.8317 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR808244 3 0.2768 0.6946 0.012 0.000 0.832 0.156 0.000 0.000
#> SRR1387240 2 0.0291 0.8074 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1408595 5 0.3483 0.5431 0.236 0.016 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1385277 4 0.0291 0.9038 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1435248 5 0.3565 0.5366 0.004 0.276 0.000 0.004 0.716 0.000
#> SRR1419110 5 0.2877 0.6448 0.012 0.168 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1408682 5 0.3329 0.5849 0.004 0.236 0.000 0.004 0.756 0.000
#> SRR1317134 1 0.3081 0.7506 0.776 0.000 0.220 0.000 0.004 0.000
#> SRR1370780 1 0.4098 0.5781 0.676 0.000 0.032 0.000 0.000 0.292
#> SRR1489307 5 0.3290 0.6203 0.016 0.208 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1453911 2 0.2239 0.7796 0.072 0.900 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR603164 5 0.1053 0.6614 0.020 0.004 0.012 0.000 0.964 0.000
#> SRR1383259 4 0.1007 0.8918 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1330854 3 0.1663 0.7710 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452423 1 0.4135 0.5691 0.668 0.000 0.032 0.000 0.000 0.300
#> SRR1368574 2 0.0436 0.8070 0.004 0.988 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1468162 1 0.2793 0.7522 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331220 5 0.6016 0.2123 0.312 0.012 0.148 0.008 0.520 0.000
#> SRR1361546 2 0.0000 0.8072 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486156 1 0.3052 0.7515 0.780 0.000 0.216 0.000 0.004 0.000
#> SRR660545 2 0.2684 0.7820 0.008 0.880 0.008 0.008 0.008 0.088
#> SRR615635 2 0.4127 0.0751 0.004 0.508 0.000 0.004 0.484 0.000
#> SRR1385411 2 0.3532 0.7222 0.000 0.828 0.092 0.044 0.000 0.036
#> SRR1342739 1 0.2706 0.7429 0.832 0.000 0.160 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102830 3 0.5889 0.6315 0.176 0.000 0.632 0.004 0.068 0.120
#> SRR662126 6 0.0914 0.8312 0.016 0.016 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1464601 5 0.3175 0.5790 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1071594 2 0.1340 0.7931 0.008 0.948 0.040 0.000 0.004 0.000
#> SRR612539 6 0.4175 0.5753 0.008 0.032 0.000 0.004 0.236 0.720
#> SRR602010 2 0.0937 0.8050 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR810249 5 0.3383 0.5491 0.004 0.268 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR818773 2 0.0881 0.8037 0.012 0.972 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1336569 1 0.3620 0.7117 0.648 0.000 0.352 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368117 2 0.0891 0.8079 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000
#> SRR1442754 3 0.1728 0.7553 0.064 0.000 0.924 0.004 0.000 0.008
#> SRR1334247 3 0.4113 0.7111 0.192 0.056 0.744 0.000 0.008 0.000
#> SRR661639 1 0.3555 0.7468 0.712 0.000 0.280 0.000 0.000 0.008
#> SRR613222 6 0.0291 0.8320 0.004 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1459937 4 0.0436 0.9039 0.004 0.000 0.004 0.988 0.004 0.000
#> SRR2185018 6 0.0632 0.8292 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR655732 6 0.0692 0.8301 0.004 0.020 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR809348 6 0.3737 0.2100 0.392 0.000 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR819261 3 0.5811 0.5639 0.208 0.000 0.556 0.012 0.224 0.000
#> SRR661074 6 0.0458 0.8311 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1349851 5 0.3706 0.2490 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1405123 4 0.0951 0.9035 0.008 0.004 0.020 0.968 0.000 0.000
#> SRR661096 2 0.0458 0.8073 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1320225 1 0.4672 0.7047 0.648 0.000 0.300 0.004 0.036 0.012
#> SRR1454651 4 0.1141 0.8898 0.000 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR1307677 2 0.1152 0.7968 0.000 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1466512 2 0.0972 0.8060 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008 0.000
#> SRR658212 2 0.3797 0.2846 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1430525 3 0.3250 0.6953 0.004 0.000 0.788 0.012 0.196 0.000
#> SRR1344422 6 0.3500 0.6509 0.000 0.000 0.000 0.204 0.028 0.768
#> SRR1353924 5 0.2845 0.6349 0.004 0.172 0.000 0.004 0.820 0.000
#> SRR1314832 3 0.3212 0.7320 0.180 0.000 0.800 0.004 0.016 0.000
#> SRR1487570 4 0.0551 0.9035 0.008 0.004 0.004 0.984 0.000 0.000
#> SRR627431 2 0.0622 0.8073 0.000 0.980 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1418561 1 0.7686 -0.3859 0.348 0.000 0.336 0.024 0.112 0.180
#> SRR1448029 5 0.3737 0.6224 0.064 0.036 0.084 0.000 0.816 0.000
#> SRR813802 6 0.6078 -0.2040 0.320 0.000 0.284 0.000 0.000 0.396
#> SRR815020 1 0.3828 0.5774 0.696 0.000 0.012 0.000 0.004 0.288
#> SRR1309702 2 0.0603 0.8068 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1435311 5 0.1382 0.6758 0.008 0.036 0.008 0.000 0.948 0.000
#> SRR612395 6 0.1065 0.8296 0.008 0.008 0.000 0.000 0.020 0.964
#> SRR603116 2 0.2664 0.7192 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1323152 5 0.6229 0.2388 0.312 0.000 0.116 0.056 0.516 0.000
#> SRR1368264 2 0.0653 0.8078 0.004 0.980 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1326624 1 0.3827 0.5736 0.820 0.000 0.060 0.036 0.008 0.076
#> SRR1429265 3 0.1204 0.7849 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327702 1 0.3014 0.7213 0.804 0.000 0.184 0.000 0.012 0.000
#> SRR615611 2 0.3737 0.2947 0.000 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1486799 1 0.2969 0.7522 0.776 0.000 0.224 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096174 4 0.1584 0.8860 0.064 0.008 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR815044 6 0.4096 0.0691 0.000 0.484 0.000 0.008 0.000 0.508
#> SRR1338560 2 0.2001 0.7876 0.000 0.900 0.000 0.004 0.092 0.004
#> SRR615862 2 0.2212 0.7580 0.000 0.880 0.000 0.008 0.000 0.112
#> SRR1480038 5 0.3841 0.3374 0.004 0.380 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR659436 6 0.0603 0.8313 0.016 0.004 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR613699 6 0.0547 0.8292 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1436563 1 0.3163 0.7516 0.764 0.000 0.232 0.000 0.004 0.000
#> SRR615323 2 0.2848 0.7475 0.008 0.828 0.000 0.004 0.160 0.000
#> SRR1330327 4 0.0622 0.9043 0.008 0.012 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1489950 5 0.2964 0.6166 0.004 0.204 0.000 0.000 0.792 0.000
#> SRR1431927 1 0.3912 0.7114 0.648 0.000 0.340 0.000 0.000 0.012
#> SRR1100588 3 0.6311 0.5089 0.256 0.000 0.484 0.004 0.240 0.016
#> SRR1444002 1 0.3819 0.6881 0.624 0.000 0.372 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318444 4 0.2144 0.8717 0.012 0.000 0.008 0.908 0.068 0.004
#> SRR600656 4 0.0551 0.9030 0.004 0.008 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR658766 6 0.4123 0.7061 0.136 0.000 0.060 0.016 0.008 0.780
#> SRR655946 6 0.0508 0.8302 0.004 0.000 0.012 0.000 0.000 0.984
#> SRR817282 1 0.3883 0.5215 0.656 0.000 0.012 0.000 0.000 0.332
#> SRR1475104 3 0.2128 0.7642 0.056 0.004 0.908 0.000 0.032 0.000
#> SRR1406418 1 0.3023 0.7532 0.784 0.000 0.212 0.000 0.004 0.000
#> SRR1090265 1 0.2265 0.6456 0.900 0.000 0.068 0.000 0.024 0.008
#> SRR1444120 2 0.0725 0.8045 0.012 0.976 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471965 1 0.3190 0.7540 0.772 0.000 0.220 0.000 0.000 0.008
#> SRR612695 3 0.5274 0.6087 0.320 0.024 0.600 0.008 0.048 0.000
#> SRR662498 6 0.0603 0.8304 0.016 0.000 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR1376764 3 0.3314 0.6189 0.004 0.256 0.740 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377006 5 0.3290 0.5815 0.024 0.000 0.116 0.020 0.836 0.004
#> SRR656860 2 0.2271 0.7663 0.004 0.904 0.004 0.056 0.000 0.032
#> SRR1480547 2 0.3861 0.4910 0.000 0.672 0.008 0.004 0.000 0.316
#> SRR1452515 5 0.6044 0.5032 0.156 0.028 0.028 0.108 0.660 0.020
#> SRR1324390 2 0.3198 0.6287 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR615273 6 0.3128 0.7411 0.052 0.008 0.096 0.000 0.000 0.844
#> SRR601695 2 0.1686 0.7931 0.000 0.924 0.000 0.064 0.012 0.000
#> SRR820907 2 0.1584 0.7989 0.000 0.928 0.000 0.008 0.064 0.000
#> SRR812773 5 0.4593 0.4573 0.276 0.000 0.028 0.020 0.672 0.004
#> SRR1405984 5 0.1542 0.6802 0.008 0.052 0.004 0.000 0.936 0.000
#> SRR1472794 5 0.4357 -0.0417 0.004 0.492 0.000 0.008 0.492 0.004
#> SRR1365448 1 0.3991 0.5402 0.524 0.000 0.472 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095720 3 0.3368 0.7059 0.028 0.124 0.828 0.004 0.000 0.016
#> SRR1435626 5 0.4653 0.4155 0.260 0.000 0.072 0.004 0.664 0.000
#> SRR1080766 5 0.3996 0.3240 0.004 0.388 0.000 0.004 0.604 0.000
#> SRR1377862 1 0.2173 0.6406 0.904 0.000 0.064 0.004 0.028 0.000
#> SRR1332299 3 0.2100 0.7693 0.112 0.000 0.884 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467966 3 0.6246 0.4401 0.292 0.000 0.432 0.004 0.268 0.004
#> SRR1320579 4 0.1621 0.8864 0.004 0.000 0.048 0.936 0.008 0.004
#> SRR1319710 2 0.2912 0.6854 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1326604 2 0.3864 0.6969 0.024 0.776 0.000 0.020 0.004 0.176
#> SRR1098879 3 0.0790 0.7754 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR662245 6 0.0508 0.8312 0.004 0.012 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1074719 5 0.1765 0.6717 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR816226 1 0.6632 0.1719 0.512 0.160 0.044 0.272 0.004 0.008
#> SRR601387 5 0.3997 0.0169 0.004 0.488 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR614575 6 0.1716 0.8198 0.028 0.036 0.000 0.000 0.004 0.932
#> SRR1353900 2 0.0405 0.8076 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR662906 3 0.6324 0.3300 0.004 0.160 0.584 0.040 0.200 0.012
#> SRR1350832 2 0.4172 0.5524 0.004 0.676 0.000 0.004 0.296 0.020
#> SRR1403280 2 0.0870 0.8091 0.000 0.972 0.000 0.004 0.012 0.012
#> SRR1313969 4 0.0291 0.9034 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1388528 1 0.4332 0.5976 0.672 0.000 0.276 0.000 0.052 0.000
#> SRR1452912 1 0.3547 0.7242 0.668 0.000 0.332 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400180 5 0.4307 0.5317 0.204 0.000 0.024 0.032 0.736 0.004
#> SRR655399 3 0.1616 0.7746 0.020 0.000 0.932 0.000 0.000 0.048
#> SRR1319753 2 0.0665 0.8068 0.008 0.980 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR818901 3 0.4799 0.5958 0.036 0.048 0.688 0.000 0.000 0.228
#> SRR607067 2 0.1218 0.8054 0.004 0.956 0.000 0.028 0.012 0.000
#> SRR1391420 1 0.3323 0.7543 0.752 0.000 0.240 0.000 0.000 0.008
#> SRR1384138 2 0.2706 0.7240 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR661961 6 0.5264 0.5830 0.224 0.016 0.068 0.000 0.024 0.668
#> SRR658259 2 0.1644 0.7732 0.004 0.920 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1310476 1 0.3515 0.5223 0.676 0.000 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1452696 2 0.1444 0.7967 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1365034 2 0.1434 0.8015 0.000 0.940 0.000 0.048 0.012 0.000
#> SRR1478053 2 0.4103 0.1959 0.004 0.544 0.000 0.004 0.448 0.000
#> SRR1475300 5 0.3930 0.3799 0.004 0.364 0.000 0.004 0.628 0.000
#> SRR1328101 5 0.3271 0.6006 0.008 0.232 0.000 0.000 0.760 0.000
#> SRR1322900 3 0.6402 0.5408 0.308 0.056 0.496 0.000 0.140 0.000
#> SRR1309942 2 0.0436 0.8069 0.004 0.988 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1345760 4 0.0508 0.9041 0.004 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1435418 1 0.3652 0.7274 0.672 0.000 0.324 0.000 0.004 0.000
#> SRR1402172 4 0.2100 0.8435 0.004 0.112 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1443436 1 0.3192 0.7562 0.776 0.000 0.216 0.000 0.004 0.004
#> SRR661675 5 0.1588 0.6765 0.004 0.072 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR661469 6 0.0622 0.8302 0.012 0.000 0.000 0.000 0.008 0.980
#> SRR1500323 2 0.3976 0.4008 0.004 0.612 0.000 0.004 0.380 0.000
#> SRR1356705 5 0.4124 0.0249 0.004 0.476 0.000 0.004 0.516 0.000
#> SRR1464915 1 0.2060 0.6945 0.900 0.000 0.084 0.000 0.016 0.000
#> SRR1312406 5 0.5147 0.3663 0.320 0.000 0.056 0.008 0.604 0.012
#> SRR1350435 1 0.4694 0.2342 0.652 0.000 0.288 0.016 0.044 0.000
#> SRR1389177 3 0.6135 0.6155 0.200 0.124 0.616 0.020 0.036 0.004
#> SRR1368072 5 0.3647 0.3902 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR601815 2 0.1556 0.7924 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR613330 1 0.3877 0.6716 0.748 0.000 0.040 0.000 0.004 0.208
#> SRR1434502 6 0.4483 0.4795 0.040 0.000 0.000 0.004 0.320 0.636
#> SRR1394190 1 0.2886 0.7432 0.836 0.000 0.144 0.000 0.004 0.016
#> SRR1481083 1 0.4139 0.7054 0.640 0.000 0.336 0.000 0.000 0.024
#> SRR816382 5 0.2032 0.6635 0.024 0.020 0.036 0.000 0.920 0.000
#> SRR1318839 3 0.0713 0.7889 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432390 4 0.1897 0.8596 0.004 0.084 0.000 0.908 0.004 0.000
#> SRR613126 5 0.3967 0.5622 0.016 0.252 0.000 0.008 0.720 0.004
#> SRR1089424 2 0.0000 0.8072 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347214 2 0.3747 0.3762 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR1309556 5 0.3972 0.5119 0.232 0.000 0.028 0.004 0.732 0.004
#> SRR1456027 4 0.0551 0.9035 0.004 0.004 0.008 0.984 0.000 0.000
#> SRR1400551 5 0.5750 -0.2393 0.172 0.000 0.380 0.000 0.448 0.000
#> SRR1320469 3 0.1204 0.7623 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR614251 2 0.1116 0.7951 0.004 0.960 0.028 0.000 0.000 0.008
#> SRR1454310 2 0.3409 0.5517 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR615105 4 0.0696 0.9023 0.004 0.004 0.000 0.980 0.008 0.004
#> SRR1433290 3 0.1075 0.7852 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166064 6 0.1644 0.7892 0.004 0.000 0.000 0.076 0.000 0.920
#> SRR601671 2 0.0551 0.8046 0.004 0.984 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR663874 6 0.0653 0.8327 0.004 0.012 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR1409130 2 0.2312 0.7900 0.004 0.896 0.000 0.008 0.080 0.012
#> SRR659696 4 0.2700 0.7909 0.004 0.156 0.000 0.836 0.004 0.000
#> SRR1408249 2 0.1493 0.7854 0.004 0.936 0.000 0.056 0.000 0.004
#> SRR663284 6 0.0363 0.8314 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1402794 5 0.6856 0.3662 0.188 0.000 0.060 0.064 0.572 0.116
#> SRR614852 4 0.0508 0.9041 0.004 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1348040 5 0.4638 0.4083 0.320 0.000 0.032 0.016 0.632 0.000
#> SRR1489610 2 0.2941 0.6807 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1488091 5 0.3198 0.5593 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1499566 5 0.3728 0.4156 0.004 0.344 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1361480 5 0.4189 0.1721 0.004 0.436 0.000 0.008 0.552 0.000
#> SRR1444501 3 0.0713 0.7889 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415773 5 0.1116 0.6724 0.008 0.028 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1388832 6 0.5701 0.4764 0.272 0.000 0.092 0.000 0.044 0.592
#> SRR1394637 3 0.4646 0.5870 0.324 0.000 0.616 0.000 0.060 0.000
#> SRR606974 2 0.0291 0.8063 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR662918 6 0.0146 0.8319 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR817421 3 0.0692 0.7845 0.020 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000
#> SRR1400823 1 0.3909 0.7546 0.720 0.000 0.244 0.000 0.000 0.036
#> SRR1381348 2 0.3794 0.6177 0.000 0.724 0.000 0.248 0.028 0.000
#> SRR608264 3 0.2608 0.7741 0.080 0.000 0.872 0.000 0.048 0.000
#> SRR1318560 3 0.1387 0.7635 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454117 2 0.3983 0.4616 0.008 0.640 0.000 0.004 0.348 0.000
#> SRR1312684 1 0.3576 0.5953 0.824 0.000 0.024 0.076 0.076 0.000
#> SRR615044 6 0.4408 0.7131 0.032 0.036 0.040 0.000 0.108 0.784
#> SRR1432743 3 0.2706 0.7667 0.124 0.000 0.852 0.000 0.024 0.000
#> SRR1388873 5 0.3905 0.3891 0.004 0.356 0.000 0.004 0.636 0.000
#> SRR1353517 1 0.2164 0.6413 0.900 0.000 0.068 0.000 0.032 0.000
#> SRR1357148 5 0.6669 -0.1623 0.244 0.036 0.320 0.000 0.400 0.000
#> SRR1406008 2 0.5919 0.4252 0.028 0.572 0.000 0.000 0.176 0.224
#> SRR1396786 5 0.1918 0.6755 0.008 0.088 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR1446564 1 0.4353 0.6933 0.612 0.000 0.360 0.004 0.024 0.000
#> SRR1318465 3 0.4936 0.6269 0.304 0.004 0.632 0.028 0.032 0.000
#> SRR1431083 1 0.3163 0.7511 0.764 0.000 0.232 0.000 0.004 0.000
#> SRR607117 4 0.3244 0.6716 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR655170 2 0.0692 0.8045 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1087825 4 0.0405 0.9037 0.004 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR662019 3 0.3202 0.7332 0.040 0.000 0.816 0.144 0.000 0.000
#> SRR1349209 4 0.2882 0.8579 0.068 0.000 0.024 0.876 0.024 0.008
#> SRR1326161 5 0.3290 0.5647 0.004 0.252 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1345284 2 0.3772 0.5256 0.004 0.672 0.000 0.004 0.320 0.000
#> SRR1416672 1 0.3699 0.7179 0.660 0.000 0.336 0.000 0.000 0.004
#> SRR663356 5 0.3444 0.6328 0.008 0.168 0.000 0.020 0.800 0.004
#> SRR1454328 5 0.3636 0.4657 0.000 0.320 0.000 0.000 0.676 0.004
#> SRR1489286 1 0.3727 0.6828 0.612 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092349 5 0.1065 0.6634 0.020 0.008 0.008 0.000 0.964 0.000
#> SRR1408183 3 0.6548 0.2768 0.308 0.000 0.340 0.008 0.336 0.008
#> SRR1084369 5 0.5274 0.0433 0.036 0.024 0.384 0.000 0.548 0.008
#> SRR598452 3 0.1307 0.7772 0.032 0.000 0.952 0.008 0.000 0.008
#> SRR660709 6 0.1873 0.8073 0.048 0.000 0.000 0.020 0.008 0.924
#> SRR809444 1 0.3161 0.5476 0.840 0.000 0.076 0.004 0.080 0.000
#> SRR1089901 5 0.1956 0.6749 0.008 0.080 0.000 0.004 0.908 0.000
#> SRR1375774 1 0.3196 0.5874 0.828 0.000 0.064 0.000 0.108 0.000
#> SRR1326292 4 0.0937 0.8958 0.000 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR657139 3 0.3037 0.7374 0.176 0.000 0.808 0.000 0.016 0.000
#> SRR1440744 2 0.0551 0.8064 0.004 0.984 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1353555 1 0.3731 0.7575 0.736 0.000 0.240 0.000 0.004 0.020
#> SRR1323087 1 0.3829 0.6395 0.760 0.000 0.180 0.000 0.060 0.000
#> SRR1452334 4 0.0862 0.9037 0.016 0.008 0.000 0.972 0.000 0.004
#> SRR1381775 1 0.3076 0.6159 0.860 0.000 0.008 0.068 0.056 0.008
#> SRR1363908 1 0.3619 0.7355 0.680 0.000 0.316 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319626 2 0.2737 0.7406 0.004 0.832 0.000 0.004 0.160 0.000
#> SRR658989 1 0.7454 -0.2401 0.344 0.000 0.152 0.004 0.160 0.340
#> SRR1353663 1 0.3695 0.6936 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000 0.000
#> SRR811771 1 0.3647 0.7051 0.640 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000
#> SRR813983 1 0.3081 0.7539 0.776 0.000 0.220 0.000 0.000 0.004
#> SRR815825 3 0.1341 0.7871 0.028 0.000 0.948 0.024 0.000 0.000
#> SRR819054 2 0.3717 0.3982 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1367988 4 0.0777 0.9017 0.004 0.024 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1331922 6 0.4555 0.6384 0.236 0.000 0.016 0.004 0.044 0.700
#> SRR615479 2 0.4517 0.5824 0.140 0.728 0.124 0.000 0.004 0.004
#> SRR1375796 2 0.0291 0.8060 0.004 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1386991 5 0.1262 0.6614 0.020 0.008 0.016 0.000 0.956 0.000
#> SRR1355217 2 0.1956 0.7668 0.004 0.920 0.060 0.008 0.004 0.004
#> SRR1356290 2 0.5402 0.5921 0.008 0.668 0.088 0.012 0.208 0.016
#> SRR659507 6 0.4965 0.2827 0.012 0.040 0.000 0.004 0.368 0.576
#> SRR663296 6 0.0260 0.8316 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR598044 2 0.3050 0.6600 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR661155 4 0.0653 0.9028 0.004 0.004 0.000 0.980 0.000 0.012
#> SRR1414727 6 0.0508 0.8308 0.012 0.000 0.000 0.000 0.004 0.984
#> SRR663477 1 0.5149 -0.2073 0.544 0.000 0.388 0.020 0.048 0.000
#> SRR1354489 3 0.4940 0.6692 0.240 0.032 0.676 0.004 0.048 0.000
#> SRR1377800 5 0.3206 0.5681 0.028 0.004 0.152 0.000 0.816 0.000
#> SRR614611 2 0.4327 0.2151 0.004 0.544 0.000 0.008 0.440 0.004
#> SRR655052 4 0.1265 0.8952 0.044 0.008 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1478968 4 0.0405 0.9039 0.004 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1351280 2 0.3717 0.3263 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR613951 4 0.5326 0.7056 0.112 0.124 0.064 0.696 0.004 0.000
#> SRR1418022 1 0.2595 0.7385 0.836 0.000 0.160 0.000 0.004 0.000
#> SRR661901 4 0.3357 0.8388 0.060 0.000 0.064 0.848 0.020 0.008
#> SRR1408161 1 0.2744 0.7154 0.840 0.000 0.144 0.000 0.016 0.000
#> SRR657054 6 0.0603 0.8304 0.016 0.000 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR655040 4 0.5247 0.6836 0.204 0.004 0.020 0.688 0.060 0.024
#> SRR810225 2 0.3706 0.4072 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1325377 2 0.1700 0.7919 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR617829 3 0.3586 0.7559 0.128 0.000 0.812 0.028 0.032 0.000
#> SRR1402328 5 0.3515 0.4860 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1480455 5 0.4420 0.4076 0.008 0.348 0.000 0.008 0.624 0.012
#> SRR1442104 3 0.1088 0.7784 0.024 0.000 0.960 0.016 0.000 0.000
#> SRR1453416 1 0.4105 0.7024 0.632 0.000 0.348 0.000 0.020 0.000
#> SRR1481396 3 0.2910 0.7673 0.068 0.000 0.852 0.000 0.080 0.000
#> SRR1414314 5 0.4107 0.1008 0.004 0.452 0.000 0.004 0.540 0.000
#> SRR663026 2 0.0547 0.8069 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1478386 2 0.3245 0.6732 0.000 0.764 0.000 0.008 0.228 0.000
#> SRR1458683 4 0.1194 0.8973 0.004 0.008 0.032 0.956 0.000 0.000
#> SRR1370572 1 0.3000 0.7452 0.824 0.000 0.156 0.000 0.004 0.016
#> SRR1467567 1 0.2520 0.7407 0.844 0.000 0.152 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468532 6 0.5991 0.4567 0.012 0.028 0.000 0.124 0.252 0.584
#> SRR1310735 1 0.3409 0.7401 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440101 4 0.0291 0.9034 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR660260 6 0.0260 0.8320 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1071231 5 0.4002 0.3458 0.008 0.404 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1459125 5 0.6349 0.1507 0.196 0.000 0.028 0.308 0.468 0.000
#> SRR1337173 5 0.5537 0.4424 0.176 0.004 0.020 0.148 0.648 0.004
#> SRR1396250 3 0.0713 0.7802 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166376 6 0.0291 0.8317 0.004 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR659816 6 0.0508 0.8306 0.012 0.000 0.000 0.000 0.004 0.984
#> SRR1401379 2 0.1863 0.7805 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR600981 4 0.1152 0.8894 0.004 0.044 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1398335 1 0.3464 0.7334 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397218 5 0.2806 0.6753 0.012 0.056 0.000 0.060 0.872 0.000
#> SRR660115 1 0.3727 0.4293 0.612 0.000 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1407950 2 0.2003 0.7741 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1359780 2 0.0291 0.8071 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490037 1 0.3288 0.7475 0.724 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000
#> SRR627439 6 0.0146 0.8319 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1397156 1 0.2946 0.7505 0.808 0.000 0.184 0.000 0.004 0.004
#> SRR1410221 5 0.1753 0.6753 0.004 0.084 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1319648 2 0.5560 0.5267 0.032 0.640 0.252 0.012 0.056 0.008
#> SRR1092985 3 0.1007 0.7687 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR656409 2 0.5122 0.6008 0.036 0.680 0.036 0.008 0.008 0.232
#> SRR1468658 4 0.0837 0.9019 0.004 0.004 0.020 0.972 0.000 0.000
#> SRR1390437 2 0.3530 0.6157 0.008 0.776 0.012 0.200 0.004 0.000
#> SRR658057 6 0.3534 0.6313 0.016 0.244 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR612635 2 0.0146 0.8067 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351480 2 0.0508 0.8082 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1436651 1 0.3215 0.7565 0.756 0.000 0.240 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441590 2 0.5606 0.0649 0.324 0.512 0.164 0.000 0.000 0.000
#> SRR659590 2 0.2473 0.7505 0.008 0.856 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR614263 6 0.3620 0.3296 0.352 0.000 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR1409575 2 0.0551 0.8064 0.004 0.984 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR659911 6 0.0982 0.8276 0.004 0.020 0.000 0.004 0.004 0.968
#> SRR1085519 3 0.1713 0.7873 0.044 0.000 0.928 0.000 0.028 0.000
#> SRR1345894 2 0.0458 0.8078 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1442928 5 0.2302 0.6648 0.008 0.120 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1464681 4 0.0458 0.9033 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1418880 1 0.3482 0.7240 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309070 5 0.6251 0.1604 0.156 0.000 0.028 0.308 0.504 0.004
#> SRR1365426 2 0.0603 0.8068 0.016 0.980 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487947 3 0.2121 0.7692 0.096 0.000 0.892 0.000 0.012 0.000
#> SRR659708 3 0.1578 0.7620 0.048 0.004 0.936 0.000 0.000 0.012
#> SRR603236 5 0.1237 0.6698 0.004 0.020 0.020 0.000 0.956 0.000
#> SRR660673 1 0.4447 0.7448 0.704 0.000 0.196 0.000 0.000 0.100
#> SRR1430729 5 0.3595 0.5356 0.008 0.288 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR663807 2 0.3468 0.5921 0.000 0.712 0.000 0.000 0.284 0.004
#> SRR1087245 2 0.0551 0.8083 0.000 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1339108 5 0.3641 0.6298 0.120 0.040 0.028 0.000 0.812 0.000
#> SRR613426 4 0.3585 0.7517 0.048 0.000 0.000 0.780 0.000 0.172
#> SRR613879 2 0.0696 0.8065 0.004 0.980 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1385101 2 0.0603 0.8041 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1387966 5 0.4103 0.1179 0.004 0.448 0.000 0.004 0.544 0.000
#> SRR1458852 2 0.0865 0.8059 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1430489 4 0.0603 0.9018 0.016 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1349231 1 0.2886 0.5837 0.876 0.028 0.032 0.000 0.060 0.004
#> SRR1376249 3 0.1010 0.7717 0.036 0.000 0.960 0.004 0.000 0.000
#> SRR1321987 2 0.3986 0.3841 0.004 0.608 0.000 0.004 0.384 0.000
#> SRR662653 2 0.2048 0.7714 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1390027 1 0.4203 0.7242 0.652 0.000 0.316 0.000 0.000 0.032
#> SRR1098474 2 0.1788 0.7767 0.004 0.916 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383081 2 0.0436 0.8053 0.004 0.988 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR2166960 6 0.0405 0.8318 0.004 0.008 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR605101 2 0.1411 0.8000 0.004 0.936 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR818600 6 0.3500 0.6371 0.000 0.204 0.000 0.000 0.028 0.768
#> SRR1367715 2 0.0717 0.8075 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1351979 3 0.0692 0.7892 0.020 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000
#> SRR1387054 3 0.3495 0.7461 0.128 0.004 0.808 0.000 0.060 0.000
#> SRR1444306 3 0.0790 0.7764 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322662 1 0.3488 0.7591 0.764 0.000 0.216 0.000 0.004 0.016
#> SRR665478 6 0.0363 0.8316 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR612767 1 0.5974 0.3400 0.528 0.164 0.000 0.288 0.000 0.020
#> SRR1489030 2 0.3508 0.5797 0.004 0.704 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1430375 2 0.5763 0.3940 0.008 0.552 0.000 0.004 0.284 0.152
#> SRR615225 4 0.0260 0.9037 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1401839 5 0.3489 0.6438 0.100 0.036 0.028 0.004 0.832 0.000
#> SRR1379110 2 0.2178 0.7584 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1077288 3 0.3134 0.7281 0.168 0.000 0.808 0.000 0.024 0.000
#> SRR1331639 4 0.0748 0.9027 0.004 0.016 0.000 0.976 0.004 0.000
#> SRR1342782 5 0.4009 0.3926 0.008 0.356 0.000 0.004 0.632 0.000
#> SRR1443003 3 0.3498 0.7432 0.044 0.108 0.824 0.000 0.024 0.000
#> SRR612839 3 0.1556 0.7744 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470093 4 0.6675 0.4013 0.200 0.000 0.164 0.528 0.108 0.000
#> SRR1395742 1 0.3665 0.7455 0.696 0.000 0.296 0.000 0.004 0.004
#> SRR1469014 1 0.3349 0.7543 0.748 0.000 0.244 0.000 0.008 0.000
#> SRR1387222 4 0.5736 0.4316 0.004 0.172 0.268 0.552 0.004 0.000
#> SRR664063 6 0.0820 0.8314 0.012 0.016 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1488214 1 0.2632 0.6180 0.832 0.000 0.000 0.000 0.004 0.164
#> SRR654766 4 0.0405 0.9039 0.004 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1320321 2 0.1501 0.7943 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1071955 1 0.3314 0.7489 0.740 0.000 0.256 0.000 0.004 0.000
#> SRR1417483 1 0.4593 0.7300 0.752 0.000 0.116 0.000 0.064 0.068
#> SRR1394231 2 0.0146 0.8071 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1488470 6 0.6810 -0.0283 0.020 0.404 0.104 0.008 0.044 0.420
#> SRR1389497 3 0.4732 0.6605 0.136 0.000 0.692 0.000 0.168 0.004
#> SRR1367109 5 0.4204 0.4740 0.272 0.000 0.028 0.004 0.692 0.004
#> SRR615311 4 0.3296 0.7416 0.020 0.004 0.000 0.796 0.000 0.180
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0