Date: 2019-12-25 22:49:39 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 17646 500
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| SD:hclust | 2 | 1.000 | 0.994 | 0.998 | ** | |
| SD:kmeans | 2 | 1.000 | 0.998 | 0.999 | ** | |
| SD:skmeans | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| SD:pam | 2 | 1.000 | 0.995 | 0.998 | ** | |
| SD:mclust | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| SD:NMF | 2 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | ** | |
| CV:hclust | 2 | 1.000 | 0.993 | 0.997 | ** | |
| CV:kmeans | 2 | 1.000 | 0.998 | 0.999 | ** | |
| CV:pam | 2 | 1.000 | 0.995 | 0.998 | ** | |
| CV:mclust | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| CV:NMF | 2 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | ** | |
| MAD:hclust | 2 | 1.000 | 0.993 | 0.997 | ** | |
| MAD:kmeans | 2 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | ** | |
| MAD:pam | 2 | 1.000 | 0.998 | 0.999 | ** | |
| ATC:hclust | 2 | 1.000 | 0.992 | 0.997 | ** | |
| ATC:kmeans | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| ATC:skmeans | 2 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | ** | |
| ATC:pam | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| MAD:mclust | 3 | 0.991 | 0.962 | 0.975 | ** | 2 |
| ATC:mclust | 3 | 0.951 | 0.961 | 0.944 | ** | 2 |
| MAD:NMF | 3 | 0.945 | 0.930 | 0.967 | * | 2 |
| MAD:skmeans | 5 | 0.933 | 0.902 | 0.947 | * | 2,3,4 |
| ATC:NMF | 3 | 0.907 | 0.884 | 0.955 | * | 2 |
| CV:skmeans | 4 | 0.900 | 0.875 | 0.938 | * | 2 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 1 0.999 1.000 0.436 0.565 0.565
#> CV:NMF 2 1 0.999 1.000 0.433 0.568 0.568
#> MAD:NMF 2 1 0.999 1.000 0.436 0.564 0.564
#> ATC:NMF 2 1 1.000 1.000 0.435 0.565 0.565
#> SD:skmeans 2 1 1.000 1.000 0.439 0.561 0.561
#> CV:skmeans 2 1 1.000 1.000 0.438 0.562 0.562
#> MAD:skmeans 2 1 1.000 1.000 0.439 0.561 0.561
#> ATC:skmeans 2 1 0.999 1.000 0.439 0.561 0.561
#> SD:mclust 2 1 1.000 1.000 0.432 0.568 0.568
#> CV:mclust 2 1 1.000 1.000 0.432 0.568 0.568
#> MAD:mclust 2 1 1.000 1.000 0.432 0.568 0.568
#> ATC:mclust 2 1 1.000 1.000 0.432 0.568 0.568
#> SD:kmeans 2 1 0.998 0.999 0.435 0.565 0.565
#> CV:kmeans 2 1 0.998 0.999 0.433 0.568 0.568
#> MAD:kmeans 2 1 0.999 1.000 0.436 0.565 0.565
#> ATC:kmeans 2 1 1.000 1.000 0.435 0.565 0.565
#> SD:pam 2 1 0.995 0.998 0.434 0.565 0.565
#> CV:pam 2 1 0.995 0.998 0.434 0.568 0.568
#> MAD:pam 2 1 0.998 0.999 0.436 0.565 0.565
#> ATC:pam 2 1 1.000 1.000 0.435 0.565 0.565
#> SD:hclust 2 1 0.994 0.998 0.434 0.568 0.568
#> CV:hclust 2 1 0.993 0.997 0.434 0.568 0.568
#> MAD:hclust 2 1 0.993 0.997 0.438 0.562 0.562
#> ATC:hclust 2 1 0.992 0.997 0.434 0.568 0.568
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.803 0.869 0.930 0.3624 0.823 0.688
#> CV:NMF 3 0.811 0.870 0.937 0.4365 0.801 0.649
#> MAD:NMF 3 0.945 0.930 0.967 0.4213 0.805 0.656
#> ATC:NMF 3 0.907 0.884 0.955 0.1630 0.936 0.887
#> SD:skmeans 3 0.787 0.905 0.926 0.4762 0.768 0.588
#> CV:skmeans 3 0.781 0.907 0.934 0.4839 0.769 0.590
#> MAD:skmeans 3 0.972 0.957 0.981 0.5194 0.768 0.588
#> ATC:skmeans 3 0.854 0.939 0.958 0.4684 0.777 0.602
#> SD:mclust 3 0.750 0.854 0.928 0.2291 0.958 0.926
#> CV:mclust 3 0.808 0.912 0.899 0.1558 0.951 0.913
#> MAD:mclust 3 0.991 0.962 0.975 0.1055 0.966 0.939
#> ATC:mclust 3 0.951 0.961 0.944 0.1043 0.954 0.919
#> SD:kmeans 3 0.683 0.875 0.830 0.3964 0.762 0.581
#> CV:kmeans 3 0.667 0.862 0.820 0.3933 0.765 0.586
#> MAD:kmeans 3 0.684 0.897 0.867 0.4175 0.771 0.594
#> ATC:kmeans 3 0.705 0.891 0.890 0.4019 0.779 0.610
#> SD:pam 3 0.702 0.876 0.859 0.4175 0.770 0.594
#> CV:pam 3 0.757 0.893 0.918 0.4894 0.765 0.586
#> MAD:pam 3 0.695 0.734 0.889 0.5158 0.771 0.594
#> ATC:pam 3 0.597 0.525 0.744 0.3537 0.831 0.701
#> SD:hclust 3 1.000 0.973 0.986 0.0628 0.981 0.967
#> CV:hclust 3 0.907 0.930 0.965 0.0983 0.984 0.971
#> MAD:hclust 3 0.991 0.971 0.977 0.0591 0.995 0.991
#> ATC:hclust 3 0.943 0.972 0.986 0.0563 0.984 0.971
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.661 0.747 0.843 0.12377 0.927 0.817
#> CV:NMF 4 0.823 0.860 0.917 0.12825 0.901 0.742
#> MAD:NMF 4 0.639 0.641 0.744 0.14776 0.832 0.583
#> ATC:NMF 4 0.702 0.766 0.851 0.20222 0.941 0.884
#> SD:skmeans 4 0.883 0.811 0.901 0.12615 0.905 0.730
#> CV:skmeans 4 0.900 0.875 0.938 0.12529 0.901 0.719
#> MAD:skmeans 4 0.910 0.905 0.954 0.10959 0.892 0.691
#> ATC:skmeans 4 0.727 0.670 0.833 0.13067 0.829 0.561
#> SD:mclust 4 0.741 0.776 0.851 0.09351 0.935 0.877
#> CV:mclust 4 0.852 0.864 0.920 0.18733 0.868 0.746
#> MAD:mclust 4 0.615 0.552 0.727 0.26142 0.807 0.639
#> ATC:mclust 4 0.746 0.923 0.899 0.16548 0.947 0.899
#> SD:kmeans 4 0.578 0.646 0.793 0.15616 0.941 0.835
#> CV:kmeans 4 0.613 0.837 0.822 0.13744 0.918 0.766
#> MAD:kmeans 4 0.670 0.581 0.764 0.14717 0.956 0.874
#> ATC:kmeans 4 0.634 0.655 0.773 0.13763 0.961 0.894
#> SD:pam 4 0.819 0.881 0.916 0.15394 0.914 0.760
#> CV:pam 4 0.703 0.864 0.888 0.08619 0.934 0.808
#> MAD:pam 4 0.621 0.441 0.679 0.08620 0.733 0.400
#> ATC:pam 4 0.702 0.746 0.856 0.20359 0.756 0.474
#> SD:hclust 4 0.964 0.960 0.980 0.01803 0.997 0.995
#> CV:hclust 4 0.891 0.864 0.942 0.05548 1.000 1.000
#> MAD:hclust 4 0.638 0.837 0.847 0.18687 0.997 0.995
#> ATC:hclust 4 0.943 0.966 0.987 0.00329 1.000 1.000
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.620 0.429 0.702 0.1077 0.962 0.889
#> CV:NMF 5 0.712 0.715 0.813 0.0776 0.872 0.616
#> MAD:NMF 5 0.624 0.532 0.725 0.0686 0.899 0.679
#> ATC:NMF 5 0.574 0.623 0.781 0.1507 0.823 0.624
#> SD:skmeans 5 0.807 0.830 0.885 0.0598 0.933 0.765
#> CV:skmeans 5 0.880 0.849 0.913 0.0649 0.908 0.686
#> MAD:skmeans 5 0.933 0.902 0.947 0.0525 0.910 0.682
#> ATC:skmeans 5 0.739 0.694 0.799 0.0451 0.884 0.619
#> SD:mclust 5 0.572 0.624 0.769 0.1793 0.791 0.566
#> CV:mclust 5 0.649 0.715 0.834 0.1160 0.948 0.871
#> MAD:mclust 5 0.531 0.574 0.714 0.1728 0.744 0.435
#> ATC:mclust 5 0.575 0.625 0.803 0.1794 0.862 0.708
#> SD:kmeans 5 0.670 0.602 0.718 0.0730 0.924 0.775
#> CV:kmeans 5 0.644 0.661 0.744 0.0947 0.926 0.748
#> MAD:kmeans 5 0.681 0.711 0.765 0.0784 0.860 0.588
#> ATC:kmeans 5 0.602 0.437 0.710 0.0756 0.920 0.771
#> SD:pam 5 0.817 0.819 0.899 0.0975 0.898 0.662
#> CV:pam 5 0.713 0.665 0.817 0.1031 0.915 0.717
#> MAD:pam 5 0.780 0.772 0.887 0.0991 0.829 0.488
#> ATC:pam 5 0.724 0.719 0.856 0.1010 0.850 0.540
#> SD:hclust 5 0.648 0.613 0.812 0.2057 0.907 0.831
#> CV:hclust 5 0.664 0.746 0.873 0.2201 0.838 0.708
#> MAD:hclust 5 0.627 0.792 0.877 0.1642 0.774 0.592
#> ATC:hclust 5 0.796 0.894 0.933 0.1151 1.000 1.000
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.655 0.658 0.766 0.0605 0.805 0.453
#> CV:NMF 6 0.713 0.651 0.793 0.0376 0.958 0.838
#> MAD:NMF 6 0.647 0.535 0.721 0.0536 0.869 0.548
#> ATC:NMF 6 0.598 0.628 0.748 0.0789 0.844 0.541
#> SD:skmeans 6 0.811 0.757 0.844 0.0417 0.945 0.777
#> CV:skmeans 6 0.794 0.716 0.752 0.0494 0.932 0.706
#> MAD:skmeans 6 0.816 0.728 0.851 0.0366 0.984 0.929
#> ATC:skmeans 6 0.706 0.497 0.723 0.0381 0.916 0.689
#> SD:mclust 6 0.556 0.538 0.710 0.0611 0.863 0.608
#> CV:mclust 6 0.594 0.604 0.754 0.1382 0.832 0.555
#> MAD:mclust 6 0.521 0.481 0.670 0.0902 0.850 0.541
#> ATC:mclust 6 0.522 0.541 0.703 0.1350 0.792 0.494
#> SD:kmeans 6 0.685 0.546 0.661 0.0574 0.878 0.583
#> CV:kmeans 6 0.700 0.624 0.713 0.0603 0.901 0.614
#> MAD:kmeans 6 0.672 0.601 0.678 0.0516 0.939 0.737
#> ATC:kmeans 6 0.589 0.351 0.534 0.0534 0.856 0.520
#> SD:pam 6 0.779 0.792 0.864 0.0379 0.968 0.856
#> CV:pam 6 0.693 0.646 0.755 0.0417 0.926 0.693
#> MAD:pam 6 0.834 0.783 0.879 0.0483 0.920 0.655
#> ATC:pam 6 0.716 0.578 0.776 0.0449 0.947 0.779
#> SD:hclust 6 0.620 0.726 0.835 0.1297 0.847 0.678
#> CV:hclust 6 0.620 0.724 0.790 0.1260 0.839 0.611
#> MAD:hclust 6 0.661 0.626 0.814 0.0995 0.868 0.657
#> ATC:hclust 6 0.610 0.782 0.872 0.2005 0.867 0.759
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 4000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 5000)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.994 0.998 0.4340 0.568 0.568
#> 3 3 1.000 0.973 0.986 0.0628 0.981 0.967
#> 4 4 0.964 0.960 0.980 0.0180 0.997 0.995
#> 5 5 0.648 0.613 0.812 0.2057 0.907 0.831
#> 6 6 0.620 0.726 0.835 0.1297 0.847 0.678
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 1 0.8661 0.600 0.712 0.288
#> SRR1398013 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.2603 0.952 0.956 0.044
#> SRR1313494 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.0376 0.993 0.996 0.004
#> SRR807775 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.1184 0.981 0.984 0.016
#> SRR1437256 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.8661 0.600 0.712 0.288
#> SRR1405413 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.8207 0.659 0.744 0.256
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 1 0.8661 0.600 0.712 0.288
#> SRR1074289 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1407449 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396859 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.1289 0.964 0.968 0.000 0.032
#> SRR1368141 1 0.2878 0.902 0.904 0.000 0.096
#> SRR1440268 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1369052 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.2878 0.902 0.904 0.000 0.096
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.2959 0.898 0.900 0.000 0.100
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR603212 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.3038 0.893 0.896 0.000 0.104
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.3267 0.879 0.884 0.000 0.116
#> SRR1445064 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452981 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0237 0.980 0.996 0.000 0.004
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR602082 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1420710 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR661064 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1337707 1 0.2796 0.907 0.908 0.000 0.092
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.4605 0.721 0.000 0.204 0.796
#> SRR1398013 1 0.0237 0.980 0.996 0.000 0.004
#> SRR1352918 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.2878 0.902 0.904 0.000 0.096
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.1529 0.779 0.040 0.000 0.960
#> SRR1313494 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400078 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1079434 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR1325559 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1383883 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.1529 0.958 0.960 0.000 0.040
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.3116 0.774 0.108 0.000 0.892
#> SRR807775 1 0.2261 0.931 0.932 0.000 0.068
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.0237 0.980 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR656794 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.1529 0.958 0.960 0.000 0.040
#> SRR1485912 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1407602 1 0.5397 0.569 0.720 0.000 0.280
#> SRR1356164 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1328692 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR1362438 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.3267 0.879 0.884 0.000 0.116
#> SRR1358041 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368200 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.2356 0.786 0.072 0.000 0.928
#> SRR1437256 1 0.2878 0.902 0.904 0.000 0.096
#> SRR1487446 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1382934 1 0.3619 0.854 0.864 0.000 0.136
#> SRR1465208 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR1409600 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR810783 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1333990 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR808106 1 0.0237 0.980 0.996 0.000 0.004
#> SRR662713 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR809382 1 0.2448 0.923 0.924 0.000 0.076
#> SRR665417 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 1 0.3340 0.874 0.880 0.000 0.120
#> SRR1413787 3 0.6168 0.299 0.412 0.000 0.588
#> SRR1478207 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1411046 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319221 3 0.4605 0.721 0.000 0.204 0.796
#> SRR1405413 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR607807 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.3038 0.893 0.896 0.000 0.104
#> SRR1406283 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1361612 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.3267 0.879 0.884 0.000 0.116
#> SRR1332879 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.9829 -0.439 0.400 0.248 0.352
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.3686 0.848 0.860 0.000 0.140
#> SRR1344253 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1384290 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.2356 0.927 0.928 0.000 0.072
#> SRR818372 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1310031 1 0.2537 0.919 0.920 0.000 0.080
#> SRR615419 1 0.2878 0.902 0.904 0.000 0.096
#> SRR1436925 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1442949 1 0.1411 0.959 0.964 0.000 0.036
#> SRR1466239 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.1964 0.942 0.944 0.000 0.056
#> SRR660522 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR815374 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1316438 1 0.1529 0.957 0.960 0.000 0.040
#> SRR1386844 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.3267 0.879 0.884 0.000 0.116
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.3267 0.879 0.884 0.000 0.116
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379303 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR613174 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351125 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR659157 1 0.1289 0.964 0.968 0.000 0.032
#> SRR1480408 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.2711 0.912 0.912 0.000 0.088
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR659247 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317201 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.2711 0.911 0.912 0.000 0.088
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323558 1 0.1163 0.966 0.972 0.000 0.028
#> SRR1381711 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR657985 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1314810 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1474095 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1315912 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 1 0.2625 0.915 0.916 0.000 0.084
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR1360785 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR810437 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR1361860 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.1643 0.953 0.956 0.000 0.044
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.3267 0.879 0.884 0.000 0.116
#> SRR1353353 1 0.3038 0.893 0.896 0.000 0.104
#> SRR1073291 1 0.1643 0.953 0.956 0.000 0.044
#> SRR1356227 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.1163 0.965 0.972 0.000 0.028
#> SRR663002 1 0.2448 0.923 0.924 0.000 0.076
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.3267 0.879 0.884 0.000 0.116
#> SRR1384006 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR818440 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337770 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1074041 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR816699 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1308612 1 0.1529 0.956 0.960 0.000 0.040
#> SRR1499418 1 0.2165 0.935 0.936 0.000 0.064
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 1 0.1964 0.942 0.944 0.000 0.056
#> SRR1436698 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1351236 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 1 0.2625 0.915 0.916 0.000 0.084
#> SRR1098216 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1289 0.962 0.968 0.000 0.032
#> SRR1502143 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487614 1 0.3192 0.884 0.888 0.000 0.112
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.1860 0.947 0.948 0.000 0.052
#> SRR1317155 1 0.0237 0.980 0.996 0.000 0.004
#> SRR1477405 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.1411 0.960 0.964 0.000 0.036
#> SRR1084790 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332588 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR661028 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.3038 0.893 0.896 0.000 0.104
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0237 0.980 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358082 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0424 0.979 0.992 0.000 0.008
#> SRR655194 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.4605 0.721 0.000 0.204 0.796
#> SRR1074289 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.1411 0.960 0.964 0.000 0.036
#> SRR1443507 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452310 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.1860 0.947 0.948 0.000 0.052
#> SRR1354247 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.0892 0.972 0.980 0.000 0.020
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR615958 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.1753 0.950 0.952 0.000 0.048
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.2625 0.915 0.916 0.000 0.084
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.0707 0.9720 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1351190 1 0.0921 0.9683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0336 0.9747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326821 1 0.0336 0.9747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399069 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1366450 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.0336 0.9744 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.1792 0.9433 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1368141 1 0.2814 0.8794 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0817 0.9699 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.2814 0.8794 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.2868 0.8752 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.0336 0.9747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.0707 0.9714 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.1302 0.9596 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0188 0.9748 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457835 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347123 1 0.2921 0.8701 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.3074 0.8557 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1445064 1 0.0817 0.9699 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0592 0.9733 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0592 0.9727 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.0817 0.9701 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1420710 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.1022 0.9667 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1337707 1 0.2704 0.8888 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.5159 0.1961 0.000 0.088 0.756 0.156
#> SRR1398013 1 0.0469 0.9738 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1352918 1 0.1022 0.9653 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.2814 0.8794 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.0000 0.1238 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0707 0.9718 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1400078 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615575 1 0.0592 0.9727 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1079434 1 0.0921 0.9690 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.1022 0.9653 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1475697 1 0.0592 0.9731 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1485812 1 0.1940 0.9371 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.1792 0.1971 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR807775 1 0.2408 0.9090 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.0592 0.9733 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR656794 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.1940 0.9371 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1485912 1 0.0592 0.9728 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1407602 1 0.4522 0.5294 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1356164 1 0.0469 0.9741 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1328692 1 0.1302 0.9596 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.3074 0.8557 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1368200 1 0.0921 0.9683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.1022 0.1993 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1437256 1 0.2814 0.8794 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1487446 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0469 0.9741 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1382934 1 0.3311 0.8300 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0817 0.9705 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1409600 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614779 1 0.0817 0.9699 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR810783 1 0.0592 0.9730 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0707 0.9714 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR808106 1 0.0592 0.9733 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR662713 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0817 0.9699 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR809382 1 0.2530 0.9011 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR665417 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 1 0.3123 0.8508 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1413787 3 0.4776 0.0875 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1478207 1 0.0707 0.9714 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817210 1 0.0707 0.9716 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1319221 3 0.5159 0.1961 0.000 0.088 0.756 0.156
#> SRR1405413 1 0.0592 0.9728 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.2921 0.8701 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0707 0.9714 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0188 0.9751 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0592 0.9728 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.3074 0.8557 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 4 0.1284 0.0000 0.012 0.000 0.024 0.964
#> SRR1076144 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.3356 0.8247 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1344253 1 0.0817 0.9705 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0592 0.9727 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.2469 0.9051 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR818372 1 0.0921 0.9683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.1389 0.9553 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1310031 1 0.2589 0.8969 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR615419 1 0.2814 0.8794 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0592 0.9728 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1442949 1 0.1940 0.9359 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.2216 0.9206 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR660522 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR815374 1 0.0921 0.9683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.0817 0.9699 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1316438 1 0.1474 0.9534 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.3074 0.8557 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.3074 0.8557 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1098761 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0921 0.9683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.1389 0.9573 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0469 0.9741 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.1022 0.9667 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR613174 1 0.1022 0.9665 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1351125 1 0.0188 0.9751 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659157 1 0.1792 0.9433 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1480408 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR657857 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.2647 0.8937 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0707 0.9715 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR659247 1 0.0592 0.9730 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0469 0.9739 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.2704 0.8883 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345995 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071035 1 0.0188 0.9751 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0707 0.9714 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1323558 1 0.1557 0.9509 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1381711 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR657985 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1314810 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1336505 1 0.0817 0.9699 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1474095 1 0.0592 0.9728 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.1389 0.9553 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380414 1 0.0817 0.9699 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 1 0.2647 0.8928 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0817 0.9705 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1360785 1 0.1022 0.9653 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR810437 1 0.1389 0.9573 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1361860 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0336 0.9747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1457619 1 0.0188 0.9748 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.1637 0.9478 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.3074 0.8557 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1353353 1 0.2921 0.8703 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1073291 1 0.1940 0.9352 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.1792 0.9425 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR663002 1 0.2530 0.9011 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.3074 0.8557 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614047 1 0.1474 0.9538 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR818440 1 0.0707 0.9716 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1337770 1 0.0336 0.9747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1399413 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0921 0.9683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1074041 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0707 0.9714 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR816699 1 0.0592 0.9727 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1308612 1 0.1716 0.9452 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1499418 1 0.2345 0.9136 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808272 1 0.2216 0.9206 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.1022 0.9653 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309534 1 0.0592 0.9731 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR615527 1 0.2647 0.8928 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.1022 0.9653 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1792 0.9428 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1502143 1 0.0707 0.9718 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1487614 1 0.3024 0.8606 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0188 0.9750 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.0921 0.9683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.1792 0.9418 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1317155 1 0.0707 0.9724 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.1637 0.9484 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1084790 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1073731 1 0.0469 0.9739 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1332588 1 0.1389 0.9553 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0707 0.9714 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.2921 0.8701 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0592 0.9733 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.5159 0.1961 0.000 0.088 0.756 0.156
#> SRR1074289 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.1557 0.9511 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1443507 1 0.0592 0.9728 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1452310 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR665610 1 0.0336 0.9746 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.1792 0.9418 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.1302 0.9594 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658657 1 0.0921 0.9686 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0592 0.9729 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR615958 1 0.1474 0.9538 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.1211 0.9618 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.2081 0.9280 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.2647 0.8929 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0188 0.9749 0.996 0.000 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.1764 0.65207 0.064 0 0.928 0 0.008
#> SRR1436370 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1397949 3 0.3966 -0.15708 0.336 0 0.664 0 0.000
#> SRR1355723 3 0.2424 0.59011 0.132 0 0.868 0 0.000
#> SRR1329744 3 0.4304 -0.91894 0.484 0 0.516 0 0.000
#> SRR657384 3 0.1952 0.63751 0.084 0 0.912 0 0.004
#> SRR1351190 3 0.0898 0.66162 0.020 0 0.972 0 0.008
#> SRR1458662 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR818573 3 0.2648 0.56286 0.152 0 0.848 0 0.000
#> SRR1396017 3 0.3895 -0.06691 0.320 0 0.680 0 0.000
#> SRR1410742 3 0.3074 0.47527 0.196 0 0.804 0 0.000
#> SRR1435963 3 0.3999 -0.21824 0.344 0 0.656 0 0.000
#> SRR1382416 3 0.4304 -0.92420 0.484 0 0.516 0 0.000
#> SRR1391354 3 0.2389 0.63037 0.116 0 0.880 0 0.004
#> SRR1087968 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1310075 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1312244 3 0.4101 -0.39139 0.372 0 0.628 0 0.000
#> SRR1325138 3 0.2690 0.56639 0.156 0 0.844 0 0.000
#> SRR1326821 3 0.3013 0.57705 0.160 0 0.832 0 0.008
#> SRR1490178 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR655613 3 0.4297 -0.88422 0.472 0 0.528 0 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1465758 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1414058 3 0.0324 0.65955 0.004 0 0.992 0 0.004
#> SRR1407449 3 0.4030 -0.27723 0.352 0 0.648 0 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1479109 3 0.3074 0.47301 0.196 0 0.804 0 0.000
#> SRR1399069 3 0.2891 0.55098 0.176 0 0.824 0 0.000
#> SRR1366450 3 0.3636 0.15524 0.272 0 0.728 0 0.000
#> SRR1396859 3 0.4015 -0.24393 0.348 0 0.652 0 0.000
#> SRR1457176 3 0.3895 -0.04907 0.320 0 0.680 0 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1434736 3 0.1704 0.65854 0.068 0 0.928 0 0.004
#> SRR1080560 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1322882 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1327614 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR658152 3 0.1670 0.63238 0.012 0 0.936 0 0.052
#> SRR1368141 3 0.2488 0.56420 0.004 0 0.872 0 0.124
#> SRR1440268 3 0.4304 -0.91894 0.484 0 0.516 0 0.000
#> SRR1453725 3 0.3857 -0.00197 0.312 0 0.688 0 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1477930 3 0.3707 0.17303 0.284 0 0.716 0 0.000
#> SRR1477591 3 0.4235 -0.67723 0.424 0 0.576 0 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR656275 3 0.1282 0.65818 0.044 0 0.952 0 0.004
#> SRR1369052 3 0.3534 0.29724 0.256 0 0.744 0 0.000
#> SRR1377735 3 0.4088 -0.37607 0.368 0 0.632 0 0.000
#> SRR1331244 3 0.3366 0.39903 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1404531 3 0.4302 -0.90705 0.480 0 0.520 0 0.000
#> SRR1324331 3 0.3366 0.39903 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1458890 3 0.2488 0.56420 0.004 0 0.872 0 0.124
#> SRR1432695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1431969 3 0.2536 0.56285 0.004 0 0.868 0 0.128
#> SRR1087393 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1077263 3 0.3013 0.57705 0.160 0 0.832 0 0.008
#> SRR1385211 3 0.3949 -0.14227 0.332 0 0.668 0 0.000
#> SRR655241 3 0.3816 0.04961 0.304 0 0.696 0 0.000
#> SRR656922 3 0.3707 0.17333 0.284 0 0.716 0 0.000
#> SRR1361630 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1318966 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1407087 3 0.0566 0.66150 0.012 0 0.984 0 0.004
#> SRR603212 3 0.3612 0.24508 0.268 0 0.732 0 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1485190 3 0.1364 0.65258 0.012 0 0.952 0 0.036
#> SRR1332232 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1312645 3 0.3231 0.48343 0.196 0 0.800 0 0.004
#> SRR1457835 3 0.3586 0.23696 0.264 0 0.736 0 0.000
#> SRR1347123 3 0.2583 0.55378 0.004 0 0.864 0 0.132
#> SRR1465501 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1330878 3 0.2719 0.54122 0.004 0 0.852 0 0.144
#> SRR1445064 3 0.0898 0.66255 0.020 0 0.972 0 0.008
#> SRR1452981 3 0.3274 0.41387 0.220 0 0.780 0 0.000
#> SRR1326708 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1407157 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1477316 3 0.2561 0.57743 0.144 0 0.856 0 0.000
#> SRR1077898 3 0.3366 0.42118 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1349080 3 0.1877 0.65816 0.064 0 0.924 0 0.012
#> SRR1076096 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1375485 3 0.4242 -0.71449 0.428 0 0.572 0 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR604414 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1380614 3 0.4088 -0.40221 0.368 0 0.632 0 0.000
#> SRR812060 3 0.0451 0.66092 0.008 0 0.988 0 0.004
#> SRR602082 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR661613 3 0.1082 0.66303 0.028 0 0.964 0 0.008
#> SRR1420710 3 0.1952 0.63751 0.084 0 0.912 0 0.004
#> SRR660426 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1416003 3 0.0693 0.66048 0.008 0 0.980 0 0.012
#> SRR661064 3 0.3796 0.07817 0.300 0 0.700 0 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1452718 3 0.4101 -0.39984 0.372 0 0.628 0 0.000
#> SRR1353243 3 0.4161 -0.49996 0.392 0 0.608 0 0.000
#> SRR1455482 3 0.4182 -0.54314 0.400 0 0.600 0 0.000
#> SRR1313473 3 0.4262 -0.74472 0.440 0 0.560 0 0.000
#> SRR1399394 3 0.3143 0.45452 0.204 0 0.796 0 0.000
#> SRR1102467 3 0.3876 -0.01949 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR1317470 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1337707 3 0.2462 0.57456 0.008 0 0.880 0 0.112
#> SRR1408752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1474617 5 0.2516 0.13449 0.140 0 0.000 0 0.860
#> SRR1398013 3 0.2017 0.64296 0.080 0 0.912 0 0.008
#> SRR1352918 3 0.2139 0.65119 0.052 0 0.916 0 0.032
#> SRR1420750 3 0.3913 -0.08656 0.324 0 0.676 0 0.000
#> SRR1071785 3 0.2488 0.56420 0.004 0 0.872 0 0.124
#> SRR1353618 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1490313 3 0.2929 0.50748 0.180 0 0.820 0 0.000
#> SRR1366560 3 0.3983 -0.18433 0.340 0 0.660 0 0.000
#> SRR1355684 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1323289 5 0.4585 0.23932 0.352 0 0.020 0 0.628
#> SRR1313494 3 0.3752 0.12426 0.292 0 0.708 0 0.000
#> SRR1309985 3 0.4015 -0.24393 0.348 0 0.652 0 0.000
#> SRR607911 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1333789 3 0.0693 0.66130 0.012 0 0.980 0 0.008
#> SRR1400078 3 0.2233 0.62191 0.104 0 0.892 0 0.004
#> SRR1088631 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR615575 3 0.0451 0.66092 0.008 0 0.988 0 0.004
#> SRR1079434 3 0.1701 0.65851 0.048 0 0.936 0 0.016
#> SRR1325559 3 0.3177 0.44788 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR1446695 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1383883 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1396100 3 0.2139 0.65119 0.052 0 0.916 0 0.032
#> SRR1475697 3 0.1522 0.66206 0.044 0 0.944 0 0.012
#> SRR1488067 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1410380 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1445490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1435044 3 0.2848 0.55777 0.156 0 0.840 0 0.004
#> SRR1485812 3 0.2036 0.63029 0.024 0 0.920 0 0.056
#> SRR1078020 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1311153 3 0.4210 -0.62585 0.412 0 0.588 0 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1343898 5 0.5302 0.25843 0.344 0 0.064 0 0.592
#> SRR807775 3 0.2505 0.59117 0.020 0 0.888 0 0.092
#> SRR1409215 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR820427 3 0.1877 0.65816 0.064 0 0.924 0 0.012
#> SRR1100656 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1362159 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1414536 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR656794 3 0.3143 0.46491 0.204 0 0.796 0 0.000
#> SRR604653 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1317685 3 0.2036 0.63029 0.024 0 0.920 0 0.056
#> SRR1485912 3 0.1831 0.64325 0.076 0 0.920 0 0.004
#> SRR1407602 3 0.4677 0.22751 0.300 0 0.664 0 0.036
#> SRR1356164 3 0.0898 0.66238 0.020 0 0.972 0 0.008
#> SRR1328692 3 0.1364 0.65258 0.012 0 0.952 0 0.036
#> SRR1362438 3 0.4150 -0.48451 0.388 0 0.612 0 0.000
#> SRR1479216 3 0.2719 0.54122 0.004 0 0.852 0 0.144
#> SRR1358041 3 0.3242 0.42439 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR1468766 3 0.0324 0.65955 0.004 0 0.992 0 0.004
#> SRR1368200 3 0.0451 0.65857 0.004 0 0.988 0 0.008
#> SRR1435602 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1501043 5 0.4890 0.26888 0.332 0 0.040 0 0.628
#> SRR1437256 3 0.2488 0.56420 0.004 0 0.872 0 0.124
#> SRR1487446 3 0.3242 0.42439 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR816653 3 0.4088 -0.37607 0.368 0 0.632 0 0.000
#> SRR815164 3 0.3366 0.38310 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1442043 3 0.3177 0.44638 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR1410573 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1352369 3 0.1571 0.65679 0.060 0 0.936 0 0.004
#> SRR1382934 3 0.2930 0.52302 0.004 0 0.832 0 0.164
#> SRR1465208 3 0.3752 0.12370 0.292 0 0.708 0 0.000
#> SRR1314728 3 0.3550 0.37178 0.236 0 0.760 0 0.004
#> SRR1470291 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1308756 3 0.0566 0.65984 0.004 0 0.984 0 0.012
#> SRR1409600 3 0.3074 0.47301 0.196 0 0.804 0 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR614779 3 0.1012 0.65152 0.020 0 0.968 0 0.012
#> SRR810783 3 0.1502 0.65429 0.056 0 0.940 0 0.004
#> SRR1333990 1 0.4307 0.97370 0.500 0 0.500 0 0.000
#> SRR1410356 3 0.0162 0.65987 0.004 0 0.996 0 0.000
#> SRR808106 3 0.1877 0.65816 0.064 0 0.924 0 0.012
#> SRR662713 3 0.0290 0.66042 0.008 0 0.992 0 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1480964 3 0.0771 0.66156 0.020 0 0.976 0 0.004
#> SRR809382 3 0.2233 0.58798 0.004 0 0.892 0 0.104
#> SRR665417 3 0.3684 0.18367 0.280 0 0.720 0 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR615623 3 0.2843 0.53565 0.008 0 0.848 0 0.144
#> SRR1413787 5 0.6612 0.09954 0.216 0 0.372 0 0.412
#> SRR1478207 3 0.0771 0.66254 0.020 0 0.976 0 0.004
#> SRR1411046 1 0.4307 0.98636 0.504 0 0.496 0 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1326560 3 0.3876 -0.03538 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR1309051 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1395616 3 0.4291 -0.84445 0.464 0 0.536 0 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR817210 3 0.1484 0.66091 0.048 0 0.944 0 0.008
#> SRR1319221 5 0.2516 0.13449 0.140 0 0.000 0 0.860
#> SRR1405413 3 0.1831 0.64298 0.076 0 0.920 0 0.004
#> SRR607807 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1390160 3 0.2583 0.55378 0.004 0 0.864 0 0.132
#> SRR1406283 3 0.3612 0.24236 0.268 0 0.732 0 0.000
#> SRR1357709 3 0.3074 0.47559 0.196 0 0.804 0 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1468208 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1312766 3 0.0162 0.65987 0.004 0 0.996 0 0.000
#> SRR1361612 3 0.4015 -0.24393 0.348 0 0.652 0 0.000
#> SRR1311224 3 0.3895 -0.05159 0.320 0 0.680 0 0.000
#> SRR1087801 3 0.3586 0.25738 0.264 0 0.736 0 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1357127 3 0.1831 0.64298 0.076 0 0.920 0 0.004
#> SRR1074980 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1317022 3 0.2719 0.54122 0.004 0 0.852 0 0.144
#> SRR1332879 3 0.4074 -0.36054 0.364 0 0.636 0 0.000
#> SRR1403177 4 0.0000 0.00000 0.000 0 0.000 1 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1500006 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1485678 3 0.2648 0.57779 0.152 0 0.848 0 0.000
#> SRR1092232 3 0.3053 0.51700 0.008 0 0.828 0 0.164
#> SRR1344253 3 0.1701 0.66053 0.048 0 0.936 0 0.016
#> SRR1384290 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1089349 3 0.0451 0.66092 0.008 0 0.988 0 0.004
#> SRR1343522 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1440940 3 0.2361 0.60070 0.012 0 0.892 0 0.096
#> SRR818372 3 0.0798 0.66216 0.016 0 0.976 0 0.008
#> SRR1323675 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR819894 3 0.2221 0.63632 0.052 0 0.912 0 0.036
#> SRR1310031 3 0.2233 0.59018 0.004 0 0.892 0 0.104
#> SRR615419 3 0.2488 0.56420 0.004 0 0.872 0 0.124
#> SRR1436925 3 0.3177 0.44597 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR1477238 3 0.4305 -0.93372 0.488 0 0.512 0 0.000
#> SRR1332566 3 0.4101 -0.39139 0.372 0 0.628 0 0.000
#> SRR1490228 3 0.1704 0.64730 0.068 0 0.928 0 0.004
#> SRR1442949 3 0.2300 0.61453 0.052 0 0.908 0 0.040
#> SRR1466239 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1329971 3 0.3561 0.26646 0.260 0 0.740 0 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1322981 3 0.0162 0.65986 0.004 0 0.996 0 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1471713 3 0.1892 0.61206 0.004 0 0.916 0 0.080
#> SRR660522 3 0.1082 0.66284 0.028 0 0.964 0 0.008
#> SRR815374 3 0.0798 0.66216 0.016 0 0.976 0 0.008
#> SRR1069564 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1416337 3 0.1012 0.65152 0.020 0 0.968 0 0.012
#> SRR1316438 3 0.1205 0.64554 0.004 0 0.956 0 0.040
#> SRR1386844 3 0.4307 -0.97399 0.500 0 0.500 0 0.000
#> SRR1373718 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1487128 3 0.4182 -0.54314 0.400 0 0.600 0 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1460296 3 0.3895 -0.04907 0.320 0 0.680 0 0.000
#> SRR1335489 3 0.3814 0.20536 0.276 0 0.720 0 0.004
#> SRR1393404 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1081425 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1401815 3 0.2719 0.54122 0.004 0 0.852 0 0.144
#> SRR1071337 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1410510 3 0.2719 0.54122 0.004 0 0.852 0 0.144
#> SRR1098761 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1312124 3 0.3752 0.12370 0.292 0 0.708 0 0.000
#> SRR615395 3 0.2561 0.57142 0.144 0 0.856 0 0.000
#> SRR1479349 3 0.4030 -0.27723 0.352 0 0.648 0 0.000
#> SRR2165033 3 0.1408 0.66020 0.044 0 0.948 0 0.008
#> SRR1089054 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR816201 3 0.1469 0.65720 0.016 0 0.948 0 0.036
#> SRR1488514 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR655840 3 0.2806 0.56241 0.152 0 0.844 0 0.004
#> SRR1379303 3 0.4294 -0.85952 0.468 0 0.532 0 0.000
#> SRR1418516 3 0.1830 0.65560 0.068 0 0.924 0 0.008
#> SRR613174 3 0.0898 0.65957 0.008 0 0.972 0 0.020
#> SRR1351125 3 0.3366 0.36865 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR659157 3 0.1670 0.63238 0.012 0 0.936 0 0.052
#> SRR1480408 3 0.2605 0.56288 0.148 0 0.852 0 0.000
#> SRR657857 3 0.1952 0.63862 0.084 0 0.912 0 0.004
#> SRR1073317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1332526 3 0.3003 0.49443 0.188 0 0.812 0 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1431270 3 0.2573 0.58073 0.016 0 0.880 0 0.104
#> SRR1085614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1330106 3 0.1831 0.64298 0.076 0 0.920 0 0.004
#> SRR1466154 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1396944 3 0.4305 -0.93372 0.488 0 0.512 0 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1457267 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR614659 3 0.1571 0.65249 0.060 0 0.936 0 0.004
#> SRR659247 3 0.1502 0.65429 0.056 0 0.940 0 0.004
#> SRR1317201 3 0.4182 -0.54677 0.400 0 0.600 0 0.000
#> SRR1473696 3 0.4074 -0.36054 0.364 0 0.636 0 0.000
#> SRR1375842 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1453662 3 0.2674 0.58092 0.140 0 0.856 0 0.004
#> SRR1345499 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1353499 3 0.3999 -0.21206 0.344 0 0.656 0 0.000
#> SRR1416693 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1070841 3 0.3109 0.46283 0.200 0 0.800 0 0.000
#> SRR1380910 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1498183 3 0.3876 -0.02814 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR612659 3 0.2338 0.58095 0.004 0 0.884 0 0.112
#> SRR1447148 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1376786 3 0.2516 0.57515 0.140 0 0.860 0 0.000
#> SRR1345995 3 0.3336 0.38707 0.228 0 0.772 0 0.000
#> SRR1071035 3 0.3586 0.25738 0.264 0 0.736 0 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR662438 3 0.4304 -0.92111 0.484 0 0.516 0 0.000
#> SRR1335355 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR659448 3 0.0162 0.65987 0.004 0 0.996 0 0.000
#> SRR1323558 3 0.1121 0.64504 0.000 0 0.956 0 0.044
#> SRR1381711 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR657985 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1314810 3 0.3550 0.37178 0.236 0 0.760 0 0.004
#> SRR1336505 3 0.1124 0.66052 0.036 0 0.960 0 0.004
#> SRR1474095 3 0.1704 0.64730 0.068 0 0.928 0 0.004
#> SRR1363831 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1442376 3 0.3366 0.37515 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1101200 3 0.2516 0.57515 0.140 0 0.860 0 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1367150 3 0.2149 0.63707 0.048 0 0.916 0 0.036
#> SRR1313406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1467277 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1084867 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1443113 3 0.3143 0.45465 0.204 0 0.796 0 0.000
#> SRR1380414 3 0.0579 0.65934 0.008 0 0.984 0 0.008
#> SRR1315912 3 0.4210 -0.62585 0.412 0 0.588 0 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR602282 3 0.2286 0.58298 0.004 0 0.888 0 0.108
#> SRR1361195 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR600493 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1477653 3 0.3612 0.24236 0.268 0 0.732 0 0.000
#> SRR1355475 3 0.0566 0.65984 0.004 0 0.984 0 0.012
#> SRR1360785 3 0.2209 0.65158 0.056 0 0.912 0 0.032
#> SRR810437 3 0.1124 0.65236 0.004 0 0.960 0 0.036
#> SRR1361860 3 0.2763 0.57800 0.148 0 0.848 0 0.004
#> SRR1441311 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1098903 3 0.2389 0.63037 0.116 0 0.880 0 0.004
#> SRR1457619 3 0.3231 0.48343 0.196 0 0.800 0 0.004
#> SRR1498529 3 0.3074 0.47834 0.196 0 0.804 0 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1445087 3 0.1357 0.64013 0.004 0 0.948 0 0.048
#> SRR1399525 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1476056 3 0.3336 0.38947 0.228 0 0.772 0 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1311916 3 0.2719 0.54122 0.004 0 0.852 0 0.144
#> SRR1353353 3 0.2583 0.55401 0.004 0 0.864 0 0.132
#> SRR1073291 3 0.1638 0.62706 0.004 0 0.932 0 0.064
#> SRR1356227 3 0.4015 -0.24393 0.348 0 0.652 0 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1350304 3 0.2149 0.62233 0.048 0 0.916 0 0.036
#> SRR663002 3 0.2233 0.58798 0.004 0 0.892 0 0.104
#> SRR1376983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1399926 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1347144 3 0.2719 0.54122 0.004 0 0.852 0 0.144
#> SRR1384006 3 0.4300 -0.89069 0.476 0 0.524 0 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR614047 3 0.1043 0.64720 0.000 0 0.960 0 0.040
#> SRR818440 3 0.1484 0.66091 0.048 0 0.944 0 0.008
#> SRR1337770 3 0.2848 0.55601 0.156 0 0.840 0 0.004
#> SRR1399413 3 0.3143 0.45465 0.204 0 0.796 0 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1473959 3 0.0798 0.66114 0.016 0 0.976 0 0.008
#> SRR1074041 3 0.0451 0.66026 0.008 0 0.988 0 0.004
#> SRR1394495 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR659460 3 0.0771 0.66254 0.020 0 0.976 0 0.004
#> SRR816699 3 0.0324 0.65966 0.004 0 0.992 0 0.004
#> SRR1308612 3 0.1357 0.64001 0.004 0 0.948 0 0.048
#> SRR1499418 3 0.2645 0.59485 0.044 0 0.888 0 0.068
#> SRR1352894 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR815805 3 0.2193 0.64049 0.092 0 0.900 0 0.008
#> SRR1331083 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR808272 3 0.1892 0.61206 0.004 0 0.916 0 0.080
#> SRR1436698 3 0.3612 0.24236 0.268 0 0.732 0 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1357672 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1351236 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1077479 3 0.4305 -0.93372 0.488 0 0.512 0 0.000
#> SRR814491 3 0.2139 0.65119 0.052 0 0.916 0 0.032
#> SRR1101256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1436004 3 0.3876 -0.02400 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1314707 3 0.2813 0.53588 0.168 0 0.832 0 0.000
#> SRR1309534 3 0.1522 0.66206 0.044 0 0.944 0 0.012
#> SRR615527 3 0.2286 0.58298 0.004 0 0.888 0 0.108
#> SRR1098216 3 0.3913 -0.07185 0.324 0 0.676 0 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1404003 3 0.2068 0.63202 0.092 0 0.904 0 0.004
#> SRR1344166 3 0.3003 0.50303 0.188 0 0.812 0 0.000
#> SRR1368638 3 0.2139 0.65119 0.052 0 0.916 0 0.032
#> SRR1431429 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR815759 3 0.2149 0.62255 0.048 0 0.916 0 0.036
#> SRR1502143 3 0.0693 0.66130 0.012 0 0.980 0 0.008
#> SRR1487614 3 0.2674 0.54306 0.004 0 0.856 0 0.140
#> SRR1402307 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR820810 3 0.2377 0.59524 0.128 0 0.872 0 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1083215 3 0.3109 0.46283 0.200 0 0.800 0 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR656421 3 0.3003 0.53126 0.188 0 0.812 0 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1499917 3 0.0898 0.66162 0.020 0 0.972 0 0.008
#> SRR1339944 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1434889 3 0.2230 0.60780 0.116 0 0.884 0 0.000
#> SRR1431847 3 0.1872 0.62751 0.020 0 0.928 0 0.052
#> SRR1317155 3 0.1386 0.66363 0.032 0 0.952 0 0.016
#> SRR1477405 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR655289 3 0.2127 0.63227 0.108 0 0.892 0 0.000
#> SRR1341683 3 0.1701 0.64729 0.016 0 0.936 0 0.048
#> SRR1084790 3 0.3039 0.51599 0.192 0 0.808 0 0.000
#> SRR1073731 3 0.1704 0.64914 0.068 0 0.928 0 0.004
#> SRR1332588 3 0.2149 0.63707 0.048 0 0.916 0 0.036
#> SRR1471157 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR654945 3 0.0162 0.65987 0.004 0 0.996 0 0.000
#> SRR661028 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1101152 3 0.1571 0.65547 0.060 0 0.936 0 0.004
#> SRR1358435 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR2165273 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1379014 3 0.3366 0.37735 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1489904 3 0.2583 0.55378 0.004 0 0.864 0 0.132
#> SRR1416386 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1406048 3 0.3752 0.12370 0.292 0 0.708 0 0.000
#> SRR606982 3 0.1877 0.65816 0.064 0 0.924 0 0.012
#> SRR1358082 1 0.4306 0.99896 0.508 0 0.492 0 0.000
#> SRR1312934 3 0.1041 0.66061 0.032 0 0.964 0 0.004
#> SRR655194 3 0.3109 0.46594 0.200 0 0.800 0 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1389820 5 0.2516 0.13449 0.140 0 0.000 0 0.860
#> SRR1074289 3 0.0451 0.66026 0.008 0 0.988 0 0.004
#> SRR1348816 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1076292 3 0.2193 0.64049 0.092 0 0.900 0 0.008
#> SRR1395810 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1498909 3 0.1444 0.64926 0.012 0 0.948 0 0.040
#> SRR1443507 3 0.1831 0.64412 0.076 0 0.920 0 0.004
#> SRR1452310 3 0.2124 0.62822 0.096 0 0.900 0 0.004
#> SRR665610 3 0.1952 0.63751 0.084 0 0.912 0 0.004
#> SRR1347322 3 0.3913 -0.07716 0.324 0 0.676 0 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1477256 3 0.4150 -0.47920 0.388 0 0.612 0 0.000
#> SRR1470230 3 0.1965 0.62451 0.024 0 0.924 0 0.052
#> SRR1354247 3 0.3876 -0.01949 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1487592 3 0.3612 0.24236 0.268 0 0.732 0 0.000
#> SRR1352299 3 0.3274 0.41117 0.220 0 0.780 0 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1434117 3 0.0955 0.65262 0.004 0 0.968 0 0.028
#> SRR1075273 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR658657 3 0.1117 0.65039 0.020 0 0.964 0 0.016
#> SRR1092773 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1365332 3 0.0290 0.66010 0.008 0 0.992 0 0.000
#> SRR615958 3 0.1043 0.64720 0.000 0 0.960 0 0.040
#> SRR1097688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1403259 3 0.1668 0.64810 0.028 0 0.940 0 0.032
#> SRR1099120 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1362200 3 0.1768 0.61967 0.004 0 0.924 0 0.072
#> SRR1464856 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1347298 3 0.2286 0.58587 0.004 0 0.888 0 0.108
#> SRR1075923 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1100703 3 0.3336 0.38666 0.228 0 0.772 0 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 3 0.3688 0.7155 0.256 0.000 0.724 0.000 0.020 0
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1075752 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1397949 1 0.3446 0.5706 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000 0
#> SRR1355723 3 0.3464 0.6290 0.312 0.000 0.688 0.000 0.000 0
#> SRR1329744 1 0.0790 0.7013 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000 0
#> SRR657384 3 0.3383 0.6920 0.268 0.000 0.728 0.000 0.004 0
#> SRR1351190 3 0.3470 0.7529 0.200 0.000 0.772 0.000 0.028 0
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR818573 3 0.3717 0.4973 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000 0
#> SRR1396017 1 0.3647 0.4673 0.640 0.000 0.360 0.000 0.000 0
#> SRR1410742 3 0.3797 0.3841 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000 0
#> SRR1435963 1 0.3515 0.5349 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000 0
#> SRR1382416 1 0.1141 0.7076 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000 0
#> SRR1391354 3 0.1858 0.6662 0.092 0.000 0.904 0.000 0.004 0
#> SRR1087968 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1310075 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312244 1 0.3221 0.6213 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000 0
#> SRR1325138 3 0.3428 0.6065 0.304 0.000 0.696 0.000 0.000 0
#> SRR1326821 3 0.2778 0.6021 0.168 0.000 0.824 0.000 0.008 0
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR655613 1 0.2300 0.6959 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000 0
#> SRR1075707 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1443871 2 0.0260 0.9937 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1102489 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1465758 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1414058 3 0.2945 0.7584 0.156 0.000 0.824 0.000 0.020 0
#> SRR1407449 1 0.3482 0.5558 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000 0
#> SRR1436858 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1479109 3 0.3782 0.3967 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000 0
#> SRR1399069 3 0.2823 0.5525 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000 0
#> SRR1366450 1 0.3955 0.3777 0.608 0.000 0.384 0.000 0.008 0
#> SRR1396859 1 0.3428 0.5697 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000 0
#> SRR1457176 1 0.3634 0.4785 0.644 0.000 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1097666 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1434736 3 0.1908 0.7231 0.096 0.000 0.900 0.000 0.004 0
#> SRR1080560 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1322882 1 0.0632 0.6972 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1327614 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR658152 3 0.3667 0.7519 0.132 0.000 0.788 0.000 0.080 0
#> SRR1368141 3 0.4390 0.7164 0.132 0.000 0.720 0.000 0.148 0
#> SRR1440268 1 0.0790 0.7013 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000 0
#> SRR1453725 1 0.3756 0.3620 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000 0
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477930 1 0.3838 0.1574 0.552 0.000 0.448 0.000 0.000 0
#> SRR1477591 1 0.2491 0.6938 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000 0
#> SRR1416049 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR656275 3 0.3431 0.7348 0.228 0.000 0.756 0.000 0.016 0
#> SRR1369052 3 0.3868 0.1036 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000 0
#> SRR1377735 1 0.3351 0.5927 0.712 0.000 0.288 0.000 0.000 0
#> SRR1331244 3 0.3371 0.3555 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000 0
#> SRR1404531 1 0.1663 0.7162 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000 0
#> SRR1324331 3 0.3371 0.3555 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000 0
#> SRR1458890 3 0.4427 0.7182 0.136 0.000 0.716 0.000 0.148 0
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1407624 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1431969 3 0.4459 0.7155 0.132 0.000 0.712 0.000 0.156 0
#> SRR1087393 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077263 3 0.2778 0.6021 0.168 0.000 0.824 0.000 0.008 0
#> SRR1385211 1 0.3717 0.4170 0.616 0.000 0.384 0.000 0.000 0
#> SRR655241 1 0.3765 0.3175 0.596 0.000 0.404 0.000 0.000 0
#> SRR656922 1 0.3843 0.1389 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000 0
#> SRR1361630 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1318966 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1407087 3 0.3017 0.7593 0.164 0.000 0.816 0.000 0.020 0
#> SRR603212 1 0.3868 -0.0704 0.504 0.000 0.496 0.000 0.000 0
#> SRR1321088 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1485190 3 0.3163 0.7601 0.140 0.000 0.820 0.000 0.040 0
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312645 3 0.3937 0.3801 0.424 0.000 0.572 0.000 0.004 0
#> SRR1457835 3 0.3866 0.1514 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000 0
#> SRR1347123 3 0.4533 0.7136 0.140 0.000 0.704 0.000 0.156 0
#> SRR1465501 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1330878 3 0.4589 0.7016 0.132 0.000 0.696 0.000 0.172 0
#> SRR1445064 3 0.3279 0.7605 0.176 0.000 0.796 0.000 0.028 0
#> SRR1452981 3 0.3847 0.2590 0.456 0.000 0.544 0.000 0.000 0
#> SRR1326708 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1407157 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1365401 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1397697 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1477316 3 0.3531 0.5906 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000 0
#> SRR1077898 3 0.3371 0.3798 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000 0
#> SRR1349080 3 0.1461 0.6860 0.044 0.000 0.940 0.000 0.016 0
#> SRR1076096 2 0.0260 0.9937 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR811261 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1375485 1 0.2854 0.6620 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000 0
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR604414 1 0.0632 0.6972 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1380614 1 0.3607 0.4799 0.652 0.000 0.348 0.000 0.000 0
#> SRR812060 3 0.3053 0.7578 0.168 0.000 0.812 0.000 0.020 0
#> SRR602082 1 0.0632 0.6972 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1069490 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR661613 3 0.3312 0.7606 0.180 0.000 0.792 0.000 0.028 0
#> SRR1420710 3 0.3290 0.7085 0.252 0.000 0.744 0.000 0.004 0
#> SRR660426 1 0.0363 0.6893 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1416003 3 0.3213 0.7601 0.160 0.000 0.808 0.000 0.032 0
#> SRR661064 1 0.3810 0.2290 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000 0
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1452718 1 0.3390 0.5775 0.704 0.000 0.296 0.000 0.000 0
#> SRR1353243 1 0.2941 0.6627 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0
#> SRR1455482 1 0.2697 0.6805 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000 0
#> SRR1313473 1 0.2454 0.6931 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000 0
#> SRR1399394 3 0.3864 0.1617 0.480 0.000 0.520 0.000 0.000 0
#> SRR1102467 1 0.3747 0.3629 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000 0
#> SRR1317470 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1337707 3 0.4281 0.7277 0.136 0.000 0.732 0.000 0.132 0
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1474617 4 0.0000 0.9910 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1398013 3 0.3298 0.7254 0.236 0.000 0.756 0.000 0.008 0
#> SRR1352918 3 0.1644 0.6768 0.028 0.000 0.932 0.000 0.040 0
#> SRR1420750 1 0.3499 0.5507 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000 0
#> SRR1071785 3 0.4427 0.7182 0.136 0.000 0.716 0.000 0.148 0
#> SRR1353618 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1082217 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1490313 3 0.3756 0.4424 0.400 0.000 0.600 0.000 0.000 0
#> SRR1366560 1 0.3409 0.5824 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000 0
#> SRR1355684 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1323289 5 0.1141 0.1328 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948 0
#> SRR1313494 1 0.3797 0.2884 0.580 0.000 0.420 0.000 0.000 0
#> SRR1309985 1 0.3428 0.5697 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000 0
#> SRR607911 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1333789 3 0.3003 0.7586 0.172 0.000 0.812 0.000 0.016 0
#> SRR1400078 3 0.3383 0.6917 0.268 0.000 0.728 0.000 0.004 0
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1092842 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR615575 3 0.3053 0.7578 0.168 0.000 0.812 0.000 0.020 0
#> SRR1079434 3 0.1261 0.6883 0.024 0.000 0.952 0.000 0.024 0
#> SRR1325559 3 0.3854 0.2317 0.464 0.000 0.536 0.000 0.000 0
#> SRR1446695 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1383883 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1396100 3 0.1644 0.6768 0.028 0.000 0.932 0.000 0.040 0
#> SRR1475697 3 0.3037 0.7613 0.176 0.000 0.808 0.000 0.016 0
#> SRR1488067 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1102103 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1105154 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1084991 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1410380 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1445490 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1454671 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1435044 3 0.3636 0.6147 0.320 0.000 0.676 0.000 0.004 0
#> SRR1485812 3 0.3796 0.7530 0.140 0.000 0.776 0.000 0.084 0
#> SRR1078020 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1311153 1 0.2941 0.6549 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1343898 5 0.1010 0.2845 0.000 0.000 0.036 0.004 0.960 0
#> SRR807775 3 0.2302 0.6341 0.008 0.000 0.872 0.000 0.120 0
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR820427 3 0.1461 0.6860 0.044 0.000 0.940 0.000 0.016 0
#> SRR1100656 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1362159 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1414536 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR656794 3 0.3409 0.5212 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000 0
#> SRR604653 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1317685 3 0.3796 0.7530 0.140 0.000 0.776 0.000 0.084 0
#> SRR1485912 3 0.3470 0.7184 0.248 0.000 0.740 0.000 0.012 0
#> SRR1407602 3 0.3547 0.4085 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332 0
#> SRR1356164 3 0.2553 0.7608 0.144 0.000 0.848 0.000 0.008 0
#> SRR1328692 3 0.3163 0.7601 0.140 0.000 0.820 0.000 0.040 0
#> SRR1362438 1 0.3076 0.6455 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000 0
#> SRR1479216 3 0.4589 0.7016 0.132 0.000 0.696 0.000 0.172 0
#> SRR1358041 3 0.3857 0.2089 0.468 0.000 0.532 0.000 0.000 0
#> SRR1468766 3 0.3017 0.7574 0.164 0.000 0.816 0.000 0.020 0
#> SRR1368200 3 0.3175 0.7578 0.164 0.000 0.808 0.000 0.028 0
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1501043 5 0.0725 0.2521 0.000 0.000 0.012 0.012 0.976 0
#> SRR1437256 3 0.4427 0.7182 0.136 0.000 0.716 0.000 0.148 0
#> SRR1487446 3 0.3864 0.1594 0.480 0.000 0.520 0.000 0.000 0
#> SRR816653 1 0.3351 0.5927 0.712 0.000 0.288 0.000 0.000 0
#> SRR815164 3 0.3862 0.2043 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000 0
#> SRR1442043 3 0.3810 0.3466 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000 0
#> SRR1410573 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1352369 3 0.3141 0.7555 0.200 0.000 0.788 0.000 0.012 0
#> SRR1382934 3 0.4792 0.6855 0.132 0.000 0.668 0.000 0.200 0
#> SRR1465208 1 0.3756 0.3563 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000 0
#> SRR1314728 3 0.3996 0.1082 0.484 0.000 0.512 0.000 0.004 0
#> SRR1470291 1 0.0260 0.6859 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0
#> SRR1308756 3 0.3175 0.7594 0.164 0.000 0.808 0.000 0.028 0
#> SRR1409600 3 0.3782 0.3967 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000 0
#> SRR816123 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR614779 3 0.0632 0.6848 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0
#> SRR810783 3 0.3217 0.7367 0.224 0.000 0.768 0.000 0.008 0
#> SRR1333990 1 0.0363 0.6908 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0
#> SRR1410356 3 0.2706 0.7570 0.160 0.000 0.832 0.000 0.008 0
#> SRR808106 3 0.1461 0.6860 0.044 0.000 0.940 0.000 0.016 0
#> SRR662713 3 0.2841 0.7582 0.164 0.000 0.824 0.000 0.012 0
#> SRR1447058 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1480964 3 0.3236 0.7580 0.180 0.000 0.796 0.000 0.024 0
#> SRR809382 3 0.4124 0.7324 0.132 0.000 0.748 0.000 0.120 0
#> SRR665417 1 0.3843 0.1616 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000 0
#> SRR1088016 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1453166 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR615623 3 0.4650 0.6981 0.132 0.000 0.688 0.000 0.180 0
#> SRR1413787 5 0.4597 0.1782 0.072 0.000 0.276 0.000 0.652 0
#> SRR1478207 3 0.3088 0.7586 0.172 0.000 0.808 0.000 0.020 0
#> SRR1411046 1 0.0146 0.6844 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326560 1 0.3672 0.4433 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000 0
#> SRR1309051 1 0.0632 0.6972 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1486949 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1395616 1 0.1556 0.7166 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000 0
#> SRR1074956 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1092961 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR817210 3 0.3168 0.7551 0.192 0.000 0.792 0.000 0.016 0
#> SRR1319221 4 0.0260 0.9955 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0
#> SRR1405413 3 0.3420 0.7227 0.240 0.000 0.748 0.000 0.012 0
#> SRR607807 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1390160 3 0.4533 0.7136 0.140 0.000 0.704 0.000 0.156 0
#> SRR1406283 1 0.3860 0.0673 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000 0
#> SRR1357709 3 0.3774 0.4164 0.408 0.000 0.592 0.000 0.000 0
#> SRR1080742 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1468208 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312766 3 0.2706 0.7570 0.160 0.000 0.832 0.000 0.008 0
#> SRR1361612 1 0.3446 0.5631 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000 0
#> SRR1311224 1 0.3684 0.4375 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000 0
#> SRR1087801 3 0.3868 0.1139 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000 0
#> SRR1099720 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1349250 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1350912 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1357127 3 0.3420 0.7227 0.240 0.000 0.748 0.000 0.012 0
#> SRR1074980 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1317022 3 0.4589 0.7016 0.132 0.000 0.696 0.000 0.172 0
#> SRR1332879 1 0.3351 0.5996 0.712 0.000 0.288 0.000 0.000 0
#> SRR1403177 6 0.0000 0.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1069614 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR818239 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1421069 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1500006 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1485678 3 0.3446 0.6109 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000 0
#> SRR1092232 3 0.4819 0.6821 0.132 0.000 0.664 0.000 0.204 0
#> SRR1344253 3 0.1480 0.7010 0.040 0.000 0.940 0.000 0.020 0
#> SRR1384290 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1089349 3 0.2945 0.7613 0.156 0.000 0.824 0.000 0.020 0
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1440940 3 0.4410 0.7399 0.164 0.000 0.716 0.000 0.120 0
#> SRR818372 3 0.3202 0.7615 0.176 0.000 0.800 0.000 0.024 0
#> SRR1323675 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR819894 3 0.1719 0.6653 0.016 0.000 0.924 0.000 0.060 0
#> SRR1310031 3 0.4243 0.7289 0.132 0.000 0.736 0.000 0.132 0
#> SRR615419 3 0.4427 0.7182 0.136 0.000 0.716 0.000 0.148 0
#> SRR1436925 3 0.3823 0.3380 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000 0
#> SRR1477238 1 0.0937 0.7050 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000 0
#> SRR1332566 1 0.3266 0.6129 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000 0
#> SRR1490228 3 0.3368 0.7286 0.232 0.000 0.756 0.000 0.012 0
#> SRR1442949 3 0.1663 0.6469 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0
#> SRR1466239 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1329971 1 0.3862 0.0593 0.524 0.000 0.476 0.000 0.000 0
#> SRR813076 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1097642 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1322981 3 0.2841 0.7569 0.164 0.000 0.824 0.000 0.012 0
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1471713 3 0.3953 0.7410 0.132 0.000 0.764 0.000 0.104 0
#> SRR660522 3 0.3269 0.7590 0.184 0.000 0.792 0.000 0.024 0
#> SRR815374 3 0.3202 0.7615 0.176 0.000 0.800 0.000 0.024 0
#> SRR1069564 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1416337 3 0.0632 0.6848 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0
#> SRR1316438 3 0.3276 0.7578 0.132 0.000 0.816 0.000 0.052 0
#> SRR1386844 1 0.0547 0.6964 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0
#> SRR1373718 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1487128 1 0.2941 0.6609 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0
#> SRR1441421 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1069919 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1460296 1 0.3634 0.4785 0.644 0.000 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1335489 1 0.3890 0.3507 0.596 0.000 0.400 0.000 0.004 0
#> SRR1393404 2 0.0260 0.9937 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1081425 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1401815 3 0.4589 0.7016 0.132 0.000 0.696 0.000 0.172 0
#> SRR1071337 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1410510 3 0.4589 0.7016 0.132 0.000 0.696 0.000 0.172 0
#> SRR1098761 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1312124 1 0.3756 0.3563 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000 0
#> SRR615395 3 0.3668 0.6222 0.328 0.000 0.668 0.000 0.004 0
#> SRR1479349 1 0.3482 0.5558 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000 0
#> SRR2165033 3 0.3539 0.7432 0.220 0.000 0.756 0.000 0.024 0
#> SRR1089054 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR816201 3 0.3739 0.7627 0.176 0.000 0.768 0.000 0.056 0
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR655840 3 0.4131 0.5044 0.384 0.000 0.600 0.000 0.016 0
#> SRR1379303 1 0.1267 0.7123 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000 0
#> SRR1418516 3 0.1418 0.6822 0.032 0.000 0.944 0.000 0.024 0
#> SRR613174 3 0.3354 0.7601 0.168 0.000 0.796 0.000 0.036 0
#> SRR1351125 3 0.3860 0.1868 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0
#> SRR659157 3 0.3667 0.7519 0.132 0.000 0.788 0.000 0.080 0
#> SRR1480408 3 0.3634 0.5472 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000 0
#> SRR657857 3 0.3290 0.7093 0.252 0.000 0.744 0.000 0.004 0
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1332526 3 0.3765 0.4347 0.404 0.000 0.596 0.000 0.000 0
#> SRR1094168 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1431270 3 0.4281 0.7303 0.136 0.000 0.732 0.000 0.132 0
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1330106 3 0.3052 0.7381 0.216 0.000 0.780 0.000 0.004 0
#> SRR1466154 1 0.0260 0.6873 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0
#> SRR1396944 1 0.0937 0.7050 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000 0
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1457267 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR614659 3 0.3534 0.7220 0.244 0.000 0.740 0.000 0.016 0
#> SRR659247 3 0.3217 0.7367 0.224 0.000 0.768 0.000 0.008 0
#> SRR1317201 1 0.2664 0.6808 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000 0
#> SRR1473696 1 0.3330 0.6049 0.716 0.000 0.284 0.000 0.000 0
#> SRR1375842 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1096363 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1453662 3 0.3795 0.5372 0.364 0.000 0.632 0.000 0.004 0
#> SRR1345499 2 0.0260 0.9937 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1353499 1 0.3547 0.5270 0.668 0.000 0.332 0.000 0.000 0
#> SRR1416693 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1070841 3 0.3747 0.4562 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000 0
#> SRR1380910 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1498183 1 0.3737 0.3932 0.608 0.000 0.392 0.000 0.000 0
#> SRR612659 3 0.4318 0.7239 0.132 0.000 0.728 0.000 0.140 0
#> SRR1447148 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR658597 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1089595 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1376786 3 0.3699 0.6056 0.336 0.000 0.660 0.000 0.004 0
#> SRR1345995 3 0.3862 0.1795 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000 0
#> SRR1071035 3 0.3868 0.1139 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000 0
#> SRR1068808 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1332754 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR662438 1 0.1610 0.7170 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000 0
#> SRR1335355 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR659448 3 0.2706 0.7570 0.160 0.000 0.832 0.000 0.008 0
#> SRR1323558 3 0.3570 0.7569 0.144 0.000 0.792 0.000 0.064 0
#> SRR1381711 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR657985 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1314810 3 0.3996 0.1085 0.484 0.000 0.512 0.000 0.004 0
#> SRR1336505 3 0.3539 0.7429 0.220 0.000 0.756 0.000 0.024 0
#> SRR1474095 3 0.3368 0.7286 0.232 0.000 0.756 0.000 0.012 0
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1442376 3 0.3857 0.2055 0.468 0.000 0.532 0.000 0.000 0
#> SRR1074909 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1101200 3 0.3699 0.6056 0.336 0.000 0.660 0.000 0.004 0
#> SRR1075408 2 0.0260 0.9937 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1367150 3 0.1625 0.6670 0.012 0.000 0.928 0.000 0.060 0
#> SRR1313406 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1068880 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1467277 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1084867 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1095431 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1443113 3 0.3817 0.3482 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000 0
#> SRR1380414 3 0.2122 0.7397 0.076 0.000 0.900 0.000 0.024 0
#> SRR1315912 1 0.2941 0.6549 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR602282 3 0.4164 0.7297 0.132 0.000 0.744 0.000 0.124 0
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR600493 1 0.0632 0.6972 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1477653 1 0.3860 0.0673 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000 0
#> SRR1355475 3 0.3175 0.7594 0.164 0.000 0.808 0.000 0.028 0
#> SRR1360785 3 0.1720 0.6763 0.032 0.000 0.928 0.000 0.040 0
#> SRR810437 3 0.3566 0.7595 0.156 0.000 0.788 0.000 0.056 0
#> SRR1361860 3 0.3728 0.5693 0.344 0.000 0.652 0.000 0.004 0
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1098903 3 0.1858 0.6662 0.092 0.000 0.904 0.000 0.004 0
#> SRR1457619 3 0.3907 0.4244 0.408 0.000 0.588 0.000 0.004 0
#> SRR1498529 3 0.3789 0.4014 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000 0
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1445087 3 0.3395 0.7560 0.132 0.000 0.808 0.000 0.060 0
#> SRR1399525 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1312844 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1085874 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1101226 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1476056 3 0.3866 0.1640 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000 0
#> SRR1075659 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1311916 3 0.4589 0.7016 0.132 0.000 0.696 0.000 0.172 0
#> SRR1353353 3 0.4459 0.7122 0.132 0.000 0.712 0.000 0.156 0
#> SRR1073291 3 0.3943 0.7532 0.156 0.000 0.760 0.000 0.084 0
#> SRR1356227 1 0.3428 0.5689 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000 0
#> SRR1080720 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1091695 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1350304 3 0.1556 0.6536 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080 0
#> SRR663002 3 0.4124 0.7324 0.132 0.000 0.748 0.000 0.120 0
#> SRR1376983 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1399926 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1347144 3 0.4589 0.7016 0.132 0.000 0.696 0.000 0.172 0
#> SRR1384006 1 0.1714 0.7125 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000 0
#> SRR1499108 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR614047 3 0.3660 0.7578 0.160 0.000 0.780 0.000 0.060 0
#> SRR818440 3 0.3261 0.7492 0.204 0.000 0.780 0.000 0.016 0
#> SRR1337770 3 0.3756 0.5570 0.352 0.000 0.644 0.000 0.004 0
#> SRR1399413 3 0.3817 0.3482 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000 0
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473959 3 0.3409 0.7550 0.192 0.000 0.780 0.000 0.028 0
#> SRR1074041 3 0.2932 0.7576 0.164 0.000 0.820 0.000 0.016 0
#> SRR1394495 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR659460 3 0.3088 0.7586 0.172 0.000 0.808 0.000 0.020 0
#> SRR816699 3 0.3017 0.7576 0.164 0.000 0.816 0.000 0.020 0
#> SRR1308612 3 0.3717 0.7576 0.160 0.000 0.776 0.000 0.064 0
#> SRR1499418 3 0.2006 0.6409 0.004 0.000 0.892 0.000 0.104 0
#> SRR1352894 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR815805 3 0.3323 0.7263 0.240 0.000 0.752 0.000 0.008 0
#> SRR1331083 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR808272 3 0.3953 0.7410 0.132 0.000 0.764 0.000 0.104 0
#> SRR1436698 1 0.3860 0.0673 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000 0
#> SRR1095627 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1357672 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1351236 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077479 1 0.0937 0.7050 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000 0
#> SRR814491 3 0.1644 0.6768 0.028 0.000 0.932 0.000 0.040 0
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1436004 1 0.3782 0.3113 0.588 0.000 0.412 0.000 0.000 0
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1078998 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1314707 3 0.3737 0.4840 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000 0
#> SRR1309534 3 0.3037 0.7613 0.176 0.000 0.808 0.000 0.016 0
#> SRR615527 3 0.4164 0.7297 0.132 0.000 0.744 0.000 0.124 0
#> SRR1098216 1 0.3647 0.4684 0.640 0.000 0.360 0.000 0.000 0
#> SRR1325847 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1404003 3 0.3489 0.6674 0.288 0.000 0.708 0.000 0.004 0
#> SRR1344166 3 0.3789 0.4223 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000 0
#> SRR1368638 3 0.1644 0.6768 0.028 0.000 0.932 0.000 0.040 0
#> SRR1431429 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1079237 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR815759 3 0.1556 0.6558 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080 0
#> SRR1502143 3 0.2932 0.7593 0.164 0.000 0.820 0.000 0.016 0
#> SRR1487614 3 0.4526 0.7049 0.132 0.000 0.704 0.000 0.164 0
#> SRR1402307 2 0.0146 0.9957 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR820810 3 0.3774 0.6201 0.328 0.000 0.664 0.000 0.008 0
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1083215 3 0.3747 0.4562 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000 0
#> SRR1476547 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR656421 3 0.2823 0.5390 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000 0
#> SRR1086116 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1499917 3 0.3409 0.7564 0.192 0.000 0.780 0.000 0.028 0
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1434889 3 0.3244 0.6955 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000 0
#> SRR1431847 3 0.2255 0.6894 0.028 0.000 0.892 0.000 0.080 0
#> SRR1317155 3 0.3003 0.7611 0.172 0.000 0.812 0.000 0.016 0
#> SRR1477405 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR655289 3 0.3050 0.7086 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000 0
#> SRR1341683 3 0.3841 0.7599 0.168 0.000 0.764 0.000 0.068 0
#> SRR1084790 3 0.2854 0.5418 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000 0
#> SRR1073731 3 0.3342 0.7353 0.228 0.000 0.760 0.000 0.012 0
#> SRR1332588 3 0.1625 0.6670 0.012 0.000 0.928 0.000 0.060 0
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR654945 3 0.2706 0.7570 0.160 0.000 0.832 0.000 0.008 0
#> SRR661028 1 0.0632 0.6972 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101152 3 0.3432 0.7445 0.216 0.000 0.764 0.000 0.020 0
#> SRR1358435 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR2165273 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1379014 3 0.3866 0.1616 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000 0
#> SRR1489904 3 0.4533 0.7136 0.140 0.000 0.704 0.000 0.156 0
#> SRR1416386 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1406048 1 0.3823 0.2611 0.564 0.000 0.436 0.000 0.000 0
#> SRR606982 3 0.1528 0.6899 0.048 0.000 0.936 0.000 0.016 0
#> SRR1358082 1 0.0000 0.6809 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312934 3 0.3424 0.7522 0.204 0.000 0.772 0.000 0.024 0
#> SRR655194 3 0.3851 0.2452 0.460 0.000 0.540 0.000 0.000 0
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473251 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1389820 4 0.0260 0.9955 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0
#> SRR1074289 3 0.2932 0.7576 0.164 0.000 0.820 0.000 0.016 0
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1076292 3 0.3271 0.7319 0.232 0.000 0.760 0.000 0.008 0
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1498909 3 0.3588 0.7601 0.152 0.000 0.788 0.000 0.060 0
#> SRR1443507 3 0.3494 0.7171 0.252 0.000 0.736 0.000 0.012 0
#> SRR1452310 3 0.3445 0.7030 0.260 0.000 0.732 0.000 0.008 0
#> SRR665610 3 0.3290 0.7068 0.252 0.000 0.744 0.000 0.004 0
#> SRR1347322 1 0.3695 0.4351 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000 0
#> SRR813395 2 0.0260 0.9953 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1477256 1 0.3126 0.6376 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000 0
#> SRR1470230 3 0.2039 0.6825 0.020 0.000 0.904 0.000 0.076 0
#> SRR1354247 1 0.3747 0.3629 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000 0
#> SRR1082640 2 0.0363 0.9932 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1487592 1 0.3864 0.0243 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000 0
#> SRR1352299 3 0.3857 0.2108 0.468 0.000 0.532 0.000 0.000 0
#> SRR1076317 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1434117 3 0.2954 0.7536 0.108 0.000 0.844 0.000 0.048 0
#> SRR1075273 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR658657 3 0.0713 0.6838 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1092773 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1365332 3 0.2743 0.7564 0.164 0.000 0.828 0.000 0.008 0
#> SRR615958 3 0.3588 0.7577 0.152 0.000 0.788 0.000 0.060 0
#> SRR1097688 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1403259 3 0.1408 0.7003 0.020 0.000 0.944 0.000 0.036 0
#> SRR1099120 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1362200 3 0.3977 0.7473 0.144 0.000 0.760 0.000 0.096 0
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9967 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1347298 3 0.4319 0.7283 0.136 0.000 0.728 0.000 0.136 0
#> SRR1075923 2 0.0146 0.9964 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0
#> SRR1100703 3 0.3862 0.1746 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4353 0.565 0.565
#> 3 3 0.683 0.875 0.830 0.3964 0.762 0.581
#> 4 4 0.578 0.646 0.793 0.1562 0.941 0.835
#> 5 5 0.670 0.602 0.718 0.0730 0.924 0.775
#> 6 6 0.685 0.546 0.661 0.0574 0.878 0.583
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.6148 0.821 0.152 0.848
#> SRR1398013 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.1414 0.979 0.980 0.020
#> SRR1405413 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.7528 0.724 0.784 0.216
#> SRR1076144 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.0938 0.987 0.012 0.988
#> SRR1074289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.6168 0.88240 0.412 0.000 0.588
#> SRR1436370 2 0.1753 0.93287 0.000 0.952 0.048
#> SRR1075752 2 0.3551 0.91562 0.000 0.868 0.132
#> SRR1397949 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 3 0.5968 0.90430 0.364 0.000 0.636
#> SRR1329744 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.1753 0.86903 0.952 0.000 0.048
#> SRR1351190 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1458662 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR818573 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.6225 -0.50843 0.568 0.000 0.432
#> SRR1435963 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.3941 0.74186 0.844 0.000 0.156
#> SRR1087968 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1310075 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 3 0.6291 0.50836 0.468 0.000 0.532
#> SRR1326821 1 0.5327 0.54171 0.728 0.000 0.272
#> SRR1490178 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR655613 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1443871 2 0.2878 0.92687 0.000 0.904 0.096
#> SRR1102489 2 0.3551 0.91562 0.000 0.868 0.132
#> SRR1465758 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.5988 0.90606 0.368 0.000 0.632
#> SRR1407449 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.3340 0.92482 0.000 0.880 0.120
#> SRR1479109 3 0.5926 0.90988 0.356 0.000 0.644
#> SRR1399069 1 0.6026 0.19098 0.624 0.000 0.376
#> SRR1366450 1 0.6235 -0.43421 0.564 0.000 0.436
#> SRR1396859 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR1434736 3 0.5465 0.85000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1080560 2 0.4002 0.91244 0.000 0.840 0.160
#> SRR1322882 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327614 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1368141 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1440268 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1325711 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477930 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR656275 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1369052 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.3686 0.75582 0.860 0.000 0.140
#> SRR1404531 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.3686 0.75582 0.860 0.000 0.140
#> SRR1458890 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1432695 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1407624 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR1431969 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1087393 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1077263 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1385211 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1318966 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1407087 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR603212 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321088 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1485190 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1332232 2 0.1643 0.93325 0.000 0.956 0.044
#> SRR1312645 1 0.4931 0.42994 0.768 0.000 0.232
#> SRR1457835 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.5968 0.90744 0.364 0.000 0.636
#> SRR1465501 2 0.3816 0.91419 0.000 0.852 0.148
#> SRR1330878 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1445064 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1452981 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.3340 0.92482 0.000 0.880 0.120
#> SRR1397697 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1477316 3 0.5882 0.90888 0.348 0.000 0.652
#> SRR1077898 1 0.3686 0.75582 0.860 0.000 0.140
#> SRR1349080 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1076096 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR811261 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR1375485 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1432563 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR604414 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR602082 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.4346 0.90939 0.000 0.816 0.184
#> SRR1078417 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1420710 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR660426 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.6111 0.89451 0.396 0.000 0.604
#> SRR661064 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1337707 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1408752 2 0.0237 0.93497 0.000 0.996 0.004
#> SRR1474617 3 0.6008 -0.07406 0.000 0.372 0.628
#> SRR1398013 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1352918 1 0.5835 0.33844 0.660 0.000 0.340
#> SRR1420750 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1353618 2 0.2878 0.92687 0.000 0.904 0.096
#> SRR1082217 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1357256 2 0.2356 0.92979 0.000 0.928 0.072
#> SRR1490313 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1366560 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1313494 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1400078 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1088631 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR1092842 2 0.3816 0.91397 0.000 0.852 0.148
#> SRR615575 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1079434 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1325559 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1383883 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1475697 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1488067 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1102103 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1105154 2 0.3551 0.91562 0.000 0.868 0.132
#> SRR1084991 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1410380 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1445490 2 0.2625 0.92822 0.000 0.916 0.084
#> SRR1454671 2 0.3551 0.92344 0.000 0.868 0.132
#> SRR1435044 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1485812 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1078020 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1311153 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1343898 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR807775 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1409215 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR820427 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1100656 2 0.4002 0.91244 0.000 0.840 0.160
#> SRR1362159 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR656794 1 0.5327 0.54171 0.728 0.000 0.272
#> SRR604653 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.5835 0.90746 0.340 0.000 0.660
#> SRR1485912 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1407602 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1356164 3 0.5905 0.91085 0.352 0.000 0.648
#> SRR1328692 3 0.5948 0.90871 0.360 0.000 0.640
#> SRR1362438 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1358041 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1368200 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1435602 2 0.1289 0.93420 0.000 0.968 0.032
#> SRR1501043 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1437256 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1487446 3 0.6180 0.87956 0.416 0.000 0.584
#> SRR816653 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.2796 0.79752 0.908 0.000 0.092
#> SRR1410573 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0424 0.93477 0.000 0.992 0.008
#> SRR1352369 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1382934 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1465208 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.6126 0.89235 0.400 0.000 0.600
#> SRR1409600 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR816123 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR614779 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR810783 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1333990 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR808106 3 0.5431 0.85218 0.284 0.000 0.716
#> SRR662713 3 0.6168 0.88274 0.412 0.000 0.588
#> SRR1447058 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1480964 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR809382 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR665417 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.4796 0.91948 0.000 0.780 0.220
#> SRR1453166 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1069826 2 0.1411 0.93256 0.000 0.964 0.036
#> SRR1077781 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR615623 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1413787 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1478207 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1411046 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1326560 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1395616 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.4346 0.90939 0.000 0.816 0.184
#> SRR1092961 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR817210 3 0.5905 0.91001 0.352 0.000 0.648
#> SRR1319221 3 0.6341 0.88472 0.312 0.016 0.672
#> SRR1405413 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR607807 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1406283 1 0.0592 0.92024 0.988 0.000 0.012
#> SRR1357709 1 0.5529 0.15242 0.704 0.000 0.296
#> SRR1080742 2 0.4452 0.90879 0.000 0.808 0.192
#> SRR1468208 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1361612 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1099720 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1349250 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1350912 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1357127 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1074980 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1317022 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1332879 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.6093 0.61416 0.776 0.156 0.068
#> SRR1076144 2 0.1643 0.93325 0.000 0.956 0.044
#> SRR1069614 2 0.4002 0.91244 0.000 0.840 0.160
#> SRR818239 2 0.4178 0.91047 0.000 0.828 0.172
#> SRR1421069 2 0.4178 0.91047 0.000 0.828 0.172
#> SRR1500006 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.6299 0.48196 0.476 0.000 0.524
#> SRR1092232 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1344253 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1384290 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1343522 2 0.0424 0.93498 0.000 0.992 0.008
#> SRR1326727 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR818372 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1323675 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR819894 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1310031 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR615419 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1436925 1 0.5733 0.00177 0.676 0.000 0.324
#> SRR1477238 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1442949 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1466239 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR1329971 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.3482 0.92391 0.000 0.872 0.128
#> SRR1097642 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1322981 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1485976 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1471713 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR660522 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR815374 3 0.6168 0.88465 0.412 0.000 0.588
#> SRR1069564 2 0.4452 0.90879 0.000 0.808 0.192
#> SRR1416337 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1316438 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1386844 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR1487128 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.3619 0.92283 0.000 0.864 0.136
#> SRR1069919 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1460296 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.3412 0.92432 0.000 0.876 0.124
#> SRR1081425 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1071337 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1071983 2 0.1031 0.93403 0.000 0.976 0.024
#> SRR1331793 2 0.2356 0.92979 0.000 0.928 0.072
#> SRR1410510 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1098761 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR1312124 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479349 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1089054 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR816201 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1488514 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.6168 0.88240 0.412 0.000 0.588
#> SRR1379303 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR613174 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1351125 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR659157 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1480408 1 0.5678 0.04947 0.684 0.000 0.316
#> SRR657857 3 0.6299 0.76652 0.476 0.000 0.524
#> SRR1073317 2 0.1031 0.93461 0.000 0.976 0.024
#> SRR1332526 1 0.1860 0.86506 0.948 0.000 0.052
#> SRR1094168 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR1431270 3 0.5859 0.90965 0.344 0.000 0.656
#> SRR1085614 2 0.0892 0.93405 0.000 0.980 0.020
#> SRR1330106 3 0.6140 0.89000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1466154 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.2356 0.92979 0.000 0.928 0.072
#> SRR1457267 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR659247 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1317201 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.1643 0.93325 0.000 0.956 0.044
#> SRR1096363 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1453662 1 0.6309 -0.70185 0.504 0.000 0.496
#> SRR1345499 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR1353499 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1380910 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0747 0.93487 0.000 0.984 0.016
#> SRR1498183 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1447148 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR658597 2 0.4178 0.91047 0.000 0.828 0.172
#> SRR1089595 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1074263 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR1376786 1 0.3482 0.72289 0.872 0.000 0.128
#> SRR1345995 1 0.1529 0.88328 0.960 0.000 0.040
#> SRR1071035 1 0.5291 0.29254 0.732 0.000 0.268
#> SRR1068808 2 0.4002 0.91244 0.000 0.840 0.160
#> SRR1332754 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR662438 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1323558 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1381711 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR657985 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1314810 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1336505 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1474095 1 0.6079 -0.34401 0.612 0.000 0.388
#> SRR1363831 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1442376 1 0.0892 0.90869 0.980 0.000 0.020
#> SRR1074909 2 0.4346 0.90939 0.000 0.816 0.184
#> SRR1101200 1 0.5810 -0.06970 0.664 0.000 0.336
#> SRR1075408 2 0.2959 0.92659 0.000 0.900 0.100
#> SRR1367150 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1313406 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1068880 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1467277 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1084867 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1095431 2 0.4291 0.90966 0.000 0.820 0.180
#> SRR1380184 2 0.3267 0.92569 0.000 0.884 0.116
#> SRR1443113 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380414 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1315912 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.1753 0.93290 0.000 0.952 0.048
#> SRR1421116 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR602282 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1361195 2 0.1643 0.93325 0.000 0.956 0.044
#> SRR600493 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.1163 0.89986 0.972 0.000 0.028
#> SRR1355475 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1360785 1 0.5785 0.36722 0.668 0.000 0.332
#> SRR810437 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1361860 3 0.5760 0.83994 0.328 0.000 0.672
#> SRR1441311 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1098903 1 0.6180 -0.01463 0.584 0.000 0.416
#> SRR1457619 3 0.6168 0.88240 0.412 0.000 0.588
#> SRR1498529 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.2537 0.92877 0.000 0.920 0.080
#> SRR1074017 2 0.2625 0.92584 0.000 0.916 0.084
#> SRR1472033 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1399525 2 0.2878 0.92458 0.000 0.904 0.096
#> SRR1312844 2 0.4346 0.90939 0.000 0.816 0.184
#> SRR1085874 2 0.4346 0.90939 0.000 0.816 0.184
#> SRR1101226 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR1476056 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.4002 0.91244 0.000 0.840 0.160
#> SRR1311916 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1353353 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1073291 3 0.6111 0.89451 0.396 0.000 0.604
#> SRR1356227 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1091695 2 0.4178 0.91047 0.000 0.828 0.172
#> SRR1350304 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR663002 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1376983 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR1399926 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1384006 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.4452 0.90879 0.000 0.808 0.192
#> SRR614047 3 0.6111 0.89451 0.396 0.000 0.604
#> SRR818440 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1337770 1 0.1753 0.87121 0.952 0.000 0.048
#> SRR1399413 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1385542 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR1473959 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1074041 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1394495 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR659460 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR816699 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1308612 3 0.6111 0.89451 0.396 0.000 0.604
#> SRR1499418 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1352894 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR815805 1 0.0892 0.91046 0.980 0.000 0.020
#> SRR1331083 2 0.3686 0.91484 0.000 0.860 0.140
#> SRR808272 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1436698 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095627 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR1357672 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1351236 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1101256 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1314707 1 0.0592 0.92012 0.988 0.000 0.012
#> SRR1309534 3 0.6126 0.89238 0.400 0.000 0.600
#> SRR615527 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1098216 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.3551 0.91562 0.000 0.868 0.132
#> SRR1404003 3 0.6168 0.88240 0.412 0.000 0.588
#> SRR1344166 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368638 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1431429 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1079237 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1080509 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR815759 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1502143 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1487614 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1402307 2 0.2796 0.92736 0.000 0.908 0.092
#> SRR820810 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1476547 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR656421 1 0.3686 0.75582 0.860 0.000 0.140
#> SRR1086116 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1499917 3 0.6111 0.89460 0.396 0.000 0.604
#> SRR1339944 2 0.1753 0.93287 0.000 0.952 0.048
#> SRR1391444 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1434889 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1431847 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1317155 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1477405 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1341683 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1084790 1 0.3686 0.75582 0.860 0.000 0.140
#> SRR1073731 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1332588 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1471157 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR654945 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR661028 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.6168 0.88465 0.412 0.000 0.588
#> SRR1358435 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR2165273 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1416386 2 0.3551 0.91562 0.000 0.868 0.132
#> SRR1406048 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1358082 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR655194 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0237 0.93497 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473251 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1389820 3 0.6026 -0.07636 0.000 0.376 0.624
#> SRR1074289 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1348816 2 0.0237 0.93482 0.000 0.996 0.004
#> SRR1076292 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1395810 2 0.2165 0.93064 0.000 0.936 0.064
#> SRR1498909 3 0.6095 0.89636 0.392 0.000 0.608
#> SRR1443507 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1452310 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR665610 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1347322 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.4605 0.90773 0.000 0.796 0.204
#> SRR1477256 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1354247 1 0.0000 0.93244 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.3686 0.92252 0.000 0.860 0.140
#> SRR1487592 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR1352299 1 0.0237 0.92830 0.996 0.000 0.004
#> SRR1076317 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1434117 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1075273 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR658657 3 0.5327 0.85668 0.272 0.000 0.728
#> SRR1092773 2 0.3482 0.91601 0.000 0.872 0.128
#> SRR1365332 3 0.6154 0.88750 0.408 0.000 0.592
#> SRR615958 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1097688 2 0.4178 0.91047 0.000 0.828 0.172
#> SRR1403259 3 0.5291 0.85688 0.268 0.000 0.732
#> SRR1099120 2 0.4002 0.91244 0.000 0.840 0.160
#> SRR1362200 3 0.5905 0.91085 0.352 0.000 0.648
#> SRR1464856 2 0.0000 0.93492 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.5882 0.91162 0.348 0.000 0.652
#> SRR1075923 2 0.3551 0.91562 0.000 0.868 0.132
#> SRR1100703 3 0.6168 0.88240 0.412 0.000 0.588
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.4735 0.53530 0.068 0.000 0.784 0.148
#> SRR1436370 2 0.0188 0.87260 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1075752 2 0.4744 0.82744 0.012 0.704 0.000 0.284
#> SRR1397949 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1355723 3 0.3806 0.55881 0.020 0.000 0.824 0.156
#> SRR1329744 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR657384 3 0.7216 -0.16254 0.412 0.000 0.448 0.140
#> SRR1351190 3 0.4356 0.55572 0.048 0.000 0.804 0.148
#> SRR1458662 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR818573 1 0.6506 0.59429 0.628 0.000 0.240 0.132
#> SRR1396017 1 0.5280 0.76322 0.752 0.000 0.124 0.124
#> SRR1410742 3 0.5771 0.39934 0.144 0.000 0.712 0.144
#> SRR1435963 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1382416 1 0.2859 0.89826 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1391354 4 0.7631 0.52015 0.320 0.000 0.224 0.456
#> SRR1087968 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1310075 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1312244 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1325138 4 0.7069 0.55972 0.124 0.000 0.408 0.468
#> SRR1326821 4 0.7818 0.56988 0.292 0.000 0.292 0.416
#> SRR1490178 2 0.0895 0.87037 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR655613 1 0.3325 0.89485 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1075707 2 0.4319 0.83592 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR1443871 2 0.3013 0.86238 0.080 0.888 0.000 0.032
#> SRR1102489 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1465758 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1414058 3 0.2976 0.58729 0.008 0.000 0.872 0.120
#> SRR1407449 1 0.2714 0.89742 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1436858 2 0.3486 0.85944 0.092 0.864 0.000 0.044
#> SRR1479109 3 0.1489 0.61185 0.004 0.000 0.952 0.044
#> SRR1399069 4 0.7421 0.64397 0.176 0.000 0.356 0.468
#> SRR1366450 3 0.4636 0.39493 0.140 0.000 0.792 0.068
#> SRR1396859 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1457176 1 0.3598 0.88805 0.848 0.000 0.124 0.028
#> SRR1097666 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR1434736 3 0.5508 -0.29199 0.016 0.000 0.508 0.476
#> SRR1080560 2 0.5137 0.82393 0.024 0.680 0.000 0.296
#> SRR1322882 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1435688 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1327614 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR658152 3 0.3444 0.58428 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1368141 3 0.3610 0.57418 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1440268 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1453725 1 0.6215 0.52631 0.600 0.000 0.328 0.072
#> SRR1325711 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1477930 1 0.2859 0.89621 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1477591 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1416049 2 0.2943 0.86315 0.076 0.892 0.000 0.032
#> SRR656275 3 0.3913 0.57209 0.028 0.000 0.824 0.148
#> SRR1369052 1 0.2988 0.89442 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR1377735 1 0.3325 0.89485 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1331244 1 0.6189 0.42444 0.640 0.000 0.092 0.268
#> SRR1404531 1 0.2714 0.89836 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1324331 1 0.5938 0.49957 0.676 0.000 0.092 0.232
#> SRR1458890 3 0.3569 0.57467 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1432695 2 0.1929 0.86918 0.036 0.940 0.000 0.024
#> SRR1407624 2 0.2845 0.86386 0.076 0.896 0.000 0.028
#> SRR1431969 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1087393 2 0.4194 0.83738 0.008 0.764 0.000 0.228
#> SRR1077263 3 0.4898 -0.21773 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1385211 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR655241 1 0.2988 0.89442 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR656922 1 0.3324 0.87978 0.852 0.000 0.136 0.012
#> SRR1361630 3 0.4746 -0.14625 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1318966 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1407087 3 0.2081 0.59917 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR603212 1 0.6150 0.47403 0.580 0.000 0.360 0.060
#> SRR1321088 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1485190 3 0.3219 0.57444 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1332232 2 0.0000 0.87304 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.6873 0.06764 0.272 0.000 0.580 0.148
#> SRR1457835 1 0.3707 0.88263 0.840 0.000 0.132 0.028
#> SRR1347123 3 0.2944 0.57724 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR1465501 2 0.5113 0.82414 0.024 0.684 0.000 0.292
#> SRR1330878 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1445064 3 0.3569 0.57499 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1452981 1 0.6403 0.57094 0.640 0.000 0.232 0.128
#> SRR1326708 1 0.3325 0.89485 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1407157 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1365401 2 0.3421 0.85999 0.088 0.868 0.000 0.044
#> SRR1397697 2 0.0895 0.86995 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1477316 3 0.5056 0.42499 0.044 0.000 0.732 0.224
#> SRR1077898 1 0.5998 0.53100 0.668 0.000 0.092 0.240
#> SRR1349080 3 0.4989 -0.25069 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1076096 2 0.3013 0.86238 0.080 0.888 0.000 0.032
#> SRR811261 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR1375485 1 0.4332 0.85176 0.800 0.000 0.160 0.040
#> SRR1432563 2 0.1411 0.87037 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR604414 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1380614 1 0.2859 0.89826 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR812060 3 0.2032 0.60991 0.028 0.000 0.936 0.036
#> SRR602082 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1069490 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR1078417 2 0.1211 0.87485 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR661613 3 0.0469 0.61611 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420710 3 0.3024 0.57357 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR660426 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1416003 3 0.4182 0.60003 0.024 0.000 0.796 0.180
#> SRR661064 1 0.2859 0.89619 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1082011 2 0.1211 0.87485 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1452718 1 0.3325 0.89485 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1353243 1 0.3325 0.89485 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1455482 1 0.2859 0.89817 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1313473 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1399394 1 0.5074 0.74347 0.724 0.000 0.236 0.040
#> SRR1102467 1 0.5833 0.67243 0.692 0.000 0.212 0.096
#> SRR1317470 3 0.4746 -0.14625 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1337707 3 0.3444 0.57517 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1408752 2 0.1022 0.87498 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1474617 3 0.8549 -0.06714 0.028 0.320 0.384 0.268
#> SRR1398013 3 0.3913 0.57212 0.028 0.000 0.824 0.148
#> SRR1352918 4 0.7478 0.64787 0.188 0.000 0.344 0.468
#> SRR1420750 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1071785 3 0.3356 0.57511 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1353618 2 0.3082 0.86185 0.084 0.884 0.000 0.032
#> SRR1082217 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1357256 2 0.2021 0.86858 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR1490313 3 0.4274 0.56079 0.044 0.000 0.808 0.148
#> SRR1366560 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1355684 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1323289 4 0.4992 0.20528 0.000 0.000 0.476 0.524
#> SRR1313494 1 0.2988 0.89442 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR1309985 1 0.4948 0.79612 0.776 0.000 0.124 0.100
#> SRR607911 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1333789 3 0.2546 0.60284 0.028 0.000 0.912 0.060
#> SRR1400078 3 0.3913 0.57212 0.028 0.000 0.824 0.148
#> SRR1088631 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1092842 2 0.4963 0.82621 0.020 0.696 0.000 0.284
#> SRR615575 3 0.1936 0.61393 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR1079434 3 0.4985 -0.22660 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1325559 1 0.4335 0.84289 0.796 0.000 0.168 0.036
#> SRR1446695 3 0.4866 -0.20111 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1383883 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1396100 3 0.5604 -0.29320 0.020 0.000 0.504 0.476
#> SRR1475697 3 0.3726 0.57750 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1488067 2 0.4744 0.82744 0.012 0.704 0.000 0.284
#> SRR1102103 2 0.3486 0.85944 0.092 0.864 0.000 0.044
#> SRR1105154 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1084991 2 0.4353 0.83541 0.012 0.756 0.000 0.232
#> SRR1410380 3 0.4713 -0.13904 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1445490 2 0.2623 0.86567 0.064 0.908 0.000 0.028
#> SRR1454671 2 0.3486 0.85944 0.092 0.864 0.000 0.044
#> SRR1435044 3 0.3542 0.59308 0.028 0.000 0.852 0.120
#> SRR1485812 3 0.3219 0.60126 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1078020 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1311153 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1376406 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1343898 3 0.5000 -0.24153 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR807775 3 0.4072 0.39804 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1409215 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR820427 3 0.4981 -0.23599 0.000 0.000 0.536 0.464
#> SRR1100656 2 0.5137 0.82393 0.024 0.680 0.000 0.296
#> SRR1362159 1 0.2714 0.89836 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1414536 3 0.4866 -0.18799 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR656794 4 0.7908 0.53723 0.304 0.000 0.336 0.360
#> SRR604653 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1317685 3 0.4277 0.37373 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1485912 3 0.3182 0.59347 0.028 0.000 0.876 0.096
#> SRR1407602 3 0.5000 -0.25179 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1356164 3 0.3486 0.59123 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1328692 3 0.3157 0.60856 0.004 0.000 0.852 0.144
#> SRR1362438 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1479216 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1358041 1 0.3161 0.89135 0.864 0.000 0.124 0.012
#> SRR1468766 3 0.2032 0.60841 0.028 0.000 0.936 0.036
#> SRR1368200 3 0.1256 0.62048 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1435602 2 0.0000 0.87304 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 4 0.4996 0.19660 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1437256 3 0.3837 0.57179 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1487446 3 0.6121 0.33746 0.164 0.000 0.680 0.156
#> SRR816653 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR815164 1 0.5998 0.66257 0.668 0.000 0.240 0.092
#> SRR1442043 3 0.7275 -0.13833 0.376 0.000 0.472 0.152
#> SRR1410573 1 0.2714 0.89836 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1096782 2 0.1743 0.87431 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR1352369 3 0.2214 0.61907 0.028 0.000 0.928 0.044
#> SRR1382934 3 0.3219 0.57444 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1465208 1 0.2714 0.89742 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1314728 1 0.5696 0.69932 0.692 0.000 0.232 0.076
#> SRR1470291 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1308756 3 0.1520 0.61772 0.020 0.000 0.956 0.024
#> SRR1409600 3 0.2984 0.59495 0.028 0.000 0.888 0.084
#> SRR816123 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR614779 3 0.4713 -0.13904 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR810783 3 0.2915 0.59613 0.028 0.000 0.892 0.080
#> SRR1333990 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1410356 3 0.1837 0.60939 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR808106 3 0.4994 -0.26333 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR662713 3 0.2773 0.59927 0.028 0.000 0.900 0.072
#> SRR1447058 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1480964 3 0.1936 0.61928 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR809382 3 0.3219 0.57444 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR665417 1 0.4764 0.81140 0.788 0.000 0.124 0.088
#> SRR1088016 2 0.5496 0.84776 0.088 0.724 0.000 0.188
#> SRR1453166 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1069826 2 0.1940 0.87294 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1077781 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR615623 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1413787 3 0.4697 0.12994 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1478207 3 0.3427 0.58826 0.028 0.000 0.860 0.112
#> SRR1411046 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1313711 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1326560 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1309051 1 0.3325 0.89485 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1486949 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1395616 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1074956 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR1092961 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR817210 3 0.2469 0.60064 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1319221 3 0.4098 0.52954 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1405413 1 0.5970 0.66133 0.668 0.000 0.244 0.088
#> SRR607807 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1390160 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1406283 3 0.5780 -0.28580 0.476 0.000 0.496 0.028
#> SRR1357709 3 0.6482 0.22268 0.208 0.000 0.640 0.152
#> SRR1080742 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR1468208 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1312766 3 0.1837 0.60939 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR1361612 1 0.2714 0.89742 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1311224 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1087801 3 0.3598 0.58111 0.028 0.000 0.848 0.124
#> SRR1099720 2 0.4319 0.83592 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR1349250 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1350912 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1357127 3 0.1388 0.62192 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR1074980 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1317022 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1332879 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1403177 1 0.7042 0.52104 0.676 0.140 0.076 0.108
#> SRR1076144 2 0.0000 0.87304 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.5137 0.82393 0.024 0.680 0.000 0.296
#> SRR818239 2 0.5254 0.82239 0.028 0.672 0.000 0.300
#> SRR1421069 2 0.5254 0.82239 0.028 0.672 0.000 0.300
#> SRR1500006 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1485678 4 0.6843 0.53310 0.100 0.000 0.440 0.460
#> SRR1092232 3 0.3219 0.57444 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1344253 3 0.4925 -0.20841 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1384290 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1089349 3 0.1474 0.61134 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1343522 2 0.0921 0.87493 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1326727 2 0.1022 0.87498 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1440940 3 0.3801 0.57828 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR818372 3 0.2973 0.57655 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1323675 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR819894 3 0.5158 -0.25924 0.004 0.000 0.524 0.472
#> SRR1310031 3 0.2704 0.57609 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR615419 3 0.3688 0.57276 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1436925 3 0.6071 0.30319 0.172 0.000 0.684 0.144
#> SRR1477238 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1332566 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1490228 3 0.1936 0.62435 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR1442949 3 0.4981 -0.22504 0.000 0.000 0.536 0.464
#> SRR1466239 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1094003 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1329971 1 0.4057 0.85519 0.812 0.000 0.160 0.028
#> SRR813076 2 0.3486 0.85944 0.092 0.864 0.000 0.044
#> SRR1097642 2 0.4319 0.83592 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR1322981 3 0.1837 0.60939 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR1485976 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1471713 3 0.2704 0.57609 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR660522 3 0.1733 0.61626 0.028 0.000 0.948 0.024
#> SRR815374 3 0.4820 0.52728 0.060 0.000 0.772 0.168
#> SRR1069564 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR1416337 3 0.4713 -0.13904 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1316438 3 0.3219 0.57444 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1386844 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1373718 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1447458 2 0.2943 0.86315 0.076 0.892 0.000 0.032
#> SRR1487128 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1441421 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1069919 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1460296 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1335489 1 0.2859 0.89607 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1393404 2 0.3486 0.85944 0.092 0.864 0.000 0.044
#> SRR1081425 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1401815 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1071337 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1071983 2 0.2053 0.87303 0.004 0.924 0.000 0.072
#> SRR1331793 2 0.2021 0.86901 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR1410510 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1098761 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR1312124 1 0.6403 0.57127 0.640 0.000 0.232 0.128
#> SRR615395 1 0.5423 0.60077 0.640 0.000 0.332 0.028
#> SRR1479349 1 0.3876 0.86436 0.836 0.000 0.124 0.040
#> SRR2165033 3 0.3962 0.57105 0.028 0.000 0.820 0.152
#> SRR1089054 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR816201 3 0.3024 0.57357 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1488514 2 0.1302 0.87467 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR655840 3 0.4829 0.52765 0.068 0.000 0.776 0.156
#> SRR1379303 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1418516 3 0.5165 -0.26117 0.004 0.000 0.512 0.484
#> SRR613174 3 0.1936 0.61393 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR1351125 3 0.1936 0.60970 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR659157 3 0.3942 0.56758 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1480408 3 0.6330 0.26335 0.200 0.000 0.656 0.144
#> SRR657857 3 0.5003 0.51048 0.084 0.000 0.768 0.148
#> SRR1073317 2 0.0336 0.87389 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1332526 3 0.7019 -0.05393 0.344 0.000 0.524 0.132
#> SRR1094168 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR1431270 3 0.3688 0.57190 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1085614 2 0.1557 0.87444 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1330106 3 0.4281 0.59489 0.028 0.000 0.792 0.180
#> SRR1466154 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1396944 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1082784 2 0.2124 0.86793 0.040 0.932 0.000 0.028
#> SRR1457267 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR614659 3 0.3863 0.56982 0.028 0.000 0.828 0.144
#> SRR659247 3 0.3760 0.56956 0.028 0.000 0.836 0.136
#> SRR1317201 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1473696 1 0.3812 0.87650 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1375842 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1388123 2 0.0000 0.87304 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1453662 3 0.5140 0.47185 0.096 0.000 0.760 0.144
#> SRR1345499 2 0.2845 0.86386 0.076 0.896 0.000 0.028
#> SRR1353499 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1416693 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1070841 3 0.1388 0.61636 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR1380910 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1333125 2 0.1022 0.87480 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1498183 1 0.3598 0.88769 0.848 0.000 0.124 0.028
#> SRR612659 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1447148 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR658597 2 0.5321 0.82212 0.032 0.672 0.000 0.296
#> SRR1089595 2 0.4319 0.83592 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR1074263 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1376786 3 0.5511 0.04174 0.332 0.000 0.636 0.032
#> SRR1345995 3 0.6136 -0.02002 0.356 0.000 0.584 0.060
#> SRR1071035 3 0.5875 0.25633 0.204 0.000 0.692 0.104
#> SRR1068808 2 0.5137 0.82393 0.024 0.680 0.000 0.296
#> SRR1332754 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR662438 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1335355 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR659448 3 0.1936 0.61393 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR1323558 3 0.1022 0.60995 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1381711 3 0.4855 -0.19369 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR657985 3 0.4746 -0.14625 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1314810 1 0.5698 0.52716 0.608 0.000 0.356 0.036
#> SRR1336505 3 0.3367 0.61284 0.028 0.000 0.864 0.108
#> SRR1474095 3 0.6500 0.10123 0.260 0.000 0.620 0.120
#> SRR1363831 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1442376 1 0.7142 0.26058 0.524 0.000 0.324 0.152
#> SRR1074909 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR1101200 3 0.4332 0.37245 0.176 0.000 0.792 0.032
#> SRR1075408 2 0.3082 0.86185 0.084 0.884 0.000 0.032
#> SRR1367150 3 0.5165 -0.26117 0.004 0.000 0.512 0.484
#> SRR1313406 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1068880 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1467277 3 0.4877 -0.19231 0.000 0.000 0.592 0.408
#> SRR1084867 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1095431 2 0.5321 0.82212 0.032 0.672 0.000 0.296
#> SRR1380184 2 0.3333 0.86129 0.088 0.872 0.000 0.040
#> SRR1443113 1 0.6145 0.23641 0.492 0.000 0.460 0.048
#> SRR1380414 3 0.4643 -0.12566 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1315912 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1075778 2 0.0000 0.87304 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR602282 3 0.3569 0.57499 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1361195 2 0.0000 0.87304 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1477653 1 0.6148 0.19768 0.484 0.000 0.468 0.048
#> SRR1355475 3 0.1936 0.61393 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR1360785 4 0.7495 0.64688 0.192 0.000 0.340 0.468
#> SRR810437 3 0.3528 0.57523 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1361860 3 0.5866 0.12629 0.052 0.000 0.624 0.324
#> SRR1441311 2 0.1624 0.87012 0.028 0.952 0.000 0.020
#> SRR1098903 4 0.7356 0.63217 0.164 0.000 0.368 0.468
#> SRR1457619 3 0.4499 0.54774 0.048 0.000 0.792 0.160
#> SRR1498529 1 0.4224 0.84368 0.812 0.000 0.144 0.044
#> SRR1097172 2 0.2300 0.86738 0.048 0.924 0.000 0.028
#> SRR1074017 2 0.3428 0.85911 0.012 0.844 0.000 0.144
#> SRR1472033 2 0.1302 0.87467 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1445087 3 0.3219 0.57444 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1399525 2 0.3873 0.85042 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1312844 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR1085874 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR1101226 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR1476056 1 0.6420 0.57149 0.640 0.000 0.228 0.132
#> SRR1075659 2 0.5137 0.82393 0.024 0.680 0.000 0.296
#> SRR1311916 3 0.2704 0.57609 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1353353 3 0.3219 0.57444 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1073291 3 0.2563 0.60932 0.020 0.000 0.908 0.072
#> SRR1356227 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1080720 2 0.4319 0.83592 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR1091695 2 0.5321 0.82212 0.032 0.672 0.000 0.296
#> SRR1350304 3 0.5165 -0.26117 0.004 0.000 0.512 0.484
#> SRR663002 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1376983 2 0.2699 0.86548 0.068 0.904 0.000 0.028
#> SRR1399926 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1347144 3 0.2704 0.57609 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1384006 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1499108 2 0.5592 0.82010 0.044 0.656 0.000 0.300
#> SRR614047 3 0.1297 0.61853 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR818440 3 0.3485 0.59571 0.028 0.000 0.856 0.116
#> SRR1337770 1 0.7186 -0.00684 0.444 0.000 0.420 0.136
#> SRR1399413 3 0.2984 0.59446 0.028 0.000 0.888 0.084
#> SRR1385542 2 0.3082 0.86185 0.084 0.884 0.000 0.032
#> SRR1473959 3 0.3913 0.57212 0.028 0.000 0.824 0.148
#> SRR1074041 3 0.1936 0.60970 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR1394495 2 0.2845 0.86386 0.076 0.896 0.000 0.028
#> SRR659460 3 0.2214 0.60738 0.028 0.000 0.928 0.044
#> SRR816699 3 0.2124 0.61025 0.028 0.000 0.932 0.040
#> SRR1308612 3 0.1520 0.61766 0.020 0.000 0.956 0.024
#> SRR1499418 3 0.4998 -0.23434 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1352894 2 0.2943 0.86311 0.076 0.892 0.000 0.032
#> SRR815805 3 0.7037 -0.14628 0.416 0.000 0.464 0.120
#> SRR1331083 2 0.4857 0.82675 0.016 0.700 0.000 0.284
#> SRR808272 3 0.2149 0.59675 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1436698 1 0.4238 0.84332 0.796 0.000 0.176 0.028
#> SRR1095627 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR1357672 3 0.4697 -0.14894 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1351236 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1077479 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR814491 3 0.5606 -0.29418 0.020 0.000 0.500 0.480
#> SRR1101256 2 0.1302 0.87467 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1436004 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1457994 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1078998 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1314707 1 0.7135 0.09704 0.468 0.000 0.400 0.132
#> SRR1309534 3 0.4010 0.57124 0.028 0.000 0.816 0.156
#> SRR615527 3 0.3311 0.56966 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1098216 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1325847 2 0.4857 0.82675 0.016 0.700 0.000 0.284
#> SRR1404003 3 0.4852 0.52664 0.072 0.000 0.776 0.152
#> SRR1344166 1 0.4508 0.82738 0.780 0.000 0.184 0.036
#> SRR1368638 3 0.5510 -0.28527 0.016 0.000 0.504 0.480
#> SRR1431429 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1079237 2 0.4744 0.82801 0.012 0.704 0.000 0.284
#> SRR1080509 2 0.1913 0.86974 0.040 0.940 0.000 0.020
#> SRR815759 3 0.4977 -0.22481 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR1502143 3 0.1733 0.61355 0.028 0.000 0.948 0.024
#> SRR1487614 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1402307 2 0.3082 0.86185 0.084 0.884 0.000 0.032
#> SRR820810 1 0.7110 0.14277 0.460 0.000 0.412 0.128
#> SRR1099212 2 0.1211 0.87485 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1083215 3 0.2845 0.59795 0.028 0.000 0.896 0.076
#> SRR1476547 2 0.4319 0.83592 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR656421 1 0.6383 0.34020 0.612 0.000 0.096 0.292
#> SRR1086116 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1499917 3 0.3597 0.57493 0.016 0.000 0.836 0.148
#> SRR1339944 2 0.0000 0.87304 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0707 0.87026 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1434889 3 0.3962 0.57012 0.028 0.000 0.820 0.152
#> SRR1431847 4 0.4989 0.17587 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1317155 3 0.4323 0.58336 0.028 0.000 0.788 0.184
#> SRR1477405 1 0.2988 0.89770 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR655289 3 0.5294 -0.28472 0.008 0.000 0.508 0.484
#> SRR1341683 3 0.3801 0.57833 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1084790 1 0.7628 -0.17670 0.440 0.000 0.212 0.348
#> SRR1073731 3 0.2704 0.58874 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1332588 3 0.5165 -0.26117 0.004 0.000 0.512 0.484
#> SRR1471157 2 0.1820 0.86974 0.036 0.944 0.000 0.020
#> SRR654945 3 0.2032 0.61232 0.028 0.000 0.936 0.036
#> SRR661028 1 0.3427 0.89320 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1413477 2 0.1302 0.87467 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1101152 3 0.3760 0.57019 0.028 0.000 0.836 0.136
#> SRR1358435 2 0.4576 0.83178 0.012 0.728 0.000 0.260
#> SRR2165273 1 0.2530 0.89838 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1379014 1 0.2859 0.89621 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1489904 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1416386 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1406048 1 0.3764 0.87015 0.844 0.000 0.116 0.040
#> SRR606982 3 0.4989 -0.23807 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1358082 1 0.2859 0.89817 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1312934 3 0.1211 0.61733 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR655194 1 0.5609 0.70777 0.712 0.000 0.200 0.088
#> SRR1331174 2 0.1022 0.87498 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1473251 2 0.4319 0.83592 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR1389820 3 0.8601 -0.08503 0.028 0.336 0.348 0.288
#> SRR1074289 3 0.2385 0.60478 0.028 0.000 0.920 0.052
#> SRR1348816 2 0.1389 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1076292 3 0.3266 0.59943 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1395810 2 0.1297 0.87043 0.016 0.964 0.000 0.020
#> SRR1498909 3 0.3695 0.60827 0.016 0.000 0.828 0.156
#> SRR1443507 3 0.2124 0.60755 0.028 0.000 0.932 0.040
#> SRR1452310 3 0.3863 0.57569 0.028 0.000 0.828 0.144
#> SRR665610 3 0.3074 0.56839 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1347322 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR813395 2 0.5636 0.81928 0.044 0.648 0.000 0.308
#> SRR1477256 1 0.3219 0.89612 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR1470230 3 0.4999 -0.23710 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1354247 1 0.2714 0.89762 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1082640 2 0.3550 0.85896 0.096 0.860 0.000 0.044
#> SRR1487592 3 0.1837 0.60939 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR1352299 1 0.5766 0.41988 0.564 0.000 0.404 0.032
#> SRR1076317 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1434117 3 0.2281 0.54105 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1075273 2 0.4621 0.82953 0.008 0.708 0.000 0.284
#> SRR658657 3 0.4989 -0.22860 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1092773 2 0.4353 0.83541 0.012 0.756 0.000 0.232
#> SRR1365332 3 0.1837 0.60939 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR615958 3 0.2704 0.57609 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1097688 2 0.5231 0.82262 0.028 0.676 0.000 0.296
#> SRR1403259 3 0.5000 -0.21494 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1099120 2 0.5137 0.82393 0.024 0.680 0.000 0.296
#> SRR1362200 3 0.2281 0.59300 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1464856 2 0.1302 0.87467 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1347298 3 0.2760 0.57554 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1075923 2 0.4770 0.82720 0.012 0.700 0.000 0.288
#> SRR1100703 3 0.3004 0.58990 0.048 0.000 0.892 0.060
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.3388 0.50208 0.040 0.000 0.864 0.040 0.056
#> SRR1436370 2 0.3143 0.75247 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1075752 2 0.6383 0.68971 0.000 0.516 0.000 0.256 0.228
#> SRR1397949 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1355723 3 0.3022 0.50090 0.020 0.000 0.880 0.036 0.064
#> SRR1329744 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR657384 3 0.5946 0.19738 0.304 0.000 0.600 0.036 0.060
#> SRR1351190 3 0.2966 0.51545 0.020 0.000 0.884 0.040 0.056
#> SRR1458662 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR818573 1 0.6218 0.25065 0.456 0.000 0.448 0.028 0.068
#> SRR1396017 1 0.5121 0.66330 0.708 0.000 0.212 0.024 0.056
#> SRR1410742 3 0.4261 0.45363 0.096 0.000 0.808 0.036 0.060
#> SRR1435963 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1382416 1 0.1978 0.89176 0.928 0.000 0.044 0.024 0.004
#> SRR1391354 5 0.6383 0.41886 0.196 0.000 0.264 0.004 0.536
#> SRR1087968 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1310075 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1312244 1 0.1626 0.89337 0.940 0.000 0.044 0.016 0.000
#> SRR1325138 3 0.6282 -0.58231 0.080 0.000 0.448 0.024 0.448
#> SRR1326821 5 0.6071 0.44693 0.184 0.000 0.220 0.004 0.592
#> SRR1490178 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR655613 1 0.2899 0.86066 0.872 0.000 0.100 0.020 0.008
#> SRR1075707 2 0.5103 0.71473 0.000 0.512 0.000 0.452 0.036
#> SRR1443871 2 0.0960 0.72836 0.016 0.972 0.000 0.008 0.004
#> SRR1102489 2 0.6413 0.68658 0.000 0.508 0.000 0.268 0.224
#> SRR1465758 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1414058 3 0.5665 0.42945 0.004 0.000 0.648 0.172 0.176
#> SRR1407449 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1436858 2 0.1865 0.72183 0.024 0.936 0.000 0.032 0.008
#> SRR1479109 3 0.3516 0.57099 0.004 0.000 0.812 0.020 0.164
#> SRR1399069 5 0.6011 0.54355 0.108 0.000 0.360 0.004 0.528
#> SRR1366450 3 0.4963 0.50470 0.072 0.000 0.752 0.036 0.140
#> SRR1396859 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1457176 1 0.3216 0.84325 0.852 0.000 0.116 0.020 0.012
#> SRR1097666 2 0.6902 0.67113 0.016 0.480 0.000 0.276 0.228
#> SRR1434736 5 0.4446 0.66365 0.004 0.000 0.476 0.000 0.520
#> SRR1080560 2 0.6544 0.67515 0.000 0.468 0.000 0.308 0.224
#> SRR1322882 1 0.2615 0.87468 0.892 0.000 0.080 0.020 0.008
#> SRR1435688 2 0.3796 0.75734 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1327614 1 0.1408 0.89326 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR658152 3 0.4395 0.39956 0.000 0.000 0.748 0.188 0.064
#> SRR1368141 3 0.5408 0.02791 0.000 0.000 0.532 0.408 0.060
#> SRR1440268 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1453725 3 0.6473 -0.12956 0.428 0.000 0.452 0.028 0.092
#> SRR1325711 2 0.3796 0.75734 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1477930 1 0.1357 0.89232 0.948 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR1477591 1 0.2086 0.89008 0.924 0.000 0.048 0.020 0.008
#> SRR1416049 2 0.0727 0.73377 0.004 0.980 0.000 0.012 0.004
#> SRR656275 3 0.2710 0.52110 0.016 0.000 0.896 0.032 0.056
#> SRR1369052 1 0.1788 0.88618 0.932 0.000 0.056 0.008 0.004
#> SRR1377735 1 0.2104 0.89090 0.924 0.000 0.044 0.024 0.008
#> SRR1331244 1 0.4867 0.48634 0.652 0.000 0.036 0.004 0.308
#> SRR1404531 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1324331 1 0.4508 0.58603 0.708 0.000 0.032 0.004 0.256
#> SRR1458890 3 0.5461 0.02493 0.000 0.000 0.528 0.408 0.064
#> SRR1432695 2 0.1965 0.74915 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1407624 2 0.0404 0.73184 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.5883 0.08991 0.000 0.000 0.524 0.368 0.108
#> SRR1087393 2 0.5100 0.71542 0.000 0.516 0.000 0.448 0.036
#> SRR1077263 5 0.4166 0.60210 0.004 0.000 0.348 0.000 0.648
#> SRR1385211 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR655241 1 0.2158 0.87968 0.920 0.000 0.052 0.008 0.020
#> SRR656922 1 0.3462 0.77635 0.792 0.000 0.196 0.012 0.000
#> SRR1361630 5 0.4047 0.57234 0.000 0.000 0.320 0.004 0.676
#> SRR1318966 2 0.6374 0.68994 0.000 0.512 0.000 0.280 0.208
#> SRR1407087 3 0.3991 0.55408 0.000 0.000 0.780 0.048 0.172
#> SRR603212 3 0.6458 0.07919 0.376 0.000 0.500 0.028 0.096
#> SRR1321088 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1485190 3 0.5394 0.03932 0.000 0.000 0.540 0.400 0.060
#> SRR1332232 2 0.3242 0.75350 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1312645 3 0.5227 0.34733 0.172 0.000 0.724 0.040 0.064
#> SRR1457835 1 0.3863 0.78644 0.792 0.000 0.176 0.020 0.012
#> SRR1347123 3 0.6058 0.08463 0.008 0.000 0.508 0.388 0.096
#> SRR1465501 2 0.6491 0.68172 0.000 0.488 0.000 0.284 0.228
#> SRR1330878 3 0.5815 0.04599 0.000 0.000 0.508 0.396 0.096
#> SRR1445064 3 0.5188 0.18329 0.000 0.000 0.600 0.344 0.056
#> SRR1452981 1 0.6177 0.31402 0.496 0.000 0.412 0.036 0.056
#> SRR1326708 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1407157 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.1865 0.72183 0.024 0.936 0.000 0.032 0.008
#> SRR1397697 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1477316 3 0.4434 0.34553 0.032 0.000 0.784 0.044 0.140
#> SRR1077898 1 0.5031 0.60226 0.692 0.000 0.036 0.024 0.248
#> SRR1349080 5 0.4434 0.66604 0.000 0.000 0.460 0.004 0.536
#> SRR1076096 2 0.0833 0.72939 0.016 0.976 0.000 0.004 0.004
#> SRR811261 2 0.6888 0.67053 0.016 0.484 0.000 0.272 0.228
#> SRR1375485 1 0.5011 0.62965 0.660 0.000 0.292 0.036 0.012
#> SRR1432563 2 0.2852 0.75222 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR604414 1 0.2899 0.86066 0.872 0.000 0.100 0.020 0.008
#> SRR1380614 1 0.1978 0.89176 0.928 0.000 0.044 0.024 0.004
#> SRR812060 3 0.3826 0.57215 0.012 0.000 0.796 0.020 0.172
#> SRR602082 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1069490 2 0.6774 0.67229 0.008 0.468 0.000 0.300 0.224
#> SRR1078417 2 0.3752 0.75757 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR661613 3 0.3264 0.56774 0.000 0.000 0.820 0.016 0.164
#> SRR1420710 3 0.2291 0.51384 0.000 0.000 0.908 0.036 0.056
#> SRR660426 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1416003 3 0.3205 0.53304 0.008 0.000 0.864 0.072 0.056
#> SRR661064 1 0.1862 0.88564 0.932 0.000 0.048 0.004 0.016
#> SRR1082011 2 0.3752 0.75757 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1452718 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1353243 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1455482 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1313473 1 0.1408 0.89338 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1399394 1 0.6084 0.42337 0.544 0.000 0.356 0.020 0.080
#> SRR1102467 1 0.5827 0.37018 0.520 0.000 0.408 0.020 0.052
#> SRR1317470 5 0.4047 0.57234 0.000 0.000 0.320 0.004 0.676
#> SRR1337707 3 0.5447 0.03788 0.000 0.000 0.536 0.400 0.064
#> SRR1408752 2 0.3684 0.75808 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1474617 4 0.7316 0.49063 0.008 0.116 0.212 0.560 0.104
#> SRR1398013 3 0.2766 0.52136 0.012 0.000 0.892 0.040 0.056
#> SRR1352918 5 0.6012 0.53390 0.116 0.000 0.332 0.004 0.548
#> SRR1420750 1 0.2124 0.88999 0.924 0.000 0.044 0.020 0.012
#> SRR1071785 3 0.5454 0.03744 0.000 0.000 0.532 0.404 0.064
#> SRR1353618 2 0.1059 0.72782 0.020 0.968 0.000 0.008 0.004
#> SRR1082217 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1357256 2 0.1851 0.74798 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1490313 3 0.3058 0.51335 0.024 0.000 0.880 0.040 0.056
#> SRR1366560 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.6857 -0.38854 0.004 0.000 0.252 0.348 0.396
#> SRR1313494 1 0.1357 0.89232 0.948 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR1309985 1 0.4744 0.71141 0.744 0.000 0.184 0.020 0.052
#> SRR607911 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.3446 0.57102 0.012 0.000 0.828 0.016 0.144
#> SRR1400078 3 0.2766 0.51799 0.012 0.000 0.892 0.040 0.056
#> SRR1088631 2 0.3796 0.75734 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1092842 2 0.6472 0.68260 0.000 0.492 0.000 0.284 0.224
#> SRR615575 3 0.3787 0.57265 0.012 0.000 0.800 0.020 0.168
#> SRR1079434 5 0.4528 0.65195 0.000 0.000 0.444 0.008 0.548
#> SRR1325559 1 0.4235 0.73823 0.748 0.000 0.220 0.020 0.012
#> SRR1446695 5 0.4135 0.59626 0.004 0.000 0.340 0.000 0.656
#> SRR1383883 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1396100 5 0.4664 0.64018 0.008 0.000 0.436 0.004 0.552
#> SRR1475697 3 0.4914 0.27365 0.000 0.000 0.676 0.260 0.064
#> SRR1488067 2 0.6396 0.68783 0.000 0.512 0.000 0.264 0.224
#> SRR1102103 2 0.2201 0.71834 0.032 0.920 0.000 0.040 0.008
#> SRR1105154 2 0.6413 0.68661 0.000 0.508 0.000 0.268 0.224
#> SRR1084991 2 0.5483 0.71340 0.000 0.512 0.000 0.424 0.064
#> SRR1410380 5 0.4066 0.56574 0.000 0.000 0.324 0.004 0.672
#> SRR1445490 2 0.0798 0.73366 0.016 0.976 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454671 2 0.2116 0.71907 0.028 0.924 0.000 0.040 0.008
#> SRR1435044 3 0.1764 0.54635 0.012 0.000 0.940 0.036 0.012
#> SRR1485812 3 0.5008 0.17326 0.000 0.000 0.644 0.300 0.056
#> SRR1078020 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1311153 1 0.1978 0.89176 0.928 0.000 0.044 0.024 0.004
#> SRR1376406 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1343898 4 0.6742 0.37156 0.000 0.000 0.260 0.388 0.352
#> SRR807775 3 0.6429 0.00857 0.000 0.000 0.496 0.208 0.296
#> SRR1409215 2 0.3816 0.75741 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR820427 5 0.4403 0.65644 0.000 0.000 0.436 0.004 0.560
#> SRR1100656 2 0.6544 0.67515 0.000 0.468 0.000 0.308 0.224
#> SRR1362159 1 0.1787 0.89212 0.936 0.000 0.044 0.016 0.004
#> SRR1414536 5 0.4084 0.58445 0.000 0.000 0.328 0.004 0.668
#> SRR656794 5 0.6431 0.41957 0.176 0.000 0.224 0.020 0.580
#> SRR604653 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1317685 3 0.5785 -0.30748 0.000 0.000 0.560 0.108 0.332
#> SRR1485912 3 0.3247 0.57229 0.016 0.000 0.840 0.008 0.136
#> SRR1407602 5 0.4473 0.63282 0.000 0.000 0.412 0.008 0.580
#> SRR1356164 3 0.3819 0.39388 0.000 0.000 0.756 0.228 0.016
#> SRR1328692 3 0.4004 0.42312 0.004 0.000 0.748 0.232 0.016
#> SRR1362438 1 0.2615 0.87468 0.892 0.000 0.080 0.020 0.008
#> SRR1479216 3 0.5883 0.08991 0.000 0.000 0.524 0.368 0.108
#> SRR1358041 1 0.2284 0.86667 0.896 0.000 0.096 0.004 0.004
#> SRR1468766 3 0.3667 0.57364 0.012 0.000 0.812 0.020 0.156
#> SRR1368200 3 0.3531 0.57531 0.012 0.000 0.820 0.016 0.152
#> SRR1435602 2 0.3305 0.75453 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1501043 5 0.6732 -0.37237 0.000 0.000 0.260 0.340 0.400
#> SRR1437256 3 0.5281 0.05578 0.000 0.000 0.548 0.400 0.052
#> SRR1487446 3 0.4602 0.40854 0.112 0.000 0.784 0.040 0.064
#> SRR816653 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR815164 1 0.6139 0.38772 0.520 0.000 0.380 0.020 0.080
#> SRR1442043 3 0.5821 0.24998 0.244 0.000 0.648 0.040 0.068
#> SRR1410573 1 0.1787 0.89212 0.936 0.000 0.044 0.016 0.004
#> SRR1096782 2 0.3966 0.75532 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1352369 3 0.3801 0.58172 0.012 0.000 0.808 0.028 0.152
#> SRR1382934 3 0.5447 0.02809 0.000 0.000 0.536 0.400 0.064
#> SRR1465208 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1314728 1 0.5820 0.58366 0.628 0.000 0.268 0.024 0.080
#> SRR1470291 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.3972 0.56913 0.008 0.000 0.788 0.032 0.172
#> SRR1409600 3 0.4043 0.55325 0.012 0.000 0.792 0.036 0.160
#> SRR816123 2 0.6902 0.67113 0.016 0.480 0.000 0.276 0.228
#> SRR614779 5 0.4066 0.56574 0.000 0.000 0.324 0.004 0.672
#> SRR810783 3 0.3402 0.57097 0.012 0.000 0.832 0.016 0.140
#> SRR1333990 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1410356 3 0.3748 0.57310 0.012 0.000 0.804 0.020 0.164
#> SRR808106 5 0.4675 0.66915 0.008 0.000 0.444 0.004 0.544
#> SRR662713 3 0.3402 0.57097 0.012 0.000 0.832 0.016 0.140
#> SRR1447058 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1480964 3 0.3255 0.58091 0.012 0.000 0.840 0.012 0.136
#> SRR809382 3 0.5394 0.03932 0.000 0.000 0.540 0.400 0.060
#> SRR665417 1 0.4711 0.70961 0.744 0.000 0.188 0.020 0.048
#> SRR1088016 2 0.5079 0.70730 0.016 0.728 0.000 0.156 0.100
#> SRR1453166 2 0.6396 0.68798 0.000 0.508 0.000 0.280 0.212
#> SRR1069826 2 0.4127 0.75588 0.000 0.680 0.000 0.312 0.008
#> SRR1077781 2 0.3796 0.75734 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR615623 3 0.5808 0.05006 0.000 0.000 0.512 0.392 0.096
#> SRR1413787 4 0.6801 0.39498 0.000 0.000 0.312 0.376 0.312
#> SRR1478207 3 0.5400 0.46204 0.012 0.000 0.680 0.212 0.096
#> SRR1411046 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1313711 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1326560 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1309051 1 0.2086 0.89008 0.924 0.000 0.048 0.020 0.008
#> SRR1486949 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1395616 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1074956 2 0.6774 0.67229 0.008 0.468 0.000 0.300 0.224
#> SRR1092961 2 0.6888 0.67053 0.016 0.484 0.000 0.272 0.228
#> SRR817210 3 0.2046 0.56311 0.000 0.000 0.916 0.016 0.068
#> SRR1319221 3 0.5987 -0.20075 0.008 0.000 0.460 0.448 0.084
#> SRR1405413 1 0.6255 0.32428 0.492 0.000 0.404 0.024 0.080
#> SRR607807 1 0.1282 0.89297 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1390160 3 0.5773 0.05699 0.000 0.000 0.512 0.396 0.092
#> SRR1406283 3 0.6756 0.27209 0.288 0.000 0.540 0.040 0.132
#> SRR1357709 3 0.4605 0.41552 0.120 0.000 0.780 0.032 0.068
#> SRR1080742 2 0.6916 0.67183 0.016 0.476 0.000 0.280 0.228
#> SRR1468208 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1312766 3 0.3748 0.57310 0.012 0.000 0.804 0.020 0.164
#> SRR1361612 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1311224 1 0.2727 0.87258 0.888 0.000 0.080 0.020 0.012
#> SRR1087801 3 0.3320 0.56708 0.016 0.000 0.844 0.016 0.124
#> SRR1099720 2 0.5103 0.71473 0.000 0.512 0.000 0.452 0.036
#> SRR1349250 2 0.6408 0.68722 0.000 0.508 0.000 0.272 0.220
#> SRR1350912 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1357127 3 0.3667 0.57947 0.012 0.000 0.812 0.020 0.156
#> SRR1074980 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1317022 3 0.5808 0.05006 0.000 0.000 0.512 0.392 0.096
#> SRR1332879 1 0.3063 0.85569 0.864 0.000 0.104 0.020 0.012
#> SRR1403177 1 0.6675 0.55524 0.636 0.092 0.032 0.196 0.044
#> SRR1076144 2 0.3242 0.75350 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1069614 2 0.6533 0.67688 0.000 0.472 0.000 0.304 0.224
#> SRR818239 2 0.6554 0.67425 0.000 0.464 0.000 0.312 0.224
#> SRR1421069 2 0.6554 0.67425 0.000 0.464 0.000 0.312 0.224
#> SRR1500006 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1485678 5 0.5701 0.46723 0.068 0.000 0.464 0.004 0.464
#> SRR1092232 3 0.5499 0.01965 0.000 0.000 0.532 0.400 0.068
#> SRR1344253 5 0.4331 0.63042 0.000 0.000 0.400 0.004 0.596
#> SRR1384290 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.3438 0.56579 0.000 0.000 0.808 0.020 0.172
#> SRR1343522 2 0.3661 0.75817 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1326727 2 0.3684 0.75808 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1440940 3 0.4058 0.45073 0.000 0.000 0.784 0.152 0.064
#> SRR818372 3 0.2370 0.51528 0.000 0.000 0.904 0.040 0.056
#> SRR1323675 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR819894 5 0.4557 0.64083 0.004 0.000 0.440 0.004 0.552
#> SRR1310031 3 0.5970 0.10617 0.000 0.000 0.524 0.356 0.120
#> SRR615419 3 0.5401 0.04200 0.000 0.000 0.536 0.404 0.060
#> SRR1436925 3 0.4461 0.45149 0.108 0.000 0.792 0.032 0.068
#> SRR1477238 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1332566 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1490228 3 0.3666 0.58278 0.012 0.000 0.824 0.032 0.132
#> SRR1442949 5 0.4397 0.65032 0.000 0.000 0.432 0.004 0.564
#> SRR1466239 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.3837 0.75749 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1329971 1 0.5090 0.72745 0.732 0.000 0.160 0.024 0.084
#> SRR813076 2 0.2201 0.71834 0.032 0.920 0.000 0.040 0.008
#> SRR1097642 2 0.5103 0.71473 0.000 0.512 0.000 0.452 0.036
#> SRR1322981 3 0.3748 0.57310 0.012 0.000 0.804 0.020 0.164
#> SRR1485976 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1471713 3 0.5883 0.08991 0.000 0.000 0.524 0.368 0.108
#> SRR660522 3 0.3961 0.57363 0.012 0.000 0.792 0.028 0.168
#> SRR815374 3 0.3097 0.50739 0.024 0.000 0.876 0.032 0.068
#> SRR1069564 2 0.6835 0.67108 0.012 0.476 0.000 0.288 0.224
#> SRR1416337 5 0.4066 0.56574 0.000 0.000 0.324 0.004 0.672
#> SRR1316438 3 0.5499 0.01965 0.000 0.000 0.532 0.400 0.068
#> SRR1386844 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1373718 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1447458 2 0.0324 0.73232 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487128 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1441421 2 0.2201 0.71834 0.032 0.920 0.000 0.040 0.008
#> SRR1069919 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1460296 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1335489 1 0.1628 0.88798 0.936 0.000 0.056 0.008 0.000
#> SRR1393404 2 0.1865 0.72183 0.024 0.936 0.000 0.032 0.008
#> SRR1081425 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1401815 3 0.5815 0.04599 0.000 0.000 0.508 0.396 0.096
#> SRR1071337 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1071983 2 0.4030 0.75316 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1331793 2 0.1478 0.74558 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1410510 3 0.5883 0.08991 0.000 0.000 0.524 0.368 0.108
#> SRR1098761 2 0.6902 0.67113 0.016 0.480 0.000 0.276 0.228
#> SRR1312124 1 0.5625 0.44422 0.564 0.000 0.368 0.012 0.056
#> SRR615395 1 0.6938 0.09017 0.420 0.000 0.412 0.036 0.132
#> SRR1479349 1 0.3926 0.79782 0.820 0.000 0.112 0.020 0.048
#> SRR2165033 3 0.2791 0.51971 0.016 0.000 0.892 0.036 0.056
#> SRR1089054 2 0.2352 0.71746 0.032 0.912 0.000 0.048 0.008
#> SRR816201 3 0.2291 0.51384 0.000 0.000 0.908 0.036 0.056
#> SRR1488514 2 0.3774 0.75739 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR655840 3 0.3595 0.49008 0.040 0.000 0.852 0.044 0.064
#> SRR1379303 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1418516 5 0.4557 0.64083 0.004 0.000 0.440 0.004 0.552
#> SRR613174 3 0.3787 0.57265 0.012 0.000 0.800 0.020 0.168
#> SRR1351125 3 0.4000 0.56916 0.012 0.000 0.788 0.028 0.172
#> SRR659157 3 0.5498 0.07080 0.000 0.000 0.568 0.356 0.076
#> SRR1480408 3 0.4586 0.42234 0.128 0.000 0.780 0.036 0.056
#> SRR657857 3 0.3880 0.48098 0.056 0.000 0.836 0.044 0.064
#> SRR1073317 2 0.3452 0.75674 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1332526 3 0.5470 0.30325 0.228 0.000 0.680 0.036 0.056
#> SRR1094168 2 0.6892 0.67146 0.016 0.484 0.000 0.268 0.232
#> SRR1431270 3 0.5569 0.05001 0.000 0.000 0.556 0.364 0.080
#> SRR1085614 2 0.3837 0.75731 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1330106 3 0.3468 0.52361 0.012 0.000 0.848 0.092 0.048
#> SRR1466154 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1396944 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1082784 2 0.1851 0.74798 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1457267 1 0.1282 0.89311 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR614659 3 0.3068 0.54077 0.016 0.000 0.872 0.028 0.084
#> SRR659247 3 0.3145 0.56997 0.012 0.000 0.844 0.008 0.136
#> SRR1317201 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1473696 1 0.5940 0.52774 0.596 0.000 0.300 0.020 0.084
#> SRR1375842 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1388123 2 0.3242 0.75350 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1096363 2 0.6374 0.68994 0.000 0.512 0.000 0.280 0.208
#> SRR1453662 3 0.3940 0.51567 0.052 0.000 0.828 0.032 0.088
#> SRR1345499 2 0.0510 0.73140 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1416693 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1070841 3 0.3748 0.57320 0.012 0.000 0.804 0.020 0.164
#> SRR1380910 1 0.1626 0.89248 0.940 0.000 0.044 0.016 0.000
#> SRR1333125 2 0.3586 0.75781 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1498183 1 0.3805 0.77748 0.784 0.000 0.192 0.016 0.008
#> SRR612659 3 0.5883 0.08991 0.000 0.000 0.524 0.368 0.108
#> SRR1447148 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR658597 2 0.6705 0.67361 0.004 0.460 0.000 0.308 0.228
#> SRR1089595 2 0.5103 0.71473 0.000 0.512 0.000 0.452 0.036
#> SRR1074263 2 0.3774 0.75739 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1376786 3 0.6206 0.37619 0.200 0.000 0.632 0.036 0.132
#> SRR1345995 3 0.6143 0.37501 0.196 0.000 0.636 0.032 0.136
#> SRR1071035 3 0.5164 0.46328 0.120 0.000 0.732 0.024 0.124
#> SRR1068808 2 0.6544 0.67515 0.000 0.468 0.000 0.308 0.224
#> SRR1332754 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR662438 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1335355 1 0.1121 0.89305 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.3787 0.57265 0.012 0.000 0.800 0.020 0.168
#> SRR1323558 3 0.4593 0.51557 0.000 0.000 0.736 0.080 0.184
#> SRR1381711 5 0.4151 0.60040 0.000 0.000 0.344 0.004 0.652
#> SRR657985 5 0.4200 0.57312 0.004 0.000 0.320 0.004 0.672
#> SRR1314810 1 0.6323 0.17911 0.456 0.000 0.436 0.024 0.084
#> SRR1336505 3 0.3054 0.53795 0.012 0.000 0.876 0.052 0.060
#> SRR1474095 3 0.5554 0.38775 0.180 0.000 0.692 0.028 0.100
#> SRR1363831 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1442376 3 0.6316 0.11155 0.344 0.000 0.544 0.040 0.072
#> SRR1074909 2 0.6684 0.67226 0.004 0.468 0.000 0.300 0.228
#> SRR1101200 3 0.5546 0.48432 0.108 0.000 0.708 0.040 0.144
#> SRR1075408 2 0.1186 0.72751 0.020 0.964 0.000 0.008 0.008
#> SRR1367150 5 0.4557 0.64083 0.004 0.000 0.440 0.004 0.552
#> SRR1313406 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1068880 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1467277 5 0.4101 0.58954 0.000 0.000 0.332 0.004 0.664
#> SRR1084867 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1095431 2 0.6785 0.67306 0.008 0.464 0.000 0.304 0.224
#> SRR1380184 2 0.1455 0.72541 0.008 0.952 0.000 0.032 0.008
#> SRR1443113 3 0.6681 0.22820 0.328 0.000 0.520 0.036 0.116
#> SRR1380414 5 0.4769 0.47834 0.004 0.000 0.392 0.016 0.588
#> SRR1315912 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1075778 2 0.3242 0.75350 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1421116 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR602282 3 0.5499 0.02711 0.000 0.000 0.532 0.400 0.068
#> SRR1361195 2 0.3242 0.75350 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR600493 1 0.2228 0.88747 0.916 0.000 0.056 0.020 0.008
#> SRR1477653 3 0.6775 0.23728 0.312 0.000 0.520 0.036 0.132
#> SRR1355475 3 0.3787 0.57265 0.012 0.000 0.800 0.020 0.168
#> SRR1360785 5 0.6000 0.53354 0.116 0.000 0.328 0.004 0.552
#> SRR810437 3 0.4920 0.26396 0.000 0.000 0.644 0.308 0.048
#> SRR1361860 3 0.5090 0.13218 0.036 0.000 0.712 0.040 0.212
#> SRR1441311 2 0.2329 0.75092 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1098903 5 0.5961 0.54849 0.104 0.000 0.356 0.004 0.536
#> SRR1457619 3 0.3581 0.49390 0.036 0.000 0.852 0.044 0.068
#> SRR1498529 1 0.5154 0.65623 0.684 0.000 0.248 0.020 0.048
#> SRR1097172 2 0.1430 0.74338 0.004 0.944 0.000 0.052 0.000
#> SRR1074017 2 0.4825 0.73249 0.000 0.568 0.000 0.408 0.024
#> SRR1472033 2 0.3774 0.75739 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1445087 3 0.5394 0.03932 0.000 0.000 0.540 0.400 0.060
#> SRR1399525 2 0.5896 0.73426 0.000 0.600 0.000 0.216 0.184
#> SRR1312844 2 0.6774 0.67229 0.008 0.468 0.000 0.300 0.224
#> SRR1085874 2 0.6859 0.67268 0.012 0.468 0.000 0.296 0.224
#> SRR1101226 2 0.6892 0.67146 0.016 0.484 0.000 0.268 0.232
#> SRR1476056 1 0.6142 0.36207 0.520 0.000 0.388 0.036 0.056
#> SRR1075659 2 0.6544 0.67515 0.000 0.468 0.000 0.308 0.224
#> SRR1311916 3 0.5883 0.08991 0.000 0.000 0.524 0.368 0.108
#> SRR1353353 3 0.5447 0.02809 0.000 0.000 0.536 0.400 0.064
#> SRR1073291 3 0.4235 0.56306 0.008 0.000 0.772 0.044 0.176
#> SRR1356227 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1080720 2 0.5103 0.71473 0.000 0.512 0.000 0.452 0.036
#> SRR1091695 2 0.6705 0.67361 0.004 0.460 0.000 0.308 0.228
#> SRR1350304 5 0.4410 0.64059 0.000 0.000 0.440 0.004 0.556
#> SRR663002 3 0.5808 0.06274 0.000 0.000 0.512 0.392 0.096
#> SRR1376983 2 0.0000 0.73418 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1347144 3 0.5883 0.08991 0.000 0.000 0.524 0.368 0.108
#> SRR1384006 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1499108 2 0.6916 0.67183 0.016 0.476 0.000 0.280 0.228
#> SRR614047 3 0.3806 0.56946 0.008 0.000 0.796 0.024 0.172
#> SRR818440 3 0.1356 0.54944 0.012 0.000 0.956 0.028 0.004
#> SRR1337770 3 0.5888 0.20411 0.304 0.000 0.604 0.036 0.056
#> SRR1399413 3 0.3673 0.57157 0.012 0.000 0.820 0.028 0.140
#> SRR1385542 2 0.0854 0.72901 0.012 0.976 0.000 0.008 0.004
#> SRR1473959 3 0.2791 0.51971 0.016 0.000 0.892 0.036 0.056
#> SRR1074041 3 0.3826 0.57215 0.012 0.000 0.796 0.020 0.172
#> SRR1394495 2 0.0404 0.73184 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.3573 0.57338 0.012 0.000 0.816 0.016 0.156
#> SRR816699 3 0.3826 0.57215 0.012 0.000 0.796 0.020 0.172
#> SRR1308612 3 0.3928 0.56952 0.008 0.000 0.788 0.028 0.176
#> SRR1499418 5 0.5467 0.55063 0.000 0.000 0.384 0.068 0.548
#> SRR1352894 2 0.0671 0.73039 0.016 0.980 0.000 0.000 0.004
#> SRR815805 3 0.5438 0.22018 0.300 0.000 0.632 0.048 0.020
#> SRR1331083 2 0.6417 0.68676 0.000 0.508 0.000 0.264 0.228
#> SRR808272 3 0.4190 0.54472 0.000 0.000 0.768 0.060 0.172
#> SRR1436698 1 0.6672 0.39763 0.528 0.000 0.312 0.032 0.128
#> SRR1095627 2 0.6902 0.67113 0.016 0.480 0.000 0.276 0.228
#> SRR1357672 5 0.4523 0.55181 0.004 0.000 0.344 0.012 0.640
#> SRR1351236 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1077479 1 0.2264 0.88765 0.912 0.000 0.060 0.024 0.004
#> SRR814491 5 0.4664 0.64018 0.008 0.000 0.436 0.004 0.552
#> SRR1101256 2 0.3774 0.75739 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1436004 1 0.2844 0.86778 0.880 0.000 0.088 0.020 0.012
#> SRR1457994 2 0.3774 0.75739 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1078998 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1314707 3 0.5937 0.19027 0.316 0.000 0.592 0.036 0.056
#> SRR1309534 3 0.3631 0.49951 0.012 0.000 0.840 0.080 0.068
#> SRR615527 3 0.5513 0.00778 0.000 0.000 0.524 0.408 0.068
#> SRR1098216 1 0.1408 0.89233 0.948 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR1325847 2 0.6413 0.68661 0.000 0.508 0.000 0.268 0.224
#> SRR1404003 3 0.3310 0.50510 0.036 0.000 0.868 0.040 0.056
#> SRR1344166 1 0.5087 0.57934 0.636 0.000 0.320 0.028 0.016
#> SRR1368638 5 0.4664 0.64018 0.008 0.000 0.436 0.004 0.552
#> SRR1431429 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1079237 2 0.6388 0.68872 0.000 0.508 0.000 0.284 0.208
#> SRR1080509 2 0.2068 0.74985 0.004 0.904 0.000 0.092 0.000
#> SRR815759 5 0.4321 0.64041 0.000 0.000 0.396 0.004 0.600
#> SRR1502143 3 0.3787 0.57265 0.012 0.000 0.800 0.020 0.168
#> SRR1487614 3 0.5815 0.04599 0.000 0.000 0.508 0.396 0.096
#> SRR1402307 2 0.0854 0.72901 0.012 0.976 0.000 0.008 0.004
#> SRR820810 3 0.5839 0.14958 0.352 0.000 0.568 0.024 0.056
#> SRR1099212 2 0.3752 0.75757 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1083215 3 0.3497 0.56820 0.012 0.000 0.828 0.020 0.140
#> SRR1476547 2 0.5103 0.71473 0.000 0.512 0.000 0.452 0.036
#> SRR656421 1 0.5199 0.25838 0.548 0.000 0.036 0.004 0.412
#> SRR1086116 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1499917 3 0.2576 0.51831 0.008 0.000 0.900 0.036 0.056
#> SRR1339944 2 0.3210 0.75289 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1391444 2 0.3074 0.75097 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1434889 3 0.2606 0.52111 0.012 0.000 0.900 0.032 0.056
#> SRR1431847 4 0.6783 0.33091 0.000 0.000 0.280 0.372 0.348
#> SRR1317155 3 0.3916 0.50572 0.012 0.000 0.816 0.116 0.056
#> SRR1477405 1 0.1787 0.89212 0.936 0.000 0.044 0.016 0.004
#> SRR655289 5 0.4586 0.61984 0.004 0.000 0.468 0.004 0.524
#> SRR1341683 3 0.4349 0.42833 0.000 0.000 0.756 0.176 0.068
#> SRR1084790 5 0.6246 0.28122 0.324 0.000 0.132 0.008 0.536
#> SRR1073731 3 0.1195 0.54022 0.000 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1332588 5 0.4557 0.64083 0.004 0.000 0.440 0.004 0.552
#> SRR1471157 2 0.1908 0.74885 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR654945 3 0.3787 0.57265 0.012 0.000 0.800 0.020 0.168
#> SRR661028 1 0.2011 0.89082 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008
#> SRR1413477 2 0.3774 0.75739 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1101152 3 0.3216 0.56326 0.012 0.000 0.852 0.020 0.116
#> SRR1358435 2 0.6223 0.70005 0.000 0.512 0.000 0.328 0.160
#> SRR2165273 1 0.1282 0.89270 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1379014 1 0.1430 0.89122 0.944 0.000 0.052 0.004 0.000
#> SRR1489904 3 0.5798 0.17211 0.000 0.000 0.556 0.336 0.108
#> SRR1416386 2 0.6396 0.68783 0.000 0.512 0.000 0.264 0.224
#> SRR1406048 1 0.2857 0.83895 0.868 0.000 0.112 0.008 0.012
#> SRR606982 5 0.4434 0.66216 0.000 0.000 0.460 0.004 0.536
#> SRR1358082 1 0.1787 0.89212 0.936 0.000 0.044 0.016 0.004
#> SRR1312934 3 0.3098 0.57125 0.000 0.000 0.836 0.016 0.148
#> SRR655194 1 0.5515 0.52655 0.608 0.000 0.324 0.016 0.052
#> SRR1331174 2 0.3684 0.75808 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1473251 2 0.5103 0.71473 0.000 0.512 0.000 0.452 0.036
#> SRR1389820 4 0.7023 0.46154 0.008 0.120 0.176 0.600 0.096
#> SRR1074289 3 0.3667 0.57364 0.012 0.000 0.812 0.020 0.156
#> SRR1348816 2 0.3837 0.75749 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1076292 3 0.3388 0.44069 0.000 0.000 0.792 0.200 0.008
#> SRR1395810 2 0.2891 0.75206 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1498909 3 0.3398 0.52989 0.008 0.000 0.852 0.076 0.064
#> SRR1443507 3 0.3809 0.57252 0.020 0.000 0.804 0.016 0.160
#> SRR1452310 3 0.2217 0.53308 0.012 0.000 0.920 0.024 0.044
#> SRR665610 3 0.2409 0.50474 0.000 0.000 0.900 0.032 0.068
#> SRR1347322 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR813395 2 0.6902 0.67113 0.016 0.480 0.000 0.276 0.228
#> SRR1477256 1 0.1885 0.89171 0.932 0.000 0.044 0.020 0.004
#> SRR1470230 5 0.5467 0.56063 0.000 0.000 0.384 0.068 0.548
#> SRR1354247 1 0.1704 0.88771 0.928 0.000 0.068 0.004 0.000
#> SRR1082640 2 0.2278 0.71722 0.032 0.916 0.000 0.044 0.008
#> SRR1487592 3 0.4157 0.56383 0.012 0.000 0.784 0.040 0.164
#> SRR1352299 3 0.6874 0.15387 0.352 0.000 0.484 0.040 0.124
#> SRR1076317 2 0.6396 0.68783 0.000 0.512 0.000 0.264 0.224
#> SRR1434117 3 0.4037 0.49607 0.004 0.000 0.752 0.020 0.224
#> SRR1075273 2 0.6287 0.69839 0.000 0.536 0.000 0.240 0.224
#> SRR658657 5 0.5400 0.55863 0.004 0.000 0.364 0.056 0.576
#> SRR1092773 2 0.5598 0.71627 0.000 0.524 0.000 0.400 0.076
#> SRR1365332 3 0.3748 0.57310 0.012 0.000 0.804 0.020 0.164
#> SRR615958 3 0.5871 0.32330 0.000 0.000 0.604 0.212 0.184
#> SRR1097688 2 0.6694 0.67466 0.004 0.464 0.000 0.304 0.228
#> SRR1403259 5 0.6732 -0.30761 0.000 0.000 0.272 0.316 0.412
#> SRR1099120 2 0.6544 0.67515 0.000 0.468 0.000 0.308 0.224
#> SRR1362200 3 0.4486 0.52849 0.000 0.000 0.748 0.080 0.172
#> SRR1464856 2 0.3796 0.75734 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1347298 3 0.5843 0.05585 0.000 0.000 0.512 0.388 0.100
#> SRR1075923 2 0.6396 0.68783 0.000 0.512 0.000 0.264 0.224
#> SRR1100703 3 0.4353 0.55270 0.028 0.000 0.788 0.044 0.140
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.4442 0.60837 0.020 0.000 0.440 0.536 0.004 0.000
#> SRR1436370 2 0.0632 0.63224 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1075752 6 0.3838 0.77247 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1397949 1 0.1294 0.88075 0.956 0.000 0.008 0.008 0.004 0.024
#> SRR1355723 4 0.4683 0.60952 0.012 0.000 0.436 0.532 0.016 0.004
#> SRR1329744 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR657384 4 0.5648 0.54624 0.124 0.000 0.352 0.516 0.004 0.004
#> SRR1351190 4 0.4446 0.60684 0.020 0.000 0.444 0.532 0.004 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.64140 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 3 0.6545 -0.30040 0.256 0.000 0.364 0.360 0.004 0.016
#> SRR1396017 4 0.5014 -0.09889 0.468 0.000 0.028 0.484 0.008 0.012
#> SRR1410742 4 0.4631 0.60772 0.032 0.000 0.428 0.536 0.004 0.000
#> SRR1435963 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1382416 1 0.1067 0.88405 0.964 0.000 0.004 0.004 0.004 0.024
#> SRR1391354 5 0.6178 0.64768 0.056 0.000 0.076 0.228 0.608 0.032
#> SRR1087968 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1310075 1 0.0922 0.88449 0.968 0.000 0.004 0.004 0.000 0.024
#> SRR1312244 1 0.1464 0.88565 0.944 0.000 0.004 0.016 0.000 0.036
#> SRR1325138 4 0.6525 -0.02142 0.012 0.000 0.172 0.484 0.304 0.028
#> SRR1326821 5 0.6095 0.65946 0.064 0.000 0.236 0.044 0.612 0.044
#> SRR1490178 2 0.0146 0.64195 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR655613 1 0.3006 0.82093 0.856 0.000 0.100 0.012 0.004 0.028
#> SRR1075707 2 0.4002 -0.15395 0.000 0.660 0.000 0.000 0.020 0.320
#> SRR1443871 2 0.4758 0.60558 0.000 0.716 0.000 0.180 0.064 0.040
#> SRR1102489 6 0.3833 0.77683 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1465758 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1414058 3 0.4490 0.40784 0.004 0.000 0.756 0.136 0.072 0.032
#> SRR1407449 1 0.2255 0.85123 0.892 0.000 0.004 0.088 0.000 0.016
#> SRR1436858 2 0.5348 0.57966 0.000 0.668 0.000 0.192 0.064 0.076
#> SRR1479109 3 0.0603 0.51558 0.004 0.000 0.980 0.016 0.000 0.000
#> SRR1399069 5 0.6295 0.54146 0.020 0.000 0.100 0.336 0.512 0.032
#> SRR1366450 3 0.3007 0.45248 0.052 0.000 0.872 0.044 0.008 0.024
#> SRR1396859 1 0.1138 0.88440 0.960 0.000 0.004 0.012 0.000 0.024
#> SRR1457176 1 0.3973 0.69348 0.744 0.000 0.216 0.008 0.004 0.028
#> SRR1097666 6 0.4661 0.76519 0.004 0.360 0.000 0.028 0.008 0.600
#> SRR1434736 5 0.5017 0.70565 0.000 0.000 0.120 0.200 0.668 0.012
#> SRR1080560 6 0.3782 0.80321 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1322882 1 0.2316 0.85376 0.900 0.000 0.064 0.004 0.004 0.028
#> SRR1435688 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1327614 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR658152 4 0.5222 0.49168 0.004 0.000 0.312 0.608 0.044 0.032
#> SRR1368141 4 0.7726 -0.02423 0.004 0.000 0.252 0.336 0.208 0.200
#> SRR1440268 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1453725 3 0.6047 0.06534 0.248 0.000 0.556 0.168 0.004 0.024
#> SRR1325711 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1477930 1 0.3245 0.76770 0.796 0.000 0.004 0.184 0.000 0.016
#> SRR1477591 1 0.2429 0.85367 0.896 0.000 0.064 0.008 0.004 0.028
#> SRR1416049 2 0.4398 0.61928 0.000 0.756 0.000 0.144 0.060 0.040
#> SRR656275 4 0.4177 0.58926 0.012 0.000 0.468 0.520 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.3354 0.76248 0.792 0.000 0.008 0.184 0.000 0.016
#> SRR1377735 1 0.1995 0.87665 0.924 0.000 0.024 0.012 0.004 0.036
#> SRR1331244 1 0.5664 0.28656 0.552 0.000 0.012 0.044 0.352 0.040
#> SRR1404531 1 0.1096 0.88284 0.964 0.000 0.004 0.008 0.004 0.020
#> SRR1324331 1 0.5130 0.48128 0.640 0.000 0.012 0.020 0.280 0.048
#> SRR1458890 4 0.7726 -0.02411 0.004 0.000 0.252 0.336 0.208 0.200
#> SRR1432695 2 0.2344 0.64525 0.000 0.896 0.000 0.052 0.048 0.004
#> SRR1407624 2 0.4235 0.61768 0.000 0.756 0.000 0.160 0.064 0.020
#> SRR1431969 3 0.7335 0.23557 0.004 0.000 0.444 0.204 0.188 0.160
#> SRR1087393 2 0.3922 -0.14700 0.000 0.664 0.000 0.000 0.016 0.320
#> SRR1077263 5 0.4809 0.68594 0.000 0.000 0.296 0.044 0.640 0.020
#> SRR1385211 1 0.1375 0.87946 0.952 0.000 0.008 0.008 0.004 0.028
#> SRR655241 1 0.3371 0.75385 0.780 0.000 0.004 0.200 0.000 0.016
#> SRR656922 1 0.5663 0.48177 0.608 0.000 0.176 0.192 0.000 0.024
#> SRR1361630 5 0.3653 0.68021 0.000 0.000 0.300 0.008 0.692 0.000
#> SRR1318966 6 0.4072 0.76525 0.000 0.448 0.000 0.000 0.008 0.544
#> SRR1407087 3 0.1477 0.50830 0.004 0.000 0.940 0.008 0.048 0.000
#> SRR603212 3 0.5017 0.23996 0.236 0.000 0.672 0.060 0.004 0.028
#> SRR1321088 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1485190 3 0.7761 0.13659 0.004 0.000 0.324 0.240 0.232 0.200
#> SRR1332232 2 0.0865 0.62616 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1312645 4 0.5296 0.59530 0.060 0.000 0.392 0.532 0.008 0.008
#> SRR1457835 1 0.4538 0.56067 0.656 0.000 0.300 0.012 0.004 0.028
#> SRR1347123 3 0.7418 0.22583 0.004 0.000 0.428 0.204 0.192 0.172
#> SRR1465501 6 0.3930 0.79993 0.000 0.420 0.000 0.000 0.004 0.576
#> SRR1330878 3 0.7669 0.18126 0.004 0.000 0.364 0.208 0.216 0.208
#> SRR1445064 4 0.7312 0.10032 0.004 0.000 0.292 0.400 0.192 0.112
#> SRR1452981 4 0.6144 0.41465 0.268 0.000 0.208 0.508 0.008 0.008
#> SRR1326708 1 0.1003 0.88123 0.964 0.000 0.004 0.000 0.004 0.028
#> SRR1407157 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1365401 2 0.5348 0.57966 0.000 0.668 0.000 0.192 0.064 0.076
#> SRR1397697 2 0.0000 0.64140 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.5489 0.56613 0.004 0.000 0.348 0.556 0.072 0.020
#> SRR1077898 1 0.5019 0.52159 0.656 0.000 0.016 0.016 0.268 0.044
#> SRR1349080 5 0.5121 0.71829 0.000 0.000 0.144 0.172 0.668 0.016
#> SRR1076096 2 0.4693 0.60728 0.000 0.720 0.000 0.180 0.064 0.036
#> SRR811261 6 0.4672 0.75925 0.004 0.364 0.000 0.028 0.008 0.596
#> SRR1375485 1 0.6201 0.28151 0.516 0.000 0.300 0.152 0.004 0.028
#> SRR1432563 2 0.1176 0.64625 0.000 0.956 0.000 0.024 0.020 0.000
#> SRR604414 1 0.3234 0.80539 0.836 0.000 0.120 0.012 0.004 0.028
#> SRR1380614 1 0.2051 0.87638 0.924 0.000 0.024 0.008 0.016 0.028
#> SRR812060 3 0.0508 0.52154 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR602082 1 0.0748 0.88327 0.976 0.000 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR1069490 6 0.4058 0.79706 0.004 0.372 0.000 0.000 0.008 0.616
#> SRR1078417 2 0.1765 0.57325 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR661613 3 0.1296 0.51370 0.004 0.000 0.952 0.032 0.012 0.000
#> SRR1420710 4 0.4117 0.59890 0.004 0.000 0.464 0.528 0.004 0.000
#> SRR660426 1 0.1116 0.88032 0.960 0.000 0.008 0.000 0.004 0.028
#> SRR1416003 4 0.4908 0.56874 0.008 0.000 0.428 0.520 0.044 0.000
#> SRR661064 1 0.2963 0.80265 0.828 0.000 0.004 0.152 0.000 0.016
#> SRR1082011 2 0.1765 0.57325 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1452718 1 0.1375 0.87946 0.952 0.000 0.008 0.008 0.004 0.028
#> SRR1353243 1 0.1375 0.87946 0.952 0.000 0.008 0.008 0.004 0.028
#> SRR1455482 1 0.0653 0.88477 0.980 0.000 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR1313473 1 0.0748 0.88578 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1399394 3 0.5523 0.09947 0.388 0.000 0.524 0.056 0.004 0.028
#> SRR1102467 4 0.5976 0.40245 0.264 0.000 0.248 0.484 0.000 0.004
#> SRR1317470 5 0.3690 0.67532 0.000 0.000 0.308 0.008 0.684 0.000
#> SRR1337707 4 0.7794 -0.08052 0.004 0.000 0.276 0.292 0.220 0.208
#> SRR1408752 2 0.1663 0.58245 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1474617 6 0.8452 -0.15822 0.000 0.136 0.104 0.172 0.228 0.360
#> SRR1398013 4 0.4400 0.60214 0.012 0.000 0.456 0.524 0.008 0.000
#> SRR1352918 5 0.5896 0.67257 0.020 0.000 0.096 0.240 0.612 0.032
#> SRR1420750 1 0.3262 0.79839 0.828 0.000 0.132 0.008 0.004 0.028
#> SRR1071785 4 0.7737 -0.04040 0.004 0.000 0.260 0.328 0.212 0.196
#> SRR1353618 2 0.4913 0.59998 0.000 0.704 0.000 0.184 0.064 0.048
#> SRR1082217 2 0.5548 0.56416 0.000 0.644 0.000 0.208 0.064 0.084
#> SRR1357256 2 0.2407 0.64488 0.000 0.892 0.000 0.056 0.048 0.004
#> SRR1490313 4 0.4297 0.60256 0.012 0.000 0.452 0.532 0.004 0.000
#> SRR1366560 1 0.0862 0.88467 0.972 0.000 0.004 0.008 0.000 0.016
#> SRR1355684 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1323289 5 0.6776 0.29186 0.000 0.000 0.088 0.172 0.488 0.252
#> SRR1313494 1 0.3194 0.78495 0.808 0.000 0.004 0.168 0.000 0.020
#> SRR1309985 1 0.4535 0.32016 0.548 0.000 0.016 0.424 0.000 0.012
#> SRR607911 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1333789 3 0.1074 0.50355 0.012 0.000 0.960 0.028 0.000 0.000
#> SRR1400078 4 0.4297 0.60256 0.012 0.000 0.452 0.532 0.004 0.000
#> SRR1088631 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1092842 6 0.3810 0.79274 0.000 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR615575 3 0.0870 0.52248 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR1079434 5 0.4499 0.72327 0.000 0.000 0.140 0.152 0.708 0.000
#> SRR1325559 1 0.4941 0.45610 0.600 0.000 0.344 0.024 0.004 0.028
#> SRR1446695 5 0.4244 0.67924 0.000 0.000 0.320 0.020 0.652 0.008
#> SRR1383883 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1396100 5 0.5560 0.68723 0.000 0.000 0.112 0.240 0.616 0.032
#> SRR1475697 4 0.5349 0.43781 0.004 0.000 0.256 0.632 0.084 0.024
#> SRR1488067 6 0.3843 0.76628 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1102103 2 0.5548 0.56416 0.000 0.644 0.000 0.208 0.064 0.084
#> SRR1105154 6 0.3833 0.77683 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1084991 2 0.4012 -0.22928 0.000 0.640 0.000 0.000 0.016 0.344
#> SRR1410380 5 0.3482 0.66758 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1445490 2 0.4164 0.61857 0.000 0.752 0.000 0.172 0.064 0.012
#> SRR1454671 2 0.5442 0.57372 0.000 0.660 0.000 0.192 0.064 0.084
#> SRR1435044 3 0.4555 -0.49261 0.012 0.000 0.532 0.440 0.016 0.000
#> SRR1485812 4 0.7260 0.09802 0.004 0.000 0.292 0.412 0.112 0.180
#> SRR1078020 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1311153 1 0.0748 0.88327 0.976 0.000 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR1376406 2 0.0000 0.64140 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.7054 0.22329 0.000 0.000 0.120 0.184 0.460 0.236
#> SRR807775 3 0.6473 0.23379 0.000 0.000 0.556 0.152 0.192 0.100
#> SRR1409215 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR820427 5 0.4602 0.72606 0.000 0.000 0.160 0.144 0.696 0.000
#> SRR1100656 6 0.3782 0.80321 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1362159 1 0.0653 0.88526 0.980 0.000 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR1414536 5 0.3816 0.68503 0.000 0.000 0.296 0.016 0.688 0.000
#> SRR656794 5 0.6087 0.47181 0.076 0.000 0.384 0.020 0.492 0.028
#> SRR604653 1 0.0837 0.88369 0.972 0.000 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1317685 5 0.6903 0.40337 0.000 0.000 0.268 0.244 0.424 0.064
#> SRR1485912 3 0.2288 0.45910 0.016 0.000 0.900 0.068 0.000 0.016
#> SRR1407602 5 0.4584 0.71005 0.000 0.000 0.100 0.196 0.700 0.004
#> SRR1356164 4 0.6137 0.38394 0.004 0.000 0.328 0.524 0.092 0.052
#> SRR1328692 4 0.6570 0.26391 0.004 0.000 0.380 0.440 0.100 0.076
#> SRR1362438 1 0.2622 0.85021 0.888 0.000 0.064 0.016 0.004 0.028
#> SRR1479216 3 0.7358 0.23322 0.004 0.000 0.440 0.204 0.188 0.164
#> SRR1358041 1 0.4624 0.67168 0.720 0.000 0.084 0.176 0.000 0.020
#> SRR1468766 3 0.0820 0.51030 0.012 0.000 0.972 0.016 0.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.1269 0.51820 0.012 0.000 0.956 0.020 0.012 0.000
#> SRR1435602 2 0.0937 0.62366 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1501043 5 0.6621 0.31203 0.000 0.000 0.096 0.160 0.528 0.216
#> SRR1437256 4 0.7179 0.12217 0.004 0.000 0.220 0.460 0.196 0.120
#> SRR1487446 4 0.5377 0.58167 0.080 0.000 0.368 0.540 0.008 0.004
#> SRR816653 1 0.1976 0.87167 0.924 0.000 0.032 0.008 0.004 0.032
#> SRR815164 3 0.6139 0.05323 0.384 0.000 0.476 0.100 0.008 0.032
#> SRR1442043 4 0.5314 0.58858 0.072 0.000 0.380 0.536 0.008 0.004
#> SRR1410573 1 0.0798 0.88553 0.976 0.000 0.004 0.004 0.004 0.012
#> SRR1096782 2 0.2623 0.52256 0.000 0.852 0.000 0.000 0.016 0.132
#> SRR1352369 3 0.2058 0.50277 0.012 0.000 0.924 0.024 0.028 0.012
#> SRR1382934 3 0.7793 0.12853 0.004 0.000 0.312 0.240 0.224 0.220
#> SRR1465208 1 0.2152 0.86447 0.904 0.000 0.004 0.068 0.000 0.024
#> SRR1314728 1 0.5350 0.26000 0.516 0.000 0.412 0.032 0.004 0.036
#> SRR1470291 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1308756 3 0.1065 0.51960 0.008 0.000 0.964 0.008 0.020 0.000
#> SRR1409600 3 0.1931 0.49531 0.020 0.000 0.928 0.032 0.004 0.016
#> SRR816123 6 0.4661 0.76519 0.004 0.360 0.000 0.028 0.008 0.600
#> SRR614779 5 0.3601 0.67097 0.000 0.000 0.312 0.004 0.684 0.000
#> SRR810783 3 0.1297 0.49390 0.012 0.000 0.948 0.040 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1410356 3 0.0508 0.51933 0.012 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR808106 5 0.4905 0.71818 0.004 0.000 0.140 0.168 0.684 0.004
#> SRR662713 3 0.1332 0.50133 0.012 0.000 0.952 0.028 0.000 0.008
#> SRR1447058 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1480964 3 0.2110 0.43866 0.012 0.000 0.900 0.084 0.004 0.000
#> SRR809382 3 0.7764 0.13728 0.004 0.000 0.324 0.240 0.228 0.204
#> SRR665417 1 0.4461 0.19272 0.512 0.000 0.020 0.464 0.000 0.004
#> SRR1088016 2 0.6523 0.12444 0.004 0.508 0.000 0.132 0.064 0.292
#> SRR1453166 6 0.3971 0.76919 0.000 0.448 0.000 0.000 0.004 0.548
#> SRR1069826 2 0.2494 0.52503 0.000 0.864 0.000 0.000 0.016 0.120
#> SRR1077781 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR615623 3 0.7631 0.18982 0.004 0.000 0.376 0.208 0.204 0.208
#> SRR1413787 5 0.7513 0.05899 0.000 0.000 0.216 0.188 0.376 0.220
#> SRR1478207 3 0.5591 0.32707 0.012 0.000 0.672 0.072 0.172 0.072
#> SRR1411046 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1313711 2 0.0000 0.64140 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1309051 1 0.1716 0.87128 0.932 0.000 0.036 0.000 0.004 0.028
#> SRR1486949 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1395616 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1074956 6 0.4058 0.79706 0.004 0.372 0.000 0.000 0.008 0.616
#> SRR1092961 6 0.4661 0.76519 0.004 0.360 0.000 0.028 0.008 0.600
#> SRR817210 3 0.3591 0.03229 0.004 0.000 0.732 0.256 0.004 0.004
#> SRR1319221 6 0.7721 -0.41389 0.000 0.000 0.252 0.240 0.228 0.280
#> SRR1405413 3 0.6083 0.07156 0.320 0.000 0.524 0.120 0.004 0.032
#> SRR607807 1 0.0951 0.88437 0.968 0.000 0.004 0.008 0.000 0.020
#> SRR1390160 3 0.7537 0.20559 0.004 0.000 0.400 0.212 0.204 0.180
#> SRR1406283 3 0.3417 0.39362 0.156 0.000 0.808 0.008 0.004 0.024
#> SRR1357709 4 0.5195 0.59876 0.052 0.000 0.392 0.540 0.008 0.008
#> SRR1080742 6 0.4602 0.77337 0.004 0.364 0.000 0.024 0.008 0.600
#> SRR1468208 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1312766 3 0.0508 0.51933 0.012 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.1464 0.88095 0.944 0.000 0.004 0.036 0.000 0.016
#> SRR1311224 1 0.3091 0.81399 0.844 0.000 0.116 0.008 0.004 0.028
#> SRR1087801 3 0.3024 0.36537 0.016 0.000 0.840 0.128 0.000 0.016
#> SRR1099720 2 0.4002 -0.15395 0.000 0.660 0.000 0.000 0.020 0.320
#> SRR1349250 6 0.3838 0.77247 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1350912 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1357127 3 0.1269 0.51555 0.012 0.000 0.956 0.020 0.012 0.000
#> SRR1074980 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1317022 3 0.7631 0.19091 0.004 0.000 0.376 0.204 0.208 0.208
#> SRR1332879 1 0.3858 0.72593 0.760 0.000 0.200 0.008 0.004 0.028
#> SRR1403177 1 0.7004 0.47416 0.564 0.056 0.012 0.096 0.056 0.216
#> SRR1076144 2 0.0790 0.62831 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1069614 6 0.3789 0.80144 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR818239 6 0.3727 0.80510 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1421069 6 0.3727 0.80510 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1500006 1 0.0837 0.88454 0.972 0.000 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1485678 3 0.7082 -0.34766 0.024 0.000 0.340 0.284 0.328 0.024
#> SRR1092232 3 0.7793 0.12853 0.004 0.000 0.312 0.240 0.224 0.220
#> SRR1344253 5 0.4507 0.69708 0.000 0.000 0.284 0.052 0.660 0.004
#> SRR1384290 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1089349 3 0.0717 0.51511 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1343522 2 0.1501 0.59448 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1326727 2 0.2070 0.57428 0.000 0.896 0.000 0.000 0.012 0.092
#> SRR1440940 4 0.4794 0.54773 0.004 0.000 0.344 0.596 0.056 0.000
#> SRR818372 4 0.4208 0.59838 0.004 0.000 0.452 0.536 0.008 0.000
#> SRR1323675 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR819894 5 0.5560 0.68723 0.000 0.000 0.112 0.240 0.616 0.032
#> SRR1310031 3 0.7069 0.25910 0.004 0.000 0.488 0.204 0.172 0.132
#> SRR615419 4 0.7415 0.06807 0.004 0.000 0.236 0.416 0.200 0.144
#> SRR1436925 4 0.4968 0.58814 0.056 0.000 0.432 0.508 0.000 0.004
#> SRR1477238 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1332566 1 0.1059 0.88541 0.964 0.000 0.004 0.016 0.000 0.016
#> SRR1490228 3 0.1991 0.49305 0.012 0.000 0.920 0.044 0.024 0.000
#> SRR1442949 5 0.4535 0.72436 0.000 0.000 0.152 0.144 0.704 0.000
#> SRR1466239 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1094003 2 0.2450 0.54700 0.000 0.868 0.000 0.000 0.016 0.116
#> SRR1329971 1 0.4830 0.43434 0.588 0.000 0.364 0.012 0.004 0.032
#> SRR813076 2 0.5522 0.56675 0.000 0.648 0.000 0.204 0.064 0.084
#> SRR1097642 2 0.4002 -0.15395 0.000 0.660 0.000 0.000 0.020 0.320
#> SRR1322981 3 0.0508 0.51933 0.012 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.64140 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.7248 0.24428 0.004 0.000 0.460 0.204 0.180 0.152
#> SRR660522 3 0.0870 0.52248 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR815374 4 0.4442 0.60717 0.020 0.000 0.440 0.536 0.004 0.000
#> SRR1069564 6 0.4169 0.78767 0.004 0.364 0.000 0.004 0.008 0.620
#> SRR1416337 5 0.3601 0.67097 0.000 0.000 0.312 0.004 0.684 0.000
#> SRR1316438 3 0.7790 0.12688 0.004 0.000 0.312 0.240 0.232 0.212
#> SRR1386844 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1373718 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1447458 2 0.4170 0.62171 0.000 0.768 0.000 0.144 0.064 0.024
#> SRR1487128 1 0.1148 0.88570 0.960 0.000 0.004 0.016 0.000 0.020
#> SRR1441421 2 0.5548 0.56416 0.000 0.644 0.000 0.208 0.064 0.084
#> SRR1069919 2 0.0291 0.64184 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1460296 1 0.1294 0.88075 0.956 0.000 0.008 0.008 0.004 0.024
#> SRR1335489 1 0.1237 0.88537 0.956 0.000 0.004 0.020 0.000 0.020
#> SRR1393404 2 0.5395 0.57677 0.000 0.664 0.000 0.192 0.064 0.080
#> SRR1081425 1 0.0922 0.88410 0.968 0.000 0.004 0.000 0.004 0.024
#> SRR1401815 3 0.7704 0.17251 0.004 0.000 0.352 0.208 0.216 0.220
#> SRR1071337 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1071983 2 0.2783 0.48810 0.000 0.836 0.000 0.000 0.016 0.148
#> SRR1331793 2 0.2814 0.64076 0.000 0.864 0.000 0.080 0.052 0.004
#> SRR1410510 3 0.7379 0.23080 0.004 0.000 0.436 0.204 0.188 0.168
#> SRR1098761 6 0.4661 0.76519 0.004 0.360 0.000 0.028 0.008 0.600
#> SRR1312124 4 0.6000 0.36097 0.328 0.000 0.168 0.492 0.004 0.008
#> SRR615395 3 0.4053 0.31349 0.228 0.000 0.732 0.008 0.004 0.028
#> SRR1479349 1 0.4497 0.45339 0.600 0.000 0.020 0.368 0.000 0.012
#> SRR2165033 4 0.4169 0.60027 0.012 0.000 0.456 0.532 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR816201 4 0.4114 0.60035 0.004 0.000 0.460 0.532 0.004 0.000
#> SRR1488514 2 0.1765 0.57325 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR655840 4 0.4665 0.61025 0.020 0.000 0.432 0.536 0.008 0.004
#> SRR1379303 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1418516 5 0.5522 0.68901 0.000 0.000 0.108 0.240 0.620 0.032
#> SRR613174 3 0.0870 0.52248 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR1351125 3 0.0912 0.52177 0.012 0.000 0.972 0.004 0.004 0.008
#> SRR659157 4 0.7599 0.01040 0.004 0.000 0.264 0.368 0.176 0.188
#> SRR1480408 4 0.4792 0.60331 0.044 0.000 0.416 0.536 0.004 0.000
#> SRR657857 4 0.4783 0.60851 0.020 0.000 0.436 0.524 0.020 0.000
#> SRR1073317 2 0.1007 0.62087 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1332526 4 0.5196 0.58138 0.080 0.000 0.396 0.520 0.004 0.000
#> SRR1094168 6 0.4672 0.75925 0.004 0.364 0.000 0.028 0.008 0.596
#> SRR1431270 4 0.7643 -0.04644 0.000 0.000 0.276 0.312 0.212 0.200
#> SRR1085614 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1330106 4 0.5098 0.56266 0.012 0.000 0.424 0.512 0.052 0.000
#> SRR1466154 1 0.1116 0.88032 0.960 0.000 0.008 0.000 0.004 0.028
#> SRR1396944 1 0.0951 0.88437 0.968 0.000 0.004 0.008 0.000 0.020
#> SRR1082784 2 0.2278 0.64558 0.000 0.900 0.000 0.052 0.044 0.004
#> SRR1457267 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR614659 4 0.4184 0.56395 0.012 0.000 0.488 0.500 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.2070 0.43118 0.012 0.000 0.896 0.092 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1473696 3 0.4803 0.00631 0.432 0.000 0.528 0.008 0.004 0.028
#> SRR1375842 1 0.0748 0.88427 0.976 0.000 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR1388123 2 0.0865 0.62616 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1096363 6 0.4072 0.76525 0.000 0.448 0.000 0.000 0.008 0.544
#> SRR1453662 4 0.4794 0.55295 0.032 0.000 0.480 0.480 0.004 0.004
#> SRR1345499 2 0.4447 0.61345 0.000 0.736 0.000 0.176 0.064 0.024
#> SRR1353499 1 0.1375 0.87946 0.952 0.000 0.008 0.008 0.004 0.028
#> SRR1416693 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1070841 3 0.0653 0.51877 0.012 0.000 0.980 0.004 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1333125 2 0.1657 0.60850 0.000 0.928 0.000 0.000 0.016 0.056
#> SRR1498183 1 0.5189 0.58167 0.652 0.000 0.248 0.068 0.004 0.028
#> SRR612659 3 0.7335 0.23557 0.004 0.000 0.444 0.204 0.188 0.160
#> SRR1447148 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR658597 6 0.3852 0.80387 0.000 0.384 0.000 0.000 0.004 0.612
#> SRR1089595 2 0.4002 -0.15395 0.000 0.660 0.000 0.000 0.020 0.320
#> SRR1074263 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1376786 3 0.3159 0.42535 0.112 0.000 0.844 0.016 0.004 0.024
#> SRR1345995 3 0.3605 0.40645 0.104 0.000 0.824 0.040 0.004 0.028
#> SRR1071035 3 0.3636 0.39180 0.076 0.000 0.824 0.076 0.004 0.020
#> SRR1068808 6 0.3782 0.80321 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1332754 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR662438 1 0.0837 0.88267 0.972 0.000 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1335355 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR659448 3 0.0870 0.52248 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR1323558 3 0.2960 0.46706 0.004 0.000 0.868 0.076 0.028 0.024
#> SRR1381711 5 0.3816 0.68762 0.000 0.000 0.296 0.016 0.688 0.000
#> SRR657985 5 0.3827 0.67577 0.000 0.000 0.308 0.008 0.680 0.004
#> SRR1314810 3 0.5103 0.19947 0.312 0.000 0.620 0.020 0.016 0.032
#> SRR1336505 3 0.4413 -0.57264 0.012 0.000 0.492 0.488 0.008 0.000
#> SRR1474095 3 0.5317 0.11774 0.144 0.000 0.648 0.188 0.000 0.020
#> SRR1363831 2 0.0000 0.64140 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.5832 0.53492 0.132 0.000 0.320 0.532 0.008 0.008
#> SRR1074909 6 0.3819 0.79837 0.000 0.372 0.000 0.000 0.004 0.624
#> SRR1101200 3 0.2390 0.47905 0.060 0.000 0.900 0.012 0.004 0.024
#> SRR1075408 2 0.4913 0.59998 0.000 0.704 0.000 0.184 0.064 0.048
#> SRR1367150 5 0.5560 0.68723 0.000 0.000 0.112 0.240 0.616 0.032
#> SRR1313406 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1068880 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1467277 5 0.3797 0.68676 0.000 0.000 0.292 0.016 0.692 0.000
#> SRR1084867 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1095431 6 0.4090 0.80292 0.004 0.384 0.000 0.000 0.008 0.604
#> SRR1380184 2 0.5105 0.59286 0.000 0.700 0.000 0.160 0.064 0.076
#> SRR1443113 3 0.4522 0.30912 0.180 0.000 0.736 0.052 0.004 0.028
#> SRR1380414 3 0.4293 -0.22585 0.000 0.000 0.584 0.016 0.396 0.004
#> SRR1315912 1 0.1363 0.87919 0.952 0.000 0.012 0.004 0.004 0.028
#> SRR1075778 2 0.0865 0.62616 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1421116 2 0.0000 0.64140 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 4 0.7804 -0.05642 0.004 0.000 0.256 0.300 0.220 0.220
#> SRR1361195 2 0.0865 0.62616 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR600493 1 0.2180 0.86253 0.912 0.000 0.048 0.008 0.004 0.028
#> SRR1477653 3 0.4262 0.33164 0.188 0.000 0.748 0.032 0.004 0.028
#> SRR1355475 3 0.0870 0.52248 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR1360785 5 0.5854 0.67556 0.020 0.000 0.092 0.240 0.616 0.032
#> SRR810437 4 0.6687 0.21279 0.004 0.000 0.320 0.456 0.168 0.052
#> SRR1361860 4 0.6008 0.50766 0.012 0.000 0.300 0.548 0.120 0.020
#> SRR1441311 2 0.1934 0.64609 0.000 0.916 0.000 0.044 0.040 0.000
#> SRR1098903 5 0.5916 0.66922 0.020 0.000 0.096 0.244 0.608 0.032
#> SRR1457619 4 0.4594 0.60986 0.016 0.000 0.436 0.536 0.008 0.004
#> SRR1498529 1 0.5770 0.01715 0.456 0.000 0.152 0.388 0.000 0.004
#> SRR1097172 2 0.3447 0.63305 0.000 0.820 0.000 0.108 0.064 0.008
#> SRR1074017 2 0.3483 0.22016 0.000 0.748 0.000 0.000 0.016 0.236
#> SRR1472033 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1445087 3 0.7761 0.13659 0.004 0.000 0.324 0.240 0.232 0.200
#> SRR1399525 2 0.3966 -0.53223 0.000 0.552 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR1312844 6 0.4058 0.79706 0.004 0.372 0.000 0.000 0.008 0.616
#> SRR1085874 6 0.4192 0.79503 0.004 0.372 0.000 0.004 0.008 0.612
#> SRR1101226 6 0.4672 0.75925 0.004 0.364 0.000 0.028 0.008 0.596
#> SRR1476056 4 0.6025 0.38739 0.300 0.000 0.168 0.516 0.008 0.008
#> SRR1075659 6 0.3782 0.80321 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1311916 3 0.7288 0.23998 0.004 0.000 0.452 0.204 0.188 0.152
#> SRR1353353 3 0.7793 0.12853 0.004 0.000 0.312 0.240 0.224 0.220
#> SRR1073291 3 0.1194 0.51485 0.004 0.000 0.956 0.008 0.032 0.000
#> SRR1356227 1 0.1138 0.88440 0.960 0.000 0.004 0.012 0.000 0.024
#> SRR1080720 2 0.4002 -0.15395 0.000 0.660 0.000 0.000 0.020 0.320
#> SRR1091695 6 0.3862 0.80506 0.000 0.388 0.000 0.000 0.004 0.608
#> SRR1350304 5 0.5388 0.69472 0.000 0.000 0.108 0.228 0.636 0.028
#> SRR663002 3 0.7507 0.21222 0.004 0.000 0.408 0.208 0.200 0.180
#> SRR1376983 2 0.4044 0.62185 0.000 0.772 0.000 0.148 0.064 0.016
#> SRR1399926 1 0.1036 0.88386 0.964 0.000 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1347144 3 0.7248 0.24428 0.004 0.000 0.460 0.204 0.180 0.152
#> SRR1384006 1 0.0748 0.88488 0.976 0.000 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1499108 6 0.4602 0.77337 0.004 0.364 0.000 0.024 0.008 0.600
#> SRR614047 3 0.0653 0.51919 0.004 0.000 0.980 0.004 0.012 0.000
#> SRR818440 3 0.4705 -0.43386 0.012 0.000 0.564 0.396 0.028 0.000
#> SRR1337770 4 0.5674 0.51643 0.156 0.000 0.320 0.520 0.004 0.000
#> SRR1399413 3 0.2432 0.45175 0.016 0.000 0.892 0.072 0.000 0.020
#> SRR1385542 2 0.4755 0.60638 0.000 0.724 0.000 0.164 0.064 0.048
#> SRR1473959 4 0.4175 0.59673 0.012 0.000 0.464 0.524 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.0363 0.52002 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.4200 0.61914 0.000 0.760 0.000 0.156 0.064 0.020
#> SRR659460 3 0.1269 0.50662 0.012 0.000 0.956 0.020 0.000 0.012
#> SRR816699 3 0.0870 0.52248 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR1308612 3 0.0748 0.51882 0.004 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000
#> SRR1499418 5 0.4030 0.70551 0.000 0.000 0.104 0.140 0.756 0.000
#> SRR1352894 2 0.4303 0.61567 0.000 0.748 0.000 0.168 0.064 0.020
#> SRR815805 4 0.6428 0.48847 0.132 0.000 0.384 0.444 0.020 0.020
#> SRR1331083 6 0.3817 0.78919 0.000 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568
#> SRR808272 3 0.2074 0.49683 0.004 0.000 0.912 0.036 0.048 0.000
#> SRR1436698 3 0.4672 0.20341 0.364 0.000 0.596 0.008 0.004 0.028
#> SRR1095627 6 0.4661 0.76519 0.004 0.360 0.000 0.028 0.008 0.600
#> SRR1357672 5 0.4350 0.53570 0.000 0.000 0.428 0.016 0.552 0.004
#> SRR1351236 1 0.0837 0.88454 0.972 0.000 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1077479 1 0.2000 0.86875 0.920 0.000 0.044 0.004 0.004 0.028
#> SRR814491 5 0.5560 0.68723 0.000 0.000 0.112 0.240 0.616 0.032
#> SRR1101256 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1436004 1 0.3702 0.75172 0.780 0.000 0.180 0.008 0.004 0.028
#> SRR1457994 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1078998 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1314707 4 0.5493 0.55459 0.120 0.000 0.356 0.520 0.004 0.000
#> SRR1309534 4 0.4659 0.59170 0.012 0.000 0.408 0.556 0.024 0.000
#> SRR615527 3 0.7805 0.12621 0.004 0.000 0.304 0.244 0.228 0.220
#> SRR1098216 1 0.0862 0.88636 0.972 0.000 0.004 0.016 0.000 0.008
#> SRR1325847 6 0.3833 0.77683 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1404003 4 0.4442 0.60837 0.020 0.000 0.440 0.536 0.004 0.000
#> SRR1344166 1 0.6424 0.08760 0.468 0.000 0.268 0.240 0.004 0.020
#> SRR1368638 5 0.5560 0.68723 0.000 0.000 0.112 0.240 0.616 0.032
#> SRR1431429 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1079237 6 0.4242 0.75595 0.000 0.448 0.000 0.000 0.016 0.536
#> SRR1080509 2 0.2318 0.64509 0.000 0.892 0.000 0.064 0.044 0.000
#> SRR815759 5 0.4428 0.72209 0.000 0.000 0.220 0.084 0.696 0.000
#> SRR1502143 3 0.0622 0.52129 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008 0.000
#> SRR1487614 3 0.7644 0.18754 0.004 0.000 0.372 0.208 0.212 0.204
#> SRR1402307 2 0.4564 0.61157 0.000 0.736 0.000 0.164 0.064 0.036
#> SRR820810 4 0.5685 0.52656 0.124 0.000 0.372 0.496 0.004 0.004
#> SRR1099212 2 0.1765 0.57325 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1083215 3 0.1773 0.49060 0.016 0.000 0.932 0.036 0.000 0.016
#> SRR1476547 2 0.4002 -0.15395 0.000 0.660 0.000 0.000 0.020 0.320
#> SRR656421 5 0.5489 0.12597 0.424 0.000 0.016 0.020 0.500 0.040
#> SRR1086116 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1499917 4 0.4117 0.59890 0.004 0.000 0.464 0.528 0.004 0.000
#> SRR1339944 2 0.0713 0.63036 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1391444 2 0.0146 0.64195 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1434889 4 0.4308 0.59141 0.012 0.000 0.468 0.516 0.004 0.000
#> SRR1431847 5 0.6787 0.28390 0.000 0.000 0.096 0.220 0.500 0.184
#> SRR1317155 4 0.4890 0.56823 0.012 0.000 0.368 0.576 0.044 0.000
#> SRR1477405 1 0.0837 0.88500 0.972 0.000 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR655289 5 0.5836 0.63838 0.000 0.000 0.136 0.268 0.568 0.028
#> SRR1341683 4 0.4921 0.50877 0.004 0.000 0.336 0.592 0.068 0.000
#> SRR1084790 5 0.6478 0.57224 0.160 0.000 0.212 0.020 0.564 0.044
#> SRR1073731 3 0.4297 -0.51921 0.004 0.000 0.532 0.452 0.012 0.000
#> SRR1332588 5 0.5560 0.68723 0.000 0.000 0.112 0.240 0.616 0.032
#> SRR1471157 2 0.2278 0.64558 0.000 0.900 0.000 0.052 0.044 0.004
#> SRR654945 3 0.0870 0.52248 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR661028 1 0.1786 0.87200 0.932 0.000 0.032 0.004 0.004 0.028
#> SRR1413477 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1101152 3 0.3806 0.10895 0.012 0.000 0.736 0.240 0.004 0.008
#> SRR1358435 2 0.4250 -0.58747 0.000 0.528 0.000 0.000 0.016 0.456
#> SRR2165273 1 0.0837 0.88470 0.972 0.000 0.004 0.004 0.000 0.020
#> SRR1379014 1 0.2925 0.80513 0.832 0.000 0.004 0.148 0.000 0.016
#> SRR1489904 3 0.7068 0.25266 0.004 0.000 0.492 0.180 0.184 0.140
#> SRR1416386 6 0.3838 0.77247 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1406048 1 0.3837 0.70279 0.744 0.000 0.016 0.224 0.000 0.016
#> SRR606982 5 0.4566 0.72232 0.000 0.000 0.140 0.160 0.700 0.000
#> SRR1358082 1 0.0653 0.88526 0.980 0.000 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR1312934 3 0.1226 0.49752 0.004 0.000 0.952 0.040 0.004 0.000
#> SRR655194 4 0.5802 0.31256 0.356 0.000 0.164 0.476 0.000 0.004
#> SRR1331174 2 0.1663 0.58245 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1473251 2 0.4002 -0.15395 0.000 0.660 0.000 0.000 0.020 0.320
#> SRR1389820 6 0.8361 -0.13452 0.000 0.140 0.084 0.172 0.244 0.360
#> SRR1074289 3 0.1074 0.50355 0.012 0.000 0.960 0.028 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.2358 0.55542 0.000 0.876 0.000 0.000 0.016 0.108
#> SRR1076292 4 0.6012 0.41597 0.004 0.000 0.376 0.496 0.080 0.044
#> SRR1395810 2 0.1092 0.64606 0.000 0.960 0.000 0.020 0.020 0.000
#> SRR1498909 4 0.4654 0.55753 0.004 0.000 0.452 0.512 0.032 0.000
#> SRR1443507 3 0.1546 0.50267 0.020 0.000 0.944 0.020 0.000 0.016
#> SRR1452310 3 0.4303 -0.53066 0.012 0.000 0.524 0.460 0.004 0.000
#> SRR665610 4 0.4107 0.60365 0.004 0.000 0.452 0.540 0.004 0.000
#> SRR1347322 1 0.1375 0.87946 0.952 0.000 0.008 0.008 0.004 0.028
#> SRR813395 6 0.4661 0.76519 0.004 0.360 0.000 0.028 0.008 0.600
#> SRR1477256 1 0.1375 0.87946 0.952 0.000 0.008 0.008 0.004 0.028
#> SRR1470230 5 0.4067 0.70606 0.000 0.000 0.104 0.144 0.752 0.000
#> SRR1354247 1 0.2265 0.86242 0.904 0.000 0.028 0.056 0.000 0.012
#> SRR1082640 2 0.5520 0.56365 0.000 0.644 0.000 0.212 0.060 0.084
#> SRR1487592 3 0.1434 0.51230 0.020 0.000 0.948 0.008 0.000 0.024
#> SRR1352299 3 0.4757 0.29040 0.204 0.000 0.708 0.056 0.004 0.028
#> SRR1076317 6 0.3838 0.77247 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1434117 3 0.1982 0.48837 0.000 0.000 0.912 0.016 0.068 0.004
#> SRR1075273 6 0.3864 0.72334 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR658657 5 0.4580 0.70631 0.000 0.000 0.120 0.168 0.708 0.004
#> SRR1092773 2 0.3911 -0.30875 0.000 0.624 0.000 0.000 0.008 0.368
#> SRR1365332 3 0.0622 0.51771 0.012 0.000 0.980 0.008 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.4989 0.38365 0.004 0.000 0.712 0.160 0.084 0.040
#> SRR1097688 6 0.3862 0.80506 0.000 0.388 0.000 0.000 0.004 0.608
#> SRR1403259 5 0.6269 0.36751 0.000 0.000 0.092 0.164 0.584 0.160
#> SRR1099120 6 0.3789 0.80144 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1362200 3 0.2727 0.47762 0.004 0.000 0.876 0.068 0.048 0.004
#> SRR1464856 2 0.2214 0.56746 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1347298 3 0.7400 0.22812 0.004 0.000 0.432 0.204 0.188 0.172
#> SRR1075923 6 0.3838 0.77247 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1100703 3 0.2756 0.44541 0.032 0.000 0.876 0.072 0.000 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4395 0.561 0.561
#> 3 3 0.787 0.905 0.926 0.4762 0.768 0.588
#> 4 4 0.883 0.811 0.901 0.1261 0.905 0.730
#> 5 5 0.807 0.830 0.885 0.0598 0.933 0.765
#> 6 6 0.811 0.757 0.844 0.0417 0.945 0.777
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 2 0 1 0 1
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 2 0 1 0 1
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 2 0 1 0 1
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 2 0 1 0 1
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 2 0 1 0 1
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.5465 0.84930 0.712 0 0.288
#> SRR1436370 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1397949 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1355723 3 0.6225 -0.15984 0.432 0 0.568
#> SRR1329744 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR657384 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1351190 3 0.3752 0.71517 0.144 0 0.856
#> SRR1458662 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR818573 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1396017 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1410742 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1435963 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1382416 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1391354 1 0.0000 0.73748 1.000 0 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1310075 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1312244 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1325138 1 0.4291 0.53029 0.820 0 0.180
#> SRR1326821 1 0.3752 0.58667 0.856 0 0.144
#> SRR1490178 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR655613 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1075707 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1465758 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1414058 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1407449 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1436858 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1479109 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.73748 1.000 0 0.000
#> SRR1366450 3 0.6267 -0.25494 0.452 0 0.548
#> SRR1396859 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1457176 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1097666 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1434736 1 0.4452 0.50253 0.808 0 0.192
#> SRR1080560 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1322882 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1435688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1327614 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR658152 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1440268 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1453725 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1325711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1477930 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1477591 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1416049 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR656275 3 0.0237 0.89595 0.004 0 0.996
#> SRR1369052 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1377735 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1331244 1 0.0000 0.73748 1.000 0 0.000
#> SRR1404531 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1324331 1 0.0000 0.73748 1.000 0 0.000
#> SRR1458890 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1432695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1087393 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1077263 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1385211 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR655241 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR656922 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1361630 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1318966 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1407087 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR603212 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1321088 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1312645 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1457835 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1347123 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1465501 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1452981 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1326708 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1407157 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1365401 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1477316 1 0.3686 0.62253 0.860 0 0.140
#> SRR1077898 1 0.0000 0.73748 1.000 0 0.000
#> SRR1349080 3 0.6026 0.64425 0.376 0 0.624
#> SRR1076096 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1375485 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1432563 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR604414 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1380614 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR812060 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR602082 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1069490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR661613 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1420710 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR660426 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1416003 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR661064 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1082011 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1452718 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1353243 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1455482 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1313473 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1399394 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1102467 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1317470 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1337707 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1474617 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1398013 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1352918 1 0.3686 0.59279 0.860 0 0.140
#> SRR1420750 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1071785 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1353618 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1490313 3 0.4654 0.59971 0.208 0 0.792
#> SRR1366560 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1355684 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1323289 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1313494 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1309985 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR607911 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1333789 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1400078 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR615575 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1079434 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1325559 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1446695 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1383883 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1396100 1 0.6308 -0.39952 0.508 0 0.492
#> SRR1475697 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1410380 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1445490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1435044 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1485812 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1078020 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1311153 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1376406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1343898 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR807775 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1409215 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR820427 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1100656 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1362159 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1414536 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR656794 1 0.4555 0.48669 0.800 0 0.200
#> SRR604653 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1317685 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1485912 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1407602 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1356164 3 0.0237 0.89603 0.004 0 0.996
#> SRR1328692 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1362438 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1479216 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1358041 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1468766 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1368200 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1501043 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1437256 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1487446 3 0.5363 0.43490 0.276 0 0.724
#> SRR816653 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR815164 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1442043 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1410573 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1096782 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1352369 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1382934 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1465208 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1314728 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1470291 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1308756 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1409600 3 0.1529 0.85938 0.040 0 0.960
#> SRR816123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR614779 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR810783 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1333990 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1410356 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR808106 1 0.6126 -0.12290 0.600 0 0.400
#> SRR662713 3 0.5058 0.50655 0.244 0 0.756
#> SRR1447058 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1480964 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR665417 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1088016 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1413787 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1478207 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1411046 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1313711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1326560 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1309051 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1486949 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1395616 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1074956 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR817210 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1319221 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1405413 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR607807 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1390160 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1406283 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1357709 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1080742 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1468208 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1312766 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1361612 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1311224 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1087801 3 0.5529 0.37609 0.296 0 0.704
#> SRR1099720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1357127 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1332879 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1403177 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1500006 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1485678 1 0.4931 0.42118 0.768 0 0.232
#> SRR1092232 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1344253 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1384290 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1089349 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR818372 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1323675 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR819894 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1310031 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR615419 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1436925 1 0.4931 0.91995 0.768 0 0.232
#> SRR1477238 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1332566 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1490228 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1442949 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1466239 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1094003 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1329971 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR813076 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1322981 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR660522 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR815374 3 0.1163 0.87188 0.028 0 0.972
#> SRR1069564 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1416337 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1316438 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1386844 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1373718 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1447458 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1487128 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1441421 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1460296 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1335489 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1393404 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1081425 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1401815 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1098761 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1312124 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR615395 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1479349 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR2165033 3 0.5560 0.36603 0.300 0 0.700
#> SRR1089054 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR816201 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR655840 1 0.5733 0.79473 0.676 0 0.324
#> SRR1379303 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1418516 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR613174 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1351125 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR659157 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1480408 1 0.4796 0.93352 0.780 0 0.220
#> SRR657857 1 0.4702 0.94250 0.788 0 0.212
#> SRR1073317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1332526 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1094168 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1330106 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1466154 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1396944 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1082784 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1457267 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR614659 3 0.3116 0.77139 0.108 0 0.892
#> SRR659247 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1317201 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1473696 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1375842 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1388123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1453662 1 0.5178 0.89163 0.744 0 0.256
#> SRR1345499 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1353499 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1416693 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1070841 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1380910 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1333125 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1498183 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR612659 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1376786 1 0.5216 0.88670 0.740 0 0.260
#> SRR1345995 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1071035 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1068808 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR662438 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1335355 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR659448 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1323558 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1381711 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR657985 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1314810 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1336505 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1474095 3 0.6126 -0.00618 0.400 0 0.600
#> SRR1363831 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1442376 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1074909 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1101200 3 0.6140 -0.06144 0.404 0 0.596
#> SRR1075408 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1367150 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1313406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1467277 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1084867 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1443113 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1380414 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1315912 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1075778 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR600493 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1477653 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1355475 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1360785 1 0.4002 0.56067 0.840 0 0.160
#> SRR810437 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1361860 1 0.2796 0.66016 0.908 0 0.092
#> SRR1441311 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1098903 1 0.4452 0.50544 0.808 0 0.192
#> SRR1457619 1 0.5397 0.86075 0.720 0 0.280
#> SRR1498529 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1097172 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1476056 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1075659 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1311916 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1353353 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1073291 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1356227 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1080720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1350304 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR663002 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1376983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1399926 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1347144 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1384006 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1499108 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR614047 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR818440 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1337770 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1399413 3 0.5431 0.40229 0.284 0 0.716
#> SRR1385542 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1473959 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1074041 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR659460 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR816699 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1499418 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1352894 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR815805 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1331083 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1436698 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1095627 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1357672 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1351236 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1077479 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR814491 3 0.4605 0.78734 0.204 0 0.796
#> SRR1101256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1436004 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1457994 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1314707 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1309534 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR615527 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1098216 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1325847 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1404003 1 0.5431 0.85483 0.716 0 0.284
#> SRR1344166 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1368638 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1431429 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR815759 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1502143 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1487614 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR820810 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1099212 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1083215 3 0.6309 -0.41148 0.500 0 0.500
#> SRR1476547 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.73748 1.000 0 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1499917 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1434889 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1431847 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1317155 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1477405 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR655289 3 0.4654 0.78594 0.208 0 0.792
#> SRR1341683 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.73748 1.000 0 0.000
#> SRR1073731 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1332588 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1471157 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR654945 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR661028 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1413477 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1101152 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1358435 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR2165273 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1379014 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1489904 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1416386 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1406048 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR606982 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1358082 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1312934 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR655194 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1331174 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1389820 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1074289 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1076292 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1498909 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1443507 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1452310 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR665610 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1347322 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR813395 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1477256 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1470230 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1354247 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1082640 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1487592 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1352299 1 0.4555 0.95470 0.800 0 0.200
#> SRR1076317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1434117 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1075273 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR658657 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1092773 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1365332 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR615958 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1403259 3 0.4555 0.78854 0.200 0 0.800
#> SRR1099120 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.89974 0.000 0 1.000
#> SRR1075923 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000
#> SRR1100703 3 0.6235 -0.17064 0.436 0 0.564
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.3751 0.3490 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1397949 1 0.0188 0.9342 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355723 3 0.3820 0.4177 0.064 0.000 0.848 0.088
#> SRR1329744 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.4964 0.4288 0.616 0.000 0.380 0.004
#> SRR1351190 3 0.0779 0.5884 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.2142 0.8907 0.928 0.000 0.056 0.016
#> SRR1396017 1 0.4522 0.5402 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1410742 3 0.4837 0.1034 0.348 0.000 0.648 0.004
#> SRR1435963 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.5730 0.7091 0.040 0.000 0.344 0.616
#> SRR1087968 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 4 0.5386 0.7097 0.020 0.000 0.368 0.612
#> SRR1326821 4 0.5143 0.3651 0.360 0.000 0.012 0.628
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1075707 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443871 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102489 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465758 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.4936 0.7287 0.004 0.000 0.624 0.372
#> SRR1407449 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1479109 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1399069 4 0.5467 0.7090 0.024 0.000 0.364 0.612
#> SRR1366450 3 0.7366 0.3629 0.344 0.000 0.484 0.172
#> SRR1396859 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1097666 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1434736 4 0.6567 0.6835 0.128 0.000 0.256 0.616
#> SRR1080560 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1322882 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.0657 0.5896 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1368141 3 0.0657 0.6023 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1440268 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0779 0.9276 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416049 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR656275 3 0.0779 0.5962 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1369052 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1331244 1 0.4713 0.4062 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4624 0.4529 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1458890 3 0.0657 0.6023 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1087393 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077263 4 0.1022 0.6325 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 4 0.0592 0.6200 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1318966 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1407087 3 0.4905 0.7289 0.004 0.000 0.632 0.364
#> SRR603212 1 0.0779 0.9276 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1321088 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485190 3 0.4781 0.7273 0.004 0.000 0.660 0.336
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.4905 0.4536 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1457835 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1347123 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1465501 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1330878 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1445064 3 0.0895 0.6067 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1452981 1 0.4905 0.4536 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1326708 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1407157 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.7068 -0.3364 0.156 0.000 0.548 0.296
#> SRR1077898 1 0.4454 0.5393 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1349080 4 0.4283 0.7365 0.004 0.000 0.256 0.740
#> SRR1076096 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR811261 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1375485 1 0.0804 0.9277 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR602082 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.4920 0.7290 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1420710 3 0.0524 0.5960 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR660426 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416003 3 0.0524 0.5996 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR661064 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0336 0.9329 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353243 1 0.0188 0.9342 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0779 0.9276 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1102467 1 0.0592 0.9259 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1317470 4 0.0592 0.6200 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1337707 3 0.1743 0.6224 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1398013 3 0.0376 0.5965 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1352918 4 0.5371 0.7108 0.020 0.000 0.364 0.616
#> SRR1420750 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1071785 3 0.1305 0.6166 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR1353618 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1082217 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.1004 0.5853 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR1366560 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 4 0.0707 0.6185 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1313494 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.1792 0.8818 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1400078 3 0.0376 0.5969 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615575 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1079434 4 0.4222 0.7363 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1325559 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1446695 4 0.0469 0.6226 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1383883 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 4 0.5070 0.7132 0.008 0.000 0.372 0.620
#> SRR1475697 3 0.1004 0.5772 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR1488067 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102103 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1105154 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084991 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410380 4 0.0592 0.6200 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1435044 3 0.2266 0.6345 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1485812 3 0.2714 0.6403 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1078020 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 4 0.1022 0.6061 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR807775 4 0.4933 -0.4430 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 4 0.4222 0.7363 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1100656 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 4 0.0707 0.6229 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR656794 4 0.4889 0.3556 0.360 0.000 0.004 0.636
#> SRR604653 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 4 0.4304 0.7298 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1485912 3 0.4837 0.7290 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR1407602 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1356164 3 0.1978 0.6264 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1328692 3 0.3052 0.6533 0.004 0.000 0.860 0.136
#> SRR1362438 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1479216 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1358041 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1368200 3 0.4920 0.7290 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 4 0.3528 0.7065 0.000 0.000 0.192 0.808
#> SRR1437256 3 0.0524 0.5996 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1487446 3 0.4964 0.0420 0.380 0.000 0.616 0.004
#> SRR816653 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR815164 1 0.0779 0.9286 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1442043 1 0.4964 0.4265 0.616 0.000 0.380 0.004
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.4950 0.7280 0.004 0.000 0.620 0.376
#> SRR1382934 3 0.4837 0.7289 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR1465208 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0779 0.9286 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1470291 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.4950 0.7287 0.004 0.000 0.620 0.376
#> SRR1409600 3 0.5997 0.6929 0.048 0.000 0.576 0.376
#> SRR816123 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR614779 4 0.0592 0.6200 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR810783 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1333990 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR808106 4 0.5727 0.7179 0.076 0.000 0.236 0.688
#> SRR662713 3 0.5298 0.7236 0.016 0.000 0.612 0.372
#> SRR1447058 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1480964 3 0.4781 0.7290 0.004 0.000 0.660 0.336
#> SRR809382 3 0.4741 0.7258 0.004 0.000 0.668 0.328
#> SRR665417 1 0.1211 0.9066 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1088016 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453166 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1413787 4 0.0707 0.6185 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1478207 3 0.4905 0.7289 0.004 0.000 0.632 0.364
#> SRR1411046 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1486949 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1092961 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR817210 3 0.4343 0.7063 0.004 0.000 0.732 0.264
#> SRR1319221 2 0.0804 0.9821 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1405413 1 0.1059 0.9241 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR607807 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1406283 1 0.4776 0.6867 0.776 0.000 0.164 0.060
#> SRR1357709 3 0.5163 -0.2034 0.480 0.000 0.516 0.004
#> SRR1080742 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1468208 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1361612 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1087801 3 0.4228 0.6940 0.008 0.000 0.760 0.232
#> SRR1099720 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1349250 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1350912 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357127 3 0.4800 0.7297 0.004 0.000 0.656 0.340
#> SRR1074980 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1317022 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1332879 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1403177 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818239 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1421069 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.6150 0.6829 0.060 0.000 0.360 0.580
#> SRR1092232 3 0.4761 0.7266 0.004 0.000 0.664 0.332
#> SRR1344253 4 0.1557 0.6430 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1384290 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.0376 0.5965 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR818372 3 0.0376 0.5965 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1323675 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819894 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1310031 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR615419 3 0.0657 0.6023 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1436925 3 0.2924 0.5103 0.100 0.000 0.884 0.016
#> SRR1477238 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.4761 0.7285 0.004 0.000 0.664 0.332
#> SRR1442949 4 0.4222 0.7363 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1466239 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0592 0.9300 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR813076 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1097642 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1322981 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR660522 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR815374 3 0.1610 0.5720 0.032 0.000 0.952 0.016
#> SRR1069564 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1416337 4 0.0592 0.6200 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1316438 3 0.4677 0.7229 0.004 0.000 0.680 0.316
#> SRR1386844 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1071337 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1098761 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1312124 1 0.4677 0.5384 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR615395 1 0.2831 0.8251 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1479349 1 0.1211 0.9066 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR2165033 3 0.3852 0.3441 0.192 0.000 0.800 0.008
#> SRR1089054 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816201 3 0.0524 0.5960 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 3 0.4720 0.1395 0.324 0.000 0.672 0.004
#> SRR1379303 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR613174 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1351125 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR659157 3 0.0895 0.5956 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1480408 3 0.4343 0.2359 0.264 0.000 0.732 0.004
#> SRR657857 3 0.5112 -0.0605 0.436 0.000 0.560 0.004
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.5119 -0.0731 0.440 0.000 0.556 0.004
#> SRR1094168 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1431270 3 0.2773 0.6343 0.004 0.000 0.880 0.116
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.0376 0.5965 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1466154 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396944 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.0927 0.5937 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR659247 3 0.4313 0.6974 0.004 0.000 0.736 0.260
#> SRR1317201 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453662 3 0.2300 0.5362 0.064 0.000 0.920 0.016
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416693 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR612659 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1447148 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR658597 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1089595 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.7289 0.5492 0.192 0.000 0.528 0.280
#> SRR1345995 1 0.4359 0.7525 0.816 0.000 0.084 0.100
#> SRR1071035 1 0.5069 0.4583 0.664 0.000 0.320 0.016
#> SRR1068808 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332754 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1323558 3 0.4920 0.7290 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1381711 4 0.1022 0.6316 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR657985 4 0.0592 0.6200 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1314810 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1336505 3 0.0895 0.6116 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1474095 1 0.7387 0.1783 0.520 0.000 0.224 0.256
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.4905 0.4536 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1074909 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1101200 3 0.5615 0.7153 0.032 0.000 0.612 0.356
#> SRR1075408 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1367150 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1313406 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1068880 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1467277 4 0.0817 0.6260 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1084867 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1095431 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1380184 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443113 1 0.1888 0.8920 0.940 0.000 0.044 0.016
#> SRR1380414 4 0.1637 0.5493 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1315912 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0524 0.5996 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1477653 1 0.6426 0.4152 0.620 0.000 0.108 0.272
#> SRR1355475 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1360785 4 0.5371 0.7108 0.020 0.000 0.364 0.616
#> SRR810437 3 0.0779 0.6051 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1361860 3 0.7870 -0.4710 0.276 0.000 0.364 0.360
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.5371 0.7108 0.020 0.000 0.364 0.616
#> SRR1457619 3 0.4973 0.1006 0.348 0.000 0.644 0.008
#> SRR1498529 1 0.1940 0.8734 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.4781 0.7273 0.004 0.000 0.660 0.336
#> SRR1399525 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312844 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1085874 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1101226 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1476056 1 0.4713 0.4674 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1075659 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311916 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1353353 3 0.4741 0.7258 0.004 0.000 0.668 0.328
#> SRR1073291 3 0.4950 0.7280 0.004 0.000 0.620 0.376
#> SRR1356227 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1091695 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1350304 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR663002 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1384006 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR614047 3 0.4920 0.7290 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR818440 3 0.2401 0.6381 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR1337770 1 0.4585 0.5187 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1399413 3 0.5543 0.7175 0.028 0.000 0.612 0.360
#> SRR1385542 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1473959 3 0.0376 0.5969 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1074041 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR816699 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1308612 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1499418 4 0.4250 0.7356 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.1557 0.8885 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1331083 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808272 3 0.4905 0.7289 0.004 0.000 0.632 0.364
#> SRR1436698 1 0.1004 0.9222 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1095627 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1357672 4 0.0336 0.6129 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1314707 1 0.4624 0.5055 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1309534 3 0.1004 0.5772 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR615527 3 0.4800 0.7280 0.004 0.000 0.656 0.340
#> SRR1098216 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404003 3 0.3052 0.4441 0.136 0.000 0.860 0.004
#> SRR1344166 1 0.0707 0.9235 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1368638 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1431429 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1079237 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 4 0.4103 0.7344 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1502143 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1487614 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1402307 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR820810 1 0.4908 0.5900 0.692 0.000 0.292 0.016
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.5713 0.7113 0.036 0.000 0.604 0.360
#> SRR1476547 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR656421 1 0.4972 0.1355 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1086116 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499917 3 0.0524 0.5960 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.0657 0.5969 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1431847 4 0.4304 0.7352 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1317155 3 0.0376 0.5965 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.4761 0.7126 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1341683 3 0.0524 0.5996 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1084790 4 0.5080 0.2208 0.420 0.000 0.004 0.576
#> SRR1073731 3 0.2714 0.6414 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1332588 4 0.4790 0.7140 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR661028 1 0.0469 0.9314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.0779 0.5962 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1358435 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2165273 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1416386 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1406048 1 0.0336 0.9312 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR606982 4 0.4222 0.7363 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.4936 0.7290 0.004 0.000 0.624 0.372
#> SRR655194 1 0.1474 0.8960 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389820 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074289 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.2466 0.6356 0.004 0.000 0.900 0.096
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.0524 0.5996 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1443507 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1452310 3 0.0524 0.6001 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR665610 3 0.0895 0.5868 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0376 0.9962 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 4 0.4250 0.7356 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9354 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0188 0.9968 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487592 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1352299 1 0.0657 0.9297 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1076317 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1434117 4 0.4996 -0.5483 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1075273 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658657 4 0.4730 0.7190 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1092773 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365332 3 0.4964 0.7282 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR615958 3 0.4905 0.7289 0.004 0.000 0.632 0.364
#> SRR1097688 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403259 4 0.4193 0.7340 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1099120 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362200 3 0.4905 0.7289 0.004 0.000 0.632 0.364
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9975 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.4920 0.7282 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1075923 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100703 3 0.7403 0.5432 0.168 0.000 0.452 0.380
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 4 0.2843 0.8440 0.008 0.000 0.144 0.848 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1397949 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.3283 0.8358 0.008 0.000 0.116 0.848 0.028
#> SRR1329744 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR657384 4 0.2966 0.8413 0.016 0.000 0.136 0.848 0.000
#> SRR1351190 4 0.2719 0.8445 0.004 0.000 0.144 0.852 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.5460 0.5752 0.656 0.000 0.148 0.196 0.000
#> SRR1396017 1 0.3895 0.5325 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1410742 4 0.2966 0.8413 0.016 0.000 0.136 0.848 0.000
#> SRR1435963 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 5 0.4054 0.7529 0.020 0.000 0.000 0.248 0.732
#> SRR1087968 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310075 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 4 0.3969 0.4082 0.004 0.000 0.000 0.692 0.304
#> SRR1326821 5 0.4779 0.6805 0.164 0.000 0.096 0.004 0.736
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.1341 0.8972 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1443871 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102489 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1465758 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414058 3 0.2329 0.7892 0.000 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1407449 1 0.0290 0.9284 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1436858 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1479109 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1399069 5 0.4101 0.6664 0.004 0.000 0.000 0.332 0.664
#> SRR1366450 3 0.3209 0.6406 0.180 0.000 0.812 0.008 0.000
#> SRR1396859 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457176 1 0.1341 0.8972 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1434736 5 0.4489 0.7540 0.068 0.000 0.000 0.192 0.740
#> SRR1080560 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1322882 1 0.0703 0.9196 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 4 0.1894 0.8233 0.000 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1368141 4 0.2879 0.7227 0.000 0.000 0.032 0.868 0.100
#> SRR1440268 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453725 1 0.3848 0.7637 0.788 0.000 0.172 0.040 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0404 0.9267 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1477591 1 0.0290 0.9275 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR656275 4 0.2732 0.8427 0.000 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1369052 1 0.0609 0.9231 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1377735 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.4310 0.3289 0.604 0.000 0.000 0.004 0.392
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4084 0.4873 0.668 0.000 0.000 0.004 0.328
#> SRR1458890 4 0.2879 0.7227 0.000 0.000 0.032 0.868 0.100
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431969 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1087393 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1077263 5 0.3689 0.7145 0.000 0.000 0.256 0.004 0.740
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0404 0.9269 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR656922 1 0.3141 0.8255 0.852 0.000 0.108 0.040 0.000
#> SRR1361630 5 0.3561 0.7106 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1318966 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1407087 3 0.1774 0.8177 0.000 0.000 0.932 0.052 0.016
#> SRR603212 1 0.3455 0.7498 0.784 0.000 0.208 0.008 0.000
#> SRR1321088 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485190 3 0.5613 0.5860 0.000 0.000 0.592 0.308 0.100
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 4 0.3255 0.8235 0.052 0.000 0.100 0.848 0.000
#> SRR1457835 1 0.1544 0.8885 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1465501 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1330878 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1445064 4 0.2879 0.7227 0.000 0.000 0.032 0.868 0.100
#> SRR1452981 4 0.4502 0.6787 0.180 0.000 0.076 0.744 0.000
#> SRR1326708 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.3450 0.7718 0.012 0.000 0.044 0.848 0.096
#> SRR1077898 1 0.3741 0.6177 0.732 0.000 0.004 0.000 0.264
#> SRR1349080 5 0.4537 0.7880 0.000 0.000 0.076 0.184 0.740
#> SRR1076096 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR811261 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1375485 1 0.3955 0.7727 0.800 0.000 0.116 0.084 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.1341 0.8972 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0794 0.8210 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1420710 4 0.2648 0.8439 0.000 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR660426 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.2351 0.8240 0.000 0.000 0.088 0.896 0.016
#> SRR661064 1 0.0510 0.9249 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.3388 0.7591 0.792 0.000 0.200 0.008 0.000
#> SRR1102467 1 0.5475 0.4351 0.604 0.000 0.088 0.308 0.000
#> SRR1317470 5 0.3561 0.7106 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1337707 4 0.3697 0.6828 0.000 0.000 0.080 0.820 0.100
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1398013 4 0.2377 0.8444 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1352918 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1420750 1 0.0290 0.9276 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071785 4 0.2959 0.7202 0.000 0.000 0.036 0.864 0.100
#> SRR1353618 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082217 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.2843 0.8440 0.008 0.000 0.144 0.848 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.4238 0.6640 0.000 0.000 0.164 0.068 0.768
#> SRR1313494 1 0.0290 0.9284 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309985 1 0.2732 0.7980 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR607911 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333789 3 0.0290 0.8253 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1400078 4 0.2648 0.8439 0.000 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR615575 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079434 5 0.4100 0.7828 0.000 0.000 0.044 0.192 0.764
#> SRR1325559 1 0.2233 0.8566 0.892 0.000 0.104 0.004 0.000
#> SRR1446695 5 0.3689 0.7145 0.000 0.000 0.256 0.004 0.740
#> SRR1383883 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396100 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1475697 4 0.2221 0.8031 0.000 0.000 0.052 0.912 0.036
#> SRR1488067 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1102103 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1105154 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1084991 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1410380 5 0.3561 0.7106 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1435044 4 0.4042 0.7998 0.000 0.000 0.212 0.756 0.032
#> SRR1485812 4 0.5091 0.4748 0.000 0.000 0.244 0.672 0.084
#> SRR1078020 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.4666 0.6247 0.000 0.000 0.180 0.088 0.732
#> SRR807775 3 0.4832 0.5888 0.000 0.000 0.712 0.088 0.200
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 5 0.4537 0.7880 0.000 0.000 0.076 0.184 0.740
#> SRR1100656 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 5 0.3689 0.7145 0.000 0.000 0.256 0.004 0.740
#> SRR656794 5 0.5810 0.5830 0.212 0.000 0.176 0.000 0.612
#> SRR604653 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.4819 0.7790 0.000 0.000 0.092 0.192 0.716
#> SRR1485912 3 0.1197 0.8076 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1407602 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1356164 4 0.2863 0.7430 0.000 0.000 0.064 0.876 0.060
#> SRR1328692 4 0.4002 0.6770 0.000 0.000 0.120 0.796 0.084
#> SRR1362438 1 0.0404 0.9260 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1358041 1 0.1106 0.9138 0.964 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1468766 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1368200 3 0.0290 0.8274 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.4199 0.7151 0.000 0.000 0.056 0.180 0.764
#> SRR1437256 4 0.2795 0.7245 0.000 0.000 0.028 0.872 0.100
#> SRR1487446 4 0.2966 0.8429 0.016 0.000 0.136 0.848 0.000
#> SRR816653 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.3612 0.7777 0.800 0.000 0.172 0.028 0.000
#> SRR1442043 4 0.3060 0.8392 0.024 0.000 0.128 0.848 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.0671 0.8277 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1382934 3 0.5596 0.5923 0.000 0.000 0.596 0.304 0.100
#> SRR1465208 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1314728 1 0.1908 0.8694 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1308756 3 0.0510 0.8269 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1409600 3 0.0613 0.8225 0.004 0.000 0.984 0.008 0.004
#> SRR816123 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR614779 5 0.3561 0.7106 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR810783 3 0.0290 0.8258 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1333990 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1410356 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR808106 5 0.5094 0.7722 0.056 0.000 0.048 0.156 0.740
#> SRR662713 3 0.0404 0.8236 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1447058 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480964 3 0.3160 0.6628 0.000 0.000 0.808 0.188 0.004
#> SRR809382 3 0.5674 0.5577 0.000 0.000 0.576 0.324 0.100
#> SRR665417 1 0.2329 0.8352 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1088016 2 0.1331 0.9284 0.000 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1453166 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1069826 2 0.0290 0.9364 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1413787 5 0.4647 0.6299 0.000 0.000 0.172 0.092 0.736
#> SRR1478207 3 0.4637 0.7280 0.000 0.000 0.740 0.160 0.100
#> SRR1411046 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309051 1 0.0290 0.9275 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1395616 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074956 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1092961 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR817210 3 0.4294 -0.1942 0.000 0.000 0.532 0.468 0.000
#> SRR1319221 2 0.5180 0.7195 0.000 0.664 0.004 0.072 0.260
#> SRR1405413 1 0.3476 0.7749 0.804 0.000 0.176 0.020 0.000
#> SRR607807 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1390160 3 0.4818 0.7307 0.000 0.000 0.720 0.180 0.100
#> SRR1406283 3 0.3424 0.5588 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000
#> SRR1357709 4 0.2966 0.8413 0.016 0.000 0.136 0.848 0.000
#> SRR1080742 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1468208 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312766 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1361612 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311224 1 0.0510 0.9239 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.3586 0.4992 0.000 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1099720 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1349250 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1350912 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357127 3 0.2209 0.8040 0.000 0.000 0.912 0.056 0.032
#> SRR1074980 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317022 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1332879 1 0.1792 0.8759 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.2358 0.9130 0.000 0.888 0.000 0.008 0.104
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR818239 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1421069 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 5 0.6588 0.4581 0.044 0.000 0.088 0.352 0.516
#> SRR1092232 3 0.5644 0.5720 0.000 0.000 0.584 0.316 0.100
#> SRR1344253 5 0.4210 0.7391 0.000 0.000 0.224 0.036 0.740
#> SRR1384290 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1089349 3 0.0162 0.8268 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 4 0.1831 0.8256 0.000 0.000 0.076 0.920 0.004
#> SRR818372 4 0.2763 0.8451 0.000 0.000 0.148 0.848 0.004
#> SRR1323675 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR819894 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1310031 3 0.4226 0.7548 0.000 0.000 0.776 0.140 0.084
#> SRR615419 4 0.2879 0.7227 0.000 0.000 0.032 0.868 0.100
#> SRR1436925 4 0.3409 0.8294 0.032 0.000 0.144 0.824 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490228 3 0.4269 0.6524 0.000 0.000 0.756 0.188 0.056
#> SRR1442949 5 0.4537 0.7880 0.000 0.000 0.076 0.184 0.740
#> SRR1466239 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.2377 0.8408 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1097642 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1322981 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4334 0.7512 0.000 0.000 0.768 0.140 0.092
#> SRR660522 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815374 4 0.2763 0.8432 0.004 0.000 0.148 0.848 0.000
#> SRR1069564 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1416337 5 0.3561 0.7106 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1316438 3 0.5744 0.5377 0.000 0.000 0.564 0.332 0.104
#> SRR1386844 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1373718 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447458 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1393404 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1071337 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1098761 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1312124 1 0.4909 0.3248 0.588 0.000 0.032 0.380 0.000
#> SRR615395 3 0.2648 0.6838 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.2605 0.8148 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR2165033 4 0.2798 0.8443 0.008 0.000 0.140 0.852 0.000
#> SRR1089054 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR816201 4 0.2648 0.8439 0.000 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.2909 0.8430 0.012 0.000 0.140 0.848 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR613174 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR659157 4 0.3460 0.7198 0.000 0.000 0.044 0.828 0.128
#> SRR1480408 4 0.2966 0.8413 0.016 0.000 0.136 0.848 0.000
#> SRR657857 4 0.3243 0.8347 0.032 0.000 0.116 0.848 0.004
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.3238 0.8353 0.028 0.000 0.136 0.836 0.000
#> SRR1094168 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1431270 4 0.5820 0.4184 0.000 0.000 0.196 0.612 0.192
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 4 0.2754 0.8091 0.000 0.000 0.080 0.880 0.040
#> SRR1466154 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 4 0.2773 0.8414 0.000 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR659247 3 0.1732 0.7812 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1317201 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473696 1 0.2813 0.7994 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1453662 4 0.3098 0.8395 0.016 0.000 0.148 0.836 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070841 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.2753 0.8222 0.856 0.000 0.136 0.008 0.000
#> SRR612659 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1447148 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR658597 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1089595 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.1408 0.7956 0.044 0.000 0.948 0.008 0.000
#> SRR1345995 3 0.4339 0.4005 0.336 0.000 0.652 0.012 0.000
#> SRR1071035 3 0.4152 0.4685 0.296 0.000 0.692 0.012 0.000
#> SRR1068808 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1332754 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.1478 0.8140 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1381711 5 0.3689 0.7145 0.000 0.000 0.256 0.004 0.740
#> SRR657985 5 0.3561 0.7106 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1314810 1 0.0880 0.9140 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1336505 4 0.2930 0.8413 0.000 0.000 0.164 0.832 0.004
#> SRR1474095 1 0.6346 0.0555 0.436 0.000 0.404 0.160 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.3554 0.8221 0.040 0.000 0.088 0.848 0.024
#> SRR1074909 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1101200 3 0.0324 0.8257 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1075408 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367150 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1313406 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1068880 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467277 5 0.3689 0.7145 0.000 0.000 0.256 0.004 0.740
#> SRR1084867 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095431 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1380184 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1443113 1 0.4583 0.6032 0.672 0.000 0.296 0.032 0.000
#> SRR1380414 3 0.3816 0.4309 0.000 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1315912 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 4 0.2879 0.7227 0.000 0.000 0.032 0.868 0.100
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0404 0.9260 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.3246 0.6377 0.184 0.000 0.808 0.008 0.000
#> SRR1355475 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360785 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR810437 4 0.2879 0.7227 0.000 0.000 0.032 0.868 0.100
#> SRR1361860 4 0.4722 0.5651 0.012 0.000 0.040 0.716 0.232
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 5 0.3612 0.7507 0.000 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1457619 4 0.2966 0.8413 0.016 0.000 0.136 0.848 0.000
#> SRR1498529 1 0.5847 0.0317 0.480 0.000 0.096 0.424 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0671 0.9339 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.5596 0.5919 0.000 0.000 0.596 0.304 0.100
#> SRR1399525 2 0.2890 0.8990 0.000 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1312844 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1085874 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1101226 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1476056 4 0.3300 0.6467 0.204 0.000 0.004 0.792 0.000
#> SRR1075659 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1311916 3 0.4334 0.7512 0.000 0.000 0.768 0.140 0.092
#> SRR1353353 4 0.5382 0.3615 0.000 0.000 0.260 0.640 0.100
#> SRR1073291 3 0.1121 0.8204 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1356227 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1080720 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1091695 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1350304 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR663002 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347144 3 0.4334 0.7512 0.000 0.000 0.768 0.140 0.092
#> SRR1384006 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499108 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR614047 3 0.0162 0.8278 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR818440 4 0.5128 0.6125 0.000 0.000 0.344 0.604 0.052
#> SRR1337770 4 0.3697 0.8000 0.080 0.000 0.100 0.820 0.000
#> SRR1399413 3 0.3013 0.6903 0.008 0.000 0.832 0.160 0.000
#> SRR1385542 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473959 4 0.2690 0.8435 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1074041 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816699 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 5 0.3616 0.7753 0.000 0.000 0.032 0.164 0.804
#> SRR1352894 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR815805 1 0.2790 0.8531 0.880 0.000 0.068 0.052 0.000
#> SRR1331083 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR808272 3 0.1908 0.8036 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1436698 1 0.3876 0.5840 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1357672 5 0.3796 0.6655 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0609 0.9218 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1314707 4 0.3749 0.7985 0.080 0.000 0.104 0.816 0.000
#> SRR1309534 4 0.2735 0.8270 0.000 0.000 0.084 0.880 0.036
#> SRR615527 3 0.5613 0.5860 0.000 0.000 0.592 0.308 0.100
#> SRR1098216 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325847 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1404003 4 0.2843 0.8440 0.008 0.000 0.144 0.848 0.000
#> SRR1344166 1 0.4624 0.6985 0.744 0.000 0.112 0.144 0.000
#> SRR1368638 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1431429 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079237 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 5 0.4657 0.7878 0.000 0.000 0.108 0.152 0.740
#> SRR1502143 3 0.0290 0.8273 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1487614 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1402307 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR820810 4 0.5974 0.4521 0.292 0.000 0.144 0.564 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0898 0.8142 0.020 0.000 0.972 0.008 0.000
#> SRR1476547 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR656421 5 0.4440 0.1087 0.468 0.000 0.000 0.004 0.528
#> SRR1086116 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499917 4 0.2648 0.8439 0.000 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.2732 0.8427 0.000 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1431847 5 0.4104 0.7003 0.000 0.000 0.032 0.220 0.748
#> SRR1317155 4 0.1671 0.8268 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 5 0.3636 0.7466 0.000 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1341683 4 0.2130 0.8241 0.000 0.000 0.080 0.908 0.012
#> SRR1084790 5 0.5441 0.5498 0.280 0.000 0.096 0.000 0.624
#> SRR1073731 4 0.3550 0.7899 0.000 0.000 0.236 0.760 0.004
#> SRR1332588 5 0.3561 0.7576 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.0000 0.8279 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 4 0.3305 0.7982 0.000 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1358435 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR2165273 1 0.0162 0.9294 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1379014 1 0.0404 0.9267 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1489904 3 0.4386 0.7494 0.000 0.000 0.764 0.140 0.096
#> SRR1416386 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1406048 1 0.0609 0.9220 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR606982 5 0.4479 0.7880 0.000 0.000 0.072 0.184 0.744
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.1671 0.7882 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR655194 1 0.3655 0.7696 0.804 0.000 0.036 0.160 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1389820 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1074289 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 4 0.4333 0.6231 0.000 0.000 0.188 0.752 0.060
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.1764 0.8070 0.000 0.000 0.064 0.928 0.008
#> SRR1443507 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452310 4 0.3508 0.7787 0.000 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR665610 4 0.2763 0.8427 0.000 0.000 0.148 0.848 0.004
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9296 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.3123 0.8971 0.000 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1477256 1 0.0162 0.9286 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.3616 0.7753 0.000 0.000 0.032 0.164 0.804
#> SRR1354247 1 0.0992 0.9168 0.968 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR1082640 2 0.0162 0.9368 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487592 3 0.0324 0.8257 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1352299 1 0.4309 0.5999 0.676 0.000 0.308 0.016 0.000
#> SRR1076317 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1434117 3 0.2848 0.6941 0.000 0.000 0.840 0.004 0.156
#> SRR1075273 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR658657 5 0.3305 0.7638 0.000 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1092773 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1365332 3 0.0162 0.8270 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR615958 3 0.3366 0.7733 0.000 0.000 0.828 0.140 0.032
#> SRR1097688 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1403259 5 0.4010 0.7110 0.000 0.000 0.032 0.208 0.760
#> SRR1099120 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1362200 3 0.2329 0.7892 0.000 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.4437 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.140 0.100
#> SRR1075923 2 0.3013 0.8977 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1100703 3 0.3276 0.7078 0.032 0.000 0.836 0.132 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.1267 0.841499 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1397949 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355723 4 0.1555 0.837651 0.008 0.000 0.040 0.940 0.012 0.000
#> SRR1329744 1 0.0622 0.880669 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR657384 4 0.1267 0.841499 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1458662 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.5679 0.304962 0.132 0.000 0.352 0.508 0.000 0.008
#> SRR1396017 4 0.3993 0.336662 0.400 0.000 0.000 0.592 0.000 0.008
#> SRR1410742 4 0.1267 0.841499 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1382416 1 0.1275 0.880093 0.956 0.000 0.016 0.012 0.000 0.016
#> SRR1391354 5 0.2454 0.827589 0.000 0.000 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1087968 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1310075 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1312244 1 0.0881 0.882545 0.972 0.000 0.012 0.008 0.000 0.008
#> SRR1325138 4 0.3240 0.574822 0.000 0.000 0.004 0.752 0.244 0.000
#> SRR1326821 5 0.2653 0.821073 0.012 0.000 0.144 0.000 0.844 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.3043 0.744239 0.792 0.000 0.200 0.000 0.000 0.008
#> SRR1075707 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR1443871 2 0.0508 0.854224 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1102489 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1465758 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1414058 3 0.3464 0.411649 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1407449 1 0.2048 0.802175 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0603 0.853518 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1479109 3 0.0405 0.853311 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1399069 5 0.3547 0.605140 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1366450 3 0.1728 0.808658 0.064 0.000 0.924 0.004 0.000 0.008
#> SRR1396859 1 0.0622 0.880669 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1457176 1 0.3073 0.736343 0.788 0.000 0.204 0.000 0.000 0.008
#> SRR1097666 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1434736 5 0.3219 0.797770 0.076 0.000 0.000 0.076 0.840 0.008
#> SRR1080560 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR1322882 1 0.3103 0.734166 0.784 0.000 0.208 0.000 0.000 0.008
#> SRR1435688 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR658152 4 0.2346 0.759977 0.000 0.000 0.008 0.868 0.000 0.124
#> SRR1368141 6 0.3684 0.459761 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1440268 1 0.0622 0.880669 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1453725 3 0.5671 0.358802 0.304 0.000 0.540 0.148 0.000 0.008
#> SRR1325711 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.3565 0.546844 0.692 0.000 0.000 0.304 0.000 0.004
#> SRR1477591 1 0.3012 0.746971 0.796 0.000 0.196 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416049 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR656275 4 0.1531 0.838512 0.000 0.000 0.068 0.928 0.000 0.004
#> SRR1369052 1 0.3464 0.533025 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.1434 0.870540 0.940 0.000 0.048 0.000 0.000 0.012
#> SRR1331244 1 0.3991 0.119533 0.524 0.000 0.000 0.004 0.472 0.000
#> SRR1404531 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1324331 1 0.3795 0.420843 0.632 0.000 0.000 0.004 0.364 0.000
#> SRR1458890 6 0.3756 0.415456 0.000 0.000 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1432695 2 0.0146 0.856008 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1407624 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1431969 6 0.3198 0.704882 0.000 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1087393 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR1077263 5 0.2520 0.823462 0.000 0.000 0.152 0.004 0.844 0.000
#> SRR1385211 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR655241 1 0.2933 0.712096 0.796 0.000 0.000 0.200 0.000 0.004
#> SRR656922 1 0.5446 0.116998 0.472 0.000 0.092 0.428 0.000 0.008
#> SRR1361630 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1318966 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1407087 3 0.2300 0.728906 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR603212 3 0.3692 0.601720 0.244 0.000 0.736 0.012 0.000 0.008
#> SRR1321088 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1485190 6 0.3455 0.747695 0.000 0.000 0.144 0.056 0.000 0.800
#> SRR1332232 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1312645 4 0.1699 0.834200 0.016 0.000 0.032 0.936 0.000 0.016
#> SRR1457835 1 0.3934 0.458300 0.616 0.000 0.376 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347123 6 0.3266 0.695971 0.000 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1465501 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR1330878 6 0.2854 0.732120 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1445064 6 0.3765 0.406508 0.000 0.000 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1452981 4 0.2103 0.810300 0.056 0.000 0.020 0.912 0.000 0.012
#> SRR1326708 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407157 1 0.0000 0.883248 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0603 0.853518 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1397697 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.1642 0.830784 0.000 0.000 0.032 0.936 0.028 0.004
#> SRR1077898 1 0.4078 0.472753 0.640 0.000 0.020 0.000 0.340 0.000
#> SRR1349080 5 0.3107 0.845463 0.000 0.000 0.080 0.072 0.844 0.004
#> SRR1076096 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR811261 2 0.5702 0.754589 0.000 0.628 0.000 0.044 0.152 0.176
#> SRR1375485 1 0.5842 0.431026 0.528 0.000 0.272 0.192 0.000 0.008
#> SRR1432563 2 0.0146 0.856008 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR604414 1 0.3349 0.691635 0.748 0.000 0.244 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380614 1 0.1536 0.877106 0.944 0.000 0.020 0.012 0.000 0.024
#> SRR812060 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR602082 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1069490 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1078417 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0725 0.852547 0.000 0.000 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1420710 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR660426 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416003 4 0.2383 0.787203 0.000 0.000 0.024 0.880 0.000 0.096
#> SRR661064 1 0.3012 0.715898 0.796 0.000 0.000 0.196 0.000 0.008
#> SRR1082011 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353243 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1455482 1 0.0508 0.882710 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313473 1 0.0260 0.883222 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1399394 3 0.4130 0.588764 0.240 0.000 0.716 0.036 0.000 0.008
#> SRR1102467 4 0.3623 0.654708 0.208 0.000 0.020 0.764 0.000 0.008
#> SRR1317470 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1337707 6 0.3424 0.650197 0.000 0.000 0.024 0.204 0.000 0.772
#> SRR1408752 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.5611 0.758575 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1398013 4 0.1633 0.835287 0.000 0.000 0.044 0.932 0.000 0.024
#> SRR1352918 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1420750 1 0.3245 0.711677 0.764 0.000 0.228 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071785 6 0.3695 0.457154 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1353618 2 0.0603 0.853518 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1082217 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1357256 2 0.0291 0.855185 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1490313 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1366560 1 0.0000 0.883248 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.883248 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 6 0.3971 0.179551 0.000 0.000 0.004 0.000 0.448 0.548
#> SRR1313494 1 0.3383 0.610769 0.728 0.000 0.000 0.268 0.000 0.004
#> SRR1309985 4 0.4080 0.142678 0.456 0.000 0.000 0.536 0.000 0.008
#> SRR607911 1 0.0146 0.882984 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.0603 0.854971 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1400078 4 0.1434 0.839308 0.000 0.000 0.048 0.940 0.000 0.012
#> SRR1088631 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR615575 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079434 5 0.3165 0.808453 0.000 0.000 0.008 0.072 0.844 0.076
#> SRR1325559 1 0.3955 0.530446 0.648 0.000 0.340 0.004 0.000 0.008
#> SRR1446695 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1383883 1 0.0520 0.881489 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1396100 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1475697 4 0.2994 0.658309 0.000 0.000 0.004 0.788 0.000 0.208
#> SRR1488067 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1102103 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1105154 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1084991 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1410380 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1445490 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1454671 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1435044 4 0.4427 0.629185 0.000 0.000 0.136 0.716 0.000 0.148
#> SRR1485812 6 0.3727 0.666885 0.000 0.000 0.040 0.188 0.004 0.768
#> SRR1078020 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1311153 1 0.1078 0.880640 0.964 0.000 0.016 0.008 0.000 0.012
#> SRR1376406 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 6 0.4026 0.350818 0.000 0.000 0.012 0.000 0.376 0.612
#> SRR807775 3 0.5861 -0.165645 0.000 0.000 0.444 0.000 0.200 0.356
#> SRR1409215 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR820427 5 0.3107 0.845463 0.000 0.000 0.080 0.072 0.844 0.004
#> SRR1100656 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR1362159 1 0.0000 0.883248 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR656794 5 0.5045 0.307579 0.076 0.000 0.412 0.000 0.512 0.000
#> SRR604653 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317685 5 0.5114 0.710605 0.000 0.000 0.052 0.080 0.692 0.176
#> SRR1485912 3 0.1232 0.838825 0.004 0.000 0.956 0.024 0.000 0.016
#> SRR1407602 5 0.2520 0.829848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.844 0.004
#> SRR1356164 4 0.4166 0.447134 0.000 0.000 0.028 0.648 0.000 0.324
#> SRR1328692 6 0.4405 0.144304 0.000 0.000 0.024 0.472 0.000 0.504
#> SRR1362438 1 0.2165 0.829650 0.884 0.000 0.108 0.000 0.000 0.008
#> SRR1479216 6 0.3151 0.710932 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1358041 1 0.3586 0.598090 0.720 0.000 0.012 0.268 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1368200 3 0.0603 0.853671 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1435602 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1501043 6 0.3961 0.201075 0.000 0.000 0.004 0.000 0.440 0.556
#> SRR1437256 6 0.3847 0.286011 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1487446 4 0.1594 0.840258 0.000 0.000 0.052 0.932 0.000 0.016
#> SRR816653 1 0.2118 0.833972 0.888 0.000 0.104 0.000 0.000 0.008
#> SRR815164 1 0.5219 0.262091 0.512 0.000 0.416 0.056 0.000 0.016
#> SRR1442043 4 0.1370 0.836704 0.012 0.000 0.036 0.948 0.000 0.004
#> SRR1410573 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096782 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.1074 0.846776 0.000 0.000 0.960 0.012 0.000 0.028
#> SRR1382934 6 0.3455 0.747695 0.000 0.000 0.144 0.056 0.000 0.800
#> SRR1465208 1 0.0858 0.873675 0.968 0.000 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1314728 1 0.4067 0.572137 0.680 0.000 0.296 0.012 0.000 0.012
#> SRR1470291 1 0.0000 0.883248 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.0790 0.845109 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1409600 3 0.0520 0.849797 0.000 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR816123 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR614779 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR810783 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1333990 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1410356 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR808106 5 0.3196 0.845793 0.004 0.000 0.076 0.072 0.844 0.004
#> SRR662713 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447058 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1480964 3 0.2398 0.773402 0.000 0.000 0.876 0.104 0.000 0.020
#> SRR809382 6 0.3377 0.747982 0.000 0.000 0.136 0.056 0.000 0.808
#> SRR665417 1 0.3838 0.131483 0.552 0.000 0.000 0.448 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.2742 0.832311 0.000 0.872 0.000 0.008 0.076 0.044
#> SRR1453166 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1069826 2 0.1059 0.852653 0.000 0.964 0.000 0.016 0.004 0.016
#> SRR1077781 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR615623 6 0.2941 0.727781 0.000 0.000 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1413787 6 0.3802 0.463210 0.000 0.000 0.012 0.000 0.312 0.676
#> SRR1478207 6 0.4695 0.362192 0.000 0.000 0.448 0.044 0.000 0.508
#> SRR1411046 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1313711 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0520 0.881489 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1309051 1 0.2553 0.798106 0.848 0.000 0.144 0.000 0.000 0.008
#> SRR1486949 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1395616 1 0.0520 0.881489 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1074956 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1092961 2 0.5702 0.754589 0.000 0.628 0.000 0.044 0.152 0.176
#> SRR817210 3 0.3601 0.486546 0.000 0.000 0.684 0.312 0.000 0.004
#> SRR1319221 6 0.4172 -0.034411 0.000 0.376 0.000 0.008 0.008 0.608
#> SRR1405413 3 0.4915 0.186663 0.396 0.000 0.552 0.036 0.000 0.016
#> SRR607807 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1390160 6 0.3394 0.723174 0.000 0.000 0.236 0.012 0.000 0.752
#> SRR1406283 3 0.1866 0.789936 0.084 0.000 0.908 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357709 4 0.1267 0.841499 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1468208 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1312766 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361612 1 0.1049 0.873175 0.960 0.000 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1311224 1 0.3615 0.620084 0.700 0.000 0.292 0.000 0.000 0.008
#> SRR1087801 3 0.2070 0.783490 0.000 0.000 0.892 0.100 0.000 0.008
#> SRR1099720 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR1349250 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1350912 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1357127 3 0.3149 0.709451 0.000 0.000 0.824 0.044 0.000 0.132
#> SRR1074980 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1317022 6 0.2969 0.725937 0.000 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1332879 1 0.4091 0.206352 0.520 0.000 0.472 0.000 0.000 0.008
#> SRR1403177 2 0.3376 0.822113 0.000 0.836 0.000 0.020 0.060 0.084
#> SRR1076144 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR818239 2 0.5673 0.756529 0.000 0.636 0.000 0.048 0.152 0.164
#> SRR1421069 2 0.5703 0.755533 0.000 0.632 0.000 0.048 0.152 0.168
#> SRR1500006 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1485678 5 0.6231 0.142241 0.036 0.000 0.132 0.408 0.424 0.000
#> SRR1092232 6 0.3377 0.747982 0.000 0.000 0.136 0.056 0.000 0.808
#> SRR1344253 5 0.2624 0.824460 0.000 0.000 0.148 0.004 0.844 0.004
#> SRR1384290 1 0.0146 0.882984 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1343522 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1440940 4 0.1807 0.812666 0.000 0.000 0.020 0.920 0.000 0.060
#> SRR818372 4 0.1500 0.839738 0.000 0.000 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR1323675 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR819894 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1310031 6 0.3531 0.620844 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR615419 6 0.3782 0.391983 0.000 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1436925 4 0.1444 0.836778 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0520 0.881587 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1332566 1 0.0622 0.880669 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1490228 3 0.4054 0.583744 0.000 0.000 0.740 0.072 0.000 0.188
#> SRR1442949 5 0.3108 0.845721 0.000 0.000 0.076 0.076 0.844 0.004
#> SRR1466239 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094003 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4464 0.282351 0.544 0.000 0.432 0.012 0.000 0.012
#> SRR813076 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1097642 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR1322981 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1485976 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 6 0.3288 0.690301 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR660522 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR815374 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1069564 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1416337 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1316438 6 0.3477 0.747999 0.000 0.000 0.132 0.056 0.004 0.808
#> SRR1386844 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1373718 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1447458 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1487128 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441421 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1069919 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1335489 1 0.0820 0.878702 0.972 0.000 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1393404 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1081425 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401815 6 0.2854 0.732120 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1071337 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1071983 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0291 0.855185 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1410510 6 0.3151 0.710932 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1098761 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1312124 4 0.4286 0.455569 0.352 0.000 0.012 0.624 0.000 0.012
#> SRR615395 3 0.1333 0.823246 0.048 0.000 0.944 0.000 0.000 0.008
#> SRR1479349 4 0.3841 0.388304 0.380 0.000 0.000 0.616 0.000 0.004
#> SRR2165033 4 0.1788 0.834654 0.004 0.000 0.076 0.916 0.000 0.004
#> SRR1089054 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR816201 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1488514 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.1333 0.839699 0.000 0.000 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR1379303 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418516 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR613174 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1351125 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR659157 6 0.4203 0.523464 0.000 0.000 0.000 0.316 0.032 0.652
#> SRR1480408 4 0.1267 0.841499 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.1787 0.833838 0.016 0.000 0.032 0.932 0.000 0.020
#> SRR1073317 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.1267 0.841499 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.5702 0.754589 0.000 0.628 0.000 0.044 0.152 0.176
#> SRR1431270 6 0.4109 0.691622 0.000 0.000 0.036 0.116 0.064 0.784
#> SRR1085614 2 0.0725 0.855021 0.000 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1330106 4 0.3364 0.663176 0.000 0.000 0.024 0.780 0.000 0.196
#> SRR1466154 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396944 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1082784 2 0.0291 0.855185 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1457267 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR614659 4 0.1753 0.828188 0.000 0.000 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR659247 3 0.1219 0.834578 0.000 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR1317201 1 0.0520 0.881587 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1473696 3 0.3874 0.363109 0.356 0.000 0.636 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375842 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1388123 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1453662 4 0.1765 0.822072 0.000 0.000 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1353499 1 0.0806 0.880829 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416693 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1070841 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1380910 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333125 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.5428 0.471860 0.568 0.000 0.308 0.116 0.000 0.008
#> SRR612659 6 0.3151 0.710932 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1447148 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR658597 2 0.5703 0.755533 0.000 0.632 0.000 0.048 0.152 0.168
#> SRR1089595 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR1074263 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.0260 0.850483 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.2070 0.776070 0.100 0.000 0.892 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071035 3 0.2257 0.758615 0.116 0.000 0.876 0.000 0.000 0.008
#> SRR1068808 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR1332754 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR662438 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1335355 1 0.0000 0.883248 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1323558 3 0.2340 0.725409 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1381711 5 0.2520 0.823462 0.000 0.000 0.152 0.004 0.844 0.000
#> SRR657985 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1314810 1 0.4181 0.659795 0.704 0.000 0.256 0.012 0.000 0.028
#> SRR1336505 4 0.1967 0.825900 0.000 0.000 0.084 0.904 0.000 0.012
#> SRR1474095 3 0.4892 0.598171 0.116 0.000 0.692 0.176 0.000 0.016
#> SRR1363831 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.1680 0.829066 0.020 0.000 0.024 0.940 0.004 0.012
#> SRR1074909 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1101200 3 0.0000 0.852842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0603 0.853518 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1367150 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1313406 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1068880 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1467277 5 0.2520 0.821513 0.000 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1084867 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1095431 2 0.5703 0.755533 0.000 0.632 0.000 0.048 0.152 0.168
#> SRR1380184 2 0.0603 0.853518 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1443113 3 0.3661 0.651737 0.200 0.000 0.768 0.020 0.000 0.012
#> SRR1380414 3 0.3650 0.497201 0.000 0.000 0.708 0.000 0.280 0.012
#> SRR1315912 1 0.1194 0.876275 0.956 0.000 0.032 0.004 0.000 0.008
#> SRR1075778 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 6 0.2969 0.626323 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1361195 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.3012 0.746971 0.796 0.000 0.196 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477653 3 0.1333 0.824127 0.048 0.000 0.944 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355475 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1360785 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR810437 6 0.3866 0.204992 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1361860 4 0.3740 0.642191 0.012 0.000 0.024 0.764 0.200 0.000
#> SRR1441311 2 0.0146 0.856008 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098903 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1457619 4 0.1434 0.839308 0.000 0.000 0.048 0.940 0.000 0.012
#> SRR1498529 4 0.3103 0.663857 0.208 0.000 0.008 0.784 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0291 0.855185 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1074017 2 0.2778 0.828219 0.000 0.872 0.000 0.032 0.016 0.080
#> SRR1472033 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1445087 6 0.3416 0.747970 0.000 0.000 0.140 0.056 0.000 0.804
#> SRR1399525 2 0.5478 0.764619 0.000 0.660 0.000 0.048 0.152 0.140
#> SRR1312844 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1085874 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1101226 2 0.5702 0.754589 0.000 0.628 0.000 0.044 0.152 0.176
#> SRR1476056 4 0.1967 0.785140 0.084 0.000 0.000 0.904 0.000 0.012
#> SRR1075659 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR1311916 6 0.3244 0.697728 0.000 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1353353 6 0.3508 0.714034 0.000 0.000 0.068 0.132 0.000 0.800
#> SRR1073291 3 0.0865 0.842392 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1356227 1 0.0520 0.881489 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1080720 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR1091695 2 0.5703 0.755533 0.000 0.632 0.000 0.048 0.152 0.168
#> SRR1350304 5 0.2520 0.829848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.844 0.004
#> SRR663002 6 0.2823 0.732744 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1376983 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1399926 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1347144 6 0.3288 0.690301 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1384006 1 0.0146 0.882984 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR614047 3 0.0547 0.853108 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR818440 4 0.5538 0.324911 0.000 0.000 0.340 0.512 0.000 0.148
#> SRR1337770 4 0.1498 0.833122 0.028 0.000 0.032 0.940 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.1606 0.821751 0.004 0.000 0.932 0.056 0.000 0.008
#> SRR1385542 2 0.0603 0.853518 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1473959 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1074041 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1394495 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR659460 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR816699 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1308612 3 0.0547 0.853108 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1499418 5 0.3031 0.783591 0.000 0.000 0.004 0.044 0.844 0.108
#> SRR1352894 2 0.0405 0.854707 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR815805 1 0.5503 0.604305 0.644 0.000 0.120 0.196 0.000 0.040
#> SRR1331083 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR808272 3 0.2300 0.728441 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1436698 3 0.2882 0.695791 0.180 0.000 0.812 0.000 0.000 0.008
#> SRR1095627 2 0.5732 0.754946 0.000 0.628 0.000 0.048 0.152 0.172
#> SRR1357672 5 0.3426 0.688821 0.000 0.000 0.276 0.000 0.720 0.004
#> SRR1351236 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077479 1 0.1269 0.878952 0.956 0.000 0.020 0.012 0.000 0.012
#> SRR814491 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1101256 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4045 0.334211 0.564 0.000 0.428 0.000 0.000 0.008
#> SRR1457994 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1314707 4 0.1492 0.834677 0.024 0.000 0.036 0.940 0.000 0.000
#> SRR1309534 4 0.2239 0.807762 0.000 0.000 0.020 0.900 0.008 0.072
#> SRR615527 6 0.3377 0.747982 0.000 0.000 0.136 0.056 0.000 0.808
#> SRR1098216 1 0.0622 0.880669 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1325847 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1404003 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1344166 4 0.5808 -0.000644 0.416 0.000 0.140 0.436 0.000 0.008
#> SRR1368638 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1431429 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1079237 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1080509 2 0.0146 0.856008 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR815759 5 0.3031 0.839207 0.000 0.000 0.108 0.044 0.844 0.004
#> SRR1502143 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1487614 6 0.2969 0.727709 0.000 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1402307 2 0.0508 0.854268 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR820810 4 0.3732 0.726170 0.076 0.000 0.144 0.780 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0000 0.852842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR656421 5 0.3756 0.400771 0.352 0.000 0.000 0.004 0.644 0.000
#> SRR1086116 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1499917 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1339944 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.1584 0.840542 0.000 0.000 0.064 0.928 0.000 0.008
#> SRR1431847 6 0.4024 0.283457 0.000 0.000 0.004 0.004 0.400 0.592
#> SRR1317155 4 0.1983 0.807355 0.000 0.000 0.020 0.908 0.000 0.072
#> SRR1477405 1 0.0146 0.883432 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1341683 4 0.2581 0.762872 0.000 0.000 0.020 0.860 0.000 0.120
#> SRR1084790 5 0.4328 0.710924 0.112 0.000 0.164 0.000 0.724 0.000
#> SRR1073731 4 0.3694 0.648775 0.000 0.000 0.232 0.740 0.000 0.028
#> SRR1332588 5 0.2416 0.829660 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1471157 2 0.0146 0.856008 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR654945 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR661028 1 0.2513 0.802416 0.852 0.000 0.140 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413477 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4234 0.239925 0.004 0.000 0.576 0.408 0.000 0.012
#> SRR1358435 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR2165273 1 0.0291 0.882501 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1379014 1 0.2902 0.716898 0.800 0.000 0.000 0.196 0.000 0.004
#> SRR1489904 6 0.3482 0.643826 0.000 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1416386 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1406048 1 0.3046 0.733750 0.800 0.000 0.000 0.188 0.000 0.012
#> SRR606982 5 0.3301 0.841744 0.000 0.000 0.064 0.068 0.844 0.024
#> SRR1358082 1 0.0146 0.883053 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312934 3 0.1297 0.838250 0.000 0.000 0.948 0.040 0.000 0.012
#> SRR655194 4 0.4025 0.310970 0.416 0.000 0.008 0.576 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0146 0.856470 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.5579 0.759188 0.000 0.648 0.000 0.048 0.152 0.152
#> SRR1389820 2 0.5611 0.758575 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1074289 3 0.0260 0.854619 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348816 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1076292 4 0.4933 0.054838 0.000 0.000 0.064 0.504 0.000 0.432
#> SRR1395810 2 0.0000 0.856091 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.2383 0.788212 0.000 0.000 0.024 0.880 0.000 0.096
#> SRR1443507 3 0.0508 0.850441 0.004 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR1452310 4 0.3420 0.670635 0.000 0.000 0.240 0.748 0.000 0.012
#> SRR665610 4 0.1411 0.841179 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1347322 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR813395 2 0.5761 0.754240 0.000 0.624 0.000 0.048 0.152 0.176
#> SRR1477256 1 0.0717 0.881493 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470230 5 0.3049 0.786851 0.000 0.000 0.004 0.048 0.844 0.104
#> SRR1354247 1 0.1268 0.872571 0.952 0.000 0.004 0.036 0.000 0.008
#> SRR1082640 2 0.0692 0.853180 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1487592 3 0.0146 0.852729 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.3564 0.655874 0.200 0.000 0.772 0.020 0.000 0.008
#> SRR1076317 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1434117 3 0.2907 0.706656 0.000 0.000 0.828 0.000 0.152 0.020
#> SRR1075273 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR658657 5 0.2942 0.761343 0.000 0.000 0.000 0.032 0.836 0.132
#> SRR1092773 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1365332 3 0.0458 0.855399 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR615958 6 0.3862 0.309999 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1097688 2 0.5703 0.755533 0.000 0.632 0.000 0.048 0.152 0.168
#> SRR1403259 6 0.4111 0.154259 0.000 0.000 0.004 0.004 0.456 0.536
#> SRR1099120 2 0.5642 0.757378 0.000 0.640 0.000 0.048 0.152 0.160
#> SRR1362200 3 0.3023 0.584418 0.000 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1464856 2 0.0260 0.856765 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1347298 6 0.2996 0.723968 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1075923 2 0.5611 0.758392 0.000 0.644 0.000 0.048 0.152 0.156
#> SRR1100703 3 0.1555 0.829732 0.012 0.000 0.940 0.040 0.000 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.995 0.998 0.4343 0.565 0.565
#> 3 3 0.702 0.876 0.859 0.4175 0.770 0.594
#> 4 4 0.819 0.881 0.916 0.1539 0.914 0.760
#> 5 5 0.817 0.819 0.899 0.0975 0.898 0.662
#> 6 6 0.779 0.792 0.864 0.0379 0.968 0.856
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.9580 0.389 0.380 0.620
#> SRR1398013 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR1405413 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.7219 0.748 0.800 0.200
#> SRR1076144 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.9896 0.217 0.440 0.560
#> SRR1074289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1397949 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1355723 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329744 1 0.5363 0.9555 0.724 0.000 0.276
#> SRR657384 3 0.0424 0.9193 0.008 0.000 0.992
#> SRR1351190 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.5497 0.9477 0.708 0.000 0.292
#> SRR1396017 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR1410742 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435963 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1382416 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1391354 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1312244 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1325138 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326821 1 0.6286 0.6178 0.536 0.000 0.464
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.5397 0.9555 0.720 0.000 0.280
#> SRR1075707 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1465758 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1414058 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407449 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.4178 0.6726 0.172 0.000 0.828
#> SRR1399069 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR1366450 3 0.2878 0.8095 0.096 0.000 0.904
#> SRR1396859 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1457176 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1097666 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1434736 3 0.2165 0.8757 0.064 0.000 0.936
#> SRR1080560 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1322882 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR658152 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440268 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1453725 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1477591 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369052 1 0.5431 0.9538 0.716 0.000 0.284
#> SRR1377735 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1331244 3 0.6168 -0.1610 0.412 0.000 0.588
#> SRR1404531 1 0.5968 0.8343 0.636 0.000 0.364
#> SRR1324331 1 0.6045 0.7981 0.620 0.000 0.380
#> SRR1458890 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.6286 0.6178 0.536 0.000 0.464
#> SRR1385211 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR655241 1 0.5529 0.9410 0.704 0.000 0.296
#> SRR656922 1 0.5678 0.9210 0.684 0.000 0.316
#> SRR1361630 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1318966 2 0.4931 0.8742 0.232 0.768 0.000
#> SRR1407087 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR603212 3 0.6302 -0.4797 0.480 0.000 0.520
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.0747 0.9158 0.016 0.000 0.984
#> SRR1457835 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1347123 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1465501 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452981 3 0.4750 0.5697 0.216 0.000 0.784
#> SRR1326708 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1407157 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077898 1 0.5178 0.9530 0.744 0.000 0.256
#> SRR1349080 3 0.1163 0.9111 0.028 0.000 0.972
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1375485 1 0.6309 0.5493 0.504 0.000 0.496
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1380614 1 0.6252 0.6748 0.556 0.000 0.444
#> SRR812060 1 0.5733 0.9052 0.676 0.000 0.324
#> SRR602082 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1069490 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0237 0.9224 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420710 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR660426 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1416003 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR661064 1 0.5431 0.9524 0.716 0.000 0.284
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.6180 0.7400 0.584 0.000 0.416
#> SRR1353243 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1455482 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1313473 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1399394 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1102467 3 0.5621 0.2666 0.308 0.000 0.692
#> SRR1317470 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1337707 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.9858 0.3604 0.256 0.396 0.348
#> SRR1398013 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352918 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR1420750 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1071785 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366560 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1355684 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1323289 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1313494 1 0.5363 0.9569 0.724 0.000 0.276
#> SRR1309985 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR607911 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1333789 1 0.6299 0.6092 0.524 0.000 0.476
#> SRR1400078 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR615575 1 0.5431 0.9525 0.716 0.000 0.284
#> SRR1079434 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1325559 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1446695 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1383883 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1396100 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR1475697 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR1488067 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1084991 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1410380 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.1163 0.9029 0.028 0.000 0.972
#> SRR1485812 3 0.0237 0.9224 0.004 0.000 0.996
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR807775 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1100656 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1362159 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1414536 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR656794 1 0.5291 0.9510 0.732 0.000 0.268
#> SRR604653 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1317685 3 0.0747 0.9190 0.016 0.000 0.984
#> SRR1485912 1 0.5431 0.9525 0.716 0.000 0.284
#> SRR1407602 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1356164 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328692 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362438 1 0.5465 0.9487 0.712 0.000 0.288
#> SRR1479216 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1358041 1 0.5431 0.9538 0.716 0.000 0.284
#> SRR1468766 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368200 3 0.3941 0.6991 0.156 0.000 0.844
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1437256 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487446 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR816653 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR815164 1 0.5327 0.9576 0.728 0.000 0.272
#> SRR1442043 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR1410573 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1382934 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 1 0.5327 0.9593 0.728 0.000 0.272
#> SRR1314728 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1470291 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1308756 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1409600 1 0.6274 0.6462 0.544 0.000 0.456
#> SRR816123 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR614779 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR810783 1 0.6126 0.7884 0.600 0.000 0.400
#> SRR1333990 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1410356 1 0.5431 0.9522 0.716 0.000 0.284
#> SRR808106 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR662713 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 3 0.0747 0.9131 0.016 0.000 0.984
#> SRR1088016 2 0.5058 0.8708 0.244 0.756 0.000
#> SRR1453166 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1478207 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1411046 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1309051 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.5291 0.9587 0.732 0.000 0.268
#> SRR1074956 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1092961 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR817210 3 0.0747 0.9120 0.016 0.000 0.984
#> SRR1319221 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR607807 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1390160 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406283 3 0.5948 0.0620 0.360 0.000 0.640
#> SRR1357709 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080742 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1468208 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1312766 1 0.5591 0.9308 0.696 0.000 0.304
#> SRR1361612 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1311224 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1087801 3 0.0747 0.9152 0.016 0.000 0.984
#> SRR1099720 2 0.0237 0.9333 0.004 0.996 0.000
#> SRR1349250 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.4504 0.6233 0.196 0.000 0.804
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1332879 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1403177 3 0.9738 -0.2381 0.304 0.252 0.444
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR818239 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1421069 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1500006 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1485678 3 0.3551 0.7437 0.132 0.000 0.868
#> SRR1092232 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344253 3 0.5905 0.1300 0.352 0.000 0.648
#> SRR1384290 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1089349 3 0.6192 -0.2511 0.420 0.000 0.580
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR818372 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1310031 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR615419 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436925 3 0.0237 0.9221 0.004 0.000 0.996
#> SRR1477238 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1332566 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1490228 3 0.0747 0.9120 0.016 0.000 0.984
#> SRR1442949 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR1466239 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR813076 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1322981 1 0.6299 0.5998 0.524 0.000 0.476
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR660522 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR815374 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069564 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1416337 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1316438 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1373718 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1335489 1 0.5291 0.9592 0.732 0.000 0.268
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1401815 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1098761 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1312124 1 0.6260 0.6554 0.552 0.000 0.448
#> SRR615395 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1479349 3 0.2356 0.8498 0.072 0.000 0.928
#> SRR2165033 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379303 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1418516 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR613174 3 0.6111 -0.1362 0.396 0.000 0.604
#> SRR1351125 1 0.5465 0.9486 0.712 0.000 0.288
#> SRR659157 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480408 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR657857 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094168 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466154 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1396944 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR614659 3 0.0237 0.9222 0.004 0.000 0.996
#> SRR659247 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317201 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1473696 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1375842 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1453662 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1416693 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1070841 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1380910 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR612659 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1089595 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.6244 0.6959 0.560 0.000 0.440
#> SRR1345995 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1071035 1 0.5431 0.9527 0.716 0.000 0.284
#> SRR1068808 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1335355 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR659448 3 0.0592 0.9182 0.012 0.000 0.988
#> SRR1323558 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1381711 3 0.0892 0.9169 0.020 0.000 0.980
#> SRR657985 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1314810 1 0.6192 0.7296 0.580 0.000 0.420
#> SRR1336505 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474095 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR1074909 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1101200 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.6154 -0.1938 0.408 0.000 0.592
#> SRR1380414 3 0.6168 -0.1748 0.412 0.000 0.588
#> SRR1315912 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1477653 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1355475 1 0.5397 0.9554 0.720 0.000 0.280
#> SRR1360785 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR810437 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361860 3 0.0237 0.9222 0.004 0.000 0.996
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1457619 3 0.0892 0.9137 0.020 0.000 0.980
#> SRR1498529 3 0.6126 -0.1697 0.400 0.000 0.600
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399525 2 0.2537 0.9146 0.080 0.920 0.000
#> SRR1312844 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1085874 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1101226 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1476056 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR1075659 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1311916 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1353353 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073291 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1356227 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1080720 2 0.0424 0.9324 0.008 0.992 0.000
#> SRR1091695 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1350304 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR663002 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1347144 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1384006 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1499108 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR614047 3 0.0237 0.9224 0.004 0.000 0.996
#> SRR818440 3 0.3038 0.7958 0.104 0.000 0.896
#> SRR1337770 3 0.4399 0.6460 0.188 0.000 0.812
#> SRR1399413 3 0.0237 0.9225 0.004 0.000 0.996
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074041 3 0.5254 0.4344 0.264 0.000 0.736
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 3 0.6291 -0.4275 0.468 0.000 0.532
#> SRR816699 3 0.4796 0.5594 0.220 0.000 0.780
#> SRR1308612 3 0.5291 0.4286 0.268 0.000 0.732
#> SRR1499418 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 3 0.5397 0.4023 0.280 0.000 0.720
#> SRR1331083 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436698 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1095627 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1357672 3 0.4178 0.6911 0.172 0.000 0.828
#> SRR1351236 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1077479 1 0.6079 0.7930 0.612 0.000 0.388
#> SRR814491 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309534 3 0.0592 0.9165 0.012 0.000 0.988
#> SRR615527 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098216 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1325847 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1404003 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344166 3 0.5835 0.1285 0.340 0.000 0.660
#> SRR1368638 3 0.0892 0.9131 0.020 0.000 0.980
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0747 0.9184 0.016 0.000 0.984
#> SRR1502143 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1487614 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 3 0.6045 -0.0729 0.380 0.000 0.620
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0747 0.9152 0.016 0.000 0.984
#> SRR1476547 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.5254 0.9529 0.736 0.000 0.264
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431847 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1317155 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477405 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR655289 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341683 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084790 1 0.5216 0.9536 0.740 0.000 0.260
#> SRR1073731 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332588 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.5785 0.8940 0.668 0.000 0.332
#> SRR661028 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1358435 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR2165273 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1379014 1 0.5327 0.9567 0.728 0.000 0.272
#> SRR1489904 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416386 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1406048 1 0.5397 0.9531 0.720 0.000 0.280
#> SRR606982 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1358082 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1312934 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR655194 1 0.5431 0.9538 0.716 0.000 0.284
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0237 0.9334 0.004 0.996 0.000
#> SRR1389820 3 0.8808 -0.0262 0.116 0.400 0.484
#> SRR1074289 3 0.5988 0.0110 0.368 0.000 0.632
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443507 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR1452310 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR665610 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347322 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR813395 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1477256 1 0.5254 0.9601 0.736 0.000 0.264
#> SRR1470230 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1354247 1 0.5431 0.9538 0.716 0.000 0.284
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.6307 0.5726 0.512 0.000 0.488
#> SRR1352299 3 0.5968 0.0321 0.364 0.000 0.636
#> SRR1076317 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1434117 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075273 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR658657 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1092773 2 0.2711 0.9125 0.088 0.912 0.000
#> SRR1365332 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
#> SRR615958 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097688 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1403259 3 0.0424 0.9195 0.008 0.000 0.992
#> SRR1099120 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9342 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.9238 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075923 2 0.5178 0.8675 0.256 0.744 0.000
#> SRR1100703 1 0.5363 0.9576 0.724 0.000 0.276
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.0188 0.9141 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1397949 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 3 0.0188 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1329744 1 0.0707 0.8887 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR657384 3 0.0469 0.9124 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1351190 3 0.0188 0.9141 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.2408 0.8742 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1396017 3 0.2081 0.8621 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1410742 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0469 0.8900 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 3 0.0336 0.9137 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1326821 1 0.5548 0.7542 0.716 0.000 0.084 0.200
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.2081 0.8814 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1075707 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1465758 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.1474 0.8903 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.4477 0.4672 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1399069 3 0.5371 0.7614 0.080 0.000 0.732 0.188
#> SRR1366450 3 0.3486 0.7222 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1097666 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1434736 3 0.5619 0.7587 0.152 0.000 0.724 0.124
#> SRR1080560 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1322882 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.2281 0.8776 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.6381 0.6357 0.652 0.000 0.152 0.196
#> SRR1404531 1 0.2345 0.8508 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1324331 1 0.4175 0.7633 0.784 0.000 0.016 0.200
#> SRR1458890 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.1302 0.9355 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1077263 1 0.5548 0.7542 0.716 0.000 0.084 0.200
#> SRR1385211 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR655241 1 0.1211 0.8874 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR656922 1 0.2760 0.8618 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1361630 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1318966 4 0.3942 0.9513 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1407087 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.4585 0.6264 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.2081 0.8628 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1457835 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1347123 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1465501 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1330878 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452981 3 0.3837 0.7109 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.0188 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077898 1 0.3610 0.7702 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1349080 3 0.5727 0.7441 0.096 0.000 0.704 0.200
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1375485 1 0.4454 0.6656 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1380614 1 0.3444 0.7805 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR812060 1 0.2814 0.8534 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0469 0.9129 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1420710 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1416003 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.1637 0.8891 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.3172 0.8082 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1399394 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1102467 3 0.4989 -0.1222 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1317470 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1337707 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.7397 0.0714 0.000 0.200 0.508 0.292
#> SRR1398013 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352918 3 0.5486 0.7508 0.080 0.000 0.720 0.200
#> SRR1420750 1 0.0188 0.8920 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071785 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1313494 1 0.0921 0.8913 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1309985 3 0.2081 0.8621 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.4382 0.6913 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1400078 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR615575 1 0.2216 0.8785 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1079434 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1325559 1 0.1118 0.8916 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1446695 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1383883 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 3 0.5486 0.7508 0.080 0.000 0.720 0.200
#> SRR1475697 3 0.2011 0.8634 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1488067 4 0.4477 0.8366 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1084991 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1410380 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.1211 0.9020 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1485812 3 0.0469 0.9115 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.3219 0.8378 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR807775 3 0.1302 0.9012 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1100656 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1362159 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR656794 1 0.3925 0.7904 0.808 0.000 0.016 0.176
#> SRR604653 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.1042 0.9091 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR1485912 1 0.2149 0.8798 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1407602 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1356164 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328692 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.2216 0.8787 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1479216 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1358041 1 0.2281 0.8776 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1468766 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.3172 0.7967 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1437256 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487446 3 0.1022 0.9008 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0336 0.8922 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1442043 3 0.2081 0.8621 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1382934 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.0592 0.8913 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1314728 1 0.0336 0.8930 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1470291 1 0.1940 0.8836 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1308756 3 0.0469 0.9115 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1409600 1 0.3649 0.7646 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR816123 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR614779 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR810783 1 0.3764 0.7854 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.2216 0.8785 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR808106 3 0.4919 0.7893 0.048 0.000 0.752 0.200
#> SRR662713 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665417 3 0.0707 0.9097 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1088016 4 0.3873 0.9620 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1453166 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413787 3 0.1792 0.8905 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1478207 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0469 0.8899 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1074956 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1092961 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR817210 3 0.0817 0.9056 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1319221 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.4967 0.3472 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1357709 3 0.0188 0.9141 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1080742 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1468208 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.2530 0.8677 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1087801 3 0.0817 0.9076 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1099720 2 0.2408 0.8513 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1349250 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.3726 0.7387 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1332879 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1403177 1 0.7671 0.3301 0.472 0.200 0.324 0.004
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR818239 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1421069 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1500006 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.3945 0.6619 0.216 0.000 0.780 0.004
#> SRR1092232 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.7289 0.4670 0.532 0.000 0.268 0.200
#> SRR1384290 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.4991 0.5116 0.608 0.000 0.388 0.004
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818372 3 0.0188 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1310031 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR615419 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436925 3 0.0188 0.9143 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1490228 3 0.0707 0.9095 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1442949 3 0.4485 0.7973 0.028 0.000 0.772 0.200
#> SRR1466239 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1322981 1 0.4304 0.6776 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR660522 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR815374 3 0.0188 0.9141 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1069564 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1416337 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1316438 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0188 0.8922 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1098761 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1312124 1 0.4072 0.6517 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR615395 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1479349 3 0.3074 0.7954 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR2165033 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 3 0.0188 0.9143 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR613174 1 0.4916 0.4241 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1351125 1 0.2281 0.8768 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR659157 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480408 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657857 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094168 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1431270 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.0336 0.9134 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR659247 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0707 0.8930 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1453662 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR612659 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1089595 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.4072 0.7436 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1345995 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1071035 1 0.2216 0.8787 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1068808 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0707 0.9091 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1323558 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1381711 3 0.4387 0.8055 0.024 0.000 0.776 0.200
#> SRR657985 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1314810 1 0.3219 0.8003 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1336505 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.2081 0.8621 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1074909 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1101200 1 0.2081 0.8813 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.4579 0.7943 0.032 0.000 0.768 0.200
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.4624 0.5616 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1380414 1 0.6903 0.5893 0.592 0.000 0.224 0.184
#> SRR1315912 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1477653 1 0.2081 0.8813 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1355475 1 0.2149 0.8799 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1360785 3 0.5486 0.7508 0.080 0.000 0.720 0.200
#> SRR810437 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361860 3 0.0376 0.9136 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1457619 3 0.2281 0.8596 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1498529 1 0.4898 0.4611 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.3801 0.6240 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1312844 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1085874 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1101226 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1476056 3 0.2011 0.8634 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1075659 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1311916 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1353353 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073291 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1356227 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1080720 2 0.2868 0.7995 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1091695 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1350304 3 0.4059 0.8080 0.012 0.000 0.788 0.200
#> SRR663002 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1384006 1 0.1118 0.8915 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1499108 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR614047 3 0.0469 0.9115 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR818440 3 0.2647 0.8435 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1337770 3 0.4134 0.6230 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1399413 3 0.0188 0.9140 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.4877 0.1658 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.4790 0.4796 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR816699 3 0.4697 0.3421 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1308612 3 0.4907 0.1371 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1499418 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 3 0.5000 -0.0685 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR1331083 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR808272 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.2081 0.8813 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1095627 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1357672 3 0.7397 0.3493 0.292 0.000 0.508 0.200
#> SRR1351236 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.2814 0.8279 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR814491 3 0.5486 0.7508 0.080 0.000 0.720 0.200
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 3 0.0188 0.9141 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1309534 3 0.2011 0.8634 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR615527 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1325847 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1404003 3 0.0188 0.9141 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1344166 1 0.4994 0.2911 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1368638 3 0.5486 0.7508 0.080 0.000 0.720 0.200
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.4175 0.8099 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1502143 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1487614 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.4972 0.3596 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0817 0.9076 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1476547 2 0.1557 0.9194 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR656421 1 0.3610 0.7702 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431847 3 0.0469 0.9128 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1317155 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.0336 0.9137 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1341683 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.3791 0.7708 0.796 0.000 0.004 0.200
#> SRR1073731 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332588 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.2921 0.8471 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR661028 1 0.1792 0.8857 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.0707 0.9096 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1358435 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR2165273 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1379014 1 0.0592 0.8887 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1489904 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416386 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1406048 1 0.0817 0.8884 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR606982 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1358082 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.2281 0.8776 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.2760 0.8128 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1389820 3 0.7205 0.2024 0.000 0.200 0.548 0.252
#> SRR1074289 1 0.4955 0.3748 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.0592 0.9099 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.2011 0.8824 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1452310 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665610 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.1022 0.8921 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR813395 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1477256 1 0.0000 0.8923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.1637 0.8944 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1354247 1 0.2281 0.8776 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.4382 0.6793 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1352299 1 0.4961 0.3636 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1076317 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1434117 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075273 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR658657 3 0.3610 0.8143 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1092773 2 0.4543 0.3244 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1365332 1 0.2081 0.8813 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR615958 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097688 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1403259 3 0.1557 0.8962 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1099120 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1362200 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9877 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.9148 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075923 4 0.3610 0.9956 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1100703 1 0.2081 0.8813 0.916 0.000 0.084 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.0162 0.84834 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0404 0.94982 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1075752 4 0.0510 0.96268 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 3 0.0162 0.84836 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329744 1 0.0290 0.92626 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR657384 3 0.0510 0.84377 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1351190 3 0.0162 0.84834 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.94934 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.2280 0.85051 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1396017 3 0.1121 0.82996 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1410742 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 3 0.3551 0.65901 0.008 0.000 0.772 0.000 0.220
#> SRR1087968 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1310075 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 3 0.0290 0.84737 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1326821 5 0.3318 0.62999 0.180 0.000 0.012 0.000 0.808
#> SRR1490178 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR655613 1 0.0963 0.91618 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1075707 4 0.0609 0.96232 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1443871 2 0.0703 0.94849 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1102489 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1407449 1 0.1270 0.89990 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1479109 5 0.4086 0.76936 0.024 0.000 0.240 0.000 0.736
#> SRR1399069 3 0.3710 0.67795 0.024 0.000 0.784 0.000 0.192
#> SRR1366450 5 0.5953 0.61812 0.124 0.000 0.336 0.000 0.540
#> SRR1396859 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1097666 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.5476 0.55747 0.184 0.000 0.656 0.000 0.160
#> SRR1080560 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1435688 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.1041 0.91613 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1325711 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1477930 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0162 0.92728 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416049 2 0.0290 0.95042 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR656275 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.2605 0.81824 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.5335 0.59473 0.668 0.000 0.132 0.000 0.200
#> SRR1404531 1 0.2020 0.84228 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.3266 0.74686 0.796 0.000 0.004 0.000 0.200
#> SRR1458890 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.94934 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1431969 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1087393 2 0.2329 0.89056 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1077263 5 0.1597 0.71341 0.048 0.000 0.012 0.000 0.940
#> SRR1385211 1 0.0703 0.92113 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.1608 0.88667 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.2852 0.79373 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1361630 5 0.0865 0.72077 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972
#> SRR1318966 4 0.1732 0.89788 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1407087 5 0.4307 0.33834 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR603212 1 0.4415 0.42364 0.604 0.000 0.388 0.000 0.008
#> SRR1321088 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1485190 3 0.1270 0.82241 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1332232 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1312645 3 0.0963 0.83354 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0703 0.92113 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.3689 0.54592 0.004 0.000 0.740 0.000 0.256
#> SRR1465501 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 5 0.3612 0.76084 0.000 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1445064 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452981 3 0.3336 0.60225 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1397697 2 0.0000 0.94934 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.0162 0.84836 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077898 1 0.3612 0.67038 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1349080 5 0.3321 0.66002 0.032 0.000 0.136 0.000 0.832
#> SRR1076096 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR811261 4 0.1270 0.92731 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1375485 1 0.3561 0.64246 0.740 0.000 0.260 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR604414 1 0.1106 0.91597 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR1380614 1 0.2966 0.73227 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR812060 5 0.4509 0.67244 0.236 0.000 0.048 0.000 0.716
#> SRR602082 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.1341 0.94206 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR661613 5 0.4824 0.63374 0.028 0.000 0.376 0.000 0.596
#> SRR1420710 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1416003 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661064 1 0.2377 0.82914 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1452718 1 0.2890 0.76870 0.836 0.000 0.160 0.000 0.004
#> SRR1353243 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0963 0.91555 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.1041 0.91613 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1102467 3 0.4219 0.20689 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.0865 0.72077 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972
#> SRR1337707 3 0.1043 0.82990 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1408752 2 0.1341 0.94193 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1474617 4 0.6462 0.00596 0.000 0.004 0.404 0.436 0.156
#> SRR1398013 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352918 3 0.4252 0.59058 0.020 0.000 0.700 0.000 0.280
#> SRR1420750 1 0.0162 0.92719 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.0290 0.84651 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353618 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1082217 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1357256 2 0.0404 0.94963 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1490313 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.0963 0.71943 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1313494 1 0.0290 0.92717 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1309985 3 0.1121 0.82996 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 5 0.4522 0.75868 0.044 0.000 0.248 0.000 0.708
#> SRR1400078 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1092842 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 5 0.4248 0.66702 0.240 0.000 0.032 0.000 0.728
#> SRR1079434 5 0.2516 0.66375 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1325559 1 0.0771 0.92158 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1446695 5 0.1952 0.70180 0.004 0.000 0.084 0.000 0.912
#> SRR1383883 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 3 0.3970 0.63534 0.020 0.000 0.744 0.000 0.236
#> SRR1475697 3 0.0703 0.83876 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1488067 4 0.3395 0.66326 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1102103 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1105154 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 4 0.0162 0.97205 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1410380 5 0.0865 0.72077 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972
#> SRR1445490 2 0.0609 0.94903 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1454671 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1435044 3 0.2516 0.73075 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1485812 3 0.2179 0.76288 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1078020 2 0.2388 0.90542 0.000 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1311153 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.1341 0.94193 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1343898 5 0.1792 0.73353 0.000 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR807775 5 0.3143 0.76794 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1409215 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR820427 5 0.2583 0.67262 0.004 0.000 0.132 0.000 0.864
#> SRR1100656 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 5 0.1043 0.72138 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR656794 5 0.4238 0.32404 0.368 0.000 0.004 0.000 0.628
#> SRR604653 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.4425 0.36948 0.004 0.000 0.452 0.000 0.544
#> SRR1485912 1 0.1251 0.91304 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR1407602 3 0.3707 0.61363 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1356164 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.1836 0.89563 0.932 0.000 0.036 0.000 0.032
#> SRR1479216 5 0.3607 0.76580 0.004 0.000 0.244 0.000 0.752
#> SRR1358041 1 0.0794 0.92037 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.2230 0.74983 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1368200 5 0.6323 0.40294 0.164 0.000 0.360 0.000 0.476
#> SRR1435602 2 0.1043 0.94590 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1501043 3 0.4150 0.48832 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1437256 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487446 3 0.1043 0.83299 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0290 0.92624 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1442043 3 0.0794 0.83759 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1352369 3 0.2286 0.76325 0.004 0.000 0.888 0.000 0.108
#> SRR1382934 3 0.1478 0.81364 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1465208 1 0.0162 0.92772 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0290 0.92656 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0703 0.92113 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1308756 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR1409600 5 0.6361 0.54489 0.296 0.000 0.196 0.000 0.508
#> SRR816123 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 5 0.0865 0.72077 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972
#> SRR810783 5 0.6554 0.46078 0.312 0.000 0.224 0.000 0.464
#> SRR1333990 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 5 0.4503 0.65107 0.256 0.000 0.040 0.000 0.704
#> SRR808106 5 0.3355 0.62569 0.012 0.000 0.184 0.000 0.804
#> SRR662713 5 0.4256 0.53829 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1447058 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1480964 3 0.0404 0.84426 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR809382 3 0.2230 0.76048 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR665417 3 0.0703 0.84022 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1088016 4 0.1082 0.94665 0.000 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1453166 4 0.0162 0.97205 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1069826 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1077781 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR615623 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1413787 5 0.2773 0.76160 0.000 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1478207 3 0.2280 0.75481 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1411046 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0162 0.94976 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326560 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0162 0.92728 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486949 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1395616 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 4 0.0609 0.95850 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR817210 3 0.0609 0.84262 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1319221 3 0.2230 0.76644 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1405413 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 5 0.3612 0.76209 0.000 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1406283 1 0.4482 0.40016 0.612 0.000 0.376 0.000 0.012
#> SRR1357709 3 0.0162 0.84834 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1080742 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 5 0.4536 0.67166 0.240 0.000 0.048 0.000 0.712
#> SRR1361612 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1087801 3 0.2248 0.77646 0.012 0.000 0.900 0.000 0.088
#> SRR1099720 2 0.3395 0.74857 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1349250 4 0.0162 0.97205 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1350912 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1357127 3 0.5628 0.44019 0.244 0.000 0.624 0.000 0.132
#> SRR1074980 2 0.1300 0.94340 0.000 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR1317022 5 0.3741 0.76384 0.004 0.000 0.264 0.000 0.732
#> SRR1332879 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1403177 1 0.7080 0.37155 0.520 0.056 0.276 0.148 0.000
#> SRR1076144 2 0.1341 0.94193 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1069614 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.6708 -0.35367 0.244 0.000 0.384 0.000 0.372
#> SRR1092232 3 0.3305 0.61234 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1344253 5 0.4225 0.29665 0.364 0.000 0.004 0.000 0.632
#> SRR1384290 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 5 0.4224 0.76992 0.040 0.000 0.216 0.000 0.744
#> SRR1343522 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1326727 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818372 3 0.0162 0.84836 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323675 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR819894 3 0.4294 0.22987 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1310031 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR615419 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436925 3 0.0162 0.84833 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.0898 0.84077 0.020 0.000 0.972 0.000 0.008
#> SRR1442949 5 0.2516 0.66375 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1466239 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1097642 4 0.0609 0.96232 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1322981 5 0.4934 0.70351 0.188 0.000 0.104 0.000 0.708
#> SRR1485976 2 0.1121 0.94497 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1471713 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR660522 5 0.3992 0.76236 0.012 0.000 0.268 0.000 0.720
#> SRR815374 3 0.0162 0.84834 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1069564 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 5 0.0865 0.72077 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972
#> SRR1316438 3 0.2230 0.76262 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1386844 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.94934 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1069919 2 0.0290 0.95013 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0162 0.92737 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1081425 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.4304 -0.24819 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1071337 2 0.2124 0.91890 0.000 0.916 0.000 0.056 0.028
#> SRR1071983 2 0.2020 0.91309 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1331793 2 0.0162 0.94984 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1410510 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR1098761 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.2690 0.78663 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.1310 0.91191 0.956 0.000 0.024 0.000 0.020
#> SRR1479349 3 0.2230 0.76210 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.0404 0.84623 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.2193 0.91586 0.000 0.912 0.000 0.060 0.028
#> SRR816201 3 0.0162 0.84836 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488514 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR655840 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.3395 0.64645 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR613174 5 0.4528 0.76352 0.060 0.000 0.212 0.000 0.728
#> SRR1351125 5 0.4192 0.67708 0.232 0.000 0.032 0.000 0.736
#> SRR659157 3 0.0609 0.84109 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1480408 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1332526 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 4 0.1410 0.91950 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1431270 3 0.2280 0.75785 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1085614 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1330106 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1396944 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1457267 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.0162 0.84834 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.0162 0.84824 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0451 0.92573 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1375842 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.94934 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1353499 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1416693 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 5 0.3790 0.76068 0.004 0.000 0.272 0.000 0.724
#> SRR1380910 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1498183 1 0.1041 0.91613 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR612659 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1447148 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR658597 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 4 0.0609 0.96232 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1074263 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1376786 5 0.5532 0.70777 0.156 0.000 0.196 0.000 0.648
#> SRR1345995 1 0.1041 0.91613 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1071035 1 0.1282 0.90970 0.952 0.000 0.044 0.000 0.004
#> SRR1068808 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR662438 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 5 0.3861 0.76445 0.008 0.000 0.264 0.000 0.728
#> SRR1323558 5 0.3741 0.76384 0.004 0.000 0.264 0.000 0.732
#> SRR1381711 5 0.0865 0.72077 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972
#> SRR657985 5 0.1544 0.71627 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1314810 1 0.2773 0.76115 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1336505 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1363831 2 0.0510 0.94951 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1442376 3 0.1121 0.82996 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1074909 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.4812 0.29165 0.600 0.000 0.028 0.000 0.372
#> SRR1075408 2 0.0794 0.94776 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1367150 3 0.3395 0.64645 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1313406 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1068880 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1467277 5 0.0955 0.72037 0.004 0.000 0.028 0.000 0.968
#> SRR1084867 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1095431 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0566 0.94999 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1443113 1 0.4339 0.49787 0.652 0.000 0.336 0.000 0.012
#> SRR1380414 5 0.1300 0.72623 0.028 0.000 0.016 0.000 0.956
#> SRR1315912 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1421116 2 0.0609 0.94915 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.1341 0.94193 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR600493 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1477653 1 0.1493 0.90672 0.948 0.000 0.028 0.000 0.024
#> SRR1355475 5 0.4197 0.66203 0.244 0.000 0.028 0.000 0.728
#> SRR1360785 3 0.6156 0.18128 0.132 0.000 0.456 0.000 0.412
#> SRR810437 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361860 3 0.0324 0.84777 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1441311 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098903 3 0.4015 0.49742 0.000 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1457619 3 0.1043 0.83252 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.4287 0.23243 0.540 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1074017 2 0.2690 0.85732 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1472033 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1445087 3 0.1341 0.81973 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1399525 2 0.3730 0.67301 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1312844 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 4 0.1410 0.91950 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1476056 3 0.0963 0.83354 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1075659 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR1353353 3 0.0510 0.84388 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1073291 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR1356227 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.3913 0.59367 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1091695 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.3508 0.63685 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR663002 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR1376983 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1399926 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 5 0.3715 0.76523 0.004 0.000 0.260 0.000 0.736
#> SRR1384006 1 0.0290 0.92721 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1499108 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 5 0.3636 0.76012 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR818440 3 0.3398 0.63774 0.216 0.000 0.780 0.000 0.004
#> SRR1337770 3 0.3508 0.56798 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1399413 5 0.4047 0.72162 0.004 0.000 0.320 0.000 0.676
#> SRR1385542 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1473959 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 5 0.4197 0.76374 0.028 0.000 0.244 0.000 0.728
#> SRR1394495 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR659460 1 0.4182 0.47615 0.644 0.000 0.352 0.000 0.004
#> SRR816699 5 0.4141 0.76578 0.028 0.000 0.236 0.000 0.736
#> SRR1308612 5 0.4424 0.76535 0.048 0.000 0.224 0.000 0.728
#> SRR1499418 5 0.3039 0.62084 0.000 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1352894 2 0.0609 0.94903 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR815805 3 0.4300 0.10104 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1331083 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1436698 1 0.1012 0.91867 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1095627 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 5 0.1364 0.71678 0.036 0.000 0.012 0.000 0.952
#> SRR1351236 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.2424 0.80524 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.3878 0.63752 0.016 0.000 0.748 0.000 0.236
#> SRR1101256 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1436004 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1457994 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1078998 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1314707 3 0.0162 0.84834 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1309534 3 0.0703 0.83876 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR615527 3 0.4297 -0.20613 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1098216 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1325847 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 3 0.0162 0.84834 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1344166 3 0.4300 -0.02521 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.3671 0.64255 0.008 0.000 0.756 0.000 0.236
#> SRR1431429 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1079237 4 0.0162 0.97205 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1080509 2 0.1914 0.94237 0.000 0.924 0.000 0.060 0.016
#> SRR815759 5 0.1282 0.71769 0.004 0.000 0.044 0.000 0.952
#> SRR1502143 5 0.3766 0.76235 0.004 0.000 0.268 0.000 0.728
#> SRR1487614 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1402307 2 0.0510 0.94939 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR820810 1 0.4262 0.27350 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1083215 3 0.4323 0.33293 0.012 0.000 0.656 0.000 0.332
#> SRR1476547 2 0.2813 0.84166 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR656421 1 0.3274 0.72487 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1086116 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1499917 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.1341 0.94193 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1391444 2 0.0290 0.95001 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1434889 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 3 0.2605 0.75107 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1317155 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 5 0.4367 0.57877 0.004 0.000 0.416 0.000 0.580
#> SRR1341683 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084790 5 0.4288 0.24746 0.384 0.000 0.004 0.000 0.612
#> SRR1073731 3 0.2773 0.69662 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1332588 3 0.3424 0.64658 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1471157 2 0.1701 0.94597 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR654945 5 0.4384 0.67811 0.228 0.000 0.044 0.000 0.728
#> SRR661028 1 0.0865 0.91990 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1413477 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1101152 3 0.3803 0.68100 0.056 0.000 0.804 0.000 0.140
#> SRR1358435 4 0.0510 0.96493 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR2165273 1 0.0162 0.92708 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.2230 0.83721 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1489904 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1416386 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0404 0.92476 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR606982 5 0.3003 0.62423 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1358082 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.3424 0.56566 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR655194 1 0.2605 0.81937 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1473251 2 0.3177 0.78849 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1389820 3 0.5797 0.23114 0.000 0.012 0.528 0.396 0.064
#> SRR1074289 5 0.4708 0.72875 0.040 0.000 0.292 0.000 0.668
#> SRR1348816 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1076292 3 0.0865 0.83935 0.004 0.000 0.972 0.000 0.024
#> SRR1395810 2 0.0671 0.95028 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1498909 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.1211 0.91412 0.960 0.000 0.024 0.000 0.016
#> SRR1452310 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 3 0.0000 0.84889 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0703 0.92113 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR813395 4 0.0609 0.95860 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.92826 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.3109 0.72098 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1354247 1 0.2648 0.81483 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0955 0.94719 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1487592 5 0.4712 0.75370 0.100 0.000 0.168 0.000 0.732
#> SRR1352299 1 0.4403 0.39675 0.608 0.000 0.384 0.000 0.008
#> SRR1076317 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 5 0.3636 0.76012 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1075273 4 0.0162 0.97205 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR658657 5 0.4294 -0.03508 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1092773 2 0.4114 0.47577 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1365332 5 0.4326 0.63831 0.264 0.000 0.028 0.000 0.708
#> SRR615958 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1097688 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.3561 0.61614 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1099120 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1464856 2 0.1410 0.94065 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1347298 5 0.3586 0.76342 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1075923 4 0.0000 0.97431 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.4768 0.45245 0.656 0.000 0.040 0.000 0.304
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1436370 2 0.0363 0.870930 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1075752 6 0.0458 0.937380 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1397949 1 0.0000 0.884939 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1329744 1 0.1265 0.881231 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044 0.000
#> SRR657384 4 0.0405 0.852342 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1351190 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0363 0.856794 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR818573 1 0.3877 0.772200 0.748 0.000 0.004 0.208 0.040 0.000
#> SRR1396017 4 0.2445 0.799104 0.108 0.000 0.000 0.872 0.020 0.000
#> SRR1410742 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1435963 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1382416 1 0.1176 0.887444 0.956 0.000 0.024 0.000 0.020 0.000
#> SRR1391354 4 0.3917 0.703765 0.024 0.000 0.008 0.728 0.240 0.000
#> SRR1087968 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1310075 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1312244 1 0.0547 0.884206 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1325138 4 0.0260 0.853489 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1326821 3 0.5701 0.595315 0.160 0.000 0.544 0.008 0.288 0.000
#> SRR1490178 2 0.1610 0.794219 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR655613 1 0.3552 0.846608 0.828 0.000 0.088 0.040 0.044 0.000
#> SRR1075707 6 0.1663 0.878409 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1443871 2 0.3717 -0.149219 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1102489 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1414058 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.1753 0.857239 0.912 0.000 0.000 0.084 0.004 0.000
#> SRR1436858 5 0.3446 0.965090 0.000 0.308 0.000 0.000 0.692 0.000
#> SRR1479109 3 0.2201 0.805977 0.048 0.000 0.900 0.052 0.000 0.000
#> SRR1399069 4 0.3333 0.747482 0.024 0.000 0.000 0.784 0.192 0.000
#> SRR1366450 3 0.6062 0.512330 0.132 0.000 0.528 0.304 0.036 0.000
#> SRR1396859 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1457176 1 0.1959 0.878055 0.924 0.000 0.020 0.024 0.032 0.000
#> SRR1097666 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 4 0.5764 0.547355 0.232 0.000 0.020 0.580 0.168 0.000
#> SRR1080560 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.4094 0.838958 0.780 0.000 0.120 0.024 0.076 0.000
#> SRR1435688 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1327614 1 0.0146 0.884894 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR658152 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368141 4 0.0146 0.853036 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1453725 1 0.2624 0.865000 0.884 0.000 0.028 0.068 0.020 0.000
#> SRR1325711 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1477930 1 0.1257 0.880745 0.952 0.000 0.000 0.028 0.020 0.000
#> SRR1477591 1 0.2294 0.865455 0.892 0.000 0.072 0.000 0.036 0.000
#> SRR1416049 2 0.0622 0.859603 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR656275 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1369052 1 0.3712 0.786441 0.768 0.000 0.000 0.180 0.052 0.000
#> SRR1377735 1 0.0508 0.885999 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331244 1 0.5124 0.617781 0.624 0.000 0.004 0.120 0.252 0.000
#> SRR1404531 1 0.3470 0.844171 0.828 0.000 0.024 0.100 0.048 0.000
#> SRR1324331 1 0.3126 0.758237 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1458890 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0363 0.856794 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1407624 2 0.1610 0.794219 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1431969 3 0.1141 0.809863 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.1610 0.863823 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1077263 3 0.4305 0.737906 0.052 0.000 0.712 0.008 0.228 0.000
#> SRR1385211 1 0.2066 0.885486 0.904 0.000 0.000 0.024 0.072 0.000
#> SRR655241 1 0.2199 0.854869 0.892 0.000 0.000 0.088 0.020 0.000
#> SRR656922 1 0.3488 0.755224 0.764 0.000 0.004 0.216 0.016 0.000
#> SRR1361630 3 0.2996 0.741827 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1318966 6 0.1141 0.900386 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1407087 3 0.3647 0.459584 0.000 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.5921 0.581241 0.580 0.000 0.152 0.232 0.036 0.000
#> SRR1321088 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1485190 4 0.2300 0.791960 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1312645 4 0.2445 0.799104 0.108 0.000 0.000 0.872 0.020 0.000
#> SRR1457835 1 0.1633 0.878174 0.932 0.000 0.044 0.024 0.000 0.000
#> SRR1347123 4 0.3996 0.209049 0.004 0.000 0.484 0.512 0.000 0.000
#> SRR1465501 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 3 0.2003 0.791192 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1445064 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452981 4 0.2994 0.703567 0.208 0.000 0.000 0.788 0.004 0.000
#> SRR1326708 1 0.1124 0.883556 0.956 0.000 0.008 0.000 0.036 0.000
#> SRR1407157 1 0.1327 0.884187 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1365401 5 0.3482 0.957255 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.862469 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.4305 0.667867 0.684 0.000 0.056 0.000 0.260 0.000
#> SRR1349080 3 0.5872 0.666764 0.056 0.000 0.600 0.112 0.232 0.000
#> SRR1076096 2 0.3684 -0.088947 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR811261 6 0.1141 0.896747 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1375485 1 0.4728 0.706062 0.704 0.000 0.052 0.208 0.036 0.000
#> SRR1432563 2 0.1501 0.803213 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR604414 1 0.3317 0.837300 0.836 0.000 0.104 0.024 0.036 0.000
#> SRR1380614 1 0.3092 0.821227 0.836 0.000 0.060 0.104 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.1408 0.805121 0.036 0.000 0.944 0.020 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.1890 0.884571 0.916 0.000 0.024 0.000 0.060 0.000
#> SRR1069490 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.1204 0.887382 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR661613 3 0.4389 0.504989 0.032 0.000 0.596 0.372 0.000 0.000
#> SRR1420710 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.2880 0.871342 0.872 0.000 0.048 0.024 0.056 0.000
#> SRR1416003 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661064 1 0.3149 0.807308 0.824 0.000 0.000 0.132 0.044 0.000
#> SRR1082011 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1452718 1 0.3798 0.830251 0.812 0.000 0.076 0.076 0.036 0.000
#> SRR1353243 1 0.0260 0.885762 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0146 0.885379 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313473 1 0.2384 0.880293 0.896 0.000 0.008 0.040 0.056 0.000
#> SRR1399394 1 0.2901 0.863275 0.872 0.000 0.056 0.032 0.040 0.000
#> SRR1102467 4 0.4482 0.221591 0.360 0.000 0.000 0.600 0.040 0.000
#> SRR1317470 3 0.2996 0.741827 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1337707 4 0.1387 0.829501 0.000 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.1204 0.887342 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1474617 6 0.6218 0.033794 0.000 0.016 0.192 0.364 0.000 0.428
#> SRR1398013 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352918 4 0.5319 0.612330 0.048 0.000 0.064 0.640 0.248 0.000
#> SRR1420750 1 0.2350 0.865010 0.888 0.000 0.076 0.000 0.036 0.000
#> SRR1071785 4 0.0632 0.847711 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1353618 5 0.3774 0.807743 0.000 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1082217 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1357256 2 0.1501 0.803512 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1490313 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1366560 1 0.0458 0.884622 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1355684 1 0.1075 0.882322 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1323289 3 0.3109 0.743223 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224 0.000
#> SRR1313494 1 0.1261 0.881873 0.952 0.000 0.000 0.024 0.024 0.000
#> SRR1309985 4 0.2527 0.797563 0.108 0.000 0.000 0.868 0.024 0.000
#> SRR607911 1 0.1556 0.883886 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1333789 3 0.2249 0.803643 0.032 0.000 0.900 0.064 0.004 0.000
#> SRR1400078 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1092842 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.0891 0.810069 0.008 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000
#> SRR1079434 3 0.4780 0.677153 0.000 0.000 0.660 0.112 0.228 0.000
#> SRR1325559 1 0.0972 0.886300 0.964 0.000 0.008 0.028 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.4886 0.716300 0.028 0.000 0.680 0.064 0.228 0.000
#> SRR1383883 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1396100 4 0.4560 0.673322 0.048 0.000 0.020 0.696 0.236 0.000
#> SRR1475697 4 0.0632 0.845648 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1488067 6 0.2260 0.771725 0.000 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1102103 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1105154 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 6 0.0458 0.939714 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1410380 3 0.2996 0.741827 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1445490 2 0.3620 0.018847 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1454671 5 0.3464 0.961692 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1435044 4 0.2491 0.750251 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1485812 4 0.2260 0.773812 0.000 0.000 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1078020 5 0.4381 0.871070 0.000 0.236 0.000 0.000 0.692 0.072
#> SRR1311153 1 0.1564 0.881890 0.936 0.000 0.024 0.000 0.040 0.000
#> SRR1376406 2 0.1204 0.887342 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1343898 3 0.3746 0.750692 0.000 0.000 0.760 0.048 0.192 0.000
#> SRR807775 3 0.0622 0.807947 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1409215 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR820427 3 0.5544 0.686312 0.040 0.000 0.628 0.104 0.228 0.000
#> SRR1100656 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.1075 0.883753 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1414536 3 0.3245 0.744108 0.000 0.000 0.764 0.008 0.228 0.000
#> SRR656794 3 0.5832 0.283339 0.360 0.000 0.468 0.004 0.168 0.000
#> SRR604653 1 0.2058 0.881185 0.908 0.000 0.036 0.000 0.056 0.000
#> SRR1317685 3 0.4150 0.351915 0.000 0.000 0.592 0.392 0.016 0.000
#> SRR1485912 1 0.2786 0.853863 0.860 0.000 0.084 0.056 0.000 0.000
#> SRR1407602 4 0.4382 0.662052 0.000 0.000 0.076 0.696 0.228 0.000
#> SRR1356164 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 4 0.1444 0.827884 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.3604 0.838956 0.820 0.000 0.104 0.032 0.044 0.000
#> SRR1479216 3 0.0363 0.808084 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.1682 0.880260 0.928 0.000 0.000 0.052 0.020 0.000
#> SRR1468766 4 0.3714 0.523981 0.004 0.000 0.340 0.656 0.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.5004 0.420581 0.084 0.000 0.568 0.348 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.0937 0.883365 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1501043 4 0.5437 0.509485 0.000 0.000 0.196 0.576 0.228 0.000
#> SRR1437256 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487446 4 0.1610 0.823500 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.2201 0.881544 0.900 0.000 0.048 0.000 0.052 0.000
#> SRR815164 1 0.2201 0.881148 0.900 0.000 0.000 0.048 0.052 0.000
#> SRR1442043 4 0.1082 0.840310 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004 0.000
#> SRR1410573 1 0.0547 0.884206 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1096782 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1352369 4 0.4190 0.610360 0.048 0.000 0.260 0.692 0.000 0.000
#> SRR1382934 4 0.1814 0.812707 0.000 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.0993 0.885254 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024 0.000
#> SRR1314728 1 0.0622 0.887962 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.2255 0.884453 0.892 0.000 0.000 0.028 0.080 0.000
#> SRR1308756 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.5018 0.508308 0.280 0.000 0.640 0.044 0.036 0.000
#> SRR816123 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614779 3 0.2996 0.741827 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR810783 3 0.5114 0.593131 0.124 0.000 0.664 0.196 0.016 0.000
#> SRR1333990 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1410356 3 0.2911 0.771877 0.072 0.000 0.868 0.024 0.036 0.000
#> SRR808106 3 0.6235 0.620567 0.052 0.000 0.540 0.144 0.264 0.000
#> SRR662713 3 0.3215 0.667747 0.004 0.000 0.756 0.240 0.000 0.000
#> SRR1447058 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1480964 4 0.2854 0.723844 0.000 0.000 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR809382 4 0.2854 0.724800 0.000 0.000 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR665417 4 0.0858 0.846266 0.028 0.000 0.000 0.968 0.004 0.000
#> SRR1088016 6 0.1411 0.900861 0.000 0.004 0.000 0.000 0.060 0.936
#> SRR1453166 6 0.0146 0.947147 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1069826 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1077781 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR615623 3 0.1957 0.793190 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR1413787 3 0.3315 0.780087 0.000 0.000 0.820 0.104 0.076 0.000
#> SRR1478207 4 0.2664 0.743094 0.000 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1313711 2 0.0146 0.865554 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326560 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1309051 1 0.2937 0.857922 0.848 0.000 0.096 0.000 0.056 0.000
#> SRR1486949 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1395616 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1074956 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 6 0.0547 0.932210 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR817210 4 0.1701 0.822549 0.008 0.000 0.072 0.920 0.000 0.000
#> SRR1319221 4 0.2416 0.770744 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.0603 0.886822 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.1075 0.882322 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1390160 3 0.2378 0.774066 0.000 0.000 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.5940 0.560936 0.584 0.000 0.180 0.200 0.036 0.000
#> SRR1357709 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1080742 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1312766 3 0.2714 0.777819 0.064 0.000 0.880 0.020 0.036 0.000
#> SRR1361612 1 0.0865 0.882959 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1311224 1 0.3270 0.840038 0.840 0.000 0.100 0.024 0.036 0.000
#> SRR1087801 4 0.4507 0.598456 0.064 0.000 0.252 0.680 0.004 0.000
#> SRR1099720 2 0.2300 0.784847 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1349250 6 0.0146 0.947147 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1350912 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1357127 4 0.5062 0.558567 0.168 0.000 0.196 0.636 0.000 0.000
#> SRR1074980 5 0.3797 0.954017 0.000 0.292 0.000 0.000 0.692 0.016
#> SRR1317022 3 0.2260 0.777971 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.3222 0.842309 0.844 0.000 0.096 0.024 0.036 0.000
#> SRR1403177 1 0.7586 0.427930 0.476 0.056 0.000 0.224 0.100 0.144
#> SRR1076144 2 0.1204 0.887342 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1069614 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.1908 0.883055 0.916 0.000 0.028 0.000 0.056 0.000
#> SRR1485678 4 0.5992 -0.127502 0.200 0.000 0.360 0.436 0.004 0.000
#> SRR1092232 4 0.3446 0.565302 0.000 0.000 0.308 0.692 0.000 0.000
#> SRR1344253 3 0.5962 0.297128 0.348 0.000 0.424 0.000 0.228 0.000
#> SRR1384290 1 0.1501 0.883928 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1089349 3 0.1341 0.808944 0.028 0.000 0.948 0.024 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1326727 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1440940 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818372 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323675 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR819894 4 0.5667 0.323707 0.000 0.000 0.240 0.532 0.228 0.000
#> SRR1310031 3 0.1075 0.810333 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR615419 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436925 4 0.0508 0.851302 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR1477238 1 0.0865 0.883024 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1332566 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1490228 4 0.1779 0.830208 0.016 0.000 0.064 0.920 0.000 0.000
#> SRR1442949 3 0.4780 0.677153 0.000 0.000 0.660 0.112 0.228 0.000
#> SRR1466239 1 0.0632 0.884089 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1094003 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1329971 1 0.1524 0.878371 0.932 0.000 0.060 0.000 0.008 0.000
#> SRR813076 5 0.3742 0.912739 0.000 0.348 0.000 0.000 0.648 0.004
#> SRR1097642 6 0.1663 0.878409 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1322981 3 0.1856 0.800638 0.048 0.000 0.920 0.032 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.1007 0.884514 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1471713 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR660522 3 0.1418 0.809034 0.024 0.000 0.944 0.032 0.000 0.000
#> SRR815374 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 3 0.2996 0.741827 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1316438 4 0.2416 0.764034 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1373718 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1447458 2 0.0458 0.854499 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1487128 1 0.0632 0.884048 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1441421 5 0.3446 0.965090 0.000 0.308 0.000 0.000 0.692 0.000
#> SRR1069919 2 0.0622 0.863812 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1460296 1 0.0790 0.884324 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1335489 1 0.0891 0.885838 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR1393404 5 0.3584 0.966015 0.000 0.308 0.000 0.000 0.688 0.004
#> SRR1081425 1 0.2058 0.881185 0.908 0.000 0.036 0.000 0.056 0.000
#> SRR1401815 3 0.3634 0.437734 0.000 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR1071337 5 0.4261 0.896824 0.000 0.252 0.000 0.000 0.692 0.056
#> SRR1071983 2 0.1814 0.845005 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1331793 2 0.0508 0.860719 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1410510 3 0.1267 0.810974 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1098761 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.2320 0.807766 0.864 0.000 0.000 0.132 0.004 0.000
#> SRR615395 1 0.3921 0.790637 0.776 0.000 0.164 0.024 0.036 0.000
#> SRR1479349 4 0.2362 0.780930 0.136 0.000 0.000 0.860 0.004 0.000
#> SRR2165033 4 0.0458 0.850458 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1089054 5 0.4294 0.890992 0.000 0.248 0.000 0.000 0.692 0.060
#> SRR816201 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR655840 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1379303 1 0.0547 0.884206 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1418516 4 0.3487 0.710785 0.000 0.000 0.020 0.756 0.224 0.000
#> SRR613174 3 0.0777 0.810073 0.004 0.000 0.972 0.024 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.1500 0.799868 0.052 0.000 0.936 0.012 0.000 0.000
#> SRR659157 4 0.1141 0.836713 0.000 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR1480408 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR657857 4 0.0260 0.852582 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1332526 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1094168 6 0.1267 0.887508 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1431270 4 0.2340 0.769033 0.000 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1330106 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.2880 0.871342 0.872 0.000 0.048 0.024 0.056 0.000
#> SRR1396944 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1082784 2 0.1610 0.794219 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1457267 1 0.0937 0.881839 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR614659 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR659247 4 0.1863 0.810739 0.000 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0547 0.884206 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1473696 1 0.2863 0.850283 0.860 0.000 0.096 0.008 0.036 0.000
#> SRR1375842 1 0.1657 0.884628 0.928 0.000 0.016 0.000 0.056 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.862469 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1345499 2 0.3684 -0.089338 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1353499 1 0.3222 0.842309 0.844 0.000 0.096 0.024 0.036 0.000
#> SRR1416693 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1070841 3 0.2311 0.804072 0.016 0.000 0.880 0.104 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0865 0.883111 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1333125 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1498183 1 0.2698 0.865626 0.880 0.000 0.016 0.064 0.040 0.000
#> SRR612659 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1447148 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR658597 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 6 0.1663 0.878409 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1074263 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1376786 3 0.3457 0.730049 0.124 0.000 0.820 0.020 0.036 0.000
#> SRR1345995 1 0.3422 0.836696 0.832 0.000 0.100 0.032 0.036 0.000
#> SRR1071035 1 0.4391 0.751076 0.732 0.000 0.196 0.032 0.040 0.000
#> SRR1068808 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR662438 1 0.1408 0.881444 0.944 0.000 0.020 0.000 0.036 0.000
#> SRR1335355 1 0.1501 0.883928 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR659448 3 0.0972 0.810418 0.008 0.000 0.964 0.028 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.2092 0.791126 0.000 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR1381711 3 0.3245 0.742315 0.008 0.000 0.764 0.000 0.228 0.000
#> SRR657985 3 0.4281 0.729775 0.000 0.000 0.704 0.068 0.228 0.000
#> SRR1314810 1 0.3122 0.801801 0.816 0.000 0.160 0.020 0.004 0.000
#> SRR1336505 4 0.0146 0.853304 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.1367 0.882534 0.944 0.000 0.012 0.044 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0458 0.873169 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1442376 4 0.2230 0.812012 0.084 0.000 0.000 0.892 0.024 0.000
#> SRR1074909 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 3 0.4959 0.201973 0.380 0.000 0.564 0.020 0.036 0.000
#> SRR1075408 5 0.3833 0.728303 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1367150 4 0.3514 0.707064 0.000 0.000 0.020 0.752 0.228 0.000
#> SRR1313406 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1068880 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1467277 3 0.2996 0.741827 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1084867 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1095431 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.1700 0.797735 0.000 0.916 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1443113 1 0.5438 0.579048 0.620 0.000 0.084 0.260 0.036 0.000
#> SRR1380414 3 0.1714 0.791819 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1315912 1 0.1723 0.877670 0.928 0.000 0.036 0.000 0.036 0.000
#> SRR1075778 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1421116 2 0.0547 0.875258 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR602282 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.1204 0.887342 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR600493 1 0.2620 0.867434 0.888 0.000 0.048 0.024 0.040 0.000
#> SRR1477653 1 0.4054 0.772843 0.760 0.000 0.180 0.024 0.036 0.000
#> SRR1355475 3 0.1549 0.804490 0.044 0.000 0.936 0.020 0.000 0.000
#> SRR1360785 4 0.7261 0.239036 0.148 0.000 0.180 0.424 0.248 0.000
#> SRR810437 4 0.0146 0.853036 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1361860 4 0.0146 0.853255 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.1556 0.799001 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1098903 4 0.4918 0.564280 0.000 0.000 0.124 0.644 0.232 0.000
#> SRR1457619 4 0.2234 0.805882 0.124 0.000 0.000 0.872 0.004 0.000
#> SRR1498529 1 0.3996 0.214756 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004 0.000
#> SRR1097172 2 0.1610 0.794219 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1074017 2 0.2416 0.766370 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1472033 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1445087 4 0.1663 0.819260 0.000 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1399525 6 0.3797 0.196049 0.000 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1312844 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 6 0.1267 0.887508 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1476056 4 0.2053 0.808087 0.108 0.000 0.000 0.888 0.004 0.000
#> SRR1075659 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1353353 4 0.1610 0.826220 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1073291 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1080720 2 0.3101 0.630627 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1091695 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 4 0.3668 0.701398 0.000 0.000 0.028 0.744 0.228 0.000
#> SRR663002 3 0.2048 0.790517 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.1610 0.794219 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1399926 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1347144 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.1757 0.885391 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076 0.000
#> SRR1499108 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614047 3 0.2135 0.789393 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000 0.000
#> SRR818440 4 0.3345 0.718407 0.184 0.000 0.028 0.788 0.000 0.000
#> SRR1337770 4 0.3314 0.625910 0.256 0.000 0.000 0.740 0.004 0.000
#> SRR1399413 3 0.4310 0.661366 0.008 0.000 0.684 0.272 0.036 0.000
#> SRR1385542 2 0.1610 0.794219 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1473959 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.2563 0.788906 0.044 0.000 0.892 0.028 0.036 0.000
#> SRR1394495 2 0.1610 0.794219 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR659460 1 0.5704 0.331545 0.500 0.000 0.184 0.316 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.1092 0.808683 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.1168 0.809785 0.016 0.000 0.956 0.028 0.000 0.000
#> SRR1499418 3 0.5309 0.619337 0.000 0.000 0.596 0.176 0.228 0.000
#> SRR1352894 2 0.3578 0.082398 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR815805 1 0.5110 0.083451 0.480 0.000 0.080 0.440 0.000 0.000
#> SRR1331083 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.3612 0.810649 0.800 0.000 0.148 0.016 0.036 0.000
#> SRR1095627 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 3 0.4193 0.743730 0.048 0.000 0.724 0.008 0.220 0.000
#> SRR1351236 1 0.0865 0.883685 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1077479 1 0.4364 0.810978 0.772 0.000 0.076 0.096 0.056 0.000
#> SRR814491 4 0.4630 0.665526 0.048 0.000 0.020 0.684 0.248 0.000
#> SRR1101256 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1436004 1 0.3700 0.811768 0.800 0.000 0.140 0.024 0.036 0.000
#> SRR1457994 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1078998 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1314707 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1309534 4 0.0632 0.845648 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR615527 3 0.3747 0.349429 0.000 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.1007 0.881310 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1325847 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1344166 4 0.4603 -0.000112 0.416 0.000 0.000 0.544 0.040 0.000
#> SRR1368638 4 0.3761 0.703811 0.008 0.000 0.020 0.744 0.228 0.000
#> SRR1431429 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1079237 6 0.0146 0.947147 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1080509 2 0.2846 0.842014 0.000 0.856 0.000 0.000 0.084 0.060
#> SRR815759 3 0.3431 0.737958 0.000 0.000 0.756 0.016 0.228 0.000
#> SRR1502143 3 0.1257 0.809080 0.020 0.000 0.952 0.028 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.1765 0.780483 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR820810 1 0.5574 0.268812 0.480 0.000 0.048 0.428 0.044 0.000
#> SRR1099212 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1083215 3 0.5512 0.117026 0.064 0.000 0.504 0.404 0.028 0.000
#> SRR1476547 2 0.2048 0.818952 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR656421 1 0.3512 0.727729 0.720 0.000 0.008 0.000 0.272 0.000
#> SRR1086116 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1499917 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.1204 0.887342 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1391444 2 0.0260 0.868584 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1434889 4 0.0146 0.853521 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1431847 4 0.2805 0.762029 0.000 0.000 0.160 0.828 0.012 0.000
#> SRR1317155 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.1267 0.884913 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR655289 3 0.4348 0.428057 0.000 0.000 0.560 0.416 0.024 0.000
#> SRR1341683 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.6192 -0.211568 0.368 0.000 0.364 0.004 0.264 0.000
#> SRR1073731 4 0.2527 0.740088 0.000 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1332588 4 0.3558 0.715842 0.000 0.000 0.028 0.760 0.212 0.000
#> SRR1471157 2 0.2660 0.837311 0.000 0.868 0.000 0.000 0.084 0.048
#> SRR654945 3 0.1341 0.807503 0.028 0.000 0.948 0.024 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.2550 0.866198 0.892 0.000 0.048 0.024 0.036 0.000
#> SRR1413477 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1101152 4 0.3602 0.719495 0.072 0.000 0.136 0.792 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.1444 0.892537 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR2165273 1 0.1141 0.883052 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1379014 1 0.2624 0.812877 0.856 0.000 0.000 0.124 0.020 0.000
#> SRR1489904 3 0.2048 0.793223 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1416386 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.1789 0.878163 0.924 0.000 0.000 0.032 0.044 0.000
#> SRR606982 3 0.5253 0.627665 0.000 0.000 0.604 0.168 0.228 0.000
#> SRR1358082 1 0.0146 0.885544 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312934 4 0.3076 0.639926 0.000 0.000 0.240 0.760 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.3265 0.728616 0.748 0.000 0.000 0.248 0.004 0.000
#> SRR1331174 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1473251 2 0.2416 0.775936 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1389820 4 0.6074 0.175479 0.000 0.048 0.092 0.464 0.000 0.396
#> SRR1074289 3 0.3559 0.767387 0.052 0.000 0.828 0.084 0.036 0.000
#> SRR1348816 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1076292 4 0.1480 0.837876 0.020 0.000 0.040 0.940 0.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.1531 0.816066 0.000 0.928 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1498909 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.2872 0.829201 0.836 0.000 0.140 0.024 0.000 0.000
#> SRR1452310 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 4 0.0000 0.853553 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.1492 0.881822 0.940 0.000 0.000 0.024 0.036 0.000
#> SRR813395 6 0.0547 0.932326 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1477256 1 0.0692 0.885440 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470230 4 0.3578 0.740027 0.000 0.000 0.164 0.784 0.052 0.000
#> SRR1354247 1 0.4733 0.774514 0.724 0.000 0.060 0.168 0.048 0.000
#> SRR1082640 5 0.3565 0.969101 0.000 0.304 0.000 0.000 0.692 0.004
#> SRR1487592 3 0.1625 0.798222 0.060 0.000 0.928 0.012 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.5930 0.551919 0.580 0.000 0.156 0.228 0.036 0.000
#> SRR1076317 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 3 0.2178 0.786953 0.000 0.000 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1075273 6 0.0146 0.947147 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR658657 4 0.5845 0.132132 0.000 0.000 0.316 0.472 0.212 0.000
#> SRR1092773 6 0.3797 0.227743 0.000 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1365332 3 0.1807 0.795362 0.060 0.000 0.920 0.020 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1097688 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 4 0.4000 0.653000 0.000 0.000 0.228 0.724 0.048 0.000
#> SRR1099120 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.0547 0.809424 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.1267 0.887429 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1347298 3 0.1007 0.811063 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1075923 6 0.0000 0.949668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.4840 0.306981 0.568 0.000 0.384 0.028 0.020 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4322 0.568 0.568
#> 3 3 0.750 0.854 0.928 0.2291 0.958 0.926
#> 4 4 0.741 0.776 0.851 0.0935 0.935 0.877
#> 5 5 0.572 0.624 0.769 0.1793 0.791 0.566
#> 6 6 0.556 0.538 0.710 0.0611 0.863 0.608
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 1 0 1 1 0
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 1 0 1 1 0
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 1 0 1 1 0
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 1 0 1 1 0
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 1 0 1 1 0
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1355723 1 0.4555 0.753 0.800 0 0.200
#> SRR1329744 1 0.3752 0.796 0.856 0 0.144
#> SRR657384 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR818573 1 0.3412 0.810 0.876 0 0.124
#> SRR1396017 1 0.3816 0.794 0.852 0 0.148
#> SRR1410742 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1382416 1 0.4002 0.688 0.840 0 0.160
#> SRR1391354 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1312244 1 0.2625 0.834 0.916 0 0.084
#> SRR1325138 1 0.5948 0.560 0.640 0 0.360
#> SRR1326821 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1465758 1 0.3267 0.755 0.884 0 0.116
#> SRR1414058 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1479109 1 0.4062 0.783 0.836 0 0.164
#> SRR1399069 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1366450 1 0.4555 0.753 0.800 0 0.200
#> SRR1396859 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1434736 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR658152 1 0.3192 0.822 0.888 0 0.112
#> SRR1368141 1 0.5785 0.451 0.668 0 0.332
#> SRR1440268 1 0.2625 0.834 0.916 0 0.084
#> SRR1453725 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1331244 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1404531 1 0.4399 0.764 0.812 0 0.188
#> SRR1324331 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1458890 3 0.4504 0.862 0.196 0 0.804
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1431969 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1077263 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1385211 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1361630 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1407087 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR603212 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1485190 1 0.0747 0.863 0.984 0 0.016
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1312645 1 0.3267 0.815 0.884 0 0.116
#> SRR1457835 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1347123 1 0.2625 0.807 0.916 0 0.084
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1330878 1 0.4121 0.729 0.832 0 0.168
#> SRR1445064 1 0.3879 0.791 0.848 0 0.152
#> SRR1452981 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1477316 1 0.5016 0.714 0.760 0 0.240
#> SRR1077898 1 0.5882 0.578 0.652 0 0.348
#> SRR1349080 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR604414 1 0.3412 0.810 0.876 0 0.124
#> SRR1380614 3 0.6045 0.331 0.380 0 0.620
#> SRR812060 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR602082 1 0.0237 0.872 0.996 0 0.004
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR661613 1 0.4399 0.764 0.812 0 0.188
#> SRR1420710 1 0.3752 0.796 0.856 0 0.144
#> SRR660426 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1452718 1 0.1753 0.834 0.952 0 0.048
#> SRR1353243 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1102467 1 0.3619 0.802 0.864 0 0.136
#> SRR1317470 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1337707 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1474617 3 0.3879 0.886 0.152 0 0.848
#> SRR1398013 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1352918 1 0.6045 0.527 0.620 0 0.380
#> SRR1420750 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1071785 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1323289 3 0.0747 0.783 0.016 0 0.984
#> SRR1313494 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1309985 1 0.3752 0.796 0.856 0 0.144
#> SRR607911 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1400078 1 0.3619 0.802 0.864 0 0.136
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1079434 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1325559 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1446695 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1383883 1 0.3192 0.760 0.888 0 0.112
#> SRR1396100 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1475697 1 0.5431 0.660 0.716 0 0.284
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1410380 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1485812 1 0.5835 0.589 0.660 0 0.340
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1311153 1 0.3752 0.796 0.856 0 0.144
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1343898 3 0.0747 0.783 0.016 0 0.984
#> SRR807775 1 0.4702 0.742 0.788 0 0.212
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR820427 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1414536 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR656794 1 0.5859 0.584 0.656 0 0.344
#> SRR604653 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1317685 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1485912 1 0.0424 0.870 0.992 0 0.008
#> SRR1407602 1 0.6215 0.420 0.572 0 0.428
#> SRR1356164 3 0.4605 0.853 0.204 0 0.796
#> SRR1328692 1 0.5926 0.191 0.644 0 0.356
#> SRR1362438 1 0.4504 0.757 0.804 0 0.196
#> SRR1479216 1 0.4002 0.785 0.840 0 0.160
#> SRR1358041 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1368200 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1501043 3 0.0747 0.783 0.016 0 0.984
#> SRR1437256 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1487446 1 0.4178 0.777 0.828 0 0.172
#> SRR816653 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR815164 1 0.4605 0.750 0.796 0 0.204
#> SRR1442043 1 0.2448 0.838 0.924 0 0.076
#> SRR1410573 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1382934 1 0.6308 -0.178 0.508 0 0.492
#> SRR1465208 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1314728 1 0.1163 0.862 0.972 0 0.028
#> SRR1470291 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1409600 1 0.3412 0.810 0.876 0 0.124
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR614779 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR810783 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR808106 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR662713 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1480964 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR809382 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR665417 1 0.5216 0.479 0.740 0 0.260
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR615623 1 0.3192 0.806 0.888 0 0.112
#> SRR1413787 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1478207 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1395616 1 0.0237 0.872 0.996 0 0.004
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR817210 1 0.4555 0.753 0.800 0 0.200
#> SRR1319221 3 0.3879 0.886 0.152 0 0.848
#> SRR1405413 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR607807 3 0.6140 0.561 0.404 0 0.596
#> SRR1390160 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1406283 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1357709 1 0.4346 0.767 0.816 0 0.184
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1468208 1 0.4452 0.631 0.808 0 0.192
#> SRR1312766 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1317022 1 0.0592 0.865 0.988 0 0.012
#> SRR1332879 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1403177 3 0.3879 0.886 0.152 0 0.848
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1485678 1 0.5760 0.607 0.672 0 0.328
#> SRR1092232 1 0.5560 0.551 0.700 0 0.300
#> SRR1344253 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1384290 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1089349 1 0.5706 0.617 0.680 0 0.320
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1440940 1 0.4002 0.785 0.840 0 0.160
#> SRR818372 1 0.4452 0.760 0.808 0 0.192
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR819894 1 0.6045 0.527 0.620 0 0.380
#> SRR1310031 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR615419 1 0.3116 0.820 0.892 0 0.108
#> SRR1436925 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1332566 1 0.2261 0.842 0.932 0 0.068
#> SRR1490228 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1442949 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1466239 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1329971 1 0.3482 0.807 0.872 0 0.128
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1322981 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1471713 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR660522 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR815374 1 0.4504 0.757 0.804 0 0.196
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1416337 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1316438 3 0.4178 0.875 0.172 0 0.828
#> SRR1386844 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1335489 1 0.3686 0.799 0.860 0 0.140
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1401815 3 0.5621 0.721 0.308 0 0.692
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1410510 1 0.3879 0.791 0.848 0 0.152
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR816201 1 0.4555 0.753 0.800 0 0.200
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR655840 1 0.3116 0.820 0.892 0 0.108
#> SRR1379303 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1418516 1 0.6045 0.527 0.620 0 0.380
#> SRR613174 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1351125 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR659157 1 0.5327 0.676 0.728 0 0.272
#> SRR1480408 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1431270 1 0.5905 0.572 0.648 0 0.352
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1396944 1 0.3340 0.749 0.880 0 0.120
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1070841 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1380910 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR612659 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR662438 1 0.2356 0.841 0.928 0 0.072
#> SRR1335355 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1323558 1 0.4452 0.760 0.808 0 0.192
#> SRR1381711 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR657985 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1314810 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1442376 1 0.3686 0.799 0.860 0 0.140
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1367150 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1467277 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1380414 1 0.5882 0.578 0.652 0 0.348
#> SRR1315912 1 0.3412 0.810 0.876 0 0.124
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR602282 3 0.3879 0.886 0.152 0 0.848
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1360785 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR810437 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1361860 1 0.5327 0.678 0.728 0 0.272
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1098903 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1457619 1 0.2625 0.834 0.916 0 0.084
#> SRR1498529 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1445087 1 0.5291 0.612 0.732 0 0.268
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1311916 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1353353 3 0.3879 0.886 0.152 0 0.848
#> SRR1073291 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1350304 1 0.6045 0.527 0.620 0 0.380
#> SRR663002 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1347144 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1384006 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR614047 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR816699 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1308612 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1499418 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR815805 1 0.1411 0.858 0.964 0 0.036
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR808272 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1436698 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1357672 1 0.5810 0.595 0.664 0 0.336
#> SRR1351236 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1077479 1 0.3038 0.823 0.896 0 0.104
#> SRR814491 1 0.6045 0.527 0.620 0 0.380
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1309534 1 0.3551 0.805 0.868 0 0.132
#> SRR615527 3 0.3879 0.886 0.152 0 0.848
#> SRR1098216 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1368638 1 0.6045 0.527 0.620 0 0.380
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR815759 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1502143 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1487614 1 0.4555 0.707 0.800 0 0.200
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR820810 1 0.3686 0.799 0.860 0 0.140
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR656421 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1499917 1 0.3686 0.799 0.860 0 0.140
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1431847 1 0.6095 0.504 0.608 0 0.392
#> SRR1317155 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR655289 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1341683 1 0.3551 0.805 0.868 0 0.132
#> SRR1084790 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1073731 1 0.3482 0.807 0.872 0 0.128
#> SRR1332588 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1101152 1 0.4346 0.767 0.816 0 0.184
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1489904 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1406048 1 0.1643 0.854 0.956 0 0.044
#> SRR606982 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1358082 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1312934 1 0.4346 0.767 0.816 0 0.184
#> SRR655194 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1389820 3 0.3879 0.886 0.152 0 0.848
#> SRR1074289 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR665610 1 0.4555 0.753 0.800 0 0.200
#> SRR1347322 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1470230 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1354247 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1434117 1 0.5058 0.710 0.756 0 0.244
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR658657 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
#> SRR615958 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1403259 1 0.6026 0.535 0.624 0 0.376
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1362200 1 0.0237 0.871 0.996 0 0.004
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1347298 1 0.0747 0.862 0.984 0 0.016
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.873 1.000 0 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1397949 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1355723 1 0.1389 0.5923 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1329744 1 0.5558 0.8373 0.608 0.000 0.028 0.364
#> SRR657384 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1351190 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4776 0.8469 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1396017 1 0.5573 0.8387 0.604 0.000 0.028 0.368
#> SRR1410742 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1435963 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1382416 4 0.7855 -0.5476 0.284 0.000 0.320 0.396
#> SRR1391354 1 0.1297 0.4884 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1312244 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1325138 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1326821 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1075707 4 0.4972 0.7887 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1465758 1 0.5016 0.8471 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR1414058 1 0.4905 0.8378 0.632 0.000 0.004 0.364
#> SRR1407449 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.3688 0.7385 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1399069 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1366450 1 0.3649 0.7331 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1396859 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1457176 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1097666 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1434736 1 0.1305 0.5205 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1080560 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1322882 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR658152 1 0.3400 0.7076 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1368141 1 0.4401 0.1938 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR1440268 1 0.5231 0.8457 0.604 0.000 0.012 0.384
#> SRR1453725 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1477591 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1369052 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1377735 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1331244 1 0.1398 0.5195 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1404531 1 0.3764 0.7394 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1324331 1 0.1798 0.5013 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR1458890 3 0.4401 0.7011 0.272 0.000 0.724 0.004
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.5977 0.7189 0.680 0.000 0.104 0.216
#> SRR1087393 2 0.4996 -0.6558 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1077263 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1385211 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR655241 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR656922 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1361630 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1318966 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1407087 1 0.4790 0.8476 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR603212 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.4955 0.5500 0.772 0.000 0.144 0.084
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1457835 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1347123 1 0.4621 -0.2871 0.708 0.000 0.284 0.008
#> SRR1465501 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1330878 1 0.4088 0.3483 0.764 0.000 0.232 0.004
#> SRR1445064 1 0.3649 0.7401 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1452981 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1326708 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1407157 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.1211 0.5754 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1077898 1 0.1661 0.5442 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1349080 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 4 0.5070 0.8428 0.000 0.416 0.004 0.580
#> SRR1375485 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.4817 0.8480 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1380614 3 0.7494 0.2804 0.352 0.000 0.460 0.188
#> SRR812060 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR602082 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1069490 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.3528 0.7279 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1420710 1 0.4103 0.7776 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR660426 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1416003 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR661064 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 4 0.7782 -0.6552 0.360 0.000 0.244 0.396
#> SRR1353243 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1455482 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1313473 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1399394 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1102467 1 0.4605 0.8253 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1317470 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1337707 1 0.2843 0.6033 0.892 0.000 0.020 0.088
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.0000 0.6391 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398013 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1352918 1 0.2089 0.4262 0.932 0.000 0.048 0.020
#> SRR1420750 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1071785 1 0.3239 0.5471 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1366560 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1355684 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1323289 3 0.5453 0.6673 0.388 0.000 0.592 0.020
#> SRR1313494 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1309985 1 0.5018 0.8240 0.656 0.000 0.012 0.332
#> SRR607911 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1333789 1 0.4817 0.8494 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1400078 1 0.4790 0.8476 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR615575 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1079434 1 0.1042 0.5016 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1325559 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1446695 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1383883 4 0.7684 -0.6906 0.388 0.000 0.216 0.396
#> SRR1396100 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1475697 1 0.4387 0.6242 0.804 0.000 0.052 0.144
#> SRR1488067 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1084991 4 0.4941 0.8231 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1410380 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1485812 1 0.0336 0.5268 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.5403 0.8306 0.628 0.000 0.024 0.348
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.5465 0.6672 0.392 0.000 0.588 0.020
#> SRR807775 1 0.0524 0.5239 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1100656 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1362159 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1414536 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR656794 1 0.1209 0.5260 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR604653 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1317685 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1485912 1 0.4817 0.8494 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1407602 1 0.3853 0.1113 0.820 0.000 0.160 0.020
#> SRR1356164 3 0.3668 0.6946 0.188 0.000 0.808 0.004
#> SRR1328692 3 0.6716 0.5491 0.404 0.000 0.504 0.092
#> SRR1362438 1 0.3688 0.7329 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1479216 1 0.1520 0.5418 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1358041 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1468766 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1368200 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.5476 0.6676 0.396 0.000 0.584 0.020
#> SRR1437256 1 0.3933 0.7135 0.792 0.000 0.008 0.200
#> SRR1487446 1 0.3123 0.6992 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR816653 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR815164 1 0.0921 0.5631 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1442043 1 0.4804 0.8488 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1410573 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.4817 0.8483 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1382934 3 0.5167 0.5712 0.488 0.000 0.508 0.004
#> SRR1465208 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1314728 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1470291 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1308756 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1409600 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR816123 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR614779 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR810783 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1333990 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1410356 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR808106 1 0.1284 0.4943 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR662713 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR809382 1 0.3948 0.5209 0.828 0.000 0.136 0.036
#> SRR665417 3 0.7362 0.0644 0.160 0.000 0.444 0.396
#> SRR1088016 2 0.2281 0.8102 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1453166 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1069826 2 0.0469 0.9575 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 1 0.3710 0.4391 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR1413787 1 0.1520 0.4740 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1478207 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1411046 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1309051 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1074956 4 0.5070 0.8428 0.000 0.416 0.004 0.580
#> SRR1092961 4 0.5193 0.8376 0.000 0.412 0.008 0.580
#> SRR817210 1 0.3649 0.7331 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1319221 3 0.0000 0.6391 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR607807 3 0.5361 0.5462 0.060 0.000 0.716 0.224
#> SRR1390160 1 0.2489 0.5030 0.912 0.000 0.068 0.020
#> SRR1406283 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1357709 1 0.2469 0.6556 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1080742 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1468208 4 0.7835 -0.5231 0.268 0.000 0.336 0.396
#> SRR1312766 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1361612 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1311224 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1087801 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1099720 2 0.4998 -0.6661 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1349250 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.3895 0.4588 0.804 0.000 0.184 0.012
#> SRR1332879 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1403177 3 0.0000 0.6391 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR818239 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1421069 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1500006 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1485678 1 0.0779 0.5229 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1092232 1 0.1398 0.4730 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1344253 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1384290 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1089349 1 0.0921 0.5340 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.0469 0.5515 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR818372 1 0.3486 0.7255 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.1724 0.4590 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1310031 1 0.5055 0.8378 0.624 0.000 0.008 0.368
#> SRR615419 1 0.2081 0.6263 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1436925 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1477238 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1332566 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1490228 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1442949 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1466239 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR813076 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 4 0.5263 0.7932 0.000 0.448 0.008 0.544
#> SRR1322981 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.5189 0.8378 0.616 0.000 0.012 0.372
#> SRR660522 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR815374 1 0.3528 0.7279 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1069564 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1416337 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1316438 3 0.5088 0.6692 0.424 0.000 0.572 0.004
#> SRR1386844 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1373718 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1335489 1 0.5326 0.8441 0.604 0.000 0.016 0.380
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1401815 3 0.5163 0.6188 0.480 0.000 0.516 0.004
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0469 0.9575 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.3486 0.7269 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1098761 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1312124 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR615395 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1479349 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR2165033 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1089054 2 0.0657 0.9551 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR816201 1 0.3444 0.7225 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.4776 0.8462 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1379303 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1418516 1 0.1724 0.4590 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR613174 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1351125 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR659157 1 0.1118 0.5684 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1480408 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR657857 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1094168 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1431270 1 0.0336 0.5266 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1466154 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1396944 1 0.7236 0.6930 0.460 0.000 0.144 0.396
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR614659 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR659247 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1317201 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1473696 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1375842 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1453662 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1416693 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1070841 1 0.4817 0.8483 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1380910 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR612659 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1089595 4 0.4972 0.7887 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1345995 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1071035 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1068808 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.5004 0.8481 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR1335355 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR659448 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1323558 1 0.3024 0.6932 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1381711 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR657985 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1314810 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1336505 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1474095 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.4817 0.8494 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1074909 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1101200 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1380414 1 0.1004 0.5211 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1315912 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0817 0.6505 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1477653 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1355475 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1360785 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR810437 1 0.4761 0.8428 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1361860 1 0.1004 0.5397 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1457619 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1498529 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3649 0.5210 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.4164 -0.2292 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1399525 2 0.4134 0.3259 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1312844 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1085874 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1101226 4 0.6295 0.7488 0.000 0.348 0.072 0.580
#> SRR1476056 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1075659 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1311916 1 0.5713 0.8210 0.620 0.000 0.040 0.340
#> SRR1353353 3 0.4122 0.6943 0.236 0.000 0.760 0.004
#> SRR1073291 1 0.4817 0.8483 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1356227 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1080720 4 0.4985 0.7641 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1091695 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1350304 1 0.1820 0.4511 0.944 0.000 0.036 0.020
#> SRR663002 1 0.4697 0.8355 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1347144 1 0.5174 0.8358 0.620 0.000 0.012 0.368
#> SRR1384006 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1499108 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR614047 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR818440 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1337770 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1399413 1 0.4817 0.8494 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1074041 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR816699 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1308612 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1499418 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1331083 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR808272 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1436698 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1095627 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1357672 1 0.0657 0.5187 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1351236 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1077479 1 0.5004 0.8481 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR814491 1 0.1724 0.4590 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1309534 1 0.3726 0.7353 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR615527 3 0.2831 0.6800 0.120 0.000 0.876 0.004
#> SRR1098216 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1325847 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1404003 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1344166 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1368638 1 0.1411 0.4813 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1174 0.4952 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1502143 1 0.4817 0.8483 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1487614 1 0.2197 0.3916 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.4543 0.8179 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1476547 4 0.4972 0.7887 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR656421 1 0.1305 0.5205 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.4761 0.8454 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1339944 2 0.0804 0.9513 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1431847 1 0.1724 0.4593 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1317155 1 0.6726 0.7486 0.536 0.000 0.100 0.364
#> SRR1477405 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR655289 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1341683 1 0.4103 0.7768 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1084790 1 0.1004 0.5115 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1073731 1 0.4697 0.8390 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1332588 1 0.1411 0.4813 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.4817 0.8494 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR661028 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.3528 0.7279 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1358435 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR2165273 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1379014 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1489904 1 0.4454 0.8061 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1416386 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1406048 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR606982 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1358082 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1312934 1 0.3528 0.7290 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR655194 1 0.4830 0.8493 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 4 0.5263 0.7932 0.000 0.448 0.008 0.544
#> SRR1389820 3 0.0000 0.6391 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074289 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.4936 0.8414 0.624 0.000 0.004 0.372
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1443507 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1452310 1 0.4830 0.8491 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR665610 1 0.2921 0.6857 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1347322 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR813395 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1477256 1 0.4843 0.8487 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1470230 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1354247 1 0.4855 0.8487 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1352299 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1076317 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1434117 1 0.2888 0.6464 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1075273 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR658657 1 0.0895 0.5078 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1092773 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1365332 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR615958 1 0.4790 0.8457 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1097688 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1403259 1 0.1520 0.4740 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1099120 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1362200 1 0.4804 0.8471 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.4418 0.4788 0.784 0.000 0.184 0.032
#> SRR1075923 4 0.4907 0.8477 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1100703 1 0.4843 0.8493 0.604 0.000 0.000 0.396
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 1 0.4341 0.25218 0.592 0.000 0.404 0.000 0.004
#> SRR1436370 2 0.2171 0.80499 0.000 0.912 0.064 0.024 0.000
#> SRR1075752 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1397949 1 0.2852 0.68149 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1355723 3 0.4101 0.53971 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.1082 0.71993 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR657384 1 0.3774 0.51614 0.704 0.000 0.296 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.4341 0.28853 0.592 0.000 0.404 0.000 0.004
#> SRR1458662 2 0.0566 0.80366 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR818573 1 0.4425 0.29215 0.600 0.000 0.392 0.000 0.008
#> SRR1396017 1 0.2900 0.72174 0.864 0.000 0.108 0.000 0.028
#> SRR1410742 1 0.4101 0.44351 0.664 0.000 0.332 0.000 0.004
#> SRR1435963 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.3671 0.57116 0.756 0.000 0.008 0.000 0.236
#> SRR1391354 3 0.3300 0.67763 0.204 0.000 0.792 0.004 0.000
#> SRR1087968 2 0.4211 0.58605 0.000 0.636 0.004 0.360 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.1043 0.74347 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1325138 3 0.3266 0.68010 0.200 0.000 0.796 0.004 0.000
#> SRR1326821 3 0.2970 0.69174 0.168 0.000 0.828 0.004 0.000
#> SRR1490178 2 0.0771 0.80502 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 4 0.4582 0.84402 0.000 0.416 0.012 0.572 0.000
#> SRR1443871 2 0.2389 0.79064 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR1102489 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1465758 1 0.0579 0.72841 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1414058 3 0.5431 0.26507 0.424 0.000 0.516 0.000 0.060
#> SRR1407449 1 0.0290 0.74087 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.2338 0.79211 0.000 0.884 0.004 0.112 0.000
#> SRR1479109 3 0.4278 0.24513 0.452 0.000 0.548 0.000 0.000
#> SRR1399069 3 0.3928 0.59314 0.296 0.000 0.700 0.004 0.000
#> SRR1366450 1 0.3895 0.41358 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0162 0.73944 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.1768 0.74080 0.924 0.000 0.072 0.000 0.004
#> SRR1097666 4 0.3123 0.72134 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1434736 3 0.4276 0.44640 0.380 0.000 0.616 0.004 0.000
#> SRR1080560 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1322882 1 0.0162 0.73944 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1327614 1 0.0290 0.73535 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR658152 3 0.4298 0.49976 0.352 0.000 0.640 0.000 0.008
#> SRR1368141 3 0.5163 0.48033 0.068 0.000 0.636 0.000 0.296
#> SRR1440268 1 0.0404 0.73255 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1453725 1 0.2286 0.72865 0.888 0.000 0.108 0.000 0.004
#> SRR1325711 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1477930 1 0.1282 0.74348 0.952 0.000 0.044 0.000 0.004
#> SRR1477591 1 0.0290 0.74087 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.2179 0.79624 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR656275 1 0.4410 0.14015 0.556 0.000 0.440 0.000 0.004
#> SRR1369052 1 0.1831 0.73906 0.920 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR1377735 1 0.0290 0.74087 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1331244 3 0.4434 0.27364 0.460 0.000 0.536 0.004 0.000
#> SRR1404531 1 0.3003 0.49461 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4692 -0.15494 0.528 0.000 0.460 0.004 0.008
#> SRR1458890 3 0.4430 0.30689 0.012 0.000 0.628 0.000 0.360
#> SRR1432695 2 0.0771 0.80491 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1407624 2 0.2806 0.76787 0.000 0.844 0.004 0.152 0.000
#> SRR1431969 3 0.6211 0.56089 0.248 0.000 0.548 0.000 0.204
#> SRR1087393 4 0.5509 0.69089 0.000 0.464 0.064 0.472 0.000
#> SRR1077263 3 0.2930 0.69246 0.164 0.000 0.832 0.004 0.000
#> SRR1385211 1 0.1041 0.74324 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR655241 1 0.0963 0.74353 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.4276 0.35777 0.616 0.000 0.380 0.000 0.004
#> SRR1361630 3 0.2124 0.67908 0.096 0.000 0.900 0.004 0.000
#> SRR1318966 4 0.5028 0.83691 0.000 0.400 0.036 0.564 0.000
#> SRR1407087 1 0.4287 0.15926 0.540 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.1952 0.73555 0.912 0.000 0.084 0.000 0.004
#> SRR1321088 2 0.3491 0.70557 0.000 0.768 0.004 0.228 0.000
#> SRR1485190 3 0.5864 0.58022 0.164 0.000 0.600 0.000 0.236
#> SRR1332232 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1312645 1 0.3684 0.54372 0.720 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.1768 0.74066 0.924 0.000 0.072 0.000 0.004
#> SRR1347123 3 0.3535 0.64766 0.080 0.000 0.832 0.000 0.088
#> SRR1465501 4 0.4150 0.85489 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1330878 3 0.5082 0.52725 0.076 0.000 0.664 0.000 0.260
#> SRR1445064 3 0.3983 0.51727 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.3928 0.51171 0.700 0.000 0.296 0.000 0.004
#> SRR1326708 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.2488 0.78639 0.000 0.872 0.004 0.124 0.000
#> SRR1397697 2 0.2171 0.80499 0.000 0.912 0.064 0.024 0.000
#> SRR1477316 3 0.3876 0.62826 0.316 0.000 0.684 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.4288 0.06336 0.612 0.000 0.384 0.004 0.000
#> SRR1349080 3 0.3550 0.65299 0.236 0.000 0.760 0.004 0.000
#> SRR1076096 2 0.2124 0.79796 0.000 0.900 0.004 0.096 0.000
#> SRR811261 4 0.1168 0.52209 0.000 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR1375485 1 0.1704 0.73976 0.928 0.000 0.068 0.000 0.004
#> SRR1432563 2 0.1478 0.80344 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.1331 0.74050 0.952 0.000 0.040 0.000 0.008
#> SRR1380614 5 0.5946 0.22457 0.380 0.000 0.112 0.000 0.508
#> SRR812060 1 0.4029 0.52098 0.680 0.000 0.316 0.000 0.004
#> SRR602082 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 4 0.3689 0.76476 0.000 0.256 0.000 0.740 0.004
#> SRR1078417 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR661613 3 0.4262 0.29034 0.440 0.000 0.560 0.000 0.000
#> SRR1420710 3 0.4161 0.40449 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.4448 0.07889 0.480 0.000 0.516 0.000 0.004
#> SRR661064 1 0.2230 0.72351 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1452718 1 0.3519 0.60271 0.776 0.000 0.008 0.000 0.216
#> SRR1353243 1 0.0290 0.74087 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.3086 0.68729 0.816 0.000 0.180 0.000 0.004
#> SRR1102467 1 0.3053 0.68489 0.828 0.000 0.164 0.000 0.008
#> SRR1317470 3 0.2286 0.68604 0.108 0.000 0.888 0.004 0.000
#> SRR1337707 3 0.3970 0.67942 0.224 0.000 0.752 0.000 0.024
#> SRR1408752 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1474617 5 0.0703 0.70822 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1398013 1 0.4448 -0.00273 0.516 0.000 0.480 0.000 0.004
#> SRR1352918 3 0.2763 0.68566 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1420750 1 0.1041 0.74324 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1071785 3 0.5365 0.61200 0.132 0.000 0.664 0.000 0.204
#> SRR1353618 2 0.2338 0.79211 0.000 0.884 0.004 0.112 0.000
#> SRR1082217 2 0.3398 0.71453 0.000 0.780 0.004 0.216 0.000
#> SRR1357256 2 0.1740 0.80795 0.000 0.932 0.056 0.012 0.000
#> SRR1490313 1 0.4359 0.27200 0.584 0.000 0.412 0.000 0.004
#> SRR1366560 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.4367 0.53411 0.000 0.000 0.416 0.004 0.580
#> SRR1313494 1 0.3969 0.49878 0.692 0.000 0.304 0.000 0.004
#> SRR1309985 1 0.3304 0.68173 0.816 0.000 0.168 0.000 0.016
#> SRR607911 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.4171 0.33837 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.4297 0.07733 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1092842 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR615575 1 0.4321 0.35122 0.600 0.000 0.396 0.000 0.004
#> SRR1079434 3 0.2389 0.68873 0.116 0.000 0.880 0.004 0.000
#> SRR1325559 1 0.1831 0.73790 0.920 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR1446695 3 0.2629 0.69357 0.136 0.000 0.860 0.004 0.000
#> SRR1383883 1 0.0404 0.72932 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396100 3 0.2890 0.69186 0.160 0.000 0.836 0.004 0.000
#> SRR1475697 3 0.4584 0.57575 0.312 0.000 0.660 0.000 0.028
#> SRR1488067 4 0.4686 0.84852 0.000 0.384 0.020 0.596 0.000
#> SRR1102103 2 0.2763 0.77072 0.000 0.848 0.004 0.148 0.000
#> SRR1105154 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1084991 4 0.4582 0.84402 0.000 0.416 0.012 0.572 0.000
#> SRR1410380 3 0.2124 0.67908 0.096 0.000 0.900 0.004 0.000
#> SRR1445490 2 0.1892 0.80114 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR1454671 2 0.2389 0.79238 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR1435044 1 0.4425 0.18324 0.544 0.000 0.452 0.000 0.004
#> SRR1485812 3 0.3081 0.70791 0.156 0.000 0.832 0.000 0.012
#> SRR1078020 2 0.4029 0.63505 0.000 0.680 0.004 0.316 0.000
#> SRR1311153 1 0.1403 0.71083 0.952 0.000 0.024 0.000 0.024
#> SRR1376406 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1343898 3 0.3422 0.27566 0.004 0.000 0.792 0.004 0.200
#> SRR807775 3 0.2930 0.70924 0.164 0.000 0.832 0.004 0.000
#> SRR1409215 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR820427 3 0.2674 0.68871 0.140 0.000 0.856 0.004 0.000
#> SRR1100656 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.2763 0.69163 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR656794 1 0.4437 -0.06721 0.532 0.000 0.464 0.004 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.2439 0.68943 0.120 0.000 0.876 0.004 0.000
#> SRR1485912 1 0.4210 0.29208 0.588 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1407602 3 0.3736 0.57254 0.072 0.000 0.824 0.004 0.100
#> SRR1356164 5 0.3476 0.68348 0.020 0.000 0.176 0.000 0.804
#> SRR1328692 5 0.6049 0.33314 0.164 0.000 0.272 0.000 0.564
#> SRR1362438 1 0.3143 0.47939 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.3074 0.70017 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.2068 0.73258 0.904 0.000 0.092 0.000 0.004
#> SRR1468766 1 0.4310 0.34976 0.604 0.000 0.392 0.000 0.004
#> SRR1368200 1 0.4029 0.51832 0.680 0.000 0.316 0.000 0.004
#> SRR1435602 2 0.2260 0.80570 0.000 0.908 0.064 0.028 0.000
#> SRR1501043 3 0.3352 0.31413 0.004 0.000 0.800 0.004 0.192
#> SRR1437256 3 0.5252 0.57113 0.292 0.000 0.632 0.000 0.076
#> SRR1487446 3 0.4074 0.53770 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.1571 0.74284 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR815164 3 0.4227 0.42157 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.4074 0.36803 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1352369 1 0.4101 0.47976 0.664 0.000 0.332 0.000 0.004
#> SRR1382934 3 0.5104 0.45517 0.060 0.000 0.632 0.000 0.308
#> SRR1465208 1 0.0290 0.74087 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.2280 0.72220 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.4450 0.06166 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004
#> SRR1409600 1 0.3661 0.57903 0.724 0.000 0.276 0.000 0.000
#> SRR816123 4 0.3123 0.72134 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR614779 3 0.3662 0.65884 0.252 0.000 0.744 0.004 0.000
#> SRR810783 1 0.4166 0.44903 0.648 0.000 0.348 0.000 0.004
#> SRR1333990 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.3741 0.59682 0.732 0.000 0.264 0.000 0.004
#> SRR808106 3 0.3949 0.58662 0.300 0.000 0.696 0.004 0.000
#> SRR662713 1 0.3366 0.65841 0.784 0.000 0.212 0.000 0.004
#> SRR1447058 2 0.3990 0.64282 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR1480964 1 0.4410 0.22400 0.556 0.000 0.440 0.000 0.004
#> SRR809382 3 0.5555 0.61835 0.152 0.000 0.644 0.000 0.204
#> SRR665417 1 0.4644 0.09559 0.528 0.000 0.012 0.000 0.460
#> SRR1088016 2 0.3838 0.66578 0.000 0.716 0.004 0.280 0.000
#> SRR1453166 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1069826 2 0.1981 0.79486 0.000 0.920 0.064 0.016 0.000
#> SRR1077781 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR615623 3 0.5215 0.55047 0.088 0.000 0.656 0.000 0.256
#> SRR1413787 3 0.2068 0.67316 0.092 0.000 0.904 0.004 0.000
#> SRR1478207 3 0.4450 0.04467 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004
#> SRR1411046 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.1638 0.80478 0.000 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR1326560 1 0.0324 0.74109 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1309051 1 0.0162 0.73941 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486949 2 0.4299 0.55277 0.000 0.608 0.004 0.388 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 4 0.2439 0.66541 0.000 0.120 0.000 0.876 0.004
#> SRR1092961 4 0.0898 0.50147 0.000 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR817210 3 0.4256 0.29496 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1319221 5 0.0703 0.70822 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1405413 1 0.3086 0.68631 0.816 0.000 0.180 0.000 0.004
#> SRR607807 5 0.4150 0.34703 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1390160 3 0.4783 0.62309 0.100 0.000 0.724 0.000 0.176
#> SRR1406283 1 0.1892 0.73693 0.916 0.000 0.080 0.000 0.004
#> SRR1357709 3 0.4088 0.54416 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1080742 4 0.2806 0.70205 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR1468208 1 0.1043 0.71734 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1312766 1 0.3579 0.62813 0.756 0.000 0.240 0.000 0.004
#> SRR1361612 1 0.1671 0.73875 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0324 0.73984 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1087801 1 0.4029 0.49898 0.680 0.000 0.316 0.000 0.004
#> SRR1099720 4 0.4811 0.78024 0.000 0.452 0.020 0.528 0.000
#> SRR1349250 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1350912 2 0.4166 0.60018 0.000 0.648 0.004 0.348 0.000
#> SRR1357127 1 0.4443 0.10759 0.524 0.000 0.472 0.000 0.004
#> SRR1074980 2 0.3550 0.69981 0.000 0.760 0.004 0.236 0.000
#> SRR1317022 3 0.5572 0.57710 0.124 0.000 0.628 0.000 0.248
#> SRR1332879 1 0.0451 0.74030 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1403177 5 0.2891 0.64691 0.000 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1076144 2 0.1877 0.80176 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1069614 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR818239 4 0.4161 0.86201 0.000 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1421069 4 0.4150 0.86005 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.4118 0.58399 0.336 0.000 0.660 0.004 0.000
#> SRR1092232 3 0.3110 0.65175 0.080 0.000 0.860 0.000 0.060
#> SRR1344253 3 0.3160 0.68030 0.188 0.000 0.808 0.004 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.4030 0.53927 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1326727 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1440940 3 0.3109 0.70257 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR818372 3 0.3774 0.59140 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.3430 0.71097 0.000 0.776 0.004 0.220 0.000
#> SRR819894 3 0.2763 0.68566 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1310031 3 0.5658 0.30089 0.408 0.000 0.512 0.000 0.080
#> SRR615419 3 0.3689 0.65997 0.256 0.000 0.740 0.000 0.004
#> SRR1436925 1 0.3635 0.60970 0.748 0.000 0.248 0.000 0.004
#> SRR1477238 1 0.0162 0.74003 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0162 0.73944 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.4450 0.05234 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004
#> SRR1442949 3 0.2674 0.68492 0.140 0.000 0.856 0.004 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1329971 1 0.1792 0.73654 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.2233 0.79524 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1097642 4 0.4722 0.84541 0.000 0.412 0.012 0.572 0.004
#> SRR1322981 1 0.3160 0.68247 0.808 0.000 0.188 0.000 0.004
#> SRR1485976 2 0.1270 0.80558 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.5773 0.32737 0.396 0.000 0.512 0.000 0.092
#> SRR660522 1 0.4446 0.06575 0.520 0.000 0.476 0.000 0.004
#> SRR815374 3 0.4182 0.45178 0.400 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR1069564 4 0.3123 0.72134 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1416337 3 0.3790 0.63541 0.272 0.000 0.724 0.004 0.000
#> SRR1316438 3 0.3203 0.44720 0.012 0.000 0.820 0.000 0.168
#> SRR1386844 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0162 0.73755 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447458 2 0.2179 0.79645 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1487128 1 0.0290 0.74170 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.3123 0.74422 0.000 0.812 0.004 0.184 0.000
#> SRR1069919 2 0.2079 0.80395 0.000 0.916 0.064 0.020 0.000
#> SRR1460296 1 0.0162 0.73944 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.1818 0.73828 0.932 0.000 0.044 0.000 0.024
#> SRR1393404 2 0.2286 0.79494 0.000 0.888 0.004 0.108 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.4617 0.53438 0.060 0.000 0.716 0.000 0.224
#> SRR1071337 2 0.4166 0.60018 0.000 0.648 0.004 0.348 0.000
#> SRR1071983 2 0.1981 0.79486 0.000 0.920 0.064 0.016 0.000
#> SRR1331793 2 0.0566 0.80495 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1410510 3 0.3816 0.57715 0.304 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1098761 4 0.3123 0.72134 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1312124 1 0.2230 0.72301 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.2338 0.72867 0.884 0.000 0.112 0.000 0.004
#> SRR1479349 1 0.1121 0.74311 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.4211 0.41386 0.636 0.000 0.360 0.000 0.004
#> SRR1089054 2 0.4251 0.57790 0.000 0.624 0.004 0.372 0.000
#> SRR816201 3 0.3932 0.57171 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR655840 1 0.4273 0.09620 0.552 0.000 0.448 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.2806 0.68639 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR613174 1 0.4288 0.38094 0.612 0.000 0.384 0.000 0.004
#> SRR1351125 1 0.3521 0.63794 0.764 0.000 0.232 0.000 0.004
#> SRR659157 3 0.3231 0.70447 0.196 0.000 0.800 0.000 0.004
#> SRR1480408 1 0.3949 0.50736 0.696 0.000 0.300 0.000 0.004
#> SRR657857 1 0.3586 0.57174 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1332526 1 0.3790 0.55526 0.724 0.000 0.272 0.000 0.004
#> SRR1094168 4 0.0771 0.50074 0.000 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR1431270 3 0.2516 0.70598 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1330106 3 0.4448 0.07889 0.480 0.000 0.516 0.000 0.004
#> SRR1466154 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0963 0.72347 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1082784 2 0.1981 0.80719 0.000 0.920 0.064 0.016 0.000
#> SRR1457267 1 0.0162 0.73755 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR614659 1 0.4310 0.31648 0.604 0.000 0.392 0.000 0.004
#> SRR659247 1 0.4367 0.28116 0.580 0.000 0.416 0.000 0.004
#> SRR1317201 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.1768 0.74080 0.924 0.000 0.072 0.000 0.004
#> SRR1375842 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.2389 0.79484 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR1096363 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1453662 1 0.3607 0.60194 0.752 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1345499 2 0.2124 0.79796 0.000 0.900 0.004 0.096 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.4420 0.19742 0.548 0.000 0.448 0.000 0.004
#> SRR1380910 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1498183 1 0.1205 0.74373 0.956 0.000 0.040 0.000 0.004
#> SRR612659 3 0.5529 0.25841 0.420 0.000 0.512 0.000 0.068
#> SRR1447148 2 0.3990 0.64282 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR658597 4 0.4171 0.86332 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1089595 4 0.4582 0.84402 0.000 0.416 0.012 0.572 0.000
#> SRR1074263 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1376786 1 0.2719 0.71261 0.852 0.000 0.144 0.000 0.004
#> SRR1345995 1 0.2719 0.70992 0.852 0.000 0.144 0.000 0.004
#> SRR1071035 1 0.2233 0.72823 0.892 0.000 0.104 0.000 0.004
#> SRR1068808 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1332754 2 0.4009 0.63874 0.000 0.684 0.004 0.312 0.000
#> SRR662438 1 0.0162 0.73745 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335355 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.4443 0.10759 0.524 0.000 0.472 0.000 0.004
#> SRR1323558 3 0.3684 0.61322 0.280 0.000 0.720 0.000 0.000
#> SRR1381711 3 0.2629 0.69147 0.136 0.000 0.860 0.004 0.000
#> SRR657985 3 0.2068 0.67316 0.092 0.000 0.904 0.004 0.000
#> SRR1314810 1 0.1908 0.73317 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1336505 3 0.4450 0.06166 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004
#> SRR1474095 1 0.2970 0.69587 0.828 0.000 0.168 0.000 0.004
#> SRR1363831 2 0.0324 0.80275 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1442376 1 0.4138 0.31366 0.616 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR1074909 4 0.4161 0.86202 0.000 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1101200 1 0.2763 0.71056 0.848 0.000 0.148 0.000 0.004
#> SRR1075408 2 0.2488 0.78609 0.000 0.872 0.004 0.124 0.000
#> SRR1367150 3 0.2763 0.68566 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1313406 2 0.3990 0.64282 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR1068880 2 0.3990 0.64282 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR1467277 3 0.2439 0.69054 0.120 0.000 0.876 0.004 0.000
#> SRR1084867 2 0.3990 0.64282 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR1095431 4 0.2813 0.72212 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1380184 2 0.2011 0.79920 0.000 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR1443113 1 0.1892 0.73693 0.916 0.000 0.080 0.000 0.004
#> SRR1380414 3 0.3884 0.63305 0.288 0.000 0.708 0.004 0.000
#> SRR1315912 1 0.0162 0.74003 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1421116 2 0.2179 0.79766 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR602282 5 0.0963 0.71247 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1361195 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR600493 1 0.2583 0.71253 0.864 0.000 0.132 0.000 0.004
#> SRR1477653 1 0.2629 0.71586 0.860 0.000 0.136 0.000 0.004
#> SRR1355475 1 0.4420 0.19529 0.548 0.000 0.448 0.000 0.004
#> SRR1360785 3 0.3300 0.67713 0.204 0.000 0.792 0.004 0.000
#> SRR810437 3 0.4560 0.08331 0.484 0.000 0.508 0.000 0.008
#> SRR1361860 3 0.4225 0.54557 0.364 0.000 0.632 0.004 0.000
#> SRR1441311 2 0.0671 0.80680 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1098903 3 0.2806 0.69099 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR1457619 1 0.3932 0.47484 0.672 0.000 0.328 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.2011 0.73487 0.908 0.000 0.088 0.000 0.004
#> SRR1097172 2 0.1041 0.80553 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1074017 2 0.4395 0.42296 0.000 0.748 0.064 0.188 0.000
#> SRR1472033 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1445087 3 0.3359 0.63401 0.072 0.000 0.844 0.000 0.084
#> SRR1399525 2 0.5507 -0.05473 0.000 0.480 0.064 0.456 0.000
#> SRR1312844 4 0.3884 0.78357 0.000 0.288 0.000 0.708 0.004
#> SRR1085874 4 0.3160 0.72417 0.000 0.188 0.000 0.808 0.004
#> SRR1101226 4 0.0898 0.47418 0.000 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1476056 1 0.2280 0.72062 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1075659 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1311916 3 0.6099 0.41116 0.352 0.000 0.512 0.000 0.136
#> SRR1353353 3 0.4383 0.09080 0.004 0.000 0.572 0.000 0.424
#> SRR1073291 1 0.4420 0.19777 0.548 0.000 0.448 0.000 0.004
#> SRR1356227 1 0.0162 0.73944 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1080720 4 0.4582 0.84402 0.000 0.416 0.012 0.572 0.000
#> SRR1091695 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1350304 3 0.2806 0.68639 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR663002 3 0.5960 0.38639 0.368 0.000 0.516 0.000 0.116
#> SRR1376983 2 0.2233 0.79483 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.5697 0.30982 0.404 0.000 0.512 0.000 0.084
#> SRR1384006 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 4 0.2966 0.72337 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR614047 1 0.4410 0.21879 0.556 0.000 0.440 0.000 0.004
#> SRR818440 1 0.4420 0.19650 0.548 0.000 0.448 0.000 0.004
#> SRR1337770 1 0.2536 0.71472 0.868 0.000 0.128 0.000 0.004
#> SRR1399413 1 0.3730 0.55587 0.712 0.000 0.288 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.2179 0.79624 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1473959 1 0.4434 0.13888 0.536 0.000 0.460 0.000 0.004
#> SRR1074041 1 0.4341 0.32503 0.592 0.000 0.404 0.000 0.004
#> SRR1394495 2 0.2233 0.79548 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR659460 1 0.4166 0.45298 0.648 0.000 0.348 0.000 0.004
#> SRR816699 1 0.4331 0.33650 0.596 0.000 0.400 0.000 0.004
#> SRR1308612 1 0.4449 0.05518 0.512 0.000 0.484 0.000 0.004
#> SRR1499418 3 0.2124 0.67908 0.096 0.000 0.900 0.004 0.000
#> SRR1352894 2 0.2338 0.79211 0.000 0.884 0.004 0.112 0.000
#> SRR815805 1 0.1792 0.73687 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1331083 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR808272 3 0.4560 0.06758 0.484 0.000 0.508 0.000 0.008
#> SRR1436698 1 0.1732 0.73726 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1095627 4 0.3123 0.72134 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1357672 3 0.2970 0.71408 0.168 0.000 0.828 0.004 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0324 0.73872 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR814491 3 0.2806 0.68639 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR1101256 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1436004 1 0.0451 0.74106 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1457994 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1078998 2 0.3990 0.64282 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR1314707 1 0.2629 0.71034 0.860 0.000 0.136 0.000 0.004
#> SRR1309534 3 0.4256 0.33226 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR615527 5 0.2179 0.70631 0.004 0.000 0.100 0.000 0.896
#> SRR1098216 1 0.0162 0.74071 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1325847 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1404003 1 0.4151 0.41801 0.652 0.000 0.344 0.000 0.004
#> SRR1344166 1 0.2338 0.72318 0.884 0.000 0.112 0.000 0.004
#> SRR1368638 3 0.2763 0.68566 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1431429 2 0.3990 0.64282 0.000 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR1079237 4 0.4331 0.86211 0.000 0.400 0.004 0.596 0.000
#> SRR1080509 2 0.1571 0.80286 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR815759 3 0.2763 0.68566 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1502143 1 0.4415 0.20989 0.552 0.000 0.444 0.000 0.004
#> SRR1487614 3 0.3526 0.63543 0.072 0.000 0.832 0.000 0.096
#> SRR1402307 2 0.2286 0.79319 0.000 0.888 0.004 0.108 0.000
#> SRR820810 1 0.4390 0.17188 0.568 0.000 0.428 0.000 0.004
#> SRR1099212 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1083215 1 0.3196 0.67750 0.804 0.000 0.192 0.000 0.004
#> SRR1476547 4 0.4722 0.84541 0.000 0.412 0.012 0.572 0.004
#> SRR656421 3 0.4029 0.56362 0.316 0.000 0.680 0.004 0.000
#> SRR1086116 2 0.3430 0.71097 0.000 0.776 0.004 0.220 0.000
#> SRR1499917 3 0.4306 0.05769 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.4186 0.79502 0.000 0.796 0.064 0.128 0.012
#> SRR1391444 2 0.1638 0.80160 0.000 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR1434889 1 0.4403 0.16812 0.560 0.000 0.436 0.000 0.004
#> SRR1431847 3 0.1952 0.66440 0.084 0.000 0.912 0.004 0.000
#> SRR1317155 1 0.5887 -0.02258 0.476 0.000 0.424 0.000 0.100
#> SRR1477405 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.2848 0.69188 0.156 0.000 0.840 0.004 0.000
#> SRR1341683 3 0.4210 0.34821 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1084790 3 0.2890 0.70108 0.160 0.000 0.836 0.004 0.000
#> SRR1073731 1 0.4305 0.03472 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1332588 3 0.3123 0.67772 0.184 0.000 0.812 0.004 0.000
#> SRR1471157 2 0.0771 0.80552 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR654945 1 0.4273 0.19991 0.552 0.000 0.448 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0162 0.73941 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413477 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1101152 3 0.4210 0.41496 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1358435 4 0.4331 0.86215 0.000 0.400 0.004 0.596 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0290 0.74087 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.5550 0.39764 0.376 0.000 0.548 0.000 0.076
#> SRR1416386 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1406048 1 0.1043 0.74347 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.2536 0.69345 0.128 0.000 0.868 0.004 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.73937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.3983 0.53926 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.1478 0.74039 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1473251 4 0.4722 0.84541 0.000 0.412 0.012 0.572 0.004
#> SRR1389820 5 0.0703 0.70822 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1074289 1 0.4310 0.34335 0.604 0.000 0.392 0.000 0.004
#> SRR1348816 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1076292 1 0.4451 0.01370 0.504 0.000 0.492 0.000 0.004
#> SRR1395810 2 0.1764 0.80348 0.000 0.928 0.064 0.008 0.000
#> SRR1498909 1 0.4451 -0.01320 0.504 0.000 0.492 0.000 0.004
#> SRR1443507 1 0.3430 0.64887 0.776 0.000 0.220 0.000 0.004
#> SRR1452310 1 0.4397 0.22835 0.564 0.000 0.432 0.000 0.004
#> SRR665610 3 0.3966 0.58703 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0162 0.74071 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813395 4 0.2536 0.67330 0.000 0.128 0.000 0.868 0.004
#> SRR1477256 1 0.0609 0.74308 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.2179 0.67862 0.100 0.000 0.896 0.004 0.000
#> SRR1354247 1 0.0162 0.73941 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082640 2 0.4238 0.57716 0.000 0.628 0.004 0.368 0.000
#> SRR1487592 1 0.3010 0.69388 0.824 0.000 0.172 0.000 0.004
#> SRR1352299 1 0.1892 0.73693 0.916 0.000 0.080 0.000 0.004
#> SRR1076317 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1434117 1 0.4430 -0.02964 0.540 0.000 0.456 0.004 0.000
#> SRR1075273 4 0.4726 0.85125 0.000 0.400 0.020 0.580 0.000
#> SRR658657 3 0.2719 0.69219 0.144 0.000 0.852 0.004 0.000
#> SRR1092773 4 0.5447 0.80332 0.000 0.400 0.064 0.536 0.000
#> SRR1365332 1 0.3715 0.60458 0.736 0.000 0.260 0.000 0.004
#> SRR615958 3 0.4561 0.05006 0.488 0.000 0.504 0.000 0.008
#> SRR1097688 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1403259 3 0.2011 0.66899 0.088 0.000 0.908 0.004 0.000
#> SRR1099120 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1362200 1 0.4735 0.11144 0.524 0.000 0.460 0.000 0.016
#> SRR1464856 2 0.1877 0.79875 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1347298 3 0.5544 0.52322 0.100 0.000 0.608 0.000 0.292
#> SRR1075923 4 0.4182 0.86425 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1100703 1 0.3123 0.68437 0.812 0.000 0.184 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 3 0.4141 0.4178 0.432 0.000 0.556 NA 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.5440 0.4988 0.000 0.520 0.000 NA 0.000 0.132
#> SRR1075752 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1397949 1 0.3198 0.5181 0.740 0.000 0.260 NA 0.000 0.000
#> SRR1355723 3 0.4365 0.5638 0.292 0.000 0.664 NA 0.004 0.000
#> SRR1329744 1 0.2301 0.7006 0.884 0.000 0.096 NA 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.4161 -0.1731 0.540 0.000 0.448 NA 0.000 0.000
#> SRR1351190 3 0.3944 0.4076 0.428 0.000 0.568 NA 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.2070 0.5659 0.000 0.892 0.000 NA 0.000 0.100
#> SRR818573 3 0.3867 0.2626 0.488 0.000 0.512 NA 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.4385 0.5283 0.696 0.000 0.240 NA 0.004 0.000
#> SRR1410742 1 0.4471 -0.2808 0.500 0.000 0.472 NA 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0260 0.7500 0.992 0.000 0.008 NA 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.4809 0.5323 0.708 0.000 0.024 NA 0.172 0.000
#> SRR1391354 3 0.4884 0.5094 0.128 0.000 0.652 NA 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.3925 0.4290 0.000 0.724 0.000 NA 0.000 0.236
#> SRR1310075 1 0.0405 0.7487 0.988 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.2048 0.7108 0.880 0.000 0.120 NA 0.000 0.000
#> SRR1325138 3 0.4890 0.5154 0.140 0.000 0.656 NA 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.4884 0.5168 0.128 0.000 0.652 NA 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.1327 0.5797 0.000 0.936 0.000 NA 0.000 0.064
#> SRR655613 1 0.0458 0.7507 0.984 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.4045 0.7811 0.000 0.268 0.000 NA 0.000 0.696
#> SRR1443871 2 0.1297 0.5739 0.000 0.948 0.000 NA 0.000 0.012
#> SRR1102489 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1465758 1 0.3799 0.4282 0.756 0.000 0.024 NA 0.012 0.000
#> SRR1414058 3 0.4249 0.6126 0.188 0.000 0.736 NA 0.068 0.000
#> SRR1407449 1 0.0713 0.7499 0.972 0.000 0.028 NA 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.1196 0.5748 0.000 0.952 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1479109 3 0.3828 0.5519 0.288 0.000 0.696 NA 0.004 0.000
#> SRR1399069 3 0.5275 0.4819 0.168 0.000 0.600 NA 0.000 0.000
#> SRR1366450 3 0.4535 0.0728 0.472 0.000 0.500 NA 0.004 0.000
#> SRR1396859 1 0.0865 0.7499 0.964 0.000 0.036 NA 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.2631 0.6866 0.840 0.000 0.152 NA 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.3629 0.6319 0.000 0.276 0.000 NA 0.000 0.712
#> SRR1434736 3 0.5787 0.4096 0.252 0.000 0.504 NA 0.000 0.000
#> SRR1080560 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1322882 1 0.1387 0.7399 0.932 0.000 0.068 NA 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1327614 1 0.2664 0.6103 0.848 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.4641 0.6241 0.204 0.000 0.712 NA 0.036 0.000
#> SRR1368141 3 0.4018 0.3724 0.000 0.000 0.656 NA 0.324 0.000
#> SRR1440268 1 0.2230 0.6987 0.892 0.000 0.084 NA 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.3835 0.3939 0.668 0.000 0.320 NA 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1477930 1 0.1387 0.7417 0.932 0.000 0.068 NA 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.1141 0.7439 0.948 0.000 0.052 NA 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0692 0.5881 0.000 0.976 0.000 NA 0.000 0.020
#> SRR656275 3 0.4076 0.4795 0.396 0.000 0.592 NA 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.1610 0.7350 0.916 0.000 0.084 NA 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.1075 0.7471 0.952 0.000 0.048 NA 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.5816 0.0934 0.484 0.000 0.304 NA 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.3053 0.6118 0.812 0.000 0.172 NA 0.004 0.000
#> SRR1324331 1 0.5771 0.1358 0.532 0.000 0.252 NA 0.004 0.000
#> SRR1458890 3 0.4167 0.2883 0.000 0.000 0.612 NA 0.368 0.000
#> SRR1432695 2 0.1007 0.5848 0.000 0.956 0.000 NA 0.000 0.044
#> SRR1407624 2 0.1327 0.5680 0.000 0.936 0.000 NA 0.000 0.064
#> SRR1431969 3 0.4201 0.5482 0.056 0.000 0.732 NA 0.204 0.000
#> SRR1087393 6 0.6095 0.1525 0.000 0.292 0.000 NA 0.000 0.384
#> SRR1077263 3 0.4667 0.5114 0.100 0.000 0.688 NA 0.004 0.000
#> SRR1385211 1 0.1663 0.7307 0.912 0.000 0.088 NA 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.1003 0.7510 0.964 0.000 0.020 NA 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.3993 -0.1704 0.520 0.000 0.476 NA 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.3773 0.5099 0.044 0.000 0.752 NA 0.000 0.000
#> SRR1318966 6 0.3863 0.7970 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.712
#> SRR1407087 3 0.3707 0.5381 0.312 0.000 0.680 NA 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.3420 0.5547 0.748 0.000 0.240 NA 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.2092 0.5354 0.000 0.876 0.000 NA 0.000 0.124
#> SRR1485190 3 0.4170 0.5006 0.032 0.000 0.724 NA 0.228 0.000
#> SRR1332232 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1312645 1 0.3979 -0.1198 0.540 0.000 0.456 NA 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.2668 0.6747 0.828 0.000 0.168 NA 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.3237 0.5328 0.020 0.000 0.828 NA 0.132 0.000
#> SRR1465501 6 0.3351 0.7977 0.000 0.288 0.000 NA 0.000 0.712
#> SRR1330878 3 0.4224 0.4945 0.024 0.000 0.732 NA 0.212 0.000
#> SRR1445064 3 0.2877 0.6335 0.168 0.000 0.820 NA 0.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.4199 -0.1048 0.568 0.000 0.416 NA 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0405 0.7487 0.988 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0935 0.7368 0.964 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1365401 2 0.1644 0.5683 0.000 0.932 0.000 NA 0.000 0.028
#> SRR1397697 2 0.5418 0.4984 0.000 0.520 0.000 NA 0.000 0.128
#> SRR1477316 3 0.4790 0.5578 0.300 0.000 0.628 NA 0.004 0.000
#> SRR1077898 1 0.4855 0.3720 0.660 0.000 0.204 NA 0.000 0.000
#> SRR1349080 3 0.5025 0.4965 0.136 0.000 0.632 NA 0.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.1010 0.5793 0.000 0.960 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR811261 6 0.2945 0.4904 0.000 0.156 0.000 NA 0.000 0.824
#> SRR1375485 1 0.2871 0.6432 0.804 0.000 0.192 NA 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.5156 0.5191 0.000 0.612 0.000 NA 0.000 0.144
#> SRR604414 1 0.2416 0.7035 0.844 0.000 0.156 NA 0.000 0.000
#> SRR1380614 5 0.7070 0.3664 0.332 0.000 0.128 NA 0.404 0.000
#> SRR812060 3 0.4389 0.3345 0.444 0.000 0.536 NA 0.008 0.000
#> SRR602082 1 0.0937 0.7407 0.960 0.000 0.040 NA 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.3954 0.6767 0.000 0.352 0.000 NA 0.000 0.636
#> SRR1078417 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR661613 3 0.3488 0.5949 0.244 0.000 0.744 NA 0.004 0.000
#> SRR1420710 3 0.3171 0.6264 0.204 0.000 0.784 NA 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0820 0.7500 0.972 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.3703 0.5609 0.304 0.000 0.688 NA 0.004 0.000
#> SRR661064 1 0.2442 0.6694 0.852 0.000 0.144 NA 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1452718 1 0.4315 0.5902 0.716 0.000 0.012 NA 0.224 0.000
#> SRR1353243 1 0.0935 0.7502 0.964 0.000 0.032 NA 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0508 0.7481 0.984 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0725 0.7493 0.976 0.000 0.012 NA 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.3930 0.0930 0.576 0.000 0.420 NA 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.3601 0.4610 0.684 0.000 0.312 NA 0.004 0.000
#> SRR1317470 3 0.4095 0.5063 0.060 0.000 0.724 NA 0.000 0.000
#> SRR1337707 3 0.3526 0.6160 0.088 0.000 0.828 NA 0.056 0.000
#> SRR1408752 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1474617 5 0.1320 0.7250 0.000 0.000 0.016 NA 0.948 0.000
#> SRR1398013 3 0.4230 0.5253 0.364 0.000 0.612 NA 0.000 0.000
#> SRR1352918 3 0.4836 0.5055 0.104 0.000 0.664 NA 0.004 0.000
#> SRR1420750 1 0.2006 0.7225 0.892 0.000 0.104 NA 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.4232 0.4902 0.028 0.000 0.716 NA 0.236 0.000
#> SRR1353618 2 0.1082 0.5760 0.000 0.956 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1082217 2 0.2003 0.5394 0.000 0.884 0.000 NA 0.000 0.116
#> SRR1357256 2 0.4277 0.5435 0.000 0.732 0.000 NA 0.000 0.124
#> SRR1490313 3 0.4010 0.4442 0.408 0.000 0.584 NA 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0508 0.7477 0.984 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0603 0.7464 0.980 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.5273 0.5798 0.000 0.000 0.212 NA 0.604 0.000
#> SRR1313494 1 0.3756 0.0903 0.600 0.000 0.400 NA 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.3464 0.4567 0.688 0.000 0.312 NA 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.1003 0.7368 0.964 0.000 0.004 NA 0.004 0.000
#> SRR1333789 3 0.3955 0.3757 0.436 0.000 0.560 NA 0.000 0.000
#> SRR1400078 3 0.3742 0.5389 0.348 0.000 0.648 NA 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1092842 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR615575 3 0.4076 0.4342 0.396 0.000 0.592 NA 0.000 0.000
#> SRR1079434 3 0.4255 0.5044 0.068 0.000 0.708 NA 0.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.2964 0.6270 0.792 0.000 0.204 NA 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.4503 0.5251 0.100 0.000 0.696 NA 0.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.3313 0.5656 0.820 0.000 0.024 NA 0.016 0.000
#> SRR1396100 3 0.4740 0.5084 0.108 0.000 0.664 NA 0.000 0.000
#> SRR1475697 3 0.5216 0.6076 0.204 0.000 0.672 NA 0.052 0.000
#> SRR1488067 6 0.3555 0.8066 0.000 0.280 0.000 NA 0.000 0.712
#> SRR1102103 2 0.1865 0.5631 0.000 0.920 0.000 NA 0.000 0.040
#> SRR1105154 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1084991 6 0.4002 0.7893 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.704
#> SRR1410380 3 0.3773 0.5083 0.044 0.000 0.752 NA 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.1196 0.5784 0.000 0.952 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1454671 2 0.0363 0.5874 0.000 0.988 0.000 NA 0.000 0.012
#> SRR1435044 3 0.3975 0.4468 0.392 0.000 0.600 NA 0.000 0.000
#> SRR1485812 3 0.4123 0.5907 0.072 0.000 0.792 NA 0.076 0.000
#> SRR1078020 2 0.3587 0.4818 0.000 0.772 0.000 NA 0.000 0.188
#> SRR1311153 1 0.2412 0.6940 0.880 0.000 0.092 NA 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.5616 0.4891 0.000 0.492 0.000 NA 0.000 0.156
#> SRR1343898 3 0.5841 -0.3054 0.000 0.000 0.464 NA 0.332 0.000
#> SRR807775 3 0.3947 0.6376 0.116 0.000 0.780 NA 0.008 0.000
#> SRR1409215 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR820427 3 0.4255 0.4990 0.068 0.000 0.708 NA 0.000 0.000
#> SRR1100656 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1362159 1 0.0508 0.7461 0.984 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1414536 3 0.4582 0.5159 0.100 0.000 0.684 NA 0.000 0.000
#> SRR656794 1 0.5376 0.0266 0.480 0.000 0.408 NA 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0935 0.7368 0.964 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1317685 3 0.4516 0.5159 0.068 0.000 0.724 NA 0.020 0.000
#> SRR1485912 3 0.3847 0.3294 0.456 0.000 0.544 NA 0.000 0.000
#> SRR1407602 3 0.5373 0.4641 0.076 0.000 0.656 NA 0.056 0.000
#> SRR1356164 5 0.5207 0.6873 0.016 0.000 0.236 NA 0.640 0.000
#> SRR1328692 5 0.5968 0.3658 0.048 0.000 0.404 NA 0.468 0.000
#> SRR1362438 1 0.3104 0.5938 0.788 0.000 0.204 NA 0.004 0.000
#> SRR1479216 3 0.2890 0.6378 0.124 0.000 0.848 NA 0.012 0.000
#> SRR1358041 1 0.2762 0.6317 0.804 0.000 0.196 NA 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.4218 0.4367 0.400 0.000 0.584 NA 0.004 0.000
#> SRR1368200 3 0.4481 0.3060 0.456 0.000 0.520 NA 0.008 0.000
#> SRR1435602 2 0.5564 0.4928 0.000 0.500 0.000 NA 0.000 0.148
#> SRR1501043 3 0.5520 0.0296 0.000 0.000 0.560 NA 0.240 0.000
#> SRR1437256 3 0.4479 0.6192 0.116 0.000 0.744 NA 0.120 0.000
#> SRR1487446 3 0.3795 0.4888 0.364 0.000 0.632 NA 0.004 0.000
#> SRR816653 1 0.2191 0.7139 0.876 0.000 0.120 NA 0.000 0.000
#> SRR815164 3 0.4184 0.3302 0.432 0.000 0.556 NA 0.004 0.000
#> SRR1442043 3 0.4399 0.3664 0.460 0.000 0.516 NA 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.1010 0.7349 0.960 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1096782 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1352369 3 0.4326 0.4547 0.368 0.000 0.608 NA 0.008 0.000
#> SRR1382934 3 0.4105 0.3518 0.000 0.000 0.632 NA 0.348 0.000
#> SRR1465208 1 0.0790 0.7499 0.968 0.000 0.032 NA 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.3927 0.3201 0.644 0.000 0.344 NA 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0603 0.7469 0.980 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.3488 0.5913 0.244 0.000 0.744 NA 0.008 0.000
#> SRR1409600 3 0.4136 0.3466 0.428 0.000 0.560 NA 0.000 0.000
#> SRR816123 6 0.3629 0.6319 0.000 0.276 0.000 NA 0.000 0.712
#> SRR614779 3 0.5078 0.5266 0.160 0.000 0.632 NA 0.000 0.000
#> SRR810783 3 0.3991 0.2910 0.472 0.000 0.524 NA 0.004 0.000
#> SRR1333990 1 0.0363 0.7502 0.988 0.000 0.012 NA 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.4315 0.1952 0.492 0.000 0.492 NA 0.004 0.000
#> SRR808106 3 0.5429 0.4394 0.188 0.000 0.576 NA 0.000 0.000
#> SRR662713 1 0.4297 -0.0551 0.532 0.000 0.452 NA 0.004 0.000
#> SRR1447058 2 0.3555 0.4845 0.000 0.776 0.000 NA 0.000 0.184
#> SRR1480964 3 0.4024 0.4343 0.400 0.000 0.592 NA 0.004 0.000
#> SRR809382 3 0.4176 0.5404 0.044 0.000 0.740 NA 0.200 0.000
#> SRR665417 1 0.5548 0.0991 0.520 0.000 0.020 NA 0.376 0.000
#> SRR1088016 2 0.3337 0.4268 0.000 0.736 0.000 NA 0.000 0.260
#> SRR1453166 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1069826 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1077781 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR615623 3 0.4354 0.4844 0.028 0.000 0.684 NA 0.272 0.000
#> SRR1413787 3 0.3804 0.4730 0.020 0.000 0.748 NA 0.012 0.000
#> SRR1478207 3 0.3499 0.5860 0.264 0.000 0.728 NA 0.004 0.000
#> SRR1411046 1 0.1080 0.7389 0.960 0.000 0.004 NA 0.004 0.000
#> SRR1313711 2 0.4774 0.5317 0.000 0.672 0.000 NA 0.000 0.136
#> SRR1326560 1 0.0806 0.7510 0.972 0.000 0.020 NA 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0717 0.7504 0.976 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.4067 0.3878 0.000 0.700 0.000 NA 0.000 0.260
#> SRR1395616 1 0.0520 0.7492 0.984 0.000 0.008 NA 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.2883 0.6001 0.000 0.212 0.000 NA 0.000 0.788
#> SRR1092961 6 0.2830 0.4694 0.000 0.144 0.000 NA 0.000 0.836
#> SRR817210 3 0.4341 0.4723 0.356 0.000 0.616 NA 0.004 0.000
#> SRR1319221 5 0.1320 0.7250 0.000 0.000 0.016 NA 0.948 0.000
#> SRR1405413 1 0.3930 0.0619 0.576 0.000 0.420 NA 0.000 0.000
#> SRR607807 5 0.6470 0.5076 0.308 0.000 0.028 NA 0.440 0.000
#> SRR1390160 3 0.3998 0.5006 0.024 0.000 0.736 NA 0.224 0.000
#> SRR1406283 1 0.3738 0.4890 0.704 0.000 0.280 NA 0.000 0.000
#> SRR1357709 3 0.4260 0.5233 0.332 0.000 0.640 NA 0.004 0.000
#> SRR1080742 6 0.3394 0.6076 0.000 0.236 0.000 NA 0.000 0.752
#> SRR1468208 1 0.2791 0.6166 0.852 0.000 0.008 NA 0.016 0.000
#> SRR1312766 3 0.4227 0.2135 0.488 0.000 0.500 NA 0.004 0.000
#> SRR1361612 1 0.1765 0.7284 0.904 0.000 0.096 NA 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.1644 0.7327 0.920 0.000 0.076 NA 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.5076 0.2870 0.456 0.000 0.476 NA 0.004 0.000
#> SRR1099720 6 0.4814 0.6569 0.000 0.304 0.000 NA 0.000 0.616
#> SRR1349250 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1350912 2 0.3848 0.4480 0.000 0.736 0.000 NA 0.000 0.224
#> SRR1357127 3 0.3864 0.5206 0.344 0.000 0.648 NA 0.004 0.000
#> SRR1074980 2 0.2219 0.5292 0.000 0.864 0.000 NA 0.000 0.136
#> SRR1317022 3 0.4028 0.5156 0.036 0.000 0.732 NA 0.224 0.000
#> SRR1332879 1 0.1918 0.7256 0.904 0.000 0.088 NA 0.000 0.000
#> SRR1403177 5 0.6044 0.6322 0.004 0.000 0.024 NA 0.528 0.136
#> SRR1076144 2 0.5616 0.4884 0.000 0.492 0.000 NA 0.000 0.156
#> SRR1069614 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR818239 6 0.3221 0.8140 0.000 0.264 0.000 NA 0.000 0.736
#> SRR1421069 6 0.3221 0.8140 0.000 0.264 0.000 NA 0.000 0.736
#> SRR1500006 1 0.1493 0.7177 0.936 0.000 0.004 NA 0.004 0.000
#> SRR1485678 3 0.5197 0.4816 0.332 0.000 0.560 NA 0.000 0.000
#> SRR1092232 3 0.3265 0.5150 0.008 0.000 0.836 NA 0.088 0.000
#> SRR1344253 3 0.4769 0.5048 0.084 0.000 0.672 NA 0.008 0.000
#> SRR1384290 1 0.1296 0.7301 0.948 0.000 0.004 NA 0.004 0.000
#> SRR1089349 3 0.5212 0.4972 0.324 0.000 0.592 NA 0.024 0.000
#> SRR1343522 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1326727 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1440940 3 0.3144 0.6366 0.172 0.000 0.808 NA 0.004 0.000
#> SRR818372 3 0.2703 0.6352 0.172 0.000 0.824 NA 0.004 0.000
#> SRR1323675 2 0.2092 0.5345 0.000 0.876 0.000 NA 0.000 0.124
#> SRR819894 3 0.4836 0.4987 0.104 0.000 0.664 NA 0.004 0.000
#> SRR1310031 3 0.4334 0.6082 0.116 0.000 0.736 NA 0.144 0.000
#> SRR615419 3 0.3239 0.6377 0.164 0.000 0.808 NA 0.004 0.000
#> SRR1436925 1 0.3998 -0.1921 0.504 0.000 0.492 NA 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.1728 0.7232 0.924 0.000 0.008 NA 0.004 0.000
#> SRR1332566 1 0.1663 0.7207 0.912 0.000 0.088 NA 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.3619 0.5525 0.316 0.000 0.680 NA 0.004 0.000
#> SRR1442949 3 0.4608 0.5126 0.100 0.000 0.680 NA 0.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.0291 0.7495 0.992 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1329971 1 0.2941 0.6141 0.780 0.000 0.220 NA 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0260 0.5873 0.000 0.992 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1097642 6 0.4045 0.7811 0.000 0.268 0.000 NA 0.000 0.696
#> SRR1322981 1 0.4227 -0.1938 0.496 0.000 0.492 NA 0.004 0.000
#> SRR1485976 2 0.4871 0.5305 0.000 0.656 0.000 NA 0.000 0.132
#> SRR1471713 3 0.4322 0.5969 0.108 0.000 0.736 NA 0.152 0.000
#> SRR660522 3 0.4014 0.5820 0.268 0.000 0.704 NA 0.012 0.000
#> SRR815374 3 0.3769 0.4989 0.356 0.000 0.640 NA 0.004 0.000
#> SRR1069564 6 0.3629 0.6319 0.000 0.276 0.000 NA 0.000 0.712
#> SRR1416337 3 0.5102 0.5261 0.160 0.000 0.628 NA 0.000 0.000
#> SRR1316438 3 0.4167 0.3062 0.000 0.000 0.708 NA 0.236 0.000
#> SRR1386844 1 0.0405 0.7490 0.988 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.1471 0.7166 0.932 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.5883 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0820 0.7519 0.972 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.2527 0.5404 0.000 0.876 0.000 NA 0.000 0.084
#> SRR1069919 2 0.5508 0.4948 0.000 0.508 0.000 NA 0.000 0.140
#> SRR1460296 1 0.1225 0.7500 0.952 0.000 0.036 NA 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.2667 0.6961 0.852 0.000 0.128 NA 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.1297 0.5739 0.000 0.948 0.000 NA 0.000 0.012
#> SRR1081425 1 0.1010 0.7354 0.960 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1401815 3 0.3587 0.4739 0.000 0.000 0.772 NA 0.188 0.000
#> SRR1071337 2 0.3848 0.4480 0.000 0.736 0.000 NA 0.000 0.224
#> SRR1071983 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1331793 2 0.1204 0.5819 0.000 0.944 0.000 NA 0.000 0.056
#> SRR1410510 3 0.2905 0.6362 0.144 0.000 0.836 NA 0.008 0.000
#> SRR1098761 6 0.3799 0.6278 0.000 0.276 0.000 NA 0.000 0.704
#> SRR1312124 1 0.3337 0.4766 0.736 0.000 0.260 NA 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.3634 0.4820 0.696 0.000 0.296 NA 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0937 0.7479 0.960 0.000 0.040 NA 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.5207 0.3493 0.432 0.000 0.492 NA 0.008 0.000
#> SRR1089054 2 0.3101 0.4550 0.000 0.756 0.000 NA 0.000 0.244
#> SRR816201 3 0.3429 0.6064 0.252 0.000 0.740 NA 0.004 0.000
#> SRR1488514 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR655840 3 0.4294 0.4368 0.428 0.000 0.552 NA 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0260 0.7500 0.992 0.000 0.008 NA 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.4780 0.4998 0.112 0.000 0.660 NA 0.000 0.000
#> SRR613174 3 0.4249 0.3951 0.416 0.000 0.568 NA 0.004 0.000
#> SRR1351125 3 0.4062 0.3157 0.440 0.000 0.552 NA 0.000 0.000
#> SRR659157 3 0.3473 0.6391 0.144 0.000 0.804 NA 0.004 0.000
#> SRR1480408 3 0.4095 0.2979 0.480 0.000 0.512 NA 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.4570 -0.1561 0.528 0.000 0.436 NA 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1332526 1 0.4169 -0.1494 0.532 0.000 0.456 NA 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.2790 0.4618 0.000 0.140 0.000 NA 0.000 0.840
#> SRR1431270 3 0.3748 0.5867 0.112 0.000 0.792 NA 0.004 0.000
#> SRR1085614 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1330106 3 0.3499 0.5866 0.264 0.000 0.728 NA 0.004 0.000
#> SRR1466154 1 0.0692 0.7452 0.976 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.2822 0.6475 0.856 0.000 0.004 NA 0.032 0.000
#> SRR1082784 2 0.4474 0.5417 0.000 0.708 0.000 NA 0.000 0.120
#> SRR1457267 1 0.1471 0.7168 0.932 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR614659 3 0.4080 0.3415 0.456 0.000 0.536 NA 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.3986 0.3226 0.464 0.000 0.532 NA 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0146 0.7497 0.996 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.3078 0.6413 0.796 0.000 0.192 NA 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0777 0.7438 0.972 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.1092 0.5872 0.000 0.960 0.000 NA 0.000 0.020
#> SRR1096363 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1453662 1 0.4096 -0.1980 0.508 0.000 0.484 NA 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0146 0.5884 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1353499 1 0.0806 0.7498 0.972 0.000 0.008 NA 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.1897 0.6954 0.908 0.000 0.004 NA 0.004 0.000
#> SRR1070841 3 0.3976 0.4689 0.380 0.000 0.612 NA 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.1010 0.7349 0.960 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1333125 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1498183 1 0.2048 0.7122 0.880 0.000 0.120 NA 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.4382 0.6134 0.200 0.000 0.716 NA 0.080 0.000
#> SRR1447148 2 0.3555 0.4845 0.000 0.776 0.000 NA 0.000 0.184
#> SRR658597 6 0.3175 0.8167 0.000 0.256 0.000 NA 0.000 0.744
#> SRR1089595 6 0.4045 0.7811 0.000 0.268 0.000 NA 0.000 0.696
#> SRR1074263 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1376786 1 0.4069 0.2561 0.612 0.000 0.376 NA 0.004 0.000
#> SRR1345995 1 0.4150 0.1781 0.592 0.000 0.392 NA 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.4098 0.4358 0.676 0.000 0.292 NA 0.000 0.000
#> SRR1068808 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1332754 2 0.3618 0.4785 0.000 0.768 0.000 NA 0.000 0.192
#> SRR662438 1 0.1643 0.7216 0.924 0.000 0.068 NA 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0777 0.7397 0.972 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR659448 3 0.4046 0.4867 0.368 0.000 0.620 NA 0.004 0.000
#> SRR1323558 3 0.2755 0.6368 0.140 0.000 0.844 NA 0.004 0.000
#> SRR1381711 3 0.4254 0.5085 0.072 0.000 0.712 NA 0.000 0.000
#> SRR657985 3 0.3825 0.4909 0.032 0.000 0.744 NA 0.004 0.000
#> SRR1314810 1 0.3652 0.5188 0.720 0.000 0.264 NA 0.000 0.000
#> SRR1336505 3 0.3656 0.5910 0.256 0.000 0.728 NA 0.004 0.000
#> SRR1474095 1 0.4165 -0.0554 0.536 0.000 0.452 NA 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.3213 0.5490 0.000 0.820 0.000 NA 0.000 0.132
#> SRR1442376 3 0.4453 0.3894 0.444 0.000 0.528 NA 0.000 0.000
#> SRR1074909 6 0.3175 0.8167 0.000 0.256 0.000 NA 0.000 0.744
#> SRR1101200 1 0.4109 0.2104 0.596 0.000 0.392 NA 0.004 0.000
#> SRR1075408 2 0.1564 0.5696 0.000 0.936 0.000 NA 0.000 0.024
#> SRR1367150 3 0.4716 0.5123 0.108 0.000 0.668 NA 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.3555 0.4845 0.000 0.776 0.000 NA 0.000 0.184
#> SRR1068880 2 0.3555 0.4845 0.000 0.776 0.000 NA 0.000 0.184
#> SRR1467277 3 0.4402 0.5152 0.084 0.000 0.700 NA 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.3555 0.4845 0.000 0.776 0.000 NA 0.000 0.184
#> SRR1095431 6 0.2912 0.6449 0.000 0.216 0.000 NA 0.000 0.784
#> SRR1380184 2 0.0146 0.5884 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1443113 1 0.3650 0.4955 0.708 0.000 0.280 NA 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.5066 0.5327 0.276 0.000 0.608 NA 0.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.1663 0.7148 0.912 0.000 0.088 NA 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1421116 2 0.0000 0.5883 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR602282 5 0.1625 0.7280 0.000 0.000 0.060 NA 0.928 0.000
#> SRR1361195 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR600493 1 0.2454 0.6801 0.840 0.000 0.160 NA 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.4015 0.2717 0.616 0.000 0.372 NA 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.4135 0.4287 0.404 0.000 0.584 NA 0.004 0.000
#> SRR1360785 3 0.4858 0.5061 0.120 0.000 0.652 NA 0.000 0.000
#> SRR810437 3 0.3852 0.5989 0.240 0.000 0.732 NA 0.012 0.000
#> SRR1361860 3 0.5432 0.4835 0.344 0.000 0.536 NA 0.004 0.000
#> SRR1441311 2 0.2867 0.5587 0.000 0.848 0.000 NA 0.000 0.112
#> SRR1098903 3 0.4740 0.5084 0.108 0.000 0.664 NA 0.000 0.000
#> SRR1457619 3 0.3997 0.2710 0.488 0.000 0.508 NA 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.2378 0.6854 0.848 0.000 0.152 NA 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.1007 0.5848 0.000 0.956 0.000 NA 0.000 0.044
#> SRR1074017 2 0.5971 0.3372 0.000 0.424 0.000 NA 0.000 0.232
#> SRR1472033 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1445087 3 0.3226 0.5287 0.020 0.000 0.836 NA 0.116 0.000
#> SRR1399525 6 0.5882 0.1532 0.000 0.380 0.000 NA 0.000 0.420
#> SRR1312844 6 0.3795 0.6911 0.000 0.364 0.000 NA 0.000 0.632
#> SRR1085874 6 0.3650 0.6348 0.000 0.280 0.000 NA 0.000 0.708
#> SRR1101226 6 0.3522 0.4520 0.000 0.128 0.000 NA 0.012 0.812
#> SRR1476056 1 0.3374 0.5511 0.772 0.000 0.208 NA 0.000 0.000
#> SRR1075659 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1311916 3 0.4298 0.5803 0.088 0.000 0.732 NA 0.176 0.000
#> SRR1353353 3 0.4473 -0.0289 0.000 0.000 0.488 NA 0.484 0.000
#> SRR1073291 3 0.4230 0.4370 0.400 0.000 0.584 NA 0.008 0.000
#> SRR1356227 1 0.0632 0.7500 0.976 0.000 0.024 NA 0.000 0.000
#> SRR1080720 6 0.4045 0.7811 0.000 0.268 0.000 NA 0.000 0.696
#> SRR1091695 6 0.3175 0.8167 0.000 0.256 0.000 NA 0.000 0.744
#> SRR1350304 3 0.4794 0.4998 0.100 0.000 0.668 NA 0.004 0.000
#> SRR663002 3 0.4341 0.6136 0.124 0.000 0.736 NA 0.136 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.5883 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0551 0.7481 0.984 0.000 0.004 NA 0.004 0.000
#> SRR1347144 3 0.4326 0.5870 0.096 0.000 0.732 NA 0.168 0.000
#> SRR1384006 1 0.0820 0.7501 0.972 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.3288 0.6385 0.000 0.276 0.000 NA 0.000 0.724
#> SRR614047 3 0.3741 0.5299 0.320 0.000 0.672 NA 0.000 0.000
#> SRR818440 3 0.3975 0.4504 0.392 0.000 0.600 NA 0.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.3784 0.3770 0.680 0.000 0.308 NA 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.4282 0.3445 0.420 0.000 0.560 NA 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0260 0.5873 0.000 0.992 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1473959 3 0.3769 0.5113 0.356 0.000 0.640 NA 0.004 0.000
#> SRR1074041 3 0.4268 0.3787 0.428 0.000 0.556 NA 0.004 0.000
#> SRR1394495 2 0.0935 0.5807 0.000 0.964 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR659460 3 0.4214 0.3039 0.460 0.000 0.528 NA 0.004 0.000
#> SRR816699 3 0.4256 0.3893 0.420 0.000 0.564 NA 0.004 0.000
#> SRR1308612 3 0.3756 0.5505 0.316 0.000 0.676 NA 0.004 0.000
#> SRR1499418 3 0.3586 0.4967 0.028 0.000 0.756 NA 0.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.0937 0.5769 0.000 0.960 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.3734 0.5338 0.716 0.000 0.264 NA 0.000 0.000
#> SRR1331083 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR808272 3 0.3512 0.5820 0.272 0.000 0.720 NA 0.008 0.000
#> SRR1436698 1 0.3376 0.5852 0.764 0.000 0.220 NA 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.3629 0.6319 0.000 0.276 0.000 NA 0.000 0.712
#> SRR1357672 3 0.4466 0.6051 0.176 0.000 0.708 NA 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0935 0.7368 0.964 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1077479 1 0.2333 0.7061 0.884 0.000 0.092 NA 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.4740 0.5084 0.108 0.000 0.664 NA 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1436004 1 0.1700 0.7306 0.916 0.000 0.080 NA 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1078998 2 0.3555 0.4845 0.000 0.776 0.000 NA 0.000 0.184
#> SRR1314707 1 0.3956 0.4420 0.704 0.000 0.264 NA 0.000 0.000
#> SRR1309534 3 0.4118 0.5760 0.312 0.000 0.660 NA 0.000 0.000
#> SRR615527 5 0.2009 0.7256 0.000 0.000 0.068 NA 0.908 0.000
#> SRR1098216 1 0.0458 0.7506 0.984 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR1325847 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1404003 3 0.4095 0.3019 0.480 0.000 0.512 NA 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.3314 0.5427 0.740 0.000 0.256 NA 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.4740 0.5084 0.108 0.000 0.664 NA 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.3555 0.4845 0.000 0.776 0.000 NA 0.000 0.184
#> SRR1079237 6 0.3541 0.8092 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.728
#> SRR1080509 2 0.4393 0.5369 0.000 0.720 0.000 NA 0.000 0.140
#> SRR815759 3 0.4716 0.5123 0.108 0.000 0.668 NA 0.000 0.000
#> SRR1502143 3 0.4109 0.4453 0.392 0.000 0.596 NA 0.004 0.000
#> SRR1487614 3 0.3084 0.5164 0.008 0.000 0.832 NA 0.136 0.000
#> SRR1402307 2 0.0146 0.5886 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR820810 3 0.3991 0.2891 0.472 0.000 0.524 NA 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1083215 1 0.4242 -0.0250 0.536 0.000 0.448 NA 0.000 0.000
#> SRR1476547 6 0.4045 0.7811 0.000 0.268 0.000 NA 0.000 0.696
#> SRR656421 3 0.5667 0.4174 0.264 0.000 0.528 NA 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.2048 0.5369 0.000 0.880 0.000 NA 0.000 0.120
#> SRR1499917 3 0.3448 0.5829 0.280 0.000 0.716 NA 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.4468 0.5396 0.000 0.684 0.000 NA 0.012 0.044
#> SRR1391444 2 0.5336 0.5121 0.000 0.572 0.000 NA 0.000 0.144
#> SRR1434889 3 0.3915 0.4490 0.412 0.000 0.584 NA 0.000 0.000
#> SRR1431847 3 0.3976 0.4650 0.020 0.000 0.740 NA 0.020 0.000
#> SRR1317155 3 0.5388 0.5797 0.240 0.000 0.640 NA 0.056 0.000
#> SRR1477405 1 0.1411 0.7195 0.936 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR655289 3 0.4613 0.5245 0.116 0.000 0.688 NA 0.000 0.000
#> SRR1341683 3 0.3732 0.6069 0.228 0.000 0.744 NA 0.004 0.000
#> SRR1084790 3 0.5053 0.5347 0.160 0.000 0.636 NA 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.3351 0.5695 0.288 0.000 0.712 NA 0.000 0.000
#> SRR1332588 3 0.4732 0.5082 0.112 0.000 0.668 NA 0.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.1007 0.5848 0.000 0.956 0.000 NA 0.000 0.044
#> SRR654945 3 0.3899 0.4764 0.364 0.000 0.628 NA 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0865 0.7497 0.964 0.000 0.036 NA 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1101152 3 0.3878 0.5085 0.348 0.000 0.644 NA 0.004 0.000
#> SRR1358435 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR2165273 1 0.1155 0.7338 0.956 0.000 0.004 NA 0.004 0.000
#> SRR1379014 1 0.0713 0.7504 0.972 0.000 0.028 NA 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.4303 0.6145 0.124 0.000 0.740 NA 0.132 0.000
#> SRR1416386 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1406048 1 0.1765 0.7214 0.904 0.000 0.096 NA 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.4332 0.5032 0.072 0.000 0.700 NA 0.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.1285 0.7243 0.944 0.000 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1312934 3 0.3189 0.6163 0.236 0.000 0.760 NA 0.004 0.000
#> SRR655194 1 0.2730 0.6564 0.836 0.000 0.152 NA 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1473251 6 0.4045 0.7811 0.000 0.268 0.000 NA 0.000 0.696
#> SRR1389820 5 0.1320 0.7250 0.000 0.000 0.016 NA 0.948 0.000
#> SRR1074289 3 0.4289 0.3536 0.444 0.000 0.540 NA 0.004 0.000
#> SRR1348816 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1076292 3 0.3831 0.5784 0.268 0.000 0.712 NA 0.012 0.000
#> SRR1395810 2 0.5364 0.5075 0.000 0.572 0.000 NA 0.000 0.152
#> SRR1498909 3 0.3584 0.5636 0.308 0.000 0.688 NA 0.004 0.000
#> SRR1443507 1 0.4096 -0.1514 0.508 0.000 0.484 NA 0.000 0.000
#> SRR1452310 3 0.3979 0.4946 0.360 0.000 0.628 NA 0.000 0.000
#> SRR665610 3 0.3915 0.5902 0.272 0.000 0.704 NA 0.004 0.000
#> SRR1347322 1 0.1074 0.7513 0.960 0.000 0.028 NA 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.3432 0.5827 0.000 0.216 0.000 NA 0.000 0.764
#> SRR1477256 1 0.1644 0.7489 0.932 0.000 0.040 NA 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.3825 0.4939 0.032 0.000 0.744 NA 0.004 0.000
#> SRR1354247 1 0.0717 0.7504 0.976 0.000 0.016 NA 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.3950 0.4225 0.000 0.720 0.000 NA 0.000 0.240
#> SRR1487592 3 0.4184 0.1680 0.488 0.000 0.500 NA 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.3674 0.5104 0.716 0.000 0.268 NA 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1434117 3 0.5646 0.3726 0.388 0.000 0.500 NA 0.020 0.000
#> SRR1075273 6 0.3789 0.8006 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.716
#> SRR658657 3 0.4402 0.5142 0.084 0.000 0.700 NA 0.000 0.000
#> SRR1092773 6 0.4749 0.7145 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.648
#> SRR1365332 3 0.4211 0.3047 0.456 0.000 0.532 NA 0.004 0.000
#> SRR615958 3 0.3373 0.5917 0.248 0.000 0.744 NA 0.008 0.000
#> SRR1097688 6 0.3151 0.8155 0.000 0.252 0.000 NA 0.000 0.748
#> SRR1403259 3 0.3976 0.4650 0.020 0.000 0.740 NA 0.020 0.000
#> SRR1099120 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1362200 3 0.4303 0.4973 0.360 0.000 0.616 NA 0.016 0.000
#> SRR1464856 2 0.5642 0.4872 0.000 0.488 0.000 NA 0.000 0.160
#> SRR1347298 3 0.4207 0.4831 0.024 0.000 0.712 NA 0.244 0.000
#> SRR1075923 6 0.3198 0.8173 0.000 0.260 0.000 NA 0.000 0.740
#> SRR1100703 1 0.4175 -0.0873 0.524 0.000 0.464 NA 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.4355 0.565 0.565
#> 3 3 0.803 0.869 0.930 0.3624 0.823 0.688
#> 4 4 0.661 0.747 0.843 0.1238 0.927 0.817
#> 5 5 0.620 0.429 0.702 0.1077 0.962 0.889
#> 6 6 0.655 0.658 0.766 0.0605 0.805 0.453
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398013 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.775 0.705 0.772 0.228
#> SRR1405413 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076144 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075752 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.1031 0.90552 0.976 0.000 0.024
#> SRR1329744 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR657384 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR818573 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410742 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1087968 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1310075 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.3267 0.80095 0.884 0.000 0.116
#> SRR1326821 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1490178 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR655613 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.1860 0.95774 0.000 0.948 0.052
#> SRR1443871 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102489 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414058 3 0.5650 0.78420 0.312 0.000 0.688
#> SRR1407449 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1479109 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1366450 1 0.1163 0.90152 0.972 0.000 0.028
#> SRR1396859 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1080560 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0237 0.92368 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368141 3 0.5968 0.73308 0.364 0.000 0.636
#> SRR1440268 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453725 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR656275 1 0.0237 0.92367 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369052 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.4346 0.70808 0.816 0.000 0.184
#> SRR1404531 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1458890 3 0.5926 0.74212 0.356 0.000 0.644
#> SRR1432695 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1407624 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431969 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1087393 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.5016 0.63337 0.760 0.000 0.240
#> SRR1385211 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.2165 0.77332 0.064 0.000 0.936
#> SRR1318966 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.5968 0.73313 0.364 0.000 0.636
#> SRR603212 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485190 3 0.5254 0.81521 0.264 0.000 0.736
#> SRR1332232 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312645 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.6180 0.65514 0.416 0.000 0.584
#> SRR1465501 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1445064 3 0.6026 0.71794 0.376 0.000 0.624
#> SRR1452981 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397697 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477316 1 0.2165 0.86334 0.936 0.000 0.064
#> SRR1077898 1 0.4346 0.70805 0.816 0.000 0.184
#> SRR1349080 1 0.4796 0.65868 0.780 0.000 0.220
#> SRR1076096 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR811261 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR604414 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0424 0.92049 0.992 0.000 0.008
#> SRR812060 1 0.5650 0.31261 0.688 0.000 0.312
#> SRR602082 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.6215 -0.17860 0.572 0.000 0.428
#> SRR1420710 1 0.0592 0.91604 0.988 0.000 0.012
#> SRR660426 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.5733 0.26906 0.676 0.000 0.324
#> SRR661064 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.2261 0.77433 0.068 0.000 0.932
#> SRR1337707 3 0.5254 0.81521 0.264 0.000 0.736
#> SRR1408752 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.0747 0.71252 0.000 0.016 0.984
#> SRR1398013 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1420750 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.5560 0.79320 0.300 0.000 0.700
#> SRR1353618 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1082217 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357256 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490313 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.0237 0.71697 0.000 0.004 0.996
#> SRR1313494 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.6180 -0.14964 0.584 0.000 0.416
#> SRR1079434 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1325559 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.6026 0.50868 0.376 0.000 0.624
#> SRR1383883 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396100 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1475697 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105154 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.1643 0.96412 0.000 0.956 0.044
#> SRR1410380 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1445490 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454671 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1435044 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485812 3 0.6309 0.46482 0.496 0.000 0.504
#> SRR1078020 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1311153 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1343898 3 0.0424 0.72642 0.008 0.000 0.992
#> SRR807775 3 0.2356 0.77674 0.072 0.000 0.928
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.5760 0.56129 0.328 0.000 0.672
#> SRR1100656 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.2261 0.77433 0.068 0.000 0.932
#> SRR656794 1 0.3551 0.78015 0.868 0.000 0.132
#> SRR604653 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.4291 0.79570 0.180 0.000 0.820
#> SRR1485912 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1356164 1 0.4555 0.62599 0.800 0.000 0.200
#> SRR1328692 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0892 0.90929 0.980 0.000 0.020
#> SRR1479216 3 0.5098 0.81636 0.248 0.000 0.752
#> SRR1358041 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0237 0.92368 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368200 1 0.2356 0.84691 0.928 0.000 0.072
#> SRR1435602 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1501043 3 0.0892 0.73949 0.020 0.000 0.980
#> SRR1437256 3 0.6026 0.71798 0.376 0.000 0.624
#> SRR1487446 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR816653 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR1442043 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.5016 0.53071 0.760 0.000 0.240
#> SRR1382934 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1465208 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.6235 0.61711 0.436 0.000 0.564
#> SRR1409600 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR810783 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.5216 0.58993 0.740 0.000 0.260
#> SRR662713 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480964 1 0.5733 0.26895 0.676 0.000 0.324
#> SRR809382 3 0.6026 0.71807 0.376 0.000 0.624
#> SRR665417 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453166 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1413787 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1478207 3 0.6260 0.59128 0.448 0.000 0.552
#> SRR1411046 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326560 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1395616 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.5254 0.50607 0.736 0.000 0.264
#> SRR1319221 3 0.4682 0.79471 0.192 0.004 0.804
#> SRR1405413 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.6225 0.62519 0.432 0.000 0.568
#> SRR1406283 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312766 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.1643 0.96412 0.000 0.956 0.044
#> SRR1349250 2 0.0424 0.99134 0.000 0.992 0.008
#> SRR1350912 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357127 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317022 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1332879 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.6286 -0.34886 0.536 0.000 0.464
#> SRR1076144 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069614 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.2959 0.82094 0.900 0.000 0.100
#> SRR1092232 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1344253 1 0.6244 0.10441 0.560 0.000 0.440
#> SRR1384290 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.2959 0.83634 0.900 0.000 0.100
#> SRR1343522 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.6140 -0.09581 0.596 0.000 0.404
#> SRR818372 1 0.4235 0.69944 0.824 0.000 0.176
#> SRR1323675 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR819894 1 0.4750 0.66304 0.784 0.000 0.216
#> SRR1310031 3 0.5291 0.81343 0.268 0.000 0.732
#> SRR615419 3 0.5254 0.81521 0.264 0.000 0.736
#> SRR1436925 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.5760 0.25402 0.672 0.000 0.328
#> SRR1442949 3 0.2165 0.77332 0.064 0.000 0.936
#> SRR1466239 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1097642 2 0.1753 0.96095 0.000 0.952 0.048
#> SRR1322981 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471713 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR660522 1 0.5363 0.42994 0.724 0.000 0.276
#> SRR815374 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1316438 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1386844 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487128 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069919 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1460296 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1081425 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1071337 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1410510 3 0.5098 0.81636 0.248 0.000 0.752
#> SRR1098761 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR816201 1 0.1289 0.90170 0.968 0.000 0.032
#> SRR1488514 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.5178 0.70987 0.256 0.000 0.744
#> SRR613174 1 0.6308 -0.43599 0.508 0.000 0.492
#> SRR1351125 1 0.3340 0.77705 0.880 0.000 0.120
#> SRR659157 3 0.5810 0.76287 0.336 0.000 0.664
#> SRR1480408 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332526 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.4974 0.81533 0.236 0.000 0.764
#> SRR1085614 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.6252 -0.26698 0.556 0.000 0.444
#> SRR1466154 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457267 1 0.0237 0.92396 0.996 0.000 0.004
#> SRR614659 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096363 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353499 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.1860 0.87186 0.948 0.000 0.052
#> SRR1380910 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498183 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1447148 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR658597 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.1753 0.96095 0.000 0.952 0.048
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR662438 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.4931 0.55232 0.768 0.000 0.232
#> SRR1323558 3 0.5327 0.81055 0.272 0.000 0.728
#> SRR1381711 3 0.2261 0.77376 0.068 0.000 0.932
#> SRR657985 3 0.2261 0.77433 0.068 0.000 0.932
#> SRR1314810 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.5859 0.18986 0.656 0.000 0.344
#> SRR1474095 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442376 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367150 1 0.4842 0.65235 0.776 0.000 0.224
#> SRR1313406 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068880 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467277 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1084867 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095431 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443113 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.5138 0.75346 0.252 0.000 0.748
#> SRR1315912 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1421116 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR602282 3 0.6126 0.68233 0.400 0.000 0.600
#> SRR1361195 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR600493 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.5706 0.28382 0.680 0.000 0.320
#> SRR1360785 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR810437 3 0.6267 0.58203 0.452 0.000 0.548
#> SRR1361860 1 0.2261 0.85883 0.932 0.000 0.068
#> SRR1441311 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1098903 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1457619 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.5254 0.81521 0.264 0.000 0.736
#> SRR1399525 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1353353 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1073291 3 0.6154 0.66907 0.408 0.000 0.592
#> SRR1356227 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.1964 0.95452 0.000 0.944 0.056
#> SRR1091695 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.5882 0.55509 0.348 0.000 0.652
#> SRR663002 3 0.5678 0.78083 0.316 0.000 0.684
#> SRR1376983 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399926 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1384006 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 3 0.6252 0.60014 0.444 0.000 0.556
#> SRR818440 1 0.2796 0.81961 0.908 0.000 0.092
#> SRR1337770 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473959 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0424 0.91996 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394495 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR659460 1 0.0237 0.92367 0.996 0.000 0.004
#> SRR816699 1 0.5733 0.26996 0.676 0.000 0.324
#> SRR1308612 3 0.6302 0.51102 0.480 0.000 0.520
#> SRR1499418 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1352894 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR815805 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.5291 0.81343 0.268 0.000 0.732
#> SRR1436698 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.4504 0.69039 0.804 0.000 0.196
#> SRR1351236 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1314707 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1098216 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.4605 0.67934 0.796 0.000 0.204
#> SRR1431429 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1079237 2 0.0892 0.98259 0.000 0.980 0.020
#> SRR1080509 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR815759 3 0.2261 0.77433 0.068 0.000 0.932
#> SRR1502143 1 0.2165 0.85710 0.936 0.000 0.064
#> SRR1487614 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1402307 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR820810 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.1964 0.95452 0.000 0.944 0.056
#> SRR656421 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1086116 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499917 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1391444 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1434889 1 0.0424 0.91995 0.992 0.000 0.008
#> SRR1431847 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1317155 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.3192 0.80601 0.888 0.000 0.112
#> SRR1341683 3 0.6299 0.52273 0.476 0.000 0.524
#> SRR1084790 1 0.4555 0.68442 0.800 0.000 0.200
#> SRR1073731 1 0.2959 0.80775 0.900 0.000 0.100
#> SRR1332588 3 0.6126 0.47351 0.400 0.000 0.600
#> SRR1471157 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR654945 1 0.2711 0.82519 0.912 0.000 0.088
#> SRR661028 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101152 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.6215 0.63290 0.428 0.000 0.572
#> SRR1416386 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.3340 0.77207 0.120 0.000 0.880
#> SRR1358082 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.6062 0.00451 0.616 0.000 0.384
#> SRR655194 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473251 2 0.1964 0.95452 0.000 0.944 0.056
#> SRR1389820 3 0.0747 0.71252 0.000 0.016 0.984
#> SRR1074289 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.5948 0.12039 0.640 0.000 0.360
#> SRR1395810 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498909 3 0.6252 0.60014 0.444 0.000 0.556
#> SRR1443507 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0747 0.91308 0.984 0.000 0.016
#> SRR1347322 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.2165 0.77332 0.064 0.000 0.936
#> SRR1354247 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487592 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.5621 0.74905 0.308 0.000 0.692
#> SRR1075273 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1092773 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.5291 0.81343 0.268 0.000 0.732
#> SRR1097688 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.2066 0.77192 0.060 0.000 0.940
#> SRR1099120 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.6079 0.70087 0.388 0.000 0.612
#> SRR1464856 2 0.0237 0.99620 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347298 3 0.5216 0.81642 0.260 0.000 0.740
#> SRR1075923 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.92711 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.2179 0.832101 0.924 0.000 0.012 0.064
#> SRR1436370 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1397949 1 0.0921 0.858084 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1355723 1 0.3583 0.721418 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1329744 1 0.4008 0.613695 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR657384 1 0.0592 0.855634 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1351190 1 0.1388 0.857223 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1458662 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0188 0.859664 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396017 1 0.3444 0.712686 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1410742 1 0.2737 0.798947 0.888 0.000 0.008 0.104
#> SRR1435963 1 0.0707 0.854168 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1382416 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.5040 0.537790 0.364 0.000 0.008 0.628
#> SRR1087968 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312244 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325138 4 0.5163 0.328739 0.480 0.000 0.004 0.516
#> SRR1326821 4 0.5099 0.519500 0.380 0.000 0.008 0.612
#> SRR1490178 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.1661 0.851148 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1075707 2 0.4456 0.859051 0.000 0.716 0.004 0.280
#> SRR1443871 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.4134 0.871476 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1465758 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.4194 0.715613 0.228 0.000 0.764 0.008
#> SRR1407449 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436858 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.3280 0.805654 0.860 0.000 0.124 0.016
#> SRR1399069 4 0.4855 0.544766 0.352 0.000 0.004 0.644
#> SRR1366450 1 0.2973 0.826005 0.884 0.000 0.096 0.020
#> SRR1396859 1 0.1867 0.823924 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1457176 1 0.1637 0.849386 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1097666 2 0.4040 0.875397 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1434736 4 0.5252 0.558324 0.336 0.000 0.020 0.644
#> SRR1080560 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1322882 1 0.1970 0.846736 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR1435688 2 0.3219 0.885929 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1327614 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.5809 0.556921 0.692 0.000 0.092 0.216
#> SRR1368141 3 0.5627 0.701826 0.240 0.000 0.692 0.068
#> SRR1440268 1 0.3444 0.712036 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1453725 1 0.2281 0.833400 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1325711 2 0.2814 0.888223 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1477930 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477591 1 0.1970 0.846736 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR1416049 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.3402 0.740039 0.832 0.000 0.164 0.004
#> SRR1369052 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1377735 1 0.1576 0.852546 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1331244 4 0.4898 0.482363 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1404531 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 4 0.4948 0.445785 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1458890 3 0.5851 0.694046 0.236 0.000 0.680 0.084
#> SRR1432695 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.2976 0.644271 0.120 0.000 0.872 0.008
#> SRR1087393 2 0.4134 0.871476 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1077263 4 0.6386 0.606181 0.140 0.000 0.212 0.648
#> SRR1385211 1 0.0336 0.859821 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR655241 1 0.1792 0.827034 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR656922 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 4 0.5112 0.449699 0.004 0.000 0.436 0.560
#> SRR1318966 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1407087 3 0.4372 0.699488 0.268 0.000 0.728 0.004
#> SRR603212 1 0.2654 0.823582 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1321088 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.4426 0.711230 0.204 0.000 0.772 0.024
#> SRR1332232 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.2469 0.794235 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1457835 1 0.1940 0.843524 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1347123 3 0.3975 0.714433 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1465501 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1330878 3 0.0804 0.487441 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1445064 3 0.5705 0.698525 0.260 0.000 0.676 0.064
#> SRR1452981 1 0.2921 0.763954 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1326708 1 0.1635 0.853050 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1407157 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.4008 0.612313 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1077898 1 0.4605 0.259294 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1349080 4 0.6050 0.607398 0.232 0.000 0.100 0.668
#> SRR1076096 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.4008 0.876273 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1375485 1 0.1211 0.858717 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.1970 0.846736 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR1380614 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812060 1 0.5285 -0.172908 0.524 0.000 0.468 0.008
#> SRR602082 1 0.0336 0.859791 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1069490 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1078417 2 0.2081 0.890625 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR661613 3 0.5399 0.335602 0.468 0.000 0.520 0.012
#> SRR1420710 1 0.5265 0.629450 0.748 0.000 0.160 0.092
#> SRR660426 1 0.1635 0.853050 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1416003 1 0.6077 -0.304081 0.496 0.000 0.460 0.044
#> SRR661064 1 0.2921 0.763187 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1082011 2 0.1940 0.890875 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1452718 1 0.1474 0.852293 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1353243 1 0.1211 0.855669 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1455482 1 0.0188 0.859485 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.2149 0.837203 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1102467 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317470 4 0.4800 0.583845 0.004 0.000 0.340 0.656
#> SRR1337707 3 0.5458 0.684317 0.204 0.000 0.720 0.076
#> SRR1408752 2 0.0707 0.891228 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1474617 3 0.2530 0.354439 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1398013 1 0.4307 0.739957 0.808 0.000 0.048 0.144
#> SRR1352918 4 0.4936 0.555056 0.340 0.000 0.008 0.652
#> SRR1420750 1 0.1902 0.846154 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1071785 3 0.5022 0.710186 0.220 0.000 0.736 0.044
#> SRR1353618 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.1510 0.856524 0.956 0.000 0.028 0.016
#> SRR1366560 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 4 0.4907 0.417325 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1313494 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309985 1 0.3610 0.690825 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR607911 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.2918 0.815451 0.876 0.000 0.116 0.008
#> SRR1400078 1 0.3542 0.781086 0.852 0.000 0.028 0.120
#> SRR1088631 2 0.4040 0.875559 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1092842 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR615575 3 0.5378 0.417928 0.448 0.000 0.540 0.012
#> SRR1079434 4 0.4428 0.614189 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1325559 1 0.0336 0.860104 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1446695 4 0.5546 0.610059 0.044 0.000 0.292 0.664
#> SRR1383883 1 0.0707 0.854280 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1396100 4 0.4955 0.552742 0.344 0.000 0.008 0.648
#> SRR1475697 1 0.4599 0.670445 0.760 0.000 0.028 0.212
#> SRR1488067 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1102103 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1084991 2 0.4456 0.859051 0.000 0.716 0.004 0.280
#> SRR1410380 3 0.5168 -0.336479 0.004 0.000 0.500 0.496
#> SRR1445490 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.2530 0.827393 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR1485812 3 0.7613 0.474999 0.352 0.000 0.440 0.208
#> SRR1078020 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0592 0.859573 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1376406 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 4 0.5163 0.292834 0.004 0.000 0.480 0.516
#> SRR807775 3 0.4540 0.394690 0.032 0.000 0.772 0.196
#> SRR1409215 2 0.3942 0.878229 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR820427 4 0.5619 0.632513 0.064 0.000 0.248 0.688
#> SRR1100656 2 0.4134 0.871476 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1362159 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 4 0.4720 0.598209 0.004 0.000 0.324 0.672
#> SRR656794 1 0.6153 0.245160 0.604 0.000 0.068 0.328
#> SRR604653 1 0.1022 0.857322 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1317685 4 0.6065 0.535621 0.080 0.000 0.276 0.644
#> SRR1485912 1 0.2530 0.823126 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1407602 4 0.4428 0.614189 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1356164 1 0.5728 0.138735 0.600 0.000 0.364 0.036
#> SRR1328692 1 0.2530 0.824342 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1362438 1 0.1724 0.855547 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1479216 3 0.2060 0.555059 0.052 0.000 0.932 0.016
#> SRR1358041 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.3494 0.759926 0.824 0.000 0.172 0.004
#> SRR1368200 1 0.4008 0.651428 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 4 0.4679 0.528489 0.000 0.000 0.352 0.648
#> SRR1437256 3 0.6560 0.654282 0.248 0.000 0.620 0.132
#> SRR1487446 1 0.2921 0.763130 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR816653 1 0.1489 0.854043 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR815164 1 0.3024 0.759002 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1442043 1 0.3123 0.746328 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1410573 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.3975 0.877361 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1352369 1 0.4624 0.404863 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1382934 3 0.2385 0.542162 0.052 0.000 0.920 0.028
#> SRR1465208 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0672 0.861123 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1470291 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.4936 0.636734 0.340 0.000 0.652 0.008
#> SRR1409600 1 0.3108 0.816094 0.872 0.000 0.112 0.016
#> SRR816123 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR614779 4 0.5147 0.403711 0.004 0.000 0.460 0.536
#> SRR810783 1 0.2976 0.812211 0.872 0.000 0.120 0.008
#> SRR1333990 1 0.1022 0.849016 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1410356 1 0.3450 0.775692 0.836 0.000 0.156 0.008
#> SRR808106 4 0.5998 0.605162 0.240 0.000 0.092 0.668
#> SRR662713 1 0.2944 0.808539 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR1447058 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.4992 -0.136839 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR809382 3 0.4956 0.714366 0.232 0.000 0.732 0.036
#> SRR665417 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088016 2 0.3726 0.880444 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1453166 2 0.4134 0.871476 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1069826 2 0.4072 0.874527 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1077781 2 0.3942 0.878215 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR615623 3 0.1042 0.485066 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1413787 3 0.5137 -0.208547 0.004 0.000 0.544 0.452
#> SRR1478207 3 0.4522 0.658405 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1411046 1 0.0336 0.858106 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313711 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.2469 0.794235 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1309051 1 0.1807 0.850253 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1486949 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074956 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1092961 2 0.4008 0.876273 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR817210 1 0.5055 0.291638 0.624 0.000 0.368 0.008
#> SRR1319221 3 0.1867 0.414764 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1405413 1 0.0592 0.860991 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR607807 1 0.0817 0.852767 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1390160 3 0.4072 0.710346 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1406283 1 0.2859 0.818525 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1357709 1 0.3074 0.750694 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1080742 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1468208 1 0.0336 0.858106 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312766 1 0.3088 0.805549 0.864 0.000 0.128 0.008
#> SRR1361612 1 0.1637 0.832463 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1311224 1 0.2048 0.844832 0.928 0.000 0.064 0.008
#> SRR1087801 1 0.2530 0.823126 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1099720 2 0.4539 0.861449 0.000 0.720 0.008 0.272
#> SRR1349250 2 0.4222 0.865703 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1350912 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.2647 0.817525 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0937 0.495990 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1332879 1 0.2412 0.835217 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1403177 3 0.6383 0.586894 0.356 0.000 0.568 0.076
#> SRR1076144 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR818239 2 0.4134 0.871476 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1421069 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1500006 1 0.1022 0.857322 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1485678 1 0.3975 0.570459 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1092232 3 0.2053 0.424602 0.004 0.000 0.924 0.072
#> SRR1344253 4 0.6890 0.529852 0.152 0.000 0.268 0.580
#> SRR1384290 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.5793 0.338247 0.628 0.000 0.324 0.048
#> SRR1343522 2 0.1940 0.890926 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1326727 2 0.0921 0.891323 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1440940 1 0.7537 -0.313758 0.456 0.000 0.348 0.196
#> SRR818372 1 0.4974 0.562246 0.736 0.000 0.224 0.040
#> SRR1323675 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 4 0.6248 0.611242 0.212 0.000 0.128 0.660
#> SRR1310031 3 0.4049 0.715871 0.212 0.000 0.780 0.008
#> SRR615419 3 0.6840 0.597125 0.220 0.000 0.600 0.180
#> SRR1436925 1 0.1389 0.854091 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1477238 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332566 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1490228 1 0.5512 -0.279830 0.496 0.000 0.488 0.016
#> SRR1442949 4 0.4567 0.616341 0.008 0.000 0.276 0.716
#> SRR1466239 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.2814 0.888307 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1329971 1 0.1798 0.854093 0.944 0.000 0.040 0.016
#> SRR813076 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.4594 0.856653 0.000 0.712 0.008 0.280
#> SRR1322981 1 0.3300 0.789057 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR1485976 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.2546 0.610538 0.092 0.000 0.900 0.008
#> SRR660522 1 0.5172 0.147512 0.588 0.000 0.404 0.008
#> SRR815374 1 0.0707 0.854071 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1069564 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1416337 4 0.5147 0.403711 0.004 0.000 0.460 0.536
#> SRR1316438 3 0.3471 0.518245 0.060 0.000 0.868 0.072
#> SRR1386844 1 0.0592 0.855463 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1373718 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.1211 0.855714 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1335489 1 0.3123 0.746961 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1393404 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.1022 0.857322 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1401815 3 0.1151 0.480065 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1071337 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.4164 0.870039 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1331793 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0937 0.495996 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1098761 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1312124 1 0.0921 0.850948 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR615395 1 0.2988 0.817407 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR1479349 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2165033 1 0.1004 0.858743 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1089054 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.4758 0.676420 0.780 0.000 0.156 0.064
#> SRR1488514 2 0.3024 0.887153 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR655840 1 0.3751 0.703066 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1379303 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418516 4 0.5420 0.624342 0.044 0.000 0.272 0.684
#> SRR613174 3 0.5244 0.456890 0.436 0.000 0.556 0.008
#> SRR1351125 1 0.4814 0.445355 0.676 0.000 0.316 0.008
#> SRR659157 3 0.7871 0.291028 0.284 0.000 0.384 0.332
#> SRR1480408 1 0.1284 0.857993 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR657857 1 0.2466 0.805439 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR1073317 2 0.0707 0.891121 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332526 1 0.0927 0.859587 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1094168 2 0.3975 0.877120 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1431270 3 0.7700 0.194139 0.220 0.000 0.396 0.384
#> SRR1085614 2 0.4134 0.871825 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1330106 3 0.6170 0.526042 0.420 0.000 0.528 0.052
#> SRR1466154 1 0.1722 0.851805 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1396944 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082784 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.1867 0.845799 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR659247 1 0.2944 0.808115 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR1317201 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473696 1 0.2654 0.823582 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1375842 1 0.1022 0.857322 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.4134 0.871476 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1453662 1 0.1118 0.857508 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.2053 0.843172 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1416693 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070841 1 0.4360 0.621725 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1380910 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0707 0.891100 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1498183 1 0.1211 0.856441 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR612659 3 0.3636 0.694882 0.172 0.000 0.820 0.008
#> SRR1447148 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1089595 2 0.4456 0.859051 0.000 0.716 0.004 0.280
#> SRR1074263 2 0.3311 0.885249 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1376786 1 0.2859 0.818525 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1345995 1 0.2859 0.818525 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1071035 1 0.2714 0.820704 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1068808 2 0.4164 0.869664 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1332754 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0469 0.859819 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.5024 0.319634 0.632 0.000 0.360 0.008
#> SRR1323558 3 0.4609 0.711691 0.224 0.000 0.752 0.024
#> SRR1381711 4 0.4456 0.613956 0.004 0.000 0.280 0.716
#> SRR657985 4 0.5125 0.521098 0.008 0.000 0.388 0.604
#> SRR1314810 1 0.2654 0.823907 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1336505 1 0.5508 -0.222919 0.508 0.000 0.476 0.016
#> SRR1474095 1 0.2408 0.828894 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.3942 0.635538 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1074909 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1101200 1 0.3032 0.808952 0.868 0.000 0.124 0.008
#> SRR1075408 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 4 0.6025 0.602062 0.236 0.000 0.096 0.668
#> SRR1313406 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 4 0.4428 0.614189 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1084867 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1380184 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.2266 0.838828 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR1380414 3 0.6882 0.177687 0.124 0.000 0.548 0.328
#> SRR1315912 1 0.1545 0.854271 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1075778 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.5787 0.698202 0.244 0.000 0.680 0.076
#> SRR1361195 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.1890 0.848548 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1477653 1 0.2859 0.818525 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1355475 1 0.5236 0.023560 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1360785 4 0.4936 0.554140 0.340 0.000 0.008 0.652
#> SRR810437 3 0.5730 0.642521 0.344 0.000 0.616 0.040
#> SRR1361860 1 0.4072 0.583291 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1441311 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.4990 0.547079 0.352 0.000 0.008 0.640
#> SRR1457619 1 0.1824 0.833618 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1498529 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1097172 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.4103 0.873372 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1472033 2 0.2647 0.888914 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1445087 3 0.4562 0.711594 0.208 0.000 0.764 0.028
#> SRR1399525 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1312844 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1085874 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1101226 2 0.3975 0.877120 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1476056 1 0.2973 0.759562 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1075659 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1311916 3 0.3249 0.665985 0.140 0.000 0.852 0.008
#> SRR1353353 3 0.4511 0.684766 0.176 0.000 0.784 0.040
#> SRR1073291 3 0.4391 0.708712 0.252 0.000 0.740 0.008
#> SRR1356227 1 0.1867 0.824003 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1080720 2 0.4690 0.856632 0.000 0.712 0.012 0.276
#> SRR1091695 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1350304 4 0.5491 0.630553 0.052 0.000 0.260 0.688
#> SRR663002 3 0.3873 0.717248 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347144 3 0.3933 0.712403 0.200 0.000 0.792 0.008
#> SRR1384006 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.4040 0.875397 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR614047 3 0.4955 0.630017 0.344 0.000 0.648 0.008
#> SRR818440 1 0.4964 0.566468 0.716 0.000 0.256 0.028
#> SRR1337770 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399413 1 0.2859 0.818525 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1385542 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.1389 0.853622 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1074041 1 0.4123 0.681149 0.772 0.000 0.220 0.008
#> SRR1394495 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.3710 0.727906 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR816699 1 0.5353 0.000472 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1308612 3 0.5172 0.539306 0.404 0.000 0.588 0.008
#> SRR1499418 4 0.4428 0.614189 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1352894 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0469 0.860215 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1331083 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR808272 3 0.4228 0.715135 0.232 0.000 0.760 0.008
#> SRR1436698 1 0.2859 0.818525 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1095627 2 0.4072 0.874442 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1357672 1 0.6677 0.009589 0.524 0.000 0.092 0.384
#> SRR1351236 1 0.0817 0.858667 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.5213 0.562903 0.328 0.000 0.020 0.652
#> SRR1101256 2 0.1557 0.891204 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1436004 1 0.2342 0.837562 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1457994 2 0.3942 0.878054 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1078998 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0336 0.857734 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309534 1 0.3668 0.709583 0.808 0.000 0.004 0.188
#> SRR615527 3 0.1820 0.488085 0.020 0.000 0.944 0.036
#> SRR1098216 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325847 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1404003 1 0.1151 0.858515 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1344166 1 0.0592 0.860773 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1368638 4 0.5799 0.593978 0.264 0.000 0.068 0.668
#> SRR1431429 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.4193 0.867771 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1080509 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 4 0.4428 0.614189 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1502143 1 0.4482 0.588874 0.728 0.000 0.264 0.008
#> SRR1487614 3 0.3726 0.716940 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0188 0.858788 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099212 2 0.3942 0.878152 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1083215 1 0.2714 0.820704 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1476547 2 0.4690 0.856632 0.000 0.712 0.012 0.276
#> SRR656421 4 0.5028 0.498676 0.400 0.000 0.004 0.596
#> SRR1086116 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.4482 0.736603 0.804 0.000 0.068 0.128
#> SRR1339944 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.4214 0.663057 0.780 0.000 0.204 0.016
#> SRR1431847 4 0.4621 0.609252 0.008 0.000 0.284 0.708
#> SRR1317155 1 0.1488 0.856670 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1477405 1 0.0469 0.859801 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR655289 4 0.5404 0.328448 0.476 0.000 0.012 0.512
#> SRR1341683 3 0.6432 0.601306 0.372 0.000 0.552 0.076
#> SRR1084790 1 0.6087 -0.081296 0.540 0.000 0.048 0.412
#> SRR1073731 1 0.5364 0.386214 0.652 0.000 0.320 0.028
#> SRR1332588 4 0.5636 0.629500 0.060 0.000 0.260 0.680
#> SRR1471157 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.4663 0.563166 0.716 0.000 0.272 0.012
#> SRR661028 1 0.1722 0.851829 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1413477 2 0.1022 0.891426 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1101152 1 0.1637 0.852543 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1358435 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR2165273 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1379014 1 0.0707 0.854168 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1489904 3 0.4391 0.708363 0.252 0.000 0.740 0.008
#> SRR1416386 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1406048 1 0.2814 0.771500 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR606982 4 0.4690 0.617926 0.012 0.000 0.276 0.712
#> SRR1358082 1 0.0469 0.859801 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1312934 3 0.5378 0.406813 0.448 0.000 0.540 0.012
#> SRR655194 1 0.0188 0.858466 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1331174 2 0.0336 0.890552 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473251 2 0.4690 0.856632 0.000 0.712 0.012 0.276
#> SRR1389820 3 0.2589 0.348243 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1074289 1 0.3032 0.808952 0.868 0.000 0.124 0.008
#> SRR1348816 2 0.3311 0.885249 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1076292 3 0.6079 0.397256 0.464 0.000 0.492 0.044
#> SRR1395810 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.5937 0.645211 0.340 0.000 0.608 0.052
#> SRR1443507 1 0.3088 0.805549 0.864 0.000 0.128 0.008
#> SRR1452310 1 0.1902 0.847651 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR665610 1 0.3356 0.724342 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1347322 1 0.1022 0.858109 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR813395 2 0.4008 0.876273 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1477256 1 0.0817 0.859027 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1470230 4 0.4428 0.614189 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1354247 1 0.0000 0.858923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.890308 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.3591 0.758768 0.824 0.000 0.168 0.008
#> SRR1352299 1 0.2593 0.826159 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1076317 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1434117 3 0.6492 0.595864 0.220 0.000 0.636 0.144
#> SRR1075273 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR658657 4 0.4428 0.614189 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1092773 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1365332 1 0.3142 0.801965 0.860 0.000 0.132 0.008
#> SRR615958 3 0.4011 0.714465 0.208 0.000 0.784 0.008
#> SRR1097688 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1403259 4 0.4456 0.611342 0.004 0.000 0.280 0.716
#> SRR1099120 2 0.4134 0.871476 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1362200 3 0.4482 0.701875 0.264 0.000 0.728 0.008
#> SRR1464856 2 0.1389 0.891508 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1347298 3 0.3893 0.710570 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1075923 2 0.4103 0.873090 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1100703 1 0.2714 0.820704 0.884 0.000 0.112 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 1 0.3849 0.52341 0.808 0.000 0.112 0.000 0.080
#> SRR1436370 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1075752 2 0.0290 0.72270 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1397949 1 0.4269 0.39997 0.756 0.000 0.056 0.188 0.000
#> SRR1355723 1 0.4781 0.42075 0.728 0.000 0.112 0.000 0.160
#> SRR1329744 1 0.4032 0.44079 0.772 0.000 0.032 0.004 0.192
#> SRR657384 1 0.2561 0.55592 0.884 0.000 0.096 0.000 0.020
#> SRR1351190 1 0.2848 0.55240 0.868 0.000 0.104 0.000 0.028
#> SRR1458662 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR818573 1 0.3730 0.47684 0.808 0.000 0.036 0.152 0.004
#> SRR1396017 1 0.4836 0.38189 0.716 0.000 0.096 0.000 0.188
#> SRR1410742 1 0.4219 0.48779 0.780 0.000 0.104 0.000 0.116
#> SRR1435963 1 0.2813 0.55456 0.876 0.000 0.084 0.000 0.040
#> SRR1382416 1 0.2966 0.46316 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1391354 5 0.4101 0.55773 0.332 0.000 0.004 0.000 0.664
#> SRR1087968 2 0.4291 0.79086 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1310075 1 0.0727 0.57221 0.980 0.000 0.012 0.004 0.004
#> SRR1312244 1 0.1628 0.56090 0.936 0.000 0.000 0.056 0.008
#> SRR1325138 1 0.5600 0.07235 0.588 0.000 0.096 0.000 0.316
#> SRR1326821 5 0.3246 0.66114 0.184 0.000 0.008 0.000 0.808
#> SRR1490178 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR655613 1 0.5583 -0.12125 0.564 0.000 0.084 0.352 0.000
#> SRR1075707 2 0.2790 0.68035 0.000 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR1443871 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1102489 2 0.0703 0.70591 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1465758 1 0.0963 0.56417 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1414058 3 0.6261 0.02424 0.068 0.000 0.492 0.408 0.032
#> SRR1407449 1 0.2103 0.57099 0.920 0.000 0.056 0.020 0.004
#> SRR1436858 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1479109 1 0.7109 -0.54336 0.440 0.000 0.152 0.368 0.040
#> SRR1399069 1 0.5790 -0.19812 0.500 0.000 0.092 0.000 0.408
#> SRR1366450 1 0.6982 -0.44367 0.468 0.000 0.128 0.360 0.044
#> SRR1396859 1 0.3090 0.54792 0.860 0.000 0.052 0.000 0.088
#> SRR1457176 1 0.5296 0.13857 0.636 0.000 0.084 0.280 0.000
#> SRR1097666 2 0.0510 0.72572 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1434736 5 0.3922 0.68928 0.180 0.000 0.040 0.000 0.780
#> SRR1080560 2 0.0510 0.71081 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1322882 1 0.6597 -0.31822 0.508 0.000 0.100 0.356 0.036
#> SRR1435688 2 0.4490 0.76739 0.000 0.724 0.000 0.224 0.052
#> SRR1327614 1 0.1697 0.55286 0.932 0.000 0.008 0.060 0.000
#> SRR658152 1 0.5516 0.26459 0.640 0.000 0.128 0.000 0.232
#> SRR1368141 3 0.5535 0.25810 0.256 0.000 0.628 0.000 0.116
#> SRR1440268 1 0.3484 0.50730 0.820 0.000 0.024 0.004 0.152
#> SRR1453725 1 0.5423 0.16501 0.644 0.000 0.112 0.244 0.000
#> SRR1325711 2 0.4797 0.77679 0.000 0.660 0.000 0.296 0.044
#> SRR1477930 1 0.2193 0.55965 0.900 0.000 0.092 0.000 0.008
#> SRR1477591 1 0.6375 -0.26632 0.524 0.000 0.092 0.356 0.028
#> SRR1416049 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR656275 1 0.4820 0.40999 0.696 0.000 0.236 0.000 0.068
#> SRR1369052 1 0.2532 0.56322 0.892 0.000 0.088 0.012 0.008
#> SRR1377735 1 0.5203 0.14649 0.648 0.000 0.080 0.272 0.000
#> SRR1331244 5 0.4304 0.28613 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1404531 1 0.3582 0.41591 0.768 0.000 0.008 0.224 0.000
#> SRR1324331 5 0.4307 0.27507 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1458890 3 0.5720 0.23712 0.268 0.000 0.604 0.000 0.128
#> SRR1432695 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1407624 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1431969 3 0.5192 0.31517 0.008 0.000 0.572 0.388 0.032
#> SRR1087393 2 0.2054 0.70909 0.000 0.920 0.000 0.028 0.052
#> SRR1077263 5 0.3531 0.64959 0.012 0.000 0.152 0.016 0.820
#> SRR1385211 1 0.3060 0.50374 0.848 0.000 0.024 0.128 0.000
#> SRR655241 1 0.3590 0.53459 0.828 0.000 0.092 0.000 0.080
#> SRR656922 1 0.2053 0.56278 0.924 0.000 0.024 0.048 0.004
#> SRR1361630 5 0.5759 0.33069 0.000 0.000 0.276 0.128 0.596
#> SRR1318966 2 0.0290 0.71941 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407087 3 0.5721 0.06600 0.056 0.000 0.516 0.416 0.012
#> SRR603212 1 0.5965 -0.19680 0.544 0.000 0.128 0.328 0.000
#> SRR1321088 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1485190 3 0.4443 0.45739 0.020 0.000 0.776 0.152 0.052
#> SRR1332232 2 0.4727 0.79004 0.000 0.532 0.000 0.452 0.016
#> SRR1312645 1 0.4064 0.49372 0.792 0.000 0.092 0.000 0.116
#> SRR1457835 1 0.5544 0.04599 0.608 0.000 0.100 0.292 0.000
#> SRR1347123 3 0.5775 0.04844 0.068 0.000 0.512 0.412 0.008
#> SRR1465501 2 0.0404 0.72433 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1330878 3 0.4589 0.43274 0.000 0.000 0.704 0.248 0.048
#> SRR1445064 3 0.6208 0.30992 0.220 0.000 0.628 0.040 0.112
#> SRR1452981 1 0.4509 0.44362 0.752 0.000 0.096 0.000 0.152
#> SRR1326708 1 0.5353 0.01479 0.600 0.000 0.072 0.328 0.000
#> SRR1407157 1 0.2439 0.52420 0.876 0.000 0.004 0.120 0.000
#> SRR1365401 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1397697 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1477316 1 0.4808 0.40345 0.724 0.000 0.108 0.000 0.168
#> SRR1077898 1 0.7014 -0.09826 0.508 0.000 0.032 0.248 0.212
#> SRR1349080 5 0.2974 0.71139 0.080 0.000 0.052 0.000 0.868
#> SRR1076096 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR811261 2 0.0609 0.72660 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1375485 1 0.3760 0.43858 0.784 0.000 0.028 0.188 0.000
#> SRR1432563 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR604414 1 0.6597 -0.31822 0.508 0.000 0.100 0.356 0.036
#> SRR1380614 1 0.3766 0.35732 0.728 0.000 0.000 0.268 0.004
#> SRR812060 3 0.7240 -0.58679 0.172 0.000 0.404 0.384 0.040
#> SRR602082 1 0.4325 0.34732 0.724 0.000 0.036 0.240 0.000
#> SRR1069490 2 0.0404 0.72086 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1078417 2 0.4835 0.78795 0.000 0.592 0.000 0.380 0.028
#> SRR661613 3 0.7400 -0.69672 0.208 0.000 0.376 0.376 0.040
#> SRR1420710 1 0.4801 0.44275 0.728 0.000 0.148 0.000 0.124
#> SRR660426 1 0.5646 -0.07618 0.576 0.000 0.080 0.340 0.004
#> SRR1416003 3 0.6021 0.19830 0.428 0.000 0.476 0.008 0.088
#> SRR661064 1 0.4300 0.47015 0.772 0.000 0.096 0.000 0.132
#> SRR1082011 2 0.4866 0.78872 0.000 0.580 0.000 0.392 0.028
#> SRR1452718 1 0.5443 0.03065 0.604 0.000 0.084 0.312 0.000
#> SRR1353243 1 0.5004 0.23532 0.672 0.000 0.072 0.256 0.000
#> SRR1455482 1 0.3821 0.41052 0.764 0.000 0.020 0.216 0.000
#> SRR1313473 1 0.2563 0.52139 0.872 0.000 0.008 0.120 0.000
#> SRR1399394 1 0.5772 -0.04449 0.584 0.000 0.120 0.296 0.000
#> SRR1102467 1 0.2036 0.57136 0.928 0.000 0.028 0.036 0.008
#> SRR1317470 5 0.4258 0.58128 0.000 0.000 0.160 0.072 0.768
#> SRR1337707 3 0.5256 0.26296 0.212 0.000 0.672 0.000 0.116
#> SRR1408752 2 0.4948 0.78873 0.000 0.536 0.000 0.436 0.028
#> SRR1474617 3 0.4266 0.26602 0.000 0.000 0.776 0.104 0.120
#> SRR1398013 1 0.4981 0.40105 0.708 0.000 0.120 0.000 0.172
#> SRR1352918 5 0.3333 0.66100 0.208 0.000 0.004 0.000 0.788
#> SRR1420750 1 0.5639 -0.10745 0.568 0.000 0.092 0.340 0.000
#> SRR1071785 3 0.4568 0.35794 0.088 0.000 0.788 0.036 0.088
#> SRR1353618 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1082217 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1357256 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1490313 1 0.2951 0.54982 0.860 0.000 0.112 0.000 0.028
#> SRR1366560 1 0.2124 0.53931 0.900 0.000 0.004 0.096 0.000
#> SRR1355684 1 0.1965 0.54141 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1323289 5 0.3366 0.56222 0.000 0.000 0.212 0.004 0.784
#> SRR1313494 1 0.2248 0.55993 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR1309985 1 0.4869 0.37435 0.712 0.000 0.096 0.000 0.192
#> SRR607911 1 0.1851 0.54557 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1333789 1 0.7021 -0.48793 0.456 0.000 0.140 0.364 0.040
#> SRR1400078 1 0.4676 0.45222 0.740 0.000 0.120 0.000 0.140
#> SRR1088631 2 0.3413 0.75377 0.000 0.832 0.000 0.124 0.044
#> SRR1092842 2 0.0162 0.71741 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615575 3 0.6954 -0.37641 0.128 0.000 0.448 0.384 0.040
#> SRR1079434 5 0.1557 0.70012 0.008 0.000 0.052 0.000 0.940
#> SRR1325559 1 0.3013 0.48810 0.832 0.000 0.008 0.160 0.000
#> SRR1446695 5 0.3264 0.63708 0.000 0.000 0.164 0.016 0.820
#> SRR1383883 1 0.1668 0.56959 0.940 0.000 0.000 0.032 0.028
#> SRR1396100 5 0.3480 0.63468 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR1475697 1 0.5654 0.24610 0.628 0.000 0.148 0.000 0.224
#> SRR1488067 2 0.0404 0.72433 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1102103 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1105154 2 0.0404 0.71315 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1084991 2 0.2079 0.68474 0.000 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR1410380 5 0.6410 0.08559 0.000 0.000 0.320 0.192 0.488
#> SRR1445490 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1454671 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1435044 1 0.3078 0.54615 0.848 0.000 0.132 0.004 0.016
#> SRR1485812 3 0.6576 0.09923 0.284 0.000 0.496 0.004 0.216
#> SRR1078020 2 0.4291 0.79086 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1311153 1 0.4896 0.23253 0.664 0.000 0.016 0.296 0.024
#> SRR1376406 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1343898 5 0.5048 0.32009 0.000 0.000 0.380 0.040 0.580
#> SRR807775 3 0.6367 0.10471 0.032 0.000 0.472 0.420 0.076
#> SRR1409215 2 0.4369 0.74726 0.000 0.740 0.000 0.208 0.052
#> SRR820427 5 0.2520 0.70966 0.048 0.000 0.056 0.000 0.896
#> SRR1100656 2 0.0703 0.70591 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1362159 1 0.3171 0.47310 0.816 0.000 0.008 0.176 0.000
#> SRR1414536 5 0.2848 0.65211 0.000 0.000 0.156 0.004 0.840
#> SRR656794 1 0.7657 -0.48723 0.416 0.000 0.096 0.348 0.140
#> SRR604653 1 0.5018 0.21711 0.664 0.000 0.068 0.268 0.000
#> SRR1317685 5 0.4860 0.63120 0.132 0.000 0.088 0.024 0.756
#> SRR1485912 1 0.6011 -0.25489 0.528 0.000 0.128 0.344 0.000
#> SRR1407602 5 0.1430 0.69792 0.004 0.000 0.052 0.000 0.944
#> SRR1356164 1 0.5677 -0.07100 0.496 0.000 0.424 0.000 0.080
#> SRR1328692 1 0.4439 0.50772 0.760 0.000 0.176 0.056 0.008
#> SRR1362438 1 0.6328 -0.18202 0.544 0.000 0.068 0.344 0.044
#> SRR1479216 3 0.5656 0.18870 0.016 0.000 0.508 0.432 0.044
#> SRR1358041 1 0.1121 0.57073 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.6949 -0.67441 0.400 0.000 0.216 0.372 0.012
#> SRR1368200 1 0.6853 -0.61787 0.424 0.000 0.220 0.348 0.008
#> SRR1435602 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1501043 5 0.3689 0.57236 0.000 0.000 0.256 0.004 0.740
#> SRR1437256 3 0.6188 0.15014 0.284 0.000 0.540 0.000 0.176
#> SRR1487446 1 0.4376 0.45915 0.764 0.000 0.092 0.000 0.144
#> SRR816653 1 0.5420 -0.01898 0.592 0.000 0.076 0.332 0.000
#> SRR815164 1 0.4646 0.43177 0.712 0.000 0.000 0.060 0.228
#> SRR1442043 1 0.4624 0.42473 0.740 0.000 0.096 0.000 0.164
#> SRR1410573 1 0.3053 0.48474 0.828 0.000 0.008 0.164 0.000
#> SRR1096782 2 0.3736 0.74742 0.000 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR1352369 4 0.6805 0.82693 0.316 0.000 0.312 0.372 0.000
#> SRR1382934 3 0.2820 0.36367 0.004 0.000 0.884 0.056 0.056
#> SRR1465208 1 0.1168 0.57153 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1314728 1 0.3863 0.43891 0.792 0.000 0.020 0.176 0.012
#> SRR1470291 1 0.1965 0.54157 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1308756 3 0.6656 -0.19207 0.092 0.000 0.460 0.408 0.040
#> SRR1409600 1 0.6896 -0.42074 0.496 0.000 0.132 0.332 0.040
#> SRR816123 2 0.0510 0.72572 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR614779 5 0.5932 0.25676 0.000 0.000 0.308 0.132 0.560
#> SRR810783 1 0.6558 -0.38876 0.488 0.000 0.136 0.360 0.016
#> SRR1333990 1 0.1725 0.56991 0.936 0.000 0.000 0.020 0.044
#> SRR1410356 1 0.7399 -0.73165 0.380 0.000 0.208 0.372 0.040
#> SRR808106 5 0.2974 0.71153 0.080 0.000 0.052 0.000 0.868
#> SRR662713 1 0.6777 -0.49694 0.460 0.000 0.168 0.356 0.016
#> SRR1447058 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1480964 3 0.6458 -0.25419 0.236 0.000 0.544 0.212 0.008
#> SRR809382 3 0.4848 0.39449 0.148 0.000 0.756 0.032 0.064
#> SRR665417 1 0.2689 0.56407 0.888 0.000 0.084 0.016 0.012
#> SRR1088016 2 0.1544 0.73721 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1453166 2 0.0963 0.70314 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1069826 2 0.1557 0.72347 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1077781 2 0.4096 0.75442 0.000 0.772 0.000 0.176 0.052
#> SRR615623 3 0.5112 0.44094 0.000 0.000 0.664 0.256 0.080
#> SRR1413787 5 0.6090 0.17765 0.000 0.000 0.348 0.136 0.516
#> SRR1478207 3 0.5296 0.28667 0.084 0.000 0.636 0.280 0.000
#> SRR1411046 1 0.0912 0.57164 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1313711 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1326560 1 0.3806 0.51458 0.812 0.000 0.084 0.000 0.104
#> SRR1309051 1 0.5395 -0.07670 0.576 0.000 0.068 0.356 0.000
#> SRR1486949 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1395616 1 0.0854 0.57139 0.976 0.000 0.004 0.012 0.008
#> SRR1074956 2 0.0404 0.72433 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1092961 2 0.0609 0.72660 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR817210 4 0.7206 0.76856 0.336 0.000 0.292 0.356 0.016
#> SRR1319221 3 0.3970 0.28822 0.000 0.000 0.800 0.096 0.104
#> SRR1405413 1 0.2727 0.52070 0.868 0.000 0.016 0.116 0.000
#> SRR607807 1 0.1893 0.56674 0.928 0.000 0.000 0.048 0.024
#> SRR1390160 3 0.5309 0.30472 0.056 0.000 0.604 0.336 0.004
#> SRR1406283 1 0.6839 -0.44986 0.468 0.000 0.132 0.368 0.032
#> SRR1357709 1 0.4386 0.46127 0.764 0.000 0.096 0.000 0.140
#> SRR1080742 2 0.0510 0.72572 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1468208 1 0.1195 0.57148 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1312766 1 0.7065 -0.57153 0.432 0.000 0.164 0.372 0.032
#> SRR1361612 1 0.3359 0.54196 0.844 0.000 0.072 0.000 0.084
#> SRR1311224 1 0.6608 -0.33433 0.504 0.000 0.108 0.356 0.032
#> SRR1087801 1 0.5681 0.05326 0.608 0.000 0.124 0.268 0.000
#> SRR1099720 2 0.2726 0.68354 0.000 0.884 0.000 0.064 0.052
#> SRR1349250 2 0.1341 0.68319 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1350912 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1357127 1 0.6212 -0.30333 0.516 0.000 0.160 0.324 0.000
#> SRR1074980 2 0.4291 0.79086 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1317022 3 0.4880 0.39863 0.004 0.000 0.660 0.296 0.040
#> SRR1332879 1 0.6461 -0.32320 0.508 0.000 0.116 0.356 0.020
#> SRR1403177 3 0.9870 0.21022 0.216 0.168 0.276 0.168 0.172
#> SRR1076144 2 0.4727 0.79004 0.000 0.532 0.000 0.452 0.016
#> SRR1069614 2 0.0404 0.71315 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR818239 2 0.0880 0.70071 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1421069 2 0.0162 0.71741 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500006 1 0.4983 0.21753 0.664 0.000 0.064 0.272 0.000
#> SRR1485678 1 0.5396 0.30649 0.656 0.000 0.000 0.220 0.124
#> SRR1092232 3 0.3579 0.30634 0.068 0.000 0.840 0.008 0.084
#> SRR1344253 5 0.7419 0.09854 0.076 0.000 0.176 0.248 0.500
#> SRR1384290 1 0.1671 0.55129 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1089349 4 0.7651 0.86792 0.296 0.000 0.284 0.372 0.048
#> SRR1343522 2 0.4990 0.78697 0.000 0.580 0.000 0.384 0.036
#> SRR1326727 2 0.4942 0.78908 0.000 0.540 0.000 0.432 0.028
#> SRR1440940 1 0.6263 0.08885 0.540 0.000 0.244 0.000 0.216
#> SRR818372 1 0.5591 0.45546 0.684 0.000 0.200 0.032 0.084
#> SRR1323675 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR819894 5 0.3033 0.71188 0.084 0.000 0.052 0.000 0.864
#> SRR1310031 3 0.5699 0.23004 0.032 0.000 0.548 0.388 0.032
#> SRR615419 3 0.6255 0.09670 0.252 0.000 0.540 0.000 0.208
#> SRR1436925 1 0.3759 0.55756 0.828 0.000 0.084 0.080 0.008
#> SRR1477238 1 0.0794 0.56646 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1332566 1 0.0960 0.57111 0.972 0.000 0.004 0.016 0.008
#> SRR1490228 3 0.6243 0.25882 0.168 0.000 0.628 0.172 0.032
#> SRR1442949 5 0.1628 0.69878 0.008 0.000 0.056 0.000 0.936
#> SRR1466239 1 0.1043 0.56294 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1094003 2 0.4527 0.77676 0.000 0.692 0.000 0.272 0.036
#> SRR1329971 1 0.5858 0.08938 0.636 0.000 0.064 0.260 0.040
#> SRR813076 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1097642 2 0.2790 0.68035 0.000 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR1322981 1 0.7211 -0.65335 0.408 0.000 0.192 0.368 0.032
#> SRR1485976 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1471713 3 0.5589 0.18819 0.016 0.000 0.516 0.428 0.040
#> SRR660522 4 0.7397 0.84577 0.252 0.000 0.328 0.388 0.032
#> SRR815374 1 0.3538 0.56413 0.848 0.000 0.080 0.056 0.016
#> SRR1069564 2 0.0404 0.72433 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416337 5 0.5864 0.28686 0.000 0.000 0.300 0.128 0.572
#> SRR1316438 3 0.4854 0.30468 0.092 0.000 0.768 0.040 0.100
#> SRR1386844 1 0.1750 0.56895 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036
#> SRR1373718 1 0.0703 0.56751 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1447458 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1487128 1 0.0404 0.56975 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1441421 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1069919 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1460296 1 0.4589 0.34677 0.724 0.000 0.064 0.212 0.000
#> SRR1335489 1 0.3474 0.51812 0.824 0.000 0.020 0.008 0.148
#> SRR1393404 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1081425 1 0.4924 0.22800 0.668 0.000 0.060 0.272 0.000
#> SRR1401815 3 0.4876 0.44209 0.000 0.000 0.700 0.220 0.080
#> SRR1071337 2 0.4291 0.79086 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1071983 2 0.3647 0.72093 0.000 0.816 0.000 0.132 0.052
#> SRR1331793 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1410510 3 0.5376 0.29442 0.004 0.000 0.544 0.404 0.048
#> SRR1098761 2 0.0404 0.72433 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1312124 1 0.3090 0.54911 0.860 0.000 0.088 0.000 0.052
#> SRR615395 1 0.6991 -0.47565 0.460 0.000 0.136 0.364 0.040
#> SRR1479349 1 0.2361 0.55763 0.892 0.000 0.096 0.000 0.012
#> SRR2165033 1 0.2615 0.56690 0.892 0.000 0.080 0.020 0.008
#> SRR1089054 2 0.4291 0.79086 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR816201 1 0.5659 0.50502 0.704 0.000 0.148 0.056 0.092
#> SRR1488514 2 0.4527 0.77016 0.000 0.700 0.000 0.260 0.040
#> SRR655840 1 0.5091 0.35393 0.692 0.000 0.112 0.000 0.196
#> SRR1379303 1 0.1041 0.56657 0.964 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR1418516 5 0.4723 0.66457 0.136 0.000 0.128 0.000 0.736
#> SRR613174 3 0.7048 -0.44342 0.140 0.000 0.428 0.392 0.040
#> SRR1351125 4 0.7554 0.87818 0.280 0.000 0.308 0.372 0.040
#> SRR659157 5 0.6804 0.19045 0.296 0.000 0.340 0.000 0.364
#> SRR1480408 1 0.2761 0.55342 0.872 0.000 0.104 0.000 0.024
#> SRR657857 1 0.3649 0.53137 0.824 0.000 0.088 0.000 0.088
#> SRR1073317 2 0.4930 0.78846 0.000 0.548 0.000 0.424 0.028
#> SRR1332526 1 0.2629 0.55719 0.880 0.000 0.104 0.004 0.012
#> SRR1094168 2 0.0703 0.72744 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1431270 5 0.6931 0.23652 0.212 0.000 0.368 0.012 0.408
#> SRR1085614 2 0.2592 0.69512 0.000 0.892 0.000 0.056 0.052
#> SRR1330106 3 0.5664 0.25200 0.348 0.000 0.560 0.000 0.092
#> SRR1466154 1 0.6038 -0.13532 0.560 0.000 0.080 0.340 0.020
#> SRR1396944 1 0.0324 0.57153 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1082784 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1457267 1 0.1851 0.54539 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR614659 1 0.4391 0.51466 0.768 0.000 0.164 0.060 0.008
#> SRR659247 1 0.6280 -0.19965 0.540 0.000 0.164 0.292 0.004
#> SRR1317201 1 0.0854 0.57139 0.976 0.000 0.004 0.012 0.008
#> SRR1473696 1 0.6475 -0.33515 0.504 0.000 0.128 0.352 0.016
#> SRR1375842 1 0.4890 0.25673 0.680 0.000 0.064 0.256 0.000
#> SRR1388123 2 0.4437 0.79116 0.000 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR1096363 2 0.0703 0.70591 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1453662 1 0.2610 0.56799 0.892 0.000 0.076 0.028 0.004
#> SRR1345499 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1353499 1 0.5744 -0.12444 0.564 0.000 0.104 0.332 0.000
#> SRR1416693 1 0.0671 0.56989 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1070841 1 0.7287 -0.75643 0.376 0.000 0.228 0.368 0.028
#> SRR1380910 1 0.2997 0.49678 0.840 0.000 0.012 0.148 0.000
#> SRR1333125 2 0.5052 0.78746 0.000 0.552 0.000 0.412 0.036
#> SRR1498183 1 0.4548 0.33112 0.716 0.000 0.052 0.232 0.000
#> SRR612659 3 0.5152 0.29793 0.012 0.000 0.572 0.392 0.024
#> SRR1447148 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR658597 2 0.0290 0.72270 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1089595 2 0.2790 0.68035 0.000 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR1074263 2 0.4519 0.76638 0.000 0.720 0.000 0.228 0.052
#> SRR1376786 1 0.6997 -0.48626 0.456 0.000 0.136 0.368 0.040
#> SRR1345995 1 0.6727 -0.34793 0.500 0.000 0.124 0.344 0.032
#> SRR1071035 1 0.6075 -0.29843 0.512 0.000 0.132 0.356 0.000
#> SRR1068808 2 0.1121 0.69210 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1332754 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR662438 1 0.4206 0.29242 0.696 0.000 0.016 0.288 0.000
#> SRR1335355 1 0.2660 0.51550 0.864 0.000 0.008 0.128 0.000
#> SRR659448 4 0.7517 0.85977 0.260 0.000 0.312 0.388 0.040
#> SRR1323558 3 0.6446 -0.10914 0.072 0.000 0.472 0.416 0.040
#> SRR1381711 5 0.1671 0.69126 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR657985 5 0.6084 0.26195 0.000 0.000 0.208 0.220 0.572
#> SRR1314810 1 0.5925 -0.07652 0.604 0.000 0.124 0.264 0.008
#> SRR1336505 3 0.6011 0.18368 0.360 0.000 0.552 0.056 0.032
#> SRR1474095 1 0.4901 0.33121 0.716 0.000 0.116 0.168 0.000
#> SRR1363831 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1442376 1 0.5053 0.32421 0.688 0.000 0.096 0.000 0.216
#> SRR1074909 2 0.0290 0.72270 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1101200 1 0.7171 -0.59907 0.424 0.000 0.172 0.368 0.036
#> SRR1075408 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1367150 5 0.4234 0.66932 0.184 0.000 0.056 0.000 0.760
#> SRR1313406 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1068880 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1467277 5 0.1544 0.69175 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1084867 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1095431 2 0.0290 0.72270 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380184 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1443113 1 0.5441 0.07522 0.624 0.000 0.096 0.280 0.000
#> SRR1380414 3 0.7466 -0.25310 0.092 0.000 0.420 0.372 0.116
#> SRR1315912 1 0.6299 -0.14598 0.556 0.000 0.080 0.328 0.036
#> SRR1075778 2 0.4807 0.78959 0.000 0.532 0.000 0.448 0.020
#> SRR1421116 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR602282 3 0.5513 0.25321 0.252 0.000 0.632 0.000 0.116
#> SRR1361195 2 0.4641 0.79045 0.000 0.532 0.000 0.456 0.012
#> SRR600493 1 0.5933 -0.15042 0.556 0.000 0.084 0.348 0.012
#> SRR1477653 1 0.6475 -0.33515 0.504 0.000 0.128 0.352 0.016
#> SRR1355475 4 0.7500 0.82905 0.244 0.000 0.336 0.380 0.040
#> SRR1360785 5 0.2930 0.67949 0.164 0.000 0.004 0.000 0.832
#> SRR810437 3 0.6223 0.36330 0.216 0.000 0.636 0.060 0.088
#> SRR1361860 1 0.4164 0.48643 0.784 0.000 0.096 0.000 0.120
#> SRR1441311 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1098903 5 0.4088 0.58043 0.304 0.000 0.008 0.000 0.688
#> SRR1457619 1 0.3532 0.53720 0.832 0.000 0.092 0.000 0.076
#> SRR1498529 1 0.2645 0.55952 0.884 0.000 0.096 0.008 0.012
#> SRR1097172 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1074017 2 0.2054 0.70909 0.000 0.920 0.000 0.028 0.052
#> SRR1472033 2 0.4957 0.78025 0.000 0.624 0.000 0.332 0.044
#> SRR1445087 3 0.5672 0.43421 0.044 0.000 0.668 0.228 0.060
#> SRR1399525 2 0.0609 0.72708 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1312844 2 0.0510 0.72572 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1085874 2 0.0404 0.72433 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1101226 2 0.0703 0.72744 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1476056 1 0.4548 0.43772 0.748 0.000 0.096 0.000 0.156
#> SRR1075659 2 0.0290 0.71531 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1311916 3 0.5508 0.18785 0.012 0.000 0.512 0.436 0.040
#> SRR1353353 3 0.3301 0.32937 0.072 0.000 0.848 0.000 0.080
#> SRR1073291 3 0.6663 -0.20050 0.092 0.000 0.448 0.420 0.040
#> SRR1356227 1 0.3476 0.53868 0.836 0.000 0.076 0.000 0.088
#> SRR1080720 2 0.2790 0.68035 0.000 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR1091695 2 0.0290 0.71910 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1350304 5 0.2726 0.71123 0.064 0.000 0.052 0.000 0.884
#> SRR663002 3 0.5216 0.36993 0.040 0.000 0.644 0.300 0.016
#> SRR1376983 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1399926 1 0.0912 0.57106 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1347144 3 0.5876 0.12036 0.040 0.000 0.516 0.412 0.032
#> SRR1384006 1 0.2196 0.56637 0.916 0.000 0.024 0.056 0.004
#> SRR1499108 2 0.0510 0.72572 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR614047 3 0.6635 -0.00806 0.092 0.000 0.480 0.388 0.040
#> SRR818440 1 0.6254 0.24295 0.600 0.000 0.276 0.060 0.064
#> SRR1337770 1 0.2748 0.56148 0.880 0.000 0.096 0.016 0.008
#> SRR1399413 1 0.6401 -0.24513 0.532 0.000 0.128 0.324 0.016
#> SRR1385542 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1473959 1 0.3551 0.56084 0.840 0.000 0.096 0.056 0.008
#> SRR1074041 4 0.7535 0.86299 0.312 0.000 0.268 0.380 0.040
#> SRR1394495 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR659460 1 0.6897 -0.68696 0.400 0.000 0.228 0.364 0.008
#> SRR816699 4 0.7424 0.74542 0.216 0.000 0.356 0.388 0.040
#> SRR1308612 3 0.7197 -0.55278 0.164 0.000 0.408 0.388 0.040
#> SRR1499418 5 0.1341 0.69444 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1352894 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR815805 1 0.2178 0.56149 0.920 0.000 0.024 0.048 0.008
#> SRR1331083 2 0.0404 0.72086 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR808272 3 0.6198 0.02370 0.052 0.000 0.484 0.424 0.040
#> SRR1436698 1 0.6794 -0.41234 0.480 0.000 0.128 0.360 0.032
#> SRR1095627 2 0.0510 0.72572 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1357672 1 0.8012 -0.60180 0.360 0.000 0.120 0.352 0.168
#> SRR1351236 1 0.4706 0.28408 0.692 0.000 0.052 0.256 0.000
#> SRR1077479 1 0.3160 0.45370 0.808 0.000 0.004 0.188 0.000
#> SRR814491 5 0.3264 0.69046 0.164 0.000 0.016 0.000 0.820
#> SRR1101256 2 0.5058 0.78607 0.000 0.576 0.000 0.384 0.040
#> SRR1436004 1 0.6753 -0.38984 0.488 0.000 0.124 0.356 0.032
#> SRR1457994 2 0.3958 0.76027 0.000 0.780 0.000 0.176 0.044
#> SRR1078998 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1314707 1 0.2522 0.55485 0.880 0.000 0.108 0.000 0.012
#> SRR1309534 1 0.5045 0.35666 0.696 0.000 0.108 0.000 0.196
#> SRR615527 3 0.3656 0.37537 0.008 0.000 0.832 0.104 0.056
#> SRR1098216 1 0.0932 0.57252 0.972 0.000 0.020 0.004 0.004
#> SRR1325847 2 0.0404 0.72086 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1404003 1 0.2470 0.55625 0.884 0.000 0.104 0.000 0.012
#> SRR1344166 1 0.2756 0.53626 0.880 0.000 0.024 0.092 0.004
#> SRR1368638 5 0.4031 0.68098 0.184 0.000 0.044 0.000 0.772
#> SRR1431429 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1079237 2 0.1357 0.69024 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1080509 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR815759 5 0.1697 0.69699 0.008 0.000 0.060 0.000 0.932
#> SRR1502143 4 0.7418 0.85056 0.320 0.000 0.264 0.384 0.032
#> SRR1487614 3 0.5126 0.30291 0.040 0.000 0.600 0.356 0.004
#> SRR1402307 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR820810 1 0.2943 0.56745 0.880 0.000 0.052 0.060 0.008
#> SRR1099212 2 0.3805 0.76480 0.000 0.784 0.000 0.184 0.032
#> SRR1083215 1 0.6386 -0.32214 0.508 0.000 0.128 0.352 0.012
#> SRR1476547 2 0.2790 0.68035 0.000 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR656421 5 0.3242 0.64565 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1086116 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1499917 1 0.4630 0.45028 0.744 0.000 0.116 0.000 0.140
#> SRR1339944 2 0.4546 0.79083 0.000 0.532 0.000 0.460 0.008
#> SRR1391444 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1434889 1 0.5531 0.26386 0.616 0.000 0.308 0.012 0.064
#> SRR1431847 5 0.5900 0.49695 0.212 0.000 0.188 0.000 0.600
#> SRR1317155 1 0.3035 0.54861 0.856 0.000 0.112 0.000 0.032
#> SRR1477405 1 0.4240 0.36827 0.736 0.000 0.036 0.228 0.000
#> SRR655289 5 0.5479 0.35767 0.436 0.000 0.052 0.004 0.508
#> SRR1341683 3 0.6495 0.18851 0.400 0.000 0.468 0.020 0.112
#> SRR1084790 1 0.7849 -0.33799 0.380 0.000 0.072 0.244 0.304
#> SRR1073731 1 0.7250 -0.23769 0.444 0.000 0.348 0.160 0.048
#> SRR1332588 5 0.5405 0.59721 0.204 0.000 0.136 0.000 0.660
#> SRR1471157 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR654945 4 0.7552 0.87920 0.288 0.000 0.296 0.376 0.040
#> SRR661028 1 0.5988 -0.16538 0.552 0.000 0.080 0.352 0.016
#> SRR1413477 2 0.4982 0.78810 0.000 0.556 0.000 0.412 0.032
#> SRR1101152 1 0.5203 0.17784 0.648 0.000 0.080 0.272 0.000
#> SRR1358435 2 0.0798 0.72113 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR2165273 1 0.0290 0.57046 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1379014 1 0.3003 0.55042 0.864 0.000 0.092 0.000 0.044
#> SRR1489904 3 0.6248 -0.05646 0.072 0.000 0.484 0.416 0.028
#> SRR1416386 2 0.0290 0.71910 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1406048 1 0.3849 0.51021 0.808 0.000 0.080 0.000 0.112
#> SRR606982 5 0.1557 0.70012 0.008 0.000 0.052 0.000 0.940
#> SRR1358082 1 0.4342 0.35421 0.728 0.000 0.040 0.232 0.000
#> SRR1312934 3 0.7513 -0.47598 0.224 0.000 0.416 0.312 0.048
#> SRR655194 1 0.2536 0.57120 0.904 0.000 0.052 0.032 0.012
#> SRR1331174 2 0.5077 0.78793 0.000 0.536 0.000 0.428 0.036
#> SRR1473251 2 0.2790 0.68035 0.000 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR1389820 3 0.4316 0.25456 0.000 0.000 0.772 0.108 0.120
#> SRR1074289 1 0.6884 -0.48122 0.460 0.000 0.148 0.364 0.028
#> SRR1348816 2 0.4295 0.76670 0.000 0.740 0.000 0.216 0.044
#> SRR1076292 3 0.5559 0.25644 0.380 0.000 0.544 0.000 0.076
#> SRR1395810 2 0.4294 0.79139 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1498909 3 0.6025 0.31398 0.264 0.000 0.616 0.028 0.092
#> SRR1443507 1 0.6738 -0.48818 0.460 0.000 0.160 0.364 0.016
#> SRR1452310 1 0.3507 0.55376 0.844 0.000 0.104 0.036 0.016
#> SRR665610 1 0.4713 0.43343 0.740 0.000 0.088 0.004 0.168
#> SRR1347322 1 0.4400 0.36835 0.736 0.000 0.052 0.212 0.000
#> SRR813395 2 0.0510 0.72572 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1477256 1 0.4224 0.38096 0.744 0.000 0.040 0.216 0.000
#> SRR1470230 5 0.1557 0.70012 0.008 0.000 0.052 0.000 0.940
#> SRR1354247 1 0.2615 0.55375 0.892 0.000 0.020 0.080 0.008
#> SRR1082640 2 0.4291 0.79086 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1487592 1 0.7348 -0.68725 0.400 0.000 0.196 0.364 0.040
#> SRR1352299 1 0.5799 -0.12110 0.564 0.000 0.112 0.324 0.000
#> SRR1076317 2 0.0290 0.71941 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1434117 3 0.6878 -0.20233 0.088 0.000 0.460 0.392 0.060
#> SRR1075273 2 0.0404 0.72439 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR658657 5 0.1638 0.69687 0.004 0.000 0.064 0.000 0.932
#> SRR1092773 2 0.0566 0.71808 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1365332 1 0.7048 -0.52933 0.444 0.000 0.152 0.368 0.036
#> SRR615958 3 0.6079 0.09735 0.044 0.000 0.496 0.420 0.040
#> SRR1097688 2 0.0404 0.72086 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1403259 5 0.2707 0.67835 0.008 0.000 0.132 0.000 0.860
#> SRR1099120 2 0.1043 0.69506 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1362200 3 0.6239 0.00841 0.060 0.000 0.484 0.420 0.036
#> SRR1464856 2 0.4902 0.78949 0.000 0.564 0.000 0.408 0.028
#> SRR1347298 3 0.5255 0.26308 0.012 0.000 0.556 0.404 0.028
#> SRR1075923 2 0.0290 0.71531 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1100703 1 0.6118 -0.09576 0.576 0.000 0.120 0.292 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 1 0.2206 0.69066 0.904 0.000 0.008 0.064 0.024 0.000
#> SRR1436370 2 0.3448 0.94748 0.000 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280
#> SRR1075752 6 0.1267 0.84348 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1397949 1 0.3810 0.30032 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.3346 0.65324 0.840 0.000 0.024 0.080 0.056 0.000
#> SRR1329744 1 0.4474 0.66189 0.744 0.000 0.036 0.160 0.060 0.000
#> SRR657384 1 0.1757 0.70461 0.928 0.000 0.012 0.052 0.008 0.000
#> SRR1351190 1 0.1327 0.70187 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR818573 1 0.3531 0.53922 0.672 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.3435 0.65564 0.804 0.000 0.000 0.136 0.060 0.000
#> SRR1410742 1 0.2307 0.68369 0.896 0.000 0.004 0.068 0.032 0.000
#> SRR1435963 1 0.1232 0.72674 0.956 0.000 0.016 0.024 0.004 0.000
#> SRR1382416 1 0.5935 0.43421 0.536 0.004 0.284 0.164 0.012 0.000
#> SRR1391354 5 0.3782 0.25552 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1087968 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1310075 1 0.2706 0.72410 0.852 0.000 0.124 0.024 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.5027 0.64659 0.692 0.004 0.136 0.152 0.016 0.000
#> SRR1325138 1 0.3374 0.64679 0.836 0.000 0.024 0.048 0.092 0.000
#> SRR1326821 5 0.2201 0.68330 0.048 0.000 0.052 0.000 0.900 0.000
#> SRR1490178 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR655613 3 0.2562 0.73583 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.3521 0.75519 0.000 0.044 0.000 0.156 0.004 0.796
#> SRR1443871 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1102489 6 0.0260 0.84130 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1465758 1 0.3745 0.69836 0.784 0.000 0.100 0.116 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.2870 0.64060 0.004 0.040 0.856 0.100 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.1926 0.71888 0.912 0.000 0.068 0.020 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1479109 3 0.1956 0.74839 0.080 0.000 0.908 0.008 0.004 0.000
#> SRR1399069 1 0.4218 0.55110 0.736 0.000 0.000 0.108 0.156 0.000
#> SRR1366450 3 0.2003 0.74956 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.3764 0.69182 0.792 0.000 0.040 0.148 0.020 0.000
#> SRR1457176 3 0.3390 0.59245 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.1501 0.83619 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1434736 5 0.4940 0.48228 0.144 0.004 0.004 0.168 0.680 0.000
#> SRR1080560 6 0.0458 0.84429 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1322882 3 0.2558 0.74217 0.156 0.000 0.840 0.004 0.000 0.000
#> SRR1435688 6 0.5572 0.16800 0.000 0.296 0.000 0.152 0.004 0.548
#> SRR1327614 1 0.4605 0.66170 0.716 0.004 0.164 0.112 0.004 0.000
#> SRR658152 1 0.3854 0.58343 0.772 0.000 0.000 0.136 0.092 0.000
#> SRR1368141 4 0.7158 0.61703 0.336 0.060 0.092 0.452 0.060 0.000
#> SRR1440268 1 0.4238 0.67482 0.760 0.000 0.040 0.160 0.040 0.000
#> SRR1453725 3 0.3659 0.45565 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 6 0.5621 -0.30233 0.000 0.400 0.000 0.128 0.004 0.468
#> SRR1477930 1 0.1480 0.71400 0.940 0.000 0.020 0.040 0.000 0.000
#> SRR1477591 3 0.2482 0.74377 0.148 0.000 0.848 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416049 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR656275 1 0.4236 0.54119 0.772 0.000 0.088 0.112 0.028 0.000
#> SRR1369052 1 0.1789 0.71231 0.924 0.000 0.044 0.032 0.000 0.000
#> SRR1377735 3 0.5242 0.55427 0.256 0.004 0.620 0.116 0.004 0.000
#> SRR1331244 1 0.3852 0.40778 0.612 0.000 0.004 0.000 0.384 0.000
#> SRR1404531 1 0.4063 0.32469 0.572 0.004 0.420 0.000 0.004 0.000
#> SRR1324331 1 0.4209 0.36088 0.588 0.000 0.004 0.012 0.396 0.000
#> SRR1458890 4 0.7145 0.58353 0.352 0.060 0.060 0.440 0.088 0.000
#> SRR1432695 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1407624 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1431969 3 0.4822 0.45990 0.024 0.100 0.708 0.168 0.000 0.000
#> SRR1087393 6 0.2700 0.77621 0.000 0.004 0.000 0.156 0.004 0.836
#> SRR1077263 5 0.2378 0.60530 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1385211 1 0.3804 0.52864 0.656 0.000 0.336 0.008 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.1757 0.70570 0.928 0.000 0.008 0.052 0.012 0.000
#> SRR656922 1 0.2257 0.71378 0.876 0.000 0.116 0.008 0.000 0.000
#> SRR1361630 5 0.4165 0.15817 0.000 0.000 0.452 0.012 0.536 0.000
#> SRR1318966 6 0.1151 0.84799 0.000 0.032 0.000 0.012 0.000 0.956
#> SRR1407087 3 0.2826 0.66436 0.024 0.008 0.856 0.112 0.000 0.000
#> SRR603212 3 0.2491 0.73850 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1485190 4 0.6453 0.57719 0.124 0.048 0.236 0.568 0.024 0.000
#> SRR1332232 2 0.4328 0.90653 0.000 0.672 0.000 0.040 0.004 0.284
#> SRR1312645 1 0.3388 0.67112 0.804 0.004 0.000 0.156 0.036 0.000
#> SRR1457835 3 0.4040 0.56657 0.304 0.004 0.676 0.012 0.004 0.000
#> SRR1347123 3 0.2924 0.68394 0.028 0.024 0.864 0.084 0.000 0.000
#> SRR1465501 6 0.1327 0.84199 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1330878 3 0.5829 -0.04608 0.000 0.160 0.500 0.332 0.008 0.000
#> SRR1445064 4 0.6688 0.56740 0.392 0.008 0.124 0.416 0.060 0.000
#> SRR1452981 1 0.2461 0.68949 0.888 0.000 0.004 0.064 0.044 0.000
#> SRR1326708 3 0.3221 0.69333 0.220 0.000 0.772 0.004 0.004 0.000
#> SRR1407157 1 0.3409 0.59075 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1397697 2 0.3426 0.95052 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1477316 1 0.2803 0.66835 0.872 0.000 0.012 0.064 0.052 0.000
#> SRR1077898 3 0.4983 0.60868 0.208 0.000 0.644 0.000 0.148 0.000
#> SRR1349080 5 0.0146 0.69972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1076096 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR811261 6 0.1765 0.81912 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1375485 1 0.3659 0.44317 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.3309 0.94982 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR604414 3 0.2378 0.74344 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.6013 0.38297 0.520 0.004 0.308 0.152 0.016 0.000
#> SRR812060 3 0.1501 0.69382 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR602082 3 0.4172 0.23510 0.424 0.000 0.564 0.008 0.004 0.000
#> SRR1069490 6 0.1204 0.84445 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1078417 2 0.5377 0.73327 0.000 0.548 0.000 0.112 0.004 0.336
#> SRR661613 3 0.2511 0.73191 0.064 0.000 0.880 0.056 0.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.2797 0.67163 0.872 0.000 0.016 0.076 0.036 0.000
#> SRR660426 3 0.2823 0.71432 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.5105 0.17991 0.640 0.000 0.100 0.248 0.012 0.000
#> SRR661064 1 0.1829 0.70223 0.928 0.000 0.008 0.028 0.036 0.000
#> SRR1082011 2 0.5266 0.74922 0.000 0.560 0.000 0.100 0.004 0.336
#> SRR1452718 3 0.3134 0.71156 0.208 0.004 0.784 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353243 3 0.5265 0.32343 0.384 0.004 0.532 0.076 0.004 0.000
#> SRR1455482 1 0.4719 0.29412 0.560 0.004 0.400 0.032 0.004 0.000
#> SRR1313473 1 0.3409 0.59376 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.2969 0.69236 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.2425 0.71623 0.880 0.000 0.100 0.012 0.008 0.000
#> SRR1317470 5 0.3371 0.43318 0.000 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1337707 4 0.6318 0.62368 0.276 0.008 0.084 0.552 0.080 0.000
#> SRR1408752 2 0.5176 0.82114 0.000 0.600 0.000 0.108 0.004 0.288
#> SRR1474617 4 0.6030 0.49502 0.000 0.228 0.096 0.592 0.084 0.000
#> SRR1398013 1 0.2937 0.63307 0.848 0.000 0.000 0.096 0.056 0.000
#> SRR1352918 5 0.1556 0.68424 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1420750 3 0.2871 0.72849 0.192 0.000 0.804 0.004 0.000 0.000
#> SRR1071785 4 0.6719 0.62855 0.268 0.020 0.136 0.520 0.056 0.000
#> SRR1353618 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1082217 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1357256 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1490313 1 0.2151 0.69535 0.904 0.000 0.016 0.072 0.008 0.000
#> SRR1366560 1 0.3463 0.66009 0.748 0.004 0.240 0.008 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.3489 0.60800 0.708 0.000 0.288 0.004 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.1418 0.67149 0.000 0.000 0.032 0.024 0.944 0.000
#> SRR1313494 1 0.1649 0.71719 0.932 0.000 0.032 0.036 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.3508 0.65081 0.800 0.000 0.000 0.132 0.068 0.000
#> SRR607911 1 0.3448 0.62435 0.716 0.000 0.280 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.1958 0.75059 0.100 0.000 0.896 0.004 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.4117 0.61766 0.740 0.004 0.000 0.192 0.064 0.000
#> SRR1088631 6 0.5056 0.52177 0.000 0.220 0.000 0.132 0.004 0.644
#> SRR1092842 6 0.0790 0.84716 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR615575 3 0.1806 0.68388 0.000 0.004 0.908 0.088 0.000 0.000
#> SRR1079434 5 0.0146 0.69972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1325559 1 0.4320 0.51810 0.640 0.004 0.332 0.020 0.004 0.000
#> SRR1446695 5 0.1957 0.64442 0.000 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1383883 1 0.4258 0.68272 0.756 0.004 0.084 0.148 0.008 0.000
#> SRR1396100 5 0.2100 0.66704 0.112 0.000 0.000 0.004 0.884 0.000
#> SRR1475697 1 0.4777 0.53196 0.688 0.004 0.004 0.204 0.100 0.000
#> SRR1488067 6 0.1387 0.84041 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1102103 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1105154 6 0.0363 0.84412 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1084991 6 0.2821 0.78927 0.000 0.040 0.000 0.096 0.004 0.860
#> SRR1410380 3 0.4319 0.17769 0.000 0.000 0.576 0.024 0.400 0.000
#> SRR1445490 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1454671 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1435044 1 0.3733 0.65765 0.764 0.004 0.020 0.204 0.008 0.000
#> SRR1485812 4 0.6170 0.51269 0.212 0.000 0.072 0.580 0.136 0.000
#> SRR1078020 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1311153 3 0.4697 0.43279 0.348 0.000 0.600 0.048 0.004 0.000
#> SRR1376406 2 0.3448 0.94748 0.000 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280
#> SRR1343898 5 0.6740 -0.09742 0.000 0.096 0.116 0.372 0.416 0.000
#> SRR807775 3 0.2527 0.64998 0.000 0.024 0.868 0.108 0.000 0.000
#> SRR1409215 6 0.4873 0.56119 0.000 0.160 0.000 0.160 0.004 0.676
#> SRR820427 5 0.0146 0.69972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1100656 6 0.0363 0.84412 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1362159 1 0.4334 0.45694 0.616 0.004 0.360 0.016 0.004 0.000
#> SRR1414536 5 0.1327 0.67946 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR656794 3 0.2789 0.74616 0.088 0.000 0.864 0.004 0.044 0.000
#> SRR604653 3 0.3499 0.53954 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.4667 0.48625 0.092 0.000 0.016 0.180 0.712 0.000
#> SRR1485912 3 0.2700 0.74483 0.156 0.004 0.836 0.004 0.000 0.000
#> SRR1407602 5 0.0260 0.69649 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1356164 1 0.6016 0.07614 0.572 0.004 0.092 0.276 0.056 0.000
#> SRR1328692 1 0.3241 0.66031 0.824 0.000 0.112 0.064 0.000 0.000
#> SRR1362438 3 0.2996 0.68774 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.3936 0.55467 0.000 0.084 0.772 0.140 0.004 0.000
#> SRR1358041 1 0.2066 0.72185 0.904 0.000 0.072 0.024 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.1995 0.73555 0.052 0.000 0.912 0.036 0.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.2685 0.74357 0.072 0.000 0.868 0.060 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1501043 5 0.4289 0.31814 0.012 0.004 0.008 0.340 0.636 0.000
#> SRR1437256 4 0.7107 0.56981 0.368 0.056 0.056 0.428 0.092 0.000
#> SRR1487446 1 0.2711 0.69022 0.872 0.004 0.000 0.068 0.056 0.000
#> SRR816653 3 0.4799 0.60200 0.252 0.000 0.656 0.088 0.004 0.000
#> SRR815164 1 0.7029 0.27593 0.440 0.000 0.116 0.156 0.288 0.000
#> SRR1442043 1 0.3138 0.66506 0.832 0.000 0.000 0.108 0.060 0.000
#> SRR1410573 1 0.4739 0.58428 0.664 0.004 0.260 0.068 0.004 0.000
#> SRR1096782 6 0.4739 0.60273 0.000 0.144 0.000 0.160 0.004 0.692
#> SRR1352369 3 0.2250 0.71882 0.040 0.000 0.896 0.064 0.000 0.000
#> SRR1382934 4 0.6474 0.59509 0.140 0.060 0.188 0.588 0.024 0.000
#> SRR1465208 1 0.2506 0.73229 0.880 0.000 0.052 0.068 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.6678 0.11183 0.364 0.004 0.420 0.164 0.048 0.000
#> SRR1470291 1 0.3266 0.63431 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.3000 0.64458 0.008 0.044 0.852 0.096 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.4233 0.67971 0.140 0.000 0.752 0.100 0.008 0.000
#> SRR816123 6 0.1501 0.83619 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR614779 3 0.4256 -0.03684 0.000 0.000 0.520 0.016 0.464 0.000
#> SRR810783 3 0.2278 0.74922 0.128 0.000 0.868 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.3876 0.69972 0.796 0.004 0.056 0.128 0.016 0.000
#> SRR1410356 3 0.1151 0.73793 0.032 0.000 0.956 0.012 0.000 0.000
#> SRR808106 5 0.0146 0.69972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR662713 3 0.2163 0.74896 0.092 0.000 0.892 0.016 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1480964 3 0.5411 -0.00296 0.132 0.000 0.532 0.336 0.000 0.000
#> SRR809382 4 0.5445 0.56801 0.116 0.016 0.132 0.692 0.044 0.000
#> SRR665417 1 0.1984 0.71476 0.912 0.000 0.056 0.032 0.000 0.000
#> SRR1088016 6 0.2178 0.77414 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1453166 6 0.0291 0.83912 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1069826 6 0.3683 0.76584 0.000 0.052 0.000 0.160 0.004 0.784
#> SRR1077781 6 0.4841 0.56513 0.000 0.160 0.000 0.156 0.004 0.680
#> SRR615623 3 0.6038 -0.18237 0.000 0.156 0.456 0.372 0.016 0.000
#> SRR1413787 5 0.6615 0.19200 0.000 0.132 0.260 0.096 0.512 0.000
#> SRR1478207 3 0.5443 0.14670 0.112 0.008 0.556 0.324 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.3458 0.71254 0.824 0.004 0.080 0.088 0.004 0.000
#> SRR1313711 2 0.3309 0.94982 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1326560 1 0.2454 0.70448 0.876 0.000 0.004 0.104 0.016 0.000
#> SRR1309051 3 0.2697 0.72743 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1395616 1 0.3633 0.69327 0.792 0.000 0.056 0.148 0.004 0.000
#> SRR1074956 6 0.1444 0.83838 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1092961 6 0.1610 0.83009 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR817210 3 0.3196 0.70594 0.108 0.000 0.828 0.064 0.000 0.000
#> SRR1319221 4 0.5872 0.50685 0.000 0.224 0.096 0.608 0.072 0.000
#> SRR1405413 1 0.5065 0.62357 0.664 0.004 0.180 0.148 0.004 0.000
#> SRR607807 1 0.4264 0.68986 0.760 0.004 0.108 0.120 0.008 0.000
#> SRR1390160 3 0.5322 0.33509 0.132 0.012 0.624 0.232 0.000 0.000
#> SRR1406283 3 0.2163 0.74892 0.092 0.000 0.892 0.016 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.2818 0.68298 0.876 0.000 0.024 0.048 0.052 0.000
#> SRR1080742 6 0.1501 0.83619 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1468208 1 0.3620 0.71070 0.816 0.004 0.088 0.084 0.008 0.000
#> SRR1312766 3 0.1462 0.74653 0.056 0.000 0.936 0.008 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.3492 0.69270 0.816 0.004 0.016 0.136 0.028 0.000
#> SRR1311224 3 0.2260 0.74649 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.3349 0.67529 0.244 0.000 0.748 0.008 0.000 0.000
#> SRR1099720 6 0.3527 0.75334 0.000 0.040 0.000 0.164 0.004 0.792
#> SRR1349250 6 0.0692 0.82906 0.000 0.020 0.000 0.004 0.000 0.976
#> SRR1350912 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1357127 3 0.3756 0.72728 0.152 0.012 0.788 0.048 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1317022 3 0.5477 0.18858 0.000 0.156 0.576 0.264 0.004 0.000
#> SRR1332879 3 0.2219 0.74688 0.136 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 5 0.9054 -0.04265 0.080 0.048 0.232 0.248 0.292 0.100
#> SRR1076144 2 0.4191 0.91067 0.000 0.676 0.000 0.040 0.000 0.284
#> SRR1069614 6 0.0458 0.84429 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR818239 6 0.0260 0.84257 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1421069 6 0.0458 0.84542 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1500006 3 0.3482 0.54762 0.316 0.000 0.684 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.4310 0.36883 0.580 0.000 0.396 0.000 0.024 0.000
#> SRR1092232 4 0.6034 0.55894 0.064 0.096 0.100 0.672 0.068 0.000
#> SRR1344253 3 0.4639 0.45202 0.016 0.004 0.660 0.032 0.288 0.000
#> SRR1384290 1 0.3198 0.64763 0.740 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.1296 0.71511 0.004 0.000 0.948 0.044 0.004 0.000
#> SRR1343522 2 0.5465 0.64364 0.000 0.508 0.000 0.112 0.004 0.376
#> SRR1326727 2 0.5121 0.83195 0.000 0.608 0.000 0.104 0.004 0.284
#> SRR1440940 1 0.3928 0.56864 0.792 0.012 0.004 0.120 0.072 0.000
#> SRR818372 1 0.2510 0.69174 0.884 0.000 0.028 0.080 0.008 0.000
#> SRR1323675 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR819894 5 0.1843 0.68578 0.080 0.000 0.004 0.004 0.912 0.000
#> SRR1310031 3 0.4459 0.47487 0.000 0.132 0.712 0.156 0.000 0.000
#> SRR615419 4 0.6828 0.54933 0.352 0.040 0.028 0.448 0.132 0.000
#> SRR1436925 1 0.2537 0.70738 0.872 0.000 0.096 0.032 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.4270 0.67841 0.748 0.004 0.088 0.156 0.004 0.000
#> SRR1332566 1 0.3812 0.69427 0.788 0.004 0.064 0.140 0.004 0.000
#> SRR1490228 4 0.6246 0.41447 0.080 0.040 0.396 0.468 0.016 0.000
#> SRR1442949 5 0.0653 0.69882 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980 0.000
#> SRR1466239 1 0.4012 0.69107 0.772 0.004 0.144 0.076 0.004 0.000
#> SRR1094003 6 0.5509 -0.10092 0.000 0.364 0.000 0.120 0.004 0.512
#> SRR1329971 3 0.5081 0.60664 0.204 0.000 0.660 0.124 0.012 0.000
#> SRR813076 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1097642 6 0.3558 0.75291 0.000 0.044 0.000 0.160 0.004 0.792
#> SRR1322981 3 0.1003 0.73263 0.020 0.000 0.964 0.016 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.3448 0.94748 0.000 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280
#> SRR1471713 3 0.3336 0.59857 0.000 0.056 0.812 0.132 0.000 0.000
#> SRR660522 3 0.1625 0.70917 0.012 0.000 0.928 0.060 0.000 0.000
#> SRR815374 1 0.2145 0.71346 0.900 0.000 0.072 0.028 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.1444 0.83838 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1416337 5 0.4264 0.08845 0.000 0.000 0.492 0.016 0.492 0.000
#> SRR1316438 4 0.5620 0.55433 0.112 0.016 0.100 0.688 0.084 0.000
#> SRR1386844 1 0.3077 0.72083 0.852 0.000 0.052 0.084 0.012 0.000
#> SRR1373718 1 0.3354 0.70728 0.812 0.000 0.128 0.060 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1487128 1 0.3588 0.70875 0.816 0.004 0.064 0.108 0.008 0.000
#> SRR1441421 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1069919 2 0.3426 0.95416 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1460296 1 0.3866 0.09402 0.516 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.4768 0.65225 0.728 0.004 0.040 0.164 0.064 0.000
#> SRR1393404 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1081425 3 0.3499 0.54014 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 4 0.6280 0.28873 0.000 0.160 0.404 0.408 0.028 0.000
#> SRR1071337 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1071983 6 0.4467 0.68148 0.000 0.112 0.000 0.164 0.004 0.720
#> SRR1331793 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1410510 3 0.4894 0.40318 0.000 0.144 0.672 0.180 0.004 0.000
#> SRR1098761 6 0.1501 0.83619 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1312124 1 0.3073 0.68010 0.816 0.004 0.000 0.164 0.016 0.000
#> SRR615395 3 0.1967 0.74998 0.084 0.000 0.904 0.012 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.1528 0.70872 0.936 0.000 0.016 0.048 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.2113 0.72045 0.908 0.004 0.060 0.028 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR816201 1 0.2947 0.68111 0.864 0.000 0.032 0.080 0.024 0.000
#> SRR1488514 6 0.5489 -0.02497 0.000 0.340 0.000 0.124 0.004 0.532
#> SRR655840 1 0.3439 0.61412 0.808 0.000 0.000 0.120 0.072 0.000
#> SRR1379303 1 0.4124 0.69162 0.772 0.004 0.124 0.092 0.008 0.000
#> SRR1418516 5 0.4309 0.35795 0.296 0.000 0.000 0.044 0.660 0.000
#> SRR613174 3 0.1806 0.68365 0.000 0.004 0.908 0.088 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.1340 0.71819 0.008 0.004 0.948 0.040 0.000 0.000
#> SRR659157 4 0.6383 0.22681 0.308 0.000 0.012 0.384 0.296 0.000
#> SRR1480408 1 0.2063 0.70080 0.912 0.000 0.020 0.060 0.008 0.000
#> SRR657857 1 0.3274 0.67189 0.804 0.004 0.000 0.168 0.024 0.000
#> SRR1073317 2 0.5164 0.79602 0.000 0.584 0.000 0.096 0.004 0.316
#> SRR1332526 1 0.1970 0.70344 0.912 0.000 0.028 0.060 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.1814 0.81495 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1431270 4 0.6211 0.17582 0.184 0.004 0.012 0.452 0.348 0.000
#> SRR1085614 6 0.3073 0.76603 0.000 0.016 0.000 0.164 0.004 0.816
#> SRR1330106 1 0.6467 -0.50529 0.448 0.004 0.108 0.380 0.060 0.000
#> SRR1466154 3 0.2762 0.72209 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.2234 0.72237 0.872 0.000 0.124 0.004 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.3309 0.94982 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1457267 1 0.4357 0.67301 0.736 0.004 0.172 0.084 0.004 0.000
#> SRR614659 1 0.2798 0.68234 0.852 0.000 0.112 0.036 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.3348 0.70841 0.216 0.000 0.768 0.016 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.4052 0.68714 0.772 0.004 0.068 0.148 0.008 0.000
#> SRR1473696 3 0.2300 0.74480 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 3 0.3531 0.52297 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.3448 0.94748 0.000 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280
#> SRR1096363 6 0.0405 0.84119 0.000 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988
#> SRR1453662 1 0.2221 0.71309 0.896 0.000 0.072 0.032 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1353499 3 0.2631 0.73185 0.180 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.3295 0.70905 0.816 0.000 0.128 0.056 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.1863 0.72924 0.036 0.000 0.920 0.044 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.3898 0.52440 0.652 0.000 0.336 0.012 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.5242 0.78433 0.000 0.576 0.000 0.104 0.004 0.316
#> SRR1498183 1 0.3843 0.21940 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.4503 0.45011 0.000 0.108 0.700 0.192 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR658597 6 0.1204 0.84445 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1089595 6 0.3521 0.75519 0.000 0.044 0.000 0.156 0.004 0.796
#> SRR1074263 6 0.5432 0.33734 0.000 0.248 0.000 0.160 0.004 0.588
#> SRR1376786 3 0.1910 0.74993 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.2178 0.74779 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 3 0.2378 0.74799 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 6 0.0146 0.84072 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1332754 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR662438 3 0.4015 0.35022 0.396 0.004 0.596 0.000 0.004 0.000
#> SRR1335355 1 0.3499 0.56227 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.1863 0.72781 0.036 0.000 0.920 0.044 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.3279 0.62113 0.000 0.060 0.828 0.108 0.004 0.000
#> SRR1381711 5 0.0363 0.70000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR657985 5 0.4129 -0.02842 0.004 0.000 0.496 0.004 0.496 0.000
#> SRR1314810 3 0.5432 0.53111 0.212 0.004 0.612 0.168 0.004 0.000
#> SRR1336505 1 0.5961 -0.40760 0.420 0.000 0.188 0.388 0.004 0.000
#> SRR1474095 1 0.4504 0.24486 0.540 0.004 0.432 0.024 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.3309 0.94982 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1442376 1 0.3996 0.61782 0.752 0.000 0.000 0.168 0.080 0.000
#> SRR1074909 6 0.1327 0.84209 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1101200 3 0.1225 0.73999 0.036 0.000 0.952 0.012 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1367150 5 0.3337 0.50683 0.260 0.000 0.000 0.004 0.736 0.000
#> SRR1313406 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1068880 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1467277 5 0.0146 0.69972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1084867 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1095431 6 0.1204 0.84445 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1380184 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1443113 3 0.3500 0.71377 0.204 0.000 0.768 0.028 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.1682 0.70446 0.000 0.000 0.928 0.052 0.020 0.000
#> SRR1315912 3 0.3121 0.72568 0.192 0.000 0.796 0.008 0.004 0.000
#> SRR1075778 2 0.4870 0.85069 0.000 0.624 0.000 0.076 0.004 0.296
#> SRR1421116 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR602282 4 0.7113 0.61546 0.348 0.048 0.096 0.444 0.064 0.000
#> SRR1361195 2 0.3840 0.93032 0.000 0.696 0.000 0.020 0.000 0.284
#> SRR600493 3 0.2631 0.73149 0.180 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.2402 0.74640 0.140 0.000 0.856 0.004 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.1398 0.71382 0.008 0.000 0.940 0.052 0.000 0.000
#> SRR1360785 5 0.1501 0.68613 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR810437 4 0.6559 0.60991 0.332 0.008 0.152 0.468 0.040 0.000
#> SRR1361860 1 0.2351 0.70930 0.904 0.000 0.032 0.036 0.028 0.000
#> SRR1441311 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1098903 5 0.3843 0.14844 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1457619 1 0.3194 0.67564 0.808 0.004 0.000 0.168 0.020 0.000
#> SRR1498529 1 0.1794 0.71138 0.924 0.000 0.040 0.036 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.3266 0.95420 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1074017 6 0.2982 0.76747 0.000 0.012 0.000 0.164 0.004 0.820
#> SRR1472033 2 0.5627 0.59007 0.000 0.484 0.000 0.132 0.004 0.380
#> SRR1445087 4 0.5967 0.45528 0.020 0.072 0.344 0.536 0.028 0.000
#> SRR1399525 6 0.1958 0.81676 0.000 0.100 0.000 0.004 0.000 0.896
#> SRR1312844 6 0.1556 0.83330 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1085874 6 0.1444 0.83838 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1101226 6 0.1814 0.81495 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1476056 1 0.2563 0.67202 0.876 0.000 0.000 0.072 0.052 0.000
#> SRR1075659 6 0.0458 0.84429 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1311916 3 0.3663 0.56693 0.000 0.068 0.784 0.148 0.000 0.000
#> SRR1353353 4 0.6961 0.62839 0.220 0.072 0.128 0.540 0.040 0.000
#> SRR1073291 3 0.1701 0.68856 0.000 0.008 0.920 0.072 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.2939 0.70340 0.848 0.000 0.016 0.120 0.016 0.000
#> SRR1080720 6 0.3593 0.75048 0.000 0.044 0.000 0.164 0.004 0.788
#> SRR1091695 6 0.0937 0.84721 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1350304 5 0.0405 0.70109 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000
#> SRR663002 3 0.5639 0.16311 0.008 0.132 0.564 0.292 0.004 0.000
#> SRR1376983 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1399926 1 0.3655 0.70432 0.800 0.000 0.088 0.108 0.004 0.000
#> SRR1347144 3 0.3023 0.62232 0.000 0.044 0.836 0.120 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.2340 0.70471 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.1610 0.83034 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR614047 3 0.4063 0.56688 0.020 0.052 0.768 0.160 0.000 0.000
#> SRR818440 1 0.6440 0.03288 0.492 0.004 0.172 0.296 0.036 0.000
#> SRR1337770 1 0.1789 0.71142 0.924 0.000 0.032 0.044 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.2595 0.74441 0.160 0.000 0.836 0.004 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1473959 1 0.2066 0.70693 0.908 0.000 0.040 0.052 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.1074 0.72438 0.012 0.000 0.960 0.028 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR659460 3 0.1863 0.73468 0.044 0.000 0.920 0.036 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.1349 0.70780 0.004 0.000 0.940 0.056 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.1327 0.70123 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1499418 5 0.0665 0.69828 0.008 0.000 0.004 0.008 0.980 0.000
#> SRR1352894 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR815805 1 0.4241 0.68302 0.748 0.004 0.080 0.164 0.004 0.000
#> SRR1331083 6 0.1075 0.84620 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR808272 3 0.2510 0.65324 0.000 0.028 0.872 0.100 0.000 0.000
#> SRR1436698 3 0.2135 0.74866 0.128 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.1501 0.83619 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1357672 3 0.2579 0.74758 0.088 0.000 0.872 0.000 0.040 0.000
#> SRR1351236 3 0.3769 0.44979 0.356 0.000 0.640 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077479 1 0.5825 0.16412 0.460 0.004 0.392 0.140 0.004 0.000
#> SRR814491 5 0.1812 0.68434 0.080 0.000 0.000 0.008 0.912 0.000
#> SRR1101256 2 0.5521 0.69863 0.000 0.528 0.000 0.128 0.004 0.340
#> SRR1436004 3 0.2234 0.74920 0.124 0.000 0.872 0.004 0.000 0.000
#> SRR1457994 6 0.5214 0.45113 0.000 0.224 0.000 0.148 0.004 0.624
#> SRR1078998 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1314707 1 0.1942 0.70082 0.916 0.000 0.012 0.064 0.008 0.000
#> SRR1309534 1 0.4264 0.60024 0.732 0.004 0.000 0.184 0.080 0.000
#> SRR615527 4 0.6190 0.51266 0.016 0.152 0.196 0.596 0.040 0.000
#> SRR1098216 1 0.3569 0.69098 0.792 0.000 0.036 0.164 0.008 0.000
#> SRR1325847 6 0.0937 0.84732 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1404003 1 0.2209 0.69589 0.900 0.000 0.024 0.072 0.004 0.000
#> SRR1344166 1 0.2597 0.69005 0.824 0.000 0.176 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 5 0.3871 0.57234 0.148 0.000 0.000 0.084 0.768 0.000
#> SRR1431429 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1079237 6 0.0692 0.83789 0.000 0.004 0.000 0.020 0.000 0.976
#> SRR1080509 2 0.3309 0.94982 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR815759 5 0.0146 0.69972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1502143 3 0.1480 0.72305 0.020 0.000 0.940 0.040 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.4082 0.51199 0.008 0.048 0.740 0.204 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR820810 1 0.2266 0.70978 0.880 0.000 0.108 0.012 0.000 0.000
#> SRR1099212 6 0.4963 0.47106 0.000 0.236 0.000 0.112 0.004 0.648
#> SRR1083215 3 0.2442 0.74637 0.144 0.000 0.852 0.004 0.000 0.000
#> SRR1476547 6 0.3593 0.75048 0.000 0.044 0.000 0.164 0.004 0.788
#> SRR656421 5 0.2320 0.64055 0.132 0.000 0.004 0.000 0.864 0.000
#> SRR1086116 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1499917 1 0.2863 0.65986 0.864 0.000 0.012 0.088 0.036 0.000
#> SRR1339944 2 0.3670 0.93780 0.000 0.704 0.000 0.012 0.000 0.284
#> SRR1391444 2 0.3426 0.95063 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1434889 1 0.5328 0.37308 0.680 0.000 0.132 0.136 0.052 0.000
#> SRR1431847 5 0.6026 0.05322 0.248 0.004 0.000 0.280 0.468 0.000
#> SRR1317155 1 0.2009 0.68817 0.904 0.000 0.008 0.084 0.004 0.000
#> SRR1477405 3 0.3993 0.03620 0.476 0.000 0.520 0.000 0.004 0.000
#> SRR655289 1 0.4121 0.32183 0.604 0.000 0.016 0.000 0.380 0.000
#> SRR1341683 1 0.5133 0.22119 0.644 0.000 0.064 0.260 0.032 0.000
#> SRR1084790 3 0.4633 0.61164 0.100 0.000 0.676 0.000 0.224 0.000
#> SRR1073731 3 0.6632 -0.30907 0.316 0.000 0.376 0.280 0.028 0.000
#> SRR1332588 5 0.4446 0.28641 0.348 0.000 0.000 0.040 0.612 0.000
#> SRR1471157 2 0.3309 0.94982 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR654945 3 0.0891 0.72454 0.008 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000
#> SRR661028 3 0.2664 0.72951 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.5344 0.68825 0.000 0.528 0.000 0.100 0.004 0.368
#> SRR1101152 3 0.3659 0.44492 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.2009 0.82987 0.000 0.024 0.000 0.068 0.000 0.908
#> SRR2165273 1 0.2664 0.69671 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.1230 0.71595 0.956 0.000 0.008 0.028 0.008 0.000
#> SRR1489904 3 0.2510 0.69261 0.028 0.008 0.884 0.080 0.000 0.000
#> SRR1416386 6 0.1152 0.84786 0.000 0.044 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1406048 1 0.3206 0.67794 0.816 0.004 0.000 0.152 0.028 0.000
#> SRR606982 5 0.0260 0.69978 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1358082 3 0.3868 -0.03294 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.3261 0.67481 0.104 0.000 0.824 0.072 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.1970 0.71516 0.912 0.000 0.060 0.028 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.5246 0.80435 0.000 0.588 0.000 0.112 0.004 0.296
#> SRR1473251 6 0.3593 0.75048 0.000 0.044 0.000 0.164 0.004 0.788
#> SRR1389820 4 0.6075 0.49743 0.000 0.228 0.096 0.596 0.076 0.004
#> SRR1074289 3 0.1753 0.75001 0.084 0.000 0.912 0.004 0.000 0.000
#> SRR1348816 6 0.5437 0.28371 0.000 0.276 0.000 0.144 0.004 0.576
#> SRR1076292 4 0.6241 0.51791 0.312 0.004 0.108 0.524 0.052 0.000
#> SRR1395810 2 0.3309 0.94982 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1498909 4 0.6757 0.60117 0.356 0.008 0.132 0.440 0.064 0.000
#> SRR1443507 3 0.1643 0.74705 0.068 0.000 0.924 0.008 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.3842 0.69250 0.784 0.004 0.112 0.100 0.000 0.000
#> SRR665610 1 0.3210 0.69427 0.852 0.000 0.048 0.032 0.068 0.000
#> SRR1347322 1 0.3833 0.25142 0.556 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.1610 0.83009 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1477256 3 0.4353 0.05021 0.472 0.004 0.512 0.008 0.004 0.000
#> SRR1470230 5 0.1686 0.69156 0.016 0.004 0.016 0.024 0.940 0.000
#> SRR1354247 1 0.2743 0.69641 0.828 0.000 0.164 0.008 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.3288 0.95555 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1487592 3 0.2471 0.71884 0.056 0.004 0.888 0.052 0.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.2664 0.73025 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.0935 0.84778 0.000 0.032 0.000 0.004 0.000 0.964
#> SRR1434117 3 0.1349 0.70513 0.004 0.000 0.940 0.056 0.000 0.000
#> SRR1075273 6 0.1219 0.84731 0.000 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR658657 5 0.2034 0.66411 0.060 0.000 0.004 0.024 0.912 0.000
#> SRR1092773 6 0.1367 0.83526 0.000 0.012 0.000 0.044 0.000 0.944
#> SRR1365332 3 0.1753 0.75043 0.084 0.000 0.912 0.004 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.3328 0.60511 0.000 0.064 0.816 0.120 0.000 0.000
#> SRR1097688 6 0.1007 0.84683 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1403259 5 0.4775 0.40630 0.156 0.000 0.004 0.152 0.688 0.000
#> SRR1099120 6 0.0146 0.84072 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1362200 3 0.2445 0.65292 0.000 0.020 0.872 0.108 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.5217 0.77976 0.000 0.576 0.000 0.100 0.004 0.320
#> SRR1347298 3 0.4232 0.50558 0.000 0.116 0.736 0.148 0.000 0.000
#> SRR1075923 6 0.0508 0.84452 0.000 0.012 0.000 0.004 0.000 0.984
#> SRR1100703 3 0.2882 0.73387 0.180 0.000 0.812 0.008 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.993 0.997 0.4342 0.568 0.568
#> 3 3 0.907 0.930 0.965 0.0983 0.984 0.971
#> 4 4 0.891 0.864 0.942 0.0555 1.000 1.000
#> 5 5 0.664 0.746 0.873 0.2201 0.838 0.708
#> 6 6 0.620 0.724 0.790 0.1260 0.839 0.611
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 1 0.895 0.550 0.688 0.312
#> SRR1398013 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.895 0.550 0.688 0.312
#> SRR1405413 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.971 0.339 0.600 0.400
#> SRR1076144 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 1 0.895 0.550 0.688 0.312
#> SRR1074289 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 0.996 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329744 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351190 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396017 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410742 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435963 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.4555 0.742 0.800 0.000 0.200
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.2165 0.902 0.936 0.000 0.064
#> SRR1326821 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407449 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399069 1 0.4399 0.755 0.812 0.000 0.188
#> SRR1366450 1 0.0892 0.937 0.980 0.000 0.020
#> SRR1396859 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.4750 0.736 0.784 0.000 0.216
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.1860 0.924 0.948 0.000 0.052
#> SRR1368141 1 0.1860 0.924 0.948 0.000 0.052
#> SRR1440268 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1369052 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.4504 0.744 0.804 0.000 0.196
#> SRR1404531 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4504 0.744 0.804 0.000 0.196
#> SRR1458890 1 0.1860 0.924 0.948 0.000 0.052
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR1385211 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR655241 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR603212 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347123 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1445064 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR1452981 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0237 0.945 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077898 1 0.4555 0.738 0.800 0.000 0.200
#> SRR1349080 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR812060 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR602082 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.1964 0.922 0.944 0.000 0.056
#> SRR1420710 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR660426 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR661064 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102467 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317470 1 0.4931 0.710 0.768 0.000 0.232
#> SRR1337707 1 0.2066 0.919 0.940 0.000 0.060
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.4963 0.576 0.008 0.200 0.792
#> SRR1398013 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1352918 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR1420750 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.1860 0.924 0.948 0.000 0.052
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1366560 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.6215 0.221 0.428 0.000 0.572
#> SRR1313494 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400078 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1079434 1 0.4931 0.712 0.768 0.000 0.232
#> SRR1325559 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446695 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR1383883 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR1475697 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.4931 0.710 0.768 0.000 0.232
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR1485812 1 0.1411 0.935 0.964 0.000 0.036
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 1 0.5497 0.613 0.708 0.000 0.292
#> SRR807775 1 0.2537 0.899 0.920 0.000 0.080
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.4931 0.710 0.768 0.000 0.232
#> SRR656794 1 0.4654 0.732 0.792 0.000 0.208
#> SRR604653 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.1411 0.935 0.964 0.000 0.036
#> SRR1485912 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407602 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR1356164 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1328692 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR1362438 1 0.0892 0.937 0.980 0.000 0.020
#> SRR1479216 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1358041 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1468766 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368200 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.6274 0.129 0.456 0.000 0.544
#> SRR1437256 1 0.1860 0.924 0.948 0.000 0.052
#> SRR1487446 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR816653 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442043 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410573 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1382934 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR1465208 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1409600 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 1 0.4931 0.710 0.768 0.000 0.232
#> SRR810783 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333990 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR808106 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR662713 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR809382 1 0.1411 0.935 0.964 0.000 0.036
#> SRR665417 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 1 0.1643 0.930 0.956 0.000 0.044
#> SRR1413787 1 0.5465 0.621 0.712 0.000 0.288
#> SRR1478207 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1411046 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1319221 3 0.4963 0.576 0.008 0.200 0.792
#> SRR1405413 1 0.0747 0.943 0.984 0.000 0.016
#> SRR607807 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR1406283 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1361612 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0747 0.943 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1332879 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.9206 0.506 0.188 0.288 0.524
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.3267 0.846 0.884 0.000 0.116
#> SRR1092232 1 0.2261 0.912 0.932 0.000 0.068
#> SRR1344253 1 0.4504 0.753 0.804 0.000 0.196
#> SRR1384290 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR818372 1 0.1964 0.922 0.944 0.000 0.056
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.5098 0.692 0.752 0.000 0.248
#> SRR1310031 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR615419 1 0.1860 0.924 0.948 0.000 0.052
#> SRR1436925 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0747 0.943 0.984 0.000 0.016
#> SRR1442949 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR1466239 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR660522 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR815374 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.4931 0.710 0.768 0.000 0.232
#> SRR1316438 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1386844 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479349 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1379303 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR613174 1 0.1031 0.941 0.976 0.000 0.024
#> SRR1351125 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR659157 1 0.1964 0.922 0.944 0.000 0.056
#> SRR1480408 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR657857 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.1753 0.928 0.952 0.000 0.048
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1466154 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR659247 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR1317201 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR612659 1 0.1643 0.930 0.956 0.000 0.044
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345995 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1323558 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR1381711 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR657985 1 0.4931 0.710 0.768 0.000 0.232
#> SRR1314810 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1474095 1 0.0747 0.943 0.984 0.000 0.016
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.5058 0.699 0.756 0.000 0.244
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.4887 0.715 0.772 0.000 0.228
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.4654 0.732 0.792 0.000 0.208
#> SRR1315912 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 1 0.1529 0.932 0.960 0.000 0.040
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1360785 1 0.4887 0.711 0.772 0.000 0.228
#> SRR810437 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR1361860 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.4555 0.742 0.800 0.000 0.200
#> SRR1457619 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1498529 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1353353 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR1073291 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1356227 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR663002 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.1860 0.925 0.948 0.000 0.052
#> SRR1384006 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 1 0.1643 0.930 0.956 0.000 0.044
#> SRR818440 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1337770 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1074041 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR816699 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1308612 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR1499418 1 0.5016 0.707 0.760 0.000 0.240
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR1436698 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.4702 0.728 0.788 0.000 0.212
#> SRR1351236 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR615527 1 0.1529 0.932 0.960 0.000 0.040
#> SRR1098216 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1344166 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.5098 0.695 0.752 0.000 0.248
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.5138 0.688 0.748 0.000 0.252
#> SRR1502143 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487614 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0424 0.946 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.4796 0.722 0.780 0.000 0.220
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.1031 0.940 0.976 0.000 0.024
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR1431847 1 0.4702 0.746 0.788 0.000 0.212
#> SRR1317155 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1477405 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.4346 0.762 0.816 0.000 0.184
#> SRR1341683 1 0.1163 0.939 0.972 0.000 0.028
#> SRR1084790 1 0.4555 0.738 0.800 0.000 0.200
#> SRR1073731 1 0.0892 0.943 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332588 1 0.5098 0.692 0.752 0.000 0.248
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.1031 0.941 0.976 0.000 0.024
#> SRR661028 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0747 0.944 0.984 0.000 0.016
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.1753 0.927 0.952 0.000 0.048
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.4796 0.727 0.780 0.000 0.220
#> SRR1358082 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR655194 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.4963 0.576 0.008 0.200 0.792
#> SRR1074289 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR1443507 1 0.0237 0.946 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452310 1 0.0892 0.942 0.980 0.000 0.020
#> SRR665610 1 0.0424 0.945 0.992 0.000 0.008
#> SRR1347322 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.4887 0.724 0.772 0.000 0.228
#> SRR1354247 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.3816 0.829 0.852 0.000 0.148
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 1 0.5058 0.699 0.756 0.000 0.244
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0592 0.945 0.988 0.000 0.012
#> SRR615958 1 0.1643 0.930 0.956 0.000 0.044
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.4605 0.748 0.796 0.000 0.204
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.1031 0.941 0.976 0.000 0.024
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.1289 0.937 0.968 0.000 0.032
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.946 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.1022 0.897 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355723 1 0.0336 0.902 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1329744 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657384 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1351190 1 0.1211 0.894 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396017 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1410742 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1435963 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1382416 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1391354 1 0.4679 0.408 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312244 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325138 1 0.1940 0.859 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1326821 1 0.4830 0.319 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.903 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414058 1 0.0707 0.901 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1407449 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1399069 1 0.4500 0.484 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1366450 1 0.0817 0.896 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1396859 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457176 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.4643 0.453 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658152 1 0.2216 0.860 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1368141 1 0.1792 0.878 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1440268 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453725 1 0.0592 0.903 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477591 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.1022 0.897 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1369052 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1377735 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1331244 1 0.4605 0.432 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1404531 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324331 1 0.4605 0.432 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1458890 1 0.1792 0.878 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.2334 0.860 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.4843 0.316 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1385211 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR655241 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR656922 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361630 1 0.4855 0.305 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.0921 0.899 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR603212 1 0.0000 0.903 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.1211 0.895 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1457835 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347123 1 0.1557 0.886 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.2401 0.856 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1445064 1 0.1389 0.890 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1452981 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326708 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407157 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1077898 1 0.4679 0.394 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1349080 1 0.4855 0.305 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.903 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380614 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR812060 1 0.0817 0.900 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR602082 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.1867 0.876 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1420710 1 0.0817 0.901 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR660426 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416003 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR661064 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353243 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455482 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313473 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399394 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102467 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317470 1 0.4830 0.330 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1337707 1 0.2773 0.833 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.1389 1.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1398013 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1352918 1 0.4955 0.187 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1420750 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071785 1 0.1792 0.878 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1366560 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355684 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323289 4 0.7771 0.434 0.256 0.000 0.320 0.424
#> SRR1313494 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309985 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR607911 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333789 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400078 1 0.0817 0.900 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615575 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079434 1 0.4866 0.298 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1325559 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1446695 1 0.4855 0.305 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1383883 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396100 1 0.4955 0.187 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1475697 1 0.1211 0.896 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.4830 0.330 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.1389 0.890 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1485812 1 0.2469 0.844 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 1 0.5950 0.131 0.544 0.000 0.040 0.416
#> SRR807775 1 0.2281 0.853 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.4855 0.305 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414536 1 0.4866 0.296 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR656794 1 0.4697 0.392 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR604653 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317685 1 0.2530 0.839 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1485912 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1407602 1 0.4961 0.171 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1356164 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328692 1 0.0921 0.900 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1362438 1 0.0817 0.896 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1479216 1 0.2401 0.856 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1358041 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1468766 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1368200 1 0.1302 0.892 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 4 0.7796 0.440 0.284 0.000 0.292 0.424
#> SRR1437256 1 0.1792 0.878 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1487446 1 0.1211 0.894 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR816653 1 0.0000 0.903 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0707 0.904 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1442043 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1410573 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0921 0.902 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1382934 1 0.1940 0.873 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1465208 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1314728 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470291 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308756 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1409600 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614779 1 0.4855 0.307 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR810783 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1333990 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1410356 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR808106 1 0.4855 0.305 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR662713 1 0.0000 0.903 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.1389 0.890 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR809382 1 0.2081 0.867 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR665417 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 1 0.2081 0.866 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1413787 1 0.5873 0.148 0.548 0.000 0.036 0.416
#> SRR1478207 1 0.0921 0.902 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1411046 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309051 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817210 1 0.1389 0.890 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1319221 3 0.1389 1.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1405413 1 0.0817 0.901 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR607807 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390160 1 0.1867 0.875 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1406283 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357709 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312766 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361612 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311224 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087801 1 0.0000 0.903 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0817 0.901 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.2401 0.856 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1332879 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403177 4 0.5887 -0.790 0.004 0.028 0.420 0.548
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485678 1 0.3024 0.772 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1092232 1 0.3428 0.792 0.844 0.000 0.012 0.144
#> SRR1344253 1 0.4543 0.479 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1384290 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089349 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.1637 0.883 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR818372 1 0.1867 0.876 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.4948 0.195 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1310031 1 0.1211 0.894 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR615419 1 0.2149 0.863 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1436925 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477238 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332566 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1490228 1 0.0817 0.901 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1442949 1 0.4955 0.187 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1466239 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.1637 0.883 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR660522 1 0.0707 0.901 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR815374 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.4855 0.307 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1316438 1 0.1302 0.891 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1386844 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1373718 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335489 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401815 1 0.2401 0.856 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.2401 0.856 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615395 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1479349 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2165033 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.1302 0.893 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1379303 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418516 1 0.4948 0.201 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR613174 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1351125 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659157 1 0.2345 0.853 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1480408 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR657857 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.2868 0.815 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.0707 0.903 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1466154 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396944 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614659 1 0.1022 0.897 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR659247 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1317201 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473696 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375842 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0469 0.903 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416693 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070841 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380910 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612659 1 0.2081 0.866 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1345995 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071035 1 0.0000 0.903 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335355 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659448 1 0.0921 0.899 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1323558 1 0.2334 0.860 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR1381711 1 0.4855 0.305 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR657985 1 0.4830 0.330 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1314810 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1336505 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1474095 1 0.0817 0.901 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.4898 0.273 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.4855 0.305 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380414 1 0.4431 0.511 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1315912 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 1 0.1940 0.873 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477653 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355475 1 0.0707 0.901 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1360785 1 0.4866 0.286 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR810437 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1361860 1 0.0707 0.902 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.4679 0.408 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1457619 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1498529 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.1389 0.890 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.2401 0.856 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1353353 1 0.1867 0.875 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1073291 1 0.0921 0.899 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1356227 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.4961 0.171 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR663002 1 0.1557 0.885 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347144 1 0.2401 0.856 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1384006 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614047 1 0.1557 0.885 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR818440 1 0.1389 0.890 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1337770 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399413 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.1302 0.892 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1074041 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0921 0.902 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR816699 1 0.0707 0.901 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1308612 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1499418 1 0.5364 0.295 0.592 0.000 0.016 0.392
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808272 1 0.1211 0.894 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1436698 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.4746 0.372 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1351236 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077479 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR814491 1 0.4955 0.187 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309534 1 0.1211 0.897 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR615527 1 0.1940 0.873 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1098216 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0592 0.903 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1344166 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368638 1 0.4948 0.201 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.4955 0.187 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1502143 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487614 1 0.1867 0.875 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0707 0.901 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656421 1 0.4804 0.332 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0817 0.900 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1431847 1 0.4643 0.458 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1317155 1 0.0592 0.903 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1477405 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR655289 1 0.4543 0.471 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1341683 1 0.1211 0.894 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1084790 1 0.4679 0.394 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1073731 1 0.1022 0.898 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1332588 1 0.4948 0.195 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR661028 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0817 0.901 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1379014 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489904 1 0.1792 0.878 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR606982 1 0.4697 0.420 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1358082 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312934 1 0.1389 0.890 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR655194 1 0.1211 0.897 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.1389 1.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1074289 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0921 0.899 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.1118 0.896 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1443507 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452310 1 0.1022 0.897 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR665610 1 0.0592 0.902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1347322 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470230 1 0.4804 0.362 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1354247 1 0.0188 0.903 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1352299 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.3356 0.758 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658657 1 0.4898 0.273 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0707 0.901 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR615958 1 0.1637 0.883 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.4679 0.424 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.1211 0.894 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.1557 0.886 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0336 0.903 0.992 0.000 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 1 0.4485 0.56295 0.680 0 0.292 0.028 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0771 0.79563 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1355723 1 0.2260 0.79750 0.908 0 0.064 0.028 0.000
#> SRR1329744 1 0.0898 0.79798 0.972 0 0.008 0.020 0.000
#> SRR657384 1 0.4026 0.65624 0.736 0 0.244 0.020 0.000
#> SRR1351190 1 0.5026 0.36221 0.588 0 0.372 0.040 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.2825 0.77135 0.860 0 0.124 0.016 0.000
#> SRR1396017 1 0.2069 0.79681 0.912 0 0.076 0.012 0.000
#> SRR1410742 1 0.1818 0.80112 0.932 0 0.044 0.024 0.000
#> SRR1435963 1 0.0771 0.79400 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1382416 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1391354 3 0.4327 0.54255 0.360 0 0.632 0.008 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1312244 1 0.0693 0.80197 0.980 0 0.008 0.012 0.000
#> SRR1325138 1 0.4132 0.62155 0.720 0 0.260 0.020 0.000
#> SRR1326821 3 0.4026 0.59027 0.244 0 0.736 0.020 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.1386 0.80314 0.952 0 0.032 0.016 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1414058 1 0.4193 0.67250 0.748 0 0.212 0.040 0.000
#> SRR1407449 1 0.1012 0.79906 0.968 0 0.012 0.020 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.2304 0.79013 0.892 0 0.100 0.008 0.000
#> SRR1399069 3 0.4627 0.41007 0.444 0 0.544 0.012 0.000
#> SRR1366450 1 0.1251 0.78775 0.956 0 0.008 0.036 0.000
#> SRR1396859 1 0.0771 0.80066 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1457176 1 0.1310 0.80180 0.956 0 0.024 0.020 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.3789 0.62073 0.224 0 0.760 0.016 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.1579 0.80393 0.944 0 0.032 0.024 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR658152 3 0.5086 0.33809 0.396 0 0.564 0.040 0.000
#> SRR1368141 3 0.5157 0.20101 0.440 0 0.520 0.040 0.000
#> SRR1440268 1 0.0898 0.79798 0.972 0 0.008 0.020 0.000
#> SRR1453725 1 0.1661 0.80409 0.940 0 0.036 0.024 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.1117 0.80305 0.964 0 0.016 0.020 0.000
#> SRR1477591 1 0.1117 0.79754 0.964 0 0.016 0.020 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.4616 0.56251 0.676 0 0.288 0.036 0.000
#> SRR1369052 1 0.1549 0.80248 0.944 0 0.040 0.016 0.000
#> SRR1377735 1 0.0912 0.80149 0.972 0 0.016 0.012 0.000
#> SRR1331244 3 0.4481 0.46500 0.416 0 0.576 0.008 0.000
#> SRR1404531 1 0.0671 0.79289 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1324331 3 0.4481 0.46500 0.416 0 0.576 0.008 0.000
#> SRR1458890 3 0.5157 0.20101 0.440 0 0.520 0.040 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.5390 0.31132 0.412 0 0.536 0.048 0.004
#> SRR1087393 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.3476 0.60083 0.176 0 0.804 0.020 0.000
#> SRR1385211 1 0.1626 0.80195 0.940 0 0.044 0.016 0.000
#> SRR655241 1 0.1469 0.80348 0.948 0 0.036 0.016 0.000
#> SRR656922 1 0.1469 0.80326 0.948 0 0.036 0.016 0.000
#> SRR1361630 3 0.3319 0.59425 0.160 0 0.820 0.020 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.4573 0.60586 0.700 0 0.256 0.044 0.000
#> SRR603212 1 0.1522 0.80301 0.944 0 0.044 0.012 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.4756 0.55334 0.668 0 0.288 0.044 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.1914 0.80052 0.924 0 0.060 0.016 0.000
#> SRR1457835 1 0.2172 0.79329 0.908 0 0.076 0.016 0.000
#> SRR1347123 1 0.5048 0.34108 0.580 0 0.380 0.040 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.5383 0.32234 0.408 0 0.540 0.048 0.004
#> SRR1445064 1 0.4668 0.44389 0.624 0 0.352 0.024 0.000
#> SRR1452981 1 0.0671 0.79983 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1326708 1 0.0865 0.79228 0.972 0 0.004 0.024 0.000
#> SRR1407157 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.2278 0.79528 0.908 0 0.060 0.032 0.000
#> SRR1077898 3 0.4902 0.36417 0.468 0 0.508 0.024 0.000
#> SRR1349080 3 0.3438 0.59801 0.172 0 0.808 0.020 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.1522 0.80301 0.944 0 0.044 0.012 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0771 0.79526 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1380614 1 0.1310 0.80021 0.956 0 0.024 0.020 0.000
#> SRR812060 1 0.4425 0.62936 0.716 0 0.244 0.040 0.000
#> SRR602082 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.5114 -0.03422 0.492 0 0.472 0.036 0.000
#> SRR1420710 1 0.4526 0.55499 0.672 0 0.300 0.028 0.000
#> SRR660426 1 0.0771 0.79539 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1416003 1 0.4747 0.43920 0.620 0 0.352 0.028 0.000
#> SRR661064 1 0.1626 0.80251 0.940 0 0.044 0.016 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1353243 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1455482 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1313473 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1399394 1 0.2046 0.79549 0.916 0 0.068 0.016 0.000
#> SRR1102467 1 0.1216 0.80234 0.960 0 0.020 0.020 0.000
#> SRR1317470 3 0.3675 0.60948 0.188 0 0.788 0.024 0.000
#> SRR1337707 3 0.5231 0.48163 0.316 0 0.624 0.056 0.004
#> SRR1408752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 5 0.0000 1.00000 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398013 1 0.4329 0.54765 0.672 0 0.312 0.016 0.000
#> SRR1352918 3 0.0992 0.41593 0.008 0 0.968 0.024 0.000
#> SRR1420750 1 0.1310 0.80324 0.956 0 0.020 0.024 0.000
#> SRR1071785 3 0.5216 0.20924 0.436 0 0.520 0.044 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.3283 0.75605 0.832 0 0.140 0.028 0.000
#> SRR1366560 1 0.0671 0.79282 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1355684 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1323289 3 0.5268 -0.24352 0.000 0 0.612 0.068 0.320
#> SRR1313494 1 0.0693 0.80151 0.980 0 0.008 0.012 0.000
#> SRR1309985 1 0.0693 0.80197 0.980 0 0.008 0.012 0.000
#> SRR607911 1 0.0865 0.79225 0.972 0 0.004 0.024 0.000
#> SRR1333789 1 0.3810 0.71495 0.788 0 0.176 0.036 0.000
#> SRR1400078 1 0.3456 0.72327 0.800 0 0.184 0.016 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR615575 1 0.4413 0.64529 0.724 0 0.232 0.044 0.000
#> SRR1079434 3 0.3326 0.58596 0.152 0 0.824 0.024 0.000
#> SRR1325559 1 0.2046 0.79819 0.916 0 0.068 0.016 0.000
#> SRR1446695 3 0.3319 0.59425 0.160 0 0.820 0.020 0.000
#> SRR1383883 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1396100 3 0.0992 0.41593 0.008 0 0.968 0.024 0.000
#> SRR1475697 1 0.4161 0.58360 0.704 0 0.280 0.016 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.3675 0.60948 0.188 0 0.788 0.024 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.4546 0.52894 0.668 0 0.304 0.028 0.000
#> SRR1485812 3 0.4948 0.32662 0.436 0 0.536 0.028 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0807 0.79831 0.976 0 0.012 0.012 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.2965 0.36528 0.012 0 0.880 0.068 0.040
#> SRR807775 1 0.5204 0.26730 0.560 0 0.392 0.048 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.3278 0.59042 0.156 0 0.824 0.020 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1414536 3 0.3399 0.59986 0.168 0 0.812 0.020 0.000
#> SRR656794 3 0.4707 0.48826 0.392 0 0.588 0.020 0.000
#> SRR604653 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1317685 3 0.5308 0.35823 0.416 0 0.532 0.052 0.000
#> SRR1485912 1 0.3152 0.76180 0.840 0 0.136 0.024 0.000
#> SRR1407602 3 0.0865 0.40562 0.004 0 0.972 0.024 0.000
#> SRR1356164 1 0.3821 0.74429 0.800 0 0.148 0.052 0.000
#> SRR1328692 1 0.4029 0.67639 0.744 0 0.232 0.024 0.000
#> SRR1362438 1 0.1331 0.78251 0.952 0 0.008 0.040 0.000
#> SRR1479216 3 0.5383 0.32234 0.408 0 0.540 0.048 0.004
#> SRR1358041 1 0.2172 0.79885 0.908 0 0.076 0.016 0.000
#> SRR1468766 1 0.4054 0.68348 0.760 0 0.204 0.036 0.000
#> SRR1368200 1 0.4977 0.40832 0.604 0 0.356 0.040 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.5295 -0.16337 0.004 0 0.636 0.068 0.292
#> SRR1437256 3 0.5157 0.20101 0.440 0 0.520 0.040 0.000
#> SRR1487446 1 0.5002 0.38191 0.596 0 0.364 0.040 0.000
#> SRR816653 1 0.1549 0.80256 0.944 0 0.040 0.016 0.000
#> SRR815164 1 0.2388 0.79473 0.900 0 0.072 0.028 0.000
#> SRR1442043 1 0.2722 0.77910 0.872 0 0.108 0.020 0.000
#> SRR1410573 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.3536 0.73922 0.812 0 0.156 0.032 0.000
#> SRR1382934 3 0.5234 0.12235 0.460 0 0.496 0.044 0.000
#> SRR1465208 1 0.0579 0.80216 0.984 0 0.008 0.008 0.000
#> SRR1314728 1 0.1281 0.80411 0.956 0 0.032 0.012 0.000
#> SRR1470291 1 0.0865 0.79225 0.972 0 0.004 0.024 0.000
#> SRR1308756 1 0.4413 0.64529 0.724 0 0.232 0.044 0.000
#> SRR1409600 1 0.2304 0.79013 0.892 0 0.100 0.008 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR614779 3 0.3438 0.60289 0.172 0 0.808 0.020 0.000
#> SRR810783 1 0.3489 0.74424 0.820 0 0.144 0.036 0.000
#> SRR1333990 1 0.0671 0.79983 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1410356 1 0.3165 0.76678 0.848 0 0.116 0.036 0.000
#> SRR808106 3 0.3278 0.59042 0.156 0 0.824 0.020 0.000
#> SRR662713 1 0.1965 0.79826 0.924 0 0.052 0.024 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.5030 0.41017 0.604 0 0.352 0.044 0.000
#> SRR809382 1 0.5237 -0.04503 0.488 0 0.468 0.044 0.000
#> SRR665417 1 0.1018 0.80042 0.968 0 0.016 0.016 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.5250 0.29393 0.416 0 0.536 0.048 0.000
#> SRR1413787 3 0.2886 0.36872 0.012 0 0.884 0.068 0.036
#> SRR1478207 1 0.3877 0.68801 0.764 0 0.212 0.024 0.000
#> SRR1411046 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1216 0.80188 0.960 0 0.020 0.020 0.000
#> SRR1309051 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0771 0.79651 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR817210 1 0.4599 0.58671 0.688 0 0.272 0.040 0.000
#> SRR1319221 5 0.0000 1.00000 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.3845 0.69468 0.768 0 0.208 0.024 0.000
#> SRR607807 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1390160 1 0.4878 0.16930 0.536 0 0.440 0.024 0.000
#> SRR1406283 1 0.1741 0.80361 0.936 0 0.040 0.024 0.000
#> SRR1357709 1 0.2351 0.78641 0.896 0 0.088 0.016 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1312766 1 0.4180 0.66595 0.744 0 0.220 0.036 0.000
#> SRR1361612 1 0.0771 0.80066 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1311224 1 0.0898 0.79333 0.972 0 0.008 0.020 0.000
#> SRR1087801 1 0.1195 0.80140 0.960 0 0.012 0.028 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.3845 0.69468 0.768 0 0.208 0.024 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.5383 0.32234 0.408 0 0.540 0.048 0.004
#> SRR1332879 1 0.1493 0.80448 0.948 0 0.024 0.028 0.000
#> SRR1403177 4 0.2773 0.00000 0.000 0 0.000 0.836 0.164
#> SRR1076144 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1485678 1 0.4452 0.50062 0.696 0 0.272 0.032 0.000
#> SRR1092232 3 0.5237 0.53586 0.272 0 0.660 0.056 0.012
#> SRR1344253 3 0.4649 0.45996 0.404 0 0.580 0.016 0.000
#> SRR1384290 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1089349 1 0.4413 0.64529 0.724 0 0.232 0.044 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.5049 0.05553 0.484 0 0.484 0.032 0.000
#> SRR818372 1 0.5177 -0.04805 0.488 0 0.472 0.040 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 3 0.1117 0.42690 0.016 0 0.964 0.020 0.000
#> SRR1310031 1 0.4836 0.46173 0.628 0 0.336 0.036 0.000
#> SRR615419 3 0.5204 0.38846 0.368 0 0.580 0.052 0.000
#> SRR1436925 1 0.1597 0.80189 0.940 0 0.048 0.012 0.000
#> SRR1477238 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1332566 1 0.0671 0.80011 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1490228 1 0.3757 0.69817 0.772 0 0.208 0.020 0.000
#> SRR1442949 3 0.0992 0.41593 0.008 0 0.968 0.024 0.000
#> SRR1466239 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.1522 0.80402 0.944 0 0.044 0.012 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.4224 0.66851 0.744 0 0.216 0.040 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.5133 0.29517 0.568 0 0.388 0.044 0.000
#> SRR660522 1 0.3550 0.72911 0.796 0 0.184 0.020 0.000
#> SRR815374 1 0.4963 0.39777 0.608 0 0.352 0.040 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.3438 0.60289 0.172 0 0.808 0.020 0.000
#> SRR1316438 1 0.4777 0.57017 0.680 0 0.268 0.052 0.000
#> SRR1386844 1 0.0671 0.79282 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1373718 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0671 0.79538 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0609 0.79294 0.980 0 0.000 0.020 0.000
#> SRR1335489 1 0.1106 0.79810 0.964 0 0.012 0.024 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1401815 3 0.5383 0.32234 0.408 0 0.540 0.048 0.004
#> SRR1071337 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.5390 0.31151 0.412 0 0.536 0.048 0.004
#> SRR1098761 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0579 0.80216 0.984 0 0.008 0.008 0.000
#> SRR615395 1 0.3193 0.75869 0.840 0 0.132 0.028 0.000
#> SRR1479349 1 0.1012 0.79906 0.968 0 0.012 0.020 0.000
#> SRR2165033 1 0.4880 0.44562 0.616 0 0.348 0.036 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.4733 0.44947 0.624 0 0.348 0.028 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.5036 0.45999 0.628 0 0.320 0.052 0.000
#> SRR1379303 1 0.0671 0.79282 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1418516 3 0.1403 0.44337 0.024 0 0.952 0.024 0.000
#> SRR613174 1 0.5000 0.30792 0.576 0 0.388 0.036 0.000
#> SRR1351125 1 0.3276 0.75557 0.836 0 0.132 0.032 0.000
#> SRR659157 3 0.5263 0.39162 0.368 0 0.576 0.056 0.000
#> SRR1480408 1 0.3779 0.70532 0.776 0 0.200 0.024 0.000
#> SRR657857 1 0.2390 0.79101 0.896 0 0.084 0.020 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.2110 0.79990 0.912 0 0.072 0.016 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.5080 0.50843 0.316 0 0.628 0.056 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.3359 0.73818 0.816 0 0.164 0.020 0.000
#> SRR1466154 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1396944 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR614659 1 0.4016 0.62674 0.716 0 0.272 0.012 0.000
#> SRR659247 1 0.3409 0.73835 0.816 0 0.160 0.024 0.000
#> SRR1317201 1 0.0693 0.80104 0.980 0 0.008 0.012 0.000
#> SRR1473696 1 0.1012 0.80280 0.968 0 0.012 0.020 0.000
#> SRR1375842 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.2777 0.78144 0.864 0 0.120 0.016 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0898 0.79673 0.972 0 0.008 0.020 0.000
#> SRR1416693 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1070841 1 0.3276 0.75548 0.836 0 0.132 0.032 0.000
#> SRR1380910 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.1915 0.80410 0.928 0 0.040 0.032 0.000
#> SRR612659 3 0.5261 0.26925 0.424 0 0.528 0.048 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.3058 0.77455 0.860 0 0.096 0.044 0.000
#> SRR1345995 1 0.2286 0.78392 0.888 0 0.108 0.004 0.000
#> SRR1071035 1 0.1195 0.80140 0.960 0 0.012 0.028 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0671 0.79289 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1335355 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR659448 1 0.4302 0.63444 0.720 0 0.248 0.032 0.000
#> SRR1323558 3 0.5396 0.30128 0.416 0 0.532 0.048 0.004
#> SRR1381711 3 0.3319 0.59425 0.160 0 0.820 0.020 0.000
#> SRR657985 3 0.3675 0.60948 0.188 0 0.788 0.024 0.000
#> SRR1314810 1 0.1281 0.80411 0.956 0 0.032 0.012 0.000
#> SRR1336505 1 0.4583 0.56030 0.672 0 0.296 0.032 0.000
#> SRR1474095 1 0.3757 0.69817 0.772 0 0.208 0.020 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.2722 0.77763 0.872 0 0.108 0.020 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.2850 0.78324 0.872 0 0.092 0.036 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.2270 0.51700 0.076 0 0.904 0.020 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.3319 0.59425 0.160 0 0.820 0.020 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.2573 0.78177 0.880 0 0.104 0.016 0.000
#> SRR1380414 3 0.4878 0.38959 0.440 0 0.536 0.024 0.000
#> SRR1315912 1 0.0693 0.79652 0.980 0 0.008 0.012 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 1 0.5161 0.08038 0.516 0 0.444 0.040 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0771 0.79539 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1477653 1 0.0992 0.79991 0.968 0 0.008 0.024 0.000
#> SRR1355475 1 0.4413 0.64438 0.724 0 0.232 0.044 0.000
#> SRR1360785 3 0.3359 0.58735 0.164 0 0.816 0.020 0.000
#> SRR810437 1 0.4733 0.44947 0.624 0 0.348 0.028 0.000
#> SRR1361860 1 0.1668 0.79840 0.940 0 0.028 0.032 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.4327 0.54255 0.360 0 0.632 0.008 0.000
#> SRR1457619 1 0.2722 0.77763 0.872 0 0.108 0.020 0.000
#> SRR1498529 1 0.1549 0.80248 0.944 0 0.040 0.016 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.4777 0.54795 0.664 0 0.292 0.044 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0912 0.80206 0.972 0 0.012 0.016 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.5383 0.32234 0.408 0 0.540 0.048 0.004
#> SRR1353353 1 0.5227 0.07044 0.508 0 0.448 0.044 0.000
#> SRR1073291 1 0.4378 0.62922 0.716 0 0.248 0.036 0.000
#> SRR1356227 1 0.0671 0.79983 0.980 0 0.004 0.016 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.0865 0.40562 0.004 0 0.972 0.024 0.000
#> SRR663002 1 0.5142 0.28113 0.564 0 0.392 0.044 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1347144 3 0.5390 0.31151 0.412 0 0.536 0.048 0.004
#> SRR1384006 1 0.0771 0.79550 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR614047 1 0.5106 0.04827 0.508 0 0.456 0.036 0.000
#> SRR818440 1 0.4599 0.58671 0.688 0 0.272 0.040 0.000
#> SRR1337770 1 0.1774 0.80232 0.932 0 0.052 0.016 0.000
#> SRR1399413 1 0.2573 0.78444 0.880 0 0.104 0.016 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.4835 0.38467 0.592 0 0.380 0.028 0.000
#> SRR1074041 1 0.4054 0.68302 0.760 0 0.204 0.036 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.3961 0.69049 0.760 0 0.212 0.028 0.000
#> SRR816699 1 0.4413 0.64438 0.724 0 0.232 0.044 0.000
#> SRR1308612 1 0.4503 0.59755 0.696 0 0.268 0.036 0.000
#> SRR1499418 3 0.2889 0.51051 0.084 0 0.880 0.020 0.016
#> SRR1352894 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.1872 0.80187 0.928 0 0.052 0.020 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR808272 1 0.4957 0.45822 0.624 0 0.332 0.044 0.000
#> SRR1436698 1 0.0992 0.79772 0.968 0 0.008 0.024 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 3 0.4639 0.56005 0.344 0 0.632 0.024 0.000
#> SRR1351236 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1077479 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR814491 3 0.0992 0.41593 0.008 0 0.968 0.024 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.1082 0.79771 0.964 0 0.008 0.028 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.1725 0.80331 0.936 0 0.044 0.020 0.000
#> SRR1309534 1 0.4138 0.58923 0.708 0 0.276 0.016 0.000
#> SRR615527 1 0.5161 0.08038 0.516 0 0.444 0.040 0.000
#> SRR1098216 1 0.0771 0.79413 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.3151 0.76411 0.836 0 0.144 0.020 0.000
#> SRR1344166 1 0.1626 0.80262 0.940 0 0.044 0.016 0.000
#> SRR1368638 3 0.1082 0.41536 0.008 0 0.964 0.028 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0992 0.41593 0.008 0 0.968 0.024 0.000
#> SRR1502143 1 0.3449 0.73933 0.812 0 0.164 0.024 0.000
#> SRR1487614 1 0.5175 0.01674 0.496 0 0.464 0.040 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.3224 0.74816 0.824 0 0.160 0.016 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.3276 0.75548 0.836 0 0.132 0.032 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR656421 3 0.4086 0.58815 0.240 0 0.736 0.024 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.4747 0.43920 0.620 0 0.352 0.028 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.3476 0.72737 0.804 0 0.176 0.020 0.000
#> SRR1431847 3 0.4014 0.62565 0.256 0 0.728 0.016 0.000
#> SRR1317155 1 0.2873 0.77352 0.856 0 0.128 0.016 0.000
#> SRR1477405 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR655289 3 0.4674 0.45929 0.416 0 0.568 0.016 0.000
#> SRR1341683 1 0.4626 0.42680 0.616 0 0.364 0.020 0.000
#> SRR1084790 3 0.4902 0.36417 0.468 0 0.508 0.024 0.000
#> SRR1073731 1 0.3845 0.69143 0.768 0 0.208 0.024 0.000
#> SRR1332588 3 0.1117 0.42690 0.016 0 0.964 0.020 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.4777 0.54375 0.664 0 0.292 0.044 0.000
#> SRR661028 1 0.0771 0.79539 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.4193 0.68133 0.748 0 0.212 0.040 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1379014 1 0.0798 0.79823 0.976 0 0.008 0.016 0.000
#> SRR1489904 1 0.5014 0.16627 0.536 0 0.432 0.032 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.1568 0.80230 0.944 0 0.036 0.020 0.000
#> SRR606982 3 0.4227 0.61813 0.292 0 0.692 0.016 0.000
#> SRR1358082 1 0.0771 0.79094 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1312934 1 0.4718 0.45574 0.628 0 0.344 0.028 0.000
#> SRR655194 1 0.4445 0.56637 0.676 0 0.300 0.024 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 5 0.0000 1.00000 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074289 1 0.4054 0.68302 0.760 0 0.204 0.036 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.3988 0.69378 0.768 0 0.196 0.036 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.4873 0.50606 0.644 0 0.312 0.044 0.000
#> SRR1443507 1 0.2450 0.79223 0.896 0 0.076 0.028 0.000
#> SRR1452310 1 0.4616 0.56585 0.676 0 0.288 0.036 0.000
#> SRR665610 1 0.4197 0.64244 0.728 0 0.244 0.028 0.000
#> SRR1347322 1 0.0703 0.79461 0.976 0 0.000 0.024 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0898 0.79363 0.972 0 0.008 0.020 0.000
#> SRR1470230 3 0.2920 0.56756 0.132 0 0.852 0.016 0.000
#> SRR1354247 1 0.0771 0.79421 0.976 0 0.004 0.020 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.2127 0.78251 0.892 0 0.108 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.2293 0.79662 0.900 0 0.084 0.016 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.5100 0.23068 0.448 0 0.516 0.036 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR658657 3 0.2270 0.51700 0.076 0 0.904 0.020 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.4313 0.65067 0.732 0 0.228 0.040 0.000
#> SRR615958 1 0.5175 0.00779 0.496 0 0.464 0.040 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.4508 0.55896 0.332 0 0.648 0.020 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.5052 0.42815 0.612 0 0.340 0.048 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.4958 0.36204 0.592 0 0.372 0.036 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.2286 0.78387 0.888 0 0.108 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 3 0.4929 0.6751 0.300 0 0.608 0.000 0.092 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.2595 0.7462 0.836 0 0.160 0.000 0.004 0.000
#> SRR1355723 1 0.4118 0.5190 0.628 0 0.352 0.000 0.020 0.000
#> SRR1329744 1 0.2302 0.7537 0.872 0 0.120 0.000 0.008 0.000
#> SRR657384 3 0.4808 0.5579 0.360 0 0.576 0.000 0.064 0.000
#> SRR1351190 3 0.4785 0.7174 0.216 0 0.664 0.000 0.120 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4097 -0.0432 0.500 0 0.492 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396017 1 0.3566 0.6836 0.744 0 0.236 0.000 0.020 0.000
#> SRR1410742 1 0.3890 0.3893 0.596 0 0.400 0.000 0.004 0.000
#> SRR1435963 1 0.1866 0.7535 0.908 0 0.084 0.000 0.008 0.000
#> SRR1382416 1 0.0405 0.7266 0.988 0 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1391354 5 0.5357 0.5886 0.180 0 0.232 0.000 0.588 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0520 0.7288 0.984 0 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR1312244 1 0.2933 0.7272 0.796 0 0.200 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325138 3 0.5313 0.4554 0.384 0 0.508 0.000 0.108 0.000
#> SRR1326821 5 0.4880 0.6771 0.076 0 0.256 0.000 0.656 0.012
#> SRR1490178 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.2762 0.7010 0.804 0 0.196 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1414058 3 0.4045 0.6285 0.312 0 0.664 0.000 0.024 0.000
#> SRR1407449 1 0.2597 0.7381 0.824 0 0.176 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.4109 0.3285 0.576 0 0.412 0.000 0.012 0.000
#> SRR1399069 5 0.5805 0.4477 0.276 0 0.228 0.000 0.496 0.000
#> SRR1366450 1 0.2408 0.7464 0.876 0 0.108 0.000 0.004 0.012
#> SRR1396859 1 0.2793 0.7266 0.800 0 0.200 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.2838 0.7293 0.808 0 0.188 0.000 0.004 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 5 0.4271 0.6659 0.060 0 0.244 0.000 0.696 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.3076 0.6679 0.760 0 0.240 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR658152 3 0.5334 0.4436 0.120 0 0.536 0.000 0.344 0.000
#> SRR1368141 3 0.5354 0.5902 0.160 0 0.580 0.000 0.260 0.000
#> SRR1440268 1 0.2302 0.7537 0.872 0 0.120 0.000 0.008 0.000
#> SRR1453725 1 0.3288 0.6674 0.724 0 0.276 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.2260 0.7524 0.860 0 0.140 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.1970 0.7553 0.900 0 0.092 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 3 0.4544 0.7026 0.256 0 0.668 0.000 0.076 0.000
#> SRR1369052 1 0.3668 0.5507 0.668 0 0.328 0.000 0.004 0.000
#> SRR1377735 1 0.3189 0.6968 0.760 0 0.236 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331244 5 0.5593 0.4969 0.280 0 0.184 0.000 0.536 0.000
#> SRR1404531 1 0.0405 0.7270 0.988 0 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1324331 5 0.5593 0.4969 0.280 0 0.184 0.000 0.536 0.000
#> SRR1458890 3 0.5354 0.5902 0.160 0 0.580 0.000 0.260 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.4873 0.5081 0.100 0 0.632 0.000 0.268 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 5 0.4052 0.7071 0.020 0 0.260 0.000 0.708 0.012
#> SRR1385211 1 0.3684 0.5408 0.664 0 0.332 0.000 0.004 0.000
#> SRR655241 1 0.3742 0.5192 0.648 0 0.348 0.000 0.004 0.000
#> SRR656922 1 0.3266 0.6197 0.728 0 0.272 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 5 0.3900 0.7087 0.016 0 0.248 0.000 0.724 0.012
#> SRR1318966 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.3834 0.6850 0.268 0 0.708 0.000 0.024 0.000
#> SRR603212 1 0.3221 0.6323 0.736 0 0.264 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.3699 0.7155 0.212 0 0.752 0.000 0.036 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.3717 0.6452 0.708 0 0.276 0.000 0.016 0.000
#> SRR1457835 1 0.3937 0.3017 0.572 0 0.424 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347123 3 0.4625 0.7180 0.216 0 0.680 0.000 0.104 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.4892 0.5014 0.100 0 0.628 0.000 0.272 0.000
#> SRR1445064 3 0.4513 0.7225 0.212 0 0.692 0.000 0.096 0.000
#> SRR1452981 1 0.2912 0.7143 0.784 0 0.216 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.1049 0.7378 0.960 0 0.032 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407157 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.3953 0.5702 0.656 0 0.328 0.000 0.016 0.000
#> SRR1077898 5 0.5966 0.4380 0.312 0 0.192 0.000 0.488 0.008
#> SRR1349080 5 0.3883 0.7052 0.024 0 0.220 0.000 0.744 0.012
#> SRR1076096 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.3266 0.6242 0.728 0 0.272 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.1349 0.7452 0.940 0 0.056 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380614 1 0.1858 0.7469 0.912 0 0.076 0.000 0.012 0.000
#> SRR812060 3 0.3897 0.6723 0.280 0 0.696 0.000 0.024 0.000
#> SRR602082 1 0.0405 0.7272 0.988 0 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.5635 0.6529 0.208 0 0.576 0.000 0.208 0.008
#> SRR1420710 3 0.4892 0.6969 0.272 0 0.628 0.000 0.100 0.000
#> SRR660426 1 0.2442 0.7472 0.852 0 0.144 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416003 3 0.4813 0.7083 0.248 0 0.648 0.000 0.104 0.000
#> SRR661064 1 0.3807 0.4701 0.628 0 0.368 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.1644 0.7499 0.920 0 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353243 1 0.0891 0.7370 0.968 0 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR1455482 1 0.0891 0.7370 0.968 0 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR1313473 1 0.0622 0.7315 0.980 0 0.012 0.000 0.008 0.000
#> SRR1399394 1 0.3937 0.2932 0.572 0 0.424 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102467 1 0.3428 0.6278 0.696 0 0.304 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.4097 0.7033 0.016 0 0.284 0.000 0.688 0.012
#> SRR1337707 3 0.4894 0.2578 0.068 0 0.556 0.000 0.376 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 4 0.0000 1.0000 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398013 3 0.4747 0.6764 0.288 0 0.632 0.000 0.080 0.000
#> SRR1352918 5 0.1686 0.5725 0.000 0 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1420750 1 0.3198 0.6837 0.740 0 0.260 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.5265 0.5820 0.148 0 0.592 0.000 0.260 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.4535 -0.1248 0.484 0 0.484 0.000 0.032 0.000
#> SRR1366560 1 0.2257 0.7555 0.876 0 0.116 0.000 0.008 0.000
#> SRR1355684 1 0.1225 0.7416 0.952 0 0.036 0.000 0.012 0.000
#> SRR1323289 5 0.6407 -0.1784 0.000 0 0.136 0.232 0.548 0.084
#> SRR1313494 1 0.3109 0.7082 0.772 0 0.224 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309985 1 0.2994 0.7221 0.788 0 0.208 0.000 0.004 0.000
#> SRR607911 1 0.0717 0.7320 0.976 0 0.016 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333789 3 0.3782 0.5363 0.360 0 0.636 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400078 3 0.4282 0.3599 0.420 0 0.560 0.000 0.020 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615575 3 0.4045 0.6746 0.268 0 0.696 0.000 0.036 0.000
#> SRR1079434 5 0.3661 0.6960 0.020 0 0.200 0.000 0.768 0.012
#> SRR1325559 1 0.3861 0.4927 0.640 0 0.352 0.000 0.008 0.000
#> SRR1446695 5 0.3900 0.7087 0.016 0 0.248 0.000 0.724 0.012
#> SRR1383883 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1396100 5 0.1686 0.5725 0.000 0 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1475697 3 0.5004 0.5529 0.348 0 0.568 0.000 0.084 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 5 0.4097 0.7033 0.016 0 0.284 0.000 0.688 0.012
#> SRR1445490 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.4738 0.6866 0.276 0 0.640 0.000 0.084 0.000
#> SRR1485812 3 0.5583 0.1712 0.140 0 0.448 0.000 0.412 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.2915 0.7370 0.808 0 0.184 0.000 0.008 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.4886 0.3700 0.000 0 0.276 0.008 0.640 0.076
#> SRR807775 3 0.5123 0.6980 0.184 0 0.660 0.000 0.144 0.012
#> SRR1409215 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 5 0.3665 0.7020 0.016 0 0.212 0.000 0.760 0.012
#> SRR1100656 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1414536 5 0.3947 0.7079 0.016 0 0.256 0.000 0.716 0.012
#> SRR656794 5 0.5917 0.4773 0.168 0 0.312 0.000 0.508 0.012
#> SRR604653 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1317685 3 0.5343 0.1271 0.108 0 0.484 0.000 0.408 0.000
#> SRR1485912 3 0.4072 0.2542 0.448 0 0.544 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407602 5 0.1625 0.5662 0.000 0 0.060 0.000 0.928 0.012
#> SRR1356164 3 0.3965 0.4489 0.388 0 0.604 0.000 0.008 0.000
#> SRR1328692 3 0.4254 0.4524 0.404 0 0.576 0.000 0.020 0.000
#> SRR1362438 1 0.1946 0.7477 0.912 0 0.072 0.000 0.004 0.012
#> SRR1479216 3 0.4892 0.5014 0.100 0 0.628 0.000 0.272 0.000
#> SRR1358041 1 0.3615 0.6249 0.700 0 0.292 0.000 0.008 0.000
#> SRR1468766 3 0.3938 0.6117 0.324 0 0.660 0.000 0.016 0.000
#> SRR1368200 3 0.4614 0.7232 0.208 0 0.684 0.000 0.108 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.6322 -0.1231 0.000 0 0.144 0.204 0.568 0.084
#> SRR1437256 3 0.5389 0.5811 0.160 0 0.572 0.000 0.268 0.000
#> SRR1487446 3 0.4771 0.7168 0.220 0 0.664 0.000 0.116 0.000
#> SRR816653 1 0.3244 0.6257 0.732 0 0.268 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.4409 0.4246 0.588 0 0.380 0.000 0.032 0.000
#> SRR1442043 1 0.4199 0.3211 0.568 0 0.416 0.000 0.016 0.000
#> SRR1410573 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.3727 0.4850 0.388 0 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 3 0.4809 0.6274 0.140 0 0.668 0.000 0.192 0.000
#> SRR1465208 1 0.3136 0.7053 0.768 0 0.228 0.000 0.004 0.000
#> SRR1314728 1 0.3512 0.6638 0.720 0 0.272 0.000 0.008 0.000
#> SRR1470291 1 0.1196 0.7433 0.952 0 0.040 0.000 0.008 0.000
#> SRR1308756 3 0.4045 0.6746 0.268 0 0.696 0.000 0.036 0.000
#> SRR1409600 1 0.4109 0.3285 0.576 0 0.412 0.000 0.012 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614779 5 0.4014 0.7061 0.016 0 0.268 0.000 0.704 0.012
#> SRR810783 3 0.4076 0.4362 0.396 0 0.592 0.000 0.012 0.000
#> SRR1333990 1 0.2793 0.7260 0.800 0 0.200 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.3997 -0.0968 0.508 0 0.488 0.000 0.004 0.000
#> SRR808106 5 0.3665 0.7020 0.016 0 0.212 0.000 0.760 0.012
#> SRR662713 1 0.3634 0.4252 0.644 0 0.356 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.4374 0.7214 0.192 0 0.712 0.000 0.096 0.000
#> SRR809382 3 0.4752 0.6492 0.140 0 0.676 0.000 0.184 0.000
#> SRR665417 1 0.3076 0.6963 0.760 0 0.240 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.4750 0.5316 0.100 0 0.656 0.000 0.244 0.000
#> SRR1413787 5 0.4781 0.3751 0.000 0 0.276 0.004 0.644 0.076
#> SRR1478207 3 0.3707 0.6341 0.312 0 0.680 0.000 0.008 0.000
#> SRR1411046 1 0.0993 0.7371 0.964 0 0.024 0.000 0.012 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.2882 0.7372 0.812 0 0.180 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309051 1 0.0777 0.7384 0.972 0 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.1434 0.7367 0.940 0 0.048 0.000 0.012 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817210 3 0.3841 0.7042 0.244 0 0.724 0.000 0.032 0.000
#> SRR1319221 4 0.0000 1.0000 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405413 3 0.4092 0.5797 0.344 0 0.636 0.000 0.020 0.000
#> SRR607807 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1390160 3 0.5023 0.7004 0.220 0 0.636 0.000 0.144 0.000
#> SRR1406283 1 0.3288 0.6455 0.724 0 0.276 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.4602 0.3773 0.572 0 0.384 0.000 0.044 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1312766 3 0.3898 0.6495 0.296 0 0.684 0.000 0.020 0.000
#> SRR1361612 1 0.2730 0.7306 0.808 0 0.192 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.1285 0.7470 0.944 0 0.052 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087801 1 0.2632 0.7397 0.832 0 0.164 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.4092 0.5797 0.344 0 0.636 0.000 0.020 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.4892 0.5014 0.100 0 0.628 0.000 0.272 0.000
#> SRR1332879 1 0.3468 0.6286 0.712 0 0.284 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403177 6 0.1765 0.0000 0.000 0 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1076144 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1485678 3 0.6079 0.2534 0.352 0 0.440 0.000 0.200 0.008
#> SRR1092232 3 0.5066 0.1074 0.064 0 0.496 0.004 0.436 0.000
#> SRR1344253 5 0.5649 0.3824 0.152 0 0.396 0.000 0.452 0.000
#> SRR1384290 1 0.0520 0.7288 0.984 0 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR1089349 3 0.4045 0.6746 0.268 0 0.696 0.000 0.036 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.5646 0.6332 0.220 0 0.536 0.000 0.244 0.000
#> SRR818372 3 0.5612 0.6509 0.208 0 0.580 0.000 0.204 0.008
#> SRR1323675 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 5 0.1858 0.5868 0.000 0 0.076 0.000 0.912 0.012
#> SRR1310031 3 0.4300 0.7213 0.208 0 0.712 0.000 0.080 0.000
#> SRR615419 3 0.5209 0.4293 0.112 0 0.564 0.000 0.324 0.000
#> SRR1436925 1 0.3756 0.5050 0.644 0 0.352 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477238 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1332566 1 0.2520 0.7486 0.844 0 0.152 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490228 3 0.4105 0.5724 0.348 0 0.632 0.000 0.020 0.000
#> SRR1442949 5 0.1686 0.5725 0.000 0 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1466239 1 0.0972 0.7406 0.964 0 0.028 0.000 0.008 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.3323 0.6902 0.752 0 0.240 0.000 0.008 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.3934 0.6357 0.304 0 0.676 0.000 0.020 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4218 0.7044 0.156 0 0.736 0.000 0.108 0.000
#> SRR660522 3 0.4047 0.4880 0.384 0 0.604 0.000 0.012 0.000
#> SRR815374 3 0.5095 0.6966 0.256 0 0.632 0.000 0.104 0.008
#> SRR1069564 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 5 0.4014 0.7061 0.016 0 0.268 0.000 0.704 0.012
#> SRR1316438 3 0.4478 0.6650 0.244 0 0.680 0.000 0.076 0.000
#> SRR1386844 1 0.1151 0.7397 0.956 0 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1373718 1 0.0820 0.7331 0.972 0 0.016 0.000 0.012 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.2278 0.7508 0.868 0 0.128 0.000 0.004 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.2092 0.7525 0.876 0 0.124 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.2778 0.7411 0.824 0 0.168 0.000 0.008 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401815 3 0.4892 0.5014 0.100 0 0.628 0.000 0.272 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4873 0.5059 0.100 0 0.632 0.000 0.268 0.000
#> SRR1098761 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.3136 0.7053 0.768 0 0.228 0.000 0.004 0.000
#> SRR615395 3 0.4018 0.3873 0.412 0 0.580 0.000 0.008 0.000
#> SRR1479349 1 0.2597 0.7381 0.824 0 0.176 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.4814 0.7123 0.256 0 0.644 0.000 0.100 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 3 0.4814 0.7051 0.256 0 0.644 0.000 0.100 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 3 0.4513 0.7114 0.212 0 0.692 0.000 0.096 0.000
#> SRR1379303 1 0.1967 0.7518 0.904 0 0.084 0.000 0.012 0.000
#> SRR1418516 5 0.1913 0.5915 0.000 0 0.080 0.000 0.908 0.012
#> SRR613174 3 0.4809 0.7198 0.208 0 0.664 0.000 0.128 0.000
#> SRR1351125 3 0.3965 0.4466 0.388 0 0.604 0.000 0.008 0.000
#> SRR659157 3 0.5195 0.3699 0.100 0 0.540 0.000 0.360 0.000
#> SRR1480408 3 0.4726 0.4091 0.424 0 0.528 0.000 0.048 0.000
#> SRR657857 1 0.4179 0.1280 0.516 0 0.472 0.000 0.012 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.4153 0.4885 0.636 0 0.340 0.000 0.024 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.5064 0.0811 0.076 0 0.492 0.000 0.432 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.4076 0.4602 0.396 0 0.592 0.000 0.012 0.000
#> SRR1466154 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396944 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR614659 3 0.4923 0.5493 0.368 0 0.560 0.000 0.072 0.000
#> SRR659247 3 0.4131 0.4775 0.384 0 0.600 0.000 0.016 0.000
#> SRR1317201 1 0.2738 0.7366 0.820 0 0.176 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473696 1 0.2595 0.7489 0.836 0 0.160 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375842 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.4400 0.3532 0.592 0 0.376 0.000 0.032 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.2003 0.7553 0.884 0 0.116 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0820 0.7331 0.972 0 0.016 0.000 0.012 0.000
#> SRR1070841 3 0.4025 0.3650 0.416 0 0.576 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380910 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.3489 0.6343 0.708 0 0.288 0.000 0.004 0.000
#> SRR612659 3 0.4746 0.5445 0.104 0 0.660 0.000 0.236 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.3857 0.0385 0.532 0 0.468 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.4072 0.1892 0.544 0 0.448 0.000 0.008 0.000
#> SRR1071035 1 0.2632 0.7397 0.832 0 0.164 0.000 0.004 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.1141 0.7480 0.948 0 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR659448 3 0.3970 0.6768 0.280 0 0.692 0.000 0.028 0.000
#> SRR1323558 3 0.4854 0.5123 0.100 0 0.636 0.000 0.264 0.000
#> SRR1381711 5 0.3900 0.7087 0.016 0 0.248 0.000 0.724 0.012
#> SRR657985 5 0.4097 0.7033 0.016 0 0.284 0.000 0.688 0.012
#> SRR1314810 1 0.3512 0.6638 0.720 0 0.272 0.000 0.008 0.000
#> SRR1336505 3 0.4757 0.6997 0.280 0 0.636 0.000 0.084 0.000
#> SRR1474095 3 0.4105 0.5724 0.348 0 0.632 0.000 0.020 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.4212 0.2960 0.560 0 0.424 0.000 0.016 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.3823 0.1972 0.564 0 0.436 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 5 0.2814 0.6506 0.000 0 0.172 0.000 0.820 0.008
#> SRR1313406 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 5 0.3900 0.7087 0.016 0 0.248 0.000 0.724 0.012
#> SRR1084867 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.4095 0.0422 0.512 0 0.480 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380414 5 0.6108 0.2744 0.184 0 0.368 0.000 0.436 0.012
#> SRR1315912 1 0.2473 0.7472 0.856 0 0.136 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.4669 0.6577 0.148 0 0.688 0.000 0.164 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.2442 0.7472 0.852 0 0.144 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477653 1 0.2416 0.7505 0.844 0 0.156 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.3956 0.6774 0.264 0 0.704 0.000 0.032 0.000
#> SRR1360785 5 0.3785 0.6968 0.028 0 0.196 0.000 0.764 0.012
#> SRR810437 3 0.4814 0.7051 0.256 0 0.644 0.000 0.100 0.000
#> SRR1361860 1 0.3690 0.6396 0.700 0 0.288 0.000 0.012 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 5 0.5357 0.5886 0.180 0 0.232 0.000 0.588 0.000
#> SRR1457619 1 0.4205 0.3084 0.564 0 0.420 0.000 0.016 0.000
#> SRR1498529 1 0.3668 0.5507 0.668 0 0.328 0.000 0.004 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.3794 0.7144 0.216 0 0.744 0.000 0.040 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.3126 0.6904 0.752 0 0.248 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.4892 0.5014 0.100 0 0.628 0.000 0.272 0.000
#> SRR1353353 3 0.4638 0.6729 0.156 0 0.692 0.000 0.152 0.000
#> SRR1073291 3 0.3950 0.6792 0.276 0 0.696 0.000 0.028 0.000
#> SRR1356227 1 0.2762 0.7274 0.804 0 0.196 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 5 0.1625 0.5662 0.000 0 0.060 0.000 0.928 0.012
#> SRR663002 3 0.4120 0.7107 0.160 0 0.744 0.000 0.096 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1347144 3 0.4873 0.5059 0.100 0 0.632 0.000 0.268 0.000
#> SRR1384006 1 0.1957 0.7551 0.888 0 0.112 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614047 3 0.5011 0.6703 0.176 0 0.644 0.000 0.180 0.000
#> SRR818440 3 0.3841 0.7042 0.244 0 0.724 0.000 0.032 0.000
#> SRR1337770 1 0.3515 0.5938 0.676 0 0.324 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.4086 0.1132 0.528 0 0.464 0.000 0.008 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.5009 0.7014 0.256 0 0.624 0.000 0.120 0.000
#> SRR1074041 3 0.3905 0.6202 0.316 0 0.668 0.000 0.016 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.3725 0.6307 0.316 0 0.676 0.000 0.008 0.000
#> SRR816699 3 0.3934 0.6796 0.260 0 0.708 0.000 0.032 0.000
#> SRR1308612 3 0.4024 0.6946 0.264 0 0.700 0.000 0.036 0.000
#> SRR1499418 5 0.4042 0.5679 0.012 0 0.264 0.004 0.708 0.012
#> SRR1352894 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.2902 0.7202 0.800 0 0.196 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808272 3 0.4085 0.7187 0.192 0 0.736 0.000 0.072 0.000
#> SRR1436698 1 0.2178 0.7550 0.868 0 0.132 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 5 0.5624 0.5798 0.124 0 0.320 0.000 0.544 0.012
#> SRR1351236 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1077479 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR814491 5 0.1686 0.5725 0.000 0 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1101256 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.1644 0.7495 0.920 0 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.3464 0.6141 0.688 0 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 3 0.5117 0.5398 0.360 0 0.548 0.000 0.092 0.000
#> SRR615527 3 0.4669 0.6577 0.148 0 0.688 0.000 0.164 0.000
#> SRR1098216 1 0.2234 0.7544 0.872 0 0.124 0.000 0.004 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.4172 0.0938 0.528 0 0.460 0.000 0.012 0.000
#> SRR1344166 1 0.3684 0.5421 0.664 0 0.332 0.000 0.004 0.000
#> SRR1368638 5 0.1745 0.5717 0.000 0 0.068 0.000 0.920 0.012
#> SRR1431429 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 5 0.1686 0.5725 0.000 0 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1502143 3 0.3923 0.3963 0.416 0 0.580 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487614 3 0.4669 0.6596 0.148 0 0.688 0.000 0.164 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 3 0.4488 0.3791 0.420 0 0.548 0.000 0.032 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.4025 0.3650 0.416 0 0.576 0.000 0.008 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656421 5 0.4744 0.6778 0.080 0 0.224 0.000 0.684 0.012
#> SRR1086116 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.4813 0.7083 0.248 0 0.648 0.000 0.104 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.4131 0.4761 0.384 0 0.600 0.000 0.016 0.000
#> SRR1431847 5 0.4768 0.4404 0.052 0 0.416 0.000 0.532 0.000
#> SRR1317155 1 0.3971 0.2066 0.548 0 0.448 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477405 1 0.0260 0.7245 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR655289 5 0.5838 0.4804 0.216 0 0.264 0.000 0.516 0.004
#> SRR1341683 3 0.5067 0.6986 0.268 0 0.612 0.000 0.120 0.000
#> SRR1084790 5 0.5966 0.4380 0.312 0 0.192 0.000 0.488 0.008
#> SRR1073731 3 0.4181 0.6263 0.328 0 0.644 0.000 0.028 0.000
#> SRR1332588 5 0.1858 0.5868 0.000 0 0.076 0.000 0.912 0.012
#> SRR1471157 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.4325 0.7146 0.244 0 0.692 0.000 0.064 0.000
#> SRR661028 1 0.2442 0.7472 0.852 0 0.144 0.000 0.004 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4868 0.4741 0.396 0 0.548 0.000 0.052 0.004
#> SRR1358435 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0520 0.7288 0.984 0 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR1379014 1 0.2219 0.7510 0.864 0 0.136 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.4815 0.7011 0.188 0 0.668 0.000 0.144 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.3874 0.5112 0.636 0 0.356 0.000 0.008 0.000
#> SRR606982 5 0.4904 0.6192 0.084 0 0.316 0.000 0.600 0.000
#> SRR1358082 1 0.0363 0.7214 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1312934 3 0.4565 0.7227 0.220 0 0.684 0.000 0.096 0.000
#> SRR655194 3 0.5166 0.5356 0.384 0 0.524 0.000 0.092 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 4 0.0000 1.0000 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074289 3 0.3905 0.6202 0.316 0 0.668 0.000 0.016 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.3835 0.6176 0.320 0 0.668 0.000 0.012 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.4431 0.7172 0.228 0 0.692 0.000 0.080 0.000
#> SRR1443507 1 0.3989 0.1075 0.528 0 0.468 0.000 0.004 0.000
#> SRR1452310 3 0.4620 0.6876 0.292 0 0.640 0.000 0.068 0.000
#> SRR665610 3 0.4668 0.6299 0.316 0 0.620 0.000 0.064 0.000
#> SRR1347322 1 0.1858 0.7563 0.904 0 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.1806 0.7542 0.908 0 0.088 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470230 5 0.3668 0.6453 0.028 0 0.228 0.000 0.744 0.000
#> SRR1354247 1 0.0806 0.7324 0.972 0 0.020 0.000 0.008 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.4089 0.0925 0.524 0 0.468 0.000 0.008 0.000
#> SRR1352299 1 0.3833 0.5102 0.648 0 0.344 0.000 0.008 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.5433 0.4832 0.144 0 0.596 0.000 0.252 0.008
#> SRR1075273 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658657 5 0.3103 0.6505 0.000 0 0.208 0.000 0.784 0.008
#> SRR1092773 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 3 0.3819 0.6642 0.280 0 0.700 0.000 0.020 0.000
#> SRR615958 3 0.4828 0.6582 0.156 0 0.668 0.000 0.176 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 5 0.5262 0.4485 0.084 0 0.416 0.000 0.496 0.004
#> SRR1099120 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.4264 0.7209 0.196 0 0.720 0.000 0.084 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.4490 0.7200 0.196 0 0.700 0.000 0.104 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 1.0000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.4072 0.1852 0.544 0 0.448 0.000 0.008 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4328 0.568 0.568
#> 3 3 0.667 0.862 0.820 0.3933 0.765 0.586
#> 4 4 0.613 0.837 0.822 0.1374 0.918 0.766
#> 5 5 0.644 0.661 0.744 0.0947 0.926 0.748
#> 6 6 0.700 0.624 0.713 0.0603 0.901 0.614
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1398013 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.9710 0.333 0.600 0.400
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR1074289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.2878 0.686 0.096 0.000 0.904
#> SRR1436370 2 0.3267 0.926 0.116 0.884 0.000
#> SRR1075752 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1397949 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1355723 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1329744 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR657384 3 0.3412 0.621 0.124 0.000 0.876
#> SRR1351190 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1458662 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1396017 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1410742 3 0.2448 0.726 0.076 0.000 0.924
#> SRR1435963 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1382416 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1391354 3 0.5650 0.642 0.312 0.000 0.688
#> SRR1087968 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1312244 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1325138 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1326821 3 0.5785 0.615 0.332 0.000 0.668
#> SRR1490178 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1075707 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1465758 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1414058 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1407449 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1436858 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399069 1 0.6302 -0.120 0.520 0.000 0.480
#> SRR1366450 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1396859 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1457176 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1097666 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1434736 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1080560 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1322882 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1435688 2 0.4121 0.924 0.168 0.832 0.000
#> SRR1327614 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR658152 3 0.0424 0.836 0.008 0.000 0.992
#> SRR1368141 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440268 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1453725 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1325711 2 0.4121 0.924 0.168 0.832 0.000
#> SRR1477930 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1477591 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1416049 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1369052 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1377735 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1331244 1 0.4974 0.600 0.764 0.000 0.236
#> SRR1404531 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1324331 1 0.4974 0.600 0.764 0.000 0.236
#> SRR1458890 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1077263 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1385211 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR655241 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR656922 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1361630 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1318966 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1407087 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR603212 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1321088 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332232 2 0.0747 0.925 0.016 0.984 0.000
#> SRR1312645 3 0.6305 -0.822 0.484 0.000 0.516
#> SRR1457835 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1347123 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1465501 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452981 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1326708 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1407157 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1365401 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.6225 -0.687 0.432 0.000 0.568
#> SRR1077898 1 0.4974 0.613 0.764 0.000 0.236
#> SRR1349080 3 0.5785 0.615 0.332 0.000 0.668
#> SRR1076096 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1375485 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1432563 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1380614 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR812060 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR602082 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1069490 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1078417 2 0.3551 0.926 0.132 0.868 0.000
#> SRR661613 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420710 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR660426 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1416003 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR661064 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1082011 2 0.3551 0.926 0.132 0.868 0.000
#> SRR1452718 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1353243 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1455482 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1313473 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1399394 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1102467 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1317470 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1337707 3 0.0237 0.837 0.004 0.000 0.996
#> SRR1408752 2 0.2261 0.926 0.068 0.932 0.000
#> SRR1474617 3 0.0592 0.830 0.012 0.000 0.988
#> SRR1398013 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352918 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1420750 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1071785 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.4974 0.221 0.236 0.000 0.764
#> SRR1366560 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1355684 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1323289 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1313494 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1309985 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR607911 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1333789 3 0.0892 0.816 0.020 0.000 0.980
#> SRR1400078 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088631 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR1092842 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR615575 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079434 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1325559 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1446695 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1383883 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1396100 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1475697 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488067 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1084991 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1410380 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1445490 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485812 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1376406 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR807775 3 0.0237 0.837 0.004 0.000 0.996
#> SRR1409215 2 0.4121 0.924 0.168 0.832 0.000
#> SRR820427 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1100656 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1362159 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1414536 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR656794 3 0.6309 0.189 0.500 0.000 0.500
#> SRR604653 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1317685 3 0.2356 0.800 0.072 0.000 0.928
#> SRR1485912 3 0.1031 0.810 0.024 0.000 0.976
#> SRR1407602 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1356164 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1328692 3 0.4654 0.348 0.208 0.000 0.792
#> SRR1362438 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1479216 3 0.0237 0.837 0.004 0.000 0.996
#> SRR1358041 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1468766 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1368200 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1437256 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487446 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR816653 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR815164 3 0.5138 0.122 0.252 0.000 0.748
#> SRR1442043 1 0.6309 0.858 0.500 0.000 0.500
#> SRR1410573 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1096782 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR1352369 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1382934 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1314728 3 0.3116 0.660 0.108 0.000 0.892
#> SRR1470291 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1308756 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409600 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR816123 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR614779 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR810783 3 0.0747 0.821 0.016 0.000 0.984
#> SRR1333990 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1410356 1 0.6252 0.967 0.556 0.000 0.444
#> SRR808106 3 0.5785 0.615 0.332 0.000 0.668
#> SRR662713 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1447058 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR809382 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1088016 2 0.0424 0.924 0.008 0.992 0.000
#> SRR1453166 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1069826 2 0.4702 0.919 0.212 0.788 0.000
#> SRR1077781 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1478207 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1411046 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1313711 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1309051 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1486949 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1074956 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1092961 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR817210 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319221 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR607807 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1390160 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406283 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1357709 1 0.6309 0.858 0.500 0.000 0.500
#> SRR1080742 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1468208 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1312766 3 0.4605 0.373 0.204 0.000 0.796
#> SRR1361612 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1311224 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1087801 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1099720 2 0.4842 0.917 0.224 0.776 0.000
#> SRR1349250 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1074980 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332879 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1403177 3 0.8801 0.300 0.148 0.292 0.560
#> SRR1076144 2 0.2261 0.926 0.068 0.932 0.000
#> SRR1069614 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR818239 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1421069 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1500006 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1485678 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1092232 3 0.0592 0.834 0.012 0.000 0.988
#> SRR1344253 3 0.4702 0.724 0.212 0.000 0.788
#> SRR1384290 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1089349 3 0.0237 0.837 0.004 0.000 0.996
#> SRR1343522 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.3686 0.926 0.140 0.860 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR818372 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1310031 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR615419 3 0.0592 0.834 0.012 0.000 0.988
#> SRR1436925 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1477238 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1332566 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1490228 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442949 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1466239 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1094003 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR1329971 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR813076 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1322981 3 0.4555 0.391 0.200 0.000 0.800
#> SRR1485976 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR660522 3 0.0747 0.821 0.016 0.000 0.984
#> SRR815374 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1069564 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1416337 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1316438 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1373718 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1447458 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1441421 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1335489 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1393404 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1401815 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098761 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1312124 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR615395 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1479349 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR2165033 3 0.2448 0.726 0.076 0.000 0.924
#> SRR1089054 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379303 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1418516 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR613174 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351125 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR659157 3 0.0592 0.834 0.012 0.000 0.988
#> SRR1480408 3 0.6274 -0.754 0.456 0.000 0.544
#> SRR657857 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1073317 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1094168 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1431270 3 0.1529 0.819 0.040 0.000 0.960
#> SRR1085614 2 0.4121 0.924 0.168 0.832 0.000
#> SRR1330106 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1466154 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1396944 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1082784 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR614659 3 0.2711 0.702 0.088 0.000 0.912
#> SRR659247 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1317201 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1473696 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1375842 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1388123 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1453662 1 0.6286 0.931 0.536 0.000 0.464
#> SRR1345499 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1416693 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1070841 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380910 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1333125 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR612659 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1089595 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1074263 2 0.3686 0.926 0.140 0.860 0.000
#> SRR1376786 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1345995 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1071035 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1068808 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1335355 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR659448 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1323558 3 0.0237 0.837 0.004 0.000 0.996
#> SRR1381711 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR657985 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1314810 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1336505 3 0.2261 0.740 0.068 0.000 0.932
#> SRR1474095 3 0.5178 0.115 0.256 0.000 0.744
#> SRR1363831 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074909 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1101200 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1075408 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1313406 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1084867 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1380414 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1315912 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1075778 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.3038 0.926 0.104 0.896 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1477653 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1355475 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1360785 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR810437 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361860 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1441311 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.5431 0.674 0.284 0.000 0.716
#> SRR1457619 3 0.3551 0.601 0.132 0.000 0.868
#> SRR1498529 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1097172 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR1472033 2 0.3551 0.926 0.132 0.868 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399525 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1312844 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1085874 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1101226 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1476056 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1075659 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1311916 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353353 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073291 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356227 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1080720 2 0.4842 0.917 0.224 0.776 0.000
#> SRR1091695 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1350304 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR663002 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1347144 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384006 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1499108 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR614047 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR818440 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1337770 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1399413 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1385542 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.2066 0.754 0.060 0.000 0.940
#> SRR1074041 3 0.1753 0.777 0.048 0.000 0.952
#> SRR1394495 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.6252 0.967 0.556 0.000 0.444
#> SRR816699 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499418 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1352894 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1331083 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436698 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1095627 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1357672 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1351236 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1077479 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR814491 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1101256 2 0.3482 0.926 0.128 0.872 0.000
#> SRR1436004 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1457994 2 0.3482 0.926 0.128 0.872 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1309534 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR615527 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098216 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1325847 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1404003 1 0.6308 0.875 0.508 0.000 0.492
#> SRR1344166 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1368638 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1431429 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1502143 3 0.2711 0.702 0.088 0.000 0.912
#> SRR1487614 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 3 0.5733 -0.276 0.324 0.000 0.676
#> SRR1099212 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.6267 0.953 0.548 0.000 0.452
#> SRR1476547 2 0.4842 0.917 0.224 0.776 0.000
#> SRR656421 1 0.5905 0.366 0.648 0.000 0.352
#> SRR1086116 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0592 0.925 0.012 0.988 0.000
#> SRR1434889 3 0.0747 0.821 0.016 0.000 0.984
#> SRR1431847 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1317155 1 0.6260 0.960 0.552 0.000 0.448
#> SRR1477405 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR655289 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1341683 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1084790 1 0.5733 0.437 0.676 0.000 0.324
#> SRR1073731 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332588 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1471157 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR661028 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1413477 2 0.3551 0.926 0.132 0.868 0.000
#> SRR1101152 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR1358435 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR2165273 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1379014 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1489904 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416386 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1406048 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR606982 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1358082 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1312934 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR655194 3 0.6291 -0.784 0.468 0.000 0.532
#> SRR1331174 2 0.3482 0.926 0.128 0.872 0.000
#> SRR1473251 2 0.4842 0.917 0.224 0.776 0.000
#> SRR1389820 3 0.0747 0.827 0.016 0.000 0.984
#> SRR1074289 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1348816 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR1076292 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443507 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1452310 3 0.0237 0.835 0.004 0.000 0.996
#> SRR665610 3 0.0237 0.837 0.004 0.000 0.996
#> SRR1347322 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR813395 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1477256 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1470230 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1354247 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1082640 2 0.0000 0.924 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.3619 0.591 0.136 0.000 0.864
#> SRR1352299 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
#> SRR1076317 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1434117 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1075273 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR658657 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1092773 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1365332 3 0.3116 0.660 0.108 0.000 0.892
#> SRR615958 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097688 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1403259 3 0.4605 0.727 0.204 0.000 0.796
#> SRR1099120 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464856 2 0.4178 0.924 0.172 0.828 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.838 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075923 2 0.4931 0.916 0.232 0.768 0.000
#> SRR1100703 1 0.6235 0.980 0.564 0.000 0.436
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.5599 0.7665 0.288 0.000 0.664 0.048
#> SRR1436370 2 0.1004 0.8620 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1075752 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.1042 0.9126 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1329744 1 0.0469 0.9184 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR657384 3 0.6145 0.4479 0.460 0.000 0.492 0.048
#> SRR1351190 3 0.4716 0.8859 0.196 0.000 0.764 0.040
#> SRR1458662 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR818573 1 0.1411 0.9049 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1396017 1 0.2060 0.8841 0.932 0.000 0.016 0.052
#> SRR1410742 3 0.5267 0.8356 0.240 0.000 0.712 0.048
#> SRR1435963 1 0.0469 0.9184 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.6086 0.8974 0.132 0.000 0.188 0.680
#> SRR1087968 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1310075 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312244 1 0.0469 0.9184 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1325138 4 0.6134 0.9060 0.116 0.000 0.216 0.668
#> SRR1326821 4 0.6457 0.8866 0.156 0.000 0.200 0.644
#> SRR1490178 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR655613 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.2522 0.8464 0.000 0.908 0.016 0.076
#> SRR1443871 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1102489 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1465758 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414058 3 0.4011 0.8969 0.208 0.000 0.784 0.008
#> SRR1407449 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1436858 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1479109 3 0.4540 0.8859 0.196 0.000 0.772 0.032
#> SRR1399069 4 0.6134 0.7573 0.216 0.000 0.116 0.668
#> SRR1366450 1 0.2647 0.7962 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1396859 1 0.0469 0.9184 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1457176 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1097666 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1434736 4 0.6289 0.9246 0.116 0.000 0.236 0.648
#> SRR1080560 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1322882 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0817 0.8589 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1327614 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658152 3 0.5395 0.8479 0.184 0.000 0.732 0.084
#> SRR1368141 3 0.4800 0.8884 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR1440268 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1453725 1 0.3626 0.6878 0.812 0.000 0.184 0.004
#> SRR1325711 2 0.0817 0.8589 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1477930 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR656275 3 0.4540 0.8899 0.196 0.000 0.772 0.032
#> SRR1369052 1 0.0804 0.9165 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1377735 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.5125 0.2209 0.604 0.000 0.008 0.388
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4955 0.0540 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1458890 3 0.4800 0.8884 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR1432695 2 0.5113 0.8526 0.000 0.760 0.152 0.088
#> SRR1407624 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1431969 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1087393 2 0.2522 0.8464 0.000 0.908 0.016 0.076
#> SRR1077263 4 0.6317 0.9243 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR656922 1 0.0524 0.9184 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1361630 4 0.6346 0.9240 0.116 0.000 0.244 0.640
#> SRR1318966 2 0.3969 0.8407 0.000 0.804 0.016 0.180
#> SRR1407087 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR603212 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1321088 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1485190 3 0.3569 0.9009 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1332232 2 0.3421 0.8557 0.000 0.868 0.044 0.088
#> SRR1312645 1 0.2578 0.8635 0.912 0.000 0.036 0.052
#> SRR1457835 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347123 3 0.3610 0.9009 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1465501 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1330878 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1445064 3 0.4446 0.8965 0.196 0.000 0.776 0.028
#> SRR1452981 1 0.1635 0.8966 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1326708 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365401 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1397697 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1477316 1 0.5067 0.5746 0.736 0.000 0.216 0.048
#> SRR1077898 1 0.4769 0.4186 0.684 0.000 0.008 0.308
#> SRR1349080 4 0.6440 0.8994 0.148 0.000 0.208 0.644
#> SRR1076096 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR811261 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1375485 1 0.0469 0.9165 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1432563 2 0.5159 0.8522 0.000 0.756 0.156 0.088
#> SRR604414 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.3972 0.8984 0.204 0.000 0.788 0.008
#> SRR602082 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1078417 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.4540 0.8945 0.196 0.000 0.772 0.032
#> SRR1420710 3 0.4800 0.8863 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR660426 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.4630 0.8886 0.196 0.000 0.768 0.036
#> SRR661064 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1082011 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102467 1 0.0804 0.9165 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1317470 4 0.6346 0.9240 0.116 0.000 0.244 0.640
#> SRR1337707 3 0.4500 0.8929 0.192 0.000 0.776 0.032
#> SRR1408752 2 0.2466 0.8608 0.000 0.916 0.028 0.056
#> SRR1474617 3 0.4958 0.8546 0.176 0.012 0.772 0.040
#> SRR1398013 3 0.4716 0.8859 0.196 0.000 0.764 0.040
#> SRR1352918 4 0.6033 0.9190 0.116 0.000 0.204 0.680
#> SRR1420750 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.4446 0.8965 0.196 0.000 0.776 0.028
#> SRR1353618 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1082217 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1357256 2 0.5159 0.8522 0.000 0.756 0.156 0.088
#> SRR1490313 3 0.6137 0.4816 0.448 0.000 0.504 0.048
#> SRR1366560 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355684 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1323289 4 0.6102 0.9033 0.116 0.000 0.212 0.672
#> SRR1313494 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1309985 1 0.1975 0.8870 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR607911 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333789 3 0.4049 0.8945 0.212 0.000 0.780 0.008
#> SRR1400078 3 0.4716 0.8859 0.196 0.000 0.764 0.040
#> SRR1088631 2 0.1406 0.8568 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1092842 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR615575 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1079434 4 0.6289 0.9242 0.116 0.000 0.236 0.648
#> SRR1325559 1 0.0524 0.9184 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1446695 4 0.6346 0.9240 0.116 0.000 0.244 0.640
#> SRR1383883 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396100 4 0.6102 0.9143 0.116 0.000 0.212 0.672
#> SRR1475697 3 0.6013 0.6878 0.312 0.000 0.624 0.064
#> SRR1488067 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1102103 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1105154 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1084991 2 0.3969 0.8407 0.000 0.804 0.016 0.180
#> SRR1410380 4 0.6400 0.9182 0.116 0.000 0.252 0.632
#> SRR1445490 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1454671 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1435044 3 0.4540 0.8937 0.196 0.000 0.772 0.032
#> SRR1485812 3 0.4446 0.8947 0.196 0.000 0.776 0.028
#> SRR1078020 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1343898 3 0.6525 0.2055 0.116 0.000 0.612 0.272
#> SRR807775 3 0.4163 0.8896 0.188 0.000 0.792 0.020
#> SRR1409215 2 0.0817 0.8589 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR820427 4 0.6317 0.9243 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR1100656 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 4 0.6317 0.9243 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR656794 4 0.7028 0.5477 0.380 0.000 0.124 0.496
#> SRR604653 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 4 0.7261 0.6172 0.152 0.000 0.368 0.480
#> SRR1485912 3 0.4049 0.8945 0.212 0.000 0.780 0.008
#> SRR1407602 4 0.6068 0.9205 0.116 0.000 0.208 0.676
#> SRR1356164 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 3 0.5550 0.5535 0.428 0.000 0.552 0.020
#> SRR1362438 1 0.0188 0.9175 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1479216 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1358041 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1468766 1 0.4961 -0.1740 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1368200 3 0.3893 0.9004 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1435602 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1501043 4 0.6373 0.9217 0.116 0.000 0.248 0.636
#> SRR1437256 3 0.4800 0.8884 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR1487446 3 0.4951 0.8755 0.212 0.000 0.744 0.044
#> SRR816653 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.6956 0.1545 0.564 0.000 0.288 0.148
#> SRR1442043 1 0.3333 0.8222 0.872 0.000 0.040 0.088
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.1406 0.8568 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1352369 1 0.4543 0.3398 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1382934 3 0.3893 0.8993 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1465208 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1314728 1 0.5453 0.0129 0.592 0.000 0.388 0.020
#> SRR1470291 1 0.0188 0.9198 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308756 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1409600 3 0.4959 0.8687 0.196 0.000 0.752 0.052
#> SRR816123 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR614779 4 0.6400 0.9182 0.116 0.000 0.252 0.632
#> SRR810783 3 0.4011 0.8969 0.208 0.000 0.784 0.008
#> SRR1333990 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1410356 3 0.4996 0.4079 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR808106 4 0.6416 0.8949 0.152 0.000 0.200 0.648
#> SRR662713 1 0.4866 0.0238 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1447058 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1480964 3 0.3751 0.9010 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR809382 3 0.3893 0.8993 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR665417 1 0.1004 0.9120 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1088016 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1453166 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1069826 2 0.2376 0.8484 0.000 0.916 0.016 0.068
#> SRR1077781 2 0.1406 0.8568 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR615623 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1413787 4 0.6400 0.9182 0.116 0.000 0.252 0.632
#> SRR1478207 3 0.3569 0.9009 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1411046 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313711 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1326560 1 0.0469 0.9184 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1309051 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1395616 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074956 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1092961 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR817210 3 0.3751 0.9009 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR1319221 3 0.4636 0.8738 0.188 0.000 0.772 0.040
#> SRR1405413 1 0.1004 0.9095 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR607807 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1390160 3 0.3751 0.9007 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR1406283 1 0.2589 0.7951 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1357709 1 0.3934 0.7757 0.836 0.000 0.116 0.048
#> SRR1080742 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1468208 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312766 3 0.4594 0.8073 0.280 0.000 0.712 0.008
#> SRR1361612 1 0.0592 0.9169 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1311224 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.4382 0.4396 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1099720 2 0.2450 0.8475 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR1349250 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1350912 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1357127 3 0.3569 0.9009 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1074980 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1317022 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1332879 1 0.0188 0.9186 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403177 3 0.8106 0.0756 0.128 0.360 0.468 0.044
#> SRR1076144 2 0.2142 0.8615 0.000 0.928 0.016 0.056
#> SRR1069614 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR818239 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1421069 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.6919 0.7119 0.120 0.000 0.352 0.528
#> SRR1092232 3 0.4121 0.8873 0.184 0.000 0.796 0.020
#> SRR1344253 4 0.7143 0.6362 0.132 0.000 0.408 0.460
#> SRR1384290 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1089349 3 0.3852 0.8982 0.192 0.000 0.800 0.008
#> SRR1343522 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1326727 2 0.0376 0.8605 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1440940 3 0.4881 0.8858 0.196 0.000 0.756 0.048
#> SRR818372 3 0.4800 0.8884 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR1323675 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR819894 4 0.6033 0.9190 0.116 0.000 0.204 0.680
#> SRR1310031 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR615419 3 0.4916 0.8771 0.184 0.000 0.760 0.056
#> SRR1436925 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1477238 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332566 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1490228 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1442949 4 0.6289 0.9242 0.116 0.000 0.236 0.648
#> SRR1466239 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1094003 2 0.1406 0.8568 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1329971 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR813076 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1097642 2 0.2522 0.8464 0.000 0.908 0.016 0.076
#> SRR1322981 3 0.4621 0.8011 0.284 0.000 0.708 0.008
#> SRR1485976 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1471713 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR660522 3 0.4049 0.8946 0.212 0.000 0.780 0.008
#> SRR815374 3 0.5284 0.8036 0.264 0.000 0.696 0.040
#> SRR1069564 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1416337 4 0.6400 0.9182 0.116 0.000 0.252 0.632
#> SRR1316438 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1386844 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1373718 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1447458 2 0.5159 0.8522 0.000 0.756 0.156 0.088
#> SRR1487128 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1441421 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1069919 2 0.3966 0.8556 0.000 0.840 0.072 0.088
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1393404 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1071337 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1071983 2 0.1406 0.8568 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1331793 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1410510 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1098761 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1312124 1 0.1975 0.8870 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR615395 1 0.3400 0.7004 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1479349 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR2165033 3 0.4872 0.8474 0.244 0.000 0.728 0.028
#> SRR1089054 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR816201 3 0.4716 0.8859 0.196 0.000 0.764 0.040
#> SRR1488514 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR655840 3 0.4800 0.8842 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR1379303 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418516 4 0.6102 0.9143 0.116 0.000 0.212 0.672
#> SRR613174 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1351125 3 0.3972 0.8984 0.204 0.000 0.788 0.008
#> SRR659157 3 0.5200 0.8495 0.184 0.000 0.744 0.072
#> SRR1480408 1 0.6114 -0.2055 0.524 0.000 0.428 0.048
#> SRR657857 1 0.2002 0.8876 0.936 0.000 0.020 0.044
#> SRR1073317 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1332526 1 0.1677 0.8966 0.948 0.000 0.012 0.040
#> SRR1094168 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1431270 3 0.6672 0.5343 0.168 0.000 0.620 0.212
#> SRR1085614 2 0.0817 0.8589 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1330106 3 0.4540 0.8906 0.196 0.000 0.772 0.032
#> SRR1466154 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082784 2 0.5204 0.8518 0.000 0.752 0.160 0.088
#> SRR1457267 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR614659 3 0.5025 0.8298 0.252 0.000 0.716 0.032
#> SRR659247 3 0.4540 0.8964 0.196 0.000 0.772 0.032
#> SRR1317201 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473696 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1096363 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1453662 1 0.4877 0.6087 0.752 0.000 0.204 0.044
#> SRR1345499 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1353499 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070841 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1498183 1 0.0524 0.9184 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR612659 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1447148 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR658597 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1089595 2 0.2522 0.8464 0.000 0.908 0.016 0.076
#> SRR1074263 2 0.0188 0.8607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1376786 1 0.3311 0.7149 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1345995 1 0.1211 0.8939 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1071035 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1068808 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1332754 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR662438 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659448 3 0.3933 0.8997 0.200 0.000 0.792 0.008
#> SRR1323558 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1381711 4 0.6317 0.9243 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR657985 4 0.6346 0.9240 0.116 0.000 0.244 0.640
#> SRR1314810 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 3 0.4840 0.8503 0.240 0.000 0.732 0.028
#> SRR1474095 3 0.4761 0.6627 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1363831 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1442376 1 0.7445 -0.0591 0.508 0.000 0.268 0.224
#> SRR1074909 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1101200 1 0.2973 0.7607 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1075408 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1367150 4 0.6102 0.9143 0.116 0.000 0.212 0.672
#> SRR1313406 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1068880 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1467277 4 0.6317 0.9243 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR1084867 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1095431 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1380184 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1443113 1 0.0592 0.9142 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1380414 3 0.7008 -0.5532 0.116 0.000 0.448 0.436
#> SRR1315912 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1421116 2 0.1661 0.8620 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR602282 3 0.4446 0.8977 0.196 0.000 0.776 0.028
#> SRR1361195 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR600493 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477653 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1355475 3 0.3972 0.8984 0.204 0.000 0.788 0.008
#> SRR1360785 4 0.6033 0.9190 0.116 0.000 0.204 0.680
#> SRR810437 3 0.4540 0.8906 0.196 0.000 0.772 0.032
#> SRR1361860 1 0.1798 0.8934 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR1441311 2 0.4920 0.8538 0.000 0.776 0.136 0.088
#> SRR1098903 4 0.6133 0.9079 0.124 0.000 0.204 0.672
#> SRR1457619 1 0.6280 0.2223 0.612 0.000 0.304 0.084
#> SRR1498529 1 0.1256 0.9079 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR1097172 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1074017 2 0.1406 0.8568 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1472033 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.3893 0.8993 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1399525 2 0.4012 0.8403 0.000 0.800 0.016 0.184
#> SRR1312844 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1085874 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1101226 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1476056 1 0.1975 0.8870 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR1075659 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1311916 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1353353 3 0.3893 0.8993 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1073291 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1356227 1 0.0592 0.9169 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1080720 2 0.2450 0.8475 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR1091695 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1350304 4 0.6033 0.9190 0.116 0.000 0.204 0.680
#> SRR663002 3 0.4019 0.8993 0.196 0.000 0.792 0.012
#> SRR1376983 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1399926 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347144 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1384006 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1499108 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR614047 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR818440 3 0.3569 0.9009 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1337770 1 0.1610 0.8998 0.952 0.000 0.016 0.032
#> SRR1399413 1 0.3306 0.7333 0.840 0.000 0.156 0.004
#> SRR1385542 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1473959 3 0.5041 0.8544 0.232 0.000 0.728 0.040
#> SRR1074041 3 0.4049 0.8945 0.212 0.000 0.780 0.008
#> SRR1394495 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR659460 3 0.4898 0.5820 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR816699 3 0.3972 0.8984 0.204 0.000 0.788 0.008
#> SRR1308612 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1499418 4 0.6317 0.9242 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR1352894 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR815805 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR808272 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1436698 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1357672 4 0.6980 0.6737 0.116 0.000 0.400 0.484
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.6033 0.9190 0.116 0.000 0.204 0.680
#> SRR1101256 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1314707 1 0.1356 0.9053 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1309534 3 0.6615 0.4661 0.404 0.000 0.512 0.084
#> SRR615527 3 0.4019 0.8993 0.196 0.000 0.792 0.012
#> SRR1098216 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325847 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1404003 1 0.5793 0.2547 0.628 0.000 0.324 0.048
#> SRR1344166 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1368638 4 0.6033 0.9190 0.116 0.000 0.204 0.680
#> SRR1431429 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1079237 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1080509 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR815759 4 0.6317 0.9243 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR1502143 3 0.4391 0.8479 0.252 0.000 0.740 0.008
#> SRR1487614 3 0.3893 0.8993 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1402307 2 0.5159 0.8522 0.000 0.756 0.156 0.088
#> SRR820810 3 0.5884 0.6344 0.364 0.000 0.592 0.044
#> SRR1099212 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1083215 3 0.4961 0.5103 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1476547 2 0.2450 0.8475 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR656421 4 0.5925 0.6799 0.284 0.000 0.068 0.648
#> SRR1086116 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1499917 3 0.4716 0.8859 0.196 0.000 0.764 0.040
#> SRR1339944 2 0.3505 0.8551 0.000 0.864 0.048 0.088
#> SRR1391444 2 0.3421 0.8557 0.000 0.868 0.044 0.088
#> SRR1434889 3 0.4755 0.8919 0.200 0.000 0.760 0.040
#> SRR1431847 4 0.6452 0.9087 0.116 0.000 0.260 0.624
#> SRR1317155 1 0.5778 0.1507 0.604 0.000 0.356 0.040
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.6167 0.9145 0.116 0.000 0.220 0.664
#> SRR1341683 3 0.4716 0.8859 0.196 0.000 0.764 0.040
#> SRR1084790 1 0.6366 -0.1791 0.512 0.000 0.064 0.424
#> SRR1073731 3 0.3751 0.9010 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR1332588 4 0.6102 0.9143 0.116 0.000 0.212 0.672
#> SRR1471157 2 0.5159 0.8522 0.000 0.756 0.156 0.088
#> SRR654945 3 0.4019 0.8993 0.196 0.000 0.792 0.012
#> SRR661028 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.8609 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4755 0.8842 0.200 0.000 0.760 0.040
#> SRR1358435 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR2165273 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1379014 1 0.0336 0.9195 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489904 3 0.3751 0.9007 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR1416386 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1406048 1 0.0779 0.9162 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR606982 4 0.6346 0.9240 0.116 0.000 0.244 0.640
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.4019 0.8993 0.196 0.000 0.792 0.012
#> SRR655194 1 0.5102 0.5656 0.732 0.000 0.220 0.048
#> SRR1331174 2 0.0188 0.8612 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1473251 2 0.2450 0.8475 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR1389820 3 0.4943 0.8333 0.164 0.016 0.780 0.040
#> SRR1074289 1 0.4999 -0.3374 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1348816 2 0.1151 0.8579 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1076292 3 0.3569 0.9009 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1395810 2 0.5113 0.8526 0.000 0.760 0.152 0.088
#> SRR1498909 3 0.4630 0.8886 0.196 0.000 0.768 0.036
#> SRR1443507 3 0.4941 0.5438 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1452310 3 0.4284 0.8961 0.200 0.000 0.780 0.020
#> SRR665610 3 0.5556 0.8386 0.188 0.000 0.720 0.092
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 4 0.6317 0.9242 0.116 0.000 0.240 0.644
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9198 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.5248 0.8514 0.000 0.748 0.164 0.088
#> SRR1487592 3 0.4539 0.8192 0.272 0.000 0.720 0.008
#> SRR1352299 1 0.0336 0.9180 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1076317 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1434117 3 0.5121 0.6790 0.116 0.000 0.764 0.120
#> SRR1075273 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR658657 4 0.6198 0.9167 0.116 0.000 0.224 0.660
#> SRR1092773 2 0.2522 0.8464 0.000 0.908 0.016 0.076
#> SRR1365332 3 0.4452 0.8365 0.260 0.000 0.732 0.008
#> SRR615958 3 0.4136 0.8977 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR1097688 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1403259 4 0.6851 0.7848 0.116 0.000 0.344 0.540
#> SRR1099120 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1362200 3 0.3893 0.8999 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1464856 2 0.1406 0.8568 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1347298 3 0.4019 0.8993 0.196 0.000 0.792 0.012
#> SRR1075923 2 0.4095 0.8393 0.000 0.792 0.016 0.192
#> SRR1100703 1 0.3172 0.7309 0.840 0.000 0.160 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.4251 0.60776 0.132 0.000 0.796 0.048 0.024
#> SRR1436370 2 0.3280 0.26251 0.000 0.812 0.000 0.176 0.012
#> SRR1075752 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1397949 1 0.0693 0.85344 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1355723 1 0.5240 0.65112 0.624 0.000 0.320 0.048 0.008
#> SRR1329744 1 0.3340 0.82400 0.852 0.000 0.096 0.044 0.008
#> SRR657384 3 0.5489 0.45478 0.224 0.000 0.680 0.064 0.032
#> SRR1351190 3 0.2505 0.67361 0.092 0.000 0.888 0.000 0.020
#> SRR1458662 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR818573 1 0.5491 0.58479 0.580 0.000 0.356 0.056 0.008
#> SRR1396017 1 0.5822 0.61920 0.596 0.000 0.320 0.052 0.032
#> SRR1410742 3 0.3773 0.63798 0.100 0.000 0.832 0.048 0.020
#> SRR1435963 1 0.2654 0.84232 0.896 0.000 0.056 0.040 0.008
#> SRR1382416 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 5 0.3605 0.87972 0.036 0.000 0.120 0.012 0.832
#> SRR1087968 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1310075 1 0.1731 0.85054 0.940 0.000 0.012 0.040 0.008
#> SRR1312244 1 0.4015 0.80383 0.800 0.000 0.140 0.052 0.008
#> SRR1325138 5 0.5918 0.60466 0.024 0.000 0.360 0.060 0.556
#> SRR1326821 5 0.3749 0.87513 0.052 0.000 0.108 0.012 0.828
#> SRR1490178 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR655613 1 0.0912 0.85208 0.972 0.000 0.016 0.012 0.000
#> SRR1075707 2 0.0404 0.54656 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1443871 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1102489 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1465758 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1414058 3 0.5815 0.76410 0.096 0.000 0.592 0.304 0.008
#> SRR1407449 1 0.4715 0.73907 0.728 0.000 0.212 0.048 0.012
#> SRR1436858 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1479109 3 0.6510 0.75413 0.096 0.000 0.572 0.284 0.048
#> SRR1399069 5 0.4822 0.78224 0.096 0.000 0.088 0.044 0.772
#> SRR1366450 1 0.4267 0.71670 0.784 0.000 0.120 0.092 0.004
#> SRR1396859 1 0.3285 0.82584 0.856 0.000 0.092 0.044 0.008
#> SRR1457176 1 0.1725 0.84262 0.936 0.000 0.044 0.020 0.000
#> SRR1097666 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1434736 5 0.3356 0.89955 0.024 0.000 0.120 0.012 0.844
#> SRR1080560 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1322882 1 0.0290 0.85125 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1435688 2 0.2864 0.38850 0.000 0.852 0.012 0.136 0.000
#> SRR1327614 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR658152 3 0.4387 0.65252 0.084 0.000 0.804 0.052 0.060
#> SRR1368141 3 0.4024 0.68859 0.092 0.000 0.820 0.064 0.024
#> SRR1440268 1 0.3113 0.83063 0.868 0.000 0.080 0.044 0.008
#> SRR1453725 1 0.4456 0.58510 0.660 0.000 0.320 0.020 0.000
#> SRR1325711 2 0.2864 0.38850 0.000 0.852 0.012 0.136 0.000
#> SRR1477930 1 0.2362 0.84517 0.912 0.000 0.040 0.040 0.008
#> SRR1477591 1 0.0290 0.85125 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416049 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR656275 3 0.3563 0.70867 0.092 0.000 0.840 0.060 0.008
#> SRR1369052 1 0.4341 0.77876 0.764 0.000 0.180 0.048 0.008
#> SRR1377735 1 0.0693 0.85318 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1331244 1 0.5350 0.00969 0.488 0.000 0.000 0.052 0.460
#> SRR1404531 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 5 0.5267 0.18377 0.428 0.000 0.000 0.048 0.524
#> SRR1458890 3 0.3960 0.68642 0.092 0.000 0.824 0.060 0.024
#> SRR1432695 2 0.4659 -0.91225 0.000 0.496 0.000 0.492 0.012
#> SRR1407624 4 0.4648 0.97852 0.000 0.464 0.000 0.524 0.012
#> SRR1431969 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1087393 2 0.0404 0.54656 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1077263 5 0.3246 0.89936 0.024 0.000 0.120 0.008 0.848
#> SRR1385211 1 0.0798 0.85494 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR655241 1 0.5291 0.65717 0.632 0.000 0.308 0.048 0.012
#> SRR656922 1 0.3646 0.80838 0.816 0.000 0.144 0.036 0.004
#> SRR1361630 5 0.3246 0.89936 0.024 0.000 0.120 0.008 0.848
#> SRR1318966 2 0.3409 0.60978 0.000 0.836 0.052 0.000 0.112
#> SRR1407087 3 0.5717 0.76642 0.092 0.000 0.608 0.292 0.008
#> SRR603212 1 0.2171 0.83188 0.912 0.000 0.064 0.024 0.000
#> SRR1321088 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1485190 3 0.5832 0.76227 0.092 0.000 0.580 0.320 0.008
#> SRR1332232 2 0.4323 -0.41453 0.000 0.656 0.000 0.332 0.012
#> SRR1312645 1 0.5976 0.57736 0.568 0.000 0.344 0.052 0.036
#> SRR1457835 1 0.2423 0.83461 0.896 0.000 0.080 0.024 0.000
#> SRR1347123 3 0.6026 0.75918 0.092 0.000 0.572 0.320 0.016
#> SRR1465501 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1330878 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1445064 3 0.5026 0.72662 0.088 0.000 0.740 0.148 0.024
#> SRR1452981 1 0.5560 0.61985 0.596 0.000 0.336 0.052 0.016
#> SRR1326708 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1365401 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1397697 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1477316 3 0.5889 -0.32863 0.464 0.000 0.464 0.048 0.024
#> SRR1077898 1 0.4709 0.28865 0.612 0.000 0.000 0.024 0.364
#> SRR1349080 5 0.3497 0.87958 0.048 0.000 0.112 0.004 0.836
#> SRR1076096 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR811261 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1375485 1 0.3724 0.78028 0.788 0.000 0.184 0.028 0.000
#> SRR1432563 4 0.4653 0.96601 0.000 0.472 0.000 0.516 0.012
#> SRR604414 1 0.0671 0.84996 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.5860 0.76292 0.100 0.000 0.588 0.304 0.008
#> SRR602082 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1078417 2 0.3044 0.35440 0.000 0.840 0.004 0.148 0.008
#> SRR661613 3 0.5028 0.73741 0.088 0.000 0.744 0.140 0.028
#> SRR1420710 3 0.3150 0.67309 0.096 0.000 0.864 0.016 0.024
#> SRR660426 1 0.0566 0.84982 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1416003 3 0.2701 0.68034 0.092 0.000 0.884 0.012 0.012
#> SRR661064 1 0.5336 0.66001 0.632 0.000 0.304 0.052 0.012
#> SRR1082011 2 0.3044 0.35440 0.000 0.840 0.004 0.148 0.008
#> SRR1452718 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.3484 0.79953 0.820 0.000 0.152 0.024 0.004
#> SRR1102467 1 0.5046 0.68047 0.656 0.000 0.292 0.044 0.008
#> SRR1317470 5 0.3356 0.89961 0.024 0.000 0.120 0.012 0.844
#> SRR1337707 3 0.5246 0.73142 0.084 0.000 0.720 0.168 0.028
#> SRR1408752 2 0.3992 -0.16037 0.000 0.720 0.000 0.268 0.012
#> SRR1474617 3 0.6606 0.70923 0.072 0.012 0.512 0.372 0.032
#> SRR1398013 3 0.2505 0.67361 0.092 0.000 0.888 0.000 0.020
#> SRR1352918 5 0.3246 0.89728 0.024 0.000 0.120 0.008 0.848
#> SRR1420750 1 0.1018 0.85027 0.968 0.000 0.016 0.016 0.000
#> SRR1071785 3 0.5229 0.74156 0.092 0.000 0.708 0.184 0.016
#> SRR1353618 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1082217 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1357256 4 0.4653 0.96601 0.000 0.472 0.000 0.516 0.012
#> SRR1490313 3 0.4940 0.51240 0.208 0.000 0.720 0.052 0.020
#> SRR1366560 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1355684 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1323289 5 0.4635 0.86188 0.024 0.000 0.132 0.072 0.772
#> SRR1313494 1 0.5154 0.68877 0.660 0.000 0.280 0.048 0.012
#> SRR1309985 1 0.5852 0.60995 0.588 0.000 0.328 0.052 0.032
#> SRR607911 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1333789 3 0.5821 0.76138 0.108 0.000 0.608 0.276 0.008
#> SRR1400078 3 0.2907 0.67115 0.092 0.000 0.876 0.016 0.016
#> SRR1088631 2 0.2771 0.40360 0.000 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR1092842 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR615575 3 0.5824 0.76386 0.088 0.000 0.596 0.304 0.012
#> SRR1079434 5 0.3122 0.89944 0.024 0.000 0.120 0.004 0.852
#> SRR1325559 1 0.5319 0.68551 0.652 0.000 0.276 0.060 0.012
#> SRR1446695 5 0.3356 0.89936 0.024 0.000 0.120 0.012 0.844
#> SRR1383883 1 0.1408 0.85122 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1396100 5 0.3294 0.89853 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR1475697 3 0.4473 0.56772 0.160 0.000 0.772 0.024 0.044
#> SRR1488067 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1102103 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1105154 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1084991 2 0.3608 0.60879 0.000 0.824 0.064 0.000 0.112
#> SRR1410380 5 0.3477 0.88893 0.024 0.000 0.140 0.008 0.828
#> SRR1445490 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1454671 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1435044 3 0.3369 0.67948 0.092 0.000 0.856 0.024 0.028
#> SRR1485812 3 0.6480 0.75136 0.088 0.000 0.576 0.284 0.052
#> SRR1078020 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1311153 1 0.0162 0.85274 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376406 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1343898 3 0.7176 0.27136 0.020 0.000 0.420 0.268 0.292
#> SRR807775 3 0.6251 0.75428 0.088 0.000 0.556 0.328 0.028
#> SRR1409215 2 0.2864 0.38850 0.000 0.852 0.012 0.136 0.000
#> SRR820427 5 0.2964 0.89959 0.024 0.000 0.120 0.000 0.856
#> SRR1100656 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1362159 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414536 5 0.2964 0.89959 0.024 0.000 0.120 0.000 0.856
#> SRR656794 5 0.6037 0.57984 0.284 0.000 0.068 0.040 0.608
#> SRR604653 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.5961 0.66846 0.064 0.000 0.216 0.064 0.656
#> SRR1485912 3 0.5816 0.76235 0.104 0.000 0.604 0.284 0.008
#> SRR1407602 5 0.3170 0.89851 0.024 0.000 0.124 0.004 0.848
#> SRR1356164 1 0.1764 0.84899 0.928 0.000 0.064 0.008 0.000
#> SRR1328692 3 0.4012 0.58556 0.216 0.000 0.760 0.012 0.012
#> SRR1362438 1 0.0671 0.85084 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1479216 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1358041 1 0.4832 0.73202 0.712 0.000 0.228 0.048 0.012
#> SRR1468766 3 0.6932 0.46259 0.348 0.000 0.360 0.288 0.004
#> SRR1368200 3 0.5585 0.76822 0.092 0.000 0.660 0.232 0.016
#> SRR1435602 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1501043 5 0.4462 0.85140 0.020 0.000 0.168 0.044 0.768
#> SRR1437256 3 0.3894 0.68496 0.092 0.000 0.828 0.056 0.024
#> SRR1487446 3 0.3429 0.65496 0.100 0.000 0.848 0.012 0.040
#> SRR816653 1 0.1485 0.85193 0.948 0.000 0.032 0.020 0.000
#> SRR815164 3 0.7382 -0.10930 0.376 0.000 0.424 0.080 0.120
#> SRR1442043 1 0.6273 0.52937 0.536 0.000 0.360 0.052 0.052
#> SRR1410573 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096782 2 0.2771 0.40360 0.000 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR1352369 1 0.6438 -0.06932 0.496 0.000 0.292 0.212 0.000
#> SRR1382934 3 0.6097 0.75756 0.092 0.000 0.572 0.316 0.020
#> SRR1465208 1 0.2438 0.84413 0.908 0.000 0.044 0.040 0.008
#> SRR1314728 3 0.7057 0.26814 0.364 0.000 0.440 0.164 0.032
#> SRR1470291 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1308756 3 0.5988 0.76374 0.088 0.000 0.592 0.300 0.020
#> SRR1409600 3 0.6762 0.73512 0.092 0.000 0.568 0.264 0.076
#> SRR816123 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR614779 5 0.3294 0.89797 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR810783 3 0.5834 0.76149 0.104 0.000 0.600 0.288 0.008
#> SRR1333990 1 0.2116 0.84783 0.924 0.000 0.028 0.040 0.008
#> SRR1410356 3 0.7002 0.57185 0.300 0.000 0.396 0.296 0.008
#> SRR808106 5 0.3413 0.87921 0.052 0.000 0.100 0.004 0.844
#> SRR662713 1 0.6905 -0.40897 0.376 0.000 0.348 0.272 0.004
#> SRR1447058 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1480964 3 0.5640 0.76924 0.092 0.000 0.624 0.276 0.008
#> SRR809382 3 0.6132 0.75466 0.088 0.000 0.572 0.316 0.024
#> SRR665417 1 0.4446 0.75432 0.752 0.000 0.196 0.040 0.012
#> SRR1088016 4 0.4294 0.98173 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1453166 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1069826 2 0.1195 0.52517 0.000 0.960 0.012 0.028 0.000
#> SRR1077781 2 0.2771 0.40360 0.000 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR615623 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1413787 5 0.3994 0.87312 0.020 0.000 0.144 0.032 0.804
#> SRR1478207 3 0.5620 0.76770 0.092 0.000 0.608 0.296 0.004
#> SRR1411046 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1313711 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1326560 1 0.2864 0.83737 0.884 0.000 0.064 0.044 0.008
#> SRR1309051 1 0.0290 0.85125 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1486949 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1395616 1 0.1731 0.85054 0.940 0.000 0.012 0.040 0.008
#> SRR1074956 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1092961 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR817210 3 0.5798 0.76388 0.096 0.000 0.596 0.300 0.008
#> SRR1319221 3 0.6384 0.72383 0.084 0.000 0.516 0.368 0.032
#> SRR1405413 1 0.5006 0.72404 0.696 0.000 0.232 0.064 0.008
#> SRR607807 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1390160 3 0.6097 0.75756 0.092 0.000 0.572 0.316 0.020
#> SRR1406283 1 0.3704 0.73315 0.820 0.000 0.088 0.092 0.000
#> SRR1357709 1 0.6295 0.42118 0.480 0.000 0.416 0.076 0.028
#> SRR1080742 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1468208 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1312766 3 0.6392 0.73599 0.160 0.000 0.532 0.300 0.008
#> SRR1361612 1 0.4444 0.77408 0.756 0.000 0.184 0.052 0.008
#> SRR1311224 1 0.0566 0.84982 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1087801 1 0.6532 0.00997 0.508 0.000 0.272 0.216 0.004
#> SRR1099720 2 0.0912 0.53568 0.000 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1349250 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1350912 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1357127 3 0.5763 0.76888 0.092 0.000 0.616 0.280 0.012
#> SRR1074980 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1317022 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1332879 1 0.1012 0.84752 0.968 0.000 0.012 0.020 0.000
#> SRR1403177 2 0.8235 -0.25253 0.048 0.372 0.320 0.228 0.032
#> SRR1076144 2 0.3890 -0.08223 0.000 0.736 0.000 0.252 0.012
#> SRR1069614 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR818239 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1421069 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1500006 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 5 0.6411 0.55781 0.052 0.000 0.372 0.060 0.516
#> SRR1092232 3 0.6177 0.75035 0.084 0.000 0.568 0.320 0.028
#> SRR1344253 5 0.7206 0.57112 0.080 0.000 0.224 0.156 0.540
#> SRR1384290 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1089349 3 0.5993 0.76023 0.100 0.000 0.576 0.312 0.012
#> SRR1343522 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1326727 2 0.2909 0.37986 0.000 0.848 0.012 0.140 0.000
#> SRR1440940 3 0.3237 0.67247 0.096 0.000 0.860 0.016 0.028
#> SRR818372 3 0.3291 0.67064 0.100 0.000 0.856 0.016 0.028
#> SRR1323675 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR819894 5 0.3294 0.89853 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR1310031 3 0.6040 0.75858 0.092 0.000 0.568 0.324 0.016
#> SRR615419 3 0.4401 0.68572 0.084 0.000 0.800 0.080 0.036
#> SRR1436925 1 0.5438 0.65665 0.628 0.000 0.300 0.060 0.012
#> SRR1477238 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1332566 1 0.3466 0.82159 0.844 0.000 0.100 0.048 0.008
#> SRR1490228 3 0.5819 0.76737 0.092 0.000 0.604 0.292 0.012
#> SRR1442949 5 0.3122 0.89944 0.024 0.000 0.120 0.004 0.852
#> SRR1466239 1 0.1205 0.85186 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1094003 2 0.2771 0.40360 0.000 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR1329971 1 0.3320 0.81831 0.856 0.000 0.096 0.032 0.016
#> SRR813076 4 0.4437 0.98705 0.000 0.464 0.000 0.532 0.004
#> SRR1097642 2 0.0404 0.54656 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.6435 0.73313 0.164 0.000 0.524 0.304 0.008
#> SRR1485976 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1471713 3 0.6161 0.75509 0.088 0.000 0.564 0.324 0.024
#> SRR660522 3 0.5815 0.76410 0.096 0.000 0.592 0.304 0.008
#> SRR815374 3 0.3878 0.63049 0.120 0.000 0.820 0.040 0.020
#> SRR1069564 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1416337 5 0.3294 0.89797 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR1316438 3 0.6132 0.75518 0.088 0.000 0.572 0.316 0.024
#> SRR1386844 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1373718 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1447458 4 0.4653 0.96601 0.000 0.472 0.000 0.516 0.012
#> SRR1487128 1 0.3570 0.82076 0.836 0.000 0.108 0.048 0.008
#> SRR1441421 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1069919 2 0.4557 -0.65689 0.000 0.584 0.000 0.404 0.012
#> SRR1460296 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1335489 1 0.3229 0.82746 0.860 0.000 0.088 0.044 0.008
#> SRR1393404 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1071337 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1071983 2 0.2771 0.40360 0.000 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR1331793 4 0.4648 0.97852 0.000 0.464 0.000 0.524 0.012
#> SRR1410510 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1098761 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1312124 1 0.5515 0.63505 0.608 0.000 0.324 0.052 0.016
#> SRR615395 1 0.6267 0.24331 0.560 0.000 0.196 0.240 0.004
#> SRR1479349 1 0.5154 0.68359 0.660 0.000 0.280 0.048 0.012
#> SRR2165033 3 0.2573 0.67187 0.104 0.000 0.880 0.000 0.016
#> SRR1089054 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR816201 3 0.2956 0.66565 0.096 0.000 0.872 0.012 0.020
#> SRR1488514 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR655840 3 0.3912 0.63185 0.096 0.000 0.828 0.040 0.036
#> SRR1379303 1 0.1408 0.85122 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1418516 5 0.3294 0.89853 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR613174 3 0.6020 0.76272 0.088 0.000 0.584 0.308 0.020
#> SRR1351125 3 0.5930 0.76526 0.092 0.000 0.596 0.296 0.016
#> SRR659157 3 0.6455 0.67617 0.084 0.000 0.640 0.152 0.124
#> SRR1480408 3 0.5244 0.40205 0.252 0.000 0.676 0.052 0.020
#> SRR657857 1 0.5647 0.60347 0.584 0.000 0.344 0.056 0.016
#> SRR1073317 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1332526 1 0.5466 0.62603 0.600 0.000 0.336 0.052 0.012
#> SRR1094168 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1431270 3 0.7127 0.50542 0.080 0.000 0.544 0.136 0.240
#> SRR1085614 2 0.2864 0.38850 0.000 0.852 0.012 0.136 0.000
#> SRR1330106 3 0.2305 0.67804 0.092 0.000 0.896 0.000 0.012
#> SRR1466154 1 0.0162 0.85182 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396944 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1082784 4 0.4650 0.97274 0.000 0.468 0.000 0.520 0.012
#> SRR1457267 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR614659 3 0.3376 0.67118 0.108 0.000 0.848 0.032 0.012
#> SRR659247 3 0.5436 0.76199 0.092 0.000 0.672 0.224 0.012
#> SRR1317201 1 0.2992 0.83453 0.876 0.000 0.072 0.044 0.008
#> SRR1473696 1 0.0771 0.84988 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1096363 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1453662 1 0.5891 0.34450 0.476 0.000 0.448 0.060 0.016
#> SRR1345499 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1070841 3 0.5735 0.76662 0.092 0.000 0.604 0.296 0.008
#> SRR1380910 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333125 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1498183 1 0.3395 0.82301 0.844 0.000 0.104 0.048 0.004
#> SRR612659 3 0.6161 0.75509 0.088 0.000 0.564 0.324 0.024
#> SRR1447148 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR658597 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1089595 2 0.0404 0.54656 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.2953 0.37067 0.000 0.844 0.012 0.144 0.000
#> SRR1376786 1 0.5730 0.44761 0.640 0.000 0.180 0.176 0.004
#> SRR1345995 1 0.3374 0.79195 0.844 0.000 0.108 0.044 0.004
#> SRR1071035 1 0.1965 0.83502 0.924 0.000 0.052 0.024 0.000
#> SRR1068808 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1332754 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0865 0.85321 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR659448 3 0.5769 0.76462 0.092 0.000 0.596 0.304 0.008
#> SRR1323558 3 0.6223 0.75527 0.088 0.000 0.564 0.320 0.028
#> SRR1381711 5 0.3122 0.89963 0.024 0.000 0.120 0.004 0.852
#> SRR657985 5 0.3356 0.89961 0.024 0.000 0.120 0.012 0.844
#> SRR1314810 1 0.1845 0.84886 0.928 0.000 0.056 0.016 0.000
#> SRR1336505 3 0.4172 0.72595 0.112 0.000 0.792 0.092 0.004
#> SRR1474095 3 0.5953 0.72389 0.164 0.000 0.620 0.208 0.008
#> SRR1363831 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1442376 3 0.7121 0.10254 0.296 0.000 0.504 0.056 0.144
#> SRR1074909 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1101200 1 0.5416 0.52715 0.676 0.000 0.144 0.176 0.004
#> SRR1075408 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1367150 5 0.3404 0.89848 0.024 0.000 0.124 0.012 0.840
#> SRR1313406 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1068880 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1467277 5 0.3122 0.89963 0.024 0.000 0.120 0.004 0.852
#> SRR1084867 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1095431 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1380184 4 0.4549 0.98301 0.000 0.464 0.000 0.528 0.008
#> SRR1443113 1 0.3847 0.78467 0.800 0.000 0.156 0.040 0.004
#> SRR1380414 5 0.7010 0.39621 0.028 0.000 0.288 0.196 0.488
#> SRR1315912 1 0.0290 0.85240 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075778 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1421116 2 0.3675 0.10712 0.000 0.772 0.004 0.216 0.008
#> SRR602282 3 0.4991 0.72600 0.092 0.000 0.740 0.148 0.020
#> SRR1361195 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR600493 1 0.2396 0.82831 0.904 0.000 0.068 0.024 0.004
#> SRR1477653 1 0.2585 0.82272 0.896 0.000 0.064 0.036 0.004
#> SRR1355475 3 0.5860 0.76292 0.100 0.000 0.588 0.304 0.008
#> SRR1360785 5 0.3246 0.89728 0.024 0.000 0.120 0.008 0.848
#> SRR810437 3 0.2900 0.68532 0.092 0.000 0.876 0.020 0.012
#> SRR1361860 1 0.5405 0.64112 0.616 0.000 0.320 0.052 0.012
#> SRR1441311 2 0.4659 -0.90231 0.000 0.500 0.000 0.488 0.012
#> SRR1098903 5 0.3707 0.87939 0.036 0.000 0.120 0.016 0.828
#> SRR1457619 3 0.6300 -0.02679 0.372 0.000 0.524 0.052 0.052
#> SRR1498529 1 0.5088 0.69689 0.672 0.000 0.268 0.048 0.012
#> SRR1097172 4 0.4648 0.97852 0.000 0.464 0.000 0.524 0.012
#> SRR1074017 2 0.2771 0.40360 0.000 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR1472033 2 0.2997 0.36109 0.000 0.840 0.012 0.148 0.000
#> SRR1445087 3 0.6147 0.75431 0.088 0.000 0.568 0.320 0.024
#> SRR1399525 2 0.3620 0.61262 0.000 0.824 0.068 0.000 0.108
#> SRR1312844 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1085874 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1101226 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1476056 1 0.5747 0.62380 0.600 0.000 0.320 0.052 0.028
#> SRR1075659 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1311916 3 0.6161 0.75509 0.088 0.000 0.564 0.324 0.024
#> SRR1353353 3 0.6097 0.75756 0.092 0.000 0.572 0.316 0.020
#> SRR1073291 3 0.5996 0.76370 0.092 0.000 0.580 0.312 0.016
#> SRR1356227 1 0.4298 0.78432 0.772 0.000 0.168 0.052 0.008
#> SRR1080720 2 0.0807 0.53862 0.000 0.976 0.012 0.012 0.000
#> SRR1091695 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1350304 5 0.3170 0.89851 0.024 0.000 0.124 0.004 0.848
#> SRR663002 3 0.6112 0.75699 0.092 0.000 0.568 0.320 0.020
#> SRR1376983 4 0.4648 0.97852 0.000 0.464 0.000 0.524 0.012
#> SRR1399926 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1347144 3 0.6161 0.75509 0.088 0.000 0.564 0.324 0.024
#> SRR1384006 1 0.1168 0.85220 0.960 0.000 0.000 0.032 0.008
#> SRR1499108 2 0.3682 0.61225 0.000 0.820 0.072 0.000 0.108
#> SRR614047 3 0.6147 0.76122 0.088 0.000 0.584 0.300 0.028
#> SRR818440 3 0.5743 0.76934 0.092 0.000 0.620 0.276 0.012
#> SRR1337770 1 0.5065 0.69333 0.676 0.000 0.264 0.048 0.012
#> SRR1399413 1 0.4911 0.51819 0.612 0.000 0.356 0.028 0.004
#> SRR1385542 4 0.4648 0.97852 0.000 0.464 0.000 0.524 0.012
#> SRR1473959 3 0.2678 0.67705 0.100 0.000 0.880 0.004 0.016
#> SRR1074041 3 0.6066 0.75625 0.120 0.000 0.568 0.304 0.008
#> SRR1394495 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR659460 3 0.6775 0.66847 0.232 0.000 0.472 0.288 0.008
#> SRR816699 3 0.5903 0.76172 0.104 0.000 0.584 0.304 0.008
#> SRR1308612 3 0.5735 0.76557 0.092 0.000 0.604 0.296 0.008
#> SRR1499418 5 0.3939 0.88918 0.024 0.000 0.124 0.036 0.816
#> SRR1352894 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR808272 3 0.6051 0.76144 0.088 0.000 0.576 0.316 0.020
#> SRR1436698 1 0.0798 0.84871 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1095627 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1357672 5 0.6203 0.66088 0.028 0.000 0.248 0.116 0.608
#> SRR1351236 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 5 0.3294 0.89853 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR1101256 2 0.2997 0.36109 0.000 0.840 0.012 0.148 0.000
#> SRR1436004 1 0.1408 0.83894 0.948 0.000 0.008 0.044 0.000
#> SRR1457994 2 0.2997 0.36109 0.000 0.840 0.012 0.148 0.000
#> SRR1078998 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1314707 1 0.5273 0.66066 0.636 0.000 0.304 0.048 0.012
#> SRR1309534 3 0.5628 0.46288 0.204 0.000 0.684 0.048 0.064
#> SRR615527 3 0.6174 0.75091 0.088 0.000 0.560 0.328 0.024
#> SRR1098216 1 0.1731 0.85054 0.940 0.000 0.012 0.040 0.008
#> SRR1325847 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1404003 3 0.5723 0.05312 0.360 0.000 0.568 0.052 0.020
#> SRR1344166 1 0.2623 0.83541 0.884 0.000 0.096 0.016 0.004
#> SRR1368638 5 0.3294 0.89853 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR1431429 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1079237 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1080509 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR815759 5 0.2964 0.89959 0.024 0.000 0.120 0.000 0.856
#> SRR1502143 3 0.6089 0.75625 0.124 0.000 0.568 0.300 0.008
#> SRR1487614 3 0.6097 0.75756 0.092 0.000 0.572 0.316 0.020
#> SRR1402307 4 0.4653 0.96601 0.000 0.472 0.000 0.516 0.012
#> SRR820810 3 0.5158 0.50508 0.212 0.000 0.704 0.064 0.020
#> SRR1099212 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1083215 3 0.6953 0.59708 0.284 0.000 0.420 0.288 0.008
#> SRR1476547 2 0.0912 0.53568 0.000 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR656421 5 0.3599 0.76999 0.140 0.000 0.020 0.016 0.824
#> SRR1086116 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1499917 3 0.2408 0.67540 0.092 0.000 0.892 0.000 0.016
#> SRR1339944 2 0.4371 -0.45186 0.000 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1391444 2 0.4339 -0.42732 0.000 0.652 0.000 0.336 0.012
#> SRR1434889 3 0.4347 0.72687 0.096 0.000 0.784 0.112 0.008
#> SRR1431847 5 0.5027 0.81146 0.024 0.000 0.208 0.052 0.716
#> SRR1317155 3 0.5408 0.09163 0.356 0.000 0.588 0.044 0.012
#> SRR1477405 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR655289 5 0.4877 0.80502 0.024 0.000 0.236 0.032 0.708
#> SRR1341683 3 0.2756 0.67782 0.096 0.000 0.880 0.012 0.012
#> SRR1084790 5 0.5652 0.32400 0.404 0.000 0.024 0.036 0.536
#> SRR1073731 3 0.3983 0.73233 0.092 0.000 0.812 0.088 0.008
#> SRR1332588 5 0.3294 0.89853 0.024 0.000 0.124 0.008 0.844
#> SRR1471157 4 0.4655 0.95790 0.000 0.476 0.000 0.512 0.012
#> SRR654945 3 0.6117 0.76082 0.088 0.000 0.576 0.312 0.024
#> SRR661028 1 0.0671 0.84996 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1413477 2 0.2997 0.36109 0.000 0.840 0.012 0.148 0.000
#> SRR1101152 3 0.3320 0.67136 0.096 0.000 0.856 0.032 0.016
#> SRR1358435 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR2165273 1 0.1331 0.85121 0.952 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1379014 1 0.2513 0.84293 0.904 0.000 0.048 0.040 0.008
#> SRR1489904 3 0.6082 0.76003 0.092 0.000 0.576 0.312 0.020
#> SRR1416386 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1406048 1 0.4735 0.74719 0.720 0.000 0.220 0.052 0.008
#> SRR606982 5 0.3246 0.89952 0.024 0.000 0.120 0.008 0.848
#> SRR1358082 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312934 3 0.6077 0.76590 0.088 0.000 0.600 0.284 0.028
#> SRR655194 3 0.5812 -0.28837 0.456 0.000 0.476 0.048 0.020
#> SRR1331174 2 0.3087 0.34326 0.000 0.836 0.004 0.152 0.008
#> SRR1473251 2 0.0912 0.53568 0.000 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1389820 3 0.6671 0.69875 0.064 0.020 0.516 0.368 0.032
#> SRR1074289 3 0.7021 0.51763 0.324 0.000 0.380 0.288 0.008
#> SRR1348816 2 0.2818 0.39622 0.000 0.856 0.012 0.132 0.000
#> SRR1076292 3 0.5509 0.76929 0.092 0.000 0.648 0.252 0.008
#> SRR1395810 4 0.4656 0.94903 0.000 0.480 0.000 0.508 0.012
#> SRR1498909 3 0.3738 0.70914 0.092 0.000 0.832 0.064 0.012
#> SRR1443507 3 0.6909 0.62634 0.268 0.000 0.436 0.288 0.008
#> SRR1452310 3 0.3234 0.71064 0.092 0.000 0.856 0.048 0.004
#> SRR665610 3 0.4430 0.59733 0.088 0.000 0.792 0.024 0.096
#> SRR1347322 1 0.0162 0.85253 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813395 2 0.3691 0.61176 0.000 0.820 0.076 0.000 0.104
#> SRR1477256 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.3458 0.89943 0.024 0.000 0.120 0.016 0.840
#> SRR1354247 1 0.0000 0.85240 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 4 0.4291 0.99075 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1487592 3 0.6392 0.73637 0.160 0.000 0.532 0.300 0.008
#> SRR1352299 1 0.1725 0.84143 0.936 0.000 0.044 0.020 0.000
#> SRR1076317 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1434117 3 0.6661 0.58699 0.024 0.000 0.544 0.264 0.168
#> SRR1075273 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR658657 5 0.3738 0.89508 0.024 0.000 0.128 0.024 0.824
#> SRR1092773 2 0.0566 0.54794 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1365332 3 0.6281 0.74644 0.144 0.000 0.544 0.304 0.008
#> SRR615958 3 0.6161 0.75509 0.088 0.000 0.564 0.324 0.024
#> SRR1097688 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1403259 5 0.4868 0.78973 0.024 0.000 0.224 0.036 0.716
#> SRR1099120 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1362200 3 0.6004 0.76265 0.088 0.000 0.588 0.304 0.020
#> SRR1464856 2 0.2771 0.40360 0.000 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR1347298 3 0.6126 0.75771 0.092 0.000 0.564 0.324 0.020
#> SRR1075923 2 0.3670 0.61272 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1100703 1 0.5258 0.54621 0.636 0.000 0.296 0.064 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.4326 0.487890 0.044 0.000 0.300 0.656 0.000 0.000
#> SRR1436370 6 0.6663 -0.004591 0.000 0.224 0.004 0.224 0.052 0.496
#> SRR1075752 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.2619 0.757022 0.880 0.040 0.008 0.072 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.3881 0.412936 0.396 0.000 0.004 0.600 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.3432 0.696411 0.800 0.052 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR657384 4 0.5000 0.592828 0.144 0.008 0.180 0.668 0.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.4300 0.412256 0.028 0.000 0.364 0.608 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR818573 4 0.4997 0.440098 0.348 0.020 0.044 0.588 0.000 0.000
#> SRR1396017 4 0.4887 0.437237 0.348 0.052 0.004 0.592 0.004 0.000
#> SRR1410742 4 0.4196 0.448008 0.028 0.000 0.332 0.640 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.3123 0.715504 0.824 0.040 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0717 0.791118 0.976 0.008 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1391354 5 0.3298 0.855642 0.016 0.020 0.044 0.064 0.856 0.000
#> SRR1087968 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1310075 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.5378 0.427975 0.576 0.112 0.008 0.304 0.000 0.000
#> SRR1325138 4 0.5392 -0.075141 0.004 0.020 0.056 0.528 0.392 0.000
#> SRR1326821 5 0.2596 0.859344 0.024 0.016 0.060 0.008 0.892 0.000
#> SRR1490178 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR655613 1 0.2808 0.756259 0.868 0.076 0.008 0.048 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.3688 0.604439 0.000 0.000 0.000 0.256 0.020 0.724
#> SRR1443871 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1102489 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.4143 0.689285 0.028 0.080 0.788 0.100 0.004 0.000
#> SRR1407449 1 0.4580 -0.015257 0.528 0.028 0.004 0.440 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1479109 3 0.5557 0.616389 0.032 0.132 0.664 0.160 0.012 0.000
#> SRR1399069 5 0.4594 0.778966 0.024 0.036 0.036 0.148 0.756 0.000
#> SRR1366450 1 0.6639 0.302492 0.528 0.116 0.224 0.132 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.3588 0.685320 0.788 0.060 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.4436 0.639794 0.744 0.088 0.020 0.148 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1434736 5 0.2899 0.874580 0.004 0.020 0.072 0.032 0.872 0.000
#> SRR1080560 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.2189 0.771026 0.904 0.060 0.004 0.032 0.000 0.000
#> SRR1435688 6 0.5722 0.371288 0.000 0.144 0.000 0.260 0.020 0.576
#> SRR1327614 1 0.1492 0.782702 0.940 0.036 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.5813 0.088418 0.020 0.064 0.516 0.380 0.020 0.000
#> SRR1368141 3 0.5556 0.182549 0.024 0.048 0.556 0.356 0.016 0.000
#> SRR1440268 1 0.3316 0.705493 0.812 0.052 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.6207 -0.168713 0.452 0.056 0.096 0.396 0.000 0.000
#> SRR1325711 6 0.5722 0.371288 0.000 0.144 0.000 0.260 0.020 0.576
#> SRR1477930 1 0.2106 0.771461 0.904 0.032 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.1844 0.777901 0.924 0.048 0.004 0.024 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR656275 4 0.4395 0.333390 0.028 0.000 0.404 0.568 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.4648 0.062742 0.520 0.032 0.004 0.444 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.3252 0.756822 0.832 0.112 0.008 0.048 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.5544 -0.022490 0.480 0.036 0.004 0.044 0.436 0.000
#> SRR1404531 1 0.0260 0.791591 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1324331 5 0.5542 0.309735 0.384 0.040 0.004 0.044 0.528 0.000
#> SRR1458890 3 0.5592 0.137337 0.024 0.048 0.540 0.372 0.016 0.000
#> SRR1432695 2 0.5324 0.835055 0.000 0.592 0.008 0.036 0.036 0.328
#> SRR1407624 2 0.4555 0.850627 0.000 0.628 0.008 0.000 0.036 0.328
#> SRR1431969 3 0.1858 0.721346 0.024 0.016 0.932 0.004 0.024 0.000
#> SRR1087393 6 0.3688 0.604439 0.000 0.000 0.000 0.256 0.020 0.724
#> SRR1077263 5 0.1788 0.874232 0.004 0.004 0.076 0.000 0.916 0.000
#> SRR1385211 1 0.2407 0.768732 0.892 0.048 0.004 0.056 0.000 0.000
#> SRR655241 4 0.4751 0.354099 0.392 0.044 0.004 0.560 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.4724 0.402819 0.616 0.040 0.012 0.332 0.000 0.000
#> SRR1361630 5 0.1901 0.874091 0.004 0.008 0.076 0.000 0.912 0.000
#> SRR1318966 6 0.0713 0.741762 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1407087 3 0.3844 0.700388 0.028 0.072 0.812 0.084 0.004 0.000
#> SRR603212 1 0.4763 0.624281 0.728 0.104 0.036 0.132 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1485190 3 0.2779 0.713498 0.028 0.036 0.888 0.036 0.012 0.000
#> SRR1332232 2 0.6986 0.593597 0.000 0.372 0.004 0.220 0.056 0.348
#> SRR1312645 4 0.4975 0.486257 0.324 0.044 0.016 0.612 0.004 0.000
#> SRR1457835 1 0.5418 0.562847 0.676 0.100 0.072 0.152 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.2590 0.724736 0.028 0.044 0.896 0.024 0.008 0.000
#> SRR1465501 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 3 0.2510 0.708085 0.024 0.056 0.896 0.004 0.020 0.000
#> SRR1445064 3 0.5173 0.436017 0.024 0.048 0.656 0.256 0.016 0.000
#> SRR1452981 4 0.4705 0.457547 0.336 0.044 0.008 0.612 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0820 0.790233 0.972 0.016 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0692 0.790534 0.976 0.020 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1397697 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1477316 4 0.4620 0.572284 0.292 0.000 0.068 0.640 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.5134 0.218656 0.548 0.048 0.008 0.008 0.388 0.000
#> SRR1349080 5 0.2543 0.859837 0.024 0.016 0.064 0.004 0.892 0.000
#> SRR1076096 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR811261 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1375485 1 0.5656 0.324318 0.560 0.088 0.032 0.320 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.5049 0.844199 0.000 0.608 0.008 0.020 0.036 0.328
#> SRR604414 1 0.3000 0.742926 0.852 0.096 0.008 0.044 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0820 0.791506 0.972 0.012 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.4283 0.681266 0.028 0.084 0.776 0.108 0.004 0.000
#> SRR602082 1 0.0260 0.791908 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1078417 6 0.6216 0.210015 0.000 0.188 0.000 0.244 0.036 0.532
#> SRR661613 3 0.5023 0.461124 0.024 0.032 0.652 0.276 0.016 0.000
#> SRR1420710 4 0.4708 0.313102 0.024 0.008 0.412 0.552 0.004 0.000
#> SRR660426 1 0.2675 0.756205 0.876 0.076 0.008 0.040 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.4576 0.290841 0.028 0.004 0.436 0.532 0.000 0.000
#> SRR661064 4 0.4638 0.400601 0.368 0.040 0.004 0.588 0.000 0.000
#> SRR1082011 6 0.6216 0.210015 0.000 0.188 0.000 0.244 0.036 0.532
#> SRR1452718 1 0.0820 0.789783 0.972 0.016 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0717 0.792002 0.976 0.016 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0146 0.792145 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0260 0.791591 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.5997 0.454619 0.604 0.104 0.084 0.208 0.000 0.000
#> SRR1102467 4 0.4332 0.346989 0.416 0.016 0.004 0.564 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.1901 0.874091 0.004 0.008 0.076 0.000 0.912 0.000
#> SRR1337707 3 0.4802 0.552074 0.020 0.056 0.724 0.180 0.020 0.000
#> SRR1408752 6 0.6908 -0.379883 0.000 0.304 0.004 0.224 0.052 0.416
#> SRR1474617 3 0.4152 0.653838 0.016 0.128 0.788 0.044 0.024 0.000
#> SRR1398013 4 0.4333 0.394521 0.028 0.000 0.376 0.596 0.000 0.000
#> SRR1352918 5 0.3007 0.867547 0.004 0.012 0.056 0.064 0.864 0.000
#> SRR1420750 1 0.3717 0.708521 0.808 0.092 0.016 0.084 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.4830 0.542678 0.024 0.052 0.716 0.192 0.016 0.000
#> SRR1353618 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1082217 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1357256 2 0.5049 0.844199 0.000 0.608 0.008 0.020 0.036 0.328
#> SRR1490313 4 0.4910 0.589073 0.152 0.000 0.192 0.656 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.1088 0.788061 0.960 0.024 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.1257 0.786137 0.952 0.028 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.5020 0.748046 0.004 0.112 0.180 0.016 0.688 0.000
#> SRR1313494 4 0.4807 0.254643 0.428 0.044 0.004 0.524 0.000 0.000
#> SRR1309985 4 0.4819 0.447819 0.344 0.048 0.004 0.600 0.004 0.000
#> SRR607911 1 0.0692 0.790534 0.976 0.020 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.5199 0.622680 0.036 0.112 0.692 0.156 0.004 0.000
#> SRR1400078 4 0.4524 0.422618 0.024 0.012 0.352 0.612 0.000 0.000
#> SRR1088631 6 0.5659 0.390961 0.000 0.136 0.000 0.260 0.020 0.584
#> SRR1092842 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.3922 0.698073 0.024 0.068 0.808 0.092 0.008 0.000
#> SRR1079434 5 0.2538 0.873219 0.004 0.012 0.076 0.020 0.888 0.000
#> SRR1325559 1 0.5744 -0.076958 0.444 0.084 0.028 0.444 0.000 0.000
#> SRR1446695 5 0.2002 0.874212 0.004 0.012 0.076 0.000 0.908 0.000
#> SRR1383883 1 0.2001 0.773938 0.912 0.040 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1396100 5 0.3099 0.867260 0.004 0.016 0.056 0.064 0.860 0.000
#> SRR1475697 4 0.5681 0.558757 0.120 0.028 0.236 0.612 0.004 0.000
#> SRR1488067 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1105154 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 6 0.1204 0.730838 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1410380 5 0.1956 0.873456 0.004 0.008 0.080 0.000 0.908 0.000
#> SRR1445490 2 0.3668 0.858165 0.000 0.668 0.004 0.000 0.000 0.328
#> SRR1454671 2 0.4004 0.856993 0.000 0.656 0.004 0.000 0.012 0.328
#> SRR1435044 3 0.5399 -0.142814 0.024 0.028 0.472 0.460 0.016 0.000
#> SRR1485812 3 0.4097 0.667420 0.024 0.068 0.804 0.084 0.020 0.000
#> SRR1078020 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1311153 1 0.1498 0.791380 0.940 0.028 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1343898 3 0.5195 0.354728 0.004 0.084 0.640 0.016 0.256 0.000
#> SRR807775 3 0.1659 0.724553 0.020 0.008 0.940 0.004 0.028 0.000
#> SRR1409215 6 0.5722 0.371288 0.000 0.144 0.000 0.260 0.020 0.576
#> SRR820427 5 0.2044 0.874437 0.004 0.008 0.076 0.004 0.908 0.000
#> SRR1100656 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.0260 0.791636 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 5 0.2044 0.874182 0.004 0.008 0.076 0.004 0.908 0.000
#> SRR656794 5 0.6739 0.579136 0.140 0.084 0.100 0.072 0.604 0.000
#> SRR604653 1 0.0508 0.791215 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.5112 0.657205 0.012 0.036 0.224 0.048 0.680 0.000
#> SRR1485912 3 0.5047 0.635061 0.036 0.104 0.708 0.148 0.004 0.000
#> SRR1407602 5 0.2678 0.873341 0.004 0.012 0.064 0.036 0.884 0.000
#> SRR1356164 1 0.2250 0.769072 0.888 0.020 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1328692 4 0.5450 0.561419 0.168 0.004 0.240 0.588 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.2685 0.758493 0.872 0.080 0.004 0.044 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.2259 0.715738 0.024 0.036 0.912 0.004 0.024 0.000
#> SRR1358041 1 0.4533 -0.080067 0.504 0.024 0.004 0.468 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.6319 0.443134 0.180 0.108 0.580 0.132 0.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.3516 0.654687 0.024 0.000 0.792 0.172 0.012 0.000
#> SRR1435602 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1501043 5 0.5120 0.713646 0.004 0.084 0.228 0.020 0.664 0.000
#> SRR1437256 3 0.5366 0.067970 0.024 0.048 0.528 0.396 0.004 0.000
#> SRR1487446 4 0.4634 0.431522 0.024 0.012 0.344 0.616 0.004 0.000
#> SRR816653 1 0.3608 0.727055 0.816 0.096 0.016 0.072 0.000 0.000
#> SRR815164 4 0.8104 0.381559 0.188 0.124 0.204 0.412 0.072 0.000
#> SRR1442043 4 0.5141 0.496651 0.316 0.044 0.016 0.612 0.012 0.000
#> SRR1410573 1 0.0622 0.791178 0.980 0.008 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1096782 6 0.5659 0.390961 0.000 0.136 0.000 0.260 0.020 0.584
#> SRR1352369 3 0.6973 0.138233 0.328 0.108 0.420 0.144 0.000 0.000
#> SRR1382934 3 0.3051 0.696890 0.024 0.056 0.872 0.032 0.016 0.000
#> SRR1465208 1 0.2420 0.764286 0.884 0.040 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1314728 4 0.7617 0.243562 0.284 0.132 0.288 0.292 0.004 0.000
#> SRR1470291 1 0.0520 0.791630 0.984 0.008 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.3378 0.713892 0.024 0.064 0.848 0.056 0.008 0.000
#> SRR1409600 3 0.5649 0.601165 0.032 0.132 0.652 0.172 0.012 0.000
#> SRR816123 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR614779 5 0.1956 0.873456 0.004 0.008 0.080 0.000 0.908 0.000
#> SRR810783 3 0.4936 0.639527 0.032 0.100 0.716 0.148 0.004 0.000
#> SRR1333990 1 0.2190 0.768251 0.900 0.040 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.6157 0.503403 0.144 0.108 0.616 0.128 0.004 0.000
#> SRR808106 5 0.2290 0.862354 0.024 0.008 0.060 0.004 0.904 0.000
#> SRR662713 3 0.6333 0.431346 0.188 0.104 0.576 0.132 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1480964 3 0.4146 0.673747 0.028 0.052 0.768 0.152 0.000 0.000
#> SRR809382 3 0.2849 0.702390 0.024 0.048 0.884 0.028 0.016 0.000
#> SRR665417 1 0.4542 0.089839 0.556 0.028 0.004 0.412 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.3547 0.853834 0.000 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1453166 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 6 0.4372 0.570493 0.000 0.028 0.000 0.260 0.020 0.692
#> SRR1077781 6 0.5659 0.390961 0.000 0.136 0.000 0.260 0.020 0.584
#> SRR615623 3 0.2510 0.708085 0.024 0.056 0.896 0.004 0.020 0.000
#> SRR1413787 5 0.3799 0.792321 0.004 0.036 0.188 0.004 0.768 0.000
#> SRR1478207 3 0.2052 0.726115 0.028 0.004 0.912 0.056 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1326560 1 0.2954 0.732848 0.844 0.048 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.1498 0.782558 0.940 0.028 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1395616 1 0.1863 0.776282 0.920 0.036 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1092961 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR817210 3 0.4702 0.666499 0.028 0.092 0.736 0.140 0.004 0.000
#> SRR1319221 3 0.4152 0.653838 0.016 0.128 0.788 0.044 0.024 0.000
#> SRR1405413 1 0.6980 0.116499 0.424 0.132 0.120 0.324 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.1341 0.785010 0.948 0.028 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.3339 0.696614 0.028 0.056 0.856 0.044 0.016 0.000
#> SRR1406283 1 0.5860 0.422571 0.596 0.112 0.240 0.052 0.000 0.000
#> SRR1357709 4 0.5122 0.581779 0.260 0.016 0.076 0.644 0.004 0.000
#> SRR1080742 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1468208 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.5306 0.619427 0.060 0.108 0.696 0.132 0.004 0.000
#> SRR1361612 1 0.4921 0.128824 0.516 0.064 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.3011 0.742725 0.852 0.100 0.012 0.036 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.6979 0.123057 0.328 0.112 0.420 0.140 0.000 0.000
#> SRR1099720 6 0.4117 0.588156 0.000 0.016 0.000 0.256 0.020 0.708
#> SRR1349250 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1357127 3 0.3997 0.701489 0.028 0.052 0.800 0.112 0.008 0.000
#> SRR1074980 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1317022 3 0.2247 0.713627 0.024 0.040 0.912 0.004 0.020 0.000
#> SRR1332879 1 0.3453 0.726043 0.828 0.104 0.024 0.044 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.7973 0.213306 0.028 0.124 0.444 0.128 0.028 0.248
#> SRR1076144 6 0.6885 -0.332293 0.000 0.292 0.004 0.224 0.052 0.428
#> SRR1069614 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.0363 0.791329 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1485678 5 0.5702 0.210760 0.004 0.020 0.080 0.440 0.456 0.000
#> SRR1092232 3 0.3157 0.691511 0.020 0.068 0.864 0.028 0.020 0.000
#> SRR1344253 5 0.6775 0.454485 0.020 0.100 0.268 0.088 0.524 0.000
#> SRR1384290 1 0.0692 0.790534 0.976 0.020 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.4474 0.679321 0.020 0.092 0.764 0.112 0.012 0.000
#> SRR1343522 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1326727 6 0.5921 0.287412 0.000 0.172 0.000 0.260 0.020 0.548
#> SRR1440940 4 0.4972 0.270402 0.024 0.020 0.424 0.528 0.004 0.000
#> SRR818372 4 0.4906 0.257849 0.024 0.016 0.432 0.524 0.004 0.000
#> SRR1323675 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR819894 5 0.2788 0.868028 0.004 0.008 0.056 0.056 0.876 0.000
#> SRR1310031 3 0.1346 0.726174 0.024 0.008 0.952 0.000 0.016 0.000
#> SRR615419 3 0.5624 0.181704 0.020 0.052 0.548 0.360 0.020 0.000
#> SRR1436925 4 0.4242 0.348887 0.412 0.012 0.004 0.572 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.1492 0.782702 0.940 0.036 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.3717 0.684208 0.776 0.064 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.2984 0.725547 0.028 0.036 0.876 0.048 0.012 0.000
#> SRR1442949 5 0.2538 0.873219 0.004 0.012 0.076 0.020 0.888 0.000
#> SRR1466239 1 0.1418 0.784331 0.944 0.032 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1094003 6 0.5659 0.390961 0.000 0.136 0.000 0.260 0.020 0.584
#> SRR1329971 1 0.6376 0.482593 0.580 0.144 0.072 0.196 0.008 0.000
#> SRR813076 2 0.4170 0.855599 0.000 0.648 0.004 0.000 0.020 0.328
#> SRR1097642 6 0.3688 0.604439 0.000 0.000 0.000 0.256 0.020 0.724
#> SRR1322981 3 0.5251 0.622022 0.056 0.108 0.700 0.132 0.004 0.000
#> SRR1485976 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1471713 3 0.1714 0.722297 0.024 0.016 0.936 0.000 0.024 0.000
#> SRR660522 3 0.4361 0.672778 0.028 0.080 0.768 0.120 0.004 0.000
#> SRR815374 4 0.4749 0.528576 0.092 0.000 0.260 0.648 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1416337 5 0.1956 0.873456 0.004 0.008 0.080 0.000 0.908 0.000
#> SRR1316438 3 0.2709 0.708770 0.024 0.044 0.892 0.020 0.020 0.000
#> SRR1386844 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.5049 0.844199 0.000 0.608 0.008 0.020 0.036 0.328
#> SRR1487128 1 0.4024 0.662944 0.744 0.072 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1069919 2 0.6628 0.729240 0.000 0.472 0.008 0.140 0.052 0.328
#> SRR1460296 1 0.0520 0.791659 0.984 0.008 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.3395 0.704193 0.808 0.060 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1081425 1 0.0508 0.791215 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.2510 0.708085 0.024 0.056 0.896 0.004 0.020 0.000
#> SRR1071337 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1071983 6 0.5659 0.390961 0.000 0.136 0.000 0.260 0.020 0.584
#> SRR1331793 2 0.4555 0.850627 0.000 0.628 0.008 0.000 0.036 0.328
#> SRR1410510 3 0.2259 0.715738 0.024 0.036 0.912 0.004 0.024 0.000
#> SRR1098761 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1312124 4 0.4697 0.440705 0.348 0.048 0.004 0.600 0.000 0.000
#> SRR615395 3 0.7090 0.107160 0.336 0.112 0.412 0.136 0.004 0.000
#> SRR1479349 4 0.4513 0.290917 0.440 0.024 0.004 0.532 0.000 0.000
#> SRR2165033 4 0.4378 0.407098 0.032 0.000 0.368 0.600 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR816201 4 0.4238 0.424855 0.028 0.000 0.344 0.628 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR655840 4 0.4528 0.453694 0.024 0.016 0.328 0.632 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.2134 0.771056 0.904 0.044 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1418516 5 0.3099 0.867260 0.004 0.016 0.056 0.064 0.860 0.000
#> SRR613174 3 0.3374 0.714168 0.024 0.068 0.848 0.052 0.008 0.000
#> SRR1351125 3 0.4001 0.697682 0.028 0.084 0.800 0.084 0.004 0.000
#> SRR659157 3 0.5874 0.484223 0.020 0.072 0.648 0.188 0.072 0.000
#> SRR1480408 4 0.4910 0.586572 0.152 0.000 0.192 0.656 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.4274 0.481371 0.336 0.024 0.004 0.636 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1332526 4 0.4022 0.461587 0.360 0.008 0.004 0.628 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1431270 3 0.6381 0.440204 0.016 0.080 0.596 0.116 0.192 0.000
#> SRR1085614 6 0.5753 0.360309 0.000 0.148 0.000 0.260 0.020 0.572
#> SRR1330106 4 0.4343 0.390526 0.028 0.000 0.380 0.592 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0914 0.788983 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.1257 0.786438 0.952 0.028 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.4971 0.845856 0.000 0.612 0.008 0.016 0.036 0.328
#> SRR1457267 1 0.1492 0.782702 0.940 0.036 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR614659 4 0.4490 0.401407 0.028 0.008 0.348 0.616 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.5148 0.565670 0.028 0.072 0.664 0.232 0.004 0.000
#> SRR1317201 1 0.3336 0.708420 0.812 0.056 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.3058 0.741999 0.848 0.104 0.012 0.036 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0363 0.791329 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1096363 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 4 0.4770 0.504073 0.328 0.012 0.044 0.616 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1353499 1 0.0914 0.788983 0.968 0.016 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.4038 0.690436 0.028 0.072 0.796 0.100 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.0260 0.791636 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.6941 0.636811 0.000 0.392 0.004 0.224 0.052 0.328
#> SRR1498183 1 0.4878 0.435084 0.628 0.052 0.016 0.304 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.1714 0.722297 0.024 0.016 0.936 0.000 0.024 0.000
#> SRR1447148 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR658597 6 0.0146 0.749624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1089595 6 0.3688 0.604439 0.000 0.000 0.000 0.256 0.020 0.724
#> SRR1074263 6 0.5946 0.274250 0.000 0.176 0.000 0.260 0.020 0.544
#> SRR1376786 1 0.6911 -0.000471 0.396 0.108 0.368 0.128 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.6344 0.420626 0.580 0.112 0.144 0.164 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.4755 0.636881 0.736 0.104 0.048 0.112 0.000 0.000
#> SRR1068808 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR662438 1 0.0260 0.791591 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0692 0.790534 0.976 0.020 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.4242 0.686970 0.028 0.088 0.780 0.100 0.004 0.000
#> SRR1323558 3 0.1401 0.723175 0.020 0.004 0.948 0.000 0.028 0.000
#> SRR1381711 5 0.1901 0.874427 0.004 0.008 0.076 0.000 0.912 0.000
#> SRR657985 5 0.2056 0.873413 0.004 0.012 0.080 0.000 0.904 0.000
#> SRR1314810 1 0.4080 0.728272 0.780 0.112 0.020 0.088 0.000 0.000
#> SRR1336505 4 0.4596 0.152596 0.028 0.004 0.460 0.508 0.000 0.000
#> SRR1474095 3 0.6422 0.425847 0.108 0.112 0.552 0.228 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1442376 4 0.6232 0.582834 0.224 0.044 0.076 0.608 0.048 0.000
#> SRR1074909 6 0.0146 0.749624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1101200 1 0.6748 0.122454 0.440 0.108 0.344 0.108 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1367150 5 0.2788 0.868028 0.004 0.008 0.056 0.056 0.876 0.000
#> SRR1313406 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1068880 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1467277 5 0.2145 0.874221 0.004 0.012 0.076 0.004 0.904 0.000
#> SRR1084867 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1095431 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1380184 2 0.4317 0.853915 0.000 0.640 0.004 0.000 0.028 0.328
#> SRR1443113 1 0.6435 0.391017 0.560 0.112 0.124 0.204 0.000 0.000
#> SRR1380414 5 0.6525 0.258216 0.004 0.088 0.364 0.084 0.460 0.000
#> SRR1315912 1 0.1564 0.786710 0.936 0.040 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1421116 6 0.6661 -0.144458 0.000 0.252 0.000 0.228 0.052 0.468
#> SRR602282 3 0.5379 0.437671 0.024 0.068 0.648 0.244 0.016 0.000
#> SRR1361195 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR600493 1 0.5327 0.572276 0.688 0.108 0.072 0.132 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.5771 0.519806 0.648 0.112 0.108 0.132 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.4137 0.687996 0.028 0.076 0.788 0.104 0.004 0.000
#> SRR1360785 5 0.2848 0.867941 0.004 0.008 0.056 0.060 0.872 0.000
#> SRR810437 4 0.4576 0.284980 0.028 0.004 0.436 0.532 0.000 0.000
#> SRR1361860 4 0.4605 0.441174 0.356 0.040 0.004 0.600 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.6015 0.791168 0.000 0.536 0.008 0.092 0.036 0.328
#> SRR1098903 5 0.3271 0.858634 0.012 0.020 0.048 0.064 0.856 0.000
#> SRR1457619 4 0.5790 0.590210 0.240 0.044 0.084 0.620 0.012 0.000
#> SRR1498529 4 0.4571 0.284110 0.432 0.028 0.004 0.536 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.4555 0.850627 0.000 0.628 0.008 0.000 0.036 0.328
#> SRR1074017 6 0.5659 0.390961 0.000 0.136 0.000 0.260 0.020 0.584
#> SRR1472033 6 0.6019 0.231607 0.000 0.188 0.000 0.260 0.020 0.532
#> SRR1445087 3 0.2645 0.708873 0.024 0.036 0.896 0.028 0.016 0.000
#> SRR1399525 6 0.0363 0.747981 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1312844 6 0.0146 0.749624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1085874 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1101226 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1476056 4 0.4910 0.418847 0.356 0.052 0.004 0.584 0.004 0.000
#> SRR1075659 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 3 0.1714 0.722297 0.024 0.016 0.936 0.000 0.024 0.000
#> SRR1353353 3 0.3467 0.690910 0.028 0.056 0.848 0.052 0.016 0.000
#> SRR1073291 3 0.3342 0.712968 0.028 0.088 0.844 0.036 0.004 0.000
#> SRR1356227 1 0.4868 0.148136 0.524 0.060 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1080720 6 0.4029 0.592669 0.000 0.012 0.000 0.256 0.020 0.712
#> SRR1091695 6 0.0146 0.749624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1350304 5 0.2689 0.872963 0.004 0.012 0.060 0.040 0.884 0.000
#> SRR663002 3 0.2152 0.717063 0.024 0.028 0.920 0.012 0.016 0.000
#> SRR1376983 2 0.4489 0.851805 0.000 0.632 0.008 0.000 0.032 0.328
#> SRR1399926 1 0.1794 0.777399 0.924 0.036 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.1714 0.722297 0.024 0.016 0.936 0.000 0.024 0.000
#> SRR1384006 1 0.0909 0.791434 0.968 0.020 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.0405 0.748722 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR614047 3 0.1877 0.726153 0.024 0.012 0.932 0.008 0.024 0.000
#> SRR818440 3 0.3559 0.704471 0.028 0.024 0.824 0.116 0.008 0.000
#> SRR1337770 4 0.3982 0.275281 0.460 0.000 0.004 0.536 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.7028 -0.194669 0.388 0.112 0.144 0.356 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.4690 0.849667 0.000 0.624 0.008 0.004 0.036 0.328
#> SRR1473959 4 0.4322 0.400051 0.028 0.000 0.372 0.600 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.4824 0.651822 0.036 0.104 0.732 0.124 0.004 0.000
#> SRR1394495 2 0.4015 0.856923 0.000 0.656 0.008 0.000 0.008 0.328
#> SRR659460 3 0.6057 0.513933 0.132 0.108 0.616 0.144 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.4137 0.687996 0.028 0.076 0.788 0.104 0.004 0.000
#> SRR1308612 3 0.4100 0.694499 0.028 0.088 0.792 0.088 0.004 0.000
#> SRR1499418 5 0.3970 0.827075 0.004 0.044 0.148 0.020 0.784 0.000
#> SRR1352894 2 0.3668 0.857992 0.000 0.668 0.004 0.000 0.000 0.328
#> SRR815805 1 0.1261 0.792296 0.952 0.024 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1331083 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 3 0.2883 0.721924 0.024 0.056 0.880 0.028 0.012 0.000
#> SRR1436698 1 0.3282 0.732733 0.836 0.108 0.020 0.036 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1357672 5 0.6166 0.541989 0.004 0.088 0.236 0.088 0.584 0.000
#> SRR1351236 1 0.0363 0.791329 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0820 0.793578 0.972 0.012 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR814491 5 0.2948 0.867647 0.004 0.012 0.056 0.060 0.868 0.000
#> SRR1101256 6 0.6019 0.231607 0.000 0.188 0.000 0.260 0.020 0.532
#> SRR1436004 1 0.3869 0.710462 0.804 0.104 0.052 0.040 0.000 0.000
#> SRR1457994 6 0.6019 0.231607 0.000 0.188 0.000 0.260 0.020 0.532
#> SRR1078998 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1314707 4 0.4144 0.392599 0.408 0.008 0.004 0.580 0.000 0.000
#> SRR1309534 4 0.5922 0.587232 0.144 0.032 0.184 0.624 0.016 0.000
#> SRR615527 3 0.3338 0.692222 0.024 0.076 0.852 0.032 0.016 0.000
#> SRR1098216 1 0.2070 0.773151 0.908 0.048 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1325847 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 4 0.4796 0.622244 0.224 0.000 0.116 0.660 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.4474 0.563421 0.696 0.052 0.012 0.240 0.000 0.000
#> SRR1368638 5 0.3099 0.867260 0.004 0.016 0.056 0.064 0.860 0.000
#> SRR1431429 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1079237 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.4195 0.855827 0.000 0.648 0.008 0.000 0.016 0.328
#> SRR815759 5 0.2350 0.873970 0.004 0.008 0.076 0.016 0.896 0.000
#> SRR1502143 3 0.4945 0.643860 0.036 0.108 0.720 0.132 0.004 0.000
#> SRR1487614 3 0.2976 0.704537 0.028 0.056 0.876 0.024 0.016 0.000
#> SRR1402307 2 0.5049 0.844199 0.000 0.608 0.008 0.020 0.036 0.328
#> SRR820810 4 0.4851 0.482994 0.060 0.012 0.292 0.636 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.7053 0.644943 0.000 0.392 0.008 0.216 0.056 0.328
#> SRR1083215 3 0.5896 0.548817 0.108 0.104 0.644 0.140 0.004 0.000
#> SRR1476547 6 0.4029 0.592669 0.000 0.012 0.000 0.256 0.020 0.712
#> SRR656421 5 0.3010 0.803482 0.084 0.016 0.008 0.028 0.864 0.000
#> SRR1086116 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1499917 4 0.4273 0.388970 0.024 0.000 0.380 0.596 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.6941 0.636811 0.000 0.392 0.004 0.224 0.052 0.328
#> SRR1391444 2 0.7065 0.608285 0.000 0.376 0.008 0.216 0.056 0.344
#> SRR1434889 3 0.4995 0.092311 0.028 0.024 0.508 0.440 0.000 0.000
#> SRR1431847 5 0.6076 0.642094 0.004 0.084 0.244 0.080 0.588 0.000
#> SRR1317155 4 0.4965 0.614740 0.216 0.000 0.140 0.644 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0260 0.791636 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 5 0.5221 0.565017 0.004 0.024 0.056 0.304 0.612 0.000
#> SRR1341683 4 0.4561 0.311777 0.028 0.004 0.424 0.544 0.000 0.000
#> SRR1084790 5 0.5703 0.436334 0.300 0.080 0.016 0.020 0.584 0.000
#> SRR1073731 3 0.4598 -0.014960 0.028 0.000 0.504 0.464 0.004 0.000
#> SRR1332588 5 0.2788 0.868028 0.004 0.008 0.056 0.056 0.876 0.000
#> SRR1471157 2 0.5123 0.842311 0.000 0.604 0.008 0.024 0.036 0.328
#> SRR654945 3 0.2815 0.726322 0.024 0.036 0.888 0.028 0.024 0.000
#> SRR661028 1 0.2883 0.747694 0.860 0.092 0.008 0.040 0.000 0.000
#> SRR1413477 6 0.5995 0.246327 0.000 0.184 0.000 0.260 0.020 0.536
#> SRR1101152 4 0.4319 0.412165 0.032 0.000 0.348 0.620 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.0891 0.789640 0.968 0.024 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.2728 0.744697 0.860 0.040 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.2325 0.727928 0.028 0.028 0.912 0.016 0.016 0.000
#> SRR1416386 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 4 0.5077 0.053066 0.464 0.064 0.004 0.468 0.000 0.000
#> SRR606982 5 0.2408 0.873285 0.004 0.024 0.076 0.004 0.892 0.000
#> SRR1358082 1 0.0260 0.791636 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.2842 0.724866 0.024 0.012 0.880 0.064 0.020 0.000
#> SRR655194 4 0.4535 0.569114 0.296 0.000 0.060 0.644 0.000 0.000
#> SRR1331174 6 0.6216 0.210015 0.000 0.188 0.000 0.244 0.036 0.532
#> SRR1473251 6 0.4029 0.592669 0.000 0.012 0.000 0.256 0.020 0.712
#> SRR1389820 3 0.4126 0.650158 0.012 0.128 0.788 0.048 0.024 0.000
#> SRR1074289 3 0.6446 0.457256 0.164 0.112 0.580 0.140 0.004 0.000
#> SRR1348816 6 0.5722 0.371288 0.000 0.144 0.000 0.260 0.020 0.576
#> SRR1076292 3 0.4713 0.638077 0.028 0.060 0.728 0.176 0.008 0.000
#> SRR1395810 2 0.5123 0.842354 0.000 0.604 0.008 0.024 0.036 0.328
#> SRR1498909 4 0.4537 0.157674 0.024 0.004 0.484 0.488 0.000 0.000
#> SRR1443507 3 0.6217 0.479827 0.156 0.108 0.596 0.140 0.000 0.000
#> SRR1452310 4 0.4580 0.244530 0.028 0.004 0.440 0.528 0.000 0.000
#> SRR665610 4 0.4976 0.428127 0.020 0.016 0.336 0.608 0.020 0.000
#> SRR1347322 1 0.0405 0.791666 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.0622 0.747530 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1477256 1 0.1088 0.793724 0.960 0.024 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.2713 0.874061 0.004 0.024 0.076 0.016 0.880 0.000
#> SRR1354247 1 0.0260 0.791591 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.3531 0.858294 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1487592 3 0.5565 0.608156 0.068 0.116 0.672 0.140 0.004 0.000
#> SRR1352299 1 0.4476 0.656794 0.756 0.104 0.036 0.104 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 3 0.4162 0.649185 0.004 0.044 0.772 0.028 0.152 0.000
#> SRR1075273 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658657 5 0.3576 0.837284 0.004 0.028 0.128 0.024 0.816 0.000
#> SRR1092773 6 0.3592 0.613246 0.000 0.000 0.000 0.240 0.020 0.740
#> SRR1365332 3 0.5035 0.641028 0.044 0.108 0.716 0.128 0.004 0.000
#> SRR615958 3 0.1714 0.722297 0.024 0.016 0.936 0.000 0.024 0.000
#> SRR1097688 6 0.0146 0.749624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1403259 5 0.4504 0.740522 0.004 0.048 0.232 0.012 0.704 0.000
#> SRR1099120 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.2416 0.726730 0.024 0.028 0.908 0.024 0.016 0.000
#> SRR1464856 6 0.5659 0.390961 0.000 0.136 0.000 0.260 0.020 0.584
#> SRR1347298 3 0.1858 0.722844 0.024 0.024 0.932 0.004 0.016 0.000
#> SRR1075923 6 0.0000 0.750133 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.7002 0.015979 0.448 0.112 0.160 0.280 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4379 0.562 0.562
#> 3 3 0.781 0.907 0.934 0.4839 0.769 0.590
#> 4 4 0.900 0.875 0.938 0.1253 0.901 0.719
#> 5 5 0.880 0.849 0.913 0.0649 0.908 0.686
#> 6 6 0.794 0.716 0.752 0.0494 0.932 0.706
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398013 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319221 2 0.506 0.874 0.112 0.888
#> SRR1405413 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076144 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074289 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 3 0.4605 0.8845 0.204 0.000 0.796
#> SRR1351190 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.3192 0.8215 0.888 0.000 0.112
#> SRR1410742 3 0.4452 0.8938 0.192 0.000 0.808
#> SRR1435963 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326821 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.4452 0.8938 0.192 0.000 0.808
#> SRR1407449 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1399069 3 0.2959 0.7728 0.100 0.000 0.900
#> SRR1366450 1 0.4452 0.7512 0.808 0.000 0.192
#> SRR1396859 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080560 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1368141 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1440268 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.2625 0.8597 0.916 0.000 0.084
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1369052 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.4555 0.7350 0.800 0.000 0.200
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4555 0.7350 0.800 0.000 0.200
#> SRR1458890 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1087393 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318966 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR603212 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.6126 0.5838 0.400 0.000 0.600
#> SRR1457835 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1465501 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1445064 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1452981 1 0.1031 0.9294 0.976 0.000 0.024
#> SRR1326708 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.6154 0.5655 0.408 0.000 0.592
#> SRR1077898 1 0.4555 0.7350 0.800 0.000 0.200
#> SRR1349080 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR602082 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.3267 0.8786 0.116 0.000 0.884
#> SRR1420710 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR660426 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.4399 0.8964 0.188 0.000 0.812
#> SRR661064 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337707 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.5810 0.4622 0.000 0.664 0.336
#> SRR1398013 3 0.4452 0.8938 0.192 0.000 0.808
#> SRR1352918 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.6126 0.5837 0.400 0.000 0.600
#> SRR1366560 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.5882 0.3069 0.652 0.000 0.348
#> SRR607911 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1400078 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1079434 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475697 3 0.4504 0.8910 0.196 0.000 0.804
#> SRR1488067 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1485812 3 0.4235 0.8970 0.176 0.000 0.824
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100656 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR656794 3 0.4654 0.6310 0.208 0.000 0.792
#> SRR604653 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485912 3 0.4399 0.8964 0.188 0.000 0.812
#> SRR1407602 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356164 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 3 0.5254 0.8178 0.264 0.000 0.736
#> SRR1362438 1 0.4062 0.7747 0.836 0.000 0.164
#> SRR1479216 3 0.3267 0.8785 0.116 0.000 0.884
#> SRR1358041 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.1753 0.9048 0.952 0.000 0.048
#> SRR1368200 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1487446 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR816653 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 3 0.2261 0.8153 0.068 0.000 0.932
#> SRR1442043 3 0.6008 0.6424 0.372 0.000 0.628
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0747 0.9375 0.984 0.000 0.016
#> SRR1382934 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1465208 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.4842 0.8649 0.224 0.000 0.776
#> SRR1470291 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1409600 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR816123 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR810783 3 0.4399 0.8964 0.188 0.000 0.812
#> SRR1333990 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.6192 0.5342 0.420 0.000 0.580
#> SRR808106 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR662713 1 0.6235 -0.0514 0.564 0.000 0.436
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.4399 0.8964 0.188 0.000 0.812
#> SRR809382 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR665417 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1413787 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478207 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1411046 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 3 0.4291 0.8979 0.180 0.000 0.820
#> SRR1319221 3 0.6126 0.3735 0.000 0.400 0.600
#> SRR1405413 1 0.4796 0.6370 0.780 0.000 0.220
#> SRR607807 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1406283 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 3 0.4452 0.8941 0.192 0.000 0.808
#> SRR1080742 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1361612 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.5397 0.4995 0.720 0.000 0.280
#> SRR1099720 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1332879 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092232 3 0.2796 0.8695 0.092 0.000 0.908
#> SRR1344253 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR818372 3 0.3941 0.8917 0.156 0.000 0.844
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310031 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR615419 3 0.3686 0.8866 0.140 0.000 0.860
#> SRR1436925 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1442949 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0424 0.9451 0.992 0.000 0.008
#> SRR813076 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR660522 3 0.4452 0.8938 0.192 0.000 0.808
#> SRR815374 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1069564 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316438 3 0.3686 0.8866 0.140 0.000 0.860
#> SRR1386844 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.3816 0.8892 0.148 0.000 0.852
#> SRR1098761 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.3340 0.8099 0.880 0.000 0.120
#> SRR615395 1 0.1753 0.9034 0.952 0.000 0.048
#> SRR1479349 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1089054 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1379303 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR613174 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1351125 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR659157 3 0.3412 0.8813 0.124 0.000 0.876
#> SRR1480408 3 0.6126 0.5838 0.400 0.000 0.600
#> SRR657857 1 0.6305 -0.2631 0.516 0.000 0.484
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1466154 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR659247 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1317201 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.6126 0.1032 0.600 0.000 0.400
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.1163 0.9254 0.972 0.000 0.028
#> SRR1071035 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1323558 3 0.2165 0.8587 0.064 0.000 0.936
#> SRR1381711 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR657985 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1474095 3 0.6062 0.6183 0.384 0.000 0.616
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1074909 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1360785 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR810437 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1361860 1 0.1860 0.9024 0.948 0.000 0.052
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457619 3 0.5497 0.7793 0.292 0.000 0.708
#> SRR1498529 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1399525 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.1643 0.9079 0.956 0.000 0.044
#> SRR1075659 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1353353 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1073291 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1356227 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR663002 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1384006 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR818440 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1337770 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.6225 -0.0469 0.568 0.000 0.432
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1074041 3 0.4399 0.8964 0.188 0.000 0.812
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 3 0.5397 0.7989 0.280 0.000 0.720
#> SRR816699 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1308612 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1499418 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1436698 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR615527 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1098216 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 3 0.6154 0.5655 0.408 0.000 0.592
#> SRR1344166 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1502143 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1487614 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.5058 0.8431 0.244 0.000 0.756
#> SRR1476547 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.6308 0.2319 0.508 0.000 0.492
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.4452 0.8938 0.192 0.000 0.808
#> SRR1431847 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317155 3 0.6154 0.5655 0.408 0.000 0.592
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341683 3 0.4399 0.8964 0.188 0.000 0.812
#> SRR1084790 1 0.6111 0.4703 0.604 0.000 0.396
#> SRR1073731 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1332588 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR661028 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1358435 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1416386 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.4291 0.8979 0.180 0.000 0.820
#> SRR655194 1 0.6126 0.1032 0.600 0.000 0.400
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.4750 0.7082 0.000 0.784 0.216
#> SRR1074289 3 0.5882 0.6913 0.348 0.000 0.652
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1443507 1 0.6062 0.1720 0.616 0.000 0.384
#> SRR1452310 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR665610 3 0.0592 0.8382 0.012 0.000 0.988
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.4555 0.8880 0.200 0.000 0.800
#> SRR1352299 1 0.0000 0.9526 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075273 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092773 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 3 0.4605 0.8846 0.204 0.000 0.796
#> SRR615958 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1097688 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.0000 0.8335 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099120 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.4346 0.8986 0.184 0.000 0.816
#> SRR1075923 2 0.0000 0.9963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.5098 0.5772 0.752 0.000 0.248
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.2999 0.84542 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1436370 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.2198 0.87991 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1329744 1 0.0336 0.92833 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR657384 3 0.5582 0.71234 0.108 0.000 0.724 0.168
#> SRR1351190 3 0.2999 0.84542 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1458662 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR818573 1 0.6275 -0.00864 0.484 0.000 0.460 0.056
#> SRR1396017 1 0.5183 0.33467 0.584 0.000 0.008 0.408
#> SRR1410742 3 0.2999 0.84542 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1435963 1 0.0336 0.92833 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1382416 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.0469 0.87337 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1087968 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1310075 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312244 1 0.0524 0.92710 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1325138 4 0.0336 0.87141 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1326821 4 0.1389 0.88448 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1490178 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR655613 1 0.0336 0.92591 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414058 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1407449 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1436858 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1479109 3 0.4535 0.53799 0.004 0.000 0.704 0.292
#> SRR1399069 4 0.0336 0.87141 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1366450 1 0.5900 0.56464 0.684 0.000 0.220 0.096
#> SRR1396859 1 0.0336 0.92833 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1457176 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 4 0.1389 0.88514 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1080560 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.4655 0.63271 0.004 0.000 0.684 0.312
#> SRR1368141 3 0.2773 0.85882 0.004 0.000 0.880 0.116
#> SRR1440268 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453725 3 0.6070 0.27110 0.404 0.000 0.548 0.048
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477591 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR656275 3 0.2714 0.85586 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1369052 1 0.0804 0.92305 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1377735 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 4 0.4746 0.40462 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1404531 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 4 0.4008 0.64917 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1458890 3 0.2888 0.85476 0.004 0.000 0.872 0.124
#> SRR1432695 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1407624 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1431969 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1087393 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1385211 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR656922 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1361630 4 0.2081 0.86773 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1318966 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR603212 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1321088 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485190 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1332232 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1312645 1 0.7213 0.03289 0.452 0.000 0.140 0.408
#> SRR1457835 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347123 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1465501 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1445064 3 0.2530 0.86613 0.004 0.000 0.896 0.100
#> SRR1452981 1 0.4153 0.77772 0.820 0.000 0.048 0.132
#> SRR1326708 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1397697 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1477316 1 0.7523 -0.10118 0.412 0.000 0.404 0.184
#> SRR1077898 4 0.4916 0.27322 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1349080 4 0.1389 0.88514 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1076096 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.2921 0.79336 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1432563 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.1743 0.87848 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR1420710 3 0.2944 0.84674 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR660426 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.2714 0.85586 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR661064 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.1716 0.88320 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1102467 1 0.1722 0.89952 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR1317470 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1337707 3 0.2773 0.85868 0.004 0.000 0.880 0.116
#> SRR1408752 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1474617 2 0.5250 0.20724 0.000 0.552 0.440 0.008
#> SRR1398013 3 0.2999 0.84542 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1352918 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1420750 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.2125 0.87509 0.004 0.000 0.920 0.076
#> SRR1353618 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1082217 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357256 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1490313 3 0.4805 0.77573 0.084 0.000 0.784 0.132
#> SRR1366560 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 4 0.2647 0.84271 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1313494 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1309985 1 0.5172 0.34519 0.588 0.000 0.008 0.404
#> SRR607911 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1400078 3 0.2944 0.84674 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615575 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1079434 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1325559 1 0.1624 0.90726 0.952 0.000 0.020 0.028
#> SRR1446695 4 0.1716 0.87969 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1383883 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396100 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1475697 4 0.7519 -0.04749 0.184 0.000 0.392 0.424
#> SRR1488067 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 4 0.2814 0.83271 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1445490 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454671 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1435044 3 0.2714 0.85785 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1485812 3 0.4889 0.46606 0.004 0.000 0.636 0.360
#> SRR1078020 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1343898 4 0.4933 0.33706 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR807775 3 0.2647 0.80461 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1100656 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR656794 4 0.3279 0.83039 0.096 0.000 0.032 0.872
#> SRR604653 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1485912 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1407602 4 0.0336 0.87766 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1356164 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 3 0.4916 0.69013 0.184 0.000 0.760 0.056
#> SRR1362438 1 0.3528 0.71691 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1479216 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1358041 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1468766 3 0.0592 0.88842 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1368200 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1435602 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1501043 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1437256 3 0.2944 0.85286 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR1487446 3 0.3539 0.81117 0.004 0.000 0.820 0.176
#> SRR816653 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 4 0.1824 0.85211 0.004 0.000 0.060 0.936
#> SRR1442043 1 0.7149 0.02682 0.452 0.000 0.132 0.416
#> SRR1410573 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.0592 0.88874 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1382934 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1465208 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1314728 3 0.7449 0.13220 0.180 0.000 0.464 0.356
#> SRR1470291 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1409600 3 0.4720 0.49205 0.004 0.000 0.672 0.324
#> SRR816123 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614779 4 0.2589 0.84483 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR810783 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1333990 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1410356 3 0.0469 0.88990 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR808106 4 0.1389 0.88514 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR662713 3 0.2011 0.84327 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1447058 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1480964 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR809382 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR665417 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1088016 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1413787 4 0.2814 0.83271 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1478207 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1411046 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313711 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326560 1 0.0336 0.92833 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309051 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1395616 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074956 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817210 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1319221 3 0.5112 0.34556 0.000 0.384 0.608 0.008
#> SRR1405413 1 0.5353 0.21106 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR607807 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390160 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1406283 1 0.4008 0.64340 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1357709 3 0.6123 0.42876 0.056 0.000 0.572 0.372
#> SRR1080742 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312766 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1361612 1 0.0469 0.92653 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311224 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.0707 0.88650 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1357127 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1074980 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1317022 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1332879 1 0.1940 0.86327 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1403177 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076144 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.0469 0.87337 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1092232 3 0.0469 0.88978 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1344253 4 0.2814 0.83271 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1384290 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.2469 0.81837 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1343522 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.3052 0.84773 0.004 0.000 0.860 0.136
#> SRR818372 3 0.3402 0.83089 0.004 0.000 0.832 0.164
#> SRR1323675 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819894 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1310031 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR615419 3 0.2999 0.84986 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1436925 1 0.2197 0.88689 0.928 0.000 0.024 0.048
#> SRR1477238 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332566 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1490228 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1442949 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1466239 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4401 0.58429 0.724 0.000 0.004 0.272
#> SRR813076 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1485976 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1471713 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR660522 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR815374 3 0.3271 0.84070 0.012 0.000 0.856 0.132
#> SRR1069564 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 4 0.2589 0.84483 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1316438 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1386844 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1373718 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447458 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487128 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441421 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1069919 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393404 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1071337 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1410510 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1098761 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.3249 0.80779 0.852 0.000 0.008 0.140
#> SRR615395 3 0.4624 0.48120 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1479349 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR2165033 3 0.2530 0.86224 0.004 0.000 0.896 0.100
#> SRR1089054 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816201 3 0.2944 0.84674 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR1488514 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR655840 3 0.3870 0.77803 0.004 0.000 0.788 0.208
#> SRR1379303 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418516 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR613174 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1351125 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR659157 3 0.4741 0.57110 0.004 0.000 0.668 0.328
#> SRR1480408 3 0.3606 0.83334 0.024 0.000 0.844 0.132
#> SRR657857 1 0.7260 0.31296 0.532 0.000 0.280 0.188
#> SRR1073317 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1332526 1 0.3325 0.82452 0.864 0.000 0.024 0.112
#> SRR1094168 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.4977 0.17943 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR1085614 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.2714 0.85586 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1466154 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082784 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.2714 0.85586 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR659247 3 0.1209 0.88347 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR1317201 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473696 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.6790 0.46500 0.296 0.000 0.576 0.128
#> SRR1345499 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070841 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1498183 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR612659 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1447148 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.4996 0.03545 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1345995 3 0.4961 0.18749 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1071035 1 0.1867 0.86784 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1323558 3 0.0469 0.88978 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1381711 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR657985 4 0.1716 0.87970 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1314810 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 3 0.1489 0.87826 0.004 0.000 0.952 0.044
#> SRR1474095 3 0.0469 0.89015 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1363831 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442376 4 0.7036 0.43391 0.208 0.000 0.216 0.576
#> SRR1074909 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.4907 0.24571 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1075408 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1367150 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1313406 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1068880 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1467277 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1084867 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1443113 1 0.3528 0.72793 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1380414 4 0.3975 0.71855 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1315912 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.2714 0.86051 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1361195 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR600493 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477653 1 0.1940 0.87467 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1355475 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1360785 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR810437 3 0.2714 0.85586 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1361860 1 0.4194 0.69742 0.764 0.000 0.008 0.228
#> SRR1441311 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1098903 4 0.0469 0.87337 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1457619 4 0.7728 0.17466 0.352 0.000 0.232 0.416
#> SRR1498529 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1097172 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1399525 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.4086 0.71361 0.776 0.000 0.008 0.216
#> SRR1075659 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1353353 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1073291 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1356227 1 0.0657 0.92506 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1080720 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR663002 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1376983 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1399926 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347144 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1384006 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499108 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614047 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR818440 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1337770 1 0.2300 0.88137 0.920 0.000 0.016 0.064
#> SRR1399413 3 0.5219 0.61134 0.244 0.000 0.712 0.044
#> SRR1385542 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1473959 3 0.2831 0.85256 0.004 0.000 0.876 0.120
#> SRR1074041 3 0.0188 0.89189 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1394495 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR659460 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR816699 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1308612 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1499418 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1352894 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808272 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1436698 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 4 0.3123 0.81473 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1351236 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.1637 0.88035 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1314707 1 0.1807 0.89658 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1309534 4 0.7599 -0.00977 0.200 0.000 0.376 0.424
#> SRR615527 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1098216 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325847 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 3 0.6194 0.61743 0.200 0.000 0.668 0.132
#> SRR1344166 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1368638 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1431429 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR815759 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1502143 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1487614 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1402307 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR820810 3 0.2999 0.84542 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1099212 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1083215 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656421 4 0.2401 0.83673 0.092 0.000 0.004 0.904
#> SRR1086116 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499917 3 0.2944 0.84674 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR1339944 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1391444 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1434889 3 0.2714 0.85586 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1431847 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1317155 3 0.5798 0.65917 0.184 0.000 0.704 0.112
#> SRR1477405 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.0469 0.87337 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1341683 3 0.2944 0.84674 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR1084790 4 0.4122 0.66721 0.236 0.000 0.004 0.760
#> SRR1073731 3 0.0376 0.89213 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1332588 4 0.0188 0.87669 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1471157 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR654945 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR661028 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.2944 0.84674 0.004 0.000 0.868 0.128
#> SRR1358435 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1379014 1 0.0188 0.92971 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489904 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1416386 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.1042 0.91841 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR606982 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1358082 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR655194 3 0.7130 0.22447 0.396 0.000 0.472 0.132
#> SRR1331174 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.5112 0.36970 0.000 0.608 0.384 0.008
#> SRR1074289 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1395810 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1498909 3 0.2714 0.85586 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1443507 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1452310 3 0.2334 0.86673 0.004 0.000 0.908 0.088
#> SRR665610 4 0.4500 0.42242 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1347322 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 4 0.1474 0.88515 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1354247 1 0.0000 0.93015 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0188 0.99222 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487592 3 0.0524 0.89167 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1352299 1 0.0336 0.92747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.3688 0.68509 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1075273 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658657 4 0.0336 0.87766 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1092773 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 3 0.0336 0.89101 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR615958 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1097688 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 4 0.2408 0.85272 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1099120 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1464856 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0524 0.89245 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1075923 2 0.0000 0.99235 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 3 0.4560 0.54620 0.296 0.000 0.700 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 4 0.1628 0.8500 0.000 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1436370 2 0.0162 0.9802 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075752 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1397949 1 0.1018 0.8858 0.968 0.000 0.016 0.016 0.000
#> SRR1355723 4 0.2124 0.8209 0.096 0.000 0.000 0.900 0.004
#> SRR1329744 1 0.3774 0.6473 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR657384 4 0.2122 0.8455 0.008 0.000 0.036 0.924 0.032
#> SRR1351190 4 0.2179 0.8418 0.000 0.000 0.100 0.896 0.004
#> SRR1458662 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR818573 4 0.3043 0.8308 0.056 0.000 0.080 0.864 0.000
#> SRR1396017 4 0.2036 0.8288 0.024 0.000 0.000 0.920 0.056
#> SRR1410742 4 0.1830 0.8499 0.000 0.000 0.068 0.924 0.008
#> SRR1435963 1 0.3210 0.7550 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1382416 1 0.0290 0.8942 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1391354 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1087968 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1310075 1 0.1341 0.8825 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1312244 1 0.4922 0.3667 0.552 0.000 0.020 0.424 0.004
#> SRR1325138 4 0.3966 0.5056 0.000 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1326821 5 0.0794 0.9106 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1490178 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR655613 1 0.2448 0.8464 0.892 0.000 0.088 0.020 0.000
#> SRR1075707 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1443871 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102489 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1465758 1 0.0963 0.8892 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1414058 3 0.0162 0.8708 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1407449 4 0.3752 0.6197 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR1436858 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1479109 3 0.2490 0.8236 0.004 0.000 0.896 0.020 0.080
#> SRR1399069 5 0.0963 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1366450 1 0.5733 0.2763 0.528 0.000 0.408 0.036 0.028
#> SRR1396859 1 0.3730 0.6600 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1457176 1 0.2661 0.8456 0.888 0.000 0.056 0.056 0.000
#> SRR1097666 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1434736 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080560 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1322882 1 0.0290 0.8921 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0703 0.8926 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR658152 4 0.3269 0.8244 0.000 0.000 0.096 0.848 0.056
#> SRR1368141 4 0.3621 0.7611 0.000 0.000 0.192 0.788 0.020
#> SRR1440268 1 0.3636 0.6826 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1453725 4 0.5359 0.6338 0.256 0.000 0.100 0.644 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.2852 0.7997 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1477591 1 0.0162 0.8929 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR656275 4 0.3480 0.6997 0.000 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1369052 4 0.3424 0.6633 0.240 0.000 0.000 0.760 0.000
#> SRR1377735 1 0.2376 0.8693 0.904 0.000 0.044 0.052 0.000
#> SRR1331244 5 0.4387 0.4352 0.348 0.000 0.000 0.012 0.640
#> SRR1404531 1 0.0290 0.8941 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1324331 5 0.3890 0.6366 0.252 0.000 0.000 0.012 0.736
#> SRR1458890 4 0.3319 0.7942 0.000 0.000 0.160 0.820 0.020
#> SRR1432695 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407624 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1431969 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1087393 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1077263 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385211 1 0.1549 0.8828 0.944 0.000 0.016 0.040 0.000
#> SRR655241 4 0.1908 0.8196 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR656922 1 0.4980 0.1227 0.488 0.000 0.028 0.484 0.000
#> SRR1361630 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318966 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1407087 3 0.0566 0.8734 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR603212 1 0.2426 0.8506 0.900 0.000 0.064 0.036 0.000
#> SRR1321088 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1485190 3 0.1750 0.8709 0.000 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1332232 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1312645 4 0.1901 0.8321 0.012 0.000 0.004 0.928 0.056
#> SRR1457835 1 0.3810 0.8030 0.812 0.000 0.088 0.100 0.000
#> SRR1347123 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1465501 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1330878 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1445064 4 0.4824 0.4316 0.000 0.000 0.376 0.596 0.028
#> SRR1452981 4 0.1894 0.8278 0.072 0.000 0.000 0.920 0.008
#> SRR1326708 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0510 0.8935 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1365401 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1397697 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477316 4 0.1820 0.8469 0.020 0.000 0.020 0.940 0.020
#> SRR1077898 5 0.4321 0.3202 0.396 0.000 0.004 0.000 0.600
#> SRR1349080 5 0.0609 0.9157 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1076096 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR811261 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1375485 4 0.5744 0.4177 0.320 0.000 0.108 0.572 0.000
#> SRR1432563 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR604414 1 0.1628 0.8681 0.936 0.000 0.056 0.008 0.000
#> SRR1380614 1 0.0404 0.8938 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR812060 3 0.0162 0.8708 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR602082 1 0.0162 0.8939 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069490 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.4374 0.5718 0.000 0.000 0.700 0.272 0.028
#> SRR1420710 4 0.2233 0.8401 0.000 0.000 0.104 0.892 0.004
#> SRR660426 1 0.1502 0.8694 0.940 0.000 0.056 0.004 0.000
#> SRR1416003 4 0.2561 0.8202 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR661064 4 0.1851 0.8207 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0162 0.8939 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313473 1 0.0162 0.8941 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399394 1 0.6495 0.0432 0.424 0.000 0.188 0.388 0.000
#> SRR1102467 4 0.2424 0.8054 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1317470 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337707 3 0.4965 0.0581 0.000 0.000 0.520 0.452 0.028
#> SRR1408752 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1474617 3 0.5916 0.2701 0.000 0.404 0.520 0.048 0.028
#> SRR1398013 4 0.2286 0.8393 0.000 0.000 0.108 0.888 0.004
#> SRR1352918 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1420750 1 0.1845 0.8649 0.928 0.000 0.056 0.016 0.000
#> SRR1071785 3 0.4924 0.1647 0.000 0.000 0.552 0.420 0.028
#> SRR1353618 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1082217 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1357256 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1490313 4 0.1731 0.8509 0.004 0.000 0.060 0.932 0.004
#> SRR1366560 1 0.0609 0.8929 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1355684 1 0.0510 0.8935 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1323289 5 0.1399 0.8975 0.000 0.000 0.028 0.020 0.952
#> SRR1313494 4 0.2230 0.8045 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1309985 4 0.2104 0.8269 0.024 0.000 0.000 0.916 0.060
#> SRR607911 1 0.0609 0.8929 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1333789 3 0.1331 0.8560 0.008 0.000 0.952 0.040 0.000
#> SRR1400078 4 0.2179 0.8415 0.000 0.000 0.100 0.896 0.004
#> SRR1088631 2 0.0290 0.9790 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1092842 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR615575 3 0.0000 0.8712 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079434 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325559 4 0.3493 0.8006 0.108 0.000 0.060 0.832 0.000
#> SRR1446695 5 0.0162 0.9221 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1383883 1 0.1121 0.8880 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1396100 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1475697 4 0.2438 0.8405 0.008 0.000 0.040 0.908 0.044
#> SRR1488067 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1102103 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1105154 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1084991 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1410380 5 0.0324 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1445490 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454671 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1435044 4 0.4224 0.7136 0.000 0.000 0.216 0.744 0.040
#> SRR1485812 3 0.4486 0.7328 0.000 0.000 0.748 0.080 0.172
#> SRR1078020 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1311153 1 0.0290 0.8935 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1376406 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1343898 3 0.5039 0.1509 0.000 0.000 0.512 0.032 0.456
#> SRR807775 3 0.2450 0.8516 0.000 0.000 0.896 0.028 0.076
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100656 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1362159 1 0.0290 0.8941 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1414536 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR656794 5 0.1121 0.9019 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR604653 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.0404 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1485912 3 0.0963 0.8601 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1407602 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356164 1 0.4063 0.6486 0.708 0.000 0.012 0.280 0.000
#> SRR1328692 4 0.2654 0.8487 0.032 0.000 0.084 0.884 0.000
#> SRR1362438 1 0.3844 0.7396 0.792 0.000 0.024 0.008 0.176
#> SRR1479216 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1358041 4 0.3642 0.6936 0.232 0.000 0.008 0.760 0.000
#> SRR1468766 3 0.1568 0.8520 0.020 0.000 0.944 0.036 0.000
#> SRR1368200 3 0.1981 0.8656 0.000 0.000 0.924 0.048 0.028
#> SRR1435602 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1501043 5 0.1836 0.8821 0.000 0.000 0.036 0.032 0.932
#> SRR1437256 4 0.2561 0.8203 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1487446 4 0.2046 0.8469 0.000 0.000 0.068 0.916 0.016
#> SRR816653 1 0.2983 0.8468 0.868 0.000 0.056 0.076 0.000
#> SRR815164 5 0.4520 0.5344 0.000 0.000 0.032 0.284 0.684
#> SRR1442043 4 0.1981 0.8274 0.016 0.000 0.000 0.920 0.064
#> SRR1410573 1 0.0162 0.8939 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096782 2 0.0290 0.9790 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1352369 3 0.2359 0.8275 0.060 0.000 0.904 0.036 0.000
#> SRR1382934 3 0.1830 0.8694 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1465208 1 0.3074 0.7729 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1314728 3 0.6415 0.3157 0.012 0.000 0.540 0.296 0.152
#> SRR1470291 1 0.0290 0.8941 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1308756 3 0.0290 0.8726 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1409600 3 0.4132 0.6817 0.004 0.000 0.760 0.032 0.204
#> SRR816123 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614779 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR810783 3 0.0963 0.8601 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1333990 1 0.1965 0.8591 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1410356 3 0.1485 0.8539 0.020 0.000 0.948 0.032 0.000
#> SRR808106 5 0.0609 0.9157 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR662713 3 0.1661 0.8499 0.024 0.000 0.940 0.036 0.000
#> SRR1447058 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480964 3 0.1410 0.8687 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR809382 3 0.1830 0.8694 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR665417 4 0.3837 0.5962 0.308 0.000 0.000 0.692 0.000
#> SRR1088016 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1453166 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1069826 2 0.0880 0.9744 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1077781 2 0.0290 0.9790 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR615623 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1413787 5 0.1444 0.8943 0.000 0.000 0.040 0.012 0.948
#> SRR1478207 3 0.1750 0.8709 0.000 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1411046 1 0.1043 0.8883 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1313711 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326560 1 0.3177 0.7646 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1395616 1 0.1671 0.8718 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1074956 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1092961 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR817210 3 0.0703 0.8653 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1319221 3 0.5653 0.4704 0.000 0.312 0.612 0.048 0.028
#> SRR1405413 3 0.6203 0.0118 0.140 0.000 0.464 0.396 0.000
#> SRR607807 1 0.0609 0.8929 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1390160 3 0.1830 0.8694 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1406283 3 0.4522 0.1299 0.440 0.000 0.552 0.008 0.000
#> SRR1357709 4 0.2228 0.8405 0.000 0.000 0.040 0.912 0.048
#> SRR1080742 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1468208 1 0.0963 0.8892 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1312766 3 0.1195 0.8593 0.012 0.000 0.960 0.028 0.000
#> SRR1361612 4 0.4060 0.3586 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1311224 1 0.1502 0.8696 0.940 0.000 0.056 0.004 0.000
#> SRR1087801 3 0.2228 0.8337 0.048 0.000 0.912 0.040 0.000
#> SRR1099720 2 0.0963 0.9735 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1349250 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1350912 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1357127 3 0.1830 0.8694 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1074980 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1317022 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1332879 1 0.2971 0.7960 0.836 0.000 0.156 0.008 0.000
#> SRR1403177 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1076144 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1069614 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR818239 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1421069 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 5 0.3876 0.5246 0.000 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1092232 3 0.1830 0.8694 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1344253 5 0.2020 0.8671 0.000 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1384290 1 0.0609 0.8929 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1089349 3 0.1121 0.8582 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1343522 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 4 0.2286 0.8386 0.000 0.000 0.108 0.888 0.004
#> SRR818372 4 0.2674 0.8331 0.000 0.000 0.120 0.868 0.012
#> SRR1323675 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR819894 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1310031 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR615419 4 0.3675 0.7616 0.000 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR1436925 4 0.2951 0.8121 0.112 0.000 0.028 0.860 0.000
#> SRR1477238 1 0.0794 0.8916 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1332566 1 0.3796 0.6449 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1490228 3 0.1830 0.8694 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1442949 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466239 1 0.0794 0.8914 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1094003 2 0.0290 0.9790 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1329971 1 0.5310 0.7414 0.740 0.000 0.080 0.108 0.072
#> SRR813076 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1097642 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1322981 3 0.1195 0.8593 0.012 0.000 0.960 0.028 0.000
#> SRR1485976 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1471713 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR660522 3 0.0162 0.8708 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR815374 4 0.2017 0.8477 0.000 0.000 0.080 0.912 0.008
#> SRR1069564 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1416337 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316438 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1386844 1 0.1270 0.8854 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1373718 1 0.0963 0.8892 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1447458 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1487128 1 0.3966 0.5771 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1441421 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1069919 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1460296 1 0.0162 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1335489 1 0.3730 0.6590 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1393404 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1071337 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1071983 2 0.0290 0.9790 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1331793 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1410510 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1098761 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1312124 4 0.1893 0.8339 0.048 0.000 0.000 0.928 0.024
#> SRR615395 3 0.2653 0.7976 0.096 0.000 0.880 0.024 0.000
#> SRR1479349 4 0.2516 0.7940 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR2165033 4 0.2280 0.8339 0.000 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1089054 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR816201 4 0.2124 0.8421 0.000 0.000 0.096 0.900 0.004
#> SRR1488514 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR655840 4 0.2074 0.8453 0.000 0.000 0.044 0.920 0.036
#> SRR1379303 1 0.1121 0.8880 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1418516 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR613174 3 0.0000 0.8712 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.0162 0.8707 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR659157 3 0.6674 0.1816 0.000 0.000 0.436 0.304 0.260
#> SRR1480408 4 0.1764 0.8502 0.000 0.000 0.064 0.928 0.008
#> SRR657857 4 0.1954 0.8391 0.028 0.000 0.008 0.932 0.032
#> SRR1073317 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1332526 4 0.2136 0.8262 0.088 0.000 0.008 0.904 0.000
#> SRR1094168 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1431270 5 0.5993 0.4397 0.000 0.000 0.232 0.184 0.584
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 4 0.2280 0.8339 0.000 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0609 0.8929 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1082784 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1457267 1 0.0609 0.8932 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR614659 4 0.2773 0.8176 0.000 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR659247 3 0.2732 0.7462 0.000 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1317201 1 0.3636 0.6833 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1473696 1 0.1628 0.8681 0.936 0.000 0.056 0.008 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1096363 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1453662 4 0.2585 0.8450 0.036 0.000 0.064 0.896 0.004
#> SRR1345499 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0963 0.8892 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1070841 3 0.0162 0.8708 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.0290 0.8941 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333125 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1498183 1 0.5344 0.0378 0.500 0.000 0.052 0.448 0.000
#> SRR612659 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1447148 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR658597 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1089595 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.4169 0.6130 0.240 0.000 0.732 0.028 0.000
#> SRR1345995 3 0.4639 0.6177 0.236 0.000 0.708 0.056 0.000
#> SRR1071035 1 0.4229 0.6284 0.704 0.000 0.276 0.020 0.000
#> SRR1068808 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1332754 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0510 0.8935 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR659448 3 0.0162 0.8708 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1323558 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1381711 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657985 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314810 1 0.4386 0.7620 0.764 0.000 0.140 0.096 0.000
#> SRR1336505 4 0.4045 0.5109 0.000 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1474095 3 0.2068 0.8335 0.004 0.000 0.904 0.092 0.000
#> SRR1363831 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1442376 4 0.2463 0.8092 0.008 0.000 0.004 0.888 0.100
#> SRR1074909 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1101200 3 0.4114 0.5672 0.272 0.000 0.712 0.016 0.000
#> SRR1075408 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1367150 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1313406 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1068880 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1467277 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084867 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1095431 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1380184 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1443113 1 0.6651 0.2165 0.428 0.000 0.336 0.236 0.000
#> SRR1380414 5 0.4256 0.2671 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1315912 1 0.0290 0.8935 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075778 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1421116 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR602282 4 0.4687 0.5228 0.000 0.000 0.336 0.636 0.028
#> SRR1361195 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR600493 1 0.2426 0.8498 0.900 0.000 0.064 0.036 0.000
#> SRR1477653 3 0.4924 0.2370 0.420 0.000 0.552 0.028 0.000
#> SRR1355475 3 0.0162 0.8708 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1360785 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR810437 4 0.2852 0.7983 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1361860 4 0.1965 0.8322 0.052 0.000 0.000 0.924 0.024
#> SRR1441311 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1098903 5 0.0880 0.9129 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1457619 4 0.2162 0.8314 0.008 0.000 0.012 0.916 0.064
#> SRR1498529 4 0.2471 0.7971 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1097172 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1074017 2 0.0290 0.9790 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1399525 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1312844 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1085874 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1101226 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1476056 4 0.2153 0.8303 0.044 0.000 0.000 0.916 0.040
#> SRR1075659 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1311916 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1353353 3 0.2054 0.8633 0.000 0.000 0.920 0.052 0.028
#> SRR1073291 3 0.0000 0.8712 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356227 4 0.4015 0.3890 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1080720 2 0.0963 0.9735 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1091695 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1350304 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663002 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1376983 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1399926 1 0.1043 0.8883 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1347144 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1384006 1 0.0703 0.8921 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1499108 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614047 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR818440 3 0.1830 0.8694 0.000 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1337770 4 0.3741 0.6653 0.264 0.000 0.004 0.732 0.000
#> SRR1399413 4 0.5159 0.7109 0.188 0.000 0.124 0.688 0.000
#> SRR1385542 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473959 4 0.2230 0.8349 0.000 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1074041 3 0.0955 0.8623 0.004 0.000 0.968 0.028 0.000
#> SRR1394495 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR659460 3 0.1251 0.8575 0.008 0.000 0.956 0.036 0.000
#> SRR816699 3 0.0162 0.8708 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.8712 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 5 0.0579 0.9166 0.000 0.000 0.008 0.008 0.984
#> SRR1352894 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR815805 1 0.0703 0.8925 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1331083 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR808272 3 0.0671 0.8736 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1436698 1 0.1638 0.8656 0.932 0.000 0.064 0.004 0.000
#> SRR1095627 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1357672 5 0.2377 0.8423 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1351236 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0290 0.8942 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR814491 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.3607 0.6974 0.752 0.000 0.244 0.004 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1314707 4 0.2179 0.8151 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000
#> SRR1309534 4 0.2414 0.8244 0.008 0.000 0.012 0.900 0.080
#> SRR615527 3 0.1750 0.8709 0.000 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1098216 1 0.1544 0.8765 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1325847 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1404003 4 0.1644 0.8505 0.008 0.000 0.048 0.940 0.004
#> SRR1344166 1 0.4909 0.3331 0.560 0.000 0.028 0.412 0.000
#> SRR1368638 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1431429 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1079237 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1080509 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR815759 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1502143 3 0.0955 0.8623 0.004 0.000 0.968 0.028 0.000
#> SRR1487614 3 0.1750 0.8709 0.000 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1402307 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR820810 4 0.2583 0.8371 0.000 0.000 0.132 0.864 0.004
#> SRR1099212 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1083215 3 0.1364 0.8558 0.012 0.000 0.952 0.036 0.000
#> SRR1476547 2 0.0963 0.9735 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR656421 5 0.0865 0.9115 0.024 0.000 0.000 0.004 0.972
#> SRR1086116 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1499917 4 0.2338 0.8375 0.000 0.000 0.112 0.884 0.004
#> SRR1339944 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1391444 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1434889 4 0.4268 0.3206 0.000 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1431847 5 0.1836 0.8829 0.000 0.000 0.032 0.036 0.932
#> SRR1317155 4 0.1965 0.8524 0.024 0.000 0.052 0.924 0.000
#> SRR1477405 1 0.0162 0.8939 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR655289 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1341683 4 0.2230 0.8360 0.000 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1084790 5 0.3966 0.7341 0.168 0.000 0.040 0.004 0.788
#> SRR1073731 4 0.4924 0.2979 0.000 0.000 0.420 0.552 0.028
#> SRR1332588 5 0.0794 0.9149 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1471157 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR654945 3 0.0955 0.8735 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR661028 1 0.1628 0.8681 0.936 0.000 0.056 0.008 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 4 0.2583 0.8360 0.000 0.000 0.132 0.864 0.004
#> SRR1358435 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR2165273 1 0.0703 0.8921 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1379014 1 0.3210 0.7541 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1489904 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1416386 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1406048 4 0.3707 0.5429 0.284 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR606982 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358082 1 0.0162 0.8939 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312934 3 0.1668 0.8721 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR655194 4 0.2157 0.8508 0.036 0.000 0.040 0.920 0.004
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0963 0.9735 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1389820 2 0.5946 0.1742 0.000 0.532 0.388 0.052 0.028
#> SRR1074289 3 0.1661 0.8499 0.024 0.000 0.940 0.036 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.3574 0.7566 0.000 0.000 0.804 0.168 0.028
#> SRR1395810 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1498909 4 0.3534 0.6983 0.000 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1443507 3 0.1668 0.8496 0.028 0.000 0.940 0.032 0.000
#> SRR1452310 4 0.4101 0.5626 0.000 0.000 0.332 0.664 0.004
#> SRR665610 4 0.3039 0.7755 0.000 0.000 0.012 0.836 0.152
#> SRR1347322 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.8935 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.0000 0.9228 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354247 1 0.0290 0.8941 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1082640 2 0.0290 0.9804 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1487592 3 0.1399 0.8573 0.020 0.000 0.952 0.028 0.000
#> SRR1352299 1 0.2260 0.8544 0.908 0.000 0.064 0.028 0.000
#> SRR1076317 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1434117 3 0.4083 0.6793 0.000 0.000 0.744 0.028 0.228
#> SRR1075273 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR658657 5 0.1251 0.9050 0.000 0.000 0.008 0.036 0.956
#> SRR1092773 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1365332 3 0.1106 0.8608 0.012 0.000 0.964 0.024 0.000
#> SRR615958 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1097688 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1403259 5 0.1818 0.8809 0.000 0.000 0.044 0.024 0.932
#> SRR1099120 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1362200 3 0.1195 0.8738 0.000 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR1464856 2 0.0290 0.9790 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347298 3 0.1582 0.8730 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1075923 2 0.1043 0.9725 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1100703 3 0.6557 0.0259 0.212 0.000 0.448 0.340 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.0458 0.82374 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.2454 0.60429 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1075752 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1397949 1 0.2400 0.80662 0.872 0.000 0.116 0.008 0.000 0.004
#> SRR1355723 4 0.0909 0.82135 0.020 0.000 0.000 0.968 0.012 0.000
#> SRR1329744 1 0.5011 0.56696 0.616 0.000 0.000 0.272 0.000 0.112
#> SRR657384 4 0.0603 0.82411 0.000 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1351190 4 0.1564 0.82109 0.000 0.000 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR1458662 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.1333 0.82567 0.000 0.000 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR1396017 4 0.1949 0.80265 0.004 0.000 0.000 0.904 0.004 0.088
#> SRR1410742 4 0.0692 0.82454 0.000 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1435963 1 0.4827 0.54294 0.620 0.000 0.000 0.296 0.000 0.084
#> SRR1382416 1 0.1584 0.83671 0.928 0.000 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR1391354 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.2846 0.80934 0.856 0.000 0.000 0.060 0.000 0.084
#> SRR1312244 4 0.6753 0.12103 0.288 0.000 0.124 0.480 0.000 0.108
#> SRR1325138 4 0.3126 0.61355 0.000 0.000 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1326821 5 0.0260 0.90707 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.3665 0.73734 0.760 0.000 0.212 0.016 0.000 0.012
#> SRR1075707 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1443871 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1465758 1 0.2277 0.82491 0.892 0.000 0.000 0.032 0.000 0.076
#> SRR1414058 3 0.1204 0.76958 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1407449 4 0.3271 0.66741 0.232 0.000 0.000 0.760 0.000 0.008
#> SRR1436858 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.1871 0.72860 0.000 0.000 0.928 0.032 0.016 0.024
#> SRR1399069 5 0.0865 0.89350 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1366450 3 0.4220 0.27468 0.304 0.000 0.664 0.000 0.028 0.004
#> SRR1396859 1 0.4973 0.57807 0.624 0.000 0.000 0.264 0.000 0.112
#> SRR1457176 1 0.4617 0.61966 0.644 0.000 0.296 0.056 0.000 0.004
#> SRR1097666 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1434736 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080560 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1322882 1 0.2520 0.78316 0.844 0.000 0.152 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435688 2 0.3428 0.13871 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1327614 1 0.1951 0.83076 0.908 0.000 0.000 0.016 0.000 0.076
#> SRR658152 4 0.4708 0.54574 0.000 0.000 0.032 0.612 0.016 0.340
#> SRR1368141 4 0.4895 0.52547 0.000 0.000 0.056 0.616 0.012 0.316
#> SRR1440268 1 0.4681 0.64798 0.676 0.000 0.000 0.212 0.000 0.112
#> SRR1453725 4 0.6044 0.43399 0.248 0.000 0.216 0.520 0.000 0.016
#> SRR1325711 2 0.3428 0.13871 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1477930 1 0.3852 0.73227 0.760 0.000 0.000 0.176 0.000 0.064
#> SRR1477591 1 0.1908 0.81371 0.900 0.000 0.096 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416049 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.3316 0.74010 0.000 0.000 0.136 0.812 0.000 0.052
#> SRR1369052 4 0.3003 0.71322 0.172 0.000 0.000 0.812 0.000 0.016
#> SRR1377735 1 0.5766 0.63748 0.580 0.000 0.284 0.048 0.000 0.088
#> SRR1331244 5 0.4204 0.58575 0.260 0.000 0.000 0.040 0.696 0.004
#> SRR1404531 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324331 5 0.3998 0.63162 0.236 0.000 0.000 0.036 0.724 0.004
#> SRR1458890 4 0.4784 0.53613 0.000 0.000 0.048 0.624 0.012 0.316
#> SRR1432695 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.3973 0.75428 0.000 0.000 0.684 0.008 0.012 0.296
#> SRR1087393 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1077263 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.2932 0.81487 0.860 0.000 0.088 0.040 0.000 0.012
#> SRR655241 4 0.1265 0.81561 0.008 0.000 0.000 0.948 0.000 0.044
#> SRR656922 4 0.4923 0.38262 0.324 0.000 0.056 0.608 0.000 0.012
#> SRR1361630 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318966 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1407087 3 0.2703 0.77205 0.000 0.000 0.824 0.004 0.000 0.172
#> SRR603212 1 0.4323 0.55445 0.612 0.000 0.364 0.012 0.000 0.012
#> SRR1321088 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.4450 0.72700 0.000 0.000 0.616 0.020 0.012 0.352
#> SRR1332232 2 0.0146 0.86076 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312645 4 0.2001 0.80134 0.004 0.000 0.000 0.900 0.004 0.092
#> SRR1457835 1 0.5138 0.48763 0.544 0.000 0.384 0.060 0.000 0.012
#> SRR1347123 3 0.4101 0.73567 0.000 0.000 0.632 0.008 0.008 0.352
#> SRR1465501 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1330878 3 0.4180 0.73507 0.000 0.000 0.632 0.008 0.012 0.348
#> SRR1445064 4 0.6159 0.13880 0.000 0.000 0.200 0.440 0.012 0.348
#> SRR1452981 4 0.1080 0.81849 0.004 0.000 0.004 0.960 0.000 0.032
#> SRR1326708 1 0.1010 0.83551 0.960 0.000 0.036 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407157 1 0.0806 0.84184 0.972 0.000 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1365401 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.0603 0.82340 0.016 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1077898 5 0.4400 0.43505 0.332 0.000 0.032 0.000 0.632 0.004
#> SRR1349080 5 0.0260 0.90707 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1375485 4 0.6111 0.25981 0.284 0.000 0.220 0.484 0.000 0.012
#> SRR1432563 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.3337 0.69182 0.736 0.000 0.260 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380614 1 0.1398 0.84004 0.940 0.000 0.000 0.008 0.000 0.052
#> SRR812060 3 0.0865 0.76554 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR602082 1 0.0000 0.84238 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1078417 2 0.3175 0.34162 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR661613 3 0.6111 0.53643 0.000 0.000 0.468 0.200 0.012 0.320
#> SRR1420710 4 0.1649 0.81963 0.000 0.000 0.032 0.932 0.000 0.036
#> SRR660426 1 0.3136 0.72184 0.768 0.000 0.228 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416003 4 0.2389 0.80021 0.000 0.000 0.060 0.888 0.000 0.052
#> SRR661064 4 0.1391 0.81526 0.016 0.000 0.000 0.944 0.000 0.040
#> SRR1082011 2 0.3198 0.32713 0.000 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1452718 1 0.1010 0.83551 0.960 0.000 0.036 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353243 1 0.1082 0.83448 0.956 0.000 0.040 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455482 1 0.0000 0.84238 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399394 3 0.6096 -0.09096 0.332 0.000 0.464 0.192 0.000 0.012
#> SRR1102467 4 0.1219 0.82069 0.048 0.000 0.004 0.948 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337707 6 0.6412 -0.56304 0.000 0.000 0.328 0.308 0.012 0.352
#> SRR1408752 2 0.0260 0.85618 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474617 6 0.5186 0.00972 0.000 0.124 0.184 0.008 0.012 0.672
#> SRR1398013 4 0.1564 0.82109 0.000 0.000 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR1352918 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1420750 1 0.3528 0.65337 0.700 0.000 0.296 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071785 6 0.6406 -0.53327 0.000 0.000 0.296 0.340 0.012 0.352
#> SRR1353618 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.0713 0.82423 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0909 0.84145 0.968 0.000 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR1355684 1 0.0909 0.84145 0.968 0.000 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR1323289 5 0.2738 0.78498 0.000 0.000 0.000 0.004 0.820 0.176
#> SRR1313494 4 0.2265 0.79628 0.052 0.000 0.000 0.896 0.000 0.052
#> SRR1309985 4 0.2001 0.80134 0.004 0.000 0.000 0.900 0.004 0.092
#> SRR607911 1 0.0806 0.84184 0.972 0.000 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1333789 3 0.0146 0.75398 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 4 0.1575 0.82611 0.000 0.000 0.032 0.936 0.000 0.032
#> SRR1088631 2 0.3647 -0.17883 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1092842 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR615575 3 0.1141 0.76889 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1079434 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325559 4 0.5375 0.51784 0.124 0.000 0.276 0.592 0.000 0.008
#> SRR1446695 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.2629 0.81711 0.868 0.000 0.000 0.040 0.000 0.092
#> SRR1396100 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1475697 4 0.2783 0.79247 0.000 0.000 0.000 0.836 0.016 0.148
#> SRR1488067 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1102103 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1084991 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1410380 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 4 0.5809 0.34029 0.000 0.000 0.140 0.504 0.012 0.344
#> SRR1485812 3 0.6178 0.63388 0.000 0.000 0.472 0.068 0.080 0.380
#> SRR1078020 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.1382 0.84229 0.948 0.000 0.008 0.008 0.000 0.036
#> SRR1376406 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.6221 -0.04210 0.000 0.000 0.240 0.008 0.404 0.348
#> SRR807775 3 0.4703 0.73810 0.000 0.000 0.652 0.008 0.060 0.280
#> SRR1409215 2 0.3428 0.13871 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR820427 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100656 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1362159 1 0.0547 0.84259 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1414536 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656794 5 0.2260 0.81149 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR604653 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317685 5 0.1074 0.89051 0.000 0.000 0.000 0.012 0.960 0.028
#> SRR1485912 3 0.0000 0.75513 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.4852 0.59497 0.656 0.000 0.012 0.260 0.000 0.072
#> SRR1328692 4 0.2345 0.82096 0.024 0.000 0.036 0.904 0.000 0.036
#> SRR1362438 1 0.4967 0.65153 0.664 0.000 0.172 0.000 0.160 0.004
#> SRR1479216 3 0.4093 0.74552 0.000 0.000 0.656 0.008 0.012 0.324
#> SRR1358041 4 0.3341 0.68917 0.208 0.000 0.004 0.776 0.000 0.012
#> SRR1468766 3 0.0935 0.74081 0.032 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368200 3 0.4130 0.74876 0.000 0.000 0.664 0.016 0.008 0.312
#> SRR1435602 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.3733 0.64646 0.000 0.000 0.008 0.004 0.700 0.288
#> SRR1437256 4 0.4403 0.56916 0.000 0.000 0.048 0.648 0.000 0.304
#> SRR1487446 4 0.1176 0.82403 0.000 0.000 0.020 0.956 0.000 0.024
#> SRR816653 1 0.4677 0.66483 0.664 0.000 0.272 0.048 0.000 0.016
#> SRR815164 5 0.5188 0.56443 0.000 0.000 0.052 0.224 0.664 0.060
#> SRR1442043 4 0.1788 0.80677 0.004 0.000 0.000 0.916 0.004 0.076
#> SRR1410573 1 0.0547 0.84259 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1096782 2 0.3647 -0.17862 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1352369 3 0.2643 0.66206 0.128 0.000 0.856 0.008 0.000 0.008
#> SRR1382934 3 0.4450 0.72700 0.000 0.000 0.616 0.020 0.012 0.352
#> SRR1465208 1 0.4186 0.70699 0.728 0.000 0.000 0.192 0.000 0.080
#> SRR1314728 3 0.5660 0.38583 0.004 0.000 0.636 0.216 0.052 0.092
#> SRR1470291 1 0.0692 0.84229 0.976 0.000 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1308756 3 0.1700 0.77213 0.000 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1409600 3 0.2989 0.68604 0.000 0.000 0.864 0.036 0.072 0.028
#> SRR816123 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR614779 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810783 3 0.0363 0.75912 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1333990 1 0.3118 0.79906 0.836 0.000 0.000 0.072 0.000 0.092
#> SRR1410356 3 0.0858 0.74298 0.028 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004
#> SRR808106 5 0.0146 0.90864 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR662713 3 0.0777 0.74473 0.024 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447058 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.3864 0.75829 0.000 0.000 0.744 0.048 0.000 0.208
#> SRR809382 3 0.4450 0.72700 0.000 0.000 0.616 0.020 0.012 0.352
#> SRR665417 4 0.3490 0.61803 0.268 0.000 0.000 0.724 0.000 0.008
#> SRR1088016 2 0.0146 0.86024 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453166 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1069826 2 0.3867 -0.70143 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1077781 2 0.3620 -0.13618 0.000 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR615623 3 0.4180 0.73507 0.000 0.000 0.632 0.008 0.012 0.348
#> SRR1413787 5 0.2994 0.74816 0.000 0.000 0.000 0.004 0.788 0.208
#> SRR1478207 3 0.4332 0.73407 0.000 0.000 0.628 0.020 0.008 0.344
#> SRR1411046 1 0.2277 0.82491 0.892 0.000 0.000 0.032 0.000 0.076
#> SRR1313711 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4560 0.67501 0.692 0.000 0.000 0.200 0.000 0.108
#> SRR1309051 1 0.1531 0.82694 0.928 0.000 0.068 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486949 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.2786 0.81182 0.860 0.000 0.000 0.056 0.000 0.084
#> SRR1074956 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1092961 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR817210 3 0.2170 0.77271 0.000 0.000 0.888 0.012 0.000 0.100
#> SRR1319221 6 0.5345 -0.31460 0.000 0.084 0.284 0.008 0.012 0.612
#> SRR1405413 3 0.5581 0.28732 0.040 0.000 0.604 0.268 0.000 0.088
#> SRR607807 1 0.1594 0.83746 0.932 0.000 0.000 0.016 0.000 0.052
#> SRR1390160 3 0.4662 0.72015 0.000 0.000 0.604 0.032 0.012 0.352
#> SRR1406283 3 0.3189 0.46928 0.236 0.000 0.760 0.000 0.000 0.004
#> SRR1357709 4 0.0717 0.82347 0.000 0.000 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1080742 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1468208 1 0.2277 0.82491 0.892 0.000 0.000 0.032 0.000 0.076
#> SRR1312766 3 0.0508 0.74955 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361612 4 0.4414 0.59102 0.180 0.000 0.000 0.712 0.000 0.108
#> SRR1311224 1 0.3547 0.64938 0.696 0.000 0.300 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087801 3 0.1411 0.72592 0.060 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099720 6 0.3860 0.80468 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1349250 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1350912 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.4113 0.75025 0.000 0.000 0.668 0.016 0.008 0.308
#> SRR1074980 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.4167 0.73699 0.000 0.000 0.636 0.008 0.012 0.344
#> SRR1332879 1 0.3807 0.56256 0.628 0.000 0.368 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403177 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1076144 2 0.0458 0.84648 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1069614 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR818239 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1421069 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1500006 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485678 5 0.3742 0.44884 0.000 0.000 0.004 0.348 0.648 0.000
#> SRR1092232 3 0.4524 0.72543 0.000 0.000 0.612 0.024 0.012 0.352
#> SRR1344253 5 0.2135 0.82665 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1384290 1 0.0806 0.84184 0.972 0.000 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1089349 3 0.1225 0.76265 0.000 0.000 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1343522 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.3409 0.15834 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1440940 4 0.1930 0.81285 0.000 0.000 0.036 0.916 0.000 0.048
#> SRR818372 4 0.2468 0.80310 0.000 0.000 0.048 0.888 0.004 0.060
#> SRR1323675 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1310031 3 0.3915 0.75689 0.000 0.000 0.696 0.008 0.012 0.284
#> SRR615419 4 0.5062 0.49918 0.000 0.000 0.068 0.600 0.012 0.320
#> SRR1436925 4 0.1866 0.80078 0.084 0.000 0.008 0.908 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.1951 0.83076 0.908 0.000 0.000 0.016 0.000 0.076
#> SRR1332566 1 0.5208 0.52660 0.592 0.000 0.004 0.296 0.000 0.108
#> SRR1490228 3 0.4147 0.74718 0.000 0.000 0.660 0.016 0.008 0.316
#> SRR1442949 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.1528 0.83797 0.936 0.000 0.000 0.016 0.000 0.048
#> SRR1094003 2 0.3647 -0.17862 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1329971 1 0.6575 0.45021 0.468 0.000 0.372 0.064 0.024 0.072
#> SRR813076 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1322981 3 0.0260 0.75255 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.3954 0.75521 0.000 0.000 0.688 0.008 0.012 0.292
#> SRR660522 3 0.1327 0.77048 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR815374 4 0.0935 0.82499 0.004 0.000 0.032 0.964 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1416337 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316438 3 0.4618 0.71972 0.000 0.000 0.600 0.028 0.012 0.360
#> SRR1386844 1 0.2579 0.81905 0.872 0.000 0.000 0.040 0.000 0.088
#> SRR1373718 1 0.2277 0.82491 0.892 0.000 0.000 0.032 0.000 0.076
#> SRR1447458 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.5569 0.37239 0.516 0.000 0.012 0.368 0.000 0.104
#> SRR1441421 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0777 0.83843 0.972 0.000 0.024 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335489 1 0.4780 0.62838 0.660 0.000 0.000 0.228 0.000 0.112
#> SRR1393404 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401815 3 0.4180 0.73507 0.000 0.000 0.632 0.008 0.012 0.348
#> SRR1071337 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.3659 -0.20001 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1331793 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4093 0.74552 0.000 0.000 0.656 0.008 0.012 0.324
#> SRR1098761 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1312124 4 0.2051 0.80145 0.004 0.000 0.004 0.896 0.000 0.096
#> SRR615395 3 0.1285 0.72871 0.052 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004
#> SRR1479349 4 0.2060 0.79677 0.084 0.000 0.000 0.900 0.000 0.016
#> SRR2165033 4 0.1934 0.81557 0.000 0.000 0.040 0.916 0.000 0.044
#> SRR1089054 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 4 0.1267 0.81957 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.1088 0.82371 0.000 0.000 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR1379303 1 0.2560 0.81968 0.872 0.000 0.000 0.036 0.000 0.092
#> SRR1418516 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR613174 3 0.1141 0.76898 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1351125 3 0.0937 0.76662 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR659157 6 0.7371 -0.53374 0.000 0.000 0.252 0.240 0.128 0.380
#> SRR1480408 4 0.0547 0.82430 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.0858 0.82113 0.000 0.000 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1073317 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.0922 0.82231 0.024 0.000 0.004 0.968 0.000 0.004
#> SRR1094168 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1431270 6 0.7226 -0.44856 0.000 0.000 0.164 0.128 0.348 0.360
#> SRR1085614 2 0.3309 0.24826 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1330106 4 0.2136 0.81040 0.000 0.000 0.048 0.904 0.000 0.048
#> SRR1466154 1 0.1082 0.83442 0.956 0.000 0.040 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396944 1 0.1528 0.83824 0.936 0.000 0.000 0.016 0.000 0.048
#> SRR1082784 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.1951 0.83076 0.908 0.000 0.000 0.016 0.000 0.076
#> SRR614659 4 0.1765 0.80417 0.000 0.000 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.2980 0.65062 0.000 0.000 0.808 0.180 0.000 0.012
#> SRR1317201 1 0.4732 0.63907 0.668 0.000 0.000 0.220 0.000 0.112
#> SRR1473696 1 0.3508 0.65772 0.704 0.000 0.292 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375842 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1388123 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1453662 4 0.1332 0.82317 0.028 0.000 0.012 0.952 0.000 0.008
#> SRR1345499 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.1010 0.83551 0.960 0.000 0.036 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416693 1 0.2277 0.82491 0.892 0.000 0.000 0.032 0.000 0.076
#> SRR1070841 3 0.1644 0.77154 0.000 0.000 0.920 0.004 0.000 0.076
#> SRR1380910 1 0.0547 0.84259 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1333125 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 4 0.5372 0.14702 0.412 0.000 0.096 0.488 0.000 0.004
#> SRR612659 3 0.3973 0.75428 0.000 0.000 0.684 0.008 0.012 0.296
#> SRR1447148 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1089595 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1074263 2 0.3390 0.17733 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1376786 3 0.2482 0.62196 0.148 0.000 0.848 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345995 3 0.3542 0.58995 0.164 0.000 0.796 0.020 0.000 0.020
#> SRR1071035 3 0.3995 -0.24981 0.480 0.000 0.516 0.000 0.000 0.004
#> SRR1068808 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1332754 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335355 1 0.0806 0.84184 0.972 0.000 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR659448 3 0.0865 0.76554 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1323558 3 0.3935 0.75598 0.000 0.000 0.692 0.008 0.012 0.288
#> SRR1381711 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657985 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.6308 0.51784 0.492 0.000 0.340 0.072 0.000 0.096
#> SRR1336505 4 0.4321 0.62744 0.000 0.000 0.204 0.712 0.000 0.084
#> SRR1474095 3 0.2231 0.72770 0.004 0.000 0.900 0.068 0.000 0.028
#> SRR1363831 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.2163 0.80076 0.000 0.000 0.000 0.892 0.016 0.092
#> SRR1074909 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1101200 3 0.2668 0.59438 0.168 0.000 0.828 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075408 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1380184 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.5125 0.30390 0.244 0.000 0.640 0.104 0.000 0.012
#> SRR1380414 5 0.3989 0.23432 0.000 0.000 0.468 0.000 0.528 0.004
#> SRR1315912 1 0.2306 0.81574 0.888 0.000 0.092 0.004 0.000 0.016
#> SRR1075778 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.1663 0.74245 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR602282 4 0.6019 0.21530 0.000 0.000 0.172 0.468 0.012 0.348
#> SRR1361195 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.3807 0.55996 0.628 0.000 0.368 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477653 3 0.3652 0.31002 0.324 0.000 0.672 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355475 3 0.0865 0.76554 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1360785 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR810437 4 0.2724 0.78471 0.000 0.000 0.084 0.864 0.000 0.052
#> SRR1361860 4 0.1707 0.81193 0.004 0.000 0.000 0.928 0.012 0.056
#> SRR1441311 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1457619 4 0.1967 0.80500 0.000 0.000 0.000 0.904 0.012 0.084
#> SRR1498529 4 0.2019 0.79703 0.088 0.000 0.000 0.900 0.000 0.012
#> SRR1097172 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3659 -0.20001 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1472033 2 0.3221 0.31212 0.000 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1445087 3 0.4450 0.72700 0.000 0.000 0.616 0.020 0.012 0.352
#> SRR1399525 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1312844 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1085874 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1101226 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1476056 4 0.1970 0.80097 0.008 0.000 0.000 0.900 0.000 0.092
#> SRR1075659 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1311916 3 0.3954 0.75521 0.000 0.000 0.688 0.008 0.012 0.292
#> SRR1353353 3 0.5606 0.64306 0.000 0.000 0.524 0.112 0.012 0.352
#> SRR1073291 3 0.1141 0.76922 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1356227 4 0.4461 0.57115 0.192 0.000 0.000 0.704 0.000 0.104
#> SRR1080720 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1091695 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1350304 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663002 3 0.4286 0.73131 0.000 0.000 0.624 0.012 0.012 0.352
#> SRR1376983 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.2277 0.82491 0.892 0.000 0.000 0.032 0.000 0.076
#> SRR1347144 3 0.3973 0.75428 0.000 0.000 0.684 0.008 0.012 0.296
#> SRR1384006 1 0.1003 0.84096 0.964 0.000 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1499108 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR614047 3 0.4138 0.74938 0.000 0.000 0.664 0.012 0.012 0.312
#> SRR818440 3 0.4278 0.73139 0.000 0.000 0.624 0.016 0.008 0.352
#> SRR1337770 4 0.2838 0.71958 0.188 0.000 0.004 0.808 0.000 0.000
#> SRR1399413 4 0.6230 0.24905 0.192 0.000 0.384 0.408 0.000 0.016
#> SRR1385542 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 4 0.1984 0.81343 0.000 0.000 0.056 0.912 0.000 0.032
#> SRR1074041 3 0.0520 0.75579 0.008 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008
#> SRR1394495 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.0858 0.74269 0.028 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004
#> SRR816699 3 0.0865 0.76554 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1308612 3 0.0937 0.76669 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1499418 5 0.1444 0.87078 0.000 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1352894 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.2207 0.83409 0.900 0.000 0.008 0.016 0.000 0.076
#> SRR1331083 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR808272 3 0.2700 0.77241 0.000 0.000 0.836 0.004 0.004 0.156
#> SRR1436698 1 0.3652 0.61894 0.672 0.000 0.324 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095627 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1357672 5 0.2597 0.77950 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1351236 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1077479 1 0.1410 0.84201 0.944 0.000 0.004 0.008 0.000 0.044
#> SRR814491 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1101256 2 0.3151 0.35559 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1436004 1 0.3996 0.33184 0.512 0.000 0.484 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457994 2 0.3126 0.36879 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1078998 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.1152 0.81988 0.044 0.000 0.004 0.952 0.000 0.000
#> SRR1309534 4 0.2060 0.81300 0.000 0.000 0.000 0.900 0.016 0.084
#> SRR615527 3 0.4450 0.72700 0.000 0.000 0.616 0.020 0.012 0.352
#> SRR1098216 1 0.3206 0.79629 0.828 0.000 0.000 0.068 0.000 0.104
#> SRR1325847 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1404003 4 0.0603 0.82438 0.004 0.000 0.016 0.980 0.000 0.000
#> SRR1344166 4 0.5265 0.13266 0.404 0.000 0.068 0.516 0.000 0.012
#> SRR1368638 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1080509 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1502143 3 0.0146 0.75667 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487614 3 0.4194 0.73318 0.000 0.000 0.628 0.008 0.012 0.352
#> SRR1402307 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 4 0.1531 0.81912 0.000 0.000 0.068 0.928 0.000 0.004
#> SRR1099212 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0508 0.74976 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1476547 6 0.3860 0.80461 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR656421 5 0.0436 0.90653 0.004 0.000 0.004 0.004 0.988 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 4 0.1789 0.81744 0.000 0.000 0.044 0.924 0.000 0.032
#> SRR1339944 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0146 0.86076 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1434889 4 0.4018 0.48550 0.000 0.000 0.324 0.656 0.000 0.020
#> SRR1431847 5 0.3555 0.66348 0.000 0.000 0.000 0.008 0.712 0.280
#> SRR1317155 4 0.1275 0.82620 0.016 0.000 0.016 0.956 0.000 0.012
#> SRR1477405 1 0.0458 0.84273 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR655289 5 0.0632 0.90030 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1341683 4 0.2001 0.81233 0.000 0.000 0.048 0.912 0.000 0.040
#> SRR1084790 5 0.3707 0.75761 0.100 0.000 0.100 0.000 0.796 0.004
#> SRR1073731 4 0.6175 0.17192 0.000 0.000 0.256 0.472 0.012 0.260
#> SRR1332588 5 0.0363 0.90642 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.3357 0.76765 0.000 0.000 0.764 0.004 0.008 0.224
#> SRR661028 1 0.3265 0.70366 0.748 0.000 0.248 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413477 2 0.3151 0.35559 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1101152 4 0.1444 0.81669 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR2165273 1 0.1092 0.84067 0.960 0.000 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1379014 1 0.4454 0.66462 0.692 0.000 0.000 0.224 0.000 0.084
#> SRR1489904 3 0.4061 0.74865 0.000 0.000 0.664 0.008 0.012 0.316
#> SRR1416386 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1406048 4 0.4218 0.63007 0.156 0.000 0.000 0.736 0.000 0.108
#> SRR606982 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0547 0.84259 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1312934 3 0.3867 0.75563 0.000 0.000 0.688 0.004 0.012 0.296
#> SRR655194 4 0.0858 0.82292 0.028 0.000 0.004 0.968 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.3126 0.36889 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1473251 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1389820 6 0.4665 0.19593 0.000 0.136 0.132 0.004 0.008 0.720
#> SRR1074289 3 0.1010 0.73920 0.036 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR1348816 2 0.3446 0.11768 0.000 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1076292 3 0.5894 0.58449 0.000 0.000 0.464 0.144 0.012 0.380
#> SRR1395810 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.3395 0.73621 0.000 0.000 0.132 0.808 0.000 0.060
#> SRR1443507 3 0.1010 0.73891 0.036 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452310 4 0.4863 0.57004 0.000 0.000 0.200 0.660 0.000 0.140
#> SRR665610 4 0.2723 0.76668 0.000 0.000 0.004 0.856 0.120 0.020
#> SRR1347322 1 0.0146 0.84278 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1477256 1 0.0909 0.84348 0.968 0.000 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470230 5 0.0000 0.90977 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.0146 0.84217 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082640 2 0.0000 0.86499 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.1036 0.74288 0.024 0.000 0.964 0.004 0.000 0.008
#> SRR1352299 1 0.3795 0.56508 0.632 0.000 0.364 0.000 0.000 0.004
#> SRR1076317 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1434117 3 0.5853 0.56211 0.000 0.000 0.512 0.004 0.216 0.268
#> SRR1075273 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR658657 5 0.1007 0.88906 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1092773 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1365332 3 0.0146 0.75398 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.3973 0.75428 0.000 0.000 0.684 0.008 0.012 0.296
#> SRR1097688 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1403259 5 0.2504 0.81631 0.000 0.000 0.004 0.004 0.856 0.136
#> SRR1099120 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1362200 3 0.3329 0.76617 0.000 0.000 0.756 0.004 0.004 0.236
#> SRR1464856 2 0.3647 -0.17862 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1347298 3 0.4061 0.74850 0.000 0.000 0.664 0.008 0.012 0.316
#> SRR1075923 6 0.3857 0.81425 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1100703 3 0.5836 0.29081 0.216 0.000 0.572 0.192 0.000 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.995 0.998 0.4336 0.568 0.568
#> 3 3 0.757 0.893 0.918 0.4894 0.765 0.586
#> 4 4 0.703 0.864 0.888 0.0862 0.934 0.808
#> 5 5 0.713 0.665 0.817 0.1031 0.915 0.717
#> 6 6 0.693 0.646 0.755 0.0417 0.926 0.693
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 1 0.653 0.798 0.832 0.168
#> SRR1398013 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.993 0.179 0.548 0.452
#> SRR1076144 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 1 0.871 0.589 0.708 0.292
#> SRR1074289 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 0.997 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1355723 3 0.1753 0.8525 0.048 0.000 0.952
#> SRR1329744 3 0.4346 0.6697 0.184 0.000 0.816
#> SRR657384 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351190 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 3 0.2066 0.8401 0.060 0.000 0.940
#> SRR1396017 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410742 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435963 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1382416 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1391354 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1087968 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1312244 1 0.5397 0.8577 0.720 0.000 0.280
#> SRR1325138 3 0.4346 0.7840 0.184 0.000 0.816
#> SRR1326821 1 0.6215 -0.2246 0.572 0.000 0.428
#> SRR1490178 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1075707 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1414058 1 0.5291 0.8767 0.732 0.000 0.268
#> SRR1407449 3 0.5497 0.4320 0.292 0.000 0.708
#> SRR1436858 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.4605 0.9440 0.796 0.000 0.204
#> SRR1399069 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1366450 1 0.6204 0.5967 0.576 0.000 0.424
#> SRR1396859 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1457176 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1097666 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.6126 0.4703 0.400 0.000 0.600
#> SRR1080560 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1435688 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR658152 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440268 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1453725 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1325711 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1477591 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1416049 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369052 3 0.2537 0.8222 0.080 0.000 0.920
#> SRR1377735 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1331244 1 0.5529 0.2492 0.704 0.000 0.296
#> SRR1404531 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1324331 1 0.0424 0.7320 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458890 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432695 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.1529 0.7131 0.960 0.000 0.040
#> SRR1385211 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR655241 3 0.2066 0.8401 0.060 0.000 0.940
#> SRR656922 1 0.6309 0.3903 0.504 0.000 0.496
#> SRR1361630 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1318966 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR603212 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1321088 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.3340 0.7679 0.120 0.000 0.880
#> SRR1457835 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1347123 1 0.5216 0.8846 0.740 0.000 0.260
#> SRR1465501 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452981 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326708 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1407157 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1365401 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.7353 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 3 0.6291 0.4731 0.468 0.000 0.532
#> SRR1076096 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.5016 0.9077 0.760 0.000 0.240
#> SRR1432563 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1380614 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR812060 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR602082 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1069490 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420710 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR660426 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1416003 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR661064 3 0.2066 0.8401 0.060 0.000 0.940
#> SRR1082011 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1353243 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1455482 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1313473 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1399394 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1102467 1 0.5926 0.7402 0.644 0.000 0.356
#> SRR1317470 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1337707 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.3918 0.7704 0.004 0.140 0.856
#> SRR1398013 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352918 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1420750 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1071785 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353618 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366560 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1355684 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1323289 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1313494 3 0.2625 0.8171 0.084 0.000 0.916
#> SRR1309985 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR607911 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1333789 1 0.5810 0.7729 0.664 0.000 0.336
#> SRR1400078 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.6286 0.4749 0.536 0.000 0.464
#> SRR1079434 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1325559 1 0.4504 0.9500 0.804 0.000 0.196
#> SRR1446695 1 0.5397 0.3138 0.720 0.000 0.280
#> SRR1383883 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1396100 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1475697 3 0.0237 0.8841 0.004 0.000 0.996
#> SRR1488067 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1445490 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.4178 0.6898 0.172 0.000 0.828
#> SRR1485812 3 0.2261 0.8321 0.068 0.000 0.932
#> SRR1078020 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1376406 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR807775 3 0.0592 0.8792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1409215 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.4702 0.7743 0.212 0.000 0.788
#> SRR1100656 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1414536 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR656794 1 0.0237 0.7402 0.996 0.000 0.004
#> SRR604653 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1317685 3 0.0424 0.8829 0.008 0.000 0.992
#> SRR1485912 3 0.4654 0.6303 0.208 0.000 0.792
#> SRR1407602 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1356164 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1328692 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362438 1 0.4504 0.9500 0.804 0.000 0.196
#> SRR1479216 3 0.6045 0.0744 0.380 0.000 0.620
#> SRR1358041 3 0.5678 0.3608 0.316 0.000 0.684
#> SRR1468766 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1368200 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1437256 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487446 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR816653 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR815164 3 0.6244 -0.1759 0.440 0.000 0.560
#> SRR1442043 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410573 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1096782 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1382934 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1314728 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1470291 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1308756 3 0.6079 0.0492 0.388 0.000 0.612
#> SRR1409600 1 0.4605 0.9434 0.796 0.000 0.204
#> SRR816123 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR810783 3 0.0237 0.8840 0.004 0.000 0.996
#> SRR1333990 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1410356 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR808106 1 0.4062 0.5607 0.836 0.000 0.164
#> SRR662713 3 0.6235 -0.1773 0.436 0.000 0.564
#> SRR1447058 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 1 0.6045 0.6798 0.620 0.000 0.380
#> SRR1088016 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1478207 3 0.0424 0.8817 0.008 0.000 0.992
#> SRR1411046 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1313711 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1309051 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1486949 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1074956 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 3 0.6244 -0.1754 0.440 0.000 0.560
#> SRR1319221 3 0.0592 0.8794 0.012 0.000 0.988
#> SRR1405413 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR607807 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1390160 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406283 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1357709 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1312766 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1361612 1 0.5760 0.7854 0.672 0.000 0.328
#> SRR1311224 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1087801 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1099720 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.6267 -0.1926 0.452 0.000 0.548
#> SRR1074980 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332879 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1403177 3 0.6126 0.3394 0.000 0.400 0.600
#> SRR1076144 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1485678 3 0.2066 0.8564 0.060 0.000 0.940
#> SRR1092232 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344253 1 0.4504 0.9413 0.804 0.000 0.196
#> SRR1384290 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1089349 1 0.5529 0.8369 0.704 0.000 0.296
#> SRR1343522 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR818372 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323675 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1310031 1 0.5431 0.8555 0.716 0.000 0.284
#> SRR615419 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436925 3 0.3752 0.7406 0.144 0.000 0.856
#> SRR1477238 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1332566 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1490228 3 0.0892 0.8745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1442949 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1466239 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1094003 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR813076 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1485976 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR660522 3 0.2165 0.8377 0.064 0.000 0.936
#> SRR815374 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.6140 0.5944 0.404 0.000 0.596
#> SRR1316438 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 1 0.5988 0.7140 0.632 0.000 0.368
#> SRR1373718 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1447458 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1441421 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1335489 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1393404 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1401815 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098761 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 3 0.2165 0.8364 0.064 0.000 0.936
#> SRR615395 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1479349 3 0.2066 0.8413 0.060 0.000 0.940
#> SRR2165033 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379303 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1418516 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR613174 1 0.5138 0.8948 0.748 0.000 0.252
#> SRR1351125 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR659157 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480408 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR657857 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466154 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1396944 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1082784 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR614659 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR659247 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317201 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1473696 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1375842 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1388123 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1416693 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1070841 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380910 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1333125 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR612659 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1345995 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1071035 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1068808 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1335355 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR659448 1 0.5098 0.8988 0.752 0.000 0.248
#> SRR1323558 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381711 3 0.6140 0.5948 0.404 0.000 0.596
#> SRR657985 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1314810 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1336505 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474095 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1363831 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1075408 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1313406 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1084867 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1380414 3 0.5882 0.6832 0.348 0.000 0.652
#> SRR1315912 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1075778 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1477653 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1355475 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1360785 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR810437 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361860 3 0.2066 0.8401 0.060 0.000 0.940
#> SRR1441311 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1457619 3 0.1964 0.8453 0.056 0.000 0.944
#> SRR1498529 3 0.2537 0.8214 0.080 0.000 0.920
#> SRR1097172 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.4654 0.6105 0.208 0.000 0.792
#> SRR1353353 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073291 1 0.5138 0.8942 0.748 0.000 0.252
#> SRR1356227 3 0.2711 0.8139 0.088 0.000 0.912
#> SRR1080720 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR663002 3 0.0237 0.8840 0.004 0.000 0.996
#> SRR1376983 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1347144 3 0.2537 0.8194 0.080 0.000 0.920
#> SRR1384006 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1499108 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR818440 3 0.3192 0.7840 0.112 0.000 0.888
#> SRR1337770 1 0.5650 0.8094 0.688 0.000 0.312
#> SRR1399413 1 0.4702 0.9373 0.788 0.000 0.212
#> SRR1385542 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074041 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1394495 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR816699 1 0.5178 0.8898 0.744 0.000 0.256
#> SRR1308612 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1499418 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1352894 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1331083 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436698 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1095627 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.1964 0.7915 0.944 0.000 0.056
#> SRR1351236 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1077479 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR814491 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1101256 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1457994 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 3 0.1163 0.8677 0.028 0.000 0.972
#> SRR1309534 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR615527 3 0.0424 0.8817 0.008 0.000 0.992
#> SRR1098216 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1325847 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344166 1 0.6309 0.3928 0.504 0.000 0.496
#> SRR1368638 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1431429 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1502143 3 0.2796 0.8045 0.092 0.000 0.908
#> SRR1487614 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 3 0.1031 0.8707 0.024 0.000 0.976
#> SRR1099212 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.4504 0.9500 0.804 0.000 0.196
#> SRR1476547 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0424 0.7320 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086116 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431847 3 0.2537 0.8453 0.080 0.000 0.920
#> SRR1317155 3 0.1860 0.8503 0.052 0.000 0.948
#> SRR1477405 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR655289 3 0.3482 0.8173 0.128 0.000 0.872
#> SRR1341683 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.7353 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332588 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1471157 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.0747 0.8770 0.016 0.000 0.984
#> SRR661028 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1413477 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358435 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1379014 1 0.4555 0.9470 0.800 0.000 0.200
#> SRR1489904 3 0.5810 0.2704 0.336 0.000 0.664
#> SRR1416386 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 3 0.5058 0.5419 0.244 0.000 0.756
#> SRR606982 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1358082 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1312934 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR655194 3 0.0424 0.8817 0.008 0.000 0.992
#> SRR1331174 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.4551 0.7747 0.024 0.132 0.844
#> SRR1074289 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1348816 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.5138 0.5032 0.252 0.000 0.748
#> SRR1395810 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443507 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1452310 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR665610 3 0.0237 0.8847 0.004 0.000 0.996
#> SRR1347322 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR813395 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1470230 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1354247 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1082640 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1352299 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR1076317 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075273 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1092773 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
#> SRR615958 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.4452 0.7793 0.192 0.000 0.808
#> SRR1099120 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075923 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.4452 0.9527 0.808 0.000 0.192
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1436370 2 0.0469 0.9512 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1075752 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1397949 1 0.0817 0.9147 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1355723 3 0.3123 0.8685 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1329744 3 0.4356 0.6904 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR657384 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1351190 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 3 0.3266 0.8556 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1396017 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1410742 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1435963 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1382416 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1391354 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1312244 1 0.3311 0.8130 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1325138 3 0.0921 0.8275 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1326821 3 0.6718 0.1771 0.380 0.000 0.524 0.096
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.1557 0.9093 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1075707 4 0.2469 0.9706 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1465758 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1414058 1 0.1940 0.8624 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1407449 3 0.4916 0.4039 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0469 0.9107 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1399069 3 0.1637 0.8143 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1366450 1 0.4134 0.5870 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1396859 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1457176 1 0.0817 0.9148 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1097666 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1434736 3 0.5728 0.4707 0.364 0.000 0.600 0.036
#> SRR1080560 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1322882 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1435688 2 0.0817 0.9432 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1327614 1 0.1557 0.9095 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR658152 3 0.2530 0.8927 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1368141 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1440268 1 0.2011 0.8991 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1453725 1 0.1716 0.9081 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1325711 2 0.0817 0.9432 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1477930 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 3 0.2530 0.8926 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1369052 3 0.3610 0.8308 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.6743 0.3024 0.512 0.000 0.392 0.096
#> SRR1404531 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1324331 1 0.4667 0.7446 0.796 0.000 0.108 0.096
#> SRR1458890 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1087393 4 0.4103 0.7773 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1077263 1 0.5092 0.7304 0.764 0.000 0.140 0.096
#> SRR1385211 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR655241 3 0.3311 0.8535 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR656922 1 0.4817 0.3609 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1361630 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1318966 4 0.2530 0.9667 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1407087 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR603212 1 0.1302 0.9120 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.4008 0.7736 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1457835 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347123 1 0.1792 0.8680 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1465501 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1330878 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1445064 3 0.2647 0.8928 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1452981 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1326708 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1407157 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1077898 1 0.4605 0.7481 0.800 0.000 0.108 0.092
#> SRR1349080 3 0.6293 0.4631 0.276 0.000 0.628 0.096
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1375485 1 0.2704 0.8660 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR812060 1 0.0336 0.9121 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR602082 1 0.0707 0.9152 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1069490 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1078417 2 0.1637 0.9107 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR661613 3 0.2530 0.8926 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1420710 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR661064 3 0.3266 0.8556 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1082011 2 0.2704 0.8376 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1452718 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.1302 0.9121 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1313473 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1399394 1 0.1557 0.9093 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1102467 1 0.3942 0.7175 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1317470 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1337707 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.4413 0.8216 0.080 0.004 0.820 0.096
#> SRR1398013 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1352918 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1420750 1 0.0188 0.9147 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071785 3 0.2530 0.8926 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1366560 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1355684 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1323289 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1313494 3 0.3528 0.8356 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1309985 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR607911 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1333789 1 0.2973 0.7771 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1400078 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1088631 2 0.2469 0.8577 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1092842 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR615575 1 0.4222 0.5165 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1079434 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1325559 1 0.1716 0.9074 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1446695 1 0.6708 0.3650 0.528 0.000 0.376 0.096
#> SRR1383883 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1396100 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1475697 3 0.2760 0.8898 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1488067 4 0.4164 0.7628 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1084991 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1410380 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.4661 0.6723 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR1485812 3 0.3975 0.8354 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.1637 0.8136 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR807775 3 0.3528 0.8749 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1409215 2 0.1022 0.9368 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR820427 3 0.2973 0.7950 0.020 0.000 0.884 0.096
#> SRR1100656 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1362159 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1414536 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR656794 1 0.4547 0.7536 0.804 0.000 0.104 0.092
#> SRR604653 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317685 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1485912 3 0.4843 0.6028 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1407602 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1356164 1 0.1792 0.9060 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1328692 3 0.2530 0.8928 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1362438 1 0.1716 0.9072 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1479216 1 0.4961 -0.0492 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1358041 3 0.4961 0.3273 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.2647 0.8928 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1437256 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1487446 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR816653 1 0.0707 0.9151 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR815164 1 0.4916 0.1594 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1442043 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1410573 1 0.0707 0.9151 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1096782 2 0.3942 0.6684 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1352369 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1382934 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1465208 1 0.1792 0.9052 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1314728 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470291 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1308756 1 0.4907 0.0440 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1409600 1 0.0469 0.9101 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR816123 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR614779 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR810783 3 0.2921 0.8910 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1333990 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.6194 0.5995 0.644 0.000 0.260 0.096
#> SRR662713 1 0.4855 0.1839 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.3356 0.8812 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR809382 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR665417 1 0.4040 0.6775 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1088016 2 0.1940 0.8921 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1453166 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1069826 2 0.4543 0.4802 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1077781 2 0.3907 0.6754 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR615623 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1413787 3 0.1637 0.8136 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1478207 3 0.3610 0.8705 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1411046 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1074956 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1092961 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR817210 1 0.4817 0.1928 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1319221 3 0.3649 0.8683 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1405413 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1390160 3 0.3311 0.8837 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1080742 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1468208 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.3610 0.7681 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0336 0.9121 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1099720 2 0.4643 0.4289 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1349250 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.4697 0.2590 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1332879 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403177 3 0.6538 0.3739 0.000 0.108 0.600 0.292
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR818239 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1421069 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1500006 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485678 3 0.2197 0.8854 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1092232 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1344253 1 0.0592 0.9104 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1384290 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1089349 1 0.2704 0.8137 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0817 0.9432 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1440940 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR818372 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1310031 1 0.2216 0.8445 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR615419 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1436925 3 0.4250 0.7347 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1477238 1 0.1557 0.9095 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1332566 1 0.2081 0.8966 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1490228 3 0.3726 0.8651 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1442949 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1466239 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1094003 2 0.1474 0.9188 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1329971 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1322981 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.3311 0.8824 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR660522 3 0.3688 0.8498 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR815374 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1069564 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1416337 3 0.5833 0.5990 0.212 0.000 0.692 0.096
#> SRR1316438 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1386844 1 0.4134 0.6756 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1373718 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.1792 0.9052 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0188 0.9556 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1460296 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1335489 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401815 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.3444 0.7553 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1098761 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1312124 3 0.3311 0.8545 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 3 0.3528 0.8423 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR2165033 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1089054 2 0.0592 0.9486 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR816201 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1379303 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1418516 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR613174 1 0.1637 0.8765 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659157 3 0.2589 0.8928 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1480408 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR657857 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1094168 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1431270 3 0.2530 0.8926 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1085614 2 0.0469 0.9514 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1330106 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR614659 3 0.2530 0.8926 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR659247 3 0.3123 0.8867 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1317201 1 0.2149 0.8941 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0188 0.9147 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1453662 3 0.2589 0.8909 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416693 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1070841 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1380910 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.1792 0.9060 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR612659 3 0.3311 0.8823 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1089595 4 0.3975 0.8024 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1074263 2 0.0921 0.9399 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1376786 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1068808 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.1557 0.9093 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1335355 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR659448 1 0.1557 0.8795 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1323558 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1381711 3 0.5833 0.5994 0.212 0.000 0.692 0.096
#> SRR657985 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1314810 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1336505 3 0.2589 0.8925 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1474095 1 0.1211 0.9137 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1074909 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1101200 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.5369 0.6988 0.164 0.000 0.740 0.096
#> SRR1315912 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0336 0.9534 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR602282 3 0.2589 0.8928 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0336 0.9121 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1360785 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR810437 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1361860 3 0.3266 0.8556 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1457619 3 0.3266 0.8606 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1498529 3 0.3726 0.8201 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3873 0.6827 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1472033 2 0.0707 0.9458 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1445087 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1399525 4 0.2814 0.9458 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1312844 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1085874 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1101226 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1476056 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1075659 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1311916 3 0.4830 0.5839 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1353353 3 0.3219 0.8843 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1073291 1 0.1637 0.8758 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1356227 3 0.3726 0.8190 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1080720 2 0.4989 -0.0315 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1091695 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1350304 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR663002 3 0.3569 0.8727 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1347144 3 0.4222 0.8038 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1384006 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1499108 4 0.2345 0.9777 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR614047 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR818440 3 0.4331 0.7857 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1337770 1 0.3400 0.7936 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1399413 1 0.0817 0.9086 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0336 0.9121 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR816699 1 0.1716 0.8731 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1308612 1 0.0336 0.9121 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1499418 3 0.2011 0.8060 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331083 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR808272 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1357672 1 0.3570 0.8113 0.860 0.000 0.092 0.048
#> SRR1351236 1 0.0188 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1101256 2 0.0707 0.9458 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1436004 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0188 0.9556 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 3 0.2973 0.8772 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1309534 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR615527 3 0.3610 0.8705 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1098216 1 0.1557 0.9095 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1325847 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1404003 3 0.2530 0.8918 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1344166 1 0.4730 0.4114 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1368638 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1502143 3 0.4304 0.7859 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1487614 3 0.3444 0.8783 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 3 0.2814 0.8821 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0188 0.9133 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1476547 2 0.4776 0.3351 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR656421 1 0.4667 0.7446 0.796 0.000 0.108 0.096
#> SRR1086116 2 0.0469 0.9511 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1499917 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0592 0.9486 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1434889 3 0.2530 0.8926 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1431847 3 0.3247 0.8594 0.060 0.000 0.880 0.060
#> SRR1317155 3 0.3444 0.8519 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1477405 1 0.0336 0.9151 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR655289 3 0.1677 0.8627 0.040 0.000 0.948 0.012
#> SRR1341683 3 0.2469 0.8923 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1084790 1 0.4605 0.7481 0.800 0.000 0.108 0.092
#> SRR1073731 3 0.2760 0.8920 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1332588 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.3688 0.8658 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.1022 0.9368 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1101152 3 0.2868 0.8910 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1358435 4 0.2408 0.9743 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR2165273 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1379014 1 0.1792 0.9052 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1489904 1 0.4989 -0.1999 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1416386 4 0.2408 0.9743 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1406048 3 0.4679 0.5625 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR606982 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1358082 1 0.0336 0.9151 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1312934 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR655194 3 0.2647 0.8893 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1331174 2 0.0469 0.9512 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1473251 2 0.4989 -0.0318 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1389820 3 0.4946 0.8234 0.124 0.004 0.784 0.088
#> SRR1074289 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.1022 0.9370 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1076292 3 0.4907 0.4948 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.2530 0.8926 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 3 0.3219 0.8843 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR665610 3 0.2654 0.8929 0.108 0.000 0.888 0.004
#> SRR1347322 1 0.1637 0.9083 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR813395 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.1637 0.8136 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1354247 1 0.1557 0.9093 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9577 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1434117 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1075273 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR658657 3 0.2281 0.7991 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1092773 4 0.4817 0.4957 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1365332 1 0.0000 0.9142 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1097688 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1403259 3 0.1637 0.8136 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1099120 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1362200 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1464856 2 0.3400 0.7608 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1347298 3 0.3266 0.8833 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1075923 4 0.2281 0.9810 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1100703 1 0.0188 0.9147 0.996 0.000 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.4415 0.2076 0.004 0.000 0.552 0.000 0.444
#> SRR1436370 2 0.0566 0.9506 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1075752 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.2074 0.7208 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1355723 5 0.4238 0.3688 0.004 0.000 0.368 0.000 0.628
#> SRR1329744 5 0.4511 0.3952 0.016 0.000 0.356 0.000 0.628
#> SRR657384 3 0.4066 0.4861 0.004 0.000 0.672 0.000 0.324
#> SRR1351190 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1458662 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR818573 5 0.4430 0.3863 0.012 0.000 0.360 0.000 0.628
#> SRR1396017 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1410742 3 0.4273 0.2012 0.000 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1435963 5 0.4341 0.5658 0.364 0.000 0.008 0.000 0.628
#> SRR1382416 1 0.1341 0.7538 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1391354 5 0.2561 0.3288 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1087968 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1310075 5 0.4341 0.5658 0.364 0.000 0.008 0.000 0.628
#> SRR1312244 1 0.5572 0.3812 0.644 0.000 0.192 0.000 0.164
#> SRR1325138 3 0.2929 0.6693 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1326821 5 0.6783 -0.1526 0.284 0.000 0.336 0.000 0.380
#> SRR1490178 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR655613 1 0.3452 0.5228 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1075707 4 0.0865 0.9459 0.000 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR1443871 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102489 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.4210 0.0699 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1414058 1 0.0898 0.7546 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1407449 5 0.5036 0.5898 0.320 0.000 0.052 0.000 0.628
#> SRR1436858 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1479109 1 0.0290 0.7603 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1399069 3 0.4030 0.3895 0.000 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1366450 1 0.5343 0.1803 0.592 0.000 0.340 0.000 0.068
#> SRR1396859 1 0.3983 0.3316 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1457176 1 0.4238 0.1430 0.628 0.000 0.004 0.000 0.368
#> SRR1097666 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.4956 0.4482 0.316 0.000 0.636 0.000 0.048
#> SRR1080560 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.3661 0.4349 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1435688 2 0.0865 0.9435 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1327614 1 0.3480 0.5350 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR658152 3 0.2077 0.7120 0.008 0.000 0.908 0.000 0.084
#> SRR1368141 3 0.2329 0.7033 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1440268 5 0.5272 0.5865 0.308 0.000 0.072 0.000 0.620
#> SRR1453725 1 0.2471 0.6782 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1325711 2 0.0955 0.9409 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1477930 5 0.4341 0.5658 0.364 0.000 0.008 0.000 0.628
#> SRR1477591 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0290 0.9558 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR656275 3 0.3209 0.6791 0.008 0.000 0.812 0.000 0.180
#> SRR1369052 5 0.5304 0.5002 0.080 0.000 0.292 0.000 0.628
#> SRR1377735 1 0.1608 0.7430 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1331244 5 0.3164 0.3958 0.044 0.000 0.104 0.000 0.852
#> SRR1404531 1 0.4305 -0.2321 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1324331 5 0.3003 0.3877 0.044 0.000 0.092 0.000 0.864
#> SRR1458890 3 0.1908 0.7094 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1432695 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407624 2 0.0162 0.9561 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431969 3 0.1965 0.7132 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1087393 4 0.2930 0.7921 0.000 0.164 0.000 0.832 0.004
#> SRR1077263 1 0.6602 0.1897 0.424 0.000 0.216 0.000 0.360
#> SRR1385211 5 0.4273 0.4262 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR655241 5 0.4941 0.4427 0.044 0.000 0.328 0.000 0.628
#> SRR656922 5 0.5470 0.5446 0.104 0.000 0.268 0.000 0.628
#> SRR1361630 3 0.4774 0.4948 0.028 0.000 0.612 0.000 0.360
#> SRR1318966 4 0.0671 0.9509 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1407087 3 0.4155 0.6880 0.144 0.000 0.780 0.000 0.076
#> SRR603212 1 0.2852 0.6482 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1321088 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1485190 3 0.3532 0.7057 0.092 0.000 0.832 0.000 0.076
#> SRR1332232 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312645 3 0.6452 0.0537 0.196 0.000 0.476 0.000 0.328
#> SRR1457835 1 0.4425 0.0487 0.600 0.000 0.008 0.000 0.392
#> SRR1347123 1 0.1270 0.7414 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1465501 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.1908 0.7135 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1445064 3 0.2813 0.7112 0.024 0.000 0.868 0.000 0.108
#> SRR1452981 5 0.4150 0.3250 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1326708 1 0.0963 0.7580 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1407157 5 0.4273 0.4262 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1365401 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1397697 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477316 3 0.2929 0.6790 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1077898 1 0.4535 0.5885 0.748 0.000 0.092 0.000 0.160
#> SRR1349080 3 0.6746 0.2021 0.260 0.000 0.380 0.000 0.360
#> SRR1076096 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811261 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.5927 -0.2660 0.468 0.000 0.104 0.000 0.428
#> SRR1432563 2 0.0162 0.9561 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR604414 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0880 0.7589 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR812060 1 0.1792 0.7064 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.3305 0.5859 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1069490 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.2179 0.8749 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR661613 3 0.2331 0.7143 0.020 0.000 0.900 0.000 0.080
#> SRR1420710 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR660426 1 0.0510 0.7613 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1416003 3 0.3010 0.6839 0.004 0.000 0.824 0.000 0.172
#> SRR661064 5 0.4430 0.3863 0.012 0.000 0.360 0.000 0.628
#> SRR1082011 2 0.3196 0.7625 0.000 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR1452718 1 0.0794 0.7600 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1353243 1 0.0963 0.7580 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1455482 1 0.2561 0.6775 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1313473 5 0.4262 0.4367 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1399394 1 0.4307 -0.2926 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1102467 5 0.5762 0.5967 0.248 0.000 0.144 0.000 0.608
#> SRR1317470 3 0.4696 0.4978 0.024 0.000 0.616 0.000 0.360
#> SRR1337707 3 0.2011 0.7107 0.004 0.000 0.908 0.000 0.088
#> SRR1408752 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1474617 3 0.4134 0.6507 0.224 0.000 0.744 0.032 0.000
#> SRR1398013 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1352918 3 0.4088 0.5119 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1420750 1 0.0290 0.7626 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071785 3 0.3039 0.6942 0.012 0.000 0.836 0.000 0.152
#> SRR1353618 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082217 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357256 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1490313 3 0.4278 0.1895 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1366560 1 0.3452 0.5399 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1355684 1 0.2929 0.6363 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1323289 3 0.4045 0.5150 0.000 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1313494 5 0.4808 0.4147 0.032 0.000 0.348 0.000 0.620
#> SRR1309985 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR607911 5 0.4126 0.5490 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1333789 1 0.6011 -0.1210 0.528 0.000 0.128 0.000 0.344
#> SRR1400078 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1088631 2 0.3048 0.7845 0.000 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR1092842 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.5578 0.2798 0.616 0.000 0.272 0.000 0.112
#> SRR1079434 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1325559 1 0.4227 -0.0658 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1446695 1 0.6779 0.0890 0.364 0.000 0.276 0.000 0.360
#> SRR1383883 5 0.4273 0.4262 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1396100 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1475697 3 0.4478 0.6413 0.144 0.000 0.756 0.000 0.100
#> SRR1488067 4 0.3010 0.7784 0.000 0.172 0.000 0.824 0.004
#> SRR1102103 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1105154 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.5107 0.4834 0.048 0.000 0.596 0.000 0.356
#> SRR1445490 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1454671 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1435044 3 0.4575 0.4434 0.328 0.000 0.648 0.000 0.024
#> SRR1485812 3 0.3661 0.5973 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311153 1 0.0880 0.7589 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9558 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0290 0.7063 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR807775 3 0.3177 0.6624 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.1638 0.9108 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR820427 3 0.4774 0.4918 0.028 0.000 0.612 0.000 0.360
#> SRR1100656 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.3143 0.6082 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1414536 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR656794 1 0.3967 0.6015 0.800 0.000 0.092 0.000 0.108
#> SRR604653 1 0.1544 0.7484 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1317685 3 0.2304 0.7128 0.100 0.000 0.892 0.000 0.008
#> SRR1485912 3 0.5304 0.3821 0.384 0.000 0.560 0.000 0.056
#> SRR1407602 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1356164 5 0.5396 0.3753 0.444 0.000 0.056 0.000 0.500
#> SRR1328692 3 0.3010 0.6842 0.004 0.000 0.824 0.000 0.172
#> SRR1362438 1 0.4743 -0.2679 0.512 0.000 0.016 0.000 0.472
#> SRR1479216 3 0.4287 0.2359 0.460 0.000 0.540 0.000 0.000
#> SRR1358041 5 0.5156 0.5889 0.320 0.000 0.060 0.000 0.620
#> SRR1468766 1 0.4088 0.3314 0.688 0.000 0.008 0.000 0.304
#> SRR1368200 3 0.2278 0.7174 0.032 0.000 0.908 0.000 0.060
#> SRR1435602 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1501043 3 0.3913 0.5355 0.000 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1437256 3 0.2852 0.6842 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1487446 3 0.1908 0.7094 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR816653 1 0.4542 -0.2054 0.536 0.000 0.008 0.000 0.456
#> SRR815164 3 0.5276 0.2298 0.436 0.000 0.516 0.000 0.048
#> SRR1442043 3 0.3171 0.6838 0.008 0.000 0.816 0.000 0.176
#> SRR1410573 1 0.2020 0.7241 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1096782 2 0.4084 0.5280 0.000 0.668 0.000 0.328 0.004
#> SRR1352369 1 0.0404 0.7624 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1382934 3 0.2193 0.7145 0.092 0.000 0.900 0.000 0.008
#> SRR1465208 5 0.4718 0.5782 0.344 0.000 0.028 0.000 0.628
#> SRR1314728 1 0.2110 0.7246 0.912 0.000 0.072 0.000 0.016
#> SRR1470291 5 0.4126 0.5490 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1308756 1 0.4201 0.1977 0.592 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.1043 0.7500 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR816123 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 3 0.5459 0.4591 0.072 0.000 0.568 0.000 0.360
#> SRR810783 3 0.5639 0.2156 0.080 0.000 0.524 0.000 0.396
#> SRR1333990 5 0.4273 0.4262 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1410356 1 0.0290 0.7615 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR808106 1 0.5825 0.2868 0.536 0.000 0.104 0.000 0.360
#> SRR662713 1 0.6772 -0.2161 0.388 0.000 0.332 0.000 0.280
#> SRR1447058 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480964 3 0.3849 0.7019 0.112 0.000 0.808 0.000 0.080
#> SRR809382 3 0.1908 0.7135 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR665417 5 0.4101 0.5567 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1088016 2 0.2077 0.8917 0.000 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1453166 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.4367 0.3072 0.000 0.580 0.000 0.416 0.004
#> SRR1077781 2 0.4029 0.5530 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR615623 3 0.1908 0.7135 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1413787 3 0.1197 0.6959 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1478207 3 0.4571 0.6548 0.188 0.000 0.736 0.000 0.076
#> SRR1411046 5 0.4497 0.4764 0.424 0.000 0.008 0.000 0.568
#> SRR1313711 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326560 5 0.4101 0.5567 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1309051 1 0.0609 0.7621 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1486949 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1395616 5 0.4367 0.5593 0.372 0.000 0.008 0.000 0.620
#> SRR1074956 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.5083 -0.0558 0.532 0.000 0.432 0.000 0.036
#> SRR1319221 3 0.3519 0.6465 0.216 0.000 0.776 0.000 0.008
#> SRR1405413 1 0.1830 0.7443 0.924 0.000 0.008 0.000 0.068
#> SRR607807 5 0.4262 0.4443 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1390160 3 0.3183 0.6864 0.156 0.000 0.828 0.000 0.016
#> SRR1406283 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 3 0.4273 0.2012 0.000 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1080742 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 5 0.4273 0.4262 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1312766 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 5 0.5781 0.5796 0.308 0.000 0.116 0.000 0.576
#> SRR1311224 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0290 0.7615 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1099720 2 0.4403 0.2468 0.000 0.560 0.000 0.436 0.004
#> SRR1349250 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357127 1 0.4171 0.2507 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317022 3 0.2020 0.7123 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.6365 0.3292 0.008 0.016 0.508 0.384 0.084
#> SRR1076144 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069614 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.1043 0.7570 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1485678 3 0.4397 0.2230 0.004 0.000 0.564 0.000 0.432
#> SRR1092232 3 0.1908 0.7135 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.1121 0.7435 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1384290 5 0.4367 0.5593 0.372 0.000 0.008 0.000 0.620
#> SRR1089349 1 0.3586 0.4686 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326727 2 0.0865 0.9435 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1440940 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR818372 3 0.1908 0.7094 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1323675 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR819894 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1310031 1 0.2127 0.6859 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR615419 3 0.2011 0.7107 0.004 0.000 0.908 0.000 0.088
#> SRR1436925 5 0.5820 0.6014 0.192 0.000 0.196 0.000 0.612
#> SRR1477238 1 0.3508 0.5291 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1332566 5 0.5644 0.5687 0.316 0.000 0.100 0.000 0.584
#> SRR1490228 3 0.3318 0.6608 0.192 0.000 0.800 0.000 0.008
#> SRR1442949 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1466239 1 0.3774 0.4350 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1094003 2 0.1768 0.9036 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1329971 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1097642 4 0.0566 0.9548 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1322981 1 0.0880 0.7495 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471713 3 0.2891 0.6821 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR660522 3 0.3237 0.7117 0.104 0.000 0.848 0.000 0.048
#> SRR815374 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1069564 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.6602 0.2807 0.216 0.000 0.424 0.000 0.360
#> SRR1316438 3 0.3093 0.6902 0.168 0.000 0.824 0.000 0.008
#> SRR1386844 5 0.5446 0.5369 0.100 0.000 0.272 0.000 0.628
#> SRR1373718 5 0.4434 0.3964 0.460 0.000 0.004 0.000 0.536
#> SRR1447458 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487128 5 0.4830 0.3188 0.488 0.000 0.020 0.000 0.492
#> SRR1441421 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1069919 2 0.0324 0.9541 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1460296 1 0.2773 0.6497 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1335489 1 0.2773 0.6497 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1393404 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1081425 1 0.1341 0.7538 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1401815 3 0.2020 0.7123 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071983 2 0.3430 0.7227 0.000 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1331793 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1410510 3 0.2516 0.7009 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1098761 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 3 0.4501 0.6359 0.128 0.000 0.756 0.000 0.116
#> SRR615395 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 5 0.5493 0.5323 0.108 0.000 0.264 0.000 0.628
#> SRR2165033 3 0.3048 0.6806 0.004 0.000 0.820 0.000 0.176
#> SRR1089054 2 0.0798 0.9505 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR816201 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1488514 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR655840 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1379303 1 0.2852 0.6434 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1418516 3 0.4210 0.5148 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR613174 1 0.1851 0.7033 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0510 0.7577 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR659157 3 0.2270 0.7148 0.020 0.000 0.904 0.000 0.076
#> SRR1480408 3 0.4268 0.2131 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR657857 5 0.4287 0.1119 0.000 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1073317 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332526 5 0.4150 0.3250 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1094168 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.2130 0.7131 0.012 0.000 0.908 0.000 0.080
#> SRR1085614 2 0.0955 0.9409 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1330106 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1466154 1 0.0162 0.7624 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396944 5 0.4397 0.4609 0.432 0.000 0.004 0.000 0.564
#> SRR1082784 2 0.0162 0.9561 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457267 1 0.3636 0.4919 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR614659 3 0.4713 0.1950 0.016 0.000 0.544 0.000 0.440
#> SRR659247 3 0.3639 0.7031 0.076 0.000 0.824 0.000 0.100
#> SRR1317201 1 0.4521 0.5627 0.748 0.000 0.088 0.000 0.164
#> SRR1473696 1 0.0404 0.7624 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1375842 1 0.2424 0.7001 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1388123 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096363 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.4965 0.1234 0.028 0.000 0.520 0.000 0.452
#> SRR1345499 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353499 1 0.0880 0.7589 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1416693 5 0.4420 0.4266 0.448 0.000 0.004 0.000 0.548
#> SRR1070841 3 0.2280 0.7077 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.3534 0.5179 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1333125 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1498183 5 0.4367 0.5594 0.372 0.000 0.008 0.000 0.620
#> SRR612659 3 0.2852 0.6859 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658597 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 4 0.2763 0.8113 0.000 0.148 0.000 0.848 0.004
#> SRR1074263 2 0.1205 0.9315 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1376786 1 0.3421 0.5421 0.788 0.000 0.008 0.000 0.204
#> SRR1345995 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.2966 0.6232 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1068808 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR662438 1 0.2852 0.6470 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1335355 5 0.4273 0.4262 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR659448 1 0.4255 0.5806 0.776 0.000 0.096 0.000 0.128
#> SRR1323558 3 0.1965 0.7130 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1381711 3 0.6468 0.3121 0.188 0.000 0.452 0.000 0.360
#> SRR657985 3 0.4313 0.5111 0.008 0.000 0.636 0.000 0.356
#> SRR1314810 1 0.1197 0.7549 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1336505 3 0.3449 0.6871 0.024 0.000 0.812 0.000 0.164
#> SRR1474095 1 0.1628 0.7473 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR1363831 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442376 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1074909 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367150 3 0.4074 0.5124 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1313406 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1068880 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1467277 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1084867 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1095431 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1443113 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.6233 0.3979 0.168 0.000 0.520 0.000 0.312
#> SRR1315912 1 0.0880 0.7589 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1075778 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1421116 2 0.0451 0.9525 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR602282 3 0.3194 0.6959 0.020 0.000 0.832 0.000 0.148
#> SRR1361195 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR600493 1 0.3636 0.3834 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1477653 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0290 0.7603 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1360785 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR810437 3 0.3093 0.6860 0.008 0.000 0.824 0.000 0.168
#> SRR1361860 3 0.4659 0.0222 0.012 0.000 0.500 0.000 0.488
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9558 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 5 0.3966 -0.0852 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1457619 3 0.4519 0.6346 0.148 0.000 0.752 0.000 0.100
#> SRR1498529 5 0.5572 0.5555 0.124 0.000 0.248 0.000 0.628
#> SRR1097172 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074017 2 0.4029 0.5532 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR1472033 2 0.0771 0.9458 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1445087 3 0.2074 0.7121 0.104 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR1399525 4 0.1282 0.9291 0.000 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR1312844 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 5 0.4150 0.3250 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1075659 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.4045 0.4703 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1353353 3 0.3536 0.7059 0.084 0.000 0.832 0.000 0.084
#> SRR1073291 1 0.1965 0.6965 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1356227 5 0.5365 0.5127 0.088 0.000 0.284 0.000 0.628
#> SRR1080720 4 0.4397 0.2089 0.000 0.432 0.000 0.564 0.004
#> SRR1091695 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR663002 3 0.3305 0.6428 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1399926 5 0.4304 0.3294 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1347144 3 0.3774 0.5565 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR1384006 5 0.4341 0.5658 0.364 0.000 0.008 0.000 0.628
#> SRR1499108 4 0.0162 0.9614 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR614047 3 0.1965 0.7130 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR818440 3 0.3809 0.6194 0.256 0.000 0.736 0.000 0.008
#> SRR1337770 5 0.4626 0.5676 0.364 0.000 0.020 0.000 0.616
#> SRR1399413 1 0.1012 0.7583 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1385542 2 0.0162 0.9561 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473959 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1074041 1 0.0451 0.7607 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1394495 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659460 1 0.1043 0.7481 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR816699 1 0.1197 0.7396 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0290 0.7603 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1499418 3 0.1608 0.6864 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1352894 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR815805 1 0.1043 0.7570 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1331083 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.2813 0.6857 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.4111 0.6006 0.788 0.000 0.120 0.000 0.092
#> SRR1351236 1 0.1043 0.7570 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1077479 1 0.1831 0.7446 0.920 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR814491 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1101256 2 0.0771 0.9458 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1436004 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0324 0.9542 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1078998 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1314707 5 0.4585 0.3995 0.020 0.000 0.352 0.000 0.628
#> SRR1309534 3 0.3280 0.6792 0.012 0.000 0.812 0.000 0.176
#> SRR615527 3 0.3109 0.6555 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.4291 -0.1476 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1325847 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 5 0.4576 0.3522 0.016 0.000 0.376 0.000 0.608
#> SRR1344166 5 0.5699 0.5966 0.156 0.000 0.220 0.000 0.624
#> SRR1368638 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1431429 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079237 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR815759 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1502143 3 0.6605 0.0625 0.312 0.000 0.452 0.000 0.236
#> SRR1487614 3 0.2561 0.6982 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9558 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 3 0.4415 0.2076 0.004 0.000 0.552 0.000 0.444
#> SRR1099212 2 0.0162 0.9552 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1083215 1 0.0162 0.7613 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.4437 0.1503 0.000 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR656421 1 0.5819 0.2371 0.456 0.000 0.092 0.000 0.452
#> SRR1086116 2 0.0693 0.9516 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1499917 3 0.2891 0.6817 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1339944 2 0.0324 0.9544 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1391444 2 0.0671 0.9483 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1434889 3 0.3700 0.6182 0.008 0.000 0.752 0.000 0.240
#> SRR1431847 3 0.0162 0.7072 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317155 5 0.6002 0.1164 0.112 0.000 0.436 0.000 0.452
#> SRR1477405 1 0.1792 0.7372 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR655289 3 0.1732 0.7140 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1341683 3 0.2966 0.6761 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1084790 1 0.4883 0.5262 0.708 0.000 0.092 0.000 0.200
#> SRR1073731 3 0.3283 0.6992 0.028 0.000 0.832 0.000 0.140
#> SRR1332588 3 0.4060 0.5125 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1471157 2 0.0162 0.9561 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR654945 3 0.3661 0.5927 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0290 0.7625 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413477 2 0.1124 0.9349 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1101152 3 0.2504 0.7195 0.064 0.000 0.896 0.000 0.040
#> SRR1358435 4 0.0566 0.9546 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR2165273 5 0.4341 0.5658 0.364 0.000 0.008 0.000 0.628
#> SRR1379014 5 0.4511 0.5719 0.356 0.000 0.016 0.000 0.628
#> SRR1489904 1 0.4268 0.1120 0.556 0.000 0.444 0.000 0.000
#> SRR1416386 4 0.0451 0.9568 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1406048 5 0.4511 0.3952 0.016 0.000 0.356 0.000 0.628
#> SRR606982 3 0.3561 0.5784 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1358082 1 0.1851 0.7330 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1312934 3 0.1965 0.7130 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR655194 3 0.4533 0.1823 0.008 0.000 0.544 0.000 0.448
#> SRR1331174 2 0.0566 0.9506 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1473251 4 0.4397 0.2091 0.000 0.432 0.000 0.564 0.004
#> SRR1389820 3 0.4210 0.6324 0.224 0.000 0.740 0.036 0.000
#> SRR1074289 1 0.0290 0.7615 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348816 2 0.1124 0.9351 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1076292 3 0.4497 0.4639 0.352 0.000 0.632 0.000 0.016
#> SRR1395810 2 0.0162 0.9561 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1498909 3 0.3093 0.6857 0.008 0.000 0.824 0.000 0.168
#> SRR1443507 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 3 0.3648 0.7028 0.084 0.000 0.824 0.000 0.092
#> SRR665610 3 0.1952 0.7122 0.004 0.000 0.912 0.000 0.084
#> SRR1347322 1 0.2773 0.6497 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR813395 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.1608 0.7426 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1470230 3 0.0290 0.7063 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354247 5 0.4126 0.5492 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1082640 2 0.0290 0.9561 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487592 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.7619 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.1965 0.7130 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1075273 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 3 0.3895 0.5381 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1092773 4 0.3949 0.5576 0.000 0.300 0.000 0.696 0.004
#> SRR1365332 1 0.0290 0.7603 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.1965 0.7130 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1097688 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.0290 0.7063 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099120 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.2773 0.6875 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.3790 0.6369 0.000 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR1347298 3 0.2424 0.7036 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1075923 4 0.0000 0.9640 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0609 0.7622 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 1 0.3782 0.2632 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1075752 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 3 0.2744 0.7548 0.144 0.000 0.840 0.016 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.2562 0.6661 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.3383 0.6419 0.728 0.000 0.004 0.268 0.000 0.000
#> SRR657384 4 0.3862 0.1866 0.476 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.2562 0.7664 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR818573 1 0.2668 0.6703 0.828 0.000 0.004 0.168 0.000 0.000
#> SRR1396017 4 0.2340 0.7517 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.3804 0.2321 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.2877 0.7083 0.820 0.000 0.168 0.012 0.000 0.000
#> SRR1382416 3 0.2660 0.7842 0.084 0.000 0.868 0.048 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.3593 0.3551 0.748 0.000 0.000 0.024 0.228 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.2527 0.7087 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 3 0.4834 0.5563 0.100 0.000 0.640 0.260 0.000 0.000
#> SRR1325138 4 0.3345 0.7448 0.184 0.000 0.000 0.788 0.028 0.000
#> SRR1326821 5 0.6711 0.4677 0.188 0.000 0.200 0.096 0.516 0.000
#> SRR1490178 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR655613 3 0.3659 0.3481 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.3830 0.5407 0.000 0.004 0.000 0.000 0.376 0.620
#> SRR1443871 2 0.0260 0.7162 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1102489 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 3 0.5033 -0.0295 0.452 0.000 0.476 0.072 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.0891 0.8093 0.008 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.2706 0.7128 0.832 0.000 0.160 0.008 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.0790 0.8153 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1399069 4 0.3852 0.4017 0.324 0.000 0.000 0.664 0.012 0.000
#> SRR1366450 3 0.4751 0.3418 0.076 0.000 0.624 0.300 0.000 0.000
#> SRR1396859 3 0.4822 0.4007 0.332 0.000 0.596 0.072 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.3866 0.2408 0.516 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 4 0.6126 0.0665 0.008 0.000 0.232 0.456 0.304 0.000
#> SRR1080560 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 3 0.3634 0.3065 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.3996 0.7152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1327614 3 0.4405 0.5815 0.240 0.000 0.688 0.072 0.000 0.000
#> SRR658152 4 0.0603 0.7705 0.016 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1368141 4 0.2092 0.7802 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.4085 0.6933 0.748 0.000 0.156 0.096 0.000 0.000
#> SRR1453725 3 0.2762 0.7097 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.4096 0.7118 0.000 0.508 0.000 0.000 0.484 0.008
#> SRR1477930 1 0.2527 0.7087 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.3592 0.7347 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344 0.000
#> SRR656275 4 0.2597 0.7623 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.2983 0.6987 0.832 0.000 0.032 0.136 0.000 0.000
#> SRR1377735 3 0.2937 0.7673 0.096 0.000 0.848 0.056 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.3341 0.3988 0.776 0.000 0.004 0.012 0.208 0.000
#> SRR1404531 1 0.3531 0.5305 0.672 0.000 0.328 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.3481 0.3667 0.756 0.000 0.004 0.012 0.228 0.000
#> SRR1458890 4 0.1765 0.7793 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.2912 0.7422 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1407624 2 0.3620 0.7363 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1431969 4 0.1714 0.7745 0.000 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1087393 6 0.4694 0.4563 0.000 0.052 0.000 0.000 0.376 0.572
#> SRR1077263 5 0.6693 0.4532 0.168 0.000 0.220 0.096 0.516 0.000
#> SRR1385211 1 0.3330 0.6058 0.716 0.000 0.284 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.2821 0.6843 0.832 0.000 0.016 0.152 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.3225 0.7246 0.828 0.000 0.080 0.092 0.000 0.000
#> SRR1361630 5 0.6084 0.5301 0.168 0.000 0.024 0.292 0.516 0.000
#> SRR1318966 6 0.1753 0.8525 0.000 0.004 0.000 0.000 0.084 0.912
#> SRR1407087 4 0.4024 0.7427 0.072 0.000 0.184 0.744 0.000 0.000
#> SRR603212 3 0.2793 0.6992 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 4 0.3072 0.7867 0.076 0.000 0.084 0.840 0.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1312645 4 0.5457 0.0694 0.356 0.000 0.132 0.512 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.3975 0.3216 0.544 0.000 0.452 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.1141 0.7998 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1465501 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 4 0.1610 0.7761 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1445064 4 0.2398 0.7894 0.104 0.000 0.020 0.876 0.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.2762 0.6464 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1326708 3 0.1007 0.8125 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.3126 0.6448 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1477316 4 0.3428 0.6377 0.304 0.000 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1077898 3 0.4356 0.6657 0.084 0.000 0.740 0.012 0.164 0.000
#> SRR1349080 5 0.6856 0.4666 0.164 0.000 0.216 0.120 0.500 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.4725 0.4992 0.604 0.000 0.332 0.064 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.2697 0.7414 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR604414 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 3 0.1334 0.8129 0.032 0.000 0.948 0.020 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.1610 0.7657 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR602082 3 0.4451 0.5730 0.248 0.000 0.680 0.072 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 5 0.4855 -0.6695 0.000 0.460 0.000 0.000 0.484 0.056
#> SRR661613 4 0.1967 0.7827 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000 0.000
#> SRR1420710 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR660426 3 0.0458 0.8154 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR661064 1 0.2632 0.6725 0.832 0.000 0.004 0.164 0.000 0.000
#> SRR1082011 5 0.5400 -0.5893 0.000 0.400 0.000 0.000 0.484 0.116
#> SRR1452718 3 0.0790 0.8147 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 3 0.1320 0.8121 0.036 0.000 0.948 0.016 0.000 0.000
#> SRR1455482 3 0.3318 0.7147 0.172 0.000 0.796 0.032 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.3175 0.6426 0.744 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.3515 0.5651 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.4482 0.6978 0.708 0.000 0.124 0.168 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.5963 0.5299 0.168 0.000 0.016 0.300 0.516 0.000
#> SRR1337707 4 0.1663 0.7802 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1474617 4 0.3780 0.6950 0.000 0.000 0.248 0.728 0.004 0.020
#> SRR1398013 4 0.2562 0.7664 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1352918 5 0.5636 0.5215 0.176 0.000 0.000 0.308 0.516 0.000
#> SRR1420750 3 0.1643 0.7996 0.008 0.000 0.924 0.068 0.000 0.000
#> SRR1071785 4 0.2454 0.7721 0.160 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.2003 0.7359 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1490313 1 0.3607 0.3938 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1366560 3 0.3446 0.5565 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 3 0.3860 0.6896 0.164 0.000 0.764 0.072 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1313494 1 0.3098 0.6836 0.812 0.000 0.024 0.164 0.000 0.000
#> SRR1309985 4 0.1765 0.7698 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.2697 0.7010 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.5262 0.2950 0.456 0.000 0.448 0.096 0.000 0.000
#> SRR1400078 4 0.1957 0.7746 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1088631 5 0.5249 -0.6172 0.000 0.420 0.000 0.000 0.484 0.096
#> SRR1092842 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.5516 0.2486 0.196 0.000 0.560 0.244 0.000 0.000
#> SRR1079434 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1325559 1 0.3747 0.4550 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 5 0.6769 0.4791 0.168 0.000 0.200 0.116 0.516 0.000
#> SRR1383883 1 0.4704 0.5308 0.628 0.000 0.300 0.072 0.000 0.000
#> SRR1396100 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1475697 4 0.2752 0.7393 0.036 0.000 0.108 0.856 0.000 0.000
#> SRR1488067 6 0.2949 0.7763 0.000 0.028 0.000 0.000 0.140 0.832
#> SRR1102103 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 6 0.0713 0.9004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1410380 5 0.6138 0.5304 0.168 0.000 0.028 0.288 0.516 0.000
#> SRR1445490 2 0.0146 0.7146 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1454671 2 0.1501 0.7309 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1435044 4 0.3133 0.6004 0.008 0.000 0.212 0.780 0.000 0.000
#> SRR1485812 4 0.2491 0.7037 0.000 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 3 0.2294 0.7901 0.036 0.000 0.892 0.072 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.3851 0.7234 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1343898 4 0.1444 0.7474 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR807775 4 0.3126 0.6747 0.000 0.000 0.248 0.752 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.4535 0.6869 0.000 0.484 0.000 0.000 0.484 0.032
#> SRR820427 5 0.6138 0.5324 0.168 0.000 0.028 0.288 0.516 0.000
#> SRR1100656 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 3 0.4145 0.6060 0.252 0.000 0.700 0.048 0.000 0.000
#> SRR1414536 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR656794 3 0.3525 0.6896 0.032 0.000 0.800 0.012 0.156 0.000
#> SRR604653 3 0.1610 0.8026 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 4 0.3053 0.6181 0.004 0.000 0.012 0.812 0.172 0.000
#> SRR1485912 4 0.4815 0.4852 0.060 0.000 0.384 0.556 0.000 0.000
#> SRR1407602 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1356164 1 0.3816 0.5883 0.688 0.000 0.296 0.016 0.000 0.000
#> SRR1328692 4 0.2814 0.7699 0.172 0.000 0.008 0.820 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.3923 0.5040 0.620 0.000 0.372 0.008 0.000 0.000
#> SRR1479216 4 0.3868 0.1511 0.000 0.000 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.2896 0.7145 0.824 0.000 0.160 0.016 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.4025 0.0834 0.416 0.000 0.576 0.008 0.000 0.000
#> SRR1368200 4 0.2001 0.7860 0.048 0.000 0.040 0.912 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.3838 0.7247 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448 0.000
#> SRR1501043 4 0.5246 0.2009 0.164 0.000 0.000 0.604 0.232 0.000
#> SRR1437256 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1487446 4 0.1141 0.7703 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.3807 0.5107 0.628 0.000 0.368 0.004 0.000 0.000
#> SRR815164 4 0.4037 0.2838 0.012 0.000 0.380 0.608 0.000 0.000
#> SRR1442043 4 0.1967 0.7717 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000 0.000
#> SRR1410573 3 0.2300 0.7642 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 5 0.5933 -0.4338 0.000 0.312 0.000 0.000 0.452 0.236
#> SRR1352369 3 0.0547 0.8157 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 4 0.1753 0.7780 0.004 0.000 0.084 0.912 0.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.2632 0.7108 0.832 0.000 0.164 0.004 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.3307 0.7414 0.044 0.000 0.808 0.148 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.2664 0.7025 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.3747 0.2006 0.000 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.1863 0.7934 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR816123 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614779 5 0.6235 0.5299 0.168 0.000 0.036 0.280 0.516 0.000
#> SRR810783 1 0.5071 0.2182 0.520 0.000 0.080 0.400 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.4061 0.6260 0.708 0.000 0.248 0.044 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.0520 0.8133 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000 0.000
#> SRR808106 5 0.5894 0.3146 0.168 0.000 0.304 0.012 0.516 0.000
#> SRR662713 3 0.5871 -0.2228 0.396 0.000 0.408 0.196 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 4 0.3261 0.7853 0.072 0.000 0.104 0.824 0.000 0.000
#> SRR809382 4 0.1556 0.7770 0.000 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR665417 1 0.2562 0.7070 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.1141 0.6798 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1453166 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 5 0.5922 -0.3579 0.000 0.252 0.000 0.000 0.464 0.284
#> SRR1077781 5 0.5742 -0.4901 0.000 0.332 0.000 0.000 0.484 0.184
#> SRR615623 4 0.1663 0.7752 0.000 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1413787 4 0.3795 0.3022 0.004 0.000 0.000 0.632 0.364 0.000
#> SRR1478207 4 0.4054 0.7439 0.072 0.000 0.188 0.740 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.4332 0.6315 0.700 0.000 0.228 0.072 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1326560 1 0.3874 0.6855 0.760 0.000 0.172 0.068 0.000 0.000
#> SRR1309051 3 0.0547 0.8165 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.2882 0.7033 0.812 0.000 0.180 0.008 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817210 3 0.4437 0.0938 0.032 0.000 0.576 0.392 0.000 0.000
#> SRR1319221 4 0.3012 0.7289 0.008 0.000 0.196 0.796 0.000 0.000
#> SRR1405413 3 0.3278 0.7551 0.088 0.000 0.824 0.088 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.4498 0.5513 0.644 0.000 0.300 0.056 0.000 0.000
#> SRR1390160 4 0.2771 0.7754 0.032 0.000 0.116 0.852 0.000 0.000
#> SRR1406283 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.3782 0.2632 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1080742 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.4704 0.5310 0.628 0.000 0.300 0.072 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.4482 0.6843 0.708 0.000 0.168 0.124 0.000 0.000
#> SRR1311224 3 0.0146 0.8147 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.0260 0.8148 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 5 0.6021 -0.2910 0.000 0.244 0.000 0.000 0.396 0.360
#> SRR1349250 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.3774 0.2039 0.000 0.000 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 4 0.1610 0.7761 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1332879 3 0.0146 0.8157 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 4 0.6555 0.3272 0.076 0.004 0.008 0.516 0.088 0.308
#> SRR1076144 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1069614 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 3 0.1204 0.8102 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.3823 0.2045 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1092232 4 0.1610 0.7761 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1344253 3 0.0858 0.8112 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1384290 1 0.2631 0.7037 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.2964 0.6387 0.004 0.000 0.792 0.204 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1326727 2 0.3996 0.7152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1440940 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR818372 4 0.1765 0.7793 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.0937 0.7248 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR819894 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1310031 3 0.1814 0.7532 0.000 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR615419 4 0.1714 0.7800 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.3375 0.7246 0.816 0.000 0.088 0.096 0.000 0.000
#> SRR1477238 3 0.4428 0.5759 0.244 0.000 0.684 0.072 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.4575 0.6724 0.696 0.000 0.180 0.124 0.000 0.000
#> SRR1490228 4 0.3819 0.7181 0.064 0.000 0.172 0.764 0.000 0.000
#> SRR1442949 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1466239 3 0.3684 0.4129 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.4756 0.6804 0.000 0.488 0.000 0.000 0.464 0.048
#> SRR1329971 3 0.1444 0.7986 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.3756 0.7309 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1097642 6 0.3699 0.5898 0.000 0.004 0.000 0.000 0.336 0.660
#> SRR1322981 3 0.0790 0.8049 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1471713 4 0.2969 0.6955 0.000 0.000 0.224 0.776 0.000 0.000
#> SRR660522 4 0.2888 0.7869 0.056 0.000 0.092 0.852 0.000 0.000
#> SRR815374 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 5 0.6825 0.5114 0.168 0.000 0.172 0.144 0.516 0.000
#> SRR1316438 4 0.2482 0.7701 0.004 0.000 0.148 0.848 0.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.3956 0.6647 0.712 0.000 0.036 0.252 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.3221 0.6279 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.2048 0.7363 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1487128 1 0.4684 0.4532 0.592 0.000 0.352 0.056 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.3991 0.7199 0.000 0.524 0.000 0.000 0.472 0.004
#> SRR1460296 3 0.2996 0.6744 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 3 0.3746 0.7058 0.140 0.000 0.780 0.080 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 3 0.1444 0.8074 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 4 0.1663 0.7752 0.000 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 5 0.5578 -0.5741 0.000 0.404 0.000 0.000 0.456 0.140
#> SRR1331793 2 0.1765 0.7335 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1410510 4 0.2664 0.7293 0.000 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1098761 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 4 0.3650 0.6876 0.092 0.000 0.116 0.792 0.000 0.000
#> SRR615395 3 0.0146 0.8144 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.3014 0.7007 0.832 0.000 0.036 0.132 0.000 0.000
#> SRR2165033 4 0.2562 0.7662 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.1814 0.7287 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR816201 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR655840 4 0.1814 0.7708 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1379303 3 0.3790 0.6963 0.156 0.000 0.772 0.072 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.5956 -0.0295 0.236 0.000 0.000 0.440 0.324 0.000
#> SRR613174 3 0.1610 0.7657 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.0547 0.8107 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR659157 4 0.0363 0.7701 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.3867 0.0253 0.512 0.000 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.3789 0.3643 0.584 0.000 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1332526 1 0.2697 0.6516 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 4 0.0692 0.7724 0.020 0.000 0.004 0.976 0.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.4096 0.7119 0.000 0.508 0.000 0.000 0.484 0.008
#> SRR1330106 4 0.2730 0.7542 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1466154 3 0.0146 0.8158 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.3023 0.6612 0.768 0.000 0.232 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.3198 0.7393 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1457267 3 0.4495 0.5581 0.256 0.000 0.672 0.072 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.3907 0.2721 0.588 0.000 0.004 0.408 0.000 0.000
#> SRR659247 4 0.3055 0.7881 0.096 0.000 0.064 0.840 0.000 0.000
#> SRR1317201 3 0.4273 0.6746 0.148 0.000 0.732 0.120 0.000 0.000
#> SRR1473696 3 0.0363 0.8163 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 3 0.2597 0.7338 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1096363 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.3883 0.4241 0.656 0.000 0.012 0.332 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 3 0.0937 0.8133 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.4495 0.5959 0.672 0.000 0.256 0.072 0.000 0.000
#> SRR1070841 4 0.2003 0.7671 0.000 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1380910 3 0.3464 0.5467 0.312 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1498183 1 0.2697 0.7040 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000 0.000
#> SRR612659 4 0.2941 0.7013 0.000 0.000 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 6 0.4134 0.5843 0.000 0.028 0.000 0.000 0.316 0.656
#> SRR1074263 2 0.4184 0.7082 0.000 0.504 0.000 0.000 0.484 0.012
#> SRR1376786 3 0.3634 0.4086 0.296 0.000 0.696 0.008 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 3 0.2823 0.6728 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 3 0.3050 0.6701 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.3101 0.6476 0.756 0.000 0.244 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.3857 0.6321 0.152 0.000 0.768 0.080 0.000 0.000
#> SRR1323558 4 0.1610 0.7761 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1381711 5 0.6829 0.5169 0.168 0.000 0.148 0.168 0.516 0.000
#> SRR657985 5 0.5939 0.3919 0.164 0.000 0.008 0.392 0.436 0.000
#> SRR1314810 3 0.2511 0.7877 0.064 0.000 0.880 0.056 0.000 0.000
#> SRR1336505 4 0.3364 0.7544 0.196 0.000 0.024 0.780 0.000 0.000
#> SRR1474095 3 0.1866 0.7996 0.084 0.000 0.908 0.008 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1442376 4 0.1714 0.7708 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1074909 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 5 0.5744 0.3522 0.168 0.000 0.000 0.408 0.424 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.1814 0.7348 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1443113 3 0.0363 0.8165 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1380414 4 0.7225 -0.0744 0.164 0.000 0.180 0.444 0.212 0.000
#> SRR1315912 3 0.0790 0.8139 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1421116 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR602282 4 0.2831 0.7832 0.136 0.000 0.024 0.840 0.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR600493 3 0.3725 0.3432 0.316 0.000 0.676 0.008 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.0547 0.8108 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1360785 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR810437 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1361860 4 0.3979 -0.0360 0.456 0.000 0.004 0.540 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.3854 0.7225 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1098903 1 0.5701 -0.0135 0.524 0.000 0.000 0.248 0.228 0.000
#> SRR1457619 4 0.2868 0.7193 0.028 0.000 0.132 0.840 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.3066 0.7076 0.832 0.000 0.044 0.124 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.1387 0.7296 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1074017 5 0.5771 -0.4887 0.000 0.336 0.000 0.000 0.476 0.188
#> SRR1472033 2 0.3996 0.7152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1445087 4 0.1714 0.7759 0.000 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1399525 6 0.3930 0.4806 0.000 0.004 0.000 0.000 0.420 0.576
#> SRR1312844 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.3175 0.6495 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000 0.000
#> SRR1075659 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 4 0.3756 0.4621 0.000 0.000 0.400 0.600 0.000 0.000
#> SRR1353353 4 0.3063 0.7878 0.092 0.000 0.068 0.840 0.000 0.000
#> SRR1073291 3 0.1610 0.7652 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.3679 0.6990 0.760 0.000 0.040 0.200 0.000 0.000
#> SRR1080720 6 0.5391 0.2670 0.000 0.116 0.000 0.000 0.392 0.492
#> SRR1091695 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR663002 4 0.2793 0.7246 0.000 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.2854 0.7423 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1399926 1 0.4941 0.3642 0.552 0.000 0.376 0.072 0.000 0.000
#> SRR1347144 4 0.3446 0.5977 0.000 0.000 0.308 0.692 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.2527 0.7087 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614047 4 0.1610 0.7761 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR818440 4 0.3534 0.6735 0.008 0.000 0.276 0.716 0.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.2738 0.7083 0.820 0.000 0.176 0.004 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.1257 0.8141 0.020 0.000 0.952 0.028 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.2697 0.7421 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1473959 4 0.2631 0.7618 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.0622 0.8127 0.008 0.000 0.980 0.012 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.1387 0.7299 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR659460 3 0.0865 0.8056 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.0937 0.8036 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.0458 0.8118 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1499418 4 0.2822 0.6870 0.040 0.000 0.000 0.852 0.108 0.000
#> SRR1352894 2 0.1387 0.7297 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR815805 3 0.1320 0.8121 0.036 0.000 0.948 0.016 0.000 0.000
#> SRR1331083 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 4 0.2941 0.6985 0.000 0.000 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR1436698 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 3 0.3727 0.7049 0.032 0.000 0.816 0.076 0.076 0.000
#> SRR1351236 3 0.1141 0.8105 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 3 0.1757 0.8038 0.076 0.000 0.916 0.008 0.000 0.000
#> SRR814491 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1101256 2 0.3996 0.7152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1436004 3 0.0260 0.8138 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.3996 0.7152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1078998 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.2706 0.6767 0.832 0.000 0.008 0.160 0.000 0.000
#> SRR1309534 4 0.2266 0.7682 0.108 0.000 0.012 0.880 0.000 0.000
#> SRR615527 4 0.2823 0.7176 0.000 0.000 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.4984 0.1688 0.492 0.000 0.440 0.068 0.000 0.000
#> SRR1325847 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.2838 0.6530 0.808 0.000 0.004 0.188 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.3268 0.7243 0.824 0.000 0.076 0.100 0.000 0.000
#> SRR1368638 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.0458 0.7183 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR815759 5 0.5610 0.5272 0.168 0.000 0.000 0.316 0.516 0.000
#> SRR1502143 1 0.6092 0.1624 0.372 0.000 0.280 0.348 0.000 0.000
#> SRR1487614 4 0.2562 0.7392 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.3765 0.7310 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR820810 1 0.3923 0.2505 0.580 0.000 0.004 0.416 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1083215 3 0.0146 0.8147 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1476547 5 0.5870 -0.2989 0.000 0.212 0.000 0.000 0.460 0.328
#> SRR656421 5 0.5999 0.3229 0.220 0.000 0.252 0.012 0.516 0.000
#> SRR1086116 2 0.2996 0.7335 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1499917 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1391444 2 0.3866 0.7180 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1434889 4 0.3547 0.5558 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR1431847 4 0.0458 0.7623 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1317155 1 0.4344 0.4030 0.628 0.000 0.036 0.336 0.000 0.000
#> SRR1477405 3 0.2170 0.7901 0.100 0.000 0.888 0.012 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.2147 0.7795 0.084 0.000 0.000 0.896 0.020 0.000
#> SRR1341683 4 0.3175 0.6872 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000 0.000
#> SRR1084790 3 0.4710 0.6161 0.116 0.000 0.708 0.012 0.164 0.000
#> SRR1073731 4 0.2911 0.7800 0.144 0.000 0.024 0.832 0.000 0.000
#> SRR1332588 5 0.5724 0.3538 0.164 0.000 0.000 0.412 0.424 0.000
#> SRR1471157 2 0.3607 0.7363 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000
#> SRR654945 4 0.3309 0.6384 0.000 0.000 0.280 0.720 0.000 0.000
#> SRR661028 3 0.0260 0.8160 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.4184 0.7083 0.000 0.504 0.000 0.000 0.484 0.012
#> SRR1101152 4 0.2134 0.7885 0.052 0.000 0.044 0.904 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.1663 0.8517 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR2165273 1 0.2527 0.7087 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.2632 0.7108 0.832 0.000 0.164 0.004 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.3823 0.0712 0.000 0.000 0.564 0.436 0.000 0.000
#> SRR1416386 6 0.0458 0.9097 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1406048 1 0.3189 0.6663 0.760 0.000 0.004 0.236 0.000 0.000
#> SRR606982 4 0.4809 0.3661 0.128 0.000 0.000 0.664 0.208 0.000
#> SRR1358082 3 0.2300 0.7635 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 4 0.1610 0.7761 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.3907 0.2702 0.588 0.000 0.004 0.408 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.3996 0.7152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1473251 6 0.5535 0.1301 0.000 0.132 0.000 0.000 0.428 0.440
#> SRR1389820 4 0.3680 0.7036 0.000 0.000 0.216 0.756 0.020 0.008
#> SRR1074289 3 0.0260 0.8148 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.3996 0.7152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1076292 4 0.3512 0.5440 0.008 0.000 0.272 0.720 0.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.3634 0.7358 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1498909 4 0.2527 0.7674 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1443507 3 0.0146 0.8144 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1452310 4 0.3520 0.7846 0.100 0.000 0.096 0.804 0.000 0.000
#> SRR665610 4 0.0692 0.7712 0.020 0.000 0.004 0.976 0.000 0.000
#> SRR1347322 3 0.2941 0.6821 0.220 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 3 0.2856 0.7731 0.076 0.000 0.856 0.068 0.000 0.000
#> SRR1470230 4 0.1610 0.7418 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1354247 1 0.2854 0.6952 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.7137 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.0000 0.8149 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 4 0.1610 0.7761 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1075273 6 0.0458 0.9094 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR658657 4 0.5224 0.2118 0.164 0.000 0.000 0.608 0.228 0.000
#> SRR1092773 6 0.4886 0.3312 0.000 0.060 0.000 0.000 0.432 0.508
#> SRR1365332 3 0.0458 0.8118 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR615958 4 0.2300 0.7525 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1097688 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 4 0.1610 0.7418 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1099120 6 0.0000 0.9198 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 4 0.2941 0.6985 0.000 0.000 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR1464856 5 0.5706 -0.5105 0.000 0.348 0.000 0.000 0.480 0.172
#> SRR1347298 4 0.2631 0.7323 0.000 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1075923 6 0.0363 0.9123 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1100703 3 0.1829 0.8027 0.024 0.000 0.920 0.056 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.432 0.568 0.568
#> 3 3 0.808 0.912 0.899 0.156 0.951 0.913
#> 4 4 0.852 0.864 0.920 0.187 0.868 0.746
#> 5 5 0.649 0.715 0.834 0.116 0.948 0.871
#> 6 6 0.594 0.604 0.754 0.138 0.832 0.555
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 1 0 1 1 0
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 1 0 1 1 0
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 1 0 1 1 0
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 1 0 1 1 0
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 1 0 1 1 0
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1075752 3 0.5968 0.903 0.000 0.364 0.636
#> SRR1397949 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329744 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.4346 0.845 0.816 0.000 0.184
#> SRR1087968 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.4178 0.853 0.828 0.000 0.172
#> SRR1326821 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1490178 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1443871 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1465758 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399069 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1366450 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396859 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1434736 1 0.4399 0.842 0.812 0.000 0.188
#> SRR1080560 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1322882 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1327614 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368141 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1440268 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1477930 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.2356 0.834 0.000 0.928 0.072
#> SRR656275 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1404531 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1458890 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1432695 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1087393 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1077263 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1385211 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1318966 2 0.4887 0.419 0.000 0.772 0.228
#> SRR1407087 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332232 2 0.0237 0.943 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312645 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465501 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1330878 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1445064 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452981 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077898 1 0.4178 0.853 0.828 0.000 0.172
#> SRR1349080 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1076096 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1375485 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0424 0.955 0.992 0.000 0.008
#> SRR812060 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1078417 3 0.6252 0.864 0.000 0.444 0.556
#> SRR661613 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420710 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR660426 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1452718 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1337707 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 1 0.5733 0.706 0.676 0.000 0.324
#> SRR1398013 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.5397 0.756 0.720 0.000 0.280
#> SRR1420750 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353618 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.5760 0.703 0.672 0.000 0.328
#> SRR1313494 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR607911 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088631 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1092842 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR615575 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.5178 0.781 0.744 0.000 0.256
#> SRR1325559 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1383883 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.5529 0.739 0.704 0.000 0.296
#> SRR1475697 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488067 3 0.6299 0.805 0.000 0.476 0.524
#> SRR1102103 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1084991 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1410380 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1445490 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.0892 0.949 0.980 0.000 0.020
#> SRR1078020 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1376406 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 1 0.5760 0.703 0.672 0.000 0.328
#> SRR807775 1 0.3816 0.870 0.852 0.000 0.148
#> SRR1409215 3 0.6244 0.870 0.000 0.440 0.560
#> SRR820427 1 0.5216 0.777 0.740 0.000 0.260
#> SRR1100656 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1362159 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR656794 1 0.4178 0.853 0.828 0.000 0.172
#> SRR604653 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.4399 0.842 0.812 0.000 0.188
#> SRR1485912 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.5733 0.707 0.676 0.000 0.324
#> SRR1356164 1 0.4121 0.839 0.832 0.000 0.168
#> SRR1328692 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479216 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358041 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.1289 0.903 0.000 0.968 0.032
#> SRR1501043 1 0.5760 0.703 0.672 0.000 0.328
#> SRR1437256 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR816653 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.4062 0.859 0.836 0.000 0.164
#> SRR1442043 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1352369 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.0892 0.950 0.980 0.000 0.020
#> SRR1465208 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR816123 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR614779 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR810783 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.4504 0.835 0.804 0.000 0.196
#> SRR662713 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1069826 3 0.6204 0.884 0.000 0.424 0.576
#> SRR1077781 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR615623 1 0.0424 0.956 0.992 0.000 0.008
#> SRR1413787 1 0.4399 0.842 0.812 0.000 0.188
#> SRR1478207 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1092961 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR817210 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319221 1 0.5733 0.706 0.676 0.000 0.324
#> SRR1405413 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.3879 0.850 0.848 0.000 0.152
#> SRR1390160 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1406283 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080742 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1468208 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1349250 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1350912 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332879 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.5760 0.701 0.672 0.000 0.328
#> SRR1076144 2 0.1031 0.915 0.000 0.976 0.024
#> SRR1069614 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR818239 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1421069 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1500006 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.4121 0.856 0.832 0.000 0.168
#> SRR1092232 1 0.4399 0.842 0.812 0.000 0.188
#> SRR1344253 1 0.4178 0.853 0.828 0.000 0.172
#> SRR1384290 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0424 0.956 0.992 0.000 0.008
#> SRR1343522 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1440940 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR818372 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323675 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.4931 0.804 0.768 0.000 0.232
#> SRR1310031 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR615419 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436925 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.4399 0.842 0.812 0.000 0.188
#> SRR1466239 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1329971 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 3 0.6225 0.876 0.000 0.432 0.568
#> SRR1322981 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR660522 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069564 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1416337 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1316438 1 0.5733 0.706 0.676 0.000 0.324
#> SRR1386844 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.0424 0.956 0.992 0.000 0.008
#> SRR1071337 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1331793 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098761 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1312124 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.6111 -0.432 0.000 0.604 0.396
#> SRR816201 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488514 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.5497 0.743 0.708 0.000 0.292
#> SRR613174 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0892 0.949 0.980 0.000 0.020
#> SRR1480408 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 3 0.5948 0.909 0.000 0.360 0.640
#> SRR1431270 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1085614 3 0.6307 0.779 0.000 0.488 0.512
#> SRR1330106 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1453662 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1089595 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1074263 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1376786 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1332754 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1381711 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR657985 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1314810 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074909 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1101200 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.4504 0.835 0.804 0.000 0.196
#> SRR1313406 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1084867 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1380184 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.4121 0.856 0.832 0.000 0.168
#> SRR1315912 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 3 0.6260 0.858 0.000 0.448 0.552
#> SRR602282 1 0.5465 0.743 0.712 0.000 0.288
#> SRR1361195 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.4399 0.842 0.812 0.000 0.188
#> SRR810437 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.0424 0.956 0.992 0.000 0.008
#> SRR1441311 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1457619 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 3 0.6008 0.909 0.000 0.372 0.628
#> SRR1472033 2 0.6309 -0.746 0.000 0.504 0.496
#> SRR1445087 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399525 2 0.1753 0.878 0.000 0.952 0.048
#> SRR1312844 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1085874 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1101226 3 0.5810 0.924 0.000 0.336 0.664
#> SRR1476056 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1311916 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353353 1 0.5733 0.706 0.676 0.000 0.324
#> SRR1073291 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1091695 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1350304 1 0.5706 0.712 0.680 0.000 0.320
#> SRR663002 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1384006 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR614047 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1352894 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR808272 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 3 0.5760 0.920 0.000 0.328 0.672
#> SRR1357672 1 0.4178 0.853 0.828 0.000 0.172
#> SRR1351236 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.5678 0.716 0.684 0.000 0.316
#> SRR1101256 2 0.4796 0.444 0.000 0.780 0.220
#> SRR1436004 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0592 0.932 0.000 0.988 0.012
#> SRR1078998 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 1 0.5733 0.706 0.676 0.000 0.324
#> SRR1098216 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1404003 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.4555 0.832 0.800 0.000 0.200
#> SRR1431429 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 3 0.5835 0.923 0.000 0.340 0.660
#> SRR1080509 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.4750 0.818 0.784 0.000 0.216
#> SRR1502143 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1402307 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR656421 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1086116 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.5835 -0.171 0.000 0.660 0.340
#> SRR1391444 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.4399 0.842 0.812 0.000 0.188
#> SRR1317155 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.4121 0.856 0.832 0.000 0.168
#> SRR1341683 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.4178 0.853 0.828 0.000 0.172
#> SRR1073731 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.4654 0.825 0.792 0.000 0.208
#> SRR1471157 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 3 0.6305 0.788 0.000 0.484 0.516
#> SRR1101152 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358435 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR2165273 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416386 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1406048 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1358082 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0237 0.958 0.996 0.000 0.004
#> SRR655194 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.5327 0.223 0.000 0.728 0.272
#> SRR1473251 3 0.6225 0.876 0.000 0.432 0.568
#> SRR1389820 1 0.5733 0.706 0.676 0.000 0.324
#> SRR1074289 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1076292 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 1 0.3941 0.864 0.844 0.000 0.156
#> SRR1347322 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1477256 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1354247 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.948 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1434117 1 0.4002 0.861 0.840 0.000 0.160
#> SRR1075273 3 0.6111 0.900 0.000 0.396 0.604
#> SRR658657 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1092773 2 0.5988 -0.307 0.000 0.632 0.368
#> SRR1365332 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097688 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1403259 1 0.4291 0.848 0.820 0.000 0.180
#> SRR1099120 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1362200 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464856 3 0.6235 0.876 0.000 0.436 0.564
#> SRR1347298 1 0.0237 0.957 0.996 0.000 0.004
#> SRR1075923 3 0.5785 0.925 0.000 0.332 0.668
#> SRR1100703 1 0.0000 0.959 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436370 4 0.4661 0.7331 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1075752 4 0.2868 0.8289 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1329744 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR657384 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1351190 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1458662 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR818573 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396017 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1410742 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1382416 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1391354 3 0.4134 0.7376 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312244 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1325138 1 0.4804 0.0797 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1326821 3 0.4961 0.5450 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1490178 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR655613 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075707 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1465758 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414058 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407449 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1399069 3 0.4713 0.6922 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR1366450 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1396859 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1457176 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1097666 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1434736 3 0.3610 0.7355 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1080560 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1322882 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1435688 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1327614 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658152 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1368141 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1440268 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1453725 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325711 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1477930 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.2149 0.8603 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR656275 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1369052 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1377735 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1331244 1 0.4996 -0.3515 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1404531 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1324331 3 0.4804 0.6642 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1458890 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432695 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1087393 4 0.4605 0.7440 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1077263 3 0.4925 0.5918 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1385211 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR655241 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR656922 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361630 3 0.4898 0.6158 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1318966 2 0.3837 0.6121 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1407087 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR603212 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321088 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1485190 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332232 2 0.0592 0.9499 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312645 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1457835 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347123 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465501 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1330878 1 0.0707 0.9533 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1445064 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1452981 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1326708 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407157 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0469 0.9535 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1477316 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1077898 1 0.4776 0.1164 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1349080 3 0.4679 0.6999 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 4 0.2149 0.8548 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1375485 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432563 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR604414 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380614 1 0.2918 0.8052 0.876 0.000 0.116 0.008
#> SRR812060 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR602082 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1069490 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1078417 4 0.4843 0.6534 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR661613 1 0.0672 0.9573 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1420710 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR660426 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416003 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR661064 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1082011 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1452718 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313473 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1399394 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102467 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1317470 3 0.4746 0.6837 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1337707 1 0.0524 0.9604 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1408752 2 0.0469 0.9535 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1474617 3 0.1978 0.5681 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1398013 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352918 3 0.1557 0.6489 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1420750 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071785 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490313 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1366560 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355684 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1323289 3 0.0000 0.5896 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309985 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR607911 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333789 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400078 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1088631 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1092842 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR615575 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079434 3 0.2081 0.6719 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1325559 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1446695 3 0.4961 0.5450 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1383883 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396100 3 0.1118 0.6304 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1475697 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1488067 4 0.4877 0.6262 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1084991 4 0.4605 0.7440 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1410380 3 0.4989 0.4796 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435044 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1485812 1 0.5024 0.1363 0.632 0.000 0.360 0.008
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1376406 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1343898 3 0.0000 0.5896 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.3649 0.6558 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1409215 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR820427 3 0.2081 0.6719 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1100656 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1362159 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414536 3 0.4331 0.7363 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR656794 1 0.4643 0.2491 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR604653 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317685 3 0.3649 0.7360 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1485912 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407602 3 0.0188 0.5949 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1356164 3 0.3710 0.6067 0.192 0.000 0.804 0.004
#> SRR1328692 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0672 0.9573 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1479216 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1358041 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1468766 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1368200 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435602 2 0.1792 0.8884 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1501043 3 0.0000 0.5896 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487446 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR816653 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR815164 1 0.4158 0.5950 0.768 0.000 0.224 0.008
#> SRR1442043 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1410573 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096782 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1352369 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1382934 1 0.6240 0.0430 0.604 0.000 0.320 0.076
#> SRR1465208 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1314728 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1470291 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1308756 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1409600 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR816123 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR614779 3 0.4907 0.6083 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR810783 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333990 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1410356 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR808106 3 0.3528 0.7339 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR662713 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR809382 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR665417 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088016 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453166 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1069826 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1077781 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR615623 1 0.2413 0.8761 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR1413787 3 0.4304 0.7367 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1478207 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1411046 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313711 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1326560 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309051 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074956 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1092961 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR817210 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1319221 3 0.1978 0.5681 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1405413 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR607807 3 0.5070 0.5018 0.372 0.000 0.620 0.008
#> SRR1390160 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1406283 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1357709 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1080742 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1468208 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312766 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361612 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1311224 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1087801 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1099720 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1349250 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.1302 0.9289 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1332879 1 0.0524 0.9604 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1403177 3 0.1978 0.5681 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1076144 2 0.1118 0.9284 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1069614 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR818239 4 0.2216 0.8538 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1421069 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1500006 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1485678 1 0.4193 0.4940 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1092232 3 0.4624 0.7122 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1344253 1 0.4761 0.1342 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1384290 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1089349 1 0.1722 0.9121 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1343522 2 0.0469 0.9535 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1326727 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1440940 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR818372 1 0.0672 0.9573 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1323675 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819894 3 0.2704 0.6993 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1310031 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR615419 1 0.0804 0.9541 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1436925 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477238 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332566 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1490228 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1442949 3 0.3569 0.7347 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1466239 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1094003 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1329971 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR813076 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1097642 4 0.4661 0.7333 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1322981 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1485976 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1471713 1 0.0817 0.9497 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR660522 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR815374 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1069564 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1416337 3 0.4941 0.5739 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1316438 3 0.0188 0.5912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1386844 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1373718 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1447458 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1487128 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1460296 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1335489 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401815 1 0.2949 0.8318 0.888 0.000 0.088 0.024
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1331793 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410510 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098761 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1312124 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR615395 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1479349 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1089054 2 0.4907 -0.0916 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR816201 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1488514 2 0.0469 0.9535 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR655840 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1379303 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1418516 3 0.1302 0.6382 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR613174 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1351125 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659157 1 0.4086 0.6136 0.776 0.000 0.216 0.008
#> SRR1480408 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR657857 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1073317 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1332526 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1094168 4 0.2814 0.8318 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1431270 3 0.4877 0.6297 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1085614 4 0.4925 0.5857 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1330106 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466154 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396944 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082784 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457267 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR614659 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659247 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317201 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473696 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375842 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1388123 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1096363 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1453662 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416693 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070841 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380910 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333125 2 0.0469 0.9535 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498183 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612659 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1089595 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1074263 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1376786 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1345995 1 0.0336 0.9621 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071035 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1068808 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1335355 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659448 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1323558 1 0.1209 0.9392 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1381711 3 0.4585 0.7169 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR657985 1 0.4998 -0.3652 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1314810 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1336505 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474095 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1363831 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442376 1 0.0927 0.9504 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1074909 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1101200 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.3400 0.7296 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4746 0.6837 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1380184 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443113 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380414 1 0.4277 0.4641 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1315912 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1075778 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1421116 4 0.4776 0.6893 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR602282 3 0.2797 0.5798 0.032 0.000 0.900 0.068
#> SRR1361195 2 0.0469 0.9535 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR600493 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477653 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355475 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1360785 3 0.3528 0.7338 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR810437 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361860 1 0.0672 0.9574 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1441311 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1098903 3 0.4933 0.5830 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1457619 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1498529 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 4 0.4164 0.7859 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1472033 4 0.4916 0.5941 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1445087 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1399525 2 0.2760 0.8016 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1312844 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1085874 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1101226 4 0.2281 0.8529 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1476056 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1075659 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1311916 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353353 3 0.2255 0.5779 0.012 0.000 0.920 0.068
#> SRR1073291 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1356227 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1080720 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1091695 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1350304 3 0.0336 0.6000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR663002 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1376983 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399926 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347144 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1384006 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1499108 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR614047 1 0.0336 0.9621 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR818440 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1337770 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0188 0.9618 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1385542 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473959 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074041 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR816699 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1308612 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1499418 3 0.4877 0.6297 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1331083 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR808272 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436698 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1095627 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1357672 1 0.4776 0.1164 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1351236 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077479 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR814491 3 0.0469 0.6047 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1101256 2 0.4277 0.4634 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1436004 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1457994 2 0.1022 0.9329 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR615527 3 0.2124 0.5734 0.008 0.000 0.924 0.068
#> SRR1098216 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325847 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1404003 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1344166 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1368638 3 0.3266 0.7246 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 4 0.2216 0.8541 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.3123 0.7187 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1502143 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487614 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1402307 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR820810 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1099212 2 0.0469 0.9535 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083215 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1476547 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR656421 3 0.4907 0.6083 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1086116 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499917 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1339944 2 0.4697 0.2016 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1391444 2 0.0336 0.9562 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1434889 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1431847 3 0.3801 0.7371 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1317155 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477405 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR655289 1 0.4356 0.4234 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1341683 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1084790 1 0.4830 0.0413 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1073731 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1332588 3 0.3172 0.7208 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1471157 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR654945 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR661028 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413477 4 0.4843 0.6535 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1101152 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1358435 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR2165273 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1379014 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489904 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416386 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1406048 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR606982 3 0.4898 0.6159 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1358082 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312934 1 0.0524 0.9598 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR655194 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1331174 2 0.4522 0.3380 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1473251 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1389820 3 0.1978 0.5681 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1074289 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348816 4 0.4643 0.7386 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1076292 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1395810 2 0.0188 0.9566 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1498909 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1443507 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1452310 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR665610 1 0.3810 0.6759 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9620 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1477256 1 0.0336 0.9612 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470230 3 0.4855 0.6418 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1354247 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9561 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1352299 1 0.0188 0.9619 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1076317 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1434117 1 0.3768 0.6839 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR1075273 4 0.4304 0.7747 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR658657 3 0.4877 0.6297 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1092773 2 0.4888 -0.0431 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1365332 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR615958 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1097688 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1403259 3 0.4790 0.6694 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1099120 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1362200 1 0.0336 0.9615 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1464856 4 0.4624 0.7415 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1347298 1 0.0469 0.9594 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1075923 4 0.2081 0.8556 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1100703 1 0.0336 0.9621 0.992 0.000 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 1 0.0968 0.823701 0.972 0.000 0.012 0.004 0.012
#> SRR1436370 2 0.1608 0.913547 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1075752 2 0.0794 0.920210 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1397949 1 0.2127 0.819362 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1355723 1 0.1471 0.820612 0.952 0.000 0.024 0.004 0.020
#> SRR1329744 1 0.1012 0.819065 0.968 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR657384 1 0.0727 0.823070 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1351190 1 0.1484 0.830749 0.944 0.000 0.008 0.000 0.048
#> SRR1458662 4 0.2280 0.809329 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR818573 1 0.1153 0.829434 0.964 0.000 0.008 0.004 0.024
#> SRR1396017 1 0.1364 0.817177 0.952 0.000 0.036 0.000 0.012
#> SRR1410742 1 0.1195 0.830459 0.960 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR1435963 1 0.0290 0.823064 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1382416 1 0.2144 0.796298 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1391354 3 0.3661 0.660004 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR1087968 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1310075 1 0.1205 0.813157 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1312244 1 0.0727 0.823070 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1325138 3 0.4088 0.645278 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.4227 0.595161 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1490178 4 0.1478 0.839258 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR655613 1 0.1478 0.827727 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1075707 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1443871 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1102489 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.1914 0.801977 0.924 0.000 0.016 0.000 0.060
#> SRR1414058 1 0.5798 0.454479 0.604 0.000 0.248 0.000 0.148
#> SRR1407449 1 0.1965 0.823817 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1436858 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1479109 1 0.1267 0.829529 0.960 0.000 0.012 0.004 0.024
#> SRR1399069 3 0.5016 0.630914 0.348 0.000 0.608 0.000 0.044
#> SRR1366450 1 0.1243 0.829277 0.960 0.000 0.008 0.004 0.028
#> SRR1396859 1 0.1074 0.820011 0.968 0.000 0.016 0.004 0.012
#> SRR1457176 1 0.2674 0.810042 0.868 0.000 0.012 0.000 0.120
#> SRR1097666 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.6010 0.402109 0.208 0.000 0.584 0.000 0.208
#> SRR1080560 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.1341 0.829409 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1435688 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1327614 1 0.1809 0.802725 0.928 0.000 0.012 0.000 0.060
#> SRR658152 1 0.4644 0.056638 0.604 0.000 0.380 0.004 0.012
#> SRR1368141 1 0.6178 0.018573 0.484 0.000 0.376 0.000 0.140
#> SRR1440268 1 0.1648 0.810451 0.940 0.000 0.020 0.000 0.040
#> SRR1453725 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR1325711 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1477930 1 0.1430 0.828496 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1477591 1 0.1043 0.829421 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1416049 4 0.3424 0.687741 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR656275 1 0.3146 0.802897 0.844 0.000 0.028 0.000 0.128
#> SRR1369052 1 0.1043 0.829950 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1377735 1 0.0771 0.830958 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1331244 1 0.4448 -0.378857 0.516 0.000 0.480 0.000 0.004
#> SRR1404531 1 0.2012 0.803576 0.920 0.000 0.020 0.000 0.060
#> SRR1324331 3 0.5546 0.576499 0.340 0.000 0.576 0.000 0.084
#> SRR1458890 1 0.6059 -0.164945 0.468 0.000 0.412 0.000 0.120
#> SRR1432695 4 0.0963 0.844632 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1407624 4 0.0609 0.841816 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1431969 1 0.5841 0.438293 0.596 0.000 0.256 0.000 0.148
#> SRR1087393 2 0.1341 0.920171 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1077263 3 0.4278 0.558261 0.452 0.000 0.548 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.2074 0.820654 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR655241 1 0.0613 0.822844 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR656922 1 0.2020 0.821847 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1361630 3 0.3932 0.666711 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.4192 0.289313 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1407087 1 0.5049 0.653381 0.704 0.000 0.148 0.000 0.148
#> SRR603212 1 0.1270 0.830592 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1321088 4 0.1043 0.844525 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1485190 1 0.6100 0.269982 0.540 0.000 0.308 0.000 0.152
#> SRR1332232 4 0.3210 0.726889 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1312645 1 0.1117 0.819692 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1457835 1 0.2624 0.814563 0.872 0.000 0.012 0.000 0.116
#> SRR1347123 1 0.5841 0.438293 0.596 0.000 0.256 0.000 0.148
#> SRR1465501 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.6588 0.300643 0.392 0.000 0.400 0.000 0.208
#> SRR1445064 1 0.5414 0.505889 0.656 0.000 0.240 0.004 0.100
#> SRR1452981 1 0.0833 0.821616 0.976 0.000 0.016 0.004 0.004
#> SRR1326708 1 0.1768 0.817481 0.924 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR1407157 1 0.1430 0.810947 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1365401 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1397697 4 0.3305 0.709439 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR1477316 1 0.1356 0.817197 0.956 0.000 0.028 0.004 0.012
#> SRR1077898 1 0.4138 -0.027594 0.616 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR1349080 3 0.4854 0.631217 0.308 0.000 0.648 0.000 0.044
#> SRR1076096 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR811261 2 0.0162 0.926545 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375485 1 0.2513 0.813988 0.876 0.000 0.008 0.000 0.116
#> SRR1432563 4 0.0703 0.842895 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR604414 1 0.0865 0.829361 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1380614 1 0.4880 0.309509 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR812060 1 0.2953 0.802248 0.844 0.000 0.012 0.000 0.144
#> SRR602082 1 0.1591 0.809800 0.940 0.000 0.004 0.004 0.052
#> SRR1069490 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.3305 0.752514 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR661613 1 0.1787 0.831289 0.936 0.000 0.016 0.004 0.044
#> SRR1420710 1 0.2881 0.743293 0.860 0.000 0.124 0.004 0.012
#> SRR660426 1 0.1908 0.827695 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1416003 1 0.3339 0.800172 0.840 0.000 0.048 0.000 0.112
#> SRR661064 1 0.1173 0.819396 0.964 0.000 0.020 0.004 0.012
#> SRR1082011 2 0.1851 0.904735 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1452718 1 0.1943 0.803038 0.924 0.000 0.020 0.000 0.056
#> SRR1353243 1 0.1270 0.831385 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1455482 1 0.1628 0.807114 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR1313473 1 0.1502 0.808923 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1399394 1 0.2674 0.810042 0.868 0.000 0.012 0.000 0.120
#> SRR1102467 1 0.0566 0.823348 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1317470 3 0.3752 0.664594 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.5911 -0.119393 0.488 0.000 0.408 0.000 0.104
#> SRR1408752 4 0.3661 0.640762 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1474617 5 0.4425 0.766161 0.000 0.000 0.392 0.008 0.600
#> SRR1398013 1 0.3170 0.737128 0.848 0.000 0.124 0.004 0.024
#> SRR1352918 3 0.1484 0.310589 0.048 0.000 0.944 0.000 0.008
#> SRR1420750 1 0.2674 0.810042 0.868 0.000 0.012 0.000 0.120
#> SRR1071785 1 0.5882 0.416967 0.588 0.000 0.264 0.000 0.148
#> SRR1353618 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1082217 4 0.3203 0.827801 0.000 0.012 0.000 0.820 0.168
#> SRR1357256 4 0.0880 0.844295 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1490313 1 0.2416 0.819987 0.888 0.000 0.012 0.000 0.100
#> SRR1366560 1 0.0955 0.820250 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1355684 1 0.1124 0.814778 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1323289 3 0.3895 -0.423046 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1313494 1 0.1041 0.829444 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1309985 1 0.1605 0.807906 0.944 0.000 0.040 0.004 0.012
#> SRR607911 1 0.1628 0.807024 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR1333789 1 0.2037 0.830285 0.920 0.000 0.012 0.004 0.064
#> SRR1400078 1 0.2929 0.738840 0.856 0.000 0.128 0.004 0.012
#> SRR1088631 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615575 1 0.3106 0.801919 0.844 0.000 0.024 0.000 0.132
#> SRR1079434 3 0.2305 0.415367 0.092 0.000 0.896 0.000 0.012
#> SRR1325559 1 0.2358 0.818583 0.888 0.000 0.008 0.000 0.104
#> SRR1446695 3 0.3983 0.662572 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.1943 0.803038 0.924 0.000 0.020 0.000 0.056
#> SRR1396100 3 0.1408 0.299261 0.044 0.000 0.948 0.000 0.008
#> SRR1475697 1 0.4170 0.465860 0.712 0.000 0.272 0.004 0.012
#> SRR1488067 2 0.2020 0.889111 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1102103 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1105154 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.1270 0.920805 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1410380 3 0.3913 0.667153 0.324 0.000 0.676 0.000 0.000
#> SRR1445490 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1454671 4 0.1478 0.842238 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1435044 1 0.1074 0.825816 0.968 0.000 0.016 0.004 0.012
#> SRR1485812 3 0.4653 0.417904 0.472 0.000 0.516 0.000 0.012
#> SRR1078020 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1311153 1 0.1970 0.806679 0.924 0.000 0.012 0.004 0.060
#> SRR1376406 4 0.2561 0.792714 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1343898 3 0.3796 -0.397642 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR807775 3 0.5480 0.601343 0.288 0.000 0.616 0.000 0.096
#> SRR1409215 2 0.1544 0.916237 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR820427 3 0.1638 0.351973 0.064 0.000 0.932 0.000 0.004
#> SRR1100656 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.1502 0.808923 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1414536 3 0.3508 0.645624 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR656794 1 0.4182 -0.088311 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.1670 0.807157 0.936 0.000 0.012 0.000 0.052
#> SRR1317685 3 0.3462 0.597804 0.196 0.000 0.792 0.000 0.012
#> SRR1485912 1 0.2177 0.828186 0.908 0.000 0.008 0.004 0.080
#> SRR1407602 3 0.2411 0.021118 0.008 0.000 0.884 0.000 0.108
#> SRR1356164 5 0.6536 -0.185408 0.396 0.000 0.196 0.000 0.408
#> SRR1328692 1 0.2863 0.815692 0.876 0.000 0.060 0.000 0.064
#> SRR1362438 1 0.1461 0.817839 0.952 0.000 0.016 0.004 0.028
#> SRR1479216 1 0.6186 -0.138543 0.452 0.000 0.412 0.000 0.136
#> SRR1358041 1 0.0510 0.828791 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1468766 1 0.2864 0.804805 0.852 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR1368200 1 0.2237 0.828327 0.904 0.000 0.008 0.004 0.084
#> SRR1435602 4 0.3966 0.534214 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1501043 3 0.3796 -0.397642 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1437256 1 0.5657 0.457320 0.616 0.000 0.256 0.000 0.128
#> SRR1487446 1 0.1173 0.819287 0.964 0.000 0.020 0.004 0.012
#> SRR816653 1 0.1851 0.825511 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR815164 1 0.4387 0.097118 0.652 0.000 0.336 0.004 0.008
#> SRR1442043 1 0.2228 0.790047 0.908 0.000 0.076 0.004 0.012
#> SRR1410573 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1096782 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1352369 1 0.2727 0.814884 0.868 0.000 0.016 0.000 0.116
#> SRR1382934 3 0.6971 0.457906 0.288 0.000 0.412 0.008 0.292
#> SRR1465208 1 0.1121 0.830212 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1314728 1 0.0912 0.825357 0.972 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1470291 1 0.1502 0.808923 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1308756 1 0.5460 0.571884 0.656 0.000 0.196 0.000 0.148
#> SRR1409600 1 0.1173 0.825577 0.964 0.000 0.020 0.004 0.012
#> SRR816123 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614779 3 0.3913 0.667153 0.324 0.000 0.676 0.000 0.000
#> SRR810783 1 0.2624 0.811920 0.872 0.000 0.012 0.000 0.116
#> SRR1333990 1 0.1469 0.810729 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1410356 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR808106 3 0.5240 0.540946 0.216 0.000 0.672 0.000 0.112
#> SRR662713 1 0.2563 0.818239 0.872 0.000 0.008 0.000 0.120
#> SRR1447058 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1480964 1 0.2818 0.804436 0.856 0.000 0.012 0.000 0.132
#> SRR809382 1 0.6338 -0.141040 0.448 0.000 0.392 0.000 0.160
#> SRR665417 1 0.1725 0.810705 0.936 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR1088016 4 0.0794 0.843773 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.1410 0.919072 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1077781 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR615623 3 0.6545 0.501474 0.316 0.000 0.464 0.000 0.220
#> SRR1413787 3 0.4495 0.634827 0.244 0.000 0.712 0.000 0.044
#> SRR1478207 1 0.5049 0.653747 0.704 0.000 0.148 0.000 0.148
#> SRR1411046 1 0.1124 0.814778 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1313711 4 0.1478 0.840398 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1326560 1 0.1568 0.810157 0.944 0.000 0.020 0.000 0.036
#> SRR1309051 1 0.1892 0.820485 0.916 0.000 0.004 0.000 0.080
#> SRR1486949 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1395616 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1074956 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817210 1 0.2886 0.816722 0.864 0.000 0.016 0.004 0.116
#> SRR1319221 5 0.4425 0.766161 0.000 0.000 0.392 0.008 0.600
#> SRR1405413 1 0.1628 0.830257 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR607807 1 0.5639 0.009321 0.524 0.000 0.080 0.000 0.396
#> SRR1390160 1 0.5841 0.438293 0.596 0.000 0.256 0.000 0.148
#> SRR1406283 1 0.2127 0.821473 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1357709 1 0.1173 0.819396 0.964 0.000 0.020 0.004 0.012
#> SRR1080742 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.1845 0.804046 0.928 0.000 0.016 0.000 0.056
#> SRR1312766 1 0.2864 0.803658 0.852 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR1361612 1 0.0727 0.823070 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1311224 1 0.2624 0.814563 0.872 0.000 0.012 0.000 0.116
#> SRR1087801 1 0.2677 0.817086 0.872 0.000 0.016 0.000 0.112
#> SRR1099720 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1357127 1 0.3146 0.802808 0.844 0.000 0.028 0.000 0.128
#> SRR1074980 4 0.0510 0.840506 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1317022 3 0.6707 0.360403 0.368 0.000 0.388 0.000 0.244
#> SRR1332879 1 0.2574 0.816443 0.876 0.000 0.012 0.000 0.112
#> SRR1403177 5 0.4425 0.766161 0.000 0.000 0.392 0.008 0.600
#> SRR1076144 4 0.3796 0.599664 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0290 0.926364 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1485678 1 0.4126 -0.018802 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1092232 3 0.5459 0.615640 0.236 0.000 0.644 0.000 0.120
#> SRR1344253 3 0.4473 0.599674 0.412 0.000 0.580 0.000 0.008
#> SRR1384290 1 0.1502 0.808923 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1089349 1 0.2304 0.797240 0.908 0.000 0.068 0.004 0.020
#> SRR1343522 4 0.2852 0.770844 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1326727 2 0.2329 0.875313 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1440940 1 0.4217 0.439981 0.704 0.000 0.280 0.004 0.012
#> SRR818372 1 0.1525 0.821036 0.948 0.000 0.036 0.004 0.012
#> SRR1323675 4 0.0880 0.844295 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR819894 3 0.1502 0.329173 0.056 0.000 0.940 0.000 0.004
#> SRR1310031 1 0.5841 0.438293 0.596 0.000 0.256 0.000 0.148
#> SRR615419 1 0.4675 -0.255065 0.544 0.000 0.444 0.004 0.008
#> SRR1436925 1 0.2074 0.820654 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1477238 1 0.1845 0.804046 0.928 0.000 0.016 0.000 0.056
#> SRR1332566 1 0.0566 0.823348 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1490228 1 0.4637 0.702051 0.744 0.000 0.128 0.000 0.128
#> SRR1442949 3 0.2583 0.489518 0.132 0.000 0.864 0.000 0.004
#> SRR1466239 1 0.1124 0.814778 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1094003 2 0.1671 0.912492 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1329971 1 0.0727 0.824464 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR813076 4 0.1121 0.844219 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1097642 2 0.1544 0.916182 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1322981 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR1485976 4 0.2648 0.786181 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1471713 1 0.6120 0.337474 0.556 0.000 0.268 0.000 0.176
#> SRR660522 1 0.3953 0.769704 0.792 0.000 0.060 0.000 0.148
#> SRR815374 1 0.0854 0.822694 0.976 0.000 0.008 0.004 0.012
#> SRR1069564 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.3932 0.666607 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1316438 3 0.4428 -0.225252 0.032 0.000 0.700 0.000 0.268
#> SRR1386844 1 0.1444 0.809156 0.948 0.000 0.012 0.000 0.040
#> SRR1373718 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1447458 4 0.1121 0.844407 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1487128 1 0.0510 0.824585 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1441421 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1069919 4 0.1732 0.832480 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1460296 1 0.1638 0.831614 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1335489 1 0.1648 0.812545 0.940 0.000 0.020 0.000 0.040
#> SRR1393404 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1081425 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1401815 3 0.6661 0.391169 0.356 0.000 0.412 0.000 0.232
#> SRR1071337 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1071983 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1331793 4 0.0794 0.843773 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1410510 1 0.6243 -0.020286 0.472 0.000 0.380 0.000 0.148
#> SRR1098761 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0404 0.823408 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR615395 1 0.2909 0.806181 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR1479349 1 0.0880 0.829654 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2165033 1 0.3134 0.801876 0.848 0.000 0.032 0.000 0.120
#> SRR1089054 2 0.3796 0.575274 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR816201 1 0.1901 0.811673 0.928 0.000 0.056 0.004 0.012
#> SRR1488514 4 0.2891 0.766840 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR655840 1 0.2407 0.780291 0.896 0.000 0.088 0.004 0.012
#> SRR1379303 1 0.1041 0.818417 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1418516 3 0.1484 0.310589 0.048 0.000 0.944 0.000 0.008
#> SRR613174 1 0.2771 0.808999 0.860 0.000 0.012 0.000 0.128
#> SRR1351125 1 0.2997 0.801402 0.840 0.000 0.012 0.000 0.148
#> SRR659157 3 0.4738 0.587085 0.420 0.000 0.564 0.004 0.012
#> SRR1480408 1 0.2068 0.824620 0.904 0.000 0.004 0.000 0.092
#> SRR657857 1 0.1074 0.821027 0.968 0.000 0.016 0.004 0.012
#> SRR1073317 4 0.1410 0.840602 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1332526 1 0.1410 0.829946 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1094168 2 0.0963 0.914056 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1431270 3 0.4118 0.662900 0.336 0.000 0.660 0.000 0.004
#> SRR1085614 2 0.2280 0.870679 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1330106 1 0.4548 0.714150 0.752 0.000 0.120 0.000 0.128
#> SRR1466154 1 0.1571 0.814082 0.936 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR1396944 1 0.1943 0.803038 0.924 0.000 0.020 0.000 0.056
#> SRR1082784 4 0.0703 0.842895 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1457267 1 0.1628 0.807024 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR614659 1 0.2522 0.816981 0.880 0.000 0.012 0.000 0.108
#> SRR659247 1 0.2723 0.811119 0.864 0.000 0.012 0.000 0.124
#> SRR1317201 1 0.0404 0.823408 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473696 1 0.2624 0.814563 0.872 0.000 0.012 0.000 0.116
#> SRR1375842 1 0.1502 0.808923 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1388123 4 0.2966 0.759197 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.2020 0.821847 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1345499 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1353499 1 0.0963 0.820323 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1416693 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1070841 1 0.2771 0.808999 0.860 0.000 0.012 0.000 0.128
#> SRR1380910 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1333125 4 0.3274 0.715305 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1498183 1 0.2674 0.810042 0.868 0.000 0.012 0.000 0.120
#> SRR612659 1 0.5752 0.473350 0.612 0.000 0.240 0.000 0.148
#> SRR1447148 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR658597 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1074263 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1376786 1 0.2818 0.807278 0.856 0.000 0.012 0.000 0.132
#> SRR1345995 1 0.2522 0.818717 0.880 0.000 0.012 0.000 0.108
#> SRR1071035 1 0.1851 0.827190 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1068808 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR662438 1 0.1502 0.808923 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1335355 1 0.1502 0.808923 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR659448 1 0.3370 0.792572 0.824 0.000 0.028 0.000 0.148
#> SRR1323558 3 0.5831 0.409129 0.408 0.000 0.496 0.000 0.096
#> SRR1381711 3 0.3612 0.657148 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR657985 3 0.3932 0.666149 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.1800 0.811092 0.932 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR1336505 1 0.3932 0.767898 0.796 0.000 0.064 0.000 0.140
#> SRR1474095 1 0.2674 0.810042 0.868 0.000 0.012 0.000 0.120
#> SRR1363831 4 0.1792 0.830775 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1442376 1 0.4666 -0.005099 0.596 0.000 0.388 0.004 0.012
#> SRR1074909 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.2771 0.808689 0.860 0.000 0.012 0.000 0.128
#> SRR1075408 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1367150 3 0.1704 0.359634 0.068 0.000 0.928 0.000 0.004
#> SRR1313406 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1068880 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1467277 3 0.3684 0.663772 0.280 0.000 0.720 0.000 0.000
#> SRR1084867 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1095431 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 4 0.1197 0.843621 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1443113 1 0.2574 0.813726 0.876 0.000 0.012 0.000 0.112
#> SRR1380414 3 0.4437 0.522188 0.464 0.000 0.532 0.000 0.004
#> SRR1315912 1 0.1285 0.821426 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1075778 4 0.2020 0.822107 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1421116 2 0.2605 0.835007 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR602282 3 0.5150 -0.507742 0.032 0.000 0.588 0.008 0.372
#> SRR1361195 4 0.2929 0.763169 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR600493 1 0.2513 0.813988 0.876 0.000 0.008 0.000 0.116
#> SRR1477653 1 0.2864 0.803658 0.852 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR1355475 1 0.3370 0.792572 0.824 0.000 0.028 0.000 0.148
#> SRR1360785 3 0.2813 0.552816 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR810437 1 0.4845 0.673862 0.724 0.000 0.148 0.000 0.128
#> SRR1361860 1 0.1356 0.817197 0.956 0.000 0.028 0.004 0.012
#> SRR1441311 4 0.0963 0.844632 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1098903 3 0.4030 0.654664 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0854 0.822789 0.976 0.000 0.008 0.004 0.012
#> SRR1498529 1 0.1121 0.830131 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1097172 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1074017 2 0.1410 0.919072 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1472033 2 0.2127 0.883456 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1445087 1 0.6238 -0.000733 0.476 0.000 0.376 0.000 0.148
#> SRR1399525 2 0.4278 0.092207 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0609 0.925489 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1476056 1 0.1106 0.819299 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR1075659 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.5854 0.440400 0.596 0.000 0.252 0.000 0.152
#> SRR1353353 3 0.6740 0.457943 0.236 0.000 0.484 0.008 0.272
#> SRR1073291 1 0.3710 0.779033 0.808 0.000 0.048 0.000 0.144
#> SRR1356227 1 0.0613 0.823250 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1080720 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.1300 0.249159 0.028 0.000 0.956 0.000 0.016
#> SRR663002 1 0.5490 0.566518 0.652 0.000 0.200 0.000 0.148
#> SRR1376983 4 0.1341 0.842210 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1399926 1 0.1331 0.811368 0.952 0.000 0.008 0.000 0.040
#> SRR1347144 1 0.5841 0.438293 0.596 0.000 0.256 0.000 0.148
#> SRR1384006 1 0.1124 0.814778 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1499108 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614047 1 0.2452 0.826814 0.896 0.000 0.016 0.004 0.084
#> SRR818440 1 0.3400 0.793977 0.828 0.000 0.036 0.000 0.136
#> SRR1337770 1 0.1478 0.830399 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1399413 1 0.2629 0.821237 0.880 0.000 0.012 0.004 0.104
#> SRR1385542 4 0.1043 0.844525 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1473959 1 0.2470 0.818653 0.884 0.000 0.012 0.000 0.104
#> SRR1074041 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR1394495 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR659460 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR816699 1 0.2997 0.801402 0.840 0.000 0.012 0.000 0.148
#> SRR1308612 1 0.3846 0.772129 0.800 0.000 0.056 0.000 0.144
#> SRR1499418 3 0.3876 0.667690 0.316 0.000 0.684 0.000 0.000
#> SRR1352894 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR815805 1 0.2079 0.803748 0.916 0.000 0.020 0.000 0.064
#> SRR1331083 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808272 1 0.5752 0.475224 0.612 0.000 0.240 0.000 0.148
#> SRR1436698 1 0.1831 0.830736 0.920 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1095627 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.4262 -0.254625 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1077479 1 0.2012 0.803576 0.920 0.000 0.020 0.000 0.060
#> SRR814491 3 0.1444 0.281119 0.040 0.000 0.948 0.000 0.012
#> SRR1101256 2 0.4171 0.352641 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1436004 1 0.2179 0.819960 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1457994 4 0.4126 0.449803 0.000 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1078998 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1314707 1 0.1251 0.830816 0.956 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR1309534 1 0.4325 0.366254 0.684 0.000 0.300 0.004 0.012
#> SRR615527 3 0.4948 -0.414146 0.024 0.000 0.612 0.008 0.356
#> SRR1098216 1 0.1725 0.810705 0.936 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR1325847 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.2352 0.824986 0.896 0.000 0.008 0.004 0.092
#> SRR1344166 1 0.1121 0.830031 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1368638 3 0.1768 0.368833 0.072 0.000 0.924 0.000 0.004
#> SRR1431429 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1079237 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR815759 3 0.1704 0.359634 0.068 0.000 0.928 0.000 0.004
#> SRR1502143 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR1487614 1 0.6537 -0.277358 0.404 0.000 0.400 0.000 0.196
#> SRR1402307 4 0.1121 0.844219 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR820810 1 0.0960 0.825630 0.972 0.000 0.008 0.004 0.016
#> SRR1099212 4 0.1965 0.824463 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1083215 1 0.2771 0.808689 0.860 0.000 0.012 0.000 0.128
#> SRR1476547 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR656421 3 0.4235 0.576487 0.424 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR1086116 4 0.1197 0.843621 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1499917 1 0.2393 0.793453 0.900 0.000 0.080 0.004 0.016
#> SRR1339944 2 0.3983 0.487225 0.000 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1391444 4 0.3074 0.747512 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1434889 1 0.1956 0.829844 0.916 0.000 0.008 0.000 0.076
#> SRR1431847 3 0.3661 0.661633 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.2411 0.822202 0.884 0.000 0.008 0.000 0.108
#> SRR1477405 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR655289 3 0.4306 0.479100 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.4702 0.631872 0.732 0.000 0.192 0.004 0.072
#> SRR1084790 1 0.4182 -0.107819 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.2775 0.819834 0.876 0.000 0.020 0.004 0.100
#> SRR1332588 3 0.1571 0.340180 0.060 0.000 0.936 0.000 0.004
#> SRR1471157 4 0.0794 0.843773 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR654945 1 0.3011 0.801283 0.844 0.000 0.016 0.000 0.140
#> SRR661028 1 0.1341 0.830944 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1413477 2 0.2020 0.893545 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1101152 1 0.0968 0.824761 0.972 0.000 0.012 0.004 0.012
#> SRR1358435 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.1628 0.807024 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR1379014 1 0.0771 0.820242 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1489904 1 0.5704 0.497403 0.620 0.000 0.232 0.000 0.148
#> SRR1416386 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0727 0.823070 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR606982 3 0.3913 0.666253 0.324 0.000 0.676 0.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.1740 0.804712 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1312934 1 0.1862 0.830683 0.932 0.000 0.016 0.004 0.048
#> SRR655194 1 0.2522 0.815306 0.880 0.000 0.012 0.000 0.108
#> SRR1331174 2 0.4242 0.284727 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1473251 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1389820 5 0.4425 0.766161 0.000 0.000 0.392 0.008 0.600
#> SRR1074289 1 0.2329 0.815844 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1348816 2 0.1478 0.918155 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1076292 1 0.5580 0.507251 0.632 0.000 0.236 0.000 0.132
#> SRR1395810 4 0.0963 0.844903 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1498909 1 0.4501 0.718495 0.756 0.000 0.116 0.000 0.128
#> SRR1443507 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR1452310 1 0.3485 0.790562 0.828 0.000 0.048 0.000 0.124
#> SRR665610 3 0.4480 0.621443 0.400 0.000 0.592 0.004 0.004
#> SRR1347322 1 0.1341 0.828433 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR813395 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0963 0.823041 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1470230 3 0.3876 0.667592 0.316 0.000 0.684 0.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.1892 0.820485 0.916 0.000 0.004 0.000 0.080
#> SRR1082640 4 0.3530 0.822988 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1487592 1 0.2997 0.801402 0.840 0.000 0.012 0.000 0.148
#> SRR1352299 1 0.2624 0.814563 0.872 0.000 0.012 0.000 0.116
#> SRR1076317 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.3196 0.586882 0.804 0.000 0.192 0.000 0.004
#> SRR1075273 2 0.0963 0.923637 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR658657 3 0.3932 0.666711 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.3210 0.740508 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1365332 1 0.2909 0.802501 0.848 0.000 0.012 0.000 0.140
#> SRR615958 1 0.3060 0.804914 0.848 0.000 0.024 0.000 0.128
#> SRR1097688 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.3586 0.656975 0.264 0.000 0.736 0.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.3639 0.781630 0.812 0.000 0.044 0.000 0.144
#> SRR1464856 2 0.1410 0.919072 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1347298 1 0.6377 -0.098670 0.452 0.000 0.380 0.000 0.168
#> SRR1075923 2 0.0000 0.926691 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.2723 0.811843 0.864 0.000 0.012 0.000 0.124
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 1 0.3483 0.6805 0.748 0.000 0.236 0.000 0.016 0.000
#> SRR1436370 6 0.1327 0.9179 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1075752 6 0.0713 0.9216 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1397949 1 0.4135 0.1725 0.584 0.000 0.404 0.008 0.004 0.000
#> SRR1355723 1 0.3380 0.7237 0.828 0.004 0.120 0.012 0.036 0.000
#> SRR1329744 1 0.3308 0.7248 0.832 0.004 0.120 0.012 0.032 0.000
#> SRR657384 1 0.3404 0.6881 0.760 0.000 0.224 0.000 0.016 0.000
#> SRR1351190 1 0.4284 0.3721 0.588 0.000 0.392 0.004 0.016 0.000
#> SRR1458662 2 0.1863 0.6907 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR818573 1 0.3844 0.5810 0.676 0.000 0.312 0.004 0.008 0.000
#> SRR1396017 1 0.4348 0.6715 0.736 0.004 0.192 0.012 0.056 0.000
#> SRR1410742 1 0.3710 0.6543 0.696 0.000 0.292 0.000 0.012 0.000
#> SRR1435963 1 0.2565 0.7290 0.872 0.000 0.104 0.016 0.008 0.000
#> SRR1382416 1 0.3461 0.7250 0.836 0.004 0.092 0.040 0.028 0.000
#> SRR1391354 5 0.6252 0.5318 0.232 0.000 0.204 0.036 0.528 0.000
#> SRR1087968 2 0.4293 0.6445 0.000 0.536 0.000 0.012 0.448 0.004
#> SRR1310075 1 0.1503 0.7255 0.944 0.000 0.032 0.016 0.008 0.000
#> SRR1312244 1 0.3499 0.7020 0.780 0.004 0.196 0.012 0.008 0.000
#> SRR1325138 1 0.6180 -0.2498 0.408 0.000 0.224 0.008 0.360 0.000
#> SRR1326821 5 0.5990 0.4203 0.344 0.000 0.204 0.004 0.448 0.000
#> SRR1490178 2 0.1204 0.7132 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR655613 1 0.2877 0.6968 0.820 0.000 0.168 0.012 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1443871 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1102489 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.1852 0.7100 0.928 0.004 0.024 0.040 0.004 0.000
#> SRR1414058 3 0.2412 0.6744 0.092 0.000 0.880 0.000 0.028 0.000
#> SRR1407449 1 0.4209 0.1931 0.588 0.000 0.396 0.012 0.004 0.000
#> SRR1436858 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1479109 1 0.4293 0.2254 0.536 0.000 0.448 0.012 0.004 0.000
#> SRR1399069 5 0.6216 0.4963 0.276 0.000 0.188 0.028 0.508 0.000
#> SRR1366450 1 0.3398 0.6949 0.768 0.004 0.216 0.012 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.3156 0.7132 0.800 0.000 0.180 0.000 0.020 0.000
#> SRR1457176 3 0.3911 0.5365 0.368 0.000 0.624 0.008 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 5 0.6766 0.4579 0.164 0.000 0.124 0.192 0.520 0.000
#> SRR1080560 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.3133 0.6520 0.780 0.000 0.212 0.008 0.000 0.000
#> SRR1435688 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1327614 1 0.2121 0.7087 0.916 0.004 0.032 0.040 0.008 0.000
#> SRR658152 3 0.6008 -0.0387 0.392 0.004 0.452 0.012 0.140 0.000
#> SRR1368141 3 0.2954 0.5168 0.048 0.000 0.844 0.000 0.108 0.000
#> SRR1440268 1 0.3091 0.7111 0.856 0.004 0.084 0.012 0.044 0.000
#> SRR1453725 3 0.3575 0.6374 0.284 0.000 0.708 0.008 0.000 0.000
#> SRR1325711 6 0.1204 0.9220 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1477930 1 0.2615 0.7033 0.852 0.000 0.136 0.008 0.004 0.000
#> SRR1477591 1 0.2743 0.6987 0.828 0.000 0.164 0.008 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.2912 0.6146 0.000 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR656275 3 0.2915 0.6845 0.184 0.000 0.808 0.000 0.008 0.000
#> SRR1369052 1 0.3512 0.6074 0.740 0.000 0.248 0.008 0.004 0.000
#> SRR1377735 1 0.3276 0.6866 0.764 0.004 0.228 0.004 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.5452 -0.1793 0.444 0.000 0.120 0.000 0.436 0.000
#> SRR1404531 1 0.2382 0.7164 0.896 0.004 0.072 0.020 0.008 0.000
#> SRR1324331 5 0.6428 0.3991 0.344 0.000 0.120 0.064 0.472 0.000
#> SRR1458890 3 0.5084 0.1035 0.076 0.000 0.660 0.028 0.236 0.000
#> SRR1432695 2 0.0547 0.7159 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1407624 2 0.1036 0.7133 0.000 0.964 0.000 0.004 0.024 0.008
#> SRR1431969 3 0.1984 0.6380 0.056 0.000 0.912 0.000 0.032 0.000
#> SRR1087393 6 0.0937 0.9274 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1077263 5 0.5962 0.4372 0.328 0.000 0.204 0.004 0.464 0.000
#> SRR1385211 1 0.4151 0.1691 0.576 0.000 0.412 0.008 0.004 0.000
#> SRR655241 1 0.2361 0.7341 0.880 0.000 0.104 0.004 0.012 0.000
#> SRR656922 1 0.4127 0.1810 0.588 0.000 0.400 0.008 0.004 0.000
#> SRR1361630 5 0.5457 0.5916 0.092 0.000 0.368 0.012 0.528 0.000
#> SRR1318966 6 0.3482 0.5318 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR1407087 3 0.2146 0.6997 0.116 0.000 0.880 0.000 0.004 0.000
#> SRR603212 1 0.3684 0.4849 0.664 0.000 0.332 0.004 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.1007 0.7163 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1485190 3 0.1863 0.6167 0.044 0.000 0.920 0.000 0.036 0.000
#> SRR1332232 2 0.2730 0.6208 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1312645 1 0.3967 0.6834 0.748 0.004 0.212 0.012 0.024 0.000
#> SRR1457835 3 0.4032 0.3903 0.420 0.000 0.572 0.008 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.2106 0.6438 0.064 0.000 0.904 0.000 0.032 0.000
#> SRR1465501 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 3 0.2716 0.4808 0.028 0.000 0.868 0.008 0.096 0.000
#> SRR1445064 3 0.3800 0.5846 0.168 0.000 0.776 0.008 0.048 0.000
#> SRR1452981 1 0.3168 0.7097 0.792 0.000 0.192 0.000 0.016 0.000
#> SRR1326708 1 0.2527 0.7120 0.868 0.000 0.108 0.024 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.2288 0.7253 0.876 0.000 0.116 0.004 0.004 0.000
#> SRR1365401 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1397697 2 0.2854 0.6063 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1477316 1 0.4096 0.6771 0.748 0.004 0.200 0.012 0.036 0.000
#> SRR1077898 1 0.4887 0.4166 0.612 0.000 0.088 0.000 0.300 0.000
#> SRR1349080 5 0.6291 0.5163 0.240 0.000 0.184 0.044 0.532 0.000
#> SRR1076096 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR811261 6 0.0260 0.9309 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1375485 3 0.4220 0.2618 0.468 0.000 0.520 0.008 0.004 0.000
#> SRR1432563 2 0.1367 0.7144 0.000 0.944 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR604414 1 0.3043 0.7010 0.796 0.000 0.196 0.004 0.004 0.000
#> SRR1380614 1 0.5348 0.5943 0.664 0.004 0.116 0.188 0.028 0.000
#> SRR812060 3 0.2912 0.6879 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0858 0.7286 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069490 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 6 0.3221 0.6852 0.000 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR661613 1 0.4732 0.2918 0.548 0.004 0.416 0.012 0.020 0.000
#> SRR1420710 1 0.4688 0.2996 0.536 0.000 0.428 0.012 0.024 0.000
#> SRR660426 1 0.3468 0.5747 0.728 0.000 0.264 0.008 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.3201 0.6934 0.208 0.000 0.780 0.000 0.012 0.000
#> SRR661064 1 0.3221 0.7116 0.792 0.000 0.188 0.000 0.020 0.000
#> SRR1082011 6 0.1714 0.8985 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1452718 1 0.3255 0.7265 0.852 0.004 0.076 0.040 0.028 0.000
#> SRR1353243 1 0.3217 0.6372 0.768 0.000 0.224 0.008 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.1405 0.7229 0.948 0.000 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1313473 1 0.1845 0.7297 0.920 0.000 0.052 0.028 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.3993 0.4484 0.400 0.000 0.592 0.008 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.2668 0.7215 0.828 0.000 0.168 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317470 5 0.5929 0.6082 0.100 0.000 0.312 0.044 0.544 0.000
#> SRR1337707 3 0.4722 0.1789 0.080 0.000 0.676 0.008 0.236 0.000
#> SRR1408752 2 0.3482 0.4525 0.000 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR1474617 4 0.1500 0.6458 0.000 0.000 0.012 0.936 0.052 0.000
#> SRR1398013 1 0.4328 0.2251 0.520 0.000 0.460 0.000 0.020 0.000
#> SRR1352918 5 0.6067 0.2901 0.036 0.000 0.136 0.296 0.532 0.000
#> SRR1420750 3 0.4072 0.3693 0.448 0.000 0.544 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.2065 0.6291 0.052 0.000 0.912 0.004 0.032 0.000
#> SRR1353618 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1082217 2 0.4450 0.6501 0.000 0.568 0.004 0.016 0.408 0.004
#> SRR1357256 2 0.0713 0.7168 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1490313 3 0.4127 0.3777 0.400 0.000 0.588 0.008 0.004 0.000
#> SRR1366560 1 0.2445 0.7233 0.872 0.000 0.108 0.020 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.2036 0.7350 0.912 0.000 0.064 0.016 0.008 0.000
#> SRR1323289 4 0.4018 0.4874 0.000 0.000 0.020 0.656 0.324 0.000
#> SRR1313494 1 0.3560 0.6510 0.732 0.000 0.256 0.008 0.004 0.000
#> SRR1309985 1 0.3832 0.6838 0.752 0.004 0.216 0.012 0.016 0.000
#> SRR607911 1 0.1232 0.7134 0.956 0.000 0.016 0.024 0.004 0.000
#> SRR1333789 3 0.4080 0.1802 0.456 0.000 0.536 0.000 0.008 0.000
#> SRR1400078 1 0.4312 0.4101 0.584 0.000 0.396 0.008 0.012 0.000
#> SRR1088631 6 0.1141 0.9238 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1092842 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.2558 0.6967 0.156 0.000 0.840 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079434 5 0.6017 0.3184 0.028 0.000 0.148 0.292 0.532 0.000
#> SRR1325559 3 0.4217 0.2271 0.464 0.000 0.524 0.008 0.004 0.000
#> SRR1446695 5 0.5621 0.5852 0.140 0.000 0.344 0.004 0.512 0.000
#> SRR1383883 1 0.2627 0.7100 0.892 0.004 0.044 0.036 0.024 0.000
#> SRR1396100 5 0.5967 0.2703 0.028 0.000 0.136 0.304 0.532 0.000
#> SRR1475697 1 0.5788 0.2547 0.492 0.004 0.380 0.012 0.112 0.000
#> SRR1488067 6 0.1444 0.9080 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1102103 2 0.4424 0.6435 0.000 0.532 0.004 0.012 0.448 0.004
#> SRR1105154 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 6 0.0865 0.9279 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1410380 5 0.5165 0.5602 0.068 0.000 0.396 0.008 0.528 0.000
#> SRR1445490 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1454671 2 0.1501 0.7101 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1435044 1 0.4150 0.3510 0.592 0.000 0.392 0.000 0.016 0.000
#> SRR1485812 3 0.6299 -0.5200 0.164 0.000 0.416 0.028 0.392 0.000
#> SRR1078020 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1311153 1 0.2417 0.7266 0.888 0.004 0.088 0.012 0.008 0.000
#> SRR1376406 2 0.2219 0.6698 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1343898 4 0.5526 0.3869 0.000 0.000 0.152 0.524 0.324 0.000
#> SRR807775 3 0.4907 -0.3929 0.040 0.000 0.544 0.012 0.404 0.000
#> SRR1409215 6 0.1204 0.9224 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR820427 5 0.6052 0.3152 0.032 0.000 0.144 0.292 0.532 0.000
#> SRR1100656 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.1801 0.7331 0.924 0.000 0.056 0.016 0.004 0.000
#> SRR1414536 5 0.6196 0.5959 0.092 0.000 0.284 0.080 0.544 0.000
#> SRR656794 1 0.5492 0.3645 0.572 0.000 0.132 0.008 0.288 0.000
#> SRR604653 1 0.2034 0.7133 0.912 0.000 0.060 0.024 0.004 0.000
#> SRR1317685 5 0.6158 0.5320 0.044 0.000 0.280 0.140 0.536 0.000
#> SRR1485912 3 0.4118 0.4105 0.396 0.000 0.592 0.004 0.008 0.000
#> SRR1407602 5 0.5477 -0.0921 0.008 0.000 0.096 0.420 0.476 0.000
#> SRR1356164 4 0.6249 0.2903 0.188 0.004 0.116 0.596 0.096 0.000
#> SRR1328692 3 0.5254 0.3285 0.376 0.004 0.548 0.012 0.060 0.000
#> SRR1362438 1 0.2853 0.7312 0.856 0.004 0.116 0.012 0.012 0.000
#> SRR1479216 3 0.3508 0.5065 0.060 0.000 0.828 0.024 0.088 0.000
#> SRR1358041 1 0.3194 0.7035 0.808 0.000 0.168 0.020 0.004 0.000
#> SRR1468766 3 0.3756 0.5458 0.352 0.000 0.644 0.004 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.4672 0.2490 0.548 0.000 0.416 0.024 0.012 0.000
#> SRR1435602 2 0.3620 0.3807 0.000 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1501043 4 0.5469 0.4043 0.000 0.000 0.144 0.532 0.324 0.000
#> SRR1437256 3 0.3159 0.6150 0.084 0.000 0.840 0.004 0.072 0.000
#> SRR1487446 1 0.3748 0.6823 0.756 0.000 0.212 0.012 0.020 0.000
#> SRR816653 1 0.3945 0.3107 0.612 0.000 0.380 0.008 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.5136 0.6013 0.672 0.004 0.172 0.012 0.140 0.000
#> SRR1442043 1 0.3761 0.6810 0.744 0.000 0.228 0.008 0.020 0.000
#> SRR1410573 1 0.1642 0.7164 0.936 0.000 0.028 0.032 0.004 0.000
#> SRR1096782 6 0.1141 0.9239 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1352369 3 0.4067 0.6128 0.296 0.000 0.680 0.012 0.012 0.000
#> SRR1382934 3 0.5162 0.0461 0.020 0.000 0.668 0.136 0.176 0.000
#> SRR1465208 1 0.3023 0.6853 0.808 0.000 0.180 0.008 0.004 0.000
#> SRR1314728 1 0.3780 0.6723 0.740 0.004 0.236 0.012 0.008 0.000
#> SRR1470291 1 0.1485 0.7127 0.944 0.000 0.028 0.024 0.004 0.000
#> SRR1308756 3 0.2491 0.6969 0.112 0.000 0.868 0.000 0.020 0.000
#> SRR1409600 1 0.4090 0.4184 0.604 0.000 0.384 0.008 0.004 0.000
#> SRR816123 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614779 5 0.5358 0.5809 0.080 0.000 0.380 0.012 0.528 0.000
#> SRR810783 3 0.3521 0.6461 0.268 0.000 0.724 0.004 0.004 0.000
#> SRR1333990 1 0.1332 0.7252 0.952 0.000 0.028 0.012 0.008 0.000
#> SRR1410356 3 0.3360 0.6564 0.264 0.000 0.732 0.004 0.000 0.000
#> SRR808106 5 0.6666 0.4744 0.184 0.000 0.124 0.156 0.536 0.000
#> SRR662713 3 0.3742 0.4909 0.348 0.000 0.648 0.004 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1480964 3 0.2854 0.6936 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000
#> SRR809382 3 0.3453 0.4215 0.040 0.000 0.808 0.008 0.144 0.000
#> SRR665417 1 0.2103 0.7364 0.912 0.000 0.056 0.020 0.012 0.000
#> SRR1088016 2 0.0458 0.7148 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1453166 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 6 0.1007 0.9265 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1077781 6 0.1204 0.9220 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR615623 3 0.3550 0.3414 0.020 0.000 0.800 0.024 0.156 0.000
#> SRR1413787 5 0.5641 0.4555 0.012 0.000 0.392 0.108 0.488 0.000
#> SRR1478207 3 0.2302 0.7009 0.120 0.000 0.872 0.000 0.008 0.000
#> SRR1411046 1 0.1426 0.7271 0.948 0.000 0.016 0.028 0.008 0.000
#> SRR1313711 2 0.1141 0.7151 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1326560 1 0.2954 0.7151 0.868 0.004 0.072 0.016 0.040 0.000
#> SRR1309051 1 0.2501 0.6910 0.872 0.000 0.108 0.016 0.004 0.000
#> SRR1486949 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1395616 1 0.1864 0.7176 0.924 0.004 0.040 0.032 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 6 0.0260 0.9295 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR817210 3 0.3541 0.6312 0.260 0.000 0.728 0.012 0.000 0.000
#> SRR1319221 4 0.1500 0.6458 0.000 0.000 0.012 0.936 0.052 0.000
#> SRR1405413 1 0.4100 0.3705 0.600 0.000 0.388 0.004 0.008 0.000
#> SRR607807 1 0.5256 0.4937 0.636 0.004 0.060 0.268 0.032 0.000
#> SRR1390160 3 0.2307 0.6338 0.068 0.000 0.896 0.004 0.032 0.000
#> SRR1406283 3 0.4397 0.2188 0.452 0.000 0.528 0.012 0.008 0.000
#> SRR1357709 1 0.3748 0.6810 0.748 0.000 0.224 0.012 0.016 0.000
#> SRR1080742 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.1168 0.7228 0.956 0.000 0.016 0.028 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.3126 0.6697 0.248 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.3110 0.7089 0.792 0.000 0.196 0.000 0.012 0.000
#> SRR1311224 1 0.4089 -0.0358 0.524 0.000 0.468 0.008 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.3996 0.4930 0.388 0.000 0.604 0.004 0.004 0.000
#> SRR1099720 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1349250 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1357127 3 0.3133 0.6909 0.212 0.000 0.780 0.000 0.008 0.000
#> SRR1074980 2 0.1615 0.7094 0.000 0.928 0.000 0.004 0.064 0.004
#> SRR1317022 3 0.1991 0.5504 0.024 0.000 0.920 0.012 0.044 0.000
#> SRR1332879 3 0.4093 0.2560 0.476 0.000 0.516 0.008 0.000 0.000
#> SRR1403177 4 0.1333 0.6442 0.000 0.000 0.008 0.944 0.048 0.000
#> SRR1076144 2 0.3547 0.4190 0.000 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1069614 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 6 0.0260 0.9309 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1421069 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.1321 0.7159 0.952 0.000 0.020 0.024 0.004 0.000
#> SRR1485678 1 0.5447 0.4802 0.604 0.000 0.168 0.008 0.220 0.000
#> SRR1092232 3 0.5315 -0.4807 0.012 0.000 0.508 0.072 0.408 0.000
#> SRR1344253 5 0.5775 0.5308 0.208 0.000 0.296 0.000 0.496 0.000
#> SRR1384290 1 0.1889 0.7222 0.920 0.000 0.056 0.020 0.004 0.000
#> SRR1089349 1 0.4591 0.2761 0.544 0.004 0.428 0.012 0.012 0.000
#> SRR1343522 2 0.2340 0.6605 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1326727 6 0.2048 0.8730 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1440940 1 0.5729 0.1612 0.460 0.004 0.424 0.012 0.100 0.000
#> SRR818372 1 0.4744 0.3749 0.576 0.004 0.384 0.012 0.024 0.000
#> SRR1323675 2 0.0547 0.7158 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR819894 5 0.6113 0.3025 0.040 0.000 0.136 0.292 0.532 0.000
#> SRR1310031 3 0.1970 0.6425 0.060 0.000 0.912 0.000 0.028 0.000
#> SRR615419 3 0.6146 -0.4061 0.196 0.000 0.440 0.012 0.352 0.000
#> SRR1436925 1 0.4220 -0.0347 0.520 0.000 0.468 0.008 0.004 0.000
#> SRR1477238 1 0.2394 0.7249 0.900 0.004 0.052 0.036 0.008 0.000
#> SRR1332566 1 0.2442 0.7285 0.852 0.000 0.144 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490228 3 0.2968 0.7021 0.168 0.000 0.816 0.000 0.016 0.000
#> SRR1442949 5 0.6278 0.4247 0.044 0.000 0.188 0.232 0.536 0.000
#> SRR1466239 1 0.1938 0.7324 0.920 0.000 0.052 0.020 0.008 0.000
#> SRR1094003 6 0.1387 0.9158 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1329971 1 0.2902 0.7106 0.800 0.000 0.196 0.000 0.004 0.000
#> SRR813076 2 0.0790 0.7171 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1097642 6 0.1204 0.9228 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1322981 3 0.3101 0.6716 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.2219 0.6695 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1471713 3 0.1938 0.6108 0.040 0.000 0.920 0.004 0.036 0.000
#> SRR660522 3 0.2623 0.7015 0.132 0.000 0.852 0.000 0.016 0.000
#> SRR815374 1 0.3832 0.6828 0.752 0.004 0.216 0.012 0.016 0.000
#> SRR1069564 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 5 0.5376 0.5838 0.092 0.000 0.372 0.008 0.528 0.000
#> SRR1316438 4 0.5813 0.1576 0.008 0.000 0.144 0.464 0.384 0.000
#> SRR1386844 1 0.1124 0.7315 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008 0.000
#> SRR1373718 1 0.1780 0.7105 0.932 0.004 0.024 0.036 0.004 0.000
#> SRR1447458 2 0.0865 0.7169 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1487128 1 0.2178 0.7281 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1069919 2 0.1663 0.6994 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1460296 1 0.3394 0.6534 0.776 0.000 0.200 0.024 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.3725 0.7135 0.804 0.004 0.128 0.012 0.052 0.000
#> SRR1393404 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1081425 1 0.1485 0.7127 0.944 0.000 0.028 0.024 0.004 0.000
#> SRR1401815 3 0.3273 0.3968 0.024 0.000 0.824 0.016 0.136 0.000
#> SRR1071337 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1071983 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1331793 2 0.0632 0.7163 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1410510 3 0.2358 0.5637 0.040 0.000 0.900 0.012 0.048 0.000
#> SRR1098761 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.3538 0.6932 0.764 0.004 0.216 0.012 0.004 0.000
#> SRR615395 3 0.3636 0.5781 0.320 0.000 0.676 0.004 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.3301 0.6422 0.772 0.000 0.216 0.008 0.004 0.000
#> SRR2165033 3 0.3052 0.6902 0.216 0.000 0.780 0.004 0.000 0.000
#> SRR1089054 6 0.3499 0.5390 0.000 0.320 0.000 0.000 0.000 0.680
#> SRR816201 1 0.4552 0.3616 0.568 0.004 0.404 0.012 0.012 0.000
#> SRR1488514 2 0.2491 0.6469 0.000 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR655840 1 0.3919 0.6689 0.728 0.004 0.244 0.008 0.016 0.000
#> SRR1379303 1 0.1918 0.7389 0.904 0.000 0.088 0.000 0.008 0.000
#> SRR1418516 5 0.5967 0.2703 0.028 0.000 0.136 0.304 0.532 0.000
#> SRR613174 3 0.3141 0.6957 0.200 0.000 0.788 0.000 0.012 0.000
#> SRR1351125 3 0.2562 0.6973 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR659157 3 0.6062 -0.5345 0.156 0.000 0.420 0.016 0.408 0.000
#> SRR1480408 3 0.4122 0.1213 0.472 0.000 0.520 0.004 0.004 0.000
#> SRR657857 1 0.3231 0.6988 0.784 0.000 0.200 0.000 0.016 0.000
#> SRR1073317 2 0.1204 0.7132 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1332526 1 0.4022 0.3960 0.628 0.000 0.360 0.008 0.004 0.000
#> SRR1094168 6 0.1267 0.9104 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1431270 5 0.5886 0.5468 0.132 0.000 0.376 0.016 0.476 0.000
#> SRR1085614 6 0.2135 0.8578 0.000 0.128 0.000 0.000 0.000 0.872
#> SRR1330106 3 0.2706 0.7032 0.160 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466154 1 0.2052 0.7050 0.912 0.000 0.056 0.028 0.004 0.000
#> SRR1396944 1 0.1786 0.7120 0.932 0.004 0.028 0.032 0.004 0.000
#> SRR1082784 2 0.1088 0.7161 0.000 0.960 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1457267 1 0.1321 0.7159 0.952 0.000 0.020 0.024 0.004 0.000
#> SRR614659 3 0.3684 0.6073 0.300 0.000 0.692 0.004 0.004 0.000
#> SRR659247 3 0.3217 0.6599 0.224 0.000 0.768 0.000 0.008 0.000
#> SRR1317201 1 0.3066 0.7288 0.836 0.004 0.136 0.012 0.012 0.000
#> SRR1473696 3 0.4098 0.1475 0.496 0.000 0.496 0.008 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.1405 0.7129 0.948 0.000 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1388123 2 0.2416 0.6557 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1096363 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.4227 -0.0592 0.496 0.000 0.492 0.008 0.004 0.000
#> SRR1345499 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1353499 1 0.2558 0.7208 0.868 0.000 0.104 0.028 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.1780 0.7105 0.932 0.004 0.024 0.036 0.004 0.000
#> SRR1070841 3 0.3134 0.6901 0.208 0.000 0.784 0.004 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.1296 0.7138 0.952 0.000 0.012 0.032 0.004 0.000
#> SRR1333125 2 0.2697 0.6231 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1498183 3 0.4114 0.3451 0.460 0.000 0.532 0.004 0.004 0.000
#> SRR612659 3 0.2046 0.6424 0.060 0.000 0.908 0.000 0.032 0.000
#> SRR1447148 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR658597 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1074263 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1376786 3 0.3862 0.4800 0.388 0.000 0.608 0.004 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.3907 0.4506 0.408 0.000 0.588 0.004 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.3945 0.2848 0.612 0.000 0.380 0.008 0.000 0.000
#> SRR1068808 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR662438 1 0.1511 0.7320 0.940 0.000 0.044 0.012 0.004 0.000
#> SRR1335355 1 0.2315 0.7336 0.892 0.000 0.084 0.016 0.008 0.000
#> SRR659448 3 0.2562 0.7005 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.4892 -0.0142 0.072 0.000 0.632 0.008 0.288 0.000
#> SRR1381711 5 0.6120 0.6041 0.128 0.000 0.280 0.048 0.544 0.000
#> SRR657985 5 0.5190 0.5835 0.096 0.000 0.376 0.000 0.528 0.000
#> SRR1314810 1 0.4245 0.7055 0.776 0.004 0.124 0.068 0.028 0.000
#> SRR1336505 3 0.2664 0.7003 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474095 3 0.3240 0.6761 0.244 0.000 0.752 0.004 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.1444 0.7073 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1442376 1 0.5299 0.5243 0.620 0.004 0.268 0.012 0.096 0.000
#> SRR1074909 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 3 0.3945 0.4977 0.380 0.000 0.612 0.008 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1367150 5 0.6188 0.3387 0.044 0.000 0.144 0.280 0.532 0.000
#> SRR1313406 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1068880 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1467277 5 0.5764 0.5979 0.076 0.000 0.340 0.044 0.540 0.000
#> SRR1084867 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1095431 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.1007 0.7162 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1443113 3 0.3997 0.1886 0.488 0.000 0.508 0.004 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.6238 -0.3117 0.260 0.000 0.416 0.008 0.316 0.000
#> SRR1315912 1 0.2165 0.7376 0.884 0.000 0.108 0.008 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.1957 0.6858 0.000 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1421116 6 0.2378 0.8278 0.000 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848
#> SRR602282 4 0.5125 0.5247 0.016 0.000 0.100 0.648 0.236 0.000
#> SRR1361195 2 0.2491 0.6469 0.000 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR600493 3 0.4224 0.2062 0.476 0.000 0.512 0.008 0.004 0.000
#> SRR1477653 3 0.3804 0.5807 0.336 0.000 0.656 0.008 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.2631 0.6995 0.180 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360785 5 0.6679 0.4861 0.128 0.000 0.172 0.164 0.536 0.000
#> SRR810437 3 0.2868 0.7001 0.132 0.000 0.840 0.000 0.028 0.000
#> SRR1361860 1 0.4318 0.6755 0.740 0.004 0.188 0.012 0.056 0.000
#> SRR1441311 2 0.0790 0.7171 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1098903 5 0.5997 0.4690 0.304 0.000 0.224 0.004 0.468 0.000
#> SRR1457619 1 0.3674 0.6853 0.756 0.004 0.220 0.012 0.008 0.000
#> SRR1498529 1 0.3672 0.5561 0.712 0.000 0.276 0.008 0.004 0.000
#> SRR1097172 2 0.4416 0.6454 0.000 0.540 0.004 0.012 0.440 0.004
#> SRR1074017 6 0.1007 0.9265 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1472033 6 0.1957 0.8771 0.000 0.112 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR1445087 3 0.2007 0.5924 0.044 0.000 0.916 0.004 0.036 0.000
#> SRR1399525 6 0.3409 0.5821 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1312844 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 6 0.0937 0.9281 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1476056 1 0.3284 0.7056 0.784 0.000 0.196 0.000 0.020 0.000
#> SRR1075659 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 3 0.1984 0.6380 0.056 0.000 0.912 0.000 0.032 0.000
#> SRR1353353 3 0.6221 -0.3156 0.020 0.000 0.488 0.276 0.216 0.000
#> SRR1073291 3 0.2882 0.7027 0.180 0.000 0.812 0.000 0.008 0.000
#> SRR1356227 1 0.2703 0.7190 0.824 0.000 0.172 0.000 0.004 0.000
#> SRR1080720 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1091695 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 5 0.5874 0.2273 0.024 0.000 0.128 0.316 0.532 0.000
#> SRR663002 3 0.2398 0.6906 0.104 0.000 0.876 0.000 0.020 0.000
#> SRR1376983 2 0.1075 0.7159 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1399926 1 0.1382 0.7305 0.948 0.000 0.036 0.008 0.008 0.000
#> SRR1347144 3 0.2128 0.6348 0.056 0.000 0.908 0.004 0.032 0.000
#> SRR1384006 1 0.1806 0.7221 0.928 0.000 0.044 0.020 0.008 0.000
#> SRR1499108 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614047 3 0.3744 0.6216 0.256 0.000 0.724 0.004 0.016 0.000
#> SRR818440 3 0.2442 0.6986 0.144 0.000 0.852 0.000 0.004 0.000
#> SRR1337770 1 0.3384 0.6301 0.760 0.000 0.228 0.008 0.004 0.000
#> SRR1399413 3 0.3881 0.4980 0.396 0.000 0.600 0.004 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0790 0.7171 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1473959 3 0.3955 0.5443 0.340 0.000 0.648 0.004 0.008 0.000
#> SRR1074041 3 0.3076 0.6769 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR659460 3 0.3265 0.6669 0.248 0.000 0.748 0.004 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.2340 0.6991 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.2562 0.7021 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 5 0.5377 0.5672 0.056 0.000 0.380 0.028 0.536 0.000
#> SRR1352894 2 0.4409 0.6524 0.000 0.588 0.004 0.016 0.388 0.004
#> SRR815805 1 0.4671 0.6816 0.744 0.004 0.120 0.100 0.032 0.000
#> SRR1331083 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 3 0.2147 0.6748 0.084 0.000 0.896 0.000 0.020 0.000
#> SRR1436698 1 0.4273 0.3367 0.596 0.000 0.380 0.024 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.6200 -0.1491 0.388 0.000 0.276 0.004 0.332 0.000
#> SRR1351236 1 0.1341 0.7142 0.948 0.000 0.028 0.024 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.2940 0.7282 0.856 0.004 0.108 0.020 0.012 0.000
#> SRR814491 5 0.5874 0.2273 0.024 0.000 0.128 0.316 0.532 0.000
#> SRR1101256 6 0.3563 0.5273 0.000 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1436004 1 0.4032 0.1325 0.572 0.000 0.420 0.008 0.000 0.000
#> SRR1457994 6 0.3851 0.1740 0.000 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1078998 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1314707 1 0.2920 0.6944 0.820 0.000 0.168 0.008 0.004 0.000
#> SRR1309534 1 0.5109 0.5585 0.644 0.004 0.256 0.012 0.084 0.000
#> SRR615527 4 0.6091 0.1465 0.008 0.000 0.336 0.448 0.208 0.000
#> SRR1098216 1 0.3078 0.7321 0.848 0.004 0.112 0.020 0.016 0.000
#> SRR1325847 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 3 0.4217 0.1468 0.464 0.000 0.524 0.008 0.004 0.000
#> SRR1344166 1 0.3753 0.5436 0.696 0.000 0.292 0.008 0.004 0.000
#> SRR1368638 5 0.6145 0.3308 0.040 0.000 0.144 0.284 0.532 0.000
#> SRR1431429 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1079237 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR815759 5 0.6100 0.3233 0.036 0.000 0.144 0.288 0.532 0.000
#> SRR1502143 3 0.3109 0.6854 0.224 0.000 0.772 0.004 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.2831 0.5065 0.032 0.000 0.868 0.016 0.084 0.000
#> SRR1402307 2 0.0790 0.7171 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR820810 1 0.3512 0.6521 0.720 0.000 0.272 0.000 0.008 0.000
#> SRR1099212 2 0.1765 0.6954 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1083215 3 0.3508 0.6356 0.292 0.000 0.704 0.004 0.000 0.000
#> SRR1476547 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR656421 5 0.6162 0.4219 0.336 0.000 0.188 0.016 0.460 0.000
#> SRR1086116 2 0.1075 0.7155 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1499917 1 0.4492 0.1635 0.496 0.000 0.480 0.008 0.016 0.000
#> SRR1339944 6 0.3797 0.3030 0.000 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1391444 2 0.2527 0.6432 0.000 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1434889 3 0.3975 0.1224 0.452 0.000 0.544 0.000 0.004 0.000
#> SRR1431847 5 0.5560 0.5479 0.036 0.000 0.360 0.064 0.540 0.000
#> SRR1317155 3 0.4461 0.2411 0.464 0.000 0.512 0.004 0.020 0.000
#> SRR1477405 1 0.1780 0.7105 0.932 0.004 0.024 0.036 0.004 0.000
#> SRR655289 1 0.5834 0.2616 0.532 0.000 0.196 0.008 0.264 0.000
#> SRR1341683 3 0.4593 0.5137 0.276 0.004 0.668 0.008 0.044 0.000
#> SRR1084790 1 0.5487 0.1432 0.508 0.000 0.136 0.000 0.356 0.000
#> SRR1073731 3 0.3714 0.6104 0.264 0.000 0.720 0.008 0.008 0.000
#> SRR1332588 5 0.6172 0.3266 0.044 0.000 0.140 0.284 0.532 0.000
#> SRR1471157 2 0.0458 0.7148 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR654945 3 0.2692 0.6987 0.148 0.000 0.840 0.000 0.012 0.000
#> SRR661028 1 0.3323 0.6288 0.752 0.000 0.240 0.008 0.000 0.000
#> SRR1413477 6 0.1610 0.9040 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1101152 1 0.3933 0.5850 0.676 0.000 0.308 0.008 0.008 0.000
#> SRR1358435 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.1237 0.7173 0.956 0.000 0.020 0.020 0.004 0.000
#> SRR1379014 1 0.2001 0.7322 0.900 0.000 0.092 0.004 0.004 0.000
#> SRR1489904 3 0.2201 0.6605 0.076 0.000 0.896 0.000 0.028 0.000
#> SRR1416386 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.2980 0.7090 0.800 0.000 0.192 0.000 0.008 0.000
#> SRR606982 5 0.5571 0.6020 0.140 0.000 0.324 0.004 0.532 0.000
#> SRR1358082 1 0.1780 0.7105 0.932 0.004 0.024 0.036 0.004 0.000
#> SRR1312934 1 0.4709 0.0606 0.488 0.004 0.480 0.012 0.016 0.000
#> SRR655194 3 0.4100 0.4438 0.388 0.000 0.600 0.008 0.004 0.000
#> SRR1331174 6 0.3782 0.3613 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1473251 6 0.1075 0.9254 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1389820 4 0.1500 0.6458 0.000 0.000 0.012 0.936 0.052 0.000
#> SRR1074289 3 0.3930 0.4132 0.420 0.000 0.576 0.004 0.000 0.000
#> SRR1348816 6 0.1141 0.9239 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1076292 3 0.3014 0.6806 0.132 0.000 0.832 0.000 0.036 0.000
#> SRR1395810 2 0.1151 0.7195 0.000 0.956 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1498909 3 0.2538 0.6991 0.124 0.000 0.860 0.000 0.016 0.000
#> SRR1443507 3 0.3337 0.6608 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000 0.000
#> SRR1452310 3 0.2902 0.6983 0.196 0.000 0.800 0.000 0.004 0.000
#> SRR665610 1 0.5903 0.3048 0.552 0.004 0.256 0.012 0.176 0.000
#> SRR1347322 1 0.2653 0.6981 0.844 0.000 0.144 0.012 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.0146 0.9304 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1477256 1 0.2473 0.7170 0.856 0.000 0.136 0.008 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.5516 0.5945 0.084 0.000 0.360 0.020 0.536 0.000
#> SRR1354247 1 0.2592 0.6987 0.864 0.000 0.116 0.016 0.004 0.000
#> SRR1082640 2 0.4505 0.6424 0.000 0.528 0.004 0.016 0.448 0.004
#> SRR1487592 3 0.2697 0.6913 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.4057 0.3712 0.436 0.000 0.556 0.008 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.5554 0.5179 0.604 0.004 0.244 0.012 0.136 0.000
#> SRR1075273 6 0.0713 0.9297 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR658657 5 0.5368 0.5908 0.092 0.000 0.368 0.008 0.532 0.000
#> SRR1092773 6 0.2762 0.7579 0.000 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1365332 3 0.3151 0.6683 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.2907 0.7000 0.152 0.000 0.828 0.000 0.020 0.000
#> SRR1097688 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 5 0.5390 0.5604 0.052 0.000 0.380 0.032 0.536 0.000
#> SRR1099120 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.2613 0.7016 0.140 0.000 0.848 0.000 0.012 0.000
#> SRR1464856 6 0.1007 0.9265 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1347298 3 0.1865 0.5947 0.040 0.000 0.920 0.000 0.040 0.000
#> SRR1075923 6 0.0000 0.9311 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 3 0.3528 0.6357 0.296 0.000 0.700 0.004 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.4325 0.568 0.568
#> 3 3 0.811 0.870 0.937 0.4365 0.801 0.649
#> 4 4 0.823 0.860 0.917 0.1282 0.901 0.742
#> 5 5 0.712 0.715 0.813 0.0776 0.872 0.616
#> 6 6 0.713 0.651 0.793 0.0376 0.958 0.838
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1436370 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1075752 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1397949 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1355723 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1329744 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR657384 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1351190 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1458662 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR818573 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1396017 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1410742 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1435963 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1382416 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1391354 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1087968 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1310075 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1312244 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1325138 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1326821 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1490178 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR655613 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1075707 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1443871 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1102489 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1465758 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1414058 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1407449 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1436858 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1479109 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1399069 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1366450 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1396859 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1457176 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1097666 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1434736 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1080560 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1322882 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1435688 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1327614 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR658152 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1368141 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1440268 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1453725 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1325711 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1477930 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1477591 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1416049 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR656275 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1369052 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1377735 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1331244 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1404531 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1324331 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1458890 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1432695 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1407624 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1431969 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1087393 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1077263 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1385211 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR655241 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR656922 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1361630 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1318966 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1407087 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR603212 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1321088 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1485190 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1332232 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1312645 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1457835 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1347123 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1465501 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1330878 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1445064 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1452981 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1326708 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1407157 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1365401 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1397697 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1477316 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1077898 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1349080 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1076096 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR811261 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1375485 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1432563 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR604414 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1380614 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR812060 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR602082 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1069490 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1078417 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR661613 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1420710 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR660426 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1416003 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR661064 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1082011 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1452718 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1353243 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1455482 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1313473 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1399394 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1102467 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1317470 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1337707 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1408752 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1474617 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1398013 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1352918 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1420750 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1071785 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1353618 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1082217 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1357256 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1490313 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1366560 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1355684 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1323289 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1313494 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1309985 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR607911 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1333789 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1400078 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1088631 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1092842 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR615575 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1079434 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1325559 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1446695 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1383883 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1396100 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1475697 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1488067 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1102103 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1105154 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1084991 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1410380 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1445490 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1454671 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1435044 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1485812 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1078020 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1311153 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1376406 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1343898 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR807775 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1409215 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR820427 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1100656 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1362159 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1414536 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR656794 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR604653 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1317685 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1485912 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1407602 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1356164 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1328692 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1362438 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1479216 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1358041 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1468766 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1368200 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1435602 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1501043 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1437256 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1487446 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR816653 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR815164 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1442043 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1410573 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1096782 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1352369 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1382934 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1465208 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1314728 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1470291 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1308756 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1409600 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR816123 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR614779 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR810783 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1333990 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1410356 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR808106 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR662713 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1447058 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1480964 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR809382 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR665417 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1088016 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1453166 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1069826 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1077781 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR615623 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1413787 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1478207 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1411046 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1313711 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1326560 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1309051 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1486949 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1395616 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1074956 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1092961 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR817210 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1319221 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1405413 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR607807 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1390160 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1406283 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1357709 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1080742 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1468208 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1312766 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1361612 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1311224 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1087801 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1099720 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1349250 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1350912 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1357127 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1074980 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1317022 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1332879 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1403177 1 0.722 0.750 0.8 0.2
#> SRR1076144 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1069614 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR818239 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1421069 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1500006 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1485678 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1092232 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1344253 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1384290 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1089349 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1343522 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1326727 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1440940 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR818372 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1323675 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR819894 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1310031 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR615419 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1436925 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1477238 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1332566 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1490228 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1442949 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1466239 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1094003 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1329971 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR813076 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1097642 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1322981 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1485976 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1471713 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR660522 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR815374 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1069564 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1416337 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1316438 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1386844 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1373718 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1447458 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1487128 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1441421 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1069919 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1460296 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1335489 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1393404 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1081425 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1401815 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1071337 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1071983 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1331793 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1410510 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1098761 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1312124 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR615395 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1479349 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR2165033 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1089054 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR816201 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1488514 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR655840 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1379303 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1418516 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR613174 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1351125 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR659157 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1480408 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR657857 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1073317 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1332526 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1094168 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1431270 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1085614 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1330106 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1466154 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1396944 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1082784 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1457267 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR614659 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR659247 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1317201 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1473696 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1375842 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1388123 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1096363 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1453662 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1345499 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1353499 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1416693 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1070841 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1380910 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1333125 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1498183 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR612659 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1447148 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR658597 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1089595 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1074263 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1376786 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1345995 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1071035 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1068808 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1332754 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR662438 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1335355 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR659448 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1323558 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1381711 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR657985 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1314810 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1336505 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1474095 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1363831 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1442376 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1074909 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1101200 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1075408 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1367150 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1313406 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1068880 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1467277 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1084867 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1095431 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1380184 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1443113 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1380414 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1315912 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1075778 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1421116 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR602282 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1361195 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR600493 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1477653 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1355475 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1360785 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR810437 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1361860 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1441311 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1098903 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1457619 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1498529 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1097172 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1074017 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1472033 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1445087 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1399525 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1312844 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1085874 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1101226 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1476056 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1075659 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1311916 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1353353 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1073291 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1356227 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1080720 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1091695 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1350304 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR663002 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1376983 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1399926 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1347144 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1384006 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1499108 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR614047 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR818440 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1337770 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1399413 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1385542 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1473959 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1074041 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1394495 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR659460 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR816699 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1308612 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1499418 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1352894 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR815805 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1331083 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR808272 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1436698 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1095627 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1357672 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1351236 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1077479 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR814491 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1101256 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1436004 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1457994 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1078998 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1314707 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1309534 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR615527 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1098216 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1325847 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1404003 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1344166 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1368638 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1431429 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1079237 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1080509 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR815759 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1502143 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1487614 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1402307 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR820810 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1099212 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1083215 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1476547 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR656421 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1086116 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1499917 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1339944 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1391444 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1434889 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1431847 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1317155 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1477405 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR655289 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1341683 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1084790 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1073731 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1332588 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1471157 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR654945 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR661028 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1413477 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1101152 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1358435 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR2165273 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1379014 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1489904 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1416386 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1406048 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR606982 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1358082 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1312934 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR655194 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1331174 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1473251 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1389820 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1074289 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1348816 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1076292 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1395810 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1498909 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1443507 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1452310 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR665610 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1347322 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR813395 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1477256 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1470230 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1354247 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1082640 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1487592 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1352299 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1076317 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1434117 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1075273 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR658657 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1092773 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1365332 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR615958 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1097688 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1403259 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1099120 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1362200 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1464856 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1347298 1 0.000 0.999 1.0 0.0
#> SRR1075923 2 0.000 1.000 0.0 1.0
#> SRR1100703 1 0.000 0.999 1.0 0.0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075752 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0237 0.9257 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329744 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR818573 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.5785 0.4689 0.668 0.000 0.332
#> SRR1087968 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1310075 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.4399 0.7076 0.812 0.000 0.188
#> SRR1326821 1 0.5529 0.5406 0.704 0.000 0.296
#> SRR1490178 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR655613 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443871 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102489 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1465758 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.6154 0.5555 0.408 0.000 0.592
#> SRR1407449 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1479109 1 0.3619 0.7711 0.864 0.000 0.136
#> SRR1399069 1 0.4654 0.6807 0.792 0.000 0.208
#> SRR1366450 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1434736 3 0.4555 0.6857 0.200 0.000 0.800
#> SRR1080560 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322882 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327614 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.4750 0.8120 0.216 0.000 0.784
#> SRR1368141 3 0.5254 0.7712 0.264 0.000 0.736
#> SRR1440268 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477930 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR656275 1 0.3482 0.7819 0.872 0.000 0.128
#> SRR1369052 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.4555 0.6906 0.800 0.000 0.200
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4555 0.6906 0.800 0.000 0.200
#> SRR1458890 3 0.4796 0.8093 0.220 0.000 0.780
#> SRR1432695 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1407624 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431969 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1087393 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077263 3 0.0747 0.8104 0.016 0.000 0.984
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1318966 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1407087 3 0.6154 0.5555 0.408 0.000 0.592
#> SRR603212 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485190 3 0.5621 0.7231 0.308 0.000 0.692
#> SRR1332232 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312645 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.6154 0.5555 0.408 0.000 0.592
#> SRR1465501 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330878 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1445064 3 0.5678 0.7131 0.316 0.000 0.684
#> SRR1452981 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1397697 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477316 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.4555 0.6906 0.800 0.000 0.200
#> SRR1349080 1 0.6299 0.0828 0.524 0.000 0.476
#> SRR1076096 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR811261 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1375485 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR604414 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 1 0.5621 0.4231 0.692 0.000 0.308
#> SRR602082 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9969 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.5785 0.6898 0.332 0.000 0.668
#> SRR1420710 1 0.6291 -0.1797 0.532 0.000 0.468
#> SRR660426 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.6180 0.0466 0.584 0.000 0.416
#> SRR661064 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1337707 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.3933 0.8181 0.092 0.028 0.880
#> SRR1398013 1 0.4062 0.7275 0.836 0.000 0.164
#> SRR1352918 3 0.6126 0.3150 0.400 0.000 0.600
#> SRR1420750 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.4702 0.8143 0.212 0.000 0.788
#> SRR1353618 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1082217 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357256 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490313 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1313494 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.4002 0.7344 0.840 0.000 0.160
#> SRR1088631 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1092842 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR615575 3 0.5678 0.7132 0.316 0.000 0.684
#> SRR1079434 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1325559 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1383883 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 3 0.6079 0.3458 0.388 0.000 0.612
#> SRR1475697 1 0.5254 0.5328 0.736 0.000 0.264
#> SRR1488067 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102103 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105154 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1084991 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1410380 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1445490 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454671 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1435044 1 0.5560 0.4440 0.700 0.000 0.300
#> SRR1485812 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1078020 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1343898 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR807775 3 0.1289 0.8155 0.032 0.000 0.968
#> SRR1409215 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR820427 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1100656 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR656794 1 0.4605 0.6857 0.796 0.000 0.204
#> SRR604653 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1485912 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1356164 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0747 0.9142 0.984 0.000 0.016
#> SRR1479216 3 0.4605 0.8174 0.204 0.000 0.796
#> SRR1358041 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.6111 0.1308 0.604 0.000 0.396
#> SRR1435602 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1501043 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1437256 3 0.4702 0.8143 0.212 0.000 0.788
#> SRR1487446 1 0.0237 0.9258 0.996 0.000 0.004
#> SRR816653 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.3116 0.8126 0.892 0.000 0.108
#> SRR1442043 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1352369 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1465208 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.5560 0.7326 0.300 0.000 0.700
#> SRR1409600 1 0.0237 0.9258 0.996 0.000 0.004
#> SRR816123 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR614779 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR810783 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 3 0.1411 0.8055 0.036 0.000 0.964
#> SRR662713 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480964 1 0.4654 0.6504 0.792 0.000 0.208
#> SRR809382 3 0.4796 0.8093 0.220 0.000 0.780
#> SRR665417 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453166 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069826 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077781 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR615623 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1413787 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1478207 3 0.6154 0.5555 0.408 0.000 0.592
#> SRR1411046 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326560 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1395616 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1092961 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR817210 1 0.4062 0.7283 0.836 0.000 0.164
#> SRR1319221 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1405413 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.6154 0.5555 0.408 0.000 0.592
#> SRR1406283 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468208 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349250 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1350912 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357127 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317022 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1332879 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.3607 0.7511 0.008 0.112 0.880
#> SRR1076144 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069614 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR818239 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1421069 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.4291 0.7186 0.820 0.000 0.180
#> SRR1092232 3 0.4178 0.8208 0.172 0.000 0.828
#> SRR1344253 3 0.0592 0.8111 0.012 0.000 0.988
#> SRR1384290 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.4555 0.8056 0.200 0.000 0.800
#> SRR1343522 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.6225 0.4964 0.432 0.000 0.568
#> SRR818372 1 0.6274 -0.1255 0.544 0.000 0.456
#> SRR1323675 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR819894 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1310031 3 0.5058 0.7900 0.244 0.000 0.756
#> SRR615419 3 0.4605 0.8174 0.204 0.000 0.796
#> SRR1436925 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.6299 -0.2107 0.524 0.000 0.476
#> SRR1442949 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1466239 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1329971 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1097642 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322981 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471713 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR660522 1 0.5835 0.3289 0.660 0.000 0.340
#> SRR815374 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1416337 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1316438 3 0.4555 0.8180 0.200 0.000 0.800
#> SRR1386844 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487128 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069919 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1071337 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1071983 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331793 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1410510 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1098761 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312124 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR816201 1 0.2537 0.8444 0.920 0.000 0.080
#> SRR1488514 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR655840 1 0.0237 0.9258 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379303 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR613174 3 0.6079 0.5970 0.388 0.000 0.612
#> SRR1351125 1 0.5650 0.4114 0.688 0.000 0.312
#> SRR659157 3 0.4121 0.8210 0.168 0.000 0.832
#> SRR1480408 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332526 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431270 3 0.1964 0.8180 0.056 0.000 0.944
#> SRR1085614 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330106 1 0.6180 0.0464 0.584 0.000 0.416
#> SRR1466154 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457267 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096363 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1453662 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353499 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.4002 0.7340 0.840 0.000 0.160
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498183 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1447148 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR658597 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1089595 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074263 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1376786 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332754 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR662438 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.5785 0.3530 0.668 0.000 0.332
#> SRR1323558 3 0.4605 0.8174 0.204 0.000 0.796
#> SRR1381711 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR657985 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1314810 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.5621 0.4225 0.692 0.000 0.308
#> SRR1474095 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442376 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101200 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367150 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1313406 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1068880 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467277 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1084867 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095431 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380184 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443113 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1315912 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1421116 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR602282 3 0.5905 0.6613 0.352 0.000 0.648
#> SRR1361195 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR600493 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.6126 0.1146 0.600 0.000 0.400
#> SRR1360785 1 0.6204 0.2438 0.576 0.000 0.424
#> SRR810437 1 0.6308 -0.2698 0.508 0.000 0.492
#> SRR1361860 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1098903 1 0.4842 0.6592 0.776 0.000 0.224
#> SRR1457619 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074017 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472033 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1445087 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1399525 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1312844 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1085874 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101226 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1476056 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1311916 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1353353 3 0.4842 0.8066 0.224 0.000 0.776
#> SRR1073291 3 0.6154 0.5555 0.408 0.000 0.592
#> SRR1356227 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1091695 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1350304 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR663002 3 0.5905 0.6612 0.352 0.000 0.648
#> SRR1376983 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399926 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1384006 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR614047 3 0.4887 0.8036 0.228 0.000 0.772
#> SRR818440 1 0.5859 0.3165 0.656 0.000 0.344
#> SRR1337770 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473959 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0237 0.9258 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394495 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR659460 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR816699 1 0.6302 -0.2278 0.520 0.000 0.480
#> SRR1308612 1 0.6140 0.0980 0.596 0.000 0.404
#> SRR1499418 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1352894 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR815805 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR808272 3 0.4887 0.8036 0.228 0.000 0.772
#> SRR1436698 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1357672 1 0.4555 0.6906 0.800 0.000 0.200
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.1411 0.8055 0.036 0.000 0.964
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1078998 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1314707 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1098216 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1404003 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1431429 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1079237 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1080509 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR815759 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1502143 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.4887 0.8035 0.228 0.000 0.772
#> SRR1402307 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR820810 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083215 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR656421 1 0.4605 0.6857 0.796 0.000 0.204
#> SRR1086116 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499917 1 0.6026 0.2074 0.624 0.000 0.376
#> SRR1339944 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1391444 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1434889 1 0.1643 0.8855 0.956 0.000 0.044
#> SRR1431847 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1317155 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.5835 0.5083 0.340 0.000 0.660
#> SRR1341683 1 0.6126 0.1141 0.600 0.000 0.400
#> SRR1084790 1 0.4555 0.6906 0.800 0.000 0.200
#> SRR1073731 1 0.4121 0.7217 0.832 0.000 0.168
#> SRR1332588 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1471157 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR654945 3 0.6079 0.5969 0.388 0.000 0.612
#> SRR661028 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101152 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR2165273 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.6154 0.5555 0.408 0.000 0.592
#> SRR1416386 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1406048 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.5785 0.6916 0.332 0.000 0.668
#> SRR655194 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1389820 3 0.3412 0.8213 0.124 0.000 0.876
#> SRR1074289 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1076292 3 0.6008 0.6268 0.372 0.000 0.628
#> SRR1395810 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498909 3 0.6079 0.5971 0.388 0.000 0.612
#> SRR1443507 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0237 0.9258 0.996 0.000 0.004
#> SRR665610 1 0.1964 0.8749 0.944 0.000 0.056
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0237 0.9969 0.000 0.996 0.004
#> SRR1487592 1 0.0592 0.9183 0.988 0.000 0.012
#> SRR1352299 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1434117 3 0.1529 0.8164 0.040 0.000 0.960
#> SRR1075273 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR658657 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1092773 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365332 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.4654 0.8165 0.208 0.000 0.792
#> SRR1097688 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403259 3 0.0424 0.8115 0.008 0.000 0.992
#> SRR1099120 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362200 3 0.5926 0.6546 0.356 0.000 0.644
#> SRR1464856 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347298 3 0.5785 0.6915 0.332 0.000 0.668
#> SRR1075923 2 0.0237 0.9968 0.000 0.996 0.004
#> SRR1100703 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.0524 0.9234 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1329744 1 0.3486 0.7551 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR657384 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1351190 1 0.1940 0.8803 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.3873 0.7023 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1410742 1 0.1677 0.9033 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR1435963 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.2987 0.8189 0.104 0.000 0.016 0.880
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.1302 0.9021 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1325138 4 0.4356 0.6055 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1326821 4 0.3047 0.8104 0.116 0.000 0.012 0.872
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075707 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1465758 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.3325 0.8349 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1399069 4 0.2647 0.8045 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1366450 1 0.0592 0.9218 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1396859 1 0.1302 0.9019 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1457176 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1097666 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1434736 4 0.3239 0.8547 0.052 0.000 0.068 0.880
#> SRR1080560 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1322882 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1435688 2 0.0817 0.9493 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1327614 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.6275 0.3412 0.076 0.000 0.596 0.328
#> SRR1368141 3 0.1545 0.8813 0.040 0.000 0.952 0.008
#> SRR1440268 1 0.3726 0.7223 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1453725 1 0.0707 0.9201 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1325711 2 0.0921 0.9492 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1477930 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 3 0.3311 0.7650 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0188 0.9253 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331244 4 0.3123 0.7737 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 4 0.2973 0.7854 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1458890 3 0.1584 0.8761 0.036 0.000 0.952 0.012
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1087393 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1077263 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR656922 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 4 0.2589 0.8745 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1318966 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1407087 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR603212 1 0.0707 0.9203 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.1389 0.8849 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.2647 0.8345 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1457835 1 0.0707 0.9201 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1347123 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1465501 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1330878 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1445064 3 0.1635 0.8831 0.044 0.000 0.948 0.008
#> SRR1452981 1 0.1302 0.9025 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1326708 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0469 0.9214 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1077898 1 0.4761 0.3542 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1349080 4 0.3149 0.8313 0.088 0.000 0.032 0.880
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1375485 1 0.0469 0.9234 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380614 1 0.0188 0.9254 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR812060 3 0.1940 0.8694 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1078417 2 0.1388 0.9488 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR661613 3 0.2216 0.8549 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1420710 3 0.5352 0.4251 0.388 0.000 0.596 0.016
#> SRR660426 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416003 3 0.3142 0.8184 0.132 0.000 0.860 0.008
#> SRR661064 1 0.0921 0.9126 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1082011 2 0.1297 0.9490 0.000 0.964 0.016 0.020
#> SRR1452718 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1353243 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0707 0.9201 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1337707 3 0.1584 0.8761 0.036 0.000 0.952 0.012
#> SRR1408752 2 0.0804 0.9493 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1474617 3 0.0817 0.8302 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1398013 1 0.5668 0.0915 0.532 0.000 0.444 0.024
#> SRR1352918 4 0.3229 0.8424 0.072 0.000 0.048 0.880
#> SRR1420750 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1071785 3 0.1452 0.8782 0.036 0.000 0.956 0.008
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0592 0.9212 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 4 0.4164 0.7215 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1313494 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.4164 0.6431 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR607911 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.1022 0.9146 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1400078 1 0.6007 0.3845 0.604 0.000 0.340 0.056
#> SRR1088631 2 0.2859 0.9401 0.000 0.880 0.008 0.112
#> SRR1092842 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR615575 3 0.1302 0.8847 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1079434 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1325559 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1383883 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396100 4 0.3156 0.8441 0.068 0.000 0.048 0.884
#> SRR1475697 1 0.6276 0.2595 0.556 0.000 0.064 0.380
#> SRR1488067 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1084991 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1410380 4 0.4585 0.6192 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.5296 -0.0613 0.500 0.000 0.492 0.008
#> SRR1485812 3 0.5928 -0.0527 0.036 0.000 0.508 0.456
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0469 0.9215 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.2281 0.7813 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR807775 3 0.1211 0.8288 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1409215 2 0.2402 0.9446 0.000 0.912 0.012 0.076
#> SRR820427 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1100656 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR656794 4 0.4482 0.6441 0.264 0.000 0.008 0.728
#> SRR604653 1 0.0188 0.9253 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317685 4 0.2589 0.8741 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1485912 1 0.1118 0.9113 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1407602 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1356164 1 0.1302 0.9063 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1328692 1 0.2149 0.8708 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1362438 1 0.0469 0.9200 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1479216 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.2345 0.8599 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1368200 3 0.2345 0.8501 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 4 0.3907 0.7668 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1437256 3 0.1584 0.8761 0.036 0.000 0.952 0.012
#> SRR1487446 1 0.2216 0.8672 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR816653 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR815164 4 0.3569 0.7243 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1442043 1 0.4040 0.6687 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1352369 1 0.3074 0.8017 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1382934 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.3486 0.7570 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1470291 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.1302 0.8847 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1409600 1 0.5678 0.4832 0.640 0.000 0.044 0.316
#> SRR816123 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR614779 4 0.3311 0.8368 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR810783 1 0.3123 0.7984 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1333990 1 0.0707 0.9173 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1410356 1 0.4164 0.6375 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR808106 4 0.2654 0.8750 0.004 0.000 0.108 0.888
#> SRR662713 1 0.3400 0.7680 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.2973 0.7995 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR809382 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.2924 0.9406 0.000 0.884 0.016 0.100
#> SRR1453166 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1069826 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1077781 2 0.2662 0.9432 0.000 0.900 0.016 0.084
#> SRR615623 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1413787 4 0.4103 0.7366 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1478207 3 0.1557 0.8826 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1411046 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1474 0.8963 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1309051 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1092961 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR817210 1 0.4972 0.1261 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1319221 3 0.1452 0.8782 0.036 0.000 0.956 0.008
#> SRR1405413 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1406283 1 0.1022 0.9137 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1357709 1 0.1389 0.8994 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1080742 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1468208 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.2973 0.8143 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1361612 1 0.1211 0.9048 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1311224 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1087801 1 0.1022 0.9137 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1099720 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1349250 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.4888 0.2863 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1332879 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1403177 3 0.5594 0.5275 0.000 0.164 0.724 0.112
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR818239 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1421069 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.4193 0.6097 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1092232 3 0.1488 0.8739 0.032 0.000 0.956 0.012
#> SRR1344253 4 0.5535 0.6488 0.040 0.000 0.304 0.656
#> SRR1384290 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.6023 0.4247 0.344 0.000 0.600 0.056
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0895 0.9494 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1440940 3 0.4903 0.6420 0.248 0.000 0.724 0.028
#> SRR818372 1 0.5408 -0.0634 0.500 0.000 0.488 0.012
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1310031 3 0.1211 0.8838 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR615419 3 0.1706 0.8734 0.036 0.000 0.948 0.016
#> SRR1436925 1 0.0188 0.9253 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0336 0.9234 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1490228 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1442949 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1466239 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.2730 0.9427 0.000 0.896 0.016 0.088
#> SRR1329971 1 0.0921 0.9127 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR813076 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1322981 1 0.4999 -0.0189 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR660522 3 0.1940 0.8681 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR815374 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1416337 4 0.2814 0.8668 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1316438 3 0.1452 0.8782 0.036 0.000 0.956 0.008
#> SRR1386844 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1373718 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.1059 0.9492 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1460296 1 0.0188 0.9253 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1335489 1 0.4855 0.3401 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1098761 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1312124 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615395 1 0.1211 0.9091 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.4621 0.5787 0.708 0.000 0.284 0.008
#> SRR1089054 2 0.0779 0.9492 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR816201 1 0.3300 0.8043 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR1488514 2 0.0188 0.9487 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655840 1 0.5307 0.6862 0.736 0.000 0.076 0.188
#> SRR1379303 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR613174 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1351125 3 0.2469 0.8432 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR659157 3 0.5776 -0.0978 0.028 0.000 0.504 0.468
#> SRR1480408 1 0.0188 0.9254 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR657857 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1431270 4 0.5143 0.5343 0.012 0.000 0.360 0.628
#> SRR1085614 2 0.2408 0.9423 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1330106 3 0.2480 0.8620 0.088 0.000 0.904 0.008
#> SRR1466154 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.2760 0.8313 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR659247 1 0.4356 0.5887 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1317201 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473696 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1453662 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.3172 0.7816 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0188 0.9487 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1498183 1 0.0188 0.9253 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612659 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1089595 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1074263 2 0.1488 0.9485 0.000 0.956 0.012 0.032
#> SRR1376786 1 0.1118 0.9113 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1345995 1 0.0592 0.9218 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1071035 1 0.0707 0.9203 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1068808 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.2149 0.8587 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1323558 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1381711 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR657985 4 0.3649 0.8060 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1314810 1 0.0817 0.9186 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1336505 3 0.2921 0.8081 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1474095 1 0.1557 0.8976 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.4761 0.4172 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1074909 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1101200 1 0.1118 0.9113 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380414 4 0.4916 0.4121 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1315912 1 0.0188 0.9253 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0779 0.9492 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR602282 3 0.1807 0.8835 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477653 1 0.0707 0.9201 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1355475 3 0.2011 0.8656 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1360785 4 0.3080 0.8249 0.096 0.000 0.024 0.880
#> SRR810437 3 0.2799 0.8438 0.108 0.000 0.884 0.008
#> SRR1361860 1 0.0336 0.9232 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.2773 0.8083 0.116 0.000 0.004 0.880
#> SRR1457619 1 0.2281 0.8586 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1498529 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1472033 2 0.1610 0.9483 0.000 0.952 0.016 0.032
#> SRR1445087 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1399525 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1312844 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1085874 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1101226 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1476056 1 0.3311 0.7782 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1075659 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1311916 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1353353 3 0.1211 0.8838 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1073291 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1356227 1 0.1022 0.9101 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1080720 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1091695 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1350304 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR663002 3 0.1389 0.8849 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347144 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR614047 3 0.1211 0.8838 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR818440 3 0.2081 0.8614 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0592 0.9218 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.1302 0.9046 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1074041 3 0.4164 0.6376 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.4746 0.4120 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR816699 3 0.1637 0.8795 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1308612 3 0.2647 0.8302 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1499418 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1331083 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR808272 3 0.1211 0.8838 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1436698 1 0.0707 0.9201 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1095627 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1357672 1 0.4908 0.5400 0.692 0.000 0.016 0.292
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1101256 2 0.1610 0.9483 0.000 0.952 0.016 0.032
#> SRR1436004 1 0.0469 0.9234 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1457994 2 0.1767 0.9478 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.4866 0.3461 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR615527 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1098216 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325847 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1404003 1 0.0336 0.9244 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1502143 1 0.4898 0.2759 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1487614 3 0.1302 0.8847 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.2011 0.8786 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1476547 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR656421 4 0.2760 0.7988 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1086116 2 0.0657 0.9491 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1499917 3 0.5231 0.4308 0.384 0.000 0.604 0.012
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.4699 0.5546 0.320 0.000 0.676 0.004
#> SRR1431847 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1317155 1 0.1022 0.9125 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.3667 0.8544 0.056 0.000 0.088 0.856
#> SRR1341683 3 0.5220 0.3251 0.424 0.000 0.568 0.008
#> SRR1084790 4 0.4746 0.4755 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1073731 3 0.4999 0.0829 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1332588 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR661028 1 0.0336 0.9246 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1413477 2 0.1706 0.9480 0.000 0.948 0.016 0.036
#> SRR1101152 1 0.0188 0.9253 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358435 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR2165273 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0188 0.9247 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489904 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1416386 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1406048 1 0.1474 0.8963 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR606982 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.3356 0.7602 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0524 0.9491 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1473251 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1389820 3 0.1388 0.8443 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1074289 1 0.1118 0.9113 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1348816 2 0.1389 0.9486 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1076292 3 0.1474 0.8842 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.1807 0.8835 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1443507 1 0.2281 0.8637 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1452310 1 0.4804 0.3676 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR665610 1 0.5126 0.1976 0.552 0.000 0.004 0.444
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 4 0.2530 0.8760 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9256 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9485 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.3837 0.7022 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1352299 1 0.0592 0.9218 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1076317 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1434117 3 0.3495 0.7330 0.016 0.000 0.844 0.140
#> SRR1075273 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR658657 4 0.2704 0.8693 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1092773 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1365332 1 0.3024 0.8066 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR615958 3 0.1118 0.8822 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1097688 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1403259 3 0.4985 -0.0772 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1099120 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1362200 3 0.1389 0.8849 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1464856 2 0.2861 0.9416 0.000 0.888 0.016 0.096
#> SRR1347298 3 0.1389 0.8849 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1075923 2 0.3108 0.9391 0.000 0.872 0.016 0.112
#> SRR1100703 1 0.0707 0.9201 0.980 0.000 0.020 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 1 0.1630 0.80050 0.944 0.000 0.036 0.016 0.004
#> SRR1436370 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.3480 0.63746 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.2124 0.78808 0.900 0.000 0.096 0.004 0.000
#> SRR1329744 1 0.2179 0.74062 0.896 0.000 0.004 0.000 0.100
#> SRR657384 1 0.0609 0.79107 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1351190 1 0.1341 0.77540 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.3074 0.71198 0.804 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.2358 0.73159 0.888 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR1410742 1 0.1285 0.78249 0.956 0.000 0.004 0.036 0.004
#> SRR1435963 1 0.0000 0.79479 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.4304 -0.32351 0.516 0.000 0.484 0.000 0.000
#> SRR1391354 5 0.0162 0.88279 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1087968 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0404 0.79688 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.1568 0.79568 0.944 0.000 0.036 0.000 0.020
#> SRR1325138 1 0.4653 0.45096 0.652 0.000 0.016 0.008 0.324
#> SRR1326821 5 0.0290 0.87993 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1490178 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 3 0.3752 0.70846 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0880 0.79696 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.4161 0.29367 0.000 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1407449 1 0.1671 0.79566 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.4674 0.72353 0.232 0.000 0.708 0.060 0.000
#> SRR1399069 1 0.4302 0.01618 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1366450 3 0.3861 0.71162 0.284 0.000 0.712 0.004 0.000
#> SRR1396859 1 0.0671 0.79215 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1457176 1 0.4302 -0.10323 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1434736 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080560 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1322882 3 0.3730 0.70876 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0703 0.92614 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.2230 0.77980 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.6002 0.18486 0.552 0.000 0.000 0.308 0.140
#> SRR1368141 4 0.2329 0.70172 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1440268 1 0.2513 0.72891 0.876 0.000 0.008 0.000 0.116
#> SRR1453725 1 0.4251 0.48963 0.672 0.000 0.316 0.012 0.000
#> SRR1325711 2 0.0703 0.92614 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0609 0.79989 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1477591 3 0.3752 0.70573 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.3890 0.59433 0.252 0.000 0.012 0.736 0.000
#> SRR1369052 1 0.1831 0.79690 0.920 0.000 0.076 0.004 0.000
#> SRR1377735 3 0.4219 0.59947 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.4294 0.12414 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1404531 1 0.4210 0.19954 0.588 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.4235 0.17456 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1458890 4 0.3048 0.66203 0.176 0.000 0.000 0.820 0.004
#> SRR1432695 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 4 0.3684 0.55518 0.000 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1087393 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1077263 5 0.0162 0.88257 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1385211 1 0.2516 0.75727 0.860 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0566 0.79115 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR656922 1 0.3143 0.70120 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1361630 5 0.1341 0.84130 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1318966 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.3932 0.40899 0.000 0.000 0.672 0.328 0.000
#> SRR603212 3 0.4063 0.71367 0.280 0.000 0.708 0.012 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 4 0.0794 0.74708 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.1740 0.76499 0.932 0.000 0.000 0.012 0.056
#> SRR1457835 3 0.4252 0.71617 0.280 0.000 0.700 0.020 0.000
#> SRR1347123 4 0.4304 0.08919 0.000 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1465501 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1330878 4 0.1965 0.73910 0.000 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1445064 4 0.0703 0.73832 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1452981 1 0.1377 0.78240 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1326708 3 0.3752 0.70573 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.3109 0.70585 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.1924 0.80011 0.924 0.000 0.064 0.008 0.004
#> SRR1077898 3 0.6441 0.40520 0.188 0.000 0.468 0.000 0.344
#> SRR1349080 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1375485 3 0.4604 0.42114 0.428 0.000 0.560 0.012 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 3 0.3730 0.70876 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR1380614 3 0.4030 0.62649 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.4088 0.34182 0.000 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR602082 1 0.4304 -0.20781 0.516 0.000 0.484 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0609 0.92629 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR661613 4 0.4874 0.41826 0.040 0.000 0.328 0.632 0.000
#> SRR1420710 1 0.3689 0.52320 0.740 0.000 0.000 0.256 0.004
#> SRR660426 3 0.3752 0.70573 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.4445 0.53288 0.300 0.000 0.024 0.676 0.000
#> SRR661064 1 0.0579 0.79115 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1082011 2 0.1043 0.92519 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1452718 3 0.3895 0.67267 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1353243 3 0.4060 0.63157 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1455482 3 0.4304 0.25111 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.3857 0.51036 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.4456 0.69150 0.320 0.000 0.660 0.020 0.000
#> SRR1102467 1 0.2329 0.77580 0.876 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.0162 0.88254 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1337707 4 0.1518 0.73145 0.048 0.000 0.004 0.944 0.004
#> SRR1408752 2 0.0510 0.92629 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1474617 4 0.0609 0.74158 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1398013 1 0.3544 0.60060 0.788 0.000 0.004 0.200 0.008
#> SRR1352918 5 0.0880 0.86709 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1420750 3 0.4074 0.60057 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000
#> SRR1071785 4 0.0771 0.74147 0.020 0.000 0.004 0.976 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.1943 0.80036 0.924 0.000 0.056 0.020 0.000
#> SRR1366560 1 0.2179 0.78264 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.2329 0.77421 0.876 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.2338 0.78527 0.000 0.000 0.004 0.112 0.884
#> SRR1313494 1 0.1478 0.79835 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.2723 0.71218 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR607911 1 0.2230 0.78006 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.4157 0.72020 0.264 0.000 0.716 0.020 0.000
#> SRR1400078 1 0.3844 0.60125 0.788 0.000 0.004 0.180 0.028
#> SRR1088631 2 0.2648 0.90862 0.000 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR615575 3 0.4367 0.24815 0.004 0.000 0.580 0.416 0.000
#> SRR1079434 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325559 1 0.1410 0.79607 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1446695 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383883 1 0.0880 0.79696 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1396100 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475697 1 0.3567 0.67302 0.820 0.000 0.004 0.032 0.144
#> SRR1488067 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1410380 5 0.5876 0.18541 0.000 0.000 0.384 0.104 0.512
#> SRR1445490 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.3707 0.49177 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1485812 5 0.6700 0.15157 0.152 0.000 0.016 0.376 0.456
#> SRR1078020 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 3 0.4210 0.56671 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 4 0.1117 0.73839 0.000 0.000 0.016 0.964 0.020
#> SRR807775 3 0.4321 0.27754 0.000 0.000 0.600 0.396 0.004
#> SRR1409215 2 0.1410 0.92332 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR820427 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100656 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.3480 0.63637 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1414536 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR656794 3 0.5646 0.27841 0.080 0.000 0.520 0.000 0.400
#> SRR604653 3 0.3913 0.66668 0.324 0.000 0.676 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.2416 0.80147 0.100 0.000 0.000 0.012 0.888
#> SRR1485912 3 0.4360 0.71558 0.284 0.000 0.692 0.024 0.000
#> SRR1407602 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356164 1 0.2236 0.78287 0.908 0.000 0.068 0.024 0.000
#> SRR1328692 1 0.4410 0.71442 0.764 0.000 0.124 0.112 0.000
#> SRR1362438 3 0.3796 0.69780 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1479216 4 0.4302 0.06781 0.000 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1358041 1 0.1410 0.79934 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.4707 0.72480 0.212 0.000 0.716 0.072 0.000
#> SRR1368200 4 0.1251 0.75237 0.008 0.000 0.036 0.956 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.4415 0.31208 0.004 0.000 0.000 0.444 0.552
#> SRR1437256 4 0.3266 0.64341 0.200 0.000 0.000 0.796 0.004
#> SRR1487446 1 0.1914 0.76235 0.924 0.000 0.000 0.016 0.060
#> SRR816653 3 0.4030 0.66503 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR815164 5 0.3305 0.65805 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1442043 1 0.2358 0.73160 0.888 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR1410573 1 0.3707 0.57409 0.716 0.000 0.284 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.4707 0.72459 0.228 0.000 0.708 0.064 0.000
#> SRR1382934 4 0.0404 0.74459 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1465208 1 0.0703 0.79846 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.6386 0.38563 0.580 0.000 0.192 0.016 0.212
#> SRR1470291 1 0.3109 0.70509 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.4249 0.21464 0.000 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1409600 3 0.6041 0.57918 0.252 0.000 0.604 0.012 0.132
#> SRR816123 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR614779 5 0.4134 0.62355 0.000 0.000 0.196 0.044 0.760
#> SRR810783 3 0.4914 0.70357 0.180 0.000 0.712 0.108 0.000
#> SRR1333990 1 0.0451 0.79557 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1410356 3 0.4879 0.68201 0.156 0.000 0.720 0.124 0.000
#> SRR808106 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR662713 3 0.4867 0.70347 0.180 0.000 0.716 0.104 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 4 0.4387 0.42352 0.012 0.000 0.348 0.640 0.000
#> SRR809382 4 0.0510 0.74523 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR665417 1 0.1892 0.79482 0.916 0.000 0.080 0.004 0.000
#> SRR1088016 2 0.2891 0.90428 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.1851 0.91972 0.000 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR615623 4 0.1608 0.74490 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1413787 5 0.2069 0.80848 0.000 0.000 0.012 0.076 0.912
#> SRR1478207 4 0.4182 0.33767 0.000 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1411046 1 0.1544 0.79858 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0703 0.78813 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1309051 3 0.3752 0.70573 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0703 0.79748 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR817210 3 0.4883 0.60170 0.092 0.000 0.708 0.200 0.000
#> SRR1319221 4 0.0510 0.74119 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1405413 1 0.1608 0.78684 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.2020 0.78757 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1390160 4 0.0771 0.74700 0.004 0.000 0.020 0.976 0.000
#> SRR1406283 3 0.3992 0.71869 0.268 0.000 0.720 0.012 0.000
#> SRR1357709 1 0.1682 0.79930 0.944 0.000 0.032 0.012 0.012
#> SRR1080742 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.1270 0.79933 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.4701 0.72172 0.204 0.000 0.720 0.076 0.000
#> SRR1361612 1 0.0566 0.79120 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1311224 3 0.3752 0.70573 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.4086 0.71141 0.284 0.000 0.704 0.012 0.000
#> SRR1099720 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 4 0.4163 0.59741 0.228 0.000 0.032 0.740 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 4 0.3143 0.65667 0.000 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1332879 3 0.3934 0.71597 0.276 0.000 0.716 0.008 0.000
#> SRR1403177 4 0.5443 0.50037 0.004 0.132 0.060 0.732 0.072
#> SRR1076144 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1500006 3 0.4074 0.59954 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.6183 0.41594 0.544 0.000 0.180 0.000 0.276
#> SRR1092232 4 0.0451 0.74436 0.004 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1344253 3 0.6124 0.30294 0.016 0.000 0.552 0.096 0.336
#> SRR1384290 1 0.2377 0.77272 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.5075 0.43841 0.044 0.000 0.628 0.324 0.004
#> SRR1343522 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0510 0.92617 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.4418 0.37584 0.652 0.000 0.000 0.332 0.016
#> SRR818372 1 0.5301 0.60654 0.676 0.000 0.104 0.216 0.004
#> SRR1323675 2 0.0290 0.92606 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR819894 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310031 3 0.4300 0.06968 0.000 0.000 0.524 0.476 0.000
#> SRR615419 4 0.3170 0.67066 0.160 0.000 0.004 0.828 0.008
#> SRR1436925 1 0.2773 0.74053 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.1965 0.79009 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0880 0.79696 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1490228 4 0.1579 0.74996 0.024 0.000 0.032 0.944 0.000
#> SRR1442949 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466239 1 0.1671 0.79517 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.2230 0.91561 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1329971 3 0.4473 0.59461 0.412 0.000 0.580 0.000 0.008
#> SRR813076 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.4757 0.59505 0.080 0.000 0.716 0.204 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 4 0.4287 0.13455 0.000 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR660522 3 0.4390 0.21700 0.004 0.000 0.568 0.428 0.000
#> SRR815374 1 0.2612 0.77535 0.868 0.000 0.124 0.008 0.000
#> SRR1069564 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1416337 5 0.3399 0.69047 0.000 0.000 0.168 0.020 0.812
#> SRR1316438 4 0.2237 0.74108 0.004 0.000 0.084 0.904 0.008
#> SRR1386844 1 0.1965 0.79084 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0880 0.79982 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0404 0.79672 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0794 0.92600 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.3796 0.53708 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.3766 0.56654 0.728 0.000 0.004 0.000 0.268
#> SRR1393404 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 3 0.4045 0.61373 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1401815 4 0.1908 0.74145 0.000 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 4 0.4126 0.35810 0.000 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1098761 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0451 0.79222 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR615395 3 0.4360 0.71406 0.284 0.000 0.692 0.024 0.000
#> SRR1479349 1 0.1251 0.80085 0.956 0.000 0.036 0.008 0.000
#> SRR2165033 1 0.3051 0.73857 0.852 0.000 0.028 0.120 0.000
#> SRR1089054 2 0.0794 0.92585 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.4158 0.73363 0.784 0.000 0.124 0.092 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.3373 0.71038 0.848 0.000 0.004 0.056 0.092
#> SRR1379303 1 0.1732 0.79412 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1418516 5 0.0794 0.87001 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR613174 3 0.4359 0.24903 0.004 0.000 0.584 0.412 0.000
#> SRR1351125 3 0.4299 0.30831 0.004 0.000 0.608 0.388 0.000
#> SRR659157 4 0.5786 0.39392 0.168 0.000 0.004 0.632 0.196
#> SRR1480408 1 0.2361 0.78937 0.892 0.000 0.096 0.012 0.000
#> SRR657857 1 0.0162 0.79408 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.2006 0.79798 0.916 0.000 0.072 0.012 0.000
#> SRR1094168 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1431270 5 0.6370 0.26769 0.156 0.000 0.004 0.340 0.500
#> SRR1085614 2 0.1908 0.91898 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1330106 4 0.4166 0.48405 0.348 0.000 0.004 0.648 0.000
#> SRR1466154 3 0.3774 0.70198 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.2377 0.77310 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.2852 0.73563 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.4171 0.72158 0.784 0.000 0.112 0.104 0.000
#> SRR659247 3 0.5961 0.49175 0.132 0.000 0.552 0.316 0.000
#> SRR1317201 1 0.0609 0.79740 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1473696 3 0.3884 0.70896 0.288 0.000 0.708 0.004 0.000
#> SRR1375842 3 0.4150 0.54844 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.2068 0.79293 0.904 0.000 0.092 0.004 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 3 0.3774 0.70184 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.1851 0.79320 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.4182 0.28677 0.000 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1380910 1 0.3395 0.65618 0.764 0.000 0.236 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.3707 0.57171 0.716 0.000 0.284 0.000 0.000
#> SRR612659 4 0.4305 0.03835 0.000 0.000 0.488 0.512 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.1043 0.92531 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.4352 0.72497 0.244 0.000 0.720 0.036 0.000
#> SRR1345995 3 0.3884 0.70920 0.288 0.000 0.708 0.004 0.000
#> SRR1071035 3 0.4157 0.72012 0.264 0.000 0.716 0.020 0.000
#> SRR1068808 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 3 0.4201 0.49892 0.408 0.000 0.592 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.3242 0.68522 0.784 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.3932 0.40969 0.000 0.000 0.672 0.328 0.000
#> SRR1323558 3 0.4283 0.14766 0.000 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1381711 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657985 5 0.5385 0.11345 0.000 0.000 0.432 0.056 0.512
#> SRR1314810 1 0.4655 -0.35395 0.512 0.000 0.476 0.012 0.000
#> SRR1336505 4 0.3919 0.65053 0.036 0.000 0.188 0.776 0.000
#> SRR1474095 1 0.5046 0.61500 0.704 0.000 0.156 0.140 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.3455 0.60656 0.784 0.000 0.000 0.008 0.208
#> SRR1074909 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1101200 3 0.4193 0.72213 0.256 0.000 0.720 0.024 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 5 0.0880 0.86711 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1313406 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.3816 0.69381 0.304 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.5961 0.31472 0.000 0.000 0.580 0.160 0.260
#> SRR1315912 3 0.3837 0.69834 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0794 0.92585 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR602282 4 0.2624 0.70616 0.116 0.000 0.012 0.872 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 3 0.3752 0.70573 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.4040 0.71570 0.276 0.000 0.712 0.012 0.000
#> SRR1355475 3 0.3876 0.42770 0.000 0.000 0.684 0.316 0.000
#> SRR1360785 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR810437 4 0.3631 0.69657 0.072 0.000 0.104 0.824 0.000
#> SRR1361860 1 0.1704 0.79861 0.928 0.000 0.068 0.004 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457619 1 0.1197 0.77611 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1498529 1 0.1768 0.79715 0.924 0.000 0.072 0.004 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.2813 0.90635 0.000 0.832 0.168 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.1197 0.92445 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1445087 4 0.2516 0.71804 0.000 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR1399525 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.2130 0.74921 0.908 0.000 0.000 0.012 0.080
#> SRR1075659 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1311916 4 0.4307 0.00908 0.000 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1353353 4 0.0162 0.74272 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1073291 3 0.3983 0.38947 0.000 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1356227 1 0.0451 0.79233 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1080720 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1350304 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663002 4 0.2583 0.72158 0.004 0.000 0.132 0.864 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0703 0.79748 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.4306 0.00593 0.000 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1384006 1 0.2329 0.77532 0.876 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR614047 4 0.4461 0.62985 0.052 0.000 0.220 0.728 0.000
#> SRR818440 4 0.0609 0.74609 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1337770 1 0.2358 0.78566 0.888 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR1399413 3 0.4444 0.60278 0.364 0.000 0.624 0.012 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.2795 0.78248 0.872 0.000 0.100 0.028 0.000
#> SRR1074041 3 0.4161 0.48527 0.016 0.000 0.704 0.280 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.4971 0.63555 0.116 0.000 0.708 0.176 0.000
#> SRR816699 3 0.3949 0.40143 0.000 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1308612 3 0.3928 0.45839 0.004 0.000 0.700 0.296 0.000
#> SRR1499418 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.4249 0.05954 0.568 0.000 0.432 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR808272 3 0.4201 0.25938 0.000 0.000 0.592 0.408 0.000
#> SRR1436698 3 0.4040 0.71570 0.276 0.000 0.712 0.012 0.000
#> SRR1095627 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1357672 3 0.5492 0.66129 0.168 0.000 0.684 0.012 0.136
#> SRR1351236 3 0.4060 0.60730 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1077479 3 0.4249 0.44974 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR814491 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101256 2 0.1197 0.92445 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1436004 3 0.3838 0.71379 0.280 0.000 0.716 0.004 0.000
#> SRR1457994 2 0.0963 0.92561 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.1670 0.80053 0.936 0.000 0.052 0.012 0.000
#> SRR1309534 1 0.2997 0.68703 0.840 0.000 0.000 0.012 0.148
#> SRR615527 4 0.0609 0.74512 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1098216 1 0.0609 0.79744 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0510 0.79192 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1344166 1 0.3636 0.60002 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR1368638 5 0.0794 0.87121 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1431429 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1502143 3 0.4960 0.63144 0.112 0.000 0.708 0.180 0.000
#> SRR1487614 4 0.3210 0.64919 0.000 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.2516 0.76803 0.860 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.4509 0.72598 0.236 0.000 0.716 0.048 0.000
#> SRR1476547 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR656421 5 0.0404 0.87708 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1086116 2 0.0609 0.92614 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.4956 0.44007 0.644 0.000 0.040 0.312 0.004
#> SRR1339944 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.3970 0.63015 0.236 0.000 0.020 0.744 0.000
#> SRR1431847 5 0.6678 0.24165 0.264 0.000 0.000 0.300 0.436
#> SRR1317155 1 0.1872 0.79999 0.928 0.000 0.052 0.020 0.000
#> SRR1477405 1 0.4256 0.09712 0.564 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR655289 5 0.2756 0.79696 0.096 0.000 0.012 0.012 0.880
#> SRR1341683 1 0.5534 0.47303 0.604 0.000 0.096 0.300 0.000
#> SRR1084790 3 0.5995 0.22716 0.112 0.000 0.468 0.000 0.420
#> SRR1073731 4 0.5375 0.46589 0.200 0.000 0.136 0.664 0.000
#> SRR1332588 5 0.0880 0.86842 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1471157 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.4101 0.33255 0.000 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR661028 3 0.3730 0.70876 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.1197 0.92445 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.4219 0.19348 0.584 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.1908 0.79155 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0794 0.80115 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.4620 0.28508 0.016 0.000 0.592 0.392 0.000
#> SRR1416386 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0671 0.78980 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR606982 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358082 1 0.4297 -0.07599 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.5168 0.09307 0.040 0.000 0.508 0.452 0.000
#> SRR655194 1 0.2358 0.78566 0.888 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR1331174 2 0.0404 0.92621 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1389820 4 0.0771 0.73977 0.000 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1074289 3 0.4016 0.71722 0.272 0.000 0.716 0.012 0.000
#> SRR1348816 2 0.0703 0.92614 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1076292 4 0.2625 0.72021 0.108 0.000 0.016 0.876 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.1430 0.73185 0.052 0.000 0.004 0.944 0.000
#> SRR1443507 3 0.4451 0.72446 0.248 0.000 0.712 0.040 0.000
#> SRR1452310 4 0.5816 -0.03249 0.440 0.000 0.092 0.468 0.000
#> SRR665610 1 0.2929 0.68631 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152
#> SRR1347322 1 0.3336 0.66829 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.4306 -0.16607 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.0000 0.88429 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354247 1 0.3707 0.57278 0.716 0.000 0.284 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.92577 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.5090 0.69224 0.208 0.000 0.688 0.104 0.000
#> SRR1352299 3 0.3928 0.70226 0.296 0.000 0.700 0.004 0.000
#> SRR1076317 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.6029 0.35491 0.008 0.000 0.604 0.236 0.152
#> SRR1075273 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR658657 5 0.3812 0.69638 0.024 0.000 0.000 0.204 0.772
#> SRR1092773 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1365332 3 0.4619 0.72523 0.216 0.000 0.720 0.064 0.000
#> SRR615958 3 0.4291 0.11161 0.000 0.000 0.536 0.464 0.000
#> SRR1097688 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1403259 4 0.5036 0.03583 0.004 0.000 0.024 0.520 0.452
#> SRR1099120 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.4249 0.20290 0.000 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1464856 2 0.2179 0.91628 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.4283 0.12913 0.000 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1075923 2 0.2966 0.90321 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1100703 3 0.4356 0.67177 0.340 0.000 0.648 0.012 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 1 0.1932 0.71350 0.924 0.000 0.040 0.016 0.000 0.020
#> SRR1436370 2 0.0291 0.87420 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1075752 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1397949 1 0.5197 0.51852 0.568 0.000 0.320 0.000 0.000 0.112
#> SRR1355723 1 0.3278 0.70164 0.808 0.000 0.152 0.000 0.000 0.040
#> SRR1329744 1 0.1845 0.70092 0.916 0.000 0.008 0.000 0.004 0.072
#> SRR657384 1 0.2009 0.68309 0.908 0.000 0.024 0.000 0.000 0.068
#> SRR1351190 1 0.1995 0.66796 0.912 0.000 0.000 0.036 0.000 0.052
#> SRR1458662 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4812 0.48108 0.588 0.000 0.344 0.000 0.000 0.068
#> SRR1396017 1 0.1411 0.70414 0.936 0.000 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1410742 1 0.2001 0.65935 0.900 0.000 0.004 0.004 0.000 0.092
#> SRR1435963 1 0.1082 0.71346 0.956 0.000 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1382416 3 0.5610 0.09485 0.416 0.000 0.440 0.000 0.000 0.144
#> SRR1391354 5 0.4281 0.47402 0.228 0.000 0.000 0.000 0.704 0.068
#> SRR1087968 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.1176 0.71605 0.956 0.000 0.024 0.000 0.000 0.020
#> SRR1312244 1 0.2357 0.70126 0.872 0.000 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR1325138 1 0.3674 0.63670 0.804 0.000 0.020 0.000 0.132 0.044
#> SRR1326821 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 3 0.2003 0.74366 0.044 0.000 0.912 0.000 0.000 0.044
#> SRR1075707 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1443871 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1465758 1 0.2784 0.70273 0.848 0.000 0.028 0.000 0.000 0.124
#> SRR1414058 3 0.3062 0.64677 0.000 0.000 0.824 0.144 0.000 0.032
#> SRR1407449 1 0.2907 0.70523 0.828 0.000 0.152 0.000 0.000 0.020
#> SRR1436858 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.2633 0.74522 0.028 0.000 0.888 0.040 0.000 0.044
#> SRR1399069 1 0.3766 0.44454 0.720 0.000 0.000 0.000 0.256 0.024
#> SRR1366450 3 0.1176 0.74927 0.020 0.000 0.956 0.000 0.000 0.024
#> SRR1396859 1 0.2673 0.68848 0.852 0.000 0.012 0.000 0.004 0.132
#> SRR1457176 3 0.4210 0.46282 0.288 0.000 0.672 0.000 0.000 0.040
#> SRR1097666 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1434736 5 0.2487 0.76485 0.032 0.000 0.000 0.000 0.876 0.092
#> SRR1080560 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1322882 3 0.1245 0.74776 0.032 0.000 0.952 0.000 0.000 0.016
#> SRR1435688 2 0.1349 0.87412 0.000 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1327614 1 0.4085 0.69062 0.752 0.000 0.120 0.000 0.000 0.128
#> SRR658152 1 0.4452 0.45036 0.712 0.000 0.004 0.212 0.004 0.068
#> SRR1368141 4 0.3559 0.30059 0.152 0.000 0.012 0.800 0.000 0.036
#> SRR1440268 1 0.2163 0.69372 0.892 0.000 0.008 0.000 0.004 0.096
#> SRR1453725 1 0.6514 0.30839 0.444 0.000 0.372 0.088 0.000 0.096
#> SRR1325711 2 0.1588 0.87310 0.000 0.924 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR1477930 1 0.1951 0.72142 0.908 0.000 0.076 0.000 0.000 0.016
#> SRR1477591 3 0.1863 0.74333 0.044 0.000 0.920 0.000 0.000 0.036
#> SRR1416049 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.6337 -0.37414 0.424 0.000 0.024 0.364 0.000 0.188
#> SRR1369052 1 0.3542 0.68247 0.788 0.000 0.160 0.000 0.000 0.052
#> SRR1377735 3 0.4992 0.50734 0.260 0.000 0.624 0.000 0.000 0.116
#> SRR1331244 1 0.4236 0.45813 0.656 0.000 0.000 0.000 0.308 0.036
#> SRR1404531 3 0.4453 0.33873 0.332 0.000 0.624 0.000 0.000 0.044
#> SRR1324331 1 0.4270 0.48912 0.684 0.000 0.000 0.000 0.264 0.052
#> SRR1458890 4 0.4289 0.15971 0.220 0.000 0.012 0.720 0.000 0.048
#> SRR1432695 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 4 0.5659 0.19507 0.000 0.000 0.424 0.424 0.000 0.152
#> SRR1087393 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1077263 5 0.0260 0.83133 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1385211 1 0.4684 0.60962 0.656 0.000 0.256 0.000 0.000 0.088
#> SRR655241 1 0.1141 0.69097 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR656922 1 0.4524 0.54849 0.628 0.000 0.320 0.000 0.000 0.052
#> SRR1361630 5 0.1082 0.80381 0.000 0.000 0.040 0.004 0.956 0.000
#> SRR1318966 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1407087 3 0.2201 0.71357 0.000 0.000 0.900 0.048 0.000 0.052
#> SRR603212 3 0.1794 0.74454 0.040 0.000 0.924 0.000 0.000 0.036
#> SRR1321088 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 4 0.4890 0.41961 0.000 0.000 0.140 0.656 0.000 0.204
#> SRR1332232 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.2053 0.68488 0.888 0.000 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1457835 3 0.2633 0.72635 0.032 0.000 0.864 0.000 0.000 0.104
#> SRR1347123 3 0.3979 0.18614 0.000 0.000 0.540 0.456 0.000 0.004
#> SRR1465501 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1330878 4 0.5492 0.35329 0.000 0.000 0.168 0.552 0.000 0.280
#> SRR1445064 4 0.2908 0.40843 0.076 0.000 0.012 0.864 0.000 0.048
#> SRR1452981 1 0.2504 0.63640 0.856 0.000 0.000 0.004 0.004 0.136
#> SRR1326708 3 0.1995 0.73936 0.052 0.000 0.912 0.000 0.000 0.036
#> SRR1407157 1 0.4670 0.57970 0.636 0.000 0.292 0.000 0.000 0.072
#> SRR1365401 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.2535 0.72622 0.888 0.000 0.064 0.012 0.000 0.036
#> SRR1077898 3 0.5807 0.41437 0.080 0.000 0.552 0.000 0.320 0.048
#> SRR1349080 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1375485 3 0.3766 0.59624 0.212 0.000 0.748 0.000 0.000 0.040
#> SRR1432563 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 3 0.1341 0.74786 0.028 0.000 0.948 0.000 0.000 0.024
#> SRR1380614 3 0.4828 0.55610 0.200 0.000 0.664 0.000 0.000 0.136
#> SRR812060 3 0.2889 0.66517 0.000 0.000 0.848 0.108 0.000 0.044
#> SRR602082 3 0.4388 0.50168 0.276 0.000 0.668 0.000 0.000 0.056
#> SRR1069490 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1078417 2 0.1152 0.87462 0.000 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR661613 4 0.4959 0.09406 0.040 0.000 0.452 0.496 0.000 0.012
#> SRR1420710 1 0.3324 0.60154 0.832 0.000 0.008 0.084 0.000 0.076
#> SRR660426 3 0.1856 0.74116 0.048 0.000 0.920 0.000 0.000 0.032
#> SRR1416003 1 0.5850 -0.00697 0.512 0.000 0.060 0.368 0.000 0.060
#> SRR661064 1 0.1926 0.68673 0.912 0.000 0.020 0.000 0.000 0.068
#> SRR1082011 2 0.1531 0.87370 0.000 0.928 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR1452718 3 0.3469 0.70096 0.104 0.000 0.808 0.000 0.000 0.088
#> SRR1353243 3 0.3958 0.66409 0.128 0.000 0.764 0.000 0.000 0.108
#> SRR1455482 3 0.4911 0.43190 0.276 0.000 0.624 0.000 0.000 0.100
#> SRR1313473 3 0.4705 -0.21096 0.476 0.000 0.480 0.000 0.000 0.044
#> SRR1399394 3 0.2384 0.73854 0.064 0.000 0.888 0.000 0.000 0.048
#> SRR1102467 1 0.3854 0.70100 0.772 0.000 0.136 0.000 0.000 0.092
#> SRR1317470 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337707 4 0.5371 0.17723 0.088 0.000 0.012 0.552 0.000 0.348
#> SRR1408752 2 0.0692 0.87502 0.000 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1474617 4 0.0717 0.47423 0.000 0.000 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1398013 1 0.3120 0.61220 0.840 0.000 0.008 0.040 0.000 0.112
#> SRR1352918 5 0.1245 0.81073 0.032 0.000 0.000 0.000 0.952 0.016
#> SRR1420750 3 0.4425 0.61244 0.176 0.000 0.712 0.000 0.000 0.112
#> SRR1071785 4 0.2071 0.44229 0.044 0.000 0.012 0.916 0.000 0.028
#> SRR1353618 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.3324 0.69393 0.832 0.000 0.084 0.008 0.000 0.076
#> SRR1366560 1 0.4190 0.69245 0.740 0.000 0.148 0.000 0.000 0.112
#> SRR1355684 1 0.4369 0.67756 0.720 0.000 0.164 0.000 0.000 0.116
#> SRR1323289 5 0.1644 0.79348 0.000 0.000 0.004 0.076 0.920 0.000
#> SRR1313494 1 0.2445 0.71535 0.872 0.000 0.108 0.000 0.000 0.020
#> SRR1309985 1 0.1219 0.70072 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR607911 1 0.3744 0.68370 0.756 0.000 0.200 0.000 0.000 0.044
#> SRR1333789 3 0.0951 0.74771 0.020 0.000 0.968 0.004 0.000 0.008
#> SRR1400078 1 0.4542 0.19185 0.636 0.000 0.008 0.028 0.004 0.324
#> SRR1088631 2 0.3290 0.84502 0.000 0.744 0.000 0.004 0.000 0.252
#> SRR1092842 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR615575 3 0.5507 0.19458 0.000 0.000 0.548 0.168 0.000 0.284
#> SRR1079434 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.4059 0.69806 0.752 0.000 0.148 0.000 0.000 0.100
#> SRR1446695 5 0.0508 0.83062 0.000 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1383883 1 0.2613 0.68889 0.848 0.000 0.012 0.000 0.000 0.140
#> SRR1396100 5 0.0363 0.83122 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1475697 1 0.3735 0.64016 0.792 0.000 0.000 0.084 0.004 0.120
#> SRR1488067 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1102103 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1084991 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1410380 5 0.4268 0.19607 0.000 0.000 0.428 0.012 0.556 0.004
#> SRR1445490 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.4222 0.58439 0.748 0.000 0.004 0.132 0.000 0.116
#> SRR1485812 5 0.8036 -0.32939 0.248 0.000 0.024 0.160 0.316 0.252
#> SRR1078020 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 3 0.4784 0.60893 0.184 0.000 0.696 0.000 0.012 0.108
#> SRR1376406 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1343898 4 0.4702 0.36516 0.000 0.000 0.036 0.644 0.020 0.300
#> SRR807775 3 0.2971 0.65410 0.000 0.000 0.832 0.144 0.004 0.020
#> SRR1409215 2 0.2402 0.86549 0.000 0.856 0.000 0.004 0.000 0.140
#> SRR820427 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1362159 1 0.4917 0.50000 0.576 0.000 0.348 0.000 0.000 0.076
#> SRR1414536 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656794 3 0.3565 0.51026 0.004 0.000 0.692 0.000 0.304 0.000
#> SRR604653 3 0.2509 0.72091 0.088 0.000 0.876 0.000 0.000 0.036
#> SRR1317685 5 0.5288 0.46364 0.148 0.000 0.000 0.040 0.676 0.136
#> SRR1485912 3 0.1829 0.74184 0.024 0.000 0.920 0.000 0.000 0.056
#> SRR1407602 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.5732 0.10255 0.552 0.000 0.124 0.020 0.000 0.304
#> SRR1328692 1 0.6077 0.45056 0.556 0.000 0.152 0.252 0.000 0.040
#> SRR1362438 3 0.1984 0.73938 0.056 0.000 0.912 0.000 0.000 0.032
#> SRR1479216 3 0.4672 0.31515 0.000 0.000 0.596 0.348 0.000 0.056
#> SRR1358041 1 0.2999 0.70494 0.836 0.000 0.124 0.000 0.000 0.040
#> SRR1468766 3 0.1536 0.74534 0.016 0.000 0.940 0.004 0.000 0.040
#> SRR1368200 4 0.5133 0.38121 0.000 0.000 0.116 0.592 0.000 0.292
#> SRR1435602 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1501043 4 0.4211 -0.07853 0.000 0.000 0.004 0.532 0.456 0.008
#> SRR1437256 4 0.5735 -0.20166 0.368 0.000 0.012 0.496 0.000 0.124
#> SRR1487446 1 0.1390 0.69186 0.948 0.000 0.000 0.016 0.004 0.032
#> SRR816653 3 0.2985 0.71948 0.100 0.000 0.844 0.000 0.000 0.056
#> SRR815164 5 0.5055 0.30762 0.244 0.000 0.000 0.000 0.624 0.132
#> SRR1442043 1 0.2146 0.69265 0.880 0.000 0.000 0.000 0.004 0.116
#> SRR1410573 1 0.5285 0.46586 0.536 0.000 0.352 0.000 0.000 0.112
#> SRR1096782 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1352369 3 0.1950 0.75051 0.028 0.000 0.924 0.016 0.000 0.032
#> SRR1382934 4 0.0993 0.47077 0.000 0.000 0.012 0.964 0.000 0.024
#> SRR1465208 1 0.2506 0.71184 0.880 0.000 0.068 0.000 0.000 0.052
#> SRR1314728 6 0.6824 0.36593 0.352 0.000 0.092 0.000 0.136 0.420
#> SRR1470291 1 0.4530 0.51886 0.600 0.000 0.356 0.000 0.000 0.044
#> SRR1308756 3 0.4681 0.45369 0.000 0.000 0.668 0.232 0.000 0.100
#> SRR1409600 3 0.5675 0.56622 0.168 0.000 0.672 0.020 0.064 0.076
#> SRR816123 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR614779 5 0.3713 0.46193 0.000 0.000 0.284 0.004 0.704 0.008
#> SRR810783 3 0.3239 0.67643 0.024 0.000 0.808 0.004 0.000 0.164
#> SRR1333990 1 0.1866 0.70401 0.908 0.000 0.008 0.000 0.000 0.084
#> SRR1410356 3 0.0914 0.73742 0.000 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016
#> SRR808106 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662713 3 0.1590 0.74251 0.008 0.000 0.936 0.008 0.000 0.048
#> SRR1447058 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.4828 0.42238 0.004 0.000 0.640 0.276 0.000 0.080
#> SRR809382 4 0.5197 0.32103 0.012 0.000 0.072 0.568 0.000 0.348
#> SRR665417 1 0.3412 0.71189 0.808 0.000 0.128 0.000 0.000 0.064
#> SRR1088016 2 0.3151 0.84512 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1453166 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1069826 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1077781 2 0.2520 0.86362 0.000 0.844 0.000 0.004 0.000 0.152
#> SRR615623 4 0.5360 0.35860 0.000 0.000 0.136 0.556 0.000 0.308
#> SRR1413787 5 0.1755 0.79368 0.000 0.000 0.032 0.028 0.932 0.008
#> SRR1478207 3 0.3747 0.33051 0.000 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.2651 0.70941 0.860 0.000 0.028 0.000 0.000 0.112
#> SRR1313711 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1155 0.70544 0.956 0.000 0.004 0.000 0.004 0.036
#> SRR1309051 3 0.1794 0.74609 0.036 0.000 0.924 0.000 0.000 0.040
#> SRR1486949 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.1856 0.71947 0.920 0.000 0.032 0.000 0.000 0.048
#> SRR1074956 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1092961 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR817210 3 0.0951 0.74478 0.004 0.000 0.968 0.020 0.000 0.008
#> SRR1319221 4 0.0622 0.47130 0.000 0.000 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1405413 1 0.3432 0.67010 0.800 0.000 0.052 0.000 0.000 0.148
#> SRR607807 1 0.4159 0.69192 0.744 0.000 0.140 0.000 0.000 0.116
#> SRR1390160 4 0.1655 0.47436 0.008 0.000 0.052 0.932 0.000 0.008
#> SRR1406283 3 0.2020 0.74807 0.020 0.000 0.920 0.020 0.000 0.040
#> SRR1357709 1 0.3325 0.68071 0.820 0.000 0.084 0.000 0.000 0.096
#> SRR1080742 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1468208 1 0.3108 0.70562 0.828 0.000 0.044 0.000 0.000 0.128
#> SRR1312766 3 0.1251 0.74465 0.012 0.000 0.956 0.024 0.000 0.008
#> SRR1361612 1 0.1949 0.69270 0.904 0.000 0.004 0.000 0.004 0.088
#> SRR1311224 3 0.1934 0.74493 0.040 0.000 0.916 0.000 0.000 0.044
#> SRR1087801 3 0.3091 0.73089 0.036 0.000 0.852 0.020 0.000 0.092
#> SRR1099720 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1349250 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1350912 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 4 0.7067 -0.02806 0.216 0.000 0.280 0.416 0.000 0.088
#> SRR1074980 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 4 0.5833 0.30361 0.000 0.000 0.256 0.492 0.000 0.252
#> SRR1332879 3 0.0993 0.74821 0.024 0.000 0.964 0.000 0.000 0.012
#> SRR1403177 6 0.5902 -0.15056 0.044 0.056 0.000 0.436 0.008 0.456
#> SRR1076144 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR818239 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1421069 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1500006 3 0.3493 0.67147 0.148 0.000 0.796 0.000 0.000 0.056
#> SRR1485678 1 0.6176 0.25095 0.448 0.000 0.380 0.000 0.144 0.028
#> SRR1092232 4 0.3969 0.34376 0.000 0.000 0.016 0.652 0.000 0.332
#> SRR1344253 3 0.4700 0.49658 0.000 0.000 0.668 0.036 0.268 0.028
#> SRR1384290 1 0.3807 0.68660 0.756 0.000 0.192 0.000 0.000 0.052
#> SRR1089349 3 0.4086 0.57650 0.000 0.000 0.752 0.124 0.000 0.124
#> SRR1343522 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.1152 0.87474 0.000 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1440940 1 0.4258 0.53590 0.756 0.000 0.024 0.160 0.000 0.060
#> SRR818372 1 0.5991 0.39655 0.552 0.000 0.164 0.256 0.000 0.028
#> SRR1323675 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 5 0.0260 0.83204 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1310031 3 0.4109 0.42188 0.000 0.000 0.648 0.328 0.000 0.024
#> SRR615419 4 0.6306 -0.22328 0.240 0.000 0.012 0.396 0.000 0.352
#> SRR1436925 1 0.4272 0.57635 0.668 0.000 0.288 0.000 0.000 0.044
#> SRR1477238 1 0.3587 0.69406 0.792 0.000 0.068 0.000 0.000 0.140
#> SRR1332566 1 0.2653 0.68846 0.844 0.000 0.012 0.000 0.000 0.144
#> SRR1490228 4 0.5643 0.29398 0.020 0.000 0.096 0.520 0.000 0.364
#> SRR1442949 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.3657 0.71348 0.792 0.000 0.100 0.000 0.000 0.108
#> SRR1094003 2 0.2805 0.85846 0.000 0.812 0.000 0.004 0.000 0.184
#> SRR1329971 3 0.5898 0.43893 0.240 0.000 0.584 0.000 0.040 0.136
#> SRR813076 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1322981 3 0.1176 0.73436 0.000 0.000 0.956 0.024 0.000 0.020
#> SRR1485976 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4929 0.32377 0.000 0.000 0.608 0.300 0.000 0.092
#> SRR660522 3 0.4100 0.60037 0.004 0.000 0.760 0.124 0.000 0.112
#> SRR815374 1 0.3874 0.63935 0.732 0.000 0.228 0.000 0.000 0.040
#> SRR1069564 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1416337 5 0.3564 0.49463 0.000 0.000 0.264 0.000 0.724 0.012
#> SRR1316438 4 0.5993 0.27650 0.020 0.000 0.120 0.484 0.004 0.372
#> SRR1386844 1 0.2510 0.71645 0.872 0.000 0.028 0.000 0.000 0.100
#> SRR1373718 1 0.2383 0.71674 0.880 0.000 0.024 0.000 0.000 0.096
#> SRR1447458 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.2623 0.69714 0.852 0.000 0.016 0.000 0.000 0.132
#> SRR1441421 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0937 0.87496 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1460296 1 0.5175 0.30316 0.492 0.000 0.420 0.000 0.000 0.088
#> SRR1335489 1 0.4204 0.57003 0.740 0.000 0.000 0.000 0.128 0.132
#> SRR1393404 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 3 0.3190 0.68462 0.136 0.000 0.820 0.000 0.000 0.044
#> SRR1401815 4 0.4569 0.43953 0.000 0.000 0.156 0.700 0.000 0.144
#> SRR1071337 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1331793 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4952 0.11133 0.000 0.000 0.524 0.408 0.000 0.068
#> SRR1098761 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1312124 1 0.2320 0.68753 0.864 0.000 0.004 0.000 0.000 0.132
#> SRR615395 3 0.1616 0.74502 0.020 0.000 0.940 0.012 0.000 0.028
#> SRR1479349 1 0.1983 0.71871 0.908 0.000 0.072 0.000 0.000 0.020
#> SRR2165033 1 0.2924 0.66828 0.864 0.000 0.024 0.084 0.000 0.028
#> SRR1089054 2 0.0790 0.87482 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR816201 1 0.4604 0.63200 0.720 0.000 0.192 0.032 0.000 0.056
#> SRR1488514 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.2673 0.62688 0.852 0.000 0.000 0.012 0.004 0.132
#> SRR1379303 1 0.3453 0.69674 0.804 0.000 0.064 0.000 0.000 0.132
#> SRR1418516 5 0.1812 0.77621 0.080 0.000 0.000 0.000 0.912 0.008
#> SRR613174 3 0.3588 0.59353 0.000 0.000 0.776 0.180 0.000 0.044
#> SRR1351125 3 0.3088 0.64391 0.000 0.000 0.808 0.172 0.000 0.020
#> SRR659157 6 0.7412 0.25893 0.220 0.000 0.008 0.312 0.096 0.364
#> SRR1480408 1 0.3229 0.70283 0.828 0.000 0.120 0.004 0.000 0.048
#> SRR657857 1 0.1196 0.70290 0.952 0.000 0.008 0.000 0.000 0.040
#> SRR1073317 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.3432 0.68730 0.800 0.000 0.148 0.000 0.000 0.052
#> SRR1094168 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1431270 6 0.7607 0.27282 0.164 0.000 0.008 0.180 0.264 0.384
#> SRR1085614 2 0.2558 0.86340 0.000 0.840 0.000 0.004 0.000 0.156
#> SRR1330106 6 0.6849 0.27944 0.336 0.000 0.044 0.280 0.000 0.340
#> SRR1466154 3 0.2294 0.73178 0.072 0.000 0.892 0.000 0.000 0.036
#> SRR1396944 1 0.3678 0.70636 0.788 0.000 0.128 0.000 0.000 0.084
#> SRR1082784 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.4691 0.64470 0.680 0.000 0.196 0.000 0.000 0.124
#> SRR614659 1 0.6086 0.22864 0.496 0.000 0.256 0.012 0.000 0.236
#> SRR659247 3 0.6846 -0.25345 0.056 0.000 0.388 0.216 0.000 0.340
#> SRR1317201 1 0.2613 0.68889 0.848 0.000 0.012 0.000 0.000 0.140
#> SRR1473696 3 0.2998 0.72777 0.064 0.000 0.856 0.008 0.000 0.072
#> SRR1375842 3 0.3637 0.65301 0.164 0.000 0.780 0.000 0.000 0.056
#> SRR1388123 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1453662 1 0.4354 0.62020 0.704 0.000 0.216 0.000 0.000 0.080
#> SRR1345499 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 3 0.3221 0.70370 0.096 0.000 0.828 0.000 0.000 0.076
#> SRR1416693 1 0.3092 0.71515 0.836 0.000 0.060 0.000 0.000 0.104
#> SRR1070841 3 0.3727 0.60725 0.004 0.000 0.768 0.188 0.000 0.040
#> SRR1380910 1 0.4905 0.52015 0.580 0.000 0.344 0.000 0.000 0.076
#> SRR1333125 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4570 0.33206 0.528 0.000 0.436 0.000 0.000 0.036
#> SRR612659 3 0.5089 0.29575 0.000 0.000 0.592 0.300 0.000 0.108
#> SRR1447148 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1089595 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1074263 2 0.2100 0.86928 0.000 0.884 0.000 0.004 0.000 0.112
#> SRR1376786 3 0.1092 0.74738 0.020 0.000 0.960 0.000 0.000 0.020
#> SRR1345995 3 0.3553 0.71510 0.068 0.000 0.820 0.016 0.000 0.096
#> SRR1071035 3 0.0909 0.74880 0.020 0.000 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR1068808 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1332754 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 3 0.3588 0.63926 0.180 0.000 0.776 0.000 0.000 0.044
#> SRR1335355 1 0.4798 0.55527 0.612 0.000 0.312 0.000 0.000 0.076
#> SRR659448 3 0.1297 0.73287 0.000 0.000 0.948 0.040 0.000 0.012
#> SRR1323558 3 0.5607 0.18122 0.000 0.000 0.544 0.216 0.000 0.240
#> SRR1381711 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657985 3 0.4208 0.17785 0.000 0.000 0.536 0.004 0.452 0.008
#> SRR1314810 6 0.6187 0.18772 0.264 0.000 0.348 0.004 0.000 0.384
#> SRR1336505 4 0.5073 0.20354 0.080 0.000 0.268 0.636 0.000 0.016
#> SRR1474095 1 0.6207 0.44923 0.516 0.000 0.320 0.064 0.000 0.100
#> SRR1363831 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.2875 0.64738 0.852 0.000 0.000 0.000 0.052 0.096
#> SRR1074909 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1101200 3 0.0862 0.74703 0.016 0.000 0.972 0.004 0.000 0.008
#> SRR1075408 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 5 0.1007 0.81003 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1380184 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.3354 0.70651 0.128 0.000 0.812 0.000 0.000 0.060
#> SRR1380414 3 0.4229 0.55618 0.000 0.000 0.728 0.008 0.208 0.056
#> SRR1315912 3 0.2499 0.73321 0.072 0.000 0.880 0.000 0.000 0.048
#> SRR1075778 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0858 0.87480 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR602282 4 0.2926 0.35737 0.112 0.000 0.012 0.852 0.000 0.024
#> SRR1361195 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR600493 3 0.1865 0.74448 0.040 0.000 0.920 0.000 0.000 0.040
#> SRR1477653 3 0.2642 0.74174 0.032 0.000 0.884 0.020 0.000 0.064
#> SRR1355475 3 0.2258 0.70928 0.000 0.000 0.896 0.060 0.000 0.044
#> SRR1360785 5 0.0146 0.83329 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR810437 1 0.7445 -0.34376 0.336 0.000 0.168 0.324 0.000 0.172
#> SRR1361860 1 0.2867 0.71591 0.848 0.000 0.040 0.000 0.000 0.112
#> SRR1441311 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 5 0.4215 0.44492 0.244 0.000 0.000 0.000 0.700 0.056
#> SRR1457619 1 0.2695 0.68561 0.844 0.000 0.008 0.000 0.004 0.144
#> SRR1498529 1 0.3307 0.68969 0.808 0.000 0.148 0.000 0.000 0.044
#> SRR1097172 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3337 0.84395 0.000 0.736 0.000 0.004 0.000 0.260
#> SRR1472033 2 0.2006 0.87029 0.000 0.892 0.000 0.004 0.000 0.104
#> SRR1445087 4 0.3789 0.39197 0.000 0.000 0.260 0.716 0.000 0.024
#> SRR1399525 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1312844 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1085874 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1101226 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1476056 1 0.1531 0.68443 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1075659 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1311916 3 0.5282 0.24299 0.000 0.000 0.568 0.304 0.000 0.128
#> SRR1353353 4 0.2081 0.44568 0.036 0.000 0.012 0.916 0.000 0.036
#> SRR1073291 3 0.1926 0.71508 0.000 0.000 0.912 0.068 0.000 0.020
#> SRR1356227 1 0.1349 0.69158 0.940 0.000 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1080720 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1091695 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1350304 5 0.0146 0.83321 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR663002 4 0.3301 0.43534 0.000 0.000 0.188 0.788 0.000 0.024
#> SRR1376983 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.2266 0.70232 0.880 0.000 0.012 0.000 0.000 0.108
#> SRR1347144 3 0.4659 0.43174 0.000 0.000 0.656 0.260 0.000 0.084
#> SRR1384006 1 0.3422 0.69834 0.792 0.000 0.168 0.000 0.000 0.040
#> SRR1499108 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR614047 4 0.6403 0.23825 0.020 0.000 0.232 0.420 0.000 0.328
#> SRR818440 4 0.4976 0.35900 0.004 0.000 0.076 0.596 0.000 0.324
#> SRR1337770 1 0.3683 0.68240 0.768 0.000 0.184 0.000 0.000 0.048
#> SRR1399413 3 0.4091 0.62081 0.200 0.000 0.732 0.000 0.000 0.068
#> SRR1385542 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.3627 0.68808 0.796 0.000 0.156 0.020 0.000 0.028
#> SRR1074041 3 0.1682 0.72845 0.000 0.000 0.928 0.020 0.000 0.052
#> SRR1394495 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.1059 0.74558 0.016 0.000 0.964 0.004 0.000 0.016
#> SRR816699 3 0.2962 0.67664 0.000 0.000 0.848 0.084 0.000 0.068
#> SRR1308612 3 0.1802 0.72577 0.000 0.000 0.916 0.072 0.000 0.012
#> SRR1499418 5 0.0725 0.82841 0.000 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1352894 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 3 0.5634 -0.05569 0.416 0.000 0.436 0.000 0.000 0.148
#> SRR1331083 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR808272 3 0.3752 0.59376 0.000 0.000 0.772 0.164 0.000 0.064
#> SRR1436698 3 0.1861 0.74817 0.020 0.000 0.928 0.016 0.000 0.036
#> SRR1095627 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1357672 3 0.3427 0.72626 0.020 0.000 0.844 0.012 0.080 0.044
#> SRR1351236 3 0.3394 0.67434 0.144 0.000 0.804 0.000 0.000 0.052
#> SRR1077479 3 0.5171 0.32587 0.336 0.000 0.560 0.000 0.000 0.104
#> SRR814491 5 0.0405 0.83081 0.008 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1101256 2 0.1753 0.87239 0.000 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1436004 3 0.1065 0.74903 0.020 0.000 0.964 0.008 0.000 0.008
#> SRR1457994 2 0.1806 0.87202 0.000 0.908 0.000 0.004 0.000 0.088
#> SRR1078998 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.2776 0.71069 0.860 0.000 0.104 0.004 0.000 0.032
#> SRR1309534 1 0.2547 0.68125 0.868 0.000 0.000 0.004 0.016 0.112
#> SRR615527 4 0.1082 0.47898 0.000 0.000 0.040 0.956 0.000 0.004
#> SRR1098216 1 0.2613 0.68743 0.848 0.000 0.012 0.000 0.000 0.140
#> SRR1325847 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1404003 1 0.2437 0.69506 0.888 0.000 0.036 0.004 0.000 0.072
#> SRR1344166 1 0.4685 0.33373 0.520 0.000 0.436 0.000 0.000 0.044
#> SRR1368638 5 0.2255 0.76572 0.080 0.000 0.000 0.000 0.892 0.028
#> SRR1431429 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1080509 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1502143 3 0.1555 0.74015 0.008 0.000 0.940 0.012 0.000 0.040
#> SRR1487614 4 0.3201 0.40579 0.000 0.000 0.208 0.780 0.000 0.012
#> SRR1402307 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.3602 0.67434 0.760 0.000 0.208 0.000 0.000 0.032
#> SRR1099212 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.2624 0.74598 0.020 0.000 0.884 0.028 0.000 0.068
#> SRR1476547 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR656421 5 0.0146 0.83285 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1086116 2 0.0632 0.87479 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1499917 1 0.4798 0.49541 0.716 0.000 0.032 0.164 0.000 0.088
#> SRR1339944 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0146 0.87373 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1434889 6 0.7097 0.11037 0.184 0.000 0.096 0.348 0.000 0.372
#> SRR1431847 1 0.7239 -0.38032 0.384 0.000 0.000 0.212 0.296 0.108
#> SRR1317155 1 0.2956 0.71261 0.856 0.000 0.100 0.016 0.000 0.028
#> SRR1477405 3 0.4913 0.30768 0.332 0.000 0.588 0.000 0.000 0.080
#> SRR655289 5 0.6436 -0.01900 0.144 0.000 0.048 0.000 0.444 0.364
#> SRR1341683 1 0.5701 0.53934 0.644 0.000 0.164 0.124 0.000 0.068
#> SRR1084790 3 0.3925 0.45946 0.008 0.000 0.656 0.000 0.332 0.004
#> SRR1073731 4 0.5637 0.07792 0.164 0.000 0.228 0.592 0.000 0.016
#> SRR1332588 5 0.2170 0.75109 0.100 0.000 0.000 0.000 0.888 0.012
#> SRR1471157 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.2066 0.71168 0.000 0.000 0.904 0.072 0.000 0.024
#> SRR661028 3 0.1498 0.74659 0.032 0.000 0.940 0.000 0.000 0.028
#> SRR1413477 2 0.1908 0.87126 0.000 0.900 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR1101152 3 0.4530 0.25083 0.356 0.000 0.600 0.000 0.000 0.044
#> SRR1358435 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR2165273 1 0.2988 0.70841 0.824 0.000 0.152 0.000 0.000 0.024
#> SRR1379014 1 0.0914 0.71532 0.968 0.000 0.016 0.000 0.000 0.016
#> SRR1489904 3 0.3636 0.49927 0.000 0.000 0.676 0.320 0.000 0.004
#> SRR1416386 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1406048 1 0.1949 0.68359 0.904 0.000 0.004 0.000 0.004 0.088
#> SRR606982 5 0.0000 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358082 3 0.4843 0.38236 0.300 0.000 0.616 0.000 0.000 0.084
#> SRR1312934 3 0.4586 0.27830 0.004 0.000 0.564 0.400 0.000 0.032
#> SRR655194 1 0.3280 0.70264 0.812 0.000 0.152 0.004 0.000 0.032
#> SRR1331174 2 0.0603 0.87494 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1473251 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1389820 4 0.0725 0.47029 0.000 0.000 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR1074289 3 0.1949 0.74902 0.020 0.000 0.924 0.020 0.000 0.036
#> SRR1348816 2 0.1753 0.87236 0.000 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1076292 4 0.4776 0.17166 0.176 0.000 0.028 0.712 0.000 0.084
#> SRR1395810 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.6158 0.03859 0.124 0.000 0.036 0.460 0.000 0.380
#> SRR1443507 3 0.1059 0.74685 0.016 0.000 0.964 0.004 0.000 0.016
#> SRR1452310 1 0.7276 -0.34618 0.376 0.000 0.104 0.256 0.000 0.264
#> SRR665610 1 0.1623 0.69760 0.940 0.000 0.004 0.004 0.020 0.032
#> SRR1347322 1 0.5011 0.46990 0.552 0.000 0.368 0.000 0.000 0.080
#> SRR813395 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1477256 3 0.5248 0.33164 0.304 0.000 0.572 0.000 0.000 0.124
#> SRR1470230 5 0.2664 0.69938 0.000 0.000 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1354247 1 0.4755 0.27626 0.492 0.000 0.460 0.000 0.000 0.048
#> SRR1082640 2 0.0000 0.87376 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.2777 0.74152 0.036 0.000 0.880 0.048 0.000 0.036
#> SRR1352299 3 0.3764 0.69536 0.108 0.000 0.796 0.008 0.000 0.088
#> SRR1076317 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1434117 3 0.3092 0.69743 0.004 0.000 0.860 0.028 0.080 0.028
#> SRR1075273 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR658657 5 0.4712 0.56267 0.096 0.000 0.000 0.180 0.708 0.016
#> SRR1092773 2 0.3426 0.84008 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1365332 3 0.1679 0.74296 0.012 0.000 0.936 0.036 0.000 0.016
#> SRR615958 3 0.4422 0.46304 0.000 0.000 0.680 0.252 0.000 0.068
#> SRR1097688 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1403259 5 0.7588 -0.19992 0.044 0.000 0.052 0.228 0.364 0.312
#> SRR1099120 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1362200 3 0.3424 0.59219 0.000 0.000 0.772 0.204 0.000 0.024
#> SRR1464856 2 0.2703 0.86049 0.000 0.824 0.000 0.004 0.000 0.172
#> SRR1347298 3 0.4009 0.49104 0.000 0.000 0.684 0.288 0.000 0.028
#> SRR1075923 2 0.3309 0.83978 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1100703 3 0.4764 0.62832 0.160 0.000 0.712 0.020 0.000 0.108
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.993 0.997 0.4376 0.562 0.562
#> 3 3 0.991 0.971 0.977 0.0591 0.995 0.991
#> 4 4 0.638 0.837 0.847 0.1869 0.997 0.995
#> 5 5 0.627 0.792 0.877 0.1642 0.774 0.592
#> 6 6 0.661 0.626 0.814 0.0995 0.868 0.657
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.7674 0.716 0.224 0.776
#> SRR1398013 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323289 2 0.8144 0.668 0.252 0.748
#> SRR1313494 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.3431 0.930 0.936 0.064
#> SRR807775 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.2603 0.953 0.956 0.044
#> SRR1437256 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319221 2 0.7674 0.716 0.224 0.776
#> SRR1405413 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.9970 0.110 0.532 0.468
#> SRR1076144 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.0938 0.986 0.988 0.012
#> SRR1344253 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.7674 0.716 0.224 0.776
#> SRR1074289 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0747 0.9702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436370 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1355723 1 0.1031 0.9706 0.976 0.000 0.024
#> SRR1329744 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR657384 1 0.0592 0.9696 0.988 0.000 0.012
#> SRR1351190 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1458662 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0424 0.9696 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396017 1 0.0237 0.9700 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410742 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435963 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1382416 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1391354 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087968 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1312244 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1325138 1 0.0592 0.9701 0.988 0.000 0.012
#> SRR1326821 1 0.1031 0.9683 0.976 0.000 0.024
#> SRR1490178 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1075707 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1414058 1 0.1289 0.9661 0.968 0.000 0.032
#> SRR1407449 1 0.0747 0.9684 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436858 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0892 0.9687 0.980 0.000 0.020
#> SRR1399069 1 0.0424 0.9696 0.992 0.000 0.008
#> SRR1366450 1 0.0747 0.9690 0.984 0.000 0.016
#> SRR1396859 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1457176 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1097666 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.0592 0.9697 0.988 0.000 0.012
#> SRR1080560 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1435688 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR658152 1 0.1411 0.9643 0.964 0.000 0.036
#> SRR1368141 1 0.3038 0.9159 0.896 0.000 0.104
#> SRR1440268 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1453725 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1325711 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1477591 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416049 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0892 0.9698 0.980 0.000 0.020
#> SRR1369052 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1377735 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331244 1 0.0592 0.9693 0.988 0.000 0.012
#> SRR1404531 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1324331 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1458890 1 0.3116 0.9121 0.892 0.000 0.108
#> SRR1432695 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.2711 0.9307 0.912 0.000 0.088
#> SRR1087393 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.0892 0.9685 0.980 0.000 0.020
#> SRR1385211 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR655241 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR656922 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1361630 1 0.0747 0.9690 0.984 0.000 0.016
#> SRR1318966 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR603212 1 0.0892 0.9705 0.980 0.000 0.020
#> SRR1321088 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.2356 0.9428 0.928 0.000 0.072
#> SRR1332232 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0592 0.9703 0.988 0.000 0.012
#> SRR1457835 1 0.0892 0.9687 0.980 0.000 0.020
#> SRR1347123 1 0.3192 0.9086 0.888 0.000 0.112
#> SRR1465501 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1445064 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1452981 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1326708 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1407157 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1365401 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0747 0.9704 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077898 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1349080 1 0.1031 0.9684 0.976 0.000 0.024
#> SRR1076096 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1432563 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1380614 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR812060 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR602082 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1069490 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1420710 1 0.0892 0.9682 0.980 0.000 0.020
#> SRR660426 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1416003 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR661064 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1082011 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353243 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1455482 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1313473 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1399394 1 0.0747 0.9701 0.984 0.000 0.016
#> SRR1102467 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1317470 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1337707 1 0.3116 0.9125 0.892 0.000 0.108
#> SRR1408752 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.1399 0.9881 0.004 0.028 0.968
#> SRR1398013 1 0.1289 0.9658 0.968 0.000 0.032
#> SRR1352918 1 0.0892 0.9692 0.980 0.000 0.020
#> SRR1420750 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1071785 1 0.3116 0.9121 0.892 0.000 0.108
#> SRR1353618 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0592 0.9701 0.988 0.000 0.012
#> SRR1366560 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1355684 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1323289 3 0.1129 0.9652 0.020 0.004 0.976
#> SRR1313494 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1309985 1 0.0592 0.9693 0.988 0.000 0.012
#> SRR607911 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1333789 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1400078 1 0.0892 0.9682 0.980 0.000 0.020
#> SRR1088631 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1079434 1 0.1643 0.9610 0.956 0.000 0.044
#> SRR1325559 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1446695 1 0.1163 0.9671 0.972 0.000 0.028
#> SRR1383883 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1396100 1 0.0892 0.9692 0.980 0.000 0.020
#> SRR1475697 1 0.2165 0.9483 0.936 0.000 0.064
#> SRR1488067 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1445490 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1485812 1 0.1529 0.9625 0.960 0.000 0.040
#> SRR1078020 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1376406 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 1 0.5291 0.6971 0.732 0.000 0.268
#> SRR807775 1 0.2165 0.9488 0.936 0.000 0.064
#> SRR1409215 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.1031 0.9684 0.976 0.000 0.024
#> SRR1100656 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1414536 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR656794 1 0.1163 0.9705 0.972 0.000 0.028
#> SRR604653 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1317685 1 0.1529 0.9625 0.960 0.000 0.040
#> SRR1485912 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1407602 1 0.1529 0.9625 0.960 0.000 0.040
#> SRR1356164 1 0.1860 0.9555 0.948 0.000 0.052
#> SRR1328692 1 0.2356 0.9428 0.928 0.000 0.072
#> SRR1362438 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1479216 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1358041 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1468766 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR1368200 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1435602 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 1 0.5327 0.6901 0.728 0.000 0.272
#> SRR1437256 1 0.3116 0.9121 0.892 0.000 0.108
#> SRR1487446 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR816653 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR815164 1 0.0892 0.9693 0.980 0.000 0.020
#> SRR1442043 1 0.0747 0.9704 0.984 0.000 0.016
#> SRR1410573 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1096782 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.1860 0.9557 0.948 0.000 0.052
#> SRR1382934 1 0.3752 0.8749 0.856 0.000 0.144
#> SRR1465208 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1314728 1 0.0592 0.9697 0.988 0.000 0.012
#> SRR1470291 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1308756 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1409600 1 0.0892 0.9687 0.980 0.000 0.020
#> SRR816123 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 1 0.1289 0.9655 0.968 0.000 0.032
#> SRR810783 1 0.0892 0.9702 0.980 0.000 0.020
#> SRR1333990 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1410356 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR808106 1 0.1031 0.9684 0.976 0.000 0.024
#> SRR662713 1 0.0892 0.9694 0.980 0.000 0.020
#> SRR1447058 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR809382 1 0.2448 0.9401 0.924 0.000 0.076
#> SRR665417 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1088016 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 1 0.3192 0.9086 0.888 0.000 0.112
#> SRR1413787 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1478207 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1411046 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1313711 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1309051 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1486949 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1074956 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1319221 3 0.1399 0.9881 0.004 0.028 0.968
#> SRR1405413 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR607807 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1390160 1 0.3192 0.9086 0.888 0.000 0.112
#> SRR1406283 1 0.0424 0.9703 0.992 0.000 0.008
#> SRR1357709 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1080742 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1312766 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR1361612 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1311224 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1087801 1 0.0424 0.9696 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099720 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1074980 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.3192 0.9084 0.888 0.000 0.112
#> SRR1332879 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1403177 1 0.8179 0.0026 0.504 0.424 0.072
#> SRR1076144 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1485678 1 0.0592 0.9702 0.988 0.000 0.012
#> SRR1092232 1 0.4399 0.8195 0.812 0.000 0.188
#> SRR1344253 1 0.1529 0.9628 0.960 0.000 0.040
#> SRR1384290 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1089349 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1343522 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.2878 0.9222 0.904 0.000 0.096
#> SRR818372 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1323675 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0592 0.9706 0.988 0.000 0.012
#> SRR1310031 1 0.2448 0.9401 0.924 0.000 0.076
#> SRR615419 1 0.3116 0.9121 0.892 0.000 0.108
#> SRR1436925 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1477238 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332566 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1490228 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1442949 1 0.1411 0.9641 0.964 0.000 0.036
#> SRR1466239 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1094003 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.1163 0.9694 0.972 0.000 0.028
#> SRR813076 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR1485976 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.2448 0.9401 0.924 0.000 0.076
#> SRR660522 1 0.1529 0.9628 0.960 0.000 0.040
#> SRR815374 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1069564 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.1289 0.9655 0.968 0.000 0.032
#> SRR1316438 1 0.2537 0.9368 0.920 0.000 0.080
#> SRR1386844 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1373718 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1447458 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1441421 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1335489 1 0.0592 0.9697 0.988 0.000 0.012
#> SRR1393404 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1401815 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1071337 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1098761 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR615395 1 0.1163 0.9705 0.972 0.000 0.028
#> SRR1479349 1 0.0747 0.9684 0.984 0.000 0.016
#> SRR2165033 1 0.0747 0.9694 0.984 0.000 0.016
#> SRR1089054 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1488514 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0592 0.9706 0.988 0.000 0.012
#> SRR1379303 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1418516 1 0.1289 0.9658 0.968 0.000 0.032
#> SRR613174 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1351125 1 0.0892 0.9685 0.980 0.000 0.020
#> SRR659157 1 0.1643 0.9608 0.956 0.000 0.044
#> SRR1480408 1 0.0592 0.9701 0.988 0.000 0.012
#> SRR657857 1 0.1289 0.9661 0.968 0.000 0.032
#> SRR1073317 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0747 0.9698 0.984 0.000 0.016
#> SRR1094168 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.2878 0.9234 0.904 0.000 0.096
#> SRR1085614 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.0747 0.9702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1466154 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1396944 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1082784 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR614659 1 0.0592 0.9701 0.988 0.000 0.012
#> SRR659247 1 0.0892 0.9702 0.980 0.000 0.020
#> SRR1317201 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1473696 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1375842 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1388123 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345499 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416693 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1070841 1 0.1163 0.9676 0.972 0.000 0.028
#> SRR1380910 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1333125 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR612659 1 0.3038 0.9159 0.896 0.000 0.104
#> SRR1447148 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0747 0.9705 0.984 0.000 0.016
#> SRR1345995 1 0.0747 0.9690 0.984 0.000 0.016
#> SRR1071035 1 0.0424 0.9696 0.992 0.000 0.008
#> SRR1068808 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1335355 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR659448 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1323558 1 0.1643 0.9607 0.956 0.000 0.044
#> SRR1381711 1 0.1163 0.9671 0.972 0.000 0.028
#> SRR657985 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1314810 1 0.0592 0.9697 0.988 0.000 0.012
#> SRR1336505 1 0.0892 0.9698 0.980 0.000 0.020
#> SRR1474095 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1363831 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0747 0.9706 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074909 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0747 0.9705 0.984 0.000 0.016
#> SRR1075408 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.1031 0.9683 0.976 0.000 0.024
#> SRR1313406 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.1163 0.9671 0.972 0.000 0.028
#> SRR1084867 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0747 0.9690 0.984 0.000 0.016
#> SRR1380414 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR1315912 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1075778 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 1 0.2711 0.9303 0.912 0.000 0.088
#> SRR1361195 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1477653 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1355475 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1360785 1 0.0747 0.9704 0.984 0.000 0.016
#> SRR810437 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1361860 1 0.0592 0.9704 0.988 0.000 0.012
#> SRR1441311 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1457619 1 0.0592 0.9703 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498529 1 0.0747 0.9698 0.984 0.000 0.016
#> SRR1097172 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.2448 0.9399 0.924 0.000 0.076
#> SRR1399525 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0424 0.9696 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075659 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1353353 1 0.3192 0.9084 0.888 0.000 0.112
#> SRR1073291 1 0.1860 0.9565 0.948 0.000 0.052
#> SRR1356227 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1080720 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.1289 0.9659 0.968 0.000 0.032
#> SRR663002 1 0.2165 0.9488 0.936 0.000 0.064
#> SRR1376983 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1347144 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1384006 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1499108 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 1 0.1643 0.9607 0.956 0.000 0.044
#> SRR818440 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1337770 1 0.0424 0.9698 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399413 1 0.0747 0.9690 0.984 0.000 0.016
#> SRR1385542 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1074041 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR1394495 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR816699 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1308612 1 0.1529 0.9624 0.960 0.000 0.040
#> SRR1499418 1 0.1860 0.9569 0.948 0.000 0.052
#> SRR1352894 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.1643 0.9603 0.956 0.000 0.044
#> SRR1331083 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 1 0.2165 0.9490 0.936 0.000 0.064
#> SRR1436698 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1095627 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1351236 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1077479 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR814491 1 0.0892 0.9692 0.980 0.000 0.020
#> SRR1101256 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1457994 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1309534 1 0.2165 0.9483 0.936 0.000 0.064
#> SRR615527 1 0.2537 0.9368 0.920 0.000 0.080
#> SRR1098216 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1325847 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0237 0.9701 0.996 0.000 0.004
#> SRR1344166 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1368638 1 0.0892 0.9692 0.980 0.000 0.020
#> SRR1431429 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1411 0.9641 0.964 0.000 0.036
#> SRR1502143 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR1487614 1 0.3267 0.9045 0.884 0.000 0.116
#> SRR1402307 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0592 0.9702 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099212 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.1163 0.9676 0.972 0.000 0.028
#> SRR1476547 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1086116 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1339944 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0592 0.9704 0.988 0.000 0.012
#> SRR1431847 1 0.2356 0.9428 0.928 0.000 0.072
#> SRR1317155 1 0.0892 0.9706 0.980 0.000 0.020
#> SRR1477405 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR655289 1 0.0747 0.9698 0.984 0.000 0.016
#> SRR1341683 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1084790 1 0.0892 0.9693 0.980 0.000 0.020
#> SRR1073731 1 0.1289 0.9661 0.968 0.000 0.032
#> SRR1332588 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1471157 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.1163 0.9664 0.972 0.000 0.028
#> SRR661028 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1413477 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0892 0.9686 0.980 0.000 0.020
#> SRR1358435 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1379014 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1489904 1 0.3192 0.9086 0.888 0.000 0.112
#> SRR1416386 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR606982 1 0.1163 0.9676 0.972 0.000 0.028
#> SRR1358082 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1312934 1 0.1031 0.9692 0.976 0.000 0.024
#> SRR655194 1 0.0747 0.9682 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331174 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.1399 0.9881 0.004 0.028 0.968
#> SRR1074289 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR1348816 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.1643 0.9603 0.956 0.000 0.044
#> SRR1395810 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.1163 0.9669 0.972 0.000 0.028
#> SRR1443507 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR1452310 1 0.1031 0.9674 0.976 0.000 0.024
#> SRR665610 1 0.0592 0.9696 0.988 0.000 0.012
#> SRR1347322 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR813395 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0892 0.9671 0.980 0.000 0.020
#> SRR1470230 1 0.2356 0.9430 0.928 0.000 0.072
#> SRR1354247 1 0.0592 0.9688 0.988 0.000 0.012
#> SRR1082640 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0592 0.9696 0.988 0.000 0.012
#> SRR1352299 1 0.0747 0.9705 0.984 0.000 0.016
#> SRR1076317 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.1643 0.9607 0.956 0.000 0.044
#> SRR1075273 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 1 0.1964 0.9541 0.944 0.000 0.056
#> SRR1092773 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.1031 0.9676 0.976 0.000 0.024
#> SRR615958 1 0.1643 0.9607 0.956 0.000 0.044
#> SRR1097688 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.2356 0.9428 0.928 0.000 0.072
#> SRR1099120 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.1964 0.9540 0.944 0.000 0.056
#> SRR1464856 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.2625 0.9338 0.916 0.000 0.084
#> SRR1075923 2 0.0000 1.0000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0747 0.9705 0.984 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.2345 0.822 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.4624 0.736 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1355723 1 0.4053 0.798 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR1329744 1 0.4907 0.664 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR657384 1 0.1940 0.821 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1351190 1 0.1305 0.810 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.3219 0.814 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1396017 1 0.3837 0.797 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1410742 1 0.3123 0.814 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1435963 1 0.4564 0.744 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1382416 1 0.4804 0.700 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1391354 1 0.3764 0.798 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1312244 1 0.4585 0.741 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1325138 1 0.2921 0.816 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1326821 1 0.4072 0.786 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4804 0.697 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1414058 1 0.1489 0.802 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1407449 1 0.4477 0.754 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.1743 0.820 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1399069 1 0.4164 0.783 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1366450 1 0.3024 0.818 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1396859 1 0.4624 0.735 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1457176 1 0.4605 0.739 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.2216 0.822 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.4907 0.663 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR658152 1 0.1452 0.795 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1368141 1 0.3392 0.734 0.872 0.000 0.072 0.056
#> SRR1440268 1 0.4907 0.664 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1453725 1 0.4406 0.763 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.4304 0.773 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1477591 1 0.4624 0.735 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.1716 0.820 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1369052 1 0.3837 0.796 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1377735 1 0.4222 0.780 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1331244 1 0.4406 0.762 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1404531 1 0.4916 0.659 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1324331 1 0.4888 0.672 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1458890 1 0.3286 0.738 0.876 0.000 0.080 0.044
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.2928 0.751 0.896 0.000 0.052 0.052
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.2149 0.822 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1385211 1 0.3907 0.794 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR655241 1 0.4193 0.780 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR656922 1 0.4134 0.785 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1361630 1 0.1302 0.817 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.0336 0.805 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR603212 1 0.3444 0.809 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.2816 0.764 0.900 0.000 0.036 0.064
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.2921 0.821 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1457835 1 0.2011 0.822 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1347123 1 0.3383 0.728 0.872 0.000 0.076 0.052
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1445064 1 0.0921 0.805 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1452981 1 0.3726 0.799 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1326708 1 0.4907 0.663 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1407157 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.2760 0.819 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1077898 1 0.4830 0.692 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1349080 1 0.2197 0.820 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.4679 0.722 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.4907 0.663 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1380614 1 0.4304 0.772 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR812060 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR602082 1 0.4907 0.663 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.0707 0.810 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1420710 1 0.1302 0.816 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR660426 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1416003 1 0.1209 0.809 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR661064 1 0.4406 0.763 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.4454 0.757 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1353243 1 0.4222 0.778 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1455482 1 0.4817 0.696 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1313473 1 0.4907 0.664 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1399394 1 0.3219 0.813 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1102467 1 0.4500 0.753 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1317470 1 0.0779 0.809 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1337707 1 0.3312 0.738 0.876 0.000 0.072 0.052
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.0336 0.967 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1398013 1 0.1398 0.817 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1352918 1 0.2281 0.820 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1420750 1 0.4356 0.767 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1071785 1 0.3286 0.738 0.876 0.000 0.080 0.044
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.3024 0.815 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1366560 1 0.4679 0.726 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1355684 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1323289 3 0.1109 0.901 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR1313494 1 0.4454 0.757 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1309985 1 0.4222 0.778 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR607911 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1333789 1 0.1209 0.811 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1400078 1 0.1716 0.820 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615575 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1079434 1 0.2376 0.804 0.916 0.000 0.016 0.068
#> SRR1325559 1 0.3764 0.799 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1446695 1 0.1109 0.810 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1383883 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1396100 1 0.2281 0.820 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1475697 1 0.2494 0.776 0.916 0.000 0.036 0.048
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.1389 0.818 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1485812 1 0.1970 0.807 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.4855 0.684 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 1 0.5426 0.481 0.708 0.000 0.232 0.060
#> SRR807775 1 0.2032 0.780 0.936 0.000 0.036 0.028
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.2197 0.820 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1414536 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR656794 1 0.3356 0.811 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR604653 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1317685 1 0.1970 0.807 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1485912 1 0.1557 0.819 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1407602 1 0.1890 0.779 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1356164 1 0.2546 0.778 0.912 0.000 0.028 0.060
#> SRR1328692 1 0.2816 0.764 0.900 0.000 0.036 0.064
#> SRR1362438 1 0.4907 0.664 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1479216 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1358041 1 0.4008 0.788 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1468766 1 0.0779 0.810 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1368200 1 0.0707 0.810 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 1 0.5417 0.496 0.704 0.000 0.240 0.056
#> SRR1437256 1 0.3286 0.738 0.876 0.000 0.080 0.044
#> SRR1487446 1 0.4008 0.788 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR816653 1 0.4222 0.780 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR815164 1 0.4072 0.786 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1442043 1 0.3726 0.804 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1410573 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.2670 0.792 0.904 0.000 0.024 0.072
#> SRR1382934 1 0.4055 0.685 0.832 0.000 0.108 0.060
#> SRR1465208 1 0.4522 0.749 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1314728 1 0.2589 0.822 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1470291 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1308756 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1409600 1 0.1743 0.820 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614779 1 0.0927 0.799 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR810783 1 0.1557 0.817 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1333990 1 0.4907 0.664 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1410356 1 0.0895 0.813 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR808106 1 0.2197 0.820 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR662713 1 0.1389 0.816 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0921 0.805 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR809382 1 0.2675 0.760 0.908 0.000 0.044 0.048
#> SRR665417 1 0.4304 0.772 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 1 0.3542 0.720 0.864 0.000 0.076 0.060
#> SRR1413787 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1478207 1 0.0336 0.805 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1411046 1 0.4925 0.655 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4843 0.688 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1309051 1 0.4907 0.663 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.4907 0.664 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817210 1 0.1489 0.813 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1319221 3 0.0336 0.967 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1405413 1 0.1389 0.818 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR607807 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1390160 1 0.3542 0.720 0.864 0.000 0.076 0.060
#> SRR1406283 1 0.3610 0.806 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1357709 1 0.3610 0.805 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1312766 1 0.0895 0.813 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1361612 1 0.4564 0.744 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1311224 1 0.4697 0.723 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1087801 1 0.3801 0.799 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.1389 0.818 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.3542 0.720 0.864 0.000 0.076 0.060
#> SRR1332879 1 0.4624 0.735 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1403177 4 0.4824 0.000 0.024 0.228 0.004 0.744
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1485678 1 0.3486 0.809 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1092232 1 0.4638 0.624 0.788 0.000 0.152 0.060
#> SRR1344253 1 0.2563 0.819 0.908 0.000 0.020 0.072
#> SRR1384290 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1089349 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.2983 0.764 0.892 0.000 0.068 0.040
#> SRR818372 1 0.1109 0.810 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.3123 0.816 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1310031 1 0.2751 0.757 0.904 0.000 0.040 0.056
#> SRR615419 1 0.3286 0.738 0.876 0.000 0.080 0.044
#> SRR1436925 1 0.3444 0.808 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1477238 1 0.4925 0.654 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1332566 1 0.4500 0.751 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1490228 1 0.1389 0.818 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1442949 1 0.1635 0.800 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1466239 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4072 0.784 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.1305 0.812 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.2751 0.757 0.904 0.000 0.040 0.056
#> SRR660522 1 0.1677 0.801 0.948 0.000 0.012 0.040
#> SRR815374 1 0.1109 0.810 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.0927 0.799 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1316438 1 0.2919 0.756 0.896 0.000 0.044 0.060
#> SRR1386844 1 0.4888 0.672 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1373718 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.4624 0.736 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4605 0.739 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1335489 1 0.3444 0.812 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1401815 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.4522 0.749 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR615395 1 0.3219 0.814 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1479349 1 0.4477 0.754 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR2165033 1 0.1389 0.814 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.1109 0.800 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.3123 0.816 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1379303 1 0.4776 0.706 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1418516 1 0.1398 0.817 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR613174 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1351125 1 0.1389 0.819 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR659157 1 0.1722 0.789 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR1480408 1 0.2921 0.816 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR657857 1 0.2730 0.810 0.896 0.000 0.016 0.088
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.3219 0.812 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.3247 0.736 0.880 0.000 0.060 0.060
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.2081 0.822 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1466154 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1396944 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR614659 1 0.3074 0.816 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR659247 1 0.1557 0.817 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1317201 1 0.4624 0.735 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1473696 1 0.4624 0.735 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1375842 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.3486 0.807 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.4776 0.707 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1416693 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1070841 1 0.1398 0.814 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1380910 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4331 0.769 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR612659 1 0.3398 0.728 0.872 0.000 0.068 0.060
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.2593 0.822 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR1345995 1 0.2281 0.822 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1071035 1 0.3801 0.799 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.4916 0.659 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1335355 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR659448 1 0.0779 0.810 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1323558 1 0.1520 0.791 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1381711 1 0.1109 0.810 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR657985 1 0.0895 0.811 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1314810 1 0.2589 0.822 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1336505 1 0.1637 0.820 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1474095 1 0.1389 0.818 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.3400 0.811 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.2593 0.822 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.2197 0.822 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.1109 0.810 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.1792 0.820 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1380414 1 0.1109 0.809 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1315912 1 0.4855 0.684 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 1 0.3164 0.751 0.884 0.000 0.052 0.064
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.4907 0.663 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1477653 1 0.4072 0.786 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1355475 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1360785 1 0.3569 0.809 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR810437 1 0.1109 0.800 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1361860 1 0.2647 0.821 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.3726 0.800 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1457619 1 0.2921 0.821 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1498529 1 0.3444 0.808 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.2830 0.759 0.900 0.000 0.040 0.060
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.3569 0.804 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1353353 1 0.3542 0.720 0.864 0.000 0.076 0.060
#> SRR1073291 1 0.1624 0.789 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1356227 1 0.4624 0.735 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.1743 0.807 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR663002 1 0.2399 0.769 0.920 0.000 0.032 0.048
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1347144 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1384006 1 0.4925 0.654 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614047 1 0.1411 0.793 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR818440 1 0.1489 0.813 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1337770 1 0.3649 0.802 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1399413 1 0.1792 0.820 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.1209 0.809 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1074041 1 0.0779 0.812 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0336 0.805 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR816699 1 0.0779 0.800 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1308612 1 0.1182 0.808 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1499418 1 0.1706 0.792 0.948 0.000 0.016 0.036
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.2596 0.803 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808272 1 0.2466 0.767 0.916 0.000 0.028 0.056
#> SRR1436698 1 0.4222 0.777 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.0779 0.812 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1351236 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1077479 1 0.4925 0.654 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR814491 1 0.2149 0.820 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4522 0.749 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.3907 0.794 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1309534 1 0.2494 0.776 0.916 0.000 0.036 0.048
#> SRR615527 1 0.2996 0.758 0.892 0.000 0.044 0.064
#> SRR1098216 1 0.4564 0.746 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.2760 0.820 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1344166 1 0.3610 0.804 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1368638 1 0.2281 0.820 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1635 0.800 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1502143 1 0.1109 0.809 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1487614 1 0.3611 0.716 0.860 0.000 0.080 0.060
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.2469 0.822 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.1398 0.814 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656421 1 0.4585 0.741 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.1209 0.809 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.2408 0.822 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1431847 1 0.2816 0.764 0.900 0.000 0.036 0.064
#> SRR1317155 1 0.2281 0.822 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1477405 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR655289 1 0.3311 0.815 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1341683 1 0.1004 0.808 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1084790 1 0.4164 0.780 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1073731 1 0.2522 0.806 0.908 0.000 0.016 0.076
#> SRR1332588 1 0.1489 0.817 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0376 0.808 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR661028 1 0.4907 0.663 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.1557 0.820 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1379014 1 0.4454 0.757 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1489904 1 0.3542 0.720 0.864 0.000 0.076 0.060
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.4331 0.768 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR606982 1 0.2342 0.817 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR1358082 1 0.4933 0.650 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1312934 1 0.1557 0.819 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR655194 1 0.4134 0.783 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.0336 0.967 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1074289 1 0.0779 0.812 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.2596 0.794 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.1305 0.804 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1443507 1 0.1389 0.818 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1452310 1 0.1022 0.807 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR665610 1 0.1867 0.821 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1347322 1 0.4522 0.750 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.4697 0.722 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1470230 1 0.2816 0.764 0.900 0.000 0.036 0.064
#> SRR1354247 1 0.4500 0.753 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.2216 0.822 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1352299 1 0.3172 0.814 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.1411 0.793 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658657 1 0.1733 0.797 0.948 0.000 0.028 0.024
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.1004 0.814 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR615958 1 0.1520 0.791 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.2816 0.764 0.900 0.000 0.036 0.064
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.1833 0.785 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.2844 0.754 0.900 0.000 0.048 0.052
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.3172 0.814 0.840 0.000 0.000 0.160
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.3895 0.67223 0.320 0 0.680 0 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1397949 1 0.2690 0.76627 0.844 0 0.156 0 0.000
#> SRR1355723 1 0.4060 0.48053 0.640 0 0.360 0 0.000
#> SRR1329744 1 0.0609 0.77079 0.980 0 0.020 0 0.000
#> SRR657384 3 0.3966 0.63878 0.336 0 0.664 0 0.000
#> SRR1351190 3 0.2690 0.82274 0.156 0 0.844 0 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR818573 1 0.4305 -0.06678 0.512 0 0.488 0 0.000
#> SRR1396017 1 0.4030 0.51768 0.648 0 0.352 0 0.000
#> SRR1410742 1 0.4304 -0.00943 0.516 0 0.484 0 0.000
#> SRR1435963 1 0.2561 0.77080 0.856 0 0.144 0 0.000
#> SRR1382416 1 0.1410 0.77709 0.940 0 0.060 0 0.000
#> SRR1391354 1 0.3999 0.52895 0.656 0 0.344 0 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1310075 1 0.0162 0.75894 0.996 0 0.004 0 0.000
#> SRR1312244 1 0.2732 0.76724 0.840 0 0.160 0 0.000
#> SRR1325138 3 0.4302 0.17275 0.480 0 0.520 0 0.000
#> SRR1326821 1 0.3661 0.65718 0.724 0 0.276 0 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR655613 1 0.1197 0.77363 0.952 0 0.048 0 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1414058 3 0.2605 0.82344 0.148 0 0.852 0 0.000
#> SRR1407449 1 0.3003 0.75155 0.812 0 0.188 0 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1479109 3 0.3876 0.68459 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR1399069 1 0.3752 0.62633 0.708 0 0.292 0 0.000
#> SRR1366450 3 0.4307 0.20467 0.496 0 0.504 0 0.000
#> SRR1396859 1 0.2471 0.77254 0.864 0 0.136 0 0.000
#> SRR1457176 1 0.2852 0.75915 0.828 0 0.172 0 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1434736 3 0.3966 0.64017 0.336 0 0.664 0 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1322882 1 0.0404 0.76536 0.988 0 0.012 0 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR658152 3 0.1908 0.80856 0.092 0 0.908 0 0.000
#> SRR1368141 3 0.0798 0.75760 0.016 0 0.976 0 0.008
#> SRR1440268 1 0.0609 0.77079 0.980 0 0.020 0 0.000
#> SRR1453725 1 0.3177 0.73531 0.792 0 0.208 0 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1477930 1 0.3508 0.68303 0.748 0 0.252 0 0.000
#> SRR1477591 1 0.2648 0.76926 0.848 0 0.152 0 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR656275 3 0.3274 0.79972 0.220 0 0.780 0 0.000
#> SRR1369052 1 0.3966 0.54772 0.664 0 0.336 0 0.000
#> SRR1377735 1 0.3424 0.71130 0.760 0 0.240 0 0.000
#> SRR1331244 1 0.3003 0.75098 0.812 0 0.188 0 0.000
#> SRR1404531 1 0.0510 0.76811 0.984 0 0.016 0 0.000
#> SRR1324331 1 0.0703 0.77267 0.976 0 0.024 0 0.000
#> SRR1458890 3 0.1106 0.76158 0.024 0 0.964 0 0.012
#> SRR1432695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1431969 3 0.1331 0.78042 0.040 0 0.952 0 0.008
#> SRR1087393 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1077263 3 0.3983 0.65108 0.340 0 0.660 0 0.000
#> SRR1385211 1 0.3857 0.60021 0.688 0 0.312 0 0.000
#> SRR655241 1 0.3661 0.65782 0.724 0 0.276 0 0.000
#> SRR656922 1 0.3661 0.64817 0.724 0 0.276 0 0.000
#> SRR1361630 3 0.3774 0.71078 0.296 0 0.704 0 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1407087 3 0.2813 0.82167 0.168 0 0.832 0 0.000
#> SRR603212 1 0.4291 0.01964 0.536 0 0.464 0 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1485190 3 0.1121 0.78236 0.044 0 0.956 0 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1312645 3 0.4273 0.27066 0.448 0 0.552 0 0.000
#> SRR1457835 3 0.3876 0.68613 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR1347123 3 0.0807 0.75402 0.012 0 0.976 0 0.012
#> SRR1465501 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1330878 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1445064 3 0.2516 0.82104 0.140 0 0.860 0 0.000
#> SRR1452981 1 0.3999 0.52813 0.656 0 0.344 0 0.000
#> SRR1326708 1 0.0609 0.77077 0.980 0 0.020 0 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1477316 3 0.4302 0.14134 0.480 0 0.520 0 0.000
#> SRR1077898 1 0.1478 0.77763 0.936 0 0.064 0 0.000
#> SRR1349080 3 0.3242 0.80157 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1375485 1 0.2230 0.76280 0.884 0 0.116 0 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR604414 1 0.0404 0.76536 0.988 0 0.012 0 0.000
#> SRR1380614 1 0.3003 0.75068 0.812 0 0.188 0 0.000
#> SRR812060 3 0.2773 0.81841 0.164 0 0.836 0 0.000
#> SRR602082 1 0.0404 0.76536 0.988 0 0.012 0 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR661613 3 0.2852 0.82087 0.172 0 0.828 0 0.000
#> SRR1420710 3 0.3534 0.76731 0.256 0 0.744 0 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1416003 3 0.2648 0.82277 0.152 0 0.848 0 0.000
#> SRR661064 1 0.3336 0.71104 0.772 0 0.228 0 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1452718 1 0.2891 0.75972 0.824 0 0.176 0 0.000
#> SRR1353243 1 0.3109 0.74325 0.800 0 0.200 0 0.000
#> SRR1455482 1 0.1732 0.77757 0.920 0 0.080 0 0.000
#> SRR1313473 1 0.0880 0.77381 0.968 0 0.032 0 0.000
#> SRR1399394 1 0.4219 0.34994 0.584 0 0.416 0 0.000
#> SRR1102467 1 0.2966 0.74823 0.816 0 0.184 0 0.000
#> SRR1317470 3 0.3143 0.80666 0.204 0 0.796 0 0.000
#> SRR1337707 3 0.0671 0.76057 0.016 0 0.980 0 0.004
#> SRR1408752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1474617 5 0.0000 0.92152 0.000 0 0.000 0 1.000
#> SRR1398013 3 0.3210 0.80289 0.212 0 0.788 0 0.000
#> SRR1352918 3 0.3366 0.77008 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1420750 1 0.3424 0.71045 0.760 0 0.240 0 0.000
#> SRR1071785 3 0.1106 0.76158 0.024 0 0.964 0 0.012
#> SRR1353618 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1490313 1 0.4307 -0.07539 0.500 0 0.500 0 0.000
#> SRR1366560 1 0.2424 0.77369 0.868 0 0.132 0 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1323289 5 0.1478 0.76699 0.000 0 0.064 0 0.936
#> SRR1313494 1 0.3366 0.71435 0.768 0 0.232 0 0.000
#> SRR1309985 1 0.3508 0.69103 0.748 0 0.252 0 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1333789 3 0.3242 0.80029 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR1400078 3 0.3395 0.78946 0.236 0 0.764 0 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR615575 3 0.2773 0.81841 0.164 0 0.836 0 0.000
#> SRR1079434 3 0.2471 0.82041 0.136 0 0.864 0 0.000
#> SRR1325559 1 0.3983 0.54427 0.660 0 0.340 0 0.000
#> SRR1446695 3 0.3366 0.78717 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1396100 3 0.3366 0.77008 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1475697 3 0.1410 0.79236 0.060 0 0.940 0 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1410380 3 0.2773 0.81896 0.164 0 0.836 0 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1435044 3 0.3424 0.78410 0.240 0 0.760 0 0.000
#> SRR1485812 3 0.2561 0.81740 0.144 0 0.856 0 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1311153 1 0.1121 0.77603 0.956 0 0.044 0 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1343898 3 0.2773 0.59748 0.000 0 0.836 0 0.164
#> SRR807775 3 0.2249 0.80996 0.096 0 0.896 0 0.008
#> SRR1409215 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR820427 3 0.3242 0.80157 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1414536 3 0.2929 0.81521 0.180 0 0.820 0 0.000
#> SRR656794 1 0.4101 0.45480 0.628 0 0.372 0 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1317685 3 0.2561 0.81740 0.144 0 0.856 0 0.000
#> SRR1485912 3 0.3561 0.76264 0.260 0 0.740 0 0.000
#> SRR1407602 3 0.1544 0.79843 0.068 0 0.932 0 0.000
#> SRR1356164 3 0.2074 0.80385 0.104 0 0.896 0 0.000
#> SRR1328692 3 0.1121 0.78236 0.044 0 0.956 0 0.000
#> SRR1362438 1 0.0609 0.77106 0.980 0 0.020 0 0.000
#> SRR1479216 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1358041 1 0.3932 0.56558 0.672 0 0.328 0 0.000
#> SRR1468766 3 0.2891 0.81987 0.176 0 0.824 0 0.000
#> SRR1368200 3 0.2852 0.82087 0.172 0 0.828 0 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1501043 3 0.2966 0.59198 0.000 0 0.816 0 0.184
#> SRR1437256 3 0.1106 0.76158 0.024 0 0.964 0 0.012
#> SRR1487446 1 0.3949 0.56244 0.668 0 0.332 0 0.000
#> SRR816653 1 0.3424 0.71130 0.760 0 0.240 0 0.000
#> SRR815164 1 0.3752 0.64143 0.708 0 0.292 0 0.000
#> SRR1442043 1 0.4210 0.35784 0.588 0 0.412 0 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1352369 3 0.2773 0.81025 0.164 0 0.836 0 0.000
#> SRR1382934 3 0.1043 0.72325 0.000 0 0.960 0 0.040
#> SRR1465208 1 0.3274 0.72612 0.780 0 0.220 0 0.000
#> SRR1314728 3 0.4114 0.55256 0.376 0 0.624 0 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1308756 3 0.2773 0.81841 0.164 0 0.836 0 0.000
#> SRR1409600 3 0.3876 0.68459 0.316 0 0.684 0 0.000
#> SRR816123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR614779 3 0.2732 0.82010 0.160 0 0.840 0 0.000
#> SRR810783 3 0.3966 0.63456 0.336 0 0.664 0 0.000
#> SRR1333990 1 0.0609 0.77079 0.980 0 0.020 0 0.000
#> SRR1410356 3 0.3274 0.79614 0.220 0 0.780 0 0.000
#> SRR808106 3 0.3242 0.80157 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR662713 3 0.3816 0.68931 0.304 0 0.696 0 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1480964 3 0.2516 0.82104 0.140 0 0.860 0 0.000
#> SRR809382 3 0.1197 0.78880 0.048 0 0.952 0 0.000
#> SRR665417 1 0.3508 0.69045 0.748 0 0.252 0 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR615623 3 0.0566 0.74760 0.004 0 0.984 0 0.012
#> SRR1413787 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1478207 3 0.2813 0.82167 0.168 0 0.832 0 0.000
#> SRR1411046 1 0.0510 0.76750 0.984 0 0.016 0 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1326560 1 0.1043 0.77560 0.960 0 0.040 0 0.000
#> SRR1309051 1 0.0404 0.76536 0.988 0 0.012 0 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1395616 1 0.0404 0.76481 0.988 0 0.012 0 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR817210 3 0.3039 0.81654 0.192 0 0.808 0 0.000
#> SRR1319221 5 0.0000 0.92152 0.000 0 0.000 0 1.000
#> SRR1405413 3 0.3395 0.78770 0.236 0 0.764 0 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1390160 3 0.0566 0.74764 0.004 0 0.984 0 0.012
#> SRR1406283 1 0.4074 0.47744 0.636 0 0.364 0 0.000
#> SRR1357709 1 0.4182 0.37732 0.600 0 0.400 0 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1312766 3 0.3336 0.78983 0.228 0 0.772 0 0.000
#> SRR1361612 1 0.2648 0.76808 0.848 0 0.152 0 0.000
#> SRR1311224 1 0.2179 0.77578 0.888 0 0.112 0 0.000
#> SRR1087801 1 0.3876 0.58379 0.684 0 0.316 0 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1357127 3 0.3395 0.78770 0.236 0 0.764 0 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1317022 3 0.0290 0.74598 0.000 0 0.992 0 0.008
#> SRR1332879 1 0.2648 0.76926 0.848 0 0.152 0 0.000
#> SRR1403177 4 0.0000 0.00000 0.000 0 0.000 1 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1485678 1 0.4278 0.14355 0.548 0 0.452 0 0.000
#> SRR1092232 3 0.1792 0.69875 0.000 0 0.916 0 0.084
#> SRR1344253 3 0.2966 0.81618 0.184 0 0.816 0 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1089349 3 0.2773 0.81841 0.164 0 0.836 0 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1440940 3 0.1697 0.78308 0.060 0 0.932 0 0.008
#> SRR818372 3 0.2732 0.82270 0.160 0 0.840 0 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR819894 3 0.4268 0.32325 0.444 0 0.556 0 0.000
#> SRR1310031 3 0.1430 0.78938 0.052 0 0.944 0 0.004
#> SRR615419 3 0.1106 0.76158 0.024 0 0.964 0 0.012
#> SRR1436925 1 0.4114 0.45194 0.624 0 0.376 0 0.000
#> SRR1477238 1 0.0290 0.76195 0.992 0 0.008 0 0.000
#> SRR1332566 1 0.2852 0.76046 0.828 0 0.172 0 0.000
#> SRR1490228 3 0.3452 0.77989 0.244 0 0.756 0 0.000
#> SRR1442949 3 0.2127 0.81363 0.108 0 0.892 0 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1329971 1 0.3636 0.66495 0.728 0 0.272 0 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1322981 3 0.3274 0.79809 0.220 0 0.780 0 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1471713 3 0.1571 0.79384 0.060 0 0.936 0 0.004
#> SRR660522 3 0.2929 0.82100 0.180 0 0.820 0 0.000
#> SRR815374 3 0.2732 0.82270 0.160 0 0.840 0 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1416337 3 0.2732 0.82010 0.160 0 0.840 0 0.000
#> SRR1316438 3 0.1043 0.77992 0.040 0 0.960 0 0.000
#> SRR1386844 1 0.0703 0.77141 0.976 0 0.024 0 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1487128 1 0.2424 0.77436 0.868 0 0.132 0 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1460296 1 0.2852 0.75915 0.828 0 0.172 0 0.000
#> SRR1335489 3 0.4283 0.31538 0.456 0 0.544 0 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1401815 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1071337 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1410510 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1098761 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1312124 1 0.3274 0.72612 0.780 0 0.220 0 0.000
#> SRR615395 1 0.4138 0.42205 0.616 0 0.384 0 0.000
#> SRR1479349 1 0.3003 0.75155 0.812 0 0.188 0 0.000
#> SRR2165033 3 0.3177 0.81031 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR816201 3 0.2377 0.81973 0.128 0 0.872 0 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR655840 3 0.4268 0.32325 0.444 0 0.556 0 0.000
#> SRR1379303 1 0.2020 0.77694 0.900 0 0.100 0 0.000
#> SRR1418516 3 0.3177 0.80546 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR613174 3 0.2891 0.81589 0.176 0 0.824 0 0.000
#> SRR1351125 3 0.3730 0.72882 0.288 0 0.712 0 0.000
#> SRR659157 3 0.1732 0.80404 0.080 0 0.920 0 0.000
#> SRR1480408 3 0.4302 0.17275 0.480 0 0.520 0 0.000
#> SRR657857 3 0.3561 0.72778 0.260 0 0.740 0 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1332526 1 0.4287 0.14248 0.540 0 0.460 0 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1431270 3 0.0510 0.76367 0.016 0 0.984 0 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1330106 3 0.3949 0.64839 0.332 0 0.668 0 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1396944 1 0.0162 0.75891 0.996 0 0.004 0 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR614659 3 0.4302 0.21367 0.480 0 0.520 0 0.000
#> SRR659247 3 0.3966 0.63456 0.336 0 0.664 0 0.000
#> SRR1317201 1 0.2605 0.77038 0.852 0 0.148 0 0.000
#> SRR1473696 1 0.2648 0.76926 0.848 0 0.152 0 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1453662 1 0.4114 0.44775 0.624 0 0.376 0 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1353499 1 0.1965 0.77712 0.904 0 0.096 0 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1070841 3 0.3752 0.70929 0.292 0 0.708 0 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1498183 1 0.3305 0.72320 0.776 0 0.224 0 0.000
#> SRR612659 3 0.0798 0.76044 0.016 0 0.976 0 0.008
#> SRR1447148 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1376786 3 0.4287 0.26744 0.460 0 0.540 0 0.000
#> SRR1345995 3 0.4150 0.54263 0.388 0 0.612 0 0.000
#> SRR1071035 1 0.3876 0.58379 0.684 0 0.316 0 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR662438 1 0.0290 0.76246 0.992 0 0.008 0 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR659448 3 0.3177 0.80409 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR1323558 3 0.2329 0.81953 0.124 0 0.876 0 0.000
#> SRR1381711 3 0.3395 0.78311 0.236 0 0.764 0 0.000
#> SRR657985 3 0.3242 0.79963 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR1314810 3 0.4088 0.56879 0.368 0 0.632 0 0.000
#> SRR1336505 3 0.3143 0.81021 0.204 0 0.796 0 0.000
#> SRR1474095 3 0.3452 0.77989 0.244 0 0.756 0 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1442376 1 0.4283 0.15922 0.544 0 0.456 0 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1101200 3 0.4287 0.26744 0.460 0 0.540 0 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1367150 3 0.3966 0.61729 0.336 0 0.664 0 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1467277 3 0.3366 0.78717 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1443113 3 0.4101 0.56317 0.372 0 0.628 0 0.000
#> SRR1380414 3 0.3177 0.80503 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR1315912 1 0.1121 0.77603 0.956 0 0.044 0 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR602282 3 0.0794 0.77033 0.028 0 0.972 0 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR600493 1 0.0404 0.76536 0.988 0 0.012 0 0.000
#> SRR1477653 1 0.3586 0.68268 0.736 0 0.264 0 0.000
#> SRR1355475 3 0.2773 0.81841 0.164 0 0.836 0 0.000
#> SRR1360785 1 0.4262 0.26293 0.560 0 0.440 0 0.000
#> SRR810437 3 0.2377 0.81973 0.128 0 0.872 0 0.000
#> SRR1361860 3 0.3949 0.61454 0.332 0 0.668 0 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1098903 1 0.4015 0.51948 0.652 0 0.348 0 0.000
#> SRR1457619 3 0.4273 0.27066 0.448 0 0.552 0 0.000
#> SRR1498529 1 0.4262 0.22223 0.560 0 0.440 0 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1445087 3 0.1121 0.78279 0.044 0 0.956 0 0.000
#> SRR1399525 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1476056 1 0.4126 0.43636 0.620 0 0.380 0 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1311916 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1353353 3 0.0290 0.74598 0.000 0 0.992 0 0.008
#> SRR1073291 3 0.2583 0.82102 0.132 0 0.864 0 0.004
#> SRR1356227 1 0.2471 0.77254 0.864 0 0.136 0 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1350304 3 0.2377 0.81580 0.128 0 0.872 0 0.000
#> SRR663002 3 0.1544 0.79947 0.068 0 0.932 0 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1347144 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1384006 1 0.0703 0.77199 0.976 0 0.024 0 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR614047 3 0.2377 0.82024 0.128 0 0.872 0 0.000
#> SRR818440 3 0.3039 0.81654 0.192 0 0.808 0 0.000
#> SRR1337770 1 0.4138 0.42475 0.616 0 0.384 0 0.000
#> SRR1399413 3 0.4101 0.56317 0.372 0 0.628 0 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1473959 3 0.2648 0.82274 0.152 0 0.848 0 0.000
#> SRR1074041 3 0.3242 0.79859 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR659460 3 0.2813 0.82167 0.168 0 0.832 0 0.000
#> SRR816699 3 0.2852 0.81677 0.172 0 0.828 0 0.000
#> SRR1308612 3 0.2929 0.81943 0.180 0 0.820 0 0.000
#> SRR1499418 3 0.2230 0.81905 0.116 0 0.884 0 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR815805 3 0.2929 0.80918 0.180 0 0.820 0 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR808272 3 0.1608 0.80196 0.072 0 0.928 0 0.000
#> SRR1436698 1 0.3395 0.71474 0.764 0 0.236 0 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1357672 3 0.3366 0.78652 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1077479 1 0.0290 0.76195 0.992 0 0.008 0 0.000
#> SRR814491 3 0.3305 0.77788 0.224 0 0.776 0 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1436004 1 0.2732 0.76546 0.840 0 0.160 0 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1314707 1 0.4015 0.50874 0.652 0 0.348 0 0.000
#> SRR1309534 3 0.1410 0.79236 0.060 0 0.940 0 0.000
#> SRR615527 3 0.0963 0.77657 0.036 0 0.964 0 0.000
#> SRR1098216 1 0.2891 0.75215 0.824 0 0.176 0 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1404003 3 0.4283 0.26716 0.456 0 0.544 0 0.000
#> SRR1344166 1 0.4060 0.48985 0.640 0 0.360 0 0.000
#> SRR1368638 3 0.3366 0.77008 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR815759 3 0.2127 0.81363 0.108 0 0.892 0 0.000
#> SRR1502143 3 0.3210 0.80287 0.212 0 0.788 0 0.000
#> SRR1487614 3 0.0404 0.74348 0.000 0 0.988 0 0.012
#> SRR1402307 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR820810 3 0.4201 0.45738 0.408 0 0.592 0 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1083215 3 0.3752 0.70929 0.292 0 0.708 0 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR656421 1 0.2690 0.76868 0.844 0 0.156 0 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1499917 3 0.2648 0.82274 0.152 0 0.848 0 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1434889 3 0.4192 0.47329 0.404 0 0.596 0 0.000
#> SRR1431847 3 0.1121 0.78236 0.044 0 0.956 0 0.000
#> SRR1317155 3 0.4126 0.49196 0.380 0 0.620 0 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR655289 1 0.4268 0.20679 0.556 0 0.444 0 0.000
#> SRR1341683 3 0.2690 0.82303 0.156 0 0.844 0 0.000
#> SRR1084790 1 0.3707 0.65067 0.716 0 0.284 0 0.000
#> SRR1073731 3 0.3366 0.76603 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR1332588 3 0.3395 0.78366 0.236 0 0.764 0 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR654945 3 0.3177 0.80331 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR661028 1 0.0404 0.76536 0.988 0 0.012 0 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1101152 3 0.3508 0.77503 0.252 0 0.748 0 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1379014 1 0.2929 0.75648 0.820 0 0.180 0 0.000
#> SRR1489904 3 0.0566 0.74764 0.004 0 0.984 0 0.012
#> SRR1416386 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1406048 1 0.3336 0.72045 0.772 0 0.228 0 0.000
#> SRR606982 3 0.3143 0.80519 0.204 0 0.796 0 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.75526 1.000 0 0.000 0 0.000
#> SRR1312934 3 0.3177 0.80957 0.208 0 0.792 0 0.000
#> SRR655194 1 0.3752 0.63293 0.708 0 0.292 0 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1389820 5 0.0000 0.92152 0.000 0 0.000 0 1.000
#> SRR1074289 3 0.3242 0.79859 0.216 0 0.784 0 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1076292 3 0.2732 0.81382 0.160 0 0.840 0 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1498909 3 0.2561 0.82346 0.144 0 0.856 0 0.000
#> SRR1443507 3 0.3480 0.77609 0.248 0 0.752 0 0.000
#> SRR1452310 3 0.2891 0.82150 0.176 0 0.824 0 0.000
#> SRR665610 3 0.3949 0.64728 0.332 0 0.668 0 0.000
#> SRR1347322 1 0.2966 0.75311 0.816 0 0.184 0 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1477256 1 0.2230 0.77701 0.884 0 0.116 0 0.000
#> SRR1470230 3 0.1270 0.78654 0.052 0 0.948 0 0.000
#> SRR1354247 1 0.2966 0.74823 0.816 0 0.184 0 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1487592 3 0.4138 0.55488 0.384 0 0.616 0 0.000
#> SRR1352299 1 0.4249 0.24954 0.568 0 0.432 0 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1434117 3 0.2471 0.82138 0.136 0 0.864 0 0.000
#> SRR1075273 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR658657 3 0.1965 0.81087 0.096 0 0.904 0 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1365332 3 0.3366 0.78783 0.232 0 0.768 0 0.000
#> SRR615958 3 0.2329 0.81953 0.124 0 0.876 0 0.000
#> SRR1097688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1403259 3 0.1121 0.78236 0.044 0 0.956 0 0.000
#> SRR1099120 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1362200 3 0.2389 0.81730 0.116 0 0.880 0 0.004
#> SRR1464856 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1347298 3 0.1484 0.78467 0.048 0 0.944 0 0.008
#> SRR1075923 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0 0.000
#> SRR1100703 1 0.4249 0.24954 0.568 0 0.432 0 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 3 0.3930 0.56091 0.092 0 0.764 0.144 0.000 0
#> SRR1436370 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1075752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1397949 1 0.4668 0.61204 0.620 0 0.316 0.064 0.000 0
#> SRR1355723 3 0.5152 0.01426 0.376 0 0.532 0.092 0.000 0
#> SRR1329744 1 0.2383 0.72714 0.880 0 0.096 0.024 0.000 0
#> SRR657384 3 0.3518 0.56662 0.092 0 0.804 0.104 0.000 0
#> SRR1351190 3 0.2838 0.43827 0.004 0 0.808 0.188 0.000 0
#> SRR1458662 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR818573 3 0.3947 0.50366 0.220 0 0.732 0.048 0.000 0
#> SRR1396017 3 0.4961 0.12631 0.348 0 0.572 0.080 0.000 0
#> SRR1410742 3 0.4449 0.47416 0.216 0 0.696 0.088 0.000 0
#> SRR1435963 1 0.4683 0.59607 0.616 0 0.320 0.064 0.000 0
#> SRR1382416 1 0.3183 0.71371 0.828 0 0.112 0.060 0.000 0
#> SRR1391354 3 0.4835 0.13199 0.336 0 0.592 0.072 0.000 0
#> SRR1087968 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1310075 1 0.1320 0.69052 0.948 0 0.016 0.036 0.000 0
#> SRR1312244 1 0.4482 0.55995 0.600 0 0.360 0.040 0.000 0
#> SRR1325138 3 0.4283 0.53262 0.180 0 0.724 0.096 0.000 0
#> SRR1326821 1 0.4322 0.34732 0.528 0 0.452 0.020 0.000 0
#> SRR1490178 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR655613 1 0.2214 0.72520 0.888 0 0.096 0.016 0.000 0
#> SRR1075707 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1443871 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1102489 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1465758 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1414058 3 0.3103 0.41244 0.008 0 0.784 0.208 0.000 0
#> SRR1407449 1 0.4863 0.45788 0.528 0 0.412 0.060 0.000 0
#> SRR1436858 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1479109 3 0.2448 0.57034 0.064 0 0.884 0.052 0.000 0
#> SRR1399069 3 0.5114 -0.22139 0.452 0 0.468 0.080 0.000 0
#> SRR1366450 3 0.4219 0.43087 0.320 0 0.648 0.032 0.000 0
#> SRR1396859 1 0.4668 0.59804 0.620 0 0.316 0.064 0.000 0
#> SRR1457176 1 0.4872 0.50167 0.548 0 0.388 0.064 0.000 0
#> SRR1097666 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1434736 3 0.4242 0.53699 0.128 0 0.736 0.136 0.000 0
#> SRR1080560 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1322882 1 0.1141 0.71794 0.948 0 0.052 0.000 0.000 0
#> SRR1435688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1327614 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR658152 3 0.3508 0.18761 0.004 0 0.704 0.292 0.000 0
#> SRR1368141 4 0.3817 0.75921 0.000 0 0.432 0.568 0.000 0
#> SRR1440268 1 0.2383 0.72714 0.880 0 0.096 0.024 0.000 0
#> SRR1453725 1 0.4929 0.42303 0.508 0 0.428 0.064 0.000 0
#> SRR1325711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477930 3 0.4903 -0.27146 0.464 0 0.476 0.060 0.000 0
#> SRR1477591 1 0.4224 0.60161 0.632 0 0.340 0.028 0.000 0
#> SRR1416049 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR656275 3 0.3715 0.51639 0.048 0 0.764 0.188 0.000 0
#> SRR1369052 3 0.4893 0.10317 0.340 0 0.584 0.076 0.000 0
#> SRR1377735 1 0.4726 0.43222 0.528 0 0.424 0.048 0.000 0
#> SRR1331244 1 0.4847 0.51570 0.560 0 0.376 0.064 0.000 0
#> SRR1404531 1 0.1657 0.72114 0.928 0 0.056 0.016 0.000 0
#> SRR1324331 1 0.2771 0.72722 0.852 0 0.116 0.032 0.000 0
#> SRR1458890 4 0.3804 0.75979 0.000 0 0.424 0.576 0.000 0
#> SRR1432695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1407624 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1431969 4 0.3765 0.76544 0.000 0 0.404 0.596 0.000 0
#> SRR1087393 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077263 3 0.2997 0.57361 0.096 0 0.844 0.060 0.000 0
#> SRR1385211 3 0.4831 -0.03863 0.392 0 0.548 0.060 0.000 0
#> SRR655241 3 0.4967 -0.16809 0.420 0 0.512 0.068 0.000 0
#> SRR656922 3 0.4847 -0.19420 0.444 0 0.500 0.056 0.000 0
#> SRR1361630 3 0.2318 0.56580 0.044 0 0.892 0.064 0.000 0
#> SRR1318966 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1407087 3 0.2454 0.47995 0.000 0 0.840 0.160 0.000 0
#> SRR603212 3 0.4150 0.37156 0.320 0 0.652 0.028 0.000 0
#> SRR1321088 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1485190 3 0.3847 -0.43925 0.000 0 0.544 0.456 0.000 0
#> SRR1332232 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312645 3 0.4949 0.51121 0.208 0 0.648 0.144 0.000 0
#> SRR1457835 3 0.3327 0.56648 0.088 0 0.820 0.092 0.000 0
#> SRR1347123 4 0.3659 0.82688 0.000 0 0.364 0.636 0.000 0
#> SRR1465501 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1330878 4 0.3464 0.83300 0.000 0 0.312 0.688 0.000 0
#> SRR1445064 3 0.2793 0.42284 0.000 0 0.800 0.200 0.000 0
#> SRR1452981 3 0.4847 0.10568 0.340 0 0.588 0.072 0.000 0
#> SRR1326708 1 0.1367 0.71506 0.944 0 0.044 0.012 0.000 0
#> SRR1407157 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1365401 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1397697 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477316 3 0.4414 0.51797 0.204 0 0.704 0.092 0.000 0
#> SRR1077898 1 0.2482 0.73169 0.848 0 0.148 0.004 0.000 0
#> SRR1349080 3 0.3896 0.44616 0.056 0 0.748 0.196 0.000 0
#> SRR1076096 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR811261 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1375485 1 0.3245 0.70572 0.800 0 0.172 0.028 0.000 0
#> SRR1432563 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR604414 1 0.1141 0.71794 0.948 0 0.052 0.000 0.000 0
#> SRR1380614 1 0.4621 0.61630 0.632 0 0.304 0.064 0.000 0
#> SRR812060 3 0.2378 0.47352 0.000 0 0.848 0.152 0.000 0
#> SRR602082 1 0.1141 0.71794 0.948 0 0.052 0.000 0.000 0
#> SRR1069490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1078417 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR661613 3 0.2454 0.47024 0.000 0 0.840 0.160 0.000 0
#> SRR1420710 3 0.2887 0.55521 0.036 0 0.844 0.120 0.000 0
#> SRR660426 1 0.0909 0.69444 0.968 0 0.012 0.020 0.000 0
#> SRR1416003 3 0.2805 0.44125 0.004 0 0.812 0.184 0.000 0
#> SRR661064 1 0.4829 0.41425 0.520 0 0.424 0.056 0.000 0
#> SRR1082011 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1452718 1 0.4278 0.60151 0.632 0 0.336 0.032 0.000 0
#> SRR1353243 1 0.4538 0.57449 0.612 0 0.340 0.048 0.000 0
#> SRR1455482 1 0.3712 0.72134 0.768 0 0.180 0.052 0.000 0
#> SRR1313473 1 0.3202 0.72128 0.816 0 0.144 0.040 0.000 0
#> SRR1399394 3 0.4720 0.29016 0.304 0 0.624 0.072 0.000 0
#> SRR1102467 1 0.4932 0.50392 0.556 0 0.372 0.072 0.000 0
#> SRR1317470 3 0.2118 0.52763 0.008 0 0.888 0.104 0.000 0
#> SRR1337707 4 0.3695 0.80506 0.000 0 0.376 0.624 0.000 0
#> SRR1408752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1474617 5 0.0146 0.90327 0.000 0 0.000 0.004 0.996 0
#> SRR1398013 3 0.3283 0.50582 0.036 0 0.804 0.160 0.000 0
#> SRR1352918 3 0.4479 0.41772 0.080 0 0.684 0.236 0.000 0
#> SRR1420750 1 0.4644 0.38160 0.504 0 0.456 0.040 0.000 0
#> SRR1071785 4 0.3804 0.75979 0.000 0 0.424 0.576 0.000 0
#> SRR1353618 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1082217 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1357256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1490313 3 0.4358 0.49833 0.196 0 0.712 0.092 0.000 0
#> SRR1366560 1 0.4495 0.65640 0.660 0 0.276 0.064 0.000 0
#> SRR1355684 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1323289 5 0.2631 0.72527 0.000 0 0.000 0.180 0.820 0
#> SRR1313494 1 0.4945 0.33732 0.484 0 0.452 0.064 0.000 0
#> SRR1309985 1 0.4992 0.26940 0.468 0 0.464 0.068 0.000 0
#> SRR607911 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1333789 3 0.2163 0.53790 0.016 0 0.892 0.092 0.000 0
#> SRR1400078 3 0.3522 0.52105 0.044 0 0.784 0.172 0.000 0
#> SRR1088631 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1092842 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR615575 3 0.2416 0.47016 0.000 0 0.844 0.156 0.000 0
#> SRR1079434 3 0.3789 0.11037 0.008 0 0.660 0.332 0.000 0
#> SRR1325559 3 0.4823 0.11012 0.348 0 0.584 0.068 0.000 0
#> SRR1446695 3 0.2398 0.54565 0.020 0 0.876 0.104 0.000 0
#> SRR1383883 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1396100 3 0.4479 0.41772 0.080 0 0.684 0.236 0.000 0
#> SRR1475697 3 0.3756 -0.26190 0.000 0 0.600 0.400 0.000 0
#> SRR1488067 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1102103 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1105154 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1084991 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1410380 3 0.2260 0.48479 0.000 0 0.860 0.140 0.000 0
#> SRR1445490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1454671 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1435044 3 0.2983 0.53003 0.032 0 0.832 0.136 0.000 0
#> SRR1485812 3 0.3879 0.20305 0.020 0 0.688 0.292 0.000 0
#> SRR1078020 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1311153 1 0.2709 0.73285 0.848 0 0.132 0.020 0.000 0
#> SRR1376406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1343898 4 0.3213 0.47223 0.000 0 0.132 0.820 0.048 0
#> SRR807775 3 0.3684 -0.13325 0.000 0 0.628 0.372 0.000 0
#> SRR1409215 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR820427 3 0.3896 0.44616 0.056 0 0.748 0.196 0.000 0
#> SRR1100656 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1362159 1 0.0790 0.68069 0.968 0 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1414536 3 0.2362 0.49962 0.004 0 0.860 0.136 0.000 0
#> SRR656794 3 0.4228 0.10152 0.392 0 0.588 0.020 0.000 0
#> SRR604653 1 0.0777 0.68803 0.972 0 0.004 0.024 0.000 0
#> SRR1317685 3 0.3879 0.20305 0.020 0 0.688 0.292 0.000 0
#> SRR1485912 3 0.2842 0.55980 0.044 0 0.852 0.104 0.000 0
#> SRR1407602 3 0.3847 -0.38400 0.000 0 0.544 0.456 0.000 0
#> SRR1356164 3 0.3965 -0.18452 0.008 0 0.604 0.388 0.000 0
#> SRR1328692 3 0.3823 -0.38354 0.000 0 0.564 0.436 0.000 0
#> SRR1362438 1 0.1686 0.72622 0.924 0 0.064 0.012 0.000 0
#> SRR1479216 4 0.3499 0.83741 0.000 0 0.320 0.680 0.000 0
#> SRR1358041 3 0.4846 0.07157 0.356 0 0.576 0.068 0.000 0
#> SRR1468766 3 0.2389 0.50674 0.008 0 0.864 0.128 0.000 0
#> SRR1368200 3 0.2454 0.47024 0.000 0 0.840 0.160 0.000 0
#> SRR1435602 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1501043 4 0.3602 0.47163 0.000 0 0.136 0.792 0.072 0
#> SRR1437256 4 0.3804 0.75979 0.000 0 0.424 0.576 0.000 0
#> SRR1487446 3 0.4893 0.07418 0.356 0 0.572 0.072 0.000 0
#> SRR816653 1 0.4726 0.43222 0.528 0 0.424 0.048 0.000 0
#> SRR815164 3 0.4581 -0.17053 0.448 0 0.516 0.036 0.000 0
#> SRR1442043 3 0.4989 0.29072 0.316 0 0.592 0.092 0.000 0
#> SRR1410573 1 0.1010 0.68240 0.960 0 0.004 0.036 0.000 0
#> SRR1096782 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1352369 3 0.3859 0.30307 0.020 0 0.692 0.288 0.000 0
#> SRR1382934 4 0.3426 0.79490 0.000 0 0.276 0.720 0.004 0
#> SRR1465208 1 0.4892 0.37456 0.500 0 0.440 0.060 0.000 0
#> SRR1314728 3 0.4442 0.52767 0.168 0 0.712 0.120 0.000 0
#> SRR1470291 1 0.1152 0.68566 0.952 0 0.004 0.044 0.000 0
#> SRR1308756 3 0.2454 0.46610 0.000 0 0.840 0.160 0.000 0
#> SRR1409600 3 0.2448 0.57034 0.064 0 0.884 0.052 0.000 0
#> SRR816123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR614779 3 0.2793 0.43028 0.000 0 0.800 0.200 0.000 0
#> SRR810783 3 0.3473 0.57084 0.096 0 0.808 0.096 0.000 0
#> SRR1333990 1 0.2361 0.72564 0.884 0 0.088 0.028 0.000 0
#> SRR1410356 3 0.1913 0.54005 0.012 0 0.908 0.080 0.000 0
#> SRR808106 3 0.3896 0.44616 0.056 0 0.748 0.196 0.000 0
#> SRR662713 3 0.3518 0.56547 0.092 0 0.804 0.104 0.000 0
#> SRR1447058 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1480964 3 0.2762 0.42883 0.000 0 0.804 0.196 0.000 0
#> SRR809382 3 0.3804 -0.34278 0.000 0 0.576 0.424 0.000 0
#> SRR665417 3 0.5034 -0.29811 0.460 0 0.468 0.072 0.000 0
#> SRR1088016 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1453166 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1069826 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077781 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR615623 4 0.3428 0.82534 0.000 0 0.304 0.696 0.000 0
#> SRR1413787 4 0.3409 0.82242 0.000 0 0.300 0.700 0.000 0
#> SRR1478207 3 0.2454 0.47995 0.000 0 0.840 0.160 0.000 0
#> SRR1411046 1 0.2001 0.70320 0.912 0 0.048 0.040 0.000 0
#> SRR1313711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326560 1 0.3240 0.72618 0.812 0 0.148 0.040 0.000 0
#> SRR1309051 1 0.1007 0.71619 0.956 0 0.044 0.000 0.000 0
#> SRR1486949 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1395616 1 0.2294 0.72230 0.892 0 0.072 0.036 0.000 0
#> SRR1074956 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1092961 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR817210 3 0.2593 0.51127 0.008 0 0.844 0.148 0.000 0
#> SRR1319221 5 0.0363 0.90275 0.000 0 0.000 0.012 0.988 0
#> SRR1405413 3 0.2826 0.53506 0.028 0 0.844 0.128 0.000 0
#> SRR607807 1 0.1007 0.67172 0.956 0 0.000 0.044 0.000 0
#> SRR1390160 4 0.3634 0.83095 0.000 0 0.356 0.644 0.000 0
#> SRR1406283 3 0.4355 -0.02137 0.420 0 0.556 0.024 0.000 0
#> SRR1357709 3 0.4747 0.28370 0.288 0 0.632 0.080 0.000 0
#> SRR1080742 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1468208 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1312766 3 0.1951 0.54477 0.016 0 0.908 0.076 0.000 0
#> SRR1361612 1 0.4725 0.57835 0.604 0 0.332 0.064 0.000 0
#> SRR1311224 1 0.3817 0.68405 0.720 0 0.252 0.028 0.000 0
#> SRR1087801 3 0.4981 -0.14902 0.436 0 0.496 0.068 0.000 0
#> SRR1099720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1349250 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1350912 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1357127 3 0.2826 0.53506 0.028 0 0.844 0.128 0.000 0
#> SRR1074980 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1317022 4 0.3531 0.83749 0.000 0 0.328 0.672 0.000 0
#> SRR1332879 1 0.4238 0.59728 0.628 0 0.344 0.028 0.000 0
#> SRR1403177 6 0.0000 0.00000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1076144 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1069614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR818239 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1421069 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1500006 1 0.0777 0.68803 0.972 0 0.004 0.024 0.000 0
#> SRR1485678 3 0.4370 0.42173 0.252 0 0.684 0.064 0.000 0
#> SRR1092232 4 0.3261 0.67909 0.000 0 0.204 0.780 0.016 0
#> SRR1344253 3 0.3907 0.32431 0.028 0 0.704 0.268 0.000 0
#> SRR1384290 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1089349 3 0.2416 0.47016 0.000 0 0.844 0.156 0.000 0
#> SRR1343522 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326727 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1440940 3 0.3975 -0.50470 0.004 0 0.544 0.452 0.000 0
#> SRR818372 3 0.3133 0.40874 0.008 0 0.780 0.212 0.000 0
#> SRR1323675 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR819894 3 0.4425 0.53857 0.176 0 0.712 0.112 0.000 0
#> SRR1310031 4 0.3868 0.59109 0.000 0 0.496 0.504 0.000 0
#> SRR615419 4 0.3804 0.75979 0.000 0 0.424 0.576 0.000 0
#> SRR1436925 3 0.4687 0.24362 0.308 0 0.624 0.068 0.000 0
#> SRR1477238 1 0.1391 0.68827 0.944 0 0.016 0.040 0.000 0
#> SRR1332566 1 0.4747 0.54337 0.584 0 0.356 0.060 0.000 0
#> SRR1490228 3 0.2771 0.54509 0.032 0 0.852 0.116 0.000 0
#> SRR1442949 3 0.3728 0.05685 0.004 0 0.652 0.344 0.000 0
#> SRR1466239 1 0.1320 0.69210 0.948 0 0.016 0.036 0.000 0
#> SRR1094003 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1329971 1 0.4331 0.33524 0.516 0 0.464 0.020 0.000 0
#> SRR813076 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1097642 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1322981 3 0.2263 0.54247 0.016 0 0.884 0.100 0.000 0
#> SRR1485976 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1471713 3 0.3833 -0.43746 0.000 0 0.556 0.444 0.000 0
#> SRR660522 3 0.3156 0.48126 0.020 0 0.800 0.180 0.000 0
#> SRR815374 3 0.3133 0.40874 0.008 0 0.780 0.212 0.000 0
#> SRR1069564 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1416337 3 0.2793 0.43028 0.000 0 0.800 0.200 0.000 0
#> SRR1316438 4 0.3868 0.57798 0.000 0 0.492 0.508 0.000 0
#> SRR1386844 1 0.2487 0.72388 0.876 0 0.092 0.032 0.000 0
#> SRR1373718 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1447458 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1487128 1 0.4332 0.64733 0.672 0 0.276 0.052 0.000 0
#> SRR1441421 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1069919 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1460296 1 0.4872 0.50167 0.548 0 0.388 0.064 0.000 0
#> SRR1335489 3 0.4843 0.48692 0.232 0 0.652 0.116 0.000 0
#> SRR1393404 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1081425 1 0.0777 0.68803 0.972 0 0.004 0.024 0.000 0
#> SRR1401815 4 0.3464 0.83300 0.000 0 0.312 0.688 0.000 0
#> SRR1071337 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1071983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1331793 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1410510 4 0.3499 0.83741 0.000 0 0.320 0.680 0.000 0
#> SRR1098761 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312124 1 0.4892 0.37456 0.500 0 0.440 0.060 0.000 0
#> SRR615395 3 0.4273 0.14777 0.380 0 0.596 0.024 0.000 0
#> SRR1479349 1 0.4863 0.45788 0.528 0 0.412 0.060 0.000 0
#> SRR2165033 3 0.3283 0.52695 0.036 0 0.804 0.160 0.000 0
#> SRR1089054 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR816201 3 0.2912 0.37975 0.000 0 0.784 0.216 0.000 0
#> SRR1488514 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR655840 3 0.4425 0.53857 0.176 0 0.712 0.112 0.000 0
#> SRR1379303 1 0.4307 0.68688 0.704 0 0.224 0.072 0.000 0
#> SRR1418516 3 0.3319 0.50175 0.036 0 0.800 0.164 0.000 0
#> SRR613174 3 0.2340 0.47945 0.000 0 0.852 0.148 0.000 0
#> SRR1351125 3 0.3063 0.56750 0.068 0 0.840 0.092 0.000 0
#> SRR659157 3 0.3717 -0.12054 0.000 0 0.616 0.384 0.000 0
#> SRR1480408 3 0.4283 0.53262 0.180 0 0.724 0.096 0.000 0
#> SRR657857 3 0.4618 0.44635 0.092 0 0.672 0.236 0.000 0
#> SRR1073317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1332526 3 0.4549 0.42661 0.232 0 0.680 0.088 0.000 0
#> SRR1094168 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1431270 4 0.3851 0.68009 0.000 0 0.460 0.540 0.000 0
#> SRR1085614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1330106 3 0.3862 0.55440 0.096 0 0.772 0.132 0.000 0
#> SRR1466154 1 0.0909 0.69444 0.968 0 0.012 0.020 0.000 0
#> SRR1396944 1 0.1367 0.68861 0.944 0 0.012 0.044 0.000 0
#> SRR1082784 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1457267 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR614659 3 0.3744 0.54381 0.184 0 0.764 0.052 0.000 0
#> SRR659247 3 0.3473 0.57084 0.096 0 0.808 0.096 0.000 0
#> SRR1317201 1 0.4538 0.58589 0.612 0 0.340 0.048 0.000 0
#> SRR1473696 1 0.4238 0.59728 0.628 0 0.344 0.028 0.000 0
#> SRR1375842 1 0.0777 0.68803 0.972 0 0.004 0.024 0.000 0
#> SRR1388123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1096363 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1453662 3 0.4621 0.24534 0.304 0 0.632 0.064 0.000 0
#> SRR1345499 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1353499 1 0.3755 0.69765 0.744 0 0.220 0.036 0.000 0
#> SRR1416693 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1070841 3 0.2852 0.56706 0.064 0 0.856 0.080 0.000 0
#> SRR1380910 1 0.1010 0.68240 0.960 0 0.004 0.036 0.000 0
#> SRR1333125 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1498183 1 0.4895 0.37693 0.496 0 0.444 0.060 0.000 0
#> SRR612659 4 0.3810 0.75840 0.000 0 0.428 0.572 0.000 0
#> SRR1447148 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR658597 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1089595 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1074263 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1376786 3 0.4325 0.51085 0.244 0 0.692 0.064 0.000 0
#> SRR1345995 3 0.2972 0.56587 0.128 0 0.836 0.036 0.000 0
#> SRR1071035 3 0.4981 -0.14902 0.436 0 0.496 0.068 0.000 0
#> SRR1068808 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1332754 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR662438 1 0.1461 0.71847 0.940 0 0.044 0.016 0.000 0
#> SRR1335355 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR659448 3 0.1970 0.53181 0.008 0 0.900 0.092 0.000 0
#> SRR1323558 3 0.3330 0.27308 0.000 0 0.716 0.284 0.000 0
#> SRR1381711 3 0.2398 0.54471 0.020 0 0.876 0.104 0.000 0
#> SRR657985 3 0.1866 0.54010 0.008 0 0.908 0.084 0.000 0
#> SRR1314810 3 0.4348 0.53402 0.152 0 0.724 0.124 0.000 0
#> SRR1336505 3 0.3612 0.50133 0.036 0 0.764 0.200 0.000 0
#> SRR1474095 3 0.2771 0.54509 0.032 0 0.852 0.116 0.000 0
#> SRR1363831 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1442376 3 0.4619 0.43335 0.244 0 0.668 0.088 0.000 0
#> SRR1074909 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101200 3 0.4325 0.51085 0.244 0 0.692 0.064 0.000 0
#> SRR1075408 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1367150 3 0.4203 0.54702 0.124 0 0.740 0.136 0.000 0
#> SRR1313406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1068880 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1467277 3 0.2398 0.54565 0.020 0 0.876 0.104 0.000 0
#> SRR1084867 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1095431 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1380184 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1443113 3 0.2771 0.56735 0.116 0 0.852 0.032 0.000 0
#> SRR1380414 3 0.2312 0.52509 0.012 0 0.876 0.112 0.000 0
#> SRR1315912 1 0.2709 0.73285 0.848 0 0.132 0.020 0.000 0
#> SRR1075778 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1421116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR602282 3 0.3868 -0.57597 0.000 0 0.504 0.496 0.000 0
#> SRR1361195 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR600493 1 0.1141 0.71794 0.948 0 0.052 0.000 0.000 0
#> SRR1477653 1 0.4644 0.36230 0.504 0 0.456 0.040 0.000 0
#> SRR1355475 3 0.2416 0.47016 0.000 0 0.844 0.156 0.000 0
#> SRR1360785 3 0.5248 0.31615 0.304 0 0.572 0.124 0.000 0
#> SRR810437 3 0.2912 0.37975 0.000 0 0.784 0.216 0.000 0
#> SRR1361860 3 0.4825 0.49430 0.152 0 0.668 0.180 0.000 0
#> SRR1441311 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1098903 3 0.4822 0.14723 0.332 0 0.596 0.072 0.000 0
#> SRR1457619 3 0.4949 0.51121 0.208 0 0.648 0.144 0.000 0
#> SRR1498529 3 0.4455 0.39550 0.240 0 0.684 0.076 0.000 0
#> SRR1097172 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1074017 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1472033 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1445087 3 0.3828 -0.41196 0.000 0 0.560 0.440 0.000 0
#> SRR1399525 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312844 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1085874 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101226 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1476056 3 0.4751 0.22808 0.312 0 0.616 0.072 0.000 0
#> SRR1075659 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1311916 4 0.3499 0.83741 0.000 0 0.320 0.680 0.000 0
#> SRR1353353 4 0.3563 0.83676 0.000 0 0.336 0.664 0.000 0
#> SRR1073291 3 0.3151 0.29089 0.000 0 0.748 0.252 0.000 0
#> SRR1356227 1 0.4652 0.60208 0.624 0 0.312 0.064 0.000 0
#> SRR1080720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1091695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1350304 3 0.3938 0.12635 0.016 0 0.660 0.324 0.000 0
#> SRR663002 3 0.3782 -0.27958 0.000 0 0.588 0.412 0.000 0
#> SRR1376983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1399926 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1347144 4 0.3499 0.83741 0.000 0 0.320 0.680 0.000 0
#> SRR1384006 1 0.2983 0.71982 0.832 0 0.136 0.032 0.000 0
#> SRR1499108 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR614047 3 0.3428 0.21892 0.000 0 0.696 0.304 0.000 0
#> SRR818440 3 0.2593 0.51127 0.008 0 0.844 0.148 0.000 0
#> SRR1337770 3 0.4620 0.25771 0.292 0 0.640 0.068 0.000 0
#> SRR1399413 3 0.2771 0.56735 0.116 0 0.852 0.032 0.000 0
#> SRR1385542 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473959 3 0.2871 0.43167 0.004 0 0.804 0.192 0.000 0
#> SRR1074041 3 0.1918 0.53328 0.008 0 0.904 0.088 0.000 0
#> SRR1394495 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR659460 3 0.2454 0.47995 0.000 0 0.840 0.160 0.000 0
#> SRR816699 3 0.2340 0.47851 0.000 0 0.852 0.148 0.000 0
#> SRR1308612 3 0.2738 0.44802 0.004 0 0.820 0.176 0.000 0
#> SRR1499418 3 0.3619 0.20286 0.004 0 0.680 0.316 0.000 0
#> SRR1352894 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR815805 3 0.4045 0.31487 0.036 0 0.696 0.268 0.000 0
#> SRR1331083 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR808272 3 0.3789 -0.31189 0.000 0 0.584 0.416 0.000 0
#> SRR1436698 1 0.4603 0.46470 0.544 0 0.416 0.040 0.000 0
#> SRR1095627 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1357672 3 0.1802 0.54536 0.012 0 0.916 0.072 0.000 0
#> SRR1351236 1 0.0790 0.68069 0.968 0 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR1077479 1 0.1391 0.68827 0.944 0 0.016 0.040 0.000 0
#> SRR814491 3 0.4478 0.40192 0.076 0 0.680 0.244 0.000 0
#> SRR1101256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1436004 1 0.4083 0.64178 0.668 0 0.304 0.028 0.000 0
#> SRR1457994 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1078998 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1314707 3 0.5022 -0.00595 0.396 0 0.528 0.076 0.000 0
#> SRR1309534 3 0.3747 -0.24869 0.000 0 0.604 0.396 0.000 0
#> SRR615527 3 0.3867 -0.54209 0.000 0 0.512 0.488 0.000 0
#> SRR1098216 1 0.4938 0.54769 0.580 0 0.340 0.080 0.000 0
#> SRR1325847 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1404003 3 0.4680 0.53136 0.184 0 0.684 0.132 0.000 0
#> SRR1344166 3 0.4751 0.20801 0.312 0 0.616 0.072 0.000 0
#> SRR1368638 3 0.4479 0.41772 0.080 0 0.684 0.236 0.000 0
#> SRR1431429 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1079237 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1080509 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR815759 3 0.3699 0.09196 0.004 0 0.660 0.336 0.000 0
#> SRR1502143 3 0.2266 0.52820 0.012 0 0.880 0.108 0.000 0
#> SRR1487614 4 0.3531 0.83505 0.000 0 0.328 0.672 0.000 0
#> SRR1402307 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR820810 3 0.3754 0.55924 0.152 0 0.776 0.072 0.000 0
#> SRR1099212 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1083215 3 0.2852 0.56706 0.064 0 0.856 0.080 0.000 0
#> SRR1476547 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR656421 1 0.4470 0.56558 0.604 0 0.356 0.040 0.000 0
#> SRR1086116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1499917 3 0.2805 0.44406 0.004 0 0.812 0.184 0.000 0
#> SRR1339944 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1391444 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1434889 3 0.3940 0.55510 0.140 0 0.764 0.096 0.000 0
#> SRR1431847 3 0.3857 -0.47736 0.000 0 0.532 0.468 0.000 0
#> SRR1317155 3 0.4953 0.49388 0.172 0 0.652 0.176 0.000 0
#> SRR1477405 1 0.0790 0.68069 0.968 0 0.000 0.032 0.000 0
#> SRR655289 3 0.4473 0.40832 0.252 0 0.676 0.072 0.000 0
#> SRR1341683 3 0.2964 0.42058 0.004 0 0.792 0.204 0.000 0
#> SRR1084790 3 0.4407 -0.27274 0.484 0 0.492 0.024 0.000 0
#> SRR1073731 3 0.4357 0.43787 0.072 0 0.696 0.232 0.000 0
#> SRR1332588 3 0.3268 0.53070 0.044 0 0.812 0.144 0.000 0
#> SRR1471157 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR654945 3 0.1908 0.52603 0.004 0 0.900 0.096 0.000 0
#> SRR661028 1 0.1141 0.71794 0.948 0 0.052 0.000 0.000 0
#> SRR1413477 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101152 3 0.3394 0.54003 0.052 0 0.804 0.144 0.000 0
#> SRR1358435 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR2165273 1 0.0865 0.67850 0.964 0 0.000 0.036 0.000 0
#> SRR1379014 1 0.4885 0.52335 0.560 0 0.372 0.068 0.000 0
#> SRR1489904 4 0.3634 0.83095 0.000 0 0.356 0.644 0.000 0
#> SRR1416386 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1406048 1 0.4797 0.37762 0.504 0 0.444 0.052 0.000 0
#> SRR606982 3 0.4050 0.40797 0.048 0 0.716 0.236 0.000 0
#> SRR1358082 1 0.1010 0.68240 0.960 0 0.004 0.036 0.000 0
#> SRR1312934 3 0.3283 0.52147 0.036 0 0.804 0.160 0.000 0
#> SRR655194 3 0.4985 -0.07533 0.400 0 0.528 0.072 0.000 0
#> SRR1331174 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473251 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1389820 5 0.0000 0.90443 0.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1074289 3 0.1918 0.53328 0.008 0 0.904 0.088 0.000 0
#> SRR1348816 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1076292 3 0.3879 0.25517 0.020 0 0.688 0.292 0.000 0
#> SRR1395810 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1498909 3 0.2854 0.40900 0.000 0 0.792 0.208 0.000 0
#> SRR1443507 3 0.2658 0.55909 0.036 0 0.864 0.100 0.000 0
#> SRR1452310 3 0.3078 0.46544 0.012 0 0.796 0.192 0.000 0
#> SRR665610 3 0.3469 0.56754 0.088 0 0.808 0.104 0.000 0
#> SRR1347322 1 0.4893 0.47714 0.536 0 0.400 0.064 0.000 0
#> SRR813395 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477256 1 0.4270 0.66203 0.684 0 0.264 0.052 0.000 0
#> SRR1470230 4 0.3867 0.58210 0.000 0 0.488 0.512 0.000 0
#> SRR1354247 1 0.4932 0.50392 0.556 0 0.372 0.072 0.000 0
#> SRR1082640 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1487592 3 0.3276 0.56312 0.132 0 0.816 0.052 0.000 0
#> SRR1352299 3 0.4150 0.33351 0.320 0 0.652 0.028 0.000 0
#> SRR1076317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1434117 3 0.3330 0.26311 0.000 0 0.716 0.284 0.000 0
#> SRR1075273 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR658657 3 0.3795 -0.05981 0.004 0 0.632 0.364 0.000 0
#> SRR1092773 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1365332 3 0.2250 0.54609 0.020 0 0.888 0.092 0.000 0
#> SRR615958 3 0.3428 0.21472 0.000 0 0.696 0.304 0.000 0
#> SRR1097688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1403259 3 0.3847 -0.43925 0.000 0 0.544 0.456 0.000 0
#> SRR1099120 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1362200 3 0.3634 -0.06148 0.000 0 0.644 0.356 0.000 0
#> SRR1464856 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1347298 4 0.3864 0.64742 0.000 0 0.480 0.520 0.000 0
#> SRR1075923 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1100703 3 0.4150 0.33351 0.320 0 0.652 0.028 0.000 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.4355 0.565 0.565
#> 3 3 0.684 0.897 0.867 0.4175 0.771 0.594
#> 4 4 0.670 0.581 0.764 0.1472 0.956 0.874
#> 5 5 0.681 0.711 0.765 0.0784 0.860 0.588
#> 6 6 0.672 0.601 0.678 0.0516 0.939 0.737
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398013 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.808 0.670 0.752 0.248
#> SRR1076144 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.0747 0.9256 0.016 0.000 0.984
#> SRR1436370 2 0.1289 0.9274 0.032 0.968 0.000
#> SRR1075752 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1397949 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1355723 3 0.5529 0.3305 0.296 0.000 0.704
#> SRR1329744 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR657384 1 0.6215 0.7061 0.572 0.000 0.428
#> SRR1351190 3 0.0237 0.9390 0.004 0.000 0.996
#> SRR1458662 2 0.1411 0.9271 0.036 0.964 0.000
#> SRR818573 1 0.5529 0.9388 0.704 0.000 0.296
#> SRR1396017 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1410742 3 0.5678 0.2585 0.316 0.000 0.684
#> SRR1435963 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1382416 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1391354 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1087968 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1310075 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1312244 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1325138 3 0.6260 -0.3423 0.448 0.000 0.552
#> SRR1326821 1 0.5591 0.9281 0.696 0.000 0.304
#> SRR1490178 2 0.1289 0.9274 0.032 0.968 0.000
#> SRR655613 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1075707 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1443871 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1102489 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1465758 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1414058 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407449 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1436858 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1479109 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399069 1 0.5465 0.9483 0.712 0.000 0.288
#> SRR1366450 3 0.6192 -0.2346 0.420 0.000 0.580
#> SRR1396859 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1457176 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1097666 2 0.4974 0.9008 0.236 0.764 0.000
#> SRR1434736 1 0.6280 0.6395 0.540 0.000 0.460
#> SRR1080560 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1322882 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR658152 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440268 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1453725 1 0.5327 0.9666 0.728 0.000 0.272
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1477591 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1416049 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR656275 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369052 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1377735 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1331244 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1404531 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1324331 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1458890 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432695 2 0.1529 0.9271 0.040 0.960 0.000
#> SRR1407624 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1077263 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385211 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR655241 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR656922 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1361630 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318966 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1407087 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR603212 1 0.6140 0.7668 0.596 0.000 0.404
#> SRR1321088 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332232 2 0.0892 0.9279 0.020 0.980 0.000
#> SRR1312645 3 0.6062 -0.0684 0.384 0.000 0.616
#> SRR1457835 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1347123 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465501 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452981 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1326708 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1407157 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1365401 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1397697 2 0.1289 0.9274 0.032 0.968 0.000
#> SRR1477316 3 0.3116 0.7960 0.108 0.000 0.892
#> SRR1077898 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1349080 3 0.3686 0.7362 0.140 0.000 0.860
#> SRR1076096 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR811261 2 0.5058 0.9005 0.244 0.756 0.000
#> SRR1375485 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1432563 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR604414 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1380614 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR812060 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR602082 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1069490 2 0.4504 0.9078 0.196 0.804 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420710 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR660426 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1416003 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR661064 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1353243 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1455482 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1313473 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1399394 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1102467 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1317470 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337707 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.8938 0.2119 0.124 0.444 0.432
#> SRR1398013 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352918 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1420750 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1071785 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353618 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1082217 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1357256 2 0.1411 0.9271 0.036 0.964 0.000
#> SRR1490313 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366560 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1355684 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1323289 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1309985 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR607911 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1333789 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400078 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR615575 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079434 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325559 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1446695 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383883 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1396100 3 0.4887 0.5547 0.228 0.000 0.772
#> SRR1475697 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488067 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1102103 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1105154 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1084991 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1410380 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445490 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1454671 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1435044 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485812 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078020 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1311153 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1376406 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409215 2 0.0237 0.9290 0.004 0.996 0.000
#> SRR820427 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100656 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1362159 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1414536 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR656794 1 0.6095 0.7902 0.608 0.000 0.392
#> SRR604653 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1317685 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485912 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407602 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356164 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328692 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362438 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1479216 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358041 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1468766 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368200 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435602 2 0.0892 0.9279 0.020 0.980 0.000
#> SRR1501043 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487446 3 0.0592 0.9302 0.012 0.000 0.988
#> SRR816653 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR815164 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1442043 1 0.6299 0.5854 0.524 0.000 0.476
#> SRR1410573 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1096782 2 0.0237 0.9290 0.004 0.996 0.000
#> SRR1352369 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1382934 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1314728 1 0.6154 0.7430 0.592 0.000 0.408
#> SRR1470291 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1308756 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409600 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR816123 2 0.4974 0.9008 0.236 0.764 0.000
#> SRR614779 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR810783 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333990 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1410356 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR808106 3 0.6225 -0.2850 0.432 0.000 0.568
#> SRR662713 3 0.2625 0.8320 0.084 0.000 0.916
#> SRR1447058 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1480964 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1088016 2 0.5058 0.9005 0.244 0.756 0.000
#> SRR1453166 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478207 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1411046 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1313711 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR1326560 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1309051 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1486949 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1395616 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1074956 2 0.4605 0.9072 0.204 0.796 0.000
#> SRR1092961 2 0.4974 0.9008 0.236 0.764 0.000
#> SRR817210 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319221 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.5529 0.9394 0.704 0.000 0.296
#> SRR607807 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1390160 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406283 1 0.6126 0.7747 0.600 0.000 0.400
#> SRR1357709 3 0.6192 -0.2306 0.420 0.000 0.580
#> SRR1080742 2 0.4842 0.9032 0.224 0.776 0.000
#> SRR1468208 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1312766 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361612 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1311224 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1087801 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099720 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1349250 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1350912 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1357127 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074980 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332879 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1403177 1 0.8493 0.5713 0.604 0.148 0.248
#> SRR1076144 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR1069614 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR818239 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1421069 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1500006 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1485678 3 0.6252 -0.3284 0.444 0.000 0.556
#> SRR1092232 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344253 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384290 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1089349 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR818372 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323675 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR819894 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310031 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR615419 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436925 3 0.5859 0.1390 0.344 0.000 0.656
#> SRR1477238 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1332566 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1490228 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442949 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466239 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR813076 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1097642 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1322981 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485976 2 0.1289 0.9274 0.032 0.968 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR660522 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR815374 3 0.0424 0.9347 0.008 0.000 0.992
#> SRR1069564 2 0.4842 0.9032 0.224 0.776 0.000
#> SRR1416337 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316438 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1373718 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1447458 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1487128 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1441421 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1335489 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1393404 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1081425 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1401815 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1071983 2 0.0424 0.9289 0.008 0.992 0.000
#> SRR1331793 2 0.1753 0.9267 0.048 0.952 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098761 2 0.4974 0.9008 0.236 0.764 0.000
#> SRR1312124 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR615395 1 0.6095 0.7901 0.608 0.000 0.392
#> SRR1479349 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR2165033 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089054 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR816201 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.0424 0.9347 0.008 0.000 0.992
#> SRR1379303 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1418516 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR613174 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351125 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR659157 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480408 3 0.6045 -0.0410 0.380 0.000 0.620
#> SRR657857 3 0.5363 0.3991 0.276 0.000 0.724
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.6302 -0.4589 0.480 0.000 0.520
#> SRR1094168 2 0.5058 0.9005 0.244 0.756 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085614 2 0.0424 0.9289 0.008 0.992 0.000
#> SRR1330106 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466154 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1396944 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1082784 2 0.1411 0.9271 0.036 0.964 0.000
#> SRR1457267 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR614659 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR659247 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317201 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1473696 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1375842 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1388123 2 0.0892 0.9279 0.020 0.980 0.000
#> SRR1096363 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1453662 3 0.1031 0.9158 0.024 0.000 0.976
#> SRR1345499 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1353499 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1416693 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1070841 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380910 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR612659 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447148 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR658597 2 0.3482 0.9117 0.128 0.872 0.000
#> SRR1089595 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.6260 -0.3484 0.448 0.000 0.552
#> SRR1345995 3 0.5560 0.3298 0.300 0.000 0.700
#> SRR1071035 3 0.6192 -0.2346 0.420 0.000 0.580
#> SRR1068808 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1332754 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR662438 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1335355 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR659448 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323558 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381711 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR657985 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314810 1 0.5988 0.8336 0.632 0.000 0.368
#> SRR1336505 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474095 3 0.2356 0.8524 0.072 0.000 0.928
#> SRR1363831 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR1442376 1 0.5968 0.8370 0.636 0.000 0.364
#> SRR1074909 2 0.3752 0.9119 0.144 0.856 0.000
#> SRR1101200 3 0.5560 0.3158 0.300 0.000 0.700
#> SRR1075408 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1367150 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313406 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1068880 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1467277 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084867 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1095431 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1380184 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1443113 1 0.5905 0.8597 0.648 0.000 0.352
#> SRR1380414 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315912 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1075778 2 0.0892 0.9279 0.020 0.980 0.000
#> SRR1421116 2 0.1643 0.9269 0.044 0.956 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361195 2 0.0892 0.9279 0.020 0.980 0.000
#> SRR600493 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1477653 3 0.5363 0.4099 0.276 0.000 0.724
#> SRR1355475 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360785 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR810437 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361860 3 0.6244 -0.3031 0.440 0.000 0.560
#> SRR1441311 2 0.1529 0.9271 0.040 0.960 0.000
#> SRR1098903 1 0.6008 0.8275 0.628 0.000 0.372
#> SRR1457619 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498529 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1097172 2 0.2356 0.9243 0.072 0.928 0.000
#> SRR1074017 2 0.0592 0.9288 0.012 0.988 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399525 2 0.3412 0.9161 0.124 0.876 0.000
#> SRR1312844 2 0.4842 0.9032 0.224 0.776 0.000
#> SRR1085874 2 0.4842 0.9032 0.224 0.776 0.000
#> SRR1101226 2 0.5058 0.9005 0.244 0.756 0.000
#> SRR1476056 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1075659 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1311916 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353353 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073291 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356227 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1080720 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1091695 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1350304 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR663002 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376983 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1399926 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1347144 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384006 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1499108 2 0.4842 0.9032 0.224 0.776 0.000
#> SRR614047 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR818440 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337770 1 0.6111 0.7752 0.604 0.000 0.396
#> SRR1399413 3 0.0592 0.9300 0.012 0.000 0.988
#> SRR1385542 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1473959 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074041 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394495 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR659460 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR816699 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499418 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352894 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR815805 1 0.5968 0.8415 0.636 0.000 0.364
#> SRR1331083 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436698 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1095627 2 0.4974 0.9008 0.236 0.764 0.000
#> SRR1357672 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351236 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1077479 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR814491 3 0.1289 0.9061 0.032 0.000 0.968
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1314707 1 0.5968 0.8371 0.636 0.000 0.364
#> SRR1309534 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR615527 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098216 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1325847 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1404003 3 0.0424 0.9347 0.008 0.000 0.992
#> SRR1344166 1 0.5363 0.9621 0.724 0.000 0.276
#> SRR1368638 3 0.0424 0.9347 0.008 0.000 0.992
#> SRR1431429 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1079237 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1080509 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR815759 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1502143 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487614 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR820810 1 0.5948 0.8479 0.640 0.000 0.360
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0892 0.9205 0.020 0.000 0.980
#> SRR1476547 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR656421 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1086116 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1499917 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339944 2 0.1289 0.9274 0.032 0.968 0.000
#> SRR1391444 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR1434889 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431847 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317155 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477405 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR655289 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341683 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084790 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1073731 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332588 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471157 2 0.1529 0.9271 0.040 0.960 0.000
#> SRR654945 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR661028 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358435 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR2165273 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1379014 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1489904 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416386 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1406048 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR606982 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358082 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1312934 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR655194 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1389820 2 0.8887 0.3353 0.124 0.488 0.388
#> SRR1074289 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395810 2 0.1163 0.9273 0.028 0.972 0.000
#> SRR1498909 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443507 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452310 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR665610 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347322 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR813395 2 0.4974 0.9008 0.236 0.764 0.000
#> SRR1477256 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1470230 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354247 1 0.5254 0.9752 0.736 0.000 0.264
#> SRR1082640 2 0.3686 0.9126 0.140 0.860 0.000
#> SRR1487592 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352299 1 0.5497 0.9437 0.708 0.000 0.292
#> SRR1076317 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1434117 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075273 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR658657 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092773 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1365332 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR615958 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097688 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1403259 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099120 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9290 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.9432 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075923 2 0.3412 0.9115 0.124 0.876 0.000
#> SRR1100703 3 0.0237 0.9390 0.004 0.000 0.996
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.5097 -0.01544 0.004 0.000 0.568 0.428
#> SRR1436370 2 0.1302 0.89521 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1075752 2 0.4352 0.87463 0.080 0.816 0.000 0.104
#> SRR1397949 1 0.2480 0.84382 0.904 0.000 0.088 0.008
#> SRR1355723 3 0.6924 -0.46471 0.108 0.000 0.464 0.428
#> SRR1329744 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR657384 4 0.7561 0.69892 0.192 0.000 0.384 0.424
#> SRR1351190 3 0.4898 0.04258 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1458662 2 0.1637 0.89519 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR818573 4 0.7916 0.67158 0.336 0.000 0.312 0.352
#> SRR1396017 1 0.7088 -0.10382 0.480 0.000 0.128 0.392
#> SRR1410742 3 0.6924 -0.47284 0.108 0.000 0.464 0.428
#> SRR1435963 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1382416 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1391354 1 0.7808 -0.51371 0.388 0.000 0.252 0.360
#> SRR1087968 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1310075 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1312244 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1325138 3 0.7284 -0.60393 0.148 0.000 0.428 0.424
#> SRR1326821 1 0.7282 -0.12559 0.512 0.000 0.316 0.172
#> SRR1490178 2 0.1637 0.89519 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR655613 1 0.2281 0.84272 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1075707 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1443871 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1102489 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1465758 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1414058 3 0.2760 0.54828 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1407449 1 0.3820 0.80952 0.848 0.000 0.088 0.064
#> SRR1436858 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1479109 3 0.2329 0.52094 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1399069 4 0.7802 0.74672 0.276 0.000 0.304 0.420
#> SRR1366450 3 0.6469 -0.11814 0.192 0.000 0.644 0.164
#> SRR1396859 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1457176 1 0.4150 0.76160 0.824 0.000 0.120 0.056
#> SRR1097666 2 0.5646 0.86097 0.088 0.708 0.000 0.204
#> SRR1434736 3 0.7414 -0.50974 0.172 0.000 0.460 0.368
#> SRR1080560 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1322882 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR658152 3 0.4855 0.19792 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1368141 3 0.4790 0.44872 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1440268 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1453725 1 0.7790 -0.47006 0.420 0.000 0.316 0.264
#> SRR1325711 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.5248 0.68758 0.748 0.000 0.088 0.164
#> SRR1477591 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1416049 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR656275 3 0.4888 0.04497 0.000 0.000 0.588 0.412
#> SRR1369052 1 0.5646 0.62551 0.708 0.000 0.088 0.204
#> SRR1377735 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1331244 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1404531 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1324331 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1458890 3 0.4804 0.44443 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1432695 2 0.1716 0.89518 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1407624 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1431969 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1087393 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1077263 3 0.3672 0.43086 0.012 0.000 0.824 0.164
#> SRR1385211 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR655241 1 0.5750 0.60501 0.696 0.000 0.088 0.216
#> SRR656922 1 0.6970 0.29004 0.576 0.000 0.168 0.256
#> SRR1361630 3 0.1022 0.56126 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1318966 2 0.4144 0.87660 0.068 0.828 0.000 0.104
#> SRR1407087 3 0.2345 0.55436 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR603212 3 0.7771 -0.59861 0.348 0.000 0.408 0.244
#> SRR1321088 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1485190 3 0.4304 0.51265 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1332232 2 0.1022 0.89568 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1312645 3 0.7007 -0.50505 0.116 0.000 0.452 0.432
#> SRR1457835 1 0.6133 0.37810 0.644 0.000 0.268 0.088
#> SRR1347123 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1465501 2 0.4483 0.87353 0.088 0.808 0.000 0.104
#> SRR1330878 3 0.3726 0.52074 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1445064 3 0.4454 0.50493 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1452981 4 0.7796 0.74174 0.284 0.000 0.292 0.424
#> SRR1326708 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1407157 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1365401 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1397697 2 0.1302 0.89521 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1477316 3 0.5901 -0.16140 0.036 0.000 0.532 0.432
#> SRR1077898 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1349080 3 0.6120 0.05629 0.076 0.000 0.628 0.296
#> SRR1076096 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR811261 2 0.5631 0.86180 0.076 0.700 0.000 0.224
#> SRR1375485 1 0.7224 0.09643 0.548 0.000 0.236 0.216
#> SRR1432563 2 0.1474 0.89569 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR604414 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1380614 1 0.2334 0.84490 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR812060 3 0.0469 0.55685 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR602082 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1069490 2 0.5457 0.86528 0.088 0.728 0.000 0.184
#> SRR1078417 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0469 0.55969 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420710 3 0.4898 0.04258 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR660426 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1416003 3 0.4948 0.19715 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR661064 1 0.5681 0.61977 0.704 0.000 0.088 0.208
#> SRR1082011 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1353243 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1455482 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1313473 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1399394 1 0.7837 -0.49066 0.408 0.000 0.300 0.292
#> SRR1102467 1 0.7851 -0.55054 0.376 0.000 0.268 0.356
#> SRR1317470 3 0.0188 0.56042 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1337707 3 0.4382 0.50911 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1408752 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.8506 0.21166 0.028 0.268 0.408 0.296
#> SRR1398013 3 0.4907 0.04085 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1352918 4 0.7796 0.74174 0.284 0.000 0.292 0.424
#> SRR1420750 1 0.2546 0.84115 0.900 0.000 0.092 0.008
#> SRR1071785 3 0.4500 0.49814 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1353618 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1082217 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1357256 2 0.1716 0.89518 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1490313 3 0.4916 0.01649 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1366560 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1355684 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1323289 3 0.4193 0.50243 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1313494 1 0.5496 0.65331 0.724 0.000 0.088 0.188
#> SRR1309985 1 0.6549 0.23805 0.556 0.000 0.088 0.356
#> SRR607911 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1333789 3 0.3672 0.43133 0.012 0.000 0.824 0.164
#> SRR1400078 3 0.4907 0.04085 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1088631 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR615575 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079434 3 0.3688 0.53599 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1325559 1 0.7099 0.04394 0.552 0.000 0.280 0.168
#> SRR1446695 3 0.1867 0.52745 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1383883 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1396100 3 0.6542 -0.32370 0.076 0.000 0.496 0.428
#> SRR1475697 4 0.4916 -0.13426 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1488067 2 0.4144 0.87674 0.068 0.828 0.000 0.104
#> SRR1102103 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1105154 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1084991 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1410380 3 0.2760 0.54874 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1445490 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1454671 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1435044 3 0.4250 0.35631 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1485812 3 0.4103 0.52826 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1078020 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1311153 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1376406 2 0.1302 0.89521 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1343898 3 0.3942 0.50891 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR807775 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1409215 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.3569 0.45876 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1100656 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1362159 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1414536 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656794 3 0.6445 -0.35801 0.444 0.000 0.488 0.068
#> SRR604653 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1317685 3 0.2921 0.55198 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1485912 3 0.3751 0.40250 0.004 0.000 0.800 0.196
#> SRR1407602 3 0.4948 0.36705 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1356164 3 0.4907 0.33744 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1328692 3 0.4356 0.48590 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1362438 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1479216 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1358041 1 0.6801 0.27027 0.568 0.000 0.124 0.308
#> SRR1468766 3 0.2868 0.47632 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1368200 3 0.1022 0.55230 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1435602 2 0.1022 0.89568 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1501043 3 0.4406 0.50317 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1437256 3 0.4981 0.35025 0.000 0.000 0.536 0.464
#> SRR1487446 3 0.5097 -0.01544 0.004 0.000 0.568 0.428
#> SRR816653 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR815164 1 0.7698 -0.34998 0.452 0.000 0.292 0.256
#> SRR1442043 4 0.7541 0.69027 0.188 0.000 0.388 0.424
#> SRR1410573 1 0.2334 0.84692 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR1096782 2 0.0469 0.89710 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1352369 3 0.2973 0.49485 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1382934 3 0.4277 0.51404 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1465208 1 0.3820 0.81022 0.848 0.000 0.088 0.064
#> SRR1314728 1 0.7355 -0.18465 0.488 0.000 0.340 0.172
#> SRR1470291 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1308756 3 0.0336 0.56105 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1409600 3 0.3161 0.47578 0.012 0.000 0.864 0.124
#> SRR816123 2 0.5646 0.86097 0.088 0.708 0.000 0.204
#> SRR614779 3 0.1022 0.56126 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR810783 3 0.4137 0.36886 0.012 0.000 0.780 0.208
#> SRR1333990 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1410356 3 0.2402 0.51806 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR808106 3 0.7099 -0.31927 0.168 0.000 0.552 0.280
#> SRR662713 3 0.4679 0.34033 0.044 0.000 0.772 0.184
#> SRR1447058 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1480964 3 0.3688 0.43856 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR809382 3 0.4277 0.51404 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR665417 1 0.6262 0.44164 0.628 0.000 0.092 0.280
#> SRR1088016 2 0.5716 0.86095 0.088 0.700 0.000 0.212
#> SRR1453166 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1069826 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.3688 0.52117 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1413787 3 0.3688 0.52117 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1478207 3 0.3356 0.53780 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1411046 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1313711 2 0.1474 0.89534 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1326560 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1309051 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1486949 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1395616 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1074956 2 0.5535 0.86346 0.088 0.720 0.000 0.192
#> SRR1092961 2 0.5655 0.86115 0.084 0.704 0.000 0.212
#> SRR817210 3 0.4250 0.33205 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1319221 3 0.4477 0.49559 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1405413 1 0.7916 -0.64265 0.356 0.000 0.320 0.324
#> SRR607807 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1390160 3 0.3688 0.52206 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1406283 3 0.6471 -0.34298 0.416 0.000 0.512 0.072
#> SRR1357709 3 0.7284 -0.60393 0.148 0.000 0.428 0.424
#> SRR1080742 2 0.5572 0.86296 0.088 0.716 0.000 0.196
#> SRR1468208 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1312766 3 0.2402 0.51806 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR1361612 1 0.3745 0.81399 0.852 0.000 0.088 0.060
#> SRR1311224 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1087801 3 0.4718 0.27770 0.012 0.000 0.708 0.280
#> SRR1099720 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1349250 2 0.4352 0.87463 0.080 0.816 0.000 0.104
#> SRR1350912 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1357127 3 0.1118 0.56035 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1074980 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1317022 3 0.3688 0.52117 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1332879 1 0.2530 0.82908 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1403177 1 0.8603 0.32555 0.536 0.116 0.176 0.172
#> SRR1076144 2 0.1118 0.89541 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1069614 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR818239 2 0.4483 0.87353 0.088 0.808 0.000 0.104
#> SRR1421069 2 0.4483 0.87353 0.088 0.808 0.000 0.104
#> SRR1500006 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1485678 3 0.7530 -0.63463 0.188 0.000 0.436 0.376
#> SRR1092232 3 0.4304 0.51242 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1344253 3 0.3024 0.49049 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1384290 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1089349 3 0.1807 0.53601 0.008 0.000 0.940 0.052
#> SRR1343522 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0188 0.89744 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1440940 4 0.5000 -0.21888 0.000 0.000 0.496 0.504
#> SRR818372 3 0.4817 0.10662 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1323675 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR819894 3 0.4925 0.00253 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1310031 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR615419 3 0.4817 0.44037 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1436925 3 0.7076 -0.50749 0.124 0.000 0.460 0.416
#> SRR1477238 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1332566 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1490228 3 0.1940 0.55127 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1442949 3 0.2589 0.55248 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1466239 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1094003 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.5690 0.44942 0.672 0.000 0.268 0.060
#> SRR813076 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1097642 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1322981 3 0.2402 0.51806 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR1485976 2 0.1302 0.89521 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1471713 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR660522 3 0.0336 0.56025 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR815374 3 0.4916 0.00522 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1069564 2 0.5572 0.86296 0.088 0.716 0.000 0.196
#> SRR1416337 3 0.1022 0.56126 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1316438 3 0.4304 0.51265 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1386844 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1373718 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1447458 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1487128 1 0.3149 0.83620 0.880 0.000 0.088 0.032
#> SRR1441421 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1069919 2 0.0188 0.89744 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1460296 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1335489 1 0.3421 0.82729 0.868 0.000 0.088 0.044
#> SRR1393404 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1081425 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1401815 3 0.3726 0.52074 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1071337 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1071983 2 0.0469 0.89710 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1331793 2 0.1940 0.89489 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1410510 3 0.3688 0.52117 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1098761 2 0.5646 0.86097 0.088 0.708 0.000 0.204
#> SRR1312124 4 0.7777 0.68585 0.316 0.000 0.260 0.424
#> SRR615395 3 0.6434 -0.34907 0.432 0.000 0.500 0.068
#> SRR1479349 1 0.6508 0.28088 0.568 0.000 0.088 0.344
#> SRR2165033 3 0.4898 0.04258 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1089054 2 0.4018 0.87076 0.004 0.772 0.000 0.224
#> SRR816201 3 0.4898 0.04258 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1488514 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 3 0.5105 -0.01746 0.004 0.000 0.564 0.432
#> SRR1379303 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1418516 3 0.4907 0.04085 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR613174 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.0657 0.55501 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR659157 3 0.4543 0.49360 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1480408 3 0.7153 -0.55174 0.132 0.000 0.444 0.424
#> SRR657857 3 0.6797 -0.43529 0.096 0.000 0.468 0.436
#> SRR1073317 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.7451 0.64423 0.172 0.000 0.412 0.416
#> SRR1094168 2 0.5690 0.86109 0.084 0.700 0.000 0.216
#> SRR1431270 3 0.4356 0.51130 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1085614 2 0.0469 0.89710 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1330106 3 0.4866 0.26138 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1466154 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1396944 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1082784 2 0.1716 0.89518 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1457267 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR614659 3 0.4888 0.04497 0.000 0.000 0.588 0.412
#> SRR659247 3 0.4500 0.18598 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1317201 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1473696 1 0.5619 0.49963 0.688 0.000 0.248 0.064
#> SRR1375842 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1388123 2 0.1022 0.89568 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1096363 2 0.4144 0.87660 0.068 0.828 0.000 0.104
#> SRR1453662 3 0.5526 -0.04520 0.020 0.000 0.564 0.416
#> SRR1345499 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1353499 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1416693 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1070841 3 0.0817 0.55259 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1380910 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1333125 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4599 0.73778 0.800 0.000 0.112 0.088
#> SRR612659 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1447148 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR658597 2 0.4542 0.87363 0.088 0.804 0.000 0.108
#> SRR1089595 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1074263 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.6448 -0.18092 0.252 0.000 0.628 0.120
#> SRR1345995 3 0.6198 0.03770 0.152 0.000 0.672 0.176
#> SRR1071035 3 0.7145 -0.36896 0.192 0.000 0.556 0.252
#> SRR1068808 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1332754 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR662438 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1335355 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR659448 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.1211 0.56101 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1381711 3 0.1716 0.53270 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR657985 3 0.0707 0.55413 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1314810 1 0.6826 -0.19648 0.484 0.000 0.416 0.100
#> SRR1336505 3 0.4855 0.07532 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1474095 3 0.5414 0.05152 0.020 0.000 0.604 0.376
#> SRR1363831 2 0.1302 0.89521 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1442376 4 0.7693 0.74065 0.224 0.000 0.352 0.424
#> SRR1074909 2 0.4969 0.87212 0.088 0.772 0.000 0.140
#> SRR1101200 3 0.5512 0.14781 0.172 0.000 0.728 0.100
#> SRR1075408 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1367150 3 0.4907 0.04085 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1313406 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1068880 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1467277 3 0.0336 0.56091 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1084867 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1095431 2 0.4483 0.87353 0.088 0.808 0.000 0.104
#> SRR1380184 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1443113 1 0.7480 -0.35995 0.444 0.000 0.376 0.180
#> SRR1380414 3 0.0592 0.55554 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1315912 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1075778 2 0.1022 0.89568 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1421116 2 0.1867 0.89506 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR602282 3 0.4454 0.50487 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1361195 2 0.1022 0.89568 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR600493 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1477653 3 0.5891 0.12922 0.132 0.000 0.700 0.168
#> SRR1355475 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360785 4 0.7881 0.68376 0.320 0.000 0.296 0.384
#> SRR810437 3 0.4406 0.50754 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1361860 4 0.7282 0.59348 0.148 0.000 0.416 0.436
#> SRR1441311 2 0.1716 0.89518 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1098903 4 0.7702 0.73716 0.224 0.000 0.360 0.416
#> SRR1457619 3 0.4925 0.00253 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1498529 1 0.7292 -0.08244 0.488 0.000 0.160 0.352
#> SRR1097172 2 0.2530 0.89183 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1074017 2 0.0469 0.89710 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1472033 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.4304 0.51265 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1399525 2 0.3279 0.88690 0.032 0.872 0.000 0.096
#> SRR1312844 2 0.5572 0.86296 0.088 0.716 0.000 0.196
#> SRR1085874 2 0.5535 0.86346 0.088 0.720 0.000 0.192
#> SRR1101226 2 0.5528 0.86263 0.064 0.700 0.000 0.236
#> SRR1476056 4 0.7807 0.73925 0.288 0.000 0.292 0.420
#> SRR1075659 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1311916 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1353353 3 0.4304 0.51265 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1073291 3 0.2345 0.55436 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1356227 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1080720 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1091695 2 0.4483 0.87353 0.088 0.808 0.000 0.104
#> SRR1350304 3 0.4916 0.04445 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR663002 3 0.3726 0.52074 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1376983 2 0.3764 0.87276 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1399926 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1347144 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1384006 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1499108 2 0.5572 0.86296 0.088 0.716 0.000 0.196
#> SRR614047 3 0.0188 0.56042 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR818440 3 0.3975 0.41877 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1337770 4 0.7665 0.73346 0.216 0.000 0.360 0.424
#> SRR1399413 3 0.4387 0.35893 0.024 0.000 0.776 0.200
#> SRR1385542 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1473959 3 0.4898 0.04258 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1074041 3 0.1305 0.54576 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR1394495 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR659460 3 0.2868 0.47608 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR816699 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499418 3 0.4331 0.51239 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1352894 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR815805 3 0.7856 -0.66345 0.276 0.000 0.388 0.336
#> SRR1331083 2 0.4483 0.87353 0.088 0.808 0.000 0.104
#> SRR808272 3 0.2589 0.55134 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1436698 1 0.5814 0.43235 0.644 0.000 0.300 0.056
#> SRR1095627 2 0.5646 0.86097 0.088 0.708 0.000 0.204
#> SRR1357672 3 0.1902 0.53108 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR1351236 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1077479 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR814491 3 0.5236 -0.03518 0.008 0.000 0.560 0.432
#> SRR1101256 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.2589 0.82510 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1314707 4 0.7740 0.74547 0.236 0.000 0.348 0.416
#> SRR1309534 3 0.4916 0.03451 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR615527 3 0.4331 0.51069 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1098216 1 0.3051 0.83884 0.884 0.000 0.088 0.028
#> SRR1325847 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1404003 3 0.5097 -0.01544 0.004 0.000 0.568 0.428
#> SRR1344166 1 0.7508 -0.12192 0.496 0.000 0.232 0.272
#> SRR1368638 3 0.5105 -0.01746 0.004 0.000 0.564 0.432
#> SRR1431429 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1079237 2 0.3996 0.87761 0.060 0.836 0.000 0.104
#> SRR1080509 2 0.1389 0.89618 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR815759 3 0.0336 0.56044 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1502143 3 0.0707 0.55413 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1487614 3 0.3726 0.52074 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1402307 2 0.3837 0.87102 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR820810 4 0.7876 0.72934 0.280 0.000 0.352 0.368
#> SRR1099212 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.4238 0.38845 0.028 0.000 0.796 0.176
#> SRR1476547 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR656421 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1086116 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1499917 3 0.4907 0.04085 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1339944 2 0.1302 0.89521 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1391444 2 0.1302 0.89521 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1434889 3 0.4888 0.04497 0.000 0.000 0.588 0.412
#> SRR1431847 3 0.4382 0.50963 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1317155 3 0.4916 0.03451 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1477405 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR655289 3 0.4916 0.00522 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1341683 4 0.5000 -0.25450 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1084790 1 0.3647 0.76721 0.832 0.000 0.152 0.016
#> SRR1073731 3 0.4103 0.37819 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1332588 3 0.4907 0.04085 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1471157 2 0.1716 0.89518 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR654945 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.5004 0.05636 0.004 0.000 0.604 0.392
#> SRR1358435 2 0.3497 0.88026 0.036 0.860 0.000 0.104
#> SRR2165273 1 0.2610 0.84721 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1379014 1 0.5292 0.68229 0.744 0.000 0.088 0.168
#> SRR1489904 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1416386 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1406048 1 0.6394 0.36671 0.596 0.000 0.088 0.316
#> SRR606982 3 0.4008 0.46978 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1358082 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1312934 3 0.2216 0.51618 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR655194 1 0.7818 -0.51423 0.388 0.000 0.256 0.356
#> SRR1331174 2 0.0336 0.89733 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473251 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1389820 3 0.8349 0.18193 0.016 0.316 0.376 0.292
#> SRR1074289 3 0.3271 0.47098 0.012 0.000 0.856 0.132
#> SRR1348816 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.4624 0.46314 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1395810 2 0.1474 0.89569 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1498909 3 0.4830 0.24438 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1443507 3 0.3377 0.46109 0.012 0.000 0.848 0.140
#> SRR1452310 3 0.4661 0.20042 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR665610 3 0.4888 0.04497 0.000 0.000 0.588 0.412
#> SRR1347322 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR813395 2 0.5655 0.86115 0.084 0.704 0.000 0.212
#> SRR1477256 1 0.2149 0.84670 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1470230 3 0.4040 0.52945 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1354247 1 0.3243 0.83241 0.876 0.000 0.088 0.036
#> SRR1082640 2 0.3873 0.87047 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1487592 3 0.2329 0.52094 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1352299 1 0.6887 -0.04990 0.528 0.000 0.356 0.116
#> SRR1076317 2 0.4352 0.87463 0.080 0.816 0.000 0.104
#> SRR1434117 3 0.0000 0.55988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.3919 0.87842 0.056 0.840 0.000 0.104
#> SRR658657 3 0.4250 0.51492 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1092773 2 0.2593 0.88222 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1365332 3 0.2329 0.52094 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR615958 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1097688 2 0.4483 0.87353 0.088 0.808 0.000 0.104
#> SRR1403259 3 0.4304 0.51265 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1099120 2 0.4419 0.87391 0.084 0.812 0.000 0.104
#> SRR1362200 3 0.2704 0.54943 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1464856 2 0.0000 0.89749 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.3649 0.52231 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1075923 2 0.4352 0.87463 0.080 0.816 0.000 0.104
#> SRR1100703 3 0.4248 0.35568 0.012 0.000 0.768 0.220
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 4 0.3885 0.7739 0.008 0.000 0.268 0.724 0.000
#> SRR1436370 2 0.0451 0.8253 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1075752 2 0.5219 0.7767 0.004 0.636 0.000 0.060 0.300
#> SRR1397949 1 0.1285 0.9172 0.956 0.000 0.036 0.004 0.004
#> SRR1355723 4 0.4558 0.7809 0.064 0.000 0.208 0.728 0.000
#> SRR1329744 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR657384 4 0.4864 0.7682 0.116 0.000 0.164 0.720 0.000
#> SRR1351190 4 0.3838 0.7658 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR1458662 2 0.0693 0.8249 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR818573 4 0.5290 0.7151 0.184 0.000 0.140 0.676 0.000
#> SRR1396017 4 0.4983 0.6196 0.268 0.000 0.048 0.676 0.008
#> SRR1410742 4 0.4645 0.7804 0.072 0.000 0.204 0.724 0.000
#> SRR1435963 1 0.1442 0.9167 0.952 0.000 0.032 0.012 0.004
#> SRR1382416 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1391354 4 0.5324 0.6942 0.216 0.000 0.096 0.680 0.008
#> SRR1087968 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1310075 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1312244 1 0.2122 0.9006 0.924 0.000 0.032 0.036 0.008
#> SRR1325138 4 0.4832 0.7725 0.104 0.000 0.176 0.720 0.000
#> SRR1326821 3 0.5738 0.3383 0.320 0.000 0.588 0.084 0.008
#> SRR1490178 2 0.0579 0.8251 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR655613 1 0.1857 0.9000 0.928 0.000 0.060 0.008 0.004
#> SRR1075707 2 0.4691 0.7950 0.020 0.756 0.000 0.060 0.164
#> SRR1443871 2 0.4479 0.7948 0.000 0.744 0.000 0.184 0.072
#> SRR1102489 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1465758 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1414058 3 0.2763 0.4202 0.000 0.000 0.848 0.004 0.148
#> SRR1407449 1 0.3876 0.7187 0.776 0.000 0.032 0.192 0.000
#> SRR1436858 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1479109 3 0.0955 0.6912 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1399069 4 0.5182 0.7381 0.164 0.000 0.120 0.708 0.008
#> SRR1366450 3 0.4239 0.5951 0.132 0.000 0.784 0.080 0.004
#> SRR1396859 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1457176 1 0.4001 0.7092 0.764 0.000 0.208 0.024 0.004
#> SRR1097666 2 0.6089 0.7630 0.012 0.536 0.000 0.096 0.356
#> SRR1434736 4 0.7161 0.4092 0.124 0.000 0.356 0.460 0.060
#> SRR1080560 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1322882 1 0.1788 0.9031 0.932 0.000 0.056 0.008 0.004
#> SRR1435688 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR1327614 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR658152 4 0.5414 0.6312 0.000 0.000 0.284 0.624 0.092
#> SRR1368141 5 0.5974 0.7981 0.000 0.000 0.320 0.132 0.548
#> SRR1440268 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1453725 3 0.6836 -0.0456 0.288 0.000 0.428 0.280 0.004
#> SRR1325711 2 0.1386 0.8284 0.016 0.952 0.000 0.000 0.032
#> SRR1477930 1 0.5114 0.2422 0.560 0.000 0.032 0.404 0.004
#> SRR1477591 1 0.1857 0.9002 0.928 0.000 0.060 0.008 0.004
#> SRR1416049 2 0.4138 0.8001 0.000 0.780 0.000 0.148 0.072
#> SRR656275 4 0.3707 0.7655 0.000 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1369052 1 0.5187 0.0568 0.504 0.000 0.032 0.460 0.004
#> SRR1377735 1 0.1538 0.9155 0.948 0.000 0.036 0.008 0.008
#> SRR1331244 1 0.1996 0.9013 0.928 0.000 0.032 0.036 0.004
#> SRR1404531 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1324331 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1458890 5 0.6175 0.7681 0.000 0.000 0.312 0.160 0.528
#> SRR1432695 2 0.1522 0.8249 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1407624 2 0.4297 0.7971 0.000 0.764 0.000 0.164 0.072
#> SRR1431969 5 0.4305 0.7896 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1087393 2 0.4653 0.7957 0.020 0.760 0.000 0.060 0.160
#> SRR1077263 3 0.1894 0.6863 0.000 0.000 0.920 0.072 0.008
#> SRR1385211 1 0.1202 0.9181 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR655241 1 0.5187 0.0550 0.504 0.000 0.032 0.460 0.004
#> SRR656922 4 0.5296 0.1171 0.468 0.000 0.048 0.484 0.000
#> SRR1361630 3 0.0290 0.6688 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1318966 2 0.5545 0.7786 0.020 0.636 0.000 0.060 0.284
#> SRR1407087 3 0.1952 0.5565 0.000 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR603212 3 0.5716 0.4172 0.216 0.000 0.636 0.144 0.004
#> SRR1321088 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1485190 5 0.5229 0.8642 0.000 0.000 0.404 0.048 0.548
#> SRR1332232 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1312645 4 0.5165 0.7768 0.092 0.000 0.188 0.708 0.012
#> SRR1457835 1 0.5942 0.2123 0.512 0.000 0.396 0.084 0.008
#> SRR1347123 5 0.4304 0.7965 0.000 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1465501 2 0.5335 0.7755 0.008 0.632 0.000 0.060 0.300
#> SRR1330878 5 0.4410 0.8424 0.000 0.000 0.440 0.004 0.556
#> SRR1445064 5 0.5726 0.8422 0.000 0.000 0.372 0.092 0.536
#> SRR1452981 4 0.5209 0.7327 0.172 0.000 0.116 0.704 0.008
#> SRR1326708 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1407157 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1365401 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1397697 2 0.0451 0.8253 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1477316 4 0.4403 0.7800 0.032 0.000 0.240 0.724 0.004
#> SRR1077898 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1349080 3 0.5066 0.4401 0.044 0.000 0.668 0.276 0.012
#> SRR1076096 2 0.4444 0.7955 0.000 0.748 0.000 0.180 0.072
#> SRR811261 2 0.6121 0.7634 0.012 0.536 0.000 0.100 0.352
#> SRR1375485 1 0.6300 -0.1472 0.448 0.000 0.132 0.416 0.004
#> SRR1432563 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR604414 1 0.1990 0.8933 0.920 0.000 0.068 0.008 0.004
#> SRR1380614 1 0.1682 0.9127 0.944 0.000 0.032 0.012 0.012
#> SRR812060 3 0.0290 0.6822 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR602082 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1069490 2 0.5773 0.7686 0.012 0.572 0.000 0.072 0.344
#> SRR1078417 2 0.0880 0.8284 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR661613 3 0.0671 0.6792 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1420710 4 0.3838 0.7658 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR660426 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1416003 4 0.5309 0.6300 0.000 0.000 0.264 0.644 0.092
#> SRR661064 1 0.5187 0.0577 0.504 0.000 0.032 0.460 0.004
#> SRR1082011 2 0.0880 0.8284 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1452718 1 0.1329 0.9169 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1353243 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1455482 1 0.0880 0.9187 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0880 0.9187 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.6669 0.0620 0.252 0.000 0.480 0.264 0.004
#> SRR1102467 4 0.5102 0.6948 0.216 0.000 0.100 0.684 0.000
#> SRR1317470 3 0.0162 0.6740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337707 5 0.5490 0.8549 0.000 0.000 0.372 0.072 0.556
#> SRR1408752 2 0.0880 0.8284 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1474617 5 0.6330 0.6283 0.020 0.096 0.204 0.032 0.648
#> SRR1398013 4 0.3957 0.7648 0.000 0.000 0.280 0.712 0.008
#> SRR1352918 4 0.5252 0.7394 0.160 0.000 0.120 0.708 0.012
#> SRR1420750 1 0.3474 0.7541 0.796 0.000 0.192 0.008 0.004
#> SRR1071785 5 0.5884 0.8260 0.000 0.000 0.352 0.112 0.536
#> SRR1353618 2 0.4479 0.7948 0.000 0.744 0.000 0.184 0.072
#> SRR1082217 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1357256 2 0.1408 0.8251 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1490313 4 0.3661 0.7698 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1366560 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1355684 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1323289 5 0.4800 0.8416 0.000 0.000 0.368 0.028 0.604
#> SRR1313494 1 0.5174 0.1166 0.520 0.000 0.032 0.444 0.004
#> SRR1309985 4 0.4790 0.5850 0.284 0.000 0.032 0.676 0.008
#> SRR607911 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1333789 3 0.2052 0.6840 0.004 0.000 0.912 0.080 0.004
#> SRR1400078 4 0.4161 0.7646 0.000 0.000 0.280 0.704 0.016
#> SRR1088631 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR1092842 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR615575 3 0.0162 0.6786 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1079434 3 0.6557 -0.4766 0.000 0.000 0.448 0.212 0.340
#> SRR1325559 1 0.6630 0.1490 0.468 0.000 0.348 0.176 0.008
#> SRR1446695 3 0.0955 0.6908 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1383883 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1396100 4 0.5036 0.7797 0.060 0.000 0.216 0.708 0.016
#> SRR1475697 4 0.6180 0.4213 0.000 0.000 0.220 0.556 0.224
#> SRR1488067 2 0.5180 0.7796 0.004 0.644 0.000 0.060 0.292
#> SRR1102103 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1105154 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1084991 2 0.4837 0.7937 0.020 0.740 0.000 0.060 0.180
#> SRR1410380 3 0.1043 0.6231 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1445490 2 0.4335 0.7967 0.000 0.760 0.000 0.168 0.072
#> SRR1454671 2 0.4581 0.7933 0.000 0.732 0.000 0.196 0.072
#> SRR1435044 3 0.5216 -0.1946 0.000 0.000 0.520 0.436 0.044
#> SRR1485812 5 0.6292 0.7276 0.000 0.000 0.400 0.152 0.448
#> SRR1078020 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1311153 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1376406 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1343898 5 0.4582 0.8504 0.000 0.000 0.416 0.012 0.572
#> SRR807775 3 0.2966 0.2937 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1409215 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR820427 3 0.3455 0.5397 0.000 0.000 0.784 0.208 0.008
#> SRR1100656 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1362159 1 0.0880 0.9187 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0000 0.6769 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656794 3 0.4347 0.4960 0.256 0.000 0.716 0.024 0.004
#> SRR604653 1 0.1041 0.9182 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1317685 3 0.5687 -0.0360 0.000 0.000 0.628 0.164 0.208
#> SRR1485912 3 0.2193 0.6777 0.000 0.000 0.900 0.092 0.008
#> SRR1407602 5 0.6622 0.5425 0.000 0.000 0.260 0.284 0.456
#> SRR1356164 4 0.6808 -0.2509 0.000 0.000 0.300 0.360 0.340
#> SRR1328692 3 0.6700 -0.4771 0.000 0.000 0.400 0.244 0.356
#> SRR1362438 1 0.1329 0.9169 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1479216 5 0.4304 0.7962 0.000 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1358041 4 0.5633 0.2426 0.428 0.000 0.064 0.504 0.004
#> SRR1468766 3 0.1704 0.6868 0.004 0.000 0.928 0.068 0.000
#> SRR1368200 3 0.0865 0.6824 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1435602 2 0.0451 0.8257 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1501043 5 0.5123 0.8635 0.000 0.000 0.384 0.044 0.572
#> SRR1437256 5 0.6396 0.6738 0.000 0.000 0.264 0.224 0.512
#> SRR1487446 4 0.4387 0.7711 0.008 0.000 0.272 0.704 0.016
#> SRR816653 1 0.1843 0.9057 0.932 0.000 0.052 0.008 0.008
#> SRR815164 4 0.7044 0.2767 0.304 0.000 0.324 0.364 0.008
#> SRR1442043 4 0.5138 0.7680 0.116 0.000 0.164 0.712 0.008
#> SRR1410573 1 0.0880 0.9187 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.1728 0.8285 0.020 0.940 0.000 0.004 0.036
#> SRR1352369 3 0.1671 0.6838 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1382934 5 0.5095 0.8650 0.000 0.000 0.400 0.040 0.560
#> SRR1465208 1 0.3609 0.7853 0.816 0.000 0.032 0.148 0.004
#> SRR1314728 3 0.6540 0.1930 0.368 0.000 0.484 0.132 0.016
#> SRR1470291 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1308756 3 0.0000 0.6769 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.1492 0.6924 0.004 0.000 0.948 0.040 0.008
#> SRR816123 2 0.6089 0.7630 0.012 0.536 0.000 0.096 0.356
#> SRR614779 3 0.0162 0.6730 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR810783 3 0.2233 0.6732 0.004 0.000 0.892 0.104 0.000
#> SRR1333990 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1410356 3 0.1205 0.6922 0.004 0.000 0.956 0.040 0.000
#> SRR808106 3 0.5752 0.3890 0.100 0.000 0.628 0.260 0.012
#> SRR662713 3 0.2482 0.6764 0.024 0.000 0.892 0.084 0.000
#> SRR1447058 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1480964 3 0.3109 0.5616 0.000 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR809382 5 0.5111 0.8630 0.000 0.000 0.408 0.040 0.552
#> SRR665417 4 0.4996 0.3079 0.420 0.000 0.032 0.548 0.000
#> SRR1088016 2 0.6089 0.7630 0.012 0.536 0.000 0.096 0.356
#> SRR1453166 2 0.5564 0.7777 0.020 0.632 0.000 0.060 0.288
#> SRR1069826 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR1077781 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR615623 5 0.4268 0.8392 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1413787 5 0.4268 0.8392 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1478207 3 0.4632 -0.6859 0.000 0.000 0.540 0.012 0.448
#> SRR1411046 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1313711 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326560 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1309051 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1486949 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1395616 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1074956 2 0.5797 0.7681 0.012 0.564 0.000 0.072 0.352
#> SRR1092961 2 0.6121 0.7634 0.012 0.536 0.000 0.100 0.352
#> SRR817210 3 0.3796 0.4072 0.000 0.000 0.700 0.300 0.000
#> SRR1319221 5 0.5030 0.8437 0.000 0.000 0.352 0.044 0.604
#> SRR1405413 3 0.6910 0.0144 0.224 0.000 0.476 0.284 0.016
#> SRR607807 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1390160 5 0.4425 0.8354 0.000 0.000 0.452 0.004 0.544
#> SRR1406283 3 0.4240 0.5095 0.240 0.000 0.732 0.024 0.004
#> SRR1357709 4 0.4818 0.7735 0.100 0.000 0.180 0.720 0.000
#> SRR1080742 2 0.6024 0.7652 0.012 0.548 0.000 0.092 0.348
#> SRR1468208 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1312766 3 0.1285 0.6921 0.004 0.000 0.956 0.036 0.004
#> SRR1361612 1 0.3733 0.7710 0.804 0.000 0.032 0.160 0.004
#> SRR1311224 1 0.1717 0.9060 0.936 0.000 0.052 0.008 0.004
#> SRR1087801 3 0.3676 0.5632 0.004 0.000 0.760 0.232 0.004
#> SRR1099720 2 0.4691 0.7950 0.020 0.756 0.000 0.060 0.164
#> SRR1349250 2 0.5316 0.7774 0.008 0.636 0.000 0.060 0.296
#> SRR1350912 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1357127 3 0.1211 0.6571 0.000 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR1074980 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1317022 5 0.4268 0.8392 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1332879 1 0.2621 0.8517 0.876 0.000 0.112 0.008 0.004
#> SRR1403177 1 0.8190 0.4316 0.536 0.100 0.152 0.076 0.136
#> SRR1076144 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1069614 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR818239 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1421069 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1500006 1 0.1041 0.9182 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1485678 4 0.5579 0.6946 0.116 0.000 0.264 0.620 0.000
#> SRR1092232 5 0.5086 0.8648 0.000 0.000 0.396 0.040 0.564
#> SRR1344253 3 0.2136 0.6723 0.000 0.000 0.904 0.088 0.008
#> SRR1384290 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1089349 3 0.1041 0.6916 0.004 0.000 0.964 0.032 0.000
#> SRR1343522 2 0.1041 0.8285 0.004 0.964 0.000 0.000 0.032
#> SRR1326727 2 0.0794 0.8283 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1440940 4 0.5164 0.6543 0.000 0.000 0.232 0.672 0.096
#> SRR818372 4 0.4130 0.7506 0.000 0.000 0.292 0.696 0.012
#> SRR1323675 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR819894 4 0.3838 0.7667 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR1310031 3 0.4256 -0.6397 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR615419 5 0.6262 0.7462 0.000 0.000 0.304 0.176 0.520
#> SRR1436925 4 0.4766 0.7782 0.072 0.000 0.220 0.708 0.000
#> SRR1477238 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1332566 1 0.2278 0.8972 0.916 0.000 0.032 0.044 0.008
#> SRR1490228 3 0.2300 0.6006 0.000 0.000 0.908 0.052 0.040
#> SRR1442949 3 0.4569 0.3567 0.000 0.000 0.748 0.148 0.104
#> SRR1466239 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1094003 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR1329971 3 0.5156 0.0156 0.464 0.000 0.504 0.024 0.008
#> SRR813076 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1097642 2 0.4691 0.7950 0.020 0.756 0.000 0.060 0.164
#> SRR1322981 3 0.1205 0.6922 0.004 0.000 0.956 0.040 0.000
#> SRR1485976 2 0.0451 0.8253 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1471713 3 0.4278 -0.6754 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR660522 3 0.0000 0.6769 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815374 4 0.3838 0.7695 0.004 0.000 0.280 0.716 0.000
#> SRR1069564 2 0.5990 0.7651 0.012 0.548 0.000 0.088 0.352
#> SRR1416337 3 0.0162 0.6730 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1316438 5 0.5195 0.8636 0.000 0.000 0.388 0.048 0.564
#> SRR1386844 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1373718 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1447458 2 0.4138 0.8001 0.000 0.780 0.000 0.148 0.072
#> SRR1487128 1 0.2201 0.8978 0.920 0.000 0.032 0.040 0.008
#> SRR1441421 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1069919 2 0.1082 0.8287 0.008 0.964 0.000 0.000 0.028
#> SRR1460296 1 0.1202 0.9181 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1335489 1 0.2710 0.8810 0.896 0.000 0.032 0.056 0.016
#> SRR1393404 2 0.4479 0.7948 0.000 0.744 0.000 0.184 0.072
#> SRR1081425 1 0.1041 0.9182 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1401815 5 0.4403 0.8442 0.000 0.000 0.436 0.004 0.560
#> SRR1071337 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1071983 2 0.2103 0.8282 0.020 0.920 0.000 0.004 0.056
#> SRR1331793 2 0.1725 0.8241 0.000 0.936 0.000 0.044 0.020
#> SRR1410510 5 0.4294 0.8183 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1098761 2 0.6089 0.7630 0.012 0.536 0.000 0.096 0.356
#> SRR1312124 4 0.5258 0.7304 0.176 0.000 0.108 0.704 0.012
#> SRR615395 3 0.4404 0.4981 0.252 0.000 0.716 0.028 0.004
#> SRR1479349 4 0.4583 0.5646 0.296 0.000 0.032 0.672 0.000
#> SRR2165033 4 0.4003 0.7591 0.000 0.000 0.288 0.704 0.008
#> SRR1089054 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR816201 4 0.3684 0.7671 0.000 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1488514 2 0.1386 0.8284 0.016 0.952 0.000 0.000 0.032
#> SRR655840 4 0.4039 0.7738 0.008 0.000 0.268 0.720 0.004
#> SRR1379303 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1418516 4 0.3934 0.7667 0.000 0.000 0.276 0.716 0.008
#> SRR613174 3 0.0000 0.6769 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.0290 0.6816 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR659157 5 0.5894 0.8210 0.000 0.000 0.356 0.112 0.532
#> SRR1480408 4 0.4725 0.7792 0.080 0.000 0.200 0.720 0.000
#> SRR657857 4 0.4705 0.7818 0.052 0.000 0.216 0.724 0.008
#> SRR1073317 2 0.1041 0.8285 0.004 0.964 0.000 0.000 0.032
#> SRR1332526 4 0.4926 0.7695 0.112 0.000 0.176 0.712 0.000
#> SRR1094168 2 0.6121 0.7634 0.012 0.536 0.000 0.100 0.352
#> SRR1431270 5 0.5360 0.8595 0.000 0.000 0.384 0.060 0.556
#> SRR1085614 2 0.1646 0.8284 0.020 0.944 0.000 0.004 0.032
#> SRR1330106 4 0.6163 0.4349 0.000 0.000 0.292 0.540 0.168
#> SRR1466154 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1396944 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1082784 2 0.1408 0.8251 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1457267 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR614659 4 0.3730 0.7630 0.000 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR659247 3 0.2929 0.6119 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1317201 1 0.1329 0.9179 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1473696 3 0.4988 0.1786 0.416 0.000 0.556 0.024 0.004
#> SRR1375842 1 0.1041 0.9182 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1388123 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1096363 2 0.5545 0.7786 0.020 0.636 0.000 0.060 0.284
#> SRR1453662 4 0.4040 0.7701 0.012 0.000 0.276 0.712 0.000
#> SRR1345499 2 0.4335 0.7967 0.000 0.760 0.000 0.168 0.072
#> SRR1353499 1 0.1329 0.9170 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1416693 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1070841 3 0.0510 0.6865 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1380910 1 0.1041 0.9188 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1333125 2 0.1386 0.8284 0.016 0.952 0.000 0.000 0.032
#> SRR1498183 1 0.4418 0.7071 0.756 0.000 0.060 0.180 0.004
#> SRR612659 5 0.4302 0.8023 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1447148 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR658597 2 0.5335 0.7755 0.008 0.632 0.000 0.060 0.300
#> SRR1089595 2 0.4691 0.7950 0.020 0.756 0.000 0.060 0.164
#> SRR1074263 2 0.1386 0.8284 0.016 0.952 0.000 0.000 0.032
#> SRR1376786 3 0.4166 0.5785 0.160 0.000 0.780 0.056 0.004
#> SRR1345995 3 0.3963 0.6230 0.104 0.000 0.808 0.084 0.004
#> SRR1071035 3 0.5305 0.4715 0.112 0.000 0.680 0.204 0.004
#> SRR1068808 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1332754 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR662438 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1335355 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR659448 3 0.0000 0.6769 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.0404 0.6653 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1381711 3 0.0771 0.6885 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR657985 3 0.0510 0.6865 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1314810 3 0.5303 0.4167 0.304 0.000 0.636 0.044 0.016
#> SRR1336505 4 0.3730 0.7624 0.000 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1474095 3 0.5021 0.0759 0.024 0.000 0.588 0.380 0.008
#> SRR1363831 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1442376 4 0.5163 0.7519 0.144 0.000 0.136 0.712 0.008
#> SRR1074909 2 0.5549 0.7730 0.008 0.600 0.000 0.068 0.324
#> SRR1101200 3 0.3359 0.6363 0.096 0.000 0.848 0.052 0.004
#> SRR1075408 2 0.4479 0.7948 0.000 0.744 0.000 0.184 0.072
#> SRR1367150 4 0.3934 0.7667 0.000 0.000 0.276 0.716 0.008
#> SRR1313406 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1068880 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1467277 3 0.0290 0.6757 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1084867 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1095431 2 0.5419 0.7756 0.012 0.632 0.000 0.060 0.296
#> SRR1380184 2 0.4096 0.8009 0.000 0.784 0.000 0.144 0.072
#> SRR1443113 3 0.5460 0.4179 0.264 0.000 0.640 0.092 0.004
#> SRR1380414 3 0.0290 0.6826 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1315912 1 0.1202 0.9177 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1075778 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1421116 2 0.1626 0.8245 0.000 0.940 0.000 0.044 0.016
#> SRR602282 5 0.5470 0.8563 0.000 0.000 0.364 0.072 0.564
#> SRR1361195 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR600493 1 0.1857 0.9000 0.928 0.000 0.060 0.008 0.004
#> SRR1477653 3 0.3460 0.6459 0.076 0.000 0.844 0.076 0.004
#> SRR1355475 3 0.0162 0.6786 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1360785 4 0.5481 0.7174 0.192 0.000 0.116 0.680 0.012
#> SRR810437 5 0.6321 0.7700 0.000 0.000 0.376 0.160 0.464
#> SRR1361860 4 0.4683 0.7775 0.092 0.000 0.176 0.732 0.000
#> SRR1441311 2 0.1522 0.8249 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1098903 4 0.5240 0.7573 0.136 0.000 0.152 0.704 0.008
#> SRR1457619 4 0.4088 0.7706 0.004 0.000 0.276 0.712 0.008
#> SRR1498529 4 0.4622 0.6007 0.276 0.000 0.040 0.684 0.000
#> SRR1097172 2 0.2932 0.8176 0.000 0.864 0.000 0.104 0.032
#> SRR1074017 2 0.2270 0.8271 0.020 0.916 0.000 0.012 0.052
#> SRR1472033 2 0.1386 0.8284 0.016 0.952 0.000 0.000 0.032
#> SRR1445087 5 0.5229 0.8642 0.000 0.000 0.404 0.048 0.548
#> SRR1399525 2 0.4584 0.8071 0.000 0.716 0.000 0.056 0.228
#> SRR1312844 2 0.5979 0.7662 0.012 0.552 0.000 0.088 0.348
#> SRR1085874 2 0.5809 0.7673 0.012 0.560 0.000 0.072 0.356
#> SRR1101226 2 0.6209 0.7651 0.012 0.536 0.000 0.112 0.340
#> SRR1476056 4 0.5152 0.7281 0.176 0.000 0.108 0.708 0.008
#> SRR1075659 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1311916 3 0.4291 -0.7020 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1353353 5 0.5204 0.8653 0.000 0.000 0.392 0.048 0.560
#> SRR1073291 3 0.0794 0.6407 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1356227 1 0.1996 0.9013 0.928 0.000 0.032 0.036 0.004
#> SRR1080720 2 0.4691 0.7950 0.020 0.756 0.000 0.060 0.164
#> SRR1091695 2 0.5237 0.7755 0.004 0.632 0.000 0.060 0.304
#> SRR1350304 4 0.4161 0.7646 0.000 0.000 0.280 0.704 0.016
#> SRR663002 5 0.4415 0.8418 0.000 0.000 0.444 0.004 0.552
#> SRR1376983 2 0.4179 0.7993 0.000 0.776 0.000 0.152 0.072
#> SRR1399926 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1347144 3 0.4273 -0.6663 0.000 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1384006 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1499108 2 0.6024 0.7652 0.012 0.548 0.000 0.092 0.348
#> SRR614047 3 0.0162 0.6740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818440 3 0.5685 -0.1005 0.000 0.000 0.520 0.396 0.084
#> SRR1337770 4 0.4889 0.7575 0.136 0.000 0.144 0.720 0.000
#> SRR1399413 3 0.2408 0.6768 0.008 0.000 0.892 0.096 0.004
#> SRR1385542 2 0.4258 0.7977 0.000 0.768 0.000 0.160 0.072
#> SRR1473959 4 0.3838 0.7658 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR1074041 3 0.0955 0.6907 0.004 0.000 0.968 0.028 0.000
#> SRR1394495 2 0.4258 0.7977 0.000 0.768 0.000 0.160 0.072
#> SRR659460 3 0.1544 0.6863 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR816699 3 0.0162 0.6786 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.6769 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 5 0.5360 0.8602 0.000 0.000 0.384 0.060 0.556
#> SRR1352894 2 0.4297 0.7971 0.000 0.764 0.000 0.164 0.072
#> SRR815805 4 0.6874 0.6073 0.212 0.000 0.220 0.536 0.032
#> SRR1331083 2 0.5237 0.7755 0.004 0.632 0.000 0.060 0.304
#> SRR808272 3 0.0794 0.6398 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1436698 3 0.4883 0.2989 0.372 0.000 0.600 0.024 0.004
#> SRR1095627 2 0.6089 0.7630 0.012 0.536 0.000 0.096 0.356
#> SRR1357672 3 0.0771 0.6890 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1351236 1 0.1041 0.9182 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1077479 1 0.1329 0.9169 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR814491 4 0.4517 0.7762 0.016 0.000 0.260 0.708 0.016
#> SRR1101256 2 0.1281 0.8284 0.012 0.956 0.000 0.000 0.032
#> SRR1436004 1 0.2956 0.8213 0.848 0.000 0.140 0.008 0.004
#> SRR1457994 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR1078998 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1314707 4 0.4926 0.7461 0.152 0.000 0.132 0.716 0.000
#> SRR1309534 4 0.3934 0.7657 0.000 0.000 0.276 0.716 0.008
#> SRR615527 5 0.5204 0.8633 0.000 0.000 0.392 0.048 0.560
#> SRR1098216 1 0.2424 0.8890 0.908 0.000 0.032 0.052 0.008
#> SRR1325847 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1404003 4 0.3790 0.7726 0.004 0.000 0.272 0.724 0.000
#> SRR1344166 4 0.5759 0.3663 0.388 0.000 0.092 0.520 0.000
#> SRR1368638 4 0.4363 0.7730 0.008 0.000 0.268 0.708 0.016
#> SRR1431429 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1079237 2 0.5524 0.7795 0.020 0.640 0.000 0.060 0.280
#> SRR1080509 2 0.0963 0.8263 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR815759 3 0.0404 0.6768 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1502143 3 0.0510 0.6865 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1487614 5 0.4425 0.8354 0.000 0.000 0.452 0.004 0.544
#> SRR1402307 2 0.4258 0.7977 0.000 0.768 0.000 0.160 0.072
#> SRR820810 4 0.5123 0.7391 0.160 0.000 0.144 0.696 0.000
#> SRR1099212 2 0.1168 0.8285 0.008 0.960 0.000 0.000 0.032
#> SRR1083215 3 0.2052 0.6826 0.004 0.000 0.912 0.080 0.004
#> SRR1476547 2 0.4691 0.7950 0.020 0.756 0.000 0.060 0.164
#> SRR656421 1 0.1455 0.9184 0.952 0.000 0.032 0.008 0.008
#> SRR1086116 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1499917 4 0.3957 0.7648 0.000 0.000 0.280 0.712 0.008
#> SRR1339944 2 0.0693 0.8260 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1391444 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1434889 4 0.3861 0.7654 0.000 0.000 0.284 0.712 0.004
#> SRR1431847 5 0.5405 0.8602 0.000 0.000 0.380 0.064 0.556
#> SRR1317155 4 0.3790 0.7681 0.000 0.000 0.272 0.724 0.004
#> SRR1477405 1 0.0880 0.9187 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.3992 0.7673 0.004 0.000 0.280 0.712 0.004
#> SRR1341683 4 0.5541 0.5731 0.000 0.000 0.236 0.636 0.128
#> SRR1084790 1 0.4866 0.3463 0.580 0.000 0.396 0.020 0.004
#> SRR1073731 3 0.4126 0.1767 0.000 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1332588 4 0.3934 0.7667 0.000 0.000 0.276 0.716 0.008
#> SRR1471157 2 0.1522 0.8249 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR654945 3 0.0162 0.6786 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR661028 1 0.1329 0.9169 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1413477 2 0.1168 0.8285 0.008 0.960 0.000 0.000 0.032
#> SRR1101152 3 0.4074 0.2020 0.000 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1358435 2 0.5097 0.7908 0.020 0.708 0.000 0.060 0.212
#> SRR2165273 1 0.1168 0.9187 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1379014 1 0.5097 0.2725 0.568 0.000 0.032 0.396 0.004
#> SRR1489904 3 0.4201 -0.5684 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1416386 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1406048 4 0.5101 0.5002 0.328 0.000 0.032 0.628 0.012
#> SRR606982 3 0.5379 0.3231 0.000 0.000 0.648 0.244 0.108
#> SRR1358082 1 0.0880 0.9187 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.1341 0.6891 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR655194 4 0.5195 0.6966 0.216 0.000 0.108 0.676 0.000
#> SRR1331174 2 0.0510 0.8277 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1473251 2 0.4691 0.7950 0.020 0.756 0.000 0.060 0.164
#> SRR1389820 5 0.6369 0.5779 0.020 0.136 0.164 0.028 0.652
#> SRR1074289 3 0.1864 0.6875 0.004 0.000 0.924 0.068 0.004
#> SRR1348816 2 0.1485 0.8284 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR1076292 5 0.6707 0.5226 0.000 0.000 0.368 0.244 0.388
#> SRR1395810 2 0.0290 0.8251 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1498909 4 0.4801 0.6910 0.000 0.000 0.284 0.668 0.048
#> SRR1443507 3 0.1928 0.6868 0.004 0.000 0.920 0.072 0.004
#> SRR1452310 4 0.4632 0.4512 0.000 0.000 0.448 0.540 0.012
#> SRR665610 4 0.3730 0.7645 0.000 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1347322 1 0.1202 0.9181 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR813395 2 0.6089 0.7630 0.012 0.536 0.000 0.096 0.356
#> SRR1477256 1 0.1329 0.9169 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1470230 5 0.6439 0.6977 0.000 0.000 0.404 0.176 0.420
#> SRR1354247 1 0.2369 0.8872 0.908 0.000 0.032 0.056 0.004
#> SRR1082640 2 0.4613 0.7928 0.000 0.728 0.000 0.200 0.072
#> SRR1487592 3 0.1202 0.6918 0.004 0.000 0.960 0.032 0.004
#> SRR1352299 3 0.5249 0.3681 0.336 0.000 0.608 0.052 0.004
#> SRR1076317 2 0.5219 0.7769 0.004 0.636 0.000 0.060 0.300
#> SRR1434117 3 0.0000 0.6769 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.5076 0.7842 0.004 0.664 0.000 0.060 0.272
#> SRR658657 5 0.6077 0.7975 0.000 0.000 0.396 0.124 0.480
#> SRR1092773 2 0.4940 0.7929 0.020 0.728 0.000 0.060 0.192
#> SRR1365332 3 0.1041 0.6916 0.004 0.000 0.964 0.032 0.000
#> SRR615958 3 0.2929 0.3077 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1097688 2 0.5237 0.7755 0.004 0.632 0.000 0.060 0.304
#> SRR1403259 5 0.5229 0.8642 0.000 0.000 0.404 0.048 0.548
#> SRR1099120 2 0.5104 0.7755 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1362200 3 0.1121 0.6132 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1464856 2 0.1041 0.8285 0.004 0.964 0.000 0.000 0.032
#> SRR1347298 5 0.4297 0.8134 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1075923 2 0.5219 0.7769 0.004 0.636 0.000 0.060 0.300
#> SRR1100703 3 0.2597 0.6625 0.004 0.000 0.872 0.120 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.2668 0.76309 0.000 0.000 0.168 0.828 0.004 0.000
#> SRR1436370 2 0.3684 0.88834 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1075752 6 0.2473 0.35635 0.000 0.136 0.000 0.008 0.000 0.856
#> SRR1397949 1 0.2309 0.84081 0.888 0.084 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.4526 0.77188 0.048 0.044 0.124 0.768 0.016 0.000
#> SRR1329744 1 0.3017 0.85356 0.816 0.164 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR657384 4 0.3874 0.77471 0.076 0.024 0.100 0.800 0.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.3296 0.75764 0.000 0.020 0.180 0.796 0.004 0.000
#> SRR1458662 2 0.3819 0.88497 0.000 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR818573 4 0.5151 0.73655 0.108 0.060 0.116 0.712 0.004 0.000
#> SRR1396017 4 0.4593 0.68430 0.176 0.096 0.012 0.716 0.000 0.000
#> SRR1410742 4 0.3376 0.77707 0.032 0.008 0.136 0.820 0.004 0.000
#> SRR1435963 1 0.3279 0.84813 0.796 0.176 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.1080 0.86368 0.960 0.032 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.4984 0.73161 0.132 0.068 0.056 0.732 0.012 0.000
#> SRR1087968 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1310075 1 0.2266 0.86566 0.880 0.108 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.3249 0.83157 0.824 0.128 0.004 0.044 0.000 0.000
#> SRR1325138 4 0.3382 0.77654 0.064 0.004 0.112 0.820 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.5885 0.42133 0.308 0.072 0.556 0.064 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.3819 0.88497 0.000 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR655613 1 0.2113 0.84229 0.912 0.048 0.032 0.008 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.4538 -0.22915 0.000 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR1443871 6 0.6525 0.23904 0.000 0.228 0.000 0.056 0.208 0.508
#> SRR1102489 6 0.2402 0.34683 0.000 0.140 0.000 0.004 0.000 0.856
#> SRR1465758 1 0.2357 0.86501 0.872 0.116 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.2558 0.52285 0.000 0.000 0.840 0.004 0.156 0.000
#> SRR1407449 1 0.5334 0.42328 0.552 0.128 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1436858 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1479109 3 0.1065 0.71797 0.008 0.008 0.964 0.020 0.000 0.000
#> SRR1399069 4 0.4712 0.75054 0.104 0.068 0.064 0.756 0.008 0.000
#> SRR1366450 3 0.4350 0.62573 0.140 0.036 0.760 0.064 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.3202 0.85090 0.800 0.176 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.5035 0.64295 0.704 0.084 0.160 0.052 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.0935 0.42401 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1434736 4 0.8347 0.37990 0.100 0.200 0.224 0.368 0.108 0.000
#> SRR1080560 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1322882 1 0.2113 0.84229 0.912 0.048 0.032 0.008 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.4123 0.88894 0.000 0.568 0.000 0.012 0.000 0.420
#> SRR1327614 1 0.2404 0.86622 0.872 0.112 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR658152 4 0.5956 0.53579 0.000 0.068 0.180 0.612 0.140 0.000
#> SRR1368141 5 0.4653 0.79891 0.000 0.004 0.188 0.112 0.696 0.000
#> SRR1440268 1 0.2744 0.86015 0.840 0.144 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1453725 3 0.7004 -0.04788 0.280 0.060 0.356 0.304 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.4123 0.88894 0.000 0.568 0.000 0.012 0.000 0.420
#> SRR1477930 4 0.5224 0.04728 0.440 0.092 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.2226 0.84250 0.904 0.060 0.028 0.008 0.000 0.000
#> SRR1416049 6 0.6412 0.12134 0.000 0.292 0.000 0.056 0.148 0.504
#> SRR656275 4 0.3023 0.75808 0.000 0.008 0.180 0.808 0.004 0.000
#> SRR1369052 4 0.5004 0.34710 0.348 0.084 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.2658 0.83650 0.864 0.112 0.016 0.008 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.3513 0.83654 0.796 0.144 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.1003 0.86116 0.964 0.028 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.2613 0.86047 0.848 0.140 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1458890 5 0.4994 0.77348 0.000 0.004 0.180 0.156 0.660 0.000
#> SRR1432695 2 0.4675 0.82554 0.000 0.584 0.000 0.016 0.024 0.376
#> SRR1407624 6 0.6520 0.20432 0.000 0.252 0.000 0.056 0.188 0.504
#> SRR1431969 5 0.3989 0.57577 0.000 0.000 0.468 0.004 0.528 0.000
#> SRR1087393 6 0.4506 -0.25191 0.000 0.348 0.000 0.044 0.000 0.608
#> SRR1077263 3 0.1836 0.71349 0.012 0.008 0.928 0.048 0.004 0.000
#> SRR1385211 1 0.2203 0.84573 0.896 0.084 0.004 0.016 0.000 0.000
#> SRR655241 4 0.5345 0.25114 0.364 0.116 0.000 0.520 0.000 0.000
#> SRR656922 4 0.5535 0.36809 0.364 0.072 0.028 0.536 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.0632 0.69302 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1318966 6 0.3422 0.27642 0.000 0.168 0.000 0.040 0.000 0.792
#> SRR1407087 3 0.2001 0.62003 0.000 0.004 0.900 0.004 0.092 0.000
#> SRR603212 3 0.6155 0.46510 0.212 0.068 0.580 0.140 0.000 0.000
#> SRR1321088 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1485190 5 0.4253 0.81602 0.000 0.020 0.228 0.032 0.720 0.000
#> SRR1332232 2 0.3706 0.89328 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1312645 4 0.5646 0.74880 0.056 0.144 0.108 0.676 0.016 0.000
#> SRR1457835 1 0.6669 0.23007 0.488 0.116 0.292 0.104 0.000 0.000
#> SRR1347123 5 0.3955 0.62889 0.000 0.000 0.436 0.004 0.560 0.000
#> SRR1465501 6 0.2790 0.36006 0.000 0.132 0.000 0.024 0.000 0.844
#> SRR1330878 5 0.3628 0.80029 0.000 0.004 0.268 0.008 0.720 0.000
#> SRR1445064 5 0.5248 0.78721 0.000 0.008 0.212 0.148 0.632 0.000
#> SRR1452981 4 0.4430 0.75889 0.096 0.044 0.076 0.776 0.008 0.000
#> SRR1326708 1 0.1010 0.86233 0.960 0.036 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.2170 0.86637 0.888 0.100 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1365401 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1397697 2 0.3684 0.88834 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1477316 4 0.3104 0.77103 0.016 0.004 0.152 0.824 0.004 0.000
#> SRR1077898 1 0.1493 0.85569 0.936 0.056 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1349080 3 0.7296 0.29408 0.084 0.144 0.492 0.240 0.040 0.000
#> SRR1076096 6 0.6519 0.22845 0.000 0.236 0.000 0.056 0.200 0.508
#> SRR811261 6 0.1194 0.42304 0.000 0.004 0.000 0.032 0.008 0.956
#> SRR1375485 1 0.6497 -0.19284 0.424 0.088 0.092 0.396 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.3819 0.88497 0.000 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR604414 1 0.2186 0.84013 0.908 0.048 0.036 0.008 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.2951 0.81360 0.844 0.128 0.004 0.004 0.020 0.000
#> SRR812060 3 0.0436 0.71192 0.004 0.000 0.988 0.004 0.004 0.000
#> SRR602082 1 0.0858 0.86693 0.968 0.028 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.1700 0.40755 0.000 0.048 0.000 0.024 0.000 0.928
#> SRR1078417 2 0.3797 0.89202 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR661613 3 0.1555 0.70000 0.000 0.012 0.940 0.040 0.008 0.000
#> SRR1420710 4 0.3321 0.75406 0.000 0.016 0.180 0.796 0.008 0.000
#> SRR660426 1 0.1226 0.85710 0.952 0.040 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.4648 0.62411 0.000 0.016 0.156 0.720 0.108 0.000
#> SRR661064 4 0.5241 0.28030 0.364 0.104 0.000 0.532 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.3797 0.89202 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1452718 1 0.1542 0.85298 0.936 0.052 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.1845 0.85131 0.916 0.072 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.1411 0.87146 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.1398 0.87282 0.940 0.052 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.7053 0.12693 0.236 0.088 0.428 0.248 0.000 0.000
#> SRR1102467 4 0.4750 0.72040 0.156 0.056 0.060 0.728 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.0291 0.70770 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1337707 5 0.4310 0.81298 0.000 0.004 0.204 0.072 0.720 0.000
#> SRR1408752 2 0.3797 0.89202 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1474617 5 0.5392 0.68423 0.000 0.064 0.104 0.072 0.720 0.040
#> SRR1398013 4 0.3386 0.75274 0.000 0.016 0.176 0.796 0.012 0.000
#> SRR1352918 4 0.5169 0.75309 0.100 0.092 0.072 0.724 0.012 0.000
#> SRR1420750 1 0.4235 0.69445 0.756 0.064 0.160 0.020 0.000 0.000
#> SRR1071785 5 0.4893 0.79344 0.000 0.004 0.200 0.128 0.668 0.000
#> SRR1353618 6 0.6525 0.23904 0.000 0.228 0.000 0.056 0.208 0.508
#> SRR1082217 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1357256 2 0.4675 0.82554 0.000 0.584 0.000 0.016 0.024 0.376
#> SRR1490313 4 0.2703 0.76101 0.000 0.000 0.172 0.824 0.004 0.000
#> SRR1366560 1 0.2494 0.86728 0.864 0.120 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.2218 0.86577 0.884 0.104 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.4405 0.78211 0.000 0.040 0.208 0.028 0.724 0.000
#> SRR1313494 4 0.5395 0.26675 0.356 0.124 0.000 0.520 0.000 0.000
#> SRR1309985 4 0.4786 0.62807 0.196 0.100 0.000 0.692 0.012 0.000
#> SRR607911 1 0.2266 0.86587 0.880 0.108 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.1524 0.71095 0.008 0.000 0.932 0.060 0.000 0.000
#> SRR1400078 4 0.5128 0.72597 0.000 0.124 0.176 0.676 0.024 0.000
#> SRR1088631 2 0.4123 0.88894 0.000 0.568 0.000 0.012 0.000 0.420
#> SRR1092842 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR615575 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079434 5 0.7067 0.56155 0.000 0.108 0.276 0.180 0.436 0.000
#> SRR1325559 1 0.7081 0.12901 0.444 0.112 0.256 0.188 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.0837 0.71611 0.004 0.000 0.972 0.020 0.004 0.000
#> SRR1383883 1 0.2357 0.86501 0.872 0.116 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1396100 4 0.5214 0.75384 0.024 0.116 0.144 0.700 0.016 0.000
#> SRR1475697 4 0.6753 0.01839 0.000 0.108 0.108 0.436 0.348 0.000
#> SRR1488067 6 0.2416 0.33311 0.000 0.156 0.000 0.000 0.000 0.844
#> SRR1102103 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1105154 6 0.2260 0.34887 0.000 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1084991 6 0.4511 -0.20259 0.000 0.332 0.000 0.048 0.000 0.620
#> SRR1410380 3 0.1075 0.66320 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1445490 6 0.6526 0.21079 0.000 0.248 0.000 0.056 0.192 0.504
#> SRR1454671 6 0.6604 0.25682 0.000 0.212 0.000 0.064 0.220 0.504
#> SRR1435044 4 0.6571 0.37880 0.000 0.108 0.340 0.464 0.088 0.000
#> SRR1485812 5 0.6669 0.68445 0.000 0.104 0.216 0.156 0.524 0.000
#> SRR1078020 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1311153 1 0.1080 0.86355 0.960 0.032 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.3684 0.88834 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1343898 5 0.3648 0.80228 0.000 0.004 0.240 0.016 0.740 0.000
#> SRR807775 3 0.2597 0.47105 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1409215 2 0.4681 0.83472 0.000 0.524 0.000 0.044 0.000 0.432
#> SRR820427 3 0.5168 0.45759 0.000 0.104 0.680 0.180 0.036 0.000
#> SRR1100656 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1362159 1 0.1858 0.86873 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR656794 3 0.4854 0.53487 0.260 0.044 0.664 0.032 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.1471 0.86895 0.932 0.064 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.7041 -0.33487 0.000 0.104 0.400 0.160 0.336 0.000
#> SRR1485912 3 0.3042 0.68831 0.008 0.044 0.856 0.088 0.004 0.000
#> SRR1407602 5 0.6668 0.52975 0.000 0.088 0.148 0.264 0.500 0.000
#> SRR1356164 5 0.6979 0.34912 0.000 0.096 0.164 0.320 0.420 0.000
#> SRR1328692 5 0.6924 0.54467 0.000 0.068 0.252 0.252 0.428 0.000
#> SRR1362438 1 0.1523 0.85465 0.940 0.044 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR1479216 5 0.3986 0.58331 0.000 0.000 0.464 0.004 0.532 0.000
#> SRR1358041 4 0.5519 0.50022 0.296 0.096 0.024 0.584 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.1554 0.71677 0.004 0.008 0.940 0.044 0.004 0.000
#> SRR1368200 3 0.1882 0.69250 0.000 0.012 0.920 0.060 0.008 0.000
#> SRR1435602 2 0.3706 0.89328 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1501043 5 0.3905 0.81258 0.000 0.004 0.212 0.040 0.744 0.000
#> SRR1437256 5 0.5248 0.69077 0.000 0.004 0.144 0.236 0.616 0.000
#> SRR1487446 4 0.4429 0.76287 0.000 0.080 0.168 0.736 0.016 0.000
#> SRR816653 1 0.2745 0.83445 0.860 0.112 0.020 0.008 0.000 0.000
#> SRR815164 4 0.7672 0.18733 0.276 0.112 0.280 0.320 0.012 0.000
#> SRR1442043 4 0.4200 0.77478 0.076 0.028 0.100 0.788 0.008 0.000
#> SRR1410573 1 0.2357 0.86967 0.872 0.116 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.4689 0.81849 0.000 0.516 0.000 0.044 0.000 0.440
#> SRR1352369 3 0.2775 0.69076 0.000 0.048 0.880 0.032 0.040 0.000
#> SRR1382934 5 0.3904 0.81504 0.000 0.004 0.232 0.032 0.732 0.000
#> SRR1465208 1 0.4792 0.66645 0.668 0.132 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.7572 0.14354 0.332 0.184 0.348 0.124 0.012 0.000
#> SRR1470291 1 0.2170 0.86637 0.888 0.100 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.0260 0.70657 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1409600 3 0.2415 0.70596 0.036 0.024 0.900 0.040 0.000 0.000
#> SRR816123 6 0.0935 0.42401 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR614779 3 0.0547 0.69615 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR810783 3 0.1531 0.70872 0.004 0.000 0.928 0.068 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.2744 0.86120 0.840 0.144 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.1049 0.71764 0.008 0.000 0.960 0.032 0.000 0.000
#> SRR808106 3 0.7430 0.28886 0.144 0.140 0.472 0.220 0.024 0.000
#> SRR662713 3 0.3009 0.69545 0.020 0.024 0.860 0.092 0.004 0.000
#> SRR1447058 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1480964 3 0.4015 0.50373 0.000 0.008 0.720 0.244 0.028 0.000
#> SRR809382 5 0.4688 0.81121 0.000 0.044 0.220 0.036 0.700 0.000
#> SRR665417 4 0.4760 0.43963 0.328 0.068 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1088016 6 0.1194 0.42289 0.000 0.008 0.000 0.032 0.004 0.956
#> SRR1453166 6 0.3229 0.31976 0.000 0.140 0.000 0.044 0.000 0.816
#> SRR1069826 2 0.4123 0.88894 0.000 0.568 0.000 0.012 0.000 0.420
#> SRR1077781 2 0.4282 0.88338 0.000 0.560 0.000 0.020 0.000 0.420
#> SRR615623 5 0.3586 0.79501 0.000 0.004 0.280 0.004 0.712 0.000
#> SRR1413787 5 0.3672 0.79765 0.000 0.004 0.276 0.008 0.712 0.000
#> SRR1478207 3 0.4468 -0.53219 0.000 0.004 0.492 0.020 0.484 0.000
#> SRR1411046 1 0.2623 0.86562 0.852 0.132 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.3819 0.88497 0.000 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR1326560 1 0.2859 0.85574 0.828 0.156 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.1226 0.85685 0.952 0.040 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1486949 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1395616 1 0.2572 0.86148 0.852 0.136 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.1564 0.41098 0.000 0.040 0.000 0.024 0.000 0.936
#> SRR1092961 6 0.1194 0.42304 0.000 0.004 0.000 0.032 0.008 0.956
#> SRR817210 3 0.4556 0.34018 0.000 0.024 0.624 0.336 0.016 0.000
#> SRR1319221 5 0.4620 0.78617 0.000 0.040 0.184 0.052 0.724 0.000
#> SRR1405413 3 0.7844 -0.05595 0.208 0.180 0.340 0.260 0.012 0.000
#> SRR607807 1 0.2450 0.86525 0.868 0.116 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1390160 5 0.4004 0.71968 0.000 0.000 0.368 0.012 0.620 0.000
#> SRR1406283 3 0.4915 0.54043 0.248 0.048 0.668 0.036 0.000 0.000
#> SRR1357709 4 0.3577 0.77735 0.060 0.012 0.116 0.812 0.000 0.000
#> SRR1080742 6 0.1003 0.42354 0.000 0.004 0.000 0.028 0.004 0.964
#> SRR1468208 1 0.2494 0.86529 0.864 0.120 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.1116 0.71766 0.008 0.004 0.960 0.028 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.5041 0.58094 0.624 0.128 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.2251 0.83871 0.904 0.052 0.036 0.008 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.5080 0.55707 0.048 0.060 0.676 0.216 0.000 0.000
#> SRR1099720 6 0.4538 -0.22915 0.000 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR1349250 6 0.3101 0.31851 0.000 0.148 0.000 0.032 0.000 0.820
#> SRR1350912 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1357127 3 0.3178 0.63223 0.000 0.044 0.856 0.056 0.044 0.000
#> SRR1074980 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1317022 5 0.3468 0.79308 0.000 0.000 0.284 0.004 0.712 0.000
#> SRR1332879 1 0.3249 0.79129 0.836 0.060 0.096 0.008 0.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.8407 0.44567 0.484 0.112 0.076 0.076 0.104 0.148
#> SRR1076144 2 0.3695 0.89133 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1069614 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR818239 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1421069 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1500006 1 0.1471 0.86895 0.932 0.064 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.4993 0.71295 0.076 0.036 0.200 0.688 0.000 0.000
#> SRR1092232 5 0.3753 0.81554 0.000 0.004 0.220 0.028 0.748 0.000
#> SRR1344253 3 0.4230 0.62779 0.008 0.108 0.788 0.052 0.044 0.000
#> SRR1384290 1 0.2218 0.86577 0.884 0.104 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.0837 0.71602 0.004 0.000 0.972 0.020 0.004 0.000
#> SRR1343522 2 0.3797 0.89202 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1326727 2 0.3797 0.89202 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1440940 4 0.4543 0.63834 0.000 0.016 0.144 0.732 0.108 0.000
#> SRR818372 4 0.3636 0.73827 0.000 0.016 0.196 0.772 0.016 0.000
#> SRR1323675 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR819894 4 0.3144 0.76223 0.000 0.016 0.172 0.808 0.004 0.000
#> SRR1310031 3 0.3774 -0.27214 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR615419 5 0.5202 0.75361 0.000 0.004 0.176 0.188 0.632 0.000
#> SRR1436925 4 0.3454 0.77719 0.060 0.004 0.124 0.812 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.2357 0.86501 0.872 0.116 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.3468 0.83075 0.804 0.128 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.3911 0.56403 0.000 0.040 0.804 0.088 0.068 0.000
#> SRR1442949 3 0.6537 0.11017 0.000 0.100 0.548 0.180 0.172 0.000
#> SRR1466239 1 0.2538 0.86667 0.860 0.124 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.4624 0.84074 0.000 0.528 0.000 0.040 0.000 0.432
#> SRR1329971 3 0.5637 0.15183 0.424 0.068 0.476 0.032 0.000 0.000
#> SRR813076 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1097642 6 0.4538 -0.22915 0.000 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR1322981 3 0.0972 0.71754 0.008 0.000 0.964 0.028 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.3684 0.88834 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1471713 3 0.3989 -0.44547 0.000 0.000 0.528 0.004 0.468 0.000
#> SRR660522 3 0.0260 0.70657 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR815374 4 0.3263 0.76185 0.000 0.020 0.176 0.800 0.004 0.000
#> SRR1069564 6 0.0922 0.42333 0.000 0.004 0.000 0.024 0.004 0.968
#> SRR1416337 3 0.0547 0.69615 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1316438 5 0.4938 0.79764 0.000 0.080 0.216 0.024 0.680 0.000
#> SRR1386844 1 0.2494 0.86529 0.864 0.120 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.2357 0.86501 0.872 0.116 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1447458 6 0.6380 0.10132 0.000 0.300 0.000 0.056 0.140 0.504
#> SRR1487128 1 0.3196 0.81795 0.828 0.108 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1441421 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1069919 2 0.4032 0.89226 0.000 0.572 0.000 0.008 0.000 0.420
#> SRR1460296 1 0.1524 0.85976 0.932 0.060 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.4646 0.73943 0.692 0.224 0.000 0.072 0.012 0.000
#> SRR1393404 6 0.6525 0.23904 0.000 0.228 0.000 0.056 0.208 0.508
#> SRR1081425 1 0.1471 0.86895 0.932 0.064 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1401815 5 0.3628 0.80029 0.000 0.004 0.268 0.008 0.720 0.000
#> SRR1071337 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1071983 2 0.4695 0.80372 0.000 0.508 0.000 0.044 0.000 0.448
#> SRR1331793 2 0.4684 0.81652 0.000 0.580 0.000 0.016 0.024 0.380
#> SRR1410510 5 0.3961 0.62529 0.000 0.000 0.440 0.004 0.556 0.000
#> SRR1098761 6 0.0935 0.42401 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1312124 4 0.5722 0.72265 0.112 0.152 0.060 0.664 0.012 0.000
#> SRR615395 3 0.4707 0.55247 0.244 0.036 0.684 0.036 0.000 0.000
#> SRR1479349 4 0.4067 0.63824 0.212 0.060 0.000 0.728 0.000 0.000
#> SRR2165033 4 0.3628 0.75629 0.000 0.036 0.184 0.776 0.004 0.000
#> SRR1089054 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR816201 4 0.2989 0.75609 0.000 0.004 0.176 0.812 0.008 0.000
#> SRR1488514 2 0.4282 0.88338 0.000 0.560 0.000 0.020 0.000 0.420
#> SRR655840 4 0.2982 0.76480 0.000 0.004 0.164 0.820 0.012 0.000
#> SRR1379303 1 0.2538 0.86667 0.860 0.124 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.3261 0.75418 0.000 0.012 0.172 0.804 0.012 0.000
#> SRR613174 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351125 3 0.0405 0.71172 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR659157 5 0.6018 0.76172 0.000 0.080 0.200 0.116 0.604 0.000
#> SRR1480408 4 0.3352 0.77756 0.056 0.004 0.120 0.820 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.5437 0.74860 0.032 0.108 0.136 0.696 0.028 0.000
#> SRR1073317 2 0.3797 0.89202 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1332526 4 0.3466 0.77384 0.072 0.008 0.100 0.820 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.1194 0.42304 0.000 0.004 0.000 0.032 0.008 0.956
#> SRR1431270 5 0.5813 0.77577 0.000 0.084 0.228 0.076 0.612 0.000
#> SRR1085614 2 0.4676 0.84072 0.000 0.528 0.000 0.044 0.000 0.428
#> SRR1330106 4 0.6346 0.36236 0.000 0.068 0.160 0.552 0.220 0.000
#> SRR1466154 1 0.1155 0.85847 0.956 0.036 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.2404 0.86529 0.872 0.112 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.4675 0.82554 0.000 0.584 0.000 0.016 0.024 0.376
#> SRR1457267 1 0.2450 0.86625 0.868 0.116 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR614659 4 0.2913 0.76209 0.004 0.004 0.180 0.812 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.2913 0.63922 0.004 0.004 0.812 0.180 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.2968 0.85659 0.816 0.168 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1473696 3 0.5539 0.29463 0.380 0.064 0.524 0.032 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.1471 0.86895 0.932 0.064 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.3695 0.89120 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1096363 6 0.3387 0.28389 0.000 0.164 0.000 0.040 0.000 0.796
#> SRR1453662 4 0.3470 0.76758 0.012 0.020 0.176 0.792 0.000 0.000
#> SRR1345499 6 0.6526 0.21079 0.000 0.248 0.000 0.056 0.192 0.504
#> SRR1353499 1 0.1644 0.85208 0.932 0.052 0.004 0.012 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.2357 0.86501 0.872 0.116 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.0291 0.71107 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.2170 0.86637 0.888 0.100 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.4282 0.88338 0.000 0.560 0.000 0.020 0.000 0.420
#> SRR1498183 1 0.5267 0.51568 0.648 0.080 0.036 0.236 0.000 0.000
#> SRR612659 5 0.3982 0.59134 0.000 0.000 0.460 0.004 0.536 0.000
#> SRR1447148 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR658597 6 0.2790 0.36006 0.000 0.132 0.000 0.024 0.000 0.844
#> SRR1089595 6 0.4538 -0.22915 0.000 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR1074263 2 0.4282 0.88338 0.000 0.560 0.000 0.020 0.000 0.420
#> SRR1376786 3 0.4154 0.62701 0.144 0.036 0.772 0.048 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.4809 0.60320 0.164 0.048 0.720 0.068 0.000 0.000
#> SRR1071035 3 0.6247 0.45523 0.172 0.068 0.572 0.188 0.000 0.000
#> SRR1068808 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1332754 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR662438 1 0.1226 0.86222 0.952 0.040 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.2170 0.86637 0.888 0.100 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1323558 3 0.0858 0.68802 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR1381711 3 0.0405 0.71250 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR657985 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1314810 3 0.6937 0.34279 0.288 0.196 0.456 0.040 0.020 0.000
#> SRR1336505 4 0.3264 0.75293 0.000 0.012 0.184 0.796 0.008 0.000
#> SRR1474095 3 0.6756 0.02114 0.064 0.136 0.456 0.336 0.008 0.000
#> SRR1363831 2 0.3684 0.88834 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1442376 4 0.4932 0.76562 0.088 0.068 0.088 0.744 0.012 0.000
#> SRR1074909 6 0.2333 0.38550 0.000 0.092 0.000 0.024 0.000 0.884
#> SRR1101200 3 0.3514 0.66255 0.096 0.036 0.828 0.040 0.000 0.000
#> SRR1075408 6 0.6525 0.23904 0.000 0.228 0.000 0.056 0.208 0.508
#> SRR1367150 4 0.3197 0.75704 0.000 0.012 0.176 0.804 0.008 0.000
#> SRR1313406 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1068880 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1467277 3 0.0767 0.70109 0.000 0.008 0.976 0.004 0.012 0.000
#> SRR1084867 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1095431 6 0.2790 0.36006 0.000 0.132 0.000 0.024 0.000 0.844
#> SRR1380184 6 0.6397 0.11188 0.000 0.296 0.000 0.056 0.144 0.504
#> SRR1443113 3 0.5598 0.49726 0.252 0.056 0.616 0.076 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.0291 0.71081 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1315912 1 0.1477 0.85349 0.940 0.048 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.3706 0.89328 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1421116 2 0.4702 0.79693 0.000 0.572 0.000 0.016 0.024 0.388
#> SRR602282 5 0.3991 0.81400 0.000 0.008 0.200 0.044 0.748 0.000
#> SRR1361195 2 0.3706 0.89328 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR600493 1 0.2113 0.84229 0.912 0.048 0.032 0.008 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.4653 0.61488 0.152 0.048 0.736 0.064 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1360785 4 0.5776 0.73016 0.112 0.140 0.072 0.664 0.012 0.000
#> SRR810437 5 0.5931 0.68846 0.000 0.004 0.260 0.240 0.496 0.000
#> SRR1361860 4 0.3780 0.77749 0.048 0.016 0.120 0.808 0.008 0.000
#> SRR1441311 2 0.4675 0.82554 0.000 0.584 0.000 0.016 0.024 0.376
#> SRR1098903 4 0.4670 0.76731 0.076 0.060 0.096 0.760 0.008 0.000
#> SRR1457619 4 0.4702 0.74478 0.000 0.112 0.168 0.708 0.012 0.000
#> SRR1498529 4 0.4054 0.70387 0.180 0.036 0.024 0.760 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.5398 0.63788 0.000 0.512 0.000 0.024 0.060 0.404
#> SRR1074017 2 0.4695 0.79757 0.000 0.508 0.000 0.044 0.000 0.448
#> SRR1472033 2 0.4282 0.88338 0.000 0.560 0.000 0.020 0.000 0.420
#> SRR1445087 5 0.4133 0.81488 0.000 0.020 0.232 0.024 0.724 0.000
#> SRR1399525 6 0.3446 -0.05278 0.000 0.308 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR1312844 6 0.1313 0.42056 0.000 0.016 0.000 0.028 0.004 0.952
#> SRR1085874 6 0.1321 0.41893 0.000 0.020 0.000 0.024 0.004 0.952
#> SRR1101226 6 0.1693 0.41742 0.000 0.004 0.000 0.044 0.020 0.932
#> SRR1476056 4 0.4695 0.75374 0.104 0.056 0.068 0.760 0.012 0.000
#> SRR1075659 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1311916 3 0.3995 -0.47653 0.000 0.000 0.516 0.004 0.480 0.000
#> SRR1353353 5 0.3986 0.81534 0.000 0.008 0.228 0.032 0.732 0.000
#> SRR1073291 3 0.0865 0.67825 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1356227 1 0.3530 0.83829 0.792 0.152 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1080720 6 0.4538 -0.22915 0.000 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR1091695 6 0.2790 0.36006 0.000 0.132 0.000 0.024 0.000 0.844
#> SRR1350304 4 0.5260 0.71923 0.000 0.116 0.176 0.672 0.036 0.000
#> SRR663002 5 0.3984 0.77108 0.000 0.008 0.320 0.008 0.664 0.000
#> SRR1376983 6 0.6392 0.08849 0.000 0.304 0.000 0.056 0.140 0.500
#> SRR1399926 1 0.2357 0.86501 0.872 0.116 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.3971 -0.39419 0.000 0.000 0.548 0.004 0.448 0.000
#> SRR1384006 1 0.2450 0.86558 0.868 0.116 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.1003 0.42354 0.000 0.004 0.000 0.028 0.004 0.964
#> SRR614047 3 0.0291 0.70770 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR818440 4 0.7053 0.16617 0.000 0.104 0.352 0.384 0.160 0.000
#> SRR1337770 4 0.3831 0.76801 0.092 0.024 0.080 0.804 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.3119 0.69026 0.036 0.032 0.856 0.076 0.000 0.000
#> SRR1385542 6 0.6506 0.19136 0.000 0.260 0.000 0.056 0.180 0.504
#> SRR1473959 4 0.3321 0.75406 0.000 0.016 0.180 0.796 0.008 0.000
#> SRR1074041 3 0.0748 0.71470 0.004 0.000 0.976 0.016 0.004 0.000
#> SRR1394495 6 0.6454 0.15049 0.000 0.280 0.000 0.056 0.160 0.504
#> SRR659460 3 0.1680 0.71684 0.004 0.016 0.936 0.040 0.004 0.000
#> SRR816699 3 0.0291 0.71081 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1308612 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499418 5 0.5768 0.77669 0.000 0.080 0.228 0.076 0.616 0.000
#> SRR1352894 6 0.6532 0.21776 0.000 0.244 0.000 0.056 0.196 0.504
#> SRR815805 4 0.7985 0.47913 0.208 0.168 0.152 0.420 0.052 0.000
#> SRR1331083 6 0.2431 0.35941 0.000 0.132 0.000 0.008 0.000 0.860
#> SRR808272 3 0.1075 0.66546 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1436698 3 0.5239 0.40755 0.340 0.048 0.580 0.032 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.0935 0.42401 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1357672 3 0.0881 0.71725 0.008 0.008 0.972 0.012 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.1349 0.87034 0.940 0.056 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.1841 0.85447 0.920 0.064 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.4990 0.73807 0.000 0.124 0.168 0.688 0.020 0.000
#> SRR1101256 2 0.4282 0.88338 0.000 0.560 0.000 0.020 0.000 0.420
#> SRR1436004 1 0.3505 0.75270 0.808 0.048 0.136 0.008 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.4282 0.88338 0.000 0.560 0.000 0.020 0.000 0.420
#> SRR1078998 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1314707 4 0.3856 0.76218 0.092 0.028 0.076 0.804 0.000 0.000
#> SRR1309534 4 0.5366 0.69704 0.000 0.108 0.176 0.668 0.048 0.000
#> SRR615527 5 0.3972 0.81465 0.000 0.016 0.220 0.024 0.740 0.000
#> SRR1098216 1 0.3677 0.82389 0.800 0.124 0.000 0.068 0.008 0.000
#> SRR1325847 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1404003 4 0.2877 0.76478 0.000 0.012 0.168 0.820 0.000 0.000
#> SRR1344166 4 0.5750 0.47118 0.328 0.068 0.052 0.552 0.000 0.000
#> SRR1368638 4 0.4951 0.74045 0.000 0.120 0.168 0.692 0.020 0.000
#> SRR1431429 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1079237 6 0.3417 0.28881 0.000 0.160 0.000 0.044 0.000 0.796
#> SRR1080509 2 0.4490 0.84617 0.000 0.596 0.000 0.008 0.024 0.372
#> SRR815759 3 0.2711 0.64566 0.000 0.080 0.876 0.020 0.024 0.000
#> SRR1502143 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487614 5 0.3827 0.77580 0.000 0.004 0.308 0.008 0.680 0.000
#> SRR1402307 6 0.6506 0.19042 0.000 0.260 0.000 0.056 0.180 0.504
#> SRR820810 4 0.4196 0.75868 0.104 0.028 0.092 0.776 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.3797 0.89202 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1083215 3 0.3273 0.68553 0.036 0.044 0.848 0.072 0.000 0.000
#> SRR1476547 6 0.4538 -0.22915 0.000 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR656421 1 0.2706 0.85775 0.852 0.124 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1086116 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1499917 4 0.3386 0.75274 0.000 0.016 0.176 0.796 0.012 0.000
#> SRR1339944 2 0.3706 0.88902 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1391444 2 0.3684 0.88834 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1434889 4 0.4557 0.74693 0.000 0.076 0.180 0.724 0.020 0.000
#> SRR1431847 5 0.5058 0.79670 0.000 0.084 0.216 0.028 0.672 0.000
#> SRR1317155 4 0.4056 0.74193 0.000 0.040 0.172 0.764 0.024 0.000
#> SRR1477405 1 0.1753 0.87014 0.912 0.084 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.4105 0.76447 0.004 0.044 0.184 0.756 0.012 0.000
#> SRR1341683 4 0.4672 0.57778 0.000 0.004 0.152 0.700 0.144 0.000
#> SRR1084790 1 0.5367 0.21447 0.540 0.068 0.372 0.020 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.5668 -0.01084 0.000 0.052 0.484 0.416 0.048 0.000
#> SRR1332588 4 0.3352 0.75469 0.000 0.016 0.172 0.800 0.012 0.000
#> SRR1471157 2 0.4675 0.82554 0.000 0.584 0.000 0.016 0.024 0.376
#> SRR654945 3 0.0291 0.71081 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR661028 1 0.1624 0.85345 0.936 0.044 0.012 0.008 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.4205 0.88638 0.000 0.564 0.000 0.016 0.000 0.420
#> SRR1101152 3 0.4535 -0.12923 0.004 0.024 0.500 0.472 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.4130 0.04369 0.000 0.260 0.000 0.044 0.000 0.696
#> SRR2165273 1 0.2266 0.86566 0.880 0.108 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1379014 4 0.5329 -0.00974 0.444 0.104 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.3989 -0.44377 0.000 0.000 0.528 0.004 0.468 0.000
#> SRR1416386 6 0.2340 0.33966 0.000 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR1406048 4 0.5625 0.57521 0.216 0.184 0.000 0.588 0.012 0.000
#> SRR606982 3 0.7044 -0.01854 0.000 0.100 0.448 0.232 0.220 0.000
#> SRR1358082 1 0.1858 0.86949 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.1152 0.71423 0.000 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR655194 4 0.4625 0.74050 0.136 0.056 0.064 0.744 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.3756 0.89568 0.000 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1473251 6 0.4538 -0.22915 0.000 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR1389820 5 0.5443 0.65850 0.000 0.096 0.080 0.072 0.716 0.036
#> SRR1074289 3 0.1340 0.71716 0.008 0.004 0.948 0.040 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.4671 0.85020 0.000 0.532 0.000 0.044 0.000 0.424
#> SRR1076292 5 0.6960 0.56654 0.000 0.104 0.204 0.220 0.472 0.000
#> SRR1395810 2 0.3819 0.88497 0.000 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR1498909 4 0.4218 0.64952 0.000 0.004 0.172 0.740 0.084 0.000
#> SRR1443507 3 0.1453 0.71612 0.008 0.008 0.944 0.040 0.000 0.000
#> SRR1452310 4 0.5672 0.58090 0.000 0.096 0.284 0.584 0.036 0.000
#> SRR665610 4 0.3329 0.75784 0.000 0.020 0.184 0.792 0.004 0.000
#> SRR1347322 1 0.1462 0.85684 0.936 0.056 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.0935 0.42401 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1477256 1 0.1956 0.85023 0.908 0.080 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.6723 0.68346 0.000 0.100 0.224 0.164 0.512 0.000
#> SRR1354247 1 0.3417 0.78892 0.812 0.052 0.004 0.132 0.000 0.000
#> SRR1082640 6 0.6564 0.27019 0.000 0.204 0.000 0.064 0.220 0.512
#> SRR1487592 3 0.1448 0.71688 0.016 0.012 0.948 0.024 0.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.5382 0.48083 0.296 0.052 0.604 0.048 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.2442 0.34212 0.000 0.144 0.000 0.004 0.000 0.852
#> SRR1434117 3 0.0146 0.70915 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075273 6 0.2823 0.25038 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR658657 5 0.6122 0.67419 0.000 0.016 0.300 0.196 0.488 0.000
#> SRR1092773 6 0.4315 -0.17895 0.000 0.328 0.000 0.036 0.000 0.636
#> SRR1365332 3 0.0891 0.71750 0.008 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.2772 0.45839 0.000 0.000 0.816 0.004 0.180 0.000
#> SRR1097688 6 0.2709 0.36006 0.000 0.132 0.000 0.020 0.000 0.848
#> SRR1403259 5 0.4331 0.81596 0.000 0.024 0.228 0.032 0.716 0.000
#> SRR1099120 6 0.2178 0.35852 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1362200 3 0.1204 0.65289 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1464856 2 0.4123 0.88894 0.000 0.568 0.000 0.012 0.000 0.420
#> SRR1347298 5 0.3838 0.61250 0.000 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1075923 6 0.2482 0.33704 0.000 0.148 0.000 0.004 0.000 0.848
#> SRR1100703 3 0.3628 0.67312 0.060 0.036 0.824 0.080 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4395 0.561 0.561
#> 3 3 0.972 0.957 0.981 0.5194 0.768 0.588
#> 4 4 0.910 0.905 0.954 0.1096 0.892 0.691
#> 5 5 0.933 0.902 0.947 0.0525 0.910 0.682
#> 6 6 0.816 0.728 0.851 0.0366 0.984 0.929
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3 4
There is also optional best \(k\) = 2 3 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 2 0 1 0 1
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 2 0 1 0 1
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 2 0 1 0 1
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 2 0 1 0 1
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 2 0 1 0 1
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.4654 0.7415 0.208 0.000 0.792
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.6079 0.3922 0.612 0.000 0.388
#> SRR1329744 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 3 0.1964 0.9211 0.056 0.000 0.944
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0592 0.9623 0.988 0.000 0.012
#> SRR1396017 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.4399 0.7765 0.812 0.000 0.188
#> SRR1435963 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.2878 0.8871 0.904 0.000 0.096
#> SRR1326821 1 0.0424 0.9654 0.992 0.000 0.008
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.5327 0.6481 0.728 0.000 0.272
#> SRR1396859 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.4291 0.7907 0.820 0.000 0.180
#> SRR1080560 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318966 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR603212 1 0.1643 0.9361 0.956 0.000 0.044
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.2796 0.8911 0.908 0.000 0.092
#> SRR1457835 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465501 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.6095 0.3478 0.608 0.000 0.392
#> SRR1077898 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.5497 0.6106 0.708 0.000 0.292
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420710 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337707 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398013 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.0592 0.9615 0.012 0.000 0.988
#> SRR1366560 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.2625 0.8899 0.000 0.084 0.916
#> SRR1313494 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400078 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079434 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.5859 0.4692 0.656 0.000 0.344
#> SRR1475697 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488067 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485812 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100656 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR656794 1 0.3267 0.8673 0.884 0.000 0.116
#> SRR604653 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485912 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407602 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356164 3 0.4399 0.7608 0.188 0.000 0.812
#> SRR1328692 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368200 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487446 3 0.3619 0.8356 0.136 0.000 0.864
#> SRR816653 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0424 0.9654 0.992 0.000 0.008
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1382934 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.4178 0.7868 0.828 0.000 0.172
#> SRR1470291 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409600 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR816123 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR810783 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR808106 1 0.4555 0.7631 0.800 0.000 0.200
#> SRR662713 3 0.4887 0.6989 0.228 0.000 0.772
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478207 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319221 2 0.3941 0.8132 0.000 0.844 0.156
#> SRR1405413 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406283 1 0.2066 0.9223 0.940 0.000 0.060
#> SRR1357709 1 0.3412 0.8570 0.876 0.000 0.124
#> SRR1080742 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.4235 0.7782 0.176 0.000 0.824
#> SRR1099720 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.3038 0.8788 0.896 0.000 0.104
#> SRR1092232 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344253 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR818372 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310031 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR615419 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436925 1 0.5465 0.6119 0.712 0.000 0.288
#> SRR1477238 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442949 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR660522 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR815374 3 0.2711 0.8886 0.088 0.000 0.912
#> SRR1069564 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316438 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098761 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.2878 0.8888 0.904 0.000 0.096
#> SRR1479349 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.1860 0.9249 0.052 0.000 0.948
#> SRR1089054 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.4605 0.7460 0.204 0.000 0.796
#> SRR1379303 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR613174 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351125 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR659157 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480408 1 0.4399 0.7762 0.812 0.000 0.188
#> SRR657857 1 0.5178 0.6765 0.744 0.000 0.256
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.2878 0.8870 0.904 0.000 0.096
#> SRR1094168 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR659247 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.6192 0.2646 0.420 0.000 0.580
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.5098 0.6897 0.752 0.000 0.248
#> SRR1345995 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.4291 0.7907 0.820 0.000 0.180
#> SRR1068808 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323558 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381711 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR657985 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314810 1 0.0892 0.9564 0.980 0.000 0.020
#> SRR1336505 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474095 3 0.5560 0.5872 0.300 0.000 0.700
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 3 0.6302 0.0469 0.480 0.000 0.520
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0237 0.9683 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380414 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.2537 0.9031 0.920 0.000 0.080
#> SRR1355475 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR810437 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361860 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.2165 0.9182 0.936 0.000 0.064
#> SRR1457619 3 0.5431 0.6100 0.284 0.000 0.716
#> SRR1498529 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399525 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353353 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073291 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR663002 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR818440 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.5138 0.6581 0.252 0.000 0.748
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074041 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR816699 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499418 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.6154 0.3206 0.408 0.000 0.592
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR615527 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 3 0.5988 0.4337 0.368 0.000 0.632
#> SRR1344166 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.4452 0.7632 0.192 0.000 0.808
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1502143 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487614 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0892 0.9560 0.980 0.000 0.020
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.5733 0.5150 0.324 0.000 0.676
#> SRR1476547 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431847 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317155 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.3038 0.8712 0.104 0.000 0.896
#> SRR1341683 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332588 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358435 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416386 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074289 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443507 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452310 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR665610 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075273 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092773 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR615958 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097688 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099120 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.9713 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075923 2 0.0000 0.9990 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 3 0.3038 0.8742 0.104 0.000 0.896
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1397949 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.1302 0.8985 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1329744 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657384 4 0.0469 0.9170 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1351190 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.3569 0.7466 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1396017 4 0.3123 0.7963 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1410742 4 0.0336 0.9183 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1435963 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1382416 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.3444 0.7593 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312244 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325138 4 0.0469 0.9170 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1326821 1 0.2197 0.9064 0.928 0.000 0.024 0.048
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465758 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414058 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.1022 0.9306 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1399069 4 0.1716 0.8852 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1366450 1 0.5296 0.0405 0.500 0.000 0.492 0.008
#> SRR1396859 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457176 1 0.0188 0.9478 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1097666 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1434736 1 0.5874 0.6489 0.700 0.000 0.176 0.124
#> SRR1080560 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1322882 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658152 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1368141 4 0.1716 0.8840 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1440268 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453725 1 0.0336 0.9453 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.3528 0.7727 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1477591 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.0469 0.9188 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1369052 1 0.4040 0.6935 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1377735 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404531 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458890 4 0.1637 0.8874 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077263 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1385211 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.4008 0.6999 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR656922 1 0.3873 0.7235 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1361630 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1318966 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1407087 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.3333 0.8543 0.872 0.000 0.088 0.040
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.3219 0.8063 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 4 0.0188 0.9189 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1457835 1 0.0336 0.9453 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347123 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1330878 3 0.0188 0.9084 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1445064 4 0.4522 0.4986 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1452981 4 0.0707 0.9133 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1326708 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1077898 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 3 0.7012 0.3015 0.372 0.000 0.504 0.124
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375485 1 0.2921 0.8319 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR602082 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0469 0.9091 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420710 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR660426 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.0592 0.9165 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR661064 1 0.3688 0.7527 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.1940 0.8972 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1102467 1 0.4643 0.5022 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1317470 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1337707 3 0.4994 0.1637 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1398013 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1352918 4 0.0469 0.9170 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1420750 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 4 0.4040 0.6476 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1366560 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355684 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323289 3 0.1284 0.8914 0.000 0.024 0.964 0.012
#> SRR1313494 1 0.3726 0.7467 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1309985 4 0.3837 0.7006 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR607911 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333789 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1400078 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615575 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1079434 3 0.3873 0.7378 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1325559 1 0.0469 0.9455 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1446695 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1383883 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396100 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1475697 4 0.0592 0.9165 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1488067 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084991 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410380 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 4 0.4994 -0.0556 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1485812 3 0.3873 0.7378 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0469 0.9062 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR807775 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.3219 0.8136 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1100656 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362159 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR656794 1 0.4262 0.6876 0.756 0.000 0.236 0.008
#> SRR604653 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.3610 0.7752 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1485912 3 0.1474 0.8907 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1407602 4 0.0592 0.9165 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1356164 4 0.3681 0.7488 0.008 0.000 0.176 0.816
#> SRR1328692 3 0.4304 0.6643 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1362438 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.3024 0.8264 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1468766 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1368200 3 0.1792 0.8830 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.3311 0.7990 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1437256 4 0.0592 0.9165 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1487446 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR816653 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.1637 0.9105 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1442043 4 0.0469 0.9170 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1410573 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.0336 0.9097 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1382934 3 0.3219 0.8063 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1465208 1 0.0469 0.9455 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1314728 1 0.2385 0.8923 0.920 0.000 0.028 0.052
#> SRR1470291 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308756 3 0.0188 0.9097 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1409600 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR816123 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614779 3 0.0188 0.9097 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR810783 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1333990 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1410356 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR808106 1 0.4482 0.6350 0.728 0.000 0.264 0.008
#> SRR662713 3 0.2976 0.8041 0.120 0.000 0.872 0.008
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.4134 0.7026 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR809382 3 0.3266 0.8027 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR665417 1 0.4730 0.4088 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1088016 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453166 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413787 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478207 3 0.0592 0.9043 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1411046 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309051 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074956 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1092961 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR817210 3 0.4830 0.4450 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1319221 2 0.3647 0.8025 0.000 0.832 0.152 0.016
#> SRR1405413 1 0.2401 0.8814 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR607807 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390160 3 0.0188 0.9084 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1406283 1 0.4741 0.5346 0.668 0.000 0.328 0.004
#> SRR1357709 4 0.0592 0.9152 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1080742 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1468208 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312766 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1361612 1 0.0707 0.9404 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1311224 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.5085 0.4121 0.008 0.000 0.616 0.376
#> SRR1099720 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1349250 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.2149 0.8698 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818239 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1421069 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500006 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.3123 0.7929 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1092232 3 0.3266 0.8027 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1344253 3 0.0895 0.9066 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1384290 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089349 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 4 0.0592 0.9165 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR818372 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1310031 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615419 4 0.1557 0.8907 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1436925 4 0.1211 0.9012 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1477238 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332566 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1490228 3 0.3311 0.8027 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1442949 3 0.3726 0.7657 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1466239 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0336 0.9453 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR813076 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1322981 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660522 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR815374 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1069564 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416337 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1316438 3 0.3266 0.8027 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1386844 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1373718 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.0188 0.9084 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312124 4 0.1118 0.9059 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR615395 1 0.5055 0.4414 0.624 0.000 0.368 0.008
#> SRR1479349 4 0.4164 0.6322 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR2165033 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1089054 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1379303 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418516 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR613174 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1351125 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR659157 4 0.3942 0.6690 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1480408 4 0.0469 0.9170 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR657857 4 0.0336 0.9183 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.1389 0.8957 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1094168 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431270 3 0.3942 0.7276 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 4 0.1474 0.8932 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1466154 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614659 4 0.0469 0.9188 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR659247 4 0.4585 0.5247 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1317201 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473696 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453662 4 0.0524 0.9190 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070841 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1380910 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612659 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1089595 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.5193 0.2453 0.412 0.000 0.580 0.008
#> SRR1345995 1 0.3768 0.7633 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR1071035 1 0.4253 0.7218 0.776 0.000 0.208 0.016
#> SRR1068808 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659448 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1323558 3 0.0188 0.9097 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1381711 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR657985 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1314810 1 0.3052 0.8246 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR1336505 4 0.0469 0.9188 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1474095 4 0.6686 0.1684 0.092 0.000 0.388 0.520
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.0336 0.9183 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1074909 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101200 3 0.3300 0.7778 0.144 0.000 0.848 0.008
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.2408 0.9010 0.920 0.000 0.036 0.044
#> SRR1380414 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1315912 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 4 0.4500 0.5080 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.5203 0.2671 0.416 0.000 0.576 0.008
#> SRR1355475 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1360785 4 0.3610 0.7364 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR810437 4 0.3400 0.7497 0.000 0.000 0.180 0.820
#> SRR1361860 4 0.0336 0.9183 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.1557 0.8897 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1457619 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1498529 4 0.3975 0.6736 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.3219 0.8063 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1399525 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312844 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085874 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101226 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1476056 4 0.1474 0.8944 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1075659 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311916 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353353 3 0.3266 0.8027 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1073291 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1080720 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1091695 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1350304 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR663002 3 0.0336 0.9075 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347144 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499108 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614047 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR818440 3 0.4925 0.3457 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1337770 4 0.0707 0.9137 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1399413 3 0.3443 0.7830 0.136 0.000 0.848 0.016
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1074041 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR816699 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1308612 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1499418 3 0.4134 0.6938 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0657 0.9410 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1331083 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808272 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.1716 0.8999 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1095627 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357672 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1351236 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.1716 0.8852 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1309534 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR615527 3 0.2921 0.8260 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1098216 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325847 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404003 4 0.0376 0.9195 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1344166 1 0.3873 0.7199 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1368638 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1502143 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1487614 3 0.0188 0.9084 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 4 0.3400 0.7625 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.3249 0.7825 0.140 0.000 0.852 0.008
#> SRR1476547 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR656421 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.0469 0.9188 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1431847 3 0.3873 0.7378 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1317155 4 0.0188 0.9198 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1477405 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1341683 4 0.0592 0.9165 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1084790 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.4746 0.5072 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1332588 4 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR661028 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 4 0.0469 0.9188 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1358435 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2165273 1 0.0188 0.9495 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1379014 1 0.1474 0.9176 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1489904 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1406048 1 0.2921 0.8360 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR606982 3 0.3942 0.7368 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1358082 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.0469 0.9091 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR655194 4 0.3726 0.7228 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389820 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074289 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.4817 0.4421 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.0592 0.9165 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1443507 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1452310 4 0.2868 0.7982 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR665610 4 0.0469 0.9188 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1347322 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1477256 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.3873 0.7378 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1354247 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1352299 1 0.0336 0.9452 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1076317 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1434117 3 0.0336 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1075273 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658657 4 0.4250 0.5951 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1092773 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365332 3 0.0524 0.9088 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR615958 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403259 3 0.3400 0.7913 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1099120 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362200 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9976 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.9090 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.0188 0.9969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100703 3 0.3787 0.7913 0.036 0.000 0.840 0.124
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 4 0.0000 0.926 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1397949 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.0290 0.925 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1329744 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR657384 4 0.0000 0.926 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.0510 0.923 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1458662 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.1300 0.906 0.016 0.000 0.028 0.956 0.000
#> SRR1396017 4 0.0609 0.920 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1410742 4 0.0000 0.926 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0609 0.947 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.0609 0.919 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1087968 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1310075 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312244 1 0.0404 0.951 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1325138 4 0.0000 0.926 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.3143 0.730 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0703 0.948 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1443871 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1102489 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1465758 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414058 3 0.3336 0.662 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1407449 4 0.4242 0.305 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1436858 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1479109 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399069 4 0.0290 0.925 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1366450 3 0.0703 0.900 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457176 1 0.2930 0.796 0.832 0.000 0.164 0.004 0.000
#> SRR1097666 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1434736 1 0.5006 0.747 0.760 0.000 0.064 0.064 0.112
#> SRR1080560 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1322882 1 0.0963 0.940 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 4 0.3816 0.537 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR1368141 5 0.1430 0.880 0.000 0.000 0.004 0.052 0.944
#> SRR1440268 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453725 3 0.6348 0.318 0.324 0.000 0.496 0.180 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 4 0.4192 0.369 0.404 0.000 0.000 0.596 0.000
#> SRR1477591 1 0.0703 0.947 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR656275 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1369052 4 0.1965 0.860 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR1377735 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0510 0.950 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458890 5 0.1768 0.870 0.000 0.000 0.004 0.072 0.924
#> SRR1432695 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1431969 5 0.2230 0.859 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1087393 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1077263 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385211 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR655241 4 0.2605 0.811 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR656922 4 0.4576 0.407 0.376 0.000 0.016 0.608 0.000
#> SRR1361630 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1318966 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1407087 3 0.4182 0.225 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR603212 3 0.3530 0.721 0.204 0.000 0.784 0.012 0.000
#> SRR1321088 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1485190 5 0.1281 0.895 0.000 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1332232 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 4 0.0703 0.921 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1457835 1 0.2124 0.882 0.900 0.000 0.096 0.004 0.000
#> SRR1347123 5 0.2280 0.857 0.000 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1465501 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1330878 5 0.1197 0.891 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1445064 5 0.1484 0.883 0.000 0.000 0.008 0.048 0.944
#> SRR1452981 4 0.0162 0.926 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1326708 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1397697 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077898 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1349080 3 0.3757 0.760 0.156 0.000 0.808 0.024 0.012
#> SRR1076096 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR811261 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1375485 1 0.4150 0.688 0.748 0.000 0.036 0.216 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.1197 0.930 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR602082 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1078417 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.0451 0.913 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1420710 4 0.0510 0.923 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR660426 1 0.0510 0.952 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.3932 0.475 0.000 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR661064 4 0.2020 0.856 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0510 0.952 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.4681 0.676 0.084 0.000 0.728 0.188 0.000
#> SRR1102467 4 0.2358 0.846 0.104 0.000 0.008 0.888 0.000
#> SRR1317470 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1337707 5 0.1485 0.891 0.000 0.000 0.020 0.032 0.948
#> SRR1408752 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1398013 4 0.0510 0.923 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1352918 4 0.0290 0.926 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1420750 1 0.2690 0.812 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR1071785 5 0.1430 0.880 0.000 0.000 0.004 0.052 0.944
#> SRR1353618 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1082217 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1357256 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1366560 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.1412 0.892 0.000 0.008 0.036 0.004 0.952
#> SRR1313494 4 0.2648 0.807 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1309985 4 0.0794 0.915 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR607911 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333789 3 0.0000 0.912 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 4 0.0703 0.921 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1088631 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR615575 3 0.0404 0.913 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1079434 5 0.1211 0.894 0.000 0.000 0.024 0.016 0.960
#> SRR1325559 1 0.4535 0.744 0.752 0.000 0.140 0.108 0.000
#> SRR1446695 3 0.0404 0.913 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1383883 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396100 4 0.0703 0.921 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1475697 5 0.3932 0.532 0.000 0.000 0.000 0.328 0.672
#> SRR1488067 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1102103 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1105154 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1084991 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1410380 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1445490 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1454671 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1435044 5 0.5396 0.461 0.000 0.000 0.072 0.340 0.588
#> SRR1485812 5 0.1106 0.894 0.000 0.000 0.024 0.012 0.964
#> SRR1078020 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311153 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.1282 0.892 0.000 0.000 0.044 0.004 0.952
#> SRR807775 3 0.1671 0.864 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1409215 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.1444 0.897 0.000 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR1100656 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1362159 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR656794 3 0.1197 0.882 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.3343 0.793 0.000 0.000 0.172 0.016 0.812
#> SRR1485912 3 0.0671 0.911 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1407602 5 0.2424 0.819 0.000 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1356164 5 0.3053 0.792 0.000 0.000 0.008 0.164 0.828
#> SRR1328692 5 0.1750 0.892 0.000 0.000 0.028 0.036 0.936
#> SRR1362438 1 0.0510 0.952 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1479216 5 0.2230 0.859 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1358041 4 0.2286 0.847 0.108 0.000 0.004 0.888 0.000
#> SRR1468766 3 0.0162 0.913 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368200 3 0.0693 0.910 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1435602 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.1281 0.895 0.000 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1437256 5 0.2020 0.850 0.000 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1487446 4 0.0703 0.921 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR816653 1 0.0963 0.939 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.6265 0.420 0.540 0.000 0.220 0.240 0.000
#> SRR1442043 4 0.0000 0.926 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.2074 0.835 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1382934 5 0.1281 0.895 0.000 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1465208 1 0.2179 0.858 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1314728 1 0.5046 0.169 0.540 0.000 0.432 0.020 0.008
#> SRR1470291 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1409600 3 0.0162 0.912 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR816123 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR614779 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR810783 3 0.0000 0.912 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1410356 3 0.0000 0.912 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 3 0.4499 0.572 0.292 0.000 0.684 0.016 0.008
#> SRR662713 3 0.0510 0.907 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1447058 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480964 3 0.2144 0.863 0.000 0.000 0.912 0.068 0.020
#> SRR809382 5 0.1106 0.894 0.000 0.000 0.024 0.012 0.964
#> SRR665417 4 0.3395 0.703 0.236 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1088016 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1453166 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1069826 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 5 0.1410 0.887 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1413787 5 0.1341 0.889 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1478207 5 0.3143 0.775 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1411046 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309051 1 0.0510 0.952 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1395616 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074956 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1092961 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR817210 3 0.3427 0.725 0.000 0.000 0.796 0.192 0.012
#> SRR1319221 5 0.3300 0.679 0.000 0.204 0.004 0.000 0.792
#> SRR1405413 3 0.5520 0.605 0.224 0.000 0.660 0.108 0.008
#> SRR607807 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1390160 5 0.1197 0.891 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1406283 3 0.0880 0.894 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1357709 4 0.0162 0.926 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1080742 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1468208 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312766 3 0.0000 0.912 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.3480 0.668 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1311224 1 0.0703 0.948 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.1197 0.888 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1099720 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1349250 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1350912 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1357127 3 0.4183 0.458 0.000 0.000 0.668 0.008 0.324
#> SRR1074980 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1317022 5 0.1410 0.887 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1332879 1 0.2966 0.779 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1076144 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR818239 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1421069 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1500006 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.1106 0.911 0.012 0.000 0.024 0.964 0.000
#> SRR1092232 5 0.1281 0.895 0.000 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1344253 3 0.0609 0.911 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1384290 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1089349 3 0.0162 0.913 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1343522 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 4 0.1671 0.875 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR818372 4 0.0510 0.923 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1323675 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR819894 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1310031 5 0.3480 0.725 0.000 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR615419 5 0.1638 0.875 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932
#> SRR1436925 4 0.0290 0.925 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.1043 0.932 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1490228 5 0.4451 0.552 0.000 0.000 0.340 0.016 0.644
#> SRR1442949 5 0.4525 0.482 0.000 0.000 0.360 0.016 0.624
#> SRR1466239 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 3 0.4227 0.285 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1097642 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1322981 3 0.0162 0.913 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485976 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 5 0.3177 0.778 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR660522 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR815374 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069564 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1416337 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1316438 5 0.1106 0.894 0.000 0.000 0.024 0.012 0.964
#> SRR1386844 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1373718 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447458 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1487128 1 0.0404 0.951 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1441421 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1069919 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0451 0.952 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1393404 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1081425 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1401815 5 0.1197 0.891 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1071337 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1071983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 5 0.2074 0.866 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1098761 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1312124 4 0.0566 0.925 0.004 0.000 0.000 0.984 0.012
#> SRR615395 3 0.0794 0.897 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1479349 4 0.0794 0.915 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR2165033 4 0.0510 0.923 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1089054 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR816201 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488514 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379303 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR613174 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351125 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR659157 5 0.1357 0.881 0.000 0.000 0.004 0.048 0.948
#> SRR1480408 4 0.0000 0.926 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657857 4 0.0404 0.925 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1073317 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.0290 0.925 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1094168 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1431270 5 0.1106 0.894 0.000 0.000 0.024 0.012 0.964
#> SRR1085614 2 0.0290 0.988 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1330106 5 0.3274 0.721 0.000 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1466154 1 0.0404 0.953 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR659247 3 0.1197 0.889 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 3 0.4219 0.295 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1453662 4 0.0162 0.926 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1345499 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1353499 1 0.0404 0.953 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070841 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1380910 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.2677 0.852 0.872 0.000 0.016 0.112 0.000
#> SRR612659 5 0.1851 0.875 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1447148 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR658597 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1089595 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1074263 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.0609 0.903 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.0963 0.891 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1071035 3 0.3419 0.744 0.180 0.000 0.804 0.016 0.000
#> SRR1068808 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1332754 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR662438 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1323558 3 0.0880 0.903 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1381711 3 0.0609 0.912 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR657985 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1314810 1 0.3835 0.649 0.732 0.000 0.260 0.000 0.008
#> SRR1336505 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1474095 3 0.4401 0.563 0.004 0.000 0.684 0.296 0.016
#> SRR1363831 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074909 2 0.0880 0.984 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1101200 3 0.0290 0.910 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1367150 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313406 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1068880 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1467277 3 0.0609 0.912 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1084867 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1095431 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1380184 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1443113 3 0.2561 0.794 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.0404 0.913 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1315912 1 0.0510 0.952 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 5 0.1484 0.883 0.000 0.000 0.008 0.048 0.944
#> SRR1361195 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0794 0.945 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.0703 0.900 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.0404 0.913 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1360785 4 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR810437 5 0.1502 0.877 0.000 0.000 0.004 0.056 0.940
#> SRR1361860 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1441311 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.0290 0.925 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1457619 4 0.0404 0.925 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1498529 4 0.0510 0.921 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1097172 2 0.0162 0.988 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074017 2 0.0162 0.989 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472033 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 5 0.1281 0.895 0.000 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1399525 2 0.0794 0.985 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1312844 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1085874 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1101226 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1476056 4 0.0162 0.926 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1075659 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1311916 5 0.2773 0.821 0.000 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1353353 5 0.1281 0.895 0.000 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1073291 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1356227 1 0.1043 0.932 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1080720 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1091695 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1350304 4 0.0794 0.919 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR663002 5 0.1197 0.891 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1376983 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1399926 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347144 5 0.3395 0.745 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1384006 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499108 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR614047 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR818440 5 0.5798 0.594 0.000 0.000 0.156 0.236 0.608
#> SRR1337770 4 0.0162 0.926 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1399413 3 0.0162 0.912 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1385542 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1473959 4 0.0510 0.923 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1074041 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394495 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659460 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR816699 3 0.0404 0.913 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1308612 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1499418 5 0.1117 0.893 0.000 0.000 0.020 0.016 0.964
#> SRR1352894 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR815805 1 0.1854 0.921 0.936 0.000 0.008 0.036 0.020
#> SRR1331083 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR808272 3 0.0609 0.910 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1436698 3 0.2329 0.817 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1357672 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351236 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR814491 4 0.0703 0.921 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1101256 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.3003 0.774 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1314707 4 0.0290 0.925 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1309534 4 0.1121 0.908 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR615527 5 0.1251 0.894 0.000 0.000 0.036 0.008 0.956
#> SRR1098216 1 0.0671 0.949 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1325847 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1404003 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344166 4 0.4610 0.376 0.388 0.000 0.016 0.596 0.000
#> SRR1368638 4 0.0703 0.921 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1431429 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1079237 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1080509 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0703 0.911 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1502143 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1487614 5 0.1197 0.891 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1402307 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR820810 4 0.0693 0.920 0.012 0.000 0.008 0.980 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0162 0.911 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR656421 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1086116 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1499917 4 0.0510 0.923 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1339944 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.0290 0.926 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1431847 5 0.1211 0.894 0.000 0.000 0.024 0.016 0.960
#> SRR1317155 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477405 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.0290 0.926 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1341683 4 0.2773 0.774 0.000 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1084790 1 0.4114 0.406 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1073731 5 0.6598 0.227 0.000 0.000 0.376 0.212 0.412
#> SRR1332588 4 0.0162 0.926 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471157 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.0290 0.913 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661028 1 0.0609 0.950 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4029 0.552 0.000 0.000 0.680 0.316 0.004
#> SRR1358435 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2165273 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1379014 4 0.4030 0.496 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1489904 5 0.3636 0.694 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1416386 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1406048 4 0.4367 0.427 0.372 0.000 0.000 0.620 0.008
#> SRR606982 5 0.4221 0.705 0.000 0.000 0.236 0.032 0.732
#> SRR1358082 1 0.0000 0.956 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.0693 0.911 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR655194 4 0.0794 0.917 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1389820 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1074289 3 0.0000 0.912 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 5 0.1469 0.888 0.000 0.000 0.016 0.036 0.948
#> SRR1395810 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.2966 0.743 0.000 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1443507 3 0.0000 0.912 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 4 0.2685 0.834 0.000 0.000 0.092 0.880 0.028
#> SRR665610 4 0.0324 0.926 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1347322 1 0.0162 0.956 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0963 0.983 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1477256 1 0.0290 0.955 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.1211 0.894 0.000 0.000 0.024 0.016 0.960
#> SRR1354247 1 0.0671 0.949 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1082640 2 0.0404 0.987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1487592 3 0.0000 0.912 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.2773 0.777 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1434117 3 0.0510 0.912 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1075273 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR658657 5 0.2136 0.861 0.000 0.000 0.008 0.088 0.904
#> SRR1092773 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1365332 3 0.0162 0.913 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615958 5 0.4297 0.251 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1097688 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1403259 5 0.1281 0.895 0.000 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1099120 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1362200 3 0.1197 0.889 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1464856 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 5 0.2280 0.856 0.000 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1075923 2 0.0703 0.985 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1100703 3 0.0162 0.912 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.0146 0.7667 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436370 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1397949 1 0.2806 0.8432 0.844 0.000 0.016 0.000 0.004 0.136
#> SRR1355723 4 0.0777 0.7617 0.004 0.000 0.000 0.972 0.000 0.024
#> SRR1329744 1 0.1714 0.8394 0.908 0.000 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR657384 4 0.0458 0.7674 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351190 4 0.1074 0.7597 0.000 0.000 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR1458662 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.2537 0.7148 0.000 0.000 0.032 0.872 0.000 0.096
#> SRR1396017 4 0.3650 0.6554 0.092 0.000 0.000 0.792 0.000 0.116
#> SRR1410742 4 0.0547 0.7666 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1435963 1 0.2462 0.8163 0.876 0.000 0.000 0.028 0.000 0.096
#> SRR1382416 1 0.1411 0.8763 0.936 0.000 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1391354 4 0.2357 0.7135 0.012 0.000 0.000 0.872 0.000 0.116
#> SRR1087968 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1310075 1 0.0260 0.8737 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1312244 1 0.3230 0.8153 0.776 0.000 0.000 0.012 0.000 0.212
#> SRR1325138 4 0.0000 0.7668 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.4700 0.5787 0.164 0.000 0.696 0.000 0.004 0.136
#> SRR1490178 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.3290 0.8269 0.820 0.000 0.044 0.000 0.004 0.132
#> SRR1075707 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1443871 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1102489 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1465758 1 0.0363 0.8733 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1414058 3 0.3198 0.5878 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1407449 4 0.4250 0.1743 0.456 0.000 0.000 0.528 0.000 0.016
#> SRR1436858 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1479109 3 0.0146 0.8477 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399069 4 0.2053 0.7235 0.004 0.000 0.000 0.888 0.000 0.108
#> SRR1366450 3 0.2101 0.8028 0.004 0.000 0.892 0.000 0.004 0.100
#> SRR1396859 1 0.2020 0.8312 0.896 0.000 0.000 0.008 0.000 0.096
#> SRR1457176 1 0.4923 0.7132 0.708 0.000 0.120 0.020 0.004 0.148
#> SRR1097666 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1434736 6 0.5691 0.4382 0.272 0.000 0.016 0.044 0.056 0.612
#> SRR1080560 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1322882 1 0.3417 0.8207 0.812 0.000 0.052 0.000 0.004 0.132
#> SRR1435688 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0363 0.8740 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR658152 4 0.6040 -0.2003 0.000 0.000 0.000 0.420 0.296 0.284
#> SRR1368141 5 0.2218 0.6919 0.000 0.000 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1440268 1 0.1556 0.8449 0.920 0.000 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1453725 3 0.7401 0.1309 0.204 0.000 0.424 0.220 0.004 0.148
#> SRR1325711 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 4 0.5035 0.2237 0.360 0.000 0.000 0.556 0.000 0.084
#> SRR1477591 1 0.3434 0.8197 0.808 0.000 0.048 0.000 0.004 0.140
#> SRR1416049 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR656275 4 0.0363 0.7654 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1369052 4 0.2852 0.6899 0.080 0.000 0.000 0.856 0.000 0.064
#> SRR1377735 1 0.3543 0.8162 0.764 0.000 0.020 0.000 0.004 0.212
#> SRR1331244 1 0.2412 0.8185 0.880 0.000 0.000 0.028 0.000 0.092
#> SRR1404531 1 0.1219 0.8752 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1324331 1 0.1444 0.8497 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1458890 5 0.2531 0.6720 0.000 0.000 0.000 0.132 0.856 0.012
#> SRR1432695 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1431969 5 0.2762 0.6587 0.000 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1087393 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1077263 3 0.1387 0.8261 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1385211 1 0.2765 0.8453 0.848 0.000 0.016 0.000 0.004 0.132
#> SRR655241 4 0.4707 0.4230 0.252 0.000 0.000 0.656 0.000 0.092
#> SRR656922 4 0.5121 0.3709 0.236 0.000 0.012 0.644 0.000 0.108
#> SRR1361630 3 0.0547 0.8462 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1318966 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1407087 3 0.4084 0.2407 0.000 0.000 0.588 0.000 0.400 0.012
#> SRR603212 3 0.5529 0.5528 0.148 0.000 0.660 0.040 0.004 0.148
#> SRR1321088 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1485190 5 0.0935 0.7324 0.000 0.000 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR1332232 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 6 0.4184 0.1234 0.000 0.000 0.000 0.488 0.012 0.500
#> SRR1457835 1 0.4881 0.7325 0.680 0.000 0.080 0.012 0.004 0.224
#> SRR1347123 5 0.2933 0.6563 0.000 0.000 0.200 0.000 0.796 0.004
#> SRR1465501 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1330878 5 0.1075 0.7341 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1445064 5 0.2312 0.6868 0.000 0.000 0.000 0.112 0.876 0.012
#> SRR1452981 4 0.1910 0.7194 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1326708 1 0.2278 0.8546 0.868 0.000 0.000 0.000 0.004 0.128
#> SRR1407157 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1397697 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.0458 0.7666 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077898 1 0.2846 0.8409 0.840 0.000 0.016 0.000 0.004 0.140
#> SRR1349080 6 0.6221 0.3620 0.108 0.000 0.264 0.064 0.004 0.560
#> SRR1076096 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR811261 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1375485 1 0.6200 0.5379 0.576 0.000 0.052 0.216 0.004 0.152
#> SRR1432563 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.3633 0.8064 0.796 0.000 0.064 0.000 0.004 0.136
#> SRR1380614 1 0.2454 0.8325 0.840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR812060 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR602082 1 0.1531 0.8718 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1069490 2 0.3371 0.8201 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1078417 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.1798 0.8273 0.000 0.000 0.932 0.020 0.020 0.028
#> SRR1420710 4 0.1225 0.7574 0.000 0.000 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR660426 1 0.2723 0.8456 0.852 0.000 0.016 0.000 0.004 0.128
#> SRR1416003 4 0.3694 0.4932 0.000 0.000 0.000 0.740 0.232 0.028
#> SRR661064 4 0.4061 0.5688 0.164 0.000 0.000 0.748 0.000 0.088
#> SRR1082011 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.2806 0.8414 0.844 0.000 0.016 0.000 0.004 0.136
#> SRR1353243 1 0.2655 0.8459 0.848 0.000 0.008 0.000 0.004 0.140
#> SRR1455482 1 0.0547 0.8766 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1313473 1 0.0508 0.8761 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1399394 3 0.5246 0.6079 0.040 0.000 0.688 0.104 0.004 0.164
#> SRR1102467 4 0.2375 0.7139 0.060 0.000 0.008 0.896 0.000 0.036
#> SRR1317470 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1337707 5 0.0508 0.7321 0.000 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1408752 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1398013 4 0.1225 0.7574 0.000 0.000 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR1352918 4 0.3823 0.0761 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1420750 1 0.4418 0.7276 0.728 0.000 0.128 0.000 0.004 0.140
#> SRR1071785 5 0.2402 0.6819 0.000 0.000 0.000 0.120 0.868 0.012
#> SRR1353618 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1082217 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1357256 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.0260 0.7662 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1366560 1 0.0260 0.8745 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355684 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.0146 0.7350 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1313494 4 0.4657 0.4471 0.228 0.000 0.000 0.672 0.000 0.100
#> SRR1309985 4 0.2491 0.7063 0.020 0.000 0.000 0.868 0.000 0.112
#> SRR607911 1 0.0260 0.8737 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333789 3 0.0000 0.8480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 4 0.4185 -0.1662 0.000 0.000 0.000 0.496 0.012 0.492
#> SRR1088631 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR615575 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1079434 5 0.4165 0.2365 0.000 0.000 0.000 0.012 0.536 0.452
#> SRR1325559 1 0.6596 0.5050 0.544 0.000 0.128 0.100 0.004 0.224
#> SRR1446695 3 0.0405 0.8479 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1383883 1 0.0363 0.8733 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396100 4 0.4157 0.0188 0.000 0.000 0.000 0.544 0.012 0.444
#> SRR1475697 6 0.5642 0.0391 0.000 0.000 0.000 0.152 0.388 0.460
#> SRR1488067 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1102103 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1105154 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1084991 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1410380 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1445490 2 0.1075 0.8826 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1454671 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1435044 6 0.6438 0.1774 0.000 0.000 0.048 0.152 0.332 0.468
#> SRR1485812 5 0.3828 0.2808 0.000 0.000 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1078020 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1311153 1 0.1531 0.8718 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1376406 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.0146 0.7350 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR807775 3 0.3727 0.3049 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.4370 0.1831 0.000 0.000 0.552 0.008 0.012 0.428
#> SRR1100656 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1362159 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR656794 3 0.2504 0.7751 0.004 0.000 0.856 0.000 0.004 0.136
#> SRR604653 1 0.1471 0.8725 0.932 0.000 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1317685 5 0.4702 0.2200 0.000 0.000 0.024 0.012 0.524 0.440
#> SRR1485912 3 0.2482 0.7744 0.000 0.000 0.848 0.004 0.000 0.148
#> SRR1407602 5 0.4742 0.1491 0.000 0.000 0.000 0.048 0.512 0.440
#> SRR1356164 5 0.5292 0.0834 0.000 0.000 0.000 0.100 0.468 0.432
#> SRR1328692 5 0.2750 0.7036 0.000 0.000 0.004 0.048 0.868 0.080
#> SRR1362438 1 0.2846 0.8409 0.840 0.000 0.016 0.000 0.004 0.140
#> SRR1479216 5 0.2793 0.6557 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1358041 4 0.4447 0.5632 0.148 0.000 0.012 0.736 0.000 0.104
#> SRR1468766 3 0.0725 0.8482 0.000 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1368200 3 0.1679 0.8272 0.000 0.000 0.936 0.028 0.008 0.028
#> SRR1435602 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.0146 0.7350 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1437256 5 0.2841 0.6402 0.000 0.000 0.000 0.164 0.824 0.012
#> SRR1487446 4 0.3835 0.4126 0.000 0.000 0.000 0.668 0.012 0.320
#> SRR816653 1 0.4149 0.7855 0.728 0.000 0.056 0.000 0.004 0.212
#> SRR815164 1 0.7025 0.3032 0.448 0.000 0.132 0.140 0.000 0.280
#> SRR1442043 4 0.1556 0.7427 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1410573 1 0.0363 0.8740 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1096782 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.3156 0.7867 0.000 0.000 0.852 0.020 0.056 0.072
#> SRR1382934 5 0.0146 0.7350 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1465208 1 0.3325 0.7680 0.820 0.000 0.000 0.084 0.000 0.096
#> SRR1314728 6 0.5603 0.4569 0.116 0.000 0.208 0.044 0.000 0.632
#> SRR1470291 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1409600 3 0.1556 0.8205 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR816123 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR614779 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR810783 3 0.0000 0.8480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.1387 0.8537 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1410356 3 0.0000 0.8480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808106 6 0.6379 0.4161 0.188 0.000 0.220 0.056 0.000 0.536
#> SRR662713 3 0.1765 0.8284 0.000 0.000 0.924 0.024 0.000 0.052
#> SRR1447058 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1480964 3 0.3640 0.6806 0.000 0.000 0.784 0.176 0.024 0.016
#> SRR809382 5 0.1610 0.7071 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR665417 4 0.3390 0.4510 0.296 0.000 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1453166 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1069826 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 5 0.1204 0.7323 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1413787 5 0.1141 0.7334 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1478207 5 0.3450 0.6279 0.000 0.000 0.208 0.012 0.772 0.008
#> SRR1411046 1 0.0458 0.8734 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1313711 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1913 0.8383 0.908 0.000 0.000 0.012 0.000 0.080
#> SRR1309051 1 0.2809 0.8445 0.848 0.000 0.020 0.000 0.004 0.128
#> SRR1486949 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1395616 1 0.1444 0.8496 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1074956 2 0.3371 0.8201 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1092961 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR817210 3 0.4650 0.5632 0.000 0.000 0.692 0.236 0.028 0.044
#> SRR1319221 5 0.2300 0.6027 0.000 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1405413 6 0.5450 0.4365 0.064 0.000 0.232 0.064 0.000 0.640
#> SRR607807 1 0.0260 0.8737 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1390160 5 0.2146 0.7108 0.000 0.000 0.116 0.000 0.880 0.004
#> SRR1406283 3 0.2655 0.7690 0.008 0.000 0.848 0.000 0.004 0.140
#> SRR1357709 4 0.0363 0.7660 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1080742 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1468208 1 0.0363 0.8740 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1312766 3 0.0000 0.8480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.4276 0.6193 0.728 0.000 0.000 0.168 0.000 0.104
#> SRR1311224 1 0.3304 0.8263 0.816 0.000 0.040 0.000 0.004 0.140
#> SRR1087801 3 0.3657 0.7366 0.000 0.000 0.792 0.108 0.000 0.100
#> SRR1099720 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1349250 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1350912 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1357127 3 0.5568 0.2834 0.000 0.000 0.552 0.000 0.236 0.212
#> SRR1074980 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1317022 5 0.1141 0.7334 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1332879 1 0.4567 0.7166 0.712 0.000 0.144 0.000 0.004 0.140
#> SRR1403177 2 0.1501 0.8824 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1076144 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR818239 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1421069 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1500006 1 0.1349 0.8736 0.940 0.000 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1485678 4 0.1549 0.7497 0.000 0.000 0.044 0.936 0.000 0.020
#> SRR1092232 5 0.0146 0.7350 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1344253 3 0.4179 0.1759 0.000 0.000 0.516 0.000 0.012 0.472
#> SRR1384290 1 0.0146 0.8742 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089349 3 0.0146 0.8482 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 4 0.2798 0.6694 0.000 0.000 0.000 0.852 0.112 0.036
#> SRR818372 4 0.1794 0.7416 0.000 0.000 0.000 0.924 0.040 0.036
#> SRR1323675 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR819894 4 0.0865 0.7641 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1310031 5 0.3578 0.4981 0.000 0.000 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR615419 5 0.2613 0.6652 0.000 0.000 0.000 0.140 0.848 0.012
#> SRR1436925 4 0.0260 0.7662 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1477238 1 0.0363 0.8733 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1332566 1 0.2618 0.8245 0.860 0.000 0.000 0.024 0.000 0.116
#> SRR1490228 3 0.5903 -0.1127 0.000 0.000 0.428 0.000 0.364 0.208
#> SRR1442949 6 0.5813 -0.0988 0.000 0.000 0.108 0.020 0.416 0.456
#> SRR1466239 1 0.0363 0.8740 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1094003 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 3 0.5601 0.2773 0.324 0.000 0.528 0.000 0.004 0.144
#> SRR813076 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1097642 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1322981 3 0.0000 0.8480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 5 0.3351 0.5687 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR660522 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR815374 4 0.0790 0.7633 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1069564 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1416337 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1316438 5 0.3756 0.3475 0.000 0.000 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1386844 1 0.0363 0.8733 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1373718 1 0.0363 0.8733 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1447458 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1487128 1 0.2783 0.8305 0.836 0.000 0.000 0.016 0.000 0.148
#> SRR1441421 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1069919 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.2592 0.8525 0.864 0.000 0.016 0.000 0.004 0.116
#> SRR1335489 1 0.4086 0.0945 0.528 0.000 0.000 0.008 0.000 0.464
#> SRR1393404 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1081425 1 0.1219 0.8745 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1401815 5 0.1075 0.7341 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1071337 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1071983 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0260 0.8888 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1410510 5 0.2416 0.6851 0.000 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1098761 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1312124 6 0.4264 0.1109 0.016 0.000 0.000 0.488 0.000 0.496
#> SRR615395 3 0.2320 0.7809 0.000 0.000 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1479349 4 0.1572 0.7500 0.036 0.000 0.000 0.936 0.000 0.028
#> SRR2165033 4 0.1867 0.7358 0.000 0.000 0.000 0.916 0.020 0.064
#> SRR1089054 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR816201 4 0.0363 0.7651 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488514 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.0260 0.7666 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1379303 1 0.0363 0.8740 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418516 4 0.0363 0.7655 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR613174 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1351125 3 0.0146 0.8475 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659157 5 0.3915 0.3090 0.000 0.000 0.000 0.004 0.584 0.412
#> SRR1480408 4 0.0000 0.7668 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.3971 -0.0941 0.000 0.000 0.000 0.548 0.004 0.448
#> SRR1073317 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.0000 0.7668 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1431270 5 0.3804 0.2984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1085614 2 0.0146 0.8895 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1330106 4 0.5836 -0.1500 0.000 0.000 0.000 0.420 0.392 0.188
#> SRR1466154 1 0.2723 0.8456 0.852 0.000 0.016 0.000 0.004 0.128
#> SRR1396944 1 0.0260 0.8737 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082784 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0363 0.8740 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR614659 4 0.0146 0.7667 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659247 3 0.1714 0.7985 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.1556 0.8472 0.920 0.000 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1473696 3 0.5536 0.3252 0.312 0.000 0.544 0.000 0.004 0.140
#> SRR1375842 1 0.1411 0.8731 0.936 0.000 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1388123 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1453662 4 0.0547 0.7666 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1345499 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1353499 1 0.2806 0.8428 0.844 0.000 0.016 0.000 0.004 0.136
#> SRR1416693 1 0.0260 0.8737 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1070841 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1380910 1 0.0146 0.8744 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333125 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.5763 0.5767 0.616 0.000 0.032 0.208 0.004 0.140
#> SRR612659 5 0.2562 0.6764 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1447148 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR658597 2 0.3151 0.8264 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1089595 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1074263 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.1806 0.8129 0.000 0.000 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR1345995 3 0.2504 0.7756 0.004 0.000 0.856 0.000 0.004 0.136
#> SRR1071035 3 0.5923 0.5399 0.124 0.000 0.640 0.092 0.004 0.140
#> SRR1068808 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1332754 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR662438 1 0.1471 0.8736 0.932 0.000 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1335355 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1323558 3 0.0790 0.8410 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1381711 3 0.0622 0.8464 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR657985 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1314810 6 0.4499 0.2994 0.288 0.000 0.060 0.000 0.000 0.652
#> SRR1336505 4 0.0909 0.7589 0.000 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR1474095 3 0.5627 0.1175 0.000 0.000 0.472 0.104 0.012 0.412
#> SRR1363831 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.3076 0.5638 0.000 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1074909 2 0.3266 0.8237 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1101200 3 0.1610 0.8174 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1075408 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1367150 4 0.0713 0.7642 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1313406 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1068880 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1467277 3 0.0820 0.8452 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1084867 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1095431 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1380184 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1443113 3 0.4263 0.6459 0.120 0.000 0.744 0.000 0.004 0.132
#> SRR1380414 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1315912 1 0.2806 0.8414 0.844 0.000 0.016 0.000 0.004 0.136
#> SRR1075778 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 5 0.0717 0.7304 0.000 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1361195 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.3395 0.8202 0.812 0.000 0.048 0.000 0.004 0.136
#> SRR1477653 3 0.2504 0.7756 0.004 0.000 0.856 0.000 0.004 0.136
#> SRR1355475 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1360785 4 0.3999 -0.1532 0.004 0.000 0.000 0.500 0.000 0.496
#> SRR810437 5 0.2446 0.6787 0.000 0.000 0.000 0.124 0.864 0.012
#> SRR1361860 4 0.0363 0.7651 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1441311 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.1910 0.7246 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1457619 4 0.3975 -0.0493 0.000 0.000 0.000 0.544 0.004 0.452
#> SRR1498529 4 0.0603 0.7655 0.004 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1097172 2 0.0547 0.8872 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1074017 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 5 0.1010 0.7314 0.000 0.000 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR1399525 2 0.3175 0.8280 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1312844 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1085874 2 0.3390 0.8191 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1101226 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1476056 4 0.1910 0.7194 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1075659 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1311916 5 0.3221 0.5928 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1353353 5 0.0291 0.7350 0.000 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1073291 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1356227 1 0.2537 0.8125 0.872 0.000 0.000 0.032 0.000 0.096
#> SRR1080720 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1091695 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1350304 6 0.4403 0.1609 0.000 0.000 0.000 0.468 0.024 0.508
#> SRR663002 5 0.0458 0.7364 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1376983 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1399926 1 0.0363 0.8733 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1347144 5 0.3390 0.5604 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR1384006 1 0.0291 0.8750 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1499108 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR614047 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR818440 6 0.6372 0.1150 0.000 0.000 0.072 0.100 0.356 0.472
#> SRR1337770 4 0.0363 0.7671 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1399413 3 0.1858 0.8104 0.000 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1385542 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1473959 4 0.1225 0.7574 0.000 0.000 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR1074041 3 0.0363 0.8480 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1394495 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR659460 3 0.0937 0.8406 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR816699 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1308612 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1499418 5 0.3765 0.3279 0.000 0.000 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1352894 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR815805 6 0.4979 0.3882 0.276 0.000 0.000 0.076 0.012 0.636
#> SRR1331083 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR808272 3 0.0713 0.8423 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1436698 3 0.3886 0.7036 0.080 0.000 0.776 0.000 0.004 0.140
#> SRR1095627 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1357672 3 0.0000 0.8480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.1471 0.8732 0.932 0.000 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1077479 1 0.2053 0.8677 0.888 0.000 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR814491 6 0.4185 0.1151 0.000 0.000 0.000 0.492 0.012 0.496
#> SRR1101256 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4732 0.6849 0.692 0.000 0.168 0.000 0.004 0.136
#> SRR1457994 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1314707 4 0.0260 0.7658 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309534 6 0.5115 0.1981 0.000 0.000 0.000 0.460 0.080 0.460
#> SRR615527 5 0.0935 0.7324 0.000 0.000 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR1098216 1 0.2889 0.7973 0.848 0.000 0.000 0.044 0.000 0.108
#> SRR1325847 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1404003 4 0.0260 0.7658 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1344166 4 0.4788 0.3708 0.248 0.000 0.012 0.668 0.000 0.072
#> SRR1368638 6 0.4185 0.1151 0.000 0.000 0.000 0.492 0.012 0.496
#> SRR1431429 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1079237 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1080509 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.4025 0.2353 0.000 0.000 0.576 0.000 0.008 0.416
#> SRR1502143 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1487614 5 0.1082 0.7366 0.000 0.000 0.040 0.000 0.956 0.004
#> SRR1402307 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR820810 4 0.0603 0.7648 0.000 0.000 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR1099212 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.1610 0.8173 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1476547 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR656421 1 0.1910 0.8500 0.892 0.000 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1086116 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1499917 4 0.1225 0.7574 0.000 0.000 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR1339944 2 0.0260 0.8888 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1391444 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.3175 0.5363 0.000 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1431847 5 0.3789 0.3247 0.000 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1317155 4 0.2129 0.7142 0.000 0.000 0.000 0.904 0.040 0.056
#> SRR1477405 1 0.0363 0.8760 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR655289 4 0.2730 0.6371 0.000 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1341683 4 0.3171 0.5623 0.000 0.000 0.000 0.784 0.204 0.012
#> SRR1084790 1 0.5451 0.4593 0.564 0.000 0.296 0.000 0.004 0.136
#> SRR1073731 4 0.7457 -0.2047 0.000 0.000 0.252 0.360 0.248 0.140
#> SRR1332588 4 0.1010 0.7609 0.000 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1471157 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.0260 0.8482 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR661028 1 0.2806 0.8433 0.844 0.000 0.016 0.000 0.004 0.136
#> SRR1413477 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4453 0.3174 0.000 0.000 0.592 0.372 0.000 0.036
#> SRR1358435 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR2165273 1 0.0260 0.8737 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1379014 4 0.5108 0.2318 0.356 0.000 0.000 0.552 0.000 0.092
#> SRR1489904 5 0.3468 0.5746 0.000 0.000 0.284 0.000 0.712 0.004
#> SRR1416386 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1406048 6 0.5757 0.2869 0.180 0.000 0.000 0.352 0.000 0.468
#> SRR606982 5 0.5446 0.1255 0.000 0.000 0.028 0.056 0.480 0.436
#> SRR1358082 1 0.0146 0.8747 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312934 3 0.0692 0.8436 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR655194 4 0.1225 0.7619 0.012 0.000 0.000 0.952 0.000 0.036
#> SRR1331174 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1389820 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1074289 3 0.0260 0.8467 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1348816 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 5 0.4157 0.2526 0.000 0.000 0.000 0.012 0.544 0.444
#> SRR1395810 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.2446 0.6618 0.000 0.000 0.000 0.864 0.124 0.012
#> SRR1443507 3 0.0865 0.8380 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1452310 4 0.5715 -0.2475 0.000 0.000 0.064 0.456 0.040 0.440
#> SRR665610 4 0.1116 0.7606 0.000 0.000 0.008 0.960 0.004 0.028
#> SRR1347322 1 0.1958 0.8649 0.896 0.000 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR813395 2 0.3409 0.8181 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1477256 1 0.2680 0.8500 0.856 0.000 0.016 0.000 0.004 0.124
#> SRR1470230 5 0.4157 0.2490 0.000 0.000 0.000 0.012 0.544 0.444
#> SRR1354247 1 0.2263 0.8490 0.900 0.000 0.000 0.060 0.004 0.036
#> SRR1082640 2 0.1141 0.8818 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1487592 3 0.1387 0.8251 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1352299 3 0.4704 0.5920 0.160 0.000 0.696 0.000 0.004 0.140
#> SRR1076317 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1434117 3 0.0458 0.8477 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1075273 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR658657 5 0.3436 0.6599 0.000 0.000 0.020 0.136 0.816 0.028
#> SRR1092773 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1365332 3 0.0000 0.8480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615958 5 0.3833 0.2670 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1097688 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1403259 5 0.0935 0.7324 0.000 0.000 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR1099120 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1362200 3 0.1387 0.8168 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.8896 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 5 0.2854 0.6490 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1075923 2 0.3126 0.8268 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1100703 3 0.2101 0.8040 0.004 0.000 0.892 0.000 0.004 0.100
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.998 0.999 0.4359 0.565 0.565
#> 3 3 0.695 0.734 0.889 0.5158 0.771 0.594
#> 4 4 0.621 0.441 0.679 0.0862 0.733 0.400
#> 5 5 0.780 0.772 0.887 0.0991 0.829 0.488
#> 6 6 0.834 0.783 0.879 0.0483 0.920 0.655
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1398013 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.358 0.926 0.932 0.068
#> SRR1405413 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.971 0.334 0.600 0.400
#> SRR1076144 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074289 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1397949 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355723 3 0.4291 0.6542 0.180 0.000 0.820
#> SRR1329744 1 0.1411 0.8018 0.964 0.000 0.036
#> SRR657384 3 0.5859 0.3892 0.344 0.000 0.656
#> SRR1351190 3 0.5785 0.4147 0.332 0.000 0.668
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.6267 0.1694 0.548 0.000 0.452
#> SRR1396017 1 0.6215 0.1926 0.572 0.000 0.428
#> SRR1410742 3 0.6154 0.2358 0.408 0.000 0.592
#> SRR1435963 1 0.0592 0.8108 0.988 0.000 0.012
#> SRR1382416 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1391354 3 0.6299 0.0390 0.476 0.000 0.524
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.1411 0.8018 0.964 0.000 0.036
#> SRR1312244 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1325138 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1326821 3 0.6260 0.1914 0.448 0.000 0.552
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.3686 0.7399 0.860 0.000 0.140
#> SRR1075707 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1465758 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1414058 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407449 1 0.3116 0.7783 0.892 0.000 0.108
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.5529 0.5051 0.296 0.000 0.704
#> SRR1399069 1 0.6302 0.0737 0.520 0.000 0.480
#> SRR1366450 3 0.6295 0.1345 0.472 0.000 0.528
#> SRR1396859 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1457176 1 0.3619 0.7410 0.864 0.000 0.136
#> SRR1097666 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1434736 1 0.3412 0.7543 0.876 0.000 0.124
#> SRR1080560 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1322882 1 0.1753 0.7997 0.952 0.000 0.048
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR658152 3 0.0237 0.7700 0.004 0.000 0.996
#> SRR1368141 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440268 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1453725 1 0.6192 0.1943 0.580 0.000 0.420
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.3551 0.7516 0.868 0.000 0.132
#> SRR1477591 1 0.0592 0.8103 0.988 0.000 0.012
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1369052 1 0.5098 0.6416 0.752 0.000 0.248
#> SRR1377735 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1331244 1 0.1411 0.8018 0.964 0.000 0.036
#> SRR1404531 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1324331 1 0.1411 0.8018 0.964 0.000 0.036
#> SRR1458890 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.6295 0.1345 0.472 0.000 0.528
#> SRR1385211 1 0.4121 0.7178 0.832 0.000 0.168
#> SRR655241 1 0.4399 0.6968 0.812 0.000 0.188
#> SRR656922 1 0.4974 0.6549 0.764 0.000 0.236
#> SRR1361630 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR1318966 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1407087 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR603212 1 0.6244 0.1360 0.560 0.000 0.440
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.6267 0.1151 0.548 0.000 0.452
#> SRR1457835 1 0.4121 0.7178 0.832 0.000 0.168
#> SRR1347123 3 0.1529 0.7628 0.040 0.000 0.960
#> SRR1465501 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452981 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1326708 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407157 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1077898 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1349080 3 0.5397 0.5510 0.280 0.000 0.720
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1375485 1 0.6045 0.3114 0.620 0.000 0.380
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.5254 0.5552 0.736 0.000 0.264
#> SRR1380614 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR812060 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR602082 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069490 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1420710 3 0.2796 0.7278 0.092 0.000 0.908
#> SRR660426 1 0.3192 0.7598 0.888 0.000 0.112
#> SRR1416003 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR661064 1 0.4974 0.6567 0.764 0.000 0.236
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.2448 0.7854 0.924 0.000 0.076
#> SRR1353243 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1455482 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1313473 1 0.3038 0.7662 0.896 0.000 0.104
#> SRR1399394 1 0.6168 0.2249 0.588 0.000 0.412
#> SRR1102467 1 0.4974 0.6549 0.764 0.000 0.236
#> SRR1317470 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1337707 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.6155 0.5000 0.008 0.664 0.328
#> SRR1398013 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1352918 1 0.6302 0.0737 0.520 0.000 0.480
#> SRR1420750 1 0.4346 0.6413 0.816 0.000 0.184
#> SRR1071785 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.4346 0.6498 0.184 0.000 0.816
#> SRR1366560 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355684 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323289 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.3551 0.7516 0.868 0.000 0.132
#> SRR1309985 1 0.6295 0.0969 0.528 0.000 0.472
#> SRR607911 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333789 3 0.5882 0.3765 0.348 0.000 0.652
#> SRR1400078 3 0.4504 0.6232 0.196 0.000 0.804
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR615575 3 0.6026 0.3434 0.376 0.000 0.624
#> SRR1079434 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325559 1 0.3816 0.7395 0.852 0.000 0.148
#> SRR1446695 3 0.3192 0.7233 0.112 0.000 0.888
#> SRR1383883 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396100 1 0.6299 0.0836 0.524 0.000 0.476
#> SRR1475697 3 0.6225 0.1734 0.432 0.000 0.568
#> SRR1488067 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1084991 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1410380 3 0.2537 0.7438 0.080 0.000 0.920
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1485812 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.4291 0.6623 0.180 0.000 0.820
#> SRR1100656 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1362159 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1414536 3 0.1163 0.7671 0.028 0.000 0.972
#> SRR656794 1 0.6274 0.0622 0.544 0.000 0.456
#> SRR604653 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1317685 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1485912 3 0.5706 0.4371 0.320 0.000 0.680
#> SRR1407602 3 0.3879 0.6630 0.152 0.000 0.848
#> SRR1356164 3 0.4796 0.6054 0.220 0.000 0.780
#> SRR1328692 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362438 1 0.3192 0.7598 0.888 0.000 0.112
#> SRR1479216 3 0.1753 0.7599 0.048 0.000 0.952
#> SRR1358041 1 0.4178 0.7277 0.828 0.000 0.172
#> SRR1468766 3 0.2448 0.7521 0.076 0.000 0.924
#> SRR1368200 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 3 0.0592 0.7681 0.012 0.000 0.988
#> SRR1487446 3 0.6180 0.2146 0.416 0.000 0.584
#> SRR816653 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR815164 1 0.3412 0.7623 0.876 0.000 0.124
#> SRR1442043 1 0.6302 0.0737 0.520 0.000 0.480
#> SRR1410573 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR1382934 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 1 0.2165 0.7926 0.936 0.000 0.064
#> SRR1314728 1 0.4605 0.6378 0.796 0.000 0.204
#> SRR1470291 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1308756 3 0.1031 0.7670 0.024 0.000 0.976
#> SRR1409600 1 0.6305 -0.0202 0.516 0.000 0.484
#> SRR816123 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR614779 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR810783 3 0.5497 0.4639 0.292 0.000 0.708
#> SRR1333990 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1410356 3 0.6180 0.2615 0.416 0.000 0.584
#> SRR808106 1 0.6305 -0.0399 0.516 0.000 0.484
#> SRR662713 3 0.1964 0.7544 0.056 0.000 0.944
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 3 0.6192 0.2051 0.420 0.000 0.580
#> SRR1088016 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1453166 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478207 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1411046 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1529 0.8016 0.960 0.000 0.040
#> SRR1309051 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.1289 0.8036 0.968 0.000 0.032
#> SRR1074956 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1092961 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR817210 3 0.4605 0.6465 0.204 0.000 0.796
#> SRR1319221 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.4974 0.6130 0.764 0.000 0.236
#> SRR607807 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1390160 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406283 3 0.6299 0.1233 0.476 0.000 0.524
#> SRR1357709 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1080742 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1468208 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1312766 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR1361612 1 0.1860 0.7988 0.948 0.000 0.052
#> SRR1311224 1 0.5291 0.5488 0.732 0.000 0.268
#> SRR1087801 3 0.5465 0.5791 0.288 0.000 0.712
#> SRR1099720 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1332879 1 0.5678 0.4394 0.684 0.000 0.316
#> SRR1403177 1 0.9229 0.3009 0.488 0.348 0.164
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR818239 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1421069 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1500006 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1485678 3 0.6295 0.0729 0.472 0.000 0.528
#> SRR1092232 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344253 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR1384290 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089349 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR818372 3 0.0747 0.7669 0.016 0.000 0.984
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 3 0.5178 0.5529 0.256 0.000 0.744
#> SRR1310031 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR615419 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436925 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1477238 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1332566 1 0.1643 0.8012 0.956 0.000 0.044
#> SRR1490228 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442949 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466239 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4346 0.6413 0.816 0.000 0.184
#> SRR813076 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1322981 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR660522 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR815374 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1069564 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1416337 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR1316438 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1373718 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.1753 0.8005 0.952 0.000 0.048
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1335489 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1401815 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1098761 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1312124 1 0.4605 0.6547 0.796 0.000 0.204
#> SRR615395 3 0.6267 0.1822 0.452 0.000 0.548
#> SRR1479349 1 0.5397 0.5627 0.720 0.000 0.280
#> SRR2165033 3 0.4504 0.6358 0.196 0.000 0.804
#> SRR1089054 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1379303 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1418516 3 0.4504 0.6365 0.196 0.000 0.804
#> SRR613174 3 0.6008 0.3547 0.372 0.000 0.628
#> SRR1351125 3 0.6295 0.1345 0.472 0.000 0.528
#> SRR659157 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480408 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR657857 3 0.5905 0.3698 0.352 0.000 0.648
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1094168 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.3879 0.6811 0.152 0.000 0.848
#> SRR1466154 1 0.3192 0.7598 0.888 0.000 0.112
#> SRR1396944 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR614659 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR659247 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317201 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473696 1 0.2625 0.7818 0.916 0.000 0.084
#> SRR1375842 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1453662 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.3192 0.7598 0.888 0.000 0.112
#> SRR1416693 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1070841 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1380910 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4346 0.7022 0.816 0.000 0.184
#> SRR612659 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1089595 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.6295 0.1352 0.472 0.000 0.528
#> SRR1345995 3 0.6295 0.1345 0.472 0.000 0.528
#> SRR1071035 1 0.6260 0.1207 0.552 0.000 0.448
#> SRR1068808 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1335355 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR659448 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR1323558 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1381711 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR657985 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314810 1 0.4346 0.6413 0.816 0.000 0.184
#> SRR1336505 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1474095 1 0.5560 0.5462 0.700 0.000 0.300
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.6302 0.0737 0.520 0.000 0.480
#> SRR1074909 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1101200 3 0.6180 0.2615 0.416 0.000 0.584
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.6192 0.1569 0.580 0.000 0.420
#> SRR1380414 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR1315912 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.4605 0.6582 0.796 0.000 0.204
#> SRR1477653 3 0.6295 0.1345 0.472 0.000 0.528
#> SRR1355475 3 0.6045 0.3384 0.380 0.000 0.620
#> SRR1360785 1 0.4399 0.6968 0.812 0.000 0.188
#> SRR810437 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361860 3 0.6192 0.2044 0.420 0.000 0.580
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.6235 0.1630 0.436 0.000 0.564
#> SRR1457619 1 0.6302 0.0334 0.520 0.000 0.480
#> SRR1498529 1 0.5497 0.5810 0.708 0.000 0.292
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399525 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1085874 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1101226 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1476056 1 0.6302 0.0737 0.520 0.000 0.480
#> SRR1075659 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1311916 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR1353353 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073291 3 0.2625 0.7414 0.084 0.000 0.916
#> SRR1356227 1 0.1964 0.7983 0.944 0.000 0.056
#> SRR1080720 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1350304 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR663002 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1347144 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1384006 1 0.1411 0.8018 0.964 0.000 0.036
#> SRR1499108 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR614047 3 0.0237 0.7703 0.004 0.000 0.996
#> SRR818440 3 0.4121 0.6850 0.168 0.000 0.832
#> SRR1337770 1 0.6267 0.1936 0.548 0.000 0.452
#> SRR1399413 3 0.1964 0.7544 0.056 0.000 0.944
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.4178 0.6623 0.172 0.000 0.828
#> SRR1074041 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 3 0.4654 0.6257 0.208 0.000 0.792
#> SRR816699 3 0.5859 0.4123 0.344 0.000 0.656
#> SRR1308612 3 0.5882 0.4034 0.348 0.000 0.652
#> SRR1499418 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.2625 0.7844 0.916 0.000 0.084
#> SRR1331083 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR808272 3 0.1289 0.7650 0.032 0.000 0.968
#> SRR1436698 1 0.5529 0.5017 0.704 0.000 0.296
#> SRR1095627 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1357672 3 0.6180 0.2615 0.416 0.000 0.584
#> SRR1351236 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077479 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR814491 1 0.6302 0.0737 0.520 0.000 0.480
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.3192 0.7598 0.888 0.000 0.112
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 3 0.6180 0.2147 0.416 0.000 0.584
#> SRR1309534 1 0.6305 0.0626 0.516 0.000 0.484
#> SRR615527 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098216 1 0.3267 0.7649 0.884 0.000 0.116
#> SRR1325847 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1404003 3 0.5835 0.3972 0.340 0.000 0.660
#> SRR1344166 1 0.5497 0.5756 0.708 0.000 0.292
#> SRR1368638 1 0.6309 0.0285 0.504 0.000 0.496
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.1964 0.7562 0.056 0.000 0.944
#> SRR1502143 3 0.1753 0.7600 0.048 0.000 0.952
#> SRR1487614 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.5529 0.5684 0.704 0.000 0.296
#> SRR1099212 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.4062 0.6793 0.164 0.000 0.836
#> SRR1476547 2 0.0237 0.9922 0.004 0.996 0.000
#> SRR656421 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1431847 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317155 3 0.4399 0.6455 0.188 0.000 0.812
#> SRR1477405 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR655289 3 0.4121 0.6679 0.168 0.000 0.832
#> SRR1341683 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1084790 1 0.5905 0.3466 0.648 0.000 0.352
#> SRR1073731 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332588 3 0.4235 0.6582 0.176 0.000 0.824
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.6045 0.3384 0.380 0.000 0.620
#> SRR661028 1 0.2066 0.7941 0.940 0.000 0.060
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1358435 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR2165273 1 0.1411 0.8018 0.964 0.000 0.036
#> SRR1379014 1 0.2959 0.7762 0.900 0.000 0.100
#> SRR1489904 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416386 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1406048 1 0.4178 0.7147 0.828 0.000 0.172
#> SRR606982 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358082 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1312934 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR655194 1 0.5497 0.5810 0.708 0.000 0.292
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0237 0.9922 0.004 0.996 0.000
#> SRR1389820 2 0.6398 0.4049 0.008 0.620 0.372
#> SRR1074289 3 0.6095 0.3139 0.392 0.000 0.608
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.1163 0.7661 0.028 0.000 0.972
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.1163 0.7624 0.028 0.000 0.972
#> SRR1443507 3 0.6026 0.3462 0.376 0.000 0.624
#> SRR1452310 3 0.3686 0.6909 0.140 0.000 0.860
#> SRR665610 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347322 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR813395 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1477256 1 0.0424 0.8119 0.992 0.000 0.008
#> SRR1470230 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354247 1 0.4842 0.6709 0.776 0.000 0.224
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.6295 0.1345 0.472 0.000 0.528
#> SRR1352299 3 0.6309 0.0612 0.500 0.000 0.500
#> SRR1076317 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1434117 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075273 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR658657 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092773 2 0.0237 0.9922 0.004 0.996 0.000
#> SRR1365332 3 0.6180 0.2615 0.416 0.000 0.584
#> SRR615958 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097688 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1403259 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099120 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9932 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.7707 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075923 2 0.0424 0.9912 0.008 0.992 0.000
#> SRR1100703 3 0.6295 0.1345 0.472 0.000 0.528
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1436370 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1075752 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1355723 1 0.6080 0.1519 0.684 0.156 0.160 0.000
#> SRR1329744 1 0.7082 0.2895 0.500 0.132 0.368 0.000
#> SRR657384 1 0.5859 0.1687 0.704 0.156 0.140 0.000
#> SRR1351190 1 0.5905 0.1658 0.700 0.156 0.144 0.000
#> SRR1458662 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR818573 3 0.7392 -0.0837 0.356 0.172 0.472 0.000
#> SRR1396017 1 0.0707 0.2135 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1410742 1 0.5452 0.1903 0.736 0.156 0.108 0.000
#> SRR1435963 1 0.6483 0.2842 0.532 0.076 0.392 0.000
#> SRR1382416 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1391354 1 0.3958 0.1781 0.816 0.024 0.160 0.000
#> SRR1087968 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1310075 1 0.7082 0.2895 0.500 0.132 0.368 0.000
#> SRR1312244 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1325138 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1326821 3 0.1356 0.3860 0.008 0.032 0.960 0.000
#> SRR1490178 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR655613 3 0.7290 -0.1751 0.328 0.168 0.504 0.000
#> SRR1075707 4 0.0336 0.9351 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1443871 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1102489 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1414058 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1407449 1 0.7221 0.2035 0.432 0.140 0.428 0.000
#> SRR1436858 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1479109 3 0.2868 0.4356 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1399069 1 0.1022 0.2145 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1366450 3 0.1890 0.3687 0.008 0.056 0.936 0.000
#> SRR1396859 1 0.6851 0.2888 0.496 0.104 0.400 0.000
#> SRR1457176 3 0.7253 -0.1571 0.308 0.172 0.520 0.000
#> SRR1097666 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.5778 0.2571 0.604 0.040 0.356 0.000
#> SRR1080560 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 3 0.7154 -0.2649 0.428 0.132 0.440 0.000
#> SRR1435688 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1327614 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR658152 1 0.7102 -0.0538 0.540 0.156 0.304 0.000
#> SRR1368141 1 0.7134 -0.0581 0.532 0.156 0.312 0.000
#> SRR1440268 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1453725 3 0.7062 -0.0107 0.260 0.176 0.564 0.000
#> SRR1325711 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1477930 1 0.5565 0.2530 0.624 0.032 0.344 0.000
#> SRR1477591 1 0.7140 0.2893 0.464 0.132 0.404 0.000
#> SRR1416049 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR656275 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1369052 3 0.7396 -0.1300 0.404 0.164 0.432 0.000
#> SRR1377735 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1331244 1 0.6919 0.2884 0.516 0.116 0.368 0.000
#> SRR1404531 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1324331 1 0.7082 0.2895 0.500 0.132 0.368 0.000
#> SRR1458890 1 0.7134 -0.0581 0.532 0.156 0.312 0.000
#> SRR1432695 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1407624 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1431969 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1087393 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1077263 3 0.0336 0.4058 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1385211 3 0.6875 -0.1816 0.420 0.104 0.476 0.000
#> SRR655241 1 0.5599 0.2390 0.664 0.048 0.288 0.000
#> SRR656922 3 0.7009 -0.1424 0.440 0.116 0.444 0.000
#> SRR1361630 3 0.4477 0.4545 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1318966 4 0.0336 0.9351 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1407087 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR603212 3 0.6031 0.1364 0.168 0.144 0.688 0.000
#> SRR1321088 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1485190 3 0.5888 0.3639 0.424 0.036 0.540 0.000
#> SRR1332232 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1312645 1 0.0921 0.2034 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1457835 3 0.6875 -0.1816 0.420 0.104 0.476 0.000
#> SRR1347123 3 0.4697 0.4458 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1465501 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1445064 1 0.7134 -0.0581 0.532 0.156 0.312 0.000
#> SRR1452981 1 0.5051 0.1947 0.768 0.132 0.100 0.000
#> SRR1326708 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1407157 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1365401 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1397697 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1477316 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1077898 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1349080 3 0.4790 0.3899 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1076096 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR811261 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 3 0.7171 -0.0178 0.212 0.232 0.556 0.000
#> SRR1432563 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR604414 3 0.6560 -0.0381 0.248 0.132 0.620 0.000
#> SRR1380614 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR812060 3 0.0817 0.4195 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR602082 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1069490 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR661613 3 0.4804 0.4380 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1420710 1 0.6731 0.0442 0.608 0.156 0.236 0.000
#> SRR660426 3 0.7082 -0.1960 0.368 0.132 0.500 0.000
#> SRR1416003 1 0.7102 -0.0538 0.540 0.156 0.304 0.000
#> SRR661064 1 0.5233 0.2158 0.648 0.020 0.332 0.000
#> SRR1082011 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1452718 3 0.7135 -0.2340 0.400 0.132 0.468 0.000
#> SRR1353243 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1455482 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1313473 3 0.7538 -0.1549 0.260 0.248 0.492 0.000
#> SRR1399394 3 0.4741 0.1810 0.228 0.028 0.744 0.000
#> SRR1102467 3 0.7186 -0.1348 0.420 0.136 0.444 0.000
#> SRR1317470 3 0.4776 0.4415 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1337707 1 0.7106 -0.0738 0.528 0.148 0.324 0.000
#> SRR1408752 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1474617 4 0.0927 0.9149 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1398013 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.2132 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420750 3 0.6936 -0.0983 0.320 0.132 0.548 0.000
#> SRR1071785 1 0.7134 -0.0581 0.532 0.156 0.312 0.000
#> SRR1353618 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1082217 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1357256 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1490313 1 0.5994 0.1591 0.692 0.156 0.152 0.000
#> SRR1366560 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1355684 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1323289 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1313494 1 0.5186 0.2573 0.640 0.016 0.344 0.000
#> SRR1309985 1 0.0336 0.2136 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR607911 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1333789 3 0.1637 0.4162 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1400078 1 0.6950 -0.0111 0.572 0.156 0.272 0.000
#> SRR1088631 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1092842 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.1118 0.4189 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1079434 3 0.4866 0.4233 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1325559 3 0.6844 -0.2047 0.444 0.100 0.456 0.000
#> SRR1446695 3 0.4500 0.4532 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1383883 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.2132 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.5096 0.1997 0.760 0.156 0.084 0.000
#> SRR1488067 4 0.4164 0.4179 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1102103 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1105154 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 3 0.4500 0.4541 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1445490 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1454671 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1435044 3 0.5760 0.3482 0.448 0.028 0.524 0.000
#> SRR1485812 1 0.6788 -0.2025 0.480 0.096 0.424 0.000
#> SRR1078020 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1311153 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1376406 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1343898 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR807775 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1409215 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR820427 3 0.4382 0.4494 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR1100656 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1414536 3 0.4817 0.4351 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR656794 3 0.3037 0.3209 0.076 0.036 0.888 0.000
#> SRR604653 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1317685 3 0.4936 0.4377 0.372 0.004 0.624 0.000
#> SRR1485912 3 0.2730 0.4159 0.088 0.016 0.896 0.000
#> SRR1407602 1 0.6790 -0.0503 0.576 0.128 0.296 0.000
#> SRR1356164 1 0.5859 0.1689 0.704 0.156 0.140 0.000
#> SRR1328692 3 0.5060 0.4172 0.412 0.004 0.584 0.000
#> SRR1362438 3 0.7082 -0.1960 0.368 0.132 0.500 0.000
#> SRR1479216 3 0.4661 0.4481 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR1358041 3 0.7279 -0.1644 0.408 0.148 0.444 0.000
#> SRR1468766 3 0.5352 0.4111 0.388 0.016 0.596 0.000
#> SRR1368200 3 0.4948 0.3947 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1435602 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1501043 1 0.6751 -0.1727 0.508 0.096 0.396 0.000
#> SRR1437256 1 0.7118 -0.0524 0.536 0.156 0.308 0.000
#> SRR1487446 1 0.3778 0.1829 0.848 0.052 0.100 0.000
#> SRR816653 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR815164 1 0.6392 0.2163 0.484 0.064 0.452 0.000
#> SRR1442043 1 0.2530 0.2137 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1096782 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1352369 3 0.6583 0.3101 0.388 0.084 0.528 0.000
#> SRR1382934 1 0.6792 -0.2172 0.476 0.096 0.428 0.000
#> SRR1465208 1 0.6432 0.2724 0.552 0.076 0.372 0.000
#> SRR1314728 3 0.6720 -0.0625 0.300 0.120 0.580 0.000
#> SRR1470291 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1308756 3 0.4761 0.4394 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1409600 3 0.1576 0.3719 0.048 0.004 0.948 0.000
#> SRR816123 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614779 3 0.4477 0.4545 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR810783 3 0.2647 0.4141 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1333990 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1410356 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR808106 1 0.6016 -0.1179 0.544 0.044 0.412 0.000
#> SRR662713 3 0.4679 0.4460 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1447058 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1480964 1 0.6214 -0.2951 0.476 0.052 0.472 0.000
#> SRR809382 1 0.6696 -0.2174 0.484 0.088 0.428 0.000
#> SRR665417 1 0.4728 0.1913 0.792 0.104 0.104 0.000
#> SRR1088016 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1077781 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR615623 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1413787 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1478207 3 0.5039 0.4169 0.404 0.004 0.592 0.000
#> SRR1411046 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1313711 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1326560 1 0.6726 0.2848 0.536 0.100 0.364 0.000
#> SRR1309051 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1486949 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1395616 1 0.7098 0.2905 0.492 0.132 0.376 0.000
#> SRR1074956 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.7312 -0.0456 0.436 0.152 0.412 0.000
#> SRR1319221 1 0.6985 -0.1851 0.480 0.116 0.404 0.000
#> SRR1405413 3 0.6718 -0.0837 0.380 0.096 0.524 0.000
#> SRR607807 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1390160 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1406283 3 0.3377 0.2975 0.012 0.140 0.848 0.000
#> SRR1357709 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1080742 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1312766 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1361612 1 0.6775 0.2809 0.516 0.100 0.384 0.000
#> SRR1311224 3 0.6587 -0.0443 0.252 0.132 0.616 0.000
#> SRR1087801 1 0.6917 0.0817 0.568 0.144 0.288 0.000
#> SRR1099720 2 0.5000 0.5536 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1349250 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1357127 3 0.4776 0.4415 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1074980 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1317022 3 0.4746 0.4411 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1332879 3 0.6086 0.0534 0.188 0.132 0.680 0.000
#> SRR1403177 3 0.9126 -0.0117 0.192 0.104 0.440 0.264
#> SRR1076144 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1069614 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1485678 3 0.7226 -0.0609 0.388 0.144 0.468 0.000
#> SRR1092232 3 0.5987 0.3386 0.440 0.040 0.520 0.000
#> SRR1344253 3 0.1610 0.4099 0.032 0.016 0.952 0.000
#> SRR1384290 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1089349 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1343522 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1326727 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1440940 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR818372 1 0.7068 -0.0424 0.548 0.156 0.296 0.000
#> SRR1323675 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR819894 1 0.5905 0.1658 0.700 0.156 0.144 0.000
#> SRR1310031 3 0.4477 0.4545 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR615419 1 0.7134 -0.0581 0.532 0.156 0.312 0.000
#> SRR1436925 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1477238 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1332566 1 0.6688 0.2855 0.536 0.096 0.368 0.000
#> SRR1490228 3 0.5581 0.3647 0.448 0.020 0.532 0.000
#> SRR1442949 3 0.4877 0.4229 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1466239 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1094003 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1329971 3 0.6936 -0.0983 0.320 0.132 0.548 0.000
#> SRR813076 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1097642 4 0.0469 0.9302 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1322981 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1485976 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1471713 3 0.4746 0.4411 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR660522 3 0.4776 0.4415 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR815374 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1069564 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 3 0.4477 0.4545 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1316438 1 0.6792 -0.2172 0.476 0.096 0.428 0.000
#> SRR1386844 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1373718 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1447458 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1487128 1 0.6554 0.2738 0.540 0.084 0.376 0.000
#> SRR1441421 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1069919 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1460296 1 0.7335 0.2849 0.444 0.156 0.400 0.000
#> SRR1335489 1 0.7060 0.2923 0.476 0.124 0.400 0.000
#> SRR1393404 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1081425 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1401815 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1071337 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1071983 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1331793 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1410510 3 0.4746 0.4411 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1098761 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.4661 0.2195 0.728 0.016 0.256 0.000
#> SRR615395 3 0.0524 0.4038 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1479349 1 0.5458 0.2140 0.720 0.076 0.204 0.000
#> SRR2165033 1 0.5905 0.1658 0.700 0.156 0.144 0.000
#> SRR1089054 2 0.4500 0.9516 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR816201 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1488514 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR655840 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1379303 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1418516 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR613174 3 0.0921 0.4210 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1351125 3 0.0000 0.4076 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.6961 -0.1342 0.512 0.120 0.368 0.000
#> SRR1480408 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR657857 1 0.5396 0.1928 0.740 0.156 0.104 0.000
#> SRR1073317 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1332526 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1094168 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.6751 -0.1727 0.508 0.096 0.396 0.000
#> SRR1085614 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1330106 1 0.6240 0.1301 0.668 0.156 0.176 0.000
#> SRR1466154 3 0.7082 -0.1960 0.368 0.132 0.500 0.000
#> SRR1396944 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1082784 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1457267 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR614659 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR659247 1 0.7133 -0.1082 0.512 0.144 0.344 0.000
#> SRR1317201 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1473696 3 0.7125 -0.2251 0.392 0.132 0.476 0.000
#> SRR1375842 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1388123 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1096363 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.6159 0.1160 0.672 0.132 0.196 0.000
#> SRR1345499 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1353499 3 0.7082 -0.1960 0.368 0.132 0.500 0.000
#> SRR1416693 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1070841 3 0.4776 0.4415 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1380910 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1333125 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1498183 3 0.7547 -0.0999 0.276 0.236 0.488 0.000
#> SRR612659 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1447148 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR658597 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1376786 3 0.0469 0.4037 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1345995 3 0.3142 0.3052 0.008 0.132 0.860 0.000
#> SRR1071035 3 0.4549 0.2209 0.188 0.036 0.776 0.000
#> SRR1068808 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR662438 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1335355 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR659448 3 0.4522 0.4533 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1323558 3 0.4746 0.4411 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1381711 3 0.4522 0.4533 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR657985 3 0.4877 0.4229 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1314810 3 0.6936 -0.0983 0.320 0.132 0.548 0.000
#> SRR1336505 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1474095 3 0.6747 0.0330 0.264 0.140 0.596 0.000
#> SRR1363831 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1442376 1 0.0000 0.2132 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1075408 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1367150 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1313406 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1068880 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1467277 3 0.4477 0.4545 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1084867 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1095431 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1443113 3 0.4957 0.2107 0.112 0.112 0.776 0.000
#> SRR1380414 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1315912 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1075778 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1421116 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR602282 1 0.7134 -0.0581 0.532 0.156 0.312 0.000
#> SRR1361195 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR600493 3 0.6851 -0.1138 0.300 0.132 0.568 0.000
#> SRR1477653 3 0.3088 0.3089 0.008 0.128 0.864 0.000
#> SRR1355475 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1360785 1 0.5088 0.2486 0.688 0.024 0.288 0.000
#> SRR810437 1 0.7216 -0.0980 0.508 0.156 0.336 0.000
#> SRR1361860 1 0.5280 0.1965 0.748 0.156 0.096 0.000
#> SRR1441311 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1098903 1 0.5613 0.1941 0.724 0.156 0.120 0.000
#> SRR1457619 1 0.3266 0.1028 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1498529 1 0.7323 0.1320 0.456 0.156 0.388 0.000
#> SRR1097172 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1074017 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1472033 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1445087 1 0.6792 -0.2172 0.476 0.096 0.428 0.000
#> SRR1399525 4 0.4941 -0.3457 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1312844 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.2132 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 3 0.4477 0.4545 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1353353 1 0.7259 -0.1140 0.492 0.156 0.352 0.000
#> SRR1073291 3 0.4477 0.4545 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1356227 1 0.6677 0.2840 0.540 0.096 0.364 0.000
#> SRR1080720 2 0.5000 0.5651 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1091695 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.4549 0.1915 0.804 0.096 0.100 0.000
#> SRR663002 3 0.4746 0.4411 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1376983 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1399926 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1347144 3 0.4746 0.4411 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1384006 1 0.7227 0.2824 0.484 0.148 0.368 0.000
#> SRR1499108 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614047 3 0.4855 0.4265 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR818440 1 0.7098 -0.0512 0.536 0.152 0.312 0.000
#> SRR1337770 1 0.6780 0.1607 0.604 0.164 0.232 0.000
#> SRR1399413 3 0.4679 0.4460 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1385542 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1473959 1 0.6080 0.1507 0.684 0.156 0.160 0.000
#> SRR1074041 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1394495 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR659460 3 0.4728 0.4237 0.216 0.032 0.752 0.000
#> SRR816699 3 0.1716 0.4280 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1308612 3 0.1474 0.4270 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1499418 1 0.7169 -0.1015 0.508 0.148 0.344 0.000
#> SRR1352894 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR815805 1 0.6158 0.2482 0.560 0.056 0.384 0.000
#> SRR1331083 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 3 0.4746 0.4405 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1436698 3 0.6194 0.0422 0.200 0.132 0.668 0.000
#> SRR1095627 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1351236 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1077479 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.2132 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1436004 3 0.7082 -0.1960 0.368 0.132 0.500 0.000
#> SRR1457994 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1078998 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1314707 1 0.5339 0.1952 0.744 0.156 0.100 0.000
#> SRR1309534 1 0.3306 0.2131 0.840 0.156 0.004 0.000
#> SRR615527 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1098216 1 0.5478 0.2602 0.628 0.028 0.344 0.000
#> SRR1325847 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.5664 0.1799 0.720 0.156 0.124 0.000
#> SRR1344166 3 0.7383 -0.1218 0.388 0.164 0.448 0.000
#> SRR1368638 1 0.1406 0.2091 0.960 0.024 0.016 0.000
#> SRR1431429 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1079237 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR815759 3 0.4776 0.4415 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1502143 3 0.4697 0.4479 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1487614 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1402307 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR820810 3 0.7344 -0.1072 0.380 0.160 0.460 0.000
#> SRR1099212 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1083215 3 0.4382 0.4494 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR1476547 4 0.4967 -0.4056 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR656421 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1086116 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1499917 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1339944 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1391444 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1434889 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1431847 1 0.6792 -0.2172 0.476 0.096 0.428 0.000
#> SRR1317155 1 0.5950 0.1625 0.696 0.156 0.148 0.000
#> SRR1477405 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR655289 1 0.6162 0.1400 0.676 0.156 0.168 0.000
#> SRR1341683 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1084790 3 0.6049 0.0930 0.184 0.132 0.684 0.000
#> SRR1073731 3 0.6451 0.2882 0.456 0.068 0.476 0.000
#> SRR1332588 1 0.6037 0.1556 0.688 0.156 0.156 0.000
#> SRR1471157 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR654945 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR661028 3 0.7149 -0.2520 0.416 0.132 0.452 0.000
#> SRR1413477 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1101152 1 0.6792 -0.2158 0.476 0.096 0.428 0.000
#> SRR1358435 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.7082 0.2895 0.500 0.132 0.368 0.000
#> SRR1379014 1 0.6023 0.2664 0.600 0.056 0.344 0.000
#> SRR1489904 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1416386 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.5207 0.2506 0.680 0.028 0.292 0.000
#> SRR606982 3 0.5300 0.4136 0.408 0.012 0.580 0.000
#> SRR1358082 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1312934 1 0.6659 -0.1863 0.512 0.088 0.400 0.000
#> SRR655194 1 0.7440 0.1299 0.440 0.172 0.388 0.000
#> SRR1331174 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1473251 4 0.4564 0.1696 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1389820 4 0.5364 0.3723 0.368 0.008 0.008 0.616
#> SRR1074289 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1348816 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1076292 1 0.6968 -0.1549 0.492 0.116 0.392 0.000
#> SRR1395810 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1498909 1 0.7012 -0.0254 0.560 0.156 0.284 0.000
#> SRR1443507 3 0.1610 0.4099 0.032 0.016 0.952 0.000
#> SRR1452310 1 0.6202 0.1352 0.672 0.156 0.172 0.000
#> SRR665610 1 0.7098 -0.0639 0.536 0.152 0.312 0.000
#> SRR1347322 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR813395 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.7135 0.2936 0.468 0.132 0.400 0.000
#> SRR1470230 1 0.6792 -0.2172 0.476 0.096 0.428 0.000
#> SRR1354247 3 0.7458 -0.1291 0.380 0.176 0.444 0.000
#> SRR1082640 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1487592 3 0.0000 0.4076 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.3731 0.2874 0.036 0.120 0.844 0.000
#> SRR1076317 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 3 0.4877 0.4229 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1075273 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.7133 -0.1084 0.512 0.144 0.344 0.000
#> SRR1092773 4 0.4222 0.3956 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1365332 3 0.1022 0.4188 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR615958 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1097688 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.6792 -0.2172 0.476 0.096 0.428 0.000
#> SRR1099120 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1464856 2 0.4331 0.9934 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1347298 3 0.4855 0.4233 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1075923 4 0.0000 0.9439 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 3 0.2271 0.3534 0.008 0.076 0.916 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 4 0.1043 0.9331 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 5 0.0162 0.8073 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1329744 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR657384 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351190 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 5 0.3983 0.3048 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1396017 5 0.3684 0.5709 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1410742 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435963 1 0.3424 0.6976 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1382416 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 5 0.2891 0.6858 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1087968 2 0.0510 0.9563 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1310075 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1312244 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326821 1 0.5155 0.3574 0.596 0.000 0.352 0.000 0.052
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.2011 0.7889 0.908 0.000 0.004 0.000 0.088
#> SRR1075707 4 0.0963 0.9358 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.2648 0.7738 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1414058 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.4305 0.2576 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.3339 0.7871 0.112 0.000 0.840 0.000 0.048
#> SRR1399069 5 0.3274 0.6520 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1366450 1 0.5350 -0.0127 0.488 0.000 0.460 0.000 0.052
#> SRR1396859 1 0.2929 0.7570 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1457176 1 0.2984 0.7622 0.860 0.000 0.032 0.000 0.108
#> SRR1097666 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.2020 0.7745 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1080560 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.3003 0.7723 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1435688 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658152 5 0.2648 0.7088 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1368141 5 0.3177 0.6754 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1440268 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1453725 1 0.5056 0.3776 0.596 0.000 0.044 0.000 0.360
#> SRR1325711 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1477930 1 0.4060 0.5087 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1477591 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369052 5 0.2690 0.6868 0.156 0.000 0.000 0.000 0.844
#> SRR1377735 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.3177 0.7334 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1404531 1 0.0162 0.8162 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324331 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1458890 5 0.3177 0.6754 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.1732 0.9284 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1077263 3 0.2139 0.8371 0.032 0.000 0.916 0.000 0.052
#> SRR1385211 1 0.3366 0.7412 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR655241 5 0.4305 -0.1278 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR656922 5 0.3752 0.5269 0.292 0.000 0.000 0.000 0.708
#> SRR1361630 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318966 4 0.0794 0.9412 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1407087 3 0.0162 0.8532 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR603212 1 0.6605 0.1753 0.460 0.000 0.288 0.000 0.252
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.4210 0.2802 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1332232 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1312645 5 0.4256 0.4061 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1457835 1 0.1792 0.7995 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1347123 3 0.0579 0.8525 0.008 0.000 0.984 0.000 0.008
#> SRR1465501 4 0.0162 0.9542 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445064 5 0.3143 0.6792 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1452981 5 0.0880 0.7983 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1326708 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.2648 0.7738 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077898 1 0.0162 0.8162 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349080 3 0.5908 0.5575 0.256 0.000 0.588 0.000 0.156
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 4 0.1270 0.9211 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1375485 1 0.4629 0.5745 0.704 0.000 0.052 0.000 0.244
#> SRR1432563 2 0.0162 0.9627 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR604414 1 0.3507 0.7224 0.828 0.000 0.120 0.000 0.052
#> SRR1380614 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.1965 0.7988 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1069490 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR661613 3 0.1544 0.8432 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1420710 5 0.0703 0.8011 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR660426 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1416003 5 0.2648 0.7088 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR661064 5 0.4182 0.2281 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1082011 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1452718 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1353243 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.4030 0.5932 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1399394 1 0.6506 0.3658 0.468 0.000 0.324 0.000 0.208
#> SRR1102467 5 0.3242 0.6159 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1317470 3 0.1197 0.8472 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1337707 5 0.4307 0.0287 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1408752 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1474617 4 0.1792 0.8895 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1398013 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352918 5 0.3684 0.5709 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1420750 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 5 0.3177 0.6754 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.1671 0.8054 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1323289 3 0.0290 0.8518 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1313494 1 0.3816 0.6029 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1309985 5 0.3684 0.5709 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR607911 1 0.2732 0.7717 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1333789 3 0.1956 0.8355 0.008 0.000 0.916 0.000 0.076
#> SRR1400078 5 0.2843 0.7119 0.008 0.000 0.144 0.000 0.848
#> SRR1088631 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1092842 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 3 0.0510 0.8534 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1079434 3 0.1818 0.8436 0.024 0.000 0.932 0.000 0.044
#> SRR1325559 1 0.1792 0.7996 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1446695 3 0.3904 0.7467 0.156 0.000 0.792 0.000 0.052
#> SRR1383883 1 0.2648 0.7738 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1396100 5 0.3684 0.5709 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1475697 5 0.3353 0.7121 0.196 0.000 0.008 0.000 0.796
#> SRR1488067 4 0.4297 0.0624 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 4 0.0162 0.9541 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1410380 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.4572 0.6215 0.036 0.000 0.684 0.000 0.280
#> SRR1485812 3 0.4114 0.3782 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1078020 2 0.1410 0.9226 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0963 0.9559 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR807775 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR820427 3 0.2036 0.8386 0.024 0.000 0.920 0.000 0.056
#> SRR1100656 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.1270 0.8458 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR656794 1 0.5084 0.3998 0.616 0.000 0.332 0.000 0.052
#> SRR604653 1 0.1341 0.8164 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1317685 3 0.0963 0.8414 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1485912 1 0.5359 0.2011 0.532 0.000 0.412 0.000 0.056
#> SRR1407602 5 0.3454 0.7099 0.028 0.000 0.156 0.000 0.816
#> SRR1356164 5 0.1568 0.7972 0.036 0.000 0.020 0.000 0.944
#> SRR1328692 3 0.4287 0.1919 0.000 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1362438 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1479216 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.4060 0.5788 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1468766 3 0.6296 0.1512 0.152 0.000 0.440 0.000 0.408
#> SRR1368200 3 0.2020 0.8258 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1435602 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1501043 3 0.4114 0.3782 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1437256 5 0.3143 0.6792 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1487446 5 0.4967 0.6981 0.192 0.000 0.104 0.000 0.704
#> SRR816653 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR815164 1 0.3480 0.7245 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1442043 5 0.2230 0.7548 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR1410573 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1352369 3 0.6268 0.2744 0.156 0.000 0.484 0.000 0.360
#> SRR1382934 3 0.4015 0.4418 0.000 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1465208 1 0.3508 0.6821 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1314728 1 0.0404 0.8155 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470291 1 0.3177 0.7576 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1308756 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.3983 0.7405 0.164 0.000 0.784 0.000 0.052
#> SRR816123 4 0.0290 0.9517 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR614779 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR810783 3 0.2471 0.7996 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1333990 1 0.2648 0.7738 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1410356 3 0.3904 0.7467 0.156 0.000 0.792 0.000 0.052
#> SRR808106 1 0.6764 -0.1132 0.368 0.000 0.268 0.000 0.364
#> SRR662713 3 0.6080 0.3521 0.136 0.000 0.520 0.000 0.344
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 5 0.4060 0.3715 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR809382 3 0.3752 0.5479 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR665417 5 0.1792 0.7740 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1088016 4 0.1270 0.9211 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1453166 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1077781 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413787 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478207 3 0.0609 0.8487 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1411046 1 0.2648 0.7738 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1313711 2 0.0794 0.9579 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1326560 1 0.3480 0.6886 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1309051 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1074956 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 4 0.1197 0.9244 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR817210 5 0.5162 0.4896 0.308 0.000 0.064 0.000 0.628
#> SRR1319221 3 0.4219 0.2740 0.000 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1405413 1 0.0963 0.8108 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR607807 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1390160 3 0.0290 0.8518 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1406283 1 0.4617 0.5893 0.716 0.000 0.224 0.000 0.060
#> SRR1357709 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080742 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.2648 0.7738 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1312766 3 0.3904 0.7467 0.156 0.000 0.792 0.000 0.052
#> SRR1361612 1 0.2966 0.7541 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1311224 1 0.3409 0.7299 0.836 0.000 0.112 0.000 0.052
#> SRR1087801 5 0.3319 0.7065 0.160 0.000 0.020 0.000 0.820
#> SRR1099720 2 0.4138 0.4233 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1349250 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.2554 0.8321 0.036 0.000 0.892 0.000 0.072
#> SRR1074980 2 0.0703 0.9517 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.4238 0.6438 0.756 0.000 0.192 0.000 0.052
#> SRR1403177 1 0.7002 0.4982 0.588 0.200 0.004 0.104 0.104
#> SRR1076144 2 0.1197 0.9519 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1069614 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 5 0.4779 0.1081 0.388 0.000 0.024 0.000 0.588
#> SRR1092232 3 0.2690 0.7395 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1344253 1 0.5255 0.2585 0.560 0.000 0.388 0.000 0.052
#> SRR1384290 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1089349 3 0.1893 0.8418 0.024 0.000 0.928 0.000 0.048
#> SRR1343522 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1326727 2 0.1121 0.9534 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1440940 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818372 5 0.2377 0.7291 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1323675 2 0.0290 0.9600 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR819894 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310031 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615419 5 0.3177 0.6754 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1436925 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477238 1 0.0162 0.8163 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332566 1 0.3177 0.7329 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1490228 3 0.3752 0.5982 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1442949 3 0.1544 0.8434 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1466239 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0510 0.9610 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1329971 1 0.0162 0.8154 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 4 0.0880 0.9389 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1322981 3 0.1907 0.8420 0.028 0.000 0.928 0.000 0.044
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660522 3 0.1430 0.8454 0.004 0.000 0.944 0.000 0.052
#> SRR815374 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069564 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316438 3 0.3999 0.4504 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1386844 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1373718 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.3424 0.6970 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.1671 0.7980 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1335489 1 0.0290 0.8159 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0290 0.9600 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1071983 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098761 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.2891 0.6984 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR615395 3 0.3555 0.7803 0.124 0.000 0.824 0.000 0.052
#> SRR1479349 5 0.3039 0.6611 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR2165033 5 0.3779 0.6315 0.236 0.000 0.012 0.000 0.752
#> SRR1089054 2 0.2424 0.8410 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR816201 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488514 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR655840 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613174 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.0794 0.8493 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR659157 5 0.3876 0.5211 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1480408 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657857 5 0.1430 0.7841 0.052 0.000 0.004 0.000 0.944
#> SRR1073317 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1332526 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094168 4 0.1270 0.9211 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1431270 3 0.4114 0.3782 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1085614 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1330106 5 0.0290 0.8062 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1466154 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1396944 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614659 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659247 5 0.2891 0.6923 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1317201 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1375842 1 0.0162 0.8164 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1388123 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1096363 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 5 0.1197 0.7917 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1416693 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1070841 3 0.1270 0.8458 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1380910 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1498183 5 0.4300 -0.1957 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR612659 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 4 0.0794 0.9414 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1074263 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1376786 3 0.3944 0.7437 0.160 0.000 0.788 0.000 0.052
#> SRR1345995 1 0.4519 0.5870 0.720 0.000 0.228 0.000 0.052
#> SRR1071035 1 0.6792 0.2663 0.380 0.000 0.324 0.000 0.296
#> SRR1068808 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.2648 0.7738 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR659448 3 0.0865 0.8525 0.004 0.000 0.972 0.000 0.024
#> SRR1323558 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381711 3 0.2054 0.8383 0.028 0.000 0.920 0.000 0.052
#> SRR657985 3 0.1410 0.8440 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1314810 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474095 1 0.3878 0.6537 0.748 0.000 0.016 0.000 0.236
#> SRR1363831 2 0.0609 0.9597 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1442376 5 0.3684 0.5709 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1074909 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 3 0.5154 0.3659 0.372 0.000 0.580 0.000 0.048
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.4946 0.4556 0.648 0.000 0.300 0.000 0.052
#> SRR1380414 3 0.1197 0.8472 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1315912 1 0.1121 0.8089 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1075778 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 5 0.3177 0.6754 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1361195 2 0.1121 0.9534 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR600493 1 0.3464 0.7746 0.836 0.000 0.068 0.000 0.096
#> SRR1477653 3 0.5204 0.4204 0.368 0.000 0.580 0.000 0.052
#> SRR1355475 3 0.1661 0.8466 0.024 0.000 0.940 0.000 0.036
#> SRR1360785 1 0.3816 0.6030 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR810437 5 0.2966 0.6778 0.000 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1361860 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457619 5 0.4256 0.4061 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1498529 5 0.2230 0.7292 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1472033 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1445087 3 0.3999 0.4504 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1399525 2 0.3913 0.5550 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1312844 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 4 0.1270 0.9211 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1476056 5 0.3612 0.5886 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1075659 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353353 5 0.3534 0.6171 0.000 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1073291 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.3039 0.7472 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1080720 2 0.4045 0.4910 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1091695 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 5 0.1478 0.7840 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR663002 3 0.0162 0.8528 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1347144 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.3586 0.7127 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1499108 4 0.0162 0.9542 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR614047 3 0.0162 0.8537 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818440 5 0.5320 0.3538 0.368 0.000 0.060 0.000 0.572
#> SRR1337770 5 0.2424 0.7199 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1399413 3 0.2761 0.8174 0.024 0.000 0.872 0.000 0.104
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074041 3 0.2300 0.8334 0.040 0.000 0.908 0.000 0.052
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.6309 0.3478 0.340 0.000 0.492 0.000 0.168
#> SRR816699 3 0.1216 0.8514 0.020 0.000 0.960 0.000 0.020
#> SRR1308612 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 5 0.3707 0.5861 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.3242 0.6352 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1331083 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.4021 0.6765 0.780 0.000 0.168 0.000 0.052
#> SRR1095627 4 0.0404 0.9494 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1357672 3 0.2054 0.8383 0.028 0.000 0.920 0.000 0.052
#> SRR1351236 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814491 5 0.3684 0.5709 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1101256 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1436004 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1457994 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309534 5 0.1270 0.7830 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR615527 3 0.0290 0.8518 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1098216 1 0.3796 0.6105 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1325847 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344166 5 0.2329 0.7208 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1368638 5 0.3210 0.6665 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0880 0.9569 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR815759 3 0.1270 0.8458 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1502143 3 0.1282 0.8481 0.004 0.000 0.952 0.000 0.044
#> SRR1487614 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 5 0.2813 0.6727 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1099212 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1083215 3 0.4075 0.7427 0.160 0.000 0.780 0.000 0.060
#> SRR1476547 2 0.4138 0.4158 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR656421 1 0.2329 0.7879 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339944 2 0.0162 0.9627 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431847 3 0.4088 0.3994 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1317155 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655289 5 0.1792 0.7745 0.000 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1341683 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084790 1 0.3821 0.6966 0.800 0.000 0.148 0.000 0.052
#> SRR1073731 3 0.4243 0.6517 0.024 0.000 0.712 0.000 0.264
#> SRR1332588 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.1430 0.8454 0.004 0.000 0.944 0.000 0.052
#> SRR661028 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1413477 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1101152 3 0.4990 0.4182 0.036 0.000 0.580 0.000 0.384
#> SRR1358435 4 0.1197 0.9265 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR2165273 1 0.2690 0.7716 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1379014 5 0.4291 0.0933 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1489904 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416386 4 0.0794 0.9415 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1406048 1 0.3796 0.6107 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR606982 3 0.3909 0.7163 0.024 0.000 0.760 0.000 0.216
#> SRR1358082 1 0.0000 0.8161 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.4150 0.4412 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR655194 5 0.4045 0.2540 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1331174 2 0.1270 0.9503 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1473251 4 0.4201 0.2818 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1389820 4 0.4404 0.7686 0.000 0.016 0.104 0.788 0.092
#> SRR1074289 3 0.4159 0.7391 0.156 0.000 0.776 0.000 0.068
#> SRR1348816 2 0.1197 0.9519 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1076292 5 0.5046 0.6312 0.156 0.000 0.140 0.000 0.704
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9631 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 5 0.2605 0.7125 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1443507 3 0.5320 0.1074 0.424 0.000 0.524 0.000 0.052
#> SRR1452310 5 0.0000 0.8079 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR665610 5 0.2773 0.7030 0.000 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1347322 1 0.1270 0.8062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR813395 4 0.0963 0.9334 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1477256 1 0.0162 0.8161 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470230 5 0.5204 0.3341 0.052 0.000 0.368 0.000 0.580
#> SRR1354247 5 0.3242 0.6155 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1082640 2 0.0794 0.9488 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1487592 3 0.2690 0.7644 0.156 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.5188 0.3445 0.600 0.000 0.344 0.000 0.056
#> SRR1076317 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.1197 0.8472 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1075273 4 0.1478 0.9116 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR658657 5 0.4268 0.1035 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1092773 4 0.4291 0.0985 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1365332 3 0.2054 0.8383 0.028 0.000 0.920 0.000 0.052
#> SRR615958 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097688 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 5 0.4256 0.2234 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1099120 4 0.0000 0.9555 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.1043 0.9547 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.8535 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075923 4 0.0162 0.9542 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1100703 3 0.4602 0.6584 0.240 0.000 0.708 0.000 0.052
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 6 0.1007 0.9216 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1397949 1 0.2969 0.7307 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1355723 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR657384 4 0.0458 0.8283 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.5045 0.0761 0.076 0.000 0.000 0.512 0.412 0.000
#> SRR1396017 1 0.2762 0.7386 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1410742 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0363 0.8111 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1382416 5 0.3868 0.1387 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1391354 1 0.3823 0.2812 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.1679 0.9369 0.012 0.936 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1310075 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1312244 1 0.2178 0.7927 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1325138 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1326821 5 0.2696 0.8269 0.116 0.000 0.028 0.000 0.856 0.000
#> SRR1490178 2 0.0547 0.9497 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR655613 5 0.1141 0.8504 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1075707 6 0.1327 0.9084 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1443871 2 0.0806 0.9484 0.008 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1102489 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1414058 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.3690 0.6006 0.700 0.000 0.000 0.288 0.012 0.000
#> SRR1436858 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1479109 3 0.2378 0.7977 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1399069 4 0.3789 0.1881 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1366450 5 0.1245 0.8479 0.032 0.000 0.016 0.000 0.952 0.000
#> SRR1396859 1 0.0405 0.8122 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1457176 5 0.3596 0.6456 0.244 0.000 0.008 0.008 0.740 0.000
#> SRR1097666 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.2668 0.7736 0.828 0.000 0.000 0.004 0.168 0.000
#> SRR1080560 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 5 0.2697 0.7830 0.188 0.000 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1435688 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1327614 1 0.2527 0.7763 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR658152 4 0.0146 0.8300 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1368141 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1453725 5 0.4920 0.5735 0.036 0.000 0.044 0.260 0.660 0.000
#> SRR1325711 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1477930 1 0.3634 0.4776 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000 0.000
#> SRR1477591 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.0865 0.8230 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1369052 4 0.5348 0.3680 0.152 0.000 0.000 0.576 0.272 0.000
#> SRR1377735 1 0.2883 0.7392 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1331244 1 0.0405 0.8122 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1404531 5 0.1204 0.8495 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1324331 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1458890 4 0.0458 0.8279 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0692 0.9491 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.1501 0.9241 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1077263 3 0.1765 0.8408 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1385211 5 0.3819 0.5197 0.372 0.000 0.000 0.004 0.624 0.000
#> SRR655241 1 0.2854 0.7090 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR656922 4 0.4799 0.2864 0.340 0.000 0.000 0.592 0.068 0.000
#> SRR1361630 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318966 6 0.0713 0.9322 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1407087 3 0.0632 0.8731 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR603212 5 0.1053 0.8432 0.012 0.000 0.004 0.020 0.964 0.000
#> SRR1321088 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1485190 4 0.3797 0.3073 0.000 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1312645 1 0.3575 0.7715 0.796 0.000 0.000 0.128 0.076 0.000
#> SRR1457835 1 0.3411 0.7193 0.756 0.000 0.004 0.008 0.232 0.000
#> SRR1347123 3 0.0363 0.8787 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465501 6 0.0146 0.9463 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1330878 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445064 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452981 4 0.2260 0.7477 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1326708 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1407157 5 0.3864 0.3681 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1365401 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077898 5 0.2092 0.8025 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1349080 3 0.6110 0.4128 0.028 0.000 0.512 0.156 0.304 0.000
#> SRR1076096 2 0.0692 0.9492 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR811261 6 0.1542 0.9045 0.008 0.052 0.000 0.000 0.004 0.936
#> SRR1375485 5 0.2964 0.7137 0.204 0.000 0.000 0.004 0.792 0.000
#> SRR1432563 2 0.0146 0.9505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR604414 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1380614 1 0.2883 0.7392 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR812060 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602082 5 0.2300 0.8187 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1069490 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR661613 3 0.0520 0.8790 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1420710 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660426 5 0.2003 0.8332 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1416003 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661064 1 0.1075 0.8000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1452718 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1353243 1 0.2941 0.7337 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1455482 1 0.2969 0.7307 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1313473 5 0.5058 0.6225 0.164 0.000 0.000 0.200 0.636 0.000
#> SRR1399394 3 0.5105 0.5986 0.088 0.000 0.660 0.024 0.228 0.000
#> SRR1102467 4 0.5431 0.2443 0.132 0.000 0.000 0.524 0.344 0.000
#> SRR1317470 3 0.0260 0.8796 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1337707 4 0.3789 0.3171 0.000 0.000 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1474617 6 0.1765 0.8658 0.000 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1398013 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.2527 0.7573 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1420750 5 0.2048 0.8057 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1071785 4 0.1663 0.7959 0.000 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.1049 0.9458 0.008 0.960 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1082217 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.2527 0.7748 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1355684 1 0.3309 0.5518 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1323289 3 0.0146 0.8791 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.1714 0.7909 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.2135 0.7677 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR607911 5 0.3101 0.7332 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756 0.000
#> SRR1333789 3 0.2136 0.8502 0.000 0.000 0.904 0.048 0.048 0.000
#> SRR1400078 4 0.2178 0.7418 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1092842 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079434 3 0.1501 0.8422 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.2933 0.7513 0.796 0.000 0.000 0.004 0.200 0.000
#> SRR1446695 3 0.2762 0.7532 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1383883 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1396100 1 0.2912 0.7216 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1475697 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488067 6 0.3862 0.0419 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1102103 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1105154 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 6 0.0146 0.9461 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1410380 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0547 0.9497 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1454671 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1435044 3 0.6261 0.3077 0.116 0.000 0.504 0.324 0.056 0.000
#> SRR1485812 4 0.3864 0.1339 0.000 0.000 0.480 0.520 0.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.2414 0.9073 0.012 0.896 0.000 0.000 0.036 0.056
#> SRR1311153 5 0.2092 0.8302 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1376406 2 0.0865 0.9459 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1343898 3 0.0363 0.8766 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR807775 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR820427 3 0.1714 0.8430 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1100656 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.3563 0.4524 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1414536 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656794 5 0.1408 0.8466 0.036 0.000 0.020 0.000 0.944 0.000
#> SRR604653 5 0.2135 0.8280 0.128 0.000 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1317685 3 0.0937 0.8612 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1485912 3 0.3934 0.7782 0.036 0.000 0.796 0.052 0.116 0.000
#> SRR1407602 4 0.0777 0.8239 0.024 0.000 0.004 0.972 0.000 0.000
#> SRR1356164 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 4 0.3706 0.3360 0.000 0.000 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR1362438 5 0.0937 0.8515 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1479216 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.3586 0.6279 0.720 0.000 0.000 0.268 0.012 0.000
#> SRR1468766 3 0.4589 0.0873 0.000 0.000 0.504 0.460 0.036 0.000
#> SRR1368200 3 0.1814 0.8254 0.000 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1501043 4 0.3866 0.1249 0.000 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1437256 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487446 4 0.3868 -0.0963 0.496 0.000 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR816653 5 0.3866 0.0620 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516 0.000
#> SRR815164 5 0.3930 0.3011 0.420 0.000 0.000 0.004 0.576 0.000
#> SRR1442043 4 0.3198 0.5835 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.2300 0.7899 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1096782 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1352369 4 0.5844 0.1345 0.000 0.000 0.344 0.456 0.200 0.000
#> SRR1382934 4 0.3866 0.1252 0.000 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.2070 0.8077 0.908 0.000 0.000 0.048 0.044 0.000
#> SRR1314728 1 0.2697 0.7599 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1470291 5 0.3198 0.7202 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1308756 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.3221 0.6779 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR816123 6 0.0260 0.9434 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR614779 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810783 3 0.2668 0.7538 0.000 0.000 0.828 0.168 0.004 0.000
#> SRR1333990 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1410356 5 0.1444 0.8114 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR808106 5 0.1245 0.8319 0.000 0.000 0.016 0.032 0.952 0.000
#> SRR662713 3 0.4550 0.2121 0.000 0.000 0.544 0.420 0.036 0.000
#> SRR1447058 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1480964 4 0.2793 0.6818 0.000 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR809382 3 0.3789 0.2020 0.000 0.000 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR665417 4 0.3327 0.7380 0.088 0.000 0.000 0.820 0.092 0.000
#> SRR1088016 6 0.1141 0.9103 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1453166 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1077781 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR615623 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413787 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478207 3 0.0937 0.8650 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1313711 2 0.0713 0.9475 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1326560 1 0.0405 0.8118 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1309051 5 0.2003 0.8332 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1486949 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1395616 1 0.1714 0.7686 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1074956 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 6 0.1075 0.9138 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR817210 4 0.0777 0.8222 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR1319221 4 0.3828 0.2592 0.000 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.2805 0.7618 0.812 0.000 0.000 0.004 0.184 0.000
#> SRR607807 1 0.3290 0.5734 0.744 0.000 0.000 0.004 0.252 0.000
#> SRR1390160 3 0.0146 0.8791 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1406283 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1357709 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1080742 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1312766 3 0.3854 0.2629 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1361612 1 0.1411 0.8118 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060 0.000
#> SRR1311224 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1087801 4 0.3737 0.3540 0.000 0.000 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1099720 2 0.3607 0.5017 0.000 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1349250 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1357127 3 0.2837 0.8312 0.000 0.000 0.856 0.056 0.088 0.000
#> SRR1074980 2 0.1767 0.9348 0.012 0.932 0.000 0.000 0.036 0.020
#> SRR1317022 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332879 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1403177 5 0.6970 0.4676 0.196 0.168 0.000 0.016 0.524 0.096
#> SRR1076144 2 0.1075 0.9422 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1069614 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 5 0.2003 0.8332 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1485678 4 0.2265 0.7929 0.076 0.000 0.004 0.896 0.024 0.000
#> SRR1092232 3 0.2854 0.6690 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR1344253 3 0.5992 0.5383 0.036 0.000 0.576 0.192 0.196 0.000
#> SRR1384290 5 0.3101 0.7332 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756 0.000
#> SRR1089349 3 0.0458 0.8779 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1343522 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1326727 2 0.1007 0.9435 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1440940 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818372 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.1483 0.9406 0.012 0.944 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR819894 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1310031 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615419 4 0.0146 0.8301 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1436925 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.1204 0.8051 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1332566 1 0.0405 0.8122 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1490228 3 0.3563 0.4943 0.000 0.000 0.664 0.336 0.000 0.000
#> SRR1442949 3 0.1908 0.8473 0.028 0.000 0.916 0.056 0.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.1957 0.8000 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1094003 2 0.0458 0.9504 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1329971 5 0.2219 0.7979 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR813076 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1097642 6 0.1204 0.9150 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1322981 3 0.1663 0.8452 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660522 3 0.1588 0.8551 0.000 0.000 0.924 0.004 0.072 0.000
#> SRR815374 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316438 4 0.3867 0.1115 0.000 0.000 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1373718 1 0.1556 0.7827 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.1913 0.8060 0.908 0.000 0.000 0.012 0.080 0.000
#> SRR1441421 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 5 0.2915 0.7418 0.184 0.000 0.000 0.008 0.808 0.000
#> SRR1335489 1 0.2491 0.7771 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1393404 2 0.1124 0.9448 0.008 0.956 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1081425 5 0.2003 0.8332 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1401815 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.1483 0.9406 0.012 0.944 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1071983 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098761 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.2907 0.7799 0.828 0.000 0.000 0.020 0.152 0.000
#> SRR615395 5 0.2135 0.7683 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1479349 4 0.3774 0.2143 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000 0.000
#> SRR2165033 4 0.2793 0.6642 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.3364 0.8219 0.012 0.820 0.000 0.000 0.036 0.132
#> SRR816201 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR655840 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.2178 0.7927 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1418516 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613174 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.1007 0.8702 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR659157 4 0.2416 0.7518 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1480408 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.0547 0.8275 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1332526 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.1141 0.9103 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1431270 4 0.3866 0.1249 0.000 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1330106 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466154 5 0.2003 0.8332 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1396944 1 0.3636 0.4396 0.676 0.000 0.000 0.004 0.320 0.000
#> SRR1082784 2 0.0458 0.9501 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1457267 1 0.1204 0.8047 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR614659 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR659247 4 0.0547 0.8280 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.2178 0.7927 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1473696 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1375842 5 0.2048 0.8317 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1388123 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1096363 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 4 0.2308 0.7957 0.040 0.000 0.068 0.892 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0692 0.9491 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1353499 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1416693 1 0.0458 0.8114 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1070841 3 0.0146 0.8801 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.3244 0.6147 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1333125 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1498183 5 0.3469 0.7746 0.104 0.000 0.000 0.088 0.808 0.000
#> SRR612659 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR658597 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 6 0.1204 0.9152 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1074263 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1376786 5 0.1387 0.8136 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1345995 5 0.2294 0.8105 0.036 0.000 0.072 0.000 0.892 0.000
#> SRR1071035 5 0.2657 0.8292 0.076 0.000 0.020 0.024 0.880 0.000
#> SRR1068808 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR662438 5 0.2048 0.8057 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1335355 5 0.3823 0.4046 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR659448 3 0.0713 0.8751 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1323558 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381711 3 0.1663 0.8452 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR657985 3 0.1663 0.8321 0.000 0.000 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.2883 0.7392 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1336505 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.6649 0.4965 0.532 0.000 0.116 0.144 0.208 0.000
#> SRR1363831 2 0.0547 0.9489 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1442376 1 0.3620 0.4789 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR1074909 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 5 0.1498 0.8414 0.032 0.000 0.028 0.000 0.940 0.000
#> SRR1075408 2 0.0806 0.9484 0.008 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1367150 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1068880 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1467277 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1095431 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.0260 0.9505 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1443113 5 0.0935 0.8503 0.032 0.000 0.004 0.000 0.964 0.000
#> SRR1380414 3 0.0713 0.8751 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1315912 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1075778 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 4 0.1444 0.8042 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.1007 0.9436 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR600493 5 0.1141 0.8504 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1477653 3 0.3982 0.2666 0.004 0.000 0.536 0.000 0.460 0.000
#> SRR1355475 3 0.1075 0.8677 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1360785 1 0.1714 0.7909 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR810437 4 0.0260 0.8297 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1361860 4 0.0146 0.8303 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0547 0.9497 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1098903 4 0.1863 0.7808 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.3578 0.7712 0.784 0.000 0.000 0.052 0.164 0.000
#> SRR1498529 4 0.1910 0.7778 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0547 0.9497 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1074017 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1472033 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1445087 4 0.3866 0.1247 0.000 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.3515 0.5646 0.000 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1312844 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 6 0.1644 0.9024 0.012 0.052 0.000 0.000 0.004 0.932
#> SRR1476056 1 0.3828 0.2829 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1075659 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353353 4 0.1863 0.7884 0.000 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR1073291 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0405 0.8122 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1080720 2 0.3515 0.5549 0.000 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1091695 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 4 0.3244 0.5665 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR663002 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0547 0.9497 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1399926 1 0.0363 0.8120 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1347144 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384006 5 0.3649 0.7440 0.196 0.000 0.000 0.040 0.764 0.000
#> SRR1499108 6 0.0146 0.9463 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR614047 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818440 4 0.4483 0.6505 0.032 0.000 0.200 0.724 0.044 0.000
#> SRR1337770 4 0.1682 0.8103 0.052 0.000 0.000 0.928 0.020 0.000
#> SRR1399413 3 0.5004 0.3737 0.000 0.000 0.568 0.084 0.348 0.000
#> SRR1385542 2 0.0692 0.9491 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1473959 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.3747 0.4173 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1394495 2 0.0547 0.9497 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR659460 3 0.5505 0.6125 0.024 0.000 0.628 0.148 0.200 0.000
#> SRR816699 3 0.1501 0.8528 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1308612 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 4 0.2969 0.6951 0.000 0.000 0.224 0.776 0.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.0692 0.9491 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR815805 1 0.5472 0.3972 0.504 0.000 0.000 0.132 0.364 0.000
#> SRR1331083 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436698 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1095627 6 0.0363 0.9409 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1357672 3 0.1814 0.8395 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1351236 5 0.0937 0.8514 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1077479 5 0.2003 0.8332 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR814491 1 0.2562 0.7551 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1436004 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1457994 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1078998 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1314707 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1309534 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 3 0.0146 0.8791 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.3488 0.6473 0.780 0.000 0.000 0.036 0.184 0.000
#> SRR1325847 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1344166 4 0.4350 0.4599 0.048 0.000 0.000 0.660 0.292 0.000
#> SRR1368638 1 0.3868 0.1031 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1079237 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.1334 0.9490 0.000 0.948 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR815759 3 0.0458 0.8761 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1502143 3 0.1444 0.8549 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1487614 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0806 0.9486 0.008 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR820810 5 0.4819 0.2058 0.056 0.000 0.000 0.416 0.528 0.000
#> SRR1099212 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1083215 3 0.2883 0.7385 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1476547 2 0.3695 0.4242 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR656421 1 0.0458 0.8121 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1086116 2 0.1225 0.9434 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1499917 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.0146 0.9505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.0937 0.8217 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1431847 4 0.3828 0.2550 0.000 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000
#> SRR1317155 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 5 0.2178 0.8268 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR655289 4 0.2912 0.7833 0.076 0.000 0.072 0.852 0.000 0.000
#> SRR1341683 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084790 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1073731 3 0.3659 0.4237 0.000 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1332588 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.0547 0.9497 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR654945 3 0.1444 0.8549 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR661028 5 0.0865 0.8511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1413477 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1101152 3 0.5136 0.1500 0.000 0.000 0.496 0.420 0.084 0.000
#> SRR1358435 6 0.1501 0.8977 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR2165273 1 0.1556 0.7841 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1379014 1 0.3050 0.6743 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416386 6 0.0865 0.9279 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1406048 1 0.0363 0.8111 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.4002 0.5263 0.000 0.000 0.660 0.320 0.020 0.000
#> SRR1358082 1 0.3797 0.4308 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1312934 3 0.3774 0.2514 0.000 0.000 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR655194 4 0.2996 0.6637 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.1141 0.9407 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1473251 6 0.3789 0.2770 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1389820 6 0.5058 0.6433 0.000 0.032 0.100 0.180 0.000 0.688
#> SRR1074289 5 0.3101 0.5987 0.000 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1348816 2 0.1075 0.9423 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1076292 4 0.3530 0.7002 0.000 0.000 0.056 0.792 0.152 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9504 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443507 3 0.2560 0.8171 0.036 0.000 0.872 0.000 0.092 0.000
#> SRR1452310 4 0.0000 0.8307 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 4 0.1387 0.8061 0.000 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1347322 5 0.2883 0.7050 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR813395 6 0.0865 0.9236 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1477256 1 0.3592 0.5512 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344 0.000
#> SRR1470230 4 0.2883 0.6905 0.000 0.000 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1354247 5 0.4148 0.6876 0.108 0.000 0.000 0.148 0.744 0.000
#> SRR1082640 2 0.1930 0.9292 0.012 0.924 0.000 0.000 0.036 0.028
#> SRR1487592 3 0.2793 0.7498 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1352299 5 0.0935 0.8503 0.032 0.000 0.004 0.000 0.964 0.000
#> SRR1076317 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075273 6 0.1327 0.9039 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR658657 4 0.3464 0.5082 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR1092773 6 0.3847 0.1316 0.000 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR1365332 3 0.1663 0.8452 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR615958 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097688 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 4 0.2631 0.7164 0.000 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1099120 6 0.0000 0.9477 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0937 0.9447 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1347298 3 0.0000 0.8804 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075923 6 0.0146 0.9463 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1100703 3 0.3221 0.6801 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4322 0.568 0.568
#> 3 3 0.991 0.962 0.975 0.1055 0.966 0.939
#> 4 4 0.615 0.552 0.727 0.2614 0.807 0.639
#> 5 5 0.531 0.574 0.714 0.1728 0.744 0.435
#> 6 6 0.521 0.481 0.670 0.0902 0.850 0.541
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 1 0 1 1 0
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 1 0 1 1 0
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 1 0 1 1 0
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 1 0 1 1 0
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 1 0 1 1 0
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436370 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1397949 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1329744 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR657384 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351190 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1458662 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1396017 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1410742 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1435963 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1382416 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1087968 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312244 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1325138 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1326821 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1443871 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1465758 1 0.4605 0.699 0.796 0.000 0.204
#> SRR1414058 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436858 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1366450 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1457176 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1434736 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1322882 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0237 0.967 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327614 1 0.1643 0.941 0.956 0.000 0.044
#> SRR658152 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1368141 1 0.1643 0.956 0.956 0.000 0.044
#> SRR1440268 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1453725 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1477591 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1369052 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1377735 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1404531 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1458890 1 0.1289 0.968 0.968 0.000 0.032
#> SRR1432695 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.1753 0.956 0.000 0.952 0.048
#> SRR1077263 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR656922 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361630 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1407087 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.0424 0.977 0.992 0.000 0.008
#> SRR1332232 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1457835 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1465501 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1330878 1 0.1860 0.932 0.948 0.000 0.052
#> SRR1445064 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1452981 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1326708 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077898 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1375485 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.5882 0.345 0.652 0.000 0.348
#> SRR812060 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1078417 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR660426 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR661064 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082011 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1317470 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1408752 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.2878 0.948 0.096 0.000 0.904
#> SRR1398013 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1352918 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1420750 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.1031 0.974 0.976 0.000 0.024
#> SRR1353618 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1366560 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.2878 0.948 0.096 0.000 0.904
#> SRR1313494 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1309985 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR607911 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1088631 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR615575 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1325559 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.3619 0.816 0.864 0.000 0.136
#> SRR1396100 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1475697 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488067 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1102103 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1084991 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1410380 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1485812 1 0.0747 0.970 0.984 0.000 0.016
#> SRR1078020 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.3038 0.951 0.104 0.000 0.896
#> SRR807775 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1362159 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR656794 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.1031 0.963 0.976 0.000 0.024
#> SRR1485912 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.1860 0.948 0.948 0.000 0.052
#> SRR1356164 3 0.4555 0.860 0.200 0.000 0.800
#> SRR1328692 1 0.5431 0.527 0.716 0.000 0.284
#> SRR1362438 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1468766 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.3116 0.951 0.108 0.000 0.892
#> SRR1437256 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1487446 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR816653 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1442043 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1410573 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.6295 -0.126 0.528 0.000 0.472
#> SRR1465208 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1314728 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR816123 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR614779 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1410356 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.2878 0.874 0.904 0.000 0.096
#> SRR662713 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR665417 1 0.2356 0.907 0.928 0.000 0.072
#> SRR1088016 2 0.2356 0.950 0.000 0.928 0.072
#> SRR1453166 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1069826 2 0.0592 0.965 0.000 0.988 0.012
#> SRR1077781 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 1 0.2261 0.913 0.932 0.000 0.068
#> SRR1413787 1 0.1643 0.941 0.956 0.000 0.044
#> SRR1478207 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1313711 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1309051 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074956 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1092961 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR817210 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319221 3 0.2878 0.948 0.096 0.000 0.904
#> SRR1405413 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR607807 3 0.5760 0.675 0.328 0.000 0.672
#> SRR1390160 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1406283 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1080742 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1468208 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312766 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1311224 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.1529 0.958 0.000 0.960 0.040
#> SRR1349250 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1350912 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1332879 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.2878 0.948 0.096 0.000 0.904
#> SRR1076144 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR818239 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1421069 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1500006 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1092232 1 0.5926 0.332 0.644 0.000 0.356
#> SRR1344253 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR818372 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1323675 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1310031 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR615419 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436925 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1477238 1 0.1411 0.950 0.964 0.000 0.036
#> SRR1332566 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1490228 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1466239 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1322981 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1069564 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1416337 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316438 3 0.3482 0.935 0.128 0.000 0.872
#> SRR1386844 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1373718 1 0.1289 0.954 0.968 0.000 0.032
#> SRR1447458 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1441421 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1393404 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.5926 0.327 0.644 0.000 0.356
#> SRR1071337 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0424 0.966 0.000 0.992 0.008
#> SRR1331793 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1312124 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR615395 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR2165033 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1089054 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488514 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1379303 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1418516 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR613174 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1480408 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR657857 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1073317 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1094168 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1431270 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1085614 2 0.0237 0.967 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330106 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1466154 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.5216 0.585 0.740 0.000 0.260
#> SRR1082784 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR659247 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1317201 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1473696 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1453662 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1345499 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.1031 0.962 0.976 0.000 0.024
#> SRR1070841 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1089595 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1074263 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1332754 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1474095 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074909 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1101200 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1313406 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1380184 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.3192 0.949 0.112 0.000 0.888
#> SRR1361195 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR810437 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361860 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1441311 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1457619 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1498529 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1097172 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.1643 0.957 0.000 0.956 0.044
#> SRR1472033 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.2959 0.871 0.900 0.000 0.100
#> SRR1399525 2 0.1529 0.958 0.000 0.960 0.040
#> SRR1312844 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1085874 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1101226 2 0.4062 0.880 0.000 0.836 0.164
#> SRR1476056 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1075659 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1311916 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353353 3 0.3116 0.951 0.108 0.000 0.892
#> SRR1073291 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1080720 2 0.2625 0.946 0.000 0.916 0.084
#> SRR1091695 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1350304 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR663002 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1347144 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1499108 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR614047 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1337770 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1399413 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074041 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1352894 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR808272 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1357672 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1101256 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1309534 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR615527 3 0.3038 0.951 0.104 0.000 0.896
#> SRR1098216 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1325847 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1404003 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1344166 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1368638 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1431429 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1080509 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.1643 0.941 0.956 0.000 0.044
#> SRR1402307 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1099212 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR656421 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1086116 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1339944 2 0.3941 0.843 0.000 0.844 0.156
#> SRR1391444 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1431847 1 0.0892 0.977 0.980 0.000 0.020
#> SRR1317155 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1477405 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1341683 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1084790 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1332588 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1471157 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358435 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR2165273 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1379014 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1489904 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1406048 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR606982 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331174 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1389820 3 0.2878 0.948 0.096 0.000 0.904
#> SRR1074289 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1395810 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1443507 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR665610 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1347322 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1477256 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1354247 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082640 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1434117 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR658657 1 0.0747 0.979 0.984 0.000 0.016
#> SRR1092773 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1365332 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1403259 1 0.1163 0.971 0.972 0.000 0.028
#> SRR1099120 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1362200 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.0424 0.977 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075923 2 0.2711 0.945 0.000 0.912 0.088
#> SRR1100703 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 3 0.4933 0.825214 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1397949 1 0.4661 0.345425 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1355723 3 0.5097 0.818311 0.428 0.000 0.568 0.004
#> SRR1329744 1 0.4941 0.079703 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR657384 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1351190 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 3 0.4992 0.686512 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR1396017 1 0.4999 -0.370756 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1410742 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1435963 3 0.4967 0.599477 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1382416 3 0.4985 -0.175588 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1391354 3 0.4925 0.820873 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1087968 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1310075 1 0.4888 0.206024 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1312244 1 0.4907 -0.000324 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1325138 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1326821 1 0.4134 0.455252 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1490178 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655613 1 0.4624 0.389073 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1075707 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1443871 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102489 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1465758 1 0.5613 0.261881 0.592 0.000 0.380 0.028
#> SRR1414058 1 0.2081 0.420777 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1407449 3 0.4994 0.501209 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1436858 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479109 1 0.0188 0.476409 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399069 3 0.4916 0.809183 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1366450 1 0.3688 0.496182 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1396859 3 0.4898 0.739418 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1457176 1 0.4103 0.477639 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1097666 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1434736 1 0.4978 0.116789 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR1080560 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1322882 1 0.4072 0.479290 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1435688 2 0.1022 0.835200 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1327614 1 0.5016 0.268990 0.600 0.000 0.396 0.004
#> SRR658152 3 0.4916 0.810476 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1368141 3 0.6120 0.662716 0.432 0.000 0.520 0.048
#> SRR1440268 1 0.4898 0.188330 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1453725 1 0.4697 0.342193 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1325711 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1477930 3 0.4933 0.813780 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1477591 1 0.3837 0.492189 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1416049 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR656275 3 0.4933 0.825214 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1369052 3 0.4941 0.805544 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1377735 1 0.4564 0.405953 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1331244 3 0.4941 0.726306 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1404531 1 0.4746 0.339074 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1324331 1 0.4955 0.025952 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1458890 3 0.5558 0.738718 0.432 0.000 0.548 0.020
#> SRR1432695 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1407624 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.2408 0.397107 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1087393 2 0.3400 0.781416 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1077263 1 0.3688 0.472118 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1385211 1 0.4817 0.283983 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR655241 3 0.4948 0.639279 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR656922 3 0.4948 0.809648 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1361630 1 0.1118 0.463210 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1318966 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1407087 1 0.2281 0.471203 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR603212 1 0.4477 0.415870 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1321088 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485190 1 0.3975 0.278842 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1457835 1 0.4643 0.353559 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1347123 1 0.2408 0.397107 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1465501 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1330878 1 0.2737 0.390250 0.888 0.000 0.104 0.008
#> SRR1445064 3 0.4925 0.807681 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1452981 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1326708 1 0.4746 0.348411 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1407157 1 0.4817 0.296815 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1365401 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1397697 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.4907 0.822787 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1077898 1 0.4543 0.410897 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1349080 1 0.4643 0.272511 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1076096 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR811261 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1375485 1 0.4661 0.305233 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.3801 0.493284 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1380614 3 0.6873 -0.202181 0.252 0.000 0.588 0.160
#> SRR812060 1 0.0188 0.478366 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR602082 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1069490 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1078417 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR661613 1 0.4304 0.387728 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1420710 3 0.4933 0.825214 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR660426 1 0.4624 0.395097 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1416003 3 0.4933 0.825214 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR661064 3 0.4916 0.815676 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1082011 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452718 3 0.4992 -0.183508 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR1353243 1 0.4746 0.339074 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1455482 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1313473 1 0.4790 0.320007 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1399394 1 0.4564 0.328093 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1102467 3 0.4985 0.687567 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1317470 1 0.0921 0.467806 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1337707 3 0.4916 0.800947 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1408752 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1474617 4 0.4790 0.903076 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1398013 3 0.4907 0.821634 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1352918 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1420750 1 0.3649 0.498215 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1071785 3 0.4948 0.761954 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1353618 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082217 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357256 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1366560 1 0.4843 0.270009 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1355684 1 0.4817 0.296815 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1323289 4 0.4790 0.903076 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1313494 3 0.4907 0.820617 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1309985 3 0.4916 0.826226 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR607911 1 0.4830 0.283920 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1333789 1 0.2011 0.496516 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1400078 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1088631 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1092842 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR615575 1 0.0469 0.474540 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1079434 1 0.4967 -0.286422 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1325559 1 0.4730 0.262279 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1446695 1 0.3172 0.485724 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1383883 1 0.4866 0.239373 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1396100 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1475697 3 0.4916 0.800947 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1488067 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1102103 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1105154 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1084991 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1410380 1 0.1022 0.465365 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435044 3 0.4933 0.825285 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1485812 1 0.4941 -0.199506 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1078020 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311153 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 4 0.5550 0.884597 0.020 0.000 0.428 0.552
#> SRR807775 1 0.1867 0.433773 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1409215 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR820427 1 0.4661 0.263733 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1100656 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1362159 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1414536 1 0.0921 0.472207 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR656794 1 0.3610 0.498079 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR604653 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1317685 1 0.4933 -0.163085 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1485912 1 0.4454 0.345893 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1407602 3 0.5459 0.770098 0.432 0.000 0.552 0.016
#> SRR1356164 3 0.6773 -0.703248 0.108 0.000 0.544 0.348
#> SRR1328692 3 0.6722 -0.061705 0.408 0.000 0.500 0.092
#> SRR1362438 1 0.4277 0.457102 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1479216 1 0.2081 0.421795 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1358041 3 0.4961 0.659632 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1468766 1 0.1474 0.482722 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1368200 1 0.4746 0.178405 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1435602 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1501043 4 0.5508 0.897482 0.020 0.000 0.408 0.572
#> SRR1437256 3 0.4898 0.810139 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1487446 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR816653 1 0.4477 0.403485 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR815164 1 0.4933 -0.178942 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1442043 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1410573 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1096782 2 0.0592 0.839280 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1352369 1 0.2469 0.468412 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1382934 1 0.6547 0.142547 0.616 0.000 0.124 0.260
#> SRR1465208 3 0.4996 0.424845 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1314728 1 0.4804 0.259523 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1470291 1 0.4830 0.283679 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1308756 1 0.1211 0.460612 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1409600 1 0.2216 0.499178 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR816123 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR614779 1 0.0921 0.472207 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR810783 1 0.3569 0.480172 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1333990 1 0.4948 0.053372 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1410356 1 0.1302 0.491720 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR808106 1 0.5483 0.230037 0.536 0.000 0.448 0.016
#> SRR662713 1 0.3266 0.487905 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1447058 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480964 1 0.4855 -0.029283 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR809382 1 0.4898 -0.128840 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR665417 1 0.6121 0.150835 0.552 0.000 0.396 0.052
#> SRR1088016 2 0.4250 0.743323 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1453166 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1069826 2 0.1716 0.824596 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1077781 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR615623 1 0.2867 0.386652 0.884 0.000 0.104 0.012
#> SRR1413787 1 0.2737 0.390250 0.888 0.000 0.104 0.008
#> SRR1478207 1 0.3942 0.320874 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1411046 1 0.4888 0.206024 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4967 -0.031058 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1309051 1 0.4431 0.434741 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1486949 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1395616 1 0.4907 0.170343 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1074956 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1092961 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR817210 1 0.4500 0.297739 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1319221 4 0.4790 0.903076 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1405413 1 0.4843 0.063569 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR607807 3 0.7117 -0.526959 0.180 0.000 0.556 0.264
#> SRR1390160 1 0.2408 0.397107 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1406283 1 0.4008 0.483809 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1357709 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1080742 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1468208 1 0.4972 0.178157 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1312766 1 0.0188 0.476486 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1361612 3 0.4907 0.820617 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1311224 1 0.3975 0.485637 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1087801 1 0.4406 0.381880 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1099720 2 0.3486 0.778085 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1349250 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1350912 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357127 1 0.4477 0.309385 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1074980 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317022 1 0.2408 0.397107 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1332879 1 0.3649 0.497343 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1403177 4 0.4790 0.903076 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1076144 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1069614 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR818239 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1421069 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1500006 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1485678 1 0.4994 -0.503338 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1092232 1 0.7044 0.031381 0.452 0.000 0.120 0.428
#> SRR1344253 1 0.3528 0.465270 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1384290 1 0.4817 0.296815 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1089349 1 0.2216 0.499003 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1343522 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1326727 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1440940 3 0.4907 0.816571 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR818372 3 0.4941 0.821252 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1323675 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819894 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1310031 1 0.1940 0.428687 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR615419 3 0.4898 0.810139 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1436925 3 0.4933 0.825297 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1477238 1 0.4855 0.254248 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1332566 3 0.4967 0.699458 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1490228 1 0.4866 -0.095390 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1442949 1 0.4996 -0.505972 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1466239 1 0.4888 0.207016 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1094003 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1329971 1 0.3942 0.487743 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.4804 0.692589 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1322981 1 0.0188 0.476486 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.1557 0.448706 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR660522 1 0.1022 0.465365 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR815374 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1069564 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1416337 1 0.0707 0.471647 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1316438 3 0.6607 -0.822898 0.080 0.000 0.476 0.444
#> SRR1386844 1 0.4925 0.128347 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1373718 1 0.4866 0.239373 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.4898 0.169258 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1441421 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069919 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1460296 1 0.4776 0.330640 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1335489 1 0.4877 0.205770 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1393404 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081425 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1401815 1 0.4746 0.203449 0.688 0.000 0.304 0.008
#> SRR1071337 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071983 2 0.1022 0.835242 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1331793 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.2081 0.420790 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1098761 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1312124 3 0.4907 0.811959 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR615395 1 0.3123 0.501177 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1479349 3 0.4898 0.759709 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR2165033 1 0.4996 -0.521700 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1089054 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR816201 3 0.4933 0.825214 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1488514 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR655840 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1379303 1 0.4877 0.223285 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1418516 3 0.4898 0.815380 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR613174 1 0.0188 0.476409 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351125 1 0.0188 0.476486 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659157 3 0.4898 0.810139 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1480408 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR657857 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1073317 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1332526 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1094168 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1431270 3 0.4916 0.815258 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1085614 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1330106 3 0.4916 0.810885 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1466154 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1396944 1 0.5172 0.238592 0.588 0.000 0.404 0.008
#> SRR1082784 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.4817 0.296815 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR614659 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR659247 1 0.4925 -0.173464 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1317201 1 0.4916 0.146814 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1473696 1 0.3688 0.496477 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1375842 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1388123 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096363 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1453662 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1345499 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353499 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1416693 1 0.4866 0.239373 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1070841 1 0.3356 0.483061 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1380910 1 0.4804 0.308602 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1333125 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498183 1 0.4697 0.340710 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR612659 1 0.1557 0.448684 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1447148 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658597 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1089595 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1074263 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1376786 1 0.1474 0.491169 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1345995 1 0.3610 0.498108 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1071035 1 0.4164 0.452087 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1068808 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1332754 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662438 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1335355 1 0.4817 0.296815 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR659448 1 0.0592 0.473368 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1323558 1 0.1211 0.460472 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1381711 1 0.2011 0.477866 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR657985 1 0.1118 0.462701 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1314810 1 0.4477 0.415544 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1336505 3 0.4994 0.684118 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1474095 1 0.4585 0.287493 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1074909 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1101200 1 0.1867 0.496106 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1075408 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367150 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1313406 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1068880 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1467277 1 0.2868 0.451873 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1084867 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095431 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1380184 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.3873 0.486264 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1380414 1 0.0188 0.476409 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1315912 1 0.4543 0.411708 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1075778 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1421116 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR602282 4 0.5352 0.900838 0.016 0.000 0.388 0.596
#> SRR1361195 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR600493 1 0.3801 0.493755 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1477653 1 0.0921 0.474451 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1355475 1 0.0469 0.474540 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1360785 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR810437 3 0.4955 0.769590 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1361860 3 0.4981 0.648081 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1457619 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1498529 3 0.4925 0.820873 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3266 0.786037 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1472033 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1445087 1 0.4678 0.295895 0.744 0.000 0.232 0.024
#> SRR1399525 2 0.3610 0.770179 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1312844 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1085874 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1101226 4 0.4776 -0.322759 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1476056 3 0.4916 0.826226 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1075659 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1311916 1 0.1557 0.448706 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1353353 4 0.6211 0.839268 0.052 0.000 0.460 0.488
#> SRR1073291 1 0.0469 0.474540 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1356227 3 0.4916 0.780431 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1080720 2 0.4776 0.698514 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1091695 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1350304 3 0.4907 0.821634 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR663002 1 0.2281 0.407529 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1376983 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399926 1 0.4916 0.149158 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1347144 1 0.1474 0.451679 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1384006 1 0.4888 0.206024 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1499108 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR614047 1 0.3569 0.474112 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR818440 1 0.4998 -0.578110 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1337770 3 0.4948 0.707269 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1399413 1 0.3610 0.484565 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1385542 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1473959 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.476667 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659460 1 0.1867 0.488340 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR816699 1 0.0188 0.476486 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1308612 1 0.0921 0.467499 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1499418 3 0.4981 0.724323 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1352894 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815805 1 0.5099 0.272028 0.612 0.000 0.380 0.008
#> SRR1331083 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR808272 1 0.1022 0.465365 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1436698 1 0.4072 0.478625 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1095627 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1357672 1 0.0336 0.476911 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1351236 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1077479 1 0.4746 0.339074 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR814491 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1101256 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1436004 1 0.3837 0.492189 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1457994 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1078998 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1314707 3 0.4916 0.800498 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1309534 3 0.4916 0.822040 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR615527 4 0.5517 0.895955 0.020 0.000 0.412 0.568
#> SRR1098216 1 0.4877 0.204821 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1325847 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1404003 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1344166 1 0.4999 -0.557286 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1368638 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1431429 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079237 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1080509 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.4605 0.206223 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1502143 1 0.0469 0.474540 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1487614 1 0.2408 0.397107 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1099212 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083215 1 0.3172 0.498021 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1476547 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR656421 1 0.4916 0.134122 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1086116 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499917 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1339944 2 0.5050 0.352383 0.000 0.588 0.004 0.408
#> SRR1391444 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1431847 3 0.5119 0.763291 0.440 0.000 0.556 0.004
#> SRR1317155 3 0.5236 0.796084 0.432 0.000 0.560 0.008
#> SRR1477405 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR655289 3 0.4925 0.830041 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1341683 3 0.4925 0.802758 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1084790 1 0.3649 0.498215 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1073731 1 0.4972 -0.410192 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1332588 3 0.4916 0.826604 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0000 0.476667 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.4103 0.476607 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1413477 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1101152 1 0.4933 -0.203668 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1358435 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR2165273 1 0.4888 0.206024 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1379014 3 0.4907 0.770855 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1489904 1 0.1716 0.440018 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1416386 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1406048 3 0.4916 0.826226 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR606982 1 0.4888 -0.045802 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1358082 1 0.4761 0.340464 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1312934 1 0.4713 0.178963 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR655194 1 0.5000 -0.425465 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR1331174 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1473251 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1389820 4 0.4790 0.903076 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1074289 1 0.0336 0.478212 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1348816 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1076292 1 0.4996 -0.510971 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.839306 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.4916 0.821732 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.476667 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.5000 -0.604860 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR665610 3 0.4955 0.799122 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1347322 1 0.4761 0.329854 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR813395 2 0.4804 0.695434 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1477256 1 0.4746 0.339074 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1470230 1 0.4998 -0.517384 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1354247 1 0.4830 0.269045 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1082640 2 0.0188 0.838957 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487592 1 0.0592 0.475188 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1352299 1 0.3942 0.486381 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1076317 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1434117 1 0.3486 0.487022 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1075273 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR658657 3 0.4925 0.807681 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1092773 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1365332 1 0.0188 0.476486 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615958 1 0.1211 0.460612 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1097688 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1403259 1 0.5459 -0.313269 0.552 0.000 0.432 0.016
#> SRR1099120 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1362200 1 0.0707 0.471878 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1464856 2 0.0469 0.839904 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1347298 1 0.2408 0.397107 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1075923 2 0.4790 0.696490 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1100703 1 0.1211 0.487245 0.960 0.000 0.040 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 1 0.5525 0.5493 0.636 0.000 0.240 0.124 0.000
#> SRR1436370 2 0.0609 0.8289 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1075752 4 0.4294 0.8949 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1397949 1 0.4848 0.1034 0.556 0.000 0.420 0.024 0.000
#> SRR1355723 1 0.5208 0.5746 0.720 0.000 0.180 0.068 0.032
#> SRR1329744 1 0.4221 0.5464 0.780 0.000 0.108 0.112 0.000
#> SRR657384 1 0.5450 0.5575 0.648 0.000 0.228 0.124 0.000
#> SRR1351190 1 0.5500 0.5548 0.640 0.000 0.236 0.124 0.000
#> SRR1458662 2 0.0290 0.8317 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4907 0.5507 0.656 0.000 0.292 0.052 0.000
#> SRR1396017 1 0.6346 0.5684 0.640 0.000 0.168 0.132 0.060
#> SRR1410742 1 0.5423 0.5594 0.652 0.000 0.224 0.124 0.000
#> SRR1435963 1 0.3723 0.5524 0.804 0.000 0.044 0.152 0.000
#> SRR1382416 1 0.6055 0.3491 0.628 0.000 0.212 0.020 0.140
#> SRR1391354 1 0.5405 0.5678 0.660 0.000 0.204 0.136 0.000
#> SRR1087968 2 0.3209 0.7508 0.000 0.812 0.008 0.180 0.000
#> SRR1310075 1 0.3898 0.5113 0.804 0.000 0.080 0.116 0.000
#> SRR1312244 1 0.4159 0.5123 0.776 0.000 0.156 0.068 0.000
#> SRR1325138 1 0.5396 0.5604 0.656 0.000 0.220 0.124 0.000
#> SRR1326821 1 0.4649 0.3140 0.580 0.000 0.404 0.016 0.000
#> SRR1490178 2 0.1168 0.8337 0.000 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR655613 1 0.4181 0.3515 0.712 0.000 0.268 0.020 0.000
#> SRR1075707 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1443871 2 0.2971 0.7690 0.000 0.836 0.008 0.156 0.000
#> SRR1102489 4 0.4283 0.9012 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1465758 1 0.5812 0.4571 0.700 0.000 0.104 0.120 0.076
#> SRR1414058 3 0.0865 0.7224 0.024 0.000 0.972 0.000 0.004
#> SRR1407449 1 0.4017 0.5627 0.788 0.000 0.064 0.148 0.000
#> SRR1436858 2 0.2971 0.7690 0.000 0.836 0.008 0.156 0.000
#> SRR1479109 3 0.2233 0.7097 0.104 0.000 0.892 0.004 0.000
#> SRR1399069 1 0.5909 0.5797 0.664 0.000 0.188 0.112 0.036
#> SRR1366450 3 0.4538 0.2707 0.452 0.000 0.540 0.008 0.000
#> SRR1396859 1 0.4350 0.5665 0.764 0.000 0.084 0.152 0.000
#> SRR1457176 1 0.4817 0.0482 0.572 0.000 0.404 0.024 0.000
#> SRR1097666 4 0.3774 0.7610 0.000 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR1434736 1 0.5040 0.4832 0.660 0.000 0.272 0.000 0.068
#> SRR1080560 4 0.4283 0.9012 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1322882 1 0.4437 0.2682 0.664 0.000 0.316 0.020 0.000
#> SRR1435688 2 0.2424 0.6662 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1327614 1 0.5484 0.4461 0.720 0.000 0.140 0.080 0.060
#> SRR658152 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR1368141 1 0.6800 0.4722 0.556 0.000 0.272 0.060 0.112
#> SRR1440268 1 0.3731 0.5300 0.816 0.000 0.072 0.112 0.000
#> SRR1453725 1 0.4622 0.0546 0.548 0.000 0.440 0.012 0.000
#> SRR1325711 2 0.1197 0.8069 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1477930 1 0.5010 0.5736 0.708 0.000 0.148 0.144 0.000
#> SRR1477591 1 0.4726 0.0312 0.580 0.000 0.400 0.020 0.000
#> SRR1416049 2 0.2971 0.7971 0.000 0.836 0.008 0.156 0.000
#> SRR656275 1 0.4762 0.5563 0.700 0.000 0.236 0.064 0.000
#> SRR1369052 1 0.5043 0.5742 0.704 0.000 0.160 0.136 0.000
#> SRR1377735 1 0.4525 0.1697 0.624 0.000 0.360 0.016 0.000
#> SRR1331244 1 0.4309 0.5662 0.768 0.000 0.084 0.148 0.000
#> SRR1404531 1 0.4014 0.3677 0.728 0.000 0.256 0.016 0.000
#> SRR1324331 1 0.4121 0.5437 0.788 0.000 0.100 0.112 0.000
#> SRR1458890 1 0.6658 0.4875 0.572 0.000 0.268 0.060 0.100
#> SRR1432695 2 0.1408 0.8325 0.000 0.948 0.008 0.044 0.000
#> SRR1407624 2 0.1956 0.8222 0.000 0.916 0.008 0.076 0.000
#> SRR1431969 3 0.0992 0.7198 0.024 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR1087393 2 0.3876 -0.1548 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1077263 3 0.4574 0.1658 0.412 0.000 0.576 0.012 0.000
#> SRR1385211 1 0.4382 0.3822 0.688 0.000 0.288 0.024 0.000
#> SRR655241 1 0.3930 0.5587 0.792 0.000 0.056 0.152 0.000
#> SRR656922 1 0.5423 0.5627 0.652 0.000 0.224 0.124 0.000
#> SRR1361630 3 0.0510 0.7289 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1318966 4 0.4291 0.8955 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1407087 3 0.2930 0.6370 0.164 0.000 0.832 0.004 0.000
#> SRR603212 1 0.4367 0.3117 0.620 0.000 0.372 0.008 0.000
#> SRR1321088 2 0.3053 0.7620 0.000 0.828 0.008 0.164 0.000
#> SRR1485190 3 0.6187 0.1159 0.316 0.000 0.572 0.032 0.080
#> SRR1332232 2 0.0290 0.8300 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1312645 1 0.5450 0.5598 0.648 0.000 0.228 0.124 0.000
#> SRR1457835 1 0.4717 0.1157 0.584 0.000 0.396 0.020 0.000
#> SRR1347123 3 0.2234 0.6785 0.036 0.000 0.916 0.004 0.044
#> SRR1465501 4 0.4287 0.8956 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1330878 3 0.3085 0.6168 0.060 0.000 0.868 0.004 0.068
#> SRR1445064 1 0.5519 0.5291 0.648 0.000 0.268 0.064 0.020
#> SRR1452981 1 0.5369 0.5622 0.660 0.000 0.216 0.124 0.000
#> SRR1326708 1 0.4589 0.2866 0.680 0.000 0.292 0.020 0.008
#> SRR1407157 1 0.5631 0.4222 0.680 0.000 0.188 0.108 0.024
#> SRR1365401 2 0.2193 0.8142 0.000 0.900 0.008 0.092 0.000
#> SRR1397697 2 0.0609 0.8289 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1477316 1 0.5659 0.5577 0.632 0.000 0.244 0.120 0.004
#> SRR1077898 1 0.4360 0.2898 0.680 0.000 0.300 0.020 0.000
#> SRR1349080 1 0.4299 0.3757 0.608 0.000 0.388 0.000 0.004
#> SRR1076096 2 0.1764 0.8255 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR811261 4 0.3586 0.7341 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1375485 1 0.4419 0.3551 0.668 0.000 0.312 0.020 0.000
#> SRR1432563 2 0.0510 0.8283 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR604414 1 0.4744 0.0301 0.572 0.000 0.408 0.020 0.000
#> SRR1380614 5 0.6437 0.1059 0.380 0.000 0.140 0.008 0.472
#> SRR812060 3 0.1671 0.7221 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.4106 0.3577 0.724 0.000 0.256 0.020 0.000
#> SRR1069490 4 0.3949 0.8011 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1078417 2 0.0703 0.8257 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR661613 3 0.4627 0.0585 0.444 0.000 0.544 0.012 0.000
#> SRR1420710 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR660426 1 0.4428 0.3107 0.692 0.000 0.284 0.020 0.004
#> SRR1416003 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR661064 1 0.5136 0.5725 0.692 0.000 0.180 0.128 0.000
#> SRR1082011 2 0.0794 0.8235 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1452718 1 0.6356 0.3161 0.584 0.000 0.244 0.020 0.152
#> SRR1353243 1 0.4585 0.1855 0.628 0.000 0.352 0.020 0.000
#> SRR1455482 1 0.4380 0.3552 0.716 0.000 0.256 0.020 0.008
#> SRR1313473 1 0.4424 0.4225 0.744 0.000 0.212 0.032 0.012
#> SRR1399394 1 0.4747 0.0123 0.500 0.000 0.484 0.016 0.000
#> SRR1102467 1 0.4789 0.5796 0.728 0.000 0.156 0.116 0.000
#> SRR1317470 3 0.0609 0.7257 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.6033 0.5162 0.620 0.000 0.268 0.064 0.048
#> SRR1408752 2 0.0880 0.8209 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1474617 5 0.1544 0.7090 0.000 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1398013 1 0.5382 0.5436 0.640 0.000 0.260 0.100 0.000
#> SRR1352918 1 0.5475 0.5536 0.644 0.000 0.232 0.124 0.000
#> SRR1420750 1 0.4738 -0.1516 0.520 0.000 0.464 0.016 0.000
#> SRR1071785 1 0.6156 0.5118 0.612 0.000 0.268 0.064 0.056
#> SRR1353618 2 0.2358 0.8054 0.000 0.888 0.008 0.104 0.000
#> SRR1082217 2 0.2929 0.7722 0.000 0.840 0.008 0.152 0.000
#> SRR1357256 2 0.0162 0.8312 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490313 1 0.5490 0.5479 0.636 0.000 0.248 0.116 0.000
#> SRR1366560 1 0.5362 0.4609 0.712 0.000 0.152 0.112 0.024
#> SRR1355684 1 0.5427 0.4524 0.704 0.000 0.164 0.108 0.024
#> SRR1323289 5 0.1544 0.7090 0.000 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1313494 1 0.5703 0.5528 0.616 0.000 0.244 0.140 0.000
#> SRR1309985 1 0.5592 0.5609 0.636 0.000 0.220 0.144 0.000
#> SRR607911 1 0.5323 0.4588 0.716 0.000 0.148 0.112 0.024
#> SRR1333789 3 0.3550 0.5937 0.236 0.000 0.760 0.004 0.000
#> SRR1400078 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR1088631 2 0.1478 0.7882 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1092842 4 0.4287 0.8990 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR615575 3 0.1341 0.7274 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.6082 0.4906 0.568 0.000 0.336 0.052 0.044
#> SRR1325559 1 0.4309 0.3774 0.676 0.000 0.308 0.016 0.000
#> SRR1446695 3 0.3766 0.5008 0.268 0.000 0.728 0.004 0.000
#> SRR1383883 1 0.5624 0.4651 0.716 0.000 0.084 0.116 0.084
#> SRR1396100 1 0.5541 0.5523 0.636 0.000 0.236 0.128 0.000
#> SRR1475697 1 0.6012 0.5292 0.624 0.000 0.264 0.064 0.048
#> SRR1488067 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1102103 2 0.2798 0.7819 0.000 0.852 0.008 0.140 0.000
#> SRR1105154 4 0.4291 0.8955 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1084991 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1410380 3 0.0794 0.7266 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0451 0.8326 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1454671 2 0.3246 0.7769 0.000 0.808 0.008 0.184 0.000
#> SRR1435044 1 0.5005 0.5347 0.660 0.000 0.276 0.064 0.000
#> SRR1485812 1 0.6366 0.4215 0.512 0.000 0.372 0.028 0.088
#> SRR1078020 2 0.3421 0.7237 0.000 0.788 0.008 0.204 0.000
#> SRR1311153 1 0.4328 0.3629 0.724 0.000 0.248 0.020 0.008
#> SRR1376406 2 0.0703 0.8257 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1343898 5 0.3953 0.6967 0.040 0.000 0.144 0.012 0.804
#> SRR807775 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.1197 0.8098 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR820427 3 0.5051 -0.2593 0.480 0.000 0.492 0.004 0.024
#> SRR1100656 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1362159 1 0.4701 0.3636 0.708 0.000 0.248 0.028 0.016
#> SRR1414536 3 0.1544 0.7271 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR656794 3 0.4537 0.4214 0.396 0.000 0.592 0.012 0.000
#> SRR604653 1 0.4460 0.3576 0.716 0.000 0.252 0.020 0.012
#> SRR1317685 1 0.5932 0.4002 0.520 0.000 0.380 0.004 0.096
#> SRR1485912 3 0.4604 0.1024 0.428 0.000 0.560 0.012 0.000
#> SRR1407602 1 0.6879 0.4811 0.548 0.000 0.268 0.056 0.128
#> SRR1356164 5 0.3119 0.7233 0.072 0.000 0.068 0.000 0.860
#> SRR1328692 5 0.6695 0.1755 0.276 0.000 0.248 0.004 0.472
#> SRR1362438 1 0.4540 0.2046 0.640 0.000 0.340 0.020 0.000
#> SRR1479216 3 0.0992 0.7198 0.024 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR1358041 1 0.4808 0.5760 0.728 0.000 0.136 0.136 0.000
#> SRR1468766 3 0.2806 0.6751 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR1368200 1 0.4538 0.1854 0.540 0.000 0.452 0.008 0.000
#> SRR1435602 2 0.1965 0.7593 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1501043 5 0.3966 0.6696 0.036 0.000 0.176 0.004 0.784
#> SRR1437256 1 0.5968 0.5192 0.624 0.000 0.268 0.064 0.044
#> SRR1487446 1 0.5369 0.5654 0.660 0.000 0.216 0.124 0.000
#> SRR816653 1 0.4752 0.1032 0.568 0.000 0.412 0.020 0.000
#> SRR815164 1 0.4490 0.5731 0.724 0.000 0.224 0.052 0.000
#> SRR1442043 1 0.5369 0.5623 0.660 0.000 0.216 0.124 0.000
#> SRR1410573 1 0.5145 0.3945 0.700 0.000 0.224 0.052 0.024
#> SRR1096782 2 0.1965 0.7417 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1352369 3 0.3750 0.5685 0.232 0.000 0.756 0.000 0.012
#> SRR1382934 3 0.5746 -0.1706 0.072 0.000 0.472 0.004 0.452
#> SRR1465208 1 0.3921 0.5567 0.800 0.000 0.072 0.128 0.000
#> SRR1314728 1 0.4880 0.3538 0.616 0.000 0.356 0.012 0.016
#> SRR1470291 1 0.5268 0.4600 0.720 0.000 0.152 0.104 0.024
#> SRR1308756 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.3861 0.5718 0.284 0.000 0.712 0.004 0.000
#> SRR816123 4 0.3752 0.7593 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR614779 3 0.0794 0.7280 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR810783 3 0.4517 0.2126 0.388 0.000 0.600 0.012 0.000
#> SRR1333990 1 0.3670 0.5236 0.820 0.000 0.068 0.112 0.000
#> SRR1410356 3 0.2890 0.6745 0.160 0.000 0.836 0.004 0.000
#> SRR808106 1 0.6319 0.2603 0.528 0.000 0.256 0.000 0.216
#> SRR662713 3 0.4135 0.4026 0.340 0.000 0.656 0.004 0.000
#> SRR1447058 2 0.3171 0.7546 0.000 0.816 0.008 0.176 0.000
#> SRR1480964 3 0.5261 -0.1865 0.424 0.000 0.528 0.048 0.000
#> SRR809382 1 0.6539 0.3847 0.488 0.000 0.392 0.048 0.072
#> SRR665417 1 0.6505 0.4254 0.584 0.000 0.076 0.068 0.272
#> SRR1088016 2 0.4273 0.0747 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1453166 4 0.4278 0.9013 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1069826 2 0.1908 0.7466 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1077781 2 0.2127 0.7188 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR615623 3 0.3018 0.6193 0.056 0.000 0.872 0.004 0.068
#> SRR1413787 3 0.2954 0.6254 0.056 0.000 0.876 0.004 0.064
#> SRR1478207 3 0.4065 0.4335 0.264 0.000 0.720 0.016 0.000
#> SRR1411046 1 0.4442 0.5005 0.784 0.000 0.084 0.116 0.016
#> SRR1313711 2 0.0162 0.8303 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326560 1 0.4266 0.5471 0.776 0.000 0.104 0.120 0.000
#> SRR1309051 1 0.4206 0.3435 0.708 0.000 0.272 0.020 0.000
#> SRR1486949 2 0.3455 0.7234 0.000 0.784 0.008 0.208 0.000
#> SRR1395616 1 0.4069 0.4989 0.792 0.000 0.096 0.112 0.000
#> SRR1074956 4 0.4138 0.8391 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1092961 4 0.3561 0.7298 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR817210 3 0.5043 0.0927 0.356 0.000 0.600 0.044 0.000
#> SRR1319221 5 0.1544 0.7090 0.000 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1405413 1 0.4658 0.3215 0.576 0.000 0.408 0.016 0.000
#> SRR607807 5 0.5961 0.5638 0.200 0.000 0.068 0.068 0.664
#> SRR1390160 3 0.2819 0.6367 0.052 0.000 0.884 0.004 0.060
#> SRR1406283 1 0.4752 0.0484 0.568 0.000 0.412 0.020 0.000
#> SRR1357709 1 0.5423 0.5584 0.652 0.000 0.224 0.124 0.000
#> SRR1080742 4 0.3752 0.7593 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1468208 1 0.5511 0.4704 0.724 0.000 0.088 0.116 0.072
#> SRR1312766 3 0.2732 0.6587 0.160 0.000 0.840 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.5006 0.5754 0.708 0.000 0.156 0.136 0.000
#> SRR1311224 1 0.4717 0.0639 0.584 0.000 0.396 0.020 0.000
#> SRR1087801 1 0.4559 0.2338 0.512 0.000 0.480 0.008 0.000
#> SRR1099720 2 0.4074 -0.3742 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1349250 4 0.4283 0.9012 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1350912 2 0.3053 0.7620 0.000 0.828 0.008 0.164 0.000
#> SRR1357127 3 0.4682 0.1370 0.356 0.000 0.620 0.024 0.000
#> SRR1074980 2 0.3013 0.7652 0.000 0.832 0.008 0.160 0.000
#> SRR1317022 3 0.2446 0.6520 0.044 0.000 0.900 0.000 0.056
#> SRR1332879 1 0.4744 -0.1880 0.508 0.000 0.476 0.016 0.000
#> SRR1403177 5 0.2020 0.7030 0.000 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1076144 2 0.0794 0.8235 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1069614 4 0.4287 0.8990 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR818239 4 0.4268 0.8994 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1421069 4 0.4278 0.9013 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1500006 1 0.4597 0.3624 0.716 0.000 0.244 0.020 0.020
#> SRR1485678 1 0.4987 0.4750 0.616 0.000 0.340 0.044 0.000
#> SRR1092232 5 0.7118 0.2366 0.212 0.000 0.296 0.028 0.464
#> SRR1344253 3 0.4517 0.0285 0.436 0.000 0.556 0.008 0.000
#> SRR1384290 1 0.5362 0.4567 0.712 0.000 0.152 0.112 0.024
#> SRR1089349 3 0.3421 0.6552 0.204 0.000 0.788 0.008 0.000
#> SRR1343522 2 0.1121 0.8109 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1326727 2 0.0703 0.8257 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1440940 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR818372 1 0.4815 0.5508 0.692 0.000 0.244 0.064 0.000
#> SRR1323675 2 0.3013 0.7652 0.000 0.832 0.008 0.160 0.000
#> SRR819894 1 0.5450 0.5561 0.648 0.000 0.228 0.124 0.000
#> SRR1310031 3 0.0992 0.7198 0.024 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR615419 1 0.5835 0.5333 0.640 0.000 0.256 0.064 0.040
#> SRR1436925 1 0.4937 0.5553 0.672 0.000 0.264 0.064 0.000
#> SRR1477238 1 0.5258 0.4664 0.740 0.000 0.124 0.076 0.060
#> SRR1332566 1 0.3934 0.5496 0.800 0.000 0.076 0.124 0.000
#> SRR1490228 1 0.5229 0.4435 0.548 0.000 0.404 0.048 0.000
#> SRR1442949 1 0.5140 0.5169 0.624 0.000 0.324 0.048 0.004
#> SRR1466239 1 0.5022 0.4766 0.736 0.000 0.136 0.112 0.016
#> SRR1094003 2 0.0703 0.8257 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1329971 1 0.4641 -0.0062 0.532 0.000 0.456 0.012 0.000
#> SRR813076 2 0.1168 0.8345 0.000 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR1097642 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1322981 3 0.2605 0.6726 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.8314 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR660522 3 0.0880 0.7299 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR815374 1 0.5525 0.5524 0.636 0.000 0.240 0.124 0.000
#> SRR1069564 4 0.3932 0.7945 0.000 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1416337 3 0.0963 0.7300 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1316438 5 0.4772 0.6347 0.068 0.000 0.208 0.004 0.720
#> SRR1386844 1 0.3670 0.5137 0.820 0.000 0.068 0.112 0.000
#> SRR1373718 1 0.5485 0.4715 0.724 0.000 0.100 0.116 0.060
#> SRR1447458 2 0.1628 0.8285 0.000 0.936 0.008 0.056 0.000
#> SRR1487128 1 0.3767 0.5093 0.812 0.000 0.120 0.068 0.000
#> SRR1441421 2 0.3013 0.7652 0.000 0.832 0.008 0.160 0.000
#> SRR1069919 2 0.0794 0.8236 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1460296 1 0.4721 0.1728 0.628 0.000 0.348 0.020 0.004
#> SRR1335489 1 0.3934 0.5468 0.800 0.000 0.124 0.076 0.000
#> SRR1393404 2 0.2249 0.8118 0.000 0.896 0.008 0.096 0.000
#> SRR1081425 1 0.4597 0.3624 0.716 0.000 0.244 0.020 0.020
#> SRR1401815 3 0.4392 0.3861 0.048 0.000 0.748 0.004 0.200
#> SRR1071337 2 0.3209 0.7508 0.000 0.812 0.008 0.180 0.000
#> SRR1071983 2 0.2561 0.6613 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1331793 2 0.0451 0.8326 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1410510 3 0.0992 0.7198 0.024 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR1098761 4 0.3752 0.7593 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1312124 1 0.5434 0.5711 0.656 0.000 0.208 0.136 0.000
#> SRR615395 3 0.4482 0.4790 0.348 0.000 0.636 0.016 0.000
#> SRR1479349 1 0.4757 0.5717 0.732 0.000 0.120 0.148 0.000
#> SRR2165033 1 0.5631 0.5211 0.608 0.000 0.316 0.056 0.020
#> SRR1089054 2 0.3455 0.7234 0.000 0.784 0.008 0.208 0.000
#> SRR816201 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR1488514 2 0.1121 0.8109 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR655840 1 0.5475 0.5536 0.644 0.000 0.232 0.124 0.000
#> SRR1379303 1 0.4640 0.4883 0.760 0.000 0.120 0.112 0.008
#> SRR1418516 1 0.5240 0.5548 0.660 0.000 0.244 0.096 0.000
#> SRR613174 3 0.1792 0.7215 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.2605 0.6726 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR659157 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR1480408 1 0.5450 0.5561 0.648 0.000 0.228 0.124 0.000
#> SRR657857 1 0.5024 0.5721 0.692 0.000 0.212 0.096 0.000
#> SRR1073317 2 0.0794 0.8235 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1332526 1 0.5369 0.5623 0.660 0.000 0.216 0.124 0.000
#> SRR1094168 4 0.3586 0.7337 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1431270 1 0.4983 0.5342 0.664 0.000 0.272 0.064 0.000
#> SRR1085614 2 0.2230 0.7026 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1330106 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR1466154 1 0.4657 0.3192 0.696 0.000 0.268 0.020 0.016
#> SRR1396944 1 0.5530 0.4593 0.724 0.000 0.104 0.076 0.096
#> SRR1082784 2 0.0290 0.8307 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1457267 1 0.5400 0.4531 0.708 0.000 0.156 0.112 0.024
#> SRR614659 1 0.4865 0.5460 0.684 0.000 0.252 0.064 0.000
#> SRR659247 1 0.5024 0.3782 0.528 0.000 0.440 0.032 0.000
#> SRR1317201 1 0.3857 0.5100 0.808 0.000 0.084 0.108 0.000
#> SRR1473696 1 0.4746 -0.1904 0.504 0.000 0.480 0.016 0.000
#> SRR1375842 1 0.4460 0.3576 0.716 0.000 0.252 0.020 0.012
#> SRR1388123 2 0.1697 0.8281 0.000 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR1096363 4 0.4291 0.8955 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1453662 1 0.4793 0.5587 0.700 0.000 0.232 0.068 0.000
#> SRR1345499 2 0.1331 0.8320 0.000 0.952 0.008 0.040 0.000
#> SRR1353499 1 0.4460 0.3600 0.716 0.000 0.252 0.020 0.012
#> SRR1416693 1 0.5534 0.4688 0.720 0.000 0.104 0.116 0.060
#> SRR1070841 3 0.3689 0.4968 0.256 0.000 0.740 0.004 0.000
#> SRR1380910 1 0.5324 0.4145 0.700 0.000 0.200 0.076 0.024
#> SRR1333125 2 0.0963 0.8177 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1498183 1 0.4482 0.1528 0.612 0.000 0.376 0.012 0.000
#> SRR612659 3 0.0794 0.7219 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.3093 0.7605 0.000 0.824 0.008 0.168 0.000
#> SRR658597 4 0.4287 0.8984 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1089595 4 0.4283 0.9012 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1074263 2 0.1410 0.8042 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1376786 3 0.3783 0.5791 0.252 0.000 0.740 0.008 0.000
#> SRR1345995 3 0.4497 0.3151 0.424 0.000 0.568 0.008 0.000
#> SRR1071035 1 0.4276 0.3031 0.616 0.000 0.380 0.004 0.000
#> SRR1068808 4 0.4287 0.8990 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1332754 2 0.3053 0.7637 0.000 0.828 0.008 0.164 0.000
#> SRR662438 1 0.4157 0.3497 0.716 0.000 0.264 0.020 0.000
#> SRR1335355 1 0.5566 0.4290 0.688 0.000 0.180 0.108 0.024
#> SRR659448 3 0.1043 0.7303 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.0703 0.7277 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1381711 3 0.3333 0.5491 0.208 0.000 0.788 0.004 0.000
#> SRR657985 3 0.0703 0.7282 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.4347 0.3170 0.636 0.000 0.356 0.004 0.004
#> SRR1336505 1 0.6324 0.4964 0.564 0.000 0.320 0.060 0.056
#> SRR1474095 1 0.4659 0.0415 0.496 0.000 0.492 0.012 0.000
#> SRR1363831 2 0.0693 0.8336 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1442376 1 0.5632 0.5559 0.628 0.000 0.232 0.140 0.000
#> SRR1074909 4 0.4291 0.8988 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1101200 3 0.3809 0.5730 0.256 0.000 0.736 0.008 0.000
#> SRR1075408 2 0.2753 0.7853 0.000 0.856 0.008 0.136 0.000
#> SRR1367150 1 0.5599 0.5388 0.620 0.000 0.260 0.120 0.000
#> SRR1313406 2 0.3093 0.7605 0.000 0.824 0.008 0.168 0.000
#> SRR1068880 2 0.3282 0.7426 0.000 0.804 0.008 0.188 0.000
#> SRR1467277 3 0.3461 0.5174 0.224 0.000 0.772 0.004 0.000
#> SRR1084867 2 0.3171 0.7545 0.000 0.816 0.008 0.176 0.000
#> SRR1095431 4 0.4278 0.8977 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1380184 2 0.0880 0.8298 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1443113 1 0.4582 0.1299 0.572 0.000 0.416 0.012 0.000
#> SRR1380414 3 0.1671 0.7232 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.4181 0.3515 0.712 0.000 0.268 0.020 0.000
#> SRR1075778 2 0.0794 0.8235 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1421116 2 0.2193 0.8142 0.000 0.900 0.008 0.092 0.000
#> SRR602282 5 0.0912 0.7256 0.016 0.000 0.012 0.000 0.972
#> SRR1361195 2 0.0880 0.8209 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR600493 1 0.4747 -0.0647 0.500 0.000 0.484 0.016 0.000
#> SRR1477653 3 0.3741 0.5774 0.264 0.000 0.732 0.004 0.000
#> SRR1355475 3 0.1341 0.7274 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.5222 0.5691 0.680 0.000 0.196 0.124 0.000
#> SRR810437 1 0.5112 0.5324 0.664 0.000 0.268 0.064 0.004
#> SRR1361860 1 0.5055 0.5830 0.708 0.000 0.208 0.072 0.012
#> SRR1441311 2 0.0451 0.8311 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1098903 1 0.5450 0.5559 0.648 0.000 0.228 0.124 0.000
#> SRR1457619 1 0.5289 0.5482 0.652 0.000 0.252 0.096 0.000
#> SRR1498529 1 0.5016 0.5735 0.704 0.000 0.176 0.120 0.000
#> SRR1097172 2 0.0290 0.8317 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3480 0.2511 0.000 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1472033 2 0.1965 0.7414 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1445087 3 0.6236 0.1755 0.116 0.000 0.536 0.012 0.336
#> SRR1399525 2 0.3999 0.3933 0.000 0.740 0.000 0.240 0.020
#> SRR1312844 4 0.3999 0.8036 0.000 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1085874 4 0.3966 0.7994 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1101226 4 0.4891 0.6213 0.000 0.172 0.000 0.716 0.112
#> SRR1476056 1 0.5365 0.5683 0.664 0.000 0.204 0.132 0.000
#> SRR1075659 4 0.4283 0.9012 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1311916 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1353353 5 0.4846 0.5787 0.056 0.000 0.244 0.004 0.696
#> SRR1073291 3 0.1270 0.7282 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.4648 0.5702 0.740 0.000 0.104 0.156 0.000
#> SRR1080720 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1091695 4 0.4291 0.8988 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1350304 1 0.5470 0.5459 0.636 0.000 0.252 0.112 0.000
#> SRR663002 3 0.1251 0.7151 0.036 0.000 0.956 0.000 0.008
#> SRR1376983 2 0.1408 0.8317 0.000 0.948 0.008 0.044 0.000
#> SRR1399926 1 0.3906 0.5044 0.804 0.000 0.084 0.112 0.000
#> SRR1347144 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.4838 0.5035 0.748 0.000 0.128 0.112 0.012
#> SRR1499108 4 0.3837 0.7618 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR614047 3 0.4201 0.3929 0.328 0.000 0.664 0.008 0.000
#> SRR818440 1 0.6419 0.4210 0.512 0.000 0.376 0.052 0.060
#> SRR1337770 1 0.4571 0.5844 0.736 0.000 0.188 0.076 0.000
#> SRR1399413 3 0.4397 0.1119 0.432 0.000 0.564 0.004 0.000
#> SRR1385542 2 0.2358 0.8053 0.000 0.888 0.008 0.104 0.000
#> SRR1473959 1 0.4923 0.5469 0.680 0.000 0.252 0.068 0.000
#> SRR1074041 3 0.1732 0.7225 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.1408 0.8315 0.000 0.948 0.008 0.044 0.000
#> SRR659460 3 0.3521 0.5947 0.232 0.000 0.764 0.004 0.000
#> SRR816699 3 0.2280 0.7064 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.0880 0.7302 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.5628 0.5247 0.632 0.000 0.284 0.060 0.024
#> SRR1352894 2 0.2136 0.8146 0.000 0.904 0.008 0.088 0.000
#> SRR815805 1 0.5004 0.4593 0.672 0.000 0.256 0.000 0.072
#> SRR1331083 4 0.4287 0.8990 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR808272 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.4875 0.0635 0.576 0.000 0.400 0.020 0.004
#> SRR1095627 4 0.3752 0.7593 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1357672 3 0.1638 0.7264 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1351236 1 0.4532 0.3601 0.716 0.000 0.248 0.020 0.016
#> SRR1077479 1 0.4407 0.4086 0.724 0.000 0.244 0.020 0.012
#> SRR814491 1 0.5541 0.5522 0.636 0.000 0.236 0.128 0.000
#> SRR1101256 2 0.1197 0.8069 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1436004 1 0.4717 0.0451 0.584 0.000 0.396 0.020 0.000
#> SRR1457994 2 0.1792 0.7603 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1078998 2 0.3093 0.7605 0.000 0.824 0.008 0.168 0.000
#> SRR1314707 1 0.4783 0.5834 0.724 0.000 0.176 0.100 0.000
#> SRR1309534 1 0.5238 0.5436 0.652 0.000 0.260 0.088 0.000
#> SRR615527 5 0.1012 0.7257 0.020 0.000 0.012 0.000 0.968
#> SRR1098216 1 0.4219 0.5337 0.772 0.000 0.156 0.072 0.000
#> SRR1325847 4 0.4287 0.8990 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1404003 1 0.5475 0.5536 0.644 0.000 0.232 0.124 0.000
#> SRR1344166 1 0.3863 0.5591 0.772 0.000 0.200 0.028 0.000
#> SRR1368638 1 0.5516 0.5544 0.640 0.000 0.232 0.128 0.000
#> SRR1431429 2 0.3209 0.7508 0.000 0.812 0.008 0.180 0.000
#> SRR1079237 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1080509 2 0.0404 0.8293 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR815759 1 0.4886 0.3685 0.528 0.000 0.448 0.024 0.000
#> SRR1502143 3 0.1121 0.7299 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.2954 0.6254 0.056 0.000 0.876 0.004 0.064
#> SRR1402307 2 0.1168 0.8343 0.000 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR820810 1 0.5164 0.5604 0.672 0.000 0.232 0.096 0.000
#> SRR1099212 2 0.1965 0.7414 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1083215 3 0.4251 0.3890 0.372 0.000 0.624 0.004 0.000
#> SRR1476547 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR656421 1 0.4587 0.5346 0.744 0.000 0.160 0.096 0.000
#> SRR1086116 2 0.2971 0.7690 0.000 0.836 0.008 0.156 0.000
#> SRR1499917 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR1339944 2 0.5836 0.3844 0.000 0.608 0.000 0.216 0.176
#> SRR1391444 2 0.0000 0.8314 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.4762 0.5563 0.700 0.000 0.236 0.064 0.000
#> SRR1431847 1 0.6215 0.5078 0.600 0.000 0.280 0.064 0.056
#> SRR1317155 1 0.6090 0.5399 0.636 0.000 0.236 0.060 0.068
#> SRR1477405 1 0.4657 0.3655 0.716 0.000 0.240 0.024 0.020
#> SRR655289 1 0.5091 0.5582 0.676 0.000 0.236 0.088 0.000
#> SRR1341683 1 0.4960 0.5337 0.668 0.000 0.268 0.064 0.000
#> SRR1084790 3 0.4656 0.1036 0.480 0.000 0.508 0.012 0.000
#> SRR1073731 1 0.5432 0.4549 0.544 0.000 0.392 0.064 0.000
#> SRR1332588 1 0.5693 0.5557 0.620 0.000 0.236 0.144 0.000
#> SRR1471157 2 0.0898 0.8338 0.000 0.972 0.008 0.020 0.000
#> SRR654945 3 0.1671 0.7197 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.4585 0.1728 0.628 0.000 0.352 0.020 0.000
#> SRR1413477 2 0.0794 0.8235 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1101152 1 0.4866 0.4904 0.620 0.000 0.344 0.036 0.000
#> SRR1358435 4 0.4283 0.9012 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR2165273 1 0.4747 0.4862 0.764 0.000 0.100 0.116 0.020
#> SRR1379014 1 0.4757 0.5712 0.732 0.000 0.120 0.148 0.000
#> SRR1489904 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1416386 4 0.4291 0.8988 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1406048 1 0.5046 0.5748 0.704 0.000 0.156 0.140 0.000
#> SRR606982 1 0.4985 0.3623 0.524 0.000 0.452 0.016 0.008
#> SRR1358082 1 0.4716 0.3679 0.716 0.000 0.236 0.024 0.024
#> SRR1312934 1 0.5049 0.3130 0.488 0.000 0.480 0.032 0.000
#> SRR655194 1 0.4545 0.5750 0.752 0.000 0.116 0.132 0.000
#> SRR1331174 2 0.0794 0.8235 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1473251 4 0.4273 0.9003 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1389820 5 0.1544 0.7090 0.000 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1074289 3 0.1908 0.7303 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.1965 0.7414 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1076292 1 0.6460 0.4617 0.532 0.000 0.348 0.052 0.068
#> SRR1395810 2 0.0703 0.8256 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1498909 1 0.4815 0.5508 0.692 0.000 0.244 0.064 0.000
#> SRR1443507 3 0.2930 0.6823 0.164 0.000 0.832 0.004 0.000
#> SRR1452310 1 0.5180 0.5268 0.624 0.000 0.312 0.064 0.000
#> SRR665610 1 0.5005 0.5346 0.660 0.000 0.276 0.064 0.000
#> SRR1347322 1 0.4234 0.3670 0.724 0.000 0.252 0.020 0.004
#> SRR813395 4 0.3707 0.7530 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1477256 1 0.4157 0.3516 0.716 0.000 0.264 0.020 0.000
#> SRR1470230 1 0.5543 0.5149 0.612 0.000 0.316 0.056 0.016
#> SRR1354247 1 0.4256 0.4720 0.764 0.000 0.184 0.048 0.004
#> SRR1082640 2 0.3282 0.7426 0.000 0.804 0.008 0.188 0.000
#> SRR1487592 3 0.3039 0.6493 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.4713 -0.0302 0.544 0.000 0.440 0.016 0.000
#> SRR1076317 4 0.4291 0.8955 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1434117 3 0.4590 0.2257 0.420 0.000 0.568 0.012 0.000
#> SRR1075273 4 0.4291 0.8955 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR658657 1 0.5230 0.5323 0.660 0.000 0.268 0.064 0.008
#> SRR1092773 4 0.4291 0.8955 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1365332 3 0.2561 0.6767 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.0703 0.7249 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1097688 4 0.4283 0.9012 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1403259 1 0.6970 0.4371 0.504 0.000 0.324 0.056 0.116
#> SRR1099120 4 0.4278 0.9013 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1362200 3 0.0609 0.7289 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0794 0.8280 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1347298 3 0.1605 0.7032 0.040 0.000 0.944 0.004 0.012
#> SRR1075923 4 0.4291 0.8955 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1100703 3 0.3550 0.6367 0.236 0.000 0.760 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.3361 0.62671 0.188 0.004 0.020 0.788 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.5997 0.60184 0.080 0.484 0.052 0.000 0.000 0.384
#> SRR1075752 6 0.1714 0.64605 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1397949 3 0.6232 -0.11299 0.368 0.008 0.384 0.240 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.3258 0.60165 0.120 0.000 0.016 0.832 0.032 0.000
#> SRR1329744 1 0.4948 -0.12855 0.512 0.040 0.012 0.436 0.000 0.000
#> SRR657384 4 0.3759 0.61959 0.216 0.008 0.024 0.752 0.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.4205 0.62806 0.188 0.000 0.084 0.728 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.3464 0.73797 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR818573 4 0.4227 0.52073 0.116 0.016 0.092 0.772 0.004 0.000
#> SRR1396017 4 0.4702 0.44920 0.408 0.032 0.008 0.552 0.000 0.000
#> SRR1410742 4 0.3340 0.62317 0.196 0.004 0.016 0.784 0.000 0.000
#> SRR1435963 4 0.4680 0.39620 0.396 0.032 0.008 0.564 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.7107 0.47485 0.448 0.012 0.144 0.304 0.092 0.000
#> SRR1391354 4 0.3617 0.58177 0.244 0.020 0.000 0.736 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.2300 0.70417 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1310075 1 0.5149 0.18157 0.596 0.040 0.036 0.328 0.000 0.000
#> SRR1312244 4 0.6071 -0.23720 0.364 0.020 0.132 0.480 0.004 0.000
#> SRR1325138 4 0.3370 0.61799 0.212 0.004 0.012 0.772 0.000 0.000
#> SRR1326821 4 0.6393 -0.36021 0.272 0.016 0.296 0.416 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.3351 0.74871 0.000 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR655613 1 0.5903 0.49037 0.520 0.008 0.260 0.212 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.0146 0.68782 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1443871 2 0.2416 0.72403 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1102489 6 0.0260 0.68891 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1465758 1 0.4540 0.38741 0.736 0.036 0.044 0.180 0.004 0.000
#> SRR1414058 3 0.2592 0.71479 0.016 0.000 0.864 0.116 0.004 0.000
#> SRR1407449 4 0.4810 0.42980 0.376 0.032 0.016 0.576 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.2378 0.72145 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1479109 3 0.2594 0.71506 0.060 0.004 0.880 0.056 0.000 0.000
#> SRR1399069 4 0.4773 0.52142 0.320 0.032 0.016 0.628 0.004 0.000
#> SRR1366450 3 0.6034 -0.04956 0.360 0.008 0.444 0.188 0.000 0.000
#> SRR1396859 4 0.4607 0.46210 0.356 0.028 0.012 0.604 0.000 0.000
#> SRR1457176 3 0.5937 -0.06355 0.388 0.008 0.440 0.164 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.3101 0.54833 0.000 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR1434736 4 0.5860 0.14042 0.276 0.004 0.136 0.564 0.020 0.000
#> SRR1080560 6 0.0260 0.68891 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1322882 1 0.6195 0.44885 0.476 0.016 0.292 0.216 0.000 0.000
#> SRR1435688 6 0.6029 -0.36510 0.080 0.372 0.056 0.000 0.000 0.492
#> SRR1327614 1 0.4825 0.46753 0.700 0.032 0.068 0.200 0.000 0.000
#> SRR658152 4 0.2350 0.62042 0.036 0.000 0.076 0.888 0.000 0.000
#> SRR1368141 4 0.4049 0.53762 0.128 0.000 0.056 0.784 0.032 0.000
#> SRR1440268 1 0.4960 0.04003 0.584 0.040 0.020 0.356 0.000 0.000
#> SRR1453725 3 0.5984 0.12122 0.340 0.008 0.468 0.184 0.000 0.000
#> SRR1325711 6 0.6076 -0.48930 0.080 0.428 0.056 0.000 0.000 0.436
#> SRR1477930 4 0.4119 0.51182 0.336 0.016 0.004 0.644 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.6150 0.38699 0.472 0.016 0.320 0.192 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.2941 0.73061 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR656275 4 0.1408 0.62875 0.036 0.000 0.020 0.944 0.000 0.000
#> SRR1369052 4 0.4122 0.52776 0.316 0.020 0.004 0.660 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.6157 0.41224 0.464 0.012 0.308 0.216 0.000 0.000
#> SRR1331244 4 0.4312 0.44727 0.368 0.028 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.5771 0.55354 0.528 0.004 0.200 0.268 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.5111 -0.13653 0.492 0.040 0.020 0.448 0.000 0.000
#> SRR1458890 4 0.4050 0.53538 0.124 0.000 0.064 0.784 0.028 0.000
#> SRR1432695 2 0.3309 0.75106 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1407624 2 0.3398 0.75430 0.008 0.740 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1431969 3 0.2243 0.71253 0.004 0.000 0.880 0.112 0.004 0.000
#> SRR1087393 6 0.5109 0.28188 0.080 0.168 0.056 0.000 0.000 0.696
#> SRR1077263 3 0.6070 0.25712 0.240 0.008 0.480 0.272 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.6518 0.41719 0.392 0.016 0.248 0.340 0.004 0.000
#> SRR655241 4 0.4543 0.43960 0.380 0.032 0.004 0.584 0.000 0.000
#> SRR656922 4 0.4285 0.61601 0.212 0.020 0.032 0.732 0.004 0.000
#> SRR1361630 3 0.1970 0.72365 0.008 0.000 0.900 0.092 0.000 0.000
#> SRR1318966 6 0.0865 0.68018 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1407087 3 0.3804 0.69040 0.044 0.008 0.772 0.176 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.6283 0.40000 0.400 0.008 0.296 0.296 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.2219 0.71156 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1485190 4 0.6463 -0.20436 0.160 0.004 0.396 0.408 0.032 0.000
#> SRR1332232 2 0.5834 0.65381 0.068 0.536 0.056 0.000 0.000 0.340
#> SRR1312645 4 0.4136 0.62910 0.192 0.000 0.076 0.732 0.000 0.000
#> SRR1457835 3 0.6321 -0.12261 0.360 0.012 0.384 0.244 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.4476 0.57375 0.116 0.000 0.740 0.128 0.016 0.000
#> SRR1465501 6 0.1863 0.65048 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1330878 3 0.5574 0.44200 0.140 0.000 0.648 0.164 0.048 0.000
#> SRR1445064 4 0.2006 0.61865 0.004 0.000 0.104 0.892 0.000 0.000
#> SRR1452981 4 0.3271 0.61035 0.232 0.000 0.008 0.760 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.5991 0.52590 0.544 0.020 0.224 0.212 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.4849 0.49725 0.716 0.032 0.108 0.144 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.2941 0.74921 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1397697 2 0.6046 0.59185 0.080 0.480 0.056 0.000 0.000 0.384
#> SRR1477316 4 0.4074 0.61271 0.212 0.028 0.020 0.740 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.6154 0.46156 0.488 0.016 0.284 0.212 0.000 0.000
#> SRR1349080 4 0.5855 -0.10020 0.200 0.004 0.256 0.536 0.004 0.000
#> SRR1076096 2 0.3221 0.75191 0.000 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR811261 6 0.3050 0.54360 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1375485 1 0.6566 0.40927 0.380 0.016 0.276 0.324 0.004 0.000
#> SRR1432563 2 0.5739 0.66065 0.060 0.544 0.056 0.000 0.000 0.340
#> SRR604414 1 0.6206 0.43764 0.472 0.016 0.296 0.216 0.000 0.000
#> SRR1380614 5 0.7260 0.38378 0.280 0.008 0.108 0.172 0.432 0.000
#> SRR812060 3 0.2608 0.71847 0.048 0.000 0.872 0.080 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.5975 0.52536 0.536 0.016 0.228 0.220 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.2378 0.60390 0.000 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848
#> SRR1078417 2 0.6029 0.60024 0.080 0.492 0.056 0.000 0.000 0.372
#> SRR661613 3 0.6279 0.21633 0.244 0.008 0.448 0.296 0.004 0.000
#> SRR1420710 4 0.1501 0.62675 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.6048 0.51296 0.532 0.020 0.236 0.212 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.1814 0.62110 0.000 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR661064 4 0.3586 0.57745 0.268 0.012 0.000 0.720 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.6023 0.60657 0.080 0.496 0.056 0.000 0.000 0.368
#> SRR1452718 1 0.7636 0.40506 0.396 0.016 0.200 0.260 0.128 0.000
#> SRR1353243 1 0.6011 0.43777 0.488 0.008 0.292 0.212 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.5806 0.54407 0.568 0.016 0.200 0.216 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.5375 0.52888 0.596 0.008 0.128 0.268 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.6543 0.05905 0.300 0.016 0.400 0.280 0.004 0.000
#> SRR1102467 4 0.4476 0.58311 0.256 0.016 0.032 0.692 0.004 0.000
#> SRR1317470 3 0.1714 0.72190 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1337707 4 0.2658 0.61538 0.036 0.000 0.100 0.864 0.000 0.000
#> SRR1408752 6 0.6075 -0.49226 0.080 0.424 0.056 0.000 0.000 0.440
#> SRR1474617 5 0.0551 0.75823 0.004 0.008 0.004 0.000 0.984 0.000
#> SRR1398013 4 0.3130 0.63760 0.144 0.004 0.028 0.824 0.000 0.000
#> SRR1352918 4 0.3370 0.61900 0.212 0.004 0.012 0.772 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.6004 0.17955 0.432 0.012 0.396 0.160 0.000 0.000
#> SRR1071785 4 0.3567 0.57669 0.100 0.000 0.100 0.800 0.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.2883 0.74616 0.000 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1082217 2 0.2340 0.71911 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1357256 2 0.5765 0.67686 0.068 0.560 0.056 0.000 0.000 0.316
#> SRR1490313 4 0.3453 0.63248 0.180 0.004 0.028 0.788 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.5253 0.44030 0.664 0.040 0.088 0.208 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.5214 0.45480 0.664 0.028 0.108 0.200 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.0551 0.75823 0.004 0.008 0.004 0.000 0.984 0.000
#> SRR1313494 4 0.4864 0.59034 0.260 0.020 0.060 0.660 0.000 0.000
#> SRR1309985 4 0.4052 0.58337 0.260 0.020 0.012 0.708 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.4966 0.41393 0.692 0.036 0.076 0.196 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.4741 0.62177 0.136 0.008 0.700 0.156 0.000 0.000
#> SRR1400078 4 0.1908 0.62260 0.004 0.000 0.096 0.900 0.000 0.000
#> SRR1088631 6 0.6076 -0.49000 0.080 0.428 0.056 0.000 0.000 0.436
#> SRR1092842 6 0.0547 0.68780 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR615575 3 0.2629 0.72467 0.040 0.000 0.868 0.092 0.000 0.000
#> SRR1079434 4 0.4322 0.50327 0.128 0.004 0.116 0.748 0.004 0.000
#> SRR1325559 4 0.6602 -0.42486 0.332 0.016 0.300 0.348 0.004 0.000
#> SRR1446695 3 0.4934 0.60062 0.124 0.008 0.672 0.196 0.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.4753 0.36516 0.716 0.036 0.052 0.192 0.004 0.000
#> SRR1396100 4 0.3720 0.62046 0.208 0.012 0.020 0.760 0.000 0.000
#> SRR1475697 4 0.3612 0.56402 0.148 0.000 0.036 0.800 0.016 0.000
#> SRR1488067 6 0.0146 0.68857 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1102103 2 0.2597 0.73356 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1105154 6 0.0547 0.68740 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1084991 6 0.0000 0.68833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 3 0.2019 0.72272 0.012 0.000 0.900 0.088 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.3707 0.73630 0.008 0.680 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1454671 2 0.3938 0.61161 0.012 0.672 0.004 0.000 0.000 0.312
#> SRR1435044 4 0.3202 0.57561 0.040 0.000 0.144 0.816 0.000 0.000
#> SRR1485812 4 0.5259 0.41115 0.148 0.004 0.112 0.692 0.044 0.000
#> SRR1078020 2 0.2664 0.64442 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1311153 1 0.5898 0.55022 0.560 0.020 0.192 0.228 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.6046 0.58212 0.080 0.480 0.056 0.000 0.000 0.384
#> SRR1343898 5 0.5430 0.77343 0.124 0.000 0.048 0.164 0.664 0.000
#> SRR807775 3 0.2333 0.71351 0.004 0.000 0.872 0.120 0.004 0.000
#> SRR1409215 6 0.6055 -0.42626 0.080 0.392 0.056 0.000 0.000 0.472
#> SRR820427 4 0.5535 0.18369 0.140 0.004 0.252 0.596 0.008 0.000
#> SRR1100656 6 0.0000 0.68833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.5354 0.56000 0.608 0.004 0.176 0.212 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.3426 0.71699 0.068 0.000 0.808 0.124 0.000 0.000
#> SRR656794 3 0.5756 -0.05740 0.416 0.008 0.444 0.132 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.5862 0.53585 0.568 0.020 0.204 0.208 0.000 0.000
#> SRR1317685 4 0.5177 0.36759 0.156 0.004 0.140 0.680 0.020 0.000
#> SRR1485912 3 0.6139 0.28925 0.212 0.012 0.468 0.308 0.000 0.000
#> SRR1407602 4 0.4269 0.52846 0.168 0.000 0.024 0.752 0.056 0.000
#> SRR1356164 5 0.5912 0.76129 0.152 0.004 0.060 0.156 0.628 0.000
#> SRR1328692 4 0.7486 -0.39770 0.152 0.004 0.168 0.340 0.336 0.000
#> SRR1362438 1 0.6166 0.45522 0.484 0.016 0.288 0.212 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.2053 0.71771 0.004 0.000 0.888 0.108 0.000 0.000
#> SRR1358041 4 0.5175 0.52722 0.288 0.024 0.068 0.620 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.4789 0.63899 0.124 0.008 0.692 0.176 0.000 0.000
#> SRR1368200 4 0.6406 -0.20951 0.252 0.016 0.272 0.456 0.004 0.000
#> SRR1435602 6 0.6035 -0.40473 0.080 0.376 0.056 0.000 0.000 0.488
#> SRR1501043 5 0.5861 0.74923 0.144 0.000 0.052 0.192 0.612 0.000
#> SRR1437256 4 0.2711 0.62606 0.056 0.000 0.068 0.872 0.004 0.000
#> SRR1487446 4 0.4230 0.61615 0.224 0.004 0.056 0.716 0.000 0.000
#> SRR816653 3 0.6319 -0.12851 0.340 0.012 0.400 0.248 0.000 0.000
#> SRR815164 4 0.4528 0.45348 0.168 0.012 0.084 0.732 0.004 0.000
#> SRR1442043 4 0.3488 0.61750 0.216 0.004 0.016 0.764 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.5205 0.56860 0.648 0.012 0.144 0.196 0.000 0.000
#> SRR1096782 6 0.6076 -0.49645 0.080 0.432 0.056 0.000 0.000 0.432
#> SRR1352369 3 0.5140 0.58335 0.164 0.004 0.640 0.192 0.000 0.000
#> SRR1382934 3 0.7513 -0.07199 0.148 0.004 0.388 0.208 0.252 0.000
#> SRR1465208 4 0.5005 0.36575 0.404 0.036 0.020 0.540 0.000 0.000
#> SRR1314728 4 0.6245 -0.35437 0.320 0.004 0.320 0.356 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.5014 0.44383 0.688 0.036 0.080 0.196 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.1908 0.72214 0.004 0.000 0.900 0.096 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.4430 0.63046 0.152 0.008 0.732 0.108 0.000 0.000
#> SRR816123 6 0.2969 0.55832 0.000 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR614779 3 0.2404 0.72405 0.016 0.000 0.872 0.112 0.000 0.000
#> SRR810783 3 0.6012 0.30451 0.220 0.008 0.492 0.280 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.5001 -0.04815 0.532 0.040 0.016 0.412 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.3585 0.64346 0.172 0.000 0.780 0.048 0.000 0.000
#> SRR808106 4 0.7496 -0.25867 0.184 0.008 0.264 0.404 0.140 0.000
#> SRR662713 3 0.5860 0.32103 0.220 0.008 0.532 0.240 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.2597 0.68496 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1480964 4 0.5443 0.05662 0.092 0.008 0.344 0.552 0.004 0.000
#> SRR809382 4 0.5463 0.36365 0.136 0.004 0.244 0.608 0.008 0.000
#> SRR665417 1 0.7254 0.03459 0.416 0.032 0.052 0.324 0.176 0.000
#> SRR1088016 2 0.3869 0.02135 0.000 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR1453166 6 0.0000 0.68833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.6068 0.53411 0.080 0.456 0.056 0.000 0.000 0.408
#> SRR1077781 6 0.6076 -0.49645 0.080 0.432 0.056 0.000 0.000 0.432
#> SRR615623 3 0.5232 0.50829 0.120 0.000 0.672 0.176 0.032 0.000
#> SRR1413787 3 0.5201 0.49366 0.124 0.000 0.672 0.176 0.028 0.000
#> SRR1478207 3 0.4568 0.61890 0.060 0.004 0.684 0.248 0.004 0.000
#> SRR1411046 1 0.4957 0.25932 0.644 0.040 0.036 0.280 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.5458 0.68050 0.056 0.568 0.040 0.000 0.000 0.336
#> SRR1326560 4 0.5256 0.21101 0.460 0.036 0.024 0.476 0.004 0.000
#> SRR1309051 1 0.6132 0.49633 0.512 0.020 0.256 0.212 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.2854 0.63315 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1395616 1 0.5039 0.28030 0.636 0.040 0.040 0.284 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.2416 0.62479 0.000 0.156 0.000 0.000 0.000 0.844
#> SRR1092961 6 0.3076 0.54008 0.000 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR817210 3 0.5556 0.29155 0.136 0.000 0.452 0.412 0.000 0.000
#> SRR1319221 5 0.0551 0.75823 0.004 0.008 0.004 0.000 0.984 0.000
#> SRR1405413 4 0.6503 -0.25530 0.272 0.016 0.288 0.420 0.004 0.000
#> SRR607807 5 0.6263 0.55577 0.388 0.028 0.036 0.068 0.480 0.000
#> SRR1390160 3 0.4478 0.56762 0.116 0.000 0.728 0.148 0.008 0.000
#> SRR1406283 1 0.5955 0.20952 0.440 0.008 0.384 0.168 0.000 0.000
#> SRR1357709 4 0.3230 0.62125 0.212 0.000 0.012 0.776 0.000 0.000
#> SRR1080742 6 0.2823 0.56690 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1468208 1 0.5010 0.34620 0.696 0.040 0.052 0.204 0.008 0.000
#> SRR1312766 3 0.2554 0.70330 0.076 0.000 0.876 0.048 0.000 0.000
#> SRR1361612 4 0.4502 0.52362 0.320 0.020 0.020 0.640 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.6146 0.30797 0.452 0.016 0.352 0.180 0.000 0.000
#> SRR1087801 4 0.6032 -0.15165 0.168 0.008 0.344 0.476 0.004 0.000
#> SRR1099720 6 0.4273 0.41462 0.048 0.136 0.048 0.000 0.000 0.768
#> SRR1349250 6 0.0260 0.68891 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1350912 2 0.2178 0.70867 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1357127 3 0.5653 0.36852 0.140 0.004 0.496 0.360 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.2219 0.71156 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1317022 3 0.4044 0.61638 0.064 0.000 0.772 0.148 0.016 0.000
#> SRR1332879 1 0.6015 0.23069 0.444 0.012 0.380 0.164 0.000 0.000
#> SRR1403177 5 0.3478 0.76239 0.040 0.060 0.016 0.036 0.848 0.000
#> SRR1076144 2 0.6075 0.51739 0.080 0.440 0.056 0.000 0.000 0.424
#> SRR1069614 6 0.0547 0.68780 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR818239 6 0.0865 0.67720 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1421069 6 0.0146 0.68794 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1500006 1 0.5543 0.54836 0.616 0.020 0.156 0.208 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.5870 0.18888 0.192 0.016 0.212 0.576 0.004 0.000
#> SRR1092232 4 0.7215 0.11754 0.140 0.004 0.164 0.456 0.236 0.000
#> SRR1344253 3 0.5953 0.19890 0.196 0.004 0.456 0.344 0.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.4893 0.41413 0.704 0.040 0.072 0.184 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.4345 0.63754 0.176 0.004 0.728 0.092 0.000 0.000
#> SRR1343522 6 0.6076 -0.48998 0.080 0.428 0.056 0.000 0.000 0.436
#> SRR1326727 2 0.6016 0.61240 0.080 0.500 0.056 0.000 0.000 0.364
#> SRR1440940 4 0.2088 0.63422 0.028 0.000 0.068 0.904 0.000 0.000
#> SRR818372 4 0.2020 0.62258 0.008 0.000 0.096 0.896 0.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.2219 0.71156 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR819894 4 0.3398 0.61800 0.216 0.004 0.012 0.768 0.000 0.000
#> SRR1310031 3 0.2006 0.71811 0.004 0.000 0.892 0.104 0.000 0.000
#> SRR615419 4 0.1951 0.62893 0.016 0.000 0.076 0.908 0.000 0.000
#> SRR1436925 4 0.3806 0.56823 0.080 0.012 0.112 0.796 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.4814 0.42262 0.684 0.032 0.052 0.232 0.000 0.000
#> SRR1332566 4 0.4974 0.32264 0.420 0.024 0.028 0.528 0.000 0.000
#> SRR1490228 4 0.4380 0.44918 0.040 0.012 0.232 0.712 0.004 0.000
#> SRR1442949 4 0.2946 0.59489 0.024 0.004 0.120 0.848 0.004 0.000
#> SRR1466239 1 0.5332 0.32909 0.628 0.040 0.068 0.264 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.6029 0.60186 0.080 0.492 0.056 0.000 0.000 0.372
#> SRR1329971 3 0.6235 -0.18323 0.360 0.012 0.412 0.216 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.3428 0.74198 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1097642 6 0.0000 0.68833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 3 0.2527 0.70807 0.064 0.004 0.884 0.048 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.4900 0.71549 0.032 0.624 0.032 0.000 0.000 0.312
#> SRR1471713 3 0.1957 0.71852 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR660522 3 0.2954 0.71414 0.048 0.000 0.844 0.108 0.000 0.000
#> SRR815374 4 0.3996 0.62984 0.168 0.000 0.080 0.752 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.2883 0.57980 0.000 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR1416337 3 0.2263 0.72445 0.016 0.000 0.884 0.100 0.000 0.000
#> SRR1316438 5 0.6550 0.70742 0.148 0.004 0.084 0.216 0.548 0.000
#> SRR1386844 1 0.4982 0.07486 0.576 0.040 0.020 0.364 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.4493 0.38346 0.728 0.036 0.044 0.192 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.3330 0.74979 0.000 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1487128 1 0.5719 0.29046 0.472 0.032 0.076 0.420 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.2219 0.71156 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1069919 2 0.6035 0.59256 0.080 0.488 0.056 0.000 0.000 0.376
#> SRR1460296 1 0.5888 0.49320 0.524 0.008 0.256 0.212 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.5310 -0.10712 0.480 0.036 0.036 0.448 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.2969 0.74988 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1081425 1 0.5741 0.54344 0.588 0.020 0.184 0.208 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.6421 0.24438 0.140 0.000 0.564 0.192 0.104 0.000
#> SRR1071337 2 0.2416 0.69745 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1071983 6 0.6023 -0.38520 0.080 0.368 0.056 0.000 0.000 0.496
#> SRR1331793 2 0.3464 0.73797 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1410510 3 0.2053 0.71771 0.004 0.000 0.888 0.108 0.000 0.000
#> SRR1098761 6 0.2941 0.55873 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1312124 4 0.4981 0.59710 0.244 0.020 0.076 0.660 0.000 0.000
#> SRR615395 3 0.5241 0.16736 0.388 0.008 0.528 0.076 0.000 0.000
#> SRR1479349 4 0.4454 0.48189 0.348 0.032 0.004 0.616 0.000 0.000
#> SRR2165033 4 0.4270 0.53058 0.100 0.000 0.156 0.740 0.004 0.000
#> SRR1089054 2 0.2793 0.62445 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR816201 4 0.1556 0.62617 0.000 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1488514 6 0.6068 -0.44996 0.080 0.408 0.056 0.000 0.000 0.456
#> SRR655840 4 0.3359 0.62053 0.196 0.008 0.012 0.784 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.5233 0.32697 0.628 0.040 0.056 0.276 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.3037 0.62841 0.160 0.004 0.016 0.820 0.000 0.000
#> SRR613174 3 0.2629 0.71419 0.060 0.000 0.872 0.068 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.2826 0.69650 0.092 0.000 0.856 0.052 0.000 0.000
#> SRR659157 4 0.1644 0.62507 0.028 0.000 0.040 0.932 0.000 0.000
#> SRR1480408 4 0.3401 0.62227 0.204 0.004 0.016 0.776 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.2772 0.62312 0.180 0.000 0.004 0.816 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.6071 0.52885 0.080 0.452 0.056 0.000 0.000 0.412
#> SRR1332526 4 0.3543 0.61441 0.224 0.004 0.016 0.756 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.3023 0.54607 0.000 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1431270 4 0.1765 0.62261 0.000 0.000 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1085614 6 0.6023 -0.36407 0.080 0.368 0.056 0.000 0.000 0.496
#> SRR1330106 4 0.1700 0.62542 0.004 0.000 0.080 0.916 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.5838 0.54222 0.572 0.020 0.196 0.212 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.6030 0.34797 0.612 0.028 0.064 0.240 0.056 0.000
#> SRR1082784 2 0.5693 0.67527 0.060 0.560 0.056 0.000 0.000 0.324
#> SRR1457267 1 0.4752 0.45777 0.724 0.036 0.084 0.156 0.000 0.000
#> SRR614659 4 0.2322 0.62465 0.036 0.004 0.064 0.896 0.000 0.000
#> SRR659247 4 0.5730 0.16676 0.156 0.012 0.248 0.580 0.004 0.000
#> SRR1317201 1 0.5113 0.09172 0.572 0.040 0.028 0.360 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.5966 0.13136 0.412 0.008 0.412 0.168 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.5816 0.53960 0.576 0.020 0.196 0.208 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.3266 0.75274 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1096363 6 0.0632 0.68621 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1453662 4 0.3618 0.58872 0.084 0.016 0.084 0.816 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.3351 0.74836 0.000 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1353499 1 0.5808 0.53629 0.568 0.016 0.204 0.212 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.4429 0.37717 0.732 0.036 0.040 0.192 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.4780 0.62605 0.120 0.008 0.692 0.180 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.4970 0.55894 0.696 0.028 0.104 0.172 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.6076 0.49138 0.080 0.432 0.056 0.000 0.000 0.432
#> SRR1498183 1 0.6537 0.20192 0.368 0.016 0.360 0.252 0.004 0.000
#> SRR612659 3 0.2320 0.71393 0.004 0.000 0.864 0.132 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.2178 0.70867 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR658597 6 0.1556 0.66906 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1089595 6 0.0000 0.68833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 6 0.6041 -0.41491 0.080 0.380 0.056 0.000 0.000 0.484
#> SRR1376786 3 0.4047 0.46043 0.296 0.000 0.676 0.028 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.5695 0.34263 0.272 0.008 0.552 0.168 0.000 0.000
#> SRR1071035 4 0.6414 -0.44629 0.292 0.008 0.304 0.392 0.004 0.000
#> SRR1068808 6 0.0363 0.68879 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1332754 2 0.2178 0.70867 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR662438 1 0.5991 0.52593 0.544 0.020 0.224 0.212 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.5095 0.48333 0.692 0.036 0.112 0.160 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.2145 0.72198 0.028 0.000 0.900 0.072 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.2053 0.72203 0.004 0.000 0.888 0.108 0.000 0.000
#> SRR1381711 3 0.4585 0.63875 0.088 0.008 0.704 0.200 0.000 0.000
#> SRR657985 3 0.2491 0.72070 0.020 0.000 0.868 0.112 0.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.6302 0.37516 0.388 0.008 0.304 0.300 0.000 0.000
#> SRR1336505 4 0.4143 0.53420 0.120 0.000 0.120 0.756 0.004 0.000
#> SRR1474095 3 0.6199 0.25009 0.212 0.008 0.460 0.316 0.004 0.000
#> SRR1363831 2 0.3446 0.74033 0.000 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1442376 4 0.3576 0.61598 0.212 0.012 0.012 0.764 0.000 0.000
#> SRR1074909 6 0.1556 0.66442 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1101200 3 0.3936 0.47437 0.288 0.000 0.688 0.024 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.2597 0.73456 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1367150 4 0.3562 0.63084 0.168 0.004 0.040 0.788 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.2178 0.70867 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1068880 2 0.2416 0.69166 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1467277 3 0.4485 0.62318 0.064 0.004 0.684 0.248 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.2219 0.70738 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1095431 6 0.0790 0.68051 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1380184 2 0.6016 0.61260 0.080 0.500 0.056 0.000 0.000 0.364
#> SRR1443113 1 0.6173 0.28225 0.400 0.008 0.372 0.220 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.2318 0.71754 0.044 0.000 0.892 0.064 0.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.6115 0.47563 0.500 0.016 0.272 0.212 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.6066 0.54592 0.080 0.460 0.056 0.000 0.000 0.404
#> SRR1421116 2 0.3126 0.75286 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR602282 5 0.4784 0.79649 0.140 0.000 0.028 0.112 0.720 0.000
#> SRR1361195 2 0.6075 0.50616 0.080 0.440 0.056 0.000 0.000 0.424
#> SRR600493 1 0.6157 0.21020 0.404 0.012 0.392 0.192 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.4013 0.58596 0.212 0.008 0.740 0.040 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.2384 0.71763 0.048 0.000 0.888 0.064 0.000 0.000
#> SRR1360785 4 0.3716 0.59771 0.248 0.008 0.012 0.732 0.000 0.000
#> SRR810437 4 0.2510 0.61423 0.028 0.000 0.100 0.872 0.000 0.000
#> SRR1361860 4 0.4012 0.57773 0.232 0.000 0.032 0.728 0.008 0.000
#> SRR1441311 2 0.4363 0.72063 0.040 0.636 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1098903 4 0.3488 0.61867 0.216 0.004 0.016 0.764 0.000 0.000
#> SRR1457619 4 0.3020 0.63257 0.076 0.000 0.080 0.844 0.000 0.000
#> SRR1498529 4 0.4014 0.57902 0.268 0.016 0.012 0.704 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.3464 0.73797 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1074017 6 0.4923 0.14854 0.028 0.264 0.052 0.000 0.000 0.656
#> SRR1472033 6 0.6055 -0.41785 0.080 0.392 0.056 0.000 0.000 0.472
#> SRR1445087 4 0.7514 -0.18146 0.156 0.004 0.276 0.380 0.184 0.000
#> SRR1399525 6 0.5430 -0.26123 0.072 0.396 0.012 0.000 0.004 0.516
#> SRR1312844 6 0.3023 0.56895 0.000 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1085874 6 0.2823 0.58550 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1101226 6 0.4377 0.43169 0.000 0.244 0.000 0.000 0.068 0.688
#> SRR1476056 4 0.3507 0.59965 0.232 0.012 0.004 0.752 0.000 0.000
#> SRR1075659 6 0.0363 0.68879 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1311916 3 0.2053 0.71771 0.004 0.000 0.888 0.108 0.000 0.000
#> SRR1353353 5 0.6274 0.72309 0.144 0.004 0.068 0.204 0.580 0.000
#> SRR1073291 3 0.2433 0.72208 0.044 0.000 0.884 0.072 0.000 0.000
#> SRR1356227 4 0.4515 0.46542 0.356 0.028 0.008 0.608 0.000 0.000
#> SRR1080720 6 0.0260 0.68715 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1091695 6 0.0790 0.68773 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1350304 4 0.3296 0.62513 0.180 0.004 0.020 0.796 0.000 0.000
#> SRR663002 3 0.2320 0.70908 0.004 0.000 0.864 0.132 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.3330 0.74944 0.000 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1399926 1 0.5183 0.20035 0.600 0.040 0.040 0.320 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.1863 0.72042 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.5282 0.19924 0.584 0.040 0.044 0.332 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.3330 0.52263 0.000 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR614047 3 0.5272 0.54232 0.148 0.008 0.628 0.216 0.000 0.000
#> SRR818440 4 0.4559 0.42329 0.060 0.000 0.272 0.664 0.004 0.000
#> SRR1337770 4 0.4044 0.60445 0.176 0.008 0.060 0.756 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.6031 0.19818 0.244 0.008 0.492 0.256 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.2823 0.74417 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1473959 4 0.2070 0.62705 0.012 0.000 0.092 0.896 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.2511 0.71516 0.056 0.000 0.880 0.064 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.3330 0.74932 0.000 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR659460 3 0.4637 0.62042 0.136 0.008 0.712 0.144 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.2389 0.71497 0.052 0.000 0.888 0.060 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.2147 0.72303 0.020 0.000 0.896 0.084 0.000 0.000
#> SRR1499418 4 0.3432 0.59117 0.064 0.004 0.104 0.824 0.004 0.000
#> SRR1352894 2 0.2941 0.74820 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR815805 4 0.6320 -0.25021 0.364 0.004 0.160 0.448 0.024 0.000
#> SRR1331083 6 0.0547 0.68780 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR808272 3 0.1663 0.72219 0.000 0.000 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.6015 0.27781 0.460 0.012 0.360 0.168 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.3023 0.55411 0.000 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1357672 3 0.2308 0.72047 0.040 0.000 0.892 0.068 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.5741 0.54344 0.588 0.020 0.184 0.208 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.6241 0.50870 0.440 0.012 0.188 0.356 0.004 0.000
#> SRR814491 4 0.3485 0.62348 0.204 0.004 0.020 0.772 0.000 0.000
#> SRR1101256 6 0.6066 -0.44230 0.080 0.404 0.056 0.000 0.000 0.460
#> SRR1436004 1 0.6088 0.37774 0.468 0.012 0.328 0.192 0.000 0.000
#> SRR1457994 6 0.6071 -0.45609 0.080 0.412 0.056 0.000 0.000 0.452
#> SRR1078998 2 0.2178 0.70867 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1314707 4 0.4431 0.56143 0.248 0.032 0.016 0.700 0.004 0.000
#> SRR1309534 4 0.2573 0.63484 0.112 0.000 0.024 0.864 0.000 0.000
#> SRR615527 5 0.4672 0.79999 0.112 0.000 0.040 0.108 0.740 0.000
#> SRR1098216 1 0.5610 -0.00773 0.488 0.040 0.056 0.416 0.000 0.000
#> SRR1325847 6 0.0547 0.68780 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1404003 4 0.3371 0.62339 0.200 0.004 0.016 0.780 0.000 0.000
#> SRR1344166 4 0.4938 0.26302 0.244 0.016 0.068 0.668 0.004 0.000
#> SRR1368638 4 0.3480 0.62281 0.200 0.008 0.016 0.776 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.2340 0.70159 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1079237 6 0.0000 0.68833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.5853 0.64550 0.068 0.528 0.056 0.000 0.000 0.348
#> SRR815759 4 0.5034 0.22770 0.080 0.004 0.328 0.588 0.000 0.000
#> SRR1502143 3 0.2066 0.72101 0.024 0.000 0.904 0.072 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.5042 0.51358 0.124 0.000 0.700 0.140 0.036 0.000
#> SRR1402307 2 0.3748 0.74338 0.012 0.688 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR820810 4 0.3870 0.61063 0.128 0.012 0.072 0.788 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.6074 0.51013 0.080 0.444 0.056 0.000 0.000 0.420
#> SRR1083215 3 0.5412 0.45357 0.200 0.008 0.612 0.180 0.000 0.000
#> SRR1476547 6 0.0146 0.68782 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR656421 1 0.5854 -0.10350 0.452 0.032 0.076 0.436 0.004 0.000
#> SRR1086116 2 0.2260 0.71458 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1499917 4 0.2499 0.64169 0.048 0.000 0.072 0.880 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.6743 0.35232 0.024 0.500 0.044 0.000 0.140 0.292
#> SRR1391444 2 0.5900 0.66810 0.080 0.548 0.056 0.000 0.000 0.316
#> SRR1434889 4 0.1320 0.62834 0.036 0.000 0.016 0.948 0.000 0.000
#> SRR1431847 4 0.3218 0.57777 0.080 0.000 0.072 0.840 0.008 0.000
#> SRR1317155 4 0.3707 0.56379 0.120 0.000 0.044 0.808 0.028 0.000
#> SRR1477405 1 0.5543 0.55022 0.616 0.020 0.156 0.208 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.2697 0.63308 0.068 0.008 0.048 0.876 0.000 0.000
#> SRR1341683 4 0.2255 0.62156 0.028 0.000 0.080 0.892 0.000 0.000
#> SRR1084790 3 0.6173 0.07737 0.324 0.012 0.452 0.212 0.000 0.000
#> SRR1073731 4 0.4044 0.47887 0.040 0.004 0.212 0.740 0.004 0.000
#> SRR1332588 4 0.3577 0.61618 0.200 0.016 0.012 0.772 0.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.3446 0.74033 0.000 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR654945 3 0.2442 0.71704 0.048 0.000 0.884 0.068 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.6166 0.45522 0.484 0.016 0.288 0.212 0.000 0.000
#> SRR1413477 6 0.6073 -0.47778 0.080 0.416 0.056 0.000 0.000 0.448
#> SRR1101152 4 0.5775 0.15506 0.200 0.016 0.188 0.592 0.004 0.000
#> SRR1358435 6 0.0547 0.68780 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR2165273 1 0.4778 0.35102 0.692 0.040 0.044 0.224 0.000 0.000
#> SRR1379014 4 0.4266 0.47602 0.356 0.020 0.004 0.620 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.2053 0.71798 0.000 0.000 0.888 0.108 0.004 0.000
#> SRR1416386 6 0.0632 0.68621 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1406048 4 0.4452 0.53039 0.312 0.028 0.012 0.648 0.000 0.000
#> SRR606982 4 0.5013 0.27348 0.108 0.004 0.228 0.656 0.004 0.000
#> SRR1358082 1 0.5448 0.55207 0.628 0.020 0.144 0.208 0.000 0.000
#> SRR1312934 4 0.5550 0.18902 0.104 0.016 0.288 0.588 0.004 0.000
#> SRR655194 4 0.5288 0.46563 0.332 0.024 0.064 0.580 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.6071 0.53498 0.080 0.452 0.056 0.000 0.000 0.412
#> SRR1473251 6 0.0146 0.68782 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1389820 5 0.0551 0.75823 0.004 0.008 0.004 0.000 0.984 0.000
#> SRR1074289 3 0.3123 0.71502 0.076 0.000 0.836 0.088 0.000 0.000
#> SRR1348816 6 0.6063 -0.43248 0.080 0.400 0.056 0.000 0.000 0.464
#> SRR1076292 4 0.4980 0.45880 0.140 0.004 0.164 0.684 0.008 0.000
#> SRR1395810 2 0.5856 0.58018 0.060 0.476 0.056 0.000 0.000 0.408
#> SRR1498909 4 0.1643 0.62889 0.008 0.000 0.068 0.924 0.000 0.000
#> SRR1443507 3 0.3886 0.68020 0.124 0.008 0.784 0.084 0.000 0.000
#> SRR1452310 4 0.3091 0.58575 0.024 0.000 0.148 0.824 0.004 0.000
#> SRR665610 4 0.2250 0.61989 0.020 0.000 0.092 0.888 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.5822 0.51747 0.540 0.008 0.236 0.216 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.2941 0.55373 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1477256 1 0.5911 0.50371 0.520 0.008 0.252 0.220 0.000 0.000
#> SRR1470230 4 0.3666 0.57145 0.068 0.004 0.120 0.804 0.004 0.000
#> SRR1354247 1 0.5853 0.29411 0.508 0.012 0.112 0.360 0.008 0.000
#> SRR1082640 2 0.2454 0.68784 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1487592 3 0.3434 0.67204 0.140 0.004 0.808 0.048 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.6101 0.24119 0.416 0.008 0.376 0.200 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.1007 0.67574 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1434117 3 0.5626 0.40566 0.244 0.008 0.572 0.176 0.000 0.000
#> SRR1075273 6 0.1700 0.63603 0.004 0.080 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR658657 4 0.2006 0.61829 0.004 0.000 0.104 0.892 0.000 0.000
#> SRR1092773 6 0.0632 0.68621 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1365332 3 0.2499 0.70454 0.072 0.000 0.880 0.048 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.2092 0.71864 0.000 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR1097688 6 0.0458 0.68815 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1403259 4 0.5082 0.43734 0.160 0.004 0.104 0.700 0.032 0.000
#> SRR1099120 6 0.0000 0.68833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.1958 0.72427 0.004 0.000 0.896 0.100 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.6016 0.61286 0.080 0.500 0.056 0.000 0.000 0.364
#> SRR1347298 3 0.4461 0.60432 0.080 0.000 0.732 0.172 0.016 0.000
#> SRR1075923 6 0.1075 0.67227 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1100703 3 0.4743 0.60068 0.152 0.008 0.700 0.140 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.4363 0.564 0.564
#> 3 3 0.945 0.930 0.967 0.4213 0.805 0.656
#> 4 4 0.639 0.641 0.744 0.1478 0.832 0.583
#> 5 5 0.624 0.532 0.725 0.0686 0.899 0.679
#> 6 6 0.647 0.535 0.721 0.0536 0.869 0.548
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1436370 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1075752 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1397949 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1355723 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1329744 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR657384 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1351190 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1458662 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR818573 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1396017 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1410742 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1435963 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1382416 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1391354 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1087968 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1310075 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1312244 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1325138 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1326821 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1490178 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR655613 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1075707 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1443871 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1102489 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1465758 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1414058 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1407449 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1436858 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1479109 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1399069 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1366450 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1396859 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1457176 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1097666 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1434736 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1080560 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1322882 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1435688 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1327614 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR658152 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1368141 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1440268 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1453725 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1325711 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1477930 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1477591 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1416049 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR656275 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1369052 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1377735 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1331244 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1404531 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1324331 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1458890 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1432695 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1407624 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1431969 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1087393 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1077263 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1385211 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR655241 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR656922 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1361630 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1318966 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1407087 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR603212 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1321088 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1485190 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1332232 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1312645 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1457835 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1347123 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1465501 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1330878 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1445064 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1452981 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1326708 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1407157 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1365401 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1397697 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1477316 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1077898 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1349080 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1076096 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR811261 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1375485 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1432563 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR604414 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1380614 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR812060 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR602082 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1069490 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1078417 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR661613 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1420710 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR660426 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1416003 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR661064 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1082011 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1452718 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1353243 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1455482 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1313473 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1399394 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1102467 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1317470 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1337707 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1408752 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1474617 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1398013 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1352918 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1420750 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1071785 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1353618 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1082217 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1357256 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1490313 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1366560 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1355684 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1323289 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1313494 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1309985 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR607911 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1333789 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1400078 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1088631 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1092842 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR615575 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1079434 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1325559 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1446695 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1383883 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1396100 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1475697 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1488067 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1102103 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1105154 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1084991 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1410380 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1445490 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1454671 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1435044 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1485812 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1078020 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1311153 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1376406 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1343898 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR807775 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1409215 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR820427 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1100656 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1362159 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1414536 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR656794 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR604653 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1317685 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1485912 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1407602 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1356164 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1328692 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1362438 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1479216 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1358041 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1468766 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1368200 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1435602 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1501043 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1437256 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1487446 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR816653 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR815164 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1442043 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1410573 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1096782 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1352369 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1382934 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1465208 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1314728 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1470291 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1308756 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1409600 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR816123 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR614779 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR810783 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1333990 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1410356 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR808106 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR662713 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1447058 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1480964 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR809382 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR665417 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1088016 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1453166 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1069826 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1077781 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR615623 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1413787 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1478207 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1411046 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1313711 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1326560 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1309051 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1486949 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1395616 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1074956 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1092961 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR817210 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1319221 2 0.795 0.684 0.24 0.76
#> SRR1405413 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR607807 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1390160 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1406283 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1357709 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1080742 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1468208 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1312766 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1361612 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1311224 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1087801 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1099720 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1349250 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1350912 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1357127 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1074980 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1317022 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1332879 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1403177 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1076144 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1069614 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR818239 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1421069 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1500006 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1485678 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1092232 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1344253 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1384290 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1089349 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1343522 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1326727 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1440940 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR818372 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1323675 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR819894 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1310031 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR615419 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1436925 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1477238 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1332566 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1490228 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1442949 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1466239 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1094003 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1329971 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR813076 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1097642 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1322981 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1485976 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1471713 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR660522 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR815374 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1069564 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1416337 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1316438 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1386844 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1373718 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1447458 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1487128 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1441421 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1069919 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1460296 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1335489 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1393404 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1081425 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1401815 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1071337 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1071983 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1331793 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1410510 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1098761 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1312124 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR615395 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1479349 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR2165033 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1089054 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR816201 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1488514 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR655840 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1379303 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1418516 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR613174 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1351125 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR659157 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1480408 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR657857 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1073317 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1332526 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1094168 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1431270 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1085614 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1330106 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1466154 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1396944 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1082784 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1457267 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR614659 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR659247 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1317201 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1473696 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1375842 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1388123 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1096363 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1453662 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1345499 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1353499 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1416693 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1070841 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1380910 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1333125 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1498183 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR612659 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1447148 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR658597 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1089595 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1074263 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1376786 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1345995 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1071035 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1068808 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1332754 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR662438 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1335355 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR659448 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1323558 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1381711 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR657985 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1314810 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1336505 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1474095 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1363831 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1442376 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1074909 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1101200 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1075408 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1367150 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1313406 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1068880 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1467277 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1084867 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1095431 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1380184 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1443113 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1380414 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1315912 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1075778 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1421116 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR602282 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1361195 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR600493 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1477653 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1355475 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1360785 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR810437 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1361860 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1441311 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1098903 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1457619 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1498529 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1097172 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1074017 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1472033 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1445087 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1399525 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1312844 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1085874 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1101226 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1476056 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1075659 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1311916 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1353353 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1073291 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1356227 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1080720 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1091695 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1350304 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR663002 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1376983 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1399926 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1347144 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1384006 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1499108 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR614047 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR818440 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1337770 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1399413 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1385542 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1473959 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1074041 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1394495 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR659460 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR816699 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1308612 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1499418 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1352894 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR815805 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1331083 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR808272 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1436698 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1095627 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1357672 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1351236 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1077479 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR814491 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1101256 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1436004 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1457994 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1078998 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1314707 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1309534 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR615527 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1098216 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1325847 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1404003 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1344166 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1368638 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1431429 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1079237 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1080509 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR815759 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1502143 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1487614 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1402307 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR820810 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1099212 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1083215 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1476547 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR656421 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1086116 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1499917 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1339944 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1391444 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1434889 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1431847 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1317155 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1477405 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR655289 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1341683 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1084790 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1073731 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1332588 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1471157 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR654945 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR661028 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1413477 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1101152 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1358435 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR2165273 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1379014 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1489904 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1416386 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1406048 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR606982 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1358082 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1312934 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR655194 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1331174 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1473251 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1389820 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1074289 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1348816 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1076292 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1395810 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1498909 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1443507 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1452310 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR665610 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1347322 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR813395 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1477256 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1470230 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1354247 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1082640 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1487592 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1352299 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1076317 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1434117 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1075273 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR658657 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1092773 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1365332 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR615958 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1097688 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1403259 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1099120 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1362200 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1464856 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1347298 1 0.000 1.000 1.00 0.00
#> SRR1075923 2 0.000 0.998 0.00 1.00
#> SRR1100703 1 0.000 1.000 1.00 0.00
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.1031 0.98106 0.000 0.976 0.024
#> SRR1443871 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1407449 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0892 0.95229 0.980 0.000 0.020
#> SRR1399069 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.1411 0.93669 0.964 0.000 0.036
#> SRR1080560 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.5327 0.58122 0.728 0.000 0.272
#> SRR1368141 3 0.2625 0.89196 0.084 0.000 0.916
#> SRR1440268 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.6215 0.13670 0.572 0.000 0.428
#> SRR1369052 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 3 0.1163 0.91390 0.028 0.000 0.972
#> SRR1432695 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1087393 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.1529 0.93274 0.960 0.000 0.040
#> SRR1385211 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.1163 0.91387 0.028 0.000 0.972
#> SRR1318966 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.1163 0.91390 0.028 0.000 0.972
#> SRR603212 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1332232 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.2796 0.88638 0.092 0.000 0.908
#> SRR1465501 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1445064 3 0.4504 0.79513 0.196 0.000 0.804
#> SRR1452981 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 3 0.1411 0.91230 0.036 0.000 0.964
#> SRR602082 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.5926 0.55297 0.356 0.000 0.644
#> SRR1420710 1 0.4062 0.77690 0.836 0.000 0.164
#> SRR660426 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.6111 0.46558 0.396 0.000 0.604
#> SRR661064 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.6286 0.27346 0.464 0.000 0.536
#> SRR1337707 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1408752 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.0000 0.89171 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398013 1 0.0747 0.95597 0.984 0.000 0.016
#> SRR1352918 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1353618 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.0000 0.89171 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400078 1 0.0892 0.95233 0.980 0.000 0.020
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 3 0.1289 0.91327 0.032 0.000 0.968
#> SRR1079434 3 0.3267 0.86822 0.116 0.000 0.884
#> SRR1325559 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.3267 0.84928 0.884 0.000 0.116
#> SRR1383883 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0747 0.98715 0.000 0.984 0.016
#> SRR1410380 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1445490 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0424 0.96250 0.992 0.000 0.008
#> SRR1485812 3 0.2165 0.90242 0.064 0.000 0.936
#> SRR1078020 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.89171 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100656 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.2261 0.90056 0.068 0.000 0.932
#> SRR656794 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.1289 0.91327 0.032 0.000 0.968
#> SRR1485912 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1356164 1 0.3192 0.84974 0.888 0.000 0.112
#> SRR1328692 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362438 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1358041 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.2356 0.89899 0.928 0.000 0.072
#> SRR1368200 1 0.6095 0.26383 0.608 0.000 0.392
#> SRR1435602 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0000 0.89171 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 3 0.1289 0.91326 0.032 0.000 0.968
#> SRR1487446 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.6302 -0.08245 0.520 0.000 0.480
#> SRR1382934 3 0.0892 0.91065 0.020 0.000 0.980
#> SRR1465208 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.1163 0.91391 0.028 0.000 0.972
#> SRR1409600 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR816123 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR810783 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR1333990 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.3267 0.84602 0.884 0.000 0.116
#> SRR808106 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0592 0.95940 0.988 0.000 0.012
#> SRR1447058 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.6309 -0.14273 0.504 0.000 0.496
#> SRR809382 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR665417 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1413787 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1478207 3 0.4178 0.82070 0.172 0.000 0.828
#> SRR1411046 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.5785 0.43789 0.668 0.000 0.332
#> SRR1319221 3 0.0000 0.89171 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.2066 0.90343 0.060 0.000 0.940
#> SRR1406283 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0592 0.95956 0.988 0.000 0.012
#> SRR1361612 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0892 0.98412 0.000 0.980 0.020
#> SRR1349250 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.1643 0.92934 0.956 0.000 0.044
#> SRR1074980 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1332879 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1076144 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092232 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1344253 1 0.1529 0.93431 0.960 0.000 0.040
#> SRR1384290 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.5650 0.62298 0.312 0.000 0.688
#> SRR1343522 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.6286 0.27588 0.464 0.000 0.536
#> SRR818372 1 0.4504 0.72407 0.804 0.000 0.196
#> SRR1323675 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310031 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR615419 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1436925 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.4002 0.83328 0.160 0.000 0.840
#> SRR1442949 3 0.1860 0.90687 0.052 0.000 0.948
#> SRR1466239 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.1031 0.98106 0.000 0.976 0.024
#> SRR1322981 1 0.3879 0.80040 0.848 0.000 0.152
#> SRR1485976 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR660522 3 0.4178 0.82189 0.172 0.000 0.828
#> SRR815374 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1316438 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1386844 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1071337 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1098761 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479349 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.1411 0.93670 0.964 0.000 0.036
#> SRR1488514 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.1753 0.92445 0.952 0.000 0.048
#> SRR613174 3 0.1289 0.91327 0.032 0.000 0.968
#> SRR1351125 3 0.5733 0.61331 0.324 0.000 0.676
#> SRR659157 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1480408 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1085614 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.5650 0.63431 0.312 0.000 0.688
#> SRR1466154 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0592 0.95910 0.988 0.000 0.012
#> SRR659247 1 0.1529 0.93322 0.960 0.000 0.040
#> SRR1317201 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.6095 0.47486 0.392 0.000 0.608
#> SRR1380910 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1447148 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.1031 0.98106 0.000 0.976 0.024
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.2625 0.89253 0.084 0.000 0.916
#> SRR1323558 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1381711 1 0.3116 0.85518 0.892 0.000 0.108
#> SRR657985 1 0.6168 0.19564 0.588 0.000 0.412
#> SRR1314810 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.6302 -0.08140 0.520 0.000 0.480
#> SRR1474095 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0424 0.96276 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075408 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.2165 0.90244 0.064 0.000 0.936
#> SRR1084867 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.1411 0.91223 0.036 0.000 0.964
#> SRR1315912 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.1163 0.91391 0.028 0.000 0.972
#> SRR1361195 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.6111 0.46541 0.396 0.000 0.604
#> SRR1360785 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR810437 3 0.4399 0.80491 0.188 0.000 0.812
#> SRR1361860 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1399525 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1353353 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1073291 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1356227 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.1031 0.98106 0.000 0.976 0.024
#> SRR1091695 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.1289 0.94100 0.968 0.000 0.032
#> SRR663002 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1376983 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1384006 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR818440 1 0.5291 0.58823 0.732 0.000 0.268
#> SRR1337770 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.1643 0.90973 0.044 0.000 0.956
#> SRR1394495 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 3 0.6302 0.22040 0.480 0.000 0.520
#> SRR816699 3 0.1289 0.91327 0.032 0.000 0.968
#> SRR1308612 3 0.4842 0.76280 0.224 0.000 0.776
#> SRR1499418 3 0.1860 0.90693 0.052 0.000 0.948
#> SRR1352894 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1436698 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1098216 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.6079 0.47813 0.388 0.000 0.612
#> SRR1502143 3 0.5397 0.68538 0.280 0.000 0.720
#> SRR1487614 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1402307 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.1031 0.98106 0.000 0.976 0.024
#> SRR656421 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.2356 0.89810 0.928 0.000 0.072
#> SRR1339944 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.6280 0.00931 0.540 0.000 0.460
#> SRR1431847 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1317155 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR1341683 3 0.6154 0.43708 0.408 0.000 0.592
#> SRR1084790 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.6026 0.31479 0.624 0.000 0.376
#> SRR1332588 1 0.1753 0.92444 0.952 0.000 0.048
#> SRR1471157 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.3879 0.84033 0.152 0.000 0.848
#> SRR661028 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.3752 0.84643 0.144 0.000 0.856
#> SRR1416386 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.5905 0.39193 0.648 0.000 0.352
#> SRR1358082 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.6095 0.47501 0.392 0.000 0.608
#> SRR655194 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.1031 0.98106 0.000 0.976 0.024
#> SRR1389820 3 0.0000 0.89171 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074289 1 0.0892 0.95201 0.980 0.000 0.020
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.4702 0.77523 0.212 0.000 0.788
#> SRR1395810 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.2165 0.90197 0.064 0.000 0.936
#> SRR1443507 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0237 0.96583 0.996 0.000 0.004
#> SRR665610 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.1289 0.91327 0.032 0.000 0.968
#> SRR1354247 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.4887 0.66724 0.772 0.000 0.228
#> SRR1352299 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.2878 0.88428 0.096 0.000 0.904
#> SRR1075273 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 3 0.4291 0.81262 0.180 0.000 0.820
#> SRR1092773 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1097688 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1099120 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1464856 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.1031 0.91410 0.024 0.000 0.976
#> SRR1075923 2 0.0000 0.99906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.96893 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 4 0.4134 0.84421 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1436370 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075752 2 0.3444 0.90570 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1397949 1 0.3801 0.41547 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1355723 4 0.4343 0.84679 0.264 0.000 0.004 0.732
#> SRR1329744 4 0.4382 0.84499 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR657384 4 0.4277 0.84967 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1351190 4 0.4164 0.84679 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1458662 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4941 -0.34824 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1396017 4 0.4222 0.84951 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1410742 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1435963 4 0.4431 0.84118 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1382416 1 0.3801 0.41808 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1391354 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1087968 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 4 0.4907 0.70695 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1312244 4 0.4998 0.55770 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1325138 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1326821 1 0.1022 0.65988 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1490178 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0188 0.67175 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075707 2 0.4072 0.87437 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1443871 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.3688 0.89784 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1465758 1 0.4992 -0.46161 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1414058 3 0.4981 0.37506 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1407449 4 0.4804 0.76246 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1436858 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.1022 0.66551 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1399069 4 0.4134 0.84421 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1366450 1 0.0336 0.67124 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396859 4 0.4500 0.83303 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1457176 1 0.1716 0.63826 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1097666 2 0.3172 0.91091 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1434736 4 0.5573 0.81419 0.272 0.000 0.052 0.676
#> SRR1080560 2 0.3649 0.89951 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1322882 1 0.0188 0.67175 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435688 2 0.2469 0.92013 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1327614 1 0.4843 -0.18571 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR658152 4 0.5219 0.51372 0.056 0.000 0.216 0.728
#> SRR1368141 3 0.4955 0.54004 0.008 0.000 0.648 0.344
#> SRR1440268 4 0.4477 0.83543 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1453725 1 0.1940 0.62848 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1325711 2 0.1474 0.92368 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1477930 4 0.4356 0.84720 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1477591 1 0.0000 0.67191 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.6158 0.08210 0.056 0.000 0.384 0.560
#> SRR1369052 4 0.4304 0.84918 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1377735 1 0.1557 0.64388 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1331244 4 0.4382 0.84519 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1404531 1 0.3649 0.45228 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1324331 4 0.4564 0.82362 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1458890 3 0.5007 0.52617 0.008 0.000 0.636 0.356
#> SRR1432695 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.4585 0.54296 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1087393 2 0.3688 0.89915 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1077263 1 0.2011 0.61235 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1385211 1 0.4643 0.03092 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR655241 4 0.4304 0.84918 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR656922 4 0.4992 0.60226 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1361630 1 0.5000 -0.29057 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR1318966 2 0.3569 0.90263 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1407087 3 0.4916 0.43924 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR603212 1 0.0188 0.67175 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321088 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.1661 0.66520 0.052 0.000 0.944 0.004
#> SRR1332232 2 0.0592 0.92367 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312645 4 0.4250 0.84978 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1457835 1 0.2704 0.57858 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1347123 1 0.4948 -0.15312 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1465501 2 0.3356 0.90775 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1330878 3 0.3486 0.62871 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1445064 3 0.5233 0.54152 0.020 0.000 0.648 0.332
#> SRR1452981 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1326708 1 0.0817 0.66426 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1407157 1 0.4843 -0.18073 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1365401 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1477316 4 0.4193 0.84871 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1077898 1 0.2149 0.61780 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1349080 1 0.5007 -0.01209 0.636 0.000 0.008 0.356
#> SRR1076096 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.3074 0.91205 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1375485 1 0.4040 0.35853 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1432563 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR604414 1 0.0188 0.67183 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380614 1 0.4250 0.27176 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR812060 1 0.4925 -0.12792 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR602082 1 0.3123 0.53409 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1069490 2 0.3528 0.90327 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1078417 2 0.0921 0.92391 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR661613 1 0.5167 -0.25440 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR1420710 4 0.5653 0.58243 0.096 0.000 0.192 0.712
#> SRR660426 1 0.0469 0.66967 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416003 3 0.6277 0.20645 0.056 0.000 0.476 0.468
#> SRR661064 4 0.4250 0.84978 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1082011 2 0.0707 0.92448 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1452718 1 0.0336 0.67102 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353243 1 0.2868 0.56401 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1455482 1 0.4072 0.34279 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1313473 1 0.4713 -0.03535 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1399394 1 0.1211 0.65517 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1102467 4 0.4925 0.69436 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1317470 1 0.4454 0.21670 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1337707 3 0.4382 0.58740 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1408752 2 0.0817 0.92381 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1474617 3 0.0336 0.66458 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1398013 4 0.5528 0.67170 0.124 0.000 0.144 0.732
#> SRR1352918 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1420750 1 0.0336 0.67102 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071785 3 0.3945 0.63630 0.004 0.000 0.780 0.216
#> SRR1353618 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.4313 0.84437 0.260 0.000 0.004 0.736
#> SRR1366560 1 0.4933 -0.31473 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1355684 1 0.4855 -0.19709 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1323289 3 0.0188 0.66458 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313494 4 0.4406 0.84324 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1309985 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR607911 1 0.4972 -0.40198 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1333789 1 0.0592 0.66997 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1400078 4 0.5690 0.71287 0.168 0.000 0.116 0.716
#> SRR1088631 2 0.3266 0.91150 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1092842 2 0.3610 0.90106 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR615575 3 0.4996 0.34060 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1079434 3 0.4978 0.56571 0.012 0.000 0.664 0.324
#> SRR1325559 1 0.4697 -0.00904 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1446695 1 0.4382 0.29204 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1383883 4 0.5000 0.53749 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1396100 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1475697 4 0.5417 0.74685 0.180 0.000 0.088 0.732
#> SRR1488067 2 0.3400 0.90710 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1102103 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.3610 0.90106 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1084991 2 0.4072 0.87437 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1410380 3 0.4996 0.33982 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 4 0.4697 0.84508 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1485812 3 0.4769 0.57784 0.008 0.000 0.684 0.308
#> SRR1078020 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.1940 0.62848 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1376406 2 0.0469 0.92352 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1343898 3 0.0469 0.66476 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR807775 3 0.4855 0.47415 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1409215 2 0.3123 0.91451 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR820427 1 0.5929 0.03103 0.596 0.000 0.048 0.356
#> SRR1100656 2 0.3649 0.89951 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1362159 1 0.4564 0.09527 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1414536 3 0.4998 0.33016 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR656794 1 0.0336 0.67124 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR604653 1 0.2408 0.60084 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1317685 3 0.4831 0.60192 0.016 0.000 0.704 0.280
#> SRR1485912 1 0.0188 0.67175 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407602 3 0.4837 0.54219 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR1356164 4 0.6492 0.56679 0.144 0.000 0.220 0.636
#> SRR1328692 1 0.6214 0.18755 0.636 0.000 0.092 0.272
#> SRR1362438 1 0.0817 0.66433 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1479216 3 0.4804 0.49251 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1358041 4 0.4830 0.75283 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1468766 1 0.2647 0.58060 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1368200 3 0.4961 0.31103 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1435602 2 0.0336 0.92485 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1501043 3 0.2921 0.66535 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1437256 3 0.4964 0.50087 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1487446 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR816653 1 0.1867 0.63237 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR815164 4 0.4941 0.68204 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1442043 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1410573 1 0.4790 -0.11937 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1096782 2 0.3400 0.90929 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1352369 1 0.3751 0.43828 0.800 0.000 0.196 0.004
#> SRR1382934 3 0.1059 0.66709 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR1465208 4 0.4543 0.82751 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1314728 1 0.4981 -0.40959 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1470291 1 0.4996 -0.49316 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1308756 1 0.5000 -0.30462 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR1409600 1 0.0469 0.67068 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR816123 2 0.3219 0.91012 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR614779 3 0.4955 0.40861 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR810783 1 0.0592 0.67031 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1333990 4 0.4830 0.75026 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1410356 1 0.3074 0.54018 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR808106 1 0.3907 0.39825 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR662713 1 0.1557 0.64830 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.6079 0.50406 0.300 0.000 0.628 0.072
#> SRR809382 3 0.2530 0.66982 0.004 0.000 0.896 0.100
#> SRR665417 4 0.4730 0.78531 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR1088016 2 0.2973 0.91377 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1453166 2 0.3688 0.89784 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1069826 2 0.3444 0.90774 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1077781 2 0.3400 0.90990 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR615623 3 0.1867 0.66180 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1413787 3 0.2868 0.64691 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1478207 3 0.4564 0.54806 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1411046 4 0.4981 0.61829 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1313711 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1326560 4 0.4331 0.84808 0.288 0.000 0.000 0.712
#> SRR1309051 1 0.0188 0.67175 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486949 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 4 0.4888 0.71957 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1074956 2 0.3400 0.90612 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1092961 2 0.3123 0.91165 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR817210 1 0.5203 0.39036 0.720 0.000 0.232 0.048
#> SRR1319221 3 0.0336 0.66458 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1405413 1 0.4925 -0.30727 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR607807 1 0.4999 -0.50881 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1390160 3 0.4713 0.51649 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR1406283 1 0.0592 0.67001 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1357709 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1080742 2 0.3219 0.91012 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1468208 4 0.4999 0.54848 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1312766 1 0.1940 0.63583 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1361612 4 0.4406 0.84324 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1311224 1 0.0188 0.67183 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087801 1 0.1022 0.66097 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1099720 2 0.4040 0.87695 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1349250 2 0.4008 0.87947 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1350912 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.4360 0.46018 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1074980 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.3873 0.61056 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.67191 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.3257 0.66737 0.004 0.000 0.844 0.152
#> SRR1076144 2 0.0469 0.92352 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1069614 2 0.3610 0.90106 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR818239 2 0.3649 0.89951 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1421069 2 0.3528 0.90375 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1500006 1 0.2281 0.60929 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1485678 1 0.4817 -0.15423 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1092232 3 0.2466 0.66871 0.004 0.000 0.900 0.096
#> SRR1344253 1 0.3172 0.53614 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1384290 1 0.4985 -0.43883 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1089349 1 0.4746 0.04966 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1343522 2 0.1867 0.92327 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1326727 2 0.0817 0.92381 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1440940 4 0.5471 0.39696 0.048 0.000 0.268 0.684
#> SRR818372 4 0.6320 0.66812 0.180 0.000 0.160 0.660
#> SRR1323675 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 4 0.4939 0.80502 0.220 0.000 0.040 0.740
#> SRR1310031 3 0.4804 0.49251 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR615419 3 0.4605 0.55494 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1436925 1 0.4998 -0.50737 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1477238 1 0.4999 -0.50881 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1332566 4 0.4898 0.71257 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1490228 3 0.2797 0.67214 0.068 0.000 0.900 0.032
#> SRR1442949 3 0.5244 0.40499 0.008 0.000 0.556 0.436
#> SRR1466239 1 0.4989 -0.44875 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1094003 2 0.1118 0.92412 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1329971 1 0.0336 0.67094 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR813076 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.4072 0.87437 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1322981 1 0.3172 0.53507 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1485976 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1471713 3 0.4817 0.48755 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR660522 1 0.4866 -0.04523 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR815374 4 0.4564 0.82305 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1069564 2 0.3311 0.90798 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1416337 3 0.4985 0.36932 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1316438 3 0.3494 0.65933 0.004 0.000 0.824 0.172
#> SRR1386844 4 0.4804 0.76226 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1373718 4 0.4999 0.55218 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1447458 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 4 0.4967 0.64501 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1441421 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0707 0.92579 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1460296 1 0.3528 0.47440 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1335489 4 0.4543 0.82955 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1393404 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.2530 0.59198 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1401815 3 0.2408 0.65551 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.3610 0.90342 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1331793 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4382 0.57125 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR1098761 2 0.3311 0.90798 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1312124 4 0.4250 0.84978 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR615395 1 0.0817 0.66816 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1479349 4 0.4304 0.84918 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR2165033 4 0.4661 0.80382 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1089054 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 4 0.5361 0.77794 0.208 0.000 0.068 0.724
#> SRR1488514 2 0.3172 0.91386 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR655840 4 0.4956 0.81160 0.232 0.000 0.036 0.732
#> SRR1379303 1 0.4955 -0.35746 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1418516 4 0.5454 0.62078 0.096 0.000 0.172 0.732
#> SRR613174 1 0.4992 -0.25889 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1351125 1 0.4431 0.21897 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR659157 3 0.5060 0.45677 0.004 0.000 0.584 0.412
#> SRR1480408 4 0.4222 0.84958 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR657857 4 0.4250 0.85014 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1073317 2 0.1211 0.92426 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1332526 4 0.4222 0.84958 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1094168 2 0.3024 0.91292 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1431270 3 0.4720 0.56671 0.004 0.000 0.672 0.324
#> SRR1085614 2 0.3764 0.89579 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1330106 3 0.5735 0.44529 0.032 0.000 0.576 0.392
#> SRR1466154 1 0.0469 0.66967 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396944 4 0.4998 0.55954 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1082784 2 0.0188 0.92335 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457267 1 0.4898 -0.25649 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR614659 4 0.5873 0.79537 0.256 0.000 0.076 0.668
#> SRR659247 1 0.5910 0.32789 0.672 0.000 0.244 0.084
#> SRR1317201 4 0.4898 0.71186 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1473696 1 0.0188 0.67183 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375842 1 0.2469 0.59656 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1388123 2 0.0469 0.92352 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1096363 2 0.3649 0.89958 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1453662 4 0.4898 0.71781 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1345499 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0469 0.66967 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416693 4 0.5000 0.52575 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1070841 1 0.4916 -0.09312 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1380910 1 0.4624 0.04567 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1333125 2 0.1022 0.92336 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1498183 1 0.3528 0.47670 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR612659 3 0.4605 0.54027 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.3486 0.90437 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1089595 2 0.4072 0.87437 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1074263 2 0.2345 0.92101 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1376786 1 0.0592 0.67001 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1345995 1 0.0188 0.67183 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071035 1 0.0188 0.67175 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1068808 2 0.3688 0.89784 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1332754 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.2345 0.60631 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1335355 1 0.4713 -0.03804 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR659448 1 0.4661 0.11134 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1323558 3 0.4907 0.44652 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1381711 1 0.4193 0.34420 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR657985 1 0.3942 0.37440 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1314810 1 0.0592 0.66888 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1336505 3 0.7239 0.24102 0.156 0.000 0.500 0.344
#> SRR1474095 1 0.4134 0.32167 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1363831 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442376 4 0.4164 0.84679 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1074909 2 0.3444 0.90520 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1101200 1 0.1792 0.63879 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 4 0.4283 0.84142 0.256 0.000 0.004 0.740
#> SRR1313406 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4406 0.57004 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.3444 0.90520 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1380184 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0592 0.66804 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1380414 1 0.4907 -0.09724 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1315912 1 0.0336 0.67102 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1075778 2 0.0921 0.92331 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1421116 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.4964 0.50116 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1361195 2 0.0469 0.92352 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR600493 1 0.0336 0.67102 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477653 1 0.0188 0.67169 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1355475 1 0.4382 0.23824 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1360785 4 0.4277 0.84974 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR810437 3 0.5297 0.56708 0.032 0.000 0.676 0.292
#> SRR1361860 4 0.4564 0.82268 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1441311 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1457619 4 0.4304 0.84917 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1498529 4 0.4277 0.84967 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1097172 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.3528 0.90532 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1472033 2 0.1792 0.92320 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1445087 3 0.2011 0.66110 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1399525 2 0.3219 0.91064 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1312844 2 0.3172 0.91091 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1085874 2 0.3400 0.90612 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1101226 2 0.3024 0.91292 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1476056 4 0.4193 0.84877 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1075659 2 0.3649 0.89951 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1311916 3 0.4817 0.48797 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1353353 3 0.2973 0.66725 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1073291 1 0.4977 -0.20749 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1356227 4 0.4356 0.84670 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1080720 2 0.4103 0.87172 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1091695 2 0.3528 0.90327 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1350304 4 0.5458 0.54953 0.076 0.000 0.204 0.720
#> SRR663002 3 0.4193 0.58918 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 4 0.4994 0.58036 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1347144 3 0.4843 0.47895 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1384006 4 0.4998 0.56654 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1499108 2 0.3123 0.91165 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR614047 3 0.4624 0.53732 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR818440 4 0.7803 0.28656 0.252 0.000 0.352 0.396
#> SRR1337770 4 0.4697 0.79466 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR1399413 1 0.0376 0.67212 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1385542 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 4 0.4632 0.83425 0.308 0.000 0.004 0.688
#> SRR1074041 1 0.4585 0.15915 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.4277 0.27933 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR816699 1 0.4830 -0.01358 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1308612 1 0.4543 0.17075 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1499418 3 0.4608 0.58493 0.004 0.000 0.692 0.304
#> SRR1352894 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 4 0.5126 0.65372 0.444 0.000 0.004 0.552
#> SRR1331083 2 0.3486 0.90437 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR808272 3 0.4989 0.36194 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1436698 1 0.0657 0.67128 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1095627 2 0.3219 0.91012 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1357672 1 0.0592 0.67001 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1351236 1 0.2814 0.56778 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1077479 1 0.3801 0.41967 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR814491 4 0.4164 0.84679 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1101256 2 0.1022 0.92393 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1436004 1 0.0000 0.67191 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.3444 0.90821 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1078998 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.4222 0.84958 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1309534 4 0.4164 0.84679 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR615527 3 0.1743 0.66494 0.056 0.000 0.940 0.004
#> SRR1098216 4 0.4500 0.83448 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1325847 2 0.3528 0.90375 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1404003 4 0.4313 0.84437 0.260 0.000 0.004 0.736
#> SRR1344166 1 0.4955 -0.36744 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1368638 4 0.5041 0.80768 0.232 0.000 0.040 0.728
#> SRR1431429 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.3873 0.88762 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1080509 2 0.0469 0.92352 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR815759 3 0.5330 0.66149 0.132 0.000 0.748 0.120
#> SRR1502143 1 0.4477 0.21879 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1487614 3 0.4406 0.56938 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 4 0.4817 0.76209 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1099212 2 0.3444 0.90774 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1083215 1 0.0000 0.67191 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.4134 0.86900 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR656421 1 0.4994 -0.47474 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1086116 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 4 0.5568 0.65981 0.120 0.000 0.152 0.728
#> SRR1339944 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1391444 2 0.0188 0.92404 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1434889 3 0.5657 0.37711 0.024 0.000 0.540 0.436
#> SRR1431847 3 0.4964 0.50390 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1317155 4 0.4343 0.84679 0.264 0.000 0.004 0.732
#> SRR1477405 1 0.3688 0.44345 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR655289 4 0.4428 0.84856 0.276 0.000 0.004 0.720
#> SRR1341683 4 0.6252 -0.08742 0.056 0.000 0.432 0.512
#> SRR1084790 1 0.0188 0.67175 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073731 3 0.7079 0.38432 0.276 0.000 0.556 0.168
#> SRR1332588 4 0.5540 0.63973 0.108 0.000 0.164 0.728
#> SRR1471157 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.4643 0.12694 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR661028 1 0.0336 0.67102 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413477 2 0.0921 0.92331 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1101152 1 0.3157 0.55547 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1358435 2 0.3610 0.90122 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR2165273 4 0.4996 0.57158 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1379014 4 0.4356 0.84707 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1489904 1 0.4972 -0.20255 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1416386 2 0.3528 0.90375 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1406048 4 0.4250 0.84978 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR606982 3 0.5807 0.63596 0.132 0.000 0.708 0.160
#> SRR1358082 1 0.3569 0.46715 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1312934 3 0.4741 0.53665 0.328 0.000 0.668 0.004
#> SRR655194 4 0.4746 0.78213 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1331174 2 0.0817 0.92381 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1473251 2 0.4134 0.86900 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1389820 3 0.0336 0.66458 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1074289 1 0.1792 0.62977 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1348816 2 0.2345 0.92112 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1076292 3 0.5252 0.54349 0.020 0.000 0.644 0.336
#> SRR1395810 2 0.0336 0.92342 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1498909 3 0.4741 0.56156 0.004 0.000 0.668 0.328
#> SRR1443507 1 0.0707 0.66901 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1452310 4 0.4718 0.84651 0.280 0.000 0.012 0.708
#> SRR665610 4 0.4509 0.84812 0.288 0.000 0.004 0.708
#> SRR1347322 1 0.4222 0.28560 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR813395 2 0.3123 0.91165 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1477256 1 0.3942 0.38676 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1470230 3 0.4936 0.57425 0.012 0.000 0.672 0.316
#> SRR1354247 4 0.4999 0.56170 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1082640 2 0.0000 0.92410 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.2647 0.56357 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1352299 1 0.0469 0.66967 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1076317 2 0.3528 0.90375 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1434117 1 0.4994 -0.25938 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1075273 2 0.3528 0.90375 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR658657 3 0.4706 0.61144 0.020 0.000 0.732 0.248
#> SRR1092773 2 0.3569 0.90263 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1365332 1 0.0921 0.66683 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR615958 3 0.4855 0.47271 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1097688 2 0.3486 0.90437 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1403259 3 0.3306 0.66517 0.004 0.000 0.840 0.156
#> SRR1099120 2 0.3726 0.89602 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1362200 3 0.4977 0.38282 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1464856 2 0.0707 0.92448 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1347298 3 0.4855 0.47342 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1075923 2 0.3528 0.90375 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1100703 1 0.0672 0.67202 0.984 0.000 0.008 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 1 0.3487 0.694291 0.780 0.000 0.000 0.212 0.008
#> SRR1436370 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075752 2 0.4182 0.375465 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1397949 3 0.4331 0.209612 0.400 0.000 0.596 0.004 0.000
#> SRR1355723 1 0.4124 0.711691 0.776 0.000 0.036 0.180 0.008
#> SRR1329744 1 0.2355 0.728095 0.916 0.000 0.024 0.024 0.036
#> SRR657384 1 0.3735 0.729020 0.816 0.000 0.048 0.132 0.004
#> SRR1351190 1 0.2777 0.726964 0.864 0.000 0.000 0.120 0.016
#> SRR1458662 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR818573 1 0.5255 0.450706 0.560 0.000 0.388 0.052 0.000
#> SRR1396017 1 0.1399 0.738424 0.952 0.000 0.000 0.028 0.020
#> SRR1410742 1 0.3521 0.709064 0.820 0.000 0.000 0.140 0.040
#> SRR1435963 1 0.1907 0.753050 0.928 0.000 0.044 0.028 0.000
#> SRR1382416 1 0.5220 0.160214 0.536 0.000 0.428 0.024 0.012
#> SRR1391354 1 0.3631 0.711749 0.840 0.000 0.012 0.080 0.068
#> SRR1087968 2 0.0162 0.694746 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310075 1 0.3412 0.741046 0.820 0.000 0.152 0.028 0.000
#> SRR1312244 1 0.4084 0.707064 0.800 0.000 0.144 0.024 0.032
#> SRR1325138 1 0.3678 0.714615 0.804 0.000 0.020 0.168 0.008
#> SRR1326821 3 0.3284 0.690909 0.148 0.000 0.828 0.000 0.024
#> SRR1490178 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR655613 3 0.2020 0.706741 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.5178 -0.008318 0.000 0.480 0.040 0.480 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.4300 0.204799 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1465758 1 0.3318 0.703668 0.800 0.000 0.192 0.008 0.000
#> SRR1414058 3 0.4249 0.505953 0.000 0.000 0.688 0.016 0.296
#> SRR1407449 1 0.4049 0.737424 0.792 0.000 0.124 0.084 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.2770 0.698753 0.044 0.000 0.880 0.000 0.076
#> SRR1399069 1 0.3588 0.715855 0.836 0.000 0.008 0.104 0.052
#> SRR1366450 3 0.1410 0.709449 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.1626 0.743165 0.940 0.000 0.044 0.016 0.000
#> SRR1457176 3 0.3715 0.565526 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000
#> SRR1097666 2 0.4030 0.434837 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1434736 1 0.4412 0.570830 0.756 0.000 0.008 0.048 0.188
#> SRR1080560 2 0.4291 0.240479 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1322882 3 0.1851 0.709067 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.4240 0.552095 0.000 0.736 0.036 0.228 0.000
#> SRR1327614 1 0.4147 0.554936 0.676 0.000 0.316 0.008 0.000
#> SRR658152 1 0.4609 0.599978 0.744 0.000 0.000 0.104 0.152
#> SRR1368141 4 0.6738 -0.513714 0.256 0.000 0.000 0.380 0.364
#> SRR1440268 1 0.2351 0.734450 0.916 0.000 0.036 0.020 0.028
#> SRR1453725 3 0.4485 0.458423 0.292 0.000 0.680 0.028 0.000
#> SRR1325711 2 0.4021 0.575704 0.000 0.764 0.036 0.200 0.000
#> SRR1477930 1 0.3780 0.732719 0.808 0.000 0.060 0.132 0.000
#> SRR1477591 3 0.2304 0.709095 0.100 0.000 0.892 0.000 0.008
#> SRR1416049 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.6714 0.175548 0.496 0.000 0.012 0.196 0.296
#> SRR1369052 1 0.3844 0.729292 0.804 0.000 0.064 0.132 0.000
#> SRR1377735 3 0.3741 0.621650 0.264 0.000 0.732 0.004 0.000
#> SRR1331244 1 0.1893 0.743766 0.936 0.000 0.024 0.028 0.012
#> SRR1404531 3 0.4387 0.362549 0.348 0.000 0.640 0.012 0.000
#> SRR1324331 1 0.2342 0.743516 0.916 0.000 0.040 0.024 0.020
#> SRR1458890 5 0.6744 0.437291 0.260 0.000 0.000 0.356 0.384
#> SRR1432695 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 5 0.4650 -0.062781 0.000 0.000 0.468 0.012 0.520
#> SRR1087393 2 0.5165 0.128557 0.000 0.512 0.040 0.448 0.000
#> SRR1077263 3 0.2625 0.682046 0.016 0.000 0.876 0.000 0.108
#> SRR1385211 1 0.4448 0.243311 0.516 0.000 0.480 0.004 0.000
#> SRR655241 1 0.1942 0.749119 0.920 0.000 0.012 0.068 0.000
#> SRR656922 1 0.4847 0.696802 0.704 0.000 0.216 0.080 0.000
#> SRR1361630 3 0.4299 0.400115 0.000 0.000 0.608 0.004 0.388
#> SRR1318966 2 0.4953 0.216978 0.000 0.532 0.028 0.440 0.000
#> SRR1407087 3 0.4838 0.407497 0.004 0.000 0.632 0.028 0.336
#> SRR603212 3 0.2233 0.709209 0.080 0.000 0.904 0.016 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 5 0.5420 0.536231 0.004 0.000 0.172 0.148 0.676
#> SRR1332232 2 0.1725 0.674777 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1312645 1 0.2278 0.707618 0.908 0.000 0.000 0.032 0.060
#> SRR1457835 3 0.4166 0.467306 0.348 0.000 0.648 0.004 0.000
#> SRR1347123 3 0.4652 0.532043 0.008 0.000 0.700 0.032 0.260
#> SRR1465501 2 0.4114 0.404895 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1330878 5 0.4127 0.313118 0.000 0.000 0.312 0.008 0.680
#> SRR1445064 5 0.6789 0.388006 0.284 0.000 0.000 0.348 0.368
#> SRR1452981 1 0.2983 0.717339 0.868 0.000 0.000 0.076 0.056
#> SRR1326708 3 0.2813 0.677492 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.4264 0.485359 0.620 0.000 0.376 0.004 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477316 1 0.3844 0.714980 0.792 0.000 0.024 0.176 0.008
#> SRR1077898 3 0.3561 0.602998 0.260 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1349080 3 0.7755 0.067885 0.356 0.000 0.376 0.076 0.192
#> SRR1076096 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.3895 0.469164 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1375485 3 0.4622 0.055885 0.440 0.000 0.548 0.012 0.000
#> SRR1432563 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR604414 3 0.1908 0.706969 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.5561 0.396490 0.596 0.000 0.340 0.036 0.028
#> SRR812060 3 0.3635 0.566349 0.000 0.000 0.748 0.004 0.248
#> SRR602082 3 0.4101 0.412948 0.332 0.000 0.664 0.004 0.000
#> SRR1069490 2 0.4182 0.368506 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1078417 2 0.3695 0.607576 0.000 0.800 0.036 0.164 0.000
#> SRR661613 3 0.6085 0.369835 0.044 0.000 0.580 0.056 0.320
#> SRR1420710 1 0.4933 0.601672 0.688 0.000 0.004 0.248 0.060
#> SRR660426 3 0.2439 0.698016 0.120 0.000 0.876 0.004 0.000
#> SRR1416003 1 0.6810 0.065466 0.460 0.000 0.008 0.300 0.232
#> SRR661064 1 0.2284 0.739746 0.912 0.000 0.004 0.056 0.028
#> SRR1082011 2 0.3309 0.634956 0.000 0.836 0.036 0.128 0.000
#> SRR1452718 3 0.2674 0.697777 0.140 0.000 0.856 0.000 0.004
#> SRR1353243 3 0.4225 0.432331 0.364 0.000 0.632 0.004 0.000
#> SRR1455482 3 0.4446 0.002311 0.476 0.000 0.520 0.004 0.000
#> SRR1313473 1 0.4989 0.404099 0.552 0.000 0.416 0.032 0.000
#> SRR1399394 3 0.2852 0.668546 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.4712 0.721560 0.732 0.000 0.168 0.100 0.000
#> SRR1317470 3 0.3596 0.619139 0.012 0.000 0.776 0.000 0.212
#> SRR1337707 5 0.5954 0.532836 0.216 0.000 0.000 0.192 0.592
#> SRR1408752 2 0.3165 0.636829 0.000 0.848 0.036 0.116 0.000
#> SRR1474617 5 0.3612 0.593351 0.000 0.000 0.008 0.228 0.764
#> SRR1398013 1 0.4610 0.640752 0.740 0.000 0.000 0.168 0.092
#> SRR1352918 1 0.2616 0.696990 0.888 0.000 0.000 0.036 0.076
#> SRR1420750 3 0.2843 0.699665 0.144 0.000 0.848 0.000 0.008
#> SRR1071785 5 0.6232 0.525055 0.148 0.000 0.000 0.372 0.480
#> SRR1353618 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1490313 1 0.3874 0.699315 0.776 0.000 0.016 0.200 0.008
#> SRR1366560 1 0.4227 0.599769 0.692 0.000 0.292 0.016 0.000
#> SRR1355684 1 0.4392 0.481459 0.612 0.000 0.380 0.008 0.000
#> SRR1323289 5 0.3563 0.596233 0.000 0.000 0.012 0.208 0.780
#> SRR1313494 1 0.2426 0.753836 0.900 0.000 0.036 0.064 0.000
#> SRR1309985 1 0.1741 0.726026 0.936 0.000 0.000 0.024 0.040
#> SRR607911 1 0.4309 0.613294 0.676 0.000 0.308 0.016 0.000
#> SRR1333789 3 0.1701 0.708890 0.048 0.000 0.936 0.000 0.016
#> SRR1400078 1 0.4238 0.557975 0.756 0.000 0.000 0.052 0.192
#> SRR1088631 2 0.4866 0.397939 0.000 0.620 0.036 0.344 0.000
#> SRR1092842 2 0.4273 0.278437 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR615575 3 0.4341 0.428272 0.000 0.000 0.628 0.008 0.364
#> SRR1079434 5 0.5512 0.510782 0.280 0.000 0.008 0.080 0.632
#> SRR1325559 1 0.4392 0.440779 0.612 0.000 0.380 0.008 0.000
#> SRR1446695 3 0.4697 0.448947 0.008 0.000 0.620 0.012 0.360
#> SRR1383883 1 0.2997 0.718298 0.840 0.000 0.148 0.012 0.000
#> SRR1396100 1 0.2325 0.703650 0.904 0.000 0.000 0.028 0.068
#> SRR1475697 1 0.3800 0.657018 0.812 0.000 0.000 0.080 0.108
#> SRR1488067 2 0.4171 0.382182 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.4291 0.240479 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1084991 4 0.5049 -0.111920 0.000 0.480 0.032 0.488 0.000
#> SRR1410380 3 0.4047 0.494648 0.000 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1445490 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.3210 0.685144 0.860 0.000 0.008 0.040 0.092
#> SRR1485812 5 0.5257 0.529708 0.264 0.000 0.004 0.076 0.656
#> SRR1078020 2 0.0162 0.694746 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311153 3 0.3612 0.568911 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0579 0.694526 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1343898 5 0.1893 0.585862 0.000 0.000 0.048 0.024 0.928
#> SRR807775 3 0.4455 0.343247 0.000 0.000 0.588 0.008 0.404
#> SRR1409215 2 0.4866 0.400411 0.000 0.620 0.036 0.344 0.000
#> SRR820427 1 0.7564 -0.234848 0.368 0.000 0.296 0.040 0.296
#> SRR1100656 2 0.4294 0.228941 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1362159 1 0.4425 0.270816 0.544 0.000 0.452 0.004 0.000
#> SRR1414536 3 0.4288 0.407958 0.000 0.000 0.612 0.004 0.384
#> SRR656794 3 0.2729 0.703371 0.060 0.000 0.884 0.000 0.056
#> SRR604653 3 0.3461 0.600237 0.224 0.000 0.772 0.004 0.000
#> SRR1317685 5 0.5000 0.556741 0.240 0.000 0.008 0.060 0.692
#> SRR1485912 3 0.2873 0.703904 0.120 0.000 0.860 0.000 0.020
#> SRR1407602 5 0.5475 0.452285 0.320 0.000 0.000 0.084 0.596
#> SRR1356164 1 0.5535 0.410601 0.628 0.000 0.000 0.116 0.256
#> SRR1328692 1 0.6777 0.455045 0.512 0.000 0.324 0.128 0.036
#> SRR1362438 3 0.2424 0.693896 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1479216 5 0.4560 -0.129235 0.000 0.000 0.484 0.008 0.508
#> SRR1358041 1 0.3791 0.748547 0.812 0.000 0.112 0.076 0.000
#> SRR1468766 3 0.2437 0.695008 0.032 0.000 0.904 0.004 0.060
#> SRR1368200 3 0.5143 0.238457 0.040 0.000 0.532 0.000 0.428
#> SRR1435602 2 0.0579 0.694526 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1501043 5 0.5252 0.578067 0.068 0.000 0.000 0.316 0.616
#> SRR1437256 5 0.6818 0.338303 0.316 0.000 0.000 0.328 0.356
#> SRR1487446 1 0.1830 0.727771 0.932 0.000 0.000 0.028 0.040
#> SRR816653 3 0.4199 0.585013 0.296 0.000 0.692 0.004 0.008
#> SRR815164 1 0.5606 0.670119 0.708 0.000 0.144 0.052 0.096
#> SRR1442043 1 0.1741 0.737404 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR1410573 1 0.4165 0.535280 0.672 0.000 0.320 0.008 0.000
#> SRR1096782 2 0.4969 0.334713 0.000 0.588 0.036 0.376 0.000
#> SRR1352369 3 0.3680 0.686286 0.052 0.000 0.840 0.020 0.088
#> SRR1382934 5 0.4995 0.588044 0.020 0.000 0.020 0.316 0.644
#> SRR1465208 1 0.1942 0.750800 0.920 0.000 0.068 0.012 0.000
#> SRR1314728 1 0.6817 0.418312 0.564 0.000 0.216 0.044 0.176
#> SRR1470291 1 0.3957 0.641349 0.712 0.000 0.280 0.008 0.000
#> SRR1308756 3 0.4225 0.437147 0.000 0.000 0.632 0.004 0.364
#> SRR1409600 3 0.3401 0.689940 0.064 0.000 0.840 0.000 0.096
#> SRR816123 2 0.4060 0.424968 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR614779 3 0.4235 0.331353 0.000 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR810783 3 0.2053 0.708307 0.048 0.000 0.924 0.004 0.024
#> SRR1333990 1 0.2171 0.739798 0.912 0.000 0.064 0.024 0.000
#> SRR1410356 3 0.2915 0.672497 0.024 0.000 0.860 0.000 0.116
#> SRR808106 3 0.7037 0.388906 0.256 0.000 0.544 0.072 0.128
#> SRR662713 3 0.2464 0.698823 0.032 0.000 0.908 0.012 0.048
#> SRR1447058 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 5 0.7710 0.217779 0.100 0.000 0.376 0.140 0.384
#> SRR809382 5 0.3556 0.611444 0.104 0.000 0.012 0.044 0.840
#> SRR665417 1 0.4410 0.723311 0.764 0.000 0.112 0.124 0.000
#> SRR1088016 2 0.3796 0.490201 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1453166 2 0.4449 0.164514 0.000 0.512 0.004 0.484 0.000
#> SRR1069826 2 0.5052 0.249346 0.000 0.552 0.036 0.412 0.000
#> SRR1077781 2 0.4787 0.432360 0.000 0.640 0.036 0.324 0.000
#> SRR615623 5 0.3910 0.482029 0.000 0.000 0.196 0.032 0.772
#> SRR1413787 5 0.3318 0.499683 0.000 0.000 0.180 0.012 0.808
#> SRR1478207 3 0.6967 -0.015938 0.024 0.000 0.440 0.172 0.364
#> SRR1411046 1 0.2909 0.729048 0.848 0.000 0.140 0.012 0.000
#> SRR1313711 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326560 1 0.1668 0.753039 0.940 0.000 0.028 0.032 0.000
#> SRR1309051 3 0.2329 0.697612 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.2748 0.744322 0.880 0.000 0.096 0.016 0.008
#> SRR1074956 2 0.4101 0.410198 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1092961 2 0.4030 0.436265 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR817210 3 0.5826 0.598999 0.132 0.000 0.696 0.068 0.104
#> SRR1319221 5 0.3910 0.590820 0.000 0.000 0.008 0.272 0.720
#> SRR1405413 1 0.4849 0.623307 0.712 0.000 0.232 0.024 0.032
#> SRR607807 1 0.3639 0.716565 0.792 0.000 0.184 0.024 0.000
#> SRR1390160 3 0.6575 -0.043431 0.004 0.000 0.428 0.176 0.392
#> SRR1406283 3 0.2580 0.700453 0.044 0.000 0.892 0.000 0.064
#> SRR1357709 1 0.4204 0.716266 0.796 0.000 0.028 0.140 0.036
#> SRR1080742 2 0.4060 0.424968 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1468208 1 0.3053 0.721290 0.828 0.000 0.164 0.008 0.000
#> SRR1312766 3 0.2645 0.696718 0.044 0.000 0.888 0.000 0.068
#> SRR1361612 1 0.1377 0.740438 0.956 0.000 0.020 0.020 0.004
#> SRR1311224 3 0.1965 0.706131 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.3531 0.675226 0.148 0.000 0.816 0.036 0.000
#> SRR1099720 4 0.5178 -0.098501 0.000 0.480 0.040 0.480 0.000
#> SRR1349250 4 0.4302 -0.154568 0.000 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.6132 0.324910 0.112 0.000 0.532 0.008 0.348
#> SRR1074980 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 5 0.4283 0.248898 0.000 0.000 0.348 0.008 0.644
#> SRR1332879 3 0.1892 0.709355 0.080 0.000 0.916 0.000 0.004
#> SRR1403177 5 0.4339 0.620764 0.140 0.000 0.024 0.048 0.788
#> SRR1076144 2 0.1300 0.685675 0.000 0.956 0.028 0.016 0.000
#> SRR1069614 2 0.4278 0.269717 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR818239 2 0.4287 0.252713 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1421069 2 0.4268 0.287515 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1500006 3 0.3430 0.604701 0.220 0.000 0.776 0.004 0.000
#> SRR1485678 1 0.5396 0.469190 0.560 0.000 0.376 0.064 0.000
#> SRR1092232 5 0.2230 0.612259 0.044 0.000 0.000 0.044 0.912
#> SRR1344253 3 0.5325 0.488586 0.032 0.000 0.640 0.028 0.300
#> SRR1384290 1 0.4086 0.636235 0.704 0.000 0.284 0.012 0.000
#> SRR1089349 3 0.4047 0.498158 0.000 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1343522 2 0.4119 0.566620 0.000 0.752 0.036 0.212 0.000
#> SRR1326727 2 0.2616 0.657262 0.000 0.888 0.036 0.076 0.000
#> SRR1440940 1 0.5618 0.460891 0.608 0.000 0.000 0.280 0.112
#> SRR818372 1 0.5205 0.603655 0.660 0.000 0.020 0.280 0.040
#> SRR1323675 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.4238 0.671990 0.776 0.000 0.000 0.136 0.088
#> SRR1310031 3 0.4637 0.249140 0.000 0.000 0.536 0.012 0.452
#> SRR615419 5 0.6673 0.417015 0.276 0.000 0.000 0.284 0.440
#> SRR1436925 1 0.5579 0.626441 0.620 0.000 0.264 0.116 0.000
#> SRR1477238 1 0.3319 0.714140 0.820 0.000 0.160 0.020 0.000
#> SRR1332566 1 0.2464 0.738121 0.888 0.000 0.096 0.016 0.000
#> SRR1490228 5 0.3863 0.524727 0.012 0.000 0.176 0.020 0.792
#> SRR1442949 5 0.5417 0.272622 0.432 0.000 0.004 0.048 0.516
#> SRR1466239 1 0.3455 0.692461 0.784 0.000 0.208 0.008 0.000
#> SRR1094003 2 0.3695 0.610854 0.000 0.800 0.036 0.164 0.000
#> SRR1329971 3 0.3123 0.677082 0.184 0.000 0.812 0.000 0.004
#> SRR813076 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.5178 -0.008318 0.000 0.480 0.040 0.480 0.000
#> SRR1322981 3 0.3194 0.658068 0.020 0.000 0.832 0.000 0.148
#> SRR1485976 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1471713 3 0.4542 0.244408 0.000 0.000 0.536 0.008 0.456
#> SRR660522 3 0.3579 0.581389 0.004 0.000 0.756 0.000 0.240
#> SRR815374 1 0.4139 0.726115 0.784 0.000 0.084 0.132 0.000
#> SRR1069564 2 0.4088 0.415375 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1416337 3 0.4138 0.410165 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1316438 5 0.3355 0.612224 0.084 0.000 0.012 0.048 0.856
#> SRR1386844 1 0.2416 0.742136 0.888 0.000 0.100 0.012 0.000
#> SRR1373718 1 0.3727 0.707525 0.768 0.000 0.216 0.016 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.2873 0.728764 0.856 0.000 0.128 0.016 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.1399 0.687696 0.000 0.952 0.028 0.020 0.000
#> SRR1460296 3 0.4551 0.262539 0.368 0.000 0.616 0.016 0.000
#> SRR1335489 1 0.3684 0.686720 0.840 0.000 0.024 0.044 0.092
#> SRR1393404 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 3 0.3689 0.550860 0.256 0.000 0.740 0.004 0.000
#> SRR1401815 5 0.3849 0.438897 0.000 0.000 0.232 0.016 0.752
#> SRR1071337 2 0.0162 0.694746 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071983 2 0.5077 0.201561 0.000 0.536 0.036 0.428 0.000
#> SRR1331793 2 0.0162 0.695744 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1410510 5 0.4582 0.079919 0.000 0.000 0.416 0.012 0.572
#> SRR1098761 2 0.4101 0.411203 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1312124 1 0.1780 0.728566 0.940 0.000 0.008 0.024 0.028
#> SRR615395 3 0.2376 0.701660 0.044 0.000 0.904 0.000 0.052
#> SRR1479349 1 0.3532 0.735079 0.824 0.000 0.048 0.128 0.000
#> SRR2165033 1 0.3471 0.749155 0.836 0.000 0.072 0.092 0.000
#> SRR1089054 2 0.0162 0.694746 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR816201 1 0.4211 0.682800 0.752 0.000 0.016 0.216 0.016
#> SRR1488514 2 0.4677 0.468986 0.000 0.664 0.036 0.300 0.000
#> SRR655840 1 0.4155 0.679425 0.780 0.000 0.000 0.144 0.076
#> SRR1379303 1 0.3642 0.668658 0.760 0.000 0.232 0.008 0.000
#> SRR1418516 1 0.5038 0.578449 0.704 0.000 0.000 0.164 0.132
#> SRR613174 3 0.3928 0.522658 0.000 0.000 0.700 0.004 0.296
#> SRR1351125 3 0.3455 0.616103 0.008 0.000 0.784 0.000 0.208
#> SRR659157 5 0.5284 0.384637 0.376 0.000 0.000 0.056 0.568
#> SRR1480408 1 0.4002 0.705567 0.780 0.000 0.028 0.184 0.008
#> SRR657857 1 0.2775 0.730964 0.884 0.000 0.004 0.076 0.036
#> SRR1073317 2 0.3919 0.588277 0.000 0.776 0.036 0.188 0.000
#> SRR1332526 1 0.4221 0.713976 0.780 0.000 0.052 0.160 0.008
#> SRR1094168 2 0.3837 0.480564 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1431270 5 0.5089 0.489530 0.312 0.000 0.004 0.048 0.636
#> SRR1085614 2 0.5175 0.056965 0.000 0.496 0.040 0.464 0.000
#> SRR1330106 5 0.6851 0.224634 0.356 0.000 0.004 0.248 0.392
#> SRR1466154 3 0.2488 0.695778 0.124 0.000 0.872 0.004 0.000
#> SRR1396944 1 0.4370 0.720754 0.744 0.000 0.200 0.056 0.000
#> SRR1082784 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1457267 1 0.4003 0.596276 0.704 0.000 0.288 0.008 0.000
#> SRR614659 1 0.6278 0.608964 0.656 0.000 0.076 0.144 0.124
#> SRR659247 3 0.5426 0.563915 0.088 0.000 0.680 0.016 0.216
#> SRR1317201 1 0.2685 0.732750 0.880 0.000 0.092 0.028 0.000
#> SRR1473696 3 0.2068 0.708737 0.092 0.000 0.904 0.000 0.004
#> SRR1375842 3 0.3607 0.570024 0.244 0.000 0.752 0.004 0.000
#> SRR1388123 2 0.0898 0.689834 0.000 0.972 0.008 0.020 0.000
#> SRR1096363 2 0.4659 0.116942 0.000 0.500 0.012 0.488 0.000
#> SRR1453662 1 0.4967 0.701323 0.704 0.000 0.192 0.104 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 3 0.2707 0.691828 0.132 0.000 0.860 0.008 0.000
#> SRR1416693 1 0.3333 0.701387 0.788 0.000 0.208 0.004 0.000
#> SRR1070841 3 0.3845 0.593780 0.012 0.000 0.760 0.004 0.224
#> SRR1380910 1 0.4451 0.183455 0.504 0.000 0.492 0.004 0.000
#> SRR1333125 2 0.3810 0.593878 0.000 0.788 0.036 0.176 0.000
#> SRR1498183 3 0.4392 0.244030 0.380 0.000 0.612 0.008 0.000
#> SRR612659 5 0.4528 0.003364 0.000 0.000 0.444 0.008 0.548
#> SRR1447148 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.4171 0.373522 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1089595 4 0.5178 -0.098501 0.000 0.480 0.040 0.480 0.000
#> SRR1074263 2 0.4240 0.552095 0.000 0.736 0.036 0.228 0.000
#> SRR1376786 3 0.1626 0.707876 0.044 0.000 0.940 0.000 0.016
#> SRR1345995 3 0.2077 0.709639 0.084 0.000 0.908 0.000 0.008
#> SRR1071035 3 0.2628 0.705793 0.088 0.000 0.884 0.028 0.000
#> SRR1068808 2 0.4302 0.192794 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 3 0.4151 0.443455 0.344 0.000 0.652 0.004 0.000
#> SRR1335355 1 0.4517 0.367377 0.556 0.000 0.436 0.008 0.000
#> SRR659448 3 0.3402 0.628812 0.008 0.000 0.804 0.004 0.184
#> SRR1323558 5 0.4561 -0.149519 0.000 0.000 0.488 0.008 0.504
#> SRR1381711 3 0.4387 0.475581 0.012 0.000 0.640 0.000 0.348
#> SRR657985 3 0.3077 0.679034 0.028 0.000 0.864 0.008 0.100
#> SRR1314810 3 0.6621 0.409743 0.276 0.000 0.564 0.044 0.116
#> SRR1336505 4 0.7728 -0.467220 0.324 0.000 0.052 0.336 0.288
#> SRR1474095 1 0.4538 0.227654 0.540 0.000 0.452 0.008 0.000
#> SRR1363831 2 0.0404 0.694401 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1442376 1 0.3119 0.704725 0.860 0.000 0.000 0.068 0.072
#> SRR1074909 2 0.4150 0.386916 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1101200 3 0.2396 0.692393 0.024 0.000 0.904 0.004 0.068
#> SRR1075408 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.3326 0.713943 0.824 0.000 0.000 0.152 0.024
#> SRR1313406 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 5 0.4748 0.156698 0.004 0.000 0.384 0.016 0.596
#> SRR1084867 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.4161 0.380578 0.000 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.2471 0.693287 0.136 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.3861 0.542459 0.004 0.000 0.712 0.000 0.284
#> SRR1315912 3 0.2179 0.703083 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.3115 0.632505 0.000 0.852 0.036 0.112 0.000
#> SRR1421116 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR602282 4 0.6783 -0.501490 0.280 0.000 0.000 0.372 0.348
#> SRR1361195 2 0.1579 0.679647 0.000 0.944 0.024 0.032 0.000
#> SRR600493 3 0.2127 0.703129 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.2305 0.710033 0.092 0.000 0.896 0.000 0.012
#> SRR1355475 3 0.3318 0.626463 0.008 0.000 0.800 0.000 0.192
#> SRR1360785 1 0.2989 0.688208 0.872 0.000 0.004 0.044 0.080
#> SRR810437 5 0.6771 0.476601 0.224 0.000 0.004 0.356 0.416
#> SRR1361860 1 0.3474 0.744216 0.836 0.000 0.044 0.116 0.004
#> SRR1441311 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.3695 0.720843 0.836 0.000 0.016 0.096 0.052
#> SRR1457619 1 0.0898 0.741554 0.972 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR1498529 1 0.3846 0.725134 0.800 0.000 0.056 0.144 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.5096 0.149549 0.000 0.520 0.036 0.444 0.000
#> SRR1472033 2 0.4087 0.568711 0.000 0.756 0.036 0.208 0.000
#> SRR1445087 5 0.4824 0.501251 0.004 0.000 0.200 0.076 0.720
#> SRR1399525 2 0.4088 0.419948 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1312844 2 0.4030 0.436218 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1085874 2 0.4114 0.404895 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1101226 2 0.3857 0.477380 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1476056 1 0.2726 0.719281 0.884 0.000 0.000 0.064 0.052
#> SRR1075659 2 0.4273 0.278437 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1311916 3 0.4557 0.200639 0.000 0.000 0.516 0.008 0.476
#> SRR1353353 5 0.5815 0.551940 0.104 0.000 0.000 0.356 0.540
#> SRR1073291 3 0.3741 0.550420 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1356227 1 0.2087 0.730381 0.928 0.000 0.020 0.020 0.032
#> SRR1080720 4 0.5178 -0.098501 0.000 0.480 0.040 0.480 0.000
#> SRR1091695 2 0.4227 0.330270 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1350304 1 0.4854 0.426378 0.680 0.000 0.000 0.060 0.260
#> SRR663002 5 0.4470 0.195075 0.000 0.000 0.372 0.012 0.616
#> SRR1376983 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.3081 0.721272 0.832 0.000 0.156 0.012 0.000
#> SRR1347144 3 0.4622 0.274607 0.000 0.000 0.548 0.012 0.440
#> SRR1384006 1 0.5215 0.658856 0.656 0.000 0.256 0.088 0.000
#> SRR1499108 2 0.3999 0.445618 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR614047 5 0.4294 -0.064001 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR818440 1 0.5956 0.339141 0.600 0.000 0.056 0.040 0.304
#> SRR1337770 1 0.4221 0.728856 0.780 0.000 0.112 0.108 0.000
#> SRR1399413 3 0.2358 0.705338 0.104 0.000 0.888 0.008 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.4268 0.713181 0.772 0.000 0.048 0.172 0.008
#> SRR1074041 3 0.3280 0.634511 0.012 0.000 0.812 0.000 0.176
#> SRR1394495 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.3317 0.674398 0.032 0.000 0.848 0.008 0.112
#> SRR816699 3 0.3766 0.561228 0.004 0.000 0.728 0.000 0.268
#> SRR1308612 3 0.3402 0.625512 0.008 0.000 0.804 0.004 0.184
#> SRR1499418 5 0.4754 0.542693 0.264 0.000 0.000 0.052 0.684
#> SRR1352894 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.5146 0.710133 0.724 0.000 0.172 0.080 0.024
#> SRR1331083 2 0.4192 0.364404 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR808272 3 0.4135 0.466982 0.000 0.000 0.656 0.004 0.340
#> SRR1436698 3 0.2189 0.710464 0.084 0.000 0.904 0.000 0.012
#> SRR1095627 2 0.4060 0.424968 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1357672 3 0.1800 0.708587 0.048 0.000 0.932 0.000 0.020
#> SRR1351236 3 0.4066 0.443484 0.324 0.000 0.672 0.004 0.000
#> SRR1077479 3 0.4610 0.330333 0.388 0.000 0.596 0.016 0.000
#> SRR814491 1 0.3216 0.664611 0.848 0.000 0.000 0.044 0.108
#> SRR1101256 2 0.3883 0.587813 0.000 0.780 0.036 0.184 0.000
#> SRR1436004 3 0.2069 0.710441 0.076 0.000 0.912 0.000 0.012
#> SRR1457994 2 0.4958 0.342498 0.000 0.592 0.036 0.372 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.4260 0.713379 0.776 0.000 0.052 0.164 0.008
#> SRR1309534 1 0.2344 0.707582 0.904 0.000 0.000 0.032 0.064
#> SRR615527 5 0.4138 0.542513 0.000 0.000 0.148 0.072 0.780
#> SRR1098216 1 0.3575 0.749215 0.848 0.000 0.056 0.076 0.020
#> SRR1325847 2 0.4235 0.330200 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1404003 1 0.3876 0.713264 0.796 0.000 0.024 0.168 0.012
#> SRR1344166 1 0.5579 0.479775 0.552 0.000 0.368 0.080 0.000
#> SRR1368638 1 0.3551 0.635919 0.820 0.000 0.000 0.044 0.136
#> SRR1431429 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.5047 0.085254 0.000 0.496 0.032 0.472 0.000
#> SRR1080509 2 0.0510 0.693268 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR815759 5 0.6247 0.560039 0.200 0.000 0.116 0.048 0.636
#> SRR1502143 3 0.3163 0.643280 0.012 0.000 0.824 0.000 0.164
#> SRR1487614 5 0.5168 0.000596 0.000 0.000 0.452 0.040 0.508
#> SRR1402307 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.4761 0.713083 0.728 0.000 0.168 0.104 0.000
#> SRR1099212 2 0.5019 0.291390 0.000 0.568 0.036 0.396 0.000
#> SRR1083215 3 0.2519 0.710857 0.100 0.000 0.884 0.000 0.016
#> SRR1476547 4 0.5178 -0.091976 0.000 0.476 0.040 0.484 0.000
#> SRR656421 1 0.3419 0.705707 0.804 0.000 0.180 0.016 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.695876 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.4645 0.633158 0.724 0.000 0.000 0.204 0.072
#> SRR1339944 2 0.0912 0.690973 0.000 0.972 0.016 0.012 0.000
#> SRR1391444 2 0.0579 0.694526 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1434889 5 0.6566 0.338972 0.324 0.000 0.016 0.148 0.512
#> SRR1431847 5 0.5421 0.420844 0.352 0.000 0.004 0.060 0.584
#> SRR1317155 1 0.3525 0.711395 0.800 0.000 0.008 0.184 0.008
#> SRR1477405 3 0.4341 0.223657 0.404 0.000 0.592 0.004 0.000
#> SRR655289 1 0.4294 0.678184 0.788 0.000 0.008 0.092 0.112
#> SRR1341683 1 0.6620 0.020748 0.436 0.000 0.000 0.336 0.228
#> SRR1084790 3 0.2358 0.707373 0.104 0.000 0.888 0.000 0.008
#> SRR1073731 5 0.8270 0.239597 0.268 0.000 0.232 0.136 0.364
#> SRR1332588 1 0.4886 0.608910 0.712 0.000 0.000 0.188 0.100
#> SRR1471157 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR654945 3 0.3430 0.605868 0.004 0.000 0.776 0.000 0.220
#> SRR661028 3 0.2074 0.704398 0.104 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.3655 0.605086 0.000 0.804 0.036 0.160 0.000
#> SRR1101152 3 0.4443 0.461980 0.300 0.000 0.680 0.008 0.012
#> SRR1358435 2 0.5092 0.180440 0.000 0.524 0.036 0.440 0.000
#> SRR2165273 1 0.3789 0.695768 0.760 0.000 0.224 0.016 0.000
#> SRR1379014 1 0.2580 0.753364 0.892 0.000 0.044 0.064 0.000
#> SRR1489904 3 0.4617 0.492810 0.004 0.000 0.668 0.024 0.304
#> SRR1416386 2 0.4273 0.274762 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1406048 1 0.2221 0.710760 0.912 0.000 0.000 0.036 0.052
#> SRR606982 5 0.6142 0.594132 0.124 0.000 0.120 0.084 0.672
#> SRR1358082 3 0.4331 0.222944 0.400 0.000 0.596 0.004 0.000
#> SRR1312934 3 0.6152 0.181335 0.044 0.000 0.544 0.052 0.360
#> SRR655194 1 0.3590 0.746950 0.828 0.000 0.080 0.092 0.000
#> SRR1331174 2 0.3064 0.636589 0.000 0.856 0.036 0.108 0.000
#> SRR1473251 4 0.5178 -0.091976 0.000 0.476 0.040 0.484 0.000
#> SRR1389820 5 0.3835 0.589901 0.000 0.000 0.008 0.260 0.732
#> SRR1074289 3 0.2104 0.707557 0.044 0.000 0.924 0.008 0.024
#> SRR1348816 2 0.4240 0.550280 0.000 0.736 0.036 0.228 0.000
#> SRR1076292 5 0.5289 0.491770 0.316 0.000 0.004 0.060 0.620
#> SRR1395810 2 0.0290 0.695500 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1498909 5 0.6691 0.415320 0.260 0.000 0.000 0.312 0.428
#> SRR1443507 3 0.1907 0.706599 0.044 0.000 0.928 0.000 0.028
#> SRR1452310 1 0.3322 0.678571 0.848 0.000 0.004 0.044 0.104
#> SRR665610 1 0.3961 0.731612 0.812 0.000 0.072 0.108 0.008
#> SRR1347322 3 0.4682 0.059731 0.420 0.000 0.564 0.016 0.000
#> SRR813395 2 0.3999 0.443951 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1477256 1 0.4449 0.112147 0.512 0.000 0.484 0.004 0.000
#> SRR1470230 5 0.5302 0.472046 0.320 0.000 0.008 0.052 0.620
#> SRR1354247 1 0.5467 0.622354 0.624 0.000 0.276 0.100 0.000
#> SRR1082640 2 0.0162 0.694746 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487592 3 0.2773 0.677295 0.020 0.000 0.868 0.000 0.112
#> SRR1352299 3 0.2583 0.693867 0.132 0.000 0.864 0.004 0.000
#> SRR1076317 2 0.4291 0.240479 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1434117 3 0.3884 0.525378 0.000 0.000 0.708 0.004 0.288
#> SRR1075273 2 0.4219 0.344138 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR658657 5 0.6749 0.525809 0.180 0.000 0.012 0.348 0.460
#> SRR1092773 2 0.5028 0.182489 0.000 0.524 0.032 0.444 0.000
#> SRR1365332 3 0.2067 0.707135 0.048 0.000 0.920 0.000 0.032
#> SRR615958 3 0.4510 0.290064 0.000 0.000 0.560 0.008 0.432
#> SRR1097688 2 0.4201 0.351790 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1403259 5 0.5520 0.599733 0.104 0.000 0.024 0.180 0.692
#> SRR1099120 2 0.4304 0.183543 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1362200 3 0.3969 0.507888 0.000 0.000 0.692 0.004 0.304
#> SRR1464856 2 0.2388 0.664040 0.000 0.900 0.028 0.072 0.000
#> SRR1347298 3 0.4574 0.331038 0.000 0.000 0.576 0.012 0.412
#> SRR1075923 2 0.4287 0.251168 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1100703 3 0.2629 0.693262 0.136 0.000 0.860 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.1096 0.62845 0.004 0.000 0.020 0.964 0.008 0.004
#> SRR1436370 2 0.0865 0.83879 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1075752 6 0.3634 0.82528 0.000 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1397949 3 0.5763 -0.11043 0.372 0.000 0.452 0.176 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.1862 0.63134 0.020 0.000 0.024 0.932 0.004 0.020
#> SRR1329744 1 0.3559 0.62232 0.744 0.000 0.012 0.240 0.000 0.004
#> SRR657384 4 0.2846 0.60871 0.084 0.000 0.060 0.856 0.000 0.000
#> SRR1351190 4 0.3510 0.47588 0.212 0.000 0.004 0.768 0.012 0.004
#> SRR1458662 2 0.0713 0.84200 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR818573 4 0.4495 0.37646 0.028 0.000 0.388 0.580 0.000 0.004
#> SRR1396017 1 0.3852 0.46494 0.612 0.000 0.000 0.384 0.004 0.000
#> SRR1410742 4 0.2044 0.60685 0.076 0.000 0.004 0.908 0.008 0.004
#> SRR1435963 1 0.4254 0.44187 0.576 0.000 0.020 0.404 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.4399 0.61392 0.740 0.000 0.116 0.136 0.004 0.004
#> SRR1391354 4 0.3933 0.52443 0.124 0.000 0.000 0.784 0.012 0.080
#> SRR1087968 2 0.0146 0.84350 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310075 4 0.5719 0.18884 0.232 0.000 0.248 0.520 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.4201 0.63368 0.732 0.000 0.068 0.196 0.000 0.004
#> SRR1325138 4 0.1421 0.62649 0.028 0.000 0.028 0.944 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.2545 0.68495 0.068 0.000 0.888 0.020 0.024 0.000
#> SRR1490178 2 0.0790 0.84059 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR655613 3 0.1461 0.68146 0.016 0.000 0.940 0.044 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.4801 0.79433 0.088 0.280 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1443871 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 6 0.3371 0.84007 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000 0.708
#> SRR1465758 1 0.4918 0.54901 0.604 0.000 0.088 0.308 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.3445 0.52021 0.000 0.000 0.732 0.000 0.260 0.008
#> SRR1407449 4 0.4950 0.45637 0.184 0.000 0.164 0.652 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.3046 0.60879 0.012 0.000 0.800 0.000 0.188 0.000
#> SRR1399069 4 0.3559 0.43143 0.240 0.000 0.000 0.744 0.012 0.004
#> SRR1366450 3 0.0777 0.68280 0.000 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1396859 1 0.3695 0.62059 0.732 0.000 0.024 0.244 0.000 0.000
#> SRR1457176 3 0.4545 0.51368 0.192 0.000 0.696 0.112 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.3864 0.66719 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1434736 1 0.3093 0.56387 0.848 0.000 0.000 0.104 0.024 0.024
#> SRR1080560 6 0.3309 0.83650 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1322882 3 0.1511 0.68299 0.012 0.000 0.940 0.044 0.004 0.000
#> SRR1435688 2 0.4775 0.25068 0.084 0.632 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1327614 1 0.5002 0.57763 0.636 0.000 0.136 0.228 0.000 0.000
#> SRR658152 4 0.5142 0.30100 0.292 0.000 0.000 0.620 0.064 0.024
#> SRR1368141 4 0.4270 0.35649 0.008 0.000 0.000 0.660 0.308 0.024
#> SRR1440268 1 0.3648 0.62282 0.740 0.000 0.016 0.240 0.000 0.004
#> SRR1453725 3 0.4468 0.34202 0.040 0.000 0.640 0.316 0.004 0.000
#> SRR1325711 2 0.4300 0.49018 0.080 0.712 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1477930 4 0.3020 0.60276 0.076 0.000 0.080 0.844 0.000 0.000
#> SRR1477591 3 0.2056 0.68035 0.080 0.000 0.904 0.004 0.012 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.2596 0.60108 0.004 0.000 0.016 0.872 0.104 0.004
#> SRR1369052 4 0.2983 0.60726 0.032 0.000 0.136 0.832 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.4262 0.16762 0.560 0.000 0.424 0.012 0.004 0.000
#> SRR1331244 1 0.4177 0.34027 0.520 0.000 0.012 0.468 0.000 0.000
#> SRR1404531 3 0.5599 0.26223 0.216 0.000 0.568 0.212 0.000 0.004
#> SRR1324331 1 0.4361 0.43402 0.552 0.000 0.024 0.424 0.000 0.000
#> SRR1458890 4 0.4468 0.29839 0.016 0.000 0.000 0.612 0.356 0.016
#> SRR1432695 2 0.0790 0.84059 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1407624 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 5 0.4098 0.17828 0.000 0.000 0.444 0.004 0.548 0.004
#> SRR1087393 6 0.4871 0.79863 0.088 0.296 0.000 0.000 0.000 0.616
#> SRR1077263 3 0.3003 0.62710 0.016 0.000 0.812 0.000 0.172 0.000
#> SRR1385211 3 0.5863 -0.05712 0.236 0.000 0.480 0.284 0.000 0.000
#> SRR655241 4 0.4196 0.25609 0.332 0.000 0.028 0.640 0.000 0.000
#> SRR656922 4 0.4296 0.51575 0.052 0.000 0.244 0.700 0.000 0.004
#> SRR1361630 3 0.4189 0.16537 0.008 0.000 0.552 0.000 0.436 0.004
#> SRR1318966 6 0.3871 0.83813 0.016 0.308 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR1407087 3 0.4668 0.41869 0.000 0.000 0.648 0.040 0.296 0.016
#> SRR603212 3 0.1949 0.66722 0.004 0.000 0.904 0.088 0.000 0.004
#> SRR1321088 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 5 0.5005 0.49572 0.020 0.000 0.056 0.208 0.696 0.020
#> SRR1332232 2 0.1802 0.80019 0.012 0.916 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1312645 1 0.3023 0.61745 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1457835 3 0.4646 0.05181 0.460 0.000 0.500 0.040 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.3838 0.53629 0.000 0.000 0.732 0.008 0.240 0.020
#> SRR1465501 6 0.3789 0.78437 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1330878 5 0.4074 0.51766 0.020 0.000 0.264 0.000 0.704 0.012
#> SRR1445064 4 0.4470 0.35114 0.012 0.000 0.000 0.656 0.300 0.032
#> SRR1452981 4 0.3750 0.47416 0.200 0.000 0.000 0.764 0.016 0.020
#> SRR1326708 3 0.2618 0.65954 0.116 0.000 0.860 0.024 0.000 0.000
#> SRR1407157 3 0.6099 -0.29981 0.288 0.000 0.376 0.336 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0865 0.83879 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1477316 4 0.1734 0.62208 0.048 0.000 0.004 0.932 0.008 0.008
#> SRR1077898 3 0.4067 0.53647 0.260 0.000 0.700 0.040 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.6491 0.39393 0.620 0.000 0.096 0.156 0.064 0.064
#> SRR1076096 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 6 0.3868 0.64243 0.000 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1375485 3 0.5573 0.14111 0.176 0.000 0.536 0.288 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0865 0.83879 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR604414 3 0.1398 0.67943 0.008 0.000 0.940 0.052 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.3785 0.61751 0.788 0.000 0.088 0.120 0.000 0.004
#> SRR812060 3 0.2664 0.60316 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR602082 3 0.4297 0.53448 0.100 0.000 0.724 0.176 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.3592 0.80809 0.000 0.344 0.000 0.000 0.000 0.656
#> SRR1078417 2 0.3960 0.57129 0.072 0.752 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR661613 3 0.4941 0.46153 0.008 0.000 0.660 0.104 0.228 0.000
#> SRR1420710 4 0.3009 0.62306 0.016 0.000 0.040 0.864 0.076 0.004
#> SRR660426 3 0.1461 0.68009 0.016 0.000 0.940 0.044 0.000 0.000
#> SRR1416003 4 0.3592 0.55425 0.004 0.000 0.016 0.784 0.184 0.012
#> SRR661064 4 0.4513 0.40704 0.248 0.000 0.056 0.688 0.004 0.004
#> SRR1082011 2 0.3645 0.62957 0.064 0.784 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1452718 3 0.3455 0.60378 0.200 0.000 0.776 0.020 0.004 0.000
#> SRR1353243 1 0.4632 0.40058 0.620 0.000 0.328 0.048 0.004 0.000
#> SRR1455482 1 0.5307 0.48538 0.588 0.000 0.256 0.156 0.000 0.000
#> SRR1313473 4 0.5386 0.21537 0.096 0.000 0.432 0.468 0.000 0.004
#> SRR1399394 3 0.1895 0.67197 0.016 0.000 0.912 0.072 0.000 0.000
#> SRR1102467 4 0.4324 0.53283 0.080 0.000 0.192 0.724 0.000 0.004
#> SRR1317470 3 0.3273 0.57913 0.008 0.000 0.776 0.000 0.212 0.004
#> SRR1337707 5 0.5312 -0.01367 0.036 0.000 0.000 0.456 0.472 0.036
#> SRR1408752 2 0.3626 0.63903 0.068 0.788 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1474617 5 0.2290 0.60700 0.004 0.000 0.012 0.032 0.908 0.044
#> SRR1398013 4 0.2836 0.59959 0.052 0.000 0.000 0.872 0.060 0.016
#> SRR1352918 1 0.5261 0.46651 0.588 0.000 0.000 0.312 0.012 0.088
#> SRR1420750 3 0.3056 0.62639 0.184 0.000 0.804 0.008 0.004 0.000
#> SRR1071785 4 0.4735 0.18762 0.008 0.000 0.000 0.564 0.392 0.036
#> SRR1353618 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0790 0.84059 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1490313 4 0.0951 0.62825 0.004 0.000 0.020 0.968 0.008 0.000
#> SRR1366560 1 0.5503 0.49372 0.552 0.000 0.172 0.276 0.000 0.000
#> SRR1355684 4 0.6086 -0.19154 0.348 0.000 0.276 0.376 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.2439 0.61830 0.008 0.000 0.020 0.028 0.904 0.040
#> SRR1313494 4 0.4417 -0.02398 0.416 0.000 0.028 0.556 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.3830 0.50258 0.620 0.000 0.000 0.376 0.004 0.000
#> SRR607911 4 0.5741 0.14957 0.172 0.000 0.372 0.456 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.0993 0.68444 0.000 0.000 0.964 0.024 0.012 0.000
#> SRR1400078 1 0.6011 0.35730 0.548 0.000 0.000 0.280 0.036 0.136
#> SRR1088631 2 0.5095 -0.50277 0.080 0.500 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1092842 6 0.3409 0.84170 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR615575 3 0.4797 0.36903 0.012 0.000 0.640 0.000 0.292 0.056
#> SRR1079434 1 0.6358 -0.03604 0.504 0.000 0.004 0.056 0.324 0.112
#> SRR1325559 1 0.5903 0.32183 0.428 0.000 0.364 0.208 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.5446 0.20870 0.032 0.000 0.564 0.000 0.340 0.064
#> SRR1383883 1 0.4085 0.62300 0.716 0.000 0.052 0.232 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.4077 0.57731 0.692 0.000 0.000 0.280 0.012 0.016
#> SRR1475697 4 0.5127 -0.13056 0.452 0.000 0.000 0.480 0.060 0.008
#> SRR1488067 6 0.3789 0.77632 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1102103 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 6 0.3390 0.84120 0.000 0.296 0.000 0.000 0.000 0.704
#> SRR1084991 6 0.4775 0.79856 0.084 0.284 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1410380 3 0.3221 0.52349 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.3234 0.61638 0.812 0.000 0.008 0.164 0.012 0.004
#> SRR1485812 5 0.6584 0.21722 0.376 0.000 0.000 0.104 0.432 0.088
#> SRR1078020 2 0.0146 0.84350 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311153 3 0.4079 0.57407 0.172 0.000 0.744 0.084 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.1075 0.83103 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1343898 5 0.4944 0.60760 0.104 0.000 0.032 0.000 0.704 0.160
#> SRR807775 3 0.3782 0.35514 0.000 0.000 0.636 0.000 0.360 0.004
#> SRR1409215 2 0.5149 -0.42698 0.084 0.476 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR820427 1 0.6915 -0.12482 0.464 0.000 0.160 0.016 0.304 0.056
#> SRR1100656 6 0.3309 0.83661 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1362159 1 0.5870 0.40260 0.480 0.000 0.276 0.244 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.5027 0.28618 0.012 0.000 0.600 0.000 0.324 0.064
#> SRR656794 3 0.2510 0.66392 0.028 0.000 0.872 0.000 0.100 0.000
#> SRR604653 3 0.3150 0.62158 0.052 0.000 0.828 0.120 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.6616 -0.25091 0.396 0.000 0.008 0.032 0.392 0.172
#> SRR1485912 3 0.3523 0.60906 0.180 0.000 0.780 0.000 0.040 0.000
#> SRR1407602 1 0.7289 -0.20300 0.368 0.000 0.000 0.132 0.324 0.176
#> SRR1356164 4 0.6159 0.11575 0.348 0.000 0.000 0.476 0.148 0.028
#> SRR1328692 4 0.5609 0.53226 0.048 0.000 0.208 0.660 0.060 0.024
#> SRR1362438 3 0.1564 0.68220 0.024 0.000 0.936 0.040 0.000 0.000
#> SRR1479216 5 0.4381 0.14002 0.016 0.000 0.456 0.000 0.524 0.004
#> SRR1358041 4 0.5238 0.26790 0.292 0.000 0.128 0.580 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.1552 0.68100 0.000 0.000 0.940 0.036 0.020 0.004
#> SRR1368200 3 0.4583 0.33126 0.016 0.000 0.616 0.024 0.344 0.000
#> SRR1435602 2 0.1075 0.83150 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1501043 5 0.4342 0.33037 0.008 0.000 0.000 0.308 0.656 0.028
#> SRR1437256 4 0.3910 0.35148 0.004 0.000 0.000 0.660 0.328 0.008
#> SRR1487446 1 0.4032 0.38934 0.572 0.000 0.000 0.420 0.008 0.000
#> SRR816653 3 0.4641 0.06949 0.480 0.000 0.492 0.008 0.008 0.012
#> SRR815164 1 0.6694 0.45139 0.516 0.000 0.108 0.280 0.012 0.084
#> SRR1442043 4 0.3833 0.21934 0.344 0.000 0.000 0.648 0.008 0.000
#> SRR1410573 1 0.4601 0.60968 0.688 0.000 0.112 0.200 0.000 0.000
#> SRR1096782 6 0.5112 0.66967 0.084 0.400 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1352369 3 0.4039 0.62467 0.008 0.000 0.796 0.060 0.112 0.024
#> SRR1382934 5 0.4487 0.42574 0.008 0.000 0.008 0.248 0.696 0.040
#> SRR1465208 1 0.5281 0.26997 0.456 0.000 0.084 0.456 0.000 0.004
#> SRR1314728 1 0.3508 0.57356 0.840 0.000 0.032 0.076 0.008 0.044
#> SRR1470291 4 0.5854 0.14829 0.212 0.000 0.320 0.468 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.4341 0.42269 0.008 0.000 0.668 0.000 0.292 0.032
#> SRR1409600 3 0.4403 0.55707 0.096 0.000 0.708 0.000 0.196 0.000
#> SRR816123 6 0.3860 0.68850 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR614779 3 0.3967 0.41649 0.008 0.000 0.668 0.000 0.316 0.008
#> SRR810783 3 0.1225 0.68352 0.000 0.000 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1333990 1 0.3782 0.62731 0.740 0.000 0.036 0.224 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.1285 0.67402 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR808106 3 0.7998 -0.02479 0.312 0.000 0.368 0.152 0.092 0.076
#> SRR662713 3 0.2052 0.67777 0.000 0.000 0.912 0.056 0.028 0.004
#> SRR1447058 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 4 0.6055 0.16979 0.000 0.000 0.376 0.440 0.172 0.012
#> SRR809382 5 0.5664 0.41869 0.348 0.000 0.016 0.004 0.536 0.096
#> SRR665417 4 0.3447 0.59200 0.044 0.000 0.148 0.804 0.000 0.004
#> SRR1088016 2 0.3864 -0.62223 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1453166 6 0.3371 0.83851 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000 0.708
#> SRR1069826 6 0.5100 0.71231 0.084 0.392 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1077781 2 0.5153 -0.46756 0.084 0.464 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR615623 5 0.4090 0.58733 0.012 0.000 0.192 0.000 0.748 0.048
#> SRR1413787 5 0.5840 0.60617 0.100 0.000 0.132 0.000 0.640 0.128
#> SRR1478207 5 0.6516 0.22505 0.004 0.000 0.368 0.200 0.404 0.024
#> SRR1411046 1 0.4271 0.61619 0.696 0.000 0.060 0.244 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0865 0.83879 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1326560 4 0.4116 -0.04438 0.416 0.000 0.012 0.572 0.000 0.000
#> SRR1309051 3 0.1245 0.68243 0.016 0.000 0.952 0.032 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0146 0.84350 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1395616 1 0.4859 0.51719 0.584 0.000 0.072 0.344 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.3810 0.74322 0.000 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR1092961 6 0.3867 0.64429 0.000 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR817210 3 0.5624 0.37264 0.020 0.000 0.600 0.272 0.100 0.008
#> SRR1319221 5 0.2991 0.57565 0.008 0.000 0.004 0.084 0.860 0.044
#> SRR1405413 1 0.3840 0.63034 0.776 0.000 0.068 0.152 0.000 0.004
#> SRR607807 1 0.5071 0.45831 0.540 0.000 0.084 0.376 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.6124 -0.13540 0.000 0.000 0.436 0.144 0.396 0.024
#> SRR1406283 3 0.3094 0.63747 0.036 0.000 0.824 0.000 0.140 0.000
#> SRR1357709 4 0.1793 0.62859 0.032 0.000 0.036 0.928 0.000 0.004
#> SRR1080742 6 0.3854 0.68908 0.000 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1468208 1 0.4381 0.61406 0.692 0.000 0.072 0.236 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.0937 0.67661 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1361612 1 0.3741 0.56559 0.672 0.000 0.008 0.320 0.000 0.000
#> SRR1311224 3 0.1088 0.68370 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.4418 0.52371 0.068 0.000 0.700 0.228 0.000 0.004
#> SRR1099720 6 0.4819 0.79646 0.088 0.284 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1349250 6 0.3266 0.83055 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1350912 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.6023 0.06953 0.292 0.000 0.428 0.000 0.280 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 5 0.4357 0.46923 0.020 0.000 0.304 0.000 0.660 0.016
#> SRR1332879 3 0.1092 0.68439 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000 0.000
#> SRR1403177 5 0.6640 0.32280 0.348 0.000 0.008 0.048 0.452 0.144
#> SRR1076144 2 0.1434 0.82413 0.012 0.940 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1069614 6 0.3371 0.84030 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000 0.708
#> SRR818239 6 0.3288 0.83487 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1421069 6 0.3409 0.84181 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1500006 3 0.3356 0.60726 0.052 0.000 0.808 0.140 0.000 0.000
#> SRR1485678 4 0.4218 0.38478 0.012 0.000 0.400 0.584 0.004 0.000
#> SRR1092232 5 0.5754 0.56232 0.140 0.000 0.008 0.040 0.640 0.172
#> SRR1344253 3 0.6439 0.04055 0.184 0.000 0.452 0.008 0.336 0.020
#> SRR1384290 4 0.5877 0.11413 0.212 0.000 0.332 0.456 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.4565 0.44131 0.012 0.000 0.680 0.000 0.256 0.052
#> SRR1343522 2 0.4595 0.35683 0.084 0.668 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1326727 2 0.3032 0.71685 0.056 0.840 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1440940 4 0.2699 0.58288 0.012 0.000 0.000 0.856 0.124 0.008
#> SRR818372 4 0.3944 0.60015 0.024 0.000 0.032 0.808 0.112 0.024
#> SRR1323675 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 4 0.2918 0.59366 0.084 0.000 0.000 0.864 0.032 0.020
#> SRR1310031 3 0.4086 0.08212 0.000 0.000 0.528 0.000 0.464 0.008
#> SRR615419 4 0.4383 0.28563 0.012 0.000 0.000 0.616 0.356 0.016
#> SRR1436925 4 0.3534 0.55001 0.016 0.000 0.244 0.740 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.4272 0.62042 0.704 0.000 0.052 0.240 0.000 0.004
#> SRR1332566 1 0.4191 0.62032 0.704 0.000 0.056 0.240 0.000 0.000
#> SRR1490228 5 0.6095 0.59766 0.048 0.000 0.176 0.024 0.628 0.124
#> SRR1442949 1 0.5577 0.33833 0.648 0.000 0.000 0.048 0.144 0.160
#> SRR1466239 1 0.4527 0.60925 0.680 0.000 0.084 0.236 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.4122 0.51394 0.064 0.724 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1329971 3 0.3932 0.54316 0.248 0.000 0.720 0.004 0.028 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 6 0.4819 0.79646 0.088 0.284 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1322981 3 0.2320 0.64008 0.000 0.000 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR1485976 2 0.0865 0.83879 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1471713 3 0.3950 0.19132 0.004 0.000 0.564 0.000 0.432 0.000
#> SRR660522 3 0.2631 0.62798 0.000 0.000 0.840 0.008 0.152 0.000
#> SRR815374 4 0.2979 0.61166 0.044 0.000 0.116 0.840 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.3838 0.71885 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1416337 3 0.3859 0.45705 0.008 0.000 0.692 0.000 0.292 0.008
#> SRR1316438 5 0.5764 0.51751 0.240 0.000 0.012 0.008 0.588 0.152
#> SRR1386844 1 0.4648 0.53680 0.604 0.000 0.056 0.340 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.5700 0.29162 0.436 0.000 0.160 0.404 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.4095 0.62600 0.724 0.000 0.060 0.216 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.1802 0.80315 0.012 0.916 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1460296 3 0.5130 0.35835 0.136 0.000 0.612 0.252 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.2805 0.60900 0.828 0.000 0.000 0.160 0.000 0.012
#> SRR1393404 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 3 0.3468 0.60635 0.068 0.000 0.804 0.128 0.000 0.000
#> SRR1401815 5 0.3696 0.57422 0.016 0.000 0.204 0.000 0.764 0.016
#> SRR1071337 2 0.0146 0.84350 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071983 6 0.5057 0.71908 0.088 0.352 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1331793 2 0.0547 0.84407 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1410510 5 0.4144 0.27253 0.004 0.000 0.408 0.000 0.580 0.008
#> SRR1098761 6 0.3828 0.71648 0.000 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1312124 1 0.3050 0.61688 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000 0.000
#> SRR615395 3 0.1700 0.66731 0.004 0.000 0.916 0.000 0.080 0.000
#> SRR1479349 4 0.3072 0.60291 0.084 0.000 0.076 0.840 0.000 0.000
#> SRR2165033 4 0.5109 0.22904 0.328 0.000 0.100 0.572 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0260 0.83952 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR816201 4 0.1334 0.63030 0.000 0.000 0.032 0.948 0.020 0.000
#> SRR1488514 2 0.5118 -0.32535 0.084 0.512 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR655840 4 0.2351 0.60340 0.052 0.000 0.000 0.900 0.036 0.012
#> SRR1379303 1 0.4618 0.60624 0.672 0.000 0.092 0.236 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.2328 0.60615 0.032 0.000 0.000 0.904 0.044 0.020
#> SRR613174 3 0.3076 0.54927 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1351125 3 0.3189 0.55569 0.000 0.000 0.760 0.000 0.236 0.004
#> SRR659157 1 0.7357 -0.16389 0.348 0.000 0.000 0.144 0.332 0.176
#> SRR1480408 4 0.0937 0.63150 0.000 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.4063 -0.03659 0.420 0.000 0.000 0.572 0.004 0.004
#> SRR1073317 2 0.4195 0.51503 0.076 0.724 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1332526 4 0.1444 0.63050 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.3868 0.62693 0.000 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1431270 1 0.6592 -0.15168 0.432 0.000 0.000 0.048 0.344 0.176
#> SRR1085614 6 0.4932 0.77499 0.088 0.312 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1330106 4 0.4000 0.48109 0.028 0.000 0.004 0.740 0.220 0.008
#> SRR1466154 3 0.1644 0.67869 0.028 0.000 0.932 0.040 0.000 0.000
#> SRR1396944 4 0.5500 0.03609 0.332 0.000 0.128 0.536 0.000 0.004
#> SRR1082784 2 0.0790 0.84059 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1457267 1 0.4675 0.60516 0.672 0.000 0.104 0.224 0.000 0.000
#> SRR614659 4 0.3280 0.60686 0.004 0.000 0.160 0.808 0.028 0.000
#> SRR659247 3 0.5841 0.44236 0.016 0.000 0.648 0.144 0.148 0.044
#> SRR1317201 1 0.3630 0.62839 0.756 0.000 0.032 0.212 0.000 0.000
#> SRR1473696 3 0.1668 0.68443 0.060 0.000 0.928 0.008 0.004 0.000
#> SRR1375842 3 0.3825 0.58288 0.072 0.000 0.768 0.160 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.1327 0.81730 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1096363 6 0.3653 0.83913 0.008 0.300 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR1453662 4 0.3888 0.52961 0.032 0.000 0.252 0.716 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 3 0.3159 0.64620 0.072 0.000 0.840 0.084 0.000 0.004
#> SRR1416693 1 0.5230 0.47057 0.548 0.000 0.108 0.344 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.2234 0.64390 0.000 0.000 0.872 0.004 0.124 0.000
#> SRR1380910 1 0.6066 0.24891 0.380 0.000 0.356 0.264 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.4195 0.51873 0.076 0.724 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1498183 3 0.4438 0.29170 0.044 0.000 0.628 0.328 0.000 0.000
#> SRR612659 5 0.3944 0.22531 0.004 0.000 0.428 0.000 0.568 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 6 0.3634 0.81984 0.000 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1089595 6 0.4819 0.79646 0.088 0.284 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1074263 2 0.4738 0.26326 0.084 0.640 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1376786 3 0.0622 0.68378 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1345995 3 0.1078 0.68553 0.012 0.000 0.964 0.016 0.008 0.000
#> SRR1071035 3 0.2946 0.59717 0.004 0.000 0.808 0.184 0.000 0.004
#> SRR1068808 6 0.3244 0.83007 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1332754 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 3 0.4547 0.45192 0.276 0.000 0.656 0.068 0.000 0.000
#> SRR1335355 3 0.6009 -0.20408 0.244 0.000 0.412 0.344 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.2504 0.63694 0.000 0.000 0.856 0.004 0.136 0.004
#> SRR1323558 5 0.5536 0.16236 0.020 0.000 0.452 0.000 0.452 0.076
#> SRR1381711 3 0.4102 0.34570 0.012 0.000 0.628 0.000 0.356 0.004
#> SRR657985 3 0.1780 0.67707 0.000 0.000 0.924 0.028 0.048 0.000
#> SRR1314810 1 0.3644 0.50374 0.784 0.000 0.180 0.004 0.012 0.020
#> SRR1336505 4 0.4864 0.50285 0.004 0.000 0.080 0.700 0.196 0.020
#> SRR1474095 1 0.5404 0.43023 0.548 0.000 0.312 0.140 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.1007 0.83381 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1442376 4 0.4652 -0.04009 0.404 0.000 0.000 0.560 0.024 0.012
#> SRR1074909 6 0.3789 0.77349 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1101200 3 0.1464 0.68092 0.000 0.000 0.944 0.016 0.036 0.004
#> SRR1075408 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 4 0.2147 0.60152 0.084 0.000 0.000 0.896 0.020 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0146 0.84350 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467277 5 0.6411 0.43821 0.076 0.000 0.320 0.000 0.496 0.108
#> SRR1084867 2 0.0146 0.84350 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095431 6 0.3620 0.80677 0.000 0.352 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR1380184 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.2003 0.68172 0.044 0.000 0.912 0.044 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.2941 0.57056 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1315912 3 0.1334 0.68224 0.020 0.000 0.948 0.032 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.3672 0.61553 0.056 0.776 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1421116 2 0.0713 0.84200 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR602282 4 0.4724 0.30372 0.012 0.000 0.000 0.616 0.332 0.040
#> SRR1361195 2 0.1802 0.80055 0.012 0.916 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR600493 3 0.1367 0.68082 0.012 0.000 0.944 0.044 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.2493 0.68123 0.076 0.000 0.884 0.004 0.036 0.000
#> SRR1355475 3 0.2631 0.60737 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1360785 1 0.3201 0.61376 0.780 0.000 0.000 0.208 0.000 0.012
#> SRR810437 4 0.4571 0.33811 0.008 0.000 0.028 0.628 0.332 0.004
#> SRR1361860 4 0.4127 0.33129 0.284 0.000 0.028 0.684 0.000 0.004
#> SRR1441311 2 0.0547 0.84407 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1098903 4 0.3579 0.57582 0.092 0.000 0.020 0.832 0.012 0.044
#> SRR1457619 1 0.3240 0.61553 0.752 0.000 0.004 0.244 0.000 0.000
#> SRR1498529 4 0.2412 0.62159 0.028 0.000 0.092 0.880 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0260 0.84613 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074017 6 0.5012 0.77537 0.088 0.336 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1472033 2 0.4548 0.39040 0.080 0.672 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1445087 5 0.4433 0.60922 0.024 0.000 0.072 0.108 0.776 0.020
#> SRR1399525 6 0.3857 0.71278 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1312844 6 0.3868 0.67655 0.000 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR1085874 6 0.3833 0.74008 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1101226 6 0.3868 0.62693 0.000 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1476056 4 0.3488 0.41805 0.244 0.000 0.000 0.744 0.008 0.004
#> SRR1075659 6 0.3288 0.83414 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1311916 5 0.4264 0.04607 0.016 0.000 0.484 0.000 0.500 0.000
#> SRR1353353 5 0.5002 0.03615 0.008 0.000 0.004 0.452 0.496 0.040
#> SRR1073291 3 0.2933 0.58670 0.000 0.000 0.796 0.000 0.200 0.004
#> SRR1356227 1 0.4039 0.43910 0.568 0.000 0.008 0.424 0.000 0.000
#> SRR1080720 6 0.4819 0.79646 0.088 0.284 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1091695 6 0.3409 0.83438 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1350304 1 0.5924 0.38743 0.576 0.000 0.000 0.228 0.032 0.164
#> SRR663002 5 0.4477 0.45766 0.036 0.000 0.308 0.000 0.648 0.008
#> SRR1376983 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4587 0.57732 0.640 0.000 0.064 0.296 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.3782 0.26008 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1384006 4 0.3990 0.49823 0.028 0.000 0.284 0.688 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.3867 -0.64478 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR614047 3 0.4893 -0.01651 0.012 0.000 0.512 0.000 0.440 0.036
#> SRR818440 1 0.5126 0.57381 0.688 0.000 0.008 0.160 0.128 0.016
#> SRR1337770 4 0.4316 0.53686 0.144 0.000 0.128 0.728 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.1908 0.66493 0.000 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1385542 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 4 0.2658 0.63170 0.024 0.000 0.072 0.884 0.016 0.004
#> SRR1074041 3 0.2135 0.63867 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.1816 0.67700 0.004 0.000 0.928 0.016 0.048 0.004
#> SRR816699 3 0.2883 0.57852 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1308612 3 0.2402 0.62956 0.000 0.000 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR1499418 1 0.5419 -0.12089 0.476 0.000 0.000 0.044 0.444 0.036
#> SRR1352894 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.5612 0.28288 0.484 0.000 0.088 0.412 0.012 0.004
#> SRR1331083 6 0.3515 0.83715 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR808272 3 0.3337 0.52049 0.000 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1436698 3 0.1938 0.68608 0.040 0.000 0.920 0.004 0.036 0.000
#> SRR1095627 6 0.3860 0.68850 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1357672 3 0.0972 0.68193 0.008 0.000 0.964 0.000 0.028 0.000
#> SRR1351236 3 0.4723 0.46860 0.232 0.000 0.664 0.104 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.5781 0.21203 0.428 0.000 0.396 0.176 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.3875 0.58018 0.760 0.000 0.000 0.196 0.016 0.028
#> SRR1101256 2 0.4328 0.48266 0.080 0.708 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1436004 3 0.2344 0.67836 0.068 0.000 0.896 0.008 0.028 0.000
#> SRR1457994 6 0.5147 0.55887 0.084 0.436 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1078998 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.1787 0.63093 0.004 0.000 0.068 0.920 0.000 0.008
#> SRR1309534 1 0.4174 0.49585 0.628 0.000 0.000 0.352 0.016 0.004
#> SRR615527 5 0.3663 0.62950 0.040 0.000 0.048 0.048 0.840 0.024
#> SRR1098216 1 0.5030 0.27012 0.480 0.000 0.060 0.456 0.000 0.004
#> SRR1325847 6 0.3515 0.83895 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR1404003 4 0.1405 0.62884 0.024 0.000 0.024 0.948 0.000 0.004
#> SRR1344166 4 0.3969 0.44940 0.008 0.000 0.344 0.644 0.000 0.004
#> SRR1368638 1 0.4774 0.50512 0.664 0.000 0.000 0.264 0.020 0.052
#> SRR1431429 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 6 0.3936 0.83073 0.024 0.288 0.000 0.000 0.000 0.688
#> SRR1080509 2 0.1204 0.82469 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR815759 1 0.5957 0.05370 0.544 0.000 0.008 0.008 0.260 0.180
#> SRR1502143 3 0.2006 0.64887 0.000 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1487614 5 0.4640 0.18427 0.000 0.000 0.436 0.004 0.528 0.032
#> SRR1402307 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 4 0.3509 0.54689 0.016 0.000 0.240 0.744 0.000 0.000
#> SRR1099212 6 0.5147 0.63544 0.084 0.436 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1083215 3 0.3477 0.64359 0.132 0.000 0.808 0.004 0.056 0.000
#> SRR1476547 6 0.4801 0.79433 0.088 0.280 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR656421 1 0.4431 0.62043 0.692 0.000 0.080 0.228 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.84705 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 4 0.2322 0.60485 0.036 0.000 0.000 0.896 0.064 0.004
#> SRR1339944 2 0.1297 0.83068 0.012 0.948 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1391444 2 0.0865 0.83879 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1434889 4 0.6081 0.41038 0.112 0.000 0.004 0.624 0.148 0.112
#> SRR1431847 1 0.6152 -0.03499 0.500 0.000 0.000 0.060 0.348 0.092
#> SRR1317155 4 0.2350 0.61568 0.076 0.000 0.004 0.896 0.016 0.008
#> SRR1477405 3 0.5746 -0.11091 0.376 0.000 0.452 0.172 0.000 0.000
#> SRR655289 4 0.5880 0.42152 0.196 0.000 0.024 0.640 0.040 0.100
#> SRR1341683 4 0.3387 0.56785 0.004 0.000 0.016 0.808 0.160 0.012
#> SRR1084790 3 0.2432 0.67880 0.072 0.000 0.892 0.016 0.020 0.000
#> SRR1073731 4 0.6049 0.47705 0.016 0.000 0.236 0.580 0.148 0.020
#> SRR1332588 4 0.2051 0.61211 0.036 0.000 0.000 0.916 0.040 0.008
#> SRR1471157 2 0.0713 0.84200 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR654945 3 0.2823 0.58808 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR661028 3 0.1341 0.68389 0.024 0.000 0.948 0.028 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.3776 0.57525 0.048 0.756 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1101152 3 0.4254 0.49948 0.020 0.000 0.704 0.252 0.024 0.000
#> SRR1358435 6 0.4783 0.80963 0.076 0.308 0.000 0.000 0.000 0.616
#> SRR2165273 4 0.5889 0.08277 0.264 0.000 0.260 0.476 0.000 0.000
#> SRR1379014 4 0.4363 0.22280 0.324 0.000 0.040 0.636 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.3536 0.53645 0.000 0.000 0.736 0.008 0.252 0.004
#> SRR1416386 6 0.3563 0.83513 0.000 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1406048 1 0.3652 0.60186 0.720 0.000 0.000 0.264 0.000 0.016
#> SRR606982 5 0.7760 0.36727 0.272 0.000 0.060 0.156 0.424 0.088
#> SRR1358082 3 0.5796 -0.18243 0.388 0.000 0.432 0.180 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.5862 0.15368 0.000 0.000 0.508 0.276 0.212 0.004
#> SRR655194 4 0.4947 0.39533 0.244 0.000 0.120 0.636 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.3700 0.62661 0.068 0.780 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1473251 6 0.4801 0.79433 0.088 0.280 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1389820 5 0.2965 0.58406 0.004 0.000 0.008 0.068 0.864 0.056
#> SRR1074289 3 0.1408 0.68194 0.000 0.000 0.944 0.036 0.020 0.000
#> SRR1348816 2 0.4810 0.19558 0.084 0.624 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1076292 1 0.5046 0.05138 0.516 0.000 0.000 0.048 0.424 0.012
#> SRR1395810 2 0.0865 0.83879 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1498909 4 0.3651 0.44662 0.008 0.000 0.004 0.736 0.248 0.004
#> SRR1443507 3 0.0603 0.68262 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1452310 1 0.4838 0.59803 0.692 0.000 0.000 0.216 0.056 0.036
#> SRR665610 4 0.5073 0.54294 0.140 0.000 0.120 0.704 0.032 0.004
#> SRR1347322 3 0.5153 0.26031 0.120 0.000 0.592 0.288 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.3864 0.65950 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1477256 1 0.5620 0.41755 0.512 0.000 0.320 0.168 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.6021 -0.01627 0.520 0.000 0.000 0.028 0.312 0.140
#> SRR1354247 4 0.4159 0.52471 0.040 0.000 0.252 0.704 0.000 0.004
#> SRR1082640 2 0.0146 0.84350 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487592 3 0.2915 0.61029 0.008 0.000 0.808 0.000 0.184 0.000
#> SRR1352299 3 0.2442 0.66799 0.048 0.000 0.884 0.068 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.3464 0.84057 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000 0.688
#> SRR1434117 3 0.2805 0.60472 0.000 0.000 0.812 0.004 0.184 0.000
#> SRR1075273 6 0.3659 0.81933 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR658657 4 0.5283 0.20025 0.016 0.000 0.044 0.524 0.408 0.008
#> SRR1092773 6 0.4170 0.83277 0.032 0.308 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1365332 3 0.0713 0.68045 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR615958 3 0.3852 0.30953 0.000 0.000 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR1097688 6 0.3446 0.83948 0.000 0.308 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR1403259 4 0.5912 -0.00264 0.068 0.000 0.004 0.488 0.396 0.044
#> SRR1099120 6 0.3266 0.83254 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1362200 3 0.2969 0.56866 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1464856 2 0.2826 0.71443 0.028 0.844 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1347298 3 0.4076 0.19000 0.000 0.000 0.564 0.004 0.428 0.004
#> SRR1075923 6 0.3482 0.84024 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR1100703 3 0.1995 0.67556 0.036 0.000 0.912 0.052 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.992 0.997 0.43448 0.568 0.568
#> 3 3 0.943 0.972 0.986 0.05632 0.984 0.971
#> 4 4 0.943 0.966 0.987 0.00329 1.000 1.000
#> 5 5 0.796 0.894 0.933 0.11511 1.000 1.000
#> 6 6 0.610 0.782 0.872 0.20051 0.867 0.759
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1474617 1 0.971 0.341 0.600 0.400
#> SRR1398013 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.844 0.629 0.728 0.272
#> SRR1313494 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.844 0.629 0.728 0.272
#> SRR1405413 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.722 0.750 0.800 0.200
#> SRR1076144 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 1 0.971 0.341 0.600 0.400
#> SRR1074289 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 0.995 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410742 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399069 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.1529 0.953 0.960 0.000 0.040
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.2878 0.900 0.904 0.000 0.096
#> SRR1368141 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1440268 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.3412 0.867 0.876 0.000 0.124
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.2261 0.928 0.932 0.000 0.068
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.2537 0.916 0.920 0.000 0.080
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1445064 1 0.2711 0.907 0.912 0.000 0.088
#> SRR1452981 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0424 0.977 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077898 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1420710 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR660426 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR661064 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0747 0.972 0.984 0.000 0.016
#> SRR1337707 1 0.3412 0.867 0.876 0.000 0.124
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.3482 0.644 0.000 0.128 0.872
#> SRR1398013 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR1352918 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420750 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.3412 0.867 0.876 0.000 0.124
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.0000 0.705 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.1753 0.947 0.952 0.000 0.048
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0424 0.976 0.992 0.000 0.008
#> SRR1325559 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1446695 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1383883 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1475697 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1485812 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.6062 0.418 0.384 0.000 0.616
#> SRR807775 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.1964 0.940 0.944 0.000 0.056
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.1860 0.943 0.948 0.000 0.052
#> SRR656794 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1485912 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1407602 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1356164 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1362438 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1358041 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 1 0.3412 0.867 0.876 0.000 0.124
#> SRR1437256 1 0.2878 0.898 0.904 0.000 0.096
#> SRR1487446 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.3192 0.881 0.888 0.000 0.112
#> SRR1465208 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1470291 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR809382 1 0.3267 0.877 0.884 0.000 0.116
#> SRR665417 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 1 0.3116 0.885 0.892 0.000 0.108
#> SRR1413787 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1478207 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319221 3 0.0000 0.705 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.0747 0.972 0.984 0.000 0.016
#> SRR607807 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.3116 0.886 0.892 0.000 0.108
#> SRR1406283 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0747 0.972 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1332879 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.6235 0.285 0.436 0.000 0.564
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1344253 1 0.1163 0.963 0.972 0.000 0.028
#> SRR1384290 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.3412 0.867 0.876 0.000 0.124
#> SRR818372 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR615419 1 0.2878 0.898 0.904 0.000 0.096
#> SRR1436925 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1466239 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.2261 0.928 0.932 0.000 0.068
#> SRR660522 1 0.0892 0.969 0.980 0.000 0.020
#> SRR815374 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1386844 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.1163 0.963 0.972 0.000 0.028
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.2537 0.917 0.920 0.000 0.080
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR613174 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR659157 1 0.2878 0.900 0.904 0.000 0.096
#> SRR1480408 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071035 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1323558 1 0.0892 0.969 0.980 0.000 0.020
#> SRR1381711 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR657985 1 0.0892 0.969 0.980 0.000 0.020
#> SRR1314810 1 0.1163 0.963 0.972 0.000 0.028
#> SRR1336505 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355475 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR810437 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR1361860 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.1163 0.963 0.972 0.000 0.028
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1353353 1 0.3192 0.881 0.888 0.000 0.112
#> SRR1073291 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR663002 1 0.1289 0.960 0.968 0.000 0.032
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.3340 0.872 0.880 0.000 0.120
#> SRR1384006 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 1 0.0424 0.976 0.992 0.000 0.008
#> SRR818440 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1074041 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.3038 0.890 0.896 0.000 0.104
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1351236 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR615527 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR1098216 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1860 0.943 0.948 0.000 0.052
#> SRR1502143 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.3116 0.886 0.892 0.000 0.108
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.2066 0.936 0.940 0.000 0.060
#> SRR1317155 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1477405 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.2711 0.907 0.912 0.000 0.088
#> SRR1084790 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR661028 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.3116 0.886 0.892 0.000 0.108
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.3482 0.644 0.000 0.128 0.872
#> SRR1074289 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0424 0.976 0.992 0.000 0.008
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0747 0.972 0.984 0.000 0.016
#> SRR665610 1 0.0747 0.972 0.984 0.000 0.016
#> SRR1347322 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.1753 0.947 0.952 0.000 0.048
#> SRR1354247 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.0424 0.976 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 1 0.0747 0.972 0.984 0.000 0.016
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0892 0.969 0.980 0.000 0.020
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.0592 0.974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.1643 0.950 0.956 0.000 0.044
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1458662 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0188 0.97992 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1410742 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1399069 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.1305 0.95634 0.960 0 0.004 0.036
#> SRR1080560 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.2480 0.90737 0.904 0 0.008 0.088
#> SRR1368141 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1440268 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.2918 0.87681 0.876 0 0.008 0.116
#> SRR1432695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.1902 0.93341 0.932 0 0.004 0.064
#> SRR1087393 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.0469 0.97559 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1332232 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.2125 0.92214 0.920 0 0.004 0.076
#> SRR1465501 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1330878 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1445064 1 0.2149 0.91347 0.912 0 0.000 0.088
#> SRR1452981 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0336 0.97817 0.992 0 0.000 0.008
#> SRR1077898 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1420710 1 0.0469 0.97549 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR660426 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.1637 0.94043 0.940 0 0.000 0.060
#> SRR661064 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0592 0.97366 0.984 0 0.000 0.016
#> SRR1337707 1 0.2918 0.87681 0.876 0 0.008 0.116
#> SRR1408752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.0000 -0.03667 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1398013 1 0.1637 0.94045 0.940 0 0.000 0.060
#> SRR1352918 1 0.0188 0.97992 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1420750 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.2918 0.87681 0.876 0 0.008 0.116
#> SRR1353618 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.2760 -0.07138 0.000 0 0.872 0.128
#> SRR1313494 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.1389 0.95042 0.952 0 0.000 0.048
#> SRR1088631 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0336 0.97789 0.992 0 0.000 0.008
#> SRR1325559 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1446695 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1383883 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0188 0.97992 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1475697 1 0.1743 0.94076 0.940 0 0.004 0.056
#> SRR1488067 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1410380 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1445490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0469 0.97590 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1485812 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1078020 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.7075 -0.00587 0.384 0 0.488 0.128
#> SRR807775 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.1557 0.94384 0.944 0 0.000 0.056
#> SRR1100656 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.1474 0.94701 0.948 0 0.000 0.052
#> SRR656794 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1485912 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1407602 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1356164 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.0469 0.97559 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1362438 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1358041 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1435602 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1501043 1 0.2918 0.87689 0.876 0 0.008 0.116
#> SRR1437256 1 0.2281 0.90547 0.904 0 0.000 0.096
#> SRR1487446 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.2654 0.88999 0.888 0 0.004 0.108
#> SRR1465208 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0469 0.97611 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1470291 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR816123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR809382 1 0.2714 0.88585 0.884 0 0.004 0.112
#> SRR665417 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR615623 1 0.2593 0.89354 0.892 0 0.004 0.104
#> SRR1413787 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1478207 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1319221 3 0.2760 -0.07138 0.000 0 0.872 0.128
#> SRR1405413 1 0.0592 0.97349 0.984 0 0.000 0.016
#> SRR607807 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.2593 0.89428 0.892 0 0.004 0.104
#> SRR1406283 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0592 0.97349 0.984 0 0.000 0.016
#> SRR1074980 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1332879 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1403177 4 0.0000 0.00000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1076144 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1344253 1 0.0921 0.96554 0.972 0 0.000 0.028
#> SRR1384290 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.2918 0.87681 0.876 0 0.008 0.116
#> SRR818372 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1323675 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR615419 1 0.2281 0.90547 0.904 0 0.000 0.096
#> SRR1436925 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1466239 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR813076 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.1902 0.93341 0.932 0 0.004 0.064
#> SRR660522 1 0.0779 0.97124 0.980 0 0.004 0.016
#> SRR815374 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.0469 0.97606 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1386844 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0921 0.96545 0.972 0 0.000 0.028
#> SRR1393404 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1071337 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1098761 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.2198 0.92307 0.920 0 0.008 0.072
#> SRR1089054 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.0188 0.97993 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1488514 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0188 0.97993 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR613174 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR659157 1 0.2480 0.90737 0.904 0 0.008 0.088
#> SRR1480408 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1431270 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1085614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1071035 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1323558 1 0.0707 0.97109 0.980 0 0.000 0.020
#> SRR1381711 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR657985 1 0.0779 0.97124 0.980 0 0.004 0.016
#> SRR1314810 1 0.0921 0.96545 0.972 0 0.000 0.028
#> SRR1336505 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.0469 0.97603 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1313406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1084867 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR602282 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1361195 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0188 0.97990 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1355475 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR810437 1 0.1637 0.94045 0.940 0 0.000 0.060
#> SRR1361860 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.0921 0.96554 0.972 0 0.000 0.028
#> SRR1399525 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1353353 1 0.2654 0.88999 0.888 0 0.004 0.108
#> SRR1073291 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR663002 1 0.1022 0.96243 0.968 0 0.000 0.032
#> SRR1376983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.2773 0.88131 0.880 0 0.004 0.116
#> SRR1384006 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR614047 1 0.0336 0.97794 0.992 0 0.000 0.008
#> SRR818440 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1074041 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.2530 0.89785 0.896 0 0.004 0.100
#> SRR1352894 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1351236 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0188 0.97992 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1101256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.1743 0.94076 0.940 0 0.004 0.056
#> SRR615527 1 0.1637 0.94079 0.940 0 0.000 0.060
#> SRR1098216 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0188 0.97992 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1431429 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1474 0.94701 0.948 0 0.000 0.052
#> SRR1502143 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.2593 0.89428 0.892 0 0.004 0.104
#> SRR1402307 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.1637 0.94043 0.940 0 0.000 0.060
#> SRR1339944 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.1743 0.94076 0.940 0 0.004 0.056
#> SRR1317155 1 0.0188 0.97993 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1477405 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.2149 0.91347 0.912 0 0.000 0.088
#> SRR1084790 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0469 0.97603 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1471157 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR661028 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1358435 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.2593 0.89428 0.892 0 0.004 0.104
#> SRR1416386 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0469 0.97576 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1331174 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1389820 3 0.0000 -0.03667 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1074289 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0336 0.97789 0.992 0 0.000 0.008
#> SRR1395810 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0592 0.97369 0.984 0 0.000 0.016
#> SRR665610 1 0.0592 0.97370 0.984 0 0.000 0.016
#> SRR1347322 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.1389 0.95072 0.952 0 0.000 0.048
#> SRR1354247 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.0336 0.97794 0.992 0 0.000 0.008
#> SRR1075273 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR658657 1 0.0592 0.97370 0.984 0 0.000 0.016
#> SRR1092773 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0707 0.97109 0.980 0 0.000 0.020
#> SRR1097688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.0469 0.97559 0.988 0 0.000 0.012
#> SRR1099120 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.1302 0.95351 0.956 0 0.000 0.044
#> SRR1075923 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.98178 1.000 0 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.0162 0.912 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436370 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355723 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1329744 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR657384 3 0.0794 0.912 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1351190 3 0.2074 0.882 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1458662 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396017 3 0.1792 0.891 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR1410742 3 0.1965 0.886 0 0 0.904 0.000 0.096
#> SRR1435963 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1382416 3 0.1544 0.899 0 0 0.932 0.000 0.068
#> SRR1391354 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087968 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312244 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1325138 3 0.0000 0.911 0 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1490178 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1075707 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1414058 3 0.1478 0.905 0 0 0.936 0.000 0.064
#> SRR1407449 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1436858 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.1270 0.904 0 0 0.948 0.000 0.052
#> SRR1399069 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1366450 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1396859 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1457176 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1097666 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.2852 0.841 0 0 0.828 0.000 0.172
#> SRR1080560 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1435688 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR658152 3 0.4101 0.620 0 0 0.628 0.000 0.372
#> SRR1368141 3 0.4302 0.414 0 0 0.520 0.000 0.480
#> SRR1440268 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1453725 3 0.0609 0.911 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1325711 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1477591 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416049 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1369052 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1377735 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1331244 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404531 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1324331 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458890 3 0.4235 0.532 0 0 0.576 0.000 0.424
#> SRR1432695 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.3837 0.708 0 0 0.692 0.000 0.308
#> SRR1087393 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.0880 0.911 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1385211 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR655241 3 0.1608 0.903 0 0 0.928 0.000 0.072
#> SRR656922 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1361630 3 0.0880 0.910 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1318966 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR603212 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1321088 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.3508 0.772 0 0 0.748 0.000 0.252
#> SRR1332232 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.1197 0.906 0 0 0.952 0.000 0.048
#> SRR1457835 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1347123 3 0.4015 0.658 0 0 0.652 0.000 0.348
#> SRR1465501 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.4305 0.395 0 0 0.512 0.000 0.488
#> SRR1445064 3 0.3424 0.779 0 0 0.760 0.000 0.240
#> SRR1452981 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1326708 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407157 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1365401 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.2813 0.840 0 0 0.832 0.000 0.168
#> SRR1077898 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1349080 3 0.0703 0.912 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1076096 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1432563 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1380614 3 0.2179 0.877 0 0 0.888 0.000 0.112
#> SRR812060 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR602082 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1069490 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.1792 0.891 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR1420710 3 0.2852 0.836 0 0 0.828 0.000 0.172
#> SRR660426 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416003 3 0.3274 0.796 0 0 0.780 0.000 0.220
#> SRR661064 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1082011 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 3 0.1608 0.902 0 0 0.928 0.000 0.072
#> SRR1353243 3 0.0609 0.911 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1455482 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313473 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1399394 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1102467 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1317470 3 0.3003 0.828 0 0 0.812 0.000 0.188
#> SRR1337707 3 0.4235 0.532 0 0 0.576 0.000 0.424
#> SRR1408752 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 4 0.0000 1.000 0 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398013 3 0.3586 0.754 0 0 0.736 0.000 0.264
#> SRR1352918 3 0.2074 0.881 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1420750 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1071785 3 0.4235 0.532 0 0 0.576 0.000 0.424
#> SRR1353618 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.0000 0.911 0 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355684 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1323289 5 0.4138 0.168 0 0 0.000 0.384 0.616
#> SRR1313494 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309985 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR607911 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1333789 3 0.0703 0.911 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1400078 3 0.2377 0.869 0 0 0.872 0.000 0.128
#> SRR1088631 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR615575 3 0.0609 0.911 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1079434 3 0.2929 0.834 0 0 0.820 0.000 0.180
#> SRR1325559 3 0.0794 0.910 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1446695 3 0.1965 0.888 0 0 0.904 0.000 0.096
#> SRR1383883 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396100 3 0.2074 0.881 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1475697 3 0.3816 0.716 0 0 0.696 0.000 0.304
#> SRR1488067 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.2424 0.867 0 0 0.868 0.000 0.132
#> SRR1445490 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.1792 0.892 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR1485812 3 0.4182 0.573 0 0 0.600 0.000 0.400
#> SRR1078020 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1376406 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.0510 0.267 0 0 0.016 0.000 0.984
#> SRR807775 3 0.1792 0.895 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR1409215 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.3636 0.750 0 0 0.728 0.000 0.272
#> SRR1100656 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1414536 3 0.3480 0.774 0 0 0.752 0.000 0.248
#> SRR656794 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR604653 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1317685 3 0.4182 0.573 0 0 0.600 0.000 0.400
#> SRR1485912 3 0.1851 0.889 0 0 0.912 0.000 0.088
#> SRR1407602 3 0.4305 0.395 0 0 0.512 0.000 0.488
#> SRR1356164 3 0.3586 0.764 0 0 0.736 0.000 0.264
#> SRR1328692 3 0.3452 0.780 0 0 0.756 0.000 0.244
#> SRR1362438 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1479216 3 0.4171 0.579 0 0 0.604 0.000 0.396
#> SRR1358041 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1468766 3 0.0963 0.911 0 0 0.964 0.000 0.036
#> SRR1368200 3 0.1792 0.891 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR1435602 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.4306 0.385 0 0 0.508 0.000 0.492
#> SRR1437256 3 0.3999 0.659 0 0 0.656 0.000 0.344
#> SRR1487446 3 0.0703 0.911 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR816653 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR815164 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1442043 3 0.0880 0.911 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1410573 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1096782 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.0609 0.913 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1382934 3 0.4283 0.466 0 0 0.544 0.000 0.456
#> SRR1465208 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1314728 3 0.1341 0.904 0 0 0.944 0.000 0.056
#> SRR1470291 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1308756 3 0.2605 0.856 0 0 0.852 0.000 0.148
#> SRR1409600 3 0.1341 0.903 0 0 0.944 0.000 0.056
#> SRR816123 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR614779 3 0.1792 0.895 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR810783 3 0.0703 0.911 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1333990 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1410356 3 0.0609 0.912 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR808106 3 0.1043 0.908 0 0 0.960 0.000 0.040
#> SRR662713 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1447058 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0609 0.912 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR809382 3 0.4161 0.587 0 0 0.608 0.000 0.392
#> SRR665417 3 0.1908 0.890 0 0 0.908 0.000 0.092
#> SRR1088016 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.4294 0.443 0 0 0.532 0.000 0.468
#> SRR1413787 3 0.4304 0.404 0 0 0.516 0.000 0.484
#> SRR1478207 3 0.0703 0.913 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1411046 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1313711 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309051 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1486949 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074956 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR817210 3 0.0703 0.911 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1319221 5 0.4138 0.168 0 0 0.000 0.384 0.616
#> SRR1405413 3 0.2074 0.881 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR607807 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1390160 3 0.4126 0.606 0 0 0.620 0.000 0.380
#> SRR1406283 3 0.0880 0.910 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1357709 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080742 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1312766 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1361612 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311224 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1087801 3 0.1197 0.906 0 0 0.952 0.000 0.048
#> SRR1099720 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.2074 0.881 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1074980 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.4161 0.586 0 0 0.608 0.000 0.392
#> SRR1332879 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403177 1 0.0000 0.000 1 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1485678 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1092232 3 0.4305 0.395 0 0 0.512 0.000 0.488
#> SRR1344253 3 0.3143 0.814 0 0 0.796 0.000 0.204
#> SRR1384290 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1089349 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1343522 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.4060 0.635 0 0 0.640 0.000 0.360
#> SRR818372 3 0.2074 0.882 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1323675 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1310031 3 0.2230 0.879 0 0 0.884 0.000 0.116
#> SRR615419 3 0.3999 0.659 0 0 0.656 0.000 0.344
#> SRR1436925 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1477238 3 0.0703 0.912 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1332566 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490228 3 0.2280 0.874 0 0 0.880 0.000 0.120
#> SRR1442949 3 0.4030 0.647 0 0 0.648 0.000 0.352
#> SRR1466239 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1094003 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 3 0.1121 0.907 0 0 0.956 0.000 0.044
#> SRR813076 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1485976 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.3774 0.722 0 0 0.704 0.000 0.296
#> SRR660522 3 0.2813 0.843 0 0 0.832 0.000 0.168
#> SRR815374 3 0.0794 0.912 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1069564 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.1792 0.895 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR1316438 3 0.3707 0.743 0 0 0.716 0.000 0.284
#> SRR1386844 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1373718 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1447458 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1441421 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1335489 3 0.2074 0.884 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1393404 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1401815 3 0.4305 0.395 0 0 0.512 0.000 0.488
#> SRR1071337 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4171 0.579 0 0 0.604 0.000 0.396
#> SRR1098761 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 3 0.0510 0.913 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR615395 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1479349 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR2165033 3 0.3730 0.731 0 0 0.712 0.000 0.288
#> SRR1089054 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 3 0.0510 0.913 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488514 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1379303 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1418516 3 0.2329 0.872 0 0 0.876 0.000 0.124
#> SRR613174 3 0.0609 0.911 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1351125 3 0.0880 0.911 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR659157 3 0.4101 0.620 0 0 0.628 0.000 0.372
#> SRR1480408 3 0.0000 0.911 0 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 3 0.1270 0.905 0 0 0.948 0.000 0.052
#> SRR1073317 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.0000 0.911 0 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.4161 0.587 0 0 0.608 0.000 0.392
#> SRR1085614 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.1341 0.905 0 0 0.944 0.000 0.056
#> SRR1466154 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1396944 3 0.0510 0.911 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082784 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR614659 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR659247 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1317201 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473696 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1375842 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1388123 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.0703 0.913 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1345499 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416693 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1070841 3 0.0794 0.910 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1380910 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1333125 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR612659 3 0.2020 0.889 0 0 0.900 0.000 0.100
#> SRR1447148 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345995 3 0.0963 0.909 0 0 0.964 0.000 0.036
#> SRR1071035 3 0.1197 0.906 0 0 0.952 0.000 0.048
#> SRR1068808 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1335355 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR659448 3 0.2424 0.867 0 0 0.868 0.000 0.132
#> SRR1323558 3 0.2773 0.847 0 0 0.836 0.000 0.164
#> SRR1381711 3 0.2471 0.865 0 0 0.864 0.000 0.136
#> SRR657985 3 0.2813 0.843 0 0 0.832 0.000 0.168
#> SRR1314810 3 0.2179 0.880 0 0 0.888 0.000 0.112
#> SRR1336505 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1474095 3 0.0609 0.911 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1363831 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1074909 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075408 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.2813 0.841 0 0 0.832 0.000 0.168
#> SRR1313406 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.2605 0.857 0 0 0.852 0.000 0.148
#> SRR1084867 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.0794 0.910 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1380414 3 0.0510 0.911 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1315912 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1075778 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.4304 0.404 0 0 0.516 0.000 0.484
#> SRR1361195 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1477653 3 0.0963 0.909 0 0 0.964 0.000 0.036
#> SRR1355475 3 0.0794 0.911 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1360785 3 0.0880 0.911 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR810437 3 0.3586 0.754 0 0 0.736 0.000 0.264
#> SRR1361860 3 0.1908 0.890 0 0 0.908 0.000 0.092
#> SRR1441311 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457619 3 0.0880 0.910 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1498529 3 0.0000 0.911 0 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.3242 0.804 0 0 0.784 0.000 0.216
#> SRR1399525 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1075659 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.4171 0.579 0 0 0.604 0.000 0.396
#> SRR1353353 3 0.4283 0.466 0 0 0.544 0.000 0.456
#> SRR1073291 3 0.0703 0.911 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1356227 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080720 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.4030 0.647 0 0 0.648 0.000 0.352
#> SRR663002 3 0.3612 0.755 0 0 0.732 0.000 0.268
#> SRR1376983 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1347144 3 0.4171 0.579 0 0 0.604 0.000 0.396
#> SRR1384006 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1499108 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR614047 3 0.2280 0.875 0 0 0.880 0.000 0.120
#> SRR818440 3 0.0703 0.911 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1337770 3 0.1671 0.897 0 0 0.924 0.000 0.076
#> SRR1399413 3 0.0794 0.910 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1385542 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.2127 0.880 0 0 0.892 0.000 0.108
#> SRR1074041 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1394495 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.0609 0.913 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR816699 3 0.0510 0.911 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1308612 3 0.0794 0.911 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1499418 3 0.3730 0.728 0 0 0.712 0.000 0.288
#> SRR1352894 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 3 0.0609 0.912 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1331083 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR808272 3 0.2605 0.856 0 0 0.852 0.000 0.148
#> SRR1436698 3 0.0880 0.910 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1095627 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 3 0.2424 0.867 0 0 0.868 0.000 0.132
#> SRR1351236 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1077479 3 0.0510 0.911 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR814491 3 0.2074 0.881 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1101256 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1457994 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 3 0.0794 0.911 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1309534 3 0.3816 0.716 0 0 0.696 0.000 0.304
#> SRR615527 3 0.4201 0.566 0 0 0.592 0.000 0.408
#> SRR1098216 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1325847 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1344166 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1368638 3 0.2074 0.881 0 0 0.896 0.000 0.104
#> SRR1431429 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.3612 0.754 0 0 0.732 0.000 0.268
#> SRR1502143 3 0.0609 0.911 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1487614 3 0.4182 0.573 0 0 0.600 0.000 0.400
#> SRR1402307 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 3 0.0404 0.911 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099212 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.0794 0.910 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1476547 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR656421 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086116 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.3274 0.796 0 0 0.780 0.000 0.220
#> SRR1339944 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.0290 0.910 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR1431847 3 0.3816 0.716 0 0 0.696 0.000 0.304
#> SRR1317155 3 0.2966 0.831 0 0 0.816 0.000 0.184
#> SRR1477405 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR655289 3 0.0609 0.912 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR1341683 3 0.3913 0.685 0 0 0.676 0.000 0.324
#> SRR1084790 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1073731 3 0.0794 0.912 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1332588 3 0.2813 0.841 0 0 0.832 0.000 0.168
#> SRR1471157 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.2424 0.867 0 0 0.868 0.000 0.132
#> SRR661028 3 0.0404 0.910 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR1413477 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.1197 0.906 0 0 0.952 0.000 0.048
#> SRR1358435 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1379014 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489904 3 0.4126 0.606 0 0 0.620 0.000 0.380
#> SRR1416386 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 3 0.0290 0.911 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR606982 3 0.1197 0.906 0 0 0.952 0.000 0.048
#> SRR1358082 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312934 3 0.0404 0.912 0 0 0.988 0.000 0.012
#> SRR655194 3 0.0963 0.909 0 0 0.964 0.000 0.036
#> SRR1331174 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 4 0.0000 1.000 0 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074289 3 0.0510 0.912 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1348816 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.1792 0.895 0 0 0.916 0.000 0.084
#> SRR1395810 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.0963 0.912 0 0 0.964 0.000 0.036
#> SRR1443507 3 0.0880 0.910 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1452310 3 0.2424 0.865 0 0 0.868 0.000 0.132
#> SRR665610 3 0.2561 0.860 0 0 0.856 0.000 0.144
#> SRR1347322 3 0.0290 0.912 0 0 0.992 0.000 0.008
#> SRR813395 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 3 0.0162 0.911 0 0 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470230 3 0.3707 0.744 0 0 0.716 0.000 0.284
#> SRR1354247 3 0.0510 0.909 0 0 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082640 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.0880 0.910 0 0 0.968 0.000 0.032
#> SRR1352299 3 0.0794 0.910 0 0 0.972 0.000 0.028
#> SRR1076317 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.1341 0.903 0 0 0.944 0.000 0.056
#> SRR1075273 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR658657 3 0.3074 0.823 0 0 0.804 0.000 0.196
#> SRR1092773 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 3 0.0609 0.912 0 0 0.980 0.000 0.020
#> SRR615958 3 0.2773 0.847 0 0 0.836 0.000 0.164
#> SRR1097688 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.3508 0.772 0 0 0.748 0.000 0.252
#> SRR1099120 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.0703 0.911 0 0 0.976 0.000 0.024
#> SRR1464856 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.3707 0.740 0 0 0.716 0.000 0.284
#> SRR1075923 2 0.0000 1.000 0 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 3 0.0794 0.910 0 0 0.972 0.000 0.028
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 1 0.2680 0.81507 0.860 0 0.108 0.000 0.032 0
#> SRR1436370 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1075752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1397949 1 0.1616 0.81470 0.932 0 0.048 0.000 0.020 0
#> SRR1355723 1 0.3506 0.68460 0.792 0 0.052 0.000 0.156 0
#> SRR1329744 1 0.1320 0.81077 0.948 0 0.036 0.000 0.016 0
#> SRR657384 1 0.3098 0.77710 0.812 0 0.164 0.000 0.024 0
#> SRR1351190 1 0.3659 0.47814 0.636 0 0.364 0.000 0.000 0
#> SRR1458662 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR818573 1 0.2030 0.81650 0.908 0 0.064 0.000 0.028 0
#> SRR1396017 1 0.4078 0.47559 0.640 0 0.340 0.000 0.020 0
#> SRR1410742 1 0.3933 0.64793 0.716 0 0.248 0.000 0.036 0
#> SRR1435963 1 0.1643 0.81479 0.924 0 0.068 0.000 0.008 0
#> SRR1382416 1 0.3841 0.68438 0.764 0 0.168 0.000 0.068 0
#> SRR1391354 1 0.2560 0.81158 0.872 0 0.092 0.000 0.036 0
#> SRR1087968 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1310075 1 0.1245 0.80465 0.952 0 0.016 0.000 0.032 0
#> SRR1312244 1 0.1657 0.81588 0.928 0 0.056 0.000 0.016 0
#> SRR1325138 1 0.1951 0.81729 0.908 0 0.076 0.000 0.016 0
#> SRR1326821 1 0.1633 0.79980 0.932 0 0.024 0.000 0.044 0
#> SRR1490178 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR655613 1 0.2263 0.80715 0.896 0 0.048 0.000 0.056 0
#> SRR1075707 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1443871 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1102489 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1465758 1 0.1633 0.78342 0.932 0 0.024 0.000 0.044 0
#> SRR1414058 1 0.3587 0.75952 0.792 0 0.140 0.000 0.068 0
#> SRR1407449 1 0.2831 0.79427 0.840 0 0.136 0.000 0.024 0
#> SRR1436858 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1479109 1 0.3629 0.65359 0.712 0 0.276 0.000 0.012 0
#> SRR1399069 1 0.2747 0.74501 0.860 0 0.044 0.000 0.096 0
#> SRR1366450 1 0.2263 0.80715 0.896 0 0.048 0.000 0.056 0
#> SRR1396859 1 0.2164 0.81736 0.900 0 0.068 0.000 0.032 0
#> SRR1457176 1 0.2404 0.80273 0.872 0 0.112 0.000 0.016 0
#> SRR1097666 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1434736 1 0.4968 0.20789 0.556 0 0.368 0.000 0.076 0
#> SRR1080560 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1322882 1 0.1780 0.77885 0.924 0 0.028 0.000 0.048 0
#> SRR1435688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1327614 1 0.1633 0.78342 0.932 0 0.024 0.000 0.044 0
#> SRR658152 3 0.2805 0.71149 0.160 0 0.828 0.000 0.012 0
#> SRR1368141 3 0.2070 0.52204 0.048 0 0.908 0.000 0.044 0
#> SRR1440268 1 0.1320 0.81045 0.948 0 0.036 0.000 0.016 0
#> SRR1453725 1 0.2312 0.80740 0.876 0 0.112 0.000 0.012 0
#> SRR1325711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477930 1 0.1789 0.78409 0.924 0 0.032 0.000 0.044 0
#> SRR1477591 1 0.0914 0.81175 0.968 0 0.016 0.000 0.016 0
#> SRR1416049 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR656275 1 0.2404 0.81168 0.884 0 0.080 0.000 0.036 0
#> SRR1369052 1 0.1926 0.81902 0.912 0 0.068 0.000 0.020 0
#> SRR1377735 1 0.1074 0.81414 0.960 0 0.028 0.000 0.012 0
#> SRR1331244 1 0.2277 0.81591 0.892 0 0.076 0.000 0.032 0
#> SRR1404531 1 0.1970 0.79553 0.912 0 0.028 0.000 0.060 0
#> SRR1324331 1 0.2046 0.81573 0.908 0 0.060 0.000 0.032 0
#> SRR1458890 3 0.1806 0.64554 0.088 0 0.908 0.000 0.004 0
#> SRR1432695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1407624 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1431969 3 0.3547 0.65780 0.300 0 0.696 0.000 0.004 0
#> SRR1087393 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077263 1 0.2946 0.77192 0.812 0 0.176 0.000 0.012 0
#> SRR1385211 1 0.1334 0.81450 0.948 0 0.032 0.000 0.020 0
#> SRR655241 1 0.3455 0.72998 0.784 0 0.180 0.000 0.036 0
#> SRR656922 1 0.1789 0.79317 0.924 0 0.032 0.000 0.044 0
#> SRR1361630 1 0.2706 0.78258 0.832 0 0.160 0.000 0.008 0
#> SRR1318966 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1407087 1 0.2237 0.81389 0.896 0 0.068 0.000 0.036 0
#> SRR603212 1 0.1890 0.81847 0.916 0 0.060 0.000 0.024 0
#> SRR1321088 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1485190 3 0.4975 0.61210 0.312 0 0.596 0.000 0.092 0
#> SRR1332232 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312645 1 0.3136 0.75529 0.796 0 0.188 0.000 0.016 0
#> SRR1457835 1 0.1461 0.81831 0.940 0 0.044 0.000 0.016 0
#> SRR1347123 3 0.3078 0.71836 0.192 0 0.796 0.000 0.012 0
#> SRR1465501 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1330878 3 0.2325 0.50320 0.048 0 0.892 0.000 0.060 0
#> SRR1445064 3 0.4057 0.31915 0.436 0 0.556 0.000 0.008 0
#> SRR1452981 1 0.2586 0.81391 0.868 0 0.100 0.000 0.032 0
#> SRR1326708 1 0.1092 0.79940 0.960 0 0.020 0.000 0.020 0
#> SRR1407157 1 0.1176 0.80449 0.956 0 0.020 0.000 0.024 0
#> SRR1365401 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1397697 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477316 1 0.4399 0.02342 0.516 0 0.460 0.000 0.024 0
#> SRR1077898 1 0.1320 0.80774 0.948 0 0.036 0.000 0.016 0
#> SRR1349080 1 0.2956 0.75664 0.848 0 0.064 0.000 0.088 0
#> SRR1076096 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR811261 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1375485 1 0.2163 0.81467 0.892 0 0.092 0.000 0.016 0
#> SRR1432563 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR604414 1 0.1780 0.77885 0.924 0 0.028 0.000 0.048 0
#> SRR1380614 1 0.4745 0.46515 0.644 0 0.268 0.000 0.088 0
#> SRR812060 1 0.2237 0.81389 0.896 0 0.068 0.000 0.036 0
#> SRR602082 1 0.1461 0.79156 0.940 0 0.016 0.000 0.044 0
#> SRR1069490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1078417 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR661613 1 0.3563 0.53750 0.664 0 0.336 0.000 0.000 0
#> SRR1420710 1 0.4262 -0.02264 0.508 0 0.476 0.000 0.016 0
#> SRR660426 1 0.1765 0.78249 0.924 0 0.024 0.000 0.052 0
#> SRR1416003 3 0.3993 0.16097 0.476 0 0.520 0.000 0.004 0
#> SRR661064 1 0.2537 0.81513 0.872 0 0.096 0.000 0.032 0
#> SRR1082011 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1452718 1 0.3384 0.75008 0.812 0 0.120 0.000 0.068 0
#> SRR1353243 1 0.2778 0.77080 0.824 0 0.168 0.000 0.008 0
#> SRR1455482 1 0.1564 0.81337 0.936 0 0.024 0.000 0.040 0
#> SRR1313473 1 0.1765 0.80245 0.924 0 0.024 0.000 0.052 0
#> SRR1399394 1 0.2669 0.77985 0.836 0 0.156 0.000 0.008 0
#> SRR1102467 1 0.2647 0.75075 0.868 0 0.044 0.000 0.088 0
#> SRR1317470 1 0.3998 -0.02912 0.504 0 0.492 0.000 0.004 0
#> SRR1337707 3 0.1806 0.64554 0.088 0 0.908 0.000 0.004 0
#> SRR1408752 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1474617 4 0.0000 0.99542 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1398013 3 0.3872 0.48647 0.392 0 0.604 0.000 0.004 0
#> SRR1352918 1 0.4209 0.35192 0.596 0 0.384 0.000 0.020 0
#> SRR1420750 1 0.1320 0.80774 0.948 0 0.036 0.000 0.016 0
#> SRR1071785 3 0.1806 0.64554 0.088 0 0.908 0.000 0.004 0
#> SRR1353618 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1082217 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1357256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1490313 1 0.1951 0.81729 0.908 0 0.076 0.000 0.016 0
#> SRR1366560 1 0.1644 0.81783 0.920 0 0.076 0.000 0.004 0
#> SRR1355684 1 0.1633 0.79285 0.932 0 0.024 0.000 0.044 0
#> SRR1323289 5 0.4159 0.40754 0.000 0 0.088 0.176 0.736 0
#> SRR1313494 1 0.2312 0.80145 0.876 0 0.112 0.000 0.012 0
#> SRR1309985 1 0.2164 0.81736 0.900 0 0.068 0.000 0.032 0
#> SRR607911 1 0.1780 0.77885 0.924 0 0.028 0.000 0.048 0
#> SRR1333789 1 0.3098 0.78219 0.812 0 0.164 0.000 0.024 0
#> SRR1400078 1 0.4159 0.36149 0.588 0 0.396 0.000 0.016 0
#> SRR1088631 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1092842 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR615575 1 0.2968 0.77118 0.816 0 0.168 0.000 0.016 0
#> SRR1079434 1 0.5063 0.19108 0.544 0 0.372 0.000 0.084 0
#> SRR1325559 1 0.2933 0.74727 0.796 0 0.200 0.000 0.004 0
#> SRR1446695 1 0.4076 0.46468 0.620 0 0.364 0.000 0.016 0
#> SRR1383883 1 0.1575 0.81522 0.936 0 0.032 0.000 0.032 0
#> SRR1396100 1 0.4209 0.35192 0.596 0 0.384 0.000 0.020 0
#> SRR1475697 3 0.4565 0.67317 0.260 0 0.664 0.000 0.076 0
#> SRR1488067 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1102103 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1105154 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1084991 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1410380 1 0.3774 0.35578 0.592 0 0.408 0.000 0.000 0
#> SRR1445490 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1454671 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1435044 1 0.3652 0.56182 0.672 0 0.324 0.000 0.004 0
#> SRR1485812 3 0.2623 0.68995 0.132 0 0.852 0.000 0.016 0
#> SRR1078020 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1311153 1 0.1682 0.78536 0.928 0 0.020 0.000 0.052 0
#> SRR1376406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1343898 5 0.3881 0.28436 0.004 0 0.396 0.000 0.600 0
#> SRR807775 1 0.3612 0.73969 0.764 0 0.200 0.000 0.036 0
#> SRR1409215 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR820427 3 0.3867 0.60846 0.328 0 0.660 0.000 0.012 0
#> SRR1100656 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1362159 1 0.1549 0.78880 0.936 0 0.020 0.000 0.044 0
#> SRR1414536 3 0.3899 0.53638 0.364 0 0.628 0.000 0.008 0
#> SRR656794 1 0.1088 0.81264 0.960 0 0.024 0.000 0.016 0
#> SRR604653 1 0.1780 0.77885 0.924 0 0.028 0.000 0.048 0
#> SRR1317685 3 0.2623 0.68995 0.132 0 0.852 0.000 0.016 0
#> SRR1485912 1 0.3547 0.55199 0.668 0 0.332 0.000 0.000 0
#> SRR1407602 3 0.2499 0.48853 0.048 0 0.880 0.000 0.072 0
#> SRR1356164 3 0.5788 0.39269 0.316 0 0.484 0.000 0.200 0
#> SRR1328692 3 0.5003 0.60173 0.320 0 0.588 0.000 0.092 0
#> SRR1362438 1 0.1320 0.80765 0.948 0 0.016 0.000 0.036 0
#> SRR1479216 3 0.2302 0.68788 0.120 0 0.872 0.000 0.008 0
#> SRR1358041 1 0.2404 0.80273 0.872 0 0.112 0.000 0.016 0
#> SRR1468766 1 0.3159 0.79060 0.832 0 0.100 0.000 0.068 0
#> SRR1368200 1 0.3563 0.53750 0.664 0 0.336 0.000 0.000 0
#> SRR1435602 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1501043 3 0.2608 0.47917 0.048 0 0.872 0.000 0.080 0
#> SRR1437256 3 0.3081 0.71672 0.220 0 0.776 0.000 0.004 0
#> SRR1487446 1 0.2980 0.76401 0.808 0 0.180 0.000 0.012 0
#> SRR816653 1 0.1088 0.81400 0.960 0 0.024 0.000 0.016 0
#> SRR815164 1 0.1951 0.81782 0.908 0 0.076 0.000 0.016 0
#> SRR1442043 1 0.2942 0.79392 0.836 0 0.132 0.000 0.032 0
#> SRR1410573 1 0.1713 0.78555 0.928 0 0.028 0.000 0.044 0
#> SRR1096782 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1352369 1 0.2609 0.81485 0.868 0 0.096 0.000 0.036 0
#> SRR1382934 3 0.2255 0.60827 0.080 0 0.892 0.000 0.028 0
#> SRR1465208 1 0.2311 0.81056 0.880 0 0.104 0.000 0.016 0
#> SRR1314728 1 0.3323 0.70715 0.752 0 0.240 0.000 0.008 0
#> SRR1470291 1 0.1320 0.80765 0.948 0 0.016 0.000 0.036 0
#> SRR1308756 1 0.4300 0.41286 0.608 0 0.364 0.000 0.028 0
#> SRR1409600 1 0.3670 0.64067 0.704 0 0.284 0.000 0.012 0
#> SRR816123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR614779 1 0.3612 0.73969 0.764 0 0.200 0.000 0.036 0
#> SRR810783 1 0.3062 0.78542 0.816 0 0.160 0.000 0.024 0
#> SRR1333990 1 0.1334 0.81093 0.948 0 0.032 0.000 0.020 0
#> SRR1410356 1 0.2277 0.81927 0.892 0 0.076 0.000 0.032 0
#> SRR808106 1 0.3815 0.71996 0.776 0 0.132 0.000 0.092 0
#> SRR662713 1 0.2511 0.80545 0.880 0 0.056 0.000 0.064 0
#> SRR1447058 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1480964 1 0.2560 0.81254 0.872 0 0.092 0.000 0.036 0
#> SRR809382 3 0.2980 0.71974 0.192 0 0.800 0.000 0.008 0
#> SRR665417 1 0.4167 0.64163 0.708 0 0.236 0.000 0.056 0
#> SRR1088016 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1453166 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1069826 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1077781 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR615623 3 0.2744 0.55455 0.072 0 0.864 0.000 0.064 0
#> SRR1413787 3 0.2328 0.52171 0.052 0 0.892 0.000 0.056 0
#> SRR1478207 1 0.2706 0.81317 0.860 0 0.104 0.000 0.036 0
#> SRR1411046 1 0.1625 0.81695 0.928 0 0.060 0.000 0.012 0
#> SRR1313711 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326560 1 0.2046 0.81573 0.908 0 0.060 0.000 0.032 0
#> SRR1309051 1 0.1461 0.79659 0.940 0 0.016 0.000 0.044 0
#> SRR1486949 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1395616 1 0.1845 0.77920 0.920 0 0.028 0.000 0.052 0
#> SRR1074956 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1092961 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR817210 1 0.2946 0.76498 0.812 0 0.176 0.000 0.012 0
#> SRR1319221 5 0.4159 0.40754 0.000 0 0.088 0.176 0.736 0
#> SRR1405413 1 0.3659 0.47472 0.636 0 0.364 0.000 0.000 0
#> SRR607807 1 0.3506 0.68460 0.792 0 0.052 0.000 0.156 0
#> SRR1390160 3 0.2513 0.70359 0.140 0 0.852 0.000 0.008 0
#> SRR1406283 1 0.2706 0.78258 0.832 0 0.160 0.000 0.008 0
#> SRR1357709 1 0.2277 0.81591 0.892 0 0.076 0.000 0.032 0
#> SRR1080742 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1468208 1 0.1995 0.81262 0.912 0 0.052 0.000 0.036 0
#> SRR1312766 1 0.2491 0.80540 0.868 0 0.112 0.000 0.020 0
#> SRR1361612 1 0.1643 0.81479 0.924 0 0.068 0.000 0.008 0
#> SRR1311224 1 0.1765 0.78249 0.924 0 0.024 0.000 0.052 0
#> SRR1087801 1 0.3893 0.72023 0.764 0 0.156 0.000 0.080 0
#> SRR1099720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1349250 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1350912 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1357127 1 0.3659 0.47472 0.636 0 0.364 0.000 0.000 0
#> SRR1074980 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1317022 3 0.2191 0.68895 0.120 0 0.876 0.000 0.004 0
#> SRR1332879 1 0.0909 0.81103 0.968 0 0.020 0.000 0.012 0
#> SRR1403177 6 0.0000 0.00000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1076144 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1069614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR818239 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1421069 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1500006 1 0.2129 0.76786 0.904 0 0.040 0.000 0.056 0
#> SRR1485678 1 0.1461 0.81687 0.940 0 0.044 0.000 0.016 0
#> SRR1092232 3 0.2201 0.51625 0.048 0 0.900 0.000 0.052 0
#> SRR1344253 1 0.5058 0.03050 0.500 0 0.424 0.000 0.076 0
#> SRR1384290 1 0.0914 0.80749 0.968 0 0.016 0.000 0.016 0
#> SRR1089349 1 0.2783 0.78478 0.836 0 0.148 0.000 0.016 0
#> SRR1343522 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1326727 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1440940 3 0.2595 0.71318 0.160 0 0.836 0.000 0.004 0
#> SRR818372 1 0.3634 0.49268 0.644 0 0.356 0.000 0.000 0
#> SRR1323675 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR819894 1 0.2752 0.81194 0.856 0 0.108 0.000 0.036 0
#> SRR1310031 1 0.3876 0.63021 0.700 0 0.276 0.000 0.024 0
#> SRR615419 3 0.3081 0.71672 0.220 0 0.776 0.000 0.004 0
#> SRR1436925 1 0.2383 0.81493 0.880 0 0.096 0.000 0.024 0
#> SRR1477238 1 0.2190 0.79913 0.900 0 0.040 0.000 0.060 0
#> SRR1332566 1 0.1320 0.81374 0.948 0 0.036 0.000 0.016 0
#> SRR1490228 1 0.4150 0.53524 0.652 0 0.320 0.000 0.028 0
#> SRR1442949 3 0.2877 0.71633 0.168 0 0.820 0.000 0.012 0
#> SRR1466239 1 0.1391 0.81182 0.944 0 0.040 0.000 0.016 0
#> SRR1094003 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1329971 1 0.3541 0.67571 0.728 0 0.260 0.000 0.012 0
#> SRR813076 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1097642 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1322981 1 0.2536 0.80474 0.864 0 0.116 0.000 0.020 0
#> SRR1485976 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1471713 3 0.3565 0.64998 0.304 0 0.692 0.000 0.004 0
#> SRR660522 1 0.4385 0.08664 0.532 0 0.444 0.000 0.024 0
#> SRR815374 1 0.2531 0.79843 0.856 0 0.132 0.000 0.012 0
#> SRR1069564 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1416337 1 0.3612 0.73969 0.764 0 0.200 0.000 0.036 0
#> SRR1316438 3 0.5625 0.42460 0.276 0 0.532 0.000 0.192 0
#> SRR1386844 1 0.1341 0.80643 0.948 0 0.028 0.000 0.024 0
#> SRR1373718 1 0.1633 0.78342 0.932 0 0.024 0.000 0.044 0
#> SRR1447458 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1487128 1 0.1564 0.81337 0.936 0 0.024 0.000 0.040 0
#> SRR1441421 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1069919 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1460296 1 0.1391 0.80951 0.944 0 0.040 0.000 0.016 0
#> SRR1335489 1 0.4050 0.62969 0.716 0 0.236 0.000 0.048 0
#> SRR1393404 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1081425 1 0.1700 0.78078 0.928 0 0.024 0.000 0.048 0
#> SRR1401815 3 0.2325 0.50320 0.048 0 0.892 0.000 0.060 0
#> SRR1071337 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1071983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1331793 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1410510 3 0.2302 0.68788 0.120 0 0.872 0.000 0.008 0
#> SRR1098761 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312124 1 0.2450 0.80487 0.868 0 0.116 0.000 0.016 0
#> SRR615395 1 0.2404 0.80760 0.872 0 0.112 0.000 0.016 0
#> SRR1479349 1 0.2831 0.79427 0.840 0 0.136 0.000 0.024 0
#> SRR2165033 3 0.3816 0.67834 0.296 0 0.688 0.000 0.016 0
#> SRR1089054 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR816201 1 0.2573 0.81445 0.864 0 0.112 0.000 0.024 0
#> SRR1488514 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR655840 1 0.2752 0.81194 0.856 0 0.108 0.000 0.036 0
#> SRR1379303 1 0.1657 0.81588 0.928 0 0.056 0.000 0.016 0
#> SRR1418516 1 0.4363 0.48951 0.636 0 0.324 0.000 0.040 0
#> SRR613174 1 0.3104 0.76048 0.800 0 0.184 0.000 0.016 0
#> SRR1351125 1 0.2946 0.77192 0.812 0 0.176 0.000 0.012 0
#> SRR659157 3 0.2805 0.71149 0.160 0 0.828 0.000 0.012 0
#> SRR1480408 1 0.1951 0.81729 0.908 0 0.076 0.000 0.016 0
#> SRR657857 1 0.4003 0.69253 0.756 0 0.152 0.000 0.092 0
#> SRR1073317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1332526 1 0.1951 0.81729 0.908 0 0.076 0.000 0.016 0
#> SRR1094168 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1431270 3 0.2389 0.69617 0.128 0 0.864 0.000 0.008 0
#> SRR1085614 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1330106 1 0.3344 0.77835 0.804 0 0.152 0.000 0.044 0
#> SRR1466154 1 0.1765 0.78249 0.924 0 0.024 0.000 0.052 0
#> SRR1396944 1 0.1845 0.80100 0.920 0 0.028 0.000 0.052 0
#> SRR1082784 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1457267 1 0.1176 0.80964 0.956 0 0.024 0.000 0.020 0
#> SRR614659 1 0.2331 0.81435 0.888 0 0.080 0.000 0.032 0
#> SRR659247 1 0.2709 0.80180 0.848 0 0.132 0.000 0.020 0
#> SRR1317201 1 0.1838 0.81657 0.916 0 0.068 0.000 0.016 0
#> SRR1473696 1 0.1151 0.81582 0.956 0 0.032 0.000 0.012 0
#> SRR1375842 1 0.2129 0.76786 0.904 0 0.040 0.000 0.056 0
#> SRR1388123 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1096363 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1453662 1 0.3210 0.77355 0.804 0 0.168 0.000 0.028 0
#> SRR1345499 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1353499 1 0.2058 0.77055 0.908 0 0.036 0.000 0.056 0
#> SRR1416693 1 0.1245 0.80948 0.952 0 0.032 0.000 0.016 0
#> SRR1070841 1 0.3003 0.77500 0.812 0 0.172 0.000 0.016 0
#> SRR1380910 1 0.1713 0.78555 0.928 0 0.028 0.000 0.044 0
#> SRR1333125 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1498183 1 0.1461 0.81687 0.940 0 0.044 0.000 0.016 0
#> SRR612659 1 0.3834 0.68694 0.732 0 0.232 0.000 0.036 0
#> SRR1447148 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR658597 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1089595 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1074263 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1376786 1 0.2147 0.81764 0.896 0 0.084 0.000 0.020 0
#> SRR1345995 1 0.3259 0.72962 0.772 0 0.216 0.000 0.012 0
#> SRR1071035 1 0.3893 0.72023 0.764 0 0.156 0.000 0.080 0
#> SRR1068808 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1332754 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR662438 1 0.1391 0.80820 0.944 0 0.016 0.000 0.040 0
#> SRR1335355 1 0.1780 0.77885 0.924 0 0.028 0.000 0.048 0
#> SRR659448 1 0.3774 0.35732 0.592 0 0.408 0.000 0.000 0
#> SRR1323558 1 0.3993 0.07509 0.520 0 0.476 0.000 0.004 0
#> SRR1381711 1 0.4192 0.30763 0.572 0 0.412 0.000 0.016 0
#> SRR657985 1 0.4385 0.08664 0.532 0 0.444 0.000 0.024 0
#> SRR1314810 1 0.4181 0.60347 0.700 0 0.248 0.000 0.052 0
#> SRR1336505 1 0.2404 0.81168 0.884 0 0.080 0.000 0.036 0
#> SRR1474095 1 0.2778 0.77080 0.824 0 0.168 0.000 0.008 0
#> SRR1363831 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1442376 1 0.2609 0.81318 0.868 0 0.096 0.000 0.036 0
#> SRR1074909 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101200 1 0.2147 0.81764 0.896 0 0.084 0.000 0.020 0
#> SRR1075408 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1367150 1 0.4403 -0.00259 0.508 0 0.468 0.000 0.024 0
#> SRR1313406 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1068880 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1467277 1 0.4218 0.24455 0.556 0 0.428 0.000 0.016 0
#> SRR1084867 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1095431 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1380184 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1443113 1 0.2896 0.78287 0.824 0 0.160 0.000 0.016 0
#> SRR1380414 1 0.3071 0.76360 0.804 0 0.180 0.000 0.016 0
#> SRR1315912 1 0.1995 0.79442 0.912 0 0.036 0.000 0.052 0
#> SRR1075778 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1421116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR602282 3 0.2384 0.50578 0.048 0 0.888 0.000 0.064 0
#> SRR1361195 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR600493 1 0.1151 0.80154 0.956 0 0.012 0.000 0.032 0
#> SRR1477653 1 0.3259 0.72962 0.772 0 0.216 0.000 0.012 0
#> SRR1355475 1 0.3062 0.78135 0.816 0 0.160 0.000 0.024 0
#> SRR1360785 1 0.2942 0.79392 0.836 0 0.132 0.000 0.032 0
#> SRR810437 3 0.3872 0.48647 0.392 0 0.604 0.000 0.004 0
#> SRR1361860 1 0.4227 0.62466 0.692 0 0.256 0.000 0.052 0
#> SRR1441311 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1098903 1 0.2361 0.81513 0.884 0 0.088 0.000 0.028 0
#> SRR1457619 1 0.2896 0.77897 0.824 0 0.160 0.000 0.016 0
#> SRR1498529 1 0.1951 0.81729 0.908 0 0.076 0.000 0.016 0
#> SRR1097172 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1074017 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1472033 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1445087 1 0.5296 -0.15561 0.456 0 0.444 0.000 0.100 0
#> SRR1399525 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1312844 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1085874 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101226 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1476056 1 0.2331 0.82137 0.888 0 0.080 0.000 0.032 0
#> SRR1075659 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1311916 3 0.2302 0.68788 0.120 0 0.872 0.000 0.008 0
#> SRR1353353 3 0.2255 0.60827 0.080 0 0.892 0.000 0.028 0
#> SRR1073291 1 0.2968 0.77223 0.816 0 0.168 0.000 0.016 0
#> SRR1356227 1 0.1926 0.81902 0.912 0 0.068 0.000 0.020 0
#> SRR1080720 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1091695 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1350304 3 0.2877 0.71633 0.168 0 0.820 0.000 0.012 0
#> SRR663002 3 0.3769 0.57090 0.356 0 0.640 0.000 0.004 0
#> SRR1376983 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1399926 1 0.1341 0.80643 0.948 0 0.028 0.000 0.024 0
#> SRR1347144 3 0.2302 0.68788 0.120 0 0.872 0.000 0.008 0
#> SRR1384006 1 0.1780 0.77885 0.924 0 0.028 0.000 0.048 0
#> SRR1499108 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR614047 1 0.3927 0.52286 0.644 0 0.344 0.000 0.012 0
#> SRR818440 1 0.2946 0.76498 0.812 0 0.176 0.000 0.012 0
#> SRR1337770 1 0.3269 0.74735 0.792 0 0.184 0.000 0.024 0
#> SRR1399413 1 0.2896 0.78287 0.824 0 0.160 0.000 0.016 0
#> SRR1385542 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473959 1 0.3672 0.46686 0.632 0 0.368 0.000 0.000 0
#> SRR1074041 1 0.2581 0.80147 0.860 0 0.120 0.000 0.020 0
#> SRR1394495 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR659460 1 0.2609 0.81485 0.868 0 0.096 0.000 0.036 0
#> SRR816699 1 0.3104 0.76074 0.800 0 0.184 0.000 0.016 0
#> SRR1308612 1 0.3025 0.78348 0.820 0 0.156 0.000 0.024 0
#> SRR1499418 3 0.4305 0.30759 0.436 0 0.544 0.000 0.020 0
#> SRR1352894 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR815805 1 0.2897 0.75881 0.852 0 0.060 0.000 0.088 0
#> SRR1331083 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR808272 1 0.4300 0.41286 0.608 0 0.364 0.000 0.028 0
#> SRR1436698 1 0.2593 0.78933 0.844 0 0.148 0.000 0.008 0
#> SRR1095627 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1357672 1 0.3774 0.35578 0.592 0 0.408 0.000 0.000 0
#> SRR1351236 1 0.1713 0.78555 0.928 0 0.028 0.000 0.044 0
#> SRR1077479 1 0.1921 0.79603 0.916 0 0.032 0.000 0.052 0
#> SRR814491 1 0.4209 0.35192 0.596 0 0.384 0.000 0.020 0
#> SRR1101256 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1436004 1 0.1649 0.81570 0.932 0 0.036 0.000 0.032 0
#> SRR1457994 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1078998 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1314707 1 0.2888 0.74717 0.852 0 0.056 0.000 0.092 0
#> SRR1309534 3 0.4586 0.67324 0.264 0 0.660 0.000 0.076 0
#> SRR615527 3 0.3985 0.53541 0.100 0 0.760 0.000 0.140 0
#> SRR1098216 1 0.2697 0.74797 0.864 0 0.044 0.000 0.092 0
#> SRR1325847 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1404003 1 0.2420 0.81287 0.884 0 0.076 0.000 0.040 0
#> SRR1344166 1 0.2250 0.81683 0.888 0 0.092 0.000 0.020 0
#> SRR1368638 1 0.4209 0.35192 0.596 0 0.384 0.000 0.020 0
#> SRR1431429 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1079237 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1080509 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR815759 3 0.3789 0.60406 0.332 0 0.660 0.000 0.008 0
#> SRR1502143 1 0.3071 0.76385 0.804 0 0.180 0.000 0.016 0
#> SRR1487614 3 0.2302 0.68568 0.120 0 0.872 0.000 0.008 0
#> SRR1402307 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR820810 1 0.1951 0.81782 0.908 0 0.076 0.000 0.016 0
#> SRR1099212 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1083215 1 0.2896 0.78287 0.824 0 0.160 0.000 0.016 0
#> SRR1476547 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR656421 1 0.1168 0.81271 0.956 0 0.028 0.000 0.016 0
#> SRR1086116 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1499917 3 0.3993 0.16097 0.476 0 0.520 0.000 0.004 0
#> SRR1339944 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1391444 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1434889 1 0.2294 0.81158 0.892 0 0.072 0.000 0.036 0
#> SRR1431847 3 0.4565 0.67317 0.260 0 0.664 0.000 0.076 0
#> SRR1317155 1 0.4964 0.13324 0.540 0 0.388 0.000 0.072 0
#> SRR1477405 1 0.1713 0.78555 0.928 0 0.028 0.000 0.044 0
#> SRR655289 1 0.2480 0.81656 0.872 0 0.104 0.000 0.024 0
#> SRR1341683 3 0.3672 0.65630 0.304 0 0.688 0.000 0.008 0
#> SRR1084790 1 0.1633 0.81884 0.932 0 0.044 0.000 0.024 0
#> SRR1073731 1 0.2361 0.81893 0.884 0 0.088 0.000 0.028 0
#> SRR1332588 1 0.4403 -0.00259 0.508 0 0.468 0.000 0.024 0
#> SRR1471157 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR654945 1 0.3774 0.35578 0.592 0 0.408 0.000 0.000 0
#> SRR661028 1 0.1151 0.80154 0.956 0 0.012 0.000 0.032 0
#> SRR1413477 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1101152 1 0.3050 0.70908 0.764 0 0.236 0.000 0.000 0
#> SRR1358435 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR2165273 1 0.1572 0.81405 0.936 0 0.036 0.000 0.028 0
#> SRR1379014 1 0.2046 0.81613 0.908 0 0.060 0.000 0.032 0
#> SRR1489904 3 0.2513 0.70359 0.140 0 0.852 0.000 0.008 0
#> SRR1416386 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1406048 1 0.2312 0.80625 0.876 0 0.112 0.000 0.012 0
#> SRR606982 1 0.3967 0.69646 0.760 0 0.148 0.000 0.092 0
#> SRR1358082 1 0.1713 0.78555 0.928 0 0.028 0.000 0.044 0
#> SRR1312934 1 0.2404 0.81168 0.884 0 0.080 0.000 0.036 0
#> SRR655194 1 0.3133 0.73431 0.780 0 0.212 0.000 0.008 0
#> SRR1331174 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1473251 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1389820 4 0.0146 0.99542 0.000 0 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1074289 1 0.2581 0.80147 0.860 0 0.120 0.000 0.020 0
#> SRR1348816 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1076292 1 0.4299 0.67148 0.720 0 0.188 0.000 0.092 0
#> SRR1395810 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1498909 1 0.3713 0.73614 0.744 0 0.224 0.000 0.032 0
#> SRR1443507 1 0.3014 0.76198 0.804 0 0.184 0.000 0.012 0
#> SRR1452310 1 0.3965 0.37646 0.604 0 0.388 0.000 0.008 0
#> SRR665610 1 0.3717 0.40831 0.616 0 0.384 0.000 0.000 0
#> SRR1347322 1 0.1391 0.81069 0.944 0 0.040 0.000 0.016 0
#> SRR813395 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1477256 1 0.1480 0.81626 0.940 0 0.040 0.000 0.020 0
#> SRR1470230 3 0.4827 0.65089 0.296 0 0.620 0.000 0.084 0
#> SRR1354247 1 0.2647 0.75075 0.868 0 0.044 0.000 0.088 0
#> SRR1082640 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1487592 1 0.2706 0.78258 0.832 0 0.160 0.000 0.008 0
#> SRR1352299 1 0.2841 0.78080 0.824 0 0.164 0.000 0.012 0
#> SRR1076317 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1434117 1 0.3586 0.66365 0.720 0 0.268 0.000 0.012 0
#> SRR1075273 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR658657 3 0.3869 0.02333 0.500 0 0.500 0.000 0.000 0
#> SRR1092773 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1365332 1 0.2581 0.80422 0.860 0 0.120 0.000 0.020 0
#> SRR615958 1 0.4093 0.07378 0.516 0 0.476 0.000 0.008 0
#> SRR1097688 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1403259 3 0.4975 0.61210 0.312 0 0.596 0.000 0.092 0
#> SRR1099120 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1362200 1 0.2968 0.77223 0.816 0 0.168 0.000 0.016 0
#> SRR1464856 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1347298 3 0.4147 0.39270 0.436 0 0.552 0.000 0.012 0
#> SRR1075923 2 0.0000 1.00000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1100703 1 0.2841 0.78080 0.824 0 0.164 0.000 0.012 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4352 0.565 0.565
#> 3 3 0.705 0.891 0.890 0.4019 0.779 0.610
#> 4 4 0.634 0.655 0.773 0.1376 0.961 0.894
#> 5 5 0.602 0.437 0.710 0.0756 0.920 0.771
#> 6 6 0.589 0.351 0.534 0.0534 0.856 0.520
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 2 0 1 0 1
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 1 0 1 1 0
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 1 0 1 1 0
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 1 0 1 1 0
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 2 0 1 0 1
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.5397 0.885 0.720 0.000 0.280
#> SRR1436370 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1397949 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1355723 1 0.4842 0.957 0.776 0.000 0.224
#> SRR1329744 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR657384 1 0.5397 0.886 0.720 0.000 0.280
#> SRR1351190 3 0.5621 0.471 0.308 0.000 0.692
#> SRR1458662 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1396017 3 0.0892 0.890 0.020 0.000 0.980
#> SRR1410742 3 0.5327 0.561 0.272 0.000 0.728
#> SRR1435963 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1382416 1 0.4974 0.942 0.764 0.000 0.236
#> SRR1391354 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1087968 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1310075 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1312244 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1325138 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1326821 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1490178 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1075707 2 0.4504 0.891 0.196 0.804 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1465758 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1414058 3 0.2711 0.829 0.088 0.000 0.912
#> SRR1407449 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1436858 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1479109 3 0.6267 -0.144 0.452 0.000 0.548
#> SRR1399069 1 0.4750 0.966 0.784 0.000 0.216
#> SRR1366450 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1396859 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1457176 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1097666 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1434736 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1080560 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1322882 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1435688 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR658152 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1368141 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1440268 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1453725 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1325711 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1477591 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1416049 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1369052 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1377735 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1331244 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1404531 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1324331 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1458890 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1432695 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1087393 2 0.1031 0.938 0.024 0.976 0.000
#> SRR1077263 1 0.5216 0.913 0.740 0.000 0.260
#> SRR1385211 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR655241 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR656922 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1361630 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1318966 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1407087 1 0.4931 0.948 0.768 0.000 0.232
#> SRR603212 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1321088 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1485190 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1332232 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.5760 0.809 0.672 0.000 0.328
#> SRR1457835 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1347123 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1465501 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1330878 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1445064 3 0.1643 0.873 0.044 0.000 0.956
#> SRR1452981 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1326708 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1407157 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1365401 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.2625 0.840 0.084 0.000 0.916
#> SRR1077898 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1349080 1 0.4750 0.966 0.784 0.000 0.216
#> SRR1076096 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR811261 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1375485 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1432563 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1380614 3 0.6307 -0.310 0.488 0.000 0.512
#> SRR812060 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR602082 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1069490 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.5621 0.471 0.308 0.000 0.692
#> SRR1420710 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR660426 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1416003 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR661064 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1082011 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1353243 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1455482 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1313473 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1399394 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1102467 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1317470 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1337707 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1408752 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.6867 0.588 0.040 0.672 0.288
#> SRR1398013 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1352918 1 0.6026 0.715 0.624 0.000 0.376
#> SRR1420750 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1071785 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1353618 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1082217 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1366560 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1355684 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1323289 3 0.0000 0.883 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1309985 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR607911 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1333789 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1400078 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1088631 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR615575 1 0.6204 0.597 0.576 0.000 0.424
#> SRR1079434 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1325559 1 0.6008 0.723 0.628 0.000 0.372
#> SRR1446695 3 0.4178 0.741 0.172 0.000 0.828
#> SRR1383883 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1396100 3 0.2165 0.857 0.064 0.000 0.936
#> SRR1475697 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1488067 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1102103 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1105154 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1084991 2 0.4654 0.888 0.208 0.792 0.000
#> SRR1410380 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1445490 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.3816 0.773 0.148 0.000 0.852
#> SRR1485812 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1078020 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1311153 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1376406 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.883 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1409215 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1100656 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1362159 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1414536 3 0.4121 0.747 0.168 0.000 0.832
#> SRR656794 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR604653 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1317685 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1485912 1 0.6225 0.574 0.568 0.000 0.432
#> SRR1407602 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1356164 3 0.5760 0.358 0.328 0.000 0.672
#> SRR1328692 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1362438 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1479216 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1358041 1 0.5650 0.836 0.688 0.000 0.312
#> SRR1468766 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1368200 3 0.5621 0.471 0.308 0.000 0.692
#> SRR1435602 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0000 0.883 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1487446 3 0.5650 0.459 0.312 0.000 0.688
#> SRR816653 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR815164 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1442043 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1410573 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1096782 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1382934 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1465208 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1314728 3 0.5810 0.384 0.336 0.000 0.664
#> SRR1470291 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1308756 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1409600 3 0.5621 0.471 0.308 0.000 0.692
#> SRR816123 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR614779 3 0.6062 0.201 0.384 0.000 0.616
#> SRR810783 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1333990 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1410356 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR808106 3 0.6309 -0.338 0.496 0.000 0.504
#> SRR662713 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1447058 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480964 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR809382 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR665417 1 0.4750 0.966 0.784 0.000 0.216
#> SRR1088016 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1453166 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1413787 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1478207 3 0.3686 0.782 0.140 0.000 0.860
#> SRR1411046 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1313711 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1309051 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1486949 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1395616 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1074956 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1092961 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR817210 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1319221 3 0.0000 0.883 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.5706 0.823 0.680 0.000 0.320
#> SRR607807 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1390160 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1406283 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1357709 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1080742 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1468208 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1312766 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1361612 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1311224 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1087801 3 0.4178 0.749 0.172 0.000 0.828
#> SRR1099720 2 0.0747 0.940 0.016 0.984 0.000
#> SRR1349250 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1350912 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1357127 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1074980 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1317022 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1332879 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1403177 3 0.0000 0.883 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076144 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR818239 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1421069 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1500006 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1485678 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1092232 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1344253 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1384290 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1089349 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1343522 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR818372 3 0.4062 0.752 0.164 0.000 0.836
#> SRR1323675 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR819894 1 0.6291 0.462 0.532 0.000 0.468
#> SRR1310031 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR615419 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1436925 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1477238 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1332566 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1490228 3 0.1031 0.887 0.024 0.000 0.976
#> SRR1442949 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1466239 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1094003 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR813076 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1097642 2 0.1529 0.934 0.040 0.960 0.000
#> SRR1322981 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1485976 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR660522 3 0.2711 0.837 0.088 0.000 0.912
#> SRR815374 1 0.5760 0.809 0.672 0.000 0.328
#> SRR1069564 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1416337 3 0.4974 0.637 0.236 0.000 0.764
#> SRR1316438 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1386844 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1373718 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1447458 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1441421 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1335489 1 0.4796 0.962 0.780 0.000 0.220
#> SRR1393404 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1401815 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1071337 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1098761 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1312124 1 0.5760 0.809 0.672 0.000 0.328
#> SRR615395 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1479349 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR2165033 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1089054 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR816201 1 0.5291 0.902 0.732 0.000 0.268
#> SRR1488514 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.5431 0.880 0.716 0.000 0.284
#> SRR1379303 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1418516 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR613174 3 0.6079 0.183 0.388 0.000 0.612
#> SRR1351125 1 0.5810 0.795 0.664 0.000 0.336
#> SRR659157 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1480408 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR657857 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1073317 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1094168 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1431270 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1085614 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1330106 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1466154 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1396944 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1082784 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR614659 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR659247 1 0.5216 0.913 0.740 0.000 0.260
#> SRR1317201 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1473696 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1375842 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1388123 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1453662 1 0.6026 0.714 0.624 0.000 0.376
#> SRR1345499 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1416693 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1070841 3 0.6062 0.201 0.384 0.000 0.616
#> SRR1380910 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1333125 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR612659 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1447148 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR658597 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1089595 2 0.1529 0.934 0.040 0.960 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1345995 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1071035 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1068808 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1332754 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR662438 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1335355 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR659448 3 0.4887 0.652 0.228 0.000 0.772
#> SRR1323558 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1381711 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR657985 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1314810 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1336505 3 0.4702 0.682 0.212 0.000 0.788
#> SRR1474095 1 0.6204 0.596 0.576 0.000 0.424
#> SRR1363831 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1074909 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1101200 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1075408 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.1163 0.885 0.028 0.000 0.972
#> SRR1313406 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1068880 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1467277 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1084867 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1095431 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1380414 1 0.6126 0.658 0.600 0.000 0.400
#> SRR1315912 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1075778 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1361195 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1477653 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1355475 1 0.6244 0.551 0.560 0.000 0.440
#> SRR1360785 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR810437 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1361860 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1441311 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1457619 1 0.5760 0.809 0.672 0.000 0.328
#> SRR1498529 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1097172 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1399525 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1312844 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1085874 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1101226 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1476056 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1075659 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1311916 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1353353 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1073291 3 0.5835 0.371 0.340 0.000 0.660
#> SRR1356227 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1080720 2 0.0747 0.940 0.016 0.984 0.000
#> SRR1091695 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1350304 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR663002 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1376983 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1347144 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1384006 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1499108 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR614047 3 0.2796 0.833 0.092 0.000 0.908
#> SRR818440 3 0.5591 0.482 0.304 0.000 0.696
#> SRR1337770 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1399413 1 0.4750 0.966 0.784 0.000 0.216
#> SRR1385542 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.5621 0.471 0.308 0.000 0.692
#> SRR1074041 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1394495 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR816699 1 0.5968 0.740 0.636 0.000 0.364
#> SRR1308612 3 0.5621 0.471 0.308 0.000 0.692
#> SRR1499418 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1352894 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1331083 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR808272 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1436698 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1095627 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1357672 3 0.5058 0.621 0.244 0.000 0.756
#> SRR1351236 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1077479 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR814491 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1101256 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1457994 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1314707 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1309534 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR615527 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1098216 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1325847 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1404003 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1344166 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1368638 3 0.3482 0.796 0.128 0.000 0.872
#> SRR1431429 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1079237 2 0.4654 0.888 0.208 0.792 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1502143 1 0.5859 0.780 0.656 0.000 0.344
#> SRR1487614 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1402307 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1099212 2 0.0592 0.940 0.012 0.988 0.000
#> SRR1083215 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1476547 2 0.1529 0.934 0.040 0.960 0.000
#> SRR656421 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1086116 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499917 3 0.0892 0.890 0.020 0.000 0.980
#> SRR1339944 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1431847 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1317155 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1477405 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR655289 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1341683 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1084790 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1073731 1 0.5529 0.861 0.704 0.000 0.296
#> SRR1332588 3 0.3551 0.791 0.132 0.000 0.868
#> SRR1471157 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.5098 0.613 0.248 0.000 0.752
#> SRR661028 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1413477 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.5760 0.809 0.672 0.000 0.328
#> SRR1358435 2 0.4654 0.888 0.208 0.792 0.000
#> SRR2165273 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1379014 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1489904 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1416386 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1406048 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR606982 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1358082 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1312934 1 0.5431 0.880 0.716 0.000 0.284
#> SRR655194 1 0.6225 0.574 0.568 0.000 0.432
#> SRR1331174 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.1529 0.934 0.040 0.960 0.000
#> SRR1389820 2 0.6443 0.674 0.040 0.720 0.240
#> SRR1074289 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1348816 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.6295 -0.290 0.472 0.000 0.528
#> SRR1395810 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.4750 0.674 0.216 0.000 0.784
#> SRR1443507 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1452310 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR665610 3 0.4887 0.652 0.228 0.000 0.772
#> SRR1347322 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR813395 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1477256 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1470230 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1354247 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1082640 2 0.0237 0.942 0.004 0.996 0.000
#> SRR1487592 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1352299 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR1076317 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1434117 1 0.6305 0.406 0.516 0.000 0.484
#> SRR1075273 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR658657 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1092773 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1365332 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
#> SRR615958 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1097688 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1403259 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1099120 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1362200 3 0.4887 0.652 0.228 0.000 0.772
#> SRR1464856 2 0.0000 0.942 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0592 0.895 0.012 0.000 0.988
#> SRR1075923 2 0.4702 0.887 0.212 0.788 0.000
#> SRR1100703 1 0.4702 0.971 0.788 0.000 0.212
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.4872 0.6471 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR1436370 2 0.5110 0.8734 0.000 0.656 0.016 0.328
#> SRR1075752 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.2149 0.7762 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1355723 1 0.5193 0.6762 0.580 0.000 0.412 0.008
#> SRR1329744 1 0.1209 0.7688 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR657384 1 0.3942 0.6310 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1351190 1 0.5613 0.2700 0.592 0.000 0.380 0.028
#> SRR1458662 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR818573 1 0.4277 0.7546 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1396017 3 0.5807 0.3835 0.312 0.000 0.636 0.052
#> SRR1410742 3 0.6633 0.3020 0.416 0.000 0.500 0.084
#> SRR1435963 1 0.2334 0.7519 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR1382416 1 0.3681 0.6945 0.816 0.000 0.176 0.008
#> SRR1391354 1 0.4677 0.7450 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR1087968 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1310075 1 0.3751 0.7576 0.800 0.000 0.196 0.004
#> SRR1312244 1 0.2216 0.7461 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1325138 1 0.4220 0.7494 0.748 0.000 0.248 0.004
#> SRR1326821 1 0.4250 0.7506 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1490178 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR655613 1 0.4277 0.7495 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1075707 2 0.2021 0.7730 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR1443871 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1102489 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465758 1 0.3831 0.7560 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR1414058 3 0.4106 0.3039 0.084 0.000 0.832 0.084
#> SRR1407449 1 0.2345 0.7419 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1436858 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1479109 1 0.4605 0.4414 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1399069 1 0.5028 0.6890 0.596 0.000 0.400 0.004
#> SRR1366450 1 0.3311 0.7294 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1396859 1 0.0895 0.7682 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1457176 1 0.2973 0.7113 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 3 0.6950 0.4084 0.236 0.000 0.584 0.180
#> SRR1080560 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1322882 1 0.4277 0.7495 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1435688 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1327614 1 0.3668 0.7599 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR658152 3 0.6252 0.2885 0.056 0.000 0.512 0.432
#> SRR1368141 3 0.6257 0.2752 0.056 0.000 0.508 0.436
#> SRR1440268 1 0.1398 0.7690 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1453725 1 0.3907 0.7559 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1325711 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1477930 1 0.4509 0.7466 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR1477591 1 0.0921 0.7691 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1416049 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR656275 1 0.4800 0.7445 0.656 0.000 0.340 0.004
#> SRR1369052 1 0.4103 0.7558 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1377735 1 0.1022 0.7701 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1331244 1 0.2831 0.7705 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR1404531 1 0.4250 0.7512 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1324331 1 0.3539 0.7615 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR1458890 3 0.6271 0.2128 0.056 0.000 0.492 0.452
#> SRR1432695 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1407624 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1431969 3 0.6229 0.3321 0.056 0.000 0.528 0.416
#> SRR1087393 2 0.5339 0.8670 0.000 0.688 0.040 0.272
#> SRR1077263 1 0.4406 0.7133 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1385211 1 0.1118 0.7638 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR655241 1 0.3831 0.6909 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR656922 1 0.4277 0.7495 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1361630 3 0.5410 0.4359 0.080 0.000 0.728 0.192
#> SRR1318966 2 0.0336 0.7642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407087 1 0.4866 0.7325 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR603212 1 0.4522 0.7465 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1321088 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1485190 3 0.6268 0.2377 0.056 0.000 0.496 0.448
#> SRR1332232 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1312645 1 0.3942 0.6330 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1457835 1 0.1637 0.7616 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1347123 3 0.6229 0.3313 0.056 0.000 0.528 0.416
#> SRR1465501 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.6273 0.1987 0.056 0.000 0.488 0.456
#> SRR1445064 3 0.6141 0.4812 0.076 0.000 0.624 0.300
#> SRR1452981 1 0.3052 0.7688 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR1326708 1 0.1389 0.7773 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.7690 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1397697 2 0.4800 0.8740 0.000 0.656 0.004 0.340
#> SRR1477316 3 0.6469 0.4365 0.248 0.000 0.628 0.124
#> SRR1077898 1 0.1557 0.7601 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1349080 1 0.5273 0.6149 0.536 0.000 0.456 0.008
#> SRR1076096 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR811261 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.2408 0.7410 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1432563 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR604414 1 0.4277 0.7495 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1380614 1 0.6791 0.0541 0.508 0.000 0.392 0.100
#> SRR812060 1 0.4382 0.7572 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR602082 1 0.4428 0.7494 0.720 0.000 0.276 0.004
#> SRR1069490 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR661613 1 0.6326 0.1805 0.556 0.000 0.376 0.068
#> SRR1420710 3 0.6576 0.4619 0.200 0.000 0.632 0.168
#> SRR660426 1 0.4193 0.7527 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1416003 3 0.5993 0.4766 0.064 0.000 0.628 0.308
#> SRR661064 1 0.2053 0.7589 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1082011 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1452718 1 0.4964 0.7003 0.616 0.000 0.380 0.004
#> SRR1353243 1 0.1022 0.7701 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1455482 1 0.3486 0.7613 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1313473 1 0.3400 0.7623 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1399394 1 0.3172 0.7810 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1102467 1 0.4560 0.7454 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR1317470 3 0.6461 0.4538 0.216 0.000 0.640 0.144
#> SRR1337707 3 0.6257 0.2752 0.056 0.000 0.508 0.436
#> SRR1408752 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1474617 4 0.5615 0.3450 0.000 0.188 0.096 0.716
#> SRR1398013 3 0.6106 0.4618 0.064 0.000 0.604 0.332
#> SRR1352918 1 0.4428 0.5897 0.720 0.000 0.276 0.004
#> SRR1420750 1 0.2081 0.7500 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1071785 3 0.6257 0.2752 0.056 0.000 0.508 0.436
#> SRR1353618 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1082217 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1357256 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1490313 1 0.4535 0.7312 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR1366560 1 0.0188 0.7687 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1355684 1 0.3945 0.7576 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR1323289 4 0.5769 0.3062 0.056 0.000 0.292 0.652
#> SRR1313494 1 0.2011 0.7493 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1309985 1 0.2654 0.7749 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR607911 1 0.4372 0.7511 0.728 0.000 0.268 0.004
#> SRR1333789 1 0.4040 0.7164 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1400078 3 0.6646 0.4616 0.204 0.000 0.624 0.172
#> SRR1088631 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1092842 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615575 1 0.4985 0.5766 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1079434 3 0.6135 0.4066 0.056 0.000 0.568 0.376
#> SRR1325559 1 0.4008 0.6030 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1446695 3 0.6300 0.3934 0.308 0.000 0.608 0.084
#> SRR1383883 1 0.2999 0.7691 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR1396100 3 0.6352 0.4291 0.260 0.000 0.632 0.108
#> SRR1475697 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1488067 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102103 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1105154 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084991 2 0.1452 0.7690 0.000 0.956 0.036 0.008
#> SRR1410380 3 0.5972 0.4773 0.064 0.000 0.632 0.304
#> SRR1445490 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1454671 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1435044 3 0.6338 0.3929 0.316 0.000 0.600 0.084
#> SRR1485812 3 0.6252 0.2885 0.056 0.000 0.512 0.432
#> SRR1078020 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1311153 1 0.4509 0.7466 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR1376406 2 0.4917 0.8739 0.000 0.656 0.008 0.336
#> SRR1343898 4 0.6276 -0.2164 0.056 0.000 0.464 0.480
#> SRR807775 3 0.5417 0.4446 0.056 0.000 0.704 0.240
#> SRR1409215 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR820427 3 0.6023 0.4504 0.056 0.000 0.600 0.344
#> SRR1100656 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362159 1 0.3400 0.7634 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1414536 3 0.6375 0.3840 0.312 0.000 0.600 0.088
#> SRR656794 1 0.2345 0.7461 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR604653 1 0.4250 0.7506 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1317685 3 0.6261 0.2629 0.056 0.000 0.504 0.440
#> SRR1485912 1 0.4406 0.5229 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1407602 3 0.6273 0.1987 0.056 0.000 0.488 0.456
#> SRR1356164 3 0.7319 0.0457 0.248 0.000 0.532 0.220
#> SRR1328692 3 0.6179 0.3860 0.056 0.000 0.552 0.392
#> SRR1362438 1 0.1389 0.7675 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1479216 3 0.6247 0.3003 0.056 0.000 0.516 0.428
#> SRR1358041 1 0.3486 0.6648 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1468766 1 0.5138 0.7220 0.600 0.000 0.392 0.008
#> SRR1368200 1 0.6264 0.1909 0.560 0.000 0.376 0.064
#> SRR1435602 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1501043 4 0.6276 -0.2164 0.056 0.000 0.464 0.480
#> SRR1437256 3 0.6242 0.3117 0.056 0.000 0.520 0.424
#> SRR1487446 1 0.5189 0.3088 0.616 0.000 0.372 0.012
#> SRR816653 1 0.1474 0.7593 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR815164 1 0.3024 0.7839 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1442043 1 0.3908 0.7076 0.784 0.000 0.212 0.004
#> SRR1410573 1 0.0469 0.7706 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1096782 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1352369 1 0.4624 0.7559 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1382934 3 0.6273 0.1987 0.056 0.000 0.488 0.456
#> SRR1465208 1 0.0188 0.7700 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1314728 1 0.4761 0.3437 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.7690 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.5929 0.4787 0.064 0.000 0.640 0.296
#> SRR1409600 1 0.4978 0.3109 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR816123 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614779 3 0.4304 -0.0445 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR810783 1 0.4103 0.7212 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1333990 1 0.0779 0.7681 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1410356 1 0.4564 0.7489 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR808106 3 0.5510 -0.2240 0.376 0.000 0.600 0.024
#> SRR662713 1 0.4331 0.7480 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1447058 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1480964 1 0.4843 0.7432 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR809382 3 0.6235 0.3226 0.056 0.000 0.524 0.420
#> SRR665417 1 0.5132 0.5555 0.548 0.000 0.448 0.004
#> SRR1088016 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0336 0.7642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069826 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1077781 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR615623 3 0.6252 0.2880 0.056 0.000 0.512 0.432
#> SRR1413787 3 0.6273 0.1987 0.056 0.000 0.488 0.456
#> SRR1478207 3 0.5800 0.3863 0.128 0.000 0.708 0.164
#> SRR1411046 1 0.2654 0.7450 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1313711 2 0.4761 0.8747 0.000 0.664 0.004 0.332
#> SRR1326560 1 0.2530 0.7717 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR1309051 1 0.3486 0.7613 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1486949 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1395616 1 0.4220 0.7534 0.748 0.000 0.248 0.004
#> SRR1074956 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817210 1 0.4585 0.7591 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1319221 4 0.5720 0.3135 0.052 0.000 0.296 0.652
#> SRR1405413 1 0.3873 0.6380 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR607807 1 0.4936 0.7367 0.652 0.000 0.340 0.008
#> SRR1390160 3 0.5990 0.4582 0.056 0.000 0.608 0.336
#> SRR1406283 1 0.3024 0.7418 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1357709 1 0.4343 0.7496 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1080742 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.1576 0.7695 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1312766 1 0.3907 0.7193 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1361612 1 0.2216 0.7456 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1311224 1 0.4103 0.7582 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1087801 3 0.4937 0.2246 0.172 0.000 0.764 0.064
#> SRR1099720 2 0.5366 0.8678 0.000 0.684 0.040 0.276
#> SRR1349250 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1350912 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1357127 3 0.6494 0.4488 0.232 0.000 0.632 0.136
#> SRR1074980 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1317022 3 0.6257 0.2752 0.056 0.000 0.508 0.436
#> SRR1332879 1 0.1389 0.7673 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1403177 4 0.5792 0.3000 0.056 0.000 0.296 0.648
#> SRR1076144 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1069614 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818239 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1421069 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500006 1 0.4483 0.7472 0.712 0.000 0.284 0.004
#> SRR1485678 1 0.3074 0.7164 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1092232 3 0.6273 0.1987 0.056 0.000 0.488 0.456
#> SRR1344253 3 0.5883 0.4701 0.064 0.000 0.648 0.288
#> SRR1384290 1 0.2401 0.7720 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1089349 1 0.4697 0.7530 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1343522 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1326727 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1440940 3 0.6007 0.4545 0.056 0.000 0.604 0.340
#> SRR818372 3 0.6617 0.3380 0.380 0.000 0.532 0.088
#> SRR1323675 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR819894 1 0.5256 0.4773 0.596 0.000 0.392 0.012
#> SRR1310031 3 0.6007 0.4480 0.056 0.000 0.604 0.340
#> SRR615419 3 0.6229 0.3321 0.056 0.000 0.528 0.416
#> SRR1436925 1 0.2647 0.7386 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1477238 1 0.3945 0.7596 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR1332566 1 0.2593 0.7715 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1490228 3 0.6194 0.4801 0.084 0.000 0.628 0.288
#> SRR1442949 3 0.6069 0.4374 0.056 0.000 0.588 0.356
#> SRR1466239 1 0.0336 0.7684 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1094003 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1329971 1 0.2589 0.7384 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR813076 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1097642 2 0.5041 0.8557 0.000 0.728 0.040 0.232
#> SRR1322981 1 0.3942 0.7237 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1485976 2 0.5110 0.8734 0.000 0.656 0.016 0.328
#> SRR1471713 3 0.6147 0.4043 0.056 0.000 0.564 0.380
#> SRR660522 3 0.6422 0.4352 0.248 0.000 0.632 0.120
#> SRR815374 1 0.3569 0.6612 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1069564 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.5900 0.3469 0.260 0.000 0.664 0.076
#> SRR1316438 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1386844 1 0.1305 0.7692 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1373718 1 0.4283 0.7542 0.740 0.000 0.256 0.004
#> SRR1447458 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1487128 1 0.1637 0.7682 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1441421 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1069919 2 0.4761 0.8747 0.000 0.664 0.004 0.332
#> SRR1460296 1 0.1211 0.7695 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1335489 1 0.4252 0.6356 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR1393404 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1081425 1 0.4222 0.7514 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1401815 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1071337 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1071983 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1331793 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1410510 3 0.6179 0.3829 0.056 0.000 0.552 0.392
#> SRR1098761 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.3569 0.6616 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR615395 1 0.4356 0.7604 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1479349 1 0.2944 0.7412 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR2165033 3 0.6581 0.4495 0.232 0.000 0.624 0.144
#> SRR1089054 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR816201 1 0.4564 0.6495 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1488514 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR655840 1 0.4837 0.6448 0.648 0.000 0.348 0.004
#> SRR1379303 1 0.0188 0.7686 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418516 3 0.6083 0.4231 0.056 0.000 0.584 0.360
#> SRR613174 1 0.5478 0.3198 0.540 0.000 0.444 0.016
#> SRR1351125 1 0.4720 0.6787 0.672 0.000 0.324 0.004
#> SRR659157 3 0.6273 0.1987 0.056 0.000 0.488 0.456
#> SRR1480408 1 0.4560 0.7456 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR657857 1 0.4955 0.7408 0.648 0.000 0.344 0.008
#> SRR1073317 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1332526 1 0.4560 0.7456 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR1094168 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.6188 0.3759 0.056 0.000 0.548 0.396
#> SRR1085614 2 0.5512 0.8710 0.000 0.660 0.040 0.300
#> SRR1330106 3 0.5288 0.4044 0.056 0.000 0.720 0.224
#> SRR1466154 1 0.4134 0.7571 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1396944 1 0.4535 0.7455 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR1082784 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1457267 1 0.0657 0.7685 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR614659 1 0.4356 0.7363 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR659247 1 0.4406 0.6488 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1317201 1 0.1474 0.7603 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1473696 1 0.1792 0.7564 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1375842 1 0.4483 0.7472 0.712 0.000 0.284 0.004
#> SRR1388123 2 0.4761 0.8747 0.000 0.664 0.004 0.332
#> SRR1096363 2 0.0336 0.7642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1453662 1 0.4222 0.5807 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1345499 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1353499 1 0.4304 0.7482 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1416693 1 0.1305 0.7692 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1070841 1 0.5497 0.2522 0.524 0.000 0.460 0.016
#> SRR1380910 1 0.3649 0.7597 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1333125 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1498183 1 0.2149 0.7458 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR612659 3 0.5898 0.4078 0.056 0.000 0.628 0.316
#> SRR1447148 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR658597 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.5041 0.8557 0.000 0.728 0.040 0.232
#> SRR1074263 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1376786 1 0.4304 0.7583 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1345995 1 0.3688 0.7190 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1071035 1 0.4837 0.7401 0.648 0.000 0.348 0.004
#> SRR1068808 2 0.0336 0.7642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1332754 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR662438 1 0.1637 0.7575 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1335355 1 0.3945 0.7576 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR659448 3 0.6568 0.3181 0.408 0.000 0.512 0.080
#> SRR1323558 3 0.6075 0.4800 0.076 0.000 0.636 0.288
#> SRR1381711 3 0.5950 0.4582 0.156 0.000 0.696 0.148
#> SRR657985 3 0.6463 0.4619 0.196 0.000 0.644 0.160
#> SRR1314810 1 0.3486 0.7506 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1336505 3 0.3196 0.2359 0.136 0.000 0.856 0.008
#> SRR1474095 1 0.4331 0.5438 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1363831 2 0.4781 0.8741 0.000 0.660 0.004 0.336
#> SRR1442376 1 0.4781 0.7429 0.660 0.000 0.336 0.004
#> SRR1074909 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.4331 0.7504 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1075408 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1367150 3 0.6435 0.4491 0.224 0.000 0.640 0.136
#> SRR1313406 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1068880 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1467277 3 0.5917 0.4706 0.056 0.000 0.624 0.320
#> SRR1084867 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1095431 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1443113 1 0.4222 0.7687 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1380414 1 0.5253 0.5379 0.624 0.000 0.360 0.016
#> SRR1315912 1 0.4277 0.7495 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1075778 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1421116 2 0.5018 0.8737 0.000 0.656 0.012 0.332
#> SRR602282 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1361195 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR600493 1 0.4222 0.7518 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1477653 1 0.2760 0.7305 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1355475 1 0.5028 0.5133 0.596 0.000 0.400 0.004
#> SRR1360785 1 0.3402 0.7315 0.832 0.000 0.164 0.004
#> SRR810437 3 0.6033 0.4734 0.064 0.000 0.620 0.316
#> SRR1361860 1 0.3539 0.7569 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR1441311 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1098903 1 0.4560 0.7454 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR1457619 1 0.3942 0.6310 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1498529 1 0.3052 0.7821 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR1097172 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1074017 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1472033 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1445087 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1399525 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312844 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.4699 0.7494 0.676 0.000 0.320 0.004
#> SRR1075659 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311916 3 0.6242 0.3117 0.056 0.000 0.520 0.424
#> SRR1353353 3 0.6273 0.1987 0.056 0.000 0.488 0.456
#> SRR1073291 1 0.5688 0.2806 0.512 0.000 0.464 0.024
#> SRR1356227 1 0.1305 0.7692 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1080720 2 0.5366 0.8678 0.000 0.684 0.040 0.276
#> SRR1091695 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.6097 0.4277 0.056 0.000 0.580 0.364
#> SRR663002 3 0.6147 0.4043 0.056 0.000 0.564 0.380
#> SRR1376983 2 0.5018 0.8737 0.000 0.656 0.012 0.332
#> SRR1399926 1 0.3105 0.7680 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR1347144 3 0.6123 0.4162 0.056 0.000 0.572 0.372
#> SRR1384006 1 0.4535 0.7454 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR1499108 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614047 3 0.6448 0.4325 0.252 0.000 0.628 0.120
#> SRR818440 3 0.6661 0.2129 0.456 0.000 0.460 0.084
#> SRR1337770 1 0.3688 0.6788 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1399413 1 0.5105 0.6712 0.564 0.000 0.432 0.004
#> SRR1385542 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1473959 1 0.6498 -0.1000 0.488 0.000 0.440 0.072
#> SRR1074041 1 0.4843 0.7358 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1394495 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR659460 1 0.4477 0.7641 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR816699 1 0.5127 0.5591 0.632 0.000 0.356 0.012
#> SRR1308612 3 0.5657 0.0628 0.436 0.000 0.540 0.024
#> SRR1499418 3 0.6235 0.3226 0.056 0.000 0.524 0.420
#> SRR1352894 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR815805 1 0.4535 0.7462 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR1331083 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808272 3 0.5929 0.4787 0.064 0.000 0.640 0.296
#> SRR1436698 1 0.3074 0.7219 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 3 0.6465 0.3165 0.412 0.000 0.516 0.072
#> SRR1351236 1 0.3311 0.7666 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1077479 1 0.4781 0.7432 0.660 0.000 0.336 0.004
#> SRR814491 3 0.6509 0.4485 0.228 0.000 0.632 0.140
#> SRR1101256 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1436004 1 0.4277 0.7495 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1457994 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1078998 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1314707 1 0.4761 0.7434 0.664 0.000 0.332 0.004
#> SRR1309534 3 0.6188 0.3782 0.056 0.000 0.548 0.396
#> SRR615527 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1098216 1 0.4584 0.7452 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR1325847 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404003 1 0.4560 0.7454 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR1344166 1 0.4277 0.7495 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1368638 3 0.6592 0.4175 0.284 0.000 0.600 0.116
#> SRR1431429 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1079237 2 0.1545 0.7697 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1080509 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR815759 3 0.5917 0.4706 0.056 0.000 0.624 0.320
#> SRR1502143 1 0.4857 0.6187 0.668 0.000 0.324 0.008
#> SRR1487614 3 0.6247 0.3003 0.056 0.000 0.516 0.428
#> SRR1402307 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR820810 1 0.4250 0.7559 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1099212 2 0.5466 0.8704 0.000 0.668 0.040 0.292
#> SRR1083215 1 0.3311 0.7196 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1476547 2 0.5041 0.8557 0.000 0.728 0.040 0.232
#> SRR656421 1 0.0000 0.7690 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1499917 3 0.6580 0.4622 0.196 0.000 0.632 0.172
#> SRR1339944 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1391444 2 0.4781 0.8741 0.000 0.660 0.004 0.336
#> SRR1434889 1 0.4720 0.7443 0.672 0.000 0.324 0.004
#> SRR1431847 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1317155 3 0.6123 0.3785 0.056 0.000 0.572 0.372
#> SRR1477405 1 0.3311 0.7666 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR655289 1 0.3649 0.7647 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1341683 3 0.5898 0.4726 0.056 0.000 0.628 0.316
#> SRR1084790 1 0.4134 0.7573 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1073731 1 0.4961 0.6572 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1332588 3 0.6703 0.4505 0.232 0.000 0.612 0.156
#> SRR1471157 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR654945 3 0.6568 0.3185 0.408 0.000 0.512 0.080
#> SRR661028 1 0.0469 0.7706 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1413477 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1101152 1 0.3610 0.6716 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1358435 2 0.2021 0.7730 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR2165273 1 0.1978 0.7722 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1379014 1 0.4313 0.7553 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1489904 3 0.5898 0.4726 0.056 0.000 0.628 0.316
#> SRR1416386 2 0.0336 0.7642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1406048 1 0.1867 0.7525 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR606982 3 0.6069 0.3697 0.056 0.000 0.588 0.356
#> SRR1358082 1 0.3528 0.7603 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1312934 1 0.4999 0.6739 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR655194 1 0.4406 0.5226 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1331174 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1473251 2 0.5041 0.8557 0.000 0.728 0.040 0.232
#> SRR1389820 4 0.5535 0.3392 0.000 0.192 0.088 0.720
#> SRR1074289 1 0.4605 0.7448 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1348816 2 0.5535 0.8711 0.000 0.656 0.040 0.304
#> SRR1076292 3 0.5549 0.0465 0.280 0.000 0.672 0.048
#> SRR1395810 2 0.4605 0.8747 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1498909 3 0.6110 0.2882 0.240 0.000 0.660 0.100
#> SRR1443507 1 0.3873 0.7540 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1452310 3 0.6646 0.4616 0.204 0.000 0.624 0.172
#> SRR665610 3 0.6324 0.3579 0.356 0.000 0.572 0.072
#> SRR1347322 1 0.0469 0.7706 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.1902 0.7672 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1470230 3 0.6268 0.2377 0.056 0.000 0.496 0.448
#> SRR1354247 1 0.4560 0.7454 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR1082640 2 0.5069 0.8745 0.000 0.664 0.016 0.320
#> SRR1487592 1 0.4643 0.7538 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1352299 1 0.4564 0.7464 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1076317 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1434117 1 0.5387 0.4462 0.584 0.000 0.400 0.016
#> SRR1075273 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658657 3 0.6013 0.4750 0.064 0.000 0.624 0.312
#> SRR1092773 2 0.0336 0.7642 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365332 1 0.3311 0.7047 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR615958 3 0.5941 0.4774 0.072 0.000 0.652 0.276
#> SRR1097688 2 0.0000 0.7652 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.6275 0.1860 0.056 0.000 0.484 0.460
#> SRR1099120 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362200 3 0.6430 0.3051 0.312 0.000 0.596 0.092
#> SRR1464856 2 0.5475 0.8716 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1347298 3 0.6252 0.2868 0.056 0.000 0.512 0.432
#> SRR1075923 2 0.0188 0.7649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100703 1 0.4193 0.7248 0.732 0.000 0.268 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 4 0.7103 0.05373 0.396 0.000 0.148 0.416 0.040
#> SRR1436370 2 0.1831 0.80228 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1075752 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1397949 1 0.3182 0.32241 0.844 0.000 0.000 0.124 0.032
#> SRR1355723 4 0.5525 0.56827 0.296 0.000 0.032 0.632 0.040
#> SRR1329744 1 0.2304 0.39235 0.892 0.000 0.000 0.100 0.008
#> SRR657384 1 0.5652 0.32214 0.644 0.000 0.212 0.140 0.004
#> SRR1351190 1 0.6681 0.20447 0.496 0.000 0.336 0.148 0.020
#> SRR1458662 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.4560 0.43344 0.484 0.000 0.000 0.508 0.008
#> SRR1396017 3 0.6545 0.28755 0.376 0.000 0.460 0.156 0.008
#> SRR1410742 3 0.6848 0.19251 0.356 0.000 0.436 0.196 0.012
#> SRR1435963 1 0.3012 0.42654 0.876 0.000 0.056 0.060 0.008
#> SRR1382416 1 0.5205 0.27700 0.688 0.000 0.056 0.236 0.020
#> SRR1391354 4 0.4761 0.55844 0.356 0.000 0.000 0.616 0.028
#> SRR1087968 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1310075 1 0.4315 0.08928 0.700 0.000 0.000 0.276 0.024
#> SRR1312244 1 0.3080 0.42873 0.872 0.000 0.060 0.060 0.008
#> SRR1325138 1 0.5852 -0.06599 0.480 0.000 0.064 0.444 0.012
#> SRR1326821 1 0.4811 -0.35712 0.528 0.000 0.000 0.452 0.020
#> SRR1490178 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4767 -0.29436 0.560 0.000 0.000 0.420 0.020
#> SRR1075707 2 0.5843 0.67061 0.000 0.572 0.000 0.124 0.304
#> SRR1443871 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1102489 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1465758 1 0.4252 0.11189 0.700 0.000 0.000 0.280 0.020
#> SRR1414058 3 0.6147 0.29094 0.052 0.000 0.468 0.444 0.036
#> SRR1407449 1 0.3563 0.42280 0.840 0.000 0.092 0.060 0.008
#> SRR1436858 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1479109 1 0.6707 0.23832 0.540 0.000 0.284 0.144 0.032
#> SRR1399069 4 0.5380 0.56302 0.312 0.000 0.028 0.628 0.032
#> SRR1366450 1 0.6442 0.19701 0.576 0.000 0.132 0.264 0.028
#> SRR1396859 1 0.1956 0.40631 0.916 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR1457176 1 0.3779 0.40750 0.812 0.000 0.136 0.048 0.004
#> SRR1097666 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1434736 3 0.5582 0.32163 0.280 0.000 0.636 0.064 0.020
#> SRR1080560 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1322882 1 0.4811 -0.34789 0.528 0.000 0.000 0.452 0.020
#> SRR1435688 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1327614 1 0.3852 0.22203 0.760 0.000 0.000 0.220 0.020
#> SRR658152 3 0.2378 0.44876 0.016 0.000 0.908 0.012 0.064
#> SRR1368141 3 0.3416 0.37362 0.016 0.000 0.840 0.020 0.124
#> SRR1440268 1 0.2439 0.37967 0.876 0.000 0.000 0.120 0.004
#> SRR1453725 1 0.6121 -0.08981 0.524 0.000 0.060 0.384 0.032
#> SRR1325711 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1477930 1 0.4977 -0.36838 0.500 0.000 0.000 0.472 0.028
#> SRR1477591 1 0.2017 0.38956 0.912 0.000 0.000 0.080 0.008
#> SRR1416049 2 0.0404 0.80552 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR656275 4 0.5026 0.58809 0.328 0.000 0.028 0.632 0.012
#> SRR1369052 1 0.4419 -0.03921 0.668 0.000 0.000 0.312 0.020
#> SRR1377735 1 0.1894 0.39623 0.920 0.000 0.000 0.072 0.008
#> SRR1331244 1 0.3687 0.29797 0.792 0.000 0.000 0.180 0.028
#> SRR1404531 1 0.4989 -0.30248 0.552 0.000 0.000 0.416 0.032
#> SRR1324331 1 0.4042 0.23905 0.756 0.000 0.000 0.212 0.032
#> SRR1458890 3 0.3938 0.28070 0.016 0.000 0.796 0.024 0.164
#> SRR1432695 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0703 0.80455 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1431969 3 0.1836 0.49622 0.016 0.000 0.936 0.008 0.040
#> SRR1087393 2 0.2864 0.79586 0.000 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1077263 1 0.6971 -0.00840 0.500 0.000 0.176 0.292 0.032
#> SRR1385211 1 0.1408 0.41240 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR655241 1 0.5462 0.34393 0.676 0.000 0.124 0.192 0.008
#> SRR656922 1 0.4827 -0.39136 0.504 0.000 0.000 0.476 0.020
#> SRR1361630 3 0.5309 0.50878 0.052 0.000 0.684 0.236 0.028
#> SRR1318966 2 0.4278 0.65298 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1407087 4 0.5807 0.52605 0.352 0.000 0.044 0.572 0.032
#> SRR603212 4 0.4505 0.57694 0.368 0.000 0.004 0.620 0.008
#> SRR1321088 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1485190 3 0.3801 0.36391 0.016 0.000 0.820 0.036 0.128
#> SRR1332232 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1312645 1 0.5279 0.35147 0.692 0.000 0.152 0.152 0.004
#> SRR1457835 1 0.1502 0.41355 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1347123 3 0.2482 0.47759 0.016 0.000 0.904 0.016 0.064
#> SRR1465501 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1330878 3 0.4089 0.25006 0.016 0.000 0.780 0.024 0.180
#> SRR1445064 3 0.4761 0.54886 0.052 0.000 0.748 0.176 0.024
#> SRR1452981 1 0.4940 0.20493 0.620 0.000 0.020 0.348 0.012
#> SRR1326708 1 0.3152 0.30780 0.840 0.000 0.000 0.136 0.024
#> SRR1407157 1 0.1195 0.41420 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1365401 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1397697 2 0.1282 0.80501 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1477316 3 0.6295 0.41078 0.256 0.000 0.564 0.172 0.008
#> SRR1077898 1 0.1788 0.41367 0.932 0.000 0.004 0.056 0.008
#> SRR1349080 4 0.5654 0.55335 0.248 0.000 0.076 0.652 0.024
#> SRR1076096 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR811261 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1375485 1 0.3683 0.41561 0.828 0.000 0.072 0.096 0.004
#> SRR1432563 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.4811 -0.34789 0.528 0.000 0.000 0.452 0.020
#> SRR1380614 1 0.7313 -0.02597 0.424 0.000 0.360 0.168 0.048
#> SRR812060 4 0.5483 0.45095 0.460 0.000 0.016 0.492 0.032
#> SRR602082 1 0.4965 -0.34438 0.520 0.000 0.000 0.452 0.028
#> SRR1069490 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1078417 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR661613 1 0.6855 0.10932 0.456 0.000 0.380 0.132 0.032
#> SRR1420710 3 0.5283 0.51901 0.144 0.000 0.712 0.128 0.016
#> SRR660426 1 0.4774 -0.29610 0.556 0.000 0.000 0.424 0.020
#> SRR1416003 3 0.4011 0.55550 0.040 0.000 0.804 0.140 0.016
#> SRR661064 1 0.3773 0.41206 0.824 0.000 0.060 0.108 0.008
#> SRR1082011 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1452718 4 0.6084 0.45250 0.384 0.000 0.048 0.528 0.040
#> SRR1353243 1 0.1956 0.39270 0.916 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR1455482 1 0.3970 0.16793 0.752 0.000 0.000 0.224 0.024
#> SRR1313473 1 0.3724 0.20054 0.776 0.000 0.000 0.204 0.020
#> SRR1399394 1 0.4959 0.11285 0.704 0.000 0.028 0.236 0.032
#> SRR1102467 4 0.4930 0.49757 0.424 0.000 0.000 0.548 0.028
#> SRR1317470 3 0.5145 0.53539 0.112 0.000 0.740 0.116 0.032
#> SRR1337707 3 0.3320 0.37597 0.016 0.000 0.844 0.016 0.124
#> SRR1408752 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1474617 5 0.7307 0.72389 0.000 0.056 0.216 0.228 0.500
#> SRR1398013 3 0.3778 0.54576 0.028 0.000 0.824 0.124 0.024
#> SRR1352918 1 0.6070 0.30390 0.604 0.000 0.216 0.172 0.008
#> SRR1420750 1 0.2548 0.42249 0.896 0.000 0.028 0.072 0.004
#> SRR1071785 3 0.3320 0.37597 0.016 0.000 0.844 0.016 0.124
#> SRR1353618 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1082217 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1357256 2 0.0609 0.80493 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1490313 4 0.6672 0.12782 0.408 0.000 0.100 0.456 0.036
#> SRR1366560 1 0.0992 0.41660 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1355684 1 0.4570 -0.10575 0.632 0.000 0.000 0.348 0.020
#> SRR1323289 5 0.6348 0.75242 0.016 0.000 0.408 0.104 0.472
#> SRR1313494 1 0.2437 0.43223 0.904 0.000 0.060 0.032 0.004
#> SRR1309985 1 0.3086 0.31934 0.816 0.000 0.000 0.180 0.004
#> SRR607911 1 0.4793 -0.30692 0.544 0.000 0.000 0.436 0.020
#> SRR1333789 1 0.6782 0.16027 0.532 0.000 0.172 0.268 0.028
#> SRR1400078 3 0.4931 0.53280 0.124 0.000 0.740 0.124 0.012
#> SRR1088631 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1092842 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR615575 4 0.7116 0.18157 0.340 0.000 0.180 0.448 0.032
#> SRR1079434 3 0.4698 0.41110 0.016 0.000 0.752 0.168 0.064
#> SRR1325559 1 0.5355 0.35578 0.688 0.000 0.184 0.120 0.008
#> SRR1446695 3 0.6599 0.43645 0.240 0.000 0.572 0.156 0.032
#> SRR1383883 1 0.3488 0.31439 0.808 0.000 0.000 0.168 0.024
#> SRR1396100 3 0.6251 0.40430 0.280 0.000 0.560 0.152 0.008
#> SRR1475697 3 0.4400 0.25156 0.016 0.000 0.772 0.048 0.164
#> SRR1488067 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1102103 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1105154 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1084991 2 0.5851 0.66371 0.000 0.548 0.000 0.112 0.340
#> SRR1410380 3 0.4054 0.55527 0.040 0.000 0.812 0.120 0.028
#> SRR1445490 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1454671 2 0.0992 0.80397 0.000 0.968 0.008 0.024 0.000
#> SRR1435044 3 0.6223 0.38212 0.320 0.000 0.532 0.144 0.004
#> SRR1485812 3 0.3446 0.39991 0.016 0.000 0.844 0.028 0.112
#> SRR1078020 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1311153 1 0.4978 -0.37724 0.496 0.000 0.000 0.476 0.028
#> SRR1376406 2 0.1430 0.80458 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1343898 3 0.4332 0.21979 0.016 0.000 0.768 0.036 0.180
#> SRR807775 3 0.5217 0.50923 0.048 0.000 0.692 0.232 0.028
#> SRR1409215 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR820427 3 0.2263 0.52202 0.024 0.000 0.920 0.036 0.020
#> SRR1100656 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1362159 1 0.3882 0.16973 0.756 0.000 0.000 0.224 0.020
#> SRR1414536 3 0.6683 0.43033 0.200 0.000 0.560 0.212 0.028
#> SRR656794 1 0.2783 0.41596 0.868 0.000 0.012 0.116 0.004
#> SRR604653 1 0.4793 -0.31697 0.544 0.000 0.000 0.436 0.020
#> SRR1317685 3 0.3579 0.38598 0.016 0.000 0.836 0.032 0.116
#> SRR1485912 1 0.6326 0.27771 0.592 0.000 0.256 0.124 0.028
#> SRR1407602 3 0.4089 0.25006 0.016 0.000 0.780 0.024 0.180
#> SRR1356164 3 0.6890 -0.09893 0.084 0.000 0.456 0.396 0.064
#> SRR1328692 3 0.3117 0.47766 0.020 0.000 0.876 0.052 0.052
#> SRR1362438 1 0.1956 0.39059 0.916 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR1479216 3 0.2850 0.45093 0.016 0.000 0.880 0.016 0.088
#> SRR1358041 1 0.4031 0.39721 0.788 0.000 0.160 0.048 0.004
#> SRR1468766 4 0.4902 0.57675 0.280 0.000 0.020 0.676 0.024
#> SRR1368200 1 0.6752 0.11554 0.472 0.000 0.376 0.120 0.032
#> SRR1435602 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1501043 3 0.4332 0.21979 0.016 0.000 0.768 0.036 0.180
#> SRR1437256 3 0.2408 0.44598 0.016 0.000 0.892 0.000 0.092
#> SRR1487446 1 0.6122 0.25891 0.560 0.000 0.292 0.144 0.004
#> SRR816653 1 0.0880 0.42520 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR815164 1 0.5033 -0.11609 0.644 0.000 0.012 0.312 0.032
#> SRR1442043 1 0.6062 0.28677 0.596 0.000 0.148 0.248 0.008
#> SRR1410573 1 0.1768 0.39385 0.924 0.000 0.000 0.072 0.004
#> SRR1096782 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1352369 4 0.5798 0.46267 0.404 0.000 0.036 0.528 0.032
#> SRR1382934 3 0.4089 0.25006 0.016 0.000 0.780 0.024 0.180
#> SRR1465208 1 0.0794 0.41768 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1314728 1 0.6599 0.24879 0.544 0.000 0.292 0.136 0.028
#> SRR1470291 1 0.1444 0.40691 0.948 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1308756 3 0.4636 0.54802 0.040 0.000 0.756 0.176 0.028
#> SRR1409600 1 0.6830 0.20625 0.496 0.000 0.332 0.140 0.032
#> SRR816123 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR614779 4 0.6709 0.29990 0.172 0.000 0.252 0.548 0.028
#> SRR810783 1 0.6812 0.00367 0.476 0.000 0.140 0.356 0.028
#> SRR1333990 1 0.1764 0.41284 0.928 0.000 0.000 0.064 0.008
#> SRR1410356 4 0.4564 0.53427 0.388 0.000 0.008 0.600 0.004
#> SRR808106 4 0.6740 0.39167 0.168 0.000 0.224 0.568 0.040
#> SRR662713 4 0.4383 0.52280 0.424 0.000 0.000 0.572 0.004
#> SRR1447058 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1480964 4 0.5738 0.51810 0.300 0.000 0.052 0.616 0.032
#> SRR809382 3 0.2332 0.46365 0.016 0.000 0.904 0.004 0.076
#> SRR665417 4 0.6156 0.38256 0.308 0.000 0.100 0.572 0.020
#> SRR1088016 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1453166 2 0.4278 0.65298 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1069826 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1077781 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR615623 3 0.3409 0.42400 0.016 0.000 0.844 0.024 0.116
#> SRR1413787 3 0.4015 0.26811 0.016 0.000 0.788 0.024 0.172
#> SRR1478207 3 0.6282 0.42047 0.100 0.000 0.572 0.300 0.028
#> SRR1411046 1 0.3773 0.41653 0.824 0.000 0.060 0.108 0.008
#> SRR1313711 2 0.0290 0.80629 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326560 1 0.3381 0.31915 0.808 0.000 0.000 0.176 0.016
#> SRR1309051 1 0.4141 0.12479 0.728 0.000 0.000 0.248 0.024
#> SRR1486949 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1395616 1 0.4924 -0.24217 0.552 0.000 0.000 0.420 0.028
#> SRR1074956 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1092961 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR817210 1 0.6029 -0.42504 0.464 0.000 0.048 0.456 0.032
#> SRR1319221 5 0.6348 0.75242 0.016 0.000 0.408 0.104 0.472
#> SRR1405413 1 0.5135 0.35029 0.704 0.000 0.172 0.120 0.004
#> SRR607807 4 0.5175 0.53190 0.372 0.000 0.004 0.584 0.040
#> SRR1390160 3 0.2228 0.53506 0.028 0.000 0.920 0.040 0.012
#> SRR1406283 1 0.5620 0.24545 0.660 0.000 0.064 0.244 0.032
#> SRR1357709 4 0.6166 0.13917 0.436 0.000 0.064 0.472 0.028
#> SRR1080742 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1468208 1 0.3250 0.36673 0.820 0.000 0.008 0.168 0.004
#> SRR1312766 1 0.6694 0.16978 0.544 0.000 0.160 0.268 0.028
#> SRR1361612 1 0.3266 0.42702 0.860 0.000 0.076 0.056 0.008
#> SRR1311224 1 0.4736 -0.27336 0.576 0.000 0.000 0.404 0.020
#> SRR1087801 4 0.6233 -0.01316 0.060 0.000 0.348 0.548 0.044
#> SRR1099720 2 0.2825 0.79573 0.000 0.860 0.000 0.124 0.016
#> SRR1349250 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1350912 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1357127 3 0.5470 0.49702 0.180 0.000 0.684 0.124 0.012
#> SRR1074980 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1317022 3 0.3309 0.41209 0.016 0.000 0.852 0.024 0.108
#> SRR1332879 1 0.1894 0.39426 0.920 0.000 0.000 0.072 0.008
#> SRR1403177 5 0.6348 0.75242 0.016 0.000 0.408 0.104 0.472
#> SRR1076144 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1069614 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR818239 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1421069 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1500006 4 0.4830 0.39741 0.488 0.000 0.000 0.492 0.020
#> SRR1485678 1 0.5973 0.32476 0.656 0.000 0.184 0.128 0.032
#> SRR1092232 3 0.4089 0.25006 0.016 0.000 0.780 0.024 0.180
#> SRR1344253 3 0.5774 0.48921 0.044 0.000 0.652 0.244 0.060
#> SRR1384290 1 0.2915 0.36271 0.860 0.000 0.000 0.116 0.024
#> SRR1089349 4 0.6256 0.42421 0.404 0.000 0.068 0.496 0.032
#> SRR1343522 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1326727 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1440940 3 0.2900 0.55458 0.028 0.000 0.864 0.108 0.000
#> SRR818372 3 0.6780 0.37394 0.304 0.000 0.520 0.144 0.032
#> SRR1323675 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR819894 1 0.7331 0.13249 0.416 0.000 0.316 0.236 0.032
#> SRR1310031 3 0.3939 0.53171 0.024 0.000 0.816 0.124 0.036
#> SRR615419 3 0.2457 0.46865 0.016 0.000 0.900 0.008 0.076
#> SRR1436925 1 0.5319 0.35230 0.720 0.000 0.156 0.092 0.032
#> SRR1477238 1 0.4836 0.01561 0.628 0.000 0.000 0.336 0.036
#> SRR1332566 1 0.3197 0.34529 0.836 0.000 0.000 0.140 0.024
#> SRR1490228 3 0.4743 0.54694 0.044 0.000 0.748 0.180 0.028
#> SRR1442949 3 0.2263 0.52202 0.024 0.000 0.920 0.036 0.020
#> SRR1466239 1 0.1408 0.41803 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1094003 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1329971 1 0.4547 0.39034 0.768 0.000 0.112 0.112 0.008
#> SRR813076 2 0.0992 0.80397 0.000 0.968 0.008 0.024 0.000
#> SRR1097642 2 0.3413 0.79041 0.000 0.832 0.000 0.124 0.044
#> SRR1322981 1 0.6565 0.11616 0.536 0.000 0.124 0.312 0.028
#> SRR1485976 2 0.1638 0.80352 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1471713 3 0.2925 0.49876 0.016 0.000 0.884 0.036 0.064
#> SRR660522 3 0.5815 0.52086 0.116 0.000 0.672 0.180 0.032
#> SRR815374 1 0.5574 0.33262 0.672 0.000 0.228 0.068 0.032
#> SRR1069564 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1416337 3 0.7042 0.33044 0.176 0.000 0.476 0.316 0.032
#> SRR1316438 3 0.4196 0.23289 0.016 0.000 0.768 0.024 0.192
#> SRR1386844 1 0.2286 0.38703 0.888 0.000 0.000 0.108 0.004
#> SRR1373718 1 0.4697 -0.17475 0.592 0.000 0.000 0.388 0.020
#> SRR1447458 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.3053 0.38977 0.828 0.000 0.000 0.164 0.008
#> SRR1441421 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1069919 2 0.0404 0.80637 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1460296 1 0.1894 0.39387 0.920 0.000 0.000 0.072 0.008
#> SRR1335489 1 0.5663 0.31943 0.652 0.000 0.132 0.208 0.008
#> SRR1393404 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1081425 1 0.4793 -0.31697 0.544 0.000 0.000 0.436 0.020
#> SRR1401815 3 0.4125 0.24255 0.016 0.000 0.776 0.024 0.184
#> SRR1071337 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1071983 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1331793 2 0.0609 0.80493 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1410510 3 0.3068 0.48423 0.016 0.000 0.872 0.028 0.084
#> SRR1098761 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1312124 1 0.4510 0.39045 0.756 0.000 0.164 0.076 0.004
#> SRR615395 1 0.5411 -0.32391 0.552 0.000 0.016 0.400 0.032
#> SRR1479349 1 0.4625 0.37914 0.748 0.000 0.068 0.176 0.008
#> SRR2165033 3 0.5960 0.43914 0.256 0.000 0.604 0.132 0.008
#> SRR1089054 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR816201 1 0.6926 -0.01372 0.444 0.000 0.152 0.376 0.028
#> SRR1488514 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR655840 4 0.6954 0.06931 0.396 0.000 0.144 0.428 0.032
#> SRR1379303 1 0.1408 0.41803 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1418516 3 0.4968 0.45603 0.016 0.000 0.708 0.224 0.052
#> SRR613174 1 0.7371 0.05259 0.388 0.000 0.292 0.292 0.028
#> SRR1351125 1 0.7058 -0.00941 0.480 0.000 0.184 0.304 0.032
#> SRR659157 3 0.4023 0.27564 0.016 0.000 0.792 0.028 0.164
#> SRR1480408 4 0.4909 0.52543 0.412 0.000 0.000 0.560 0.028
#> SRR657857 4 0.4743 0.56085 0.332 0.000 0.004 0.640 0.024
#> SRR1073317 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1332526 4 0.4627 0.48747 0.444 0.000 0.000 0.544 0.012
#> SRR1094168 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1431270 3 0.2630 0.46924 0.016 0.000 0.892 0.012 0.080
#> SRR1085614 2 0.2574 0.79713 0.000 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR1330106 3 0.5959 0.34230 0.032 0.000 0.532 0.388 0.048
#> SRR1466154 1 0.4736 -0.27336 0.576 0.000 0.000 0.404 0.020
#> SRR1396944 4 0.4957 0.44095 0.444 0.000 0.000 0.528 0.028
#> SRR1082784 2 0.0609 0.80493 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1457267 1 0.1628 0.41498 0.936 0.000 0.000 0.056 0.008
#> SRR614659 4 0.6572 0.22141 0.412 0.000 0.096 0.460 0.032
#> SRR659247 1 0.6880 0.15748 0.520 0.000 0.192 0.260 0.028
#> SRR1317201 1 0.1153 0.42886 0.964 0.000 0.008 0.024 0.004
#> SRR1473696 1 0.1638 0.41818 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1375842 1 0.4830 -0.40503 0.492 0.000 0.000 0.488 0.020
#> SRR1388123 2 0.0290 0.80629 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1096363 2 0.4278 0.65298 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1453662 1 0.6369 0.28595 0.588 0.000 0.244 0.144 0.024
#> SRR1345499 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1353499 4 0.4829 0.42026 0.480 0.000 0.000 0.500 0.020
#> SRR1416693 1 0.2411 0.38525 0.884 0.000 0.000 0.108 0.008
#> SRR1070841 1 0.7390 0.05700 0.364 0.000 0.332 0.276 0.028
#> SRR1380910 1 0.4380 -0.00947 0.676 0.000 0.000 0.304 0.020
#> SRR1333125 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1498183 1 0.2972 0.42715 0.872 0.000 0.084 0.040 0.004
#> SRR612659 3 0.4512 0.48396 0.016 0.000 0.760 0.176 0.048
#> SRR1447148 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR658597 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1089595 2 0.3555 0.78838 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1074263 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1376786 1 0.4897 -0.39398 0.516 0.000 0.000 0.460 0.024
#> SRR1345995 1 0.6676 0.17634 0.548 0.000 0.160 0.264 0.028
#> SRR1071035 4 0.4442 0.58490 0.304 0.000 0.004 0.676 0.016
#> SRR1068808 2 0.4278 0.65298 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1332754 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR662438 1 0.1153 0.43212 0.964 0.000 0.008 0.024 0.004
#> SRR1335355 1 0.4491 -0.05992 0.652 0.000 0.000 0.328 0.020
#> SRR659448 3 0.6794 0.28919 0.344 0.000 0.492 0.132 0.032
#> SRR1323558 3 0.4012 0.55579 0.044 0.000 0.820 0.104 0.032
#> SRR1381711 3 0.5837 0.51459 0.084 0.000 0.656 0.224 0.036
#> SRR657985 3 0.5211 0.53872 0.096 0.000 0.732 0.140 0.032
#> SRR1314810 1 0.4715 0.26823 0.684 0.000 0.024 0.280 0.012
#> SRR1336505 4 0.5914 0.19792 0.064 0.000 0.300 0.604 0.032
#> SRR1474095 1 0.6551 0.26873 0.568 0.000 0.264 0.136 0.032
#> SRR1363831 2 0.0510 0.80636 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1442376 4 0.4507 0.57062 0.340 0.000 0.004 0.644 0.012
#> SRR1074909 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1101200 4 0.4557 0.43708 0.476 0.000 0.000 0.516 0.008
#> SRR1075408 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1367150 3 0.6101 0.45916 0.208 0.000 0.624 0.148 0.020
#> SRR1313406 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1068880 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1467277 3 0.3229 0.54873 0.040 0.000 0.872 0.056 0.032
#> SRR1084867 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1095431 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1380184 2 0.0510 0.80525 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1443113 4 0.4876 0.45723 0.436 0.000 0.008 0.544 0.012
#> SRR1380414 1 0.7218 0.08958 0.444 0.000 0.240 0.288 0.028
#> SRR1315912 1 0.4818 -0.36077 0.520 0.000 0.000 0.460 0.020
#> SRR1075778 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1421116 2 0.1502 0.80439 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR602282 3 0.4161 0.23668 0.016 0.000 0.772 0.024 0.188
#> SRR1361195 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR600493 1 0.4798 -0.32777 0.540 0.000 0.000 0.440 0.020
#> SRR1477653 1 0.5490 0.34640 0.708 0.000 0.144 0.116 0.032
#> SRR1355475 1 0.7374 0.00557 0.396 0.000 0.244 0.328 0.032
#> SRR1360785 1 0.5509 0.31914 0.652 0.000 0.096 0.244 0.008
#> SRR810437 3 0.2984 0.55466 0.032 0.000 0.860 0.108 0.000
#> SRR1361860 1 0.5568 0.14992 0.568 0.000 0.040 0.372 0.020
#> SRR1441311 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.4410 0.49187 0.440 0.000 0.000 0.556 0.004
#> SRR1457619 1 0.5611 0.32878 0.652 0.000 0.196 0.148 0.004
#> SRR1498529 1 0.3942 0.18542 0.728 0.000 0.000 0.260 0.012
#> SRR1097172 2 0.0865 0.80429 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1074017 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1472033 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1445087 3 0.4334 0.24770 0.016 0.000 0.772 0.040 0.172
#> SRR1399525 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1312844 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1085874 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1101226 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1476056 4 0.4875 0.47935 0.400 0.000 0.004 0.576 0.020
#> SRR1075659 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1311916 3 0.2792 0.45577 0.016 0.000 0.884 0.016 0.084
#> SRR1353353 3 0.4089 0.25006 0.016 0.000 0.780 0.024 0.180
#> SRR1073291 1 0.7478 -0.00434 0.348 0.000 0.304 0.316 0.032
#> SRR1356227 1 0.2068 0.39552 0.904 0.000 0.000 0.092 0.004
#> SRR1080720 2 0.2825 0.79573 0.000 0.860 0.000 0.124 0.016
#> SRR1091695 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1350304 3 0.2082 0.51297 0.016 0.000 0.928 0.032 0.024
#> SRR663002 3 0.2760 0.48865 0.016 0.000 0.892 0.028 0.064
#> SRR1376983 2 0.1502 0.80431 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1399926 1 0.3412 0.32193 0.820 0.000 0.000 0.152 0.028
#> SRR1347144 3 0.2989 0.50373 0.016 0.000 0.880 0.036 0.068
#> SRR1384006 1 0.4829 -0.39187 0.496 0.000 0.000 0.484 0.020
#> SRR1499108 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR614047 3 0.5781 0.51262 0.140 0.000 0.680 0.148 0.032
#> SRR818440 3 0.6796 0.17809 0.384 0.000 0.460 0.124 0.032
#> SRR1337770 1 0.5237 0.35283 0.696 0.000 0.140 0.160 0.004
#> SRR1399413 4 0.4964 0.56316 0.244 0.000 0.056 0.692 0.008
#> SRR1385542 2 0.0404 0.80552 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1473959 3 0.6949 0.12259 0.388 0.000 0.436 0.144 0.032
#> SRR1074041 4 0.6192 0.41577 0.348 0.000 0.072 0.548 0.032
#> SRR1394495 2 0.0609 0.80493 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR659460 1 0.5838 -0.39126 0.496 0.000 0.036 0.436 0.032
#> SRR816699 1 0.7299 0.06163 0.432 0.000 0.236 0.300 0.032
#> SRR1308612 3 0.7396 0.07193 0.300 0.000 0.372 0.300 0.028
#> SRR1499418 3 0.2736 0.46899 0.016 0.000 0.892 0.024 0.068
#> SRR1352894 2 0.0609 0.80493 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR815805 4 0.4989 0.51106 0.416 0.000 0.000 0.552 0.032
#> SRR1331083 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR808272 3 0.4636 0.54802 0.040 0.000 0.756 0.176 0.028
#> SRR1436698 1 0.5651 0.29588 0.676 0.000 0.084 0.208 0.032
#> SRR1095627 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1357672 3 0.6819 0.26636 0.356 0.000 0.480 0.132 0.032
#> SRR1351236 1 0.3789 0.18892 0.768 0.000 0.000 0.212 0.020
#> SRR1077479 4 0.4761 0.55677 0.356 0.000 0.000 0.616 0.028
#> SRR814491 3 0.6104 0.42631 0.256 0.000 0.588 0.148 0.008
#> SRR1101256 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1436004 1 0.4815 -0.35619 0.524 0.000 0.000 0.456 0.020
#> SRR1457994 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1078998 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1314707 4 0.4703 0.57147 0.340 0.000 0.000 0.632 0.028
#> SRR1309534 3 0.3347 0.46802 0.024 0.000 0.864 0.056 0.056
#> SRR615527 3 0.4196 0.23289 0.016 0.000 0.768 0.024 0.192
#> SRR1098216 4 0.4902 0.50029 0.408 0.000 0.000 0.564 0.028
#> SRR1325847 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1404003 4 0.4225 0.57292 0.364 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1344166 1 0.4748 -0.42393 0.492 0.000 0.000 0.492 0.016
#> SRR1368638 3 0.6268 0.39966 0.284 0.000 0.556 0.152 0.008
#> SRR1431429 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1079237 2 0.5903 0.66487 0.000 0.548 0.000 0.120 0.332
#> SRR1080509 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR815759 3 0.2625 0.54539 0.040 0.000 0.900 0.048 0.012
#> SRR1502143 1 0.7145 0.08735 0.460 0.000 0.220 0.292 0.028
#> SRR1487614 3 0.3059 0.42948 0.016 0.000 0.868 0.020 0.096
#> SRR1402307 2 0.0703 0.80455 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR820810 1 0.4718 -0.35598 0.540 0.000 0.000 0.444 0.016
#> SRR1099212 2 0.2625 0.79725 0.000 0.876 0.000 0.108 0.016
#> SRR1083215 1 0.6191 0.28333 0.616 0.000 0.124 0.232 0.028
#> SRR1476547 2 0.3555 0.78838 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR656421 1 0.0955 0.41814 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1086116 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1499917 3 0.5484 0.50781 0.152 0.000 0.692 0.140 0.016
#> SRR1339944 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1391444 2 0.1041 0.80542 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1434889 4 0.4419 0.58818 0.344 0.000 0.008 0.644 0.004
#> SRR1431847 3 0.4174 0.24558 0.016 0.000 0.776 0.028 0.180
#> SRR1317155 3 0.5029 0.36016 0.024 0.000 0.720 0.200 0.056
#> SRR1477405 1 0.3789 0.18892 0.768 0.000 0.000 0.212 0.020
#> SRR655289 1 0.5918 -0.14918 0.568 0.000 0.052 0.348 0.032
#> SRR1341683 3 0.4121 0.55594 0.036 0.000 0.784 0.168 0.012
#> SRR1084790 1 0.4682 -0.30231 0.564 0.000 0.000 0.420 0.016
#> SRR1073731 4 0.6527 0.32059 0.336 0.000 0.112 0.524 0.028
#> SRR1332588 3 0.5937 0.48543 0.164 0.000 0.648 0.168 0.020
#> SRR1471157 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.6875 0.18852 0.372 0.000 0.460 0.136 0.032
#> SRR661028 1 0.2293 0.38043 0.900 0.000 0.000 0.084 0.016
#> SRR1413477 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1101152 1 0.5984 0.31324 0.640 0.000 0.228 0.100 0.032
#> SRR1358435 2 0.5843 0.67061 0.000 0.572 0.000 0.124 0.304
#> SRR2165273 1 0.2813 0.37361 0.868 0.000 0.000 0.108 0.024
#> SRR1379014 1 0.4940 -0.20921 0.576 0.000 0.000 0.392 0.032
#> SRR1489904 3 0.3685 0.55649 0.040 0.000 0.832 0.112 0.016
#> SRR1416386 2 0.4278 0.65298 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1406048 1 0.2103 0.43341 0.920 0.000 0.056 0.020 0.004
#> SRR606982 3 0.5036 0.33355 0.016 0.000 0.708 0.216 0.060
#> SRR1358082 1 0.3882 0.16787 0.756 0.000 0.000 0.224 0.020
#> SRR1312934 4 0.6096 0.45086 0.260 0.000 0.100 0.612 0.028
#> SRR655194 1 0.5842 0.31856 0.632 0.000 0.212 0.148 0.008
#> SRR1331174 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1473251 2 0.3555 0.78838 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1389820 5 0.7392 0.71744 0.000 0.064 0.212 0.228 0.496
#> SRR1074289 4 0.4317 0.58654 0.320 0.000 0.008 0.668 0.004
#> SRR1348816 2 0.2338 0.79755 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1076292 4 0.7066 0.15612 0.136 0.000 0.340 0.476 0.048
#> SRR1395810 2 0.0000 0.80606 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.6934 0.21252 0.152 0.000 0.436 0.384 0.028
#> SRR1443507 1 0.6541 -0.19682 0.444 0.000 0.092 0.432 0.032
#> SRR1452310 3 0.5164 0.53006 0.120 0.000 0.728 0.132 0.020
#> SRR665610 3 0.6767 0.38610 0.300 0.000 0.524 0.144 0.032
#> SRR1347322 1 0.1942 0.39665 0.920 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR813395 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1477256 1 0.3243 0.38390 0.812 0.000 0.004 0.180 0.004
#> SRR1470230 3 0.3891 0.34497 0.016 0.000 0.812 0.036 0.136
#> SRR1354247 4 0.4930 0.49757 0.424 0.000 0.000 0.548 0.028
#> SRR1082640 2 0.1211 0.80338 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1487592 4 0.5850 0.43871 0.396 0.000 0.040 0.532 0.032
#> SRR1352299 4 0.4480 0.55331 0.400 0.000 0.004 0.592 0.004
#> SRR1076317 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1434117 1 0.7300 0.07919 0.420 0.000 0.268 0.284 0.028
#> SRR1075273 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR658657 3 0.3350 0.55610 0.040 0.000 0.844 0.112 0.004
#> SRR1092773 2 0.4278 0.65298 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1365332 1 0.6197 0.29822 0.628 0.000 0.180 0.164 0.028
#> SRR615958 3 0.4524 0.55091 0.040 0.000 0.768 0.164 0.028
#> SRR1097688 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1403259 3 0.4296 0.24604 0.016 0.000 0.772 0.036 0.176
#> SRR1099120 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1362200 3 0.7167 0.22178 0.212 0.000 0.444 0.316 0.028
#> SRR1464856 2 0.2286 0.79787 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1347298 3 0.3775 0.43566 0.016 0.000 0.832 0.092 0.060
#> SRR1075923 2 0.4273 0.65408 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1100703 1 0.6707 -0.10237 0.460 0.000 0.112 0.396 0.032
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 1 0.7347 -0.286289 0.328 0.004 0.320 0.260 0.088 0.000
#> SRR1436370 2 0.4429 0.819514 0.000 0.548 0.028 0.000 0.000 0.424
#> SRR1075752 6 0.0000 0.524375 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.5030 0.312697 0.672 0.012 0.176 0.140 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.5151 0.552023 0.156 0.016 0.100 0.704 0.024 0.000
#> SRR1329744 1 0.2222 0.488522 0.896 0.008 0.012 0.084 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.5868 -0.005933 0.552 0.024 0.304 0.004 0.116 0.000
#> SRR1351190 1 0.6708 -0.288948 0.404 0.024 0.324 0.008 0.240 0.000
#> SRR1458662 2 0.5608 0.690364 0.000 0.468 0.092 0.016 0.000 0.424
#> SRR818573 4 0.5944 0.407645 0.304 0.000 0.244 0.452 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.7294 -0.173141 0.364 0.032 0.220 0.040 0.344 0.000
#> SRR1410742 1 0.7694 -0.183113 0.352 0.028 0.240 0.084 0.296 0.000
#> SRR1435963 1 0.2829 0.510498 0.876 0.020 0.076 0.020 0.008 0.000
#> SRR1382416 1 0.6378 0.206153 0.560 0.016 0.124 0.252 0.048 0.000
#> SRR1391354 4 0.4038 0.573116 0.216 0.000 0.056 0.728 0.000 0.000
#> SRR1087968 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1310075 1 0.5014 0.200383 0.636 0.020 0.064 0.280 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.2568 0.510462 0.876 0.016 0.096 0.000 0.012 0.000
#> SRR1325138 1 0.6783 -0.007214 0.432 0.016 0.168 0.348 0.036 0.000
#> SRR1326821 1 0.6060 -0.250924 0.428 0.004 0.220 0.348 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.5533 0.707618 0.000 0.476 0.084 0.016 0.000 0.424
#> SRR655613 1 0.5774 -0.243714 0.452 0.016 0.112 0.420 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.3610 0.258611 0.000 0.200 0.004 0.028 0.000 0.768
#> SRR1443871 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1102489 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1465758 1 0.4595 0.257046 0.676 0.020 0.040 0.264 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.6077 0.182171 0.000 0.000 0.400 0.296 0.304 0.000
#> SRR1407449 1 0.3571 0.470913 0.816 0.020 0.116 0.000 0.048 0.000
#> SRR1436858 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1479109 3 0.6472 0.484584 0.268 0.016 0.480 0.012 0.224 0.000
#> SRR1399069 4 0.4731 0.552009 0.172 0.004 0.084 0.720 0.020 0.000
#> SRR1366450 3 0.5401 0.438165 0.344 0.000 0.552 0.092 0.012 0.000
#> SRR1396859 1 0.1268 0.506453 0.952 0.008 0.004 0.036 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.4350 0.371069 0.728 0.020 0.204 0.000 0.048 0.000
#> SRR1097666 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1434736 5 0.6701 0.441367 0.236 0.024 0.108 0.080 0.552 0.000
#> SRR1080560 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1322882 4 0.5833 0.293499 0.416 0.016 0.120 0.448 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1327614 1 0.4238 0.358016 0.736 0.016 0.048 0.200 0.000 0.000
#> SRR658152 5 0.2425 0.683736 0.004 0.024 0.088 0.000 0.884 0.000
#> SRR1368141 5 0.1682 0.694034 0.000 0.052 0.020 0.000 0.928 0.000
#> SRR1440268 1 0.2658 0.470014 0.864 0.008 0.016 0.112 0.000 0.000
#> SRR1453725 3 0.5865 0.296538 0.296 0.004 0.500 0.200 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1477930 4 0.4886 0.317046 0.432 0.012 0.036 0.520 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.3718 0.446228 0.796 0.008 0.128 0.068 0.000 0.000
#> SRR1416049 6 0.5969 -0.570479 0.000 0.420 0.140 0.016 0.000 0.424
#> SRR656275 4 0.5470 0.483594 0.160 0.000 0.256 0.580 0.004 0.000
#> SRR1369052 1 0.4967 0.158398 0.632 0.012 0.072 0.284 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.3635 0.451185 0.804 0.008 0.120 0.068 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.3659 0.365938 0.752 0.012 0.012 0.224 0.000 0.000
#> SRR1404531 4 0.5371 0.294171 0.428 0.016 0.068 0.488 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.3788 0.334104 0.732 0.012 0.012 0.244 0.000 0.000
#> SRR1458890 5 0.2282 0.678301 0.000 0.068 0.020 0.012 0.900 0.000
#> SRR1432695 2 0.5608 0.690364 0.000 0.468 0.092 0.016 0.000 0.424
#> SRR1407624 6 0.6259 -0.435176 0.000 0.372 0.184 0.020 0.000 0.424
#> SRR1431969 5 0.1765 0.692917 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1087393 2 0.4234 0.811174 0.000 0.544 0.000 0.016 0.000 0.440
#> SRR1077263 3 0.6485 0.365026 0.300 0.000 0.480 0.172 0.048 0.000
#> SRR1385211 1 0.3275 0.471239 0.828 0.008 0.120 0.044 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.6018 0.302343 0.640 0.032 0.192 0.068 0.068 0.000
#> SRR656922 4 0.5715 0.351263 0.388 0.016 0.108 0.488 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.5277 0.009620 0.004 0.000 0.476 0.084 0.436 0.000
#> SRR1318966 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1407087 4 0.6185 0.133647 0.168 0.000 0.380 0.432 0.020 0.000
#> SRR603212 4 0.5308 0.520775 0.164 0.000 0.244 0.592 0.000 0.000
#> SRR1321088 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1485190 5 0.3433 0.682734 0.000 0.056 0.056 0.048 0.840 0.000
#> SRR1332232 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1312645 1 0.5672 0.190961 0.628 0.020 0.240 0.024 0.088 0.000
#> SRR1457835 1 0.3436 0.459573 0.812 0.004 0.128 0.056 0.000 0.000
#> SRR1347123 5 0.2301 0.694773 0.000 0.020 0.096 0.000 0.884 0.000
#> SRR1465501 6 0.0146 0.524607 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1330878 5 0.2449 0.674329 0.000 0.080 0.020 0.012 0.888 0.000
#> SRR1445064 5 0.4649 0.410772 0.008 0.004 0.356 0.028 0.604 0.000
#> SRR1452981 1 0.6232 0.169521 0.532 0.020 0.128 0.300 0.020 0.000
#> SRR1326708 1 0.4709 0.355691 0.716 0.016 0.128 0.140 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.1749 0.510528 0.932 0.008 0.024 0.036 0.000 0.000
#> SRR1365401 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1397697 2 0.4991 0.785106 0.000 0.520 0.044 0.012 0.000 0.424
#> SRR1477316 5 0.7411 0.092856 0.276 0.028 0.244 0.056 0.396 0.000
#> SRR1077898 1 0.3400 0.464610 0.816 0.008 0.132 0.044 0.000 0.000
#> SRR1349080 4 0.5672 0.498400 0.108 0.012 0.172 0.660 0.048 0.000
#> SRR1076096 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR811261 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1375485 1 0.3720 0.414723 0.768 0.020 0.196 0.000 0.016 0.000
#> SRR1432563 2 0.5533 0.707618 0.000 0.476 0.084 0.016 0.000 0.424
#> SRR604414 4 0.5835 0.284836 0.420 0.016 0.120 0.444 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.7538 -0.114570 0.320 0.024 0.064 0.292 0.300 0.000
#> SRR812060 4 0.6155 0.307311 0.260 0.000 0.324 0.412 0.004 0.000
#> SRR602082 1 0.5649 -0.245500 0.444 0.016 0.096 0.444 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1078417 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR661613 3 0.6524 0.432188 0.260 0.020 0.436 0.004 0.280 0.000
#> SRR1420710 5 0.5645 0.393878 0.084 0.024 0.300 0.008 0.584 0.000
#> SRR660426 1 0.5753 -0.177204 0.480 0.016 0.112 0.392 0.000 0.000
#> SRR1416003 5 0.4477 0.507258 0.008 0.024 0.300 0.008 0.660 0.000
#> SRR661064 1 0.4361 0.478667 0.792 0.028 0.084 0.060 0.036 0.000
#> SRR1082011 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1452718 4 0.6712 0.425184 0.212 0.020 0.220 0.512 0.036 0.000
#> SRR1353243 1 0.3662 0.449484 0.800 0.008 0.128 0.064 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.5235 0.244697 0.656 0.028 0.100 0.216 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.4681 0.322789 0.708 0.012 0.104 0.176 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.5789 0.031244 0.504 0.004 0.316 0.176 0.000 0.000
#> SRR1102467 4 0.4132 0.552748 0.220 0.008 0.044 0.728 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.5232 0.334208 0.052 0.024 0.368 0.000 0.556 0.000
#> SRR1337707 5 0.1462 0.693368 0.000 0.056 0.008 0.000 0.936 0.000
#> SRR1408752 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1474617 2 0.6971 -0.313293 0.000 0.484 0.128 0.176 0.212 0.000
#> SRR1398013 5 0.4485 0.599552 0.028 0.028 0.200 0.012 0.732 0.000
#> SRR1352918 1 0.6540 0.081683 0.548 0.028 0.260 0.044 0.120 0.000
#> SRR1420750 1 0.3494 0.475846 0.792 0.004 0.168 0.036 0.000 0.000
#> SRR1071785 5 0.1462 0.693368 0.000 0.056 0.008 0.000 0.936 0.000
#> SRR1353618 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1082217 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1357256 6 0.6130 -0.511653 0.000 0.400 0.156 0.020 0.000 0.424
#> SRR1490313 3 0.6971 0.159383 0.312 0.004 0.352 0.288 0.044 0.000
#> SRR1366560 1 0.1262 0.514844 0.956 0.008 0.020 0.016 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.5587 -0.000862 0.540 0.016 0.104 0.340 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.7149 0.320712 0.000 0.360 0.124 0.152 0.364 0.000
#> SRR1313494 1 0.2882 0.516573 0.860 0.020 0.100 0.020 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.3183 0.427201 0.812 0.008 0.016 0.164 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.5639 -0.189281 0.472 0.016 0.096 0.416 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.5904 0.490165 0.340 0.000 0.528 0.084 0.048 0.000
#> SRR1400078 5 0.5476 0.447203 0.092 0.024 0.264 0.004 0.616 0.000
#> SRR1088631 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1092842 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR615575 3 0.6744 0.489205 0.136 0.000 0.524 0.196 0.144 0.000
#> SRR1079434 5 0.5521 0.500021 0.004 0.016 0.108 0.272 0.600 0.000
#> SRR1325559 1 0.5050 0.220430 0.664 0.020 0.224 0.000 0.092 0.000
#> SRR1446695 3 0.5932 0.053518 0.096 0.020 0.468 0.008 0.408 0.000
#> SRR1383883 1 0.3219 0.426176 0.808 0.016 0.008 0.168 0.000 0.000
#> SRR1396100 5 0.7050 0.062194 0.316 0.028 0.240 0.024 0.392 0.000
#> SRR1475697 5 0.4134 0.637912 0.000 0.064 0.040 0.112 0.784 0.000
#> SRR1488067 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1102103 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1105154 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1084991 6 0.2344 0.440880 0.000 0.076 0.004 0.028 0.000 0.892
#> SRR1410380 5 0.4266 0.465857 0.000 0.020 0.356 0.004 0.620 0.000
#> SRR1445490 6 0.6335 -0.363045 0.000 0.344 0.208 0.020 0.000 0.428
#> SRR1454671 6 0.6324 -0.370145 0.000 0.348 0.204 0.020 0.000 0.428
#> SRR1435044 5 0.6667 -0.042591 0.272 0.024 0.304 0.004 0.396 0.000
#> SRR1485812 5 0.2427 0.692383 0.000 0.032 0.036 0.032 0.900 0.000
#> SRR1078020 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1311153 4 0.5566 0.318714 0.384 0.016 0.092 0.508 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.4687 0.806290 0.000 0.536 0.036 0.004 0.000 0.424
#> SRR1343898 5 0.3069 0.657815 0.000 0.096 0.032 0.020 0.852 0.000
#> SRR807775 5 0.5095 0.160132 0.000 0.000 0.420 0.080 0.500 0.000
#> SRR1409215 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR820427 5 0.2890 0.673130 0.004 0.024 0.128 0.000 0.844 0.000
#> SRR1100656 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1362159 1 0.5079 0.228799 0.656 0.016 0.100 0.228 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.5797 0.322963 0.080 0.000 0.540 0.044 0.336 0.000
#> SRR656794 1 0.3584 0.422833 0.740 0.004 0.244 0.012 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.5773 -0.229002 0.456 0.016 0.112 0.416 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.2427 0.692383 0.000 0.032 0.036 0.032 0.900 0.000
#> SRR1485912 1 0.6172 -0.291898 0.428 0.024 0.396 0.000 0.152 0.000
#> SRR1407602 5 0.2478 0.675073 0.000 0.076 0.024 0.012 0.888 0.000
#> SRR1356164 4 0.6133 0.130789 0.052 0.020 0.052 0.504 0.372 0.000
#> SRR1328692 5 0.4455 0.660049 0.008 0.020 0.124 0.088 0.760 0.000
#> SRR1362438 1 0.4141 0.412675 0.760 0.008 0.140 0.092 0.000 0.000
#> SRR1479216 5 0.2282 0.695329 0.000 0.024 0.088 0.000 0.888 0.000
#> SRR1358041 1 0.4782 0.315806 0.696 0.020 0.204 0.000 0.080 0.000
#> SRR1468766 4 0.5911 0.429659 0.132 0.012 0.236 0.596 0.024 0.000
#> SRR1368200 3 0.6425 0.430881 0.292 0.020 0.428 0.000 0.260 0.000
#> SRR1435602 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1501043 5 0.3069 0.657815 0.000 0.096 0.032 0.020 0.852 0.000
#> SRR1437256 5 0.1594 0.699939 0.000 0.016 0.052 0.000 0.932 0.000
#> SRR1487446 1 0.6363 -0.154280 0.492 0.024 0.276 0.004 0.204 0.000
#> SRR816653 1 0.2176 0.505613 0.896 0.000 0.080 0.024 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.6003 -0.129246 0.476 0.004 0.252 0.268 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.7216 0.146714 0.496 0.024 0.216 0.168 0.096 0.000
#> SRR1410573 1 0.3572 0.447572 0.812 0.008 0.100 0.080 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1352369 3 0.6189 0.025891 0.236 0.004 0.444 0.312 0.004 0.000
#> SRR1382934 5 0.2308 0.677192 0.000 0.076 0.016 0.012 0.896 0.000
#> SRR1465208 1 0.1196 0.517538 0.952 0.000 0.040 0.008 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.6500 0.394356 0.352 0.020 0.408 0.004 0.216 0.000
#> SRR1470291 1 0.2285 0.501801 0.900 0.008 0.064 0.028 0.000 0.000
#> SRR1308756 5 0.4731 0.256828 0.000 0.000 0.428 0.048 0.524 0.000
#> SRR1409600 3 0.6383 0.429421 0.308 0.020 0.436 0.000 0.236 0.000
#> SRR816123 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR614779 3 0.6435 0.317451 0.040 0.000 0.464 0.324 0.172 0.000
#> SRR810783 3 0.6040 0.479667 0.288 0.000 0.540 0.136 0.036 0.000
#> SRR1333990 1 0.0767 0.514362 0.976 0.008 0.004 0.012 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.6038 -0.186012 0.208 0.004 0.412 0.376 0.000 0.000
#> SRR808106 4 0.5999 0.434805 0.084 0.016 0.108 0.648 0.144 0.000
#> SRR662713 4 0.5507 0.541692 0.228 0.000 0.208 0.564 0.000 0.000
#> SRR1447058 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1480964 4 0.5745 0.190991 0.148 0.000 0.388 0.460 0.004 0.000
#> SRR809382 5 0.1327 0.698403 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR665417 4 0.7076 0.276769 0.244 0.020 0.184 0.484 0.068 0.000
#> SRR1088016 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1453166 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1069826 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1077781 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR615623 5 0.2285 0.692643 0.000 0.028 0.064 0.008 0.900 0.000
#> SRR1413787 5 0.2136 0.682283 0.000 0.064 0.016 0.012 0.908 0.000
#> SRR1478207 3 0.5954 0.238135 0.020 0.000 0.476 0.132 0.372 0.000
#> SRR1411046 1 0.4091 0.480736 0.800 0.028 0.112 0.036 0.024 0.000
#> SRR1313711 2 0.5276 0.753353 0.000 0.500 0.060 0.016 0.000 0.424
#> SRR1326560 1 0.3910 0.368002 0.740 0.012 0.024 0.224 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.5345 0.201700 0.628 0.024 0.100 0.248 0.000 0.000
#> SRR1486949 6 0.6397 -0.358999 0.000 0.340 0.208 0.024 0.000 0.428
#> SRR1395616 1 0.4869 -0.165941 0.500 0.024 0.020 0.456 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1092961 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR817210 3 0.6210 -0.118120 0.284 0.000 0.384 0.328 0.004 0.000
#> SRR1319221 5 0.7149 0.320712 0.000 0.360 0.124 0.152 0.364 0.000
#> SRR1405413 1 0.5349 0.068145 0.584 0.020 0.316 0.000 0.080 0.000
#> SRR607807 4 0.5293 0.498675 0.244 0.024 0.068 0.652 0.012 0.000
#> SRR1390160 5 0.2664 0.675419 0.000 0.016 0.136 0.000 0.848 0.000
#> SRR1406283 3 0.5647 0.393024 0.360 0.004 0.524 0.100 0.012 0.000
#> SRR1357709 1 0.6895 -0.096614 0.392 0.016 0.204 0.356 0.032 0.000
#> SRR1080742 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1468208 1 0.3814 0.455054 0.808 0.016 0.044 0.120 0.012 0.000
#> SRR1312766 3 0.5806 0.507215 0.324 0.000 0.548 0.084 0.044 0.000
#> SRR1361612 1 0.3018 0.507417 0.864 0.020 0.084 0.008 0.024 0.000
#> SRR1311224 1 0.5897 -0.136274 0.484 0.016 0.136 0.364 0.000 0.000
#> SRR1087801 4 0.6559 0.089663 0.040 0.008 0.236 0.512 0.204 0.000
#> SRR1099720 2 0.4493 0.826447 0.000 0.548 0.004 0.024 0.000 0.424
#> SRR1349250 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1350912 6 0.6397 -0.358999 0.000 0.340 0.208 0.024 0.000 0.428
#> SRR1357127 5 0.5731 0.368601 0.104 0.024 0.296 0.004 0.572 0.000
#> SRR1074980 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1317022 5 0.1984 0.694752 0.000 0.032 0.056 0.000 0.912 0.000
#> SRR1332879 1 0.3865 0.436174 0.784 0.008 0.132 0.076 0.000 0.000
#> SRR1403177 5 0.7149 0.320712 0.000 0.360 0.124 0.152 0.364 0.000
#> SRR1076144 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1069614 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR818239 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1421069 6 0.0146 0.524607 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500006 4 0.5656 0.372965 0.372 0.016 0.104 0.508 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.5434 -0.090565 0.528 0.020 0.388 0.004 0.060 0.000
#> SRR1092232 5 0.2449 0.674329 0.000 0.080 0.020 0.012 0.888 0.000
#> SRR1344253 5 0.6499 0.280075 0.004 0.016 0.264 0.296 0.420 0.000
#> SRR1384290 1 0.2467 0.476745 0.884 0.016 0.012 0.088 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.6239 -0.021970 0.224 0.000 0.428 0.336 0.012 0.000
#> SRR1343522 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1326727 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1440940 5 0.3784 0.589329 0.000 0.024 0.236 0.004 0.736 0.000
#> SRR818372 3 0.6575 0.179234 0.216 0.024 0.384 0.004 0.372 0.000
#> SRR1323675 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR819894 3 0.7278 0.435952 0.288 0.020 0.412 0.060 0.220 0.000
#> SRR1310031 5 0.4476 0.456867 0.000 0.000 0.308 0.052 0.640 0.000
#> SRR615419 5 0.1327 0.697593 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1436925 1 0.5284 -0.090456 0.552 0.004 0.376 0.028 0.040 0.000
#> SRR1477238 1 0.4970 -0.054702 0.512 0.016 0.036 0.436 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.2699 0.460813 0.856 0.012 0.008 0.124 0.000 0.000
#> SRR1490228 5 0.4731 0.255997 0.000 0.000 0.428 0.048 0.524 0.000
#> SRR1442949 5 0.2848 0.671971 0.004 0.024 0.124 0.000 0.848 0.000
#> SRR1466239 1 0.0146 0.517727 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1329971 1 0.4353 0.281378 0.672 0.020 0.292 0.004 0.012 0.000
#> SRR813076 6 0.6324 -0.370145 0.000 0.348 0.204 0.020 0.000 0.428
#> SRR1097642 2 0.4600 0.716348 0.000 0.500 0.004 0.028 0.000 0.468
#> SRR1322981 3 0.5791 0.473379 0.300 0.000 0.556 0.116 0.028 0.000
#> SRR1485976 2 0.4561 0.815308 0.000 0.544 0.028 0.004 0.000 0.424
#> SRR1471713 5 0.2445 0.693428 0.000 0.020 0.108 0.000 0.872 0.000
#> SRR660522 3 0.5284 0.015578 0.044 0.000 0.504 0.028 0.424 0.000
#> SRR815374 1 0.5745 -0.025689 0.548 0.020 0.308 0.000 0.124 0.000
#> SRR1069564 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1416337 3 0.6126 0.382288 0.048 0.000 0.524 0.116 0.312 0.000
#> SRR1316438 5 0.3396 0.657381 0.000 0.076 0.044 0.040 0.840 0.000
#> SRR1386844 1 0.1942 0.494652 0.916 0.008 0.012 0.064 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.5396 -0.059489 0.528 0.016 0.076 0.380 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.5608 0.690364 0.000 0.468 0.092 0.016 0.000 0.424
#> SRR1487128 1 0.3717 0.462671 0.808 0.016 0.084 0.092 0.000 0.000
#> SRR1441421 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1069919 2 0.5046 0.779328 0.000 0.516 0.048 0.012 0.000 0.424
#> SRR1460296 1 0.3772 0.444582 0.792 0.008 0.128 0.072 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.6240 0.316318 0.628 0.028 0.168 0.100 0.076 0.000
#> SRR1393404 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1081425 1 0.5770 -0.217207 0.460 0.016 0.112 0.412 0.000 0.000
#> SRR1401815 5 0.2449 0.674329 0.000 0.080 0.020 0.012 0.888 0.000
#> SRR1071337 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1071983 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1331793 6 0.6130 -0.511653 0.000 0.400 0.156 0.020 0.000 0.424
#> SRR1410510 5 0.2398 0.692160 0.000 0.020 0.104 0.000 0.876 0.000
#> SRR1098761 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1312124 1 0.5008 0.297605 0.700 0.020 0.188 0.012 0.080 0.000
#> SRR615395 1 0.6231 -0.246475 0.360 0.004 0.344 0.292 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.5150 0.397763 0.712 0.028 0.168 0.056 0.036 0.000
#> SRR2165033 5 0.6375 0.254214 0.228 0.024 0.248 0.004 0.496 0.000
#> SRR1089054 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR816201 3 0.6936 0.417977 0.288 0.000 0.424 0.216 0.072 0.000
#> SRR1488514 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR655840 3 0.7345 0.201876 0.304 0.004 0.308 0.300 0.084 0.000
#> SRR1379303 1 0.0146 0.517727 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1418516 5 0.6028 0.423727 0.004 0.016 0.156 0.304 0.520 0.000
#> SRR613174 3 0.6552 0.564173 0.156 0.000 0.548 0.108 0.188 0.000
#> SRR1351125 3 0.6523 0.431553 0.280 0.000 0.500 0.156 0.064 0.000
#> SRR659157 5 0.2066 0.686190 0.000 0.072 0.024 0.000 0.904 0.000
#> SRR1480408 4 0.5712 0.431816 0.340 0.000 0.140 0.512 0.008 0.000
#> SRR657857 4 0.5644 0.511556 0.192 0.020 0.140 0.636 0.012 0.000
#> SRR1073317 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1332526 4 0.4823 0.449174 0.388 0.000 0.060 0.552 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1431270 5 0.1075 0.698957 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1085614 2 0.4212 0.841511 0.000 0.560 0.000 0.016 0.000 0.424
#> SRR1330106 4 0.6242 -0.217451 0.004 0.000 0.304 0.352 0.340 0.000
#> SRR1466154 1 0.5777 -0.128058 0.500 0.016 0.120 0.364 0.000 0.000
#> SRR1396944 4 0.4027 0.477258 0.308 0.008 0.012 0.672 0.000 0.000
#> SRR1082784 6 0.6130 -0.511653 0.000 0.400 0.156 0.020 0.000 0.424
#> SRR1457267 1 0.0767 0.514362 0.976 0.008 0.004 0.012 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.6122 0.355870 0.220 0.000 0.528 0.228 0.024 0.000
#> SRR659247 3 0.6084 0.518730 0.332 0.000 0.520 0.084 0.064 0.000
#> SRR1317201 1 0.0632 0.521622 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.3129 0.479416 0.820 0.004 0.152 0.024 0.000 0.000
#> SRR1375842 4 0.5691 0.368657 0.372 0.016 0.108 0.504 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.5276 0.753353 0.000 0.500 0.060 0.016 0.000 0.424
#> SRR1096363 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1453662 1 0.6208 -0.158802 0.484 0.024 0.340 0.004 0.148 0.000
#> SRR1345499 6 0.6351 -0.368129 0.000 0.344 0.212 0.020 0.000 0.424
#> SRR1353499 4 0.5615 0.439922 0.324 0.016 0.112 0.548 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.2169 0.488747 0.900 0.008 0.012 0.080 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.6518 0.548713 0.172 0.000 0.536 0.080 0.212 0.000
#> SRR1380910 1 0.5408 0.110317 0.588 0.016 0.100 0.296 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1498183 1 0.2992 0.502310 0.840 0.020 0.132 0.004 0.004 0.000
#> SRR612659 5 0.5219 0.320081 0.000 0.000 0.316 0.116 0.568 0.000
#> SRR1447148 6 0.6397 -0.358999 0.000 0.340 0.208 0.024 0.000 0.428
#> SRR658597 6 0.0146 0.524607 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1089595 6 0.4602 -0.683008 0.000 0.484 0.004 0.028 0.000 0.484
#> SRR1074263 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1376786 4 0.6231 0.320802 0.332 0.004 0.296 0.368 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.5712 0.486692 0.332 0.000 0.548 0.084 0.036 0.000
#> SRR1071035 4 0.4989 0.543714 0.148 0.008 0.144 0.692 0.008 0.000
#> SRR1068808 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1332754 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR662438 1 0.1267 0.521753 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.5501 0.020679 0.552 0.016 0.096 0.336 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.6255 0.315565 0.184 0.016 0.468 0.004 0.328 0.000
#> SRR1323558 5 0.4053 0.533946 0.004 0.020 0.300 0.000 0.676 0.000
#> SRR1381711 3 0.5741 -0.078381 0.016 0.004 0.452 0.092 0.436 0.000
#> SRR657985 5 0.4975 0.232293 0.032 0.008 0.440 0.008 0.512 0.000
#> SRR1314810 1 0.6565 -0.013417 0.456 0.008 0.212 0.300 0.024 0.000
#> SRR1336505 4 0.6314 -0.163417 0.024 0.000 0.360 0.432 0.184 0.000
#> SRR1474095 3 0.6107 0.347831 0.396 0.020 0.448 0.004 0.132 0.000
#> SRR1363831 2 0.5148 0.766695 0.000 0.508 0.056 0.012 0.000 0.424
#> SRR1442376 4 0.4699 0.545609 0.228 0.000 0.104 0.668 0.000 0.000
#> SRR1074909 6 0.0146 0.524607 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1101200 4 0.6112 0.426187 0.304 0.016 0.192 0.488 0.000 0.000
#> SRR1075408 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1367150 5 0.6899 0.199936 0.204 0.028 0.276 0.028 0.464 0.000
#> SRR1313406 6 0.6397 -0.358999 0.000 0.340 0.208 0.024 0.000 0.428
#> SRR1068880 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1467277 5 0.3200 0.649175 0.000 0.016 0.196 0.000 0.788 0.000
#> SRR1084867 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1095431 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1380184 6 0.6040 -0.558811 0.000 0.416 0.140 0.020 0.000 0.424
#> SRR1443113 3 0.6205 -0.110568 0.276 0.004 0.380 0.340 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.6496 0.559743 0.204 0.000 0.552 0.108 0.136 0.000
#> SRR1315912 4 0.5831 0.301014 0.412 0.016 0.120 0.452 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1421116 2 0.4561 0.817694 0.000 0.544 0.028 0.004 0.000 0.424
#> SRR602282 5 0.3313 0.659333 0.000 0.080 0.040 0.036 0.844 0.000
#> SRR1361195 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR600493 1 0.5831 -0.239657 0.452 0.016 0.120 0.412 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.4925 0.242509 0.448 0.000 0.500 0.044 0.008 0.000
#> SRR1355475 3 0.6618 0.553380 0.148 0.000 0.544 0.128 0.180 0.000
#> SRR1360785 1 0.6307 0.296235 0.596 0.024 0.196 0.140 0.044 0.000
#> SRR810437 5 0.3790 0.606719 0.004 0.024 0.216 0.004 0.752 0.000
#> SRR1361860 4 0.6896 0.062155 0.384 0.020 0.172 0.388 0.036 0.000
#> SRR1441311 2 0.5608 0.690364 0.000 0.468 0.092 0.016 0.000 0.424
#> SRR1098903 4 0.5076 0.554301 0.248 0.000 0.132 0.620 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.5931 0.041037 0.568 0.024 0.288 0.012 0.108 0.000
#> SRR1498529 1 0.4163 0.299091 0.700 0.008 0.016 0.268 0.008 0.000
#> SRR1097172 6 0.6130 -0.511653 0.000 0.400 0.156 0.020 0.000 0.424
#> SRR1074017 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1472033 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1445087 5 0.3478 0.657641 0.000 0.064 0.040 0.060 0.836 0.000
#> SRR1399525 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1312844 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1085874 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1101226 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1476056 4 0.5674 0.401500 0.312 0.016 0.108 0.560 0.004 0.000
#> SRR1075659 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1311916 5 0.2301 0.693514 0.000 0.020 0.096 0.000 0.884 0.000
#> SRR1353353 5 0.2308 0.677192 0.000 0.076 0.016 0.012 0.896 0.000
#> SRR1073291 3 0.6668 0.551513 0.144 0.000 0.536 0.132 0.188 0.000
#> SRR1356227 1 0.1542 0.499832 0.936 0.008 0.004 0.052 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.4493 0.826447 0.000 0.548 0.004 0.024 0.000 0.424
#> SRR1091695 6 0.0146 0.524607 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1350304 5 0.2848 0.671971 0.004 0.024 0.124 0.000 0.848 0.000
#> SRR663002 5 0.1753 0.694501 0.000 0.004 0.084 0.000 0.912 0.000
#> SRR1376983 2 0.4935 0.790636 0.000 0.524 0.040 0.012 0.000 0.424
#> SRR1399926 1 0.2612 0.462437 0.868 0.016 0.008 0.108 0.000 0.000
#> SRR1347144 5 0.2790 0.683921 0.000 0.020 0.140 0.000 0.840 0.000
#> SRR1384006 4 0.5669 0.354375 0.380 0.016 0.104 0.500 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR614047 3 0.5558 -0.043154 0.056 0.016 0.464 0.012 0.452 0.000
#> SRR818440 3 0.6415 0.357941 0.204 0.020 0.448 0.004 0.324 0.000
#> SRR1337770 1 0.5909 0.127605 0.584 0.024 0.284 0.024 0.084 0.000
#> SRR1399413 4 0.5889 0.371828 0.116 0.000 0.276 0.568 0.040 0.000
#> SRR1385542 2 0.5892 0.593246 0.000 0.432 0.128 0.016 0.000 0.424
#> SRR1473959 3 0.6793 0.304500 0.308 0.024 0.372 0.008 0.288 0.000
#> SRR1074041 3 0.6020 0.124591 0.184 0.000 0.488 0.316 0.012 0.000
#> SRR1394495 6 0.6130 -0.511653 0.000 0.400 0.156 0.020 0.000 0.424
#> SRR659460 3 0.6327 -0.087688 0.304 0.004 0.392 0.296 0.004 0.000
#> SRR816699 3 0.6583 0.557320 0.196 0.000 0.544 0.116 0.144 0.000
#> SRR1308612 3 0.6425 0.515182 0.104 0.000 0.544 0.108 0.244 0.000
#> SRR1499418 5 0.2350 0.691742 0.000 0.020 0.100 0.000 0.880 0.000
#> SRR1352894 6 0.6151 -0.500963 0.000 0.396 0.160 0.020 0.000 0.424
#> SRR815805 4 0.4148 0.573541 0.184 0.012 0.056 0.748 0.000 0.000
#> SRR1331083 6 0.0146 0.524607 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR808272 5 0.4735 0.253381 0.000 0.000 0.432 0.048 0.520 0.000
#> SRR1436698 3 0.4994 0.343464 0.412 0.004 0.524 0.060 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1357672 3 0.6372 0.303245 0.208 0.024 0.444 0.000 0.324 0.000
#> SRR1351236 1 0.5143 0.253853 0.656 0.016 0.116 0.212 0.000 0.000
#> SRR1077479 4 0.4432 0.550435 0.224 0.012 0.056 0.708 0.000 0.000
#> SRR814491 5 0.6803 0.182241 0.268 0.028 0.236 0.016 0.452 0.000
#> SRR1101256 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1436004 4 0.5831 0.301014 0.412 0.016 0.120 0.452 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1078998 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1314707 4 0.4044 0.573806 0.180 0.000 0.076 0.744 0.000 0.000
#> SRR1309534 5 0.4596 0.654511 0.028 0.040 0.120 0.044 0.768 0.000
#> SRR615527 5 0.3577 0.650812 0.000 0.080 0.040 0.052 0.828 0.000
#> SRR1098216 4 0.3866 0.551086 0.232 0.008 0.024 0.736 0.000 0.000
#> SRR1325847 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1404003 4 0.4821 0.585308 0.184 0.000 0.148 0.668 0.000 0.000
#> SRR1344166 4 0.5618 0.383002 0.376 0.012 0.108 0.504 0.000 0.000
#> SRR1368638 5 0.7183 0.077521 0.312 0.028 0.228 0.036 0.396 0.000
#> SRR1431429 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1079237 6 0.2784 0.385434 0.000 0.124 0.000 0.028 0.000 0.848
#> SRR1080509 6 0.6171 -0.495299 0.000 0.392 0.164 0.020 0.000 0.424
#> SRR815759 5 0.3277 0.656371 0.008 0.024 0.156 0.000 0.812 0.000
#> SRR1502143 3 0.6451 0.562377 0.196 0.000 0.560 0.108 0.136 0.000
#> SRR1487614 5 0.2106 0.696340 0.000 0.032 0.064 0.000 0.904 0.000
#> SRR1402307 6 0.6270 -0.412553 0.000 0.364 0.188 0.020 0.000 0.428
#> SRR820810 1 0.6222 -0.299520 0.384 0.008 0.236 0.372 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.4218 0.835590 0.000 0.556 0.000 0.016 0.000 0.428
#> SRR1083215 3 0.5480 0.383018 0.396 0.000 0.512 0.068 0.024 0.000
#> SRR1476547 2 0.4602 0.674455 0.000 0.484 0.004 0.028 0.000 0.484
#> SRR656421 1 0.1059 0.516203 0.964 0.004 0.016 0.016 0.000 0.000
#> SRR1086116 6 0.6324 -0.370145 0.000 0.348 0.204 0.020 0.000 0.428
#> SRR1499917 5 0.5913 0.364952 0.116 0.024 0.288 0.008 0.564 0.000
#> SRR1339944 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1391444 2 0.5098 0.773177 0.000 0.512 0.052 0.012 0.000 0.424
#> SRR1434889 4 0.4800 0.576100 0.164 0.000 0.164 0.672 0.000 0.000
#> SRR1431847 5 0.2920 0.667401 0.000 0.080 0.040 0.016 0.864 0.000
#> SRR1317155 5 0.5610 0.464448 0.004 0.016 0.104 0.304 0.572 0.000
#> SRR1477405 1 0.5143 0.253853 0.656 0.016 0.116 0.212 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.6095 0.139102 0.332 0.000 0.428 0.236 0.004 0.000
#> SRR1341683 5 0.4308 0.511197 0.000 0.008 0.300 0.028 0.664 0.000
#> SRR1084790 1 0.6003 -0.134987 0.480 0.016 0.156 0.348 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.6450 0.312711 0.156 0.000 0.488 0.304 0.052 0.000
#> SRR1332588 5 0.6513 0.268640 0.136 0.024 0.304 0.028 0.508 0.000
#> SRR1471157 2 0.5608 0.690364 0.000 0.468 0.092 0.016 0.000 0.424
#> SRR654945 3 0.6536 0.336747 0.196 0.024 0.452 0.008 0.320 0.000
#> SRR661028 1 0.4033 0.422535 0.776 0.012 0.124 0.088 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1101152 1 0.6771 -0.281637 0.412 0.020 0.408 0.076 0.084 0.000
#> SRR1358435 6 0.3440 0.270150 0.000 0.196 0.000 0.028 0.000 0.776
#> SRR2165273 1 0.2269 0.483780 0.896 0.012 0.012 0.080 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.4434 -0.022943 0.564 0.012 0.012 0.412 0.000 0.000
#> SRR1489904 5 0.4153 0.535549 0.004 0.020 0.292 0.004 0.680 0.000
#> SRR1416386 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1406048 1 0.2402 0.518901 0.888 0.020 0.084 0.000 0.008 0.000
#> SRR606982 5 0.5809 0.394354 0.004 0.016 0.112 0.348 0.520 0.000
#> SRR1358082 1 0.5125 0.223558 0.648 0.016 0.100 0.236 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.6154 0.041753 0.100 0.000 0.440 0.412 0.048 0.000
#> SRR655194 1 0.6002 0.035922 0.560 0.024 0.276 0.008 0.132 0.000
#> SRR1331174 2 0.3937 0.845728 0.000 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1473251 2 0.4602 0.674455 0.000 0.484 0.004 0.028 0.000 0.484
#> SRR1389820 2 0.6905 -0.301270 0.000 0.496 0.128 0.168 0.208 0.000
#> SRR1074289 4 0.5438 0.402044 0.148 0.000 0.304 0.548 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.4129 0.844383 0.000 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1076292 4 0.7109 0.052787 0.056 0.012 0.268 0.424 0.240 0.000
#> SRR1395810 2 0.5453 0.723431 0.000 0.484 0.076 0.016 0.000 0.424
#> SRR1498909 3 0.6649 0.402235 0.048 0.000 0.456 0.216 0.280 0.000
#> SRR1443507 3 0.5725 0.354745 0.280 0.000 0.532 0.184 0.004 0.000
#> SRR1452310 5 0.5484 0.446635 0.068 0.028 0.288 0.008 0.608 0.000
#> SRR665610 3 0.6866 0.194968 0.236 0.024 0.388 0.016 0.336 0.000
#> SRR1347322 1 0.3634 0.449985 0.808 0.012 0.116 0.064 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.0363 0.524119 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1477256 1 0.3817 0.460758 0.804 0.012 0.092 0.088 0.004 0.000
#> SRR1470230 5 0.3106 0.682987 0.000 0.056 0.036 0.048 0.860 0.000
#> SRR1354247 4 0.3947 0.554958 0.212 0.008 0.036 0.744 0.000 0.000
#> SRR1082640 6 0.6346 -0.356295 0.000 0.340 0.212 0.020 0.000 0.428
#> SRR1487592 3 0.6060 0.159271 0.224 0.004 0.488 0.280 0.004 0.000
#> SRR1352299 4 0.6149 0.262310 0.212 0.008 0.384 0.396 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1434117 3 0.6482 0.570424 0.188 0.000 0.552 0.092 0.168 0.000
#> SRR1075273 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR658657 5 0.4065 0.561907 0.004 0.024 0.260 0.004 0.708 0.000
#> SRR1092773 6 0.0291 0.523150 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1365332 3 0.5051 0.395410 0.396 0.000 0.544 0.020 0.040 0.000
#> SRR615958 5 0.4648 0.224092 0.004 0.000 0.444 0.032 0.520 0.000
#> SRR1097688 6 0.0146 0.524607 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1403259 5 0.3229 0.669161 0.000 0.064 0.040 0.044 0.852 0.000
#> SRR1099120 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1362200 3 0.6353 0.469705 0.080 0.000 0.532 0.112 0.276 0.000
#> SRR1464856 2 0.4039 0.844414 0.000 0.568 0.000 0.008 0.000 0.424
#> SRR1347298 5 0.3917 0.631201 0.000 0.008 0.132 0.080 0.780 0.000
#> SRR1075923 6 0.0146 0.523888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1100703 3 0.5870 0.405872 0.260 0.000 0.548 0.176 0.016 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.4392 0.561 0.561
#> 3 3 0.854 0.939 0.958 0.4684 0.777 0.602
#> 4 4 0.727 0.670 0.833 0.1307 0.829 0.561
#> 5 5 0.739 0.694 0.799 0.0451 0.884 0.619
#> 6 6 0.706 0.497 0.723 0.0381 0.916 0.689
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1075752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR657384 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818573 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1310075 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR655613 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102489 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1479109 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1327614 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR658152 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477930 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR656275 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407624 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431969 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077263 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR655241 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR656922 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1318966 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR603212 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1485190 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312645 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1397697 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477316 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR811261 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR604414 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR812060 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR602082 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR661613 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR660426 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR661064 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1452718 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1474617 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1398013 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1082217 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357256 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1490313 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323289 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR607911 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092842 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488067 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1105154 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1084991 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1454671 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1435044 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1311153 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1343898 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR807775 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820427 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR656794 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR604653 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1328692 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1501043 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR816653 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR815164 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1352369 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1465208 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR816123 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR810783 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR808106 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR662713 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1480964 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR809382 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR665417 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453166 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1077781 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR615623 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1326560 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1395616 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1092961 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1319221 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR607807 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1349250 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357127 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1317022 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.753 0.724 0.216 0.784
#> SRR1076144 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069614 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR818239 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1421069 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1326727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1440940 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818372 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR819894 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615419 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1329971 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813076 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1097642 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1322981 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1471713 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR660522 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR815374 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1069564 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1386844 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487128 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1069919 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1460296 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1081425 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1071983 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1331793 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1410510 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615395 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR816201 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR655840 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR613174 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR659157 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR657857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332526 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1330106 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1457267 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR614659 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR659247 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1096363 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1353499 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498183 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR612659 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR658597 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074263 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1376786 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR662438 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR659448 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR657985 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1442376 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1367150 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1068880 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1467277 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1095431 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1443113 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1421116 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR602282 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361195 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR600493 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR810437 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1098903 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074017 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1472033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1445087 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399525 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1312844 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1085874 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101226 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1091695 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR663002 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1399926 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR818440 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473959 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR659460 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR816699 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815805 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR814491 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1436004 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1078998 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1314707 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615527 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1098216 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1079237 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR815759 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR820810 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1083215 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1499917 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1391444 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434889 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR655289 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR654945 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR661028 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1101152 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1358435 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1416386 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR606982 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR655194 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1473251 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1389820 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1074289 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1076292 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1498909 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR665610 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR813395 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1487592 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR615958 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1099120 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1347298 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1075923 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.2066 0.91588 0.940 0.000 0.060
#> SRR1436370 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 3 0.6274 0.43777 0.456 0.000 0.544
#> SRR1351190 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1458662 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 3 0.5905 0.66182 0.352 0.000 0.648
#> SRR1410742 1 0.6235 -0.07114 0.564 0.000 0.436
#> SRR1435963 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1399069 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 3 0.6168 0.54766 0.412 0.000 0.588
#> SRR1097666 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.5098 0.65602 0.752 0.000 0.248
#> SRR1080560 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368141 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.4605 0.85530 0.204 0.000 0.796
#> SRR1385211 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.1163 0.86541 0.028 0.000 0.972
#> SRR1318966 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.1163 0.95813 0.972 0.000 0.028
#> SRR603212 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.6180 0.53929 0.416 0.000 0.584
#> SRR1457835 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.0747 0.86375 0.016 0.000 0.984
#> SRR1465501 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1452981 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.6079 0.59692 0.388 0.000 0.612
#> SRR1077898 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1420710 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR660426 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR661064 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.3482 0.87423 0.128 0.000 0.872
#> SRR1337707 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398013 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1352918 3 0.6126 0.57267 0.400 0.000 0.600
#> SRR1420750 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 2 0.5178 0.63712 0.000 0.744 0.256
#> SRR1313494 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 3 0.2261 0.86966 0.068 0.000 0.932
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 3 0.4062 0.87267 0.164 0.000 0.836
#> SRR1079434 3 0.1031 0.86438 0.024 0.000 0.976
#> SRR1325559 3 0.6140 0.56457 0.404 0.000 0.596
#> SRR1446695 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1383883 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1475697 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488067 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.3412 0.87406 0.124 0.000 0.876
#> SRR1445490 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.4002 0.87311 0.160 0.000 0.840
#> SRR1485812 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 3 0.0592 0.86308 0.012 0.000 0.988
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 3 0.3482 0.87423 0.128 0.000 0.872
#> SRR1100656 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR656794 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485912 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1407602 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356164 1 0.1163 0.95814 0.972 0.000 0.028
#> SRR1328692 3 0.5621 0.73318 0.308 0.000 0.692
#> SRR1362438 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358041 3 0.6079 0.59681 0.388 0.000 0.612
#> SRR1468766 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1435602 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1487446 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR816653 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.3619 0.87441 0.136 0.000 0.864
#> SRR1470291 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.4346 0.86943 0.184 0.000 0.816
#> SRR1409600 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR816123 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 3 0.3941 0.87349 0.156 0.000 0.844
#> SRR810783 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR809382 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478207 3 0.3551 0.87444 0.132 0.000 0.868
#> SRR1411046 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319221 2 0.0592 0.98371 0.000 0.988 0.012
#> SRR1405413 3 0.5621 0.73076 0.308 0.000 0.692
#> SRR607807 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.0592 0.86308 0.012 0.000 0.988
#> SRR1406283 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.3412 0.87413 0.124 0.000 0.876
#> SRR1074980 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 2 0.5733 0.49454 0.000 0.676 0.324
#> SRR1076144 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092232 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344253 1 0.0424 0.98107 0.992 0.000 0.008
#> SRR1384290 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.1289 0.95340 0.968 0.000 0.032
#> SRR1343522 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR818372 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1323675 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 3 0.4605 0.85530 0.204 0.000 0.796
#> SRR1310031 3 0.0424 0.86197 0.008 0.000 0.992
#> SRR615419 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.4235 0.87090 0.176 0.000 0.824
#> SRR1442949 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR660522 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR815374 3 0.4555 0.85884 0.200 0.000 0.800
#> SRR1069564 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 3 0.3941 0.87349 0.156 0.000 0.844
#> SRR1316438 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098761 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 3 0.6111 0.58087 0.396 0.000 0.604
#> SRR615395 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1089054 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 3 0.6192 0.52858 0.420 0.000 0.580
#> SRR1379303 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 3 0.6168 0.54705 0.412 0.000 0.588
#> SRR613174 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1351125 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR659157 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 3 0.4974 0.82295 0.236 0.000 0.764
#> SRR1466154 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.6168 0.54742 0.412 0.000 0.588
#> SRR1317201 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.6079 0.59685 0.388 0.000 0.612
#> SRR1345499 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1380910 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1323558 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381711 3 0.4605 0.85589 0.204 0.000 0.796
#> SRR657985 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1314810 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.3116 0.84706 0.892 0.000 0.108
#> SRR1474095 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1363831 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.4555 0.85884 0.200 0.000 0.800
#> SRR1313406 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1315912 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1360785 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR810437 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1361860 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457619 3 0.4931 0.82720 0.232 0.000 0.768
#> SRR1498529 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399525 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353353 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073291 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1356227 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR663002 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 3 0.0592 0.86308 0.012 0.000 0.988
#> SRR818440 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1337770 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1074041 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1308612 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1499418 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1436698 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1351236 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 3 0.4062 0.87263 0.164 0.000 0.836
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 3 0.3816 0.87415 0.148 0.000 0.852
#> SRR615527 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.3752 0.87429 0.144 0.000 0.856
#> SRR1431429 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1502143 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1487614 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1339944 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317155 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341683 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1084790 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.6192 0.00168 0.580 0.000 0.420
#> SRR1332588 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1471157 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR661028 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4605 0.85530 0.204 0.000 0.796
#> SRR1358435 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.1163 0.86540 0.028 0.000 0.972
#> SRR1416386 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0747 0.97218 0.984 0.000 0.016
#> SRR1358082 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.4931 0.61767 0.768 0.000 0.232
#> SRR655194 3 0.6168 0.54750 0.412 0.000 0.588
#> SRR1331174 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074289 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.1031 0.96275 0.976 0.000 0.024
#> SRR1395810 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1443507 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR665610 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1347322 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354247 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.4399 0.86860 0.188 0.000 0.812
#> SRR1075273 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 3 0.2959 0.87243 0.100 0.000 0.900
#> SRR1092773 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.0237 0.86065 0.004 0.000 0.996
#> SRR1097688 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099120 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.4121 0.87215 0.168 0.000 0.832
#> SRR1464856 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.0000 0.85934 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075923 2 0.0000 0.99613 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.98998 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 4 0.4103 0.59611 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1436370 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.4817 0.28571 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1355723 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1329744 1 0.4193 0.45000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR657384 1 0.0376 0.61124 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1351190 1 0.4585 0.23640 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.0336 0.78999 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1396017 1 0.0927 0.61569 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1410742 1 0.0779 0.61544 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1435963 1 0.2281 0.61216 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1382416 1 0.4522 0.35843 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1391354 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1087968 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 4 0.4866 0.37366 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1312244 1 0.0921 0.62214 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1325138 4 0.4972 0.24328 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1326821 4 0.2408 0.75085 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1490178 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 4 0.2814 0.72518 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1075707 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465758 4 0.4877 0.36634 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR1414058 4 0.2021 0.75811 0.056 0.000 0.012 0.932
#> SRR1407449 1 0.0469 0.61703 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1436858 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.5631 0.39610 0.700 0.000 0.224 0.076
#> SRR1399069 4 0.1557 0.76928 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1366450 1 0.4103 0.51741 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1396859 1 0.3907 0.50092 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1457176 1 0.0376 0.61124 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1097666 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.4552 0.57860 0.800 0.000 0.072 0.128
#> SRR1080560 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322882 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 4 0.4996 0.17425 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR658152 3 0.4955 0.36039 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1368141 3 0.1792 0.77711 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1440268 1 0.4250 0.43707 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1453725 4 0.3400 0.65988 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 4 0.3649 0.67031 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1477591 1 0.4661 0.38235 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1416049 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.0657 0.78652 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1369052 4 0.4356 0.56836 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1377735 1 0.4804 0.31855 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1331244 1 0.4888 0.12397 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1404531 4 0.3569 0.66220 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1324331 1 0.5000 -0.15457 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1458890 3 0.1302 0.77633 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.2149 0.77334 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 4 0.7761 -0.21474 0.376 0.000 0.236 0.388
#> SRR1385211 1 0.3569 0.56032 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR655241 1 0.1557 0.62781 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR656922 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1361630 3 0.7398 0.42796 0.184 0.000 0.492 0.324
#> SRR1318966 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407087 4 0.1488 0.77439 0.032 0.000 0.012 0.956
#> SRR603212 4 0.0188 0.79073 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1321088 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.3691 0.74890 0.068 0.000 0.856 0.076
#> SRR1332232 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.1824 0.62640 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1457835 1 0.3528 0.57059 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1347123 3 0.4789 0.70684 0.172 0.000 0.772 0.056
#> SRR1465501 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.0000 0.77249 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445064 3 0.5156 0.65415 0.236 0.000 0.720 0.044
#> SRR1452981 1 0.4804 0.20466 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1326708 1 0.4916 0.21452 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1407157 1 0.3942 0.49692 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1365401 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.1411 0.61356 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1077898 1 0.3356 0.58252 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1349080 4 0.0000 0.79127 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0188 0.61304 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432563 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 4 0.0336 0.79191 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1380614 4 0.5000 0.14690 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR812060 4 0.1488 0.77439 0.032 0.000 0.012 0.956
#> SRR602082 4 0.3074 0.70532 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1069490 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.6271 -0.13822 0.492 0.000 0.452 0.056
#> SRR1420710 1 0.4877 0.04721 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR660426 4 0.0469 0.79140 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1416003 3 0.4994 0.27490 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR661064 1 0.2760 0.59434 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 4 0.3873 0.62878 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1353243 1 0.4761 0.33657 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1455482 4 0.4804 0.36783 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1313473 4 0.4830 0.35354 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1399394 4 0.4925 0.12679 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1102467 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1317470 1 0.6273 -0.14765 0.488 0.000 0.456 0.056
#> SRR1337707 3 0.0188 0.77224 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0188 0.99269 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1398013 1 0.4843 0.08054 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1352918 1 0.0804 0.61391 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1420750 1 0.2814 0.60228 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1071785 3 0.2011 0.77517 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.4250 0.56764 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1366560 1 0.3942 0.49692 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1355684 4 0.3649 0.65385 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1323289 3 0.5132 0.18572 0.004 0.448 0.548 0.000
#> SRR1313494 1 0.1792 0.62284 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1309985 4 0.4977 0.25079 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR607911 4 0.2973 0.71251 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1333789 1 0.4643 0.38862 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1400078 1 0.4877 0.04721 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615575 4 0.7855 -0.27326 0.284 0.000 0.320 0.396
#> SRR1079434 4 0.4633 0.63809 0.048 0.000 0.172 0.780
#> SRR1325559 1 0.0376 0.61124 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1446695 1 0.6421 0.09297 0.556 0.000 0.368 0.076
#> SRR1383883 1 0.4907 0.09908 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1396100 1 0.3975 0.39474 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1475697 3 0.3377 0.69557 0.140 0.000 0.848 0.012
#> SRR1488067 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410380 3 0.6438 0.24322 0.436 0.000 0.496 0.068
#> SRR1445490 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.4431 0.29194 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1485812 3 0.0895 0.77738 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR1078020 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 4 0.3123 0.70247 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1376406 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0188 0.77115 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR807775 3 0.6634 0.53131 0.116 0.000 0.592 0.292
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.4933 -0.02774 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1100656 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362159 4 0.4790 0.37658 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1414536 1 0.7789 -0.10453 0.400 0.000 0.352 0.248
#> SRR656794 1 0.2345 0.61265 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR604653 4 0.0336 0.79191 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1317685 3 0.0000 0.77249 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.4337 0.50909 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR1407602 3 0.0336 0.77151 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1356164 4 0.1557 0.76740 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1328692 1 0.0524 0.60882 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1362438 1 0.4008 0.51797 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1479216 3 0.2334 0.77393 0.088 0.000 0.908 0.004
#> SRR1358041 1 0.0376 0.61124 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1468766 4 0.0000 0.79127 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368200 1 0.5901 -0.06217 0.532 0.000 0.432 0.036
#> SRR1435602 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.0188 0.77115 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1437256 3 0.1557 0.77786 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1487446 1 0.4431 0.29194 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR816653 1 0.2408 0.61335 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR815164 4 0.2647 0.73780 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1442043 1 0.2408 0.60909 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1410573 1 0.4877 0.25905 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 4 0.1677 0.76966 0.040 0.000 0.012 0.948
#> SRR1382934 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1465208 1 0.4304 0.43094 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1314728 1 0.6121 0.03773 0.552 0.000 0.396 0.052
#> SRR1470291 1 0.4304 0.43361 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1308756 3 0.7922 0.15566 0.340 0.000 0.340 0.320
#> SRR1409600 1 0.5690 0.33250 0.672 0.000 0.268 0.060
#> SRR816123 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614779 4 0.3108 0.69238 0.112 0.000 0.016 0.872
#> SRR810783 4 0.4967 0.06759 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1333990 1 0.3907 0.50092 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1410356 4 0.0469 0.79059 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR808106 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR662713 4 0.0188 0.79073 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1447058 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 4 0.1356 0.77625 0.032 0.000 0.008 0.960
#> SRR809382 3 0.0817 0.77731 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR665417 4 0.4164 0.59721 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1088016 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1413787 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1478207 3 0.6729 0.50873 0.116 0.000 0.572 0.312
#> SRR1411046 1 0.2081 0.61773 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1313711 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4776 0.22213 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1309051 4 0.4804 0.36783 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1486949 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 4 0.4164 0.60090 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1074956 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817210 4 0.1677 0.76995 0.040 0.000 0.012 0.948
#> SRR1319221 2 0.3710 0.73495 0.004 0.804 0.192 0.000
#> SRR1405413 1 0.1356 0.61008 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR607807 4 0.3528 0.67917 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1390160 3 0.4452 0.72098 0.156 0.000 0.796 0.048
#> SRR1406283 1 0.4989 0.12644 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1357709 4 0.4222 0.55860 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1080742 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.3873 0.50444 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1312766 1 0.4605 0.40322 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1361612 1 0.1637 0.62631 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1311224 4 0.0707 0.79138 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1087801 4 0.0000 0.79127 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099720 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.4907 0.01080 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332879 1 0.4382 0.46288 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1403177 2 0.4950 0.33828 0.004 0.620 0.376 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500006 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1485678 1 0.0188 0.61304 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1092232 3 0.0000 0.77249 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344253 4 0.4188 0.56432 0.244 0.000 0.004 0.752
#> SRR1384290 1 0.4661 0.29229 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1089349 4 0.2542 0.72991 0.084 0.000 0.012 0.904
#> SRR1343522 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.4941 0.38113 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR818372 1 0.4967 -0.09143 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.5865 0.04818 0.552 0.000 0.412 0.036
#> SRR1310031 3 0.6627 0.52311 0.112 0.000 0.588 0.300
#> SRR615419 3 0.1716 0.77729 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1436925 1 0.2704 0.60747 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1477238 4 0.4804 0.41617 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1332566 1 0.4855 0.15945 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1490228 3 0.6602 0.40635 0.356 0.000 0.552 0.092
#> SRR1442949 3 0.4817 0.44931 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1466239 1 0.3801 0.51514 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.2081 0.61687 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR813076 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.4817 0.32425 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1485976 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.2466 0.77117 0.096 0.000 0.900 0.004
#> SRR660522 1 0.7625 0.08132 0.472 0.000 0.252 0.276
#> SRR815374 1 0.3668 0.46234 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR1069564 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416337 4 0.7892 -0.27159 0.340 0.000 0.292 0.368
#> SRR1316438 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1386844 1 0.4250 0.43651 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1373718 4 0.3907 0.63562 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1447458 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.4072 0.48287 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1441421 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4564 0.41182 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1335489 1 0.2973 0.58308 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1393404 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 4 0.0336 0.79191 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1401815 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1071337 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.2334 0.77393 0.088 0.000 0.908 0.004
#> SRR1098761 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.1902 0.62529 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR615395 4 0.1940 0.75745 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1479349 1 0.2345 0.61005 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR2165033 1 0.3873 0.41109 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 4 0.4222 0.55147 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1488514 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.4155 0.61226 0.240 0.000 0.004 0.756
#> SRR1379303 1 0.3907 0.50092 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1418516 4 0.3658 0.69229 0.144 0.000 0.020 0.836
#> SRR613174 1 0.7858 -0.03912 0.396 0.000 0.288 0.316
#> SRR1351125 1 0.7890 -0.05559 0.372 0.000 0.292 0.336
#> SRR659157 3 0.0707 0.77320 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1480408 4 0.2081 0.75275 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR657857 4 0.1637 0.76711 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1073317 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.1792 0.76274 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1094168 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.0336 0.77151 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 4 0.2376 0.74083 0.068 0.000 0.016 0.916
#> SRR1466154 4 0.0592 0.79169 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1396944 4 0.3444 0.68770 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1082784 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.3907 0.50092 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR614659 4 0.2281 0.73704 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR659247 1 0.6217 0.37904 0.624 0.000 0.084 0.292
#> SRR1317201 1 0.2814 0.59154 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1473696 1 0.4331 0.47071 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1375842 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1388123 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0376 0.61124 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1345499 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1416693 1 0.4277 0.43114 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1070841 1 0.7752 0.03716 0.436 0.000 0.264 0.300
#> SRR1380910 4 0.3942 0.61935 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1333125 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0188 0.61304 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612659 3 0.5753 0.59651 0.072 0.000 0.680 0.248
#> SRR1447148 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 4 0.0592 0.78947 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1345995 1 0.4697 0.38548 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1071035 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1068808 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.2647 0.60255 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1335355 4 0.4040 0.61647 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR659448 1 0.6223 0.06604 0.556 0.000 0.384 0.060
#> SRR1323558 3 0.3649 0.70731 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1381711 4 0.6031 0.05394 0.420 0.000 0.044 0.536
#> SRR657985 1 0.6957 0.26572 0.580 0.000 0.172 0.248
#> SRR1314810 4 0.4855 0.32988 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1336505 4 0.1388 0.77668 0.028 0.000 0.012 0.960
#> SRR1474095 1 0.5489 0.38038 0.700 0.000 0.240 0.060
#> SRR1363831 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.1716 0.76436 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1074909 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101200 4 0.0188 0.79073 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1075408 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.4500 0.26906 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.3569 0.71245 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 4 0.1716 0.77176 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1380414 1 0.7698 0.08884 0.440 0.000 0.236 0.324
#> SRR1315912 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1075778 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0336 0.76952 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1361195 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 4 0.0336 0.79191 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1477653 1 0.3123 0.58426 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1355475 1 0.7716 0.04482 0.396 0.000 0.224 0.380
#> SRR1360785 1 0.2704 0.59705 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR810437 1 0.4972 -0.10428 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1361860 4 0.5000 0.12491 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1441311 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1457619 1 0.0524 0.60925 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1498529 4 0.4948 0.28751 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1097172 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.3695 0.67231 0.016 0.000 0.828 0.156
#> SRR1399525 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476056 4 0.3311 0.68610 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1075659 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311916 3 0.2334 0.77393 0.088 0.000 0.908 0.004
#> SRR1353353 3 0.0000 0.77249 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073291 1 0.7870 -0.04697 0.388 0.000 0.288 0.324
#> SRR1356227 1 0.4382 0.40287 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1080720 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350304 3 0.4888 0.41928 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR663002 3 0.2868 0.75498 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4877 0.13538 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1347144 3 0.3612 0.75581 0.100 0.000 0.856 0.044
#> SRR1384006 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1499108 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614047 3 0.5864 0.58830 0.264 0.000 0.664 0.072
#> SRR818440 1 0.6147 -0.15185 0.488 0.000 0.464 0.048
#> SRR1337770 1 0.1867 0.62146 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1399413 4 0.0000 0.79127 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.4877 0.04721 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1074041 4 0.2469 0.71253 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1394495 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 4 0.1767 0.76715 0.044 0.000 0.012 0.944
#> SRR816699 1 0.7738 0.06191 0.424 0.000 0.240 0.336
#> SRR1308612 1 0.7851 -0.02620 0.396 0.000 0.280 0.324
#> SRR1499418 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1352894 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1331083 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808272 1 0.7873 -0.05100 0.388 0.000 0.292 0.320
#> SRR1436698 1 0.3486 0.55934 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1095627 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.5386 0.38759 0.708 0.000 0.236 0.056
#> SRR1351236 4 0.4830 0.34921 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1077479 4 0.0336 0.79187 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR814491 1 0.4382 0.30648 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 4 0.0336 0.79191 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1309534 1 0.4401 0.35603 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR615527 3 0.3311 0.65064 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1098216 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1325847 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404003 4 0.0188 0.79073 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1344166 4 0.0336 0.79191 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1368638 1 0.4643 0.21037 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.4713 0.50297 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR1502143 1 0.7626 0.11686 0.448 0.000 0.216 0.336
#> SRR1487614 3 0.1792 0.77711 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 4 0.0817 0.79002 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1099212 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.4406 0.46371 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1476547 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656421 1 0.3311 0.56388 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1086116 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.4877 0.04721 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.0376 0.78981 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1431847 3 0.0469 0.77043 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1317155 4 0.3172 0.68984 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1477405 4 0.4961 0.19902 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR655289 4 0.3528 0.62519 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1341683 3 0.4857 0.62008 0.284 0.000 0.700 0.016
#> SRR1084790 4 0.0469 0.79195 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1073731 4 0.2101 0.75492 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1332588 1 0.4907 0.01034 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.6290 0.11599 0.568 0.000 0.364 0.068
#> SRR661028 1 0.4730 0.36002 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1413477 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.7081 -0.00818 0.484 0.000 0.388 0.128
#> SRR1358435 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.4585 0.32806 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1379014 4 0.4585 0.50177 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1489904 3 0.4956 0.69030 0.188 0.000 0.756 0.056
#> SRR1416386 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.2408 0.60759 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR606982 4 0.0336 0.78908 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1358082 4 0.4804 0.36783 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1312934 4 0.1677 0.76943 0.040 0.000 0.012 0.948
#> SRR655194 1 0.0376 0.61124 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1331174 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.0188 0.99269 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1074289 4 0.0188 0.79073 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 4 0.1576 0.77107 0.004 0.000 0.048 0.948
#> SRR1395810 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.7476 0.32257 0.176 0.000 0.416 0.408
#> SRR1443507 4 0.4605 0.37617 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1452310 1 0.4877 0.04721 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR665610 1 0.4564 0.24158 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1347322 1 0.4866 0.26927 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR813395 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.3942 0.49692 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1470230 3 0.1211 0.77706 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1354247 4 0.0188 0.79200 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1082640 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 4 0.1389 0.77307 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1352299 4 0.0469 0.79140 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1076317 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.7448 0.17368 0.400 0.000 0.428 0.172
#> SRR1075273 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658657 3 0.4972 0.33910 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1092773 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.2530 0.60718 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR615958 3 0.4513 0.72686 0.120 0.000 0.804 0.076
#> SRR1097688 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403259 3 0.0188 0.77274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099120 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362200 3 0.7806 0.31518 0.264 0.000 0.412 0.324
#> SRR1464856 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.6383 0.54581 0.096 0.000 0.612 0.292
#> SRR1075923 2 0.0000 0.99608 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100703 4 0.4564 0.37047 0.328 0.000 0.000 0.672
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 4 0.5336 0.42635 0.288 0.000 0.084 0.628 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1397949 1 0.6603 0.04080 0.396 0.000 0.212 0.392 0.000
#> SRR1355723 4 0.3300 0.65573 0.140 0.000 0.012 0.836 0.012
#> SRR1329744 1 0.2740 0.73389 0.876 0.000 0.028 0.096 0.000
#> SRR657384 3 0.4101 0.52179 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000
#> SRR1351190 3 0.4830 0.61124 0.256 0.000 0.684 0.000 0.060
#> SRR1458662 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.2423 0.69405 0.024 0.000 0.080 0.896 0.000
#> SRR1396017 3 0.4718 0.38901 0.444 0.000 0.540 0.000 0.016
#> SRR1410742 3 0.4689 0.42895 0.424 0.000 0.560 0.000 0.016
#> SRR1435963 1 0.3944 0.55664 0.768 0.000 0.200 0.032 0.000
#> SRR1382416 1 0.3612 0.72259 0.800 0.000 0.028 0.172 0.000
#> SRR1391354 4 0.2605 0.66386 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.4114 0.51663 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1312244 1 0.3366 0.49103 0.768 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.4958 0.38256 0.592 0.000 0.036 0.372 0.000
#> SRR1326821 4 0.5002 0.21347 0.364 0.000 0.040 0.596 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 4 0.4446 0.12012 0.400 0.000 0.008 0.592 0.000
#> SRR1075707 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1443871 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1465758 1 0.3895 0.59747 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1414058 4 0.4354 0.58437 0.020 0.000 0.252 0.720 0.008
#> SRR1407449 3 0.4305 0.30467 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.3410 0.63283 0.068 0.000 0.840 0.092 0.000
#> SRR1399069 4 0.3013 0.64671 0.160 0.000 0.008 0.832 0.000
#> SRR1366450 3 0.6779 0.05939 0.284 0.000 0.384 0.332 0.000
#> SRR1396859 1 0.2850 0.73403 0.872 0.000 0.036 0.092 0.000
#> SRR1457176 3 0.4416 0.52952 0.356 0.000 0.632 0.012 0.000
#> SRR1097666 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1434736 1 0.5332 0.58785 0.728 0.000 0.148 0.068 0.056
#> SRR1080560 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1322882 4 0.2629 0.66909 0.136 0.000 0.004 0.860 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.3586 0.65753 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR658152 3 0.5408 0.53180 0.156 0.000 0.664 0.000 0.180
#> SRR1368141 5 0.2488 0.84552 0.004 0.000 0.124 0.000 0.872
#> SRR1440268 1 0.2707 0.73462 0.876 0.000 0.024 0.100 0.000
#> SRR1453725 4 0.4817 0.55522 0.056 0.000 0.264 0.680 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 4 0.4171 0.16777 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1477591 1 0.5016 0.66154 0.704 0.000 0.120 0.176 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.2424 0.69880 0.052 0.000 0.032 0.908 0.008
#> SRR1369052 1 0.4367 0.50848 0.620 0.000 0.008 0.372 0.000
#> SRR1377735 1 0.4649 0.66619 0.716 0.000 0.064 0.220 0.000
#> SRR1331244 1 0.3596 0.70662 0.784 0.000 0.016 0.200 0.000
#> SRR1404531 1 0.4888 0.28511 0.508 0.000 0.016 0.472 0.004
#> SRR1324331 1 0.3480 0.66976 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1458890 5 0.2488 0.84300 0.004 0.000 0.124 0.000 0.872
#> SRR1432695 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 5 0.4658 0.19001 0.000 0.000 0.484 0.012 0.504
#> SRR1087393 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.4865 0.33174 0.008 0.000 0.616 0.356 0.020
#> SRR1385211 1 0.4020 0.71417 0.796 0.000 0.096 0.108 0.000
#> SRR655241 1 0.3480 0.46525 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR656922 4 0.2629 0.67073 0.136 0.000 0.004 0.860 0.000
#> SRR1361630 3 0.5834 0.00184 0.004 0.000 0.472 0.444 0.080
#> SRR1318966 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1407087 4 0.3716 0.65692 0.020 0.000 0.172 0.800 0.008
#> SRR603212 4 0.1502 0.69818 0.056 0.000 0.004 0.940 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 5 0.6158 0.55922 0.016 0.000 0.280 0.120 0.584
#> SRR1332232 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.4348 0.32132 0.668 0.000 0.316 0.016 0.000
#> SRR1457835 1 0.5405 0.60308 0.660 0.000 0.204 0.136 0.000
#> SRR1347123 3 0.5207 0.35484 0.008 0.000 0.664 0.064 0.264
#> SRR1465501 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1330878 5 0.1544 0.86666 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1445064 3 0.5704 0.51583 0.028 0.000 0.680 0.116 0.176
#> SRR1452981 1 0.3488 0.71377 0.808 0.000 0.024 0.168 0.000
#> SRR1326708 1 0.5289 0.59675 0.652 0.000 0.096 0.252 0.000
#> SRR1407157 1 0.2879 0.73618 0.868 0.000 0.032 0.100 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.4666 0.45104 0.412 0.000 0.572 0.000 0.016
#> SRR1077898 1 0.5500 0.59305 0.640 0.000 0.236 0.124 0.000
#> SRR1349080 4 0.2756 0.67473 0.096 0.000 0.012 0.880 0.012
#> SRR1076096 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1375485 1 0.3890 0.45213 0.736 0.000 0.252 0.012 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 4 0.2753 0.67125 0.136 0.000 0.008 0.856 0.000
#> SRR1380614 1 0.4604 0.63080 0.680 0.000 0.016 0.292 0.012
#> SRR812060 4 0.3864 0.64669 0.020 0.000 0.188 0.784 0.008
#> SRR602082 4 0.4273 -0.07317 0.448 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1069490 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1078417 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.3497 0.61721 0.028 0.000 0.856 0.052 0.064
#> SRR1420710 3 0.4674 0.61677 0.232 0.000 0.708 0.000 0.060
#> SRR660426 4 0.3819 0.56810 0.228 0.000 0.016 0.756 0.000
#> SRR1416003 3 0.4479 0.61150 0.184 0.000 0.744 0.000 0.072
#> SRR661064 1 0.4100 0.57164 0.764 0.000 0.192 0.044 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.4758 0.40003 0.552 0.000 0.012 0.432 0.004
#> SRR1353243 1 0.5329 0.62662 0.672 0.000 0.144 0.184 0.000
#> SRR1455482 1 0.4283 0.55933 0.644 0.000 0.008 0.348 0.000
#> SRR1313473 1 0.4268 0.56541 0.648 0.000 0.008 0.344 0.000
#> SRR1399394 4 0.5274 0.41675 0.064 0.000 0.336 0.600 0.000
#> SRR1102467 4 0.2561 0.66641 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1317470 3 0.3584 0.61972 0.040 0.000 0.852 0.040 0.068
#> SRR1337707 5 0.1732 0.86201 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1408752 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.4172 0.81165 0.088 0.824 0.052 0.016 0.020
#> SRR1398013 3 0.4946 0.59390 0.276 0.000 0.664 0.000 0.060
#> SRR1352918 3 0.4682 0.43638 0.420 0.000 0.564 0.000 0.016
#> SRR1420750 1 0.5773 0.35921 0.544 0.000 0.356 0.100 0.000
#> SRR1071785 5 0.3053 0.80887 0.008 0.000 0.164 0.000 0.828
#> SRR1353618 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.5224 0.45080 0.276 0.000 0.080 0.644 0.000
#> SRR1366560 1 0.2879 0.73618 0.868 0.000 0.032 0.100 0.000
#> SRR1355684 1 0.4283 0.36060 0.544 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1323289 5 0.6464 0.66539 0.092 0.136 0.088 0.016 0.668
#> SRR1313494 1 0.4642 0.35815 0.660 0.000 0.308 0.032 0.000
#> SRR1309985 1 0.3395 0.67465 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR607911 4 0.4235 0.03896 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1333789 3 0.5192 0.48261 0.076 0.000 0.644 0.280 0.000
#> SRR1400078 3 0.4898 0.60582 0.248 0.000 0.684 0.000 0.068
#> SRR1088631 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR615575 4 0.5178 0.15883 0.004 0.000 0.448 0.516 0.032
#> SRR1079434 4 0.5339 0.55082 0.008 0.000 0.172 0.692 0.128
#> SRR1325559 3 0.4171 0.48688 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.3033 0.62850 0.052 0.000 0.864 0.084 0.000
#> SRR1383883 1 0.3039 0.71030 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1396100 3 0.5104 0.56707 0.308 0.000 0.632 0.000 0.060
#> SRR1475697 5 0.5303 0.70309 0.104 0.000 0.132 0.036 0.728
#> SRR1488067 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1102103 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1084991 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1410380 3 0.3137 0.61237 0.024 0.000 0.872 0.076 0.028
#> SRR1445490 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.4983 0.61210 0.256 0.000 0.680 0.004 0.060
#> SRR1485812 5 0.2351 0.86450 0.000 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR1078020 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 4 0.4287 -0.11194 0.460 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.1774 0.85403 0.016 0.000 0.052 0.000 0.932
#> SRR807775 4 0.5971 0.17385 0.000 0.000 0.396 0.492 0.112
#> SRR1409215 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.4618 0.61196 0.208 0.000 0.724 0.000 0.068
#> SRR1100656 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1362159 1 0.4387 0.55762 0.640 0.000 0.012 0.348 0.000
#> SRR1414536 3 0.4109 0.55598 0.012 0.000 0.764 0.204 0.020
#> SRR656794 1 0.5449 0.47325 0.632 0.000 0.264 0.104 0.000
#> SRR604653 4 0.3196 0.61816 0.192 0.000 0.004 0.804 0.000
#> SRR1317685 5 0.1704 0.86669 0.000 0.000 0.068 0.004 0.928
#> SRR1485912 3 0.3794 0.63923 0.152 0.000 0.800 0.048 0.000
#> SRR1407602 5 0.1608 0.86299 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1356164 4 0.3964 0.63987 0.120 0.000 0.012 0.812 0.056
#> SRR1328692 3 0.5117 0.52775 0.348 0.000 0.612 0.024 0.016
#> SRR1362438 1 0.5638 0.56841 0.636 0.000 0.192 0.172 0.000
#> SRR1479216 5 0.4655 0.58958 0.000 0.000 0.328 0.028 0.644
#> SRR1358041 3 0.4380 0.51280 0.376 0.000 0.616 0.008 0.000
#> SRR1468766 4 0.2116 0.69714 0.076 0.000 0.008 0.912 0.004
#> SRR1368200 3 0.3818 0.63345 0.076 0.000 0.836 0.028 0.060
#> SRR1435602 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.1670 0.85541 0.012 0.000 0.052 0.000 0.936
#> SRR1437256 5 0.2233 0.85443 0.004 0.000 0.104 0.000 0.892
#> SRR1487446 3 0.4967 0.59222 0.280 0.000 0.660 0.000 0.060
#> SRR816653 1 0.4155 0.68927 0.780 0.000 0.144 0.076 0.000
#> SRR815164 4 0.5142 0.53128 0.244 0.000 0.088 0.668 0.000
#> SRR1442043 1 0.4240 0.39037 0.700 0.000 0.284 0.012 0.004
#> SRR1410573 1 0.4313 0.67136 0.732 0.000 0.040 0.228 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 4 0.4001 0.63185 0.020 0.000 0.204 0.768 0.008
#> SRR1382934 5 0.1671 0.86650 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1465208 1 0.2951 0.73643 0.860 0.000 0.028 0.112 0.000
#> SRR1314728 3 0.3821 0.62636 0.056 0.000 0.840 0.048 0.056
#> SRR1470291 1 0.3452 0.73283 0.820 0.000 0.032 0.148 0.000
#> SRR1308756 3 0.4946 0.37713 0.012 0.000 0.636 0.328 0.024
#> SRR1409600 3 0.2871 0.64364 0.088 0.000 0.872 0.040 0.000
#> SRR816123 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR614779 4 0.4625 0.46933 0.004 0.000 0.324 0.652 0.020
#> SRR810783 3 0.4946 0.31723 0.036 0.000 0.596 0.368 0.000
#> SRR1333990 1 0.2850 0.73403 0.872 0.000 0.036 0.092 0.000
#> SRR1410356 4 0.3193 0.67773 0.028 0.000 0.132 0.840 0.000
#> SRR808106 4 0.3067 0.65644 0.120 0.000 0.012 0.856 0.012
#> SRR662713 4 0.1697 0.69829 0.060 0.000 0.008 0.932 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 4 0.3106 0.68447 0.020 0.000 0.116 0.856 0.008
#> SRR809382 5 0.1851 0.86482 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR665417 4 0.4437 -0.03504 0.464 0.000 0.004 0.532 0.000
#> SRR1088016 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1453166 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1069826 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 5 0.1965 0.85841 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1413787 5 0.1671 0.86650 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1478207 4 0.5793 0.27859 0.000 0.000 0.364 0.536 0.100
#> SRR1411046 1 0.3659 0.51837 0.768 0.000 0.220 0.012 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.3194 0.72710 0.832 0.000 0.020 0.148 0.000
#> SRR1309051 1 0.4416 0.54706 0.632 0.000 0.012 0.356 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.4227 0.42534 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1074956 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1092961 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR817210 4 0.4097 0.62013 0.020 0.000 0.216 0.756 0.008
#> SRR1319221 5 0.7235 0.44610 0.092 0.308 0.064 0.016 0.520
#> SRR1405413 3 0.4484 0.56296 0.308 0.000 0.668 0.024 0.000
#> SRR607807 4 0.4871 -0.04055 0.432 0.000 0.012 0.548 0.008
#> SRR1390160 3 0.5140 0.31603 0.008 0.000 0.624 0.040 0.328
#> SRR1406283 1 0.6775 0.01826 0.376 0.000 0.276 0.348 0.000
#> SRR1357709 4 0.5378 0.25886 0.392 0.000 0.060 0.548 0.000
#> SRR1080742 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1468208 1 0.2632 0.72735 0.888 0.000 0.040 0.072 0.000
#> SRR1312766 3 0.5180 0.41824 0.064 0.000 0.624 0.312 0.000
#> SRR1361612 1 0.3659 0.51837 0.768 0.000 0.220 0.012 0.000
#> SRR1311224 4 0.4139 0.66709 0.132 0.000 0.084 0.784 0.000
#> SRR1087801 4 0.1671 0.69373 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1099720 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1350912 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.4415 0.61903 0.160 0.000 0.768 0.008 0.064
#> SRR1074980 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 5 0.1671 0.86650 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1332879 1 0.5229 0.63905 0.684 0.000 0.144 0.172 0.000
#> SRR1403177 5 0.7494 0.41566 0.092 0.332 0.080 0.016 0.480
#> SRR1076144 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR818239 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1421069 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1500006 4 0.2848 0.65569 0.156 0.000 0.004 0.840 0.000
#> SRR1485678 3 0.4624 0.56343 0.340 0.000 0.636 0.024 0.000
#> SRR1092232 5 0.1478 0.86586 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1344253 4 0.5243 0.44029 0.040 0.000 0.328 0.620 0.012
#> SRR1384290 1 0.3319 0.72616 0.820 0.000 0.020 0.160 0.000
#> SRR1089349 4 0.4483 0.50725 0.012 0.000 0.308 0.672 0.008
#> SRR1343522 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.4936 0.58361 0.172 0.000 0.712 0.000 0.116
#> SRR818372 3 0.4431 0.61987 0.168 0.000 0.760 0.004 0.068
#> SRR1323675 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 3 0.5360 0.62056 0.244 0.000 0.676 0.028 0.052
#> SRR1310031 4 0.5908 0.22287 0.000 0.000 0.380 0.512 0.108
#> SRR615419 5 0.2338 0.84920 0.004 0.000 0.112 0.000 0.884
#> SRR1436925 3 0.6468 0.31474 0.360 0.000 0.452 0.188 0.000
#> SRR1477238 1 0.4354 0.52268 0.624 0.000 0.008 0.368 0.000
#> SRR1332566 1 0.3242 0.72109 0.816 0.000 0.012 0.172 0.000
#> SRR1490228 3 0.4818 0.49303 0.020 0.000 0.700 0.252 0.028
#> SRR1442949 3 0.5312 0.49247 0.124 0.000 0.668 0.000 0.208
#> SRR1466239 1 0.2871 0.73332 0.872 0.000 0.040 0.088 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 3 0.5703 0.14339 0.408 0.000 0.508 0.084 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0162 0.98678 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.5538 0.10377 0.068 0.000 0.504 0.428 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.5042 -0.17288 0.000 0.000 0.508 0.032 0.460
#> SRR660522 3 0.4487 0.56710 0.032 0.000 0.752 0.196 0.020
#> SRR815374 3 0.3992 0.60982 0.280 0.000 0.712 0.004 0.004
#> SRR1069564 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1416337 3 0.5255 -0.00701 0.004 0.000 0.496 0.464 0.036
#> SRR1316438 5 0.2521 0.85459 0.008 0.000 0.068 0.024 0.900
#> SRR1386844 1 0.2773 0.73465 0.868 0.000 0.020 0.112 0.000
#> SRR1373718 1 0.4283 0.34834 0.544 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.3309 0.73618 0.836 0.000 0.036 0.128 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4573 0.69585 0.744 0.000 0.092 0.164 0.000
#> SRR1335489 1 0.3970 0.61995 0.788 0.000 0.156 0.056 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 4 0.3048 0.63451 0.176 0.000 0.004 0.820 0.000
#> SRR1401815 5 0.1544 0.86666 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1071337 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 5 0.4731 0.58559 0.000 0.000 0.328 0.032 0.640
#> SRR1098761 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1312124 3 0.4830 0.25093 0.488 0.000 0.492 0.020 0.000
#> SRR615395 4 0.4572 0.55173 0.036 0.000 0.280 0.684 0.000
#> SRR1479349 1 0.3929 0.54415 0.764 0.000 0.208 0.028 0.000
#> SRR2165033 3 0.4920 0.57199 0.308 0.000 0.644 0.000 0.048
#> SRR1089054 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 4 0.5787 0.52483 0.180 0.000 0.204 0.616 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.5301 0.46536 0.272 0.000 0.076 0.648 0.004
#> SRR1379303 1 0.2927 0.73444 0.868 0.000 0.040 0.092 0.000
#> SRR1418516 4 0.4444 0.60614 0.172 0.000 0.052 0.764 0.012
#> SRR613174 3 0.4460 0.50072 0.012 0.000 0.716 0.252 0.020
#> SRR1351125 3 0.4819 0.33951 0.004 0.000 0.620 0.352 0.024
#> SRR659157 5 0.2513 0.84360 0.008 0.000 0.116 0.000 0.876
#> SRR1480408 4 0.3039 0.63056 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR657857 4 0.3344 0.64092 0.144 0.000 0.012 0.832 0.012
#> SRR1073317 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.3109 0.62341 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1094168 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1431270 5 0.1608 0.86299 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1085614 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 4 0.3219 0.67328 0.004 0.000 0.136 0.840 0.020
#> SRR1466154 4 0.4297 0.64786 0.164 0.000 0.072 0.764 0.000
#> SRR1396944 4 0.4415 0.16373 0.388 0.000 0.008 0.604 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.2905 0.73485 0.868 0.000 0.036 0.096 0.000
#> SRR614659 4 0.4086 0.60268 0.024 0.000 0.240 0.736 0.000
#> SRR659247 3 0.4584 0.54530 0.056 0.000 0.716 0.228 0.000
#> SRR1317201 1 0.3921 0.66184 0.800 0.000 0.128 0.072 0.000
#> SRR1473696 1 0.5334 0.62266 0.672 0.000 0.148 0.180 0.000
#> SRR1375842 4 0.2763 0.66254 0.148 0.000 0.004 0.848 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1453662 3 0.4166 0.54967 0.348 0.000 0.648 0.000 0.004
#> SRR1345499 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 4 0.2583 0.67342 0.132 0.000 0.004 0.864 0.000
#> SRR1416693 1 0.2773 0.73465 0.868 0.000 0.020 0.112 0.000
#> SRR1070841 3 0.4453 0.54928 0.024 0.000 0.744 0.212 0.020
#> SRR1380910 1 0.4256 0.40554 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 3 0.4517 0.42325 0.436 0.000 0.556 0.008 0.000
#> SRR612659 4 0.6478 0.23192 0.000 0.000 0.292 0.488 0.220
#> SRR1447148 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1089595 2 0.0162 0.98678 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 4 0.3769 0.65808 0.032 0.000 0.180 0.788 0.000
#> SRR1345995 3 0.5373 0.42843 0.084 0.000 0.620 0.296 0.000
#> SRR1071035 4 0.2329 0.67838 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1068808 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1332754 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.3641 0.68498 0.820 0.000 0.120 0.060 0.000
#> SRR1335355 1 0.4256 0.40262 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR659448 3 0.2853 0.63122 0.052 0.000 0.876 0.072 0.000
#> SRR1323558 3 0.4065 0.42640 0.000 0.000 0.720 0.016 0.264
#> SRR1381711 3 0.4779 0.27205 0.024 0.000 0.588 0.388 0.000
#> SRR657985 3 0.3904 0.61210 0.052 0.000 0.792 0.156 0.000
#> SRR1314810 1 0.4965 0.58228 0.644 0.000 0.052 0.304 0.000
#> SRR1336505 4 0.3077 0.68935 0.028 0.000 0.100 0.864 0.008
#> SRR1474095 3 0.3234 0.63933 0.084 0.000 0.852 0.064 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.2773 0.65127 0.164 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1074909 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1101200 4 0.2278 0.69684 0.032 0.000 0.060 0.908 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.4988 0.58799 0.284 0.000 0.656 0.000 0.060
#> SRR1313406 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4404 0.41551 0.000 0.000 0.704 0.032 0.264
#> SRR1084867 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1380184 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 4 0.5167 0.51231 0.248 0.000 0.088 0.664 0.000
#> SRR1380414 3 0.4675 0.50068 0.020 0.000 0.704 0.256 0.020
#> SRR1315912 4 0.2753 0.67071 0.136 0.000 0.008 0.856 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 5 0.2423 0.86403 0.000 0.000 0.080 0.024 0.896
#> SRR1361195 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 4 0.3197 0.67105 0.140 0.000 0.024 0.836 0.000
#> SRR1477653 3 0.5013 0.57440 0.108 0.000 0.700 0.192 0.000
#> SRR1355475 3 0.5061 0.24427 0.012 0.000 0.580 0.388 0.020
#> SRR1360785 1 0.3650 0.58660 0.796 0.000 0.176 0.028 0.000
#> SRR810437 3 0.4674 0.61677 0.232 0.000 0.708 0.000 0.060
#> SRR1361860 1 0.4114 0.63132 0.732 0.000 0.024 0.244 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.2280 0.68027 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1457619 3 0.4299 0.49762 0.388 0.000 0.608 0.000 0.004
#> SRR1498529 1 0.4555 0.51123 0.636 0.000 0.020 0.344 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 5 0.4011 0.79958 0.008 0.000 0.112 0.072 0.808
#> SRR1399525 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1312844 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1085874 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1101226 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1476056 4 0.4045 0.35999 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1075659 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1311916 5 0.4671 0.58584 0.000 0.000 0.332 0.028 0.640
#> SRR1353353 5 0.1830 0.86670 0.000 0.000 0.068 0.008 0.924
#> SRR1073291 3 0.4968 0.32090 0.012 0.000 0.612 0.356 0.020
#> SRR1356227 1 0.2773 0.73465 0.868 0.000 0.020 0.112 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1350304 3 0.5414 0.50185 0.140 0.000 0.660 0.000 0.200
#> SRR663002 3 0.5198 0.14973 0.020 0.000 0.588 0.020 0.372
#> SRR1376983 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.3209 0.71706 0.812 0.000 0.008 0.180 0.000
#> SRR1347144 3 0.5286 -0.14679 0.000 0.000 0.504 0.048 0.448
#> SRR1384006 4 0.2852 0.64246 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1499108 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR614047 3 0.4233 0.55136 0.008 0.000 0.792 0.116 0.084
#> SRR818440 3 0.3698 0.61742 0.028 0.000 0.844 0.064 0.064
#> SRR1337770 1 0.4442 0.41011 0.688 0.000 0.284 0.028 0.000
#> SRR1399413 4 0.1943 0.70004 0.056 0.000 0.020 0.924 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.4646 0.61768 0.228 0.000 0.712 0.000 0.060
#> SRR1074041 4 0.4270 0.49434 0.012 0.000 0.320 0.668 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 4 0.4128 0.61595 0.020 0.000 0.220 0.752 0.008
#> SRR816699 3 0.4974 0.37345 0.016 0.000 0.632 0.332 0.020
#> SRR1308612 3 0.4807 0.35902 0.008 0.000 0.632 0.340 0.020
#> SRR1499418 5 0.1851 0.86513 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1352894 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 4 0.3067 0.65902 0.120 0.000 0.012 0.856 0.012
#> SRR1331083 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR808272 3 0.4862 0.37945 0.012 0.000 0.640 0.328 0.020
#> SRR1436698 3 0.6747 -0.00998 0.364 0.000 0.376 0.260 0.000
#> SRR1095627 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1357672 3 0.3037 0.64588 0.100 0.000 0.860 0.040 0.000
#> SRR1351236 1 0.5252 0.54136 0.616 0.000 0.068 0.316 0.000
#> SRR1077479 4 0.3835 0.49180 0.260 0.000 0.008 0.732 0.000
#> SRR814491 3 0.5180 0.55874 0.312 0.000 0.624 0.000 0.064
#> SRR1101256 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 4 0.3081 0.66035 0.156 0.000 0.012 0.832 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.2605 0.66386 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1309534 3 0.5920 0.54310 0.312 0.000 0.592 0.024 0.072
#> SRR615527 5 0.2916 0.83730 0.008 0.000 0.072 0.040 0.880
#> SRR1098216 4 0.2605 0.66386 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1325847 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1404003 4 0.1732 0.69263 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1344166 4 0.2763 0.66547 0.148 0.000 0.004 0.848 0.000
#> SRR1368638 3 0.5218 0.55908 0.308 0.000 0.624 0.000 0.068
#> SRR1431429 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1080509 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.3786 0.49810 0.016 0.000 0.776 0.004 0.204
#> SRR1502143 3 0.4609 0.49481 0.016 0.000 0.704 0.260 0.020
#> SRR1487614 5 0.3053 0.80892 0.000 0.000 0.164 0.008 0.828
#> SRR1402307 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 4 0.3301 0.69063 0.080 0.000 0.072 0.848 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.5900 0.53000 0.600 0.000 0.212 0.188 0.000
#> SRR1476547 2 0.0162 0.98678 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR656421 1 0.2813 0.73333 0.876 0.000 0.040 0.084 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.4830 0.60973 0.256 0.000 0.684 0.000 0.060
#> SRR1339944 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.1988 0.69938 0.048 0.000 0.016 0.928 0.008
#> SRR1431847 5 0.2766 0.85098 0.008 0.000 0.084 0.024 0.884
#> SRR1317155 4 0.4846 0.54742 0.212 0.000 0.056 0.720 0.012
#> SRR1477405 1 0.5104 0.55791 0.632 0.000 0.060 0.308 0.000
#> SRR655289 4 0.4645 0.55235 0.044 0.000 0.268 0.688 0.000
#> SRR1341683 3 0.5965 0.55030 0.060 0.000 0.680 0.116 0.144
#> SRR1084790 4 0.3159 0.69014 0.056 0.000 0.088 0.856 0.000
#> SRR1073731 4 0.4065 0.62296 0.020 0.000 0.212 0.760 0.008
#> SRR1332588 3 0.4830 0.60977 0.256 0.000 0.684 0.000 0.060
#> SRR1471157 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.2859 0.63299 0.056 0.000 0.876 0.068 0.000
#> SRR661028 1 0.5116 0.65494 0.692 0.000 0.120 0.188 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.3047 0.62349 0.024 0.000 0.868 0.096 0.012
#> SRR1358435 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR2165273 1 0.3278 0.72730 0.824 0.000 0.020 0.156 0.000
#> SRR1379014 1 0.4380 0.49083 0.616 0.000 0.008 0.376 0.000
#> SRR1489904 3 0.5152 0.42592 0.012 0.000 0.668 0.052 0.268
#> SRR1416386 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1406048 1 0.4168 0.56119 0.756 0.000 0.200 0.044 0.000
#> SRR606982 4 0.2605 0.68292 0.060 0.000 0.016 0.900 0.024
#> SRR1358082 1 0.4196 0.55184 0.640 0.000 0.004 0.356 0.000
#> SRR1312934 4 0.3840 0.64134 0.016 0.000 0.196 0.780 0.008
#> SRR655194 3 0.4341 0.47231 0.404 0.000 0.592 0.000 0.004
#> SRR1331174 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0162 0.98678 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.4172 0.81165 0.088 0.824 0.052 0.016 0.020
#> SRR1074289 4 0.2144 0.69588 0.020 0.000 0.068 0.912 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 4 0.4519 0.66269 0.036 0.000 0.128 0.784 0.052
#> SRR1395810 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 4 0.5271 0.31084 0.004 0.000 0.384 0.568 0.044
#> SRR1443507 4 0.4909 0.28004 0.028 0.000 0.412 0.560 0.000
#> SRR1452310 3 0.4806 0.61076 0.252 0.000 0.688 0.000 0.060
#> SRR665610 3 0.4425 0.62522 0.244 0.000 0.716 0.000 0.040
#> SRR1347322 1 0.4465 0.68657 0.736 0.000 0.060 0.204 0.000
#> SRR813395 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1477256 1 0.2879 0.73618 0.868 0.000 0.032 0.100 0.000
#> SRR1470230 5 0.4287 0.78709 0.032 0.000 0.164 0.024 0.780
#> SRR1354247 4 0.2561 0.66641 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 4 0.4503 0.56801 0.028 0.000 0.268 0.700 0.004
#> SRR1352299 4 0.3366 0.67314 0.140 0.000 0.032 0.828 0.000
#> SRR1076317 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1434117 3 0.3972 0.56925 0.012 0.000 0.780 0.188 0.020
#> SRR1075273 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR658657 3 0.4473 0.58947 0.116 0.000 0.768 0.004 0.112
#> SRR1092773 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1365332 3 0.4657 0.61233 0.108 0.000 0.740 0.152 0.000
#> SRR615958 3 0.5399 0.41015 0.000 0.000 0.664 0.148 0.188
#> SRR1097688 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1403259 5 0.3076 0.85188 0.008 0.000 0.088 0.036 0.868
#> SRR1099120 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1362200 3 0.5271 0.23576 0.004 0.000 0.568 0.384 0.044
#> SRR1464856 2 0.0000 0.98795 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 4 0.6121 0.26799 0.000 0.000 0.324 0.528 0.148
#> SRR1075923 2 0.0955 0.97797 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1100703 4 0.4722 0.39923 0.024 0.000 0.368 0.608 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.6452 0.32460 0.292 0.000 0.072 0.508 0.000 0.128
#> SRR1436370 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1397949 3 0.5907 0.04668 0.352 0.000 0.436 0.212 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.1549 0.70721 0.020 0.000 0.000 0.936 0.000 0.044
#> SRR1329744 1 0.2738 0.53544 0.820 0.000 0.000 0.176 0.000 0.004
#> SRR657384 1 0.6089 -0.54000 0.392 0.000 0.308 0.000 0.000 0.300
#> SRR1351190 1 0.6615 -0.59490 0.332 0.000 0.328 0.000 0.024 0.316
#> SRR1458662 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 4 0.3050 0.56650 0.000 0.000 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.6381 -0.50124 0.436 0.000 0.236 0.008 0.008 0.312
#> SRR1410742 1 0.6431 -0.52001 0.420 0.000 0.252 0.008 0.008 0.312
#> SRR1435963 1 0.2724 0.41818 0.880 0.000 0.032 0.024 0.000 0.064
#> SRR1382416 1 0.4358 0.48445 0.712 0.000 0.000 0.196 0.000 0.092
#> SRR1391354 4 0.1346 0.72301 0.024 0.000 0.016 0.952 0.000 0.008
#> SRR1087968 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.3774 0.24815 0.592 0.000 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.1546 0.47973 0.944 0.000 0.020 0.016 0.000 0.020
#> SRR1325138 4 0.5434 0.10577 0.416 0.000 0.020 0.496 0.000 0.068
#> SRR1326821 4 0.4854 0.45396 0.292 0.000 0.088 0.620 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 4 0.4498 0.43962 0.300 0.000 0.056 0.644 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.3076 0.82052 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1443871 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1465758 1 0.3699 0.37745 0.660 0.000 0.000 0.336 0.000 0.004
#> SRR1414058 3 0.3737 0.27358 0.000 0.000 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.5935 -0.42276 0.492 0.000 0.228 0.004 0.000 0.276
#> SRR1436858 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.1970 0.46238 0.060 0.000 0.912 0.028 0.000 0.000
#> SRR1399069 4 0.1442 0.71352 0.040 0.000 0.004 0.944 0.000 0.012
#> SRR1366450 3 0.5039 0.36252 0.180 0.000 0.640 0.180 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.2527 0.53995 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.5994 -0.49001 0.384 0.000 0.384 0.000 0.000 0.232
#> SRR1097666 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1434736 1 0.3833 0.49004 0.812 0.000 0.004 0.064 0.028 0.092
#> SRR1080560 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1322882 4 0.2365 0.72023 0.040 0.000 0.072 0.888 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.3619 0.40624 0.680 0.000 0.000 0.316 0.000 0.004
#> SRR658152 3 0.7236 -0.61008 0.268 0.000 0.324 0.000 0.088 0.320
#> SRR1368141 5 0.3201 0.71803 0.044 0.000 0.072 0.000 0.852 0.032
#> SRR1440268 1 0.2772 0.53352 0.816 0.000 0.000 0.180 0.000 0.004
#> SRR1453725 3 0.4552 0.27188 0.044 0.000 0.592 0.364 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 4 0.3221 0.51384 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.5058 0.40735 0.636 0.000 0.164 0.200 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 4 0.2668 0.64241 0.000 0.000 0.168 0.828 0.000 0.004
#> SRR1369052 4 0.3857 0.09436 0.468 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.4716 0.43492 0.668 0.000 0.108 0.224 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.3330 0.44739 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000 0.000
#> SRR1404531 4 0.4591 0.25371 0.376 0.000 0.024 0.588 0.000 0.012
#> SRR1324331 1 0.3428 0.42428 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000 0.000
#> SRR1458890 5 0.3286 0.70596 0.044 0.000 0.040 0.000 0.848 0.068
#> SRR1432695 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 5 0.5417 0.22683 0.012 0.000 0.428 0.000 0.480 0.080
#> SRR1087393 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 3 0.2558 0.55101 0.004 0.000 0.840 0.156 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.4154 0.50872 0.744 0.000 0.112 0.144 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.3170 0.36126 0.840 0.000 0.032 0.016 0.000 0.112
#> SRR656922 4 0.1564 0.72744 0.024 0.000 0.040 0.936 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.3133 0.50762 0.000 0.000 0.780 0.212 0.008 0.000
#> SRR1318966 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1407087 3 0.4127 0.06065 0.000 0.000 0.508 0.484 0.004 0.004
#> SRR603212 4 0.2135 0.67784 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 5 0.7259 0.34926 0.012 0.000 0.296 0.056 0.348 0.288
#> SRR1332232 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.5045 0.01423 0.676 0.000 0.132 0.016 0.000 0.176
#> SRR1457835 1 0.4729 0.40034 0.656 0.000 0.248 0.096 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.4106 0.32327 0.024 0.000 0.736 0.000 0.216 0.024
#> SRR1465501 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1330878 5 0.0632 0.76332 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1445064 3 0.6091 0.05950 0.068 0.000 0.608 0.004 0.140 0.180
#> SRR1452981 1 0.4453 0.29094 0.592 0.000 0.000 0.372 0.000 0.036
#> SRR1326708 1 0.5288 0.34414 0.596 0.000 0.164 0.240 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.2848 0.53593 0.816 0.000 0.008 0.176 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.6537 -0.54138 0.404 0.000 0.256 0.008 0.012 0.320
#> SRR1077898 1 0.4760 0.40659 0.668 0.000 0.212 0.120 0.000 0.000
#> SRR1349080 4 0.3809 0.56058 0.000 0.000 0.012 0.716 0.008 0.264
#> SRR1076096 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1375485 1 0.2237 0.43132 0.896 0.000 0.080 0.004 0.000 0.020
#> SRR1432563 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 4 0.2420 0.71859 0.040 0.000 0.076 0.884 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.5667 0.28197 0.528 0.000 0.000 0.208 0.000 0.264
#> SRR812060 3 0.3851 0.12108 0.000 0.000 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR602082 4 0.3711 0.50455 0.260 0.000 0.020 0.720 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1078417 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.5737 -0.09222 0.128 0.000 0.616 0.000 0.044 0.212
#> SRR1420710 3 0.6609 -0.56165 0.308 0.000 0.348 0.000 0.024 0.320
#> SRR660426 4 0.3735 0.66949 0.124 0.000 0.092 0.784 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.6977 -0.56204 0.256 0.000 0.364 0.000 0.060 0.320
#> SRR661064 1 0.3427 0.43279 0.828 0.000 0.016 0.056 0.000 0.100
#> SRR1082011 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.5303 0.04963 0.468 0.000 0.068 0.452 0.000 0.012
#> SRR1353243 1 0.5123 0.39257 0.628 0.000 0.188 0.184 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.4493 0.33220 0.612 0.000 0.044 0.344 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.4332 0.32354 0.616 0.000 0.032 0.352 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.4152 0.38997 0.032 0.000 0.664 0.304 0.000 0.000
#> SRR1102467 4 0.1053 0.72599 0.012 0.000 0.020 0.964 0.000 0.004
#> SRR1317470 3 0.5910 -0.16439 0.140 0.000 0.584 0.000 0.040 0.236
#> SRR1337707 5 0.2202 0.74437 0.012 0.000 0.028 0.000 0.908 0.052
#> SRR1408752 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.4123 0.70268 0.032 0.772 0.016 0.000 0.016 0.164
#> SRR1398013 1 0.6606 -0.59355 0.352 0.000 0.304 0.000 0.024 0.320
#> SRR1352918 1 0.6413 -0.50953 0.428 0.000 0.248 0.008 0.008 0.308
#> SRR1420750 1 0.4436 0.37910 0.640 0.000 0.312 0.048 0.000 0.000
#> SRR1071785 5 0.3780 0.68395 0.048 0.000 0.068 0.000 0.816 0.068
#> SRR1353618 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 4 0.5893 0.48373 0.244 0.000 0.088 0.596 0.000 0.072
#> SRR1366560 1 0.2912 0.53673 0.816 0.000 0.012 0.172 0.000 0.000
#> SRR1355684 4 0.4314 0.09920 0.444 0.000 0.020 0.536 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.5546 0.57489 0.032 0.112 0.016 0.000 0.668 0.172
#> SRR1313494 1 0.4504 0.23346 0.744 0.000 0.132 0.024 0.000 0.100
#> SRR1309985 1 0.3807 0.32387 0.628 0.000 0.000 0.368 0.000 0.004
#> SRR607911 4 0.3586 0.50501 0.268 0.000 0.012 0.720 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.3025 0.55002 0.024 0.000 0.820 0.156 0.000 0.000
#> SRR1400078 3 0.6616 -0.57120 0.324 0.000 0.332 0.000 0.024 0.320
#> SRR1088631 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR615575 3 0.3290 0.46398 0.000 0.000 0.744 0.252 0.004 0.000
#> SRR1079434 4 0.6433 0.29787 0.000 0.000 0.212 0.484 0.036 0.268
#> SRR1325559 1 0.6040 -0.51224 0.420 0.000 0.296 0.000 0.000 0.284
#> SRR1446695 3 0.1606 0.44946 0.056 0.000 0.932 0.008 0.000 0.004
#> SRR1383883 1 0.3240 0.48649 0.752 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004
#> SRR1396100 1 0.6594 -0.58692 0.364 0.000 0.292 0.000 0.024 0.320
#> SRR1475697 6 0.6418 -0.37585 0.064 0.000 0.008 0.084 0.404 0.440
#> SRR1488067 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1102103 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1084991 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1410380 3 0.2649 0.39345 0.060 0.000 0.888 0.004 0.020 0.028
#> SRR1445490 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.6667 -0.56738 0.308 0.000 0.344 0.000 0.028 0.320
#> SRR1485812 5 0.2645 0.75620 0.000 0.000 0.056 0.008 0.880 0.056
#> SRR1078020 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 4 0.3840 0.46164 0.284 0.000 0.020 0.696 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.0547 0.75275 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR807775 3 0.4330 0.46673 0.000 0.000 0.696 0.236 0.068 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.6732 -0.54804 0.272 0.000 0.372 0.000 0.036 0.320
#> SRR1100656 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1362159 1 0.4809 0.31829 0.600 0.000 0.072 0.328 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.1588 0.52500 0.004 0.000 0.924 0.072 0.000 0.000
#> SRR656794 1 0.4553 0.36047 0.620 0.000 0.328 0.052 0.000 0.000
#> SRR604653 4 0.2908 0.69598 0.104 0.000 0.048 0.848 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.1092 0.76362 0.000 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020
#> SRR1485912 3 0.5357 -0.14172 0.180 0.000 0.588 0.000 0.000 0.232
#> SRR1407602 5 0.0622 0.75967 0.000 0.000 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1356164 4 0.4089 0.52360 0.000 0.000 0.000 0.696 0.040 0.264
#> SRR1328692 6 0.6311 0.52860 0.180 0.000 0.216 0.056 0.000 0.548
#> SRR1362438 1 0.5255 0.33478 0.588 0.000 0.272 0.140 0.000 0.000
#> SRR1479216 5 0.3868 0.24931 0.000 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1358041 1 0.6075 -0.52657 0.392 0.000 0.332 0.000 0.000 0.276
#> SRR1468766 4 0.2357 0.69601 0.000 0.000 0.116 0.872 0.000 0.012
#> SRR1368200 3 0.6018 -0.24402 0.156 0.000 0.552 0.000 0.032 0.260
#> SRR1435602 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.0547 0.75275 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1437256 5 0.3426 0.69990 0.048 0.000 0.048 0.000 0.840 0.064
#> SRR1487446 1 0.6614 -0.59269 0.336 0.000 0.324 0.000 0.024 0.316
#> SRR816653 1 0.3650 0.52820 0.792 0.000 0.116 0.092 0.000 0.000
#> SRR815164 4 0.5550 0.51745 0.228 0.000 0.216 0.556 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.5374 -0.02819 0.616 0.000 0.072 0.036 0.000 0.276
#> SRR1410573 1 0.4545 0.44680 0.684 0.000 0.092 0.224 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.3797 0.21600 0.000 0.000 0.580 0.420 0.000 0.000
#> SRR1382934 5 0.0632 0.76302 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1465208 1 0.3037 0.53364 0.808 0.000 0.016 0.176 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.5795 -0.12484 0.144 0.000 0.600 0.000 0.036 0.220
#> SRR1470291 1 0.3345 0.52784 0.788 0.000 0.028 0.184 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.2558 0.54943 0.004 0.000 0.840 0.156 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.4974 0.04672 0.148 0.000 0.672 0.000 0.008 0.172
#> SRR816123 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR614779 3 0.3636 0.38287 0.000 0.000 0.676 0.320 0.004 0.000
#> SRR810783 3 0.2805 0.54763 0.012 0.000 0.828 0.160 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.2491 0.54105 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.4091 0.07241 0.008 0.000 0.520 0.472 0.000 0.000
#> SRR808106 4 0.1910 0.68775 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR662713 4 0.2300 0.66580 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 4 0.3468 0.47246 0.000 0.000 0.284 0.712 0.000 0.004
#> SRR809382 5 0.2614 0.74125 0.012 0.000 0.060 0.000 0.884 0.044
#> SRR665417 4 0.3464 0.43068 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1453166 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1069826 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 5 0.0713 0.76268 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1413787 5 0.0713 0.76268 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1478207 3 0.4332 0.42781 0.000 0.000 0.672 0.276 0.052 0.000
#> SRR1411046 1 0.2366 0.44012 0.900 0.000 0.020 0.024 0.000 0.056
#> SRR1313711 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.3221 0.46977 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.4736 0.29715 0.588 0.000 0.060 0.352 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 4 0.3955 0.15412 0.436 0.000 0.000 0.560 0.000 0.004
#> SRR1074956 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1092961 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR817210 3 0.3797 0.21680 0.000 0.000 0.580 0.420 0.000 0.000
#> SRR1319221 5 0.6469 0.42402 0.032 0.220 0.016 0.000 0.540 0.192
#> SRR1405413 3 0.5919 -0.37392 0.328 0.000 0.448 0.000 0.000 0.224
#> SRR607807 4 0.3261 0.55373 0.204 0.000 0.000 0.780 0.000 0.016
#> SRR1390160 3 0.6195 -0.09207 0.032 0.000 0.500 0.000 0.312 0.156
#> SRR1406283 3 0.5195 0.30478 0.208 0.000 0.616 0.176 0.000 0.000
#> SRR1357709 4 0.5054 0.43100 0.296 0.000 0.024 0.624 0.000 0.056
#> SRR1080742 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1468208 1 0.2340 0.54320 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.2830 0.55380 0.020 0.000 0.836 0.144 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.2714 0.41464 0.880 0.000 0.036 0.020 0.000 0.064
#> SRR1311224 4 0.4960 0.41660 0.092 0.000 0.308 0.600 0.000 0.000
#> SRR1087801 4 0.1429 0.72132 0.004 0.000 0.052 0.940 0.000 0.004
#> SRR1099720 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1350912 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.6646 -0.50484 0.236 0.000 0.408 0.000 0.036 0.320
#> SRR1074980 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 5 0.1204 0.76308 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1332879 1 0.5093 0.39533 0.632 0.000 0.192 0.176 0.000 0.000
#> SRR1403177 5 0.6469 0.42256 0.032 0.220 0.016 0.000 0.540 0.192
#> SRR1076144 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR818239 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1421069 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1500006 4 0.1720 0.72567 0.032 0.000 0.040 0.928 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.5763 -0.40856 0.356 0.000 0.464 0.000 0.000 0.180
#> SRR1092232 5 0.0458 0.76209 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1344253 3 0.6654 0.16996 0.036 0.000 0.420 0.272 0.000 0.272
#> SRR1384290 1 0.2941 0.50760 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.3515 0.37984 0.000 0.000 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.7132 -0.58078 0.260 0.000 0.344 0.000 0.076 0.320
#> SRR818372 3 0.6725 -0.54428 0.268 0.000 0.376 0.000 0.036 0.320
#> SRR1323675 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 3 0.6649 -0.54609 0.304 0.000 0.372 0.004 0.020 0.300
#> SRR1310031 3 0.4301 0.46268 0.000 0.000 0.696 0.240 0.064 0.000
#> SRR615419 5 0.3351 0.70386 0.040 0.000 0.048 0.000 0.844 0.068
#> SRR1436925 3 0.7121 -0.07210 0.300 0.000 0.420 0.136 0.000 0.144
#> SRR1477238 1 0.3979 0.34042 0.628 0.000 0.000 0.360 0.000 0.012
#> SRR1332566 1 0.2996 0.50180 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.2900 0.53886 0.016 0.000 0.856 0.112 0.012 0.004
#> SRR1442949 3 0.7237 -0.59829 0.248 0.000 0.340 0.000 0.092 0.320
#> SRR1466239 1 0.2491 0.54105 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4531 0.20480 0.556 0.000 0.408 0.036 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322981 3 0.3374 0.50821 0.020 0.000 0.772 0.208 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.3955 0.02301 0.000 0.000 0.608 0.000 0.384 0.008
#> SRR660522 3 0.1524 0.51793 0.008 0.000 0.932 0.060 0.000 0.000
#> SRR815374 3 0.6104 -0.52576 0.328 0.000 0.376 0.000 0.000 0.296
#> SRR1069564 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1416337 3 0.2762 0.52012 0.000 0.000 0.804 0.196 0.000 0.000
#> SRR1316438 5 0.4172 0.63518 0.000 0.000 0.016 0.024 0.708 0.252
#> SRR1386844 1 0.2730 0.52760 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1373718 4 0.4063 0.19546 0.420 0.000 0.004 0.572 0.000 0.004
#> SRR1447458 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.3422 0.52761 0.788 0.000 0.036 0.176 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4503 0.46191 0.700 0.000 0.108 0.192 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.2563 0.50794 0.884 0.000 0.008 0.068 0.000 0.040
#> SRR1393404 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 4 0.2685 0.71196 0.072 0.000 0.060 0.868 0.000 0.000
#> SRR1401815 5 0.0547 0.76288 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 5 0.4336 0.22067 0.000 0.000 0.476 0.020 0.504 0.000
#> SRR1098761 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1312124 1 0.6029 -0.31379 0.536 0.000 0.212 0.020 0.000 0.232
#> SRR615395 3 0.4064 0.34119 0.020 0.000 0.644 0.336 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.3782 0.31558 0.792 0.000 0.032 0.028 0.000 0.148
#> SRR2165033 1 0.6550 -0.58820 0.348 0.000 0.312 0.000 0.020 0.320
#> SRR1089054 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 4 0.6806 0.05108 0.172 0.000 0.356 0.404 0.000 0.068
#> SRR1488514 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 4 0.6474 0.31580 0.276 0.000 0.068 0.512 0.000 0.144
#> SRR1379303 1 0.2527 0.53995 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.5068 0.59427 0.164 0.000 0.044 0.716 0.016 0.060
#> SRR613174 3 0.2191 0.54778 0.004 0.000 0.876 0.120 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.2482 0.55332 0.000 0.000 0.848 0.148 0.004 0.000
#> SRR659157 5 0.4644 0.53410 0.056 0.000 0.048 0.000 0.732 0.164
#> SRR1480408 4 0.2538 0.68802 0.124 0.000 0.016 0.860 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.3468 0.57202 0.008 0.000 0.000 0.728 0.000 0.264
#> SRR1073317 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 4 0.2053 0.69548 0.108 0.000 0.004 0.888 0.000 0.000
#> SRR1094168 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1431270 5 0.1890 0.75010 0.008 0.000 0.024 0.000 0.924 0.044
#> SRR1085614 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 4 0.5102 0.43624 0.000 0.000 0.212 0.628 0.000 0.160
#> SRR1466154 4 0.4314 0.61360 0.096 0.000 0.184 0.720 0.000 0.000
#> SRR1396944 4 0.3012 0.57713 0.196 0.000 0.000 0.796 0.000 0.008
#> SRR1082784 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.2527 0.53995 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.3817 0.19189 0.000 0.000 0.568 0.432 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.2554 0.53287 0.028 0.000 0.876 0.092 0.000 0.004
#> SRR1317201 1 0.1610 0.54898 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.5093 0.39769 0.632 0.000 0.192 0.176 0.000 0.000
#> SRR1375842 4 0.1564 0.72669 0.024 0.000 0.040 0.936 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1453662 1 0.6124 -0.57143 0.356 0.000 0.328 0.000 0.000 0.316
#> SRR1345499 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 4 0.1219 0.72571 0.004 0.000 0.048 0.948 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.2793 0.52237 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.1753 0.53193 0.004 0.000 0.912 0.084 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.3984 0.27486 0.596 0.000 0.008 0.396 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.5437 -0.25240 0.576 0.000 0.276 0.004 0.000 0.144
#> SRR612659 3 0.5203 0.41740 0.000 0.000 0.620 0.240 0.136 0.004
#> SRR1447148 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1089595 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.4032 0.19941 0.008 0.000 0.572 0.420 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.3101 0.54645 0.032 0.000 0.820 0.148 0.000 0.000
#> SRR1071035 4 0.1049 0.72716 0.000 0.000 0.032 0.960 0.000 0.008
#> SRR1068808 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1332754 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.2762 0.55094 0.860 0.000 0.048 0.092 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.3989 0.11612 0.528 0.000 0.004 0.468 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.2772 0.36475 0.092 0.000 0.864 0.000 0.004 0.040
#> SRR1323558 3 0.6167 -0.09835 0.048 0.000 0.564 0.000 0.196 0.192
#> SRR1381711 3 0.2778 0.54234 0.008 0.000 0.824 0.168 0.000 0.000
#> SRR657985 3 0.1624 0.45294 0.044 0.000 0.936 0.008 0.000 0.012
#> SRR1314810 1 0.5256 0.36366 0.608 0.000 0.072 0.296 0.000 0.024
#> SRR1336505 4 0.3290 0.53738 0.000 0.000 0.252 0.744 0.000 0.004
#> SRR1474095 3 0.4573 0.15706 0.100 0.000 0.716 0.004 0.004 0.176
#> SRR1363831 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 4 0.1850 0.71526 0.052 0.000 0.016 0.924 0.000 0.008
#> SRR1074909 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1101200 4 0.3023 0.56678 0.000 0.000 0.232 0.768 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.6602 -0.59177 0.356 0.000 0.300 0.000 0.024 0.320
#> SRR1313406 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4617 0.26044 0.024 0.000 0.728 0.004 0.180 0.064
#> SRR1084867 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1380184 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 4 0.4892 0.58698 0.176 0.000 0.164 0.660 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.2234 0.54928 0.004 0.000 0.872 0.124 0.000 0.000
#> SRR1315912 4 0.2608 0.71567 0.048 0.000 0.080 0.872 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 5 0.2510 0.75590 0.000 0.000 0.024 0.024 0.892 0.060
#> SRR1361195 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 4 0.3138 0.69769 0.060 0.000 0.108 0.832 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.2633 0.53468 0.032 0.000 0.864 0.104 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.2703 0.53958 0.004 0.000 0.824 0.172 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.2971 0.45866 0.860 0.000 0.012 0.052 0.000 0.076
#> SRR810437 3 0.6609 -0.56165 0.308 0.000 0.348 0.000 0.024 0.320
#> SRR1361860 1 0.4336 0.01251 0.504 0.000 0.000 0.476 0.000 0.020
#> SRR1441311 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 4 0.1418 0.72675 0.024 0.000 0.032 0.944 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.6048 -0.51970 0.416 0.000 0.296 0.000 0.000 0.288
#> SRR1498529 4 0.4333 0.06757 0.468 0.000 0.000 0.512 0.000 0.020
#> SRR1097172 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 5 0.6281 0.53917 0.000 0.000 0.112 0.072 0.536 0.280
#> SRR1399525 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1312844 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1085874 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1101226 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1476056 4 0.3163 0.55961 0.232 0.000 0.000 0.764 0.000 0.004
#> SRR1075659 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1311916 5 0.3868 0.24034 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1353353 5 0.1708 0.76221 0.000 0.000 0.024 0.004 0.932 0.040
#> SRR1073291 3 0.2632 0.54480 0.004 0.000 0.832 0.164 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.2793 0.52237 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1350304 6 0.7240 0.49916 0.272 0.000 0.320 0.000 0.088 0.320
#> SRR663002 3 0.7321 -0.33984 0.068 0.000 0.376 0.012 0.280 0.264
#> SRR1376983 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.3023 0.49866 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.3861 0.12731 0.000 0.000 0.640 0.008 0.352 0.000
#> SRR1384006 4 0.1829 0.71904 0.056 0.000 0.024 0.920 0.000 0.000
#> SRR1499108 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR614047 3 0.2507 0.41725 0.012 0.000 0.892 0.008 0.072 0.016
#> SRR818440 3 0.5253 0.00764 0.100 0.000 0.660 0.000 0.032 0.208
#> SRR1337770 1 0.4469 0.18590 0.740 0.000 0.108 0.016 0.000 0.136
#> SRR1399413 4 0.2178 0.67915 0.000 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.6609 -0.56165 0.308 0.000 0.348 0.000 0.024 0.320
#> SRR1074041 3 0.3592 0.35264 0.000 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 3 0.3747 0.26094 0.000 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR816699 3 0.2520 0.55138 0.004 0.000 0.844 0.152 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.2520 0.55138 0.004 0.000 0.844 0.152 0.000 0.000
#> SRR1499418 5 0.1707 0.76122 0.000 0.000 0.056 0.004 0.928 0.012
#> SRR1352894 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 4 0.3023 0.62014 0.004 0.000 0.000 0.784 0.000 0.212
#> SRR1331083 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR808272 3 0.2558 0.54943 0.004 0.000 0.840 0.156 0.000 0.000
#> SRR1436698 3 0.4585 0.41497 0.192 0.000 0.692 0.116 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1357672 3 0.5290 -0.09841 0.152 0.000 0.612 0.000 0.004 0.232
#> SRR1351236 1 0.5240 0.30960 0.584 0.000 0.132 0.284 0.000 0.000
#> SRR1077479 4 0.2656 0.66102 0.120 0.000 0.012 0.860 0.000 0.008
#> SRR814491 1 0.6598 -0.58943 0.360 0.000 0.296 0.000 0.024 0.320
#> SRR1101256 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 4 0.2875 0.70651 0.052 0.000 0.096 0.852 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.1149 0.72061 0.024 0.000 0.008 0.960 0.000 0.008
#> SRR1309534 6 0.6715 0.55138 0.320 0.000 0.244 0.008 0.024 0.404
#> SRR615527 5 0.4586 0.62173 0.000 0.000 0.024 0.036 0.680 0.260
#> SRR1098216 4 0.1332 0.72063 0.028 0.000 0.012 0.952 0.000 0.008
#> SRR1325847 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1404003 4 0.2152 0.71652 0.024 0.000 0.068 0.904 0.000 0.004
#> SRR1344166 4 0.2119 0.72100 0.060 0.000 0.036 0.904 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.6628 -0.57735 0.380 0.000 0.280 0.000 0.028 0.312
#> SRR1431429 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1080509 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.6552 -0.30731 0.128 0.000 0.512 0.000 0.088 0.272
#> SRR1502143 3 0.2278 0.55062 0.004 0.000 0.868 0.128 0.000 0.000
#> SRR1487614 5 0.2597 0.68450 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 4 0.3646 0.65982 0.052 0.000 0.172 0.776 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.5515 0.19616 0.492 0.000 0.372 0.136 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656421 1 0.2527 0.53995 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.6616 -0.57120 0.324 0.000 0.332 0.000 0.024 0.320
#> SRR1339944 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 4 0.2257 0.68278 0.000 0.000 0.116 0.876 0.000 0.008
#> SRR1431847 5 0.3895 0.63598 0.000 0.000 0.004 0.016 0.696 0.284
#> SRR1317155 4 0.5150 0.46733 0.068 0.000 0.020 0.612 0.000 0.300
#> SRR1477405 1 0.5164 0.30941 0.584 0.000 0.116 0.300 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.4252 0.29468 0.024 0.000 0.604 0.372 0.000 0.000
#> SRR1341683 3 0.6432 -0.18678 0.116 0.000 0.564 0.008 0.080 0.232
#> SRR1084790 4 0.4499 0.49004 0.060 0.000 0.288 0.652 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.3975 0.15653 0.000 0.000 0.544 0.452 0.000 0.004
#> SRR1332588 1 0.6616 -0.60387 0.332 0.000 0.324 0.000 0.024 0.320
#> SRR1471157 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.3815 0.31669 0.096 0.000 0.804 0.012 0.004 0.084
#> SRR661028 1 0.5071 0.40370 0.632 0.000 0.156 0.212 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4081 0.26014 0.028 0.000 0.764 0.020 0.008 0.180
#> SRR1358435 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR2165273 1 0.2912 0.51079 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1379014 4 0.3810 0.19253 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.6106 0.00787 0.040 0.000 0.556 0.000 0.240 0.164
#> SRR1416386 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1406048 1 0.2973 0.43657 0.868 0.000 0.040 0.036 0.000 0.056
#> SRR606982 4 0.4194 0.55309 0.004 0.000 0.024 0.700 0.008 0.264
#> SRR1358082 1 0.4446 0.32028 0.612 0.000 0.040 0.348 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.3998 0.03937 0.000 0.000 0.504 0.492 0.000 0.004
#> SRR655194 1 0.6014 -0.50320 0.432 0.000 0.284 0.000 0.000 0.284
#> SRR1331174 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.4157 0.69713 0.032 0.768 0.016 0.000 0.016 0.168
#> SRR1074289 4 0.3050 0.55763 0.000 0.000 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 4 0.6465 0.28306 0.004 0.000 0.236 0.472 0.024 0.264
#> SRR1395810 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.4452 0.38613 0.000 0.000 0.636 0.316 0.048 0.000
#> SRR1443507 3 0.3674 0.44690 0.016 0.000 0.716 0.268 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.6616 -0.60293 0.328 0.000 0.328 0.000 0.024 0.320
#> SRR665610 3 0.6545 -0.55498 0.308 0.000 0.356 0.000 0.020 0.316
#> SRR1347322 1 0.4549 0.44010 0.680 0.000 0.088 0.232 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1477256 1 0.2932 0.54057 0.820 0.000 0.016 0.164 0.000 0.000
#> SRR1470230 5 0.5135 0.39907 0.012 0.000 0.012 0.032 0.520 0.424
#> SRR1354247 4 0.0984 0.72425 0.012 0.000 0.012 0.968 0.000 0.008
#> SRR1082640 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.3795 0.30826 0.004 0.000 0.632 0.364 0.000 0.000
#> SRR1352299 4 0.3806 0.67130 0.088 0.000 0.136 0.776 0.000 0.000
#> SRR1076317 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1434117 3 0.1588 0.52500 0.004 0.000 0.924 0.072 0.000 0.000
#> SRR1075273 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR658657 3 0.7096 -0.53259 0.216 0.000 0.380 0.000 0.084 0.320
#> SRR1092773 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1365332 3 0.2318 0.48535 0.064 0.000 0.892 0.044 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.3046 0.40517 0.000 0.000 0.800 0.012 0.188 0.000
#> SRR1097688 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1403259 5 0.5653 0.53972 0.000 0.000 0.060 0.052 0.560 0.328
#> SRR1099120 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1362200 3 0.2738 0.53470 0.000 0.000 0.820 0.176 0.004 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.91603 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 3 0.5089 0.41187 0.000 0.000 0.624 0.260 0.112 0.004
#> SRR1075923 2 0.3101 0.81887 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1100703 3 0.3835 0.40846 0.016 0.000 0.684 0.300 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4352 0.565 0.565
#> 3 3 0.597 0.525 0.744 0.3537 0.831 0.701
#> 4 4 0.702 0.746 0.856 0.2036 0.756 0.474
#> 5 5 0.724 0.719 0.856 0.1010 0.850 0.540
#> 6 6 0.716 0.578 0.776 0.0449 0.947 0.779
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 2 0 1 0 1
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 1 0 1 1 0
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 1 0 1 1 0
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 1 0 1 1 0
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 2 0 1 0 1
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1436370 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1397949 1 0.5363 0.30602 0.724 0.000 0.276
#> SRR1355723 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1329744 3 0.6280 0.80570 0.460 0.000 0.540
#> SRR657384 1 0.6045 -0.14313 0.620 0.000 0.380
#> SRR1351190 1 0.6062 -0.16285 0.616 0.000 0.384
#> SRR1458662 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1396017 1 0.5905 -0.06379 0.648 0.000 0.352
#> SRR1410742 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1435963 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1382416 1 0.6280 -0.52810 0.540 0.000 0.460
#> SRR1391354 1 0.6062 -0.15478 0.616 0.000 0.384
#> SRR1087968 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1312244 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR1325138 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1326821 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1490178 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 3 0.6154 0.96640 0.408 0.000 0.592
#> SRR1075707 2 0.5835 0.80813 0.000 0.660 0.340
#> SRR1443871 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1465758 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1414058 1 0.4178 0.40567 0.828 0.000 0.172
#> SRR1407449 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1436858 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.3619 0.45660 0.864 0.000 0.136
#> SRR1399069 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1366450 1 0.5058 0.34449 0.756 0.000 0.244
#> SRR1396859 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1457176 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1097666 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1434736 1 0.3482 0.46486 0.872 0.000 0.128
#> SRR1080560 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1322882 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1435688 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR658152 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.5733 0.00606 0.676 0.000 0.324
#> SRR1440268 3 0.6192 0.93592 0.420 0.000 0.580
#> SRR1453725 3 0.6154 0.96631 0.408 0.000 0.592
#> SRR1325711 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1477591 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1416049 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.6280 -0.48022 0.540 0.000 0.460
#> SRR1369052 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1377735 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1331244 3 0.6168 0.95698 0.412 0.000 0.588
#> SRR1404531 3 0.6154 0.96608 0.408 0.000 0.592
#> SRR1324331 1 0.6140 -0.24005 0.596 0.000 0.404
#> SRR1458890 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR1385211 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR655241 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR656922 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1361630 1 0.3192 0.46955 0.888 0.000 0.112
#> SRR1318966 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1407087 3 0.6192 0.93882 0.420 0.000 0.580
#> SRR603212 3 0.6215 0.91916 0.428 0.000 0.572
#> SRR1321088 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.1529 0.49485 0.960 0.000 0.040
#> SRR1332232 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.4346 0.42194 0.816 0.000 0.184
#> SRR1457835 1 0.5363 0.30602 0.724 0.000 0.276
#> SRR1347123 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465501 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1330878 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1452981 1 0.6062 -0.15508 0.616 0.000 0.384
#> SRR1326708 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1407157 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1365401 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1077898 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR1349080 1 0.5650 0.04795 0.688 0.000 0.312
#> SRR1076096 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1375485 3 0.6180 0.94979 0.416 0.000 0.584
#> SRR1432563 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1380614 1 0.3340 0.46741 0.880 0.000 0.120
#> SRR812060 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR602082 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1069490 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1078417 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.4974 0.35640 0.764 0.000 0.236
#> SRR1420710 1 0.5835 -0.03068 0.660 0.000 0.340
#> SRR660426 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1416003 1 0.5988 -0.10516 0.632 0.000 0.368
#> SRR661064 1 0.6079 -0.17068 0.612 0.000 0.388
#> SRR1082011 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.4702 0.38247 0.788 0.000 0.212
#> SRR1353243 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1455482 1 0.5465 0.28256 0.712 0.000 0.288
#> SRR1313473 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1399394 1 0.5363 0.30602 0.724 0.000 0.276
#> SRR1102467 1 0.6308 -0.60690 0.508 0.000 0.492
#> SRR1317470 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398013 1 0.5859 -0.04228 0.656 0.000 0.344
#> SRR1352918 1 0.6026 -0.12897 0.624 0.000 0.376
#> SRR1420750 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR1071785 1 0.5497 0.08992 0.708 0.000 0.292
#> SRR1353618 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1366560 3 0.6192 0.93540 0.420 0.000 0.580
#> SRR1355684 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1323289 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313494 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1309985 1 0.6291 -0.51028 0.532 0.000 0.468
#> SRR607911 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1333789 1 0.4504 0.32053 0.804 0.000 0.196
#> SRR1400078 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR615575 1 0.4842 0.36894 0.776 0.000 0.224
#> SRR1079434 1 0.1411 0.50140 0.964 0.000 0.036
#> SRR1325559 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1446695 1 0.3192 0.46955 0.888 0.000 0.112
#> SRR1383883 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1396100 1 0.1529 0.50294 0.960 0.000 0.040
#> SRR1475697 1 0.5291 0.14832 0.732 0.000 0.268
#> SRR1488067 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1102103 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1084991 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1410380 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.3192 0.47137 0.888 0.000 0.112
#> SRR1485812 1 0.5465 0.09870 0.712 0.000 0.288
#> SRR1078020 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1376406 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR807775 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100656 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1362159 3 0.6180 0.94702 0.416 0.000 0.584
#> SRR1414536 1 0.0237 0.51374 0.996 0.000 0.004
#> SRR656794 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR604653 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1317685 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.4291 0.42661 0.820 0.000 0.180
#> SRR1407602 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356164 1 0.5785 -0.00925 0.668 0.000 0.332
#> SRR1328692 1 0.5560 0.07320 0.700 0.000 0.300
#> SRR1362438 1 0.5363 0.30602 0.724 0.000 0.276
#> SRR1479216 1 0.1411 0.50677 0.964 0.000 0.036
#> SRR1358041 1 0.5859 0.12473 0.656 0.000 0.344
#> SRR1468766 1 0.6302 -0.56569 0.520 0.000 0.480
#> SRR1368200 1 0.2625 0.48675 0.916 0.000 0.084
#> SRR1435602 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437256 1 0.5835 -0.03235 0.660 0.000 0.340
#> SRR1487446 1 0.3551 0.46655 0.868 0.000 0.132
#> SRR816653 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR815164 3 0.6168 0.95726 0.412 0.000 0.588
#> SRR1442043 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1410573 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1096782 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 3 0.6225 0.90544 0.432 0.000 0.568
#> SRR1382934 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465208 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1314728 1 0.4796 0.36717 0.780 0.000 0.220
#> SRR1470291 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1308756 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.3340 0.46517 0.880 0.000 0.120
#> SRR816123 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR614779 1 0.2165 0.49958 0.936 0.000 0.064
#> SRR810783 1 0.6095 -0.18594 0.608 0.000 0.392
#> SRR1333990 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1410356 1 0.5254 0.32424 0.736 0.000 0.264
#> SRR808106 1 0.5560 0.07825 0.700 0.000 0.300
#> SRR662713 1 0.6308 -0.60946 0.508 0.000 0.492
#> SRR1447058 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.6111 -0.20303 0.604 0.000 0.396
#> SRR809382 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR665417 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1088016 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1453166 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1069826 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413787 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478207 1 0.6126 -0.30603 0.600 0.000 0.400
#> SRR1411046 1 0.6215 -0.29645 0.572 0.000 0.428
#> SRR1313711 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.6079 -0.17068 0.612 0.000 0.388
#> SRR1309051 1 0.5706 0.20449 0.680 0.000 0.320
#> SRR1486949 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1074956 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1092961 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR817210 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1319221 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR607807 1 0.6291 -0.51147 0.532 0.000 0.468
#> SRR1390160 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.4750 0.37426 0.784 0.000 0.216
#> SRR1357709 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1080742 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1468208 1 0.6309 -0.63524 0.500 0.000 0.500
#> SRR1312766 1 0.4974 0.36280 0.764 0.000 0.236
#> SRR1361612 1 0.5650 0.22622 0.688 0.000 0.312
#> SRR1311224 1 0.5431 0.29220 0.716 0.000 0.284
#> SRR1087801 1 0.6062 -0.18074 0.616 0.000 0.384
#> SRR1099720 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1350912 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.1163 0.51009 0.972 0.000 0.028
#> SRR1074980 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332879 3 0.6225 0.89440 0.432 0.000 0.568
#> SRR1403177 1 0.0892 0.50631 0.980 0.000 0.020
#> SRR1076144 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR818239 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1421069 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1500006 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1485678 1 0.6305 -0.56566 0.516 0.000 0.484
#> SRR1092232 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344253 1 0.3267 0.46900 0.884 0.000 0.116
#> SRR1384290 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1089349 1 0.5363 0.30713 0.724 0.000 0.276
#> SRR1343522 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.5810 -0.02249 0.664 0.000 0.336
#> SRR818372 1 0.5327 0.14164 0.728 0.000 0.272
#> SRR1323675 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1310031 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR615419 1 0.2796 0.44786 0.908 0.000 0.092
#> SRR1436925 3 0.6295 0.75014 0.472 0.000 0.528
#> SRR1477238 3 0.6204 0.93318 0.424 0.000 0.576
#> SRR1332566 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1490228 1 0.0424 0.51324 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442949 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.6280 -0.43766 0.540 0.000 0.460
#> SRR1094003 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.4931 0.36794 0.768 0.000 0.232
#> SRR813076 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.4555 0.40621 0.800 0.000 0.200
#> SRR1485976 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0592 0.51332 0.988 0.000 0.012
#> SRR815374 1 0.6168 -0.26806 0.588 0.000 0.412
#> SRR1069564 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1416337 1 0.3267 0.46855 0.884 0.000 0.116
#> SRR1316438 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386844 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1373718 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1447458 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.5397 0.29892 0.720 0.000 0.280
#> SRR1441421 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 3 0.6274 0.80829 0.456 0.000 0.544
#> SRR1335489 1 0.3879 0.44934 0.848 0.000 0.152
#> SRR1393404 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1401815 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.0237 0.51384 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098761 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1312124 3 0.6309 0.63021 0.500 0.000 0.500
#> SRR615395 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR1479349 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR2165033 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1488514 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1379303 1 0.5560 0.25606 0.700 0.000 0.300
#> SRR1418516 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR613174 1 0.4121 0.43570 0.832 0.000 0.168
#> SRR1351125 1 0.5016 0.34919 0.760 0.000 0.240
#> SRR659157 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR657857 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1073317 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.6111 -0.20191 0.604 0.000 0.396
#> SRR1094168 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1431270 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085614 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.5926 -0.07171 0.644 0.000 0.356
#> SRR1466154 1 0.5529 0.26680 0.704 0.000 0.296
#> SRR1396944 3 0.6192 0.93592 0.420 0.000 0.580
#> SRR1082784 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.6180 -0.21934 0.584 0.000 0.416
#> SRR614659 1 0.6309 -0.64924 0.500 0.000 0.500
#> SRR659247 1 0.6062 -0.15795 0.616 0.000 0.384
#> SRR1317201 3 0.6168 0.95624 0.412 0.000 0.588
#> SRR1473696 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR1375842 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1388123 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1453662 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1345499 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1416693 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1070841 1 0.1753 0.50673 0.952 0.000 0.048
#> SRR1380910 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1333125 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR612659 1 0.4931 0.22215 0.768 0.000 0.232
#> SRR1447148 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1089595 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1345995 1 0.4974 0.35483 0.764 0.000 0.236
#> SRR1071035 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1068808 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1332754 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.5291 0.31841 0.732 0.000 0.268
#> SRR1335355 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR659448 1 0.3340 0.46648 0.880 0.000 0.120
#> SRR1323558 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.5016 0.35513 0.760 0.000 0.240
#> SRR1336505 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1474095 1 0.5138 0.33654 0.748 0.000 0.252
#> SRR1363831 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1074909 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1101200 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1075408 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.5733 0.01315 0.676 0.000 0.324
#> SRR1313406 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.0237 0.51384 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084867 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1380184 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.5968 -0.00136 0.636 0.000 0.364
#> SRR1380414 1 0.4178 0.42713 0.828 0.000 0.172
#> SRR1315912 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1075778 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 1 0.5706 0.01678 0.680 0.000 0.320
#> SRR1361195 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1477653 1 0.5138 0.33654 0.748 0.000 0.252
#> SRR1355475 1 0.4002 0.44093 0.840 0.000 0.160
#> SRR1360785 1 0.1964 0.49599 0.944 0.000 0.056
#> SRR810437 1 0.5706 0.02230 0.680 0.000 0.320
#> SRR1361860 1 0.6026 -0.12702 0.624 0.000 0.376
#> SRR1441311 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.6079 -0.17068 0.612 0.000 0.388
#> SRR1457619 1 0.5760 0.02136 0.672 0.000 0.328
#> SRR1498529 1 0.6126 -0.21786 0.600 0.000 0.400
#> SRR1097172 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.5254 0.15414 0.736 0.000 0.264
#> SRR1399525 2 0.6095 0.79325 0.000 0.608 0.392
#> SRR1312844 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1085874 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1101226 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1476056 1 0.6062 -0.15478 0.616 0.000 0.384
#> SRR1075659 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1311916 1 0.3116 0.47233 0.892 0.000 0.108
#> SRR1353353 1 0.5291 0.14551 0.732 0.000 0.268
#> SRR1073291 1 0.3619 0.45777 0.864 0.000 0.136
#> SRR1356227 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1080720 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1350304 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR663002 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1347144 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384006 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1499108 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR614047 1 0.0237 0.51374 0.996 0.000 0.004
#> SRR818440 1 0.6260 -0.47226 0.552 0.000 0.448
#> SRR1337770 1 0.6305 -0.57647 0.516 0.000 0.484
#> SRR1399413 1 0.5733 0.01386 0.676 0.000 0.324
#> SRR1385542 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1074041 1 0.5098 0.34007 0.752 0.000 0.248
#> SRR1394495 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 3 0.6244 0.87299 0.440 0.000 0.560
#> SRR816699 1 0.4796 0.37271 0.780 0.000 0.220
#> SRR1308612 1 0.3412 0.46544 0.876 0.000 0.124
#> SRR1499418 1 0.5560 0.07828 0.700 0.000 0.300
#> SRR1352894 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 3 0.6168 0.95699 0.412 0.000 0.588
#> SRR1331083 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR808272 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.4887 0.35931 0.772 0.000 0.228
#> SRR1095627 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1357672 1 0.3267 0.46855 0.884 0.000 0.116
#> SRR1351236 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1077479 1 0.6309 -0.61969 0.504 0.000 0.496
#> SRR814491 1 0.0592 0.51214 0.988 0.000 0.012
#> SRR1101256 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.6180 -0.22695 0.584 0.000 0.416
#> SRR1457994 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1309534 1 0.5431 0.11140 0.716 0.000 0.284
#> SRR615527 1 0.5254 0.15414 0.736 0.000 0.264
#> SRR1098216 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1325847 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1404003 1 0.6062 -0.15508 0.616 0.000 0.384
#> SRR1344166 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1368638 1 0.4235 0.35053 0.824 0.000 0.176
#> SRR1431429 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1080509 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.3941 0.44662 0.844 0.000 0.156
#> SRR1487614 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1099212 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.4702 0.38247 0.788 0.000 0.212
#> SRR1476547 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR656421 1 0.5926 0.07729 0.644 0.000 0.356
#> SRR1086116 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.5988 -0.10435 0.632 0.000 0.368
#> SRR1339944 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.6045 -0.13959 0.620 0.000 0.380
#> SRR1431847 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.5905 -0.06250 0.648 0.000 0.352
#> SRR1477405 1 0.5397 0.29876 0.720 0.000 0.280
#> SRR655289 3 0.6168 0.95663 0.412 0.000 0.588
#> SRR1341683 1 0.5988 -0.10361 0.632 0.000 0.368
#> SRR1084790 3 0.6154 0.96608 0.408 0.000 0.592
#> SRR1073731 1 0.6309 -0.61935 0.504 0.000 0.496
#> SRR1332588 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1471157 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.3412 0.46491 0.876 0.000 0.124
#> SRR661028 1 0.5363 0.30602 0.724 0.000 0.276
#> SRR1413477 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.6291 -0.48128 0.532 0.000 0.468
#> SRR1358435 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR2165273 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1379014 1 0.6140 -0.23414 0.596 0.000 0.404
#> SRR1489904 1 0.2878 0.47964 0.904 0.000 0.096
#> SRR1416386 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1406048 3 0.6267 0.82435 0.452 0.000 0.548
#> SRR606982 1 0.5882 -0.05018 0.652 0.000 0.348
#> SRR1358082 3 0.6140 0.97402 0.404 0.000 0.596
#> SRR1312934 1 0.5948 -0.08470 0.640 0.000 0.360
#> SRR655194 1 0.6244 -0.50304 0.560 0.000 0.440
#> SRR1331174 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389820 2 0.0237 0.90183 0.004 0.996 0.000
#> SRR1074289 1 0.6286 -0.56774 0.536 0.000 0.464
#> SRR1348816 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.6267 -0.48529 0.548 0.000 0.452
#> SRR1395810 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.6008 -0.11460 0.628 0.000 0.372
#> SRR1443507 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1452310 1 0.5905 -0.06175 0.648 0.000 0.352
#> SRR665610 1 0.1643 0.50118 0.956 0.000 0.044
#> SRR1347322 1 0.5835 0.13837 0.660 0.000 0.340
#> SRR813395 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1477256 1 0.5327 0.31267 0.728 0.000 0.272
#> SRR1470230 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354247 3 0.6215 0.90766 0.428 0.000 0.572
#> SRR1082640 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.4796 0.37336 0.780 0.000 0.220
#> SRR1352299 3 0.6154 0.96640 0.408 0.000 0.592
#> SRR1076317 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1434117 1 0.3267 0.46796 0.884 0.000 0.116
#> SRR1075273 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR658657 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092773 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1365332 1 0.5138 0.33654 0.748 0.000 0.252
#> SRR615958 1 0.0000 0.51414 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097688 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1403259 1 0.1860 0.48583 0.948 0.000 0.052
#> SRR1099120 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1362200 1 0.1031 0.51112 0.976 0.000 0.024
#> SRR1464856 2 0.0000 0.90449 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.5254 0.15414 0.736 0.000 0.264
#> SRR1075923 2 0.6140 0.78979 0.000 0.596 0.404
#> SRR1100703 1 0.5138 0.34043 0.748 0.000 0.252
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 3 0.1637 0.67110 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1355723 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.3942 0.70235 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR657384 1 0.0336 0.69254 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1351190 1 0.0921 0.69319 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1396017 1 0.2281 0.60103 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1382416 1 0.4977 0.25214 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1391354 1 0.0188 0.69357 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1312244 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4843 0.64914 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1075707 4 0.3219 0.80791 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1443871 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1414058 3 0.4643 0.54111 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1407449 1 0.4605 0.68212 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 3 0.2281 0.71172 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1399069 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366450 3 0.3400 0.65969 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1396859 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1457176 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1097666 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 3 0.2647 0.71073 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1080560 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.4790 0.65837 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR658152 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1368141 1 0.1557 0.64564 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1440268 1 0.4522 0.68763 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1453725 1 0.4843 0.64815 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1477591 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.2011 0.69587 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1369052 1 0.4500 0.68928 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1377735 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1331244 1 0.4522 0.68807 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1404531 1 0.4817 0.65220 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1324331 1 0.0817 0.69719 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1458890 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1432695 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.4776 0.62639 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1087393 2 0.0188 0.99547 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077263 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1385211 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1361630 3 0.2408 0.71110 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1318966 4 0.0817 0.97285 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1407087 1 0.4804 0.65934 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR603212 1 0.4776 0.65775 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.4888 0.59130 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.2647 0.70402 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1457835 3 0.3172 0.54281 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1347123 3 0.4304 0.67541 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1465501 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1445064 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452981 1 0.0188 0.69351 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1326708 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1407157 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1077898 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1349080 1 0.4072 0.62634 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.4866 0.64260 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1380614 3 0.2530 0.71156 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR812060 1 0.4804 0.65533 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR602082 1 0.4790 0.65886 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1069490 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.2081 0.70196 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1420710 1 0.1211 0.66519 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR660426 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1416003 1 0.0469 0.68503 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR661064 1 0.0336 0.69458 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 3 0.1118 0.69635 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1353243 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1455482 3 0.1867 0.66083 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1313473 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1399394 3 0.1637 0.67110 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1102467 1 0.2921 0.70103 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1317470 3 0.4564 0.65475 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1337707 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.0817 0.97605 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1398013 1 0.1118 0.66563 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1352918 1 0.0188 0.69050 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420750 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1071785 1 0.2149 0.61518 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 3 0.4776 -0.10677 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1355684 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1323289 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1313494 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1309985 1 0.2149 0.69534 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR607911 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1333789 1 0.4817 -0.28698 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1400078 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.1022 0.69455 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1079434 1 0.4713 -0.09215 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1325559 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1446695 3 0.2408 0.71110 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1383883 1 0.4605 0.68212 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1396100 3 0.4925 0.60926 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1475697 1 0.3219 0.51517 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1488067 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 3 0.4564 0.65475 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1445490 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 3 0.3219 0.70770 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1485812 1 0.2589 0.61155 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR807775 3 0.4605 0.65133 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.4804 0.61958 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1100656 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.4916 0.61307 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1414536 3 0.4643 0.65061 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR656794 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR604653 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1317685 3 0.4564 0.65475 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1485912 3 0.2814 0.70273 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1407602 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1356164 1 0.3172 0.68206 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1328692 1 0.2011 0.62540 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1362438 3 0.1637 0.67110 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1479216 3 0.3400 0.70233 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1358041 3 0.2760 0.59557 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1468766 1 0.3942 0.69095 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1368200 3 0.4730 0.65329 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1435602 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.4999 0.47048 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1437256 1 0.1211 0.66179 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1487446 3 0.4454 0.68045 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR816653 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR815164 1 0.4790 0.66016 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.4907 0.64251 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1382934 3 0.4624 0.64941 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1465208 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1314728 3 0.0188 0.68941 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1470291 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1308756 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1409600 3 0.2281 0.71180 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR816123 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614779 3 0.3726 0.70046 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR810783 1 0.0469 0.69535 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1333990 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1410356 3 0.1716 0.68021 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR808106 1 0.2469 0.63240 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR662713 1 0.4331 0.66965 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.0592 0.69620 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR809382 3 0.4605 0.65133 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR665417 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1088016 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.4605 0.65133 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1413787 3 0.4624 0.64943 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1478207 1 0.4761 0.57824 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1411046 3 0.3801 0.43428 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0336 0.69458 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309051 3 0.2408 0.62742 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1074956 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1319221 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1405413 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR607807 1 0.3610 0.69735 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1390160 3 0.4624 0.64941 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1406283 3 0.0592 0.69276 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.3975 0.69301 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1312766 3 0.2081 0.69101 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1361612 3 0.2281 0.63657 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1311224 3 0.1792 0.66515 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1087801 1 0.3486 0.69161 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1099720 2 0.0188 0.99547 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1349250 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.4331 0.67649 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.4605 0.65133 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1332879 3 0.4761 -0.08475 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1403177 3 0.4679 0.64407 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1076144 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1485678 1 0.2408 0.69391 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1092232 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1344253 3 0.2469 0.71144 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1384290 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1089349 3 0.4331 0.23187 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1343522 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.1302 0.65748 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR818372 1 0.3444 0.50644 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1323675 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310031 3 0.4431 0.66795 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR615419 1 0.4356 0.17630 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1436925 1 0.4134 0.69541 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1477238 1 0.4543 0.68723 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1332566 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1490228 3 0.4855 0.61450 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1442949 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1466239 3 0.4040 0.35399 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 3 0.2149 0.69239 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0336 0.99191 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1322981 3 0.2760 0.70038 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4564 0.65475 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR660522 3 0.4277 0.68012 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR815374 1 0.2149 0.68688 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1069564 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 3 0.2469 0.71143 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1316438 3 0.4804 0.61958 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1386844 1 0.4605 0.68212 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1373718 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 3 0.1716 0.66814 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.4981 0.54798 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1335489 3 0.2973 0.70621 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1401815 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4193 0.68098 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1098761 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 3 0.4585 0.06890 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR615395 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.4776 0.62613 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 3 0.2081 0.64927 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1418516 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR613174 3 0.2647 0.70865 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1351125 3 0.0817 0.68529 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR659157 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0592 0.69587 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1094168 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 3 0.4817 0.61709 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1085614 2 0.0188 0.99547 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1330106 1 0.0817 0.67606 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1466154 3 0.2149 0.64621 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1396944 1 0.4477 0.68972 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 3 0.3610 0.46856 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR614659 1 0.2868 0.70680 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR659247 1 0.0469 0.69396 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1317201 3 0.4981 -0.38689 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1473696 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1375842 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1416693 1 0.4605 0.68212 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1070841 3 0.4193 0.68831 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1380910 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR612659 1 0.3024 0.53067 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.0469 0.98819 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1345995 3 0.0921 0.68762 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1071035 1 0.1022 0.69954 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1068808 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 3 0.1474 0.67622 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1335355 1 0.4643 0.67914 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR659448 3 0.2408 0.71180 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1323558 3 0.4406 0.66872 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1381711 3 0.4804 0.61958 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR657985 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1314810 3 0.1211 0.68863 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1336505 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1474095 3 0.1118 0.68189 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.1557 0.64837 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.4134 0.68376 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.4356 0.37195 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1380414 3 0.1792 0.70754 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1315912 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 1 0.1637 0.64237 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.4830 0.65024 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1477653 3 0.1118 0.68189 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1355475 3 0.2281 0.70960 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1360785 3 0.4961 0.60141 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR810437 1 0.1637 0.64529 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1361860 1 0.0188 0.69008 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0336 0.69458 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1457619 3 0.4477 0.46381 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1498529 1 0.0707 0.69639 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.2589 0.58065 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1399525 4 0.2081 0.90977 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1312844 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0188 0.69357 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075659 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 3 0.2469 0.71118 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1353353 1 0.2530 0.58593 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1073291 3 0.2530 0.71178 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1356227 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1080720 2 0.0188 0.99547 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1091695 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR663002 3 0.4804 0.61958 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1376983 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4605 0.68212 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1347144 3 0.4477 0.66306 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1384006 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1499108 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614047 3 0.4624 0.65237 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR818440 1 0.4999 0.47997 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1337770 1 0.3907 0.69219 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1399413 1 0.1557 0.65003 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1074041 3 0.4961 -0.00989 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1394495 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.4925 0.61712 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR816699 3 0.0707 0.69302 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1308612 3 0.2589 0.71133 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1499418 1 0.4585 0.56593 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.4855 0.65065 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1331083 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1436698 3 0.0469 0.68739 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1095627 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 3 0.2469 0.71143 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1351236 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1077479 1 0.3942 0.69271 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR814491 3 0.4866 0.61170 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 3 0.4830 -0.18609 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.2868 0.55108 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR615527 1 0.2589 0.58065 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1098216 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1325847 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.0188 0.69351 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1344166 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1368638 1 0.4040 0.25613 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.4564 0.65475 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1502143 3 0.2814 0.70798 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1487614 3 0.4605 0.65133 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.4543 0.68710 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 3 0.1118 0.69635 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1476547 2 0.0469 0.98819 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR656421 3 0.2921 0.57755 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.0469 0.68533 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1339944 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0000 0.69222 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1317155 1 0.0921 0.67297 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1477405 3 0.1716 0.66799 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR655289 1 0.4804 0.65425 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1341683 1 0.0469 0.68503 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1084790 1 0.4843 0.64706 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1073731 1 0.4250 0.67642 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1332588 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1471157 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 3 0.2469 0.71181 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR661028 3 0.1637 0.67110 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 3 0.4941 -0.31751 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1358435 4 0.0188 0.99069 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR2165273 1 0.4564 0.68576 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1379014 1 0.0817 0.69659 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1489904 3 0.2760 0.71026 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1416386 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.4643 0.66508 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR606982 1 0.1022 0.66993 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1358082 1 0.4866 0.63757 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1312934 1 0.0921 0.68004 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR655194 3 0.4996 -0.07955 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0469 0.98819 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1389820 2 0.1406 0.95892 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR1074289 1 0.4624 0.63477 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.4564 0.64277 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.0336 0.68770 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1443507 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1452310 1 0.0921 0.67323 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR665610 3 0.4941 0.60460 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1347322 3 0.2704 0.60081 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR813395 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 3 0.1557 0.67398 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1470230 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1354247 1 0.4431 0.69289 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.0921 0.69351 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1352299 1 0.4843 0.64914 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1076317 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 3 0.4543 0.65992 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1075273 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658657 3 0.4830 0.61358 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1092773 4 0.0921 0.96899 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1365332 3 0.1118 0.68189 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR615958 3 0.4643 0.64838 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1097688 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 3 0.4955 0.55565 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1099120 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.4250 0.68150 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1464856 2 0.0000 0.99883 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.2589 0.58065 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1075923 4 0.0000 0.99404 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 3 0.1792 0.68407 0.068 0.000 0.932 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.3934 0.72320 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1355723 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 3 0.4114 0.30033 0.376 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR657384 3 0.4235 0.17632 0.424 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR1351190 3 0.4341 0.25042 0.404 0.000 0.592 0.000 0.004
#> SRR1458662 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 3 0.2773 0.70936 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1396017 3 0.5682 0.26702 0.372 0.000 0.540 0.000 0.088
#> SRR1410742 3 0.0955 0.76927 0.028 0.000 0.968 0.000 0.004
#> SRR1435963 1 0.3177 0.62591 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1382416 3 0.4138 0.28317 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR1391354 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 3 0.1043 0.76479 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1325138 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.3825 0.66697 0.136 0.000 0.804 0.000 0.060
#> SRR1490178 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4305 0.03636 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1075707 4 0.2929 0.77957 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1443871 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 3 0.3796 0.56286 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1414058 5 0.5039 0.64072 0.080 0.000 0.244 0.000 0.676
#> SRR1407449 1 0.3816 0.50220 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.3283 0.69538 0.832 0.000 0.028 0.000 0.140
#> SRR1399069 3 0.1478 0.75535 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1366450 1 0.6094 0.33299 0.488 0.000 0.384 0.000 0.128
#> SRR1396859 1 0.3452 0.59510 0.756 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.3413 0.71835 0.832 0.000 0.044 0.000 0.124
#> SRR1097666 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.4264 0.38910 0.620 0.000 0.004 0.000 0.376
#> SRR1080560 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 3 0.3816 0.54859 0.304 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.2280 0.64521 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR658152 5 0.2929 0.71375 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1368141 5 0.3612 0.58892 0.000 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1440268 3 0.4114 0.30033 0.376 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR1453725 3 0.6047 -0.16397 0.376 0.000 0.500 0.000 0.124
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 3 0.0510 0.77332 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.2612 0.70621 0.868 0.000 0.008 0.000 0.124
#> SRR1416049 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 3 0.2648 0.69799 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1369052 3 0.0290 0.77384 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1331244 3 0.0404 0.77401 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.4305 0.03636 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1324331 3 0.0703 0.77065 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1458890 5 0.2424 0.74110 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1432695 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087393 2 0.0162 0.98760 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1077263 1 0.6036 0.48853 0.564 0.000 0.276 0.000 0.160
#> SRR1385211 1 0.3950 0.69414 0.796 0.000 0.136 0.000 0.068
#> SRR655241 3 0.4251 0.30151 0.372 0.000 0.624 0.000 0.004
#> SRR656922 3 0.2605 0.71482 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1361630 5 0.2074 0.78143 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1318966 4 0.0703 0.96781 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1407087 3 0.5139 0.48852 0.072 0.000 0.648 0.000 0.280
#> SRR603212 1 0.4449 0.03974 0.512 0.000 0.484 0.000 0.004
#> SRR1321088 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 5 0.2648 0.73076 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1332232 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.3309 0.69852 0.836 0.000 0.036 0.000 0.128
#> SRR1457835 1 0.3875 0.72190 0.804 0.000 0.072 0.000 0.124
#> SRR1347123 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465501 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445064 3 0.3366 0.63503 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1452981 3 0.0290 0.77424 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.1478 0.70877 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1407157 1 0.3177 0.62591 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.1608 0.75238 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1077898 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1349080 3 0.3086 0.68309 0.180 0.000 0.816 0.000 0.004
#> SRR1076096 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.3177 0.62591 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 3 0.3857 0.53538 0.312 0.000 0.688 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.4452 0.57877 0.696 0.000 0.032 0.000 0.272
#> SRR812060 3 0.5565 0.57120 0.216 0.000 0.640 0.000 0.144
#> SRR602082 3 0.3752 0.55719 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1069490 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.4165 0.47847 0.672 0.000 0.008 0.000 0.320
#> SRR1420710 3 0.4192 0.23484 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR660426 1 0.4283 0.11182 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.1965 0.74112 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR661064 3 0.0880 0.76740 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.5218 0.46735 0.604 0.000 0.060 0.000 0.336
#> SRR1353243 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1455482 1 0.3934 0.72213 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1313473 3 0.3932 0.36288 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.4548 0.72015 0.752 0.000 0.124 0.000 0.124
#> SRR1102467 3 0.2424 0.72104 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1317470 5 0.2077 0.79286 0.084 0.000 0.008 0.000 0.908
#> SRR1337707 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 2 0.4746 0.35806 0.000 0.600 0.000 0.024 0.376
#> SRR1398013 3 0.2516 0.71532 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1352918 3 0.4126 0.29667 0.380 0.000 0.620 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1071785 5 0.2329 0.74311 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1353618 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.4049 0.72171 0.792 0.000 0.084 0.000 0.124
#> SRR1355684 1 0.4126 0.28290 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313494 1 0.4049 0.72171 0.792 0.000 0.084 0.000 0.124
#> SRR1309985 3 0.0794 0.77028 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR607911 3 0.2773 0.70936 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.0609 0.77326 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1400078 5 0.6172 0.37682 0.280 0.000 0.176 0.000 0.544
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 5 0.6133 0.26315 0.292 0.000 0.164 0.000 0.544
#> SRR1079434 5 0.4641 0.17936 0.012 0.000 0.456 0.000 0.532
#> SRR1325559 1 0.3752 0.72110 0.812 0.000 0.064 0.000 0.124
#> SRR1446695 1 0.4517 0.26974 0.556 0.000 0.008 0.000 0.436
#> SRR1383883 3 0.4268 0.13464 0.444 0.000 0.556 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.5827 0.33407 0.576 0.000 0.300 0.000 0.124
#> SRR1475697 3 0.5304 0.27668 0.056 0.000 0.560 0.000 0.384
#> SRR1488067 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410380 5 0.2077 0.79286 0.084 0.000 0.008 0.000 0.908
#> SRR1445490 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.2660 0.69882 0.864 0.000 0.008 0.000 0.128
#> SRR1485812 5 0.2230 0.76257 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1078020 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.4305 0.03636 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807775 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820427 5 0.5699 0.53429 0.220 0.000 0.156 0.000 0.624
#> SRR1100656 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.1792 0.65822 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1414536 5 0.2390 0.78901 0.084 0.000 0.020 0.000 0.896
#> SRR656794 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR604653 1 0.4283 0.11182 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485912 1 0.2488 0.70133 0.872 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR1407602 5 0.1410 0.78985 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1356164 3 0.3752 0.51862 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1328692 5 0.4906 0.09139 0.024 0.000 0.480 0.000 0.496
#> SRR1362438 1 0.4410 0.72276 0.764 0.000 0.112 0.000 0.124
#> SRR1479216 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1358041 1 0.3934 0.72213 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1468766 3 0.1638 0.74967 0.064 0.000 0.932 0.000 0.004
#> SRR1368200 1 0.4558 0.66068 0.724 0.000 0.060 0.000 0.216
#> SRR1435602 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437256 5 0.4219 0.28335 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1487446 1 0.3647 0.71731 0.816 0.000 0.052 0.000 0.132
#> SRR816653 1 0.3752 0.72110 0.812 0.000 0.064 0.000 0.124
#> SRR815164 1 0.4287 0.25599 0.540 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR1442043 3 0.1571 0.75193 0.060 0.000 0.936 0.000 0.004
#> SRR1410573 1 0.2488 0.70426 0.872 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.6308 0.31381 0.456 0.000 0.388 0.000 0.156
#> SRR1382934 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465208 3 0.4138 0.29837 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.2377 0.70038 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1470291 1 0.3730 0.56968 0.712 0.000 0.288 0.000 0.000
#> SRR1308756 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1409600 1 0.2971 0.68354 0.836 0.000 0.008 0.000 0.156
#> SRR816123 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 5 0.5901 0.34991 0.116 0.000 0.344 0.000 0.540
#> SRR810783 3 0.0963 0.76596 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.3177 0.62591 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.4201 0.13892 0.592 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR808106 3 0.1671 0.74338 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR662713 3 0.3305 0.62651 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 3 0.0162 0.77459 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR809382 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR665417 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615623 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413787 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478207 3 0.5490 0.28617 0.072 0.000 0.556 0.000 0.372
#> SRR1411046 1 0.3242 0.62554 0.784 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 3 0.0290 0.77424 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.4235 0.18839 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 3 0.2516 0.72142 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1074956 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 3 0.3690 0.61181 0.200 0.000 0.780 0.000 0.020
#> SRR1319221 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405413 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR607807 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 5 0.0290 0.81081 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1406283 1 0.4654 0.46347 0.628 0.000 0.024 0.000 0.348
#> SRR1357709 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.4182 0.33880 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.6060 0.33661 0.492 0.000 0.384 0.000 0.124
#> SRR1361612 1 0.3840 0.72297 0.808 0.000 0.076 0.000 0.116
#> SRR1311224 1 0.3534 0.50939 0.744 0.000 0.256 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.1041 0.77125 0.004 0.000 0.964 0.000 0.032
#> SRR1099720 2 0.0162 0.98760 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349250 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.4425 0.33590 0.600 0.000 0.008 0.000 0.392
#> SRR1074980 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332879 1 0.4104 0.72229 0.788 0.000 0.088 0.000 0.124
#> SRR1403177 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076144 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 3 0.3949 0.48753 0.332 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.3913 0.42399 0.324 0.000 0.676 0.000 0.000
#> SRR1092232 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344253 5 0.5853 -0.06620 0.432 0.000 0.096 0.000 0.472
#> SRR1384290 3 0.3177 0.61931 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.6023 0.40542 0.168 0.000 0.572 0.000 0.260
#> SRR1343522 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 3 0.3534 0.56780 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR818372 1 0.6058 0.46113 0.528 0.000 0.136 0.000 0.336
#> SRR1323675 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819894 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310031 5 0.1608 0.79762 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR615419 5 0.2424 0.74110 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1436925 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 3 0.0880 0.77066 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1332566 3 0.4101 0.31318 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000
#> SRR1490228 5 0.5153 0.61554 0.112 0.000 0.204 0.000 0.684
#> SRR1442949 5 0.2886 0.75157 0.148 0.000 0.008 0.000 0.844
#> SRR1466239 1 0.3934 0.72213 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.2488 0.70144 0.872 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR813076 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0290 0.98399 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1322981 1 0.5617 0.54992 0.620 0.000 0.256 0.000 0.124
#> SRR1485976 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR660522 5 0.3702 0.75897 0.084 0.000 0.096 0.000 0.820
#> SRR815374 1 0.5265 0.60749 0.656 0.000 0.248 0.000 0.096
#> SRR1069564 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 5 0.4252 0.51517 0.280 0.000 0.020 0.000 0.700
#> SRR1316438 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386844 3 0.4305 -0.00699 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR1373718 3 0.3796 0.56286 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.3875 0.72374 0.804 0.000 0.072 0.000 0.124
#> SRR1441421 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.3992 0.72201 0.796 0.000 0.080 0.000 0.124
#> SRR1335489 1 0.3427 0.70441 0.836 0.000 0.056 0.000 0.108
#> SRR1393404 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.4283 0.11182 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1401815 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 5 0.0794 0.80830 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1098761 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.3099 0.71454 0.848 0.000 0.028 0.000 0.124
#> SRR615395 1 0.2773 0.58376 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1479349 3 0.0290 0.77424 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.6202 0.19032 0.496 0.000 0.148 0.000 0.356
#> SRR1089054 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655840 3 0.0693 0.77483 0.008 0.000 0.980 0.000 0.012
#> SRR1379303 1 0.3934 0.72213 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1418516 3 0.1608 0.75158 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR613174 5 0.4864 0.63247 0.164 0.000 0.116 0.000 0.720
#> SRR1351125 1 0.4183 0.50628 0.668 0.000 0.008 0.000 0.324
#> SRR659157 5 0.2329 0.74311 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1480408 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 3 0.0162 0.77459 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1094168 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 5 0.0290 0.81081 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1085614 2 0.0162 0.98760 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1330106 3 0.1732 0.74827 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1466154 1 0.4235 0.18886 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR1396944 3 0.0162 0.77455 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.3934 0.72213 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR614659 3 0.0290 0.77384 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR659247 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.4049 0.72171 0.792 0.000 0.084 0.000 0.124
#> SRR1473696 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1375842 3 0.3752 0.56040 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 3 0.0162 0.77482 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345499 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.4307 0.00630 0.504 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1416693 3 0.4306 -0.02454 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1070841 5 0.6144 0.35112 0.144 0.000 0.344 0.000 0.512
#> SRR1380910 1 0.3895 0.40416 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.3177 0.62591 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR612659 5 0.0162 0.81113 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1447148 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0404 0.98023 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 3 0.4287 0.15099 0.460 0.000 0.540 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.4010 0.64934 0.760 0.000 0.032 0.000 0.208
#> SRR1071035 3 0.0963 0.76814 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1068808 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1335355 3 0.3612 0.63228 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR659448 5 0.4206 0.50714 0.288 0.000 0.016 0.000 0.696
#> SRR1323558 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1381711 5 0.6145 0.30458 0.312 0.000 0.156 0.000 0.532
#> SRR657985 5 0.4986 0.63637 0.084 0.000 0.228 0.000 0.688
#> SRR1314810 1 0.3326 0.69065 0.824 0.000 0.024 0.000 0.152
#> SRR1336505 3 0.1544 0.75360 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1474095 1 0.2329 0.70204 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1363831 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 3 0.3796 0.56632 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 3 0.1894 0.74377 0.072 0.000 0.920 0.000 0.008
#> SRR1313406 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1084867 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 3 0.3970 0.64870 0.236 0.000 0.744 0.000 0.020
#> SRR1380414 1 0.6215 0.20395 0.448 0.000 0.140 0.000 0.412
#> SRR1315912 1 0.4278 0.11705 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR602282 5 0.3774 0.54416 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1361195 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR600493 3 0.4210 0.31633 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.2377 0.70098 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1355475 1 0.5938 0.43536 0.552 0.000 0.128 0.000 0.320
#> SRR1360785 3 0.4420 0.21455 0.448 0.000 0.548 0.000 0.004
#> SRR810437 5 0.4305 0.10569 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1361860 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.3413 0.70213 0.832 0.000 0.044 0.000 0.124
#> SRR1498529 3 0.0162 0.77477 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 5 0.2648 0.73041 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1399525 4 0.1965 0.88458 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1312844 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 3 0.0290 0.77424 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1075659 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1353353 5 0.2329 0.74311 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1073291 5 0.4057 0.71712 0.120 0.000 0.088 0.000 0.792
#> SRR1356227 3 0.4101 0.31236 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0162 0.98760 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091695 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 5 0.4885 0.55562 0.056 0.000 0.276 0.000 0.668
#> SRR663002 5 0.0162 0.81101 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1376983 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 3 0.4114 0.31498 0.376 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR1347144 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1384006 3 0.2424 0.72104 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1499108 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 5 0.2077 0.79071 0.084 0.000 0.008 0.000 0.908
#> SRR818440 1 0.3485 0.72022 0.828 0.000 0.048 0.000 0.124
#> SRR1337770 3 0.0451 0.77464 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1399413 3 0.2233 0.73984 0.104 0.000 0.892 0.000 0.004
#> SRR1385542 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.1571 0.75191 0.060 0.000 0.936 0.000 0.004
#> SRR1074041 3 0.4341 0.41517 0.404 0.000 0.592 0.000 0.004
#> SRR1394495 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.6066 0.32566 0.488 0.000 0.388 0.000 0.124
#> SRR816699 1 0.4696 0.28396 0.556 0.000 0.016 0.000 0.428
#> SRR1308612 1 0.6132 0.16999 0.444 0.000 0.128 0.000 0.428
#> SRR1499418 5 0.0794 0.80694 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1352894 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 3 0.4084 0.54676 0.328 0.000 0.668 0.000 0.004
#> SRR1331083 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1436698 1 0.3816 0.54152 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1095627 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.4723 0.22595 0.536 0.000 0.016 0.000 0.448
#> SRR1351236 1 0.0880 0.68643 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1077479 3 0.0404 0.77403 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.6564 0.12563 0.460 0.000 0.316 0.000 0.224
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4235 0.18622 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 3 0.0290 0.77476 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1309534 3 0.5708 0.15994 0.088 0.000 0.528 0.000 0.384
#> SRR615527 5 0.2329 0.74311 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1098216 3 0.2424 0.72104 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1325847 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 3 0.0000 0.77488 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 3 0.0290 0.77384 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.6396 0.12346 0.376 0.000 0.452 0.000 0.172
#> SRR1431429 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 5 0.2077 0.79286 0.084 0.000 0.008 0.000 0.908
#> SRR1502143 3 0.6092 0.28569 0.256 0.000 0.564 0.000 0.180
#> SRR1487614 5 0.0000 0.81128 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402307 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820810 3 0.2773 0.70936 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.4354 0.59881 0.712 0.000 0.032 0.000 0.256
#> SRR1476547 2 0.0404 0.98023 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR656421 1 0.3934 0.72213 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR1086116 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 3 0.1851 0.74437 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1339944 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 3 0.2329 0.72394 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1431847 5 0.2280 0.74625 0.000 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1317155 3 0.2020 0.73944 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1477405 1 0.0794 0.68745 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.3561 0.51424 0.260 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1341683 3 0.1851 0.74437 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1084790 1 0.4126 0.29000 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.2471 0.68084 0.136 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR1332588 3 0.0404 0.77458 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1471157 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654945 5 0.4538 0.33986 0.364 0.000 0.016 0.000 0.620
#> SRR661028 1 0.1908 0.66386 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.6066 0.34520 0.488 0.000 0.388 0.000 0.124
#> SRR1358435 4 0.0162 0.98842 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR2165273 3 0.2648 0.67054 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1379014 3 0.0404 0.77416 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1489904 5 0.1792 0.79295 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1416386 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.3177 0.62591 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR606982 3 0.1908 0.74401 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1358082 1 0.1792 0.65822 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.4805 0.63388 0.128 0.000 0.728 0.000 0.144
#> SRR655194 1 0.3480 0.58947 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.0404 0.98023 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1389820 2 0.4771 0.21061 0.000 0.552 0.008 0.008 0.432
#> SRR1074289 3 0.4161 0.44076 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 3 0.5192 0.50305 0.076 0.000 0.644 0.000 0.280
#> SRR1395810 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.1478 0.75605 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1443507 1 0.6015 0.37116 0.516 0.000 0.360 0.000 0.124
#> SRR1452310 3 0.2732 0.69786 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR665610 1 0.5882 0.49623 0.588 0.000 0.264 0.000 0.148
#> SRR1347322 1 0.3934 0.72213 0.800 0.000 0.076 0.000 0.124
#> SRR813395 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.3590 0.72245 0.828 0.000 0.080 0.000 0.092
#> SRR1470230 5 0.1195 0.81171 0.028 0.000 0.012 0.000 0.960
#> SRR1354247 3 0.2424 0.72104 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 5 0.6411 0.13017 0.312 0.000 0.196 0.000 0.492
#> SRR1352299 1 0.4740 0.07020 0.516 0.000 0.468 0.000 0.016
#> SRR1076317 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 3 0.6544 0.08538 0.308 0.000 0.468 0.000 0.224
#> SRR1075273 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 5 0.2077 0.79286 0.084 0.000 0.008 0.000 0.908
#> SRR1092773 4 0.0794 0.96341 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1365332 1 0.3399 0.68171 0.812 0.000 0.020 0.000 0.168
#> SRR615958 5 0.1671 0.79585 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1097688 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 5 0.3661 0.59630 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1099120 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362200 5 0.2077 0.79071 0.084 0.000 0.008 0.000 0.908
#> SRR1464856 2 0.0000 0.99101 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 5 0.2329 0.74311 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1075923 4 0.0000 0.99235 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.6077 0.31667 0.480 0.000 0.396 0.000 0.124
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.0146 0.73714 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1436370 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1075752 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.0260 0.71653 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1355723 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329744 4 0.3851 0.16413 0.460 0.000 0.000 0.540 0.000 0.000
#> SRR657384 4 0.6004 0.12440 0.360 0.000 0.132 0.484 0.024 0.000
#> SRR1351190 1 0.5778 0.12982 0.508 0.000 0.112 0.360 0.020 0.000
#> SRR1458662 2 0.3288 0.78375 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR818573 4 0.3377 0.69056 0.056 0.000 0.000 0.808 0.136 0.000
#> SRR1396017 1 0.6432 0.02259 0.436 0.000 0.108 0.388 0.068 0.000
#> SRR1410742 4 0.1168 0.73443 0.016 0.000 0.000 0.956 0.028 0.000
#> SRR1435963 1 0.0458 0.71784 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1382416 4 0.4729 0.43415 0.264 0.000 0.068 0.660 0.008 0.000
#> SRR1391354 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 4 0.1625 0.73285 0.060 0.000 0.000 0.928 0.012 0.000
#> SRR1312244 1 0.1765 0.70739 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 4 0.0146 0.73714 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326821 4 0.2320 0.71677 0.080 0.000 0.004 0.892 0.024 0.000
#> SRR1490178 2 0.3409 0.78674 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR655613 4 0.6680 -0.04890 0.368 0.000 0.080 0.424 0.128 0.000
#> SRR1075707 6 0.5591 0.11125 0.000 0.144 0.000 0.000 0.388 0.468
#> SRR1443871 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 4 0.4150 0.36696 0.392 0.000 0.000 0.592 0.016 0.000
#> SRR1414058 3 0.5042 0.10561 0.000 0.000 0.576 0.332 0.092 0.000
#> SRR1407449 1 0.3958 0.62021 0.764 0.000 0.108 0.128 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.4672 0.49187 0.548 0.000 0.416 0.024 0.012 0.000
#> SRR1399069 4 0.0363 0.73589 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1366450 1 0.6014 0.38036 0.392 0.000 0.368 0.240 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.2219 0.67871 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.2100 0.69150 0.884 0.000 0.112 0.004 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.5395 0.28672 0.556 0.000 0.300 0.000 0.144 0.000
#> SRR1080560 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 4 0.5411 0.41012 0.288 0.000 0.000 0.560 0.152 0.000
#> SRR1435688 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1327614 1 0.1327 0.71230 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.6171 -0.01274 0.008 0.000 0.440 0.240 0.312 0.000
#> SRR1368141 3 0.5391 0.29305 0.000 0.000 0.456 0.112 0.432 0.000
#> SRR1440268 1 0.3860 -0.01826 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1453725 4 0.4262 -0.01484 0.476 0.000 0.016 0.508 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1477930 4 0.0692 0.73670 0.004 0.000 0.000 0.976 0.020 0.000
#> SRR1477591 1 0.2212 0.70260 0.880 0.000 0.112 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416049 2 0.3244 0.78263 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR656275 4 0.3076 0.55015 0.000 0.000 0.240 0.760 0.000 0.000
#> SRR1369052 4 0.0717 0.73760 0.016 0.000 0.000 0.976 0.008 0.000
#> SRR1377735 1 0.0260 0.71678 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 4 0.0632 0.73681 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1404531 4 0.6575 -0.08117 0.380 0.000 0.080 0.428 0.112 0.000
#> SRR1324331 4 0.1267 0.73128 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1458890 3 0.4109 0.35630 0.000 0.000 0.648 0.024 0.328 0.000
#> SRR1432695 2 0.3428 0.78700 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1407624 2 0.1387 0.73118 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1431969 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1087393 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1077263 3 0.6066 -0.32396 0.404 0.000 0.460 0.080 0.056 0.000
#> SRR1385211 1 0.0547 0.71764 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR655241 4 0.5884 0.03456 0.428 0.000 0.108 0.440 0.024 0.000
#> SRR656922 4 0.3123 0.69449 0.040 0.000 0.000 0.824 0.136 0.000
#> SRR1361630 3 0.2752 0.42035 0.036 0.000 0.856 0.000 0.108 0.000
#> SRR1318966 6 0.1261 0.92488 0.000 0.024 0.000 0.000 0.024 0.952
#> SRR1407087 4 0.4884 0.45042 0.024 0.000 0.296 0.636 0.044 0.000
#> SRR603212 4 0.5379 0.09362 0.388 0.000 0.004 0.508 0.100 0.000
#> SRR1321088 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.4921 0.37002 0.000 0.000 0.516 0.064 0.420 0.000
#> SRR1332232 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1312645 1 0.2744 0.68663 0.840 0.000 0.144 0.016 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.1913 0.71026 0.908 0.000 0.080 0.012 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1465501 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1445064 4 0.5662 0.23497 0.000 0.000 0.280 0.524 0.196 0.000
#> SRR1452981 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.2494 0.69069 0.864 0.000 0.016 0.000 0.120 0.000
#> SRR1407157 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.3717 0.78738 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1477316 4 0.1327 0.72060 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1077898 1 0.0520 0.71729 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR1349080 4 0.5009 0.53838 0.128 0.000 0.188 0.672 0.012 0.000
#> SRR1076096 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811261 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.2121 0.69602 0.892 0.000 0.096 0.012 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.3578 0.79107 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR604414 4 0.5454 0.38902 0.300 0.000 0.000 0.548 0.152 0.000
#> SRR1380614 1 0.4635 0.55381 0.672 0.000 0.256 0.008 0.064 0.000
#> SRR812060 4 0.6088 0.46726 0.040 0.000 0.248 0.556 0.156 0.000
#> SRR602082 4 0.5270 0.43580 0.268 0.000 0.000 0.588 0.144 0.000
#> SRR1069490 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR661613 1 0.3706 0.41004 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420710 4 0.6020 -0.16929 0.000 0.000 0.344 0.408 0.248 0.000
#> SRR660426 1 0.6463 0.30750 0.504 0.000 0.060 0.284 0.152 0.000
#> SRR1416003 4 0.4166 0.56854 0.000 0.000 0.076 0.728 0.196 0.000
#> SRR661064 4 0.1075 0.73521 0.048 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1452718 1 0.5310 0.41176 0.512 0.000 0.392 0.092 0.004 0.000
#> SRR1353243 1 0.0260 0.71678 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1313473 4 0.4009 0.34713 0.356 0.000 0.004 0.632 0.008 0.000
#> SRR1399394 1 0.3755 0.67716 0.800 0.000 0.132 0.044 0.024 0.000
#> SRR1102467 4 0.2300 0.69915 0.000 0.000 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1317470 3 0.3867 0.36327 0.072 0.000 0.800 0.024 0.104 0.000
#> SRR1337707 3 0.3620 0.40896 0.000 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1408752 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1474617 5 0.6502 0.11552 0.000 0.316 0.276 0.000 0.388 0.020
#> SRR1398013 4 0.4666 0.50837 0.000 0.000 0.108 0.676 0.216 0.000
#> SRR1352918 4 0.4991 0.14981 0.436 0.000 0.024 0.512 0.028 0.000
#> SRR1420750 1 0.2165 0.70254 0.884 0.000 0.108 0.000 0.008 0.000
#> SRR1071785 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1353618 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.1501 0.73075 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1490313 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.5258 0.39951 0.596 0.000 0.000 0.252 0.152 0.000
#> SRR1323289 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1313494 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1309985 4 0.2092 0.70693 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR607911 4 0.4636 0.61012 0.160 0.000 0.000 0.692 0.148 0.000
#> SRR1333789 4 0.2868 0.67157 0.000 0.000 0.132 0.840 0.028 0.000
#> SRR1400078 3 0.7114 0.12402 0.188 0.000 0.468 0.164 0.180 0.000
#> SRR1088631 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1092842 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 3 0.5523 0.31401 0.156 0.000 0.648 0.040 0.156 0.000
#> SRR1079434 3 0.6172 0.06692 0.004 0.000 0.412 0.304 0.280 0.000
#> SRR1325559 1 0.2165 0.69188 0.884 0.000 0.108 0.008 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.4702 -0.19631 0.388 0.000 0.572 0.024 0.016 0.000
#> SRR1383883 1 0.3684 0.26531 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.6193 0.33628 0.512 0.000 0.276 0.184 0.028 0.000
#> SRR1475697 4 0.6374 -0.03394 0.060 0.000 0.112 0.444 0.384 0.000
#> SRR1488067 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 6 0.1957 0.86465 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1410380 3 0.0914 0.39383 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016 0.000
#> SRR1445490 2 0.0632 0.71604 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1454671 2 0.1267 0.72490 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1435044 1 0.3017 0.67005 0.816 0.000 0.164 0.000 0.020 0.000
#> SRR1485812 3 0.4756 0.39075 0.000 0.000 0.540 0.052 0.408 0.000
#> SRR1078020 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.5423 0.17296 0.488 0.000 0.000 0.392 0.120 0.000
#> SRR1376406 2 0.3747 0.78883 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR1343898 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR807775 3 0.2730 0.45465 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1409215 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR820427 3 0.6611 0.14459 0.116 0.000 0.512 0.264 0.108 0.000
#> SRR1100656 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.2378 0.67964 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1414536 3 0.1341 0.38427 0.000 0.000 0.948 0.024 0.028 0.000
#> SRR656794 1 0.3881 0.54116 0.600 0.000 0.396 0.000 0.004 0.000
#> SRR604653 1 0.6350 0.29120 0.504 0.000 0.048 0.296 0.152 0.000
#> SRR1317685 3 0.3717 0.45104 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1485912 1 0.3023 0.67722 0.784 0.000 0.212 0.000 0.004 0.000
#> SRR1407602 3 0.4305 0.42190 0.000 0.000 0.544 0.020 0.436 0.000
#> SRR1356164 4 0.4686 0.43737 0.000 0.000 0.092 0.660 0.248 0.000
#> SRR1328692 4 0.6486 -0.29613 0.016 0.000 0.336 0.340 0.308 0.000
#> SRR1362438 1 0.5542 0.57506 0.636 0.000 0.208 0.040 0.116 0.000
#> SRR1479216 3 0.3076 0.46376 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1358041 1 0.2165 0.69188 0.884 0.000 0.108 0.008 0.000 0.000
#> SRR1468766 4 0.1714 0.71133 0.000 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.3562 0.58772 0.756 0.000 0.224 0.008 0.012 0.000
#> SRR1435602 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1501043 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1437256 5 0.6117 -0.12319 0.000 0.000 0.300 0.348 0.352 0.000
#> SRR1487446 1 0.2872 0.67590 0.832 0.000 0.152 0.004 0.012 0.000
#> SRR816653 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.3733 0.50968 0.700 0.000 0.008 0.288 0.004 0.000
#> SRR1442043 4 0.1572 0.73062 0.036 0.000 0.000 0.936 0.028 0.000
#> SRR1410573 1 0.0260 0.71678 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1352369 1 0.6955 0.20005 0.380 0.000 0.212 0.340 0.068 0.000
#> SRR1382934 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1465208 1 0.3833 0.12384 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.2996 0.65675 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.4235 0.61818 0.724 0.000 0.084 0.192 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.1910 0.43078 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1409600 1 0.3758 0.59493 0.668 0.000 0.324 0.000 0.008 0.000
#> SRR816123 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614779 3 0.5613 0.23229 0.028 0.000 0.620 0.196 0.156 0.000
#> SRR810783 4 0.3470 0.66855 0.052 0.000 0.152 0.796 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.6972 0.42790 0.440 0.000 0.300 0.108 0.152 0.000
#> SRR808106 4 0.3440 0.61514 0.000 0.000 0.196 0.776 0.028 0.000
#> SRR662713 4 0.5431 0.53948 0.172 0.000 0.096 0.668 0.064 0.000
#> SRR1447058 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 4 0.0260 0.73790 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR809382 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR665417 4 0.0260 0.73680 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1088016 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453166 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1077781 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR615623 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1413787 3 0.3695 0.45245 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1478207 3 0.5847 0.15169 0.024 0.000 0.556 0.280 0.140 0.000
#> SRR1411046 1 0.1196 0.71738 0.952 0.000 0.008 0.040 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.3464 0.78777 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1326560 4 0.0713 0.73674 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.6584 0.48427 0.548 0.000 0.176 0.156 0.120 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 4 0.2536 0.70883 0.020 0.000 0.000 0.864 0.116 0.000
#> SRR1074956 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR817210 4 0.5269 0.52008 0.220 0.000 0.108 0.648 0.024 0.000
#> SRR1319221 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1405413 1 0.0865 0.71570 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR607807 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.3819 0.42763 0.000 0.000 0.624 0.004 0.372 0.000
#> SRR1406283 1 0.3991 0.34540 0.524 0.000 0.472 0.000 0.004 0.000
#> SRR1357709 4 0.0713 0.73309 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1080742 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.3101 0.53842 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.6014 0.42834 0.484 0.000 0.300 0.208 0.008 0.000
#> SRR1361612 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.6041 0.56580 0.616 0.000 0.132 0.100 0.152 0.000
#> SRR1087801 4 0.0984 0.73937 0.012 0.000 0.012 0.968 0.008 0.000
#> SRR1099720 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1349250 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 3 0.4991 -0.17506 0.436 0.000 0.512 0.024 0.028 0.000
#> SRR1074980 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1332879 1 0.1168 0.71891 0.956 0.000 0.000 0.028 0.016 0.000
#> SRR1403177 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1076144 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1069614 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 4 0.5411 0.37679 0.288 0.000 0.000 0.560 0.152 0.000
#> SRR1485678 4 0.5176 0.28018 0.352 0.000 0.100 0.548 0.000 0.000
#> SRR1092232 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1344253 3 0.7083 -0.18625 0.356 0.000 0.376 0.160 0.108 0.000
#> SRR1384290 4 0.3390 0.54889 0.296 0.000 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.5921 0.03965 0.064 0.000 0.516 0.356 0.064 0.000
#> SRR1343522 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1326727 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1440940 4 0.5569 0.23920 0.000 0.000 0.196 0.548 0.256 0.000
#> SRR818372 1 0.5977 0.28958 0.532 0.000 0.328 0.056 0.084 0.000
#> SRR1323675 2 0.0260 0.70937 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR819894 4 0.0632 0.73421 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1310031 3 0.3175 0.46434 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR615419 3 0.4109 0.35630 0.000 0.000 0.648 0.024 0.328 0.000
#> SRR1436925 4 0.0146 0.73806 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1477238 4 0.1863 0.71816 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR1332566 4 0.3774 0.28449 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.4882 0.27405 0.004 0.000 0.672 0.188 0.136 0.000
#> SRR1442949 3 0.4475 0.33770 0.112 0.000 0.748 0.024 0.116 0.000
#> SRR1466239 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1329971 1 0.4103 0.59997 0.672 0.000 0.304 0.012 0.012 0.000
#> SRR813076 2 0.0713 0.71752 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1097642 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1322981 1 0.6039 0.36737 0.420 0.000 0.300 0.280 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1471713 3 0.3076 0.46376 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR660522 3 0.2255 0.34193 0.000 0.000 0.892 0.080 0.028 0.000
#> SRR815374 1 0.4430 0.61637 0.744 0.000 0.108 0.132 0.016 0.000
#> SRR1069564 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 3 0.4803 0.32308 0.200 0.000 0.684 0.008 0.108 0.000
#> SRR1316438 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1386844 1 0.3531 0.37180 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000
#> SRR1373718 4 0.5270 0.45815 0.268 0.000 0.000 0.588 0.144 0.000
#> SRR1447458 2 0.3198 0.78090 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1487128 1 0.1088 0.71986 0.960 0.000 0.024 0.016 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.3765 0.78746 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR1460296 1 0.0622 0.71803 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1335489 1 0.2587 0.70213 0.868 0.000 0.108 0.020 0.004 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.5565 0.22638 0.508 0.000 0.000 0.340 0.152 0.000
#> SRR1401815 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1071337 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1331793 2 0.3175 0.78036 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1410510 3 0.3647 0.45652 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1098761 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.2218 0.69611 0.884 0.000 0.104 0.012 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.6338 0.47803 0.508 0.000 0.292 0.048 0.152 0.000
#> SRR1479349 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.6237 -0.07563 0.368 0.000 0.448 0.156 0.028 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816201 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR655840 4 0.0820 0.73554 0.012 0.000 0.000 0.972 0.016 0.000
#> SRR1379303 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.1501 0.71462 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR613174 3 0.2265 0.37137 0.056 0.000 0.904 0.012 0.028 0.000
#> SRR1351125 3 0.5475 -0.12474 0.416 0.000 0.460 0.000 0.124 0.000
#> SRR659157 3 0.4026 0.41559 0.000 0.000 0.612 0.012 0.376 0.000
#> SRR1480408 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1332526 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 3 0.4377 0.41925 0.000 0.000 0.540 0.024 0.436 0.000
#> SRR1085614 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1330106 4 0.2260 0.67216 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1466154 1 0.6851 0.45919 0.508 0.000 0.200 0.140 0.152 0.000
#> SRR1396944 4 0.0260 0.73796 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1082784 2 0.0865 0.72081 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1457267 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR614659 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659247 4 0.2697 0.66190 0.000 0.000 0.188 0.812 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0717 0.71701 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.1387 0.71189 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 4 0.5331 0.43872 0.268 0.000 0.000 0.580 0.152 0.000
#> SRR1388123 2 0.3499 0.78874 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1096363 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 4 0.2605 0.68680 0.000 0.000 0.108 0.864 0.028 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 4 0.5654 -0.00719 0.404 0.000 0.000 0.444 0.152 0.000
#> SRR1416693 1 0.3515 0.38324 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.4923 0.17829 0.076 0.000 0.660 0.248 0.016 0.000
#> SRR1380910 1 0.4964 0.49323 0.648 0.000 0.000 0.200 0.152 0.000
#> SRR1333125 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1498183 1 0.2218 0.69353 0.884 0.000 0.104 0.012 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.3672 0.45413 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1447148 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658597 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 2 0.3915 0.78417 0.000 0.584 0.000 0.000 0.412 0.004
#> SRR1074263 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1376786 4 0.7053 -0.03311 0.352 0.000 0.116 0.388 0.144 0.000
#> SRR1345995 1 0.4019 0.51893 0.652 0.000 0.332 0.004 0.012 0.000
#> SRR1071035 4 0.0937 0.73565 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1068808 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.2454 0.69418 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 4 0.5314 0.47447 0.264 0.000 0.000 0.584 0.152 0.000
#> SRR659448 3 0.3743 0.32465 0.160 0.000 0.788 0.024 0.028 0.000
#> SRR1323558 3 0.3076 0.46376 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1381711 3 0.6172 0.02645 0.188 0.000 0.520 0.264 0.028 0.000
#> SRR657985 3 0.4210 0.12971 0.000 0.000 0.672 0.288 0.040 0.000
#> SRR1314810 1 0.3314 0.62109 0.740 0.000 0.256 0.000 0.004 0.000
#> SRR1336505 4 0.0547 0.73439 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1474095 1 0.0790 0.71807 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.3647 0.78989 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360 0.000
#> SRR1442376 4 0.0146 0.73714 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1074909 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 4 0.5258 0.56954 0.136 0.000 0.036 0.676 0.152 0.000
#> SRR1075408 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 4 0.3586 0.61480 0.000 0.000 0.216 0.756 0.028 0.000
#> SRR1313406 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 3 0.2996 0.46218 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1084867 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.1714 0.73944 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1443113 4 0.6585 0.46134 0.148 0.000 0.180 0.548 0.124 0.000
#> SRR1380414 3 0.4639 -0.01236 0.304 0.000 0.644 0.036 0.016 0.000
#> SRR1315912 1 0.6414 0.31041 0.508 0.000 0.056 0.284 0.152 0.000
#> SRR1075778 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1421116 2 0.3727 0.78928 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR602282 3 0.5744 0.20499 0.000 0.000 0.424 0.168 0.408 0.000
#> SRR1361195 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR600493 4 0.6828 0.01824 0.380 0.000 0.080 0.388 0.152 0.000
#> SRR1477653 1 0.2915 0.66347 0.808 0.000 0.184 0.000 0.008 0.000
#> SRR1355475 3 0.5585 -0.20195 0.380 0.000 0.520 0.068 0.032 0.000
#> SRR1360785 4 0.6452 0.09946 0.324 0.000 0.212 0.436 0.028 0.000
#> SRR810437 4 0.6123 -0.29785 0.000 0.000 0.344 0.348 0.308 0.000
#> SRR1361860 4 0.0146 0.73714 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1441311 2 0.3409 0.78674 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1098903 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.2924 0.68521 0.840 0.000 0.136 0.012 0.012 0.000
#> SRR1498529 4 0.0547 0.73749 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.1327 0.72963 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1074017 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1472033 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1445087 3 0.4787 0.38810 0.000 0.000 0.516 0.052 0.432 0.000
#> SRR1399525 6 0.2457 0.83371 0.000 0.084 0.000 0.000 0.036 0.880
#> SRR1312844 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 4 0.0146 0.73714 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1075659 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 3 0.3076 0.46376 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1353353 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1073291 3 0.2904 0.42371 0.008 0.000 0.852 0.028 0.112 0.000
#> SRR1356227 4 0.3747 0.29676 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1091695 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 3 0.6672 -0.02399 0.036 0.000 0.408 0.256 0.300 0.000
#> SRR663002 3 0.3765 0.44681 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1376983 2 0.3428 0.78700 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1399926 1 0.3843 0.03271 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.3076 0.46376 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1384006 4 0.2553 0.69597 0.008 0.000 0.000 0.848 0.144 0.000
#> SRR1499108 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614047 3 0.1714 0.42955 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR818440 1 0.2255 0.68541 0.892 0.000 0.004 0.016 0.088 0.000
#> SRR1337770 4 0.0146 0.73767 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1399413 4 0.2912 0.69165 0.000 0.000 0.116 0.844 0.040 0.000
#> SRR1385542 2 0.3175 0.78012 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1473959 4 0.2344 0.71363 0.076 0.000 0.004 0.892 0.028 0.000
#> SRR1074041 4 0.7335 0.14973 0.188 0.000 0.272 0.396 0.144 0.000
#> SRR1394495 2 0.3266 0.78387 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR659460 1 0.6586 0.32401 0.428 0.000 0.260 0.280 0.032 0.000
#> SRR816699 3 0.5408 -0.30105 0.384 0.000 0.508 0.004 0.104 0.000
#> SRR1308612 3 0.5853 -0.01597 0.364 0.000 0.504 0.028 0.104 0.000
#> SRR1499418 3 0.4254 0.43157 0.000 0.000 0.576 0.020 0.404 0.000
#> SRR1352894 2 0.1556 0.73604 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR815805 4 0.4427 0.58851 0.136 0.000 0.000 0.716 0.148 0.000
#> SRR1331083 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 3 0.2631 0.44225 0.000 0.000 0.840 0.008 0.152 0.000
#> SRR1436698 1 0.3742 0.53575 0.648 0.000 0.348 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095627 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 3 0.5688 -0.15371 0.340 0.000 0.540 0.092 0.028 0.000
#> SRR1351236 1 0.2048 0.69202 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1077479 4 0.0260 0.73745 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.6409 0.18178 0.436 0.000 0.340 0.196 0.028 0.000
#> SRR1101256 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1436004 1 0.6843 0.46219 0.508 0.000 0.204 0.136 0.152 0.000
#> SRR1457994 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 4 0.0260 0.73851 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1309534 4 0.6742 -0.06152 0.048 0.000 0.224 0.420 0.308 0.000
#> SRR615527 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1098216 4 0.2553 0.69597 0.008 0.000 0.000 0.848 0.144 0.000
#> SRR1325847 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 4 0.0000 0.73761 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 4 0.0632 0.73587 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1368638 1 0.6839 0.15187 0.436 0.000 0.196 0.300 0.068 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 6 0.1910 0.86917 0.000 0.000 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1080509 2 0.1204 0.72724 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR815759 3 0.2445 0.40594 0.000 0.000 0.872 0.020 0.108 0.000
#> SRR1502143 3 0.5585 -0.09532 0.148 0.000 0.488 0.364 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1402307 2 0.0865 0.72081 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR820810 4 0.4196 0.65052 0.116 0.000 0.000 0.740 0.144 0.000
#> SRR1099212 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1083215 1 0.4792 0.58414 0.672 0.000 0.240 0.076 0.012 0.000
#> SRR1476547 2 0.3915 0.78417 0.000 0.584 0.000 0.000 0.412 0.004
#> SRR656421 1 0.0405 0.71721 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0865 0.72081 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1499917 4 0.4456 0.55231 0.000 0.000 0.112 0.708 0.180 0.000
#> SRR1339944 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1391444 2 0.3634 0.78987 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1434889 4 0.2135 0.70585 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1431847 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1317155 4 0.2730 0.62702 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1477405 1 0.1957 0.69491 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR655289 4 0.3634 0.47225 0.296 0.000 0.008 0.696 0.000 0.000
#> SRR1341683 4 0.2762 0.62278 0.000 0.000 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1084790 1 0.5537 0.46978 0.624 0.000 0.024 0.200 0.152 0.000
#> SRR1073731 4 0.2340 0.66224 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1332588 4 0.1075 0.72740 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1471157 2 0.3409 0.78674 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR654945 3 0.3447 0.31867 0.164 0.000 0.800 0.024 0.012 0.000
#> SRR661028 1 0.5286 0.61362 0.676 0.000 0.132 0.040 0.152 0.000
#> SRR1413477 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1101152 1 0.4961 0.35487 0.572 0.000 0.080 0.348 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.3862 0.45627 0.000 0.004 0.000 0.000 0.388 0.608
#> SRR2165273 4 0.3746 0.61876 0.192 0.000 0.048 0.760 0.000 0.000
#> SRR1379014 4 0.0632 0.73681 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.2941 0.46071 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1416386 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.2003 0.68747 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR606982 4 0.1908 0.70325 0.004 0.000 0.000 0.900 0.096 0.000
#> SRR1358082 1 0.0547 0.71660 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1312934 4 0.3641 0.54050 0.000 0.000 0.248 0.732 0.020 0.000
#> SRR655194 1 0.3520 0.66556 0.820 0.000 0.108 0.056 0.016 0.000
#> SRR1331174 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1473251 2 0.3915 0.78417 0.000 0.584 0.000 0.000 0.412 0.004
#> SRR1389820 5 0.6039 0.04657 0.000 0.332 0.260 0.000 0.408 0.000
#> SRR1074289 4 0.6966 0.34249 0.184 0.000 0.180 0.492 0.144 0.000
#> SRR1348816 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1076292 4 0.5192 0.49879 0.072 0.000 0.252 0.644 0.032 0.000
#> SRR1395810 2 0.3659 0.78990 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1498909 4 0.0458 0.73568 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1443507 1 0.6420 0.46356 0.512 0.000 0.296 0.112 0.080 0.000
#> SRR1452310 4 0.4074 0.59118 0.000 0.000 0.092 0.748 0.160 0.000
#> SRR665610 1 0.6647 0.25840 0.368 0.000 0.308 0.296 0.028 0.000
#> SRR1347322 1 0.0260 0.71691 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.2191 0.69673 0.876 0.000 0.120 0.004 0.000 0.000
#> SRR1470230 3 0.3563 0.45964 0.000 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1354247 4 0.2553 0.69597 0.008 0.000 0.000 0.848 0.144 0.000
#> SRR1082640 2 0.0000 0.70572 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 3 0.5020 0.14625 0.312 0.000 0.616 0.044 0.028 0.000
#> SRR1352299 1 0.5324 0.11282 0.468 0.000 0.000 0.428 0.104 0.000
#> SRR1076317 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 3 0.5649 0.16081 0.164 0.000 0.600 0.216 0.020 0.000
#> SRR1075273 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658657 3 0.2911 0.40093 0.000 0.000 0.832 0.024 0.144 0.000
#> SRR1092773 6 0.2201 0.86994 0.000 0.028 0.000 0.000 0.076 0.896
#> SRR1365332 1 0.4798 0.54857 0.620 0.000 0.300 0.080 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.3076 0.46411 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1097688 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 5 0.5983 -0.22609 0.000 0.000 0.384 0.228 0.388 0.000
#> SRR1099120 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 3 0.1957 0.43177 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1464856 2 0.3782 0.78729 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1347298 3 0.3774 0.44534 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1075923 6 0.0000 0.96895 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.5863 0.41689 0.492 0.000 0.336 0.164 0.008 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.432 0.568 0.568
#> 3 3 0.951 0.961 0.944 0.104 0.954 0.919
#> 4 4 0.746 0.923 0.899 0.165 0.947 0.899
#> 5 5 0.575 0.625 0.803 0.179 0.862 0.708
#> 6 6 0.522 0.541 0.703 0.135 0.792 0.494
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 1 0 1 1 0
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 1 0 1 1 0
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 1 0 1 1 0
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 1 0 1 1 0
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 1 0 1 1 0
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1075752 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397949 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355723 1 0.5859 0.600 0.656 0.344 0.000
#> SRR1329744 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR818573 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396017 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087968 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1310075 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR655613 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443871 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1102489 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407449 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1479109 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399069 1 0.4555 0.790 0.800 0.200 0.000
#> SRR1366450 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080560 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322882 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1327614 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368141 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440268 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1477930 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR656275 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369052 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432695 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1407624 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1431969 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1077263 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361630 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318966 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407087 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR603212 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321088 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1485190 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332232 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1312645 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465501 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330878 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445064 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452981 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1397697 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1477316 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076096 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR811261 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR604414 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.2959 0.895 0.900 0.100 0.000
#> SRR812060 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR602082 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078417 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR661613 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420710 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR661064 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1452718 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455482 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317470 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337707 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408752 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1474617 1 0.6839 0.547 0.624 0.352 0.024
#> SRR1398013 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352918 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353618 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1082217 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1357256 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1490313 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR1313494 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1092842 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR615575 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079434 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488067 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102103 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1105154 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084991 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410380 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445490 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1454671 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1435044 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485812 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078020 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1311153 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1343898 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR807775 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR820427 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100656 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR656794 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317685 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485912 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 1 0.1964 0.937 0.944 0.056 0.000
#> SRR1356164 1 0.5859 0.600 0.656 0.344 0.000
#> SRR1328692 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362438 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358041 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368200 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1501043 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR1437256 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487446 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR816653 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1352369 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.2356 0.922 0.928 0.072 0.000
#> SRR1465208 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR816123 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR614779 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR810783 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR808106 1 0.3941 0.838 0.844 0.156 0.000
#> SRR662713 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1480964 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR809382 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR665417 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 3 0.5621 0.133 0.000 0.308 0.692
#> SRR1453166 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069826 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1077781 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR615623 1 0.4555 0.789 0.800 0.200 0.000
#> SRR1413787 1 0.1163 0.961 0.972 0.028 0.000
#> SRR1478207 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1411046 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1326560 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1395616 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092961 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR817210 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319221 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR1405413 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR607807 1 0.5859 0.600 0.656 0.344 0.000
#> SRR1390160 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406283 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468208 1 0.0592 0.974 0.988 0.012 0.000
#> SRR1312766 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087801 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1349250 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350912 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1357127 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1317022 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332879 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR1076144 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1069614 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR818239 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421069 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500006 1 0.3752 0.851 0.856 0.144 0.000
#> SRR1485678 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092232 1 0.4555 0.789 0.800 0.200 0.000
#> SRR1344253 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1326727 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1440940 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR818372 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323675 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR819894 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310031 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR615419 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442949 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466239 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1329971 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1097642 3 0.6267 -0.542 0.000 0.452 0.548
#> SRR1322981 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1471713 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR660522 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR815374 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069564 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416337 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316438 1 0.3941 0.839 0.844 0.156 0.000
#> SRR1386844 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1487128 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1069919 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1460296 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1081425 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401815 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR1071337 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1071983 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1331793 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1410510 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098761 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR816201 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR655840 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379303 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR613174 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351125 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR659157 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480408 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR657857 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1332526 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094168 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431270 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085614 3 0.4504 0.569 0.000 0.196 0.804
#> SRR1330106 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466154 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396944 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1457267 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR659247 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1096363 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1353499 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1498183 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447148 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR658597 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089595 3 0.6215 -0.457 0.000 0.428 0.572
#> SRR1074263 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1376786 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345995 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071035 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068808 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332754 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR662438 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323558 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381711 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR657985 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314810 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474095 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1442376 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074909 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101200 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1367150 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1068880 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1467277 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1095431 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380184 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1443113 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315912 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1421116 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR602282 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR1361195 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR600493 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477653 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR810437 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361860 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1098903 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457619 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1074017 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1472033 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1445087 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399525 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312844 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085874 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101226 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311916 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.0747 0.971 0.984 0.016 0.000
#> SRR1073291 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1091695 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350304 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR663002 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376983 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1399926 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499108 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR614047 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR818440 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337770 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385542 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1473959 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074041 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394495 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR659460 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR816699 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308612 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499418 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352894 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR815805 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331083 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR808272 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436698 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1436004 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1078998 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1314707 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 1 0.5905 0.589 0.648 0.352 0.000
#> SRR1098216 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325847 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404003 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344166 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1079237 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080509 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR815759 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1502143 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487614 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402307 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR820810 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099212 3 0.4750 0.509 0.000 0.216 0.784
#> SRR1083215 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR656421 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1499917 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1391444 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1434889 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431847 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317155 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477405 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341683 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084790 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073731 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332588 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR654945 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1101152 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358435 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416386 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358082 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR655194 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1473251 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389820 1 0.6839 0.547 0.624 0.352 0.024
#> SRR1074289 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348816 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1076292 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1498909 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443507 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354247 1 0.3879 0.843 0.848 0.152 0.000
#> SRR1082640 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1487592 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352299 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076317 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1434117 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075273 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR658657 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092773 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365332 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR615958 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097688 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403259 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099120 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362200 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464856 2 0.5905 1.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1347298 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075923 3 0.0000 0.956 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100703 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.0921 0.927 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1436370 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1397949 1 0.2704 0.919 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1355723 3 0.1724 0.809 0.020 0.000 0.948 0.032
#> SRR1329744 1 0.2714 0.925 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR657384 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1351190 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1458662 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.2760 0.919 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1396017 1 0.0469 0.921 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1410742 1 0.0817 0.926 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1435963 1 0.3052 0.916 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1382416 3 0.5884 0.528 0.364 0.000 0.592 0.044
#> SRR1391354 1 0.1557 0.912 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1087968 2 0.0336 0.986 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1310075 1 0.1743 0.916 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1312244 1 0.2999 0.914 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1325138 1 0.1211 0.912 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1326821 1 0.1389 0.925 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1490178 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.2345 0.926 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1075707 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1443871 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1465758 1 0.1978 0.908 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1414058 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1407449 1 0.2944 0.915 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1436858 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479109 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1399069 3 0.4731 0.732 0.160 0.000 0.780 0.060
#> SRR1366450 1 0.2589 0.925 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1396859 1 0.3105 0.917 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1457176 1 0.2868 0.915 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1097666 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1434736 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1080560 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1322882 1 0.2999 0.919 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1435688 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.1743 0.921 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR658152 1 0.0804 0.919 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1368141 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1440268 1 0.1489 0.914 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1453725 1 0.2469 0.922 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1325711 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.1867 0.918 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1477591 1 0.3105 0.915 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1416049 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.0469 0.923 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1369052 1 0.3257 0.913 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1377735 1 0.3052 0.916 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1331244 1 0.1489 0.912 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1404531 1 0.1637 0.910 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1324331 1 0.1489 0.910 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1458890 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1432695 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087393 2 0.1389 0.930 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1077263 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1385211 1 0.3052 0.914 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR655241 1 0.1545 0.908 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR656922 1 0.2868 0.920 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1361630 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318966 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1407087 1 0.0188 0.923 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR603212 1 0.0336 0.923 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1321088 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485190 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1332232 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1457835 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1347123 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1465501 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1330878 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1445064 1 0.1302 0.929 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1452981 1 0.1211 0.920 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1326708 1 0.3052 0.916 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1407157 1 0.2760 0.921 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1365401 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1397697 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0592 0.920 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1077898 1 0.3052 0.914 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1349080 1 0.0592 0.921 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1076096 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR811261 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1375485 1 0.2999 0.914 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1432563 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.3024 0.917 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1380614 3 0.5136 0.680 0.224 0.000 0.728 0.048
#> SRR812060 1 0.1118 0.929 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR602082 1 0.1824 0.908 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1069490 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1078417 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1420710 1 0.0336 0.923 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR660426 1 0.3157 0.917 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1416003 1 0.0707 0.927 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR661064 1 0.2466 0.929 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR1082011 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.5328 0.530 0.704 0.000 0.248 0.048
#> SRR1353243 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1455482 1 0.2593 0.924 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR1313473 1 0.3257 0.913 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1399394 1 0.2814 0.917 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1102467 1 0.1792 0.909 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1317470 1 0.1716 0.928 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1337707 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1408752 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.0524 0.812 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1398013 1 0.0657 0.920 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1352918 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1420750 1 0.2999 0.914 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1071785 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1353618 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082217 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357256 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.1022 0.927 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1366560 1 0.3105 0.915 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1355684 1 0.3157 0.916 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1323289 3 0.0524 0.812 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1313494 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1309985 1 0.2345 0.928 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR607911 1 0.2999 0.919 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1333789 1 0.1940 0.930 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1400078 1 0.2011 0.927 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1088631 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR615575 1 0.2530 0.920 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1079434 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325559 1 0.2999 0.916 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1446695 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1383883 1 0.1854 0.903 0.940 0.000 0.012 0.048
#> SRR1396100 1 0.1302 0.929 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1475697 1 0.4225 0.693 0.792 0.000 0.184 0.024
#> SRR1488067 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1102103 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1105154 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1084991 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1410380 1 0.0921 0.928 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1445490 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435044 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1485812 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1078020 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311153 1 0.1824 0.908 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1376406 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0188 0.814 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR807775 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409215 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1100656 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1362159 1 0.2921 0.918 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1414536 1 0.2408 0.922 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR656794 1 0.2999 0.914 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR604653 1 0.2530 0.917 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1317685 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1485912 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1407602 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1356164 3 0.0779 0.814 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1328692 1 0.5560 0.109 0.584 0.000 0.392 0.024
#> SRR1362438 1 0.3105 0.914 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1479216 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358041 1 0.2868 0.915 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1468766 1 0.1022 0.916 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1368200 1 0.2868 0.915 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1435602 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1501043 3 0.0188 0.814 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1437256 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1487446 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR816653 1 0.2999 0.914 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR815164 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1442043 1 0.0817 0.919 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1410573 1 0.3105 0.916 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1096782 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382934 1 0.0657 0.919 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1465208 1 0.3105 0.914 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1314728 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1470291 1 0.3052 0.922 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1308756 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409600 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR816123 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR614779 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810783 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1333990 1 0.3052 0.918 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1410356 1 0.1389 0.916 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR808106 3 0.4491 0.745 0.140 0.000 0.800 0.060
#> SRR662713 1 0.1389 0.916 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1447058 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480964 1 0.2704 0.921 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR809382 1 0.0336 0.925 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR665417 1 0.1722 0.904 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR1088016 4 0.4564 0.798 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1453166 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1069826 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 1 0.2011 0.887 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1413787 1 0.0469 0.920 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1478207 1 0.0469 0.926 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1411046 1 0.1576 0.928 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1313711 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1398 0.911 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1309051 1 0.1576 0.914 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1486949 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1395616 1 0.1902 0.906 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1074956 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1092961 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR817210 1 0.2647 0.919 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1319221 3 0.0524 0.812 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1405413 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR607807 3 0.0927 0.814 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1390160 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406283 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1357709 1 0.1022 0.923 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1080742 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1468208 3 0.5577 0.570 0.328 0.000 0.636 0.036
#> SRR1312766 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1361612 1 0.2999 0.914 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1311224 1 0.2921 0.917 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1087801 1 0.1398 0.910 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1099720 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1350912 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357127 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1074980 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317022 1 0.0336 0.921 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1332879 1 0.3105 0.914 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1403177 3 0.0524 0.812 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1076144 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR818239 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1421069 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1500006 1 0.4010 0.803 0.836 0.000 0.100 0.064
#> SRR1485678 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1092232 1 0.2469 0.866 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1344253 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1384290 1 0.1677 0.908 0.948 0.000 0.012 0.040
#> SRR1089349 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1343522 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR818372 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1323675 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819894 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1310031 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR615419 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436925 1 0.2868 0.917 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1477238 1 0.2048 0.903 0.928 0.000 0.008 0.064
#> SRR1332566 1 0.1576 0.915 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1490228 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1442949 1 0.0336 0.925 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466239 1 0.3105 0.915 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1094003 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR813076 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1097642 2 0.4999 -0.388 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1322981 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1485976 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.0188 0.924 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660522 1 0.1022 0.928 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR815374 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1069564 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1416337 1 0.2149 0.926 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1316438 3 0.3908 0.717 0.212 0.000 0.784 0.004
#> SRR1386844 1 0.1743 0.918 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1373718 1 0.2334 0.917 0.908 0.000 0.004 0.088
#> SRR1447458 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487128 1 0.1118 0.914 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1441421 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069919 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.3052 0.916 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1335489 1 0.0592 0.920 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1393404 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081425 1 0.2469 0.920 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1401815 3 0.1302 0.808 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1071337 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071983 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098761 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1312124 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR615395 1 0.2704 0.919 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1479349 1 0.2266 0.930 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR2165033 1 0.0804 0.919 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1089054 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR816201 1 0.2281 0.928 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1488514 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.2011 0.928 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1379303 1 0.3157 0.915 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1418516 1 0.1452 0.911 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR613174 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1351125 1 0.2408 0.923 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR659157 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1480408 1 0.1474 0.913 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR657857 1 0.1302 0.913 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1073317 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.1867 0.921 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1094168 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1431270 1 0.2149 0.926 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1085614 4 0.3726 0.969 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1330106 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466154 1 0.3074 0.916 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1396944 1 0.2048 0.903 0.928 0.000 0.008 0.064
#> SRR1082784 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.2197 0.926 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR614659 1 0.2760 0.918 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR659247 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1317201 1 0.3052 0.914 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1473696 1 0.2868 0.917 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1375842 1 0.1792 0.909 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1388123 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096363 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1453662 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1345499 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.1716 0.911 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1416693 1 0.1743 0.917 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1070841 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1380910 1 0.2999 0.919 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1333125 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.2944 0.916 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR612659 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1447148 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658597 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1089595 4 0.4998 0.435 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1074263 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.2814 0.918 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1345995 1 0.1867 0.929 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1071035 1 0.1743 0.907 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1068808 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1332754 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662438 1 0.2999 0.917 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1335355 1 0.2973 0.919 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR659448 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1323558 1 0.2530 0.920 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1381711 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657985 1 0.0524 0.921 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1314810 1 0.0469 0.922 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1336505 1 0.0469 0.922 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1474095 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1363831 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0707 0.924 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1074909 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1101200 1 0.1474 0.930 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1075408 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367150 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313406 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1068880 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1467277 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095431 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1380184 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0707 0.920 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1380414 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1315912 1 0.2216 0.924 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1075778 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.0188 0.814 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1361195 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.3024 0.916 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1477653 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1355475 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1360785 1 0.1118 0.914 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR810437 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361860 1 0.1398 0.910 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1441311 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.2814 0.919 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1457619 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1498529 1 0.2868 0.921 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1097172 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.0657 0.919 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1399525 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1312844 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1085874 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1101226 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1476056 1 0.1211 0.912 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1075659 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1311916 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353353 1 0.1004 0.914 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1073291 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1356227 1 0.3157 0.915 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1080720 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1350304 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663002 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1376983 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.1576 0.910 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1347144 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384006 1 0.1978 0.908 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1499108 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR614047 1 0.2530 0.920 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR818440 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1337770 1 0.0817 0.919 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1399413 1 0.0921 0.917 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1385542 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1074041 1 0.2589 0.921 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1394495 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.2647 0.919 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR816699 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1308612 1 0.0707 0.927 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1499418 1 0.0336 0.921 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.1902 0.905 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1331083 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR808272 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436698 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1095627 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1357672 1 0.1637 0.929 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1351236 1 0.2973 0.916 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1077479 1 0.1902 0.905 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR814491 1 0.1302 0.929 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1101256 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.2647 0.923 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1457994 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1314707 1 0.1716 0.907 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1309534 1 0.0804 0.919 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR615527 3 0.0188 0.814 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1098216 1 0.1716 0.907 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1325847 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1404003 1 0.1792 0.930 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1344166 1 0.2814 0.921 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1368638 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1431429 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079237 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1080509 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.0336 0.925 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1502143 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1487614 1 0.0336 0.921 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1402307 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR820810 1 0.2868 0.917 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1099212 4 0.4134 0.906 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1083215 1 0.0336 0.925 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1476547 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR656421 1 0.3105 0.915 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1086116 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499917 1 0.1716 0.928 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1339944 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1391444 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0469 0.923 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1431847 1 0.5161 -0.210 0.520 0.000 0.476 0.004
#> SRR1317155 1 0.1488 0.910 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1477405 1 0.2973 0.916 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR655289 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1341683 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084790 1 0.2760 0.918 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1073731 1 0.2589 0.920 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1332588 1 0.1118 0.929 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1471157 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR654945 1 0.2281 0.924 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR661028 1 0.3105 0.917 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1413477 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.2704 0.917 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1358435 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR2165273 1 0.1767 0.908 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1379014 1 0.1902 0.920 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1489904 1 0.0921 0.928 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1416386 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1406048 1 0.2999 0.914 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR606982 1 0.1109 0.915 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1358082 1 0.2530 0.921 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1312934 1 0.0188 0.923 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR655194 1 0.1661 0.930 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1331174 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 4 0.3610 0.982 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1389820 3 0.0524 0.812 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1074289 1 0.1389 0.916 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1348816 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.0000 0.923 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.2149 0.926 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1443507 1 0.2760 0.916 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1452310 1 0.0188 0.922 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR665610 1 0.1940 0.927 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1347322 1 0.3157 0.915 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR813395 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1477256 1 0.1305 0.918 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1470230 1 0.0376 0.921 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1354247 3 0.6376 0.356 0.432 0.000 0.504 0.064
#> SRR1082640 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487592 1 0.0188 0.924 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352299 1 0.1474 0.913 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1076317 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1434117 1 0.2647 0.918 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1075273 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR658657 1 0.1474 0.928 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1092773 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1365332 1 0.2814 0.915 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR615958 1 0.1389 0.929 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1097688 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1403259 1 0.2530 0.840 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR1099120 4 0.3528 0.984 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1362200 1 0.2589 0.919 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1464856 2 0.0000 0.991 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.0524 0.920 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1075923 4 0.3569 0.984 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1100703 1 0.2647 0.919 0.880 0.000 0.000 0.120
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.3491 0.54694 0.228 0.000 0.768 0.004 0.000
#> SRR1436370 2 0.0162 0.97049 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075752 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1397949 3 0.1251 0.68068 0.036 0.000 0.956 0.008 0.000
#> SRR1355723 5 0.5271 0.73370 0.384 0.000 0.004 0.044 0.568
#> SRR1329744 3 0.2798 0.63755 0.140 0.000 0.852 0.008 0.000
#> SRR657384 3 0.1872 0.66590 0.052 0.000 0.928 0.020 0.000
#> SRR1351190 3 0.2293 0.64445 0.084 0.000 0.900 0.016 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818573 3 0.0955 0.67933 0.028 0.000 0.968 0.004 0.000
#> SRR1396017 3 0.4306 -0.44432 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1410742 3 0.4415 -0.28287 0.444 0.000 0.552 0.004 0.000
#> SRR1435963 3 0.2482 0.64248 0.084 0.000 0.892 0.024 0.000
#> SRR1382416 1 0.4181 0.01841 0.796 0.000 0.052 0.016 0.136
#> SRR1391354 3 0.4620 0.04335 0.392 0.000 0.592 0.016 0.000
#> SRR1087968 2 0.2078 0.94766 0.036 0.924 0.000 0.036 0.004
#> SRR1310075 3 0.4726 0.23876 0.400 0.000 0.580 0.020 0.000
#> SRR1312244 3 0.2300 0.64531 0.072 0.000 0.904 0.024 0.000
#> SRR1325138 3 0.4666 0.00824 0.412 0.000 0.572 0.016 0.000
#> SRR1326821 3 0.3491 0.55467 0.228 0.000 0.768 0.004 0.000
#> SRR1490178 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655613 3 0.3969 0.41154 0.304 0.000 0.692 0.004 0.000
#> SRR1075707 4 0.3771 0.89096 0.036 0.156 0.000 0.804 0.004
#> SRR1443871 2 0.0162 0.97089 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102489 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1465758 3 0.4400 0.37592 0.308 0.000 0.672 0.020 0.000
#> SRR1414058 3 0.4561 -0.46347 0.488 0.000 0.504 0.008 0.000
#> SRR1407449 3 0.2130 0.66105 0.080 0.000 0.908 0.012 0.000
#> SRR1436858 2 0.1828 0.95376 0.032 0.936 0.000 0.028 0.004
#> SRR1479109 3 0.1041 0.67555 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1399069 1 0.6562 -0.24232 0.584 0.000 0.124 0.044 0.248
#> SRR1366450 3 0.2813 0.64320 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1396859 3 0.2951 0.62538 0.112 0.000 0.860 0.028 0.000
#> SRR1457176 3 0.1894 0.66719 0.072 0.000 0.920 0.008 0.000
#> SRR1097666 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1434736 1 0.4656 0.52945 0.508 0.000 0.480 0.012 0.000
#> SRR1080560 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1322882 3 0.3662 0.52262 0.252 0.000 0.744 0.004 0.000
#> SRR1435688 2 0.0794 0.96064 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1327614 3 0.2909 0.63586 0.140 0.000 0.848 0.012 0.000
#> SRR658152 1 0.4827 0.53278 0.504 0.000 0.476 0.000 0.020
#> SRR1368141 1 0.4888 0.54203 0.508 0.000 0.472 0.016 0.004
#> SRR1440268 1 0.4803 0.35769 0.536 0.000 0.444 0.020 0.000
#> SRR1453725 3 0.1041 0.67942 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1325711 2 0.0162 0.96981 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477930 3 0.3814 0.47457 0.276 0.000 0.720 0.004 0.000
#> SRR1477591 3 0.2685 0.63817 0.092 0.000 0.880 0.028 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656275 3 0.4309 0.34789 0.308 0.000 0.676 0.016 0.000
#> SRR1369052 3 0.2390 0.66993 0.084 0.000 0.896 0.020 0.000
#> SRR1377735 3 0.1764 0.66743 0.064 0.000 0.928 0.008 0.000
#> SRR1331244 3 0.5112 -0.11760 0.468 0.000 0.496 0.036 0.000
#> SRR1404531 1 0.3720 0.49870 0.760 0.000 0.228 0.012 0.000
#> SRR1324331 1 0.4846 0.45330 0.588 0.000 0.384 0.028 0.000
#> SRR1458890 1 0.5475 0.56493 0.512 0.000 0.432 0.004 0.052
#> SRR1432695 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0290 0.97060 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1431969 3 0.4196 0.16144 0.356 0.000 0.640 0.004 0.000
#> SRR1087393 2 0.2775 0.90981 0.036 0.884 0.000 0.076 0.004
#> SRR1077263 3 0.1894 0.66575 0.072 0.000 0.920 0.008 0.000
#> SRR1385211 3 0.2046 0.66098 0.068 0.000 0.916 0.016 0.000
#> SRR655241 1 0.4956 0.55619 0.548 0.000 0.428 0.008 0.016
#> SRR656922 3 0.3160 0.60408 0.188 0.000 0.808 0.004 0.000
#> SRR1361630 3 0.3689 0.46190 0.256 0.000 0.740 0.004 0.000
#> SRR1318966 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1407087 3 0.4161 0.39882 0.280 0.000 0.704 0.016 0.000
#> SRR603212 3 0.3766 0.44898 0.268 0.000 0.728 0.004 0.000
#> SRR1321088 2 0.1911 0.95186 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR1485190 1 0.4443 0.52286 0.524 0.000 0.472 0.004 0.000
#> SRR1332232 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.0771 0.67718 0.020 0.000 0.976 0.004 0.000
#> SRR1457835 3 0.2006 0.65861 0.072 0.000 0.916 0.012 0.000
#> SRR1347123 1 0.4446 0.51964 0.520 0.000 0.476 0.004 0.000
#> SRR1465501 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1330878 1 0.4907 0.54817 0.512 0.000 0.468 0.008 0.012
#> SRR1445064 3 0.3266 0.56315 0.200 0.000 0.796 0.004 0.000
#> SRR1452981 3 0.4467 0.28696 0.344 0.000 0.640 0.016 0.000
#> SRR1326708 3 0.1549 0.67248 0.040 0.000 0.944 0.016 0.000
#> SRR1407157 3 0.2270 0.67658 0.076 0.000 0.904 0.020 0.000
#> SRR1365401 2 0.1743 0.95548 0.028 0.940 0.000 0.028 0.004
#> SRR1397697 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 3 0.4451 -0.39981 0.492 0.000 0.504 0.004 0.000
#> SRR1077898 3 0.2305 0.64598 0.092 0.000 0.896 0.012 0.000
#> SRR1349080 3 0.4434 -0.31746 0.460 0.000 0.536 0.004 0.000
#> SRR1076096 2 0.1822 0.95395 0.036 0.936 0.000 0.024 0.004
#> SRR811261 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1375485 3 0.2036 0.65910 0.056 0.000 0.920 0.024 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR604414 3 0.2763 0.62968 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1380614 1 0.4514 -0.24396 0.728 0.000 0.020 0.020 0.232
#> SRR812060 3 0.3992 0.45166 0.268 0.000 0.720 0.012 0.000
#> SRR602082 3 0.4555 -0.24412 0.472 0.000 0.520 0.008 0.000
#> SRR1069490 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.2046 0.64163 0.068 0.000 0.916 0.016 0.000
#> SRR1420710 3 0.4118 0.28044 0.336 0.000 0.660 0.004 0.000
#> SRR660426 3 0.2953 0.62513 0.144 0.000 0.844 0.012 0.000
#> SRR1416003 3 0.3430 0.55275 0.220 0.000 0.776 0.004 0.000
#> SRR661064 3 0.4243 0.54679 0.264 0.000 0.712 0.024 0.000
#> SRR1082011 2 0.0609 0.96543 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1452718 1 0.4503 0.25547 0.776 0.000 0.116 0.012 0.096
#> SRR1353243 3 0.1597 0.67080 0.048 0.000 0.940 0.012 0.000
#> SRR1455482 3 0.4298 0.37577 0.352 0.000 0.640 0.008 0.000
#> SRR1313473 3 0.2674 0.65165 0.120 0.000 0.868 0.012 0.000
#> SRR1399394 3 0.1444 0.67306 0.040 0.000 0.948 0.012 0.000
#> SRR1102467 3 0.4350 0.03309 0.408 0.000 0.588 0.004 0.000
#> SRR1317470 3 0.2583 0.63098 0.132 0.000 0.864 0.004 0.000
#> SRR1337707 3 0.4165 0.26981 0.320 0.000 0.672 0.008 0.000
#> SRR1408752 2 0.0162 0.96981 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474617 5 0.0451 0.80161 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988
#> SRR1398013 1 0.4291 0.52883 0.536 0.000 0.464 0.000 0.000
#> SRR1352918 3 0.1670 0.66682 0.052 0.000 0.936 0.012 0.000
#> SRR1420750 3 0.2069 0.65636 0.076 0.000 0.912 0.012 0.000
#> SRR1071785 1 0.4448 0.50286 0.516 0.000 0.480 0.004 0.000
#> SRR1353618 2 0.1653 0.95698 0.024 0.944 0.000 0.028 0.004
#> SRR1082217 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1357256 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 3 0.3579 0.54912 0.240 0.000 0.756 0.004 0.000
#> SRR1366560 3 0.2685 0.63817 0.092 0.000 0.880 0.028 0.000
#> SRR1355684 3 0.2953 0.62346 0.144 0.000 0.844 0.012 0.000
#> SRR1323289 5 0.0451 0.80161 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988
#> SRR1313494 3 0.1732 0.67041 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1309985 3 0.2249 0.66342 0.096 0.000 0.896 0.008 0.000
#> SRR607911 3 0.3353 0.58838 0.196 0.000 0.796 0.008 0.000
#> SRR1333789 3 0.2852 0.62517 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1400078 3 0.3132 0.59943 0.172 0.000 0.820 0.008 0.000
#> SRR1088631 2 0.0510 0.96802 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1092842 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR615575 3 0.1638 0.66489 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1079434 1 0.4562 0.48849 0.496 0.000 0.496 0.008 0.000
#> SRR1325559 3 0.1697 0.67359 0.060 0.000 0.932 0.008 0.000
#> SRR1446695 3 0.2389 0.64839 0.116 0.000 0.880 0.004 0.000
#> SRR1383883 1 0.3197 0.36867 0.836 0.000 0.140 0.024 0.000
#> SRR1396100 3 0.3662 0.49451 0.252 0.000 0.744 0.004 0.000
#> SRR1475697 1 0.5240 0.59990 0.580 0.000 0.372 0.004 0.044
#> SRR1488067 4 0.2280 0.93623 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1102103 2 0.1911 0.95186 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR1105154 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1084991 4 0.3771 0.89096 0.036 0.156 0.000 0.804 0.004
#> SRR1410380 3 0.3928 0.40355 0.296 0.000 0.700 0.004 0.000
#> SRR1445490 2 0.0404 0.97019 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1454671 2 0.0703 0.96561 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1435044 3 0.1282 0.67560 0.044 0.000 0.952 0.004 0.000
#> SRR1485812 1 0.4746 0.51698 0.504 0.000 0.480 0.016 0.000
#> SRR1078020 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1311153 1 0.4213 0.55115 0.680 0.000 0.308 0.012 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 5 0.5509 0.59109 0.252 0.000 0.092 0.008 0.648
#> SRR807775 3 0.3906 0.37079 0.292 0.000 0.704 0.004 0.000
#> SRR1409215 2 0.0290 0.96838 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR820427 1 0.4443 0.52073 0.524 0.000 0.472 0.004 0.000
#> SRR1100656 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1362159 3 0.1205 0.67909 0.040 0.000 0.956 0.004 0.000
#> SRR1414536 3 0.1357 0.67228 0.048 0.000 0.948 0.004 0.000
#> SRR656794 3 0.1981 0.65874 0.064 0.000 0.920 0.016 0.000
#> SRR604653 3 0.4235 0.33401 0.336 0.000 0.656 0.008 0.000
#> SRR1317685 1 0.4743 0.53547 0.512 0.000 0.472 0.016 0.000
#> SRR1485912 3 0.1800 0.66564 0.048 0.000 0.932 0.020 0.000
#> SRR1407602 1 0.4999 0.54351 0.504 0.000 0.472 0.016 0.008
#> SRR1356164 5 0.4656 0.78208 0.256 0.000 0.004 0.040 0.700
#> SRR1328692 1 0.5686 0.59940 0.552 0.000 0.356 0.000 0.092
#> SRR1362438 3 0.2248 0.64672 0.088 0.000 0.900 0.012 0.000
#> SRR1479216 3 0.4443 -0.40179 0.472 0.000 0.524 0.004 0.000
#> SRR1358041 3 0.1981 0.66737 0.064 0.000 0.920 0.016 0.000
#> SRR1468766 1 0.4632 0.50435 0.540 0.000 0.448 0.012 0.000
#> SRR1368200 3 0.2293 0.64125 0.084 0.000 0.900 0.016 0.000
#> SRR1435602 2 0.1043 0.96420 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1501043 5 0.4269 0.76511 0.232 0.000 0.036 0.000 0.732
#> SRR1437256 3 0.4211 0.16490 0.360 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR1487446 3 0.2293 0.64125 0.084 0.000 0.900 0.016 0.000
#> SRR816653 3 0.2305 0.64437 0.092 0.000 0.896 0.012 0.000
#> SRR815164 3 0.1251 0.67563 0.036 0.000 0.956 0.008 0.000
#> SRR1442043 3 0.4481 -0.04498 0.416 0.000 0.576 0.008 0.000
#> SRR1410573 3 0.2136 0.64947 0.088 0.000 0.904 0.008 0.000
#> SRR1096782 2 0.0794 0.96064 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1352369 3 0.3779 0.49571 0.236 0.000 0.752 0.012 0.000
#> SRR1382934 1 0.5182 0.55361 0.504 0.000 0.464 0.016 0.016
#> SRR1465208 3 0.2561 0.64006 0.096 0.000 0.884 0.020 0.000
#> SRR1314728 3 0.1956 0.65796 0.076 0.000 0.916 0.008 0.000
#> SRR1470291 3 0.3929 0.59114 0.208 0.000 0.764 0.028 0.000
#> SRR1308756 3 0.4211 0.17290 0.360 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR1409600 3 0.1124 0.67545 0.036 0.000 0.960 0.004 0.000
#> SRR816123 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR614779 3 0.3957 0.41068 0.280 0.000 0.712 0.008 0.000
#> SRR810783 3 0.1444 0.67386 0.040 0.000 0.948 0.012 0.000
#> SRR1333990 3 0.2707 0.63364 0.100 0.000 0.876 0.024 0.000
#> SRR1410356 3 0.4341 0.18269 0.364 0.000 0.628 0.008 0.000
#> SRR808106 1 0.5858 -0.65848 0.512 0.000 0.024 0.048 0.416
#> SRR662713 3 0.3857 0.39697 0.312 0.000 0.688 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1480964 3 0.2763 0.62765 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR809382 3 0.3635 0.47213 0.248 0.000 0.748 0.004 0.000
#> SRR665417 1 0.4599 0.58558 0.600 0.000 0.384 0.016 0.000
#> SRR1088016 4 0.5016 0.62653 0.036 0.344 0.000 0.616 0.004
#> SRR1453166 4 0.2690 0.94474 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1069826 2 0.0880 0.96008 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1077781 2 0.0609 0.96664 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR615623 3 0.5801 0.17302 0.288 0.000 0.608 0.012 0.092
#> SRR1413787 1 0.4889 0.53506 0.504 0.000 0.476 0.016 0.004
#> SRR1478207 3 0.3689 0.46117 0.256 0.000 0.740 0.004 0.000
#> SRR1411046 3 0.4746 -0.26605 0.480 0.000 0.504 0.016 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.4404 0.56136 0.684 0.000 0.292 0.024 0.000
#> SRR1309051 1 0.4508 0.50511 0.648 0.000 0.332 0.020 0.000
#> SRR1486949 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1395616 1 0.4457 0.50993 0.620 0.000 0.368 0.012 0.000
#> SRR1074956 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1092961 4 0.2471 0.93405 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR817210 3 0.0865 0.67948 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR1319221 5 0.0451 0.80161 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988
#> SRR1405413 3 0.1877 0.66179 0.064 0.000 0.924 0.012 0.000
#> SRR607807 5 0.4019 0.79385 0.200 0.000 0.004 0.028 0.768
#> SRR1390160 3 0.3949 0.37616 0.300 0.000 0.696 0.004 0.000
#> SRR1406283 3 0.3550 0.51208 0.236 0.000 0.760 0.004 0.000
#> SRR1357709 3 0.4418 0.32904 0.332 0.000 0.652 0.016 0.000
#> SRR1080742 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1468208 1 0.4078 -0.09444 0.796 0.000 0.032 0.020 0.152
#> SRR1312766 3 0.0794 0.67745 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1361612 3 0.2362 0.64388 0.076 0.000 0.900 0.024 0.000
#> SRR1311224 3 0.1124 0.67805 0.036 0.000 0.960 0.004 0.000
#> SRR1087801 1 0.4582 0.55757 0.572 0.000 0.416 0.012 0.000
#> SRR1099720 2 0.0963 0.95887 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1349250 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1350912 2 0.1911 0.95186 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR1357127 3 0.1704 0.66044 0.068 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR1074980 2 0.1911 0.95186 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR1317022 3 0.4620 -0.04329 0.392 0.000 0.592 0.016 0.000
#> SRR1332879 3 0.2408 0.64843 0.092 0.000 0.892 0.016 0.000
#> SRR1403177 5 0.0451 0.80161 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988
#> SRR1076144 2 0.0162 0.96981 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069614 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR818239 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1421069 4 0.2377 0.93932 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1500006 1 0.5000 0.49852 0.676 0.000 0.272 0.036 0.016
#> SRR1485678 3 0.1800 0.66319 0.048 0.000 0.932 0.020 0.000
#> SRR1092232 1 0.6281 0.54855 0.456 0.000 0.420 0.008 0.116
#> SRR1344253 1 0.4300 0.51147 0.524 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.3441 0.36244 0.828 0.000 0.140 0.028 0.004
#> SRR1089349 3 0.1041 0.67904 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1343522 2 0.0880 0.96151 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1326727 2 0.0290 0.96970 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1440940 3 0.4299 0.08481 0.388 0.000 0.608 0.004 0.000
#> SRR818372 3 0.1251 0.67573 0.036 0.000 0.956 0.008 0.000
#> SRR1323675 2 0.1743 0.95559 0.028 0.940 0.000 0.028 0.004
#> SRR819894 3 0.0963 0.67099 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1310031 3 0.4252 0.20883 0.340 0.000 0.652 0.008 0.000
#> SRR615419 3 0.3766 0.44003 0.268 0.000 0.728 0.004 0.000
#> SRR1436925 3 0.1357 0.67741 0.048 0.000 0.948 0.004 0.000
#> SRR1477238 1 0.4192 0.52087 0.736 0.000 0.232 0.032 0.000
#> SRR1332566 3 0.4540 0.39497 0.320 0.000 0.656 0.024 0.000
#> SRR1490228 3 0.2806 0.62430 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR1442949 3 0.4251 0.13168 0.372 0.000 0.624 0.004 0.000
#> SRR1466239 3 0.2740 0.63403 0.096 0.000 0.876 0.028 0.000
#> SRR1094003 2 0.0404 0.96857 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1329971 3 0.1894 0.66137 0.072 0.000 0.920 0.008 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 4 0.5258 0.26519 0.036 0.472 0.000 0.488 0.004
#> SRR1322981 3 0.0955 0.67938 0.028 0.000 0.968 0.004 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4211 0.18887 0.360 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR660522 3 0.4047 0.33578 0.320 0.000 0.676 0.004 0.000
#> SRR815374 3 0.2046 0.65883 0.068 0.000 0.916 0.016 0.000
#> SRR1069564 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1416337 3 0.2806 0.61282 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR1316438 1 0.6756 0.53745 0.496 0.000 0.304 0.016 0.184
#> SRR1386844 1 0.5088 0.34023 0.528 0.000 0.436 0.036 0.000
#> SRR1373718 3 0.3353 0.58820 0.196 0.000 0.796 0.008 0.000
#> SRR1447458 2 0.0703 0.96561 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1487128 3 0.4744 -0.35137 0.476 0.000 0.508 0.016 0.000
#> SRR1441421 2 0.1653 0.95698 0.024 0.944 0.000 0.028 0.004
#> SRR1069919 2 0.1412 0.95670 0.036 0.952 0.000 0.008 0.004
#> SRR1460296 3 0.1522 0.67199 0.044 0.000 0.944 0.012 0.000
#> SRR1335489 1 0.4562 0.39901 0.500 0.000 0.492 0.008 0.000
#> SRR1393404 2 0.0703 0.96569 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1081425 3 0.3635 0.53354 0.248 0.000 0.748 0.004 0.000
#> SRR1401815 5 0.6292 0.46161 0.352 0.000 0.108 0.016 0.524
#> SRR1071337 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1071983 2 0.0880 0.96008 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.4268 0.19758 0.344 0.000 0.648 0.008 0.000
#> SRR1098761 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1312124 3 0.1410 0.66640 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR615395 3 0.0451 0.67831 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1479349 3 0.2873 0.66836 0.128 0.000 0.856 0.016 0.000
#> SRR2165033 1 0.4826 0.53539 0.508 0.000 0.472 0.000 0.020
#> SRR1089054 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR816201 3 0.2763 0.63921 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1488514 2 0.0794 0.96261 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR655840 3 0.2136 0.67500 0.088 0.000 0.904 0.008 0.000
#> SRR1379303 3 0.2740 0.63403 0.096 0.000 0.876 0.028 0.000
#> SRR1418516 1 0.4489 0.56062 0.572 0.000 0.420 0.008 0.000
#> SRR613174 3 0.1270 0.66542 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.1892 0.66577 0.080 0.000 0.916 0.004 0.000
#> SRR659157 1 0.4583 0.53659 0.528 0.000 0.464 0.004 0.004
#> SRR1480408 3 0.3884 0.45079 0.288 0.000 0.708 0.004 0.000
#> SRR657857 3 0.4637 -0.21189 0.452 0.000 0.536 0.012 0.000
#> SRR1073317 2 0.0510 0.96802 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1332526 3 0.3861 0.47519 0.284 0.000 0.712 0.004 0.000
#> SRR1094168 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1431270 3 0.2612 0.63146 0.124 0.000 0.868 0.008 0.000
#> SRR1085614 4 0.3812 0.92358 0.036 0.160 0.000 0.800 0.004
#> SRR1330106 3 0.4047 0.28793 0.320 0.000 0.676 0.004 0.000
#> SRR1466154 3 0.2193 0.65553 0.092 0.000 0.900 0.008 0.000
#> SRR1396944 1 0.4305 0.45725 0.744 0.000 0.216 0.036 0.004
#> SRR1082784 2 0.0404 0.96990 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1457267 1 0.5115 0.13705 0.484 0.000 0.480 0.036 0.000
#> SRR614659 3 0.1041 0.67929 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR659247 3 0.1121 0.67403 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1317201 3 0.2361 0.64706 0.096 0.000 0.892 0.012 0.000
#> SRR1473696 3 0.1831 0.66394 0.076 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1375842 1 0.5124 0.33339 0.484 0.000 0.484 0.028 0.004
#> SRR1388123 2 0.0510 0.96878 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1096363 4 0.2690 0.94467 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1453662 3 0.1872 0.66604 0.052 0.000 0.928 0.020 0.000
#> SRR1345499 2 0.0865 0.96537 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353499 3 0.4540 0.26208 0.340 0.000 0.640 0.020 0.000
#> SRR1416693 1 0.5100 0.28754 0.516 0.000 0.448 0.036 0.000
#> SRR1070841 3 0.0794 0.67481 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1380910 3 0.2439 0.64115 0.120 0.000 0.876 0.004 0.000
#> SRR1333125 2 0.0609 0.96568 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1498183 3 0.2110 0.66128 0.072 0.000 0.912 0.016 0.000
#> SRR612659 3 0.4193 0.33121 0.304 0.000 0.684 0.012 0.000
#> SRR1447148 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR658597 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1089595 4 0.5254 0.30719 0.036 0.460 0.000 0.500 0.004
#> SRR1074263 2 0.0794 0.96370 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1376786 3 0.0771 0.67781 0.020 0.000 0.976 0.004 0.000
#> SRR1345995 3 0.2358 0.65676 0.104 0.000 0.888 0.008 0.000
#> SRR1071035 1 0.4440 0.58807 0.660 0.000 0.324 0.012 0.004
#> SRR1068808 4 0.2891 0.91359 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1332754 2 0.1911 0.95186 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR662438 3 0.4608 0.29619 0.336 0.000 0.640 0.024 0.000
#> SRR1335355 3 0.2358 0.64990 0.104 0.000 0.888 0.008 0.000
#> SRR659448 3 0.1877 0.66700 0.064 0.000 0.924 0.012 0.000
#> SRR1323558 3 0.1557 0.66940 0.052 0.000 0.940 0.008 0.000
#> SRR1381711 3 0.4420 -0.27441 0.448 0.000 0.548 0.004 0.000
#> SRR657985 1 0.4287 0.53532 0.540 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR1314810 3 0.4151 0.25947 0.344 0.000 0.652 0.004 0.000
#> SRR1336505 3 0.4416 0.16921 0.356 0.000 0.632 0.012 0.000
#> SRR1474095 3 0.2069 0.65241 0.076 0.000 0.912 0.012 0.000
#> SRR1363831 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 3 0.3969 0.40320 0.304 0.000 0.692 0.004 0.000
#> SRR1074909 4 0.2561 0.94462 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1101200 3 0.3561 0.48852 0.260 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.0794 0.96358 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1367150 3 0.4088 0.19490 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1068880 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1467277 3 0.3689 0.46277 0.256 0.000 0.740 0.004 0.000
#> SRR1084867 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1095431 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1380184 2 0.1012 0.96644 0.020 0.968 0.000 0.012 0.000
#> SRR1443113 3 0.4306 0.33828 0.328 0.000 0.660 0.012 0.000
#> SRR1380414 3 0.0963 0.67124 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1315912 3 0.3661 0.48043 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0162 0.96981 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1421116 2 0.1728 0.95577 0.036 0.940 0.000 0.020 0.004
#> SRR602282 5 0.3783 0.78996 0.216 0.000 0.004 0.012 0.768
#> SRR1361195 2 0.0609 0.96543 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR600493 3 0.1638 0.66919 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1477653 3 0.1809 0.66275 0.060 0.000 0.928 0.012 0.000
#> SRR1355475 3 0.1043 0.67964 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1360785 3 0.4561 -0.36765 0.488 0.000 0.504 0.008 0.000
#> SRR810437 3 0.4450 -0.41950 0.488 0.000 0.508 0.004 0.000
#> SRR1361860 1 0.4627 0.51206 0.544 0.000 0.444 0.012 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 3 0.2193 0.66795 0.092 0.000 0.900 0.008 0.000
#> SRR1457619 3 0.1341 0.66338 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1498529 3 0.2864 0.65656 0.112 0.000 0.864 0.024 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0794 0.96064 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1472033 2 0.0880 0.96008 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1445087 1 0.4783 0.55400 0.532 0.000 0.452 0.004 0.012
#> SRR1399525 4 0.3484 0.93601 0.024 0.152 0.000 0.820 0.004
#> SRR1312844 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1085874 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1101226 4 0.2329 0.93709 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1476056 3 0.4574 0.01528 0.412 0.000 0.576 0.012 0.000
#> SRR1075659 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1311916 3 0.4341 -0.07059 0.404 0.000 0.592 0.004 0.000
#> SRR1353353 1 0.4997 0.54887 0.508 0.000 0.468 0.016 0.008
#> SRR1073291 3 0.0880 0.67607 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1356227 3 0.2900 0.63037 0.108 0.000 0.864 0.028 0.000
#> SRR1080720 2 0.1124 0.95878 0.004 0.960 0.000 0.036 0.000
#> SRR1091695 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1350304 3 0.4446 -0.38931 0.476 0.000 0.520 0.004 0.000
#> SRR663002 3 0.4450 -0.42815 0.488 0.000 0.508 0.004 0.000
#> SRR1376983 2 0.0162 0.97049 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399926 1 0.4602 0.52197 0.656 0.000 0.316 0.028 0.000
#> SRR1347144 3 0.4288 0.04089 0.384 0.000 0.612 0.004 0.000
#> SRR1384006 3 0.4288 0.17608 0.384 0.000 0.612 0.004 0.000
#> SRR1499108 4 0.2377 0.93932 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR614047 3 0.1041 0.67618 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR818440 3 0.0880 0.67584 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1337770 3 0.4166 0.30728 0.348 0.000 0.648 0.004 0.000
#> SRR1399413 3 0.4557 -0.35027 0.476 0.000 0.516 0.008 0.000
#> SRR1385542 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 3 0.1408 0.67198 0.044 0.000 0.948 0.008 0.000
#> SRR1074041 3 0.1124 0.67989 0.036 0.000 0.960 0.004 0.000
#> SRR1394495 2 0.0404 0.97000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR659460 3 0.1205 0.67944 0.040 0.000 0.956 0.004 0.000
#> SRR816699 3 0.0963 0.67029 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.3086 0.58849 0.180 0.000 0.816 0.004 0.000
#> SRR1499418 3 0.4269 0.33664 0.300 0.000 0.684 0.016 0.000
#> SRR1352894 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.4890 0.53693 0.628 0.000 0.332 0.040 0.000
#> SRR1331083 4 0.2605 0.94554 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR808272 3 0.4367 -0.10011 0.416 0.000 0.580 0.004 0.000
#> SRR1436698 3 0.0955 0.67968 0.028 0.000 0.968 0.004 0.000
#> SRR1095627 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1357672 3 0.3863 0.49965 0.248 0.000 0.740 0.012 0.000
#> SRR1351236 3 0.1205 0.67752 0.040 0.000 0.956 0.004 0.000
#> SRR1077479 1 0.4733 0.57917 0.624 0.000 0.348 0.028 0.000
#> SRR814491 3 0.3635 0.49461 0.248 0.000 0.748 0.004 0.000
#> SRR1101256 2 0.0609 0.96543 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1436004 3 0.3305 0.56390 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.0880 0.96008 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1078998 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1314707 1 0.4420 0.50541 0.712 0.000 0.260 0.012 0.016
#> SRR1309534 1 0.4403 0.56932 0.560 0.000 0.436 0.000 0.004
#> SRR615527 5 0.3355 0.80030 0.184 0.000 0.000 0.012 0.804
#> SRR1098216 1 0.5083 0.46643 0.532 0.000 0.432 0.036 0.000
#> SRR1325847 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1404003 3 0.3607 0.52607 0.244 0.000 0.752 0.004 0.000
#> SRR1344166 3 0.2280 0.65322 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.1281 0.67391 0.032 0.000 0.956 0.012 0.000
#> SRR1431429 2 0.1911 0.95186 0.036 0.932 0.000 0.028 0.004
#> SRR1079237 4 0.3966 0.90534 0.036 0.176 0.000 0.784 0.004
#> SRR1080509 2 0.0404 0.97022 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR815759 3 0.3461 0.51560 0.224 0.000 0.772 0.004 0.000
#> SRR1502143 3 0.0609 0.67629 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.4527 -0.02919 0.392 0.000 0.596 0.012 0.000
#> SRR1402307 2 0.0404 0.97002 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR820810 3 0.1195 0.67642 0.028 0.000 0.960 0.012 0.000
#> SRR1099212 4 0.4039 0.90138 0.036 0.184 0.000 0.776 0.004
#> SRR1083215 3 0.3895 0.35383 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1476547 4 0.3771 0.89096 0.036 0.156 0.000 0.804 0.004
#> SRR656421 3 0.2448 0.64539 0.088 0.000 0.892 0.020 0.000
#> SRR1086116 2 0.0794 0.96358 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1499917 3 0.3659 0.54884 0.220 0.000 0.768 0.012 0.000
#> SRR1339944 2 0.2036 0.95213 0.024 0.920 0.000 0.056 0.000
#> SRR1391444 2 0.0162 0.97049 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1434889 3 0.4484 0.31718 0.308 0.000 0.668 0.024 0.000
#> SRR1431847 1 0.5778 0.57075 0.524 0.000 0.392 0.004 0.080
#> SRR1317155 1 0.4875 0.59178 0.576 0.000 0.400 0.004 0.020
#> SRR1477405 3 0.1502 0.67252 0.056 0.000 0.940 0.004 0.000
#> SRR655289 3 0.0671 0.67759 0.016 0.000 0.980 0.004 0.000
#> SRR1341683 3 0.4238 0.16410 0.368 0.000 0.628 0.004 0.000
#> SRR1084790 3 0.0865 0.67924 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR1073731 3 0.1430 0.68018 0.052 0.000 0.944 0.004 0.000
#> SRR1332588 3 0.3421 0.57314 0.204 0.000 0.788 0.008 0.000
#> SRR1471157 2 0.0510 0.96878 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR654945 3 0.2522 0.64276 0.108 0.000 0.880 0.012 0.000
#> SRR661028 3 0.2616 0.63570 0.100 0.000 0.880 0.020 0.000
#> SRR1413477 2 0.0404 0.96857 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1101152 3 0.1831 0.64697 0.076 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1358435 4 0.4003 0.88966 0.036 0.180 0.000 0.780 0.004
#> SRR2165273 1 0.3495 0.39340 0.816 0.000 0.152 0.032 0.000
#> SRR1379014 3 0.4498 0.48929 0.280 0.000 0.688 0.032 0.000
#> SRR1489904 3 0.3123 0.57774 0.184 0.000 0.812 0.004 0.000
#> SRR1416386 4 0.3003 0.92067 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1406048 3 0.2408 0.64213 0.092 0.000 0.892 0.016 0.000
#> SRR606982 1 0.4713 0.55914 0.544 0.000 0.440 0.016 0.000
#> SRR1358082 3 0.3398 0.56920 0.216 0.000 0.780 0.004 0.000
#> SRR1312934 3 0.3992 0.43666 0.268 0.000 0.720 0.012 0.000
#> SRR655194 3 0.3789 0.56778 0.224 0.000 0.760 0.016 0.000
#> SRR1331174 2 0.0290 0.96970 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473251 4 0.3812 0.88703 0.036 0.160 0.000 0.800 0.004
#> SRR1389820 5 0.0451 0.80161 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988
#> SRR1074289 3 0.4557 -0.00896 0.404 0.000 0.584 0.012 0.000
#> SRR1348816 2 0.0609 0.96543 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1076292 3 0.4130 0.36342 0.292 0.000 0.696 0.012 0.000
#> SRR1395810 2 0.0000 0.97075 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 3 0.3196 0.56947 0.192 0.000 0.804 0.004 0.000
#> SRR1443507 3 0.1041 0.67961 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1452310 3 0.4276 0.10554 0.380 0.000 0.616 0.004 0.000
#> SRR665610 3 0.2361 0.66118 0.096 0.000 0.892 0.012 0.000
#> SRR1347322 3 0.2046 0.66619 0.068 0.000 0.916 0.016 0.000
#> SRR813395 4 0.2329 0.93737 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1477256 1 0.4747 0.30470 0.496 0.000 0.488 0.016 0.000
#> SRR1470230 1 0.4443 0.52286 0.524 0.000 0.472 0.004 0.000
#> SRR1354247 1 0.5650 0.33187 0.672 0.000 0.220 0.036 0.072
#> SRR1082640 2 0.1996 0.94978 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR1487592 3 0.3690 0.52171 0.224 0.000 0.764 0.012 0.000
#> SRR1352299 3 0.4470 0.17396 0.372 0.000 0.616 0.012 0.000
#> SRR1076317 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1434117 3 0.1544 0.65577 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1075273 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR658657 3 0.3398 0.54279 0.216 0.000 0.780 0.004 0.000
#> SRR1092773 4 0.2648 0.94359 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1365332 3 0.1568 0.67641 0.036 0.000 0.944 0.020 0.000
#> SRR615958 3 0.2583 0.63092 0.132 0.000 0.864 0.004 0.000
#> SRR1097688 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1403259 1 0.5099 0.56029 0.528 0.000 0.440 0.004 0.028
#> SRR1099120 4 0.2561 0.94473 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1362200 3 0.1357 0.67087 0.048 0.000 0.948 0.004 0.000
#> SRR1464856 2 0.0510 0.96755 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1347298 1 0.4740 0.54276 0.516 0.000 0.468 0.016 0.000
#> SRR1075923 4 0.2648 0.94613 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1100703 3 0.0865 0.68003 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 3 0.4692 0.43811 0.276 0.000 0.644 0.080 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.0405 0.91684 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1075752 6 0.2942 0.91078 0.000 0.132 0.000 0.032 0.000 0.836
#> SRR1397949 1 0.4753 0.33520 0.580 0.000 0.368 0.048 0.000 0.004
#> SRR1355723 4 0.6009 -0.01488 0.100 0.000 0.056 0.584 0.256 0.004
#> SRR1329744 1 0.3013 0.63128 0.832 0.000 0.140 0.024 0.000 0.004
#> SRR657384 3 0.4592 0.20102 0.468 0.000 0.496 0.036 0.000 0.000
#> SRR1351190 3 0.4778 0.25754 0.424 0.000 0.524 0.052 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR818573 1 0.5706 0.13246 0.476 0.000 0.388 0.128 0.000 0.008
#> SRR1396017 3 0.4358 0.41681 0.184 0.000 0.716 0.100 0.000 0.000
#> SRR1410742 3 0.3644 0.46991 0.120 0.000 0.792 0.088 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.2834 0.62839 0.848 0.000 0.128 0.016 0.000 0.008
#> SRR1382416 4 0.6894 0.61236 0.228 0.000 0.320 0.404 0.040 0.008
#> SRR1391354 4 0.6216 0.25480 0.284 0.000 0.336 0.376 0.000 0.004
#> SRR1087968 2 0.3377 0.84540 0.000 0.808 0.000 0.136 0.000 0.056
#> SRR1310075 1 0.3963 0.46550 0.756 0.000 0.164 0.080 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.2886 0.62783 0.836 0.000 0.144 0.016 0.000 0.004
#> SRR1325138 3 0.5469 0.19762 0.224 0.000 0.600 0.168 0.000 0.008
#> SRR1326821 3 0.5404 0.11355 0.408 0.000 0.488 0.100 0.000 0.004
#> SRR1490178 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR655613 1 0.5190 0.41067 0.576 0.000 0.324 0.096 0.000 0.004
#> SRR1075707 6 0.4237 0.74754 0.000 0.120 0.000 0.144 0.000 0.736
#> SRR1443871 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102489 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1465758 1 0.5148 0.44302 0.624 0.000 0.180 0.196 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.4102 0.40588 0.080 0.000 0.752 0.164 0.000 0.004
#> SRR1407449 1 0.3653 0.58507 0.748 0.000 0.228 0.020 0.000 0.004
#> SRR1436858 2 0.2433 0.88876 0.000 0.884 0.000 0.072 0.000 0.044
#> SRR1479109 3 0.4508 0.43146 0.316 0.000 0.632 0.052 0.000 0.000
#> SRR1399069 4 0.5875 0.54024 0.140 0.000 0.164 0.632 0.060 0.004
#> SRR1366450 3 0.4838 0.30472 0.372 0.000 0.564 0.064 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.2911 0.61362 0.856 0.000 0.100 0.036 0.000 0.008
#> SRR1457176 1 0.4074 0.47062 0.684 0.000 0.288 0.024 0.000 0.004
#> SRR1097666 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1434736 3 0.3356 0.37527 0.052 0.000 0.808 0.140 0.000 0.000
#> SRR1080560 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1322882 1 0.5035 0.47297 0.640 0.000 0.192 0.168 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1327614 1 0.4594 0.55792 0.676 0.000 0.232 0.092 0.000 0.000
#> SRR658152 3 0.4993 0.32664 0.060 0.000 0.704 0.172 0.064 0.000
#> SRR1368141 3 0.4038 0.32412 0.000 0.000 0.728 0.216 0.056 0.000
#> SRR1440268 1 0.4927 0.31144 0.652 0.000 0.248 0.092 0.000 0.008
#> SRR1453725 3 0.5280 0.37824 0.328 0.000 0.564 0.104 0.000 0.004
#> SRR1325711 2 0.0692 0.91568 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1477930 1 0.5124 0.47784 0.620 0.000 0.232 0.148 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.2604 0.61622 0.872 0.000 0.096 0.028 0.000 0.004
#> SRR1416049 2 0.0146 0.91767 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR656275 3 0.5685 0.41334 0.180 0.000 0.584 0.224 0.008 0.004
#> SRR1369052 1 0.3010 0.63686 0.828 0.000 0.148 0.020 0.000 0.004
#> SRR1377735 1 0.3759 0.57589 0.752 0.000 0.216 0.024 0.000 0.008
#> SRR1331244 1 0.4715 0.38740 0.692 0.000 0.212 0.084 0.000 0.012
#> SRR1404531 1 0.6127 -0.50265 0.392 0.000 0.236 0.368 0.000 0.004
#> SRR1324331 1 0.4952 0.23600 0.672 0.000 0.188 0.132 0.000 0.008
#> SRR1458890 3 0.4907 0.32128 0.024 0.000 0.704 0.136 0.136 0.000
#> SRR1432695 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407624 2 0.0547 0.91691 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1431969 3 0.5206 0.48638 0.100 0.000 0.692 0.152 0.056 0.000
#> SRR1087393 2 0.4059 0.80436 0.000 0.752 0.000 0.148 0.000 0.100
#> SRR1077263 3 0.5346 0.38589 0.324 0.000 0.548 0.128 0.000 0.000
#> SRR1385211 1 0.3418 0.60518 0.784 0.000 0.192 0.016 0.000 0.008
#> SRR655241 3 0.5374 -0.00660 0.276 0.000 0.584 0.136 0.004 0.000
#> SRR656922 1 0.5428 0.40882 0.568 0.000 0.264 0.168 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.4083 0.54772 0.116 0.000 0.768 0.108 0.008 0.000
#> SRR1318966 6 0.3213 0.90301 0.000 0.132 0.000 0.048 0.000 0.820
#> SRR1407087 3 0.5595 0.44968 0.180 0.000 0.600 0.208 0.008 0.004
#> SRR603212 3 0.5795 0.22389 0.328 0.000 0.496 0.172 0.000 0.004
#> SRR1321088 2 0.2608 0.88262 0.000 0.872 0.000 0.080 0.000 0.048
#> SRR1485190 3 0.4271 0.34644 0.032 0.000 0.732 0.208 0.028 0.000
#> SRR1332232 2 0.0260 0.91706 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1312645 3 0.4846 0.37454 0.356 0.000 0.576 0.068 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.3479 0.58291 0.768 0.000 0.212 0.012 0.000 0.008
#> SRR1347123 3 0.4146 0.37376 0.028 0.000 0.768 0.152 0.052 0.000
#> SRR1465501 6 0.2709 0.91370 0.000 0.132 0.000 0.020 0.000 0.848
#> SRR1330878 3 0.4037 0.32455 0.000 0.000 0.736 0.200 0.064 0.000
#> SRR1445064 3 0.4814 0.53500 0.148 0.000 0.692 0.152 0.008 0.000
#> SRR1452981 3 0.5718 0.22681 0.276 0.000 0.556 0.156 0.000 0.012
#> SRR1326708 1 0.2945 0.63187 0.824 0.000 0.156 0.020 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.5493 0.47685 0.552 0.000 0.308 0.136 0.000 0.004
#> SRR1365401 2 0.2263 0.89334 0.000 0.896 0.000 0.056 0.000 0.048
#> SRR1397697 2 0.0291 0.91750 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1477316 3 0.3172 0.45712 0.092 0.000 0.832 0.076 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.2925 0.63106 0.832 0.000 0.148 0.016 0.000 0.004
#> SRR1349080 3 0.5879 -0.14287 0.180 0.000 0.508 0.304 0.000 0.008
#> SRR1076096 2 0.2487 0.88438 0.000 0.876 0.000 0.092 0.000 0.032
#> SRR811261 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1375485 1 0.4170 0.36755 0.648 0.000 0.328 0.020 0.000 0.004
#> SRR1432563 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR604414 1 0.4918 0.50815 0.644 0.000 0.232 0.124 0.000 0.000
#> SRR1380614 4 0.7190 0.59595 0.164 0.000 0.296 0.432 0.100 0.008
#> SRR812060 3 0.5874 0.40776 0.208 0.000 0.552 0.228 0.008 0.004
#> SRR602082 1 0.5093 0.23750 0.632 0.000 0.192 0.176 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.1765 0.90713 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1078417 2 0.0547 0.91523 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR661613 3 0.5789 0.23487 0.408 0.000 0.476 0.084 0.032 0.000
#> SRR1420710 3 0.3370 0.54661 0.148 0.000 0.804 0.048 0.000 0.000
#> SRR660426 1 0.4220 0.55430 0.732 0.000 0.172 0.096 0.000 0.000
#> SRR1416003 3 0.4148 0.54203 0.148 0.000 0.744 0.108 0.000 0.000
#> SRR661064 1 0.3985 0.56796 0.744 0.000 0.208 0.040 0.000 0.008
#> SRR1082011 2 0.1745 0.89148 0.000 0.924 0.000 0.020 0.000 0.056
#> SRR1452718 4 0.6209 0.64138 0.168 0.000 0.340 0.472 0.012 0.008
#> SRR1353243 1 0.3693 0.49453 0.708 0.000 0.280 0.008 0.000 0.004
#> SRR1455482 1 0.3516 0.48202 0.788 0.000 0.164 0.048 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.2901 0.60026 0.840 0.000 0.128 0.032 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.4310 0.26376 0.580 0.000 0.396 0.024 0.000 0.000
#> SRR1102467 4 0.6120 0.20917 0.320 0.000 0.316 0.364 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.4062 0.52066 0.196 0.000 0.736 0.068 0.000 0.000
#> SRR1337707 3 0.5716 0.49025 0.140 0.000 0.636 0.168 0.056 0.000
#> SRR1408752 2 0.0692 0.91466 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1474617 5 0.0000 0.74595 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398013 3 0.3493 0.40269 0.056 0.000 0.796 0.148 0.000 0.000
#> SRR1352918 3 0.4837 0.25436 0.432 0.000 0.512 0.056 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.3584 0.52728 0.740 0.000 0.244 0.012 0.000 0.004
#> SRR1071785 3 0.4140 0.38241 0.016 0.000 0.756 0.172 0.056 0.000
#> SRR1353618 2 0.2001 0.89920 0.000 0.912 0.000 0.040 0.000 0.048
#> SRR1082217 2 0.3123 0.85332 0.000 0.824 0.000 0.136 0.000 0.040
#> SRR1357256 2 0.0146 0.91767 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1490313 3 0.4801 0.42811 0.280 0.000 0.632 0.088 0.000 0.000
#> SRR1366560 1 0.2604 0.61886 0.872 0.000 0.100 0.020 0.000 0.008
#> SRR1355684 1 0.3874 0.56820 0.760 0.000 0.172 0.068 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.0000 0.74595 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313494 1 0.4130 0.45935 0.672 0.000 0.300 0.024 0.000 0.004
#> SRR1309985 3 0.5124 0.06685 0.444 0.000 0.488 0.060 0.000 0.008
#> SRR607911 1 0.4596 0.51550 0.692 0.000 0.188 0.120 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.4498 0.44233 0.300 0.000 0.644 0.056 0.000 0.000
#> SRR1400078 3 0.3835 0.52562 0.188 0.000 0.756 0.056 0.000 0.000
#> SRR1088631 2 0.1549 0.90054 0.000 0.936 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR1092842 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR615575 3 0.5572 0.48184 0.256 0.000 0.576 0.160 0.008 0.000
#> SRR1079434 3 0.3268 0.41156 0.044 0.000 0.812 0.144 0.000 0.000
#> SRR1325559 1 0.4256 0.14432 0.564 0.000 0.420 0.012 0.000 0.004
#> SRR1446695 3 0.3860 0.50637 0.236 0.000 0.728 0.036 0.000 0.000
#> SRR1383883 1 0.5735 -0.17244 0.548 0.000 0.152 0.288 0.000 0.012
#> SRR1396100 3 0.4348 0.48014 0.268 0.000 0.676 0.056 0.000 0.000
#> SRR1475697 3 0.5257 0.15129 0.052 0.000 0.640 0.256 0.052 0.000
#> SRR1488067 6 0.2106 0.88816 0.000 0.064 0.000 0.032 0.000 0.904
#> SRR1102103 2 0.2474 0.88670 0.000 0.880 0.000 0.080 0.000 0.040
#> SRR1105154 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1084991 6 0.4237 0.74754 0.000 0.120 0.000 0.144 0.000 0.736
#> SRR1410380 3 0.4189 0.53195 0.152 0.000 0.748 0.096 0.004 0.000
#> SRR1445490 2 0.0632 0.91631 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1454671 2 0.1007 0.90966 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1435044 3 0.4361 0.44832 0.308 0.000 0.648 0.044 0.000 0.000
#> SRR1485812 3 0.3479 0.37698 0.008 0.000 0.768 0.212 0.012 0.000
#> SRR1078020 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1311153 1 0.5823 -0.21245 0.520 0.000 0.216 0.260 0.000 0.004
#> SRR1376406 2 0.0291 0.91750 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1343898 5 0.4545 0.53256 0.000 0.000 0.192 0.112 0.696 0.000
#> SRR807775 3 0.4676 0.50660 0.104 0.000 0.700 0.188 0.008 0.000
#> SRR1409215 2 0.0547 0.91523 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR820427 3 0.2999 0.41616 0.048 0.000 0.840 0.112 0.000 0.000
#> SRR1100656 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1362159 1 0.4503 0.53754 0.680 0.000 0.240 0.080 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.3934 0.48645 0.260 0.000 0.708 0.032 0.000 0.000
#> SRR656794 1 0.3875 0.48734 0.700 0.000 0.280 0.016 0.000 0.004
#> SRR604653 1 0.5122 0.44287 0.628 0.000 0.192 0.180 0.000 0.000
#> SRR1317685 3 0.3230 0.38354 0.000 0.000 0.776 0.212 0.012 0.000
#> SRR1485912 3 0.4851 0.30034 0.404 0.000 0.536 0.060 0.000 0.000
#> SRR1407602 3 0.4173 0.30905 0.000 0.000 0.712 0.228 0.060 0.000
#> SRR1356164 5 0.5420 0.48909 0.056 0.000 0.020 0.412 0.508 0.004
#> SRR1328692 3 0.4883 0.18466 0.060 0.000 0.712 0.172 0.056 0.000
#> SRR1362438 1 0.2699 0.62743 0.856 0.000 0.124 0.012 0.000 0.008
#> SRR1479216 3 0.4051 0.38425 0.012 0.000 0.760 0.172 0.056 0.000
#> SRR1358041 1 0.4124 0.37470 0.644 0.000 0.332 0.024 0.000 0.000
#> SRR1468766 3 0.5856 -0.11896 0.200 0.000 0.528 0.264 0.000 0.008
#> SRR1368200 3 0.4990 0.18094 0.452 0.000 0.480 0.068 0.000 0.000
#> SRR1435602 2 0.1983 0.90571 0.000 0.908 0.000 0.020 0.000 0.072
#> SRR1501043 5 0.5173 0.53143 0.000 0.000 0.224 0.160 0.616 0.000
#> SRR1437256 3 0.4975 0.44096 0.060 0.000 0.700 0.184 0.056 0.000
#> SRR1487446 3 0.5117 0.17103 0.448 0.000 0.480 0.068 0.004 0.000
#> SRR816653 1 0.3128 0.61607 0.812 0.000 0.168 0.012 0.000 0.008
#> SRR815164 1 0.4528 0.16627 0.564 0.000 0.404 0.028 0.000 0.004
#> SRR1442043 3 0.4774 0.33669 0.192 0.000 0.672 0.136 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.2798 0.62676 0.852 0.000 0.112 0.036 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1352369 3 0.5388 0.47140 0.200 0.000 0.604 0.192 0.000 0.004
#> SRR1382934 3 0.4065 0.32668 0.000 0.000 0.724 0.220 0.056 0.000
#> SRR1465208 1 0.2834 0.62800 0.852 0.000 0.120 0.020 0.000 0.008
#> SRR1314728 3 0.4671 0.43171 0.304 0.000 0.628 0.068 0.000 0.000
#> SRR1470291 1 0.3817 0.55332 0.784 0.000 0.152 0.052 0.000 0.012
#> SRR1308756 3 0.2948 0.53168 0.060 0.000 0.848 0.092 0.000 0.000
#> SRR1409600 3 0.4408 0.42720 0.320 0.000 0.636 0.044 0.000 0.000
#> SRR816123 6 0.1765 0.90713 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR614779 3 0.4372 0.53871 0.124 0.000 0.740 0.128 0.008 0.000
#> SRR810783 3 0.4812 0.26416 0.432 0.000 0.520 0.044 0.000 0.004
#> SRR1333990 1 0.3642 0.62087 0.800 0.000 0.140 0.048 0.000 0.012
#> SRR1410356 3 0.6031 0.05428 0.264 0.000 0.468 0.264 0.000 0.004
#> SRR808106 4 0.6561 0.39712 0.128 0.000 0.152 0.568 0.148 0.004
#> SRR662713 3 0.5791 0.16596 0.336 0.000 0.472 0.192 0.000 0.000
#> SRR1447058 2 0.3356 0.84471 0.000 0.808 0.000 0.140 0.000 0.052
#> SRR1480964 3 0.5778 0.42015 0.260 0.000 0.560 0.168 0.004 0.008
#> SRR809382 3 0.5784 0.49207 0.152 0.000 0.628 0.164 0.056 0.000
#> SRR665417 3 0.6025 -0.34714 0.172 0.000 0.520 0.292 0.008 0.008
#> SRR1088016 6 0.5612 0.12798 0.000 0.428 0.000 0.144 0.000 0.428
#> SRR1453166 6 0.3229 0.90310 0.000 0.140 0.000 0.044 0.000 0.816
#> SRR1069826 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1077781 2 0.1549 0.89901 0.000 0.936 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR615623 3 0.6277 0.36962 0.092 0.000 0.576 0.204 0.128 0.000
#> SRR1413787 3 0.4177 0.33389 0.004 0.000 0.724 0.216 0.056 0.000
#> SRR1478207 3 0.4446 0.54205 0.120 0.000 0.732 0.140 0.008 0.000
#> SRR1411046 1 0.4393 0.43760 0.640 0.000 0.316 0.044 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0146 0.91767 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326560 1 0.5591 0.01375 0.576 0.000 0.248 0.168 0.000 0.008
#> SRR1309051 1 0.4741 0.15338 0.692 0.000 0.156 0.148 0.000 0.004
#> SRR1486949 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1395616 1 0.5377 -0.00317 0.604 0.000 0.176 0.216 0.000 0.004
#> SRR1074956 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1092961 6 0.1765 0.89006 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR817210 3 0.5867 0.38818 0.308 0.000 0.508 0.176 0.000 0.008
#> SRR1319221 5 0.0000 0.74595 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405413 1 0.4535 -0.17980 0.484 0.000 0.484 0.032 0.000 0.000
#> SRR607807 5 0.4543 0.59841 0.012 0.000 0.016 0.332 0.632 0.008
#> SRR1390160 3 0.5197 0.50294 0.120 0.000 0.696 0.128 0.056 0.000
#> SRR1406283 3 0.4725 0.45017 0.264 0.000 0.648 0.088 0.000 0.000
#> SRR1357709 3 0.5357 0.27768 0.272 0.000 0.588 0.136 0.000 0.004
#> SRR1080742 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1468208 1 0.6929 -0.38890 0.428 0.000 0.192 0.312 0.064 0.004
#> SRR1312766 3 0.4976 0.31562 0.400 0.000 0.536 0.060 0.000 0.004
#> SRR1361612 1 0.3212 0.60098 0.800 0.000 0.180 0.016 0.000 0.004
#> SRR1311224 1 0.4645 0.51521 0.648 0.000 0.276 0.076 0.000 0.000
#> SRR1087801 3 0.5438 -0.02968 0.124 0.000 0.604 0.260 0.004 0.008
#> SRR1099720 2 0.1983 0.88257 0.000 0.908 0.000 0.020 0.000 0.072
#> SRR1349250 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1350912 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1357127 3 0.4312 0.48498 0.272 0.000 0.676 0.052 0.000 0.000
#> SRR1074980 2 0.3332 0.84404 0.000 0.808 0.000 0.144 0.000 0.048
#> SRR1317022 3 0.5006 0.42333 0.056 0.000 0.692 0.196 0.056 0.000
#> SRR1332879 1 0.2955 0.61472 0.816 0.000 0.172 0.008 0.000 0.004
#> SRR1403177 5 0.0000 0.74595 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076144 2 0.0547 0.91523 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1069614 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR818239 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1421069 6 0.1765 0.90895 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1500006 4 0.5777 0.57321 0.332 0.000 0.152 0.508 0.008 0.000
#> SRR1485678 1 0.4828 -0.12006 0.500 0.000 0.452 0.044 0.000 0.004
#> SRR1092232 3 0.5652 0.28848 0.032 0.000 0.616 0.212 0.140 0.000
#> SRR1344253 3 0.3211 0.39541 0.056 0.000 0.824 0.120 0.000 0.000
#> SRR1384290 1 0.5727 -0.15338 0.564 0.000 0.172 0.252 0.000 0.012
#> SRR1089349 3 0.5636 0.40770 0.308 0.000 0.516 0.176 0.000 0.000
#> SRR1343522 2 0.1983 0.88257 0.000 0.908 0.000 0.020 0.000 0.072
#> SRR1326727 2 0.0806 0.91361 0.000 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1440940 3 0.4192 0.51271 0.088 0.000 0.776 0.108 0.028 0.000
#> SRR818372 3 0.4751 0.43555 0.316 0.000 0.620 0.060 0.004 0.000
#> SRR1323675 2 0.2384 0.89012 0.000 0.888 0.000 0.064 0.000 0.048
#> SRR819894 3 0.5091 0.38316 0.332 0.000 0.580 0.084 0.000 0.004
#> SRR1310031 3 0.4132 0.48620 0.064 0.000 0.748 0.180 0.008 0.000
#> SRR615419 3 0.5647 0.48680 0.132 0.000 0.644 0.168 0.056 0.000
#> SRR1436925 3 0.4940 0.32129 0.400 0.000 0.532 0.068 0.000 0.000
#> SRR1477238 4 0.5874 0.70539 0.204 0.000 0.292 0.500 0.000 0.004
#> SRR1332566 1 0.4199 0.50770 0.736 0.000 0.196 0.060 0.000 0.008
#> SRR1490228 3 0.4662 0.54217 0.192 0.000 0.700 0.100 0.008 0.000
#> SRR1442949 3 0.3699 0.53617 0.112 0.000 0.796 0.088 0.004 0.000
#> SRR1466239 1 0.3240 0.63295 0.820 0.000 0.144 0.028 0.000 0.008
#> SRR1094003 2 0.1049 0.90845 0.000 0.960 0.000 0.008 0.000 0.032
#> SRR1329971 1 0.4467 0.10024 0.564 0.000 0.408 0.024 0.000 0.004
#> SRR813076 2 0.0363 0.91667 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1097642 2 0.5597 0.17969 0.000 0.480 0.000 0.148 0.000 0.372
#> SRR1322981 3 0.5176 0.32258 0.384 0.000 0.532 0.080 0.000 0.004
#> SRR1485976 2 0.0146 0.91767 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471713 3 0.5191 0.49263 0.112 0.000 0.696 0.136 0.056 0.000
#> SRR660522 3 0.2664 0.55229 0.136 0.000 0.848 0.016 0.000 0.000
#> SRR815374 1 0.4756 -0.12920 0.488 0.000 0.464 0.048 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.1765 0.90713 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1416337 3 0.4641 0.53253 0.200 0.000 0.684 0.116 0.000 0.000
#> SRR1316438 3 0.5352 0.11655 0.008 0.000 0.620 0.204 0.168 0.000
#> SRR1386844 1 0.4877 0.28975 0.676 0.000 0.216 0.096 0.000 0.012
#> SRR1373718 1 0.4858 0.51533 0.664 0.000 0.180 0.156 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.1082 0.91209 0.000 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1487128 3 0.5579 0.06069 0.336 0.000 0.532 0.124 0.000 0.008
#> SRR1441421 2 0.2389 0.89007 0.000 0.888 0.000 0.060 0.000 0.052
#> SRR1069919 2 0.2480 0.87958 0.000 0.872 0.000 0.104 0.000 0.024
#> SRR1460296 1 0.3705 0.56942 0.748 0.000 0.224 0.024 0.000 0.004
#> SRR1335489 3 0.4765 0.30301 0.204 0.000 0.680 0.112 0.000 0.004
#> SRR1393404 2 0.0713 0.91499 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1081425 1 0.5093 0.46032 0.632 0.000 0.192 0.176 0.000 0.000
#> SRR1401815 3 0.5801 -0.14684 0.000 0.000 0.492 0.216 0.292 0.000
#> SRR1071337 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1071983 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1331793 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1410510 3 0.4858 0.45078 0.060 0.000 0.708 0.184 0.048 0.000
#> SRR1098761 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1312124 3 0.4841 0.28293 0.412 0.000 0.536 0.048 0.000 0.004
#> SRR615395 3 0.5275 0.21694 0.412 0.000 0.504 0.076 0.000 0.008
#> SRR1479349 1 0.4389 0.33441 0.596 0.000 0.372 0.032 0.000 0.000
#> SRR2165033 3 0.4933 0.40355 0.168 0.000 0.684 0.136 0.012 0.000
#> SRR1089054 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR816201 3 0.4654 0.45541 0.268 0.000 0.652 0.080 0.000 0.000
#> SRR1488514 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR655840 3 0.5214 0.41542 0.288 0.000 0.596 0.112 0.000 0.004
#> SRR1379303 1 0.2658 0.59611 0.876 0.000 0.080 0.036 0.000 0.008
#> SRR1418516 3 0.4988 0.23882 0.084 0.000 0.668 0.232 0.008 0.008
#> SRR613174 3 0.4928 0.37924 0.352 0.000 0.572 0.076 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.5336 0.44021 0.284 0.000 0.572 0.144 0.000 0.000
#> SRR659157 3 0.4640 0.34331 0.040 0.000 0.728 0.172 0.060 0.000
#> SRR1480408 3 0.5757 0.23275 0.324 0.000 0.516 0.152 0.000 0.008
#> SRR657857 3 0.5822 0.06785 0.236 0.000 0.540 0.216 0.000 0.008
#> SRR1073317 2 0.1092 0.90961 0.000 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1332526 3 0.5790 0.07323 0.388 0.000 0.464 0.140 0.000 0.008
#> SRR1094168 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1431270 3 0.6015 0.48937 0.184 0.000 0.596 0.164 0.056 0.000
#> SRR1085614 6 0.5113 0.71294 0.000 0.236 0.000 0.144 0.000 0.620
#> SRR1330106 3 0.3900 0.53057 0.092 0.000 0.784 0.116 0.008 0.000
#> SRR1466154 1 0.4376 0.57160 0.704 0.000 0.212 0.084 0.000 0.000
#> SRR1396944 4 0.5727 0.63273 0.248 0.000 0.184 0.560 0.004 0.004
#> SRR1082784 2 0.0547 0.91708 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1457267 1 0.4660 0.31272 0.712 0.000 0.168 0.108 0.000 0.012
#> SRR614659 3 0.5304 0.36575 0.336 0.000 0.556 0.104 0.000 0.004
#> SRR659247 3 0.5152 0.32981 0.372 0.000 0.544 0.080 0.000 0.004
#> SRR1317201 1 0.2876 0.62944 0.844 0.000 0.132 0.016 0.000 0.008
#> SRR1473696 1 0.4303 0.29854 0.616 0.000 0.360 0.016 0.000 0.008
#> SRR1375842 1 0.5945 -0.29768 0.416 0.000 0.184 0.396 0.004 0.000
#> SRR1388123 2 0.0790 0.91404 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1096363 6 0.3332 0.89876 0.000 0.144 0.000 0.048 0.000 0.808
#> SRR1453662 3 0.4513 0.26003 0.440 0.000 0.528 0.032 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.1398 0.90798 0.000 0.940 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR1353499 1 0.6060 -0.14267 0.376 0.000 0.260 0.364 0.000 0.000
#> SRR1416693 1 0.4728 0.28858 0.700 0.000 0.188 0.100 0.000 0.012
#> SRR1070841 3 0.4711 0.40731 0.328 0.000 0.608 0.064 0.000 0.000
#> SRR1380910 1 0.4389 0.55614 0.712 0.000 0.188 0.100 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1498183 1 0.3863 0.55470 0.728 0.000 0.244 0.020 0.000 0.008
#> SRR612659 3 0.4602 0.48677 0.092 0.000 0.704 0.196 0.008 0.000
#> SRR1447148 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR658597 6 0.2092 0.91502 0.000 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1089595 2 0.5608 0.14822 0.000 0.472 0.000 0.148 0.000 0.380
#> SRR1074263 2 0.1926 0.88571 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1376786 1 0.5112 0.19350 0.536 0.000 0.392 0.064 0.000 0.008
#> SRR1345995 3 0.5038 0.38730 0.344 0.000 0.576 0.076 0.000 0.004
#> SRR1071035 4 0.6135 0.57905 0.208 0.000 0.384 0.400 0.000 0.008
#> SRR1068808 6 0.3023 0.84302 0.000 0.140 0.000 0.032 0.000 0.828
#> SRR1332754 2 0.3316 0.84744 0.000 0.812 0.000 0.136 0.000 0.052
#> SRR662438 1 0.3766 0.51326 0.748 0.000 0.212 0.040 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.4973 0.54522 0.624 0.000 0.264 0.112 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.3998 0.49666 0.248 0.000 0.712 0.040 0.000 0.000
#> SRR1323558 3 0.4696 0.51309 0.224 0.000 0.688 0.076 0.012 0.000
#> SRR1381711 3 0.2629 0.49210 0.068 0.000 0.872 0.060 0.000 0.000
#> SRR657985 3 0.3006 0.43234 0.064 0.000 0.844 0.092 0.000 0.000
#> SRR1314810 3 0.5447 0.27706 0.220 0.000 0.604 0.168 0.000 0.008
#> SRR1336505 3 0.4984 0.49805 0.148 0.000 0.684 0.156 0.008 0.004
#> SRR1474095 3 0.5002 0.28483 0.412 0.000 0.516 0.072 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.0146 0.91767 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442376 3 0.5828 0.31847 0.284 0.000 0.512 0.200 0.000 0.004
#> SRR1074909 6 0.2092 0.91502 0.000 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1101200 3 0.5934 0.16725 0.320 0.000 0.448 0.232 0.000 0.000
#> SRR1075408 2 0.1075 0.90786 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1367150 3 0.2869 0.54685 0.148 0.000 0.832 0.020 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1068880 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1467277 3 0.4336 0.53937 0.116 0.000 0.724 0.160 0.000 0.000
#> SRR1084867 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1095431 6 0.1663 0.90398 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1380184 2 0.0806 0.91663 0.000 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1443113 3 0.5654 0.22141 0.308 0.000 0.540 0.144 0.000 0.008
#> SRR1380414 3 0.5158 0.34979 0.356 0.000 0.556 0.084 0.000 0.004
#> SRR1315912 1 0.5467 0.40209 0.544 0.000 0.304 0.152 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.0717 0.91671 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1421116 2 0.3139 0.85430 0.000 0.816 0.000 0.152 0.000 0.032
#> SRR602282 5 0.5367 0.51341 0.000 0.000 0.224 0.188 0.588 0.000
#> SRR1361195 2 0.1616 0.89639 0.000 0.932 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR600493 1 0.4273 0.59708 0.716 0.000 0.204 0.080 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.4776 0.19499 0.460 0.000 0.496 0.040 0.000 0.004
#> SRR1355475 3 0.4842 0.41628 0.324 0.000 0.600 0.076 0.000 0.000
#> SRR1360785 3 0.5167 0.20751 0.196 0.000 0.636 0.164 0.000 0.004
#> SRR810437 3 0.3377 0.44853 0.056 0.000 0.808 0.136 0.000 0.000
#> SRR1361860 3 0.5446 -0.07485 0.156 0.000 0.600 0.236 0.000 0.008
#> SRR1441311 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1098903 3 0.5411 0.02600 0.432 0.000 0.472 0.088 0.000 0.008
#> SRR1457619 3 0.5020 0.33687 0.372 0.000 0.548 0.080 0.000 0.000
#> SRR1498529 1 0.4291 0.59442 0.708 0.000 0.240 0.040 0.000 0.012
#> SRR1097172 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1074017 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1472033 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1445087 3 0.4887 0.27216 0.028 0.000 0.688 0.212 0.072 0.000
#> SRR1399525 6 0.3908 0.87424 0.000 0.132 0.000 0.100 0.000 0.768
#> SRR1312844 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1085874 6 0.1765 0.90713 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1101226 6 0.1387 0.89149 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1476056 3 0.5812 0.11059 0.264 0.000 0.536 0.192 0.000 0.008
#> SRR1075659 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1311916 3 0.4804 0.43864 0.052 0.000 0.712 0.184 0.052 0.000
#> SRR1353353 3 0.4255 0.29357 0.000 0.000 0.708 0.224 0.068 0.000
#> SRR1073291 3 0.4889 0.44306 0.312 0.000 0.604 0.084 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.2504 0.61349 0.880 0.000 0.088 0.028 0.000 0.004
#> SRR1080720 2 0.2145 0.88239 0.000 0.900 0.000 0.028 0.000 0.072
#> SRR1091695 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1350304 3 0.3537 0.47288 0.072 0.000 0.808 0.116 0.004 0.000
#> SRR663002 3 0.3024 0.46810 0.032 0.000 0.844 0.116 0.008 0.000
#> SRR1376983 2 0.0260 0.91706 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.4970 0.13056 0.672 0.000 0.176 0.144 0.000 0.008
#> SRR1347144 3 0.4901 0.45981 0.068 0.000 0.712 0.168 0.052 0.000
#> SRR1384006 1 0.5648 0.25932 0.536 0.000 0.224 0.240 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.1863 0.91038 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR614047 3 0.4808 0.49125 0.272 0.000 0.636 0.092 0.000 0.000
#> SRR818440 3 0.4524 0.41985 0.320 0.000 0.628 0.052 0.000 0.000
#> SRR1337770 3 0.4382 0.45678 0.164 0.000 0.728 0.104 0.000 0.004
#> SRR1399413 3 0.5806 -0.10971 0.172 0.000 0.524 0.296 0.000 0.008
#> SRR1385542 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473959 3 0.4511 0.40749 0.332 0.000 0.620 0.048 0.000 0.000
#> SRR1074041 3 0.5190 0.35741 0.352 0.000 0.556 0.088 0.000 0.004
#> SRR1394495 2 0.0458 0.91806 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR659460 3 0.5647 0.43209 0.260 0.000 0.552 0.184 0.000 0.004
#> SRR816699 3 0.4938 0.38093 0.340 0.000 0.580 0.080 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.3642 0.53254 0.204 0.000 0.760 0.036 0.000 0.000
#> SRR1499418 3 0.4675 0.49294 0.096 0.000 0.696 0.200 0.008 0.000
#> SRR1352894 2 0.0291 0.91768 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR815805 4 0.5468 0.67876 0.188 0.000 0.244 0.568 0.000 0.000
#> SRR1331083 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR808272 3 0.2629 0.51920 0.068 0.000 0.872 0.060 0.000 0.000
#> SRR1436698 3 0.4970 0.35587 0.372 0.000 0.560 0.064 0.000 0.004
#> SRR1095627 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1357672 3 0.3422 0.53255 0.176 0.000 0.788 0.036 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.4278 0.57455 0.712 0.000 0.212 0.076 0.000 0.000
#> SRR1077479 4 0.5920 0.67415 0.192 0.000 0.336 0.468 0.000 0.004
#> SRR814491 3 0.3744 0.52815 0.200 0.000 0.756 0.044 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.1867 0.88626 0.000 0.916 0.000 0.020 0.000 0.064
#> SRR1436004 1 0.5482 0.41538 0.544 0.000 0.300 0.156 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.1926 0.88363 0.000 0.912 0.000 0.020 0.000 0.068
#> SRR1078998 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1314707 4 0.5620 0.69551 0.212 0.000 0.220 0.564 0.000 0.004
#> SRR1309534 3 0.3845 0.33519 0.056 0.000 0.768 0.172 0.004 0.000
#> SRR615527 5 0.5093 0.57015 0.000 0.000 0.192 0.176 0.632 0.000
#> SRR1098216 4 0.5802 0.60667 0.256 0.000 0.244 0.500 0.000 0.000
#> SRR1325847 6 0.2531 0.91484 0.000 0.132 0.000 0.012 0.000 0.856
#> SRR1404003 3 0.5804 0.31379 0.312 0.000 0.516 0.164 0.000 0.008
#> SRR1344166 1 0.5057 0.38741 0.560 0.000 0.352 0.088 0.000 0.000
#> SRR1368638 3 0.4024 0.47873 0.264 0.000 0.700 0.036 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.3316 0.84744 0.000 0.812 0.000 0.136 0.000 0.052
#> SRR1079237 6 0.4500 0.77923 0.000 0.148 0.000 0.144 0.000 0.708
#> SRR1080509 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR815759 3 0.3806 0.53589 0.164 0.000 0.768 0.068 0.000 0.000
#> SRR1502143 3 0.4938 0.38180 0.340 0.000 0.580 0.080 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.5087 0.43443 0.064 0.000 0.688 0.192 0.056 0.000
#> SRR1402307 2 0.0790 0.91429 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR820810 1 0.4587 0.29801 0.588 0.000 0.372 0.036 0.000 0.004
#> SRR1099212 6 0.5304 0.65095 0.000 0.276 0.000 0.144 0.000 0.580
#> SRR1083215 3 0.4599 0.43741 0.212 0.000 0.684 0.104 0.000 0.000
#> SRR1476547 6 0.4273 0.74331 0.000 0.120 0.000 0.148 0.000 0.732
#> SRR656421 1 0.3352 0.63389 0.812 0.000 0.148 0.032 0.000 0.008
#> SRR1086116 2 0.1007 0.90976 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1499917 3 0.3210 0.54256 0.168 0.000 0.804 0.028 0.000 0.000
#> SRR1339944 2 0.4175 0.81280 0.000 0.740 0.000 0.156 0.000 0.104
#> SRR1391444 2 0.0291 0.91750 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1434889 3 0.5882 0.26445 0.208 0.000 0.532 0.252 0.004 0.004
#> SRR1431847 3 0.5319 0.20521 0.036 0.000 0.656 0.208 0.100 0.000
#> SRR1317155 3 0.4888 0.12522 0.076 0.000 0.676 0.228 0.020 0.000
#> SRR1477405 1 0.4085 0.60237 0.736 0.000 0.192 0.072 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.5260 0.35208 0.348 0.000 0.552 0.096 0.000 0.004
#> SRR1341683 3 0.3985 0.49976 0.068 0.000 0.768 0.156 0.008 0.000
#> SRR1084790 1 0.4747 0.43111 0.608 0.000 0.324 0.068 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.5486 0.39099 0.316 0.000 0.548 0.132 0.000 0.004
#> SRR1332588 3 0.3104 0.54203 0.184 0.000 0.800 0.016 0.000 0.000
#> SRR1471157 2 0.0865 0.91273 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR654945 3 0.3909 0.50062 0.244 0.000 0.720 0.036 0.000 0.000
#> SRR661028 1 0.2696 0.59193 0.872 0.000 0.076 0.048 0.000 0.004
#> SRR1413477 2 0.0717 0.91471 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1101152 3 0.5171 0.25238 0.416 0.000 0.496 0.088 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.4500 0.76475 0.000 0.148 0.000 0.144 0.000 0.708
#> SRR2165273 1 0.5525 -0.06512 0.604 0.000 0.176 0.208 0.000 0.012
#> SRR1379014 1 0.4116 0.53967 0.752 0.000 0.180 0.056 0.000 0.012
#> SRR1489904 3 0.5408 0.50759 0.164 0.000 0.664 0.128 0.044 0.000
#> SRR1416386 6 0.3683 0.86603 0.000 0.184 0.000 0.048 0.000 0.768
#> SRR1406048 1 0.3018 0.60995 0.816 0.000 0.168 0.012 0.000 0.004
#> SRR606982 3 0.4820 0.18349 0.088 0.000 0.652 0.256 0.000 0.004
#> SRR1358082 1 0.4358 0.53351 0.716 0.000 0.184 0.100 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.5298 0.49974 0.164 0.000 0.644 0.180 0.008 0.004
#> SRR655194 3 0.4409 0.32325 0.380 0.000 0.588 0.032 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.1003 0.91110 0.000 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1473251 6 0.4313 0.73901 0.000 0.124 0.000 0.148 0.000 0.728
#> SRR1389820 5 0.0000 0.74595 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074289 3 0.6070 0.05478 0.240 0.000 0.480 0.272 0.000 0.008
#> SRR1348816 2 0.1616 0.89654 0.000 0.932 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR1076292 3 0.4566 0.52504 0.136 0.000 0.712 0.148 0.004 0.000
#> SRR1395810 2 0.0260 0.91725 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1498909 3 0.4582 0.53781 0.160 0.000 0.716 0.116 0.008 0.000
#> SRR1443507 3 0.5321 0.28870 0.400 0.000 0.504 0.092 0.000 0.004
#> SRR1452310 3 0.2771 0.54381 0.116 0.000 0.852 0.032 0.000 0.000
#> SRR665610 3 0.3808 0.50819 0.228 0.000 0.736 0.036 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.2830 0.63753 0.836 0.000 0.144 0.020 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.1714 0.90500 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1477256 3 0.4983 -0.19809 0.456 0.000 0.484 0.056 0.000 0.004
#> SRR1470230 3 0.4117 0.36213 0.036 0.000 0.752 0.188 0.024 0.000
#> SRR1354247 4 0.5719 0.62562 0.240 0.000 0.156 0.584 0.020 0.000
#> SRR1082640 2 0.3394 0.84179 0.000 0.804 0.000 0.144 0.000 0.052
#> SRR1487592 3 0.5434 0.45813 0.212 0.000 0.596 0.188 0.000 0.004
#> SRR1352299 3 0.5850 0.12241 0.268 0.000 0.528 0.196 0.000 0.008
#> SRR1076317 6 0.2531 0.91484 0.000 0.132 0.000 0.012 0.000 0.856
#> SRR1434117 3 0.5426 0.36172 0.356 0.000 0.528 0.112 0.004 0.000
#> SRR1075273 6 0.2868 0.91193 0.000 0.132 0.000 0.028 0.000 0.840
#> SRR658657 3 0.5007 0.50819 0.176 0.000 0.696 0.092 0.036 0.000
#> SRR1092773 6 0.3044 0.88549 0.000 0.116 0.000 0.048 0.000 0.836
#> SRR1365332 3 0.4925 0.24703 0.440 0.000 0.504 0.052 0.000 0.004
#> SRR615958 3 0.5248 0.51916 0.188 0.000 0.636 0.168 0.008 0.000
#> SRR1097688 6 0.2178 0.91493 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1403259 3 0.5172 0.22922 0.036 0.000 0.664 0.220 0.080 0.000
#> SRR1099120 6 0.1663 0.90070 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1362200 3 0.5010 0.50658 0.240 0.000 0.648 0.104 0.008 0.000
#> SRR1464856 2 0.0717 0.91441 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1347298 3 0.4278 0.33263 0.016 0.000 0.720 0.224 0.040 0.000
#> SRR1075923 6 0.3014 0.90957 0.000 0.132 0.000 0.036 0.000 0.832
#> SRR1100703 3 0.5266 0.37414 0.336 0.000 0.560 0.100 0.000 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17646 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.4352 0.565 0.565
#> 3 3 0.907 0.884 0.955 0.1630 0.936 0.887
#> 4 4 0.702 0.766 0.851 0.2022 0.941 0.884
#> 5 5 0.574 0.623 0.781 0.1507 0.823 0.624
#> 6 6 0.598 0.628 0.748 0.0789 0.844 0.541
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1354977 1 0 1 1 0
#> SRR1436370 2 0 1 0 1
#> SRR1075752 2 0 1 0 1
#> SRR1397949 1 0 1 1 0
#> SRR1355723 1 0 1 1 0
#> SRR1329744 1 0 1 1 0
#> SRR657384 1 0 1 1 0
#> SRR1351190 1 0 1 1 0
#> SRR1458662 2 0 1 0 1
#> SRR818573 1 0 1 1 0
#> SRR1396017 1 0 1 1 0
#> SRR1410742 1 0 1 1 0
#> SRR1435963 1 0 1 1 0
#> SRR1382416 1 0 1 1 0
#> SRR1391354 1 0 1 1 0
#> SRR1087968 2 0 1 0 1
#> SRR1310075 1 0 1 1 0
#> SRR1312244 1 0 1 1 0
#> SRR1325138 1 0 1 1 0
#> SRR1326821 1 0 1 1 0
#> SRR1490178 2 0 1 0 1
#> SRR655613 1 0 1 1 0
#> SRR1075707 2 0 1 0 1
#> SRR1443871 2 0 1 0 1
#> SRR1102489 2 0 1 0 1
#> SRR1465758 1 0 1 1 0
#> SRR1414058 1 0 1 1 0
#> SRR1407449 1 0 1 1 0
#> SRR1436858 2 0 1 0 1
#> SRR1479109 1 0 1 1 0
#> SRR1399069 1 0 1 1 0
#> SRR1366450 1 0 1 1 0
#> SRR1396859 1 0 1 1 0
#> SRR1457176 1 0 1 1 0
#> SRR1097666 2 0 1 0 1
#> SRR1434736 1 0 1 1 0
#> SRR1080560 2 0 1 0 1
#> SRR1322882 1 0 1 1 0
#> SRR1435688 2 0 1 0 1
#> SRR1327614 1 0 1 1 0
#> SRR658152 1 0 1 1 0
#> SRR1368141 1 0 1 1 0
#> SRR1440268 1 0 1 1 0
#> SRR1453725 1 0 1 1 0
#> SRR1325711 2 0 1 0 1
#> SRR1477930 1 0 1 1 0
#> SRR1477591 1 0 1 1 0
#> SRR1416049 2 0 1 0 1
#> SRR656275 1 0 1 1 0
#> SRR1369052 1 0 1 1 0
#> SRR1377735 1 0 1 1 0
#> SRR1331244 1 0 1 1 0
#> SRR1404531 1 0 1 1 0
#> SRR1324331 1 0 1 1 0
#> SRR1458890 1 0 1 1 0
#> SRR1432695 2 0 1 0 1
#> SRR1407624 2 0 1 0 1
#> SRR1431969 1 0 1 1 0
#> SRR1087393 2 0 1 0 1
#> SRR1077263 1 0 1 1 0
#> SRR1385211 1 0 1 1 0
#> SRR655241 1 0 1 1 0
#> SRR656922 1 0 1 1 0
#> SRR1361630 1 0 1 1 0
#> SRR1318966 2 0 1 0 1
#> SRR1407087 1 0 1 1 0
#> SRR603212 1 0 1 1 0
#> SRR1321088 2 0 1 0 1
#> SRR1485190 1 0 1 1 0
#> SRR1332232 2 0 1 0 1
#> SRR1312645 1 0 1 1 0
#> SRR1457835 1 0 1 1 0
#> SRR1347123 1 0 1 1 0
#> SRR1465501 2 0 1 0 1
#> SRR1330878 1 0 1 1 0
#> SRR1445064 1 0 1 1 0
#> SRR1452981 1 0 1 1 0
#> SRR1326708 1 0 1 1 0
#> SRR1407157 1 0 1 1 0
#> SRR1365401 2 0 1 0 1
#> SRR1397697 2 0 1 0 1
#> SRR1477316 1 0 1 1 0
#> SRR1077898 1 0 1 1 0
#> SRR1349080 1 0 1 1 0
#> SRR1076096 2 0 1 0 1
#> SRR811261 2 0 1 0 1
#> SRR1375485 1 0 1 1 0
#> SRR1432563 2 0 1 0 1
#> SRR604414 1 0 1 1 0
#> SRR1380614 1 0 1 1 0
#> SRR812060 1 0 1 1 0
#> SRR602082 1 0 1 1 0
#> SRR1069490 2 0 1 0 1
#> SRR1078417 2 0 1 0 1
#> SRR661613 1 0 1 1 0
#> SRR1420710 1 0 1 1 0
#> SRR660426 1 0 1 1 0
#> SRR1416003 1 0 1 1 0
#> SRR661064 1 0 1 1 0
#> SRR1082011 2 0 1 0 1
#> SRR1452718 1 0 1 1 0
#> SRR1353243 1 0 1 1 0
#> SRR1455482 1 0 1 1 0
#> SRR1313473 1 0 1 1 0
#> SRR1399394 1 0 1 1 0
#> SRR1102467 1 0 1 1 0
#> SRR1317470 1 0 1 1 0
#> SRR1337707 1 0 1 1 0
#> SRR1408752 2 0 1 0 1
#> SRR1474617 2 0 1 0 1
#> SRR1398013 1 0 1 1 0
#> SRR1352918 1 0 1 1 0
#> SRR1420750 1 0 1 1 0
#> SRR1071785 1 0 1 1 0
#> SRR1353618 2 0 1 0 1
#> SRR1082217 2 0 1 0 1
#> SRR1357256 2 0 1 0 1
#> SRR1490313 1 0 1 1 0
#> SRR1366560 1 0 1 1 0
#> SRR1355684 1 0 1 1 0
#> SRR1323289 1 0 1 1 0
#> SRR1313494 1 0 1 1 0
#> SRR1309985 1 0 1 1 0
#> SRR607911 1 0 1 1 0
#> SRR1333789 1 0 1 1 0
#> SRR1400078 1 0 1 1 0
#> SRR1088631 2 0 1 0 1
#> SRR1092842 2 0 1 0 1
#> SRR615575 1 0 1 1 0
#> SRR1079434 1 0 1 1 0
#> SRR1325559 1 0 1 1 0
#> SRR1446695 1 0 1 1 0
#> SRR1383883 1 0 1 1 0
#> SRR1396100 1 0 1 1 0
#> SRR1475697 1 0 1 1 0
#> SRR1488067 2 0 1 0 1
#> SRR1102103 2 0 1 0 1
#> SRR1105154 2 0 1 0 1
#> SRR1084991 2 0 1 0 1
#> SRR1410380 1 0 1 1 0
#> SRR1445490 2 0 1 0 1
#> SRR1454671 2 0 1 0 1
#> SRR1435044 1 0 1 1 0
#> SRR1485812 1 0 1 1 0
#> SRR1078020 2 0 1 0 1
#> SRR1311153 1 0 1 1 0
#> SRR1376406 2 0 1 0 1
#> SRR1343898 1 0 1 1 0
#> SRR807775 1 0 1 1 0
#> SRR1409215 2 0 1 0 1
#> SRR820427 1 0 1 1 0
#> SRR1100656 2 0 1 0 1
#> SRR1362159 1 0 1 1 0
#> SRR1414536 1 0 1 1 0
#> SRR656794 1 0 1 1 0
#> SRR604653 1 0 1 1 0
#> SRR1317685 1 0 1 1 0
#> SRR1485912 1 0 1 1 0
#> SRR1407602 1 0 1 1 0
#> SRR1356164 1 0 1 1 0
#> SRR1328692 1 0 1 1 0
#> SRR1362438 1 0 1 1 0
#> SRR1479216 1 0 1 1 0
#> SRR1358041 1 0 1 1 0
#> SRR1468766 1 0 1 1 0
#> SRR1368200 1 0 1 1 0
#> SRR1435602 2 0 1 0 1
#> SRR1501043 1 0 1 1 0
#> SRR1437256 1 0 1 1 0
#> SRR1487446 1 0 1 1 0
#> SRR816653 1 0 1 1 0
#> SRR815164 1 0 1 1 0
#> SRR1442043 1 0 1 1 0
#> SRR1410573 1 0 1 1 0
#> SRR1096782 2 0 1 0 1
#> SRR1352369 1 0 1 1 0
#> SRR1382934 1 0 1 1 0
#> SRR1465208 1 0 1 1 0
#> SRR1314728 1 0 1 1 0
#> SRR1470291 1 0 1 1 0
#> SRR1308756 1 0 1 1 0
#> SRR1409600 1 0 1 1 0
#> SRR816123 2 0 1 0 1
#> SRR614779 1 0 1 1 0
#> SRR810783 1 0 1 1 0
#> SRR1333990 1 0 1 1 0
#> SRR1410356 1 0 1 1 0
#> SRR808106 1 0 1 1 0
#> SRR662713 1 0 1 1 0
#> SRR1447058 2 0 1 0 1
#> SRR1480964 1 0 1 1 0
#> SRR809382 1 0 1 1 0
#> SRR665417 1 0 1 1 0
#> SRR1088016 2 0 1 0 1
#> SRR1453166 2 0 1 0 1
#> SRR1069826 2 0 1 0 1
#> SRR1077781 2 0 1 0 1
#> SRR615623 1 0 1 1 0
#> SRR1413787 1 0 1 1 0
#> SRR1478207 1 0 1 1 0
#> SRR1411046 1 0 1 1 0
#> SRR1313711 2 0 1 0 1
#> SRR1326560 1 0 1 1 0
#> SRR1309051 1 0 1 1 0
#> SRR1486949 2 0 1 0 1
#> SRR1395616 1 0 1 1 0
#> SRR1074956 2 0 1 0 1
#> SRR1092961 2 0 1 0 1
#> SRR817210 1 0 1 1 0
#> SRR1319221 1 0 1 1 0
#> SRR1405413 1 0 1 1 0
#> SRR607807 1 0 1 1 0
#> SRR1390160 1 0 1 1 0
#> SRR1406283 1 0 1 1 0
#> SRR1357709 1 0 1 1 0
#> SRR1080742 2 0 1 0 1
#> SRR1468208 1 0 1 1 0
#> SRR1312766 1 0 1 1 0
#> SRR1361612 1 0 1 1 0
#> SRR1311224 1 0 1 1 0
#> SRR1087801 1 0 1 1 0
#> SRR1099720 2 0 1 0 1
#> SRR1349250 2 0 1 0 1
#> SRR1350912 2 0 1 0 1
#> SRR1357127 1 0 1 1 0
#> SRR1074980 2 0 1 0 1
#> SRR1317022 1 0 1 1 0
#> SRR1332879 1 0 1 1 0
#> SRR1403177 1 0 1 1 0
#> SRR1076144 2 0 1 0 1
#> SRR1069614 2 0 1 0 1
#> SRR818239 2 0 1 0 1
#> SRR1421069 2 0 1 0 1
#> SRR1500006 1 0 1 1 0
#> SRR1485678 1 0 1 1 0
#> SRR1092232 1 0 1 1 0
#> SRR1344253 1 0 1 1 0
#> SRR1384290 1 0 1 1 0
#> SRR1089349 1 0 1 1 0
#> SRR1343522 2 0 1 0 1
#> SRR1326727 2 0 1 0 1
#> SRR1440940 1 0 1 1 0
#> SRR818372 1 0 1 1 0
#> SRR1323675 2 0 1 0 1
#> SRR819894 1 0 1 1 0
#> SRR1310031 1 0 1 1 0
#> SRR615419 1 0 1 1 0
#> SRR1436925 1 0 1 1 0
#> SRR1477238 1 0 1 1 0
#> SRR1332566 1 0 1 1 0
#> SRR1490228 1 0 1 1 0
#> SRR1442949 1 0 1 1 0
#> SRR1466239 1 0 1 1 0
#> SRR1094003 2 0 1 0 1
#> SRR1329971 1 0 1 1 0
#> SRR813076 2 0 1 0 1
#> SRR1097642 2 0 1 0 1
#> SRR1322981 1 0 1 1 0
#> SRR1485976 2 0 1 0 1
#> SRR1471713 1 0 1 1 0
#> SRR660522 1 0 1 1 0
#> SRR815374 1 0 1 1 0
#> SRR1069564 2 0 1 0 1
#> SRR1416337 1 0 1 1 0
#> SRR1316438 1 0 1 1 0
#> SRR1386844 1 0 1 1 0
#> SRR1373718 1 0 1 1 0
#> SRR1447458 2 0 1 0 1
#> SRR1487128 1 0 1 1 0
#> SRR1441421 2 0 1 0 1
#> SRR1069919 2 0 1 0 1
#> SRR1460296 1 0 1 1 0
#> SRR1335489 1 0 1 1 0
#> SRR1393404 2 0 1 0 1
#> SRR1081425 1 0 1 1 0
#> SRR1401815 1 0 1 1 0
#> SRR1071337 2 0 1 0 1
#> SRR1071983 2 0 1 0 1
#> SRR1331793 2 0 1 0 1
#> SRR1410510 1 0 1 1 0
#> SRR1098761 2 0 1 0 1
#> SRR1312124 1 0 1 1 0
#> SRR615395 1 0 1 1 0
#> SRR1479349 1 0 1 1 0
#> SRR2165033 1 0 1 1 0
#> SRR1089054 2 0 1 0 1
#> SRR816201 1 0 1 1 0
#> SRR1488514 2 0 1 0 1
#> SRR655840 1 0 1 1 0
#> SRR1379303 1 0 1 1 0
#> SRR1418516 1 0 1 1 0
#> SRR613174 1 0 1 1 0
#> SRR1351125 1 0 1 1 0
#> SRR659157 1 0 1 1 0
#> SRR1480408 1 0 1 1 0
#> SRR657857 1 0 1 1 0
#> SRR1073317 2 0 1 0 1
#> SRR1332526 1 0 1 1 0
#> SRR1094168 2 0 1 0 1
#> SRR1431270 1 0 1 1 0
#> SRR1085614 2 0 1 0 1
#> SRR1330106 1 0 1 1 0
#> SRR1466154 1 0 1 1 0
#> SRR1396944 1 0 1 1 0
#> SRR1082784 2 0 1 0 1
#> SRR1457267 1 0 1 1 0
#> SRR614659 1 0 1 1 0
#> SRR659247 1 0 1 1 0
#> SRR1317201 1 0 1 1 0
#> SRR1473696 1 0 1 1 0
#> SRR1375842 1 0 1 1 0
#> SRR1388123 2 0 1 0 1
#> SRR1096363 2 0 1 0 1
#> SRR1453662 1 0 1 1 0
#> SRR1345499 2 0 1 0 1
#> SRR1353499 1 0 1 1 0
#> SRR1416693 1 0 1 1 0
#> SRR1070841 1 0 1 1 0
#> SRR1380910 1 0 1 1 0
#> SRR1333125 2 0 1 0 1
#> SRR1498183 1 0 1 1 0
#> SRR612659 1 0 1 1 0
#> SRR1447148 2 0 1 0 1
#> SRR658597 2 0 1 0 1
#> SRR1089595 2 0 1 0 1
#> SRR1074263 2 0 1 0 1
#> SRR1376786 1 0 1 1 0
#> SRR1345995 1 0 1 1 0
#> SRR1071035 1 0 1 1 0
#> SRR1068808 2 0 1 0 1
#> SRR1332754 2 0 1 0 1
#> SRR662438 1 0 1 1 0
#> SRR1335355 1 0 1 1 0
#> SRR659448 1 0 1 1 0
#> SRR1323558 1 0 1 1 0
#> SRR1381711 1 0 1 1 0
#> SRR657985 1 0 1 1 0
#> SRR1314810 1 0 1 1 0
#> SRR1336505 1 0 1 1 0
#> SRR1474095 1 0 1 1 0
#> SRR1363831 2 0 1 0 1
#> SRR1442376 1 0 1 1 0
#> SRR1074909 2 0 1 0 1
#> SRR1101200 1 0 1 1 0
#> SRR1075408 2 0 1 0 1
#> SRR1367150 1 0 1 1 0
#> SRR1313406 2 0 1 0 1
#> SRR1068880 2 0 1 0 1
#> SRR1467277 1 0 1 1 0
#> SRR1084867 2 0 1 0 1
#> SRR1095431 2 0 1 0 1
#> SRR1380184 2 0 1 0 1
#> SRR1443113 1 0 1 1 0
#> SRR1380414 1 0 1 1 0
#> SRR1315912 1 0 1 1 0
#> SRR1075778 2 0 1 0 1
#> SRR1421116 2 0 1 0 1
#> SRR602282 1 0 1 1 0
#> SRR1361195 2 0 1 0 1
#> SRR600493 1 0 1 1 0
#> SRR1477653 1 0 1 1 0
#> SRR1355475 1 0 1 1 0
#> SRR1360785 1 0 1 1 0
#> SRR810437 1 0 1 1 0
#> SRR1361860 1 0 1 1 0
#> SRR1441311 2 0 1 0 1
#> SRR1098903 1 0 1 1 0
#> SRR1457619 1 0 1 1 0
#> SRR1498529 1 0 1 1 0
#> SRR1097172 2 0 1 0 1
#> SRR1074017 2 0 1 0 1
#> SRR1472033 2 0 1 0 1
#> SRR1445087 1 0 1 1 0
#> SRR1399525 2 0 1 0 1
#> SRR1312844 2 0 1 0 1
#> SRR1085874 2 0 1 0 1
#> SRR1101226 2 0 1 0 1
#> SRR1476056 1 0 1 1 0
#> SRR1075659 2 0 1 0 1
#> SRR1311916 1 0 1 1 0
#> SRR1353353 1 0 1 1 0
#> SRR1073291 1 0 1 1 0
#> SRR1356227 1 0 1 1 0
#> SRR1080720 2 0 1 0 1
#> SRR1091695 2 0 1 0 1
#> SRR1350304 1 0 1 1 0
#> SRR663002 1 0 1 1 0
#> SRR1376983 2 0 1 0 1
#> SRR1399926 1 0 1 1 0
#> SRR1347144 1 0 1 1 0
#> SRR1384006 1 0 1 1 0
#> SRR1499108 2 0 1 0 1
#> SRR614047 1 0 1 1 0
#> SRR818440 1 0 1 1 0
#> SRR1337770 1 0 1 1 0
#> SRR1399413 1 0 1 1 0
#> SRR1385542 2 0 1 0 1
#> SRR1473959 1 0 1 1 0
#> SRR1074041 1 0 1 1 0
#> SRR1394495 2 0 1 0 1
#> SRR659460 1 0 1 1 0
#> SRR816699 1 0 1 1 0
#> SRR1308612 1 0 1 1 0
#> SRR1499418 1 0 1 1 0
#> SRR1352894 2 0 1 0 1
#> SRR815805 1 0 1 1 0
#> SRR1331083 2 0 1 0 1
#> SRR808272 1 0 1 1 0
#> SRR1436698 1 0 1 1 0
#> SRR1095627 2 0 1 0 1
#> SRR1357672 1 0 1 1 0
#> SRR1351236 1 0 1 1 0
#> SRR1077479 1 0 1 1 0
#> SRR814491 1 0 1 1 0
#> SRR1101256 2 0 1 0 1
#> SRR1436004 1 0 1 1 0
#> SRR1457994 2 0 1 0 1
#> SRR1078998 2 0 1 0 1
#> SRR1314707 1 0 1 1 0
#> SRR1309534 1 0 1 1 0
#> SRR615527 1 0 1 1 0
#> SRR1098216 1 0 1 1 0
#> SRR1325847 2 0 1 0 1
#> SRR1404003 1 0 1 1 0
#> SRR1344166 1 0 1 1 0
#> SRR1368638 1 0 1 1 0
#> SRR1431429 2 0 1 0 1
#> SRR1079237 2 0 1 0 1
#> SRR1080509 2 0 1 0 1
#> SRR815759 1 0 1 1 0
#> SRR1502143 1 0 1 1 0
#> SRR1487614 1 0 1 1 0
#> SRR1402307 2 0 1 0 1
#> SRR820810 1 0 1 1 0
#> SRR1099212 2 0 1 0 1
#> SRR1083215 1 0 1 1 0
#> SRR1476547 2 0 1 0 1
#> SRR656421 1 0 1 1 0
#> SRR1086116 2 0 1 0 1
#> SRR1499917 1 0 1 1 0
#> SRR1339944 2 0 1 0 1
#> SRR1391444 2 0 1 0 1
#> SRR1434889 1 0 1 1 0
#> SRR1431847 1 0 1 1 0
#> SRR1317155 1 0 1 1 0
#> SRR1477405 1 0 1 1 0
#> SRR655289 1 0 1 1 0
#> SRR1341683 1 0 1 1 0
#> SRR1084790 1 0 1 1 0
#> SRR1073731 1 0 1 1 0
#> SRR1332588 1 0 1 1 0
#> SRR1471157 2 0 1 0 1
#> SRR654945 1 0 1 1 0
#> SRR661028 1 0 1 1 0
#> SRR1413477 2 0 1 0 1
#> SRR1101152 1 0 1 1 0
#> SRR1358435 2 0 1 0 1
#> SRR2165273 1 0 1 1 0
#> SRR1379014 1 0 1 1 0
#> SRR1489904 1 0 1 1 0
#> SRR1416386 2 0 1 0 1
#> SRR1406048 1 0 1 1 0
#> SRR606982 1 0 1 1 0
#> SRR1358082 1 0 1 1 0
#> SRR1312934 1 0 1 1 0
#> SRR655194 1 0 1 1 0
#> SRR1331174 2 0 1 0 1
#> SRR1473251 2 0 1 0 1
#> SRR1389820 2 0 1 0 1
#> SRR1074289 1 0 1 1 0
#> SRR1348816 2 0 1 0 1
#> SRR1076292 1 0 1 1 0
#> SRR1395810 2 0 1 0 1
#> SRR1498909 1 0 1 1 0
#> SRR1443507 1 0 1 1 0
#> SRR1452310 1 0 1 1 0
#> SRR665610 1 0 1 1 0
#> SRR1347322 1 0 1 1 0
#> SRR813395 2 0 1 0 1
#> SRR1477256 1 0 1 1 0
#> SRR1470230 1 0 1 1 0
#> SRR1354247 1 0 1 1 0
#> SRR1082640 2 0 1 0 1
#> SRR1487592 1 0 1 1 0
#> SRR1352299 1 0 1 1 0
#> SRR1076317 2 0 1 0 1
#> SRR1434117 1 0 1 1 0
#> SRR1075273 2 0 1 0 1
#> SRR658657 1 0 1 1 0
#> SRR1092773 2 0 1 0 1
#> SRR1365332 1 0 1 1 0
#> SRR615958 1 0 1 1 0
#> SRR1097688 2 0 1 0 1
#> SRR1403259 1 0 1 1 0
#> SRR1099120 2 0 1 0 1
#> SRR1362200 1 0 1 1 0
#> SRR1464856 2 0 1 0 1
#> SRR1347298 1 0 1 1 0
#> SRR1075923 2 0 1 0 1
#> SRR1100703 1 0 1 1 0
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1354977 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1436370 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397949 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1355723 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1329744 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR818573 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1396017 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391354 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087968 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325138 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326821 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490178 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR655613 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075707 2 0.0424 0.99262 0.000 0.992 0.008
#> SRR1443871 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465758 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414058 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1407449 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.0592 0.93248 0.988 0.000 0.012
#> SRR1399069 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1366450 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457176 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097666 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434736 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080560 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322882 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435688 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.1289 0.91450 0.968 0.000 0.032
#> SRR1368141 3 0.6309 0.53340 0.496 0.000 0.504
#> SRR1440268 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453725 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1325711 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477591 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR656275 1 0.1163 0.92101 0.972 0.000 0.028
#> SRR1369052 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377735 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331244 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404531 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324331 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458890 3 0.5678 0.79536 0.316 0.000 0.684
#> SRR1432695 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431969 1 0.6299 -0.45984 0.524 0.000 0.476
#> SRR1087393 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1385211 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR656922 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1361630 1 0.3412 0.78854 0.876 0.000 0.124
#> SRR1318966 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407087 1 0.3116 0.81522 0.892 0.000 0.108
#> SRR603212 1 0.0592 0.93264 0.988 0.000 0.012
#> SRR1321088 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485190 1 0.4654 0.61561 0.792 0.000 0.208
#> SRR1332232 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457835 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347123 1 0.5327 0.43400 0.728 0.000 0.272
#> SRR1465501 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330878 3 0.5733 0.79404 0.324 0.000 0.676
#> SRR1445064 1 0.5397 0.40716 0.720 0.000 0.280
#> SRR1452981 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326708 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077898 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349080 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1076096 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR811261 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375485 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR604414 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380614 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR812060 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR602082 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069490 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078417 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR661613 1 0.4002 0.72195 0.840 0.000 0.160
#> SRR1420710 1 0.0237 0.93519 0.996 0.000 0.004
#> SRR660426 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416003 1 0.2165 0.87967 0.936 0.000 0.064
#> SRR661064 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353243 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1455482 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313473 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399394 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1102467 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1317470 1 0.1163 0.92112 0.972 0.000 0.028
#> SRR1337707 3 0.5678 0.79535 0.316 0.000 0.684
#> SRR1408752 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.2878 0.51186 0.000 0.096 0.904
#> SRR1398013 1 0.0237 0.93519 0.996 0.000 0.004
#> SRR1352918 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420750 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071785 3 0.6307 0.55721 0.488 0.000 0.512
#> SRR1353618 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1366560 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355684 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323289 3 0.2959 0.69316 0.100 0.000 0.900
#> SRR1313494 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309985 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR607911 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333789 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1400078 1 0.0237 0.93464 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088631 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR615575 1 0.1964 0.88985 0.944 0.000 0.056
#> SRR1079434 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1325559 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446695 1 0.0424 0.93438 0.992 0.000 0.008
#> SRR1383883 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475697 1 0.0747 0.92971 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488067 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102103 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084991 2 0.0424 0.99262 0.000 0.992 0.008
#> SRR1410380 1 0.2711 0.84625 0.912 0.000 0.088
#> SRR1445490 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.0592 0.93142 0.988 0.000 0.012
#> SRR1485812 1 0.3879 0.73781 0.848 0.000 0.152
#> SRR1078020 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.3551 0.72442 0.132 0.000 0.868
#> SRR807775 1 0.6225 -0.29098 0.568 0.000 0.432
#> SRR1409215 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR820427 1 0.0424 0.93438 0.992 0.000 0.008
#> SRR1100656 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362159 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414536 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR656794 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR604653 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1317685 1 0.5706 0.25598 0.680 0.000 0.320
#> SRR1485912 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407602 3 0.6140 0.72617 0.404 0.000 0.596
#> SRR1356164 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1328692 1 0.0237 0.93505 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362438 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479216 1 0.6308 -0.51405 0.508 0.000 0.492
#> SRR1358041 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468766 1 0.0237 0.93519 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368200 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1435602 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.4555 0.76255 0.200 0.000 0.800
#> SRR1437256 1 0.6308 -0.51411 0.508 0.000 0.492
#> SRR1487446 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR816653 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR815164 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442043 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410573 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1382934 3 0.5465 0.79141 0.288 0.000 0.712
#> SRR1465208 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314728 1 0.0892 0.92712 0.980 0.000 0.020
#> SRR1470291 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308756 1 0.1643 0.90429 0.956 0.000 0.044
#> SRR1409600 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR816123 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR614779 1 0.1964 0.88985 0.944 0.000 0.056
#> SRR810783 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333990 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410356 1 0.0592 0.93264 0.988 0.000 0.012
#> SRR808106 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR662713 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1447058 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR809382 3 0.6280 0.62519 0.460 0.000 0.540
#> SRR665417 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088016 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453166 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069826 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR615623 3 0.6204 0.69453 0.424 0.000 0.576
#> SRR1413787 3 0.5835 0.78884 0.340 0.000 0.660
#> SRR1478207 1 0.6008 0.00343 0.628 0.000 0.372
#> SRR1411046 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309051 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074956 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092961 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR817210 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1319221 3 0.2537 0.66932 0.080 0.000 0.920
#> SRR1405413 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR607807 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390160 1 0.6307 -0.50087 0.512 0.000 0.488
#> SRR1406283 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1357709 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080742 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468208 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312766 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1361612 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311224 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1087801 1 0.0237 0.93519 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099720 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350912 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.0592 0.93248 0.988 0.000 0.012
#> SRR1074980 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.6045 0.75670 0.380 0.000 0.620
#> SRR1332879 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403177 3 0.2959 0.69325 0.100 0.000 0.900
#> SRR1076144 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR818239 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421069 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500006 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1485678 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092232 3 0.4796 0.77033 0.220 0.000 0.780
#> SRR1344253 1 0.0592 0.93264 0.988 0.000 0.012
#> SRR1384290 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089349 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1343522 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.3686 0.76028 0.860 0.000 0.140
#> SRR818372 1 0.1860 0.89477 0.948 0.000 0.052
#> SRR1323675 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR819894 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1310031 1 0.5948 0.06881 0.640 0.000 0.360
#> SRR615419 3 0.6299 0.58838 0.476 0.000 0.524
#> SRR1436925 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477238 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490228 1 0.2796 0.84016 0.908 0.000 0.092
#> SRR1442949 1 0.1163 0.92101 0.972 0.000 0.028
#> SRR1466239 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322981 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471713 1 0.6280 -0.40206 0.540 0.000 0.460
#> SRR660522 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR815374 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1069564 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416337 1 0.1529 0.90876 0.960 0.000 0.040
#> SRR1316438 3 0.5859 0.78690 0.344 0.000 0.656
#> SRR1386844 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373718 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1447458 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1401815 3 0.5560 0.79395 0.300 0.000 0.700
#> SRR1071337 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410510 1 0.6309 -0.52712 0.504 0.000 0.496
#> SRR1098761 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312124 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR615395 1 0.0592 0.93264 0.988 0.000 0.012
#> SRR1479349 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089054 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR816201 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488514 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR655840 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1379303 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418516 1 0.0592 0.93270 0.988 0.000 0.012
#> SRR613174 1 0.1643 0.90432 0.956 0.000 0.044
#> SRR1351125 1 0.1411 0.91305 0.964 0.000 0.036
#> SRR659157 1 0.5363 0.42093 0.724 0.000 0.276
#> SRR1480408 1 0.0237 0.93519 0.996 0.000 0.004
#> SRR657857 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1073317 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.0237 0.93519 0.996 0.000 0.004
#> SRR1094168 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431270 3 0.6308 0.54570 0.492 0.000 0.508
#> SRR1085614 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.1529 0.90884 0.960 0.000 0.040
#> SRR1466154 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396944 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR614659 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR659247 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1317201 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473696 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375842 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1388123 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453662 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416693 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070841 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1380910 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR612659 1 0.6252 -0.34022 0.556 0.000 0.444
#> SRR1447148 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR658597 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089595 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074263 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345995 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071035 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1068808 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332754 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR662438 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335355 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR659448 1 0.0592 0.93248 0.988 0.000 0.012
#> SRR1323558 1 0.4605 0.62540 0.796 0.000 0.204
#> SRR1381711 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR657985 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1314810 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336505 1 0.2537 0.85788 0.920 0.000 0.080
#> SRR1474095 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1363831 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1074909 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101200 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1075408 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.0237 0.93519 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313406 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.3340 0.79536 0.880 0.000 0.120
#> SRR1084867 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380184 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380414 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1315912 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1075778 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR602282 1 0.6308 -0.51424 0.508 0.000 0.492
#> SRR1361195 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR600493 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1477653 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355475 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1360785 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR810437 1 0.1289 0.91712 0.968 0.000 0.032
#> SRR1361860 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1457619 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1498529 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445087 1 0.5859 0.14875 0.656 0.000 0.344
#> SRR1399525 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312844 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085874 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101226 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476056 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075659 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311916 1 0.6295 -0.44578 0.528 0.000 0.472
#> SRR1353353 3 0.5926 0.77923 0.356 0.000 0.644
#> SRR1073291 1 0.2625 0.85203 0.916 0.000 0.084
#> SRR1356227 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350304 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR663002 1 0.2066 0.88488 0.940 0.000 0.060
#> SRR1376983 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347144 1 0.6252 -0.34020 0.556 0.000 0.444
#> SRR1384006 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499108 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR614047 1 0.3752 0.75285 0.856 0.000 0.144
#> SRR818440 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1337770 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399413 1 0.0592 0.93264 0.988 0.000 0.012
#> SRR1385542 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.0592 0.93270 0.988 0.000 0.012
#> SRR1074041 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1394495 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR659460 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR816699 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1308612 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1499418 1 0.6079 -0.08398 0.612 0.000 0.388
#> SRR1352894 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR815805 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331083 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR808272 1 0.1163 0.92101 0.972 0.000 0.028
#> SRR1436698 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095627 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1357672 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351236 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077479 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457994 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309534 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR615527 3 0.6079 0.74759 0.388 0.000 0.612
#> SRR1098216 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1325847 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404003 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1344166 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431429 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080509 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR815759 1 0.1411 0.91352 0.964 0.000 0.036
#> SRR1502143 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1487614 3 0.5905 0.78221 0.352 0.000 0.648
#> SRR1402307 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR820810 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099212 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083215 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476547 2 0.1753 0.95774 0.000 0.952 0.048
#> SRR656421 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.0424 0.93424 0.992 0.000 0.008
#> SRR1339944 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.0892 0.92779 0.980 0.000 0.020
#> SRR1431847 1 0.5882 0.13002 0.652 0.000 0.348
#> SRR1317155 1 0.0424 0.93427 0.992 0.000 0.008
#> SRR1477405 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR655289 1 0.0592 0.93264 0.988 0.000 0.012
#> SRR1341683 1 0.4931 0.55358 0.768 0.000 0.232
#> SRR1084790 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1073731 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332588 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1471157 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR654945 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR661028 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.0892 0.92761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1358435 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165273 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379014 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489904 1 0.6260 -0.35608 0.552 0.000 0.448
#> SRR1416386 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406048 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR606982 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
#> SRR1358082 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312934 1 0.1964 0.88985 0.944 0.000 0.056
#> SRR655194 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.2537 0.92794 0.000 0.920 0.080
#> SRR1389820 3 0.2959 0.50306 0.000 0.100 0.900
#> SRR1074289 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1348816 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.1411 0.91305 0.964 0.000 0.036
#> SRR1395810 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.5098 0.50825 0.752 0.000 0.248
#> SRR1443507 1 0.0592 0.93264 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452310 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR665610 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347322 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR813395 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477256 1 0.0000 0.93554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.1643 0.90438 0.956 0.000 0.044
#> SRR1354247 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1082640 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.1031 0.92447 0.976 0.000 0.024
#> SRR1352299 1 0.0424 0.93434 0.992 0.000 0.008
#> SRR1076317 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1434117 1 0.1860 0.89477 0.948 0.000 0.052
#> SRR1075273 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR658657 1 0.4931 0.55357 0.768 0.000 0.232
#> SRR1092773 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365332 1 0.0237 0.93525 0.996 0.000 0.004
#> SRR615958 1 0.5948 0.06880 0.640 0.000 0.360
#> SRR1097688 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403259 1 0.4062 0.71410 0.836 0.000 0.164
#> SRR1099120 2 0.0237 0.99593 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362200 1 0.3619 0.76745 0.864 0.000 0.136
#> SRR1464856 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.5497 0.36498 0.708 0.000 0.292
#> SRR1075923 2 0.0000 0.99919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100703 1 0.0747 0.93033 0.984 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1354977 1 0.4632 0.7341 0.688 0.000 0.004 0.308
#> SRR1436370 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075752 2 0.0817 0.9842 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1397949 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1355723 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1329744 1 0.1174 0.6923 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR657384 1 0.2111 0.6671 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR1351190 1 0.2742 0.6453 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1458662 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818573 1 0.4792 0.7302 0.680 0.000 0.008 0.312
#> SRR1396017 1 0.3266 0.5980 0.868 0.000 0.108 0.024
#> SRR1410742 1 0.2742 0.6365 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1435963 1 0.2282 0.6601 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1382416 1 0.2742 0.6368 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1391354 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1087968 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310075 1 0.3400 0.7479 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1312244 1 0.2363 0.6565 0.920 0.000 0.056 0.024
#> SRR1325138 1 0.4323 0.7437 0.776 0.000 0.020 0.204
#> SRR1326821 1 0.4277 0.7428 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1490178 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655613 1 0.4072 0.7467 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1075707 2 0.1109 0.9814 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1443871 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102489 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1465758 1 0.4250 0.7426 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1414058 1 0.6141 0.6809 0.616 0.000 0.072 0.312
#> SRR1407449 1 0.2282 0.6601 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1436858 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479109 1 0.1452 0.7140 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1399069 1 0.4914 0.7282 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR1366450 1 0.0524 0.7103 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1396859 1 0.0804 0.6989 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1457176 1 0.1629 0.6824 0.952 0.000 0.024 0.024
#> SRR1097666 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1434736 1 0.2949 0.6226 0.888 0.000 0.088 0.024
#> SRR1080560 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1322882 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1435688 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327614 1 0.3610 0.7476 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR658152 1 0.5036 0.2859 0.696 0.000 0.280 0.024
#> SRR1368141 3 0.7159 0.5451 0.200 0.000 0.556 0.244
#> SRR1440268 1 0.2363 0.6567 0.920 0.000 0.056 0.024
#> SRR1453725 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1325711 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477930 1 0.4454 0.7339 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1477591 1 0.1792 0.7301 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1416049 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656275 1 0.5878 0.6969 0.632 0.000 0.056 0.312
#> SRR1369052 1 0.4222 0.7436 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1377735 1 0.2081 0.7341 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1331244 1 0.2089 0.7205 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR1404531 1 0.3688 0.7481 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1324331 1 0.2125 0.7333 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1458890 3 0.4348 0.7014 0.196 0.000 0.780 0.024
#> SRR1432695 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407624 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431969 3 0.3718 0.7419 0.168 0.000 0.820 0.012
#> SRR1087393 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077263 1 0.5130 0.7244 0.668 0.000 0.020 0.312
#> SRR1385211 1 0.3024 0.7446 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR655241 1 0.3015 0.6184 0.884 0.000 0.092 0.024
#> SRR656922 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1361630 1 0.7198 0.5444 0.540 0.000 0.180 0.280
#> SRR1318966 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1407087 1 0.7203 0.5388 0.524 0.000 0.164 0.312
#> SRR603212 1 0.4792 0.7302 0.680 0.000 0.008 0.312
#> SRR1321088 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485190 3 0.6201 0.4540 0.376 0.000 0.564 0.060
#> SRR1332232 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312645 1 0.2363 0.6572 0.920 0.000 0.056 0.024
#> SRR1457835 1 0.2216 0.7354 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1347123 3 0.6074 0.5009 0.340 0.000 0.600 0.060
#> SRR1465501 2 0.0817 0.9842 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1330878 3 0.1584 0.7399 0.036 0.000 0.952 0.012
#> SRR1445064 1 0.7706 0.0428 0.412 0.000 0.364 0.224
#> SRR1452981 1 0.1356 0.6980 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR1326708 1 0.2216 0.7356 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1407157 1 0.0937 0.6967 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1365401 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397697 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477316 1 0.2483 0.7002 0.916 0.000 0.052 0.032
#> SRR1077898 1 0.0921 0.7126 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1349080 1 0.4914 0.7282 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR1076096 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811261 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1375485 1 0.2282 0.6601 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1432563 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR604414 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1380614 1 0.2813 0.6323 0.896 0.000 0.080 0.024
#> SRR812060 1 0.5657 0.7079 0.644 0.000 0.044 0.312
#> SRR602082 1 0.4454 0.7339 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1069490 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1078417 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661613 1 0.5572 0.5520 0.716 0.000 0.196 0.088
#> SRR1420710 1 0.3205 0.6205 0.872 0.000 0.104 0.024
#> SRR660426 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1416003 1 0.5206 0.3953 0.668 0.000 0.308 0.024
#> SRR661064 1 0.1724 0.6796 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1082011 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452718 1 0.1059 0.7036 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1353243 1 0.2589 0.7392 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1455482 1 0.3024 0.7453 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1313473 1 0.3266 0.7466 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1399394 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1102467 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1317470 1 0.3913 0.5696 0.824 0.000 0.148 0.028
#> SRR1337707 3 0.2976 0.7335 0.120 0.000 0.872 0.008
#> SRR1408752 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474617 3 0.1637 0.7126 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1398013 1 0.3552 0.5882 0.848 0.000 0.128 0.024
#> SRR1352918 1 0.2443 0.6528 0.916 0.000 0.060 0.024
#> SRR1420750 1 0.1022 0.7140 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1071785 3 0.2976 0.7532 0.120 0.000 0.872 0.008
#> SRR1353618 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082217 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357256 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490313 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1366560 1 0.0188 0.7100 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1355684 1 0.4406 0.7363 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1323289 3 0.0804 0.7297 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1313494 1 0.1118 0.7158 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1309985 1 0.4222 0.7438 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR607911 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1333789 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1400078 1 0.3910 0.5453 0.820 0.000 0.156 0.024
#> SRR1088631 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092842 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR615575 1 0.6483 0.6519 0.592 0.000 0.096 0.312
#> SRR1079434 1 0.6202 0.6766 0.612 0.000 0.076 0.312
#> SRR1325559 1 0.2596 0.6451 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR1446695 1 0.3051 0.6391 0.884 0.000 0.088 0.028
#> SRR1383883 1 0.1833 0.6769 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1396100 1 0.3080 0.6129 0.880 0.000 0.096 0.024
#> SRR1475697 1 0.3711 0.5795 0.836 0.000 0.140 0.024
#> SRR1488067 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1102103 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105154 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1084991 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1410380 1 0.5442 0.2678 0.672 0.000 0.288 0.040
#> SRR1445490 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454671 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435044 1 0.3813 0.5596 0.828 0.000 0.148 0.024
#> SRR1485812 1 0.7330 0.5055 0.508 0.000 0.180 0.312
#> SRR1078020 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311153 1 0.4277 0.7419 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1376406 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343898 3 0.0927 0.7318 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR807775 3 0.7831 0.2698 0.280 0.000 0.408 0.312
#> SRR1409215 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820427 1 0.2329 0.6587 0.916 0.000 0.072 0.012
#> SRR1100656 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1362159 1 0.4304 0.7411 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1414536 1 0.5636 0.7111 0.648 0.000 0.044 0.308
#> SRR656794 1 0.1059 0.6946 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR604653 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1317685 3 0.7475 0.3337 0.332 0.000 0.476 0.192
#> SRR1485912 1 0.1488 0.6894 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1407602 3 0.4436 0.6923 0.216 0.000 0.764 0.020
#> SRR1356164 1 0.5578 0.7112 0.648 0.000 0.040 0.312
#> SRR1328692 1 0.2402 0.6525 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR1362438 1 0.1792 0.7301 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1479216 3 0.3760 0.7535 0.136 0.000 0.836 0.028
#> SRR1358041 1 0.2111 0.6678 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR1468766 1 0.4868 0.7365 0.684 0.000 0.012 0.304
#> SRR1368200 1 0.2174 0.6895 0.928 0.000 0.052 0.020
#> SRR1435602 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501043 3 0.1305 0.7280 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR1437256 3 0.5186 0.7294 0.164 0.000 0.752 0.084
#> SRR1487446 1 0.2443 0.6531 0.916 0.000 0.060 0.024
#> SRR816653 1 0.0592 0.7079 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR815164 1 0.4382 0.7382 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1442043 1 0.2335 0.6570 0.920 0.000 0.060 0.020
#> SRR1410573 1 0.1389 0.7197 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1096782 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352369 1 0.5733 0.7044 0.640 0.000 0.048 0.312
#> SRR1382934 3 0.3320 0.7511 0.056 0.000 0.876 0.068
#> SRR1465208 1 0.2281 0.7377 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1314728 1 0.1624 0.6972 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1470291 1 0.0779 0.6989 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1308756 1 0.6693 0.6471 0.580 0.000 0.116 0.304
#> SRR1409600 1 0.2596 0.6449 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR816123 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR614779 1 0.6535 0.6467 0.588 0.000 0.100 0.312
#> SRR810783 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1333990 1 0.1629 0.6824 0.952 0.000 0.024 0.024
#> SRR1410356 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR808106 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR662713 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1447058 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480964 1 0.5578 0.7109 0.648 0.000 0.040 0.312
#> SRR809382 3 0.3694 0.7557 0.124 0.000 0.844 0.032
#> SRR665417 1 0.4304 0.7402 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1088016 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1453166 2 0.0921 0.9825 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1069826 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077781 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615623 3 0.6279 0.6538 0.180 0.000 0.664 0.156
#> SRR1413787 3 0.2319 0.7502 0.036 0.000 0.924 0.040
#> SRR1478207 3 0.7846 0.2421 0.296 0.000 0.404 0.300
#> SRR1411046 1 0.2742 0.6368 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1313711 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326560 1 0.1624 0.7098 0.952 0.000 0.020 0.028
#> SRR1309051 1 0.1557 0.7272 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1486949 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395616 1 0.4040 0.7467 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1074956 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1092961 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR817210 1 0.5578 0.7109 0.648 0.000 0.040 0.312
#> SRR1319221 3 0.1474 0.7148 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1405413 1 0.0927 0.6968 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR607807 1 0.4164 0.7449 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1390160 3 0.4633 0.7330 0.172 0.000 0.780 0.048
#> SRR1406283 1 0.1792 0.7294 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1357709 1 0.4468 0.7444 0.752 0.000 0.016 0.232
#> SRR1080742 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1468208 1 0.2742 0.6368 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1312766 1 0.4072 0.7474 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1361612 1 0.2282 0.6601 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1311224 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1087801 1 0.4632 0.7335 0.688 0.000 0.004 0.308
#> SRR1099720 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349250 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1350912 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1357127 1 0.3659 0.5804 0.840 0.000 0.136 0.024
#> SRR1074980 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317022 3 0.4127 0.7459 0.124 0.000 0.824 0.052
#> SRR1332879 1 0.2345 0.7370 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1403177 3 0.2412 0.7181 0.008 0.000 0.908 0.084
#> SRR1076144 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069614 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR818239 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1421069 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1500006 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1485678 1 0.1767 0.7217 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1092232 3 0.1297 0.7356 0.016 0.000 0.964 0.020
#> SRR1344253 1 0.5279 0.7314 0.716 0.000 0.052 0.232
#> SRR1384290 1 0.1833 0.6767 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1089349 1 0.5411 0.7168 0.656 0.000 0.032 0.312
#> SRR1343522 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326727 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440940 1 0.4991 0.1379 0.608 0.000 0.388 0.004
#> SRR818372 1 0.4746 0.6189 0.776 0.000 0.168 0.056
#> SRR1323675 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819894 1 0.5130 0.7252 0.668 0.000 0.020 0.312
#> SRR1310031 3 0.7872 0.1081 0.344 0.000 0.376 0.280
#> SRR615419 3 0.3099 0.7558 0.104 0.000 0.876 0.020
#> SRR1436925 1 0.4072 0.7467 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1477238 1 0.2281 0.7387 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1332566 1 0.0188 0.7064 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490228 1 0.7102 0.5675 0.548 0.000 0.164 0.288
#> SRR1442949 1 0.4898 0.3468 0.716 0.000 0.260 0.024
#> SRR1466239 1 0.1520 0.6850 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1094003 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329971 1 0.0804 0.6987 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR813076 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097642 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1322981 1 0.2345 0.7373 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1485976 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471713 3 0.4452 0.7415 0.156 0.000 0.796 0.048
#> SRR660522 1 0.5031 0.7357 0.740 0.000 0.048 0.212
#> SRR815374 1 0.2081 0.7342 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1069564 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1416337 1 0.6375 0.6624 0.600 0.000 0.088 0.312
#> SRR1316438 3 0.4104 0.7138 0.164 0.000 0.808 0.028
#> SRR1386844 1 0.1929 0.6737 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1373718 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1447458 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487128 1 0.1624 0.6825 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1441421 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069919 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1460296 1 0.3610 0.7474 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1335489 1 0.2882 0.6275 0.892 0.000 0.084 0.024
#> SRR1393404 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081425 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1401815 3 0.1510 0.7390 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR1071337 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071983 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331793 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410510 3 0.5820 0.6754 0.204 0.000 0.696 0.100
#> SRR1098761 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1312124 1 0.2111 0.6678 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR615395 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1479349 1 0.1677 0.6797 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR2165033 1 0.3760 0.5525 0.836 0.000 0.136 0.028
#> SRR1089054 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816201 1 0.5130 0.7252 0.668 0.000 0.020 0.312
#> SRR1488514 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655840 1 0.5130 0.7248 0.668 0.000 0.020 0.312
#> SRR1379303 1 0.1182 0.6922 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1418516 1 0.5453 0.7259 0.660 0.000 0.036 0.304
#> SRR613174 1 0.6202 0.6765 0.612 0.000 0.076 0.312
#> SRR1351125 1 0.5807 0.7011 0.636 0.000 0.052 0.312
#> SRR659157 3 0.5663 0.4730 0.440 0.000 0.536 0.024
#> SRR1480408 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR657857 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1073317 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332526 1 0.4454 0.7339 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1094168 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1431270 3 0.5206 0.6404 0.308 0.000 0.668 0.024
#> SRR1085614 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330106 1 0.6261 0.6721 0.608 0.000 0.080 0.312
#> SRR1466154 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1396944 1 0.4406 0.7363 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1082784 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457267 1 0.1629 0.6824 0.952 0.000 0.024 0.024
#> SRR614659 1 0.4792 0.7302 0.680 0.000 0.008 0.312
#> SRR659247 1 0.3257 0.7451 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1317201 1 0.1182 0.6922 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1473696 1 0.0592 0.7145 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375842 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1388123 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096363 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1453662 1 0.1545 0.6826 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1345499 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353499 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1416693 1 0.1833 0.6767 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1070841 1 0.5535 0.7172 0.656 0.000 0.040 0.304
#> SRR1380910 1 0.4304 0.7411 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1333125 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498183 1 0.1297 0.6900 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR612659 3 0.7768 0.3257 0.260 0.000 0.428 0.312
#> SRR1447148 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658597 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1089595 2 0.0707 0.9855 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1074263 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376786 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1345995 1 0.4072 0.7467 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1071035 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1068808 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1332754 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662438 1 0.2443 0.6528 0.916 0.000 0.060 0.024
#> SRR1335355 1 0.4454 0.7339 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR659448 1 0.2915 0.6490 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1323558 1 0.5495 0.0353 0.624 0.000 0.348 0.028
#> SRR1381711 1 0.5207 0.7353 0.680 0.000 0.028 0.292
#> SRR657985 1 0.1624 0.7076 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1314810 1 0.1557 0.7266 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1336505 1 0.6319 0.6672 0.604 0.000 0.084 0.312
#> SRR1474095 1 0.2521 0.7208 0.912 0.000 0.024 0.064
#> SRR1363831 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442376 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1074909 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1101200 1 0.4914 0.7282 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR1075408 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367150 1 0.2489 0.6534 0.912 0.000 0.068 0.020
#> SRR1313406 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068880 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467277 1 0.5957 0.1848 0.588 0.000 0.364 0.048
#> SRR1084867 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095431 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1380184 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443113 1 0.4250 0.7441 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1380414 1 0.4466 0.7405 0.784 0.000 0.036 0.180
#> SRR1315912 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1075778 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421116 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR602282 3 0.7542 0.4303 0.212 0.000 0.476 0.312
#> SRR1361195 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR600493 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1477653 1 0.2704 0.7401 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1355475 1 0.5657 0.7079 0.644 0.000 0.044 0.312
#> SRR1360785 1 0.2521 0.6488 0.912 0.000 0.064 0.024
#> SRR810437 1 0.4365 0.5068 0.784 0.000 0.188 0.028
#> SRR1361860 1 0.4372 0.7424 0.728 0.000 0.004 0.268
#> SRR1441311 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098903 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1457619 1 0.1488 0.6892 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1498529 1 0.4277 0.7419 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1097172 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074017 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472033 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445087 3 0.7844 0.1706 0.288 0.000 0.404 0.308
#> SRR1399525 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312844 2 0.0817 0.9842 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1085874 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1101226 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1476056 1 0.4250 0.7414 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1075659 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1311916 3 0.4057 0.7468 0.160 0.000 0.812 0.028
#> SRR1353353 3 0.2926 0.7533 0.048 0.000 0.896 0.056
#> SRR1073291 1 0.6430 0.6572 0.596 0.000 0.092 0.312
#> SRR1356227 1 0.0524 0.7103 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1080720 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091695 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1350304 1 0.4225 0.5085 0.792 0.000 0.184 0.024
#> SRR663002 1 0.4882 0.3397 0.708 0.000 0.272 0.020
#> SRR1376983 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399926 1 0.0804 0.6991 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1347144 3 0.5247 0.6917 0.228 0.000 0.720 0.052
#> SRR1384006 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1499108 2 0.0817 0.9842 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR614047 1 0.6941 0.2527 0.520 0.000 0.360 0.120
#> SRR818440 1 0.5314 0.7106 0.740 0.000 0.084 0.176
#> SRR1337770 1 0.1452 0.6851 0.956 0.000 0.036 0.008
#> SRR1399413 1 0.4914 0.7282 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR1385542 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473959 1 0.3435 0.7349 0.864 0.000 0.036 0.100
#> SRR1074041 1 0.4914 0.7282 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR1394495 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659460 1 0.5130 0.7249 0.668 0.000 0.020 0.312
#> SRR816699 1 0.5389 0.7201 0.660 0.000 0.032 0.308
#> SRR1308612 1 0.5657 0.7079 0.644 0.000 0.044 0.312
#> SRR1499418 3 0.6773 0.5472 0.276 0.000 0.588 0.136
#> SRR1352894 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815805 1 0.5026 0.7261 0.672 0.000 0.016 0.312
#> SRR1331083 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR808272 1 0.6202 0.6765 0.612 0.000 0.076 0.312
#> SRR1436698 1 0.0707 0.7126 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1095627 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1357672 1 0.0927 0.6969 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1351236 1 0.3907 0.7472 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1077479 1 0.4454 0.7339 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR814491 1 0.3143 0.6078 0.876 0.000 0.100 0.024
#> SRR1101256 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436004 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1457994 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078998 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314707 1 0.4792 0.7302 0.680 0.000 0.008 0.312
#> SRR1309534 1 0.3205 0.6033 0.872 0.000 0.104 0.024
#> SRR615527 3 0.6950 0.5795 0.180 0.000 0.584 0.236
#> SRR1098216 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1325847 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1404003 1 0.4914 0.7282 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR1344166 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1368638 1 0.3205 0.6144 0.872 0.000 0.104 0.024
#> SRR1431429 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079237 2 0.0817 0.9842 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1080509 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815759 1 0.4194 0.5336 0.800 0.000 0.172 0.028
#> SRR1502143 1 0.5411 0.7168 0.656 0.000 0.032 0.312
#> SRR1487614 3 0.5113 0.7163 0.152 0.000 0.760 0.088
#> SRR1402307 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820810 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1099212 2 0.0336 0.9891 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1083215 1 0.0592 0.7012 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1476547 2 0.0927 0.9845 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR656421 1 0.0188 0.7100 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086116 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499917 1 0.3659 0.5827 0.840 0.000 0.136 0.024
#> SRR1339944 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391444 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1434889 1 0.5657 0.7077 0.644 0.000 0.044 0.312
#> SRR1431847 3 0.5613 0.5593 0.380 0.000 0.592 0.028
#> SRR1317155 1 0.5799 0.7229 0.668 0.000 0.068 0.264
#> SRR1477405 1 0.3764 0.7475 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR655289 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1341683 1 0.7481 0.4545 0.488 0.000 0.204 0.308
#> SRR1084790 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1073731 1 0.5411 0.7168 0.656 0.000 0.032 0.312
#> SRR1332588 1 0.4979 0.7283 0.760 0.000 0.064 0.176
#> SRR1471157 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR654945 1 0.2319 0.6864 0.924 0.000 0.036 0.040
#> SRR661028 1 0.2408 0.7379 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1413477 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101152 1 0.5108 0.7277 0.672 0.000 0.020 0.308
#> SRR1358435 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2165273 1 0.1520 0.6852 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1379014 1 0.4040 0.7449 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1489904 3 0.5599 0.6514 0.288 0.000 0.664 0.048
#> SRR1416386 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1406048 1 0.0657 0.7010 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR606982 1 0.5026 0.7261 0.672 0.000 0.016 0.312
#> SRR1358082 1 0.4008 0.7468 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1312934 1 0.6375 0.6624 0.600 0.000 0.088 0.312
#> SRR655194 1 0.2282 0.6601 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1331174 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473251 2 0.1042 0.9831 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1389820 3 0.2281 0.7027 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1074289 1 0.4914 0.7282 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR1348816 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076292 1 0.6375 0.6623 0.600 0.000 0.088 0.312
#> SRR1395810 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498909 1 0.7443 0.4689 0.492 0.000 0.196 0.312
#> SRR1443507 1 0.4792 0.7304 0.680 0.000 0.008 0.312
#> SRR1452310 1 0.2376 0.6595 0.916 0.000 0.068 0.016
#> SRR665610 1 0.2282 0.6601 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1347322 1 0.2281 0.7372 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR813395 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1477256 1 0.1913 0.6736 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1470230 1 0.5277 0.2217 0.668 0.000 0.304 0.028
#> SRR1354247 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1082640 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487592 1 0.5578 0.7113 0.648 0.000 0.040 0.312
#> SRR1352299 1 0.4477 0.7332 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1076317 2 0.1022 0.9808 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1434117 1 0.6319 0.6672 0.604 0.000 0.084 0.312
#> SRR1075273 2 0.0817 0.9842 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR658657 1 0.5696 -0.3807 0.496 0.000 0.480 0.024
#> SRR1092773 2 0.0707 0.9855 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1365332 1 0.1118 0.7176 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR615958 3 0.7824 0.1980 0.328 0.000 0.404 0.268
#> SRR1097688 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1403259 3 0.5917 0.4280 0.444 0.000 0.520 0.036
#> SRR1099120 2 0.1118 0.9789 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1362200 1 0.7098 0.5621 0.536 0.000 0.152 0.312
#> SRR1464856 2 0.0000 0.9912 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347298 1 0.7630 0.3860 0.460 0.000 0.228 0.312
#> SRR1075923 2 0.0592 0.9868 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1100703 1 0.4655 0.7321 0.684 0.000 0.004 0.312
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1354977 3 0.4842 0.51143 0.264 0.000 0.684 NA 0.004
#> SRR1436370 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1075752 2 0.0404 0.73762 0.000 0.988 0.000 NA 0.000
#> SRR1397949 3 0.1608 0.67943 0.072 0.000 0.928 NA 0.000
#> SRR1355723 3 0.4697 0.54568 0.224 0.000 0.720 NA 0.008
#> SRR1329744 1 0.2966 0.77145 0.816 0.000 0.184 NA 0.000
#> SRR657384 1 0.3752 0.72106 0.708 0.000 0.292 NA 0.000
#> SRR1351190 1 0.3579 0.75937 0.756 0.000 0.240 NA 0.004
#> SRR1458662 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR818573 3 0.1569 0.68434 0.044 0.000 0.944 NA 0.004
#> SRR1396017 1 0.3067 0.75486 0.856 0.000 0.120 NA 0.012
#> SRR1410742 1 0.3692 0.73876 0.812 0.000 0.152 NA 0.008
#> SRR1435963 1 0.3242 0.76532 0.784 0.000 0.216 NA 0.000
#> SRR1382416 1 0.3080 0.74189 0.844 0.000 0.140 NA 0.008
#> SRR1391354 3 0.4290 0.58393 0.196 0.000 0.756 NA 0.004
#> SRR1087968 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1310075 3 0.4666 0.28759 0.412 0.000 0.572 NA 0.000
#> SRR1312244 1 0.3636 0.73250 0.728 0.000 0.272 NA 0.000
#> SRR1325138 3 0.5286 0.12774 0.448 0.000 0.504 NA 0.000
#> SRR1326821 3 0.2930 0.63907 0.164 0.000 0.832 NA 0.000
#> SRR1490178 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR655613 3 0.2471 0.66406 0.136 0.000 0.864 NA 0.000
#> SRR1075707 2 0.2074 0.67974 0.000 0.896 0.000 NA 0.000
#> SRR1443871 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1102489 2 0.1478 0.70576 0.000 0.936 0.000 NA 0.000
#> SRR1465758 3 0.2813 0.64961 0.168 0.000 0.832 NA 0.000
#> SRR1414058 3 0.2278 0.66301 0.044 0.000 0.916 NA 0.032
#> SRR1407449 1 0.3274 0.76364 0.780 0.000 0.220 NA 0.000
#> SRR1436858 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1479109 3 0.4287 -0.19292 0.460 0.000 0.540 NA 0.000
#> SRR1399069 3 0.4902 0.54121 0.224 0.000 0.712 NA 0.016
#> SRR1366450 3 0.4161 0.07586 0.392 0.000 0.608 NA 0.000
#> SRR1396859 1 0.3333 0.75957 0.788 0.000 0.208 NA 0.000
#> SRR1457176 1 0.4283 0.43032 0.544 0.000 0.456 NA 0.000
#> SRR1097666 2 0.1043 0.72547 0.000 0.960 0.000 NA 0.000
#> SRR1434736 1 0.3170 0.77101 0.828 0.000 0.160 NA 0.004
#> SRR1080560 2 0.1197 0.71594 0.000 0.952 0.000 NA 0.000
#> SRR1322882 3 0.1197 0.69169 0.048 0.000 0.952 NA 0.000
#> SRR1435688 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1327614 3 0.3561 0.50231 0.260 0.000 0.740 NA 0.000
#> SRR658152 1 0.3633 0.62259 0.832 0.000 0.040 NA 0.116
#> SRR1368141 5 0.6601 0.44392 0.096 0.000 0.380 NA 0.488
#> SRR1440268 1 0.3001 0.76389 0.844 0.000 0.144 NA 0.004
#> SRR1453725 3 0.1544 0.68170 0.068 0.000 0.932 NA 0.000
#> SRR1325711 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1477930 3 0.4297 0.57371 0.236 0.000 0.728 NA 0.000
#> SRR1477591 3 0.4161 0.08293 0.392 0.000 0.608 NA 0.000
#> SRR1416049 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR656275 3 0.2761 0.66218 0.048 0.000 0.896 NA 0.028
#> SRR1369052 3 0.3530 0.62689 0.204 0.000 0.784 NA 0.000
#> SRR1377735 3 0.4161 0.08602 0.392 0.000 0.608 NA 0.000
#> SRR1331244 1 0.4616 0.57481 0.676 0.000 0.288 NA 0.000
#> SRR1404531 3 0.3177 0.58828 0.208 0.000 0.792 NA 0.000
#> SRR1324331 1 0.4786 0.52241 0.652 0.000 0.308 NA 0.000
#> SRR1458890 5 0.4689 0.38215 0.392 0.000 0.008 NA 0.592
#> SRR1432695 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1407624 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1431969 5 0.4678 0.70547 0.064 0.000 0.224 NA 0.712
#> SRR1087393 2 0.3876 0.85881 0.000 0.684 0.000 NA 0.000
#> SRR1077263 3 0.1628 0.68461 0.056 0.000 0.936 NA 0.008
#> SRR1385211 3 0.3661 0.44266 0.276 0.000 0.724 NA 0.000
#> SRR655241 1 0.3190 0.76275 0.840 0.000 0.140 NA 0.008
#> SRR656922 3 0.1331 0.69203 0.040 0.000 0.952 NA 0.000
#> SRR1361630 3 0.3365 0.60872 0.044 0.000 0.836 NA 0.120
#> SRR1318966 2 0.0510 0.74865 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1407087 3 0.2144 0.63028 0.020 0.000 0.912 NA 0.068
#> SRR603212 3 0.1701 0.68819 0.048 0.000 0.936 NA 0.000
#> SRR1321088 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1485190 5 0.6420 0.64474 0.180 0.000 0.232 NA 0.572
#> SRR1332232 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1312645 1 0.3561 0.74391 0.740 0.000 0.260 NA 0.000
#> SRR1457835 3 0.4210 0.00567 0.412 0.000 0.588 NA 0.000
#> SRR1347123 3 0.5737 -0.34521 0.084 0.000 0.464 NA 0.452
#> SRR1465501 2 0.0404 0.74099 0.000 0.988 0.000 NA 0.000
#> SRR1330878 5 0.2850 0.73391 0.036 0.000 0.092 NA 0.872
#> SRR1445064 3 0.5978 -0.16178 0.064 0.000 0.516 NA 0.400
#> SRR1452981 1 0.4210 0.68102 0.740 0.000 0.224 NA 0.000
#> SRR1326708 3 0.3932 0.29421 0.328 0.000 0.672 NA 0.000
#> SRR1407157 1 0.3983 0.66247 0.660 0.000 0.340 NA 0.000
#> SRR1365401 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1397697 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1477316 1 0.4441 0.65173 0.720 0.000 0.236 NA 0.000
#> SRR1077898 3 0.4297 -0.22657 0.472 0.000 0.528 NA 0.000
#> SRR1349080 3 0.3875 0.61881 0.140 0.000 0.808 NA 0.008
#> SRR1076096 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR811261 2 0.1121 0.72298 0.000 0.956 0.000 NA 0.000
#> SRR1375485 1 0.3816 0.70245 0.696 0.000 0.304 NA 0.000
#> SRR1432563 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR604414 3 0.1043 0.69044 0.040 0.000 0.960 NA 0.000
#> SRR1380614 1 0.3099 0.74785 0.848 0.000 0.132 NA 0.008
#> SRR812060 3 0.0771 0.68376 0.004 0.000 0.976 NA 0.020
#> SRR602082 3 0.3513 0.64371 0.180 0.000 0.800 NA 0.000
#> SRR1069490 2 0.1908 0.68534 0.000 0.908 0.000 NA 0.000
#> SRR1078417 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR661613 3 0.5885 0.20005 0.296 0.000 0.572 NA 0.132
#> SRR1420710 1 0.3982 0.77154 0.772 0.000 0.200 NA 0.016
#> SRR660426 3 0.1341 0.68503 0.056 0.000 0.944 NA 0.000
#> SRR1416003 1 0.7402 -0.16826 0.368 0.000 0.248 NA 0.352
#> SRR661064 1 0.3197 0.76072 0.832 0.000 0.152 NA 0.004
#> SRR1082011 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1452718 1 0.4305 0.34476 0.512 0.000 0.488 NA 0.000
#> SRR1353243 3 0.3932 0.29158 0.328 0.000 0.672 NA 0.000
#> SRR1455482 3 0.3508 0.50629 0.252 0.000 0.748 NA 0.000
#> SRR1313473 3 0.3990 0.42821 0.308 0.000 0.688 NA 0.000
#> SRR1399394 3 0.1544 0.68025 0.068 0.000 0.932 NA 0.000
#> SRR1102467 3 0.3958 0.60456 0.176 0.000 0.780 NA 0.000
#> SRR1317470 1 0.4937 0.46159 0.544 0.000 0.428 NA 0.028
#> SRR1337707 5 0.3523 0.68699 0.120 0.000 0.044 NA 0.832
#> SRR1408752 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1474617 5 0.0867 0.69384 0.008 0.000 0.008 NA 0.976
#> SRR1398013 1 0.3716 0.71888 0.812 0.000 0.152 NA 0.024
#> SRR1352918 1 0.3213 0.76200 0.836 0.000 0.144 NA 0.004
#> SRR1420750 3 0.4278 -0.15066 0.452 0.000 0.548 NA 0.000
#> SRR1071785 5 0.4351 0.71155 0.132 0.000 0.100 NA 0.768
#> SRR1353618 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1082217 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1357256 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1490313 3 0.4663 0.53260 0.236 0.000 0.712 NA 0.004
#> SRR1366560 1 0.4273 0.44545 0.552 0.000 0.448 NA 0.000
#> SRR1355684 3 0.2674 0.67086 0.140 0.000 0.856 NA 0.000
#> SRR1323289 5 0.0693 0.69720 0.012 0.000 0.008 NA 0.980
#> SRR1313494 1 0.4297 0.38577 0.528 0.000 0.472 NA 0.000
#> SRR1309985 3 0.4716 0.49973 0.308 0.000 0.656 NA 0.000
#> SRR607911 3 0.2513 0.68338 0.116 0.000 0.876 NA 0.000
#> SRR1333789 3 0.2017 0.68892 0.080 0.000 0.912 NA 0.000
#> SRR1400078 1 0.4074 0.76320 0.780 0.000 0.180 NA 0.028
#> SRR1088631 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1092842 2 0.1608 0.69742 0.000 0.928 0.000 NA 0.000
#> SRR615575 3 0.2074 0.66955 0.036 0.000 0.920 NA 0.044
#> SRR1079434 3 0.5641 0.49578 0.184 0.000 0.692 NA 0.076
#> SRR1325559 1 0.3607 0.75103 0.752 0.000 0.244 NA 0.004
#> SRR1446695 1 0.4273 0.47756 0.552 0.000 0.448 NA 0.000
#> SRR1383883 1 0.3351 0.75612 0.828 0.000 0.148 NA 0.004
#> SRR1396100 1 0.3320 0.76743 0.828 0.000 0.152 NA 0.008
#> SRR1475697 1 0.5119 0.58076 0.748 0.000 0.124 NA 0.080
#> SRR1488067 2 0.0000 0.74361 0.000 1.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1102103 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1105154 2 0.1121 0.71862 0.000 0.956 0.000 NA 0.000
#> SRR1084991 2 0.2127 0.66823 0.000 0.892 0.000 NA 0.000
#> SRR1410380 3 0.6199 -0.17110 0.392 0.000 0.468 NA 0.140
#> SRR1445490 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1454671 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1435044 1 0.4114 0.74307 0.732 0.000 0.244 NA 0.024
#> SRR1485812 3 0.6516 0.34339 0.168 0.000 0.612 NA 0.172
#> SRR1078020 2 0.4030 0.86548 0.000 0.648 0.000 NA 0.000
#> SRR1311153 3 0.4268 0.57633 0.268 0.000 0.708 NA 0.000
#> SRR1376406 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1343898 5 0.0807 0.69878 0.012 0.000 0.012 NA 0.976
#> SRR807775 3 0.2563 0.56944 0.008 0.000 0.872 NA 0.120
#> SRR1409215 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR820427 1 0.3864 0.73617 0.784 0.000 0.188 NA 0.008
#> SRR1100656 2 0.1671 0.69395 0.000 0.924 0.000 NA 0.000
#> SRR1362159 3 0.2127 0.66290 0.108 0.000 0.892 NA 0.000
#> SRR1414536 3 0.1872 0.68454 0.052 0.000 0.928 NA 0.020
#> SRR656794 3 0.4287 -0.19487 0.460 0.000 0.540 NA 0.000
#> SRR604653 3 0.1410 0.68319 0.060 0.000 0.940 NA 0.000
#> SRR1317685 5 0.6740 0.54066 0.112 0.000 0.340 NA 0.508
#> SRR1485912 1 0.4278 0.45284 0.548 0.000 0.452 NA 0.000
#> SRR1407602 1 0.5366 -0.24012 0.492 0.000 0.036 NA 0.464
#> SRR1356164 3 0.5743 0.48747 0.220 0.000 0.668 NA 0.064
#> SRR1328692 1 0.4099 0.70695 0.764 0.000 0.200 NA 0.004
#> SRR1362438 3 0.4015 0.23119 0.348 0.000 0.652 NA 0.000
#> SRR1479216 5 0.4873 0.64744 0.044 0.000 0.312 NA 0.644
#> SRR1358041 1 0.4171 0.56994 0.604 0.000 0.396 NA 0.000
#> SRR1468766 3 0.4450 0.57598 0.216 0.000 0.736 NA 0.004
#> SRR1368200 3 0.4818 -0.20798 0.460 0.000 0.520 NA 0.020
#> SRR1435602 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1501043 5 0.2331 0.72717 0.020 0.000 0.080 NA 0.900
#> SRR1437256 5 0.6005 0.67564 0.148 0.000 0.156 NA 0.660
#> SRR1487446 1 0.3884 0.72370 0.708 0.000 0.288 NA 0.004
#> SRR816653 3 0.4306 -0.28938 0.492 0.000 0.508 NA 0.000
#> SRR815164 3 0.3011 0.67746 0.140 0.000 0.844 NA 0.000
#> SRR1442043 1 0.3966 0.71711 0.784 0.000 0.176 NA 0.004
#> SRR1410573 3 0.4297 -0.22571 0.472 0.000 0.528 NA 0.000
#> SRR1096782 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1352369 3 0.1741 0.68492 0.040 0.000 0.936 NA 0.024
#> SRR1382934 5 0.3264 0.74538 0.016 0.000 0.164 NA 0.820
#> SRR1465208 3 0.4300 -0.12981 0.476 0.000 0.524 NA 0.000
#> SRR1314728 3 0.4305 -0.26916 0.488 0.000 0.512 NA 0.000
#> SRR1470291 1 0.4192 0.55349 0.596 0.000 0.404 NA 0.000
#> SRR1308756 3 0.2409 0.65851 0.032 0.000 0.900 NA 0.068
#> SRR1409600 1 0.4219 0.52893 0.584 0.000 0.416 NA 0.000
#> SRR816123 2 0.0963 0.72794 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR614779 3 0.1557 0.65198 0.008 0.000 0.940 NA 0.052
#> SRR810783 3 0.1502 0.69245 0.056 0.000 0.940 NA 0.000
#> SRR1333990 1 0.3210 0.76666 0.788 0.000 0.212 NA 0.000
#> SRR1410356 3 0.1043 0.69026 0.040 0.000 0.960 NA 0.000
#> SRR808106 3 0.4804 0.54779 0.224 0.000 0.716 NA 0.012
#> SRR662713 3 0.1901 0.68606 0.056 0.000 0.928 NA 0.004
#> SRR1447058 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1480964 3 0.3423 0.64467 0.080 0.000 0.856 NA 0.020
#> SRR809382 5 0.5158 0.66951 0.100 0.000 0.224 NA 0.676
#> SRR665417 3 0.4990 0.42273 0.324 0.000 0.628 NA 0.000
#> SRR1088016 2 0.1197 0.76101 0.000 0.952 0.000 NA 0.000
#> SRR1453166 2 0.0963 0.72550 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR1069826 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1077781 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR615623 5 0.4610 0.59844 0.016 0.000 0.388 NA 0.596
#> SRR1413787 5 0.3509 0.74367 0.008 0.000 0.196 NA 0.792
#> SRR1478207 3 0.3209 0.47640 0.008 0.000 0.812 NA 0.180
#> SRR1411046 1 0.3013 0.77008 0.832 0.000 0.160 NA 0.000
#> SRR1313711 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1326560 1 0.4193 0.69318 0.748 0.000 0.212 NA 0.000
#> SRR1309051 3 0.4242 -0.05161 0.428 0.000 0.572 NA 0.000
#> SRR1486949 2 0.4030 0.86548 0.000 0.648 0.000 NA 0.000
#> SRR1395616 3 0.4824 0.37603 0.376 0.000 0.596 NA 0.000
#> SRR1074956 2 0.1270 0.71758 0.000 0.948 0.000 NA 0.000
#> SRR1092961 2 0.1478 0.70945 0.000 0.936 0.000 NA 0.000
#> SRR817210 3 0.1216 0.67801 0.020 0.000 0.960 NA 0.020
#> SRR1319221 5 0.1124 0.69045 0.000 0.000 0.004 NA 0.960
#> SRR1405413 1 0.4219 0.53251 0.584 0.000 0.416 NA 0.000
#> SRR607807 3 0.5195 0.29384 0.388 0.000 0.564 NA 0.000
#> SRR1390160 5 0.5401 0.44807 0.060 0.000 0.404 NA 0.536
#> SRR1406283 3 0.3837 0.34851 0.308 0.000 0.692 NA 0.000
#> SRR1357709 3 0.5131 0.34413 0.364 0.000 0.588 NA 0.000
#> SRR1080742 2 0.0963 0.72794 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR1468208 1 0.3005 0.75335 0.856 0.000 0.124 NA 0.008
#> SRR1312766 3 0.2127 0.66524 0.108 0.000 0.892 NA 0.000
#> SRR1361612 1 0.3366 0.75829 0.768 0.000 0.232 NA 0.000
#> SRR1311224 3 0.1544 0.68073 0.068 0.000 0.932 NA 0.000
#> SRR1087801 3 0.4481 0.54026 0.232 0.000 0.720 NA 0.000
#> SRR1099720 2 0.4074 0.85503 0.000 0.636 0.000 NA 0.000
#> SRR1349250 2 0.1732 0.69242 0.000 0.920 0.000 NA 0.000
#> SRR1350912 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1357127 1 0.4273 0.75119 0.732 0.000 0.240 NA 0.020
#> SRR1074980 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1317022 5 0.4465 0.68080 0.024 0.000 0.304 NA 0.672
#> SRR1332879 3 0.3857 0.34850 0.312 0.000 0.688 NA 0.000
#> SRR1403177 5 0.4193 0.67993 0.020 0.004 0.016 NA 0.776
#> SRR1076144 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1069614 2 0.1410 0.70710 0.000 0.940 0.000 NA 0.000
#> SRR818239 2 0.1965 0.68165 0.000 0.904 0.000 NA 0.000
#> SRR1421069 2 0.1270 0.71758 0.000 0.948 0.000 NA 0.000
#> SRR1500006 3 0.1341 0.69094 0.056 0.000 0.944 NA 0.000
#> SRR1485678 3 0.4060 0.27530 0.360 0.000 0.640 NA 0.000
#> SRR1092232 5 0.2172 0.72768 0.016 0.000 0.076 NA 0.908
#> SRR1344253 3 0.4977 0.47084 0.292 0.000 0.660 NA 0.008
#> SRR1384290 1 0.2966 0.77102 0.816 0.000 0.184 NA 0.000
#> SRR1089349 3 0.0510 0.68447 0.000 0.000 0.984 NA 0.016
#> SRR1343522 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1326727 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1440940 1 0.6602 0.24152 0.552 0.000 0.144 NA 0.276
#> SRR818372 3 0.6417 0.08886 0.280 0.000 0.504 NA 0.216
#> SRR1323675 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR819894 3 0.4412 0.61030 0.192 0.000 0.756 NA 0.012
#> SRR1310031 3 0.2997 0.54809 0.012 0.000 0.840 NA 0.148
#> SRR615419 5 0.4123 0.73745 0.072 0.000 0.132 NA 0.792
#> SRR1436925 3 0.3010 0.63587 0.172 0.000 0.824 NA 0.000
#> SRR1477238 1 0.4925 0.48923 0.632 0.000 0.324 NA 0.000
#> SRR1332566 1 0.3861 0.73084 0.728 0.000 0.264 NA 0.000
#> SRR1490228 3 0.3648 0.51672 0.016 0.000 0.792 NA 0.188
#> SRR1442949 1 0.4403 0.66338 0.784 0.000 0.092 NA 0.112
#> SRR1466239 1 0.3774 0.71304 0.704 0.000 0.296 NA 0.000
#> SRR1094003 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1329971 1 0.4242 0.51222 0.572 0.000 0.428 NA 0.000
#> SRR813076 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1097642 2 0.2605 0.78166 0.000 0.852 0.000 NA 0.000
#> SRR1322981 3 0.3336 0.51419 0.228 0.000 0.772 NA 0.000
#> SRR1485976 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1471713 5 0.4974 0.56046 0.032 0.000 0.408 NA 0.560
#> SRR660522 3 0.2771 0.66644 0.128 0.000 0.860 NA 0.012
#> SRR815374 3 0.4210 0.01650 0.412 0.000 0.588 NA 0.000
#> SRR1069564 2 0.1270 0.71758 0.000 0.948 0.000 NA 0.000
#> SRR1416337 3 0.1626 0.66615 0.016 0.000 0.940 NA 0.044
#> SRR1316438 5 0.5314 0.55550 0.288 0.000 0.044 NA 0.648
#> SRR1386844 1 0.2930 0.76931 0.832 0.000 0.164 NA 0.000
#> SRR1373718 3 0.2020 0.68076 0.100 0.000 0.900 NA 0.000
#> SRR1447458 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1487128 1 0.3452 0.75499 0.756 0.000 0.244 NA 0.000
#> SRR1441421 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1069919 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1460296 3 0.3561 0.46247 0.260 0.000 0.740 NA 0.000
#> SRR1335489 1 0.3022 0.76343 0.848 0.000 0.136 NA 0.004
#> SRR1393404 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1081425 3 0.1478 0.68251 0.064 0.000 0.936 NA 0.000
#> SRR1401815 5 0.3178 0.72925 0.048 0.000 0.088 NA 0.860
#> SRR1071337 2 0.4030 0.86548 0.000 0.648 0.000 NA 0.000
#> SRR1071983 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1331793 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1410510 5 0.5103 0.42008 0.036 0.000 0.452 NA 0.512
#> SRR1098761 2 0.1732 0.69618 0.000 0.920 0.000 NA 0.000
#> SRR1312124 1 0.3774 0.71566 0.704 0.000 0.296 NA 0.000
#> SRR615395 3 0.1544 0.68073 0.068 0.000 0.932 NA 0.000
#> SRR1479349 1 0.3360 0.75493 0.816 0.000 0.168 NA 0.004
#> SRR2165033 1 0.3876 0.76095 0.796 0.000 0.168 NA 0.024
#> SRR1089054 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR816201 3 0.3984 0.63728 0.140 0.000 0.804 NA 0.012
#> SRR1488514 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR655840 3 0.5022 0.52953 0.252 0.000 0.688 NA 0.016
#> SRR1379303 1 0.3684 0.72990 0.720 0.000 0.280 NA 0.000
#> SRR1418516 3 0.5934 0.39049 0.312 0.000 0.596 NA 0.044
#> SRR613174 3 0.1725 0.68538 0.044 0.000 0.936 NA 0.020
#> SRR1351125 3 0.2036 0.68310 0.056 0.000 0.920 NA 0.024
#> SRR659157 1 0.3693 0.52048 0.804 0.000 0.016 NA 0.168
#> SRR1480408 3 0.4597 0.52526 0.260 0.000 0.696 NA 0.000
#> SRR657857 3 0.5050 0.47607 0.280 0.000 0.664 NA 0.008
#> SRR1073317 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1332526 3 0.4413 0.55830 0.232 0.000 0.724 NA 0.000
#> SRR1094168 2 0.0880 0.73026 0.000 0.968 0.000 NA 0.000
#> SRR1431270 5 0.6100 0.16260 0.424 0.000 0.096 NA 0.472
#> SRR1085614 2 0.3913 0.85367 0.000 0.676 0.000 NA 0.000
#> SRR1330106 3 0.5467 0.52398 0.164 0.000 0.712 NA 0.076
#> SRR1466154 3 0.1478 0.68185 0.064 0.000 0.936 NA 0.000
#> SRR1396944 3 0.4668 0.51950 0.272 0.000 0.684 NA 0.000
#> SRR1082784 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1457267 1 0.3480 0.75027 0.752 0.000 0.248 NA 0.000
#> SRR614659 3 0.0955 0.69144 0.028 0.000 0.968 NA 0.004
#> SRR659247 3 0.3109 0.55868 0.200 0.000 0.800 NA 0.000
#> SRR1317201 1 0.3895 0.68445 0.680 0.000 0.320 NA 0.000
#> SRR1473696 3 0.4256 -0.08971 0.436 0.000 0.564 NA 0.000
#> SRR1375842 3 0.1270 0.69254 0.052 0.000 0.948 NA 0.000
#> SRR1388123 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1096363 2 0.0510 0.74865 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1453662 1 0.3579 0.75235 0.756 0.000 0.240 NA 0.004
#> SRR1345499 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1353499 3 0.0880 0.69296 0.032 0.000 0.968 NA 0.000
#> SRR1416693 1 0.2891 0.77131 0.824 0.000 0.176 NA 0.000
#> SRR1070841 3 0.1549 0.68787 0.040 0.000 0.944 NA 0.016
#> SRR1380910 3 0.2127 0.66652 0.108 0.000 0.892 NA 0.000
#> SRR1333125 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1498183 1 0.4273 0.45690 0.552 0.000 0.448 NA 0.000
#> SRR612659 3 0.4623 0.42922 0.040 0.000 0.752 NA 0.184
#> SRR1447148 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR658597 2 0.0963 0.72794 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR1089595 2 0.2127 0.75521 0.000 0.892 0.000 NA 0.000
#> SRR1074263 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1376786 3 0.1197 0.68659 0.048 0.000 0.952 NA 0.000
#> SRR1345995 3 0.2280 0.65170 0.120 0.000 0.880 NA 0.000
#> SRR1071035 3 0.4150 0.59951 0.180 0.000 0.772 NA 0.004
#> SRR1068808 2 0.1732 0.69242 0.000 0.920 0.000 NA 0.000
#> SRR1332754 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR662438 1 0.3895 0.67657 0.680 0.000 0.320 NA 0.000
#> SRR1335355 3 0.2280 0.67143 0.120 0.000 0.880 NA 0.000
#> SRR659448 3 0.4297 -0.24301 0.472 0.000 0.528 NA 0.000
#> SRR1323558 1 0.6081 0.36169 0.476 0.000 0.400 NA 0.124
#> SRR1381711 3 0.3183 0.65913 0.108 0.000 0.856 NA 0.008
#> SRR657985 3 0.4227 -0.00843 0.420 0.000 0.580 NA 0.000
#> SRR1314810 1 0.4307 0.28912 0.500 0.000 0.500 NA 0.000
#> SRR1336505 3 0.4267 0.60902 0.112 0.000 0.804 NA 0.040
#> SRR1474095 3 0.4262 -0.11875 0.440 0.000 0.560 NA 0.000
#> SRR1363831 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1442376 3 0.4607 0.54575 0.228 0.000 0.720 NA 0.004
#> SRR1074909 2 0.0963 0.72794 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR1101200 3 0.0510 0.69128 0.016 0.000 0.984 NA 0.000
#> SRR1075408 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1367150 1 0.3850 0.72053 0.792 0.000 0.172 NA 0.004
#> SRR1313406 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1068880 2 0.4030 0.86548 0.000 0.648 0.000 NA 0.000
#> SRR1467277 3 0.6494 -0.14503 0.192 0.000 0.444 NA 0.364
#> SRR1084867 2 0.4030 0.86548 0.000 0.648 0.000 NA 0.000
#> SRR1095431 2 0.1608 0.70275 0.000 0.928 0.000 NA 0.000
#> SRR1380184 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1443113 3 0.2280 0.67038 0.120 0.000 0.880 NA 0.000
#> SRR1380414 3 0.2864 0.63552 0.136 0.000 0.852 NA 0.012
#> SRR1315912 3 0.1197 0.68874 0.048 0.000 0.952 NA 0.000
#> SRR1075778 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1421116 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR602282 3 0.6845 0.05770 0.128 0.000 0.536 NA 0.288
#> SRR1361195 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR600493 3 0.1341 0.68420 0.056 0.000 0.944 NA 0.000
#> SRR1477653 3 0.3210 0.54418 0.212 0.000 0.788 NA 0.000
#> SRR1355475 3 0.1403 0.68533 0.024 0.000 0.952 NA 0.024
#> SRR1360785 1 0.2989 0.75699 0.852 0.000 0.132 NA 0.008
#> SRR810437 1 0.4640 0.65001 0.756 0.000 0.148 NA 0.088
#> SRR1361860 3 0.5230 0.36997 0.348 0.000 0.600 NA 0.004
#> SRR1441311 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1098903 3 0.4100 0.59231 0.192 0.000 0.764 NA 0.000
#> SRR1457619 1 0.4045 0.64429 0.644 0.000 0.356 NA 0.000
#> SRR1498529 3 0.5030 0.40298 0.352 0.000 0.604 NA 0.000
#> SRR1097172 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1074017 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1472033 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1445087 3 0.6953 0.11160 0.160 0.000 0.540 NA 0.252
#> SRR1399525 2 0.0703 0.75227 0.000 0.976 0.000 NA 0.000
#> SRR1312844 2 0.0609 0.74516 0.000 0.980 0.000 NA 0.000
#> SRR1085874 2 0.1341 0.71490 0.000 0.944 0.000 NA 0.000
#> SRR1101226 2 0.1410 0.71231 0.000 0.940 0.000 NA 0.000
#> SRR1476056 3 0.5052 0.39275 0.340 0.000 0.612 NA 0.000
#> SRR1075659 2 0.1478 0.70894 0.000 0.936 0.000 NA 0.000
#> SRR1311916 5 0.5204 0.55807 0.052 0.000 0.368 NA 0.580
#> SRR1353353 5 0.3989 0.73883 0.048 0.000 0.144 NA 0.800
#> SRR1073291 3 0.1579 0.67966 0.024 0.000 0.944 NA 0.032
#> SRR1356227 1 0.3949 0.69966 0.696 0.000 0.300 NA 0.000
#> SRR1080720 2 0.4088 0.85031 0.000 0.632 0.000 NA 0.000
#> SRR1091695 2 0.1410 0.71199 0.000 0.940 0.000 NA 0.000
#> SRR1350304 1 0.3690 0.66237 0.832 0.000 0.068 NA 0.092
#> SRR663002 1 0.5834 0.43257 0.648 0.000 0.132 NA 0.204
#> SRR1376983 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1399926 1 0.3388 0.75881 0.792 0.000 0.200 NA 0.000
#> SRR1347144 5 0.5291 0.37950 0.048 0.000 0.456 NA 0.496
#> SRR1384006 3 0.2519 0.68130 0.100 0.000 0.884 NA 0.000
#> SRR1499108 2 0.0510 0.74317 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR614047 3 0.5117 0.33253 0.072 0.000 0.652 NA 0.276
#> SRR818440 3 0.4955 0.40350 0.248 0.000 0.680 NA 0.072
#> SRR1337770 1 0.3661 0.74137 0.724 0.000 0.276 NA 0.000
#> SRR1399413 3 0.2850 0.65690 0.092 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1385542 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1473959 3 0.4783 0.00854 0.452 0.000 0.532 NA 0.004
#> SRR1074041 3 0.0566 0.69132 0.012 0.000 0.984 NA 0.000
#> SRR1394495 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR659460 3 0.1251 0.68788 0.036 0.000 0.956 NA 0.008
#> SRR816699 3 0.1484 0.68681 0.048 0.000 0.944 NA 0.008
#> SRR1308612 3 0.1106 0.68201 0.012 0.000 0.964 NA 0.024
#> SRR1499418 5 0.5283 0.42487 0.048 0.000 0.444 NA 0.508
#> SRR1352894 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR815805 3 0.2374 0.67231 0.052 0.000 0.912 NA 0.016
#> SRR1331083 2 0.0963 0.72794 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR808272 3 0.2316 0.67443 0.036 0.000 0.916 NA 0.036
#> SRR1436698 3 0.4101 0.15712 0.372 0.000 0.628 NA 0.000
#> SRR1095627 2 0.1197 0.72037 0.000 0.952 0.000 NA 0.000
#> SRR1357672 3 0.4302 -0.25376 0.480 0.000 0.520 NA 0.000
#> SRR1351236 3 0.2690 0.61713 0.156 0.000 0.844 NA 0.000
#> SRR1077479 3 0.4665 0.51913 0.260 0.000 0.692 NA 0.000
#> SRR814491 1 0.3300 0.76459 0.836 0.000 0.140 NA 0.012
#> SRR1101256 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1436004 3 0.1270 0.68766 0.052 0.000 0.948 NA 0.000
#> SRR1457994 2 0.4030 0.86325 0.000 0.648 0.000 NA 0.000
#> SRR1078998 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1314707 3 0.4221 0.58514 0.188 0.000 0.764 NA 0.004
#> SRR1309534 1 0.3453 0.71718 0.832 0.000 0.136 NA 0.020
#> SRR615527 5 0.6442 0.54695 0.080 0.000 0.332 NA 0.544
#> SRR1098216 3 0.3920 0.62053 0.156 0.000 0.796 NA 0.004
#> SRR1325847 2 0.1121 0.71862 0.000 0.956 0.000 NA 0.000
#> SRR1404003 3 0.3707 0.63266 0.116 0.000 0.828 NA 0.012
#> SRR1344166 3 0.2625 0.67703 0.108 0.000 0.876 NA 0.000
#> SRR1368638 1 0.3512 0.76979 0.816 0.000 0.160 NA 0.012
#> SRR1431429 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1079237 2 0.0880 0.72863 0.000 0.968 0.000 NA 0.000
#> SRR1080509 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR815759 1 0.5524 0.64600 0.628 0.000 0.276 NA 0.092
#> SRR1502143 3 0.1282 0.68695 0.044 0.000 0.952 NA 0.004
#> SRR1487614 5 0.4989 0.56781 0.020 0.000 0.400 NA 0.572
#> SRR1402307 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR820810 3 0.2077 0.68901 0.084 0.000 0.908 NA 0.000
#> SRR1099212 2 0.3796 0.85580 0.000 0.700 0.000 NA 0.000
#> SRR1083215 3 0.4307 -0.32768 0.500 0.000 0.500 NA 0.000
#> SRR1476547 2 0.2806 0.72819 0.000 0.844 0.000 NA 0.004
#> SRR656421 1 0.4150 0.58211 0.612 0.000 0.388 NA 0.000
#> SRR1086116 2 0.4015 0.86658 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1499917 1 0.3433 0.75613 0.832 0.000 0.136 NA 0.024
#> SRR1339944 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1391444 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1434889 3 0.3541 0.63691 0.076 0.000 0.852 NA 0.028
#> SRR1431847 1 0.4548 0.44258 0.756 0.000 0.048 NA 0.180
#> SRR1317155 3 0.5512 0.35885 0.340 0.000 0.596 NA 0.016
#> SRR1477405 3 0.3210 0.54691 0.212 0.000 0.788 NA 0.000
#> SRR655289 3 0.1041 0.69432 0.032 0.000 0.964 NA 0.000
#> SRR1341683 3 0.5815 0.43288 0.116 0.000 0.672 NA 0.180
#> SRR1084790 3 0.1478 0.68225 0.064 0.000 0.936 NA 0.000
#> SRR1073731 3 0.2467 0.66455 0.052 0.000 0.908 NA 0.016
#> SRR1332588 1 0.5727 0.05799 0.488 0.000 0.448 NA 0.016
#> SRR1471157 2 0.3999 0.86694 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR654945 3 0.4306 -0.29344 0.492 0.000 0.508 NA 0.000
#> SRR661028 3 0.3730 0.40772 0.288 0.000 0.712 NA 0.000
#> SRR1413477 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1101152 3 0.1544 0.68121 0.068 0.000 0.932 NA 0.000
#> SRR1358435 2 0.1043 0.75363 0.000 0.960 0.000 NA 0.000
#> SRR2165273 1 0.3039 0.76929 0.808 0.000 0.192 NA 0.000
#> SRR1379014 3 0.5094 0.37635 0.352 0.000 0.600 NA 0.000
#> SRR1489904 3 0.6233 -0.14401 0.144 0.000 0.460 NA 0.396
#> SRR1416386 2 0.0510 0.74865 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1406048 1 0.3636 0.73389 0.728 0.000 0.272 NA 0.000
#> SRR606982 3 0.5270 0.50714 0.240 0.000 0.684 NA 0.028
#> SRR1358082 3 0.2813 0.60576 0.168 0.000 0.832 NA 0.000
#> SRR1312934 3 0.2116 0.65683 0.028 0.000 0.924 NA 0.040
#> SRR655194 1 0.3242 0.76496 0.784 0.000 0.216 NA 0.000
#> SRR1331174 2 0.3999 0.86603 0.000 0.656 0.000 NA 0.000
#> SRR1473251 2 0.3087 0.67820 0.008 0.836 0.000 NA 0.004
#> SRR1389820 5 0.1356 0.68624 0.012 0.000 0.004 NA 0.956
#> SRR1074289 3 0.2460 0.66582 0.072 0.000 0.900 NA 0.004
#> SRR1348816 2 0.4015 0.86485 0.000 0.652 0.000 NA 0.000
#> SRR1076292 3 0.3308 0.62426 0.052 0.000 0.860 NA 0.076
#> SRR1395810 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1498909 3 0.3755 0.59785 0.048 0.000 0.840 NA 0.080
#> SRR1443507 3 0.1270 0.68593 0.052 0.000 0.948 NA 0.000
#> SRR1452310 1 0.3443 0.74967 0.816 0.000 0.164 NA 0.008
#> SRR665610 1 0.3895 0.68716 0.680 0.000 0.320 NA 0.000
#> SRR1347322 3 0.3857 0.36397 0.312 0.000 0.688 NA 0.000
#> SRR813395 2 0.1121 0.72298 0.000 0.956 0.000 NA 0.000
#> SRR1477256 1 0.3177 0.76818 0.792 0.000 0.208 NA 0.000
#> SRR1470230 1 0.4424 0.57511 0.780 0.000 0.080 NA 0.128
#> SRR1354247 3 0.3844 0.61474 0.164 0.000 0.792 NA 0.000
#> SRR1082640 2 0.4030 0.86548 0.000 0.648 0.000 NA 0.000
#> SRR1487592 3 0.1670 0.68520 0.052 0.000 0.936 NA 0.012
#> SRR1352299 3 0.1544 0.68625 0.068 0.000 0.932 NA 0.000
#> SRR1076317 2 0.0963 0.72390 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR1434117 3 0.2149 0.68176 0.048 0.000 0.916 NA 0.036
#> SRR1075273 2 0.0404 0.73760 0.000 0.988 0.000 NA 0.000
#> SRR658657 1 0.5526 0.58831 0.680 0.000 0.136 NA 0.172
#> SRR1092773 2 0.0510 0.73681 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1365332 3 0.4235 -0.05116 0.424 0.000 0.576 NA 0.000
#> SRR615958 3 0.3789 0.43531 0.020 0.000 0.768 NA 0.212
#> SRR1097688 2 0.1341 0.71488 0.000 0.944 0.000 NA 0.000
#> SRR1403259 1 0.6640 -0.03789 0.532 0.000 0.100 NA 0.324
#> SRR1099120 2 0.2074 0.66764 0.000 0.896 0.000 NA 0.000
#> SRR1362200 3 0.1557 0.65522 0.008 0.000 0.940 NA 0.052
#> SRR1464856 2 0.3983 0.86684 0.000 0.660 0.000 NA 0.000
#> SRR1347298 3 0.4462 0.52373 0.056 0.000 0.788 NA 0.124
#> SRR1075923 2 0.0162 0.74558 0.000 0.996 0.000 NA 0.000
#> SRR1100703 3 0.1197 0.68632 0.048 0.000 0.952 NA 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1354977 4 0.5252 0.77513 0.144 0.000 0.264 0.592 0.000 0.000
#> SRR1436370 2 0.3714 0.95012 0.000 0.656 0.000 0.004 0.000 0.340
#> SRR1075752 6 0.1714 0.85518 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1397949 3 0.1643 0.68951 0.068 0.000 0.924 0.008 0.000 0.000
#> SRR1355723 4 0.4705 0.77429 0.088 0.000 0.260 0.652 0.000 0.000
#> SRR1329744 1 0.4036 0.69671 0.756 0.000 0.136 0.108 0.000 0.000
#> SRR657384 1 0.4428 0.45378 0.580 0.000 0.388 0.032 0.000 0.000
#> SRR1351190 1 0.3592 0.67678 0.740 0.000 0.240 0.020 0.000 0.000
#> SRR1458662 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR818573 3 0.3736 0.29314 0.008 0.000 0.716 0.268 0.008 0.000
#> SRR1396017 1 0.1908 0.66339 0.916 0.000 0.028 0.056 0.000 0.000
#> SRR1410742 1 0.4377 0.16360 0.540 0.000 0.024 0.436 0.000 0.000
#> SRR1435963 1 0.3102 0.71504 0.816 0.000 0.156 0.028 0.000 0.000
#> SRR1382416 1 0.3432 0.59028 0.764 0.000 0.020 0.216 0.000 0.000
#> SRR1391354 4 0.5123 0.76780 0.092 0.000 0.316 0.588 0.004 0.000
#> SRR1087968 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1310075 3 0.6109 -0.24486 0.312 0.000 0.376 0.312 0.000 0.000
#> SRR1312244 1 0.3512 0.62972 0.720 0.000 0.272 0.008 0.000 0.000
#> SRR1325138 4 0.5198 0.71500 0.204 0.000 0.180 0.616 0.000 0.000
#> SRR1326821 3 0.3563 0.65252 0.132 0.000 0.796 0.072 0.000 0.000
#> SRR1490178 2 0.3714 0.95012 0.000 0.656 0.000 0.004 0.000 0.340
#> SRR655613 3 0.2688 0.67796 0.064 0.000 0.868 0.068 0.000 0.000
#> SRR1075707 6 0.4614 0.67905 0.000 0.208 0.000 0.108 0.000 0.684
#> SRR1443871 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1102489 6 0.0405 0.86729 0.000 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988
#> SRR1465758 3 0.4503 0.53210 0.232 0.000 0.684 0.084 0.000 0.000
#> SRR1414058 3 0.2879 0.51829 0.004 0.000 0.816 0.176 0.004 0.000
#> SRR1407449 1 0.3161 0.69643 0.776 0.000 0.216 0.008 0.000 0.000
#> SRR1436858 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1479109 3 0.3421 0.52504 0.256 0.000 0.736 0.008 0.000 0.000
#> SRR1399069 4 0.4745 0.77475 0.088 0.000 0.268 0.644 0.000 0.000
#> SRR1366450 3 0.3202 0.62431 0.176 0.000 0.800 0.024 0.000 0.000
#> SRR1396859 1 0.4575 0.64694 0.696 0.000 0.124 0.180 0.000 0.000
#> SRR1457176 3 0.4062 0.08370 0.440 0.000 0.552 0.008 0.000 0.000
#> SRR1097666 6 0.1471 0.87424 0.000 0.064 0.000 0.004 0.000 0.932
#> SRR1434736 1 0.2509 0.69760 0.876 0.000 0.088 0.036 0.000 0.000
#> SRR1080560 6 0.0777 0.87483 0.000 0.024 0.000 0.004 0.000 0.972
#> SRR1322882 3 0.2146 0.60391 0.004 0.000 0.880 0.116 0.000 0.000
#> SRR1435688 2 0.4139 0.92737 0.000 0.640 0.000 0.024 0.000 0.336
#> SRR1327614 3 0.4291 0.48771 0.292 0.000 0.664 0.044 0.000 0.000
#> SRR658152 1 0.2790 0.61183 0.868 0.000 0.012 0.088 0.032 0.000
#> SRR1368141 5 0.5901 0.09127 0.020 0.000 0.120 0.408 0.452 0.000
#> SRR1440268 1 0.3506 0.64758 0.792 0.000 0.052 0.156 0.000 0.000
#> SRR1453725 3 0.1908 0.68716 0.056 0.000 0.916 0.028 0.000 0.000
#> SRR1325711 2 0.3984 0.94042 0.000 0.648 0.000 0.016 0.000 0.336
#> SRR1477930 4 0.5519 0.70103 0.144 0.000 0.344 0.512 0.000 0.000
#> SRR1477591 3 0.2980 0.60939 0.192 0.000 0.800 0.008 0.000 0.000
#> SRR1416049 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR656275 3 0.4956 -0.30727 0.032 0.000 0.536 0.412 0.020 0.000
#> SRR1369052 3 0.5191 0.30099 0.172 0.000 0.616 0.212 0.000 0.000
#> SRR1377735 3 0.3368 0.56717 0.232 0.000 0.756 0.012 0.000 0.000
#> SRR1331244 4 0.5223 0.34867 0.396 0.000 0.096 0.508 0.000 0.000
#> SRR1404531 3 0.3893 0.64197 0.156 0.000 0.764 0.080 0.000 0.000
#> SRR1324331 4 0.5166 0.38242 0.384 0.000 0.092 0.524 0.000 0.000
#> SRR1458890 5 0.4378 0.35798 0.368 0.000 0.000 0.032 0.600 0.000
#> SRR1432695 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1407624 2 0.4153 0.94518 0.000 0.636 0.000 0.024 0.000 0.340
#> SRR1431969 5 0.5214 0.54683 0.072 0.000 0.304 0.020 0.604 0.000
#> SRR1087393 2 0.4493 0.88224 0.000 0.596 0.000 0.040 0.000 0.364
#> SRR1077263 3 0.1341 0.68560 0.028 0.000 0.948 0.024 0.000 0.000
#> SRR1385211 3 0.3110 0.61686 0.196 0.000 0.792 0.012 0.000 0.000
#> SRR655241 1 0.2221 0.66783 0.896 0.000 0.032 0.072 0.000 0.000
#> SRR656922 3 0.3394 0.38779 0.012 0.000 0.752 0.236 0.000 0.000
#> SRR1361630 3 0.2247 0.66603 0.012 0.000 0.904 0.024 0.060 0.000
#> SRR1318966 6 0.2805 0.72874 0.000 0.184 0.000 0.004 0.000 0.812
#> SRR1407087 3 0.3094 0.54539 0.000 0.000 0.824 0.140 0.036 0.000
#> SRR603212 3 0.3950 0.15288 0.008 0.000 0.672 0.312 0.008 0.000
#> SRR1321088 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1485190 5 0.6337 0.49200 0.044 0.000 0.192 0.240 0.524 0.000
#> SRR1332232 2 0.3833 0.94766 0.000 0.648 0.000 0.008 0.000 0.344
#> SRR1312645 1 0.3641 0.65637 0.732 0.000 0.248 0.020 0.000 0.000
#> SRR1457835 3 0.3314 0.53995 0.256 0.000 0.740 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347123 3 0.5290 0.21242 0.020 0.000 0.592 0.076 0.312 0.000
#> SRR1465501 6 0.1863 0.84476 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1330878 5 0.2831 0.70669 0.016 0.000 0.084 0.032 0.868 0.000
#> SRR1445064 5 0.6068 0.31057 0.012 0.000 0.328 0.188 0.472 0.000
#> SRR1452981 4 0.4756 0.34633 0.380 0.000 0.056 0.564 0.000 0.000
#> SRR1326708 3 0.3073 0.60063 0.204 0.000 0.788 0.008 0.000 0.000
#> SRR1407157 1 0.4531 0.36686 0.556 0.000 0.408 0.036 0.000 0.000
#> SRR1365401 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1397697 2 0.3819 0.94923 0.000 0.652 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1477316 4 0.4806 0.32879 0.380 0.000 0.060 0.560 0.000 0.000
#> SRR1077898 3 0.3710 0.47042 0.292 0.000 0.696 0.012 0.000 0.000
#> SRR1349080 4 0.4705 0.60627 0.036 0.000 0.440 0.520 0.004 0.000
#> SRR1076096 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR811261 6 0.1779 0.87214 0.000 0.064 0.000 0.016 0.000 0.920
#> SRR1375485 1 0.4084 0.42586 0.588 0.000 0.400 0.012 0.000 0.000
#> SRR1432563 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR604414 3 0.1806 0.62986 0.004 0.000 0.908 0.088 0.000 0.000
#> SRR1380614 1 0.2833 0.62736 0.836 0.000 0.012 0.148 0.004 0.000
#> SRR812060 3 0.1398 0.64817 0.000 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR602082 3 0.5347 -0.43266 0.108 0.000 0.480 0.412 0.000 0.000
#> SRR1069490 6 0.1078 0.83943 0.008 0.016 0.000 0.012 0.000 0.964
#> SRR1078417 2 0.3927 0.94623 0.000 0.644 0.000 0.012 0.000 0.344
#> SRR661613 3 0.4153 0.56208 0.212 0.000 0.736 0.028 0.024 0.000
#> SRR1420710 1 0.4389 0.70943 0.736 0.000 0.168 0.084 0.012 0.000
#> SRR660426 3 0.1644 0.68357 0.040 0.000 0.932 0.028 0.000 0.000
#> SRR1416003 5 0.7008 -0.00240 0.216 0.000 0.072 0.348 0.364 0.000
#> SRR661064 1 0.4371 0.50302 0.664 0.000 0.052 0.284 0.000 0.000
#> SRR1082011 2 0.3912 0.94486 0.000 0.648 0.000 0.012 0.000 0.340
#> SRR1452718 3 0.4203 0.39774 0.316 0.000 0.652 0.032 0.000 0.000
#> SRR1353243 3 0.2915 0.62415 0.184 0.000 0.808 0.008 0.000 0.000
#> SRR1455482 3 0.4011 0.60052 0.212 0.000 0.732 0.056 0.000 0.000
#> SRR1313473 3 0.4619 0.52396 0.244 0.000 0.668 0.088 0.000 0.000
#> SRR1399394 3 0.1075 0.69000 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102467 4 0.4822 0.75737 0.072 0.000 0.332 0.596 0.000 0.000
#> SRR1317470 3 0.4228 0.21502 0.392 0.000 0.588 0.020 0.000 0.000
#> SRR1337707 5 0.3563 0.66496 0.132 0.000 0.048 0.012 0.808 0.000
#> SRR1408752 2 0.3984 0.94042 0.000 0.648 0.000 0.016 0.000 0.336
#> SRR1474617 5 0.0508 0.67994 0.012 0.000 0.000 0.004 0.984 0.000
#> SRR1398013 1 0.4288 0.46352 0.660 0.000 0.012 0.308 0.020 0.000
#> SRR1352918 1 0.3867 0.60889 0.748 0.000 0.052 0.200 0.000 0.000
#> SRR1420750 3 0.3490 0.51243 0.268 0.000 0.724 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071785 5 0.4257 0.68068 0.072 0.004 0.056 0.080 0.788 0.000
#> SRR1353618 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1082217 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1357256 2 0.3699 0.95089 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR1490313 4 0.4990 0.78127 0.108 0.000 0.276 0.616 0.000 0.000
#> SRR1366560 3 0.4318 0.04246 0.448 0.000 0.532 0.020 0.000 0.000
#> SRR1355684 3 0.4558 0.48558 0.132 0.000 0.700 0.168 0.000 0.000
#> SRR1323289 5 0.0520 0.68175 0.008 0.000 0.000 0.008 0.984 0.000
#> SRR1313494 3 0.4379 0.21038 0.396 0.000 0.576 0.028 0.000 0.000
#> SRR1309985 4 0.6062 0.44755 0.288 0.000 0.304 0.408 0.000 0.000
#> SRR607911 3 0.4582 0.40613 0.100 0.000 0.684 0.216 0.000 0.000
#> SRR1333789 3 0.3892 0.47312 0.060 0.000 0.752 0.188 0.000 0.000
#> SRR1400078 1 0.2755 0.69657 0.844 0.000 0.140 0.012 0.004 0.000
#> SRR1088631 2 0.4064 0.93784 0.000 0.644 0.000 0.020 0.000 0.336
#> SRR1092842 6 0.0291 0.86451 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR615575 3 0.0881 0.67461 0.008 0.000 0.972 0.012 0.008 0.000
#> SRR1079434 4 0.5766 0.69711 0.064 0.000 0.288 0.580 0.068 0.000
#> SRR1325559 1 0.2871 0.69831 0.804 0.000 0.192 0.004 0.000 0.000
#> SRR1446695 3 0.4209 0.16764 0.396 0.000 0.588 0.012 0.004 0.000
#> SRR1383883 1 0.4426 0.45479 0.652 0.000 0.052 0.296 0.000 0.000
#> SRR1396100 1 0.1930 0.68099 0.916 0.000 0.048 0.036 0.000 0.000
#> SRR1475697 4 0.5216 0.39321 0.320 0.000 0.028 0.596 0.056 0.000
#> SRR1488067 6 0.2003 0.82935 0.000 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR1102103 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1105154 6 0.1010 0.87738 0.000 0.036 0.000 0.004 0.000 0.960
#> SRR1084991 6 0.1970 0.80133 0.000 0.092 0.000 0.008 0.000 0.900
#> SRR1410380 3 0.4459 0.47372 0.244 0.000 0.692 0.008 0.056 0.000
#> SRR1445490 2 0.4371 0.93818 0.000 0.620 0.000 0.036 0.000 0.344
#> SRR1454671 2 0.4153 0.94518 0.000 0.636 0.000 0.024 0.000 0.340
#> SRR1435044 1 0.3466 0.67126 0.760 0.000 0.224 0.008 0.008 0.000
#> SRR1485812 4 0.6130 0.67079 0.084 0.000 0.232 0.580 0.104 0.000
#> SRR1078020 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1311153 4 0.5604 0.56607 0.144 0.000 0.404 0.452 0.000 0.000
#> SRR1376406 2 0.3819 0.94923 0.000 0.652 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1343898 5 0.0767 0.68723 0.004 0.000 0.008 0.012 0.976 0.000
#> SRR807775 3 0.2179 0.63020 0.000 0.000 0.900 0.036 0.064 0.000
#> SRR1409215 2 0.4078 0.93445 0.000 0.640 0.000 0.020 0.000 0.340
#> SRR820427 1 0.5207 0.25889 0.564 0.000 0.072 0.352 0.012 0.000
#> SRR1100656 6 0.0508 0.85803 0.000 0.012 0.000 0.004 0.000 0.984
#> SRR1362159 3 0.2266 0.67759 0.108 0.000 0.880 0.012 0.000 0.000
#> SRR1414536 3 0.0692 0.68444 0.020 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000
#> SRR656794 3 0.3670 0.47713 0.284 0.000 0.704 0.012 0.000 0.000
#> SRR604653 3 0.1723 0.67892 0.036 0.000 0.928 0.036 0.000 0.000
#> SRR1317685 5 0.6640 0.37154 0.052 0.000 0.196 0.292 0.460 0.000
#> SRR1485912 3 0.4152 0.03551 0.440 0.000 0.548 0.012 0.000 0.000
#> SRR1407602 5 0.4960 0.48510 0.308 0.000 0.000 0.092 0.600 0.000
#> SRR1356164 4 0.5741 0.68733 0.060 0.000 0.252 0.604 0.084 0.000
#> SRR1328692 1 0.5495 0.04980 0.472 0.000 0.088 0.428 0.012 0.000
#> SRR1362438 3 0.2915 0.61700 0.184 0.000 0.808 0.008 0.000 0.000
#> SRR1479216 5 0.4797 0.26101 0.016 0.000 0.460 0.024 0.500 0.000
#> SRR1358041 1 0.4123 0.35015 0.568 0.000 0.420 0.012 0.000 0.000
#> SRR1468766 4 0.5153 0.53254 0.084 0.000 0.452 0.464 0.000 0.000
#> SRR1368200 3 0.3791 0.46196 0.300 0.000 0.688 0.008 0.004 0.000
#> SRR1435602 2 0.3819 0.94923 0.000 0.652 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1501043 5 0.2245 0.69458 0.008 0.004 0.028 0.052 0.908 0.000
#> SRR1437256 5 0.5340 0.36263 0.040 0.000 0.044 0.352 0.564 0.000
#> SRR1487446 1 0.3990 0.61412 0.688 0.000 0.284 0.028 0.000 0.000
#> SRR816653 3 0.4057 0.25411 0.388 0.000 0.600 0.012 0.000 0.000
#> SRR815164 3 0.5084 0.14838 0.124 0.000 0.612 0.264 0.000 0.000
#> SRR1442043 4 0.4587 0.09829 0.456 0.000 0.036 0.508 0.000 0.000
#> SRR1410573 3 0.4092 0.36848 0.344 0.000 0.636 0.020 0.000 0.000
#> SRR1096782 2 0.3998 0.93740 0.000 0.644 0.000 0.016 0.000 0.340
#> SRR1352369 3 0.0767 0.67475 0.008 0.000 0.976 0.012 0.004 0.000
#> SRR1382934 5 0.3025 0.68657 0.000 0.000 0.156 0.024 0.820 0.000
#> SRR1465208 3 0.5093 0.16322 0.388 0.000 0.528 0.084 0.000 0.000
#> SRR1314728 3 0.4541 0.27947 0.360 0.000 0.596 0.044 0.000 0.000
#> SRR1470291 3 0.4531 0.13973 0.408 0.000 0.556 0.036 0.000 0.000
#> SRR1308756 3 0.3301 0.57700 0.004 0.000 0.828 0.100 0.068 0.000
#> SRR1409600 3 0.4361 0.04937 0.436 0.000 0.544 0.016 0.004 0.000
#> SRR816123 6 0.1895 0.86854 0.000 0.072 0.000 0.016 0.000 0.912
#> SRR614779 3 0.2282 0.60974 0.000 0.000 0.888 0.088 0.024 0.000
#> SRR810783 3 0.2632 0.54521 0.004 0.000 0.832 0.164 0.000 0.000
#> SRR1333990 1 0.3176 0.71823 0.812 0.000 0.156 0.032 0.000 0.000
#> SRR1410356 3 0.1082 0.66560 0.004 0.000 0.956 0.040 0.000 0.000
#> SRR808106 4 0.4711 0.77058 0.080 0.000 0.280 0.640 0.000 0.000
#> SRR662713 3 0.3109 0.41732 0.000 0.000 0.772 0.224 0.004 0.000
#> SRR1447058 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1480964 3 0.4532 -0.44778 0.024 0.000 0.508 0.464 0.004 0.000
#> SRR809382 5 0.5961 0.35464 0.096 0.000 0.364 0.040 0.500 0.000
#> SRR665417 4 0.5023 0.76807 0.144 0.000 0.220 0.636 0.000 0.000
#> SRR1088016 6 0.3512 0.66029 0.000 0.196 0.000 0.032 0.000 0.772
#> SRR1453166 6 0.1714 0.85833 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1069826 2 0.4153 0.93115 0.000 0.636 0.000 0.024 0.000 0.340
#> SRR1077781 2 0.4153 0.93115 0.000 0.636 0.000 0.024 0.000 0.340
#> SRR615623 5 0.4881 0.35329 0.012 0.000 0.428 0.036 0.524 0.000
#> SRR1413787 5 0.3726 0.66363 0.004 0.000 0.216 0.028 0.752 0.000
#> SRR1478207 3 0.2277 0.63449 0.000 0.000 0.892 0.032 0.076 0.000
#> SRR1411046 1 0.2221 0.69586 0.896 0.000 0.072 0.032 0.000 0.000
#> SRR1313711 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1326560 4 0.4837 0.21562 0.432 0.000 0.056 0.512 0.000 0.000
#> SRR1309051 3 0.4130 0.52249 0.260 0.000 0.696 0.044 0.000 0.000
#> SRR1486949 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1395616 4 0.5787 0.65334 0.244 0.000 0.252 0.504 0.000 0.000
#> SRR1074956 6 0.1080 0.87672 0.004 0.032 0.000 0.004 0.000 0.960
#> SRR1092961 6 0.1245 0.86140 0.000 0.032 0.000 0.016 0.000 0.952
#> SRR817210 3 0.2118 0.60572 0.000 0.000 0.888 0.104 0.008 0.000
#> SRR1319221 5 0.0777 0.68026 0.000 0.024 0.000 0.004 0.972 0.000
#> SRR1405413 1 0.4377 0.29992 0.540 0.000 0.436 0.024 0.000 0.000
#> SRR607807 4 0.4957 0.75887 0.148 0.000 0.204 0.648 0.000 0.000
#> SRR1390160 3 0.4922 0.36390 0.076 0.000 0.632 0.008 0.284 0.000
#> SRR1406283 3 0.2703 0.62751 0.172 0.000 0.824 0.004 0.000 0.000
#> SRR1357709 4 0.5142 0.76757 0.156 0.000 0.224 0.620 0.000 0.000
#> SRR1080742 6 0.1471 0.87424 0.000 0.064 0.000 0.004 0.000 0.932
#> SRR1468208 1 0.2398 0.65153 0.876 0.000 0.020 0.104 0.000 0.000
#> SRR1312766 3 0.1700 0.68901 0.048 0.000 0.928 0.024 0.000 0.000
#> SRR1361612 1 0.3141 0.70044 0.788 0.000 0.200 0.012 0.000 0.000
#> SRR1311224 3 0.0777 0.68478 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000 0.000
#> SRR1087801 4 0.4775 0.77462 0.084 0.000 0.284 0.632 0.000 0.000
#> SRR1099720 2 0.4511 0.87373 0.000 0.620 0.000 0.048 0.000 0.332
#> SRR1349250 6 0.0291 0.86451 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1350912 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1357127 1 0.3668 0.64553 0.728 0.000 0.256 0.008 0.008 0.000
#> SRR1074980 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1317022 5 0.4588 0.56100 0.008 0.000 0.320 0.040 0.632 0.000
#> SRR1332879 3 0.2902 0.61146 0.196 0.000 0.800 0.004 0.000 0.000
#> SRR1403177 5 0.6784 0.65325 0.064 0.108 0.056 0.100 0.636 0.036
#> SRR1076144 2 0.3912 0.94486 0.000 0.648 0.000 0.012 0.000 0.340
#> SRR1069614 6 0.0603 0.87165 0.000 0.016 0.000 0.004 0.000 0.980
#> SRR818239 6 0.0603 0.84659 0.000 0.016 0.000 0.004 0.000 0.980
#> SRR1421069 6 0.0935 0.87666 0.000 0.032 0.000 0.004 0.000 0.964
#> SRR1500006 3 0.2218 0.61866 0.012 0.000 0.884 0.104 0.000 0.000
#> SRR1485678 3 0.4535 0.44950 0.296 0.000 0.644 0.060 0.000 0.000
#> SRR1092232 5 0.2884 0.70649 0.016 0.004 0.072 0.036 0.872 0.000
#> SRR1344253 4 0.5475 0.69728 0.120 0.000 0.348 0.528 0.004 0.000
#> SRR1384290 1 0.4299 0.64644 0.720 0.000 0.092 0.188 0.000 0.000
#> SRR1089349 3 0.2257 0.59425 0.000 0.000 0.876 0.116 0.008 0.000
#> SRR1343522 2 0.4139 0.93491 0.000 0.640 0.000 0.024 0.000 0.336
#> SRR1326727 2 0.3912 0.94486 0.000 0.648 0.000 0.012 0.000 0.340
#> SRR1440940 1 0.6820 -0.06618 0.336 0.000 0.040 0.308 0.316 0.000
#> SRR818372 3 0.5090 0.41834 0.292 0.000 0.624 0.024 0.060 0.000
#> SRR1323675 2 0.4319 0.93809 0.000 0.620 0.000 0.032 0.000 0.348
#> SRR819894 3 0.6003 -0.53134 0.176 0.000 0.420 0.396 0.008 0.000
#> SRR1310031 3 0.3023 0.58136 0.000 0.000 0.828 0.032 0.140 0.000
#> SRR615419 5 0.3632 0.69440 0.028 0.004 0.068 0.072 0.828 0.000
#> SRR1436925 3 0.4358 0.58839 0.196 0.000 0.712 0.092 0.000 0.000
#> SRR1477238 4 0.5050 0.30401 0.416 0.000 0.076 0.508 0.000 0.000
#> SRR1332566 1 0.5150 0.61424 0.624 0.000 0.188 0.188 0.000 0.000
#> SRR1490228 3 0.5399 0.24913 0.004 0.000 0.588 0.148 0.260 0.000
#> SRR1442949 1 0.2627 0.64940 0.884 0.000 0.064 0.016 0.036 0.000
#> SRR1466239 1 0.3852 0.56444 0.664 0.000 0.324 0.012 0.000 0.000
#> SRR1094003 2 0.3998 0.94289 0.000 0.644 0.000 0.016 0.000 0.340
#> SRR1329971 3 0.3966 0.06354 0.444 0.000 0.552 0.004 0.000 0.000
#> SRR813076 2 0.4292 0.94186 0.000 0.628 0.000 0.032 0.000 0.340
#> SRR1097642 6 0.5224 -0.33828 0.000 0.440 0.000 0.092 0.000 0.468
#> SRR1322981 3 0.2664 0.65266 0.136 0.000 0.848 0.016 0.000 0.000
#> SRR1485976 2 0.3819 0.94923 0.000 0.652 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1471713 3 0.4821 -0.22939 0.008 0.000 0.484 0.036 0.472 0.000
#> SRR660522 3 0.2308 0.69290 0.068 0.000 0.892 0.040 0.000 0.000
#> SRR815374 3 0.3494 0.54342 0.252 0.000 0.736 0.012 0.000 0.000
#> SRR1069564 6 0.1082 0.87716 0.000 0.040 0.000 0.004 0.000 0.956
#> SRR1416337 3 0.1642 0.65350 0.004 0.000 0.936 0.032 0.028 0.000
#> SRR1316438 5 0.4253 0.66182 0.132 0.000 0.012 0.100 0.756 0.000
#> SRR1386844 1 0.3315 0.68685 0.820 0.000 0.076 0.104 0.000 0.000
#> SRR1373718 3 0.3508 0.63387 0.132 0.000 0.800 0.068 0.000 0.000
#> SRR1447458 2 0.3699 0.95089 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR1487128 1 0.4025 0.69043 0.720 0.000 0.232 0.048 0.000 0.000
#> SRR1441421 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1069919 2 0.3927 0.94623 0.000 0.644 0.000 0.012 0.000 0.344
#> SRR1460296 3 0.3201 0.60048 0.208 0.000 0.780 0.012 0.000 0.000
#> SRR1335489 1 0.2201 0.68715 0.900 0.000 0.052 0.048 0.000 0.000
#> SRR1393404 2 0.4371 0.93818 0.000 0.620 0.000 0.036 0.000 0.344
#> SRR1081425 3 0.1713 0.67731 0.028 0.000 0.928 0.044 0.000 0.000
#> SRR1401815 5 0.2328 0.69604 0.000 0.000 0.052 0.056 0.892 0.000
#> SRR1071337 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1071983 2 0.3984 0.94042 0.000 0.648 0.000 0.016 0.000 0.336
#> SRR1331793 2 0.3898 0.94980 0.000 0.652 0.000 0.012 0.000 0.336
#> SRR1410510 3 0.4649 -0.16262 0.012 0.000 0.504 0.020 0.464 0.000
#> SRR1098761 6 0.0976 0.85231 0.008 0.016 0.000 0.008 0.000 0.968
#> SRR1312124 1 0.3986 0.56777 0.664 0.000 0.316 0.020 0.000 0.000
#> SRR615395 3 0.0632 0.68548 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479349 1 0.4494 0.60375 0.692 0.000 0.092 0.216 0.000 0.000
#> SRR2165033 1 0.2651 0.67583 0.872 0.000 0.088 0.036 0.004 0.000
#> SRR1089054 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR816201 3 0.4846 -0.08777 0.060 0.000 0.592 0.344 0.004 0.000
#> SRR1488514 2 0.4153 0.93115 0.000 0.636 0.000 0.024 0.000 0.340
#> SRR655840 4 0.5570 0.76031 0.172 0.000 0.260 0.564 0.004 0.000
#> SRR1379303 1 0.3699 0.54730 0.660 0.000 0.336 0.004 0.000 0.000
#> SRR1418516 4 0.5421 0.73693 0.120 0.000 0.184 0.656 0.040 0.000
#> SRR613174 3 0.0405 0.67695 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000 0.000
#> SRR1351125 3 0.1562 0.68633 0.032 0.000 0.940 0.024 0.004 0.000
#> SRR659157 1 0.3321 0.54317 0.820 0.000 0.000 0.100 0.080 0.000
#> SRR1480408 4 0.5011 0.78167 0.116 0.000 0.264 0.620 0.000 0.000
#> SRR657857 4 0.4791 0.77386 0.104 0.000 0.244 0.652 0.000 0.000
#> SRR1073317 2 0.3912 0.94486 0.000 0.648 0.000 0.012 0.000 0.340
#> SRR1332526 4 0.5267 0.76527 0.120 0.000 0.320 0.560 0.000 0.000
#> SRR1094168 6 0.2199 0.85678 0.000 0.088 0.000 0.020 0.000 0.892
#> SRR1431270 5 0.6006 0.32267 0.328 0.000 0.092 0.052 0.528 0.000
#> SRR1085614 2 0.4575 0.87898 0.000 0.600 0.000 0.048 0.000 0.352
#> SRR1330106 4 0.5224 0.72894 0.048 0.000 0.316 0.600 0.036 0.000
#> SRR1466154 3 0.0972 0.68580 0.028 0.000 0.964 0.008 0.000 0.000
#> SRR1396944 4 0.5163 0.77919 0.140 0.000 0.252 0.608 0.000 0.000
#> SRR1082784 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1457267 1 0.3259 0.68988 0.772 0.000 0.216 0.012 0.000 0.000
#> SRR614659 3 0.2149 0.64872 0.016 0.000 0.900 0.080 0.004 0.000
#> SRR659247 3 0.2667 0.66407 0.128 0.000 0.852 0.020 0.000 0.000
#> SRR1317201 1 0.4110 0.45570 0.608 0.000 0.376 0.016 0.000 0.000
#> SRR1473696 3 0.3383 0.51677 0.268 0.000 0.728 0.004 0.000 0.000
#> SRR1375842 3 0.2778 0.53169 0.008 0.000 0.824 0.168 0.000 0.000
#> SRR1388123 2 0.3714 0.95012 0.000 0.656 0.000 0.004 0.000 0.340
#> SRR1096363 6 0.2838 0.72307 0.000 0.188 0.000 0.004 0.000 0.808
#> SRR1453662 1 0.5167 0.62515 0.620 0.000 0.208 0.172 0.000 0.000
#> SRR1345499 2 0.4371 0.93818 0.000 0.620 0.000 0.036 0.000 0.344
#> SRR1353499 3 0.2243 0.60629 0.004 0.000 0.880 0.112 0.004 0.000
#> SRR1416693 1 0.3518 0.69820 0.804 0.000 0.104 0.092 0.000 0.000
#> SRR1070841 3 0.1148 0.68051 0.020 0.000 0.960 0.016 0.004 0.000
#> SRR1380910 3 0.2815 0.67127 0.120 0.000 0.848 0.032 0.000 0.000
#> SRR1333125 2 0.3912 0.94486 0.000 0.648 0.000 0.012 0.000 0.340
#> SRR1498183 3 0.4261 0.18481 0.408 0.000 0.572 0.020 0.000 0.000
#> SRR612659 3 0.5549 -0.00936 0.000 0.000 0.556 0.232 0.212 0.000
#> SRR1447148 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR658597 6 0.1327 0.87312 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1089595 6 0.5066 0.40016 0.000 0.304 0.000 0.104 0.000 0.592
#> SRR1074263 2 0.3984 0.94042 0.000 0.648 0.000 0.016 0.000 0.336
#> SRR1376786 3 0.0937 0.66116 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1345995 3 0.2212 0.66944 0.112 0.000 0.880 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071035 4 0.4732 0.76044 0.068 0.000 0.320 0.612 0.000 0.000
#> SRR1068808 6 0.0508 0.85803 0.000 0.012 0.000 0.004 0.000 0.984
#> SRR1332754 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR662438 1 0.3967 0.51116 0.632 0.000 0.356 0.012 0.000 0.000
#> SRR1335355 3 0.3419 0.64051 0.104 0.000 0.812 0.084 0.000 0.000
#> SRR659448 3 0.3867 0.44121 0.296 0.000 0.688 0.012 0.004 0.000
#> SRR1323558 3 0.5870 0.18742 0.332 0.000 0.532 0.036 0.100 0.000
#> SRR1381711 3 0.4573 0.00928 0.044 0.000 0.624 0.328 0.004 0.000
#> SRR657985 3 0.4215 0.53320 0.244 0.000 0.700 0.056 0.000 0.000
#> SRR1314810 3 0.4209 0.25978 0.384 0.000 0.596 0.020 0.000 0.000
#> SRR1336505 4 0.4943 0.65386 0.032 0.000 0.404 0.544 0.020 0.000
#> SRR1474095 3 0.3494 0.52920 0.252 0.000 0.736 0.012 0.000 0.000
#> SRR1363831 2 0.3714 0.95012 0.000 0.656 0.000 0.004 0.000 0.340
#> SRR1442376 4 0.5163 0.77798 0.112 0.000 0.276 0.608 0.004 0.000
#> SRR1074909 6 0.1141 0.87677 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1101200 3 0.2442 0.56113 0.000 0.000 0.852 0.144 0.004 0.000
#> SRR1075408 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1367150 1 0.4508 0.26824 0.568 0.000 0.036 0.396 0.000 0.000
#> SRR1313406 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1068880 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1467277 3 0.6159 0.14859 0.120 0.000 0.520 0.048 0.312 0.000
#> SRR1084867 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1095431 6 0.0508 0.86910 0.000 0.012 0.000 0.004 0.000 0.984
#> SRR1380184 2 0.3699 0.95066 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR1443113 3 0.2997 0.66578 0.096 0.000 0.844 0.060 0.000 0.000
#> SRR1380414 3 0.1753 0.67857 0.084 0.000 0.912 0.004 0.000 0.000
#> SRR1315912 3 0.1387 0.64079 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR1075778 2 0.3898 0.94274 0.000 0.652 0.000 0.012 0.000 0.336
#> SRR1421116 2 0.3898 0.94980 0.000 0.652 0.000 0.012 0.000 0.336
#> SRR602282 4 0.5621 0.61011 0.028 0.000 0.188 0.620 0.164 0.000
#> SRR1361195 2 0.3927 0.94623 0.000 0.644 0.000 0.012 0.000 0.344
#> SRR600493 3 0.1285 0.65544 0.004 0.000 0.944 0.052 0.000 0.000
#> SRR1477653 3 0.2219 0.65651 0.136 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355475 3 0.0777 0.67195 0.004 0.000 0.972 0.024 0.000 0.000
#> SRR1360785 1 0.3247 0.64491 0.808 0.000 0.036 0.156 0.000 0.000
#> SRR810437 1 0.5993 0.55169 0.604 0.000 0.064 0.188 0.144 0.000
#> SRR1361860 4 0.5040 0.76253 0.152 0.000 0.212 0.636 0.000 0.000
#> SRR1441311 2 0.3912 0.94887 0.000 0.648 0.000 0.012 0.000 0.340
#> SRR1098903 4 0.4970 0.71237 0.064 0.000 0.372 0.560 0.004 0.000
#> SRR1457619 1 0.4361 0.33259 0.552 0.000 0.424 0.024 0.000 0.000
#> SRR1498529 4 0.5528 0.73840 0.192 0.000 0.252 0.556 0.000 0.000
#> SRR1097172 2 0.3898 0.94980 0.000 0.652 0.000 0.012 0.000 0.336
#> SRR1074017 2 0.4153 0.93115 0.000 0.636 0.000 0.024 0.000 0.340
#> SRR1472033 2 0.4139 0.92737 0.000 0.640 0.000 0.024 0.000 0.336
#> SRR1445087 4 0.5769 0.54242 0.020 0.000 0.196 0.584 0.200 0.000
#> SRR1399525 6 0.2838 0.71666 0.000 0.188 0.000 0.004 0.000 0.808
#> SRR1312844 6 0.1910 0.84314 0.000 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1085874 6 0.0922 0.87441 0.004 0.024 0.000 0.004 0.000 0.968
#> SRR1101226 6 0.1225 0.87084 0.000 0.036 0.000 0.012 0.000 0.952
#> SRR1476056 4 0.5040 0.76158 0.152 0.000 0.212 0.636 0.000 0.000
#> SRR1075659 6 0.0405 0.86729 0.000 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988
#> SRR1311916 5 0.5001 0.21762 0.032 0.000 0.468 0.020 0.480 0.000
#> SRR1353353 5 0.3210 0.68909 0.004 0.000 0.072 0.088 0.836 0.000
#> SRR1073291 3 0.1010 0.66430 0.004 0.000 0.960 0.036 0.000 0.000
#> SRR1356227 1 0.5320 0.55710 0.576 0.000 0.280 0.144 0.000 0.000
#> SRR1080720 2 0.4842 0.81574 0.000 0.600 0.000 0.076 0.000 0.324
#> SRR1091695 6 0.0603 0.87104 0.000 0.016 0.000 0.004 0.000 0.980
#> SRR1350304 1 0.3511 0.59902 0.800 0.000 0.004 0.148 0.048 0.000
#> SRR663002 1 0.6596 0.03250 0.416 0.000 0.032 0.244 0.308 0.000
#> SRR1376983 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1399926 1 0.4617 0.56495 0.664 0.000 0.084 0.252 0.000 0.000
#> SRR1347144 3 0.4334 0.18017 0.012 0.000 0.608 0.012 0.368 0.000
#> SRR1384006 3 0.4847 -0.09071 0.072 0.000 0.588 0.340 0.000 0.000
#> SRR1499108 6 0.1957 0.83863 0.000 0.112 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR614047 3 0.3708 0.64584 0.060 0.000 0.816 0.032 0.092 0.000
#> SRR818440 3 0.4768 0.56288 0.192 0.000 0.708 0.032 0.068 0.000
#> SRR1337770 1 0.4330 0.56429 0.632 0.000 0.332 0.036 0.000 0.000
#> SRR1399413 3 0.4421 -0.33038 0.020 0.000 0.552 0.424 0.004 0.000
#> SRR1385542 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1473959 1 0.6049 0.22208 0.428 0.000 0.376 0.188 0.008 0.000
#> SRR1074041 3 0.2513 0.55944 0.000 0.000 0.852 0.140 0.008 0.000
#> SRR1394495 2 0.4306 0.94005 0.000 0.624 0.000 0.032 0.000 0.344
#> SRR659460 3 0.0653 0.67301 0.004 0.000 0.980 0.012 0.004 0.000
#> SRR816699 3 0.0547 0.68475 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308612 3 0.0922 0.66908 0.004 0.000 0.968 0.024 0.004 0.000
#> SRR1499418 3 0.5199 0.10603 0.040 0.000 0.560 0.032 0.368 0.000
#> SRR1352894 2 0.4306 0.94005 0.000 0.624 0.000 0.032 0.000 0.344
#> SRR815805 3 0.4218 -0.20417 0.012 0.000 0.584 0.400 0.004 0.000
#> SRR1331083 6 0.1267 0.87487 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR808272 3 0.4086 0.38780 0.004 0.000 0.728 0.220 0.048 0.000
#> SRR1436698 3 0.2772 0.61995 0.180 0.000 0.816 0.004 0.000 0.000
#> SRR1095627 6 0.1584 0.87415 0.000 0.064 0.000 0.008 0.000 0.928
#> SRR1357672 3 0.3797 0.46506 0.292 0.000 0.692 0.016 0.000 0.000
#> SRR1351236 3 0.2593 0.64885 0.148 0.000 0.844 0.008 0.000 0.000
#> SRR1077479 4 0.4913 0.77843 0.112 0.000 0.252 0.636 0.000 0.000
#> SRR814491 1 0.1930 0.66942 0.916 0.000 0.036 0.048 0.000 0.000
#> SRR1101256 2 0.3984 0.94042 0.000 0.648 0.000 0.016 0.000 0.336
#> SRR1436004 3 0.1524 0.65122 0.008 0.000 0.932 0.060 0.000 0.000
#> SRR1457994 2 0.4306 0.91057 0.000 0.624 0.000 0.032 0.000 0.344
#> SRR1078998 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1314707 4 0.4809 0.75933 0.072 0.000 0.328 0.600 0.000 0.000
#> SRR1309534 1 0.3897 0.50621 0.712 0.000 0.008 0.264 0.016 0.000
#> SRR615527 4 0.5422 0.14838 0.008 0.000 0.096 0.520 0.376 0.000
#> SRR1098216 4 0.4918 0.76352 0.084 0.000 0.320 0.596 0.000 0.000
#> SRR1325847 6 0.1082 0.87769 0.000 0.040 0.000 0.004 0.000 0.956
#> SRR1404003 4 0.4729 0.65018 0.040 0.000 0.412 0.544 0.004 0.000
#> SRR1344166 3 0.4732 -0.01794 0.068 0.000 0.612 0.320 0.000 0.000
#> SRR1368638 1 0.2822 0.69891 0.864 0.000 0.076 0.056 0.004 0.000
#> SRR1431429 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1079237 6 0.2744 0.80618 0.000 0.144 0.000 0.016 0.000 0.840
#> SRR1080509 2 0.3804 0.95055 0.000 0.656 0.000 0.008 0.000 0.336
#> SRR815759 1 0.5202 0.34766 0.532 0.000 0.400 0.036 0.032 0.000
#> SRR1502143 3 0.0547 0.68508 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487614 3 0.4493 -0.04355 0.004 0.000 0.548 0.024 0.424 0.000
#> SRR1402307 2 0.3912 0.94887 0.000 0.648 0.000 0.012 0.000 0.340
#> SRR820810 3 0.3370 0.59092 0.064 0.000 0.812 0.124 0.000 0.000
#> SRR1099212 2 0.4167 0.91769 0.000 0.612 0.000 0.020 0.000 0.368
#> SRR1083215 3 0.3804 0.37757 0.336 0.000 0.656 0.008 0.000 0.000
#> SRR1476547 6 0.5508 0.33419 0.000 0.352 0.000 0.140 0.000 0.508
#> SRR656421 1 0.4853 0.19978 0.488 0.000 0.456 0.056 0.000 0.000
#> SRR1086116 2 0.4384 0.93585 0.000 0.616 0.000 0.036 0.000 0.348
#> SRR1499917 1 0.3000 0.67749 0.852 0.000 0.044 0.096 0.008 0.000
#> SRR1339944 2 0.3927 0.94623 0.000 0.644 0.000 0.012 0.000 0.344
#> SRR1391444 2 0.3819 0.94923 0.000 0.652 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1434889 4 0.4801 0.50694 0.024 0.000 0.472 0.488 0.016 0.000
#> SRR1431847 1 0.5059 0.37230 0.628 0.000 0.000 0.232 0.140 0.000
#> SRR1317155 4 0.4955 0.75397 0.132 0.000 0.204 0.660 0.004 0.000
#> SRR1477405 3 0.3168 0.60906 0.192 0.000 0.792 0.016 0.000 0.000
#> SRR655289 3 0.2261 0.61862 0.008 0.000 0.884 0.104 0.004 0.000
#> SRR1341683 4 0.6371 0.47554 0.020 0.000 0.348 0.416 0.216 0.000
#> SRR1084790 3 0.0972 0.67400 0.008 0.000 0.964 0.028 0.000 0.000
#> SRR1073731 3 0.3894 0.10242 0.004 0.000 0.664 0.324 0.008 0.000
#> SRR1332588 4 0.5237 0.66434 0.228 0.000 0.148 0.620 0.004 0.000
#> SRR1471157 2 0.3898 0.94980 0.000 0.652 0.000 0.012 0.000 0.336
#> SRR654945 3 0.3741 0.39890 0.320 0.000 0.672 0.008 0.000 0.000
#> SRR661028 3 0.2821 0.64753 0.152 0.000 0.832 0.016 0.000 0.000
#> SRR1413477 2 0.3833 0.94766 0.000 0.648 0.000 0.008 0.000 0.344
#> SRR1101152 3 0.2006 0.68815 0.080 0.000 0.904 0.016 0.000 0.000
#> SRR1358435 6 0.4291 0.50166 0.000 0.268 0.000 0.052 0.000 0.680
#> SRR2165273 1 0.4237 0.67634 0.736 0.000 0.120 0.144 0.000 0.000
#> SRR1379014 4 0.5119 0.76576 0.156 0.000 0.220 0.624 0.000 0.000
#> SRR1489904 3 0.5310 0.45967 0.180 0.000 0.644 0.016 0.160 0.000
#> SRR1416386 6 0.2378 0.78485 0.000 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848
#> SRR1406048 1 0.4214 0.63878 0.680 0.000 0.276 0.044 0.000 0.000
#> SRR606982 4 0.5046 0.75827 0.076 0.000 0.256 0.648 0.020 0.000
#> SRR1358082 3 0.2912 0.63785 0.172 0.000 0.816 0.012 0.000 0.000
#> SRR1312934 3 0.3287 0.42269 0.000 0.000 0.768 0.220 0.012 0.000
#> SRR655194 1 0.3269 0.71085 0.792 0.000 0.184 0.024 0.000 0.000
#> SRR1331174 2 0.3984 0.94042 0.000 0.648 0.000 0.016 0.000 0.336
#> SRR1473251 6 0.5223 0.57926 0.000 0.272 0.000 0.136 0.000 0.592
#> SRR1389820 5 0.0767 0.67850 0.012 0.004 0.000 0.008 0.976 0.000
#> SRR1074289 3 0.3930 -0.24971 0.000 0.000 0.576 0.420 0.004 0.000
#> SRR1348816 2 0.3984 0.94042 0.000 0.648 0.000 0.016 0.000 0.336
#> SRR1076292 3 0.4672 0.51462 0.024 0.000 0.728 0.136 0.112 0.000
#> SRR1395810 2 0.3563 0.95097 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1498909 3 0.5157 -0.21608 0.008 0.000 0.552 0.368 0.072 0.000
#> SRR1443507 3 0.0891 0.67638 0.008 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000
#> SRR1452310 1 0.4233 0.53632 0.684 0.000 0.048 0.268 0.000 0.000
#> SRR665610 1 0.3975 0.44112 0.600 0.000 0.392 0.008 0.000 0.000
#> SRR1347322 3 0.3043 0.61634 0.200 0.000 0.792 0.008 0.000 0.000
#> SRR813395 6 0.1462 0.87533 0.000 0.056 0.000 0.008 0.000 0.936
#> SRR1477256 1 0.4085 0.69672 0.752 0.000 0.128 0.120 0.000 0.000
#> SRR1470230 1 0.4679 0.47430 0.724 0.000 0.020 0.128 0.128 0.000
#> SRR1354247 4 0.4775 0.74342 0.064 0.000 0.348 0.588 0.000 0.000
#> SRR1082640 2 0.4446 0.93313 0.000 0.612 0.000 0.040 0.000 0.348
#> SRR1487592 3 0.0972 0.68621 0.028 0.000 0.964 0.008 0.000 0.000
#> SRR1352299 3 0.1498 0.67707 0.028 0.000 0.940 0.032 0.000 0.000
#> SRR1076317 6 0.1471 0.87343 0.000 0.064 0.000 0.004 0.000 0.932
#> SRR1434117 3 0.1003 0.68606 0.028 0.000 0.964 0.004 0.004 0.000
#> SRR1075273 6 0.1858 0.85554 0.000 0.092 0.000 0.004 0.000 0.904
#> SRR658657 1 0.5227 0.61310 0.664 0.000 0.196 0.028 0.112 0.000
#> SRR1092773 6 0.2442 0.79694 0.000 0.144 0.000 0.004 0.000 0.852
#> SRR1365332 3 0.3104 0.61486 0.184 0.000 0.800 0.016 0.000 0.000
#> SRR615958 3 0.2393 0.64255 0.004 0.000 0.884 0.020 0.092 0.000
#> SRR1097688 6 0.0858 0.87577 0.000 0.028 0.000 0.004 0.000 0.968
#> SRR1403259 4 0.6299 -0.13359 0.128 0.000 0.044 0.444 0.384 0.000
#> SRR1099120 6 0.1082 0.82020 0.000 0.040 0.000 0.004 0.000 0.956
#> SRR1362200 3 0.1857 0.64634 0.004 0.000 0.924 0.044 0.028 0.000
#> SRR1464856 2 0.3819 0.94923 0.000 0.652 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1347298 3 0.5386 -0.25787 0.000 0.000 0.524 0.352 0.124 0.000
#> SRR1075923 6 0.1863 0.84696 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1100703 3 0.0622 0.67714 0.008 0.000 0.980 0.012 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0